CN107615065B - 对生物材料评估腺病毒或腺相关病毒的病毒类型的非缔合的病毒尺寸颗粒 - Google Patents

对生物材料评估腺病毒或腺相关病毒的病毒类型的非缔合的病毒尺寸颗粒 Download PDF

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Abstract

用于评估生物材料中具有指示特定表位的非缔合的病毒尺寸颗粒的方法和流体样品，所述表位指示腺相关病毒的病毒类型或腺病毒的病毒类型，所述方法使用与表位特异性结合的荧光抗体染色剂，其中对具有病毒尺寸颗粒和荧光抗体染色剂的流体样品进行流式细胞术，以鉴定荧光发射检测事件，该事件指示有非缔合的标记的病毒尺寸颗粒通过流式细胞仪的流动池，该非缔合的标记的病毒尺寸颗粒包含所述病毒尺寸颗粒和荧光抗体染色剂。

Description

对生物材料评估腺病毒或腺相关病毒的病毒类型的非缔合的 病毒尺寸颗粒
交叉引用
本申请要求以下美国临时专利申请的优先权且将它们每一个引入作为参考：序列号62/280,079，名称为FLOW CYTOMETRY METHOD FOR EVALUATING BIOLOGICAL MATERIALFOR UNASSOCIATED PARTICLES OF VIRUS SIZE，2016年1月18日提交，且其代理机构案卷编号为50911-00035；序列号62/280,029，名称为EVALUATING BIOLOGICALMATERIAL FORUNASSOCIATED VIRUS-SIZE PARTICLES OF BACULOVIRUS VIRAL TYPE，2016年1月18日提交，且其代理机构案卷编号为50911-00036；序列号62/280,042，名称为EVALUATINGBIOLOGICAL MATERIAL FOR UNASSOCIATED VIRUS-SIZE PARTICLES OF ADENOVIRUS VIRALTYPE，2016年1月18日提交，且其代理机构案卷编号为50911-00037；序列号62/280,048，名称为EVALUATING BIOLOGICAL MATERIAL FOR UNASSOCIATED VIRUS-SIZE PARTICLES OFADENO-ASSOCIATED VIRUS VIRAL TYPE，2016年1月18日提交，且其代理机构案卷编号为50911-00041；序列号62/273,874，名称为FLOW CYTOMETRY METHOD FOR EVALUATINGBIOLOGICAL MATERIAL FOR UNASSOCIATED PARTICLES OF VIRUS SIZE，2015年12月31日提交，且其代理机构案卷编号为50911-00040；和序列号62/137,102，名称为FLOW CYTOMETRYMETHOD FOR EVALUATING BIOLOGICAL MATERIAL FOR UNASSOCIATED PARTICLES OF VIRUSSIZE，2015年3月23日提交，且其代理机构案卷编号为50911-00027。
技术领域
本发明涉及用于评估生物材料的病毒类型的非缔合的病毒尺寸颗粒的流式细胞术，所述病毒类型为腺病毒或腺相关病毒(AAV)。
背景技术
腺病毒和腺相关病毒是无包膜病毒，其通过流式细胞术特别难以准确定量。所谓量化或定量是指计数和确定各病毒颗粒的浓度。
腺病毒是尺寸大约90至100纳米的非包膜病毒家族，其具有含有尺寸为26至48kbp的双链DNA基因组的的二十面体核衣壳。腺病毒对许多脊椎动物宿主有感染性，包括感染人的许多不同的血清型。腺病毒是用于许多病毒治疗应用的重要病毒，包括用于溶瘤、基因治疗和免疫治疗应用。腺病毒是将遗传负载物递送到特定细胞类型(特别是肿瘤细胞)的主要手段之一。腺病毒具有很高的潜在毒性，对腺病毒进行严格且准确的监测和定量在各个制造阶段以及对于在病毒治疗制剂中的精确给药都是非常重要的。例如，已知腺病毒在人类中，主要在儿童中，引起呼吸系统疾病，并且关键的病毒基因被所需的一种或多种治疗基因所替代是至关重要的。为了避免这个问题，以及避免宿主对载体的免疫应答的可能性，也正在研究非人类的腺病毒毒株。这一点，特别是因为其与定量相关，已经被FDA特别指出：“鉴于腺病毒颗粒本身的潜在毒性，CBER建议基于颗粒数量对患者给药。”(Guidance forHuman Somatic Cell Therapy&Gene Therapy,FDA Centers for Biologics Evaluationand Research,1998.)
腺相关病毒(AAV)是一种小型、无包膜病毒家族，具有约20纳米尺寸和4.7kb单链DNA基因组。AAV具有许多能够感染人宿主中的分裂和静止细胞的血清型。腺相关病毒是用于许多病毒疗法应用的重要病毒，包括作为基因治疗载体。由于极小的体积，腺相关病毒难以检测和准确量化，例如在用于制备重组腺相关病毒和用于给药控制的制造操作中。
腺相关病毒(AAV)通常是非复制型的，复制通常需要存在另外的因子。例如，可以使用一些腺病毒基因的蛋白质在腺病毒存在下复制AAV。使用AAV作为病毒载体的一些优点是不存在致病性、低宿主免疫应答和长期表达。在制造和配制操作过程中精确定量AAV对监测制造建构物的性能和跟踪产品产量以及提供准确的剂量是重要的。即使不是致病性的，感染性病毒剂如腺相关病毒的过量给药也可对患者造成严重问题。
最有问题的步骤之一是在生长、收获、纯化和释放期间定量腺病毒或AAV病毒载体。诸如定量PCR和在260nm和280nm处的吸光度读数的方法是高度可变的，导致在任何给定步骤存在对颗粒过高或过低的评估。制造的后果是产品损失、延误和成本超支，这是为严重的，但仍比不上给药过少(无治疗效果)或过多(不良免疫反应)的产品相关的风险。显然，对于用于载体介导的基因治疗的AAV病毒颗粒的快速、更精确的量化方法有非常关键的需求。
一些其他传统的病毒量化方法包括透射电子显微镜(TEM)和免疫单扩散(SRID)测定。这些传统方法往往具有以下一个或多个限制：耗时、昂贵、高度技术性、结果的高可变性和主观性。推荐通常用于病毒定量的一些较新的方法包括场流分级和多角度光散射(FFF-MALS)、可调电阻脉冲感测(TRPS)和纳米粒子跟踪分析(NTS)。所有这些较新的方法在某些情况下相对于传统的量化方法可以具有一些优点，但也具有限制，包括通常提供有限的病毒数据。在AAV的情况下，因为AAV的非复制性质，通常用作许多病毒的量化测量法的斑块滴度测定通常不是对AAV有用的技术。此外，因为AAV的非复制性质，通常用作许多病毒的量化测量法的斑块滴度测定通常不是腺相关病毒的有用技术。
用于量化AAV的非常常见的方法是定量PCR，但是该技术通常被认为最多提供了颗粒数的间接读数，并且在相同的仪器上对相同样品进行的结果可以变化多达3倍，当样品被不同的硬件和/或不同的实验室人员进行分析时甚至更多(多达10倍)。使用qPCR的能力也常常被超过正常4.7kb基因组大小的构建体的异常包装所混淆。由于qPCR通常低估拷贝数(并且由此推断，低估了颗粒计数)，因此关于注射了超过必需量的AAV颗粒的考虑是有根据的。
使用蛋白质和核酸荧光染色剂的组合进行精心控制的流式细胞术也用于定量各种病毒。流式细胞术是一种分析技术，其中随着颗粒在流体样品中流过，通过通常称为流动池的研究试管时测量颗粒的物理和/或化学性质。虽然可以通过使流体样品经受各种刺激来研究流体样品，但光是一种常见的刺激技术。含有流动池和相关流体流、光输送和光检测组件的装置通常称为流式细胞仪。
已经使用Virus
Figure BDA0001474422350000031
流式细胞仪(ViroCyt，Inc.)来检测多种病毒的游离、非缔合的病毒颗粒(有时称为病毒体)的存在，这是通过非常低且被精确控制的样品穿过流动池的流速且组合使用具有不同荧光发射特征的两种荧光染色剂，其中一种染色剂对于标记核酸具有亲和性，另一种对标记蛋白质具有亲和性。染色剂对于病毒类型是非特异性的，但是对于两种荧光染色剂的两种不同荧光发射的同时检测事件的鉴定可以指示这种非缔合的病毒颗粒穿过流动池。与仅测量颗粒、病毒体或其他颗粒的存在的场流分级和多角度光散射(FFF-MALS)、可调电阻脉冲感测(TRPS)和纳米粒子跟踪分析(NTS)这些技术不同，由于用于计数的染料的性质，Virus
Figure BDA0001474422350000041
流式细胞仪提供更多的生物相关信息。
上述类型的非特异性蛋白质和核酸染料是荧光的。染料分子在游离、未结合状态下仅具有非常弱的荧光响应，但当分子取向在与粒子结合而变得固定时，荧光响应的大小显著增加。从游离、未结合状态到结合状态的荧光响应的这种增加可以是增加一个数量级以上。这允许从未结合的染料分子的背景荧光中鉴定出结合的染料分子的强荧光信号，因为来自未结合的染料分子的荧光响应相对弱得多。
然而，在一些情况下，这种流式细胞术技术有局限性。一个限制是该技术对于无包膜病毒如腺病毒或腺相关病毒的评估不是最佳的。在腺病毒或腺相关病毒上不存在容易获得的包膜蛋白，这可显著限制腺病毒或腺相关病毒定量技术的准确性。
鉴于腺病毒或腺相关病毒作为病毒治疗剂的重要性以及使用这种感染性材料所涉及的潜在风险，将需要快速、便宜且可靠的定量技术。
发明内容
流式细胞术作为定量评估病毒颗粒的有用技术是相对较新的。生物材料的大多数流式细胞术评估涉及到检测和研究尺寸大约为源自多细胞有机体或更大有机体的细胞尺寸的颗粒的性质。这样的颗粒可以是单独的细胞或微球体(通常由诸如胶乳或聚苯乙烯的材料制成)，其被官能化以结合具有较小的感兴趣的生物单元的亲和力。这种微球也有时称为珠粒或微珠。通常在流式细胞术中通过检测和分析从流动池发出的散射光来鉴定细胞或微球颗粒的存在。还已经使用了各种荧光染色技术来提供关于这种颗粒的一些特定生物学特性的附加信息，例如所检测到的细胞或与微球结合的生物材料的特定生物学属性。通过还检测来自荧光染料的特定荧光发射来补充细胞或微球颗粒的光散射检测。一些荧光染料包括结合于感兴趣的特定表位具有结合能力的抗体的荧光分子以用于评估。然而，这些染料往往是荧光团，其无论是否结合于颗粒都表现出高水平的荧光响应。通过流式细胞术有效定量流体样品中的病毒-尺寸颗粒，需要计算病毒尺寸的各个非缔合的颗粒、测量样品流量、并根据测量的颗粒数量和测量的样品流量计算病毒尺寸颗粒的浓度。与荧光染色剂不同，来自未结合的荧光团染色剂的背景信号的存在是一个重大问题。可以使用一些技术来确保检测到的荧光信号与感兴趣的细胞或微球相关联，而不是来自染色的碎片或可能残留在溶液中的游离的未结合的荧光染色剂分子。用所需的荧光染料染色颗粒后，颗粒可以从在溶液中含有残余荧光染色剂分子的液体中分离，例如通过过滤或通过加速沉降，例如通过离心和倾析分离。然后将分离的细胞或微球体颗粒重新悬浮在不含未结合的荧光染色剂的新鲜悬浮液中。此外，可以执行时间相关分析以识别指示存在细胞或微球颗粒的光散射检测和指示存在荧光染色剂的荧光发射检测的同时事件的发生，这有助于确保检测到的荧光信号实际上与细胞或微球的生物材料的性质有关。
然而，已经发现，可以使用荧光抗体染色剂进行腺病毒或腺相关病毒颗粒的流式细胞术定量，并且不进行通过光散射检测的颗粒鉴定，不在病毒颗粒染色后从具有残留的未结合的抗体染色剂的液体中分离染色的腺病毒或腺相关病毒颗粒，且不需要同时检测非特异性蛋白质和核酸染色剂或光散射检测。这有助于实际使用荧光团抗体染色剂来检测和定量颗粒的腺病毒或腺相关病毒的病毒类型，并且不会由于光散射检测或同时检测核酸和蛋白质荧光染色剂而使病毒尺寸颗粒的鉴定复杂化，并且不在染色后从流体样品中的残留未结合的抗体染色荧光团去除染色颗粒。在这种颗粒，特别是AAV颗粒的尺寸非常小的情况下，这是特别显著的。
本发明的一个方面是用于评估生物材料样品的具有特定表位(即特定抗体结合能力，其指示腺病毒或腺相关病毒的病毒类型)的非缔合的病毒尺寸颗粒，例如病毒或病毒样颗粒的方法。该方法包括对包含至少一部分待评估的生物材料样品的流体样品进行流式细胞术，其中流体样品包含能够直接或间接与特定表位结合的荧光抗体染色剂。该流式细胞术可以包括使流体样品流过流式细胞仪的流动池；使流过流动池的流体样品经受能够引起来自荧光抗体染色剂的荧光发射响应的激发辐射；以及在所述荧光发射的波长范围内检测来自所述流动池的辐射并评估所检测到的辐射，以鉴定指示有所述非缔合的标记的病毒尺寸颗粒通过所述流动池的检测事件，该颗粒包含具有所述表位的所述病毒尺寸颗粒和荧光抗体染色剂。每个这样的检测事件对应于单个这样的非缔合的标记的颗粒。
许多特征改进和附加特征适用于本发明的该方面和其它方面。这些特征改进和附加特征可以在本方面的主题中或本发明的任何其它方面中单独使用或以任何组合使用。因此，以下特征中的每一个可以与本方面的任何其他特征或特征的组合或本发明的任何其它方面一起使用，但不是必须。
该方法可以包括制备流体样品，其包含待评估非缔合的病毒尺寸颗粒的存在的生物材料和至少一种荧光抗体染色剂，该荧光抗体染色剂能够通过表位直接或间接与非缔合的病毒尺寸颗粒结合，从而形成在流式细胞术期间可检测的非缔合的标记的病毒尺寸颗粒。制备流体样品可以包括将待评估的生物材料或其一部分与荧光抗体染色剂混合。对流体样品进行流式细胞术可以包括在流动条件下使流体样品流过流式细胞仪的流动池，以使病毒尺寸颗粒单独通过流动池。
被靶向已用于检测的非缔合的病毒尺寸颗粒可以是包括感兴趣的表位的任何病毒尺寸颗粒。该颗粒可以具有多个表位，其中至少一个对于颗粒评估是感兴趣的。多个表位可以在相同的感兴趣的病毒尺寸颗粒上是感兴趣的，并且可以使用相应数量的不同荧光抗体染色剂进行靶向。可以被靶向用于检测的一些非缔合的病毒尺寸颗粒的实例包括病毒颗粒(包括病毒和具有病毒属性的诸如病毒样颗粒的颗粒)。本发明提供的讨论主要通过参考病毒颗粒来举例说明，但是所讨论的原理也适用于具有可以被靶向用于检测的特定表位的其他病毒尺寸颗粒(例如，外来体和其它纳米颗粒)。
该方法的显著优点是，不需要在流式细胞术之前从流体样品中除去溶液中残留的未结合的荧光抗体染色剂。从用于评估的荧光标记的感兴趣的病毒尺寸颗粒分离剩余未结合的荧光抗体染色剂将需要麻烦且耗时的处理，例如超速离心。这与在以前的应用中从较大的标记颗粒如细胞或免疫测定珠中分离抗体染色剂显著不同，并且将荧光抗体染色剂从病毒尺寸颗粒中比在这种较大粒子背景中的分离显著地更复杂、耗时和昂贵。在优选实施方案中，制备流体样品包括，在混合后，在流式细胞术之前，不从流体样品中除去未结合的荧光抗体染色剂，即未结合在非缔合的标记的颗粒中的荧光抗体染色剂(例如在溶液中游离)。换句话说，当对流体样品进行流式细胞术时，来自混合步骤的残余未结合荧光抗体染色剂可以保持在流体样品中，从而以保留在流体样品中。这种未结合的荧光抗体染色剂可以代表在所述混合步骤期间与生物材料混合的多数或甚至大多数荧光抗体染色剂。然而，流式细胞术性能的一个重要考虑是控制该残留的未结合的荧光抗体染色剂分子在溶液中的的浓度，使得来自这种未结合的荧光抗体染色剂分子的荧光发射信号不会覆盖或影响来自非缔合的标记的病毒尺寸颗粒的荧光发射信号，并防止非缔合的标记的颗粒的发射信号变化。在一些优选的实施方案中，进料到流式细胞仪的流体样品可以具有的该未结合的荧光抗体染色剂(未结合在非缔合的标记的颗粒中)的浓度为以下：其范围的下限为0.25微克/毫升、0.5微克/毫升、0.7微克/毫升、1微克/毫升、2微克/毫升、3微克/毫升或5微克/毫升，且上限为10微克/毫升、8微克/毫升、7微克/毫升、6微克/毫升、5微克/毫升、4微克/毫升、3微克/毫升、2.5微克/毫升或2微克/毫升，其中上限大于下限。当流体样品包括多种不同类型的荧光抗体染色剂时，残留的未结合的荧光抗体染色剂的这种浓度可以应用到每种单独的荧光抗体染色剂类型的浓度和/或一部分或全部荧光抗体染色剂的组合浓度。约2、约2.5或约3微克/毫升或在相对较窄的范围内(例如，在0.5微克/毫升以内)高于或低于2、2.5或3微克/毫升的残留的未结合的荧光抗体染色剂的这种浓度可优选用于许多实施方案。在一些优选的实施方案中，进料到流式细胞仪的流体样品可以具有的荧光抗体染色剂的总浓度(包括残留、未结合的荧光抗体染色剂和在非缔合的标记的颗粒中结合的荧光抗体染色剂)为以下：其范围的下限为0.25微克/毫升、0.5微克/毫升、0.7微克/毫升、1微克/毫升、2微克/毫升、3微克/毫升或5微克/毫升且上限为10微克/毫升、8微克/毫升、7微克/毫升、6微克/毫升、5微克/毫升、4微克/毫升、3微克/毫升、2.5微克/毫升或2微克/毫升，其中上限大于下限。约2、2.5或3微克/毫升或在相对较窄的范围内(例如，在0.5微克/毫升以内)高于或低于2、2.5或3微克/毫升的荧光抗体染色剂的这种浓度可优选用于许多实施方案。当流体样品包括多种不同类型的荧光抗体染色剂时，荧光抗体染色剂的这种总浓度可以应用到每种单独的荧光抗体类型的总浓度和/或一部分或全部荧光抗体染色剂的组合浓度。约2、2.5或3微克/毫升或在相对较窄的范围内(例如，在0.5微克/毫升以内)高于或低于2、2.5或3微克/毫升的这种浓度可能优选用于许多实施方案。如将理解的，对于荧光抗体染色剂的这种总浓度或残留的非缔合的抗体染色剂的浓度来说的最佳浓度在特定应用之间可以有所不同，但是规定范围通常可应用于许多应用。特定应用的最佳浓度可以取决于如下变量：例如，靶向的非缔合的病毒尺寸颗粒的浓度、在这种非缔合的颗粒上的表位的量(针对荧光抗体染色剂的结合位点的数量)以及荧光抗体染色剂与非缔合的颗粒上的表位结合的亲和力。在一些优选的实施方案中，进料到流式细胞仪的流体样品可以具有的非缔合的标记的颗粒的浓度为以下：其范围下限为1x 105、1x 106或1x 107个颗粒/毫升，且上限为1x109、1x 108或1x 107个颗粒/毫升，条件是上限大于下限。当流体样品包括具有不同表位(被不同类型的荧光抗体染色剂检测)的多种不同类型的颗粒时，可以将非缔合的标记的颗粒的这种浓度应用于每种颗粒类型的非缔合的标记的颗粒的浓度和/或所有待检测的颗粒类型的一些或全部非缔合的标记的颗粒的组合浓度。在一些优选的实施方案中，当将流体样品送入流式细胞仪时，基本上所有待检测的颗粒类型都是非缔合的标记的病毒尺寸颗粒。在一些优选的实施方案中，当在流式细胞术期间发生指示流式细胞术中非缔合的标记的病毒尺寸颗粒的检测事件时，每分钟存在许多这样的检测事件，其范围下限为每分钟300、1000或10,000次这样的检测事件，并且上限为每分钟325,000或100,000次这样的检测事件。如将理解的，样品流体需要以各种不同的稀释程度运行，以获得所需浓度的非缔合的标记的颗粒和荧光染料(结合和不结合非缔合的标记的颗粒)和每分钟检测事件的适当计数。
