CN108300723A - 应用于筛选生物被膜抑制剂的新型报告基因系统 - Google Patents
应用于筛选生物被膜抑制剂的新型报告基因系统 Download PDFInfo
- Publication number
- CN108300723A CN108300723A CN201810043945.XA CN201810043945A CN108300723A CN 108300723 A CN108300723 A CN 108300723A CN 201810043945 A CN201810043945 A CN 201810043945A CN 108300723 A CN108300723 A CN 108300723A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- biofilm
- gene
- bsra
- genes
- screening
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000012216 screening Methods 0.000 title claims abstract description 18
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 title claims abstract description 10
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 95
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims abstract description 16
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 15
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 claims description 14
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 13
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 13
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 12
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 12
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 10
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims description 8
- 230000029087 digestion Effects 0.000 claims description 6
- 230000008859 change Effects 0.000 claims description 5
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 4
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 abstract description 37
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 abstract description 34
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 abstract description 31
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 abstract description 26
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 abstract description 13
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 abstract description 10
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 abstract description 9
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 abstract description 7
- 238000012545 processing Methods 0.000 abstract description 7
- 208000037581 Persistent Infection Diseases 0.000 abstract description 6
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 abstract description 5
- 230000004913 activation Effects 0.000 abstract description 2
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 21
- 238000000034 method Methods 0.000 description 15
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 13
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 12
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 11
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 10
- 239000003471 mutagenic agent Substances 0.000 description 10
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 10
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 9
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 9
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 8
- 101150113943 algD gene Proteins 0.000 description 7
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 7
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 7
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 101100361766 Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) algU gene Proteins 0.000 description 6
- 230000005611 electricity Effects 0.000 description 6
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 6
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 6
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 6
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 6
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 6
