CN103229040A - 3d数据分析装置和3d数据分析方法 - Google Patents

3d数据分析装置和3d数据分析方法 Download PDF

Info

Publication number
CN103229040A
CN103229040A CN2011800570230A CN201180057023A CN103229040A CN 103229040 A CN103229040 A CN 103229040A CN 2011800570230 A CN2011800570230 A CN 2011800570230A CN 201180057023 A CN201180057023 A CN 201180057023A CN 103229040 A CN103229040 A CN 103229040A
Authority
CN
China
Prior art keywords
stereo
picture
data analysis
separated region
data
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN2011800570230A
Other languages
English (en)
Other versions
CN103229040B (zh
Inventor
铃木俊辅
藤卷敦男
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Sony Corp
Original Assignee
Sony Corp
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Sony Corp filed Critical Sony Corp
Publication of CN103229040A publication Critical patent/CN103229040A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN103229040B publication Critical patent/CN103229040B/zh
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • HELECTRICITY
    • H04ELECTRIC COMMUNICATION TECHNIQUE
    • H04NPICTORIAL COMMUNICATION, e.g. TELEVISION
    • H04N13/00Stereoscopic video systems; Multi-view video systems; Details thereof
    • H04N13/30Image reproducers
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N15/00Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume or surface-area of porous materials
    • G01N15/10Investigating individual particles
    • G01N15/14Optical investigation techniques, e.g. flow cytometry
    • G01N15/1434Optical arrangements
    • G01N15/1436Optical arrangements the optical arrangement forming an integrated apparatus with the sample container, e.g. a flow cell
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T19/00Manipulating 3D models or images for computer graphics
    • G06T19/20Editing of 3D images, e.g. changing shapes or colours, aligning objects or positioning parts
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N15/00Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume or surface-area of porous materials
    • G01N15/10Investigating individual particles
    • G01N15/14Optical investigation techniques, e.g. flow cytometry
    • G01N15/1434Optical arrangements
    • G01N2015/144Imaging characterised by its optical setup
    • G01N2015/1445Three-dimensional imaging, imaging in different image planes, e.g. under different angles or at different depths, e.g. by a relative motion of sample and detector, for instance by tomography
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2219/00Indexing scheme for manipulating 3D models or images for computer graphics
    • G06T2219/20Indexing scheme for editing of 3D models
    • G06T2219/2016Rotation, translation, scaling

Landscapes

  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Computer Graphics (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Software Systems (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Architecture (AREA)
  • Dispersion Chemistry (AREA)
  • Computer Hardware Design (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Multimedia (AREA)
  • Signal Processing (AREA)
  • Image Processing (AREA)
  • Processing Or Creating Images (AREA)
  • Automatic Analysis And Handling Materials Therefor (AREA)
  • Image Generation (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
  • Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)

Abstract

本发明提供了一种3D数据分析装置和3D数据分析方法,其能容易并直观地进行围选,并能进行高精度的分析,而无需参考大量的直方图或细胞图,或无需回顾3D分布图等。本发明提供了3D数据分析装置(1),该3D数据分析装置(1)包括:数据存储单元(130),存储微粒测量数据;输入单元(141),从测量数据中选择独立的三种变量;数据处理单元(120),计算以三种变量为其坐标轴的坐标空间中位置和形状,并创建示出微粒特性分布的3D立体图像;以及显示单元(142),显示3D立体图像。所述3D数据分析装置(1)基于来自输入单元(141)的输入信号,可变地设定坐标空间内的可变分隔区域,并在3D立体图像中显示该区域。

Description

3D数据分析装置和3D数据分析方法
技术领域
本发明涉及3D数据分析装置和3D数据分析方法。更具体地,本发明涉及能够指定3D立体图像中的待分析微粒的3D数据分析装置等。
背景技术
为分析包括诸如细胞、微生物、和脂质体这样的生物相关颗粒、以及诸如胶乳颗粒、凝胶颗粒、和工业用途颗粒这样的合成颗粒的微粒,使用了微粒测量装置,该微粒测量装置将微粒的分散液导入流道中,并用光、电或磁的方式测量微粒。
作为一个例子,提供了颗粒分析器,该颗粒分析器根据尺寸或形状区分合成颗粒。可通过颗粒分析器测量的参数(变量)示例包括微粒的基本成分和颗粒直径。
此外,为分析生物相关颗粒,使用了流式细胞仪(流式细胞分析仪)。可以通过流式细胞仪测量的参数示例包括微粒的前向散射光(FS)、侧向散射(SS)、荧光(FL)以及阻抗。前向散射光(FS)、侧向散射(SS)、和荧光(FL)用作指示细胞或微生物(以下简称为“细胞”)的光学特性的参数,而阻抗用作指示细胞电特性的参数。
具体地,首先,前向散射光是在关于激光轴的向前方向上以小角度散射的光,前向散射光包括激光在细胞表面上生成的散射光、衍射光和折射光。前向散射光主要用作指示细胞尺寸的参数。接着,侧向散射是关于激光轴以约90度散射的光,并且是激光在细胞内颗粒体或核中生成的散射光。侧向散射主要用作指示细胞内部结构的参数。此外,荧光是从标记到细胞上的荧光染料生成的光,并用作指示是否存在通过被荧光标记的抗原所识别的细胞表面抗原、荧光染料所结合的核酸量等的参数。此外,阻抗通过电阻方法测量,并用作指示细胞体积的参数。
为分析流式细胞仪的测量数据,使用了数据分析装置,其中以这些参数为坐标轴绘制细胞的测量值,从而创建显示细胞群体中细胞的特性分布的图。使用一个测量参数的一维分布图称为直方图(histogram),其被创建为利用X轴指示测量参数并用Y轴指示细胞数量(计数)。此外,其中使用两个测量参数的二维分布图称为细胞图(cytogram),其通过根据坐标平面中测量值绘制细胞来创建,该坐标平面具有指示一个测量参数的X轴和指示其它测量参数的Y轴。
作为样本的细胞群体包括无需分析的不必要的细胞,所以在从作为样本的细胞群体中选择待分析的细胞小群体之后,进行测量数据分析。待分析的细胞小群体通过指定该细胞小群体在直方图或细胞图上所存在的区域而选择。该操作称为“围选”(“gating”),因为作为目标的细胞被围入在直方图或细胞图上被指定的区域中。
在以一个测量参数作为坐标轴的直方图上,或在以一个组合的测量参数作为坐标轴的细胞图上,在某些情形中,待分析的细胞小群体与不必要的细胞可能存在于重叠的区域。例如,当淋巴细胞与人体外围血液(peripheral blood)作为样本一起被分析时,在以前向散射光(FS)和侧向散射(SS)为坐标轴的细胞图上,在某些情形中部分单核细胞存在于与淋巴细胞相同的区域中。因此,当进行围选时,用户不得不指定只有淋巴细胞存在的区域以便不围入单核细胞。
为了指定区域以使仅围入待分析的细胞小群体而不围入不必要的细胞,通常,用户在参考多个直方图或细胞图的同时不得不进行围选。随着流式细胞仪的性能的改善,可测量的参数数量增加,所以用户不得不参考更多的直方图或细胞图。此外,现今,用户要求在成像其中组合两个细胞图的三维分布图(3D分布图)的同时进行围选操作。
为协助用户进行围选操作,专利文献1提出了“一种分析装置,包括:测量数据获取器件,用于从分析物中获取第一、第二、和第三测量数据项;3D分布图创建器件,用于以第一、第二、和第三测量数据为轴创建指示分析物中所含有的所形成元素的3D分布图;区域设定器件,用于在3D分布图上可变地设定分隔区域;以及参考分布图创建器件,用于关于所形成元素而创建以第一和第二测量数据项为轴的2D分布图和以第一测量数据项为轴的频率分布图中的至少一个,所述所形成元素属于通过区域设定器件设定的分隔区域”(见,专利文献1的权利要求9)。通过分析装置,可以在参考与3D分布图一起显示的2D分布图(细胞图)和频率分布图(直方图)的同时在3D分布图上设定分隔区域。应该注意的是,分析装置的3D分布图并不是被立体观察,而是被二维显示在显示器上。
关于本发明,将描述双透镜立体图像技术(3D立体图像技术)。在双透镜立体图像中,首先,当用右眼和左眼观察对象时准备两个图像。接着,同时显示这些图像,且用于右眼的图像仅对右眼显现,而用于左眼的图像仅对左眼显现。因此,当在3D空间中观察对象时会重建在眼中出现的图像,并使用户立体观察该对象。
对于允许立体观察的3D显示器,主要采用(a)眼镜型、(b)裸眼型、和(c)观察器型。(a)眼镜型包括互补色(anaglyph)型、偏振滤光型和分时型。此外,(b)裸眼型包括视差屏障型和双凸透镜型,而(c)观察器类型包括立体镜型和头戴型。
引用列表
专利文献
专利文献1:日本专利申请公开号2006-17497
发明内容
本发明要解决的问题