本发明公开的方法的另一个优点是可以使用流式细胞术鉴定特定类型的病毒尺寸颗粒(例如，如具有的特定抗原结合能力所示)，而不检测光散射，以鉴定颗粒的存在，例如在鉴定宿主细胞中的病毒类型或附着于微球的病毒类型时的情况。在优选的实施方案中，流式细胞术不包括(不存在)检测光散射，并且可以仅包括检测荧光染色剂的荧光发射或仅检测一种或多种荧光抗体染色剂的荧光发射。
荧光抗体染色剂可以包括连接到抗体分子上的一种或多种荧光组分，该抗体分子特异性结合到腺病毒或腺相关病毒的病毒类型的靶向颗粒的表位。这些荧光组分可以是具有荧光活性任何组分，以作用为附着于抗体分子的荧光标记。荧光组分与抗体分子的连接可以是直接或间接的。连接可以通过化学键或其它附着机制。可以包含在荧光抗体染色剂中的荧光组分的一些实例包括荧光团(荧光化合物)、荧光导电纳米晶体(量子点)、荧光聚合物、荧光藻胆色素和重组荧光蛋白。这里的描述主要参考荧光团的用途进行示例，但是该描述也适用于可附着于抗体分子的其它荧光组分。在荧光团的情况下，该荧光抗体染色剂的每个荧光抗体染色剂的抗体分子可优选包含的附着的荧光团基团(染料分子)的平均数量(F/P比)的范围下限为3、4或5且上限为10、9、8或7，其中5至7的范围对许多应用是优选的。荧光抗体染色剂的抗体分子可以是单克隆或多克隆的。在许多情况下，单克隆抗体可优选用于靶向检测。然而，多克隆抗体对于针对各种病毒血清型的评估的一些应用可以是优选的，例如当单克隆抗体不与全部靶标血清型结合时。荧光抗体染色剂的表位靶标可以在靶标病毒尺寸颗粒的构成蛋白质上或可以为存在于病毒颗粒的组装衣壳中但不存在于单个构成蛋白质中的构象表位。对于腺相关病毒，特别是用于荧光抗体染色剂的一些优选抗体与腺相关病毒的组装衣壳的构象表位结合。特别是在极小尺寸的腺相关病毒的情况下，靶向构象表位有助于区分完整病毒结构与可含有单个蛋白的片段。
靶向用于评估的至少一种病毒类型是腺病毒病毒类型或腺相关病毒病毒类型。可以靶向鉴定的其它一些病毒类型的实例包括杆状病毒、腺病毒、流感病毒、肠病毒、腺相关病毒或诺如病毒，例如在涉及在流体样品中评估两种不同靶标病毒类型的存在的应用中。病毒类型是指针对检测和鉴别的病毒属性的特定类别，并且其可以是家族、亚家族、种或血清型水平或前述的任何可鉴别的子集。作为一些实例，靶标病毒类型可以包括病毒的单一特异性血清型，或者可以包括病毒的多种血清型，它们共享共同的抗原属性以与荧光抗体染色剂相互作用(例如，包含与相同的单克隆荧光抗体染色剂结合的共同表位多种血清型)。所鉴定的不同靶标病毒类型可以代表例如不同的家族、亚家族、属、种或血清型。另一个这样的实例可以是评估作为不同病毒类型的不同种的病毒。
腺相关病毒和腺病毒尤其各自包括许多鉴定的血清型，并且荧光抗体染色剂可靶向腺病毒或腺相关病毒的病毒类型的单一血清型或两种或更多种不同血清型。例如，荧光抗体染色剂可以是单克隆的，并靶向与仅一种血清型相关的特定表位，或者可靶向两种或更多种不同血清型共有的特定表位。作为另一个实例，荧光抗体染色剂可以是多克隆的并能够与不同血清型的不同表位结合。
在一些应用中，腺病毒或腺相关病毒之一的病毒类型的病毒尺寸颗粒可以作为第一病毒类型被靶向，另一病毒类型的病毒尺寸颗粒可以作为第二病毒类型被靶向。
在一些应用中，杆状病毒类型的病毒尺寸颗粒可以作为第二病毒类型被靶向，例如在涉及使用杆状病毒基因表达系统制备的腺病毒的病毒类型或腺相关病毒的病毒类型的病毒样颗粒的应用中。
杆状病毒是长达300nm的杆形状的病毒家族，其特别可用于产生重组蛋白质。杆状病毒通常在昆虫细胞中感染和复制，并且使用基因修饰的杆状病毒表达载体在昆虫细胞系统中表达重组蛋白质是众所周知的技术。杆状病毒也可以被基因修饰以包括哺乳动物启动子以驱动哺乳动物细胞中的重组蛋白表达。包括可用于通过转导到哺乳动物细胞而将插入的遗传物质转移的哺乳动物启动子的修饰的杆状病毒系统通常称为“BacMam”系统，以用于将杆状病毒基因转移到哺乳动物细胞中。
杆状病毒也可用于生产病毒样颗粒，其可以包括多种病毒蛋白质。可以在这种病毒样颗粒中表达的示例性病毒类型包括腺病毒的病毒类型或腺相关病毒的病毒类型。取决于具体过程或过程中的处理阶段，杆状病毒可以是期望的产物或不期望的污染物。在任一情况下，在生产操作中的各个点处对杆状病毒的准确监测和定量对于过程和产品控制都是重要的。当使用利用非特异性的荧光蛋白和核酸染色的组合的现有技术时，在一些杆状病毒蛋白表达系统(例如，BacMam系统)中胎牛血清(FBS)的存在可使来自感兴趣的病毒颗粒中的染色蛋白的荧光信号与来自染色的血清蛋白的高水平的背景荧光信号的区分被显著复杂化。
荧光抗体染色剂可以通过表位直接或间接地与病毒颗粒结合。通过表位直接结合，是指荧光抗体染色剂的抗体部分上的位点与表位结合。通过表位间接结合，是指在表位和荧光抗体染色剂之间存在中间结合单元。例如，中间结合单元可以是与表位直接结合的不同抗体(不同于荧光抗体染色剂的抗体)，并且该荧光抗体染色剂与该抗体结合，从而使荧光抗体染色剂结合至非缔合的标记的颗粒中。
荧光抗体染色剂可以包括荧光成分，例如荧光团，其通过任何方便的激发辐射激发，且在激发辐射的吸收光谱和荧光发射的发射光谱之间具有适当的斯托克斯位移。荧光团可以通过与其中染料处于固定的高度荧光状态的形式的另一分子连接或缀合的荧光染料分子提供。荧光染料可以直接与抗体缀合，或者可以与另外的组分缀合，然后该另外的组分与抗体连接(例如下面讨论的生物素化的荧光抗体染色剂)。
荧光抗体染色剂或者其它也可以使用的荧光染色剂的激发辐射可以在所用的一种或多种荧光染色剂的任何合适的一个或多个波长范围内。当使用多种荧光染料时，优选不同荧光染色剂的发射光谱不重叠或仅最小程度地重叠，从而便于单独检测。激发辐射通常可以在可见或近可见的光谱内(例如，紫外至近红外)。激发辐射的一些示例光源包括提供窄光谱的LED和激光器。各种小型激光器可用作激发辐射源。一些示例性激光器是绿光激光器，例如绿色He-Ne或Nd:YAG激光器。提供激发辐射的其他可能的激光器在以下讨论，例如：Methods in Molecular Biology,Vol.263,Flow Cytometry Protocols,第2版,,Hawley、Teresa S.和Haley Robert G.编辑,Humana Press,2004,第23章"Small Lasersin Flow Cytometry",Telford,William G.,399-418页；Methodsin Cell Biology,Vol.102,Recent Advances in Cytometry,Part A:Instrumentation,Methods,Darzynkiewicz,Zbigniew等人编辑,Elsevier,2011,第15章"Lasers in FlowCytometry",Telford,William G.,375-407页；和Telford,William G.等人,Supercontinuum white light lasers for flow cytometry,Cytometry A.2009May,75(5):450-459.doi:10.1002/cyto.a.20687。
在一些优选的实施方案中，当将两种或更多种不同的荧光染色剂用于单一流体样品时，例如评估不同的生物材料组分(其可以是不同的病毒类型，例如，腺病毒作为一种病毒类型和腺相关病毒作为第二病毒类型，或反之；或者腺病毒或腺相关病毒之一作为一种病毒类型，而第二种病毒类型为不同于腺病毒或腺相关病毒的病毒类型；或两种病毒类型是不同的腺相关病毒血清型或是不同的腺病毒血清型)时，多个荧光染色剂可以优选地被相同的窄谱激发辐射激发，尽管在其它实施方式中，可使用多个激发辐射源或提供多个激发辐射光谱的单个光源(例如，可调白光源)，只要不同荧光染色剂的荧光发射响应可通过该不同的激发辐射光谱区分。许多应用的一些示例性激发辐射可以是包括以下波长之一的窄光谱：350纳米、405纳米、488纳米、532纳米、543纳米、561纳米和635纳米。荧光发射光谱可以包括任何窄的光谱，通常在可见光和近可见光谱内。通常优选荧光染色剂(包括荧光抗体染色剂)的荧光发射光谱相对于该荧光染色剂的激发光谱峰值波长具有显著的峰值波长的斯托克斯位移。波长的斯托克斯位移可以是至少5纳米，至少10纳米，至少20纳米或更多。许多荧光染色剂具有10至50纳米范围内的斯托克斯位移，尽管有些可具有更大的斯托克斯位移。
用于一些病毒类型的荧光抗体染色剂的一些示例性抗体示于表1。
Figure BDA0001474422350000121
荧光抗体染色剂的抗体可以是泛血清型抗体(与多种血清型结合)。来自Takara的多克隆M149产品是抗人A、B型流感的兔多克隆抗体，其为跨越多种流感病毒血清型(包括B型流感病毒和A型流感病毒的多种血清型)的泛血清型。荧光抗体染色剂的单克隆抗体可以是血清型特异性的，或可以在一定程度上是泛血清型。例如，表1中列出的ADK8/9是AAV-8和AAV-9血清型的泛血清型。作为另一个实例，对于腺病毒，荧光抗体染色剂中的抗体例如与存在于多种血清型间的衣壳蛋白结合。例如表1中列出的8C4即为这种情况，其与存在于多种腺病毒血清型间的六邻体蛋白质结合。
可以在荧光抗体染色剂中使用多种荧光团。荧光团可以直接连接到抗体上或通过连接基团连接。这样的连接基团可以是生物素化的抗体上的生物素衍生的连接基团，荧光团缀合的抗生蛋白链菌素可以通过该连接基团与抗体结合。为了便于参考，具有连接到生物素化抗体的荧光团的这种荧光抗体染色剂在本发明中可被称为生物素化的荧光抗体染色剂。表2显示了AlexaFluor产品系列(Life Technologies，Thermo Fisher Scientific)中可以以缀合形式用作荧光团的一些示例荧光染料产品，以及染料分子缀合物的峰值激发(吸收)波长和发射波长。缀合物的斯托克斯位移是这些波长之间的差异：
Figure BDA0001474422350000131
Figure BDA0001474422350000141
以缀合物形式被用作荧光团并与绿色激光激发光源一起使用的一些示例染料(用于多种抗体以产生荧光抗体染色)，被示于表3中。
Figure BDA0001474422350000142
表2和3中列举的任何示例染料或其它染料可与表1中列举的任何示例抗体一起用于荧光抗体染色剂中。
流体样品可以仅包含单一荧光染色剂，其将是荧光抗体染色剂。在替代实施方案中，流体样品可以包含多种荧光染色剂(即，两种或多于两种不同的荧光染色剂)，其中至少一种是荧光抗体染色剂。当使用多种荧光染色剂时，两种或多于两种的荧光染色剂可以是荧光抗体染色剂和/或一种或多于一种可以是荧光抗体染色剂以外的荧光染色剂，例如非特异性荧光染色剂。这种非特异性荧光染色剂的一个实例是用于标记核酸的染色剂。非特异性荧光染色剂，是指对病毒类型不具有特异性的荧光染色剂。可由绿色激光光源激发的一种核酸的非特异性荧光染色剂的实例是来自Life Technologies(Thermo FisherScientific)的POPO-3。当使用多种不同的荧光抗体染色剂时，不同的荧光抗体染色剂可以被指向鉴定不同病毒类型的病毒颗粒，在这种情况下，每种不同的荧光抗体染色剂都能够与不同病毒类型的不同病毒颗粒结合形成不同的非缔合的标记的颗粒。作为一个示例，第一荧光抗体染色剂可以与腺相关病毒结合，而第二荧光抗体染色剂可以与腺病毒结合，反之亦然。多种不同的荧光抗体染色剂也可用于与多种不同的病毒血清型结合。作为一个实例，第一荧光抗体染色剂可以与第一腺相关病毒血清型结合，第二荧光抗体染色可以与第二腺相关病毒血清型结合。作为另一个实例，第一荧光抗体染色剂可以与第一腺病毒血清型结合，并且第二荧光抗体染色剂可以与第二腺病毒血清型结合。流式细胞术可以包括在不同荧光抗体染色剂的不同波长范围内检测来自流动池的辐射，以鉴定指示不同非缔合的标记的颗粒类型(指示不同病毒类型的存在)穿过流动池的检测事件。
可以在液体介质中混合荧光抗体染色剂和用于评估的生物材料，例如在缓冲的含水液体中进行。在混合期间，荧光抗体染色剂可以以荧光团已经连接到抗体的形式提供，或者荧光抗体染色剂可以在混合期间由向混合所提供的前体成分原位形成。荧光抗体染色剂可以在混合期间从这些前体的溶液中形成，然后附着于非缔合的颗粒，和/或可在非缔合的颗粒上形成，以形成非缔合的标记的颗粒。例如，在生物素化的荧光抗体染色剂的情况下，生物素化的抗体染色剂可以预先制备并以预先制备的状态提供至混合物，例如分散在缓冲溶液中的状态，或者生物素化的抗体染色剂的前体可被分别提供至混合，并且可以在混合期间才第一次接触以便原位形成生物素化的抗体。作为一个实例，预先制备的生物素化抗体和预先制备的荧光团:抗生蛋白链菌素缀合物可以单独向混合步骤提供，例如在独立的缓冲溶液制剂中。预先制备的生物素化抗体和预先制备的荧光团:抗生蛋白链菌素缀合物然后可以反应以形成生物素化的荧光抗体染色剂。这种反应可在抗体与非缔合的颗粒结合之前发生，和/或这种反应可在生物素化的荧光抗体已经结合到非缔合的颗粒之后发生，在这种情况下，生物素化的荧光抗体染色剂可以直接在未缔合的颗粒上形成，从而形成非缔合的标记的颗粒，同时形成生物素化的荧光抗体染色剂。当将这些前体单独提供给混合时，可以以适当比例加入前体以提供所需浓度的所得荧光抗体染色剂，优选不含大量的残留的非缔合的荧光团:抗生蛋白链菌素缀合物，其将显著增加额外的背景荧光。
被靶向用于检测的病毒尺寸颗粒可以是病毒颗粒。病毒颗粒是指病毒的各个颗粒(例如病毒体)或病毒样颗粒，病毒类型是指与该类型病毒相关的病毒或病毒样颗粒的特定类型。如将理解的，病毒样颗粒是与病毒相似但是由于缺乏完整的病毒构成(例如病毒遗传物质)而不具有感染性的颗粒。被靶向用于检测的病毒尺寸颗粒可以是具有用于与抗体结合的表位的外来体或其他纳米粒子。
病毒尺寸颗粒或病毒尺寸的颗粒是指尺寸为单个、游离的病毒颗粒或病毒体的数量级的颗粒，通常在几十纳米到几百纳米的范围内。在一些实施方案中，病毒尺寸颗粒可以具有的尺寸范围下限为10纳米、20纳米、40纳米、60纳米、80纳米，且上限为2微米、1微米、600纳米、300纳米、200纳米、100纳米、75纳米或50纳米，只要上限大于下限即可。在一些实施方案中，病毒尺寸颗粒可以具有在该范围内的长度尺寸、直径尺寸或最大截面尺寸中的任何一个或多个。所谓颗粒是非缔合的，是指颗粒不是大于病毒尺寸的较大颗粒结构的一部分，例如非缔合的颗粒不在宿主细胞内，或不与微球体结合，或不为大于病毒尺寸的聚集体的一部分。腺病毒通常具有二十面体形状，直径约90至100纳米。腺相关病毒具有二十面体形状，尺寸约20纳米(直径)。由于存在附着的抗体染色剂，相对于未标记的病毒尺寸颗粒(例如未标记的病毒体或病毒样颗粒)，非缔合的标记的颗粒将会稍大。即使具有结合的荧光抗体染色剂，所述非缔合的标记的颗粒也为病毒尺寸，并且其最大截面尺寸通常可以大于未标记的病毒尺寸颗粒的最大截面尺寸，该未标记病毒尺寸颗粒的最大截面尺寸的范围下限为10纳米、20纳米或30纳米，上限为200纳米、150纳米、100纳米、50纳米或25纳米，其中上限大于下限。例如，相对于未标记的病毒尺寸颗粒，尺寸约为5至10纳米数量级的单个抗体分子通常可将标记的颗粒的最大截面尺寸增加两倍，或增加约10至20纳米。如将理解的，间接结合的抗体染色剂可以由于中间结合基团而使最大截面尺寸增加更大的量。在极小尺寸的腺相关病毒情况下，非缔合的标记的颗粒(包括具有结合的荧光抗体染色剂的腺相关病毒颗粒)例如通常具有与该荧光抗体染色剂所结合的腺相关病毒颗粒相比，约2至4倍大的最大截面尺寸(例如，直径)。
待评估的生物材料可以从任何来源获得。一些示例来源包括：培养病毒的制造操作；制备基因修饰的病毒颗粒(例如，病毒样颗粒)例如用于替代形式的疫苗，其中制备基因修饰的病毒以用于表达重组蛋白质，或用于递送用于病毒治疗的遗传物质；或者制备纯化的病毒尺寸颗粒的批次以测试生物流体制造中的排阻限(exclusion limit)。该方法可以与这样的制造操作相关联或作为其一部分而进行。生物材料可以是对初始生物材料的先前处理的结果，该初始生物材料可以是已经纯化或以其它方式处理的粗物质，以制备对流式细胞术评价的更合适的样品。可以提供生物材料用于以任何方便的形式与荧光抗体染色剂混合，包括在缓冲水溶液中，例如磷酸盐缓冲溶液中，其可以包含一种或多种添加剂或可用于加工的其它试剂。类似地，荧光抗体染色可以以任何方便的形式提供，包括在缓冲溶液中，例如磷酸盐缓冲溶液或其它缓冲溶液中。生物材料可以以纯化形式提供，例如可以由纯化处理产生。这种纯化处理可以如国际专利公开WO2014/210370A1中所公开的，其全部内容通过引用并入本发明。可以提供生物材料以在Tris-HCl缓冲溶液中与荧光抗体染色剂混合(如WO2014/210370A1中所公开用于流式细胞术的)，或可使用不同的缓冲溶液。流式细胞仪可以例如是Virus
Figure BDA0001474422350000171
2100流式细胞仪，或优选为Virus
Figure BDA0001474422350000172
3100流式细胞仪(ViroCyt，Inc.)。这样的流式细胞仪被特别设计为以非常低的样品流速操作以评估流体样品中病毒尺寸颗粒的存在。尽管不太优选，也可以使用其它流式细胞仪，其使得病毒尺寸颗粒充分集中在流体样品流的中心以在流动池中进行研究。配备有用于激发辐射的绿光激光源的其它流式细胞仪的一些实例是
Figure BDA0001474422350000173
NxT(Thermo Fisher Scientific)、
Figure BDA0001474422350000174
Space(Sysmex)和S1000EXi(Stradedigm)。可以包括绿光激光以外的激发辐射源的其它流式细胞仪的一些实例是ACSCaliburTM(Becton Dickinson)、BD LSRFortessaTM(BectonDickinson)、BD FACSCantoTM(Becton Dickinson)、FACSVerse(Becton Dickinson)、GalliosTM(Beckman Coulter)、CyAnTMADP(Beckman Coulter)、SE520EXi(Stratedigm)和SP6800(SONY)。如上所述，流体样品中的生物材料可以是用于增强流式细胞术评估的纯化形式，并且其可以是根据WO2014/210370A1中公开的方法纯化生物材料的粗样品的结果。
制备流体样品可以包括在将用于评估的生物材料与荧光抗体染色剂混合之前纯化生物材料的粗样品，以制备用于进行流式细胞术的流体样品的生物材料。纯化可以包括过滤出粗样品中较大尺寸杂质的颗粒。这种较大尺寸的杂质可以包括大于病毒尺寸颗粒。这种较大尺寸的杂质可包括例如细胞碎片、细菌、分枝杆菌蛋白质聚集体、脂质、脂质组装体、脂质-蛋白质组装体、卵磷脂、脂质-蛋白聚集体、脂质体、核糖体、囊泡、蛋白质-核酸复合物或其它材料。过滤可以包括以下列过滤器分离尺寸或过滤尺寸的过滤：不大于2微米，不大于1.5微米，不大于1.3微米，不大于1微米，不大于0.9微米，不大于0.8微米或不大于0.75微米的过滤。分离尺寸通常可以是至少0.05微米、至少0.1微米、至少0.3微米、至少0.4微米、至少0.5微米、至少0.6微米或至少0.7微米。纯化可以包括层析去除至少一部分较小尺寸的杂质(其可以小于病毒尺寸)。这种较小尺寸的杂质可包括例如蛋白质和/或核酸，以及衍生自病毒的物质，例如来自病毒的片段或碎片。层析去除可包括离心机中的旋转层析。旋转层析可以包括在捕获较小尺寸杂质的色谱介质的存在下离心要纯化的样品，其可以在缓冲溶液中。可以进一步处理包含残留生物材料的上清液，例如通过过滤，或被直接提供以与荧光抗体染色剂混合。
在其它实施方式中，流体样品可以包括未被纯化或未被纯化到显著程度的粗制形式的生物材料样品。即使使用该生物材料的粗样品，标记的病毒尺寸颗粒的荧光抗体染色剂峰值信号的特异性也可以与背景读数区分开。
在一些优选的实施方案中，流式细胞术可以包括以非常低的流体样品流速使流体样品流过流式细胞仪流动池。这样的样品流体流速可以在每分钟250-3000纳升的范围内。如上所述，也可以使用具有较大流速的流式细胞仪，其能够将病毒大小的颗粒集中在流体样品流的中心中以用于在流动池研究。这种流式细胞仪可以例如具有高达1毫升/分钟的流体样品流速。在优选的实施方案中，流式细胞术可以包括用鞘液将流体样品流通过流体动力集中，并使流体样品和鞘液流过流动池。此外，在一些更优选的实施方式中，流式细胞术或该流式细胞术使用的流式细胞仪(例如，Virus
Figure BDA0001474422350000181
3100流式细胞仪)可以采用对如下所述的荧光发射信号的颗粒属性进行评估：国际专利申请号PCT/US2015/033907(公开号WO2015/187783)，标题为FLOW CYTOMTER PEAK SIGNAL IDENTIFICATIONEMPLOYINGDYNAMIC THRESHOLDING，其全部内容通过引用并入本发明。这样，评估使用动态阈值测定以鉴定颗粒计数的峰值信号阈值，并且其特别有利地用于与本发明公开的方法一起使用以定量评估标记的非缔合的病毒尺寸颗粒。已经发现Virus
Figure BDA0001474422350000182
3100流式细胞仪具有以下有利能力：将来自非缔合的标记的病毒尺寸颗粒的荧光响应信号与残留的未结合的荧光抗体染色剂的背景信号区分开来；鉴定指示非缔合的标记的病毒尺寸颗粒通过流式细胞仪流动池的荧光响应检测事件；根据这些检测事件对流体样品中的这种非缔合的标记的颗粒进行计数；并相对于通过流动池的流体样品实时地计算并显示流动样品中非缔合的标记的颗粒的浓度。Virus
Figure BDA0001474422350000183
3100流式细胞仪监测、测量并小心控制流向流动池的流体样品流速，并且与其他流式细胞仪不同，其随着时间的推移使用积分的流速测量数据，以确定通过流动池的样品流体体积，从而用于浓度计算的目的。附加信息在WO2010/132053中提供，其内容通过引用并入本发明。
在一些实施方案中该流式细胞术可包括将检测事件计数为出现了通过流动池的非缔合的标记的每一个颗粒，以确定通过流动池的流体样品体积中非缔合的标记的颗粒的计数；确定与计数相对应的通过流动池的流体样品的体积；和使用非缔合的标记的颗粒的计数确定通过流动池的流体样品体积中非缔合的标记的颗粒的浓度。这样的计数可以相对于对应于检测事件的辐射的检测而实时进行，并且浓度的确定也可以相对于流体样品通过流动池的体积而实时进行。确定通过流动池的流体样品的体积可以包括用流量传感器实时测量流体样品流向流动池的流速，并随时间对所得到的流速测量数据进行积分。可以在不与光散射检测信息关联的情况下鉴定指示非缔合的标记的颗粒通过流动池的检测事件。流式细胞术操作控制和数据采集和分析(例如，鉴定检测事件、计数、确定体积、确定浓度、流速测量数据、积分测量的流速数据)可以由电子控制器执行，例如使用Virus
Figure BDA0001474422350000191
3100流式细胞仪。
流体样品可以包括多种荧光染色剂(两种或更多种荧光染色剂)，其中至少一种是荧光抗体染色剂。在一些实施方案中，荧光染色剂可以是具有第一荧光发射的第一荧光染色剂，并且流体样品可以包含具有不同的第二荧光发射的不同的第二荧光染色剂(以及还可以有不同的第三或甚至更多不同的荧光染色剂)。可以单独检测第一和第二荧光发射。用于第一荧光发射的第一检测事件可以指示第一颗粒性质(例如，表位的存在)，并且用于第二荧光发射的第二检测事件可指示第二颗粒性质(例如，存在不同表位或一些其他性质)。第一和第二检测事件的不同性质可以与存在于单个病毒尺寸颗粒上的两种性质有关(在这种情况下，第一和第二检测事件将与单个颗粒通过流动池的时间重合)或者可以与存在于不同颗粒上的每种性质有关(在这种情况下，第一和第二检测事件不会在时间上重合)。这样的第一和第二荧光染色剂可以被相同波长的激发辐射激发，也可不被激发，尽管为了简化操作，方便地使两种荧光染色剂都被相同窄谱的激发辐射激发。
在一些实施方案中，第一荧光染色剂可以是荧光抗体染色剂，第二荧光染色剂可以是核酸染色剂，其可以是非特异性荧光染色剂。用于第二荧光发射的检测事件可以指示含有用荧光核酸染色剂染色的核酸的病毒尺寸颗粒的通过。可以对第一和第二荧光染色剂的单独检测的结果进行比较，以鉴定与所述第二检测事件在时间上重合的所述第一检测事件的出现，这可以进一步指示同时包含表位和核酸性质的非缔合的标记的颗粒通过流动池，例如其可以指示完整的病毒颗粒。第一和第二检测事件的比较可选地或附加地可以包括鉴定不与第二检测事件在时间上重合的第一检测事件的发生，由于没有遗传物质，这可以例如指示具有表位性质而不具有核酸性质的病毒样颗粒或外来体(或其它纳米颗粒)。第一和第二检测事件的比较可以可选地或另外包括鉴定不与第一检测事件在时间上重合的第二检测事件的出现，这例如可以指示包含核酸性质但不包含表位性质的外来体(或其他纳米颗粒)。
当使用多种荧光染色剂时，会有多种荧光抗体染色剂。例如，具有第一荧光发射的第一荧光抗体染色剂能够与第一表位结合，并且具有第二荧光发射的不同的第二荧光抗体染色剂能够与不同的第二表位结合。也可以使用第三种或更多种额外的荧光抗体染色剂和/或一种或多种非特异性染色剂(例如，非特异性核酸染色剂)，尽管所用的流式细胞仪将需要具有区分所有不同的荧光发射光谱的能力。可以分别检测第一和第二荧光发射。对第一荧光发射的辐射的第一检测事件可以指示包括含第一表位的病毒尺寸颗粒的非缔合的标记的病毒尺寸颗粒的通过，并且对第二荧光发射的辐射的第二检测事件可以指示包括含第二表位的病毒尺寸颗粒的非缔合的标记的病毒尺寸颗粒的通过。在病毒尺寸颗粒同时具有第一和第二表位的情况下，第一和第二检测事件将在时间上重合，而当存在两种不同种类的病毒尺寸颗粒、一种具有第一表位而另一种具有第二表位时，第一和第二检测事件不会在时间上重合。例如，第一表位可以指示第一病毒类型的颗粒，第二表位可以指示不同的第二病毒类型的颗粒。或者，第一和第二表位都可以指示相同的病毒类型，例如当病毒颗粒同时包含第一和第二表位时。例如，第一病毒类型可以是腺相关病毒的病毒类型，第二病毒类型可以是不同病毒(例如，腺病毒或杆状病毒)。或者，例如，第一病毒类型可以是腺病毒，第二病毒类型可以是不同的病毒(例如，腺相关病毒或杆状病毒)。作为另一个实例，第一和第二病毒类型可以是不同的腺相关病毒血清型或第一和第二病毒类型可以是不同的腺病毒血清型。
为了获得关于待评价的生物材料样品的内容的更多的吸接，可以通过流式细胞术分别评估样品的不同部分，其中用于在每一个被不同的流式细胞术评估的不同的流体样品中使用不同的荧光抗体染色剂。以这种方式，可以处理生物材料样品的多个部分以制备不同流体样品的基质以用于流式细胞术，使用不同的荧光染色剂组合，以测试生物材料样品中颗粒性质的不同组合。每种不同的流体样品可以例如包含荧光抗体染色剂与非特异性荧光染色剂(例如，核酸染色剂)和/或与多种荧光抗体染色剂的不同组合。这样的矩阵型评估可以例如用于制备并通过流式细胞术测试一种或多于一种不同标记的流体样品，以评估所需病毒尺寸的产物颗粒的存在和/或评估是否存在不需要的病毒尺寸的污染物颗粒。
包括流式细胞术在内的评估方法可以是包含病毒尺寸颗粒的产品的制造方法的一部分，也可以与其关联进行。这种制造可以包括：在生物生产操作中生成病毒尺寸颗粒；从该生物生产操作收获包含病毒尺寸颗粒的粗产物；和纯化至少一部分该粗产物材料以制备包含病毒尺寸颗粒的纯化产物。这样的纯化产物可以是最终产物，或者可以是可被进一步加工的中间产物。作为制造的一部分或与制造关联而进行的流式细胞术评估可以包括从生产处理的阶段收集生物材料样品(在该阶段病毒颗粒预期将存在于生物材料中)，和评估所述样品是否存在具有特定表位的病毒尺寸颗粒，包括使至少一部分样品进行流式细胞术。包括流式细胞术的这种评估可以例如包括所述特征的任一种或以上所述特征的任何组合。这种制造可以包括进行多次收集以从制造的多个不同阶段收集待评估的不同的所述生物材料样品，且对每个这样收集的待评估的生物材料样品进行评估,包括流式细胞术。以这种方式，可以通过制造处理的各个阶段来验证产品产量和质量，并且处理问题可以被快速鉴定、分析并采取矫正行动。例如，可以在生成或收获期间的第一阶段和在纯化期间或之后的第二阶段进行收集。
包括流式细胞术在内的评估方法可以在不是该制造的一部分或不是与其关联的环境中进行。例如，可以结合研究或诊断活动来执行该方法。
本发明公开的方法的一个应用是当生物材料样品被怀疑包含病毒样颗粒时评估生物材料样品的病毒样颗粒。以下就可以是这种情况，例如在制造病毒样颗粒或包含病毒样颗粒的产品例如以用于疫苗或作为载体(载体)的操作期间或与制造操作有关的期间。
本发明中公开的方法的一个应用是评估生物材料的完整病毒颗粒。这种病毒检测可以是评估病毒污染物和/或评估所需病毒产物的存在。在一个变体中，病毒可以是被编辑用于病毒治疗的病毒。这样的病毒可以是例如抗癌溶瘤病毒，其为用于基因治疗或免疫治疗的病毒载体。
本发明的另一方面是流体制剂形式的组合物，例如用于流式细胞术评估的制剂中的流体样品。该流体制剂包含：
水性液体介质；
水性液体介质中的非缔合的标记的病毒尺寸颗粒，其浓度为1x 105至15x 109个非缔合的标记的颗粒/毫升，其中所述非缔合的标记的颗粒各自包含具有特定表位的病毒尺寸颗粒和对与所述表位直接或间接的结合有特异性的荧光抗体染色剂，所述表位指示腺病毒的病毒类型或腺相关病毒的病毒类型；和
水性液体介质中非缔合状态的荧光抗体染色剂(不结合在非缔合的标记的颗粒)的浓度范围为0.25(或更多)微克/毫升至10(或更少)微克/毫升。
许多特征改进和附加特征适用于本发明的该方面和其它方面。这些特征改进和附加特征可以在本方面的主题或本发明的任何其它方面中单独使用或以任何组合使用。因此，以下特征中的每一个可以但不是必须与本方面的任何其他特征或特征的组合或本发明的任何其它方面一起使用。
这样的流体制剂可以是或具有关于该方法方面的流体样品所描述的任何一个或多个特征。水性液体介质、非缔合的标记的颗粒及其浓度和组分、病毒尺寸颗粒、表位、荧光抗体染色剂和非缔合的浓度的荧光抗体染色剂的浓度可以是或具有关于该方法方面的流体样品描述的任何一个或多个特征。
参照附图以及下面提供的讨论、参照下面描述的实施方式和权利要求书将进一步理解本方面和其它方面的其它特征。
附图简述
图1显示了本发明的流式细胞术方法的一些实施方案的一般流程框图。
图2示出了图1的一般流程中的一些更具体的处理实施方案的流程框图。
图3示出了可以在流式细胞术中与图2所示的流程一起进行的流程实例。
图4示出了图1的一般流程中的一些其他更具体的流程实施方案的过程框图。
图5示出了可以在流式细胞术中与图4所示的流程一起进行的流程实例。
图6示出了图1的一般流程中的一些其他更具体的流程实施方案的过程框图。
图7示出了可以在流式细胞术中与图6所示的流程一起进行的流程实例。
图8示出了图1的一般流程中的一些其他更具体的流程实施方案的流程框图。
图9示出了图8的流程的纯化粗样品步骤中的一些更具体的流程实施方案的流程框图。
图10是总结下面给出的实施例1的结果的图。
图11-12是总结下面给出的实施例2的结果的图。
图13是总结下面给出的实施例3的结果的图。
图14是总结下面给出的实施例4的结果的图。
发明详述
图1显示了用于评估生物材料是否存在目标腺病毒或腺相关病毒的病毒类型的非缔合的病毒颗粒的流式细胞术方法的一般流程框图。图1所示的方法包括制备流体样品102以制备流体样品104，然后对流体样品104进行流式细胞术106的步骤。由制备流体样品102步骤得到的流体样品104包含能够与目标病毒类型的非缔合的病毒颗粒直接或间接结合以形成非缔合的标记的颗粒的荧光抗体染色剂，该非缔合的标记的颗粒可以在流式细胞术106期间检测。制备流体样品102可以包括将待测试的生物材料与至少一种荧光抗体染色剂混合。图2示出了图1所示的一般流程的更具体的示例性实施方案的流程框图，其中制备流体样品102包括混合108步骤，在该步骤期间，待评估的生物材料110与荧光抗体染色剂112混合，该荧光抗体染色剂112能够与指示生物材料110所被评估的目标腺病毒或腺相关病毒的病毒类型的表位直接或间接结合。随着被引入混合108中，生物材料110可以以适于处理的浓度存在于缓冲溶液中，并且可以是来自生物材料的初始粗样品的先前处理的结果。可以将生物材料110进料到混合108中的这种溶液也可以包含在处理期间有用的其它添加剂或试剂。同样，可以将荧光抗体染色剂在适当缓冲的溶液中与一种或多种添加剂或其它试剂一起提供至混合108步骤。例如，在混合108之前，荧光抗体染色剂112可以在缓冲溶液中提供，该溶液还包含用于稳定、有助于保护或分散荧光抗体染色剂112的试剂。例如，荧光抗体染色剂112可以在含有抗凝聚剂(例如牛白蛋白)和/或抗微生物剂(例如叠氮化钠)的缓冲溶液中提供。缓冲溶液可以是磷酸盐缓冲溶液或在适当的PH下的其它缓冲溶液。
图3示出了可以在图2的示例性实施方式的流式细胞术106期间进行的流程的实例。如图3所示，通过流式细胞仪的流动池114的流体样品104流在流动池114中经受激发辐射116，例如来自激光、LED或其他光源的激发辐射。在图3所示的示例中，通过流动池114的流体样品104的流沿着流动箭头118的方向。检测器系统120包括用于在荧光抗体染色剂112的荧光发射的波长范围内检测来自流动池的辐射的光学组件。图3中示出了非缔合的标记的病毒尺寸颗粒122的通过，该非缔合的标记的颗粒122包括腺病毒或腺相关病毒的病毒类型的病毒颗粒并且具有与其结合的荧光抗体染色剂。图3还示出了光电检测器的输出(C1)的示例时间图124，其检测荧光发射并且在时间t1显示与该非缔合的标记的颗粒122通过流动池114对应的峰值电压。另外为了说明的目的，图3示出了流体样品104中的残留的、未结合的荧光抗体染色剂112，这会造成时间图124中的一些更大的背景峰值。。
进行流式细胞术106的图1的流体样品104可以使用两种或更多种不同的荧光染色剂制成，其中至少一种是用于腺病毒或腺相关病毒病毒类型的荧光抗体染色剂。图4示出了与图2所示相同的示例流程，除了在混合108期间将第二荧光染色剂126提供给混合108步骤以使其包含在进行流式细胞术106的流体样品104中。在图4所示的实例中，第二荧光染色剂126是对于病毒类型没有选择性的核酸的染色剂。第二荧光染色剂126可以是荧光染色剂，并且可以在具有荧光抗体染色剂112的单一制剂中提供，或者可以以独立的制剂提供。在优选的流程情况下，可将荧光抗体染色剂112和第二荧光染色剂126提供在单一制剂中，例如具有所需比例的单一缓冲溶液中，以被包含在流体样品104中。图5示出了图4的流式细胞术106的流程的示例。如图5所示，通过流动池114的流体样品104的流在流动池114中经受激发辐射116。在图5所示的图示中，检测系统120包括用于检测来自荧光抗体染色剂112的荧光发射的第一光电检测器和用于检测来自第二荧光染色剂的不同荧光发射的第二光电检测器。图5显示了非缔合的标记的颗粒128的实例，该颗粒包含其上附着有荧光抗体染色剂112和第二荧光染色剂126的腺病毒或腺相关病毒的病毒类型的病毒颗粒。图5显示第一时间图130和第二时间图132，第一时间图130具有检测来自荧光抗体染色剂112的荧光发射的第一光电检测器的示例性输出(C1)，第二时间图132显示检测来自第二荧光染色剂126的荧光发射的第二光电检测器的示例性输出(C2)。在第一时间图130和第二时间图132中的时间t2处的电压峰的时间重合指示非缔合的标记的颗粒128通过流动池114。在第二时间图132中显示的时间t1和t3处的电压峰值指示含有第二荧光染色剂但不含有荧光抗体染色剂112的颗粒通过流动池114。可包含第二荧光染色剂126而不是荧光抗体染色剂112的这种颗粒可以是例如与非缔合的标记的颗粒128的病毒颗粒的病毒类型不同的病毒类型的病毒颗粒。时间图130中显示的更大背景幅度和更大背景峰可以指示未结合的荧光抗体染色剂112通过流动池114。为了说明的目的，图5显示在穿过流动池114的流体样品104中存在的该未结合的荧光抗体染色剂112。第二时间图132包括具有较小背景峰的背景图案，其指示第二荧光染色剂，该第二荧光染色剂是当不附着在颗粒的核酸时提供非常少的背景荧光发射的荧光材料。
图6示出了与图4所示相同的示例流程，不同之处在于提供给混合步骤108的第二荧光染色剂是第二荧光抗体染色剂134，其特异结合至与荧光抗体染色剂112不同的病毒类型的病毒颗粒的表位(例如不同于腺病毒或腺相关病毒或为不同腺病毒或腺相关病毒的不同血清型)。可以使用如图6所示的流程来区分存在于生物材料110中的不同病毒类型的病毒颗粒的存在并定量流体样品中两种不同类型中每一种的病毒颗粒。图7示出了可以在图6所示的流程实例的流式细胞术106期间发生的流程的实例。图7与图5相同，除了显示流体样品104，其包含示例性的第一类型的非缔合的标记的颗粒136和第二类型的非缔合的标记的颗粒138，该第一类型的非缔合的标记的颗粒136包含具有与其连接的荧光抗体染色剂112的第一病毒类型的腺病毒或腺相关病毒的病毒颗粒，该第二类型的非缔合的标记的颗粒138包含附着有第二抗体染色剂134的第二病毒类型的病毒颗粒。图7示出了第一时间图140和第二时间图142，第一时间图140示出了检测荧光抗体染色剂112的荧光发射的第一光电检测器的示例性输出(C1)，第二时间图142示出检测来自第二抗体染色剂134的荧光发射的第二光电检测器的示例性输出(C2)。为了说明的目的，图7中的流体样品104显示为包含非缔合的第一荧光抗体染色剂112和非缔合的第二荧光抗体染色剂134。如图7所示，在时间t1的第一时间图140上的电压峰指示第一类型的非缔合的标记的颗粒136通过流动池114，并且在第二时间图142中显示的t2处的电压峰值指示第二类型非缔合的标记的颗粒138通过流动池114。
图8示出了根据图1所示的一般流程的流程示例，其中制备流体样品102包括在混合108之前纯化粗样品的步骤144。在纯化粗样品144期间，生物材料的粗样品146进行纯化处理以去除可能干扰流式细胞术106的至少一部分杂质，以制备更纯形式的生物材料110，从而在混合108期间与荧光抗体染色剂112混合，以制备流体样品104。为了说明的目的，图8中的流程包括向混合108提供第二荧光染色剂148以使其包含在流体样品中。第二荧光染色剂148可以是不同于荧光抗体染色剂112的第二荧光抗体染色剂，或可以是非特异性荧光染色剂，例如核酸染色剂。生物材料146的粗样品可以用缓冲溶液或其它试剂以稀释形式提供也可以不以稀释形式提供，并且在引入纯化粗样品144步骤之前可以经过处理或可以不经过处理。
图9显示了可以在图8所示的一般流程的纯化粗样品144步骤期间进行的流程的实例。在图9所示的实例流程中，纯化粗品样品144包括层析去除步骤150，然后是过滤步骤152。在层析去除150期间，通过色谱法从生物材料146的粗样品中除去较小尺寸的杂质154，其中较小尺寸的杂质154被保留在色谱介质中。较小尺寸的杂质可以是小于病毒尺寸的杂质。然后对来自层析去除150的经处理的液体156进行过滤152，以过滤出较大尺寸的杂质158。较大尺寸的杂质158可以作为过滤器保留物被去除，并且提供给混合108的生物材料110可以是或包含来自过滤152的滤液或其部分，其有或没有进一步的处理。
实施例
在下面的实施例中，在Virus
Figure BDA0001474422350000261
3100流式细胞仪(ViroCyt，Inc.)上进行流式细胞术测试。在这些实施例中提及的图中绘制病毒颗粒浓度相对稀释因子的图是对数图。在染色后不洗涤染色的病毒样品，且不检测光散射以辅助颗粒检测的情况下进行使用荧光抗体染色剂的流式细胞术测试。除了下面另有说明，这些实施例中的荧光抗体染色剂通常包含的附着的染料分子(荧光团)相对于的平均数量基于荧光抗体染色剂中的每个抗体分子的平均数量(F/P比例)为3至7。这些实施例中提供的荧光抗体染色剂浓度是样品中的总浓度。应当理解，一些这种荧光抗体染色剂附着并染色样品中的病毒颗粒，但当样品进行流式细胞术时，样品中的大多数荧光抗体染色剂通常将处于未结合状态。这些实施例中的所有样品流体用缓冲溶液制备为pH在pH7至pH8的范围内。
实施例1-2:
在以下实施例1和2中，使用包含与Alexa Fluor 532染料(在以下称为CF-A20抗体染色剂)缀合的抗AAV-2单克隆抗体A20(PROGEN Biotechnik)的荧光抗体染色剂进行流式细胞术测试来评估腺相关病毒血清型2(AAV-2)。A20是AAV-2和AAV-3的组装衣壳的构象表位的抗体。
实施例1:
相对于对A20抗体无抗原性的AAV-5和AAV-9的对照，使用荧光抗体染色剂CF-A20对AAV-2测试制剂进行对比流式细胞术测试。使用从不同商业来源获得的AAV-2制备两种不同的AAV-2测试制剂。对于所有测试，测试溶液中的CF-A20抗体染色剂(结合和未结合至AAV-2)的总浓度为约2.5微克/毫升。对于每个稀释系列，以病毒储液的不同稀释度制备五种测试溶液，以提供五种不同的病毒浓度，从而用于在缓冲溶液中测试。对于特异性对照，针对AAV-5和AAV-9血清型以及包含CF-A20但无任何类型的病毒的缓冲溶液测试荧光抗体染色剂。
结果总结在图10中，其显示，对于CF-A20染色试验和对照，通过流式细胞术测定的每个AAV-2样品的AAV-2浓度为稀释因子的函数。纵轴和横轴均为对数刻度。如图10所示，对于两个AAV-2测试制剂中的每一个，CF-A20测试指示的AAV-2浓度接近。图10还总结了相对于流式细胞仪的近似检测下限(约105.5个颗粒/毫升)的对照制剂的数据。结果表明，来自抗体染色剂处理的AAV-2样品的数据在不同的AAV-2来源之间是相当一致的。此外，抗体未能结合AAV-5或AAV-9，证实了相对于那些其他血清型，荧光抗体染色剂对AAV-2的特异性。此外，当添加到空白培养基中时，荧光抗体染色剂不会将背景增加到不可接受的水平。
实施例2:
针对包含约1x 105至1x 108个AAV-2颗粒/毫升的AAV-2溶液的滴定使用多种抗体染色剂浓度进行流式细胞术稀释系列。每个稀释系列包括对以不同稀释度的AAV-2储液制备的200微升样品进行流式细胞术，每个稀释系列中的所有样品含有相同浓度的荧光抗体染色剂。三种稀释系列以抗体染色剂浓度为约0.91、1.82和2.73微克CF-A20抗体染色剂/毫升样品运行。进行流式细胞术测试以检测和评估染色的AAV-2的荧光发射。每个稀释系列的流式细胞术测试结果总结在图11和12中。图11显示了通过流式细胞术确定的样品的未校正AAV-2浓度(病毒颗粒/毫升)的图，而图12显示相同数据的图，但校正了稀释因子。两个图都是对数图。图11和图12在中间稀释因子处都显示出一般良好的结果(接近线性拟合)，图12所示的针对稀释进行校正的流式细胞术结果接近中间稀释因子的AAV-2储液的实际AAV-2浓度。在较低的稀释因子(样品中更高的AAV-2浓度)和更高的稀释因子(样品中较低的AAV-2浓度)结果趋于不佳，这可表明，由于一些AAV-2颗粒在较低的稀释因子下聚集而导致计数更低，和由于在较高稀释因子处来自未结合的抗体染色剂的背景信号的可能干扰导致计数更高。
实施例3-4:
在以下实施例3和4中，进行流式细胞术测试以评估多种腺病毒血清型，其使用8C4单克隆抗体-CF 532缀合物(以下称为CF-8C4)作为荧光抗体染色剂。8C4抗体对腺病毒的六邻体蛋白具有特异性，并且对于不同的腺病毒血清型(至少针对血清型2至6进行测试)是有效的。
实施例3:
使用荧光抗体染色剂CF-8C4在含有不同腺病毒血清型的两种不同的测试制剂上对腺病毒测试制剂进行对比流式细胞术检测。一个测试制剂包括腺病毒血清型4，另一个测试制剂包含腺病毒血清型5。对于所有测试，测试溶液中CF-8C4抗体染色剂(结合和未结合到腺病毒)的总浓度为约2.5微克/毫升。对于每个测试制剂，对于每个稀释系列，以病毒储液的不同稀释度制备4种测试溶液，以提供四种不同的病毒浓度以用于在缓冲溶液中对每种测试制剂测试。
结果总结在图13中，其显示了通过流式细胞术测定的每种不同血清型的稀释系列中每种稀释度的腺病毒浓度作为稀释因子的函数。纵轴和横轴均为对数标度。如图13所示，每个稀释系列的浓度几乎落在指示CF-8C4与两种血清型结合的线上，但数据倾向于在浓度处于或低于流式细胞仪检测限(约105.5个颗粒/毫升)的高稀释因子时偏离。
实施例4：
相对于对8C4抗体无抗原性的流感病毒和慢病毒的对照，使用与实施例1(CF-8C4)中使用的相同的荧光抗体染色剂在腺病毒测试制剂上进行对比流式细胞术测试。测试制剂中使用的腺病毒是血清型4。对于所有测试，测试溶液中CF-8C4抗体染色剂(结合和未结合到腺病毒)的总浓度为约2.5微克/毫升。对于每个稀释系列，以腺病毒储液的不同稀释度制备6种测试溶液，以提供6种不同的病毒浓度，从而用于在缓冲溶液中测试。对于特异性对照，针对流感和慢病毒类型的无关病毒测试荧光抗体染色剂。
结果总结在图14中，其显示了通过流式细胞术测定的每种稀释度的腺病毒浓度作为不同测试制剂的稀释因子的函数。纵轴和横轴均为对数标度。如图14所示，对于腺病毒，稀释系列的浓度曲线显示出良好的线性。图14还总结了对照制剂相对于流式细胞仪的近似检测下限(约105.5个颗粒/毫升)的数据，表明荧光抗体染色剂未能结合流感病毒和慢病毒对照，证实了荧光抗体染色剂的特异性。
示例实施方案组合
可以是具有或不具有如上所公开的额外特征的权利要求的主题的一些示例性实施方案组合以及各种类型的实施应用总结如下：
1.评估生物材料样品中的具有病毒类型的特定表位的非缔合的病毒尺寸颗粒的方法，所述病毒类型选自以下：腺病毒的病毒类型或腺相关病毒的病毒类型，该方法包括:
对包含该生物材料样品至少一部分的流体样品进行流式细胞术，其中所述流体样品包含能与特定表位直接或间接结合的荧光抗体染色剂，所述流式细胞术包括:
使流体样品流过流式细胞仪的流动池；
使流过流动池的流体样品经受能引起源自荧光抗体染色剂的荧光发射响应的激发辐射；和
在所述荧光发射的波长范围内检测来自所述流动池的辐射，并评估所检测到的辐射，以鉴定指示有非缔合的标记的病毒尺寸颗粒通过流动池的检测事件，该颗粒包含具有所述表位的所述病毒尺寸颗粒和所述荧光抗体染色剂。
2.根据示例实施方案组合1的方法，其中所述生物材料样品被怀疑包含病毒样颗粒。
3.根据示例实施方案组合2的方法，其中所述病毒尺寸颗粒为病毒样颗粒。
4.根据示例实施方案组合3的方法，其中所述生物材料包含与病毒样颗粒不同病毒类型的病毒颗粒。
5.根据示例实施方案组合4的方法，其中：
所述荧光抗体染色剂为第一荧光抗体染色剂，所述表位为第一表位，所述非缔合的标记的颗粒为第一非缔合的标记的颗粒，所述荧光发射为第一荧光发射，所述检测为第一检测，所述检测事件为第一检测事件且所述病毒颗粒具有与第一表位不同的第二表位；
所述流体样品包含不同于第一荧光抗体染色剂且能够与第二表位直接或间接结合的第二荧光抗体染色剂，该第二荧光抗体染色剂具有对激发辐射的第二荧光发射响应，其与第一荧光发射响应不同；且
所述流式细胞术包括第二检测，其在第二荧光发射的波长范围内检测源自流动池的第二辐射，以及评估所检测到的第二辐射以用于检测事件，所述检测事件指示有第二非缔合的标记的病毒尺寸颗粒穿过流动池，该第二非缔合的标记的病毒尺寸颗粒包括所述病毒颗粒和第二荧光抗体染色剂。
6.根据示例实施方案组合4或实施方案组合5的方法，其中所述病毒颗粒为杆状病毒类型。
7.根据示例实施方案组合4-6任一项的方法，其中所述表位为第一表位，所述流式细胞术为第一流式细胞术，所述流体样品为包含所述生物材料样品的第一部分的第一流体样品，所述非缔合的标记的颗粒为第一非缔合的标记的颗粒且所述激发辐射为第一激发辐射，且该方法包括:
对包含生物材料样品的第二部分的第二流体样品进行流式细胞术，其中所述流体样品包含第二荧光抗体染色剂，该第二荧光抗体染色剂不同于第一抗体染色剂且能够直接或间接结合与第一表位不同的第二表位，第二流式细胞术包括:
使第二流体样品流过流式细胞仪的流动池；
使流过流动池的第二流体样品经受第二激发辐射，该第二激发辐射与第一激发辐射相同或不同，且能够从第二荧光抗体染色剂引起第二荧光发射响应，该第二荧光发射响应与第一荧光发射响应不同；和
在所述荧光发射的波长范围内检测来自所述流动池的辐射，并评估所检测到的辐射，以鉴定指示有第二非缔合的标记的病毒尺寸颗粒穿过流动池的检测事件，该第二非缔合的标记的病毒尺寸颗粒包含具有第二表位的病毒尺寸颗粒和第二荧光抗体染色剂。
8.根据示例实施方案组合7的方法，其中:
所述第一和第二流体样品各自包含至少两种不同的荧光抗体染色剂以与两种不同的表位直接或间接结合；且
第一和第二流体样品各自包含至少一种不在彼此另一所述流体样品中的荧光抗体染色剂。
9.根据示例实施方案组合8的方法，其中各个所述流体样品的至少两种荧光抗体染色剂靶向检测所述流体样品中的至少两种不同类型的病毒尺寸颗粒，且至少一种所述类型的颗粒在第一样品流体和第二样品流体之间不同。
10.根据示例实施方案组合4-9任一项的方法，其中所述生物材料样品为从用于产生病毒样颗粒的生产操作的阶段收集的样品，预期在该阶段过程中该病毒样颗粒存在于生物材料中。
11.制备包含病毒样颗粒的产品的方法，该方法包括:
生产处理以制备包含病毒样颗粒的纯化产物，所述生产处理包括:
在生物生产操作中生成病毒样颗粒；
从该生物生产操作收获粗产物，其包含在生成过程中产生的病毒样颗粒；
纯化至少一部分该粗产物材料以制备包含病毒样颗粒的纯化产物；
从生产处理的阶段收集生物材料样品，预期在该阶段过程中病毒样颗粒存在于生物材料中；
评估所述样品是否存在具有特定表位的病毒尺寸颗粒，所述评估包括进行根据示例实施方案组合4-10任一项的方法。
12.根据示例实施方案组合11的方法，包括将所述收集进行多次以从多个不同的所述阶段收集不同的待评估的所述生物材料样品且对每个待评估的所述收集的生物材料样品进行所述评估。
13.根据示例实施方案组合12的方法，其中所述多个不同的所述阶段至少包括在所述生成或收获过程中的第一阶段和在所述纯化过程中或之后的第二阶段。
14.根据示例实施方案组合1的方法，其中所述病毒尺寸颗粒为腺病毒或腺相关病毒的病毒颗粒。
15.根据示例实施方案组合14的方法，其中：
所述荧光抗体染色剂为第一荧光染色剂，所述荧光发射为第一荧光发射，所述检测为第一检测且所述检测事件为第一检测事件；
所述流体样品包含用于核酸的第二荧光染色剂，该第二荧光染色剂当附着于核酸时针对激发辐射具有第二荧光发射响应，该第二荧光发射响应不同于第一荧光发射响应；且
所述流式细胞术包括第二检测，其在第二荧光发射的波长范围内检测源自流动池的第二辐射，以及评估检测到的第二辐射，以评估指示有用第二荧光染色剂染色的包含核酸的病毒尺寸颗粒通过的检测事件；和
比较第一检测和第二检测的结果，以用于鉴定所述第一检测事件与所述第二检测事件是否发生时间上的重合，其进一步指示有包含所述病毒颗粒的所述非缔合的标记的颗粒通过流动池。
16.根据示例实施方案组合15的方法，其中：
所述荧光抗体染色剂为第一荧光抗体染色剂，所述病毒类型为第一病毒类型，所述表位为第一表位，所述荧光发射为第一荧光发射，所述检测为第一检测且所述检测事件为第一检测事件；
所述流体样品包含第二荧光抗体染色剂，该第二荧光抗体染色剂不同于第一荧光抗体染色剂且能够与不同于第一表位的第二表位直接或间接结合，该第二荧光抗体染色剂对激发辐射具有第二荧光发射响应，该第二荧光发射响应与第一荧光发射响应不同；且
所述流式细胞术包括第二检测，其在第二荧光发射的波长范围内检测源自流动池的第二辐射，以及评估检测到的第二辐射，以评估指示有非缔合的标记的病毒尺寸颗粒通过流动池的检测事件，该非缔合的标记的病毒尺寸颗粒包含具有第二表位的病毒尺寸颗粒和第二荧光抗体染色剂。
17.根据示例实施方案组合16的方法，其中所述第一和第二表位指示不同于第一病毒类型的第二病毒类型。
18.根据示例实施方案组合17的方法，其中所述第一病毒类型为腺相关病毒的病毒类型且第二病毒类型为腺病毒的病毒类型。
19.根据示例实施方案组合17的方法，其中所述第一病毒类型为腺病毒的病毒类型且第二病毒类型为腺相关病毒的病毒类型。
20.根据示例实施方案组合17的方法，其中所述第一表位指示第一腺相关病毒血清型且第二表位指示不同的第二腺相关病毒血清型。
21.根据示例实施方案组合17的方法，其中所述第一表位指示第一腺病毒血清型且第二表位指示不同的第二腺病毒血清型。
22.根据示例实施方案组合14的方法，其中所述表位为第一表位，所述流式细胞术为第一流式细胞术，所述流体样品为包含所述生物材料样品第一部分的第一流体样品，所述非缔合的标记的颗粒为第一非缔合的标记的颗粒且所述激发辐射为第一激发辐射，且该方法包括:
对包含生物材料样品第二部分的第二流体样品进行流式细胞术，其中所述流体样品包含第二荧光抗体染色剂，该第二荧光抗体染色剂不同于第一抗体染色剂且能够直接或间接结合不同于第一表位的第二表位，第二流式细胞术包括:
使第二流体样品流过流式细胞仪的流动池；
使流过流动池的第二流体样品经受第二激发辐射，该第二激发辐射与第一激发辐射相同或不同，且能够从第二荧光抗体染色剂引起第二荧光发射响应，该第二荧光发射响应不同于第一荧光发射响应；和
在所述荧光发射的波长范围内检测来自所述流动池的辐射并评估所检测到的辐射，以鉴定指示有第二非缔合的标记的病毒尺寸颗粒通过流动池的检测事件，该第二非缔合的标记的病毒尺寸颗粒包含具有第二表位的病毒尺寸颗粒和第二荧光抗体染色剂。
23.根据示例实施方案组合22的方法，其中:
所述第一和第二流体样品各自包含至少两种不同的荧光抗体染色剂以与两种不同的表位直接或间接结合；且
第一和第二流体样品各自包含至少一种不在彼此另一所述流体样品中的荧光抗体染色剂。
24.根据示例实施方案组合23的方法，其中各个所述流体样品的至少两种荧光抗体染色剂靶向检测所述流体样品中的至少两种不同类型的病毒尺寸颗粒，且至少一种所述类型的颗粒在第一样品流体和第二样品流体之间不同。
25.根据示例实施方案组合24的方法，其中第一流体样品中的至少一种荧光抗体染色剂靶向检测腺病毒的病毒类型或腺相关病毒的病毒类型的第一病毒类型的表位，且第二流体样品中的至少一种荧光抗体染色剂靶向检测不同于第一病毒类型的第二病毒类型的表位。
26.根据示例实施方案组合24的方法，其中:
第一流体样品中的至少一种荧光抗体染色剂靶向检测腺相关病毒血清型的表位，且第二流体样品中的至少一种荧光抗体染色剂靶向检测不同的腺相关病毒血清型；或者
第一流体样品中的至少一种荧光抗体染色剂靶向检测腺病毒血清型的表位，且第二流体样品中的至少一种荧光抗体染色剂靶向检测不同的腺病毒血清型。
27.根据示例实施方案组合14-26任一项的方法，其中所述生物材料样品为在用于产生病毒颗粒的生产操作的阶段收集的样品，预期在该阶段中病毒颗粒存在于生物材料中。
28.制备包含腺病毒或腺相关病毒的病毒颗粒的产品的方法，该方法包括:
生产处理以制备包含所述病毒颗粒的纯化产物，所述生产处理包括:
在生物生产操作中生成病毒颗粒；
从该生物生产操作收获粗产物，其包含在该生成过程中产生的病毒颗粒；
纯化至少一部分该粗产物材料以制备包含腺相关病毒颗粒的纯化产物；
从生产处理的阶段收集生物材料样品，预期在该阶段中病毒颗粒存在于生物材料中；
评估所述样品是否存在具有特定表位的病毒尺寸颗粒，所述评估包括进行根据示例实施方案组合14-28任一项的方法。
29.根据示例实施方案组合28的方法，包括将所述收集进行多次以从多个不同的所述阶段收集不同的待评估的所述生物材料样品，且对每个待评估的所述收集的生物材料样品进行所述评估。
30.根据示例实施方案组合29的方法，其中所述多个不同的所述阶段至少包括在所述生成或收获过程中的第一阶段和在所述纯化过程中或之后的第二阶段。
31.根据示例实施方案组合28-29任一项的方法，其中所述病毒颗粒的腺病毒或腺相关病毒已被修饰以表达重组蛋白。
32.根据示例实施方案组合1-31任一项的方法，其中所述流体样品中的生物材料为去除了较大尺寸组分的纯化生物材料，过滤尺寸不大于2微米，且该流体样品包含的未结合在非缔合的标记的颗粒中的荧光抗体染色剂的浓度范围为0.25微克/毫升流体样品至10微克/毫升流体样品。
33.根据示例实施方案组合1-32任一项的方法，其中进样至流式细胞仪的所述流体样品包含的荧光抗体染色剂的总浓度范围为0.25微克/毫升至10微克/毫升。
34.根据示例实施方案组合1-33任一项的方法，其中所述病毒尺寸颗粒为腺相关病毒的病毒类型，且该非缔合的标记的颗粒具有的最大截面尺寸范围为10纳米至100纳米。
35.根据示例实施方案组合1-33任一项的方法，其中所述病毒尺寸颗粒为腺病毒的病毒类型，且该非缔合的标记的颗粒具有的最大截面尺寸范围为80纳米至200纳米。
36.根据示例实施方案组合1-35任一项的方法，其中所述激发辐射包括在520纳米至550纳米的波长范围内的辐射。
37.根据示例实施方案组合1-36任一项的方法，其中所述荧光发射具有的斯托克斯位移为至少10纳米的波长。
38.根据示例实施方案组合1-37任一项的方法，其中进样至流式细胞仪的流体样品包含的未结合在非缔合的标记的颗粒中的荧光抗体染色剂的浓度范围为0.25微克/毫升至10微克/毫升。
39.根据示例实施方案组合1-38任一项的方法，其中进样至流式细胞仪的流体样品具有的非缔合的标记的颗粒的浓度范围为1x 105至1x 109个颗粒/毫升。
40.根据示例实施方案组合1-39任一项的方法，其中所述荧光抗体染色剂包含附着至抗体分子的荧光团。
41.根据示例实施方案组合40的方法，其中所述荧光抗体染色剂在该荧光抗体染色剂中每个抗体分子平均包含3至8个附着的荧光团。
42.根据示例实施方案组合40或示例实施方案组合41的方法，其中所述抗体分子为单克隆的。
43.根据示例实施方案组合40或示例实施方案组合41的方法，其中所述抗体分子为多克隆的。
44.根据示例实施方案组合1-43任一项的方法，其中所述流式细胞术包括使所述流体样品以250至3000纳升/分钟范围内的流体样品流速流过流动池。
45.根据示例实施方案组合1-44任一项的方法，其中所述病毒类型为腺病毒的病毒类型。
46.根据示例实施方案组合45的方法，其中所述荧光抗体染色剂包括8C4单克隆抗体。
47.根据示例实施方案组合1-46任一项的方法，其中所述病毒类型为腺相关病毒的病毒类型。
48.根据示例组合47的方法，其中所述荧光抗体染色剂包括一种或多种选自以下的单克隆抗体：抗AAV-1抗体(任选ADK1a)、抗AAV-2抗体(任选A20)、抗AAV-3抗体(任选A20)、抗AAV-4抗体(任选ADK4)、抗AAV-5抗体(任选ADK5a和/或ADK5b)、抗AAV-6抗体(任选ADK6)、抗AAV-8抗体(任选ADK8和/或ADK8/9)、抗AAV-9抗体(任选ADK9和/或ADK 8/9)，及其组合。
1A.评估生物材料中是否存在具有特定表位的非缔合的病毒尺寸颗粒的流式细胞术方法，该表位指示选自腺病毒的病毒类型或腺相关病毒的病毒类型，该方法包括:
制备流体样品，包括将待评估是否存在非缔合的颗粒的生物材料与荧光抗体染色剂混合，该荧光抗体染色剂能够通过表位直接或间接与非缔合的颗粒结合以形成非缔合的标记的病毒尺寸颗粒；
对流体样品进行流式细胞术，包括:
在使病毒尺寸颗粒各自通过流动池的流动条件下使流体样品流过流式细胞仪的流动池；
使流过流动池的流体样品经受能从荧光抗体染色剂引起荧光发射响应的激发辐射；和
在所述荧光发射的波长范围内检测来自所述流动池的辐射并评估所检测到的辐射，以鉴定指示有所述非缔合的标记的颗粒通过流动池的检测事件。
2A.根据示例实施方案组合1A的流式细胞术方法，其中所述制备流体样品包括，在混合之前，纯化生物材料的粗样品以制备用于进行流式细胞术的流体样品的生物材料，所述纯化包括以不大于2微米的过滤尺寸过滤出粗样品的颗粒，且层析去除至少一部分小于病毒尺寸的杂质。
3A.根据示例实施方案组合2A的流式细胞术方法，其中所述层析去除包括在离心机中旋转层析。
4A.根据示例实施方案组合1A-3A任一项的流式细胞术方法，其中所述制备流体样品包括，在混合后，在流式细胞术之前，不从流体样品去除未结合在非缔合的标记的颗粒中的荧光抗体。
5A.根据示例实施方案组合1A-4A任一项的流式细胞术方法，其中所述荧光抗体染色剂包含生物素化抗体和荧光团缀合的抗生蛋白链菌素。
6A.根据示例实施方案组合5A的流式细胞术方法，其中所述荧光团缀合的抗生蛋白链菌素在被提供至混合步骤时附着至生物素化抗体。
7A.根据示例实施方案组合6A的流式细胞术方法，其中所述荧光团缀合的抗生蛋白链菌素和该生物素化抗体在独立制剂中被提供至混合步骤，且该荧光团缀合的抗生蛋白链菌素在混合过程中在溶液中附着至生物素化抗体。
8A.评估生物材料是否存在具有特定表位的非缔合的病毒尺寸颗粒的流式细胞术方法，该表位指示选自以下的病毒类型：腺病毒的病毒类型和腺相关病毒的病毒类型，该方法包括:
对包含待评估的生物材料和荧光抗体染色剂的流体样品进行流式细胞术，该荧光抗体染色剂能够通过表位直接或间接与非缔合的颗粒结合以形成非缔合的标记的病毒尺寸颗粒，所述流式细胞术包括:
在使病毒尺寸颗粒各自通过流动池的流动条件下使流体样品流过流式细胞仪的流动池；
使流过流动池的流体样品经受能引起源自荧光抗体染色剂的荧光发射响应的激发辐射；和
在荧光抗体染色剂的荧光发射的波长范围内检测源自流动池的辐射，并评估所检测到的辐射，以鉴定指示所述非缔合的标记的颗粒通过流动池的检测事件；
其中流体样品中的生物材料为去除了较大尺寸组分的纯化生物材料，过滤尺寸不大于2微米，且该流体样品包含的未结合在非缔合的标记的颗粒中的荧光抗体染色剂的浓度范围为0.25微克/毫升流体样品至10微克/毫升流体样品。
9A.根据示例实施方案组合1A-8A任一项的方法，其中所述流式细胞术不检测光散射。
10A.根据示例实施方案组合1A-9A任一项的流式细胞术方法，其中进样至流式细胞仪的流体样品包含的荧光抗体染色剂的总浓度范围为0.25微克/毫升至10微克/毫升。
11A.根据示例实施方案组合1A-10A任一项的流式细胞术方法，其中进样至流式细胞仪的流体样品包含的未结合在非缔合的标记的颗粒中的荧光抗体染色剂的浓度范围为0.25微克/毫升至10微克/毫升。
12A.根据示例实施方案组合1A-11A任一项的流式细胞术方法，其中进样至流式细胞仪的流体样品具有的非缔合的标记的颗粒的浓度范围为1x 105至1x 109个颗粒/毫升。
13A.根据示例实施方案组合1A-12A任一项的流式细胞术方法，其中所述激发辐射包括在520纳米至550纳米的波长范围内的辐射。
14A.根据示例实施方案组合1A-13A任一项的流式细胞术方法，其中所述荧光发射具有的斯托克斯位移为至少10纳米的波长。
15A.根据示例实施方案组合1A-14A任一项的流式细胞术方法，其中所述荧光抗体染色剂包含附着至抗体分子的荧光团。
16A.根据示例实施方案组合15A的流式细胞术方法，其中所述荧光抗体染色剂在该荧光抗体染色剂中每个抗体分子平均包含3至8个附着的荧光团。
17A.根据示例实施方案组合15A或示例实施方案组合16A任一项的流式细胞术方法，其中所述抗体分子为单克隆的。
18A.根据示例实施方案组合15A或示例实施方案组合16A任一项的流式细胞术方法，其中所述抗体分子为多克隆的。
19A.根据示例实施方案组合1A-18A任一项的流式细胞术方法，其中所述荧光抗体染色剂为第一荧光染色剂，且所述流体样品包含具有由激发辐射引起的第二荧光发射响应的第二荧光染色剂，该第二荧光发射响应不同于第一荧光染色剂的第一荧光发射响应。
20A.根据示例实施方案组合19A的流式细胞术方法，其中所述第二荧光染色剂包括对颗粒类型不具有特异性的荧光核酸染色剂。
21A.根据示例实施方案组合19A的流式细胞术方法，其中:
所述非缔合的颗粒为第一非缔合的颗粒，所述表位为第一表位，所述非缔合的颗粒为第一颗粒类型且所述非缔合的标记的颗粒为第一非缔合的标记的颗粒；
所述第二荧光染色剂为不同于第一荧光抗体染色剂的第二荧光抗体染色剂，且该第二荧光抗体染色剂能够结合具有第二表位的第二非缔合的病毒尺寸颗粒以形成第二非缔合的标记的病毒尺寸颗粒，该第二表位指示不同于第一颗粒类型的第二颗粒类型；和
该方法包括在第二荧光发射的波长范围内检测来自所述流动池的辐射，并评估所检测到的辐射，以鉴定指示有第二非缔合的标记的颗粒通过流动池的检测事件。
22A.根据示例实施方案组合19A-21A任一项的流式细胞术方法，其中所述第二荧光发射具有的峰值波长与第一荧光发射的峰值波长有至少20纳米的纳米上的不同。
23A.根据示例实施方案组合1A-22A任一项的流式细胞术方法，其中各个所述荧光抗体染色剂能够与对应的所述非缔合的颗粒直接结合以形成对应的所述非缔合的标记的颗粒。
24A.根据示例实施方案组合1A-23A任一项的流式细胞术方法，其中所述非缔合的标记的颗粒具有的最大截面尺寸范围为10纳米至200纳米。
25A.根据示例实施方案组合1A-24A任一项的流式细胞术方法，其中所述流式细胞术包括使流体样品以250至3000纳升/分钟范围内的流体样品流速流过流动池。
26A.根据示例实施方案组合1A-25A任一项的流式细胞术方法，其中所述流式细胞术包括用鞘液将流体样品流通过流体动力集中，并使流体样品和鞘液流过流动池。
27A.根据示例实施方案组合1A-26A任一项的流式细胞术方法，其中所述流式细胞术包括独立检测至少两种不同的荧光发射且不检测光散射。
28A.根据示例实施方案组合1A-27A任一项的流式细胞术方法，其中所述病毒类型为腺相关病毒的病毒类型。
29A.根据示例实施方案组合1A-27A任一项的流式细胞术方法，其中所述病毒类型为腺病毒的病毒类型。
30A.根据示例实施方案组合28A或示例实施方案组合29A的流式细胞术方法，其中所述病毒颗粒包括选自以下的成员：病毒类型的病毒颗粒、病毒类型的病毒样颗粒及其组合。
31A.根据示例实施方案组合1A-30A任一项的流式细胞术方法，其中所述病毒类型为腺相关病毒的病毒类型，且该非缔合的标记的颗粒具有的最大截面尺寸范围为10纳米至100纳米。
32A.根据示例实施方案组合1A-30A任一项的流式细胞术方法，其中所述病毒类型为腺病毒的病毒类型，且该非缔合的标记的颗粒具有的最大截面尺寸范围为80纳米至200纳米。
33A.流体制剂，包含；
水性液体介质；
在水性液体介质中的非缔合的标记的病毒尺寸颗粒，其浓度为1x 105至1x 109个非缔合的标记的颗粒/毫升，其中所述非缔合的标记的颗粒各自包含具有指示病毒类型的特定表位的病毒尺寸颗粒和对于与所述表位直接或间接结合有特异性的荧光抗体染色剂，所述病毒类型选自腺病毒的病毒类型和腺相关病毒的病毒类型；和
未结合的荧光抗体染色剂在水性液体介质中的浓度范围为0.25微克/毫升至10微克/毫升，该未结合的荧光抗体染色剂未结合在非缔合的标记的颗粒中。
34A.根据示例实施方案组合33A的流体制剂，其中所述非缔合的标记的颗粒为示例实施方案组合1-48和1A-33A任一项中的非缔合的标记的颗粒。
1B.评估生物材料样品中的非缔合的病毒尺寸颗粒的流式细胞术方法，所述非缔合的病毒尺寸颗粒为选自以下的病毒类型：腺病毒的病毒类型和腺相关病毒的病毒类型，且具有指示病毒类型的特定表位，该方法包括:
对包含该生物材料样品至少一部分的流体样品进行流式细胞术，其中所述流体样品包含能与特定表位直接或间接结合的荧光抗体染色剂，所述流式细胞术包括:
使流体样品流过流式细胞仪的流动池；
使流过流动池的流体样品经受能从荧光抗体染色剂引起荧光发射响应的激发辐射；和
在所述荧光发射的波长范围内检测来自所述流动池的辐射，并评估所检测到的辐射，以鉴定指示有非缔合的标记的病毒尺寸颗粒通过所述流动池的检测事件，该非缔合的标记的病毒尺寸颗粒包含具有所述表位的病毒类型的所述病毒尺寸颗粒和荧光抗体染色剂。
2B.根据示例实施方案组合1B的方法，其中进样至流式细胞仪的流体样品包含的未结合在非缔合的标记的颗粒中的荧光抗体染色剂的浓度范围为0.25微克/毫升至10克/微升。
3B.根据示例实施方案组合1B或2B任一项的流式细胞术方法，其中进样至流式细胞仪的流体样品包含的荧光抗体染色剂的总浓度范围为0.25微克/毫升至10微克/毫升。
4B.根据示例实施方案组合1B-3B任一项的流式细胞术方法，其中所述表位为腺相关病毒血清型的组装衣壳的构象表位，且所述荧光抗体染色剂包括该构象表位的单克隆抗体。
5B.根据示例实施方案组合1B-4B任一项的流式细胞术方法，其中所述病毒尺寸颗粒包括腺相关病毒颗粒。
6B.根据示例实施方案组合5B的流式细胞术方法，其中所述腺相关病毒颗粒表达重组蛋白。
7B.根据示例实施方案组合1B-3B任一项的流式细胞术方法，其中所述表位为腺病毒六邻体蛋白质。
8B根据示例实施方案组合7B的流式细胞术方法，其中所述荧光抗体染色剂包括8C4单克隆抗体。
9B.根据示例实施方案组合1B-4B、7B和8B任一项的流式细胞术方法，其中所述病毒尺寸颗粒包括腺病毒颗粒。
10B.根据示例实施方案组合9B的流式细胞术方法，其中所述腺病毒颗粒表达重组蛋白。
11B.根据示例实施方案组合1B-10B任一项的流式细胞术方法，其中：
所述荧光抗体染色剂为第一荧光染色剂，所述荧光发射为第一荧光发射，所述检测为第一检测且所述检测事件为第一检测事件；
所述流体样品包含用于核酸的第二荧光染色剂，该第二荧光染色剂在附着于核酸时针对激发辐射具有第二荧光发射响应，该第二荧光发射响应不同于第一荧光发射响应；且
所述流式细胞术包括第二检测，其在第二荧光发射的波长范围内检测源自流动池的第二辐射，以及评估检测到的第二辐射，以评估指示有用第二荧光染色剂染色的包含核酸的病毒尺寸颗粒通过的检测事件；和
比较第一检测和第二检测的结果，以用于鉴定所述第一检测事件与所述第二检测事件是否发生时间上的重合，这进一步指示有包含所述病毒类型的所述病毒尺寸颗粒的所述非缔合的标记的颗粒通过流动池。
12B.根据示例实施方案组合1B-10B任一项的流式细胞术方法，其中：
所述荧光抗体染色剂为第一荧光抗体染色剂，所述表位为第一表位，所述荧光发射为第一荧光发射，所述检测为第一检测，所述病毒类型为第一病毒类型，所述非缔合的标记的颗粒为第一非缔合的标记的病毒尺寸颗粒且所述检测事件为第一检测事件；
所述流体样品包含第二荧光抗体染色剂，该第二荧光抗体染色剂不同于第一荧光抗体染色剂且能够与不同于第一表位的第二表位直接或间接结合，第二表位指示不同于第一病毒类型的第二病毒类型且该第二荧光抗体染色剂对激发辐射具有第二荧光发射响应，该第二荧光发射响应与第一荧光发射响应不同；且
所述流式细胞术包括第二检测，其在第二荧光发射的波长范围内检测源自流动池的第二辐射，以及评估检测到的第二辐射，以评估指示有第二非缔合的标记的病毒尺寸颗粒通过流动池的检测事件，该第二非缔合的标记的病毒尺寸颗粒包含具有第二表位的病毒尺寸颗粒和第二荧光抗体染色剂。
13B.根据示例实施方案组合12B的流式细胞术方法，其中具有第一表位的病毒尺寸颗粒包括病毒样颗粒。
14B.根据示例实施方案组合13B的流式细胞术方法，其中所述第二病毒类型为杆状病毒的病毒类型。
15B.根据示例实施方案组合12B的流式细胞术方法，其中所述第一病毒类型为腺相关病毒血清型且第二病毒类型为不同的腺相关病毒血清型。
16B.根据示例实施方案组合12B的流式细胞术方法，其中所述第一病毒类型为腺相关病毒的病毒类型且第二病毒类型为腺病毒的病毒类型。
17B.根据示例实施方案组合12B的流式细胞术方法，其中所述第一病毒类型为腺病毒的病毒类型且第二病毒类型为腺相关病毒的病毒类型。
18B.根据示例实施方案组合12B的流式细胞术方法，其中所述第一病毒类型为腺病毒血清型且第二病毒类型为不同的腺病毒血清型。
19B.根据示例实施方案组合1B-10B任一项的流式细胞术方法，其中所述表位为第一表位，所述病毒类型为第一病毒类型，所述流式细胞术为第一流式细胞术，所述流体样品为包含所述生物材料样品的第一部分的第一流体样品，所述非缔合的标记的颗粒为第一非缔合的标记的颗粒且所述激发辐射为第一激发辐射，且该方法包括:
对包含生物材料样品的第二部分的第二流体样品进行流式细胞术，其中所述流体样品包含不同于第一荧光抗体染色剂的第二荧光抗体染色剂，且该第二荧光抗体染色剂能够与不同于第一表位的第二表位直接或间接结合，第二表位指示不同于第一病毒类型的第二病毒类型且第二流式细胞术包括:
使第二流体样品流过流式细胞仪的流动池；
使流过流动池的第二流体样品经受第二激发辐射，该第二激发辐射与第一激发辐射相同或不同，且能够从第二荧光抗体染色剂引起不同于第一荧光发射响应的第二荧光发射响应；和
在所述荧光发射的波长范围内检测来自所述流动池的辐射并评估所检测到的辐射，以鉴定指示有第二非缔合的标记的病毒尺寸颗粒通过流动池的检测事件，该第二非缔合的标记的病毒尺寸颗粒包含具有第二表位的病毒尺寸颗粒和第二荧光抗体染色剂。
20B.根据示例实施方案组合19B的流式细胞术方法，其中:
所述第一和第二流体样品各自包含至少两种不同的荧光抗体染色剂以与两种不同的表位直接或间接结合；且
第一和第二流体样品各自包含至少一种不在彼此另一所述流体样品中的荧光抗体染色剂。
21B.根据示例实施方案组合20B的流式细胞术方法，其中各个所述流体样品的至少两种荧光抗体染色剂靶向检测所述流体样品中的至少两种不同类型的病毒尺寸颗粒，且至少一种所述类型的颗粒在第一样品流体和第二样品流体之间不同。
22B.根据示例实施方案组合1B-21B任一项的流式细胞术方法，其中所述生物材料样品为从产生病毒颗粒的生产操作的阶段收集的样品，预期在该阶段过程中病毒类型的病毒尺寸颗粒存在于生物材料中。
23B.制备包含选自以下的病毒类型的病毒尺寸颗粒的产品的流式细胞术方法：腺病毒的病毒类型和腺相关病毒的病毒类型，该方法包括:
生产处理以制备包含所述病毒类型的病毒尺寸颗粒的纯化产物，所述生产处理包括:
在生物生产操作中生成病毒尺寸颗粒；
从该生物生产操作收获粗产物，该粗产物包含在该生成操作中产生的病毒尺寸颗粒的；
纯化至少一部分该粗产物材料以制备包含病毒尺寸颗粒的纯化产物；
从生产处理的阶段收集生物材料样品，预期在该阶段过程中该病毒尺寸颗粒存在于生物材料中；
评估所述样品是否存在具有指示所述病毒类型的特定表位的病毒尺寸颗粒，所述评估包括进行根据示例实施方案组合1B-21B任一项的方法。
24B.根据示例实施方案组合23B的流式细胞术方法，包括将所述收集进行多次以从多个不同的所述阶段收集不同的待评估的所述生物材料样品，且对每个待评估的所述收集的生物材料样品进行所述评估。
25B.根据示例实施方案组合24B的流式细胞术方法，其中所述多个不同的所述阶段至少包括在所述生成或收获过程中的第一阶段和在所述纯化过程中或之后的第二阶段。
26B.根据示例实施方案组合1B-25B任一项的流式细胞术方法，其中流体样品中的生物材料为去除了较大尺寸组分的纯化生物材料，过滤尺寸不大于2微米。
27B.根据示例实施方案组合1B-26B任一项的流式细胞术方法，其中进样至流式细胞仪的所述流体样品具有的非缔合的标记的颗粒的浓度范围为1x 105至1x 109个颗粒/毫升。
28B.根据示例实施方案组合1B-27B任一项的流式细胞术方法，其中所述荧光抗体染色剂包含附着至抗体分子的荧光团，且该流体样品中的荧光抗体染色剂在荧光抗体染色剂中每个所述抗体分子平均包含3至8个附着的荧光团。
29B.根据示例实施方案组合1B-28B任一项的流式细胞术方法，其中所述荧光抗体染色剂的抗体为单克隆的。
30B.根据示例实施方案组合1B-29B任一项的流式细胞术方法，其中所述流式细胞术包括将所述流体样品以250至3000纳升/分钟范围内的流体样品流速流过流动池。
31B.根据示例实施方案组合1B-30B任一项的流式细胞术方法，包括:
制备该流体样品，包括将待评估是否存在非缔合的病毒尺寸颗粒的生物材料与荧光抗体染色剂混合。
32B.根据示例实施方案组合31B的方法，其中所述制备该流体样品包括，在混合之前，纯化生物材料的粗样品以制备用于进行流式细胞术的流体样品的生物材料，所述纯化包括以不大于2微米的过滤尺寸过滤出粗样品的颗粒，且包括在离心机中旋转层析以去除至少一部分小于病毒尺寸的杂质。
33B.根据示例实施方案组合31B或示例实施方案组合32B任一项的流式细胞术方法，其中所述制备流体样品包括，在混合后，在流式细胞术之前，不从流体样品去除未结合在非缔合的标记的颗粒中的荧光抗体染色剂。
34B.根据示例实施方案组合31B-33B任一项的流式细胞术方法，其中所述荧光抗体染色剂包含生物素化抗体和荧光团缀合的抗生蛋白链菌素。
35B.根据示例实施方案组合34B的流式细胞术方法，其中所述荧光团缀合的抗生蛋白链菌素在被提供至混合步骤时附着至生物素化抗体。
36B.根据示例实施方案组合35B的流式细胞术方法，其中所述荧光团缀合的抗生蛋白链菌素和该生物素化抗体在独立制剂中提供至混合步骤，且该荧光团缀合的抗生蛋白链菌素在混合过程中在溶液中附着至生物素化抗体。
37B.根据示例实施方案组合1B-36B任一项的流式细胞术方法，其中所述流式细胞术不检测光散射。
38B.根据示例实施方案组合1B-37B任一项的流式细胞术方法，其中所述荧光抗体染色剂为第一荧光染色剂，且所述流体样品包含具有由激发辐射引起的第二荧光发射响应的第二荧光染色剂，该第二荧光发射响应不同于第一荧光染色剂的第一荧光发射响应，且。
39B.根据示例实施方案组合1B-38B任一项的流式细胞术方法，其中所述病毒类型为腺相关病毒的病毒类型，且所述表位为腺相关病毒血清型的组装衣壳的构象表位且所述荧光抗体染色剂包括该构象表位的单克隆抗体，且所述方法包括以下的任一个或多个:
(i)所述血清型为AAV-1且所述单克隆抗体为ADKla；
(ii)所述血清型为AAV-2且所述单克隆抗体为A20；
(iii)所述血清型为AAV-3且所述单克隆抗体为A20；
(iv)所述血清型为AAV-4且所述单克隆抗体为ADK4；
(v)所述血清型为AAV-5且所述单克隆抗体选自ADK5a、ADK5b及其组合；
(vi)所述血清型为AAV-6且所述单克隆抗体为ADK6；
(vii)所述血清型为AAV-8且所述单克隆抗体选自ADK8、ADK8/9及其组合；和
(viii)所述血清型为AAV-9且所述单克隆抗体选自ADK9、ADK8/9及其组合。
40B.根据示例实施方案组合1B-38B任一项的流式细胞术方法，其中所述病毒类型为腺病毒的病毒类型且所述表位为腺病毒六邻体蛋白质且所述荧光抗体染色剂包括8C4单克隆抗体。
41B.用于进样至流式细胞仪以进行流式细胞术评估的流体样品，包括；
水性液体介质；
在水性液体介质中的非缔合的标记的病毒尺寸颗粒，其浓度为1x 105至1x 109个非缔合的标记的颗粒/毫升，其中所述非缔合的标记的颗粒各自包含：
病毒类型的病毒尺寸颗粒，该病毒类型选自具有指示病毒类型的特定表位的腺病毒的病毒类型和腺相关病毒的病毒类型；和
对于与所述表位直接或间接结合有特异性的荧光抗体染色剂；和
未结合的荧光抗体染色剂在水性液体介质中的浓度范围为0.25微克/毫升至10微克/毫升，所述未结合的荧光抗体染色剂未结合在非缔合的标记的颗粒中。
42B.根据示例实施方案组合41B的流体样品，其中所述流体样品包含的荧光抗体染色剂的总浓度范围为0.25微克/毫升至10微克/毫升。
43B.根据示例实施方案组合41B或示例实施方案组合42B任一项的流体样品，其中流体样品中的生物材料为去除了较大尺寸组分的纯化生物材料，过滤尺寸不大于2微米。
44B.根据示例实施方案组合41B-43B任一项的流体样品，其中所述非缔合的标记的颗粒具有的最大截面尺寸不大于100纳米。
45B.根据示例实施方案组合41B-44B任一项的流体样品，其中所述荧光抗体染色剂包括含着至抗体分子的荧光团，且该流体样品中的荧光抗体染色剂在该荧光抗体染色剂中每个抗体分子平均包含3至8个附着的荧光团。
45B.根据示例实施方案组合41B-45B任一项的流体样品，其中抗体染色剂的抗体为单克隆的。
46B.根据示例实施方案组合41B-45B任一项的流体样品，其中所述病毒尺寸颗粒包括被修饰以表达重组蛋白的腺相关病毒。
47B.根据示例实施方案组合41B-46B任一项的流体样品，其中所述病毒尺寸颗粒包括被修饰以表达重组蛋白的腺病毒。
48B.根据示例实施方案组合41B-45B任一项的流体样品，其中所述病毒类型为腺相关病毒的病毒类型且所述表位为组装衣壳的构象表位。
49B.根据示例实施方案组合41B-45B任一项的流体样品，其中所述病毒类型为腺病毒的病毒类型且所述表位为六邻体蛋白质。
50B.根据示例实施方案组合41B-49B任一项的流体样品，其中所述荧光抗体染色剂包含生物素化抗体和荧光团缀合的抗生蛋白链菌素。
51B.根据示例实施方案组合41B-50B任一项的流体样品，其中：
所述荧光抗体染色剂为具有第一荧光发射的第一荧光染色剂；且
所述流体样品包含用于核酸的第二荧光染色剂，所述第二荧光染色剂具有不同于第一荧光发射的第二荧光发射。
52B.根据示例实施方案组合41B-50B任一项的流体样品，其中：
所述荧光抗体染色剂为第一荧光抗体染色剂，所述表位为第一表位，所述荧光发射为第一荧光发射，所述病毒类型为第一病毒类型且所述非缔合的标记的颗粒为第一非缔合的标记的病毒尺寸颗粒；
所述流体样品包含第二荧光抗体染色剂，该第二荧光抗体染色剂不同于第一荧光抗体染色剂且能够与不同于第一表位的第二表位直接或间接结合，第二表位指示不同于第一病毒类型的第二病毒类型，且该第二荧光抗体染色剂具有不同于第一荧光发射响应的第二荧光发射响应。
53B.根据示例实施方案组合52B的流体样品，其中具有第一表位的病毒尺寸颗粒为病毒样颗粒。
54B.根据示例实施方案组合52B的流体样品，其中所述具有第二表位的病毒尺寸颗粒为病毒样颗粒。
55B.根据示例实施方案组合52B-54B任一项的流体样品，其中所述第一病毒类型为腺病毒的病毒类型且第二病毒类型为腺相关病毒的病毒类型。
56B.根据示例实施方案组合52B-54B任一项的流体样品，其中所述第一病毒类型为腺相关病毒的病毒类型且第二病毒类型为腺病毒的病毒类型。
57B.根据示例实施方案组合52B-54B任一项的流体样品，其中所述第一表位指示第一腺相关病毒血清型且第二表位指示不同的第二腺相关病毒血清型。
58B.根据示例实施方案组合52B-54B任一项的流体样品，其中所述第一表位指示第一腺病毒血清型且第二表位指示不同的第二腺病毒血清型。
59B.根据示例实施方案组合41B-58B任一项的流体样品，其中所述非缔合的标记的颗粒为示例实施方案组合1-48、1A-32A和1B-40B任一项中的非缔合的标记的颗粒。
60B.根据示例实施方案1-48、1A-34A和1B-59B任一项的方法或流体样品，其中所述病毒类型为腺病毒的病毒类型。
61B.根据示例实施方案1-48、1A-34A和1B-59B任一项的方法或流体样品，其中所述病毒类型为腺相关病毒的病毒类型。
1C.根据权利要求1-48、1A-32A、1B-40B和60B-61B任一项的方法，其中所述流式细胞术包括:
将检测事件计数为所出现的通过流动池的非缔合的标记的颗粒的个体，以确定通过流动池的一定体积流体样品中非缔合的标记的颗粒的计数；
确定与计数相对应的通过流动池的流体样品的体积；和
使用非缔合的标记的颗粒的计数确定通过流动池的流体样品体积中非缔合的标记的颗粒的浓度。
2C.根据示例实施方案组合1C的方法，其中所述流式细胞术包括:
根据与检测事件对应的辐射的检测，实时地对所述非缔合的标记的颗粒进行计数；和
根据通过流动池的流体样品的体积来实时确定浓度。
3C.根据权利要求1C或权利要求2C的方法，其中确定流体样品通过流动池的体积包括用流量传感器实时地测量流体样品到流动池的流速，并随时间积分所得到的流速测量数据。
4C.根据权利要求1C-3C任一项的方法，其中对指示有非缔合的标记的颗粒通过流动池的检测事件的鉴定是在没有与光散射检测相关联的信息的情况下确定的。
本发明及其不同方面的前述讨论呈现用于说明和描述的目的。前述内容并不意欲将本发明仅限定为本发明中所特定公开的形式。因此，与上面教导以及相关领域的技术和知识相当的变化和修改处于本发明的范围内。上文中所述的实施例进一步用于解释用于实践本发明的已知的最好方式，并使本领域其它技术人员能够以这样或其它的实施例以及本发明的特定应用或使用所需的各种修改利用本发明。请注意，所附权利要求应理解为包括现有技术所允许程度的替代实施例。尽管本发明的说明已包括一个或多个可能实施方式的描述以及某些变化和修改，但是在理解本发明之后，其它变化和修改在本发明的范围内，例如处于本领域技术和知识范围内的变化和修改。本发明意在获得包含所允许范围内的替代实施例的权益，包括所要求的替代的、可互换的和/或等同的结构、功能、范围或步骤，不管这种替代的、可互换的和/或等同的结构、功能、范围或步骤是否在本发明中公开，本发明并不意图捐献任何可获得专利的主题。而且，相对于任何所公开的变化所描述和主张的任何特征可与任何其它变化中的一个或多个任何特征以任意结合的方式相结合，甚至于这些特征可能在技术上是不兼容的，并且，所有这样的结合都包含在本发明的范围内。特定组合中的一个或多个特征的描述不排除包括附加一个或多个特征。处理步骤和排序仅用于说明，并且这样的示例不排除包括其他步骤或其他步骤顺序。在所示处理步骤之间或在任何所示处理步骤之前或之后可以包括附加步骤。
术语“包括”及这些术语的语法变体意在是包含性的和非限制性的，因为使用这样的术语说明存在一些情况或特征，但并不排除任何其它情况或特征。使用术语“包括”及这些术语的语法变体指代一个或多个部件、子部件或材料的存在，也包括并意在公开更特定的实施例，其中，术语“包括”(或这样的术语的变体)由更窄的术语“基本由…构成”或“由…构成”或“仅由…构成”(或这样的更窄术语的适当语法变体)替代。例如，某物“包括”一定元件的表述还意在包括并公开“由一定元件基本构成”的物体以及“由一定元件构成”的物体的更多特定的更窄实施例。各特征的示例已提供用于解释的目的，术语“示例”、“例如”等指代示例性示例，其不限制并不应解释或理解为限制特征为任何特定的示例。后面有一数字的术语“至少”(例如至少一个)意味着数字可大于所示数字。术语“至少一部分”意味着所有或小于所有的一部分。术语“至少一部分”意味着所有或小于所有的一部分。
例如生物材料样品的“部分”或材料，是指这种材料的一些组分或成分，包括材料的相同组成等分部分和材料的加工部分，该加工部分其不再具有相同的组成，但具有来自该材料的一种或多种组分并且可以与其它不是源自该材料的组分(例如，缓冲溶液，试剂)混合。例如，即使流体样品仅包含与粗样品分离的一些纯化的生物成分，包含要进行流式细胞术的生物材料的流体样品也包括收集的粗生物材料样品的一部分。作为另一个例子，如果制备为包括用于评估的一些生物材料的流体样品批次被分成单独的等分试样用于单独的等分试样的单独的流式细胞计数运行，则每个这样的等分试样包括该批次的一部分生物材料，并且包括来自可能已经被纯化的生物材料的粗品样品的生物材料的部分。

Claims (50)

1.一种流式细胞术方法，用于评估生物材料样品的病毒类型的非缔合的病毒尺寸颗粒，所述病毒类型选自腺病毒的病毒类型和腺相关病毒的病毒类型，该方法包括:
对包含该生物材料样品至少一部分的流体样品进行流式细胞术，其中所述流体样品包含能与所述病毒类型的表位直接或间接结合的荧光抗体染色剂，所述流式细胞术包括:
使流体样品流过流式细胞仪的流动池；
使流过流动池的流体样品经受能从荧光抗体染色剂引起荧光发射响应的激发辐射；和
在所述荧光发射的波长范围内检测来自所述流动池的辐射，并评估所检测到的辐射，以鉴定指示有所述非缔合的标记的病毒尺寸颗粒通过所述流动池的检测事件，该非缔合的标记的病毒尺寸颗粒包括与一部分所述荧光抗体染色剂结合的所述病毒类型的所述病毒尺寸颗粒，
其中所述非缔合的标记的病毒尺寸颗粒的颗粒尺寸范围为10纳米至200纳米；且
其中进样至流式细胞仪的流体样品包含的未结合在非缔合的标记的颗粒中的荧光抗体染色剂的浓度范围为0.25微克/毫升至10微克/毫升。
2.根据权利要求1的流式细胞术方法，其中未结合在非缔合的标记的颗粒中的荧光抗体染色剂的浓度范围为0.5微克/毫升至10微克/毫升。
3.根据权利要求2的流式细胞术方法，其中进样至流式细胞仪的流体样品包含的荧光抗体染色剂的总浓度范围为0.5微克/毫升至10微克/毫升。
4.制备包含病毒类型的病毒尺寸颗粒的产物的流式细胞术方法，所述病毒类型选自腺病毒的病毒类型和腺相关病毒的病毒类型，该方法包括:
生产处理以制备包含所述病毒类型的病毒尺寸颗粒的纯化产物，所述生产处理包括:
在生物生产操作中生成病毒尺寸颗粒；
从该生物生产操作收获粗产物，该粗产物包含在生成操作中产生的病毒尺寸颗粒；
纯化至少一部分该粗产物材料以制备包含病毒尺寸颗粒的纯化产物；从生产处理的阶段收集生物材料样品，预期在该阶段过程中该病毒尺寸颗粒存在于生物材料中；评估所述样品是否存在具有指示所述病毒类型的特定表位的病毒尺寸颗粒，所述评估包括进行根据权利要求1-3任一项的方法。
5.根据权利要求4的流式细胞术方法，包括将所述收集进行多次以从多个不同的所述阶段收集不同的待评估的所述生物材料样品且对每个待评估的所述收集的生物材料样品进行所述评估。
6.根据权利要求5的流式细胞术方法，其中所述多个不同的所述阶段至少包括在所述生成或收获过程中的第一阶段和在所述纯化过程中或之后的第二阶段。
7.根据权利要求1-3任一项的流式细胞术方法，包括:
制备该流体样品，包括将待评估是否存在非缔合的病毒尺寸颗粒的生物材料与荧光抗体染色剂混合。
8.根据权利要求7的流式细胞术方法，包括：在混合后，在流式细胞术之前，不从流体样品中除去未结合在非缔合的标记的病毒尺寸颗粒中的荧光抗体染色剂，其中在进样到流式细胞仪时未结合在非缔合的标记的病毒尺寸颗粒中的荧光抗体染色剂代表在所述混合步骤期间与生物材料混合的多数荧光抗体染色剂。
9.根据权利要求7的流式细胞术方法，其中所述制备流体样品包括，在混合后，在流式细胞术之前，不从流体样品去除未结合在非缔合的标记的颗粒中的荧光抗体染色剂。
10.根据权利要求1-3任一项的流式细胞术方法，其中所述流式细胞术不检测光散射。
11.根据权利要求3的流式细胞术方法，其中进样至流式细胞仪的流体样品具有的非缔合的标记的颗粒的浓度范围为1x 105至1x 109个颗粒/毫升。
12.根据权利要求11的流式细胞术方法，其中所述荧光抗体染色剂包含附着至抗体分子的荧光团，且该流体样品中的荧光抗体染色剂在所述荧光抗体染色剂中每个所述抗体分子平均包含3至8个附着的荧光团。
13.根据权利要求12的流式细胞术方法，其中病毒类型是腺病毒的病毒类型。
14.根据权利要求12的流式细胞术方法，其中病毒类型是腺相关病毒的病毒类型。
15.根据权利要求12的流式细胞术方法，其中所述荧光抗体染色剂为第一荧光染色剂，且所述流体样品包含具有由激发辐射引起的第二荧光发射响应的第二荧光染色剂，该第二荧光发射响应不同于第一荧光染色剂的第一荧光发射响应。
16.根据权利要求15的流式细胞术方法，其中所述第二荧光染色剂包括对颗粒类型不具有特异性的荧光核酸染色剂。
17.根据权利要求15的流式细胞术方法，其中:
所述非缔合的标记的颗粒为第一非缔合的标记的颗粒，所述表位为第一表位，所述病毒尺寸颗粒为第一病毒尺寸颗粒，所述病毒类型为第一病毒类型且所述非缔合的标记的颗粒为第一非缔合的标记的颗粒；
所述第二荧光染色剂为不同于第一荧光抗体染色剂的第二荧光抗体染色剂，且该第二荧光抗体染色剂能够与具有第二表位的第二病毒尺寸颗粒结合以形成第二病毒尺寸的非缔合的标记的颗粒，所述第二表位指示不同于第一病毒类型的第二病毒类型；且
该方法包括在第二荧光发射的波长范围内检测来自所述流动池的辐射并评估所检测到的辐射，以鉴定指示有第二非缔合的标记的颗粒通过流动池的检测事件。
18.根据权利要求17的流式细胞术方法，其中所述第二荧光发射具有的峰值波长与第一荧光发射的峰值波长有至少20纳米的不同，且该流式细胞术包括独立检测至少第一和第二荧光发射且不检测光散射。
19.根据权利要求18的流式细胞术方法，其中所述第一病毒尺寸颗粒包括第一病毒类型的病毒样颗粒。
20.根据权利要求19的流式细胞术方法，其中所述第二病毒尺寸颗粒包括杆状病毒类型的病毒颗粒。
21.根据权利要求13的流式细胞术方法，其中所述表位为腺病毒六邻体蛋白质且所述荧光抗体染色剂包括单克隆抗体。
22.根据权利要求21的流式细胞术方法，其中所述单克隆抗体为8C4单克隆抗体。
23.根据权利要求13的流式细胞术方法，其中所述病毒尺寸颗粒包括被修饰以表达重组蛋白的腺病毒。
24.根据权利要求14的流式细胞术方法，其中所述表位为组装衣壳的构象表位。
25.根据权利要求14的流式细胞术方法，其中所述表位为腺相关病毒血清型的组装衣壳的构象表位且所述荧光抗体染色剂包括该构象表位的单克隆抗体，且:
(i)所述血清型为AAV-1且所述单克隆抗体为ADKla；
(ii)所述血清型为AAV-2且所述单克隆抗体为A20；
(iii)所述血清型为AAV-3且所述单克隆抗体为A20；
(iv)所述血清型为AAV-4且所述单克隆抗体为ADK4；
(v)所述血清型为AAV-5且所述单克隆抗体选自ADK5a、ADK5b及其组合；
(vi)所述血清型为AAV-6且所述单克隆抗体为ADK6；
(vii)所述血清型为AAV-8且所述单克隆抗体选自ADK8、ADK8/9及其组合；和/或
(viii)所述血清型为AAV-9且所述单克隆抗体选自ADK9、ADK8/9及其组合。
26.根据权利要求14的流式细胞术方法，其中所述病毒尺寸颗粒包括被修饰以表达重组蛋白的腺相关病毒。
27.根据权利要求11-26任一项的流式细胞术方法，其中所述流式细胞术不检测光散射。
28.根据权利要求27的流式细胞术方法，其中所述流式细胞术包括仅检测荧光发射响应。
29.根据权利要求11-26任一项的流式细胞术方法，包括制备该流体样品，所述制备该流体样品包括:
将待评估是否存在非缔合的病毒尺寸颗粒的生物材料与荧光抗体染色剂混合；和
在混合后，在流式细胞术之前，不从流体样品去除未结合在非缔合的标记的颗粒中的荧光抗体染色剂。
30.根据权利要求11-26任一项的流式细胞术方法，其中：
未结合在非缔合的标记的病毒尺寸颗粒中的荧光抗体染色剂的浓度范围为0.5微克/毫升至5微克/毫升；且
流体样品包含的荧光抗体染色剂的总浓度范围为0.5微克/毫升至5微克/毫升。
31.根据权利要求1-3和11-26任一项的方法，其中每个所述流式细胞术包括:
将检测事件计数为通过流动池的非缔合的标记的颗粒的个体的出现，以确定通过流动池的一定体积流体样品中非缔合的标记的颗粒的计数；
确定与计数相对应的通过流动池的流体样品的体积；
使用非缔合的标记的颗粒的计数确定通过流动池的流体样品体积中非缔合的标记的颗粒的浓度；
根据与检测事件对应的辐射的检测，实时地对所述非缔合的标记的颗粒进行计数；和
根据通过流动池的流体样品的体积来实时确定浓度；
确定通过流动池的流体样品的体积包括用流量传感器实时地测量流体样品到流动池的流速并随时间积分所得到的流速测量数据；和
鉴定指示非缔合的标记的颗粒通过流动池的检测事件是在没有与光散射检测信息关联的情况下确定的。
32.用于进样至流式细胞仪以进行流式细胞术评估的流体样品，包括：
水性液体介质；
在水性液体介质中的颗粒尺寸范围为10纳米至200纳米的非缔合的标记的病毒尺寸颗粒，其浓度为1x 105至1x 109个非缔合的标记的颗粒/毫升，其中所述非缔合的标记的颗粒各自包含：
病毒类型的病毒尺寸颗粒，所述病毒类型选自腺病毒的病毒类型和腺相关病毒的病毒类型，所述病毒尺寸颗粒具有指示病毒类型的特定表位；和
对于与所述表位直接或间接结合有特异性的荧光抗体染色剂；和在水性液体介质中的荧光抗体染色剂的未结合部分，其未结合在非缔合的标记的颗粒中，且浓度范围为0.25微克/毫升至10微克/毫升。
33.根据权利要求32的流体样品，其中所述流体样品包含的荧光抗体染色剂的总浓度范围为0.5微克/毫升至10微克/毫升，其中荧光抗体染色剂的未结合部分为流体样品中的多数荧光抗体染色剂。
34.根据权利要求32的流体样品，其中所述荧光抗体染色剂包含附着至抗体分子的荧光团，且该流体样品中的荧光抗体染色剂在所述荧光抗体染色剂中每个抗体分子平均包含3至8个附着的荧光团。
35.根据权利要求32的流体样品，其中流体样品中荧光抗体染色剂的未结合部分的浓度和荧光抗体染色剂的总浓度各自在0.5微克/毫升至10微克/毫升的范围内。
36.根据权利要求32的流体样品，其中流体样品中的生物材料为去除了较大尺寸组分的纯化生物材料，过滤尺寸不大于2微米。
37.根据权利要求32的流体样品，其中所述荧光抗体染色剂包含附着至抗体分子的荧光团，且该流体样品中的荧光抗体染色剂在每个抗体分子中平均包含3至7个附着的荧光团。
38.根据权利要求37的流体样品，其中抗体染色剂的抗体为单克隆的。
39.根据权利要求32的流体样品，其中所述病毒尺寸颗粒包括被修饰以表达重组蛋白的腺病毒或腺相关病毒。
40.根据权利要求32的流体样品，其中：
所述荧光抗体染色剂为具有第一荧光发射的第一荧光染色剂；且
所述流体样品包含用于核酸的第二荧光染色剂，所述第二荧光染色剂具有不同于第一荧光发射的第二荧光发射。
41.根据权利要求32的流体样品，其中：
所述荧光抗体染色剂为第一荧光抗体染色剂，所述表位为第一表位，所述荧光发射为第一荧光发射，所述病毒类型为第一病毒类型且所述非缔合的标记的颗粒为第一非缔合的标记的病毒尺寸颗粒；
所述流体样品包含第二荧光抗体染色剂，该第二荧光抗体染色剂不同于第一荧光抗体染色剂且能够与不同于第一表位的第二表位直接或间接结合，第二表位指示不同于第一病毒类型的第二病毒类型且该第二荧光抗体染色剂具有不同于第一荧光发射响应的第二荧光发射响应。
42.根据权利要求41的流体样品，其中具有第一表位的病毒尺寸颗粒为病毒样颗粒。
43.根据权利要求42的流体样品，其中所述第二病毒类型为杆状病毒类型。
44.根据权利要求36-43任一项的流体样品，其中：
荧光抗体染色剂的未结合部分的浓度范围为0.5微克/毫升至5微克/毫升；且
流体样品包含的荧光抗体染色剂的总浓度范围为0.5微克/毫升至5微克/毫升。
45.根据权利要求32-43任一项的流体样品，其中所述病毒类型为腺相关病毒的病毒类型。
46.根据权利要求45的流体样品，其中所述表位为组装衣壳的构象表位。
47.根据权利要求45的流体样品，其中所述表位为腺相关病毒血清型的组装衣壳的构象表位且所述荧光抗体染色剂包括该构象表位的单克隆抗体，且:
(i)所述血清型为AAV-1且所述单克隆抗体为ADKla；
(ii)所述血清型为AAV-2且所述单克隆抗体为A20；
(iii)所述血清型为AAV-3且所述单克隆抗体为A20；
(iv)所述血清型为AAV-4且所述单克隆抗体为ADK4；
(v)所述血清型为AAV-5且所述单克隆抗体选自ADK5a、ADK5b及其组合；
(vi)所述血清型为AAV-6且所述单克隆抗体为ADK6；
(vii)所述血清型为AAV-8且所述单克隆抗体选自ADK8、ADK8/9及其组合；和/或
(viii)所述血清型为AAV-9且所述单克隆抗体选自ADK9、ADK8/9及其组合。
48.根据权利要求32-43任一项的流体样品，其中所述病毒类型为腺病毒的病毒类型。
49.根据权利要求48的流体样品，其中所述表位为腺病毒六邻体蛋白质且所述荧光抗体染色剂包括单克隆抗体。
50.根据权利要求49的流体样品，其中所述单克隆抗体为8C4单克隆抗体。
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Families Citing this family (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107615065B (zh) 2015-03-23 2020-07-24 以埃森生物科学股份有限公司的名义经营的埃森仪器股份有限公司 对生物材料评估腺病毒或腺相关病毒的病毒类型的非缔合的病毒尺寸颗粒
US10429302B2 (en) 2015-08-11 2019-10-01 Scintillon Institute For Biomedical And Bioenergy Research Optical analyses of particles and vesicles
US11058312B2 (en) * 2016-12-02 2021-07-13 Sensor Electronic Technology, Inc. Fluorescent sensing for evaluating fluid flow
US20210262931A1 (en) * 2018-06-21 2021-08-26 Codiak Biosciences, Inc. Methods of measuring extracellular vesicles and nanoparticles in complex matrices by light scattering
ES2967515T3 (es) * 2018-08-01 2024-04-30 Sartorius Bioanalytical Instr Inc Métodos, kits y composiciones de tinción para la evaluación de citometría de flujo de partículas del tamaño de un virus no asociadas utilizando múltiples colorantes fluorogénicos
US11137337B2 (en) * 2019-01-21 2021-10-05 Essen Instruments, Inc. Flow cytometry with data analysis for optimized dilution of fluid samples for flow cytometry investigation
EP3948279A1 (en) 2019-03-26 2022-02-09 Essen Instruments, Inc. d/b/a Essen BioScience, Inc. Flow cytometry evaluation for unassociated non-enveloped viral particles
CN112113822A (zh) * 2019-06-21 2020-12-22 深圳迈瑞生物医疗电子股份有限公司 生物样本染色装置、推片染色机及生物样本染色方法
WO2021153659A1 (ja) * 2020-01-31 2021-08-05 Ａｇｃ株式会社 アデノ随伴ウイルス（ａａｖ）の定量方法
US11709116B2 (en) 2020-02-04 2023-07-25 Sartorius Bioanalytical Instruments, Inc. Liquid flourescent dye concentrate for flow cytometry evaluation of virus-size particles and related products and methods
CN111366525B (zh) * 2020-03-12 2021-08-13 西安交通大学 一种快速检测离体血样中SARS-CoV-2病毒感染的方法及应用

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6248514B1 (en) * 1996-07-09 2001-06-19 Canji, Inc. Methods for measuring viral infectivity
CN1563990A (zh) * 2004-04-02 2005-01-12 浙江大学 免疫聚苯乙烯微球检测流行性感冒病毒的方法
CN102046815A (zh) * 2008-06-02 2011-05-04 通用电气健康护理生物科学股份公司 用于病毒检测的方法
US8003314B2 (en) * 2007-04-16 2011-08-23 Diagnostic Hybrids, Inc. Methods for direct fluorescent antibody virus detection in liquids
WO2014210370A1 (en) * 2013-06-28 2014-12-31 Virocyt, Llc Processing biological material for flow cytometry evaluation for virus particles

Family Cites Families (17)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2089638T3 (es) * 1993-06-03 1996-10-01 Bernd Dr Med Burkhardt Deteccion de antigenos viricos o bacterianos por medio de citometria en medio fluido.
EP0947525A1 (en) * 1998-03-27 1999-10-06 Innogenetics N.V. Epitopes in viral envelope proteins and specific antibodies directed against these epitopes: use for detection of HCV viral antigen in host tissue
CN100354430C (zh) * 2001-09-06 2007-12-12 基因描绘系统有限公司 一种检测样品中靶细胞或病毒的方法
US7786282B2 (en) 2001-12-06 2010-08-31 The Regents Of The University Of California Nucleic acid molecules encoding TNF-α ligand polypeptides having a CD154 domain
WO2006008468A2 (en) * 2004-07-20 2006-01-26 The University Of Warwick Adenovirus vector and method to manipulate the adenovirus genome
KR20070061802A (ko) * 2004-07-29 2007-06-14 킴 래버러터리즈, 아이엔씨. 초음파 감응 센서 및 분석 대상물의 고속 검출 방법
US9198984B2 (en) 2006-04-28 2015-12-01 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Scalable production method for AAV
CN101387636A (zh) * 2008-08-07 2009-03-18 中国药品生物制品检定所 应用流式细胞术检测病毒载体类基因治疗药物感染滴度
US10031061B2 (en) 2009-05-13 2018-07-24 Intellicyt Corporation Flow measurement and control for improved quantification of particles in flow cytometry
CN101762703A (zh) * 2010-01-18 2010-06-30 南京工业大学 丙型肝炎病毒(hcv)抗体检验试剂盒及其制备方法和检测方法
WO2012050645A2 (en) * 2010-06-25 2012-04-19 Purdue Research Foundation Pathogen detection
CN102590068B (zh) * 2012-03-08 2015-04-01 南开大学 基于流式细胞术快速定量检测淡水环境中总病毒的方法
GR1008033B (el) * 2012-03-29 2013-11-18 Βασιλειος Τσιλιβακος Μεθοδος διερευνησης της παρουσιας ενδοκυτταριων μολυσματικων παραγοντων σε κυτταρα του σπερματος
US9945847B2 (en) * 2013-09-23 2018-04-17 Assaypro, Llc Immunoassays using over-labeled fluorescent probes
WO2015187783A1 (en) 2014-06-05 2015-12-10 Virocyt, Inc. Flow cytometer signal peak identification employing dynamic thresholding
CN107615065B (zh) * 2015-03-23 2020-07-24 以埃森生物科学股份有限公司的名义经营的埃森仪器股份有限公司 对生物材料评估腺病毒或腺相关病毒的病毒类型的非缔合的病毒尺寸颗粒
US11137337B2 (en) 2019-01-21 2021-10-05 Essen Instruments, Inc. Flow cytometry with data analysis for optimized dilution of fluid samples for flow cytometry investigation

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6248514B1 (en) * 1996-07-09 2001-06-19 Canji, Inc. Methods for measuring viral infectivity
CN1563990A (zh) * 2004-04-02 2005-01-12 浙江大学 免疫聚苯乙烯微球检测流行性感冒病毒的方法
US8003314B2 (en) * 2007-04-16 2011-08-23 Diagnostic Hybrids, Inc. Methods for direct fluorescent antibody virus detection in liquids
CN102046815A (zh) * 2008-06-02 2011-05-04 通用电气健康护理生物科学股份公司 用于病毒检测的方法
WO2014210370A1 (en) * 2013-06-28 2014-12-31 Virocyt, Llc Processing biological material for flow cytometry evaluation for virus particles

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Evaluation of ViroCyt Virus Counter for Rapid Filovirus Quantitation;Cynthia A. Rossi et al.,;《Viruses》;20150220;第7卷(第3期);全文 *
Nanoparticle-based flow virometry for the analysis of individual virions;Anush Arakelyan et al.,;《Journal of Clinical Investigation》;20130808;第123卷(第9期);全文 *
Rapid microchip-based electrophoretic immunoassays for the detection of swine influenza virus;David S. Reichmuth et al.,;《Lab on a Chip》;20081231;第8卷(第8期);全文 *

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