CN102737382A - 一种前列腺超声图像自动精确分割方法 - Google Patents

一种前列腺超声图像自动精确分割方法 Download PDF

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Abstract

前列腺超声图像自动精确分割方法,属于计算机辅助诊断领域。该方法使用通过各向异性扩散构建的多尺度空间,通过Gabor滤波提取各个尺度下前列腺超声图像的纹理特征。同时,使用非参数核密度估计方法构建前列腺形状空间,并通过均值漂移(meanshift)在形状空间内进行搜索。在纹理特征和形状空间的双重约束下,得到前列腺轮廓的粗分割。最后,使用活动轮廓模型(activecontourmodels),结合方向梯度,自适应探测范围,求精分割结果,最后稳健地得到前列腺超声图像的精确分割。该方法解决了超声图像对比度低,斑点噪声、阴影区域对分割干扰大的问题;实现前列腺超声图像精确分割;可以适应各个厂商生产的不同型号超声机,对超声成像系统参数设置不敏感。

Description

一种前列腺超声图像自动精确分割方法
技术领域
本发明涉及计算机辅助诊断领域,具体涉及图像分割技术。 
背景技术
超声医学(Ultrasonic Medicine)是医学影像学(Medical Imageology)的一个重要组成部分,和CT、MRI、同位素扫描(Radioisotope Scan)共同被称为现在医学影像诊断的四项主要检查方法。 
对前列腺轮廓的准确提取,是计算机参与一系列辅助分析的基础。然而人工边界提取十分费时,同时,受限于人的经验、相关知识以及注意力,分析结果可能多变且不准确。所以,用计算机实现自动前列腺超声图像的轮廓提取,不仅具有理论研究价值,对于推动医疗技术的发展,较早发现病变,及时提供治疗,降低死亡率,减轻病人痛苦,也具有十分重要的意义。 
早在2003年,东南大学罗立民教授提出了一种超声波多尺度非线性的自适应边界检测方法,首先对超声图像进行多尺度分解,然后用非线性软阈值法抑制斑点噪声之后用小波变换重建图像最后使用基于“窄条”的线性边界检测方法对已经将降噪的图像进行处理。但由于区域增长过程的时间开销,其计算量较大。同年,Mohamed等提出了一种使用gabor滤波提取纹理的分割方法。此外,局部二值模式(Local Binary Pattern)提取纹理特征也广泛应用到了超声图像分割中。两年后,北京交通大学阮秋琦教授提出了一种提出了一种超声图像去噪与边缘增强算法:可以在去除噪声的同时,保持重要的边缘、局部细节和超声回声亮条。虽然对抑制噪声增强边界有较好的效果,但没有将其应用到对图像的分割和边缘检测中。英属哥伦比亚大学Badiei等人于2006年提出了一种通过用户交互,由用户提供6个输入点,来控制椭圆形变,从而寻找前列腺边缘的方法。这种方法简单高效,对一般形状的前列腺有较好的效果,而对于形变比较严重,形状不规则的目标,则难以达到理想的效果。同年,南京理工大学夏德深教授提出了一种先验形状参数活动轮廓模型,并将其应用在医学图像分割中,通过引入一种非距离性的先验形状力场,构建一种新的能反映先验形状的参数活动轮廓模型,新的先验形状活动轮廓模型避免了曲线之间距离的计算,减少了模型的复杂性.但是该模型在处理图像之前需要人工定义活动轮廓模型的初始曲线。加拿大西安大略大学Nanayakkara等人在中提出了另一种新算法,使用域知识,结合模糊集的思想,利用一系列基于区域自适应算子,对离散动态轮廓(Discrete Dynamic Contour,DDC)模型进行了改进,它不仅可以扩大DDC在非边界区域的检测范围,同时能增强其在目标轮廓附近的稳定性,起到很好的自适应效果。然而,这种方法没有考虑超声图像中由阴影导致的边界丢失问题,从而使得DDC模型在这类区域使用很大的探测范围,导致了不准确的分割结果。华中科技大学谢长生教授于2007年提出了多尺度形态学操作和模糊聚类技术相结合的图像分割方法. 首先使用了多尺度形态学滤波器提取超声图像的亮和暗特征, 然后根据这些特征的尺度特性进行加权, 从而实现了超声图像对比度增强和噪声抑制的目的. 然后,使用模糊聚类技术对增强后的超声图像进行分割.该方法对医学超声图像的增强和边缘检测有一定的效果但对于特定器官的处理效果欠佳。2010年,哈尔滨工业大学唐降龙教授提出了一种结合全局概率密度差异与局部灰度拟合的主动轮廓模型对超声图像进行分割的方法. 该方法分别在原始超声图像与预处理图像上利用了图像的全局和局部信息. 在原始图像上, 利用各区域的灰度分布, 并结合超声图像的背景知识对图像的全局信息建模。飞利浦北美研究院Yang等人也于2010年提出了一种新的思路,使用部分活动轮廓模型(Partial Active Shape Models)来处理边界丢失的问题,使用在结合离散可形变模型(Discrete Deformable Model)进一步对分割结果求精。该方法使用未经预处理的图像,没有进一步挖掘图像中蕴含的信息(如纹理特性)。同时超声图像信噪比、对比度都较低,直接在原始图像上进行处理,难以得到较好的处理结果。另外,该方法对目标形状的建模也有一定局限性,因为主成分分析(Principal Component Analysis)只能去除训练集中不同维度的线性相关性,对于现实数据存在的普遍相关相关性难以彻底去除,故在训练集合很接近高斯分布的时候能很好模拟它,对于一些复杂分布则难以取得良好的效果。 
发明内容
本发明为了解决超声图像对比度低,斑点噪声、阴影区域对分割干扰大的,没有临床实用的前列腺超声图像自动分割辅助系统,而提出了一种前列腺超声图像自动精确分割方法。 
