CN107871059A - 基因测序仪运行模拟方法和系统 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种基因测序仪模拟运行方法和系统,所述基因测序仪包括至少一个设备单元和控制基因测序仪工作的基因测序系统,所述方法包括提供至少一个虚拟串口;提供至少一个虚拟设备,所述至少一个虚拟设备通过所述虚拟串口连接所述基因测序系统,所述基因测序系统通过所述虚拟串口向所述虚拟设备发送动作指令,所述虚拟设备通过所述虚拟串口接受基因测序系统发出的动作指令,并通过所述虚拟串口反馈响应指令给基因测序系统,所述基因测序系统根据虚拟设备反馈的响应指令完成基因测序系统的初始化。本发明的基因测序仪运行模拟方法提高了现有基因测序系统初始化效率低的问题。
Description
技术领域
本发明涉及基因测序领域,更具体地说,本发明涉及一种基因测序仪运行模拟方法和系统。
背景技术
基因测序仪通常包括安装于电脑或服务器的基因测序仪系统、连接到电脑或服务器并由基因测序仪系统驱动的设备单元。现有技术中,对基因测序仪系统进行升级或调试需要连接并启用设备单元正常进行,增加了实际硬件设备单元的启动次数和工作时间,减少了整个基因测序仪的使用寿命,而且这些设备单元开机时响应速度和驱动响应缓慢也影响了基因测序仪系统初始化的效率。
发明内容
本发明的目的在于提供一种基因测序仪运行模拟方法,旨在解决现有技术基因测序系统初始化效率低的问题。
一种基因测序仪模拟运行方法,所述基因测序仪包括至少一个设备单元和控制基因测序仪工作的基因测序系统,所述方法包括:
提供至少一个虚拟串口;
提供至少一个虚拟设备,所述至少一个虚拟设备通过所述虚拟串口连接所述基因测序系统,所述基因测序系统通过所述虚拟串口向所述虚拟设备发送动作指令,所述虚拟设备通过所述虚拟串口接受基因测序系统发出的动作指令,并通过所述虚拟串口反馈响应指令给基因测序系统,所述基因测序系统根据虚拟设备反馈的响应指令完成基因测序系统的初始化。
进一步地,所述虚拟串口包括存储动作指令的指令缓存区,所述虚拟设备包括监听指令缓存区内动作指令的独立线程。
进一步地,所述虚拟设备内预设多条对应不同动作指令的响应指令,当指令缓存区内动作指令被虚拟设备读取时,虚拟设备判断指令缓存区内的动作指令类型后反馈对应的响应指令给基因测序系统。
进一步地,所述虚拟设备读取指令缓存区内动作指令,根据预设的通讯协议对接收的动作指令进行识别后生成对应的响应指令并反馈给基因测序系统。
进一步地,所述预设的通讯协议至少包括包头信息、数据信息和校验位。
进一步地,虚拟设备包括虚拟机械臂,所述动作指令的数据信息中包括的序列化的多位数据,所述虚拟机械臂对序列化的多位数据移位实现反序列化,得到虚拟机械臂移动到指定位置的坐标数据,并对应生成响应命令反馈基因测序系统。
进一步地,所述至少一个虚拟设备包括虚拟明场灯设备、虚拟九孔泵设备、虚拟温控设备和虚拟显示面板,所述虚拟明场灯设备、虚拟九孔泵设备、虚拟温控设备和虚拟显示面板分别通过不同的虚拟串口连接所述基因测序系统,每个虚拟串口包括存储动作指令的指令缓存区。
进一步地,所述至少一个虚拟设备包括虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台,所述虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台通过共用虚拟串口连接所述基因测序系统。
进一步地,所述共用虚拟串口包括存储动作指令的指令缓存区,所述虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台分别包括一个命令缓存区,所述共用虚拟串口内的动作指令由所述虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台中的任意一个读取并判断后存入对应的命令缓存区,虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台分别从对应命令缓存区内读取对应的动作指令。
进一步地,所述指令缓存区为命令缓存区中的一个。
进一步地,所述的基因测序仪运行模拟方法进一步包括预先存储进行基因测序时设备单元产生的数据文件至对应的目录,所述虚拟设备根据动作指令从对应目录读取数据文件并反馈给基因测序系统,所述基因测序系统根据虚拟设备反馈的响应指令和数据文件完成模拟基因测序。
一种基因测序仪模拟运行系统,包括:
至少一个虚拟设备;
连接至少一个虚拟设备的虚拟串口;
控制基因测序仪工作的基因测序系统,所述至少一个虚拟设备通过所述虚拟串口连接所述基因测序系统,所述基因测序系统通过所述虚拟串口向所述虚拟设备发送动作指令,所述虚拟设备通过所述虚拟串口接受基因测序系统发出的动作指令,并通过所述虚拟串口反馈响应指令给基因测序系统,所述基因测序系统根据虚拟设备反馈的响应指令完成基因测序系统的初始化。
进一步地,所述虚拟串口包括存储动作指令的指令缓存区,所述虚拟设备包括监听指令缓存区内动作指令的独立线程。
进一步地,所述虚拟设备内预设多条对应不同动作指令的响应指令,当指令缓存区内动作指令被虚拟设备读取时,虚拟设备判断指令缓存区内的动作指令类型后反馈对应的响应指令给基因测序系统。
进一步地,所述虚拟设备读取指令缓存区内动作指令,根据预设的通讯协议对接收的动作指令进行识别后生成对应的响应指令并反馈给基因测序系统。
进一步地,所述至少一个虚拟设备包括虚拟明场灯设备、虚拟九孔泵设备、虚拟温控设备和虚拟显示面板,所述虚拟明场灯设备、虚拟九孔泵设备、虚拟温控设备和虚拟显示面板分别通过不同的虚拟串口连接所述基因测序系统,每个虚拟串口包括存储动作指令的指令缓存区。
进一步地,所述至少一个虚拟设备包括虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台,所述虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台通过共用虚拟串口连接所述基因测序系统。
相对于现有技术,本发明的基因测序仪运行模拟方法和系统采用虚拟设备进行测序,实现了基因测序系统不连接硬件设备单元的初始化、运行和调试,加快了基因测序系统进行调试和修改的效率,减少了实际硬件设备单元的启动次数和工作时间,延长了整个基因测序仪的使用寿命。另外本发明的基因测序系统和虚拟设备通信时可以自动生成响应指令并反馈基因测序系统,简化了基因测序系统模拟运行的流程,提高了系统运行的效率。再有,本发明的多个虚拟设备分别设立命令缓存区对动作指令进行缓存,可以实现多个虚拟设备共用一个虚拟串口和基因测序系统通信,大大提高了虚拟设备和基因测序系统之间通过虚拟串口连接的兼容性。另外,本发明的虚拟设备可以解析动作指令获得所需数据文件的名称,然后从预先设定的对应目录查找或匹配预先存储的数据文件给基因测序系统,大大简化了整个基因测序仪运行模拟过程,提高了基因测序仪运行模拟运行的效率。
附图说明
图1为本发明第一实施方式基因测序仪运行模拟系统的运行环境示意图。
图2为本发明第一实施方式基因测序仪运行模拟方法的流程示意图。
图3为本发明第一实施方式基因测序仪运行模拟方法中自定义协议的示意图。
具体实施方式
为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白,以下结合附图及实施方式,对本发明进行进一步详细说明。
图1是本发明基因测序仪模拟运行系统的运行环境示意图。本发明基因测序仪模拟运行系统包括至少一个虚拟设备200;连接至少一个虚拟设备200的虚拟串口300;控制基因测序仪工作的基因测序系统100,所述至少一个虚拟设备200通过所述虚拟串口300连接所述基因测序系统100,所述基因测序系统100通过所述虚拟串口300向所述虚拟设备200发送动作指令,所述虚拟设备200通过所述虚拟串口300接受基因测序系统100发出的动作指令,并通过所述虚拟串口300反馈响应指令给基因测序系统100,所述基因测序系统100根据虚拟设备200反馈的响应指令完成基因测序系统100的初始化。
较佳实施例中,所述基因测序系统100、虚拟设备200及虚拟串口300可以是具有特定功能的嵌入式集成芯片或写入存储器500中由处理器400执行的软件代码。本实施例中,所述基因测序系统100包括机械臂控制模块110、XY平台控制模块120、升降平台控制模块130、明场灯控制模块140、九孔泵控制模块150、温控控制模块160和显示控制模块170,分别用于控制包括机械臂、XY平台、升降平台、明场灯设备、九孔泵设备、温控设备和显示面板在内设备单元600,执行对应功能或动作实现基因测序。
所述至少一个虚拟设备200包括虚拟机械臂210、虚拟XY平台220、虚拟升降平台230、虚拟明场灯设备240、虚拟九孔泵设备250、虚拟温控设备260和虚拟显示面板270,在实现基因测序仪模拟运行的过程中,这些虚拟设备200分别取代机械臂、XY平台、升降平台、明场灯设备、九孔泵设备、温控设备和显示面板和基因测序系统100通信,减少了实际硬件设备单元600的启动次数和工作时间,延长了整个基因测序仪的使用寿命,加快了基因测序系统100进行调试、修改和升级的效率,实现了基因测序系统100不连接硬件设备单元600的初始化、运行、调试和升级。
本实施方式中,所述虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230通过共用虚拟串口300连接所述基因测序系统100。所述共用虚拟串口300包括存储动作指令的指令缓存区,所述虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230分别包括一个命令缓存区,所述共用虚拟串口300内的动作指令由所述虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230中预设的一个读取并判断后存入对应的命令缓存区,虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230分别从对应命令缓存区内读取对应的动作指令。一实施例中,为了节省内存占用的数量,所述指令缓存区为命令缓存区中的一个,即命令缓存区中的一个同时充当指令缓存区控制共用虚拟串口300,无需单独设置指令缓存区。
一实施方式中,所述虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230通过共用虚拟串口300连接所述基因测序系统100。所述共用虚拟串口300包括存储动作指令的指令缓存区,所述虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230分别包括一个命令缓存区,所述共用虚拟串口300内的动作指令由所述虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230中预设的一个读取并判断后存入对应的命令缓存区,虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230分别从对应命令缓存区内读取对应的动作指令。
一实施例中,所述虚拟设备200内预设多条对应不同动作指令的响应指令,当指令缓存区内动作指令被虚拟设备200读取时,虚拟设备200判断指令缓存区内的动作指令类型后反馈对应的响应指令给基因测序系统100。本实施方式主要用于响应指令种类较少的虚拟设备200,例如虚拟明场灯设备240、虚拟九孔泵设备250、虚拟温控设备260和虚拟显示面板270。
一实施方式中,所述虚拟设备200读取指令缓存区内动作指令,根据预设的通讯协议对接收的动作指令进行识别后生成对应的响应指令并反馈给基因测序系统100。本实施方式主要适用于具有自定义通讯协议的虚拟设备200,例如虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230。请参考图3,一实施例中预设的通讯协议至少包括包头信息、数据信息和校验位。其中包头信息至少包括命令码cmd,是定义在通信协议中的、具有特殊意义的指令标示符,如在虚拟机械臂210的通信协议中,33表示X轴电机前进;在虚拟显示面板270的通信的通信协议中,12表示读取虚拟显示面板270软件版本。一实施例中,虚拟机械臂210解析收到的动作指令后判断命令的类型,如果是复位动作指令则直接反馈预设的复位响应指令,如果是移动到指定位置的动作指令,则提取数据信息中包括的序列化的多位数据,对多位数据移位实现反序列化,得到虚拟机械臂210移动到指定位置的坐标数据,并对应生成响应命令反馈基因测序系统100。
相对于现有技术,本发明的基因测序仪运行模拟系统采用虚拟设备200进行测序,实现了基因测序系统100不连接硬件设备单元600的初始化、运行和调试,加快了基因测序系统100进行调试和修改的效率,减少了实际硬件设备单元600的启动次数和工作时间,延长了整个基因测序仪的使用寿命。另外本发明的基因测序系统100和虚拟设备200通信时可以自动生成响应指令并反馈基因测序系统100,简化了基因测序系统100模拟运行的流程,提高了系统运行的效率。再有,本发明的多个虚拟设备200分别设立命令缓存区对动作指令进行缓存,可以实现多个虚拟设备200共用一个虚拟串口300和基因测序系统100通信,大大提高了虚拟设备200和基因测序系统100之间通过虚拟串口300连接的兼容性。另外,本发明的虚拟设备200可以解析动作指令获得所需数据文件的名称,然后从预先设定的对应目录查找或匹配预先存储的数据文件给基因测序系统100,大大简化了整个基因测序仪运行模拟过程,提高了基因测序仪运行模拟运行的效率。
一并参阅图2,本发明还提供一种基因测序仪模拟运行方法。所述基因测序仪包括至少一个设备单元600和控制基因测序仪工作的基因测序系统100,所述方法包括:
步骤S11,提供至少一个虚拟串口300;
步骤S12,提供至少一个虚拟设备200,所述至少一个虚拟设备200通过所述虚拟串口300连接所述基因测序系统100;
步骤S13,所述基因测序系统100通过所述虚拟串口300向所述虚拟设备200发送动作指令,所述虚拟设备200通过所述虚拟串口300接受基因测序系统100发出的动作指令,并通过所述虚拟串口300反馈响应指令给基因测序系统100,所述基因测序系统100根据虚拟设备200反馈的响应指令完成基因测序系统100的初始化。
本实施例中,连接虚拟设备200和基因测序系统100的虚拟串口300包括一对互相连接的串口(串口A和串口B),串口A和串口B分别对应连接基因测序系统100(上位机)和虚拟设备200(下位机)。
本实施例中,所述设备单元600可以包括机械臂、XY平台、升降平台、明场灯设备、九孔泵设备、温控设备和显示面板中的一种或多种。所述基因测序系统100可以是具有特定功能的嵌入式集成芯片或写入存储器500中由处理器400执行的软件代码,所述基因测序系统100包括机械臂控制模块110、XY平台控制模块120、升降平台控制模块130、明场灯控制模块140、九孔泵控制模块150、温控控制模块160和显示控制模块170,分别用于控制机械臂、XY平台、升降平台、明场灯设备、九孔泵设备、温控设备和显示面板执行对应功能或动作实现基因测序。所述至少一个虚拟设备200包括虚拟机械臂210、虚拟XY平台220、虚拟升降平台230、虚拟明场灯设备240、虚拟九孔泵设备250、虚拟温控设备260和虚拟显示面板270,在实现基因测序仪模拟运行的过程中,这些虚拟设备200分别取代机械臂、XY平台、升降平台、明场灯设备、九孔泵设备、温控设备和显示面板和基因测序系统100通信,减少了实际硬件设备单元600的启动次数和工作时间,延长了整个基因测序仪的使用寿命,加快了基因测序系统100进行调试和修改的效率,实现了基因测序系统100不连接硬件设备单元600的初始化、运行和调试。
替代实施中,所述基因测序仪模拟运行方法进一步包括预先存储进行基因测序时设备单元600产生的数据文件至对应的目录,所述虚拟设备200根据动作指令从对应目录读取数据文件并反馈给基因测序系统100,所述基因测序系统100根据虚拟设备200反馈的响应指令和数据文件完成模拟基因测序。一实施例中,所述虚拟设备200解析动作指令获得所需数据文件的名称,然后从对应目录中匹配相同名称的文件并传输给基因测序系统100,以进行模拟基因测序的数据处理。另一实施例中,所述虚拟设备200解析动作指令获得所需数据文件的名称,然后在对应目录中匹配最相似名称的文件并传输给基因测序系统100,以进行模拟基因测序的数据处理。
本实施方式中,虚拟设备200中的虚拟明场灯设备240、虚拟九孔泵设备250、虚拟温控设备260和虚拟显示面板270分别通过不同的虚拟串口300连接所述基因测序系统100,每个虚拟串口300包括存储动作指令的指令缓存区,每个虚拟设备200包括监听对应指令缓存区内动作指令的独立线程,例如所述虚拟明场灯设备240、虚拟九孔泵设备250、虚拟温控设备260和虚拟显示面板270分别包括监听对应虚拟串口300的指令缓存区的独立线程,用于读取对应指令缓存区内的动作指令。
本实施方式中,所述虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230通过共用虚拟串口300连接所述基因测序系统100。所述共用虚拟串口300包括存储动作指令的指令缓存区,所述虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230分别包括一个命令缓存区,所述共用虚拟串口300内的动作指令由所述虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230中预设的一个读取并判断后存入对应的命令缓存区,虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230分别从对应命令缓存区内读取对应的动作指令。一实施例中,为了节省内存占用的数量,所述指令缓存区为命令缓存区中的一个,即命令缓存区中的一个同时充当指令缓存区用于控制共用虚拟串口300,无需单独设置指令缓存区。
一实施例中,所述虚拟设备200内预设多条对应不同动作指令的响应指令,当指令缓存区内动作指令被虚拟设备200读取时,虚拟设备200判断指令缓存区内的动作指令类型后反馈对应的响应指令给基因测序系统100。本实施方式主要用于响应指令种类较少的虚拟设备200,例如虚拟明场灯设备240、虚拟九孔泵设备250、虚拟温控设备260和虚拟显示面板270。
一实施方式中,所述虚拟设备200读取指令缓存区内动作指令,根据预设的通讯协议对接收的动作指令进行识别后生成对应的响应指令并反馈给基因测序系统100。本实施方式主要适用于具有自定义通讯协议的虚拟设备200,例如虚拟机械臂210、虚拟XY平台220和虚拟升降平台230。请参考图3,一实施例中预设的通讯协议至少包括包头信息、数据信息和校验位。其中包头信息至少包括命令码cmd,是定义在通信协议中的、具有特殊意义的指令标示符,如在虚拟机械臂210的通信协议中,33表示X轴电机前进;在虚拟显示面板270的通信的通信协议中,12表示读取虚拟显示面板270软件版本。一实施例中,虚拟机械臂210解析收到的动作指令后判断命令的类型,如果是复位动作指令则直接反馈预设的复位响应指令,如果是移动到指定位置的动作指令,则提取数据信息中包括的序列化的4位数据,对4位数据移位实现反序列化,得到虚拟机械臂210移动到指定位置的坐标数据,并对应生成响应命令反馈基因测序系统100。
相对于现有技术,本发明的基因测序仪运行模拟方法采用虚拟设备200进行测序,实现了基因测序系统100不连接硬件设备单元600的初始化、运行和调试,加快了基因测序系统100进行调试和修改的效率,减少了实际硬件设备单元600的启动次数和工作时间,延长了整个基因测序仪的使用寿命。另外本发明的基因测序系统100和虚拟设备200通信时可以自动生成响应指令并反馈基因测序系统100,简化了基因测序系统100模拟运行的流程,提高了系统运行的效率。再有,本发明的多个虚拟设备200分别设立命令缓存区对动作指令进行缓存,可以实现多个虚拟设备200共用一个虚拟串口300和基因测序系统100通信,大大提高了虚拟设备200和基因测序系统100之间通过虚拟串口300连接的兼容性。另外,本发明的虚拟设备200可以解析动作指令获得所需数据文件的名称,然后从预先设定的对应目录查找或匹配预先存储的数据文件给基因测序系统100,大大简化了整个基因测序仪运行模拟过程,提高了基因测序仪运行模拟运行的效率。
以上所述仅为本发明的较佳实施方式而已,并不用以限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
Claims (17)
1.一种基因测序仪模拟运行方法,所述基因测序仪包括至少一个设备单元和控制基因测序仪工作的基因测序系统,所述方法包括:
提供至少一个虚拟串口;
提供至少一个虚拟设备,所述至少一个虚拟设备通过所述虚拟串口连接所述基因测序系统,所述基因测序系统通过所述虚拟串口向所述虚拟设备发送动作指令,所述虚拟设备通过所述虚拟串口接受基因测序系统发出的动作指令,并通过所述虚拟串口反馈响应指令给基因测序系统,所述基因测序系统根据虚拟设备反馈的响应指令完成基因测序系统的初始化。
2.根据权利要求1所述的基因测序仪模拟运行方法,其特征在于,所述虚拟串口包括存储动作指令的指令缓存区,所述虚拟设备包括监听指令缓存区内动作指令的独立线程。
3.根据权利要求2所述的基因测序仪运行模拟方法,其特征在于,所述虚拟设备内预设多条对应不同动作指令的响应指令,当指令缓存区内动作指令被虚拟设备读取时,虚拟设备判断指令缓存区内的动作指令类型后反馈对应的响应指令给基因测序系统。
4.根据权利要求2所述的基因测序仪运行模拟方法,其特征在于,所述虚拟设备读取指令缓存区内动作指令,根据预设的通讯协议对接收的动作指令进行识别后生成对应的响应指令并反馈给基因测序系统。
5.根据权利要求4所述的基因测序仪运行模拟方法,其特征在于,所述预设的通讯协议至少包括包头信息、数据信息和校验位。
6.根据权利要求5所述的基因测序仪运行模拟方法,其特征在于,虚拟设备包括虚拟机械臂,所述动作指令的数据信息中包括的序列化的多位数据,所述虚拟机械臂对序列化的多位数据移位实现反序列化,得到虚拟机械臂移动到指定位置的坐标数据,并对应生成响应命令反馈基因测序系统。
7.根据权利要求1所述的基因测序仪运行模拟方法,其特征在于,所述至少一个虚拟设备包括虚拟明场灯设备、虚拟九孔泵设备、虚拟温控设备和虚拟显示面板,所述虚拟明场灯设备、虚拟九孔泵设备、虚拟温控设备和虚拟显示面板分别通过不同的虚拟串口连接所述基因测序系统,每个虚拟串口包括存储动作指令的指令缓存区。
8.根据权利要求1所述的基因测序仪运行模拟方法,其特征在于,所述至少一个虚拟设备包括虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台,所述虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台通过共用虚拟串口连接所述基因测序系统。
9.根据权利要求8所述的基因测序仪运行模拟方法,其特征在于,所述共用虚拟串口包括存储动作指令的指令缓存区,所述虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台分别包括一个命令缓存区,所述共用虚拟串口内的动作指令由所述虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台中的任意一个读取并判断后存入对应的命令缓存区,虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台分别从对应命令缓存区内读取对应的动作指令。
10.根据权利要求9所述的基因测序仪运行模拟方法,其特征在于,所述指令缓存区为命令缓存区中的一个。
11.根据权利要求1所述的基因测序仪运行模拟方法, 进一步包括预先存储进行基因测序时设备单元产生的数据文件至对应的目录,所述虚拟设备根据动作指令从对应目录读取数据文件并反馈给基因测序系统,所述基因测序系统根据虚拟设备反馈的响应指令和数据文件完成模拟基因测序。
12.一种基因测序仪模拟运行系统,包括:
至少一个虚拟设备;
连接至少一个虚拟设备的虚拟串口;
控制基因测序仪工作的基因测序系统,所述至少一个虚拟设备通过所述虚拟串口连接所述基因测序系统,所述基因测序系统通过所述虚拟串口向所述虚拟设备发送动作指令,所述虚拟设备通过所述虚拟串口接受基因测序系统发出的动作指令,并通过所述虚拟串口反馈响应指令给基因测序系统,所述基因测序系统根据虚拟设备反馈的响应指令完成基因测序系统的初始化。
13.根据权利要求12所述的基因测序仪模拟运行系统,其特征在于,所述虚拟串口包括存储动作指令的指令缓存区,所述虚拟设备包括监听指令缓存区内动作指令的独立线程。
14.根据权利要求13所述的基因测序仪模拟运行系统,其特征在于,所述虚拟设备内预设多条对应不同动作指令的响应指令,当指令缓存区内动作指令被虚拟设备读取时,虚拟设备判断指令缓存区内的动作指令类型后反馈对应的响应指令给基因测序系统。
15.根据权利要求14所述的基因测序仪模拟运行系统,其特征在于,所述虚拟设备读取指令缓存区内动作指令,根据预设的通讯协议对接收的动作指令进行识别后生成对应的响应指令并反馈给基因测序系统。
16.根据权利要求12所述的基因测序仪模拟运行系统,其特征在于,所述至少一个虚拟设备包括虚拟明场灯设备、虚拟九孔泵设备、虚拟温控设备和虚拟显示面板,所述虚拟明场灯设备、虚拟九孔泵设备、虚拟温控设备和虚拟显示面板分别通过不同的虚拟串口连接所述基因测序系统,每个虚拟串口包括存储动作指令的指令缓存区。
17.根据权利要求12所述的基因测序仪模拟运行系统,其特征在于,所述至少一个虚拟设备包括虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台,所述虚拟机械臂、虚拟XY平台和虚拟升降平台通过共用虚拟串口连接所述基因测序系统。
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Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN2478110Y (zh) * | 2001-04-25 | 2002-02-20 | 张宏 | 全自动基因测序仪 |
CN101795270A (zh) * | 2010-01-12 | 2010-08-04 | 山东高效能服务器和存储研究院 | 一种基于串口的服务器控制方法 |
CN101894066A (zh) * | 2010-04-28 | 2010-11-24 | 北京同有飞骥科技有限公司 | 一种基于磁盘阵列虚拟化的网络存储管理软件测试方法 |
WO2012089168A1 (zh) * | 2010-12-31 | 2012-07-05 | 深圳华因康基因科技有限公司 | 一种对基因测序仪的测序过程进行控制的方法及系统 |
CN105629780A (zh) * | 2014-12-01 | 2016-06-01 | 深圳华大基因研究院 | 基因测序仪的控制装置、方法和基因测序仪 |
-
2016
- 2016-09-23 CN CN201610847508.4A patent/CN107871059A/zh active Pending
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN2478110Y (zh) * | 2001-04-25 | 2002-02-20 | 张宏 | 全自动基因测序仪 |
CN101795270A (zh) * | 2010-01-12 | 2010-08-04 | 山东高效能服务器和存储研究院 | 一种基于串口的服务器控制方法 |
CN101894066A (zh) * | 2010-04-28 | 2010-11-24 | 北京同有飞骥科技有限公司 | 一种基于磁盘阵列虚拟化的网络存储管理软件测试方法 |
WO2012089168A1 (zh) * | 2010-12-31 | 2012-07-05 | 深圳华因康基因科技有限公司 | 一种对基因测序仪的测序过程进行控制的方法及系统 |
CN105629780A (zh) * | 2014-12-01 | 2016-06-01 | 深圳华大基因研究院 | 基因测序仪的控制装置、方法和基因测序仪 |
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