CN112292141A - 产生长链双羧基脂肪酸(lcdfa)的微生物及其用途 - Google Patents

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Abstract

一种增加哺乳动物受试者中胃道酸(GTA)产生的方法。该方法包括给药治疗有效量的组合物,包含选自以下微生物种的至少一种活或减毒培养物:布劳特氏菌属、普拉梭菌、拟杆菌属、瘤胃菌科、毛螺菌科、粪球菌属、罗氏菌属、颤螺菌属、布氏瘤胃球菌、瘤胃球菌属、梭菌科、长链多尔氏菌、单形拟杆菌、多尔氏菌属、链球菌属、梭菌目、厌氧棒状菌属、小杆菌属、青春双岐杆菌、红蝽杆菌科、粪杆菌属、萨特氏菌属、卵形拟杆菌、副拟杆菌属、瘤胃球菌属、粪拟杆菌、两形真杆菌、考拉杆菌属和肠杆菌科;或增加消化道中微生物物种的生长和/或生存力的益生元组合物。给药该组合物增加了受试者中至少一种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的合成。还描述了测定胃肠道炎症状态的方法及用于检测和治疗胃道酸(GTA)不足的试剂盒。

Description

产生长链双羧基脂肪酸(LCDFA)的微生物及其用途
技术领域
本发明涉及通过控制消化道微生物组来治疗胃肠炎症和胃道酸(GTA)长链脂肪酸缺乏症。本发明还涉及在哺乳动物受试者中增加胃道酸(GTA)产生的组合物和方法。
背景技术
广泛认为慢性炎症是胃肠道(GI)癌症的主要潜在病因,包括结肠直肠癌、胰腺癌、胃癌、食道癌、卵巢癌等(Marusawa和Jenkins 2014;Hussain和Harris 2007;Chapkin,McMurray和Lupton,2007;Demaria等,2010;Itzkowitz和Yio,2004;Maccio和Madeddu,2012;Schwartsburd,2004;Terzic等,2010;Wu等,2014)。慢性炎症可导致氧化应激,进而可导致致癌事件以及驱动细胞恶性转化的遗传突变(Mannick等和Zhang等)。癌症的生长随后由微环境中细胞因子和血管生成因子的促炎环境驱动。
尽管有大量证据将胃肠道癌症与慢性炎症相关联,但是所有对癌症(例如结直肠癌)早期检测的重点都唯一地集中在改善对肿瘤衍生标记或癌前病变的检测上,以及没有潜在的代谢或炎症危险因素。在结直肠癌的情况下,主要的筛查方式是通过内窥镜检查直接观察癌症的生长或癌前病变,检测粪便中的潜血,或者粪便或血液中最近的甲基化的肿瘤DNA。为了使这些方式中的每一种有效,必须存在最小的肿瘤负荷,其大小足以物理观察或活检病变,或者具有足够的肿瘤负荷以在粪便或血液中产生可检测水平的肿瘤衍生生物标志物。因此,这种方法从一开始就没有希望阻止疾病的发生,而是只能以在早期阶段检测到的形式提供希望,在这种情况下治疗通常更有效。
Ritchie等人通过对与无病受试者进行分型的结直肠癌、胰腺癌和卵巢癌的小分子的非目标代谢组学分析,鉴定了肠炎状态的关键成分(Ritchie等人2010a;Ritchie等人2010c;Ritchie等人2010b;Ritchie等人2011;Ritchie等人2013b;Ritchie等人2013a;Ritchie等人2015)。最初认为新的代谢产物家族是维生素E代谢产物,但随后被证明是新的长链多不饱和二羧酸脂肪酸(称为胃道酸GTA),其碳原子数在28至36之间,分子量约为446Da至596Da,与对照相比,显示出这些癌症患者的血清中持续降低。
尽管在各种细胞系统中将含半纯化的GTA和缺少GTA的提取物与LPS并用,但GTA在体外显示具有抗炎和抗增殖活性(Ritchie等,2011)。已显示抗炎活性是通过NF-κB介导的,NF-κB是一种与多种促炎性细胞因子(包括TNF-α和白介素-1β)活化有关的转录因子。具体地,GTA显著上调了IκBα(一种使NF-κB失活的抑制蛋白)。NF-κB的过表达与慢性炎症的多个方面相关,并且已成为合成和天然产物治疗下调的靶标(Ben-Neriah和Karin 2011;Spehlmann和Eckmann 2009;Suhr等2001;Xu等,2005年;Freitas和Fraga,2018年)。
这些GTA继续成为关注和研究的来源,以更好地了解它们的作用机制以及在治疗炎症和疾病(例如癌症)中的潜在作用。
发明内容
本发明的目的是提供用于检测和减轻受试者的胃肠道(GI)炎症的新方法。
因此,本文提供了一种方法,该方法用于通过测量血液中的长链二元脂肪酸(LCDFA)或GTA的水平来识别患有GI炎症的受试者,然后用化学试剂或微生物进行治疗以恢复或增强GTA水平。
在某些实施方式中,所述微生物是产生长链脂肪酸的细菌,特别是来自布劳特氏菌属和普拉梭菌种的细菌。
还显示出特定的微生物物种与这些GTA水平相关,所以提出的方法是增加这些微生物物种,以减少胃肠道炎症。
还提供了一种用于识别与各种胃肠道相关癌症的发展相关的潜在代谢炎性病症的方法,所述癌症包括但不限于结肠直肠癌、胰腺癌和卵巢癌,然后该方法通过治疗处理潜在的炎症来降低风险。
因此,提供了一种在哺乳动物受试者中增加胃道酸(GTA)产生的方法。该方法包括给药治疗有效量的包含选自以下微生物物种的至少一种活培养物或减毒培养物的组合物或增加消化道中所述微生物物种的生长和/或生存力的益生元组合物:布劳特氏菌属(Blautia)、普拉梭菌(Faecalibacterium prausnitzii)、拟杆菌属(Bacteroides)、瘤胃菌科(Ruminococcaceae)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)、粪球菌属(Coprococcus)、罗氏菌属(Roseburia)、颤螺菌属(Oscillospira)、布氏瘤胃球菌(Ruminococcus bromii)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、梭菌科(Costridiaceae)、长链多尔氏菌(Dorea formicigenerans)、单形拟杆菌(Bacteroides uniformis)、多尔氏菌属(Dorea)、链球菌属(Streptococcus)、梭菌目(Clostridiales)、厌氧棒状菌属(Anaerostipes)、小杆菌属(Dialister)、青春双岐杆菌(Bifidobacterium adolescentis)、红蝽杆菌科(Coriobacteriaceae)、粪杆菌属(Faecalibacterium)、萨特氏菌属(Sutterella)、卵形拟杆菌(Bacteroides ovatus)、副拟杆菌属(Parabacteroides)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、粪拟杆菌(Bacteroidesfaecis)、两形真杆菌(Eubacterium biforme)、考拉杆菌属(Phascolartobacterium)和肠杆菌科(Enterobacteriaceae);其中所述组合物增加了所述受试者中至少一种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的合成。
在某些实施方式中,该方法进一步包括测量受试者中一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的循环水平的步骤。因此,如果发现受试者中一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢产物的水平低于预定的对照水平、从受试者获得的较早检测值或健康受试者的正常水平,则可以给药所述组合物。例如,但不希望受到限制,该对照可以包括健康个体典型的至少一种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的预定阈值。
在另外的实施方式中,所述组合物可以包含来自布劳特氏菌属的微生物物种的活培养物或减毒培养物,普拉梭菌的活培养物或减毒培养物或其组合。通常,将此类培养物配制在适于给药到受试者胃肠道的药学上可接受的赋形剂或载体中。
在其他实施方式中,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物是28~36个碳的二羧酸脂肪酸,所述二羧酸脂肪酸包括单键或双键连接的两个14~18个碳长度的二聚脂肪酸结构。在其他实施方式中,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物可以是以下的一种:GTA-446、GTA-448、GTA-450、GTA-452、GTA-464、GTA-466、GTA-468、GTA-474、GTA-476、GTA-478、GTA-484、GTA-490、GTA-492、GTA-494、GTA-502、GTA-504、GTA-512、GTA-518、GTA-520、GTA-522、GTA-524、GTA-530、GTA-532、GTA-536、GTA-538、GTA-540、GTA-550、GTA-574、GTA-576、GTA-580、GTA-590、GTA-592、GTA-594和GTA-596。
在非限制实施方式中,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物可具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量:446.3396(GTA-446、)、448.3553(GTA-448)、450.3709(GTA-450)、452.3866(GTA-452)、464.3522(GTA-464)、466.3661(GTA-466)、468.3814(GTA-468)、474.3736(GTA-474)、476.3866GTA-476、478.4022(GTA-478)、484.3764(GTA-484)、490.3658(GTA-490)、492.3815(GTA-492)、494.3971(GTA-494)、502.4022(GTA-502)、504.4195(GTA-504)、512.4077(GTA-512)、518.3974(GTA-518)、520.4128(GTA-520)、522.4284(GTA-522)、524.4441(GTA-524)、530.4335(GTA-530)、532.4492(GTA-532)、536.4077(GTA-536)、538.4233(GTA-538)、540.4389(GTA-540)、550.4597(GTA-550)、574.4597(GTA-574)、576.4754(GTA-576)、580.5067(GTA-580)、590.4546(GTA-590)、592.4703(GTA-592)、594.4859(GTA-594)或596.5016(GTA-596)。
在其他非限制实施方式中,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物可具有分子式:C28H46O4(GTA-446)、C28H48O4(GTA-448)、C28H50O4(GTA-450)、C28H52O4(GTA-452)、464.3522(GTA-464)、466.3661(GTA-466)、C28H52O5(GTA-468)、C30H50O4(GTA-474)、C30H52O4GTA-476、C30H54O4(GTA-478)、C28H52O6(GTA-484)、C30H50O5(GTA-490)、C30H52O5(GTA-492)、C30H54O5(GTA-494)、C32H54O4(GTA-502)、C32H56O4(GTA-504)、C30H56O6(GTA-512)、C32H54O5(GTA-518)、C32H56O5(GTA-520)、C32H58O5(GTA-522)、C32H60O5GTA-524、C34H58O4(GTA-530)、C34H60O4(GTA-532)、C32H56O6(GTA-536)、C32H58O6(GTA-538)、C32H60O6(GTA-540)、C34H62O5(GTA-550)、C36H62O5(GTA-574)、C36H64O5(GTA-576)、C36H68O5(GTA-580)、C36H62O6(GTA-590)、C36H64O6(GTA-592)、C36H66O6(GTA-594)或C36H68O6(GTA-596)。
在其他非限制实施方式中,可使用碰撞诱导解离(CID)串联质谱法测量所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物。所述GTA可为以下列出的一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物:
·GTA-446,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量446.3396,分子式为C28H46O4,通过使用N2作为碰撞气体CIDMS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量445的子离子:427、409、401和383;
·GTA-448,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量448.3553,分子式为C28H48O4,通过使用N2作为碰撞气体CIDMS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量447的子离子:429、411、403和385;
·GTA-450,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量450.3709,分子式为C28H50O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量449的子离子:431、413、405和387;
·GTA-452,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量452.3866,分子式为C28H52O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量451的子离子:433、407和389;
·GTA-464具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量464.3522,分子式为C28H48O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量463的子离子:445、419、401和383;
·GTA-466具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量466.3661,分子式为C28H50O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量465的子离子:447、421和403;
·GTA-468具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量468.3814,分子式为C28H52O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量467的子离子:449、423和405;
·GTA-474具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量474.3736,分子式为C30H50O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量473的子离子:455、429和411;
·GTA-476具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量476.3866,分子式为C30H52O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量475的子离子:457、431、439和413;
·GTA-478具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量478.4022,分子式为C30H54O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量477的子离子:459、433、441和415;
·GTA-484具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量484.3764,分子式为C28H52O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量483的子离子:465、315、439483、421和447;
·GTA-490具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量490.3658,分子式为C30H50O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量489的子离子:445、471、427和319;
·GTA-492具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量492.3815,分子式为C30H52O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量491的子离子:241、249、267、473和447;
·GTA-494具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量494.3971,分子式为C30H54O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量493的子离子:475、215和449;
·GTA-502具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量502.4022,分子式为C32H54O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量501的子离子:483、457、465和439;
·GTA-504具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量504.4195,分子式为C32H56O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量503的子离子:485、459、467和441;
·GTA-512具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量512.4077,分子式为C30H56O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量511的子离子:493、315和467;
·GTA-518具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量518.3974,分子式为C32H54O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量517的子离子:499、473、499、481和445;
·GTA-520具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量520.4128,分子式为C32H56O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量519的子离子:501、457、475、459、447和483;
·GTA-522具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量522.4284,分子式为C32H58O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量521的子离子:503、459、477、504、441和485;
·GTA-524具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量524.4441,分子式为C32H60O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量523的子离子:505、461、479、506、443和487;
·GTA-530具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量530.4335,分子式为C34H58O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量529的子离子:467、511和485;
·GTA-532具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量532.4492,分子式为C34H60O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量531的子离子:513、469、487和495;
·GTA-536具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量536.4077,分子式为C32H56O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量535的子离子:473;
·GTA-538具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量538.4233,分子式为C32H58O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量537的子离子:519、475、493、501和457;
·GTA-540具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量540.4389,分子式为C32H60O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量539的子离子:315、521、495和477;
·GTA-550具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量550.4597,分子式为C34H62O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量549的子离子:487、531、251、253、513、469和506;
