CN106446568B - 一种实现远程病理会诊的方法及装置 - Google Patents

一种实现远程病理会诊的方法及装置 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种实现远程病理会诊的方法,用于便捷高效地实现远程病理诊断,该方法包括:接收第一终端上传的咨询单;获取病理切片对应的数字化病理切片文件;将数字化病理切片文件解析为每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件;将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为数字化病理切片文件对应的病理图像数据,将病理图像数据与咨询单进行匹配关联;将咨询单以及与咨询单匹配的病理图像数据发送给第二终端。本发明还公开了一种实现远程病理会诊的装置。

Description

一种实现远程病理会诊的方法及装置
技术领域
本发明涉及通信技术领域,具体涉及一种实现远程病理会诊的方法及装置。
背景技术
在医疗实践中,病理学需要通过对病变组织的大体、光镜下组织结构和细胞形态特点(少数情况应用电镜)、相关内源性和外源性基因和/或其表达产物进行检测,在医疗过程中起着非常重要的作用。但在实际情况下,普通二三线城市医院的病理科医生与一线城市中三甲医院的病理科医生相比,存在较大的知识和经验差距,而二三线城市医院承担了大多数病人的诊断和治疗工作,这之间存在着巨大的病理会诊需求。
传统的病理跨院会诊,需要患者自行借出病理切片,亲自送达或邮寄到会诊医院进行病理会诊,耗时很长,效率低下。随着科学技术的发展,逐渐出现了远程病理会诊方案,在现有技术中远程病理会诊主要通过动态实时图像远程会诊的方式实现,即在初诊医院和会诊医院各搭建一套会诊系统,两套会诊系统通过网络连接,初诊医院的会诊系统连接显微镜,并可通过电子方式对显微镜进行调整,如移动视野,调整焦距;会诊医院的会诊系统可以远程连接到初诊医院的系统,实现对显微镜的远程控制,并可实时接收查看显微镜的图像,通过上述方式实现在远端实时看到会诊医院显微镜下的病理切片进行会诊。但是,现有技术的动态实时图像远程病理会诊的方式需要在初诊医院和会诊医院均部署一套会诊系统,成本高,实施难度大;会诊时需要事先预约双方医生时间,协调难度大;无法脱离医院环境,难以充分利用医生的业余时间;会诊时仍需使用病理切片,反复取用容易对病理切片造成磨损、保存等诸多问题。
发明内容
有鉴于此,本发明提供一种实现远程病理会诊的方法及装置,以解决现有技术中远程病理会诊实施难度大、时间协调难度大且容易损坏病理切片的技术问题。
为解决上述问题,本发明提供的技术方案如下:
一种实现远程病理会诊的方法,所述方法包括:
接收第一终端上传的咨询单;
获取病理切片对应的数字化病理切片文件;
将所述数字化病理切片文件解析为每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件;
将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为所述数字化病理切片文件对应的病理图像数据,将所述病理图像数据与所述咨询单进行匹配关联;
将所述咨询单以及与所述咨询单匹配的所述病理图像数据发送给第二终端。
相应的,所述将所述数字化病理切片文件解析为每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件,包括:
将所述数字化病理切片文件解析为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件,并由所述最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件生成所述最大缩放级别以下的各个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件。
相应的,所述将所述数字化病理切片文件解析为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件,包括:
当所述数字化病理切片文件为瓦片式病理切片文件,获取所述数字化病理切片文件的宽度为W像素,所述数字化病理切片文件的高度为H像素,设置瓦片图片文件的高度为tW像素,所述瓦片图片文件的宽度为tH像素,计算所述瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间[0,X]以及所述瓦片图片文件在高度方向的位置索引区间[0,Y],其中当W/tW为整数时,X=W/tW-1,当W/tW不为整数时,X=Floor(W/tW),Floor(W/tW)为W/tW的向下取整数值,当H/tH为整数时,Y=H/tH-1,当H/tH不为整数时,Y=Floor(H/tH),Floor(H/tH)为H/tH的向下取整数值;
由所述瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间[0,X]以及所述瓦片图片文件在高度方向的位置索引区间[0,Y]确定每个所述瓦片图片文件的位置索引;
根据每个所述瓦片图片文件的位置索引以及所述瓦片图片文件的高度、所述瓦片图片文件的宽度,确定每个所述瓦片图片文件对角线顶点的坐标;
根据每个所述瓦片图片文件对角线顶点的坐标,将所述数字化病理切片文件切分为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
当所述数字化病理切片文件为线扫描式病理切片文件,在所述数字化病理切片文件中每读取R行像素的图像,将所述R行像素的图像截取为N张S*R像素的瓦片图片文件,从而将所述数字化病理切片文件切分为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件。
相应的,所述由所述最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件生成所述最大缩放级别以下的各个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件,包括:
将所述最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件,每相邻的四张瓦片图片文件进行合并,并将合并后的四张瓦片图片文件等比例缩放到合并前的一张瓦片图片文件的图像像素大小,得到下一缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
