CN105441461B - 一种三七转录因子基因PnWRKY1的应用 - Google Patents

一种三七转录因子基因PnWRKY1的应用 Download PDF

Info

Publication number
CN105441461B
CN105441461B CN201610001931.2A CN201610001931A CN105441461B CN 105441461 B CN105441461 B CN 105441461B CN 201610001931 A CN201610001931 A CN 201610001931A CN 105441461 B CN105441461 B CN 105441461B
Authority
CN
China
Prior art keywords
radix notoginseng
pnwrky1
transcription factor
gene
cell line
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201610001931.2A
Other languages
English (en)
Other versions
CN105441461A (zh
Inventor
葛锋
黄壮嘉
刘迪秋
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Kunming University of Science and Technology
Original Assignee
Kunming University of Science and Technology
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Kunming University of Science and Technology filed Critical Kunming University of Science and Technology
Priority to CN201610001931.2A priority Critical patent/CN105441461B/zh
Publication of CN105441461A publication Critical patent/CN105441461A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN105441461B publication Critical patent/CN105441461B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8201Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
    • C12N15/8202Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation by biological means, e.g. cell mediated or natural vector
    • C12N15/8205Agrobacterium mediated transformation
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

本发明公开了一种三七转录因子基因PnWRKY1的用途,即在提高三七皂苷生物合成关键酶基因表达量和增加三七愈伤组织中总皂苷与单体皂苷含量的应用,PnWRKY1基因核苷酸序列如SEQ ID NO︰1所示,编码WRKY类转录因子;本发明采用功能基因组学和代谢工程相关技术证明三七PnWRKY1转录因子具有正调控三七皂苷生物合成的功能。将本发明所述的三七PnWRKY1转录因子基因构建到植物表达载体上并转入三七愈伤组织中使其过量表达,增强了三七皂苷合成途径关键酶基因的表达量,提高了三七总皂苷与单体皂苷的产量。

Description

一种三七转录因子基因PnWRKY1的应用
技术领域
本发明涉及分子生物学以及基因工程领域,尤其是一种三七皂苷生物合成相关转录因子基因PnWRKY1的应用。
背景技术
三七Panax notoginseng (Burk.) F. H. Chen为五加科人参属植物,根和根茎入药,是云南的道地药材。三七作为传统中药已有悠久的应用历史,清代药学著作《本草纲目拾遗》中记载“人参补气第一,三七补血第一,味同而功亦等,故称人参三七,为中药之最珍贵者”。三七具有活血和止血的双重功效,是驰名中外的“云南白药”的重要成分。三七主产于我国云南省文山州,均为人工栽培品,全世界98%的三七原药材产于云南,三七已经成为云南省最重要的药材资源。
三七皂苷(saponins of Panax notoginseng, PNS)是三七的主要药用成分,由多种四环三萜皂苷组成。目前,已从三七的根块、根茎(剪口)、茎、叶和花等部位分离和鉴定出70余种达玛烷型四环三萜皂苷,如人参皂苷Rb1、Rg1、Rh1、Rd、Re和F1等,这些单体皂苷大多数为达玛烷20(S)-原人参二醇型[20(S)-protopanaxadiol]和20(S)-原人参三醇型[20(S)-protopanaxatriol],未发现含有齐墩果酸型皂苷,这与人参和西洋参有显著差异。三七皂苷具有扩张冠状动脉和外周血管、增加脑血流量的作用;还有抑制血小板凝聚、降低血液粘稠度、抑制血栓形成的功效;同时,兼具降血脂、抗疲劳、耐缺氧,提高和增强巨噬细胞功能等作用。
三七为多年生草本植物,一般需生长3-7年方能入药,故名“三七”。三七对生境要求苛刻,适合种植三七的土地面积有限;同时,三七生长过程中病虫害严重,土壤次生盐渍化和酸化突出,导致三七种植需要“轮作”。这种生长周期长,土地利用率低下的现状,制约了三七产业的可持续发展。近些年,以三七为组分的药品市场迅速扩大,导致三七药材需求增长,供需矛盾突出。鉴于人工栽培时间长,化学合成机理和路线不够清晰等弊端,利用生物工程技术和基因调控的方法来生产三七皂苷逐渐成为研究热点。
茉莉酸甲酯(MeJA)是植物重要次级代谢信号分子,在植物抗逆自我保护过程中扮演重要角色,能够引起细胞次生代谢物的合成。目前,有关茉莉酸甲酯介导的植物次生代谢合成过程已经从研究重要基因的表达逐步过渡到相关转录因子的研究。越来越多的证据表明,控制重要萜类次生代谢物合成的转录因子大多能被茉莉酸甲酯诱导表达。
转录因子对基因的转录激活是植物次生代谢过程重要的调控环节。利用转录因子作为改造植物代谢途径的工具,以其独有的“多点调控”优势,弥补了代谢工程操作中单个关键酶基因作用不足和多个关键酶基因可能产生组成性致死表达的情况,成为一种新的策略。次生代谢途径中多个功能相关的酶基因常被同一转录因子正调控或负调控,对转录因子进行基因修饰显然比多基因操作更容易改良目标次生代谢途径。
WRKY是植物特有的锌指型转录调控因子,是植物中比较大的转录因子家族,越来越多的研究表明该类转录因子对真核生物的次生代谢过程具有重要调控作用。例如木本棉(Gossypium arboreum)GaWRKY1转录因子可调节倍半萜烯合酶(+)-δ-杜松烯合酶A的活性;番茄(Solanum lycopersicum) SLWRKY73转录因子能激活其萜类合成酶基因的启动子,促进萜类合成酶基因的表达;西洋参(Panax quinquefolium)PqWRKY1转录因子可正调控三萜皂苷合成途径关键酶基因的表达。
随着对植物次生代谢网络的深入解析和调控机制的阐明,特别是调节特定次生代谢物合成的转录因子的分离和鉴定,基于转录因子的基因工程将为开发利用植物次生代谢物提供更加有效的手段。本发明以体外培养的三七愈伤组织为研究对象,克隆PnWRKY1转录因子基因,并对该转录因子进行分析和功能鉴定,明确PnWRKY1转录因子在三七皂苷生物合成过程中的地位和作用,为获得高效、稳定的三七皂苷合成调控技术和同源或异源高效表达系统的建立提供理论参考和依据。
发明内容
本发明的目的是提供一种三七转录因子基因PnWRKY1的用途,即三七转录因子基因PnWRKY1在提高三七皂苷合成代谢途径中关键酶基因表达量和增加三七愈伤组织中总皂苷与单体皂苷含量的应用;本发明从三七中克隆获得可调控三七皂苷生物合成的转录因子基因PnWRKY1以及明确该转录因子的应用。
本发明利用酵母单杂交方法和cDNA末端快速扩增技术从三七中克隆到一个与MeJA诱导相关的WRKY类转录因子基因并对其编码蛋白进行功能鉴定。发明人将这个基因命名为PnWRKY1,基因登录号为KM925138,其中所述cDNA如SEQ ID NO︰1所示。对该基因进行序列分析,表明PnWRKY1全长cDNA大小为1190 bp,具有810 bp的开放阅读框(Open readingframe,ORF),编码含有269个氨基酸的蛋白质,氨基酸序列如SEQ ID NO︰2所示。利用植物表达载体,通过农杆菌介导法将本发明的PnWRKY1转录因子基因导入三七愈伤组织中,可提高三七皂苷合成途径关键酶基因的表达量,使三七皂苷的产量增加。
上述转录因子基因可应用于正调控三七皂苷的生物合成,具体操作如下:
(1)基因全长cDNA的获得:首先利用酵母单杂交方法筛选出三七中与MeJA诱导相关的WRKY类转录因子,再利用cDNA末端快速扩增技术(3’RACE)获得PnWRKY1的全长cDNA,设计引物扩增PnWRKY1的ORF框然后将其连接到pGEM-T easy载体上,经测序验证获得具有目的基因的克隆;
(2)植物表达载体构建与遗传转化:用限制性内切酶BamHⅠ和PstⅠ酶切pGEM-T-PnWRKY1质粒,通过胶回收获得目的基因片段。用同样的内切酶消化植物表达载体pCAMBIA2300S,胶回收获得载体大片段。将目的基因片段与pCAMBIA2300S载体片段连接,构建植物超表达载体pCAMBIA2300S-PnWRKY1,通过液氮冻融法将pCAMBIA2300S-PnWRKY1质粒导入农杆菌菌株EHA105中;利用农杆菌介导的遗传转化法,将PnWRKY1导入三七愈伤组织中使其过量表达。通过抗生素筛选和qRT-PCR筛选阳性转基因细胞系;
(3)转基因细胞系总皂苷含量检测:提取三七非转基因和转基因细胞系中的皂苷,分析非转基因和转基因细胞系间总皂苷含量的差异;
(4)转基因细胞系部分重要单体皂苷含量检测:制备三七非转基因和总皂苷含量得到提高的转基因细胞系的皂苷溶液,利用HPLC法对非转基因和转基因细胞系中的部分重要单体皂苷含量进行测定,分析非转基因和转基因细胞系间单体皂苷含量的差异。
本发明为提高三七中皂苷的含量提供了一种新方法,利用生物工程技术和基因调控的方法可更高效率合成三七皂苷,克服了人工栽培周期长、化学合成机理和路线不够清晰等缺点。将转录因子PnWRKY1基因导入三七细胞中表达,使三七皂苷生物合成途径关键酶基因的表达量提高,增加了三七皂苷的产量,为大规模产业化生产三七皂苷提供了理论参考和科学依据。
附图说明
图1为本发明中三七总RNA电泳图谱;
图2为本发明中纯化mRNA电泳图谱,其中M为DL2000 DNA Marker,1为纯化的mRNA;
图3为本发明中酵母单杂交表达文库中片段扩增结果,其中M为DL2000 DNAMarker,1-16为不同的酵母菌落PCR产物;
图4为本发明中PnWRKY1全长cDNA扩增结果,其中M为DL2000 DNA Marker,1为PnWRKY1全长cDNA扩增产物;
图5为本发明中PnWRKY1的三维结构预测;
图6为本发明中qRT-PCR结果分析图,表示三七皂苷合成途径中受PnWRKY1调控的SSSEDS基因在野生型和转基因细胞系中的表达水平,其中C为野生型细胞系,1-3为转基因细胞系;
图7为本发明中三七总皂苷含量测定结果,其中C为野生型细胞系,1-3为转基因细胞系;
图8为本发明三七细胞中部分重要单体皂苷含量测定结果,其中C为野生型细胞系,1-3为转基因细胞系。
具体实施方式
下面通过附图和实施例对本发明进一步说明,但本发明保护范围不局限于所述内容,实施例中方法如无特殊说明均为常规方法,使用的试剂如无特殊说明均为常规市售试剂或按常规方法配制的试剂。
实施例1:PnWRKY1基因的克隆以及生物信息学分析
采用改良的异硫氰酸胍法提取经茉莉酸甲酯处理3-6 h的三七细胞总RNA(图1),并参照NucleoTeap® mRNA (MACHERGY-NAGEL)试剂盒进行mRNA的分离(图2);取1µg mRNA按照MatchmakerTM Gold Yeast One-Hybrid Library Screening System构建cDNA文库,并利用Trimmer-2 cDNA normalization kit试剂盒进行文库的均一化。
设计添加了酶切位点Xho I和Hind 的诱饵序列---3个重复的JERE序列,通过退火将该序列合成为双链。用Xho I和Hind 对pAbAi载体和JERE诱饵序列进行双酶切,胶回收目的片段,将回收的JERE诱饵片段与线性pAbAi载体片段4℃过夜进行连接,然后转化入大肠杆菌感受态中,挑选单克隆进行菌液PCR检测并对阳性单克隆进行测序;引物根据插入片段进行设计,上游引物为:5’-GTTCCTTATATGTAGCTTTCGACAT-3’,下游引物为:5’-CTCCTTTCAAAGAAGGCGGTC-3’。将成功连接的pJERE-AbAi重组质粒利用同源法导入到Y1Hgold酵母感受态细胞中,再将均一化后的三七细胞cDNA转入该酵母感受态细胞中,将转化细胞涂布到含AbA抗性的SD/-Leu酵母培养基上,30 ℃培养3-5天。待酵母长出后,进行酵母菌落PCR验证(图3),挑选插入片段大于500 bp的克隆进行测序。
由测序结果知,本实验经酵母单杂交筛选获得了与茉莉酸甲酯诱导相关的WRKY类转录因子基因。通过使用cDNA末端快速扩增技术(3’RACE)得到了PnWRKY1基因的3’片段,其引物为5’-GCCATGACCTTGAGCCCACCGACGG-3’。再根据PnWRKY1基因的5’和3’末端序列设计引物,用于扩增PnWRKY1基因cDNA全长,分别为PnWRKY1 F:5’-TCAGTTGACCTTGTTAGGTTTCTGA-3’;PnWRKY1 R:5’-TTAGTCTCAATGAATGAAT GACATC-3’。PCR反应条件:94 ℃,5 min;94 ℃,30s;51 ℃,30 s;72 ℃,80 s,32个循环;72 ℃,10 min。将PCR产物用1.2%的琼脂糖凝胶分离(图4)、胶回收并连接到pGEM T-easy载体上,转化大肠杆菌感受态,挑单克隆摇菌,菌液PCR检测后送测序。
最终获得的PnWRKY1全长cDNA大小为1190 bp,通过NCBI ORF finder (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)分析发现其包含一个810 bp的ORF(见序列表)。PnWRKY1编码蛋白的分子量约为29.5 KD,等电点为9.94,不稳定系数为62.93,预测PnWRKY1编码的蛋白质不稳定。生物信息学预测PnWRKY1不包含跨膜区,不含信号肽,具有一个WRKY转录因子特征保守结构域。通过在线工具iPSORT预测PnWRKY1可能定位于细胞核。借助SWISS-MODEL对PnWRKY1进行三维结构预测分析(图5),结果表明,其与拟南芥中AtWRKY1转录因子的空间结构相似度极高,都包含6个β折叠,且其中DNA结构域完全相同,这更进一步说明PnWRKY1属于WRKY类转录因子。
实施例2:植物表达载体构建
根据PnWRKY1基因ORF框的5’和3’末端序列设计引物,用于扩增PnWRKY1基因的ORF,分别为上游引物:5’-GGATCCCTGAAGATGGAAAATCATGTTGGGA-3’;下游引物:5’-CTGCAGGATTTCATCATTTCGACTCTACTAG-3’。PCR反应条件:94 ℃,5 min;94 ℃,30 s;57 ℃,30 s;72 ℃,1 min,32个循环;72 ℃,10 min。将PCR产物用1.2%的琼脂糖凝胶分离、胶回收并连接到pGEM T-easy载体上,转化大肠杆菌感受态,挑单克隆摇菌,菌液PCR检测后送测序。
采用SanPrep柱式质粒DNA小量抽提试剂盒(上海生工)提取经测序正确的大肠杆菌质粒pGEM-T-PnWRKY1以及植物表达载体pCAMBIA2300S的质粒,取1 μL用于琼脂糖凝胶电泳以检测所提取质粒的完整性和浓度高低。用BamH Ⅰ(TaKaRa)和PstⅠ (TaKaRa)分别对质粒pGEM-T-PnWRKY1和pCAMBIA2300S进行双酶切(100 μL体系),反应体系和操作过程为:取20 μL pGEM-T-PnWRKY1或pCAMBIA2300S质粒,依次加入10 μL 10×K buffer、5 μL BamH I、5 μL Pst I、60 μL ddH2O,混匀后短时离心,置于37 ℃过夜反应。将所有酶切产物点于琼脂糖凝胶中进行电泳,然后对PnWRKY1片段和pCAMBIA2300S大片段分别进行胶回收,整个过程使用SanPrep柱式DNA胶回收试剂盒(上海生工)。取1 μL回收产物通过琼脂糖凝胶电泳检测回收片段的大小以及浓度,置于-20 ℃保存备用。
利用T4 DNA Ligase (TaKaRa),将回收的PnWRKY1 DNA片段和pCAMBIA2300S载体片段连接起来,反应体系(20 μL)和操作过程为:取10 μL PnWRKY1 DNA片段依次加入2 μLpCAMBIA2300S载体DNA、2 μL 10×T4 DNA Ligase Buffer、1 μL T4 DNA Ligase、5 μLddH2O,混匀后短时离心,置于16 ℃水浴过夜反应。接着采用热激转化法将连接产物转入大肠杆菌Trans1-T1中,用含有50 mg/L卡那霉素(kanamycin,Km)的固体培养基筛选阳性克隆。挑选单菌落摇菌,以菌液为模板用扩增PnWRKY1的特异性引物进行PCR,挑选出PnWRKY1与pCAMBIA2300S成功连接的克隆,所检测的菌株若为阳性,加入20%甘油混匀后置于-80 ℃保存备用。
用试剂盒提取并纯化上述大肠杆菌中的pCAMBIA2300S-PnWRKY1质粒。制备农杆菌EHA105菌株的感受态细胞并分装于1.5 mL离心管中,每管150 μL,液氮速冻后置于-80 ℃保存备用。采用液氮冻融法将上述构建的植物表达载体pCAMBIA2300S-PnWRKY1转入所制备的农杆菌EHA105感受态细胞中。操作步骤为:取3 μg pCAMBIA2300S-PnWRKY1质粒加入含有150 μL感受态细胞的离心管中,轻轻混匀后冰浴30 min,接着转入液氮中速冻5 min,然后迅速置于37 ℃水浴5 min,之后立即冰浴2 min,加入600 μL LB液体培养基,28 ℃振荡培养4 h。将活化后的农杆菌涂于含有50 mg/L Km的LB固体培养基上,28 ℃静置培养。挑选单菌落摇菌,用扩增PnWRKY1的特异引物进行PCR,检测pCAMBIA2300S-PnWRKY1是否转入农杆菌中。对于阳性克隆,加入甘油后置于-80 ℃保存备用。
实施例3:农杆菌介导的三七遗传转化
从-80 ℃冰箱中取出保存的含有pCAMBIA2300S-PnWRKY1质粒的农杆菌EHA105菌种,接种于5 mL含有50 mg/L Km和25 mg/L利福平的LB液体培养基中,28 ℃培养至浑浊。吸取1 mL浑浊的菌液至含有50 mg/L Km的LB固体培养基上,28 ℃培养48 h。将LB固体培养基上的农杆菌刮下适量接种于MGL液体培养基中,附加40 mg/L的乙酰丁香酮,28 ℃振荡培养至OD600为0.6时停止摇菌,所得菌液用于侵染。
将生长状态较好的三七愈伤组织接种到MS预培养基(含35 mg/L乙酰丁香酮)上进行预培养3天。预培养完成后,将愈伤组织完全浸泡于上述农杆菌菌液中进行振荡培养。浸染完毕,除去菌液,用无菌的滤纸吸取愈伤组织表面的菌液,再将愈伤组织接种到MS共培养基(含35 mg/L乙酰丁香酮)上进行共培养3天。共培养完成后,用无菌水对愈伤组织进行洗涤,再转接于含400 mg/L头孢霉素的MS培养基上进行除菌培养,于25 ℃暗培养15天,防止农杆菌过度生长。最后将愈伤组织转接到筛选培养基中,每45天继代一次。经过5次筛选,最终分离出具有Km抗性的增值速度快的纯的细胞系,用于后续检测。
实施例4:PnWRKY1基因超表达对三七皂苷合成途径关键酶基因SSSEDS表达量的影
选取25天左右、生长状态良好的三七转基因细胞系和野生型细胞系,分别提取RNA,然后按照GoTaq® 2-Step RT-qPCR System试剂盒说明书合成cDNA,反应体系和操作过程为:在离心管中加入4 µg 总RNA和1 µL Oligo(dT)15,用Nuclease-free Water补齐至10µL,将反应体系放于70 ℃变性5 min,然后置于冰上5 min。随后将离心管在离心机中短暂离心,使反应液收集于管底,再向其中加入4 µL GoScriptTM 5×Reaction Buffer、2 µLMgCl2 (25 mM)、1 µL PCR Nucleotide Mix(10 mM)、0.5 µL Recombinant RNasinRibonuclease Inhibitor和1 µL GoScriptTM Reverse Transcriptase,将整个反应体系漩涡混匀,离心收集到管底,将反应物置于42 ℃恒温水浴锅中反应1 h,再于70 ℃水浴中维持15 min以终止反应,最后将合成的cDNA置于-20 ℃冰箱中保存备用。
以该cDNA为模板,根据三七GAPDH基因(登录号:KF815711.1)、鲨烯合酶(Squalenesynthase, SS)基因(登录号:KC953032.1)、鲨烯环氧酶(Squalene epoxidase, SE)基因(登录号:KC422651.1)以及达玛烯二醇合酶(Dammarenediol-II synthase)基因(登录号:KC953035.1)设计引物,依据GoTaq® 2-Step RT-qPCR System试剂盒说明书进行荧光半定量PCR扩增三七内参基因和皂苷合成途径关键酶基因。所用引物序列为GAPDH F:5’-CTACCAACTGTCTTGCTCCCCT-3’,GAPDH R:5’-TGATGCAGCTCTTCCACCTCTC-3’;SS F:5’-GCAGGACTTGTTGGATTAGGGT-3’,SS R:5’-AACATGCGTGACTTTGGTATCTC -3’;SE F:5’-TGGTTGATTTGCCTGGAC-3’,SE R:5’-AATTGGACGCGGGTTTAG-3’;DS F:5’-TATGAGTGGGAAGGGTGC-3’,DS R:5’-TGGCGATAATTGCTTGAGTA-3’。具体反应体系和操作过程为:在PCR管中加入20 ngcDNA、25 µL GoTaq® qPCR Master Mix (2×)和0.2 µL qPCR Primers(GAPDH F / GAPDH R,SS F / SS R, SE F / SE R, DS F / DS R, 10 mM),用Nuclease-Free Water补齐至50 µL。将反应体系漩涡混匀后,离心将其收集到管底,随后将其置于荧光定量PCR仪中进行反应,采用两步法进行荧光定量PCR,反应参数如下:热启动 95 ℃ 2 min;变性 95 ℃ 15 s,退火/延伸60 ℃ 1 min,共45个循环。每个样品对应的每个基因重复检测2次。
qRT-PCR结果显示,转PnWRKY1基因三七细胞中SSSEDS基因的表达量都比野生型的高(图6),说明PnWRKY1作为转录因子,能够促进三七皂苷合成代谢途径中关键酶基因SSSEDS的表达。图中,C表示对照组野生型细胞系,1、2和3分别表示不同的转基因细胞系实验组。
实施例5:PnWRKY1基因超表达对三七总皂苷合成量的影响
选取生长35天左右的转基因细胞系和野生型细胞系,分别置于洗净的100 mL三角瓶中,加入20 mL的甲醇溶液浸泡过夜后,常温超声波处理1 h。过滤,收集滤液,将滤液挥干后再用甲醇溶解,定容至25 mL,得粗提液。将残渣在50 ℃下烘至恒重,称重。精密吸取粗提液5 mL,置50 mL烧杯中水浴蒸干。蒸干后用4倍体积的蒸馏水分次溶解,充分溶解后过滤,滤液全部转移至已处理好的Hsp100大孔树脂柱内,先用2个柱体积的蒸馏水慢慢洗去糖类等杂质。Molish反应检测糖类杂质是否去除干净,如果结果呈阳性,继续用蒸馏水洗至阴性,然后用75%乙醇溶液洗脱2个柱体积,收集醇液,水浴蒸干,残渣用甲醇溶液溶解,定容至25 mL。
精确吸取此样品150 μL至带塞的10 mL试管中(设3个重复),挥干溶剂,加入新配制的5%香草醛-冰醋酸溶液0.2 mL,高氯酸0.8 mL,混匀后60 ℃水浴加热15 min,立即用冰水冷却,加入5 mL冰醋酸,混匀静止10 min后554 nm测吸光度,参照标准曲线计算PNS含量。结果显示,转PnWRKY1基因三七细胞中总皂苷含量高于野生型细胞中总皂苷含量(图7),结合qRT-PCR结果,表明PnWRKY1转录因子参与了三七皂苷的合成代谢调控,有助于皂苷产量的提高。图中,C表示对照组野生型细胞系,1、2和3分别表示不同的转基因细胞系实验组。
实施例6:PnWRKY1基因超表达对三七单体皂苷合成量的影响
利用HPLC法测定三七细胞系中部分重要单体皂苷(Rb1、Rg1、Rh1、Rd、Re和F1)的含量。高效液相色谱条件为:高效液相色谱仪(戴安ULTIMATE 3000 LPG-3400A四元梯度泵,WPS-3000SL自动进样器,PDA-3000二极管阵列检测器,TCC-3000柱温箱),Waterssymmertry C18色谱柱(4.6×250mm, 5 µm),采用乙腈(A):水(B)为流动相进行线性梯度洗脱(v/v),检测柱温30℃,检测波长为203 nm,流速设定为1.0 mL/min。
精确称取适量的单体皂苷Rb1、Rg1、Rh1、Rd、Re和F1标准品,加入1 mL甲醇溶液,制成浓度分别为340,300,260,320,280,300 µg/mL的标准品混合溶液。分别吸取4,6,8,10,15,20,25,30 µL的混合标准品溶液注入高效液相色谱仪,根据上述色谱条件进行测定。以进样量(µg)为横坐标(x),色谱峰的面积为纵坐标(y),绘制得出各单体皂苷的线性回归方程。
分别称取0.1 g非转基因和总皂苷含量得到提高的转基因三七细胞粉末于干净的50 mL三角瓶中,各自加入10 mL 70%甲醇溶液,过夜浸泡后用超声破碎仪处理90 min(60w,4 s/5 s)。超声结束后,去滤渣留滤液,将滤液放置在50 ℃烘箱中过夜烘干。加10 mL蒸馏水溶解烘干后的残余物,之后用相同体积的水饱合正丁醇(勿使用未水饱合过的正丁醇)萃取2-3次,将最终收集到的萃取液放置在50 ℃烘箱中过夜烘干。用适量100%甲醇溶解烘干后的残余物,之后将溶液定容至5 mL,混合均匀后经0.45 μm滤膜过滤,利用高效液相色谱测定皂苷溶液中部分重要单体皂苷的含量。结果显示,非转基因与转基因三七细胞系均检测到了Rb1、Rg1、Rh1、Rd、Re和F1这六种单体皂苷,转基因细胞系与非转基因细胞系相比,这六种单体皂苷均出现不同幅度增长(图8)。目前普遍认为,T-DNA插入到宿主基因组上的位点具有随机性,但本实验结果证明这种随机性当中可能蕴含着某种定向(趋向)性。图中,C表示对照组野生型细胞系,1、2和3分别表示不同的转基因细胞系实验组。
序列表
<110> 昆明理工大学
<120> 一种三七转录因子基因PnWRKY1的应用
<160> 17
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 1190
<212> DNA
<213> Panax notoginseng
<220>
<221> mRNA
<222> (1)..(1190)
<220>
<221> 5'UTR
<222> (1)..(27)
<220>
<221> CDS
<222> (28)..(837)
<220>
<221> 3'UTR
<222> (838)..(1190)
<400> 1
tcagttgacc ttgttaggtt tctgaagatg gaaaatcatg ttgggattca tgaatcagca 60
gcagcagccg cctcagctga gacgaagact attgaagaac agcattcgca tattacaatc 120
tcaccatcaa caaattcaac tcgatttttc caaaaaagcc gtgaatcgaa ccggccacgc 180
ccggtttcgc cgtggaccac aggtccgtct acttcttctc agtctgaacc atttacaccg 240
attcagctca aaccaatccc taaaccgtgc gactcaaaaa tatctgaaga atgtaaaacc 300
aaaaatactc cgatatcgtc cgggagctcg tcgatcaccg gagaggaagg aaccgtttcc 360
aatggtaagc gaggattatt aaacaccgca gcagcaccgg caccgcgggt ttattcgtcc 420
agaaagcccc ctcttccgtc atctcacagg aaaagatgcc gtgaccttga gcccaccgac 480
ggaatttctg gcaaacgttc aatttcacgc ggctgccact gttgcaagag aaggaaaaca 540
gtggagatta gaagagtaac aacaacaaaa ggaggttcat catccattcc tgcggatgag 600
tattcatgga ggaagtacta tcaaaagtta atcccgggca ctctcttccc aagaggatat 660
tacaaatgca gtagcgtaaa gggatgcccg gcgaggaagc acgcggtgag atcccaagat 720
gatccaacgg tgctagtcgt gacatacgaa ggagagcacc gtcataaccg ttggattcta 780
ccgggaaggc taaataggag tggtagtgtt gttggtatac tagtagagtc gaaatgatga 840
aatcattttt gtatttatgt tttgtgagag aaggatcaga tggatgagca ggagcagaac 900
atcatcttgc gacttgaaag ggagccaagg ggagctggtc tggtcgagct aaatctcacg 960
actttgcttg attaatgcaa agggagggct ccaggagaat aaatgaatac attcatccat 1020
ccatcatatg catccttctt gagcacatac atgaaaggat gtaattaatt ttatgatgta 1080
gtagtaattt tctttaatta gtggattaca aaagcaagtg caagcaattc acttttatta 1140
cacttcatct gctggttgaa tcaaagatgt cattcattca ttgagactaa 1190
<210> 2
<211> 269
<212> PRT
<213> Panax notoginseng
<400> 2
Met Glu Asn His Val Gly Ile His Glu Ser Ala Ala Ala Ala Ala Ser
1 5 10 15
Ala Glu Thr Lys Thr Ile Glu Glu Gln His Ser His Ile Thr Ile Ser
20 25 30
Pro Ser Thr Asn Ser Thr Arg Phe Phe Gln Lys Ser Arg Glu Ser Asn
35 40 45
Arg Pro Arg Pro Val Ser Pro Trp Thr Thr Gly Pro Ser Thr Ser Ser
50 55 60
Gln Ser Glu Pro Phe Thr Pro Ile Gln Leu Lys Pro Ile Pro Lys Pro
65 70 75 80
Cys Asp Ser Lys Ile Ser Glu Glu Cys Lys Thr Lys Asn Thr Pro Ile
85 90 95
Ser Ser Gly Ser Ser Ser Ile Thr Gly Glu Glu Gly Thr Val Ser Asn
100 105 110
Gly Lys Arg Gly Leu Leu Asn Thr Ala Ala Ala Pro Ala Pro Arg Val
115 120 125
Tyr Ser Ser Arg Lys Pro Pro Leu Pro Ser Ser His Arg Lys Arg Cys
130 135 140
Arg Asp Leu Glu Pro Thr Asp Gly Ile Ser Gly Lys Arg Ser Ile Ser
145 150 155 160
Arg Gly Cys His Cys Cys Lys Arg Arg Lys Thr Val Glu Ile Arg Arg
165 170 175
Val Thr Thr Thr Lys Gly Gly Ser Ser Ser Ile Pro Ala Asp Glu Tyr
180 185 190
Ser Trp Arg Lys Tyr Tyr Gln Lys Leu Ile Pro Gly Thr Leu Phe Pro
195 200 205
Arg Gly Tyr Tyr Lys Cys Ser Ser Val Lys Gly Cys Pro Ala Arg Lys
210 215 220
His Ala Val Arg Ser Gln Asp Asp Pro Thr Val Leu Val Val Thr Tyr
225 230 235 240
Glu Gly Glu His Arg His Asn Arg Trp Ile Leu Pro Gly Arg Leu Asn
245 250 255
Arg Ser Gly Ser Val Val Gly Ile Leu Val Glu Ser Lys
260 265
<210> 3
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
gttccttata tgtagctttc gacat 25
<210> 4
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
ctcctttcaa agaaggcggt c 21
<210> 5
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 5
gccatgacct tgagcccacc gacgg 25
<210> 6
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 6
tcagttgacc ttgttaggtt tctga 25
<210> 7
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 7
ttagtctcaa tgaatgaatg acatc 25
<210> 8
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 8
ggatccctga agatggaaaa tcatgttggg a 31
<210> 9
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 9
ctgcaggatt tcatcatttc gactctacta g 31
<210> 10
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 10
ctaccaactg tcttgctccc ct 22
<210> 11
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 11
tgatgcagct cttccacctc tc 22
<210> 12
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 12
gcaggacttg ttggattagg gt 22
<210> 13
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 13
aacatgcgtg actttggtat ctc 23
<210> 14
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 14
tggttgattt gcctggac 18
<210> 15
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 15
aattggacgc gggtttag 18
<210> 16
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 16
tatgagtggg aagggtgc 18
<210> 17
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 17
tggcgataat tgcttgagta 20

Claims (2)

1.三七转录因子基因PnWRKY1在提高三七皂苷合成代谢途径中关键酶基因SE、DS表达量和增加三七愈伤组织中总皂苷与单体皂苷含量的应用,其特征在于:所述三七转录因子基因PnWRKY1的核苷酸序列如SEQ ID NO︰1 所示。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于具体操作如下:
(1)将三七转录因子基因PnWRKY1与植物超表达载体pCAMBIA2300S连接,构建植物超表达载体;
(2)将上述构建的表达载体通过农杆菌介导转入三七愈伤组织中;
(3)通过抗生素筛选三七转基因细胞系,qRT-PCR检测转基因细胞系中三七皂苷合成途径关键酶基因表达量;
(4)提取三七非转基因和转基因细胞系中的总皂苷,分析非转基因和转基因细胞系间总皂苷含量的差异,筛选出总皂苷含量得到提高的阳性转基因细胞系;
(5)制备三七非转基因和总皂苷含量得到提高的转基因细胞系的皂苷溶液,利用高效液相色谱即HPLC法对非转基因和转基因细胞系中的部分重要单体皂苷含量进行测定,分析非转基因和转基因细胞系间单体皂苷含量的差异,最后筛选出单体皂苷含量得到提高的阳性转基因细胞系。
CN201610001931.2A 2016-01-06 2016-01-06 一种三七转录因子基因PnWRKY1的应用 Active CN105441461B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610001931.2A CN105441461B (zh) 2016-01-06 2016-01-06 一种三七转录因子基因PnWRKY1的应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610001931.2A CN105441461B (zh) 2016-01-06 2016-01-06 一种三七转录因子基因PnWRKY1的应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN105441461A CN105441461A (zh) 2016-03-30
CN105441461B true CN105441461B (zh) 2019-02-05

Family

ID=55552092

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201610001931.2A Active CN105441461B (zh) 2016-01-06 2016-01-06 一种三七转录因子基因PnWRKY1的应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN105441461B (zh)

Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105861517B (zh) * 2016-04-20 2019-07-05 昆明理工大学 一种三七抗菌肽基因PnSN1及其应用
CN109295069B (zh) * 2018-09-19 2021-08-20 昆明理工大学 珠子参转录因子基因PjMYB1的应用
CN109652581B (zh) * 2018-12-25 2022-04-12 云南农业大学 三七SSR标记在皂苷Rd含量确定上的用途
CN112831504B (zh) * 2021-03-16 2023-03-24 昆明理工大学 三七WRKY转录因子基因PnWRKY9及其应用
CN113265408B (zh) * 2021-05-27 2022-06-14 昆明理工大学 一种三七DOF转录因子基因PnDof1及其应用
CN113493795B (zh) * 2021-08-03 2022-10-28 昆明理工大学 一种人参皂苷Rh2的制备方法
CN115725620B (zh) * 2022-09-12 2023-09-15 昆明理工大学 一种在三七细胞中合成竹节参皂苷的方法
CN116218875B (zh) * 2023-03-31 2023-12-05 广西中医药大学 绞股蓝转录因子GpbHLH4及其应用
CN116218877B (zh) * 2023-04-28 2023-11-24 昆明理工大学 三七WRKY转录因子PnWRKY12的应用

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102888424A (zh) * 2012-09-14 2013-01-23 吉林农业大学 一种植物双元表达载体pMHZ112及应用
CN102899378A (zh) * 2012-10-18 2013-01-30 昆明理工大学 红曲霉对三七药材进行生物转化的方法
CN103088027A (zh) * 2013-02-05 2013-05-08 中南大学 一种调控人参皂苷积累的pdr转运蛋白基因启动子及其应用
CN103614411A (zh) * 2013-11-02 2014-03-05 吉林农业大学 西洋参发状根诱导及植株再生研究方法
WO2014195944A1 (en) * 2013-06-05 2014-12-11 Yeda Research And Development Co. Ltd. Plant with altered content of steroidal glycoalkaloids
CN105087601A (zh) * 2015-09-07 2015-11-25 昆明理工大学 一种珠子参转录因子基因PjWRKY1的应用

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102888424A (zh) * 2012-09-14 2013-01-23 吉林农业大学 一种植物双元表达载体pMHZ112及应用
CN102899378A (zh) * 2012-10-18 2013-01-30 昆明理工大学 红曲霉对三七药材进行生物转化的方法
CN103088027A (zh) * 2013-02-05 2013-05-08 中南大学 一种调控人参皂苷积累的pdr转运蛋白基因启动子及其应用
WO2014195944A1 (en) * 2013-06-05 2014-12-11 Yeda Research And Development Co. Ltd. Plant with altered content of steroidal glycoalkaloids
CN103614411A (zh) * 2013-11-02 2014-03-05 吉林农业大学 西洋参发状根诱导及植株再生研究方法
CN105087601A (zh) * 2015-09-07 2015-11-25 昆明理工大学 一种珠子参转录因子基因PjWRKY1的应用

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Analysis of the transcriptome of Panax notoginseng root uncovers putative triterpene saponin-biosynthetic genes and genetic markers;Hongmei Luo等;《BMC Genomics》;20111231;第12卷(第S5期);第1-15页
Production of ginseng saponins: elicitation strategy and signal transductions;Shadi Rahimi等;《Appl Microbiol Biotechnol》;20150721;第99卷(第15期);第1-13页
植物萜类物质生物合成的相关转录因子及其应用前景;赵恒伟等;《中草药》;20121231;第43卷(第12期);第2512-2519页
药用植物转录组研究专题;王尧龙等;《中国中药杂志》;20150630;第40卷(第11期);第2055-2061页

Also Published As

Publication number Publication date
CN105441461A (zh) 2016-03-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN105441461B (zh) 一种三七转录因子基因PnWRKY1的应用
CN105087601B (zh) 一种珠子参转录因子基因PjWRKY1的应用
CN106497939B (zh) 一种三七转录因子基因PnMYB1及其应用
CN105441463B (zh) 一种三七转录因子基因PnbHLH1及其应用
CN105441462B (zh) 一种三七转录因子基因PnERF1及其应用
CN105087599B (zh) 一种珠子参转录因子基因PjERF1的应用
CN109295080B (zh) 珠子参β-香树脂醇合成酶基因Pjβ-AS的用途
CN104894143B (zh) 一种提高丹参毛状根中丹参酮含量的方法
CN112430261B (zh) Wrky32调控yft1表达影响番茄果色及其在番茄品质改良中应用
CN109161550A (zh) 一种调控番茄果实抗坏血酸含量的SlbHLH59基因及应用方法
CN109576284A (zh) 一个多功能的myb转录因子基因及其用途
CN108503699A (zh) 枸杞基因以及其编码蛋白质、重组载体、及其用途
CN113265408B (zh) 一种三七DOF转录因子基因PnDof1及其应用
CN105087600B (zh) 一种珠子参转录因子基因PjbHLH1的应用
KR101662268B1 (ko) 감초속 식물 유래 트리테르펜 산화 효소, 그것을 코딩하는 유전자 및 그의 이용법
CN107955067B (zh) 参与桃黄酮醇生物合成调控的两个myb转录因子及其应用
CN114634939B (zh) 一种调节人参中茉莉酸甲酯合成的PgJMT1基因及其应用
Zhao et al. Inducement and cultivation of novel red Cyclocarya paliurus callus and its unique morphological and metabolic characteristics
Xia et al. Structural and interactions analysis of a transcription factor PnMYB2 in Panax notoginseng
CN114736910A (zh) 人参PgRb1-057-001基因及其应用
CN109022459B (zh) 一种青稞阿魏酰酪胺酰基转移酶基因及其用途
CN117683776A (zh) 一种低温和干旱诱导的ProPgCOMT2启动子及其在人参皂苷生物合成中的应用
CN109295069B (zh) 珠子参转录因子基因PjMYB1的应用
CN108220300A (zh) 一种万寿菊转录因子基因及应用
CN114395566B (zh) 甘薯ERF转录因子IbERF4在促进植物绿原酸类物质合成中的用途

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant