CN112365958A - 一种dicom文件信息读取及图像格式转换方法 - Google Patents
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Abstract
一种DICOM文件信息读取及图像格式转换方法，包括步骤1读取DICOM格式文件；步骤2提取并保存文件中的PHI信息；步骤3提取文件中的医学图像，转换为jpg格式保存。本发明基于目前存在的上述需求，提供一种DICOM文件信息读取及图像格式转换方法。读取和保存DICOM文件中的PHI信息，并且将其中的医学图像转换为常用的jpg格式存储。本发明能够对DICOM文件进行处理，提取出其中的患者PHI信息，并保存为资料组；能够提取DICOM文件中的医学图像数据，并将其保存为jpg格式，方便后续的使用。
Description
技术领域
本发明涉及DICOM文件信息读取及图像格式转换方法。
背景技术
DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)即医学数字成像和通信，是医学图像和相关信息的国际标准(ISO 12052)。它定义了质量能满足临床需要的可用于数据交换的医学图像格式。
DICOM是部署最为广泛的医疗信息标准之一，给放射学实践带来了革命性的改变，使高级医学图像应用成为可能。患者的医学图像都以DICOM文件格式进行存储。这个格式包含关于患者的PHI(protected health information)信息，例如姓名，性别，年龄，以及其他图像相关信息，比如捕获并生成图像的设备信息，医疗的一些上下文相关信息等。
在医疗实际应用中，医生通常使用DICOM阅读器阅读并对图像中发现的问题进行诊断。而普通开发者在缺少专业DICOM阅读器的情况下，想要获取DICOM文件中的PHI信息，查看DICOM文件中的医学图像是比较麻烦的。因此，需要一种处理DICOM文件的方法。
发明内容
本发明要克服现有技术的上述缺点，提供一种DICOM文件信息读取及图像格式转换方法。读取和保存DICOM文件中的PHI信息，并且将其中的医学图像转换为常用的jpg格式存储。
本发明解决技术问题采用如下技术方案：
一种DICOM文件信息读取及图像格式转换方法，包括以下步骤：
步骤1：读取DICOM格式文件；
步骤2：提取并保存文件中的PHI信息；
步骤3：提取文件中的医学图像，转换为jpg格式保存。
步骤1具体包括：
11)传入DICOM文件，将文件以二进制字符串的形式打开；
12)跳过文件开头预设字节的导言部分，然后读取4字节的前缀部分是否为“DICM”来判断是否为DICOM格式文件；
13)依次读取之后的文件元dataElement至文件末尾。
步骤2具体包括：
21)读取文件元dataElement的Tag，确定该文件元的数据字典，标志着对应的患者PHI信息类别；
22)读取文件元dataElement的VR，确定该文件元的数据类型，标志着对应的患者PHI信息的数据类型；
23)读取文件元dataElement的VL，确定该文件元的数据长度；
24)根据文件元dataElement的数据长度VL来读取VF，即文件元的数据值，将数据值和对应的数据字典以资料组dataset的形式保存下来；
25)重复上述步骤，直至处理完所有的dataElement，最后返回一个包含所有患者PHI信息的资料组。
步骤3具体包括：
31)获取并复制DICOM文件中的像素数据；
32)设置所需要的jpg图像的分辨率；
33)设置画布大小；
34)创建一个figure对象，以画布大小为长宽，并设置坐标不可见；
35)将像素数据以灰度图的方式画在figure对象上，同时设置图的位置；
36)将figure对象以jpg的格式保存。
优选地，步骤12)所述的文件开头预设字节，是128字节。
优选地，步骤33)所述的设置画布大小，具体为jpg图像分辨率的百分之一，使jpg的水平和垂直分辨率均为100dpi。
本发明对对医学图像的进一步处理有重要意义。首先传入DICOM文件，将文件以二进制字符串的形式打开；然后跳过文件开头128字节的导言部分，读取4字节的前缀部分是否为“DICM”来判断是否为DICOM格式文件；最后依次读取之后的文件元dataElement至文件末尾。同时提取和保存PHI信息，通过figure对象将图像数据以jpg的格式保存下来。
本发明具有如下有益效果：
(1)能够对DICOM文件进行处理，提取出其中的患者PHI信息，并保存为资料组；
(2)能够提取DICOM文件中的医学图像数据，并将其保存为jpg格式，方便后续的使用。
附图说明
图1是DICOM文件的文件格式。
图2是通过本发明提取的患者的PHI信息的部分展示。
图3是通过本发明方法提取并且转换为jpg图像的手掌骨结果图。
具体实施方式
下面结合附图对本发明的技术方案作进一步阐述。
一种DICOM文件信息读取及图像格式转换方法，包括以下步骤：