重复执行将当前缩放级别对应的一组瓦片图片文件,每相邻的四张瓦片图片文件进行合并,并将合并后的四张瓦片图片文件等比例缩放到合并前的一张瓦片图片文件的图像像素大小,得到下一缩放级别对应的一组瓦片图片文件直到获得最小级别对应的一组瓦片图片文件。
相应的,所述将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为所述数字化病理切片文件对应的病理图像数据,将所述病理图像数据与所述咨询单进行匹配关联,包括:
所述将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为所述数字化病理切片文件对应的病理图像数据;
获取所述咨询单中记录的患者姓名、患者年龄、就诊医院以及病理切片编号中的一个或多个作为第一组数据;
获取所述病理图像数据所对应的患者姓名、患者年龄、就诊医院以及病理切片编号中的一个或多个作为第二组数据;
如果所述第一组数据与所述第二组数据中存在就诊医院相同且病理切片编号相同的情况,则将所述第一组数据对应的咨询单与所述第二组数据对应的病理图像数据进行匹配关联;
如果所述第一组数据与所述第二组数据中不存在就诊医院相同且病理切片编号相同的情况,则将所述第一数据与所述第二组数据中的患者姓名转换为患者姓名拼音;
如果所述第一组数据与所述第二组数据中存在就诊医院相同、患者姓名拼音相同且患者年龄相差绝对值不超过预设阈值的情况,则将所述第一组数据对应的咨询单与所述第二组数据对应的病理图像数据进行匹配关联;
如果所述第一组数据与所述第二组数据中不存在就诊医院相同、患者姓名拼音相同且患者年龄相差绝对值不超过预设阈值的情况,则提示关联失败。
相应的,所述方法还包括:
接收所述第二终端对所述咨询单的回复信息,并将所述回复信息发送给所述第一终端。
一种实现远程病理会诊的装置,所述装置包括:
第一接收单元,用于接收第一终端上传的咨询单;
获取单元,用于获取病理切片对应的数字化病理切片文件;
解析单元,用于将所述数字化病理切片文件解析为每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件;
关联单元,用于将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为所述数字化病理切片文件对应的病理图像数据,将所述病理图像数据与所述咨询单进行匹配关联;
第一发送单元,用于将所述咨询单以及与所述咨询单匹配的所述病理图像数据发送给第二终端。
相应的,所述解析单元包括:
解析子单元,用于将所述数字化病理切片文件解析为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
生成子单元,用于由所述最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件生成所述最大缩放级别以下的各个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件。
相应的,所述解析子单元包括:
计算子单元,用于当所述数字化病理切片文件为瓦片式病理切片文件,获取所述数字化病理切片文件的宽度为W像素,所述数字化病理切片文件的高度为H像素,设置瓦片图片文件的高度为tW像素,所述瓦片图片文件的宽度为tH像素,计算所述瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间[0,X]以及所述瓦片图片文件在高度方向的位置索引区间[0,Y],其中当W/tW为整数时,X=W/tW-1,当W/tW不为整数时,X=Floor(W/tW),Floor(W/tW)为W/tW的向下取整数值,当H/tH为整数时,Y=H/tH-1,当H/tH不为整数时,Y=Floor(H/tH),Floor(H/tH)为H/tH的向下取整数值;
第一确定子单元,用于由所述瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间[0,X]以及所述瓦片图片文件在高度方向的位置索引区间[0,Y]确定每个所述瓦片图片文件的位置索引;
第二确定子单元,用于根据每个所述瓦片图片文件的位置索引以及所述瓦片图片文件的高度、所述瓦片图片文件的宽度,确定每个所述瓦片图片文件对角线顶点的坐标;
第一切分子单元,用于根据每个所述瓦片图片文件对角线顶点的坐标,将所述数字化病理切片文件切分为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
第二切分子单元,用于当所述数字化病理切片文件为线扫描式病理切片文件,在所述数字化病理切片文件中每读取R行像素的图像,将所述R行像素的图像截取为N张S*R像素的瓦片图片文件,从而将所述数字化病理切片文件切分为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件。
相应的,所述生成子单元具体用于:
将所述最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件,每相邻的四张瓦片图片文件进行合并,并将合并后的四张瓦片图片文件等比例缩放到合并前的一张瓦片图片文件的图像像素大小,得到下一缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
重复执行将当前缩放级别对应的一组瓦片图片文件,每相邻的四张瓦片图片文件进行合并,并将合并后的四张瓦片图片文件等比例缩放到合并前的一张瓦片图片文件的图像像素大小,得到下一缩放级别对应的一组瓦片图片文件直到获得最小级别对应的一组瓦片图片文件。
相应的,所述关联单元包括:
确定子单元,用于所述将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为所述数字化病理切片文件对应的病理图像数据;
第一获取子单元,用于获取所述咨询单中记录的患者姓名、患者年龄、就诊医院以及病理切片编号中的一个或多个作为第一组数据;
第二获取子单元,用于获取所述病理图像数据所对应的患者姓名、患者年龄、就诊医院以及病理切片编号中的一个或多个作为第二组数据;
第一关联子单元,用于如果所述第一组数据与所述第二组数据中存在就诊医院相同且病理切片编号相同的情况,则将所述第一组数据对应的咨询单与所述第二组数据对应的病理图像数据进行匹配关联;
转换子单元,用于如果所述第一组数据与所述第二组数据中不存在就诊医院相同且病理切片编号相同的情况,则将所述第一数据与所述第二组数据中的患者姓名转换为患者姓名拼音;
第二关联子单元,用于如果所述第一组数据与所述第二组数据中存在就诊医院相同、患者姓名拼音相同且患者年龄相差绝对值不超过预设阈值的情况,则将所述第一组数据对应的咨询单与所述第二组数据对应的病理图像数据进行匹配关联;
提示子单元,用于如果所述第一组数据与所述第二组数据中不存在就诊医院相同、患者姓名拼音相同且患者年龄相差绝对值不超过预设阈值的情况,则提示关联失败。
相应的,所述装置还包括:
第二接收单元,用于接收所述第二终端对所述咨询单的回复信息;
第二发送单元,用于将所述回复信息发送给所述第一终端。
由此可见,本发明实施例具有如下有益效果:
通过获取使用第一终端的提单医生上传的病理会诊咨询单以及数字化病理切片文件,将数字化病理切片文件转换为一系列瓦片图片文件以适合在移动终端显示病理切片图像,并将咨询单与该系列瓦片图片文件相关联发送给第二终端,以使使用第二终端的会诊医生可以随时随地查看咨询单内容以及对应的病理图像数据,并针对该咨询单内容进行回复,完成远程病理会诊工作,使远程病理会诊实施难度降低、无需协调双方医生的时间,会诊效率提高,且对数字化病理切片文件解析后进行传输无需再反复调用病理切片,减少对病理切片的损坏。
附图说明
图1为本发明实施例中提供的实现远程病理会诊的方法实施例的流程图;
图2为本发明实施例中提供的实现远程病理会诊的方法实施例的流程示意图;
图3为本发明实施例中提供的实现远程病理会诊的装置实施例的示意图。
具体实施方式
为使本发明的上述目的、特征和优点能够更加明显易懂,下面结合附图和具体实施方式对本发明实施例作进一步详细的说明。
首先,对本发明实施例中可能出现的专业术语进行说明。
病理是用以检查机体器官、组织或细胞中的病理改变的病理形态学方法。为探讨器官、组织或细胞所发生的疾病过程,可采用某种病理形态学检查的方法,检查他们所发生的病变,探讨病变产生的原因、发病机理、病变的发生发展过程。
会诊是指多个医生共同诊断疑难病症,可以是同医院同科室多个医生,也可以是同医院不同科室、或不同医院的多个医生。
移动终端是一种尺寸便于携带的智能计算设备,一般包括可触控的显示屏幕、触控或物理的输入设备、内置或可拆卸的电源装置、支持无线网络的连接能力,例如智能手机、智能平板电脑等。
初诊医院是指患者初次就诊的医院,也用来指为患者制作病理切片的医院;会诊医院是指患者需要进行病理会诊的医院;提单医生是指帮助患者通过移动终端提交会诊咨询单的医生,该医生可以是患者的主治医生,对患者的病情有较为全面的了解;接单医生是指通过移动终端收到会诊咨询请求的医生,该医生一般是会诊医院年资较高医生,具备丰富的经验。
WSI是指利用全自动显微镜扫描系统,结合虚拟病理切片软件系统,把传统玻璃病理切片进行扫描、无缝拼接,生成一张全视野(Whole Slide Image,简称WSI)的数字化病理切片文件。
本发明实施例中提供的实现远程病理会诊的方法及装置,是针对现有技术中远程病理会诊存在的技术问题,提出通过移动互联网,在移动终端上进行病理的远程会诊,使病理科医生可以摆脱实验室和显微镜的束缚,随时随地开展病理会诊工作。
本发明的基本思路在于提单医生利用移动终端提交病理会诊咨询单以后,可自行或委托第三方机构,将制备好的病理切片进行数字化扫描,得到全视野(WSI)数字化病理切片文件,并将全视野数字化切片文件上传到服务器,由服务器对全视野数字化切片文件进行解析和处理,生成适合在移动终端进行显示的图片文件结构,并将解析后的全视野数字化切片文件与提单医生提交的病理会诊咨询单进行关联发送给接单医生使用的移动终端;接单医生在接收到该会诊咨询单后,可在移动终端查看病理会诊咨询单详情,对病理图像数据进行查看、缩放、移动、标记等操作,并反馈会诊意见。
基于上述思想,参见图1所示,示出了本发明实施例中提供的实现远程病理会诊的方法实施例,本实施例将从实现远程病理会诊的装置角度进行描述,该实现远程病理会诊的装置具体可以集成服务器中,可以包括以下步骤:
步骤101:接收第一终端上传的咨询单。
第一终端可以为提单医生所使用的移动终端,提单医生通过第一终端向服务器提交远程病理会诊咨询单,在咨询单中可以包括患者的基本信息以及病理切片编号等信息,患者的基本信息例如患者姓名、患者性别、患者年龄、就诊医院等。提单医生可以在第一终端中手动输入患者的基本信息也可以通过第一终端与就诊医院现有系统对接自动获得患者的基本信息;在第一终端中手动输入病理切片编号,也可以通过扫描二维码或者条形码的方式自动输入病理切片编号。在提单医生递交咨询单后,服务器可以接收第一终端上传的咨询单。
步骤102:获取病理切片对应的数字化病理切片文件。
对病理切片进行数字化,得到全视野数字化病理切片文件即WSI文件,并将数字化病理切片文件上传或拷贝到服务器,服务器获取病理切片对应的数字化病理切片文件。
对病理切片进行数字化,需要使用切片扫描仪或其他类似切片扫描设备。根据初诊医院情况不同,扫描病理切片至少有以下几种实现方式:(a)初诊医院院内扫描病理切片;(b)初诊医院通过第三方检验机构等扫描病理切片;(c)初诊医院将病理切片寄给会诊服务提供方,由会诊服务提供方扫描病理切片。病理切片扫描完毕后,将得到的全视野数字化病理切片文件上传到服务器至少有以下几种实现方式:(a)将全视野数字化病理切片文件拷贝到初诊医院的前置服务器,通过前置服务器自动上传到服务器;(b)通过会诊服务提供方提供的网页上传工具手工上传到服务器;(c)直接拷贝到服务器。本发明实施例对将数字化病理切片文件的获取方式以及将数字化病理切片文件上传至服务器的方式不进行限定。
步骤103:将数字化病理切片文件解析为每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件。
服务器检测到全视野数字化病理切片文件上传到指定的目录后,自动调用对应的解析程序对数字化病理切片文件进行解析,生成可以在移动设备客户端显示的图片,即将数字化病理切片文件解析为每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件。处理后的数字化病理切片文件被解析为每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件,更适合在移动设备上进行查看,方便会诊医生随时随地展开病理会诊。
