CN107760695A - 莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在调控莱茵衣藻镉耐受性中的应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在调控莱茵衣藻镉耐受性中的应用。本发明通过将含巴龙霉素抗性基因的aphⅧ片段(SEQ ID NO:3)随机插入衣藻中得到了对镉显著敏感的莱茵衣藻突变藻株,进一步鉴定发现突变藻株的镉敏感性是由于aphⅧ片段插入到Cre03.g157400.t1.2基因(CDS序列如SEQ ID NO:1所示)中造成的。通过降低莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因的表达、使该基因失活或缺失该基因能够降低莱茵衣藻的镉耐受性;通过基因工程手段获得的镉敏感型莱茵衣藻藻株可应用于镉污染水域的监控与检测中。本发明为污水的监控与检测提供了新的方向。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域和环境污水治理领域,具体涉及莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在调控莱茵衣藻镉耐受性中的应用。
背景技术
随着现代工业化的不断提高,环境污染已经成为全球化的问题,由于一些工厂的不合理开发和工业的不合理发展导致了一系列的环境污染问题,其中污染最严重的是水体和大气。重金属镉的污染就是其中的一种主要工业污染,无论工业废气和废水,还是汽车尾气等里面都含有大量的镉,随着工业废水废气和汽车尾气的不断排放,又因为水体和大气都具有流动性,使重金属污染在水体、土壤、大气中不断的积累,最后生态环境遭到破坏,人类的生存和发展受到威胁。目前重金属镉的污染已经越来越严重,如何科学地进行重金属镉的污染治理和回收已经成为了科学研究中的重点和热点问题。
目前,对重金属污染的治理主要有物理化学法和生物法。相比较而言,传统的物理化学法往往成本较高、操作复杂的特点,更适合集中处理高浓度的重金属污染区域。而相对来说大流域、低浓度的重金属污染治理来说生物法则具有更多的优势。能够吸附和代谢重金属的微生物种类主要包括一些工程细菌、真菌和藻类等。相对于工程细菌和真菌容易造成二次污染来说,藻类是进行重金属污水治理和回收的一种理想材料。
莱茵衣藻是一种单细胞的真核生物,能够进行光合作用,又被称为“绿色酵母”。莱茵衣藻基因组测序工作已经完成,有利于进一步研究重金属镉的代谢调控网络。同时莱茵衣藻遗传转化体系较为成熟,易获得突变体,并且衣藻细胞易培养,生长繁殖快,是一种重要的研究模式生物。本发明中通过获得的氯化镉敏感突变藻株,进一步鉴定得到了与重金属镉调控相关的基因Cre03.g157400.t1.2及其编码蛋白,可应用于镉污染水域的监控与治理中,同时进一步研究Cre03.g157400.t1.2基因在衣藻重金属镉代谢调控中的作用,能够为生物法重金属镉的治理奠定理论基础。
发明内容
本发明的首要目的在于提供莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在调控莱茵衣藻镉耐受性中的应用。基于Cre03.g157400.t1.2基因调控莱茵衣藻镉耐受性的功能,本发明的目的还在于提供莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在降低莱茵衣藻镉耐受性中的应用,提供莱茵衣藻镉敏感型藻株的获得方法以及镉敏感型藻株的应用等。
本发明的目的通过下述技术方案实现:
本发明通过将含巴龙霉素抗性基因的aphⅧ片段随机插入衣藻中得到了对镉显著敏感的莱茵衣藻突变藻株,进一步鉴定发现突变藻株的镉敏感性是由于aphⅧ片段插入到Cre03.g157400.t1.2基因第13个内含子中造成的,该基因的CDS序列如SEQ ID NO:1所示。
基于上述发现,本发明的目的之一是提供莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在调控莱茵衣藻镉耐受性中的应用。
所述Cre03.g157400.t1.2基因的核苷酸序列为下述序列中的一种:
(1)包含如SEQ ID NO:1所示5232bp的核苷酸序列;
(2)包含编码SEQ ID NO:2所示蛋白质的核苷酸序列;
(3)包含与SEQ ID NO:1所示核苷酸序列具有90%以上的同源性且编码相同功能蛋白质的核苷酸序列。
所述Cre03.g157400.t1.2基因的编码蛋白为下述蛋白中的一种:
(1)包含如SEQ ID NO:2所示氨基酸序列;
(2)包含由SEQ ID NO:2所示氨基酸序列经若干个氨基酸的取代、缺失或者增加等变化且衍生出的具有与SEQ ID NO:2所示蛋白相同活性的衍生蛋白。
本发明的目的之二是提供上述莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在降低莱茵衣藻镉耐受性中的应用。通过降低莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因的表达、使Cre03.g157400.t1.2基因失活或缺失Cre03.g157400.t1.2基因进而降低莱茵衣藻对镉的耐受性。
本发明的目的之三是提供利用上述莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因降低莱茵衣藻镉耐受性的方法。所述方法为通过降低莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因的表达、使Cre03.g157400.t1.2基因失活或缺失Cre03.g157400.t1.2基因来降低莱茵衣藻对镉的耐受性。
本发明的目的之四是提供一种莱茵衣藻镉敏感型藻株。所述镉敏感型藻株为不含Cre03.g157400.t1.2基因活性的Cre03.g157400.t1.2基因突变株或Cre03.g157400.t1.2基因缺失株,或Cre03.g157400.t1.2基因表达下降的Cre03.g157400.t1.2基因表达缺陷株。
本发明的目的之五是提供一种莱茵衣藻敏感型藻株的获得方法。所述获得方法包括:通过插入突变或者定点突变的方法获得莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因突变株,通过构建Crispr载体进而获得莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因缺失株,通过构建RNAi干涉载体进而获得莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因表达缺陷株。
本发明的目的之六是提供上述莱茵衣藻镉敏感型藻株在重金属镉污染的监测与检测中的应用。根据莱茵衣藻的Cre03.g157400.t1.2基因表达缺陷株、Cre03.g157400.t1.2基因突变株或Cre03.g157400.t1.2基因缺失株对重金属镉的敏感性,只能在较低浓度的含重金属镉的环境中生长的特性,其可应用于镉污染的监测和检测中,尤其可应用于污水中镉的监测和检测中,如所述莱茵衣藻镉敏感型藻株可以监测环境水体中的镉含量是否超标,方便检测环境中镉污染程度并起到预防或者改善环境镉污染。所述莱茵衣藻镉敏感型藻株应用于监控或者检测环境水体中重金属镉污染的状况,为水体中重金属镉的检测、以及生物法处理污水提供一种新的思路与新的材料。同时,研究Cre03.g157400.t1.2基因在衣藻重金属镉代谢调控网络中的作用机制,可进一步为生物法治理污水提供理论基础。
本发明的有益效果是:
(1)本发明发现的Cre03.g157400.t1.2基因及其编码蛋白,是一种新的与重金属镉调控相关的基因及蛋白,未见相关报道。
(2)本发明采用的获得重金属镉敏感突变藻株的方法简单、技术体系成熟,可进一步改进和应用到其他的藻类或模式植物中。
(3)本发明中Cre03.g157400.t1.2基因因插入突变形成的重金属镉敏感型突变体与野生型衣藻相比,具有显著的重金属镉敏感的特性,能够进一步用于研究Cre03.g157400.t1.2基因在镉吸附和代谢调控中的作用机制。
(4)藻类是研究生物法治理重金属水体污染的重要模式生物,本发明中获得的Cre03.g157400.t1.2基因突变体(HM3)表现出了显著的重金属镉敏感特性,可应用到镉污染水域的监控与检测中,为含镉污水的检测提供新生物材料和新的方向。
附图说明
图1为pJMG-aphⅧ质粒酶切后琼脂糖凝胶电泳图。
图2为野生型莱茵衣藻21gr和氯化镉敏感型突变藻株(HM3)在含0.4mM氯化镉的固体平板上的生长对比图。
图3为氯化镉敏感型突变藻株(HM3)经RESDA-PCR后琼脂糖凝胶电泳图。
图4为氯化镉敏感型突变藻株(HM3)中Cre03.g157400.t1.2基因插入突变位点示意图。
具体实施方式
为了让该领域或者相关人员能够更好的了解这个发明,下面结合以下几个实施例进行说明,这些方法只是为了更好的阐述该发明,并不限制本发明。以下实施例中,没有特殊说明的均为常规方法。
下述实施例中所用培养基配方如下:
TAP培养基配方:Tris 1.21g、SolutionI(盐溶液)12.5mL、SolutionⅡ(磷酸盐)0.188mL、SolutionIII(微量元素)0.5mL、GAA(冰醋酸)0.5mL,按顺序加各组分,定容至500mL即可。固体培养基则加入7.5g Agar(琼脂)。
TAgP培养基配方:Tris 1.21g、SolutionI(盐溶液)12.5mL、甘油磷酸钠(1M)0.376mL、SolutionIII(微量元素)0.5mL、GAA(冰醋酸)0.5mL,按顺序加各组分,定容至500mL即可。若要配制固体培养基则加入7.5g Agar(琼脂)。
实施例1:莱茵衣藻重金属镉敏感型突变藻珠的筛选
(1)目的片段的准备
首先提取PJMG-aphⅧ质粒(Zhangfeng Hu,Yinwen Liang,Wei He,Junmin Pan*,Cilia Disassembly with Two Distinct Phases of Regulation,Cell Reports,2015,10(11):1803-1810)(含有aphⅧ片段),然后用EcoRⅠ和cutsmart Buffer酶切,将酶切产物琼脂糖凝胶电泳,将目的片段切胶回收,如图1所示,M为DL2000DNA Marker,1为酶切产物,箭头所指的条带为需要回收的目的片段aphⅧ(序列SEQ ID NO:3所示)。胶回收主要采用生工公司胶回收试剂盒(货号为B518191-0100),按照胶条的重量,加入胶条重量3-6倍的BufferB2,用20μL的Elution Buffer洗脱DNA片段,使终浓度在10ng/μL左右。
(2)衣藻感受态细胞的准备
将莱茵衣藻21gr转接到新鲜的TAP固体培养基上活化,大约3天左右,转接到TAP液体中吹气培养,连续光照(24h光照)使细胞浓度长到1×107细胞/mL。转接至含100mL TAP液体培养基的三角瓶中使初始浓度为1×106细胞/mL,在连续光照条件下摇床上培养20h左右,使衣藻细胞浓度达到5×106细胞/mL时立即进行感受态细胞的制备。
(3)电击转化法获得衣藻转化子
将预先准备好的插入片段(aphⅧ)加入装有250μL浓度1×108细胞/mL的感受态细胞的电击杯中,冰上放置10min,电击仪电击(型号BTX ECM630,电击参数:电压800V、电阻1575Ω、电容50μF),冰上再放10min让DNA充分进入感受态细胞中,最后转入装有10mL TAP+60mM山梨醇(含60mM山梨醇的TAP液体培养基)的50mL离心管中过夜修复(锡箔纸包住,摇床上100r/min慢摇过夜),次日涂布含巴龙霉素10μg/mL的平板,通常一个转化子可以涂2-3个平板,封口膜密封,光周期(14h光照/10h黑暗)下倒置培养。
(4)重金属镉敏感型突变藻株的筛选
待转化子长好后,将单克隆的藻株挑到TAP固体培养基上,并进行编号。生长3-4天至突变体藻株活力最佳,再转接到0.4mM氯化镉的固体平板上,每天观察并记录野生型和突变体的生长状况。若在野生型衣藻能够正常生长的情况下,突变体藻株生长受到抑制或者逐渐死亡,则初步认定为镉敏感型突变藻株。重复筛选3-4次,结果一致则可判定该突变藻株为重金属镉敏感型突变藻株。如图2所示,野生型衣藻21gr能够在0.4mM氯化镉的固体平板上正常进行生长,而所筛选的突变体HM3则生长显著受到抑制,说明HM3突变藻株具有显著的镉敏感特性,属于重金属镉敏感型突变体。
实施例2:莱茵衣藻重金属镉敏感突变藻株突变基因的鉴定
(1)突变体基因组DNA的提取
a:将上述筛选到的镉敏感型突变体HM3,用枪头接到液体培养基中,待细胞长到对数期,收集细胞到1.5mL的EP管中,室温14000rpm离心1min,弃上清,将沉淀用液氮冷冻,-80℃保存备用。
b:将上述收集的细胞用液氮取出,加入700μL预热的CTAB裂解液,放在65℃的水浴锅里水浴一个小时左右,其间多次颠倒混匀,使细胞充分裂解。
c:待细胞充分裂解后,向该EP管中加入700μL苯酚:氯仿:异戊醇=25:24:1的混合溶液,摇晃EP管,充分混合均匀,14000rpm离心10min。
d:离心完后,将上清吸到新的EP管中,再加入等体积氯仿:异戊醇=24:1的混合溶液,上下颠倒EP管,14000rpm离心10min。
e:取离心后的上清到另一个新的EP管中,然后加入四分之三体积的异丙醇,轻轻地颠倒几次,于-20℃中放置15-20min,直到有絮状物出现。
f:将上述的EP管取出,14000rpm离心10min,弃上清,用70%的乙醇洗涤沉淀,大约3-5次,每次14000rpm离心5min。
g:最后用50μL的ddH2O溶解DNA。
(2)RESDA-PCR
根据插入片段aphⅧ的核酸序列设计特异引物F-Z2和F-Z8,根据衣藻基因组特点设计引物Q0和由Q0与AluI、PstI、SacII、TaqI限制性内切酶特异识别序列组成的简并引物DegAluI、DegPstI、DegSacII、DegTaqI。以提取的敏感型突变体藻株(HM3)的基因组DNA做模板,进行RESDA-PCR,得到四种PCR产物,如图3所示,M为DL2000DNA Marker,A、P、S、T分别代表包含AluI、PstI、SacII、TaqI限制性内切酶的扩增产物。将500bp以上条带的胶块切割下来送测序。RESDA-PCR中所用引物见下表所示:
(3)分析镉敏感型突变藻株HM3的插入突变基因及插入突变位点
将测序结果与aphⅧ片段序列进行比对,得到插入片段aphⅧ的部分序列及其侧翼序列,在Phytozome网站上的衣藻数据库中进行序列比对,可获得插入突变基因的核酸序列及编码蛋白的氨基酸序列,进一步分析可获得具体插入突变位点。如图4所示,本发明所获得的氯化镉敏感型突变体是由于aphⅧ片段反向插入到Cre03.g157400.t1.2基因的第13个内含子中而形成的突变体。
上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。
序列表
<110> 江汉大学
<120> 莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在调控莱茵衣藻镉耐受性中的应用
<160> 3
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 5232
<212> DNA
<213> Chlamydomonas reinhardti
<400> 1
atggccgcaa atgtcgcacg ggcacgtggc gcgccacggc ggaatccctt ccgccgcatc 60
cagcaccaga agaagcagaa gcacctccag aagtcttaca gccagtacaa cctgtcccac 120
cttgatagtt ctgcgggtga aagctcaagc agcaagaagc gcaagcactt gggtggtgtg 180
tatgggctgc tggcacgcca catcgacgtg ccccagcacc tgatggacaa ggcacaggag 240
atggcggagg gccgcccgcc gaccttcttc agcaggcgct cgctgctggg cctgcccatg 300
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gacgggcggc tggtcacgta cgcctatgtg gcgtacggca agttcgcgat ggacctgctg 600
gccagcattc ccttcttcgt gctggtgggg accatcgcca gcggcggtgg gagcggcgag 660
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cctccgcggg tgccctccgt cggcaccatc ggggcgccgc tggcggcggg tcagcagtcc 3540
cagtcacgta tcggggggcc tcgccgcaca gtgacggagg cctcactgac ctcaccacga 3600
cggcagcagc cgacggcccc ctcctggcat ccggcggcgg cggcggcacc agcacccgct 3660
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ggcgtgtggg gccccgcggg cgcgcgcctt gccaattcca acatcgggcg cccatccctg 4740
gacctggcgc cctccgctcg cgcctgggca gccgccaacg caaacagcac tgccagcagt 4800
accgctaccg gcaccgcgcc tgccggcgca acgggcgtag cgggcacgtc ggctccgggc 4860
gcggtcaagg gccccagcaa cagcagcgtt gccgggcacg tcgccgccac tgccgccgcc 4920
gctgcgcagt tcgccgcgtt cgcctcggag gcacccgggc cgtccatggg tgtgctgcca 4980
ccagccatgg cctacgccag ccgccgcggc ggccgcggcg gcggctcgga cgccgcgcaa 5040
tggtcgcaag gtcctagcgg cttcctcatg tctactggcg gcactgtggg cggcggaggc 5100
ggcgggaccg gcagcggcgg cgcggagagc cggcgggcca gccgcggcac ggacacgtgg 5160
cgggggcacg cgcctggcca ggcggctatg gacctcgtgg cgccgtctgt gaccctcgcg 5220
ccgtactttt ag 5232
<210> 2
<211> 1743
<212> PRT
<213> Chlamydomonas reinhardti
<400> 2
Met Ala Ala Asn Val Ala Arg Ala Arg Gly Ala Pro Arg Arg Asn Pro
1 5 10 15
Phe Arg Arg Ile Gln His Gln Lys Lys Gln Lys His Leu Gln Lys Ser
20 25 30
Tyr Ser Gln Tyr Asn Leu Ser His Leu Asp Ser Ser Ala Gly Glu Ser
35 40 45
Ser Ser Ser Lys Lys Arg Lys His Leu Gly Gly Val Tyr Gly Leu Leu
50 55 60
Ala Arg His Ile Asp Val Pro Gln His Leu Met Asp Lys Ala Gln Glu
65 70 75 80
Met Ala Glu Gly Arg Pro Pro Thr Phe Phe Ser Arg Arg Ser Leu Leu
85 90 95
Gly Leu Pro Met Leu His Pro Tyr Ser Arg Val Ser Val Ala Trp Arg
100 105 110
Ala Ala Met Leu Val Phe Asp Leu Thr Phe Thr Ala Phe Trp Val Pro
115 120 125
Leu Asn Ile Gly Phe Cys Tyr Ser Asn Tyr Gly Asn Leu Ala Ala Pro
130 135 140
Cys Thr Gln Ser Asp Leu Ala Gly Gly Ile Val Tyr Val Ser Asn Trp
145 150 155 160
Leu Met Gly Phe Leu Met Gly Ala Val Leu Ser Asn Gly Ser Lys Arg
165 170 175
Ala Val Cys Val Asp Gly Arg Leu Val Thr Tyr Ala Tyr Val Ala Tyr
180 185 190
Gly Lys Phe Ala Met Asp Leu Leu Ala Ser Ile Pro Phe Phe Val Leu
195 200 205
Val Gly Thr Ile Ala Ser Gly Gly Gly Ser Gly Glu Thr Arg Leu Leu
210 215 220
Ser Leu Leu Ser Leu Leu Arg Leu Val Arg Met Leu Arg Leu Val Asn
225 230 235 240
Thr Val Lys Val Val Tyr Gln Asp Ser Leu Ser Gly His Tyr Arg Met
245 250 255
Ser Phe Ile Thr Arg Thr Val Ser Val Ser Ala Met Tyr Leu Leu Leu
260 265 270
Leu Gly Phe Gln Phe Ala Val Val Val Asn Met Cys Ala Ser Leu Met
275 280 285
Ile Met Leu Ala Ala Phe Tyr Gly Tyr Glu Asn Thr Trp Gln Asp Ser
290 295 300
Leu Gly Trp Trp Trp Gly Ser Trp Glu Asp Leu Gln Pro Val Gly Leu
305 310 315 320
Trp Tyr Asn Ala Val Tyr Trp Val Ile Thr Ala Leu Thr Thr Thr Gly
325 330 335
Ala Gly Gln Ala Pro Arg Gln Ala Gly Glu Gln Val Val Ser Asn Phe
340 345 350
Cys Ser Val Tyr Gly Met Val Phe Asn Gly Leu Val Val Gly Val Val
355 360 365
Gly Arg Ala Leu Met Gln Ala Thr Gly Asp Ala Ser Asn Leu Tyr Leu
370 375 380
Ser Arg Lys Lys Val Gly Leu Val Ser Ser Trp Ala Asp Thr Arg His
385 390 395 400
Leu Pro Pro Ser Val Lys Lys Glu Leu Gln Val Tyr Phe Ala Asp Ser
405 410 415
Glu Leu Ala Arg Gly Glu Phe Gly Phe Glu Ala Gly Val Ile Glu Gly
420 425 430
Leu Pro Thr Thr Leu Arg Arg Gln Val Val Ala Tyr Val Val Arg Pro
435 440 445
Leu Val Asp Lys Val His Ile Leu Ser Ala Ala Glu His Glu Leu Arg
450 455 460
Asp Leu Ile Ala Thr Met Phe Arg Pro Leu Asp Val Pro Pro Gly His
465 470 475 480
Asp Leu Cys Arg Gln Gly His Leu Ala Asp Arg Leu Trp Leu Val Glu
485 490 495
Trp Gly Thr Val Val Ala Leu Arg His Lys Glu Gln Glu Ala His Pro
500 505 510
Thr Thr Gly Met Thr Cys Leu Leu Gly Glu Gly Val Leu Leu Arg Gly
515 520 525
Val Met Asp Val Ala Ala Val Arg Pro Trp Thr Leu Arg Thr Ser Ser
530 535 540
Ala Cys Arg Leu Trp Glu Leu Ala Trp Glu Asp Leu Glu Pro Leu Leu
545 550 555 560
Arg Val Tyr Pro Arg Leu Gln Ser Ile Ala Leu Gln Tyr Ile Lys Asp
565 570 575
Arg Leu Ile Arg Ala Leu Asp Gly Ile Pro Gln Arg Asp Thr Ala Trp
580 585 590
Cys Glu Leu Val Ala Val Leu Ser Arg Ile Leu Lys Gln Pro Ala Gln
595 600 605
Leu Asp Gln Ala Arg Asp Asn Leu Glu Ala Leu Glu Gln Ser Arg Glu
610 615 620
Glu Asp Gly Ser Leu Pro Ala Leu Leu Ser Ser Trp Leu Glu Ala Gly
625 630 635 640
Ile Ser Thr Thr Leu Glu Leu Gly Ala Thr Gly Ala Gln Lys Arg Gly
645 650 655
Leu Val Thr Met Ser Ile Met Leu Ala Arg Gln Ser Lys Asp Ala Leu
660 665 670
Gly Ala Pro Ser Thr Ala Leu Ser Gly Pro Tyr Pro Pro Tyr Ala Asn
675 680 685
His Pro Leu Gly Ala Pro Ser Leu Ala Leu Leu Pro Arg Tyr Gly Gly
690 695 700
Gly Gly Gly Gly Pro Gly Gly Gly Gly Phe Arg Arg Gly Gly Thr Gly
705 710 715 720
Ala Ser Gly Leu Ala Ala Gln Ser Val Gly Leu Gly Met Leu Leu Pro
725 730 735
Gly Gly Thr Thr Ala Ala Thr Leu Gln Arg Glu Pro Ser Ala Gly Ala
740 745 750
Pro Gly Leu Thr Gly Phe Gly Gly Gly Met Gly Ser Gly Ser Gly Leu
755 760 765
Gly Ala Ser Ser Val Glu Leu Pro Thr Pro Val Glu Ala Glu Gly Glu
770 775 780
Glu Asp Val His Ala Pro Val Gln Ala Gln Arg Leu Trp Gln Gly Lys
785 790 795 800
Ser Glu Ala Ala Ser Ser Pro Ala Ser Thr Ala Ala Ala Arg Gly His
805 810 815
Gly Gly Ala Arg Arg Ser Arg Ser Phe Thr Ser Cys Ser Ala His Ala
820 825 830
Ser Gly Thr Pro Thr Pro Pro Ser Arg Gly Ser Gln Pro Pro Pro Gly
835 840 845
Gly Leu Pro Ser Ser Pro Met Gln Ile Ala Leu Ser Ser Ala Leu Leu
850 855 860
Gln Pro Ser Arg Pro Pro Pro Thr Pro Ser Arg Leu Ala Ile Ser Ser
865 870 875 880
Arg Gln His His Ser His Asn Leu Leu Gly Ser Glu Ala Thr Gly Gly
885 890 895
Asp Thr Glu Thr Gly Ala Ala Ala Arg Ala Gly Gly Ala Ala Ala Val
900 905 910
Ala Ala Gly Gly Ala Arg Pro Gly Arg Pro Gly Pro Ala Asp Ser Tyr
915 920 925
Ala Arg Ser Pro Leu Gly Gly Arg Pro Pro Pro Arg Arg Ser Phe Ser
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945 950 955 960
Ala Ser Gly Ala Thr Ala Ser Ala Ala Ala Ala Asp Glu Thr Val Glu
965 970 975
Gln Ala Arg Ala Glu Phe Arg Pro Pro Leu Gln Ala Pro Gln Pro Pro
980 985 990
Gln Ser Pro Gln Leu Pro Ser Gln Arg Ser Pro Phe Leu Ser His Pro
995 1000 1005
Asp Glu Ala Ala Arg Leu Asp Ser Ala Gly Ser Gly Ser Arg Arg Gly
1010 1015 1020
Gly Pro Pro Ser Trp Val Leu Asn Pro Met Ala Glu Gly Glu Pro Leu
1025 1030 1035 1040
Pro Leu Gly Glu Val Glu Gly Asp Ala Glu Ala Leu Val Leu Ala Thr
1045 1050 1055
Ala Thr Pro Glu Gly Leu Gly Leu Ala Thr Val Thr Pro Glu Ala Leu
1060 1065 1070
Gly Leu Ala Ala Asp Val Ala Ala Ser Ala Ala Ala Ala Glu Ala Gln
1075 1080 1085
Arg Ser Gln Ala Gly Gln Gly Met Ala Met Ser Pro Ala Ala Ser Thr
1090 1095 1100
Ser Gly Met Glu Gly Thr Val Ser Thr Ala Pro Asp Ser Pro Gln Arg
1105 1110 1115 1120
Ser Glu Pro Glu Glu Arg Leu Ser Val Ile Ala His Thr Ser Arg Ala
1125 1130 1135
Phe Gly Val Val Asp Ala Gly Gly Val Pro Leu Val Gly Ala Ala Pro
1140 1145 1150
Ala Ala Ala Pro Gln His Ala Arg Pro Pro Arg Val Pro Ser Val Gly
1155 1160 1165
Thr Ile Gly Ala Pro Leu Ala Ala Gly Gln Gln Ser Gln Ser Arg Ile
1170 1175 1180
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1185 1190 1195 1200
Arg Gln Gln Pro Thr Ala Pro Ser Trp His Pro Ala Ala Ala Ala Ala
1205 1210 1215
Pro Ala Pro Ala Leu Ser Arg Ala Asp Ser Phe Thr Ala Gly Ala Pro
1220 1225 1230
Pro Ala Leu Ala His Ala Ala Gly Gly Ala Arg Ser Gly His Val Arg
1235 1240 1245
Phe Phe Arg Ser Phe Ser Leu Ala Ala Gly Asn Pro Gly Ile Ala Ala
1250 1255 1260
Val Ser Val Gly Ala Ala Ala Ala Asp Ala Asp Ser Ser His Leu Met
1265 1270 1275 1280
Asp Arg Leu Arg Ala Ala Arg Glu Arg Ala Asn Ser Leu Ser Arg Arg
1285 1290 1295
Arg Val His Ser Ala Glu Leu Ala Pro Gly Asp Leu Leu Ser Gln Ala
1300 1305 1310
Asp Gln Ala Ala Ala Pro Ser Arg Glu Leu Asn Arg Ser Thr Gly Asp
1315 1320 1325
Gly Ala Asp Gly Ala Asp Gly Ala Gly Ile Val Val Arg Gly Gly Gly
1330 1335 1340
Gly Asp Asp Asp Asp Cys Glu Arg Gly Asp Ala Pro Pro Tyr Tyr Arg
1345 1350 1355 1360
Thr Gly Thr Gly Ile Ser Ser Val Ser Gly Met Ala Glu Ser Ala Ala
1365 1370 1375
Ala Ala Ala Ala Ala Ala Asp Arg Pro Asp Gly Leu Val Pro Ser Ala
1380 1385 1390
Ser Gly Arg Ser Val Arg Leu Ala Thr Ala Pro Leu Pro Gly Arg Val
1395 1400 1405
Ser Ala Leu Leu Ala Arg Ser Gly Thr Pro Pro Arg Ala Pro Ser Ser
1410 1415 1420
Ser Gly Val Ser Gly Val Ser Tyr Gly Gly Gly Ser Gly Gly Leu Leu
1425 1430 1435 1440
Gly Lys Ser Gly Gly Gly Leu Val Ser Pro Arg Ser Arg Ser Pro Gly
1445 1450 1455
Pro Gly Asp Ala Gly Pro Gly Ser Gly Val Gly Ala Pro Val Thr Ala
1460 1465 1470
Val Ala Ala Gly Ala Ser Val Ala Ala Ala Ala Ala Asn Ala Ala Gly
1475 1480 1485
Gly Gly Gly Gly Cys Thr Gly Pro Ala Gln Cys Pro Thr Cys Gly Lys
1490 1495 1500
Cys Thr Cys Ala Val Cys Lys Ser Arg Ala Val Ala Ala Ala Gln Ala
1505 1510 1515 1520
Leu Glu Ala Gly Ala Ala Val Val Ala Ala Pro Pro Val Arg Ala Ser
1525 1530 1535
Gly Pro Pro Arg Gly Ala Ser Gly Val Ala Leu Ala Asp Gly Ser Ser
1540 1545 1550
Arg Gly Pro Ser Ser Ala Pro Arg Gly Val Trp Gly Pro Ala Gly Ala
1555 1560 1565
Arg Leu Ala Asn Ser Asn Ile Gly Arg Pro Ser Leu Asp Leu Ala Pro
1570 1575 1580
Ser Ala Arg Ala Trp Ala Ala Ala Asn Ala Asn Ser Thr Ala Ser Ser
1585 1590 1595 1600
Thr Ala Thr Gly Thr Ala Pro Ala Gly Ala Thr Gly Val Ala Gly Thr
1605 1610 1615
Ser Ala Pro Gly Ala Val Lys Gly Pro Ser Asn Ser Ser Val Ala Gly
1620 1625 1630
His Val Ala Ala Thr Ala Ala Ala Ala Ala Gln Phe Ala Ala Phe Ala
1635 1640 1645
Ser Glu Ala Pro Gly Pro Ser Met Gly Val Leu Pro Pro Ala Met Ala
1650 1655 1660
Tyr Ala Ser Arg Arg Gly Gly Arg Gly Gly Gly Ser Asp Ala Ala Gln
1665 1670 1675 1680
Trp Ser Gln Gly Pro Ser Gly Phe Leu Met Ser Thr Gly Gly Thr Val
1685 1690 1695
Gly Gly Gly Gly Gly Gly Thr Gly Ser Gly Gly Ala Glu Ser Arg Arg
1700 1705 1710
Ala Ser Arg Gly Thr Asp Thr Trp Arg Gly His Ala Pro Gly Gln Ala
1715 1720 1725
Ala Met Asp Leu Val Ala Pro Ser Val Thr Leu Ala Pro Tyr Phe
1730 1735 1740
<210> 3
<211> 2118
<212> DNA
<213> Chlamydomonas reinhardti
<400> 3
aattcgatct ggcacgacag gtttcccgac tggaaagcgg gcagtgagcg caacgcaatt 60
aatgtgagtt agctcactca ttaggcaccc caggctttac actttatgct tccggctcgt 120
atgttgtgtg gaattgtgag cggataacaa tttcacacag gaaacagcta tgaccatgat 180
tacgccaagc gcgcaattaa ccctcactaa agggaacaaa agctggagct ccaccgcggt 240
ggcggccgct ctagaactag tggatccact atagggcgaa ttggagctcc accgcggtgg 300
cggccgctct agagacggcg gggagctcgc tgaggcttga catgattggt gcgtatgttt 360
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gcgatggggc gcgcggcgtc cagaaggcgc catacggccc gctggcggca cccatccggt 480
ataaaagccc gcgaccccga acggtgacct ccactttcag cgacaaacga gcacttatac 540
atacgcgact attctgccgc tatacataac cactcagcta gcttaagatc ccatcaagct 600
tgcatgccgg gcgcgccaga aggagcgcag ccaaaccagg atgatgtttg atggggtatt 660
tgagcacttg caacccttat ccggaagccc cctggcccac aaaggctagg cgccaatgca 720
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gttctttact tttttacaag agaagtcact caacatctta aaatggccag gtgagtcgac 840
gagcaagccc ggcggatcag gcagcgtgct tgcagatttg acttgcaacg cccgcattgt 900
gtcgacgaag gcttttggct cctctgtcgc tgtctcaagc agcatctaac cctgcgtcgc 960
cgtttccatt tgcaggatgg ccactccgcc ctccccggtg ctgaagaatt tcgaagcatg 1020
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aaggtggcag ctctgggggc cggggtgggc ttgttgggtg aggctgagcg gctggtgtgg 1200
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cagcggctgg acgtggcggt ggcgctcgcg gggctcgctc gttcgctgca cgcgctggac 1380
tgggagcggt gtccgttcga tcgcagtctc gcggtgacgg tgccgcaggc ggcccgtgct 1440
gtcgctgaag ggagcgtcga cttggaggat ctggacgagg agcggaaggg gtggtcgggg 1500
gagcggcttc tcgccgagct ggagcggact cggcctgcgg acgaggatct ggcggtttgc 1560
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ttgatctgag ccttgccccc tgacgaacgg cggtggatgg aagatactgc tctcaagtgc 1980
tgaagcggta gcttagctcc ccgtttcgtg ctgatcagtc tttttcaaca cgtaaaaagc 2040
ggaggagttt tgcaattttg ttggttgtaa cgatcctccg ttgattttgg cctctttctc 2100
catgggcggg ctggaatt 2118
Claims (9)
1.莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在调控莱茵衣藻镉耐受性中的应用,其特征在于:所述Cre03.g157400.t1.2基因的核苷酸序列为下述序列中的一种:
(1)包含如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列;
(2)包含编码SEQ ID NO:2所示蛋白质的核苷酸序列;
(3)包含与SEQ ID NO:1所示核苷酸序列具有90%以上的同源性且编码相同功能蛋白质的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述Cre03.g157400.t1.2基因的编码蛋白为下述蛋白中的一种:
(1)包含如SEQ ID NO:2所示氨基酸序列;
(2)包含由SEQ ID NO:2所示氨基酸序列经若干个氨基酸的取代、缺失或者增加等变化且衍生出的具有与SEQ ID NO:2所示蛋白相同活性的衍生蛋白。
3.莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在降低莱茵衣藻镉耐受性中的应用,其特征在于:通过降低莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因的表达、使Cre03.g157400.t1.2基因失活或缺失Cre03.g157400.t1.2基因进而降低莱茵衣藻对镉的耐受性。
4.一种降低莱茵衣藻镉耐受性的方法,其特征在于:通过降低莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因的表达、使Cre03.g157400.t1.2基因失活或缺失Cre03.g157400.t1.2基因来降低莱茵衣藻对镉的耐受性。
5.一种莱茵衣藻镉敏感型藻株,其特征在于:所述镉敏感型藻株为不含Cre03.g157400.t1.2基因活性的Cre03.g157400.t1.2基因突变株或Cre03.g157400.t1.2基因缺失株,或Cre03.g157400.t1.2基因表达下降的Cre03.g157400.t1.2基因表达缺陷株。
6.一种莱茵衣藻镉敏感型藻株的获得方法,其特征在于:为下述方法中的一种:
通过插入突变或者定点突变的方法获得莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因突变株;
通过构建Crispr载体进而获得莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因缺失株;
通过构建RNAi干涉载体进而获得莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因表达缺陷株。
7.权利要求5所述的莱茵衣藻镉敏感型藻株在镉污染的监测或检测中的应用。
8.莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在镉污染的监测或检测中的应用。
9.莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在镉污染的治理中的应用。
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Country Status (1)
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Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN116970616A (zh) * | 2023-09-25 | 2023-10-31 | 烟台大学 | 红条毛肤石鳖ArWz-4基因在镉污染监测中的应用 |
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2017
- 2017-11-29 CN CN201711230079.7A patent/CN107760695A/zh not_active Withdrawn
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PB01 | Publication | ||
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SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
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WW01 | Invention patent application withdrawn after publication |
Application publication date: 20180306 |
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