CN106170498A - 抗‑light抗体 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及抗人LIGHT抗体、新的医疗用途和方法。

Description

抗-LIGHT抗体
本发明涉及抗人LIGHT抗体、新的医疗用途和方法。
背景
LIGHT(类淋巴毒素，具有可诱导表达并且与HSV糖蛋白D竞争HVEM，即一种由T淋巴细胞表达的受体)是一种与慢性炎症性自身免疫疾病过程有关的潜在细胞因子靶标(Immunity.1998Jan；8(1):21-30,“LIGHT,a new member of the TNF superfamily,andlymphotoxin alpha are ligands for herpesvirus entry mediator”,Mauri DN等)。作为配体TNF超家族(TNFSF)的成员，LIGHT也被称作TNFSF14或CD258。LIGHT以受严格调控的方式在活化时表达于T细胞表面上，其在4小时内出现，在12-24小时达到峰值，而在48小时消失(J Biol Chem.2002Nov 8；277(45):42841-51.Epub 2002Sep 4,“Mechanismsregulating expression of the tumor necrosis factor-related LIGHT gene.Role ofcalcium-signaling pathway in the transcriptional control”,Castellano R等)。然而，LIGHT也以可检测水平组成性地存在于未成熟树突状细胞表面上(JImmunol.2000Apr15；164(8):4105-10,“LIGHT,a TNF-like molecule,costimulates Tcell proliferation and is required for dendritic cell-mediated allogeneic Tcell response”,Tamada K等)及消化道T细胞和天然杀伤(NK)细胞上(J Immunol.2005Jan15；174(2):646-53,“LIGHT is constitutively expressed on T and NK cells in thehuman gut and can be induced by CD2-mediated signalling”,Cohavy O等)。LIGHT通过结合三种TNF超家族受体(包括淋巴毒素β受体(LTβR)(Science.1994Apr29；264(5159):707-10,“A lymphotoxin-beta-specific receptor”,Crowe PD等；J Immunol.1997Oct 1；159(7):3288-98,“Characterization of lymphotoxin-alpha beta complexes on thesurface of mouse lymphocytes”,Browning JL等)、疱疹病毒侵入介体(HVEM)(Cell.1996Nov1；87(3):427-36,“Herpes simplex virus-1entry into cells mediatedby a novel member of the TNF/NGF receptor family”,Montgomery RI等)和诱饵受体3(DcR3)(J Biol Chem.1999May 14；274(20):13733-6,“A newly identified member oftumor necrosis factor receptor superfamily(TR6)suppresses LIGHT-mediatedapoptosis”,Yu KY等))来介导其生物效应。
用抑制性LTβR-Fc融合蛋白处理的小鼠会减轻CD4+CD45RBhigh T细胞转移结肠炎模型的炎性症状，即CD4+T细胞介导的病理(Gastroenterology.1998Dec；115(6):1464-75,“Both the lymphotoxin and tumor necrosis factor pathways are involved inexperimental murine models of colitis”,Mackay F等)。LIGHT的组成型转基因T细胞特异性表达也已证实会导致具有类似人类炎症性肠病(IBD)的类自身免疫性病理的严重肠炎(J Immunol.2005Jun15；174(12):8173-82,“The critical role of LIGHT in promotingintestinal inflammation and Crohn's disease”,Wang J等；J Immunol.2001Dec1；167(11):6330-7,“Constitutive expression of LIGHT on T cells leads to lymphocyteactivation,inflammation,and tissue destruction”,Shaikh RB等；J Immunol.2001Nov1；167(9):5099-105,“The critical role of LIGHT,a TNF family member,in T celldevelopment”,Wang J等；J Clin Invest.2004Mar；113(6):826-35,“Dysregulated LIGHTexpression on T cells mediates intestinal inflammation and contributes to IgAnephropathy”,Wang J等)。当来自LIGHT转基因动物的肠系膜淋巴结细胞转移到RAG-/-时，表达LIGHT的淋巴细胞可诱导类IBD症状(例如人克罗恩氏病(Crohn's disease)、裂隙状溃疡(fissuring ulcer)、回肠炎的细胞因子特征以及结肠性IFN-γ和TNF的增加(JImmunol.2005Jun 15；174(12):8173-82,“The critical role of LIGHT in promotingintestinal inflammation and Crohn's disease”,Wang J等)。在人类疾病中，发现患有活性克罗恩氏病的患者体内的LIGHT表达增加(Cohavy等2005上述；Wang等2005上述；Wang等2004上述；J Immunol.2004Jul 1；173(1):251-8,“LIGHT expression by mucosal Tcells may regulate IFN-gamma expression in the intestine”,Cohavy O等)。也已证实LIGHT在IBD患者消化道T细胞中会升高(Cohavy等2004上述)。遗传证据也证实LIGHT在IBD中的作用(J Immunol.2001Nov 1；167(9):5122-8,“Genomic characterization ofLIGHT reveals linkage to an immune response locus on chromosome19p13.3anddistinct isoforms generated by alternate splicing or proteolysis”,Granger SW等；Am J Hum Genet.2000Jun；66(6):1863-70.Epub 2000Apr 21,“Genomewide search inCanadian families with inflammatory bowel disease reveals two novelsusceptibility loci”,Rioux JD等；Inflamm Bowel Dis.2004May；10(3):173-81,“inflammatory bowel disease is linked to 19p13and associated with ICAM-12,LowJH等；Gastroenterology.2003Feb；124(2):521-36,“The genetics of inflammatorybowel disease”,Bonen DK,Cho JH)。
人LIGHT(hLIGHT)也与移植物抗宿主疾病(GvHD)有关。例如，已证实LIGHT为T细胞提供有效协同刺激活性，从而增强不依赖于B7-CD28途径的Th1细胞因子增殖及产生(参见例如Tamada等2000上述)。以任一抗HVEM单克隆抗体、HVEM-Ig或LTβR融合蛋白阻断LIGHT-HVEM协同刺激作用会抑制同种异体T细胞响应(参见例如Tamada等2000上述；JImmunol.1998Aug 15；161(4):1786-94,“Antibodies to TR2(herpesvirus entrymediator),a new member of the TNF receptor superfamily,block T cellproliferation,expression of activation markers,and production of cytokines”,Harrop JA等)。此外，体内施用LTβR-Ig或鼠类抗LIGHT抗体会抑制鼠类急性GVHD模型中的抗宿主细胞毒性T淋巴细胞(CTL)响应(Nat Med.2000Mar；6(3):283-9,“Modulation of T-cell-mediated immunity in tumor and graft-versus-host disease models throughthe LIGHT co-stimulatory pathway”,Tamada K等)。
炎症性肠病(IBD)-最常见的代表是克罗恩氏病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)-是一类胃肠道炎症性病症，其特征在于对肠内容物抗原的异常免疫反应，该异常免疫反应导致持续炎症状态。参考World J Gastroenterol.2010Sep 14；16(34):4264-71,"Intestinalepithelial cells in inflammatory bowel diseases",Roda G等。炎症性肠病(IBD)的发病机理似乎涉及负责维持肠稳态和口服耐受性的一个或多个元件的原发性缺陷。最重要的元件的代表是肠屏障，一种主要由肠上皮细胞(IEC)形成的复杂系统。IEC在产生粘液和调节其组成上具有积极作用；它们提供能够控制通过肠粘膜的抗原流量的物理屏障。同时，它们能够起到非专职性抗原呈递细胞的作用，方式是通过加工抗原并将抗原直接呈递给肠免疫系统的细胞。另一方面，免疫细胞调控上皮生长和分化，从而在屏障内产生连续的双向交互(cross-talk)。已在IBD中鉴定出屏障功能的若干改变，从粘液特征开始到其组分，从上皮连接到Toll样受体，以及改变的免疫反应。这些缺陷是否为上皮损伤或继发效应的主要导因还尚待了解。作者综述了上皮屏障的可能作用并且具体描述了IEC在IBD发病机理中的作用。
发明概述
本发明提供了用于治疗或预防人类中hLIGHT介导的疾病或病状的抗人LIGHT抗体和片段以及新颖医疗应用。为此，本发明提供：-
一种抗体或其片段，其特异性结合214E hLIGHT并且与选自1C02、13H04和31A10的抗体竞争结合所述hLIGHT。
本发明还提供相关的药物组合物、试剂盒、方法、核酸、载体、宿主细胞和用途。
本发明的其他模式如下。
在第一模式中
一种特异性结合hLIGHT的抗体或其片段，其在一种方法中用于治疗或预防hLIGHT介导的疾病或病状，在所述方法中将所述抗体或片段施用于所述人类，其中所述抗体或片段通过降低下述一项或多项来治疗或预防所述hLIGHT介导的疾病或病状：
a.选自人类的IL-2、TNFα和干扰素γ的细胞因子的分泌；
b.人类的白细胞的增殖；和
c.表达hLIGHT受体的人上皮细胞对hLIGHT的结合。
在第二模式中
一种抗体或其片段，其特异性结合214E hLIGHT并且与选自31A10、29C09、14B09、62C01、13H04、144F05、42A02和117C06的抗体竞争结合所述hLIGHT。
在第三模式中
特异性结合hLIGHT的抗体或片段在制备用于向人类施用，通过降低下述一项或多项来治疗或预防人类中hLIGHT介导的疾病或病状的药剂中的用途：
a.选自人类的IL-2、TNFα和干扰素γ的细胞因子的分泌；
b.人类的白细胞的增殖；和
c.表达hLIGHT受体的人上皮细胞对hLIGHT的结合。
在第四模式中
一种通过降低以下中的一者、多者或全部来治疗或预防hLIGHT介导的疾病或病症的方法：
a.选自人类的IL-2、TNFα和干扰素γ的细胞因子的分泌；
b.人类的白细胞的增殖；和
c.表达hLIGHT的受体的人上皮细胞对hLIGHT的结合；
其中所述方法包括向所述人类施用治疗有效量的特异性结合hLIGHT的抗体或片段。
在第五模式中
一种包含可变结构域的抗体或抗体片段，所述可变结构域
i.特异性结合214E hLIGHT和214K hLIGHT两者，
ii.与包含01C02的可变区的抗体竞争结合214E hLIGHT，并且
iii.不与包含选自01C06和18E04的抗体的可变区的抗体竞争结合214E hLIGHT。
本发明还提供药物组合物、试剂盒、核酸、载体和宿主。
附图简述
图1：
图1示出HT29IL-8细胞因子释放测定中所有8种经鉴定的先导mAb候选物，其中将重组hLIGHT-214E添加到培养物中来诱导通过HT29细胞的IL-8分泌。如果hLIGHT的抗体抑制重组hLIGHT-214E与HT29细胞经由表达于细胞表面上的hLIGHT受体的结合，则此IL-8分泌将被中和。简而言之，用hLIGHT对HT29细胞(一种人结肠直肠腺癌细胞系)进行涂布接种和处理，所述hLIGHT用不同浓度的41个纯化抗体命中物(hit)中的每一种预先温育。选出8个最佳克隆物并描绘于图1中。图1的数据源于单一实验，该单一实验代表至少两次独立实验。
图2：
图2示出与仅第二检测抗体(如灰色柱状图中的填充所示)相比，0.64μg/ml的所有8种先导克隆物与CHO-S-hLIGHT 214E细胞的结合。图中的术语“无抗体”指定的应用是不使用第一抗体但不缺乏第二检测抗体。图2的数据源于单一实验。使同种型对照(小鼠IgG1/κ,Sigma M9269)并行运行以证实特异性(图中最后一组)。
图3：
在如实施例2中所概述的HTRF测定中，测试8种先导抗体中和重组hLIGHT与其受体(人HVEM或人LTβR)结合的能力。图3A示出中和LTβR与重组hLIGHT-214E结合的抗体的先导物组。图3B示出对HVEM与hLIGHT的结合的中和。图3A和图3B均源于单一实验，该单一实验代表至少三次独立实验。在两次测定中均运行同种型对照小鼠IgG1抗体(Sigma M9269)(如A和B组中的圆形填充所示)。
图4：
图4A示出HT29IL-8细胞因子释放测定中两种额外的源自杂交瘤的先导mAb候选物，其中将重组hLIGHT-214E添加到培养物中来诱导通过HT29细胞的IL-8分泌。如果hLIGHT的抗体抑制重组hLIGHT-214E与HT29细胞经由表达于细胞表面上的hLIGHT受体的结合，则此IL-8分泌将被中和。简而言之，用hLIGHT对HT29细胞(一种人结肠直肠腺癌细胞系)进行涂布接种和处理，所述hLIGHT用不同浓度的自杂交瘤上清液纯化的抗体命中物中的每一种预先温育。
图4B示出自单个B细胞(BCT)克隆的两种经鉴定的先导mAb候选物。在两种情况中，数据均源于单一实验，该单一实验代表至少两次独立实验。
图5：
图5示出与仅第二检测抗体(如灰色柱状图中的填充所示)相比，0.64μg/ml的两种额外的源自杂交瘤的先导抗体与CHO-S-hLIGHT 214E细胞的结合。图中的术语“无抗体”指定的应用是不使用第一抗体但不缺乏第二检测抗体。图5的数据源于单一实验。使同种型对照(小鼠IgG1/κ,Sigma M9269)并行运行以证实特异性(图中最后一组)。
图6：
在如实施例2中所概述的HTRF测定中，测试两种额外的源自杂交瘤的抗体中和重组hLIGHT与其受体(人HVEM或人LTβR)结合的能力。图6A示出中和LTβR与重组hLIGHT-214E结合的抗体的先导物组。图6B示出对HVEM与hLIGHT的结合的中和。图6A和图6B均源于单一实验，该单一实验代表至少两次独立实验。在两次测定中均运行同种型对照小鼠IgG1抗体(Sigma M9269)(如填充的圆形所示)。
图6C示出LTβR与hLIGHT的结合的中和，而图6D示出HVEM通过先导BCT mAb与hLIGHT的结合的中和。数据源于单一实验，该单一实验代表两次独立实验。在两次测定中均运行内部(in-house)产生的非结合IgG4(PE)同种型对照(如填充的圆形所示)。
图7：
图7示出SPR测定中抗体与重组人LIGHT-214E和兔LIGHT的结合。在抗人IgG传感器芯片表面上捕获LIGHT抗体，然后使人和兔LIGHT蛋白质通过捕获的mAb。结果表示为随时间推移的响应单位(RU)。人LIGHT传感图为黑色；兔LIGHT传感图为浅灰色。
图8：
在如实施例13中所概述的HTRF测定中，测试最后一组四个抗体中和重组人LIGHT与其受体(人HVEM或人LTβR)结合的能力。图8A示出中和HVEM与重组hLIGHT-214E的结合的抗体的先导物组。图8B示出LTβR与hLIGHT-214E的结合的中和。图8A和图8B均源于单一实验，该单一实验代表两次独立实验。在两次测定中均运行内部产生的非结合IgG4(PE)同种型对照。
图8C示出HT29IL-8释放测定中抗体的先导物组，其中将重组hLIGHT-214E添加到培养物中来诱导通过HT29细胞的IL-8分泌。如果hLIGHT的抗体抑制重组hLIGHT-214E与HT29细胞经由表达于细胞表面上的hLIGHT受体的结合，则此IL-8分泌将被中和。简而言之，用hLIGHT对HT29细胞(一种人结肠直肠腺癌细胞系)进行涂布接种和处理，所述hLIGHT用不同浓度的自杂交瘤上清液纯化的抗体命中物中的每一种预先温育。也运行内部产生的非结合IgG4(PE)同种型对照。
发明详述
本发明提供以下方面。
本发明(例如)对于治疗或预防炎症性肠病，例如UC或CD，或对于治疗或预防气道炎症性疾病或病状有用。在一个实例中，这个方面对于治疗或预防哮喘有用。
1.一种特异性结合hLIGHT的抗体或其片段，其在一种方法中用于治疗或预防hLIGHT介导的疾病或病状，在所述方法中将所述抗体或片段施用于所述人类，其中所述抗体或片段通过降低下述一项或多项来治疗或预防所述hLIGHT介导的疾病或病状：
a.选自人类的IL-2(白细胞介素-2)、TNFα和干扰素γ的细胞因子的分泌；
b.人类的白细胞的增殖；和
c.表达hLIGHT受体的人上皮细胞对hLIGHT的结合。
发明人因而首次将(a)、(b)和(c)的降低鉴定为治疗和/或预防人类中LIGHT介导的疾病和病状的途径并且他们提供了用于此目的的抗体和抗体片段。
在一个实例中，(a)、(b)或(c)的降低或本文公开的任何其他降低是与处于患hLIGHT介导的疾病或病状的风险的人类中的水平相比，降低至少10或20％。在一个实例中，后者是方面1中叙述的施用所述抗体或片段之前的人类，在另一个实例中后者是不同的人类。在一个实例中，所述降低为至少10、20、30、40、50或60％。
在一个实例中，在体外测定中(如以下进一步所解释)，所述抗体或片段能够实现有关细胞因子分泌的降低，因此向人类施用此类抗体或片段导致(a)的降低。
在一个实例中，在体外测定中(如以下进一步所解释)，所述抗体或片段能够实现白细胞(例如，PBMC)增殖的降低，因此向人类施用此类抗体或片段导致(b)的降低。
在一个实例中，在体外测定中(如以下进一步所解释)，所述抗体或片段能够实现表达hLIGHT受体的人上皮细胞对hLIGHT的结合的降低，因此向人类施用此类抗体或片段导致(c)的降低。
另外或可选地，可以使用来自于受治人类的样品进行对所述降低的评估。例如，参考J Clin Immunol.2004Jan；24(1):74-85；“Increased expression of CCL20in humaninflammatory bowel disease”；Kaser A等。该出版物提供了普遍适用的使用组织活检并读出降低的细胞因子水平的技术的实例，降低的细胞因子水平表明体内用抗体处理后细胞因子分泌降低。类似方法可用于测定已经接受本发明抗体的人类中一种或多种细胞因子分泌的降低。技术人员将熟悉评估患者或患者样品中的细胞因子水平的技术，例如通过使用以下的一种或多种：组织活检、免疫组织化学、免疫荧光、组织染色、细胞因子mRNA定量(例如，使用PCR，如TaqmanTM PCR)、细胞因子蛋白质检测和定量(例如，使用细胞因子-特异性工具抗体和定量，如通过ELISA或另一种标准的蛋白质定量技术)。例如，所述疾病或病状为胃肠道的疾病或病状(例如，IBD)时，可进行来自于已经接受本发明抗体的患者的相关肠组织的活检，接着为细胞因子mRNA和/或细胞因子蛋白质定量(例如，使用定量PCR)。将结果与来自于抗体施用之前同一患者的相关活检组织中的细胞因子定量比较或与患有相同疾病或病状，但未接受抗LIGHT治疗或对该疾病或病状的治疗的另一人类患者比较。这样，技术人员可以确定本发明的抗体降低人类受者中细胞因子的分泌。不评估肠组织水平，可以视所述疾病或病状的特性和位置而定，改为使用来自于人类患者的不同组织或样品。例如，所述疾病或病状为气道(例如，肺部)的疾病或病状时，可能取肺部或其他组织样品进行细胞因子评估。可选地，正如对于技术人员将显而易见的那样，可以使用支气管肺泡灌洗(BAL)样品。在另一个实例中，对于一些疾病或病状而言，可以评估取自已经接受本发明抗体的人类的血液、血清或血浆中细胞因子的降低，然后如以上所讨论那样，与接受所述抗体之前的水平比较或与未治人类中的水平比较。
正如本领域中所知，术语“白细胞”包括(例如)淋巴细胞、多形核白细胞和单核细胞中的一种或多种。正如也对技术人员显而易见的那样，术语“单核细胞”包括(例如)外周血单核细胞(PBMC)或单核细胞来源的细胞，例如树突状细胞(DC)。参见，例如Immunobiology.2013Nov；218(11):1392-401.doi:10.1016/j.imbio.2013.07.005.Epub2013Jul25；“Leukoreduction system chambers are an efficient,valid,and economicsource of functional monocyte-derived dendritic cells and lymphocytes”,Pfeiffer IA等。
正如对于技术人员显而易见的那样，可以使用组织活检、染色和组织学技术评估白细胞，例如固有层淋巴细胞(LPL)的增殖。苏木精和伊红染剂(H&E染剂或HE染剂)，例如，在组织学上常用于寻找浸润性淋巴细胞(各种人类组织)并且是组织学上的主要染剂之一。它是医疗诊断中使用最广泛的染剂并且常常是黄金标准，并且同样可以用于按照本发明评估白细胞的增殖。例如，可以获得来自于患有LIGHT介导的疾病或病状或处于LIGHT介导的疾病或病状风险的人类的胃肠道组织(例如，肠组织)，染色并评估LPL浸润的程度。与施用之前得自同一人类的组织或得自尚未接受治疗而处于所述疾病或病状的风险或患有所述疾病或病状的另一人类的组织中的浸润程度相比，可在来自于已经接受本发明抗体的人类的此类组织间做比较。例如，在取自患有IBD的相同(或不同)人类的人肠组织间比较。
例如，可以使用对来自于已经接受了本发明抗体的人类的相关活检组织的体外受体占有率测定，评估表达hLIGHT受体的人上皮细胞对hLIGHT的结合。可以用来自于抗体施用之前的人类或来自于尚未接受治疗但是患有相同疾病或病状或处于相同疾病或病状风险的另一人类的测定组织进行比较。受体占有率测定为技术人员所熟悉。
在Deuring等，“The cell biology of the intestinal epithelium and itsrelation to inflammatory bowel disease”，The International Journal ofBiochemistry&Cell Biology 45(2013)798–806.中综述了肠上皮、其损伤和与炎症性肠病的联系的细胞生物学。炎症性肠病(IBD)是一种影响胃肠道的慢性炎症性病症，明显地发病率越来越高并且倾向于更严重的临床表型。该疾病特征在于对肠腔菌群(luminal flora)的免疫反应放大，表明可能涉及肠内菌群屏障功能的缺乏，并且研究支持这一见解(Cucchiara等，2012；Jostins等，2012；Manichanh等，2012；Salzman等，2007，全部在Deuring等中有引用)。IBD包括两大类：克罗恩氏病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)。CD患者可在其整个胃肠道中具有炎症性病变，而UC患者中的炎症限于结肠。
参考Hisamatsu等(“Immune aspects of the pathogenesis of inflammatorybowel disease”,Pharmacology&Therapeutics 137(2013)283–297)和其中引用的文件。肠上皮细胞起到屏障的作用以防止病原体侵入和抗原流入。IEC产生粘蛋白和三叶因子，其是覆盖肠腔表面的粘液层的重要保护组分。IEC还产生几种类型的抗菌肽如防御素，其是传统的先天免疫机制。因此，对该屏障系统的破坏不但可允许病原性微生物侵入，而且允许共生细菌和食物抗原侵入。IEC还通过几种先天免疫受体如toll样受体(TLR)和NOD作为病原体的感受器，并且产生细胞因子和趋化因子以募集免疫细胞。TLR信号途径诱导IEC中促炎性细胞因子和趋化因子的产生，并且还影响上皮完整性。已经报道了关于IEC和免疫细胞之间交互作用的重要发现。IEC中的NF-κB信号传导在肠免疫稳态中起重要作用(Nenci等，2007；Zaph等，2007)。Nenchiet等报道称，在其IEC中缺乏NEMO(也称为IKKγ)有条件发展自发性结肠炎。在NEMO敲除小鼠中，凋亡IEC的数量增加，导致损坏上皮屏障的完整性。此外，这些小鼠表现出由IEC产生的抗菌防御素肽的产量降低。这些变化导致肠道菌群的转移和先天免疫细胞的募集(Nenci等，2007)。Günther等证明IEC中的半胱天冬酶-8在保护这些细胞免于TNF-α诱导的坏死性细胞死亡中起关键作用。
肉芽肿形成是人克罗恩氏病最重要的病理特征之一。Mizoguchi等证明，F4/80-阳性未成熟CD11c+树突状细胞(DC)产生IL-23并且有助于鼠类结肠炎模型中的肉芽肿形成(Mizoguchi等，2007)。Th1免疫反应在克罗恩氏病中突出。实际上，克罗恩氏病的LP中的CD4+T细胞表达T-bet并且产生大量的干扰素(IFN)-γ(Matsuoka等，2004)。Sakuraba等证明，克罗恩氏病患者的肠系膜淋巴结中的DC强烈促进Th1和Th17免疫反应(Sakuraba等，2009)。肠系膜淋巴结DC有助于IBD发病机理，特别是克罗恩氏病的发病机理。
参考Nat Med.2011May；17(5):596–603.doi:10.1038/nm.2356，“The tumornecrosis factor family member LIGHT is a target for asthmatic airwayremodelling”,Taylor A Doherty等及其组合引用的文件。患有慢性哮喘的个体显示出肺部功能的逐步下降，这被认为是由于气道的结构重塑，其特征在于上皮下纤维化和平滑肌增生。经证实LIGHT会在变应原暴露后在肺部炎症细胞上表达。
细胞因子在疾病和病状中的作用
参考Muzes等，World J Gastroenterol 2012November 7；18(41):5848-5861ISSN1007-9327(印刷)ISSN 2219-2840(在线)，“Changes of the cytokine profile ininflammatory bowel Diseases”。
细胞因子是粘膜相关免疫系统用于维持正常肠稳态必不可少的信号。其有利于炎症发生的特征不平衡可导致疾病状态，如在炎症性肠病(IBD)中观察到的疾病状态，例如克罗恩氏病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)。促炎性细胞因子如IL-1α、IL-1β、IL-2、-6、-8、-12、-17、-23、IFN-γ或TNFα在IBD中的作用与UC和CD的发生和进展相关。常常将CD描述为T-辅助细胞(Th)1介导的疾病的原型，这是因为主要炎症介质为Th1细胞因子如白细胞介素(IL)-12、干扰素(IFN)-γ和肿瘤坏死因子(TNF)-α。
类TNF配体与其受体的结合触发直接涉及细胞增殖、分化和存活的细胞内途径。TNF/TNF受体蛋白超家族的大多数成员在免疫细胞上表达并且在免疫反应的多个组分中起关键性作用。TNF-α是IBD发病机理中的主要细胞因子。其通过粘附分子的表达、成纤维细胞增殖、促凝血因子以及引发细胞毒性、凋亡和急性期反应发挥其多效性作用。IBD中TNF-α的来源部分为先天免疫细胞，如巨噬细胞或单核细胞，并且也可以是分化的Th1细胞。TNF-α的血清水平与UC和CD的临床活性相关联[31]。其在IBD中的慢性炎症中起协调作用。TNF-α在CD中的作用已经受到广泛研究。使TNF-α与血清可溶性TNF受体1和2(sTNFR1和2)结合引发促炎性信号传导。sTNFR1和2的水平在CD中升高。
肿瘤坏死因子样因子(TL1A)，即TNF家族的另一成员，通过与死亡受体3(DR3)结合而刺激IFN-γ分泌。DR3由很高比率的来自于UC和CD粘膜活检的细胞表达，并且在IBD患者中随疾病活性一起观察到IFN-γ水平升高。TL1A/DR3系统涉及CD的发病机理。固有层的巨噬细胞是TL1A的主要生产者，其表达在CD中显著增强。已经发现TL1A和IL-23协同促进粘膜T细胞对IFN-γ的产生。FN-Y：由TH1T-细胞产生。一旦引发炎症，就产生IFN-γ并且随后通过免疫系统的各种分子和途径起作用以加剧炎症过程。存在大量广泛记载IFN-γ的促炎特性的文献，IFN-γ的促炎特性已经导致IFN-γ是炎症和自身免疫性疾病中的主要促炎性细胞因子的主流观念。在小鼠的实验炎症性肠病中成因性地涉及干扰素-γ(Ito等，Clinicaland Experimental Immunology(2006)，146:330–338)。研究明确证明，就体重减轻的程度、DAI、组织学评分和MPO活性而言，IFN-γ–/–小鼠在用DSS刺激后表现出结肠炎减弱。在显示严重IBD样症状的经DSS治疗的野生型(WT)小鼠的结肠中产生越来越多的IFN-γ。
白细胞介素-2(IL-2)由T细胞产生并且对于T细胞分化成效应T细胞而言是最重要的。IL-2对于T细胞增殖也很重要。这对于IBD而言很重要，是因为效应T细胞被认为是在IBD中引起损伤的主要细胞类型。
IL-8(白细胞介素-8；aka CXCL8)主要介导中性粒细胞活化并迁移到来自于外周血的组织和炎症部位。已经发现IL-8的组织水平在活性UC中与正常结肠组织相比更高，并且已将其血清浓度与UC的内窥镜检查和组织学严重程度相关联。IL-8对于炎症情况和癌症很重要(参见，例如“The Chemokine CXCL8in Carcinogenesis and Drug Response”,ISRNOncol.2013Oct 9；2013:859154；Gales D等；和Future Oncol.2010Jan；6(1):111-6.doi:10.2217/fon.09.128；“CXCL8and its cognate receptors in melanoma progressionand metastasis”，Singh S等)。特别是在癌症中，IL-8被认为还通过支持血管生成起作用。
2.根据方面1所述的抗体或片段，其用于治疗或预防所述人类中hLIGHT介导的上皮细胞损伤。
如本文所解释，炎症性肠病(IBD)的发病机理似乎涉及负责维持肠稳态和口服耐受性的一个或多个元件的原发性缺陷。最重要的元件的代表是肠屏障，一种主要由肠上皮细胞(IEC)形成的复杂系统。因此，本发明的这个方面对于治疗或预防炎症性肠病，例如UC或CD有用。这个方面对于治疗或预防气道炎症性疾病或病状也有用。在一个实例中，这个方面对于治疗或预防哮喘有用。
3.根据方面1或2所述的抗体或片段，其中所述抗体或片段拮抗hLIGHT与选自HVEM和LTβR的hLIGHT受体的结合。
在一个实例中，hLIGHT受体由选自上皮细胞、胃肠细胞、结肠细胞、肠细胞、肺部上皮细胞或滑膜细胞的人类细胞表达。本发明的这个方面对于治疗或预防炎症性肠病，例如UC或CD有用。这个方面对于治疗或预防气道炎症性疾病或病状也有用。在一个实例中，这个方面对于治疗或预防哮喘有用。
在另一个实施方案中，所述抗体或片段拮抗hLIGHT与选自FcβR和DcR3的hLIGHT受体的结合。
4.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中所述白细胞选自多形核白细胞、单核细胞、外周血单核细胞(PBMC)、淋巴细胞、T细胞、树突状细胞(DC细胞)和天然杀伤细胞(NK细胞)。
5.根据方面4所述的抗体或片段，其中所述白细胞包含固有层淋巴细胞(LPL)并且所述疾病或病状是胃肠道(GI道)的疾病或病状。
6.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中所述上皮细胞包含选自胃肠细胞、结肠细胞、肠细胞和气道(例如，肺部)上皮细胞的细胞。
7.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其用于通过降低所述人类中的T细胞增殖来治疗或预防所述人类中的所述hLIGHT介导的疾病、病状或上皮细胞损伤。
在一个实例中，在体外测定中(例如在DC细胞/T细胞体外测定中，例如以下进一步所解释)所述抗体或片段能够实现T细胞增殖的降低，因此向人类施用此类抗体或片段导致所述人类中T细胞增殖的降低。
8.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其用于通过拮抗人类的hLIGHT和白细胞之间的相互作用来治疗或预防所述人类中的所述hLIGHT介导的疾病、病状或上皮细胞损伤，其中白细胞增殖降低。
在一个实例中，在体外测定中(例如在MLR体外测定中，例如以下进一步所解释)所述抗体或片段能够实现白细胞(例如，单核细胞)增殖的降低，因此向人类施用此类抗体或片段导致所述人类中白细胞增殖的降低。
9.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其用于通过拮抗所述人类中由T细胞介导的LIGHT/LIGHT受体相互作用而降低人类白细胞增殖来治疗或预防所述人类中的所述hLIGHT介导的疾病、病状或上皮细胞损伤。
在一个实例中，在体外测定中所述抗体或片段能够实现白细胞(例如，单核细胞)增殖的降低，其中在所述测定中所述抗体或片段拮抗T细胞介导的LIGHT/LIGHT受体相互作用，因此向人类施用此类抗体或片段导致所述人类中白细胞增殖的降低。
10.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其用于通过降低人类中选自IL-2、TNFα和干扰素γ的细胞因子的分泌来治疗或预防所述人类中的所述hLIGHT介导的疾病、病状或上皮细胞损伤。
在一个实例中，所述抗体或片段是用于通过降低人类中(i)IL-2和干扰素γ，(ii)IL-2和TNFα或(iii)干扰素γ和TNFα的分泌来治疗或预防所述人类中的所述hLIGHT介导的疾病、病状或上皮细胞损伤。
在一个实例中，在体外测定中(例如在MLR体外测定中，例如以下进一步所解释)所述抗体或片段能够实现选自IL-2、TNFα和干扰素γ的细胞因子的分泌的降低，因此向人类施用此类抗体或片段导致所述人类中所述所选细胞因子分泌的降低。
11.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其用于通过降低人类中IL-8细胞因子的分泌来治疗或预防所述人类中的所述hLIGHT介导的疾病、病状或上皮细胞损伤。
在一个实例中，在体外测定中(例如在MLR体外测定中，例如以下进一步所解释)所述抗体或片段能够实现IL-8分泌的降低，因此向人类施用此类抗体或片段导致所述人类中IL-8分泌的降低。
12.根据方面10或11所述的抗体或片段，其用于通过降低人类中由树突状细胞(DC细胞)与T细胞的相互作用介导的所述细胞因子的分泌来治疗或预防所述疾病、病状或上皮细胞损伤。
在一个实例中，在DC细胞/T细胞体外测定中(例如以下进一步所解释)所述抗体或片段能够实现所述细胞因子分泌的降低，因此向人类施用此类抗体或片段导致所述人类中所述细胞因子分泌的降低。
13.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中上皮细胞损伤是人类中所述疾病或病状的症状或原因。
14.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中所述人类患有炎症性肠病(IBD)、同种异体移植排斥、移植物抗宿主病(GvHD)或气道炎症或处于这些疾病的风险并且所述方法治疗或预防人类中的IBD、同种异体移植排斥、GvHD或气道炎症。
在任一前述方面的实例中，人类患有炎症性或自身免疫性疾病或病状或处于炎症性或自身免疫性疾病或病状的风险或已经被诊断为这样。
15.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中hLIGHT为214E hLIGHT。
在一个实例中，所述抗体或片段特异性结合214E hLIGHT并且所述人类中的疾病或病状由214E hLIGHT或214K hLIGHT介导。在一个实施方案中，所述疾病或病状由hLIGHT介导，所述hLIGHT包含214E和214K亚基的混合物，例如两个214E亚基和一个21K亚基；或两个214K亚基和一个214E亚基。这对于治疗杂合(一个LIGHT等位基因为214E等位基因而另一个为214K等位基因)的人类有用。
16.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中所述抗体或片段特异性结合214KhLIGHT。
这对于治疗214K纯合人类或杂合(214E和214K)人类有用。
17.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中已经对编码214E hLIGHT多肽的核苷酸序列为人类基因分型。
在一个实例中，在向人类施用所述抗体或片段之前为人类基因分型。
18.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中已经对214E hLIGHT多肽为人类进行表型分型。
在一个实例中，在向人类施用所述抗体或片段之前为人类进行表型分型。
19.一种抗体或抗体片段
其中所述抗体或片段包含可变结构域，所述可变结构域
i.特异性结合214E hLIGHT和214K hLIGHT两者，
ii.与包含01C02或13H04的可变区的抗体竞争结合214E hLIGHT并且
iii.不与包含选自01C06和18E04的抗体的可变区的抗体竞争结合214E hLIGHT；或
其中所述抗体或片段包含可变结构域，所述可变结构域
iv.特异性结合214E hLIGHT和214K hLIGHT两者，
v.与包含31A10的可变区的抗体竞争结合214E hLIGHT并且
vi.与包含选自01C06和18E04的抗体的可变区的抗体竞争结合214E hLIGHT。
20.根据方面19所述的抗体或片段，其中(ii)、(iii)、(v)和(vi)使用表面等离子共振(SPR)测定。
21.根据方面19或20所述的抗体或片段，其中(ii)、(iii)、(v)和(vi)使用呈人IgG4抗体形式(任选地IgG4(PE))的可变结构域测定。
22.根据方面19、20或21所述的抗体或片段，其中所述抗体呈人IgG4形式(任选地IgG4(PE))。
23.根据方面19-22中任一项所述的抗体或片段，其包含VH结构域，所述VH结构域包含与SEQ ID NO:368至少95％同一性的氨基酸序列。
24.根据方面19-23中任一项所述的抗体或片段，其包含VL结构域，所述VL结构域包含与SEQ ID NO:370至少95％同一性的氨基酸序列。
25.根据方面19-24中任一项所述的抗体或片段，其包含VH结构域，所述VH结构域包含SEQ ID NO:368。
26.根据方面19-25中任一项所述的抗体或片段，其包含VL结构域，所述VL结构域包含SEQ ID NO:370。
27.一种抗体或其片段，其特异性结合214E hLIGHT并且与选自由1C02、1C06、18E04、98C07、31A10、29C09、14B09、62C01、13H04、144F05、42A02和117C06组成的组的抗体竞争结合所述hLIGHT。在一个替代方案中，所述组由31A10、29C09、14B09、62C01、13H04、144F05、42A02和117C06组成。在一个实例中，所选抗体为31A10。在一个实例中，所选抗体为1C02。在一个实例中，所选抗体为13H04。在一个实例中，所选抗体为31A10。
在任一方面的实例中，竞争通过表面等离子共振(SPR)测定，此类技术对于技术人员显而易见。SPR可以使用BiacoreTM、ProteonTM或另一种标准的SPR技术进行。此类竞争可能是由于(例如)抗体/片段与hLIGHT的相同或重叠表位结合。
28.根据方面19-27中任一项所述的抗体或片段，其中所述抗体或片段是根据方面1-18中的任一项。
29.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其包含λ轻链可变结构域(任选地，其为人类的)。
在本发明任一方面的实例中，所述抗体或片段的可变结构域为人类的或经人源化。另外，任选地所述抗体或片段还包含人类或人源化恒定区(例如，人Fc和/或人CL)。在本发明任一方面的实例中，所述抗体或片段的可变结构域由转基因动物(例如，啮齿动物、小鼠、大鼠、兔、鸡、绵羊、骆驼或鲨鱼)产生。在本发明任一方面的实例中，通过噬菌体展示、核糖体展示或酵母展示产生或鉴定所述抗体或片段的可变结构域。
在本发明任一方面的实例中，所述抗体或片段是重组的。
在本发明任一方面的实例中，所述抗体或片段由重组哺乳动物、细菌、昆虫、植物或酵母细胞产生。在一个实例中，哺乳动物细胞为CHO或HEK293细胞并且所述抗体或片段包含CHO或HEK293细胞糖基化。
在本发明任一方面的实例中，所述抗体或片段经分离。
30.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中所述抗体或片段特异性结合214KhLIGHT并且与选自由1C02、1C06、18E04、31A10、29C09、14B09、13H04、144F05和42A02组成的组的抗体竞争结合所述214K hLIGHT。在一个替代方案中，所述组由31A10、29C09、14B09、13H04、144F05和42A02组成。在一个实例中，所选抗体为31A10。在一个实例中，所选抗体为1C02。在一个实例中，所选抗体为1C02。在一个实例中，所选抗体为13H04。在一个实例中，所选抗体为31A10。
31.根据方面1-29中任一项所述的抗体或片段，其中所述抗体或片段特异性结合(i)214E hLIGHT并且与选自由1C02、1C06、18E04、14B09、13H04和42A02组成的组的抗体竞争结合所述214E hLIGHT；并且特异性结合(ii)214K hLIGHT并且与选自由1C02、1C06、18E04、14B09、13H04和42A02组成的组的抗体竞争结合所述214K hLIGHT。这些抗体或片段结合E和K等位基因两者并且因此对于所有人类(E/E纯合体、K/K纯合体和E/K杂合体)普遍有用。在一个替代方案中，所述组由14B09、13H04和42A02组成。在一个实例中，所选抗体为1C02。在一个实例中，所选抗体为13H04。
32.根据方面1-29中任一项所述的抗体或片段，其中所述抗体或片段特异性结合(i)214E hLIGHT并且与选自31A10、29C09和144F05的抗体竞争结合所述214E hLIGHT；并且特异性结合(ii)214K hLIGHT并且与选自31A10、29C09和144F05的抗体竞争结合所述214KhLIGHT。这些抗体或片段结合E和K等位基因两者并且因此对于所有人类(E/E纯合体、K/K纯合体和E/K杂合体)的治疗、基因分型或诊断普遍有用。在一个实例中，所选抗体为31A10。
33.根据方面1-29中任一项所述的抗体或片段，其中(i)所述抗体或片段特异性结合214E hLIGHT并且与98C07、62C01或117C06竞争结合所述214E hLIGHT；并且(ii)所述抗体或片段不特异性结合214K hLIGHT。结合E等位基因而非K的抗体或片段对于为E/E纯合体和E/K杂合体的人类的治疗、诊断或基因分型有用。用这些抗体或片段，区别这种人类与K/K纯合体的基因分型是可能的。在一个实例中，所选抗体为98C07。
34.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其包含VH结构域，所述VH结构域包含选自以下各项的HCDR1的HCDR1序列：
a.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT；
b.29C09，并且其中所述抗体或片段与29C09竞争结合所述hLIGHT；
c.14B09，并且其中所述抗体或片段与14B09竞争结合所述hLIGHT；
d.62C01，并且其中所述抗体或片段与62C01竞争结合所述hLIGHT；
e.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；
f.144F05，并且其中所述抗体或片段与144F05竞争结合所述hLIGHT；
g.42A02，并且其中所述抗体或片段与42A02竞争结合所述hLIGHT；
h.117C06，并且其中所述抗体或片段与117C06竞争结合所述hLIGHT；
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
j.1C06，并且其中所述抗体或片段与1C06竞争结合所述hLIGHT；
k.18E04，并且其中所述抗体或片段与18E04竞争结合所述hLIGHT；和
l.98C07，并且其中所述抗体或片段与98C07竞争结合所述hLIGHT。
在一个实例中HCDR1序列选自以下抗体的HCDR1：
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；及
m.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
35.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其包含VH结构域，所述VH结构域包含选自以下各项的HCDR2的HCDR2序列：
a.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT；
b.29C09，并且其中所述抗体或片段与29C09竞争结合所述hLIGHT；
c.14B09，并且其中所述抗体或片段与14B09竞争结合所述hLIGHT；
d.62C01，并且其中所述抗体或片段与62C01竞争结合所述hLIGHT；
e.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；
f.144F05，并且其中所述抗体或片段与144F05竞争结合所述hLIGHT；
g.42A02，并且其中所述抗体或片段与42A02竞争结合所述hLIGHT；
h.117C06，并且其中所述抗体或片段与117C06竞争结合所述hLIGHT；
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
j.1C06，并且其中所述抗体或片段与1C06竞争结合所述hLIGHT；
k.18E04，并且其中所述抗体或片段与18E04竞争结合所述hLIGHT；和
l.98C07，并且其中所述抗体或片段与98C07竞争结合所述hLIGHT。
在一个实例中HCDR2序列选自以下抗体的HCDR2：
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；及
iii.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
36.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其包含VH结构域，所述VH结构域包含选自以下各项的HCDR3的HCDR3序列：
a.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT；
b.29C09，并且其中所述抗体或片段与29C09竞争结合所述hLIGHT；
c.14B09，并且其中所述抗体或片段与14B09竞争结合所述hLIGHT；
d.62C01，并且其中所述抗体或片段与62C01竞争结合所述hLIGHT；
e.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；
f.144F05，并且其中所述抗体或片段与144F05竞争结合所述hLIGHT；
g.42A02，并且其中所述抗体或片段与42A02竞争结合所述hLIGHT；
h.117C06，并且其中所述抗体或片段与117C06竞争结合所述hLIGHT；
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
j.1C06，并且其中所述抗体或片段与1C06竞争结合所述hLIGHT；
k.18E04，并且其中所述抗体或片段与18E04竞争结合所述hLIGHT；和
l.98C07，并且其中所述抗体或片段与98C07竞争结合所述hLIGHT。
在一个实例中HCDR3序列选自以下抗体的HCDR3：
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；及
iii.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
37.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其包含VH结构域，所述VH结构域包含(i)CDR1和2，(ii)CDR1和3，(iii)CDR2和3或(iv)CDR1、2和3序列：
a.方面34-36的(a)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT；
b.方面34-36的(b)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与29C09竞争结合所述hLIGHT；
c.方面34-36的(c)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与14B09竞争结合所述hLIGHT；
d.方面34-36的(d)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与62C01竞争结合所述hLIGHT；
e.方面34-36的(e)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；
f.方面34-36的(f)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与144F05竞争结合所述hLIGHT；
g.方面34-36的(g)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与42A02竞争结合所述hLIGHT；
h.方面34-36的(h)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与117C06竞争结合所述hLIGHT；
i.方面34-36的(i)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
j.方面34-36的(j)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与1C06竞争结合所述hLIGHT；
k.方面34-36的(k)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与18E04竞争结合所述hLIGHT；或
l.方面34-36的(l)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与98C07竞争结合所述hLIGHT。
38.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其包含VH结构域，所述VH结构域包含选自由SEQ ID NO:2、30、58、86、114、142、170、198和226组成的组；或选自由SEQ ID NO:368、312、340、396、2、58、86、114、142、170、198和266组成的组的氨基酸序列。在一个替代方案中，所述组由SEQ ID NO:2、58、86、114、142、170、198和266。
一方面，本发明提供一种抗hLIGHT抗体或片段(任选地根据本文叙述的任何其他方面)，其包含VH结构域，所述VH结构域包含选自SEQ ID NO:2、30、58、86、114、142、170、198、226；或选自SEQ ID NO:2、58、86、114、142、170、198、226的氨基酸序列。
在本发明的另一实例中，所述抗体或片段包含下面序列表中列出的VH结构域氨基酸序列。另外或可选地，所述抗体或片段包含下面序列表中列出的HCDR1结构域氨基酸序列。另外或可选地，所述抗体或片段包含下面序列表中列出的HCDR2结构域氨基酸序列。另外或可选地，所述抗体或片段包含下面序列表中列出的HCDR3结构域氨基酸序列。
在本发明的一个实例中，所述抗体或片段包含下面序列表中列出的VL结构域氨基酸序列。另外或可选地，所述抗体或片段包含下面序列表中列出的LCDR1结构域氨基酸序列。另外或可选地，所述抗体或片段包含下面序列表中列出的LCDR2结构域氨基酸序列。另外或可选地，所述抗体或片段包含下面序列表中列出的LCDR3结构域氨基酸序列。
在本文任一方面的实例中，所述抗体或片段包含重链，该重链包含选自SEQ IDNO:254、256、258、260、264和266的恒定区和任选地如方面30中叙述的VH结构域。在一个实例中，所述抗体或片段包含此类重链的两个拷贝。在另一实例中，重链包含啮齿动物、大鼠、小鼠、人、兔、鸡、骆驼、绵羊、牛、非人灵长类动物或鲨鱼恒定区(例如，Fc)。
在本文任一方面的实例中，所述抗体或片段包含重链，该重链包含γ(例如，人γ)恒定区，例如人γ1恒定区。
在本文任一方面的实例中，所述抗体或片段为嵌合型，例如，其包含人可变结构域和非人(例如，啮齿动物、小鼠或大鼠)恒定区。
39.根据方面34-38中任一项所述的抗体或片段，其包含所述VH结构域的第一和第二拷贝。
40.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其包含VL结构域，所述VL结构域包含选自以下各项的LCDR1的LCDR1序列：
a.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT；
b.29C09，并且其中所述抗体或片段与29C09竞争结合所述hLIGHT；
c.14B09，并且其中所述抗体或片段与14B09竞争结合所述hLIGHT；
d.62C01，并且其中所述抗体或片段与62C01竞争结合所述hLIGHT；
e.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；
f.144F05，并且其中所述抗体或片段与144F05竞争结合所述hLIGHT；
g.42A02，并且其中所述抗体或片段与42A02竞争结合所述hLIGHT；
h.117C06，并且其中所述抗体或片段与117C06竞争结合所述hLIGHT
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
j.1C06，并且其中所述抗体或片段与1C06竞争结合所述hLIGHT；
k.18E04，并且其中所述抗体或片段与18E04竞争结合所述hLIGHT；和
l.98C07，并且其中所述抗体或片段与98C07竞争结合所述hLIGHT。
在一个实例中LCDR1序列选自以下抗体的LCDR1：
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；及
iii.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
41.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其包含VL结构域，所述VL结构域包含选自以下各项的LCDR2的LCDR2序列：
a.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT；
b.29C09，并且其中所述抗体或片段与29C09竞争结合所述hLIGHT；
c.14B09，并且其中所述抗体或片段与14B09竞争结合所述hLIGHT；
d.62C01，并且其中所述抗体或片段与62C01竞争结合所述hLIGHT；
e.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；
f.144F05，并且其中所述抗体或片段与144F05竞争结合所述hLIGHT；
g.42A02，并且其中所述抗体或片段与42A02竞争结合所述hLIGHT；
h.117C06，并且其中所述抗体或片段与117C06竞争结合所述hLIGHT；
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
j.1C06，并且其中所述抗体或片段与1C06竞争结合所述hLIGHT；
k.18E04，并且其中所述抗体或片段与18E04竞争结合所述hLIGHT；和
l.98C07，并且其中所述抗体或片段与98C07竞争结合所述hLIGHT。
在一个实例中LCDR2序列选自以下抗体的LCDR2：
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；及
iii.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
42.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其包含VL结构域，所述VL结构域包含选自以下各项的LCDR3的LCDR3序列：
a.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT；
b.29C09，并且其中所述抗体或片段与29C09竞争结合所述hLIGHT；
c.14B09，并且其中所述抗体或片段与14B09竞争结合所述hLIGHT；
d.62C01，并且其中所述抗体或片段与62C01竞争结合所述hLIGHT；
e.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；
f.144F05，并且其中所述抗体或片段与144F05竞争结合所述hLIGHT；
g.42A02，并且其中所述抗体或片段与42A02竞争结合所述hLIGHT；
h.117C06，并且其中所述抗体或片段与117C06竞争结合所述hLIGHT；
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
j.1C06，并且其中所述抗体或片段与1C06竞争结合所述hLIGHT；
k.18E04，并且其中所述抗体或片段与18E04竞争结合所述hLIGHT；和
l.98C07，并且其中所述抗体或片段与98C07竞争结合所述hLIGHT。
在一个实例中LCDR3序列选自以下抗体的LCDR3：
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；及
iii.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
在(ii)的一个替代方案中，LCDR3是13H04的LCDR3(SEQ ID NO:163或168)，例外的是在CDR的第一个位置存在除Cys以外的氨基酸。例如，存在Cys被另一氨基酸的保守性置换。例如，在第一个位置存在Ser而不是Cys。在一个实例中，本发明的抗体或片段包含13H04的VL结构域，但是在LCDR3的第一个位置具有所述变化。
43.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其包含VL结构域，所述VL结构域包含(i)CDR1和2，(ii)CDR1和3，(iii)CDR2和3或(iv)CDR1、2和3序列：
a.方面40-42的(a)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT；
b.方面40-42的(b)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与29C09竞争结合所述hLIGHT；
c.方面40-42的(c)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与14B09竞争结合所述hLIGHT；
d.方面40-42的(d)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与62C01竞争结合所述hLIGHT；
e.方面40-42的(e)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；
f.方面40-42的(g)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与144F05竞争结合所述hLIGHT；
g.方面40-42的(i)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与42A02竞争结合所述hLIGHT；
h.方面40-42的(j)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与117C06竞争结合所述hLIGHT；
i.方面40-42的(i)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
j.方面40-42的(j)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与1C06竞争结合所述hLIGHT；
k.方面40-42的(k)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与18E04竞争结合所述hLIGHT；或
l.方面40-42的(l)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与98C07竞争结合所述hLIGHT。
44.根据方面40-43中任一项所述的抗体或片段，其包含VL结构域，所述VL结构域包含选自由SEQ ID NO:370、314、342、398、16、72、100、128、156、184、212和240组成的组的氨基酸序列。在一个替代方案中，所述组由SEQ ID NO:16、72、100、128、156、184、212和240组成。
在本发明的一个方面，提供了一种抗hLIGHT抗体或片段(任选地根据本文的任何其他方面)，其包含VL结构域，所述VL结构域包含选自SEQ ID NO:16、44、72、100、128、156、184、212和240；或选自SEQ ID NO:16、72、100、128、156、184、212和240的氨基酸序列。
在本文任一方面的实例中，所述抗体或片段包含轻链(例如，λ轻链)，该轻链包含选自SEQ ID NO:268、270、272、274、276、278、280、284、286、288、290、292、294、296和298的恒定区和任选地如方面36中叙述的VL结构域(例如，λVL)。在一个实例中，所述抗体或片段包含此类轻链的两个拷贝(任选地还包含上述重链的两个拷贝)。在另一个实例中，轻链包含啮齿动物、大鼠、小鼠、人、兔、鸡、骆驼、绵羊、牛、非人灵长类动物或鲨鱼恒定区。
在一个实例中，所述抗体或片段包含λ轻链，该轻链包含选自SEQ ID NO:278、280、284、286、288、290、292、294、296和298的恒定区和任选地λVL结构域。
在一个实例中，所述抗体或片段的VL结构域为λ轻链可变结构域。
45.根据方面32-36中任一项所述的抗体或片段，其包含所述VL结构域的第一和第二拷贝。
46.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中所述抗体或片段与mAb664竞争结合214E hLIGHT。
抗体mAb664是可从R&D Systems得到的小鼠IgG1抗LIGHT抗体(目录号mAB664，克隆名称115520)。
47.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中所述hLIGHT是人细胞表面表达的hLIGHT，例如在上皮细胞(例如，本文公开的任何类型的上皮细胞)上。
48.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中与体外对照MLR测定中在hLIGHT的存在下对hLIGHT有特异性的抗体缺乏时的人PBMC或T细胞的增殖相比，在体外混合淋巴细胞反应(MLR)测定中在hLIGHT的存在下所述抗体或片段使人PBMC或T细胞的增殖降低至少20、30、40、50或60％。在下面的实例中提供了对合适的测定的说明。
49.根据方面48所述的抗体或片段，其中所述测定中的hLIGHT是在人树突状细胞(DC细胞)表面表达的。在下面的实例中提供了对合适的测定的说明。
50.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中所述抗体或片段降低来自于表达214E hLIGHT受体的人上皮细胞(例如，人结肠细胞)的IL-8分泌。在一个实例中所述细胞表达HVEM或LTβR。在一个实例中，所述抗体或片段降低体外HT-29细胞(HTB-38)的IL-8分泌。
51.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中所述抗体或片段降低来自于体外表达214E hLIGHT的人HT-29细胞的IL-8分泌。
52.根据方面51所述的抗体或片段，其中与HT-29体外对照测定中在对hLIGHT有特异性的抗体缺乏时表达214E hLIGHT的HT-29细胞的IL-8产量相比，所述抗体或片段使IL-8分泌降低至少20、30、40、50或60％。
53.根据方面52所述的抗体或片段，其中在HT-29体外测定中所述抗体或片段完全抑制IL-8分泌。
54.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中所述抗体或片段降低由人树突状细胞(DC细胞)与人T细胞的相互作用介导的细胞因子分泌，其中所述细胞因子选自干扰素γ、IL-8、TNFα和IL-2中的一种、两种、更多种或全部(例如，IL-2和/或干扰素γ)。这可以(例如)使用MLR体外测定(例如，DC/T细胞MLR体外测定)评估。在下面的实例中提供了对合适的测定的说明。
在一个实例中，正如例如当DC细胞来自于不同于T细胞人类来源的人类时可能的那样，DC细胞与T细胞错配，例如MHC错配。在一个实例中，通过人单核细胞经GMCSF和IL-4的体外诱导产生DC细胞。
55.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中与对hLIGHT有特异性的抗体缺乏时由人树突状细胞(DC细胞)与人T细胞的相互作用介导的干扰素γ的产量相比，所述抗体或片段使干扰素γ分泌降低至少20、30、40、50或60％。
56.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中与对hLIGHT有特异性的抗体缺乏时由人树突状细胞(DC细胞)与人T细胞的相互作用介导的TNFα的产量相比，所述抗体或片段使TNFα分泌降低至少20、30、40、50或60％。
57.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中与对hLIGHT有特异性的抗体缺乏时由人树突状细胞(DC细胞)与人T细胞的相互作用介导的IL-2的产量相比，所述抗体或片段使IL-2分泌降低至少10、20、30、40、50或60％。
58.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中在人外周血单核细胞(PBMC)混合淋巴细胞(MLR)测定中所述抗体或片段降低细胞因子分泌，其中所述细胞因子选自干扰素γ、IL-8、TNFα和IL-2中的一种、两种、更多种或全部(例如，IL-2和/或干扰素γ)。
59.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中与在人PBMC MLR测定中对hLIGHT有特异性的抗体缺乏时干扰素γ的产量相比，所述抗体或片段使干扰素γ分泌降低至少20、30、40、50或60％。
60.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中与在人PBMC MLR测定中对hLIGHT有特异性的抗体缺乏时TNFα的产量相比，所述抗体或片段使TNFα分泌降低至少20、30、40、50或60％。
61.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中与在人PBMC MLR测定中对hLIGHT有特异性的抗体缺乏时IL-2的产量相比，所述抗体或片段使IL-2分泌降低至少10、20、30、40、50或60％。
62.根据方面54-61中任一项所述的抗体或片段，其中所述细胞为原代细胞。
“原代细胞”是指人体中的细胞或已经从患者体内取出用于体外结合本发明的抗体或片段的此类细胞(例如，在诊断人类的LIGHT状态或疾病/病状状态的方法中可能有用)。如本文中所用的原代细胞并非通常已经经过许多次体外培养的人类细胞系的细胞。在该实施方案中本发明的抗体或片段特异性抑制hLIGHT与受体(例如，HVEM或LTβR)结合的能力是有利的，因为其提供了针对患有hLIGHT介导的疾病或病状或处于hLIGHT介导的疾病或病状风险的人类患者中的细胞的实用性的直接指示。
63.根据任一前述方面所述的抗体或片段，其中在HTRF(均相时间分辨荧光)测定中所述抗体或片段抑制214E hLIGHT与人HVEM和/或人淋巴毒素β受体的结合，IC50为1×10-8或更低。在一个实例中，IC50在1×10-8至1×10-11的范围内或在1×10-9至1×10-10的范围内。
64.一种药物组合物，其包含任一项前述方面所述的抗体或片段和稀释剂、赋形剂或载体；并且还任选地包含抗炎药物。
65.一种试剂盒，其包含根据方面1-63中任一项所述的抗体或片段和用于将人类基因分型为对于编码214E hLIGHT多肽的核苷酸序列而言为阳性或阴性的工具和/或用于将人类表型分型为对于214E hLIGHT多肽而言为阳性或阴性的工具。在一个实例中，用于基因分型的工具包含在严格条件下与214E hLIGHT的至少10、15或20个连续核苷酸杂交的核酸，其中所述核苷酸包含214E并且所述核酸在相同条件下不与214K hLIGHT的至少分别10、15或20个连续核苷酸杂交，其中所述核苷酸包含214K。在一个实例中，用于表型分型的工具包含特异性结合214E LIGHT而非214K LIGHT的抗体或片段(例如，本发明的抗体或片段)。
在严格条件下的杂交对于技术人员将显而易见，例如，65℃下5×SSC、5×Denhardt试剂和0.5％SDS的条件。在一个实例中，严格条件包含在约45℃的6×氯化钠/柠檬酸钠(SSC)中与过滤器结合的DNA杂交，接着在约50-65℃的0.2×SSC/0.1％SDS中洗涤一次或多次；或者可为高度严格条件(例如，在约45℃的6×SSC中与过滤器结合的核酸杂交，接着在约68℃的0.1×SSC/0.2％SDS中洗涤一次或多次)，或本领域技术人员已知的其他严格杂交条件。(参见例如Ausubel，F.M.等编辑，1989，Current Protocols in MolecularBiology，第I卷，Green Publishing Associates,Inc.and John Wiley&Sons,Inc.,NewYork，第6.3.1-6.3.6和2.10.3页)。
66.一种试剂盒，其包含根据方面1-63中任一项所述的抗体或片段和用于将人类基因分型为对于编码214K hLIGHT多肽的核苷酸序列而言为阳性或阴性的工具和/或用于将人类表型分型为对于214K hLIGHT多肽而言为阳性或阴性的工具。在一个实例中，用于基因分型的工具包含在严格条件下与214K hLIGHT的至少10、15或20个连续核苷酸杂交的核酸，其中所述核苷酸包含214K并且所述核酸在相同条件下不与214E hLIGHT的至少分别10、15或20个连续核苷酸杂交，其中所述核苷酸包含214E。在一个实例中，用于表型分型的工具包含特异性结合214K LIGHT而非214E LIGHT的抗体或片段(例如，本发明的抗体或片段)。
本发明还提供了用于治疗和/或预防LIGHT介导的病状或疾病的药物组合物或试剂盒，所述组合物或试剂盒包含本发明的抗体或片段(和任选地抗炎药物)，任选地与标签或用于治疗和/或预防人类中的所述疾病或病状的使用说明书组合；任选地其中所述标签或说明书包含上市许可证号(例如，FDA或EMA许可证号)；任选地其中所述试剂盒包括含所述抗体或片段的IV或注射装置。
67.一种核酸，其编码方面1-63中任一项叙述的抗体的HCDR3。
68.根据方面67所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:375、376、319、320、347、348、403、404、7、13、63、69、91、97、119、125、147、153、175、181、203、209、231和237的序列至少80、85、90、95、96、97、98或99％同一性或100％同一性的；或选自SEQ ID NO:375、376、319、320、347、348、403、404、7、13、63、69、91、97、119、125、147、153、175、181、203、209、231和237的核苷酸序列。在一个实例中，核苷酸序列与选自SEQ ID NO:7、13、35、41、63、69、91、97、119、125、147、153、175、181、203、209、231和237的序列至少80、85、90、95、96、97、98或99％同一性或100％同一性；或选自SEQ ID NO:7、13、63、69、91、97、119、125、147、153、175、181、203、209、231和237。
一方面，本发明提供了一种包含编码抗hLIGHT抗体的VH结构域的核苷酸序列的核酸，其中所述核苷酸序列包含与选自SEQ ID NO:7、13、35、41、63、69、91、97、119、125、147、153、175、181、203、209、231和237的序列至少80、85、90、95、96、97、98或99％同一性或100％同一性；或选自SEQ ID NO:7、13、63、69、91、97、119、125、147、153、175、181、203、209、231和237的HCDR3序列。任选地，所述抗体是根据本文的任何其他方面。
在另一个实施方案中，提供了根据方面59所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:7、13、35、41、63、69、91、97、119、125、147、153、175、181、203、209、231和237的序列100％同一性；或除1、2或3个核苷酸置换外，选自SEQ ID NO:7、13、63、69、91、97、119、125、147、153、175、181、203、209、231和237的核苷酸序列，其中每个置换在相应的蛋白质序列上均不产生氨基酸变化或产生保守性氨基酸变化(即，核苷酸置换为同义置换)。技术人员将熟悉保守性氨基酸变化。
氨基酸置换包括其中氨基酸被不同的天然产生的氨基酸残基置换的改变。可将此类置换分类为“保守性”，在这种情况下多肽中所含的氨基酸残基被具有关于极性、侧链官能度或大小的相似特征的另一天然产生的氨基酸置换。此类保守性置换在本领域中熟知。本发明所涵盖的置换也可为“非保守性”，其中肽中存在的氨基酸残基被具有不同性质的氨基酸，如来自于不同类别的天然产生的氨基酸置换(例如，用丙氨酸置换带电或疏水性氨基酸)，或可选地，其中天然产生的氨基酸被非常规氨基酸置换。
另外或可选地，提供了根据方面59所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:7、13、35、41、63、69、91、97、119、125、147、153、175、181、203、209、231和237的序列100％同一性的；或选自SEQ ID NO:7、13、63、69、91、97、119、125、147、153、175、181、203、209、231和237的核苷酸序列，除1、2、3、4、5、6或7个同义核苷酸置换外并且没有在相应的蛋白质序列上产生保守性氨基酸变化的1、2或3个核苷酸置换。
69.一种核酸，其编码方面1-63中任一项叙述的抗体的HCDR2；任选地其中所述核苷酸是根据方面67或68。
70.根据方面69所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:373、374、317、318、345、346、401、402、5、11、61、67、89、95、117、123、145、151、173、179、201、207、229和235的序列至少80、85、90、95、96、97、98或99％同一性或100％同一性的；或选自SEQ ID NO:373、374、317、318、345、346、401、402、5、11、61、67、89、95、117、123、145、151、173、179、201、207、229和235的核苷酸序列。在一个实例中，核苷酸序列与选自SEQ ID NO:5、11、33、39、61、67、89、95、117、123、145、151、173、179、201、207、229和235的序列至少80、85、90、95、96、97、98或99％同一性或100％同一性；或选自SEQ ID NO:5、11、61、67、89、95、117、123、145、151、173、179、201、207、229和235
一方面，本发明提供了一种包含编码抗hLIGHT抗体的VH结构域的核苷酸序列的核酸，其中所述核苷酸序列包含与选自SEQ ID NO:5、11、33、39、61、67、89、95、117、123、145、151、173、179、201、207、229和235的序列至少80、85、90、95、96、97、98或99％同一性或100％同一性的；或选自SEQ ID NO:5、11、61、67、89、95、117、123、145、151、173、179、201、207、229和235的HCDR2序列。任选地，所述抗体是根据本文的任何其他方面。
在另一个实施方案中，提供了根据方面61所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:5、11、33、39、61、67、89、95、117、123、145、151、173、179、201、207、229和235的序列100％同一性的；或除1、2或3个核苷酸置换外，选自SEQ ID NO:5、11、61、67、89、95、117、123、145、151、173、179、201、207、229和235的核苷酸序列，其中每个置换在相应的蛋白质序列上均不产生氨基酸变化或产生保守性氨基酸变化(即，核苷酸置换为同义置换)。技术人员将熟悉保守性氨基酸变化。
另外或可选地，提供了根据方面61所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:5、11、33、39、61、67、89、95、117、123、145、151、173、179、201、207、229和235的序列100％同一性的；或选自SEQ ID NO:5、11、61、67、89、95、117、123、145、151、173、179、201、207、229和235的核苷酸序列，除1、2、3、4、5、6或7个同义核苷酸置换外并且没有在相应的蛋白质序列上产生保守性氨基酸变化的1、2或3个核苷酸置换。
71.一种核酸，其编码方面1-63中任一项叙述的抗体的HCDR1；任选地其中所述核苷酸是根据方面67-70。
72.根据方面63所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:371、372、315、316、343、344、399、400、3、9、59、65、87、93、115、121、143、149、171、177、199、205、227和233的序列至少80、85、90、95、96、97、98或99％同一性或100％同一性的；或选自SEQ ID NO:371、372、315、316、343、344、399、400、3、9、59、65、87、93、115、121、143、149、171、177、199、205、227和233的核苷酸序列。在一个实例中，核苷酸序列与选自SEQ ID NO:3、9、31、37、59、65、87、93、115、121、143、149、171、177、199、205、227和233的序列至少80、85、90、95、96、97、98或99％同一性或100％同一性；或选自SEQ ID NO:3、9、59、65、87、93、115、121、143、149、171、177、199、205、227和233
一方面，本发明提供了一种包含编码抗hLIGHT抗体的VH结构域的核苷酸序列的核酸，其中所述核苷酸序列包含与选自SEQ ID NO:3、9、31、37、59、65、87、93、115、121、143、149、171、177、199、205、227和233的序列至少80、85、90、95、96、97、98或99％同一性或100％同一性的；或选自SEQ ID NO:3、9、59、65、87、93、115、121、143、149、171、177、199、205、227和233的HCDR1序列。任选地，所述抗体是根据本文的任何其他方面。
在另一个实施方案中，提供了根据方面63所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:3、9、31、37、59、65、87、93、115、121、143、149、171、177、199、205、227和233的序列100％同一性的；或除1、2或3个核苷酸置换外，选自SEQ ID NO:3、9、59、65、87、93、115、121、143、149、171、177、199、205、227和233的核苷酸序列，其中每个置换在相应的蛋白质序列上均不产生氨基酸变化或产生保守性氨基酸变化(即，核苷酸置换为同义置换)。技术人员将熟悉保守性氨基酸变化。
另外或可选地，提供了根据方面63所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:3、9、31、37、59、65、87、93、115、121、143、149、171、177、199、205、227和233的序列100％同一性的；或选自SEQ ID NO:3、9、59、65、87、93、115、121、143、149、171、177、199、205、227和233的核苷酸序列，除1、2、3、4、5、6或7个同义核苷酸置换外并且没有在相应的蛋白质序列上产生保守性氨基酸变化的1、2或3个核苷酸置换。
73.一种核酸，其编码方面1-63中任一项叙述的抗体的VH结构域和/或VL结构域。
74.根据方面65所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:367、311、339、395、1、29、57、85、113、141、169、197和225的序列至少80、85、90、95、96、97、98或99％同一性或100％同一性的；或选自SEQ ID NO:367、311、339、395、1、57、85、113、141、169、197和225的核苷酸序列。在一个实例中，核苷酸序列与选自SEQ ID NO:1、29、57、85、113、141、169、197和225的序列至少80、85、90、95、96、97、98或99％同一性或100％同一性；或选自SEQ ID NO:1、57、85、113、141、169、197和225。
在另一个实施方案中，提供了根据方面65所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:1、29、57、85、113、141、169、197和225的序列100％同一性的；或除1、2或3个核苷酸置换外，选自SEQ ID NO:1、57、85、113、141、169、197和225的核苷酸序列，其中每个置换在相应的蛋白质序列上均不产生氨基酸变化或产生保守性氨基酸变化(即，核苷酸置换为同义置换)。技术人员将熟悉保守性氨基酸变化。
另外或可选地，提供了根据方面65所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:1、29、57、85、113、141、169、197和225的序列100％同一性的；或选自SEQ ID NO:1、57、85、113、141、169、197和225的核苷酸序列，除1、2、3、4、5、6或7个同义核苷酸置换外并且没有在相应的蛋白质序列上产生保守性氨基酸变化的1、2或3个核苷酸置换。
75.根据方面65或66所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:369、313、341、397、15、43、71、99、127、155、183、211和239的序列至少80、85、90、95、96、97、98或99％同一性或100％同一性的；或选自SEQ ID NO:369、313、341、397、15、71、99、127、155、183、211和239的核苷酸序列。在一个实例中，核苷酸序列与选自SEQ ID NO:15、43、71、99、127、155、183、211和239的序列至少80、85、90、95、96、97、98或99％同一性或100％同一性；或选自SEQ ID NO:15、71、99、127、155、183、211和239。
在另一个实施方案中，提供了根据方面65或66所述的核酸，其包含与选自SEQ IDNO:15、43、71、99、127、155、183、211和239的序列100％同一性的；或除1、2或3个核苷酸置换外，选自SEQ ID NO:15、71、99、127、155、183、211和239的核苷酸序列，其中每个置换在相应的蛋白质序列上均不产生氨基酸变化或产生保守性氨基酸变化(即，核苷酸置换为同义置换)。技术人员将熟悉保守性氨基酸变化。
另外或可选地，提供了根据方面65或66所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:15、43、71、99、127、155、183、211和239的序列100％同一性的；或选自SEQ ID NO:15、71、99、127、155、183、211和239的核苷酸序列，除1、2、3、4、5、6或7个同义核苷酸置换外并且没有在相应的蛋白质序列上产生保守性氨基酸变化的1、2或3个核苷酸置换。
76.一种核酸，其编码方面1-63中任一项叙述的抗体的重链或轻链。
77.根据方面76所述的核酸，其包含如方面67-75中任一项所叙述的核苷酸序列。
78.一种载体，其包含根据方面67-77中任一项所述的核酸；任选地其中所述载体为CHO或HEK293载体。在一个实例中，载体为酵母载体，例如酵母(Saccharomyces)或毕赤酵母(Pichia)载体。
79.一种宿主，其包含根据方面67-77中任一项所述的核酸或根据方面70所述的载体。在一个实例中，宿主为哺乳动物(例如人类，例如CHO或HEK293)细胞系或酵母或细菌细胞系。
80.一种特异性结合hLIGHT的抗体或片段在制备用于向人类施用，通过降低下述一项或多项来治疗或预防人类中hLIGHT介导的疾病或病状的药剂中的用途：
m.选自人类的IL-2、TNFα和干扰素γ的细胞因子的分泌；
n.人类的白细胞的增殖；和
o.表达hLIGHT受体的人上皮细胞对hLIGHT的结合。
上述任一方面、实例或实施方案的特征任选地加以必要的变更适用于该用途。
81.一种通过降低下述一项、多项或全部来治疗或预防人类中hLIGHT介导的疾病或病状的方法：
p.选自人类的IL-2、TNFα和干扰素γ的细胞因子的分泌；
q.人类的白细胞的增殖；和
r.表达hLIGHT的受体的人上皮细胞对hLIGHT的结合；
其中所述方法包括向所述人类施用治疗有效量的特异性结合hLIGHT的抗体或片段。
上述任一方面、实例或实施方案的特征任选地加以必要的变更适用于该用途。
本发明的方法治疗或预防人类中的所述疾病或病状。所述抗体或片段的“治疗有效量”是产生所述治疗或预防有效的量(分一个或几个剂量施用，可在时间上间隔，例如基本上每月施用一次)。这对于技术人员将显而易见并且可根据特定的人类患者和针对的疾病或病状而变化。
82.根据方面80或81所述的方法或用途，其用于通过降低所述人类中的T细胞增殖来治疗或预防所述人类中的所述hLIGHT介导的疾病、病状或上皮细胞损伤。
83.根据方面80-82中任一项所述的方法或用途，其用于通过拮抗人类的hLIGHT和白细胞之间的相互作用来治疗或预防所述人类中的所述hLIGHT介导的疾病、病状或上皮细胞损伤，其中白细胞增殖降低。
84.根据方面80-83中任一项所述的方法或用途，其用于通过拮抗所述人类中由T细胞介导的LIGHT/LIGHT受体相互作用而降低人类白细胞增殖来治疗或预防所述人类中的所述hLIGHT介导的疾病、病状或上皮细胞损伤。
85.根据方面80-84中任一项所述的方法或用途，其用于通过降低人类中IL-8细胞因子的分泌来治疗或预防所述人类中的所述hLIGHT介导的疾病、病状或上皮细胞损伤。
86.根据方面85所述的方法，其用于通过降低人类中由树突状细胞(DC细胞)与T细胞的相互作用介导的所述IL-8的分泌来治疗或预防所述疾病、病状或上皮细胞损伤。
87.根据方面80-86中任一项所述的方法或用途，其中上皮细胞损伤是人类中所述疾病或病状的症状或原因。
88.根据方面80-87中任一项所述的方法或用途，其中所述人类患有炎症性肠病(IBD)、同种异体移植排斥或移植物抗宿主病(GvHD)或处于这些疾病的风险并且所述方法治疗或预防人类中的IBD、同种异体移植排斥或GvHD。
89.根据方面80-88中任一项所述的方法或用途，其中hLIGHT为214E hLIGHT。
90.根据方面80-89中任一项所述的方法或用途，其中已经对编码214E hLIGHT多肽的核苷酸序列将人类基因分型为阳性。
任选地，所述方法包括在向患者施用所述抗体或片段之前进行基因分型。
91.根据方面80-90中任一项所述的方法或用途，其中已经对214E hLIGHT多肽将人类表型分型为阳性。
任选地，所述方法包括在向患者施用所述抗体或片段之前进行表型分型。
92.根据方面80-91中任一项所述的方法或用途，其中所述方法或用途包括对编码214E hLIGHT多肽的核苷酸序列将人类基因分型为阳性。
任选地，所述方法包括在向患者施用所述抗体或片段之前进行基因分型。
93.根据方面80-92中任一项所述的方法或用途，其中所述方法或用途包括对214EhLIGHT多肽将人类表型分型为阳性。
任选地，所述方法包括在向患者施用所述抗体或片段之前进行表型分型。
94.根据方面80-93中任一项所述的方法或用途，其中所述抗体或片段是根据方面1-63中任一项或本文描述的任一实例、模式或实施方案。
在本发明抗体或片段的一个实例中，所述抗体或片段特异性结合兔LIGHT蛋白(SEQ ID NO:423)和人LIGHT蛋白(SEQ ID NO:308)，其中与人LIGHT胞外蛋白的结合亲和力至少为与兔LIGHT胞外蛋白结合的亲和力，例如为与兔LIGHT胞外蛋白结合的亲和力的1-2倍。下面的实施例中示出了说明性抗体。这种特征对于涉及LIGHT的疾病的兔模型中的药物开发和试验有用。
95.根据任一前述方面所述的抗体、片段、组合物、试剂盒、方法或用途，其用于治疗或预防人类中的炎症性或自身免疫性疾病或病状或用于降低或预防人类中的血管生成。
96.根据任一前述方面所述的抗体、片段、组合物、试剂盒、方法或用途，其中所述疾病或病状选自炎症性肠病(IBD)、克罗恩氏病、类风湿性关节炎、银屑病、细支气管炎、龈炎、移植排斥、同种异体移植排斥、移植物抗宿主病(GvHD)、哮喘、成人呼吸窘迫综合征(ARDS)、败血性休克、溃疡性结肠炎、舍格伦综合征(Sjorgen's syndrome)和气道炎症。
在一个实例中，所述疾病或病状是EP1958637或EP2034832中公开的LIGHT介导的疾病或病状。
在一个实例中，所述疾病或病状为炎症性或自身免疫性疾病或病状。
如本文中所用，炎症性疾病或病状是指导致炎症，例如由中性粒细胞趋化性引起的病理状态。此类病状的实例包括炎症性皮肤病，包括银屑病；与炎症性肠病相关的反应(如克罗恩氏病和溃疡性结肠炎)；缺血再灌注；成人呼吸窘迫综合征；皮炎；脑膜炎；脑炎；葡萄膜炎；自身免疫性疾病如类风湿性关节炎、舍格伦综合征、脉管炎；涉及血细胞渗出的疾病；中枢神经系统(CNS)炎症性病症、败血病或外伤继发性多器官损伤综合征；酒精性肝炎、细菌性肺炎、抗原-抗体复合物介导的疾病；肺部炎症，包括胸膜炎、肺泡炎、脉管炎、肺炎、慢性支气管炎、支气管扩张和囊肿性纤维化等。优选的适应症为细菌性肺炎和炎症性肠病如溃疡性结肠炎。因此在一个实例中提供本发明是为了治疗或预防此类病状中的任一种或多种。
在一个实例中，所述疾病或病状为精神分裂症。在一个实例中，所述疾病或病状为癌症。
如实例中所解释的那样，发明人设计了一系列对于鉴定本发明的抗体和片段特别有用的标准，这些标准是：-
(a)在HTRF测定中所述抗体或片段结合CHO-S细胞上的细胞表面hLIGHT和/或结合重组hLIGHT的能力；
(b)在受体中和HTRF测定和/或流式细胞术受体中和测定中所述抗体或片段中和人HVEM和/或LTβR的能力；和
(c)所述抗体或片段特异性结合人和食蟹猴LIGHT的能力(有用，使得可以在作为人类替代者的食蟹猴模型中评估所述抗体或片段的PK、PD、功效和其他参数)。
因此，在本发明的一个实例中所述抗体或片段满足标准(a)、(b)和(c)。
在一个实例中，设置标准(a)，使得通过FACS测定所述抗体或片段显示<70％受体与CHO-S LIGHT-214E细胞结合。
在一个实例中，设置标准(a)，使得在HTRF测定中所述抗体或片段显示<90％受体与LIGHT结合。
在一个实例中，设置标准(a)，使得在HTRF测定中所述抗体或片段显示至少20％效果。
在一个实例中，HVEM-Fc和/或LTβR-Fc用于标准(b)中。
在一个实施方案中，本发明抗体或片段的测定或试验在或基本上在pH7下(例如，对于体外试验和测定而言)并且在或基本上在室温下进行。
任选地，所述抗体或片段特异性结合hLIGHT(例如，214E hLIGHT)，例如在本文公开的SPR条件下，通过SPR测定，亲和力(表观亲和力，Kd)低于1μM，为1000nM至100nM、100nM至10nM、10nM至1nM、1000pM至500pM、500pM至200pM，低于200pM，为200pM至150pM、200pM至100pM、100pM至10pM、10pM至1pM，例如在1mM至1pM(例如1mM至100pM；10nM至100pM；1nM至10pM；或100pM至1pM)的范围内。另外或可选地，所述抗体或片段特异性结合食蟹猴LIGHT(例如，214E cyno LIGHT)，例如在本文公开的SPR条件下，通过SPR测定，亲和力(表观亲和力，Kd)低于1μM，为1000nM至100nM、100nM至10nM、10nM至1nM、1000pM至500pM、500pM至200pM，低于200pM，为200pM至150pM、200pM至100pM、100pM至10pM、10pM至1pM，例如在1mM至1pM(例如1mM至100pM；10nM至100pM；1nM至10pM；或100pM至1pM)的范围内。此类结合测量可使用本领域已知的各种结合测定进行，例如使用表面等离子共振(SPR)，例如用BiacoreTM或使用ProteOn XPR36TM 或使用(Sapidyne Instruments,Inc)。
在一个实例中，抗体或片段可结合214E和214K hLIGHT两者，表观亲和力相似(例如，表观亲和力(Kd)相互差异不超过2倍)。在另一个实例中，所述抗体或片段可结合214EhLIGHT，但是以比对于214E hLIGHT的表观亲和力低20倍的表观亲和力(Kd)结合214KhLIGHT≥或其不结合214K hLIGHT(例如在本文公开的SPR条件下，通过SPR测定)。
在一个实例中，所述抗体或片段结合214E和21K hLIGHT，其中所述抗体或片段与214K hLIGHT结合的Kd(通过SPR测定)是与21E hLIGHT结合的Kd的至少60、70、80、90或95％。
LIGHT结合能力、特异性和亲和力(Kd，K解离和/或K缔合)可以通过本领域中的任何常规方法，例如通过表面等离子共振(SPR)测定。术语“Kd”，如本文中所用，意在指特定抗体-抗原相互作用的平衡解离常数。
在一个实施方案中，表面等离子共振(SPR)在25℃下进行。在另一个实施方案中，SPR在37℃下进行。
在一个实施方案中，SPR在生理pH，如约pH7下或在pH7.6下(例如，使用pH7.6的Hepes缓冲盐水(也称为HBS-EP))进行。
在一个实施方案中，SPR在生理盐水平，例如150mM NaCl下进行。
在一个实施方案中，SPR在不超过0.05体积％的洗涤剂水平下，例如在0.05％的P20(聚山梨醇酯20；例如吐温-20(Tween-20TM))和3mM的EDTA存在下进行。
在一个实例中，SPR在25℃或37℃下在pH7.6的缓冲液、150mM NaCl、0.05％洗涤剂(例如，P20)和3mM EDTA中进行。缓冲液可含10mM Hepes。在一个实例中，SPR在25℃或37℃下在HBS-EP中进行。HBS-EP可从Teknova Inc获得(California；目录号H8022)。
在一个实例中，所述抗体或片段的亲和力使用SPR通过以下方式测定：
1.例如通过伯胺偶联使抗小鼠(或其他有关的人、大鼠或非人脊椎动物抗体恒定区物种匹配的)IgG(例如，BiacoreTM BR-1008-38)偶联到生物传感器芯片(例如，GLM芯片)上；
2.使抗小鼠IgG(或其他匹配物种抗体)暴露于试验IgG抗体以将试验抗体捕获在芯片上；
3.在1024nM、256nM、64nM、16nM、4nM和0nM下(即单独的缓冲液)使试验抗体经过芯片的捕获表面；并且
4.例如在以上讨论的SPR条件下(例如，在25℃下在生理缓冲液中)，使用表面等离子共振测定试验抗体与试验抗原的结合亲和力。可以使用任何标准SPR装置，例如用BiacoreTM或使用ProteOn XPR36TM 进行SPR。
捕获表面的再生可以用pH1.7的10mM甘氨酸进行。这样去除捕获的抗体并且使表面用于另一次相互作用。可以使用标准技术，例如使用ProteOn XPR36TM分析软件所固有的模型将结合数据拟合为1:1固有模型。
在一个实例中，本发明的抗体或片段装在医疗容器，例如小瓶、注射器、IV容器或注射装置(例如，眼内或玻璃体内注射装置)中。在一个实例中，所述抗体或片段在体外，例如在无菌容器内。在一个实例中，本发明提供了一种试剂盒，其包含本发明的抗体或片段、包装和用于人类中治疗或预防或诊断LIGHT介导的疾病或病状的使用说明书。在一个实例中，说明书指出在向人类施用所述抗体或片段之前应对本发明的LIGHT变体序列为人类进行基因分型。在一个实例中，说明书指出在向人类施用所述抗体或片段之前应对本发明的LIGHT变体序列为人类进行表型分型。在一个实例中，人类为中国人(例如，汉族或CHS)并且说明书为中文(例如，汉语)。
在一个实例中所述抗体或片段的结合位点选自多个结合位点(例如，文库)。例如，所述多个结合位点包含或由多个4-链抗体或其片段，例如dAb、Fab或scFv组成。产生供筛选的多个结合位点的合适方法包括噬菌体展示(产生抗体结合位点的噬菌体展示文库)、核糖体展示(产生抗体结合位点的核糖体展示文库)、酵母展示(产生抗体结合位点的酵母展示文库)或用LIGHT或LIGHT表位免疫接种非人脊椎动物(例如，啮齿动物，例如小鼠或大鼠，例如VelocimouseTM、KymouseTM、XenomouseTM、Aliva MouseTM、HuMab MouseTM、OmnimouseTM、OmniratTM或MeMo MouseTM)和分离抗体生成细胞库(例如，B细胞、浆细胞或浆母细胞库)和/或分离抗体、片段或结合位点库。
术语“表位”是抗原被抗体或片段结合的区域。表位可定义为结构性或功能性。功能性表位通常是结构性表位的子集并且具有直接有助于相互作用的亲和力的那些残基。表位也可为构象性，即由非线性氨基酸组成。在某些实施方案中，表位可包括是化学活性表面分子类，如氨基酸、糖侧链、磷酰基或磺酰基的决定簇，并且在某些实施方案中，可具有特定三维结构特征和/或特定电荷特征。
关于本发明任一方面，例如抗体或片段的术语“分离的”，意指受试抗体或片段等(1)不含通常将与之一起被发现的至少一些其他蛋白质，(2)基本上不含来自于相同来源，例如来自于相同物种的其他蛋白质，(3)由来自于不同物种的细胞表达，(4)已经与至少约50％在自然界中与之缔合的多核苷酸、脂质、碳水化合物或其他物质分开，(5)与在自然界中未与之缔合的多肽(通过共价或非共价相互作用)可操作地缔合，或(6)未出现在自然界中。通常，“分离的”抗体、片段等构成给定样品的至少约5％、至少约10％、至少约25％或至少约50％。合成来源的基因组DNA、cDNA、mRNA或其他RNA或其任何组合可编码此类分离的抗体、片段等。优选地，分离的抗体、片段等基本上不含在其自然环境中发现的，会干扰其治疗、诊断、预防、研究或其他用途的蛋白质或多肽或其他污染物。
例如，“分离的”抗体是已经鉴定，从其产生环境的组分(例如，天然地或重组地)分开和/或回收的抗体。优选地，分离的多肽不与来自于其产生环境的所有其他组分缔合，例如，使得已经将抗体分离到FDA可批准或批准的标准。其产生环境的污染物组分，如由重组转染细胞产生的污染物组分，是通常会干扰抗体的研究、诊断或治疗用途的物质，并且可包括酶、激素和其他蛋白或非蛋白溶质。在优选的实施方案中，多肽将被纯化至：(1)例如通过Lowry法测定，高于95重量％的抗体，并且在一些实施方案中，高于99重量％的抗体；(2)足以通过使用转杯式测序仪获得N端或内部氨基酸序列的至少15个残基的程度；或(3)在非还原或还原条件下使用考马斯蓝(Coomassie blue)或优选地，银染色通过SDS-PAGE达到的均一性。因为抗体自然环境的至少一种组分将不存在，所以分离的抗体包括重组细胞内的原位抗体。然而，通常，将通过至少一个纯化步骤制备分离的多肽或抗体。
免疫缀合物
本发明涵盖缀合至治疗部分(“免疫缀合物”)，如细胞毒素、化疗药物、免疫抑制剂或放射性同位素的抗体或片段。细胞毒素剂包括对细胞有害的任何试剂。用于形成免疫缀合物的合适的细胞毒素剂和化疗剂的实例在本领域中已知，参见例如通过引用整体并入本文的WO05/103081。
双特异性
本发明的抗体和片段可为单特异性、双特异性或多特异性。多特异性mAb可对一个靶多肽的不同表位有特异性或者可含对一个以上靶多肽有特异性的抗原结合结构域。参见例如Tutt等(1991)J.Immunol.147:60-69。人抗hLIGHT抗体或片段可与另一种功能分子，例如另一种肽或蛋白质连接或共表达。例如，抗体或其片段可与一个或多个其他分子实体，如另一抗体或抗体片段功能性连接(例如，通过化学偶联、基因融合、非共价缔合或其他方式)以产生具有第二结合特异性的双特异性或多特异性抗体。
可用于本发明情况下的示例性双特异性抗体形式涉及使用第一免疫球蛋白(Ig)CH3结构域和第二Ig CH3结构域，其中第一和第二Ig CH3结构域相互至少一个氨基酸不同，并且与没有氨基酸残基的双特异性抗体相比，至少一个氨基酸差异降低了双特异性抗体与蛋白质A的结合。在一个实施方案中，第一Ig CH3结构域结合蛋白质A而第二Ig CH3结构域含有降低或消除蛋白质A结合的突变，如H95R修饰(按IMGT外显子编号；H435R，按EU编号)。第二CH3结构域还可包含Y96F修饰(按IMGT；Y436F，按EU)。在第二CH3内可发现的其他修饰包括：在IgG1抗体情况下的D16E、L18M、N44S、K52N、V57M和V821(按IMGT；D356E、L358M、N384S、K392N、V397M和V422I，按EU)；在IgG2抗体情况下的N44S、K52N和V82I(按IMGT；N384S、K392N和V422I，按EU)；和在IgG4抗体情况下的Q15R、N44S、K52N、V57M、R69K、E79Q和V82I(按IMGT；Q355R、N3845、K392N、V397M、R409K、E419Q和V422I，按EU)。上述双特异性抗体形式上的改变涵盖在本发明的范围之内。
在某些实施方案中，所述抗体或其LIGHT结合片段包含少于6个CDR。在一些实施方案中，所述抗体或其抗原结合片段包含或由选自HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3的1、2、3、4或5个CDR组成。在具体实施方案中，所述抗体或其抗原结合片段包含或由选自序列表中的HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3的1、2、3、4或5个CDR组成。
在具体实施方案中，本发明的抗体为全人抗体、单克隆抗体、重组抗体、拮抗性抗体、hLIGHT中和抗体或其任何组合或本发明提供了其hLIGHT结合片段。在一个实例中，所述抗体是包含人可变结构域和非人(例如，小鼠或大鼠或兔)恒定结构域的嵌合抗体。在特定实施方案中，所述抗体为全人抗体，如全人单克隆抗体或其抗原结合片段，其特异性结合hLIGHT。在优选实施方案中，所述抗体为拮抗性抗体。在优选实施方案中，所述抗体为中和抗体。
在一个实例中，所述抗体或片段为λ型抗体或片段(即，其可变结构域为λ可变结构域)。任选地，所述抗体或片段还包含λ恒定结构域。
在某些实施方案中，所述抗体与HVEM、LTβR、DcR3或其融合蛋白(例如，Fc:HVEM、Fc:LTβR或Fc:DcR3)竞争(例如，以剂量依赖方式)结合hLIGHT，如细胞表面表达的hLIGHT或可溶性hLIGHT。在本文的实施例中提供了示例性竞争阻断试验。
另一方面，本文提供了分离的核酸，其编码结合hLIGHT多肽(例如，细胞表面表达的或可溶性hLIGHT)、hLIGHT多肽片段或hLIGHT表位的抗体。在某些实施方案中，核酸编码如序列表中所公开的VH链、VL链、VH结构域、VL结构域、HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3。
另一方面，本文提供了包含编码本发明的抗体或片段的核酸的载体和宿主细胞。
在某些实施方案中，抗体特异性结合hLIGHT的一种或多种单核苷酸多态性(SNP)变体，如包含SNP 214E的hLIGHT(本文称为“214E hLIGHT”)和/或包含SNP 214K的hLIGHT(本文称为“214K hLIGHT”)。在一个实例中，214E hLIGHT包含SNP 32S。在一个实例中，214EhLIGHT包含SNP 32L。在一个实例中，214K hLIGHT包含SNP 32S。在一个实例中，214KhLIGHT包含SNP 32L。LIGHT为3个单体LIGHT多肽的三聚体。对于SNP 214E为纯合体的人产生具有214E SNP的亚基单体并且因此这些人体内的hLIGHT(三聚体)仅包含在其组成亚基的位置214处的E。对于SNP 214K和214E为杂合体的人有可能产生包含在位置214处的不同亚基的混合物的hLIGHT(三聚体)。在本发明任一方面的一个实例中，hLIGHT是包含单体的三聚体的214E hLIGHT，其中每个单体均包含214E(本文称为“214E hLIGHT三聚体”)。在本发明任一方面的另一个实例中，hLIGHT是包含单体的三聚体的214K hLIGHT，其中每个单体均包含214K(本文称为“214K hLIGHT”)。
一方面，本文提供了一种降低(例如，至少20、30、40 50或60％)或完全抑制受试者(例如，人类受试者)中hLIGHT与HVEM,LTβR和DcR3中的一种、多种或全部结合的方法，其包括向受试者施用有效量的特异性结合214E hLIGHT和/或214K hLIGHT(例如，细胞表面表达的或可溶性hLIGHT)的本发明的抗体或其片段。
一方面，本文提供了一种治疗或预防受试者(例如，人类受试者)中hLIGHT介导的疾病或病状的方法，所述方法包括向受试者施用有效量的特异性结合214E hLIGHT和/或214K hLIGHT(例如，细胞表面表达的或可溶性hLIGHT)的本发明的抗体或其片段，其中所述疾病或病状通过所述抗体或片段治疗或预防。在一个实例中，所述方法包括降低或抑制受试者的hLIGHT生物活性，如IL-2、IL-8、TNFα和干扰素γ中的一种、多种或全部的分泌。在一个实例中，生物活性选自IL-2、TNFα和干扰素γ中的一种、多种或全部的分泌。在一个实例中，生物活性选自IL-8、CCL20和RANTES中的一种、多种或全部的分泌。
一方面，本文提供了一种降低或抑制受试者(例如，人类受试者)的hLIGHT生物活性，如IL-2、IL-8、TNFα和干扰素γ中的一种、多种或全部的分泌的方法，所述方法包括向受试者施用有效量的特异性结合214E hLIGHT和/或214K hLIGHT(例如，细胞表面表达的或可溶性hLIGHT)的本发明的抗体或其片段，其中hLIGHT生物活性通过所述抗体或片段降低。在一个实例中，生物活性选自IL-2、TNFα和干扰素γ中的一种、多种或全部的分泌。在一个实例中，生物活性选自IL-8、CCL20和RANTES中的一种、多种或全部的分泌。
术语“约”或“大约”意为在给定值或范围的20％，优选10％且更优选5％(或1％或更小)范围内。
如本文中所用，“施用”是指如同其在体外所存在那样将物质(例如，本文提供的抗hLIGHT抗体)注射或以其他方式物理递送到患者体内的行为，例如通过粘膜、皮内、静脉、肌肉内递送和/或本文描述的或本领域已知的任何其他物理递送方法。在治疗疾病或其症状时，物质的施用通常在疾病或其症状发作之后进行。在预防疾病或其症状时，物质的施用通常在疾病或其症状发作之前进行。
为测定两个氨基酸序列或两个核酸序列的百分比同一性，为了最佳比较目的将所述序列进行比对(例如，可以在第一氨基酸或核酸序列中引入空位，以与第二氨基酸或核酸序列最佳比对)。然后比较在相应氨基酸位置或核苷酸位置的氨基酸残基或核苷酸。第一序列中的位置被第二序列中相应位置的相同氨基酸残基或核苷酸占据时，则分子在该位置相同。两个序列之间的百分比同一性是序列共有的相同位置数量的函数(即，同一性％＝相同重叠位置/位置总数×100％)。在一个实施方案中，两个序列为相同长度。
两个序列(例如，氨基酸序列或核酸序列)之间百分比同一性的测定也可使用数学算法实现。用于两个序列比较的数学算法的优选、非限制性实例为Karlin和Altschul，1990，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.87:2264 2268的算法，如同Karlin和Altschul，1993，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.90:5873 5877中所修改。将此类算法并入Altschul等，1990，J.Mol.Biol.215:403的NBLAST和XBLAST程序中。BLAST核苷酸搜索可以用设为，例如得分＝100、字长＝12的NBLAST核苷酸程序参数进行以获得与本发明的核酸分子同源的核苷酸序列。BLAST蛋白质搜索可以用设为，例如得分50、字长＝3的XBLAST程序参数进行以获得与本发明的蛋白质分子同源的氨基酸序列。为了获得用于比较目的的空位比对，可如Altschul等，1997，Nucleic Acids Res.25:3389 3402中所述，利用空位BLAST。可选地，可以使用PSIBLAST进行检测分子间(Id.)远源关系的迭代搜索。当利用BLAST、空位BLAST和PSI Blast程序时，可以使用各程序(例如，XBLAST和NBLAST)的默认参数(参见例如，万维网上的美国国家生物技术信息中心(NCBI)，ncbi.nlm.nih.gov)。用于序列比较的数学算法的另一个优选、非限制性实例为Myers和Miller，1988，CABIOS 4:11 17的算法。将此类算法并入ALIGN程序(2.0版本)中，该程序是GCG序列比对软件包的一部分。当利用ALIGN程序比较氨基酸序列时，可以使用PAM120权重残基表、为12的空位长度罚分和为4的空位罚分。
可以使用与上述技术相似的技术，允许或不允许空位，测定两个序列之间的百分比同一性。在计算百分比同一性中，通常仅对精确匹配计数。
如本文中所用，hLIGHT的“拮抗剂”或“抑制剂”是指能够抑制或以其他方式降低，例如表达hLIGHT的细胞中或表达hLIGHT配体，如hLIGHT受体的细胞中hLIGHT的一种或多种生物活性的配体(例如，抗体或片段)。例如，在某些实施方案中，本发明的抗体是抑制或以其他方式降低CCL20、IL-8和/或RANTES从具有细胞表面表达的hLIGHT受体(例如，HVEM、LTβR和/或DcR3)的细胞的分泌(当所述抗体与所述细胞接触时)的拮抗剂。在一些实施方案中，hLIGHT的拮抗剂(例如，本发明的拮抗性抗体)可，例如通过抑制或以其他方式降低表达hLIGHT受体的细胞的活化和/或细胞信号途径而起作用，从而相对于在拮抗剂缺乏时hLIGHT介导的生物活性，抑制细胞的hLIGHT介导的生物活性。在某些实施方案中本文提供的抗体为全人、拮抗性抗hLIGHT抗体，优选为全人、单克隆、拮抗性抗hLIGHT抗体。
术语“抗体”和“免疫球蛋白”或“Ig”在本文可互换使用。特异性结合hLIGHT抗原的抗体或其片段可与有关抗原交叉反应。优选地，特异性结合hLIGHT抗原的抗体或其片段不与其他抗原交叉反应。特异性结合hLIGHT抗原的抗体或其片段可以通过免疫测定、BIAcoreTM或本领域技术人员已知的其他技术鉴定。抗体或其片段在其以使用实验技术，如放射性免疫测定法(RIA)和酶联免疫吸附测定法(ELISA)测定的比对任何交叉反应性抗原更高的亲和力结合hLIGHT抗原时，特异性结合hLIGHT抗原。通常特异性或选择性反应将是本底信号或噪声的至少两倍并且更通常为本底的10倍以上。关于抗体特异性的讨论，参见例如，Paul编，1989，Fundamental Immunology Second Edition，Raven Press，New York，第332-336页。
本发明的抗体包括但不限于合成抗体、单克隆抗体、重组产生的抗体、多特异性抗体(包括双特异性抗体)、人抗体、人源化抗体、嵌合抗体、胞内抗体、单链Fvs(scFv)(例如，包括单特异性、双特异等)、骆驼源化抗体、Fab片段、F(ab′)片段、二硫化物连接的Fvs(sdFv)、抗独特型(抗Id)抗体及上述任一种的表位结合片段。具体而言，本发明的抗体包括免疫球蛋白分子和免疫球蛋白分子的免疫活性部分，即含有特异性结合hLIGHT抗原的抗原结合位点(例如，抗hLIGHT抗体的一个或多个互补决定区(CDR))的抗原结合结构域或分子。本发明的抗体可为任何类型(例如，IgG、IgE、IgM、IgD、IgA和IgY)、任何类别(例如，IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2)或任何亚类(例如，IgG2a和IgG2b)的免疫球蛋白分子。在优选的实施方案中，hLIGHT抗体为全人，如全人单克隆hLIGHT抗体。在某些实施方案中，本发明的抗体为IgG抗体，或其一个类别(例如，人IgG1或IgG4)或亚类。
术语“抗原结合结构域”、“抗原结合区”、“抗原结合片段”及相似术语是指包含与抗原相互作用并且对结合剂赋予其对抗原的特异性和亲和力的氨基酸残基的抗体部分(例如，互补决定区(CDR))。抗原结合区可源自任何动物种类，如啮齿动物(例如，兔、大鼠或仓鼠)和人类。优选地，抗原结合区将为人类来源。
如本文中所用，术语“组合物”旨在涵盖含有(任选地)指定量的指定成分(例如，本发明的抗体)的产品，以及由(任选地)指定量的指定成分的组合直接或间接产生的产品。
术语“恒定区”或“恒定结构域”是指轻链和重链的羧基端部分，其未直接涉及抗体与抗原的结合，但是表现出各种效应功能，例如与Fc受体的相互作用。该术语是指相对于免疫球蛋白的含有抗原结合位点的另一部分(可变结构域)，具有更保守的氨基酸序列的免疫球蛋白分子部分。恒定结构域含有重链的CH1、CH2和CH3结构域和轻链的CHL结构域。
在多肽的情况下，如本文中所用的术语“衍生物”是指包含hLIGHT多肽、hLIGHT多肽片段，或特异性结合hLIGHT多肽的抗体的氨基酸序列，已经通过引入氨基酸残基置换、缺失或添加而改变的多肽。如本文中所用的术语“衍生物”是指(例如)已经通过分子与多肽任何类型的共价连接而化学修饰的hLIGHT多肽、hLIGHT多肽片段，或特异性结合hLIGHT多肽的抗体。例如，但不以限制的方式，(例如)可通过已知糖基化、乙酰化、聚乙二醇化、磷酸化、酰胺化、用已知保护/封端基团衍生化、蛋白水解切割、连接到细胞配体或其他蛋白质等，化学修饰hLIGHT多肽、hLIGHT多肽片段或hLIGHT抗体。以不同于自然发生的或起始肽或多肽的方式，在连接的分子的类型或位置上修饰衍生物。衍生物还包括天然存在于所述肽或多肽上的一个或多个化学基团的缺失。可通过化学修饰，使用本领域技术人员已知的技术，包括但不限于化学切割、乙酰化、配制、衣霉素的代谢合成等，化学修饰hLIGHT多肽、hLIGHT多肽片段或hLIGHT抗体的衍生物。进一步地，hLIGHT多肽、hLIGHT多肽片段或hLIGHT抗体的衍生物可含一个或多个非经典氨基酸。多肽衍生物具有与本文描述的hLIGHT多肽、hLIGHT多肽片段或hLIGHT抗体相似或相同的功能。
如本文中所用的术语“有效量”是指足以降低和/或改善给定疾病和/或与之相关的症状的严重程度和/或持续时间的疗法(例如，本文提供的抗体或药物组合物)的量。该术语还涵盖对于减少或改善给定疾病的增进或进展，减少或改善给定疾病的复发、发展或发作，和/或提高或增强另一疗法(例如，除本文提供的抗hLIGHT抗体外的疗法)的预防或治疗效果所必需的量。在一些实施方案中，本发明抗体的有效量为约0.1mg/kg(mg抗体/kg受试者重量)至约100mg/kg。在某些实施方案中，其中提供的抗体的有效量为约0.1mg/kg、约0.5mg/kg、约1mg/kg、3mg/kg、5mg/kg、约10mg/kg、约15mg/kg、约20mg/kg、约25mg/kg、约30mg/kg、约35mg/kg、约40mg/kg、约45mg/kg、约50mg/kg、约60mg/kg、约70mg/kg、约80mg/kg、约90mg/kg或约100mg/kg(或其中的范围)。在一些实施方案中，如本文中所用的“有效量”还指用于达到指定结果(例如，抑制细胞的hLIGHT生物活性，如抑制CCL20、IL-8或RANTES从细胞中分泌)的本发明抗体的量。
如本文中所用的术语“表位”是指在抗原，如hLIGHT多肽或hLIGHT多肽片段的表面上，能够被抗体的一个或多个抗原结合区结合并且在动物，优选哺乳动物中且最优选在人类中具有抗原或免疫原活性，能够引发免疫反应的局部区域。具有免疫原活性的表位是在动物中引发抗体反应的多肽的一部分。具有抗原活性的表位是通过本领域熟知的任何方法，例如通过本文描述的免疫测定法测定，抗体特异性结合的多肽的一部分。抗原表位不一定为免疫原性。表位通常由化学活性表面分子类如氨基酸或糖侧链组成并且具有特定三维结构特征以及特定电荷特征。有助于表位的多肽区域可为多肽的连续氨基酸或表位可一起来自于多肽的两个或更多个非连续区域。表位可能是或可能不是抗原的三维表面特征。在某些实施方案中，hLIGHT表位是hLIGHT多肽(例如，呈hLIGHT多肽的三聚体形式)的三维表面特征。在其他实施方案中，hLIGHT表位是hLIGHT多肽(例如，呈hLIGHT多肽的三聚体形式或单体形式)的线性特征。本文提供的抗体可特异性结合hLIGHT单体(变性)形式的表位，hLIGHT三聚体(天然)形式的表位或hLIGHT单体(变性)形式和三聚体(天然)形式两者的表位。在具体实施方案中，本文提供的抗体特异性结合三聚体形式的hLIGHT的表位，而不特异性结合单体形式的hLIGHT。
如本文中所用的术语“赋形剂”是指常用作药物的稀释剂、媒介物、防腐剂、粘合剂或稳定剂的惰性物质并且包括但不限于蛋白质(例如，血清白蛋白等)、氨基酸(例如，天冬氨酸、谷氨酸、赖氨酸、精氨酸、甘氨酸、组氨酸等)、脂肪酸和磷脂(例如，烷基磺酸酯、辛酸酯等)、表面活性剂(例如，SDS、聚山梨醇酯、非离子表面活性剂等)、糖类(例如，蔗糖、麦芽糖、海藻糖等)和多元醇(例如，甘露糖醇、山梨糖醇等)。同样参见Remington'sPharmaceutical Sciences(1990)Mack Publishing Co.,Easton,Pa.，其据此通过引用整体并入。
在肽或多肽的情况下，如本文中所用的术语“片段”是指包含少于全长氨基酸序列的肽或多肽。此类片段可(例如)由于在氨基末端截断、在羧基末端截断和/或残基从氨基酸序列的内部缺失而产生。片段可(例如)由选择性RNA剪接或体内蛋白酶活性产生。在某些实施方案中，hLIGHT片段包括包含hLIGHT多肽或特异性结合hLIGHT多肽的抗体的至少5个连续氨基酸残基、至少10个连续氨基酸残基、至少15个连续氨基酸残基、至少20个连续氨基酸残基、至少25个连续氨基酸残基、至少40个连续氨基酸残基、至少50个连续氨基酸残基、至少60个连续氨基酸残基、至少70个连续氨基酸残基、至少80个连续氨基酸残基、至少90个连续氨基酸残基、至少100个连续氨基酸残基、至少125个连续氨基酸残基、至少150个连续氨基酸残基、至少175个连续氨基酸残基、至少200个连续氨基酸残基或至少250个连续氨基酸残基的氨基酸序列的多肽。在一个具体实施方案中，hLIGHT多肽或特异性结合hLIGHT抗原的抗体的片段保持所述多肽或抗体的至少1种、至少2种或至少3种功能。
术语“全人抗体”或“人抗体”在本文中可互换使用并且是指包含人可变区和最优选地人恒定区的抗体。在具体实施方案中，该术语是指包含人类来源的可变区和恒定区的抗体。在某些实施方案中，“全人”抗hLIGHT抗体还可涵盖结合hLIGHT多肽并且由是人种系免疫球蛋白核酸序列天然存在的体细胞变体的核酸序列编码的抗体。在一个具体实施方案中，本文提供的抗hLIGHT抗体为全人抗体。术语“全人抗体”包括如Kabat等所述，具有对应于人种系免疫球蛋白序列的可变和恒定区的抗体。(参见Kabat等(1991)Sequences ofProteins of Immunological Interest，第5版，U.S.Department of Health and HumanServices，NIH 91-3242号出版物)。例如，在本文的实施例中提供了产生全人抗体的示例性方法，但是可使用本领域已知的任何方法。
短语“重组人抗体”包括通过重组方式制备、表达、产生或分离的人抗体，如使用转染到宿主细胞中的重组表达载体表达的抗体，从重组、组合人抗体库分离的抗体，从对于人免疫球蛋白基因而言为转基因和/或转染色体(transchromosomal)的动物(例如，小鼠或牛)分离的抗体(参见例如，Taylor,L.D.等(1992)Nucl.Acids Res.20:6287-6295)或通过涉及将人免疫球蛋白基因序列剪接到其他DNA序列上的任何其他方式制备、表达、产生或分离的抗体。此类重组人抗体可具有源自人种系免疫球蛋白序列的可变和恒定区(参见Kabat,E.A.等(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest，第5版，U.S.Department of Health and Human Services，NIH第91-3242号出版物)。然而，在某些实施方案中，此类重组人抗体经受体外诱变(或，当使用对于人Ig序列而言为转基因的动物时，为体内体细胞诱变)并且因此重组抗体的VH和VL区的氨基酸序列虽然源自人种系VH和VL序列并与之相关，但不可能天然存在于体内人抗体种系库中的序列。
如本文中所用的术语“融合蛋白”是指包含抗体的氨基酸序列和异源多肽或蛋白质(即，通常并非抗体(例如，非抗hLIGHT抗原抗体)的一部分的多肽或蛋白质)的氨基酸序列的多肽。术语“融合”当关于hLIGHT或抗hLIGHT抗体使用时是指肽或多肽或其片段、变体和/或衍生物与异源肽或多肽的连接。优选地，融合蛋白保持hLIGHT或抗hLIGHT抗体的生物活性。在某些实施方案中，融合蛋白包含hLIGHT抗体VH结构域、VL结构域、VH CDR(一个、两个或三个VH CDR)和/或VL CDR(一个、两个或三个VL CDR)，其中融合蛋白特异性结合hLIGHT表位。
术语“重链”当关于抗体使用时是指基于重链恒定结构域的氨基酸序列，称为α、δ、ε、γ和μ的5个不同类型。这些不同类型的重链熟知并且分别产生5个类别的抗体IgA、IgD、IgE、IgG和IgM，包括IgG的4个亚类，即IgG1、IgG1、IgG3和IgG4。优选地重链为人重链。
如本文中所用的术语“宿主”是指动物，优选为哺乳动物并且更优选为人类。
如本文中所用的术语“宿主细胞”是指经核酸分子转染的特定受试细胞及此类细胞的子代或可能的子代。由于在下一代中可发生的突变或环境影响或核酸分子整合到宿主细胞基因组中，此类细胞的子代可能与经核酸分子转染的母细胞不同。
如本文中所用的术语“免疫调节剂”及其变型，包括但不限于免疫调节剂，是指调节宿主免疫系统的试剂。在某些实施方案中，免疫调节剂为免疫抑制剂。在某些其他实施方案中，免疫调节剂为免疫刺激剂。根据本发明，本发明联合疗法中使用的免疫调节剂不包括抗hLIGHT抗体或抗原结合片段。免疫调节剂包括但不限于小分子、肽、多肽、蛋白质、融合蛋白、抗体、无机分子、模拟剂和有机分子。
如本文中所用，在施用其他疗法的情况下的术语“联合”是指使用一种以上的疗法。术语“联合”的使用不限制向受感染的受试者施用疗法的顺序。第一疗法可在向已患、患有或易感hLIGHT介导的疾病的受试者施用第二疗法之前(例如，1分钟、45分钟、30分钟、45分钟、1小时、2小时、4小时、6小时、12小时、24小时、48小时、72小时、96小时、1周、2周、3周、4周、5周、6周、8周或12周)、同时或之后(例如，1分钟、45分钟、30分钟、45分钟、1小时、2小时、4小时、6小时、12小时、24小时、48小时、72小时、96小时、1周、2周、3周、4周、5周、6周、8周或12周)施用。任何附加疗法均可与其他附加疗法一起按任何顺序施用。在某些实施方案中，本发明的抗体可与一种或多种疗法(例如，并非本发明的抗体，同时施用以预防、治疗、管理和/或改善hLIGHT介导的疾病的疗法)联合施用。可与本发明的抗体联合施用的疗法的非限制性实例包括止痛剂、麻醉剂、抗生素或免疫调节剂或U.S.Pharmacopoeia(美国药典)和/或Physician's Desk Reference(医师案头参考)中列出的任何其他试剂。
“分离的”或“纯化的”抗体(例如)基本上不含来自于抗体所来源的细胞或组织源的细胞物质或其他污染蛋白，或当通过化学方法合成时基本上不含化学前体或其他化学药品。用语“基本上不含细胞物质”包括这样的抗体制剂，其中该抗体与其从中分离的细胞的细胞组分相分离或通过重组法产生。因此，基本上不含细胞物质的抗体包括具有少于约30％、20％、10％或5％(按干重计)的异源蛋白(本文也称为“污染蛋白”)的抗体制剂。当通过重组法产生抗体时，其还优选基本上不含培养基，即培养基占蛋白制剂体积的约20％、10％或5％以下。当通过化学合成产生抗体时，其优选基本上不含化学前体或其他化学药品，即将其与蛋白质合成所涉及的化学前体或其他化学药品相分离。因此，此类抗体制剂具有少于约30％、20％、10％、5％(按干重计)的化学前体或除目标抗体以外的化合物。在一个优选的实施方案中，本发明的抗体经分离或纯化。
“分离的”核酸分子是与核酸分子的自然来源中存在的其他核酸分子相分离的核酸分子。而且，“分离的”核酸分子，如cDNA分子，当通过重组技术产生时可基本上不含其他细胞物质或培养基，或当通过化学方法合成时基本上不含化学前体或其他化学药品。在一个具体实施方案中，编码本发明抗体的核酸分子经分离或纯化。
术语“人LIGHT”、“hLIGHT”或“hLIGHT多肽”及类似术语是指包含序列表及相关多肽，包括其SNP变体中的氨基序列的多肽(“多肽”、“肽”和“蛋白质”在本文中可互换使用)。相关多肽包括等位基因变体(例如，SNP变体)；剪接变体；片段；衍生物；置换、缺失和插入变体；融合多肽；和种间同源物，其保持hLIGHT活性和/或足以产生抗hLIGHT免疫反应。示例性非同义SNP变体包括但不限于包含214E-32S(在hLIGHT多肽的位置214处为谷氨酸且在位置32处为丝氨酸(例如以SEQ ID NO:52描述的hLIGHT多肽))、214K-32S、214E-32L和214E-32L的hLIGHT多肽。还涵盖足以产生抗hLIGHT免疫反应的可溶性形式的hLIGHT。正如本领域的技术人员将认识到那样，本发明的抗hLIGHT抗体可结合hLIGHT多肽、多肽片段、抗原和/或表位，因为表位是较大抗原的一部分，较大抗原是较大多肽片段的一部分，较大多肽片段又是较大多肽hLIGHT的一部分，多肽hLIGHT可以呈三聚体(天然)或单体(变性)形式存在。
术语“Kabat编号”和类似术语在本领域中被公认并且是指为比抗体或其抗原结合部分的重链和轻链可变区中的其他氨基酸残基更加可变(即，高变)的氨基酸残基编号的体系(Kabat等(1971)Ann.NY Acad.Sci.190:382-391和Kabat等(1991)Sequences ofProteins of Immunological Interest，第5版，U.S.Department of Health and HumanServices，NIH第91-3242号出版物).对于重链可变区而言，高变区通常范围对于CDR1从氨基酸位置31到35，对于CDR2从氨基酸位置50到65，且对于CDR3从氨基酸位置95到102。对于轻链可变区而言，高变区通常范围对于CDR1从氨基酸位置24到34，对于CDR2从氨基酸位置50到56，且对于CDR3从氨基酸位置89到97。
术语“轻链”当关于抗体使用时是指基于恒定结构域的氨基酸序列称为κ或λ的两个不同类型。轻链氨基酸序列在本领域中熟知。在优选的实施方案中，轻链为人轻链。
术语“单克隆抗体”是指从一群同源或基本上同源的抗体获得的抗体，并且每种单克隆抗体通常将识别抗原上的单个表位。在优选实施方案中，如本文中所用的“单克隆抗体”是由单个杂交瘤或其他细胞产生的抗体，其中例如通过ELISA或本领域中已知或本文提供的实施例中的其他抗原结合或竞争结合测定法所测定，该抗体仅特异性结合hLIGHT表位。术语“单克隆”不限于制备该抗体的任何特定方法。例如，本发明的单克隆抗体可通过如Kohler等；Nature,256:495(1975)中描述的杂交瘤法制备，或者例如可使用如本文所述的技术从噬菌体文库分离。制备克隆细胞系及由此表达的单克隆抗体的其他方法在本领域中熟知(参见例如，Short Protocols in Molecular Biology，(2002)第5版中的第11章，Ausubel等编，John Wiley and Sons,New York)。在本文的实施例中提供了产生其他单克隆抗体的其他示例性方法。
术语“天然产生的”或“天然的”当连同生物材料如核酸分子、多肽、宿主细胞等使用时，是指在自然界中发现的并且不受人类操纵的那些。
如本文中所用的术语“药学上可接受的”意指经联邦或州政府的管理机构批准，或列入《美国药典》或其他通常公认的药典中用于动物，并且更具体地讲用于人类。
如本文中所用的术语“多克隆抗体”是指在对蛋白质的免疫反应中产生的具有许多表位的抗体群并且包括各种针对蛋白质内的相同和不同表位的不同抗体。产生多克隆抗体的方法在本领域中已知(参见例如Short Protocols in Molecular Biology，(2002)第5版中的第11章，Ausubel等编，John Wiley and Sons,New York)。
如本文中所用，术语“多核苷酸”、“核苷酸”、“核酸”、“核酸分子”和其他类似术语可互换使用并且包括DNA、RNA、mRNA等。
如本文中所用，术语“预防”是指由施用本文提供的疗法或疗法组合(例如，预防或治疗剂，如本发明抗体的组合)产生的对hLIGHT介导的疾病和/或与之相关的症状的发展、复发、发作或传播的完全或部分抑制。
如本文中所用，术语“预防剂”是指可以完全或部分抑制受试者中hLIGHT介导的疾病和/或与之相关的症状的发展、复发、发作或传播的任何试剂。在某些实施方案中，术语“预防剂”是指本发明的抗体。在某些其他实施方案中，术语“预防剂”是指除本发明抗体以外的试剂。优选地，预防剂是已知用于或已经或目前用于预防hLIGHT介导的疾病和/或与之相关的症状或阻碍hLIGHT介导的疾病和/或与之相关的症状的发作、发展、进展和/或严重程度的试剂。在具体实施方案中，预防剂为全人抗hLIGHT抗体，如全人抗hLIGHT单克隆抗体。
有助于表位的hLIGHT区域可为多肽的连续氨基酸或表位可一起来自于多肽的两个或更多个非连续区域。表位可能是或可能不是抗原的三维表面特征。hLIGHT抗原表面上能够引发免疫反应的局部区域是hLIGHT表位。表位可能是或可能不是抗原的三维表面特征。
“hLIGHT介导的疾病”和“hLIGHT介导的病状”可互换使用并且是指完全或部分由hLIGHT引起或是hLIGHT的结果的任何疾病或病状。在某些实施方案中，hLIGHT在细胞表面上异常(高度)表达。在一些实施方案中，hLIGHT可在特定细胞类型上异常上调。在其他实施方案中，由hLIGHT与hLIGHT配体的结合引起正常、异常或过度细胞信号传导。在某些实施方案中，hLIGHT配体是hLIGHT受体(例如，HVEM、LTβR或DCR3)，例如其在细胞，如结肠上皮细胞的表面上表达。在某些实施方案中，hLIGHT介导的疾病是炎症性肠病(IBD)，如克罗恩氏病(CD)或溃疡性结肠炎(UC)。在其他实施方案中，hLIGHT介导的疾病是移植物抗宿主病(GVHD)。
术语“hLIGHT受体”或“hLIGHT结合受体”在本文中可互换使用并且是指结合hLIGHT的受体多肽。在具体实施方案中，hLIGHT受体为HVEM、FcβR或DcR3。在一些实施方案中，hLIGHT受体在细胞表面，如结肠上皮细胞的表面上表达。
如本文中所用，术语“受试者”和“患者”可互换使用。如本文中所用，受试者优选为哺乳动物如非灵长类动物(例如，猪、马、猫、狗、大鼠等)或灵长类动物(例如，猴子和人)，最优选为人。在一个实施方案中，受试者是患有hLIGHT介导的疾病的哺乳动物，优选为人。在另一个实施方案中，受试者是处于发展hLIGHT介导的疾病风险的哺乳动物，优选为人。
如本文中所用，“基本上所有”是指至少约60％、至少约70％、至少约75％、至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约98％、至少约99％或约100％。
如本文中所用的“基本上不含表面活性剂”是指特异性结合hLIGHT抗原的抗体制剂，所述制剂含有少于0.0005％、少于0.0003％或少于0.0001％的表面活性剂和/或少于0.0005％、少于0.0003％或少于0.0001％的表面活性剂。
如本文中所用的“基本上不含盐”是指特异性结合hLIGHT抗原的抗体制剂，所述制剂含有少于0.0005％、少于0.0003％或少于0.0001％的无机盐。
如本文中所用的术语“表面活性剂”是指具有两性结构的有机物质；即，其由溶解性倾向相反的基团，通常为油溶性烃链和水溶性离子基团组成。可根据表面活性部分的电荷将表面活性剂分类为阴离子、阳离子和非离子型表面活性剂。表面活性剂常用作润湿剂、乳化剂、增溶剂和分散剂，用于各种药物组合物和生物材料的制备。
如本文中所用，术语“标签”是指连接到(例如)多肽和/或编码hLIGHT或hLIGHT抗体或其抗原结合片段的多核苷酸的任何类型的部分。例如，编码hLIGHT、hLIGHT抗体或其抗原结合片段的多核苷酸可含编码(例如)可检测部分或有助于亲和纯化的部分的一个或多个附加标签编码核苷酸序列。翻译时，标签和抗体可呈融合蛋白的形式。关于标签的术语“可检测”或“检测”是指能够可见的任何标签或其中标签的存在能够另外测定和/或测量(例如，通过定量)。可检测标签的非限制性实例为荧光标签。
如本文中所用，术语“治疗剂”是指可用于hLIGHT介导的疾病和/或与之相关的症状的治疗、管理或改善的任何试剂。在某些实施方案中，术语“治疗剂”是指本发明的抗体。在某些其他实施方案中，术语“治疗剂”是指除本发明的抗体以外的试剂。优选地，治疗剂是已知用于或已经或目前用于hLIGHT介导的疾病或与之相关的一种或多种症状的治疗、管理或改善的试剂。在具体实施方案中，治疗剂为全人抗hLIGHT抗体，如全人抗hLIGHT单克隆抗体。
疗法的组合(例如，使用预防或治疗剂)比任两种或更多种单一疗法的加合效应更有效。例如，预防和/或治疗剂的组合的协同效应允许向患有hLIGHT介导的疾病的受试者使用更低剂量的一种或多种试剂和/或不那么频繁地施用所述试剂。能够利用更低剂量的预防或治疗疗法和/或不那么频繁地施用所述疗法降低了向受试者施用所述疗法相关的毒性，而未降低所述疗法在hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗或改善上的功效。另外，协同效应可引起疗法在hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗或改善上的功效提高。最后，疗法(例如，预防或治疗剂)组合的协同效应可避免或减少与使用任何单一疗法相关的不良或有害副作用。
如本文中所用，术语“疗法”是指可用于hLIGHT介导的疾病(例如，IBD或GVHD)的预防、管理、治疗和/或改善的任何方案、方法和/或试剂。在某些实施方案中，术语“疗法”是指在预防、管理、治疗和/或改善本领域技术人员如医务人员所知的hLIGHT介导的疾病中有用的生物疗法、支持疗法和/或其他疗法。
如本文中所用，术语“治疗”是指由施用一种或多种疗法(包括但不限于施用一种或多种预防或治疗剂，如本发明的抗体)引起的对hLIGHT介导的疾病(例如，IBD或GVHD)的进展、严重程度和/或持续时间的降低或改善。在具体实施方案中，此类术语是指对hLIGHT与HVEM结合的减少或抑制，对hLIGHT与LTβR结合的减少或抑制，对hLIGHT与DcR3结合的减少或抑制，对CCL20从受试者的表达hLIGHT受体的细胞的产生或分泌的减少或抑制，对IL-8从受试者的表达hLIGHT受体的细胞的产生或分泌的减少或抑制，对RANTES从受试者的表达hLIGHT受体的细胞的产生或分泌的减少或抑制，和/或对hLIGHT介导的疾病如IBD或GVHD相关的一种或多种症状的抑制或减轻。在具体实施方案中，预防剂为全人抗hLIGHT抗体，如全人抗hLIGHT单克隆抗体。
术语“可变区”或“可变结构域”是指轻链和重链的一部分，通常是重链中氨基末端约120至130个氨基酸和轻链中约100至110个氨基酸，其在序列上在抗体间广泛不同并且用于每种特定抗体对其特定抗原的结合和特异性中。序列的可变性集中在称为互补决定区(CDR)的那些区域中，而可变结构域中更加高度保守的区域被称为骨架区(FR)。轻链和重链的CDR主要负责抗体与抗原的相互作用。本文所用的氨基酸位置的编号是根据EU索引，如同Kabat等(1991)Sequences of proteins of immunological interest(华盛顿哥伦比亚特区的美国卫生和公众服务部(U.S.Department of Health and Human Services,Washington,D.C.))第5版(“Kabat等”)所述。在优选实施方案中，可变区为人可变区。
抗体
本发明的抗体包括但不限于合成抗体、单克隆抗体、重组产生的抗体、多特异性抗体(包括双特异性抗体)、人抗体、人源化抗体、嵌合抗体、胞内抗体、单链Fvs(scFv)(例如，包括单特异性、双特异等)、骆驼源化抗体、Fab片段、F(ab′)片段、二硫化物连接的Fvs(sdFv)、抗独特型(抗Id)抗体及上述任一种的表位结合片段。
具体而言，本文提供的抗体包括免疫球蛋白分子和免疫球蛋白分子的免疫活性部分，即含有特异性结合hLIGHT抗原的抗原结合位点的分子。本文提供的免疫球蛋白分子可为任何类型(例如，IgG、IgE、IgM、IgD、IgA和IgY)、类别(例如，IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2)或亚类的免疫球蛋白分子。在一个具体的实施方案中，本文提供的抗体为IgG抗体，优选为IgG1或IgG4。
抗体的变体和衍生物包括保持特异性结合表位的能力的抗体片段。优选片段包括Fab片段(含有抗原结合结构域并且包含通过二硫键桥接的轻链和部分重链的抗体片段)；Fab′(含有包含Fab和通过铰链区的重链附加部分的单个抗结合结构域的抗体片段)；F(ab′)2(通过重链铰链区内的链间二硫键连接的两个Fab′分子；Fab′分子可针对相同或不同表位)；双特异性Fab(具有两个抗原结合结构域，其中每一个均可指向不同表位的Fab分子)；包含可变区的单链Fab链，也称为sFv(通过10-25个氨基酸连接在一起的抗体单一轻链和重链的可变抗原结合决定区)；二硫化物连接的Fv或dsFv(通过二硫键连接在一起的抗体单一轻链和重链的可变抗原结合决定区)；骆驼源化VH(其中VH界面处的一些氨基酸是在天然产生的骆驼抗体的重链中发现的氨基酸的抗体单一重链的可变抗原结合决定区)；双特异性sFv(具有两个抗原结合结构域，其中每一个均可指向不同表位的sFv或dsFv分子)；双链抗体(当第一sFv的VH结构域与第二sFv的VL结构域组装并且第一sFv的VL结构域与第二sFv的VH结构域组装时形成的二聚化sFv；双链抗体的两个抗原结合区可针对相同或不同表位)；和三链抗体(以类似于双链抗体的方式形成的三聚化sFv，但是其中在单个复合物中产生3个抗原结合结构域；3个抗原结合结构域可针对相同或不同表位)。抗体的衍生物还包括抗体结合位点的一个或多个CDR序列。当存在两个或更多个CDR序列时CDR序列可在骨架上连接在一起。在某些实施方案中，与本发明一起使用的抗体包含单链Fv(“scFv”)。scFv是包含抗体的VH和VL结构域的抗体片段，其中这些结构域存在于单一多肽链中。通常，scFv多肽还包含介于VH和VL结构域之间，使得scFv能够形成供抗原结合的所需结构的多肽接头。对scFv的综述，参见Pluckthun，在The Pharmacology of Monoclonal Antibodies中，第113卷，Rosenburg和Moore编Springer-Verlag，New York，第269-315页(1994)。
本发明的抗体可来自于任何动物来源，包括鸟类和哺乳动物(例如，人、鼠类、驴、绵羊、兔、山羊、豚鼠、骆驼、马或鸡)。在某些实施方案中，本发明的抗体为人或人源化单克隆抗体。如本文中所用，“人”抗体包括具有人免疫球蛋白的氨基酸序列的抗体并且包括分离自人免疫球蛋白文库或表达来自于人类基因的抗体的小鼠的抗体。
在优选实施方案中，本发明的抗体为全人抗体，如特异性结合hLIGHT多肽、hLIGHT多肽片段或hLIGHT表位的全人抗体。此类全人抗体将比全小鼠(或其他全或部分非人物种抗体)、人源化抗体或嵌合抗体有利以在向受试者施用时，最小化有害或不需要的副作用，如针对非全人抗体(例如，源自其他物种的抗hLIGHT抗体)的免疫反应。
本发明的抗体可为单特异性、双特异性、三特异性或更高多特异性。多特异性抗体可对hLIGHT多肽的不同表位有特异性或可对hLIGHT多肽以及异源表位，如异源多肽或固体支撑材料均有特异性。在优选实施方案中，本文提供的抗体对hLIGHT多肽的给定表位为单特异性并且不特异性结合其他表位。
本文还提供了产生本文所述的抗hLIGHT抗体或片段的B细胞(例如，永生化B细胞)或杂交瘤。
在某些实施方案中，本文提供了一种分离的抗体，其特异性结合hLIGHT表位，其中抗体与hLIGHT表位的结合受本发明的抗体或片段竞争性阻断(例如，以剂量依赖方式)。所述抗体可能或可能不是全人抗体。在优选实施方案中，所述抗体为全人单克隆抗hLIGHT抗体，并且甚至更优选为全人、单克隆、拮抗性抗hLIGHT抗体。在本文的实施例中提供了可用的示例性竞争阻断试验。
在一些实施方案中，本发明的抗体或片段与HVEM、LTβR、DcR3(或其融合蛋白)竞争(例如，以剂量依赖方式)结合细胞表面表达的hLIGHT。在其他实施方案中，本发明的抗体或片段与HVEM、LTβR、DcR3(或其融合蛋白)竞争(例如，以剂量依赖方式)结合可溶性hLIGHT。在本文的实施例中提供了可用的示例性竞争结合测定。在一个实施方案中，所述抗体或片段部分或完全抑制HVEM、LTβR和/或DcR3与细胞表面表达的hLIGHT，如hLIGHT的结合。在另一个实施方案中，所述抗体部分或完全抑制HVEM、LTβR和/或DcR3与可溶性hLIGHT的结合。在一些实施方案中，所述抗体或片段部分或完全抑制CCL20、IL-8和/或RANTES从具有细胞表面表达的hLIGHT配体，如hLIGHT受体(例如，HVEM、LTβR和/或DcR3)的细胞分泌。在某些实施方案中，表达hLIGHT受体的细胞是结肠上皮细胞。
优选地，本发明的抗体为全人、单克隆抗体，如特异性结合hLIGHT的全人、单克隆拮抗性抗体。
在一些实施方案中，本文提供的抗体或片段结合hLIGHT表位，其是hLIGHT多肽(呈hLIGHT多肽的三聚体形式)的三维表面特征。有助于表位的hLIGHT多肽区域可为多肽的连续氨基酸或表位可一起来自于多肽的两个或更多个非连续区域。hLIGHT表位可呈(a)hLIGHT的三聚体形式(“三聚体hLIGHT表位”)，(b)hLIGHT的单体形式(“单体hLIGHT表位”)，(c)hLIGHT的三聚体和单体形式，(d)hLIGHT的三聚体而非单体形式，或(e)hLIGHT的单体形式而非三聚体形式存在。
例如，在一些实施方案中，表位仅呈三聚体(天然)形式存在或可用于结合，但不呈三体(变性)形式存在或可用于抗hLIGHT抗体结合。在其他实施方案中，hLIGHT表位是hLIGHT多肽(例如，呈hLIGHT多肽的三聚体形式或单体形式)的线性特征。本文提供的抗体可特异性结合(a)hLIGHT单体(变性)形式的表位，(b)hLIGHT三聚体形式的表位，(c)hLIGHT单体而非三聚体形式的表位，(d)hLIGHT三聚体而非单体形式的表位，或(e)hLIGHT单体和三聚体形式两者。在优选实施方案中，本文提供的抗体特异性结合hLIGHT三聚体形式的表位，但不特异性结合hLIGHT单体形式的表位。
本发明还提供了特异性结合hLIGHT表位的抗体，该抗体包含本文所述的特异性结合hLIGHT抗原的VH结构域、VH CDR、VL结构域和VL CDR的衍生物。本发明还提供了包含实施例中公开的抗体衍生物的抗体，其中所述抗体特异性结合hLIGHT表位。本领域技术人员已知的标准技术可用于在编码本发明的分子的核苷酸序列中引入突变，包括例如产生氨基酸置换的定点诱变和PCR介导的诱变。优选地，衍生物相对于原分子包括少于25个氨基酸置换、少于20个氨基酸置换、少于15个氨基酸置换、少于10个氨基酸置换、少于5个氨基酸置换、少于4个氨基酸置换、少于3个氨基酸置换或少于2个氨基酸置换。在一个优选实施方案中，衍生物具有在一个或多个预测非必需氨基酸残基处产生的保守性氨基酸置换。可选地，突变可沿着整个或部分编码序列，例如通过饱和诱变随机引入，并且可筛选所得突变体的生物活性以鉴定保持活性的突变体。诱变后，可表达编码的蛋白质并测定蛋白质的活性。
在另一个实施方案中，特异性结合hLIGHT表位的抗体包含与序列表的可变结构域氨基酸序列至少35％、至少40％、至少45％、至少50％、至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％同一性的可变结构域氨基酸序列。
在具体实施方案中，所述抗体为全人抗人抗体，如全人单克隆抗体。多核苷酸可通过本领域已知的任何方法产生。示例性方法包括用hLIGHT抗原(能够引发免疫反应并且任选缀合至载体的任何hLIGHT多肽)免疫接种转基因动物(例如，小鼠)，该动物能够在缺乏内源性免疫球蛋白产生时产生人抗体库；参见例如Jakobovits等，(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.,90:2551；Jakobovits等，(1993)Nature,362:255 258(1993)；Bruggermann等，(1993)Year in Immunol.,7:33。在本文提供的实施例中可以找到产生全人抗hLIGHT抗体的其他方法。
可选地，可通过体外筛选噬菌体展示抗体文库产生全人抗体；参见例如Hoogenboom等，J.Mol.Biol.,227:381(1991)；Marks等，J.Mol.Biol.,222:581(1991)，其通过引用并入本文。已经描述了各种含抗体的噬菌体展示文库并且可易于为本领域技术人员制备。文库可含多种多样的可筛选适当靶标的人抗体序列，如人Fab、Fv和scFv片段。
本发明的抗体和片段包括经化学修饰，即通过任何类型的分子与抗体的共价连接修饰的抗体和片段。例如，但不以限制的方式，抗体衍生物包括已经(例如)通过已知糖基化、乙酰化、聚乙二醇化、磷酸化、酰胺化、用已知保护/封端基团衍生化、蛋白水解切割、连接到细胞配体或其他蛋白质等化学修饰的抗体。许多化学修饰中的任一种均可通过已知技术进行，包括但不限于特异性化学切割、乙酰化、甲酰化、衣霉素的代谢合成等。另外，所述抗体可含一个或多个非经典氨基酸。
本发明还提供了特异性结合hLIGHT抗原的抗体，其包含本领域技术人员已知的骨架区(例如，人或非人骨架)。骨架区可为，例如，天然产生的或共有骨架区。更优选地，本发明抗体的骨架区为人类的(对于人骨架区的列表，参见例如Chothia等，1998，J.Mol.Biol.278:457-479，其通过引用整体并入本文)。还参见Kabat等(1991)Sequencesof Proteins of Immunological Interest(U.S.Department of Health and HumanServices,Washington,D.C.)第5版。
在一个具体实施方案中，本发明提供了特异性结合hLIGHT抗原的抗体，所述抗原包含序列表中一个或多个CDR的氨基酸序列和在下列1、2、3个或更多个残基处具有一个或多个氨基酸置换的人骨架区：(a)在鼠类抗体骨架(即，供者抗体骨架)和人抗体骨架(即，受者抗体骨架)之间不同的稀有骨架残基；(b)在供者抗体骨架和受者抗体骨架之间不同时的游标区(Vernier zone)残基；(c)VH/VL界面处在供者抗体骨架和受者抗体骨架之间不同的链间包装残基；(d)在供者抗体骨架和受者抗体骨架序列，特别是对于鼠类抗体CDR环的规范类别的定义至关重要的骨架区之间不同的规范残基；(e)与CDR相邻的残基；(g)能够与抗原相互作用的残基；(h)能够与CDR相互作用的残基；和(i)VH结构域和VL结构域之间的接触残基。在某些实施方案中，特异性结合包含在以上鉴定的1、2、3个或更多个残基处具有一个或多个氨基酸置换的人骨架区的hLIGHT抗原的抗体是拮抗性hLIGHT抗体。
本发明涵盖特异性结合hLIGHT抗原的抗体，所述抗体包含序列表中VH结构域和/或VL结构域的氨基酸序列，但是在骨架区中有突变(例如，一个或多个氨基酸置换)。在某些实施方案中，特异性结合hLIGHT抗原的抗体包含实施例中公开的抗体的VH结构域和/或VL结构域或其抗原结合片段的氨基酸序列，在VH结构域和/或VL结构域的骨架区中具有一个或多个氨基酸残基置换。
在一些实施方案中，本文提供的抗体降低或抑制hLIGHT与HVEM、LTβR和/或DcR3的结合，和/或降低或抑制受试者(例如，人类受试者)中的hLIGHT生物活性，如CCL20、IL8和/或RANTES的分泌。在某些实施方案中，本文提供的抗体，如人单克隆抗hLIGHT抗体，降低或抑制可溶性或细胞表面表达的hLIGHT与HVEM或LTβR的结合，和/或在接触可溶性或细胞表面表达的hLIGHT后降低或抑制受试者中CCL20和/或RANTES的分泌。在一些实施方案中，hLIGHT为hLIGHT的SNP变体，如214E-32S、214K-32S、214E-32L或214K-32L。本文提供的抗体对hLIGHT与HVEM、LTβR和/或DCR3结合的阻断活性可使用如实施例中所述的测定法检测。本文提供的hLIGHT抗体对表达hLIGHT受体的细胞的生物活性的抑制可使用如实施例中所述的测定法检测。
本发明还提供了包含本文提供的特异性结合hLIGHT抗原的抗体和异源多肽的融合蛋白。在一些实施方案中，与抗体融合的异源多肽对于使抗体靶向具有细胞表面表达的hLIGHT的细胞有用。
抗体缀合物和融合蛋白
以下关于缀合物和融合蛋白的讨论也适用于片段，以致提到抗体的公开加以必要的变更也可适用于本发明的片段。
在一些实施方案中，本发明的抗体缀合或重组融合至诊断剂、可检测试剂或治疗剂或任何其他分子。缀合或重组融合的抗体可作为临床试验程序的一部分用于，例如监测或诊断hLIGHT介导的疾病的发作、发展、进展和/或严重程度，如测定特定疗法的功效。
此类诊断和检测可(例如)通过使抗体与可检测物质偶联来实现，可检测物质包括但不限于各种酶，例如但不限于辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶或乙酰胆碱酯酶；辅基，例如但不限于链霉亲和素/生物素和亲和素/生物素；荧光物质，例如但不限于伞形酮、荧光素、异硫氰酸荧光素、若丹明(rhodamine)、二氯三嗪基胺荧光素、丹磺酰氯或藻红蛋白；发光物质，例如但不限于鲁米诺(luminol)；生物发光物质，例如但不限于萤光素酶、萤光素和水母发光蛋白；放射性物质，例如但不限于碘(131I、125I、123I和121I)、碳(14C)、硫(35S)、氚(3H)、铟(115In、113In、112In和111In)、锝(99Tc)、铊(201Ti)、镓(68Ga、67Ga)、钯(103Pd)、钼(99Mo)、氙(133Xe)、氟(18F)、153Sm、177Lu、159Gd、149Pm、140La、175Yb、166Ho、90Y、47Sc、186Re、188Re、142Pr、105Rh、97Ru、68Ge、57Co、65Zn、85Sr、32P、153Gd、169Yb、51Cr、54Mn、75Se、113Sn和117Sn；和使用各种正电子发射断层扫描的正电子发射金属，和非放射性顺磁金属离子。
本发明还涵盖缀合或重组融合至治疗部分(或一个或多个治疗部分)的本发明抗体的用途。抗体可缀合或重组融合至治疗部分，如细胞毒素(例如，细胞抑制剂或杀细胞剂)、治疗剂或放射性金属离子(例如，α-发射体)。细胞毒素或细胞毒性剂包括对细胞有害的任何试剂。治疗部分包括但不限于抗代谢物(例如，甲氨蝶呤(methotrexate)、6-颈基嘌呤、6-硫鸟嘌呤、阿糖胞苷(cytarabine)、5-氟尿嘧啶、氮烯咪胺(decarbazine))；烷化剂(例如，双氯乙基甲胺(mechlorethamine)、塞替派(thioepa)苯丁酸氮芥(chlorambucil)、美法仑(melphalan)、卡莫司汀(carmustine，BSNU)和洛莫司汀(lomustin,CCNU)、环磷酰胺(cyclophosphamide)、白消安(busulfan)、二溴甘露醇、链脲菌素(streptozotocin)、丝裂霉素C(mitomycin C)和顺-二氯二胺铂(II)(DDP)和顺铂(cisplatin))；蒽环霉素(例如，柔红霉素(daunorubicin)(原道诺霉素(daunomycin))和多柔比星(doxorubicin))；抗生素(例如，d放线菌素(d actinomycin)(原放线菌素(actinomycin))、博来霉素(bleomycin)、光神霉素(mithramycin)和蒽霉素(anthramycin，AMC))；澳瑞他汀(Auristatin)分子(例如，澳瑞他汀PHE、苔藓抑素1(bryostatin 1)和索拉他汀10(solastatin 10)；参见Woyke等，Antimicrob.Agents Chemother.46:3802-8(2002)，Woyke等，Antimicrob.AgentsChemother.45:3580-4(2001)，Mohammad等，Anticancer Drugs 12:735-40(2001)，Wall等，Biochem.Biophys.Res.Commun 266:76-80(1999)，Mohammad等，Int.J.Oncol.15:367-72(1999)，其全部通过引用并入本文)；激素(例如，糖皮质激素(glucocorticoid)、孕酮(progestin)、雄激素(androgen)和雌激素(estrogen))、DNA修复酶抑制剂(例如，依托泊苷(etoposide)或拓扑替康(topotecan))、激酶抑制剂(例如，化合物ST1571、甲磺酸伊马替尼(imatinib mesylate)(Kantarjian等，Clin Cancer Res.8(7):2167-76(2002))；细胞毒性剂(例如，紫杉醇(paclitaxel)、细胞松弛素B(cytochalasin B)、短杆菌肽D(gramicidinD)、溴化乙锭(ethidium bromide)、依米丁(emetine)、丝裂霉素、依托泊苷(etoposide)、替尼泊苷(tenoposide)、长春新碱(vincristine)、长春花碱(vinblastine)、秋水仙素(colchicin)、阿霉素(doxorubicin)、柔红霉素、二羟基炭疽菌素二酮(dihydroxyanthracin dione)、米托蒽醌(mitoxantrone)、光神霉素、放线菌素D、1-去氢睾酮、糖皮质激素、普鲁卡因(procaine)、丁卡因(tetracaine)、利多卡因(lidocaine)、心得安(propranolol)和嘌呤霉素(puromycin)及其类似物或同系物和美国专利第6,245,759、6,399,633、6,383,790、6,335,156、6,271,242、6,242,196、6,218,410、6,218,372、6,057,300、6,034,053、5,985,877、5,958,769、5,925,376、5,922,844、5,911,995、5,872,223、5,863,904、5,840,745、5,728,868、5,648,239、5,587,459号中公开的那些化合物)；法呢基转移酶抑制剂(例如，R115777、BMS-214662，和例如美国专利第6,458,935、6,451,812、6,440,974、6,436,960、6,432,959、6,420,387、6,414,145、6,410,541、6,410,539、6,403,581、6,399,615、6,387,905、6,372,747、6,369,034、6,362,188、6,342,765、6,342,487、6,300,501、6,268,363、6,265,422、6,248,756、6,239,140、6,232,338、6,228,865、6,228,856、6,225,322、6,218,406、6,211,193、6,187,786、6,169,096、6,159,984、6,143,766、6,133,303、6,127,366、6,124,465、6,124,295、6,103,723、6,093,737、6,090,948、6,080,870、6,077,853、6,071,935、6,066,738、6,063,930、6,054,466、6,051,582、6,051,574和6,040,305号中公开的那些)；拓扑异构酶抑制剂(例如，喜树碱(camptothecin)；伊立替康(irinotecan)；SN-38；拓扑替康；9-氨基喜树碱；GG-211(GI 147211)；DX-8951f；IST-622；鲁比替康(rubitecan)；吡唑啉吖啶(pyrazoloacridine)；XR-5000；圣托品(s aintopin)；UCE6；UCE1022；TAN-1518A；TAN 1518B；KT6006；KT6528；ED-110；NB-506；ED-110；NB-506；和蝴蝶霉素(rebecca mycin))；博格雷(bulgarein)；DNA小沟结合剂如赫斯特(Hoescht)染料33342和赫斯特染料33258；两面针碱(nitidine)；花椒宁碱(fagaronine)；表小檗碱(epiberberine)；柯楠因(coralyne)；β-拉帕醌(beta-lapachone)；BC-4-1；二膦酸盐(例如，阿仑膦酸盐(alendronate)、英卡膦酸盐(cima dronte)、氯屈膦酸盐(clodronate)、替鲁膦酸盐(tiludronate)、依替膦酸盐(etidronate)、伊班膦酸盐(ibandronate)、奈立膦酸盐(neridronate)、奥盘膦酸盐(olpandronate)、利塞膦酸盐(risedronate)、吡膦酸盐(piridr onate)、帕米膦酸盐(pamidronate)、唑来膦酸盐(zolendronate))，HMG-CoA还原酶抑制剂(如洛伐他汀(lovastatin)、辛伐他汀(simvastatin)、阿托伐他汀(atorvastatin)、普伐他汀(pravastatin)、氟伐他汀(fluvastati n)、他汀(statin)、西立伐他汀(cerivastatin)、来适可(lescol)、力普妥(l upitor)、罗苏伐他汀(rosuvastatin)和阿托伐他汀)；反义寡核苷酸(例如美国专利第6,277,832、5,998,596、5,885,834、5,734,033和5,618,709中公开的那些)；腺苷脱氨酶抑制剂(如磷酸氟达拉滨(Fludarabinephosphate)和2-氯脱氧腺苷)；替伊莫单抗(ibritumomab tiuxetan， )；托西莫单抗(tositumomab，)及其药学上可接受的盐、溶剂合物、包合物和前药。
进一步地，本发明的抗体可缀合或重组融合至改变给定生物反应的治疗部分或药物部分。治疗部分或药物部分不得被解释为限于经典的化疗剂。例如，药物部分可为具有所需生物活性的蛋白质、肽或多肽。此类蛋白质可包括例如，毒素如相思豆毒素(abrin)、蓖麻毒素A(ricin A)、假单胞菌外毒素、霍乱毒素或白喉毒素；蛋白质，如肿瘤坏死因子、γ-干扰素、α-干扰素、神经生长因子、血小板源性生长因子、组织纤溶酶原激活物、凋亡剂，如TNF-γ、TNF-γ、AIM I(参见国际公开号WO 97/33899)、AIM II(参见国际公开号WO 97/34911)、Fas配体(Takahashi等，1994，J.Immunol.，6:1567-1574)和VEGF(参见国际公开号WO 99/23105)，抗-血管新生剂，例如血管抑素(angiostatin)、内皮抑素(endostatin)或凝固途径的组分(例如，组织因子)；或生物反应调节剂，例如，淋巴因子(例如，干扰素γ、白细胞介素-1(“IL-1”)、白细胞介素-2(“IL-2”)、白细胞介素-5(“IL-5”)、白细胞介素-6(“IL-6”)、白细胞介素-7(“IL-7”)、白细胞介素-9(“IL-9”)、白细胞介素-10(“IL-10”)、白细胞介素-12(“IL-12”)、白细胞介素-15(“IL-15”)、白细胞介素-23(“IL-23”)、粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(“GM-CSF”)和粒细胞集落刺激因子(“G-CSF”))或生长因子(例如，生长激素(“GH”))或凝固剂(例如，钙、维生素K、组织因子，例如但不限于哈格曼因子(Hagemanfactor)(因子XII)、高分子量激肽原(HMWK)、前激肽释放酶(PK)、凝固蛋白因子II(凝血酶原)、因子V、XIIa、VIII、XIIIa、XI、XIa、IX、IXa、X、磷脂和纤维蛋白单体)。
本发明涵盖重组融合或化学缀合至异源蛋白或多肽(或其片段，优选约10个、约20个、约30个、约40个、约50个、约60个、约70个、约80个、约90个或约100个氨基酸的多肽)以产生融合蛋白的本发明的抗体。具体而言，本发明提供了包含本发明抗体的抗原结合片段(例如，Fab片段、Fd片段、Fv片段、F(ab)2片段、VH结构域、VH CDR、VL结构域或VL CDR)和异源蛋白、多肽或肽的融合蛋白。在一个实施方案中，与抗体融合的异源蛋白、多肽或肽对于使抗体靶向特定细胞类型，如表达hLIGHT或hLIGHT受体的细胞有用。例如，特异性结合由特定细胞类型(例如，免疫细胞)表达的细胞表面受体的抗体可融合或缀合至本发明经修饰的抗体。
本发明的缀合或融合蛋白包含本文描述的本发明的抗体和异源多肽。在一个实施方案中，本发明的缀合或融合蛋白包含实施例中公开的抗体的可变结构域和异源多肽。
另外，本发明的抗体可缀合至治疗部分，如放射性金属离子如α发射物(如213Bi)，或者可缀合至用于将放射性金属离子，包括但不限于131In、131LU、131Y、131Ho、131Sm与多肽缀合的大环螯合剂。在某些实施方案中，大环螯合剂是1,4,7,10-四氮杂环十二烷-N,N’,N”,N”’-四乙酸(DOTA)，其可通过接头分子与抗体连接。此类接头分子是本领域公知的并且在Denardo等，1998，Clin Cancer Res.4(10):2483-90；Peterson等，1999，Bioconjug.Chem.10(4):553-7；和Zimmerman等，1999，Nucl.Med.Biol.26(8):943-50中有描述，其各自通过引用整体并入。
而且，本发明的抗体可与标记序列，如利于纯化的肽融合。.在优选实施方案中，标记氨基酸序列为六-组氨酸肽，如pQE载体(QIAGEN,Inc.)中提供的标签，其中，许多可购买获得。如Gentz等，1989，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:821-824中所述，例如六-组氨酸提供了对融合蛋白的简便纯化。用于纯化的其他肽标签包括但不限于对应于源自流感血凝素蛋白的表位的血凝素(“HA”)标签(Wilson等，1984，Cell 37:767)，及“FLAG”标签。
使治疗部分(包括多肽)融合或缀合至抗体的方法是熟知的，参见例如Arnon等，“Monoclonal Antibodies For Immunotargeting Of Drugs In Cancer Therapy”，在Monoclonal Antibodies And Cancer Therapy中，Reisfeld等(编)，第243-56页(AlanR.Liss,Inc.1985)；Hellstrom等，“Antibodies For Drug Delivery”，在Controlled DrugDelivery(第2版)中，Robinson等(编)，第623-53页(Marcel Dekker,Inc.1987)；Thorpe，“Antibody Carriers Of Cytotoxic Agents In Cancer Therapy:A Review”，在Monoclonal Antibodies 84:Biological And Clinical Applications中，Pinchera等(编)，第475-506页(1985)；“Analysis,Results,And Future Prospective Of TheTherapeutic Use Of Radiolabeled Antibody In Cancer Therapy”，在MonoclonalAntibodies For Cancer Detection And Therapy中，Baldwin等(编)，第303-16页(Academic Press 1985)，Thorpe等，1982，Immunol.Rev.62:119-58；美国专利第5,336,603、5,622,929、5,359,046、5,349,053、5,447,851、5,723,125、5,783,181、5,908,626、5,844,095和5,112,946；EP 307,434；EP 367,166；EP 394,827号；PCT公开WO 91/06570、WO96/04388、WO 96/22024、WO 97/34631和WO 99/04813；Ashkenazi等，Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88:10535-10539，1991；Traunecker等，Nature，331:84-86，1988；Zheng等，J.Immunol.，154:5590-5600，1995；Vil等，Proc.Natl.Acad.Sci.USA，89:11337-11341，1992，其通过引用整体并入本文。
可(例如)通过基因改组、基序改组、外显子改组和/或密码子改组(统称为“DNA改组”)的技术生成融合蛋白。DNA改组可用于改变本发明抗体的活性(例如，抗体具有更高亲和力和更低解离速率)。通常参见美国专利第5,605,793、5,811,238、5,830,721、5,834,252和5,837,458号；Patten等，1997，Curr.Opinion Biotechnol.8:724-33；Harayama，1998，Trends Biotechnol.16(2):76-82；Hansson等，1999，J.Mol.Biol.287:265-76；及Lorenzo和Blasco，1998，Biotechniques24(2):308-313(这些专利和出版物中的每一个均据此通过引用整体并入)。可在重组之前通过易错PCR、随机核苷酸插入或其他方法进行随机诱变来改变抗体或编码的抗体。编码本发明的抗体的多核苷酸可与一种或多种异源分子的一个或多个组分、基序、区段、部分、结构域、片段等重新组合。
如通过引用整体并入本文的美国专利第4,676,980号中所述，本发明的抗体也可缀合至第二抗体以形成抗体异源缀合物。
应选择缀合或重组融合至特异性结合hLIGHT抗原的本发明抗体的治疗部分或药物以实现所需预防或治疗效果。在某些实施方案中，抗体是经修饰的抗体。临床或其他医务人员在决定哪种治疗部分或药物缀合或重组融合至本发明的抗体时应考虑以下因素：疾病特征、疾病严重程度和受试者的状况。
本发明的抗体也可连接到固体支撑体上，这对靶抗原的免疫测定或纯化特别有用。此类固体支撑体包括但不限于玻璃、纤维素、聚丙烯酰胺、尼龙(nylon)、聚苯乙烯、聚氯乙烯或聚丙烯。
药物组合物
以下关于组合物的讨论也适用于片段，以致提到抗体的公开加以必要的变更也可适用于本发明的片段。
可通过将具有所需程度的纯度的抗体与任选生理上可接受的载体、赋形剂或稳定剂(Remington's Pharmaceutical Sciences(1990)Mack Publishing Co.,Easton,Pa.)混合，制备呈冻干制剂或水溶液形式的含本文提供的本发明的一种或多种抗体的治疗制剂供储存。可接受的载体、赋形剂或稳定剂在所用剂量和浓度下对受者无毒性并且包括：缓冲剂，如磷酸盐、柠檬酸盐和其他有机酸；抗氧化剂，包括抗坏血酸和甲硫氨酸；防腐剂(如十八烷基二甲基苄基氯化铵；氯化六烃季铵；苯扎氯铵、氯化苄乙氧铵；苯酚、丁醇或苄醇；如对羟基苯甲酸甲酯或对羟基苯甲酸丙酯的对羟基苯甲酸烷基酯；儿茶酚；间苯二酚；环己醇；3-戊醇；和间甲酚)；低分子量(少于约10个残基)多肽；蛋白质，如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白；亲水性聚合物，如聚乙烯吡咯烷酮；氨基酸，如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、组氨酸、精氨酸或赖氨酸；单糖、二糖和其他碳水化合物，包括葡萄糖、甘露糖或糊精；螯合剂如EDTA；糖如蔗糖、甘露糖醇、海藻糖或山梨糖醇；成盐反离子如钠；金属络合物(例如，Zn-蛋白质络合物)；和/或非离子型表面活性剂如TWEENTM、PLURONICSTM或聚乙二醇(PEG)。
本文提供的本发明的抗体也可以(例如)配制于脂质体中。含目标分子的脂质体通过本领域已知的方法制备，如Epstein等(1985)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:3688；Hwang等(1980)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4030；美国专利第4,485,045和4,544,545号中所述。美国专利第5,013,556号中公开了循环时间延长的脂质体。
可通过反相蒸发法，用含有磷脂酰胆碱、胆固醇和PEG衍化磷脂酰乙醇胺(PEG-PE)的脂质组合物生成特别有用的免疫脂质体。挤压脂质体通过规定孔径的过滤器以产生具有所需直径的脂质体。本文提供的抗体的Fab’片段可经由二硫化物交换反应缀合至如Martin等(1982)J.Biol.Chem.257:286-288中所述的脂质体。化疗剂(如多柔比星)任选地含在脂质体内；参见Gabizon等，(1989)J.National Cancer Inst.81(19):1484。
制剂，如本文描述的那些，在对于治疗的特定适应症必要时也可含有一种以上的活性化合物。在某些实施方案中，制剂包含本发明的抗体和一种或多种具有互补活性，不会相互带来不利影响的活性化合物。此类分子以对于预期目的有效的量适当地联合存在。例如，本发明的抗体可与一种或多种其他治疗剂联合。此类联合疗法可连续或同时或按顺序向患者施用。
也可将本发明的抗体包埋在例如通过凝聚技术或通过界面聚合制备的微胶囊(分别例如为羟甲基纤维素或明胶微胶囊和聚(甲基丙烯酸甲酯)微胶囊)中，包埋在胶态药物递送系统(例如脂质体、白蛋白微球、微乳液、纳米粒子和纳米胶囊)中或包埋在粗乳液中。在Remington's Pharmaceutical Sciences(1990)Mack Publishing Co.,Easton,Pa.中公开的此类技术。
可用于体内施用的制剂可无菌。这易于通过(例如)无菌滤过膜过滤实现。
也可制备持续释放制剂。持续释放制剂的合适实例包括含有拮抗剂的固体疏水性聚合物的半透性基质，所述基质呈成形制品(例如薄膜或微胶囊)的形式。持续释放基质的实例包括聚酯、水凝胶(例如聚(2-羟基-甲基丙烯酸酯)或聚(乙烯醇))、聚丙交酯(美国专利第3,773,919号)、L-谷氨酸与L-谷氨酸-乙酯的共聚物、不可降解的乙烯-乙酸乙烯酯、可降解的乳酸-乙醇酸共聚物如LUPRON DEPOTTM(由乳酸-乙醇酸共聚物和醋酸亮丙瑞林(leuprolide acetate)组成的可注射微球)以及聚-D-(-)-3-羟基丁酸。虽然聚合物如乙烯-乙酸乙烯酯和乳酸-乙醇酸使得分子能够释放100天以上，但是某些水凝胶释放蛋白质的时间期限较短。当封装抗体在体内长时间保持时，其可由于在37℃下暴露于湿气而变性或聚集，导致生物活性的丧失和可能的免疫原性变化。可根据所涉机制设计合理的策略进行稳定化。例如，如果发现聚集机制是通过硫基-二硫化物交换的分子间S—S键形成，则可通过修饰巯基残基，从酸性溶液中冻干，控制水分含量，使用适当的添加剂，并开发特定聚合物基质组合物来实现稳定化。
本文提供的药物组合物含治疗有效量的于药学上可接受的载体中的本文提供的本发明的一种或多种抗体，和任选一种或多种附加预防或治疗剂。此类药物组合物在hLIGHT介导的疾病，如炎症性肠病或其一种或多种症状的预防、治疗、管理或改善中有用。
适于施用本文提供的化合物的药物载体包括本领域技术人员已知适于特定施用模式的任何此类载体。
另外，本发明的抗体可作为组合物中唯一的药物活性成分配制或可与其他活性成分(如一种或多种其他预防或治疗剂)组合。
所述组合物可含本发明的一种或多种抗体。在一个实施方案中，将抗体配制成供口服施用的合适药物制剂，如溶液、混悬液、片剂、分散片、丸剂、胶囊、粉剂、持续释放制剂或酏剂或配制成供肠胃外施用的无菌溶液或混悬液，以及透皮贴片制剂和干粉吸入剂。在一个实施方案中，使用本领域熟知的技术和程序将上述抗体配制成药物组合物(参见例如Ansel(1985)Introduction to Pharmaceutical Dosage Forms，第4版，第126页)。
在所述组合物中，有效浓度的一种或多种抗体或其衍生物与合适的药物载体混合。组合物中所述化合物的浓度对于在施用后递送治疗、预防或改善hLIGHT介导的疾病或其症状的量有效。
在一个实施方案中，所述组合物配制用于单剂量施用。为配制组合物，按有效浓度将一定重量分数的化合物溶解、悬浮、分散或以其他方式与所选载体混合，以便缓解、预防受治病状，或改善一种或多种症状。
本发明的抗体按足以在对受治患者没有不良副作用时产生治疗上有用的效果的有效量包括在药学上可接受的载体中。可通过使用常规方法在体外和体内系统中试验化合物根据经验测定治疗有效浓度，然后由其推断出用于人类的剂量。
药物组合物中抗体的浓度将取决于，例如抗体的物理化学特征、用药方案和施用的量以及本领域技术人员已知的其他因素。
在一个实施方案中，治疗有效剂量产生约0.1ng/ml至约50-100μg/ml的抗体血清浓度。在另一个实施方案中，药物组合物提供每天约0.001mg至约2000mg抗体/kg体重的剂量。可制备药物剂量单位形式以提供每个剂量单位形式约0.01mg、0.1mg或1mg至约500mg、1000mg或2000mg，并且在一个实施方案中约10mg至约500mg抗体和/或其他任选必需成分的组合。
抗体可一次性施用，或者可分成多个较小剂量在不同的时间间隔施用。应理解，精确剂量和治疗持续时间是受治疾病的函数并且可使用已知的试验方案根据经验测定或通过从体内或体外试验数据推断而测定。应当注意，浓度和剂量值还可随要缓解的病状的严重程度而变化。还应当理解，对于任何特定受试者，具体的剂量方案可随着时间根据个体需要以及管理或监督组合物施用的人员的专业判断而调整，并且本文提出的浓度范围仅为示例性并非旨在限制要求保护的组合物的范围或实践。
抗体混合或添加后，所得混合物可为溶液、混悬液、乳液等。所得混合物的形式取决于许多因素，包括预期施用模式和化合物在所选载体或媒介物中的溶解度。有效浓度足以改善受治疾病、病症或病状的症状并且可根据经验确定。
药物组合物呈单位剂量形式，如片剂、胶囊、丸剂、粉剂、粒剂、无菌肠胃外溶液或混悬液和口服溶液或混悬液，及含有适量化合物或其药学上可接受的衍生物的水-油乳液提供，以向人类和动物施用。在一个实施方案中，抗体呈单位剂量形式或多剂量形式配制和施用。如本文中所用的单位剂量形式是指适于人类和动物受试者并且如本领域已知的那样单独包装的物理离散单元。每个单位剂量含有预定量的抗体，该预定量的抗体足以与需要的药物载体、媒介物或稀释剂组合产生所需治疗效果。单位剂量形式的实例包括安瓿和注射器及单独包装的片剂或胶囊。单位剂量形式可分多份或多次施用。多剂量形式是包装在单个容器中呈分开的单位剂量形式施用的多个相同单位剂量形式。多剂量形式的实例包括片剂或胶囊的小瓶、瓶或品脱或加仑瓶。因此，多剂量形式是多个在包装上未分开的单位剂量。
在优选实施方案中，本发明的一种或多种抗hLIGHT抗体呈液体药物制剂。药学上可施用的液体组合物可以例如通过将以上定义的活性化合物和任选的药物辅剂在载体，如水、盐水、右旋糖水溶液、甘油、乙二醇、乙醇等等中溶解、分散或以其他方式混合来制备，从而形成溶液或混悬液。如果需要，要施用的药物组合物也可含微量无毒辅助物质如润湿剂、乳化剂、增溶剂、pH缓冲剂等，例如乙酸盐、柠檬酸钠、环糊精衍生物、脱水山梨糖醇单月桂酸酯、三乙醇胺乙酸钠、油酸三乙醇胺以及其他此类试剂。
制备此类剂型的实际方法是本领域技术人员已知的或将是显而易见的；例如参见Remington's Pharmaceutical Sciences(1990)Mack Publishing Co.,Easton,Pa.。
可以制备含有在0.005％至100％范围内的抗体，余量由无毒载体构成的剂型或组合物。制备这些组合物的方法为本领域技术人员已知。
口服药物剂型为固体、凝胶或液体。固体剂型为片剂、胶囊、粒剂和散装粉剂。口服片剂的类型包括压缩、咀嚼糖锭和片剂，其可有肠溶包衣、糖衣或薄膜包衣。胶囊可为硬或软明胶胶囊，而粒剂和粉剂可与本领域技术人员已知的其他成分的组合一起呈非泡腾或泡腾形式提供。
在某些实施方案中，所述制剂为固体剂型。在某些实施方案中，所述制剂为胶囊或片剂。片剂、丸剂、胶囊、锭剂等可含以下成分或相似性质的化合物中的一种或多种：粘合剂；润滑剂；稀释剂；助流剂；崩解剂；着色剂；甜味剂；调味剂；润湿剂；催吐包衣；和薄膜包衣。粘合剂的实例包括微晶纤维素、黄蓍胶、葡萄糖溶液、阿拉伯胶浆、明胶溶液、糖蜜、聚乙烯吡咯烷酮、聚烯吡酮、交聚维酮、蔗糖和淀粉糊。润滑剂包括滑石、淀粉、硬脂酸镁或钙、石松子和硬脂酸。稀释剂包括，例如乳糖、蔗糖、淀粉、高岭土、盐、甘露糖醇和磷酸二钙。助流剂包括但不限于胶态二氧化硅。崩解剂包括交联羧甲基纤维素钠、羟基乙酸淀粉钠、海藻酸、玉米淀粉、马铃薯淀粉、膨润土、甲基纤维素、琼脂和羧甲基纤维素。着色剂包括，例如经批准认证的水溶性FD和C染料中的任一种及其混合物；和悬浮在氧化铝水合物上的水溶性FD和C染料。甜味剂包括蔗糖、乳糖、甘露糖醇和人工甜味剂如糖精和许多喷雾干燥的调味料。调味剂包括从植物如水果中提取的天然调味料和产生快感的化合物的合成掺合物，例如但不限于薄荷和水杨酸甲酯。润湿剂包括单硬脂酸丙二醇酯、山梨糖醇酐单油酸酯、二乙二醇单月桂酸酯和聚氧乙烯月桂酰醚。催吐包衣包括脂肪酸、脂肪、蜡、虫胶、氨化虫胶和邻苯二甲酸乙酸纤维素。薄膜包衣包括羟乙基纤维素、羧甲基纤维素钠、聚乙二醇4000和邻苯二甲酸乙酸纤维素。
本发明的抗体可以在保护其免受胃部酸性环境的组合物中提供。例如，将组合物配制在肠溶衣中，肠溶衣保持其在胃部的完整性并且在肠道释放活性化合物。也可以与抗酸剂或其他此类成分组合配制所述组合物。
当剂量单位形式为胶囊时，其除了以上类型的材料外还可以包含液体载体，如脂肪油。另外，剂量单位形式可含改变剂量单位的物理形式的各种其他材料，例如糖和其他肠溶剂包衣。所述化合物也可作为酏剂、混悬液、糖浆剂、糯米纸囊剂、喷剂、口香糖等的组分施用。糖浆剂除了活性化合物外还可含作为甜味剂的蔗糖以及某些防腐剂、染料和着色剂及调味料。
所述抗体也可与不损害所需作用的其他活性材料或与对所需作用进行补充的其他材料，如抗酸剂、H2阻断剂和利尿剂混合。活性成分是如本文所述的抗体或其药学上可接受的衍生物。可包括高达约98重量％的较高浓度的活性成分。
在所有实施方案中，片剂和胶囊制剂可如本领域技术人员已知那样涂有包衣以便改变或维持活性成分的溶解。因此，例如，它们可涂有常规的肠可消化包衣，如水杨酸苯酯、蜡和邻苯二甲酸乙酸纤维素。
在优选实施方案中，所述制剂为液体剂型。液体剂型包括水溶液、乳液、混悬液、溶液和/或由非泡腾粒剂复水的混悬液和由泡腾粒剂复水的泡腾制剂。水溶液包括，例如酏剂和糖浆剂。乳液为水包油型或油包水型。
酏剂为澄清、甜味、水醇制剂。酏剂中使用的药学上可接受的载体包括溶剂。糖浆剂是糖，例如蔗糖的浓缩水溶液，并且可含防腐剂。乳液是双相体系，其中一种液体呈小球体的形式遍布分散于另一种液体中。乳液中使用的药学上可接受的载体为非水液体、乳化剂和防腐剂。混悬液使用药学上可接受的助悬剂和防腐剂。非泡腾粒剂中用于复水成液体口服剂型的药学上可接受的物质包括稀释剂、甜味剂和润湿剂。泡腾粒剂中用于复水成液体口服剂型的药学上可接受的物质包括有机酸和二氧化碳源。着色剂和调味剂用于上述所有剂型中。
溶剂包括甘油、山梨糖醇、乙二醇和糖浆。防腐剂的实例包括甘油、对羟基苯甲酸甲酯和对羟基苯甲酸丙酯、苯甲酸、苯甲酸钠和醇。用于乳液中的非水液体的实例包括矿物油和棉籽油。乳化剂的实例包括明胶、阿拉伯胶、黄芪胶、膨润土和表面活性剂如聚氧乙烯山梨糖醇酐单油酸酯。助悬剂包括羧甲基纤维素钠、果胶、黄芪胶、Veegum和阿拉伯胶。甜味剂包括蔗糖、糖浆、甘油和人工甜味剂如糖精。润湿剂包括单硬脂酸丙二醇酯、山梨糖醇酐单油酸酯、二乙二醇单月桂酸酯和聚氧乙烯月桂酰醚。有机酸包括柠檬酸和酒石酸。二氧化碳源包括碳酸氢钠和碳酸钠。着色剂包括经批准认证的水溶性FD和C染料中的任一种及其混合物。调味剂包括从植物如水果中提取的天然调味料和产生愉悦口感的化合物的合成掺合物。
对于固体剂型而言，在例如碳酸丙烯、植物油或甘油三酯中的溶液或混悬液，在一个实施方案中，被封装在明胶胶囊中。此类溶液及其制备和封装在美国专利第4,328,245、4,409,239和4,410,545号中公开。对于液体剂型而言，例如在聚乙二醇中的溶液可用足量的药学上可接受的液体载体，例如水稀释以易于测量施用。
可选地，可通过将活性化合物或盐溶解或分散在植物油、二醇、甘油三酯、丙二醇酯(例如，碳酸丙烯)和其他此类载体中，并且将这些溶液或混悬液封装在硬或软明胶胶囊壳中来制备液体或半固体口服制剂。其他有用的制剂包括美国专利第RE28,819和4,358,603号中提出的那些。简言之，此类制剂包括但不限于含本文提供的化合物、二烷基化单或聚亚烷基二醇(包括但不限于1,2-二甲氧基甲烷、二甘醇二甲醚、三甘醇二甲醚、四甘醇二甲醚、聚乙二醇-350-二甲醚、聚乙二醇-550-二甲醚、聚乙二醇-750-二甲醚)和一种或多种抗氧化剂(如丁羟甲苯(BHT)、丁羟茴醚(BHA)、没食子酸丙酯、维生素E、氢醌、羟基香豆素、乙醇胺、卵磷脂、脑磷脂、抗坏血酸、苹果酸、山梨糖醇、磷酸、硫代二丙酸及其酯和二硫代氨基甲酸酯)的那些，其中350、550和750是指聚乙二醇的大致平均分子量。
其他制剂包括但不限于醇水溶液，包括药学上可接受的缩醛。这些制剂中所用的醇是具有一个或多个羟基的任何药学上可接受的水溶性溶剂，包括但不限于丙二醇和乙醇。缩醛包括但不限于低级烷基醛的二(低级烷基)缩醛如乙醛二乙缩醛。
在一个实施方案中，本文还考虑到了特征在于皮下、肌肉或静脉注射的肠胃外施用。注射剂可以常规形式制备，如作为液体溶液或悬浮液、注射前适于在液体中的溶液或悬浮液的固体形式或作为乳液。注射剂、溶液和乳液还含一种或多种赋形剂。合适的赋形剂为，例如水、盐水、右旋糖、丙三醇或乙醇。另外，如果需要，要施用的药物组合物也可含微量无毒辅助物质如润湿剂、乳化剂、pH缓冲剂、稳定剂、溶解度增强剂以及其他此类试剂，例如乙酸钠、脱水山梨糖醇单月桂酸酯、油酸三乙醇胺和环糊精。
本文还考虑到了维持恒定剂量水平的缓释或持续释放系统的植入(参见例如美国专利第3,710,795号)。简言之，本文提供的化合物分散在内部固体基质中，例如聚甲基丙烯酸甲酯、聚甲基丙烯酸丁酯、增塑或未增塑聚氯乙烯、增塑尼龙、增塑聚对苯二甲酸乙二醇酯、天然橡胶、聚异戊二烯、聚异丁烯、聚丁二烯、聚乙烯、乙烯-乙酸乙烯酯共聚物、硅橡胶、聚二甲硅氧烷、碳酸硅共聚物、亲水性聚合物(如丙烯酸和甲基丙烯酸酯的水凝胶)、胶原蛋白、被外部聚合膜(例如，聚乙烯、聚丙烯、乙烯/丙烯共聚物、乙烯/丙烯酸乙酯共聚物、乙烯/乙酸乙烯酯共聚物)包围的交联聚乙烯醇和部分水解的交联聚乙酸乙烯酯、硅橡胶、聚二甲基硅氧烷、氯丁橡胶、氯化聚乙烯、聚氯乙烯、氯乙烯与乙酸乙烯酯、偏二氯乙烯、乙烯和丙烯的共聚物、离聚物聚对苯二甲酸乙二醇酯、丁基橡胶、表氯醇橡胶、乙烯/乙烯醇共聚物、乙烯/乙酸乙烯酯/乙烯醇三元共聚物和不溶于体液的乙烯/乙烯基氧乙醇。在控制释放速率的步骤中抗体通过外部聚合膜扩散。此类肠胃外组合物中所含的抗体的量高度取决于其特异性性质以及化合物的活性和受试者的需要。
供肠胃外施用的制剂包括易于注射的无菌溶液，就在使用之前易于和溶剂组合的无菌干燥可溶性产品(如冻干粉，包括皮下注射片)，易于注射的无菌混悬液，就在使用之前易于和媒介物组合的无菌干燥不溶性产品和无菌乳液。所述溶液可为水性或非水性。
若静脉施用，则合适的载体包括生理盐水或磷酸盐缓冲盐水(PBS)及含有增稠剂和增溶剂，如葡萄糖、聚乙二醇和聚丙二醇的溶液及其混合物。
肠胃外制剂中所用的药学上可接受的载体包括水性媒介物、非水性媒介物、抗菌剂、等渗剂、缓冲剂、抗氧化剂、局部麻醉剂、助悬剂和分散剂、乳化剂、掩蔽或螯合剂和其他药学上可接受的物质。
水性媒介物的实例包括氯化钠注射剂、林格氏注射剂(Ringers Injection)、等渗右旋糖注射我、无菌水注射剂、右旋糖和乳酸林格氏注射剂。非水性肠胃外媒介物包括植物来源的不挥发性油、棉籽油、芝麻油和花生油。可向包装在多剂量容器中的肠胃外制剂添加抑菌或抑真菌浓度的抗菌剂，其包括苯酚或甲酚、汞剂、苯甲醇、氯丁醇、对羟基苯甲酸甲酯和丙酯、硫柳汞、苯扎氯铵和氯化苄乙氧铵。等渗剂包括氯化钠和右旋糖。缓冲剂包括磷酸盐和柠檬酸盐。抗氧化剂包括硫酸氢钠。局部麻醉剂包括盐酸普鲁卡因。助悬剂和分散剂包括羧甲基纤维素钠、羟丙基甲基纤维素和聚乙烯吡咯烷酮。乳化剂包括聚山梨醇酯80(吐温80)。金属离子的掩蔽或螯合剂包括EDTA。药物载体还包括用于水溶性媒介物的乙醇、聚乙二醇和聚丙二醇；和用于pH调节的氢氧化钠、盐酸、柠檬酸或乳酸。
调节药物活性化合物的浓度，使得注射剂提供有效量以产生所需药理学效应。如本领域所知，精确剂量取决于患者或动物的年龄、重量和状况。
单位剂量肠胃外制剂可包装在安瓿、小瓶或带针头的注射器中。如本领域已知和实践的那样，用于肠胃外施用的所有制剂均可无菌。
说明性地，静脉或动脉输注含活性化合物的无菌水溶液是有效的施用模式。另一个实施方案是必要时注射以产生所需药理学效应的含活性物质的无菌水或油溶液或混悬液。
设计用于局部和全身施用的注射剂。在一个实施方案中，将治疗有效剂量配制为含有至少约0.1％w/w至约90％w/w或更高，在某些实施方案中超过1％w/w浓度的活性化合物用于受治组织。
抗体呈微粉化或其他合适的形式悬浮。所得混合物的形式取决于许多因素，包括预期施用模式和化合物在所选载体或媒介物中的溶解度。有效浓度足以改善所述病状的症状并且可根据经验确定。
在其他实施方案中，药物制剂为冻干粉，其可复水为溶液、乳液和其他混合物进行施用。其也可复水和配制为固体或凝胶。
通过将本文提供的抗体或其药学上可接受的衍生物溶解在合适的溶剂中来制备冻干粉。在一些实施方案中，冻干粉无菌。溶剂可含提高稳定性的赋形剂或粉剂或由粉剂制备的复水溶液的其他药理学组分。可用的赋形剂包括但不限于右旋糖、山梨糖醇、果糖、玉米糖浆、木糖醇、甘油、葡萄糖、蔗糖或其他合适的试剂。溶剂还可含缓冲剂，如柠檬酸盐、磷酸钠或钾或本领域技术人员已知的其他此类缓冲剂，在一个实施方案中，大约为中性pH。溶液的后续无菌过滤，接着在本领域技术人员已知的标准条件下冻干提供了所选制剂。在一个实施方案中，所得溶液将被分到小瓶中进行冻干。每个小瓶将装有单个剂量或多个剂量的化合物。冻干粉可储存在适当条件下，如在约4℃至室温下。
用注射用水对这种冻干粉复水提供了用于肠胃外施用的制剂。为了复水，将冻干粉添加到无菌水或其他合适的载体中。精确的量取决于所选化合物。此量可根据经由确定。
如对于局部和全身施用所述，制备外用混合物。所得混合物可为溶液、混悬液、乳液等并且可配制成乳膏、凝胶、软膏、乳液、溶液、酏剂、洗剂、混悬液、酊剂、糊剂、泡沫、气溶胶、冲洗剂、喷雾剂、栓剂、绷带、皮肤贴片或适于表面施用的任何其他制剂。
本发明的抗体可配制成用于例如通过吸入表面应用的气溶胶(参见例如美国专利第4,044,126、4,414,209和4,364,923号，其描述了用于递送对治疗炎症性疾病，特别是哮喘有用的类固醇的气溶胶)。用于向呼吸道施用的这些制剂，单独地或与惰性载体如乳糖组合，对于喷雾器而言可以呈气溶胶或溶液形式，或对于吹入而言呈微细粉末。在此类情况下，制剂的颗粒将具有在一个实施方案中小于50微米，在一个实施方案中小于10微米的直径。
所述化合物可配制用于局部或表面应用，例如呈凝胶、乳膏和洗剂向(例如)眼部的皮肤和粘膜表面应用和用于向眼部应用或用于脑池内或脊柱内应用。考虑将表面施用用于透皮递送并且也用于向眼部或粘膜施用，或用于吸入疗法。也可施用单独的或与其他药学上可接受的赋形剂组合的活性化合物的鼻用溶液。
这些溶液，特别是预期做眼用的那些，可用适当的盐配制为0.01％-10％等渗溶液，pH约5-7。
本文还考虑了其他施用途径，如透皮贴片，包括离子电渗和电泳设备，及直肠施用。
透皮贴片，包括离子电渗和电泳设备为本领域技术人员熟知。例如，在美国专利第6,267,983、6,261,595、6,256,533、6,167,301、6,024,975、6,010715、5,985,317、5,983,134、5,948,433和5,860,957中公开了此类贴片。
例如，用于直肠施用的药物剂型为全身作用的直肠栓剂、胶囊和片剂。本文中所用的直肠栓剂意指用于插入直肠，在体温下熔化或软化，释放一种或多种药理学或治疗活性成分的固体。用于直肠栓剂中的药学上可接受的物质为基质或媒介物和提高熔点的试剂。用于直肠栓剂中的药学上可接受的物质为基质或媒介物和提高熔点的试剂。基质的实例包括可可油(可可豆油)、甘油-明胶、碳蜡(聚乙二醇)和脂肪酸甘油单酯、甘油二酯和甘油三酯的适当混合物。可使用各种基质的组合。提高栓剂熔点的试剂包括鲸蜡和蜡。直肠栓剂可通过压缩法或通过模塑制备。在一个实施方案中，直肠栓剂的重量为约2至3gm。
可以使用与用于口服施用的制剂相同的药学上可接受的物质和通过相同方法制备用于直肠施用的片剂和胶囊。
本文提供的抗体和其他组合物也可配制为靶向特定组织、受体或待治受试者身体的其他区域。许多此类靶向方法为本领域技术人员熟知。本文考虑了所有此类靶向方法，用于即用型组合物。对于靶向方法的非限制性实例，参见例如美国专利第6,316,652、6,274,552、6,271,359、6,253,872、6,139,865、6,131,570、6,120,751、6,071,495、6,060,082、6,048,736、6,039,975、6,004,534、5,985,307、5,972,366、5,900,252、5,840,674、5,759,542和5,709,874号。在一些实施方案中，本发明的抗hLIGHT抗体靶向(或以其他方式施用)到例如患IBD或处于患IBD风险的患者的结肠。
在一个实施方案中，脂质体栓剂，包括组织靶向脂质体，如肿瘤靶向脂质体，也可适合作为药学上可接受的载体。这些均可根据本领域技术人员已知的方法而制备。例如，如美国专利第4,522,811号中所述，制备脂质体制剂。简言之，可通过在烧瓶内部干燥卵磷脂酰胆碱和脑磷脂酰丝氨酸(7:3摩尔比)形成脂质体如多层囊泡(MLV)。添加本文提供的化合物在缺乏二价阳离子的磷酸盐缓冲盐水(PBS)中的溶液并且振荡烧瓶直至脂质膜分散。洗涤所得囊泡以去除未封装的化合物，通过离心粒化，然后重悬于PBS中。
施用和给药方法
本发明还提供了包含本发明的一种或多种抗体或片段的用于hLIGHT介导的疾病(或其症状)的预防、管理、治疗和/或改善的组合物。关于抗体的讨论加以必要的变更也适用于本发明的片段。
在某些实施方案中，本文提供了包含本发明的一种或多种抗体的用于hLIGHT介导的疾病如IBD(例如，溃疡性结肠炎或克罗恩氏病)或其症状的预防、管理、治疗和/或改善的组合物。IBD症状范围可从轻度到重度并且通常取决于所涉肠道的部分。IBD的示例性症状包括腹部痉挛和疼痛、出血性腹泻、严重的排便紧迫性、发烧、食欲不振、重量减轻、贫血、疲劳和/或下肢、脚踝、小腿、大腿和手臂生疮。IBD的示例性肠道并发症包括由溃疡引起的大量出血、肠穿孔或破裂、狭窄和梗阻、瘘管(异常通道)和肛周疾病、中毒性巨结肠(例如，结肠急性肺梗阻性扩张)和/或恶性肿瘤(例如，结肠或小肠癌症)。IBD的示例性肠外并发症包括关节炎、皮肤病、眼部炎症、肝脏和肾脏病症和/或骨质流失。这些症状的任何组合均可使用本文提供的组合物和方法预防、管理、治疗和/或改善。
在某些实施方案中，本文提供了包含本发明的一种或多种抗体的用于hLIGHT介导的疾病如GVHD或其症状的预防、管理、治疗和/或改善的组合物。GVHD通常在同种异体或匹配的无关骨髓移植(BMT)之后发生。
在一些实施方案中，GVHD为急性GVHD。GVHD的症状可以迅速发生并且可为轻度或重度。在某些情况下，急性GVHD在移植后约3个月内发生，例如在移植后血细胞计数恢复时。在某些情况下，急性GVHD影响皮肤、胃肠(GI)道和/或肝脏。例如，在一些患者中，急性皮肤GVHD以例如，患者手掌、脚底或肩部的皮疹开始。然而，皮疹可以变得广泛，并且可使人发痒和疼痛和/或可能起泡和脱皮。急性肝脏GVHD可影响肝脏的正常功能，如肝酶，并且又可引起黄疸。如果肝脏变大，则急性肝脏GVHD也可引起患者腹部变得肿胀和疼痛。最后，急性肠GVHD(或消化系统的GVHD)的症状可包括腹泻、粪便中有粘液或血、痉挛或腹痛、不消化、恶心和/或食欲不振。急性GVHD的其他全身症状可包括贫血、低烧和/或更易感染。急性GVHD的这些症状的任何组合均可使用本文提供的组合物和方法预防、管理、治疗和/或改善。
在其他实施方案中，GVHD为慢性GVHD。慢性GVHD可在移植后约3个月至约1年或更长时间发生。慢性GVHD可为轻度或重度，并且通常包括与急性GVHD症状相似的症状。慢性GVHD可影响皮肤和消化系统，包括肝脏，但是也可涉及其他器官和免疫系统(例如，使患者更易感染)和/或结缔组织。慢性皮肤GVHD的症状包括皮疹、皮肤干燥、皮肤紧绷、皮肤瘙痒、肤色变暗、皮肤增厚，和/或可影响毛发(例如，脱发、变成灰白)或指甲(例如，指甲硬或脆)。慢性肠GVHD可影响消化系统、口腔、食道、胃部衬里和/或肠衬里，并且症状可包括腹泻、口干或口疮、吞咽疼痛、胃部营养吸收率低、胃气胀、胃痉挛。慢性肝脏GVHD可引起肝脏的损伤和瘢疤形成(硬化)。眼部的慢性GVHD可影响产泪腺体，使眼部变得干燥、灼烧和疼痛或难以忍受强光。慢性肺部GVHD可引起呼吸短促、喘息、久咳和/或更易胸部感染。慢性GVHD可影响连接肌肉与骨骼的肌腱(例如，炎症)，致使难以伸直或弯曲您的手臂和腿部。慢性GVHD的这些症状的任何组合可使用本文提供的组合物和方法预防、管理、治疗和/或改善。
在一个具体实施方案中，用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善的组合物包含本发明抗体，例如实施例中公开的抗体的轻链结合位点。
在另一个实施方案中，用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善的组合物包含一种或多种抗体，所述抗体包含一个或多个VH结构域，其具有序列中任一VH结构域的氨基酸序列。在另一个实施方案中，用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善的组合物包含一种或多种抗体，所述抗体包含一个或多个VH CDR1，其具有序列表中任一VH CDR1的氨基酸序列。在另一个实施方案中，用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善的组合物包含一种或多种抗体，所述抗体包含一个或多个VH CDR2，其具有序列表中任一VH CDR2的氨基酸序列。在一个优选实施方案中，用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善的组合物包含一种或多种抗体，所述抗体包含一个或多个VH CDR3，其具有序列表中任一VH CDR3的氨基酸序列。
在另一个实施方案中，用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善的组合物包含一种或多种抗体，所述抗体包含一个或多个VL结构域，其具有序列表中任一VL结构域的氨基酸序列。在另一个实施方案中，用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善的组合物包含一种或多种抗体，所述抗体包含一个或多个VL CDR1，其具有序列表中任一VL CDR1的氨基酸序列。在另一个实施方案中，用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善的组合物包含一种或多种抗体，所述抗体包含一个或多个VL CDR2，其具有序列表中任一VL CDR2的氨基酸序列。在一个优选实施方案中，用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善的组合物包含一种或多种抗体，所述抗体包含一个或多个VL CDR3，其具有序列表中任一VL CDR3的氨基酸序列。
在另一个实施方案中，用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善的组合物包含一种或多种抗体，所述抗体包含一个或多个具有序列表中任一VH结构域的氨基酸序列的VH结构域，和一个或多个具有序列表中任一VL结构域的氨基酸序列的VL结构域。
在另一个实施方案中，用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善的组合物包含一种或多种抗体，所述抗体包含一个或多个具有序列表中任一VH CDR1的氨基酸序列的VH CDR1，和一个或多个具有序列表中任一VL CDR1的氨基酸序列的VL CDR1。在另一个实施方案中，用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善的组合物包含一种或多种抗体，所述抗体包含一个或多个具有序列表中任一VH CDR1的氨基酸序列的VH CDR1，和一个或多个具有序列表中任一VL CDR2的氨基酸序列的VL CDR2。在另一个实施方案中，用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善的组合物包含一种或多种抗体，所述抗体包含一个或多个具有序列表中任一VH CDR1的氨基酸序列的VH CDR1，和一个或多个具有任一VL CDR3的氨基酸序列的VL CDR3，所述VL CDR3具有序列表中任一VL CDR3的氨基酸序列。
如本文别处更详细地讨论，本发明的组合物可单独使用或与其他化合物或组合物联合使用。而且，所述抗体还可重组融合至异源多肽的N-或C-末端，或化学缀合(包括共价和非共价缀合)至多肽或其他组合物。例如，本发明的抗体可重组融合或缀合至在检测测定法中用作标记的分子，和效应分子如异源多肽、药物、放射性核苷酸或毒素。参见例如PCT公开WO 92/08495、WO 91/14438、WO 89/12624、美国专利第5,314,995号和EP 396,387。
在一些实施方案中，本文提供了降低或抑制受试者(例如，人类受试者)中hLIGHT与HVEM、LTβR和/或DcR3的结合的方法，其包括向受试者施用有效量的特异性结合hLIGHT多肽(例如，细胞表面表达的或可溶性hLIGHT)的抗体。在一个实施方案中，hLIGHT为hLIGHT的SNP变体，如214E-32S、214K-32S、214E-32L或214K-32L。在一些实施方案中，受试者中的hLIGHT生物活性，如CCL20、IL8和/或RANTES或本文公开的另一细胞因子的分泌也被降低。
在某些实施方案中，本文提供了降低或抑制受试者(例如，人类受试者)中的hLIGHT生物活性，如CCL20、IL8和/或RANTES或其他细胞因子的分泌，其包括向受试者施用有效量的特异性结合hLIGHT多肽(例如，细胞表面表达的hLIGHT)的抗体，其中hLIGHT生物活性被所述抗体降低。在一些实施方案中，hLIGHT为hLIGHT的SNP变体，如214E-32S、214K-32S、214E-32L或214K-32L。
在其他实施方案中，本文提供了降低或抑制具有细胞表面表达的hLIGHT的细胞中hLIGHT与HVEM、LTβR和/或DcR3的结合的方法，其包括使细胞接触有效量的特异性结合hLIGHT多肽(例如，细胞表面表达的或可溶性hLIGHT)，如hLIGHT多肽、hLIGHT多肽片段或hLIGHT多肽表位的抗体。在某些实施方案中，hLIGHT为hLIGHT的SNP变体，如214E-32S、214K-32S、214E-32L或214K-32L。在一些实施方案中，细胞中的hLIGHT生物活性，如CCL20、IL8和/或RANTES或本文公开的其他细胞因子的分泌也被降低。
在某些实施方案中，本文提供了降低或抑制具有细胞表面表达的hLIGHT受体(例如，HVEM、LTβR和/或Dc3R)的细胞中的hLIGHT生物活性，如CCL20、IL8和/或RANTES或本文公开的其他细胞因子的分泌，其包括使细胞接触有效量的特异性结合hLIGHT多肽(例如，细胞表面表达的或可溶性hLIGHT)的抗体，其中hLIGHT生物活性被所述抗体降低。在一些实施方案中，hLIGHT为hLIGHT的SNP变体，如214E-32S、214K-32S、214E-32L或214K-32L。
在体外和体内诊断和治疗方法中，本发明的抗体可用于，例如纯化、检测和靶向hLIGHT抗原。例如，经修饰的抗体在免疫测定中具有定性和定量测定生物样品中的hLIGHT水平的用途。参见例如Harlow等Antibodies:A Laboratory Manual,(Cold Spring HarborLaboratory Press，第2版，1988)(通过引用整体并入本文)。
本发明还提供了通过向受试者施用有效量的抗体或包含本发明抗体的药物组合物来预防、管理、治疗和/或改善hLIGHT介导的疾病的方法。一方面，抗体基本上纯化(即，基本上不含限制其效果或产生不良副作用的物质)。在优选实施方案中，抗体为全人单克隆抗体，如全人单克隆拮抗性抗体。施用疗法的受试者优选为哺乳动物如非灵长类动物(例如，牛、猪、马、猫、狗、大鼠等)或灵长类动物(例如，猴子如食蟹猴或人类)。在一个优选实施方案中，受试者为人类。在另一个实施方案中，受试者为人类婴幼儿或早产人类婴幼儿。在另一个实施方案中，受试者为患有hLIGHT介导的疾病的人类。
各种递送系统已知并且可用于施用预防或治疗剂(例如，本发明的抗体)，包括但不限于封装在脂质体、微粒、微胶囊、能够表达抗体的重组细胞中，受体介导的胞吞作用(参见例如Wu和Wu,J.Biol.Chem.262:4429-4432(1987))，构建作为逆转录病毒或其他载体的一部分的核酸等。施用预防或治疗剂(例如，本发明的抗体)或药物组合物的方法包括但不限于肠胃外施用(例如，皮内、肌肉内、腹腔内、静脉和皮下)、硬膜外和粘膜施用(例如，鼻内和口腔途径)。在一个具体实施方案中，经鼻内、肌肉内、静脉或皮下施用预防或治疗剂(例如，本发明的抗体)或药物组合物。预防或治疗剂或组合物可通过任何常规途径，例如通过输注或快速浓注，通过上皮或粘膜衬里(例如，口腔黏膜、鼻内粘膜、直肠和肠粘膜等)施用并且可与其他生物活性剂一起施用。施用可以是全身性的或局部的。另外，也可采用肺部施用，例如通过使用吸入器或喷雾器并且用雾化剂配制。参见例如美国专利第6,019,968、5,985,320、5,985,309、5,934,272、5,874,064、5,855,913、5,290,540和4,880,078号；和PCT公开号WO 92/19244、WO 97/32572、WO 97/44013、WO 98/31346和WO 99/66903，其各自通过引用整体并入本文。
在一个具体实施方案中，可期望向需要治疗的区域局部施用预防或治疗剂，或本发明的药物组合物。这可通过，例如但不以限制的方式，局部输注、表面施用(例如，通过鼻腔喷雾)、注射或借助于植入物来实现，所述植入物可为多孔、无孔或明胶材料，包括膜，如硅橡胶膜或纤维。优选地，当施用本发明的抗体时，必须小心使用不吸收抗体的材料。
在另一个实施方案中，预防或治疗剂或本发明的组合物可以在囊泡，尤其是脂质体中递送(参见Langer，1990，Science249:1527-1533；Treat等，在Liposomes in theTherapy of Infectious Disease and Cancer中，Lopez-Berestein和Fidler(编)，Liss,New York，第353-365页(1989)；Lopez-Berestein，同上，第317-327页；通常参见出处同上)。
在另一个实施方案中，预防或治疗剂或本发明的组合物可以在控释或持续释放系统中递送。在一个实施方案中，在一个实施方案中，可用泵实现控释或持续释放(参见Langer，上述；Sefton，1987，CR C Crit.Ref.Biomed.Eng.14:20；Buchwald等，1980，Surgery 88:507；Saudek等，1989，N.Engl.J.Med.321:574)。在另一个实施方案中，可用聚合材料实现预防或治疗剂(例如，本发明的抗体)或本发明的组合物的控释或持续释放(参见例如Medical Applications of Co ntrolled Release，Langer和Wise(编)，CRC Pres.,Boca Raton,Fla.(1974)；Controlled Drug Bioavailability，Drug Product Design andPer formance，Smolen和Ball(编)，Wiley,New York(1984)；Ranger和P eppas，1983,J.,Macromol.Sci.Rev.Macromol.Chem.23:61；还参见Levy等，1985，Science 228:190；During等，1989，Ann.Neurol.25:351；Howard等，1989，J.Neurosurg.7 1:105)；美国专利第5,679,377号；美国专利第5,916,597号；美国专利第5,912,015号；美国专利第5,989,463号；美国专利第5,128,326；PCT公开号WO 99/15154；和PCT公开号WO 99/20253。持续释放制剂中所用的聚合物的实例包括但不限于聚(2-甲基丙烯酸羟乙酯)、聚(甲基丙烯酸甲酯)、聚(丙烯酸)、聚(乙烯-共-乙酸乙烯酯)、聚(甲基丙烯酸)、聚乙交酯(PLG)、聚酸酐、就(N-乙烯吡咯烷酮)、聚(乙烯醇)、聚丙烯酰胺、聚(乙二醇)、聚丙交酯(PLA)、聚(丙交酯-共-乙交酯)(PLGA)和聚原酸酯。在一个优选实施方案中，持续释放制剂中所用的聚合物为惰性，不含可浸出杂质，储存稳定，无菌且生物可降解。再一个实施方案中，控释或持续释放系统可置于治疗靶标，即鼻通道或肺部附近，从而仅需全身剂量的一部分(参见例如Goodson，在Medical Applications of Controlled Release中，上述第2卷，第115-138页(1984))。Langer(1990,Scien ce 249:1527-1533)综述讨论了控释系统。本领域技术人员已知的任何技术均可用于制备包含本发明的一种或多种抗体的持续释放制剂。参见例如，美国专利第4,526,938号、PCT公开WO 91/05548、PCT公开WO 96/20698，Ning等，1996，“IntratumoralRadioimmunotherapy of a Human Colon Cancer Xenograft Using a Sustained-Release Ge l,”Radiotherapy&Oncology 39:179-189，Song等，1995,“Antibod yMediated Lung Targeting of Long-Circulating Emulsions,”PDA J ournal ofPharmaceutical Science&Technology 50:372-397,Cleek等，1997,“BiodegradablePolymeric Carriers for a bFGF Antibody f or Cardiovascular Application,”Pro.Int'l.Symp.Control.Rel.Bioact.Mater.24:853-854，及Lam等，1997,“Microencapsulation of Recom binant Humanized Monoclonal Antibody for LocalDelivery,”Proc.Int'l.Symp.Control Rel.Bioact.Mater.24:759-760，其各自通过引用整体并入本文。
在一个具体实施方案中，当本发明的组合物是编码预防或治疗剂(例如，本发明的抗体)的核酸时，可例如通过使用逆转录病毒载体(参见美国专利第4,980,286号)将其构建为适当核酸表达载体的一部分并施用使其变成细胞内的，或通过直接注射，或通过使用微粒轰击(例如，基因枪；Biolistic,Dupont)或涂上脂质或细胞表面受体或转染剂，或通过将其与已知会进入细胞核的同源框样肽(homeobox-like peptide)连接在一起施用(参见例如Joliot等，1991，Proc.Natl.Acad.Sci.USA88:1864-1868)等，在体内施用所述核酸以促进其编码的预防或治疗剂的表达。可选地，可在细胞内引入核酸并且通过同源重组并入宿主细胞DNA中进行表达。
在一个具体实施方案中，本发明的组合物包含本发明的一种、两种或更多种抗体或片段。在另一个实施方案中，本发明的组合物包含本发明的一种、两种或更多种抗体或片段和除本发明抗体以外的预防或治疗剂。优选地，已知所述试剂用于或已经或目前用于hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或改善。除预防或治疗剂外，本发明的组合物还包含载体。
本发明的组合物包括用于制备可用于制备单位剂量形式的药物组合物(例如，适于向受试者或患者施用的组合物)的散装药物组合物。在一个优选实施方案中，本发明的组合物为药物组合物。此类组合物包含预防或治疗有效量的一种或多种预防或治疗剂(例如，本发明的抗体或其他预防或治疗剂)和药学上可接受的载体。优选地，将药物组合物配制为适于向受试者施用的途径。
在一个具体实施方案中，术语“载体”是指与治疗剂一起施用的稀释剂、佐剂(例如，弗氏佐剂(Freund's adjuvant)(完全和不完全))、赋形剂或媒介物。此类药物载体可为无菌液体，如水和油，包括石油、动物、植物或合成来源的油，如花生油、大豆油、矿物油、芝麻油等。当静脉施用药物组合物时，水为优选载体。也可采用盐水溶液及右旋糖和甘油水溶液作为液体载体，特别是对于注射液而言。合适的药物赋形剂包括淀粉、葡萄糖、乳糖、蔗糖、明胶、麦芽、稻米、面粉、白垩、硅胶、硬脂酸钠、单硬脂酸甘油酯、滑石、氯化钠、脱脂乳粉、甘油、丙烯、二醇、水、乙醇等。若需要，所述组合物也可含少量润湿或乳化剂或pH缓冲剂。这些组合物可以呈溶液、混悬液、乳液、片剂、丸剂、胶囊、粉剂、持续释放制剂等形式。口服制剂可包括标准载体如制药级甘露糖醇、乳糖、淀粉、硬脂酸镁、糖精钠、纤维素、碳酸镁等。合适的药物载体的实例在Remington's Pharmaceutical Sciences(1990)MackPublishing Co.,Easton,Pa.中有描述。此类组合物将含有预防或治疗有效量的优选呈纯化形式的抗体，连同适量的载体，以便提供用于向患者恰当施用的形式。制剂应适合施用模式。
在一个优选实施方案中，根据如同适于向人类静脉施用的药物组合物的常规程序配制组合物。通常，用于静脉施用的组合物是在无菌等渗水性缓冲剂中的溶液。必要时，组合物也可包括增溶剂和局部麻醉剂如利诺卡因(lignocaine)以减轻注射部位的疼痛。然而，此类组合物可通过除静脉以外的途径施用。
通常，本发明组合物的成分单独提供或呈单位剂量形式混在一起，例如在指出活性剂的量的密闭容器如安瓿或小袋呈冻干粉剂或无水浓缩物。要通过输注施用组合物时，可用装有制药级无菌水或盐水的输液瓶将其分散。通过注射施用组合物时，可以提供一安瓿的无菌注射用水或盐水，以便可在施用之前将成分混合。
本发明还规定，将本发明的抗体包装在指出抗体的量的密闭容器如安瓿或小袋中。在一个实施方案中，抗体作为干燥灭菌冻干粉或无水浓缩物在密闭容器中提供并且可(例如)用水或盐水复水至适当浓度，向受试者施用。优选地，抗体作为干燥无菌冻干粉在密闭容器中以至少0.1mg、至少0.5mg、至少1mg、至少2mg或至少3mg，并且更优选至少5mg、至少10mg、至少15mg、至少25mg、至少30mg、至少35mg、至少45mg、至少50mg、至少60mg、至少75mg、至少80mg、至少85mg、至少90mg、至少95mg或至少100mg的单位剂量提供。冻干抗体可在2至8℃之间储存在其原始容器中并且抗体可以在复水后12小时内，优选6小时内、5小时内、3小时内或1小时内施用。在一个替代实施方案中，抗体呈液体形式在指出抗体的量和浓度的密闭容器中提供。优选地，在密闭容器中提供液体形式的抗体，至少0.1mg/ml、至少0.5mg/ml或至少1mg/ml，并且更优选至少5mg/ml、至少10mg/ml、至少15mg/ml、至少25mg/ml、至少30mg/ml、至少40mg/ml、至少50mg/ml、至少60mg/ml、至少70mg/ml、至少80mg/ml、至少90mg/ml或至少100mg/ml。
本发明的组合物可配制成中性或盐形式。药学上可接受的盐包括与诸如源自盐酸、磷酸、乙酸、草酸、酒石酸等的阴离子形成的盐，和与诸如源自钠、钾、铵、钙、氢氧化铁、异丙胺、三乙胺、2-乙基氨基乙醇、组氨酸、普鲁卡因等的阳离子形成的盐。
可通过标准临床技术测定在hLIGHT介导的疾病的预防、管理、治疗和/或缓解中将有效的治疗剂(例如，本发明的抗体)或本发明的组合物的量。
因此，可向患者施用产生约0.1μg/ml至约450μg/ml，和在一些实施方案中至少0.1μg/ml、至少0.2μg/ml、至少0.4μg/ml、至少0.5μg/ml、至少0.6μg/ml、至少0.8μg/ml、至少1μg/ml、至少1.5μg/ml，并且更优选地至少2μg/ml、至少5μg/ml、至少10μg/ml、至少15μg/ml、至少20μg/ml、至少25μg/ml、至少30μg/ml、至少35μg/ml、至少40μg/ml、至少50μg/ml、至少75μg/ml、至少100μg/ml、至少125μg/ml、至少150μg/ml、至少200μg/ml、至少250μg/ml、至少300μg/ml、至少350μg/ml、至少400μg/ml或至少450μg/ml的血清滴度的剂量的抗体或组合物以预防、管理、治疗和/或缓解hLIGHT介导的疾病。另外，可任选地采用体内测定来帮助鉴定最佳剂量范围。制剂中采用的精确剂量还将取决于施用途径和hLIGHT介导的疾病严重性，并且应根据医师的判断和每位患者的情形决定。
可由从体外或动物模型试验系统得到的剂量-反应曲线推断有效剂量。
对于本发明的抗体而言，向患者施用的剂量通常为0.1mg/kg至100mg/kg患者体重。在一些实施方案中，向患者施用的剂量为约1mg/kg至75mg/kg患者体重。优选地，向患者施用的剂量介于1mg/kg至20mg/kg患者体重之间，更优选地为1mg/kg至5mg/kg患者体重。通常，由于对外源多肽的免疫反应，人抗体在人体内比来自其他物种的抗体具有更长的半衰期。因此，更低剂量的人抗体和不太频繁的施用往往是可能的。进一步地，可通过修饰例如脂化，增强抗体的吸收和组织穿透性来降低本发明抗体施用的剂量和频率。
在一个实施方案中，施用大约100mg/kg或更少、大约75mg/kg或更少、大约50mg/kg或更少、大约25mg/kg或更少、大约10mg/kg或更少、大约5mg/kg或更少、大约1mg/kg或更少、大约0.5mg/kg或更少或大约0.1mg/kg或更少的本发明的抗体或片段5次、4次、3次、2次或，优选地1次以管理hLIGHT介导的疾病。在一些实施方案中，施用本发明的抗体约1-12次，其中由医师确定，必要时该剂量可(例如)每周、每两周、每月、每两个月、每三个月施用一次等等。在一些实施方案中，可以更频繁地(例如，3-6次)施用较低剂量(例如，1-15mg/kg)。在其他实施方案中，可以不那么频繁地(例如，1-3次)施用较高剂量(例如，25-100mg/kg)。然而，正如本领域人员将显而易见的那样，其他给药量和方案易于测定并且在本发明的范围之内。
在一个具体实施方案中，向受试者，优选向人类施用大约100mg/kg、大约75mg/kg或更少、大约50mg/kg或更少、大约25mg/kg或更少、大约10mg/kg或更少、大约5mg/kg或更少、大约1mg/kg或更少、大约0.5mg/kg或更少、大约0.1mg/kg或更少的呈持续释放制剂的本发明的抗体或片段，以预防、管理、治疗和/或改善hLIGHT介导的疾病。在另一个具体实施方案中，向受试者，优选向人类施用大约100mg/kg、大约75mg/kg或更少、大约50mg/kg或更少、大约25mg/kg或更少、大约10mg/kg或更少、大约5mg/kg或更少、大约1mg/kg或更少、大约0.5mg/kg或更少或大约0.1mg/kg或更少的不呈持续释放制剂的本发明的抗体药丸，以预防、管理、治疗和/或改善hLIGHT介导的疾病，并且在一定时间段后，向所述受试者(例如，经鼻或肌肉内)施用大约100mg/kg、大约75mg/kg或更少、大约50mg/kg或更少、大约25mg/kg或更少、大约10mg/kg或更少、大约5mg/kg或更少、大约1mg/kg或更少、大约0.5mg/kg或更少或大约5mg/kg或更少的本发明的抗体2、3或4次(优选一次)。根据本实施方案，一定时间段可为1至5天、一周、两周或一个月。
在一些实施方案中，在一年期内以两周一次(例如，约14天)的间隔向患者施用单剂量的本发明的抗体或片段2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25或26次，以预防、管理、治疗和/或改善hLIGHT介导的疾病，其中所述剂量选自约0.1mg/kg、约0.5mg/kg、约1mg/kg、约5mg/kg、约10mg/kg、约15mg/kg、约20mg/kg、约25mg/kg、约30mg/kg、约35mg/kg、约40mg/kg、约45mg/kg、约50mg/kg、约55mg/kg、约60mg/kg、约65mg/kg、约70mg/kg、约75mg/kg、约80mg/kg、约85mg/kg、约90mg/kg、约95mg/kg、约100mg/kg或其组合(即，每个剂量月剂量可能相同或可能不同)。
在另一个实施方案中，在一年期内以约每月一次(例如，约30天)的间隔向患者施用单剂量的本发明的抗体2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12次，以预防、管理、治疗和/或改善hLIGHT介导的疾病，其中所述剂量选自约0.1mg/kg、约0.5mg/kg、约1mg/kg、约5mg/kg、约10mg/kg、约15mg/kg、约20mg/kg、约25mg/kg、约30mg/kg、约35mg/kg、约40mg/kg、约45mg/kg、约50mg/kg、约55mg/kg、约60mg/kg、约65mg/kg、约70mg/kg、约75mg/kg、约80mg/kg、约85mg/kg、约90mg/kg、约95mg/kg、约100mg/kg或其组合(即，每个剂量月剂量可能相同或可能不同)。
在一个实施方案中，在一年期内以约每两月一次(例如，约60天)的间隔向患者施用单剂量的本发明的抗体或片段2、3、4、5或6次，以预防、管理、治疗和/或改善hLIGHT介导的疾病，其中所述剂量选自约0.1mg/kg、约0.5mg/kg、约1mg/kg、约5mg/kg、约10mg/kg、约15mg/kg、约20mg/kg、约25mg/kg、约30mg/kg、约35mg/kg、约40mg/kg、约45mg/kg、约50mg/kg、约55mg/kg、约60mg/kg、约65mg/kg、约70mg/kg、约75mg/kg、约80mg/kg、约85mg/kg、约90mg/kg、约95mg/kg、约100mg/kg或其组合(即，每个两月一次剂量可能相同或可能不同)。
在一些实施方案中，在一年期内以约每三月一次(例如，约120天)的间隔向患者施用单剂量的本发明的抗体或片段2、3或4次，以预防、管理、治疗和/或改善hLIGHT介导的疾病，其中所述剂量选自约0.1mg/kg、约0.5mg/kg、约1mg/kg、约5mg/kg、约10mg/kg、约15mg/kg、约20mg/kg、约25mg/kg、约30mg/kg、约35mg/kg、约40mg/kg、约45mg/kg、约50mg/kg、约55mg/kg、约60mg/kg、约65mg/kg、约70mg/kg、约75mg/kg、约80mg/kg、约85mg/kg、约90mg/kg、约95mg/kg、约100mg/kg或其组合(即，每个三月一次剂量可能相同或可能不同)。
在某些实施方案中，向患者施用一定剂量的本发明的抗体或片段的途径为鼻内、肌肉内、静脉或其组合，但是本文描述的其他途径也可接受。每个剂量可以或可以不通过相同施用途径施用。在一些实施方案中，本发明的抗体或片段可经由多种施用途径，与其他剂量的本发明的相同或不同抗体或片段同时或继其之后施用。
在某些实施方案中，向受试者预防性或治疗性施用本发明的抗体或片段。本发明的抗体或片段可向受试者预防性或治疗性施用以便预防、减轻或改善hLIGHT介导的疾病或其症状。
基因疗法
在一个具体实施方案中，施用本发明的核酸或核苷酸序列以通过基因疗法的方式预防、管理、治疗和/或改善hLIGHT介导的疾病。基因疗法是指通过向受试者施用表达或可表达的核酸来进行的疗法。在本发明的一个实施方案中，核酸产生其编码的抗体，并且该抗体介导预防或治疗作用。
可根据本发明使用本领域中可用基因疗法的任何方法。
抗体的诊断用途
虽然关于诊断用途提到了抗体，但是本文公开应解读为加以必要的变更也适用于本发明的片段。
特异性结合hLIGHT抗原的本发明的标记抗体及其衍生物和类似物可用于诊断目的以检测、诊断或监测hLIGHT介导的疾病。本发明提供了检测hLIGHT介导的疾病的方法，其包括：(a)使用特异性结合hLIGHT抗原的本发明的一种或多种抗体测定受试者的细胞或组织样品中hLIGHT抗原的表达；并且(b)将hLIGHT抗原的水平与对照水平，例如正常组织样品(例如，来自于未患hLIGHT介导的疾病的患者，或来自于疾病发作之前的相同患者)中的水平作比较，由此与hLIGHT抗原对照水平相比，测定的hLIGHT抗原水平升高表明为hLIGHT介导的疾病。
本发明提供了诊断hLIGHT介导的疾病的诊断测定法，其包括：(a)使用特异性结合hLIGHT抗原的本发明的一种或多种抗体测定个体的细胞或组织样品中hLIGHT抗原的水平；并且(b)将hLIGHT抗原的水平与对照水平，例如正常组织样品中的水平作比较，由此与hLIGHT抗原对照水平相比，测定的hLIGHT抗原水平升高表明为hLIGHT介导的疾病。对hLIGHT介导的疾病更确定的诊断可允许健康专业人士早期采取预防措施或积极治疗，从而预防hLIGHT介导的疾病的发展或进一步进展。
本发明的抗体可用于使用如本文所述或如本领域技术人员已知的经典免疫组织学方法测定生物样品中的hLIGHT抗原水平(例如，参见Jalkanen等，1985,J.Cell.Biol.101:976-985；和Jalkanen等，1987,J.Cell.Biol.105:3087-3096)。其他基于抗体的用于检测蛋白质基因表达的方法包括免疫测定，如酶联免疫吸附测定(ELISA)和放射性免疫测定(RIA)。合适的抗体测定标记在本领域中已知并且包括酶标记，如葡萄糖氧化酶；放射性同位素，如碘(125I,121I)、碳(14C)、硫(35S)、氚(3H)、铟(121In)和锝(99Tc)；发光标记，如鲁米诺；和荧光标记，如荧光素和若丹明，及生物素。
本发明的一个方面是对人类中hLIGHT介导的疾病的检测和诊断。在一个实施方案中，诊断包括：a)向受试者施用(例如，经肠胃外、皮下或腹腔内)有效量的特异性结合hLIGHT抗原的标记抗体；b)在施用之后等待一定时间间隔以容许标记抗体在受试者表达hLIGHT抗原的部位优先浓缩(并且未结合的标记分子被清除至本底水平)；c)测定本底水平；并且d)检测受试者中的标记抗体，以致检测到高于本底水平的标记抗体表明受试者患有hLIGHT介导的疾病。本底水平可通过各种方法测定，包括将检测到的标记分子的量与先前对特定系统测定的标准值作比较。
在本领域中应理解，受试者的大小和所用的成像系统将决定产生诊断图像所需的成像部分的量。在放射性同位素部分的情况下，对于人类受试者而言，注射的放射活性物质的量通常范围为约5至20毫居里的99Tc。然后标记抗体将优先在含有特异性蛋白质的细胞位置积聚。体内肿瘤成像在S.W.Burchiel等，“Immunopharmacokinetics of RadiolabeledAntibodies and Their Fragments.”(Tumor Imaging中的第13章:The RadiochemicalDetection of Cancer,S.W.Burchiel和B.A.Rhodes编，Masson Publishing Inc.(1982)中有描述。
根据几个变量，包括所用标记的类型和施用模式，施用之后容许标记抗体在受试者的部位优先浓缩和未结合的标记抗体被清除至本底水平的时间间隔为6至48小时或6至24小时或6至12小时。在另一个实施方案中，施用之后的时间间隔为5至20天或5至10天。
在一个实施方案中，对hLIGHT介导的疾病的监测通过重复诊断hLIGHT介导的疾病的方法来实现，例如，在初次诊断1个月后，在初次诊断6个月后，在初次诊断1年后，等等。
可使用本领域已知用于体内扫描的方法在受试者中检测标记分子的存在。这些方法取决于所用标记的类型。技术人员将能够确定用于检测特定标记的适当方法。可用于本发明的诊断方法中的方法和装置包括但不限于计算机断层扫描(CT)、全身扫描如正电子发射断层扫描(PET)、磁共振成像(MRI)和超声波检查法。
在一个具体实施方案中，所述分子经放射性同位素标记并且在患者中使用放射响应性手术仪器检测(Thurston等，美国专利第5,441,050号)。在另一个实施方案中，所述分子经荧光化合物标记并且在患者中使用荧光响应性扫描仪器检测。在另一个实施方案中，所述分子经正电子发射金属标记并且在患者中使用正电子发射断层扫描检测。再一个实施方案中，所述分子标记有顺磁性标记并且在患者中使用磁共振成像(MRI)检测。
生成抗体的方法
特异性结合抗原(LIGHT)的本发明的抗体和片段可通过本领域中对于抗体合成已知的任何方法，尤其是通过化学合成或优选通过重组表达技术而生成。除非另有说明，否则本发明的实践采用分子生物学、微生物学、遗传分析、重组DNA、有机化学、生物化学、PCR、寡核苷酸合成和修饰、核酸杂交和本领域技术范围内相关领域的常规技术。这些技术在本文引用的参考文献中有描述并且在文献中得到全面解释。参见例如Maniatis等(1982)Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press；Sambrook等(1989),Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Second Edition,ColdSpring Harbor Laboratory Press；Sambrook等(2001)Molecular Cloning:A LaboratoryManual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.；Ausubel等，Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley&Sons(1987年和年度更新)；Current Protocols in Immunology,John Wiley&Sons(1987年和年度更新)Gait(编)(1984)Oligonucleotide Synthesis:A Practical Approach,IRL Press；Eckstein(编)(1991)Oligonucleotides and Analogues:A Practical Approach,IRL Press；Birren等(编)(1999)Genome Analysis:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor LaboratoryPress。
可通过本领域熟知的各种程序生成特异性结合抗原的多克隆抗体。例如，可向各种宿主动物，包括但不限于兔、小鼠、大鼠等施用人抗原，以诱导产生含有对人抗原有特异性的多克隆抗体的血清。根据宿主种类，可使用各种佐剂来增强免疫反应，并且包括但不限于弗氏佐剂(完全和不完全)、矿物凝胶(如氢氧化铝)、表面活性物质(如溶血卵磷脂、pluronic多元醇、聚阴离子、肽、油乳液、钥孔血蓝素、二硝基酚)和可能有用的人用佐剂如BCG(卡介苗)和短棒状杆菌。此类佐剂也是本领域熟知的
单克隆抗体可使用本领域已知的多种技术制备，包括使用杂交瘤、重组和噬菌体展示技术或其组合。例如，单克隆抗体可使用杂交瘤技术，包括本领域已知和例如在Harlow等，Antibodies:A Laboratory Manual,(Cold Spring Harbor Laboratory Press，第2版，1988)；Hammerling等：Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas 563 681(Elsevier,N.Y.,1981)中教导的那些技术制备(所述参考文献通过引用整体并入)。如本文中所用的术语“单克隆抗体”不限于通过杂交瘤技术生成的抗体。本文别处讨论了生成单克隆抗体的其他示例性方法，例如使用KM MouseTM。在本文的实施例中提供了生成单克隆抗体另外的示例性方法。
使用杂交瘤技术生成和筛选特异性抗体的方法是本领域常规且熟知的。简言之，可用hLIGHT抗原为小鼠免疫接种并且一旦检测到免疫反应，例如在小鼠血清中检测到对hLIGHT抗原有特异性的抗体，就收获小鼠脾脏并且分离脾细胞。然后通过熟知的技术使脾细胞融合至任何合适的骨髓瘤细胞，例如来自于可从ATCC获得的细胞系SP20的细胞。选择杂交瘤并通过有限稀释法克隆。
另外，可以使用RIMMS(重复性免疫多位点)技术为动物免疫接种(Kilptrack等，1997Hybridoma 16:381-9，其通过引用整体并入)。然后通过本领域已知的方法为分泌能够结合本发明的多肽的细胞测定杂交瘤克隆物。可通过用阳性杂交瘤克隆物为小鼠免疫接种产生通常含高水平抗体的腹水。
因此，本发明提供了通过培养分泌本发明经修饰的抗体的杂交瘤细胞来产生抗体的方法，其中优选地，通过使分离自经hLIGHT抗原免疫接种的小鼠的脾细胞与骨髓瘤细胞融合，然后筛选由融合产生的杂交瘤的杂交瘤克隆物，该克隆物分泌能够结合hLIGHT抗原的抗体。
识别特异性hLIGHT抗原的抗体片段可通过本领域技术人员已知的任何技术产生。例如，本发明的Fab和F(ab′)2片段可通过使用酶如木瓜蛋白酶(生成Fab片段)或胃蛋白酶(制备F(ab′)2片段)对免疫球蛋白分子进行蛋白水解切割来生成。F(ab′)2片段含有可变区、轻链恒定区和重链的CH1结构域。进一步地，本发明的抗体也可以使用本领域已知的各种噬菌体展示方法产生。
例如，抗体也可以使用各种噬菌体展示方法产生。在噬菌体展示方法中，功能性抗体结构域展示在携带编码它们的多核苷酸序列的噬菌体颗粒的表面。具体而言，由动物cDNA文库(例如，受影响组织的人或鼠类cDNA文库)扩增编码VH和VL结构域的DNA序列。通过PCR使编码VH和VL结构域的DNA与scFv接头重组在一起并且克隆到噬菌粒载体中。该载体在大肠杆菌(E.coli)中电穿孔并且大肠杆菌被辅助噬菌体感染。这些方法中所用的噬菌体通常为丝状噬菌体，包括fd和M13并且VH和VL结构域通常重组融合至噬菌体基因III或基因VIII。可用抗原，例如使用标记抗原或被结合或捕获到固体表面或珠粒上的抗原选择或鉴定表达结合特定抗原的抗原结合结构域的噬菌体。可用于制备本发明抗体的噬菌体展示方法的实例包括在以下参考文献中公开的那些：Brinkman等，1995，J.Immunol.Methods 182:41-50；Ames等，1995，J.Immunol.Methods 184:177-186；Kettleborough等，1994，Eur.J.Immunol.24:952-958；Persic等，1997，Gene 187:9-18；Burton等，1994，Advancesin Immunology 57:191-280；PCT申请号PCT/GB91/O1 134；国际公开号WO 90/02809、WO91/10737、WO 92/01047、WO 92/18619、WO 93/1 1236、WO 95/15982、WO 95/20401和WO97/13844；和美国专利第5,698,426、5,223,409、5,403,484、5,580,717、5,427,908、5,750,753、5,821,047、5,571,698、5,427,908、5,516,637、5,780,225、5,658,727、5,733,743和5,969,108；其各自通过引用整体并入本文。
如以上参考文献中所述，噬菌体选择后，来自噬菌体的抗体编码区可分离并用于生成全抗体，包括人抗体，或任何其他所需的抗原结合片段，并且在任何所需宿主中表达，宿主包括哺乳动物细胞、昆虫细胞、植物细胞、酵母和细菌，例如，如下所述。也可使用本领域已知的方法，如PCT公开号WO 92/22324；Mullinax等，1992，BioTechniques 12(6):864-869；Sawai等，1995，AJRI 34:26-34；和Better等，1988，Science 240:1041-1043中公开的方法(所述参考文献通过引用整体并入)，采用重组产生Fab、Fab′和F(ab′)2片段的技术。
为生成全抗体，可以使用包括VH或VL核苷酸序列的PCR引物、限制位点和保护限制位点的侧翼序列扩增scFv克隆物中的VH或VL序列。利用本领域技术人员已知的克隆技术，可将PCR扩增的VH结构域克隆到表达VH恒定区，例如人γ4恒定区的载体中，并且可将PCR扩增的VL结构域克隆到表达VL恒定区，例如人κ或λ恒定区的载体中。也可将VH和VL结构域克隆到表达必需恒定区的一个载体中。然后使用本领域技术人员已知的技术将重链转化载体和轻链转化载体共转染至细胞系中以产生表达全长抗体，例如IgG的稳定或瞬时细胞系中。
对于一些用途，包括抗体在人类中的体内用途和体外检测测定而言，可优选使用人或嵌合抗体。全人抗体对于人类受试者的治疗性治疗而言特别理想。人抗体可通过本领域已知的各种方法制备，包括上述使用源自人免疫球蛋白序列的抗体文库的噬菌体展示方法。也参见美国专利第4,444,887和4,716,111号；和国际公开号WO 98/46645、WO 98/50433、WO 98/24893、WO 98/16654、WO 96/34096、WO 96/33735和WO 91/10741；其各自通过引用整体并入本文。
在优选实施方案中，生成人抗体。人抗体和/或全人抗体可以使用本领域已知的任何方法，包括本文提供的实施例生成。例如，不能表达功能内源性免疫球蛋白，但是可以表达人免疫球蛋白基因的转基因小鼠。例如，可随机地或通过同源重组将人重链和轻链免疫球蛋白基因复合物引入小鼠胚胎干细胞。可选地，除人重链和轻链基因外，还可将人可变区、恒定区和多样性区引入小鼠胚胎干细胞。通过同源重组引入人免疫球蛋白基因座，可单独或同时致使小鼠重链和轻链免疫球蛋白基因无功能性。具体而言，JH区的纯合性缺失防止内源性抗体生成。将修饰过的胚胎干细胞扩增并且显微注射到胚泡中以产生嵌合小鼠。然后培养嵌合小鼠以产生表达人抗体的纯合子后代。以正常方式用所选抗原，例如本发明的整条多肽或一部分免疫接种转基因小鼠。可以使用常规杂交瘤技术从免疫过的转基因小鼠获得针对所述抗原的单克隆抗体。由转基因小鼠携带的人免疫球蛋白转基因在B细胞分化期间重排，并且随后进行类别转换和体细胞突变。因此，使用这种技术，有可能产生在治疗上有用的IgG、IgA、IgM以及IgE抗体。对于这种产生人抗体的技术的综述，参见Lonberg和Huszar(1995,Int.Rev.Immunol.13:65-93)。对于这种产生人抗体和人单克隆抗体的技术及产生此类抗体的方案的详细讨论，参见例如PCT公开号WO 98/24893、WO 96/34096和WO96/33735；和美国专利第5,413,923、5,625,126、5,633,425、5,569,825、5,661,016、5,545,806、5,814,318和5,939,598号，其各自通过引用整体并入。在本文的实施例中详述了其他方法。此外，可以使公司如Abgenix,Inc.(Freemont,Calif.)和Genpharm(San Jose,Calif.)使用类似于上述的技术提供针对所选抗原的人抗体。
嵌合抗体是抗体的不同部分源自不同的免疫球蛋白分子的分子。产生嵌合抗体的方法在本领域中已知。参见例如Morrison，1985，Science 229:1202；Oi等，1986，BioTechniques 4:214；Gillies等，1989，J.Immunol.Methods 125:191-202；和美国专利第5,807,715、4,816,567、4,816,397和6,331,415，其通过引用整体并入本文。
人源化抗体是能够结合预定抗原并且包含基本上具有人免疫球蛋白的氨基酸序列的骨架区和基本上具有非人免疫球蛋白的氨基酸序列的CDR的抗体或其变体或其片段。人源化抗体包含至少一个并且通常两个下述可变结构域的基本上全部，所述可变结构域(Fab、Fab′、F(ab′)2、Fabc、Fv)中，CDR区的全部或基本上全部对应于非人免疫球蛋白(即，供者抗体)的CDR区，而骨架区的全部或基本上全部则为人免疫球蛋白共有序列的骨架区。优选地，人源化抗体还包含免疫球蛋白恒定区(Fc)的至少一部分，该恒定区通常为人免疫球蛋白的恒定区。一般地，抗体将含有轻链以及至少重链的可变结构域。抗体还可包括重链的CH1、铰链、CH2、CH3和CH4区。人源化抗体可选自任何类别的免疫球蛋白，包括IgM、IgG、IgD、IgA和IgE，和任何同种型，包括IgG1、IgG2、IgG3和IgG4。通常恒定结构域是补体固定恒定结构域，其中期望人源化抗体表现出细胞毒活性，并且该类别通常为IgG1。此类细胞毒活性不合需要时，恒定结构域可为IgG2类。可用于本发明的某些实施方案中的VL和VH恒定结构域的实例包括但不限于Johnson等(1997)J.Infect.Dis.176,1215-1224中描述的C-κ和C-γ-1(nG1m)和美国专利第5,824,307号至描述的那些。人源化抗体可包含来自于一个以上类别或同种型的序列，并且选择特定恒定结构域以优化所需效应功能是在本领域的普通技术范围内。人源化抗体的骨架和CDR区不需要精确对应于亲本序列，例如可通过至少一个残基的置换、插入或缺失诱变供者CDR或共有骨架，使得该位点的CDR或骨架残基不对应于共有或引入抗体。然而，此类突变不会很广泛。通常，至少75％的人源化抗体残基将对应于亲本FR和CDR序列的残基，更经常为90％，且最优选高于95％。人源化抗体可以使用本领域中已知的各种技术产生，包括但不限于CDR移植(欧洲专利第EP 239,400号；国际公开号WO91/09967；和美国专利第5,225,539、5,530,101和5,585,089号)，镶面或表面重修(欧洲专利第EP 592,106和EP 519,596号；Padlan，1991，Molecular Immunology 28(4/5):489-498；Studnicka等，1994，Protein Engineering 7(6):805-814；和Roguska等，1994，PNAS91:969-973)，链改组(美国专利第5,565,332号)和例如美国专利第6,407,213号、美国专利第5,766,886号、WO 9317105，Tan等，J.Immunol.169:1119 25(2002)，Caldas等，ProteinEng.13(5):353-60(2000)，Morea等，Methods 20(3):267 79(2000)，Baca等，J.Biol.Chem.272(16):10678-84(1997)，Roguska等，Protein Eng.9(10):895 904(1996)，Couto等，Cancer Res.55(23Supp):5973s-5977s(1995)，Couto等，Cancer Res.55(8):1717-22(1995)，Sandhu J S,Gene 150(2):409-10(1994)，和Pedersen等，J.Mol.Biol.235(3):959-73(1994)中公开的技术。还参见美国专利公开第US 2005/0042664A1号(2005年2月24日)，其通过引用整体并入本文。常常，骨架区内的骨架残基将被来自于CDR供者抗体的相应残基置换以改变，优选提高抗原结合。通过本领域熟知的方法来鉴定这些骨架置换，例如通过对CDR和骨架残基相互作用的建模来鉴定对抗原结合很重要的骨架残基和通过序列比较来鉴定特定位置的异常骨架残基。(参见例如Queen等，美国专利第5,585,089号；和Reichmann等，1988，Nature 332:323，其通过引用整体并入本文。)
单结构域抗体，例如缺乏轻链的抗体，可以通过本领域熟知的方法产生。参见Riechmann等，1999，J.Immunol.231:25-38；Nuttall等，2000，Curr.Pharm.Biotechnol.1(3):253-263；Muylderman，2001，J.Biotechnol.74(4):277302；美国专利第6,005,079号；和国际公开号WO 94/04678、WO 94/25591和WO 01/44301，其各自通过引用整体并入本文。
进一步地，特异性结合hLIGHT抗原的抗体又可使用本领域技术人员熟知的技术用于产生“模拟”抗原的抗独特型抗体。(参见例如Greenspan和Bona，1989，FASEB J.7(5):437-444；和Nissinoff，1991，J.Immunol.147(8):2429-2438)。
试剂盒
本发明还提供了一种药物或诊断包或试剂盒，其包含填充有本发明药物组合物的一种或多种成分，如本文提供的一种或多种抗体或片段的一个或多个容器。任选地，伴随此类容器的可以是呈管理药物或生物产品的生产、使用或销售的政府机构规定的形式的通知，该通知反映该机构对生产、使用或销售供人类施用的批准，例如许可证号。
本发明提供了可用于以上方法的试剂盒。在一个实施方案中，试剂盒包含在一个或多个容器中的本发明的抗体，优选纯化抗体。在一个具体实施方案中，本发明的试剂盒含作为对照的基本上分离的hLIGHT抗原。优选地，本发明的试剂盒还包含不与hLIGHT抗原反应的对照抗体。在另一个具体实施方案中，本发明的试剂盒含用于检测经修饰的抗体与hLIGHT抗原的结合的工具(例如，所述抗体可缀合至可检测底物如荧光化合物、酶底物、放射性化合物或发光化合物，或识别第一抗体的第二抗体可缀合至可检测底物)。在具体实施方案中，所述试剂盒可包括重组产生的或化学合成的hLIGHT抗原。试剂盒至提供的hLIGHT抗原也可连接到固体支撑体上。在一个更加具体的实施方案至上述试剂盒的检测工具包括hLIGHT抗原所连接的固体支撑体。此类试剂盒也可包括非缀合报告因子标记的抗人抗体。在本实施方案中，可通过所述报告因子标记的抗体的结合检测所述抗体与hLIGHT抗原的结合。
"保守性氨基酸置换"是由一个氨基酸经具有类似结构和/或化学性质的另一个氨基酸置换，如异亮氨酸或缬氨酸置换亮氨酸，谷氨酸置换天冬氨酸，或丝氨酸置换苏氨酸而产生。因此，特定氨基酸序列的“保守性置换”是指对多肽活性并非至关重要的那些氨基酸的置换或氨基酸经具有类似性质(例如，酸性、碱性、带正电或负电、极性或非极性等)的其他氨基酸置换，使得甚至至关重要的氨基酸的置换也不会降低所述肽的活性，(即，所述肽穿透血脑屏障(BBB)的能力)。提供功能上相似的氨基酸的保守性置换表在本领域中熟知。例如，以下六组各自含有是对彼此的保守性置换的氨基酸：1)丙氨酸(A)、丝氨酸(S)、苏氨酸(T)；2)天冬氨酸(D)、谷氨酸(E)；3)天冬酰胺(N)、谷氨酰胺(Q)；4)精氨酸(R)、赖氨酸(K)；5)异亮氨酸(I)、亮氨酸(L)、甲硫氨酸(M)、缬氨酸(V)；和6)苯丙氨酸(F)、酪氨酸(Y)、色氨酸(W)。(也参见Creighton,Proteins,W.H.Freeman and Company(1984)，其通过引用整体并入)。在一些实施方案中，如果变化不降低所述肽的活性，则将改变、添加或删除单个氨基酸或一小部分氨基酸的单独置换、缺失或添加也可被视为“保守性置换”。插入或缺失通常是在约1至5个氨基酸范围内。保守性氨基酸的选择可以基于所述肽中要置换的氨基酸的定位而选择，例如该氨基酸是在肽的外部并且暴露于溶剂，还是在内部并且不暴露于溶剂。
在替代实施方案至，可以基于现有氨基酸的定位，即其对溶剂的暴露(即，如果与未暴露于溶剂的内部定位的氨基酸相比，氨基酸暴露于溶剂或存在于所述肽或多肽的外表面上)，选择将要置换现有氨基酸的氨基酸。此类保守性氨基酸置换的选择在本领域中熟知，例如在Dordo等，J.MoI Biol,1999,217,721-739和Taylor等，J.Theor.Biol.119(1986)；205-218及S.French和B.Robson，J.MoI.Evol.19(1983)171中所公开那样。因此，可以选择适于蛋白质或肽外部的氨基酸(即，暴露于溶剂的氨基酸)的保守性氨基酸置换，例如但不限于，可以使用以下置换：F置换Y、S或K置换T、A置换P、D或Q置换E、D或G置换N、K置换R、N或A置换G、S或K置换T、N或E置换D、L或V置换I、Y置换F、T或A置换S、K置换R、N或A置换G、R置换K、S、K或P置换A。
在替代实施方案中，也可以选择所涵盖的适于蛋白质或肽外部的氨基酸的保守性氨基酸置换，例如可以使用适于蛋白质或肽内部的氨基酸(即，氨基酸未暴露于溶剂)的保守性置换，例如但不限于，可以使用以下保守性置换：其中F置换Y，A或S置换T，L或V置换I，Y置换W，L置换M，D置换N，A置换G，A或S置换T，N置换D，L或V置换I，Y或L置换F，A或T置换S及S、G、T或V置换A。在一些实施方案中，在变体的范围内还涵盖非保守性氨基酸置换。
如本文中所用，“抗体”是指无论是源自天然产生抗体的任何物种，还是通过重组DNA技术产生的，分离自血清、B细胞、杂交瘤、转染瘤、酵母或细菌的IgG、IgM、IgA、IgD或IgE分子或其抗原特异性抗体片段(包括但不限于Fab、F(ab')2、Fv、二硫化物连接的Fv、scFv、单结构域抗体、闭合构象多特异性抗体、二硫化物连接的scfv、双链抗体)。可使用常规技术使抗体人源化。
如本文所述，“抗原”是被抗体试剂上的结合位点结合的分子。通常，抗原被抗体配体结合并且能够引起体内抗体反应。抗原可为多肽、蛋白质、核酸或其他分子或其部分。术语“抗原决定簇”是指抗原上被抗原结合分子，并且更特别地，是被所述分子的抗原结合位点识别的表位。
如本文中所用，术语“抗体片段”是指包括至少一个免疫球蛋白可变结构域或免疫球蛋白可变结构域序列并且特异性结合给定抗原的多肽。抗体片段可包含抗体或包含抗体的抗原结合结构域的多肽。在一些实施方案中，抗体片段可包含单克隆抗体或包含单克隆抗体的抗原结合结构域的多肽。例如，抗体可包括重(H)链可变区(本文缩写为VH)和轻(L)链可变区(本文缩写为VL)。在另一个实例至，抗体包括两个重(H)链可变区和两个轻(L)链可变区。术语“抗体片段”涵盖抗体的抗原结合片段(例如，单链抗体、Fab和sFab片段、F(ab')2、Fd片段、Fv片段、scFv和结构域抗体(dAb)片段(参见例如de Wildt等，EurJ.Immunol.1996；26(3):629-39；其通过引用整体并入本文))以及完整抗体。抗体可具有IgA、IgG、IgE、IgD、IgM(及其亚型和组合)的结构特征。抗体可来自于任何来源，包括小鼠、兔、猪、大鼠和灵长类动物(人和非人灵长类动物)及灵长类化抗体。抗体还包括微型抗体(midibody)、人源化抗体、嵌合抗体等。
如本文中所用，“抗体可变结构域”是指抗体分子的轻链和重链包括互补决定区(CDR；即CDR1、CDR2和CDR3)和骨架区(FR)的氨基酸序列的部分。VH是指重链的可变结构域。VL是指轻链的可变结构域。根据本发明中所用的方法，分配给CDR和FR的氨基酸位置可根据Kabat(Sequences of Proteins of Immunological Interest(National Institutes ofHealth,Bethesda,Md.,1987年和1991年))或根据IMGT命名法定义。
如本文中所用，术语“抗体结合位点”是指包含抗体的一个或多个CDR并且能够结合抗原的多肽或结构域。例如，多肽包含CDR3(例如，HCDR3)。例如多肽包含抗体可变结构域的CDR1和2(例如，HCDR1和2)或CDR 1-3(例如，HCDR1-3)。在一个实例中，抗体结合位点可由单个可变结构域(例如，VH或VL结构域)提供。在另一个实例中，结合位点包含VH/VL对或两个或更多个此类配对。
如本文中所用，“基因分型”是指例如通过测定基因组内一个或多个位置的核酸序列来测定细胞和/或受试者在该位置的具体等位基因组成的过程。基因分型是指核酸分子和/或核酸水平的分析。如本文中所用，“表型分型”是指例如通过测定表达产物的多肽序列来测定细胞和/或受试者的表达产物的同一性和/或组成的过程。表型分型是指蛋白质分析和/或蛋白质水平的分析。
如本文中所用，术语“治疗”是指治疗性治疗，其中目的是逆转、减轻、改善、抑制、减缓或终止疾病或病症相关的情况的进展或严重程度。术语“治疗”包括减少或减轻病状、疾病或病症的至少一种副作用或症状。如果减少一种或多种症状或临床标志，则通常治疗“有效”。可选地，如果疾病的进展降低或停止，则治疗“有效”。即，“治疗”不仅包括症状或标志的改善，而且包括与在没有治疗时将预计到的相比，症状停止，或至少减缓其进展或恶化。有益或所需的临床结果包括但不限于，可检测或不可检测的一种或多种症状减轻、疾病的程度减弱、疾病状态稳定(即，不恶化)、疾病进展延迟或减缓、疾病状态改善或缓和、缓解(部分或完全)和/或死亡率降低。术语疾病的“治疗”还包括提供疾病症状或副作用的缓解(包括姑息疗法)。为了使治疗有效，不考虑完全治愈。所述方法在某些方面上也可包括治愈。
如本文中所用，术语“药物组合物”是指与药学上可接受的载体例如制药业中常用的载体组合的活性剂。短语“药学上可接受的”在本文中用于指在合理医学判断范围内，适合接触人类和动物的组织使用，无过度毒性、刺激、变态反应或其他问题或并发症，与合理的利益/风险比相称的那些化合物、材料、组合物和/或剂型。
如本文中所用，术语“施用”是指通过引起在所需部位至少部分递送所述制剂的方法或途径将本文公开的化合物置于受试者体内。可通过在受试者中产生有效治疗的任何适当途径施用包含本文公开的化合物的药物组合物。
可单独或同时施用多种组合物。单独施用是指在不同时间，例如间隔至少10、20、30或10-60分钟，或间隔1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12小时施用两种组合物。也可以间隔24小时，或甚至间隔更长时间施用组合物。可选地，可同时，例如间隔少于10或少于5分钟施用两种或更多种组合物。同时施用的组合物在一些方面可作为混合物施用，对于每种组分而言有或无相似或不同的时间释放机制。
如本文中所用，“授权编号”或“上市授权编号”是指管理机构在该机构确定特定医疗产品和/或组合物可以在机构管辖区域内上市和/或提供出售后颁发的编号。如本文中所用，“管理机构”是指负责评价，例如医疗产品和/或组合物的安全性和功效并且控制此类产品和/或组合物在指定区域的销售/上市的机构之一。美国的食品和药物管理局(FDA)和欧洲的欧洲药品管理局(EPA)仅仅是此类管理机构的两个实例。其他非限制性实例可包括SDA、MPA、MHPRA、IMA、ANMAT、香港卫生署药物办公室(Hong Kong Department of Health-Drug Office)、CDSCO、Medsafe和KFDA。
如本文中所用，“注射装置”是指设计用于进行注射的装置，注射包括将注射装置临时流体偶联到人的组织，通常是皮下组织的步骤。注射还包括将一定量的液体药物施用到组织内并且将注射装置从所述组织去偶联或移除。在一些实施方案中，注射装置可为静脉装置或IV装置，这是当靶组织为循环系统中的血液，例如静脉中的血液时使用的一种类型的注射装置。注射装置的常见、但非限制性实例为针头和注射器。
如本文中所用，“缓冲剂”是指能够吸收一定量的酸或碱，但是在pH上不经历强烈变化的化学试剂。
如本文中所用，“包装”是指如何将组分组织和/或约束到适于分布和/或使用的单位中。包装包括，例如盒子、包、注射器、安瓿、小瓶、管、蛤壳包装、维持无菌性的屏障和/或容器、标签等。
如本文中所用，“说明书”是指物品的直接容器上的书写、印刷或图形材料的展示，例如装有药物活性剂的小瓶上展示的书面材料，或关于装有目标组合物的试剂盒中所包括的目标产品的组成和用途的详情。说明书提出了考虑要施用或进行时的治疗方法。
如本文中所用，术语“包含”在提及抗体、片段、用途、组合物、方法及其各自对所述方法或组合物必不可少的组分时使用，然而无论是否必不可少，对于包括未指定的要素是开放性的。
术语“由......组成”是指如本文所述的抗体、片段、用途、组合物、方法及其各自的组分，其不包括实施方案的描述中未叙述的任何要素。
如本文中所用，术语“基本上由......组成”是指指定实施方案所需的那些要素。该术语容许不实质上影响该实施方案的基本和新颖性或功能性特征的要素存在。
除非上下文另外明确指出，否则单数术语“一”、“一种(个)”和“所述(该)”包括复数指示物。类似地，除非上下文另外明确指出，否则词“或”旨在包括“和”。虽然与本文所述的那些类似或等效的方法和材料可用于本公开的实践或试验，但下面描述了合适的方法和材料。缩写“例如(e.g.)”来源于拉丁文例如(exempli gratia)，并在本文中用于指非限制性实例。因此，缩写“例如(e.g.)”与术语“例如(for example)”同义。
细胞生物学和分子生物学中常用术语的定义可以在以下参考文献中找到：MerckResearch Laboratories出版的“The Merck Manual of Diagnosis and Therapy”，第19版，2006(ISBN 0-911910-19-0)；Robert S.Porter等(编)，Blackwell Science Ltd.出版的The Encyclopedia of Molecular Biology，1994(ISBN 0-632-02182-9)；BenjaminLewin，Jones&Bartlett Publishing出版的Genes X，2009(ISBN-10:0763766321)；Kendrew等(编)，VCH Publishers,Inc.出版的Molecular Biology and Biotechnology:aComprehensive Desk Reference，1995(ISBN1-56081-569-8)和Current Protocols inProtein Sciences 2009，Wiley Intersciences，Coligan等编。
除非另有说明，否则本发明使用标准程序进行，例如在Sambrook等，MolecularCloning:A Laboratory Manual(第4版)，Cold Spring Harbor Laboratory Press,ColdSpring Harbor,N.Y.,USA(2012)；Davis等，Basic Methods in Molecular Biology,Elsevier Science Publishing,Inc.,New York,USA(1995)；或Methods in Enzymology:Guide to Molecular Cloning Techniques第152卷，S.L.Berger和A.R.Kimmel编，Academic Press Inc.,San Diego,USA(1987)；Current Protocols in Protein Science(CPPS)(John E.Coligan等编，John Wiley and Sons,Inc.)，Current Protocols in CellBiology(CPCB)(Juan S.Bonifacino等编，John Wiley and Sons,Inc.)，和Culture ofAnimal Cells:A Manual of Basic Technique by R.Ian Freshney,Publisher:Wiley-Liss；第5版(2005),Animal Cell Culture Methods(Methods in Cell Biology，第57卷，Jennie P.Mather和David Barnes编辑，Academic Press，第1版，1998)中所述，其全部通过引用整体并入本文。
其他术语在本文在本发明各个方面的描述中有定义。
本申请全篇引用的所有专利和其他出版物；包括参考文献、颁发的专利、发表的专利申请和共同待决专利申请明确地通过引用并入本文用于描述和公开，例如此类出版物中描述的可能连同本文所述技术一起使用的方法的目的。这些出版物仅提供本申请申请日之前的公开内容。就此而言，决不应解释为承认发明人因现有发明或任何其他原因而无权将此公开提前。所有关于日期的陈述或关于这些文件内容的说明均基于申请人可获得的信息，并且不应构成有关这些文件日期或内容的修正的任何许可。
本公开的实施方案的描述并非旨在详尽无遗或将本公开限于公开的精确形式。虽然本文描述本公开的具体实施方案和实例是为了说明的目的，但是正如相关领域的技术人员将认识到那样，在本公开的范围内各种等效修改也是可能的。例如，虽然方法步骤或功能以指定顺序呈现，但是替代实施方案可按不同顺序执行功能，或可基本上同时执行功能。本文提供的公开的教导可视情况而定适用于其他程序或方法。可组合本文描述的各个实施方案以提供另外的实施方案。如有必要，可修改本公开的各个面面，以采用以上参考文献和申请的组合物、功能和概念来提供本公开另外的实施方案。而且，由于生物功能等效性因素，可在蛋白质结构上做一些变化，在种类或量上不影响生物或化学作用。可根据详细描述对本公开做这些和其他变化。旨在将所有此类修改包括在所附权利要求书的范围之内。
任何前述实施方案的具体要素可以组合或替换为其他实施方案中的要素。此外，虽然与本公开的某些实施方案相关的优点已经在这些实施方案的上下文中有描述，但是其他实施方案也可表现出此类优点，并非所有实施方案都必须表现出此类优点才属于本公开的范围。
应理解，本文描述的特定模式、方面、实例、条款和实施方案是以说明的方式示出而不是作为对本发明的限制。在不脱离本发明范围的前提下，本发明的主要特征可用于各个实施方案。本领域的技术人员使用不超过常规的研究将认识到或能够确定本文所述特定程序的许多等效方案。此类等效方案被视为在本发明的范围内并且被权利要求书所包括。说明书中提到的所有出版物和专利申请表明了本发明所属领域中技术人员的技术水平。所有出版物和专利申请通过引用并入本文，其程度如同特别地且单独地指出将每个单独的出版物或专利申请通过引用并入一样。在权利要求书和/或说明书中词“一”或“一种(个)”当连同术语“包含”使用时可意指“一个”，但是与“一个或多个”、“至少一个”和“一个或一个以上”的含义一致。虽然本公开支持指仅替代方案和“和/或”的定义，但除非明确表明是指仅替代方案或替代方案互相排斥，否则权利要求书中术语“或”的使用是用于意指“和/或”。在本申请通篇，术语“约”用于表明值包括对于用于测定该值的装置、方法的固有误差变化或研究受试者间存在的变化。
如本说明书和权利要求书中所用，词“包含”(及包含的任何形式)、“具有”(及具有的任何形式)、“包括”(及包括的任何形式)或“含有”(及含有的任何形式)是包括性或开放式的并且不排除另外、未叙述的要素或方法步骤。
除非另外从上下文显而易见，否则本公开的任何部分均可结合本公开的任何其他部分进行阅读。
可根据本公开制备和执行本文公开且要求保护的所有组合物和/或方法，无需过度实验。虽然已经按照优选实施方案描述了本发明的组合物和方法，但是对于本领域技术人员将显而易见的是，在不脱离本发明的概念、精神和范围的前提下，可对所述组合物和/或方法和在本文所述方法的步骤或步骤的顺序上施以改变。本领域技术人员显而易见的所有此类相似替代和修改均被视为在如所附权利要求书所定义的本发明的精神。范围和概念范围之内。
实施例
实施例1
抗原制备、免疫接种程序和杂交瘤产生
以下实施例提供了使用KyouseTM系统(参见例如WO2011004192)产生和鉴定一组抗人LIGHT单克隆抗体的详细描述。为此，用小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)上展示的可溶性重组人LIGHT或表面表达的人LIGHT免疫接种含有许多人免疫球蛋白基因的基因工程小鼠。提出了各种免疫接种方案，包括常规腹腔内注射以及在多个部位快速免疫接种的方案，经过几周后使动物加强(参见下面的详细方法)。在每种方案结束时，取出次级淋巴组织如脾脏，和在一些情况下，取出淋巴结。将组织制备成单细胞悬液并且与SP2/0细胞融合产生稳定的杂交瘤细胞系。
材料和方法
重组食蟹猴和人LIGHT(214E和214K等位基因)的克隆表达和纯化：
使用标准的限制酶消化和连接将编码人(214E hLIGHT-其中所有亚基均具有214E)和食蟹猴(食蟹猕猴(Macaca fascicularis))LIGHT的cDNA克隆到pREP4表达质粒(Invitrogen)中。使用214E LIGHT pREP4载体作为模板产生替代人类形式(214K hLIGHT-其中所有亚基均具有214K)并且通过定点诱变引入214K突变。构建体还含有FLAG肽基序以帮助纯化。为构建体测序以确保其正确的序列组成。
使用Invitrogen的FreeStyleTM CHO-S悬浮适应细胞系瞬时表达人LIGHT-214E(即，214E hLIGHT)、LIGHT-214K(即，214K hLIGHT)以及食蟹猴LIGHT以产生重组蛋白。使用PEI(聚乙烯亚胺MW40000)将质粒转染到细胞中并让其过度生长13天，之后收获上清液用于纯化。在过度生长期间为细胞供给来自于GE Healthcare的ActiCHOTMFeeds A和B以帮助提高生产率和促进细胞的长寿。在过度生长期间定期取样以监测细胞生长和活力。
在两步法中纯化FLAG标记的LIGHT蛋白质；首先使用M2抗FLAG亲和色谱法纯化来自于CHO-S表达的澄清组织培养上清液。然后使含有LIGHT蛋白质的洗脱部分经受尺寸排阻色谱法并且通过SDS-PAGE分析评估纯度并通过在OD280nm下读数的分光光度计量化。
表达214E和214K人LIGHT的稳定转染的MEF和CHO-S细胞的产生：
全长214E和214K人LIGHT序列经密码子优化用于哺乳动物表达并且克隆到表达载体中CMV启动子的下方，启动子两侧是促进稳定整合到细胞基因组中的3’和5’piggyBac特异性末端重复序列(参见：“A hyperactive piggyBac transposase for mammalianapplications”；Yusa K,Zhou L,Li MA,Bradley A,Craig NL.Proc Natl Acad Sci U SA.2011Jan 25)。此外，表达载体含有嘌呤霉素或新霉素(neomycin)选择盒以促进稳定细胞系产生。使用FreeStyle Max转染试剂(Invitrogen)根据生产商说明书将hLIGHT表达质粒与编码piggyBac转座酶的质粒共同转染至内部来源的小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)系(用于产生该系的胚胎得自与C57BL6雌性小鼠交配的129S5)和CHO-S细胞中。转染24小时后，为培养基补充G418或新霉素并且生长至少2周以选择稳定细胞系，每3-4天更换培养基。使用抗人LIGHT–PE缀合抗体(eBioscience,12-2589-42)通过流式细胞术评估hLIGHT的表达。完全MEF培养基由补充了10％v/v胎牛血清(Gibco)的杜尔贝科改良伊格尔培养基(Dulbecco'sModified Eagle's Medium)(Gibco)构成。完全CHO-S培养基由补充了8mM Glutamax(Gibco)的CD-CHO培养基构成。
用于小鼠免疫接种的MEF细胞的制备：
去除细胞培养基并用1XPBS洗涤细胞一次。用胰蛋白酶处理细胞5分钟以将细胞从组织培养表面松开。收集细胞并且通过添加含10％v/v胎牛血清(FCS)的完全培养基来中和胰蛋白酶。然后300xg离心细胞10分钟并用25ml的1XPBS洗涤。为细胞计数并且按适当浓度重悬于1XPBS中。
免疫接种程序：
用CHO-S细胞表达的呈可溶性形式的或经稳定转染的MEF细胞表达的呈膜结合形式的214E hLIGHT为转基因KymiceTM小鼠免疫接种。根据免疫接种程序将小鼠分成四组并且如下免疫接种：第1组仅给予1×10E07MEF-214E hLIGHT细胞(重悬于无佐剂的1XPBS中)；第2组给予乳化于Sigma佐剂体系(Sigma S6322)中的1×10E07MEF-214E hLIGHT细胞；第3组接受乳化于Sigma佐剂中的1×10E07MEF-214E hLIGHT细胞和214E hLIGHT蛋白质的交替方案，其中抗原初免作为MEF细胞在腹腔内给予，接着是蛋白质(从15μg蛋白质开始，接着是5μg蛋白质的递减量)和MEF细胞的交替方案。为了最终加强，在腹腔内注射细胞以及静脉给予蛋白质。第4组接受乳化于Sigma佐剂体系中的214E hLIGHT蛋白质(25μg用作初免，接着是15、10和5μg用于之后的加强)。
用细胞免疫接种时，佐剂与细胞按1:1v/v比率混合并且在腹腔内注射之前通过移液轻轻混合。用蛋白质免疫接种时，佐剂与蛋白质按1:1v/v比率混合并且重复涡旋。所有小鼠在初免之前放血，然后每三周加强一次。收集间隔至少2周的至少3次连续放血并且使用ELISA或基于流式细胞术的测定法分析hLIGHT特异性IgG滴度。滴度数据用于选择用于融合和杂交瘤产生的小鼠。最后加强在收集组织3天之前施用。取脾脏组织并经受杂交瘤融合。从来自于第3组用MEF-214E hLIGHT细胞和重组蛋白(214E hLIGHT)的组合免疫接种的小鼠分离抗体克隆物31A10和62C01。
多个部位快速免疫接种：
在用乳化于Sigma佐剂体系(Sigma S6322)中的重组表达的214E hLIGHT和hLIGHT-214K的等量混合物免疫接种之前，为转基因KymiceTM小鼠预先放血。对于所有免疫接种而言，使用异氟烷(Isoflurane)麻醉小鼠并且所有注射在小鼠腹侧的6个部位皮下施用(参考文献：“Rapid Development of Affinity Matured Monoclonal AntibodiesUsing RIMMS”；Kilpatrick等Hybridoma,1997)。使小鼠回到其居住笼中并恢复监测。每3至4天为小鼠加强7倍，总共25天。最后一次加强2天后取脾脏和淋巴结组织并用于杂交瘤融合。收集末期放血并且使用标准的ELISA方案分析hLIGHT特异性IgG滴度。使用RIMMS免疫接种方案由该实验分离抗体克隆物42A02、29C09、14B09、13H04、117C06和144F05。
通过FACS使用CHO-S表达的hLIGHT测定血清滴度：
按1×10E05个细胞/孔的密度将稀释于FACS缓冲液(PBS+1％w/v BSA+0.1％w/vNaN3)中的表达214E hLIGHT或214K hLIGHT的CHO-S细胞或未转染的CHO-S细胞分布到96孔V形底板(Greiner)中。用150μl的PBS洗涤细胞并且300xg离心3分钟。抽吸上清液并添加150μl的PBS。重复该洗涤步骤。将样品稀释于FACS缓冲液中，制备小鼠血清的滴定液。然后以50μl/孔向细胞板添加这种滴定液。为测定由于免疫接种引起的活性水平的变化，将来自于免疫接种前的每只动物的血清在FACS缓冲液中稀释至1/100并向细胞中添加50μl/孔。将合适的参考抗体(抗LIGHT抗体，R&D system，MAB664)或小鼠IgG1对照抗体(Sigma)稀释于FACS缓冲液中(介于1-9μg/ml之间)并且向细胞中添加50μl。在4℃下温育细胞30分钟。用150μl的PBS洗涤细胞两次，在每个洗涤步骤之后离心并抽吸上清液(300xg离心3分钟)。为检测抗体结合，将APC山羊抗小鼠IgG(Jackson ImmunoResearch)在FACS缓冲液中稀释至1/500并向细胞中添加50μl。在4℃下于黑暗中温育细胞30分钟。用150μl的PBS洗涤细胞两次，在每个洗涤步骤之后离心并抽吸上清液(300xg离心3分钟)。为固定细胞，添加100μl 2％v/v多聚甲醛并且在4℃下温育细胞30分钟，通过300xg离心使细胞团块化并且使所述板重悬于50μl的FACS缓冲液中。使用BD FACS阵列仪器，通过流式细胞术测量APC信号强度(几何平均值)。
使用重组hLIGHT通过ELISA测定血清滴度：
使用反向LIGHT ELISA方案测定小鼠血清样品中的滴度。在4℃下使抗小鼠IgG捕获抗体(Southern Biotech)(4μg/ml稀释于PBS中，50μl/孔)吸附到96孔低自体荧光、高蛋白结合板(Costar)过夜。通过用PBS-吐温(0.1％v/v)洗涤去除过量IgG并且在室温下用在PBS中的1％w/v牛血清白蛋白(BSA,Sigma)封闭孔1小时，之后如先前所述洗涤该板。将样品稀释于试剂稀释剂(0.1％w/v BSA/PBS)中，制备小鼠血清的滴定液。然后以50μl/孔向ELISA板添加这种滴定液。为测定由于免疫接种引起的活性水平的变化，将来自于免疫接种前的每只动物的血清在试剂稀释剂中稀释至1/100并以50μl/孔向ELISA板中添加。作为生物素化LIGHT结合的阳性对照，将稀释至1μg/ml的抗LIGHT抗体(R&D systems)以50μl加入板中。小鼠IgG1同种型对照(Sigma)作为阴性对照被包括在内并且在试剂稀释剂中稀释至1μg/ml并以50μl/孔向ELISA板中添加。在一些情况下，将来自于用非相关抗原免疫接种的小鼠的血清样品稀释至1/1000并以50μl/孔向ELISA板中添加。该板在室温下温育至少1小时。温育之后，如之前洗涤板以去除未结合的蛋白质。然后将生物素化LIGHT(100ng/ml于试剂稀释剂中；50μl/孔)添加到板中并且在室温下温育1小时。通过用PBS-吐温(0.1％v/v)洗涤去除未结合的生物素化LIGHT，而用稀释于测定缓冲液(PerkinElmer)中的链霉亲和素-Europium3+缀合物(检测，PerkinElmer)或稀释于试剂稀释剂中的链霉亲和素-HRP检测剩余的生物素化LIGHT。
在链霉亲和素-HRP的情况下，如先前所述洗涤板并向板中添加50μL的TMB(Sigma)。然后通过添加50μL的1M硫酸(Fluka分析)终止反应。在Envision酶标仪(PerkinElmer)上测量450nm下的OD。
在链霉亲和素-Europium3的情况下，用TBS(Tris缓冲盐水)-吐温(0.1％v/v)洗涤板并且向板中添加200μL/孔的DELFIA增强液(Perkin Elmer)。在615nm下在Envision酶标仪(PerkinElmer)上测量时间分辨荧光。按铕计数绘制荧光数据。
鼠类组织分离和制备：
从经过免疫接种的小鼠切除脾脏并且在1xPBS中洗涤并保持在冰上直至进一步处理。使用时，取出腋窝、腹股沟以及肠系膜淋巴结并置于冰上的无菌1XPBS中直至进一步处理。在含有1x PBS(Invitrogen)和3％热灭活FBS(Invitrogen)的缓冲液中制备组织。通过45μm滤网(BD Falcon)捣碎组织并且用30ml 3％FBS/PBS缓冲液冲洗，之后在4℃下700g离心10分钟，分散脾细胞。为去除红血细胞，使团块化脾细胞重悬于4ml红血细胞裂解缓冲液(Sigma)中。温育4分钟后，通过添加3％FBS/1XPBS缓冲液终止裂解反应。用45μm滤网滤出细胞块。使剩余的脾细胞团块化进行另外的程序。对于KM050实验，通过45μm滤网(BD Falcon)捣碎组织并且用30ml3％FBS/PBS缓冲液冲洗，之后在4℃下700g离心10分钟，分散淋巴结。淋巴结未遭受红血细胞裂解。使剩余的淋巴结细胞团块化进行另外的程序。
杂交瘤融合：
最终加强之后，取脾脏或淋巴结并且使用分离系统使B细胞经受正向选择方法。简言之，使用淋巴结时在红血细胞裂解后将那些细胞与来自于相应小鼠的脾细胞混合并且测定总细胞数。添加抗小鼠IgG1加上抗小鼠IgG2a+b微珠(Miltenyi Biotec)之前，使细胞重悬于80μl 3％FBS/PBS缓冲液(每1×10E07个细胞)中并且在4℃下温育15分钟。然后将细胞/微珠混合物涂到置于磁力MACS分离器中并用3％FBS/PBS缓冲液洗涤的预湿LS柱上。IgG阳性细胞集中在3％FBS/PBS缓冲液中经标记、柱结合的成分中。
用CpG处理富集的B细胞过夜(最终浓度25μM)并且次日于BSA融合缓冲液(0.3M D-山梨糖醇、0.11mM水合醋酸钙、0.5mM醋酸镁四水合物和0.1％BSA(v/w)，调至pH7.2)中洗涤一次。经洗涤的细胞重悬于200μl的BSA融合缓冲液并测定细胞计数。以相同方式处理SP2/0细胞，但洗涤两次，一次用BSA融合缓冲液代替。使用BTX ECM 2001电细胞操纵器(HarvardApparatus)通过电融合，使B细胞按3:1比率与SP2/0骨髓瘤细胞融合。让每次融合在回收培养基(杜尔贝科改良伊格尔培养基-高葡萄糖(无酚红，无L-G)，含OPI(Sigma)、L-Glutamax(Gibco)、20％FBS(Gibco，用于杂交瘤的批量试验)和2-巯基乙醇)中过夜，重悬于1份回收培养基和9份半固体培养基中(ClonaCell-HY杂交瘤选择培养基D，StemcellTechnologies)中，然后接种到10cm陪替氏培养皿(petri dish)上。12天后将可见菌落挑选至96孔板中并且在筛选之前再培养2-3天。
杂交瘤孔的单克隆：
使用以下程序单克隆发现为多克隆的杂交瘤。使用台盼蓝(Trypan Blue)拒染法在Cedex细胞计数器上为取自生长在24孔板的一个孔上的现有菌落的细胞计数并且按400个可见细胞/ml的最终浓度接种到10cm陪替氏培养皿的1份杂交瘤维持培养基(改进DMEM(Gibco，目录号12491)L-Glutamax(Gibco，目录号35050)、20％FBS(Gibco，用于杂交瘤的批量试验)、HT补充物(Gibco，目录号41065)、青霉素-链霉素和2-巯基乙醇)与9份半固体培养基(ClonaCell-HY杂交瘤选择培养基D，目录号0.804，Stemcell Technologies)中。12天后将可见菌落挑选至96孔板中并且在筛选之前再培养2-3天。每个亲本菌落挑选最多4x96孔板并且筛选用于hLIGHT结合和受体中和。取最佳单克隆杂交瘤克隆物。使用这种程序单克隆抗体31A10和144F05。
实施例2
杂交瘤上清液筛选
杂交瘤克隆物产生后，在连续的初次和二次筛选中评估杂交瘤上清液并且基于抗体与hLIGHT的结合和受体中和活性的标准选择适当的杂交瘤克隆物。使用这种筛选级联，试验25163个杂交瘤克隆物并且将540个鉴定为初次命中物(primary hit)。之后，通过使用二次筛选标准确认41个杂交瘤克隆物(参见材料和方法中的详情)(表1)。
表1：通过筛选集中克隆物编号
通过二次筛选鉴定的41个克隆物中，发明人根据发明人设计的所需选择标准选择8个克隆物为抗体先导物组的一部分(参见实施例3中的详情)。
对于初次筛选，发明人设计了以下选择标准：如果上清液中存在的抗体可结合细胞表面上表达的天然展示的214E hLIGHT，则选择含杂交瘤克隆物的孔。该测定法通过在细胞表面涂布接种表达hLIGHT的CHO-S细胞，接着用杂交瘤上清液温育，接着用荧光检测抗体温育来完成。使用能够读取适当荧光的酶标仪读出上清液中抗LIGHT抗体的存在。此外，发明人使用HTRF(均相时间分辨荧光)测定法评估了用于结合重组表达的人LIGHT-214E的杂交瘤上清液。然后使用来自于以上提到的两种初次筛选测定法的数据精选出满足某些选择标准的克隆物(参见下面更多的详细描述)并且移至二次筛选，其中测定了每种抗体中和214E hLIGHT与两种受体LTβR和HVEM的结合的能力。发明人决定使用受体中和HTRF测定法和基于流式细胞术的受体中和测定法对此进行评估。最后，发明人决定通过SPR分析杂交瘤上清液以评价抗体对重组三聚体人LIGHT(即，重组214E hLIGHT和214K hLIGHT)的表观亲和力以及与食蟹猴LIGHT的交叉反应性。
当杂交瘤上清液中的抗体以高表观亲和力与h LIGHT-214E结合，但不一定与214KhLIGHT结合，以及与重组食蟹猴LIGHT交叉反应时，将抗体定义为二次命中物。另外，在试验的两种测定法中的至少一种(即：HTRF或基于流式细胞术的测定法)中，上清液中的抗体必须至少中和LIGHT受体之一，即：LTβR或HVEM。
材料和方法
初次筛选-与细胞表达的人LIGHT-214E的结合：
测试从杂交瘤细胞收集的上清液以评估分泌的抗体结合CHO-S细胞表面表达的214E hLIGHT的能力。为测定CHO-S 214E hLIGHT结合，按2xE04/孔将细胞涂布接种在黑壁透明底的经组织培养处理的384孔板(Costar)中补充了10％v/v FBS(GIBCO)的F12培养基(GIBCO)中并培养过夜。从384孔测定板去除培养基。向每个孔添加至少40μl稀释于杂交瘤维持培养基(HMM)中的杂交瘤上清液或阳性对照抗人LIGHT参考抗体(最终浓度为1μg/ml)或同种型IgG1对照抗体(在一些情况下称为Cm7，Sigma M9269，最终浓度为1μg/ml)。HMM由补充了1x Glutamax(Gibco)、20％v/v FBS(Gibco)、0.05mMβ-巯基乙醇、1xHT补充物(Gibco)和1x青霉素/链霉素(Gibco)的改进DMEM(Gibco)构成。在4℃下温育板1小时。抽吸培养基并且添加50μl、1000ng/mL补充了稀释于FACS缓冲液(PBS+1％w/v BSA+0.1％v/vNaN3)中的0.2μM DRAQ5(Biostatus)的山羊抗小鼠Alexa Fluor790(JacksonImmunoResearch 115-655-071)。在4℃下再温育板1小时。抽吸上清液并且添加25μl的4％v/v多聚甲醛并在室温下温育板15分钟。用100μl PBS洗板两次，然后完全去除洗涤缓冲液。通过使用Odyssey红外成像系统扫描板读取荧光强度。根据推荐的算法将抗小鼠结合(800nm通道)归一化为细胞数量(700nm通道)。如下面所详述(方程式1)计算百分比效应。使用参考抗体在1μg/ml的最终测定浓度下定义总结合。使用小鼠IgG1同种型对照(Sigma)在1μg/ml的最终测定浓度下定义非特异性结合。对于源自KM044-2的克隆物而言，应用高于或等于3.0％反应的选择标准将孔定义为命中物。可选地，对于源自KM050的克隆物而言，应用高于或等于5.0％反应的选择标准将孔定义为命中物(参见表1)。
方程式1：由初次筛选(LI-COR)和HTRF计算百分比效应
(使用800％响应值(LI-COR)或665/620nm比率(参见方程式2)(HTRF)
非特异性结合＝来自于含同种型对照小鼠IgG1的孔的值
总结合＝来自于含参考抗体的孔的值
初次筛选-与重组人LIGHT-214E的结合：
与筛选与CHO-S表达的LIGHT-214E的结合并行，也测试从杂交瘤孔收集的上清液以评估分泌的抗体结合作为重组蛋白质(在内部产生，参见实施例1中的详情)表达的214EhLIGHT的能力。通过(均相时间分辨荧光，Cisbio)测定形式，使用生物素化214EhLIGHT鉴定分泌的抗体与重组214E hLIGHT的结合。将5μl杂交瘤上清液转移到白色384孔低容量非结合表面聚苯乙烯板(Greiner)。5μl稀释于HTRF缓冲液(PBS(Sigma)+0.53M KF(Sigma)+0.1％w/v BSA(Sigma)中的20nM生物素化214E hLIGHT在室温下用稀释到5nM工作浓度的5μl杂交瘤上清液或5μl参考抗体或小鼠IgG1同种型对照预先温育1小时。添加10μl组合检测试剂，即1:200稀释于HTRF测定缓冲液中，最终稀释1:400的链霉亲和素D2(Cisbio)和1:200稀释于HTRF测定缓冲液中，最终稀释1:400的经铕穴状化合物(Cisbio)标记的山羊抗小鼠IgG(Southern Biotech)。使用EnVision酶标仪(Perkin Elmer)在620nm和665nm发射波长下读取时间分辨荧光之前，让板在黑暗中温育2小时。可以在Mathis(1995)Clinical Chemistry41(9),1391-1397中找到测定技术的更多详情。通过分别根据方程式2和方程式1计算每个样品的665/620比率和百分比效应分析数据。
方程式2：665/620比率的计算
665/620比率＝(样品665/620nm值)×10000
对于源自KM044-2和KM050的克隆物，发明人应用高于或等于20％效应的选择标准，将孔定义为来自于表1所述的重组214E hLIGHT结合的命中物。
二次筛选-与细胞表达的重组人LIGHT-214E的结合
为确定使用初次筛选选择标准选择的孔是否具有发明人设定的所需特征，进行了许多测定。由初次筛选被选为命中物的杂交瘤克隆物培养3天并且试验从杂交瘤细胞收集的上清液以评估结合CHO-S表达的214E hLIGHT的分泌抗体是否也可结合CHO-S表达的214KhLIGHT(a)，在一些情况下是否也可结合未转染的CHO-S细胞(b)，及它们是否中和重组LTβR-Fc或HVEM-Fc与CHO-S 214E hLIGHT的结合和(c)中和LTβR Fc或HVEM Fc与重组生物素化214E hLIGHT(d)的结合的能力。
与CHO-S表达的hLIGHT的结合和受体中和(测定a、b和c)：
按1×10E05个细胞/孔的密度将稀释于FACS缓冲液(PBS+1％w/v BSA+0.1％w/vNaN3)中的表达214E hLIGHT或214K hLIGHT的CHO-S细胞或未转染的CHO-S细胞分布到96孔V形底板(Greiner)中。用150μl的PBS洗涤细胞并且300xg离心3分钟。抽吸上清液并添加150μl的PBS。重复该洗涤步骤。
向经过洗涤的细胞中添加25μl稀释于FACS缓冲液中的杂交瘤上清液或来自杂交瘤上清液的纯化抗体并且温育10-15分钟。将参考抗体或小鼠IgG1对照抗体(Sigma,M9269)于FACS缓冲液中稀释到50μg/mL并向细胞中添加25μl。然后向孔中添加25μl于FACS缓冲液中稀释到720ng/mL的人HVEM huFc(R&D Systems，356-HV-100/CF)或稀释到1300ng/mL的人LTβR huFc(R&D Systems，629-LR-100/CF)。在4℃下温育细胞30分钟。
用150μl的PBS洗涤细胞两次，在每个洗涤步骤之后离心并抽吸上清液(300xg离心3分钟)。
为检测抗体和受体结合，向细胞中添加50μl以1:500稀释于FACS缓冲液中的山羊抗人IgG-PE(Jackson ImmunoResearch)和APC抗小鼠IgG(Jackson ImmunoResearch)。在4℃下于黑暗中温育细胞30分钟。
用150μl的PBS洗涤细胞两次，在每个洗涤步骤之后离心并抽吸上清液(300xg离心3分钟)。
为固定细胞，添加100μl 2％v/v多聚甲醛并且在4℃下温育细胞30分钟，通过300xg离心使细胞团块化并且使所述板重悬于50μl的FACS缓冲液中。使用BD FACS阵列仪器，通过流式细胞术测量PE和APC信号强度(几何平均值)。
使用方程式3计算受体结合％。将与CHO表达的LIGHT的结合定义为几何平均值>非特异性结合几何平均值2倍(IgG1同种型对照+受体对照孔的平均值)。
方程式3：受体结合的百分比(FACS)
基于几何平均值荧光
非特异性结合＝无抗体，无受体
总结合＝仅受体(LTβR或HVEM)结合(无抑制剂)+1μg/ml的同种型对照
二次筛选-HTRF配体/受体中和(测定d)：
进行以下方法。在室温下预先温育5μL稀释于HTRF缓冲液中2.5nM最终浓度(10nM工作浓度)的Flag标记LIGHT(内部)与5μl从杂交瘤孔收集的上清液1小时。向用于定义总结合的孔，添加5μl的LIGHT(10nM工作浓度，2.5nM最终浓度)和5μl杂交瘤维持培养基(HMM)。向用于定义非特异性结合的孔(仅受体)，添加10μl的HMM。或，在一些情况下，非特异性结合定义为5μl于HMM中稀释到1200nM的参考抗体和5μl的LIGHT(10nM工作浓度，2.5nM最终浓度)。总和非特异性结合孔作为含有从杂交瘤孔收集的上清液的孔在室温下在相同板中预先温育1小时。
光受体在HTRF测定缓冲液中稀释，并加入到所有孔中，5微升/孔的HVEM-Fc或LTβR-Fc的(R&D系统)为1.2纳米的HVEM(0.3纳米决赛)和0.4纳米的LTβR(0.1纳米决赛)。
为了检测结合，向所有孔中添加5μl的组合检测试剂。抗-flag D2(Cisbio)于HTRF测定缓冲液中稀释到20nM(5nM最终浓度)并且抗人Fc K(Cisbio)1:100稀释于HTRF测定缓冲液中(最终稀释1:400)。
使用EnVision酶标仪(Perkin Elmer)在620nm和665nm发射波长下读取时间分辨荧光之前，让板在黑暗中温育3小时。可以在Mathis(1995)Clinical Chemistry 41(9),1391-1397中找到测定技术的更多详情。通过分别根据方程式4和方程式5计算每个样品的665/620比率(2)和受体百分比来分析数据。
方程式4
665/620比率(2)＝样品665/620nm值
方程式5：受体结合的百分比(HTRF)
基于对665/620比率(2)的计算(方程式4)
非特异性结合＝300nM最终浓度下的受体和参考抗体
总结合＝受体(HVEM或LTβR)和LIGHT(无抑制剂)
来自二次筛选的命中标准选择：
基于结合和中和测定选择一组命中物。发明人将CHO-S LIGHT-214E测定中的命中物定义为通过FACS测定<70％受体与CHO-S LIGHT-214E细胞结合。将flag LIGHT/HVEM-Fc或flag LIGHT/LTβR Fc HTRF中和测定中的命中物定义为<90％受体与LIGHT结合的克隆物。与CHO-S LIGHT-214E和在一些情况下与CHO-LIGHT 214K的结合定义为>2*本底(小鼠IgG1结合)几何平均值。表1中总结了数据。还考虑了通过SPR的表观亲和力测量。
实施例3
抗体先导物表征
在二次筛选中鉴定41个杂交瘤克隆物后，扩大所选孔并且使用基于标准蛋白质G的亲和色谱纯化法(参见下面的方法)纯化鼠类/人嵌合抗体。使抗体经受各种测定以评估其阻断hLIGHT与其受体HVEM和LTβR结合的能力，以及每种抗体以高表观亲和力结合人以及食蟹猴LIGHT的能力。为辨认所选41种中哪种抗体最佳，使用体外细胞因子释放测定试验所有克隆物，其中向培养物中添加重组人LIGHT-214E以诱导HT29细胞分泌IL-8。更具体地在这项测定中，用hLIGHT对HT29细胞(一种人结肠直肠腺癌细胞系)进行涂布接种和处理，所述hLIGHT用不同浓度的41个纯化抗体命中物中的每一种预先温育。选出8个最佳中和物并于图1中描绘了这些所选抗体的滴定。图1的数据源于单一实验，该单一实验代表至少两次独立实验。(此外，如同通过流式细胞术测定那样，所选8个先导物全部试验以结合如同在CHO-S细胞的细胞表面表达的，天然表达的hLIGHT-214E。图2示出与仅第二检测抗体相比，0.64μg/ml的所有先导克隆物与CHO-S-hLIGHT 214E细胞的结合。图2中术语“无抗体”指定的应用是不使用第一抗体但不缺乏第二检测抗体。图2的数据源于单一实验。同种型对照(小鼠IgG1/κ，Sigma M9269)并行运行以证明特异性。此外，在实施例2中概述的HTRF测定中，测试8种先导抗体中和重组hLIGHT与其受体(人HVEM或人LTβR)的结合的能力。图3A示出中和LTβR与重组214E hLIGHT结合的抗体的先导物组。图3B示出对HVEM与hLIGHT的结合的中和。图3A和图3B均源于单一实验，该单一实验代表至少三次独立实验。在两次测定中均运行同种型对照小鼠IgG1抗体(Sigma M9269)。8种先导抗体全部再次经受SPR分析，评价对hLIGHT的表观亲和力以及与食蟹猴LIGHT的交叉反应性水平。另外，测定了与小鼠LIGHT的交叉反应性，但是经证实对于在此呈现的抗体先导物组而言极弱或完全不存在。在表2中可以看到鉴定的8种先导候选抗体的总结。
材料和方法：
从杂交瘤上清液纯化抗体：
使用蛋白质G亲和色谱法纯化抗体。使用IgG洗脱试剂(Pierce)从蛋白质G培养基洗脱抗体并且洗脱的抗体在使用之前经缓冲液交换到PBS中。通过SDS-PAGE分析评估抗体纯度并通过在OD280nm下读数的分光光度计量化。
对LIGHT诱导的从HT29细胞释放IL8的抑制：
将上皮细胞形态的HT29细胞(美国模式培养物保藏所，ATCC#HTB-38)结直肠腺癌(Fogh J.and Trempe G Human tumor cells in vitro.New York:Plenum Press；1975)维持在McCoys 5a培养基(GIBCO)+10％v/v FBS(GIBCO)中。由100％汇合率将细胞分流在1:4和1:12之间用于常规培养。将培养基中100μl、1×10E06/ml的HT29细胞分散在96孔透明板(Costar)中(1×10E05个细胞/孔)。使用抑制剂的滴定液以便如同在所述测定中通过IC50值测量那样，确定克隆效力。从50nM最终浓度(200nM工作浓度)，在培养基中滴定抗体。将150μl的抑制剂滴定液添加到150μl稀释于培养基中的重组214E hLIGHT(内部表达)(10ng/mL最终浓度，所以为40ng/mL工作浓度)。抑制剂滴定液和hLIGHT一起在37℃下在96孔无菌U形底透明板(Costar)中预先温育30分钟。将100μl的hLIGHT+抑制剂滴定液添加到细胞中(一式两份)或100μl的对照(培养基或0.5μg/mL最终浓度的LTα1β2(R&D Systems，678-LY-010/CF)或10ng/mL终浓度的仅LIGHT或仅培养基)中。然后在潮湿气氛中在37℃和5％CO2下培养细胞过夜(16-18小时)。温育期后去除来自于HT29细胞的经调节的上清液并且通过IL-8ELISA(R&D systems)测定IL8的水平。
使用人IL-8Duoset ELISA试剂盒(R&D)Systems)测定上清液中的IL-8水平。在4℃下使IL-8捕获抗体(4μg/ml稀释于PBS中，50μl/孔)吸附到96孔低自体荧光、高蛋白结合板(Costar)过夜。通过用PBS-吐温洗涤去除过量IgG并且在室温下用在PBS中的1％牛血清白蛋白(BSA)封闭孔1小时，之后如先前所述洗涤该板。然后以50μl/孔添加经调节的培养基，还向ELISA板添加IL-8标准品(从2000pg/ml开始，1:2稀释)作为ELISA对照并且在室温下温育该板至少1小时。
温育之后，如之前洗涤板以去除未结合的蛋白质。然后向板中添加生物素化IL-8检测Ab(20ng/ml于试剂稀释剂中(0.1％BSA/PBS)；50μl/孔)并且在室温下温育1小时。通过用PBS-吐温(0.1％v/v)洗涤去除未结合的检测抗体，而用链霉亲和素-Europium3+缀合物(检测，PerkinElmer)检测剩余的生物素化抗体。在615nm下在Envision酶标仪(PerkinElmer)上测量时间分辨荧光。按铕计数绘制荧光数据。如同方程式6使用在抑制剂对照(最大对照)缺乏并且无LIGHT对照(培养基对照)时，来自于LIGHT刺激的铕计数，将抑制剂数据归一化为最大IL-8释放量的百分比。使用GraphPad Prism软件，使用四参数逻辑方程式(方程式7)通过曲线拟合测定IC50值。
方程式6：LIGHT诱导的IL8释放％
最大值＝仅LIGHT(无抑制剂)
培养基＝仅培养基(无LIGHT)
方程式7：四参数逻辑计算
Y＝最小值+(最大值-最小值)/(1+10^((LogIC50-X)*斜率))
X＝浓度算法
Y＝特异性结合(方程式6)
最大值和最小值＝与Y相同单位的稳定期(特异性结合)
与X相同单位的Log IC50。Y从最小值开始并且以S形达到最大值。X增加时，特异性结合降低。
纯化自杂交瘤上清液的抗体与CHO-S表达的hLIGHT的结合
纯化自杂交瘤上清液的抗体的结合如本文所述进行。
HTRF配体/受体中和：
用抑制剂滴定液进行以下方法以便如同在所述测定中通过IC50值测量那样，确定克隆效力。在HTRF缓冲液中稀释到2.5nM最终浓度(10nM工作浓度)的Flag标记的hLIGHT(内部)与纯化自杂交瘤上清液(在HTRF测定缓冲液中从300nM最终浓度开始稀释(1200nM工作浓度))的5μl抗体滴定液在室温下预先温育1小时。向用于定义总结合的孔，添加5μl的LIGHT(10nM工作浓度，2.5nM最终浓度)和5μl杂交瘤维持培养基(HMM)。向用于定义非特异性结合的孔(仅受体)，添加10μl的HMM。总和非特异性结合孔在也含抑制剂滴定液的相同板中在室温下预先温育1小时。
光受体在HTRF测定缓冲液中稀释，并加入到所有孔中，5微升/孔的HVEM-Fc或LTβR-Fc的(R&D系统)为1.2纳米的HVEM(0.3纳米决赛)和0.4纳米的LTβR(0.1纳米决赛)。
为了检测结合，向所有孔中添加5μl的组合检测试剂。抗-flag D2(Cisbio)于HTRF测定缓冲液中稀释到20nM(5nM最终浓度)并且抗人Fc K(Cisbio)1:100稀释于HTRF测定缓冲液中(最终稀释1:400)。
使用EnVision酶标仪(Perkin Elmer)在620nm和665nm发射波长下读取时间分辨荧光之前，让板在黑暗中温育3小时。可以在Mathis(1995)Clinical Chemistry 41(9),1391-1397中找到测定技术的更多详情。通过分别根据方程式8和方程式9计算每个样品的ΔF值％和受体％来分析数据。
方程式8：ΔF％的计算
非特异性对照＝仅受体
方程式9：受体结合的百分比(HTRF)
基于ΔF％的计算(方程式8)
总结合＝受体(HVEM或LTβR)和LIGHT(无抑制剂)
表面等离子共振分析：
使用ProteOnTM XPR36阵列系统(BioRad)进行SPR分析。使用胺偶联将抗小鼠IgG(GE Healthcare BR-1008-38)固定在GLC生物传感器表面，然后使用1M乙醇胺封闭该表面。试验抗体被捕获在该表面上并且使用256nM单一浓度下的重组hLIGHT(214E、214K和食蟹猴变体)，使用缓冲液注射(即，0nM)双重参考结合传感图以去除基线漂移和注射伪差。使用ProteOn XPR36分析软件所固有的1:1模型测定LIGHT-抗体相互作用的表观亲和力。使用HBS-EP(Teknova)作为运行缓冲液运行该测定并且在25℃下运行。
实施例4
抗体结合表征研究
使用SPR的抗体交叉阻断实验证明分离的抗体属于3个不同的表位类别。抗体克隆物31A10、29C09和144F05结合1类表位并且可以类似表观亲和力识别两种hLIGHT等位基因变体(214E和214K)。抗体克隆物62C01和117C06分类为表位类别2，其容许与显性人LIGHT等位基因变体214E的高亲和力结合，但是与次要等位基因变体214K的结合也降低20倍以上或被完全消除。最后，抗体克隆物14B09、13H04和42A02被鉴定为3类表位结合剂，其中抗体以类似的高表观亲和力识别两种人LIGHT等位基因变体(214E和214K)。有趣的是，表位类别2和3的抗体相互竞争hLIGHT结合。然而，由于表位类别2抗体不能识别LIGHT的次要等位基因变体而表位类别3抗体可以的差异性结合性质，(虽然不希望受任何理论约束)我们推断表位类别2和3的抗体必须结合LIGHT分子表面的单独表位。表位类别1和3的抗体不相互竞争并且(虽然不希望受任何理论约束)我们推断它们因此必须结合不同的表位。同样，表位类别1和2的抗体不相互竞争并且(虽然不希望受任何理论约束)我们推断它们因此必须结合不同的表位。
表3中总结了来自于该项交叉结合研究的数据：
表3：
材料和方法
抗体竞争SPR：
竞争SPR中试验的所有抗体均呈人IgG4(PE)形式(重新格式化方法参见实施例5)。为研究可共用LIGHT上的相同结合区的抗体，在ProteOnTM XPR36测定系统上进行基于SPR的测定。使抗人IgG抗体(Jackson Immunoresearch，109-005-008、109-006-008和309-006-008)固定在GLC生物传感器表面，并且如以上进行的测定使用标准胺偶联固定在GLC生物传感器芯片上。抗人IgG作为捕获表面用于捕获作为“配体”的试验抗体进行分析。使用ProteOnTM XPR36测定系统在垂直或水平方向上针对捕获表面的能力，如以下进行测定。在垂直方向上捕获“配体”抗体，然后使用1:1000小鼠血清稀释液在水平方向上封闭捕获表面。然后使LIGHT在水平方向上通过捕获表面并且与捕获的配体抗体结合，之后使相同的配体抗体通过“抗体-LIGHT”复合物，(LIGHT为三聚体，所以这确保所有可用LIGHT分子均被配体抗体结合)，同样配体抗体的第二应用也在垂直方向上。然后使分析抗体在水平方向上通过“抗体-LIGHT配体复合物”，如果未见结合则Ab共用相似表位，如果发生结合则Ab不共用相似表位。通过监测传感图来确定结合/不结合，使用非LIGHT结合抗体作为对照样品双重参考传感图并且包括在每组配体抗体运行中。相互作用完成之后，使用10mM甘氨酸(pH1.7)再生抗小鼠IgG捕获表面，留下可用于另一轮分析的捕获表面。使用HBS-EP作为运行缓冲液在25℃下运行测定。
实施例5
先导抗体候选物的序列恢复
选择和表征先导候选物后，使用RT-PCR，使用正向和反向引物的混合物恢复其全人可变结构域。使抗体重新格式化为人IgG4骨架并且使用瞬时表达体系在CHO-S细胞中表达。序列表和表4中展示了所有序列的总结。
表4：
nt-核苷酸
aa-氨基酸
指出了从种系片段序列变化的数量
材料和方法
从杂交瘤细胞分离RNA：
使用TRIzolTM试剂(Invitrogen)从杂交瘤细胞提取总RNA。通过分光光度法分析分离的RNA的量和质量。
通过RT-PCR恢复抗体可变结构域：
所选克隆物用于制备总RNA，总RNA在RT-PCR反应中用于恢复重链V区。IgG特异性反向引物和Ig前导序列特异性正向引物集或可选地IgG特异性反向引物和Ig 5’非翻译区(UTR)序列特异性正向引物集用于重链。κ恒定区特异性反向引物和κ前导序列特异性正向引物集或可选地κ恒定区特异性反向引物和κ5’UTR序列特异性正向引物集用于κ轻链。λ特异性3’UTR反向引物和λ前导序列特异性正向引物集或可选地λ特异性3’UTR反向引物和λ5’UTR序列特异性正向引物集或可选地λ恒定区特异性反向引物和λ前导序列特异性正向引物集或可选地λ恒定区特异性反向引物和λ5’UTR序列特异性正向引物集用于λ轻链。通过琼脂糖凝胶电泳分离RT-PCR产物，在正向和反向为预计尺寸的DNA测序。可选地，将RT-PCR产物亚克隆到克隆载体中并且提交单独克隆物的DNA进行测序。
具有IgG4骨架的抗体的重新格式化
重链可变区编码序列经密码子优化用于哺乳动物表达并且通过重叠延伸PCR与经过密码子优化的人IgG4-PE恒定区框内融合，然后使用标准限制酶消化和连接克隆到pXC-18.4表达质粒(Lonza)中。框内具有人κ恒定区的κ轻链可变区编码序列或全长λ轻链编码序列经密码子优化用于哺乳动物表达并且使用标准限制酶消化和连接克隆到pXC-17.4表达质粒(Lonza)中。为了重链和轻链同时表达，使用标准限制酶消化和连接使载体pXC-17.4和pXC-18.4融合成单个载体。
为所有构建体测序以确保其正确的序列组成。
实施例6
测定抗LIGHT抗体在树突状细胞-T细胞混合淋巴细胞反应中对T细胞激活的作用
树突状细胞由单核细胞前体产生。单核细胞前体分离自使用Ficoll-Paque plus(GE Healthcare)密度梯度离心从去白细胞系统腔(NHSBT)分离的外周血单核细胞(PBMC)。单核细胞是使用阴性选择分离磁珠(Miltenyi)分离自PBMC。在培养基(补充了10％v/v FBS的RPMI(Gibco))中用100ng/ml的细胞因子GM-CSF(Peprotech)和100ng/ml的IL-4(Peprotech)培养单核细胞7天。7天之后，使用细胞解离培养基(Gibco)取出细胞并且立即使用细胞刮勺或冷藏保存供进一步使用。使用阴性选择分离磁珠(Miltenyi)从同种异体PBMC分离T细胞。
在37°℃下于PBS中用10μg/ml丝裂霉素C(Sigma)预先温育树突状细胞。然后在PBS中洗涤细胞3次，300xg离心3分钟，每次洗涤后抽吸上清液。将同种异体T细胞添加到96孔板中补充了10％v/v FBS的RPMI中，然后基于细胞数量/孔，按范围为1:1至4:1的树突状细胞/T细胞规定比率添加树突状细胞。在37℃下温育细胞5天。5天之后，根据生产商的建议通过duoset ELISA(R&D Systems)测量TNF-α、IFN-γ和IL-2。根据生产商的建议通过CFSE稀释测量增殖。
测定抗LIGHT抗体在同种异体PBMC混合淋巴细胞反应中的作用
使用Ficoll-Paque plus(GE Healthcare)密度梯度离心从去白细胞系统腔(NHSBT)分离PBMC。在37℃下于PBS中用10μg/ml丝裂霉素C(Sigma)预先温育PBMC。然后在PBS中洗涤细胞3次，300xg离心3分钟，每次洗涤后抽吸上清液。按1×10E06/ml的浓度、100μl/孔将同种异体PBMC(未经丝裂霉素C处理)添加到96孔板中补充了10％v/v FBS的RPMI中。然后向96孔板中的同种异体PBMC(未经丝裂霉素C处理)中添加经丝裂霉素C处理的PBMC，基于细胞数量/孔，最终细胞比率在1:1至4:1经丝裂霉素C:未经丝裂霉素C处理的范围内。在37℃/5％CO2下温育细胞5天。5天之后，根据生产商的建议通过duoset ELISA(R&DSystems)测量TNF-α、IFN-γ和IL-2。根据生产商的建议通过CFSE稀释测量增殖。
实施例7
抗原制备、免疫接种程序和杂交瘤产生
以下实施例提供了使用如以上所讨论的KyouseTM系统产生和鉴定另一组抗人LIGHT单克隆抗体的详细描述。在实施例1中可以找到详细描述。如实施例1中所述，从使用来自于使用RIMMS方案免疫接种的小鼠的脾细胞产生的杂交瘤分离抗体18E04和98C07。
从单个的B细胞(BCT)克隆抗体
此处使用来自于第4组(免疫接种程序)的转基因小鼠。鼠类组织分离和制备及B细胞的富集按照上面实施例1的方法进行。另外，抗原特异性B细胞是在含裂解缓冲液的96孔板中分选的单个细胞。使裂解物经受RT-PCR并且送所得重链和轻链产物测序。
将序列转染到CHO细胞中进行表达。转染5天后收集上清液并且按照实施例8中描述的杂交瘤上清液那样筛选。
实施例8
杂交瘤上清液筛选
杂交瘤克隆物产生后，在连续的初次和二次筛选中评估杂交瘤上清液并且基于抗体与hLIGHT的结合和受体中和活性的标准选择适当的杂交瘤克隆物。在实施例2中可以找到对筛选和通过初次和二次筛选选择命中物的详细描述。以这种方式选择抗体克隆物18E04和98C07。
当杂交瘤上清液中的抗体以高表观亲和力与hLIGHT-214E结合，但不一定与hLIGHT-214K结合，以及与重组食蟹猴LIGHT交叉反应时，将抗体定义为二次命中物。另外，在试验的两种测定法中的至少一种(即：HTRF或基于流式细胞术的测定法)中，上清液中的抗体必须至少中和LIGHT受体之一，即：LTβR或HVEM。
对于使用BCT产生的抗体，筛选级联如实施例2中所述，具有下述修改。基于初次和二次筛选及SPR分析，还为先导物组选择了两种BCT克隆物。发明人设计了对于BCT克隆物的所需选择标准(参见实施例9中的详情)。以这种方式选择抗体01C02和01C06。
如果上清液中存在的抗体可结合CHO-S细胞的细胞表面上表达的天然展示的hLIGHT-214E或重组表达的人LIGHT-214E，则选择含BCT克隆物的孔。另外，发明人决定通过SPR分析上清液以评价抗体对重组三聚体人LIGHT的表观亲和力。最后发明人决定使用受体中和HTRF测定法评估每种抗体中和重组表达的hLIGHT-214E与HVEM的结合的能力。使用来自于前面提到的测定法的数据，满足某些选择标准的克隆物(参见下面更多的详细描述)然后与非FcR结合性和铰链区稳定的人恒定区(IgG4(PE))重新格式化以允许进一步表征。
材料和方法
初次筛选-与细胞表达的人LIGHT-214E的结合：
对于抗体克隆物18E04和98C07，按照实施例2进行筛选。应用高于或等于5.0％反应的选择标准将孔定义为命中物。
方程式1：由初次筛选(LI-COR)和HTRF计算百分比效应
(使用800％响应值(LI-COR)或665/620nm比率(参见方程式2)(HTRF)
非特异性结合＝来自于含同种型对照小鼠IgG1的孔的值
总结合＝来自于含参考抗体的孔的值
对于使用BCT产生的抗体，使用相同方法，做以下修改：在CHO培养基中培养抗体生成细胞时，将阳性对照参考抗体和同种型对照抗体稀释于CHO培养基(CD CHO培养基(Gibco)和8mM L-谷氨酰胺)中。
初次筛选-与重组人LIGHT-214E的结合：
对于从杂交瘤筛选的克隆物(18E04和98C07)，方法如实施例2中所述。
对于从BCT筛选的克隆物，使用实施例2中方法的修改形式。5μl稀释于HTRF缓冲液(PBS(Sigma)+0.53M KF(Sigma)+0.1％w/v BSA(Sigma)中的20nM生物素化hLIGHT-214E在室温下用5μl的1:100稀释于HTRF测定缓冲液中的链霉亲和素D2(Cisbio)预先温育1小时。将在CHO培养基中稀释到5nM工作浓度的5μl的CHO上清液或5μl的参考抗体或小鼠IgG1同种型对照转移到白色384孔低容量非结合表面聚苯乙烯板(Greiner)。添加5μl的1:1000稀释于HTRF测定缓冲液中，最终稀释1:4000的经铕穴状化合物(Cisbio)标记的山羊抗小鼠IgG(Southern Biotech)。使用EnVision酶标仪(Perkin Elmer)在620nm和665nm发射波长下读取时间分辨荧光之前，让板在黑暗中温育2小时。如同对杂交瘤描述的那样进行分析。
通过分别根据方程式2和方程式1计算每个样品的665/620比率和百分比效应分析数据。
方程式2：665/620比率的计算
665/620比率＝(样品665/620nm值)×10000
对于源自杂交瘤的克隆物，发明人应用高于或等于20％效应的选择标准，将孔定义为来自于重组hLIGHT-214E结合的命中物。对于源自BCT的克隆物，发明人应用高于或等于10％效应的选择标准，将孔定义为来自于重组hLIGHT-214E结合的命中物。
二次筛选-与细胞表达的重组人LIGHT-214E的结合
如先前所述，筛选上清液以评估结合CHO-S表达的hLIGHT-214E的分泌抗体是否也可结合CHO-S表达的hLIGHT-214K(a)，在一些情况下是否也可结合未转染的CHO-S细胞(b)，它们是否中和重组LTβR-Fc或HVEM-Fc与CHO-S hLIGHT-214E的结合及(c)中和LTβR-Fc或HVEM-Fc与重组生物素化hLIGHT-214E(d)的结合的能力。
与CHO-S表达的hLIGHT的结合和受体中和(测定a、b和c)：
按照实施例2筛选杂交瘤来源的克隆物。
方程式3：受体结合的百分比(FACS)
基于几何平均值荧光
非特异性结合＝无抗体，无受体
总结合＝仅受体(LTβR或HVEM)结合(无抑制剂)+1μg/ml的同种型对照
二次筛选-HTRF配体/受体中和(测定d)：
如实施例2中所述筛选杂交瘤克隆物。
对于源自BCT的克隆物，使用受体中和HTRF测定法测试来自于CHO细胞的上清液中和重组表达的hLIGHT-214E与HVEM的结合的能力。如实施例2中所述进行测定，做以下修改。向用于定义总结合的孔，添加5μl的LIGHT(10nM工作浓度，2.5nM最终浓度)和5μl的CHO培养基。向用于定义非特异性结合的孔(仅受体)，添加10μl的CHO培养基。按照杂交瘤克隆物那样分析数据。
方程式4
665/620比率(2)＝样品665/620nm值
方程式5：受体结合的百分比(HTRF)
基于对665/620比率(2)的计算(方程式4)
非特异性结合＝300nM的受体和参考抗体
总结合＝受体(HVEM或LTβR)和LIGHT(无抑制剂)
来自二次筛选的命中标准选择：
基于结合和中和测定选择命中物。发明人将CHO-S LIGHT-214E/HVEM-Fc或LTβR-Fc中的命中物定义为通过FACS测定<70％受体与CHO-S LIGHT-214E细胞结合。将flagLIGHT/HVEM-Fc或flag LIGHT/LTβR Fc HTRF中和测定中的命中物定义为具有<90％受体结合的克隆物。与CHO-S LIGHT-214E和在一些情况下与CHO-LIGHT 214K的结合定义为>2*本底(小鼠IgG1结合)几何平均值。对于BCT，将通过HTRF中和测定<40％受体与flag-LIGHT/HVEM结合被视为命中物。对于BCT命中物的进展还需要与食蟹猴LIGHT的交叉反应性和与天然和/或重组hLIGHT 214E的结合。还考虑了通过SPR的表观亲和力测量。
实施例9
抗体先导物表征
扩大所选孔并且使用基于标准蛋白质G的亲和色谱纯化法(参见实施例3)纯化鼠类C/人V嵌合抗体。使两种杂交瘤来源的克隆物和两种BCT来源的克隆物经受各种测定以评估其阻断hLIGHT与其受体HVEM和LTβR结合的能力，以及每种抗体以高表观亲和力结合人以及食蟹猴LIGHT的能力。图4A示出了另外的杂交瘤克隆物阻断hLIGHT诱导的HT29细胞释放IL8的能力。图4B示出了BCT产生的克隆物的结果。图4的数据源于单一实验，该单一实验代表至少两次独立实验。图5示出与仅第二检测抗体相比，0.64μg/ml的先导杂交瘤克隆物与CHO-S-hLIGHT 214E细胞的结合。图5中术语“无抗体”指定的应用是不使用第一抗体但不缺乏第二检测抗体。图5的数据源于单一实验。同种型对照(小鼠IgG1/κ，Sigma M9269)并行运行以证明特异性。
另外，在所概述的HTRF测定中，测试抗体中和重组hLIGHT与其受体(人HVEM或人LTβR)的结合的能力。
图6A示出另外的杂交瘤克隆物对LTβR与重组hLIGHT-214E的结合的中和。图6B示出对HVEM与hLIGHT的结合的中和。图6A和图6B均源于单一实验，该单一实验代表至少两次独立实验。在两次测定中均运行同种型对照小鼠IgG1抗体(Sigma M9269)。先导抗体再次经受SPR分析，评价对hLIGHT的表观亲和力以及与食蟹猴LIGHT的交叉反应性水平。缺乏与小鼠LIGHT的交叉反应性。图6C示出BCT来源的克隆物对LTβR与hLIGHT的结合的中和，而图6D示出对HVEM结合的中和。在表5中可以看到另外的先导候选抗体的总结。
材料和方法：
从杂交瘤上清液纯化抗体：
按照实施例3纯化抗体。
BCT来源的抗体的重新格式化
按照实施例10，抗体01C02和01C06与铰链区稳定的、非FcR结合性人恒区定(IgG4(PE))重新格式化。该实施例中的所有测定均用这些重新格式化的抗体进行。
对LIGHT诱导的从HT29细胞释放IL8的抑制：
这项测定按照实施例3进行。
纯化自杂交瘤上清液的抗体与CHO-S表达的hLIGHT的结合
纯化自杂交瘤上清液的抗体的结合如本文所述进行。
HTRF配体/受体中和：
抗体18E04和98C07的分析按照实施例3进行。
对于BCT来源的与人IgG4(PE)恒定区重新格式化的克隆物的分析，按照实施例3进行测定，做以下修改：HVEM-Fc和LTβR-Fc经AlexaFluor 647标记，并且使用抗Flag K抗体(Cisbio)进行检测。
表面等离子共振分析：
对于杂交瘤来源的克隆物，这按照实施例3进行。对于BCT来源的克隆物，使抗人IgG(Jackson Immunoresearch，109-005-008、109-006-008和309-006-008)固定在生物传感器表面。其余测定如之前那样进行。
实施例10
先导抗体候选物的序列恢复
选择和表征先导候选物后，使用RT-PCR，使用正向和反向引物的混合物恢复其全人可变结构域。使抗体重新格式化为人IgG4骨架并且使用瞬时表达体系在CHO-S细胞中表达。序列表(表6)中展示了所有序列的总结。
表6
nt-核苷酸
aa-氨基酸
指出了从种系片段序列变化的数量
材料和方法
从杂交瘤细胞分离RNA：
方法如实施例5中所述。
通过RT-PCR恢复抗体可变结构域：
方法如实施例5中所述。
具有人IgG4骨架的抗体的重新格式化
方法如实施例5中所述。
实施例11
抗体结合表征研究
使用SPR的抗体交叉阻断实验证明分离的抗体属于3个表位类别。抗体克隆物01C06和18E04结合1类表位并且可以类似表观亲和力识别两种LIGHT等位基因变体(214E和214K)。抗体克隆物98C07分类为表位类别2，其容许与显性人LIGHT等位基因变体214E的高亲和力结合，但是与次要等位基因变体214K的结合也降低20倍以上或被完全消除。最后，抗体克隆物01C02被鉴定为3类表位结合剂，其以类似的高表观亲和力识别两种人LIGHT等位基因变体(214E和214K)。有趣的是，表位类别2和3的抗体相互竞争hLIGHT结合。然而，由于表位类别2抗体不能识别LIGHT的次要等位基因变体而表位类别3抗体可以的差异性结合性质，表位类别2和3的抗体必须结合LIGHT分子表面的单独表位。表位类别1和3的抗体不相互竞争并且因此必须结合不同的表位。
表7中总结了来自于该项交叉结合研究的数据：
材料和方法
抗体竞争SPR：
如实施例4中所述，进行竞争SPR测定。如实施例5中所述，所有抗体与人IgG4(PE)骨架重新格式化。
实施例12
对先导抗体与兔LIGHT结合的评估
基于IC50值，评估前8种抗体与兔LIGHT的结合。先导mAb不结合小鼠LIGHT时，与兔LIGHT的结合将在动物模型方面提供更多选择。通过SPR，与3种工具mAb并行分析先导抗体。结果在图7中示出。显示8种先导抗体中有4种以广泛相似的动力学结合人和兔LIGHT蛋白质(分别为SEQ ID NO:308和423)。有趣的是，工具抗体不结合兔LIGHT。将4种结合剂选择为最终先导物组：1C02、13H04、98C07和31A10。如实施例4和11中所述，这4种抗体也分布在3个表位类别中。
材料和方法
人LIGHT 214E和兔LIGHT蛋白质的结合使用ProteOn XPR36阵列系统(BioRad)，使用表面等离子共振(SPR)进行。通过伯胺偶联使3种抗人抗体的混合物-Jackson Labs 109-005-008、109-006-008和309-006-008固定在GLC芯片上，在10mM乙酸盐(pH4.5)中的浓度为这样产生适于捕获人抗体的捕获表面。LIGHT抗体被捕获在这种抗人IgG表面上，然后使人和兔LIGHT蛋白质通过200nM浓度下的捕获LIGHT Ab。使用缓冲液注射以双重参考LIGHT结合传感图。使用HBS-EP作为运行缓冲液在25℃下运行测定。
实施例13
最终先导物组的表征
如同实施例3中那样，分析最终IgG4(PE)形式先导物组的中和活性。在HTRF测定中，测试抗体中和hLIGHT与其受体(HVEM和LTβR)的结合的能力。还测试了抗体中和LIGHT诱导的HT29结肠癌细胞释放IL8的能力。图8和表8中示出了结果和对先导mAb特征的总结。
表8
CNROR–无法分辨解离速率
最终先导物组具有优良的结合和中和特征。所有先导物均中和LIGHT诱导的IL-8释放，对于4种先导物中的3种而言IC50值为亚纳摩尔级。所有4种先导物均中和LIGHT与可溶性HVEM和LTβR的结合，IC50值低于5nM。4种先导物以亚纳摩尔级亲和力结合人和食蟹猴LIGHT两者，并且除98C07外，全部先导物结合主要和次要人LIGHT变体。
材料和方法
按照实施例3进行HTRF测定，做以下修改：HVEM-Fc和LTβR-Fc经AlexaFluor 647标记，并且使用抗Flag K抗体(Cisbio)进行检测。
按照实施例3进行HT29IL-8释放测定。如实施例9中所述，按照BCT来源的克隆物那样进行SPR。
LIGHT序列
人LIGHT-214E(天然、非密码子优化序列)
核苷酸序列
氨基酸序列
MEESVVRPSVFVVDGQTDIPFTRLGRSHRRQSCSVARVGLGLLLLLMGAGLAVQGWFLLQLHWRLGEMVTRLPDGPAGSWEQLIQERRSHEVNPAAHLTGANSSLTGSGGPLLWETQLGLAFLRGLSYHDGALVVTKAGYYYIYSKVQLGGVGCPLGLASTITHGLYKRTPRYPEELELLVSQQSPCGRATSSSRVWWDSSFLGGVVHLEAGEVVVRVLDERLVRLRDGTRSYFGAFMV[SEQ ID NO：300]
：等位基因变体
人LIGHT-214K(天然、非密码子优化序列)
核苷酸序列
氨基酸序列
MEESVVRPSVFVVDGQTDIPFTRLGRSHRRQSCSVARVGLGLLLLLMGAGLAVQGWFLLQLHWRLGEMVTRLPDGPAGSWEQLIQERRSHEVNPAAHLTGANSSLTGSGGPLLWETQLGLAFLRGLSYHDGALVVTKAGYYYIYSKVQLGGVGCPLGLASTITHGLYKRTPRYPEELELLVSQQSPCGRATSSSRVWWDSSFLGGVVHLEAGEVVVRVLDERLVRLRDGTRSYFGAFMV[SEQ ID NO：302]
：等位基因变体
人LIGHT-214E(密码子优化序列-型式1)
用于产生稳定细胞系(用于免疫接种的MEF细胞、用于筛选的CHO细胞)的人LIGHT经密码子优化。这种LIGHT为全长，具有胞外结构域、跨膜结构域和胞质尾区。
核苷酸序列
ATGGAAGAGTCCGTCGTGCGGCCCTCCGTGTTCGTGGTGGATGGCCAGACCGACATCCCCTTCACCAGACTGGGCCGGTCCCACAGACGGCAGTCTTGCTCTGTGGCTAGAGTGGGCCTGGGCCTCCTGCTGCTGCTGATGGGAGCTGGACTGGCTGTGCAGGGCTGGTTTCTGCTGCAGCTGCATTGGCGGCTGGGCGAGATGGTCACCAGGCTGCCTGATGGCCCTGCTGGCTCTTGGGAGCAGCTGATCCAGGAACGGCGGTCCCACGAAGTGAATCCTGCCGCTCATCTGACCGGCGCCAACTCTTCCCTGACCGGATCTGGTGGACCCCTGCTGTGGGAGACTCAGCTGGGCCTGGCTTTCCTGCGGGGCCTGTCTTACCATGATGGCGCCCTGGTCGTGACCAAGGCCGGCTACTACTACATCTACTCCAAGGTGCAGCTGGGCGGCGTGGGCTGTCCTCTGGGACTGGCTTCTACCATCACCCACGGCCTGTACAAGCGGACCCCCAGATACCCCGAGGAACTGGAACTGCTGGTGTCCCAGCAGTCCCCTTGTGGCAGAGCCACCTCCTCCAGCAGAGTGTGGTGGGACTCCTCTTTCCTGGGCGGGGTGGTGCATCTGGAAGCCGGCGAAAGGTGGTCGTGCGGGTGCTGGATGAGAGACTCGTGCGGCTGAGGGACGGCACCAGAAGCTACTTCGGCGCCTTTATGGTG[SEQ ID NO：303]
氨基酸序列
MEESVVRPSVFVVDGQTDIPFTRLGRSHRRQSCSVARVGLGLLLLLMGAGLAVQGWFLLQLHWRLGEMVTRLPDGPAGSWEQLIQERRSHEVNPAAHLTGANSSLTGSGGPLLWETQLGLAFLRGLSYHDGALWTKAGYYYIYSKVQLGGVGCPLGLASTITHGLYKRTPRYPEELELLVSQQSPCGRATSSSRVWWDSSFLGGVVHLEAGEVVVRVLDERLVRLRDGTRSYFGAFMV[SEQ ID NO：304]
：等位基因变体
人LIGHT-214K(密码子优化序列-型式1)
用于产生稳定细胞系(用于免疫接种的MEF细胞、用于筛选的CHO细胞)的人LIGHT经密码子优化。这种LIGHT为全长，具有胞外结构域、跨膜结构域和胞质尾区。
核苷酸序列
ATGGAAGAGTCCGTCGTGCGGCCCTCCGTGTTCGTGGTGGATGGCCAGACCGACATCCCCTTCACCAGACTGGGCCGGTCCCACAGACGGCAGTCTTGCTCTGTGGCTAGAGTGGGCCTGGGCCTCCTGCTGCTGCTGATGGGAGCTGGACTGGCTGTGCAGGGCTGGTTTCTGCTGCAGCTGCATTGGCGGCTGGGCGAGATGGTCACCAGGCTGCCTGATGGCCCTGCTGGCTCTTGGGAGCAGCTGATCCAGGAACGGCGGTCCCACGAAGTGAATCCTGCCGCTCATCTGACCGGCGCCAACTCTTCCCTGACCGGATCTGGTGGACCCCTGCTGTGGGAGACTCAGCTGGGCCTGGCTTTCCTGCGGGGCCTGTCTTACCATGATGGCGCCCTGGTCGTGACCAAGGCCGGCTACTACTACATCTACTCCAAGGTGCAGCTGGGCGGCGTGGGCTGTCCTCTGGGACTGGCTTCTACCATCACCCACGGCCTGTACAAGCGGACCCCCAGATACCCCGAGGAACTGGAACTGCTGGTGTCCCAGCAGTCCCCTTGTGGCAGAGCCACCTCCTCCAGCAGAGTGTGGTGGGAGTCCTCTTTCCTGGGCGGGGTGGTGCATCTGGAAGCCGGCGAAAGGTGGTCGTGCGGGTGCTGGATGAGAGACTCGTGCGGCTGAGGGACGGCACCAGAAGCTACTTCGGCGCCTTTATGGTG[SEQ ID NO：305]
氨基酸序列
MEESVVRPSVFVVDGQTDIPFTRLGRSHRRQSCSVARVGLGLLLLLMGAGLAVQGWFLLQLHWRLGEMVTRLPDGPAGSWEQLIQERRSHEVNPAAHLTGANSSLTGSGGPLLWETQLGLAFLRGLSYHDGALVVTKAGYYYIYSKVQLGGVGCPLGLASTITHGLYKRTPRYPEELELLVSQQSPCGRATSSSRVWWDSSFLGGVVHLEAGEVVVRVLDERLVRLRDGTRSYFGAFMV[SEQ ID NO：306]
：等位基因变体
人LIGHT-214E(密码子优化序列-型式2；包括FLAG标签)
用于在CHO细胞中表达重组LIGHT(包括可切割FLAG标签)的人LIGHT也经密码子优化。
核苷酸序列
ATGGGCTGGTCCTGCATCATCCTGTTCCTGGTGGCCACCGCTACCGGCGTGCATTCCATGGACTACAAGGACGACGACGACAAGGGCGGAGGATCCGGAGGAGGCTCCGGAGGCGGATCCATTGAGGGCAGGGATGGACCTGCCGGATCCTGGGAGCAGCTGATCCAGGAGAGGCGGTCCCACGAAGTGAATCCCGCCGCTCACCTGACCGGAGCCAATAGCTCCCTCACAGGATCCGGCGGACCTCTGCTGTGGGAAACCCAACTGGGACTCGCCTTCCTGAGGGGCCTCTCCTACCACGATGGCGCTCTGGTCGTGACCAAGGCCGGCTACTACTACATCTACTCCAAGGTGCAGCTGGGCGGAGTGGGATGTCCTCTGGGACTGGCCAGCACCATCACCCATGGCCTCTACAAGAGGACCCCTAGGTATCCTGAGGAACTGGAGCTGCTGGTGAGCCAGCAGTCCCCTTGCGGAAGGGCTACCAGCTCCTCCAGGGTGTGGTGGGATTCCTCCTTCCTGGGAGGAGTCGTGCACCTGGAGGCTGGCGAGAGGTCGTGGTGAGGGTGCTGGACGAGAGGCTGGTGCGGCTCAGGGATGGCACAAGGTCCTACTTCGGCGCCTTCATGGTG[SEQ ID NO：307]
：等位基因变体
氨基酸序列
MGWSCIILFLVATATGVHSM [SEQ ID NO：308]
下划线：IgK前导序列
斜体：FLAG标签
下划线斜体：接头
粗体下划线：FXa切割位点
粗体：hLIGHT-214E胞外结构域(Asp74-Val240)
：等位基因变体
人LIGHT-214K(密码子优化序列-型式2；包括FLAG标签)
用于在CHO细胞中表达重组LIGHT(包括可切割FLAG标签)的人LIGHT也经密码子优化。
核苷酸序列
ATGGGCTGGTCCTGCATCATCCTGTTCCTGGTGGCCACCGCTACCGGCGTGCATTCCATGGACTACAAGGACGACGACGACAAGGGCGGAGGATCCGGAGGAGGCTCCGGAGGCGGATCCATTGAGGGCAGGGATGGACCTGCCGGATCCTGGGAGCAGCTGATCCAGGAGAGGCGGTCCCACGAAGTGAATCCCGCCGCTCACCTGACCGGAGCCAATAGCTCCCTCACAGGATCCGGCGGACCTCTGCTGTGGGAAACCCAACTGGGACTCGCCTTCCTGAGGGGCCTCTCCTACCACGATGGCGCTCTGGTCGTGACCAAGGCCGGCTACTACTACATCTACTCCAAGGTGCAGCTGGGCGGAGTGGGATGTCCTCTGGGACTGGCCAGCACCATCACCCATGGCCTCTACAAGAGGACCCCTAGGTATCCTGAGGAACTGGAGCTGCTGGTGAGCCAGCAGTCCCCTTGCGGAAGGGCTACCAGCTCCTCCAGGGTGTGGTGGGATTCCTCCTTCCTGGGAGGAGTCGTGCACCTGGAGGCTGGCGAGAGGTCGTGGTGAGGGTGCTGGACGAGAGGCTGGTGCGGCTCAGGGATGGCACAAGGTCCTACTTCGGCGCCTTCATGGTG[SEQ ID NO：309]
氨基酸序列
MGWSCIILFLVATATGVHSM [SEQ ID NO：310]
下划线：IgK前导序列
斜体：FLAG标签
下划线斜体：接头
粗体下划线：FXa切割位点
粗体：hLIGHT-214E胞外结构域(Asp74-Val240)
：等位基因变体
兔LIGHT蛋白质的氨基酸序列
DYKDDDDKGGGSGGGSGGGSIEGRDQDTGSWEQLVQARRSHKASPAAHLTGANSSSMGTGGPLLWETQLGLAFLRGLGYHDGALVTTQAGYYYIYSKVQLGGVGCPQGLATDLPVTHGLYKRTTRYPEELELLVSRRSPCGRAASSRVWWDSSFLGGVVHLEAGEEVVVRVLEEQLVRLRDGTRSYFGAFMV[SEQ ID NO：423]
其中：-
DYKDDDDK＝FLAG标签；
GGGSGGGSGGGS＝GS接头；
IEGR＝因子Xa切割位点；并且其余序列为LIGHT蛋白质序列。
序列表
序列相关表
IMGT表明使用IMGT命名法确定CDR；
KABAT表明使用Kabat命名法确定CDR。
序列相关表中的编号优先于该文本别处任何不一致的编号。

Claims (36)

1.一种抗体或其片段，其特异性结合214E hLIGHT并且与选自1C02、13H04和31A10的抗体竞争结合所述hLIGHT。
2.根据权利要求1所述的抗体或抗体片段，
其中所述抗体或片段包含可变结构域，所述可变结构域
i.特异性结合214E hLIGHT和214K hLIGHT两者，
ii.与包含01C02或13H04的可变区的抗体竞争结合214E hLIGHT并且
iii.不与包含选自01C06和18E04的抗体的可变区的抗体竞争结合214E hLIGHT；或
其中所述抗体或片段包含可变结构域，所述可变结构域
iv.特异性结合214E hLIGHT和214K hLIGHT两者，
v.与包含31A10的可变区的抗体竞争结合214E hLIGHT并且
vi.与包含选自01C06和18E04的抗体的可变区的抗体竞争结合214E hLIGHT；
任选地，其中(ii)、(iii)、(v)和(vi)使用表面等离子共振(SPR)测定。
3.根据权利要求1所述的抗体，其中(ii)、(iii)、(v)和(vi)使用呈人IgG4抗体形式(任选地IgG4(PE))的可变结构域测定。
4.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其中所述抗体呈人IgG4形式(任选地IgG4(PE))。
5.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其包含VH结构域，所述VH结构域包含与SEQ ID NO:368至少95％同一性的氨基酸序列，或包含SEQ ID NO:368。
6.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其包含VL结构域，所述VL结构域包含与SEQ ID NO:370至少95％同一性的氨基酸序列，或包含SEQ ID NO:370。
7.根据权利要求1-5中任一项所述的抗体或片段，其包含λ轻链可变结构域。
8.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其包含VH结构域，所述VH结构域包含选自以下各项的HCDR1的HCDR1序列：
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；及
iii.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
9.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其包含VH结构域，所述VH结构域包含选自以下各项的HCDR2的HCDR2序列：
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；及
iii.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
10.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其包含VH结构域，所述VH结构域包含选自以下各项的HCDR3的HCDR3序列：
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；及
iii.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
11.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其包含VH结构域，所述VH结构域包含：
i.权利要求8-10的(a)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.权利要求8-10的(a)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；或
iii.权利要求8-10的(a)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
12.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其包含VL结构域，所述VL结构域包含选自以下各项的LCDR1的LCDR1序列：
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；及
iii.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
13.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其包含VL结构域，所述VL结构域包含选自以下各项的LCDR2的LCDR2序列：
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；及
iii.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
14.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其包含VL结构域，所述VL结构域包含选自以下各项的LCDR3的LCDR3序列：
i.1C02，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.13H04，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；及
iii.31A10，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
15.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其包含VL结构域，所述VL结构域包含：
i.权利要求12-14的(a)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与1C02竞争结合所述hLIGHT；
ii.权利要求12-14的(a)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与13H04竞争结合所述hLIGHT；或
iii.权利要求12-14的(a)中叙述的CDR1、2和3序列，并且其中所述抗体或片段与31A10竞争结合所述hLIGHT。
16.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其中所述抗体或片段与mAb664竞争结合214E hLIGHT。
17.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其中所述hLIGHT是人细胞表面表达的hLIGHT。
18.根据任一项前述权利要求所述的体外抗体或片段，其中所述抗体或片段降低来自于表达214E hLIGHT受体的人上皮细胞(例如，来自于体外人HT-29细胞)的IL-8分泌，任选地，其中与HT-29体外对照测定中在对hLIGHT有特异性的抗体缺乏时表达214E hLIGHT的HT-29细胞的IL-8产量相比，所述抗体或片段降低IL-8分泌至少20％。
19.根据权利要求18所述的抗体或片段，其中所述细胞为原代细胞。
20.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其中所述抗体或片段特异性结合兔LIGHT蛋白质(SEQ ID NO:423)和人LIGHT蛋白质(SEQ ID NO:308)，其中与人LIGHT胞外蛋白的结合亲和力至少为与兔LIGHT胞外蛋白结合的亲和力。
21.根据任一项前述权利要求所述的抗体或片段，其中在HTRF测定中，所述抗体或片段抑制214E hLIGHT与人HVEM和/或人淋巴毒素β受体的结合，IC50为1×10-8或更低。
22.一种药物组合物，其包含任一项前述权利要求所述的抗体或片段和稀释剂、赋形剂或载体；并且还任选地包含抗炎药物。
23.一种试剂盒，其包含根据权利要求1-21中任一项所述的抗体或片段和用于将人类基因分型为对于编码214E hLIGHT多肽的核苷酸序列而言为阳性或阴性的工具和/或用于将人类表型分型为对于214E hLIGHT多肽而言为阳性或阴性的工具。
24.一种试剂盒，其包含根据权利要求1-21中任一项所述的抗体或片段和用于将人类基因分型为对于编码214K hLIGHT多肽的核苷酸序列而言为阳性或阴性的工具和/或用于将人类表型分型为对于214K hLIGHT多肽而言为阳性或阴性的工具。
25.一种核酸，其编码权利要求1-21中任一项叙述的抗体的HCDR3。
26.根据权利要求25所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:375、376、147、153、7和13的序列至少95％同一性或100％同一性的核苷酸序列。
27.一种核酸，其编码权利要求1-21中任一项叙述的抗体的VH结构域和/或VL结构域，或编码其重链或轻链。
28.根据权利要求27所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:367、1和141的序列至少95％同一性或100％同一性的核苷酸序列。
29.根据权利要求27或28所述的核酸，其包含与选自SEQ ID NO:369、15和155的序列至少95％同一性的核苷酸序列。
30.一种载体，其包含根据权利要求25-29中任一项所述的核酸；任选地，其中所述载体为CHO或HEK293载体。
31.一种宿主细胞，其包含根据权利要求25-29中任一项所述的核酸或根据权利要求30所述的载体。
32.根据权利要求1-21中任一项所述的特异性结合hLIGHT的抗体或片段在制备用于向人类施用，通过降低下述一项或多项来治疗或预防所述人类中hLIGHT介导的疾病或病状的药剂中的用途：
i.选自人类的IL-2、TNFα和干扰素γ的细胞因子的分泌；
ii.人类的白细胞的增殖；和
iii.表达hLIGHT受体的人上皮细胞对hLIGHT的结合。
33.一种方法，其通过降低下述一项、多项或全部来治疗或预防人类中hLIGHT介导的疾病或病状：
i.选自人类的IL-2、TNFα和干扰素γ的细胞因子的分泌；
ii.人类的白细胞的增殖；和
iii.表达hLIGHT的受体的人上皮细胞对hLIGHT的结合；
其中所述方法包括向所述人类施用治疗有效量的特异性结合hLIGHT的抗体或片段，其中所述抗体或片段是根据权利要求1-21中任一项所述。
34.根据权利要求32或33所述的方法或用途，其中所述人类已经基因分型为对于编码214E hLIGHT多肽的核苷酸序列而言为阳性和/或所述人类已经表型分型为对于214EhLIGHT多肽而言为阳性。
35.根据任一项前述权利要求所述的抗体、片段、组合物、试剂盒、方法或用途，其用于治疗或预防人类中的炎症性或自身免疫性疾病或病状或用于降低或预防人类中的血管生成。
36.根据任一项前述权利要求所述的抗体、片段、组合物、试剂盒、方法或用途，其中所述疾病或病状选自炎症性肠病(IBD)、克罗恩氏病、类风湿性关节炎、银屑病、细支气管炎、龈炎、移植排斥、同种异体移植排斥、移植物抗宿主病(GvHD)、哮喘、成人呼吸窘迫综合征(ARDS)、败血性休克、溃疡性结肠炎、舍格伦综合征和气道炎症。
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