CN108474874A - 用于数字病理学的校准载玻片 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及数字病理学。为了提高微观水平的均匀性和增强针对颜色校准的时间稳定性,为数字病理学扫描显微镜提供校准载玻片(10)。所述校准载玻片包括衬底(12)和像素布局(14),所述像素布局包括被布置在所述衬底的表面(18)上的多个间隔开的金属纳米结构(16)。所述衬底是光学透明的。所述金属纳米结构被布置为产生等离子体共振以用于在明场照明下生成彩色图像。所述彩色图像包括被提供用于校准数字病理学成像系统的多个校准颜色值。
Description
技术领域
本发明涉及数字病理学中的全载玻片成像领域,并且具体涉及校准载玻片、校准系统以及用于校准数字病理学扫描显微镜的方法。
背景技术
在数字病理学中,捕获病理学载玻片的图像并以数字形式存储该图像,能够在计算机监视器上查看、管理和分析该图像。因此,以恒定且可靠的方式显示来自病理学载玻片的颜色是重要的。然而,不同的数字病理学扫描器之间的颜色响应可能不同。即使是相同的数字病理学扫描器,颜色响应也会随着时间而变化。
因此,已经开发出校准载玻片来校准数字病理学扫描器的颜色响应,以便建立与标准颜色空间的已知关系。例如,在P.Shrestha和B.Hulsken的“Color accuracy andreproducibility in whole slide imaging scanners”(Medical Imaging 2014:DigitalPathology,2014年的SPIE会议论文集的第9041卷)中,已经基于合成目标(例如,Macbeth颜色目标的照相透明度)开发出颜色校准载玻片。这样的基于胶片的方法涉及利用成像设备对目标进行成像,然后使用结果得到的图像来产生特定于该设备的颜色校正曲线。然而,这样的方法受限于这样的事实:颜色是由青色、品红色和黄色薄膜染料的组合产生的,这些染料具有与组织病理学染色剂的光谱基本不同的光谱。
为了克服这些限制,在Y.Murakami、H.Gunji、F.Kimura、A.Saito、T.Abe、M.Sakamoto、P.Bautista和Y.Yagi的“Color correction in whole slide digitalpatholog”(2012年11月的第20届IS&T颜色与成像会议论文集)中描述了校准载玻片,其中,所述校准载玻片包括九个特别针对苏木精和曙红(H&E)染色剂而选择的微型彩色胶片。
为了准确表示要被成像的目标材料,在P.Pututista、N.Hashimoto和Y.Yagi的“Color standardization in whole slide imaging using a color calibrationslide”(Journal of Pathology Informatics,2014年,第5卷,第1期,第4篇文章)中已经提出了基于组织的彩色目标,例如以标准方式染色的小鼠胚胎截面。
尽管已经做出了通过使颜色适应要被成像的目标材料来提高颜色校准的准确性的努力,但是这些方法中的许多方法的共同的问题是:在微观水平上,校准载玻片可能具有可能影响图像质量的颗粒结构。即使对于相同的校准载玻片,颜色(例如,由经染色的聚合物膜生成的颜色)也可能不稳定,这种颜色随着时间的推移可能会褪色。
发明内容
可能需要提供具有改善的微观水平均匀性和增强的时间稳定性的校准载玻片。
本发明的目的通过独立权利要求的主题来解决,其中,进一步的实施例被包含在从属权利要求中。应当注意,下文中对本发明的描述方面也适用于校准载玻片、校准系统以及用于校准数字病理学扫描显微镜的方法。
根据本发明的第一方面,提供了一种用于数字病理学扫描显微镜的校准载玻片。所述校准载玻片包括:衬底和像素布局,所述像素布局包括被布置在所述衬底的表面上的多个间隔开的金属纳米结构。所述衬底是光学透明的。所述金属纳米结构被布置为产生用于在明场照明下生成彩色图像的等离子体共振。所述彩色图像包括被提供用于校准数字病理学扫描显微镜的多个校准颜色值。