步骤1：由图1可知DICOM文件的具体文件格式，从而通过字节码处理的方式读取DICOM文件；
步骤2：提取并保存文件中的PHI信息，最后以资料组的形式保存，如图2所示；
步骤3：提取文件中的医学图像，转换为jpg格式保存，如图3所示。
步骤1具体包括：
11)传入DICOM文件，将文件以二进制字符串的形式打开；
12)跳过文件开头预设字节的导言部分，然后读取4字节的前缀部分是否为“DICM”来判断是否为DICOM格式文件；
13)依次读取之后的文件元dataElement至文件末尾。
步骤2具体包括：
21)读取文件元dataElement的Tag，确定该文件元的数据字典，标志着对应的患者PHI信息类别；
22)读取文件元dataElement的VR，确定该文件元的数据类型，标志着对应的患者PHI信息的数据类型；
23)读取文件元dataElement的VL，确定该文件元的数据长度；
24)根据文件元dataElement的数据长度VL来读取VF，即文件元的数据值，将数据值和对应的数据字典以资料组dataset的形式保存下来；
25)重复上述步骤，直至处理完所有的dataElement，最后返回一个包含所有患者PHI信息的资料组。
步骤3具体包括：
31)获取并复制DICOM文件中的像素数据；
32)设置所需要的jpg图像的分辨率；
33)设置画布大小；
34)创建一个figure对象，以画布大小为长宽，并设置坐标不可见；
35)将像素数据以灰度图的方式画在figure对象上，同时设置图的位置；
36)将figure对象以jpg的格式保存。
优选地，步骤12)所述的文件开头预设字节，是128字节。
优选地，步骤33)所述的设置画布大小，具体为jpg图像分辨率的百分之一，使jpg的水平和垂直分辨率均为100dpi。
最后应说明的是：以上实施方式仅用以说明本发明的技术方案，而非对其限制；尽管参照前述实施方式对本发明进行了详细的说明，本领域的普通技术人员应当理解：其依然可以对前述实施方式所记载的技术方案进行修改，或者对其中部分技术特征进行等同替换；而这些修改或者替换，并不使相应技术方案的本质脱离本发明实施方式技术方案的精神和范围。
Claims (3)
1.一种DICOM文件信息读取及图像格式转换方法，包括以下步骤：
步骤1：读取DICOM格式文件，具体包括：
11)传入DICOM文件，将文件以二进制字符串的形式打开；
12)跳过文件开头预设字节的导言部分，然后读取4字节的前缀部分是否为“DICM”来判断是否为DICOM格式文件；
13)依次读取之后的文件元dataElement至文件末尾。
步骤2：提取并保存文件中的PHI信息，具体包括：
21)读取文件元dataElement的Tag，确定该文件元的数据字典，标志着对应的患者PHI信息类别；
22)读取文件元dataElement的VR，确定该文件元的数据类型，标志着对应的患者PHI信息的数据类型；
23)读取文件元dataElement的VL，确定该文件元的数据长度；
24)根据文件元dataElement的数据长度VL来读取VF，即文件元的数据值，将数据值和对应的数据字典以资料组dataset的形式保存下来；
25)重复上述步骤，直至处理完所有的dataElement，最后返回一个包含所有患者PHI信息的资料组。
步骤3：提取文件中的医学图像，转换为jpg格式保存，具体包括：
31)获取并复制DICOM文件中的像素数据；
32)设置所需要的jpg图像的分辨率；
33)设置画布大小；
34)创建一个figure对象，以画布大小为长宽，并设置坐标不可见；
35)将像素数据以灰度图的方式画在figure对象上，同时设置图的位置；
36)将figure对象以jpg的格式保存。
2.如权利要求1所述的一种DICOM文件信息读取及图像格式转换方法，其特征在于：步骤12)所述的文件开头预设字节，是128字节。
3.如权利要求1所述的一种DICOM文件信息读取及图像格式转换方法，其特征在于：步骤33)所述的设置画布大小，具体为jpg图像分辨率的百分之一，使jpg的水平和垂直分辨率均为100dpi。
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| CN103577699A (zh) * | 2013-11-14 | 2014-02-12 | 哈尔滨工程大学 | 一种基于Android平台的DICIOM医学图像显示处理方法 |
| CN107872476A (zh) * | 2016-09-26 | 2018-04-03 | 中国石油化工股份有限公司 | 图片传输方法及系统 |
| CN111276222A (zh) * | 2018-12-05 | 2020-06-12 | 珠海横琴盛达兆业科技投资有限公司 | 一种基于python实现医学图像文件连续转换成jpg映像文件的方法 |
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