如上所述,通常在用作流式细胞仪的数据分析装置中,在围选时为了仅围入待分析的细胞小群体而不围入不必要的细胞,用户需要在参考大量的直方图或细胞图、或对通过组合两个细胞图获取的三维分布图(3D分布图)进行成像的同时进行操作。因此,在传统的数据分析装置中,需要花费很长的时间进行围选操作,且在用户操作不熟练的情况下,不必要的细胞被混入,这会导致分析精度的问题。
鉴于上述,本发明的目的是提供数据分析装置,该装置能够执行容易并直观的围选操作,而无需参考大量的直方图或细胞图,或无需对3D分布图进行成像,并且能够进行高精度分析。
解决问题的手段
为解决上述问题,本发明提供了3D数据分析装置,该3D数据分析装置包括:数据存储单元,存储微粒测量数据;输入单元,选择测量数据中独立的三种变量;数据处理单元,计算以三种变量为坐标轴的坐标空间中位置和图形,并创建表示微粒特性分布的3D立体图像;以及显示单元,显示3D立体图像,3D数据分析装置基于来自输入单元的输入信号,可变地在坐标空间内设定分隔区域,并在3D立体图像中显示该区域。
通过3D数据分析装置,可以在立体观察以任意选择的三种参数为坐标轴的3D分布图的同时在坐标空间中对待分析的微粒和微粒小群体进行围选。
此外,本发明还提供一种3D数据分析方法,该3D数据分析方法包括以下步骤:选择微粒测量数据中独立的三种变量;计算以三种变量为坐标轴的坐标空间中位置和图形,并创建表示微粒特性分布的3D立体图像;显示3D立体图像;并在3D图像中的坐标空间内设定分隔区域。
在本发明中,“微粒”广泛地包括,诸如细胞、微生物、和脂质体这样的生物相关颗粒、诸如胶乳颗粒、凝胶颗粒,和工业用途颗粒这样的合成颗粒等。
细胞包括动物细胞(造血细胞等)和植物细胞。微生物包括诸如大肠杆菌这样的细菌、诸如烟草花叶病毒这样的病毒、以及诸如酵母这样的真菌。生物相关颗粒包括形成多种细胞的染色体、脂质体、线粒体、细胞器(细胞器官)等。此外,生物相关颗粒可以包括生物相关聚合物,如核酸、蛋白质以及核酸与蛋白质的复合物(complex)。工业用途的颗粒可以是有机或无机聚合物材料、金属等。有机聚合物材料包括聚苯乙烯、苯乙烯-二乙烯基苯、聚甲基丙烯酸甲酯等。无机聚合物材料包括玻璃、二氧化硅、磁性材料等。金属包括胶体金、铝等。这些微粒一般具有球状的形态但也可以是非球状的形态。此外,这些微粒的尺寸、质量等也没有具体限制。
发明效果
根据本发明,提供了数据分析装置,该数据分析装置能够执行容易并直观的围选操作,而无需参考大量的直方图或细胞图,或无需对3D分布图进行成像,并且能进行高精度分析。
附图说明
图1是用于说明根据本发明的3D分析装置结构的框图,该3D分析装置结构被设置为与流式细胞仪接合。
图2是用于说明根据本发明的3D分析装置的功能结构的框图。
图3是用于说明由根据本发明的3D数据分析装置所显示的3D分布图的示意图。
图4是用于说明由根据本发明的3D数据分析装置所显示的双透镜立体图像(3D立体图像)的示意图。
图5是用于说明可在根据本发明的3D数据分析装置中设定的分隔区域的具体例子的示意图。
图6是用于说明可在根据本发明的3D数据分析装置中设定的分隔区域的具体例子的示意图。
图7是用于说明3D立体图像中对应于微粒的图形形状的示意图。
图8是用于说明受阴影处理影响的图形的立体观察图像的示意图。
图9是用于说明进行阴影处理的方法的示意图。
图10是用于说明坐标轴的立体观察图像的概念图。
图11是用于说明通过摇摆对应于微粒的图形而获取的动态图像的立体观察图像的概念图。
具体实施方式
在下文中,将参照附图描述实施本发明的优选实施方式。应该注意,下面将描述的实施方式是本发明典型实施方式的示例,所以本发明的保护范围并不由于本实施方式而被狭隘地说明。应该注意,将以下面的次序给出描述。
1.3D数据分析装置的结构
2.3D立体图像的显示
3.围选
4.3D立体图像的特性
(4-1)图形形状
(4-2)图形的阴影处理
(4-3)坐标轴
(4-4)动态图像
1.3D数据分析装置的结构
图1示出了根据本发明的3D数据分析装置的结构。这里,示出的是实施方式,其中,3D数据分析装置与微粒测量装置相邻连接设置,从而构成微粒分析系统。此外,图2示出了微粒测量系统的功能结构。在下文中,将描述其中流式细胞仪用作微粒测量装置的示例。
附图中附图标记1表示的3D数据分析装置,通过用通信电缆4连接到流式细胞仪2来构成微粒分析系统3。3D数据分析装置1包括中央处理单元(CPU)10、存储器20、硬盘30、用户接口等。3D数据分析程序31、微粒的测量数据32、操作系统(OS)33等存储并保持在硬盘30中。用户接口包括从诸如鼠标41和键盘42这样的从用户处接收信息输入的输入设备、以及诸如显示器43和打印机44这样的向用户输出信息的输出设备。应该注意,诸如杆式控制器和手写板这样的输入设备可被设置为代替鼠标41和键盘42,或与这些设备一起工作。
数据存储单元130(硬盘30)存储微粒(细胞)的测量数据32,该数据从流式细胞仪2输出。从流式细胞仪2的输入和输出接口250输出的测量数据通过通信电缆4输入到3D数据分析装置1的输入和输出接口150,并被存储在数据存储单元30(硬盘30)中。
