CN106874512B

CN106874512B - 一种生物分析平台中的工程师信息推送方法

Info

Publication number: CN106874512B
Application number: CN201710127282.5A
Authority: CN
Inventors: 白丽军; 杨斌; 李山; 周炜; 蒋瑞; 胡涛; 李良波; 翟洋; 康泷; 文琳
Original assignee: Chengdu Life Baseline Technology Co ltd
Current assignee: Chengdu Life Baseline Technology Co ltd
Priority date: 2017-03-06
Filing date: 2017-03-06
Publication date: 2020-07-21
Anticipated expiration: 2037-03-06
Also published as: CN106874512A

Abstract

本发明公开了一种生物分析平台中的工程师信息推送方法包括：步骤1：生物信息分析工程师在生物分析平台中输入业务技能信息；步骤2：生物信息分析工程师在生物分析平台中输入成功项目信息，生物分析平台提取出生物信息分析工程师的分析技能特征信息；步骤3：用户在生物分析服务平台上发布生物信息分析的项目需求后，生物分析平台智能匹配出相应的生物信息分析工程师进行信息推送；步骤4：生物分析平台自动匹配出相应的生物信息分析工程师进行信息，并将匹配出的生物信息分析工程师信息推送给用户，实现了通过本方法能够快速准确的推送给用户需要的生物信息分析工程师的技术效果。

Description

一种生物分析平台中的工程师信息推送方法

技术领域

本发明涉及生物分析研究领域，具体地，涉及一种生物分析平台中的工程师信息推送方法。

背景技术

从事生命科学的科研人员在明确了生物信息分析目标后，首先会设计一个生物信息分析方案，之后需要找最合适的生物信息分析工程师来进行数据分析。生物信息分析工作量大且对专业知识和技能要求较高，在实际工作中，很难联系到有这种分析项目经验、或者了解该领域的工程师，也没有一个便捷的方法将生物信息分析需求信息精确推送给最合适的工程师。

因此，在传统的过程中科研人员往往通过别人介绍或者自己寻找，或者采用中介的形式来联系生物信息分析工程师，采用上述方式效率较低，且对生物信息分析工程师没有足够的了解，对其生物信息分析技能无法确定，导致分析质量也无法保障，影响研究效果。

综上所述，本申请发明人在实现本申请发明技术方案的过程中，发现上述技术至少存在如下技术问题：

在现有技术中，现有的科研人员在寻求生物信息分析工程师时存在效率较低，且无法获得生物信息分析工程师准确信息，生物信息分析质量无法保障的技术问题。

发明内容

本发明提供了一种生物分析平台中的工程师信息推送方法，解决了现有的科研人员在寻求生物信息分析工程师时存在效率较低，且无法获得生物信息分析工程师准确信息，生物信息分析质量无法保障的技术问题，实现了通过本方法能够快速准确的推送给用户需要的生物信息分析工程师，且能够获得准确的生物信息分析工程师的技能信息，便于用户快速准确的寻找到对应的高质量的生物信息分析工程师，保障生物信息分析质量的技术效果。

为解决上述技术问题，本申请提供了一种生物分析平台中的工程师信息推送方法，所述方法包括：

步骤1：生物信息分析工程师在生物分析平台中输入业务技能信息，生物分析平台对生物信息分析工程师输入的业务技能信息进行存储；

步骤2：生物信息分析工程师在生物分析平台中输入成功项目信息，生物分析平台分析输入的成功项目信息，基于项目的分析类型和成功项目信息，提取出生物信息分析工程师的分析技能特征信息，其中，分析技能特征信息用于代表生物信息分析工程师的分析技能能力；

步骤3：用户在生物分析服务平台上发布生物信息分析的项目需求后，一方面可选择浏览生物信息分析工程师信息后进行预约；另一方面可选择由生物分析平台智能匹配出相应的生物信息分析工程师进行信息推送；

步骤4：用户选择由生物分析平台智能匹配后，生物分析平台自动匹配出相应的生物信息分析工程师进行信息，并将匹配出的生物信息分析工程师信息推送给用户。

其中，生物信息分析工程师和用户均可以生物分析平台进行注册，在注册时，生物信息分析工程师就可以输入自己的相关业务技能信息，用户注册后就可以在平台上寻找相应的已经注册的生物信息分析工程师。

进一步的，业务技能信息包括：生物信息分析类型和每种分析类型下的具体业务技能。

进一步的，所述步骤2具体包括：

步骤2.1：基于输入的成功项目信息，生物分析平台提取对应的生物信息分析类型；

步骤2.2：对每一种生物信息分析类型，查询生物云平台中分析流程所对应的软件名称，基于查询获得的软件名称，生成生物信息分析工程师的分析技能特征信息。

进一步的，所述方法还包括步骤5：用户在发布需求时选择生物信息分析项目由团队或者单位完成，生物分析平台中智能匹配出相应的团队或者单位，并将匹配出的团队或者单位信息推送给，团队或者单位由多个相应的生物信息分析工程师组成。

进一步的，在将生物信息分析工程师信息推送给用户时，按照下列顺序进行先后推送：

首先推送与该用户有过合作关系的生物信息分析工程师；

其次推送完成过该物种和该类型的成功项目的生物信息分析工程师；

其次推送拥有与项目相应业务技能的生物信息分析工程师；

其次推送拥有与项目相应分析技能特征信息的生物信息分析工程师。

本发明采用特征智能匹配的形式，通过分析生物信息工程师的成功项目经验，提取每个工程师在生物信息分析的技能特征，针对某个具体的生物信息分析项目，结合科研人员、项目类型等特点，快速、精确的将项目需求推送给最合适的工程师。

生物分析平台中项目信息的推送过程描述如下：

1、工程师输入自己的业务技能；

2、工程师录入自己的成功项目经验，平台自动分析项目内容，根据项目的不同分析类型，提取标志工程师分析能力的技能特征；

3、科研人员在生物分析服务平台上发布一个生物信息分析的项目需求，可浏览工程师后进行预约，也可以由平台智能匹配进行信息推送；

4、平台在智能匹配时，按照是否近期承接过该科研人员项目、是否完成过该物种和该类型的成功项目经验、是否拥有承担该项目的业务技能、是否拥有该分析项目的技能特征的优先顺序，自动向满足条件的工程师推送消息。推送方式包括短信、邮件、微信等；

5、平台在智能匹配时，如果科研人员在发布需求时明确该生物信息分析项目必须由团队或者单位承接，则平台按照以上优先顺序向满足条件的团队或者单位推送消息。

虽然本申请中的推送方式较为常见，但是本申请中推送的过程和相应的信息为本申请的重点，本申请的发明人通过对生物信息分析进行研究，并通过大量的实验研究出如何通过生物信息分析工程师的信息提取出相应的技能特征信息，以及研发出了相应的生物分析平台智能匹配方式和推送顺序，这与传统的人工寻找生物信息分析工程师和简单的推送有本质的区别，具有明显的技术效果和优点。

本申请提供的一个或多个技术方案，至少具有如下技术效果或优点：

实现了通过本方法能够快速准确的推送给用户需要的生物信息分析工程师，且能够获得准确的生物信息分析工程师的技能信息，便于用户快速准确的寻找到对应的高质量的生物信息分析工程师，保障生物信息分析质量的技术效果。

附图说明

此处所说明的附图用来提供对本发明实施例的进一步理解，构成本申请的一部分，并不构成对本发明实施例的限定；

图1是本申请中生物分析平台中的工程师信息推送方法的示意图；

图2是本申请中输入业务技能的选择路径的示意图；

图3是本申请中Genebang_RNAref-rep_Pipeline流程示意图。

具体实施方式

为了能够更清楚地理解本发明的上述目的、特征和优点，下面结合附图和具体实施方式对本发明进行进一步的详细描述。需要说明的是，在相互不冲突的情况下，本申请的实施例及实施例中的特征可以相互组合。

在下面的描述中阐述了很多具体细节以便于充分理解本发明，但是，本发明还可以采用其他不同于在此描述范围内的其他方式来实施，因此，本发明的保护范围并不受下面公开的具体实施例的限制。

请参考图1，本申请提供了一种生物分析平台中的工程师信息推送方法，所述方法包括：

具体实施过程如下：

步骤1：生物信息分析工程师设置自己的业务技能；

(1)设置自己擅长的生物信息分析类型。分析类型包括DNA、RNA、蛋白质组学、代谢组学4种大类，每种大类包括多个具体小的类型，例如RNA大类下包括真核转录组测序、原核转录组测序、表达谱、原核链特异转录组测序、Small RNA测序、长链非编码RNA测序、降解组测序、CircRNA测序等；

(2)设置每种分析类型下的具体业务技能。例如当工程师设置自己擅长的生物信息分析类型为“RNA”下的“CircRNA测序”时，可设置针对该类型具体擅长的业务技能为“标准化分析”包括：数据过滤质控及统计、参考基因组比对及统计、CircRNA鉴定及分析统计、CircRNA表达分析、来源基因鉴定、来源基因的功能注释，“个性化分析”包括：基因和miRNA共表达分析、cicRNA与miRNA互作分析等。设置业务技能的选择路径图如图2所示。

步骤2：工程师录入自己的成功项目经验，平台自动分析项目内容，根据项目的不同分析类型，提取标志工程师分析能力的技能特征

(1)对工程师的每一个成功项目经验，提取对应的生物信息分析类型。

(2)对每一种生物信息分析类型，查询基因帮生物云平台中标准化分析流程所对应的软件名称，将这些软件作为工程师熟悉的技能特征。

例如：工程师录入了一个成功项目经验，其中一个分析类型为“真核转录组测序”，该分析类型在基因帮生物云平台上有多个分析流程，其中一个的标准化分析流程为“Genebang_RNAref-rep_Pipeline”，该流程的包括多个模块，软件包括SOAPnuke、Hisat2、Bowtie2、Samtools、RSEM、GATK、StringTie、rMATS，就将这些软件就作为工程师熟悉的技能特征。“Genebang_RNAref-rep_Pipeline”流程如图3所示。其中filter模块主要软件为SOAPnuke，Hisat_genome模块的主要软件为Hisat2、Samtools，expression_rsem模块主要软件为Bowtie2、Samtools……

步骤3：科研人员在生物分析服务平台上发布一个生物信息分析的项目需求，可浏览工程师后进行预约，也可以由平台智能匹配进行信息推送；

(1)当科研人员通过多种筛选条件选择工程师进行预约后，则平台只向预约的工程师推送信息；

(2)当科研人员选择由平台进行智能匹配，则平台通过步骤4、步骤5进行信息推送。

步骤4：平台在智能匹配时，按照以下规则的优先顺序，自动向满足条件的前多少名工程师推送消息。推送方式包括短信、邮件、微信等；

(1)是否近期承接过该科研人员项目；

(2)是否完成过该物种和该类型的成功项目经验；

(3)是否拥有承担该项目分析类型的业务技能；

(4)是否拥有进行该分析项目的技能特征。

按以上规则的优先顺序选择排名前50名工程师，向他们推送消息。

例如：科研人员需要针对某个物种进行转录组测序及分析，选择由平台进行智能匹配推送给对应的工程师。平台首先选择最近一年内承担过该科研人员生物信息分析的工程师，再选择完成过该物种转录组分析的工程师，再选择个人业务技能中设置有RNA转录组测序的工程师，再选择拥有SOAPnuke、Hisat2、Bowtie2、RSEM、GATK、StringTie、Rmats技能特征的工程师，选择以上50名工程师，通过短信、邮件、微信等方式进行消息推送。

步骤5：平台在智能匹配时，如果科研人员在发布需求时明确该生物信息分析项目必须由团队或者单位承接，则平台按照步骤4的优先顺序选择拥有以上工程师的团队或者单位，向对应团队或单位的商务人员和工程师推送消息。

尽管已描述了本发明的优选实施例，但本领域内的技术人员一旦得知了基本创造性概念，则可对这些实施例作出另外的变更和修改。所以，所附权利要求意欲解释为包括优选实施例以及落入本发明范围的所有变更和修改。

显然，本领域的技术人员可以对本发明进行各种改动和变型而不脱离本发明的精神和范围。这样，倘若本发明的这些修改和变型属于本发明权利要求及其等同技术的范围之内，则本发明也意图包含这些改动和变型在内。

Claims

1.一种生物分析平台中的工程师信息推送方法，其特征在于，所述方法包括：

步骤1：生物信息分析工程师在生物分析平台中输入业务技能信息，生物分析平台对生物信息分析工程师输入的业务技能信息进行存储；生物信息分析工程师在生物分析平台中设置自己擅长的生物信息分析类型，分析类型包括DNA、RNA、蛋白质组学、代谢组学4种大类，每种大类包括多个具体小的类型；生物信息分析工程师在生物分析平台中设置每种分析类型下的具体业务技能；

所述步骤2具体包括：

步骤2.2：对每一种生物信息分析类型，查询生物云平台中分析流程所对应的软件名称，基于查询获得的软件名称，生成生物信息分析工程师的分析技能特征信息；

2.根据权利要求1所述的生物分析平台中的工程师信息推送方法，其特征在于，业务技能信息包括：生物信息分析类型和每种分析类型下的具体业务技能。

3.根据权利要求1所述的生物分析平台中的工程师信息推送方法，其特征在于，所述方法还包括步骤5：用户在发布需求时选择生物信息分析项目由团队或者单位完成，生物分析平台中智能匹配出相应的团队或者单位，并将匹配出的团队或者单位信息推送给，团队或者单位由多个相应的生物信息分析工程师组成。