通过这种方式,创建像素以支持个体颜色,像素也可以被小型化并且在光学衍射极限处被并置。另外,当在高数值孔径(NA)处的明场光学显微镜中观察时,这能够产生鲜艳的颜色。由于等离子体共振特征低于光学分辨率极限,因此校准载玻片在微观水平上是均匀的。另外,所生成的颜色在时间上是稳定的,由此使得能够及时评估数字病理学扫描显微镜的稳定性。
应当注意,术语“扫描显微镜”在本发明的含义中是指适合用于所谓的数字病理学中的全载玻片成像的任何类型的显微镜。例如,本发明包括基于行的扫描以及基于拼片的扫描显微镜。
根据范例,所述金属纳米结构被布置为彼此耦合以调谐共振波长,使得所生成的彩色图像的所述多个校准颜色值能适于选定的颜色校准方法的目标颜色。
通过结合局域和耦合共振,可以设计一种校准载玻片,其共振波长的范围为从紫外到红色。
根据范例,所述校准载玻片还被提供有至少一个布局,所述至少一个布局选自包括以下的组:单层的着色微珠;以及分辨率和失真测试目标。
换句话说,校准载玻片包括两个或更多个不同的样本或目标。在范例中,校准载玻片包括具有来自等离子体效应的颜色的颜色目标以及单层的着色微珠。在另外的范例中,校准包括具有来自等离子体效应的颜色的颜色目标、单层的着色微珠,以及分辨率和失真测试目标。
通过这种方式,能够利用等离子体共振来模拟颜色和幻影特征。能够利用微珠来评估焦点和成像。分辨率和失真目标评估分辨率和拼接伪影。通过在同一校准载玻片上组合多个目标,可以实现更高效和更准确的校准。
根据本发明的第二方面,提供了一种校准系统,所述校准系统包括:扫描显微镜,以及根据上述和下述范例中的一个所述的校准载玻片。所述扫描显微镜包括被布置在光路中的光源、光探测器。在校准中,所述校准载玻片被布置在所述光路中。所述光源被配置为提供照射所述校准载玻片以产生用于生成彩色图像的等离子体共振的光。所述光探测器被配置为探测通过所述校准载玻片的光以采集所述彩色图像的图像数据作为用于校准目的的校准测试数据。
扫描显微镜可以是例如明场数字病理学扫描器,明场和荧光数字病理学扫描器,或者明场、荧光和荧光原位杂交(FISH)数字病理学扫描器。
根据范例,所述校准系统还被提供有校准设备,所述校准设备包括存储单元和处理单元。所述存储单元被配置为存储预定标准校准数据。所述处理单元被配置为比较所采集的校准测试数据与所存储的预定标准校准数据以生成颜色校正曲线。所述颜色校正曲线用于校正利用所述扫描显微镜获得的病理学样本的病理学图像数据的颜色和/或分辨率。
根据范例,除了所述像素布局以外,在所述校准载玻片的所述表面上提供至少一个布局,所述至少一个布局选自包括以下的组:单层的着色微珠,以及分辨率和失真测试目标。所述光探测器被配置为采集所述至少一个布局的图像数据作为另外的校准测试数据。所述存储单元被配置为存储所述至少一个布局的另外的预定标准校准数据。所述处理单元被配置为比较所采集的另外的校准测试数据与所存储的另外的预定标准校准数据以用于校准所述扫描显微镜的参数。所述参数选自包括以下的组:所述扫描显微镜的聚焦质量;分辨率和拼接伪影。
根据范例,所述金属纳米结构被布置为产生等离子体共振,所述等离子体共振允许吸收激发波长处的光以产生用于生成荧光图像的光致发光和/或荧光。所述荧光图像包括为校准荧光显微镜而提供的多个像素强度值。
换句话说,校准载玻片不仅能够用于校准颜色,而且还能够用于校准荧光响应,例如用于明场和荧光成像系统。由于不需要改变用于校准颜色和荧光响应的校准载玻片,因此可以提高校准过程的效率。
根据本发明的第三方面,提供了一种用于校准扫描显微镜的方法,所述扫描显微镜包括被布置在光路中的光源和光探测器,所述方法包括以下步骤:
a)利用来自所述光源的光朝向所述光探测器照射校准载玻片;
其中,所述校准载玻片被布置在所述光路中;
其中,所述校准载玻片包括衬底和像素布局,所述像素布局包括被布置在所述衬底的表面上的多个间隔开的金属纳米结构,其中,所述金属纳米结构被布置为产生等离子体共振;并且
其中,照射所述校准载玻片的光产生等离子体共振,以用于生成包括用于校准扫描显微镜的多个校准颜色值的彩色图像;
b)检测通过所述校准载玻片的光并采集所述彩色图像的图像数据作为校准测试数据;并且;
c)使用所述校准测试数据以用于所述扫描显微镜的校准目的。
根据范例,所述方法的步骤c)还包括以下子步骤:
c1)提供预定标准校准数据;
c2)比较所获得的校准测试数据与所述预定标准校准数据以生成颜色校正曲线;并且