测量数据32在数据处理单元120中处理。数据处理单元120当从输入单元141(鼠标41,键盘42等)接收到用户的输入时开始进行处理。也就是说,当用户选择和输入测量数据32中的独立的三种变量(参数)时,数据处理单元120创建以所选参数为坐标轴的表示微粒特性分布的3D分布图。通过在以所选参数为坐标轴的坐标空间中绘制微粒来创建3D分布图。通过根据所选参数的测量值计算微粒在坐标空间中的位置和图形、并在所计算的位置上绘制所计算的图形,来进行微粒的绘制。
此外,在所创建的3D分布图的坐标空间中,数据处理单元120根据来自输入单元141的用户输入信号设定用于执行对微粒的围选的分隔区域。使用诸如鼠标41和键盘42这样的输入设备,通过移动、变形、放大、或缩小3D分布图中显示的指针来执行来自输入单元141的用户输入。
此外,数据处理单元120执行对存在于所设定的分隔区域中的微粒的测量数据的处理(集群分析)(cluster analysis)。通过集群分析,例如,计算的是统计数据,诸如分隔区域中存在的微粒与所有微粒的比率、分隔区域中存在的微粒数量、平均值、标准偏差、变异系数等。
这里,“独立参数”是指从微粒的前向散射光(FS)、侧向散射(SS)、荧光(FL)以及阻抗等中选择的且互不相同的参数。荧光(FL)可以被作为对于标记到微粒上的荧光的每种波长都不同的参数进行处理,并且用FL1、FL2到FLn(n:大于等于3的整数)等表示。作为独立的三种参数,前向散射光(FS)、侧向散射(SS)、和荧光(FL1)的组合,或前向散射光(FS)、侧向散射(SS)和阻抗的组合被作为示例给出。此外,独立的三种参数可以是从测量数据中任意选择的组合。
通过数据处理单元120创建的3D分布图、及其坐标空间中设定的分隔区域在输出单元142(显示器43)上被显示为3D立体图像。3D立体图像是下面将详细描述的双透镜立体图像。可以根据来自输入单元141(鼠标41或键盘42)的用户输入信号,以旋转方式、或任意放大或缩小的方式执行输出单元142上的3D立体图像的显示。此外,数据处理单元120的集群分析结果也输出至输出单元142(显示器43、打印机44等)。例如,统计数据可用数值或图形显示在显示单元142上,或者可以被打印。
流式细胞仪2可具有与通常公知装置相同的结构,或可以被配置为适当修改该结构,具体地,包括控制单元210、流动系统220、检测系统230、输入和输出接口250等。
在流动细胞或微芯片中形成的流道中,流动系统220使含有微粒的样本液层流流向鞘液层流的中心,从而将层流中的微粒设置为一行。检测系统230获取指示流动通过流道的微粒的特性的参数值。具体地,光学检测单元231用光照射流动的微粒,检测从微粒发出的散射光、荧光等,并获取其强度。光学检测单元231包括激光源、透镜、镜子、滤光片、诸如CCD和CMOS元件这样的区域图像拾取元件、PMT(光电倍增管)等。此外,电检测单元232包括设置成与流动微粒相对的电极,并获取微粒的阻抗、电容值、电感等。流式细胞仪2可以具有对根据分析结果被确定具有所期望特性的微粒进行筛分的筛分系统240。对于筛分系统240,例如可以采用这样一种系统,该系统喷射含有微粒的液滴到流动细胞外的空间,并控制液滴的移动方向,从而仅将期望的微粒收集到容器中。
在检测系统230中检测的散射光、荧光等的强度的测量值,或阻抗、电容值、电感等测量值被转换成电信号,并从输入和输出接口250输出作为测量数据。
2.3D立体图像的显示
图3示意性示出了根据本发明的3D数据分析装置所显示的3D分布图。该3D分布图在显示单元142上被显示为3D立体图像,并可以由用户立体地视觉确认。
3D分布图5示出了以用户所选的三种参数作为坐标轴的坐标空间6中微粒特性分布。在3D分布图5中,在由所选参数的测量值计算的位置处,绘制对应于相应微粒的图形7。
在该图中,三种参数是前向散射光(FS-Lin:X轴)、侧向散射(SS-Lin:Y轴)、和第一荧光(FL1-Lin:Z轴)的组合的情形被作为例子给出。用于各坐标轴的参数可以是任意选择的组合。例如,第一荧光(FL1),第二荧光(FL2)、和阻抗可以分别用于X轴、Y轴和Z轴。
在3D分布图5的坐标空间6中,当执行对微粒的围选时,显示用于设定分隔区域的指针50。指针50也可以在3D立体图像中被用户立体可视地确认。通过来自输入单元141的用户输入信号,指针50在坐标空间6中任意移动、变形、放大、或缩小。
只要在3D立体图像的立体观察时,指针50的形状被可视地确认为预定的3D形状,那么指针50的形状就没有具体限制,例如,可以使用如图3(A)中所示的球形形状或图3(B)示出的立方体形状。
3D分布图的3D立体显示利用双透镜立体图像进行。图4示意性示出通过根据本发明的3D数据分析装置显示的双透镜立体图像。
当用户选择参数时,数据处理单元120创建3D分布图5,并创建当用左眼观察分布图时的图像(左眼图像5L),和当用右眼观察时的图像(右眼图像5R)。输出单元142(显示器43)同时显示左眼图像5L和右眼图像5R,并进行分离呈现,以使左眼图像5L仅对左眼呈现,而右眼图像5R仅对右眼呈现。
例如,在属于上述眼镜类型中的一种的时分系统中,通过交替显示具有微小时间差的左眼图像5L和右眼图像5R,并使快门眼镜8与此同步,可以进行分离呈现。此外,对于分离分布,可以使用另一种诸如互补色型和偏振滤光型这样的眼镜型、诸如视差屏障型和双凸透镜型这样的裸眼型、以及诸如立体镜型和头戴型这样的观察器型。
通过进行左眼图像5L和右眼图像5R的分离呈现,当在3D空间中观察3D分布图时,显示器43重建眼睛中看见的图像,并使用户立体观察分布图。
3.围选
使用诸如鼠标41和键盘42这样的输入设备,通过移动、变形、放大、或缩小3D分布图中显示的指针50来执行对用于进行微粒围选的分隔区域的设定。分隔区域被设定在指针50的内部空间内,所述指针50可被移动等。图5示出可被设定的分隔区域的具体示例。
图5中的(A)示出椭圆球形指针50的内部空间中设定的分隔区域51。分隔区域51可这样设定:移动图3中(A)所示的指针50到对应于待分析微粒的图形7存在的区域,使指针从正圆变形为椭球并扩大指针,并使指针50的内部空间整体或部分匹配该区域。多个分隔区域51可以被设定,两个以上的待分析的微粒小群体可被围入分隔区域中。
此外,图5中(B)示出了沿着移动的指针50的内部空间轨迹连续设定的分隔区域51。分隔区域51可通过移动图3中(A)示出的指针50来设定,以使其内部空间穿过对应于待分析微粒的图形7存在的区域,并用指针内部空间轨迹整体或部分地匹配该区域。可以用不连续的两个以上的轨迹设定多个分隔区域51,并在各分隔区域中围入两个以上的待分析的微粒小群体。
指针50可变形成任何形状,放大或缩小成任何尺寸(体积),并在3D分布图中移动,以在指针50内部空间中设定的分隔区域51中围入对应于待分析微粒的图形7。此时,在3D立体图像中可用不同于在分隔区域51外存在的图形7的颜色(色调、彩度、亮度)显示分隔区域中围入的图形7。图5中,在分隔区域51中被围入的图形被标示成黑色,而分隔区域外的图形7标示成白色。
被围入在分隔区域内的图形7和存在于分隔区域51外的图形7可在3D立体图像中用图6中示出的不同形状显示。图6中,被围选入分隔区域51中的图形7被标示成八面体的形式(见图7中的(B)),而在分隔区域外的图形7被标示成六面体的形式(见图7中的(A))。
被围入在分隔区域中的图形7和存在于分隔区域51外的图形7可以被以不同颜色和不同形状显示。例如,在对应于分隔区域中围入的图形7的微粒是白细胞的情形中,可以用类似于白细胞的颜色和形状标示图形。相反,例如,在存在于分隔区域51外的图形7是红细胞的情形中,可以用类似于红细胞的颜色和形状标示图形。
此外,也可以使被围入的图形7以外的图形7(在分隔区域51外存在的图形7)不显示在3D立体图像中。可选地,相反,在对应于不用分析的微粒的图形7被围选的情形中,可以使被围选的图形7(存在于分隔区域中的图形7)不显示在3D立体图像中。
如上所述,在3D数据分析装置1中,用户在立体观察以任意选择的三种参数为坐标轴的3D分布图并观察坐标空间中显示的指针的同时,可以进行对待分析的微粒和微粒小群体的围选。因此,在3D数据分析装置1中,可以容易并直观地指定分布图上待分析的微粒和微粒小群体,并进行围选而不参考大量的直方图或细胞图,或不以传统的方式对3D分布图进行成像。此外,用于坐标轴的参数被任意地组合以显示3D分布图,因此可以用一个图形获取与微粒三种特性相关的信息。因此,在3D数据分析装置1中,可以进行对待分析的微粒和微粒小群体的高精度的围选,并通过与用直方图或细胞图的传统显示相比减少参考图形的数量,来提高围选操作的效率。
4.3D立体图像的特性
在下文中,将按次序描述根据本发明的3D数据分析装置所显示的3D立体图像的特性。
(4-1)图形形状
在图3中均由附图标记7表示的对应于微粒的图形可被计算为由均具有预定形状的多边形构成的多面体,并被显示在3D立体图像中。如上描述,根据用户所选参数的测量值,数据处理单元120计算微粒在坐标空间中的位置和图形7,并创建3D分布图。此时,通过将图形7计算为由具有预定形状的多边形构成的多面体,可以减少数据处理单元120中的计算负荷。此外,通过在3D立体图像中将图形7显示为由具有预定形状的多边形构成的多面体,可以增强观察图像立体时图像的立体效果。
例如,可以采用图7的(A)中所示的由六个三角形构成的六面体、或图7的(B)中所示的八个三角形构成的八面体作为由具有预定形状的多边形构成的多面体。在分隔区域内外图形7的形状可被设定为不同的形状,且只要设置由均具有预定形状的多边形构成的多面体,图形7的形状没有具体限制。从立体效果和减少计算负荷的角度看,六面体或八面体是优选的。
(4-2)图形阴影处理
在3D立体图像中,当被立体观察时,被观察到靠前的图形7用增强的阴影指示,而被观察到靠后的图形7用减少的阴影指示。以这种方式,下文中图形7的阴影改变处理称为“阴影处理”。
图8示出了被阴影处理的图形7的立体观察图像(下文中,简称为“立体图像”)的概念图。朝着附图中的箭头方向,被观察到靠前的图形7更黑,被观察到靠后的图形7更白。以这种方式,通过进行用于图形7的阴影处理,给予3D立体图像中的立体图像以深度,并可以增强立体效果。
参考图9,将描述阴影处理方法。在显示器43上,左眼图像和右眼图像同时显示,当被立体观察时,在显示器43的屏幕上的位置处所观察的图形70的左眼图像和右眼图像以重叠的方式被显示(见图9(B))。
在显示器43上显示的左眼图像与右眼图像相比位置靠右的情形中(见图9(A)),与显示器43的屏幕上的位置相比,图形被立体显示得靠前。被以从屏幕位置处弹出的方式观察到的图形的立体图像在图中以附图标记71表示,而在显示器43上显示的图形71的左眼图像和右眼图像分别以符号71L和71R表示。另一方面,在显示器43上显示的左眼图像与右眼图像相比位置靠左的情形(见图9(C))中,图形被立体地观察到从显示器43的屏幕上的位置靠后。被以弹出的方式从屏幕位置观察到的图形的立体图像被以附图标记72表示,在显示器43上显示的图形71的左眼图像和右眼图像分别以符号72L和72R表示。
在阴影处理中,被观察到靠前的图形71的左眼图像71L和右眼图像71R被显示得更黑,而被观察到靠后的图形72的左眼图像72L和右眼图像72R被显示得更白。
(3-3)坐标轴
在3D立体图像中,当进行立体观察时,坐标轴被观察到靠前的部分被显示得更粗,坐标轴被观察到靠后的部分被显示得更细。图10示出了具有变化的粗度的坐标轴的立体图像的概念图。以这种方式,通过改变坐标轴的粗度,经由给予3D立体图像的立体图像以深度可以增强立体效果。
此外,如图10所示,当进行立体观察时,作为,坐标轴的刻度间隔的被观察到靠前的部分被设定得更宽,而其刻度间隔的被观察到靠后的部分则被设定得更窄,可以给予立体图像以进一步的深度。此外,坐标轴的名称(附图中SS-Lin)和刻度值字符(附图中200、400、600、800、1000)朝向前面显示得更大,朝向后面则显示得更小,因此可以获取相同的效果。应该注意,坐标轴的粗度、比例间隔尺寸和字符尺寸的改变处理也可通过应用上述的阴影处理来执行。
(4-4)动态图像
如上所述,基于来自输入单元141(鼠标41、键盘42等)的用户的输入信号,通过任意旋转、放大、或缩小可以进行3D立体图像到输出单元142(显示器43)的显示。当3D立体图像旋转时,如图3所示,优选地,坐标轴在形成坐标空间6的3D配置(附图中立方体)的各边上显示。由于这些坐标轴,坐标空间6的3D配置变得更清晰,所以当3D立体图像旋转时,3D分布图的方向改变易于识别。
在显示器43上显示的3D立体图像可以可选地通过来自用户的输入旋转,或可以在某一方向上一直缓慢地旋转。通过将3D立体图像显示为总是旋转的动态图像,相比于具有静态图像的显示,立体效果可被增强。
此外,在显示器43上显示的3D立体图像可以以摇摆对应于微粒的图形的这种动态图像进行显示。此时,当执行立体观察时,与被观察到靠后的图形相比,被观察到靠前的图形摇摆强度更大。图10中示出了被给出摇摆操作的图形的立体图像概念图。图形71和72如附图中箭头所示左右摇摆,左右摇摆的幅度对于被观察到靠前的图形71更大,对于被观察到靠后的图形72更小。以这种方式,当执行立体观察时,与被观察到靠后的图形相比,被观察到靠前的图形以强度更大的摇摆方式被显示,因此给予3D立体图像的立体图像以深度,且可以增强立体效果。
如上所述,根据本发明的3D数据分析装置被设计为增强所显示的3D立体图像的立体效果。因此,即使在仅由点(对应于微粒的图形)和线(坐标轴)构成的3D分布图的情形中,用户也可以在优选地视觉确认立体图像的同时分析测量数据,并且容易和直观地在分布图上指定待分析的微粒和微粒小群体。
产业适用性
通过根据本发明的3D数据分析装置,可以进行方便、直观的围选操作,并且进行高精度的分析,而无需参考大量的直方图或细胞图,或无需对3D分布图进行成像。因此,根据本发明的3D数据分析装置与例如流式细胞仪一起使用,并可以在医疗、公共卫生、药物发现(drug discovery)等领域方便地高精度地分析细胞或微生物的特性。
附图标号说明
1:3D数据分析装置
10:中央处理单元
110:控制单元
120:数据处理单元
130:数据存储单元
141:输入单元
142:显示单元
150:输入和输出接口
2:流式细胞仪
210:控制单元
220:流动系统
230:检测系统
231:光学检测单元
232:电检测单元
240:筛分系统
250:输入和输出接口
3:微粒分析系统
30:硬盘
31:3D数据分析程序
32:测量数据
33:操作系统
4:通信电缆
41:鼠标
42:键盘
43:显示器
44:打印机
5:3D分布图
50:指针
51:分隔区域
6:坐标空间
7:图形
8:快门眼镜

Claims (10)

1.一种3D数据分析装置,包括:
数据存储单元,存储微粒的测量数据;
输入单元,选择所述测量数据中的独立的三种变量;
数据处理单元,计算以所述三种变量为坐标轴的坐标空间中的位置和图形,并创建表征所述微粒的特性分布的3D立体图像;以及
显示单元,显示所述3D立体图像,
所述3D数据分析装置基于来自所述输入单元的输入信号,可变地设定所述坐标空间内的分隔区域,并在所述3D立体图像中显示所述区域。
2.根据权利要求1所述的3D数据分析装置,其中,
在所述3D立体图像的立体图像观察时,所述分隔区域被设定在被可视地确认为预定3D形状的指针的内部空间内,以及
所述输入单元包括输入设备,所述输入设备移动、变形、放大、或缩小所述坐标空间中的所述指针。
3.根据权利要求2所述的3D数据分析装置,其中,
沿着在所述坐标空间中移动的所述指针的轨迹连续地设定所述分隔区域。
4.根据权利要求3所述的3D数据分析装置,其中,
在所述3D立体图像中,存在于所述分隔区域内的所述图形均以与存在于所述分隔区域外的所述图形不同的颜色显示。
5.根据权利要求3所述的3D数据分析装置,其中,
在所述3D立体图像中,存在于所述分隔区域内的所述图形均以与存在于所述分隔区域外的所述图形不同的形状显示。
6.根据权利要求3所述的3D数据分析装置,其中,
在所述3D立体图像中,存在于所述分隔区域内的所述图形被设定为非显示状态。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的3D数据分析装置,其中,
所述显示单元是显示器,以及
所述3D数据分析装置包括:
眼镜,用于立体观察所述显示器上显示的所述3D立体图像。
8.一种微粒分析系统,通过连接设置根据权利要求1至6中任一项所述的3D数据分析装置与微粒测量装置被配置而成。
9.一种3D数据分析方法,包括以下步骤:
选择微粒的测量数据中的独立的三种变量;
计算以所述三种变量为坐标轴的坐标空间中的位置和图形,并创建表征所述微粒的特性分布的3D立体图像;
显示所述3D立体图像;以及
在所述3D立体图像的所述坐标空间中设定分隔区域。
10.根据权利要求9所述的3D数据分析方法,其中,
在所述3D立体图像的立体图像观察时被可视地确认为预定3D形状的指针在所述坐标空间中被移动、变形、放大或缩小,所述分隔区域被设定在所述指针的内部空间内。
CN201180057023.0A 2010-12-03 2011-11-25 3d数据分析装置和3d数据分析方法 Expired - Fee Related CN103229040B (zh)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2010-269945 2010-12-03
JP2010269945A JP5707904B2 (ja) 2010-12-03 2010-12-03 3dデータ解析装置および3dデータ解析方法
PCT/JP2011/077196 WO2012073825A1 (ja) 2010-12-03 2011-11-25 3dデータ解析装置および3dデータ解析方法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN103229040A true CN103229040A (zh) 2013-07-31
CN103229040B CN103229040B (zh) 2015-10-21

Family

ID=46171763

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201180057023.0A Expired - Fee Related CN103229040B (zh) 2010-12-03 2011-11-25 3d数据分析装置和3d数据分析方法

Country Status (5)

Country Link
US (1) US9185394B2 (zh)
EP (1) EP2647999B1 (zh)
JP (1) JP5707904B2 (zh)
CN (1) CN103229040B (zh)
WO (1) WO2012073825A1 (zh)

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11275242B1 (en) 2006-12-28 2022-03-15 Tipping Point Medical Images, Llc Method and apparatus for performing stereoscopic rotation of a volume on a head display unit
US11315307B1 (en) 2006-12-28 2022-04-26 Tipping Point Medical Images, Llc Method and apparatus for performing rotating viewpoints using a head display unit
US10795457B2 (en) 2006-12-28 2020-10-06 D3D Technologies, Inc. Interactive 3D cursor
US11228753B1 (en) 2006-12-28 2022-01-18 Robert Edwin Douglas Method and apparatus for performing stereoscopic zooming on a head display unit
JP6420976B2 (ja) * 2014-06-26 2018-11-07 アズビル株式会社 粒子検出装置及び粒子の検出方法
JP6318026B2 (ja) * 2014-06-26 2018-04-25 アズビル株式会社 粒子検出装置及び粒子の検出方法
JP7374943B2 (ja) * 2021-02-26 2023-11-07 シスメックス株式会社 表示方法および検体分析装置

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH03251971A (ja) * 1990-03-01 1991-11-11 Toshiba Corp 画像表示装置
JPH07129792A (ja) * 1993-10-29 1995-05-19 Canon Inc 画像処理方法および画像処理装置
JP2006000127A (ja) * 2004-06-15 2006-01-05 Fuji Photo Film Co Ltd 画像処理方法および装置並びにプログラム
JP2006017497A (ja) * 2004-06-30 2006-01-19 Sysmex Corp 分析装置、分析プログラム、分析方法
US20070035552A1 (en) * 2005-08-15 2007-02-15 Takashi Nozaki Graphics processing apparatus and graphics processing method

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5264964A (en) * 1991-12-18 1993-11-23 Sades Faris Multi-mode stereoscopic imaging system
DE69434685T2 (de) 1993-08-04 2006-09-14 Canon K.K. Bildverarbeitungsverfahren und -gerät
US8131053B2 (en) * 1999-01-25 2012-03-06 Amnis Corporation Detection of circulating tumor cells using imaging flow cytometry

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH03251971A (ja) * 1990-03-01 1991-11-11 Toshiba Corp 画像表示装置
JPH07129792A (ja) * 1993-10-29 1995-05-19 Canon Inc 画像処理方法および画像処理装置
JP2006000127A (ja) * 2004-06-15 2006-01-05 Fuji Photo Film Co Ltd 画像処理方法および装置並びにプログラム
JP2006017497A (ja) * 2004-06-30 2006-01-19 Sysmex Corp 分析装置、分析プログラム、分析方法
US20070035552A1 (en) * 2005-08-15 2007-02-15 Takashi Nozaki Graphics processing apparatus and graphics processing method

Also Published As

Publication number Publication date
JP2012117993A (ja) 2012-06-21
EP2647999A4 (en) 2017-08-02
CN103229040B (zh) 2015-10-21
WO2012073825A1 (ja) 2012-06-07
US9185394B2 (en) 2015-11-10
EP2647999B1 (en) 2021-06-16
US20130251242A1 (en) 2013-09-26
JP5707904B2 (ja) 2015-04-30
EP2647999A1 (en) 2013-10-09

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN103843337B (zh) 用于3d数据分析的装置、方法以及微粒分析系统
CN103229040B (zh) 3d数据分析装置和3d数据分析方法
US9959450B2 (en) Apparatus, method and program for 3D data analysis, and microparticle analysis system
CN103229041A (zh) 3d数据分析装置、3d数据分析方法和3d数据分析程序
JP5624881B2 (ja) 位置特有のマルチパラメータデータセットを分析し比較するグラフィックユーザインターフェイス
WO2014186527A1 (en) Efficient contours and gating in flow cytometry
JP2013088167A5 (zh)
CN102590046B (zh) 3d数据分析装置、方法和程序
CN102227624A (zh) 用于显示三维物体散点图的系统和方法
WO2022063086A1 (zh) 散点图像的显示方法及样本分析设备、相关装置

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20151021

Termination date: 20211125