- 238000011160 research Methods 0.000 description 6
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 6
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 5
- 206010027336 Menstruation delayed Diseases 0.000 description 5
- 229920000615 alginic acid Polymers 0.000 description 5
- 235000010443 alginic acid Nutrition 0.000 description 5
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 5
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 5
- 238000007852 inverse PCR Methods 0.000 description 5
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 5
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 5
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 5
- 101100138645 Bacillus licheniformis pelA gene Proteins 0.000 description 4
- 101100192384 Escherichia coli (strain K12) manY gene Proteins 0.000 description 4
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 4
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 4
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 4
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 4
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 4
- 238000003235 crystal violet staining Methods 0.000 description 4
- 238000013461 design Methods 0.000 description 4
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 4
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 4
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 4
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 4
- 230000009456 molecular mechanism Effects 0.000 description 4
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 4
- 101150044611 pel gene Proteins 0.000 description 4
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 4
- FHVDTGUDJYJELY-UHFFFAOYSA-N 6-{[2-carboxy-4,5-dihydroxy-6-(phosphanyloxy)oxan-3-yl]oxy}-4,5-dihydroxy-3-phosphanyloxane-2-carboxylic acid Chemical compound O1C(C(O)=O)C(P)C(O)C(O)C1OC1C(C(O)=O)OC(OP)C(O)C1O FHVDTGUDJYJELY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229940072056 alginate Drugs 0.000 description 3
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 3
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 3
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 description 3
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 3
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 3
- 230000032770 biofilm formation Effects 0.000 description 3
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 3
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 3
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 3
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 3
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 3
- FRXSZNDVFUDTIR-UHFFFAOYSA-N 6-methoxy-1,2,3,4-tetrahydroquinoline Chemical compound N1CCCC2=CC(OC)=CC=C21 FRXSZNDVFUDTIR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000052510 DNA-Binding Proteins Human genes 0.000 description 2
- 101710096438 DNA-binding protein Proteins 0.000 description 2
- 208000008589 Obesity Diseases 0.000 description 2
- 241001620960 Pseudomonas aeruginosa PAK Species 0.000 description 2
- 108700005078 Synthetic Genes Proteins 0.000 description 2
- 241000255588 Tephritidae Species 0.000 description 2
- 101150029220 Tprg1l gene Proteins 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 238000007622 bioinformatic analysis Methods 0.000 description 2
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 2
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 2
- 230000036541 health Effects 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 2
- PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N isoamylol Chemical compound CC(C)CCO PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- 235000020824 obesity Nutrition 0.000 description 2
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 2
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 2
- 230000008844 regulatory mechanism Effects 0.000 description 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 2
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 2
- 101150029062 15 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150112516 ALG8 gene Proteins 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 108020004256 Beta-lactamase Proteins 0.000 description 1
- 206010011409 Cross infection Diseases 0.000 description 1
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 1
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 241000204031 Mycoplasma Species 0.000 description 1
- 206010029803 Nosocomial infection Diseases 0.000 description 1
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 1
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 1
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010013381 Porins Proteins 0.000 description 1
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 229960000583 acetic acid Drugs 0.000 description 1
- 230000003044 adaptive effect Effects 0.000 description 1
- 239000000443 aerosol Substances 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 101150099072 alg44 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150049633 algE gene Proteins 0.000 description 1
- 101150104595 algF gene Proteins 0.000 description 1
- 101150047145 algG gene Proteins 0.000 description 1
- 101150067700 algI gene Proteins 0.000 description 1
- 101150065963 algK gene Proteins 0.000 description 1
- 101150001652 algL gene Proteins 0.000 description 1
- 101150093480 algU gene Proteins 0.000 description 1
- 101150056298 algX gene Proteins 0.000 description 1
- 239000002647 aminoglycoside antibiotic agent Substances 0.000 description 1
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000008485 antagonism Effects 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 230000000845 anti-microbial effect Effects 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- 210000001367 artery Anatomy 0.000 description 1
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 235000015278 beef Nutrition 0.000 description 1
- 230000006399 behavior Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- NWFNSTOSIVLCJA-UHFFFAOYSA-L copper;diacetate;hydrate Chemical compound O.[Cu+2].CC([O-])=O.CC([O-])=O NWFNSTOSIVLCJA-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- ZXJXZNDDNMQXFV-UHFFFAOYSA-M crystal violet Chemical compound [Cl-].C1=CC(N(C)C)=CC=C1[C+](C=1C=CC(=CC=1)N(C)C)C1=CC=C(N(C)C)C=C1 ZXJXZNDDNMQXFV-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000002425 crystallisation Methods 0.000 description 1
- 230000008025 crystallization Effects 0.000 description 1
- 238000005034 decoration Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 238000004821 distillation Methods 0.000 description 1
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 1
- 238000010195 expression analysis Methods 0.000 description 1
- 210000002744 extracellular matrix Anatomy 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- 238000011010 flushing procedure Methods 0.000 description 1
- 235000021393 food security Nutrition 0.000 description 1
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 1
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002070 germicidal effect Effects 0.000 description 1
- 239000012362 glacial acetic acid Substances 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 101150005437 mucA gene Proteins 0.000 description 1
- 101150069935 mucB gene Proteins 0.000 description 1
- -1 mucC Proteins 0.000 description 1
- 101150071635 mucD gene Proteins 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 1
- 230000032696 parturition Effects 0.000 description 1
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 1
- 230000035699 permeability Effects 0.000 description 1
- 238000002205 phenol-chloroform extraction Methods 0.000 description 1
- 102000007739 porin activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- LISFMEBWQUVKPJ-UHFFFAOYSA-N quinolin-2-ol Chemical compound C1=CC=C2NC(=O)C=CC2=C1 LISFMEBWQUVKPJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 238000004064 recycling Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000008261 resistance mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000003068 static effect Effects 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
- C07K14/21—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Pseudomonadaceae (F)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6897—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids involving reporter genes operably linked to promoters
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明涉及一种应用于筛选生物被膜抑制剂的新型报告基因系统,本申请证明bsrA基因能够抑制铜绿假单胞菌生物被膜的形成,其编码基因在细菌中过表达,能够显著抑制生物被膜的产量。因此,以该基因为标记,构建一种新型报告基因系统,筛选能够激活标记基因表达的小分子化合物,后者能够从基因水平对生物被膜的合成进行抑制,有助于解决由生物被膜引起的持续性感染、抗生素耐药性,同时通过研究该基因抑制生物被膜形成的机制能过更好的解决食品加工行业中微生物生物膜形成机制以及生物被膜的抑制和去除问题。
Description
技术领域
本发明属于生物工程领域,具体地,本发明涉及一种调节基因在抑制微生物的生物被膜(biofilm)中的应用。通过构建融合报告基因系统筛选一种小分子化合物激活筛选标记基因,使标记基因的表达提高,从而能够抑制生物被膜合成。对于由铜绿假单胞菌引起多重耐药性及生物被膜引发食源性疾病方面的具有重要意义。
背景技术
目前院内感染治疗方法主要是应用抗生素杀死或者抑制病原菌的生长。但是铜绿假单胞菌自身具有一些耐药机制,包括低渗透性的外膜、不同外排泵组成型基因的表达和抗生素失活酶的产生(如头孢菌素酶)等,同时也能够获得一些抗性基因(如β-内酰胺酶的基因、编码失活氨基糖苷类抗生素的酶的基因以及修饰靶位的基因)、降低表达一些孔蛋白或者突变喹诺酮靶位基因等,所以铜绿假单胞菌对临床应用的抗生素都产生了耐药性,而且耐药程度日趋严重,多重耐药已成为当今医药界的一个世界性难题。美国传染病协会抗菌工作组(Antimicrobial Availability Task Force of the Infectious DiseasesSociety of America)重点考虑提高耐药菌株的治疗水平。世界卫生组织还设立了专门机构来协调各国对细菌耐药性的研究与监测。
生物被膜作为一种高度组织群体,具有高度的功能性、结构性和协调性。生物被膜菌生物学特性与浮游菌具有很大的区别,较浮游菌相比生物被膜菌的耐药性明显增加,有更强的环境适应能力;因此,临床上与细菌生物被膜有关的许多感染性疾病现在都难以治愈。目前,国内外研究表明导致生物被膜菌耐药的因素很多,主要包括:①在生物被膜形成的早期,特定的细菌基因表达使得生物被膜菌耐药性较浮游菌明显增加;②生物被膜菌分泌大量胞外基质,这些基质作为屏障,降低了抗生素的渗透性,导致生物被膜菌不易被杀灭;③成熟的生物被膜生成后,自内向外菌体密度增加,形成了氧浓度和营养成分梯度,生物被膜菌的生长速度和代谢活性减慢;④表型变异的产生使生物被膜内细菌对多种抗生素产生耐药[8]。所以,生物被膜在由铜绿假单胞菌引起的持续性感染以及慢性感染中发挥重要作用,如何有效抑制生物被膜的形成对治疗铜绿假单胞菌感染起重要作用。
食品安全是卫生部门十分重视的问题,由微生物引起的污染问题繁多。生物被膜的形成对工业环境具有严重的影响,一方面,生物被膜能引起一系列的工业运作问题,例如,降低热量传递、堵塞管,堵塞过滤器,并造成表面损坏。另一方面,生物被膜极易形成污染源,特别是在食品工业中,细菌附着到食物接触面,为细菌污染提供了一个及其丰富的病原体污染源,对人类健康带来不可避免的风险。对食品工业中生物被膜的微生物组成分析表明,混合生物被膜包括病原菌和腐败菌,这些微生物可以通过以下几个来源,如水、生冷类食品和动物,散布于食品工业并长时间吸附在设备表面。因此,有效的抑制生物被膜的形成对食品安全问题也起着十分重要的作用。
本发明通过构建Tn5G转座子文库发现一株生物被膜产量增加的突变株,并通过反向PCR鉴定Tn5G插入位点,分析其突变基因,并利用互补实验证实了该基因调节生物被膜合成。通过该基因构建一种基因报告系统筛选出小分子化合物,这种小分子化合物能够激活标记基因的表达,从而能够从基因水平对生物被膜的合成阶段进行抑制,有助于解决由生物被膜引起的持续性感染、抗生素耐药性、以及由生物被膜引起的食源性感染等问题。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是提供能够抑制铜绿假单胞菌生物被膜合成的基因,以该基因作为筛选标记,筛选能够促进该基因表达的小分子化合物,通过该基因表达的增加从而使合成生物被膜的能力降低。本发明通过对生物被膜合成相关基因表达的研究,能够更好地了解bsrA与生物被膜合成相关基因相互作用的分子机制,为解决由生物被膜引起的高度耐药性提供理论依据。同时,食品工业中,微生物生物被膜引起食品污染,引发食源性疾病,通过研究该基因抑制生物被膜形成的机制能过更好的解决食品加工行业中微生物生物膜形成机制以及生物被膜的抑制和去除问题。
本发明的技术方案为:
bsrA基因作为筛选生物被膜抑制剂标记基因的应用,所述bsrA基因如序列1所示。
包含bsrA基因的报告基因系统。
而且,所述报告基因为LacZ基因。
包含bsrA基因的报告基因系统作为筛选生物被膜抑制剂的应用。
包含bsrA基因的报告基因系统作为筛选破坏或抑制生物被膜制剂的标记的应用。
包含权利要求1所述基因的载体或微生物。
bsrA基因作为标记生物被膜改变的应用。
bsrA基因作为在检测中药和/或天然药物和/或化合物药物对生物被膜抑制剂活性标记的应用。
本发明的优点和技术效果如下:
