CN107220499B - 切片文件存储方法及装置 - Google Patents

Abstract

本发明提供了一种切片文件存储方法及装置，所述方法包括：获取扫描设备扫描病理切片后得到的切片文件；根据所述切片层、所述行号及所述列号确定每个所述切片图片的第一存储位置标识；将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置，解决整个切片文件上传时间长的技术问题，达到将切片文件中的各个切片图片分别存储到与第一存储位置标识对应的存储位置，分别存储多个切片图片，能够提高文件存储效率，在任一张切片图片存储完毕后，医生即可观看，便于快速诊断和临床会诊时使用，避免将整个存储切片文件上传至服务器时导致的上传慢，耗时过长，未上传完毕无法观看切片图片的问题的技术效果。

Description

切片文件存储方法及装置

技术领域

本发明涉及计算机技术领域，尤其是涉及一种切片文件存储方法及装置。

背景技术

数字切片系统将整个载玻片全信息、全方位快速扫描，使传统物质化的载玻片变成新一代数字化病理切片，是对病理诊断技术实现划时代的变革。可使病理医生脱离显微镜，随时随地通过网络解决病理诊断，实现全球在线同步远程会诊或离线远程会诊，由于提供全切片信息，使诊断价值等同显微镜观察，其时间空间穿插传递优势具有重大意义。该系统可广泛用于病理临床诊断、病理教学、组织学细胞成像、荧光分析、免疫组化数字成像。

然而，由于目前切片文件非常大，大约都在1G-2G，使得将整个切片文件上传至服务器的时间过长，大约要30-60分钟甚至更久，在切片文件未上传完毕时，无法查看切片文件，在需要快速诊断的情况下，时间无法满足需求，需要等待，浪费大量时间；若提高带宽，可以有效地提高上传速度，但成本高且无法普及。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一种切片文件存储方法及装置，以缓解现有技术中存在的整个切片文件上传至服务器时时间过长的技术问题。

第一方面，本发明实施例提供了一种切片文件存储方法，包括：

获取扫描设备扫描病理切片后得到的切片文件，所述切片文件包括多个切片图片、每个所述切片图片所在的切片层以及所述切片图片在所在的所述切片层中的行号及列号，所述切片层与所述切片图片的放大倍率对应；

根据所述切片层、所述行号及所述列号确定每个所述切片图片的第一存储位置标识，与所述第一存储位置标识对应的存储位置位于存储所述切片文件的存储区域内；

将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置。

结合第一方面，本发明实施例提供了第一方面的第一种可能的实施方式，其中，所述根据所述切片层、所述行号及所述列号确定每个所述切片图片的第一存储位置标识，包括：

获取切片文件标识、切片文件大小、当前系统时间、各个所述切片图片的层号、行号及列号；

按照预设标识生成规则，根据所述切片文件标识、所述切片文件大小、所述当前系统时间、各个所述切片图片的层号、行号及列号生成第一存储位置标识，所述第一存储位置标识对应的存储位置位于所述存储区域内的图片分区中。

结合第一方面，本发明实施例提供了第一方面的第二种可能的实施方式，其中，所述图片分区位于外网的至少一个存储节点上；

所述将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置，包括：

获取所述切片文件的大小；

按照预设分布式存储规则，根据所述切片文件的大小在至少一个预设的存储节点上确定所述切片文件的图片分区；

在所述图片分区中，根据所述第一存储位置标识查找对应的存储位置；

将多个所述切片图片分别存储到查找到的存储位置。

结合第一方面，本发明实施例提供了第一方面的第三种可能的实施方式，其中，所述图片分区位于本地服务器；

所述将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置，包括：

在所述本地服务器中，根据所述第一存储位置标识查找对应的存储位置；

将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置。

结合第一方面，本发明实施例提供了第一方面的第四种可能的实施方式，其中，所述存储区域包括固定信息分区，所述方法还包括：

获取所述切片文件的文件信息，所述文件信息包括归属信息、时间信息、切片层信息、图片信息、倍率信息、病例基本信息和/或病例签发报告；

将所述归属信息、时间信息、切片层信息、图片信息、病例基本信息和/或病例签发报告存储到所述固定信息分区中对应的存储位置。

结合第一方面，本发明实施例提供了第一方面的第五种可能的实施方式，其中，所述方法还包括：

获取所述切片文件中各个切片层的标签图和标签图信息，所述标签图信息包括所述标签图所在切片层的层号、行号、列号、起始位置和大小；

按照预设标识生成规则，根据所述标签图所在切片层的层号、行号、列号、起始位置和大小生成所述标签图的第二存储位置标识，每个所述第二存储位置标识唯一对应一个预设的存储区域；

将各个标签图分别存储到所述固定信息分区中与所述标签图的第二存储位置标识对应的存储区域。

结合第一方面，本发明实施例提供了第一方面的第六种可能的实施方式，其中，所述方法还包括：

获取所述切片文件中各个切片层的缩略图和缩略图信息，所述缩略图信息包括所述缩略图所在切片层的层号、行号、列号、起始位置和大小；

按照预设标识生成规则，根据所述缩略图所在切片层的层号、行号、列号、起始位置和大小生成所述缩略图的第三存储位置标识，每个所述第三存储位置标识唯一对应一个预设的存储区域；

将各个所述缩略图分别存储到所述固定信息分区中与所述缩略图的第三存储位置标识对应的存储区域。

第二方面，本发明实施例还提供一种切片文件存储装置，包括：

获取模块，用于获取扫描设备扫描病理切片后得到的切片文件，所述切片文件包括多个切片图片、每个所述切片图片所在的切片层以及所述切片图片在所在的所述切片层中的行号及列号，所述切片层与所述切片图片的放大倍率对应；

确定模块，用于根据所述切片层、所述行号及所述列号确定每个所述切片图片的第一存储位置标识，与所述第一存储位置标识对应的存储位置位于存储所述切片文件的存储区域内；

存储模块，用于将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置。

第三方面，本发明实施例还提供一种电子设备，包括存储器、处理器及存储在所述存储器上并可在所述处理器上运行的计算机程序，所述处理器执行所述计算机程序时实现上述第一方面所述的方法的步骤。

第四方面，本发明实施例还提供一种具有处理器可执行的非易失的程序代码的计算机可读介质，所述程序代码使所述处理器执行所述第一方面所述的方法。

本发明实施例带来了以下有益效果：本发明实施例通过首先获取扫描设备扫描病理切片后得到的切片文件，然后根据所述切片层、所述行号及所述列号确定每个所述切片图片的第一存储位置标识，可以将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置。

本发明实施例能够将切片文件中的各个切片图片分别存储到与第一存储位置标识对应的存储位置，分别存储多个切片图片，能够提高文件存储效率，在任一张切片图片存储完毕后，医生即可观看，便于快速诊断和临床会诊时使用，避免将整个存储切片文件上传至服务器时导致的上传慢，耗时过长，未上传完毕无法观看切片图片的问题。

本发明的其他特征和优点将在随后的说明书中阐述，并且，部分地从说明书中变得显而易见，或者通过实施本发明而了解。本发明的目的和其他优点在说明书、权利要求书以及附图中所特别指出的结构来实现和获得。

为使本发明的上述目的、特征和优点能更明显易懂，下文特举较佳实施例，并配合所附附图，作详细说明如下。

附图说明

为了更清楚地说明本发明具体实施方式或现有技术中的技术方案，下面将对具体实施方式或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图是本发明的一些实施方式，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。

图1为本发明实施例提供的一种切片存储方法的流程图；

图2为图1中步骤S103的一种流程图；

图3为图1中步骤S103的另一种流程图；

图4为本发明实施例提供的一种切片存储装置的结构图。

图标：11-获取模块；12-确定模块；13-存储模块。

具体实施方式

为使本发明实施例的目的、技术方案和优点更加清楚，下面将结合附图对本发明的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例是本发明一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本发明保护的范围。

目前由于目前切片文件非常大，大约都在1G-2G，使得将整个切片文件上传至服务器的时间过长，大约要30-60分钟甚至更久，在需要快速诊断的情况下，时间无法满足需求，需要等待，浪费大量时间；若提高带宽，可以有效地提高上传速度，但成本高且无法普及，基于此，本发明实施例提供的一种切片文件存储方法及装置，可以将切片文件中的各个切片图片分别存储到与第一存储位置标识对应的存储位置，分别存储多个切片图片，能够提高文件存储效率，在任一张切片图片存储完毕后，医生即可观看，便于快速诊断和临床会诊时使用，避免将整个存储切片文件上传至服务器时导致的上传慢，耗时过长，未上传完毕无法观看切片图片的问题。

为便于对本实施例进行理解，首先对本发明实施例所公开的一种切片文件存储方法进行详细介绍，如图1所示，切片文件存储方法包括以下步骤。

步骤S101，获取扫描设备扫描病理切片后得到的切片文件。

在本发明实施例中，切片文件即数字切片，数字切片并非一张静态图片，它是包含了玻璃切片上的所有病变信息，此数字切片(超大空间、高分辨率图片)可以在电脑上进行任意的放大和缩小，并切片利用数字切片可以观测到玻璃切片上的任何一个位置，也可以将相应的位置放大到5倍、10倍、20倍、40倍，如同在显微镜上的放大缩小一样。扫描设备扫描病理切片后得到的切片文件中包括多个切片图片、每个所述切片图片所在的切片层以及所述切片图片在所在的所述切片层中的行号及列号，行号和列号即切片图片在当前放大倍率下的任一切片层中所在的行号和列号，所述切片层与所述切片图片的放大倍率对应，不同所述放大倍率下各层的切片图片不同。

步骤S102，根据所述切片层、所述行号及所述列号确定每个所述切片图片的第一存储位置标识。

在本发明实施例中，与所述第一存储位置标识对应的存储位置位于存储所述切片文件的存储区域内。

在该步骤中，可以首先获取切片文件的切片文件标识、切片文件大小、当前系统时间、各个所述切片图片的层号、行号及列号；切片文件标识可以指在扫描生成切片文件后用户为切片文件设置的标识，切片文件大小即切片文件所占存储空间的大小，例如1G或者2G等等，当前系统时间即生成第一存储位置标识时的系统时间，然后按照预设标识生成规则，根据所述切片文件标识、所述切片文件大小、所述当前系统时间、各个所述切片图片的层号、行号及列号生成第一存储位置标识，所述第一存储位置标识对应的存储位置位于所述存储区域内的图片分区中。

步骤S103，将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置。

在本发明实施例中，所述图片分区可以位于外网的至少一个存储节点上，例如，图片分区的前部四分之一可以位于存储节点001上，图片分区的中部四分之一可以位于存储节点002上，图片分区的后部三分之一可以位于存储节点003上等等。这时，如图2所示，所述步骤S103可以包括以下步骤。

步骤S201，获取所述切片文件的大小。.

步骤S202，按照预设分布式存储规则，根据所述切片文件的大小在至少一个预设的存储节点上确定所述切片文件的图片分区。

预设分布式存储规则可以指在每个存储节点上存储切片文件的大小，例如，假设存在10个存储节点，则可以在每个存储节点上分别存储切片文件的十分之一，当然，也可以在每个存储节点上存储其他比例，可以根据实际需要设定，本发明实施例中不做限定。

步骤S203，在所述图片分区中，根据所述第一存储位置标识查找对应的存储位置。

在该步骤中，根据第一存储位置标识在至少一个存储节点上分别查找与第一存储位置标识对应的存储位置。

步骤S204，将多个所述切片图片分别存储到查找到的存储位置。

本发明实施例通过将多个切片图片分别存储在至少一个存储节点上，可以减少切片文件的上传时间，提高切片文件上传效率。

由于冰冻读片一般要求30分钟内出诊断报告，所以为了便于冰冻读片，在本发明实施例中，所述图片分区还可以位于本地服务器上，这时本地服务器连接的路由器需要进行端口映射设置，以便外网中的设备能够访问本地服务器。这时，如图3所示，所述步骤S103可以包括以下步骤。

步骤S301，在所述本地服务器中，根据所述第一存储位置标识查找对应的存储位置。

步骤S302，将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置。

在本发明的又一实施例中，所述存储区域还包括固定信息分区，所述方法还包括以下步骤。

获取所述切片文件的文件信息，所述文件信息包括归属信息、时间信息、切片层信息、图片信息、倍率信息、病例基本信息和/或病例签发报告；

归属信息可以指切片文件所属集体或者个人的名称等，时间信息可以指创建切片文件的时间等，切片层信息可以指切片层最小标识和最大标识等，图片信息可以指图片分辨率大小等，倍率信息可以指图片放大倍数的最小值和最大值等，病例基本信息可以指提供病理切片的患者的年龄、性别和临床诊断信息等等，本发明实施例中的病例基本信息兼容医学数字成像和通信(Digital Imaging and Communications in Medicine，DICOM)的国际协议，病例签发报告可以指疾病诊断结果等。

将所述归属信息、时间信息、切片层信息、图片信息、病例基本信息和/或病例签发报告存储到所述固定信息分区中对应的存储位置。

为了便于区分各个切片文件，在本发明的又一实施例中，所述方法还包括以下步骤。

获取所述切片文件中各个切片层的标签图和标签图信息，每个切片文件只对应一个标签图，所述标签图信息包括所述标签图所在切片层的层号、行号、列号、起始位置和大小；

按照预设标识生成规则，根据所述标签图所在切片层的层号、行号、列号、起始位置和大小生成所述标签图的第二存储位置标识，每个所述第二存储位置标识唯一对应一个预设的存储区域；

将各个标签图分别存储到所述固定信息分区中与所述标签图的第二存储位置标识对应的存储区域。

本发明实施例可以为每个切片文件分别存储对应的标签图，可以便于区分各个切片文件。

为了便于医生了解当前观看的切片图片在整个病理切片中的位置，所述方法还包括以下步骤。

获取所述切片文件中各个切片层的缩略图和缩略图信息，每个切片层对应一个缩略图，所述缩略图信息包括所述缩略图所在切片层的层号、行号、列号、起始位置和大小；

按照预设标识生成规则，根据所述缩略图所在切片层的层号、行号、列号、起始位置和大小生成所述缩略图的第三存储位置标识，每个所述第三存储位置标识唯一对应一个预设的存储区域；

将各个所述缩略图分别存储到所述固定信息分区中与所述缩略图的第三存储位置标识对应的存储区域。

本发明实施例可以为每个切片层分别存储对应的缩略图，可以便于医生了解当前查看的切片图片在整个病理切片中的位置。

如图4所示，在本发明的又一实施例中，还提供一种切片文件存储装置，包括：获取模块11、确定模块12和存储模块13；

获取模块11，用于获取扫描设备扫描病理切片后得到的切片文件，所述切片文件包括多个切片图片、每个所述切片图片所在的切片层以及所述切片图片在所在的所述切片层中的行号及列号，所述切片层与所述切片图片的放大倍率对应；

确定模块12，用于根据所述切片层、所述行号及所述列号确定每个所述切片图片的第一存储位置标识，与所述第一存储位置标识对应的存储位置位于存储所述切片文件的存储区域内；

存储模块13，用于将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置。

在本发明的又一实施例中，还提供一种电子设备，包括存储器、处理器及存储在所述存储器上并可在所述处理器上运行的计算机程序，所述处理器执行所述计算机程序时实现上述方法实施例所述的方法的步骤。

在本发明的又一实施例中，还提供一种具有处理器可执行的非易失的程序代码的计算机可读介质，所述程序代码使所述处理器执行上述方法实施例所述的方法。

本发明实施例所提供的切片文件存储方法及装置的计算机程序产品，包括存储了程序代码的计算机可读存储介质，所述程序代码包括的指令可用于执行前面方法实施例中所述的方法，具体实现可参见方法实施例，在此不再赘述。

所属领域的技术人员可以清楚地了解到，为描述的方便和简洁，上述描述的系统和装置的具体工作过程，可以参考前述方法实施例中的对应过程，在此不再赘述。

另外，在本发明实施例的描述中，除非另有明确的规定和限定，术语“安装”、“相连”、“连接”应做广义理解，例如，可以是固定连接，也可以是可拆卸连接，或一体地连接；可以是机械连接，也可以是电连接；可以是直接相连，也可以通过中间媒介间接相连，可以是两个元件内部的连通。对于本领域的普通技术人员而言，可以具体情况理解上述术语在本发明中的具体含义。

所述功能如果以软件功能单元的形式实现并作为独立的产品销售或使用时，可以存储在一个计算机可读取存储介质中。基于这样的理解，本发明的技术方案本质上或者说对现有技术做出贡献的部分或者该技术方案的部分可以以软件产品的形式体现出来，该计算机软件产品存储在一个存储介质中，包括若干指令用以使得一台计算机设备(可以是个人计算机，服务器，或者网络设备等)执行本发明各个实施例所述方法的全部或部分步骤。而前述的存储介质包括：U盘、移动硬盘、只读存储器(ROM，Read-Only Memory)、随机存取存储器(RAM，Random Access Memory)、磁碟或者光盘等各种可以存储程序代码的介质。

在本发明的描述中，需要说明的是，术语“中心”、“上”、“下”、“左”、“右”、“竖直”、“水平”、“内”、“外”等指示的方位或位置关系为基于附图所示的方位或位置关系，仅是为了便于描述本发明和简化描述，而不是指示或暗示所指的装置或元件必须具有特定的方位、以特定的方位构造和操作，因此不能理解为对本发明的限制。此外，术语“第一”、“第二”、“第三”仅用于描述目的，而不能理解为指示或暗示相对重要性。

最后应说明的是：以上所述实施例，仅为本发明的具体实施方式，用以说明本发明的技术方案，而非对其限制，本发明的保护范围并不局限于此，尽管参照前述实施例对本发明进行了详细的说明，本领域的普通技术人员应当理解：任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明揭露的技术范围内，其依然可以对前述实施例所记载的技术方案进行修改或可轻易想到变化，或者对其中部分技术特征进行等同替换；而这些修改、变化或者替换，并不使相应技术方案的本质脱离本发明实施例技术方案的精神和范围，都应涵盖在本发明的保护范围之内。因此，本发明的保护范围应所述以权利要求的保护范围为准。

Claims (8)

1.一种切片文件存储方法，其特征在于，包括：

获取扫描设备扫描病理切片后得到的切片文件，所述切片文件包括多个切片图片、每个所述切片图片所在的切片层以及所述切片图片在所在的所述切片层中的行号及列号，所述切片层与所述切片图片的放大倍率对应；

根据所述切片层、所述行号及所述列号确定每个所述切片图片的第一存储位置标识，与所述第一存储位置标识对应的存储位置位于存储所述切片文件的存储区域内；

将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置；

所述根据所述切片层、所述行号及所述列号确定每个所述切片图片的第一存储位置标识，包括：

获取切片文件标识、切片文件大小、当前系统时间、各个所述切片图片的层号、行号及列号；

按照预设标识生成规则，根据所述切片文件标识、所述切片文件大小、所述当前系统时间、各个所述切片图片的层号、行号及列号生成第一存储位置标识，所述第一存储位置标识对应的存储位置位于所述存储区域内的图片分区中；

所述存储区域包括固定信息分区，所述方法还包括：

获取所述切片文件的文件信息，所述文件信息包括归属信息、时间信息、切片层信息、图片信息、倍率信息、病例基本信息和/或病例签发报告；

将所述归属信息、时间信息、切片层信息、图片信息、病例基本信息和/或病例签发报告存储到所述固定信息分区中对应的存储位置。

2.根据权利要求1所述的切片文件存储方法，其特征在于，所述图片分区位于外网的至少一个存储节点上；

所述将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置，包括：

获取所述切片文件的大小；

按照预设分布式存储规则，根据所述切片文件的大小在至少一个预设的存储节点上确定所述切片文件的图片分区；

在所述图片分区中，根据所述第一存储位置标识查找对应的存储位置；

将多个所述切片图片分别存储到查找到的存储位置。

3.根据权利要求1所述的切片文件存储方法，其特征在于，所述图片分区位于本地服务器；

所述将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置，包括：

在所述本地服务器中，根据所述第一存储位置标识查找对应的存储位置；

将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置。

4.根据权利要求1所述的切片文件存储方法，其特征在于，所述方法还包括：

获取所述切片文件中各个切片层的标签图和标签图信息，所述标签图信息包括所述标签图所在切片层的层号、行号、列号、起始位置和大小；

按照预设标识生成规则，根据所述标签图所在切片层的层号、行号、列号、起始位置和大小生成所述标签图的第二存储位置标识，每个所述第二存储位置标识唯一对应一个预设的存储区域；

将各个标签图分别存储到所述固定信息分区中与所述标签图的第二存储位置标识对应的存储区域。

5.根据权利要求4所述的切片文件存储方法，其特征在于，所述方法还包括：

获取所述切片文件中各个切片层的缩略图和缩略图信息，所述缩略图信息包括所述缩略图所在切片层的层号、行号、列号、起始位置和大小；

按照预设标识生成规则，根据所述缩略图所在切片层的层号、行号、列号、起始位置和大小生成所述缩略图的第三存储位置标识，每个所述第三存储位置标识唯一对应一个预设的存储区域；

将各个所述缩略图分别存储到所述固定信息分区中与所述缩略图的第三存储位置标识对应的存储区域。

6.一种切片文件存储装置，其特征在于，包括：

获取模块，用于获取扫描设备扫描病理切片后得到的切片文件，所述切片文件包括多个切片图片、每个所述切片图片所在的切片层以及所述切片图片在所在的所述切片层中的行号及列号，所述切片层与所述切片图片的放大倍率对应；

确定模块，用于根据所述切片层、所述行号及所述列号确定每个所述切片图片的第一存储位置标识，与所述第一存储位置标识对应的存储位置位于存储所述切片文件的存储区域内；

存储模块，用于将多个所述切片图片分别存储到与所述第一存储位置标识对应的存储位置；

所述确定模块，还用于：

获取切片文件标识、切片文件大小、当前系统时间、各个所述切片图片的层号、行号及列号；

按照预设标识生成规则，根据所述切片文件标识、所述切片文件大小、所述当前系统时间、各个所述切片图片的层号、行号及列号生成第一存储位置标识，所述第一存储位置标识对应的存储位置位于所述存储区域内的图片分区中；

所述存储区域包括固定信息分区，所述装置还用于：

获取所述切片文件的文件信息，所述文件信息包括归属信息、时间信息、切片层信息、图片信息、倍率信息、病例基本信息和/或病例签发报告；

将所述归属信息、时间信息、切片层信息、图片信息、病例基本信息和/或病例签发报告存储到所述固定信息分区中对应的存储位置。

7.一种电子设备，包括存储器、处理器及存储在所述存储器上并可在所述处理器上运行的计算机程序，其特征在于，所述处理器执行所述计算机程序时实现上述权利要求1至5任一项所述的方法的步骤。

8.一种具有处理器可执行的非易失的程序代码的计算机可读介质，其特征在于，所述程序代码使所述处理器执行所述权利要求1至5任一所述的方法。

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