本发明使用通过各向异性扩散构建的多尺度空间,通过Gabor滤波提取各个尺度下前列腺超声图像的纹理特征。同时,使用非参数核密度估计方法构建前列腺形状空间,并通过均值漂移(mean shift)在形状空间内进行搜索。在纹理特征和形状空间的双重约束下,得到前列腺轮廓的粗分割。最后,使用活动轮廓模型(active contour models),结合方向梯度,自适应探测范围,求精分割结果,最后稳健地得到前列腺超声图像的精确分割。 
本发明的前列腺超声图像自动精确分割方法步骤如下所示: 
步骤一: 基于一个数据集的学习样本图片,使用各向异性扩散方法,构建出尺度空间。由超声图像专家手工精确分割,使用Gabor滤波在不同方向、不同频率以及不同尺度下提取超声图像轮廓边缘的纹理特征;
步骤二: 自动初始化起始轮廓模型,从最粗糙的尺度开始,由学习提取的纹理特征和模型轮廓边缘的方向梯度特征作为引导,结合由核密度估计构建的形状空间,共同在子空间约束下寻找目标轮廓,进行初步分割,具体实现步骤为:
步骤A: 模型轮廓上的每一个控制点,都在法向方向上考察临近的坐标点,考虑法线上点纹理特征和方向梯度特征的共同作用,该控制点移向作用最强点的位置;
步骤B: 每一个控制点独立移动过后,模型的形状可能已经被破坏,此时,通过核密度估计方法,考察当前模型形状是否在形状空间之内,如果是,则进入步骤A,否则进入步骤C;
步骤C: 对当前形状使用均值漂移算法,使其向核密度高的方向移动,直到其核密度估计值满足形状空间要求;
步骤D: 考察当前是否在最精细一级的尺度下操作,是则进入步骤三,否则切换到更精细一级尺度,进入步骤A;
步骤三: 对原始超声图像使用均值偏移算法平滑,结合显著点监测算法,使用步骤二的输出形状为初始形状,使用活动轮廓模型进一步求精分割结果,得到最后的前列腺超声图像精确分割结果。
附图说明
图1本发明方法的流程框图; 
图2是本发明的控制点法向运动示意图;
图3是本发明的自适应探测距离示意图;
图4是本发明步骤二的输出结果示意图;
图5是本发明的最终分割示意图,与图4对应;
图6是本发明的最终分割结果与专家分割结果的对比示意图,其中虚线为专家分割结果,实线为本发明的分割结果。
具体实施方式
结合图1说明本实施方式,本实施方式的步骤如下: 
步骤一: 基于一个数据集的学习样本图片,使用各向异性扩散方法,构建出尺度空间。由超声图像专家手工精确分割,使用Gabor滤波在不同方向、不同频率以及不同尺度下提取超声图像轮廓边缘的纹理特征;
步骤二: 自动初始化起始轮廓模型,从最粗糙的尺度开始,由学习提取的纹理特征和模型轮廓边缘的方向梯度特征作为引导,结合由核密度估计构建的形状空间,共同在子空间约束下寻找目标轮廓,进行初步分割,具体实现步骤为:
步骤A: 模型轮廓上的每一个控制点,都在法向方向上考察临近的坐标点,考虑法线上点纹理特征和方向梯度特征的共同作用,该控制点移向作用最强点的位置;
步骤B: 每一个控制点独立移动过后,模型的形状可能已经被破坏,此时,通过核密度估计方法,考察当前模型形状是否在形状空间之内,如果是,则进入步骤A,否则进入步骤C;
步骤C: 对当前形状使用均值漂移算法,使其向核密度高的方向移动,直到其核密度估计值满足形状空间要求;
步骤D: 考察当前是否在最精细一级的尺度下操作(步骤二分割结果示例见图4),是则进入步骤三,否则切换到更精细一级尺度,进入步骤A;
步骤三: 对原始超声图像使用均值偏移算法平滑,结合显著点监测算法,使用步骤二的输出形状为初始形状,使用活动轮廓模型进一步求精分割结果,得到最后的前列腺超声图像精确分割结果(步骤三分割结果示例见图5,与专家分割结果的对比示例见图6)。
步骤一的实现细节为:对学习数据集轮廓上的每一个控制点编号 
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE001
,则每一个形状轮廓可以表示为一个
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE002
维空间内的一个点: 
Figure 712036DEST_PATH_IMAGE003
                                            (1)
Gabor滤波的实部为
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE004
                                      (2)
其中
Figure 611859DEST_PATH_IMAGE005
                                                             (3)
                                                        (4)
符号
Figure 240286DEST_PATH_IMAGE007
表示正弦曲线的波长因子,
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE008
表示Gabor函数的方向,
Figure 276375DEST_PATH_IMAGE009
表示相位,
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE010
表示高斯卷积的标准差,表示空间长宽比。则使用Gabor函数对不同尺度下的图像卷积可以得到前列腺轮廓上的纹理特征:
                                                                     (5)
不同尺度下每一个控制点的纹理特征可以表示为
Figure DEST_PATH_IMAGE013
                                                                (6)
其中
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE014
     (7)
其中,
Figure DEST_PATH_IMAGE015
分别表示所选取的波长和角度个数,
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE016
代表所在的尺度。不同尺度的图像由不同的各向异性扩散次数和下采样率的不同来决定,越粗糙的尺度扩散迭代次数和下采样率越高。各向异性扩散方程为
                                  (8)
其中
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE018
为各向异性的扩散率,
Figure DEST_PATH_IMAGE019
表示散度,
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE020
表示梯度。
步骤二的实现细节为:对形状上每一个控制,在其由内而外的相对于形状轮廓的法向量上,构建如下向量: 
                                                (9)
其中
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE022
是在模型上的点
Figure DEST_PATH_IMAGE023
,
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE024
表示点
Figure DEST_PATH_IMAGE025
的灰度值。由上式可以定义轮廓曲线上一个控制点的方向梯度
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE026
                                                                        (10)
其中
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE028
定义为
Figure 279360DEST_PATH_IMAGE029
                                     (11)
则步骤二A中每一个控制点的独立移动方程为
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE030
                                                      (12)
其次,基于原始形状训练集
Figure DEST_PATH_IMAGE031
,使用普氏分析(Procrustes analysis)将其校准,得到校准后训练集
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE032
,则在形状空间中一点的概率密度可以用非参数核密度估计方法表示为
                                           (13)
其中,
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE034
为通过普氏方法向训练集校正过的形状轮廓。为了降低空间维度,使用主成分分析对训练集矩阵
Figure DEST_PATH_IMAGE035
进行处理,得到它的前个特征向量构成的矩阵为
Figure DEST_PATH_IMAGE037
,由此我们可以在去除各个维度的线性相关性的同时,降低形状空间的维度
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE038
                                                             (14)
Figure 590780DEST_PATH_IMAGE039
                                                            (15)
从而(13)式可以表示为
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE040
                                         (16)
对于每一个分割形状,使用(16)式对其考察,如满足概率密度要求,则认为形状可以接受;如不满足,则使用均值漂移算法对形状进行修正,直到满足为止:
Figure 960582DEST_PATH_IMAGE041
                                                  (17)
随后,需要将满足条件的形状最终恢复为图像中的一个分割
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE042
                                                                                      (18)
最后,还需要把
Figure DEST_PATH_IMAGE043
校正回到原始的位置方向和大小,得到步骤二的输出结果为
步骤三的实现细节为:基于步骤二的输出结果,使用如下能量泛函求精最终分割结果: 
Figure 179073DEST_PATH_IMAGE045
                             (19)
其中
                                                         (20)
Figure DEST_PATH_IMAGE047
                                                (21)
在求解能量泛函时使用动态规划
(22)
同时引入自适应探测范围在增大探测范围的同时提高稳定性,降低运算量(如图3所示,虚线为(9)式中
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE050
的考察范围,均相等;实线为自适应探测范围)
Figure 100762DEST_PATH_IMAGE051
                                                             (23)
其中
Figure 709598DEST_PATH_IMAGE026
在(10)式中定义,
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE052
为阈值,
Figure 679828DEST_PATH_IMAGE053
的定义为
Figure 2012102075060100002DEST_PATH_IMAGE054
                                         (24)
式中表示期望,并且

Claims (5)

1.前列腺超声图像自动精确分割方法,该方法使用通过各向异性扩散构建的多尺度空间,通过Gabor滤波提取各个尺度下前列腺超声图像的纹理特征;同时,使用非参数核密度估计方法构建前列腺形状空间,并通过均值漂移(mean shift)在形状空间内进行搜索;在纹理特征和形状空间的双重约束下,得到前列腺轮廓的粗分割;最后,使用活动轮廓模型(active contour models),结合方向梯度,自适应探测范围,求精分割结果,最后稳健地得到前列腺超声图像的精确分割。
2.根据权利要求1所述的前列腺超声图像自动精确分割方法,其特征在于它的步骤如下:
步骤一:基于一个数据集的学习样本图片,使用各向异性扩散方法,构建出尺度空间;由超声图像专家手工精确分割,使用Gabor滤波在不同方向、不同频率以及不同尺度下提取超声图像轮廓边缘的纹理特征;
步骤二:自动初始化起始轮廓模型,从最粗糙的尺度开始,由学习提取的纹理特征和模型轮廓边缘的方向梯度特征作为引导,结合由核密度估计构建的形状空间,共同在子空间约束下寻找目标轮廓,进行初步分割,具体实现步骤为:
步骤A:模型轮廓上的每一个控制点,都在法向方向上考察临近的坐标点,考虑法线上点纹理特征和方向梯度特征的共同作用,该控制点移向作用最强点的位置;
步骤B:每一个控制点独立移动过后,模型的形状可能已经被破坏,此时,通过核密度估计方法,考察当前模型形状是否在形状空间之内,如果是,则进入步骤A,否则进入步骤C;
步骤C:对当前形状使用均值漂移算法,使其向核密度高的方向移动,直到其核密度估计值满足形状空间要求;
步骤D:考察当前是否在最精细一级的尺度下操作,是则进入步骤三,否则切换到更精细一级尺度,进入步骤A;
步骤三:对原始超声图像使用均值偏移算法平滑,结合显著点监测算法,使用步骤二的输出形状为初始形状,使用活动轮廓模型进一步求精分割结果,得到最后的前列腺超声图像精确分割结果。
3.根据权利要求2所述的前列腺超声图像自动精确分割方法,其特征在于步骤一,对学习数据集轮廓上的每一个控制点编号                                                ,则每一个形状轮廓可以表示为一个
Figure 969471DEST_PATH_IMAGE002
维空间内的一个点:
Figure 663758DEST_PATH_IMAGE003
                                 (1)
Gabor滤波的实部为
Figure 377636DEST_PATH_IMAGE004
                             (2)
其中
Figure 422952DEST_PATH_IMAGE005
                                              (3)
Figure 818161DEST_PATH_IMAGE006
                                                 (4)
符号
Figure 366954DEST_PATH_IMAGE007
表示正弦曲线的波长因子,
Figure 517313DEST_PATH_IMAGE008
表示Gabor函数的方向,
Figure 784346DEST_PATH_IMAGE009
表示相位,
Figure 983246DEST_PATH_IMAGE010
表示高斯卷积的标准差,
Figure 448863DEST_PATH_IMAGE011
表示空间长宽比;
则使用Gabor函数对不同尺度下的图像卷积可以得到前列腺轮廓上的纹理特征:
                                             (5)
不同尺度下每一个控制点的纹理特征可以表示为
Figure 462135DEST_PATH_IMAGE013
                                                       (6)
其中
           (7)
上式中,
Figure 784849DEST_PATH_IMAGE015
分别表示所选取的波长和角度个数,
Figure 214693DEST_PATH_IMAGE016
代表所在的尺度;
不同尺度的图像由不同的各向异性扩散次数和下采样率的不同来决定,越粗糙的尺度扩散迭代次数和下采样率越高;
各向异性扩散方程为
Figure 190740DEST_PATH_IMAGE017
                                 (8)
其中
Figure 793759DEST_PATH_IMAGE018
为各向异性的扩散率,
Figure 437230DEST_PATH_IMAGE019
表示散度,
Figure 772397DEST_PATH_IMAGE020
表示梯度。
4.根据权利要求2所述的前列腺超声图像自动精确分割方法,其特征在于步骤二,首先,对形状上每一个控制,在其由内而外的相对于形状轮廓的法向量上,构建如下向量:
Figure 501318DEST_PATH_IMAGE021
                             (9)
其中
Figure 642450DEST_PATH_IMAGE022
是在模型上的点,
Figure 646495DEST_PATH_IMAGE024
表示点
Figure 927959DEST_PATH_IMAGE025
的灰度值;
由上式可以定义轮廓曲线上一个控制点的方向梯度
Figure 810464DEST_PATH_IMAGE026
Figure 162948DEST_PATH_IMAGE027
                                               (10)
其中定义为
                            (11)
则步骤二A中每一个控制点的独立移动方程为
                                  (12)
其次,基于原始形状训练集
Figure 498935DEST_PATH_IMAGE031
,使用普氏分析(Procrustes analysis)将其校准,得到校准后训练集
Figure 409122DEST_PATH_IMAGE032
,则在形状空间中一点的概率密度可以用非参数核密度估计方法表示为
Figure 334353DEST_PATH_IMAGE033
                          (13)
其中,为通过普氏方法向训练集校正过的形状轮廓;
为了降低空间维度,使用主成分分析对训练集矩阵
Figure 948054DEST_PATH_IMAGE035
进行处理,得到它的前
Figure 232404DEST_PATH_IMAGE036
个特征向量构成的矩阵为
Figure 644931DEST_PATH_IMAGE037
,由此我们可以在去除各个维度的线性相关性的同时,降低形状空间的维度
Figure 407351DEST_PATH_IMAGE038
                                              (14)
                                             (15)
从而(13)式可以表示为
Figure 106502DEST_PATH_IMAGE040
                        (16)
对于每一个分割形状,使用(16)式对其考察,如满足概率密度要求,则认为形状可以接受;如不满足,则使用均值漂移算法对形状进行修正,直到满足为止:
Figure 6325DEST_PATH_IMAGE041
                               (17)
随后,需要将满足条件的形状最终恢复为图像中的一个分割
Figure 634753DEST_PATH_IMAGE042
                                                          (18)
最后,还需要把
Figure 670842DEST_PATH_IMAGE043
校正回到原始的位置方向和大小,得到步骤二的输出结果为
Figure 296995DEST_PATH_IMAGE044
5.根据权利要求2所述的前列腺超声图像自动精确分割方法,其特征在于步骤三,基于步骤二的输出结果,使用如下能量泛函求精最终分割结果:
Figure 684114DEST_PATH_IMAGE045
                             (19)
其中
Figure 850653DEST_PATH_IMAGE046
                                           (20)
Figure 6828DEST_PATH_IMAGE047
                             (21)
在求解能量泛函时使用动态规划
Figure 803883DEST_PATH_IMAGE048
(22)
同时引入自适应探测范围
Figure 412719DEST_PATH_IMAGE049
在增大探测范围的同时提高稳定性,降低运算量
                                                            (23)
其中
Figure 659209DEST_PATH_IMAGE026
在(10)式中定义,
Figure 627165DEST_PATH_IMAGE051
为阈值,
Figure 788544DEST_PATH_IMAGE052
的定义为
                               (24)
式中
Figure 365336DEST_PATH_IMAGE054
表示期望,
Figure 566510DEST_PATH_IMAGE055
并且
Figure 149938DEST_PATH_IMAGE056
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