CN107106616A - 包括改善神经发育障碍行为的细菌的组合物和方法 - Google Patents

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Abstract

一些实施方式包括用于治疗需要治疗的受试者的一种或多种自闭症谱系障碍(ASD)和/或精神分裂症症状的细菌物种。需要治疗的受试者可以具有成人的肠道微生物群标签特征。细菌物种可以包括拟杆菌属(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和/或普通拟杆菌)和/或肠球菌属(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)。经过治疗，可以改善受试者的一种或多种ASD相关行为。

Description

包括改善神经发育障碍行为的细菌的组合物和方法
相关申请的交叉引用
本申请要求2014年10月30日提交的美国临时申请号62/072,905的权益，据此其通过引用全文并入。
关于联邦资助的研发的声明
本发明在由美国国立卫生研究院授予的批准号为MH100556的政府支持下做出。政府具有本发明的某些权利。
背景技术
自闭症谱系障碍(ASD)是基于重复行为和社会互动和交流受损的呈现而诊断的神经发育障碍。目前在美国ASD的流行率是惊人的1/68，这代表了非常重要的医学和社会议题。虽然ASD的根本原因大部分是未知的，但是与基因和环境风险因素两者都相关。
技术领域
本文描述的一些实施方式通常涉及益生菌组合物，其可以用于治疗自闭症谱系障碍(ASD)症状。在某些实施方式中，益生菌组合物可以用于治疗具有成人抗生素谱的个体的ASD症状。
发明内容
根据本文描述的某些实施方式，用于改善人的行为表现的方法。所述方法可以包括鉴定具有包括至少500种不同的微生物物种的肠道微生物群(microbiota)标签(signature)的人受试者。所述方法可以包括将有效量的一种或多种拟杆菌属(Bacteroides)细菌施用于人受试者。在一些实施方式中，所述方法进一步包括将人受试者的肠道微生物群标签鉴定为成人肠道微生物群标签。在一些实施方式中，受试者患有焦虑、自闭症谱系障碍(ASD)、精神分裂症或具有ASD或精神分裂症的症状中的一种或多种的病理状态。在一些实施方式中，所述方法进一步包括有效量的一种或多种拟杆菌属细菌，所述一种或多种拟杆菌属细菌包括脆弱拟杆菌(B.fragilis)。在一些实施方式中，有效量的一种或多种拟杆菌属细菌包括脆弱拟杆菌、多形拟杆菌(B.thetaiotaomicron)、普通拟杆菌(B.vulgatus)或列出的细菌的两种或三种的混合物，例如：脆弱拟杆菌和多形拟杆菌；脆弱拟杆菌和普通拟杆菌；多形拟杆菌和普通拟杆菌；或脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌的混合物。在一些实施方式中，所述方法进一步包括将一定量的肠球菌属(Enterococcus)细菌施用于受试者。在一些实施方式中，在所述方法中施用于受试者的单独活性成分基本上由一种或多种拟杆菌属细菌组成。在一些实施方式中，施用于受试者的单独活性成分基本上由脆弱拟杆菌组成。在一些实施方式中，有效量的一种或多种拟杆菌属细菌在基本上不含除了拟杆菌属细菌以外的细菌的组合物中。在一些实施方式中，有效量的拟杆菌属细菌在基本上不含除了脆弱拟杆菌以外的细菌的组合物中。在一些实施方式中，有效量的一种或多种拟杆菌属细菌是口服施用的。在一些实施方式中，改善行为表现包括改善交流行为、重复行为、焦虑或列出的这些行为的两种或更多种的组合。在一些实施方式中，人受试者是成人。
附图说明
图1A和图1B是根据本文描述的一些实施方式用包括脆弱拟杆菌的益生菌处理成年母体免疫激活(MIA)小鼠纠正了探究行为缺陷的一系列图。图1A描述了进入中心区域的数量。图1B描述了总的行动距离。
图2是证明根据本文描述的一些实施方式用包括脆弱拟杆菌的益生菌处理成年MIA小鼠减少了重复行为的图。
图3是证明根据本文描述的一些实施方式用包括脆弱拟杆菌的益生菌处理成年MIA小鼠增加了交流行为的图。
具体实施方式
在以下的详细描述中，参考作为本文的一部分的附图。在图中，除非上下文中另有说明，相似的符号典型地鉴别相似的组分。在详细描述、附图和权利要求中描述的说明性的实施方式不意味着是限制性的。可以利用其它实施方式，并且可以进行其它修改，而不背离本文提供的主题的精神或范围。容易理解的是，如本文通常描述的和附图中说明的，本公开的各方面可以以多种不同的布局被安排、代替、结合、分离和设计，所有这些在本文中是被明确地预期的。
不被任何理论所限制，预期的是在自闭症谱系障碍(ASD)中可以存在肠道免疫脑连接(gut-immune-brain connection)。因为肠道微生物群落(microbiome)在婴儿和“成人”(三岁或更大)中可以是不同的，预期的是益生菌不必对婴儿肠道微生物群落具有与成人肠道微生物群落相同的作用，因此在婴儿和成人之间不必是可互换的。根据本文描述的一些实施方式，提供了包括一种或多种细菌物种的益生菌，其可以施用于受试者以治疗ASD和/或精神分裂症的一种或多种症状，并且所述益生菌具有成人的肠道微生物群标签特征。施用如本文描述的益生菌之后可以改善ASD和/或精神分裂症症状，例如重复行为、焦虑和交流行为缺陷。在一些实施方式中，益生菌包括以下细菌中的一种或多种：脆弱拟杆菌、多形拟杆菌、普通拟杆菌和粪肠球菌(Enterococcus faecalis)。益生菌可以在具有成人肠道微生物群落的受试者中改善重复行为、焦虑和交流行为。
基于许多大的流行病学研究(所述流行病学研究关于怀孕期间后代的ASD风险提高的母体细菌或病毒感染)，以及基于对小鼠、大鼠和猴子的临床前研究(所述临床前研究证明了怀孕期间母体感染或免疫激活为后代提供了与ASD相关的行为和神经病理学异常)，母体感染被鉴定为ASD的主要非遗传原因。ASD也是与从癫痫到免疫失调的各种医学疾病共患的。胃肠问题如便秘、腹痛、肠道通透性和肠道微生物群组成改变在ASD个体的重要子集中是普遍的。总的来说，越来越多的证据表明了肠脑相互作用在ASD的发病机制中的潜在作用。
注意的是，除了表现出ASD和精神分裂症的基本的行为和神经病理学特征以外，用于自闭症的母体免疫激活(MIA)小鼠模型还显示了ASD相关的免疫学异常和胃肠异常。进一步地，用人共生细菌脆弱拟杆菌处理断乳的MIA后代纠正了胃肠缺陷和行为缺陷。在生育过程中，肠道微生物群被继承，其后所述肠道微生物群发育和成熟直至达到基于物种组成和丰度的成人微生物群标签。预期的是根据本文描述的一些实施方式，脆弱拟杆菌提供了用于ASD和/或精神分裂症的症状的潜在的益生菌处理。
为了检验脆弱拟杆菌纠正在成年期间ASD和精神分裂症的行为异常的能力，在6周龄时用脆弱拟杆菌处理成年MIA小鼠后代，然后检验对ASD相关行为表现的作用。观察到用脆弱拟杆菌处理ASD和精神分裂症模型后代(与未处理的对照相比)纠正了与ASD和精神分裂症相关的焦虑和探索行为的缺陷(见图1)。观察到用脆弱拟杆菌处理ASD和精神分裂症模型后代(与未处理的对照相比)纠正了与ASD和精神分裂症相关的重复行为的缺陷(见图2)。还观察到用脆弱拟杆菌处理ASD和精神分裂症模型后代(与未处理的对照相比)纠正了与ASD和精神分裂症相关的交流行为的缺陷(见图3)。如此，预期的是根据本文描述的一些实施方式，对具有ASD或精神分裂症和具有成人肠道微生物群标签的受试者的处理可以缓解ASD和/或精神分裂症的症状。例如，所述症状包括焦虑、重复行为和交流行为缺陷中的至少一种。
定义
除非另有定义，本文使用的技术和科学术语具有与本公开所属领域的普通技术人员通常所理解的相同的含义。见例如Singleton等人,微生物学和分子生物学词典(Dictionary of Microbiology and Molecular Biology)第二版,J.Wiley&Sons(纽约,NY1994)；Sambrook等人,分子克隆，实验指南(Molecular Cloning,A Laboratory Manual),冷泉港出版社(Cold Springs Harbor Press)(冷泉港,NY1989)。出于本公开的目的，如下定义以下术语。
如本文使用的，术语“受试者”是脊椎动物，如哺乳动物。术语“哺乳动物”定义为属于哺乳纲的个体，包括而不限制于人、家养动物和农场动物以及动物园动物、运动动物和宠物动物，如羊、狗、马、猫或牛。在一些实施方式中，受试者是人。在一些实施方式中，受试者是非人灵长类。
如本文使用的，术语“病症/障碍/症状”或“行为异常”是指受试者表现的症状，包括但不限于焦虑、脆性X染色体(Fragile X)、雷特氏综合征、结节性硬化症、强迫症、注意力缺失症、精神分裂症、自闭性障碍(经典自闭症)、亚斯伯格症(Asperger’s disorder)(亚斯伯格综合征(Asperger syndrome))、尚未指定的广泛性发展障碍(pervasivedevelopmental disorder not otherwise specified,PDD-NOS)、儿童期崩解症(CDD)或具有ASD的症状的一种或多种的病理状态。
如本文使用的，术语“需要治疗的受试者”是指表现或患有上文提及的行为障碍/症状的一种或多种的受试者。在一些实施方式中，需要治疗的受试者患有精神分裂症、ASD或与ASD或精神分裂症相关的胃肠病理或免疫学病理(例如肠漏综合征(leaky gutsyndrome))。适当的有资格人员能够使用标准的行为测试方案/指南来鉴别需要治疗的个体。相同的行为测试方案/指南也可以用于确定是否存在对个体的障碍和/或症状的改善。
如本文使用的，术语“行为表现的改善”是指对患有ASD、精神分裂症或具有ASD或精神分裂症的症状的一种或多种的病理状态的个体表现的行为障碍、症状和/或异常的一种或多种的预防，或对其严重性或频率降低(无论任何程度)。行为症状的非限制性实例包括交流受损、社交能力受损、语言理解和/或产生受损、重复行为和焦虑增长。通过个体自己进行治疗或通过他人治疗(医学的或其他)观察到改善。在一些实施方式中，将包括有效量的如本文描述的拟杆菌属细菌和/或肠球菌属细菌的益生菌施用于受试者。在一些实施方式中，在施用益生菌后，改善了受试者的感觉运动门控行为。在一些实施方式中，在施用益生菌后，改善了受试者的交流行为。如本文使用的，“交流行为”是指交流、语言理解和产生以及社交能力，包括有声和无声社会交流。在一些实施方式中，基于社交能力受损，受试者被鉴定为交流行为缺陷。在一些实施方式中，基于语言理解和产生受损，受试者被鉴定为交流行为缺陷。
如本文使用的，术语“治疗”是指响应于受试者，尤其是患有ASD、精神分裂症或具有ASD或精神分裂症的症状的一种或多种的病理状态的受试者所表现的疾病、障碍或病理状况所作出的临床干预。治疗的目的可以包括但不限于一种中的一种或多种：缓解或预防症状，放缓或停止疾病、障碍或病症的进展或恶化，以及缓解疾病、障碍或病症。在一些实施方式中，“治疗”是指治疗性治疗(therapeutic treatment)和预防性措施或预防措施。需要治疗的那些包括已经受到疾病或障碍或不希望的病理学状况影响的那些以及待预防的疾病或障碍或不希望的病理学状况的那些。例如，在一些实施方式中，治疗可以改善受试者的行为表现，包括ASD相关的行为如感觉运动门控行为缺陷和/或交流行为缺陷。如本文使用的，术语“预防”是指减少以后表现那些行为症状的个体负担的任何行为。这发生在初级、二级和三级预防水平，其中：a)初级预防避免症状/障碍/病症的发展；b)二级预防行为的目的在于症状/障碍/状况的治疗的早期，由此提高干预的机会以预防症状/障碍/病症进展和症状出现；以及c)三级预防通过例如恢复功能和/或减少任何症状/障碍/病症或相关并发症来减少已确立的症状/障碍/病症的负面影响。