c3)通过使用所述颜色校正曲线来校正利用所述扫描显微镜获得的病理学样本的病理学图像数据的颜色和/或分辨率。
根据范例,除了所述像素布局以外,在所述校准载玻片的所述表面上提供至少一个布局,所述至少一个布局选自包括以下的组:单层的着色微珠,以及分辨率和失真测试目标;并且
其中,所述方法还包括以下步骤:
d)采集所述至少一个布局的图像数据作为另外的校准测试数据;
e)提供所述至少一个布局的另外的预定标准校准数据;并且
f)比较所采集的另外的校准测试数据与所存储的另外的预定标准校准数据以用于校准所述扫描显微镜的参数;
其中,所述参数选自包括以下的组:
-所述扫描显微镜的聚焦质量;以及
-分辨率和拼接伪影。
根据本发明的第四方面,提供了一种用于制造具有多个布局的校准载玻片的方法(300),所述多个布局包括:具有被布置在衬底的表面上的多个间隔开的金属纳米结构的像素布局、单层的着色微珠,以及分辨率和失真测试目标,所述方法包括以下步骤:
aa)在形成显微镜载玻片的衬底上沉积单层的着色微珠;
bb)在形成两个盖玻片的两个不同衬底上沉积像素布局以及分辨率和失真测试目标;并且
cc)在所述显微镜载玻片上组装两个盖玻片以形成校准载玻片。
换句话说,能够在单独的衬底上完成这三个过程,在完成这些过程之后,将单独的衬底组装在一起。
通过这种方式,虽然这三种技术(纳米压印光刻与干法刻蚀、化学键合,以及光学光刻)的制造方法彼此并不兼容,但是也可以将所有三种技术结合在一个校准载玻片上。
根据本发明的一个方面,提供了利用等离子体共振效应来生成颜色的校准载玻片。由于校准载玻片的厚度与病理学载玻片相兼容,因此能够用小于1μm的金属纳米结构的薄层来生成颜色,并且因此适合用于针对数字病理学的颜色校准。校准载玻片在透射模式中工作,而颜色信息被编码在金属纳米结构的尺寸参数中。换句话说,调节尺寸参数能够调谐等离子体共振并因此确定个体像素的颜色。另外,校准载玻片在微观水平上均匀并且所生成的颜色在时间上稳定。另外,由于制造工艺(例如,纳米压印光刻与干法蚀刻),能够在大批量下保证均匀性,这适合用于标准化目的或用于评估扫描器到扫描器的可变性。
参考下文描述的实施例,本发明的这些方面和其他方面将变得明显并且得到阐明。
附图说明
下面将参考以下附图来描述本发明的示范性实施例:
图1A和图1B示出了校准载玻片的范例的示意图。
图2A至图2D示出了校准载玻片的另外的范例。
图3示出了校准载玻片的另外的范例。
图4示出了校准载玻片的另外的范例。
图5示出了校准系统的范例。
图6示出了用于校准扫描显微镜的方法的范例的基本步骤。
图7示出了用于校准扫描显微镜的方法的另外的范例。
图8示出了用于制造具有多个布局的校准载玻片的方法的范例的基本步骤。
这些附图仅是示意性说明的,并不是按比例绘制的。在所有附图中,相同的附图标记指代相同或相似的特征。
具体实施方式
图1B示出了用于扫描显微镜36的校准载玻片10的范例的俯视图(参见图5中的范例)。图1A示出了沿着图1B中示出的线1A-1A的截面图。
校准载玻片10包括衬底12和像素布局14。像素布局14包括被布置在衬底12的表面18上的多个间隔开的金属纳米结构16。衬底12是光学透明的。金属纳米结构16被布置为产生等离子体共振以用于生成彩色图像,例如在明场照明下生成具有蓝色或黄色的图像。所述彩色图像包括被提供用于校准扫描显微镜的多个校准颜色值。
任选地,提供盖玻片20以用于覆盖和保护像素布局14。为了安装任选的盖玻片20,可以使用胶水、树脂或进入金属纳米结构16之间的任何其他适当的材料。
另外的选择是用光学透明氧化物层(未示出)覆盖金属纳米结构16。利用氧化物层,金属纳米结构16能够得到共形地涂覆。氧化物层可以由例如二氧化硅(SiO2)、氮化硅(Si3N4)、SiO2与Si3N4(SiOxNy)的混合物或任何其他适当的氧化物或材料制成。任选的氧化物层可以提供更好的保护并且易于盖玻片附着。也称为电介质衬底的衬底12可以由在工作波长下透明的任何适当的材料制成,这种材料允许在没有可感知的散射或吸收的情况下透射光。例如,衬底可以由二氧化硅、二氧化钛、氮化硅、石英、熔融石英、塑料、蓝宝石等制成。衬底12可以是完全透明的。例如,衬底12能够透过超过90%的光。衬底12也可以是部分透明的。例如,衬底12能够透过60%的光。衬底12的透明度使得校准载玻片10能够在透射模式中工作,例如在明光照明下工作。
