CN109727674A - 一种基因检测报告的解读方法及装置 - Google Patents

Abstract

本发明提供了一种基因检测报告的解读方法及装置，其中，该方法包括：获取基因检测报告中的检测项；判断数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项；在判断结果为是的情况下，根据数据库中预先保存的检测项与检测结果文献的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果；根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告，因此，可以解决相关技术中解读人员通过查找文献进行基因检测报告的解读容易出错的问题，通过系统自动获取基因检测报告中各项检测相关的文献，并从文献中匹配对应的检测结果，提高了基因检测报告解读的准确性。

Description

一种基因检测报告的解读方法及装置

技术领域

本发明涉及通信领域，具体而言，涉及一种基因检测报告的解读方法及装置。

背景技术

目前，随着基因检测技术的不断发展，客户量不短增加，遗传解读人员要面对不断激增的报告量，而传统的以查找相关文献对检测结果进行分析的方式，效率低、工作时间长、操作繁琐复杂。为解决解读人员当前面临的问题，提高解读的工作效率，遗传解读系统应运而生。

现有技术中，解读人员获取染色体、基因名称、基因型、变异区域等基因相关信息，获取信息为几十至数百条。

解读人员逐条分析，根据每一条数据的基因名称、位点等相关信息查找线下文库，若未匹配出则需到相关网站查找文献进行分析，结该条信息解读结果。分析后的解读结果需整理到线下文库中，以备下次使用。

将全部信息解读完毕后，提取出变异基因，总结最终解读结果是否具有致病性，若存在致病性则需根据不同致病原因查找相应治疗方案，并将最终关键基因数据及治疗方案粘贴至报告模板中。

当前解读人员查找文献人为进行数据分析的方式效率低下，且容易出错。当报告量多时，加重解读人员的工作负担，在这种高负担的工作情况下，人为判读数据的方式一旦出现一例数据解读错误，报告到达患者手中，对于企业都是不可估量的损失。

针对相关技术中解读人员通过查找文献进行基因检测报告的解读容易出错的问题，尚未提出解决方案。

发明内容

本发明实施例提供了一种基因检测报告的解读方法及装置，以至少解决相关技术中解读人员通过查找文献进行基因检测报告的解读容易出错的问题。

根据本发明的一个实施例，提供了一种基因检测报告的解读方法，包括：

获取基因检测报告中的检测项；

判断数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项；

在判断结果为是的情况下，根据数据库中预先保存的检测项与检测结果文献的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果；

根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告。

可选地，在判断所述数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项之后，所述方法还包括：

在判断结果为否的情况下，将所述检测项标记为未解读。

可选地，在将所述检测项标记为未解读之后，所述方法还包括：

获取所述检测项对应的检测结果文献；

根据所述检测结果文献获取所述检测项对应的检测结果；

将所述检测项与所述检测结果文献的对应关系更新到所述数据库中。

可选地，在判断所述数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项之后，所述方法还包括：

在判断结果为是的情况下，若从所述数据库中未获取到与所述检测项对应的检测结果文献，将所述检测项标记为无文献。

可选地，在根据所述数据库中预先保存的检测项与检测结果的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果之后，所述方法还包括：

将所述检测项标记为已解读。

可选地，根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告包括：

在所述基因检测报告的所有检测项为已解读或无文献，或者所述基本检测报告的部分检测项为已解读，且所有检测项中除所述部分检测项之外的检测项为无文献的情况下，接收生成解读报告的报告生成指令；

根据所述报告生成指令生成所述基因检测报告的解读报告。

可选地，在根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告之后，所述方法还包括：

通过邮件或短消息的方式向预先设置的一个或多个终端发送通知消息，其中，所述通知消息用于提示所述基因检测报告的解读报告已生成。

可选地，所述检测项包括以下至少之一：染色体、基因名称、基因类型、变异区域。

根据本发明的另一个实施例，还提供了一种基因检测报告的解读装置，包括：

第一获取模块，用于获取基因检测报告中的检测项；

判断模块，用于判断数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项；

第二获取模块，用于在判断结果为是的情况下，根据数据库中预先保存的检测项与检测结果文献的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果；

生成模块，用于根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告。

可选地，所述装置还包括：

第一标记模块，用于判断结果为否的情况下，将所述检测项标记为未解读。

可选地，所述装置还包括：

第三获取模块，用于获取所述检测项对应的检测结果文献；

第四获取模块，用于根据所述检测结果文献获取所述检测项对应的检测结果；

更新模块，用于将所述检测项与所述检测结果文献的对应关系更新到所述数据库中。

可选地，所述装置还包括：

第二标记模块，用于在判断结果为是的情况下，若从所述数据库中未获取到与所述检测项对应的检测结果文献，将所述检测项标记为无文献。

可选地，所述装置还包括：

第三标记模块，用于将所述检测项标记为已解读。

可选地，所述生成模块包括：

接收单元，用于在所述基因检测报告的所有检测项为已解读或无文献，或者所述基本检测报告的部分检测项为已解读，且所有检测项中除所述部分检测项之外的检测项为无文献的情况下，接收生成解读报告的报告生成指令；

生成单元，用于根据所述报告生成指令生成所述基因检测报告的解读报告。

可选地，所述装置还包括：

发送模块，用于通过邮件或短消息的方式向预先设置的一个或多个终端发送通知消息，其中，所述通知消息用于提示所述基因检测报告的解读报告已生成。

可选地，所述检测项包括以下至少之一：染色体、基因名称、基因类型、变异区域。

根据本发明的又一个实施例，还提供了一种存储介质，所述存储介质中存储有计算机程序，其中，所述计算机程序被设置为运行时执行上述任一项方法实施例中的步骤。

根据本发明的又一个实施例，还提供了一种电子装置，包括存储器和处理器，所述存储器中存储有计算机程序，所述处理器被设置为运行所述计算机程序以执行上述任一项方法实施例中的步骤。

通过本发明，获取基因检测报告中的检测项；判断数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项；在判断结果为是的情况下，根据数据库中预先保存的检测项与检测结果文献的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果；根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告，因此，可以解决相关技术中解读人员通过查找文献进行基因检测报告的解读容易出错的问题，通过系统自动获取基因检测报告中各项检测相关的文献，并从文献中匹配对应的检测结果，提高了基因检测报告解读的准确性。

附图说明

此处所说明的附图用来提供对本发明的进一步理解，构成本申请的一部分，本发明的示意性实施例及其说明用于解释本发明，并不构成对本发明的不当限定。在附图中：

图1是本发明实施例的一种基因检测报告的解读方法的移动终端的硬件结构框图；

图2是根据本发明实施例的一种基因检测报告的解读方法的流程图；

图3是根据本发明实施例的一种基因检测报告的解读装置的框图；

图4是根据本发明优选实施例的一种基因检测报告的解读装置的框图一；

图5是根据本发明优选实施例的一种基因检测报告的解读装置的框图二；

图6是根据本发明优选实施例的一种基因检测报告的解读装置的框图三。

具体实施方式

下文中将参考附图并结合实施例来详细说明本发明。需要说明的是，在不冲突的情况下，本申请中的实施例及实施例中的特征可以相互组合。

需要说明的是，本发明的说明书和权利要求书及上述附图中的术语“第一”、“第二”等是用于区别类似的对象，而不必用于描述特定的顺序或先后次序。

实施例1

本申请实施例一所提供的方法实施例可以在移动终端、计算机终端或者类似的运算装置中执行。以运行在移动终端上为例，图2是根据本发明实施例的一种基因检测报告的解读方法的流程图，如图1所示，移动终端10可以包括一个或多个(图1中仅示出一个)处理器102(处理器102可以包括但不限于微处理器MCU或可编程逻辑器件FPGA等的处理装置)和用于存储数据的存储器104，可选地，上述移动终端还可以包括用于通信功能的传输设备106以及输入输出设备108。本领域普通技术人员可以理解，图1所示的结构仅为示意，其并不对上述移动终端的结构造成限定。例如，移动终端10还可包括比图1中所示更多或者更少的组件，或者具有与图1所示不同的配置。

存储器104可用于存储计算机程序，例如，应用软件的软件程序以及模块，如本发明实施例中的报文接收方法对应的计算机程序，处理器102通过运行存储在存储器104内的计算机程序，从而执行各种功能应用以及数据处理，即实现上述的方法。存储器104可包括高速随机存储器，还可包括非易失性存储器，如一个或者多个磁性存储装置、闪存、或者其他非易失性固态存储器。在一些实例中，存储器104可进一步包括相对于处理器102远程设置的存储器，这些远程存储器可以通过网络连接至移动终端10。上述网络的实例包括但不限于互联网、企业内部网、局域网、移动通信网及其组合。

传输装置106用于经由一个网络接收或者发送数据。上述的网络具体实例可包括移动终端10的通信供应商提供的无线网络。在一个实例中，传输装置106包括一个网络适配器(Network Interface Controller，简称为NIC)，其可通过基站与其他网络设备相连从而可与互联网进行通讯。在一个实例中，传输装置106可以为射频(Radio Frequency，简称为RF)模块，其用于通过无线方式与互联网进行通讯。

在本实施例中提供了一种运行于上述移动终端或网络架构的基因检测报告的解读方法，图2是根据本发明实施例的一种基因检测报告的解读方法的流程图，如图2所示，该流程包括如下步骤：

步骤S202，获取基因检测报告中的检测项；

步骤S204，判断数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项；

步骤S206，在判断结果为是的情况下，根据数据库中预先保存的检测项与检测结果文献的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果；

步骤S208，根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告。

通过上述步骤S202至S208，获取基因检测报告中的检测项；判断数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项；在判断结果为是的情况下，根据数据库中预先保存的检测项与检测结果文献的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果；根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告，因此，可以解决相关技术中解读人员通过查找文献进行基因检测报告的解读容易出错的问题，通过系统自动获取基因检测报告中各项检测相关的文献，并从文献中匹配对应的检测结果，提高了基因检测报告解读的准确性。

在一实施例中，在数据库中不存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项的情况下，将所述检测项标记为未解读。

进一步地，在将所述检测项标记为未解读之后，获取所述检测项对应的检测结果文献；根据所述检测结果文献获取所述检测项对应的检测结果；将所述检测项与所述检测结果文献的对应关系更新到所述数据库中，所有未解读的检测项需要解读人员从其他专业的网站查询相关文献进行解读，添加解读结果，并将查询到的相关文献上传到数据库中供以后解读。

在另一实施例中，在上述步骤S204之后，在数据库中存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项的情况下，但是从所述数据库中未获取到与所述检测项对应的检测结果文献，则将所述检测项标记为无文献。被标记为无文献的检测项，后续无需解读人员进一步解读，可以直接生成解读报告。

本发明实施例中，在根据所述数据库中预先保存的检测项与检测结果的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果之后，所述方法还包括：将所述检测项标记为已解读。

进一步地，根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告具体可以包括：

在所述基因检测报告的所有检测项为已解读或无文献，或者所述基本检测报告的部分检测项为已解读，且所有检测项中除所述部分检测项之外的检测项为无文献的情况下，接收生成解读报告的报告生成指令；

根据所述报告生成指令生成所述基因检测报告的解读报告。

在一个可选的实施例中，在上述步骤S208之后，所述方法还包括：

通过邮件或短消息的方式向预先设置的一个或多个终端发送通知消息，其中，所述通知消息用于提示所述基因检测报告的解读报告已生成，及时通知相关部门，使得相关人员能够及时处理解读报告。

可选地，所述检测项包括以下至少之一：染色体、基因名称、基因类型、变异区域。

本发明实施例提供解读库，减少解读人员查阅文献时间。根据基因名称、基因类型、变异区域等基因相关信息，自动带出变异相应结论，无需人为判断。

本发明实施例具体可以通过Java等编程语言实现，数据库可以采用MySql数据库；前端框架采用jsp技术；底层采用的技术架构：(struts2+Spring+Hibernate3)，struts2是MVC框架；具有丰富的标签库，Spring核心出发点就是降低程序复杂度、耦合度、隔离变化点，Hibernate3对JDBC进行了非常轻量级的对象封装。ssh框架的支持使系统的开发更加便利、快捷。

解读人员获取染色体、基因名称、基因型、变异区域等基因相关信息，获取信息为几十至数百条，将数据结果以Excel等形式上传至系统。

系统中已存在强大的基因解读库，上传后的数据以基因名称，位点等相关数据自动查找解读库，匹配成功的数据则解读人员无需进行解读节省大量解读时间，若解读库中不存在该数据不能匹配对应结果则解读人员查找相关文献后，线上对数据进行解读并录入结果，新解读的数据将自动存入解读库中以便下次使用，方便对于解读库的管理。

解读人员只需对解读状态为未解读的一条数据进行线上解读，其他数据系统已从解读库中自动带出并匹配，极大地减少了解读人员的解读时间。

对于处于未解读的检测项，选择一条未检测的数据，点击“解读开始”，进入解读详情页面。进入解读详情页面后，点击解读图标对解读状态为未解读的数据进行解读，已解读或无文献的数据系统已从解读库中查出对应结果无需人为解读。完成解读之后，点击“解读完成”。

全部信息解读完毕后系统自动分析最终解读结果是否具有致病性，若存在致病性根据不同致病原因自动去解读库中查找相应治疗方案，并自动将最终关键基因数据及治疗方案填入报告模板中。

利用互联网思维解决基因行业解读困难的思想，自动解读，自动整理解读库，节省解读人员时间。

解读结果判定极大减少人为判定成分，多数由系统进行判定，提高解读数据准确性。减少解读人员查阅文献及判定时间，提高工作效率，并且实现了自动整理解读库。极大的减少了解读人员的工作负担，提高工作效率并激发员工的工作积极性。

实施例2

在本实施例中还提供了一种基因检测报告的解读装置，该装置用于实现上述实施例及优选实施方式，已经进行过说明的不再赘述。如以下所使用的，术语“模块”可以实现预定功能的软件和/或硬件的组合。尽管以下实施例所描述的装置较佳地以软件来实现，但是硬件，或者软件和硬件的组合的实现也是可能并被构想的。

图3是根据本发明实施例的一种基因检测报告的解读装置的框图，如图3所示，包括：

第一获取模块32，用于获取基因检测报告中的检测项；

判断模块34，用于判断数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项；

第二获取模块36，用于在判断结果为是的情况下，根据数据库中预先保存的检测项与检测结果文献的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果；

生成模块38，用于根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告。

图4是根据本发明优选实施例的一种基因检测报告的解读装置的框图一，如图4所示，所述装置还包括：

第一标记模块42，用于判断结果为否的情况下，将所述检测项标记为未解读。

图5是根据本发明优选实施例的一种基因检测报告的解读装置的框图二，如图5所示，所述装置还包括：

第三获取模块52，用于获取所述检测项对应的检测结果文献；

第四获取模块54，用于根据所述检测结果文献获取所述检测项对应的检测结果；

更新模块56，用于将所述检测项与所述检测结果文献的对应关系更新到所述数据库中。

图6是根据本发明优选实施例的一种基因检测报告的解读装置的框图三，如图6所示，所述装置还包括：

第二标记模块62，用于在判断结果为是的情况下，若从所述数据库中未获取到与所述检测项对应的检测结果文献，将所述检测项标记为无文献。

可选地，所述装置还包括：

第三标记模块，用于将所述检测项标记为已解读。

可选地，所述生成模块包括：

接收单元，用于在所述基因检测报告的所有检测项为已解读或无文献，或者所述基本检测报告的部分检测项为已解读，且所有检测项中除所述部分检测项之外的检测项为无文献的情况下，接收生成解读报告的报告生成指令；

生成单元，用于根据所述报告生成指令生成所述基因检测报告的解读报告。

可选地，所述装置还包括：

发送模块，用于通过邮件或短消息的方式向预先设置的一个或多个终端发送通知消息，其中，所述通知消息用于提示所述基因检测报告的解读报告已生成。

可选地，所述检测项包括以下至少之一：染色体、基因名称、基因类型、变异区域。

需要说明的是，上述各个模块是可以通过软件或硬件来实现的，对于后者，可以通过以下方式实现，但不限于此：上述模块均位于同一处理器中；或者，上述各个模块以任意组合的形式分别位于不同的处理器中。

实施例3

本发明的实施例还提供了一种存储介质，该存储介质中存储有计算机程序，其中，该计算机程序被设置为运行时执行上述任一项方法实施例中的步骤。

可选地，在本实施例中，上述存储介质可以被设置为存储用于执行以下步骤的计算机程序：

S1，获取基因检测报告中的检测项；

S2，判断数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项；

S3，在判断结果为是的情况下，根据数据库中预先保存的检测项与检测结果文献的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果；

S4，根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告。

可选地，在本实施例中，上述存储介质可以包括但不限于：U盘、只读存储器(Read-Only Memory，简称为ROM)、随机存取存储器(Random Access Memory，简称为RAM)、移动硬盘、磁碟或者光盘等各种可以存储计算机程序的介质。

实施例4

本发明的实施例还提供了一种电子装置，包括存储器和处理器，该存储器中存储有计算机程序，该处理器被设置为运行计算机程序以执行上述任一项方法实施例中的步骤。

可选地，上述电子装置还可以包括传输设备以及输入输出设备，其中，该传输设备和上述处理器连接，该输入输出设备和上述处理器连接。

可选地，在本实施例中，上述处理器可以被设置为通过计算机程序执行以下步骤：

S1，获取基因检测报告中的检测项；

S2，判断数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项；

S3，在判断结果为是的情况下，根据数据库中预先保存的检测项与检测结果文献的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果；

S4，根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告。

可选地，本实施例中的具体示例可以参考上述实施例及可选实施方式中所描述的示例，本实施例在此不再赘述。

显然，本领域的技术人员应该明白，上述的本发明的各模块或各步骤可以用通用的计算装置来实现，它们可以集中在单个的计算装置上，或者分布在多个计算装置所组成的网络上，可选地，它们可以用计算装置可执行的程序代码来实现，从而，可以将它们存储在存储装置中由计算装置来执行，并且在某些情况下，可以以不同于此处的顺序执行所示出或描述的步骤，或者将它们分别制作成各个集成电路模块，或者将它们中的多个模块或步骤制作成单个集成电路模块来实现。这样，本发明不限制于任何特定的硬件和软件结合。

以上所述仅为本发明的优选实施例而已，并不用于限制本发明，对于本领域的技术人员来说，本发明可以有各种更改和变化。凡在本发明的原则之内，所作的任何修改、等同替换、改进等，均应包含在本发明的保护范围之内。

Claims (11)

1.一种基因检测报告的解读方法，其特征在于，包括：

获取基因检测报告中的检测项；

判断数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项；

在判断结果为是的情况下，根据数据库中预先保存的检测项与检测结果文献的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果；

根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，在判断所述数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项之后，所述方法还包括：

在判断结果为否的情况下，将所述检测项标记为未解读。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，在将所述检测项标记为未解读之后，所述方法还包括：

获取所述检测项对应的检测结果文献；

根据所述检测结果文献获取所述检测项对应的检测结果；

将所述检测项与所述检测结果文献的对应关系更新到所述数据库中。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，在判断所述数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项之后，所述方法还包括：

在判断结果为是的情况下，若从所述数据库中未获取到与所述检测项对应的检测结果文献，将所述检测项标记为无文献。

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，在根据所述数据库中预先保存的检测项与检测结果的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果之后，所述方法还包括：

将所述检测项标记为已解读。

6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告包括：

在所述基因检测报告的所有检测项为已解读或无文献，或者所述基本检测报告的部分检测项为已解读，且所有检测项中除所述部分检测项之外的检测项为无文献的情况下，接收生成解读报告的报告生成指令；

根据所述报告生成指令生成所述基因检测报告的解读报告。

7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法，其特征在于，在根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告之后，所述方法还包括：

通过邮件或短消息的方式向预先设置的一个或多个终端发送通知消息，其中，所述通知消息用于提示所述基因检测报告的解读报告已生成。

8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，

所述检测项包括以下至少之一：染色体、基因名称、基因类型、变异区域。

9.一种基因检测报告的解读装置，其特征在于，包括：

第一获取模块，用于获取基因检测报告中的检测项；

判断模块，用于判断数据库中是否存在与所述基因检测报告中的检测项匹配的检测项；

第二获取模块，用于在判断结果为是的情况下，根据数据库中预先保存的检测项与检测结果文献的对应关系获取所述基因检测报告中的检测项对应的检测结果；

生成模块，用于根据所述检测结果生成所述基因检测报告的解读报告。

10.一种存储介质，其特征在于，所述存储介质中存储有计算机程序，其中，所述计算机程序被设置为运行时执行所述权利要求1至8任一项中所述的方法。

11.一种电子装置，包括存储器和处理器，其特征在于，所述存储器中存储有计算机程序，所述处理器被设置为运行所述计算机程序以执行所述权利要求1至8任一项中所述的方法。