CN111859899A - Word文档的解析与填充方法、装置、设备和存储介质 - Google Patents
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Abstract
本申请提供了一种Word文档的解析与填充方法、装置、设备和存储介质,通过获取临床试验数据,并将通过检测的临床试验数据上传以进行收录;在作为病例报告表模板的Word文档中埋入数据标记以设置为填充点位;解析所述Word文档的编排结构并识别所述填充点位,并将收录的所述临床试验数据针对每个所述填充点位关联要填充的数据字段;复制一份作为病例报告表的模板的Word文档,并在各所述填充点位分别填充各自所关联的数据字段,以形成最终病例报告表的Word文档。本申请可以有效减少科研人员的工作负担,也利于科研数据的集中管理。同时由于不需要从零开始生成word文件,其通用性更好,可以按照科研人员的需求对文档进行随意配置。
Description
技术领域
本发明涉及计算机技术领域,特别是涉及一种Word文档的解析与填充方法、装置、设备和存储介质。
背景技术
CRF(病例报告表Case Report Form)是临床试验中获取研究资料的重要手段,是收集、记录和保存临床试验资料的载体。医生经常会用各种方式收集临床实验数据,这些数据最终都需要被填写到每个病例的Word格式CRF中。
目前已经有一些自动生成word文档的方法,但由于CRF的模板通常变动频繁,如果用软件直接生成word难度较大。另外,CRF文件涉及的数据往往较多,一般还需要对数据进行层级化管理,因此,亟需提供一种针对CRF填充场景的自动生成word文档的方案。
发明内容
鉴于以上所述现有技术的缺点,本申请的目的在于提供一种Word文档的解析与填充方法、装置、设备和存储介质,以解决现有技术中存在的至少一个问题。
为实现上述目的及其他相关目的,本申请提供一种Word文档的解析与填充方法,所述方法包括:获取临床试验数据,并将通过检测的临床试验数据上传以进行收录;在作为病例报告表模板的Word文档中埋入数据标记以设置为填充点位;解析所述Word文档的编排结构并识别所述填充点位,并将收录的所述临床试验数据针对每个所述填充点位关联要填充的数据字段;复制一份作为病例报告表的模板的Word文档,并在各所述填充点位分别填充各自所关联的数据字段,以形成最终病例报告表的Word文档。
于本申请的一实施例中,所述将通过检测的临床试验数据上传以进行收录,包括:检测各所述临床试验数据中是否含有唯一确定受试者身份的ID;将含有所述ID的临床试验数据上传以进行收录,以便依据所述ID进行数据关联;和/或,检测各所述临床试验数据内部是否出现重复列名;将未出现重复列名的临床试验数据上传以进行收录,以防止在进行数据关联时出现歧义
于本申请的一实施例中,所述Word文档的底层为xml文件,解析所述xml文件可得到所述Word文档的编排结构。
于本申请的一实施例中,所述解析所述Word文档的编排结构并识别所述填充点位,包括:调用python的python-docx库解析所述Word文档,以获取所述Word文档基于基本单位的表征编排结构的信息树;在所述信息树中的各基本单位中寻找埋入的表示所述填充点位的数据标记,并记录在所述word文档中的相应的位置。
于本申请的一实施例中,所述方法还包括:核对各识别出的所述填充点位;若出现重复的所述填充点位,则生成错误提示。
于本申请的一实施例中,所述将收录的所述临床试验数据针对每个所述填充点位关联要填充的数据字段,包括:针对各所述填充点位设置有选择框,以供从所述选择框中选择想要填充的数据字段,即可完成关联;在数据关联时,若想要填充的数据字段出现缺失时可设置缺失默认值;或,针对是否型变量在填充时设置为自动填充。
为实现上述目的及其他相关目的,本申请提供一种Word文档的解析与填充装置,所述装置包括:数据收录模块,用于获取临床试验数据,并将通过检测的临床试验数据上传以进行收录;点位设置模块;用于在作为病例报告表模板的Word文档中埋入数据标记以设置为填充点位;文档解析模块,用于解析所述Word文档的编排结构并识别所述填充点位,并将收录的所述临床试验数据针对每个所述填充点位关联要填充的数据字段;文档填充模块,用于复制一份作为病例报告表的模板的Word文档,并在各所述填充点位分别填充各自所关联的数据字段,以形成最终病例报告表的Word文档。
为实现上述目的及其他相关目的,本申请提供一种计算机设备,所述设备包括:存储器、及处理器;所述存储器用于存储计算机指令;所述处理器运行计算机指令实现如上所述的方法。
为实现上述目的及其他相关目的,本申请提供一种计算机可读存储介质,存储有计算机指令,所述计算机指令被运行时执行如上所述的方法。
综上所述,本申请提供的一种Word文档的解析与填充方法、装置、设备和存储介质,通过获取临床试验数据,并将通过检测的临床试验数据上传以进行收录;在作为病例报告表模板的Word文档中埋入数据标记以设置为填充点位;解析所述Word文档的编排结构并识别所述填充点位,并将收录的所述临床试验数据针对每个所述填充点位关联要填充的数据字段;复制一份作为病例报告表的模板的Word文档,并在各所述填充点位分别填充各自所关联的数据字段,以形成最终病例报告表的Word文档。
具有以下有益效果:
本申请可以有效减少科研人员的工作负担,也利于科研数据的集中管理。同时由于不需要从零开始生成word文件,其通用性更好,可以按照科研人员的需求对文档进行随意配置。
附图说明
图1显示为本申请于一实施例中Word文档的解析与填充方法的流程示意图。
图2显示为本申请于一实施例中Word文档的解析与填充装置的模块示意图。
图3显示为本申请于一实施例中计算机设备的结构示意图。
具体实施方式
以下通过特定的具体实例说明本申请的实施方式,本领域技术人员可由本说明书所揭露的内容轻易地了解本申请的其他优点与功效。本申请还可以通过另外不同的具体实施方式加以实施或应用,本说明书中的各项细节也可以基于不同观点与应用,在没有背离本申请的精神下进行各种修饰或改变。需说明的是,在不冲突的情况下,以下实施例及实施例中的特征可以相互组合。
需要说明的是,以下实施例中所提供的图示仅以示意方式说明本申请的基本构想,虽然图式中仅显示与本申请中有关的组件而非按照实际实施时的组件数目、形状及尺寸绘制,但其实际实施时各组件的型态、数量及比例可为一种随意的改变,且其组件布局型态也可能更为复杂。
鉴于上述现有技术存在的问题,本发明的目的在于提供一种Word文档的解析与填充方法、装置、设备和存储介质,以提供针对CRF填充场景的方案。
如图1所示,展示为本申请于一实施例中的Word文档的解析与填充方法的流程示意图。
如图所示,所述方法包括:
步骤S101:获取临床试验数据,并将通过检测的临床试验数据上传以进行收录。
于本实施例中,所述临床试验数据可以是研究人员从各种渠道和平台获取到的excel或csv的格式的临床实验数据。
于本实施例中,所述将通过检测的临床试验数据上传以进行收录,包括:
一方面:检测各所述临床试验数据中是否含有唯一确定受试者身份的ID;将含有所述ID的临床试验数据上传以进行收录,以便依据所述ID进行数据关联。
举例来说,本申请要求每个数据集必须含有“personID”,以便系统进行数据关联。需说明的是,填充一篇CRF需要的数据往往需要很多张表合并在一起。在数据上传的时候就检查是否存在该列并以此进行数据关联。
另一方面,检测各所述临床试验数据内部是否出现重复列名;将未出现重复列名的临床试验数据上传以进行收录,以防止在进行数据关联时出现歧义。
于本实施例中,本申请中要求每个数据集内部不允许出现重复列名,以防止在进行数据关联时出现歧义。
因此,通过上述两项检测后,数据才可以被成功上传以进行收录。
步骤S102:在作为病例报告表模板的Word文档中埋入数据标记以设置为填充点位。
于本实施例中,所述Word文档的底层为xml文件,解析所述xml文件可得到所述Word文档的编排结构。word文档底层是xml为载体的复合结构化文件,通过解析这些xml文件可以得到word文档的编排结构。一般CRF都会有一个用作模板的word文件。例如,科研人员会手工填写这个模板文件,来得到不同受试者的CRF。
于本实施例中,在本申请中要求用户在制作模板时,按要求在模板文件中埋入数据标记以作为后续填充数据的填充点位,如“<#1#>”代表编号为1的信息点位。其中,本申请还要求这些填充点位在一篇文章中是不允许重复的,以防止编码发生冲突。
步骤S103:解析所述Word文档的编排结构并识别所述填充点位,并将收录的所述临床试验数据针对每个所述填充点位关联要填充的数据字段。
于本实施例中,所述解析所述Word文档的编排结构并识别所述填充点位,包括:
调用python的python-docx库解析所述Word文档,以获取所述Word文档基于基本单位的表征编排结构的信息树;在所述信息树中的各基本单位中寻找埋入的表示所述填充点位的数据标记,并记录在所述word文档中的相应的位置。
简单来说,解析所述Word文档可通过调用python的python-docx库可以分别解析出word文档中的所有表格、段落等信息,这些信息以树状结构存储(编排结构)。忽略掉其中的中间层级,在最后一层是“data”,可以理解为符合同样字符格式的连续字符。“data”是构成word文档的基本单位,word文档是由这些基本单位按层级组织起来的。Word文件解析就是把整篇文档转换成这些叶子节点为“data”。在所有的“data”中寻找埋入的标记,就得到了所有的表示所述填充点位的数据标记。
于本实施例中,所述方法还包括:核对各识别出的所述填充点位;若出现重复的所述填充点位,则生成错误提示。
在解析时,程序自动发现文件中出现的这些填充点位,并记录其在文件中的位置。同时,程序在完成一次解析后会核对所发现的点位,如果出现重复点位,则给出报错提示,提示作者修改模板文件,直至核查通过。
于本实施例中,所述将收录的所述临床试验数据针对每个所述填充点位关联要填充的数据字段,包括:针对各所述填充点位设置有选择框,以供从所述选择框中选择想要填充的数据字段,即可完成关联;在数据关联时,若想要填充的数据字段出现缺失时可设置缺失默认值;或,针对是否型变量在填充时设置为自动填充。
在实际使用中,数据缺失是很常见的现象。在数据关联时,除了设置想要填充的数据字段,也可同时设置数据缺失时填充的默认值。同时对“是否型”变量,可以设置该点位为“是否型”变量,填充时会自动填充为或“□”。另外,本申请同时考虑到多次迭代的需求,对应设置不要求每次数据关联都必须给每个点位设置数据源,可以以警告的方式给出提醒。
步骤S104:复制一份作为病例报告表的模板的Word文档,并在各所述填充点位分别填充各自所关联的数据字段,以形成最终病例报告表的Word文档。
于本实施例中,数据关联完成后,可以开始进行自动填充。程序会先复制一份模板文件,并按照文件解析时记录的埋点信息把点位替换成对应的数据。最终重新打包文件,形成word文档。
综上所述,本申请针对临床研究中CRF填充这一应用场景,设计了一种Word文档的解析与填充方法,本方法可以有效减少科研人员的工作负担,也利于科研数据的集中管理。同时由于不需要从零开始生成word文件,其通用性更好,可以按照科研人员的需求对文档进行随意配置。
如图2所示,展示为本申请于一实施例中的Word文档的解析与填充装置的模块示意图。如图所示,所述装置200包括:
数据收录模块201,用于获取临床试验数据,并将通过检测的临床试验数据上传以进行收录;
点位设置模块202;用于在作为病例报告表模板的Word文档中埋入数据标记以设置为填充点位;
文档解析模块203,用于解析所述Word文档的编排结构并识别所述填充点位,并将收录的所述临床试验数据针对每个所述填充点位关联要填充的数据字段;
文档填充模块204,用于复制一份作为病例报告表的模板的Word文档,并在各所述填充点位分别填充各自所关联的数据字段,以形成最终病例报告表的Word文档。
需要说明的是,上述装置各模块/单元之间的信息交互、执行过程等内容,由于与本申请所述方法实施例基于同一构思,其带来的技术效果与本申请方法实施例相同,具体内容可参见本申请前述所示的方法实施例中的叙述,此处不再赘述。
还需要说明的是,应理解以上装置的各个模块的划分仅仅是一种逻辑功能的划分,实际实现时可以全部或部分集成到一个物理实体上,也可以物理上分开。且这些单元可以全部以软件通过处理元件调用的形式实现;也可以全部以硬件的形式实现;还可以部分模块通过处理元件调用软件的形式实现,部分模块通过硬件的形式实现。例如,文档填充模块204可以为单独设立的处理元件,也可以集成在上述装置的某一个芯片中实现,此外,也可以以程序代码的形式存储于上述装置的存储器中,由上述装置的某一个处理元件调用并执行以上文档填充模块204的功能。其它模块的实现与之类似。此外这些模块全部或部分可以集成在一起,也可以独立实现。这里所述的处理元件可以是一种集成电路,具有信号的处理能力。在实现过程中,上述方法的各步骤或以上各个模块可以通过处理器元件中的硬件的集成逻辑电路或者软件形式的指令完成。
例如,以上这些模块可以是被配置成实施以上方法的一个或多个集成电路,例如:一个或多个特定集成电路(Application Specific Integrated Circuit,简称ASIC),或,一个或多个微处理器(digital signal processor,简称DSP),或,一个或者多个现场可编程门阵列(Field Programmable Gate Array,简称FPGA)等。再如,当以上某个模块通过处理元件调度程序代码的形式实现时,该处理元件可以是通用处理器,例如中央处理器(Central Processing Unit,简称CPU)或其它可以调用程序代码的处理器。再如,这些模块可以集成在一起,以片上系统(system-on-a-chip,简称SOC)的形式实现。
如图3所示,展示为本申请于一实施例中的计算机设备的结构示意图。如图所示,所述计算机设备300包括:存储器301、及处理器302;所述存储器301用于存储计算机指令;所述处理器302运行计算机指令实现如图1所述的方法。
在一些实施例中,所述计算机设备300中的所述存储器301的数量均可以是一或多个,所述处理器302的数量均可以是一或多个,而图3中均以一个为例。
于本申请一实施例中,所述计算机设备300中的处理器302会按照如图1所述的步骤,将一个或多个以应用程序的进程对应的指令加载到存储器301中,并由处理器302来运行存储在存储器301中的应用程序,从而实现如图1所述的方法。
所述存储器301可以包括随机存取存储器(Random Access Memory,简称RAM),也可以包括非易失性存储器(non-volatile memory),例如至少一个磁盘存储器。所述存储器301存储有操作系统和操作指令、可执行模块或者数据结构,或者它们的子集,或者它们的扩展集,其中,操作指令可包括各种操作指令,用于实现各种操作。操作系统可包括各种系统程序,用于实现各种基础业务以及处理基于硬件的任务。
所述处理器302可以是通用处理器,包括中央处理器(Central Processing Unit,简称CPU)、网络处理器(Network Processor,简称NP)等;还可以是数字信号处理器(Digital Signal Processing,简称DSP)、专用集成电路(Application SpecificIntegrated Circuit,简称ASIC)、现场可编程门阵列(Field-Programmable Gate Array,简称FPGA)或者其他可编程逻辑器件、分立门或者晶体管逻辑器件、分立硬件组件。
在一些具体的应用中,所述计算机设备300的各个组件通过总线系统耦合在一起,其中总线系统除包括数据总线之外,还可以包括电源总线、控制总线和状态信号总线等。但是为了清除说明起见,在图3中将各种总线都成为总线系统。
于本申请的一实施例中,本申请提供一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,该程序被处理器执行时实现如图1所述的方法。
所述计算机可读存储介质,本领域普通技术人员可以理解:实现上述装置及各单元功能的实施例可以通过计算机程序相关的硬件来完成。前述的计算机程序可以存储于一计算机可读存储介质中。该程序在执行时,执行包括上述装置及各单元功能的实施例;而前述的存储介质包括:ROM、RAM、磁碟或者光盘等各种可以存储程序代码的介质。
综上所述,本申请提供的一种Word文档的解析与填充方法、装置、设备和存储介质,通过获取临床试验数据,并将通过检测的临床试验数据上传以进行收录;在作为病例报告表模板的Word文档中埋入数据标记以设置为填充点位;解析所述Word文档的编排结构并识别所述填充点位,并将收录的所述临床试验数据针对每个所述填充点位关联要填充的数据字段;复制一份作为病例报告表的模板的Word文档,并在各所述填充点位分别填充各自所关联的数据字段,以形成最终病例报告表的Word文档。
本申请有效克服了现有技术中的种种缺点而具高度产业利用价值。
上述实施例仅例示性说明本申请的原理及其功效,而非用于限制本发明。任何熟悉此技术的人士皆可在不违背本申请的精神及范畴下,对上述实施例进行修饰或改变。因此,举凡所属技术领域中包含通常知识者在未脱离本发明所揭示的精神与技术思想下所完成的一切等效修饰或改变,仍应由本申请的权利要求所涵盖。
Claims (9)
1.一种Word文档的解析与填充方法,其特征在于,所述方法包括:
获取临床试验数据,并将通过检测的临床试验数据上传以进行收录;
在作为病例报告表模板的Word文档中埋入数据标记以设置为填充点位;
解析所述Word文档的编排结构并识别所述填充点位,并将收录的所述临床试验数据针对每个所述填充点位关联要填充的数据字段;
复制一份作为病例报告表的模板的Word文档,并在各所述填充点位分别填充各自所关联的数据字段,以形成最终病例报告表的Word文档。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述将通过检测的临床试验数据上传以进行收录,包括:
检测各所述临床试验数据中是否含有唯一确定受试者身份的ID;
将含有所述ID的临床试验数据上传以进行收录,以便依据所述ID进行数据关联;和/或,
检测各所述临床试验数据内部是否出现重复列名;
将未出现重复列名的临床试验数据上传以进行收录,以防止在进行数据关联时出现歧义。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述Word文档的底层为xml文件,解析所述xml文件可得到所述Word文档的编排结构。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述解析所述Word文档的编排结构并识别所述填充点位,包括:
调用python的python-docx库解析所述Word文档,以获取所述Word文档基于基本单位的表征编排结构的信息树;
在所述信息树中的各基本单位中寻找埋入的表示所述填充点位的数据标记,并记录在所述word文档中的相应的位置。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
核对各识别出的所述填充点位;
若出现重复的所述填充点位,则生成错误提示。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述将收录的所述临床试验数据针对每个所述填充点位关联要填充的数据字段,包括:
针对各所述填充点位设置有选择框,以供从所述选择框中选择想要填充的数据字段,即可完成关联;
在数据关联时,若想要填充的数据字段出现缺失时可设置缺失默认值;或,针对是否型变量在填充时设置为自动填充。
7.一种Word文档的解析与填充装置,其特征在于,所述装置包括:
数据收录模块,用于获取临床试验数据,并将通过检测的临床试验数据上传以进行收录;
点位设置模块;用于在作为病例报告表模板的Word文档中埋入数据标记以设置为填充点位;
文档解析模块,用于解析所述Word文档的编排结构并识别所述填充点位,并将收录的所述临床试验数据针对每个所述填充点位关联要填充的数据字段;
文档填充模块,用于复制一份作为病例报告表的模板的Word文档,并在各所述填充点位分别填充各自所关联的数据字段,以形成最终病例报告表的Word文档。
8.一种计算机设备,其特征在于,所述设备包括:存储器、及处理器;所述存储器用于存储计算机指令;所述处理器运行计算机指令实现如权利要求1至6中任意一项所述的方法。
9.一种计算机可读存储介质,其特征在于,存储有计算机指令,所述计算机指令被运行时执行如权利要求1至6中任一项所述的方法。
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SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
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