CN111210884A - 一种临床医疗数据采集方法、装置、介质及设备 - Google Patents
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Abstract
本申请提供了一种临床医疗数据采集的方法、装置、介质及设备,属于计算机技术领域,用于解决相关技术中数据采集方法工作量大,不利于项目快速部署与实施的问题。所述采集方法包括:根据医院内网中各个数据源的数量,创建对应数量的数据传输线程;根据第三方服务器发出的采集数据请求,利用数据传输线程从所述各个数据源中获取患者的基本信息和所有检查信息;采用MPI算法对患者的基本信息和所有检查信息进行解析,得到文本数据和文件数据;将所述文本数据和所述文件数据分别上传给所述第三方服务器。基于配置方式实现对医院信息系统异构数据源进行多维度信息集成,最终实现持续连接、高并发、速度快等数据集成的目的。
Description
技术领域
本申请涉及计算机技术领域,特别是涉及一种临床医疗数据采集方法、装置、介质及设备。
背景技术
随着医疗信息化的发展,医疗信息量越来越庞大,且由于历史原因,各医疗机构通常基于独立构建的医疗信息系统对各自机构进行着信息化管理,因而这种状况便造成了医疗行业的数据呈现“分散化、碎片化、低透明度、语义复杂性”等不良特征。
随着互联网技术的快速发展,互联网+医疗应用获得了快速发展。但是,面对如今各医疗机构独立建设和运维的封闭式医疗信息系统,许多应用和平台在日常数据采集的过程中都相继地遇到不同程度的阻碍,从医院内部获取多维度的医疗临床信息只能通过大量接口开发来解决,接口开发不仅仅带来大量的开发工作,同时带来了大量的测试工作,不利于项目快速部署与实施。因此,相关技术中的数据采集方法存在工作量大,不利于项目快速部署与实施的问题。
发明内容
由于相关技术中的数据采集方法存在工作量大,不利于项目快速部署与实施的问题。如果可以减少工作量,将大大提高效率,利于项目快速部署与实施。
为了解决上述问题,本申请提供了一种临床医疗数据采集方法,应用于部署在医院内网的中间服务器,所述方法包括:
根据医院内网中各个数据源的数量,创建对应数量的数据传输线程;
接收第三方服务器发出的采集数据请求;
根据所述采集数据请求,通过预先配置的所述中间服务器与所述各个数据源之间的连接,利用所述数据传输线程从所述各个数据源中获取患者的基本信息和所有检查信息;
利用所述各个数据传输线程,采用MPI算法对患者的基本信息和所有检查信息进行解析,得到文本数据和文件数据;
将所述文本数据和所述文件数据分别上传给所述第三方服务器。
优选地,所述方法还包括:根据所述各个数据源的信息,利用所述中间服务器提供的JABC,配置所述中间服务器与所述各个数据源之间的连接。
优选地,利用所述各个数据传输线程,采用MPI算法对所述基本信息和所述检查信息进行解析,得到文本数据和文件数据,包括:
根据所述各个数据源的信息,配置与所述各个数据源对应的配置信息;
根据所述数据采集请求中的患者基本信息和所述配置信息,遍历所述各个数据传输线程传输的患者的基本信息和所有检查信息;
根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的基本信息,判断所述中间服务器的数据库中是否存在患者的标识,如果不存在所述标识,则根据所述基本信息创建新标识;
根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息,得到文本数据和文件数据。
优选地,根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息,得到文本数据和文件数据,包括:
对所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息中的文本信息进行解析,得到所述各个数据传输线程对应的单文本数据,将所有所述单文本数据汇总关联到所述中间服务器的数据库中相应的患者的标识中,得到文本数据;
对所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息中的文件信息进行解析,得到所述各个数据传输线程对应的单文件数据,将所有所述单文件数据单独进行汇总,得到文件数据。
优选地,所述将所述文本数据和文件数据分别上传给第三方服务器,包括:
针对所述文本数据,创建对外文本传输线程;
通过所述对外文本传输线程,将所述文本数据上传给所述第三方服务器;
针对所述文件数据,创建对外文件传输线程和对外分片文件传输线程;
通过所述对外文件传输线程和所述对外分片文件传输线程,将所述文件数据持续上传给所述第三方服务器。
优选地,所述文件数据储存于文件待上传列表中;所述方法还包括:
通过所述中间服务器的后台线程检测所述文件待上传列表中是否存在文件数据;若所述文件待上传列表中存在文件数据,读取所述文件数据,并判断所述文件数据中各文件的大小;
通过所述对外文件传输线程和所述对外分片文件传输线程,将所述文件数据持续上传给所述第三方服务器,包括:
若所述文件的大小小于或等于预设阈值,通过中间服务器创建的对外文件传输线程,将所述文件数据上传给所述第三方服务器;
若所述文件的大小大于所述预设阈值,获取所述文件的总大小,并对所述文件切片,得到至少两个分片单元,每个分片单元的大小小于或等于所述预设阈值;
标记每一个分片单元的索引,并将所述文件的总大小标记到每一个分片单元中;
根据所述分片单元的总数,创建相应数量的多个对外分片文件传输线程;
通过所述多个对外分片文件传输线程,将已标记索引和所述总文件大小的多个分片单元持续上传给所述第三方服务器。
本申请还提供了一种临床医疗数据采集装置,应用于部署在医院内网的中间服务器,所述装置包括:
第一创建线程模块,用于根据医院内网中各个数据源的数量,创建对应数量的数据传输线程;
接收请求模块,用于接收第三方服务器发出的采集数据请求;
获取信息模块,用于根据所述采集数据请求,通过预先配置的所述中间服务器与所述各个数据源之间的连接,利用所述数据传输线程从所述各个数据源中获取患者的基本信息和所有检查信息;
解析模块,用于利用所述各个数据传输线程,采用MPI算法对患者的基本信息和所有检查信息进行解析,得到文本数据和文件数据;
上传模块,用于将所述文本数据和所述文件数据分别上传给所述第三方服务器。
优选地,还包括:第一配置模块,用于根据所述各个数据源的信息,利用所述中间服务器提供的JABC,配置所述中间服务器与所述各个数据源之间的连接。
优选地,所述解析模块,包括:
第二配置子模块,用于根据所述各个数据源的信息,配置与所述各个数据源对应的配置信息;
遍历子模块,用于根据所述数据采集请求中的患者基本信息和所述配置信息,遍历所述各个数据传输线程传输的患者的基本信息和所有检查信息;
第一判断子模块,用于根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的基本信息,判断所述中间服务器的数据库中是否存在患者的标识,如果不存在所述标识,则根据所述基本信息创建新标识;
解析子模块,用于根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息,得到文本数据和文件数据。
优选地,所述解析子模块,包括:
第一解析子模块,用于对所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息进行解析,得到所述各个数据传输线程对应的单文本数据,将所有所述单文本数据汇总关联到所述中间服务器的数据库中相应的患者的标识中,得到文本数据;
第二解析子模块,用于对所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息中的文件信息进行解析,得到所述各个数据传输线程对应的单文件数据,将所有所述单文件数据单独进行汇总,得到文件数据。
优选地,所述上传模块,包括:
第二创建线程子模块,用于针对所述文本数据,创建对外文本传输线程;
第一上传子模块,用于通过所述对外文本传输线程,将所述文本数据上传给所述第三方服务器;
第三创建线程子模块,用于针对所述文件数据,创建对外文件传输线程和对外分片文件传输线程;
第二上传子模块,用于通过所述对外文件传输线程和所述对外分片文件传输线程,将所述文件数据持续上传给所述第三方服务器。
优选地,所述文件数据储存于文件待上传列表中,所述装置还包括:
第二判断子模块,用于通过所述中间服务器的后台线程检测所述文件待上传列表中是否存在文件数据;若所述文件待上传列表中存在文件数据,读取所述文件数据,并判断所述文件数据中各文件的大小;
所述第二上传子模块,包括:
第三上传子模块,用于若所述文件的大小小于或等于预设阈值,通过中间服务器创建的对外文件传输线程,将所述文件数据上传给所述第三方服务器;
切片子模块,用于若所述文件的大小大于所述预设阈值,获取所述文件的总大小,并对所述文件切片,得到至少两个分片单元,每个分片单元的大小小于或等于所述预设阈值;
标记子模块,用于标记每一个分片单元的索引,并将所述文件的总大小标记到每一个分片单元中;
第四创建线程子模块,用于根据所述分片单元的总数,创建相应数量的多个对外分片文件传输线程;
第四上传子模块,用于通过所述多个对外分片文件传输线程,将已标记索引和所述总文件大小的多个分片单元持续上传给所述第三方服务器。
本申请还提供了一种计算机可读介质,其上存储有计算机程序,该程序被处理器执行时实现如上述方法中的任一步骤。
本申请还提供了一种电子设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,所述处理器执行时实现如上述方法中的任一步骤。
本申请实施例公开的临床医疗数据采集方法,通过根据医院内网中各个数据源的数量,创建对应数量的数据传输线程;根据第三方服务器发出的采集数据请求,利用数据传输线程从所述各个数据源中获取患者的基本信息和所有检查信息;采用MPI算法对患者的基本信息和所有检查信息进行解析,得到文本数据和文件数据;将所述文本数据和所述文件数据分别上传给所述第三方服务器,解决了相关技术中数据采集工作量大,不利于高并发、快速的、高效等采集数据的问题,利于项目快速部署与实施。本实施例公开的临床医疗数据采集方法,基于配置方式实现对医院信息系统异构数据源进行多维度信息集成,可以保持多个异构数据源的持续连接;同时,对于诊断级医学图像、数字病理切片等大容量数字医学影像文件数据采用分片上传的方式实现数据集成,具备高并发、速度快等特点。
其中,通过本申请的方法,可以实现项目快速部署与实施,即通过本发明的配置信息和数据传输线程可以实现直接从医院内网的数据源中获取患者信息并传给第三方服务器,而不用与医院对接、临时开发新系统以及大量接口来解决数据的获取与传输。
另外,基于配置方式实现对医院信息系统异构数据源进行多维度信息集成,是指通过本发明的方法,集成医院信息系统的各种异构数据源。
本方法采用上述技术方案,与现有传统接口开发方式相比,具有如下优点:第一、针对不同的医院内外网数据传输特点,通过特有的配置方式(即通过本发明的配置信息和数据传输线程,获取医院内网中各个数据源中的患者的所有信息)生成和提供不同的数据集成解决方案,实现医院专网内临床医疗数据自动上传;第二、所述提供不同的数据集成,是指通过本发明的方法,不仅可以对不同类型的数据源中的数据进行集成,还可以适用于不同类型数据源的各种接口,通过医院内网提供的各个数据源的各种接口,获取各个数据源中的数据,即通过本发明的方法可以适用于医院内网中各个数据源提供的各种获取患者所有信息的接口,而不需要经过该代码等操作,具备多种数据交互模式,包括视图、接口等,将院内患者信息分解成(模板-数据元)模型,针对具体情况灵活配置;第三、针对影像文件等数据,具备多线程上传数据功能;第四、本发明的方法,可以实现跨平台(Windows/Linux)运行,并大大减少了项目开发量及成本。
附图说明
为了更清楚地说明本申请实施例的技术方案,下面将对实施例或相关技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本申请的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动性的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1是本申请根据一实施例示出的临床医疗数据采集方法流程图。
图2是本申请根据一实施例示出的临床医疗数据采集装置的示意图。
图3是本申请根据一实施例示出的临床医疗数据采集方法应用环境。
具体实施方式
下面将结合本申请实施例中的附图,对本申请实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例是本申请一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本申请中的实施例,本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本申请保护的范围。
本发明涉及医院内外网之间临床医疗信息的采集方法,目的是提供一种通过配置放射实现与医院专网内医疗信息系统(医院内网)(HIS、LIS、PACS、PIS、心电、超声等)的数据集成方法,实现数据交互,减少程序接口开发工作。
本实施例第一方面提供一种临床医疗数据采集方法,如图3所示,该方法应用于部署在医院内网的中间服务器,用于连接外网环境的外网服务器(第三方服务器)与内网环境中的医院专网医疗信息系统的各个院内数据源,实现减少工作量,将大大提高效率,利于项目快速部署与实施的目的。
本实施例第一方面提供一种临床医疗数据采集方法,如图1所示,该方法包括:
第一步:配置连接和配置信息,创建数据传输线程。
1.1根据医院内网提供的数据源信息(包括:服务地址、账户信息、数据格式以及字段映射等),选择与医院专网医疗信息系统对应的JDBC(Java数据库连接驱动),通过中间服务器提供的JABC配置中间服务器与医院内网各个数据源之间的连接,实现通过中间服务器提供的JABC连接医院内网中的各个数据源,获取所述各个数据源中患者的所有信息(基本信息和所有检查信息);
其中,所述数据传输线程的作用是,从医院专网内医疗信息系统的数据源中,获取并存储患者的基本信息和所有检查信息,然后在数据传输线程中,采用MPI算法对存储的基本信息和所有检查信息进行解析,得到文本数据和文件数据的字段信息。一个数据传输线程对应一个数据源,实现多线程获取数据的目的。
1.2同时根据所述数据源信息配置与各数据源对应的中间服务器的配置信息(即字段映射,包括患者的基本信息字段、检验检查目录信息字段等);
其中,所述配置信息是指,中间服务器根据医院内网的各个数据源中的患者的所有信息,预先配置(录置)的字段映射信息,存储于中间服务器中,每一个字段映射与医院内网中的各个数据源中患者的所有信息的对应信息相对应,实现一一循环映射的过滤过程。
1.3同时根据所述数据源信息的数量,创建对应数量的数据传输线程(数据传输线程与医院内网的数据源连接,并从个数据源中获取患者信息);
第二步:接收第三方服务器发出的采集患者数据的请求;根据所述采集数据请求,通过预先配置的所述中间服务器与所述各个数据源之间的连接,利用所述数据传输线程从所述各个数据源中获取患者的基本信息和所有检查信息;
第三步:采用MPI算法对各个数据传输线程中患者的基本信息和所有检查信息进行解析,得到文本数据和文件数据;
3.1根据所述数据采集请求中的患者基本信息和所述配置信息,遍历所述各个数据传输线程中患者的基本信息和所有检查信息;
3.2根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的基本信息,判断中间服务器的数据库中是否存在患者的标识。如果存在所述标识,则执行步骤3.3;如果不存在所述标识,则根据所述基本信息创建新标识,再执行步骤3.3。
3.3根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息,得到文本数据和文件数据;
3.3.1对所述各个数据传输线程传输的患者标识对应患者的所有检查信息中的文本信息进行解析,得到各个数据传输线程对应的单文本数据,将所有所述单文本数据汇总关联到所述中间服务器的数据库中相应的患者的标识中,得到文本数据(该文本数据可通过患者的标识对患者的信息进行识别和判断该患者是否为第三方服务器数据采集请求的患者);
3.3.2对所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息中的文件信息进行解析,得到各个数据传输线程对应的单文件数据,将所有所述单文件数据单独进行汇总,得到文件数据,并将所述文件数据储存于文件待上传列表中。
第四步:将所述文本数据和所述文件数据分别上传给所述第三方服务器。
4.1针对所述文本数据,通过中间服务器创建对外文本传输线程;通过所述对外文本传输线程,将所述文本数据直接上传给所述第三方服务器;
4.2针对所述文件数据,所述文件数据储存于文件待上传列表中;创建对外文件传输线程和对外分片文件传输线程;通过对外文件传输线程和对外分片文件传输线程将所述文件数据上传给第三方服务器;
4.2.1通过中间服务器的后台线程检测文件待上传列表中是否存在文件数据。若所述文件待上传列表中存在文件数据,读取所述文件数据,以预设阈值(如100MB)为判断依据,判断所述文件数据中文件的大小;
4.2.1.1若所述文件大小小于或等于预设阈值,通过中间服务器创建的对外文件传输线程,将所述文件数据上传给第三方服务器
4.2.1.2若所述文件大小大于预设阈值,获取所述文件总大小,并对所述文件切片,得到至少两个分片单元,每个分片单元的大小小于或等于所述预设阈值;其中,所述切片为:将文件以100MB为单元进行切分,不足100MB为一单元;
4.2.1.3标记每一个分片单元的索引,并将所述文件总大小标记到每一个分片单元中;
4.2.1.4根据所述分片单元的总数,创建相应数量的多个对外分片文件传输线程;通过多个对外分片文件传输线程,将已标记索引和所述总文件大小的多个分片单元持续上传给第三方服务器;
其中,一个分片单元由一个对外分片文件传输线程传给第三方服务器;第三方服务器接收到多个分片单元后,可以根据每个分片单元的索引将所有分片单元进行组合,还原被切片的所述文件,得到还原文件,并可以根据标记的文件总大小与已还原文件的大小进行匹配,判断还原文件是否完整。
其中,文本数据包括:患者的姓名、性别、家庭住址、检查名称、检查类别、正常值范围等,类似于体检单上记载的数据;文件数据包括:影像数据、病理切片等大数据。
本实施例第二方面提供一种临床医疗数据采集方法,下面以第三方获取患者a的临床医疗数据为例,对本发明的方法进行进一步解释。
步骤一、结合上述第一步的内容进行描述。信息科开放中间服务器运行端口,同时提供医院内网中的各个数据源(包括文件储存地址)的服务地址、账户信息、数据格式以及字段映射等数据源信息,其中每个数据源对应一个数据源类别,类别数为数据源个数相同;中间服务器的运维人员根据信息科提供的各个数据源信息,通过JDBC将各个数据传输线程与各个数据源连接,同时根据数据源信息整理部署各数据源的配置信息(即字段映射,包括患者的基本信息字段、检验检查目录信息字段)并上传至医院内网的中间服务器。
步骤二、第三方应用系统请求中间服务器的接口,通过该接口向中间服务器提出采集患者a的数据信息的请求;中间服务器根据请求中所携带的患者a的基本信息(包括:患者a的姓名、性别、年龄、出生年月、住址等);通过预先配置的连接,从信息科开通的端口,访问医院专网医疗信息系统对应的数据源,从各个数据源中获取患者a的基本信息和所有检查信息(包括检验检查目录信息),并将获取的各个数据源中的患者a的基本信息和所有检查信息,储存于与各个数据源对应的各自数据传输线程中;其中,也可以根据获取到的目录信息的分类数量,创建对应数量的数据传输线程,因为该分类数量与医院专网医疗信息系统中的数据源数量相同。
步骤三、与上述第三步内容相似,并作出如下进一步解释:
其中,所述标识对应一个存储列表,用于存储患者a的对应的基本信息和所有检查信息;所述解析是指:解析成中间服务器的对应字段信息;
所述自定义的MPI算法具体步骤为:
通过患者姓名、性别、出生年月、地址等信息进行索引匹配,加权公式表达为:Sim(Xi,Yj)=∑kakSim(Xik,Yjk)其中Sim(Xi,Yj)是身份记Xi,Yj的相似程度;Sim(Xik,Yjk)指两条患者身份记录Xi,Yj中的第K个信息项的相似程度,相同返回1,不同返回0;ak是第K个信息项的权重,这项数值可以根据情况具体调整,但其累计值为1,即Ekak=1。因此=∑kakSim(Xik,Yjk)是累加的相似度,其取值范围在0~1之间。本系统的不同信息的权值可以动态根据需求进行调整。
通过上述步骤3.3.1得到一个数据传输线程中解析到的患者a的文本数据后,对文本数据进行储存,得到文本传输包,再将文本传输包生成字符串a,然后将各个数据传输线程中患者a的文本数据都关联到该字符串中得到新的字符串b。然后通过对外传输线程将新的字符串b上传给第三方服务器。
上述步骤3.3.2中,还可以包括:将患者所有检查数据通过配置信息进行解析得到文本数据,同时将没有配置成功的数据(即文件信息)进行过滤,得到文件数据;其中,解析得到的是字段信息。然后将每个数据传输线程中的字段信息对应文件类型的数据(即文件信息)单独进行汇总并存储在文件待上传列表中,得到文件传输包,在文件待上传列表中,将文件传输包生成新字符串c;再将每个数据传输线程中解析好的文件数据与文件数据对应的数据类型进行组合,加载至在文件待上传列表中的新字符串c中。
步骤四、与上述第四步相似,其中,针对较大文件数据作进一步解释,以影像文件为例,步骤还可以如下:
读取影像检查文件待上传列表;通过第一步配置的配置的院内医疗信息系统文件储存地址(该文件储存地址属于医院内网医疗信息系统中各个数据源)获取影像文件;对较大的文件,进行分片;获取文件总大小信息;将文件以100MB为单元进行切分,不足100MB为一单元;标记每一个分片的索引,以及源文件的总大小;创建对应文件数量的传输线程;持续上传文件。
本实施例公开的临床医疗数据采集方法,基于配置方式实现对医院信息系统异构数据源进行多维度信息集成,可以保持多个异构数据源的持续连接;同时,对于诊断级医学图像、数字病理切片等大容量数字医学影像文件数据采用分片上传的方式实现数据集成,具备高并发、速度快等特点。
本方法采用上述技术方案,与现有传统接口开发方式相比,具有如下优点:针对不同的医院内外网数据传输特点,通过特有的配置方式生成和提供不同的数据集成解决方案,实现医院专网内临床医疗数据自动上传;具备多种数据交互模式,包括视图、接口等,将院内患者信息分解成(模板-数据元)模型,针对具体情况灵活配置;针对影像文件等数据,具备多线程上传数据功能;跨平台(Windows/Linux)运行;大大减少了项目开发量及成本。
本申请实施例第三方面提供了一种临床医疗数据采集装置,如图2所示,所述装置包括:
第一创建线程模块,用于根据医院内网中各个数据源的数量,创建对应数量的数据传输线程;
接收请求模块,用于接收第三方服务器发出的采集数据请求;
获取信息模块,用于根据所述采集数据请求,通过预先配置的所述中间服务器与所述各个数据源之间的连接,利用所述数据传输线程从所述各个数据源中获取患者的基本信息和所有检查信息;
解析模块,用于利用所述各个数据传输线程,采用MPI算法对患者的基本信息和所有检查信息进行解析,得到文本数据和文件数据;
上传模块,用于将所述文本数据和所述文件数据分别上传给所述第三方服务器。
优选地,所述装置还包括:第一配置模块,用于根据所述各个数据源的信息,利用所述中间服务器提供的JABC,配置所述中间服务器与所述各个数据源之间的连接。
优选地,所述解析模块,包括:
第二配置子模块,用于根据所述各个数据源的信息,配置与所述各个数据源对应的配置信息;
遍历子模块,用于根据所述数据采集请求中的患者基本信息和所述配置信息,遍历所述各个数据传输线程传输的患者的基本信息和所有检查信息;
第一判断子模块,用于根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的基本信息,判断所述中间服务器的数据库中是否存在患者的标识,如果不存在所述标识,则根据所述基本信息创建新标识;
解析子模块,用于根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息,得到文本数据和文件数据。
优选地,所述解析子模块,包括:
第一解析子模块,用于对所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息进行解析,得到所述各个数据传输线程对应的单文本数据,将所有所述单文本数据汇总关联到所述中间服务器的数据库中相应的患者的标识中,得到文本数据;
第二解析子模块,用于对所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息中的文件信息进行解析,得到所述各个数据传输线程对应的单文件数据,将所有所述单文件数据单独进行汇总,得到文件数据。
优选地,所述上传模块,包括:
第二创建线程子模块,用于针对所述文本数据,创建对外文本传输线程;
第一上传子模块,用于通过所述对外文本传输线程,将所述文本数据上传给所述第三方服务器;
第三创建线程子模块,用于针对所述文件数据,创建对外文件传输线程和对外分片文件传输线程;
第二上传子模块,用于通过所述对外文件传输线程和所述对外分片文件传输线程,将所述文件数据持续上传给所述第三方服务器。
优选地,所述文件数据储存于文件待上传列表中,所述装置还包括:
第二判断模块,用于通过所述中间服务器的后台线程检测所述文件待上传列表中是否存在文件数据;若所述文件待上传列表中存在文件数据,读取所述文件数据,并判断所述文件数据中各文件的大小;
所述第二上传子模块,包括:
第三上传子模块,用于若所述文件的大小小于或等于预设阈值,通过中间服务器创建的对外文件传输线程,将所述文件数据上传给所述第三方服务器;
切片子模块,用于若所述文件的大小大于所述预设阈值,获取所述文件的总大小,并对所述文件切片,得到至少两个分片单元,每个分片单元的大小小于或等于所述预设阈值;
标记子模块,用于标记每一个分片单元的索引,并将所述文件的总大小标记到每一个分片单元中;
第四创建线程子模块,用于根据所述分片单元的总数,创建相应数量的多个对外分片文件传输线程;
第四上传子模块,用于通过所述多个对外分片文件传输线程,将已标记索引和所述总文件大小的多个分片单元持续上传给所述第三方服务器。
本申请实施例第三方面提供一种计算机可读介质,其上存储有计算机程序,该程序被处理器执行时实现如本申请第一方面所述方法中的步骤。
本申请实施例第四方面提供一种电子设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,所述处理器执行时实现如本申请第一方面所述方法中的步骤。
对于装置实施例而言,由于其与方法实施例基本相似,所以描述的比较简单,相关之处参见方法实施例的部分说明即可。
本说明书中的各个实施例均采用递进的方式描述,每个实施例重点说明的都是与其他实施例的不同之处,各个实施例之间相同相似的部分互相参见即可。
本领域内的技术人员应明白,本发明实施例的实施例可提供为方法、装置、或计算机程序产品。因此,本发明实施例可采用完全硬件实施例、完全软件实施例、或结合软件和硬件方面的实施例的形式。而且,本发明实施例可采用在一个或多个其中包含有计算机可用程序代码的计算机可用存储介质(包括但不限于磁盘存储器、CD-ROM、光学存储器等)上实施的计算机程序产品的形式。
本发明实施例是参照根据本发明实施例的方法、终端设备(系统)、和计算机程序产品的流程图和/或方框图来描述的。应理解可由计算机程序指令实现流程图和/或方框图中的每一流程和/或方框、以及流程图和/或方框图中的流程和/或方框的结合。可提供这些计算机程序指令到通用计算机、专用计算机、嵌入式处理机或其他可编程数据处理终端设备的处理器以产生一个机器,使得通过计算机或其他可编程数据处理终端设备的处理器执行的指令产生用于实现在流程图一个流程或多个流程和/或方框图一个方框或多个方框中指定的功能的装置。
这些计算机程序指令也可存储在能引导计算机或其他可编程数据处理终端设备以特定方式工作的计算机可读存储器中,使得存储在该计算机可读存储器中的指令产生包括指令装置的制造品,该指令装置实现在流程图一个流程或多个流程和/或方框图一个方框或多个方框中指定的功能。
这些计算机程序指令也可装载到计算机或其他可编程数据处理终端设备上,使得在计算机或其他可编程终端设备上执行一系列操作步骤以产生计算机实现的处理,从而在计算机或其他可编程终端设备上执行的指令提供用于实现在流程图一个流程或多个流程和/或方框图一个方框或多个方框中指定的功能的步骤。
尽管已描述了本发明实施例的优选实施例,但本领域内的技术人员一旦得知了基本创造性概念,则可对这些实施例做出另外的变更和修改。所以,所附权利要求意欲解释为包括优选实施例以及落入本发明实施例范围的所有变更和修改。
最后,还需要说明的是,在本文中,诸如第一和第二等之类的关系术语仅仅用来将一个实体或者操作与另一个实体或操作区分开来,而不一定要求或者暗示这些实体或操作之间存在任何这种实际的关系或者顺序。而且,术语“包括”、“包含”或者其任何其他变体意在涵盖非排他性的包含,从而使得包括一系列要素的过程、方法、物品或者终端设备不仅包括那些要素,而且还包括没有明确列出的其他要素,或者是还包括为这种过程、方法、物品或者终端设备所固有的要素。在没有更多限制的情况下,由语句“包括一个……”限定的要素,并不排除在包括所述要素的过程、方法、物品或者终端设备中还存在另外的相同要素。
以上对本发明所提供的一种基于临床医疗数据采集方法、装置、设备及介质,进行了详细介绍,本文中应用了具体个例对本发明的原理及实施方式进行了阐述,以上实施例的说明只是用于帮助理解本发明的方法及其核心思想;同时,对于本领域的一般技术人员,依据本发明的思想,在具体实施方式及应用范围上均会有改变之处,综上所述,本说明书内容不应理解为对本发明的限制。
Claims (14)
1.一种临床医疗数据采集方法,其特征在于,应用于部署在医院内网的中间服务器,所述方法包括:
根据医院内网中各个数据源的数量,创建对应数量的数据传输线程;
接收第三方服务器发出的采集数据请求;
根据所述采集数据请求,通过预先配置的所述中间服务器与所述各个数据源之间的连接,利用所述数据传输线程从所述各个数据源中获取患者的基本信息和所有检查信息;
利用所述各个数据传输线程,采用MPI算法对患者的基本信息和所有检查信息进行解析,得到文本数据和文件数据;
将所述文本数据和所述文件数据分别上传给所述第三方服务器。
2.根据权利要求1所述的临床医疗数据采集方法,其特征在于,所述方法还包括:
根据所述各个数据源的信息,利用所述中间服务器提供的JABC,配置所述中间服务器与所述各个数据源之间的连接。
3.根据权利要求1所述的临床医疗数据采集方法,其特征在于,利用所述各个数据传输线程,采用MPI算法对所述基本信息和所述检查信息进行解析,得到文本数据和文件数据,包括:
根据所述各个数据源的信息,配置与所述各个数据源对应的配置信息;
根据所述数据采集请求中的患者基本信息和所述配置信息,遍历所述各个数据传输线程传输的患者的基本信息和所有检查信息;
根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的基本信息,判断所述中间服务器的数据库中是否存在患者的标识,如果不存在所述标识,则根据所述基本信息创建新标识;
根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息,得到文本数据和文件数据。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息,得到文本数据和文件数据,包括:
对所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息中的文本信息进行解析,得到所述各个数据传输线程对应的单文本数据,将所有所述单文本数据汇总关联到所述中间服务器的数据库中相应的患者的标识中,得到文本数据;
对所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息中的文件信息进行解析,得到所述各个数据传输线程对应的单文件数据,将所有所述单文件数据单独进行汇总,得到文件数据。
5.根据权利要求1所述的临床医疗数据采集方法,其特征在于,所述将所述文本数据和文件数据分别上传给第三方服务器,包括:
针对所述文本数据,创建对外文本传输线程;
通过所述对外文本传输线程,将所述文本数据上传给所述第三方服务器;
针对所述文件数据,创建对外文件传输线程和对外分片文件传输线程;
通过所述对外文件传输线程和所述对外分片文件传输线程,将所述文件数据持续上传给所述第三方服务器。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述文件数据储存于文件待上传列表中;所述方法还包括:
通过所述中间服务器的后台线程检测所述文件待上传列表中是否存在文件数据;若所述文件待上传列表中存在文件数据,读取所述文件数据,并判断所述文件数据中各文件的大小;
通过所述对外文件传输线程和所述对外分片文件传输线程,将所述文件数据持续上传给所述第三方服务器,包括:
若所述文件的大小小于或等于预设阈值,通过中间服务器创建的对外文件传输线程,将所述文件数据上传给所述第三方服务器;
若所述文件的大小大于所述预设阈值,获取所述文件的总大小,并对所述文件切片,得到至少两个分片单元,每个分片单元的大小小于或等于所述预设阈值;
标记每一个分片单元的索引,并将所述文件的总大小标记到每一个分片单元中;
根据所述分片单元的总数,创建相应数量的多个对外分片文件传输线程;
通过所述多个对外分片文件传输线程,将已标记索引和所述总文件大小的多个分片单元持续上传给所述第三方服务器。
7.一种临床医疗数据采集装置,其特征在于,应用于部署在医院内网的中间服务器,所述装置包括:
第一创建线程模块,用于根据医院内网中各个数据源的数量,创建对应数量的数据传输线程;
接收请求模块,用于接收第三方服务器发出的采集数据请求;
获取信息模块,用于根据所述采集数据请求,通过预先配置的所述中间服务器与所述各个数据源之间的连接,利用所述数据传输线程从所述各个数据源中获取患者的基本信息和所有检查信息;
解析模块,用于利用所述各个数据传输线程,采用MPI算法对患者的基本信息和所有检查信息进行解析,得到文本数据和文件数据;
上传模块,用于将所述文本数据和所述文件数据分别上传给所述第三方服务器。
8.根据权利要求7所述的装置,其特征在于,还包括:
第一配置模块,用于根据所述各个数据源的信息,利用所述中间服务器提供的JABC,配置所述中间服务器与所述各个数据源之间的连接。
9.根据权利要求7所述的装置,其特征在于,所述解析模块,包括:
第二配置子模块,用于根据所述各个数据源的信息,配置与所述各个数据源对应的配置信息;
遍历子模块,用于根据所述数据采集请求中的患者基本信息和所述配置信息,遍历所述各个数据传输线程传输的患者的基本信息和所有检查信息;
第一判断子模块,用于根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的基本信息,判断所述中间服务器的数据库中是否存在患者的标识,如果不存在所述标识,则根据所述基本信息创建新标识;
解析子模块,用于根据所述配置信息和MPI算法解析所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息,得到文本数据和文件数据。
10.根据权利要求9所述的方法装置,其特征在于,所述解析子模块,包括:
第一解析子模块,用于对所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息中的文本信息进行解析,得到所述各个数据传输线程对应的单文本数据,将所有所述单文本数据汇总关联到所述中间服务器的数据库中相应的患者的标识中,得到文本数据;
第二解析子模块,用于对所述各个数据传输线程传输的患者的所有检查信息中的文件信息进行解析,得到所述各个数据传输线程对应的单文件数据,将所有所述单文件数据单独进行汇总,得到文件数据。
11.根据权利要求7所述的装置,其特征在于,所述上传模块,包括:
第二创建线程子模块,用于针对所述文本数据,创建对外文本传输线程;
第一上传子模块,用于通过所述对外文本传输线程,将所述文本数据上传给所述第三方服务器;
第三创建线程子模块,用于针对所述文件数据,创建对外文件传输线程和对外分片文件传输线程;
第二上传子模块,用于通过所述对外文件传输线程和所述对外分片文件传输线程,将所述文件数据持续上传给所述第三方服务器。
12.根据权利要求11所述的装置,其特征在于,所述文件数据储存于文件待上传列表中,所述装置还包括:
第二判断模块,用于通过所述中间服务器的后台线程检测所述文件待上传列表中是否存在文件数据;若所述文件待上传列表中存在文件数据,读取所述文件数据,并判断所述文件数据中各文件的大小;
所述第二上传子模块包括:
第三上传子模块,用于若所述文件的大小小于或等于预设阈值,通过中间服务器创建的对外文件传输线程,将所述文件数据上传给所述第三方服务器;
切片子模块,用于若所述文件的大小大于所述预设阈值,获取所述文件的总大小,并对所述文件切片,得到至少两个分片单元,每个分片单元的大小小于或等于所述预设阈值;
标记子模块,用于标记每一个分片单元的索引,并将所述文件的总大小标记到每一个分片单元中;
第四创建线程子模块,用于根据所述分片单元的总数,创建相应数量的多个对外分片文件传输线程;
第四上传子模块,用于通过所述多个对外分片文件传输线程,将已标记索引和所述总文件大小的多个分片单元持续上传给所述第三方服务器。
13.一种计算机可读介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,该程序被处理器执行时实现如权利要求1-6任一所述的方法中的步骤。
14.一种电子设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行时实现如权利要求1-6任一所述的方法的步骤。
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