金属纳米结构16可以包括选自包括以下的组的金属:金、银、铜和铝。也可以考虑适合用于产生等离子体共振的其他金属。任选地或优选地,金属是铝或铝合金。铝能够支持等离子体共振到紫外线(UV)中,这对于银和金是不可能的。另外,铝在环境中稳定并且比银和金成本更低。
术语“纳米结构”涉及具有在纳米尺度上的至少一个维度的结构。
在范例中,每个金属纳米结构具有在30nm至700nm,优选在60nm至450nm的范围内的横截面尺寸22。横截面尺寸22涉及沿着被布置有金属纳米结构16的衬底12的表面18的尺寸。在图1B中,金属纳米结构16被图示为具有圆形形状的横截面。在这种情况下,横截面尺寸22涉及圆形的直径。
在另外的范例中,每个金属纳米结构具有在10nm至1μm,优选在25nm至150nm的范围内的厚度24。术语“厚度”涉及从衬底12的表面18延伸的金属纳米结构16的高度。
如图1A所示,金属纳米结构16可以在衬底12的表面18上形成突起。在另一范例中(未示出),金属纳米结构16可以在衬底12的表面18上形成凹陷。
金属纳米结构16可以沿着衬底12的表面18进行周期性布置。例如,在图1B中,金属纳米结构16被布置为二维正方形晶格。金属纳米结构16也可以被不同地布置,例如被布置在二维六角形晶格中。
在另一范例(未示出)中,金属纳米结构16以准周期性的方式进行布置,并且具有不规则的周期性。
在范例中,相邻金属纳米结构16之间的距离26与可见光波长相当,所述距离在100nm至1μm,优选在180nm至650nm的范围内。距离26也可以被称为间距,其是两个相邻金属纳米结构的中心之间的距离。作为选择,金属纳米结构16可以被布置为彼此耦合以调谐共振波长,使得生成彩色图像的多个校准颜色值能适于选定的颜色校准方法的目标颜色。
术语“校准”涉及建立与标准颜色空间的已知关系。
术语“校准颜色值”涉及针对选定的颜色校准方法的彩色图像的颜色值。因此,校准颜色值可能会根据选定的颜色校准方法而变化。在范例中,对于Macbeth颜色目标,校准颜色值对应于由橙色、浅色皮肤、青色、品红色、黄色等的组合产生的颜色的颜色值。在另一范例中,使用基于组织的颜色目标,并且校准颜色值与组织的颜色有关,例如与以标准方式染色的小鼠胚胎截面的颜色有关。在另外的范例中,校准颜色值包括已经用病理学染色剂(例如,苏木精、曙红、苯胺蓝等)染色的一组代表性生物聚合物的着色斑块。
目标颜色可能与选定的颜色校准方法中使用的颜色有关。例如,如果颜色校正基于Macbeth颜色图表,则目标颜色与由橙色、浅色皮肤、青色、品红色、黄色等的组合产生的颜色有关。在另一范例中,如果使用基于组织的颜色校正方法,则目标颜色表示要被成像的目标材料,从而基于染色的组织来产生彩色幻影。在另外的范例中,如果颜色校准基于与在用染色的组织样品观察病理学载玻片时遇到的光谱类似的光谱,则目标颜色表示已经用病理学染色剂染色的生物聚合物的着色斑块。
术语“耦合”涉及耦合相邻金属纳米结构之间的等离子体共振。
金属纳米结构之间的耦合允许调谐共振波长,例如从紫外到红色进行调谐。
金属纳米结构16在衬底18的表面18上的布置定义了像素布局14。
图2A至图2D示出了校准载玻片10的像素布局14的其他范例的俯视图。
在图2A中,像素布局14包括单尺寸金属纳米结构16的晶格。每个金属纳米结构16定义了像素。
在图2B、图2C和图2D中,颜色由多个金属纳米结构单元28的周期性设定,因此每个金属纳米结构单元定义了大像素。
在图2B和图2C中,每个金属纳米结构单元28包括具有不同横截面尺寸的金属纳米结构16。
在图2D中,金属纳米结构单元28包括具有与用于生成不同颜色的像素布局14的其余部分不同的横截面尺寸的金属纳米结构16。
可以通过使用从包括纳米压印光刻与干法蚀刻的组中选择的方法来制造金属纳米结构16的像素布局14。
由于制造工艺的原因,能够保证大批量的均匀性,这适合用于标准化目的。
图3示出了包括至少两个像素子布局30的像素布局14的另外的范例。至少两个像素子布局30被配置为生成不同的颜色,例如,具有不同尺寸和/或不同布置的金属纳米结构16。