在本发明的一些可能的实现方式中,将数字化病理切片文件解析为每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件的具体实现可以包括:
将数字化病理切片文件解析为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件,并由最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件生成最大缩放级别以下的各个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件。
其中,在本发明的一些可能的实现方式中,将数字化病理切片文件解析为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件的具体实现可以包括:
当数字化病理切片文件为瓦片式病理切片文件,获取数字化病理切片文件的宽度为W像素,数字化病理切片文件的高度为H像素,设置瓦片图片文件的高度为tW像素,瓦片图片文件的宽度为tH像素,计算瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间[0,X]以及瓦片图片文件在高度方向的位置索引区间[0,Y],其中当W/tW为整数时,X=W/tW-1,当W/tW不为整数时,X=Floor(W/tW),Floor(W/tW)为W/tW的向下取整数值,当H/tH为整数时,Y=H/tH-1,当H/tH不为整数时,Y=Floor(H/tH),Floor(H/tH)为H/tH的向下取整数值;
由瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间[0,X]以及瓦片图片文件在高度方向的位置索引区间[0,Y]确定每个瓦片图片文件的位置索引;
根据每个瓦片图片文件的位置索引以及瓦片图片文件的高度、瓦片图片文件的宽度,确定每个瓦片图片文件对角线顶点的坐标;
根据每个瓦片图片文件对角线顶点的坐标,将数字化病理切片文件切分为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件。
当数字化病理切片文件为线扫描式病理切片文件,在数字化病理切片文件中每读取R行像素的图像,将R行像素的图像截取为N张S*R像素的瓦片图片文件,从而将数字化病理切片文件切分为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件。
服务器上的解析程序需要对全视野数字化切片文件进行解析,将完整的全视野数字化病理切片文件解析为多组瓦片图片文件,每组瓦片图片文件包括多张瓦片图片,并根据切片扫描仪扫描时使用的物镜倍数,将上述组张瓦片图片文件存放到对应级别的文件夹中,扫描物镜倍数与缩放级别的对应关系例如:40X:5级,20X:4级,10X:3级,5X:2级,2X:1级,即物镜倍数为40X对应缩放级别为5级,物镜倍数为20X对应缩放级别为4级,物镜倍数为10X对应缩放级别为3级,物镜倍数为5X对应缩放级别为2级,物镜倍数为2X对应缩放级别为1级,扫描物镜倍数与缩放级别的对应关系可以根据实际情况进行设置,本发明对此不进行限定。
设全视野数字化病理切片文件的宽度为W像素,高度为H像素的情况下,根据文件格式的不同,将数字化病理切片文件解析为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件至少有以下两种实现方式:
(a)数字化病理切片文件为瓦片式病理切片文件,设每个瓦片图片的宽度为tW像素,高度为tH像素,由全视野数字化病理切片文件内部定义,瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间为[0,X],当W/tW为整数时,X=W/tW-1,当W/tW不为整数时,X=Floor(W/tW),Floor函数为向下取整函数,瓦片图片文件在在高度方向的位置索引区间为[0,Y],当H/tH为整数时,Y=H/tH-1,当H/tH不为整数时,Y=Floor(H/tH),Floor函数为向下取整函数。例如,数字化病理切片文件的宽度为4000像素,高度为4000像素,每个瓦片图片的宽度为100像素,高度为100像素,则瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间为[0,39],在高度方向的位置索引区间为[0,39]。
根据各个瓦片图片文件在数字化病理切片文件中的位置索引,以及瓦片图片文件的高度、瓦片图片文件的宽度,确定每个瓦片图片文件对角线顶点的坐标,逐个读取各个瓦片图片,并将其保存为本地文件,每个瓦片图片文件命名格式为“X_Y.jpg”,X为瓦片图片文件在宽度方向的位置索引,Y为瓦片图片文件在高度方向的位置索引,保存后的一组瓦片图片文件的数量为C=(X+1)*(Y+1)。
(b)当数字化病理切片文件为线扫描式病理切片文件,从数字化病理切片文件中逐行读取图片像素数据,每读取到R(例如R=256)行后,根据累计读取的像素数据生成W*R像素的图片,从该图片的一角起,将该图片截取为N张S*R像素的瓦片图片,则该瓦片图片文件的高度为R像素,瓦片图片文件的宽度为S像素,N=CEILING(W/S),CEILING函数为向上取整函数。当一侧瓦片图片文件的宽度小于S时,缺失部分可以以白色像素填充,使瓦片图片文件的尺寸维持S*R像素,当瓦片图片为正方形时,S=R。将生成的一组瓦片图片保存为本地文件,文件命名格式为“X_Y.jpg”,X=FLOOR(当前瓦片左上角像素高度坐标绝对值/R),Y=FLOOR(当前瓦片左上角像素宽度坐标绝对值/R),保存后的全部图片数量C=(X+1)*(Y+1)。
通过上述两种方式对全视野数字化病理切片文件进行解析并得到最大缩放级别下所有的瓦片图片文件。
在本发明的一些可能的实现方式中,由最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件生成最大缩放级别以下的各个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件的具体实现可以包括:
将最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件,每相邻的四张瓦片图片文件进行合并,并将合并后的四张瓦片图片文件等比例缩放到合并前的一张瓦片图片文件的图像像素大小,得到下一缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
重复执行将当前缩放级别对应的一组瓦片图片文件,每相邻的四张瓦片图片文件进行合并,并将合并后的四张瓦片图片文件等比例缩放到合并前的一张瓦片图片文件的图像像素大小,得到下一缩放级别对应的一组瓦片图片文件直到获得最小级别对应的一组瓦片图片文件。
对全视野数字化切片文件进行解析后,可得到最大缩放级别的所有瓦片图片文件,如需在移动设备上逐级缩放显示,还需要进一步处理以得到各个缩放级别的所有瓦片图片文件。基于上述步骤得到的最大缩放级别的瓦片图片文件中,可以从一角例如左上角开始将每相邻的4张瓦片图片合并为1张更大的瓦片图片,设合并前每张瓦片的宽为S像素、高为R像素,则合并后的瓦片图片的宽为2S像素、高为2R像素,将合并后的瓦片图片等比例缩放到S*R像素,得到下一缩放级别的瓦片图片文件。依次重复该过程,将当前级别所有瓦片图片文件均合并缩放得到下一缩放级别的一组瓦片图片文件,当该过程进行到最边缘时,如遇到瓦片缺失,则缺失部分可以以白色像素填充,以使其合并后的瓦片图片尺寸维持2S*2R像素。依次执行上述过程,得到从最大缩放级别直至最小缩放级别所有的瓦片图片文件,并将所有的瓦片图片文件和配置文件上传到指定的服务器目录下。
在实际应用中,还可以在数据库的病理图像数据表中插入一条记录,记录当前数字化病理切片文件解析的关键信息如宽度、高度、瓦片图片宽度、瓦片图片高度、文件名、患者姓名、就诊医院、在服务器存放相对路径等信息。
步骤104:将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为数字化病理切片文件对应的病理图像数据,将病理图像数据与咨询单进行匹配关联。
服务器实时或周期性监测已提交的咨询单和处理后的全视野数字化病理切片文件(即病理图像数据),根据设定的规则将两者进行匹配关联。服务器上的咨询单关联程序至少支持两种方式触发自动关联:(a):实时,当咨询单提交后,咨询单后台服务通过通知消息或调用接口的方式主动通知咨询单关联程序,触发自动关联;(b)定时,咨询单关联程序周期性的检查是否有咨询单需要关联,如有则触发自动关联。
在本发明的一些可能的实现方式中,将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为数字化病理切片文件对应的病理图像数据,将病理图像数据与咨询单进行匹配关联的具体实现可以包括:
将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为数字化病理切片文件对应的病理图像数据;
获取咨询单中记录的患者姓名、患者年龄、就诊医院以及病理切片编号中的一个或多个作为第一组数据;
获取病理图像数据所对应的患者姓名、患者年龄、就诊医院以及病理切片编号中的一个或多个作为第二组数据;
如果第一组数据与第二组数据中存在就诊医院相同且病理切片编号相同的情况,则将第一组数据对应的咨询单与第二组数据对应的病理图像数据进行匹配关联;
如果第一组数据与第二组数据中不存在就诊医院相同且病理切片编号相同的情况,则将第一数据与第二组数据中的患者姓名转换为患者姓名拼音;
如果第一组数据与第二组数据中存在就诊医院相同、患者姓名拼音相同且患者年龄相差绝对值不超过预设阈值的情况,则将第一组数据对应的咨询单与第二组数据对应的病理图像数据进行匹配关联;
如果第一组数据与第二组数据中不存在就诊医院相同、患者姓名拼音相同且患者年龄相差绝对值不超过预设阈值的情况,则关联失败。
在实际应用中,咨询单关联程序可以从数据库的咨询单表中读取所有未关联病理图像数据的咨询单,获取咨询单中的患者姓名、患者年龄、就诊医院、病理切片编号等数据,从病理图像数据表中读取所有未关联的病理图像数据,从病理图像数据中获取患者姓名、患者年龄、就诊医院、病理切片编号等数据。如果上述两组数据中存在相同就诊医院且相同病理切片编号的数据,则自动关联成功,否则,将两组数据中的患者姓名均转换为拼音,并对转换后的患者姓名拼音全部大写、去掉所有空格,继续判断两组数据中是否存在相同医院、相同患者姓名拼音且年龄相差绝对值不超过预设阈值(例如3岁)的数据,如果存在,则自动关联成功,否则关联失败。
步骤105:将咨询单以及与咨询单匹配的病理图像数据发送给第二终端。
关联成功后的咨询单在满足一定规则(例如延时20分钟等)的情况下,可以将咨询单以及与咨询单匹配的病理图像数据发送给第二终端,并可以通过短信、微信等方式通知接单医师。
在本发明的一些可能的实现方式中,本发明实施例中提供的实现远程病理会诊的方法还可以包括:接收第二终端对咨询单的回复信息,并将回复信息发送给第一终端。
接单医生可以查看已经关联好的咨询单,并根据自己的经验对咨询单进行回复或拒绝,或要求提单医生补充更多资料。
为便于理解,参见图2所示,再对本发明实施例中提供的实现远程病理会诊的方法实施例的流程进行说明。
在初诊医院,提单医生使用第一终端向服务器提交咨询单,如果在初诊医院可以进行病理切片扫描,则在初诊医院院内扫描病理切片,生成病理切片对应的数字化病理切片文件,并上传到服务器,如果在初诊医院无法进行病理切片扫描,则可以第三方检验机构或者服务器的提供方进行病理切片扫描,生成病理切片对应的数字化病理切片文件,并上传到服务器;对数字化病理切片文件进行解析和处理,即将数字化病理切片文件解析为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件,并由最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件生成最大缩放级别以下的各个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件;将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为数字化病理切片文件对应的病理图像数据,将病理图像数据与咨询单进行匹配关联;将咨询单以及与咨询单匹配的病理图像数据发送给第二终端,在会诊医院的会诊医生通过第二终端查看咨询单以及关联的病理图像数据,并可以对咨询单回复咨询意见。
这样,本实施例通过获取使用第一终端的提单医生上传的病理会诊咨询单以及数字化病理切片文件,将数字化病理切片文件转换为一系列瓦片图片文件以适合在移动终端显示病理切片图像,并将咨询单与该系列瓦片图片文件相关联发送给第二终端,以使使用第二终端的会诊医生可以随时随地查看咨询单内容以及对应的病理图像数据,并针对该咨询单内容进行回复,完成远程病理会诊工作,使远程病理会诊实施难度降低、无需协调双方医生的时间,会诊效率提高,且对数字化病理切片文件解析后进行传输无需再反复调用病理切片,减少对病理切片的损坏。
参见图3所示,示出了本发明实施例中提供的实现远程病理会诊的装置实施例,可以包括:
第一接收单元301,用于接收第一终端上传的咨询单。
获取单元302,用于获取病理切片对应的数字化病理切片文件。
解析单元303,用于将数字化病理切片文件解析为每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件。
在本发明的一些可能的实现方式中,解析单元可以包括:
解析子单元,用于将数字化病理切片文件解析为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
生成子单元,用于由最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件生成最大缩放级别以下的各个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件。
其中,在本发明的一些可能的实现方式中,解析子单元可以包括:
计算子单元,用于当数字化病理切片文件为瓦片式病理切片文件,获取数字化病理切片文件的宽度为W像素,数字化病理切片文件的高度为H像素,设置瓦片图片文件的高度为tW像素,瓦片图片文件的宽度为tH像素,计算瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间[0,X]以及瓦片图片文件在高度方向的位置索引区间[0,Y],其中当W/tW为整数时,X=W/tW-1,当W/tW不为整数时,X=Floor(W/tW),Floor(W/tW)为W/tW的向下取整数值,当H/tH为整数时,Y=H/tH-1,当H/tH不为整数时,Y=Floor(H/tH),Floor(H/tH)为H/tH的向下取整数值;
第一确定子单元,用于由瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间[0,X]以及瓦片图片文件在高度方向的位置索引区间[0,Y]确定每个瓦片图片文件的位置索引;
第二确定子单元,用于根据每个瓦片图片文件的位置索引以及瓦片图片文件的高度、瓦片图片文件的宽度,确定每个瓦片图片文件对角线顶点的坐标;
第一切分子单元,用于根据每个瓦片图片文件对角线顶点的坐标,将数字化病理切片文件切分为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
第二切分子单元,用于当数字化病理切片文件为线扫描式病理切片文件,在数字化病理切片文件中每读取R行像素的图像,将R行像素的图像截取为N张S*R像素的瓦片图片文件,从而将数字化病理切片文件切分为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件。
在本发明的一些可能的实现方式中,生成子单元可以具体用于:
将最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件,每相邻的四张瓦片图片文件进行合并,并将合并后的四张瓦片图片文件等比例缩放到合并前的一张瓦片图片文件的图像像素大小,得到下一缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
重复执行将当前缩放级别对应的一组瓦片图片文件,每相邻的四张瓦片图片文件进行合并,并将合并后的四张瓦片图片文件等比例缩放到合并前的一张瓦片图片文件的图像像素大小,得到下一缩放级别对应的一组瓦片图片文件直到获得最小级别对应的一组瓦片图片文件。
关联单元304,用于将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为数字化病理切片文件对应的病理图像数据,将病理图像数据与咨询单进行匹配关联。
在本发明的一些可能的实现方式中,关联单元可以包括:
确定子单元,用于将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为数字化病理切片文件对应的病理图像数据;
第一获取子单元,用于获取咨询单中记录的患者姓名、患者年龄、就诊医院以及病理切片编号中的一个或多个作为第一组数据;
第二获取子单元,用于获取病理图像数据所对应的患者姓名、患者年龄、就诊医院以及病理切片编号中的一个或多个作为第二组数据;
第一关联子单元,用于如果第一组数据与第二组数据中存在就诊医院相同且病理切片编号相同的情况,则将第一组数据对应的咨询单与第二组数据对应的病理图像数据进行匹配关联;
转换子单元,用于如果第一组数据与第二组数据中不存在就诊医院相同且病理切片编号相同的情况,则将第一数据与第二组数据中的患者姓名转换为患者姓名拼音;
第二关联子单元,用于如果第一组数据与第二组数据中存在就诊医院相同、患者姓名拼音相同且患者年龄相差绝对值不超过预设阈值的情况,则将第一组数据对应的咨询单与第二组数据对应的病理图像数据进行匹配关联;
提示子单元,用于如果第一组数据与第二组数据中不存在就诊医院相同、患者姓名拼音相同且患者年龄相差绝对值不超过预设阈值的情况,则提示关联失败。
第一发送单元305,用于将咨询单以及与咨询单匹配的病理图像数据发送给第二终端。
在本发明的一些可能的实现方式中,本发明实施例中提供的远程病理会诊的装置还可以包括:
第二接收单元,用于接收第二终端对咨询单的回复信息;
第二发送单元,用于将回复信息发送给第一终端。
这样,本实施例通过获取使用第一终端的提单医生上传的病理会诊咨询单以及数字化病理切片文件,将数字化病理切片文件转换为一系列瓦片图片文件以适合在移动终端显示病理切片图像,并将咨询单与该系列瓦片图片文件相关联发送给第二终端,以使使用第二终端的会诊医生可以随时随地查看咨询单内容以及对应的病理图像数据,并针对该咨询单内容进行回复,完成远程病理会诊工作,使远程病理会诊实施难度降低、无需协调双方医生的时间,会诊效率提高,且对数字化病理切片文件解析后进行传输无需再反复调用病理切片,减少对病理切片的损坏。
需要说明的是,本说明书中各个实施例采用递进的方式描述,每个实施例重点说明的都是与其他实施例的不同之处,各个实施例之间相同相似部分互相参见即可。对于实施例公开的系统或装置而言,由于其与实施例公开的方法相对应,所以描述的比较简单,相关之处参见方法部分说明即可。
还需要说明的是,在本文中,诸如第一和第二等之类的关系术语仅仅用来将一个实体或者操作与另一个实体或操作区分开来,而不一定要求或者暗示这些实体或操作之间存在任何这种实际的关系或者顺序。而且,术语“包括”、“包含”或者其任何其他变体意在涵盖非排他性的包含,从而使得包括一系列要素的过程、方法、物品或者设备不仅包括那些要素,而且还包括没有明确列出的其他要素,或者是还包括为这种过程、方法、物品或者设备所固有的要素。在没有更多限制的情况下,由语句“包括一个……”限定的要素,并不排除在包括所述要素的过程、方法、物品或者设备中还存在另外的相同要素。
结合本文中所公开的实施例描述的方法或算法的步骤可以直接用硬件、处理器执行的软件模块,或者二者的结合来实施。软件模块可以置于随机存储器(RAM)、内存、只读存储器(ROM)、电可编程ROM、电可擦除可编程ROM、寄存器、硬盘、可移动磁盘、CD-ROM、或技术领域内所公知的任意其它形式的存储介质中。
对所公开的实施例的上述说明,使本领域专业技术人员能够实现或使用本发明。对这些实施例的多种修改对本领域的专业技术人员来说将是显而易见的,本文中所定义的一般原理可以在不脱离本发明的精神或范围的情况下,在其它实施例中实现。因此,本发明将不会被限制于本文所示的这些实施例,而是要符合与本文所公开的原理和新颖特点相一致的最宽的范围。

Claims (10)

1.一种实现远程病理会诊的方法,其特征在于,所述方法包括:
接收第一终端上传的咨询单;
获取病理切片对应的数字化病理切片文件;
将所述数字化病理切片文件解析为每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件;
将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为所述数字化病理切片文件对应的病理图像数据,将所述病理图像数据与所述咨询单进行匹配关联;
将所述咨询单以及与所述咨询单匹配的所述病理图像数据发送给第二终端;
所述将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为所述数字化病理切片文件对应的病理图像数据,将所述病理图像数据与所述咨询单进行匹配关联,包括:
所述将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为所述数字化病理切片文件对应的病理图像数据;
获取所述咨询单中记录的患者姓名、患者年龄、就诊医院以及病理切片编号中的一个或多个作为第一组数据;
获取所述病理图像数据所对应的患者姓名、患者年龄、就诊医院以及病理切片编号中的一个或多个作为第二组数据;
如果所述第一组数据与所述第二组数据中存在就诊医院相同且病理切片编号相同的情况,则将所述第一组数据对应的咨询单与所述第二组数据对应的病理图像数据进行匹配关联;
如果所述第一组数据与所述第二组数据中不存在就诊医院相同且病理切片编号相同的情况,则将所述第一组数据与所述第二组数据中的患者姓名转换为患者姓名拼音;
如果所述第一组数据与所述第二组数据中存在就诊医院相同、患者姓名拼音相同且患者年龄相差绝对值不超过预设阈值的情况,则将所述第一组数据对应的咨询单与所述第二组数据对应的病理图像数据进行匹配关联;
如果所述第一组数据与所述第二组数据中不存在就诊医院相同、患者姓名拼音相同且患者年龄相差绝对值不超过预设阈值的情况,则提示关联失败。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述将所述数字化病理切片文件解析为每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件,包括:
将所述数字化病理切片文件解析为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件,并由所述最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件生成所述最大缩放级别以下的各个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述将所述数字化病理切片文件解析为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件,包括:
当所述数字化病理切片文件为瓦片式病理切片文件,获取所述数字化病理切片文件的宽度为W像素,所述数字化病理切片文件的高度为H像素,设置瓦片图片文件的高度为tW像素,所述瓦片图片文件的宽度为tH像素,计算所述瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间[0,X]以及所述瓦片图片文件在高度方向的位置索引区间[0,Y],其中当W/tW为整数时,X=W/tW-1,当W/tW不为整数时,X=Floor(W/tW),Floor(W/tW)为W/tW的向下取整数值,当H/tH为整数时,Y=H/tH-1,当H/tH不为整数时,Y=Floor(H/tH),Floor(H/tH)为H/tH的向下取整数值;
由所述瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间[0,X]以及所述瓦片图片文件在高度方向的位置索引区间[0,Y]确定每个所述瓦片图片文件的位置索引;
根据每个所述瓦片图片文件的位置索引以及所述瓦片图片文件的高度、所述瓦片图片文件的宽度,确定每个所述瓦片图片文件对角线顶点的坐标;
根据每个所述瓦片图片文件对角线顶点的坐标,将所述数字化病理切片文件切分为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
当所述数字化病理切片文件为线扫描式病理切片文件,在所述数字化病理切片文件中每读取R行像素的图像,将所述R行像素的图像截取为N张S*R像素的瓦片图片文件,从而将所述数字化病理切片文件切分为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件。
4.根据权利要求2或3所述的方法,其特征在于,所述由所述最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件生成所述最大缩放级别以下的各个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件,包括:
将所述最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件,每相邻的四张瓦片图片文件进行合并,并将合并后的四张瓦片图片文件等比例缩放到合并前的一张瓦片图片文件的图像像素大小,得到下一缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
重复执行将当前缩放级别对应的一组瓦片图片文件,每相邻的四张瓦片图片文件进行合并,并将合并后的四张瓦片图片文件等比例缩放到合并前的一张瓦片图片文件的图像像素大小,得到下一缩放级别对应的一组瓦片图片文件直到获得最小级别对应的一组瓦片图片文件。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
接收所述第二终端对所述咨询单的回复信息,并将所述回复信息发送给所述第一终端。
6.一种实现远程病理会诊的装置,其特征在于,所述装置包括:
第一接收单元,用于接收第一终端上传的咨询单;
获取单元,用于获取病理切片对应的数字化病理切片文件;
解析单元,用于将所述数字化病理切片文件解析为每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件;
关联单元,用于将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为所述数字化病理切片文件对应的病理图像数据,将所述病理图像数据与所述咨询单进行匹配关联;
第一发送单元,用于将所述咨询单以及与所述咨询单匹配的所述病理图像数据发送给第二终端;
所述关联单元包括:
确定子单元,用于所述将每个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件作为所述数字化病理切片文件对应的病理图像数据;
第一获取子单元,用于获取所述咨询单中记录的患者姓名、患者年龄、就诊医院以及病理切片编号中的一个或多个作为第一组数据;
第二获取子单元,用于获取所述病理图像数据所对应的患者姓名、患者年龄、就诊医院以及病理切片编号中的一个或多个作为第二组数据;
第一关联子单元,用于如果所述第一组数据与所述第二组数据中存在就诊医院相同且病理切片编号相同的情况,则将所述第一组数据对应的咨询单与所述第二组数据对应的病理图像数据进行匹配关联;
转换子单元,用于如果所述第一组数据与所述第二组数据中不存在就诊医院相同且病理切片编号相同的情况,则将所述第一组数据与所述第二组数据中的患者姓名转换为患者姓名拼音;
第二关联子单元,用于如果所述第一组数据与所述第二组数据中存在就诊医院相同、患者姓名拼音相同且患者年龄相差绝对值不超过预设阈值的情况,则将所述第一组数据对应的咨询单与所述第二组数据对应的病理图像数据进行匹配关联;
提示子单元,用于如果所述第一组数据与所述第二组数据中不存在就诊医院相同、患者姓名拼音相同且患者年龄相差绝对值不超过预设阈值的情况,则提示关联失败。
7.根据权利要求6所述的装置,其特征在于,所述解析单元包括:
解析子单元,用于将所述数字化病理切片文件解析为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
生成子单元,用于由所述最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件生成所述最大缩放级别以下的各个缩放级别分别对应的一组瓦片图片文件。
8.根据权利要求7所述的装置,其特征在于,所述解析子单元包括:
计算子单元,用于当所述数字化病理切片文件为瓦片式病理切片文件,获取所述数字化病理切片文件的宽度为W像素,所述数字化病理切片文件的高度为H像素,设置瓦片图片文件的高度为tW像素,所述瓦片图片文件的宽度为tH像素,计算所述瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间[0,X]以及所述瓦片图片文件在高度方向的位置索引区间[0,Y],其中当W/tW为整数时,X=W/tW-1,当W/tW不为整数时,X=Floor(W/tW),Floor(W/tW)为W/tW的向下取整数值,当H/tH为整数时,Y=H/tH-1,当H/tH不为整数时,Y=Floor(H/tH),Floor(H/tH)为H/tH的向下取整数值;
第一确定子单元,用于由所述瓦片图片文件在宽度方向的位置索引区间[0,X]以及所述瓦片图片文件在高度方向的位置索引区间[0,Y]确定每个所述瓦片图片文件的位置索引;
第二确定子单元,用于根据每个所述瓦片图片文件的位置索引以及所述瓦片图片文件的高度、所述瓦片图片文件的宽度,确定每个所述瓦片图片文件对角线顶点的坐标;
第一切分子单元,用于根据每个所述瓦片图片文件对角线顶点的坐标,将所述数字化病理切片文件切分为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
第二切分子单元,用于当所述数字化病理切片文件为线扫描式病理切片文件,在所述数字化病理切片文件中每读取R行像素的图像,将所述R行像素的图像截取为N张S*R像素的瓦片图片文件,从而将所述数字化病理切片文件切分为最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件。
9.根据权利要求7或8所述的装置,其特征在于,所述生成子单元具体用于:
将所述最大缩放级别对应的一组瓦片图片文件,每相邻的四张瓦片图片文件进行合并,并将合并后的四张瓦片图片文件等比例缩放到合并前的一张瓦片图片文件的图像像素大小,得到下一缩放级别对应的一组瓦片图片文件;
重复执行将当前缩放级别对应的一组瓦片图片文件,每相邻的四张瓦片图片文件进行合并,并将合并后的四张瓦片图片文件等比例缩放到合并前的一张瓦片图片文件的图像像素大小,得到下一缩放级别对应的一组瓦片图片文件直到获得最小级别对应的一组瓦片图片文件。
10.根据权利要求6所述的装置,其特征在于,所述装置还包括:
第二接收单元,用于接收所述第二终端对所述咨询单的回复信息;
第二发送单元,用于将所述回复信息发送给所述第一终端。
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