CN107001444A - 识别eb病毒短肽的t细胞受体 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种能够结合源自于EB病毒潜伏膜蛋白(LMP‑2)肽的T细胞受体(TCR),所述肽以SSCSSCPLSK‑HLA A1101复合物的形式被呈递。本发明还提供了编码所述TCR的核酸分子、包含所述核酸分子的载体以及转导所述TCR的细胞。
Description
本发明涉及能够识别源自EB病毒(Epstein Barr virus,EBV)抗原的TCR,本发明还涉及转导上述TCR来获得的EBV特异性的T细胞,及他们在预防和治疗EBV相关疾病中的用途。
EBV是全球范围普遍存在的一种人类疱疹病毒。研究显示,超过95%的成年人体内含有针对这种病毒的抗体,这也就意味着他们在某一阶段被这种病毒感染过。大多数被感染过的人的体内一生都会存在EBV,一般很少出现问题。然而,在某些情况下,EBV与一些癌症的发生相关,包括伯基特淋巴瘤(Burkitt’s lymphoma)、霍奇金淋巴瘤(Hodgkin lymphoma)、EBV阳性移植后淋巴增生病(PTLD)或鼻咽癌等。比如,LMP1和LMP2是属于EBV的潜伏期膜蛋白,会被多数鼻咽癌细胞表达(Raab-Traub N.Epstein-Barr virus in the pathogenesis of NPC[J].Semin Cancer Biol,2002,12(6):431-441.)。对于上述疾病的治疗,可以采用化疗和放射性治疗等方法,但都会对自身的正常细胞造成损害。
T细胞过继免疫治疗是将对靶细胞抗原具有特异性的反应性T细胞转入病人体内,使其针对靶细胞发挥作用。T细胞受体(TCR)是T细胞表面的一种膜蛋白,其能够识别相应的靶细胞抗原。在免疫系统中,通过抗原特异性的TCR与短肽-主组织相容性复合体(pMHC复合物)的结合引发T细胞与抗原呈递细胞(APC)直接的物理接触,然后T细胞及APC两者的其他细胞膜表面分子就发生相互作用,引起一系列后续的细胞信号传递和其他生理反应,从而使得不同抗原特异性的T细胞对其靶细胞发挥免疫效应。因此,本领域技术人员致力于分离出对EBV抗原具有特异性的TCR,以及将该TCR转导T细胞来获得对EBV抗原具有特异性的T细胞,从而使他们在细胞免疫治疗中发挥作用。
发明内容
本发明的目的是提供一种能够结合SSCSSCPLSK-HLA A1101复合物的TCR,以及编码所述TCR的核酸分子和包含所述核酸分子的载体。另外,本发明还提供了转导本发明TCR的细胞。
在本发明的第一方面,提供了一种TCR,其包含TCRα链可变域和TCRβ链可变域,并且所述TCRα链可变域包含3个互补决定区(CDR):
αCDR1:TTSDR (SEQ ID NO:10)
αCDR2:LLSNGAV (SEQ ID NO:11)和
αCDR3:AISTGFQKLV (SEQ ID NO:12)和/或所述TCRβ链可变域包含3个互补决定区:
βCDR1:SNHLY (SEQ ID NO:13)
βCDR2:FYNNEI (SEQ ID NO:14)和
βCDR3:ASSEGPSGSSYEQY (SEQ ID NO:15)。
在另一优选例中,所述TCR能够特异性结合源自于EB病毒(Epstein Barr Virus)潜伏膜蛋白(LMP-2)的短肽。
在另一优选例中,所述短肽为:SSCSSCPLSK。
在另一优选例中,所述TCR能够特异性结合SSCSSCPLSK-HLA A1101复合物。
在另一优选例中,所述TCRα链可变域包含与SEQ ID NO:1具有至少90%,优选地至少95%,更优选地至少98%序列相同性的氨基酸序列;
在另一优选例中,所述TCRβ链可变域包含与SEQ ID NO:5具有至少90%,优选地至少95%,更优选地至少98%序列相同性的氨基酸序列。
在另一优选例中,所述TCR包含α链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:1。
在另一优选例中,所述TCR包含β链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:5。
在另一优选例中,所述TCR为αβ异质二聚体。
在另一优选例中,所述TCR的α链氨基酸序列为SEQ ID NO:3。
在另一优选例中,所述TCR的β链氨基酸序列为SEQ ID NO:7。
在另一优选例中,所述TCR是可溶的。
在另一优选例中,半胱氨酸残基在所述TCR的α和β链恒定域之间形成人工二硫键。
在另一优选例中,在所述TCR中形成人工二硫键的半胱氨酸残基取代了选自下列的一组或多组位点:
TRAC*01外显子1的Thr48和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser57;
TRAC*01外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser77;
TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser17;
TRAC*01外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Asp59;
TRAC*01外显子1的Ser15和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu15;
TRAC*01外显子1的Arg53和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser54;
TRAC*01外显子1的Pro89和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ala19;和
TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu20。
在另一优选例中,所述TCR为单链。
在另一优选例中,所述TCR是由α链可变域与β链可变域通过肽连接序列连接而成。
在另一优选例中,所述TCR在α链可变区氨基酸第11、13、19、21、53、76、89、91、或第94位,和/或α链J基因短肽氨基酸倒数第3位、倒数第5位或倒数第7位中具有一个或多个突变;和/或所述TCR在β链可变区氨基酸第11、13、19、21、53、76、89、91、或第94位,和/或β链J基因短肽氨基酸倒数第2位、倒数第4位或倒数第6位中具有一个或多个突变,其中氨基酸位置编号按IMGT(国际免疫遗传学信息系统)中列出的位置编号。
在另一优选例中,在所述TCR的α链和/或β链的C-或N-末端结合有偶联物。
在另一优选例中,与所述TCR结合的偶联物为可检测标记物、治疗剂、PK修饰部分或其组合。
优选地,所述可检测标记物包括:荧光或发光标记物、放射性标记物、MRI(磁共振成像)或CT(电子计算机X射线断层扫描技术)造影剂、或能够产生可检测产物的酶。
优选地,所述治疗剂包括:放射性核素、生物毒素、细胞因子(如IL-2等)、抗体、抗体Fc片段、抗体scFv片段、金纳米颗粒/纳米棒、病毒颗粒、脂质体、纳米磁粒、前药激活酶(例如,DT-心肌黄酶(DTD)或联苯基水解酶-样蛋白质(BPHL))、化疗剂(例如,顺铂)或任何形式的纳米颗粒等。
在另一优选例中,与所述T细胞受体结合的治疗剂为连接于所述TCR的α或β链的C-或N-末端的抗-CD3抗体或任何与CD3特异性结合的蛋白质、小分子化合物或有机大分子化合物。
在本发明的第二方面,提供了一种核酸分子,所述核酸分子包含编码本发明第一方面中任一所述的T细胞受体或其互补序列。
在另一优选例中,所述核酸分子包含编码TCRα链可变域的核苷酸序列SEQ ID NO:2。
在另一优选例中,所述核酸分子包含编码TCRβ链可变域的核苷酸序列SEQ ID NO:6。
在另一优选例中,所述核酸分子包含编码TCRα链的核苷酸序列SEQ ID NO:4和/或包含编码TCRβ链的核苷酸序列SEQ ID NO:8。
在本发明的第三方面,提供了一种载体,所述的载体含有本发明第二方面中任一所述的核酸分子。
在另一优选例中,所述的载体为病毒载体。
在另一优选例中,所述的载体为慢病毒载体。
在本发明的第四方面,提供了一种分离的宿主细胞,所述的宿主细胞中含有本发明第三方面中任一所述的载体或染色体中整合有外源的本发明第二方面中任一所述的核酸分子。
在本发明的第五方面,提供了一种细胞,所述细胞转导本发明第二方面中任一所述的核酸分子或本发明第三方面中任一所述载体。
在另一优选例中,所述细胞为T细胞。
在另一优选例中,所述细胞为干细胞。
在本发明的第六方面,提供了一种药物组合物,其特征在于,所述组合物含有药学上可接受的载体以及本发明第一方面中任一所述的TCR、或本发明第二方面任一所述的核酸分子、或本发明第五方面中任一所述的细胞。
在本发明的第七方面,提供了本发明第一方面中任一项所述的T细胞受体或本发明第五方面中任一所述的细胞的用途,其特征在于,用于制备治疗肿瘤
或HCV病毒感染的药物。
在本发明的第八方面,提供了一种治疗疾病的方法,其特征在于,包括给需要治疗的对象施用适量的本发明第一方面中任一所述的TCR、或本发明第五方面中所述的细胞或本发明第六方面中所述的药物组合物。
在另一优选例中,所述的疾病为EBV阳性霍奇金淋巴瘤、EBV阳性鼻咽癌、EBV阳性移植后淋巴增生病或伯基特淋巴瘤。
应理解,在本发明范围内中,本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具体描述的各技术特征之间都可以互相组合,从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅,在此不再一一累述。
图1a、图1b、图1c和图1d分别为TCRα链可变域氨基酸序列、TCRα链可变域核苷酸序列、TCRα链氨基酸序列和TCRα链核苷酸序列。
图2a、图2b、图2c和图2d分别为TCRβ链可变域氨基酸序列、TCRβ链可变域核苷酸序列、TCRβ链氨基酸序列和TCRβ链核苷酸序列。
图3为单克隆细胞的CD8+及EBV-四聚体-PE双阳性染色结果。
图4为四聚体染色TCR转导的原代T细胞的实验结果图。
图5为TCR-转导的T细胞对靶细胞特异性地激活反应的ELISPOT实验结果图。
图6为通过非放射性细胞毒性实验检测本发明TCR转导的T细胞对负载EBV LMp2A 340-349 SSCSSCPLSK短肽特异性靶细胞和非特异性靶细胞的杀伤作用的实验结果图。
图7为通过不同靶细胞负载短肽检测效应细胞特异性杀伤能力的实验结果图。
本发明人经过广泛而深入的研究,找到了与EBV抗原LMP-2A 340-349(SSCSSCPLSK)(SEQ ID NO:9)能够特异性结合的TCR,所述抗原以SSCSSCPLSK-HLA A1101复合物的形式被呈递。本发明还提供了编码所述TCR的核酸分子以及包含所述核酸分子的载体。另外,本发明还提供了转导本发明TCR的细胞。
术语
T细胞受体(TCR),是由α链/β链或者γ链/δ链以异质二聚体形式存在的细胞膜表面的糖蛋白。在95%的T细胞中TCR异质二聚体由α和β链组成,而5%的T细胞具有由γ和δ链组成的TCR。天然αβ异质二聚TCR具有α链和β链,α链和β链构成αβ异源二聚TCR的亚单位。广义上讲,α和β各链包含可变区、连接区和恒定区,β链通常还在可变区和连接区之间含有短的多变区,但该多变区常视作连接区的一部分。各可变区包含嵌合在框架结构(framework regions)中的3个CDR(互补决定区),CDR1、CDR2和CDR3。
CDR区决定了TCR与pMHC复合物的结合,其中CDR3由可变区和连接区重组而成,被称为超变区。TCR的α和β链一般看作各有两个“结构域”即可变域和恒定域,可变域由连接的可变区和连接区构成。此外,TCR的α和β链还包含跨膜区和胞质区,胞质区很短。
LMP-2是指两种与EB病毒相关的病毒蛋白,LMP-2A和LMP-2B,它们是发挥阻断酪氨酸激酶信号传导作用的跨膜蛋白。
MHC分子是免疫球蛋白超家族的蛋白质,可以是Ⅰ类或Ⅱ类MHC分子。因此,其对于抗原的呈递具有特异性,不同的个体有不同的MHC,能呈递一种蛋白抗原中不同的短肽到各自的APC细胞表面。人类的MHC通常称为HLA基因或HLA复合体。
在本发明的一个优选例中,本发明的TCR分子的恒定域是人的恒定域。本领域技术人员知晓或可以通过查阅相关书籍或IMGT(国际免疫遗传学信息系统)的公开数据库来获得人的恒定域氨基酸序列。例如,本发明TCR分子α链的恒定域序列可以为“TRAC*01”,TCR分子β链的恒定域序列可以为“TRBC1*01”或“TRBC2*01”。IMGT的TRAC*01中给出的氨基酸序列的第53位为Arg,在此表示为:TRAC*01外显子1的Arg53,其他以此类推。
在本发明中,术语“本发明多肽”、“本发明的TCR”、“本发明的T细胞受体”可互换使用。
发明详述
TCR分子
在抗原加工过程中,抗原在细胞内被降解,然后通过MHC分子携带至细胞表面。T细胞受体能够识别抗原呈递细胞表面的肽-MHC复合物。因此,本发明的第一方面提供了一种能够特异性结合SSCSSCPLSK-HLA A1101复合物的TCR分子。优选地,所述TCR分子是分离的或纯化的。该TCR的α和β链各具有3个互补决定区(CDR)。
α链包含具有以下氨基酸序列的CDR:
α CDR1-TTSDR (SEQ ID NO:10)
α CDR2-LLSNGAV (SEQ ID NO:11)
α CDR3-AISTGFQKLV (SEQ ID NO:12)
β链包含具有以下氨基酸序列的CDR:
β CDR1-SNHLY (SEQ ID NO:13)
β CDR2-FYNNEI (SEQ ID NO:14)
β CDR3-ASSEGPSGSSYEQY (SEQ ID NO:15)
可以将上述本发明的CDR区氨基酸序列嵌入到任何适合的框架结构中来制备嵌合TCR。只要框架结构与本发明的TCR的CDR区兼容,本领域技术人员根据本发明公开的CDR区就能够设计或合成出具有相应功能的TCR分子。因此,本发明TCR分子是指包含上述α和/或β链CDR区序列及任何适合的框架结构的TCR分子。
在本发明的一个优选例中,本发明的TCR分子是由α与β链构成的异质二聚体。具体地,一方面所述异质二聚TCR分子的α链包含可变域和恒定域,所述α链可变域氨基酸序列包含上述α链的CDR1(SEQ ID NO:10)、CDR2(SEQ
ID NO:11)和CDR3(SEQ ID NO:12)。优选地,所述TCR分子包含α链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:1。更优选地,所述TCR分子的α链可变域氨基酸序列为SEQ ID NO:1。另一方面,所述异质二聚TCR分子的β链包含可变域和恒定域,所述β链可变域氨基酸序列包含上述β链的CDR1(SEQ ID NO:13)、CDR2(SEQ ID NO:14)和CDR3(SEQ ID NO:15)。优选地,所述TCR分子包含β链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:5。更优选地,所述TCR分子的β链可变域氨基酸序列为SEQ ID NO:5。
在本发明的一个优选例中,本发明的TCR分子是由α链的部分或全部和/或β链的部分或全部组成的单链TCR分子。有关单链TCR分子的描述可以参考文献Chung et al(1994)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91,12654-12658。根据文献中所述,本领域技术人员能够容易地构建包含本发明CDRs区的单链TCR分子。具体地,所述单链TCR分子包含Vα、Vβ和Cβ,优选地按照从N端到C端的顺序连接。或者,所述单链TCR分子由Vα、Vβ和连接序列(linker)构成,如专利文献PCT/CN2014/080773中所述。所述单链TCR分子的α链可变域氨基酸序列包含上述α链的CDR1(SEQ ID NO:10)、CDR2(SEQ ID NO:11)和CDR3(SEQ ID NO:12)。优选地,所述单链TCR分子包含α链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:1。更优选地,所述单链TCR分子的α链可变域氨基酸序列为SEQ ID NO:1。所述单链TCR分子的β链可变域氨基酸序列包含上述β链的CDR1(SEQ ID NO:13)、CDR2(SEQ ID NO:14)和CDR3(SEQ ID NO:15)。优选地,所述单链TCR分子包含β链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:5。更优选地,所述单链TCR分子的β链可变域氨基酸序列为SEQ ID NO:5。
在本发明的一个优选例中,本发明的TCR分子的恒定域是人的恒定域。本领域技术人员知晓或可以通过查阅相关书籍或IMGT(国际免疫遗传学信息系统)的公开数据库来获得人的恒定域氨基酸序列。优选地,本发明TCR分子α链的氨基酸序列为SEQ ID NO:3,和/或β链的氨基酸序列为SEQ ID NO:7。
天然存在的TCR是一种膜蛋白,通过其跨膜区得以稳定。如同免疫球蛋白(抗体)作为抗原识别分子一样,TCR也可以被开发应用于诊断和治疗,这时需要获得可溶性的TCR分子。可溶性的TCR分子不包括其跨膜区。可溶性TCR有很广泛的用途,它不仅可用于研究TCR与pMHC的相互作用,也可用作检测感染的诊断工具或作为自身免疫病的标志物。类似地,可溶性TCR可以被用来将治疗剂(如细胞毒素化合物或免疫刺激性化合物)输送到呈递特异性抗原的细胞,另外,可溶性TCR还可与其他分子(如,抗-CD3抗体)结合来重新定向T细胞,从而使其靶向呈递特定抗原的细胞。本领域技术人员知晓获得可溶性TCR的方法。
为获得可溶性TCR,一方面,本发明TCR可以是在其α和β链恒定域的残基之间引入人工二硫键的TCR。半胱氨酸残基在所述TCR的α和β链恒定域间形成人工链间二硫键。半胱氨酸残基可以取代在天然TCR中合适位点的其他氨基酸残基以形成人工链间二硫键。二硫键的位置以及制备可溶性TCR的方法可以参考文献(Jonathan M.Boulter etal.,2003,Protein Engineering 16(9):707-711)以及专利文献PCT/CN2015/093806。例如,取代TRAC*01外显子1的Thr48和取代TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser57的半胱氨酸残基来形成二硫键。引入半胱氨酸残基以形成二硫键的其他位点还可以是:TRAC*01
外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser77;TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser17;TRAC*01外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Asp59;TRAC*01外显子1的Ser15和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu15;TRAC*01外显子1的Arg53和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser54;TRAC*01外显子1的Pro89和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ala19;或TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu20。即半胱氨酸残基取代了上述α与β链恒定域中任一组位点。可在本发明TCR恒定域的一个或多个C末端截短最多50个、或最多30个、或最多15个、或最多10个、或最多8个或更少的氨基酸,以使其不包括半胱氨酸残基来达到缺失天然二硫键的目的,也可通过将形成天然二硫键的半胱氨酸残基突变为另一氨基酸来达到上述目的。
如上所述,本发明的TCR可以包含在其α和β链恒定域的残基间引入的人工二硫键。应注意,恒定域间含或不含上文所述的引入的人工二硫键,本发明的TCR均可含有TRAC恒定域序列和TRBC1或TRBC2恒定域序列。TCR的TRAC恒定域序列和TRBC1或TRBC2恒定域序列可通过存在于TCR中的天然二硫键连接。
为获得可溶性TCR,另一方面,本发明TCR还包括在其疏水芯区域发生突变的TCR,这些疏水芯区域的突变优选为能够使本发明可溶性TCR的稳定性提高的突变,如在公开号为WO2014/206304的专利文献中所述。这样的TCR可在其下列可变域疏水芯位置发生突变:(α和/或β链)可变区氨基酸第11,13,19,21,53,76,89,91,94位,和/或α链J基因(TRAJ)短肽氨基酸位置倒数第3,5,7位,和/或β链J基因(TRBJ)短肽氨基酸位置倒数第2,4,6位,其中氨基酸序列的位置编号按国际免疫遗传学信息系统(IMGT)中列出的位置编号。本领域技术人员知晓上述国际免疫遗传学信息系统,并可根据该数据库得到不同TCR的氨基酸残基在IMGT中的位置编号。
另外,本发明的TCR还可以是包含衍生自超过一种物种序列的杂合TCR。例如,有研究显示鼠科TCR在人T细胞中比人TCR能够更有效地表达。因此,本发明TCR可包含人可变域和鼠的恒定域。这一方法的缺陷是可能引发免疫应答。因此,在其用于过继性T细胞治疗时应当有调节方案来进行免疫抑制,以允许表达鼠科的T细胞的植入。
应理解,本文中氨基酸名称采用国际通用的单英文字母标识,与其相对应的氨基酸名称三英文字母简写分别是:Ala(A)、Arg(R)、Asn(N)、Asp(D)、Cys(C)、Gln(Q)、Glu(E)、Gly(G)、His(H)、Ile(I)、Leu(L)、Lys(K)、Met(M)、Phe(F)、Pro(P)、Ser(S)、Thr(T)、Trp(W)、Tyr(Y)、Val(V);
核酸分子
本发明的第二方面提供了编码本发明第一方面TCR分子或其部分的核酸分子,所述部分可以是一个或多个CDR,α和/或β链的可变域,以及α链和/或β链。
编码本发明第一方面TCR分子α链CDR区的核苷酸序列如下:
α CDR1-accacttcagacaga (SEQ ID NO:16)
α CDR2-ttgctatcaaatggagcagtg (SEQ ID NO:17)
α CDR3-gccatctcaacaggctttcagaaacttgta (SEQ ID NO:18)
编码本发明第一方面TCR分子β链CDR区的核苷酸序列如下:
β CDR1-tctaatcacttatac (SEQ ID NO:19)
β CDR2-ttttataataatgaaatc (SEQ ID NO:20)
β CDR3-gccagcagtgaaggccctagcgggagctcctacgagcagtac (SEQ ID NO:21)
因此,编码本发明TCRα链的本发明核酸分子的核苷酸序列包括SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:18,和/或编码本发明TCRβ链的本发明核酸分子的核苷酸序列包括SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20和SEQ ID NO:21。优选地,编码本发明TCRα链的本发明核酸分子的核苷酸序列包括SEQ ID NO:2和/或编码本发明TCRβ链的本发明核酸分子的核苷酸序列包括SEQ ID NO:6。更优选地,本发明核酸分子的核苷酸序列为SEQ ID NO:4和/或SEQ ID NO:8。
本发明核酸分子的核苷酸序列可以是单链或双链的,该核酸分子可以是RNA或DNA,并且可以包含或不包含内含子。一般情况下,本发明核酸分子的核苷酸序列不包含内含子但能够编码本发明多肽。应理解,由于遗传密码的简并,不同的核苷酸序列可以编码相同的多肽。因此,编码本发明TCR的核酸序列可以与本发明附图中所示的核酸序列相同或是简并的变异体。以本发明中的其中一个例子来说明,“简并的变异体”是指编码具有SEQ ID NO:1的蛋白序列,但与SEQ ID NO:2的序列有差别的核酸序列。
核苷酸序列可以是经密码子优化的。不同的细胞在具体密码子的利用上是不同的,可以根据细胞的类型,改变序列中的密码子来增加表达量。哺乳动物细胞以及多种其他生物的密码子选择表是本领域技术人员公知的。
本发明的核酸分子全长序列或其片段通常可以用但不限于PCR扩增法、重组法或人工合成的方法获得。目前,已经可以完全通过化学合成来得到编码本发明TCR(或其片段,或其衍生物)的DNA序列。然后可将该DNA序列引入本领域中已知的各种现有的DNA分子(或如载体)和细胞中。DNA可以是编码链或非编码链。
载体
本发明还涉及包含本发明的核酸分子的载体,包括表达载体,即能够在体内或体外表达的构建体。常用的载体包括细菌质粒、噬菌体和动植物病毒。
病毒递送系统包括但不限于腺病毒载体、腺相关病毒(AAV)载体、疱疹病毒载体、逆转录病毒载体、慢病毒载体、杆状病毒载体。
优选地,载体可以将本发明的核苷酸转移至细胞中,例如T细胞中,使得该细胞表达EBV特异性的TCR。理想的情况下,该载体应当能够在T细胞中持续高水平地表达。
细胞
本发明还涉及用本发明的载体或编码序列经基因工程产生的宿主细胞。所述宿主细胞中含有本发明的载体或染色体中整合有本发明的核酸分子。宿主细胞选自:原核细胞和真核细胞,例如大肠杆菌、酵母细胞、CHO细胞等。
另外,本发明还包括表达本发明的TCR的分离的细胞,特别是T细胞。该
T细胞可衍生自从受试者分离的T细胞,或者可以是从受试者中分离的混合细胞群,诸如外周血淋巴细胞(PBL)群的一部分。如,该细胞可以分离自外周血单核细胞(PBMC),可以是CD4+辅助T细胞或CD8+细胞毒性T细胞。该细胞可在CD4+辅助T细胞/CD8+细胞毒性T细胞的混合群中。一般地,该细胞可以用抗体(如,抗-CD3或抗-CD28的抗体)活化,以便使它们能够更容易接受转染,例如用包含编码本发明TCR分子的核苷酸序列的载体进行转染。
备选地,本发明的细胞还可以是或衍生自干细胞,如造血干细胞(HSC)。将基因转移至HSC不会导致在细胞表面表达TCR,因为干细胞表面不表达CD3分子。然而,当干细胞分化为迁移至胸腺的淋巴前体(lymphoid precursor)时,CD3分子的表达将启动在胸腺细胞的表面表达该引入的TCR分子。
有许多方法适合于用编码本发明TCR的DNA或RNA进行T细胞转染(如,Robbins等.,(2008)J.Immunol.180:6116-6131)。表达本发明TCR的T细胞可以用于过继免疫治疗。本领域技术人员能够知晓进行过继性治疗的许多合适方法(如,Rosenberg等.,(2008)Nat Rev Cancer8(4):299-308)。
EBV相关疾病
本发明还涉及在受试者中治疗和/或预防与EBV相关疾病的方法,其包括过继性转移EBV特异性T细胞至该受试者的步骤。该EBV特异性T细胞可识别SSCSSCPLSK-HLA A1101复合物。
EBV特异性的T细胞可用于治疗任何呈递抗原LMP-2A 340-349(SSCSSCPLSK)的EBV相关疾病。包括但不限于伯基特淋巴瘤(Burkitt’s lymphoma)、EBV阳性霍奇金淋巴瘤、EBV阳性鼻咽癌或EBV阳性移植后淋巴增生病(PTLD)。
伯基特淋巴瘤是非洲赤道区域最常见的儿童恶性肿瘤。遗传研究已显示在非洲赤道区域的绝大多数伯基特淋巴瘤源自EBV感染的淋巴细胞。某些地理区域和患者人群中,在高至50%的伯基特淋巴瘤病例中发现了EBV遗传材料。
鼻咽癌是指发生于鼻咽腔顶部和侧壁的恶性肿瘤。是中国高发恶性肿瘤之一,发病率为耳鼻咽喉恶性肿瘤之首。免疫学和生物化学研究证实EB病毒与鼻咽癌关系密切。
移植后淋巴增生病(PTLD)是指可能在器官移植后的人中形成的一种疾病。EBV病毒与大多数PTLD病例有牵连。表现形式可以是不同的,从血液中淋巴细胞数量的增加到血细胞恶性生长,如B细胞淋巴瘤。
治疗方法
可以通过分离患有EBV相关疾病的病人或志愿者的T细胞,并将本发明的TCR导入上述T细胞中,随后将这些基因工程修饰的细胞回输到病人体内来进行治疗。因此,本发明提供了一种治疗EBV相关疾病的方法,包括将分离的表达本发明TCR的T细胞,优选地,该T细胞来源于病人本身,输入到病人体内。一般地,包括(1)分离病人的T细胞,(2)用本发明核酸分子或能够编码本发明TCR分子的核酸分子体外转导T细胞,(3)将基因工程修饰的T细胞输入到病人体内。分离、转染及回输的细胞的数量可以由医师决定。
本发明的主要优点在于:
(1)本发明的TCR能够与EBV抗原LMP-2A 340-349(SSCSSCPLSK)(SEQ ID NO:9)特异性结合,同时转导了本发明TCR的细胞能够被特异性激活并且对靶细胞具有很强的杀伤性。
下面的具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件,例如(Sambrook和Russell等人,分子克隆:实验室手册(Molecular Cloning-A Laboratory Manual)(第三版)(2001)CSHL出版社)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。除非另外说明,否则百分比和份数按重量计算。除非另外说明,否则百分比和份数按重量计算。以下实施例中所用的实验材料和试剂如无特别说明均可从市售渠道获得。
实施例1 克隆EBV特异性T细胞
利用合成短肽EBV LMp2A 340-349 SSCSSCPLSK(北京赛百盛基因技术有限公司)刺激来自于基因型为HLA-A1101的健康志愿者的外周血淋巴细胞(PBL)。将EBV LMp2A 340-349 SSCSSCPLSK短肽与带有生物素标记的HLA-A*1101复性,制备pHLA单倍体。这些单倍体与用PE标记的链霉亲和素(BD公司)组合成PE标记的四聚体,分选该四聚体及抗-CD8-APC双阳性细胞。扩增分选的细胞,并按上述方法进行二次分选,随后用有限稀释法进行单克隆。单克隆细胞用四聚体染色,筛选到的双阳性克隆如图3所示。
实施例2 获取EBV特异性T细胞克隆的TCR基因与载体的构建
用Quick-RNATM MiniPrep(ZYMO research)抽提实施例1中筛选到的EBV LMp2A 340-349特异性、HLA-A1101限制性的T细胞克隆的总RNA。cDNA的合成采用clontech的SMART RACE cDNA扩增试剂盒,采用的引物是设计在在人类TCR基因的C端保守区。将序列克隆至T载体(TAKARA)上进行测序。经测序,该双阳性克隆表达的TCR的α链和β链序列结构分别如图1和图2所示,图1a、图1b、图1c和图1d分别为TCRα链可变域氨基酸序列、TCRα链可变域核苷酸序列、TCRα链氨基酸序列和TCRα链核苷酸序列;图2a、图2b、图2c和图2d分别为TCRβ链可变域氨基酸序列、TCRβ链可变域核苷酸序列、TCRβ链氨基酸序列和TCRβ链核苷酸序列。
经鉴定,α链包含具有以下氨基酸序列的CDR:
α CDR1-TTSDR (SEQ ID NO:10)
α CDR2-LLSNGAV (SEQ ID NO:11)
α CDR3-AISTGFQKLV (SEQ ID NO:12)
β链包含具有以下氨基酸序列的CDR:
β CDR1-SNHLY (SEQ ID NO:13)
β CDR2-FYNNEI (SEQ ID NO:14)
β CDR3-ASSEGPSGSSYEQY (SEQ ID NO:15)。
通过重叠(overlap)PCR分别将TCRα链和β链的全长基因克隆至慢病毒表达载体pLenti(addgene)。具体为:用overlap PCR将TCRα链和TCRβ链的全长基因进行连接得到TCRα-2A-TCRβ片段。将慢病毒表达载体及TCRα
-2A-TCRβ酶切连接得到pLenti-EBVTRA-2A-TRB-IRES-NGFR质粒。作为对照用,同时也构建表达eGFP的慢病毒载体pLenti-eGFP。之后再用293T/17包装假病毒。
实施例3 EBV特异性T细胞受体慢病毒包装与原代T细胞转染EBV TCR
(a)通过293T/17细胞的快速介导瞬时转染(Express-In-mediated transient transfection)制备慢病毒
利用第三代慢病毒包装系统包装含有编码所需TCR的基因的慢病毒。利用快速介导瞬时转染(Express-In-mediated transient transfection)(开放生物系统公司(Open Biosystems)),用4种质粒(含有实施例2所述pLenti-EBVTRA-2A-TRB-IRES-NGFR的一种慢病毒载体,以及含有构建传染性但非复制型慢病毒颗粒所必需的其他组分的3种质粒)转染293T/17细胞。
为进行转染,第0天种细胞,在15厘米培养皿,种上1.7×107个293T/17细胞,使细胞均匀分布在培养皿上,汇合度略高于50%。第1天转染质粒,包装pLenti-EBVTRA-2A-TRB-IRES-NGFR和pLenti-eGFP假病毒,将以上表达质粒与包装质粒pMDLg/pRRE,pRSV-REV和pMD.2G混匀,一个15厘米直径平皿的用量如下:22.5微克:15微克:15微克:7.5微克。转染试剂PEI-MAX与质粒的比例是2:1,每个平皿的使用量为114.75微克。具体操作为:把表达质粒与包装质粒加入1800微升OPTI-MEM((吉布可公司(Gibco),目录号31985-070)培养基中混合均匀,室温静置5分钟成为DNA混合液;取相应量PEI与1800微升OPTI-MEM培养基混合均匀,室温静置5分钟成为PEI混合液。把DNA混合液和PEI混合液混合在一起并在室温静置30分钟,再添加3150微升OPTI-MEM培养基,混合均匀后加入到已经转换成11.25毫升OPTI-MEM的293T/17细胞中,轻轻晃动培养皿,使培养基混合均匀,37℃/5%CO2下培养。转染5-7小时,去除转染培养基,换成含有10%胎牛血清的DMEM((吉布可公司(Gibco),目录号C11995500bt))完全培养基,37℃/5%CO2下培养。第3和第4天收集含有包装的慢病毒的培养基上清。为收获包装的慢病毒,把所收集到的培养上清3000g离心15分钟去除细胞碎片,再经0.22微米过滤器(默克密理博(Merck Millipore),目录号SLGP033RB)过滤,最后用50KD截留量的浓缩管(默克密理博(Merck Millipore),目录号UFC905096)进行浓缩,除去大部分上清液,最后浓缩到1毫升,等分分装后-80℃冻存。取假病毒样品进行病毒滴度测定,步骤参照p24 ELISA(Clontech,目录号632200)试剂盒说明书。作为对照用,同时也包转pLenti-eGFP的假病毒。
(b)用含有EBV特异性T细胞受体基因的慢病毒转导原代T细胞
从健康志愿者的血液中分离到CD8+T细胞,再用包装的慢病毒转导。计数这些细胞,在48孔板中,在含有50IU/ml IL-2和10ng/ml IL-7的含10%FBS(吉布可公司(Gibco),目录号C10010500BT)的1640(吉布可公司(Gibco),目录号C11875500bt)培养基中以1×106个细胞/毫升(0.5毫升/孔)与预洗涤的抗CD3/CD28抗体-包被小珠(T细胞扩增物,life technologies,目录号11452D)共孵育过夜刺激,细胞:珠=3:1。
刺激过夜后,根据p24 ELISA试剂盒所测到的病毒滴度,按MOI=10的比例加入已浓缩的EBV特异性T细胞受体基因的慢病毒,32℃,900g离心感染1小时。感染完毕后去除慢病毒感染液,用含有50IU/ml IL-2和10ng/ml IL-7
的含10%FBS的1640培养基重悬细胞,37℃/5%CO2下培养3天。转导3天后计数细胞,稀释细胞至0.5×106个细胞/毫升。每两天计数一次细胞,替换或加入含有50IU/ml IL-2和10ng/ml IL-7的新鲜培养基,维持细胞在0.5×106-1×106个细胞/毫升。从第3天开始通过流式细胞术分析细胞,从第5天开始用于功能试验(例如,IFN-γ释放的ELISPOT和非放射性细胞毒性检测)。从第10天开始或在细胞减缓分裂和尺寸变小之时,冷冻储存等分细胞,至少4×106个细胞/管(1×107个细胞/毫升,90%FBS/10%DMSO)。
(c)四聚体染色TCR转导的原代T细胞
EBV LMp2A 340-349 SSCSSCPLSK短肽与带有生物素标记的HLA-A*1101复性,制备pHLA单倍体。这些单倍体用PE标记的链霉亲和素(BD)组合成PE标记的四聚体,称为EBV-tetramer-PE。此四聚体能把表达了EBV特异性T细胞受体基因的T细胞标记为阳性细胞。把(b)中经转染的T细胞样品与EBV-tetramer-PE在冰上孵育30分钟,然后加入anti-CD8-APC(biolegend)抗体,继续冰上孵育15分钟。样品用含有2%FBS的PBS清洗2次后用BD Calibur或BD Arial检测或分选表达了EBV特异性T细胞受体基因的EBV-tetramer-PE和CD8双阳性的T细胞,数据分析采用CellQuest软件(BD)或者FlowJo软件(Tree Star Inc,Ashland,OR)分析。
经检测分析,结果如图4所示,用EBV-tetramer-PE和抗CD8抗体染色后,未经TCR慢病毒感染的NC组T细胞无EBV-tetramer-PE阳性细胞,而经TCR慢病毒感染的T细胞出现较多表达TCR的EBV-tetramer-PE阳性细胞(EBV tetramer组),当用非EBV-tetramer-PE的其他tetramer-PE(Nonspecific tetramer组)染色时只有少量非特异性的阳性细胞。
实施例4 转导本发明TCR的T细胞的特异性激活实验
ELISPOT方案
进行以下试验以证明TCR-转导的T细胞对靶细胞特异性的激活反应。利用ELISPOT试验检测的IFN-γ产量作为T细胞激活的读出值。
试剂
试验培养基:10%FBS(吉布可公司(Gibco),目录号16000-044),RPMI 1640(吉布可公司(Gibco),目录号C11875500bt)
洗涤缓冲液:0.01M PBS/0.05%吐温20
PBS(吉布可公司(Gibco),目录号C10010500BT)
PVDF ELISPOT 96孔板(默克密理博(Merck Millipore),目录号MSIPS4510)
人IFN-γELISPOT PVDF-酶试剂盒(BD)装有所需的所有其他试剂(捕捉和检测抗体,链霉亲和素-碱性磷酸酶和BCIP/NBT溶液)
方法
靶细胞制备
本实施例的靶细胞为Epstein-Barr病毒(EBV)转化的永生化淋巴母细胞系(LCL)。B95-8细胞经十四酰乙酸佛波醇酯(TPA)诱导生产含有EBV的培养基上清,4℃/600g离心10分钟去除杂质,然后过0.22微米过滤器,等分分装-70℃保存。从基因型为HLA-A11/A02/A24的健康志愿者的外周血淋巴细胞(PBL),取10毫升浓度为2×107/毫升的PBL悬浮液于25平方厘米的培养瓶中,加入环孢霉素后在37℃/CO2培养箱中孵育1小时,快速解冻一份EBV,按
1/10稀释加入到上述细胞中,轻轻摇匀并把培养瓶直立置于37℃/CO2培养箱中培养。培养12天后添加10毫升培养基继续培养,约30天后进一步扩大培养并进行流式检测,其中CD19+CD23hiCD58+为永生化淋巴母细胞系(LCL)。本ELISPOT试验以HLA-A11为靶细胞。
效应细胞制备
本试验的效应细胞(T细胞)是实施例3中经流式细胞术分析表达EBV特异性TCR的CD8+T细胞,并以同一志愿者的CD8+T作为阴性对照效应细胞。用抗CD3/CD28包被珠(T细胞扩增物,life technologies)刺激T细胞,用携带EBV特异性TCR基因的慢病毒转导(依据实施例3),在含有50IU/ml IL-2和10ng/ml IL-7的含10%FBS的1640培养基扩增直至转导后9-12天,然后将这些细胞置于试验培养基中,300g常温离心10分钟进行洗涤。然后将细胞以2×所需终浓度重悬在试验培养基中。同样处理阴性对照效应细胞。
ELISPOT
按照生产商提供的说明书,如下所述准备孔板:以每块板10毫升无菌PBS按1:200稀释抗人IFN-γ捕捉抗体,然后将100微升的稀释捕捉抗体等分加入各孔。4℃下孵育孔板过夜。孵育后,洗涤孔板以除去多余的捕捉抗体。加入100微升/孔含有10%FBS的RPMI 1640培养基并在室温下温育孔板2小时以封闭孔板。然后从孔板中洗去培养基,通过在纸上轻弹和轻拍ELISPOT孔板以除去任何残余的洗涤缓冲液。
EBV CD8+T细胞(EBV TCR转导的T细胞,效应细胞)、CD8+T细胞(阴性对照效应细胞)和LCL细胞(靶细胞)依据实施例3所述制备,LCL包括特异性靶细胞LCL-A11(基因型为HLA-A11的LCL细胞)和非特异性靶细胞LCL-A24(基因型为HLA-A24的LCL细胞)并在相应实验组加入对应短肽,其中PEBV为LMp2A 340-349 SSCSSCPLSK短肽,PA24为非EBV TCR特异结合短肽。
然后采用以下顺序将试验的诸组分加入ELISPOT孔板:
130微升靶细胞77000个细胞/毫升(得到总共约10000个靶细胞/孔)。
50微升效应细胞(1000个EBV TCR阳性T细胞)。
20微升10-4摩尔/升的EBV LMp2A 340-349 SSCSSCPLSK/PA24短肽溶液(终浓度为10-5摩尔/升)。
所有孔一式三份制备添加。
然后温育孔板过夜(37℃/5%CO2)第二天,弃培养基,用双蒸水洗涤孔板2次,再用洗涤缓冲液洗涤3次,在纸巾上轻拍以除去残余的洗涤缓冲液。然后用含有10%FBS的PBS稀释检测一抗,按100微升/孔加入各孔。室温下温育孔板2小时,再用洗涤缓冲液洗涤3次,在纸巾上轻拍孔板以除去过量的洗涤缓冲液。
用含有10%FBS的PBS按1:10000稀释链霉亲和素-碱性磷酸酶,将100微升稀释的链霉亲和素-碱性磷酸酶加入各孔并在室温下温育孔板1小时。然后用洗涤缓冲液洗涤3次PBS洗涤2次,在纸巾上轻拍孔板以除去过量的洗涤缓冲液和PBS。洗涤完毕后加入试剂盒提供的BCIP/NBT溶液100微升/孔进行显影。在显影期间用锡箔纸覆盖孔板避光,静置5-15分钟。在此期间常规检测显影孔板的斑点,确定终止反应的最佳时间。去除BCIP/NBT溶液并用双蒸水冲洗孔板以中止显影反应,甩干,然后将孔板底部去除,在室温下干燥孔板
直至每个孔完全干燥,再利用免疫斑点平板计数计(CTL,细胞技术有限公司(Cellular Technology Limited))计数孔板内底膜形成的斑点。
结果
通过ELISPOT试验(如上所述)检验EBV TCR转导的T细胞对负载EBV LMp2A 340-349 SSCSSCPLSK短肽特异性靶细胞和非特异性靶细胞起反应的IFN-γ释放。利用graphpad prism6绘制各孔中观察到的ELSPOT斑点数量。
实验结果如图5所示,转导本发明TCR的T细胞仅对特定基因型的负载其特异的短肽的靶细胞有激活反应,而对其他非特异靶细胞基本没有激活反应。同时,也可以看出未转导本发明TCR的T细胞的激活反应很差。
实施例5 转导本发明TCR的T细胞的非放射性细胞毒性试验
该试验是51Cr释放细胞毒性试验的比色替代试验,定量测定细胞裂解后释放的乳酸脱氢酶(LDH)。采用30分钟偶联的酶反应来检测释放在培养基中的LDH,在酶反应中LDH可使一种四唑盐(INT)转化为红色的甲臜(formazan)。生成的红色产物的量与裂解的细胞数成正比。可以用标准的96孔读板计收集490nm可见光吸光值数据。
材料
CytoTox非放射性细胞毒性检测(普罗迈格公司,G1780)含有底物混合物、试验缓冲液、裂解溶液和终止缓冲液。
试验培养基:10%FBS(热灭活的,吉布可公司(Gibco)),含酚红的90%RPMI 1640(吉布可公司(Gibco),目录号C11875500bt),1%青霉素/链霉素(吉布可公司,目录号15070-063)。
微孔圆底96孔组织培养板(纽克公司(Nunc),目录号163320)
96孔免疫平板Maxisorb(纽克公司(Nunc),目录号442404)
方法
靶细胞制备
该试验所用的靶细胞LCL与实施例4的ELISPOT方案中的靶细胞制备方法一样,本方案中用到的靶细胞包括LCL-A11、LCL-A02(基因型为HLA-A02的LCL细胞)和LCL-A24。在试验培养基中制备靶细胞:靶细胞浓度调至3×105个/毫升,每孔取50微升从而得1.5×104个细胞/孔。
效应细胞制备
本试验的效应细胞(T细胞)是实施例3中经流式细胞术分析表达EBV特异性TCR的CD8+T细胞。效应细胞与靶细胞之比采用1:1(3×105个/毫升,每孔取50微升从而得1.5×104个细胞/孔)。
短肽溶液制备
LMp2A 340-349 SSCSSCPLSK短肽用含10%FBS的RPMI 1640培养基通过10倍稀释依次稀释成10-4M-10-12M的工作液,使其加入到实验组后最终浓度梯度为10-5M-10-13M。
(a)通过靶细胞负载不同浓度的短肽检测效应细胞杀伤能力
试验准备
采用以下顺序将试验的诸组分加入微孔圆底96孔组织培养板:
-50ul靶细胞(如上所述制备)加入各孔
-50ul效应细胞(如上所述制备)加入各孔
-12ul短肽溶液加入各孔
-8ul培养补入孔(不负载短肽实验组直接补20ul培养基)。
如下所述制备对照组:
-不负载短肽实验组(未处理的LCL-A11):含有50ul效应细胞和50ul靶细胞。
-效应细胞自发释放:仅有50ul效应细胞。
-靶细胞自发释放:仅有50ul靶细胞。
-靶细胞最大释放:仅有50ul靶细胞。
-试剂培养基对照:仅有120ul培养基。
所有孔一式三份制备,终体积为120ul(不够的用培养基补足)。
37℃温育24小时。收集所有孔上清前,将靶细胞最大释放对照孔在-70℃放置细胞大约30分钟,再在37℃融化15分钟,以使靶细胞全部裂解。
在250g离心平板4分钟。将试验平板各孔的50ul上清液转移至96孔免疫平板Maxisorb板的相应孔。利用试验缓冲液(12ml)重建底物混合物,然后加50ul至平板各孔。平板盖上盖子后在阴暗处室温温育30分钟。将50ul终止溶液加入平板各孔以终止反应。加入终止溶液后1小时内计数记录490nm的吸光度。
计算结果
从实验组、靶细胞自发释放组和效应细胞自释放组的所有吸光度值中扣除培养基背景的吸光度值。
将上述中获得的经过校正的值带入下面公式,计算每个效靶比所产生的细胞毒性百分比。
%细胞毒性=100×(实验-效应细胞自发-靶细胞自发)/(靶细胞最大-靶细胞自发)
结果
通过非放射性细胞毒性检测(如上所述)检验EBV TCR转导的T细胞对负载EBV LMp2A 340-349 SSCSSCPLSK短肽特异性靶细胞和非特异性靶细胞起反应的LDH释放。利用graphpad prism6绘制各孔中490nm可见光吸光值。
实验数据统计结果如图6所示,在10-5M-10-13M的短肽浓度范围内EBV CD8+T细胞随着短肽浓度的升高,其对靶细胞LCL-A11的杀伤作用增强;对不负载短肽的靶细胞LCL-A11无杀伤作用。
(b)通过不同靶细胞负载短肽检测效应细胞特异性杀伤能力
靶细胞制备
LCL-A11、LCL-A02和LCL-A24三种靶细胞加入10-5M LMp2A 340-349 SSCSSCPLSK(PEBV)短肽,37℃温育2小时。去除含短肽的培养基,用新的试验培养基重悬细胞至3×105个/毫升,每孔取50微升从而得1.5×104个细胞/孔。另设三种靶细胞不负载短肽作为空白对照组。
效应细胞制备
本试验的效应细胞(T细胞)是实施例3中经流式细胞术分析表达EBV特异性TCR的CD8+T细胞。效应细胞与靶细胞之比采用1:1(3×105个/毫升,每孔取50微升从而得1.5×104个细胞/孔)。
试验准备
采用以下顺序将试验的诸组分加入微孔圆底96孔组织培养板:
-50ul靶细胞(如上所述制备)加入各孔
-50ul效应细胞(如上所述制备)加入各孔
如下所述制备对照组:
-不负载短肽实验组:含有50ul效应细胞和50ul靶细胞。
-效应细胞自发释放:仅有50ul效应细胞。
-靶细胞自发释放:仅有50ul靶细胞。
-靶细胞最大释放:仅有50ul靶细胞。
-试剂培养基对照:仅有100ul培养基。
所有孔一式三份制备,终体积为120ul(不够的用培养基补足)。
细胞培养、样品处理及检测和计算结果方法与本实施例(a)试验一样。
结果
图7显示EBV CD8+T细胞对负载了短肽LMp2A 340-349 SSCSSCPLSK(PEBV)的LCL-A11靶细胞的特异性杀伤作用。而对不负载短肽或负载短肽的其他靶细胞无明显杀伤作用。
在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考,就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解,在阅读了本发明的上述讲授内容之后,本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改,这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。
Claims (24)
- 一种T细胞受体(TCR),其特征在于,其包含TCRα链可变域和TCRβ链可变域,所述TCRα链可变域包含3个互补决定区(CDR):αCDR1:TTSDR(SEQ ID NO:10)αCDR2:LLSNGAV(SEQ ID NO:11)和αCDR3:AISTGFQKLV(SEQ ID NO:12)和/或所述TCRβ链可变域包含3个互补决定区:βCDR1:SNHLY(SEQ ID NO:13)βCDR2:FYNNEI(SEQ ID NO:14)和βCDR3:ASSEGPSGSSYEQY(SEQ ID NO:15)。
- 如权利要求1所述的TCR,其特征在于,所述TCRα链可变域包含与SEQ ID NO:1具有至少90%序列相同性的氨基酸序列;和/或所述TCRβ链可变域包含与SEQ ID NO:5具有至少90%序列相同性的氨基酸序列。
- 如权利要求1或2所述的TCR,其特征在于,所述TCR包含α链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:1。
- 如权利要求1-3中任一所述的TCR,其特征在于,所述TCR包含β链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:5。
- 如以上任一权利要求所述TCR,其特征在于,所述TCR为αβ异质二聚体。
- 如权利要求5所述的TCR,其特征在于,其包含TCRα链恒定区TRAC*01和TCRβ链恒定区TRBC1*01或TRBC2*01。
- 如权利要求6中所述的TCR,其特征在于,所述TCR的α链氨基酸序列为SEQ ID NO:3。
- 如权利要求6或7中所述TCR,其特征在于,所述TCR的β链氨基酸序列为SEQ ID NO:7。
- 如权利要求1-6中任一所述TCR,其特征在于,所述TCR是可溶的。
- 如权利要求9所述的TCR,其特征在于,半胱氨酸残基在所述TCR的α和β链恒定域之间形成人工二硫键。
- 如权利要求10所述的TCR,其特征在于,在所述TCR中形成人工二硫键的半胱氨酸残基取代了选自下列的一组或多组位点:TRAC*01外显子1的Thr48和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser57;TRAC*01外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser77;TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser17;TRAC*01外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Asp59;TRAC*01外显子1的Ser15和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu15;TRAC*01外显子1的Arg53和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser54;TRAC*01外显子1的Pro89和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ala19;和TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu20。
- 如权利要求9所述的TCR,其特征在于,所述TCR为单链。
- 如权利要求12所述的TCR,其特征在于,所述TCR是由α链可变域与β链可变域通过肽连接序列连接而成。
- 如权利要求13所述的TCR,其特征在于,所述TCR在α链可变区氨基酸第11、13、19、21、53、76、89、91、或第94位,和/或α链J基因短肽氨基酸倒数第3位、倒数第5位或倒数第7位中具有一个或多个突变;和/或所述TCR在β链可变区氨基酸第11、13、19、21、53、76、89、91、或第94位,和/或β链J基因短肽氨基酸倒数第2位、倒数第4位或倒数第6位中具有一个或多个突变,其中氨基酸位置编号按IMGT(国际免疫遗传学信息系统)中列出的位置编号。
- 一种核酸分子,其特征在于,所述核酸分子包含编码上述任一权利要求所述的TCR分子的核酸序列或其互补序列。
- 如权利要求15所述的核酸分子,其特征在于,其包含编码TCRα链可变域的核苷酸序列SEQ ID NO:2。
- 如权利要求15或16所述的核酸分子,其特征在于,其包含编码TCRβ链可变域的核苷酸序列SEQ ID NO:6。
- 如权利要求15-17中任一所述的核酸分子,其特征在于,其包含编码TCRα链的核苷酸序列SEQ ID NO:4和/或包含编码TCRβ链的核苷酸序列SEQ ID NO:8。
- 一种载体,其特征在于,所述的载体含有权利要求15-18中任一所述的核酸分子;优选地,所述的载体为病毒载体;更优选地,所述的载体为慢病毒载体。
- 一种分离的宿主细胞,其特征在于,所述的宿主细胞中含有权利要求19中所述的载体或染色体中整合有外源的权利要求15-18中任一所述的核酸分子。
- 一种细胞,其特征在于,所述细胞转导权利要求15-18中任一所述的核酸分子或权利要求19中所述载体;优选地,所述细胞为T细胞或干细胞。
- 一种药物组合物,其特征在于,所述组合物含有药学上可接受的载体以及权利要求1-14中任一项所述的TCR、或权利要求15-18中任一所述的核酸分子、或权利要求21中所述的细胞。
- 权利要求1-14中任一项所述的T细胞受体或权利要求21中所述的细胞的用途,其特征在于,用于制备治疗肿瘤或EB病毒感染的药物。
- 一种治疗疾病的方法,其特征在于,包括给需要治疗的对象施用适量的权利要求1-14中任一所述的TCR、或权利要求21中所述的细胞或权利要求22中所述的药物组合物;优选地,所述的疾病为EBV阳性霍奇金淋巴瘤、EBV阳性鼻咽癌、EBV阳性移植后淋巴增生病或伯基特淋巴瘤。
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