CN109313214A - 用于系统的共用管线选择器阀 - Google Patents

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Abstract

一种系统可包括:流动池,其支撑所关注分析物;选择器阀,其耦接至该流动池以从多个流动路径中选择穿过该流动池的流动路径;泵,其耦接至该流动池以在分析操作期间使流体移位通过该选定流动路径;及控制电路,其耦接至该选择器阀以命令该选择器阀选择该选定流动路径。

Description

用于系统的共用管线选择器阀
相关申请的交叉参考
本申请要求2017年12月13日申请的美国专利申请第15/841,095号的优先权权益,该美国专利申请要求2017年1月5日申请的美国专利申请第62/442,677号的优先权权益,以及要求2017年3月24日申请的英国(GB)专利申请第1704761.4号的优先权权益,该英国专利申请也要求美国专利申请第62/442,677号的优先权权益,所有这些在先申请特此以全文引用的方式并入本文中。
背景
用于对所关注分子(具体地,是DNA、RNA及其他生物样品)测序的仪器已被开发且不断地演进。在测序操作之前,准备所关注分子的样品以便形成将与试剂混合且最终引入至流动池中的库,在流动池中,个别分子将附着于位点处且被放大以增强可检测性。测序操作接着包括重复以下步骤的循环:在位点处结合分子,标记经结合组份,对位点处的组份成像,及处理所得图像数据。
在此等测序系统中,流体系统(或子系统)在诸如程控计算机及适当接口的控制系统的控制下提供物质(例如,试剂)的流动。
概述
本说明书中所描述的主题的一个或更多个实施方案的细节阐述于附图及以下描述中。其他特征、方面及优点将自描述、附图及权利要求变得明显。
在一些实施方案中,可提供一种系统,其包括:多个流动路径,其用以在流动池安装于该系统中时与该流动池流体地连接以支撑所关注分析物;流动路径选择器阀,其耦接至该流动路径,该流动路径选择器阀用以在该流动路径之间作出选择;泵,其在该流动池安装于该系统中时与该流动池流体地连接且在分析操作期间使流体移位通过该流动路径中的由该流动路径选择器阀选择的一者;及控制电路,其操作性地耦接至该流动路径选择器阀,该控制电路具有一个或更多个处理器及储存计算机可执行指令的存储器,该计算机可执行指令在由该一个或更多个处理器执行时控制该一个或更多个处理器以命令该流动路径选择器阀选择该选定流动路径。
在该系统的一些实施方案中,该多个流动路径可包括:第一流动路径,其用以提供穿过该流动池的第一通道的流体流动;及第二流动路径,其用以提供穿过该流动池的第二通道的流体流动,其中该第二流动路径不同于该第一流动路径。
在该系统的一些实施方案中,该多个流动路径可包括第三流动路径,该第三流动路径包括该第一流动路径及该第二流动路径两者。
在该系统的一些实施方案中,该流动路径选择器阀可进一步流体地耦接至在该流动池安装于该系统中时绕过该流动池的旁路管线,且该流动路径选择器阀也可是可控制的以选择该旁路管线而非该流动路径。
在该系统的一些实施方案中,该控制电路可自动地命令该流动路径选择器阀在该分析操作期间基于分析协议而选择该选定流动路径。
在该系统的一些实施方案中,该系统可进一步包括在流体方向上定位于该流动路径选择器阀上游的试剂选择器阀,该试剂选择器阀用以从多种试剂中选择试剂且将该选定试剂引导至该流动路径选择器阀的入口。
在该系统的一些实施方案中,该系统可包括用以在该流动池安装于该系统中时使该流动池与该流动路径选择器阀流体地连接的一个或更多个歧管,且该一个或更多个歧管可在该流动池安装于该系统中时流体地插入于该流动路径选择器阀与该流动池之间。
在该系统的一些实施方案中,该泵可包括在流体方向上位于该流动池下游的注射泵。
在一些实施方案中,可提供一种系统,其包括:试剂选择器阀,其用以根据分析协议而从多种试剂中选择试剂;流动池,其用以支撑所关注分析物;流动路径选择器阀,其流体地插入于该试剂选择器阀与该流动池之间,该流动路径选择器阀用以根据该分析协议而从穿过该流动池的多个流动路径中选择穿过该流动池的流动路径且引导该选定试剂通过该选定流动路径;泵,其与该流动池流体地连接,该泵用以根据该分析协议而使该选定试剂移位通过该选定流动路径;及控制电路,其操作性地耦接至该流动路径选择器阀,该控制电路具有一个或更多个处理器及储存(store或storing)计算机可执行指令的存储器,该计算机可执行指令在由该一个或更多个处理器执行时控制该一个或更多个处理器以使该流动路径选择器阀选择该选定流动路径。
在该系统的一些实施方案中,该多个流动路径可包括穿过该流动池的一个通道的第一流动路径及穿过该流动池的第二通道的第二流动路径,其中该第二流动路径不同于该第一流动路径。
在该系统的一些实施方案中,该多个流动路径可包括第三流动路径,该第三流动路径包括该第一流动路径及该第二流动路径两者。
在该系统的一些实施方案中,该流动路径选择器阀可进一步与绕过该流动池的旁路管线流体地连接,且该流动路径选择器阀可进一步可控制以选择该旁路管线而非穿过该流动池的流动路径。
在该系统的一些实施方案中,该系统可包括一个或更多个歧管,该一个或更多个歧管在该流动池安装于测序系统中时流体地耦接于该选择器阀与该流动池之间以使该流动池与该选择器阀接合。
在一些实施方案中,可提供一种方法,其包括:控制在流体方向上处于流动池上游的流动路径选择器阀以根据分析协议而从穿过该流动池的多个流动路径中选择穿过该流动池的流动路径及使试剂移位通过该选定流动路径,其中该多个流动路径包括穿过该流动池的一个通道的第一流动路径、穿过该流动池的第二通道的一第二流动路径及包括该第一流动路径及该第二流动路径两者的第三流动路径,其中该第二流动路径不同于该第一流动路径。
在该方法的一些实施方案中,该方法可进一步包括控制与该流动路径选择器阀流体地连接的试剂选择器阀,该试剂选择器阀用以根据该分析协议而从多种试剂中选择不同试剂以用于移位通过该流动路径选择器阀及该流动池,其中该流动路径选择器阀可流体地插入于该试剂选择器阀与该流动池之间。
在该方法的一些实施方案中,该方法可进一步包括在该分析协议的连续循环期间命令该流动路径选择器阀、该试剂选择器阀或该流动路径选择器阀及该试剂选择器阀的位置改变。
在该方法的一些实施方案中,该方法可进一步包括命令该流动路径选择器阀选择绕过该流动池的旁路管线而非穿过该流动池的流动路径。
在该方法的一些实施方案中,该方法可进一步包括将该流动池安装于测序系统中以使该流动池与多个歧管流体地连接,该多个歧管流体地插入于该流动路径选择器阀与该流动池之间以使该流动池与该流动路径选择器阀流体地连接,其中该流动池的该安装是在使该试剂移位之前执行的。
在该方法的一些实施方案中,该试剂可藉由定位于该流动池下游的泵来移位通过该选定流动路径。
在该系统的一些此等实施方案中,该泵可包括或可为注射泵。
本说明书中所描述的主题的一个或更多个实施方案的细节阐述于附图及以下描述中。其他特征、方面及优点将自描述、附图及权利要求变得明显。应注意,以下诸图的相对尺寸可能未按比例绘制。
附图简述
当参看附图阅读以下详细描述时,本公开的此等及其他特征、方面及优点将变得更好理解,其中遍及附图的类似字符表示类似部分,其中:
图1是可使用所公开技术的实例测序系统的图形概述;
图2是图1的实例测序系统的流体系统的一个实施方案的图形概述;
图3是图1的实例测序系统的实例处理及控制系统的图形概述;
图4是用于图1的实例测序系统的流体系统的一部分的另一实施方案的图形概述;
图5是用于图1的测序系统中的共用管线选择器阀的实施方案的示意性分解图;
图6是说明藉由图1的测序系统的共用管线选择器阀实现的实例端口组合的示意图;
图7A及图7B是图1的测序系统的共用管线选择器阀的实施方案的不同配置的横截面正视图且其描绘流体可流动通过该阀的方式的实例;
图8A至图8F是图1的测序系统的共用管线选择器阀的实施方案的不同配置的横截面平面图,这些不同配置表明阀的不同端口组合;
图9A至图9D是穿过图1的测序系统的流动池的各种流动路径的图形概述,上述各种流动路径由共用管线选择器阀选择;
图10是充装流体系统而不将流体抽吸至图1的测序系统的流动池中的实例方法的说明;
图11是用于与图1的测序系统对接的歧管总成的实施方案的透视图,该歧管总成具有试剂选择器阀、共用管线选择器阀、喷嘴及各种流体通道;
图12是操作图1的测序系统的方法的实施方案的流程图;及
图13是用于图1的测序系统且具有用以在各种试剂之间作出选择且组合各种试剂的额外共用管线选择器阀的流体系统的另一实施方案的示意性概述。
详细描述
图1说明被配置以处理分子样品的测序系统10的实施方案,这些分子样品可被测序以判定其组份、组份排序,且大体上判定样品的结构。该系统包括接收及处理生物样品的仪器12。样品源14提供在许多状况下将包括组织样品的样品16。例如,样品源可包括个人或个体,诸如人类、动物、微生物、植物或其他供体(包括环境样品)或是包括所关注有机分子的任何其他个体,该有机分子的序列将得到判定。当然,系统可与除获自生物体的那些样品以外的样品(包括合成分子)一起使用。在许多状况下,分子将包括DNA、RNA或具有碱基对的其他分子,这些分子的序列可界定具有最终关注的特定功能的基因及变异体。
样品16被引入至样品/库准备系统18中。此系统可隔离、分裂及以其他方式准备样品以供分析。所得库包括长度有助于测序操作的所关注分子。所得库接着被提供至仪器12,在该仪器中执行测序操作。实际上,有时可被称作模板的库在自动化或半自动化程序中与试剂组合,且接着在测序之前被引入至流动池。
在图1中所说明的实施方案中,仪器包括接收样品库的流动池或阵列20。流动池包括允许测序化学反应发生(包括库的分子的附着,及在测序操作期间可检测到的部位或位点处的放大)的一个或更多个流体通道。例如,流动池/阵列20可包括在该部位或位点处固定于一个或更多个表面上的测序模板。“流动池”可包括图案化阵列,诸如微阵列、纳米阵列等。实际上,该部位或位点可按规则的重复图案、复杂的非重复图案或随机配置而安置于支撑体的一个或更多个表面上。为使测序化学反应能够发生,流动池也允许引入用于反应、冲洗等的物质,诸如各种试剂、缓冲剂及其他反应介质。物质流经流动池且可在各个位点处与所关注分子接触。
在仪器中,流动池20安装于可移动载台22上,在此实施方案中,可移动载台可在如由参考数字24指示的一个或更多个方向上移动。例如,流动池20可按可移除且可替换的匣的形式提供,该匣可与系统的可移动载台22或其他组件上的端口对接,以便允许将试剂及其他流体递送至流动池20或自流动池递送试剂及其他流体。载台与光学检测系统26相关联,该光学检测系统可在测序期间将辐射或光28引导至流动池。光学检测系统可使用诸如萤光显微法的各种方法以检测安置于流动池的位点处的分析物。藉助于非限制性实例,光学检测系统26可使用共焦线扫描以产生渐进像素化图像数据,渐进像素化图像数据可被分析以定位流动池中的各个位点且判定最近附着或结合至每一位点的核苷酸的类型。也可合适地使用其他成像技术,诸如沿着样品扫描一个或更多个辐射点的技术,或使用“步进拍摄(step and shoot)”成像方法的技术。光学检测系统26及载台22可合作以在获得区域图像(或如所提到,可按任何合适的模式(例如,点扫描、线扫描、“步进拍摄”扫描)扫描流动池)的同时使流动池及检测系统维持静态关系。
虽然许多不同技术可用于成像或更通常来说是用于检测位点处的分子,但当前涵盖的实施方案可利用引起激发萤光标记的波长下的共焦光学成像。凭借吸收光谱而激发的标记凭借其发射光谱而传回萤光信号。光学检测系统26被配置以俘获此类信号,以允许对信号发射位点进行分析的解析度处理像素化图像数据,且处理及储存所得图像数据(或自其导出的数据)。
在测序操作中,循环操作或程序是以自动或半自动方式实施的,在自动或半自动方式中促进反应(诸如,藉由单核苷酸或藉由寡核苷酸促进反应),继而冲洗、成像及解块以准备好用于后续循环。在自准备好用于测序且固定于流动池上的样品库提取出所有有用信息之前,该库可经受数个此等循环。光学检测系统可藉由使用电子检测电路(例如,摄影机或成像电子电路或晶片)自在测序操作的每一循环期间对流动池(及其位点)的扫描产生图像数据。所得图像数据接着可被分析,以定位图像数据中的各个位点且分析及特性化存在于位点处的分子,诸如参考在特定部位处所检测到的特定色彩或波长的光(特定萤光标记的特性发射光谱),如由该部位处的图像数据中的像素的群组或群集所指示。例如,在DNA或RNA测序应用中,四种常见的核苷酸可由可区分的萤光发射光谱(光的波长或波长范围)表示。每一发射光谱接着可被指派对应于那个核苷酸的值。基于此分析,且追踪针对每一位点所判定的循环值,可针对每一位点判定各个核苷酸及其次序。接着可进一步处理这些序列以组装包括基因、染色体等的较长片段。如本公开中所使用,术语“自动”及“半自动”意谓,一旦操作开始,或一旦包括该操作的程序开始,该操作便由与人类的交互很少或不存在人类的交互的系统程序设计或配置来执行。
在所说明的实施方案中,试剂30经由阀门(valving)32而被抽取或抽吸至流动池中。阀门可诸如经由吸液管或吸管(图1中未展示)自储存有试剂的容器或器皿获取试剂。阀门32可允许基于所执行的规定操作序列而选择试剂。阀门可进一步接收用于经由流动路径34将试剂引导至流动池20中的命令。退出或流出流动路径36引导来自流动池的已使用试剂。在所说明实施方案中,泵38用以使试剂移动通过系统。泵也可提供其他有用功能,诸如量测通过系统的试剂或其他流体、抽吸空气或其他流体等。泵38下游的额外阀门40允许将已使用试剂适当地引导至处置器皿或容器42。
仪器进一步包括一系列电路,其辅助命令各种系统组件的操作、藉由来自传感器的回馈来监视组件的操作、收集图像数据,以及至少部分地处理图像数据。在图1中所说明的实施方案中,控制/监督系统44包括控制系统46及数据采集与分析系统48。两个系统将包括一个或更多个处理器(例如,数字处理电路(诸如,微处理器、多核处理器、FPGA)或任何其他合适的处理电路)及相关联的存储器电路50(例如,固态存储器装置、动态存储器装置、机载及/或机外存储器装置等),该存储器电路可储存用于控制例如一个或更多个计算机、处理器或其他类似逻辑装置以提供某些功能性的机器可执行指令。专用或通用计算机可至少部分地组成控制系统及数据采集与分析系统。控制系统可包括例如被配置(例如,被程序设计)以处理针对流体学、光学件、载台控制以及仪器的任何其他有用功能的命令的电路。数据采集与分析系统48与光学检测系统对接,以命令光学检测系统或载台或其两者的移动、用于循环检测的光的发射、对传回信号的接收及处理等。仪器也可包括如以参考数字52所指示的各种接口,诸如准许控制及监视仪器、传送样品、启动自动或半自动测序操作、产生报告等的操作员接口。最后,在图1的实施方案中,外部网络或系统54可耦接至仪器且与其合作,例如以用于分析、控制、监视、服务及其他操作。
应注意,虽然在图1中说明单一流动池及流体学路径以及单一光学检测系统,但在一些仪器中,可容纳多于一个流动池及流体学路径。例如,在当前涵盖的实施方案中,提供两个此类配置以增强测序及产量。实际上,可提供任何数目的流动池及路径。这些流动池及路径可利用相同或不同的试剂收容器、处置收容器、控制系统、图像分析系统等。在提供多个流体学系统的情况下,该多个流体学系统可分别地受控制或以协调方式受控制。
图2说明图1的测序系统的实例流体系统。在所说明的实施方案中,流动池20包括可成对地分组以用于在分析(例如,包括测序)操作期间接收流体物质(例如,试剂、缓冲剂、反应介质)的一系列流道或通路56A及56B。通路56A耦接至共用管线58(第一共用管线),而通路56B耦接至第二共用管线60。还提供旁路管线62以允许流体绕过流动池而不进入其中。如上文所提到,一系列器皿或容器64允许储存可在分析操作期间利用的试剂及其他流体。试剂选择器阀(RSV)66耦接至马达或致动器(图中未示)以允许选择试剂中的一个或更多个来被引入至流动池中。选定试剂接着前进至类似地包括马达(图中未示)的共用管线选择器阀(CLSV)68。可命令共用管线选择器阀以选择共用管线58及60中的一个或更多个或两个共用管线,以使试剂64以受控方式流动至通路56A及/或56B,或选择旁路管线62以使试剂中的一个或更多个流经旁路管线。
已使用试剂经由耦接于流动池与泵38之间的管线退出流动池。在所说明实施方案中,泵包括具有一对注射器70的注射泵,这对注射器由致动器72控制及移动,以在测试、验证及分析(例如,测序)循环的不同操作期间抽吸试剂及其他流体且喷射该试剂及流体。泵总成可包括各种其他部件及组件,包括阀门、仪器、致动器等(图中未示)。在所说明实施方案中,压力传感器74A及74B感测泵的入口管线上的压力,同时提供压力传感器74C以感测由注射泵输出的压力。
由系统使用的流体自泵进入已使用的试剂选择器阀76。此阀允许为已使用的试剂及其他流体选择多个流动路径中的一个。在所说明实施方案中,第一流动路径通向第一已使用试剂收容器78,而第二流动路径经由流量计80通向第二已使用试剂收容器82。取决于所使用的试剂,将该试剂或该试剂中的某些收集在单独器皿中以供处置可为有利的,且已使用试剂选择器阀76允许此控制。
应注意,泵总成内的阀门可允许包括试剂、溶剂、清洁剂、空气等的各种流体由泵抽吸且经由共用管线、旁路管线及流动池中的一个或更多个来注入或循环。此外,如上文所提到,在当前涵盖的实施方案中,在共同控制下提供图2中所展示的流体学系统的两个并行实施方案。流体学系统中的每一者可以是单一分析仪器的部分,且可并行地对不同流动池及样品库进行包括测序操作的功能。
流体学系统根据实施用于测试、验证、分析(例如,包括测序)等的规定协议的控制系统46的命令而操作。规定协议将预先被建立,且包括用于活动的一系列事件或操作,诸如抽吸试剂、抽吸空气、抽吸其他流体、喷射此等试剂、空气及流体等。该协议将允许协调此类流体操作与仪器的其他操作,诸如在流动池中发生的反应、流动池及其位点的成像等。在所说明实施方案中,控制系统46使用一个或更多个阀接口84以及泵接口86,阀接口被配置以为阀提供命令信号,泵接口被配置以命令泵致动器的操作。也可提供各种输入/输出电路88以用于诸如自压力传感器74A至74C及流量计80接收回馈及处理此回馈。
图3说明控制/监督系统44的某些功能组件。如所说明,存储器电路50储存在测试、调测、故障诊断、服务及分析操作期间执行的规定例程。许多此等协议及例程可实施且储存于存储器电路中,且此等协议及例程可不时地更新或更改。如图3中所说明,此等协议及例程可包括流体学控制协议90,流体学控制协议用于控制各种阀、泵及任何其他流体学致动器,以及用于接收及处理来自诸如阀的流体学传感器以及流量及压力传感器的回馈。载台控制协议92允许诸如在成像期间视需要移动流动池。光学件控制协议94允许将命令发布至成像组件,以照明流动池的部分及接收传回信号以供处理。图像采集与处理协议96允许图像数据至少部分地被处理以供提取用于分析的有用数据。其他协议及例程可如由参考数字98所指示提供于相同或不同的存储器电路中。实际上,存储器电路可被提供为一个或更多个存储器装置,诸如易失性存储器及非易失性存储器两者。此存储器可位于仪器内,且一些存储器可以是机外的。
一个或更多个处理器100存取所存储协议且对仪器实施该协议。如上文所提到,处理电路可以是专用计算机、通用计算机或任何合适的硬件、固件及软件平台的部分。处理器及对仪器的操作可由人类操作员经由操作员接口101命令。操作员接口可允许测试、调测、故障诊断及服务,以及允许报告可能出现在仪器中的任何问题。操作员接口也可允许启动及监视分析操作。
图4说明用于仪器12的实施方案的流体系统120的一部分,其中箭头指示在样品分析期间使物质(例如,试剂、缓冲剂、分析物)流动通过各种所说明流动路径的能力。对于图4中所说明的实施方案,流动池20包括表示为通路群组A及通路群组B的两个通路群组。流动池20的其他实施方案可包括不同数目的通路群组,诸如多于两个的通路群组。在另外的其他实施方案中,流动池20可包括仅一个通路群组。流动池20可为分析系统的可移除及/或可替换物品。
两个所说明通路群组A及B中的每一者包括图4中表示为通路L1、L2、L3及L4的两个相应流体通道或通路。就此而言,通路群组A及B可被称作“通路对”,因为该通路群组各自包括两个相应通路。对于所说明实施方案,流动池20被设计以操作使得可在分析协议期间促动物质(例如,流体)在由箭头指示的方向上通过通路群组A及B。用于测试等的其他协议可使某些物质在不同方向上流动。
另外,图4中所说明的流体系统的泵38包括多个注射泵124(例如,注射泵124A及124B)。如所说明,注射泵124各自包括分别由致动器128(例如,致动器128A及128B)致动的一个或更多个相应注射器126(例如,对应于通路群组A的注射器126A及对应于通路群组B的注射器126B)。所说明注射泵124还包括阀门130(例如,阀门130A及130B),其使得注射泵能够将流体推送至泵124的不同孔口或端口中及自泵的不同孔口或端口抽出流体。
完全或部分地经由控制注射泵124、RSV 66及CLSV 68来协调流体前进通过流动池20的方式。如上文关于图2所阐述,RSV 66流体地耦接至各种试剂源,且允许试剂源与CLSV68之间的选择性流体耦接。作为实例,RSV至CLSV共用管线140可使RSV 66的试剂出口端口与CLSV 68的共用管线入口端口流体地耦接,且RSV至CLSV共用管线140被设计以使各种流体(例如,试剂)在RSV 66与CLSV 68之间流动。
如本文中进一步详细论述,CLSV 68允许在RSV 66处选择(例如,经由选定试剂端口)的试剂与流动池20内的各种流动路径之间的选择性流体耦接。以此方式,CLSV 68耦接至流动池20以从多个流动路径中选择供流体通过流动池20的流动路径,且该多个流动路径包括穿过流动池的一个通道的第一流动路径及穿过流动池的第二通道的第二流动路径,该第二流动路径不同于该第一流动路径。在某些实施方案中,该多个流动路径包括第三流动路径,该第三流动路径包括该第一流动路径及该第二流动路径两者。在所说明实施方案中,此意谓除其他外,CLSV 68也被配置以允许RSV 66与通路群组A及通路群组B(分别是第一通路群组及第二通路群组)中的任一者或两者(且在某些实施方案中与其他流动路径)之间的选定流体耦接。以此方式,CLSV 68允许流动池20的每一通路群组或通路对的个别定址。CLSV 68还允许RSV 66与旁路管线142之间的选择性流体耦接,该旁路管线可用于充装使用试剂而不将流体抽吸至流动池20中,可用于某些测试协议及其他协议。如本文中所使用,术语“流体耦接”意欲指示流动路径之间的耦接,以允许该流动路径之间的流体流动。因此,选定或选择性流体耦接指示选择性地耦接流动路径以允许流体在其间流动的能力,该流动路径另外(在不流体地耦接时)彼此流体地隔离(流体无法在其间流动)。在分析操作期间,控制电路自动地命令CLSV 68(例如,经由马达)基于分析协议而选择选定流动路径。例如,流动池可安装于测序系统中,且一个或更多个歧管(例如,多个歧管)可在流动池20适当地安装时使流动池20与CLSV 68接合。控制电路可执行某些诊断以确保已建立适当的流体连接,可执行包括对流体系统120的试剂充装的某些预分析(例如,预测序)操作,且可接着开始各种分析(例如,包括测序)协议。
可使用阀68的某些物理特征实现使用如上文所阐述的CLSV 68的选择性流体耦接,阀68的实施方案示意性地说明于图5中。如所展示,CLSV 68包括被展示为彼此分离的静止部分150及可移动部分152。当被组装时,静止部分150及可移动部分152以防止其相应流体组件(例如,流体端口、流体通道)之间的流体泄漏的方式定位成彼此直接相抵。可移动部分152被配置以相对于静止部分150移动(例如,平移、旋转),如由箭头154所展示,以形成其相应流体组件之间的各种流体连接。可移动部分152是否平移、旋转或进行平移及旋转两者将取决于CLSV 68的特定几何配置(例如,细长、环形、多边形)以及阀68的各种机械耦接156及流体耦接158的性质。CLSV 68的机械耦接156可包括由阀68与测序系统10的其他组件(诸如,包括如本文中所描述的阀66、68及各种流动路径的歧管总成的外壳)之间的扣件进行的耦接。机械耦接156还可包括可移动部分152与诸如马达的致动器之间及可移动部分152与静止部分150之间进行的耦接。
流体耦接158可以是动态的,这是因为该耦接可被调整、关闭、开放、形成、堵塞等。流体耦接158可包括至诸如共用管线58及60以及图4的RSV至CLSV共用管线140的各种管线(例如,图2的流动路径34)的耦接。在某些实施方案中,流体耦接可包括一个或更多个歧管,该一个或更多个歧管操作以例如在流动池20安装于测序系统中时将CLSV 68流体地耦接至流动池20。
根据当前实施方案,可移动部分152相对于静止部分150的移动154调整各个通道160与各个端口162之间的重叠以产生流体耦接端口的各种组合。流体耦接端口的各种组合用以判定流体通过流动池20的流动路径。
在所说明实施方案中,各个通道160是可移动部分152的部分(例如,形成于可移动部分中),且各个端口162是静止部分150的部分(例如,形成于静止部分中)。然而,CLSV 68的其他实施方案可具有在可移动部分152中的一些或所有各个端口162及在静止部分150中的一些或所有各个通道160。可例如藉由消减制造(例如,蚀刻、机械加工及光刻)或藉由增材制造实现在其相应部分中形成各个通道160及各个端口162。CLSV 68的一种或更多种材料可被选择或设计以耐受在系统10(图1)的分析及测试协议期间通常使用的流体,例如使得该一种或更多种材料并不吸附至试剂中且防止断裂或其他化学诱发的降解。另外,CLSV68的一种或更多种材料可选择为在可移动部分150与静止部分152之间具有一定的摩擦系数,以提供对可移动部分152的偶然移动的充分抵抗,同时仍允许可移动部分152在由致动器或使用者施加的一定量的力下自由地移动。
如所展示,可移动部分152及静止部分150包括在轴向方向164上重叠的环形几何结构。在所说明实施方案中,重叠使得可移动部分152的中心点166与静止部分150的中心点168沿轴向方向164基本上对准。阀68的其他实施方案可具有如下配置:其中,中心点166、168例如归因于包括阀68的匣内的空间约束、某些设计考虑因素等而彼此偏移。实际上,可移动部分152及静止部分150可能并非相同大小(例如,具有相同的周长、长度或深度),且可能具有不同几何结构(不同形状)。例如,虽然可移动部分152在图5的示意图中相对于静止部分150以堆迭关系展示,但CLSV 68的某些实施方案可具有巢套于静止部分150内(但也呈堆迭关系)的可移动部分152。
为使用CLSV 68产生流体耦接,延伸穿过静止部分150的厚度170(例如,在平行的平坦表面172、174之间)的各个端口162之中的某些端口在轴向方向166上与某些内部通道160对准。各个端口162自表面172穿过静止部分150延伸至表面174,表面172是静止部分150的背对可移动部分152的第一面,表面174是静止部分150的面向及直接邻接可移动部分152的第二面。各个端口162在静止部分150中彼此分离并相异,且可用以取决于流体耦接158的配置而递送或接收流体。
根据本实施方案,各个通道160具有允许各个端口162的不同组合彼此耦接的几何结构。此示意性地展示于图6中,图6包括CLSV 68的不同实例端口组合。如所展示,CLSV 68的实施方案包括五个不同端口,但其他数目的端口可包括于其他实施方案中。
如由实例阀配置68A描绘,阀68的第一流体通道160A流体地耦接端口1、2及3。作为实例,端口2可以是入口,且端口1及3可以是通路群组出口(通向通路群组)。此配置可被称作高产量配置,其中例如在并行的通路群组A及B中进行并行操作(例如,测序操作)。在例如压力测试协议的某些测试协议中,某些流体可在不同流动方向上前进,也就是说,自通路群组A及B开始,且通过阀68及共用管线140返回。
在实例阀配置68B中,阀68的第二流体通道160B仅流体地耦接端口2及3。在其中2是流体入口且3是流体出口的实施方案中,CLSV 68因此选择流经流动池20的单一通路群组。在阀配置68C中,第三流体通道160C流体地耦接端口2及端口5。在此配置中,CLSV 68仅允许流体在这些端口之间流动,且在端口5流体地耦接至除通路群组外的管线(例如,旁路管线)时,不允许流动至流动池20的通路群组而改为绕过该通路群组。CLSV 68的各种端口的流体耦接可产生除图6中所展示的组合外的组合,且实际上,可使用CLSV 68的实施方案选择端口中的任一者或端口的组合。
再次,可藉由相对于静止部分150移动CLSV 68的可移动部分152来产生不同的流体耦接端口组合,使得可移动部分152的不同的各个通道160与静止部分150的各个端口162的各种组合对准。可参看作为CLSV 68的实施方案的横截面正视图的图7A及图7B进一步了解通道160可用以流体地耦接端口162的方式。在图7A及图7B中所说明的实施方案中,为清楚起见在图中未展示端口162中的某些端口(例如,旁路管线端口及空气入口端口)。然而应了解,这类端口可存在于阀68的不同区中。
在图7A及图7B中,可移动部分152巢套于静止部分150的收容器区180内,且可相对于静止部分150旋转。在所描绘实施方案中,第一通道160A与第一端口(通路群组A端口162A)、第二端口(通路群组B端口162B)及第三端口(RSV端口162C)轴向地重叠以将端口彼此流体地耦接。根据本实施方案且如所展示,通道160仅部分地延伸穿过可移动部分152的厚度182(如由平行的表面184、186之间的距离判定,其中表面184邻接静止部分150的表面174且表面186背对静止部分150)。
因为可移动部分152抵靠静止部分150而紧密地密封,所以流体仅在端口162A、162B及162C之间通过。当物质例如在测序协议的部分期间前进至流动池20(图4)中时,流体可仅以由自端口162C延伸且延伸至端口162A及162B的箭头描绘的方式流动,该方式由第一通道160A的形状判定。另外,如由作为可移动部分152相对于图7A的旋转产生的CLSV 68的定向的图7B中所展示,可移动部分152(其主体)抵靠通路群组A端口162A而牢固地密封,使得流体不离开端口162A。不同于第一通道160A如图7A中与端口对准,在图7B中,第二通道160B与端口162B及162C对准,该第二通道流体地连接两个端口且允许流体流经每一端口且流出CLSV 68。在流体例如在测序协议期间前进至流动池20中时,流体可如由箭头所展示自RSV 66流动、流经RSV端口162C、流经第二通道160B、流出通路群组B端口162B且流动至通路群组B(例如,经由图2及图4的管线60)。
可藉由调整可移动部分152相对于静止部分150的位置及藉由使用泵38进行适当抽吸来实现数个其他流体组合及流动方向。在可移动部分152及静止部分150两者均为环形的实施方案中,可移动部分152的旋转接着用以对准弧形通道160中的特定的一个以及定位于静止部分150的不同圆周位置处的端口162中的一个或更多个。通道160将具有不同几何结构,其大体上指示不同形状但具有某些共用参数(例如,如由通道160沿可移动部分152的厚度182的大小判定的通道深度、如由通道160在可移动部分的径向方向上的大小判定的通道宽度)。不同几何结构允许进行不同流体连接。
具有用于RSV 66、用于通路群组A及B、用于旁路管线142及用于空气的端口的CLSV68的一个实施方案展示于图8A至图8F中,这些图是在各种位置或定向中的CLSV 68的图形平面图。不同阴影或散列用以区分CLSV 68的端口162。应了解,图8A至图8F中所说明的CLSV68的一系列位置可藉由测序系统的控制电路命令,以例如对应于某些测试操作、预测序操作或测序操作。
图8A至图8F中所说明的CLSV 68具有绕轴向方向164旋转且包括各种内部通道160的可移动部分152。再次,可移动部分152抵靠端口162而牢固地密封,使得流体不离开端口162,除非通道160合适地对准以使得能够流动至另一端口162。例如,图8A中所说明的CLSV68的、在下文被称作“RSV至通路群组A及B”位置的定向使用第一通道160A的实施方案将RSV端口162C流体地耦接至通路群组A端口162A及通路群组B端口162B两者,该第一通道被几何设计以与端口162A、162B及162C轴向重叠以将这些端口流体地耦接在一起。应注意,在图8A中所展示的位置中的CLSV 68的剩余通道160被定位及几何设计成使得其并不将CLSV 68的其他端口162耦接在一起。
可移动部分152相对于静止部分150绕轴向方向164的顺时针旋转将CLSV 68转变至图8B中所展示的位置,该位置使用第二通道160B的实施方案产生通路群组A端口162A与RSV端口162C的流体耦接,该位置在下文被称作“RSV至通路群组A”位置,该第二通道被几何设计以与端口162A及162C轴向重叠以将该端口流体地耦接在一起。如所展示,在图8B中所展示的位置中的CLSV 68的剩余通道160被定位及几何设计成使得其并不将CLSV 68的其他端口162耦接在一起。因此,尽管第一通道160A流体地耦接至通路群组B端口162B,但通路群组B端口162B保持与其他端口流体地隔离,这是因为通道160彼此流体地隔离。
继续顺时针旋转,CLSV 68转变至图8C中所展示的配置,其中RSV端口162C使用第二通道160B流体地耦接至通路群组B端口162B,其在下文被称作“RSV至通路群组B”位置。因为第二通道160B的大小被适当地设定为仅耦接两个邻近端口162,所以其可用于若干不同位置中以耦接邻近端口162。因此,根据当前实施方案,通道160中的一者可用以产生端口162之间的流体耦接的多于一个的组合。此处,归因于通道160的定位及几何设计结合端口162的相应位置,剩余端口162再次与其他端口162隔离。
图8A至图8C中所说明的定向使得图4中所说明的流体系统120的实施方案能够如上文所描述操作,以引导自RSV 66接收的流体通过单一通路群组(例如,通路群组A或B)或同时通过通路群组A及B两者。另外,虽然在顺时针旋转的情况下进行描述,但取决于通道160的当前位置及所要端口组合,CLSV 68可另外或替代地逆时针旋转。例如,自图8A中所展示的定向开始,可移动部分152可逆时针旋转以产生图8D中所展示的定向。
图8D中所说明的定向使得流体系统120的实施方案能够使流体在RSV 66与旁路管线142之间流动,且该定向在下文被称作“RSV至旁路”位置。在此位置中,第三通道160C的实施方案将RSV端口162C流体地耦接至旁路端口162D。在所说明位置中,第三通道160C被几何设计及定位以仅流体地耦接RSV端口162C与旁路端口162D,同时维持剩余端口162的流体隔离。
如上文所阐述,CLSV 68还包括空气入口端口162E,其允许将空气抽吸至流体系统120中且可用于诊断或其他目的。图8E中所说明的定向(例如,由可移动部分152自图8D逆时针旋转产生的定向)(例如,其在下文被称作“空气至通路群组A及B”位置)使用第四通道160D将空气入口端口162E流体地耦接至通路群组A端口162A及通路群组B端口162B两者。所说明定向可用于在压力测试或其他协议之前对通路群组A及B进行干燥。
图8F中所说明的在下文被称作“空气至旁路”位置的定向可由可移动部分152的进一步旋转产生。在此配置中,第一通道160A将空气入口端口162E流体地耦接至旁路端口162D,其可用于在某些压力测试期间使得空气能够被引入至流体系统120中。应注意,第二通道160B也可产生此流体耦接。
图8A至图8F中所说明的CLSV 68的定向以及其他可能位置也可用于诊断目的以使得处理器100能够隔离、准备及测试流体系统的各种流动路径。由上文所描述的CLSV 68的某些位置(具体而言,是涉及RSV 66的那些位置)产生的通过流体系统120的实例流体流动路径描绘于图9A至图9D中。
在图9A中所描绘的实施方案中,CLSV 68是在关于图8A所描述的“RSV至通路群组A及B”位置中。因此,在操作期间,RSV 66选择试剂64,该试剂经由RSV至CLSV共用管线140前进至CLSV 68。因为RSV端口162C经由CLSV 68流体地耦接至通路群组A端口162A及通路群组B端口162B,所以试剂流经CLSV 68且分别经由共用管线58及60流动至通路群组A及B。在图9A的实施方案中,此情形展示为通路群组A及B两者被阴影化,连同粗体箭头指示流体前进通过流动池20且至注射泵124。此配置可被视为表示流动池20的最高位准的测序产量。
在图9B中所描绘的实施方案中,CLSV 68是在关于图8B所描述的“RSV至通路群组A”位置中。因此,在操作期间,RSV 66选择试剂64,该试剂经由共用管线140前进至CLSV 68。因为RSV端口162C经由CLSV 68仅流体地耦接至通路群组A端口162A,所以试剂流经CLSV 68且经由共用管线58流动至通路群组A(通路1及2,L1及L2)。在图9B的实施方案中,此情形展示为仅通路群组A被阴影化,连同管线58上的粗体箭头指示流体前进通过流动池20且至对应注射泵124A。此情形允许通路群组A中的与在通路群组B中进行的测序操作分离且相异的测序操作,且允许测序操作的参数在通路群组A与B之间独立地受控制。
在图9C中所描绘的实施方案中,CLSV 68是在关于图8C所描述的“RSV至通路群组B”位置中。因此,在操作期间且在控制电路的命令下,RSV 66选择试剂64,该试剂经由共用管线140前进至CLSV 68。因为RSV端口162C经由CLSV 68仅流体地耦接至通路群组B端口162B,所以试剂流经CLSV 68且经由共用管线58流动至通路群组B(通路3及4,L3及L4)。在图9B的实施方案中,此情形展示为仅通路群组B被阴影化,连同管线58上的粗体箭头指示流体前进通过流动池20且至对应注射泵124B。
如上文所阐述,在某些实施方案中,可能需要将通路群组与CLSV 68的输出隔离,同时也允许某些试剂流经CLSV 68,以便例如充装流体学系统120用于在测序期间引入新试剂。例如,在某些协议期间,可能需要用待使用的试剂填充自RSV 66延伸且穿过CLSV 68的流体元件。在此等实施方案中,CLSV 68可定位于关于图8D所描述的“RSV至旁路”位置中。在所说明实施方案中,CLSV 68被定位使得RSV端口162C仅流体地耦接至旁路端口162D,藉此允许流体在旁路管线142与CLSV 68之间流动但不在CLSV 68与通路群组A及/或B之间流动。此情形说明为粗体箭头自CLSV 68穿过旁路管线142且引导至注射泵124A。应注意,可结合旁路管线142使用注射泵124A及124B中的任一者或两者,但在一个特定实施方案中,仅结合注射泵124A使用旁路管线142。
使用旁路端口162D的实例操作序列描绘于图10中,该实例操作序列是充装流体系统120的某些部分而不抽吸流体通过流动池20的方法200。应注意,此充装在测序操作中常常是重要的,其利用大约数微升的流体量。因此,仍存在于流体管线内的任何材料可引起量测的不准确性,可引起相对试剂量的变化等。
为开始该充装序列且如首先在202处所展示,CLSV 68是在第一位置中,在此状况下是在上文指示为“RSV至通路群组A及B”位置的“高输出”位置中。在此位置中,流体系统120可能已完成协议以准备好流动池20供引入试剂64中的一个或更多个。
为使流体系统120准备好接收及使用新试剂,可使CLSV 68移动(例如,藉由马达及相关联控制器)至在204处展示为关于图9D所讨论的“RSV至旁路”位置的第二位置。再次,在此位置中,旁路端口162D与RSV端口162C流体地连接。如自202至204的转变中所展示,可藉由可移动部分152相对于静止部分150的逆时针移动使CLSV 68自第一位置移位至第二位置。此移位使第三通道160C移动至使RSV端口162C与旁路端口162D流体地耦接的位置。
RSV 66也以可控制方式定位(例如,藉由马达及相关联控制器)以选择所要的试剂,如在206处所展示。RSV 66可具有对应于各种可用试剂的数个不同位置,且在被适当选择时,试剂可随后被抽吸通过RSV 66且朝向CLSV 68抽吸至共用管线140中。如在208处所展示,可使用注射泵124中的一个或更多个来实现此抽吸。在所说明实施方案中,注射泵124流体地连接至旁路管线142,该旁路管线又流体地耦接至旁路回路210,该旁路回路可充当用于待用于充装及/或冲洗流体系统120的物质的贮藏所。旁路回路210的直径或宽度可大于共用管线58、60的直径或宽度,例如以实现对适当量的缓冲剂、试剂等的贮藏。根据所说明实施方案,选定试剂64被抽吸至旁路回路210中而不进入旁路管线142。
一旦试剂被适当地抽吸至旁路回路210中,试剂便可直接分配至RSV 66的辅助废弃物端口中或分配至注射泵废弃物中。例如,如在212处所展示,这可藉由以下操作执行:使RSV 66转变至其废弃物端口,及使注射泵124对旁路管线142及旁路回路210加压以相较于在208处执行的抽吸促动试剂在反向流动方向上流动。如在214处所展示,可针对需要充装的每一试剂执行先前所提到的程序,继而CLSV 68转变回至适当测序位置(例如,RSV至通路群组A及B位置)。
可参看图11进一步理解本文中所描述的各种特征的各种连接件、流体管线等的性质,图11是具有RSV 66、CLSV 68、旁路回路210及各种流体连接件的歧管总成220的透视图。在某些实施方案中,歧管总成220可被视为吸管歧管总成,该吸管歧管总成被配置以与各种试剂贮器对接,以允许RSV 66自此等试剂的源选择此等试剂以供最终递送到流动池20。
歧管总成220包括被形成以界定用于试剂及其他流体的流动路径的通道。如图11中可见,阀66及68由马达222及224驱动及控制。一个或更多个马达接口或连接件226将电力及在需要时将信号提供至马达且自马达提供电力及信号。如上文所提到,在测试、调测及服务期间以及在测序操作期间,马达(及由此的阀)由控制电路控制。
歧管总成220内的试剂及流体流道耦接至吸管228,在操作期间,吸管228自相应容器(图示未示)抽取试剂及其他流体。在图11中一般藉由参考数字230指明的用于试剂及流体的流动路径可藉由模制、蚀刻或任何其他合适的制程形成于歧管总成220的主体232(例如,单体结构)中,以在命令上文所讨论的泵抽吸试剂及流体时允许试剂及流体自吸管移动至阀。吸管中的至少一者被配置为喷嘴吸管234以在测序操作期间(例如,在反应及成像之前)辅助混合试剂。图11中也说明旁路回路210,在该回路中,可抽取及移动试剂及流体以用于混合(例如,藉此充当混合体积)且在适当时充装流体系统120。在旁路回路或旁路管线充当混合体积的实施方案中,混合体积可以是旁路管线62或旁路回路210的一部分或全部。例如,试剂可按所要序列抽吸至旁路回路或管线中,而使得试剂并不横越旁路回路或管线的整个长度(此可引起试剂被投送以供处置)。一旦旁路管线(或其充当混合体积的一部分)已装载有所要序列的试剂,则可使用阀切换引入试剂所通过的旁路管线的末端,以便与通向例如目的地容器的流动路径流体地连接,使得装载至旁路管线中的整组试剂可接着往回自旁路管线排出且至目的地容器中。例如,目的地容器可以是被设计以含有试剂的贮器、管路或其他器皿。例如,目的地容器可用作试剂及/或其他材料可传送至的临时工作体积,以便例如藉由混合来准备试剂及/或其他材料,以供递送至流动池。因此,一旦在目的地容器中得到准备,试剂及其他流体便可自目的地容器传送至流动池。
应理解,术语“流体地连接”或其类似术语可在本文中用以描述两个或更多个组件之间的使此等组件彼此流体连通的连接,大致相同地,“电连接”可用以描述两个或多于两个组件之间的电连接。术语“流体地插入”可例如用以描述组件的特定排序。例如,若组件B流体地插入于组件A与组件C之间,则自组件A流动至组件C的流体在到达组件C之前将流经组件B。
可根据本文中所描述的实施方案执行操作测序系统的各种方法。作为一个实例,图12描绘了操作具有CLSV 68的测序系统以例如分别地定址流动池20的通路群组的方法240的实施方案。可基于例如在测序协议、测试协议或其类似协议期间由控制电路执行的指令来执行方法240的全部或一部分。另外应注意,本文中所描述的某些动作可按不同于所呈现的那些次序的次序执行,或某些动作可被完全省略,且在适当时其他操作可被包括于方法240中。
如上文所提到,测序系统的某些组件可以是可移除、可替换或可处置的。在某些实施方案中,流动池20例如可以是可处置式匣的、或是具有被配置以与测序系统的各种连接器对接的特征的类似结构的一部分。因此,方法240包括例如在控制电路判定流动池20已安装至测序系统中时使流动池20与在CLSV 68和流动池20之间的一个或更多个(例如,多个)歧管流体地接合(区块242)。该流体接合引起流动池20与CLSV 68接合,其在试剂自RSV 66及CLSV 68移位之前发生。
方法240还包括控制(区块244)CLSV 68(例如,其位置)以从穿过流动池20的多个流动路径中选择穿过流动池的流动路径。例如,选择穿过流动池20的流动路径可包括选择流体将在流动池20内流经哪些通路。参看图9A至图9C,例如,控制电路可在仅流经通路群组A的第一流动路径(例如,如图9B中所展示)、仅流经通路群组B的第二流动路径(例如,如图9C中所展示)或包括第一流动路径及第二流动路径两者的第三流动路径(例如,如图9A中所展示)之间作出选择。
可与选择用于流动池20的适当试剂一致地执行选择用于试剂的适当流动路径。因此,方法240可包括控制(区块246)在流体方向上处于CLSV 68上游的RSV 66,以根据测序协议而从多种试剂选择不同试剂用于移位通过CLSV 68及流动池20。
方法240接着包括根据测序协议使试剂移位(区块248)通过选定流动路径。例如,控制电路可使泵38抽取选定试剂通过RSV 66、通过RSV至CLSV共用管线140、通过CLSV 66且通过选定流动路径(穿过流动池20)。
在各种测序操作期间,可利用各种试剂,意谓CLSV 68及/或RSV 66的各种位置可被选择以在试剂之间适当地作出转变。因此,方法240包括在测序协议的连续循环期间命令(区块250)CLSV 68及/或RSV 66的位置改变。连续循环可以是试剂引入至流动池20中的循环,或测序反应序列的整个循环,或其两者。例如,RSV 66及CLSV 68的位置的改变可如关于图10所描述的那样执行,以在试剂之间作出转变。实际上,此转变可涉及命令CLSV 68选择旁路管线而非穿过流动池20的流动路径,例如以进行对歧管总成220的某些流体结构的试剂充装。
应了解,本文中所描述的CLSV 68可另外或替代地用以在不同共用管线之间作出选择及/或组合不同共用管线。例如,在一个实施方案中且如图13中示意性地展示,额外的CLSV 260可定位于CLSV 68上游,CLSV 68定位于RSV 66与流动池20之间。额外的CLSV 260可用以在例如通向各种试剂的端口之间作出选择以使得试剂能够以各种组合被抽取至额外的CLSV 260及后续流体元件中。作为一个实例,额外的CLSV 260可被控制电路命令以转变至流体地耦接通向第一试剂源262及第二试剂源264的端口的位置。藉由以此方式将端口流体地耦接在一起,额外的CLSV 260允许例如藉由泵38的动作同时将第一试剂及第二试剂抽吸至流体系统120中。RSV 66的、对应于来自额外CLSV 260的组合的端口可被选择,以允许至CLSV 68且随后至流动池20的流体耦接。
作为一个实例,此配置可尤其适用于避免封装及运送可另外用可源于本端的液体稀释的大体积物质。在缓冲剂的情况下(例如,第一试剂源262可以是浓缩的缓冲溶液),且第二试剂源264可以是诸如水的稀释剂。在某些情境中,如所展示流体地耦接第一试剂源262与第二试剂源264使得浓缩的缓冲溶液变得被稀释至适当程度可以是有用的。当前涵盖如下情形:使用额外阀门可适于进一步控制不同试剂的相对混合量(例如,以控制相对流量)。
若存在,则除非明确地指示特定次序或序列,否则在本公开及权利要求中对例如(a)、(b)、(c)…或其类似者的序数指示符的使用将应被理解为不传达任何此次序或序列。例如,若存在标示为(i)、(ii)及(iii)的三个步骤,则应理解,除非另外指示,否则可按任何次序(或若未另外禁止,则甚至同时地)执行此等步骤。例如,若步骤(ii)涉及处置在步骤(i)中产生的元件,则步骤(ii)可被视为在步骤(i)之后的某一点处发生。类似地,若步骤(i)涉及处置在步骤(ii)中产生的元件,则应反过来进行理解。
也应理解,“用以”的使用(例如,“用以在两个流动路径之间切换的阀”)可用诸如“被配置以”(例如,“被配置以在两个流动路径之间切换的阀”)或其类似词语的语言来替换。
当用于参考量或类似可定量属性时,除非另外指示,否则诸如“约”、“大约”、“实质上”、“标称”或其类似者的术语应被理解为包括所指定值的±10%内的值。
除本公开中列出的权利要求以外,以下额外实施方案也应被理解为在本公开的范围内:
实施方案1:一种系统包括:流动池,其支撑所关注分析物;选择器阀,其耦接至该流动池以从多个流动路径中选择穿过该流动池的流动路径;泵,其耦接至该流动池以在分析操作期间使流体移位通过该选定流动路径;及控制电路,其耦接至该选择器阀以命令该选择器阀选择该选定流动路径。
实施方案2:如实施方案1的系统,其中,该多个流动路径包括穿过该流动池的一个通道的第一流动路径及穿过该流动池的第二通道的第二流动路径,该第二流动路径不同于该第一流动路径。
实施方案3:如实施方案2的系统,其中,该多个流动路径包括第三流动路径,该第三流动路径包括该第一流动路径及该第二流动路径两者。
实施方案4:如实施方案1的系统,其中,该选择器阀耦接至绕过该流动池的旁路管线,且其中该选择器阀也可控制以选择该旁路管线而非穿过该流动池的流动路径。
实施方案5:如实施方案1的系统,其中,在该分析操作期间,该控制电路自动地命令该选择器阀基于分析协议而选择该选定流动路径。
实施方案6:如实施方案1的系统,其包括在流体方向上处于该选择器阀上游的试剂选择器阀以从多种试剂中选择试剂且将该选定试剂引导至该选择器阀的入口。
实施方案7:如实施方案1的系统,其包括多个歧管,该多个歧管在该流动池安装于测序系统中时流体地耦接于该选择器阀与该流动池之间,以使该流动池与该选择器阀接合。
实施方案8:如实施方案1的系统,其中,该泵包括在流体方向上处于该流动池下游的注射泵。
实施方案9:一种系统,包括:试剂选择器阀,其根据分析协议而从多种试剂中选择试剂;流动池,其用以支撑所关注分析物;选择器阀,其耦接于该试剂选择器阀与该流动池之间以根据该分析协议而从多个流动路径中选择穿过该流动池的流动路径且引导该选定试剂通过该选定流动路径;泵,其耦接至该流动池以根据该分析协议而使该选定试剂移位通过该选定流动路径;及控制电路,其耦接至该选择器阀以命令该选择器阀选择该选定流动路径。
实施方案10:如实施方案9的系统,其中,该多个流动路径包括穿过该流动池的一个通道的第一流动路径及穿过该流动池的第二通道的第二流动路径,该第二流动路径不同于该第一流动路径。
实施方案11:如实施方案10的系统,其中,该多个流动路径包括第三流动路径,该第三流动路径包括该第一流动路径及该第二流动路径两者。
实施方案12:如实施方案9的系统,其中,该选择器阀耦接至绕过该流动池的旁路管线,且其中该选择器阀也可控制以选择该旁路管线而非穿过该流动池的流动路径。
实施方案13:如实施方案9的系统,其包括多个歧管,该多个歧管在该流动池安装于测序系统中时流体地耦接于该选择器阀与该流动池之间以使该流动池与该选择器阀接合。
实施方案14:一种方法,包括:控制在流体方向上处于流动池上游的选择器阀以从穿过该流动池的多个流动路径中选择穿过该流动池的流动路径;根据分析协议而使试剂移位通过该选定流动路径;其中该多个流动路径包括穿过该流动池的一个通道的第一流动路径、穿过该流动池的第二通道的第二流动路径及包括该第一流动路径及该第二流动路径两者的第三流动路径,该第二流动路径不同于该第一流动路径。
实施方案15:如实施方案14的方法,其包括控制在流体方向上处于该选择器阀上游的试剂选择器阀以根据该分析协议而自多种试剂选择不同试剂以用于移位通过该选择器阀及该流动池。
实施方案16:如实施方案15的方法,其包括在该分析协议的连续循环期间命令该选择器阀及/或该试剂选择器阀的位置改变。
实施方案17:如实施方案14的方法,其包括命令该选择器阀选择旁路管线而非穿过该流动池的流动路径。
实施方案18:如实施方案14的方法,其包括在该流动池安装于测序系统中时及在使该试剂移位之前使该流动池与多个歧管流体地耦接,以使该流动池与该选择器阀接合,该多个歧管在该选择器阀与该流动池之间。
实施方案19:如实施方案14的方法,其中,该试剂藉由在流体方向上处于该流动池下游的泵而移位通过该选定流动路径。
实施方案20:如实施方案19的方法,其中,该泵包括注射泵。
应了解,前述概念(假设此类概念并非相互不一致)的所有组合预期为本文中所公开的本发明主题的部分。在本公开结尾处出现的所主张主题的所有组合被预期为本文中所公开的本发明主题的部分。也应了解,本文中明确使用的也可出现在以引用方式并入的任何公开内容中的术语应符合与本文中所公开的特定概念大部分一致的含义。

Claims (20)

1.一种系统,其包含:
多个流动路径,其在流动池安装于所述系统中时与所述流动池流体地连接,以支撑所关注的分析物;
流动路径选择器阀,其耦接至所述流动路径,所述流动路径选择器阀用以在所述流动路径之间作出选择;
泵,其在所述流动池安装于所述系统中时与所述流动池流体地连接,且在分析操作期间使流体移位通过所述流动路径中的由所述流动路径选择器阀选择的一者;及
控制电路,其操作性地耦接至所述流动路径选择器阀,所述控制电路具有一个或更多个处理器及储存计算机可执行指令的存储器,所述计算机可执行指令在由所述一个或更多个处理器执行时控制所述一个或更多个处理器以命令所述流动路径选择器阀选择所选定流动路径。
2.如权利要求1所述的系统,其中,所述多个流动路径包含:第一流动路径,其提供穿过所述流动池的第一通道的流体流动;及第二流动路径,其提供穿过所述流动池的第二通道的流体流动,所述第二流动路径不同于所述第一流动路径。
3.如权利要求2所述的系统,其中,所述多个流动路径包含第三流动路径,所述第三流动路径包括所述第一流动路径及所述第二流动路径两者。
4.如权利要求1所述的系统,其中,所述流动路径选择器阀进一步流体地耦接至在所述流动池安装于所述系统中时绕过所述流动池的旁路管线,且其中所述流动路径选择器阀也可控制地选择所述旁路管线而非所述流动路径。
5.如权利要求1所述的系统,其中,在所述分析操作期间,所述控制电路自动地命令所述流动路径选择器阀基于分析协议而选择所述选定流动路径。
6.如权利要求1所述的系统,其还包含试剂选择器阀,所述试剂选择器阀在流体方向上定位于所述流动路径选择器阀上游且用以从多种试剂中选择试剂,并将所选定试剂引导至所述流动路径选择器阀的入口。
7.如权利要求1所述的系统,其包含用以在所述流动池安装于所述系统中时使所述流动池与所述流动路径选择器阀流体地连接的一个或更多个歧管,其中,所述一个或更多个歧管在所述流动池安装于所述系统中时流体地插入于所述流动路径选择器阀与所述流动池之间。
8.如权利要求1所述的系统,其中,所述泵包含在流体方向上位于所述流动池下游的注射泵。
9.一种系统,其包含:
试剂选择器阀,其根据分析协议而从多种试剂中选择试剂;
流动池,其支撑所关注分析物;
流动路径选择器阀,其流体地插入于所述试剂选择器阀与所述流动池之间,所述流动路径选择器阀用以从穿过所述流动池的多个流动路径中选择穿过所述流动池的流动路径且根据所述分析协议而引导所选定试剂通过所选定流动路径;
泵,其与所述流动池流体地连接,所述泵用以根据所述分析协议而使所述选定试剂移位通过所述选定流动路径;及
控制电路,其操作性地耦接至所述流动路径选择器阀,所述控制电路具有一个或更多个处理器及储存计算机可执行指令的存储器,所述计算机可执行指令在由所述一个或更多个处理器执行时控制所述一个或更多个处理器以使所述流动路径选择器阀选择所述选定流动路径。
10.如权利要求9所述的系统,其中,所述多个流动路径包含穿过所述流动池的一个通道的第一流动路径及穿过所述流动池的第二通道的第二流动路径,所述第二流动路径不同于所述第一流动路径。
11.如权利要求10所述的系统,其中,所述多个流动路径包含第三流动路径,所述第三流动路径包括所述第一流动路径及所述第二流动路径两者。
12.如权利要求9所述的系统,其中,所述流动路径选择器阀进一步与绕过所述流动池的旁路管线流体地连接,且其中所述流动路径选择器阀进一步可控制以选择所述旁路管线而非穿过所述流动池的流动路径。
13.如权利要求9所述的系统,其包含一个或更多个歧管,所述一个或更多个歧管在所述流动池安装于测序系统中时流体地耦接于所述选择器阀与所述流动池之间,以使所述流动池与所述选择器阀接合。
14.一种方法,其包含:
控制在流体方向上处于流动池上游的流动路径选择器阀,以从穿过所述流动池的多个流动路径中选择穿过所述流动池的流动路径;及
根据分析协议使试剂移位通过所选定流动路径,其中,所述多个流动路径包含穿过所述流动池的一个通道的第一流动路径、穿过所述流动池的第二通道的第二流动路径及包括所述第一流动路径及所述第二流动路径两者的第三流动路径,其中,所述第二流动路径不同于所述第一流动路径。
15.如权利要求14所述的方法,其还包含控制与所述流动路径选择器阀流体地连接的试剂选择器阀,所述试剂选择器阀用以根据所述分析协议而从多种试剂中选择不同试剂以用于移位通过所述流动路径选择器阀及所述流动池,其中,所述流动路径选择器阀流体地插入于所述试剂选择器阀与所述流动池之间。
16.如权利要求15所述的方法,其还包含在所述分析协议的连续循环期间命令所述流动路径选择器阀、所述试剂选择器阀或所述流动路径选择器阀及所述试剂选择器阀的位置改变。
17.如权利要求14所述的方法,其还包含命令所述流动路径选择器阀选择绕过所述流动池的旁路管线而非穿过所述流动池的流动路径。
18.如权利要求14所述的方法,其还包含将所述流动池安装于测序系统中以使所述流动池与多个歧管流体地连接,所述多个歧管流体地插入于所述流动路径选择器阀与所述流动池之间,以使所述流动池与所述流动路径选择器阀流体地连接,其中,所述流动池的所述安装是在使所述试剂移位之前执行的。
19.如权利要求14所述的方法,其中所述试剂藉由定位于所述流动池下游的泵来移位通过所述选定流动路径。
20.如权利要求19所述的方法,其中所述泵包含注射泵。
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DK (1) DK3469380T3 (zh)
ES (1) ES2905754T3 (zh)
GB (1) GB201704761D0 (zh)
IL (1) IL262683B2 (zh)
MY (1) MY193989A (zh)
RU (1) RU2721898C1 (zh)
SA (1) SA518400528B1 (zh)
SG (1) SG11201811312WA (zh)
TW (1) TWI759390B (zh)
WO (1) WO2018128843A1 (zh)

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2021212276A1 (zh) * 2020-04-20 2021-10-28 深圳华大智造科技股份有限公司 铺液装置、铺液方法、铺液系统及组合装置与过液装置
CN114981011A (zh) * 2019-12-30 2022-08-30 伊鲁米那有限公司 流通池组件和相关试剂选择器阀
CN116044729A (zh) * 2022-12-23 2023-05-02 郑州思昆生物工程有限公司 一种注射泵的控制方法、装置、计算机设备及存储介质
WO2024113148A1 (zh) * 2022-11-29 2024-06-06 深圳华大智造科技股份有限公司 流体系统、生化分析检测平台和流体操作方法

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114682310B (zh) * 2020-12-31 2023-12-05 深圳市真迈生物科技有限公司 液路系统、测序系统和方法
WO2023248229A1 (en) * 2022-06-22 2023-12-28 Codiq 4.0 Ltd Improved systems, methods, and computer program products for enhancing production which involves material flow

Citations (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2000037163A1 (en) * 1998-12-23 2000-06-29 Nanogen, Inc. Integrated portable biological detection system
US20100024527A1 (en) * 2001-04-25 2010-02-04 Biotrove, Inc. Systems and methods for high-throughput screening of fluidic samples
US20100111768A1 (en) * 2006-03-31 2010-05-06 Solexa, Inc. Systems and devices for sequence by synthesis analysis
CN102439132A (zh) * 2010-05-07 2012-05-02 全技术联合公司 用于分析样品和收集样品级分的方法和装置
US20130065316A1 (en) * 2008-10-20 2013-03-14 David Baltimore System and Method for Analyzing a Biological Sample
US20130157251A1 (en) * 2010-01-13 2013-06-20 John Gerard Quinn In situ-dilution method and system for measuring molecular and chemical interactions
US20130260372A1 (en) * 2012-04-03 2013-10-03 Illumina, Inc. Integrated optoelectronic read head and fluidic cartridge useful for nucleic acid sequencing
US20150045234A1 (en) * 2013-08-08 2015-02-12 Illumina, Inc. Fluidic system for reagent delivery to a flow cell
WO2015183871A1 (en) * 2014-05-27 2015-12-03 Illumina, Inc. Systems and methods for biochemical analysis including a base instrument and a removable cartridge
CN204945154U (zh) * 2012-02-24 2016-01-06 魄金莱默保健科学有限公司 用于将样品加载至流动池的系统、套件和井下工具系统
US20160074864A1 (en) * 2009-04-10 2016-03-17 Canon U.S. Life Sciences, Inc. Fluid interface cartridge for a microfluidic chip
CN105555966A (zh) * 2013-07-31 2016-05-04 株式会社日立高新技术 核酸分析用流动池和核酸分析装置

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5800784A (en) 1996-07-09 1998-09-01 Horn; Marcus J. Chemical sample treatment system and cassette, and methods for effecting multistep treatment process
US20030095897A1 (en) * 2001-08-31 2003-05-22 Grate Jay W. Flow-controlled magnetic particle manipulation
US7744817B2 (en) 2003-08-11 2010-06-29 Sakura Finetek U.S.A., Inc. Manifold assembly
JP2007133829A (ja) * 2005-11-14 2007-05-31 Hamlet Motoyama Japan:Kk 流体制御装置と圧力調節弁と制御方法
US9067728B2 (en) * 2012-03-01 2015-06-30 Clasen Quality Coatings, Inc. Container including a magnetically operated scraper
JP6484222B2 (ja) * 2013-05-07 2019-03-13 マイクロニクス, インコーポレイテッド 核酸の調製および分析のためのデバイス
US10113995B2 (en) 2014-11-18 2018-10-30 Idex Health & Science Llc Multi-position, micro-fluidic valve assembly with multiple radial grooves to enable individual or combined flows
GB201704758D0 (en) * 2017-01-05 2017-05-10 Illumina Inc Reagent channel mixing systema and method

Patent Citations (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2000037163A1 (en) * 1998-12-23 2000-06-29 Nanogen, Inc. Integrated portable biological detection system
US20100024527A1 (en) * 2001-04-25 2010-02-04 Biotrove, Inc. Systems and methods for high-throughput screening of fluidic samples
US20100111768A1 (en) * 2006-03-31 2010-05-06 Solexa, Inc. Systems and devices for sequence by synthesis analysis
US20130065316A1 (en) * 2008-10-20 2013-03-14 David Baltimore System and Method for Analyzing a Biological Sample
US20160074864A1 (en) * 2009-04-10 2016-03-17 Canon U.S. Life Sciences, Inc. Fluid interface cartridge for a microfluidic chip
US20130157251A1 (en) * 2010-01-13 2013-06-20 John Gerard Quinn In situ-dilution method and system for measuring molecular and chemical interactions
CN102439132A (zh) * 2010-05-07 2012-05-02 全技术联合公司 用于分析样品和收集样品级分的方法和装置
CN204945154U (zh) * 2012-02-24 2016-01-06 魄金莱默保健科学有限公司 用于将样品加载至流动池的系统、套件和井下工具系统
US20130260372A1 (en) * 2012-04-03 2013-10-03 Illumina, Inc. Integrated optoelectronic read head and fluidic cartridge useful for nucleic acid sequencing
CN105555966A (zh) * 2013-07-31 2016-05-04 株式会社日立高新技术 核酸分析用流动池和核酸分析装置
US20150045234A1 (en) * 2013-08-08 2015-02-12 Illumina, Inc. Fluidic system for reagent delivery to a flow cell
WO2015183871A1 (en) * 2014-05-27 2015-12-03 Illumina, Inc. Systems and methods for biochemical analysis including a base instrument and a removable cartridge

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114981011A (zh) * 2019-12-30 2022-08-30 伊鲁米那有限公司 流通池组件和相关试剂选择器阀
CN114981011B (zh) * 2019-12-30 2024-03-29 伊鲁米那有限公司 流通池组件和相关试剂选择器阀
WO2021212276A1 (zh) * 2020-04-20 2021-10-28 深圳华大智造科技股份有限公司 铺液装置、铺液方法、铺液系统及组合装置与过液装置
WO2024113148A1 (zh) * 2022-11-29 2024-06-06 深圳华大智造科技股份有限公司 流体系统、生化分析检测平台和流体操作方法
CN116044729A (zh) * 2022-12-23 2023-05-02 郑州思昆生物工程有限公司 一种注射泵的控制方法、装置、计算机设备及存储介质

Also Published As

Publication number Publication date
TWI759390B (zh) 2022-04-01
JP7287785B2 (ja) 2023-06-06
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GB201704761D0 (en) 2017-05-10
DK3469380T3 (da) 2022-01-24
SG11201811312WA (en) 2019-01-30
US10865442B2 (en) 2020-12-15
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KR102468915B1 (ko) 2022-11-18

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