CN104483376A - 一种筛选环孢素a于免疫t细胞中药物作用靶位的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种利用蛋白质组学技术对环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位进行筛选的方法。本筛选环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位的方法利用蛋白质组学技术,对环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位进行筛选,方法包括以下步骤:步骤1)建立环孢素A于免疫T细胞作用样品组群、步骤2)制备免疫T细胞二维电泳蛋白质样品、步骤3)双向凝胶电泳、步骤4)图像采集分析得出结果。本发明筛选环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位的方法,操作思路明确、结果真实可靠,克服了常规筛选手段由于分析数据过于庞大和复杂,造成筛选结果误差较大,准确率低的缺陷,为临床用药提供了具有药理意义和指导作用的检测结果。
Description
技术领域
本发明涉及一种利用蛋白质组学技术对环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位进行筛选的方法。
背景技术
环孢素A(cyclosprine,CsA)是由11个氨基酸组成的环状多肽,是土壤中一种真菌的活性代谢物。1978年英国首次将环孢素A应用于临床肾移植,此后环孢素A又用于肝、心、肺、胰腺、骨髓等器官的移植,均取得令人满意的效果,明显提高病人的生存率。1984年环孢素A进入我国,形成了环孢素A加硫唑嘌呤加激素的三联免疫抑制方案,大大提高了移植存活率,同时也使移植术后急性排斥反应的发生率大幅下降。环孢素A作为一种强效免疫抑制剂,近年来人们对它的研究越来越多,发现它还可用来治疗自身免疫性疾病、血液病及寄生虫病等。目前,临床上针对个体病患,环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位一直无法确定,且常规筛选手段由于分析数据过于庞大和复杂,造成筛选结果误差较大,准确率低,难以在临床用药时提供具有药理意义和指导作用的检测结果。
发明内容
本发明要解决的技术问题是如何克服现有技术的上述缺陷,提供一种利用蛋白质组学技术对环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位进行筛选的方法。
为解决上述技术问题,本筛选环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位的方法利用蛋白质组学技术,对环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位进行筛选,其具体方法包括以下步骤:
步骤1):将培养至第五日的免疫T细胞,分为等量的对照组和若干试验组,向试验组中分别加入不同浓度的环孢素A,整体形成环孢素A对免疫T细胞模型的药物作用样品组群;
步骤2):将步骤1)所述的环孢素A对免疫T细胞模型的药物作用样品组群培养至对数生长期;弃去培养液,刮取细胞收集细胞到若干对应的离心管;收集完成后用磷酸缓冲液冲洗细胞5次,经冲洗后吸干离心管内残留磷酸缓冲液,然后加入等体积10mol/L脲、50mmol/L DTT、5%的3-[(3-胆酰胺丙基)-二乙胺1-丙磺酸、30mmol/L三羟甲基氨基甲烷形成的混合溶液,反复冻融细胞5~8次;放入冰盐浴中静置30min;然后升温至10℃的条件下离心2h;离心完成后取上清液测定蛋白浓度,并根据测得的蛋白质浓度标记、分装,转移至70℃的保温箱中储存存储备用;
步骤3):将步骤2)中存储备用的上清液取出两组,每组各50ug,与等量10mol/L尿素、5%的3-[(3-胆酰胺丙基)-二乙胺]-丙磺酸,20mmol/L二硫苏糖醇0.5%的IPG缓冲液组成的混合液体混合;混合后加入IPG持胶槽中,IPG干胶条的胶面向下放入槽中,并于其表面涂抹一层有机矿物油,IPG持胶槽加盖后置于IPGphor水平电泳仪电极板上进行等电聚焦;等电聚焦结束后,IPG干胶条在平衡液中平衡30min;平衡完成后将IPG干胶条移至SDS-PAGE分离胶上,并以琼脂糖封胶,将玻璃板置于电泳槽中以恒流方式进行电泳,至电泳槽中溴酚蓝前沿延伸至距凝胶底边5mm处停止电泳,得到凝胶;
步骤4):将由步骤3)得到的凝胶染色,并用凝胶扫描仪透射扫描;将得到图像用PDQUEST软件进行分析,图像分析过程包括图谱的剪切,蛋白质点的检测,不同凝胶间的匹配,量的归一化以及利用内标2DMARKER的标准分了量和等电点确定胶内蛋白点的相对分子量和等电点;以正常条件下免疫T细胞蛋白质的双向电泳图谱为参考胶,与环孢素A作用下培养的免疫T细胞蛋白质的双向电泳图谱进行配比,获得环孢素A作用于免疫T细胞的差异表达蛋白质;
步骤5):将由步骤4)得到的差异表达蛋白质经胶内酶切后,通过质谱,测定差异表达蛋白质;与质谱库比较,筛选出差异表达蛋白质;明确差异蛋白后,其生物学功能确定,通过蛋白印迹验证,即得环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位。
本发明筛选环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位的方法,操作思路明确、结果真实可靠,克服了常规筛选手段由于分析数据过于庞大和复杂,造成筛选结果误差较大,准确率低的缺陷,为临床用药提供了具有药理意义和指导作用的检测结果。
具体实施方式
本将培养至第五日的免疫T细胞,分为等量的对照组和若干试验组,向试验组中分别加入不同浓度的环孢素A,整体形成环孢素A对免疫T细胞模型的药物作用样品组群;
步骤2):将步骤1)所述的环孢素A对免疫T细胞模型的药物作用样品组群培养至对数生长期;弃去培养液,刮取细胞收集细胞到若干对应的离心管;收集完成后用磷酸缓冲液冲洗细胞5次,经冲洗后吸干离心管内残留磷酸缓冲液,然后加入等体积10mol/L脲、50mmol/L DTT、5%的3-[(3-胆酰胺丙基)-二乙胺1-丙磺酸、30mmol/L三羟甲基氨基甲烷形成的混合溶液,反复冻融细胞5~8次;放入冰盐浴中静置30min;然后升温至10℃的条件下离心2h;离心完成后取上清液测定蛋白浓度,并根据测得的蛋白质浓度标记、分装,转移至70℃的保温箱中储存存储备用;
步骤3):将步骤2)中存储备用的上清液取出两组,每组各50ug,与等量10mol/L尿素、5%的3-[(3-胆酰胺丙基)-二乙胺]-丙磺酸,20mmol/L二硫苏糖醇0.5%的IPG缓冲液组成的混合液体混合;混合后加入IPG持胶槽中,IPG干胶条的胶面向下放入槽中,并于其表面涂抹一层有机矿物油,IPG持胶槽加盖后置于IPGphor水平电泳仪电极板上进行等电聚焦;等电聚焦结束后,IPG干胶条在平衡液中平衡30min;平衡完成后将IPG干胶条移至SDS-PAGE分离胶上,并以琼脂糖封胶,将玻璃板置于电泳槽中以恒流方式进行电泳,至电泳槽中溴酚蓝前沿延伸至距凝胶底边5mm处停止电泳,得到凝胶;
步骤4):将由步骤3)得到的凝胶染色,并用凝胶扫描仪透射扫描;将得到图像用PDQUEST软件进行分析,图像分析过程包括图谱的剪切,蛋白质点的检测,不同凝胶间的匹配,量的归一化以及利用内标2DMARKER的标准分了量和等电点确定胶内蛋白点的相对分子量和等电点;以正常条件下免疫T细胞蛋白质的双向电泳图谱为参考胶,与环孢素A作用下培养的免疫T细胞蛋白质的双向电泳图谱进行配比,获得环孢素A作用于免疫T细胞的差异表达蛋白质;
步骤5):将由步骤4)得到的差异表达蛋白质经胶内酶切后,通过质谱,测定差异表达蛋白质;与质谱库比较,筛选出差异表达蛋白质;明确差异蛋白后,其生物学功能确定,通过蛋白印迹验证,即得环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位。
本发明包括但不限于上述实施方式,任何符合本权利要求书描述的产品,均落入本发明的保护范围之内。
Claims (1)
1.一种筛选环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位的方法,其特征是:本方法利用蛋白质组学技术,对环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位进行筛选,其具体方法包括以下步骤:
步骤1):将培养至第五日的免疫T细胞,分为等量的对照组和若干试验组,向试验组中分别加入不同浓度的环孢素A,整体形成环孢素A对免疫T细胞模型的药物作用样品组群;
步骤2):将步骤1)所述的环孢素A对免疫T细胞模型的药物作用样品组群培养至对数生长期;弃去培养液,刮取细胞收集细胞到若干对应的离心管;收集完成后用磷酸缓冲液冲洗细胞5次,经冲洗后吸干离心管内残留磷酸缓冲液,然后加入等体积10mol/L脲、50mmol/L DTT、5%的3-[(3-胆酰胺丙基)-二乙胺1-丙磺酸、30mmol/L三羟甲基氨基甲烷形成的混合溶液,反复冻融细胞5~8次;放入冰盐浴中静置30min;然后升温至10℃的条件下离心2h;离心完成后取上清液测定蛋白浓度,并根据测得的蛋白质浓度标记、分装,转移至70℃的保温箱中储存存储备用;
步骤3):将步骤2)中存储备用的上清液取出两组,每组各50ug,与等量10mol/L尿素、5%的3-[(3-胆酰胺丙基)-二乙胺]-丙磺酸,20mmol/L二硫苏糖醇0.5%的IPG缓冲液组成的混合液体混合;混合后加入IPG持胶槽中,IPG干胶条的胶面向下放入槽中,并于其表面涂抹一层有机矿物油,IPG持胶槽加盖后置于IPGphor水平电泳仪电极板上进行等电聚焦;等电聚焦结束后,IPG干胶条在平衡液中平衡30min;平衡完成后将IPG干胶条移至SDS-PAGE分离胶上,并以琼脂糖封胶,将玻璃板置于电泳槽中以恒流方式进行电泳,至电泳槽中溴酚蓝前沿延伸至距凝胶底边5mm处停止电泳,得到凝胶;
步骤4):将由步骤3)得到的凝胶染色,并用凝胶扫描仪透射扫描;将得到图像用PDQUEST软件进行分析,图像分析过程包括图谱的剪切,蛋白质点的检测,不同凝胶间的匹配,量的归一化以及利用内标2DMARKER的标准分了量和等电点确定胶内蛋白点的相对分子量和等电点;以正常条件下免疫T细胞蛋白质的双向电泳图谱为参考胶,与环孢素A作用下培养的免疫T细胞蛋白质的双向电泳图谱进行配比,获得环孢素A作用于免疫T细胞的差异表达蛋白质;
步骤5):将由步骤4)得到的差异表达蛋白质经胶内酶切后,通过质谱,测定差异表达蛋白质;与质谱库比较,筛选出差异表达蛋白质;明确差异蛋白后,其生物学功能确定,通过蛋白印迹验证,即得环孢素A于免疫T细胞中药物作用靶位。
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