·GTA-574具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量574.4597,分子式为C36H62O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量573的子离子:295、223、555和511;
·GTA-576具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量576.4754,分子式为C36H64O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量575的子离子:277、297、557、513和495;
·GTA-580具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量580.5067,分子式为C36H68O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量579的子离子:561、543、535、517和499;
·GTA-590具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量590.4546,分子式为C36H62O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量589的子离子:545;
·GTA-592具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量592.4703,分子式为C36H64O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量591的子离子:555和113;
·GTA-594具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量594.4859,分子式为C36H66O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量593的子离子:557371、315和277;以及
·GTA-596具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量596.5016,分子式为C36H68O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量595的子离子:279、315、297、577和559。
例如,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物是GTA-446,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物具有化学式C28H46O4,并且所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物结构为:
Figure BDA0002818047720000111
本文还提供了一种确定哺乳动物受试者体内胃肠道炎症状态的方法。所述方法包括测量一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的循环水平,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物是28~36个碳的二羧酸脂肪酸,所述二羧酸脂肪酸包括单键或双键连接的两个长度为14~18个碳的较短链的二聚脂肪酸结构;并且如果检测到这些GTA二羧酸脂肪酸代谢物的一种或多种的水平低于预定对照水平、所述受试者的较早检测值或健康受试者的正常水平,则将该受试者评估为患有胃肠道炎症或具有胃肠道炎症的风险。
在所述方法的其他实施方式中,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物可为选自以下的一种:GTA-446、GTA-448、GTA-450、GTA-452、GTA-464、GTA-466、GTA-468、GTA-474、GTA-476、GTA-478、GTA-484、GTA-490、GTA-492、GTA-494、GTA-502、GTA-504、GTA-512、GTA-518、GTA-520、GTA-522、GTA-524、GTA-530、GTA-532、GTA-536、GTA-538、GTA-540、GTA-550、GTA-574、GTA-576、GTA-580、GTA-590、GTA-592、GTA-594和GTA-596。
在非限制实施方式中,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物可具有1PPM道尔顿之内质量精度的如下准确的中性质量:46.3396(GTA-446)、448.3553(GTA-448)、450.3709(GTA-450)、452.3866(GTA-452)、464.3522(GTA-464)、466.3661(GTA-466)、468.3814(GTA-468)、474.3736(GTA-474)、476.3866GTA-476、478.4022(GTA-478)、484.3764(GTA-484)、490.3658(GTA-490)、492.3815(GTA-492)、494.3971(GTA-494)、502.4022(GTA-502)、504.4195(GTA-504)、512.4077(GTA-512)、518.3974(GTA-518)、520.4128(GTA-520)、522.4284(GTA-522)、524.4441(GTA-524)、530.4335(GTA-530)、532.4492(GTA-532)、536.4077(GTA-536)、538.4233(GTA-538)、540.4389(GTA-540)、550.4597(GTA-550)、574.4597(GTA-574)、576.4754(GTA-576)、580.5067(GTA-580)、590.4546(GTA-590)、592.4703(GTA-592)、594.4859(GTA-594)或596.5016(GTA-596)。
在其他非限制实施方式中,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物可有分子式C28H46O4(GTA-446)、C28H48O4(GTA-448)、C28H50O4(GTA-450)、C28H52O4(GTA-452)、464.3522(GTA-464)、466.3661(GTA-466)、C28H52O5(GTA-468)、C30H50O4(GTA-474)、C30H52O4GTA-476、C30H54O4(GTA-478)、C28H52O6(GTA-484)、C30H50O5(GTA-490)、C30H52O5(GTA-492)、C30H54O5(GTA-494)、C32H54O4(GTA-502)、C32H56O4(GTA-504)、C30H56O6(GTA-512)、C32H54O5(GTA-518)、C32H56O5(GTA-520)、C32H58O5(GTA-522)、C32H60O5GTA-524、C34H58O4(GTA-530)、C34H60O4(GTA-532)、C32H56O6(GTA-536)、C32H58O6(GTA-538)、C32H60O6(GTA-540)、C34H62O5(GTA-550)、C36H62O5(GTA-574)、C36H64O5(GTA-576)、C36H68O5(GTA-580)、C36H62O6(GTA-590)、C36H64O6(GTA-592)、C36H66O6(GTA-594)或C36H68O6(GTA-596)。
在其他非限制实施方式中,可使用碰撞诱导解离(CID)串联质谱法测量所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物。所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物可选自以下列出的一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物:
·GTA-446,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量446.3396,分子式为C28H46O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量445的子离子:427、409、401和383;
·GTA-448,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量448.3553,分子式为C28H48O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量447的子离子:429、411、403和385;
·GTA-450,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量450.3709,分子式为C28H50O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量449的子离子:431、413、405和387;
·GTA-452,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量452.3866,分子式为C28H52O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量451的子离子:433、407和389;
·GTA-464具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量464.3522,分子式为C28H48O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量463的子离子:445、419、401和383;
·GTA-466具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量466.3661,分子式为C28H50O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量465的子离子:447、421和403;
·GTA-468具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量468.3814,分子式为C28H52O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量467的子离子:449、423和405;
·GTA-474具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量474.3736,分子式为C30H50O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量473的子离子:455、429和411;
·GTA-476具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量476.3866,分子式为C30H52O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量475的子离子:457、431、439和413;
·GTA-478具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量478.4022,分子式为C30H54O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量477的子离子:459、433、441和415;
·GTA-484具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量484.3764,分子式为C28H52O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量483的子离子:465、315、439 483、421和447;
·GTA-490具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量490.3658,分子式为C30H50O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量489的子离子:445、471、427和319;
·GTA-492具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量492.3815,分子式为C30H52O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量491的子离子:241、249、267、473和447;
·GTA-494具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量494.3971,分子式为C30H54O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量493的子离子:475、215和449;
·GTA-502具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量502.4022,分子式为C32H54O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量501的子离子:483、457、465和439;
·GTA-504具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量504.4195,分子式为C32H56O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量503的子离子:485、459、467和441;
·GTA-512具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量512.4077,分子式为C30H56O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量511的子离子:493、315和467;
·GTA-518具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量518.3974,分子式为C32H54O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量517的子离子:499、473、499、481和445;
·GTA-520具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量520.4128,分子式为C32H56O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量519的子离子:501、457、475、459、447和483;
·GTA-522具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量522.4284,分子式为C32H58O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量521的子离子:503、459、477、504、441和485;
·GTA-524具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量524.4441,分子式为C32H60O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量523的子离子:505、461、479、506、443和487;
·GTA-530具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量530.4335,分子式为C34H58O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量529的子离子:467、511和485;
·GTA-532具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量532.4492,分子式为C34H60O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量531的子离子:513、469、487和495;
·GTA-536具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量536.4077,分子式为C32H56O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量535的子离子:473;
·GTA-538具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量538.4233,分子式为C32H58O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量537的子离子:519、475、493、501和457;
·GTA-540具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量540.4389,分子式为C32H60O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量539的子离子:315、521、495和477;
·GTA-550具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量550.4597,分子式为C34H62O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量549的子离子:487、531、251、253、513、469和506;
·GTA-574具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量574.4597,分子式为C36H62O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量573的子离子:295、223、555和511;
·GTA-576具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量576.4754,分子式为C36H64O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量575的子离子:277、297、557、513和495;
·GTA-580具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量580.5067,分子式为C36H68O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量579的子离子:561、543、535、517和499;
·GTA-590具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量590.4546,分子式为C36H62O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量589的子离子:545;
·GTA-592具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量592.4703,分子式为C36H64O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量591的子离子:555和113;
·GTA-594具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量594.4859,分子式为C36H66O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量593的子离子:557371、315和277;以及
·GTA-596具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量596.5016,分子式为C36H68O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量595的子离子:279、315、297、577和559。
在一个具体的实施方式中,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物可为GTA-446,所述代谢物具有分子式C28H46O4,并且所述代谢物的结构为:
Figure BDA0002818047720000181
本文还提供了一种用于检测和治疗哺乳动物受试者中的胃道酸(GTA)不足的试剂盒,所述试剂盒包括:
·血液样本采集装置,用于从所述哺乳动物受试者采集血液样本,
·包装,以及将所述血液样本送到中央处理设备以测试所述血液样本中一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物水平的说明书,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物是28至36个碳的二羧酸脂肪酸,所述二羧酸脂肪酸包括单键或双键连接的两个14~18个碳长度的较短链的二聚脂肪酸结构;和
·从所述中央处理设备获得所述血液样本检测结果的说明,其中在包括测得低GTA水平的阳性检测结果的情形下,提供了增强GTA的抗炎益生元、益生菌或合成的GTA产品。
在试剂盒的某些实施方式中,所述增强GTA的抗炎益生元、益生菌或合成的GTA产品是包含微生物物种的至少一种活培养物或减毒培养物的组合物或增加消化道中所述微生物物种的生长和/或生存力的益生元组合物,所述微生物物种选自布劳特氏菌属、普拉梭菌、拟杆菌属、瘤胃菌科、毛螺菌科、粪球菌属、罗氏菌属、颤螺菌属、布氏瘤胃球菌、瘤胃球菌属、梭菌科、长链多尔氏菌、单形拟杆菌、多尔氏菌属、链球菌属、梭菌目、厌氧棒状菌属、小杆菌属、青春双岐杆菌、红蝽杆菌科、粪杆菌属、萨特氏菌属、卵形拟杆菌、副拟杆菌属、瘤胃球菌属、粪拟杆菌、两形真杆菌、考拉杆菌属和肠杆菌科的微生物,其中给药所述组合物给所述受试者提高了所述受试者中至少一种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的合成。
在其他实施方式中,如果确定所述受试者中一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的水平低于预定的对照水平、所述受试者的较早检测值或健康受试者的正常水平,则提供所述组合物。在一个具体的实施方式中,所述对照可为针对所述至少一种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的预定阈值。
在另一些其他实施方式中,所述组合物可包含在适合于给药到所述受试者的胃肠道的药学上可接受的载体中的布劳特氏菌属的微生物物种的活培养物或减毒培养物、普拉梭菌的活培养物或减毒培养物或其组合。
在试剂盒的其他实施方式中,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物可为以下的一种:GTA-446、GTA-448、GTA-450、GTA-452、GTA-464、GTA-466、GTA-468、GTA-474、GTA-476、GTA-478、GTA-484、GTA-490、GTA-492、GTA-494、GTA-502、GTA-504、GTA-512、GTA-518、GTA-520、GTA-522、GTA-524、GTA-530、GTA-532、GTA-536、GTA-538、GTA-540、GTA-550、GTA-574、GTA-576、GTA-580、GTA-590、GTA-592、GTA-594和GTA-596。
在非限制实施方式中,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物可具有1PPM道尔顿之内的质量精度的准确中性质量446.3396(GTA-446)、448.3553(GTA-448)、450.3709(GTA-450)、452.3866(GTA-452)、464.3522(GTA-464)、466.3661(GTA-466)、468.3814(GTA-468)、474.3736(GTA-474)、476.3866GTA-476、478.4022(GTA-478)、484.3764(GTA-484)、490.3658(GTA-490)、492.3815(GTA-492)、494.3971(GTA-494)、502.4022(GTA-502)、504.4195(GTA-504)、512.4077(GTA-512)、518.3974(GTA-518)、520.4128(GTA-520)、522.4284(GTA-522)、524.4441(GTA-524)、530.4335(GTA-530)、532.4492(GTA-532)、536.4077(GTA-536)、538.4233(GTA-538)、540.4389(GTA-540)、550.4597(GTA-550)、574.4597(GTA-574)、576.4754(GTA-576)、580.5067(GTA-580)、590.4546(GTA-590)、592.4703(GTA-592)、594.4859(GTA-594)或596.5016(GTA-596)。
在其他非限制实施方式中,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物可具有分子式C28H46O4(GTA-446)、C28H48O4(GTA-448)、C28H50O4(GTA-450)、C28H52O4(GTA-452)、464.3522(GTA-464)、466.3661(GTA-466)、C28H52O5(GTA-468)、C30H50O4(GTA-474)、C30H52O4GTA-476、C30H54O4(GTA-478)、C28H52O6(GTA-484)、C30H50O5(GTA-490)、C30H52O5(GTA-492)、C30H54O5(GTA-494)、C32H54O4(GTA-502)、C32H56O4(GTA-504)、C30H56O6(GTA-512)、C32H54O5(GTA-518)、C32H56O5(GTA-520)、C32H58O5(GTA-522)、C32H60O5GTA-524、C34H58O4(GTA-530)、C34H60O4(GTA-532)、C32H56O6(GTA-536)、C32H58O6(GTA-538)、C32H60O6(GTA-540)、C34H62O5(GTA-550)、C36H62O5(GTA-574)、C36H64O5(GTA-576)、C36H68O5(GTA-580)、C36H62O6(GTA-590)、C36H64O6(GTA-592)、C36H66O6(GTA-594)或C36H68O6(GTA-596)。
在其他非限制实施方式中,可使用碰撞诱导解离(CID)串联质谱法测量所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物。所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物可为选自以下列出的一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物:
·GTA-446,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量446.3396,分子式为C28H46O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量445的子离子:427、409、401和383;
·GTA-448,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量448.3553,分子式为C28H48O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量447的子离子:429、411、403和385;
·GTA-450,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量450.3709,分子式为C28H50O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量449的子离子:431、413、405和387;
·GTA-452,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量452.3866,分子式为C28H52O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量451的子离子:433、407和389;
·GTA-464具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量464.3522,分子式为C28H48O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量463的子离子:445、419、401和383;
·GTA-466具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量466.3661,分子式为C28H50O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量465的子离子:447、421和403;
·GTA-468具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量468.3814,分子式为C28H52O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量467的子离子:449、423和405;
·GTA-474具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量474.3736,分子式为C30H50O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量473的子离子:455、429和411;
·GTA-476具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量476.3866,分子式为C30H52O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量475的子离子:457、431、439和413;
·GTA-478具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量478.4022,分子式为C30H54O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量477的子离子:459、433、441和415;
·GTA-484具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量484.3764,分子式为C28H52O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量483的子离子:465、315、439 483、421和447;
·GTA-490具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量490.3658,分子式为C30H50O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量489的子离子:445、471、427和319;
·GTA-492具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量492.3815,分子式为C30H52O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量491的子离子:241、249、267、473和447;
·GTA-494具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量494.3971,分子式为C30H54O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量493的子离子:475、215和449;
·GTA-502具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量502.4022,分子式为C32H54O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量501的子离子:483、457、465和439;
·GTA-504具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量504.4195,分子式为C32H56O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量503的子离子:485、459、467和441;
·GTA-512具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量512.4077,分子式为C30H56O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量511的子离子:493、315和467;
·GTA-518具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量518.3974,分子式为C32H54O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量517的子离子:499、473、499、481和445;
·GTA-520具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量520.4128,分子式为C32H56O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量519的子离子:501、457、475、459、447和483;
·GTA-522具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量522.4284,分子式为C32H58O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量521的子离子:503、459、477、504、441和485;
·GTA-524具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量524.4441,分子式为C32H60O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量523的子离子:505、461、479、506、443和487;
·GTA-530具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量530.4335,分子式为C34H58O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量529的子离子:467、511和485;
·GTA-532具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量532.4492,分子式为C34H60O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量531的子离子:513、469、487和495;
·GTA-536具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量536.4077,分子式为C32H56O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量535的子离子:473;
·GTA-538具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量538.4233,分子式为C32H58O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量537的子离子:519、475、493、501和457;
·GTA-540具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量540.4389,分子式为C32H60O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量539的子离子:315、521、495和477;
·GTA-550具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量550.4597,分子式为C34H62O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量549的子离子:487、531、251、253、513、469和506;
·GTA-574具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量574.4597,分子式为C36H62O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量573的子离子:295、223、555和511;
·GTA-576具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量576.4754,分子式为C36H64O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量575的子离子:277、297、557、513和495;
·GTA-580具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量580.5067,分子式为C36H68O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量579的子离子:561、543、535、517和499;
·GTA-590具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量590.4546,分子式为C36H62O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量589的子离子:545;
·GTA-592具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量592.4703,分子式为C36H64O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量591的子离子:555和113;
·GTA-594具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量594.4859,分子式为C36H66O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量593的子离子:557371、315和277;以及
·GTA-596具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量596.5016,分子式为C36H68O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母[M-H]质量595的子离子:279、315、297、577和559。
在该试剂盒一个具体的实施方式中,所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物是GTA-446,所述代谢物具有分子式C28H46O4,并且所述代谢物的结构为:
Figure BDA0002818047720000261
根据上述方法和试剂盒的其他实施方式,所述胃道酸(GTA)不足可为胃肠道(GI)炎症状态的标志。
附图说明
通过以下参考附图的描述,本发明的这些和其他特征将变得更加明显,其中:
图1示出了本文提供的机制,由于微生物组组成的改变致使的GTA水平降低可导致炎症和癌症发展;
图2示出了本文所述的个性化GTA测试和治疗方法的示意图;以及
图3示出了操作分类单元(OTU)的图,其代表与低GTA水平或高GTA水平相关的特定属和种级微生物。
图4示出了说明人和动物(狗和猪)中的消化道微生物产生GTA 445.4/383.4(本文也称为GTA 446)的图。
图5示出了说明人和动物(狗和猪)中的消化道微生物产生GTA 447.4/385.4(本文也称为GTA 448)的图。
图6示出了说明人和动物(狗和猪)中的消化道微生物产生GTA 449.4/405.4(本文也称为GTA 450)的图。
图7示出了说明人和动物(狗和猪)中的消化道微生物产生GTA 463.4/419.4(本文也称为GTA 464)的图。
图8示出了说明人和动物(狗和猪)中的消化道微生物产生GTA 465.4/403.4(在本文中也称为GTA 466)的图。
图9示出了说明人和动物(狗和猪)中的消化道微生物产生GTA 467.4/423.4(本文也称为GTA 468)的图。
具体实施方式
本文显示胃酸(GTA)是由特定的消化道微生物产生的。微生物组随时间的变化可能因此导致产生GTA的能力受损。
如图1所示,GTA代谢物通过下调NFκB参与预防慢性炎症,如左图所示。在这种状态下,由于最佳的微生物组组成,体内充足的GTA水平可维持相对较低水平的NF-κB表达。当由于微生物组组成的变化,特定微生物种类的相对丰度的变化或多样性的变化而导致GTAs的水平不足时(右图),NFκB的表达将不再被抑制,从而导致多种促炎蛋白质被诱导。这会在胃肠道中产生氧化环境,从而导致细胞中的DNA突变,并最终增加患癌症的风险。因此,GTA缺乏症不是潜隐血或甲基化DNA之类的肿瘤标志物;而是疾病前的代谢不足,导致体内的癌变环境。
基于对消化道微生物在GTA产生中的作用的新理解,本文提供了一种方法,该方法通过使用益生元或益生菌方法增加特定菌株或给药纯合成的GTA来增加体内GTA水平。
使用所描述的方法来增加GTA水平也代表了一种减少胃肠道内炎症的新方法。
特别地,已经发现来自布劳特氏菌属、普拉梭菌、拟杆菌属、瘤胃菌科、毛螺菌科、粪球菌属、罗氏菌属、颤螺菌属、布氏瘤胃球菌、瘤胃球菌属、梭菌科、长链多尔氏菌、单形拟杆菌、多尔氏菌属、链球菌属、梭菌目、厌氧棒状菌属、小杆菌属、青春双岐杆菌、红蝽杆菌科、粪杆菌属、萨特氏菌属、卵形拟杆菌、副拟杆菌属、瘤胃球菌属、粪拟杆菌、两形真杆菌、考拉杆菌属和肠杆菌科的微生物对于消化道内GTA的生物合成很重要。因此,给药治疗有效量的包含至少一种这些微生物物种的至少一种活培养物或减毒培养物的组合物,或增加消化道中微生物物种的生长和/或生存力的益生元组合物,从而提供了一种增加个人的GTA合成方法。受试者可以是哺乳动物,特别是人类受试者。
在大多数实施方式中,GTA将是28~36个碳的二羧酸脂肪酸,其包括单键或双键连接的两个14~18个碳长度的短链二聚脂肪酸结构。例如,GTA二羧酸脂肪酸代谢物可以是GTA-446,其分子式为C28H46O4,其结构为:
Figure BDA0002818047720000281
这些GTA的其他实例包括GTA-448、GTA-450、GTA-452、GTA-464、GTA-466、GTA-468、GTA-474、GTA-476、GTA-478、GTA-484、GTA-490、GTA-492、GTA-494、GTA-502、GTA-504、GTA-512、GTA-518、GTA-520、GTA-522、GTA-524、GTA-530、GTA-532、GTA-536、GTA-538、GTA-540、GTA-550、GTA-574、GTA-576、GTA-580、GTA-590、GTA-592、GTA-594和GTA-596。
可以多种方式测量这些GTA的水平,包括质谱法。例如,可以基于对由碰撞诱导解离(CID)串联质谱法产生的一个或多个子离子片段的检测来识别或测量。下表列出了上面列出的每个GTA的片段。
尽管下文描述的完整的CID碎片图谱代表了这些目标分析物的独特指纹,但是人们会意识到,并非需要检测每个子碎片离子以实施所述方法。实际上,人们将会理解,可以选择任何数量或组合的子离子质量,以专门检测和测量样品中母体分析物的水平。人们将进一步理解,适当的子离子的选择取决于多个标准,例如信噪比、所选分析物的转变特异性、信号的可再现性、跨各种基质的干扰、母结构失去中性的复杂性和预期的特异性等等。在许多情况下,可以根据这些标准选择单个子片段离子,并将其用于量化相应的母体分析物。
GTA二羧基脂肪酸代谢物:
446.3396(GTA-446):
446.4
CE:-35V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
