CN105637612B - 用于任意四极传输窗口化的系统及方法 - Google Patents

用于任意四极传输窗口化的系统及方法 Download PDF

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Abstract

本发明提供用于塑形用以针对连续窗口化获取实验的前体质量范围选择前体离子的有效传输窗的系统及方法。对于至少一个前体质量范围，使用处理器选择离子转移函数，所述离子转移函数为质量的函数。使用所述处理器指示传输来自样本的离子的四极滤质器在时间上产生两个或两个以上传输窗。所述两个或两个以上传输窗经产生以针对所述至少一个前体质量范围使用由所述离子转移函数描述的形状渐增地创建有效传输窗。

Description

用于任意四极传输窗口化的系统及方法
相关申请案的交叉参考
本申请案主张2013年10月16日申请的序列号为61/891,573的美国临时专利申请案的权益，所述临时专利申请案的全部内容以引用的方式并入本文中。
背景技术
串联质谱分析法或质谱分析法/质谱分析法(MS/MS)是一种可提供定性信息及定量信息两者的方法。在串联质谱分析法中，前体离子由第一质量分析器选择或传输，经碎片化，且由第二质量分析器或在第一分析器的第二次扫描中分析碎片离子或产物离子。产物离子光谱可用以识别所关注的分子。一或多个产物离子的强度可用以定量存在于样本中的化合物的量。
选择反应监测(SRM)是众所周知的串联质谱分析技术，其中单个前体离子经传输、经碎片化，且产物离子被传递到第二分析器，其分析所选择产物质量范围。在所选择前体离子碎片化以产生在所选择碎片质量范围中的产物离子时产生响应。举例来说，产物离子的响应可用于定量。
串联质谱分析技术(例如，SRM)的灵敏度及特异性受前体质量范围或前体质量传输窗的宽度(由第一质量分析器选择)影响。宽前体质量范围传输更多离子，从而给出增加的灵敏度。然而，宽前体质量范围还可允许不同质量的前体离子通过。如果其它质量的前体离子产生与所选择前体相同质量的产物离子，那么可发生离子干扰。结果是降低的特异性。
在一些质谱仪中，第二质量分析器可以高分辨率及高速操作，从而允许更容易地区分不同产物离子。这在很大程度上允许恢复因使用宽前体质量范围而损失的特异性。因此，这些质谱仪使在使用宽前体质量范围以最大化灵敏度的同时恢复特异性可行。
一种经开发以利用高分辨率及高速质谱仪的这种性质的串联质谱分析技术为连续窗口化获取(SWATH)。SWATH允许使用具有邻近或重叠前体质量范围的多个产物离子扫描在一定时间间隔内扫描质量范围。第一质量分析器选择每一前体质量范围以用于碎片化。接着，使用高分辨率第二质量分析器检测从每一前体质量范围的碎片化所产生的产物离子。SWATH允许增加前体离子扫描的灵敏度而不会像以往那样损失特异性。
并非所有质谱仪都能够以其标准配置执行SWATH技术。举例来说，一些质谱仪的第一质量分析器无法在宽前体质量窗内均匀地传输前体离子。这使得难以将质量范围分成邻近或重叠前体质量窗。此外，可存在定制选择窗的形状为有用的情况，即，在离子传输与质量不一致的情况下有意地构造窗。
发明内容
揭示一种用于塑形用以针对连续窗口化获取(SWATH)实验的前体质量范围选择前体离子的有效传输窗的方法。对于至少一个前体质量范围，使用处理器选择离子转移函数，所述离子转移函数为质量的函数。使用所述处理器指示传输来自样本的离子的四极滤质器在时间上产生两个或两个以上传输窗。所述两个或两个以上传输窗经产生以针对所述至少一个前体质量范围使用由所述离子转移函数描述的形状渐增地创建有效传输窗。
揭示一种用于塑形用以针对连续窗口化获取(SWATH)实验的前体质量范围选择前体离子的有效传输窗的系统。所述系统包含四极滤质器及处理器。
所述四极滤质器传输来自样本的离子。所述处理器选择至少一个前体质量范围及为质量的函数的离子转移函数。所述处理器指示所述四极滤质器在时间上产生两个或两个以上传输窗。所述两个或两个以上传输窗针对所述至少一个前体质量范围使用所述离子转移函数的形状渐增地创建有效传输窗。
揭示一种计算机程序产品，其包含非暂时性且有形计算机可读存储媒体，所述存储媒体的内容包含具有指令的程序，所述指令在处理器上执行以便执行用于塑形用以针对SWATH实验的前体质量范围选择前体离子的有效传输窗。
在各种实施例中，所述方法包含提供一种系统，其中所述系统包括一或多个相异软件模块，且其中所述相异软件模块包括选择模块及控制模块。对于至少一个前体质量范围，所述选择模块选择为质量的函数的离子转移函数。
所述控制模块指示传输来自样本的离子的四极滤质器在时间上产生两个或两个以上传输窗。所述两个或两个以上传输窗经产生以针对至少一个前体质量范围使用由离子转移函数描述的形状渐增地创建有效传输窗。
本文阐述申请者的教示的这些特征及其它特征。
附图说明
技术人员将理解下文所描述的图式仅用于说明目的。不希望图式以任何方式限制本教示的范围。
图1为说明本教示的实施例可实施于其上的计算机系统的框图。
图2为根据各种实施例的用以传输连续窗口化获取(SWATH)前体质量范围的理想传输窗的示范性标绘图。
图3为根据各种实施例的用以传输SWATH前体质量范围的非理想传输窗的示范性标绘图。
图4为根据各种实施例的用以在时间上塑形用以传输SWATH前体质量范围的有效传输窗的三个非理想传输窗的示范性标绘图。
图5为根据各种实施例的跨越SWATH前体质量范围在时间上移位以针对SWATH前体质量范围产生非均匀有效传输窗的均匀传输窗的示范性标绘图。
图6为根据各种实施例的在SWATH实验中使用静态20Da传输窗所产生的针对聚丙二醇(PPG)溶液的20Da范围的前体质谱的示范性标绘图。
图7为根据各种实施例的在SWATH实验中使用跨越20Da质量窗而线性步进的多个动态10Da传输窗所产生的针对PPG溶液的20Da范围的前体质谱的示范性标绘图。
图8为根据各种实施例的由图6的PPG质谱的质量强度分割的图7的PPG质谱的质量强度的示范性标绘图。
图9为根据各种实施例的展示用于塑形用以针对SWATH实验的前体质量范围选择前体离子的有效传输窗的系统的示意图。
图10为根据各种实施例的展示用于塑形用以针对SWATH实验的前体质量范围选择前体离子的有效传输窗的方法的示范性流程图。
图11为根据各种实施例的包含执行用于塑形用以针对SWATH实验的前体质量范围选择前体离子的有效传输窗的方法的一或多个相异软件模块的系统的示意图。
在详细描述本教示的一或多个实施例之前，所属领域的技术人员应了解，本教示在其应用上不受限于下文详细描述中所阐释或图式中所说明的构造细节、组件布置及步骤布置。此外，应理解，本文所使用的短语及术语用于描述目的且不应被视为限制性的。
具体实施方式
计算机实施系统
图1为说明计算机系统100的框图，本教示的实施例可实施于计算机系统100上。计算机系统100包含总线102或用于传达信息的其它通信机制，及与总线102耦合以用于处理信息的处理器104。计算机系统100还包含存储器106，其可为随机存取存储器(RAM)或其它动态存储装置，存储器106耦合到总线102用于存储待由处理器104执行的指令。存储器106还可用于在执行待由处理器104执行的指令期间存储临时变量或其它中间信息。计算机系统100进一步包含只读存储器(ROM)108或耦合到总线102以用于存储用于处理器104的静态信息及指令的其它静态存储装置。存储装置110(例如磁盘或光盘)经提供且耦合到总线102以用于存储信息及指令。
计算机系统100可经由总线102耦合到显示器112(例如阴极射线管(CRT)或液晶显示器(LCD))以用于向计算机用户显示信息。输入装置114(包含字母数字键及其它键)耦合到总线102以用于将信息及命令选择传达到处理器104。另一类型的用户输入装置为光标控制件116(例如鼠标、轨迹球或光标方向键)以用于将方向信息及命令选择传达到处理器104且用于控制显示器112上的光标移动。此输入装置通常在两个轴(第一轴(即，x)及第二轴(即，y))上具有两个自由度，此允许所述装置在平面中指定位置。