本发明主要鉴定了抑制铜绿假单胞菌生物被膜合成相关基因表达的基因。通过构建菌株PAK-AR2的转座子Tn5G突变文库,获得一株生物被膜增加的突变株将其命名为P2-7,通过测其生物被膜发现,其形成生物被膜的能力显著性增加。反向PCR鉴定其突变基因为PA2121,通过生物信息学分析发现PA2121编码一DNA结合蛋白,属于LysR family家族调节因子。构建携带有PA2121基因的重组质粒pXJ1601,将其电转入突变株P2-7中,得到P2-7/pXJ1601。通过结晶紫染色法分析,PA2121突变后其形成生物被膜的能力增加,通过测定P2-7/pXJ1601的生物被膜发现其形成生物被膜的能力回复到野生型状态。因此得到结论突变基因PA2121抑制生物被膜的合成,将其命名为brsA(biofilm synthesis repressorA)。
为了分析调节因子bsrA对生物被膜的调节机制。本发明构建了三种主要成分的四个操纵子Pel、Psl、algD、algU启动子的融合报告基因,通过接合转移的方法将携带有三种成分的融合报告基因分别转入野生型PAK-AR2、突变株P2-7中,通过测定编码β-半乳糖苷酶的活力发现,Psl、Pel、algU、algD这四种操纵子启动子的表达水平在P2-7和PAK-AR2中存在显著性差异。所以,得出结论,突变株P2-7中胞外多糖Pel、Psl、alginate的产量比野生型PAK-AR2高。同时,为了分析基因bsrA对生物被膜的抑制作用,将构建的bsrA过表达质粒导入生物被膜产量高的菌株中,分别是铜绿假单胞菌PAK、临床菌株TJ45、TJ54,发现bsrA过表达后这三株菌生物被膜的产量下降。从而验证了该基因对生物被膜的抑制作用。通过对生物被膜早晚期以及bsrA在生物被膜早期、晚期的表达情况分析发现,在早期生物被膜开始增长时,bsrA的表达水平高,当生物被膜处于较低增长水平时,bsrA的表达水平也处于较低水平。所以,通过以上实验验证并证明了bsrA抑制生物被膜的形成及其调节机制。鉴于该基因的抑制作用,本申请以该基作为筛选标记构建新型报告基因系统,筛选小分子化合物通过促进或激活该标记基因的表达来抑制生物被膜的形成。
本发明涉及一种铜绿假单胞菌基因功能及其应用,铜绿假单胞菌的基因bsrA是生物被膜合成过程的调节基因,该转录调节因子能够抑制生物被膜的合成,可用于合成促进该基因表达的药物,从而抑制生物被膜合成而降低抗生素耐药性的应用。
本发明通过对生物被膜合成相关基因表达的研究,能够更好地理解bsrA与生物被膜合成相关基因相互作用的分子机制,为解决抗生素耐药性提供理论依据。同时,食品工业中,微生物生物被膜引起食品污染,引发食源性疾病,通过研究该基因抑制生物被膜形成的机制能过更好的解决食品加工行业中微生物生物膜形成机制以及生物被膜的抑制和去除问题。
本申请的重要意义在于:该转录调节因子能够抑制生物被膜的合成,通过合成促进该基因表达的药物或者小分子化合物,从而抑制生物被膜合成而降低抗生素耐药性。本发明通过对生物被膜合成相关基因表达的研究,能够更好地了解bsrA与生物被膜合成相关基因相互作用的分子机制,为解决由生物被膜引起的高度耐药性提供理论依据。同时,食品工业中,微生物生物被膜引起食品污染,引发食源性疾病,通过研究该基因抑制生物被膜形成的机制能过更好的解决食品加工行业中微生物生物膜形成机制以及生物被膜的抑制和去除问题。
附图说明
图1为生物被膜生产能力分析图;
图2生物被膜合成相关基因Psl、Pel、algU、algD这四个操纵子启动子的表达水平示意图,其中,图2a为12h的、图2b为24h的,图2c为36h的,图2d为48的;
图3生物被膜早晚期图;
图4bsrA表达的时间曲线分析图;
图5过表达bsrA对生物被膜的抑制作用。
具体实施方式
以下所述,仅为本发明的较佳实施例而已,并非对本发明作任何形式上的限制;凡本行业的普通技术人员均可按以上所述而顺畅地实施本发明;但是,凡熟悉本专业的技术人员在不脱离本发明技术方案范围内,可利用以上所揭示的技术内容而作出的些许更动、修饰与演变的等同变化,均为本发明的等效实施例。
本发明将基因bsrA作为标记基因,构建基因报告系统来筛选促进标记基因表达的小分子化合物的应用。
本发明通过构建菌株PAK-AR2的转座子Tn5G突变文库,获得生物被膜阳性突变株。反向PCR鉴定突变株的Tn5G插入位点,并且通过blastP分析出突变基因。构建基因的表达载体,对相应突变株进行基因功能回复实验,用实验证明该基因是能够抑制生物被膜合成相关基因的表达。该基因可以作为筛选抑制生物被膜合成的小分子化合物的依据,进一步筛选出治疗和防治由生物被膜引起的持续性感染的药物以及能够应用于食品工业中的生物被膜抑制剂。
本申请通过构建Tn5G转座子文库发现一株生物被膜产量增加的突变株,并通过反向PCR鉴定Tn5G插入位点,分析其突变基因,并利用互补实验证实了该基因调节生物被膜合成。该基因的发现有助于从基因水平解决由于生物被膜引起的持续性感染、抗生素耐药性、以及由生物被膜引起的食源性感染。
本申请用于研究该基因的方法具体步骤如下:
1、材料和方法
菌株和质粒:实验所用菌株及质粒,具体见表1所示,实验所涉及的引物具体见表2所示。
2、转座子文库构建
参照实验方法描述(见[Kagami Y,Ratliff M,Surber M,etal.TyPeII Proteinseeretion by Pseudomonas aeruginosa:genetiesu P Pression of a eonditionalmutationinthe Like eomponentXepT bythe eytoplasmie eomponent XepR[J〕.Moleeularmier obiology,1998,27(1):221一233])并做了相应的修改构建耐受噬菌体K5的突变株文库),
具体如下:将供体菌菌株E.coli/PRK2013Tn5G和受体菌菌株PAK-AR2过夜培养,过夜培养菌液转接到加有相应抗生素的液体培养基扩大培养,即E.coli/PRK2013Tn5G转接至含有庆大霉素(10μg/mL)液体LB培养基中,PAK-AR2转接至含有氨苄青霉素(10μg/mL)的液体LB培养基中,培养10h。菌液以4000rpm/min离心收集菌体,分别用新鲜LB液体培养基洗涤E.coli/PRK2013Tn5G和PAK-AR2菌体3次,以去除残留的抗生素。最后将E.coli/PRK2013Tn5G和PAK-AR2两种菌泥混匀,加入牛肉膏蛋白脉培养基平板,37℃培养9h。用l mL液体LB重悬菌泥,加入5mL含有庆大霉素(100μg/mL)、氨苄青霉素(100μg/mL)的噬菌体K5纯裂解液,并置于37℃摇床以220rpm培养4h,以裂解对噬菌体K5敏感的突变株,离心收集菌体,涂于含有庆大霉素(100μg/mL)、氨苄青霉素(100μg/mL)的LB平板,37℃培养12h。对平板上的单菌落进行纯化,对纯化后的单菌落使用双层平板法进一步验证突变株对K5的敏感性。
3、反向PCR鉴定Tn5G插入位点
通过苯酚-氯仿抽提法取突变株P2-7的基因组DNA,使用限制性内切酶TaqI酶切基因组DNA,65℃处理4h,用苯酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)纯化回收酶切产物,用T4DNA连接酶将酶切产物在16℃处理12h,使DNA片段发生自身环化,以连接产物为模板,根据Tn5G的末端反向重复序列设计一对引物OTn1(5’GATCCTGGAAAACGGGAAAG 3’)和OTn2(5’CCATCTCATCAGAGGGTAGT 3’),反向PCR鉴定突变株P2-7基因组内转座子的插入位点,并通过BLASTN分析插入位点所在的基因。
4、互补实验(Complementation experiment)
我们使用突变基因上游序列1000bp在启动子预测网站(http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html)预测突变基因的启动子区,并且以预测启动子上游500bp序列和终止密码子下游500bp序列利用Primer Premier 5设计引物,用来扩增突变基因。根据载体pUCP20存在的酶切位点和突变基因的序列选择两种限制性内切酶。以铜绿假单胞菌PAK的基因组DNA为模板,扩增目的基因,回收纯化基因,并用酶切位点对应的限制性内切酶酶切目的基因和pUCP20质粒,回收纯化酶切产物,在T4DNA连接酶作用下将基因和载体pUCP20连接,转化大肠杆菌DH5α,筛选鉴定阳性转化子。将验证正确的重组质粒通过电转化转入突变株P2-7中,用双层平板方法检测转化子是否恢复了对噬菌体的敏感性;用结晶紫染色法检测转化子形成生物被膜的能力是否恢复到野生型状态。
5、生物被膜的测定