“药学上可接受的”载体是对以采用的剂量和浓度暴露于其中的细胞或哺乳动物无毒的载体。根据本文的方法、用途、组合物和试剂盒的“药学上可接受的”载体可以包括但不限于有机或无机的固体或液体赋形剂，所述赋形剂适用于选择的施用方式如口服施用或注射以及以常见的药物制剂形式被施用，所述常见的药物制剂形式如固体(比如片剂、颗粒剂、粉剂、胶囊剂)和液体(溶液、乳剂、悬液)等。通常，生理学上可接受的载体使pH缓冲的水溶液如磷酸盐缓冲液或柠檬酸缓冲液。生理学上可接受的载体也可以包括以下的一种或多种：抗氧化剂，包括抗坏血酸；低分子量(少于约10个残基)多肽；蛋白如血清白蛋白、明胶、免疫球蛋白；亲水聚合物如聚乙烯吡咯烷酮、氨基酸；糖类如葡萄糖、甘露糖或糊精；螯合剂如EDTA；糖醇如甘露醇或山梨醇；盐形成的抗衡离子如钠；以及非离子型表面活性剂如TWEENTM表面活性剂、聚乙二醇(PEG)和PLURONICSTM表面活性剂。也可以将助剂、稳定剂、乳化剂、润滑剂、粘合剂、pH调节控制剂、等渗剂和其他常见的添加剂添加至载体。
根据本文的方法、用途、组合物和试剂盒的药学上可接受或适当的载体可以包括已知对GI道的受损情形有益的其他化合物(例如抗氧化剂如维生素C、维生素E、硒或锌)；或食品组合物。所述食品组合物可以是但不限于牛奶、酸奶、凝乳、奶酪、发酵乳、乳基发酵产品、冰淇淋、发酵的谷物基产品、乳基粉、婴儿配方奶粉、片剂、液体细菌悬液、干燥口服补充剂或润湿口服补充剂。
如本文使用的，术语“益生菌”是指当以足够的量施用时为宿主提供健康益处的活微生物。根据本文的方法、用途、组合物和试剂盒的益生菌可以是在食品和膳食补充剂(例如但不限于胶囊剂、片剂、粉剂和液体)中可用的。含有益生菌的食品的非限制性实例包括乳制品如酸奶、发酵乳和未发酵乳、思慕雪、黄油、奶油、鹰嘴豆泥(hummus)、康普茶(kombucha)、沙拉酱、味噌、印尼豆豉(tempeh)、营养棒和一些果汁和大豆饮料。在一些实施方式中，益生菌包括一种微生物。在一些实施方式中，益生菌包括微生物的组合。在一些实施方式中，益生菌包括一种组合物。在一些实施方式中，益生菌包括两种或更多种组合物，其可以一起使用，例如同时施用或顺序施用。注意的是，益生菌可以充当用于施用于受试者的“活性成分”或一种组合物或多种组合物。也就是说，方法、用途和/或一种组合物或多种组合物(单独地或总体地)可以包括有效量的益生菌，以改善受试者的至少一种行为。在一些实施方式中，益生菌是用于施用于受试者的单独的活性成分。在一些实施方式中，可以在基本上不含或不含细菌(而不是益生菌)、抗生素和药物的组合物或方法或用途中提供用于施用于受试者的“单独的活性成分”益生菌。即使益生菌是“单独的”活性成分，包括益生菌的一种组合物或多种组合物可以包括基本上不会影响受试者的行为但对益生菌的功能或其施用有用的额外的物质(如缓冲液、细菌原料、赋形剂、风味剂和/或食品)。
在一些实施方式中，益生菌被包括在基本上不含细菌(而不是益生菌)和/或药物或抗生素的一种组合物或多种组合物中。“基本上不含”或“基本上不存在”应该理解为虽然细菌(而不是益生菌)、药物和/或抗生素以痕量存在，但是细菌(而不是益生菌)、药物和/或抗生素对受试者没有明显影响。
如本文使用的，益生菌的“有效量”是指足以使受试者的行为获得临床上显著改变的量。
如本文使用的，术语“营养药品(neutraceutical)”是指提供健康益处的食品(作为强化食品或膳食补充剂)，营养药品不经受与药物相同的测试和规定。
如本文使用的，术语“微生物群标签”(或任选地“肠道微生物群标签”)包括该根术语的多样化形式和变体，其是指肠道中的微生物群谱，可以包括全部数目的肠道中的微生物和/或肠道中的微生物群的特定门和/或种的相对丰度。如本文使用的，“成人微生物群标签”(或任选地“成人肠道微生物群标签”)包括该根术语的多样化形式和变体，其是指至少3岁的人的微生物群标签特征。如本文使用的，术语“婴儿微生物群标签”(或任选地“婴儿肠道微生物群标签”)包括该根术语的多样化形式和变体，其是指3岁以下的人的微生物群标签特征。如本文使用的，术语“成人”是指至少3岁的人。
不被任何理论所限制，微生物群标签可以受到环境因素和生活事件例如饮食、卫生、感染或其他疾病以及发育事件例如激素改变影响。断乳或刚刚断乳的婴儿(3岁以下)被预计具有与已经食用更多种食物和更多暴露于感染等的更年长个体不同的微生物群落特征(因此具有不同的微生物群标签)。因此，不被任何理论所限制，影响具有婴儿微生物群标签的个体的干预(例如益生菌治疗)不必被预计与具有成人微生物群标签的个体是相当或相似的，因为婴儿肠道微生物群落与成人微生物群落是本质上不同的。
典型的新生儿肠道可以具有约100种不同的微生物物种，然而典型的成人(三岁或更大)的肠道可以具有约1000种不同的微生物物种。在一些实施方式中，成人肠道微生物群标签的特征是至少约500种不同的微生物物种，例如至少约500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1050、1100、1150、1200、1250、1300、1350、1400、1450或1500种不同物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围。在一些实施方式中，婴儿肠道微生物群落具有低于成人肠道微生物群落的微生物的总物种数目。任选地，微生物群标签还可以通过各种门的相对丰度(该度量标准可以单独使用或与不同物种的总数共同使用)来表征。在一些实施方式中，婴儿(即低于三岁)肠道微生物群标签通过以下门的相对丰度来表征(按从多到少的顺序)：放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)。在一些实施方式中，成人肠道微生物群标签通过以下门的相对丰度来表征(按从多到少的顺序)：厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门、变形菌门。在一些实施方式中，年长成人肠道微生物群标签通过以下门的相对丰度来表征：厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门、变形菌门。如此，在一些实施方式中，成人肠道微生物群标签通过以下门的相对丰度来表征(按从多到少的顺序)：(a)厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门、变形菌门；(b)厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门、变形菌门。
在一些实施方式中，肠道微生物群标签可以通过分析来自受试者的代表肠的样品的组成来表征，所述样品例如粪便样品，或肠活组织检查或拭样。肠样品中不同物种的数目和/或物种的相对组成和/或肠道样品中门的数目可以通过鉴定不同门的核酸特征来确定。例如，可以比较相对保守的核酸如16s rRNA亚基的序列。通过大量本领域技术人员已知的技术可以进行比较，如核酸分析如微阵列分析、核酸测序(如多路测序)、聚合酶链式反应(如常规聚合酶链式反应和/或定量聚合酶链式反应)和核酸探针杂交等。可以与参比比对核酸来确定样品中存在的微生物物种。
用于治疗ASD和/或精神分裂症的益生菌
不被任何理论所限制，预期的是用于自闭症的MIA小鼠模型显示了ASD和精神分裂症的病理学特征和行为特征两者，还展示了免疫学和胃肠异常，所述小鼠模型与相应的人类障碍相关。本文证明了用人共生细菌如脆弱拟杆菌处理MIA后代纠正了具有成人肠道微生物群肠道标签的受试者的特定的胃肠和行为缺陷。因此，一些实施方式包括对具有成人肠道微生物群肠道标签的受试者的ASD和/或精神分裂症的症状的益生菌治疗和/或预防。
在一些实施方式中，受试者需要改善焦虑、重复行为和交流行为(例如交流、语言理解和产生以及社交能力，包括有声和无声社会交流)。提供了用于施用于受试者(或用于治疗受试者)的有效量的益生菌，所述有效量的益生菌包括以下中的至少一种、由以下中的至少一种组成或基本上由以下中的至少一种组成：(a)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)；(b)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌(E.faecium)、海氏肠球菌(E.hirae)、鸟肠球菌(E.avium)、耐久肠球菌(E.durans)、鹑鸡肠球菌(E.gallinarum)或铅黄肠球菌(E.casseliflavus))；(c)脆弱拟杆菌；(d)多形拟杆菌；(e)普通拟杆菌；(g)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌；(h)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌；(i)多形拟杆菌和普通拟杆菌；(j)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌；(k)脆弱拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(l)多形拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(m)普通拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(n)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(o)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(p)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(q)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(r)脆弱拟杆菌和粪肠球菌；(s)多形拟杆菌和粪肠球菌；(t)普通拟杆菌和粪肠球菌；(u)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及粪肠球菌；(v)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；(w)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；或(x)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌、普通拟杆菌和粪肠球菌。施用所述细菌后，可以改善焦虑、重复行为和交流行为缺陷。任选地，受试者被鉴定为具有包括至少500种不同的微生物物种的肠道微生物标签，例如至少500、600、700、800、900、1000、111、1200、1300、1400或1500种不同的物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围。任选地，受试者被鉴定为具有成人肠道微生物标签。任选地，基于本文描述的特定微生物门的相对数量鉴定成人肠道微生物标签。任选地，除了鉴定的益生菌的细菌以外，没有或基本上没有向受试者施用其他细菌，如此，用于治疗受试者的益生菌在不含或基本上不含其他细菌的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用抗生素，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含抗生素的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药物，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药物的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药学活性成分，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药学活性成分的一种组合物或多种组合物中。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。在一些实施方式中，需要改善焦虑、重复行为和交流行为缺陷的受试者具有ASD。在一些实施方式中，需要改善焦虑、重复行为和交流行为的受试者具有精神分裂症。在一些实施方式中，要改善的交流行为包括以下中的至少一种：交流、语言理解和产生以及社交能力。在一些实施方式中，需要改善焦虑、重复行为和交流行为的受试者至少3岁，例如至少3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50岁，其中包括列出值的任意两个之间的范围。
在一些实施方式中，受试者需要改善交流行为(例如语言理解和/或产生、社交能力和/或交流)。提供了用于施用于受试者(或用于治疗受试者)的有效量的益生菌，所述益生菌包括以下的至少一种、由以下的至少一种组成或基本上由以下的至少一种组成：(a)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)；(b)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(c)脆弱拟杆菌；(d)多形拟杆菌；(e)普通拟杆菌；(g)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌；(h)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌；(i)多形拟杆菌和普通拟杆菌；(j)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌；(k)脆弱拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(l)多形拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(m)普通拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(n)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(o)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(p)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(q)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(r)脆弱拟杆菌和粪肠球菌；(s)多形拟杆菌和粪肠球菌；(t)普通拟杆菌和粪肠球菌；(u)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及粪肠球菌；(v)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；(w)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；或(x)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌、普通拟杆菌和粪肠球菌。施用所述细菌后，可以改善交流行为。任选地，受试者被鉴定为具有包括至少500种不同的微生物物种的肠道微生物标签，例如至少500、600、700、800、900、1000、111、1200、1300、1400或1500种不同的物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围。任选地，受试者被鉴定为具有成人肠道微生物标签。任选地，基于本文描述的特定微生物门的相对数量鉴定成人肠道微生物标签。任选地，除了鉴定的益生菌的细菌以外，没有或基本上没有向受试者施用其他细菌，如此，用于治疗受试者的益生菌在不含或基本上不含其他细菌的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用抗生素，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含抗生素的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药物，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药物的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药学活性成分，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药学活性成分的一种组合物或多种组合物中。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。在一些实施方式中，需要改善交流行为的受试者具有ASD。在一些实施方式中，需要改善交流行为的受试者具有精神分裂症。在一些实施方式中，要改善的交流行为包括以下的至少一种：交流、语言理解和产生以及社交能力。在一些实施方式中，需要改善交流行为的受试者至少3岁，例如至少3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50岁，其中包括列出值的任意两个之间的范围。
在一些实施方式中，受试者需要改善重复行为。提供了用于施用于受试者(或用于治疗受试者)的有效量的益生菌，所述益生菌包括以下的至少一种、由以下的至少一种组成或基本上由以下的至少一种组成：(a)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)；(b)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(c)脆弱拟杆菌；(d)多形拟杆菌；(e)普通拟杆菌；(g)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌；(h)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌；(i)多形拟杆菌和普通拟杆菌；(j)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌；(k)脆弱拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(l)多形拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(m)普通拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(n)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(o)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(p)多形拟杆菌和普通拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(q)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(r)脆弱拟杆菌和粪肠球菌；(s)多形拟杆菌和粪肠球菌；(t)普通拟杆菌和粪肠球菌；(u)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌和粪肠球菌；(v)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌和粪肠球菌；(w)多形拟杆菌和普通拟杆菌和粪肠球菌；或(x)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌、普通拟杆菌和粪肠球菌。施用所述细菌后，可以改善交流行为。任选地，受试者被鉴定为具有包括至少500种不同的微生物物种的肠道微生物标签，例如至少500、600、700、800、900、1000、111、1200、1300、1400或1500种不同的物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围。任选地，受试者被鉴定为具有成人肠道微生物标签。任选地，基于本文描述的特定微生物门的相对数量鉴定成人肠道微生物标签。在一些实施方式中，成人肠道微生物标签被鉴定为包括如本文描述的微生物门的相对丰度。任选地，除了鉴定的益生菌的细菌以外，没有或基本上没有向受试者施用其他细菌，如此，用于治疗受试者的益生菌在不含或基本上不含其他细菌的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用抗生素，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含抗生素的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药物，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药物的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药学活性成分，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药学活性成分的一种组合物或多种组合物中。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。在一些实施方式中，需要改善重复行为的受试者具有ASD。在一些实施方式中，需要改善重复行为的受试者具有精神分裂症。在一些实施方式中，需要改善重复行为的受试者至少3岁，例如至少3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50岁，其中包括列出值的任意两个之间的范围。
在一些实施方式中，受试者需要改善焦虑。提供了用于施用于受试者(或用于治疗受试者)的有效量的益生菌，所述益生菌包括以下的至少一种、由以下的至少一种组成或基本上由以下的至少一种组成：(a)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)；(b)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(c)脆弱拟杆菌；(d)多形拟杆菌；(e)普通拟杆菌；(g)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌；(h)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌；(i)多形拟杆菌和普通拟杆菌；(j)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌；(k)脆弱拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(l)多形拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(m)普通拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(n)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(o)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(p)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(q)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(r)脆弱拟杆菌和粪肠球菌；(s)多形拟杆菌和粪肠球菌；(t)普通拟杆菌和粪肠球菌；(u)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及粪肠球菌；(v)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；(w)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；或(x)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌、普通拟杆菌和粪肠球菌。施用所述细菌后，可以改善交流行为。任选地，受试者被鉴定为具有包括至少500种不同的微生物物种的肠道微生物标签，例如至少500、600、700、800、900、1000、111、1200、1300、1400或1500种不同的物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围。任选地，受试者被鉴定为具有成人肠道微生物标签。任选地，基于本文描述的特定微生物门的相对数量鉴定成人肠道微生物标签。任选地，除了鉴定的益生菌的细菌以外，没有或基本上没有向受试者施用其他细菌，如此，用于治疗受试者的益生菌在不含或基本上不含其他细菌的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用抗生素，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含抗生素的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药物，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药物的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药学活性成分，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药学活性成分的一种组合物或多种组合物中。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。在一些实施方式中，需要改善焦虑的受试者具有ASD。在一些实施方式中，需要改善焦虑的受试者具有精神分裂症。在一些实施方式中，需要改善焦虑的受试者至少3岁，例如至少3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50岁，其中包括列出值的任意两个之间的范围。
在一些实施方式中，受试者需要改善重复行为和交流行为(包括语言理解和/或产生、社交能力和交流)。提供了用于施用于受试者(或用于治疗受试者)的有效量的益生菌，所述益生菌包括以下的至少一种、由以下的至少一种组成或基本上由以下的至少一种组成：(a)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)；(b)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(c)脆弱拟杆菌；(d)多形拟杆菌；(e)普通拟杆菌；(g)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌；(h)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌；(i)多形拟杆菌和普通拟杆菌；(j)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌；(k)脆弱拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(l)多形拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(m)普通拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(n)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(o)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(p)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(q)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(r)脆弱拟杆菌和粪肠球菌；(s)多形拟杆菌和粪肠球菌；(t)普通拟杆菌和粪肠球菌；(u)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及粪肠球菌；(v)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；(w)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；或(x)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌、普通拟杆菌和粪肠球菌。施用所述细菌后，可以改善交流行为。任选地，受试者被鉴定为具有包括至少500种不同的微生物物种的肠道微生物标签，例如至少500、600、700、800、900、1000、111、1200、1300、1400或1500种不同的物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围。任选地，受试者被鉴定为具有成人肠道微生物标签。任选地，基于本文描述的特定微生物门的相对数量鉴定成人肠道微生物标签。任选地，除了鉴定的益生菌的细菌以外，没有或基本上没有向受试者施用其他细菌，如此，用于治疗受试者的益生菌在不含或基本上不含其他细菌的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用抗生素，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含抗生素的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药物，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药物的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药学活性成分，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药学活性成分的一种组合物或多种组合物中。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。在一些实施方式中，需要改善重复行为和交流行为的受试者具有ASD。在一些实施方式中，需要改善重复行为和交流行为的受试者具有精神分裂症。在一些实施方式中，要改善的交流行为包括以下的至少一种：交流、语言理解和产生以及社交能力。在一些实施方式中，需要改善重复行为和交流行为的受试者具有ASD。在一些实施方式中，需要改善重复行为和交流行为的受试者具有精神分裂症。在一些实施方式中，需要改善重复行为和交流行为的受试者至少3岁，例如至少3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50岁，其中包括列出值的任意两个之间的范围。
在一些实施方式中，受试者需要改善焦虑和交流行为(包括语言理解和/或产生、社交能力和交流)。提供了用于施用于受试者(或用于治疗受试者)的有效量的益生菌，所述益生菌包括以下的至少一种、由以下的至少一种组成或基本上由以下的至少一种组成：(a)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)；(b)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(c)脆弱拟杆菌；(d)多形拟杆菌；(e)普通拟杆菌；(g)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌；(h)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌；(i)多形拟杆菌和普通拟杆菌；(j)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌；(k)脆弱拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(l)多形拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(m)普通拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(n)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(o)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(p)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(q)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(r)脆弱拟杆菌和粪肠球菌；(s)多形拟杆菌和粪肠球菌；(t)普通拟杆菌和粪肠球菌；(u)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及粪肠球菌；(v)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；(w)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；或(x)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌、普通拟杆菌和粪肠球菌。施用所述细菌后，可以改善交流行为。任选地，受试者被鉴定为具有包括至少500种不同的微生物物种的肠道微生物标签，例如至少500、600、700、800、900、1000、111、1200、1300、1400或1500种不同的物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围。任选地，受试者被鉴定为具有成人肠道微生物标签。任选地，基于本文描述的特定微生物门的相对数量鉴定成人肠道微生物标签。在一些实施方式中，成人肠道微生物标签被鉴定为包括如本文描述的微生物门的相对丰度。任选地，除了鉴定的益生菌的细菌以外，没有或基本上没有向受试者施用其他细菌，如此，用于治疗受试者的益生菌在不含或基本上不含其他细菌的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用抗生素，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含抗生素的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药物，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药物的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药学活性成分，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药学活性成分的一种组合物或多种组合物中。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。在一些实施方式中，需要改善焦虑和交流行为的受试者具有ASD。在一些实施方式中，需要改善焦虑和交流行为的受试者具有精神分裂症。在一些实施方式中，要改善的交流行为包括以下的至少一种：交流、语言理解和产生以及社交能力。在一些实施方式中，需要改善焦虑和交流行为的受试者至少3岁，例如至少3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50岁，其中包括列出值的任意两个之间的范围。
在一些实施方式中，受试者需要改善焦虑和重复行为。提供了用于施用于受试者(或用于治疗受试者)的有效量的益生菌，所述益生菌包括以下的至少一种、由以下的至少一种组成或基本上由以下的至少一种组成：(a)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)；(b)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(c)脆弱拟杆菌；(d)多形拟杆菌；(e)普通拟杆菌；(g)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌；(h)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌；(i)多形拟杆菌和普通拟杆菌；(j)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌；(k)脆弱拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(l)多形拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(m)普通拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(n)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(o)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(p)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(q)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(r)脆弱拟杆菌和粪肠球菌；(s)多形拟杆菌和粪肠球菌；(t)普通拟杆菌和粪肠球菌；(u)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及粪肠球菌；(v)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；(w)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；或(x)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌、普通拟杆菌和粪肠球菌。施用所述细菌后，可以改善交流行为。任选地，受试者被鉴定为具有包括至少500种不同的微生物物种的肠道微生物标签，例如至少500、600、700、800、900、1000、111、1200、1300、1400或1500种不同的物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围。任选地，受试者被鉴定为具有成人肠道微生物标签。任选地，基于本文描述的特定微生物门的相对数量鉴定成人肠道微生物标签。任选地，除了鉴定的益生菌的细菌以外，没有或基本上没有向受试者施用其他细菌，如此，用于治疗受试者的益生菌在不含或基本上不含其他细菌的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用抗生素，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含抗生素的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药物，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药物的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药学活性成分，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药学活性成分的一种组合物或多种组合物中。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。任选地，脆弱拟杆菌包括野生型脆弱拟杆菌、缺少多糖A的突变型脆弱拟杆菌(dPSA)或野生型脆弱拟杆菌和dPSA脆弱拟杆菌的组合。在一些实施方式中，需要改善焦虑和重复行为的受试者具有ASD。在一些实施方式中，需要改善焦虑和重复行为的受试者具有精神分裂症。在一些实施方式中，需要改善焦虑和重复行为的受试者至少3岁，例如至少3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50岁，其中包括列出值的任意两个之间的范围。
在一些实施方式中，益生菌包括任意的以上公开的细菌物种或细菌物种的组合，所述益生菌被提供用于以一种益生菌组合物的方式施用于受试者(或所述益生菌用于施用于受试者)。在一些实施方式中，益生菌包括任意的以上公开的细菌物种或细菌物种的组合，该益生菌以两种或更多种不同的益生菌组合物的方式施用于受试者(或该益生菌用于施用于受试者)。例如，“细菌A和细菌B”的益生菌可以以包括细菌A和细菌B的一种组合物的方式施用，或以包括细菌A的第一组合物连同包括细菌B的第二组合物的方式施用。在一些实施方式中，第一和第二组合物是同时施用的。在一些实施方式中，第一和第二组合物是单独施用的。
在一些实施方式中，以包括第一拟杆菌属细菌或拟杆菌属细菌的组合的第一组合物和包括第二拟杆菌属细菌或拟杆菌属细菌的组合的第二组合物来提供包括如本文描述的拟杆菌属细菌的组合的益生菌。在一些实施方式中，以包括如本文描述的肠球菌属细菌的第一组合物和包括拟杆菌属细菌或拟杆菌属细菌的组合的第二组合物来提供包括如本文描述的肠球菌属细菌和拟杆菌属细菌的组合的益生菌。在一些实施方式中，肠球菌属细菌和第一拟杆菌属细菌(或拟杆菌属细菌的组合)以第一组合物施用，肠球菌属细菌和不同于第一拟杆菌属细菌的第二拟杆菌属细菌(或拟杆菌属细菌的组合)以第二组合物施用。在一些实施方式中，肠球菌属细菌和第一拟杆菌属细菌(或拟杆菌属细菌的组合)以第一组合物施用，不同于第一拟杆菌属细菌的第二拟杆菌属细菌(或拟杆菌属细菌的组合)以第二组合物施用。
根据上述的任意的实施方式，任选地，每种组合物、用途或方法不含或基本上不含除了鉴定的益生菌细菌以外的细菌。根据上述的任意的实施方式，任选地，每种组合物不含或基本上不含抗生素。根据上述的任意的实施方式，任选地，每种组合物不含或基本上不含除了益生菌以外的细菌以及抗生素。
根据本文描述的实施方式，任选地，本文描述的方法、用途和组合物的益生菌可以用于任何适合的给药途径。例如，益生菌可以通过口服给药施用、直肠给药、经皮给药、鼻内给药或吸入给药来施用于受试者。在一些实施方式中，益生菌通过口服施用于受试者。
在一些实施方式中，益生菌组合物、用途或方法中的有效量的细菌包括至少约104个菌落形成单位(cfu)，例如至少约104、105、106、107、108、109、1010、1011、1012或1013cfu，其中包括任意的列出值之间的范围，例如104～108cfu、104～109cfu、104～1010cfu、104～1011cfu、104～1012cfu、104～1012cfu、105～108cfu、105～109cfu、105～1010cfu、105～1011cfu、105～1012cfu、105～1012cfu、106～108cfu、106～109cfu、106～1010cfu、106～1011cfu、106～1012cfu、106～1012cfu、107～108cfu、107～109cfu、107～1010cfu、107～1011cfu、107～1012cfu、107～1012cfu、～109cfu、108～1010cfu、108～1011cfu、108～1012cfu或108～1012cfu。在一些实施方式中，有效量的细菌包括用于施用于受试者的组合物中的对数期数量的细菌(37℃下)。在一些实施方式中，有效量的细菌包括用于施用于受试者的组合物中的稳定期数量的细菌(37℃下)。
治疗和/或预防ASD和/或精神分裂症的症状的方法
在一些实施方式中，提供了治疗ASD和/或精神分裂症的症状的方法。所述方法可以包括鉴定受试者为可能需要改善焦虑、重复行为和/或交流行为。任选地，所述方法可以包括从受试者的样品中确定受试者的肠道微生物标签。任选地，如果受试者的肠道微生物标签包括至少500种不同的微生物物种，例如至少500、600、700、800、900、1000、111、1200、1300、1400或1500种不同的物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围，则确定使受试者可经受治疗方法。任选地，受试者被鉴定为具有成人肠道微生物标签。任选地，基于本文描述的特定微生物门的相对数量鉴定成人肠道微生物标签。所述方法可以包括将有效量的如本文描述的益生菌施用于需要改善行为的受试者，所述益生菌包括以下，基本上由以下组成或由以下组成：肠球菌属细菌、拟杆菌属细菌或肠球菌属细菌和拟杆菌属细菌的组合。在施用益生菌后，受试者可以显示焦虑、重复行为或交流行为的改善。在一些实施方式中，受试者需要改善焦虑，在施用益生菌后，改善了焦虑。在一些实施方式中，受试者需要改善交流行为，在施用益生菌后，改善了交流行为。在一些实施方式中，受试者需要改善焦虑和重复行为，在施用益生菌后，改善了交流行为。在一些实施方式中，受试者需要改善焦虑和交流行为，在施用益生菌后，改善了交流行为。在一些实施方式中，受试者需要改善重复行为和交流行为，在施用益生菌后，改善了交流行为。在一些实施方式中，需要改善的交流行为(其在施用益生菌后得到改善)包括交流、社交能力或语言理解和/或语言产生的至少一种。在一些实施方式中，受试者被进一步鉴定为需要改善肠屏障完整性缺陷，在施用益生菌后，改善了肠屏障完整性缺陷的缺陷。任选地，受试者至少3岁。
在一些实施方式中，提供了治疗ASD症状的方法。所述方法可以包括鉴定受试者为需要改善焦虑、重复行为和/或交流行为。任选地，所述方法可以包括从受试者的样品中确定受试者的肠道微生物标签。任选地，如果受试者的肠道微生物标签包括至少500种不同的微生物物种，例如至少500、600、700、800、900、1000、111、1200、1300、1400或1500种不同的物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围，则确定受试者可经受治疗方法。任选地，受试者被鉴定为具有成人肠道微生物标签。任选地，基于本文描述的特定微生物门的相对数量鉴定成人肠道微生物标签。所述方法可以包括施用包括以下，基本上由以下组成或由以下组成的益生菌：有效量的如本文描述的拟杆菌属细菌、或拟杆菌属和肠球菌属细菌的组合。在施用益生菌后，可以改善焦虑、重复行为和/或交流行为。在一些实施方式中，所述方法包括确定受试者需要改善焦虑和重复行为。在施用益生菌后，可以改善焦虑和重复行为。任选地，受试者至少3岁。在一些实施方式中，所述方法包括确定受试者需要改善焦虑和交流行为。在施用益生菌后，可以改善焦虑和交流行为。在一些实施方式中，所述方法包括确定受试者需要改善重复行为和交流行为。在施用益生菌后，改善了重复行为和交流行为。在一些实施方式中，所述方法包括确定受试者需要改善焦虑、交流行为和重复行为，在施用益生菌后，改善了焦虑、交流行为和重复行为。在一些实施方式中，需要改善的交流行为(并且随后被改善)包括交流、社交能力或语言理解和/或语言产生中的至少一种。在一些实施方式中，所述方法进一步包括确定受试者是否具有ASD。在一些实施方式中，治疗ASD症状。在一些实施方式中，受试者被进一步鉴定为需要改善肠屏障完整性缺陷，在施用益生菌后，改善了肠屏障完整性缺陷的缺陷。
在一些实施方式中，提供了治疗精神分裂症症状的方法。所述方法可以包括鉴定受试者为需要改善焦虑、重复行为和/或交流行为。任选地，所述方法可以包括从受试者的样品中确定受试者的肠道微生物标签。任选地，如果受试者的肠道微生物标签包括至少500种不同的微生物物种，例如至少500、600、700、800、900、1000、111、1200、1300、1400或1500种不同的物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围，则确定使受试者可经受治疗方法。任选地，受试者被鉴定为具有成人肠道微生物标签。任选地，基于本文描述的特定微生物门的相对数量鉴定成人肠道微生物标签。所述方法可以包括施用包括以下，基本上由以下组成或由以下组成的益生菌：有效量的如本文描述的拟杆菌属细菌或拟杆菌属和肠球菌属细菌的组合。在施用益生菌后，可以改善焦虑、重复行为和/或交流行为。在一些实施方式中，所述方法包括确定受试者需要改善焦虑和重复行为。在施用益生菌后，可以改善焦虑和重复行为。任选地，受试者至少3岁。在一些实施方式中，所述方法包括确定受试者需要改善焦虑和交流行为。在施用益生菌后，可以改善焦虑和交流行为。在一些实施方式中，所述方法包括确定受试者需要改善重复行为和交流行为。施用益生菌后，改善了重复行为和交流行为。在一些实施方式中，所述方法包括确定受试者需要改善焦虑、交流行为和重复行为，在施用益生菌后，改善了焦虑、交流行为和重复行为。在一些实施方式中，需要改善的交流行为(并且随后被改善)包括交流、社交能力或语言理解和/或语言产生中的至少一种。在一些实施方式中，所述方法进一步包括确定受试者是否具有精神分裂症。在一些实施方式中，治疗精神分裂症症状。在一些实施方式中，受试者被进一步鉴定为需要改善肠屏障完整性缺陷，在施用益生菌后，改善了肠屏障完整性缺陷的缺陷。
在一些实施方式中，提供了预防ASD和/或精神分裂症症状的方法。所述方法可以包括鉴定受试者为处于发生焦虑、重复行为和/或交流行为缺陷的风险中。任选地，所述方法可以包括从受试者的样品中确定受试者的肠道微生物标签。任选地，如果受试者的肠道微生物标签包括至少500种不同的微生物物种，例如至少500、600、700、800、900、1000、111、1200、1300、1400或1500种不同的物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围，则确定受试者可经受治疗方法。任选地，受试者被鉴定为具有成人肠道微生物标签。任选地，基于本文描述的特定微生物门的相对数量鉴定成人肠道微生物标签。所述方法可以包括施用包括以下，基本上由以下组成或由以下组成的益生菌：有效量的如本文描述的拟杆菌属细菌或拟杆菌属和肠球菌属细菌的组合。受试者可以发生最轻的焦虑、重复行为和/或交流行为的缺陷或不发生可辨别的焦虑、重复行为和/或交流行为缺陷。在一些实施方式中，确定受试者处于发生焦虑的风险中。施用益生菌后，受试者可以发生最轻的焦虑或不发生焦虑。任选地，处于风险中的受试者是儿童、青少年或三岁或三岁以上的成人。在一些实施方式中，确定受试者处于发生重复行为的风险中。施用益生菌后，受试者可以发生最轻的重复行为或不发生重复行为。在一些实施方式中，确定受试者处于发生交流行为缺陷的风险中。施用益生菌后，受试者可以发生最轻的交流行为缺陷或不发生交流行为缺陷。在一些实施方式中，没有发生可辨别的缺陷的交流行为包括语言理解和/或产生、社交能力或交流中的至少一种。在一些实施方式中，所述方法进一步包括确定受试者是否处于ASD的风险中。在一些实施方式中，预防了ASD症状。在一些实施方式中，所述方法进一步包括确定受试者是否处于精神分裂症的风险中。在一些实施方式中，预防了精神分裂症症状。在一些实施方式中，预防了ASD和精神分裂症症状。
在一些实施方式中，提供了预防ASD症状的方法。所述方法可以包括鉴定受试者为处于发生焦虑、重复行为和/或交流行为缺陷的风险中。任选地，所述方法可以包括从受试者的样品中确定受试者的肠道微生物标签。任选地，如果受试者的肠道微生物标签包括至少500种不同的微生物物种，例如至少500、600、700、800、900、1000、111、1200、1300、1400或1500种不同的物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围，则确定使受试者可经受治疗方法。任选地，受试者被鉴定为具有成人肠道微生物标签。任选地，基于本文描述的特定微生物门的相对数量鉴定成人肠道微生物标签。所述方法可以包括施用包括以下，基本上由以下组成或由以下组成的益生菌：有效量的如本文描述的拟杆菌属细菌或拟杆菌属和肠球菌属细菌的组合。受试者可以发生最轻的焦虑、重复行为和/或交流行为缺陷或不发生可辨别的焦虑、重复行为和/或交流行为缺陷。任选地，处于风险中的受试者是儿童、青少年或三岁或三岁以上的成人。在一些实施方式中，确定受试者处于发生焦虑的风险中。施用益生菌后，受试者可以发生最轻的焦虑或不发生焦虑。在一些实施方式中，确定受试者处于发生重复行为的风险中。施用益生菌后，受试者可以发生最轻的重复行为或不发生重复行为。在一些实施方式中，确定受试者处于发生交流行为缺陷的风险中。施用益生菌后，受试者可以发生最轻的交流行为缺陷或不发生交流行为缺陷。在一些实施方式中，没有发生可辨别的缺陷的交流行为包括语言理解和/或产生、社交能力或交流中的至少一种。在一些实施方式中，所述方法进一步包括确定受试者是否处于ASD的风险中。在一些实施方式中，预防了ASD症状。
在一些实施方式中，提供了预防精神分裂症症状的方法。所述方法可以包括鉴定受试者处于发生焦虑、重复行为和/或交流行为缺陷的风险中。任选地，所述方法可以包括从受试者的样品中确定受试者的肠道微生物标签。任选地，如果受试者的肠道微生物标签包括至少500种不同的微生物物种，例如至少500、600、700、800、900、1000、111、1200、1300、1400或1500种不同的物种，其中包括列出值的任意两个之间的范围，则确定使受试者可经受治疗方法。任选地，受试者被鉴定为具有成人肠道微生物标签。任选地，基于本文描述的特定微生物门的相对数量鉴定成人肠道微生物标签。所述方法可以包括施用包括以下，基本上由以下组成或由以下组成的益生菌：有效量的如本文描述的拟杆菌属细菌或拟杆菌属和肠球菌属细菌的组合。受试者可以发生最轻的焦虑、重复行为和/或交流行为缺陷或不发生可辨别的焦虑、重复行为和/或交流行为缺陷。任选地，处于风险中的受试者是儿童、青少年或三岁或三岁以上的成人。在一些实施方式中，确定受试者处于发生焦虑的风险中。施用益生菌后，受试者可以发生最轻的焦虑或不发生焦虑。在一些实施方式中，确定受试者处于发生重复行为的风险中。施用益生菌后，受试者可以发生最轻的重复行为或不发生重复行为。在一些实施方式中，确定受试者处于发生交流行为缺陷的风险中。施用益生菌后，受试者可以发生最轻的交流行为缺陷或不发生交流行为缺陷。在一些实施方式中，没有发生可辨别的缺陷的交流行为包括语言理解和/或产生、社交能力或交流中的至少一种。在一些实施方式中，所述方法进一步包括确定受试者是否处于精神分裂症的风险中。在一些实施方式中，预防了精神分裂症症状。
在一些实施方式中，根据上述的任意方法，使用本领域技术人员已知的适合的方法，通过分析来自受试者的样品中的核酸来确定受试者的肠道微生物标签。例如，可以确认样品中的核酸的序列以确定肠道中的不同微生物物种的数目。例如，可以使用多路测序来测序来自样品的核酸。例如，可以在微阵列上分析核酸。例如，可以通过聚合酶链式反应(常规或定量的)来分析核酸。例如，可以通过核酸探针杂交来分析核酸。任选地，使核酸序列与参比进行比较，所述参比例如确认来源的微生物物种的核酸数据库。任选地，核酸包括核糖体RNA16s亚基。任选地，从样品分离核酸之后确认其序列。任选地，合并来自样品的核酸，使得可以从合并的核酸确认微生物群体的序列(例如通过多路分析)。在一些实施方式中，样品包括粪便样品。
在一些实施方式中，根据上述的任意方法，益生菌包括以下、基本上由以下组成或由以下组成：本文描述的任意方法的拟杆菌属细菌，或肠球菌属细菌和拟杆菌属细菌的组合；所述益生菌选自由以下组成的组：(a)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)；(b)拟杆菌属细菌(例如脆弱拟杆菌、多形拟杆菌或普通拟杆菌)和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(c)脆弱拟杆菌；(d)多形拟杆菌；(e)普通拟杆菌；(g)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌；(h)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌；(i)多形拟杆菌和普通拟杆菌；(j)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌；(k)脆弱拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(l)多形拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(m)普通拟杆菌和肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(n)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(o)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(p)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(q)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌和普通拟杆菌以及肠球菌属细菌(例如粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌、鸟肠球菌、耐久肠球菌、鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌)；(r)脆弱拟杆菌和粪肠球菌；(s)多形拟杆菌和粪肠球菌；(t)普通拟杆菌和粪肠球菌；(u)脆弱拟杆菌和多形拟杆菌以及粪肠球菌；(v)脆弱拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；(w)多形拟杆菌和普通拟杆菌以及粪肠球菌；或(x)脆弱拟杆菌、多形拟杆菌、普通拟杆菌和粪肠球菌。任选地，除了鉴定的益生菌的细菌以外，没有或基本上没有向受试者施用其他细菌，如此，用于治疗受试者的益生菌在不含或基本上不含其他细菌的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用抗生素，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含抗生素的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药物，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药物的一种组合物或多种组合物中。任选地，没有或基本上没有向受试者施用药学活性成分，如此，用于施用于受试者的益生菌在不含或基本上不含药学活性成分的一种组合物或多种组合物中。
在一些实施方式中，根据上述的任意方法，根据行为评估和/或来自受试者的样品的至少一种生物标记物的存在、不存在和/或水平的确定中的至少一种，进行对需要改善行为的受试者的确定。在一些实施方式中，例如涉及婴儿和/或儿童的用途、方法和或组合物，基于母体免疫激活和/或其他风险因素，鉴定处于ASD行为的风险中的受试者。在一些实施方式中，基于ASD相关代谢物或肠道中的代谢物和体液(例如血液和尿液)中额代谢物的组合或其任意组合的水平，将受试者诊断为具有ASD。基于受试者的代谢物水平诊断ASD的方法详细地描述于美国公开号2014/0065132，据此其通过引用全文并入。在一些实施方式中，确定患者具有在与语言产生、语言识别、冲动控制和/或社会化相关的脑区域(例如大脑皮层区、胼胝体区、布若卡氏区和/或韦尼克氏区)中的损害和发育缺陷。在一些实施方式中，使用例如精神障碍的诊断和统计手册(Diagnostic and Statistical Manual of MentalDisorders)，第四版(DSM-4)或第五版(DSM-5)中的标准诊断标准来鉴定ASD行为例如交流缺陷、发声缺陷、感觉运动缺陷、焦虑和/或重复行为，或这些中的两种或更多种的组合。在一些实施方式中，使用行为测试来确定受试者的ASD的存在或不存在，所述行为测试例如自闭症行为检查量表(ABC)、自闭症诊断访谈量表修订改版(ADI-R)、儿童自闭症评定量表(CARS)和/或前语言性自闭症诊断观察记录表(PL-ADOS)。行为测试可以包括但不限于检测以下的存在和/或程度：1)专注于强度或集中异常的一种或多种感兴趣的千篇一律的和受限的模式，2)顽固地遵守特定的无功能的惯例或习惯，c)千篇一律的和重复的动作怪癖(如拍打手、拍动手指等)和/或d)持续专注于物体的部分。行为测试可以包括的并且根据测试建议受试者需要改善行为表现的行为的非限制性实例包括：a)感觉行为，包括当学习时很少使用视觉辨别，似乎不在听人说话，以致让人怀疑具有听力损失，有时显示对很大的声音没有“吃惊反应”，有时疼痛刺激如受伤、割伤和注射不能引起反应，当强光直射眼睛时常常不会眨眼，在许多声音下捂耳朵，当存在自然光线时斜视、皱眉或捂眼睛，对“新”人经常没有视觉反应，长时间凝视一个地方；b)相关行为：经常注意不到社会/环境刺激，无社交性微笑，当伸手拿东西时不能拿到，对其他人的面部表情/感情没有反应，主动回避目光接触，拒绝被接触或拥抱，用胳膊抱时软弱无力，僵硬和难以抱住，游戏时不模仿其他儿童，没有发展任何友谊，经常受到惊吓或焦虑不安、“看穿(looks through)”人；c)身体和物体使用行为：长时间自己旋转，不能适当地使用玩具，坚持保持某些物体在他/她身边，长时间自己摇摆，进行大量的扑和猛冲，拍打手，用脚尖走路、通过撞头、咬手、扭转、旋转、猛击物体伤害自己，摸、嗅和/或尝环境中的物体，纠缠在一些复杂的“仪式行为”上如一定要把什么东西摆在什么位置，变得非常有破坏性；和d)语言行为：不能马上对简单命令作出反应，代词运用颠倒，讲话不合音调，当另外两人中叫到自己名字时对自己名字没有反应，很少说“是”或“我”，不能对含有介词语句的简单命令作出反应，通过打手势获得想要的物体，不停地重复短语，不能指出多于五种物体的名称，每天使用0～5个无意识词语来交流想要的和需要的，不停地重复声音或词语，重复其他人的问话或回答，每天使用至少15个但少于30个无意识短语来交流，学会做一件简单的事但很快就“遗忘”，对日常/环境改变产生强烈反应，具有一个发展领域的“特殊能力”，似乎与智力低下不相符合、大发脾气或经常发点脾气，通过咬、打和/或踢伤害其他人，不能等待想要的东西、难以上厕所、在没有人频繁帮助下不能自己穿衣服，频繁地意识不到所处的环境，以及可能不在意危险情况，特别喜欢摆弄、着迷于单调的东西，和/或在30个月龄时或之前鉴定出发育迟缓。本领域普通技术人员会理解，主治医师会知道如何鉴定需要如本文公开的治疗的受试者。
在一些实施方式中，根据上述的任意方法，所述方法包括以一次施用一种或多种组合物的方式施用有效量的益生菌。在一些实施方式中，如上文描述的，所述方法包括以两次或更多次施用如本文描述的单一组合物的方式施用有效量的益生菌。例如，可以以约1分钟、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55分钟、1小时、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23小时、1天、2、3、4、5、6、7、8、9或10天的间隔施用组合物，其中包括列出值的任意两个之间的范围，例如1分钟～10分钟、1分钟～30分钟、1分钟～1小时、1分钟～2小时、1分钟～4小时、1分钟～12小时、1分钟～18小时、1分钟～1天、10分钟～30分钟、10分钟～1小时、10分钟～2小时、10分钟～4小时、10分钟～12小时、10分钟～18小时、10分钟～1天、30分钟～1小时、30分钟～2小时、30分钟～4小时、30分钟～12小时、30分钟～18小时、30分钟～1天、30分钟～2天、1小时～2小时、1小时～4小时、1小时～12小时、1小时～18小时、1小时～1天、4小时～12小时、4小时～18小时、4小时～1天、1天～2天、1天～3天、1天-4天、1天～5天、1天～7天、1天～10天、2天～3天、2天-4天、2天～5天、2天～7天、2天～10天或5天～10天。在一些实施方式中，如上文描述的，所述方法包括以两次或更多次施用一种组合物的方式施用有效量的两种或更多种如本文描述的不同的组合物。例如，可以在施用第一组合物后1分钟、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55分钟、1小时、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23小时、1天、2、3、4、5、6、7、8、9或10天施用第二组合物，其中包括列出值的任意两个之间的范围，例如1分钟～10分钟、1分钟～30分钟、1分钟～1小时、1分钟～2小时、1分钟～4小时、1分钟～12小时、1分钟～18小时、1分钟～1天、10分钟～30分钟、10分钟～1小时、10分钟～2小时、10分钟～4小时、10分钟～12小时、10分钟～18小时、10分钟～1天、30分钟～1小时、30分钟～2小时、30分钟～4小时、30分钟～12小时、30分钟～18小时、30分钟～1天、30分钟～2天、1小时～2小时、1小时～4小时、1小时～12小时、1小时～18小时、1小时～1天、4小时～12小时、4小时～18小时、4小时～1天、1天～2天、1天～3天、1天～4天、1天～5天、1天～7天、1天～10天、2天～3天、2天～4天、2天～5天、2天～7天、2天～10天或5天～10天。在一些实施方式中，以缓释制剂(例如缓释胶囊或植入物)施用益生菌如上描述的任意时间
在一些实施方式中，将益生菌施用于受试者，直到观察到行为表现改善。任选地，在观察到行为表现改善后向受试者使用益生菌，例如用于巩固或保持改善的行为表现。
实施例
在以下实施例中，更详细地公开了上文讨论的实施方式的一些方面，其不以任何方式意图限制本公开的范围。
实施例1：证明用包括脆弱拟杆菌的益生菌处理成年MIA小鼠纠正了探索行为缺陷 的成年处理
为免疫激活的母鼠的6周龄后代提供含有脆弱拟杆菌的苹果酱或仅苹果酱1周。细菌处理后4周，在开放式田野探索测定中测试小鼠的焦虑样行为和探索行为。如由增加的进入中心区域的数量(图1A)和提高的在开放区域中行动的总距离(图1B)测量的，用脆弱拟杆菌处理成年小鼠显著提高MIA后代的探索行为。对母鼠施用Poly(I:C)作为免疫激活剂。检测非免疫激活的母鼠(盐水处理)的后代作为另外的对照。图1A至图1B中使用的缩写：Sal＝盐水后代对照，pIC＝poly(I:C)后代，NB＝碳酸氢钠载体，BF＝脆弱拟杆菌。
如由进入中心区域的数量和开放区域中行动的总距离测量的，脆弱拟杆菌处理的免疫激活母鼠的成年后代的焦虑样行为和探索行为显著高于未处理的对照。会理解处理的后代具有成人肠道微生物群落标签。因此，用包括脆弱拟杆菌、基本上由脆弱拟杆菌组成或由脆弱拟杆菌组成的益生菌处理可以改善具有成人肠道微生物群落并且显示根据本文描述的一些实施方式的ASD症状的受试者的焦虑样行为和探索行为。
实施例2：证明用包括脆弱拟杆菌的益生菌处理成年MIA小鼠减少了根据本文描述 的一些实施方式的重复行为的成年处理
为免疫激活的母鼠的6周龄后代提供含有脆弱拟杆菌的苹果酱或仅苹果酱1周。细菌处理后4周，在老一套的大理石埋藏测定(stereotyped marble burying assay)中测试小鼠的重复行为。如图2所示，与未处理的对照相比，用脆弱拟杆菌的成年处理降低了MIA后代的老一套的大理石埋藏。向母鼠施用Poly(I:C)作为免疫激活剂。检测非免疫激活的母鼠(盐水处理)的后代作为另外的对照。图2中的缩写：Sal＝盐水后代对照，pIC＝poly(I:C)后代，NB＝碳酸氢钠载体，BF＝脆弱拟杆菌。为了检验统计学显著性，进行了单因素方差分析(ANOVA)的p值和进行Bonferroni事后检验(显示p＝0.0867)。
如由大理石埋藏测试测量的，脆弱拟杆菌处理的免疫激活母鼠的成年后代的重复行为相对于未处理的对照减少。因此，用包括脆弱拟杆菌、基本上由脆弱拟杆菌组成或由脆弱拟杆菌组成的益生菌处理可以改善具有成人肠道微生物群落并且显示根据本文描述的一些实施方式的ASD症状的受试者的重复行为。
实施例3：证明用包括脆弱拟杆菌的益生菌处理成年MIA小鼠(具有典型的成人微 生物群落)提高了根据本文描述的一些实施方式的交流行为的成年处理
为免疫激活的母鼠的6周龄后代提供含有脆弱拟杆菌的苹果酱或仅苹果酱1周。细菌处理后4周，如通过对暴露于雄性小鼠的响应而产生超声声音测量的，测试雄性小鼠的交流行为。与未处理的对照相比，用脆弱拟杆菌进行的成年处理提高了由MIA后代产生的呼叫次数(见图3)。向母鼠施用Poly(I:C)作为免疫激活剂。检测非免疫激活的母鼠(盐水处理)的后代作为另外的对照。图3中的缩写：Sal＝盐水后代对照，pIC＝poly(I:C)后代，NB＝碳酸氢钠载体，BF＝脆弱拟杆菌。
如通过产生超声声音测量的，脆弱拟杆菌处理的免疫激活母鼠的成年后代的交流行为相对于未处理的对照提高。因此，用包括脆弱拟杆菌、基本上由脆弱拟杆菌组成或由脆弱拟杆菌组成的益生菌处理可以改善具有成人肠道微生物群落并且显示根据本文描述的一些实施方式的ASD症状的受试者的交流行为。
实施例4：通过脆弱拟杆菌纠正ASD相关行为
人受试者显示焦虑和社交能力受损。通过从受试者的粪便样品分离的核酸的高通量测序(和比对)确定受试者具有包括至少800种不同微生物物种的肠道微生物谱。受试者在8周内每周消耗包括有效量的基本上由脆弱拟杆菌组成的益生菌的凝胶胶囊。消耗凝胶胶囊约8周后，预期受试者显示焦虑和社交能力的改善。
实施例5：通过脆弱拟杆菌纠正ASD相关行为
人受试者显示重复行为和语言理解和使用受损。通过从受试者的粪便样品分离的核酸的高通量测序(和比对)确定受试者具有包括至少1000种不同微生物物种的肠道微生物谱。受试者消耗包括有效量的基本上由脆弱拟杆菌组成的益生菌的谷物棒，直到预期症状改善。预期受试者显示重复行为和语言理解和使用受损的改善。
实施例5：通过脆弱拟杆菌纠正ASD相关行为
人受试者显示重复行为和语言理解和使用受损。通过从受试者的粪便样品分离的核酸的高通量测序(和比对)确定受试者具有包括至少1000种不同微生物物种的肠道微生物谱，包括相对数量(从多到少)的以下门：厚壁菌门>拟杆菌门>放线菌门>变形菌门。受试者消耗包括有效量的基本上由多形拟杆菌组成的益生菌的酸奶饮料，直到预期症状改善。所述酸奶饮料基本上不含药物和抗生素。预期受试者显示重复行为和语言理解和使用受损的改善。
在之前描述的实施方式中的至少一些中，实施方式中使用的一种或多种元素可以相互交换地在另一实施方式中使用，除非这样的替换是技术上不可行的。本领域技术人员会理解，可以对上文描述的方法和结构进行各种其他省略、添加和修改而不背离要求保护的主题的范围。所有这些修改和改变意图落在如所附的权利要求所限定的主题的范围内。
关于本文的基本上任何复数和/或单数术语的使用，本领域技术人员可以从复数转化为单数，和/或从单数转化为复数，以适合于上下文和/或应用。为了清楚，本文可以专门地陈述各种单数/复数置换。
本领域技术人员会理解，通常，本文使用的术语，尤其是所附的权利要求(例如所附权利要求的主体)中的术语通常意指“开放性”术语(例如术语“包括(including)”应该被解释为“包括但不限于”，术语“具有”应该被解释为“至少具有”，术语“包括(includes)”应该被解释为“包括但不限于”等)。本领域技术人员会进一步理解，如果打算列举特定数目的介绍的权利要求，权利要求中会明确地列举这样的意图，在不存在这样的列举时，不存在这样的意图。例如，为了帮助理解，以下所附的权利要求可以含有介绍性短语的使用“至少一种一个”和“一种或多种/一个或多个”来介绍权利要求列举。然而，这样的短语的使用不应该被理解为暗示通过不定冠词“a”或“an”介绍的权利要求列举将含有这样介绍的权利要求列举的任何特定的权利要求局限于仅含有一个这样的列举的实施方式，即使相同的权利要求包括介绍性短语“一种或多种/一个或多个”或“至少一种/至少一个”和不定冠词如“a”或“an”(例如“a”和/或“an”应该被理解为“至少一种/至少一个”或“一种或多种/一个或多个”)；这对于用于介绍权利要求列举的定冠词也是适用的。另外，虽然明确地列举了特定数目的介绍的权利要求列举，但是本领域技术人员会认识到，这样的列举应该被解释为意思是至少列举的数目(例如不加修饰的列举“两种列举”而没有其他修饰词，是指至少两种列举，或两种或更多种列举)。此外，在使用的类似于“A、B和C的至少一种，等”的惯用语的情况下，通常这样的结构意指在本领域技术人员会理解惯用语(例如“具有A、B和C的至少一种的系统”会包括但不限于具有单独的A、单独的B、单独的C、A和B一起、A和C一起、B和C一起和/或A、B和C一起等的系统)的意义上说。在使用类似于“A、B或C的至少一种，等”的惯用语的情况下。通常这样的结构意指本领域技术人员会理解惯用语(例如“具有A、B或C的至少一种的系统”会包括但不限于具有单独的A、单独的B、单独的C、A和B一起、A和C一起、B和C一起和/或A、B和C一起等的系统)的意义上说。本领域技术人员会进一步理解，无论在说明书、权利要求或附图中，几乎任何的呈现两个或更多个可供选择的术语的分隔的词语和/或短语应该被理解为考虑包括术语的一个，两个术语的任何一个或两个术语的可能性。例如，短语“A或B”会被理解为包括“A”或“B”或“A和B”的可能性。
另外，在本公开的特征或方面以马库什群组的方式描述的情况下，本领域技术人员会认识到，由此本公开也以马库什群组的任何个体成员或亚组成员描述。
正如本领域技术人员会理解的，出于任意目的和所有目的，如以提供书面描述的方式，本文公开的所有范围也涵盖任意和所有可能的亚范围和其亚范围的组合。任何列出的范围可以被容易地识别为充分描述该范围以及使该范围能够分解为至少相同的两部分、三部分、四部分、五部分、十部分等。作为非限制性实例，本文描述的每个范围容易被分解为下三分之一、中三分之一和上三分之一等。正如本领域技术人员也会理解的，如“高达”“至少”“大于”和“小于”等的所有语言包括列举的数目，并且是指可以随后分解为上文讨论的亚范围的范围。最后，正如本领域技术人员会理解的，具有1～3个项目的组是指具有1、2或3个项目的组。相似地，具有1～5个项目的组是指具有1、2、3、4或5个项目的组，等等。
虽然本文已经公开了各种方面和实施方式，其他方面和实施方式对本领域技术人员会变得明显。本文公开的各种方面和实施方式用于举例说明性目的，而不意图限制，通过以下权利要求说明准确的范围和精神。

Claims (13)

1.一种用于改善人的行为表现的方法，所述方法包括：
鉴定具有肠道微生物群标签的人受试者，所述肠道微生物群标签包括至少500种不同的微生物物种；和
将有效量的一种或多种拟杆菌属(Bacteroides)细菌施用于所述人受试者。
2.权利要求1所述的方法，其进一步包括将所述人受试者的肠道微生物群标签鉴定为成人肠道微生物群标签。
3.权利要求1至2中任一项所述的方法，其中，所述受试者患有焦虑、自闭症谱系障碍(ASD)、精神分裂症或具有ASD或精神分裂症的症状中的一种或多种的病理状态。
4.权利要求1至3中任一项所述的方法，其中，所述有效量的一种或多种拟杆菌属(Bacteroides)细菌包括脆弱拟杆菌(B.fragilis)。
5.权利要求1至3中任一项所述的方法，其中，所述有效量的一种或多种拟杆菌属细菌包括脆弱拟杆菌、多形拟杆菌(B.thetaiotaomicron)、普通拟杆菌(B.vulgatus)或列出的细菌的两种或三种的混合物。
6.权利要求1至5中任一项所述的方法，其进一步包括将一定量的肠球菌属(Enterococcus)细菌施用于受试者。
7.权利要求1至5中任一项所述的方法，其中，所述方法中施用于受试者的单独活性成分基本上由一种或多种拟杆菌属细菌组成。
8.权利要求1至5中任一项或权利要求7所述的方法，其中，所述方法中施用于受试者的单独活性成分基本上由脆弱拟杆菌组成。
9.权利要求1至7中任一项所述的方法，其中，所述有效量的一种或多种拟杆菌属细菌在基本上不含除了拟杆菌属细菌以外的细菌的组合物中。
10.权利要求1至9中任一项所述的方法，其中，所述有效量的拟杆菌属细菌在基本上不含除了脆弱拟杆菌以外的细菌的组合物中。
11.权利要求1至10中任一项所述的方法，其中，所述有效量的一种或多种拟杆菌属细菌经口服施用。
12.权利要求1至11中任一项所述的方法，其中，改善行为表现包括改善交流行为、重复行为、焦虑或列出的这些行为中的两种或三种的组合。
13.权利要求1至12中任一项所述的方法，其中，所述人受试者是成人。
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