401 10.3333 100
445 8.1667 79.0323
427 4.5 43.5484
83 2.8333 27.4194
223 2.5 24.1935
222 2.1667 20.9677
205 1.8333 17.7419
383 1.8333 17.7419
59 1.6667 16.129
97 1 9.6774
81 0.6667 6.4516
109 0.6667 6.4516
203 0.6667 6.4516
221 0.6667 6.4516
409 0.6667 6.4516
123 0.5 4.8387
177 0.5 4.8387
233 0.5 4.8387
259 0.5 4.8387
428 0.5 4.8387
代谢物446.3396(GTA-446)的分子式为C28H46O4,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。然而,出于检测和测量的目的,这些片段的子集或甚至一个将更加实际。因此,在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,可能更优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量445的子离子:427、409、401和383。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量445/401或445/383可用于测量GTA-446的水平。
448.3553(GTA-448):
Figure BDA0002818047720000291
Figure BDA0002818047720000301
代谢物448.3553(GTA-448)的分子式为C28H48O4,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。然而,出于检测和测量的目的,这些片段的子集或甚至一个将更加实际。因此,在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,可能更优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量447的子离子:429、411、403和385。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量447/385可用于测量GTA-448的水平。
450.3709(GTA-450):
Figure BDA0002818047720000302
Figure BDA0002818047720000311
代谢物450.3709(GTA-450)的分子式为C28H50O4,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量449的子离子:431、413、405和387。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量449/405可用于测量GTA-450的水平。
452.3866(GTA-452):
452.4
CE:-35V
m/z(amu)
451(M-H+)
433
407
389
281
279
183
169
153
139
125
111
97
代谢物452.3866(GTA-452)的分子式为C28H52O4,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量451的子离子:433、407和389。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量451/407可用于测量GTA-452的水平。
464.3522(GTA-464):
Figure BDA0002818047720000312
Figure BDA0002818047720000321
代谢物464.3522(GTA-464)的分子式为C28H48O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量463的子离子:445、419、401和383。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量463/419可用于测量GTA-464的水平。
466.3661(GTA-466):
466.4
CE:-35V
m/z(amu)
465(M-H+)
447
433
421
405
403
349
297
279
241
223
185
代谢物466.3661(GTA-466)的分子式为C28H50O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量465的子离子:447、421和403。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量465/403可用于测量GTA-466的水平。
468.3814(GTA-468):
Figure BDA0002818047720000322
Figure BDA0002818047720000331
代谢物468.3814(GTA-468)的分子式为C28H52O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量467的子离子:449、423和405。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量467/423可用于测量GTA-468的水平。
474.3736(GTA-474):
Figure BDA0002818047720000332
Figure BDA0002818047720000341
代谢物474.3736(GTA-474)的分子式为C30H50O4,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量473的子离子:455、429和411。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量473/429可用于测量GTA-474的水平。
476.3866(GTA-476):
476.5
CE:-35V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
475 4.1818 100
457 2.9091 69.5652
431 1.5455 36.9565
413 0.8182 19.5652
279 0.4545 10.8696
439 0.3636 8.6957
458 0.3636 8.6957
458 0.3636 8.6957
476 0.2727 6.5217
57 0.1818 4.3478
59 0.1818 4.3478
83 0.1818 4.3478
97 0.1818 4.3478
111 0.1818 4.3478
123 0.1818 4.3478
235 0.1818 4.3478
251 0.1818 4.3478
414 0.1818 4.3478
432 0.1818 4.3478
71 0.0909 2.1739
代谢物476.3866(GTA-476)的分子式为C30H52O4,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量475的子离子:457、431、439和413。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量475/431可用于测量GTA-476的水平。
478.4022(GTA-478):
478.4
CE:-35V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
477 7.4286 100
459 5.2857 71.1538
433 2 26.9231
415 1.6429 22.1154
478 0.7857 10.5769
434 0.5 6.7308
460 0.5 6.7308
125 0.3571 4.8077
281 0.3571 4.8077
97 0.2857 3.8462
111 0.2857 3.8462
435 0.2857 3.8462
59 0.2143 2.8846
123 0.2143 2.8846
223 0.2143 2.8846
416 0.2143 2.8846
434 0.2143 2.8846
435 0.2143 2.8846
441 0.2143 2.8846
477 0.2143 2.8846
代谢物478.4022(GTA-478)的分子式为C30H54O4,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量477的子离子:459、433、441和415。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量477/433可用于测量GTA-478的水平。
484.3764(GTA-484):
Figure BDA0002818047720000351
Figure BDA0002818047720000361
代谢物484.3764(GTA-484)的分子式为C28H52O6,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量483的子离子:465、315、439、483、421和415。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量483/315可用于测量GTA-484的水平。
490.3658(GTA-490):
490.4
CE:-35V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
489 1.1739 100
319 0.413 35.1852
445 0.3696 31.4815
241 0.3478 29.6296
471 0.3478 29.6296
427 0.1957 16.6667
113 0.1739 14.8148
195 0.1739 14.8148
223 0.1739 14.8148
249 0.1739 14.8148
490 0.1739 14.8148
97 0.1522 12.963
267 0.1522 12.963
345 0.1304 11.1111
57 0.1087 9.2593
101 0.1087 9.2593
143 0.1087 9.2593
265 0.1087 9.2593
373 0.1087 9.2593
472 0.1087 9.2593
代谢物490.3658(GTA-490)的分子式为C30H50O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量489的子离子:445、471、427和319。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量489/445可用于测量GTA-490的水平。
492.3815(GTA-492):
492.4
CE:-40V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
241 4.3077 100
249 2.6923 62.5
267 2.4615 57.1429
97 1.8462 42.8571
473 1.3846 32.1429
223 1.1538 26.7857
195 1 23.2143
143 0.9231 21.4286
447 0.9231 21.4286
101 0.8462 19.6429
491 0.8462 19.6429
113 0.7692 17.8571
319 0.6923 16.0714
57 0.5385 12.5
59 0.4615 10.7143
213 0.4615 10.7143
167 0.3846 8.9286
171 0.3846 8.9286
179 0.3846 8.9286
193 0.3846 8.9286
代谢物492.3815(GTA-492)的分子式为C30H52O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量491的子离子:241、249、267、473和447。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量491/241可用于测量GTA-492的水平。
494.3971(GTA-494):
Figure BDA0002818047720000371
Figure BDA0002818047720000381
代谢物494.3971(GTA-494)的分子式为C30H54O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量493的子离子:475、215和449。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量493/449可用于测量GTA-494的水平。
502.4022(GTA-502):
Figure BDA0002818047720000382
Figure BDA0002818047720000391
代谢物502.4022(GTA-502)的分子式为C32H54O4,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量501的子离子:483、457、465和439。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量501/457可用于测量GTA-502的水平。
504.4195(GTA-504):
504.4
CE:-40V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
485 5.8947 100
503 4.0526 68.75
441 2.5789 43.75
459 1.2105 20.5357
486 0.6842 11.6071
97 0.4211 7.1429
111 0.3684 6.25
467 0.3158 5.3571
504 0.3158 5.3571
57 0.2632 4.4643
223 0.2632 4.4643
263 0.2632 4.4643
377 0.2632 4.4643
442 0.2632 4.4643
169 0.2105 3.5714
279 0.2105 3.5714
329 0.2105 3.5714
59 0.1579 2.6786
71 0.1579 2.6786
83 0.1579 2.6786
代谢物504.4195(GTA-504)的分子式为C32H56O4,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量503的子离子:485、459、467和441。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量503/459可用于测量GTA-504的水平。
512.4077(GTA-512):
Figure BDA0002818047720000392
Figure BDA0002818047720000401
代谢物512.4077(GTA-512)的分子式为C30H56O6,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量511的子离子:493、315和467。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量511/315可用于测量GTA-512的水平。
518.3974(GTA-518):
Figure BDA0002818047720000402
Figure BDA0002818047720000411
代谢物518.3974(GTA-518)的分子式为C32H54O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量517的子离子:499、473、499、481和445。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量517/473可用于测量GTA-518的水平。
520.4128(GTA-520):
520.4
CE:-42V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
501 2.2353 100
519 1.3824 61.8421
457 0.8235 36.8421
475 0.6176 27.6316
115 0.4118 18.4211
59 0.3529 15.7895
83 0.3529 15.7895
459 0.3529 15.7895
502 0.3529 15.7895
241 0.3235 14.4737
297 0.2647 11.8421
71 0.2353 10.5263
195 0.2353 10.5263
223 0.2353 10.5263
279 0.2353 10.5263
447 0.2353 10.5263
483 0.2353 10.5263
97 0.2059 9.2105
111 0.2059 9.2105
221 0.2059 9.2105
代谢物520.4128(GTA-520)的分子式为C32H56O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量519的子离子:501、457、475、459、447和483。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量519/475可用于测量GTA-520的水平。
522.4284(GTA-522):
522.4
CE:-40V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
521 1.375 100
503 1.2917 93.9394
459 0.375 27.2727
241 0.3333 24.2424
477 0.3333 24.2424
504 0.25 18.1818
111 0.2083 15.1515
115 0.2083 15.1515
171 0.2083 15.1515
267 0.2083 15.1515
297 0.2083 15.1515
441 0.2083 15.1515
223 0.1667 12.1212
269 0.1667 12.1212
271 0.1667 12.1212
279 0.1667 12.1212
485 0.1667 12.1212
522 0.1667 12.1212
57 0.125 9.0909
59 0.125 9.0909
代谢物522.4284(GTA-522)的分子式为C32H58O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量521离子:503、459、477、504、441和485。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量521/477可用于测量GTA-522的水平。
524.4441(GTA-524):
Figure BDA0002818047720000421
Figure BDA0002818047720000431
代谢物524.4441(GTA-524)的分子式为C32H60O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量523的子离子:505、461、479、506、443和487。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量523/461可用于测量GTA-524的水平。
530.4335(GTA-530):
Figure BDA0002818047720000432
Figure BDA0002818047720000441
代谢物530.4335(GTA-530)的分子式为C34H58O4,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量529离子:467、511和485。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量529/467可用于测量GTA-530的水平。
532.4492(GTA-532):
532.5
CE:-42V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
513 1.375 100
469 1.25 90.9091
531 0.9375 68.1818
195 0.25 18.1818
470 0.25 18.1818
470 0.25 18.1818
111 0.1875 13.6364
181 0.1875 13.6364
251 0.1875 13.6364
487 0.1875 13.6364
514 0.1875 13.6364
532 0.1875 13.6364
59 0.125 9.0909
71 0.125 9.0909
97 0.125 9.0909
113 0.125 9.0909
127 0.125 9.0909
495 0.125 9.0909
514 0.125 9.0909
532 0.125 9.0909
代谢物532.4492(GTA-532)的分子式为C34H60O4,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量531离子:513、469、487和495。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量531/469可用于测量GTA-532的水平。
536.4077(GTA-536):
MS/MS跃迁535/473
代谢物536.4077(GTA-536)的分子式为C32H56O6,可由上面所示的MS/MS跃迁表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选使用一个或多个观察到的子离子(标称质量):这些包括以下母体[M-H]质量535的子离子:473。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量535/573可用于测量GTA-590的水平。
538.4233(GTA-538):
538.4
CE:-40V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
537 1.6667 100
519 1 60
475 0.6667 40
493 0.4444 26.6667
59 0.3333 20
115 0.3333 20
333 0.3333 20
501 0.3333 20
520 0.3333 20
538 0.3333 20
101 0.2222 13.3333
315 0.2222 13.3333
457 0.2222 13.3333
538 0.2222 13.3333
538 0.2222 13.3333
71 0.1111 6.6667
143 0.1111 6.6667
171 0.1111 6.6667
179 0.1111 6.6667
221 0.1111 6.6667
代谢物538.4233(GTA-538)的分子式为C32H58O6,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量537的子离子:519、475、493、501和457。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量537/475可用于测量GTA-538的水平。
540.4389(GTA-540):
540.5
CE:-35V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
315 24.6 100
539 15.6 63.4146
223 2.4 9.7561
179 2.2 8.9431
521 1.8 7.3171
297 1.2 4.878
495 1.2 4.878
477 0.8 3.252
540 0.8 3.252
241 0.6 2.439
259 0.6 2.439
316 0.6 2.439
540 0.6 2.439
125 0.4 1.626
171 0.4 1.626
225 0.4 1.626
257 0.4 1.626
279 0.4 1.626
313 0.4 1.626
314 0.4 1.626
代谢物540.4389(GTA-540)的分子式为C32H60O6,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量539的子离子:315、521、495和477。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量539/315可用于测量GTA-540的水平。
550.4597(GTA-550):
Figure BDA0002818047720000461
Figure BDA0002818047720000471
代谢物550.4597(GTA-550)的分子式为C34H62O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量549的子离子:487、531、251、253、513、469和506。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量549/487可用于测量GTA-550的水平。
574.4597(GTA-574):
Figure BDA0002818047720000472
Figure BDA0002818047720000481
代谢物574.4597(GTA-574)的分子式为C36H62O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量573的子离子:295、223、555和511。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量573/223可用于测量GTA-574的水平。
576.4754(GTA-576):
576.5
CE:-42V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
575 2.9048 100
277 1.4286 49.1803
297 1.4286 49.1803
557 1.2381 42.623
513 0.9524 32.7869
279 0.8095 27.8689
171 0.7619 26.2295
183 0.5238 18.0328
295 0.5238 18.0328
125 0.4762 16.3934
403 0.4286 14.7541
111 0.381 13.1148
495 0.381 13.1148
251 0.3333 11.4754
293 0.3333 11.4754
97 0.2857 9.8361
113 0.2857 9.8361
205 0.2857 9.8361
223 0.2857 9.8361
296 0.2857 9.8361
代谢物576.4754(GTA-576)的分子式为C36H64O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量575的子离子:277、297、557、513和495。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量575/513可用于测量GTA-576的水平。
580.5067(GTA-580):
580.5
CE:-42V
m/z(amu)
579
561
543
535
517
499
421
407
389
375
299
297
281
281
279
263
253
185
171
代谢物580.5067(GTA-580)的分子式为C36H68O5,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量579的子离子:561、543、535、517和499。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量579/517可用于测量GTA-580的水平。
590.4546(GTA-590):
MS/MS跃迁589/545
代谢物590.4546(GTA-590)的分子式为C36H62O6,并且可以通过上面显示的MS/MS跃迁来表征。在N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,可优选使用一个或多个观察到的子离子(标称质量):这些包括以下母体[M-H]质量589的子离子:545。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量589/545可用于测量GTA-590的水平。
592.4703(GTA-592):
592.5
CE:-35V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
555
113 16.1667 100
85 3.3333 20.6186
103 2 12.3711
175 2 12.3711
117 1.6667 10.3093
59 1.3333 8.2474
75 1.3333 8.2474
95 1.3333 8.2474
99 1.3333 8.2474
115 1 6.1856
149 1 6.1856
87 0.8333 5.1546
129 0.8333 5.1546
591 0.8333 5.1546
157 0.6667 4.1237
415 0.6667 4.1237
73 0.5 3.0928
415 0.5 3.0928
71 0.3333 2.0619
89 0.3333 2.0619
代谢物592.4703(GTA-592)的分子式为C36H64O6,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量591的子离子:555和113。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量591/555可用于测量GTA-592的水平。
594.4859(GTA-594):
Figure BDA0002818047720000501
Figure BDA0002818047720000511
代谢物594.4859(GTA-594)的分子式为C36H66O6,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量593的子离子:557、371、315和277。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量593/557或593/371可用于测量GTA-594的水平。
596.5016(GTA-596):
596.5
CE:-50V
m/z(amu) 强度(计数) %强度
279 53.6 100
315 35.8 66.791
297 21.6 40.2985
313 9.6 17.9104
577 7.4 13.806
281 6.8 12.6866
595 6.2 11.5672
295 3.6 6.7164
171 3.4 6.3433
516 3.2 5.9701
559 2.6 4.8507
125 2.4 4.4776
141 2 3.7313
127 1.8 3.3582
155 1.6 2.9851
169 1.4 2.6119
185 1.4 2.6119
207 1.4 2.6119
280 1.2 2.2388
373 1.2 2.2388
代谢物596.5016(GTA-596)的分子式为C36H68O6,可由上表所示的完整CID MS/MS碎片图谱表征。在使用N2作为碰撞气体和在负电离下大气压化学电离(APCI)进行分析的某些实施方式中,优选利用上表中加粗的一种或多种子离子(标称质量)。这些包括以下母体[M-H]质量595的子离子:279、315、297、577和559。在某些优选实施方式中,标称母体/子质量595/559可用于测量GTA-596的水平。
根据本文所述的方法,可以将来自受试者的生物样品与从正常人群中采集的相同类型的样品进行比较,以鉴定所述GTA生物标志物水平的差异。可以使用各种分析平台进行提取和分析样品,包括但不限于傅立叶变换离子回旋共振质谱(FTMS)和液相色谱质谱(LC-MS)。
生物样品可以源自体内的任何地方,例如但不限于血液(血清/血浆)、粪便或任何实体组织的活检,包括肿瘤、邻近的正常、平滑肌和骨骼肌、脂肪组织、肝脏、皮肤、头发、大脑、肾脏、胰腺、肺、结肠、胃或其他部位别感兴趣的是血液或血清样品。尽管本文可以使用术语“血液”或“血清”,但是本领域技术人员将认识到,也可以使用血浆或全血或全血的一部分。
当从患者抽取血液样本时,可以采用几种方式来处理样本。处理的范围可以几乎没有处理(即冷冻全血),也可以复杂到与分离特定细胞类型一样的程度。最常见和常规的方法涉及从全血制备血清或血浆。还可以考虑所有血液样品处理方法,包括将血液样品点到固相支持物上,例如滤纸或其他固定材料。
在不希望受到限制的情况下,然后可以将上述处理过的血液或血浆样品进一步处理,以使其与用于检测和测量处理过的血液样品中所含代谢物的方法学分析技术兼容。处理的类型可以几乎没有处理到复杂的差异提取和化学衍生化。提取方法可包括在诸如甲醇、乙醇、酒精和水的混合物或有机溶剂(例如乙酸乙酯或己烷)的普通溶剂中超声处理、索氏萃取、微波辅助萃取(MAE)、超临界流体萃取(SFE)、加速溶剂萃取(ASE)、加压液体萃取(PLE)、加压热水萃取(PHWE)和/或表面活性剂辅助萃取(PHWE)。提取代谢物用于FTMS分析和流动注射LC-MS/MS分析的特别感兴趣的方法是进行液/液萃取,其中非极性代谢物溶解在有机溶剂中,而极性代谢物溶解在水性溶剂中。
可以使用包括本领域已知的那些在内的任何合适的方法来分析提取的样品。例如但不希望受到限制,基本上可以在任何质谱平台上分析生物样品的提取物,无论是通过直接注射还是在色谱分离之后。典型的质谱仪包括使样品中的分子电离的源和用于检测电离的分子或分子碎片的检测器。常见源的非限制性示例包括电子碰撞、电喷雾电离(ESI)、大气压化学电离(APCI)、大气压光电离(APPI)、基质辅助激光解吸电离(MALDI)、表面增强激光解吸电离(SELDI)及其衍变。常见的质量分离和检测系统可以包括四极杆、四极杆离子阱、线性离子阱、飞行时间(TOF)、磁性扇区、离子回旋加速器(FTMS)、轨道阱及其衍变和组合。与其他基于MS的平台相比,FTMS的优势在于其高分辨能力,可分离仅相差百分之几道尔顿的代谢物,而其中许多分离度较低的仪器都会遗漏。
术语“代谢物”是指特定的GTA小分子,在样品中测量其水平或强度,并且可用作诊断疾病状态的标记。这些小分子在本文中也可以称为“代谢物标志物”、“代谢物成分”、“生物标志物”或“生化标志物”。
通常通过质谱技术测量其精确质量而表征所述代谢物。精确质量也可以称为“准确的中性质量”或“中性质量”。在本文中以道尔顿(Daltons,Da)给出代谢物的精确质量,或者与其基本相等的质量。“与其基本相等”是指精确质量的+/-5ppm的差异将表示相同的代谢物。作为中性代谢物的质量给出精确质量。在样品分析过程中发生的代谢物的离子化过程中,将导致代谢物失去或获得一个或多个氢原子以及失去或获得电子。这将精确质量更改为“电离质量”,这与精确质量的区别在于电离过程中失去或获得的氢原子和电子的质量。除非另有说明,否则本文将引用准确的中性质量。
类似地,当通过其分子式描述代谢物时,将给出中性代谢物的分子式。自然地,电离代谢物的分子式与中性分子式的不同之处在于电离过程中失去或获得的氢原子数或由于添加了非氢加成离子。
在分析期间收集数据,并量化获得一种或多种代谢物的数据。通过测量样品中特定代谢物的水平或强度来获得“定量数据”。
将量化的数据与来自一个或多个参考样品的相应数据进行比较。“参考样品”是针对特定疾病状态的任何合适的参考样品。例如,但不希望以任何方式进行限制,参考样品可以是来自对照个体的样品,即未患有胃肠道炎症和/或具有患有或不患有胃肠道炎症家族史的癌症和/或癌症(在本文中也称为“‘正常’对应物”)的人;参考样品也可以是从临床诊断为胃肠道炎症和/或癌症的患者获得的样品。如本领域技术人员所理解的,可以使用一种以上参考样品与定量数据进行比较。例如但不希望受限,一个或多个参考样品可以是从对照个体获得的第一参考样品。在监测受试者的疾病状态变化的情况下,参考样品可以包括在治疗前或治疗期间在较早的时间段获得的样品,以比较作为治疗结果的疾病状态的变化。
“内部对照代谢物”是指患者体内天然存在的内源性代谢物。在疾病状态上未变化的任何合适的内源性代谢物都可以用作内部对照代谢物。
使用GTA代谢物标志物与内部对照代谢物的比率可以提供比代谢物标志物的绝对水平的测量更稳定和可再现的测量。由于内部对照代谢物自然存在于所有样品中,并且在疾病状态下似乎没有显著变化,因此样品间差异(由于处理、提取等原因)减小。
在某些实施方式中,可以使用质谱法以外的测定平台对根据本文所述方法的GTA代谢物标志物进行测量。根据要检测的分子,当前有多种类型的检测平台选项可供选择。这些方法包括但不限于比色化学测定法(UV或其他波长)、基于抗体的酶联免疫吸附测定法(ELISA)、干化学分析(dipstick chemical assay)、图像分析(如MRI、petscan、CT扫描)以及各种其他基于质谱的系统。
在非限制性实施方式中,可以使用常规三重四极杆质谱技术进行高通量筛选(HTS)分析。HTS分析通过将血清提取物直接注入三重质谱仪,然后通过单离子监测(SIM)分别分离每个母体分子,进行工作。随后,使用惰性气体(例如N2)(称为碰撞气体,统称为碰撞诱导解离或CID)使每个分子破碎。然后,通过称为多反应监测(MRM)的方法测量每个亲本GTA生物标志物的特定片段的强度并进行记录。此外,内标分子也被添加到每个样品中并且也经历破碎。如果方法和仪器正确运行,则每个样品中的内标片段应具有相同的强度。当收集所有生物标志物片段强度以及内标片段强度时,计算生物标志物与IS片段强度的比率,并且对数变换该比率。然后将每个受试者样本的值与先前确定的疾病阳性和对照分布进行比较,以确定该人对该疾病状态阳性或阴性的相对可能性。
在本发明的其他实施方式中,提供了一种用于受试者的测试试剂盒,以收集少量的血液样本,例如扎破指尖的干燥血斑或血清样品,其可以由中央处理设备进行分析以检测作为胃肠道炎症状态指标的GTA代谢物水平。然后,中央处理设备通过各种机制的一种将结果报告返给受试者,例如打印报告、基于云的电子记录或其他无线类型的通信。如果测试结果为阳性(低GTA水平),则受试者将有机会购买增强GTA的抗炎益生元、益生菌或合成的GTA产品。图2示出了这种个性化检测和治疗方法的示意图。
中央处理设施可以包括用于布置GTA代谢物测试测定的多个选项。这些可包括但不限于:1,开发与当前实验室仪器和三重四极杆质谱仪兼容的MS/MS方法,这些仪器已在世界各地的多个实验室中很容易找到;以及/或者2,建立了可以在一个位置运送和分析样品的检测设备,然后将结果发送回患者或患者的医生。
本文还描述了治疗组合物,其包含用于增加体内内源性GTA水平的人工、天然或合成的活性剂。
此类治疗组合物可包含有效提高体内GTA水平的益生菌、非致病性细菌种群。这些治疗组合物还可用于预防、控制和/或治疗与胃肠道(GI)炎症以及/或者GI相关的癌症有关的疾病、病症和病状,包括但不限于结肠直肠癌、胰腺癌和卵巢癌。
在一些实施方式中,治疗组合物包含益生元,例如碳水化合物,以及微生物种群。
在前述方法、试剂盒和组合物的实施方式中,益生菌、非致病性细菌种群可以包括选自布劳特氏菌属、普拉梭菌、拟杆菌属、瘤胃菌科、毛螺菌科、粪球菌属、罗氏菌属、颤螺菌属、布氏瘤胃球菌、瘤胃球菌属、梭菌科、长链多尔氏菌、单形拟杆菌、多尔氏菌属、链球菌属、梭菌目、厌氧棒状菌属、小杆菌属、青春双岐杆菌、红蝽杆菌科、粪杆菌属、萨特氏菌属、卵形拟杆菌、副拟杆菌属、瘤胃球菌属、粪拟杆菌、两形真杆菌、考拉杆菌属和肠杆菌科的一种或多种微生物。
在其他实施方式中,益生菌组合物包含药学上可接受的赋形剂或载体。在一些实施方式中,药学上可接受的赋形剂或载体可以适合于通过口服或直肠给药给哺乳动物受试者。
合适的赋形剂和载体的非限制性实例包括缓冲剂、防腐剂、稳定剂、粘合剂、压实剂、润滑剂、分散增强剂、崩解剂、矫味剂、甜味剂和着色剂。
合适的缓冲剂的非限制性实例包括柠檬酸钠、碳酸镁、碳酸氢镁、碳酸钙和碳酸氢钙。
合适的防腐剂的非限制性实例包括抗氧化剂,例如α生育酚和抗坏血酸酯,以及抗微生物剂,例如对羟基苯甲酸酯、氯丁醇和苯酚。
在益生菌制剂包含厌氧细菌菌株的情况下,可以选择药物制剂和赋形剂以防止细菌菌株暴露于氧气。
合适的粘合剂的非限制性实例包括淀粉、预胶化淀粉、明胶、聚乙烯吡咯烷酮、纤维素、甲基纤维素、羧甲基纤维素钠、乙基纤维素、聚丙烯酰胺、聚乙烯基氧代偶氮烷酮、聚乙烯醇、C12~C18脂肪酸醇、聚乙二醇、多元醇、糖类、低聚糖及其组合。
合适的润滑剂的非限制性实例包括硬脂酸镁、硬脂酸钙、硬脂酸锌、氢化植物油、思迪渃泰斯(sterotex)、聚氧乙烯单硬脂酸酯、滑石粉、聚乙二醇、苯甲酸钠、十二烷基硫酸钠、十二烷基硫酸镁和轻质矿物油。
合适的分散剂的非限制性实例包括淀粉、海藻酸、聚乙烯吡咯烷酮、瓜尔胶、高岭土、膨润土、纯木纤维素、淀粉羟乙酸钠、同态硅酸盐和作为高HLB乳化表面活性剂的微晶纤维素。
在一些实施方式中,组合物包含崩解剂。在其他实施方式中,崩解剂是非泡腾崩解剂。合适的非泡腾崩解剂的非限制性实例包括淀粉,例如玉米淀粉、马铃薯淀粉、其预胶化和改性淀粉、甜味剂,粘土、例如膨润土、微晶纤维素、海藻酸盐、淀粉羟乙酸钠,树胶,例如琼脂、瓜尔胶、刺槐豆胶、卡拉雅胶(gum karaya)、果胶和黄芪胶。在另一个实施方式中,崩解剂是泡腾崩解剂。合适的泡腾崩解剂的非限制性实例包括与柠檬酸结合的碳酸氢钠以及与酒石酸结合的碳酸氢钠。
调味剂可以选自合成调味油和调味芳香剂;天然油;植物、树叶、花朵和水果的提取物;及其组合。在一些实施方式中,调味剂选自肉桂油、冬青油;薄荷油;三叶草油;干草油;茴香油;桉树;香草;柑橘油,例如柠檬油、橙油、葡萄和葡萄柚油;和水果香精,包括苹果、桃子、梨、草莓、覆盆子、樱桃、李子、菠萝和杏子。
合适的甜味剂的非限制性实例包括葡萄糖(玉米糖浆)、右旋糖、转化糖、果糖及其混合物(当不用作载体时);糖精及其各种盐,例如钠盐;二肽甜味剂,例如阿斯巴甜;二氢查尔酮化合物,甘草甜素;甜叶菊(甜菊糖);蔗糖的氯代衍生物,例如三氯蔗糖;以及糖醇,例如山梨糖醇、甘露糖醇、糖基糖醇等。还可考虑氢化淀粉水解产物和合成甜味剂3,6-二氢-6-甲基-1,2,3-氧杂噻嗪-4-酮-2,2-二氧化物,特别是钾盐(乙酰磺胺钾)及其钠盐和钙盐。
合适的着色剂的非限制性实例包括食品、药物和化妆品颜色(FD&C),药物和化妆品颜色(D&C),以及外部药物和化妆品颜色(Ext。D&C)。
赋形剂或赋形剂组合在制剂中的重量分数通常为组合物总重量的约99%或更少,例如约95%或更少、约90%或更少、约85%或更少、约80%或更少、约75%或更少、约70%或更少、约65%或更少、约60%或更少、约55%或更少、50%或更少、约45%或更少、约40%或更少、约35%或更少、约30%或更少、约25%或更少、约20%或更少、约15%或更少、约10%或更少、约5%或更少、约2%或更少或约1%或更少。
本文公开的组合物可以配制成多种形式,并通过多种不同方式给药。所述组合物可以按需要以含有常规可接受的载体、佐剂和赋形剂的制剂口服或直肠给药。在示例性实施方式中,口服给药该组合物。
用于口服给药的固体剂型包括胶囊剂、片剂、囊片、丸剂、锭剂、糖锭、散剂和颗粒剂。胶囊通常包括含细菌组合物的核心材料以及包封该核心材料的壳壁。在一些实施方式中,芯材料包括固体、液体和乳液中的至少一种。在其他实施例中,壳壁材料包括软明胶、硬明胶和聚合物中的至少一种。合适的聚合物包括但不限于:纤维素聚合物,例如羟丙基纤维素、羟乙基纤维素、羟丙基甲基纤维素(HPMC)、甲基纤维素、乙基纤维素、乙酸纤维素、邻苯二甲酸乙酸纤维素、偏苯三酸乙酸纤维素、羟丙基甲基纤维素邻苯二甲酸酯、羟丙基甲基纤维素琥珀酸酯和羧甲基纤维素钠;丙烯酸聚合物和共聚物,例如由丙烯酸、甲基丙烯酸、丙烯酸甲酯、甲基丙烯酸铵、丙烯酸乙酯、甲基丙烯酸甲酯和/或甲基丙烯酸乙酯形成的那些(例如以商品名“Eudragit”出售的那些共聚物);乙烯基聚合物和共聚物,例如聚乙烯吡咯烷酮、聚乙酸乙烯酯、邻苯二甲酸聚乙酸乙烯酯、乙酸乙烯酯巴豆酸共聚物和乙烯-乙酸乙烯酯共聚物;和虫胶(纯虫胶)。在其他实施方式中,至少一种聚合物用作掩味剂。
片剂、丸剂等可以被压缩、多次压缩、多层和/或包衣。包衣可以是单层或多层。在一个实施方式中,包衣材料包含选自植物、真菌和微生物中至少一种的糖、多糖和糖蛋白中的至少一种。非限制性实例包括玉米淀粉、小麦淀粉、马铃薯淀粉、木薯淀粉、纤维素、半纤维素、右旋糖酐、麦芽糊精、环糊精、菊粉、果胶、甘露聚糖、阿拉伯胶、刺槐豆胶、豆科灌木胶、瓜尔胶、卡拉雅胶、达瓦树胶(gum ghatti)、黄芪胶、海藻胶(Funori)、角叉菜胶、琼脂、海藻酸盐、壳聚糖或结冷胶。在一些实施方式中,包衣材料包含蛋白质。在另一个实施方式中,包衣材料包括脂肪和油中的至少一种。在其他实施方式中,高温熔融脂肪和油中的至少一种。在另一个实施方式中,脂肪和油中的至少一种被氢化或部分氢化。在一个实施方式中,脂肪和油中的至少一种衍生自植物。在其他实施方式中,脂肪和油中的至少一种包括甘油酯、游离脂肪酸和脂肪酸酯中的至少一种。在一些实施方式中,包衣材料包括至少一种食用蜡。可食用蜡可以源自动物、昆虫或植物。非限制性实例包括蜂蜡、羊毛脂、杨梅蜡、巴西棕榈蜡和米糠蜡。片剂和丸剂还可以用肠溶衣制备。
或者,可以将体现本文公开的细菌组合物的粉末或颗粒掺入食品中。在一些实施方式中,食品是用于口服给药的饮料。合适饮料的非限制性实例包括果汁、果汁饮料、人工调味饮料、人工甜味饮料、碳酸饮料、运动饮料、液体乳制品、奶昔、酒精饮料、咖啡因饮料、婴儿配方奶粉等等。其他适合口服给药方法包括水性和非水性溶液、乳液、悬浮液和/或由非泡腾颗粒重构的溶液和/或悬浮液,其包含至少一种合适的溶剂、防腐剂、乳化剂、助悬剂、稀释剂、甜味剂、着色剂和调味剂。
在一些实施方式中,食品可以是固体食品。固体食品的合适实例包括但不限于食物棒、点心棒、饼干、布朗尼蛋糕、松饼、梳打饼、冰淇淋棒、冷冻酸奶棒等。
在其他实施方式中,将本文公开的组合物掺入治疗性食物中。在一些实施方式中,治疗性食品是即食食品,其任选地包含一些或全部必需的大量营养素和微量营养素。在另一实施方式中,将本文公开的组合物掺入补充食品中,所述补充食品被设计成可与现有膳食混合。在一个实施方式中,补充食品包含一些或全部必需的大量营养素和微量营养素。在另一实施方式中,将本文公开的细菌组合物与现有食品混合或添加到现有食品中以强化食品的蛋白质营养。实例包括主食(谷物、盐、糖、食用油、人造黄油),饮料(咖啡、茶、苏打水、啤酒、白酒、运动饮料)、小吃、糖果和其他食品。
具有或不具有一种或多种益生元的微生物组合物通常被配制用于口服或胃内给药,通常向哺乳动物受试者给药。在特定实施方式中,将组合物配制成用于口服给药的固体、半固体、凝胶或液体形式,例如丸剂、片剂、胶囊或锭剂形式。在一些实施方式中,尽管孢子通常对胃和小肠有抵抗力,但是这些制剂包含肠溶衣或由肠溶衣包被以保护细菌通过胃和小肠。在其他实施方式中,可以将具有或不具有一种或多种益生元的微生物组合物与萌发剂一起配制以增强植入或功效。在其他实施方式中,细菌组合物可以与益生元物质共同配制或共同给药,以增强植入或功效。在一些实施方式中,细菌组合物可以与益生元物质共同配制或共同给药,以增强植入或功效。
参考以下实施例进一步定义本发明,这些实施例不应解释为限制性的。
实施例
1.鉴定与GTA水平相关的消化道微生物
方法:使用Illumina Miseq仪器,对从405个人类结肠粘膜和粪便样品中提取的总DNA进行了微生物16S rRNA基因的微生物V4可变区的高通量扩增子测序。每个样品的数据被抽样(rarefied)为8700个总序列。通过占总数的百分比来过滤操作分类单元(OTU),并选择前90%与血清GTA水平进行比较。通过流动注射串联质谱法测定同一受试者的35种GTA的血清水平。然后将GTA水平与OUT水平的序列数据进行比对,然后基于GTA级别进行五分位数分析,以识别出最高和最低GTA五分位数间的统计上显著不同的OTU。
结果:在多个GTA中最低和最高血清GTA五分位数间的OTU的比较显示,代表特定微生物的几种OTU的相对丰度有显著差异(p<E-4),特别是由来自布劳特氏菌属和普拉梭菌的产生短链脂肪酸的细菌(表1至34)。对这些微生物的初步文献调查揭示了它们在结肠癌、脂肪酸代谢和炎症中的作用。此外,我们观察到68%的最低GTA五分位数包括溃疡性结肠炎、克罗恩病和癌症,只有25%的健康对照或有非GI相关疾病。GTA最高的五分之一人群主要包括健康个体或有非GI相关疾病的个体,只有2%的个体患有克罗恩病和癌症,而没有溃疡性结肠炎。这些结果表明,GTA和特定微生物均与GI相关的炎症和癌症有关。据我们所知,这是在这些过程中将GTA代谢物与布劳特氏菌属和普拉梭菌相联系的第一份报告。
在所有可操作的分类单位(OTU;基于RNA序列相似性的生物群)中,与GTA产生最经常相关的消化道微生物(p<E-4)(在所有34种GTA中,如表1至表34所示)属于布劳特氏菌属(24%)、普拉梭菌(19%)、拟杆菌属(12%)、瘤胃菌科(7%)、毛螺菌科(7%)。其余的OTU类别及其百分比频率如图3所示。
表1:具有高和低GTA-446水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000611
表2:具有高和低GTA-448水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000621
表3:具有高和低GTA-450水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000622
表4:具有高和低GTA-452水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000623
表5:具有高和低GTA-464水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000631
表6:具有高和低GTA-466水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000632
表7:具有高和低GTA-468水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000641
表8:具有高和低GTA-474水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000642
表9:具有高和低GTA-476水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000651
表10:具有高和低GTA-478水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000652
表11:具有高和低GTA-484水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000653
表12:具有高和低GTA-490水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000661
表13:具有高和低GTA-492水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000662
表14:具有高和低GTA-494水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000671
表15:具有高和低GTA-502水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000672
表16:具有高和低GTA-504水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000673
表17:具有高和低GTA-512水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000681
表18:具有高和低GTA-518水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000682
表19:具有高和低GTA-520水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000683
表20:具有高和低GTA-522水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000684
表21:具有高和低GTA-524水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000691
表22:具有高和低GTA-530水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000692
表23:具有高和低GTA-532水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000693
表24:具有高和低GTA-536水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000694
表25:具有高和低GTA-538水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000695
表26:具有高和低GTA-540水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000701
表27:具有高和低GTA-550水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000702
表28:具有高和低GTA-574水平的消化道微生物:
表29:具有高和低GTA-576水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000703
表30:具有高和低GTA-580水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000704
表31:具有高和低GTA-590水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000711
表32:具有高和低GTA-592水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000712
表33:具有高和低GTA-594水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000713
表34:具有高和低GTA-496水平的消化道微生物:
Figure BDA0002818047720000721
2.测量消化道微生物样品中的GTA水平
将三个人、一只狗和一只猪粪便样品在有氧和无氧条件下的脑心浸液(BHI)培养基中培养24、48、72和96小时。通过机械裂解和在有机溶剂中超声处理来提取细胞团,然后通过串联质谱分析溶剂以测定GTA含量。
在高于背景水平的大多数样品中检测到选定的GTA。例如,与人血清样品相比,检测到的GTA-445.4/383.4和GTA 447.4/385.4处于相对较低的水平,但仍高于本底水平。检出的GTA 449.4/405.4、463.4/419.4、465.4/403.4均远高于本底水平,接近人类血清样品的50%,尤其是在所有分析条件下的72小时内。这些结果如图4~9所示。
该结果提供了第一个证据,表明GTA似乎是消化道微生物的产物。因此,本发明提供了通过提供包含产生GTA的微生物的组合的益生菌,微生物源在受试者中产生GTA或增加GTA水平的用途。这可以包括使用工业发酵系统商业生产GTA,分离、选择和/或富集参与GTA生产的微生物菌株的方法。
通过示例的方式描述了一个或多个当前优选的实施方式。对于本领域技术人员将显而易见的是,在不脱离权利要求书所限定的本发明的范围的情况下,可以进行多种变化和修改。
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以上列出的出版物各自通过引用整体并入本文。

Claims (27)

1.一种增加哺乳动物受试者胃道酸(GTA)产生的方法,包括给药治疗有效量的包含具有微生物物种的至少一种活培养物或减毒培养物的组合物或增加消化道中所述微生物物种的生长和/或生存力的益生元组合物,所述微生物物种选自布劳特氏菌属、普拉梭菌、拟杆菌属、瘤胃菌科、毛螺菌科、粪球菌属、罗氏菌属、颤螺菌属、布氏瘤胃球菌、瘤胃球菌属、梭菌科、长链多尔氏菌、单形拟杆菌、多尔氏菌属、链球菌属、梭菌目、厌氧棒状菌属、小杆菌属、青春双岐杆菌、红蝽杆菌科、粪杆菌属、萨特氏菌属、卵形拟杆菌、副拟杆菌属、瘤胃球菌属、粪拟杆菌、两形真杆菌、考拉杆菌属和肠杆菌科,其中所述组合物增加了所述受试者中至少一种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的合成。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述方法还包括以下步骤:测量受试者中一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的循环水平,并且如果所述受试者中的所述一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的水平低于预定的对照水平、低于针对所述受试者的较早检测值或低于针对健康受试者的正常水平,则给药所述组合物。
3.根据权利要求2所述的方法,其中所述对照包括针对所述至少一种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的预定阈值。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述组合物包含在适合于给药至所述受试者的胃肠道的药学上可接受的载体中的布劳特氏菌属的微生物物种的活培养物或减毒的培养物、普拉梭菌的活培养物或减毒的培养物、或其组合。
5.根据权利要求1所述的方法,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物是28~36个碳的二羧酸脂肪酸,所述二羧酸脂肪酸包括单键或双键连接的两个14~18个碳长度的较短链的二聚脂肪酸结构。
6.根据权利要求1所述的方法,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物选自:GTA-446、GTA-448、GTA-450、GTA-452、GTA-464、GTA-466、GTA-468、GTA-474、GTA-476、GTA-478、GTA-484、GTA-490、GTA-492、GTA-494、GTA-502、GTA-504、GTA-512、GTA-518、GTA-520、GTA-522、GTA-524、GTA-530、GTA-532、GTA-536、GTA-538、GTA-540、GTA-550、GTA-574、GTA-576、GTA-580、GTA-590、GTA-592、GTA-594和GTA-596。
7.根据权利要求1所述的方法,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量:446.3396(GTA-446)、448.3553(GTA-448)、450.3709(GTA-450)、452.3866(GTA-452)、464.3522(GTA-464)、466.3661(GTA-466)、468.3814(GTA-468)、474.3736(GTA-474)、476.3866GTA-476、478.4022(GTA-478)、484.3764(GTA-484)、490.3658(GTA-490)、492.3815(GTA-492)、494.3971(GTA-494)、502.4022(GTA-502)、504.4195(GTA-504)、512.4077(GTA-512)、518.3974(GTA-518)、520.4128(GTA-520)、522.4284(GTA-522)、524.4441(GTA-524)、530.4335(GTA-530)、532.4492(GTA-532)、536.4077(GTA-536)、538.4233(GTA-538)、540.4389(GTA-540)、550.4597(GTA-550)、574.4597(GTA-574)、576.4754(GTA-576)、580.5067(GTA-580)、590.4546(GTA-590)、592.4703(GTA-592)、594.4859(GTA-594)或596.5016(GTA-596)。
8.根据权利要求1所述的方法,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物具有分子式:C28H46O4(GTA-446)、C28H48O4(GTA-448)、C28H50O4(GTA-450)、C28H52O4(GTA-452)、464.3522(GTA-464)、466.3661(GTA-466)、C28H52O5(GTA-468)、C30H50O4(GTA-474)、C30H52O4GTA-476、C30H54O4(GTA-478)、C28H52O6(GTA-484)、C30H50O5(GTA-490)、C30H52O5(GTA-492)、C30H54O5(GTA-494)、C32H54O4(GTA-502)、C32H56O4(GTA-504)、C30H56O6(GTA-512)、C32H54O5(GTA-518)、C32H56O5(GTA-520)、C32H58O5(GTA-522)、C32H60O5GTA-524、C34H58O4(GTA-530)、C34H60O4(GTA-532)、C32H56O6(GTA-536)、C32H58O6(GTA-538)、C32H60O6(GTA-540)、C34H62O5(GTA-550)、C36H62O5(GTA-574)、C36H64O5(GTA-576)、C36H68O5(GTA-580)、C36H62O6(GTA-590)、C36H64O6(GTA-592)、C36H66O6(GTA-594)或C36H68O6(GTA-596)。
9.根据权利要求2所述的方法,其中使用碰撞诱导解离(CID)串联质谱法测量所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物,并且所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物选自以下列出的一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物:
GTA-446,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量446.3396,分子式为C28H46O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量445的子离子:427、409、401和383;
GTA-448,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量448.3553,分子式为C28H48O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量447的子离子:429、411、403和385;
GTA-450,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量450.3709,分子式为C28H50O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量449的子离子:431、413、405和387;
GTA-452,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量452.3866,分子式为C28H52O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量451的子离子:433、407和389;
GTA-464具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量464.3522,分子式为C28H48O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量463的子离子:445、419、401和383;
GTA-466具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量466.3661,分子式为C28H50O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量465的子离子:447、421和403;
GTA-468具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量468.3814,分子式为C28H52O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量467的子离子:449、423和405;
GTA-474具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量474.3736,分子式为C30H50O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量473的子离子:455、429和411;
GTA-476具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量476.3866,分子式为C30H52O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量475的子离子:457、431、439和413;
GTA-478具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量478.4022,分子式为C30H54O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量477的子离子:459、433、441和415;
GTA-484具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量484.3764,分子式为C28H52O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量483的子离子:465、315、439483、421和447;
GTA-490具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量490.3658,分子式为C30H50O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量489的子离子:445、471、427和319;
GTA-492具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量492.3815,分子式为C30H52O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量491的子离子:241、249、267、473和447;
GTA-494具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量494.3971,分子式为C30H54O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量493的子离子:475、215和449;
GTA-502具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量502.4022,分子式为C32H54O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量501的子离子:483、457、465和439;
GTA-504具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量504.4195,分子式为C32H56O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量503的子离子:485、459、467和441;
GTA-512具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量512.4077,分子式为C30H56O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量511的子离子:493、315和467;
GTA-518具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量518.3974,分子式为C32H54O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量517的子离子:499、473、499、481和445;
GTA-520具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量520.4128,分子式为C32H56O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量519的子离子:501、457、475、459、447和483;
GTA-522具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量522.4284,分子式为C32H58O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量521的子离子:503、459、477、504、441和485;
GTA-524具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量524.4441,分子式为C32H60O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量523的子离子:505、461、479、506、443和487;
GTA-530具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量530.4335,分子式为C34H58O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量529的子离子:467、511和485;
GTA-532具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量532.4492,分子式为C34H60O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量531的子离子:513、469、487和495;
GTA-536具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量536.4077,分子式为C32H56O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量535的子离子:473;
GTA-538具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量538.4233,分子式为C32H58O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量537的子离子:519、475、493、501和457;
GTA-540具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量540.4389,分子式为C32H60O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量539的子离子:315、521、495和477;
GTA-550具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量550.4597,分子式为C34H62O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量549的子离子:487、531、251、253、513、469和506;
GTA-574具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量574.4597,分子式为C36H62O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量573的子离子:295、223、555和511;
GTA-576具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量576.4754,分子式为C36H64O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量575的子离子:277、297、557、513和495;
GTA-580具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量580.5067,分子式为C36H68O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量579的子离子:561、543、535、517和499;
GTA-590具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量590.4546,分子式为C36H62O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量589的子离子:545;
GTA-592具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量592.4703,分子式为C36H64O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量591的子离子:555和113;
GTA-594具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量594.4859,分子式为C36H66O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量593的子离子:557371、315和277;以及
GTA-596具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量596.5016,分子式为C36H68O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量595的子离子:279、315、297、577和559。
10.根据权利要求1所述的方法,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物是GTA-446,具有分子式C28H46O4,并且具有结构:
Figure FDA0002818047710000071
11.一种通过测量一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的循环水平来确定体内胃肠道炎症状态的方法,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物是28~36个碳的二羧酸脂肪酸,所述二羧酸脂肪酸包括单键或双键连接的两个14~18个碳长度的较短链的二聚脂肪酸结构;
其中如果所述受试者中一种或多种所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物的水平低于预定对照水平、低于针对所述受试者的较早检测值或低于针对健康受试者的正常水平,则评估所述受试者为患有胃肠道炎症或具有胃肠道炎症的风险。
12.根据权利要求11所述的方法,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物选自:GTA-446、GTA-448、GTA-450、GTA-452、GTA-464、GTA-466、GTA-468、GTA-474、GTA-476、GTA-478、GTA-484、GTA-490、GTA-492、GTA-494、GTA-502、GTA-504、GTA-512、GTA-518、GTA-520、GTA-522、GTA-524、GTA-530、GTA-532、GTA-536、GTA-538、GTA-540、GTA-550、GTA-574、GTA-576、GTA-580、GTA-590、GTA-592、GTA-594和GTA-596。
13.根据权利要求12所述的方法,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物具有如下1PPM道尔顿之内质量精度的准确的中性质量:446.3396(GTA-446)、448.3553(GTA-448)、450.3709(GTA-450)、452.3866(GTA-452)、464.3522(GTA-464)、466.3661(GTA-466)、468.3814(GTA-468)、474.3736(GTA-474)、476.3866GTA-476、478.4022(GTA-478)、484.3764(GTA-484)、490.3658(GTA-490)、492.3815(GTA-492)、494.3971(GTA-494)、502.4022(GTA-502)、504.4195(GTA-504)、512.4077(GTA-512)、518.3974(GTA-518)、520.4128(GTA-520)、522.4284(GTA-522)、524.4441(GTA-524)、530.4335(GTA-530)、532.4492(GTA-532)、536.4077(GTA-536)、538.4233(GTA-538)、540.4389(GTA-540)、550.4597(GTA-550)、574.4597(GTA-574)、576.4754(GTA-576)、580.5067(GTA-580)、590.4546(GTA-590)、592.4703(GTA-592)、594.4859(GTA-594)或596.5016(GTA-596)。
14.根据权利要求12所述的方法,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物具有分子式C28H46O4(GTA-446)、C28H48O4(GTA-448)、C28H50O4(GTA-450)、C28H52O4(GTA-452)、464.3522(GTA-464)、466.3661(GTA-466)、C28H52O5(GTA-468)、C30H50O4(GTA-474)、C30H52O4 GTA-476、C30H54O4(GTA-478)、C28H52O6(GTA-484)、C30H50O5(GTA-490)、C30H52O5(GTA-492)、C30H54O5(GTA-494)、C32H54O4(GTA-502)、C32H56O4(GTA-504)、C30H56O6(GTA-512)、C32H54O5(GTA-518)、C32H56O5(GTA-520)、C32H58O5(GTA-522)、C32H60O5 GTA-524、C34H58O4(GTA-530)、C34H60O4(GTA-532)、C32H56O6(GTA-536)、C32H58O6(GTA-538)、C32H60O6(GTA-540)、C34H62O5(GTA-550)、C36H62O5(GTA-574)、C36H64O5(GTA-576)、C36H68O5(GTA-580)、C36H62O6(GTA-590)、C36H64O6(GTA-592)、C36H66O6(GTA-594)或C36H68O6(GTA-596)。
15.根据权利要求11所述的方法,其中使用碰撞诱导解离(CID)串联质谱法测量所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物,并且所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物选自以下列出的一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物:
GTA-446,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量446.3396,分子式为C28H46O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量445的子离子:427、409、401和383;
GTA-448,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量448.3553,分子式为C28H48O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量447的子离子:429、411、403和385;
GTA-450,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量450.3709,分子式为C28H50O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量449的子离子:431、413、405和387;
GTA-452,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量452.3866,分子式为C28H52O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量451的子离子:433、407和389;
GTA-464具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量464.3522,分子式为C28H48O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量463的子离子:445、419、401和383;
GTA-466具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量466.3661,分子式为C28H50O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量465的子离子:447、421和403;
GTA-468具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量468.3814,分子式为C28H52O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量467的子离子:449、423和405;
GTA-474具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量474.3736,分子式为C30H50O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量473的子离子:455、429和411;
GTA-476具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量476.3866,分子式为C30H52O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量475的子离子:457、431、439和413;
GTA-478具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量478.4022,分子式为C30H54O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量477的子离子:459、433、441和415;
GTA-484具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量484.3764,分子式为C28H52O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量483的子离子:465、315、439483、421和447;
GTA-490具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量490.3658,分子式为C30H50O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量489的子离子:445、471、427和319;
GTA-492具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量492.3815,分子式为C30H52O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量491的子离子:241、249、267、473和447;
GTA-494具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量494.3971,分子式为C30H54O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量493的子离子:475、215和449;
GTA-502具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量502.4022,分子式为C32H54O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量501的子离子:483、457、465和439;
GTA-504具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量504.4195,分子式为C32H56O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量503的子离子:485、459、467和441;
GTA-512具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量512.4077,分子式为C30H56O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量511的子离子:493、315和467;
GTA-518具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量518.3974,分子式为C32H54O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量517的子离子:499、473、499、481和445;
GTA-520具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量520.4128,分子式为C32H56O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量519的子离子:501、457、475、459、447和483;
GTA-522具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量522.4284,分子式为C32H58O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量521的子离子:503、459、477、504、441和485;
GTA-524具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量524.4441,分子式为C32H60O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量523的子离子:505、461、479、506、443和487;
GTA-530具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量530.4335,分子式为C34H58O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量529的子离子:467、511和485;
GTA-532具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量532.4492,分子式为C34H60O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量531的子离子:513、469、487和495;
GTA-536具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量536.4077,分子式为C32H56O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量535的子离子:473;
GTA-538具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量538.4233,分子式为C32H58O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量537的子离子:519、475、493、501和457;
GTA-540具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量540.4389,分子式为C32H60O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量539的子离子:315、521、495和477;
GTA-550具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量550.4597,分子式为C34H62O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量549的子离子:487、531、251、253、513、469和506;
GTA-574具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量574.4597,分子式为C36H62O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量573的子离子:295、223、555和511;
GTA-576具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量576.4754,分子式为C36H64O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量575的子离子:277、297、557、513和495;
GTA-580具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量580.5067,分子式为C36H68O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量579的子离子:561、543、535、517和499;
GTA-590具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量590.4546,分子式为C36H62O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量589的子离子:545;
GTA-592具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量592.4703,分子式为C36H64O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量591的子离子:555和113;
GTA-594具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量594.4859,分子式为C36H66O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量593的子离子:557371、315和277;以及
GTA-596具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量596.5016,分子式为C36H68O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量595的子离子:279、315、297、577和559。
16.根据权利要求11所述的方法,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物是GTA-446,具有分子式C28H46O4,并且结构为:
Figure FDA0002818047710000141
17.一种用于检测和治疗哺乳动物受试者中的胃道酸(GTA)不足的试剂盒,所述试剂盒包括:
血液样本采集装置,用于从所述哺乳动物受试者采集血液样本,
包装,以及将所述血液样本送到中央处理设备以测试所述血液样本中一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物水平的说明书,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物是28~36个碳的二羧酸脂肪酸,所述二羧酸脂肪酸包括单键或双键连接的两个14~18个碳长度的较短链的二聚脂肪酸结构;和
从所述中央处理设备获得所述血液样本检测结果的说明,其中在包括测得的低GTA水平的阳性检测结果的情形下,提供增强GTA的抗炎益生元、益生菌或合成的GTA产品。
18.根据权利要求17所述的试剂盒,其中所述增强GTA的抗炎益生元、益生菌或合成的GTA产品是包含具有微生物物种的至少一种活培养物或减毒培养物的组合物或增加消化道中所述微生物物种的生长和/或生存力的益生元组合物,所述微生物物种选自布劳特氏菌属、普拉梭菌、拟杆菌属、瘤胃菌科、毛螺菌科、粪球菌属、罗氏菌属、颤螺菌属、布氏瘤胃球菌、瘤胃球菌属、梭菌科、长链多尔氏菌、单形拟杆菌、多尔氏菌属、链球菌属、梭菌目、厌氧棒状菌属、小杆菌属、青春双岐杆菌、红蝽杆菌科、粪杆菌属、萨特氏菌属、卵形拟杆菌、副拟杆菌属、瘤胃球菌属、粪拟杆菌、两形真杆菌、考拉杆菌属和肠杆菌科的微生物,其中所述组合物增加了所述受试者中至少一种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的合成。
19.根据权利要求17所述的试剂盒,其中如果所述受试者中一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的水平低于预定的对照水平、低于针对所述受试者的较早检测值或低于针对健康受试者的正常水平,则提供所述组合物。
20.根据权利要求19所述的试剂盒,其中所述对照包括针对所述至少一种GTA二羧酸脂肪酸代谢物的预定阈值。
21.根据权利要求17所述的试剂盒,其中所述组合物包含在适合于给药至所述受试者的胃肠道的药学上可接受的载体中的布劳特氏菌属的微生物物种的活培养物或减毒的培养物、普拉梭菌的活培养物或减毒的培养物、或其组合。
22.根据权利要求17所述的试剂盒,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物选自:GTA-446、GTA-448、GTA-450、GTA-452、GTA-464、GTA-466、GTA-468、GTA-474、GTA-476、GTA-478、GTA-484、GTA-490、GTA-492、GTA-494、GTA-502、GTA-504、GTA-512、GTA-518、GTA-520、GTA-522、GTA-524、GTA-530、GTA-532、GTA-536、GTA-538、GTA-540、GTA-550、GTA-574、GTA-576、GTA-580、GTA-590、GTA-592、GTA-594和GTA-596。
23.根据权利要求22所述的试剂盒,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量446.3396(GTA-446)、448.3553(GTA-448)、450.3709(GTA-450)、452.3866(GTA-452)、464.3522(GTA-464)、466.3661(GTA-466)、468.3814(GTA-468)、474.3736(GTA-474)、476.3866GTA-476、478.4022(GTA-478)、484.3764(GTA-484)、490.3658(GTA-490)、492.3815(GTA-492)、494.3971(GTA-494)、502.4022(GTA-502)、504.4195(GTA-504)、512.4077(GTA-512)、518.3974(GTA-518)、520.4128(GTA-520)、522.4284(GTA-522)、524.4441(GTA-524)、530.4335(GTA-530)、532.4492(GTA-532)、536.4077(GTA-536)、538.4233(GTA-538)、540.4389(GTA-540)、550.4597(GTA-550)、574.4597(GTA-574)、576.4754(GTA-576)、580.5067(GTA-580)、590.4546(GTA-590)、592.4703(GTA-592)、594.4859(GTA-594)或596.5016(GTA-596)。
24.根据权利要求22所述的试剂盒,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物具有分子式C28H46O4(GTA-446)、C28H48O4(GTA-448)、C28H50O4(GTA-450)、C28H52O4(GTA-452)、464.3522(GTA-464)、466.3661(GTA-466)、C28H52O5(GTA-468)、C30H50O4(GTA-474)、C30H52O4GTA-476、C30H54O4(GTA-478)、C28H52O6(GTA-484)、C30H50O5(GTA-490)、C30H52O5(GTA-492)、C30H54O5(GTA-494)、C32H54O4(GTA-502)、C32H56O4(GTA-504)、C30H56O6(GTA-512)、C32H54O5(GTA-518)、C32H56O5(GTA-520)、C32H58O5(GTA-522)、C32H60O5 GTA-524、C34H58O4(GTA-530)、C34H60O4(GTA-532)、C32H56O6(GTA-536)、C32H58O6(GTA-538)、C32H60O6(GTA-540)、C34H62O5(GTA-550)、C36H62O5(GTA-574)、C36H64O5(GTA-576)、C36H68O5(GTA-580)、C36H62O6(GTA-590)、C36H64O6(GTA-592)、C36H66O6(GTA-594)或C36H68O6(GTA-596)。
25.根据权利要求17所述的试剂盒,其中,使用碰撞诱导解离(CID)串联质谱法测量所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物,并且所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物选自以下列出的一种或多种GTA二羧酸脂肪酸代谢物:
GTA-446,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量446.3396,分子式为C28H46O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量445的子离子:427、409、401和383;
GTA-448,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量448.3553,分子式为C28H48O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量447的子离子:429、411、403和385;
GTA-450,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量450.3709,分子式为C28H50O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量449的子离子:431、413、405和387;
GTA-452,具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量452.3866,分子式为C28H52O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量451的子离子:433、407和389;
GTA-464具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量464.3522,分子式为C28H48O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量463的子离子:445、419、401和383;
GTA-466具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量466.3661,分子式为C28H50O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量465的子离子:447、421和403;
GTA-468具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量468.3814,分子式为C28H52O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量467的子离子:449、423和405;
GTA-474具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量474.3736,分子式为C30H50O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量473的子离子:455、429和411;
GTA-476具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量476.3866,分子式为C30H52O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量475的子离子:457、431、439和413;
GTA-478具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量478.4022,分子式为C30H54O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量477的子离子:459、433、441和415;
GTA-484具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量484.3764,分子式为C28H52O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量483的子离子:465、315、439483、421和447;
GTA-490具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量490.3658,分子式为C30H50O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量489的子离子:445、471、427和319;
GTA-492具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量492.3815,分子式为C30H52O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量491的子离子:241、249、267、473和447;
GTA-494具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量494.3971,分子式为C30H54O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量493的子离子:475、215和449;
GTA-502具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量502.4022,分子式为C32H54O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量501的子离子:483、457、465和439;
GTA-504具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量504.4195,分子式为C32H56O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量503的子离子:485、459、467和441;
GTA-512具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量512.4077,分子式为C30H56O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量511的子离子:493、315和467;
GTA-518具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量518.3974,分子式为C32H54O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量517的子离子:499、473、499、481和445;
GTA-520具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量520.4128,分子式为C32H56O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量519的子离子:501、457、475、459、447和483;
GTA-522具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量522.4284,分子式为C32H58O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量521的子离子:503、459、477、504、441和485;
GTA-524具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量524.4441,分子式为C32H60O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量523的子离子:505、461、479、506、443和487;
GTA-530具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量530.4335,分子式为C34H58O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量529的子离子:467、511和485;
GTA-532具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量532.4492,分子式为C34H60O4,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量531的子离子:513、469、487和495;
GTA-536具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量536.4077,分子式为C32H56O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量535的子离子:473;
GTA-538具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量538.4233,分子式为C32H58O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量537的子离子:519、475、493、501和457;
GTA-540具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量540.4389,分子式为C32H60O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量539的子离子:315、521、495和477;
GTA-550具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量550.4597,分子式为C34H62O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量549的子离子:487、531、251、253、513、469和506;
GTA-574具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量574.4597,分子式为C36H62O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量573的子离子:295、223、555和511;
GTA-576具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量576.4754,分子式为C36H64O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量575的子离子:277、297、557、513和495;
GTA-580具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量580.5067,分子式为C36H68O5,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量579的子离子:561、543、535、517和499;
GTA-590具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量590.4546,分子式为C36H62O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量589的子离子:545;
GTA-592具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量592.4703,分子式为C36H64O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量591的子离子:555和113;
GTA-594具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量594.4859,分子式为C36H66O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量593的子离子:557371、315和277;以及
GTA-596具有1PPM道尔顿之内质量精度的准确中性质量596.5016,分子式为C36H68O6,通过使用N2作为碰撞气体CID MS/MS碎片模式表征,并且在负电离化下大气压化学电离(APCI)分析,含有母体[M-H]质量595的子离子:279、315、297、577和559。
26.根据权利要求17所述的试剂盒,其中所述GTA二羧酸脂肪酸代谢物是GTA-446,具有分子式C28H46O4,并且具有结构:
Figure FDA0002818047710000211
27.根据权利要求17所述的试剂盒,其中所述胃道酸(GTA)不足是胃肠道(GI)炎症状态的标志。
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