这可以为选定的颜色校准方法提供颜色图表(或颜色目标)的灵活设计。例如,像素布局14可以以像素子布局30的形式表示具有24个灰度场和264个颜色场的IT8颜色目标。像素布局14还可以以像素布局30的形式表示具有8个颜色场的MGH(马萨诸塞州总医院)颜色目标。因此,像素子布局也可以被称为颜色样本。
由于等离子体共振特征低于光学分辨率极限,因此校准载玻片在微观水平上是均匀的。另外,校准载玻片与病理学载玻片完全兼容,因为校准载玻片的厚度与病理学载玻片的厚度相似。另外,所生成的颜色在时间上稳定。这使得能够及时评估扫描显微镜的稳定性。
图4示出了另外的范例,其中,除了像素布局14以外,在校准载玻片10的表面18上提供至少一个布局32、34。至少一个布局32、34选自包括以下的组:单层的着色微珠,以及分辨率和失真测试目标。作为选择,布局32、34都被提供在表面18上:布局32包括单层的着色微珠;并且布局34包括分辨率和失真测试目标。
换句话说,校准载玻片10可以包括两个或更多个不同的样本或目标:例如,具有来自等离子体效应的颜色的颜色目标、单层的着色微珠,以及分辨率和失真测试目标。
通过这种方式,能够用等离子体共振来模拟颜色和幻影特征。能够利用微珠来评估焦点和成像。分辨率和失真目标评估分辨率和拼接伪影。因此,校准过程的效率可以得到改善。另外,这也使得用户能够将这个复杂样品嵌入到扫描器或扫描器台中。
可以以任何合适的方法将多种布局沉积在衬底上。在范例中,如图6中的选择所示,布局38的微珠以化学方式被附着到衬底12,而像素布局14的金属纳米结构以及布局40的分辨率和失真目标例如通过光学光刻工艺被沉积在两个盖玻片26上。
这可以允许多种布局与不同制造方法的组合。
图5以示意图示出了校准系统100的范例。校准系统100包括扫描显微镜36和根据上述范例的校准载玻片10。
扫描显微镜36包括被布置在光路44中的光源38、任选的光学器件布置40和光探测器42。
光学器件布置40可以包括第一光学器件子布置39和第二光学器件子布置41。
第一光学器件子布置39被布置在光源38与校准载玻片10之间的光路44中,以用于将来自光源38的光46(用两个实线箭头指示)引导到校准载玻片10。第一光学器件子布置39可以包括例如聚光透镜、反射镜等(未进一步示出)。
可以包括显微镜物镜和其他成像光学器件(未进一步示出)的第二光学器件子布置41被布置在校准载玻片10与光探测器42之间的光路44中,以用于引导光46通过校准载玻片的10到达光探测器42。
在校准中,校准载玻片10被布置在光路44中(用虚线指示)。光源38被配置为提供穿过光学器件布置40的光46(用两个实线箭头指示)以照射校准载玻片,从而产生等离子体共振以用于生成彩色图像。光探测器42被配置为探测通过校准载玻片10的光以采集彩色图像的图像数据作为用于校准目的校准测试数据。换句话说,在校准中,校准载玻片10在透射模式中工作,以用于透射要由光探测器42探测的光。
扫描显微镜36可以是例如明场数字病理学扫描器,明场和荧光数字病理学扫描器,或者明场、荧光和FISH数字病理学扫描器。扫描显微镜被提供为将玻璃载玻片转换成数字载玻片,例如,病理学样本的全载玻片图像,能够在计算机监视器上查看、管理和分析所述全载玻片图像。
校准载玻片的金属纳米结构也可以被布置为产生等离子体共振,所述等离子体共振允许吸收激发波长处的光以产生用于生成荧光图像的光致发光和/或荧光。荧光图像包括为校准荧光显微镜而提供的多个像素强度值。
基于等离子体共振的校准载玻片显示出宽的吸收和发射光谱,当用对应的激发波长处的光激发时,所述宽的吸收和发射光谱可以覆盖所有典型的荧光通道。因此,校准载玻片的相同区可以提供在大的光谱范围上的光致发光和/或荧光输出。换句话说,校准载玻片上的一种类型的等离子体结构可以用于校准所有荧光通道。这可以取代对多种荧光染料的需要。另外,由于金属纳米结构中的激发光的自然共振吸收以及不同波长处的激发光的一部分的再发射,这样的校准载玻片的光致发光和/或荧光可能不易劣化。
由于校准载玻片也在激发波长处的光下产生光致发光和/或荧光,因此相同的校准载玻片也可以提供用于荧光校准的手段。换句话说,在明场和荧光数字病理学扫描器中,不需要改变用于明场成像和荧光成像的校准载玻片。因此,可以提高校准效率。
任选地,如图4所示,校准系统100还被提供有校准设备48。校准设备48包括存储单元50和处理单元52。
处理单元52被配置为比较所采集的校准测试数据与所存储的预定标准校准数据以生成颜色校正曲线。颜色校正曲线用于校正用扫描显微镜获得的病理学样本的病理学图像数据的颜色和/或分辨率。
颜色校正曲线可以是例如颜色校正矩阵。颜色校正可以基于例如经验模型。
在范例中,校准设备与扫描显微镜集成在一起。在另一范例中,校准设备是接收来自扫描显微镜的校准测试数据的计算机。
作为另外的选择,除了像素布局14以外,在校准载玻片10的表面18上提供至少一个布局32、34,所述至少一个布局32、34选自包括以下的组:单层的着色微珠,以及分辨率和失真测试目标(参见图4)。光探测器被配置为采集至少一个布局32、34的图像数据作为另外的校准测试数据。存储单元50被配置为存储至少一个布局32、34的另外的预定标准校准数据。处理单元52被配置为比较所采集的另外的校准测试数据与所存储的另外的预定标准校准数据以用于校准扫描显微镜36的参数。所述参数选自包括以下的组:扫描显微镜的聚焦质量,以及分辨率和拼接伪影。
对扫描显微镜的聚焦质量的校准可以基于选择包括以下的组的微珠图像的性质的测量结果:强度、面积、密度和分布。然后将测得的性质的值与另外的预定标准校准数据(即,已知值)进行比较以用于校准扫描显微镜。
因此,能够使用相同的校准载玻片来校准颜色、聚焦质量、分辨率和拼接伪影。因此能够提高校准过程的效率。
在范例中,校准载玻片10永久地安装在扫描显微镜36上。
换句话说,校准载玻片可以被集成在扫描显微镜36中。这可以确保及时获得非常高的质量。
图6示出了用于校准扫描显微镜的方法200,所述扫描显微镜包括被布置在光路中的光源和光探测器。所述方法包括以下步骤:
-在第一步骤210(也被称为步骤a))中,利用来自光源的光朝向光探测器照射校准载玻片。校准载玻片被布置在光路中。校准载玻片包括衬底和像素布局,像素布局包括被布置在衬底的表面上的多个间隔开的金属纳米结构,其中,金属纳米结构被布置为产生等离子体共振。照射校准载玻片的光产生等离子体共振,以用于生成包括用于校准扫描显微镜的多个校准颜色值的彩色图像。
-在第二步骤220(也被称为步骤b))中,检测通过校准载玻片的光并采集彩色图像的图像数据作为校准测试数据;
-在第三步骤230(也被称为步骤c))中,使用校准测试数据以用于扫描显微镜的校准目的。
-在作为图5中的选择所示出的范例中,方法的步骤c)(即,方法的步骤230)还包括以下子步骤:
-在第一子步骤232(也被称为子步骤c1))中,提供预定标准校准数据。
-在第二子步骤234(也被称为子步骤c2))中,比较所获得的校准测试数据与预定标准校准数据以生成颜色校正曲线。
-在第三子步骤236(也被称为子步骤c3))中,通过使用颜色校正曲线来校正利用扫描显微镜获得的病理学样本的病理学图像数据的颜色和/或分辨率。
例如,在第一步骤210(即,步骤a))中,光学器件布置可以被提供用于将来自光源的光导向光探测器。光学器件布置可以包括第一光学器件子布置和第二光学器件子布置。第一光学器件子布置可以包括聚光透镜、反射镜等,其被布置在光源与校准载玻片之间的光路中,用于将光引导和聚焦在校准载玻片上。第二光学器件子布置可以包括显微镜物镜和其他成像光学器件,其被布置在校准载玻片与光探测器之间的光路中,用于将光导向光探测器。
图7示出了另外的选择(用虚线箭头指示),其中,除了像素布局以外,在校准载玻片的表面上提供至少一个布局,所述至少一个布局选自包括以下的组:单层的着色微珠,以及分辨率和失真测试目标。所述方法还可以包括以下步骤:
-在第四步骤240(也被称为步骤d))中,采集至少一个布局的图像数据作为另外的校准测试数据。
-在第五步骤250(也被称为步骤e))中,提供了至少一个布局的另外的预定标准校准数据。
-在第六步骤260(也被称为步骤f))中,比较所采集的另外的校准测试数据与所存储的另外的预定标准校准数据以用于校准扫描显微镜的参数,其中,所述参数选择包括以下的组:扫描显微镜的聚焦质量,以及分辨率和拼接伪影。
图8示出了制造具有多个布局的校准载玻片的方法300,所述多个布局包括:具有被布置在衬底的表面上的多个间隔开的金属纳米结构的像素布局、单层的着色微珠,以及分辨率和失真测试目标,所述方法包括以下步骤:
aa)在形成显微镜载玻片的衬底上沉积302单层的着色微珠;
bb)在形成两个盖玻片的两个不同衬底上沉积304像素布局以及分辨率和失真测试目标;并且
cc)在显微镜载玻片上组装306两个盖玻片以形成校准载玻片。
可以使用纳米压印光刻与干法蚀刻来制备金属纳米结构。例如,衬底保形压印光刻(SCIL)可以用于在连续的铝层上定义蚀刻掩模(例如基于二氧化硅的溶胶-凝胶),之后使用基于氯化学的各向异性反应离子蚀刻将该图案转移到铝中。
可以经由光学光刻工艺来制造分辨率和失真目标。
为了制造单层的着色微珠,通常需要对表面上的珠粒的印刷/点样步骤以及随后将珠粒过量洗涤的特定化学工艺。
然而,由于SCIL会破坏化学表面改性,因此在SCIL或光学光刻之后在相同载玻片上制作微珠单层是不可能的。在微珠之后制作SCIL也是不可能的,因为紫外线步骤破坏了与表面结合的微珠,并且表面改性使得不可能进行铝沉积。在SCIL之后的任选的光刻也是不可能的,因为SCIL蚀刻破坏了用光学光刻制作的特征。
虽然每一个目标(像素布局、着色的微珠,以及分辨率和失真测试目标)都是经由非常不同的过程创建的,并且这些过程彼此并不兼容,但是仍然能够通过将这些目标制造在不同的衬底上而在单个校准载玻片中组合这些目标。必须注意,本发明的实施例是参考不同主题来描述的。尤其地,一些实施例是参考方法型权利要求来描述的,而其他实施例是参考装置型权利要求来描述的。然而,除非另有说明,本领域技术人员将从以上和以下的描述中推断出,除属于一种类型的主题的特征的任意组合之外,涉及不同主题的特征之间的任意组合也被认为在本申请中被公开。然而,所有的特征都能够被组合来提供多于特征的简单加合的协同效应。
尽管已经在附图和前面的描述中详细图示和描述了本发明,但是这样的图示和描述应当被认为是图示性或示范性的,而非限制性的。本发明不限于所公开的实施例。本领域技术人员通过研究附图、公开内容以及权利要求,在实践请求保护的发明时能够理解并实现对所公开的实施例的其他变型。
在权利要求中,“包括”一词不排除其他元件或步骤,并且词语“一”或“一个”不排除多个。单个处理器或其他单元可以实现在权利要求中记载的若干项的功能。尽管某些措施被记载在互不相同的从属权利要求中,但是这并不指示不能有利地使用这些措施的组合。权利要求中的任何附图标记都不应被解释为对范围的限制。
Claims (15)
1.一种用于数字病理学扫描显微镜的校准载玻片(10),包括:
-衬底(12);以及
-像素布局(14),其包括被布置在所述衬底的表面(18)上的多个间隔开的金属纳米结构(16);
其中,所述衬底是光学透明的;
其中,所述金属纳米结构被布置为产生用于在明场照明下生成彩色图像的等离子体共振;并且
其中,所述彩色图像包括被提供用于校准数字病理学扫描显微镜的多个校准颜色值。
2.根据权利要求1所述的校准载玻片,其中,所述金属纳米结构被布置为彼此耦合以调谐共振波长,使得所生成的彩色图像的所述多个校准颜色值能适于选定的颜色校准方法的目标颜色。
3.根据权利要求1或2所述的校准载玻片,其中,所述像素布局包括至少两个像素子布局(30),其中,所述至少两个像素子布局被配置为生成不同的颜色。
4.根据前述权利要求中的任一项所述的校准载玻片,其中,所述金属纳米结构包括选自包括以下的组的金属:金、银、铜和铝;
其中,优选地,所述金属是铝或铝合金。
5.根据前述权利要求中的任一项所述的校准载玻片,其中,每个金属纳米结构具有在30nm至700nm,优选在60nm至450nm的范围内的横截面尺寸(22);
其中,每个金属纳米结构具有在10nm至1μm,优选在25nm至150nm的范围内的厚度(24);并且/或者
其中,相邻金属纳米结构之间的距离(26)与可见光波长相当,所述距离在100nm至1μm,优选在180nm至650nm的范围内。
6.根据前述权利要求中的任一项所述的校准载玻片,其中,除了所述像素布局(32、34)以外,在所述校准载玻片的所述表面上提供至少一个布局,所述至少一个布局选自包括以下的组:
-单层的着色微珠;以及
-分辨率和失真测试目标。
7.根据前述权利要求中的任一项所述的校准载玻片,其中,所述金属纳米结构被布置为产生等离子体共振,所述等离子体共振允许吸收激发波长处的光以产生用于生成荧光图像的光致发光和/或荧光;并且
其中,所述荧光图像包括为校准荧光显微镜而提供的多个像素强度值。
8.一种校准系统(100),包括:
-扫描显微镜(36);以及
-根据前述权利要求中的一项所述的校准载玻片;
其中,所述扫描显微镜包括:
-光源(38);以及
-光探测器(42);
其中,所述光源和所述光探测器被布置在光路(44)中;
其中,在校准中,所述校准载玻片被布置在所述光源与所述光探测器之间的所述光路中;
其中,所述光源被配置为提供照射所述校准载玻片以产生用于生成彩色图像的等离子体共振的光;并且
其中,所述光探测器被配置为探测通过所述校准载玻片的光以采集所述彩色图像的图像数据作为用于校准目的的校准测试数据。
9.根据权利要求8所述的系统,其中,所述校准系统还被提供有校准设备(48),所述校准设备包括:
-存储单元(50);以及
-处理单元(52);
其中,所述存储单元被配置为存储预定标准校准数据;
其中,所述处理单元被配置为比较所采集的校准测试数据与所存储的预定标准校准数据以生成颜色校正曲线;并且
其中,所述颜色校正曲线用于校正利用所述扫描显微镜获得的病理学样本的病理学图像数据的颜色和/或分辨率。
10.根据权利要求8或9所述的系统,其中,除了所述像素布局以外,在所述校准载玻片的所述表面上提供至少一个布局,所述至少一个布局选自包括以下的组:单层的着色微珠,以及分辨率和失真测试目标;
其中,所述光探测器被配置为采集所述至少一个布局的图像数据作为另外的校准测试数据;
其中,所述存储单元被配置为存储所述至少一个布局的另外的预定标准校准数据;
其中,所述处理单元被配置为比较所采集的另外的校准测试数据与所存储的另外的预定标准校准数据以用于校准所述扫描显微镜的参数;并且
其中,所述参数选自包括以下的组:
-所述扫描显微镜的聚焦质量;
-分辨率和拼接伪影。
11.根据权利要求8至10中的任一项所述的系统,其中,所述校准载玻片被永久地安装在所述扫描显微镜上。
12.一种用于校准扫描显微镜的方法(200),所述扫描显微镜包括被布置在光路中的光源和光探测器,所述方法包括以下步骤:
a)利用来自所述光源的光朝向所述光探测器照射(210)校准载玻片;
其中,所述校准载玻片被布置在所述光路中;
其中,所述校准载玻片包括衬底和像素布局,所述像素布局包括被布置在所述衬底的表面上的多个间隔开的金属纳米结构,其中,所述金属纳米结构被布置为产生等离子体共振;并且
其中,照射所述校准载玻片的光产生等离子体共振,以用于生成包括用于校准扫描显微镜的多个校准颜色值的彩色图像;
b)检测(220)通过所述校准载玻片的光并采集所述彩色图像的图像数据作为校准测试数据;并且
c)使用(230)所述校准测试数据以用于所述扫描显微镜的校准目的。
13.根据权利要求12所述的方法,其中,所述方法的步骤c)还包括以下子步骤:
c1)提供(232)预定标准校准数据;
c2)比较(234)所获得的校准测试数据与所述预定标准校准数据以生成颜色校正曲线;并且
c3)通过使用所述颜色校正曲线来校正(236)利用所述扫描显微镜获得的病理学样本的病理学图像数据的颜色和/或分辨率。
14.根据权利要求12或13所述的方法,其中,除了所述像素布局以外,在所述校准载玻片的所述表面上提供至少一个布局,所述至少一个布局选自包括以下的组:单层的着色微珠,以及分辨率和失真测试目标;并且
其中,所述方法还包括以下步骤:
d)采集(240)所述至少一个布局的图像数据作为另外的校准测试数据;
e)提供(250)所述至少一个布局的另外的预定标准校准数据;并且
f)比较(260)所采集的另外的校准测试数据与所存储的另外的预定标准校准数据以用于校准所述扫描显微镜的参数;
其中,所述参数选自包括以下的组:
-所述扫描显微镜的聚焦质量;以及
-分辨率和拼接伪影。
15.一种制造具有多个布局的校准载玻片的方法(300),所述多个布局包括:具有被布置在衬底的表面上的多个间隔开的金属纳米结构的像素布局、单层的着色微珠,以及分辨率和失真测试目标,所述方法包括以下步骤:
aa)在形成显微镜载玻片的衬底上沉积(302)单层的着色微珠;
bb)在形成两个盖玻片的两个不同衬底上沉积(304)像素布局以及分辨率和失真测试目标;并且
cc)在所述显微镜载玻片上组装(306)两个盖玻片以形成校准载玻片。
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