CN110711202A - Phb2基因或蛋白的抑制剂在制备抗猪圆环病毒2型药物中的应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种PHB2基因或蛋白的抑制剂在制备抗猪圆环病毒2型药物中的应用。本发明的PHB2基因或蛋白的抑制剂在制备抗猪圆环病毒2型药物中的应用,通过间接免疫荧光试验检测PCV2在PK‑15细胞中的增殖变化,检测PCV2感染PK‑15细胞后PHB2 mRNA的动态变化,和鉴定在PHB2基因或蛋白的抑制剂转染PK‑15细胞中PCV2 Cap蛋白表达。结果表明,PHB2在正常及PCV2感染的PK‑15细胞中均有效表达。PCV2可显著影响PK‑15细胞中PHB2转录,而且PHB2对PCV2病毒复制具有调节作用,下调PHB2的表达,即PHB2基因敲除或蛋白表达下调,能明显抑制PCV2复制,对阐明PCV2致病机理和研究新的抗病毒药物具有重要意义。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域,特别地,涉及一种PHB2基因或蛋白的抑制剂在制备抗猪圆环病毒2型药物中的应用。
背景技术
猪圆环病毒(porcine circovirus,PCV)属于圆环病毒科圆环病毒属,是无囊膜的环状单链DNA病毒(直径17nm)。目前在猪群中已鉴定出PCV1、PCV2和PCV3。其中,PCV2临床或亚临床感染被认为是猪圆环病毒病(porcine circovirus diseases and porcinecircovirus-associated diseases,PCVD/PCVAD)的主要原因,PCVD/PCVAD传染性强、流行范围广,不同猪(群或场)的PCVAD发病率和严重程度存在差异,该疾病日趋复杂,其代表性特征主要是猪皮炎和肾病综合征(Porcine dermatitis and nephropathy syndrome,PDNS)、断奶仔猪多系统衰竭综合征(Post-weaningmultisystemic wasting syndrome,PMWS)以及猪呼吸系统疾病综合征(Porcine respiratory disease complex,PRDC),还可引起繁殖障碍等,严重危害全球养殖业。PCV2Cap蛋白(Capsidprotein)是PCV2唯一的核衣壳蛋白,也是主要免疫原性蛋白,基于PCV2Cap蛋白组装的病毒样颗粒(Virus-likeparticles,VLPs)亚单位疫苗可应用于猪场PCV2的预防。
迄今为止,PCVD/PCVAD的确切机制还有待阐明,加上临床上PCV2基因组的高突变率和混合感染问题日益严重,使防控PCV2流行面临严峻挑战。Shuang等在研究泛素-蛋白酶体系统(UPS)与PCV2复制的互作时发现,其蛋白酶体抑制剂(MG132和lactacystin)显著降低PCV2早期复制滴度,UPS可能以细胞周期依赖的方式降低病毒蛋白表达和RNA转录,表明PCV2复制效率与UPS密切相关。Liu等利用Hsp 90抑制剂(17-AAG)腹腔注射小鼠后发现,17-AAG能够显著降低血液和组织中PCV2病毒载量,可降低PCV2感染小鼠血液和组织中的病毒载量,表明Hsp 90与PCV2复制密切相关。Wang等研究发现波形蛋白(Vimentin)可以与PCV2Cap蛋白之间的相互作用,并对PCV2在PK-15细胞中的复制有一定的抑制作用。目前PCV2感染与宿主细胞之间的相互作用网络还不是十分清楚,而PCV2与宿主细胞内蛋白分子互作的研究报道相对较少。
抗增殖蛋白(prohibitins,PHBs)是一种高度保守和结构非常稳定的蛋白质家族(包括PHB1和PHB2等),PHBs广泛分布于各种生物细胞,呈现不同细胞定位,主要存在于线粒体内膜,也少量分布于细胞质膜和细胞核。PHBs是细胞中重要的多功能蛋白,直接参与调控细胞增殖、凋亡和分化等多种细胞生物学进程,与肿瘤、糖尿病和肥胖症等疾病密切相关。而PHB2是PHBs家族中的重要成员,是线粒体与细胞核间相互交流的重要媒介。
发明内容
本发明提供了一种PHB2基因或蛋白的抑制剂在制备抗猪圆环病毒2型药物中的应用,解决如何抑制猪圆环病毒2型的复制的技术问题。
本发明采用的技术方案如下:
一种PHB2基因或蛋白的抑制剂在制备抗猪圆环病毒2型药物中的应用。
进一步地,抑制剂选择以能够抑制PHB2蛋白表达或基因转录的小干扰RNA(siRNA)、双链RNA(dsRNA)、短发夹RNA(shRNA)或反义寡核苷酸;或能表达或形成siRNA、dsRNA、shRNA或反义寡核苷酸的构建物。
进一步地,siRNA包括PHB2siRNA-1或PHB2siRNA-2;PHB2siRNA-1的靶序列如SEQID NO:1所示,或者,PHB2siRNA-2的靶序列如SEQ ID NO:2所示。
进一步地,shRNA的编码序列正义链如SEQ ID NO:3所示,反义链如SEQ ID NO:4所示。
根据本发明的另一方面,还提供了一种抑制猪圆环病毒2型的siRNA的靶序列,siRNA包括PHB2siRNA-1或PHB2siRNA-2;PHB2siRNA-1的靶序列如SEQ ID NO:1所示,或者,PHB2siRNA-2的靶序列如SEQ ID NO:2所示。
根据本发明的另一方面,还提供了一种抑制猪圆环病毒2型的shRNA分子,shRNA分子的编码序列正义链如SEQ ID NO:3所示,反义链如SEQ ID NO:4所示。
根据本发明的另一方面,还提供了一种含有上述抑制猪圆环病毒2型的shRNA分子的shRNA表达质粒。
根据本发明的另一方面,还提供了一种药物组合物,包括上述siRNA的靶序列、shRNA分子、shRNA表达质粒中的一种,还包含药学可接受的载体和/或赋形剂。
根据本发明的另一方面,还提供了一种用于抑制猪圆环病毒2型复制的试剂盒,包括上述siRNA的靶序列、上述shRNA分子、上述shRNA表达质粒中的一种。
本发明具有以下有益效果:
本发明的PHB2基因或蛋白的抑制剂在制备抗猪圆环病毒2型药物中的应用,通过间接免疫荧光试验检测PCV2在PK-15细胞中的增殖变化,检测PCV2感染PK-15细胞后PHB2mRNA的动态变化,和鉴定在PHB2基因或蛋白的抑制剂转染PK-15细胞中PCV2Cap蛋白表达。结果表明,PHB2在正常及PCV2感染的PK-15细胞中均有效表达。PCV2可显著影响PK-15细胞中PHB2转录,而且PHB2对PCV2病毒复制具有调节作用,下调PHB2的表达,即PHB2基因敲除或蛋白表达下调,能明显抑制PCV2的复制,对阐明PCV2致病机理和研究新的抗病毒药物具有重要意义。
除了上面所描述的目的、特征和优点之外,本发明还有其它的目的、特征和优点。下面将参照附图,对本发明作进一步详细的说明。
附图说明
构成本申请的一部分的附图用来提供对本发明的进一步理解,本发明的示意性实施例及其说明用于解释本发明,并不构成对本发明的不当限定。在附图中:
图1是本发明的PCV2在PK-15细胞中的增殖情况示意图;
图2是本发明的gC1qR和PHB2荧光定量PCR引物溶解曲线图;
图3是本发明的gC1qR和PHB2荧光定量PCR扩增曲线图;
图4是本发明的PCV2感染PK-15细胞后gC1qR基因mRNA水平的变化结果示意图;
图5是本发明的PCV2感染PK-15细胞后PHB2基因mRNA水平的变化结果示意图;
图6是本发明的siRNA转染PK-15细胞后PHB2基因mRNA水平的变化结果示意图;
图7是本发明的siRNA转染PK-15细胞后PCV2Cap蛋白Westernblot鉴定图;
图8是本发明的siRNA转染PK-15细胞后PCV2Cap蛋白的变化结果示意图;
图9是本发明的siRNA转染PK-15细胞后IFA检测结果图;
图10是本发明的shRNA设计示意图;
图11是本发明的shRNA转染PK-15细胞后PHB2基因mRNA水平的变化结果示意图;以及
图12是本发明的shRNA转染PK-15细胞后PCV2Cap蛋白的变化结果示意图。
具体实施方式
需要说明的是,在不冲突的情况下,本申请中的实施例及实施例中的特征可以相互组合。下面将参考附图并结合实施例来详细说明本发明。
本实施例中,一种PHB2基因或蛋白的抑制剂在制备抗猪圆环病毒2型药物中的应用。本发明的PHB2基因或蛋白的抑制剂在制备抗猪圆环病毒2型药物中的应用,通过间接免疫荧光试验检测PCV2在PK-15细胞中的增殖变化,检测PCV2感染PK-15细胞后PHB2mRNA的动态变化,和鉴定在PHB2基因或蛋白的抑制剂转染PK-15细胞中PCV2Cap蛋白表达。结果表明,PHB2在正常及PCV2感染的PK-15细胞中均有效表达。PCV2可显著影响PK-15细胞中PHB2转录,而且PHB2对PCV2病毒复制具有调节作用,下调PHB2的表达,即PHB2基因敲除或蛋白表达下调,能明显抑制PCV2的复制,对阐明PCV2致病机理和研究新的抗病毒药物具有重要意义。
基于GenBank库中猪PHB2基因序列(Gene ID:100627467),设计并合成引物,引物F1(Forwardprimer)如SEQ ID NO:5所示,具体的:ctgccctccattgtcaacga,引物R1(Reverseprimer)如SEQ ID NO:6所示,具体的:cagctcccttcggatcaaca;并以TBP作为内参基因,依据TBP基因序列(Gene ID:110259740),设计并合成引物,引物F2(Forwardprimer)如SEQ IDNO:7所示,具体的:gatggacgttcggtttagg,引物R2(Reverse primer)如SEQ ID NO:8所示,具体的:agcagcacagtacgagcaa;提取具有PCV2感染的PK-15细胞的cDNA,以cDNA为模板,进行PCR扩增,检测PHB2在PCV2感染的PK-15细胞中mRNA动态变化。在PCV2感染的作用下,PK-15细胞中PHB2mRNA转录水平升高,在感染后6h内,PHB2mRNA转录水平逐渐上升,且呈现时间相关性,在感染后6h时显著升高,是对照组的4.08倍(P<0.01),且达到了最高水平。说明PCV2感染对细胞宿主因子PHB2mRNA转录的影响。经过前期的试验研究发现将PCV2病毒样颗粒(virus-like particles,VLPs)侵染猪肺泡巨噬细胞(3D4/2细胞系),利用免疫共沉淀联合质谱方法发现,PHB2是PCV2VLPs候选细胞互作蛋白之一,提示该蛋白可能参与了PCV2细胞入侵和复制,因此进一步探究PHB2在PCV2感染细胞过程中发挥的作用。
本实施例中,抑制剂选择为能够抑制PHB2蛋白表达或基因转录的小干扰RNA(siRNA)、双链RNA(dsRNA)、短发夹RNA(shRNA)或反义寡核苷酸;或能表达或形成siRNA、dsRNA、shRNA或反义寡核苷酸的构建物。
本实施例中,siRNA包括PHB2siRNA-1或PHB2siRNA-2。PHB2siRNA-1的靶序列如SEQID NO:1所示,或者,PHB2siRNA-2的靶序列如SEQ ID NO:2所示。将PHB2siRNA-1、PHB2siRNA-2的干扰片段转染PK-15细胞,并检测PHB2基因变化,PHB2siRNA-1和PHB2siRNA-2都可以抑制PHB2在PK-15细胞中mRNA的转录水平。优选地,siRNA选择PHB2siRNA-2,其敲除效率最高(71%)。将PCV2接种转染PHB2siRNA-1或PHB2siRNA-2后的PK-15细胞,并进行培养。检测结果显示,PCV2Cap蛋白水平均显著降低。说明PHB2基因敲除或蛋白表达下调,能明显抑制PCV2复制,指示PHB2siRNA-1和PHB2siRNA-2均能抑制PCV2复制。PHB2siRNA-1的靶序列具体为5′-ccaucacugagcugagcuu-3′。PHB2siRNA-2的靶序列具体为5′-ccaguacccuaucaucuau-3′。
本实施例中,shRNA的编码序列正义链如SEQ ID NO:3所示,反义链如SEQ ID NO:4所示。通过已选的靶点序列设计shRNA干扰序列,获得上述shRNA的编码序列正义链和反义链,并合成双链DNAoligo(简称ds oligo),将ds oligo与线性化载体连接,转化大肠杆菌DH5α中获得菌液,提取质粒获得shRNA表达质粒。线性化载体采用pENTRTM/U6。shRNA的编码序列正义链具体为5'-caccg*ccagtaccctatcatctatcgaaatagatgatagggtactgg-3',shRNA的编码序列反义链具体为5'-aaaaccagtaccctatcatctatttcgatagatgatagggtactggc*-3'。
根据本发明的另一方面,还提供了一种抑制猪圆环病毒2型的siRNA的靶序列,siRNA包括PHB2siRNA-1或PHB2siRNA-2;PHB2siRNA-1的靶序列如SEQ ID NO:1所示,或者,PHB2siRNA-2的靶序列如SEQ ID NO:2所示。
根据本发明的另一方面,还提供了一种抑制猪圆环病毒2型的shRNA分子,shRNA分子的编码序列正义链如SEQ ID NO:3所示,反义链如SEQ ID NO:4所示。
根据本发明的另一方面,还提供了一种含有上述抑制猪圆环病毒2型的shRNA分子的shRNA表达质粒。
根据本发明的另一方面,还提供了一种药物组合物,包括上述siRNA的靶序列、shRNA分子、shRNA表达质粒中的一种,还包含药学可接受的载体和/或赋形剂。在制备这些药物组合物时,通常将活性成分与赋形剂混合,或用赋形剂稀释,或包在可以以胶囊或药囊形式存在的载体中。用于预防或治疗由PCV2感染导致的疾病。
根据本发明的另一方面,还提供了一种用于抑制猪圆环病毒2型复制的试剂盒,包括siRNA的靶序列、shRNA分子、shRNA表达质粒中的一种。
实施例
病毒PCV2d毒株,GenBank登录号:KJ867555,其TCID50为1×105.66/mL,本实验室保存。
猪肾上皮细胞(PK-15),本实验室保存。
兔源性抗PCV2Cap多克隆抗体,本实验室保存;异硫氰酸荧光素(FITC)偶联的驴抗兔IgG抗体,购自Life Technologies公司;过氧化物酶(HRP)标记的羊抗兔IgG抗体,购自KPL公司。
Trizol reagent和LipofectamineTM 2000转染试剂,购自Invitrogen公司。
M-MLV反转录酶及相关试剂盒,购自Promega公司。
EasyTaq DNA聚合酶,购自北京全式金生物公司。
DMEM细胞培养基及小牛血清,购自Gibco公司。
其他相关试剂均为国产分析纯。
实验数据以平均数±标准差(mean±SD)表示,利用SPSS Statistics 22.0软件中的单因素方差分析(one-wayANOVA)法,对结果进行分析。0.01<P<0.05为差异显著,用*标示;P<0.01为差异极显著,用**标示。
实施例1
1.1PCV2d感染PK-15细胞
将无PCV1/PCV2污染的PK-15细胞接种于6孔细胞培养板中,用含10%NBCS(新生牛血清)的DMEM培养基培养细胞,至细胞融合率为60%。用TCID50=1×105.66/mL的PCV2d感染PK-15细胞后,分别于3、6、12、24和48h收集各孔细胞,作为实验组;不做任何处理的细胞标记为0h,作为对照组,每个时间点设置3个复孔。
1.2间接免疫荧光法检测PCV2在PK-15细胞中的增殖
利用上述方法将PCV2d感染PK-15细胞后,分别于0.5、1、12、24和36h用4%多聚甲醛固定细胞20min,再用含0.1%Triton X-100的PBS透化处理细胞10min,PBS洗3次后在含3%BSA(小牛血清白蛋白)的PBS中封闭1h。以兔源性抗PCV2Cap的多克隆抗体作为一抗室温孵育1h,FITC标记的驴抗兔IgG的抗体作为二抗室温避光孵育1h,于荧光倒置显微镜下观察,以上每两步骤间用PBS洗3次,每次5min。
1.3细胞RNA提取及其反转录
利用细胞RNA提取试剂盒(Trizol法)对上述收集的细胞进行总RNA提取。取2uLRNA样品,利用NanoDrop分光光度计测定RNA浓度及纯度(D260nm/280nm比值)。取1ug细胞总RNA,利用M-MLV First Strand cDNA Synthesis Kit试剂盒反转录合成cDNA。
1.4PCV2感染PK-15细胞中PHB2mRNA水平的检测
基于GenBank库中猪PHB2基因序列(Gene ID:100627467),设计并合成引物,引物F1(Forwardprimer)如SEQ ID NO:5所示,引物R1(Reverse primer)如SEQ ID NO:6所示;并以TBP作为内参基因,依据TBP基因序列(Gene ID:110259740),设计并合成引物,引物F2(Forwardprimer)如SEQ ID NO:7所示,引物R2(Reverse primer)如SEQ ID NO:8所示;以cDNA为模板,利用AceQ qPCRGreen Master Mix试剂盒进行SYBR Green荧光定量PCR扩增,检测PHB2在PCV2感染的PK-15细胞中mRNA动态变化,反应条件为:95℃,5min;95℃,10s,60℃,30s,重复40个循环;最后为溶解曲线设置阶段,95℃,15s;60℃,1min;95℃,15s。
对比例1
对比例1的步骤与实施例1的步骤相同,区别在于:基于GenBank库中猪gC1qR基因序列(Gene ID:110256103),设计并合成引物,引物F3(Forward primer)如SEQ ID NO:9所示,具体的actcccaacttcgtggttgaag,引物R3(Reverse primer)如SEQ ID NO:10所示;具体的cctcgtcctcttgtccaatctc。
检测结果如下所示:
图1是本发明的PCV2在PK-15细胞中的增殖情况示意图。
图2是本发明的gC1qR和PHB2荧光定量PCR引物溶解曲线图。
图3是本发明的gC1qR和PHB2荧光定量PCR扩增曲线图。
图4是本发明的PCV2感染PK-15细胞后gC1qR基因mRNA水平的变化结果示意图。
图5是本发明的PCV2感染PK-15细胞后PHB2基因mRNA水平的变化结果示意图。
如图1所示,PCV2感染PK-15细胞后,随着时间的推移(0h~36h),PK-15细胞中特异性的荧光信号(PCV2)数量不断增多,荧光强度不断增强,且大部分荧光信号由点状分布于细胞膜周边(0.5h~1h),逐渐聚集在细胞质和细胞核(12h~24h),最后到感染后36h时,PCV2阳性信号均聚集在细胞核。结果表明PCV2在1h内完成入侵,随后在PK-15细胞中不断增殖。
如图2和图3所示,通过荧光定量PCR对不同样品进行分析,gC1qR引物和PHB2引物的溶解曲线均峰值集中无杂带,显示出单一峰,同时扩增曲线清晰,平台期稳定,表明检测方法具有较好的准确性和敏感性。
如图4和图5所示,在PCV2感染的作用下,PK-15细胞中PHB2mRNA转录水平(除了24h外)均升高,在感染后6h内,PHB2mRNA转录水平逐渐上升,且呈现时间相关性,在感染后6h时显著升高,是对照组的4.08倍(P<0.01),且达到了最高水平。而后随着时间的推移,PHB2mRNA表达呈下降趋势。而gC1qRmRNA转录水平在病毒感染6h时升高,是对照组的1.25倍,而随着时间(12h、24h和48h)转录水平下降,尽管在48h又再次升高,但仍低于对照组。因此,通过实施例1与对比例1的检测可知,并非所有蛋白在PCV2感染的作用下,PK-15细胞中的mRNA转录都会提高,本发明则是PCV2特异性的促进PHB2在PK-15细胞中PHB2mRNA转录水平。
实施例2
PK-15细胞长成单层后转染靶向PHB2基因的RNA干扰片段。干扰片段是PHB2siRNA-1,PHB2siRNA-1的靶序列如SEQ ID NO:1所示,转染PK-15细胞。qPCR用于检测PHB2基因的RNA干扰效率。转染24h后弃培养基,PBS洗涤3次后,用PCV2侵染细胞1h后弃培养基,PBS洗涤3次后,换新鲜培养基继续培养48h。裂解细胞计算蛋白浓度后,以β-actin作为内参,分别以抗β-actin(鼠源)和兔源性抗PCV2Cap的多克隆抗体作为一抗,以对应的HRP标记的抗鼠和抗兔抗体作为二抗,进行Western blot试验,检测PCV2Cap蛋白的变化。
实施例3
PK-15细胞长成单层后转染靶向PHB2基因的RNA干扰片段。干扰片段是PHB2siRNA-2,PHB2siRNA-2的靶序列如SEQ ID NO:2所示,转染PK-15细胞。qPCR用于检测PHB2基因的RNA干扰效率。转染24h后弃培养基,PBS洗涤3次后,用PCV2侵染细胞1h后弃培养基,PBS洗涤3次后,换新鲜培养基继续培养48h。裂解细胞计算蛋白浓度后,以β-actin作为内参,分别以抗β-actin(鼠源)和兔源性抗PCV2Cap的多克隆抗体作为一抗,以对应的HRP标记的抗鼠和抗兔抗体作为二抗,进行Western blot试验,检测PCV2Cap蛋白的变化。并采用IFA测试方法检测PCV2在PK-15细胞中的增殖,其操作方法与实施例1的1.2步骤相似。
对比例2
无关干扰片段siRNA-NC作为对照,siRNA-NC的靶序列如SEQ ID NO:11所示,具体的:5′-uucuccgaacgugucacgu-3′。其他步骤与实施例2相同。
检测结果如下所示:
图6是本发明的siRNA转染PK-15细胞后PHB2基因mRNA水平的变化结果示意图。
图7是本发明的Western blot鉴定图;泳道1:无关干扰片段siRNA-NC;泳道2:干扰片段PHB2siRNA-1;泳道3:干扰片段PHB2siRNA-2;Cap代表PCV2Cap蛋白,β-actin为内参蛋白。
图8是本发明的siRNA转染PK-15细胞后PCV2Cap蛋白的变化结果示意图。
图9是本发明的siRNA转染PK-15细胞后PCV2的IFA检测结果图;1:siRNA-NC;2:PHB2siRNA-2。
如图6所示,为了验证PHB2与PCV2复制间的关系,PHB2siRNA-1、PHB2siRNA-2及无关干扰片段siRNA-NC为对照转染PK-15细胞,qPCR检测PHB2基因变化,结果显示PHB2siRNA-1和PHB2siRNA-2都可以抑制PHB2在PK-15细胞中mRNA的转录水平。其中,PHB2siRNA-2的敲除效率最高(71%),可以明显抑制PHB2在PK-15细胞中mRNA的转录水平(0.01<P<0.05)。
如图7、图8和图9所示,siRNA转染24h后,接种PCV2培养48h,Westernbot鉴定结果显示,PHB2siRNA-2干扰组中PCV2Cap蛋白水平显著低于对照组,约低于siRNA-NC的25%(0.01<p<0.05)。并且IFA结果表明,与对比例2的siRNA-NC相比,PHB2siRNA-2的使用能导致荧光信号(代表PCV2)减少,说明PHB2基因的沉默能抑制PCV2复制。
实施例4
4.1shRNA预处理
如图10所示,通过PHB2siRNA-2靶点序列设计shRNA序列,shRNA的编码序列正义链(简称Top Strand oligo)如SEQ ID NO:3所示,反义链(简称Bottom Strand oligo)如SEQID NO:4所示。shRNA由公司合成。其中,CACCG*与AAAA代表loop序列。
反应体系(20μL)如下:5μLtop strand oligo(200μM),5μLbottom strand oligo(200μM),2μL 10×Oligo Annealing Buffer(100mM Tris-HCl,10mM EDTA,1M NaCl pH8.0),8μL DNase/RNase-free water。分别将20μL体系的PCR管于95℃4min,室温10min,获得ds oligo产物,用DNase/RNase-free water稀释产物(1μL)100倍,再分别取10μL 10×OligoAnnealing Buffer和89μLDNase/RNase-free water与1μL稀释后的产物混匀,获得稀释后的产物浓度(5nM)。
4.2shRNA表达质粒的构建
反应体系(20μL):4μL 5×Ligation Buffer,2μLpENTRTM/U6,2μLds oligo(5nM),2μL DNase/RNase-Free water,1μLT4DNALigase。反应体系室温放置6min。然后反应产物(2μL)加入大肠杆菌(DH5α)中,经过热激(42℃)1min、冰上放置6min后,加入300μL SOC培养基,然后37℃培养1h。取50μL转化菌液涂布在LB培养板中于37℃培养12h,再将单克隆菌落至LB培养基中培养12h。按质粒提取试剂盒的说明书提取质粒。
4.3shRNA表达质粒抑制PCV2
将shRNA表达质粒转染PK-15细胞,qPCR用于检测PHB2基因的RNA干扰效率。转染24h后弃培养基,PBS洗涤3次后,用PCV2侵染细胞1h后弃培养基,PBS洗涤3次后,换新鲜培养基继续培养至48h。Western blot检测PCV2Cap蛋白表达量的变化。
检测结果如下所示:
图10是本发明的shRNA设计示意图;
图11是本发明的shRNA转染PK-15细胞后PHB2基因mRNA水平的变化结果示意图,shRNA-NC代表对照组,即为空载体;
图12是本发明的shRNA转染PK-15细胞后PCV2Cap蛋白表达量变化的结果示意图,shRNA-NC代表对照组,即为空载体。
如图11所示,shRNA和空载体转染PK-15细胞,qPCR检测PHB2基因变化,结果显示shRNA可以明显抑制PHB2在PK-15细胞中mRNA的转录水平(0.01<P<0.05)。
如图12所示,shRNA和空载体转染24h后,接种PCV2培养48h,Western bot鉴定结果显示,shRNA干扰组中PCV2Cap蛋白水平显著低于对照组(0.01<P<0.05)。与相应的PHB2siRNA抑制PCV2复制的结果相似(如图9),说明shRNA-2同样能抑制PCV2复制。
以上所述仅为本发明的优选实施例而已,并不用于限制本发明,对于本领域的技术人员来说,本发明可以有各种更改和变化。凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
序列表
<110> 湖南农业大学
<120> PHB2基因或蛋白的抑制剂在制备抗猪圆环病毒2型药物中的应用
<160> 11
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
ccaucacuga gcugagcuu 19
<210> 2
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
ccaguacccu aucaucuau 19
<210> 3
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
caccgccagt accctatcat ctatcgaaat agatgatagg gtactgg 47
<210> 4
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
aaaaccagta ccctatcatc tatttcgata gatgataggg tactggc 47
<210> 5
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
ctgccctcca ttgtcaacga 20
<210> 6
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
cagctccctt cggatcaaca 20
<210> 7
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 7
gatggacgtt cggtttagg 19
<210> 8
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
agcagcacag tacgagcaa 19
<210> 9
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 9
actcccaact tcgtggttga ag 22
<210> 10
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 10
cctcgtcctc ttgtccaatc tc 22
<210> 11
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 11
uucuccgaac gugucacgu 19
Claims (9)
1.一种PHB2基因或蛋白的抑制剂在制备抗猪圆环病毒2型药物中的应用。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述抑制剂选择以能够抑制PHB2蛋白表达或基因转录的小干扰RNA(siRNA)、双链RNA(dsRNA)、短发夹RNA(shRNA)或反义寡核苷酸;或能表达或形成所述siRNA、dsRNA、shRNA或反义寡核苷酸的构建物。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,
所述siRNA包括PHB2 siRNA-1或PHB2 siRNA-2;
所述PHB2 siRNA-1的靶序列如SEQ ID NO:1所示,或者
所述PHB2 siRNA-2的靶序列如SEQ ID NO:2所示。
4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,
所述shRNA的编码序列正义链如SEQ ID NO:3所示,反义链如SEQ ID NO:4所示。
5.一种抑制猪圆环病毒2型的siRNA的靶序列,其特征在于,
所述siRNA包括PHB2 siRNA-1或PHB2 siRNA-2;
所述PHB2 siRNA-1的靶序列如SEQ ID NO:1所示,或者
所述PHB2 siRNA-2的靶序列如SEQ ID NO:2所示。
6.一种抑制猪圆环病毒2型的shRNA分子,其特征在于,
所述shRNA分子的编码序列正义链如SEQ ID NO:3所示,反义链如SEQ ID NO:4所示。
7.一种含有权利要求6所述的抑制猪圆环病毒2型的shRNA分子的shRNA表达质粒。
8.一种药物组合物,其特征在于,包括权利要求5所述的siRNA的靶序列、权利要求6所述的shRNA分子、权利要求7所述的shRNA表达质粒中的一种,还包含药学可接受的载体和/或赋形剂。
9.一种用于抑制猪圆环病毒2型复制的试剂盒,其特征在于,包括权利要求5所述的siRNA的靶序列、权利要求6所述的shRNA分子、权利要求7所述的shRNA表达质粒中的一种。
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