首先将过夜培养的菌液按10%的接种量转接到每孔含有180μL新鲜1/3LB的96孔板中,37℃静置培养48h。将96孔板倒置,轻轻甩出孔中菌液,将96孔板缓缓放入静止的蒸馏水中,甩出孔中蒸馏水,以此方法冲洗三次,将孔中多余的蒸馏水甩干,加入200μL的0.1%的结晶紫溶液,染色15min后将孔中的结晶紫甩出,并用蒸馏水冲洗3次,洗去没有结合的结晶紫,甩干孔中的蒸馏水,加入200μL的无水乙醇,然后静置15min充分洗脱生物被膜上结合的结晶紫,将96孔板中溶液转移至新的96孔板中,测定OD595吸光值。
6、转录融合报告基因构建及酶活测定
选择生物被膜合成相关操纵子psl、pel、algD、algU,通过fruitfly网站预测四个操纵子基因启动子区域,并分别设计引物扩增启动子区域片段,启动子区域上游用EcoRI酶切位点,下游用BamHI酶切位点,将PCR扩增片段与pDN19lacΩ连接转化构建融合报告基因。将构建好的重组质粒通过电转的方式导入到野生菌株PAK-AR2、突变株P2-7以及中。按照融合报告基因酶活测定方法,测定四个融合报告基因在两株菌中的β-半乳糖苷酶活性。将构建好的菌株接到5mL LB中37℃振荡过夜培养,按3%的接种量转接过夜培养菌液到5mL新鲜LB中,培养至OD600=0.6左右,按照标准的酶活测定方法测定。每个菌株测定三次作为平行。
7、生物被膜早晚期的测定
将菌株AR2、P2-7接到5mL LB中37℃振荡过夜培养,按10%的转接量转接过夜菌液到含有1/3LB的96孔板中。静置于37℃培养中,每隔一段时间结晶紫染色法测生物被膜直到测至48h为止。即轻轻倒掉孔中的菌液,并用水反复冲洗两次自然晾干15min。每孔加入200ul的1%结晶紫—3%冰醋酸水溶液染色15min,用水反复冲洗并甩干,每孔加入200μL95%的乙醇,充分溶解结晶紫,并测定波长OD595时结晶紫溶液的吸光度。
8、bsrA表达的时间曲线
设计引物扩增bsrA启动子区域片段,启动子区域上游用EcoRI酶切位点,下游用BamHI酶切位点,将PCR扩增片段与pDN19lacΩ连接转化构建融合报告基因。将构建好的重组质粒通过电转的方式导入到野生菌株PAK-AR2中。按照融合报告基因酶活测定方法,测定其在48h内酶活的变化情况。
表1 菌株和质粒说明
Apr,氨节青霉素抗性;Gmr,庆大霉素抗性;Spr,Smr分别表示壮观霉素和链霉素
表2 引物序列说明
下划线碱基表示引物酶切位点
9、结果和讨论
(1)生物被膜的测定
筛选得到一株耐受噬菌体K5的突变株,将其命名为P2-7,反向PCR鉴定其突变基因为bsrA,通过生物信息学分析发现bsrA编码一DNA结合蛋白,属于LysR family家族调节因子。构建携带有bsrA基因的重组质粒pXJ1601,将其电转入突变株P2-7中,得到P2-7/pXJ1601,通过噬菌体敏感实验观察到P2-7/pXJ1601没有恢复对噬菌体K5敏感性。通过结晶紫染色法分析,bsrA突变后其形成生物被膜的能力增加,构建重组质粒pXJ1601,将其电转入突变株P2-7中,得到回复株P2-7/pXJ1601,通过测定P2-7/pXJ1601的生物被膜发现其形成生物被膜的能力回复到野生型状态(图1)。
(2)bsrA与生物被膜合成相关基因的表达相关
铜绿假单胞菌在生物被膜形成过程中主要产生三种胞外多糖,分别是藻酸盐(alginate)、Pel(Pellicle Formation)、Psl(Polysaccharide Synthesis Locus),Psl操纵子包括15个基因(pslA–pslO PA2231-PA2245),这15个基因编码的蛋白用于合成胞外多糖Psl,Pel操纵子包含7个基因(pelA-pelF,PA3058-PA3064),这7个基因用于合成胞外多糖Pel。藻酸盐主要由algD基因簇(algD alg8 alg44 algK algE algG algX algL algI algFalgA)中的基因编码的酶合成的,同时algU基因簇(algU、mucA、mucB、mucC、mucD)中的基因主要用于调节硅藻酸盐的合成。为了分析生物被膜这三种主要成分的合成基因在P2-7中的表达情况,将三种主要成分的四个操纵子的启动子构建融合报告基因,通过接合转移的方法将携带有三种成分的融合报告基因分别转入野生型PAK-AR2、突变株P2-7、中,通过测定在12h、24h、36h、48h时编码β-半乳糖苷酶的活力发现,Psl、Pel、algU、algD这四个操纵子启动子的表达水平在P2-7和PAK-AE2中存在显著性差异(图2a为12h的、图2b为24h的,图2c为36h的,图2d为48的)。所以,得出结论,突变株P2-7中胞外多糖Pel、Psl、alginate的产量比野生型PAK-AR2高,P2-7中三种胞外多糖均增加。
(3)过表达基因bsrA抑制生物被膜的合成
与野生PAK-AR2相比突变株P2-7的生物被膜的能力增加,推测突变基因bsrA可能抑制生物被膜的形成。为了验证bsrA对生物被膜确实存在一定的抑制作用,将bsrA在PAK和临床菌株TJ45、TJ54中过表达后,检测其形成生物被膜的能力是否下降。将bsrA在PAK、TJ45、TI54中过表达后,PAK、TJ45、TI54形成生物被膜的能力降低(图3)。由此推断bsrA对生物被膜的形成起到一定的抑制作用。
(4)bsrA对早期生物被膜的影响。
有研究表明,Pel、Psl在生物被膜早期微型菌落开始形成时便产生,并且Pel、Psl对生物被膜成熟期蘑菇型大菌落结构的形成起重要作用。实验发现与野生AR2相比P2-7形成生物被膜的能力增加,为了研究bsrA对生物被膜早晚期的影响作用。通过结晶紫染色法分别测6-48h内P2-7与AR2生物被膜的变化情况,发现在第10h时P2-7形成生物被膜的能力就显著性高于AR2(图4),所以,推测bsrA对生物被膜早期有影响。
(5)bsrA表达的时间曲线
将构建的bsrA启动子的融合报告基因导入PAK-AR2后,分别测其3h、6h、8h、10h、12h、24h、48h的酶活发现,在生物被膜形成初期,生物被膜开始增多时bsrA的表达水平明显增高,当生物被膜的增长缓慢时,bsrA的表达水平也处于较低水平(图5)。
(6)构建bsrA融合报告基因系统及筛选化合物
通过fruitfly网站预测bsrA启动子区域,并分别设计引物扩增启动子区域片段,启动子区域上游用EcoRI酶切位点,下游用BamHI酶切位点,将PCR扩增片段与质粒pDN19lacΩ连接转化构建融合报告基因。将构建好的重组质粒通过电转的方式导入到野生菌株PAK-AR2中。将一些小分子化合物按照一定的浓度加入液体LB中与含有bsrA融合报告基因系统的PAK-AR2菌株共同培养,每间隔一段时间测菌株酶活情况,通过测定的酶活高低来反应bsrA基因表达水平的高低,以此来筛选能够影响bsrA表达的小分子化合物。
10、本申请的重要意义
人们发现生长于生物被膜中的细菌,无论其形态结构、生理生化特性、对抗菌药物的敏感性等都与普通浮游生长的细菌显著不同,致病特点也不同。生物被膜可以保护细菌逃逸宿主免疫和抗菌药物的杀伤作用。即使抗菌药物达到对该菌MIC的100倍以上,生物被膜中的细菌仍能存活而不被杀灭,从而产生对抗菌药物的高度耐药性,导致临床感染的难治性。
此外,有了生物膜的保护,细菌就能抵抗清洗和消毒因子,降低清洗和消毒的效果,给食品生产加工企业污染埋下隐患。食品工业中食源性病原菌和腐败菌形成的生物被膜不仅可以通过残留、接触的方式引起各种污染,还可通过散播微生物或微生物团形成的气溶胶的方式污染整个生产环境,而且这种污染是随机性的,在生产过程中隐蔽性强、易被忽视且很难控制和防范。
本申请中发现的基因bsrA能够从基因水平抑制生物被膜的合成,该基因通过抑制生物被膜合成相关基因的表达,在生物被膜形成初期时便对生物被膜合成基因Pel、Psl的表达起到抑制作用。从而使最终生物被膜的产量显著性降低。该转录调节因子能够抑制生物被膜的合成,通过合成促进该基因表达的药物或者小分子化合物,从而抑制生物被膜合成而降低抗生素耐药性。本发明通过对生物被膜合成相关基因表达的研究,能够更好地了解bsrA与生物被膜合成相关基因相互作用的分子机制,为解决由生物被膜引起的高度耐药性提供理论依据。同时,食品工业中,微生物生物被膜引起食品污染,引发食源性疾病,通过研究该基因抑制生物被膜形成的机制能过更好的解决食品加工行业中微生物生物膜形成机制以及生物被膜的抑制和去除问题。
序列1:bsrA序列表
atgaagctgaacttgcagcagctcgacctcaacctgcttctggtcttcgatgccctgatgcgcgaacgcaacctgtcgcgcgcggcgatccgcctgcatc
gcagccagccggcggtgagcaacgccctcgcccgcctgcgcgaacagctcgaccagccgctgttccggcgcgccgccaagggcctggaacccaccgccgc
cgccctcgccctgtacgtgccggtgcgccaggccctgcatctgctgcaggccggccttggctcccaggaaaccttcgatccgcacactgcgcggaccttt
cgcctgacgatgaacgactatgcccagttgcgcctgctgccgggcctggtgacccgcctgaagaccctggccccgcgggtgacgctggaggtacgtcccg
acgaaggcgcctcgatcccggcgcaactggccagcggcgaactcgacctggcgatcgactacctgtacttcgacgagcccgagctggcctaccggccggt
cggcgaggaacgcctggtggtgatcggccggcagggccatccggccttccgcggcggcctcgaccgcgcggcctacgaggccgcgcagcacgtctcgatc
ctgccgcgggtcgggcgcggcagtccgctggagatcgtcctcggctcggccagggtgcagcgccaggtgcaattgctggtgcctcactacctgaccatcc
cggccatcgtcgccagcaccgagctgctcggcaccgtgccacgccgcctggccgagcgcttcgccggcagccatggtttgcaactggcggacgtcccctt
cgagatggccccggtgcaggtcaacctgatctggcatcgccagcaggaagcgacgcccggcctgcaatggctacgcgagcagatcgtgcagatcgaacag ggctga。
Claims (10)
1.bsrA基因作为筛选生物被膜抑制剂标记基因的应用,所述bsrA基因如序列1所示。
2.包含bsrA基因的报告基因系统。
3.根据权利要2所述的包含bsrA基因的报告基因系统,其特征在于:所述报告基因为LacZ基因。
4.根据权利要3所述的包含bsrA基因的报告基因系统,其特征在于:所述bsrA基因与LacZ基因经过EcoRI酶和BamHI酶切后连接。
5.权利要求2或3所述的包含bsrA基因的报告基因系统作为筛选生物被膜抑制剂的应用。
6.权利要求2或3所述的包含bsrA基因的报告基因系统作为筛选破坏或抑制生物被膜化合物的标记的应用。
7.权利要求2或3所述的包含bsrA基因的报告基因系统作为筛选破坏或抑制生物被膜制剂的标记的应用。
8.包含权利要求1所述基因的载体或微生物。
9.bsrA基因作为标记生物被膜改变的应用。
10.bsrA基因作为在检测中药和/或天然药物和/或化合物药物对生物被膜抑制剂活性标记的应用。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201810043945.XA CN108300723B (zh) | 2018-01-17 | 2018-01-17 | 应用于筛选生物被膜抑制剂的报告基因系统 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201810043945.XA CN108300723B (zh) | 2018-01-17 | 2018-01-17 | 应用于筛选生物被膜抑制剂的报告基因系统 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN108300723A true CN108300723A (zh) | 2018-07-20 |
CN108300723B CN108300723B (zh) | 2022-04-08 |
Family
ID=62865683
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201810043945.XA Expired - Fee Related CN108300723B (zh) | 2018-01-17 | 2018-01-17 | 应用于筛选生物被膜抑制剂的报告基因系统 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN108300723B (zh) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111849848A (zh) * | 2020-07-23 | 2020-10-30 | 江南大学 | 一种抗噬菌体的大肠杆菌底盘细胞的构建及应用 |
CN115029366A (zh) * | 2022-06-11 | 2022-09-09 | 江苏科技大学 | 一种基于重组大肠杆菌高产生物被膜的方法及其在催化黄酮苷类化合物上的应用 |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2006102255A1 (en) * | 2005-03-21 | 2006-09-28 | Sequoia Sciences, Inc. | Inhibition of biofilm formation |
US7807149B2 (en) * | 2003-07-23 | 2010-10-05 | Biocontrol Limited | Bacteriophage-containing therapeutic agents |
CN103173547A (zh) * | 2013-03-12 | 2013-06-26 | 浙江大学 | 一种检测活细胞内环二鸟苷酸含量的报告系统及其应用 |
CN105400876A (zh) * | 2015-12-03 | 2016-03-16 | 天津科技大学 | 铜绿假单胞菌与噬菌体感染相关基因及应用 |
CN106591419A (zh) * | 2016-12-22 | 2017-04-26 | 南京巨鲨显示科技有限公司 | 一种新型基因工程生物指示剂 |
-
2018
- 2018-01-17 CN CN201810043945.XA patent/CN108300723B/zh not_active Expired - Fee Related
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7807149B2 (en) * | 2003-07-23 | 2010-10-05 | Biocontrol Limited | Bacteriophage-containing therapeutic agents |
WO2006102255A1 (en) * | 2005-03-21 | 2006-09-28 | Sequoia Sciences, Inc. | Inhibition of biofilm formation |
CN103173547A (zh) * | 2013-03-12 | 2013-06-26 | 浙江大学 | 一种检测活细胞内环二鸟苷酸含量的报告系统及其应用 |
CN105400876A (zh) * | 2015-12-03 | 2016-03-16 | 天津科技大学 | 铜绿假单胞菌与噬菌体感染相关基因及应用 |
CN106591419A (zh) * | 2016-12-22 | 2017-04-26 | 南京巨鲨显示科技有限公司 | 一种新型基因工程生物指示剂 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
NCBI: "probable transcriptional regulator [Pseudomonas aeruginosa PAO1]", 《NCBI》 * |
吴国营等: "铜绿假单胞菌主要RND外排泵表达与β-内酰胺类抗生素耐药性的相关性研究", 《临床儿科杂志》 * |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111849848A (zh) * | 2020-07-23 | 2020-10-30 | 江南大学 | 一种抗噬菌体的大肠杆菌底盘细胞的构建及应用 |
CN115029366A (zh) * | 2022-06-11 | 2022-09-09 | 江苏科技大学 | 一种基于重组大肠杆菌高产生物被膜的方法及其在催化黄酮苷类化合物上的应用 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN108300723B (zh) | 2022-04-08 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Cai et al. | Genomic and metabolic traits endow Bacillus velezensis CC09 with a potential biocontrol agent in control of wheat powdery mildew disease | |
Van Tyne et al. | Friend turned foe: evolution of enterococcal virulence and antibiotic resistance | |
Esmaeel et al. | Burkholderia genome mining for nonribosomal peptide synthetases reveals a great potential for novel siderophores and lipopeptides synthesis | |
Nadarasah et al. | Quantitative evaluation of the host-colonizing capabilities of the enteric bacterium Pantoea using plant and insect hosts | |
Slightom et al. | Surface colonization by marine roseobacters: integrating genotype and phenotype | |
Ross et al. | Biosynthesis of antifungal and antibacterial polyketides by Burkholderia gladioli in coculture with Rhizopus microsporus | |
Zaid et al. | Comparative genome analysis reveals phylogenetic identity of Bacillus velezensis HNA3 and genomic insights into its plant growth promotion and biocontrol effects | |
Hasan et al. | The unravelled Enterococcus faecalis zoonotic superbugs: Emerging multiple resistant and virulent lineages isolated from poultry environment | |
Van Hop et al. | Biological control of Xanthomonas oryzae pv. oryzae causing rice bacterial blight disease by Streptomyces toxytricini VN08-A-12, isolated from soil and leaf-litter samples in Vietnam | |
Pedroso et al. | Biofilm and toxin profile: A phenotypic and genotypic characterization of coagulase-negative staphylococci isolated from human bloodstream infections | |
Nakayama et al. | Inhibitory effects of Bacillus probionts on growth and toxin production of Vibrio harveyi pathogens of shrimp | |
El Othmany et al. | Current understanding on adhesion and biofilm development in actinobacteria | |
CN101926829A (zh) | 枯草芽孢杆菌降解细菌群体感应信号及作为抗菌剂的用途 | |
Boluk et al. | Genomic and phenotypic biology of novel strains of Dickeya zeae isolated from pineapple and taro in Hawaii: insights into genome plasticity, pathogenicity, and virulence determinants | |
Murfin et al. | Comparison of Xenorhabdus bovienii bacterial strain genomes reveals diversity in symbiotic functions | |
CN108300723A (zh) | 应用于筛选生物被膜抑制剂的新型报告基因系统 | |
Le Han et al. | Whole-genome analysis and secondary metabolites production of a new strain Brevibacillus halotolerans 7WMA2: A potential biocontrol agent against fungal pathogens | |
Rahmani et al. | Drug resistance in Vibrio cholerae strains isolated from clinical specimens | |
CN109706111A (zh) | 铜绿假单胞菌群体感应体系抑制剂的快速筛选模型及其构建方法 | |
CN106632606B (zh) | 抗菌脂肽bacaucin衍生物及其在抑制细菌感染中的应用 | |
US9057089B2 (en) | Methods for natural product optimization | |
Wang et al. | Whole-genome analysis of the benzoic acid-degrading bacterium Bacillus halotolerans B28 to reveal its phytoprobiotic effects | |
Özkaya et al. | Marine fungi against aquaculture pathogens and induction of the activity via co‐Culture | |
Wang et al. | Hosts manipulate lifestyle switch and pathogenicity heterogeneity of opportunistic pathogens in the single-cell resolution | |
Agarwal et al. | Isolation of Pseudomonas species from soil sample for production of Pyoverdine and evaluation of its potential as an antimicrobial agent |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant | ||
CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee |
Granted publication date: 20220408 |
|
CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee |