实施例1
本实施例描述通过来自Streptomyces lavendulae的indigoidine合成酶BpsA来测定L-谷氨酰胺的含量的方法。
一、细菌菌株,载体和培养条件
Streptomyces lavendulae ATCC 11924从美国典型培养物保藏中心(ATCC)获得。它可以在YEME培养基(酵母提取物3克/升,蛋白胨5克/升,麦芽膏3克/升,葡萄糖10克/升)中30℃下生长,以获得细胞来提取基因组DNA。大肠杆菌XL1-Blue是从安捷伦公司购买,大肠杆菌BL21(DE3)是从美国New England Biolabs公司购买。
大肠杆菌XL1-Blue(安捷伦)和pJET1.2载体(Fermentas公司)用于基因克隆和测序。大肠杆菌BL21(DE3)以及pET28a(Novagen公司)和pACYCDuet-1(EMD Millipore公司)表达载体用于蛋白表达。大肠杆菌细胞在Luria-Bertani(LB)培养基中培养。必要时,合适的抗生素,加入以下浓度:氨苄青霉素,50微克/毫升;卡那霉素,50微克/毫升;氯霉素,25微克/毫升。对于蛋白质表达,200微摩尔/升的异丙基-β-D-硫代半乳糖苷的(IPTG)加入到大肠杆菌BL21(DE3)的培养液中诱导蛋白表达。
二、DNA操作
S.lavendulae ATCC 11924的基因组DNA用标准方法分离出来。大肠杆菌中的质粒用GeneJETTM质粒小量提取试剂盒(Fermentas公司)提取。
三、BpsA在大肠杆菌BL21(DE3)中的表达
利用S.lavendulae ATCC 11924的基因组DNA做模板,用PCR将3.9-kb的bpsA基因扩增出来。我们使用热启动高保真DNA聚合酶(New England Biolabs公司)和一对特异性引物,5'-aaCATATGactcttcaggagaccagcgtgctc-3'(NdeI位点以粗体表示)和5'-atAAGCTTctcgccgagcaggtagcggatgtg-3'(HindIII位点以粗体表示)。扩增的bpsA利用T4DNA连接酶连到克隆载体pJET1.2中得到pJET1.2-bpsA。测序后,用NdeI和HindIII将bpsA基因从质粒pJET1.2-bpsA中切下,并连接到pET28a载体中的相同位点之间,产生质粒pET28a-bpsA。
用同样的方法,可以将一个来自枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)的磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶(SEQ ID NO.5)基因sfp从该菌的基因组中克隆并连接到pACYCDuet-1的NcoI和EcoRI位点之间,得到pACYCDuet-1-sfp。所用的引物为5'-aaCCATGGatgaagatttacggaattta-3'(NcoI位点以粗体表示)和5'-aaGAATTCttataaaagctcttcgtacg-3'(EcoRI位点以粗体表示)。
将pET28a-bpsA和pACYCDuet-1-sfp导入大肠杆菌BL21(DE3)中,正确的菌落利用LB琼脂加50微克/毫升卡那霉素和25微克/毫升氯霉素来选择。为了表达BpsA,含有pET28a-bpsA和pACYCDuet-1-sfp的大肠杆菌BL21(DE3)菌株生长在含有50微克/毫升卡那霉素和25微克/毫升氯霉素的LB液体培养基中。生长温度37℃,转速250rpm。当OD600达到0.4~1.0时,加入200微毫摩尔/升的IPTG以诱导BpsA和Sfp的表达。将温度调至较低的温度(15℃-25℃),继续培养14小时。
四、蛋白表达的SDS-PAGE分析
上述第三项中的BpsA在大肠杆菌BL21(DE3)中的表达可以通过SDS-PAGE进行分析。将50毫升的培养液在2700×g的转速下离心5分钟。细胞重新悬浮于3毫升的裂解缓冲液(20毫摩尔/升Tris-HCl,500毫摩尔/升氯化钠,pH值7.9)中。超声处理10分钟后(18瓦,间隔30秒),将细胞裂解液在21000×g下离心10分钟。不可溶的蛋白用8摩尔/升的尿素溶解。可溶和不溶的蛋白都用12%的SDS-PAGE胶分析。
五、从大肠杆菌BL21(DE3)/pET28a-bpsA+pACYCDuet-1-sfp中纯化BpsA
将质粒pET28a-bpsA和pACYCDuet-1-sfp导入到大肠杆菌BL21(DE3)中。将该菌株在2个两升的大三角瓶中培养。每个摇瓶中含有500毫升的LB培养基以及50微克/毫升卡那霉素和25微克/毫升氯霉素。培养温度37℃,转速250rpm。当OD600达到0.6时,加入200微摩尔/升(终浓度)的IPTG在18℃下表达。
14小时后,在2700×g下将该大肠杆菌培养液离5分钟。将细胞重新悬浮于裂解缓冲液(20毫摩尔/升Tris-HCl,500毫摩尔/升氯化钠,pH值7.9)中,并在冰上通过超声裂解细胞。细胞碎片通过在21000×g离心30分钟除去。将所得的上清液与Ni-NTA树脂孵育4小时后,将混合物装到一个开放柱,通过逐步增加咪唑的浓度(0毫摩尔/升,10毫摩尔/升,50毫摩尔/升和250毫摩尔/升)的缓冲液A(50毫摩尔/升Tris-HCl,pH值7.9,2毫摩尔/升EDTA,2毫摩尔/升DTT)来洗脱带有C端组氨酸标签的BpsA。利用Amicon-15离心式过滤器将含BpsA的部分进行浓缩并交换到50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液(pH 7.8)。
纯化后的BpsA存于50%的甘油中并保存在-20℃,或者,也可将磷酸钠缓冲液中的酶冷冻干燥以方便存储和以后使用。
六、在酶标仪上测定BpsA合成indigoidine速率与时间的关系
将146.15毫克的L-谷氨酰胺溶解于10毫升50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液中,得到100毫摩尔/升的L-谷氨酰胺溶液。将9.52毫克的氯化镁和55.12毫克的ATP分别溶解于1毫升pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液中。
用pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液将100毫摩尔/升的L-谷氨酰胺溶液稀释成10毫摩尔/升。96孔板的每个孔中含有250微升的反应体系,其组成为2.5毫摩尔/升ATP和氯化镁、2.5毫摩尔/升的L-谷氨酰胺、1微摩尔/升的BpsA以及pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液。该96孔板震荡20秒,在室温下反应。该反应有三个平行。酶标仪连续地扫描不同时间点反应体系在600纳米下的吸光度。图2显示的为测得的数值,其中吸光度数据为三个平行反应的平均值。如图2所示,反应开始阶段初速度较快,速度稳定,40分钟以后,速率变慢。我们在以下的实验中选择了30和20分钟作为反应时间。
七、在酶标仪上测定indigoidine浓度和600纳米下吸收值的线性关系
在第六项中我们测定的是BpsA与L-谷氨酰胺反应产物在600纳米下吸收值与时间的关系。接下来我们用酶标仪来测定不同浓度的indigoidine在600纳米下的吸收值。我们首先将1毫克的indigoidine完全溶解在1毫升的二甲基亚砜中。然后将该溶液用pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液稀释至一系列浓度(表1)。将250微升的这些不同浓度的indigoidine溶液转至96孔板中,并在酶标仪上测量它们在600纳米下的吸光值。pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸盐缓冲液作为空白对照。测量的数值列在表1中。
表1
根据不同indigoidine浓度下的不同吸光度值,可以建立一个两者线性关系的标准曲线,如图3所示。因而,我们可以确定indigoidine浓度和其在酶标仪上600纳米下的吸光度值成正比。利用这个线性关系,我们在检测L-谷氨酰胺的过程中只需要测定吸光度值即可,而无需计算出indigoidine的实际浓度。
八、建立一个用于在酶标仪上30分钟测定L-谷氨酰胺的标准曲线
在第六项中我们发现在反应的初始阶段0-40分钟,反应速率保持一个较为稳定的状态。我们选择30分钟作为测定L-谷氨酰胺的反应时间。在第七项中我们发现反应产物indigoidine的浓度与600纳米下的吸光度成线性关系。据此我们将建立一个标准曲线来描述L-谷氨酰胺浓度与反应初速度的关系。基本方法是将不同浓度的L-谷氨酰胺溶液与BpsA反应30分钟,再测定反应产物在600纳米下的吸光度。
L-谷氨酰胺、ATP、和氯化镁溶液的配制如第六项中所述。
用pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液将100毫摩尔/升的L-谷氨酰胺溶液稀释成以下浓度:30毫摩尔/升,20毫摩尔/升,10毫摩尔/升,8毫摩尔/升,4毫摩尔/升,3毫摩尔/升,2毫摩尔/升。
96孔板的每个孔中含有250微升的反应体系,其组成为2.5毫摩尔/升ATP和氯化镁、12.5微升的L-谷氨酰胺、1微摩尔/升的的BpsA以及pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液。反应开始之前,先制备含有50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液,BpsA,ATP和氯化镁的母液。再将237.5微升此母液加入到各个孔当中。然后添加12.5微升的L-谷氨酰胺溶液,组成总体积为250微升的反应体系。各个反应中L-谷氨酰胺的终浓度分别为1.5毫摩尔/升、1毫摩尔/升、0.5毫摩尔/升、0.4毫摩尔/升、0.2毫摩尔/升、0.15毫摩尔/升和0.1毫摩尔/升。不含L-谷氨酰胺的母液作为阴性对照。所有反应都有三个平行。
该96孔板震荡20秒,在室温下反应30分钟。利用酶标仪对反应体系在600纳米处的吸光度值进行测量,结果如表2所示:
表2
根据不同L-谷氨酰胺浓度下反应产物的不同吸光度值,可以建立一个线性关系的标准曲线,如图4所示。通过该标准曲线,我们可以根据待测样品与BpsA反应30分钟后在600纳米的吸光度来推算出其L-谷氨酰胺的含量。
九、三种已知浓度的L-谷氨酰胺标准溶液在酶标仪上的测定
为了检测第八项中建立的标准曲线的准确性,我们对三个已知浓度的L-谷氨酰胺溶液进行了测定。反应条件如第八项所述,每个反应体系中含有12.5微升的待测样品。这三个已知L-谷氨酰胺样品在反应体系中分别为1毫摩尔/升,0.5毫摩尔/升和0.2毫摩尔/升。反应条件和测定方法如第八项中所述。结果如表3所示:
表3
根据测定的吸光度值以及第八项中的标准曲线,对于1毫摩尔/升,0.5毫摩尔/升和0.2毫摩尔/升的L-谷氨酰胺溶液,利用本发明的方法测得的浓度分别是1.01、0.53和0.19毫摩尔/升。由此可见,利用本发明的测定方法测定的浓度与实际浓度高度一致。
十、利用酶标仪测定动物细胞培养液样品中L-谷氨酰胺的浓度
利用第八项中建立的标准曲线,我们用本发明的方法测定了一种3T3小鼠胚胎成纤维细胞培养物中L-谷氨酰胺的浓度。取出12.5微升培养液加入到96孔板中含237.5毫升反应母液的孔中。三组平行实验同时进行。反应条件,反应时间及吸光度值测定方法如第八项所述。通过所测吸光度值和第八项中建立的标准曲线,该培养液中的L-谷氨酰胺浓度被确定为1.37±0.12毫摩尔/升。
十一、建立一个用于在紫外可见分光光度计上30分钟测量L-谷氨酰胺浓度的标准曲线
L-谷氨酰胺、ATP、和氯化镁溶液的配制如第六项中所述。
用pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液将100毫摩尔/升的L-谷氨酰胺溶液稀释成以下浓度:30毫摩尔/升,20毫摩尔/升,10毫摩尔/升,8毫摩尔/升,4毫摩尔/升。
每个比色皿中含有750微升的反应液,包括7.5微升的1毫摩尔/升的ATP和氯化镁,37.5微升的L-谷氨酰胺溶液,1微尔/升的BpsA,和50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液。该反应液需要先制备含有pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液,BpsA,ATP和氯化镁的母液。然后将712.5微升的母液分装到不同的比色皿中。最后将37.5微升的L-谷氨酰胺溶液加入到比色皿中,即得到750微升的反应液。以没有加L-谷氨酰胺的母液作为阴性对照。所有反应都有三个平行。
将比色皿中的的反应液用移液枪混合。在室温下反应30分钟。用紫外可见分光光度计上在600纳米下测量反应液的吸光度值,其结果如表4所示:
表4
利用表4中的数据,可以建立一个标准曲线描述在该分析条件下L-谷氨酰胺和600纳米下吸光度值的比例关系,如图5所示。通过该标准曲线,我们可以根据待测样品与BpsA反应30分钟后在600纳米的吸光度来推算出其L-谷氨酰胺的含量。
十二、紫外可见分光光度计上测量两个已知浓度的L-谷氨酰胺溶液
为了检测第十一项中建立的标准曲线的准确性,两种单独制备的L-谷氨酰胺的溶液被分别加入到含有750微升的反应液的比色皿中。这两种L-谷氨酰胺溶液的实际制备浓度分别为1.5毫摩尔/升和1毫摩尔/升。最终反应产物的吸光度值的测量如上所述。两个平行实验的测量结果如表5所示:
表5
根据表5中的测量数据,再对照第十一项中建立的标准曲线,我们可以算出这两个溶液中L-谷氨酰胺的浓度分别是1.47毫摩尔/升和1.03毫摩尔/升。可见,L-谷氨酰胺的测定浓度非常接近于L-谷氨酰胺的实际浓度,证明该方法是一种快速而准确的L-谷氨酰胺测定法。
十三、在紫外可见分光光度计上测定微生物培养物中的L-谷氨酰胺含量
为了进一步检验在比色皿中的L-谷氨酰胺测量方法,本实施例选用微生物培养物作为测试样品。该细菌名为Streptomyces chromofuscus,培养在YM培养基中(0.4%葡萄糖,0.4%酵母提取物,1%麦芽提取物,pH值7.3)。将37.5微升的发酵液中加入到三个含有712.5微升的反应母液的比色皿中,以形成总体积750微升的反应体系。测定方法如第十一项所述。根据第十一项中建立的标准曲线,L-谷氨酰胺在此微生物培养物的浓度被测定为0.134±0.004毫摩尔/升。
十四、建立一个用于在酶标仪上20分钟测定L-谷氨酰胺的标准曲线
在第六项中我们发现在反应的初始阶段0-40分钟,反应速率保持一个较为稳定的状态。在第八到第十三项中,我们选择了30分钟作为测定L-谷氨酰胺的反应时间。在实施例1的接下来的实验中,我们测试了反应20分钟检测L-谷氨酰胺的方法。在第七项中我们发现反应产物indigoidine的浓度与600纳米下的吸光度成线性关系。据此我们可以建立一个标准曲线来描述L-谷氨酰胺浓度与反应初速度的关系。基本方法是将不同浓度的L-谷氨酰胺溶液与BpsA反应20分钟,再测定反应产物在600纳米下的吸光度。
L-谷氨酰胺、ATP、和氯化镁溶液的配制如第六项中所述。
用pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液将100毫摩尔/升的L-谷氨酰胺溶液稀释成以下浓度:40毫摩尔/升,30毫摩尔/升,20毫摩尔/升,10毫摩尔/升。
96孔板的每个孔中含有250微升的反应体系,其组成为2.5毫摩尔/升ATP和氯化镁、12.5微升的L-谷氨酰胺、1微摩尔/升的的BpsA以及pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液。反应开始之前,先制备含有50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液,BpsA,ATP和氯化镁的母液。再将237.5微升此母液加入到各个孔当中。然后添加12.5微升的L-谷氨酰胺溶液,组成总体积为250微升的反应体系。各个反应中L-谷氨酰胺的终浓度分别为2毫摩尔/升,1.5毫摩尔/升、1毫摩尔/升和0.5毫摩尔/升。不含L-谷氨酰胺的母液作为阴性对照。所有反应都有三个平行。
该96孔板震荡20秒,在室温下反应20分钟。利用酶标仪对反应体系在600纳米处的吸光度值进行测量,结果如表6所示:
表6
根据不同L-谷氨酰胺浓度下反应产物的不同吸光度值,可以建立一个线性关系的标准曲线,如图6所示。通过该标准曲线,我们可以根据待测样品反应20分钟后在600纳米的吸光度来推算出其L-谷氨酰胺的含量。
十五、两种已知浓度的L-谷氨酰胺标准溶液在酶标仪上反应20分钟的测定
我们随后用BpsA对两种L-谷氨酰胺标准溶液进行了测定。反应条件如第十四项所述,每个反应体系中含有12.5微升的待测样品。这两个已知L-谷氨酰胺样品在反应体系中分别为0.8毫摩尔/升和1.2毫摩尔/升。反应条件和测定方法如第十四项中所述。根据测定的吸光度值以及第十四项中的标准曲线,对于这两种L-谷氨酰胺溶液,利用本发明的方法测得的浓度分别是0.83和1.24毫摩尔/升。由此可见,利用本发明的测定方法测定的浓度与实际浓度很一致。
十六、建立一个用于在紫外可见分光光度计上20分钟测量L-谷氨酰胺浓度的标准曲线
L-谷氨酰胺、ATP、和氯化镁溶液的配制如第六项中所述。
用pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液将100毫摩尔/升的L-谷氨酰胺溶液稀释成以下浓度:40毫摩尔/升,30毫摩尔/升,20毫摩尔/升,10毫摩尔/升。
每个比色皿中含有750微升的反应液,包括7.5微升的1毫摩尔/升的ATP和氯化镁,37.5微升的L-谷氨酰胺溶液,1微尔/升的BpsA,和pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液。该反应液需要先制备含有50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液,BpsA,ATP和氯化镁的母液。然后将712.5微升的母液分装到不同的比色皿中。最后将37.5微升的L-谷氨酰胺溶液加入到比色皿中,即得到750微升的反应液。以没有加L-谷氨酰胺的比色皿作为阴性对照。所有反应都有三个平行。
将比色皿中的的反应液用移液枪混合。在室温下反应20分钟。用紫外可见分光光度计上在600纳米下测量反应液的吸光度值,其结果如表7所示:
表7
利用表7中的数据,可以建立一个标准曲线来描述在该分析条件下L-谷氨酰胺浓度和反应产物在600纳米下吸光度值的比例关系,如图7所示。通过该标准曲线,我们可以根据待测样品反应20分钟后在600纳米的吸光度来推算出其L-谷氨酰胺的含量。
十七、紫外可见分光光度计上反应20分钟测量两个已知浓度的L-谷氨酰胺溶液
我们随后用BpsA对两种L-谷氨酰胺标准溶液进行了测定,反应时间为20分钟。反应条件如第十六项所述,每个反应体系中含有37.5微升的待测样品。这两个已知L-谷氨酰胺样品在反应体系中分别为0.7毫摩尔/升和1.6毫摩尔/升。反应条件和测定方法如第十六项中所述。根据测定的吸光度值以及第十六项中的标准曲线,对于这两种L-谷氨酰胺溶液,利用本发明的方法测得的浓度分别是0.68和1.64毫摩尔/升。由此可见,利用本发明的测定方法测定的浓度与实际浓度很一致。
实施例2
本实施例描述通过来自Streptomyces chromofuscus的indigoidine合成酶Sc-IndC来测定L-谷氨酰胺的含量的方法。
一、细菌菌株,载体和培养条件
Streptomyces chromofuscus ATCC 49982从美国典型培养物保藏中心(ATCC)获得。它可以在YEME培养基(酵母提取物3克/升,蛋白胨5克/升,麦芽膏3克/升,葡萄糖10克/升)中30℃下生长,以获得细胞来提取基因组DNA。大肠杆菌XL1-Blue是从安捷伦公司购买,大肠杆菌BL21(DE3)是从美国New England Biolabs公司购买。
大肠杆菌XL1-Blue(安捷伦)和pJET1.2载体(Fermentas公司)用于基因克隆和测序。大肠杆菌BL21(DE3)以及pET28a(Novagen公司)和pACYCDuet-1(EMD Millipore公司)表达载体用于蛋白表达。大肠杆菌细胞在Luria-Bertani(LB)培养基中培养。
二、DNA操作
S.chromofuscus ATCC 49982的基因组DNA用标准方法分离出来。大肠杆菌中的质粒用GeneJETTM质粒小量提取试剂盒(Fermentas公司)提取。
三、Sc-IndC在大肠杆菌BL21(DE3)中的表达
利用PCR将4134-bp的sc-indC基因从S.chromofuscus ATCC 49982的基因组DNA中扩增出来。我们使用热启动高保真DNA聚合酶(New England Biolabs公司)和一对特异性引物,5'-aaCATatgagcgtagagaccatccc(NdeI位点以粗体表示)和5'-aaAAGCTTtcagtagttgggcgtcttgc-3'(HindIII位点以粗体表示)。扩增的sc-indC利用T4DNA连接酶连到克隆隆载体pJET1.2中得到pJET1.2-sc-indC。测序后,用NdeI和HindIII将sc-indC基因从质粒pJET1.2-sc-indC中切下,并连接到pET28a载体中的相同位点之间,产生质粒pET28a-sc-indC。
将pET28a-sc-indC和实施例1第三项中构建的pACYCDuet-1-sfp导入大肠杆菌BL21(DE3)中,正确的菌落利用LB琼脂加50微克/毫升卡那霉素和25微克/毫升氯霉素来选择。为了表达Sc-IndC,含有pET28a-sc-indC和pACYCDuet-1-sfp的大肠杆菌BL21(DE3)菌株生长在含有50微克/毫升卡那霉素和25微克/毫升氯霉素的LB液体培养基中。生长温度37℃,转速250rpm。当OD600达到0.4~1.0时,加入200微毫摩尔/升的IPTG以诱导Sc-IndC和Sfp的表达。将温度调至较低的温度(15℃-25℃),继续培养14小时。
四、从大肠杆菌BL21(DE3)/pET28a-sc-indC+pACYCDuet-1-sfp中纯化Sc-IndC
将质粒pET28a-sc-indC和pACYCDuet-1-sfp导入到大肠杆菌BL21(DE3)中。将该菌株在1升(平均分装在两个2升的大三角瓶中)的含有50微克/毫升卡那霉素和25微克/毫升氯霉素的LB培养基中培养。培养温度37℃,转速250rpm。当OD600达到0.6时,加入200微摩尔/升(终浓度)的IPTG在18℃下表达。
14小时后,在2700×g下将该大肠杆菌培养液离5分钟。将菌体重新悬浮于裂解缓冲液(20毫摩尔/升Tris-HCl,500毫摩尔/升氯化钠,pH值7.9)中,并在冰上通过超声裂解细胞。细胞碎片通过在21000×g离心30分钟除去。将所得的上清液与Ni-NTA树脂孵育4小时后,将混合物装到一个开放柱,通过逐步增加咪唑的浓度(0毫摩尔/升,10毫摩尔/升,50毫摩尔/升和250毫摩尔/升)的在缓冲液A(50毫摩尔/升Tris-HCl,pH值7.9,2毫摩尔/升EDTA,2毫摩尔/升DTT)来洗脱带有N端组氨酸标签的Sc-IndC。利用Amicon-15离心式过滤器将含Sc-IndC的部分进行浓缩并交换到50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液(pH7.8)。
纯化后的Sc-IndC存于50%的甘油中并保存在-20℃,或者,也可将磷酸钠缓冲液中的酶冷冻干燥以方便存储和以后使用。
五、建立一个用于在酶标仪上使用Sc-IndC测定L-谷氨酰胺的标准曲线
L-谷氨酰胺、ATP、和氯化镁溶液的配制如实施例1第六项中所述。
用pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液将100毫摩尔/升的L-谷氨酰胺溶液稀释成以下浓度:20毫摩尔/升,16毫摩尔/升,12毫摩尔/升,8毫摩尔/升,4毫摩尔/升。
96孔板的每个孔中含有250微升的反应体系,其组成为2.5毫摩尔/升ATP和氯化镁、12.5微升的L-谷氨酰胺、1微摩尔/升的的Sc-IndC以及pH值为7.8的50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液。反应开始之前,先制备含有50毫摩尔/升的磷酸钠缓冲液,Sc-IndC,ATP和氯化镁的母液。再将237.5微升此母液加入到各个孔当中。然后添加12.5微升的L-谷氨酰胺溶液,组成总体积250微升的反应体系。各个反应中L-谷氨酰胺的终浓度分别为1毫摩尔/升、0.8毫摩尔/升、0.6毫摩尔/升、0.4毫摩尔/升、和0.2毫摩尔/升。不含L-谷氨酰胺的母液作为阴性对照。所有反应都有三个平行。
该96孔板震荡20秒,在室温下反应30分钟。利用酶标仪对反应体系在600纳米出的吸光度值进行测量,结果如表8所示。
表8
根据不同L-谷氨酰胺浓度下的不同吸光度值,可以建立一个线性关系的标准曲线,如图8所示。
六、两种已知浓度的L-谷氨酰胺标准溶液在酶标仪上的测定
我们随后用Sc-IndC对两种L-谷氨酰胺标准溶液进行了测定。反应条件如第五项所述,每个反应体系中含有12.5微升的待测样品。这两个已知L-谷氨酰胺样品在反应体系中分别为0.5毫摩尔/升和0.8毫摩尔/升。反应条件和测定方法如第五项中所述。根据测定的吸光度值以及第五项中的标准曲线,对于这两种L-谷氨酰胺溶液,利用本发明的方法测得的浓度分别是0.53和0.78毫摩尔/升。由此可见,利用本发明的测定方法测定的浓度与实际浓度很一致。
<110> 陶淑芳
<120> 基于单酶反应的L-谷氨酰胺的比色测定方法及测定试剂盒
<160> 4
<210> 1
<211> 1488
<212> PRT
<213> 菊迪卡氏菌(Dickeya chrysanthemi)
<400> 1
MDNISNHAFN YPVLVLNKGL LPEHDDIALA RYLFSALALA VSRITQNEEM IVGFHLHPQE 60
ITRWKDDECI RQYILPLNIR FNSATPIAGF IREIMTWMTP DAIHQKNAMG ASVLTLGPQH 120
ALHDIFDLEI SWQPPVESEP VQALTCHVAS REDALVLTLR FNPARFSATQ MQKLPEVWRQ 180
ITASAAKNGA ETLRDIGLID DAERQRVLHA FNQTEQAWDG ETTVAARLKN RAQRHPEQTA 240
VVFRDETLSY RQLYQQAGAL AHYLNALETE RERCVGLFVE PSLTLMTGVW GILLSGNAYL 300
PLSPEYPEDR LAYMLENSQT RIIVTQPHLR ERLLALAPPG IQVVTSDDVD AFMRQHAHSL 360
PDAPQNDIAP HHLAYVIYTS GSTGKPKGVM IEHHSVLNQM NWLAQTVGLN QETVILQKTP 420
MSFDAAQWEI LSPACGCRVV MGEPGVYRNP EQLVDMLAEY RVTTLQCVPT LLQALLDTER 480
LTHCPALRQI FSGGEALQKH LAQACLETLP DCQLINLYGP TECTINNSAF RVDPVSVRQG 540
PDTLSIGAPV ANTRYYILDN CLTPVAVGQI GELYIGGDGV ARGYLNRDDL TAERFIVDPF 600
APAGSGRRLY QTGDIASWNP DGTVQYAGRA DNQVKLRGYR VELDEIRSAI ETHEWVKAAA 660
VIVRNDPFTG YQNLISFIEL NAREAALMDQ GNHGSHHQSK ADKAQVMLQL ANKGCREFPA 720
ASQPYTLDLP GKQPDEKQRL TAFSRKTYRF YDGGAVSRED ILSLLHEPLL TAISRQPDAL 780
TLDELGHWLR YLGQFTSAER LLPKYTYASP GALYATQVFL ELNGVAGLTA GHYYYQPVHH 840
QLVRVSEQAA VTPGSLRLHF VGKKSAIEPI YKNNIREVLQ MEMGHIIGML DIILPDYGLG 900
VALCDAAALD PTPLAIDLDD DYLGACDVLS GPRLPTDDDL DIYVQTAGAN IADLPVGTYR 960
YVRGDLQHIA DDVIDKKHVI AINQAVYERS SFGISVASRT EGWAGYVHVG RKLQRLQMNP 1020
LNIGLMSSGY SSETGNDLPA ARRFWQILGH RTGPYYFFIG GRISDEQKYS EGMREDAVHM 1080
KGPAEMIRDD LAAFMPDYMM PNKVLILDEM PLTANGKIDM KALANINVEL KHKTIVAPRN 1140
PLEHQVMAIW QAKLKREEMS VDDNFFESGG NSLIAVSLIN ELNATLNASL PLQVLFQAPT 1200
VEKLAAWLSR ARREPVSRLV QLQPKGRQAP IYCWPGLGGY CMNLRLLARQ LGAERPFFGI 1260
QAHGINPDET PYATIGEMAA RDIELIRQHQ PHGPYTLWGY SFGARVAFET AWQLELAGEV 1320
VENLYLLAPG SPKLRDERVA AMNRKADFDN PGYLTILFSV FIGSITDPEL ERCLETVRDE 1380
ESFVAFITGL NPALDDGLVR RITRIVAQTF EFTYTFSELQ QRQLNAPVTI IKAQGDDYSF 1440
IENHGGFSAQ PPTVLELMAD HYSMLKAPGI DELTSVIQYQ QSPPSLVG 1488
<210> 2
<211> 1282
<212> PRT
<213> 淡紫灰链霉菌(Streptomyces lavendulae)
<400> 2
MTLQETSVLE PTLQGTTTLP GLLAQRVAEH PEAIAVAYRD DKLTFRELAS RSAALADYLE 60
HLGVSADDCV GLFVEPSIDL MVGAWGILNA GAAYLPLSPE YPEDRLRYMI ENSETKIILA 120
QQRLVSRLRE LAPKDVTIVT LRESEAFVRP EGTEAPAARS ARPDTLAYVI YTSGSTGKPK 180
GVMIEHRSIV NQLGWLRETY AIDRSKVILQ KTPMSFDAAQ WEILSPANGA TVVMGAPGVY 240
ADPEGLIETI VKHNVTTLQC VPTLLQGLID TEKFPECVSL QQIFSGGEAL SRLLAIQTTQ 300
EMPGRALINV YGPTETTINS SSFPVDPADL DEGPQSISIG SPVHGTTYHI LDKETLKPVG 360
VGEIGELYIG GIQLARGYLH RDDLTAERFL EIELEEGAEP VRLYKTGDLG QWNNDGTVQF 420
AGRADNQVKL RGYRVELDEI SLAIENHDWV RNAAVIVKND GRTGFQNLIA CIELSEKEAA 480
LMDQGNHGSH HASKKSKLQV KAQLSNPGLR DDAELAARPA FDLEGAEPTP EQRARVFARK 540
TYRFYEGGAV TQADLLGLLG ATVTAGYSRK AADLAPAELG QILRWFGQYI SEERLLPKYG 600
YASPGALYAT QMYFELEGVG GLKPGYYYYQ PVRHQLVLIS EREATGKATA QIHFIGKKSG 660
IEPVYKNNIL EVLEIETGHM VGLFEQILPA YGLDIHDRAY EPAVKDLLDV ADEDYYLGTF 720
ELVPHAGARD DQAEVYVQTH GGKVAGLPEG QYRYENGELT RFSDDIVLKK HVIAINQSVY 780
QAASFGISVY SRAEEEWLKY ITLGKKLQHL MMNGLNLGFM SSGYSSKTGN PLPASRRMDA 840
VLGANGVDSA PMYFFVGGRI SDEQIGHEGM REDSVHMRGP AELIRDDLVS FLPDYMIPNR 900
VVVFDRLPLS ANGKIDVKAL AASDQVNAEL VERPFVAPRT ETEKEIAAVW EKALRRENAS 960
VQDDFFESGG NSLIAVGLVR ELNARLGVSL PLQSVLESPT IEKLARRLER EVAQESSRFV 1020
RLHAETGKAR PVICWPGLGG YPMNLRSLAG EIGLGRSFYG VQSYGINEGE TPYETITEMA 1080
KKDIEALKEI QPAGPYTLWG YSFGARVAFE TAYQLEQAGE KVDNLFLIAP GSPKVRAENG 1140
KVWGREASFA NRGYTTILFS VFTGTISGPD LDRCLETVTD EASFAEFISE LKGIDVDLAR 1200
RIISVVGQTY EFEYSFHELA ERTLQAPISI FKAVGDDYSF LENSSGYSAE PPTVIDLDAD 1260
HYSLLREDIG ELVKHIRYLL GE 1282
<210> 3
<211> 1283
<212> PRT
<213> 金色链霉菌(Streptomyces aureofaciens)
<400> 3
MTLQETSVLE PTLRGTTTLP DLLAKRVAEH PEATAVAYRD EKLTYRELAS RSSALAEYLR 60
HLGVSTDDCV GLFVEPSIDL MVGAWGILSA GAAYLPLSPE YPEDRLRYMI ENSQAKIILA 120
QQRLVTRLRE LAPQDVRVVT LRESEAFVLP EGQVAPAIEG ARPDSLAYVI YTSGSTGKPK 180
GVMIEHHSIV SQLGWLRETY GIDRSKTILQ KTPMSFDAAQ WEILSPANGA TVVMGAPGVY 240
ADPEGLIETI VKYGVTTLQC VPTLLQGLLD TEKFPECTSL QQIFSGGEAL SRLLAIQTTQ 300
EMPGRALINV YGPTECTINS SSYAVDPAEL GEAPQSISIG APVADTEYHI LGKEDLKPVG 360
VGEIGELYIG GGQLARGYLH RPDLTAERFL EIEVTEGAGP VRLYKTGDLG QWNPDGTVQF 420
AGRADNQVKL RGYRVELDEI SLAIENHDWV RNAAVIVKND GRTGFQNLIA CVELSEKEAA 480
LMDQGNHGSH HASKKSKLQV KAQLSNPGLR DDADLAARVA YDLPGAEPTP EQRSRVFARK 540
TYRFYEGGAV TEADLLALLG GQVPAAYSRK AADLAPAELG QILRWFGQYL SEERLLPKYG 600
YASPGALYAT QLYFELEGVG GLQPGYYYYQ PQRHQLVLIS EKAATGRPTA HIHFIGKRGG 660
IEPVYKNNIQ EVLEIETGHI VGLFEQVLPA YGLDIRDLAY EPAVRDLLDV PEEDFYLGTF 720
ELVPHTGRRE DHAEVYVQTH GSKVANLPEG QYRYADGTLT RFSDDIVLKK QVIAINQSVY 780
QAASFGISVI SRAPEEWMHY VTLGKKLQHL MMNGLGLGFM SSGYSSKTGN PLPASRRIDS 840
VLQANGVESG PSYFFVGGRV SDEQLGHEGM REDSVHMRGP AELIRDDLVS FLPDYMIPNR 900
VVVFERLPLS ANGKIDAKAL AASDQVNAEL VERPFVAPRT ETEKEIAEVW AKSLRRESVS 960
VQDDFFESGG NSLIAVGLIR ELNSRLGVSL PLQSVLESPT VEKLSRRLER EVAQESSRLV 1020
RLHAETGKDR PVLCWPGLGG YPMNLRTLAG EIGLGRSFYG IQAHGINEGE APYATITEMA 1080
KADIEAIKEL QPKGPYTLWG YSFGARVAFE TAYQLEQAGE KVDNLFLIAP GSPTVRAENG 1140
KVYGREASFA NRAYTTILFS VFTGTISGPD LEKCLESATD EESFAGFISE LKGIDVDLAK 1200
RIISVVGQTY EFEYSFRELA ERTLAAPVTI FKARGDDYSF IENSNGYSAE PPTVIDLDAD 1260
HYSLLRTPDI GELVKHIRYL LGE 1283
<210> 4
<211> 1377
<212> PRT
<213> 褐色链霉菌(Streptomyces chromofuscus)
<400> 4
MSVETIPCSR RAALGLPGLL RERARATPDR TAAVHEHQSL TFAQLTEDSS HVGALLRQAG 60
VGRDSRVGVF MEPSLDLLTG VWGILWAGGC YVPLSPEYPE ERIAYMLADA GVDIVLTQEF 120
LRSTLQELAP AGVVVLTLDE MLRTAERDGS AFGRPEPEVR PDDLAYVIYT SGSTGKPKGV 180
MVEHRSIVSQ MRWLHDECGI DENEIILQKT PMSFDAAQWE LLALACGSTV VMGSSGIYRD 240
PEAIISTVQR HGVTTLQCVP TLLQALLDTE KFPDCGTLRR IFSGGEALSR SLAAQCLDTM 300
PGARLVNLYG PTECTINASS FVVDRAALED GPLVMPIGTP VHDTSLHVLR PDGAPVSAGE 360
IGELYIGGVQ VARGYLGRPD LTGDRFMADP FSDAPGSRLY RTGDLAHVNA DGTVQFVGRA 420
DNQVKLRGYR VELDEIRQTV ETHDWVRAAA VLLRDDATTG FQNLVAFVEL NPKEAALMDQ 480
GNHGSHHQSK ASRLQVRAQL AHPGCRDDAD LAGRAAIDLP GAEATPGQRA LAFSRKTYRF 540
YEGSPVTRDD ILHLLGPRPR PRPSARTSDI VGRDELGTIL RNFGRHLSDQ RLLPKYAYAS 600
PGSLYATQLY VEIGGGHDVP AGLYYYHPLH HRLVLVGPAS ETETSPVRIH FLGKHGAIEP 660
VYRNNVREVL EIEAGHMVGL FEEVLPAHGL RIAAAAYQPA VRHRLDCAPE DHYLGSFDLL 720
PQARGASEDT DTLDIYVQAH STRIEGLPPG QYRYTGAGLV RIGDDVILKK HVIAINQRVY 780
ERSDFGISLV ATGSASWRRY LDLGRGLQRL QMNDLHLGFM SSGYSSKSGN DLPSAKRLGR 840
ILADGGLPAG PSYFCVGGRV SDAQWRGEDM KEDVVHMQGP AELIKEDLAA LLPRYMLPNR 900
IVVLDRLPQT ANGKIDLKAL QTTQEAQLTV GERAFMAPRT PLERRIRDIW QAVLKRDQVS 960
VTDDFFELGG NSLLAVALVS RLNADFGGAI PLQILFEAPT VERLAAALEA TSPRPASRLV 1020
PLQPEGRGTP LYCWPGLGGY PMNLRPLAAA LGTERPVHGV QAHGINPGEF PYDDVRAMAA 1080
ADVEAIREIQ PHGPYLLCGY SFGARVAFEA ARQLEQAGEQ VEQLFLVAPG QPRLRPEDAV 1140
GATGRADFTD RAFLALLFSV FAGTLSGPRL DQCLRTVTDE DGFVAFVTAS FPGLGEELVR 1200
AVTGIVRRTY SLTYEFHELR GRRLDAPVTL VRATDDNYSF IEHEGGYSAR PPAVHQLRSG 1260
HYELLREPHV ARLAAVLNDR LSAGPSTSPR HSQPAQATVQ EVGVPHINIK HFPVSITEEK 1320
ELELVAAVTT AVRNAFGCTE EVVSIALEPV AQEVWNERVY IPEIVARQEL LRKTPNY 1377
<210> 5
<211> 224
<212> PRT
<213> 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)
<400> 5
MKIYGIYMDR PLSQEENERF MSFISPEKRE KCRRFYHKED AHRTLLGDVL VRSVISRQYQ 60
LDKSDIRFST QEYGKPCIPD LPDAHFNISH SGRWVIGAFD SQPIGIDIEK TKPISLEIAK 120
RFFSKTEYSD LLAKDKDEQT DYFYHLWSMK ESFIKQEGKG LSLPLDSFSV RLHQDGQVSI 180
ELPDSHSPCY IKTYEVDPGY KMAVCAAHPD FPEDITMVSY EELL 224