CN110184357A - 结肠癌的预后预测诊断用基因标记物及其用途 - Google Patents

结肠癌的预后预测诊断用基因标记物及其用途 Download PDF

Info

Publication number
CN110184357A
CN110184357A CN201910508831.2A CN201910508831A CN110184357A CN 110184357 A CN110184357 A CN 110184357A CN 201910508831 A CN201910508831 A CN 201910508831A CN 110184357 A CN110184357 A CN 110184357A
Authority
CN
China
Prior art keywords
ptbp3
expression
prognosis
reagent
colon cancer
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201910508831.2A
Other languages
English (en)
Inventor
侯平甫
白津
郑骏年
陈芳
李敏乐
李中伟
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Xuzhou Medical University
Original Assignee
Xuzhou Medical University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Xuzhou Medical University filed Critical Xuzhou Medical University
Priority to CN201910508831.2A priority Critical patent/CN110184357A/zh
Publication of CN110184357A publication Critical patent/CN110184357A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • G01N33/57419—Specifically defined cancers of colon
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/118—Prognosis of disease development

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明涉及结肠癌预后预测诊断用基因标志物及其用途。本发明首次证实了PTBP3在结肠癌中表达的高低与患者预后直接相关，高表达PTBP3的结肠癌患者与低表达PTBP3的患者相比，生存时间显著减少。通过检测PTBP3转录水平的表达情况，可以预估结肠癌患者的预后情况，从而制备含有检测PTBP3基因试剂的结肠癌预后评价试剂盒，可以更加精准、更加客观的评判患者预后。

Description

结肠癌的预后预测诊断用基因标记物及其用途
技术领域
本发明涉及分子生物学、临床预后判断领域，尤其涉及结肠癌的预后预测诊断用基因标记物及其用途。
背景技术
结肠直肠癌(CRC)，也被称为结肠癌或大肠癌，在美国是第五最常见的癌症形式，在中国是第四常见癌症而在欧洲是引起癌症相关死亡的第三主要原因。在世界范围内，疾病发生率在男性中排名第三位，死亡率第四位，在女性疾病发病率中排名第二位，死亡率达第三位。近年来，我国结直肠癌的发病率呈逐年上升的趋势。事实上，CRC通常是可治愈的，特别是在早期阶段被诊断时。在不同国家已采取若干筛查策略。常规CRC筛查测试包括粪便隐血测试(FOBT)、乙状结肠镜检、结肠镜检、气钡双重造影或直肠指检。它们都具有优点和局限性，但依从性仍低于预期，主要是由于后勤(logistics)或患者的不适。目前针对结直肠癌的治疗主要以手术为主，结合放疗化疗为辅的综合治疗方法。但目前结直肠癌的预后情况很差，术后存在生存率低、耐药性高或复发转移的情况，对病人及其家人身体及经济上带来很大的负担，严重影响着人们的生活水平和质量。
在临床实践中，目前结直肠癌的预后判断以病理学检查作为最重要和最可靠的预后指标，而分子标志物被认为是结直肠癌预后判断的新发展方向。目前，国内外研究者发现包括CD29、IGR5、CD44和β-catenin等基因在结直肠癌组织中存在异常表达的情况，对这些关键分子标志在患者中的表达量测量有望成为新的结直肠癌的预后判断方式。尽管如此，这些标志物的特异性和灵敏度仍有待改善，严重影响其在结直肠癌预后判断中的效能，因此仍未进入临床应用阶段。鉴于此，更加特异的结直肠癌预后判断分子标志物仍有待开发。
发明内容
本发明的目的是提供PTBP3在制备结肠癌预后预测产品中的应用。本发明的申请人通过对临床结肠癌病例组织样本中PTBP3表达检测，发现PTBP3结肠癌组织中高表达。结合这些临床病例的生存状况分析其与PTBP3表达的关系，证明PTBP3高表达与较差的总体生存率和无病生存率相关。由此本发明可以获得以下结论：PTBP3可作为结肠癌预后的特异标志基因，相比传统的检测手段，更快速、更特异、更灵敏、更准确，能够实现结肠癌的预后判断，从而降低结肠癌的死亡率。
为了实现上述目的，本发明采用了如下技术方案：
本发明提供了检测PTBP3表达的试剂在制备结肠癌患者预后预测产品中的应用。
进一步，所述试剂包括检测PTBP3的RNA转录水平的试剂、检测PTBP3的蛋白表达水平的试剂。
本发明对PTBP3的RNA转录水平的检测通过针对基因的PCR扩增来进行。需要从组织内分离mRNA和由mRNA合成cDNA的过程。为了分离mRNA，可以利用本领域公知的分离RNA的方法。cDNA合成过程可以以mRNA为模板，利用本领域公知的cDNA合成方法。本发明中mRNA测定可以利用本领域公知的方法进行，可以通过使用了由报告荧光色素和/或猝灭(quencher)荧光色素标记的探针的光学定量分析系统来测定。上述测定利用产业上销售的设备、例如ABI PRISM 7700TM、Sequence Detection System TM、罗氏分子生化公司的Lightcycler及其附属的软件等系统来进行。这样的测定数据以测定值或阈值循环(Ct或Cp)的形式表示。测定出的荧光值首次被记录为在统计学上有显著差异的值时的点为阈值循环，其与检测对象以PCR反应的模板的形式存在时的早期值呈反比例，因此，阈值循环值小的情况下，说明在定量上存在更多的检测对象。
更进一步，所述检测PTBP3的RNA转录水平的试剂包括特异性扩增PTBP3的引物或探针；检测PTBP3的蛋白表达水平的试剂包括针对PTBP3蛋白的特异性抗体。
本发明涉及的引物表示寡核苷酸，在诱导与核酸链(模板)互补的引物延伸产物的合成的条件下，即，在存在核苷酸和DNA聚合酶之类的聚合剂、并且适宜的温度和pH的条件下，作为合成的起始点起作用。优选引物为单链的脱氧核糖核苷酸。本发明中利用的引物包括天然(naturally occurring)dNMP(dAMP、dGMP、dCMP和dTMP)、变形核苷酸或非天然核苷酸。此外，引物可以包含核糖核苷酸。
本发明的引物是退火到靶核酸上、利用模板依赖性核酸聚合酶形成与靶核酸互补的序列的延伸引物，其延伸至固定化探针被退火的位置，占据探针被退火的部位。
本发明中利用的延伸引物包含与靶核酸的第1位置互补的杂交核苷酸序列。术语“互补”的含义是指，在规定的退火或杂交条件下引物或探针与靶核酸序列选择性地进行杂交的程度的充分的互补，具有将实质上互补(substantially complementary)和完全互补(substantially complementary)全部包括在内的含义，优选其含义为完全互补。本说明书中与引物序列关联使用的术语“实质上互补的序列”不仅包括完全一致的序列，也包括在能够退火到特定序列上而发挥引物作用的范围内与作为比较对象的序列有部分不一致的序列。
引物必须足够长到能够在聚合物的存在下引发延伸产物的合成的程度。引物的适宜长度取决于多种要素，例如温度、应用领域和引物来源，典型的长度为15-30个核苷酸。较短的引物分子为了与模板形成充分稳定的杂交复合物，通常要求更低的温度。术语“退火”或“引发”是指寡脱氧核苷酸或核酸并置在模板核酸上，上述并置是指聚合酶使核苷酸聚合而形成与模板核酸或其一部分互补的核酸分子。
引物的序列不需要具有与模板的一部分序列完全互补的序列，只要在能够与模板杂交而发挥引物固有的作用的范围内具有充分的互补性即可。因此，本发明中的引物不需要具有与作为模板的上述核苷酸序列完美地互补的序列，只要在能够与该基因序列杂交而作为引物起作用的范围内具有充分的互补性即可。这样的引物的设计可以参照上述的核苷酸序列由本领域技术人员容易地实施，例如可以利用引物设计用程序(例如：PRIMER 3程序)。
本发明所涉及的探针是具有在严格条件下全部或部分与PTBP3基因标记杂交的DNA。在此，本发明中的“严格条件”可以例举有：在含有50％甲酰胺、5×SSC、5×登哈特溶液(Denhardt氏溶液)、0.1M磷酸二氢钠(pH6.5)、0.5％SDS、100μg/ml变性鲑鱼精子(denatured salmon sperm)DNA的缓冲液中在42℃温度下杂交，以及用含有1×SSC(0.15MNaCl、0.015M柠檬酸钠)、0.1％的SDS(十二烷基硫酸钠)的缓冲液在42℃温度下进行洗涤处理(条件1)；或者在含有5×SSC、5×登哈特溶液、0.1M磷酸二氢钠(pH6.5)、0.5％SDS、100μg/ml变性鲑鱼精子DNA的缓冲液中在65℃温度下杂交，以及用含有0.1×SSC、0.1％的SDS的缓冲液在65℃温度下进行洗涤处理(条件2)，更优选为后者(条件2)。进而，作为影响杂交严格性的因素，除上述温度条件以外还有各种因素，本领域技术人员均能够对各种因素进行组合，实现与上述例举出的杂交严格性等同的严格性。
本发明涉及的探针还可以赋予其适当的荧光标记等标记。
可将上述探针固定于基片上制备用于检测基因标记的DNA微阵列或DNA芯片。所述DNA微阵列或DNA芯片可通过常规方法制得。DNA微阵列是例如通过在基片上分别展开预先制备好的含有各种探针的溶液后干燥得到的。此外，DNA芯片是例如通过在基片上用光刻法合成具有所希望的碱基序列的DNA而得到的。
本发明的抗体可通过标记物进行标记。标记物可使用酶、放射性同位素、荧光色素、生物素(biotin)、地高辛(digoxygenin)等。酶只要是满足转数(turnover number)大、与抗体结合的状态稳定、能够使基质特异性着色等条件即可，没有特别限制，例如，通常可使用用于EIA(酶联免疫检测法)的过氧化物酶、β-半乳糖苷酶、碱性磷酸酶、葡萄糖氧化酶、乙酰胆碱酯酶、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶、苹果酸脱氢酶等。此外还可使用酶抑制剂及辅酶等。上述酶和抗体的结合能够通过使用马来酰亚胺等交联剂的公知方法进行。
作为基质可以根据所使用的酶的种类，使用公知物质。例如，使用多肽作为酶时，作为基质可以使用3,3’,5,5’-四甲基对二氨基联苯；使用碱性磷酸酶作为酶时，作为基质可以使用对硝基苯酚。
作为放射性同位素可使用125I、3H等用于RIA(放射免疫检测法)中的常规放射性同位素。
作为荧光色素可使用异硫氰酸荧光素酯(FITC)及四甲基异硫氰酸罗丹明(TRITC)等用于荧光抗体法中的常规荧光色素。
本发明涉及的产品通过检测PTBP3表达预测结肠癌患者预后，PTBP3表达高代表结肠癌患者预后差。
本发明所涉及的结肠癌患者包括TNM分期I期、II期、III期、IV期。
特别地，所述结肠癌患者包括TNM分期III期、IV期。
本发明还提供了一种结肠癌预后预测产品，所述产品包括检测PTBP3表达的试剂、产品说明书；说明书中记载内容包括：利用所述试剂检测PTBP3表达的步骤、结肠癌预后的判断原则，判断原则为：PTBP3表达高代表结肠癌患者预后差。
进一步，所述试剂包括检测PTBP3的RNA转录水平的试剂、检测PTBP3的蛋白表达水平的试剂。
更进一步，所述检测PTBP3的RNA转录水平的试剂包括特异性扩增PTBP3的引物或探针；检测PTBP3的蛋白表达水平的试剂包括针对PTBP3蛋白的特异性抗体。
本发明的所述产品包括试剂盒、芯片或试纸。
本发明还提供了一种结肠癌预后预测模型，所述模型中的生物标志物包括PTBP3。
本领域技术人员熟知，人类疾病多数为多基因疾病，为了提高疾病的诊断率，现在常用的做法是建立基因集，所述基因集是几个与疾病相关的基因组合，利用生物信息学分析可将基因集中的基因按照其所占比重构建用于诊断疾病的模型，例如该模型的一种使用方法是：分别检测基因集中的几个基因的表达量，带入模型公式，计算风险值，或超过一定值，则说明该检测对象患有该疾病的风险大。
本发明还提供了一种结肠癌预后预测系统，所述系统包括前面所述的模型。
本发明涉及的结肠癌预后预测系统可以包括数据收集模块、数据分析模块。所述数据分析模块利用前面所述的预测模型带入收集到的信息对患病与否进行诊断、对病人预后进行预测。
本发明涉及的术语“预后”表示提供对结肠癌可能的进程和结果的预测。它既包括判断疾病的特定后果(如康复，某种症状、体征和并发症等其它异常的出现或消失及死亡)，也包括提供时间线索，如预测某段时间内发生某种结局的可能性。预后可包括癌症并发症、转移、扩散的可能性，癌症的可能的结果，恢复的可能性，总存活率和/或总死亡率。优选地，预后是患者恢复或具有癌症的复发/再发的概率。例如“预后较好”是指癌症不易发生复发转移，“预后较差”是指癌症更易发生复发转移。这个信息不仅对于患者有用，对于医生确定最有效的疗程也有用。确定癌症复发的可能性或转移的可能性能帮助医生确定是否应采取更保守或更激进的治疗方法。预后供用于对预测为可从给定治疗方案获益的患者进行选择和分类。预后还可用于设计结肠癌治疗的合适疗法，例如通过显示结肠癌是否仍处于良性阶段或者结肠癌是否已发展到需要介入性治疗的阶段来实现。
本发明涉及的术语“高表达”或“低表达”是指来自对象的样品中PTBP3的表达水平高于或低于某一参考值，该参考值是本领域技术人员通过常规技术手段从特定群体，例如结肠癌预后较好的群体中获得的具有统计学意义的平均值或中位值。
本发明的PTBP3高低表达是依据PTBP3染色评分进行，随后由专业人员进行评定，分组为高、低表达。
采用上述方案，本发明具有以下优点：
本发明首次证实了PTBP3基因在结肠癌中表达的高低与患者预后直接相关，高表达PTBP3的结肠癌患者与低表达PTBP3的患者相比，生存时间显著减少。通过检测PTBP3转录水平的表达情况，可以预估结肠癌患者的预后情况，从而制备含有检测PTBP3基因试剂的结肠癌预后评价试剂盒，可以更加精准、更加客观的评判患者预后。
附图说明
图1显示利用IHC检测PTBP3蛋白表达的统计图；
图2显示利用Kaplan–Meier生存分析评价PTBP3表达与CRC患者OS和DFS的相关性的结果图；
图3显示利用Kaplan–Meier生存分析评价PTBP3表达与TNM分级OS和DFS的相关性的结果图；
图4显示利用Kaplan–Meier生存分析评价PTBP3表达与侵袭深度分期OS和DFS的相关性的结果图；
图5显示利用Kaplan–Meier生存分析评价PTBP3表达与与淋巴结转移分期OS和DFS的相关性的结果图。
具体实施方式
下面通过实施例对本发明进行具体的描述，有必要在此指出的是以下实施例只用于对本发明进行进一步说明，不能理解为对本发明保护范围的限制，该领域的技术人员可以根据上述本发明内容对本发明作出一些非本质的改进和调整。下述实施例中，若非特意表明，所用的试剂均为分析纯，所用试剂均可从商业渠道获得。文中未注明具体条件的实验方法，通常按照常规条件如J.萨姆布鲁克等编著的科学出版社2002年出版的《分子克隆实验指南》一书中所述的条件，或按照制造商所建议的条件。除非另行定义，文中所使用的所有专业与科学用语与本领域熟练人员所熟悉的意义相同。此外，任何与所记载内容相似或均等的方法及材料皆可应用于本发明中。
实施例1 PTBP3表达高低与结肠癌预后相关性研究
1、病人和样本收集
组织微阵列切片包括568对组织样本(CRC患者的癌组织和相应的癌旁组织)。组织样本来源于2010-2015年在中国徐州医科大学附属医院收集的CRC患者。患者平均年龄是61.7岁，其中约57.6％的患者是男性，42.4％的患者是女性。61.4％的患者处于肿瘤TNM分期I和分期II，38.9％的患者处于肿瘤TNM分期III和分期IV。生存时间根据手术时间到死亡时间或到最后随访时间来计算。医院伦理委员会同意了该项研究。
2、IHC检测PTBP3蛋白表达
对结肠癌患者组织微阵列切片进行IHC检测PTBP3蛋白表达，IHC步骤同之前报道的一样(参考文献：Hou PF,Jiang T,Chen F,Shi PC,Li HQ,Bai J,et al.KIF4Afacilitates cell proliferation via induction of p21-mediated cell cycleprogression and promotes metastasis in colorectal cancer.Cell death&disease2018；9)。anti-PTBP3(Santa Cruz Biotechnology)抗体1:100稀释使用。
结果显示，与CRC患者的癌旁组织相比，CRC患者癌组织中PTBP3蛋白表达显著上调(图1，p<0.001)。
3、PTBP3蛋白表达与CRC组织样本临床病理特征之间的相关性分析
分析了PTBP3表达与CRC组织样本的临床病理特征之间的相关性，如表1所示，分析结果显示：与TNM分级I期和II期相比，TNM分期III期和IV期的癌组织样本中PTBP3表达显著增加。
4、PTBP3蛋白表达与生存状况相关性分析
使用Kaplan–Meier生存分析评价PTBP3表达对CRC患者总体生存率(OS)和无病生存率(DFS)的影响。结果显示，PTBP3高表达与较差OS(p<0.001，log-rank检验，图2A)和较差DFS(p<0.001，log-rank检验，图2B)相关。
结果还显示，PTBP3高表达与TNM分期I期和II期的较差OS并不相关(图3A)，但是与TNM分期III期和IV期的较差OS相关(p<0.001，图3B)，与侵袭深度分期T1/T2的较差OS相关(p<0.001，图4A)，与侵袭深度分期T1/T2的较差OS相关(p<0.001，图4B)，与淋巴结转移分期N0的较差OS相关(p<0.001，图5A)，与淋巴结转移分期N1/N2/N3的较差OS相关(p<0.001，图5B)。
为了检测PTBP3表达是否是CRC的独立诊断因素，使用单变量和多变量Cox回归分析模型以确认CRC患者PTBP3表达的诊断价值。
单变量Cox回归分析显示，PTBP3表达是CRC患者OS和DFS的一个重要的诊断因素(见表2)，多变量Cox回归分析显示，PTBP3表达也是CRC患者OS(HR 2.484，95％CI 1.761-3.502，p<0.001)和DFS(HR 4.830，95％CI 2.763-8.445，p<0.001)的一个独立的诊断标记(见表3)。
表1 PTBP3蛋白表达与CRC组织样本临床病理特征之间的相关性分析
a：双尾Fisher’s exact tests
*p<0.05，***p<0.001
表2单变量Cox回归分析
HR：危害比；CI：置信区间；
PTBP3:低vs高；年龄:≤60vs>60；性别:男vs女；侵袭深度:T1-T2vsT3-T4；远端转移:M0vs M1；分化:低vs中/高；TNM分期为I、II、III、IV；肿瘤大小:<5vs≥5
表3多变量Cox回归分析
变量编码：肿瘤评分编码为1(阴性)和2(阳性)，年龄编码为1(≤60岁)和2(>60岁)，性别编码为1(男)和2(女)，肿瘤大小编码为1(≥5cm)和2(<5cm)，TNM分期编码为1(I-II)和2(III-IV)，远处转移编码为1(M0)和2(M1)
CI:置信区间
上述实施例的说明只是用于理解本发明的方法及其核心思想。应当指出，对于本领域的普通技术人员来说，在不脱离本发明原理的前提下，还可以对本发明进行若干改进和修饰，这些改进和修饰也将落入本发明权利要求的保护范围内。

Claims (10)

1.检测PTBP3表达的试剂在制备结肠癌患者预后预测产品中的应用。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述试剂包括检测PTBP3的RNA转录水平的试剂、检测PTBP3的蛋白表达水平的试剂。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述检测PTBP3的RNA转录水平的试剂包括特异性扩增PTBP3的引物或探针；检测PTBP3的蛋白表达水平的试剂包括针对PTBP3蛋白的特异性抗体。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的应用，其特征在于，所述产品通过检测PTBP3表达预测结肠癌患者预后，PTBP3表达高代表结肠癌患者预后差。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的应用，其特征在于，所述结肠癌患者包括TNM分期I期、II期、III期、IV期。
6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述结肠癌患者包括TNM分期III期、IV期。
7.一种结肠癌预后预测产品，其特征在于，所述产品包括检测PTBP3表达的试剂、产品说明书；说明书中记载内容包括：利用所述试剂检测PTBP3表达的步骤、结肠癌预后的判断原则，判断原则为：PTBP3表达高代表结直肠癌患者预后差。
8.根据权利要求7所述的产品，其特征在于，所述产品包括试剂盒、芯片或试纸。
9.一种结肠癌预后预测模型，其特征在于，所述模型中的生物标志物包括PTBP3。
10.一种结肠癌预后预测系统，其特征在于，所述系统包括权利要求9所述的模型。
CN201910508831.2A 2019-06-13 2019-06-13 结肠癌的预后预测诊断用基因标记物及其用途 Pending CN110184357A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910508831.2A CN110184357A (zh) 2019-06-13 2019-06-13 结肠癌的预后预测诊断用基因标记物及其用途

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910508831.2A CN110184357A (zh) 2019-06-13 2019-06-13 结肠癌的预后预测诊断用基因标记物及其用途

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN110184357A true CN110184357A (zh) 2019-08-30

Family

ID=67721498

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201910508831.2A Pending CN110184357A (zh) 2019-06-13 2019-06-13 结肠癌的预后预测诊断用基因标记物及其用途

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN110184357A (zh)

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20110077636A (ko) * 2009-12-30 2011-07-07 한국과학기술연구원 대장암 예후진단용 단백질 마커 디펜신­５와 ｒｏｄ１단백질의 조합 및 이들 각각에 대한 항체를 포함하는 대장암 예후진단키트
GB2463401A8 (en) * 2008-11-12 2013-05-15 Caris Mpi Inc Methods and systems of using exosomes for determining phenotypes
CN103429258A (zh) * 2011-01-04 2013-12-04 詹纳里克斯公司 通过施用溶瘤痘苗病毒生成针对肿瘤抗原的抗体和生成肿瘤特异性补体依赖性细胞毒性
CN108034724A (zh) * 2017-12-29 2018-05-15 中山大学肿瘤防治中心 用于预测结直肠癌预后及死亡风险的环状rna分子标记物及其应用

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB2463401A8 (en) * 2008-11-12 2013-05-15 Caris Mpi Inc Methods and systems of using exosomes for determining phenotypes
KR20110077636A (ko) * 2009-12-30 2011-07-07 한국과학기술연구원 대장암 예후진단용 단백질 마커 디펜신­５와 ｒｏｄ１단백질의 조합 및 이들 각각에 대한 항체를 포함하는 대장암 예후진단키트
CN103429258A (zh) * 2011-01-04 2013-12-04 詹纳里克斯公司 通过施用溶瘤痘苗病毒生成针对肿瘤抗原的抗体和生成肿瘤特异性补体依赖性细胞毒性
CN108034724A (zh) * 2017-12-29 2018-05-15 中山大学肿瘤防治中心 用于预测结直肠癌预后及死亡风险的环状rna分子标记物及其应用

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
HYE-JUNG KIM等: "Profiling of differentially expressed proteins in stage IV colorectal cancers with good and poor outcomes", 《J PROTEOMICS》 *
MARTA KUBIAK等: "Chromosome Conformation Capture Reveals Two Elements That Interact with the PTBP3 (ROD1) Transcription Start Site", 《INT J MOL SCI》 *
叶剑强等: "NDRG1、LDH-5和PTEN在左半结直肠癌中的表达及临床病理意义", 《诊断病理学杂志》 *
科曼（CORMAN，M.L.）: "《结直肠外科学第6版》", 31 January 2016, 上海科学技术出版社 *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
ES2636470T3 (es) Marcadores de expresión génica para predecir la respuesta a la quimioterapia
CN111910004B (zh) cfDNA在早期乳腺癌无创诊断中的应用
US20100075323A1 (en) Molecular markers for lung and colorectal carcinomas
CN103097548A (zh) 基于多癌症侵袭相关机制的生物标记
EP2304630A1 (en) Molecular markers for cancer prognosis
CN110551819A (zh) 一组卵巢癌预后相关基因的应用
WO2012158780A2 (en) Lung cancer signature
CN104140967A (zh) 与结直肠癌肝转移相关的长链非编码rna clmat1及其应用
US20130090258A1 (en) Method for detecting colorectal tumor
US20220127678A1 (en) Biomarker panel for diagnosis and prognosis of cancer
US20150024956A1 (en) Methods for diagnosis and/or prognosis of gynecological cancer
US20230257826A1 (en) Methods for predicting prostate cancer and uses thereof
CN107574247A (zh) 一种基于clcf1基因的胶质母细胞瘤辅助诊断、预后评价试剂盒及其使用方法
WO2014159425A1 (en) Bladder cancer detection and monitoring
CN115851951A (zh) 含多组学标志物组合物的早期肝癌检测模型构建及试剂盒
US20140162895A1 (en) System, computer program and method for determining behavior of thyroid tumor
JP2022149754A (ja) がんの同時検出方法
CN102159728A (zh) 乳腺癌转移的判断方法及血清的评价方法
US20150329911A1 (en) Nucleic acid biomarkers for prostate cancer
CN110184357A (zh) 结肠癌的预后预测诊断用基因标记物及其用途
CN116804218A (zh) 用于检测肺结节良恶性的甲基化标志物及其应用
US20120184452A1 (en) Methods for diagnosing follicular thyroid cancer
CN113943803A (zh) Htr6在乳腺癌的诊断、预后中的应用
US10407737B2 (en) Methods and kits for identifying pre-cancerous colorectal polyps and colorectal cancer
CN107475430A (zh) 一种基于ifi30基因的胶质母细胞瘤辅助诊断、预后评价试剂盒及其使用方法

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination