CN107541554B - 用于人体个体识别和/或亲权鉴定的遗传标记及其检测方法和试剂盒 - Google Patents
用于人体个体识别和/或亲权鉴定的遗传标记及其检测方法和试剂盒 Download PDFInfo
- Publication number
- CN107541554B CN107541554B CN201710828377.XA CN201710828377A CN107541554B CN 107541554 B CN107541554 B CN 107541554B CN 201710828377 A CN201710828377 A CN 201710828377A CN 107541554 B CN107541554 B CN 107541554B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- dna
- intelligent
- homo sapiens
- snps
- individual identification
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明公开了一种用于人体个体识别和/或亲权鉴定的遗传标记组合及其检测方法。本发明通过对多种族进行全基因组SNPs无偏扫描筛选在多种族广泛适用的SNPs位点组合,从全基因组范围内25,580,678个SNPs位点中筛选出116个在来自全球不同地区的37个群体中均具有高等位基因频率、低差异、相互独立遗传的常染色体SNPs位点和12个在来自全球不同地区的37个群体中均具有高等位基因频率、低差异、相互独立遗传的X染色体SNPs位点。本发明的SNPs位点组合与现有的商业化试剂盒相比,具有更高更广阔的多种族适应性,且累积个体识别概率和累积非父排除概率均显著优于商业化试剂盒,检测结果更佳准确,具有较大的应用前景。
Description
技术领域
本发明属于法医遗传学技术领域。更具体地,涉及一种用于人体个体识别和 /或亲权鉴定的遗传标记及其检测方法和试剂盒。
背景技术
DNA证据被广泛应用于人体个体识别和亲权鉴定中,在刑事诉讼、民法案件、灾难性事故处理、科学研究等领域发挥关键的科学证据作用。所谓DNA证据即不同个体的染色体上的遗传标记基因型是否满足法医遗传学要求。目前 DNA鉴定主要是检验相互独立遗传的十三至二十多个不等的短串联重复片段(Short tandem repeats,STRs),被称为第二代遗传标记。
第三代遗传标记—单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)已开始被应用于DNA鉴定。随着基因组学理论和DNA测序技术的进一步发展, SNPs被发现具有诸多STRs所不具备的特点,使其在法医学应用中更具优势,比如:
(1)在全基因组范围内具有更高的分布密度,具有远多于STRs的候选位点;
(2)SNPs为单碱基变异位点,远远短于数十甚至上百个碱基长度的STRs,使得其PCR扩增片段可以更短,对于高度降解检材DNA鉴定具有极大优势;
(3)低至10-8的突变率,相比STR平均10-3的突变率,在亲权鉴定中更理想;
(4)SNPs在多种更快速、更廉价的高通量测序平台实现了自动分型分析,与各种测序平台的匹配度更高,利于在更广范围不同实验室之间实现应用;
(5)SNPs可用于人体外貌特征表型推断和生物学祖源推断,在无法直接锁定犯罪嫌疑人的情况下,可帮助提供侦查线索,缩小侦查范围。
目前已有的代表性SNPs法医遗传学鉴定技术均基于欧盟筛选的SNPforID 52和耶鲁大学Kidd实验室筛选的个体识别SNPs组合。这两个组合的筛选过程主要是收集几个(前者)或数十个(后者)群体,选定几十或几百个SNPs作为初始候选位点,最终从中筛选出52个或45个位点用于DNA鉴定。由于候选位点的选择偏好差异及所检测的人群差异,上述位点在多种族中的广泛适用性受限。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是克服现有SNPs组合在人体个体识别方面受多种族限制的缺陷和不足,提供一套能在多种族广泛适用的个体识别和亲权鉴定 SNPs组合;本发明通过对多种族进行全基因组SNPs无偏扫描筛选在多种族广泛适用的SNPs位点组合,从全基因组范围内25,580,678个SNPs位点中筛选出 116个在来自全球不同地区的37个群体中均具有高等位基因频率、相互独立遗传的常染色体SNPs位点和12个在上述37个群体中均具有高等位基因频率、相互独立遗传的X染色体SNPs位点。所述116个SNPs在来自全世界不同地区的 37个群体的单个位点随机匹配概率在0.333~0.529范围内,累积随机匹配概率在1.93×10-50~2.01×10-48范围内,在来自全世界不同地区的37个群体的单个位点非父排除概率在0.012~0.419范围内,累积非父排除概率在0.9999999996653~ 0.9999999999945范围内。加上X染色体SNPs位点的分型,将进一步降低本遗传标记组合的累积随机匹配概率,进一步提高累积非父排除概率;此外,根据X 染色体遗传的特殊规律,应用本遗传标记组合中的X染色体SNPs可同步实现性别推断,在各种刑事和民事司法鉴定中具有良好的应用前景。
本发明的目的是提供一种用于人体个体识别的遗传标记。
本发明的另一目的是提供一种用于人体个体识别的引物池。
本发明的再一目的是提供一种人体个体识别和/或亲权鉴定的方法。
本发明的上述目的是通过以下技术方案给予实现的:
一种用于人体个体识别的遗传标记,包括如下所示的116个常染色体SNPs 位点及12个X染色体SNPs位点:rs2662800、rs11938834、rs10852588、rs2624459、 rs17533、rs163192、rs4644087、rs12934069、rs628221、rs1293288、rs10911093、 rs1538197、rs9308179、rs11914834、rs1078226、rs6955484、rs6136874、rs4239719、 rs7127767、rs2826399、rs1354147、rs508485、rs4835587、rs2895309、rs3010325、 rs11785007、rs4539869、rs564060、rs6962246、rs7710068、rs4582363、rs447205、 rs471234、rs4708582、rs2941011、rs879628、rs10451160、rs7728549、rs397728、 rs10865186、rs3790955、rs825411、rs4773029、rs974110、rs623052、rs2127995、 rs4750494、rs1176842、rs9864924、rs4487849、rs4942242、rs2267708、rs6989344、rs9504195、rs980346、rs2380437、rs6694450、rs4449484、rs4469483、rs4722897、 rs4790519、rs4607417、rs530913、rs3850890、rs9542974、rs9544749、rs4942486、 rs6073336、rs2024408、rs4282012、rs9432040、rs1574275、rs9364939、rs7582470、 rs937002、rs12694624、rs208869、rs1193735、rs12819145、rs271397、rs7142477、 rs11655774、rs12925084、rs10518608、rs7607215、rs2459110、rs2570703、rs431951、 rs12605006、rs9672254、rs9297731、rs12350076、rs10256874、rs7167880、rs560476、 rs7561460、rs783622、rs10783100、rs2425427、rs1971391、rs1445688、rs11590681、 rs722847、rs6460078、rs10503926、rs530022、rs1012515、rs4701737、rs1404719、 rs6431272、rs7326317、rs10490047、rs7983579、rs2831350、rs1464095、rs7710223、 rs11159161、rs1807986、rs5916698、rs2071178、rs5985930、rs6520279、rs5905669、 rs3128264、rs5966755、rs17332040、rs5907677、rs12843815。
本发明基于HapMap数据库和千人基因组数据库,从全基因组范围内 25,580,678个SNPs位点中筛选出116个在来自全球不同地区的37个群体中(包括:ACB-1KG、ASW-1KG、ESN-1KG、GWD-1KG、LWK-1KG、MSL-1KG、 YRI-1KG、CLM-1KG、MXL-1KG、PEL-1KG、PUR-1KG、CDX-1KG、CHB-1KG、 CHS-1KG、JPT-1KG、KHV-1KG、CEU-1KG、FIN-1KG、GBR-1KG、IBS-1KG、 TSI-1KG、BEB-1KG、GIH-1KG、ITU-1KG、PJL-1KG、STU-1KG、ASW-HapMap、 CEU-HapMap、CHB-HapMap、CHD-HapMap、GIH-HapMap、JPT-HapMap、 LWK-HapMap、MEX-HapMap、MKK-HapMap、TSI-HapMap、YRI-HapMap) 均具有高等位基因频率、相互独立遗传的常染色体SNPs位点及12个X染色体 SNPs位点;所述128个SNPs在每个群体中都相互无连锁不平衡。
衡量该SNPs组合能否应用于人体个体识别的指标是随机匹配概率(MP)。 MP是指来自群体中随机两个个体的生物检材的遗传标记基因型偶然一致的理论概率。一个遗传标记位点的某个基因型的MP等于该基因型在群体中的期望频率;多个相互独立遗传(即无连锁不平衡)的遗传标记位点的基因型组合的CMP 等于单个位点基因型期望频率的乘积。CMP越小,说明两份检材偶然匹配的可能性越小,即两份检材来自同一个体的可能性越大,同一认定证据越可靠。国际标准的13个CODIS(Combined DNA Index System)STRs位点在7个不同群体中的最小CMP数量级是10-15。用以评估该SNPs组合能否应用于亲权鉴定(即系统效能)的指标是非父排除概率(EP)。EP是指:根据孟德尔遗传定律,不是孩子生父的男子能被遗传标记基因型排除为孩子生父的理论概率。多个相互独立遗传的遗传标记位点的基因型组合的CEP等于1-累积非父不能排除概率,累积非父不能排除概率等于不能被单个遗传标记位点排除的概率的乘积。根据中华人民共和国公共安全行业标准《法庭科学DNA亲子鉴定规范》(GA/T 965-2011) 和司法鉴定技术规范《亲权鉴定技术规范》(SF/Z JD0105001-2016),关于可用于亲权鉴定的遗传标记累积非父排除概率规定为应≥0.9999。
本发明提供的116个常染色体SNPs在来自全世界不同地区的37个群体的 MP在0.333~0.529范围内,CMP在1.93×10-50~2.01×10-48范围内。所述116个 SNPs在来自全世界不同地区的37个群体的非父排除概率在0.012~0.419范围内,累积非父排除概率在0.9999999996653~0.9999999999945范围内。在此基础上,增加上述12个X染色体SNPs位点的分型,将进一步显著降低本遗传标记组合的CMP值,提高CEP值。更重要的是,应用12个X染色体SNPs位点的分型可同步实现性别推断。
本发明提供的116个相互独立遗传的常染色体SNPs位点和12个X染色体 SNPs位点,其法医学应用可通过对这些位点进行分型,比对来自犯罪现场和嫌疑人员的生物检材,或来自父母与孩子的生物检材的分型结果而实现。
在上述37个群体的3个(GWD-1KG、PUR-1KG、STU-1KG)中,本发明提供的116个常染色体SNPs中任意取≥38个位点的组合可获得小于10-15的 CMP。
在上述37个群体的19个(ESN-1KG、LWK-1KG、YRI-1KG、CLM-1KG、 JPT-1KG、KHV-1KG、IBS-1KG、TSI-1KG、BEB-1KG、GIH-1KG、ITU-1KG、 PJL-1KG、CHD-HapMap、GIH-HapMap、JPT-HapMap、LWK-HapMap、 MKK-HapMap、TSI-HapMap、YRI-HapMap)中,本发明提供的116个常染色体 SNPs中任意取≥39个位点的组合可获得小于10-15的CMP。
在上述37个群体的14个(ACB-1KG、ASW-1KG、MSL-1KG、MXL-1KG、 PEL-1KG、CDX-1KG、CHB-1KG、CHS-1KG、CEU-1KG、FIN-1KG、GBR-1KG、 CEU-HapMap、CHB-HapMap、MEX-HapMap)中,本发明提供的116个常染色体SNPs中任意取≥40个位点的组合可获得小于10-15的CMP。
在上述37个群体的1个(ASW-HapMap)中,本发明提供的116个常染色体SNPs中任意取≥41个位点的组合可获得小于10-15的CMP。
在上述37个群体的1个(CHB-1KG)中,本发明提供的116个常染色体SNPs 中任意取≥53个位点的组合可获得大于0.9999的CEP。
在上述37个群体的1个(FIN-1KG)中,本发明提供的116个常染色体SNPs 中任意取≥54个位点的组合可获得大于0.9999的CEP。
在上述37个群体的6个(ESN-1KG、LWK-1KG、YRI-1KG、KHV-1KG、 CEU-1KG、CHB-HapMap)中,本发明提供的116个常染色体SNPs中任意取≥55 个位点的组合可获得大于0.9999的CEP。
在上述37个群体的7个(ASW-1KG、CDX-1KG、JPT-1KG、GBR-1KG、 BEB-1KG、CEU-HapMap、YRI-HapMap)中,本发明提供的116个常染色体SNPs 中任意取≥56个位点的组合可获得大于0.9999的CEP。
在上述37个群体的9个(ACB-1KG、MXL-1KG、PEL-1KG、IBS-1KG、 TSI-1KG、GIH-1KG、CHD-HapMap、JPT-HapMap、LWK-HapMap)中,本发明提供的116个常染色体SNPs中任意取≥57个位点的组合可获得大于0.9999的 CEP。
在上述37个群体的7个(GWD-1KD、MSL-1KG、CLM-1KG、PUR-1KG、 CHS-1KG、MEX-HapMap、MKK-HapMap)中,本发明提供的116个常染色体 SNPs中任意取≥58个位点的组合可获得大于0.9999的CEP。
在上述37个群体的4个(ITU-1KG、PJL-1KG、GIH-HapMap、TSI-HapMap) 中,本发明提供的116个常染色体SNPs中任意取≥59个位点的组合可获得大于 0.9999的CEP。
在上述37个群体的1个(ASW-HapMap)中,本发明提供的116个常染色体SNPs中任意取≥60个位点的组合可获得大于0.9999的CEP。
在上述37个群体的1个(STU-1KG)中,本发明提供的116个常染色体SNPs 中任意取≥62个位点的组合可获得大于0.9999的CEP。
另外,本发明上述116个常染色体SNPs位点中,有34个可被其它1个或多个SNPs位点替代,原因是这些替代SNPs同样在上述37个群体中均具有高多态性,但在某些群体中与被替代位点非完全独立遗传;所述34个SNPs位点及对应的可替代的SNPs位点如下所示:rs10911093可替代为rs10797785或 rs9787011;rs2895309可替代为rs2399091;rs271397可替代为rs9451;rs1078226 可替代为rs2354159或rs3127637;rs1012515可替代为rs9389449、rs3799480或rs1498553;rs6460078可替代为rs10949838;rs7127767可替代为rs12278842、 rs12287199或rs1498553;rs9542974可替代为rs4465496、rs7997643或rs7325978; rs4239719可替代为rs6044214或rs6044218;rs4539869可替代为rs4541312、rs7278737或rs1556277;rs7561460可替代为rs11691240或rs4851526;rs1354147 可替代为rs1501871;rs163192可替代为rs163191;rs564060可替代为rs561292; rs6962246可替代为rs17620176;rs10503926可替代为rs10503927;rs508485可替代为rs621425;rs17533可替代为rs273696;rs6136874可替代为rs6046415; rs2826399可替代为rs2826388、rs2826390或rs10470220;rs11914834可替代为 rs4676908或rs2128205;rs9308179可替代为rs7659974、rs7682836、rs10002827、 rs11100846或rs11100847;rs2624459可替代为rs2007303;rs4644087可替代为 rs6569474;rs6955484可替代为rs7782649;rs12350076可替代为rs10967993; rs4942242可替代为rs1105856或rs7331003;rs628221可替代为rs694808或 rs11660213;rs2425427可替代为rs3091601;rs5916698可替代为rs5962235;rs5985930可替代为rs4633214或rs2625019;rs6520279可替代为rs2070584; rs3128264可替代为rs1099985;rs722847可替代为rs12397120。
同时,上述遗传标记在人体个体识别和/或亲权鉴定中的应用;在制备法医学个体识别和/或亲权鉴定试剂盒中的应用均在本发明保护范围内。
一种用于人体个体识别的引物池,包括依次用于检测上述128个SNPs位点的128个引物组,每个引物组包括一对扩增引物和一条单碱基延伸引物,其引物序列依次如SEQ IDNO:1~384所示。
一种人体个体识别和/或亲权鉴定的方法,包括如下步骤:
S1.提取样本DNA;
S2.以S1的DNA为模板,当进行个体识别时,用上述引物池扩增检测至少 38个常染色体SNPs位点;当进行亲权鉴定时,用上述引物池扩增检测至少53 个常染色体SNPs位点;
S3.将S2的扩增产物用树脂纯化,再进行质谱检测,得到所有位点的基因型数据;
S4.对分型结果进行法医遗传学参数分析,得到个体识别和/或亲权鉴定结果。
其中,步骤S2中每个SNPs位点的检测方法为:以S1的DNA为模板,用所述扩增引物进行PCR扩增反应,扩增产物用碱性磷酸酶处理,再用所述单碱基延伸引物进行单碱基延伸反应。
优选地,当需性别推断时,步骤S2中还需用上述引物池扩增检测12个X 染色体SNPs位点。
具体地,所述PCR为多重PCR,其引物组合为:SEQ ID NO:1~90在一个反应孔中反应;SEQ ID NO:91~180在一个反应孔中反应;SEQ ID NO:181~ 270在一个反应孔中反应;SEQ ID NO:271~384在一个反应孔中反应。
更有优选地,是以上述116个常染色体SNPs检测引物组和12个X染色体 SNPs检测引物组进行多重PCR扩增反应。
优选地,S2所述PCR反应体系为:1.25×PCR缓冲液(含15mM MgCl2) 0.625μL,1.625mM MgCl2(25mM)0.325μL,500μM dNTP Mix(25mM)0.100μL,100μM引物混合物(500nM)1.000μL,20ng/μLDNA模板1.000μL,0.5U/rxn HotStar Taq(5U/μL)0.100μL,H2O 1.850μL,共5μL。
优选地,所述PCR反应程序为:94℃5min;(94℃20s,56℃30s,72℃ 1min)循环45次;72℃3min。
优选地,S3所述碱性磷酸酶处理的反应体系为:10×SAP缓冲液0.17μL, 1U/μLSAP酶0.30μL,PCR产物5.00μL,H2O 1.53μL,共7.00μL。
优选地,所述碱性磷酸酶处理的反应程序为:37℃,20min;85℃,5min。
优选地,所述延伸的反应体系为:延伸反应液2μL,SAP+PCR反应产物 7μL,共9μL。
优选地,所述延伸反应程序为:94℃30s;(94℃5s;(52℃5s,80℃5s) 循环5次)循环40次;72℃3min。
另外,还可采用Illumina或Thermo公司的第二代测序技术对本发明中的116 个常染色体SNPs位点和12个X染色体SNPs位点进行检测。
同时,上述方法在个体识别和/或亲权鉴定或在制备个体识别和/或亲权鉴定试剂盒中的应用均在本发明保护范围内。
进一步,本发明提供一种用于人体个体识别和/或亲权鉴定的试剂盒,当进行个体识别时,所述试剂盒包括检测权利要求1所述的116个常染色体SNPs位点中的至少38个SNPs位点的试剂;当进行亲权鉴定时,所述试剂盒包括检测权利要求1所述的116个常染色体SNPs位点中的至少53个SNPs位点的试剂。
优选地,所述试剂盒还包括检测上述12个X染色体SNPs位点的试剂。
优选地,所述试剂包括检测引物和PCR扩增等所需试剂;所述检测引物为上述引物池。
同时,本发明还提供使用上述试剂盒进行个体识别和/或亲权鉴定中的应用,具体步骤如下:
S1.提取样本DNA;
S2.以S1的DNA为模板,当进行个体识别时,用上述引物池扩增检测至少 38个常染色体SNPs位点;当进行亲权鉴定时,用上述引物池扩增检测至少53 个常染色体SNPs位点;
S3.将S2的扩增产物用树脂纯化,再进行质谱检测,得到所有位点的基因型数据;
S4.对分型结果进行法医遗传学参数分析,得到个体识别和/或亲权鉴定结果。
其中,步骤S2中每个SNPs位点的检测方法为:以S1的DNA为模板,用所述扩增引物进行多重PCR扩增反应,扩增产物用碱性磷酸酶处理,再用所述单碱基延伸引物进行单碱基延伸反应。
另外,当需性别推断时,步骤S2中还需用上述引物池扩增检测12个X染色体SNPs位点。
其中,所述多重PCR引物组合为:SEQ ID NO:1~90在一个反应孔中反应; SEQ IDNO:91~180在一个反应孔中反应;SEQ ID NO:181~270在一个反应孔中反应;SEQ ID NO:271~384在一个反应孔中反应。
当想获得更佳精确和可靠的检测结果时,可同时检测上述116个常染色体 SNPs位点和12个X染色体SNPs位点,即以上述116个常染色体SNPs检测引物组和12个X染色体SNPs检测引物组进行多重PCR扩增反应。
具体地,S2所述PCR反应体系为:1.25×PCR缓冲液(含15mM MgCl2) 0.625μL,1.625mM MgCl2(25mM)0.325μL,500μM dNTP Mix(25mM)0.100μL, 100μM引物混合物(500nM)1.000μL,20ng/μLDNA模板1.000μL,0.5U/rxn HotStar Taq(5U/μL)0.100μL,H2O1.850μL,共5μL;PCR反应程序为:94℃ 5min;(94℃20s,56℃30s,72℃1min)循环45次;72℃3min。
具体地,S3所述碱性磷酸酶处理的反应体系为:10×SAP缓冲液0.17μL, 1U/μLSAP酶0.30μL,PCR产物5.00μL,H2O 1.53μL,共7.00μL;所述碱性磷酸酶处理的反应程序为:37℃,20min;85℃,5min。
具体地,所述延伸的反应体系为:延伸反应液2μL,SAP+PCR反应产物 7μL,共9μL;所述延伸反应程序为:94℃30s;(94℃5s;(52℃5s,80℃5s) 循环5次)循环40次;72℃3min。
与现有技术相比,本发明具有以下有益效果:
(1)本发明的SNPs位点组合与现有的商业化试剂盒(包括STR试剂盒和 SNP试剂盒)相比,具有更高更广阔的多种族适应性,且CMP和CEP均显著优于商业化试剂盒,检测结果更加准确。
(2)本发明的SNPs位点与STR遗传标记相比,PCR扩增片段更短,对于高度降解检材DNA鉴定具有极大优势。
(3)本发明的SNPs位点与STR遗传标记相比,有更低的突变率,在亲缘关系鉴定中更理想;与各种测序平台的匹配度更高,利于在更广范围不同实验室之间实现应用。
(4)本发明是从全基因组范围内25,580,678个SNPs位点中无偏筛选出128 个在来自全球37个群体中均具有高多态性的相互独立遗传SNPs,可在多种族中广泛适用,更具普遍代表性。
(5)本发明常染色体SNPs与X染色体SNPs的组合可以同步实现性别推断和身份鉴定,而无需用两个不同试剂盒分别检验。
具体实施方式
以下结合具体实施例来进一步说明本发明,但实施例并不对本发明做任何形式的限定。除非特别说明,本发明采用的试剂、方法和设备为本技术领域常规试剂、方法和设备。
除非特别说明,以下实施例所用试剂和材料均为市购。
实施例1 128个SNPs在134个中国人样本中的验证及与商业化试剂盒的比较
1、研究对象
研究对象为134个中国汉族人外周血样本,其中96个来自广州,34个来自郑州。所有样本依据知情同意原则签署知情同意书。
2、基因分型
(1)引物设计
针对本发明的128个SNPs设计扩增引物和单碱基延伸引物,其序列如下表1所示,由引物合成公司合成。
表1本发明128个SNPs的扩增引物和单碱基延伸引物序列
(2)DNA提取和质检
提取基因组DNA,使用NanoDrop2000仪器进行OD值检测,1.25%琼脂糖凝胶电泳检测,DNA质检合格,转移至96孔板,-20℃保存备用。
(3)扩增反应
采用表2所述反应体系,以表1中的正向引物和反向引物进行PCR扩增反应,PCR反应程序为:94℃5min;(94℃20s,56℃30s,72℃1min)循环 45次;72℃3min。
表2 PCR扩增反应体系
(4)反应产物碱性磷酸酶处理
配制虾碱性磷酸酶(shrimp alkaline phosphatase,SAP)处理反应液,将步骤(3)的PCR反应产物进行碱性磷酸酶处理,其反应体系如表3所示,反应程序为:37℃,20min;85℃,5min;4℃,∞。
表3 PCR扩增反应产物碱性磷酸酶处理的反应体系
反应物 | 浓度 | 体积(1rxn) |
H<sub>2</sub>O(HPLC级) | / | 1.53μL |
SAP缓冲液 | 10x | 0.17μL |
SAP酶 | 1U/μL | 0.30μL |
PCR产物 | / | 5.00μL |
总体积 | / | 7.00μL |
(5)单碱基延伸反应
配置延伸反应液,将步骤(4)碱性磷酸化处理后的PCR反应产物进行延伸反应,延伸反应液组分如表4所示,延伸反应体系如表5所示,延伸反应的程序如表6所示:
表5延伸反应液组分
表6延伸反应体系
反应物 | 体积(μL) |
延伸反应液 | 2 |
SAP+PCR反应产物 | 7 |
总体积 | 9 |
表7延伸反应程序
(6)树脂纯化
在384/6MG Dimple板里均匀填充树脂并放置10分钟使其晾干。在384样本板的每个孔中加16μL水。将384样本板轻轻翻转过来扣在Dimple板上,然后轻敲使树脂落入样本板的每个孔中。将384样本板放置翻转离心机中室温旋转混匀30分钟。
(7)质谱检测
启动MassARRAY Nanodispenser RS1000点样仪,将树脂纯化后的延伸产物移至384-well SpectroCHIP bioarray上。将点样后的SpectroCHIP芯片使用 MALDI-TOF质谱仪分析,检测结果使用TYPER4.0软件获取原始数据及基因分型图。对分型结果进行群体遗传学和法医遗传学参数分析,获得个体识别或亲缘关系鉴定系统效能评估指标。
3、分析结果
将128个SNPs中的常染色体SNPs在134个样本中的基因型经遗传学分析后,获得在广州汉族人群样本中的CMP和CEP分别为9.220×10-47和 0.999999999896,获得在郑州汉族人群的CMP和CEP分别为8.366×10-46和 0.999999999939。经分子方差分析显示两个群体无群体间遗传差异,两个群体可合并为一个。合并后的CMP和CEP分别为4.697×10-47和0.999999999862。采用本发明的12个X染色体SNPs的基因型对134个样本的性别进行推断,推断率为100%,错误率为0。以上结果显示所述位点及其检测方法适用于本次应用。
4、与商业化STR和SNP试剂盒的比较
基于22个STRs组合的商业化试剂盒Fusion STR System (Promega公司)在108个中国汉族人群中的检验结果为:CMP=2.147×10-25, CEP=0.999999999673。基于欧盟筛选的SNPforID 52和耶鲁大学Kidd实验室筛选的SNPs组合(如“背景技术”所述)开发的商业化试剂盒HID-Ion AmpliSeqTM Identity Panel(Thermo Fisher Scientific公司)含90个个体识别SNPs。其曾在108 个中国汉族人群中的检验结果为:CMP=1.318×10-33,CEP=0.999999724。更进一步的,我们从本发明的SNPs组合中随机抽取90个常染色体SNPs,以保持与 HID-Ion AmpliSeqTM Identity Panel试剂盒所含数目一致。在134个中国汉族人群中,本发明的SNPs中任意90个常染色体SNPs组合所获得的CMP在 3.071×10-39~5.368×10-38范围内,比Fusion STR System低至少13个数量级,相同位点数情况下比HID-Ion AmpliSeqTM Identity Panel低至少5个数量级;所获得的CEP在0.9999999728~0.99999999736范围内,比Fusion STR System在小数点后少至多2个9,相同位点数情况下比HID-Ion AmpliSeqTM Identity Panel在小数点后多至少1个9。
因此,与现有的商业化试剂盒相比,本发明的SNPs组合具有更高更广阔的多种族适应性,检测中可同步实现性别推断,且CMP和CEP均显著优于商业化试剂盒,检测结果更加准确。
序列表
<110> 中山大学
<120> 用于人体个体识别和亲权鉴定的遗传标记及其检测方法和试剂盒
<130> 1713053ZBSH042
<141> 2017-09-14
<160> 384
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 1
acgttggatg ttattcttct ctgggccctc 30
<210> 2
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 2
acgttggatg cctagaagga tgaaacagcg 30
<210> 3
<211> 15
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 3
gccctctttc ctgac 15
<210> 4
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 4
acgttggatg agagggaaca tgtgctaagg 30
<210> 5
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 5
acgttggatg tttctctcca ctccatcacc 30
<210> 6
<211> 15
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 6
taaggcatgc ccagg 15
<210> 7
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 7
acgttggatg caggtcagga tgtcatgaag 30
<210> 8
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 8
acgttggatg gtggttttcc ctgatttccc 30
<210> 9
<211> 15
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 9
gtcatgaagg ggtcg 15
<210> 10
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 10
acgttggatg atgaaacaaa aatccaccgc 30
<210> 11
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 11
acgttggatg cagtgttttg agacaggttg 30
<210> 12
<211> 16
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 12
tccaccgcat tatctg 16
<210> 13
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 13
acgttggatg atttccctgc tttgactcgg 30
<210> 14
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 14
acgttggatg caagtttctt tcctgccgtc 30
<210> 15
<211> 16
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 15
ggggaaagtc tgcaca 16
<210> 16
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 16
acgttggatg gggagtataa aggtccagtc 30
<210> 17
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 17
acgttggatg aagcctcatg gagacctttg 30
<210> 18
<211> 17
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 18
aggtccagtc atttcaa 17
<210> 19
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 19
acgttggatg ggagggaaag ctaaatagtg 30
<210> 20
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 20
acgttggatg ctcttaaagg ctaagccacg 30
<210> 21
<211> 17
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 21
gattcagcaa ctggaag 17
<210> 22
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 22
acgttggatg gaagttgact tctgcccaag 30
<210> 23
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 23
acgttggatg tcctgactct cagtttccag 30
<210> 24
<211> 18
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 24
ccccaagtct aaacctca 18
<210> 25
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 25
acgttggatg ggatcttctg attccaagtc 30
<210> 26
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 26
acgttggatg aacagactaa taccccttcc 30
<210> 27
<211> 18
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 27
ttccaagtct agggttct 18
<210> 28
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 28
acgttggatg agacgtaaca catcagaggc 30
<210> 29
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 29
acgttggatg actatgctct gttgtgaccc 30
<210> 30
<211> 18
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 30
ggctgtgatt catactca 18
<210> 31
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 31
acgttggatg tgcttgttga ttgctcactc 30
<210> 32
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 32
acgttggatg tagagagcac gtcatagttg 30
<210> 33
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 33
ctcactcttt actgaacac 19
<210> 34
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 34
acgttggatg ccatgtgact attgctatgc 30
<210> 35
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 35
acgttggatg ggtgaaaaga ggttacatgc 30
<210> 36
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 36
ccactgctct tacttatgc 19
<210> 37
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 37
acgttggatg ggcagaagct aggaagaaac 30
<210> 38
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 38
acgttggatg gttgggatgg tttcgttctc 30
<210> 39
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 39
gcgaggaaga aacaagcca 19
<210> 40
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 40
acgttggatg ggcttttgct gacaacttgg 30
<210> 41
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 41
acgttggatg cgttagcaag agaagtcagg 30
<210> 42
<211> 20
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 42
aggtaactat tcttgccttt 20
<210> 43
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 43
acgttggatg ctcaagagcc cagaagacag 30
<210> 44
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 44
acgttggatg agagttgaag gcactggaag 30
<210> 45
<211> 20
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 45
gcccagaaga cagttaaacc 20
<210> 46
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 46
acgttggatg gcaccatatc tgtgcagttc 30
<210> 47
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 47
acgttggatg ggtgaccagc tttttatggg 30
<210> 48
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 48
ttagtcagta ggacaagtca a 21
<210> 49
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 49
acgttggatg agagacgatg gttctggaag 30
<210> 50
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 50
acgttggatg gatgatctgt gcacggaatc 30
<210> 51
<211> 0
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 51
<210> 52
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 52
acgttggatg gcctgatttg ttggccttac 30
<210> 53
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 53
acgttggatg gagaagtgaa gtctgactcc 30
<210> 54
<211> 22
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 54
acgttggatg gagaagtgaa gt 22
<210> 55
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 55
acgttggatg atacgaggtc atctcaggtc 30
<210> 56
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 56
acgttggatg gcagagtgaa tgactgtttc 30
<210> 57
<211> 22
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 57
gcggtcatct caggtcacca ta 22
<210> 58
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 58
acgttggatg tgatacactc accctttggc 30
<210> 59
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 59
acgttggatg ttcgtctgtc gtgcatgttg 30
<210> 60
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 60
cagcgttaat attgtccatt tca 23
<210> 61
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 61
acgttggatg tttcctagca aagcctgaac 30
<210> 62
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 62
acgttggatg ctttttgtga aggctaggag 30
<210> 63
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 63
gggtcctgaa ctagcttagg tgt 23
<210> 64
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 64
acgttggatg caaagaattc cacagagtt 29
<210> 65
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 65
acgttggatg gggtgggaat tagactctg 29
<210> 66
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 66
gtggttgcgt gatattttga tga 23
<210> 67
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 67
acgttggatg gaactcttca agagtgcctc 30
<210> 68
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 68
acgttggatg gagaaagatg atgaggttac 30
<210> 69
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 69
gtgactccct tgttgctttc tata 24
<210> 70
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 70
acgttggatg tataatcact gcctctaccc 30
<210> 71
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 71
acgttggatg gtgctcagac acagtgtcag 30
<210> 72
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 72
ggggctgcct ctacccatac ttcta 25
<210> 73
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 73
acgttggatg cagtgccacg aagtagaatg 30
<210> 74
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 74
acgttggatg aagtgactga ggcatgtgtg 30
<210> 75
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 75
cctacgtaga atgaacttga gcttt 25
<210> 76
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 76
acgttggatg tgcatgccta gaatgtaaac 30
<210> 77
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 77
acgttggatg gatgatggca aggatcagtc 30
<210> 78
<211> 26
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 78
ccccccacat tatcagcctg ccctgc 26
<210> 79
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 79
acgttggatg gattagatta gggcccactc 30
<210> 80
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 80
acgttggatg ccctagttcc tcagaatgtg 30
<210> 81
<211> 26
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 81
cggtcccact ctagcagtct catttt 26
<210> 82
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 82
acgttggatg ttgaccattt ggcttcaaac 30
<210> 83
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 83
acgttggatg ctcagattac cccagttatg 30
<210> 84
<211> 26
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 84
tactagaggg ttaaaagatt tacata 26
<210> 85
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 85
acgttggatg aagggaagac ctggatatct 30
<210> 86
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 86
acgttggatg ctttaaatgt gaatggcct 29
<210> 87
<211> 27
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 87
ctttactaat acacattgat acacttt 27
<210> 88
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 88
acgttggatg aaacctcacc atgttccctg 30
<210> 89
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 89
acgttggatg aaattagctg gcagccagtg 30
<210> 90
<211> 27
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 90
ttcgcatatc tgttttccac agtaatc 27
<210> 91
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 91
acgttggatg ctggttagca atggctagag 30
<210> 92
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 92
acgttggatg actcaggtgg agtggcacag 30
<210> 93
<211> 15
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 93
tgctcactcg gctct 15
<210> 94
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 94
acgttggatg atgggctgaa ttcgttcctg 30
<210> 95
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 95
acgttggatg ctcctggaag gagaaaatgg 30
<210> 96
<211> 15
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 96
gtgattcgtg cctcc 15
<210> 97
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 97
acgttggatg aaggccttag tctggatgtg 30
<210> 98
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 98
acgttggatg cttctttccc ctgttcttcc 30
<210> 99
<211> 15
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 99
gatgtgggga tcacg 15
<210> 100
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 100
acgttggatg gccacaaaca tcatgcagac 30
<210> 101
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 101
acgttggatg gtttcaaagc tgagcacacg 30
<210> 102
<211> 16
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 102
actagaaggg gtcaga 16
<210> 103
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 103
acgttggatg gatcctctgc acagcatttg 30
<210> 104
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 104
acgttggatg tttgaggtac agggctctac 30
<210> 105
<211> 17
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 105
ctggtagctg ttctctt 17
<210> 106
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 106
acgttggatg ggagttttct ccccaaacac 30
<210> 107
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 107
acgttggatg ttttgacgga ctgtaccacc 30
<210> 108
<211> 18
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 108
tccccaaaca cacttaat 18
<210> 109
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 109
acgttggatg atctttaaac ctcgggtggc 30
<210> 110
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 110
acgttggatg cccccatttt aacttgtgcg 30
<210> 111
<211> 18
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 111
cagctgttgt gatcgagg 18
<210> 112
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 112
acgttggatg tggcttccca atactgtgtc 30
<210> 113
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 113
acgttggatg tgctgtctgc cttcctctg 29
<210> 114
<211> 18
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 114
ttttagacag gggcaagt 18
<210> 115
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 115
acgttggatg ctcatcttgt tcacctctgg 30
<210> 116
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 116
acgttggatg caccgatgcc atctcttaac 30
<210> 117
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 117
gaccctctgc tcatagtta 19
<210> 118
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 118
acgttggatg tacaggttga acagcaggac 30
<210> 119
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 119
acgttggatg tgtcagggac atgttggaag 30
<210> 120
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 120
cccaggacat aagcagcac 19
<210> 121
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 121
acgttggatg aatggctccc aaaaccactg 30
<210> 122
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 122
acgttggatg agcgatccta aggtaacctc 30
<210> 123
<211> 20
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 123
actctttcaa cccttttctt 20
<210> 124
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 124
acgttggatg gttaataagg ctgtgactcg 30
<210> 125
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 125
acgttggatg tcttttccac tgactgcagg 30
<210> 126
<211> 20
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 126
gtgctgtgac tcgttgatac 20
<210> 127
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 127
acgttggatg tgtttagggt ctttggagag 30
<210> 128
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 128
acgttggatg caggacatga gtcatattgg 30
<210> 129
<211> 20
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 129
gggctcaagt taaggcgaga 20
<210> 130
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 130
acgttggatg gcattcaaac atcatgtgag 30
<210> 131
<211> 31
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 131
acgttggatg cctgcaagga taatctttct c 31
<210> 132
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 132
gtcatttcct ttgaggaata a 21
<210> 133
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 133
acgttggatg atcagcacag caacttcagg 30
<210> 134
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 134
acgttggatg ggctgtttct ggacagcttg 30
<210> 135
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 135
gggagaagcc cagagggatg a 21
<210> 136
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 136
acgttggatg agatcgttcc ttgggtacag 30
<210> 137
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 137
acgttggatg ctcttttgaa ccttcctagc 30
<210> 138
<211> 22
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 138
ccatgctttg gcatgtgatt tt 22
<210> 139
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 139
acgttggatg tgcaactgat gtagagcagg 30
<210> 140
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 140
acgttggatg gagccctctt ggatattttc 30
<210> 141
<211> 22
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 141
gagtccagag gaagccgtta tt 22
<210> 142
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 142
acgttggatg cctccatttc ttgggtttgc 30
<210> 143
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 143
acgttggatg tttacctgcg ctgaggaaac 30
<210> 144
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 144
cccggtttgc ttccatttgt ata 23
<210> 145
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 145
acgttggatg cttctatcct gcagcatgag 30
<210> 146
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 146
acgttggatg gattcagata caggactgtg 30
<210> 147
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 147
caaatcctca tagccaagca aaa 23
<210> 148
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 148
acgttggatg tcctcttagt tttccacttg 30
<210> 149
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 149
acgttggatg gctgtgtttc cctaatttgc 30
<210> 150
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 150
tggcaaaaat tatgggagaa ata 23
<210> 151
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 151
acgttggatg tcctcttagt tttccacttg 30
<210> 152
<211> 31
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 152
acgttggatg gctatgtttg tactgaaagg c 31
<210> 153
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 153
gggcgtggac tgtatgatca tgg 23
<210> 154
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 154
acgttggatg acttctcgac tatctcccac 30
<210> 155
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 155
acgttggatg atcctctctg cctagtagac 30
<210> 156
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 156
ccaggcagcc agcaagttgc ttta 24
<210> 157
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 157
acgttggatg tgcagagtta cccggccttg 30
<210> 158
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 158
acgttggatg atagggtaac ccacaccaag 30
<210> 159
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 159
ttggtcaagg accaggtctc tgta 24
<210> 160
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 160
acgttggatg agtgccttga gataggtgag 30
<210> 161
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 161
acgttggatg tacaaccagg tactcttcag 30
<210> 162
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 162
cccctagctg gactctccag gccta 25
<210> 163
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 163
acgttggatg ggaaagccac tgaaagttag 30
<210> 164
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 164
acgttggatg aggctcaggt cctatctaac 30
<210> 165
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 165
tagaagtgat ttgttagcag tataa 25
<210> 166
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 166
acgttggatg acactatcaa cggtgatggg 30
<210> 167
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 167
acgttggatg gtattatgca cggcagatgg 30
<210> 168
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 168
ccagggatgg gaaaacagaa gacac 25
<210> 169
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 169
acgttggatg aagagctcca caggaagaac 30
<210> 170
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 170
acgttggatg gcctcttgta aagagagctg 30
<210> 171
<211> 26
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 171
aatagactgc tcagtttcaa accttt 26
<210> 172
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 172
acgttggatg accaagtaac ttgataggac 30
<210> 173
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 173
acgttggatg acctatgatc tctgcccaag 30
<210> 174
<211> 26
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 174
tacttcattt aaaagtcatt gtagtg 26
<210> 175
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 175
acgttggatg gctagttgtg tatgcttggg 30
<210> 176
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 176
acgttggatg gcccaaactc ataagaatcc 30
<210> 177
<211> 26
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 177
agtggtgtat gcttggggga gtttca 26
<210> 178
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 178
acgttggatg tatgtattca ctggcatcac 30
<210> 179
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 179
acgttggatg gcttttactg acaacgatcc 30
<210> 180
<211> 27
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 180
ttctccactg gcatcactta ttgatac 27
<210> 181
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 181
acgttggatg tccaagttcc ttgactgacc 30
<210> 182
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 182
acgttggatg tgaagtaccg gccagtagag 30
<210> 183
<211> 15
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 183
actgaccccc aggac 15
<210> 184
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 184
acgttggatg tgaggcccaa ggaaagacac 30
<210> 185
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 185
acgttggatg tgctgcagtg tgggaaggg 29
<210> 186
<211> 15
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 186
agacaccaag cccga 15
<210> 187
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 187
acgttggatg tatccgaagt cacacaaccg 30
<210> 188
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 188
acgttggatg ctttgcagtg agggctttgg 30
<210> 189
<211> 16
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 189
acagccagga tttgaa 16
<210> 190
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 190
acgttggatg agacctagtc tctgatgctc 30
<210> 191
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 191
acgttggatg gttgcatcac gtgattgtgg 30
<210> 192
<211> 17
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 192
cactgccttt tcccttg 17
<210> 193
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 193
acgttggatg cgtgagcatt tctcctctac 30
<210> 194
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 194
acgttggatg tgtggcagat gtgagtagtg 30
<210> 195
<211> 17
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 195
ccacttcttt cctcagg 17
<210> 196
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 196
acgttggatg ccaataggtt tcttcatgag 30
<210> 197
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 197
acgttggatg gcaggaagct gaaaattcac 30
<210> 198
<211> 17
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 198
gaagctagtt gcgaccc 17
<210> 199
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 199
acgttggatg accacaccct taagatgagc 30
<210> 200
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 200
acgttggatg cagaacaaaa aagttccatc 30
<210> 201
<211> 18
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 201
gtcctgttta aagccatc 18
<210> 202
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 202
acgttggatg accactgttg ggtgatcctg 30
<210> 203
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 203
acgttggatg tggtcagtgc tatgtgagtg 30
<210> 204
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 204
cccccctctc gagcctcat 19
<210> 205
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 205
acgttggatg gggagtaaaa tcatcagaag 30
<210> 206
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 206
acgttggatg tccattgtct ggttcttcgg 30
<210> 207
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 207
aatgcatacc attaagccc 19
<210> 208
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 208
acgttggatg gtgtaggata ctgttacaac 30
<210> 209
<211> 31
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 209
acgttggatg gagatttctt tgctgtgaat g 31
<210> 210
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 210
taacttctgg agacgaaga 19
<210> 211
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 211
acgttggatg tgaggaagtg acaagttcag 30
<210> 212
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 212
acgttggatg acaggttgct tgttcagagg 30
<210> 213
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 213
tgttcagatc tgagggaca 19
<210> 214
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 214
acgttggatg agcccacttc ttttcagtgc 30
<210> 215
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 215
acgttggatg aggcaaaaca gcacatgcac 30
<210> 216
<211> 20
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 216
gctcccacag tgtatcattc 20
<210> 217
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 217
acgttggatg tgactgcagg gtggatttac 30
<210> 218
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 218
acgttggatg tgttccctcc tgccatctg 29
<210> 219
<211> 20
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 219
ttttcgtctc ctgcagcagc 20
<210> 220
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 220
acgttggatg tggcagtgcc tcttccaag 29
<210> 221
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 221
acgttggatg aaatgtaccc actggctgtc 30
<210> 222
<211> 20
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 222
ccccaggcag gggtgtggag 20
<210> 223
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 223
acgttggatg cctaagggta ggtttgtttg 30
<210> 224
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 224
acgttggatg gttgtaaaag gcatatgtcc 30
<210> 225
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 225
ttttgacttt gacataccaa g 21
<210> 226
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 226
acgttggatg atccctgctc tttcgtaccc 30
<210> 227
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 227
acgttggatg accgggagtg ctgttttctg 30
<210> 228
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 228
ttctgcatgt gaatctcatg t 21
<210> 229
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 229
acgttggatg gcatttcaca ataaagggag 30
<210> 230
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 230
acgttggatg gtctcctcag acttagtttc 30
<210> 231
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 231
aataaaggga gtatggatct a 21
<210> 232
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 232
acgttggatg gttttgctct tgtttttccc 30
<210> 233
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 233
acgttggatg atcctctaac tctgtagccc 30
<210> 234
<211> 22
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 234
ttgtttttcc catctttttc ca 22
<210> 235
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 235
acgttggatg ggtaatcatg cttccttcgg 30
<210> 236
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 236
acgttggatg aaggagatgt ggtcacatgg 30
<210> 237
<211> 22
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 237
gggagccaga aacggtcccc at 22
<210> 238
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 238
acgttggatg cactgacatc aattccgagc 30
<210> 239
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 239
acgttggatg actgttagtc acaagtgccc 30
<210> 240
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 240
cccgagattc ctcagcattt cag 23
<210> 241
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 241
acgttggatg cactcaggcc atgatcattc 30
<210> 242
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 242
acgttggatg gatggctaac tagagatgtc 30
<210> 243
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 243
gatgatcatt cacctgtaaa gtt 23
<210> 244
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 244
acgttggatg cacaggtcta aactgtatgc 30
<210> 245
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 245
acgttggatg tgtttcgact tgaggaaacc 30
<210> 246
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 246
gggttctaag aagcagagtg tat 23
<210> 247
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 247
acgttggatg ccactgtggc ctatttcaag 30
<210> 248
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 248
acgttggatg tggctccgaa gaactgattg 30
<210> 249
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 249
gtgaaatcaa ttggttcaca aaat 24
<210> 250
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 250
acgttggatg aggcctgata gacaatgatg 30
<210> 251
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 251
acgttggatg actaactgta ccaaattgc 29
<210> 252
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 252
ccccgtccag catgctacca aatgt 25
<210> 253
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 253
acgttggatg gcaggcaaaa attcctatgg 30
<210> 254
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 254
acgttggatg tccagatccc aggaaaacac 30
<210> 255
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 255
atatggtttg tactttcatt gaatt 25
<210> 256
<211> 31
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 256
acgttggatg gtcttcaaac caaaccaaag g 31
<210> 257
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 257
acgttggatg gtcaggcaga acgtattttc 30
<210> 258
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 258
aatgaaaaga aaaaaaaaaa cagta 25
<210> 259
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 259
acgttggatg cacttggtcc aactgcagag 30
<210> 260
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 260
acgttggatg ttgggttttg cctcagactc 30
<210> 261
<211> 26
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 261
cctttccaac tgcagagaca atcatt 26
<210> 262
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 262
acgttggatg acacctctta caagaggcac 30
<210> 263
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 263
acgttggatg aattacagcc cattccctcc 30
<210> 264
<211> 26
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 264
gcgcttacaa gaggcacctg gcgaca 26
<210> 265
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 265
acgttggatg ggcgttttta ctgctccaaa 30
<210> 266
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 266
acgttggatg ctaggtaggc atttggtata 30
<210> 267
<211> 26
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 267
gaaggtttct aggcaaaaac ggcaag 26
<210> 268
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 268
acgttggatg ccaaggaaca gtcacagatg 30
<210> 269
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 269
acgttggatg aggcaggctt atttgtcatc 30
<210> 270
<211> 26
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 270
gggagatgtg gtttgcattg ataaaa 26
<210> 271
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 271
acgttggatg gcactttgag aatggccaag 30
<210> 272
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 272
acgttggatg ccccagcagt gtaaagactc 30
<210> 273
<211> 15
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 273
ccaagattct gcccc 15
<210> 274
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 274
acgttggatg tgccttcctg acaacaactg 30
<210> 275
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 275
acgttggatg tgtacctatg tatgattcc 29
<210> 276
<211> 15
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 276
tgacacagca ggaag 15
<210> 277
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 277
acgttggatg gtgcagtgcc atgtttgttc 30
<210> 278
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 278
acgttggatg tgaggttgag ggaacatgac 30
<210> 279
<211> 16
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 279
aacccatgtt ccatgc 16
<210> 280
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 280
acgttggatg aacactacgt tggactgtgc 30
<210> 281
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 281
acgttggatg tgtgggtttt acatcccttg 30
<210> 282
<211> 16
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 282
tgtgcaggtc cactta 16
<210> 283
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 283
acgttggatg agtcaggaaa gatgtcacag 30
<210> 284
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 284
acgttggatg ccctcttctt ggcttgttag 30
<210> 285
<211> 17
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 285
cagtgacaac aagccac 17
<210> 286
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 286
acgttggatg agagaacgag tgccaaaacc 30
<210> 287
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 287
acgttggatg tccaaggtca cagagctaag 30
<210> 288
<211> 17
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 288
caaggattgt gtaggct 17
<210> 289
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 289
acgttggatg acccctcttt ggaagaactg 30
<210> 290
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 290
acgttggatg cgagttatgc gtgtgttgag 30
<210> 291
<211> 18
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 291
cccccccttc ttagcatc 18
<210> 292
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 292
acgttggatg gtatctcttt cactcctggc 30
<210> 293
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 293
acgttggatg ttcctagtgt gttactgctc 30
<210> 294
<211> 18
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 294
cccgccctgc ctgggcac 18
<210> 295
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 295
acgttggatg catgcccagt tttttatgcc 30
<210> 296
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 296
acgttggatg gtcatatctc cccttcattg 30
<210> 297
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 297
agttttttat gccaccaaa 19
<210> 298
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 298
acgttggatg ttgcttcctg gatgagtctg 30
<210> 299
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 299
acgttggatg ccccctgcca gtaaataaag 30
<210> 300
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 300
tccagttggt gtcatttat 19
<210> 301
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 301
acgttggatg actcttctct gcctcttctc 30
<210> 302
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 302
acgttggatg tgccatcaca ggtgtctttg 30
<210> 303
<211> 20
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 303
tttgcctctt ctcatcactt 20
<210> 304
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 304
acgttggatg cgtgatgata tctggagaac 30
<210> 305
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 305
acgttggatg gtcatgctca tgactgacat 30
<210> 306
<211> 20
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 306
agggcttagt ccatagtaaa 20
<210> 307
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 307
acgttggatg tctgtgatgt ctggaactgg 30
<210> 308
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 308
acgttggatg gggaaactca aagtacacac 30
<210> 309
<211> 20
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 309
tttgagcagg cagtggtcca 20
<210> 310
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 310
acgttggatg ccttccatcc ttcagttctc 30
<210> 311
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 311
acgttggatg agagcaaaac tccgtctcag 30
<210> 312
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 312
tccttcagtt ctcatcagtt a 21
<210> 313
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 313
acgttggatg taaccaaaga gatggttggc 30
<210> 314
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 314
acgttggatg agtcttccaa cccttcctac 30
<210> 315
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 315
atggttggct taagaggaat c 21
<210> 316
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 316
acgttggatg catgtctgtc cttttatggc 30
<210> 317
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 317
acgttggatg gctacagata tccctggaac 30
<210> 318
<211> 22
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 318
gcatacatgt atcacaacac ga 22
<210> 319
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 319
acgttggatg ccaggtcagc cattctgttg 30
<210> 320
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 320
acgttggatg ccatttcaca gctctggtag 30
<210> 321
<211> 22
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 321
tgtggaaatg aacctctctt ag 22
<210> 322
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 322
acgttggatg attggcatcc cagagggtca 30
<210> 323
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 323
acgttggatg acacactcac cttgatgtcc 30
<210> 324
<211> 22
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 324
gggaaggaca caggtctgga gt 22
<210> 325
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 325
acgttggatg ggctcattat ttcacaactg 30
<210> 326
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 326
acgttggatg cagtgccttt ggaaacattg 30
<210> 327
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 327
tcattatttc acaactgatc ttc 23
<210> 328
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 328
acgttggatg gagcccctag ctctagaaag 30
<210> 329
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 329
acgttggatg aatggagacg ggtagtacac 30
<210> 330
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 330
cccccagctc tagaaagccc agaa 24
<210> 331
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 331
acgttggatg ccatgtagtg tggtaaatac 30
<210> 332
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 332
acgttggatg tatacagcgc ctaatacttg 30
<210> 333
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 333
ttaaatacat aaaccagcaa ctaa 24
<210> 334
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 334
acgttggatg gtatcacctg attcccactg 30
<210> 335
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 335
acgttggatg tgtctagatt tcttgctggg 30
<210> 336
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 336
gcagaaatgt tgaaagattt ttta 24
<210> 337
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 337
acgttggatg agatgacagc tgtaggttag 30
<210> 338
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 338
acgttggatg gggtgaggat ttctgtttg 29
<210> 339
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 339
tggcaatgag tttaaatgct tgaac 25
<210> 340
<211> 31
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 340
acgttggatg caaagctcag tatgtatttc c 31
<210> 341
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 341
acgttggatg cctctcaaca gttgccaaag 30
<210> 342
<211> 26
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 342
tttcccatga attatttcac gcctta 26
<210> 343
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 343
acgttggatg cctagtcttg caccaagaac 30
<210> 344
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 344
acgttggatg tgctgtggta tctttttggg 30
<210> 345
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 345
gggagggtga gcagatgaaa aaatg 25
<210> 346
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 346
acgttggatg taggttgcac gctccttatg 30
<210> 347
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 347
acgttggatg accctgagct tgttttcctg 30
<210> 348
<211> 26
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 348
atgaaaatct aatgtctgat gatctc 26
<210> 349
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 349
acgttggatg ctatcattct gctccttttc 30
<210> 350
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 350
acgttggatg ggttgtgatc agaaagcttc 30
<210> 351
<211> 26
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 351
gtaattattg acatgtcaca taataa 26
<210> 352
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 352
acgttggatg gagaaaagac acactctagt 30
<210> 353
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 353
acgttggatg cttttattac attttcctgt 30
<210> 354
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 354
acaggttatc atcaatgatt cca 23
<210> 355
<211> 31
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 355
acgttggatg ttatggatta ttacttcctt g 31
<210> 356
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 356
acgttggatg tacccagtat ttccctacc 29
<210> 357
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 357
gtatcaccat gactagcatt aca 23
<210> 358
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 358
acgttggatg agttttattg gaccacagc 29
<210> 359
<211> 31
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 359
acgttggatg gtcacaacta ctcaattcca c 31
<210> 360
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 360
gataaaagaa cctatagaca atatg 25
<210> 361
<211> 31
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 361
acgttggatg atctactctt caaaactaag g 31
<210> 362
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 362
acgttggatg ccatatactg gtactggtct 30
<210> 363
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 363
gacctctgag ttaagccatg agt 23
<210> 364
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 364
acgttggatg ctcctggcag gatctgtaac 30
<210> 365
<211> 28
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 365
acgttggatg acagacaccc cgaatgct 28
<210> 366
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 366
attgctcttg tagaacatc 19
<210> 367
<211> 31
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 367
acgttggatg tggaaaagtg taaaattggt g 31
<210> 368
<211> 31
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 368
acgttggatg gcacctcatt tttatagtgc t 31
<210> 369
<211> 16
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 369
tatagtgcta tgcaga 16
<210> 370
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 370
acgttggatg actccacaac tgtgctaag 29
<210> 371
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 371
acgttggatg tttcaaggag aaatactgct 30
<210> 372
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 372
ttctacaaag cagtctttc 19
<210> 373
<211> 31
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 373
acgttggatg gcaacatttg ttaaatctga t 31
<210> 374
<211> 32
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 374
acgttggatg ccctatacta cgtaagagaa at 32
<210> 375
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 375
ttctacaaag cagtctttc 19
<210> 376
<211> 28
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 376
acgttggatg catatcaggg gaatggaa 28
<210> 377
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 377
acgttggatg acaccaagga gaagataagc 30
<210> 378
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 378
ttgcacaggg gtccatggta g 21
<210> 379
<211> 34
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 379
acgttggatg gtttttctag ttctgtgaag aatg 34
<210> 380
<211> 34
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 380
acgttggatg gtagaatcaa tactgtgaaa atgg 34
<210> 381
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 381
ttcccataaa aatagtatc 19
<210> 382
<211> 29
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 382
acgttggatg ccgtcagtat ctctgtggc 29
<210> 383
<211> 32
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 383
acgttggatg acagaccata aagacaaaag tg 32
<210> 384
<211> 20
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 384
ctcacactgg acctgatcct 20
Claims (9)
1.用于人体个体识别的遗传标记,其特征在于,由116个常染色体SNPs位点及12个X染色体SNPs位点组成:rs2662800、rs11938834、rs10852588、rs2624459、rs17533、rs163192、rs4644087、rs12934069、rs628221、rs1293288、rs10911093、rs1538197、rs9308179、rs11914834、rs1078226、rs6955484、rs6136874、rs4239719、rs7127767、rs2826399、rs1354147、rs508485、rs4835587、rs2895309、rs3010325、rs11785007、rs4539869、rs564060、rs6962246、rs7710068、rs4582363、rs447205、rs471234、rs4708582、rs2941011、rs879628、rs10451160、rs7728549、rs397728、rs10865186、rs3790955、rs825411、rs4773029、rs974110、rs623052、rs2127995、rs4750494、rs1176842、rs9864924、rs4487849、rs4942242、rs2267708、rs6989344、rs9504195、rs980346、rs2380437、rs6694450、rs4449484、rs4469483、rs4722897、rs4790519、rs4607417、rs530913、rs3850890、rs9542974、rs9544749、rs4942486、rs6073336、rs2024408、rs4282012、rs9432040、rs1574275、rs9364939、rs7582470、rs937002、rs12694624、rs208869、rs1193735、rs12819145、rs271397、rs7142477、rs11655774、rs12925084、rs10518608、rs7607215、rs2459110、rs2570703、rs431951、rs12605006、rs9672254、rs9297731、rs12350076、rs10256874、rs7167880、rs560476、rs7561460、rs783622、rs10783100、rs2425427、rs1971391、rs1445688、rs11590681、rs722847、rs6460078、rs10503926、rs530022、rs1012515、rs4701737、rs1404719、rs6431272、rs7326317、rs10490047、rs7983579、rs2831350、rs1464095、rs7710223、rs11159161、rs1807986、rs5916698、rs2071178、rs5985930、rs6520279、rs5905669、rs3128264、rs5966755、rs17332040、rs5907677、rs12843815。
2.权利要求1所述遗传标记在人体个体识别和/或亲权鉴定或在制备个体识别和/或亲权鉴定试剂盒中的应用。
3.一种用于人体个体识别的引物池,其特征在于,包括依次用于检测权利要求1中128个SNPs位点的128个引物组,每个引物组包括一对扩增引物和一条单碱基延伸引物,其引物序列依次如SEQ ID NO:1~384所示。
4.一种对中国汉族人群进行人体个体识别和/或亲权鉴定的方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1.提取中国汉族人群样本DNA;
S2.以S1的DNA为模板,用权利要求3所述引物池扩增检测至少90个常染色体SNPs位点;
S3.将S2的扩增产物用树脂纯化,再进行质谱检测,得到所有位点的基因型数据;
S4.对分型结果进行法医遗传学参数分析,得到对中国汉族人群的个体识别和/或亲权鉴定结果;
其中,步骤S2中每个SNPs位点的检测方法为:以S1的DNA为模板,用所述扩增引物进行PCR扩增反应,扩增产物用碱性磷酸酶处理,再用所述单碱基延伸引物进行单碱基延伸反应。
5.权利要求4所述方法在对中国汉族人群进行个体识别和/或亲权鉴定中的应用或在制备对中国汉族人群进行个体识别和/或亲权鉴定试剂盒中的应用。
6.一种用于对中国汉族人群进行人体个体识别和/或亲权鉴定的试剂盒,其特征在于,包括检测权利要求1所述的116个常染色体SNPs位点中的至少90个SNPs位点的试剂。
7.根据权利要求6所述试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括检测权利要求1所述的12个X染色体SNPs位点的试剂。
8.根据权利要求6或7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂包括检测引物和PCR扩增所需试剂;所述检测引物为权利要求3所述引物池。
9.权利要求6~8任一项所述试剂盒在对中国汉族人群进行个体识别和/或亲权鉴定中的应用。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201710828377.XA CN107541554B (zh) | 2017-09-14 | 2017-09-14 | 用于人体个体识别和/或亲权鉴定的遗传标记及其检测方法和试剂盒 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201710828377.XA CN107541554B (zh) | 2017-09-14 | 2017-09-14 | 用于人体个体识别和/或亲权鉴定的遗传标记及其检测方法和试剂盒 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN107541554A CN107541554A (zh) | 2018-01-05 |
CN107541554B true CN107541554B (zh) | 2021-06-11 |
Family
ID=60964344
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201710828377.XA Active CN107541554B (zh) | 2017-09-14 | 2017-09-14 | 用于人体个体识别和/或亲权鉴定的遗传标记及其检测方法和试剂盒 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN107541554B (zh) |
Families Citing this family (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN108504744B (zh) * | 2018-03-14 | 2019-02-22 | 中国科学院北京基因组研究所 | 一种用于法医检测的微单倍型遗传标记及其试剂盒 |
CN108504750B (zh) * | 2018-04-23 | 2021-10-15 | 深圳华大法医科技有限公司 | 确定菌群snp位点集合的方法、系统及其应用 |
CN109321660A (zh) * | 2018-10-09 | 2019-02-12 | 北京优迅医学检验实验室有限公司 | 遗传标记组合、个体基因身份证及其应用 |
CN109273046B (zh) * | 2018-10-19 | 2022-04-22 | 江苏东南证据科学研究院有限公司 | 一种基于概率统计模型的生物学全同胞鉴定方法 |
CN110129457B (zh) * | 2019-06-19 | 2020-03-20 | 上海仁东医学检验所有限公司 | 一种遗传标记组合及其应用 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN106566873A (zh) * | 2015-12-17 | 2017-04-19 | 复旦大学 | 用于法医学个体识别的分子标记和试剂盒 |
CN106868150A (zh) * | 2017-03-09 | 2017-06-20 | 广州市刑事科学技术研究所 | 一种人类常染色体和Y染色体InDel遗传多态性位点复合扩增试剂盒及其应用 |
-
2017
- 2017-09-14 CN CN201710828377.XA patent/CN107541554B/zh active Active
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN106566873A (zh) * | 2015-12-17 | 2017-04-19 | 复旦大学 | 用于法医学个体识别的分子标记和试剂盒 |
CN106868150A (zh) * | 2017-03-09 | 2017-06-20 | 广州市刑事科学技术研究所 | 一种人类常染色体和Y染色体InDel遗传多态性位点复合扩增试剂盒及其应用 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
47个SNPs复合检测方法的建立及其法医学应用;刘超等;《中国法医学杂志》;20090430;第24卷(第4期);230-234 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN107541554A (zh) | 2018-01-05 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN107541554B (zh) | 用于人体个体识别和/或亲权鉴定的遗传标记及其检测方法和试剂盒 | |
US20200291478A1 (en) | Identification of polymorphic sequences in mixtures of genomic dna | |
KR102049191B1 (ko) | 카피수 변이를 판정하기 위한 dna 단편 크기의 사용 | |
DK2366031T3 (en) | METHODS FOR SEQUENCING In PRENATAL DIAGNOSTICS | |
US20230340590A1 (en) | Method for verifying bioassay samples | |
CN104131072B (zh) | 一种对未知检材进行个体识别和亲权鉴定的方法和系统 | |
CN105463116B (zh) | 一种基于20个三等位基因snp遗传标记的法医学复合检测试剂盒及检测方法 | |
CN105567822B (zh) | 一种用于肺癌风险预测的基因检测引物组和试剂盒 | |
Stepanov et al. | Forensic and population genetic characteristics of 62 X chromosome SNPs revealed by multiplex PCR and MALDI-TOF mass spectrometry genotyping in 4 North Eurasian populations | |
AU2018201992A1 (en) | Sequencing methods and compositions for prenatal diagnoses | |
CN112342303A (zh) | 一种基于ngs的人类y染色体str和snp遗传标记联合检测体系及检测方法 | |
Hui et al. | Novel association analysis between 9 short tandem repeat loci polymorphisms and coronary heart disease based on a cross-validation design | |
CN114381517B (zh) | 检测SNP rs12569857多态性在制备筛查高原肺水肿易感人群试剂盒中的应用 | |
Imo et al. | Highly polymorphic di-and trinucleotide microsatellite markers for the grapevine yellows disease vector Hyalesthes obsoletus (Auchenorrhyncha: Cixiidae) | |
Li et al. | Typing of 67 SNP loci on X chromosome by PCR and MALDI-TOF MS | |
Damour et al. | Identification and characterization of novel DIP-STRs from whole-genome sequencing data | |
CN112011622B (zh) | 一种对未知来源个体进行非、东亚、欧洲群体来源分析的方法和系统 | |
CN105886497A (zh) | 多态性短串联重复基因座等位基因梯、其制备方法、鉴定及应用 | |
CN111485024B (zh) | 用于个体特征确认的引物组合、及其应用 | |
CN116144793A (zh) | 一种基于基因分型鉴定滩羊与非滩羊的方法 | |
RU2600874C2 (ru) | Набор олигонуклеотидных праймеров и зондов для генотипирования полиморфных локусов днк, ассоциированных с риском развития спорадической формы болезни альцгеймера в российских популяциях | |
KR20130099456A (ko) | 부녀 관계 확인용 마커 조성물 및 그의 용도 | |
Mehta | Genotyping Tools for Forensic DNA Phenotyping: From Low-to High-throughput | |
Fakorede et al. | Allele frequencies and haplotype diversities of five Y-chromosome short tandem repeat loci in a random sample of Yoruba population in Lagos, Nigeria | |
KR101731618B1 (ko) | 부계 확인용 마커 조성물 및 그의 용도 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |