CN110488000B - 一种用于抽提膜蛋白的裂解液 - Google Patents

一种用于抽提膜蛋白的裂解液 Download PDF

Info

Publication number
CN110488000B
CN110488000B CN201910804197.7A CN201910804197A CN110488000B CN 110488000 B CN110488000 B CN 110488000B CN 201910804197 A CN201910804197 A CN 201910804197A CN 110488000 B CN110488000 B CN 110488000B
Authority
CN
China
Prior art keywords
membrane protein
protein
lysis solution
lysate
extracting
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201910804197.7A
Other languages
English (en)
Other versions
CN110488000A (zh
Inventor
徐世华
华权高
李立
吴笛笛
舒芹
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Wuhan Genecreate Biological Engineering Co ltd
Original Assignee
Wuhan Genecreate Biological Engineering Co ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Wuhan Genecreate Biological Engineering Co ltd filed Critical Wuhan Genecreate Biological Engineering Co ltd
Priority to CN201910804197.7A priority Critical patent/CN110488000B/zh
Publication of CN110488000A publication Critical patent/CN110488000A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN110488000B publication Critical patent/CN110488000B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/531—Production of immunochemical test materials

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

本发明提供一种用于抽提膜蛋白的裂解液，包括：去垢剂、缓冲剂、蛋白酶抑制剂及氯化钠溶液；其中，所述去垢剂包括聚乙二醇辛基苯基醚或3‑[3‑(胆酰胺丙基)二甲氨基]丙磺酸内盐中的一种或两种；所述缓冲剂包括三(羟甲基)氨基甲烷或3‑环己胺基‑2‑羟基丙磺酸中的一种或两种；所述去垢剂占所述用于抽提膜蛋白的裂解液的质量比为0.2％～2％。本发明的有益效果在于：本发明裂解液在提高膜蛋白提取率的同时又能保证后续抗原抗体免疫复合物生成率，提高后续检测的成功率。

Description

一种用于抽提膜蛋白的裂解液
技术领域
本发明属于生物技术领域，具体涉及一种用于抽提膜蛋白的裂解液。
背景技术
免疫共沉淀是一项生命科学研究中常用的蛋白质相互作用研究实验方法，由于蛋白质相互作用是细胞内以及细胞间分子功能、代谢过程的主要形式之一，能够解答大量生物学基础科学问题，因此免疫共沉淀实验是现今细胞生物学、生物化学、分子生物学研究领域常用技术。膜蛋白在许多生命过程的分子机制中起着关键作用，如细胞的能量代谢、分化增殖、物质运输、信号转导等。同时膜蛋白也是药物研究中的热门靶点，据统计有60％的药物以膜蛋白为作用靶点。因此，应用于膜蛋白的免疫共沉淀技术具有非常重要的科研以及应用价值。
在蛋白抽提环节中，为了促进蛋白溶解，通常会在裂解液中加入去垢剂，现今常用的去垢剂包括温和型去垢剂聚乙二醇辛基苯基醚(Triton X-100)、乙基苯基聚乙二醇(NP-40)及强离子型取垢剂十二烷基硫酸钠(SDS)等等，选用不同类型不同浓度的去垢剂对膜蛋白的提取及后续的免疫共沉淀实验都会造成很大的影响。
目前采用的裂解液配方中，以温和型去垢剂为主的配方往往会出现膜蛋白溶解率不高；采用强离子型去垢剂如SDS与脱氧胆酸钠进行配合使用会增加膜蛋白的溶解率，但会导致抗原抗体免疫复合物形成受到抑制；这些原因都不能有效将膜蛋白及其相互作用蛋白进行沉淀并收集，导致后续检测成功率降低，因此，选用研究合适裂解液配方兼顾膜蛋白的溶解率及后续蛋白沉淀物的生成很有必要。
发明内容
为解决现有裂解液在膜蛋白免疫共沉淀测试中，提取后的膜蛋白与抗体反应生成抗原抗体免疫复合物生成率低的技术问题，本发明提供一种抽提膜蛋白的裂解液。
具体技术方案如下：
一种用于抽提膜蛋白的裂解液，其不同之处在于，所述用于抽提膜蛋白的裂解液包括：
去垢剂、缓冲剂、蛋白酶抑制剂及氯化钠溶液；
其中，所述去垢剂包括聚乙二醇辛基苯基醚或3-[3-(胆酰胺丙基)二甲氨基]丙磺酸内盐中的一种或两种；
所述缓冲剂包括三(羟甲基)氨基甲烷或3-环己胺基-2-羟基丙磺酸中的一种或两种；
所述去垢剂占所述抽提膜蛋白的裂解液的质量比为0.2％～2％。
上述技术方案中，所述用于抽提膜蛋白的裂解液还包括质量比为3％～15％的甘油。
上述技术方案中，所述用于抽提膜蛋白的裂解液还包括还原剂。
上述技术方案中，所述氯化钠溶液的浓度为80mmol/L～180mmol/L。
上述技术方案中，所述三(羟甲基)氨基甲烷的pH值为7～8，浓度为15mmol/L～60mmol/L。
上述技术方案中，所述缓冲剂包括3-环己胺基-2-羟基丙磺酸，所述3-环己胺基-2-羟基丙磺酸的占所述用于抽提膜蛋白的裂解液的质量比为0.3％～0.6％。
上述技术方案中，所述蛋白酶抑制剂包括乙二胺四乙酸或苯甲基磺酰氟中的一种或两种；
其中，所述乙二胺四乙酸的浓度为0.8mmol/L～2.5mmol/L；所述苯甲基磺酰氟的浓度为0.8mmol/L～1.2mmol/L。
上述技术方案中，所述去垢剂包括聚乙二醇辛基苯基醚，所述聚乙二醇辛基苯基醚占所述用于抽提膜蛋白的裂解液的质量百分比为0.2％～1.5％。
上述技术方案中，所述3-[3-(胆酰胺丙基)二甲氨基]丙磺酸内盐占所述用于抽提膜蛋白的裂解液的质量百分比为0.3％～1.2％。
上述技术方案中，所述还原剂包括二硫苏糖醇，所述二硫苏糖醇的浓度为4mmol/L～6mmol/L。
与现有技术相比，本发明的有益效果在于：本发明裂解液在提高膜蛋白提取率的同时又能保证后续抗原抗体免疫复合物生成率，提高后续检测的成功率。
附图说明
图1为实施例五实验1.1蛋白抽提后PAGE检测效果图；
图2为实施例五实验1.2蛋白抽提后PAGE检测效果图；
图3为实施例六免疫共沉淀产物WesternBlot检测结果。
具体实施方式
以下结合附图对本发明的原理和特征进行描述，所举实例只用于解释本发明，并非用于限定本发明的范围。
本发明成分“去垢剂”可将疏水蛋白从其膜结构中溶解下来，3-[3-(胆酰胺丙基)二甲氨基]丙磺酸内盐(CHAPS)为一种两性表面活性剂，也是一种非变性的zwitterionic去垢剂，可有效增加膜蛋白的溶解，用于蛋白质裂解液中以研究蛋白和蛋白之间的相互作用；
本发明成分“缓冲剂”可以防止pH的大幅度变化，而且可以将离子强度保持在生理范围内，并防止蛋白质与其他离子结合形成不溶性产物，3-环己胺基-2-羟基丙磺酸(CAPSO)是一种生物缓冲剂，可用于免疫印迹和免疫沉淀实验；
本发明成分“蛋白酶抑制剂”可抑制因“去垢剂”破坏膜结构释放出的大量蛋白酶的作用，从而保护膜蛋白；
本发明成分“氯化钠溶液”可保证整个膜蛋白提取过程中接近于生理盐水的浓度；
本发明成分“还原剂”可以防止蛋白－SH被氧化而失活；
本发明成分“甘油”由于其粘性，可以对蛋白质起到一个很好的保护作用。
实施例各成分中文与英文简称对比：
聚乙二醇辛基苯基醚：Triton X-100；3-[3-(胆酰胺丙基)二甲氨基]丙磺酸内盐：CHAPS；十二烷基硫酸钠:SDS；三(羟甲基)氨基甲烷：Tris-HCl；3-环己胺基-2-羟基丙磺酸：CAPSO；乙二胺四乙酸：EDTA；苯甲基磺酰氟：PMSF；二硫苏糖醇:DTT；G型链球菌分离而得的细胞壁蛋白：Protein G；磷酸缓冲盐溶液：PBS。
实施例一
按下列浓度或质量百分比配置裂解液：
50mmol/L Tris-HCl(pH8.0)，100mmol/L NaCl，2mmol/L EDTA，10％甘油，0.4％Triton X-100，0.4％CAPSO，0.4％CHAPS，5mmol/L DTT、1x PIC(碧云天蛋白酶抑制剂混合物)、1mmol/LPMSF。
实施例二
按下列浓度或质量百分比配置裂解液：
50mmol/L Tris-HCl(pH8.0)，100mmol/L NaCl，2mmol/L EDTA，10％甘油，0.4％Triton X-100，0.4％CHAPS，5mmol/L DTT、1x PIC(碧云天蛋白酶抑制剂混合物)、1mmol/LPMSF。
实施例三
按下列浓度或质量百分比配置裂解液：
50mmol/L Tris-HCl(pH7.4)，150mmol/L NaCl，1mmol/L EDTA，10％甘油，1％Triton X-100，0.5％CAPSO，5mmol/L DTT、1x PIC(碧云天蛋白酶抑制剂混合物)、1mmol/LPMSF。
实施例四
按下列浓度或质量百分比配置裂解液：
50mmol/L Tris-HCl(pH7.4)，150mmol/L NaCl，1mmol/L EDTA，10％甘油，1％CHAPS，5mmol/L DTT、1x PIC(碧云天蛋白酶抑制剂混合物)、1mmol/LPMSF。
对比例一
按下列浓度或质量百分比配置裂解液：
50mmol/L Tris-HCl(pH8.0)，100mmol/L NaCl，2mmol/L EDTA，10％甘油，0.8％SDS，0.4％CAPSO，5mmol/L DTT、1x PIC(碧云天蛋白酶抑制剂混合物)、1mmol/LPMSF。
实施例五
膜蛋白抽提效果验证：
1.1
收集三种不同细胞样品后，每种细胞样品均分为三份，一组为实验一组依次标号为1a、1b、1c；
一组为对照组，对应依次标号为2a、2b、2c；
一组为实验二组，对应依次标号为3a、3b、3c；
实验一组加入实施例一裂解液，混匀，再将冰盒放在摇床上摇动30min，使样品充分裂解，超声破碎30s(超声2s,间歇3s为一个循环，共6个循环)，然后12000rpm 4℃离心20min，吸取上清作为抽提产物；
对照一组加入对比例一裂解液，混匀，再将冰盒放在摇床上摇动30min，使样品充分裂解，超声破碎30s(超声2s,间歇3s为一个循环，共6个循环)，然后12000rpm 4℃离心20min，吸取上清作为抽提产物；
实验二组加入实施例二裂解液，混匀，再将冰盒放在摇床上摇动30min，使样品充分裂解，超声破碎30s(超声2s,间歇3s为一个循环，共6个循环)，然后12000rpm 4℃离心20min，吸取上清作为抽提产物；
将实验一组、对比一组、实验二组的抽提物稀释10倍后，分别用紫外分光光度计进行浓度检测，测试结果如表1所示；
将实验一组、对比一组的抽提物分别用PAGE检测抽提效率，测试结果如图1所示，结果显示在未加入SDS进行抽提的情况下，其膜蛋白抽提效率依旧很高。
表1实验一组、实验二组及对照组抽提物浓度测试结果
Figure BDA0002183161630000071
1.2
收集三种不同的细胞样品后依次标记为A、B、C，每份细胞均分为三份，依次标号为依次标号为1-A、2-A、3-A，1-B、2-B、3-B，1-C、2-C、3-C，其中，1-A、1-B、1-C样品加入实施例一裂解液，2-A、2-B、2-C样品加入对比例一裂解液，3-A、3-B、3-C样品加入市面上广泛使用的某品牌IP弱裂解液进行抽提；
混匀，再将冰盒放在摇床上摇动30min，使样品充分裂解，超声破碎30s(超声2s,间歇3s为一个循环，共6个循环)，然后12000rpm4℃离心20min，吸取上清作为抽提产物；
抽提物稀释10倍后分别用紫外分光光度计进行浓度检测，测试结果如表2所示；
抽提物分别用PAGE检测抽提效率，测试结果如图2所示，本发明抽提液与加入SDS的抽提液及市面上广泛使用的某品牌裂解液相比，具有良好的抽提效果。
表1抽提物浓度测试结果
Figure BDA0002183161630000081
实施例六
免疫共沉淀实验
选择实施例五中1a及2a提取物作为免疫共沉淀实验：
2.1
蛋白抽提产物预处理：准备Protein G琼脂凝胶珠，用PBS洗珠子两遍，然后用PBS制成50％浓度，剪去枪头避免在涉及琼脂糖的操作中破坏琼脂凝胶珠；在每1mL实施例五抽提产物中(约含2mg细胞总蛋白)，加入100μL Protein G琼脂凝胶珠(50％)，1μL非免疫血清，4℃摇床上摇晃2h后，4000r/min离心去除珠子，收集上清，以去除非特异性杂蛋白，降低背景；
抗原抗体免疫复合物形成及沉淀收集：从处理好的全细胞裂解液中取出2mg，加入抗体，4℃旋转孵育过夜；加入100μL Protein G琼脂糖珠，4℃缓慢摇动与抗原抗体混合物孵育5h；4000rpm离心3min，收集琼脂糖珠-抗原抗体复合物，用预冷PBS洗3遍，第三次后重复离心，确保洗液完全去除；PBST洗珠子4次5min/次；用40μL 2×上样缓冲液将琼脂糖珠-抗原抗体复合物悬起，大孔Tip头混匀。
2.2
将上述样品95℃煮5min，免疫共沉淀产物Western Blot检测结果，测试结果如图3，使用本发明裂解液后续免疫共沉淀效率高。
本发明选用去垢剂是膜蛋白溶解的关键成分，辅之三(羟甲基)氨基甲烷或3-环己胺基-2-羟基丙磺酸作为缓冲剂可兼顾后续的免疫共沉淀过程中抗原抗体免疫复合物形成效率，加之其余成分的相互配合，提高实验成功率。
本发明的较佳实施例，并不用以限制本发明，凡在本发明的精神和原则之内，所作的任何修改、等同替换、改进等，均应包含在本发明的保护范围之内。

Claims (1)

1.一种用于抽提膜蛋白的裂解液，其特征在于，所述用于抽提膜蛋白的裂解液包括：
50 mmol/L 的pH为8.0的Tris-HCl，100 mmol/L NaCl，2 mmol/L EDTA，质量百分比为10% 甘油，质量百分比为0.4% Triton X-100，质量百分比为0.4% CAPSO，质量百分比为0.4% CHAPS，5 mmol/L DTT、蛋白酶抑制剂混合物1x PIC及1 mmol/L PMSF。
CN201910804197.7A 2019-08-28 2019-08-28 一种用于抽提膜蛋白的裂解液 Active CN110488000B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910804197.7A CN110488000B (zh) 2019-08-28 2019-08-28 一种用于抽提膜蛋白的裂解液

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910804197.7A CN110488000B (zh) 2019-08-28 2019-08-28 一种用于抽提膜蛋白的裂解液

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN110488000A CN110488000A (zh) 2019-11-22
CN110488000B true CN110488000B (zh) 2021-02-23

Family

ID=68554984

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201910804197.7A Active CN110488000B (zh) 2019-08-28 2019-08-28 一种用于抽提膜蛋白的裂解液

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN110488000B (zh)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111381045B (zh) * 2020-01-20 2023-07-25 武汉三鹰生物技术有限公司 一种跨膜蛋白的检测方法
CN111610324B (zh) * 2020-06-06 2022-10-14 北京均大检测科技有限公司 一种ripa裂解液及其制备方法

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101463071A (zh) * 2009-01-13 2009-06-24 张振冬 牙鲆红细胞外膜蛋白的制备方法
CN104628810A (zh) * 2013-11-08 2015-05-20 中国科学院大连化学物理研究所 一种细胞膜蛋白质富集纯化方法
CN108251379A (zh) * 2018-01-15 2018-07-06 福建省农业科学院生物技术研究所 一种杂交瘤细胞株、创伤弧菌膜蛋白单克隆抗体和创伤弧菌检测试剂盒
CN108383901A (zh) * 2018-02-12 2018-08-10 昆明医科大学 一种脑组织膜蛋白的提取方法
CN109897086A (zh) * 2017-12-08 2019-06-18 中国科学院大连化学物理研究所 一种基于离子液体的膜蛋白质复合物提取方法及其应用

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101463071A (zh) * 2009-01-13 2009-06-24 张振冬 牙鲆红细胞外膜蛋白的制备方法
CN104628810A (zh) * 2013-11-08 2015-05-20 中国科学院大连化学物理研究所 一种细胞膜蛋白质富集纯化方法
CN109897086A (zh) * 2017-12-08 2019-06-18 中国科学院大连化学物理研究所 一种基于离子液体的膜蛋白质复合物提取方法及其应用
CN108251379A (zh) * 2018-01-15 2018-07-06 福建省农业科学院生物技术研究所 一种杂交瘤细胞株、创伤弧菌膜蛋白单克隆抗体和创伤弧菌检测试剂盒
CN108383901A (zh) * 2018-02-12 2018-08-10 昆明医科大学 一种脑组织膜蛋白的提取方法

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
γδT细胞识别人多发性骨髓瘤细胞XG-7膜热休克蛋白-70;江晓丰等;《中国免疫学杂志》;19991231;第15卷(第4期);第160页 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN110488000A (zh) 2019-11-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Klein et al. RNA-binding proteins are a major target of silica nanoparticles in cell extracts
CN110488000B (zh) 一种用于抽提膜蛋白的裂解液
Long et al. BRCA1 promotes unloading of the CMG helicase from a stalled DNA replication fork
Nittis et al. Revealing novel telomere proteins using in vivo cross-linking, tandem affinity purification, and label-free quantitative LC-FTICR-MS
Adamson et al. Involvement of hemin, a stimulatory fraction from ribosomes and a protein synthesis inhibitor in the regulation of hemoglobin synthesis
Moriyama et al. Purification and properties of a vanadate-and N-ethylmaleimide-sensitive ATPase from chromaffin granule membranes.
Marie et al. Proteomic analysis of the acid‐soluble nacre matrix of the bivalve unio pictorum: detection of novel carbonic anhydrase and putative protease inhibitor proteins
KR100326619B1 (ko) 염기해리분석법
Lu et al. Coevolution of eukaryote-like Vps4 and ESCRT-III subunits in the Asgard archaea
Seow et al. Proteomic investigation of metabolic shift in mammalian cell culture
Ai et al. Synthetic E2-Ub-nucleosome conjugates for studying nucleosome ubiquitination
Thoduvayil et al. Triton X‐114 fractionated subcellular proteome of Leptospira interrogans shows selective enrichment of pathogenic and outer membrane proteins in the detergent fraction
Saravanan et al. Glycosaminoglycans from marine clam Meretrix meretrix (Linne.) are an anticoagulant
Sontag et al. Identification of novel host interactors of effectors secreted by Salmonella and Citrobacter
Wu et al. Basic pH reversed-phase liquid chromatography (bRPLC) in combination with tip-based strong cation exchange (SCX-Tip), ReST, an efficient approach for large-scale cross-linked peptide analysis
Polevoda et al. Structural and functional assessment of APOBEC3G macromolecular complexes
Madani et al. Engineering a cysteine-deficient functional Candida albicans Cdr1 molecule reveals a conserved region at the cytosolic apex of ABCG transporters important for correct folding and trafficking of Cdr1
Novotný et al. Membrane proteins and proteomics of Cronobacter sakazakii cells: reliable method for identification and subcellular localization
Elmore et al. Biochemical purification of native immune protein complexes
CN107561164A (zh) 一种尿液蛋白质组学样品预处理方法及应用
Gentzel et al. Proteomic navigation using proximity-labeling
Kuhn et al. Proteomics study of anthrax lethal toxin‐treated murine macrophages
Antonets et al. The Gln3 transcriptional regulator of Saccharomyces cerevisiae manifests prion-like properties upon overproduction
Alekseev et al. Mass spectrometry identification of NASP binding partners in HeLa cells
McGee et al. Direct detection of intact Klebsiella pneumoniae carbapenemase variants from cell lysates: Identification, characterization and clinical implications

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant