CN110325213A - 神经退行性或神经炎性疾病中胶质细胞活化的早期检测 - Google Patents

神经退行性或神经炎性疾病中胶质细胞活化的早期检测 Download PDF

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Abstract

本公开内容提供了用于确定用SEMA4D拮抗剂(例如SEMA4D拮抗剂抗体)治疗神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤的疗效的方法,其中该方法提供了脑中葡萄糖摄取的差异测量,例如,通过FDG‑PET成像。

Description

神经退行性或神经炎性疾病中胶质细胞活化的早期检测
相关申请的交叉引用
本申请要求2017年2月22日提交的美国临时专利申请系列号62/461,945的权益,其公开内容通过引用全文纳入本文。
序列表陈述
本文通过USPTO的EFS系统提供序列表,该序列表包含名为58008_172847_SeqList_ST25.txt的文件,该文件为5880字节(在中统计)且创建于2018年2月20日,包括10条序列,并且通过引用其全文纳入本文。
背景技术
脑信号蛋白4D(SEMA4D),也称作CD100,是一种属于脑信号蛋白基因家族的跨膜蛋白。SEMA4D在细胞表面上表达为同二聚体,但在细胞激活之后,SEMA4D可通过蛋白水解切割从细胞表面释放以生成该蛋白质的溶解形式sSEMA4D,其也具有生物活性。参见Suzuki等,Nature Rev.Immunol.3:159-167(2003);Kikutani等,Nature Immunol.9:17-23(2008)。
SEMA4D在包括脾脏、胸腺和淋巴结的淋巴器官中以及如脑、心脏和肾脏的非淋巴器官中以高水平表达。在淋巴器官中,SEMA4D在静息T细胞上大量表达,但在静息B细胞和抗原呈递细胞(APC)如树突细胞(DC)上仅弱表达。然而,在用各种免疫刺激物活化之后,其表达在这些细胞中上调。细胞活化也增加了可溶性SEMA4D从免疫细胞的释放。
SEMA4D涉及神经退行性疾病、自身免疫疾病、脱髓鞘疾病和癌症。在中枢神经系统(CNS)中,SEMA4D在例如浸润的免疫细胞和少突胶质细胞前体细胞上表达,并且其受体在例如神经元、少突胶质细胞、星形胶质细胞和内皮细胞上表达(Okuno,T.等,J.Immunol.184:1499–1506(2010))。SEMA4D可以作为轴突导向分子(Swiercz等,Neuron 35:51-63(2002))并且可以介导包括GABA能和谷氨酸能突触发育(Paradis等,Neuron 53:217-232(2007))等的活性。
还显示SEMA4D在神经元和少突胶质细胞前体细胞的迁移和分化、CNS炎症和神经退行性变中起作用。例如,SEMA4D缺陷小鼠对实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)的发展具有抗性(Kumanogoh A等,Immunity 13:621-631(2000)),并且SEMA4D的阻断可以抑制EAE中的小胶质细胞活化和神经炎症(Okuno,T.等,J.Immunol.184:1499–1506(2010))。类似地,内皮细胞的SEMA4D刺激可导致促炎细胞因子IL-8的产生(Yang,YH等,PLoS One 6:e25826(2011))。
亨廷顿病(HD)是一种遗传性、致命的神经退行性疾病,由亨廷顿(HTT)基因外显子1中编码多聚谷氨酰胺的CAG道致病性扩增至36或更多次重复所致(亨廷顿病协作研究组(HDCRG)Cell 72:971-983(1993))。HTT中的36或更多个谷氨酰胺(扩增的多聚Q)导致变化形式的产生,称为mHTT(突变HTT),其增加某些类型神经元的退行性变的速率。退行性变的程度与多聚Q长度有关,并且占发病年龄变异和HD症状的进展速率的约60%。HD是一种常染色体显性遗传疾病,父母患有HD的每个人天生具有50/50的机会(风险)遗传单一突变的亨廷顿基因(通过其携带的X或Y性染色体)。任何遗传这种基因的人都会在生命的某个阶段发展出这种疾病。根据美国国家神经疾病和中风研究所(NINDS),美国任何时候均有3万名患者患有HD,另有150,000名患者患有该疾病的风险为50%。HD是一种复杂且严重衰弱的绝症,对此无治愈方法。
HD的特征是运动和认知缺陷以及精神障碍,死亡通常发生在发病后15-20年。疾病发作(临床上定义为运动缺陷的表现)通常发生在中年,HD的许多特征可以提前数年到几十年,包括例如免疫激活(Bjorkqvist M等,J.Exp.Med 205:1869-1877(2008)),纹状体萎缩和脑白质损失(Tabrizi SJ等,Lancet Neurol.8:791-801(2009))。另外,可出现人HD纹状体内神经元和少突胶质细胞谱系细胞的严重减少的转换(Ernst A等,Cell 156:1072-1083(2014))。转录失调可能是HD的早期特征;例如,SEMA4D及其主要CNS受体丛蛋白-B1的表达可在HD纹状体和皮质中升高,但不在小脑中升高(Hodges等,Hum.Mol.Genet.15:965-977(2006))。
通过抗SEMA4D治疗抑制SEMA4D信号转导代表了治疗HD的新方法。在特定方面,使用HD的YAC128转基因小鼠模型的工作证明,用抗SEMA4D抗体治疗改善了某些神经病理学作用,包括纹状体萎缩、皮质萎缩和胼胝体萎缩,并且预防了睾丸退行性变。此外,在用抗SEMA4D抗体治疗的YAC128小鼠中,一部分行为症状得到改善,包括减少焦虑样行为和挽救认知缺陷。参见Southwell AL等,Neurobiol.Dis.76:46-56(2015)和美国专利号9,249,227(2016年2月2日授予)。鉴于可度量HD症状的发展和缓解这些症状的长时间,仍然需要一种对于给定的疗法,特别是抗SEMA4D治疗是否对遗传易患HD的个体有效进行早期、可重复检测的方法。
发明内容
本公开内容提供了用于确定脑信号蛋白4D(SEMA4D)拮抗剂抗体或其抗原结合片段是否能够有效治疗神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的方法。
在一个方面,该方法包括将有效量的SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段给予患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的风险的对象;相对于给予SEMA4D拮抗剂之前检测的对象脑中葡萄糖摄取的基线水平,测量该对象脑中葡萄糖摄取水平;和,如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;或,如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
另一方面,该方法包括测量患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤风险的对象脑中的葡萄糖摄取的基线水平;向对象给予有效量的SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段;在给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段后,重新测量对象脑中的葡萄糖摄取水平;和,如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
在另一个方面,该方法包括将起始剂量的SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段给予患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的风险的对象;相对于给予SEMA4D拮抗剂之前测量的对象脑中葡萄糖摄取的基线水平,测量该对象脑中葡萄糖摄取水平;和,如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则调节SEMA4D拮抗剂抗体或其片段的剂量,所述调节根据增加的水平确定,或,如果检测到相对于基线的葡萄糖摄取无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。根据该方面,该方法可以进一步包括,相对于步骤(b)中所测试的情况,增加SEMA4D拮抗剂抗体的剂量,和,相对于不同先前未治疗的患者中或对同一患者停止治疗一段时间(该段时间经确定以允许该神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤中历史缺陷的累积)后该同一患者中的新基线,重新测量葡萄糖摄取水平的变化,和,如果检测到进一步增加,则进一步调节SEMA4D拮抗剂抗体的剂量。
另一方面,该方法包括测量患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤风险的对象脑中葡萄糖摄取的基线水平;向对象给予起始剂量的SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段;在给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段后,重新测量该对象脑中的葡萄糖摄取水平;和,如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则调节SEMA4D拮抗剂抗体或其片段的剂量,所述调节根据增加的水平确定,或,如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。根据该方面,该方法可以进一步包括,相对于步骤(c)中所测试的情况,增加SEMA4D拮抗剂抗体的剂量,和,相对于不同先前未治疗的患者中或对同一患者停止治疗一段时间(该段时间经确定以允许该神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤中历史缺陷的累积)后该同一患者中的新基线,重新测量葡萄糖摄取水平的变化,和,如果检测到进一步增加,则调节SEMA4D拮抗剂抗体的剂量。
在另一方面,该方法包括将SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段给予患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的风险的对象;相对于给予SEMA4D拮抗剂之前测量的对象脑中葡萄糖摄取的基线水平,测量该对象脑中葡萄糖摄取水平;和,如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;或,如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
另一方面,该方法包括检测患有、确定患有或疑似患有神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的对象脑中的葡萄糖摄取的基线水平;向对象给予SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段;在给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段后,重新测量对象脑中的葡萄糖摄取水平;和,如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;或,如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
在另一个方面,该方法包括将SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段给予患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的风险的对象;相对于给予SEMA4D拮抗剂之前检测的对象脑中葡萄糖摄取的基线水平,指令(order)对于该对象脑中葡萄糖摄取水平的测量;和,如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;或,如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
另一方面,该方法包括指令对于患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤风险的对象脑中的葡萄糖摄取的基线水平的测量;向对象给予SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段;在给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段后,指令对于对象脑中的葡萄糖摄取水平的重新测量;和,如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;或,如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
在另一方面,该方法包括测量对象脑中葡萄糖摄取的基线水平,该对象表现为患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎症性疾病、病症或损伤的风险;和,在由医疗服务提供者向该对象提供SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段之后,重新测量对象大脑中的葡萄糖摄取水平;和,如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则指示医疗服务提供者继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;或,如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则指示医疗服务提供者停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
在某些方面,用于所提供方法的SEMA4D拮抗剂抗体或其片段抑制SEMA4D与其受体(例如丛蛋白-B1,丛蛋白-B2或CD72)的相互作用。在某些方面,SEMA4D拮抗剂抗体或其片段抑制SEMA4D介导的丛蛋白-B1信号转导。
在某些方面,用于所提供方法的SEMA4D拮抗剂抗体或其片段竞争性抑制参照抗体与SEMA4D结合,所述参照抗体包含可变重链区(VH)和可变轻链区(VL),其中所述可变重链区包含氨基酸序列SEQ ID NO:1,且所述可变轻链区包含氨基酸序列SEQ ID NO:5。在某些方面,用于所提供方法的SEMA4D拮抗剂抗体或其片段与参照抗体结合相同的SEMA4D表位,所述参照抗体包含含有氨基酸序列SEQ ID NO:1的VH和含有氨基酸序列SEQ ID NO:5的VL。
在某些方面,用于所提供方法的SEMA4D拮抗剂抗体具有VH和VL,其中VH包括三个互补决定区(CDR)HCDR1、HCDR2和HCDR3,其中VL具有三个CDR LCDR1、LCDR2和LCDR3,并且其中,除了一个或多个CDR中的至少一个或两个单保守氨基酸取代以外,所述CDR分别包含氨基酸序列SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7和SEQ IDNO:8。在某些方面,用于所提供方法的SEMA4D拮抗剂抗体具有VH和VL,其中VH包括三个互补决定区(CDR)HCDR1、HCDR2和HCDR3,其中VL包括三个CDR LCDR1、LCDR2和LCDR3,并且其中,CDR分别包括氨基酸序列SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ IDNO:7和SEQ ID NO:8。在某些方面,VH具有与SEQ ID NO:1至少90%相同的氨基酸序列,并且VL具有与SEQ ID NO:5至少90%相同的氨基酸序列。在某些方面,VH包括氨基酸序列SEQ IDNO:1,且VL包括氨基酸序列SEQ ID NO:5。
在所提供方法的某些方面,给予第一剂量的SEMA4D拮抗剂抗体,然后在其后每周至少一次,每两周至少一次,每三周至少一次,每月至少一次,或每两个月至少一次给予SEMA4D拮抗剂抗体。
在所提供方法的某些方面,在第一剂量的SEMA4D拮抗剂抗体之前即刻测量葡萄糖摄取的基线测量值。在所提供方法的某些方面,在第一剂量后至少一周,第一剂量后至少两周,第一剂量后至少一个月,第一剂量后至少两个月,第一剂量后至少三个月,第一剂量后至少四个月,第一剂量后至少五个月,第一剂量后至少六个月,或其任何组合测量葡萄糖摄取相对于基线的变化。
在所提供方法的某些方面,通过18F-氟脱氧葡萄糖正电子发射断层扫描(FDG-PET)成像测量对象脑中的葡萄糖摄取。
在所提供方法的某些方面,对象是人。在所提供方法的某些方面,神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤是阿尔茨海默氏病,帕金森病,亨廷顿病,唐氏综合症,共济失调,肌萎缩侧索硬化症(ALS),多发性硬化症,(MS),癫痫,脑膜炎,脑水肿,脊髓损伤,创伤性脑损伤,额颞叶痴呆(FTD),HIV相关认知障碍,CNS狼疮,轻度认知障碍或其组合。
在所提供方法的某些方面,神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤是亨廷顿病(HD)。在某些方面,对象因HD家族史或遗传测试而具有发展HD的风险,例如,其中基因测试揭示对象的HTT基因中有36个或更多CAG重复。在某些方面,对象因轻度运动功能障碍、轻度认知障碍或轻度神经精神病学特征而疑似患有HD。在某些方面,对象因脑萎缩、增高的均匀亨廷顿病评定量表评分(UHDRS)、增高的亨廷顿病认知评估套组(HD-CAB)评分、增高的亨廷顿病定量运动评估评分或它们的组合而被诊断为患有HD。在某些方面,对象处于HD的症状前、早期前驱,晚期前驱,早期表现,中期表现或晚期表现阶段。
附图简述
图1是用于SIGNAL临床研究的A组的治疗计划示意图。
图2的示意图和时间线显示待与SIGNAL临床研究的A组做比较的不同患者“组”:VV(7-0)组在研究的前6个月盲段期间用VX15处理;PV(7-0)组在研究的前6个月盲段期间用安慰剂处理;VV(12-7)组从研究起始时用VX15处理,评价自第7个月起至第11个月的阶段;PV(12-7)组在研究的前6个月接受安慰剂,然后在第7个月起始时交叉接受VX15,评价自第7个月起至第11个月的阶段;VV(12-0)组在整个研究中用VX15处理,评价第0天至第11个月;和,PV(12-0)组在研究的前6个月接受安慰剂,然后在第7个月起始时交叉接受VX15,评价自第0天至第11个月的阶段。
图3A-B MRI体积:VV(7-0)–PV(7-0):图3A显示6个月后VX15处理组(VV(7-0),n=17)与6个月后安慰剂处理组(PV(7-0),n=19)在6个月处理过程中各脑目标区域(ROI)的MRI体积(mm3)的最小二乘方(LS)平均变化的差异,对该大脑区域的左半球、右半球和左右半球的平均值进行单独测量。包括各点的短线是95%置信区间。图3B显示图3A的相同组和脑目标区域的MRI体积的变化,表示为各组处理起始时基线的%。
图4A-B,MRI体积:PV(12-7)–PV(7-0):图4A显示以下组之间的6个月处理过程中各脑目标区域(ROI)的MRI体积(mm3)的最小二乘方(LS)平均变化的差异:前6个月用安慰剂处理然后第7至11个月用VX15处理的组,评价自第7个月起到第11个月的阶段(PV(12-7),n=19),和前6个月用安慰剂治疗的同一组,评价第0天到第6个月末(PV(7-0),n=19),对该大脑区域的左半球、右半球和左右半球的平均值进行单独测量。包括各点的短线是95%置信区间。图4B显示图4A的相同组和脑目标区域的MRI体积的变化,表示为各组评价起始时基线的%。
图5A-B,MRI体积:VV(12-7)–PV(7-0):图5A显示以下组之间的各脑目标区域(ROI)的MRI体积(mm3)的最小二乘方(LS)平均变化的差异:VX15处理组,评价自第7个月起到第11个月阶段(VV(12-7),n=17),和6个月后的安慰剂处理组,评价从第0天到第6个月末(PV(7-0),n=19)。包括各点的短线是95%置信区间。图5B显示图5A的相同组和脑目标区域的MRI体积的变化,表示为各组评价起始时基线的%。
图6A-B,MRI体积:VV(12-0)–PV(12-0):图6A显示以下组之间的处理满11个月的各脑目标区域(ROI)的MRI体积(mm3)的最小二乘方(LS)平均变化的差异:VX15处理组,评价自第0天起至第11个月的阶段(VV(12-0),n=17),和安慰剂/交叉处理组,评价自第0天起至第11个月的阶段(PV(12-0),n=19)。包括各点的短线是95%置信区间。图6B显示图6A的相同组和脑目标区域的MRI体积的变化,表示为各组处理起始时基线的%。
图7是星形胶质细胞中谷氨酸摄取和代谢与葡萄糖转运和糖酵解之间的联系的示意图。将谷氨酰胺转运至神经元以合成谷氨酸完成该循环。
图8A-B,VV(7-0)–PV(7-0)之间的FDG-PET信号变化:图8A显示以下组之间的6个月处理过程中各脑目标区域(ROI)FDG-PET信号(表示为SUV(标准摄取值))的最小二乘方(LS)平均变化的差异:6个月后的VX15处理组(VV(7-0),n=11)和6个月后的安慰剂处理组(PV(7-0),n=8)。ROI通过对该对象进行MRI配准来定义,且FDG-PET信号相对于参考区域(脑干)校准。对于皮质ROI,对左半球、右半球和左半球与右半球的平均值进行单独测量。包括各点的短线是95%置信区间。图8B显示图8A的相同组和脑目标区域的FDG-PET信号的变化,表示为各组处理起始时基线的%。
图9A-B,PV(12-7)–PV(7-0)之间的FDG-PET信号变化:图9A显示以下组之间的各脑目标区域(ROI)的FDG-PET信号的最小二乘方(LS)平均变化的差异:前6个月用安慰剂处理然后第7至11个月用VX15处理的组,评价自第7个月起至第11个月的阶段(PV(12-7),n=8),和前6个月用安慰剂处理的相同组,评价第0天至第6个月末(PV(7-0),n=8)。包括各点的短线是95%置信区间。图9B显示图9A的相同组和脑目标区域的FDG-PET信号的变化,表示为各组评价起始时基线的%。
图10A-B,VV(12-7)–PV(7-0)之间的FDG-PET信号变化:图10A显示以下组之间的各脑目标区域(ROI)的FDG-PET信号的最小二乘方(LS)平均变化的差异:VX15处理组,评价自第7个月起到第11个月阶段(VV(12-7),n=11),和6个月后的安慰剂处理组,评价从第0天到第6个月末(PV(7-0),n=8)。包括各点的短线是95%置信区间。图10B显示图10A的相同组和脑目标区域的FDG-PET信号的变化,表示为各组评价起始时基线的%。
图11A-B,VV(12-0)–PV(12-0)之间的FDG-PET信号变化:图12A显示以下组之间的处理满11个月的各脑目标区域(ROI)的FDG-PET信号的最小二乘方(LS)平均变化的差异:VX15处理组,评价自第0天起至第11个月的阶段(VV(12-0),n=11),和安慰剂/交叉处理组,评价自第0天起至第11个月的阶段(PV(12-0),n=8)。包括各点的短线是95%置信区间。图12B显示图12A的相同组和脑目标区域的FDG-PET信号的变化,表示为各组处理起始时基线的%。
图12显示通过MRI和FDG-PET观察到的不同VX15处理效果的示意图。
具体实施方式
定义
应注意,术语“一个”或“一种”实体指一种或多种该实体;例如,“一种结合分子”应理解为代表一种或多种结合分子。如此,本文所述术语"一个"(或"一种")、"一个或多个"和"至少一个"在本文中可互换使用。
此外,本文所用“和/或”应被视作具体公开了两种特征或组分的每一种,伴随或不伴随另一种。因此,本文短语"A和/或B"中使用的术语"和/或"旨在包括"A和B"、"A或B"、"A"(单独)和"B"(单独)。类似地,在词组中使用的术语“和/或”(例如“A、B和/或C”)指包括以下例子:A、B、和C;A、B、或C;A或C;A或B;B或C;A和C;A和B;B和C;A(单独);B(单独);和C(单独)。
除非另有定义,本文使用的科技术语与本公开所属领域普通技术人员所理解的通常含义相同。例如,《生物医药和分子生物学简明词典》(Concise Dictionary ofBiomedicine and Molecular Biology),Juo,Pei-Show,第2版,2002,CRC出版社(CRCPress);《细胞和分子生物学词典》(The Dictionary of Cell and Molecular Biology),第3版,1999,学术出版社(Academic Press);和《牛津生物化学和分子生物学辞典》(OxfordDictionary Of Biochemistry And Molecular Biology),修订,2000,牛津大学出版社(Oxford University Press),向技术人员提供了本公开使用的很多术语的常用词典。
单位、前缀和符号以它们的国际单位制(SI)接受的形式表示。数值范围包括限定该范围的数值。除非另外说明,氨基酸以氨基到羧基的取向从左到右书写。本文提供的标题不是本公开各种方面或某方面的限制,可以参考说明书整体理解本公开的各种方面或实施方式。因此,下面紧接着定义的术语完全参考说明书全文定义。
在任何用语言"包括"描述的实施方式中,也提供了"由……组成"和/或"基本由……组成"的其它类似实施方式。
本文中氨基酸由IUPAC-IUB生物化学命名委员会推荐的公知三字母符号或单字母符号表示。同样,核苷酸按其普遍接受的单字母代码指称。
本文所用的术语“多肽”意在包括单数形式“多肽”和复数形式“多肽”,指由酰胺键(也称肽键)线性连接的多个单体(氨基酸)所组成的分子。术语"多肽"指的是两个或更多个氨基酸的任何一条链或多条链,并且不表示特定长度的产物。因此,肽、二肽、三肽、寡肽、“蛋白质”、“氨基酸链”或其它任何用于指两个或多个氨基酸的一条或多条链的术语均包含于“多肽”的定义内,术语“多肽”可与任意这些术语替代或互换使用。术语"多肽"还指多肽表达后修饰的产物,所述修饰包括但不限于糖基化、乙酰基化、磷酸化、酰胺化,和通过已知保护/阻断基团、蛋白酶切割或非天然产生氨基酸修饰的衍生化。多肽可由生物来源衍生或由重组技术产生,但不必定由指定核酸序列翻译而来。其可以任何方式产生,包括通过化学合成。
本文公开的多肽的大小可以是约3个或更多个、5个或更多个、10个或更多个、20个或更多个、25个或更多个、50个或更多个、75个或更多个、100个或更多个、200个或更多个、500个或更多个、1,000个或更多个或者2,000个或更多个氨基酸。多肽可具有确定的三维结构,但它们不必定具有这种结构。具有确定三维结构的多肽被称为折叠多肽,不具有确定三维结构但能采用大量不同构象的多肽被称为非折叠多肽。本文所用的术语糖蛋白指偶联到至少一个糖部分的蛋白质,所述糖部分通过某一氨基酸如丝氨酸或天冬酰胺的含氧或含氮侧链连接于该蛋白质。
“分离的”多肽或其片段、变体或衍生物指不处于其天然环境中的多肽。对具体纯化水平没有要求。例如,可从其原生或天然环境中移出分离的多肽。在宿主细胞中表达的重组产生多肽和蛋白质被认为是如本文公开的分离的,通过任何合适技术分离、分级,或者部分或基本上纯化的天然或重组多肽也如此。
本文中所用的术语"非天然产生的多肽"或其任何语法变化形式,是条件性的限定,其明确地排除,但排除,被法官或管理部门或司法机关或可能会被法官或管理部门或司法机关确定或解释为"天然产生的"那些多肽形式。
本文公开的其它多肽是前述多肽的片段、衍生物、类似物或变体,及其任何组合。本文所述的术语"片段"、"变体"、"衍生物"和"类似物"包括保持对应的原始抗体或多肽的至少一些性质(例如,特异性结合至抗原)的任何多肽。除本文他处讨论的具体抗体片段外,多肽的片段还包括,例如,蛋白酶水解片段以及缺失片段。例如,多肽的变体包括如上所述的片段,以及因氨基酸取代、缺失或插入而具有改变的氨基酸序列的多肽。在某些方面中,变体可以是非天然产生的。可使用本领域已知的诱变技术生成非天然产生变体。变体多肽可包含保守或非保守性氨基酸取代、缺失或添加。衍生物是经改变从而显示原始多肽上不存在的其它特征的多肽。例子包括融合蛋白。多肽变体在本文中也可称作“多肽类似物”。本文所用的多肽的"衍生物"还可指:具有通过功能侧基的反应经由化学方法衍生的一个或多个氨基酸的对象多肽。“衍生物”还包括含有20种标准氨基酸中的一个或多个衍生形式的那些肽。例如,4-羟基脯氨酸可取代脯氨酸;5-羟基赖氨酸可取代赖氨酸;3-甲基组氨酸可取代组氨酸;高丝氨酸可取代丝氨酸;且鸟氨酸可取代赖氨酸。
“保守性氨基酸取代”是其中一个氨基酸被具有相似侧链的另一个氨基酸替代的情况。本领域中已定义了具有类似侧链的氨基酸的家族,包括碱性侧链(如赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、酸性侧链(如天冬氨酸、谷氨酸)、不带电荷的极性侧链(如天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸)、非极性侧链(如甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸)、β-分支侧链(如苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)和芳族侧链(如酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)。例如,苯丙氨酸取代成酪氨酸是保守取代。在某些实施方式中,本公开的多肽和抗体的序列中的保守取代不废除包含所述氨基酸序列的多肽或抗体与所述结合分子结合的抗原的结合。鉴定不消除抗原结合的核苷酸和氨基酸保守取代的方法是本领域熟知的(参见,例如,Brummell等,Biochem.32:1180-1 187(1993);Kobayashi等,Protein Eng.12(10):879-884(1999);和Burks等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 94:.412-417(1997))。
术语"多核苷酸"意在包括单个核酸和多个核酸,指分离的核酸分子或构建物,例如信使RNA(mRNA)、cDNA或质粒DNA(pDNA)。多核苷酸可包含常规磷酸二酯键或非常规键(如酰胺键,如肽核酸(PNA)中发现的酰胺键)。术语"核酸"或"核酸序列"指多核苷酸中存在的任何一种或多种核酸区段,如DNA或RNA片段。
"分离的"核酸或多核苷酸意为与其原始环境分离的核酸或多核苷酸的任何形式。例如,凝胶纯化的多核苷酸,或载体中编码所含多肽的重组多核苷酸将被视作是“分离的”。并且,认为已被工程改造以具有供于克隆的限制性位点的多核苷酸区段(例如,PCR产物)是"分离的"。分离的多核苷酸的其它示例包括在异源性宿主细胞中维持的重组多核苷酸或在非原始溶液(例如缓冲液或盐水)中(部分地或基本上)纯化的重组多核苷酸。分离的RNA分子包括多核苷酸的体内或体外RNA转录本,其中,所述转录本不是自然中存在的转录本。分离的多核苷酸或核酸还包括通过合成方式产生的此类分子。此外,多核苷酸或核酸可以是或可包括调节元件例如启动子、核糖体结合位点,或转录终止子。
本文中所用的术语"非天然产生的多核苷酸"或其任何语法变化形式,是条件性的限定,其明确地排除,但排除,被判定机构或管理部门或司法机关或可能会被判定机构或管理部门或司法机关确定或解释为"天然产生的"那些核酸或多核苷酸形式。
本文所用的术语“编码区”指由翻译成氨基酸的密码子组成的核酸部分。虽然"终止密码子"(TAG、TGA或TAA)不被翻译成氨基酸,但它可被认为是编码区的一部分,而任何侧接序列如启动子、核糖体结合位点、转录终止子、内含子等均不是编码区的一部分。两个或更多个编码区可存在于单一多核苷酸构建物中,例如在单一载体上,或者在分开的多核苷酸构建物中,例如在单独(不同)载体上。此外,任何载体均能包含单一编码区,或可包含两个或更多个编码区,例如,单一载体可分开编码免疫球蛋白重链可变区和免疫球蛋白轻链可变区。此外,载体、多核苷酸或核酸可包括异源性的编码区,其融合或不融合至另一个编码区。异源性的编码区包括不限于,编码专有的元件或基序(例如分泌信号肽或异源性的功能结构域)的那些。
在某些实施方式中,所述多核苷酸或核酸是DNA。对DNA而言,包含多肽编码核酸的多核苷酸通常包含启动子和/或其它转录或翻译控制元件,这些元件与一个或多个编码区操作性连接。操作性连接指当基因产物如多肽的编码区与一个或多个调控序列以此方式连接时,将该基因产物的表达置于所述调控序列的影响或控制下。如果启动子功能的诱导使编码所需基因产物的mRNA转录,且如果两个DNA片段间连接的属性不干扰表达调控序列指导基因产物表达或不干扰转录DNA模板的能力,则两个DNA片段(如多肽编码区及其相连的启动子)“操作性连接”。因此,如果启动子能够影响核酸的转录,则启动子区域与多肽编码核酸操作性连接。启动子可以是在预定细胞中指导DNA实质转录的细胞特异性启动子。启动子以外的其它转录控制元件如增强子、操纵基因、阻遏物和转录终止信号,能与多核苷酸可操作连接以指导细胞特异性转录。
多种转录控制区对于本领域技术人员而言是已知的。它们包括但不限于在脊椎动物细胞中发挥作用的转录控制区,例如但不限于,来自巨细胞病毒(立即早期启动子,与内含子-A联用)、猿病毒40(早期启动子)和逆转录病毒(如劳氏肉瘤病毒)的启动子和增强子区段。其它转录控制区包括源自脊椎动物基因的那些,例如肌动蛋白、热激蛋白、牛生长激素和兔β-珠蛋白,以及能够控制真核细胞中的基因表达的其它序列。其它合适的转录控制区包括组织特异性启动子和增强子以及淋巴因子诱导型启动子(例如,通过干扰素或白介素诱导的启动子)。
类似地,本领域普通技术人员了解各种翻译控制元件。它们包括但不限于:核糖体结合位点、翻译起始和终止密码子以及衍生自小核糖核酸病毒的元件(特别是内部核糖体进入位点或IRES,也称为CITE序列)。
在其它实施方式中,多核苷酸可以是RNA,例如,信使RNA(mRNA)、转移RNA或核糖体RNA的形式。
多核苷酸和核酸编码区可与编码分泌或信号肽的其它编码区相关联,所述编码分泌或信号肽引导本文所述的多核苷酸编码的多肽的分泌。根据信号假说,哺乳动物细胞分泌的蛋白质具有信号肽或分泌前导序列,一旦生长的蛋白质链跨粗面内质网的输出启动,所述序列从成熟蛋白质上切除。本领域普通技术人员了解,脊椎动物细胞分泌的多肽可具有融合于所述多肽N末端的信号肽,它们从完整或“全长”多肽上切割产生分泌或“成熟”形式的多肽。在某些实施方式中,使用天然信号肽,例如免疫球蛋白重链或轻链信号肽,或者使用仍然能够指导与其操作性相连多肽分泌的该序列的功能衍生物。或者,可采用异源性的哺乳动物信号肽或其功能衍生物。例如,野生型前导序列可用小鼠β-葡萄糖醛酸酶或人组织纤溶酶原激活剂(TPA)的前导序列取代。
本文公开了某些结合分子,或抗原结合片段、变体、或其衍生物。除非特定地述及全尺寸抗体,否则术语“结合分子”涵盖全尺寸抗体以及所述抗体的抗原结合亚基、片段、变体、类似物或衍生物,例如,以类似于抗体分子的方式结合抗原但采用不同的支架的工程改造的抗体分子或片段。
本文中所用的术语"结合分子"以其最宽泛的含义指特异性结合至受体(例如,表位或抗原决定簇)的分子。如本文进一步描述,结合分子可包含本文所述的多种“抗原结合结构域”之一。结合分子的非限制性示例是抗体或其保持抗原特异性结合性的片段、变体或衍生物。
本文中所用的术语“结合结构域”或“抗原结合结构域”指的是必需且足以特异性结合至表位的结合分子的区域。例如,“Fv”,例如,抗体的可变重链和可变轻链,作为两个分开多肽亚基形式或作为单链形式,被视作是“结合结构域”。其它结合结构域包括但不限于,源自骆驼科物种的抗体的可变重链(VHH),或在纤连蛋白支架上表达的六个免疫球蛋白互补决定区(CDR)。本文所述的“结合分子”可包括一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个、十一个、十二个或更多个“抗原结合结构域”。
术语“抗体”和“免疫球蛋白”在本文中可互换使用。抗体(或其片段、变体或衍生物,如本文所述)包括:至少重链的可变区(对于骆驼科物种而言)或至少重链和轻链的可变区。对于脊椎动物系统中的基本免疫球蛋白结构的了解相对较好。参见例如,Harlow等,《抗体:实验室手册》(Antibodies:A Laboratory Manual)(冷泉港实验室出版社(Cold SpringHarbor Laboratory Press),第2版,1988)。除非另有说明,术语“抗体”涵盖从抗体的小抗原结合片段到全尺寸抗体的范围内的任何物质,例如,IgG抗体,其包括两个完整重链和两个完整轻链,IgA抗体,其包括四个完整重链和四个完整轻链,并且任选地包括J链和/或分泌型组分,或IgM抗体,其包括十个或十二个完整重链和十个或十二个完整轻链且任选地包括J链。
正如下文中更详细讨论,术语“免疫球蛋白”包括可通过生化性质区分的各种类型多肽。本领域技术人员应理解,重链分为γ、μ、α、δ或ε(gamma、mu、alpha、delta或epsilon),其中还有一些亚类(如γ1-γ4或α1-α2)。该链的特性决定抗体"类别"分别为IgG、IgM、IgA、IgG或IgE。免疫球蛋白亚类(同种型)如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、IgA2等已被充分表征,且已知提供功能性特化。根据本文公开内容,本领域技术人员不难区分这些类别和同种型的修饰形式,因此,它们被涵盖在本公开范围内。
轻链分类为κ或λ(kappa或lambda)。各重链类别可与κ或λ轻链结合。通常,轻链和重链互相共价结合,并且当由杂交瘤、B细胞或遗传工程改造的宿主细胞生成免疫球蛋白时,两条重链的“尾”部通过共价二硫键或非共价连接结合在一起。在重链中,氨基酸从Y构型的分叉末端处的N-端到各条链的底部处的C-端。某些抗体(例如,IgG抗体)的基础结构包括两个重链亚基和两个轻链亚基,其通过二硫键共价连接以形成“Y”结构,也在本文中称为“H2L2”结构。
轻链和重链都被划分成具有结构和功能同源性的区域。从功能角度使用术语"恒定"和"可变"。在这方面,应理解可变轻(VL)链或可变重(VK)链部分的可变区决定抗原识别和特异性。相反,轻链(CL)和重链(CH1、CH2或CH3)的恒定区提供生物学性质,例如分泌、经胎盘移动、Fc受体结合、补体结合等。按照习惯,恒定区结构域的编号随着远离抗原结合位点或抗体的N末端而增加。N末端部分是可变区,并且C末端部分是恒定区;CH3(或者,在IgM的情况中,CH4)和CL结构域实际上分别包括重链和轻链的羧基端。
如上所述,可变区(即“结合结构域”)允许结合分子选择性地识别抗原上的表位并特异性地结合该表位。也即,结合分子(例如抗体)的VL结构域和VH结构域,或这些互补决定区(CDR)亚组组合形成限定三维抗原结合位点的可变区。更具体地,抗原结合位点由各VH和VL链上的三个CDR确定。某些抗体形成较大结构。例如,IgA可形成这样的分子,该分子包括两个H2L2结合单元、J链和分泌组分,其全部通过二硫键共价连接,并且IgM可形成这样的五聚或六聚分子,该分子包括五个或六个H2L2单元和任选地通过二硫键共价连接的J链。
抗体抗原结合结构域中存在的六个“互补决定区”或“CDR”是氨基酸的非连续短序列,其特异性地定位,以随着抗体在水性环境中采用其三维构型而形成结合结构域。结合结构域中的其余氨基酸称为“构架”区,显示较小的分子间差异。构架区主要采用β-片层构象,并且CDR形成连接β-片层结构且在某些情况下形成β-片层结构的部分的环。因此,构架区用于通过链间非共价相互作用形成为CDR提供正确方向位置的支架。由定位的CDR形成的结合结构域确定了与免疫反应性抗原上的表位互补的表面。这种互补表面促进了抗体与其互补表位的非共价结合。任何给定的重或轻链可变区中分别组成CDR和构架区域的氨基酸均可由本领域普通技术人员容易地鉴定,因为它们已以多种不同的方式被定义(参见,"免疫学热门蛋白质序列(Sequences of Proteins of Immunological Interest)",Kabat,E.等,美国卫生及公共服务部(U.S.Department of Health and Human Services),(1983);和Chothia和Lesk,J.Mol.Biol.,196:901-917(1987),其通过引用其全文纳入本文)。
除非明确表述为相反的含义,否则在本领域内所使用和/或接受的某一术语有两种或多种定义的情况下,本文所用的术语定义应包括所有这些含义。具体示例是使用术语"互补决定区"("CDR")描述在重链和轻链多肽的可变区内发现的非毗连抗原结合位点。这些具体的区域已被描述,例如,由Kabat等,美国卫生及公共服务部,"免疫学热门蛋白质序列(Sequences of Proteins of Immunological Interest)"(1983),和由Chothia等,J.Mol.Biol.196:901-917(1987),其通过引用纳入本文。Kabat和Chothia定义包括氨基酸在彼此比较时的重叠或子集。不过,除非另有说明,述及抗体或其变体的CDR的定义(或本领域普通技术人员已知的其它定义)意图落在本文定义或所用的术语范围之内。合适的氨基酸残基包括上文引用的各参考文献中定义的CDR,如下表1所示以作对比。涵盖具体CDR的确切氨基酸编号将根据CDR的序列和大小而变化。鉴于抗体的可变区氨基酸序列,本领域技术人员能够常规地确定哪些氨基酸包含具体CDR。
表1 CDR定义1
Kabat Chothia
VH CDR1 31-35 26-32
VH CDR2 50-65 52-58
VH CDR3 95-102 95-102
VL CDR1 24-34 26-32
VL CDR2 50-56 50-52
VL CDR3 89-97 91-96
1表1中所有CDR定义的编号均按照Kabat等所述的编号规则(见下文)。
Kabat等也定义了适用于任何抗体的可变区序列的编号系统。本领域普通技术人员能明确地将所述"Kabat编号"系统应用于任何可变区序列,而不依赖序列本身外的任何实验数据。本文所用的“Kabat编号”指由Kabat等,美国卫生与公众服务部,“免疫学热门蛋白质序列(Sequences of Proteins of Immunological Interest)”(1983)中所述的编号系统。除非明确注明采用Kabat编号系统,否则,对本公开的全部氨基酸序列采用连贯的编号。
结合分子,例如,抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物,包括但不限于,多克隆、单克隆、人、人源化的或嵌合抗体、单一链抗体、表位结合片段,例如,Fab、Fab'和F(ab')2、Fd、Fvs、单链Fvs(scFv)、单链抗体、二硫键连接的Fvs(sdFv)、包含VL或VH结构域的片段、通过Fab表达文库产生的片段。ScFv分子是本领域已知的,并且描述于例如美国专利号5,892,019。本公开所涵盖的免疫球蛋白或抗体分子可具有免疫球蛋白分子的任何类型(如IgG、IgE、IgM、IgD、IgA和IgY)、类(如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2等)或小类。
“特异性结合”一般表示结合分子,例如抗体或其片段、变体或衍生物通过其抗原结合结构域结合表位,并且该结合需要抗原结合结构域和表位之间的一些互补性。按照这一定义,当结合分子通过其抗原结合结构域与表位结合比其与随机、无关的表位结合更容易时,称该结合分子"特异性结合"该表位。本文中使用术语“特异性”定性分析某一抗体与某一表位结合的相对亲和性。例如,可认为结合分子"A"比结合分子"B"对给定表位具有更高特异性,或者可以说结合分子"A"以比其对相关表位"D"的特异性更高的特异性结合表位"C"。
可以说本文公开的结合分子,例如,抗体或其片段、变体或衍生物,以小于或等于5x 10-2-1、10-2-1、5X 10-3-1、10-3-1、5X 10-4-1、10-4-1、5X 10-5-1、或10-5-1 5X10-6-1、10-6-1、5X 10-7-1或10-7-1的解离速率(k(off))结合靶标抗原。
可以说本文公开的结合分子,例如,抗体或抗原结合片段、变体或衍生物,以大于或等于103M-1-1、5X 103M-1-1、104M-1-1、5X 104M-1-1、105M-1-1、5X 105M-1-1、106M-1-1、或5X 106M-1-1或107M-1-1的结合速率(k(on))结合靶标抗原。
如果结合分子,例如抗体或其片段、变体或衍生物,以一定程度上阻断参照抗体或抗原结合片段与表位的结合的程度优先结合该表位,则可以说,该结合分子,例如,抗体或其片段、变体或衍生物竞争性地抑制参照抗体或抗原结合片段与给定的表位的结合。可通过本领域已知的任意方法确定竞争性抑制,例如,竞争ELISA试验。可以说,结合分子竞争性地抑制参照抗体或抗原结合片段与给定表位的至少90%、至少80%、至少70%、至少60%或至少50%的结合。
本文所用的术语"亲和性"指单独表位与例如免疫球蛋白分子的一个或多个结合结构域结合的强度量度。参见例如,Harlow等,《抗体:实验室手册》(Antibodies:ALaboratory Manual)(冷泉港实验室出版社(Cold Spring Harbor Laboratory Press),第2版,1988),第27-28页。本文中所用的术语"亲和力(avidity)"指的是结合结构域的群和抗体之间的复合物的总体稳定性。参见,例如,Harlow,第29-34页。亲和力既与群体中单独结合结构域与特定表位的亲和性相关,也与免疫球蛋白分子和抗原的价态相关。例如,二价单克隆抗体和具有高度重复表位结构的抗原例如多聚体之间的相互作用是具有高亲和力的一个例子。二价单克隆抗体与以高密度存在于细胞表面上的受体之间的相互作用也将具有高亲和力。
本文公开的结合分子或其抗原结合片段、变体或衍生物也可就其交叉反应性进行描述或说明。本文所用的术语"交叉反应性"指,结合分子(例如抗体或其片段、变体或衍生物)对某一种抗原具有特异性、与第二种抗原发生反应的能力;它是两种不同抗原性物质之间关联性的量度。因此,如果结合分子与诱导其形成的表位以外的其它表位结合,则具有交叉反应性。交叉反应性表位通常含有许多与诱导表位相同的互补结构特征,在某些情况下甚至比原始表位更匹配。
结合分子,例如,抗体或其片段、变体或衍生物还可就它们与抗原的结合亲和性来描述或说明。例如,结合分子可以不超过5x 10-2M、10-2M、5x 10-3M、10-3M、5x 10-4M、10-4M、5x10-5M、10-5M、5x 10-6M、10-6M、5x 10-7M、10-7M、5x 10-8M、10-8M、5x 10-9M、10-9M、5x 10-10M、10-10M、5x 10-11M、10-11M、5x 10-12M、10-12M、5x 10-13M、10-13M、5x 10-14M、10-14M、5x 10-15M或10-15M的解离常数或KD结合抗原。
包括单链抗体或其它结合结构域的抗体片段可单独存在或联合以下的一种或多种存在:铰链区、CH1、CH2、CH3或CH4结构域,J链或分泌组件。还包括抗原结合片段,其可包括一个或多个可变区与铰链区、CH1、CH2、CH3或CH4结构域、J链或分泌型组分中的一个或多个的任何组合。结合分子,例如,抗体或其抗原结合片段,可来自任何动物来源,包括鸟类和哺乳动物。所述抗体可以是人、鼠、驴、兔、山羊、豚鼠、骆驼、美洲鸵、马或鸡抗体。在另一个实施方式中,可变区可以是软骨鱼(condricthoid)来源(例如,来自鲨鱼)。本文中所用的"人"抗体包括,具有人免疫球蛋白的氨基酸序列的抗体,且包括从人免疫球蛋白文库分离或来自一种或多种人免疫球蛋白的动物转基因的抗体,并且其可在一些示例中表达内源性免疫球蛋白,但一些则不是,如下文所述,例如,描述于Kucherlapati等的美国专利号5,939,598。
本文中所用的术语“重链亚基”包括这样的氨基酸序列,其源自免疫球蛋白重链、结合分子,例如,包含重链亚基的抗体,包括如下至少一项:VH结构域、CH1结构域、铰链(例如,上部、中部和/或下部铰链区)结构域、CH2结构域、CH3结构域、CH4结构域,或其变体或片段。例如,结合分子,例如,抗体或其片段、变体或衍生物,除了VH结构域以外,还可包括但不限于:CH1结构域;CH1结构域、铰链和CH2结构域;CH1结构域和CH3结构域;CH1结构域、铰链和CH3结构域;或CH1结构域、铰链结构域,CH2结构域和CH3结构域。在某些方面中,结合分子,例如,抗体或其片段、变体或衍生物,除VH结构域以外,还可包括,CH3结构域和CH4结构域;或CH3结构域、CH4结构域和J链。此外,用于本公开的结合分子可缺乏某些恒定区部分,例如,CH2结构域的全部或部分。本领域普通技术人员应理解,可修饰这些结构域(例如重链亚基),从而其氨基酸序列不同于原始免疫球蛋白分子。
结合分子(例如抗体或其片段、变体或衍生物)的重链亚基可以包括衍生自不同免疫球蛋白分子的结构域。例如,多肽的重链亚基可以包括衍生自IgG1分子的CH1结构域和衍生自IgG3分子的铰链区。在另一个示例中,重链亚基可以包括部分衍生自IgG1分子和部分衍生自IgG3分子的绞链区。在另一个示例中,重链部分可以包括部分衍生自IgG1分子和部分衍生自IgG4分子的嵌合铰链。
本文所用的术语“轻链亚基”包括衍生自免疫球蛋白轻链的氨基酸序列。轻链亚基包括VL或CL(例如,Cκ或Cλ)结构域中的至少一个。
结合分子,例如,抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可就它们识别或特异性结合的表位或抗原部分进行描述或说明。靶抗原与抗体的抗原结合结构域特异性相互作用的部分是“表位”或“抗原决定簇”。靶抗原可包含单个表位,或至少两个表位,并可包括任意数量的表位,这取决于抗原的大小、构象和类型。
如前所述,各种免疫球蛋白类别的恒定区的亚基结构和三维构型是众所周知的。本文所用的术语“VH结构域”包括免疫球蛋白重链的氨基末端可变区,术语“CH1结构域”包括免疫球蛋白重链的第一(最靠氨基末端)恒定区结构域。CH1结构域邻近VH结构域,并且位于典型免疫球蛋白重链分子的铰链区的氨基末端。
本文所用的术语“CH2结构域”包括这样的重链分子部分,其例如从IgG抗体的约氨基酸244延伸到氨基酸360,采用常规的编号方案(氨基酸244至360,Kabat编号系统;和氨基酸231-340,EU编号系统;参见Kabat EA等,同前)。CH3结构域从CH2结构域延伸至IgG分子的C末端并且包含约108个氨基酸。某些免疫球蛋白类别,例如,IgM,还包括CH4区。
本文所用的术语“绞链区”包括连接CH1结构域和CH2结构域的重链分子部分。该铰链区包含约25个氨基酸并且是柔性的,因此允许两个N末端抗原结合区域独立地移动。
本文所用的术语“二硫键”包括两个硫原子之间形成的共价键。氨基酸半胱氨酸包含可形成二硫键或桥接第二巯基基团的巯基基团。在某些IgG分子中,CH1和CL区域通过二硫键连接,并且两条重链通过位于对应于使用Kabat编号系统的239和242位(EU编号系统是226或229位)的两个二硫键连接。
本文所用的术语“嵌合抗体”指这样的抗体,其中免疫反应性区域或位点获自或衍生自第一物种,而恒定区(其可能是完整、一部分或修饰的)获自第二物种。在一些实施方式中,靶标结合区或位点将是来自非人来源(例如,小鼠或灵长类)并且恒定区是人的。
术语"多特异性抗体"或"双特异性抗体"指的是在单一抗体分子中具有针对两个或更多个不同的表位的结合结构域的抗体。可构建除了标准抗体结构以外的具有两种结合特异性的其它结合分子。由双特异性抗体或多特异性抗体进行的表位结合可以是同时或相继的。三元杂交瘤(trioma)和杂合杂交瘤是可分泌双特异性抗体的细胞系的两个示例。双特异性抗体还可通过重组手段构建。(和Heiss,Future Oncol.6:1387-94(2010);Mabry和Snavely,IDrugs.13:543-9(2010))。双特异性抗体也可以是双抗体(diabody)。
本文中所用的术语“工程改造的抗体”指的是这样的抗体,其中重链和轻链之一或两者中的可变区通过在CDR或构架区域的一个或多个氨基酸的至少部分替代而被改变。在某些方面中,来自具有已知特异性的抗体的整个CDR可被移植到异源性抗体的构架区域中。虽然替代性的CDR可衍生自与产生构架区的抗体属于同一类或甚至亚类的抗体,但CDR仍可衍生自不同类别的抗体,例如,不同物种的抗体。将来自具有已知特异性的非人抗体的一个或多个“供体”CDR移植到人重链或轻链构架区内形成的工程改造的抗体在本文中称为“人源化抗体”。在某些方面,并非全部CDR由来自供体可变区的完整CDR替代,而供体的抗原结合能力仍可被转移至受者可变结构域。鉴于例如美国专利号5,585,089、5,693,761、5,693,762和6,180,370中给出的解释,本领域技术人员完全有能力通过进行常规实验法或通过试验和误差检定来获得有功能的工程改造的或人源化的抗体。
本文所用的术语“工程改造的”包括通过合成手段(例如通过重组技术、体外肽合成,通过酶或化学偶联肽,或这些技术的一些组合)进行的核酸或多肽分子的操作。
本文中所用的术语“连接的”、“融合的”或“融合(体)”或其它语法等同形式可互换使用。这些术语指表示包括化学偶联或重组方式在内的各种方式将两个或更多元件或组件接合在一起。“框内融合”指以维持原始多核苷酸开放阅读框(ORF)翻译读框的方式,将两个或多个ORF连接形成连续的较长ORF。因此,重组融合蛋白是包含两个或多个区段的单一蛋白质,所述区段对应原始ORF编码的多肽(这些区段在自然条件下通常不如此连接)。尽管因此阅读框在融合片段中是连续的,但区段仍可被物理或空间分隔,如框内接头序列。例如,编码免疫球蛋白可变区CDR的多核苷酸可框内融合,但用编码至少一个免疫球蛋白构架区或额外CDR区的多核苷酸间隔开,前提是"融合的"DR作为连续多肽的一部分共同翻译。
对于多肽而言,“线性序列”或“序列”是多肽中从氨基到羧基末端方向上氨基酸的顺序,在序列中彼此相邻的氨基酸是多肽一级结构中的毗连残基。多肽的部分位于在连续的多肽链中出现得较早的多肽的另一部分的“氨基末端”或“N末端”。类似地,多肽的部分位于在连续的多肽链中出现得较晚的多肽的另一部分的“羧基末端”或“C末端”。例如,在典型的抗体中,可变区位于恒定区的“N末端”,并且恒定区位于可变区的“C末端”。
本文所用的术语“表达”指基因产生生化物质如多肽的过程。该过程包括在细胞内基因功能存在的任何表现,包括但不限于,基因敲减以及瞬时表达和稳定表达。它包括但不限于,基因转录成信使RNA(mRNA)和这类mRNA翻译成多肽。如果所需的最终产物是生化物质(biochemical),则表达包括产生该生化物质和任何前体。基因的表达产生“基因产物”。本文中所用的基因产物可以是核酸,例如,通过基因转录产生的信使RNA,或由转录本翻译的多肽。本文所述的基因产物还包括具有转录后修饰的核酸,例如聚腺苷酸化,或具有翻译后修饰的多肽,如甲基化、糖基化、加入脂质、连接其它蛋白质亚基、经蛋白酶水解切割等。
本文中所用的术语“神经炎症”指中枢神经系统(CNS)中发生的炎症,并且典型的是星形胶质细胞和小神经胶质细胞的活化,活性氧物质的产生,以及脑中促炎性细胞因子的表达,例如过表达。典型的促炎细胞因子包括但不限于白介素-6(IL-6),白介素-1β(IL-1β)和肿瘤坏死因子α(TNF-α)。神经炎症可由疾病、病症或损伤,例如多发性硬化症(MS)、脑膜炎、脑水肿、脊髓损伤、创伤性脑损伤、病毒或细菌感染、环境暴露如污染或毒素、衰老或其组合引起。在某些情况下,神经炎症可能是后续神经退行性变至脑的原因,在其它情况下,神经炎症可能是神经退行性变的结果。
如本文所用,术语“神经退行性变”是指CNS和脑中细胞的实际分解,损伤或死亡,例如神经元或其它脑细胞的结构和/或功能的丧失。神经退行性变可以是神经炎症的结果和/或神经炎症的原因。
如本文所用,术语“神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤”是指最终导致神经炎症或神经退行性变的疾病、病症或损伤的全部范围。实例包括但不限于阿尔茨海默病,帕金森氏病,亨廷顿病,唐氏综合症,共济失调,肌萎缩侧索硬化症(ALS),多发性硬化症,(MS),癫痫,脑膜炎,脑水肿,脊髓损伤,创伤性脑损伤,额颞部痴呆(FTD),HIV相关的认知障碍,CNS狼疮,轻度认知障碍或其组合。
术语例如“处理”或“治疗”或“以治疗”或“缓解”或“以缓解"指的是治愈、减缓、减少现存的已经诊断的病理病症或紊乱的症状,和/或截停或减缓现存的已经诊断的病理病症或紊乱的进展的治疗性措施。术语例如“预防”、“防御”、“避免”、“遏制”等指的是预防未经诊断的目标病理病症或紊乱的进展的预防性的或预防用的措施。因此,“需要治疗的那些(对象)”可包括已经患有疾病的那些(对象);易于患有疾病的那些(对象);和需要预防疾病的那些(对象)。
术语“治疗有效量”是指对“治疗”对象或哺乳动物中的疾病、病症或损伤而言有效的抗体、多肽、多核苷酸、小有机分子或其它药物的量。在癌症的情况中,治疗有效量的药物可减少癌细胞的数量;阻滞或停止癌细胞分裂、降低或阻滞肿瘤尺寸增加;抑制,例如,压制、阻滞、防止、停止、延迟或逆转癌细胞浸润至周边器官,包括,例如,癌症扩散到软组织和骨;抑制,例如,压制、阻滞、防止、收缩、停止、延迟或逆转肿瘤转移;抑制,例如,压制、阻滞、防止、停止、延迟或逆转肿瘤生长;一定程度上缓解与癌症相关的一种或多种症状,降低发病率和死亡率;改善生活质量;或这些效果的组合。就药物预防生长和/或杀伤存在的癌细胞的程度而言,其可以指代抑制细胞生长的和/或细胞毒性的。
述及“对象”或“个体”或“动物”或“患者”或“哺乳动物”,其指需要诊断、预防或治疗的任何对象,特别是哺乳动物对象。哺乳动物对象包括人、家养动物、家畜和动物园动物、竞技动物或宠物,如犬、猫、豚鼠、兔、大鼠、小鼠、马、猪、奶牛、熊等。
如本文所用,短语例如“将受益于治疗的对象”和“需要治疗的动物”包括受益于给予本文所述疗法的对象,例如哺乳动物对象。
本文所用术语“医疗服务提供者”是指直接接触或向活的对象(例如人类患者)给予治疗的个人或机构。医疗提供者的非限制性示例包括医生、护士、技师、治疗师、药师、顾问、替代医学从业者、医学设备、医生办公室、医院、急救室、诊所、急救中心、替代医学诊所/设备、和提供关于患者健康状态的全部或任意部分的一般和/或特殊治疗、评价、维持、疗法、医药和/或建议的任意其它实体,包括但不限于一般医学、特殊医学、手术、和/或任何其它类型治疗、评价、维持、疗法、医药和/或建议。
如本文所用,术语“临床实验室”指用于获得数据和/或检查和/或处理从活的对象中获得的数据和/或源自活的对象(例如,人)的材料的设施。处理的非限制性实例包括对象的射线照相(例如,X射线),荧光照相,断层摄影(例如,正电子发射断层扫描或PET扫描)或磁共振(MRI)成像,对人体源性材料的生物学,生物化学,血清学,化学,免疫血液学,血液学,生物物理学,细胞学,病理学,遗传学或其它检查,目的是提供数据或信息,例如用于诊断、预防或治疗任何疾病或损伤,或评估活体对象(例如,人)的健康状况。这些检查可包括获得对象的成像数据,收集或以其它方式获得样品,准备、确定、测量或以其它方式描述活的对象(例如,人)身体中或获自活的对象(例如,人)的身体的样品中各种物质的存在或不存在的操作。
本文所用术语“医疗服务提供者”包括整体或部分提供、赠予、供应、支付,或者与给予患者一种或多种医疗福利、福利计划、健康保险和/或医疗费用账户计划的渠道的个体部门、组织或集团。
在一些方面,医疗服务提供者可管理或指示另一医疗服务提供者给予治疗以治疗特定疾病、病症或损伤。医疗服务提供者可在第一医疗服务提供者的控制下实施或指示另一医疗服务提供者或患者执行以下行为:提交对于患者的成像研究或对患者进行成像研究,获取样品,处理样品,提交样品,接收样品,转移样品,分析或测量样品,量化样品,提供分析/测量/定量样品后获得的结果,接收分析/测量/量化样品后获得的结果,比较/评分在分析/测量/量化一个或多个样品后获得的结果,提供来自一个或多个样品的比较/得分,从一个或多个样品获得比较/得分,给予治疗(例如,比较基线成像结果与治疗方案后获得的结果),开始给予治疗,停止给予治疗,继续给予治疗,暂时中断给予治疗,增加给予的治疗剂的量,减少给予的治疗剂的量,继续给予一定量的治疗剂,增加治疗剂的给予频率,降低治疗剂的给予频率,保持相同的治疗剂给药频率,用至少另一种疗法或治疗剂替代疗法或治疗剂,将疗法或治疗剂与至少另一种疗法或其它治疗剂组合。
在一些方面中,医疗提供者可授权或拒绝例如,成像研究、收集样品、处理样品、提交样品、接收样品、转移样品、分析或测量样品、定量样品、提供在分析/测量/定量样品之后得到的结果、转移在分析/测量/定量样品之后得到的结果、比较/评分在分析/测量/定量一个或多个样品之后得到的结果、转移来自一个或多个样品的比较/得分、给予治疗或治疗剂、开始给予治疗或治疗剂、停止给予治疗或治疗剂、持续给予治疗或治疗剂、暂时中断给予治疗或治疗剂、增加给予的治疗剂的量、减少给予的治疗剂的量、继续给予一定量的治疗剂、增加给予治疗剂的频率、降低给予治疗剂的频率、维持治疗剂的相同给药频率、由至少一种其它治疗或治疗剂取代治疗或治疗剂、或将治疗或治疗剂与至少一种其它治疗或治疗剂组合。在某些方面,医疗服务益处提供者可基于伴随诊断测定的结果来授权或拒绝治疗,例如,显示某种疗法在给定的个体患者中是否有效的成像研究。
在某些方面,临床实验室可以,例如,根据医疗服务提供者的命令对患者进行成像研究,比较基线和给药治疗后的随访成像研究,收集或获取样品,处理样品,提交样品,接收样品,转移样品,分析或检测样品,量化样品,提供分析/测量/定量样品后获得的结果,接收分析/测量/量化样品后获得的结果,比较/评分在分析/测量/量化一个或多个样品后获得的结果,提供来自一个或多个样品的比较/得分,从一个或多个样品获得比较/得分,或其它相关活动。临床实验室通常执行由医疗服务提供者或医疗服务益处提供者指令的测试,并且通常在医疗服务提供者和/或医疗服务益处提供者的控制下工作,或者在与医疗服务提供者和/或医疗服务益处提供者的联合企业中工作。
靶标多肽描述-SEMA4D
本文所用术语“脑信号蛋白-4D”、“SEMA4D”和“SEMA4D多肽”可互换使用,如“SEMA4D”和“Sema4D”。在某些实施方式中,SEMA4D表达在细胞表面上或由细胞分泌。在另一个实施方式中,SEMA4D是膜结合的。在另一个实施方式中,SEMA4D是可溶的,例如sSEMA4D。在另一实施方式中,SEMA4D可包括完整大小的SEMA4D或其片段,或SEMA4D变体多肽,其中SEMA4D或SEMA4D变体多肽的片段保留完整大小的SEMA4D的一些或全部功能性质。
完整大小的人SEMA4D蛋白是由两条150kDa的多肽链组成的同二聚体跨膜蛋白。SEMA4D属于脑信号蛋白家族细胞表面受体并且也称为CD100。人和小鼠SEMA4D/Sema4D从其跨膜形式经蛋白水解切割以形成120-kDa可溶性形式,产生两种Sema4D同种型(Kumanogoh等,J.Cell Science 116(7):3464(2003))。脑信号蛋白由原始定义为轴突引导因子的可溶性膜结合蛋白组成,所述轴突引导因子在建立神经元与其合适靶标的精确连接中起到重要作用。从结构上考虑,IV类脑信号蛋白,SEMA4D,由氨基末端信号序列后跟特征性“Sema”结构域组成,其含有17个保守的半胱氨酸残基、Ig-样结构域、富赖氨酸伸长段、疏水性跨膜结构域和胞质尾。
SEMA4D多肽包含约13个氨基酸的信号序列,之后是约512个氨基酸的脑信号蛋白结构域,约65个氨基酸的免疫球蛋白样(Ig-样)结构域,104个氨基酸的富赖氨酸伸长段,约19个氨基酸的疏水性跨膜区,和110个氨基酸的胞质尾。胞质尾中酪氨酸磷酸化的共有位点支持SEMA4D与酪氨酸激酶的预期联合(Schlossman等编,(1995)Leucocyte Typing V(牛津,牛经大学出版社(Oxford University Press,Oxford)))。
SEMA4D已知具有至少3个功能性受体,丛蛋白-B1、丛蛋白-B2和CD72。丛蛋白-B1在非淋巴组织中表达并且已经显示为SEMA4D的高亲和性(1nM)受体(Tamagnone等,Cell 99:71-80(1999))。已显示丛蛋白-B1信号转导的SEMA4D刺激诱导神经元的生长锥塌陷,并且诱导少突细胞的突起延伸塌陷(process extension collapse)和凋亡(Giraudon等,J.Immunol.172:1246-1255(2004);Giraudon等,NeuroMolecular Med.7:207-216(2005))。在与SEMA4D结合之后,丛蛋白B1信号转导介导R-Ras的失活,导致整联蛋白介导的胞外基质粘附减少,以及RhoA的激活,导致通过重组细胞骨架的细胞塌陷。参见Kruger等,NatureRev.Mol.Cell Biol.6:789-800(2005);Pasterkamp,TRENDS in Cell Biology 15:61-64(2005)。丛蛋白-B2对SEMA4D具有瞬时亲和性,并且近期报告表明PLXNB2在角质细胞上表达并且激活SEMA4D阳性γδT细胞以促进上皮细胞修复(Witherden等,Immunity.2012年8月24日;37(2):314-25)。
在淋巴组织中,CD72用作低亲和性(300nM)SEMA4D受体(Kumanogoh等,Immunity13:621-631(2000))。B细胞和抗原呈递细胞(APC)表达CD72,并且抗-CD72抗体的许多作用与sSEMA4D相同,如增强CD40-诱导的B细胞应答和B细胞CD23脱落。认为CD72通过招募酪蛋白磷酸酶SHP-1发挥B细胞应答的负调节物的作用,其可与许多抑制性受体联合。SEMA4D与CD72的相互作用导致SHP-1的解离,以及这种负激活信号的失去。已经证明SEMA4D促进T细胞刺激和B细胞聚集与存活(体外)。SEMA4D表达型细胞或sSEMA4D的添加体外增强CD40诱导的B细胞增殖和免疫球蛋白产生,并且体内加快抗体应答(Ishida等,Inter.Immunol.15:1027-1034(2003);Kumanogoh和H.Kukutani,Trends in Immunol.22:670-676(2001))。sSEMA4D增强CD40诱导的DC成熟,包括共刺激分子上调和增加的IL-12分泌。另外,sSEMA4D可抑制免疫细胞迁移,这可通过添加阻断性抗-SEMA4D小鼠抗体来逆转(Elhabazi等,J.Immunol.166:4341-4347(2001);Delaire等,J.Immunol.166:4348-4354(2001))。
Sema4D在包括脾脏、胸腺和淋巴结的淋巴器官中以及如脑、心脏和肾脏的非淋巴器官中以高水平表达。在淋巴器官中,Sema4D在静息T细胞上大量表达,但是在静息B细胞和抗原呈递细胞(APC)如树突细胞(DC)上仅弱表达。
细胞激活增加了SEMA4D的表面表达以及可溶性SEMA4D(sSEMA4D)的生成。SEMA4D的表达特性表明其在免疫系统中起到重要的生理和病理作用。SEMA4D已经显示促进B细胞激活、聚集和存活;增强CD40-诱导的增殖和抗体产生;增强对T细胞以来抗原的抗体响应;增加T细胞增殖;增强树突细胞成熟和刺激T细胞的能力;和直接涉及脱髓鞘和轴突变性(Shi等,Immunity 13:633-642(2000);Kumanogoh等,J Immunol 169:1175-1181(2002);和Watanabe等,J Immunol 167:4321-4328(2001))。
抗-SEMA4D抗体
已经在本领域中描述了结合SEMA4D的抗体。参见例如,美国公开号2008/0219971A1、US 2010/0285036 A1和US 2006/0233793 A1、国际专利申请WO 93/14125、WO 2008/100995和WO 2010/129917,以及Herold等,Int.Immunol.7(1):1-8(1995),其各自通过引用全文纳入本文。在某些方面中,本文提供的抗体是SEMA4D拮抗剂抗体,其中它们干扰、抑制、阻遏或破坏SEMA4D的一种或多种活性或功能。
在某些实施方式中,SEMA4D拮抗剂抗体阻遏SEMA4D与其受体中的一种或多种,例如丛蛋白-B1、丛蛋白-B2和/或CD72的相互作用。具有这些性质的抗-SEMA4D抗体可用于本文提供的方法。可使用的抗体包括,但不限于MAbs VX15/2503,67,76,2282及其抗原结合片段、变体或衍生物,其全部描述于US 2010/0285036 A1和US 2008/0219971 A1。本文中MabVX15/2503也称作“VX15”,这些术语可互换使用。VX15包含具有氨基酸序列SEQ ID NO:1的重链可变区和具有氨基酸序列SEQ ID NO:5的轻链可变区。可用于本文提供的方法的其它抗体包括US 2006/0233793 A1中所述的BD16抗体及其抗原结合片段、变体或衍生物;或MAb301、MAb 1893、MAb 657、MAb 1807、MAb 1656、MAb 1808、Mab 59、MAb 2191、MAb 2274、MAb2275、MAb 2276、MAb 2277、MAb 2278、MAb 2279、MAb 2280、MAb 2281、MAb 2282、MAb 2283、MAb 2284和MAb 2285中的任何一种,及其任何片段、变体或衍生物,如US 2008/0219971 A1所述。在某些实施方式中,用于本文提供的方法的抗-SEMA4D抗体结合人、鼠、或人和鼠SEMA4D。还可使用与任意前述抗体结合相同表位的抗体和/或竞争性抑制任意前述抗体的结合或活性的抗体。
在某些实施方式中,可用于本文提供的方法的抗-SEMA4D抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物具有与参照抗-SEMA4D抗体分子的氨基酸序列具有至少约80%、约85%、约88%、约89%、约90%、约91%、约92%、约93%、约94%或约95%序列相同性的氨基酸序列,例如,上述的那些。在另一个实施方式中,所述结合分子与参照抗体共有至少约96%、约97%、约98%、约99%或100%的序列相同性。
在某些方面中,SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可以抑制SEMA4D与其受体例如丛蛋白-B1、丛蛋白-B2或CD72的相互作用。在某些方面中,SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可以抑制SEMA4D介导的丛蛋白-B1信号转导。
在某些方面中,SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物竞争性地抑制参照抗体结合SEMA4D,所述参照抗体包含含有氨基酸序列SEQ ID NO:1的可变重链区(VH)和含有氨基酸序列SEQ ID NO:5的可变轻链区(VL)。在某些方面中,SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物结合与参照抗体相同的SEMA4D表位,所述参照抗体包含含有氨基酸序列SEQ ID NO:1的VH和含有氨基酸序列SEQ ID NO:5的VL。在某些方面中,SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物的VH包含3个互补决定区(CDR):HCDR1、HCDR2和HCDR3,并且VL包含3个cCDR:LCDR1、LCDR2和LCDR3,所述CDR分别包含氨基酸序列SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8,除了在一个或多个CDR中至少一个、两个、三个、四个、五个或六个单个保守氨基酸取代之外。在某些方面中,CDR分别包含氨基酸序列SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQID NO:6、SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8。
在某些方面中,SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物的VH包含与SEQ ID NO:1至少70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%相同的氨基酸序列并且SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物的VL包含与SEQ ID NO:5至少70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%相同的氨基酸序列;或者VH包含与SEQ ID NO:9至少70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%相同的氨基酸序列并且VL包含与SEQ ID NO:10至少70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%相同的氨基酸序列。在某些方面中,VH包含氨基酸序列SEQ ID NO:1,且VL包含氨基酸序列SEQ ID NO:5;或者VH包含氨基酸序列SEQ IDNO:9,且VL包含氨基酸序列SEQ ID NO:10。
本文提供的方法中使用的还包括编码本文所述的抗-SEMA4D抗体,或其抗原结合片段、变体或衍生物的多肽,编码这类多肽的多核苷酸,包含这类多核苷酸的载体,和包含这类载体或多核苷酸的宿主细胞,全部用于产生用于本文所述方法的抗-SEMA4D抗体,或其抗原结合片段、变体或衍生物。
本发明SEMA4D拮抗剂抗体的合适生物活性变体可用于本发明的方法。这种变体将保持母体抗-SEMA4D抗体的所需结合性质。本领域中制备抗体变体的方法通常是可得的。
诱变和改变核苷酸序列的方法本领域中熟知。参见例如,Walker和Gaastra编(1983)Techniques in Molecular Biology(《分子生物学技术》)(纽约麦克米兰出版公司(MacMillan Publishing Company));Kunkel,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:488-492(1985);Kunkel等,Methods Enzymol.154:367-382(1987);Sambrook等(1989)MolecularCloning:A Laboratory Manual(《分子克隆:实验室手册》)(纽约州冷泉港(Cold SpringHarbor,N.Y.));美国专利号4,873,192;以及其中引用的参考文献;其通过引用纳入本文。有关不影响感兴趣多肽生物学活性的合适氨基酸取代的指南可参见下述文献中的模型:Dayhoff等(1978),Atlas of Protein Sequence and Structure(《蛋白质序列和结构图册》)(华盛顿特区的国家生物医学研究基金会(Natl.Biomed.Res.Found.,Washington,D.C.)),第345-352页,通过引用全文纳入本文。Dayhoff等的模型利用单点可接受突变(Point Accepted Mutation,PAM)氨基酸相似矩阵(PAM 250矩阵)来确定合适的保守性氨基酸取代。在某些方面中,使用保守取代,如用具有相似特性的另一氨基酸替换一种氨基酸。Dayhoff等模型的PAM 250矩阵中教导的保守性氨基酸取代的示例包括但不限于:
构建所述SEMA4D拮抗剂结合分子的变体如抗体或其抗原结合片段、感兴趣多肽时,生成修饰,从而变体持续拥有所需属性,如能特异性结合SEMA4D,如人、灵长动物、鼠、或者人和鼠的SEMA4D,例如在表面上表达或由细胞分泌,并具有SEMA4D阻断活性,如本文所述。在某些方面中,编码变体多肽的DNA中产生的突变维持阅读框并且不产生可生成二级mRNA结构的互补区。参见欧洲专利申请公开号75,444。
测量抗-SEMA4D结合分子如抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物的结合特异性的方法包括但不限于:标准竞争结合实验、T细胞或B细胞的免疫球蛋白分泌的监测试验、T细胞增殖实验、凋亡实验、ELISA实验等。参见例如,WO 93/14125;Shi等,Immunity 13:633-642(2000);Kumanogoh等,J Immunol 169:1175-1181(2002);Watanabe等,J Immunol 167:4321-4328(2001);Wang等,Blood 97:3498-3504(2001);和Giraudon等,J Immunol 172(2):1246-1255(2004)公开的实验,其都通过引用纳入本文。
用于测量抗-SEMA4D抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物的抗-血管生成能力的方法是本领域所熟知的。
本文在讨论本文公开的任何具体多肽(包括恒定区、CDR、VH结构域或VL结构域)是否与另一多肽至少约65%、约70%、约75%、约80%、约85%、约90%、约91%、约92%、约93%、约94%、约95%、约96%、约97%、约98%、约99%或者甚至约100%相同时,相同性%可采用本领域已知的方法和计算机程序/软件测定,例如但不限于BESTFIT程序(威斯康星序列分析软件包,用于Unix系统的第8版,遗传学计算机团队(Genetics Computer Group),威斯康星州麦迪逊科学大道575大学研究园(University Research Park),53711)。53711).BESTFIT利用Smith和Waterman(1981)Adv.Appl.Math.2:482-489的局部同源性算法,以找到两条序列之间的最佳同源性区段。使用BESTFIT或任何其它序列比对程序来确定某具体序列是否与本发明所述参照序列(例如)95%相同时,当然要设定参数从而在参照多肽序列的全长上计算相同性百分数,并且在参照序列的氨基酸总数中允许多至5%的同源性缺口。
出于本发明的目的,可采用史密斯-沃特曼(Smith-Waterman)同源性搜索算法测定序列相同性百分数,该算法使用仿射缺口搜索,其中缺口开放罚12分,缺口延伸罚2分,BLOSUM矩阵计62分。Smith和Waterman(1981)Adv.Appl.Math.2:482-489中公开了史密斯-沃特曼同源性检索算法。变体与参照抗SEMA4D抗体(如MAb VX15/2503、67、76或2282)可以相差例如少至1-15个氨基酸残基,少至1-10个氨基酸残基,如6-10个,少至5个,少至4、3、2或甚至1个氨基酸残基。
可以多种方式使抗-SEMA4D抗体的恒定区突变从而改变效应物功能。参见例如美国专利号6,737,056B1和美国专利申请公开号2004/0132101A1,其公开了使抗体与Fc受体的结合最优化的Fc突变。
在可用于本文提供的方法的抗-SEMA4D抗体或其片段、变体或衍生物中,可使用本领域已知的技术突变Fc部分以降低效应物功能。例如,恒定区结构域的缺失或失活(通过点突变或其它方式)可降低循环的修饰抗体与Fc受体的结合,从而提高肿瘤定位。在其它情况中,与本发明一致的恒定区修饰对互补结合进行调节并因此缩短血清半衰期。可利用恒定区的其它修饰来改变二硫键连接或寡糖部分,能因抗原特异性或抗体灵活性提高而加强定位。无需过多实验,即可容易地利用熟知的免疫学技术测定或定量分析修饰所产生的生理学概况、生物利用度和其它生化作用,如肿瘤定位、生物分布和血清半衰期。
用于本文提供的方法的抗-SEMA4D抗体包括修饰的衍生物,例如通过将任何类型的分子共价连接到抗体上,其中该共价连接不会阻碍抗体特异性结合其关联表位。例如但不限于,抗体衍生物包括通过例如糖基化、乙酰化、PEG化、磷酸化、酰胺化、由已知保护/阻断基团进行的衍生化、蛋白水解切割、连接于细胞配体或其它蛋白质等方法修饰的抗体。通过已知技术可进行任意多种化学修饰,包括但不限于:特异性化学切割、乙酰化、甲酰化等。此外,衍生物可包含一种或多种非经典氨基酸。
“保守性氨基酸取代”是氨基酸残基被具有带相似电荷的侧链的氨基酸残基取代。本领域已定义具有带相似电荷的侧链的氨基酸残基家族。这些家族包括:具有碱性侧链的氨基酸(如赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、具有酸性侧链的氨基酸(如天冬氨酸、谷氨酸)、具有不带电极性侧链的氨基酸(如甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸)、具有非极性侧链的氨基酸(如丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸)、具有β-分支侧链的氨基酸(如苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)和具有芳族侧链的氨基酸(如酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)。或者,也可沿编码序列的全部或部分随机引入突变(例如通过饱和诱变),然后可筛选所得突变体的生物学活性,以鉴定保持活性(例如,结合抗SEMA4D多肽的能力或阻遏SEMA4D与其受体相互作用的能力)的突变体。
例如,可仅在抗体分子的构架区内或仅在CDR区内引入突变。引入的突变可以是沉默或天然错义突变,即对抗体结合抗原的能力没有或几乎没有影响。可使用这些突变类型来优化密码子使用,或提高杂交瘤的抗体生成。或者,非天然错义突变可改变抗体结合抗原的能力。本领域技术人员将能够设计并测试具有所需性质的突变体分子,如没有抗原结合活性或结合活性的变化(例如,改善抗原结合活性或改变抗体特异性)。诱变之后,编码的蛋白质可经常规表达并且能使用本文所述的技术或者通过本领域已知的常规修饰技术来确定编码的蛋白质的功能和/或生物活性(例如,免疫特异性结合SEMA4D多肽的至少一个表位的能力)。
在某些实施方式中,用于本文提供的方法的SEMA4D拮抗剂抗体包含至少一个优化的互补决定区(CDR)。述及“优化的CDR”意指该CDR已经修饰并且经优化以提高包含优化的CDR的抗-SEMA4D抗体的结合亲和性和/或抗-SEMA4D活性。“抗-SEMA4D活性”或“SEMA4D阻断活性”可包括调节下列一种或多种SEMA4D相关活性的活性:B细胞活性、聚集和存活;CD40-诱导的增殖和抗体产生;对T细胞依赖抗原的抗体应答;T细胞或其它免疫细胞增殖;树突细胞成熟;脱髓鞘和轴突变性;多潜能神经前体和/或少突细胞的凋亡;诱导内皮细胞迁移;抑制自发性单核细胞迁移;抑制、延迟或减少肿瘤细胞生长或转移,与细胞表面丛蛋白B1或其它受体结合,或者与可溶性SEMA4D或SEMA4D+细胞表面上表达的SEMA4D相关的任意其它活性。在特定的实施方式中,抗-SEMA4D活性包括抑制、延迟或减少肿瘤转移的能力,与对于原代肿瘤细胞生长和肿瘤转移的抑制、延迟或减少相联合,或独立于原代肿瘤细胞生长和肿瘤转移。抗-SEMA4D活性也可导致与SEMA4D表达相关的疾病的发病或严重性降低,包括但不限于某些类型的癌症包括淋巴瘤,自身免疫疾病,炎性疾病包括中枢神经系统(CNS)和外周神经系统(PNS)炎性疾病,移植排斥和侵入性血管生成。基于鼠抗-SEMA4D MAb BD16的优化的抗体的示例描述于美国专利公开号2008/0219971 A1、国际专利申请号WO 93/14125和Herold等,Int.Immunol.7(1):1-8(1995),其各自通过引用全文纳入本文。修饰可包括取代CDR内的氨基酸残基,使得抗-SEMA4D抗体保留对SEMA4D抗原的特异性并且具有改善的结合亲和性和/或改善的抗-SEMA4D活性。
星形胶质细胞和星形胶质细胞活化
星形胶质细胞是专门的胶质细胞,其在健康的中枢神经系统中发挥许多重要的复杂功能,包括血流调节、液体/离子/pH/神经递质稳态、突触形成/功能、能量和代谢,以及血脑屏障维持(Barres BA,Neuron 60:430–440(2008))。重要的是,星形胶质细胞通过称为反应性星形胶质细胞增生的过程对CNS损伤作出响应,导致“反应性星形胶质细胞”或“星形胶质细胞活化”,这些术语在本文中可互换使用。反应性星形胶质细胞增生可作为神经炎性和神经退行性变疾病的主要病理标志。越来越多的证据指向活性星形胶质细胞在CNS疾病中通过丧失正常星形胶质细胞功能或获得异常活性而起到主要或促进作用的潜力。考虑到它们在许多CNS疾病中的核心作用,明显需要鉴定并严格测试恢复正常星形胶质细胞功能以有效减慢或者甚至逆转疾病进展的新分子靶标。星形胶质细胞可以通过几种途径影响CNS疾病。
通过由从循环到神经元的能量底物(例如,从毛细血管吸收葡萄糖)的分布影响神经元的活性,星形胶质细胞可在脑功能中发挥核心作用。参见P.Lecca,技术报告CoSBi 07/2007,特伦托大学计算与系统生物学中心(University of Trento Centre forComputational and Systems Biology),可获自网址www.cosbi.eu/research/publications?pdf=5041(末次访问2017年1月30日)。Lecca报道,神经元占大约50%的大脑皮质体积,而星形胶质细胞数量超过了神经元(同上)。单个星形胶质细胞可以与许多细胞接触。星形胶质细胞是具有多个细小突起的星形细胞,其覆盖供给大脑的毛细血管的整个表面。因此,星形胶质细胞形成葡萄糖进入脑实质时遇到的第一个细胞屏障。因此,星形胶质细胞是CNS中葡萄糖摄取的主要部位(同上)。
星形胶质细胞中葡萄糖的摄取由谷氨酸引发(参见图7,来自Raichle ME和MintunMA,Ann.Rev.Neurosci.29:449-76(2006))。Raichle和Mintun指出,谷氨酸摄取会触发星形胶质细胞中的非氧化性葡萄糖利用(有氧糖酵解)和通过葡萄糖转运蛋白GLUT1从循环中摄取葡萄糖。谷氨酸是大脑皮层的主要兴奋性神经递质(图7)。还参见Hertz,L等,J.Cerebr.Blood Flow Metab.27:219-249(2007)和Kasiscke,HD等,Science 305:99-103(2004)。星形胶质细胞突起摇动(cradle)神经元之间的突触并且可摄取游离谷氨酸并将其转化为谷氨酰胺(Maragakis,NJ和JD Rothstein Nature Clinical Practice/Neurology2:679-689(2006))。摄取和转化需要能量,每个谷氨酸摄取需要两个ATP分子。调节突触中的谷氨酸水平很重要,因为过量的兴奋性递质可引发兴奋性毒性和神经退行性变。
然而,在反应性星形胶质细胞增生期间,星形胶质细胞可以拉回它们的突起,并且不再摇动突触或摄取过量的谷氨酸。因此,可以减少星形胶质细胞中的葡萄糖代谢,特别是从毛细血管摄取葡萄糖。反应性星形胶质细胞下调谷氨酸受体和相关的糖酵解和葡萄糖转运,其可被检测为减少的FDG-PET信号。反应性星形胶质细胞增生是神经炎症和神经退行性疾病的主要病理标志。越来越多的证据指向活性星形胶质细胞在CNS疾病中通过丧失正常星形胶质细胞功能或获得异常活性而起到主要或促进作用的潜力。考虑到它们在许多CNS疾病中的核心作用,明显需要鉴定并严格测试恢复正常星形胶质细胞功能以有效减慢或者甚至逆转疾病进展的新分子靶标。存在几条星形胶质细胞可影响CNS疾病的潜在途径。
星形胶质细胞和少突胶质细胞前体细胞(OPC)支持。在神经炎性疾病(例如多发性硬化症)中发生的脱髓鞘与包含少突胶质细胞谱系的细胞的显著破坏和缺失相关(Ozawa K等.Brain 117:1311-1322(1994))。内源性髓鞘再生机制在恢复期期间失败,部分原因是OPC不能完全分化成成熟的髓鞘少突胶质细胞(Wolswijk G.Brain 123:105-115(2000))。从其它实验诱导的脱髓鞘模型获得的数据表明,与恢复成熟的少突胶质细胞相比,新近成熟的OPC是恢复期的髓鞘再生所需的(Levine JM,Reynolds R.Exp Neurol.160:333-347(1999))。已经显示星形胶质细胞在支持少突胶质细胞系的功能和活力中起显著作用。例如,Talbott及其同事显示,在溴化乙锭诱导的脱髓鞘病变中,Nkx2.2+/Olig2+OPC需要星形胶质细胞才能完全分化成少突胶质细胞并进行髓鞘再生(Talbott,JF等,Exp Neurol.192:11-24(2005))。Arai和Lo证明,在体外,星形胶质细胞为OPC提供可溶性营养因子支持,其保护这些细胞免于增加的氧化应激(Arai,K.和Lo,E.H.J.Neurosci.Res.88:758–763(2010))。其他人已显示,在实验性自身免疫性脑脊髓炎、实验性视神经炎和脊髓损伤的情况下抑制星形胶质细胞活化导致改善的髓鞘再生特征和功能性结果测量值(Brambilla R等,J Immunol 182:2628–2640(2009);Brambilla R等,J Neuroinflammation 9:213;Brambilla R等,J Exp Med 202:145–156(2005))。
考虑到星形胶质细胞在促进OPC存活和功能中起到的作用,SEMA4D-表达OPC和SEMA4D受体表达星形胶质细胞的并置表明星形胶质细胞的疾病相关激活和丛蛋白-B受体及SEMA4D信号转导的相关上调可影响OPC功能。
星形胶质细胞和神经元支持。越来越多的证据表明,星形胶质细胞通过调节释放突触活性分子(包括谷氨酸、嘌呤(ATP和腺苷)、GABA和D-丝氨酸)在突触传递中发挥作用(Halassa MM等的综述,Trends Mol Med 13:54–63(2007);Nedergaard M等.TrendsNeurosci 26:523–530(2003))。这种胶质递质的释放响应于神经元突触活性的变化而发生,涉及星形胶质细胞的兴奋性,如星形胶质细胞钙信号转导的增加所反映,并且可改变神经元兴奋性(同上)。除了通过释放胶质细胞对突触活动产生直接影响外,星形胶质细胞还有可能通过释放生长因子和相关分子对突触功能产生强大而长期的影响(Barres BANeuron 60:430–440(2008))。
星形胶质细胞和血脑屏障(BBB)的完整性。星形胶质细胞在形成血脑屏障(BBB)和调节通过BBB的转运(对于合适的神经元功能而言关键的内稳态过程)中起到重要作用。BBB是高度复杂的神经血管系统的大脑内皮结构,其包含周细胞、星形胶质细胞和内皮细胞。BBB的减弱已涉及许多神经退行性疾病,包括脑膜炎、脑水肿、癫痫、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、中风、肌萎缩侧索硬化症(ALS)和多发性硬化症(MS);综述见(Zlokovic BVNat Rev Neurosci.12:723-738(2011))。
星形胶质细胞是“极化的”细胞,其中它们延伸特殊的膜过程,包括与特定细胞类型相互作用的膜组分和独特细胞器。例如,靠近脑微血管或软脑脊膜(pia)的星形胶质细胞过程的特征在于高密度的水通道,水通道蛋白4(Aqp4)(Neely JD等,Proc Natl Acad SciUSA 98:14108-14113(2001);Amiry-Moghaddam M等,Proc Natl Acad Sci USA 100:2106-2111(2003))。相反,面向突触区域的星形胶质细胞过程富含谷氨酸转运蛋白,而Aqp4的密度相对较低(Nielsen S等,(1997)J Neurosci 17:171-180(1997);Chaudhry FA等,Neuron15:711-720(1995))。星形胶质细胞极化在经历神经退行性的大脑中被破坏。例如,在阿尔滋海默症的情况中,Aqp4染色强度在有明显淀粉样斑块负担的区域中明显降低。事实上,Yang及其同事表明,tg-ArcSwe AD小鼠中淀粉样蛋白病理的积累在时间和空间上与星形胶质细胞极化的丧失相关(Yang JL等,J Alzheimer’s Dis.27:711-22(2011))。
SEMA4D信号转导在促进星形胶质细胞活化和反应性星形胶质细胞增生中的作用。考虑到SEMA4D受体表达和星形胶质细胞活化标志物GFAP的相关性,存在SEMA4D信号转导可增强星形胶质细胞活化的可能,从而在疾病阶段期间提供“前馈”机制。参见例如,美国专利号9249227,其通过引用全文纳入本文。
脑区葡萄糖摄取增加是SEMA4D拮抗剂抗体治疗效果的早期指征
本公开内容提供了早期生物标志物测试,以确定SEMA4D拮抗剂抗体治疗是否可能有效治疗对象的神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤。该测试需要测量患者脑葡萄糖摄取的基线水平,例如通过18F-氟脱氧葡萄糖正电子发射断层扫描(FDG-PET)成像,向对象给予一种或多种初始剂量的SEMA4D拮抗剂抗体,然后重新测量对象脑中的葡萄糖摄取。例如由于在本文他处所解释的疾病病理学中反应性星形胶质细胞的累积,患有累积缺陷(在本文中有时称为历史缺陷)的患者在脑葡萄糖摄取中,将呈现对SEMA4D拮抗剂抗体治疗的响应,此时葡萄糖摄取的重新测量(例如通过FDG-PET)显示相较于基线测量值的增加。这表明葡萄糖摄取的缺乏与可通过SEMA4D拮抗剂逆转的致病机制相关。葡萄糖摄取的不足可能在开始治疗之前的数周、数月或数年内发展。如果未观察到FDG-PET信号的增加,则可以得出结论:患者对SEMA4D拮抗剂抗体治疗没有反应,因为患者没有脑葡萄糖摄取缺陷,或者该疾病或该患者中这种缺陷的致病基础无法通过SEMA4D拮抗剂治疗逆转。无论哪种方式,然后可以调整或中断用SEMA4D拮抗剂抗体的治疗。
在某些方面,本公开内容提供了用于确定脑信号蛋白4D(SEMA4D)拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物是否将有效治疗确定或特定的神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的方法,其中该方法包括:将有效量的SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物给予患有、疑似患有或有发展该神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的对象;测量对象脑中葡萄糖摄取水平,相对于给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段、变体或衍生物之前检测的对象脑中葡萄糖摄取的基线水平;和,如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段、变体或衍生物;或,如果检测到葡萄糖摄取相对于基线没有变化或降低,则停止或调整SEMA4D拮抗剂抗体或其片段、变体或衍生物的给予。
在某些方面,脑葡萄糖摄取测量可例如由临床实验室在医疗服务提供者的明确指示和控制下进行。在某些方面,医疗服务提供者可指令执行脑葡萄糖摄取测量。在某些方面,脑葡萄糖摄取测量可以由临床实验室执行,然后临床实验室可以指示或建议医疗服务提供者对对象或患者的最佳治疗。例如,该方法可以包括由临床实验室测量显示为患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的患者的脑中葡萄糖摄取的基线水平;然后,在由医疗服务提供者向对象给予SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物后,重新测量对象脑中的葡萄糖摄取水平;然后,如果检测到脑葡萄糖摄取增加超过基线,则指示医疗服务提供者继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段、变体或衍生物;或者,如果检测到葡萄糖摄取相对于基线没有变化或降低,则指示医疗服务提供者停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段、变体或衍生物。在某些方面,SEMA4D拮抗剂抗体的给予和对象脑中葡萄糖摄取的测量可由相同的人或机构进行。在某些方面,本文提供的方法可以在授权支付用SEMA4D拮抗剂抗体进一步治疗之前由医疗服务益处提供者订购。
本领域普通技术人员应理解,SEMA4D拮抗剂抗体的“有效剂量”可在个体对象或患者之间变化。本公开还提供了一种方法,其中确定个体对象的有效剂量。通过测量个体对象脑中葡萄糖摄取的变化,医疗服务提供者可以使用本文提供的方法来调整剂量,以找到针对给定对象的最有效剂量。例如,如果在给予SEMA4D拮抗剂抗体后未见葡萄糖摄取超过基线的变化或仅见小变化,则可增加抗体的剂量,然后重新测量对象脑中的葡萄糖摄取。如果随后见到变化,则医疗服务提供者可以继续用该剂量治疗对象。在某些方面,可以采取葡萄糖摄取的多次测量来“微调”针对给定对象或患者的最佳SEMA4D拮抗剂抗体剂量。但是,必须注意留出足够的时间来累积历史或同时期的亏缺(deficit),其可能会被SEMA4D拮抗剂治疗所逆转。对于各感兴趣的疾病,这可在进展非常缓慢疾病中通过将治疗恢复(resumption)从几个月延迟到几年来建立。
本公开还提供了治疗患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤风险的对象的方法,其中所述方法包括:向患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的风险的对象给予SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物;测量对象脑中葡萄糖摄取水平,相对于给药前测量的对象脑中葡萄糖摄取的基线水平,例如通过FDG-PET进行测量;如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段、变体或衍生物;或如果检测到葡萄糖摄取相对于基线没有变化或降低,则停止或调整SEMA4D拮抗剂抗体或其片段、变体或衍生物的给予。所述治疗方法还可包括测量对象的脑中葡萄糖摄取的基线水平,或者在一些方面,这种基线测量可于先前进行。
如上所述,在调整SEMA4D拮抗剂抗体的剂量后,可通过另行测量对象脑中的葡萄糖摄取来进一步“微调”治疗方法。此外,治疗的葡萄糖摄取测量可例如通过临床实验室在医疗服务提供者的明确指示和控制下进行。在某些方面,医疗服务提供者可以指令葡萄糖摄取测量作为治疗方案的一部分来执行。在某些方面,葡萄糖摄取测量可以由临床实验室执行,然后临床实验室可以指导或建议医疗服务提供者关于对象或患者的治疗。在某些方面,SEMA4D拮抗剂抗体的给予和对象脑中葡萄糖摄取的检测可由相同的人或机构进行。在某些方面,本文提供的方法可以在授权支付用SEMA4D拮抗剂抗体进一步治疗之前由医疗服务益处提供者订购。
在某些方面,用于本文提供方法的SEMA4D拮抗剂抗体或其片段、变体或衍生物可抑制SEMA4D与其受体(例如丛蛋白-B1,丛蛋白-B2或CD72)的相互作用。在某些方面,SEMA4D拮抗剂抗体或其片段、变体或衍生物可以抑制SEMA4D介导的丛蛋白-B1信号转导。在某些方面,SEMA4D拮抗剂抗体或其片段、变体或衍生物与SEMA4D拮抗剂抗体VX15有关。例如,在某些方面,SEMA4D拮抗剂抗体或其片段、变体或衍生物可竞争性地抑制或结合与VX15相同的表位,VX15即为参照抗体,其包含含有氨基酸序列SEQ ID NO:1的可变重链区(VH)和含有氨基酸序列SEQ ID NO:5的可变轻链区(VL)。在某些方面,SEMA4D拮抗剂抗体具有VH和VL,所述VH具有三个互补决定区(CDR)HCDR1、HCDR2和HCDR3,所述VL具有三个CDR LCDR1、LCDR2和LCDR3,其中所述CDR分别包含氨基酸序列SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ IDNO:6、SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8,除了在这些CDR的一个或多个中存在至少一个、两个、三个、四个、五个或六个单保守氨基酸取代。在某些方面,SEMA4D拮抗剂抗体具有VH和VL,所述VH具有三个互补决定区(CDR)HCDR1、HCDR2和HCDR3,所述VL具有三个CDR LCDR1、LCDR2和LCDR3,并且其中,所述CDR分别包含氨基酸序列SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8。在某些方面,SEMA4D拮抗剂抗体的VH具有与SEQID NO:1至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%相同的氨基酸序列,且SEMA4D拮抗剂抗体的VL具有与SEQ ID NO:5至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%相同的氨基酸序列;或者,VH具有与SEQ ID NO:9至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%相同的氨基酸序列,且VL具有与SEQ ID NO:10至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%相同的氨基酸序列。在某些方面,SEMA4D拮抗剂抗体的VH具有氨基酸序列SEQ ID NO:1,且SEMA4D拮抗剂抗体的VL具有氨基酸序列SEQ ID NO:5;或SEMA4D拮抗剂抗体的VH具有氨基酸序列SEQ ID NO:9,且SEMA4D拮抗剂抗体的VL具有氨基酸序列SEQ ID NO:10。
根据本文提供的方法,可给予第一剂量的SEMA4D拮抗剂抗体,然后可给予其它剂量的SEMA4D拮抗剂抗体,例如,至少每周一次,至少每两周一次,至少每三周一次,至少每月一次,或至少每两个月一次等等。如果根据本文提供的方法发现治疗有效,则可在需要时,在一些情况下,在对象或患者的整个寿命期间或在其它情况下持续给予SEMA4D抗体,直至对象或患者的神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤得到控制、治愈或症状减轻之时。
根据本文提供的方法,对象脑中葡萄糖摄取的基线测量值通常在第一剂量的SEMA4D拮抗剂抗体之前即刻检测,但是在某些情况下可以更早地进行,或者在某些情况下可以在第一剂量SEMA4D拮抗剂抗体后即刻进行。在评估剂量调节的那些方法中,可在第一次剂量后的一段时间内进行新的“基线”测量,所述一段时间从几个月到几年,取决于疾病进展的速率。相对于基线测量,在SEMA4D拮抗剂抗体的第一剂量后,作为SEMA4D拮抗剂抗体有效治疗标志物的葡萄糖摄取的累积或“历史”亏缺的恢复可迅速出现,或者可能需要一段时间,或者使用现有技术,例如FDG-PET,可以观察多剂量的SEMA4D拮抗剂抗体。因此,相对于基线的对象脑中的葡萄糖摄取的重新测量可如下进行,例如,在第一剂量后至少一周,第一剂量后至少两周,第一剂量后至少一个月,第一剂量后至少两个月,第一剂量后至少三个月,第一剂量后至少四个月,第一剂量后至少五个月,第一剂量后至少六个月,或甚至更晚,或其任何组合。
在某些方面,经历本文提供的方法的患者或对象是哺乳动物对象,例如啮齿动物,非人灵长类动物或人对象。
根据本文提供的方法可从给予SEMA4D拮抗剂抗体中受益的神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤可以是:例如,阿尔茨海默氏病,帕金森病,亨廷顿病,唐氏综合症,共济失调,肌萎缩侧索硬化症(ALS),多发性硬化症,(MS),癫痫,脑膜炎,脑水肿,脊髓损伤,创伤性脑损伤,额颞叶痴呆(FTD),HIV相关认知障碍,CNS狼疮,轻度认知障碍或其组合。
在某些方面,该疾病是亨廷顿病(HD),如本文他处所述。在某些方面,由于HD的家族史或遗传测试(例如,显示对象的HTT基因包含36个或更多CAG重复的测试),对象有发展HD的风险。本文提供的方法的益处是这些对象通常不表现出HD的外在症状,但显然存在风险。如实施例中所示,早期治疗可以提供优于后期治疗的益处,并且可以评估这些个体是否可以在其表现出任何外在症状之前从根据本文提供的方法用SEMA4D拮抗剂抗体治疗获益。在某些方面,对象由于例如轻度运动功能障碍、轻度认知障碍或轻度神经精神病学特征而疑似患有HD。用于确定这种轻度功能障碍的测试是本领域普通技术人员所熟知的,并且可以在文献中获得,例如,参见Bates,GP等,Nature Reviews/Disease Primers 1:1-21(2015)。在某些方面,对象因例如增高的均匀亨廷顿病评定量表评分(UHDRS)、增高的亨廷顿病认知评估套组(HD-CAB)评分、定量运动评估评分或它们的组合而被诊断为患有HD。在已知有HD风险的那些对象中,对象可处于HD的症状前阶段、HD的早期前驱阶段、HD的晚期前驱阶段,并且在诊断后,HD的早期表现阶段、HD的中期表现阶段,或HD的晚期表现阶段。HD的各个阶段的指征和症状可见于,例如Bates,GP等,Nature Reviews/Disease Primers 1:1-21(2015)。
使用SEMA4D拮抗剂抗体的治疗方法
本公开的诊断方法涉及SEMA4D拮抗剂抗体(包括其抗原结合片段、变体和衍生物)用以治疗患有神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤的对象,或用以评估对象是否会受益于采用SEMA4D拮抗剂抗体的治疗的用途。虽然以下说明涉及给予SEMA4D拮抗剂抗体,本文所述的方法也适用于保留本公开的SEMA4D拮抗剂抗体的所需性质的SEMA4D拮抗剂抗体的抗原结合片段、变体和衍生物或其它生物制剂或小分子,所述性质例如,能够特异性结合SEMA4D,例如,人、小鼠或人和小鼠SEMA4D,具有SEMA4D中和活性,和/或阻断SEMA4D与其受体(例如丛蛋白-B1)的相互作用。
在一个方面,本发明提供了如本文中所述的SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段或能够结合并中和SEMA4D的其它生物制剂或小分子向患者的给予,其中该患者患有、疑似患有或有发展神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤的风险。在另一个方面,治疗还旨在包括向患者给予包含SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段的药物组合物,其中所述患者患有、疑似患有或具有发展神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤的风险。
如本文所述的SEMA4D拮抗剂抗体或其结合片段可用于治疗各种神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤。在一些方面,治疗旨在诱导与疾病、病症或损伤相关的症状的改善。在其它实施方案中,治疗旨在减少、延缓或阻止症状表现的增加。在其它方面,治疗旨在抑制,例如抑制、延缓、预防、停止或逆转症状的表现。在其它方面,治疗旨在于一定程度上缓解与病症相关的一种或多种症状。在这些情况中,症状可以是,例如,神经精神症状、认知症状和/或运动功能障碍。在其它方面,治疗旨在降低发病率和死亡率。在其它方面,治疗旨在改善生活质量。
在一个方面,本公开涉及SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物作为药物的用途,特别是用于治疗各种神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤,以改善与病症相关的症状。
根据本公开的方法,可采用至少一种SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物,或本文他处所定义的其它生物制剂或小分子来促进关于神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤的积极(positive)治疗反应。关于神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤的“积极治疗反应”旨在包括与病症相关的症状的改善。这种积极治疗反应不仅限于给药途径,可包括给予供体、供体组织(如器官灌注)、宿主、其任何组合等。具体地,本文提供的方法涉及抑制、预防、减少、减轻或减弱患者中神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤的进展。因此,例如,疾病的改善可表征为缺乏临床可观察到的症状,临床可观察到的症状的发生率降低,或临床可观察到的症状的改变。
SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物或其它生物制剂或小分子可与用于神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤治疗的至少一种或多种其它治疗组合使用;其中在SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物治疗之前、期间或之后给予其它疗法。因此,在组合疗法包括将SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物的给予与另一种治疗剂的给予相组合的情况中,本发明的方法包括共同给予、使用单独制剂或单一药物制剂,同时或以任意顺序连续给予。
在某些方面,神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤可以是,例如,阿尔茨海默病,帕金森氏病,亨廷顿病,唐氏综合症,共济失调,肌萎缩侧索硬化症(ALS),额颞叶痴呆(FTD),HIV-相关的认知障碍,CNS狼疮,轻度认知障碍,多发性硬化,癫痫,脑膜炎或其组合。在任何上述方法的某些方面,神经退行性疾病是亨廷顿病。
在一些方面,医疗服务提供者可以管理或指示其他医疗服务提供者给予包含有效量的SEMA4D拮抗剂抗体的疗法,其中对象患有、疑似患有或有感染神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤的风险。医疗服务提供者可执行或指示其他医疗服务提供者或患者进行以下动作:获取样品或图像、处理样品或图像、提交样品或图像、接收样品或图像、转移样品或图像、分析或测量样品或图像、定量样品或图像、提供在分析/测量/定量样品或图像之后得到的结果、接收在分析/测量/定量样品或图像之后得到的结果、比较/评分在分析/测量/定量一个或多个样品或图像之后得到的结果、提供来自一个或多个样品的比较/得分、获取来自一个或多个样品或图像的比较/得分、给予治疗,例如,有效量的SEMA4D拮抗剂抗体,开始给予治疗、停止给予治疗、继续给予治疗、暂时中断给予治疗、增加给予的治疗剂的量、减少给予的治疗剂的量、继续给予一定量的治疗剂、增加给予治疗剂的频率、降低给予治疗剂的频率、保持治疗剂的相同给药频率、由至少一种其它治疗或治疗剂取代治疗或治疗剂、将治疗或治疗剂与至少一种其它治疗或治疗剂组合。
在一些方面中,医疗服务提供者可授权或拒绝例如,进行成像、收集样品或图像、处理样品或图像、提交样品或图像、接收样品或图像、转移样品或图像、分析或测量样品或图像、定量样品或图像、提供在分析/测量/定量样品或图像之后得到的结果、转移在分析/测量/定量样品或图像之后得到的结果、比较/评分在分析/测量/定量一个或多个样品或图像之后得到的结果、转移来自一个或多个样品或图像的比较/得分、给予治疗或治疗剂、开始给予治疗或治疗剂、停止给予治疗或治疗剂、持续给予治疗或治疗剂、暂时中断给予治疗或治疗剂、增加给予的治疗剂的量、减少给予的治疗剂的量、继续给予一定量的治疗剂、增加给予治疗剂的频率、降低给予治疗剂的频率、维持治疗剂的相同给药频率、由至少一种其它治疗或治疗剂取代治疗或治疗剂、或将治疗或治疗剂与至少一种其它治疗或治疗剂组合。
另外,医疗益处提供者可以,例如授权或拒绝治疗处方,授权或拒绝治疗覆盖范围,授权或拒绝治疗成本的退还,确定或拒绝治疗合格性等。
在一些方面中,临床实验室可以,例如,收集或获取样品或图像、处理样品或图像、提交样品或图像、接收样品或图像、转移样品或图像、分析或测量样品或图像、定量样品或图像、提供在分析/测量/定量样品或图像之后得到的结果、接收在分析/测量/定量样品或图像之后得到的结果、比较/评分在分析/测量/定量一个或多个样品或图像之后得到的结果、提供来自一个或多个样品或图像的比较/得分、获取来自一个或多个样品或图像的比较/得分或其它相关活动。
在某些方面,任何上述方法可用于确定对象是否患有神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤,其中葡萄糖摄取的变化可以是经受SEMA4D拮抗剂治疗的病理因素。
在一些方面中,医疗服务提供者、临床实验室、或其它实体可以,例如,收集或获取图像、处理图像、提交图像、接收图像、转移图像、分析或检测图像、定量图像、提供在分析/测量/定量图像之后得到的结果、接收在分析/测量/定量图像之后得到的结果、比较/评分在分析/测量/定量一个或多个图像之后得到的结果、提供来自一个或多个图像的比较/得分、获取来自一个或多个图像的比较/得分、或其它相关活动。可用于这些方面的图像包括但不限于通过血管造影、超声、计算机断层扫描(CT)、核磁共振成像(MRI)、正电子发射断层成像(PET),例如FDG-PET、光学相干断层成像(OCT)、近红外光谱(NIRS),和NIR荧光获得的图像。在某些实施方式中,可使用已经在文献中描述的成像技术(Tardif等.CircCardiovasc Imaging 4:319-333(2011))。
药物组合物和给药方法
本领域技术人员熟知或不难确定制备和给予SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物的方法。SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物的给药途径可以是,例如,口服、胃肠道外、吸入或外用。本文所用的术语胃肠外包括例如,静脉内、动脉内、腹膜内、肌肉内、皮下、直肠或阴道给药。虽然所有这些给药形式均明确认为在本发明范围内,但给药形式的例子是注射液,特别是用于静脉内或动脉内注射或滴注。合适的注射用药物组合物可包含缓冲剂(如乙酸盐、磷酸盐或柠檬酸盐缓冲剂)、表面活性剂(如聚山梨酯),以及任选的稳定剂(如人白蛋白)等。然而,在与本文所教授内容相符的其它方法中,SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可直接递送到不良细胞群的位点,从而增加患病组织与治疗剂的接触。
如本文所讨论的,SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可以药学有效量给予,用于体内治疗神经炎性或神经退行性疾病、病症或损伤。在这方面,应理解,将配制本发明公开的SEMA4D拮抗剂抗体以利于给药并提高活性物质的稳定性。在某些实施方式中,本发明的药物组合物包含药学上可接受的无毒无菌运载体,如生理盐水、无毒缓冲液、防腐剂等。出于本申请目的,SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物的药学有效量应认为指足以实现有效结合靶标和足以实现某一益处,例如,改善与神经退行性疾病相关的症状的量。本文提供的诊断方法允许技术人员针对任何个体对象或患者确定和/或“微调”SEMA4D拮抗剂抗体或其片段的有效量。
本发明所用的药物组合物包含药学上可接受的运载体,包括例如,离子交换剂、氧化铝、硬脂酸铝、卵磷脂,血清蛋白质如人血清白蛋白,缓冲物质如磷酸盐、甘氨酸、山梨酸、山梨酸钾、饱和植物脂肪酸的部分甘油酯混合物、水、盐或电解质,如硫酸鱼精蛋白、磷酸氢二钠、磷酸氢钾、氯化钠、锌盐、胶体二氧化硅、三硅酸镁、聚乙烯吡咯烷酮、纤维素基物质、聚乙二醇、羧甲基纤维素钠、聚丙烯酸酯、蜡、聚乙烯-聚氧丙烯-段聚合物、聚乙二醇和羊毛脂。
胃肠道外给药制剂包括无菌的水性或非水性溶液、悬液和乳液。非水性溶剂的示例是丙二醇,聚乙二醇,植物油如橄榄油,和可注射的有机酯如油酸乙酯。水性运载体包括例如,水、醇/水溶液、乳液或悬液,包括盐水和缓冲介质。在本发明中,药学上可接受的运载体包括但不限于:0.01-0.1M,例如,约0.05M的磷酸盐缓冲液或0.8%盐水。其它常见的胃肠道外载剂包括磷酸钠溶液、林格右旋糖、右旋糖和氯化钠、乳酸林格溶液或固定油。静脉内载剂包括液体和营养补充剂、电解质补充剂,例如基于林格右旋糖的那些物质等。也可存在防腐剂和其它添加剂,例如,抗微生物剂、抗氧化剂、螯合剂和惰性气体等。
更具体地,适于注射应用的药物组合物包括无菌水溶液(水溶性时)或分散液,以及用于临时制备无菌注射液或分散液的无菌粉末。在这种情况下,该组合物必须无菌,并应该是达到存在注射容易性(easy syringability)程度的流体。它应该在制造和储存条件下稳定,并且应该在保存过程中能够抵抗微生物如细菌和真菌的污染作用。运载体可以是包含如水、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇和液体聚乙二醇等)及其合适混合物的溶剂或分散介质。可维持合适的流动性,例如通过使用诸如卵磷脂的涂料、分散液情况下通过保持所需粒度以及通过使用表面活性剂。适用于本文所述治疗方法的制剂可参见《雷明顿药物科学》(Remington's Pharmaceutical Sciences)(马克出版公司(Mack Publishing Co.))第16版(1980)。
也可通过各种抗菌剂和抗真菌剂(如对羟基苯甲酸酯类、氯丁醇、苯酚、抗坏血酸、硫柳汞等)实现防止微生物的作用。在许多情况下,可以包括等渗剂,例如糖,多元醇,例如甘露醇,山梨糖醇或氯化钠。可在组合物中包含延迟吸收的物质(如单硬脂酸铝和明胶)以延长可注射组合物的吸收。
在任何情况下,制备无菌注射溶液可通过将所需量的活性化合物(如SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物,本身或与其它活性剂联合)掺入含有本文所列一种成分或多种成分组合的合适溶剂,然后如需要进行过滤除菌。通常,将活性活化物掺入含有碱性分散介质和上述其它所需成分的无菌载剂中制备分散液。在用于制备无菌注射液的无菌粉末情况中,制备方法包括真空干燥和冷冻干燥,得到由其之前无菌过滤的溶液得到活性组分和任何其它所需组分的粉末。注射制剂在无菌条件下按照本领域已知方法加工,装入容器(如安瓿、袋、瓶、注射器或小管)中,并密封。此外,可以试剂盒的形式包装并销售制剂。这类制品可具有标签或药品说明书,表明相关组合物可用于治疗患有或倾向于患有疾病或病症的对象。
胃肠道外制剂可以是单次推注剂量,输注或负荷推注剂量,随后是维持剂量。可在具体固定或可变的间隔处给予这些组合物,例如,每天一次或者“按需”基础。
用于本公开的某些药物组合物可以可接受的剂型口服给予,包括例如,胶囊、片剂、水性悬液或溶液。也可通过鼻气溶胶或吸入来给予某些药物组合物。这类组合物可采用苯甲醇或其它合适的防腐剂,吸收促经济以增强生物可及性,和/或其它常规增溶剂或分散剂制备成盐水溶液。
将SEMA4D拮抗剂抗体或其片段、变体或衍生物与运载体材料组合以产生单一剂型的量将根据所治疗的宿主和特定的给药方式而变化,并且可根据本文提供的方法来确定。可以单剂型、多剂型或在确立的时间段内的输注中给予组合物。也可调节给药方案,以提供最优所需响应(例如,治疗或预防性响应)。
在本发明范围内,SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可按照上述治疗方法给予人或其它动物,其给予量足以产生疗效。所述SEMA4D拮抗剂抗体,或其抗原结合片段、变体或衍生物可以常规剂型给予所述人或其它动物,该剂型根据已知技术将本发明抗体与常规的药学上可接受运载体或稀释剂混合来制备。本领域技术人员应认识到,药学上可接受运载体或稀释剂的形式和特点由混合的活性成分含量、给药途径和其它熟知变量决定。本领域技术人员还将理解,可使用包含本公开的SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物的一种或多种物质的混合物。
根据本公开内容,本领域普通技术人员容易确定待给予的SEMA4D拮抗剂抗体或其结合片段、变体或衍生物的量。影响给药方式以及SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物各自用量的因素包括但不限于:接受治疗的个体的疾病严重程度、病史、年龄、身高、重量、健康和身体状况。类似地,SEMA4D拮抗剂抗体或其片段、变体或衍生物的给予量取决于给药方式、对象是否接受单一剂量或多剂量的此种药剂。
除非另有说明,本发明的实施将采用细胞生物学、细胞培养、分子生物学、转基因生物学、微生物学、重组DNA和免疫学的常规技术,它们均在本领域技术范围内。这些技术在文献中已有充分描述。参见例如,Sambrook等编(1989)Molecular Cloning A LaboratoryManual(《分子克隆:实验室手册》)(第2版;冷泉港实验室出版社(Cold Spring HarborLaboratory Press));Sambrook等编(1992)Molecular Cloning:A Laboratory Manual(《分子克隆:实验室手册》),(纽约州的冷泉港实验室出版社(Cold Springs HarborLaboratory,NY));D.N.Glover编,(1985)DNA Cloning(《DNA克隆》),第I和II卷;Gait编(1984)Oligonucleotide Synthesis(《寡核苷酸合成》);Mullis等,美国专利号4,683,195;Hames和Higgins编(1984)Nucleic Acid Hybridization(《核酸杂交》);Hames和Higgins编(1984)Transcription And Translation(《转录和翻译》);Freshney(1987)Culture OfAnimal Cells(《动物细胞培养》)(ARL公司(Alan R.Liss,Inc.));Immobilized Cells AndEnzymes(《固定的细胞和酶》)(IRL出版社)(1986);Perbal(1984)A Practical Guide ToMolecular Cloning(《分子克隆实践指南》);论文,Methods In Enzymology(《酶学方法》)(学术出版社公司(Academic Press,Inc.),纽约州);Miller和Calos编(1987)GeneTransfer Vectors For Mammalian Cells(《哺乳动物细胞的转基因载体》)(冷泉港实验室出版社(Cold Spring Harbor Laboratory));Wu等编,Methods In Enzymology(《酶学方法》),第154和155卷;Mayer和Walker编(1987)Immunochemical Methods In Cell AndMolecular Biology(《细胞和分子生物学中的免疫化学方法》)(学术出版社(AcademicPress),伦敦);Weir和Blackwell编(1986)Handbook Of Experimental Immunology(《实验免疫学手册》),第I-IV卷;Manipulating the Mouse Embryo(《小鼠胚胎操作》),纽约州冷泉港的冷泉港实验室出版社(Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,N.Y.),(1986);和Ausubel等(1989)Current Protocols in Molecular Biology(《新编分子生物学实验指南》)(马里兰州巴尔的摩的约翰韦利父子公司(John Wiley&Sons,Baltimore,Md.))。
抗体工程的一般原理可参见Borrebaeck编(1995)Antibody Engineering(《抗体工程》)(第2版;牛津大学出版社(Oxford Univ.Press))。蛋白质工程的一般原理可参见Rickwood等编(1995)Protein Engineering,A Practical Approach(《蛋白质工程,实践方法》),(英国牛津的牛津大学出版社的IRL出版公司(IRL Press at Oxford Univ.Press,Oxford,Eng.))。抗体和抗体-半抗原结合的一般原理可参见:Nisonoff(1984)MolecularImmunology(《分子免疫学》)(第2版;马萨诸塞州桑德兰的辛奥尔联合公司(SinauerAssociates,Sunderland,Mass.));和Steward(1984)Antibodies,Their Structure andFunction(《抗体的结构和功能》)(Chapman和Hall,纽约州纽约市)。此外,本领域已知且没有具体描述的免疫学标准方法通常按照下述文献所述进行:Current Protocols inImmunology(《新编免疫学实验指南》),纽约州的约翰韦利父子公司(John Wiley&Sons);Stites等编(1994)Basic and Clinical Immunology(《基础和临床免疫学》)(第8版;Appleton和Lange,康涅狄格州的诺沃克(Norwalk,Conn.))和Mishell和Shiigi(编)(1980)Selected Methods in Cellular Immunology(《细胞免疫学的选用方法》)(W.H.弗里曼公司(W.H.Freeman and Co),纽约州)。
列出免疫学通用原理的标准参考文献包括:Current Protocols in Immunology(《新编免疫学实验指南》),约翰韦利父子公司(John Wiley&Sons),纽约州;Klein(1982)J.,Immunology:The Science of Self-Nonself Discrimination(《免疫学:自身-非自身区别的科学》)(约翰韦利父子公司,纽约州);Kennett等编(1980)Monoclonal Antibodies,Hybridoma:A New Dimension in Biological Analyses(《单克隆抗体,杂交瘤:生物学分析的新领域》)(普莱努公司(Plenum Press),纽约州);Campbell(1984)"MonoclonalAntibody Technology"in Laboratory Techniques in Biochemistry and MolecularBiology"(《生化和分子生物学实验室技术》中的“单克隆抗体技术”),Burden等编(的埃尔斯威尔公司(Elsevere),阿姆斯特丹);Goldsby等编(2000)Kuby Immunnology(《库比免疫学》)(第4版;H.弗里曼公司(H.Freemand&Co.));Roitt等(2001)Immunology(《免疫学》)(第6版;伦敦:摩兹比公司(Mosby));Abbas等(2005)Cellular and Molecular Immunology(《细胞和分子免疫学》)(第5版;埃尔斯威尔健康科学分公司(Elsevier Health SciencesDivision));Kontermann和Dubel(2001)Antibody Engineering(《抗体工程》)(施普林格公司(Springer Verlag));Sambrook和Russell(2001)Molecular Cloning:A LaboratoryManual(《分子克隆:实验室手册》)(冷泉港出版社(Cold Spring Harbor Press));Lewin(2003)Gene VIII(《基因VIII》)(普伦蒂斯霍尔出版社(Prentice Hall)2003);Harlow和Lane(1988)Antibodies:A Laboratory Manual(《抗体:实验室手册》)(冷泉港出版社);Dieffenbach和Dveksler(2003)PCR Primer(《PCR引物》)(冷泉港出版社)。
将上文中引用的所有参考文献以及其中引用的所有参考文献通过引用全文纳入本文。
通过说明的方式,而非限制性方式提供以下实施例。
实施例
实施例1:临床方案
信号临床试验的组A方案示于图1。年龄为21岁或更大,晚期前驱(CAG龄产物评分(CAP评分)大于200且诊断置信水平(DCL)为2或3)或早期表现HD(总功能容量(TFC)大于或等于11)的三十六(36)名个体被招募进信号组A。所有招募的对象也已经历遗传测试,已知CAG重复大于或等于36。所有对象都能够参与研究并提供知情同意书。对象经随机化,其中17名患者分配到VX15治疗组,且19名患者分配到安慰剂治疗组。招募了21名前驱和15名早期表现状态对象。该研究中招募的患者总结显示于表2。
表2:患者数据
如图1所示,组A对象用VX15或安慰剂治疗6个月,然后所有对象用VX15治疗另外5个月,随后3个月随访。
组A患者用6个20mg/kg的每月静脉内剂量的VX15(n=17)或安慰剂治疗(n=19)。这部分研究为盲式研究。在最初的6个月后,所有招募进组A的对象继续使用VX15/2503进行开放标签(open-label)治疗另5个月。各种研究组和治疗时间表如图2所示,其中还指示了下文用于描述不同治疗方案和时间范围的命名法,例如,PV(7-0)表示在前6个月期间用安慰剂(P)然后在接下来的5个月期间用VX15(V)治疗的组,并着重于研究开始时基线,访问0,访问7(在6个月末)(7-0)之间的MRI体积或FDG-PET信号的变化。这是用于与所有其它5或6个月VX15治疗期进行比较的对照。在每个月访问时,对患者的安全性、耐受性和功效进行筛选。测试血液样品的总血清可溶性SEMA4D(sSEMA4D)。在每月访问期间,定期进行功效评估。其中包括亨廷顿病-认知评估套组(HD-CAB)和定量运动(Q-Motor)套组。HD-CAB可区分对照、前HD和早期HD对象。所述套组(battery)对疾病状态具有高度敏感性,具有较大的效应大小和高可靠性,以及充分表征的心理测量学和实践效果(Stout JC等,Mov Disord.29:1281-1288(2014))。HD中的运动症状可以使用Q-运动评估法来客观地评估。Q-运动套组包括与功能相关的日常任务相关的不同运动任务的评估(参见例如,Tabrizi SJ等,LancetNeurol.8:791-801(2009))。在基线时,t=0,并且在治疗6个月结束时的月访问7(v7)和治疗11个月结束时的访问12(v12)期间,所有患者均进行了MRI成像,且患者亚组接受FDG-PET成像。分析多个脑区域的MRI和FDG-PET信号的变化。对于感兴趣的主要脑区域(ROI),MRI示于表3和4中,FDG-PET示于表5中。适用时,对左右半球进行单独测量,且同时计算其平均值。
表3:MRI皮质体积测量
先例兴趣* ROI
一级 中央前回
一级 缘上回
一级 颞上回
一级 颞中回
一级 额中部额回
二级 尾中额回
二级 岛盖部
二级 三角部
二级 眶部
二级 颞下回
二级 横颞叶皮层
二级 额上回
二级 旁中央小叶
二级 中央后回
二级 楔前页皮质
二级 舌回
二级 距状裂外周皮层
二级 楔状皮层
二级 枕叶皮层外侧
二级 前喙扣带皮质
二级 前扣带回上部
二级 扣带回后部
二级 顶下小叶
二级 顶上小叶
二级 眶额中线部
表4:MRI体积测量
先例兴趣* ROI
一级 尾状
一级 硬膜
一级 总白质
二级 海马
二级 杏仁体
二级 苍白球
二级 丘脑
*基于先前对亨廷顿病自然史的研究
表5:用于FDG-PET摄取测量的脑ROI
在所有组A对象接受6个月的盲式治疗后,完成了对组A的双盲部分的主要数据的分析。在所有组A对象完成11个月的治疗之后,完成对成像数据的分析。
治疗方法耐受性良好,依从性良好。没有发现安全问题信号。
统计学方法分析遵循意向治疗(ITT)原则,并使用标准统计方法,费舍尔精确检验、卡方检验和逻辑回归分类数据、双样本t检验、协方差分析和混合效应模型重复测量(MMRM)(用于连续数据)。
组A的MRI结果示于图3-6中。这些结果显示了在用VX15对比安慰剂治疗(如下详述)的对象中,在相当长度的不同时间点之间,不同脑ROI的MIR检测的体积中的平均变化。MRI体积以mm3表示,如通过本领域普通技术人员熟悉的方法所确定。相较于使用安慰剂治疗的前6个月期间观察到的MRI体积减少,PV(7-0),每另5-6个月时间框架的VX15治疗,VV(7-0),PV(12-7)和VV(12-7),在大多数ROI中预防或最小化疾病相关的脑容量减少。对于每个这样的比较,可以显著性P<0.001(通过卡方检验统计检验确定)拒绝零差异周围的随机分布的空假设(null hypothesis)。在图6中,比较安慰剂组(PV(12-0))(其中6个月,访问7后首次交叉VX15治疗)和贯穿完整期间接受VX15的组(VV(12-0))的MRI体积变化的结果表明,与接受完整11个月的VX15治疗的组相比,安慰剂组在6个月后的延迟的治疗起始没有弥补仅用安慰剂治疗的前6个月期间MRI体积的减少。这证明了早期开始治疗的预防益处,并且表明VX15是疾病改善型疗法。这示意性地显示在图12的上半部分中。
在FDG-PET成像中观察到的结果显示在图8-11中。FDG-PET以各脑ROI,相对于参考区域,脑干(SUVR),对于各治疗方案和观察的治疗时间段的SUV(标准摄取值)表示。在试验的前半部分,在SEMA4D-处理(VV(7-0))组观察到葡萄糖摄取的额外增加(supernumeraryincrease),相较于对照安慰剂处理的(PV(7-0))组(图8)。也即,VX15治疗的VV(7-0)组的大部分脑ROI中FDG-PET信号的平均增加大于安慰剂PV(7-0)组在同一时间段在相同ROI中观察到的平均降低。同样,比较安慰剂治疗的患者在治疗的前6个月(PV(7-0))和相同患者在试验的最后5个月内用VX15治疗(PV(12-7))的FDG-PET成像,显示葡萄糖摄取的额外相对增加(图9)。在两种情况下,使用卡方统计检验可以p<0.001拒绝零差异附近的随机分布的空假设。相比之下,比较来自在前6个月先用VX15治疗的患者(VV(12-7))和试验的前段期间的安慰剂组(PV(7-0))的最后5个月期间获得的平均FDG-PET信号,显示与零附近的随机分布没有显著差异(通过相同的卡方检验)(图10)。同样地,在整个11个月的治疗期间,在VX15治疗组(VV(12-0))和安慰剂治疗组(PV(12-0))之间未观察到显著差异(图11)。
无论是在VV(7-0)和PV(7-0)之间还是PV(12-7)和PV(7-0)之间做比较,VX15治疗均明显导致FDG-PET信号相对于治疗阶段的前6个月期间于安慰剂组中观察到的减少的额外增加。然而,在接下来的5个月内继续用VX15治疗,VV(12-7),并没有重复相同的大的治疗作用,但似乎只是防止或最小化FDG-PET信号的进一步下降。不受特定理论的束缚,对采用VX15进行初始治疗的额外益处的合理解释是它逆转了在起始治疗之前积累的葡萄糖摄取的历史亏缺。这可能反映了积累的反应性星形胶质细胞逆转正常的星形胶质细胞功能,包括增加的谷氨酸转运和葡萄糖摄取和糖酵解。然而,一旦在VV(7-0)期间通过VX15治疗捕获到该益处,则在VV(12-7)期间不重复进行继续治疗。该效果示意性地显示在图12的下半部分中。对于这种葡萄糖摄取历史亏缺的校正的观察可提供治疗效果的早期生物标志物。
本公开的广度和范围不应受限于上述任何示例性实施方式,而应仅根据所附权利要求书及其等同内容来定义。
表6:序列
序列表
<110> 瓦西尼斯公司(Vaccinex, Inc.)
M·造德尔(ZAUDERER, Maurice)
<120> 神经退行性或神经炎性疾病中胶质细胞活化的早期检测
<130> 58008-172847
<150> 62/461,945
<151> 2017-02-22
<160> 10
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> VX15/2503 VH
<400> 1
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Gln Ile Asn Pro Thr Thr Gly Gly Ala Ser Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Ile Thr Val Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Tyr Tyr Tyr Gly Arg His Phe Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Thr Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 2
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> VX15/2503 HCDR1
<400> 2
Gly Tyr Ser Phe Ser Asp Tyr Tyr Met His
1 5 10
<210> 3
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> VX15/2503 HCDR2
<400> 3
Gln Ile Asn Pro Thr Thr Gly Gly Ala Ser Tyr Asn Gln Lys Phe Lys
1 5 10 15
Gly
<210> 4
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> VX15/2503 HCDR3
<400> 4
Tyr Tyr Tyr Gly Arg His Phe Asp Val
1 5
<210> 5
<211> 111
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> VX15/2503 VL
<400> 5
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Asp Tyr Asp
20 25 30
Gly Asp Ser Tyr Met Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35 40 45
Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Asn Leu Glu Ser Gly Val Pro Asp
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65 70 75 80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Asn
85 90 95
Glu Asp Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 6
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> VX15/2503 LCDR1
<400> 6
Lys Ala Ser Gln Ser Val Asp Tyr Asp Gly Asp Ser Tyr Met Asn
1 5 10 15
<210> 7
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> VX15/2503 LCDR2
<400> 7
Ala Ala Ser Asn Leu Glu Ser
1 5
<210> 8
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> VX15/2503 LCDR3
<400> 8
Gln Gln Ser Asn Glu Asp Pro Tyr Thr
1 5
<210> 9
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Mab 67 VH
<400> 9
Gln Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Lys Gln Ser Pro Glu Asn Ser Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Gln Ile Asn Pro Thr Thr Gly Gly Ala Ser Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Lys Ser Leu Thr Ser Glu Glu Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Thr Arg Tyr Tyr Tyr Gly Arg His Phe Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Thr Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 10
<211> 111
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Mab 67 VL
<400> 10
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Gln Arg Ala Thr Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Asp Tyr Asp
20 25 30
Gly Asp Ser Tyr Met Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35 40 45
Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Asn Leu Glu Ser Gly Ile Pro Ala
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Asn Ile His
65 70 75 80
Pro Val Glu Glu Glu Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Asn
85 90 95
Glu Asp Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110

Claims (32)

1.一种用于确定脑信号蛋白4D(SEMA4D)拮抗剂抗体或其抗原结合片段是否能够有效治疗神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的方法,包括:
(a)将有效量的SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段给予患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的风险的对象;
(b)相对于在给予SEMA4D拮抗剂之前测量的该对象脑中葡萄糖摄取的基线水平,测量该对象脑中葡萄糖摄取的水平;和
i.如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;或
ii.如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
2.一种用于确定脑信号蛋白4D(SEMA4D)拮抗剂抗体或其抗原结合片段是否将有效治疗神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的方法,包括:
(a)测量患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤风险的对象脑中葡萄糖摄取的基线水平;
(b)向对象给予有效量的SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段;
(c)在给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段后,重新测量对象脑中的葡萄糖摄取水平;和
i.如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;或
ii.如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
3.一种用于确定脑信号蛋白4D(SEMA4D)拮抗剂抗体或其片段用于治疗神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的有效剂量的方法,包括:
(a)将起始剂量的SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段给予患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的风险的对象;
(b)相对于在给予SEMA4D拮抗剂之前测量的该对象脑中葡萄糖摄取的基线水平,测量该对象脑中葡萄糖摄取的水平;和
i.如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则调节SEMA4D拮抗剂抗体或其片段的剂量,所述调节根据增加的水平确定,或
ii.如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
4.如权利要求3所述的方法,其还包括,相对于步骤(b)中所测试的情况,增加SEMA4D拮抗剂抗体的剂量,和,相对于不同先前未治疗的患者中或对同一患者停止治疗一段时间后该同一患者中的新基线,重新测量葡萄糖摄取水平的变化,该段时间经确定以允许该神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤中历史缺陷的累积,和,如果检测到进一步增加,则进一步调节SEMA4D拮抗剂抗体的剂量。
5.一种用于确定脑信号蛋白4D(SEMA4D)拮抗剂抗体或其片段用于治疗神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的有效剂量的方法,包括:
(a)测量患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤风险的对象脑中葡萄糖摄取的基线水平;
(b)向对象给予起始剂量的SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段;
(c)在给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段后,重新测量对象脑中的葡萄糖摄取水平;和
i.如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则调节SEMA4D拮抗剂抗体或其片段的剂量,所述调节根据增加的水平确定,或
ii.如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
6.如权利要求5所述的方法,其还包括,相对于步骤(c)中所测试的情况,增加SEMA4D拮抗剂抗体的剂量,和,相对于不同先前未治疗的患者中或对同一患者停止治疗一段时间后该同一患者中的新基线,重新测量葡萄糖摄取水平的变化,该段时间经确定以允许该神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤中历史缺陷的累积,和,如果检测到进一步增加,则进一步调节SEMA4D拮抗剂抗体的剂量。
7.一种治疗患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤风险的对象的方法,包括:
(a)将SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段给予患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的风险的对象;
(b)相对于在给予SEMA4D拮抗剂之前测量的该对象脑中葡萄糖摄取的基线水平,测量该对象脑中葡萄糖摄取的水平;和
i.如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;或
ii.如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
8.一种治疗患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤风险的对象的方法,包括:
(a)测量患有、确定患有或疑似患有神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的对象脑中葡萄糖摄取的基线水平;
(b)向对象给予SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段;
(c)在给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段后,重新测量对象脑中的葡萄糖摄取水平;和
i.如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;或
ii.如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
9.一种用于确定脑信号蛋白4D(SEMA4D)拮抗剂抗体或其抗原结合片段是否将有效治疗神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的方法,包括:
(a)将SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段给予患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的风险的对象;
(b)给出指令,以相对于在给予SEMA4D拮抗剂之前测量的该对象脑中葡萄糖摄取的基线水平,测量该对象脑中葡萄糖摄取的水平;和
i.如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;或
ii.如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
10.一种用于确定脑信号蛋白4D(SEMA4D)拮抗剂抗体或其抗原结合片段是否将有效治疗神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的方法,包括:
(a)给出指令,以测量患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤风险的对象脑中葡萄糖摄取的基线水平;
(b)向对象给予SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段;
(c)给出指令,以在给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段后,重新测量对象脑中的葡萄糖摄取水平;和
i.如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;或
ii.如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
11.一种用于确定脑信号蛋白4D(SEMA4D)拮抗剂抗体或其抗原结合片段是否将有效治疗神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤的方法,包括:
(a)测量显示为患有、疑似患有或有发展神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤风险的对象脑中葡萄糖摄取的基线水平;和
(b)重新测量在由医疗服务提供者向对象给予SEMA4D拮抗剂抗体或其抗原结合片段之后该对象脑中的葡萄糖摄取水平;和
i.如果检测到葡萄糖摄取增加超过基线,则指令该医疗服务提供者继续给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段;或
ii.如果检测到葡萄糖摄取相对于基线无变化或降低,则指令该医疗服务提供者停止给予SEMA4D拮抗剂抗体或其片段。
12.如权利要求1-11中任一项所述的方法,其中所述SEMA4D拮抗剂抗体或其片段抑制SEMA4D与其受体的相互作用。
13.如权利要求12所述的方法,其中,所述受体是丛蛋白-B1、丛蛋白-B2或CD72。
14.如权利要求1-3中任一项所述的方法,其中,所述SEMA4D拮抗剂抗体或其片段抑制SEMA4D介导的丛蛋白-B1信号转导。
15.如权利要求1-14中任一项所述的方法,其中,所述SEMA4D拮抗剂抗体或其片段竞争性地抑制参照抗体结合SEMA4D,所述参照抗体包含可变重链区(VH)和可变轻链区,其中所述VH包含氨基酸序列SEQ ID NO:1,且所述VL包含氨基酸序列SEQ ID NO:5。
16.如权利要求1-15中任一项所述的方法,其中,所述SEMA4D拮抗剂抗体或其片段与参照抗体结合至相同的SEMA4D表位,所述参照抗体包含VH和VL,所述VH包含氨基酸序列SEQID NO:1,且所述VL包含氨基酸序列SEQ ID NO:5。
17.如权利要求15或权利要求16所述的方法,其中,所述SEMA4D拮抗剂抗体包含VH和VL,其中,所述VH包含三个互补决定区(CDR)HCDR1、HCDR2和HCDR3,其中,所述VL包含三个CDR LCDR1、LCDR2和LCDR3,并且其中,除了一个或多个CDR中的至少一个或两个单保守氨基酸取代以外,所述CDR分别包含氨基酸序列SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQID NO:6、SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8。
18.如权利要求15或权利要求16所述的方法,其中,所述SEMA4D拮抗剂抗体包含VH和VL,其中,所述VH包含三个互补决定区(CDR)HCDR1、HCDR2和HCDR3,其中,所述VL包含三个CDR LCDR1、LCDR2和LCDR3,并且其中,所述CDR分别包含氨基酸序列SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8。
19.如权利要求15-18中任一项所述的方法,其中,所述VH包含与SEQ ID NO:1至少90%相同的氨基酸序列,且所述VL包含与SEQ ID NO:5至少90%相同的氨基酸序列。
20.如权利要求19所述的方法,其中,所述VH包含氨基酸序列SEQ ID NO:1,且所述VL包含氨基酸序列SEQ ID NO:5。
21.如权利要求1-20中任一项所述的方法,其中,给予第一剂量的SEMA4D拮抗剂抗体,然后在其后每周至少一次,每两周至少一次,每三周至少一次,每月至少一次,或每两个月至少一次给予SEMA4D拮抗剂抗体。
22.如权利要求21所述的方法,其中,对于葡萄糖摄取的基线测量在给予第一剂量的SEMA4D拮抗剂抗体之前即刻检测。
23.如权利要求21或权利要求22所述的方法,其中,在第一剂量后至少一周,第一剂量后至少两周,第一剂量后至少一个月,第一剂量后至少两个月,第一剂量后至少三个月,第一剂量后至少四个月,第一剂量后至少五个月,第一剂量后至少六个月,或其任何组合时测量葡萄糖摄取相对于基线的变化。
24.如权利要求1-23中任一项所述的方法,其中,通过18F-氟脱氧葡萄糖正电子发射断层扫描(FDG-PET)成像检测对象脑中的葡萄糖摄取。
25.如权利要求1-24中任一项所述的方法,其中,所述对象是人。
26.如权利要求1-25中任一项所述的方法,其中,神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤是阿尔茨海默氏病,帕金森病,亨廷顿病,唐氏综合症,共济失调,肌萎缩侧索硬化症(ALS),多发性硬化症,(MS),癫痫,脑膜炎,脑水肿,脊髓损伤,创伤性脑损伤,额颞叶痴呆(FTD),HIV相关认知障碍,CNS狼疮,轻度认知障碍或其组合。
27.如权利要求26所述的方法,其中,神经退行性或神经炎性疾病、病症或损伤是亨廷顿病(HD)。
28.如权利要求27所述的方法,其中,所述对象因HD家族历史或遗传测试而有发展HD的风险。
29.如权利要求28所述的方法,其中,遗传测试揭示对象的HTT基因中有36个或更多个CAG重复。
30.如权利要求27-29中任一项所述的方法,其中,所述对象由于轻度运动功能障碍、轻度认知障碍或轻度神经精神病学特征而疑似患有HD。
31.如权利要求27-30中任一项所述的方法,其中,对象因脑萎缩、增高的均匀亨廷顿病评定量表评分(UHDRS)、增高的亨廷顿病认知评估套组(HD-CAB)评分、增高的亨廷顿病定量运动评估评分或它们的组合而被诊断为患有HD。
32.如权利要求31所述的方法,其中,对象处于HD的症状前、早期前驱,晚期前驱,早期表现,中期表现或晚期表现阶段。
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