CN111235247A - 一种低腹脂优质鸡的选育方法 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种低腹脂优质鸡的选育方法，通过鸡粪便中的肠道菌群的丰富度来推测沉积脂肪量，以肠道微生物多样性作为预示腹脂的选种指标，组建一个基础鸡群，在基础鸡群的基础上进行淘汰和选择种鸡个体。使用Chao1指数和ACE指数作为预测和鉴定鸡的腹部脂肪沉积的生物标志，并对活体脂肪沉积量以及腹部脂肪的沉积范围实现稳定可靠的预测和鉴定，得到微生物多样性作为预测腹脂的指标，既能实现预测鉴定，又能有效避免传统的分子标记方法中需要采血等有创采样方式，从而避免鸡因采血导致的伤口感染、应激、生产性能下降等问题。本发明的选育方法还能解决过往低腹脂选育方法中误差较大、费时费力、操作复杂、难以推广和效率低的问题。
Description
技术领域
本发明涉及家禽选育技术领域，具体而言，涉及一种低腹脂优质鸡的选育方法。
背景技术
肉鸡体脂(尤其是腹脂)沉积过多一直困扰着世界范围内肉鸡育种工作者，而鸡普遍存在腹脂沉积过多的问题，腹脂过多一方面降低饲料转化效率，提高优质鸡的饲养成本，脂肪过多丢弃也造成浪费和污染环境；另一方面，腹脂沉积过多会降低消费者对优质鸡品质的认可，影响价格和销售。此外，鸡过肥会严重影响产蛋率、受精率和孵化率，加大了产蛋期的死淘率，影响种群的繁殖性能。腹脂沉积性状虽然受营养、饲养方式等因素影响较大，但其最主要的还是与遗传相关，通过遗传选育是有效降低优质肉鸡品种腹脂沉积率的最根本办法。高效、准确地淘汰高腹脂个体，选留腹脂沉积性状适中的个体组建群体，加快低脂品系的建立，改良腹脂性状，改善胴体品质，具有可观的经济价值。现有技术中，采用活体手摸法选择低腹脂鸡误差较大，易受选种人员的主观影响，准确率往往不高；BLUP选择法虽然较为准确，但费时费力，对育种企业要求太高，还难全面推广应用；而表型值综合选择法需要在不同的日龄阶段测定不同的性状，逐步选择和淘汰，操作较为繁琐复杂，表型测定也易受人员主观影响，存在误差，同时测定工作持续到200日龄以上，影响育种效率。
如专利号为为CN107064521B涉及茶花鸡的选育方法，可进行早期选育，缩短了选育周期。再如专利号为CN109924166A涉及一种腹脂率低的优质鸡选育方法，但总体上不能快速有效地推测优质鸡的腹脂沉积性状。
综合上，在家禽选育技术领域，特别是活体脂肪沉积鉴定领域，其实际应用中的亟待处理的实际问题还有很多未提出具体的解决方案。
发明内容
本发明提出了一种活体脂肪量沉积的无损检测方法以解决所述问题。
为了实现上述目的，本发明采用如下技术方案：
一种低腹脂优质鸡的选育方法，所述选育方法通过鸡粪便中的肠道菌群的丰富度来推测沉积脂肪量，以肠道微生物多样性作为预示腹脂的选种指标，组建一个基础鸡群，在基础鸡群的基础上进行淘汰和选择种鸡个体，所述选育方法包括如下步骤：
1).组建一个基础鸡群，在基础鸡群饲养到成熟期的基础上，收集所有基础鸡群中的粪便，去除粪便中的杂质；
2).通过引物设计、粪便中的微生物DNA提取、DNA扩增、DNA测序的步骤后，测得的序列使用数据处理系统计算得到微生物多样性的Chao1值以及ACE值；
3).在基础鸡群中随机抽取若干只鸡进行宰杀，进行屠体重、全净膛重称重，收集沉积的腹部脂肪称重，并计算得到第一世代的腹脂重和腹脂率；
4).结合步骤2)得到的微生物多样性的Chao1值以及ACE值，在剩余的基础鸡群中将Chao1值小于2300并且ACE值小于2300的鸡个体淘汰，其余鸡个体进行留种，繁育第二世代；
5).在第二世代饲养到成熟期的基础上，收集所有第二世代所有个体的粪便，去除粪便中的杂质，对洁净的粪便进行微生物多样性进行分析，将Chao1值小于2300并且ACE值也小于2300的个体淘汰，其它第二世代个体作为留种繁育第三世代；
6).重复步骤5)的操作，不断进行世代的选育，得到腹脂率低的优质鸡品系。
可选地，所述基础鸡群饲养到成熟期为饲养期达到120日龄的鸡群性成熟期。
可选地，所述去除粪便中杂质的方法为：将收集到的粪便放入粪便杂质预处理设备中，所述粪便杂质预处理设备包括收集槽、过滤装置以及搅拌装置，所述过滤装置安装在所述收集槽的上部，所述搅拌装置安装在所述收集槽的内，且所述过滤装置上安装有若干震动装置，所述搅拌装置包括搅拌轴、搅拌桨以及用于驱动所述搅拌轴的驱动电机，且所述搅拌桨安装在所述搅拌轴上；粪便在安装有若干震动装置的过滤网中进行分散以及大颗粒杂质的过滤，分散且过滤后的粪便进入所述收集槽中，启动所述搅拌装置，使得粪便在所述收集槽中形成更加分散的预处理粪便。
可选地，所述引物设计为采用引物515f以及引物806r。
可选地，所述粪便中的微生物DNA提取为：将浓度为15-20mol/L的生理盐水加入上述预处理粪便中，且固液比为1:5-15，并高速搅拌形成悬浮液，使用微生物DNA提取试剂盒提取粪便中微生物的总DNA。
可选地，所述DNA扩增为：采用体外DNA扩增技术，将515f/806r引物扩增16S rDNA的V4区，用试剂盒纯化回收PCR产物。
可选地，所述DNA测序为：使用Hiseq2500对纯化回收的PCR产物进行测序，测得的序列使用Flash v1.2.7合并配对末端，嵌合序列使用Uchime算法去除，使用QIIME v1.7.0执行原始标记质控，最后使用Uparse v7.0.1001对具有97％的相似性阈值的TaxonomicUnit进行操作分析。
可选地，所述随机抽取若干只鸡进行宰杀的数量占所述基础集群的数量的1/10-1/5。
可选地，所述腹脂率为：
腹脂率＝腹脂重/(全净堂重+腹脂重)*100％。
与现有技术相比，本发明所取得的有益技术效果是：
1、本发明的通过对鸡的粪便的微生物多样性进行分析，能使用Chao1指数和ACE指数作为预测和鉴定鸡的腹部脂肪沉积的生物标志，并对活体脂肪沉积量以及腹部脂肪的沉积范围实现稳定可靠的预测和鉴定，得到微生物多样性作为预测腹脂的指标，既能实现预测鉴定，又能有效避免传统的分子标记方法中需要采血等有创采样方式，从而避免鸡因采血导致的伤口感染、应激、生产性能下降等问题。
2、本发明运用菌群多样性Chao1值和ACE值开展优质鸡低腹脂沉积选育，只需要在性成熟日龄单次采样分析，分析方法简便，可以实现全自动检测，成本低廉，可操作性强，结果显著可靠，可以解决过往低腹脂选育方法中误差较大、费时费力、操作复杂、难以推广和效率不高的问题。
3.本发明运用菌群多样性Chao1值和ACE值开展优质鸡低腹脂沉积选育，显著降低鸡的腹脂沉积、减少群体性状分化的问题，选育进展明显，能快速达到育种目标。
附图说明
从以下结合附图的描述可以进一步理解本发明。图中的部件不一定按比例绘制，而是将重点放在示出实施例的原理上。在不同的视图中，相同的附图标记指定对应的部分。
图1是本发明实施例之一中一种低腹脂优质鸡的选育方法的腹脂重的示意图；
图2是是本发明实施例之一中一种低腹脂优质鸡的选育方法的腹脂率的示意图；
图3是是本发明实施例之一中一种低腹脂优质鸡的选育方法的腹脂率的方差变化示意图；
图4是是本发明实施例之一中一种低腹脂优质鸡的选育方法的腹脂重的方差变化示意图。
具体实施方式
为了使得本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白，以下结合其实施例，对本发明进行进一步详细说明；应当理解，此处所描述的具体实施例仅用于解释本发明，并不用于限定本发明。对于本领域技术人员而言，在查阅以下详细描述之后，本实施例的其它系统、方法和/或特征将变得显而易见。本实施例不能理解为对本专利的限制，对于本领域的普通技术人员而言，可以根据具体情况理解上述术语的具体含义。
本发明为一种活体脂肪量沉积的无损检测方法，根据图1-4所示讲述以下实施例：
实施例1：
一种低腹脂优质鸡的选育方法，所述选育方法通过鸡粪便中的肠道菌群的丰富度来推测沉积脂肪量，以肠道微生物多样性作为预示腹脂的选种指标，组建一个基础鸡群，在基础鸡群的基础上进行淘汰和选择种鸡个体，所述选育方法包括如下步骤：
1).组建一个基础鸡群，在基础鸡群饲养达到120日龄的鸡群性成熟期，收集所有基础鸡群中的粪便，去除粪便中的杂质，且所述去除粪便中杂质的方法为：将收集到的粪便放入粪便杂质预处理设备中，所述粪便杂质预处理设备包括收集槽、过滤装置以及搅拌装置，所述过滤装置安装在所述收集槽的上部，所述搅拌装置安装在所述收集槽的内，且所述过滤装置上安装有若干震动装置，所述搅拌装置包括搅拌轴、搅拌桨以及用于驱动所述搅拌轴的驱动电机，且所述搅拌桨安装在所述搅拌轴上；粪便在安装有若干震动装置的过滤网中进行分散以及大颗粒杂质的过滤，分散且过滤后的粪便进入所述收集槽中，启动所述搅拌装置，使得粪便在所述收集槽中形成更加分散的预处理粪便；
2).通过引物设计、粪便中的微生物DNA提取、DNA扩增、DNA测序的步骤后，测得的序列使用数据处理系统计算得到微生物多样性的Chao1值以及ACE值；且所述引物设计为采用引物515f以及引物806r；所述粪便中的微生物DNA提取为：将浓度为15-20mol/L的生理盐水加入上述预处理粪便中，且固液比为1:5-15，并高速搅拌形成悬浮液，使用微生物DNA提取试剂盒提取粪便中微生物的总DNA；所述DNA扩增为：采用体外DNA扩增技术，将515f/806r引物扩增16S rDNA的V4区，用试剂盒纯化回收PCR产物；所述DNA测序为：使用Hiseq2500对纯化回收的PCR产物进行测序，测得的序列使用Flash v1.2.7合并配对末端，嵌合序列使用Uchime算法去除，使用QIIME v1.7.0执行原始标记质控，最后使用Uparse v7.0.1001对具有97％的相似性阈值的Taxonomic Unit进行操作分析；
3).在基础鸡群中随机抽取占所述基础集群的数量的1/10-1/5的鸡个体进行宰杀，进行屠体重、全净膛重称重，收集沉积的腹部脂肪称重，并计算得到第一世代的腹脂重和腹脂率，其中，所述腹脂率为：
腹脂率＝腹脂重/(全净堂重+腹脂重)*100％。
4).结合步骤2)得到的微生物多样性的Chao1值以及ACE值，在剩余的基础鸡群中将Chao1值小于2300并且ACE值小于2300的鸡个体淘汰，其余鸡个体进行留种，繁育第二世代；
5).在第二世代饲养到成熟期的基础上，收集所有第二世代所有个体的粪便，去除粪便中的杂质，对洁净的粪便进行微生物多样性进行分析，将Chao1值小于2300并且ACE值也小于2300的个体淘汰，其它第二世代个体作为留种繁育第三世代；
6).重复步骤5)的操作，不断进行世代的选育，得到腹脂率低的优质鸡品系。
通过本实施例的选育方法，能快速达到育种目标，有效选育出低腹脂率的优质鸡，不仅能实现预测鉴定，又能有效避免传统的分子标记方法中需要采血等有创采样方式，从而避免鸡因采血导致的伤口感染、应激、生产性能下降等问题。
实施例2：
本实施例中采用活体试验，试验动物来自某原种场，以相同日龄的清远麻鸡母鸡为试验对象，所有试验鸡采用完全相同的日粮结构，相同饲养条件。
1).将饲养到120日龄时收集基础群所有鸡个体的洁净粪便进行微生物多样性分析；所述多样性分析，包括以下步骤：引物的设计：采用国际通用引物515f/806r，其中，所述515f为:GTGCCAGCMGCCGCGGTAA，所述806r为：GGACTACHVGGGTWTCTAAT；DNA的提取：使用微生物DNA提取试剂盒(Qiagen)提取盲肠内容物的总DNA；DNA的扩增：采用上述515f/806r引物扩增16S rDNA的V4区，用QIAquick试剂盒(QIAGEN)纯化回收PCR产物；DNA测序：使用Hiseq2500对PCR产物进行测序，测得的序列使用Flash v1.2.7合并配对末端，嵌合序列使用Uchime算法去除，使用QIIME v1.7.0执行原始标记质控，最后使用Uparse v7.0.1001对具有97％的相似性阈值的Taxonomic Unit(OTU)进行操作；OTU分析：对得到的OTU数据计算微生物α多样性的Chao1值、ACE值。
2).在基础群所有鸡个体中中随机抽取50只鸡宰杀，进行屠体重、全净膛重称重，收集沉积的腹部脂肪称重，计算第一世代的腹脂重和腹脂率；
3).根据微生物多样性分析结果，在剩余的基础群中将Chao1指数小于2300并且ACE指数也小于2300的个体淘汰，其余个体留种，繁育下一代；
4).第二世代的鸡群饲养到120日龄时，重复上述操作，收集所有个体的洁净粪便进行微生物多样性分析，淘汰Chao1指数小于2300并且ACE指数也小于2300的个体，其余个体留种繁育下一代；
5).在第二世代群体中随机抽取50只鸡宰杀，进行屠体重、全净膛重称重，收集沉积的腹部脂肪称重，计算第二世代的腹脂重和腹脂率。
结果显示：根据两个世代随机抽样的腹脂重和腹脂率测定，未经选育的第一世代的50只鸡，平均腹脂重45.15g,平均腹脂率4.13％；经过肠道微生物多样性选育的第二世代的50只鸡，平均腹脂重37.96g,平均腹脂率3.69％，可见，腹脂重和腹脂率均显著降低，具体如图1和图2所示。同时，经过选育，腹脂重标准差从第一世代抽样样本的21.22下降到第二世代抽样样本的13.05，腹脂率标准差从第一世代抽样样本的1.53下降到第二世代抽样样本的1.24，具体如图3和图4所示。
综合上，本发明的低腹脂优质鸡的选育方法，选育进展明显，能快速达到育种目标，且只需要在性成熟日龄单次采样分析，分析方法简便，可以实现全自动检测，成本低廉，可操作性强，结果显著可靠，可以解决过往低腹脂选育方法中误差较大、费时费力、操作复杂、难以推广和效率不高的问题。
虽然上面已经参考各种实施例描述了本发明，但是应当理解，在不脱离本发明的范围的情况下，可以进行许多改变和修改。也就是说上面讨论的方法，系统和设备是示例。各种配置可以适当地省略，替换或添加各种过程或组件，随着技术发展其中的元素可以更新，即许多元素是示例，并不限制本公开或权利要求的范围。
综上，其旨在上述详细描述被认为是例示性的而非限制性的，并且应当理解，以下权利要求(包括所有等同物)旨在限定本发明的精神和范围。以上这些实施例应理解为仅用于说明本发明而不用于限制本发明的保护范围。在阅读了本发明的记载的内容之后，技术人员可以对本发明作各种改动或修改，这些等效变化和修饰同样落入本发明权利要求所限定的范围。
Claims (9)
1.一种低腹脂优质鸡的选育方法，其特征在于，所述选育方法通过鸡粪便中的肠道菌群的丰富度来推测沉积脂肪量，以肠道微生物多样性作为预示腹脂的选种指标，组建一个基础鸡群，在基础鸡群的基础上进行淘汰和选择种鸡个体，所述选育方法包括如下步骤：
1).组建一个基础鸡群，在基础鸡群饲养到成熟期的基础上，收集所有基础鸡群中的粪便，去除粪便中的杂质；
2).通过引物设计、粪便中的微生物DNA提取、DNA扩增、DNA测序的步骤后，测得的序列使用数据处理系统计算得到微生物多样性的Chao1值以及ACE值；
3).在基础鸡群中随机抽取若干只鸡进行宰杀，进行屠体重、全净膛重称重，收集沉积的腹部脂肪称重，并计算得到第一世代的腹脂重和腹脂率；
4).结合步骤2)得到的微生物多样性的Chao1值以及ACE值，在剩余的基础鸡群中将Chao1值小于2300并且ACE值小于2300的鸡个体淘汰，其余鸡个体进行留种，繁育第二世代；
5).在第二世代饲养到成熟期的基础上，收集所有第二世代所有个体的粪便，去除粪便中的杂质，对洁净的粪便进行微生物多样性进行分析，将Chao1值小于2300并且ACE值也小于2300的个体淘汰，其它第二世代个体作为留种繁育第三世代；
6).重复步骤5)的操作，不断进行世代的选育，得到腹脂率低的优质鸡品系。
2.根据权利要求1所述的低腹脂优质鸡的选育方法，其特征在于，所述基础鸡群饲养到成熟期为饲养期达到120日龄的鸡群性成熟期。
3.根据权利要求1所述的低腹脂优质鸡的选育方法，其特征在于，所述去除粪便中杂质的方法为：将收集到的粪便放入粪便杂质预处理设备中，所述粪便杂质预处理设备包括收集槽、过滤装置以及搅拌装置，所述过滤装置安装在所述收集槽的上部，所述搅拌装置安装在所述收集槽的内，且所述过滤装置上安装有若干震动装置，所述搅拌装置包括搅拌轴、搅拌桨以及用于驱动所述搅拌轴的驱动电机，且所述搅拌桨安装在所述搅拌轴上；粪便在安装有若干震动装置的过滤网中进行分散以及大颗粒杂质的过滤，分散且过滤后的粪便进入所述收集槽中，启动所述搅拌装置，使得粪便在所述收集槽中形成更加分散的预处理粪便。
4.根据权利要求1所述的低腹脂优质鸡的选育方法，其特征在于，所述引物设计为采用引物515f以及引物806r。
5.根据权利要求1所述的低腹脂优质鸡的选育方法，其特征在于，所述粪便中的微生物DNA提取为：将浓度为15-20mol/L的生理盐水加入预处理粪便中，且固液比为1:5-15，并高速搅拌形成悬浮液，使用微生物DNA提取试剂盒提取粪便中微生物的总DNA。
6.根据权利要求1所述的低腹脂优质鸡的选育方法，其特征在于，所述DNA扩增为：采用体外DNA扩增技术，将515f/806r引物扩增16S rDNA的V4区，用试剂盒纯化回收PCR产物。
7.根据权利要求1所述的低腹脂优质鸡的选育方法，其特征在于，所述DNA测序为：使用Hiseq2500对纯化回收的PCR产物进行测序，测得的序列使用Flash v1.2.7合并配对末端，嵌合序列使用Uchime算法去除，使用QIIME v1.7.0执行原始标记质控，最后使用Uparsev7.0.1001对具有97％的相似性阈值的Taxonomic Unit进行操作分析。
8.根据权利要求1所述的低腹脂优质鸡的选育方法，其特征在于，所述随机抽取若干只鸡进行宰杀的数量占所述基础集群的数量的1/10-1/5。
9.根据权利要求1所述的低腹脂优质鸡的选育方法，其特征在于，所述腹脂率为：腹脂率＝腹脂重/(全净堂重+腹脂重)*100%。
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| CN113455464A (zh) * | 2021-08-22 | 2021-10-01 | 文昌龙泉文昌鸡实业有限公司 | 一种低腹脂优质文昌鸡的选育方法 |
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| CN106489824A (zh) * | 2016-10-14 | 2017-03-15 | 东北农业大学 | 一种高低腹脂肉鸡品系的选育方法 |
| CN106755447A (zh) * | 2017-01-04 | 2017-05-31 | 安徽农业大学 | 一种降低白羽王鸽乳鸽腹脂率的分子标记辅助选择方法 |
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2020
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