计算机系统100可执行本教示。与本教示的某些实施方案一致，由计算机系统100响应于处理器104执行包含于存储器106中的由一或多个指令组成的一或多个序列而提供结果。此类指令可自另一计算机可读媒体(例如存储装置110)读取到存储器106中。包含于存储器106中的指令序列的执行致使处理器104执行本文所描述的过程。替代地，可使用硬接线电路替代软件指令或与软件指令组合以实施本教示。因此，本教示的实施方案不受限于硬件电路及软件的任何特定组合。
本文所使用的术语“计算机可读媒体”是指参与向处理器104提供指令以供执行的任何媒体。此媒体可呈许多形式，包含(但不限于)非易失性媒体、易失性媒体及传输媒体。非易失性媒体包含(例如)光盘或磁盘，例如存储装置110。易失性媒体包含动态存储器，例如存储器106。传输媒体包含同轴缆线、铜线及光纤，其包含包括总线102的导线。
计算机可读媒体的常见形式包含(例如)软磁盘、软盘、硬盘、磁带、或任何其它磁媒体、CD-ROM、数字视频光盘(DVD)、蓝光光盘、任何其它光学媒体、指状驱动器、存储卡、RAM、PROM、及EPROM、FLASH-EPROM、任何其它存储器片或存储器匣、或计算机可从其读取的任何其它有形媒体。
在将由一或多个指令组成的一或多个序列载送到处理器104以供执行时可涉及到各种形式的计算机可读媒体。举例来说，指令最初可携载在远程计算机的磁盘上。所述远程计算机可将指令加载入其动态存储器且使用调制解调器经由电话线发送指令。计算机系统100的本地调制解调器可接收电话线上的数据且使用红外发射器将所述数据转换为红外信号。耦合到总线102的红外检测器可接收红外信号中所携载的数据且将数据放置于总线102上。总线102将数据载送到存储器106，处理器104从存储器106检索且执行所述指令。由存储器106接收的指令可任选地在由处理器104执行之前或之后存储于存储装置110上。
根据各种实施例，经配置以由处理器执行以执行方法的指令存储于计算机可读媒体上。计算机可读媒体可为存储数字信息的装置。举例来说，计算机可读媒体包含所属领域已知的用于存储软件的光盘只读存储器(CD-ROM)。计算机可读媒体由适于执行经配置以被执行的指令的处理器来存取。
已出于说明及描述的目的呈现本教示的各种实施方案的以下描述。所述描述并非为详尽的且不将本教示限于所揭示的精确形式。鉴于上文教示修改及变化为可能的，或可从实践本教示来获得修改及变化。另外，虽然所描述的实施方案包含软件，但本教示可被实施为硬件及软件的组合或单独以硬件实施。可使用面向对象编程系统及非面向对象编程系统两者来实施本教示。
用于塑形传输窗的系统及方法
如上文所描述，连续窗口化获取(SWATH)是一种串联质谱分析技术，其允许使用具有邻近或重叠前体质量范围的多个产物离子扫描在一定时间间隔内扫描质量范围。第一质量分析器选择每一前体质量范围以用于碎片化。接着，使用高分辨率第二质量分析器检测从每一前体质量范围的碎片化所产生的产物离子。SWATH允许增加前体离子扫描的灵敏度而不会像以往那样损失特异性。
然而，不幸的是，并非所有质谱仪都能够以其当前配置执行SWATH技术。举例来说，一些质谱仪的第一质量分析器无法产生可用以在前体质量范围内均匀地传输前体离子的传输窗。这使得难以将质量范围分成邻近或重叠前体质量范围。
图2为根据各种实施例的用以传输SWATH前体质量范围的理想传输窗的示范性标绘图200。理想传输窗210传输具有在M1与M2之间的质量的前体离子且具有设定质量或中心质量215。SWATH窗大小为M2-M1。这些前体离子被均匀地传输，这是因为理想传输窗210具有陡峭的垂直边缘220及230。换句话说，当质量从M1增加到M2时，理想传输窗210的前体离子传输率是均匀的或恒定的。然而，不幸的是，许多质谱仪不能够产生具有与边缘220及230一样陡峭的边缘的传输窗。另外，一些质谱仪的边缘的确切形状可为未知的。
图3为根据各种实施例的用以传输SWATH前体质量范围的非理想传输窗的示范性标绘图300。非理想传输窗310也用以传输具有在M1与M2之间的质量的前体离子且具有设定质量315。SWATH窗大小为M2-M1。然而，非理想传输窗310不具有像图2中所展示的理想传输窗210那样的陡峭边缘220及230。举例来说，图3的边缘320及330随质量变化。换句话说，当质量在边缘320及330处改变时，非理想传输窗310的前体离子传输率是不均匀的或不恒定的。另外，这种随质量的变化可为未知的或可为不可预测的。举例来说，当分辨率增加时，一些四极产生更像三角形的传输窗，如非理想传输窗310。
类似于图3的非理想传输窗310的传输窗产生针对SWATH方法的若干问题。为跨越每一整个SWATH窗提供均匀前体离子传输，必须增加这些传输窗的宽度，这也增加了SWATH前体质量范围之间的重叠。此可导致工作循环增加以及对在第二质量分析器中恢复更多特异性的需要增加。
在各种实施例中，在时间上使用两个或两个以上传输窗以塑形用以传输SWATH方法的前体质量范围的前体离子的有效传输窗。举例来说，使用两个或两个以上传输窗以塑形类似于图2中所展示的理想传输窗的有效传输窗。两个或两个以上传输窗中的每一者的宽度、设定质量或中心质量及持续时间可变化或可保持恒定。
图4为根据各种实施例的用以在时间上塑形用以传输SWATH前体质量范围的有效传输窗的三个非理想传输窗的示范性标绘图400。标绘图400包含非理想传输窗410、310及440。非理想传输窗410、310及440分别具有设定质量415、315及445。举例来说，使用非理想传输窗410及440来使非理想传输窗310的边缘320及330变陡峭。举例来说，非理想传输窗440可为在不同时间移动到不同设定质量的非理想传输窗410，或可为不同传输窗。在三个不同时间使用非理想传输窗410、310及440来渐增地产生更近似于图2的理想传输窗210的有效传输窗。
图4描绘在时间上使用两个或两个以上非均匀传输窗产生均匀有效传输窗的方法。一般来说，跨越SWATH前体质量范围均匀地传输前体离子的传输窗或有效传输窗是所需的。然而，如果非均匀性是众所周知的，那么非均匀传输窗或非均匀有效传输窗也可为合意的。
在各种实施例中，在时间上使用两个或两个以上传输窗以塑形用以传输SWATH方法的前体质量范围的前体离子的非均匀有效传输窗。两个或两个以上传输窗为(举例来说)与SWATH前体质量范围相比更窄的窗。举例来说，两个或两个以上传输窗可为在宽度、设定质量及/或持续时间上变化的传输窗。替代地，两个或两个以上传输窗可为跨越SWATH前体质量范围而步进的一个均匀传输窗。
非均匀有效传输窗的形状可为随质量变化的任何任意形状。非均匀有效传输窗的形状可包含(但不限于)三角形、倒三角形、曲线或具有凹口的三角形或曲线。然而，应注意，越来越复杂的形状有可能降低系统的整体处理量。
图5为根据各种实施例的跨越SWATH前体质量范围在时间上移位以针对SWATH前体质量范围产生非均匀有效传输窗的均匀传输窗的示范性标绘图500。均匀传输窗510具有(举例来说)SWATH前体质量范围M2-M1的宽度的一半。通过使均匀传输窗510跨越SWATH前体质量范围M2-M1步进来产生在质量520处具有顶点的三角形有效传输窗(未展示)。举例来说，均匀传输窗510在时间上从设定质量515步进到设定质量516，且接着从设定质量516步进到设定质量517。举例来说，均匀传输窗510跨越SWATH前体质量范围M2-M1而步进直到边缘530达到质量M2。因此，接近质量520的前体离子几乎总是被传输，而接近质量M1及质量M2的离子几乎从未被传输。在质量M1与质量520之间的离子根据三角形有效传输窗的一侧的斜率而被传输，且在质量520与质量M2之间的离子根据三角形有效传输窗的另一侧的斜率而被传输。
标绘图500中所展示的均匀传输窗510为理想或近理想传输窗。尽管具有理想或近理想传输窗的陡峭边缘是重要的，但其不是必要的。然而，必要的是使用两个或两个以上传输窗的已知区域来塑形非均匀有效传输窗。
实验结果
遵循类似于图5中所展示的方法，使用四极在100ms SWATH停留周期期间使动态传输窗的设定质量线性斜升。静态(矩形)SWATH窗为20Da宽且具有宽度为10Da的动态传输窗在SWATH停留周期期间在10Da范围内线性倾斜。尽管SWATH窗为20Da宽，但有效填充时间在中间为最大且在低及高质量边界处线性降低到零。
图6为根据各种实施例的在SWATH实验中使用静态20Da传输窗所产生的针对聚丙二醇(PPG)溶液的20Da范围的前体质谱610的示范性标绘图600。使用与SWATH前体质量范围基本上相同宽度的单个静态传输窗来传输在317Da与337Da之间的SWATH前体质量范围的前体离子。换句话说，使用类似于图2中所展示的传输窗的传输窗来产生前体质谱610。注意，在317Da与337Da之间PPG质谱610的质量强度是相对均匀的。
图7为根据各种实施例的在SWATH实验中使用跨越20Da质量窗而线性步进的多个动态10Da传输窗所产生的针对PPG溶液的20Da范围的前体质谱710的示范性标绘图700。使用定制循环使单个10Da均匀传输窗在多个时间周期内倾斜且跨越20DaSWATH前体质量范围具有多个设定质量。换句话说，使用在时间上跨越SWATH前体质量范围移动的单一均匀传输窗来产生前体质谱710，类似于图5中所展示的方法。与图6中所展示的PPG质谱610的质量强度对比，在317Da与337Da之间的PPG质谱710的质量强度具有三角形形状。
图8为根据各种实施例的由图6的PPG质谱610的质量强度分割的图7的PPG质谱710的质量强度的示范性标绘图800。标绘图800证实了通过使用跨越20Da质量窗而线性步进的多个动态10Da传输窗来创建的有效传输窗的三角形形状。本质上，使用跨越SWATH前体质量范围而线性步进的多个传输窗来创建质量维度中的三角转移函数。
用于塑形传输窗的系统
图9为根据各种实施例的展示用于塑形用以针对SWATH实验的前体质量范围选择前体离子的有效传输窗的系统900的示意图。系统900包含四极滤质器910及处理器920。
四极滤质器910可包含执行两个或两个以上质量分析的一或多个物理质量分析器。四极滤质器910还可包含分离装置(未展示)。所述分离装置可执行分离技术，其包含(但不限于)液相色谱法、气相色谱法、毛细管电泳或离子迁移。
处理器920可为(但不限于)计算机、微处理器、或能够从四极滤质器910发送及接收控制信号及数据且处理数据的任何装置。处理器920与四极滤质器910通信。
四极滤质器910传输来自样本的离子。在获取期间，处理器920选择至少一个前体质量范围及为质量的函数的离子转移函数，且指示所述四极滤质器在时间上产生两个或两个以上传输窗，所述两个或两个以上传输窗针对至少一个前体质量范围使用离子转移函数的形状渐增地创建有效传输窗。
在各种实施例中，离子转移函数将恒定前体离子传输率定义为质量的函数。
在各种实施例中，离子转移函数将非恒定前体离子传输率定义为质量的函数。
在各种实施例中，处理器920通过指示四极滤质器910在时间上改变影响两个或两个以上传输窗的宽度、中心质量或持续时间的一或多个四极参数来指示四极滤质器在时间上产生两个或两个以上传输窗，所述两个或两个以上传输窗针对至少一个前体质量范围使用离子转移函数的形状渐增地创建有效传输窗。
在各种实施例中，影响两个或两个以上传输窗的中心质量的四极参数包括射频(RF)参数，且影响两个或两个以上传输窗的宽度的四极参数包括RF参数与直流(DC)参数的比率。
在各种实施例中，两个或两个以上传输窗中的每一传输窗的宽度小于至少一个前体质量范围的宽度。
在各种实施例中，一或多个传输窗经重叠使得质量范围的部分与其它部分相比更频繁地传输。
在各种实施例中，两个或两个以上传输窗中的每一传输窗的宽度小于至少一个前体质量范围的宽度，且两个或两个以上传输窗中的任何两个传输窗之间的重叠小于任何两个传输窗中的任一传输窗的宽度。
在各种实施例中，重叠为两个传输窗中的每一者的分率的一小部分。举例来说，两个或两个以上传输窗中的每一传输窗为至少一个前体质量范围的一半，且两个或两个以上传输窗中的任何两个传输窗之间的重叠小于任何两个传输窗中的任一传输窗的宽度百分之十。
用于塑形传输窗的方法
图10为根据各种实施例的展示用于塑形用以针对SWATH实验的前体质量范围选择前体离子的有效传输窗的方法1000的示范性流程图。
在方法1000的步骤1010中，对于至少一个前体质量范围，使用处理器选择离子转移函数，所述离子转移函数为质量的函数。
在步骤1020中，使用处理器指示传输来自样本离子的四极滤质器在时间上产生两个或两个以上传输窗。所述两个或两个以上传输窗经产生以针对至少一个前体质量范围使用由离子转移函数描述的形状渐增地创建有效传输窗。
用于塑形传输窗的计算机程序产品
在各种实施例中，计算机程序产品包含有形计算机可读存储媒体，其内容包含具有指令的程序，所述指令在处理器上执行以便执行用于塑形用以针对连续窗口化获取实验的前体质量范围选择前体离子的有效传输窗的方法。此方法由包含一或多个相异软件模块的系统来执行。
图11为根据各种实施例的包含执行用于塑形用以针对SWATH实验的前体质量范围选择前体离子的有效传输窗的方法的一或多个相异软件模块的系统1100的示意图。系统1100包含选择模块1110及控制模块1120。
对于至少一个前体质量范围，选择模块1110选择离子转移函数，所述离子转移函数为质量的函数。
控制模块1120指示传输来自样本的离子的四极滤质器在时间上产生两个或两个以上传输窗。所述两个或两个以上传输窗经产生以针对至少一个前体质量范围使用由离子转移函数描述的形状渐增地创建有效传输窗。
尽管结合各种实施例描述本教示，但不希望将本教示限于此类实施例。相反，本教示涵盖各种替代、修改及等效物，如由所属领域的技术人员将了解。
此外，在描述各种实施例时，本说明书可能已将方法及/或过程呈现为特定步骤序列。然而，在某种程度上，所述方法或过程不依赖于本文所阐述的特定步骤顺序，不应将所述方法或过程限于所描述的特定步骤序列。如所属领域的一般技术人员将了解，其它步骤序列可为可能的。因此，本说明书中所阐述的特定步骤顺序不应被解释为对权利要求书的限制。另外，不应将涉及方法及/或过程的权利要求限于按所书写的顺序执行其步骤，且所属领域的技术人员可容易地了解，序列可变化且仍保持在各种实施例的精神及范围内。

Claims (20)

1.一种用于塑形用以针对连续窗口化获取实验的前体质量范围选择和传输前体离子的有效传输窗的方法，其包括：
对于至少一个前体质量范围，使用处理器选择用于传输在所述至少一个前体质量范围内的前体离子的有效传输窗的形状；以及
使用所述处理器指示传输来自样本的所述前体离子的四极滤质器产生两个或更多个传输窗，所述两个或更多个传输窗用于在时间上产生具有经选择的形状的用于传输在所述至少一个前体质量范围内的所述前体离子的所述有效传输窗。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述经选择的形状包括作为质量的函数的前体离子传输的均匀形状。
3.根据权利要求1所述的方法，其中所述经选择的形状包括作为质量的函数的前体离子传输的非均匀形状。
4.根据权利要求3所述的方法，其中所述经选择的形状包括以下一者或多者：三角形、倒三角形、曲线和具有凹口的三角形或曲线。
5.根据权利要求1所述的方法，其中指示所述四极滤质器产生两个或更多个传输窗包括：
指示所述四极滤质器在时间上改变影响所述两个或更多个传输窗的宽度、中心质量或持续时间的一或多个四极参数。
6.根据权利要求5所述的方法，其中影响所述两个或更多个传输窗的中心质量的四极参数包括射频RF参数，且影响所述两个或更多个传输窗的宽度的四极参数包括所述射频RF参数与直流DC参数的比率。
7.根据权利要求5所述的方法，其中所述两个或更多个传输窗中的每一传输窗的宽度小于所述至少一个前体质量范围的宽度。
8.根据权利要求1所述的方法，其中所述两个或更多个传输窗经重叠使得所述前体质量范围的部分与其它部分相比更频繁地传输。
9.根据权利要求8所述的方法，其中所述两个或更多个传输窗中的每一传输窗的宽度小于所述至少一个前体质量范围的宽度，且所述两个或更多个传输窗中的任何两个传输窗之间的重叠小于所述任何两个传输窗中的任一传输窗的宽度。
10.一种用于塑形用以针对串联质谱分析实验选择和传输前体离子的有效传输窗的系统，其包括：
四极滤质器，其传输来自样本的前体离子；及
处理器，其与所述四极滤质器通信，所述处理器在获取期间
选择至少一个前体质量范围及用于传输在所述至少一个前体质量范围内的所述前体离子的有效传输窗的形状，以及
指示所述四极滤质器产生两个或更多个传输窗，所述两个或更多个传输窗用于在时间上产生具有经选择的形状的用于传输在所述至少一个前体质量范围内的所述前体离子的所述有效传输窗。
11.根据权利要求10所述的系统，其中所述经选择的形状包括作为质量的函数的前体离子传输的均匀形状。
12.根据权利要求10所述的系统，其中所述经选择的形状包括作为质量的函数的前体离子传输的非均匀形状。
13.根据权利要求10所述的系统，其中所述处理器通过以下途径指示所述四极滤质器产生两个或更多个传输窗
指示所述四极滤质器在时间上改变影响所述两个或更多个传输窗的宽度、中心质量或持续时间的一或多个四极参数。
14.根据权利要求13所述的系统，其中影响所述两个或更多个传输窗的中心质量的四极参数包括射频RF参数，且影响所述两个或更多个传输窗的宽度的四极参数包括所述射频RF参数与直流DC参数的比率。
15.一种非暂时性且有形计算机可读存储媒体，所述存储媒体的内容包含具有指令的程序，所述指令在处理器上执行以便执行用于塑形用以针对连续窗口化获取实验的前体质量范围选择和传输前体离子的有效传输窗的方法，所述方法包括：
提供一种系统，其中所述系统包括一或多个相异软件模块，且其中所述相异软件模块包括选择模块及控制模块；
对于至少一个前体质量范围，使用所述选择模块选择用于传输在所述至少一个前体质量范围内的前体离子的有效传输窗的形状；以及
使用所述控制模块指示传输来自样本的所述前体离子的四极滤质器产生两个或更多个传输窗，所述两个或更多个传输窗用于在时间上产生具有经选择的形状的用于传输在所述至少一个前体质量范围内的所述前体离子的所述有效传输窗。
16.根据权利要求15所述的非暂时性且有形计算机可读存储媒体，其中所述经选择的形状包括作为质量的函数的前体离子传输的均匀形状。
17.根据权利要求15所述的非暂时性且有形计算机可读存储媒体，其中所述经选择的形状包括作为质量的函数的前体离子传输的非均匀形状。
18.根据权利要求15所述的非暂时性且有形计算机可读存储媒体，其中指示所述四极滤质器产生两个或更多个传输窗包括：
指示所述四极滤质器在时间上改变影响所述两个或更多个传输窗的宽度、中心质量或持续时间的一或多个四极参数。
19.根据权利要求18所述的非暂时性且有形计算机可读存储媒体，其中所述两个或更多个传输窗中的每一传输窗的宽度小于所述至少一个前体质量范围的宽度。
20.根据权利要求15所述的非暂时性且有形计算机可读存储媒体，其中所述两个或更多个传输窗经重叠使得所述前体质量范围的部分与其它部分相比更频繁地传输。
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