CN108949590B - 一种高产生木薯淀粉酶的草酸青霉工程菌及其应用 - Google Patents

一种高产生木薯淀粉酶的草酸青霉工程菌及其应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种高产生木薯淀粉酶的草酸青霉工程菌及其应用。本发明提供的工程菌是将特异DNA分子通过同源重组取代草酸青霉基因组DNA中PoxPepA蛋白酶的编码基因得到的;特异DNA分子中具有特异表达盒,其中启动子为序列26第1至19位所示启动子pPoxEgCel5B,启动编码特异蛋白质的基因的表达;特异蛋白质自包括信号肽spPoxGA15A、生淀粉糖化酶;生淀粉糖化酶为序列26第20至635位所示蛋白质。本发明提供的工程菌,用于生产生木薯淀粉酶具有非常高的产量,可用于相关工业,具有重大的应用推广价值。

Description

一种高产生木薯淀粉酶的草酸青霉工程菌及其应用
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及一种高产生木薯淀粉酶的草酸青霉工程菌及其应用。
背景技术
进入21世纪以来,随着全球经济的快速发展,资源枯竭、能源短缺、环境污染以及生态破坏等一系列问题日益凸显。寻找和开发利用绿色可再生能源迫在眉睫。生物质资源是地球上储量最丰富、分布最广的可再生绿色资源。生物质资源的高效开发和利用,对解决能源危机和生态环境问题具有重要作用。
淀粉是自然界中仅次于纤维素的一种可再生生物质资源,是由α-1,4/α-1,6糖苷键连接葡萄糖残基的大分子聚合物,分为直链淀粉和支链淀粉两种类型。淀粉包括非粮木薯淀粉,是一种重要的工业原材料,可用于生产葡萄糖、果葡糖浆和燃料乙醇等产品。广西木薯资源丰富,其种植面积和产量均占全国的70%以上。
生淀粉酶可直接作用、水解未经蒸煮的生淀粉颗粒,包括α-生淀粉酶(Rawstarch-digestingα-amylase)、β-生淀粉酶(Raw starch-digestingβ-amylase)和生淀粉糖化酶(Raw starch-digesting glucoamylase,RSDG),一些微生物如曲霉(Aspergillus)和青霉(Penicillium)等能够产生生淀粉酶。RSDG可直接将未经蒸煮的生淀粉水解成葡萄糖,应用在生淀粉加工产业中,节约成本,减少环境污染。相关报道表明,将RSDG应用于以淀粉原料的燃料酒精生产中,可减少所生产出酒精的燃烧值10%-20%的能量消耗。
发明内容
本发明的目的是提供一种高产生木薯淀粉酶的草酸青霉工程菌及其应用。
本发明提供的工程菌,涉及草酸青霉中一个蛋白酶基因插入位点、一个启动子序列、一个信号肽编码序列,具有高产生木薯淀粉酶的优势。
本发明提供了一种工程菌,是将特异DNA分子通过同源重组取代草酸青霉基因组DNA中PoxPepA蛋白酶的编码基因得到的;所述特异DNA分子中具有特异表达盒,其中启动子为启动子pPoxEgCel5B,启动编码特异蛋白质的基因的表达;
所述特异蛋白质自上游至下游包括如下两个区段:信号肽spPoxGA15A、生淀粉糖化酶;
信号肽spPoxGA15A如序列表的序列26第1至19位氨基酸残基所示;
生淀粉糖化酶为如下(a1)或(a2)或(a3):
(a1)序列表的序列26第20至635位氨基酸残基组成的蛋白质;
(a2)来源于青霉且与(a1)具有98%以上同一性(identity)的蛋白质;
(a3)在(a1)或(a2)的N端或/和C端连接标签得到的蛋白质。
所述特异蛋白质自上游至下游由如下两个区段组成:信号肽spPoxGA15A、生淀粉糖化酶。
所述特异蛋白质为如下(b1)或(b2):
(b1)序列表的序列26第1至635位氨基酸残基组成的蛋白质;
(b2)序列表的序列26所示的蛋白质。
所述编码特异蛋白质的基因自上游至下游依次由如下两个区段组成:序列表的序列21所示的DNA区段,序列表的序列24所示的DNA区段。
所述PoxPepA蛋白酶为如下(c1)或(c2):
(c1)序列表的序列25所示的蛋白质;
(c2)来源于青霉且与(c1)具有98%以上同一性的蛋白质。
特异DNA分子中具有用于实现所述同源重组的上游同源臂和下游同源臂。所述上游同源臂如序列表的序列1所示。所述下游同源臂如序列表的序列3所示。
所述启动子pPoxEgCel5B如序列表的序列14所示。
所述特异表达盒自上游至下游依次由如下区段组成:序列表的序列14所示的DNA区段,序列表的序列21所示的DNA区段,序列表的序列24所示的DNA区段,序列表的序列16所示的DNA区段。
所述特异DNA分子自上游至下游依次由如下区段组成:序列表的序列1所示的DNA区段,序列表的序列2所示的DNA区段,序列表的序列14所示的DNA区段,序列表的序列21所示的DNA区段,序列表的序列24所示的DNA区段,序列表的序列16所示的DNA区段,序列表的序列3所示的DNA区段。
本发明还保护一种工程菌,是特异DNA分子与草酸青霉进行同源重组得到的工程菌;所述特异DNA分子中具有特异表达盒,其中启动子为启动子pPoxEgCel5B,启动编码特异蛋白质的基因的表达;
所述特异蛋白质自上游至下游包括如下两个区段:信号肽spPoxGA15A、生淀粉糖化酶;
信号肽spPoxGA15A如序列表的序列26第1至19位氨基酸残基所示;
生淀粉糖化酶为如下(a1)或(a2)或(a3):
(a1)序列表的序列26第20至635位氨基酸残基组成的蛋白质;
(a2)来源于青霉且与(a1)具有98%以上同一性的蛋白质;
(a3)在(a1)或(a2)的N端或/和C端连接标签得到的蛋白质。
所述特异蛋白质自上游至下游由如下两个区段组成:信号肽spPoxGA15A、生淀粉糖化酶。
所述特异蛋白质为如下(b1)或(b2):
(b1)序列表的序列26第1至635位氨基酸残基组成的蛋白质;
(b2)序列表的序列26所示的蛋白质。
所述编码特异蛋白质的基因自上游至下游依次由如下两个区段组成:序列表的序列21所示的DNA区段,序列表的序列24所示的DNA区段。
所述PoxPepA蛋白酶为如下(c1)或(c2):
(c1)序列表的序列25所示的蛋白质;
(c2)来源于青霉且与(c1)具有98%以上同一性的蛋白质。
特异DNA分子中具有用于实现所述同源重组的上游同源臂和下游同源臂。所述上游同源臂如序列表的序列1所示。所述下游同源臂如序列表的序列3所示。
所述启动子pPoxEgCel5B如序列表的序列14所示。
所述特异表达盒自上游至下游依次由如下区段组成:序列表的序列14所示的DNA区段,序列表的序列21所示的DNA区段,序列表的序列24所示的DNA区段,序列表的序列16所示的DNA区段。
所述特异DNA分子自上游至下游依次由如下区段组成:序列表的序列1所示的DNA区段,序列表的序列2所示的DNA区段,序列表的序列14所示的DNA区段,序列表的序列21所示的DNA区段,序列表的序列24所示的DNA区段,序列表的序列16所示的DNA区段,序列表的序列3所示的DNA区段。
本发明还保护一种工程菌,是线性化重组质粒与草酸青霉进行同源重组得到的工程菌;所述线性化重组质粒中具有特异DNA分子;所述特异DNA分子中具有特异表达盒,其中启动子为启动子pPoxEgCel5B,启动编码特异蛋白质的基因的表达;
所述特异蛋白质自上游至下游包括如下两个区段:信号肽spPoxGA15A、生淀粉糖化酶;
信号肽spPoxGA15A如序列表的序列26第1至19位氨基酸残基所示;
生淀粉糖化酶为如下(a1)或(a2)或(a3):
(a1)序列表的序列26第20至635位氨基酸残基组成的蛋白质;
(a2)来源于青霉且与(a1)具有98%以上同一性的蛋白质;
(a3)在(a1)或(a2)的N端或/和C端连接标签得到的蛋白质。
所述特异蛋白质自上游至下游由如下两个区段组成:信号肽spPoxGA15A、生淀粉糖化酶。
所述特异蛋白质为如下(b1)或(b2):
(b1)序列表的序列26第1至635位氨基酸残基组成的蛋白质;
(b2)序列表的序列26所示的蛋白质。
所述编码特异蛋白质的基因自上游至下游依次由如下两个区段组成:序列表的序列21所示的DNA区段,序列表的序列24所示的DNA区段。
所述PoxPepA蛋白酶为如下(c1)或(c2):
(c1)序列表的序列25所示的蛋白质;
(c2)来源于青霉且与(c1)具有98%以上同一性的蛋白质。
特异DNA分子中具有用于实现所述同源重组的上游同源臂和下游同源臂。所述上游同源臂如序列表的序列1所示。所述下游同源臂如序列表的序列3所示。
所述启动子pPoxEgCel5B如序列表的序列14所示。
所述特异表达盒自上游至下游依次由如下区段组成:序列表的序列14所示的DNA区段,序列表的序列21所示的DNA区段,序列表的序列24所示的DNA区段,序列表的序列16所示的DNA区段。
所述特异DNA分子自上游至下游依次由如下区段组成:序列表的序列1所示的DNA区段,序列表的序列2所示的DNA区段,序列表的序列14所示的DNA区段,序列表的序列21所示的DNA区段,序列表的序列24所示的DNA区段,序列表的序列16所示的DNA区段,序列表的序列3所示的DNA区段。
所述重组质粒为将所述特异DNA分子插入pEASY-Blunt克隆载体的Sac I和Not I酶切位点之间,得到的重组质粒pEASY-Blunt-PoxGA15A。
所述线性化重组质粒是用限制性内切酶Hind III酶切重组质粒pEASY-Blunt-PoxGA15A得到线性化质粒。
本发明还保护一种特异DNA分子,为如下(d1)或(d2):(d1)特异DNA分子甲,自上游至下游依次由如下区段组成:序列表的序列14所示的DNA区段,序列表的序列21所示的DNA区段,序列表的序列24所示的DNA区段,序列表的序列16所示的DNA区段;
(d2)特异DNA分子乙,自上游至下游依次由如下区段组成:序列表的序列1所示的DNA区段,序列表的序列2所示的DNA区段,序列表的序列14所示的DNA区段,序列表的序列21所示的DNA区段,序列表的序列24所示的DNA区段,序列表的序列16所示的DNA区段,序列表的序列3所示的DNA区段。
本发明还保护具有所述特异DNA分子的特异重组质粒。所述重组质粒具体为将所述特异DNA分子插入pEASY-Blunt克隆载体的Sac I和Not I酶切位点之间,得到的重组质粒pEASY-Blunt-PoxGA15A。
本发明还保护工程菌OXPoxGA15A,工程菌OXPoxGA15A,又称为Penicilliumoxalicum OXPoxGA15A草酸青霉OXPoxGA15A,已于2017年12月15日保藏于中国典型培养物保藏中心(地址:中国,武汉,武汉大学),保藏编号为CCTCC NO:M 2017794。
本发明还保护以上任一所述工程菌或特异DNA分子或特异重组质粒在生产生木薯淀粉酶和/或生淀粉糖化酶中的应用。所述生淀粉糖化酶为如下(b1)或(b2):(b1)序列表的序列26第1至635位氨基酸残基组成的蛋白质;(b2)序列表的序列26所示的蛋白质。
本发明提供的工程菌,可以通过发酵制备得到具有生木薯淀粉酶的粗酶液,可以直接作为生木薯淀粉酶使用,也可以与其它生木薯淀粉酶复配混合使用,也可用于纯酶制剂的制备。
以上任一所述草酸青霉具体可为突变体ΔPoxKu70。
本发明提供的工程菌,用于生产生木薯淀粉酶具有非常高的产量,可用于相关工业,具有重大的应用推广价值。
附图说明
图1为草酸青霉蛋白酶基因缺失突变株蛋白酶产量的测定结果。
图2为突变体ΔPoxKu70和工程菌ΔPoxPepA的纤维素酶产量、木聚糖酶产量、生木薯淀粉酶产量的结果;FPase(滤纸酶);CMCase(羧甲基纤维素酶);pNPGase(β-葡萄糖苷酶);pNPCase(外切纤维素酶);Xylanase(木聚糖酶);RCSDE(生木薯淀粉酶)。
图3为启动子活性比较的结果。
图4为信号肽活性比较的结果。
图5为检测生木薯淀粉酶产量的结果。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。WA:麦麸加Avicel。
载体pCPXG418:参考文献Chen MM,Jiang MG,Shang JJ,et al.CYPI,ahypovirus-regulated cyclophilin,is required for virulence in the chestnutblight fungus.Mol Plant Pathol.2011;12(3):239-246;质粒pCPXG418在文献中的名称为“transformation vector pCPXG418”。
再生培养基:酸水解酪蛋白1.0g、酵母提取物1.0g、蔗糖342.0g、琼脂粉17.0g,用蒸馏水定容至1L,121℃灭菌20分钟。
WA培养基:KH2PO4 4.0g、(NH4)2SO4 4.0g、MgSO4·7H2O 0.6g、CaCl2 0.6g、FeSO4·7H2O 0.005g、MnSO4 0.0016g、ZnCl2 0.0017g、CoCl2 0.002g、麦麸4g、Avicel 1g、Tween 801mL,用蒸馏水定容至1L,pH5.5;121℃灭菌20分钟。
STC溶液:山梨醇91g、Tris 6.05g、CaCl2 2.25g,溶于400mL去离子水中,用稀HCl溶液调pH至7.0,蒸馏水定容至500mL。
PTC溶液:聚乙二醇3350 40g、Tris 3.03g、CaCl2 2.25g,溶于200mL去离子水中,用稀HCl溶液调pH至8.0,蒸馏水定容至250mL。
草酸青霉(Penicillium oxalicum)菌株HP7-1,又称Penicillium oxalicum HP7-1,简称草酸青霉HP7-1。草酸青霉HP7-1在CGMCC的保藏编号为:CGMCC 10781。
草酸青霉突变体ΔPoxKu70,又称Penicillium oxalicum mutantΔPoxKu70,简称突变体ΔPoxKu70。突变体ΔPoxKu70是在草酸青霉HP7-1的基础上敲除PoxKu70基因得到的。突变体ΔPoxKu70在CGMCC的保藏编号为:CGMCC 3.15650。
p-NP的全称为对硝基苯。p-NPC的全称为对硝基苯纤维二糖苷。CMC的全称为羧甲基纤维素。p-NPG的全称为对硝基苯-α-D-葡萄糖苷。
葡萄糖标准曲线的制作方法:用无菌去离子水作为溶剂,先制备浓度为1mg/mL的葡萄糖母液,然后稀释得到各个浓度的葡萄糖标准溶液(浓度依次为0.1mg/mL、0.2mg/mL、0.3mg/mL、0.4mg/mL、0.5mg/mL、0.6mg/mL、0.7mg/mL);向500μL葡萄糖标准液中加入1000μLDNS溶液,沸水浴10min,冷却至室温后,吸取200μL至酶标板,测定540nm波长处吸光值;以葡萄糖浓度为横坐标,吸光值为纵坐标,绘制标准曲线;标准曲线的函数式为:y=3.1835x-0.0216(R2=0.9997),其中y为光吸收值,x为葡萄糖浓度。
p-NP标准曲线的制作方法:用无菌去离子水作为溶剂,先制备浓度为10mM的p-NP标准液母液,然后稀释得到各个浓度的p-NP标准溶液(浓度依次为0mM、0.1mM、0.2mM、0.3mM、0.4mM、0.5mM);分别吸取140μL各个浓度的p-NP标准溶液到1.5mL离心管中,向每个离心管中加入70μL 0.4M Na2CO3溶液,混匀后瞬时离心使得溶液聚集到离心管底部;取200μL反应液于96孔酶标板中,在410nm波长下测定其OD值,绘制p-NP标准曲线,回归方程为y=7.3081x+0.0544,R2=0.9999,其中y为光吸收值,x为p-NP浓度。
滤纸酶(FPase)产量的测定方法如下:
①取发酵体系,4℃离心,收集上清液,即为发酵上清。
②取发酵上清,采用pH5.0的磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液作为溶剂进行稀释,得到待测酶液;将待测酶液沸水煮10分钟灭活,得到灭活酶液;
③向含有Whatman 1号滤纸条的离心管中加入1mL pH5.0的磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液,50℃预热5min;
④加入500μL待测酶液或500μL灭活酶液,50℃静置反应60min,然后加入3mL DNS溶液终止反应,沸水煮10min,放入冰水混合物中冷却,然后吸取200μL至酶标板测定540nm波长处吸光值,根据葡萄糖标准曲线计算糖浓度,一个酶活力单位(U)定义为每分钟产生1μmol还原糖所需的酶量,然后根据稀释倍数换算得到发酵上清中的滤纸酶浓度。
木聚糖酶(xylanase)产量的测定方法如下:
①取发酵体系,4℃离心,收集上清液,即为发酵上清。
②取发酵上清,采用磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液作为溶剂进行稀释,得到待测酶液;将待测酶液沸水煮10分钟灭活,得到灭活酶液;
③向2mL离心管中加入450μL 1g/100ml木聚糖水溶液,50℃预热5min;
④加入50μL待测酶液或50μL灭活酶液,50℃静置反应10min,然后加入1mL DNS溶液终止反应,沸水煮10min,放入冰水混合物中冷却,然后吸取200μL至酶标板,测定540nm波长处吸光值,根据葡萄糖标准曲线计算糖浓度,一个酶活力单位(U)定义为每分钟产生1μmol还原糖所需的酶量,然后根据稀释倍数换算得到发酵上清中的木聚糖酶浓度。
羧甲基纤维素酶(CMCase)产量的测定方法如下:
①取发酵体系,4℃离心,收集上清液,即为发酵上清。
②取发酵上清,采用磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液作为溶剂进行稀释,得到待测酶液;将待测酶液沸水煮10分钟灭活,得到灭活酶液;
③向2mL离心管中加入450μL 1g/100ml CMC水溶液,50℃预热5min;
④加入50μL待测酶液或50μL灭活酶液,50℃静置反应30min,然后加入1mL DNS溶液终止反应,沸水煮10min,放入冰水混合物中冷却,然后吸取200μL至酶标板,测定540nm波长处吸光值,根据葡萄糖标准曲线计算糖浓度,一个酶活力单位(U)定义为每分钟产生1μmol还原糖所需的酶量,然后根据稀释倍数换算得到发酵上清中的羧甲基纤维素酶浓度。
β-葡萄糖苷酶(pNPGase)产量的测定方法如下:
①取发酵体系,4℃离心,收集上清液,即为发酵上清。
②取发酵上清,采用pH5.5的磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液作为溶剂进行稀释,得到待测酶液;将待测酶液沸水煮10分钟灭活,得到灭活酶液;
③向1.5mL离心管中加入116μL pH5.5的磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液,再加入14μL25mM p-NPG水溶液,50℃预热5min。
④加入10μL待测酶液或10μL灭活酶液,50℃静置反应15min,加入70μL 0.4MNa2CO3水溶液终止反应,然后吸取200μL至酶标板,测定410nm波长处吸光值,根据p-NP标准曲线计算浓度,一个酶活力单位(U)定义为每分钟产生1μmol p-NP所需的酶量,然后根据稀释倍数换算得到发酵上清中的β-葡萄糖苷酶浓度。
外切纤维素酶(pNPCase)产量的测定方法如下:
①取发酵体系,4℃离心,收集上清液,即为发酵上清。
②取发酵上清,采用pH5.5的磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液作为溶剂进行稀释,得到待测酶液;将待测酶液沸水煮10分钟灭活,得到灭活酶液;
③向1.5mL离心管中加入58μL pH5.5的磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液,再加入14μLp-NPC溶液,50℃预热5min。
④加入68μL待测酶液或68μL灭活酶液,50℃静置反应15min,加入70μL 0.4MNa2CO3水溶液终止反应,然后吸取200μL至酶标板测定410nm波长处吸光值,根据p-NP标准曲线计算浓度,一个酶活力单位(U)定义为每分钟产生1μmol pNP所需的酶量,然后根据稀释倍数换算得到发酵上清中的外切纤维素酶浓度。
生木薯淀粉酶活力的测定方法如下:
①取发酵体系,4℃离心,收集上清液,即为发酵上清。
②取发酵上清,采用pH 4.5的柠檬酸-磷酸氢二钠缓冲液作为溶剂进行稀释,得到待测酶液;将待测酶液沸水煮10分钟灭活,得到灭活酶液;
③向2mL离心管中加入450μL 1g/100ml木薯生淀粉溶液(溶剂为pH 4.5的柠檬酸-磷酸氢二钠缓冲液),40℃预热5min;
④加入50μL待测酶液或50μL灭活酶液,40℃静置反应30min,加入1mL DNS溶液终止反应,沸水煮10min,冷却至室温,12000rpm离心5min收集上清液,然后吸取200μL至酶标板测定540nm波长处吸光值,根据葡萄糖标准曲线计算糖浓度,一个酶活力单位(U)定义为每分钟产生1μmol还原糖所需的酶量,然后根据稀释倍数换算得到发酵上清中的生木薯淀粉酶浓度。
蛋白酶产量的测定方法如下:
①采用蒸馏水为溶剂,制备酪氨酸标准溶液(浓度依次为0、20、40、60、80、100μg/mL);向100μL酪氨酸标准溶液中加入100μL 0.5M碳酸钠水溶液,然后加入100μL福林酚试剂,混匀后28℃反应30分钟,然后取200μL测量660nm波长处吸光值,以酪氨酸浓度为横坐标、吸光值为纵坐标绘制标准曲线。
②取450μL 1%酪蛋白溶液(溶剂为pH5.5的柠檬酸-磷酸氢二钠缓冲液),加至2mLEP管中,28℃预热5分钟;然后加入50μL粗酶液并混匀,28℃反应10分钟;然后加入800μL10%三氯乙酸溶液终止反应,12000rpm离心5分钟,收集上清液;取100μL上清液,加入100μL0.5M碳酸钠溶液和100μL福林酚试剂,混匀后28℃反应30分钟,然后取200μL测量660nm波长处吸光值,根据标准曲线计算蛋白酶酶活力。一个酶活力单位(U)定义为每分钟产生1mol酪氨酸所需的酶量。
G418表达盒如序列表的序列2所示。序列表的序列2中,第1至714位核苷酸组成启动子,第715-1470位核苷酸组成G418基因,第1471-1890位核苷酸组成终止子。
实施例1、草酸青霉蛋白酶基因缺失突变株的构建
一、草酸青霉中候选蛋白酶基因的确定
分析草酸青霉HP7-1的基因组及转录组,筛选得到转录水平排名前四的4个酸性蛋白酶基因:POX01336(PoxAlp2)、POX03146(PoxPep2)、POX05007(PoxPepA)和POX07371(PoxSed1)。
二、草酸青霉中蛋白酶基因敲除盒的构建
PoxPepA敲除盒自上游至下游依次由同源左臂、G418表达盒和同源右臂组成。同源左臂如序列表的序列1所示。同源右臂如序列表的序列3所示。PoxPepA敲除盒用于通过同源重组敲除基因组中的PoxPepA基因(PoxPepA基因的开放阅读框如序列表的序列4所示)。
PoxAlp2敲除盒自上游至下游依次由同源左臂、G418表达盒和同源右臂组成。同源左臂如序列表的序列5所示。同源右臂如序列表的序列6所示。PoxAlp2敲除盒用于通过同源重组敲除基因组中的PoxAlp2基因(PoxAlp2基因的开放阅读框如序列表的序列7所示)。
PoxPep2敲除盒自上游至下游依次由同源左臂、G418表达盒和同源右臂组成。同源左臂如序列表的序列8所示。同源右臂如序列表的序列9所示。PoxPep2敲除盒用于通过同源重组敲除基因组中的PoxPep2基因(PoxPep2基因的开放阅读框如序列表的序列10所示)。
PoxSed1敲除盒自上游至下游依次由同源左臂、G418表达盒和同源右臂组成。同源左臂如序列表的序列11所示。同源右臂如序列表的序列12所示。PoxSed1敲除盒用于通过同源重组敲除基因组中的PoxSed1基因(PoxSed1基因的开放阅读框如序列表的序列13所示)。
三、草酸青霉蛋白酶基因缺失突变株的构建
分别采用步骤二的四个敲除盒进行草酸青霉蛋白酶基因缺失突变株的构建。
1、向敲除盒(5μg DNA)加入2μL 100mM亚精胺水溶液,混匀后加入到100μL突变体ΔPoxKu70原生质体中,混合均匀,冰上静置30分钟。
2、完成步骤1后,向体系中加入1mL PTC溶液,混合均匀,室温静置25分钟。
3、完成步骤2后,向体系中加入2mL STC溶液,混合均匀,将混合液加入到15mL 55℃的再生培养基中,混合均匀,然后将混合液倒入无菌培养皿中(每个培养皿倒入3mL左右);待完全凝固后,室温放置30分钟,然后加入40mL含800μg/mL G418和250μg/mL潮霉素的固体PDA培养基,覆盖在表面;待完全凝固后,放入28℃培养箱中倒置培养5天。
4、完成步骤3后,用0.1%(体积百分含量)吐温80水溶液清洗以收集孢子,然后将孢子悬液用无菌水进行梯度稀释,将各个稀释液涂布在含800μg/mL G418和250μg/mL潮霉素的PDA培养基平板上,28℃倒置培养3天。
5、完成步骤4后,挑选单菌落,提取基因组DNA,进行PCR鉴定。
采用PoxPepA敲除盒进行上述步骤,得到的PoxPepA基因被敲除的工程菌命名为工程菌ΔPoxPepA。
采用PoxAlp2敲除盒进行上述步骤,得到的PoxAlp2基因被敲除的工程菌命名为工程菌ΔPoxAlp2。
采用PoxPep2敲除盒进行上述步骤,得到的PoxPep2基因被敲除的工程菌命名为工程菌ΔPoxPep2。
采用PoxSed1敲除盒进行上述步骤,得到的PoxSed1基因被敲除的工程菌命名为工程菌ΔPoxSed1。
四、草酸青霉蛋白酶基因缺失突变株蛋白酶产量的测定
分别将步骤三的四个工程菌作为待测菌,检测蛋白酶产量。
将1mL待测菌的孢子悬浮液(孢子悬浮液中,孢子浓度为1×108个孢子/mL)接种到100mL WA培养基中,28℃、180rpm振荡培养144小时,然后4℃、8000rpm离心10分钟,收集上清液。检测上清液中的蛋白酶浓度。
结果见图1。与突变体ΔPoxKu70相比,工程菌ΔPoxPepA的蛋白酶产量降低了76.9%,然而,工程菌ΔPoxPep2、工程菌ΔPoxAlp2和工程菌ΔPoxSed1的蛋白酶产量无显著性差异。结果表明,PoxPepA基因是草酸青霉菌株中非常关键的一个胞外蛋白酶基因。
五、工程菌ΔPoxPepA进一步的验证及表型分析
用Southern杂交试验进一步对工程菌ΔPoxPepA进行验证。突变体△PoxKu70得到4394bp的杂交带,工程菌ΔPoxPepA得到大小为7453bp的杂交带,杂交带大小和预计大小一致。结果表明,工程菌ΔPoxPepA中PoxPepA基因已被敲除,而且敲除盒也没有发生其他位点的整合。
检测突变体ΔPoxKu70和工程菌ΔPoxPepA的纤维素酶产量、木聚糖酶产量、生木薯淀粉酶产量。结果见图2。相比突变体ΔPoxKu70,工程菌ΔPoxPepA的纤维素酶(FPase、CMCase、pNPCase和pNPGase)产量、木聚糖酶(Xylanase)产量和生木薯淀粉酶(RCSDE)产量均无显著差异。
突变体△PoxKu70和工程菌ΔPoxPepA在PDA平板上培养6天后,生长无明显差异。
实施例2、草酸青霉中强诱导型启动子的鉴定
一、草酸青霉中候选启动子的确定
分析草酸青霉HP7-1在含有WA或葡萄糖的培养条件下的转录组,将转录水平由高到低排名前五的5个基因:POX02308(PoxLPMO9A)、POX06820(POX06820)、POX01166(PoxEgCel5B)、POX00089(PoxChiB1)和POX04786(PoxCbhCel6A)的启动子作为候选启动子。上述5个基因在含WA的培养条件下FPKM(Fragments per kilobase of exon per millionmapped reads)值分别为:10021.93、7952.22、7468.14、6795.32和5574.13。上述5个基因在含葡萄糖的培养条件下FPKM(Fragments per kilobase of exon per million mappedreads)值分别为:49.15、1906.28、50.77、1940.06和20.36。POX02308、POX06820、POX01166、POX00089和POX04786基因分别编码裂解性多糖单加氧酶(LPMO)、糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白、内切β-1,4葡聚糖酶、内切几丁质酶以及纤维二糖水解酶。
二、特异DNA分子的构建
DNA分子Ⅰ自上游至下游依次由同源左臂、G418表达盒、启动子、gfp基因、终止子和同源右臂组成。同源左臂如序列表的序列1所示。启动子为序列表的序列14所示的启动子pPoxEgCel5B。gfp基因如序列表的序列15所示。终止子如序列表的序列16所示。同源右臂如序列表的序列3所示。
DNA分子Ⅱ自上游至下游依次由同源左臂、G418表达盒、启动子、gfp基因、终止子和同源右臂组成。同源左臂如序列表的序列1所示。启动子为序列表的序列17所示的启动子pPoxLPMO9A。gfp基因如序列表的序列15所示。终止子如序列表的序列16所示。同源右臂如序列表的序列3所示。
DNA分子Ⅲ自上游至下游依次由同源左臂、G418表达盒、启动子、gfp基因、终止子和同源右臂组成。同源左臂如序列表的序列1所示。启动子为序列表的序列18所示的启动子pPoxCbhCel6A。gfp基因如序列表的序列15所示。终止子如序列表的序列16所示。同源右臂如序列表的序列3所示。
DNA分子Ⅳ自上游至下游依次由同源左臂、G418表达盒、启动子、gfp基因、终止子和同源右臂组成。同源左臂如序列表的序列1所示。启动子为序列表的序列19所示的启动子pPOX06820。gfp基因如序列表的序列15所示。终止子如序列表的序列16所示。同源右臂如序列表的序列3所示。
DNA分子Ⅴ自上游至下游依次由同源左臂、G418表达盒、启动子、gfp基因、终止子和同源右臂组成。同源左臂如序列表的序列1所示。启动子为序列表的序列20所示的启动子pPoxChiB1。gfp基因如序列表的序列15所示。终止子如序列表的序列16所示。同源右臂如序列表的序列3所示。
三、重组质粒的构建
将DNA分子Ⅰ插入pEASY-Blunt克隆载体的Sac I和Not I酶切位点之间,得到重组质粒pEASY-Blunt-pPoxEgCel5B。
将DNA分子Ⅱ插入pEASY-Blunt克隆载体的Sac I和Not I酶切位点之间,得到重组质粒pEASY-Blunt-pPoxLPMO9A。
将DNA分子Ⅲ插入pEASY-Blunt克隆载体的Sac I和Not I酶切位点之间,得到重组质粒pEASY-Blunt-pPoxCbhCel6A。
将DNA分子Ⅳ插入pEASY-Blunt克隆载体的Sac I和Not I酶切位点之间,得到重组质粒pEASY-Blunt-pPOX06820。
将DNA分子Ⅴ插入pEASY-Blunt克隆载体的Spe I和Not I酶切位点之间,得到重组质粒pEASY-Blunt-pPoxChiB1。
四、工程菌的构建
分别将步骤三的四个重组质粒作为待测质粒。
1、取待测质粒,用限制性内切酶进行酶切(其中重组质粒pEASY-Blunt-pPoxLPMO9A、pEASY-Blunt-pPOX06820和pEASY-Blunt-pPoxEgCel5B用Hind III酶切,pEASY-Blunt-pPoxChiB1和pEASY-Blunt-pPoxCbhCel6A用Not I酶切),得到线性化质粒。
2、将线性化质粒导入突变体ΔPoxKu70原生质体,得到工程菌。
重组质粒pEASY-Blunt-pPoxEgCel5B进行上述步骤,得到的工程菌命名为工程菌pPoxEgCel5B-gfp。
重组质粒pEASY-Blunt-pPoxLPMO9A进行上述步骤,得到的工程菌命名为工程菌pPoxLPMO9A-gfp。
重组质粒pEASY-Blunt-pPoxCbhCel6A进行上述步骤,得到的工程菌命名为工程菌pPoxCbhCel6A-gfp。
重组质粒pEASY-Blunt-pPOX06820进行上述步骤,得到的工程菌命名为工程菌pPOX06820-gfp。
重组质粒pEASY-Blunt-pPoxChiB1进行上述步骤,得到的工程菌命名为工程菌pPoxChiB1-gfp。
五、启动子活性比较
分别将步骤四的五个工程菌作为待测菌,检测荧光强度。
将1mL待测菌的孢子悬浮液(孢子悬浮液中,孢子浓度为1×108个孢子/mL)接种到100mL WA培养基中,28℃、180rpm振荡培养,每24小时取样菌体,进行菌体破碎然后提取胞内蛋白,检测荧光强度。
结果见图3。五个启动子在含有WA的培养条件下的强弱关系为:pPoxEgCel5B>pPoxLPMO9A>pPoxCbhCel6A>pPOX06820>pPoxChiB1。最强启动子为pPoxEgCel5B启动子。
实施例3、草酸青霉中高效分泌信号肽的鉴定
一、候选信号肽的初步筛选
分析草酸青霉114-2在WA培养条件下的分泌组,筛选得到相对分泌量排名前三的分泌蛋白(PDE_09417、PDE_01201和PDE_07945),所占比例分别为29%、11%和10%。NCBIBlastP比对分析显示PDE_09417,PDE_01201和PDE_07945在草酸青霉HP7-1中同源蛋白分别为POX01356、POX09352和POX05587,一致性分别为99%、98%和98%。POX01356、POX09352和POX05587分别注释为糖苷水解酶GA15A、α-淀粉酶Amy13A和纤维二糖水解酶Cel7A-2。
二、特异DNA分子的构建
DNA分子ⅰ自上游至下游依次由同源左臂、G418表达盒、启动子、信号肽编码序列、gfp基因、终止子和同源右臂组成。同源左臂如序列表的序列1所示。启动子为序列表的序列14所示的启动子pPoxEgCel5B。信号肽编码序列为序列表的序列21所示的信号肽spPoxGA15A编码序列。gfp基因如序列表的序列15所示。终止子如序列表的序列16所示。同源右臂如序列表的序列3所示。
DNA分子ⅱ自上游至下游依次由同源左臂、G418表达盒、启动子、信号肽编码序列、gfp基因、终止子和同源右臂组成。同源左臂如序列表的序列1所示。启动子为序列表的序列14所示的启动子pPoxEgCel5B。信号肽编码序列为序列表的序列22所示的信号肽spPoxAmy13A编码序列。gfp基因如序列表的序列15所示。终止子如序列表的序列16所示。同源右臂如序列表的序列3所示。
DNA分子ⅲ自上游至下游依次由同源左臂、G418表达盒、启动子、信号肽编码序列、gfp基因、终止子和同源右臂组成。同源左臂如序列表的序列1所示。启动子为序列表的序列14所示的启动子pPoxEgCel5B。信号肽编码序列为序列表的序列23所示的信号肽spPoxCbhCel7A-2编码序列。gfp基因如序列表的序列15所示。终止子如序列表的序列16所示。同源右臂如序列表的序列3所示。
三、重组质粒的构建
将DNA分子ⅰ插入pEASY-Blunt克隆载体的Sac I和Not I酶切位点之间,得到重组质粒pEASY-Blunt-spPoxGA15A。
将DNA分子ⅱ插入pEASY-Blunt克隆载体的Sac I和Not I酶切位点之间,得到重组质粒pEASY-Blunt-spPoxAmy13A。
将DNA分子ⅲ插入pEASY-Blunt克隆载体的Sac I和Not I酶切位点之间,得到重组质粒pEASY-Blunt-spPoxCbhCel7A-2。
四、工程菌的构建
分别将步骤三的三个重组质粒作为待测质粒。
1、取待测质粒,用限制性内切酶Hind III进行酶切,得到线性化质粒。
2、将线性化质粒导入突变体ΔPoxKu70原生质体,得到工程菌。
重组质粒pEASY-Blunt-spPoxGA15A进行上述步骤,得到的工程菌命名为工程菌spPoxGA15A-gfp。
重组质粒pEASY-Blunt-spPoxAmy13A进行上述步骤,得到的工程菌命名为工程菌spPoxAmy13A-gfp。
重组质粒pEASY-Blunt-spPoxCbhCel7A-2进行上述步骤,得到的工程菌命名为工程菌spPoxCbhCel7A-2-gfp。
五、信号肽活性比较
分别将步骤四的五个工程菌作为待测菌,检测荧光强度。
将1mL待测菌的孢子悬浮液(孢子悬浮液中,孢子浓度为1×108个孢子/mL)接种到100mL WA培养基中,28℃、180rpm振荡培养,每24小时取样上清液,检测荧光强度。
结果见图4,这三个信号肽的分泌强度关系为spPoxGA15A>spPoxAmy13A>spPoxCbhCel7A-2。最强信号肽为spPoxGA15A。
实施例4、草酸青霉生淀粉糖化酶基因过量表达菌株的构建
一、特异DNA分子的构建
特异DNA分子自上游至下游依次由同源左臂、G418表达盒、启动子、信号肽编码序列、生淀粉糖化酶基因(PoxGA15A基因)、终止子和同源右臂组成。同源左臂如序列表的序列1所示。启动子为序列表的序列14所示的启动子pPoxEgCel5B。信号肽编码序列为序列表的序列21所示的信号肽spPoxGA15A编码序列。PoxGA15A基因如序列表的序列24所示。终止子如序列表的序列16所示。同源右臂如序列表的序列3所示。
二、重组质粒的构建
将步骤一构建的特异DNA分子插入pEASY-Blunt克隆载体的Sac I和Not I酶切位点之间,得到重组质粒pEASY-Blunt-PoxGA15A。
三、工程菌的构建
1、取重组质粒pEASY-Blunt-PoxGA15A,用限制性内切酶Hind III进行酶切,得到线性化质粒。
2、将线性化质粒导入突变体ΔPoxKu70原生质体,得到工程菌,将该工程菌命名为工程菌OXPoxGA15A。
四、检测生木薯淀粉酶产量
将1mL待测菌的孢子悬浮液(孢子悬浮液中,孢子浓度为1×108个孢子/mL)接种到100mL WA培养基中,28℃、180rpm振荡培养168小时,每24小时取培养上清,以生木薯淀粉为底物测定生木薯淀粉酶产量。
待测菌为步骤三制备的工程菌OXPoxGA15A。
结果表明,在2-7天中,相比突变体ΔPoxKu70,工程菌OXPoxGA15A的生木薯淀粉酶产量显著提高,见图5。其中,在第七天,工程菌OXPoxGA15A的生木薯淀粉酶产量达到了241.6U/mL,是突变体ΔPoxKu70的4.4倍。
现有技术中其它菌株的生木薯淀粉酶产量为:草酸青霉HP7-1,55.1U/mL;Laceyella sacchari LP175,181.1U/mL(文献:Lomthong T,Chotineeranat S,Kitpreechavanich V,Production and characterization of raw starch degradingenzyme from a newly isolated thermophilic filamentous bacterium,Laceyellasacchari LP175.Starch/
Figure BDA0001740496560000121
2015;67:255–266.);P.oxalicum GXU20,20.0U/mL(文献:Lin HJ,Xian L,Zhang QJ,et al.Production of raw cassava starch-degradingenzyme by Penicillium and its use in conversion of raw cassava flour toethanol.J Ind Microbiol Biotechnol.2011;38:733–742);Aspergillus sp.MZA-3,3.3U/mL(Moshi AP,Hosea KMM,Elisante E,Mamo G,Onnby L,Nges IA(2016)Productionof raw starch degrading enzyme by Aspergillus sp and its use in conversion ofinedible wild cassava flour to bioethanol.J Biosci Bioeng.2016;121:457–463.)。
工程菌OXPoxGA15A,又称为Penicillium oxalicum OXPoxGA15A草酸青霉OXPoxGA15A,已于2017年12月15日保藏于中国典型培养物保藏中心(地址:中国,武汉,武汉大学),保藏编号为CCTCC NO:M 2017794。
SEQUENCE LISTING
<110> 广西大学
<120> 一种高产生木薯淀粉酶的草酸青霉工程菌及其应用
<130> GNCYX181337
<160> 26
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 2476
<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
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gaatgtgtgt cctgtaggct tgagagttca aggaagaaac atgcaattat ctttgcgaac 240
ccagggctgg tgacggaatt ttcatagtca agctatcaga gtaaagaaga ggagcatgtc 300
aaagtacaat tagagacaaa tatatagtcg cgtggagcca agagcggatt cctcagtctc 360
gtaggtctct tgacgaccgt tgatctgctt gatctcgtct cccgaaaatg aaaatagctc 420
tgctaagcta ttcttctctt cgccggagcc tgaaggcgtt actaggttgc agtcaatgca 480
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<210> 3
<211> 2189
<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
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<210> 4
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<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
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catcgggtaa tgacgcactc ccctgccttg gggcctggtt cccactccga cgccccgtct 2640
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<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
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<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
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<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
<400> 11
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<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
<400> 12
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<213> Penicillium oxalicum
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<212> DNA
<213> Artificial sequence
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ctgctggagt tcgtgaccgc cgccgggatc actctcggca tggacgagct gtacaagtaa 720
<210> 16
<211> 754
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<400> 16
atatagctac atctaatctc cgcgcgagtg ggagccagag gagaagatgg tttgccgtgg 60
ctagacgttt catatttttt tccgaaggag taacggtagc gggggggact ccgatgggcc 120
tattgatccc tcgcgttcct cttaccgact cccctgtctc tcttcaatag ttgcttttct 180
tttcagcggt gttcatcgat tgatgatggg tgcgtggaaa ggggaatact cttggactgg 240
gccctggaga aatgagggaa tagcctcgtg caggtctctg tacagttttg ataacgcttt 300
aattacctgg gaacgatatc gtggtgacta atggtgaatg tgatttggac ctaattttaa 360
atacattttt ttttctacca agttactcct gaccctcttt ttaaagtata tttccttctt 420
tctccacttc tatgttgagt tgggcctctg gttcagcttt taatttactc tgggatattc 480
caagtgtcac ttcctcctgg catgaacggg atgagcgaaa gtggtgtatt ctgtccgaag 540
gctttgccat tgaagctcca cgaatcagat cttgactttt gactgtgtct ctgtcttttt 600
ctacctatgt gaaacgaaaa ccatccatcg ttgtacaact cggaaccctc ttgcaagatc 660
aattgtgatg ctacggactc gaatatatcc acagggaagc ctgtgcccta ttgtacccgt 720
tgaccgatac ctagtcgctc gacaagtcat cagt 754
<210> 17
<211> 2000
<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
<400> 17
tggagagatg cgacgtgtcg aaatactcga aatcagggtg attaaatgag gactgacgat 60
ctcgggggga ctgaggatca tattcaattt atactccacg tcgatcagac atgtggacaa 120
agagtatgca atggtgcgtg agaaatacct agtatctatt tgcctgtgac tacaagatca 180
aatctgttga atgtttcagc tctacttcat tcaatgtctt tgctagaatt ggagctgcag 240
ttgatagtga ttgtattatt gttgaatgtt cggagatttg aactcgaaat agcaaagtca 300
ttttctttat cgtgtgtcct ttgtcatttg gaccgagttg cttgttccga gtcaaagcgc 360
ccaagtcagg cacaatgccc gagtcttcgg catgactcga gtcaagaaaa tgaagatcca 420
atgtcgattg aatcattgtg tgatcctgtt tctattttcg gaacatacag gtggtacagt 480
aggtaggcgg gcctgaaatg atactgcaaa ggcaaaaaga aaatggggaa aatgtgatta 540
atatacttct taatgggcat tcaaggaagg tattcctgct ctatattcca cattggcaca 600
tggagagtcg tctcttcaaa gcctctggct cattgatttg agaaaagtcg acattcatct 660
ggaacaggta cctgacatag ttcagaccag aactcaatgg aagtacaccc accaacggac 720
tgtcattcga cgactgctga tatttcccag gcatggccac cgccaatttt cgatttccca 780
atcactggtg ttttcctttt cattgttgaa gctaccggaa ccatattcca aaacgcaagt 840
tgggtctggc catggaagag acaaaaggat cccacttgca gtattggctt tgcgagaccc 900
tctatgaatg aacagggatg gggagtcagg gtgccgagga tacctttgcg acactgggcc 960
gacttgcttg aaaccaggtt tttctgaaac gacaggatgc gctggtcatt tcagtggatt 1020
cctacctttt ggggtacctg cttcatctca tctattttca caattacccg ataggcccgt 1080
agcgccgatg tcatacctat catcatctca tgttcatcat tctctgagcg acatatttgt 1140
gtcccgtagg tgaacatctt tggtatatgg agatcgacaa agcgtctcgc acggtgctga 1200
aacatctctc gtatcatgct ccttggcgcc gactaaagtg atctatgtat gagtgagatc 1260
atcttgtccc attggcagca acatgttcaa acttttgatc acttcagatt gatttgacaa 1320
gggcagatga cttcggtaag agtcagcatg ctgcgacttt gttgatcttt actattcagg 1380
ccacggacca tgcacggcaa aataccacga ctctgcatca ttcggcacat tgcaacgtct 1440
cgggccacag ccacgctggt tgaatccctg ctagctccat ttaagtacta gggtactgca 1500
ttaccccgga ttaccattca gagagaccca tgcatactca cggaagaaat gggactagat 1560
tatatggtcg cccgtagcat ttgaactcta aatcctagca agcgtctgaa tttcataccc 1620
cggcagactc tctgtgatct cgctgatttg tggtagagaa atatccgacg tcgtcaaagc 1680
accctgcagc tgggatggct tctgtttctg cggggtatct caatcaaatt ggtgcaaaaa 1740
tgttgacatg gcaggaagat ggtgaagaat cttggattta tccctgtctg tatgcattac 1800
cggttatgat tccagtgttg gggacctagg tagagtacct ttatcaattt ttgcatttcg 1860
ctactacaga ttgaggagat gatgcatata agtagaagat aatcaccctt tctctctctc 1920
tttgattctc tcaggccgaa tctattcaaa ccagctactt cttcactgct tcaagacctg 1980
tactccattc tcgtttcatc 2000
<210> 18
<211> 2000
<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
<400> 18
tttctgcatg agcggagaat tctgccaagg agtcaacacg ctcgacgtga aagtagacga 60
acaacccaga cgacggcctc gggaggaatc ccatcggaaa cggcgttggg ctggtggatc 120
ggaacgtcaa agagcatacg gaaagactcc gaccttgacg gatgcatagc gaagaatttc 180
cgtttcctgc tgaggttatc gaacatgtct tcctccctct ctctctcgcc ccccttgcaa 240
gctttgtaag aatattgatt gtgtattctg tctgtcgtgg gggatcaacc accaagttca 300
gcctgctgtt gagtggaaat cagccctgct gggaatattc tggatgagat ctccatgcac 360
caccatgcaa tatatttctg cctacaggct aagtctccgg ccatggtcag agactctctc 420
ccccacatga tggtcggcaa tcggtccgca ccgagttcag taagaccagg cctggagaaa 480
caatcagaat gccgagtaag atgaaggatc caccgacggt gaaaggcttg tcagccggac 540
tcgatcacct tgacgcctgc acttctggag tcggaaggcg gtccgccccc gtgccttctg 600
cagaaataaa gtggccagtc accgccctgc ccgcgttttg ttccgcggaa tgcggatcca 660
gtcaagtctg acgaagatga tgcggaggga tgagacggca atccgtgagc cacttggtag 720
gagtctgact cggaactcca cctctccaga ctggtcatga caaggaatct tgagtctgct 780
gggcctgcaa tattacccct ccgaggaaag aaaaaaaaaa gggaatgtgt atttcgcgat 840
gtgtcggact agtgatgatc ttccaccgtg agatcctgca atctccacca ccccggcagc 900
tctgaccgtg ggtttcaaag gaccacctgt catttccctt tcaccgagaa tcctccatgg 960
tctggataga tgacccctga tataccgaga agacacgtct caatgctctt gtctggccgt 1020
atcgatatca gcggcgcaag aatggaatgc tcacgggctg tcaagtgaag tcggtttttg 1080
tctcgcaggc ctcaagaaac tctccaggca gatgtggctt ccgatatgaa acggctatcg 1140
aagcctcttc ccccagagtc tagcgtcagc ttctacccaa acgatcatgt gaactgaaac 1200
cacgcctctg atcgcgatca ctttcattga ccaagccatg gagaataccc ggcggattag 1260
cctatgtagc tccagcacag gccacagtgg cacaatccac ggcccaattg agaaaaacca 1320
cagatgctca gtggacccaa gcttcagtaa tgagtgagac ccttaaagaa aatgtgaaga 1380
ggcaatatca tcaaggtgca tggggcgtct accccgcata ctcacatcca ccctggaaaa 1440
aacccgagac cctttgacat ctgcaactcg gtgaagaatg caagtttctc atctatcgcg 1500
gcgacgctta ccggtttggg actccccgtg gtgcttaagg cccgaagcga tggcgacagc 1560
ccctgacgaa gcggagcaga agttgcagga tccaattgcc ggtgtatgcg ggcgtcctgg 1620
ggtacatggc cctttttggc caggggttct tttcatgtgg atgatatact cccattctgg 1680
gatagggtgt acttcaaagg cctactattc gcctgcagat caagatttgt tgcagtcacc 1740
ttgcagatat ccctggagaa agtgggattc ttcactctcc aaccctccgc gccatttcga 1800
gatagtatgc cgtgcccgtt agggctgtcg gaatgaagcc taaggggaaa cagactcgga 1860
tggactgtca aaatttgggt atatatacca ttagttgaga ccgccagatt cgagatcttt 1920
tttttgtctt tcttccaagc agatcaggct cgacttcttc attgacaatc aacgatagac 1980
acgacaaatt cctgatcacc 2000
<210> 19
<211> 2000
<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
<400> 19
gtgaccagca tctaaccaag ggtgctttga ctgctttctt ttgggacccc cgacgatcgc 60
ggtaccctgt actgtacgat acagaaccac cgcgagggat gacggatgaa cggcgcgatg 120
cactcccaca gttctaggct cttgcccctt gcaacgtgat ggtcatttac accagttgtt 180
tacagcaacg ggttggtgtt gatggtggat cgtggtgggt gaagtgcatg gacggttcag 240
gggcaaaggt ggagacactg gcgggcccat cgagccggac atgaatggct cgggcgcggg 300
gggttgtcgc caggaacggg tagtgggtca cctcgaggga gcggtggatt ggtggaggag 360
tcgaaatgtg acgcgggctg aaactcgcta attgatcatg gtccctcttc gtctcgacgt 420
gcactcggcg taatctgctg gtggatttaa gagtctcacc tcttcattca tgaggtcagc 480
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catatgttgc gggtcatgga cacctggaca gtgcccgact ggagtatgta ctcattgagg 660
caacattaca gtagtgtgtc cactacgata tgtatgcatc cgttggtagc agacatagca 720
tccttttcaa ctgtttgcta cataagtacc taaggatatg ctgtagcaat ttggccttgg 780
tctggcctgc gctcatcgac cagacggcat ccactgactg gcgagccctc catgattgag 840
cacatgaggg aagaagacct cagttaccca agaaagctac aattctttgc tctcaacata 900
tccctgctga agtcgcagag catcatccag gcattctgtt gaccctgctg tgtagactag 960
tgtgcgttga tagatgcagt catgcaaaac aagcagctga ttgaggaggt gtgcagccct 1020
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gactccccaa tccaccacgg gctcagtcgg tacagcgaga tggcgccccc cccacgcgcc 1320
ctgtgacacc aatcaagaac ccgtagttcc tgtggctctg tgggtcagga tcaatcaggg 1380
ctgtgcgatt gattcaacgg gaaatcaggt acagacaaca agagtttagg ggcggcaaac 1440
caatgcaggt accacagtcc catattctcg tatgcttcga gtacgaaaga ccaaagtaaa 1500
agtggttttt gaccgcaaga tggtaggtac ttgatactct ccccacctcg aacgggcctt 1560
tgggtgcgac cagagcgcta gctcgcgaag atggggtccg ctgggccagc gtgcagtagc 1620
ccctgtgcaa gtgggaggtt ccagaactcc ccatctcgag tcagactcgc atcacatcaa 1680
cacccccccc cccctttttt tttaaggggg cccagagaga gtaagagaga gagagtgagt 1740
gattggaccc gccgatcaag cagcctaatc tccctgttca tacaaagggc ccccgactcc 1800
cccccgtgct ctcttcctct ctttctttct tctccaagtc catacttcgt tgccatcgca 1860
tcagtcactc tctcgacttc ggtcatccac tctttaccaa ctactacact ctttgcctca 1920
aaaagccttc gcttttttaa atcgcctttt tcaaatcacc tgaacggttt tatcttccat 1980
ttcacccacc aacattcaaa 2000
<210> 20
<211> 2000
<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
<400> 20
tctgtcaaaa ttattttgag acgttttaaa aaaaaattcc cccaattttg tattttattt 60
ttgacacctg gtggttgatt tggccccttt acaattagcg tgacttgttc ttgatggatg 120
acgggagttc ttgcagatgc tctgcacttc tgcagagcga ttcttctcca aatacttgcc 180
cgagtcatct gatgttaaaa aaagctactg acggactcta agctcactgg tcactttcac 240
agcgttttcg gacattggga gatacgtgat tgatattgaa tccgatcaaa tgtcgagatc 300
attttgcagg aagaaagaag acaagaaatc cagtagatca agctcttgtc tctgagcgag 360
ataatatgaa tacatctcaa acttccctct tcaaagagta gacgagcttt aaacagagtt 420
aatgcacgga aatattaagc cttctgagta aaacaatcgc atatagtcgt ccacgtaggc 480
agagagagac gctcggcgcg tagaggaaag cacgtgagag ccccgtgagc tccggagcac 540
ccaagagggg aagagcctcg aggatgaaac ttagcacttg gacttaactt gtggcggaga 600
accaggcgcc tggtggtgca acgatctcat ggcctcttcc tcccccccgc catgccgccc 660
cgttcaggca catggtttca tatctttcga tgattcttag cagaacatta cccgagacac 720
ctcagatccg atctaagaca ccgttcgggc acactaagtc cagtctcggc ggatcagact 780
ccaccgaata ggccccaaac ccccaactcg acactccctt cctctctccc aagctcgcga 840
tcaaggtcgc aacaatggct ccatcaagca tatcatgctg acactcgcat ctccagttgc 900
ggccccctcg aaagtcgagc cgtgaggatt cgggaggtca aaagaggacc cgacactccg 960
tcttgggtcg catagcacat gccccggtcg catggttaat gagtgttaca tttgtagacc 1020
gcgcgggtga tgcgttcctg cagctcgcac cgacgagggt ggcctctaaa caatctcatt 1080
cgtcaagctt gcagccgagt gaataatcct gaacaatctc ggctgtagcg ttatcgaccc 1140
tttttttggt ggtcaacgcc tccactcccc ccacccccac tgtgatcaag ttacatcgag 1200
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ggagaatgca acatccgcga ctgagatgcc aggtgaacgg cagacacatt agagttcact 1320
caactttttc agagttaccc ctgacaaaga tcgagcgtga tctgccacag gctgtcggcc 1380
atcggccatg cagaacacca agagtatcta gcatcagcaa tgagtgggac cgtgcgcatc 1440
cttaacgtcc acggtctagg tcggcgtcac atttcgcaag tttggagcgg tccctggtct 1500
tttcttcctt ccagcgcttc gagtgcattc accggtgacc ttcatctgtt gcatgggtca 1560
tgacccgatg gcccctttgc agccaccaga aatgtgaccg ttcctcgtcg acagcctcag 1620
ccactgaaac ggtggtgatc gcattggcca tgagcagaca acgagtgccc ccgatcttcg 1680
tttcggttac cgaaattaga aagcttacat gggagcgtga gcaagtggaa cccaacttgg 1740
tatcgtcaac tcgttgagct catttcgcaa aatgacctgg tagagagagg gtgtcttttc 1800
tttggaggtg aagcagacca cgttgctggc ttgggtccgg tgagcacaag ggctgctata 1860
gaggtggtgg ataaagcgcg agtgcgaaac atacaaatat actggtattt cccaacctgg 1920
cttcctttca atttctccaa caccagagtc gccggatcga ccagacattc cctcgagata 1980
cttccaacca ctcctttacc 2000
<210> 21
<211> 57
<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
<400> 21
atgtctcgac ttctctacgc actgggtgcg ctggccgtgg gtcaatctgc cctggca 57
<210> 22
<211> 60
<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
<400> 22
atgaaattcc ttggactagc tgctttgttt cttgcccaga ccgtggcggg tctgacggct 60
<210> 23
<211> 60
<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
<400> 23
atgaagggtt ccatctccta ccagatctac aagggggctc tcctcctctc ctccctgctg 60
<210> 24
<211> 1869
<212> DNA
<213> Penicillium oxalicum
<400> 24
gctcctcagc tgtctcctcg tgccactagc ttggattcct ggttgtcttc cgagaccact 60
ttctctctca atggtatcct ggccaacatt ggctccagcg gtgcctactc caagagtgcc 120
gccagtggtg cggtcattgc cagccctagc acatccaacc ctgactatta ctacacctgg 180
acccgcgacg ctgcgcttac tctcaaagcc cttgtggata ttttccgtaa tggaaacctg 240
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attgccttga ttgactttgg taactggttg atcgacaatg gatacaagag ctatgcggtc 480
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tccggctttg atctctggga ggaggtcaac agcatgtcct tcttcaccgt ggcgaaccag 600
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atcaacgcca acactggcgg tggccgctcc ggcaaggact ccaacaccat cctcgccagt 780
attcacacct ttgaccctgc ggcctcgtgc gacgacgtca ctttccagcc ttgctcttcc 840
cgtgcccttg ccaaccacaa ggtgtacacc gactctttcc gctccgtcta cgctctgaac 900
tccggaattg cccagggcaa ggccgtatct gtcggccgct accccgagga ttcctactac 960
ggcggcaacc cttggttcct gtccaacctc gccgcggccg agcagctcta cgatgccatc 1020
taccagtgga acaagatcgg ctccatcacc attaccagca cctccctcgc tttcttcaag 1080
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atcatcagcg ctgtgaagac ttatgccgac ggctacgtca gcattgtgca atcccactcc 1200
tacgccaacg gctctctttc cgagcagttt gaccgcacca cgggtctctc catctccgct 1260
cgtgacctca cctggtccta cgctgcgctc ctgactgcca acgaccgccg caacggtgtc 1320
gtccctccct cgtggggcgc tagctctgcc aacagcattc ccggctcgtg ctccatgggc 1380
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ggcaccgctg ctccttcgtc tacgtcgacc accacgaagg cccccaccac caccaccgcc 1500
accaccacca cttctgccgg ctcttgcacc acccccaccg ccgtcgctgt gaccttcgat 1560
gagattgcca ccaccacctt tggtgagaat gtctacctgg tcggttctat ttctcagctc 1620
ggtaactgga acaccgccaa cggtattccc ctgagcgcta gcaagtacac ttcgagcaac 1680
cctctgtggt acgccacggt caacttgccg gcgggtacca ccttccagta caagtacttc 1740
cgcaaggaga gcgacggttc catcaagtgg gagagcgacc ctaaccgctc ctacaccgtc 1800
cctgccaagt gcggtaccac tactgctacc gagaacgaca cctggcgcca ccaccaccat 1860
caccactaa 1869
<210> 25
<211> 395
<212> PRT
<213> Penicillium oxalicum
<400> 25
Met Val Val Phe Ser Lys Val Thr Ala Val Leu Ala Ser Leu Ala Val
1 5 10 15
Val Ser Ser Ala Met Pro Thr Gly Asp Ala Ala Lys Ala Ser Pro Lys
20 25 30
Ala Asn Phe Ser Ile Lys Gln Thr Val Arg Pro Gly Ser Lys Lys Val
35 40 45
Val Asn Leu Pro Ala Met Tyr Ala Ala Ser Ile Ala Lys Tyr Gly Gly
50 55 60
Lys Val Pro Gln Ser Val Lys Ala Ala Ala Ala Ala Gly Thr Ala Ile
65 70 75 80
Thr Thr Pro Thr Glu Asn Asp Glu Glu Tyr Leu Thr Pro Val Thr Val
85 90 95
Gly Gly Ser Thr Leu Asn Leu Asp Phe Asp Thr Gly Ser Ala Asp Leu
100 105 110
Trp Val Phe Ser Ser Gln Leu Pro Ser Ser Glu Thr Gln Gly His Asp
115 120 125
Ile Tyr Arg Pro Ser Arg Asn Ala Arg Lys Leu Ser Gly Tyr Thr Trp
130 135 140
Ser Ile Ser Tyr Gly Asp Gly Ser Thr Ala Ser Gly Asn Val Tyr Lys
145 150 155 160
Asp Thr Val Thr Val Gly Gly Val Thr Ala Ser Ser Gln Ala Val Glu
165 170 175
Ala Ala Gln Thr Val Ser Gln Gln Phe Val Gln Asn Ala Gly Asn Asp
180 185 190
Gly Leu Leu Gly Leu Ala Phe Ser Ser Ile Asn Thr Val Gln Pro Gln
195 200 205
Ala Gln Thr Thr Phe Phe Asp Thr Val Gln Ser Gln Leu Asp Ser Pro
210 215 220
Leu Phe Ala Val Thr Leu Lys His Asn Ala Pro Gly Thr Tyr Asp Phe
225 230 235 240
Gly Phe Ile Asp Asn Ser Lys Tyr Thr Gly Gln Leu Ala Tyr Thr Pro
245 250 255
Val Asp Asn Ser Gln Gly Phe Trp Ser Phe Thr Ala Asp Ser Tyr Ser
260 265 270
Ala Gly Ser Ala Gln Gly Gly Ser Ile Gln Gly Ile Ala Asp Thr Gly
275 280 285
Thr Thr Leu Leu Leu Leu Asp Asp Ser Val Val Asp Asn Tyr Tyr Ser
290 295 300
Gln Val Glu Gly Ala Asn Ser Asp Ser Ser Ala Gly Gly Ile Thr Val
305 310 315 320
Pro Cys Asp Ala Gln Leu Pro Asp Phe Val Val Ser Ile Ala Gly Tyr
325 330 335
Asp Ala Val Val Pro Gly Ser Leu Ile Asn Tyr Ala Pro Leu Ser Gly
340 345 350
Asn Thr Cys Phe Gly Gly Ile Gln Ser Asn Ser Gly Ile Gly Phe Ser
355 360 365
Ile Phe Gly Asp Ile Phe Leu Lys Ser Gln Tyr Val Val Phe Asp Ala
370 375 380
Ser Gly Pro Gln Leu Gly Phe Ala Ala Gln Ala
385 390 395
<210> 26
<211> 641
<212> PRT
<213> Artificial sequence
<400> 26
Met Ser Arg Leu Leu Tyr Ala Leu Gly Ala Leu Ala Val Gly Gln Ser
1 5 10 15
Ala Leu Ala Ala Pro Gln Leu Ser Pro Arg Ala Thr Ser Leu Asp Ser
20 25 30
Trp Leu Ser Ser Glu Thr Thr Phe Ser Leu Asn Gly Ile Leu Ala Asn
35 40 45
Ile Gly Ser Ser Gly Ala Tyr Ser Lys Ser Ala Ala Ser Gly Ala Val
50 55 60
Ile Ala Ser Pro Ser Thr Ser Asn Pro Asp Tyr Tyr Tyr Thr Trp Thr
65 70 75 80
Arg Asp Ala Ala Leu Thr Leu Lys Ala Leu Val Asp Ile Phe Arg Asn
85 90 95
Gly Asn Leu Gly Leu Gln Thr Val Ile Glu Gln Tyr Val Asn Ala Gln
100 105 110
Ala Lys Leu Gln Thr Val Ser Asn Pro Ser Gly Gly Leu Ser Asp Gly
115 120 125
Ala Gly Leu Gly Glu Pro Lys Phe Asn Val Asp Leu Ser Ala Phe Thr
130 135 140
Gly Ala Trp Gly Arg Pro Gln Arg Asp Gly Pro Ala Leu Arg Ala Ile
145 150 155 160
Ala Leu Ile Asp Phe Gly Asn Trp Leu Ile Asp Asn Gly Tyr Lys Ser
165 170 175
Tyr Ala Val Asn Asn Val Trp Pro Ile Val Arg Asn Asp Leu Ala Tyr
180 185 190
Val Ala Gln Tyr Trp Ser Gln Ser Gly Phe Asp Leu Trp Glu Glu Val
195 200 205
Asn Ser Met Ser Phe Phe Thr Val Ala Asn Gln His Arg Ser Leu Val
210 215 220
Glu Gly Ser Ala Phe Ala Ser Arg Val Gly Ala Ser Cys Ser Gly Cys
225 230 235 240
Asp Ser Gln Ala Pro Gln Ile Leu Cys Tyr Met Gln Ser Phe Trp Thr
245 250 255
Gly Ser Tyr Ile Asn Ala Asn Thr Gly Gly Gly Arg Ser Gly Lys Asp
260 265 270
Ser Asn Thr Ile Leu Ala Ser Ile His Thr Phe Asp Pro Ala Ala Ser
275 280 285
Cys Asp Asp Val Thr Phe Gln Pro Cys Ser Ser Arg Ala Leu Ala Asn
290 295 300
His Lys Val Tyr Thr Asp Ser Phe Arg Ser Val Tyr Ala Leu Asn Ser
305 310 315 320
Gly Ile Ala Gln Gly Lys Ala Val Ser Val Gly Arg Tyr Pro Glu Asp
325 330 335
Ser Tyr Tyr Gly Gly Asn Pro Trp Phe Leu Ser Asn Leu Ala Ala Ala
340 345 350
Glu Gln Leu Tyr Asp Ala Ile Tyr Gln Trp Asn Lys Ile Gly Ser Ile
355 360 365
Thr Ile Thr Ser Thr Ser Leu Ala Phe Phe Lys Asp Val Tyr Pro Ser
370 375 380
Ala Ala Thr Gly Thr Tyr Ala Ser Gly Ser Thr Thr Phe Asn Ala Ile
385 390 395 400
Ile Ser Ala Val Lys Thr Tyr Ala Asp Gly Tyr Val Ser Ile Val Gln
405 410 415
Ser His Ser Tyr Ala Asn Gly Ser Leu Ser Glu Gln Phe Asp Arg Thr
420 425 430
Thr Gly Leu Ser Ile Ser Ala Arg Asp Leu Thr Trp Ser Tyr Ala Ala
435 440 445
Leu Leu Thr Ala Asn Asp Arg Arg Asn Gly Val Val Pro Pro Ser Trp
450 455 460
Gly Ala Ser Ser Ala Asn Ser Ile Pro Gly Ser Cys Ser Met Gly Ser
465 470 475 480
Ala Thr Gly Ser Tyr Ala Thr Pro Ser Val Gly Ser Trp Pro Ala Thr
485 490 495
Leu Thr Ser Gly Thr Ala Ala Pro Ser Ser Thr Ser Thr Thr Thr Lys
500 505 510
Ala Pro Thr Thr Thr Thr Ala Thr Thr Thr Thr Ser Ala Gly Ser Cys
515 520 525
Thr Thr Pro Thr Ala Val Ala Val Thr Phe Asp Glu Ile Ala Thr Thr
530 535 540
Thr Phe Gly Glu Asn Val Tyr Leu Val Gly Ser Ile Ser Gln Leu Gly
545 550 555 560
Asn Trp Asn Thr Ala Asn Gly Ile Pro Leu Ser Ala Ser Lys Tyr Thr
565 570 575
Ser Ser Asn Pro Leu Trp Tyr Ala Thr Val Asn Leu Pro Ala Gly Thr
580 585 590
Thr Phe Gln Tyr Lys Tyr Phe Arg Lys Glu Ser Asp Gly Ser Ile Lys
595 600 605
Trp Glu Ser Asp Pro Asn Arg Ser Tyr Thr Val Pro Ala Lys Cys Gly
610 615 620
Thr Thr Thr Ala Thr Glu Asn Asp Thr Trp Arg His His His His His
625 630 635 640
His

Claims (4)

1.一种工程菌,是将特异DNA分子通过同源重组取代草酸青霉基因组DNA中PoxPepA蛋白酶的编码基因得到的;所述特异DNA分子中具有特异表达盒,其中启动子为启动子pPoxEgCel5B,启动编码特异蛋白质的基因的表达;
所述PoxPepA蛋白酶为序列表的序列25所示的蛋白质;
所述启动子pPoxEgCel5B如序列表的序列14所示;
所述特异蛋白质为(b1)或(b2):
(b1)序列表的序列26第1至635位氨基酸残基组成的蛋白质;
(b2)序列表的序列26所示的蛋白质;
所述草酸青霉为突变体∆PoxKu70。
2.如权利要求1所述的工程菌,其特征在于:所述编码特异蛋白质的基因自上游至下游依次由如下两个区段组成:序列表的序列21所示的DNA区段,序列表的序列24所示的DNA区段。
3.草酸青霉(Penicillium oxalicum)OXPoxGA15A,其保藏编号为CCTCC No.M2017794。
4.权利要求1至3中任一所述工程菌在生产生淀粉糖化酶中的应用。
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