CN102121017A - 水稻温敏雄性不育基因、其编码蛋白及其应用 - Google Patents
水稻温敏雄性不育基因、其编码蛋白及其应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN102121017A CN102121017A CN2010105994091A CN201010599409A CN102121017A CN 102121017 A CN102121017 A CN 102121017A CN 2010105994091 A CN2010105994091 A CN 2010105994091A CN 201010599409 A CN201010599409 A CN 201010599409A CN 102121017 A CN102121017 A CN 102121017A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- gene
- rice
- protein
- amino acid
- seq
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 82
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 title claims abstract description 35
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 title claims abstract description 35
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title claims abstract description 24
- 206010021929 Infertility male Diseases 0.000 title claims abstract description 17
- 208000007466 Male Infertility Diseases 0.000 title claims abstract description 17
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 title abstract 2
- 230000035558 fertility Effects 0.000 claims abstract description 7
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract description 6
- 230000008827 biological function Effects 0.000 claims abstract description 5
- 241000219194 Arabidopsis Species 0.000 claims abstract description 4
- 241000209094 Oryza Species 0.000 claims description 33
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 7
- 101100000148 Oryza sativa subsp. japonica 4CLL9 gene Proteins 0.000 claims description 4
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 2
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 5
- 102000008300 Mutant Proteins Human genes 0.000 claims 1
- 108010021466 Mutant Proteins Proteins 0.000 claims 1
- 238000007792 addition Methods 0.000 claims 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims 1
- 238000009405 line breeding Methods 0.000 claims 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 abstract description 7
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 abstract description 7
- 238000009395 breeding Methods 0.000 abstract description 6
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 abstract description 6
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 abstract description 3
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 abstract description 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 abstract 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 abstract 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 16
- 238000011160 research Methods 0.000 description 7
- 101710153103 Long-chain-fatty-acid-CoA ligase FadD13 Proteins 0.000 description 6
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 6
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 4
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 4
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 3
- 238000009402 cross-breeding Methods 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 230000006870 function Effects 0.000 description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 3
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 2
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 2
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 2
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 2
- 239000000575 pesticide Substances 0.000 description 2
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 2
- 241000219195 Arabidopsis thaliana Species 0.000 description 1
- 208000030853 Asthma-Chronic Obstructive Pulmonary Disease Overlap Syndrome Diseases 0.000 description 1
- 241000219193 Brassicaceae Species 0.000 description 1
- 206010064571 Gene mutation Diseases 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 101000708283 Oryza sativa subsp. indica Protein Rf1, mitochondrial Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700001094 Plant Genes Proteins 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 125000000218 acetic acid group Chemical group C(C)(=O)* 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000003044 adaptive effect Effects 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 238000003766 bioinformatics method Methods 0.000 description 1
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 description 1
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 239000013000 chemical inhibitor Substances 0.000 description 1
- 210000003763 chloroplast Anatomy 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 230000001143 conditioned effect Effects 0.000 description 1
- 230000010154 cross-pollination Effects 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 230000008034 disappearance Effects 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008303 genetic mechanism Effects 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N isoamylol Chemical compound CC(C)CCO PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000009400 out breeding Methods 0.000 description 1
- 230000001376 precipitating effect Effects 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 229960004249 sodium acetate Drugs 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 238000012916 structural analysis Methods 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
Images
Landscapes
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
本发明涉及一种水稻温敏雄性不育基因、其编码蛋白及其应用。该基因具有下列核苷酸序列之一：1.具有SEQIDNO1所示的核苷酸序列，2.与SEQIDNO3所示的拟南芥基因的碱基序列的同源性最高，期望值达到1.8e-27，且编码相同生物学功能蛋白质的DNA序列。本发明的基因OsATMS1的转录表达具有对环境温度敏感的特性，能够使植物雄性育性具备温敏特征，预示着它在作物杂交育种以及产量提高方面的应用价值。
Description
技术领域
本发明涉及一种水稻温敏雄性不育基因、其编码蛋白及其应用。
背景技术
杂交育种技术: 雄性不育是植物界非常普遍的现象，受内、外源多种因素控制和影响。由于雄性不育品种为农业生产上异花授粉提供了极大的便利，所以成为杂交育种和生产的基础。上世纪70年代，以袁隆平为代表的我国一批水稻育种学家在细胞质雄性不育野败系基础上，相继育种成功恢复系和保持系，创建了所谓杂交育种三系法（不育系，恢复系和保持系），至今基于三系法的杂交水稻单在我国已播种5亿公顷，增加水稻产量20%以上，为我国的粮食安全做出巨大贡献。三系法虽然功勋卓著，然而其基因型单一，同时细胞质雄性不育来源于线粒体或者叶绿体发育的缺陷，在一定的遗传背景下可能会引发植物整体上生长和适应力上的隐患。与三系法相比，基于核基因突变的光敏雄性不育或者温敏雄性不育的两系法杂交稻种子生产的程序简化，种子成本低，基因型配套多样，有利于推广，因此光敏、尤其以温敏为主的核不育水稻目前已成为我国超级杂交稻的雄性不育系的主力。
但是，尽管在应用上以温敏雄性不育系为代表的对外界环境因素敏感的条件型雄性不育系列已经崭露头角，但和原先的三系法比较，因为这类雄性不育特性的不稳定，在出现反常低温，或者高温的情况下育性会有一定程度的恢复，因此，这类雄性不育系列的使用受气候条件的制约大，也因此严重限制了应用的范围。解决这个问题的根本出路在于从基因水平了解温敏雄性不育的遗传学机制，明晰其育性随外界条件变化的特性，从而因地制宜地选择合适的基因型雄性不育品种；或者根据这类基因编码蛋白，比如酶类的理化特点，在出现育性恢复的反常天气时，能够针对性地采取相应手段，比如使用酶类化学抑制剂抑制其蛋白活性，从而抑制不育系恢复育性。
拟南芥（Arabidopsis thaliana）是一种十字花科的小型野草，早在16世纪被发现，19世纪末，科学家就注意到了它的研究价值。它是国际上第一个完成全部基因组序列测定的高等植物，其研究成果对于其它高等植物包括农作物的研究，产生了重大的影响，因此拟南芥的研究越来越受到国际植物学界及各国政府的重视。通过对拟南芥基因组的研究，推动了许多其它植物相关基因的研究，尤其是推动经济作物中相关基因的研究，给人类带来巨大的经济效益。我们实验室目前克隆鉴定了一个对环境温度敏感的雄性不育突变体atms1，发现控制表型的基因ATMS1编码一种脂酰辅酶A合成酶。
水稻中，脂酰辅酶A合成酶构成一个大家族，其中，只有OsATMS1基因（LOC_Os04g24530）在花药中特异表达，而且编码的蛋白与拟南芥花药特异基因ATMS1高度同源。通过对拟南芥ATMS1基因功能的研究，以及通过比较基因组学的手段，证明水稻OsATMS1是拟南芥ATMS1的同源基因。它们的蛋白同源性在97%的保守区域内达到76.4%， 基因表达模式十分相近，所以，我们认为OsATMS1与ATMS1在功能上也十分相近。最重要的是OsATMS1基因的转录表达对环境温度高度敏感，有望将该基因进行功能修饰后选育水稻温敏雄性不育系。因此，水稻OsATMS1的克隆及功能鉴定对于提高我国水稻产量以及简化杂交稻种子生产程序都有着重要的意义。
发明内容
本发明的目的之一在于提供了一个水稻温敏雄性不育基因，该基因是从水稻中分离出来的一个DNA分子，称为OsATMS1。
本发明的目的之二在于提供该基因的编码蛋白。
本发明的目的之三在于提供该基因在水稻两系法育种中的应用。
为达到以上目的，本发明采用如下技术方案：
一种水稻温敏雄性不育基因，其特征在于，该基因具有下列核苷酸序列之一：
1) 具有SEQ ID NO 1 所示的碱基序列；
2) 与SEQ ID NO 1 所示的碱基序列具有很高的同源性，期望值达到1.8e-27，且编码相同生物学功能蛋白质的DNA序列。
一种根据上述的水稻温敏雄性不育基因，其特征在于该蛋白具有下列氨基酸序列之一：
1) 具有SEQ ID NO 2 所示的氨基酸序列；
2) 通过将SEQ ID NO 2的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加而产生的衍生蛋白质的氨基酸序列，该衍生蛋白质与SEQ ID NO 2的蛋白具有相同的生物学功能。
一种上述的基因在控制水稻雄性育性中的作用。
一种上述的基因在水稻两系法育种中的应用。
一个获得上述基因的方法，该方法的具体步骤为：利用Rice Genome Annotation Project网站所提供的BLAST软件比对该网站的基因数据库后，得到与ATMS1同源性最高的水稻基因OsATMS1,其Gene ID为LOC_Os04g24530，进而得到该基因的碱基序列及其编码蛋白的氨基酸序列。
本发明的基因OsATMS1的转录表达具有对环境温度敏感的特性，能够使植物雄性育性具备温敏特征，预示着它在作物杂交育种以及产量提高方面的应用价值。
附图说明
图1为本发明的基因OsATMS1编码的蛋白的结构图，图中该蛋白的398位的甘氨酸在其催化功能中起着重要的作用；
图2为本发明的基因OsATMS1编码的蛋白的进化分析图，表明该编码蛋白与拟南芥ATMS1基因编码蛋白同属于脂酰辅酶A合成酶家族，二者在进化上很接近；
图3为本发明的基因OsATMS1基因在不同温度下的转录表达的RT-PCR检测：Actin是总cDNA水平的对照。
具体实施方式
下面结合具体实施，进一步阐明本发明。应理解，这些实例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下面实例中未注明具体实验条件的实验方法，通常按照常规条件，分子克隆（Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd ed.）中所述条件或按照制造厂商所建议的条件。
实施例一：OsATMS1基因的获得：利用Rice Genome Annotation Project网站所提供的BLAST软件比对该网站的基因数据库后，得到与ATMS1同源性最高的水稻基因OsATMS1,其Gene ID为LOC_Os04g24530，进而得到该基因的碱基序列及其编码蛋白的氨基酸序列。
实施例二：生物信息学方法分析OsATMS1基因及其蛋白的结构：经RGAP 6.1的BLAST分析，水稻OsATMS1基因与拟南芥ATMS1基因的同源性很高，期望值达到1.8e-27。从Rice Genome Annotation Project得到其蛋白序列，经Vector NTI 9.1.0软件分析显示：该蛋白含有555个氨基酸，蛋白分子量大小约为59.4kDa，等电点为5.69。利用CN3D 4.1软件对OsATMS1基因编码的蛋白的三维结构分析表明，该蛋白含有四香豆酸辅酶A连接酶结构域和乙酰蛋白合成酶结构域，这是脂酰辅酶A合成酶均具备的特征，表明该蛋白是脂酰辅酶A合成酶，参见图1。进化分析表明，OsATMS1基因编码的蛋白属于脂酰辅酶A合成酶ACOS家族，参见图2。
实施例三：OsATMS1基因温敏特性的检测与分析：先在人工光照培养室20℃和30℃处理水稻，后采用传统的苯酚：氯仿：异戊醇、醋酸钠层析和异丙醇沉淀的方法提取处理后水稻花序的总RNA，然后利用Invitrogen公司的M-MLV First Strand Kit（cat no. c28025-032, lot no. 8210069）反转录出cDNA，根据目的基因内含子两端序列，在1117和1772位点处设计如下所示的上下游引物，PCR扩增后通过琼脂糖凝胶电泳技术检测。
Sense primer: TTCATCCTGCCGAACCTG
Anti-sense primer: ACGCCACTATCTCCTCCT
电泳结果表明：水稻中OsATMS1在20℃的转录表达比30℃高，参见图3。图中显示，20℃下用于检测的总cDNA模板数量要少于30℃下的总cDNA数量，而从中检测到的OsATMS1水平却显著高于30℃下的水平，意味着低温20℃下OsATMS1的表达显著高于高温30℃下的表达水平，所以，OsATMS1的转录表达具有温敏特性。
序 列 表
<110> 上海大学
<120> 水稻温敏雄性不育基因、其编码蛋白及其应用
<160> 2
<210> 1
<211> 1667
<212> DNA
<213> 水稻
<400> 1
ATGGG CGACG CCGCG GTACC CGCCA TGGTG GTGGA GGAGG AGGAA CAGGA GCACG TGTTC 60
CGGAG CAGGT TCCCG CCGGT GGCCG TGCCG GACGG CGTCA CCGTG CCGGA GTTCG TGCTG 120
GACGG CGCCG AGGCC TACGC CGACA GGGTG GCGCT CGTGG AGGCC GCGGC GGGCG GGCGG 180
TCGTA CACGT ACGGC GAGGT GGCGC GCGAC ACGGC GCGGT TCGCC AGGGC GCTCC GGTCG 240
GTGGG CGTCC GGAAG GGGCA CGTCG TCGTC GTCGC GCTCC CAAAC CTCGC CGTGT ACCCC 300
GTCGT GTCGC TCGGG ATCAT GTCGG CGGGG GCCGT GTTCT CCGGC GTGAA CCCGC GCGCG 360
CTCGC CGCGG AGATC AAGAA GCAGG TGGAG GACTC CGAGG CGAAG CTGGT CGTTG CCAAC 420
GAGGT CGCGT TCGAC AAGGT GAAGG ACGCC GGCGT GCCGG TGATC GGCGT CGGCG ACAGG 480
GAGCG GATGC CTGGG GCGAT CAGCT GGGAC GGGCT CCTCG CCGCG GCGGA CCGCA CCGGC 540
GCCGG GGTGG TGCCG GTGGA CGCGG CGCAG CAGTC CGACC TGTGC GCGCT CCCCT ACTCC 600
TCCGG CACCA CCGGC GTGTC CAAGG GCGTG ATGCT GAGCC ACCGC AACCT GGTGT CCAAC 660
CTCTG CTCGT CCATG TTCGC CGTGG CGCCG GAGAC GGCCG GGCAG GTGGT GACGC TGGGG 720
CTCAT GCCGT TCTTC CACAT CTACG GCATC ACCGG CATCT GCTGC GCCAC GCTCC GGCAC 780
AAGGG CACGG TGGTG GTGAT GGACC GCTTC GACCT CCGCA CGTTC CTCCG TGCGC TCGTC 840
GACCA CCGCG TCATG TTCGC GCCGC TGGTT CCCCC CGTGA TGCTC GCCAT GGTCA AGAGC 900
CCCGT CGCCG ACGAG TTCGA CCTCT CCGAC CTCGC CCTCA AGTCC GTCAT GACCG CCGCC 960
GCGCC GCTCG CCCCC GACCT CCTCG CCGCG TTCCA GCGCA AGTTC CCCGG CGTGC AGGTG 1020
GAGGA AGCCT ACGGC CTCAC CGAGC ACAGC TGCAT CACCC TCACG CACGC CGCCG GCGAC 1080
GGCCA CGGCC ACGTC GCCAA GAAGA GCTCG GTGGG GTTCA TCCTG CCGAA CCTGA GGTGA 1140
AGTTC GTGGA CCCGG ACACC GGGAG GTCGC TGCCG GCGAA CACGC CGGGG GAGCT GTGCG 1200
TGCGG AGCCA GAGCG TGATG CAGGG GTACT ACAAG AGGAA GGAGG AGACG GAGCG CACGG 1260
TGGAC GGCAA GGGGT GGCTG CACAC CGGCG ACGTT GGGTA CATCG ACGGC GACGG CGACG 1320
TGTTC ATCGT GGACA GGATC AAGGA GCTGA TCAAG TACAA GGGGT TTCAG GTCGC CCCCG 1380
CCGAG CTCGA GGCCG TCCTC CTCTC CCACC CCTCC GTTGA GGACG CCGCC GTCTT CGGGG 1440
TGCCG GACGA GGAGG CCGGC GAGGT GCCGG TGGCG TGCGT GGTGC GGCGG CACGG TGCGG 1500
AGGAG GGGGA GGAGG AGATA GTGGC GTACG TGGCG GAGAG GGTGG CGTCG TACAA GCGGG 1560
TCCGG GTGCT GCACA TCGTC GACGC CATCC CCAAG TCGGT GTCCG GGAAG ATCCT GAGGA 1620
GGCAG CTTAG GGACG AGTTC ATCAA GAGGA TGAAA CCGTC AGCTT GA 1667
<210> 2
<211> 537
<212> PRT
<213> 水稻
<400> 2
MGDAA VPAMV VEEEE QEHVF RSRFP PVAVP DGVTV PEFVL DGAEA YADRV ALVEA AAGGR 60
SYTYG EVARD TARFA RALRS VGVRK GHVVV VALPN LAVYP VVSLG IMSAG AVFSG VNPRA 120
LAAEI KKQVE DSEAK LVVAN EVAFD KVKDA GVPVI GVGDR ERMPG AISWD GLLAA ADRTG 180
AGVVP VDAAQ QSDLC ALPYS SGTTG VSKGV MLSHR NLVSN LCSSM FAVAP ETAGQ VVTLG 240
LMPFF HIYGI TGICC ATLRH KGTVV VMDRF DLRTF LRALV DHRVM FAPLV PPVML AMVKS 300
PVADE FDLSD LALKS VMTAA APLAP DLLAA FQRKF PGVQV EEAYG LTEHS CITLT HAAGD 360
GHGHV AKKSS VGFIL PNLEV KFVDP DTGRS LPANT PGELC VRSQS VMQGY YKRKE ETERT 420
VDGKG WLHTG DVGYI DGDGD VFIVD RIKEL IKYKG FQVAP AELEA VLLSH PSVED AAVFG 480
VPDEE AGEVP VACVV RRHGA EEGEE EIVAY VAERV ASYKR VRVLH IVDAI PKSVS GKILR 520
RQLRD EFIKR MKPSA 537
<210> 3
<211> 1629
<212> DNA
<213> 拟南芥
<400> 3
ATGGAGAGTCAAAAGCAAGAAGATAATGAATACATTTTCCGCAGTTTGTATCCATCTGTGCCCATTCCTGACAAACTTACACTGCCTGAATTTGTGCTCCAAGGAGTTGAAGAATACACAGAGAATGTAGCGTTTGTAGAAGCGGTGACCGGAAAAGCTGTGACGTACGGTGATGTAGTGAGGGACACAAAGAGGCTAGCCAAAGCGTTGACATCTCTCGGACTAAGGAAAGGTCAAGTGATGGTTGTGGTCCTACCAAACGTCGCCGAGTATGGGATTATTGCCCTTGGTATTATGTCTGCCGGTGGAGTCTTCTCCGGTGCAAATCCGACGGCTCTTGTTTCCGAGATCAAGAAGCAAGTTGAAGCTTCCGGTGCTAGAGGAATCATCACTGATGCTACTAACTATGAAAAGGTGAAATCACTAGGTTTACCGGTGATAGTGTTAGGTGAAGAGAAGATAGAAGGAGCAGTAAACTGGAAAGATCTTCTAGAAGCAGGAGACAAATGCGGAGATACCGACAATGAAGAGATTCTTCAGACAGATCTTTGTGCACTTCCTTTTTCTTCAGGAACAACAGGATTACAAAAAGGAGTAATGCTCACACATCGCAATCTCATAGCCAATCTTTGCTCTACTCTCTTCGGTGTCAGGTCTGAAATGATCGGTCAGATCGTGACGCTTGGTTTGATCCCATTCTTTCATATTTACGGTATCGTTGGCATATGTTGTGCTACAATGAAGAATAAAGGCAAAGTTGTTGCTATGAGTCGGTACGATCTAAGGATTTTCTTGAATGCTTTGATTGCTCATGAGGTTTCGTTTGCGCCTATAGTTCCGCCGATTATATTGAATCTTGTTAAGAATCCGATAGTTGATGAGTTTGATCTTTCGAAGCTTAAACTTCAGTCTGTCATGACTGCTGCTGCTCCTTTAGCTCCTGAGCTTCTTACTGCCTTCGAAGCCAAGTTTCCTAATGTCCAAGTCCAAGAGGCTTATGGATTAACGGAGCATAGTTGCATTACGTTAACTCACGGAGATCCAGAGAAAGGACAAGGAATCGCGAAACGAAACTCGGTTGGTTTCATACTTCCGAATCTCGAGGTAAAGTTCATAGATCCTGACACCGGTAGATCACTCCCGAAGAACACTTCTGGTGAGCTATGTGTGAGGAGCCAATGTGTAATGCAAGGTTACTTCATGAACAAGGAAGAGACTGACAAGACAATTGATGAACAAGGTTGGCTTCACACAGGAGACATAGGTTACATCGATGATGATGGAGACATCTTCATCGTTGATCGTATCAAAGAACTTATTAAATACAAAGGTTTTCAGGTTGCTCCGGCCGAGCTTGAAGCTATTCTACTCACTCATCCATCCGTTGAAGACGTTGCCGTCGTGCCGTTACCGGACGAGGAAGCCGGGGAGATTCCGGCGGCTTGCGTGGTGATAAATCCGAAAGCGACAGAAAAGGAAGAAGACATTCTCAACTTTGTTGCAGCAAATGTGGCTCATTACAAGAAGGTTAGAGCCGTCCATTTTGTGGATTCAATCCCTAAATCTCTCTCTGGTAAAATCATGAGGAGGCTTCTTAGAGACAAGATCCTCAGCATCAACAAGAAGTAG
<210> 4
<211> 542
<212> PRT
<213> 拟南芥
<400> 4
MESQKQEDNEYIFRSLYPSVPIPDKLTLPEFVLQGVEEYTENVAFVEAVTGKAVTYGDVVRDTKRLAKALTSLGLRKGQVMVVVLPNVAEYGIIALGIMSAGGVFSGANPTALVSEIKKQVEASGARGIITDATNYEKVKSLGLPVIVLGEEKIEGAVNWKDLLEAGDKCGDTDNEEILQTDLCALPFSSGTTGLQKGVMLTHRNLIANLCSTLFGVRSEMIGQIVTLGLIPFFHIYGIVGICCATMKNKGKVVAMSRYDLRIFLNALIAHEVSFAPIVPPIILNLVKNPIVDEFDLSKLKLQSVMTAAAPLAPELLTAFEAKFPNVQVQEAYGLTEHSCITLTHGDPEKGQGIAKRNSVGFILPNLEVKFIDPDTGRSLPKNTSGELCVRSQCVMQDYFMNKEETDKTIDEQGWLHTGDIGYIDDDGDIFIVDRIKELIKYKGFQVAPAELEAILLTHPSVEDVAVVPLPDEEAGEIPAACVVINPKATEKEEDILNFVAANVAHYKKVRAVHFVDSIPKSLSGKIMRRLLRDKILSINKK。
Claims (5)
1.一种水稻温敏雄性不育基因，其特征在于，该基因具有下列核苷酸序列之一：
a.具有SEQ ID NO 1 所示的碱基序列；
b.与SEQ ID NO 1 所示的拟南芥基因的碱基序列的同源性最高，期望值达到1.8e-27，且编码相同生物学功能蛋白质的DNA序列。
2.一种根据权利要求1所述的水稻温敏雄性不育基因，其特征在于该蛋白具有下列氨基酸序列之一：
a.具有SEQ ID NO 2 所示的氨基酸序列；
b.通过将SEQ ID NO 2的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加而产生的衍生蛋白质的氨基酸序列，该衍生蛋白质与SEQ ID NO 2所示的拟南芥突变蛋白具有相同的生物学功能。
3.一种根据权利要求1所述的基因在控制水稻雄性育性中的作用。
4.一种根据权利要求1所述的基因在水稻两系法育种中的应用。
5.一种获得根据权利要求1所述的基因的方法，该方法的具体步骤为：利用Rice Genome Annotation Project网站所提供的BLAST软件比对该网站的基因数据库后，得到与ATMS1同源性最高的水稻基因OsATMS1,其Gene ID为LOC_Os04g24530，进而得到该基因的碱基序列及其编码蛋白的氨基酸序列。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN2010105994091A CN102121017A (zh) | 2010-12-22 | 2010-12-22 | 水稻温敏雄性不育基因、其编码蛋白及其应用 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN2010105994091A CN102121017A (zh) | 2010-12-22 | 2010-12-22 | 水稻温敏雄性不育基因、其编码蛋白及其应用 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN102121017A true CN102121017A (zh) | 2011-07-13 |
Family
ID=44249685
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN2010105994091A Pending CN102121017A (zh) | 2010-12-22 | 2010-12-22 | 水稻温敏雄性不育基因、其编码蛋白及其应用 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN102121017A (zh) |
Cited By (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN103098702A (zh) * | 2013-01-18 | 2013-05-15 | 西北农林科技大学 | 一种k型温敏雄性不育小麦的育种方法 |
| CN103098701A (zh) * | 2013-01-18 | 2013-05-15 | 西北农林科技大学 | 一种快速选育k型小麦温敏雄性不育系的方法 |
| CN106609280A (zh) * | 2015-10-09 | 2017-05-03 | 上海师范大学 | 花粉发育相关的酰基辅酶a连接酶或其编码基因的用途及培育植物不育系的方法 |
| CN109354617A (zh) * | 2018-12-10 | 2019-02-19 | 中国科学院东北地理与农业生态研究所 | 水稻环境条件性致死突变基因osesl1及其编码蛋白和应用 |
-
2010
- 2010-12-22 CN CN2010105994091A patent/CN102121017A/zh active Pending
Cited By (9)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN103098702A (zh) * | 2013-01-18 | 2013-05-15 | 西北农林科技大学 | 一种k型温敏雄性不育小麦的育种方法 |
| CN103098701A (zh) * | 2013-01-18 | 2013-05-15 | 西北农林科技大学 | 一种快速选育k型小麦温敏雄性不育系的方法 |
| CN103098701B (zh) * | 2013-01-18 | 2014-10-29 | 西北农林科技大学 | 一种快速选育k型小麦温敏雄性不育系的方法 |
| CN106609280A (zh) * | 2015-10-09 | 2017-05-03 | 上海师范大学 | 花粉发育相关的酰基辅酶a连接酶或其编码基因的用途及培育植物不育系的方法 |
| CN106609280B (zh) * | 2015-10-09 | 2020-09-11 | 上海师范大学 | 花粉发育相关的酰基辅酶a连接酶或其编码基因的用途及培育植物不育系的方法 |
| CN109354617A (zh) * | 2018-12-10 | 2019-02-19 | 中国科学院东北地理与农业生态研究所 | 水稻环境条件性致死突变基因osesl1及其编码蛋白和应用 |
| WO2020119359A1 (zh) * | 2018-12-10 | 2020-06-18 | 中国科学院东北地理与农业生态研究所 | 水稻环境条件性致死突变基因osesl1及其编码蛋白和应用 |
| CN109354617B (zh) * | 2018-12-10 | 2021-09-21 | 中国科学院东北地理与农业生态研究所 | 水稻环境条件性致死突变基因osesl1及其编码蛋白和应用 |
| US11339402B2 (en) | 2018-12-10 | 2022-05-24 | Northeast Institute Of Geography And Agroecology, Chinese Academy Of Science | Rice environmental conditional-lethal mutant gene oses11, encoding protein and use thereof |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN107266541B (zh) | 玉米转录因子ZmbHLH167及其应用 | |
| CN106520785B (zh) | 调控花青素合成与代谢的小麦新基因ThMYC4E | |
| AU4690093A (en) | Assessment of trans-acting factors allelic variation | |
| CN102121017A (zh) | 水稻温敏雄性不育基因、其编码蛋白及其应用 | |
| KR20130054482A (ko) | 포티바이러스 속 바이러스를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| CN113832244B (zh) | 莲dna品种分子鉴定的mnp核心引物组合及其应用 | |
| CN102108360B (zh) | 一种来源于荧光假单胞菌的epsp合酶基因及其应用 | |
| KR20130054481A (ko) | 식물 바이러스를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| CN102108363A (zh) | 来源于人苍白杆菌的epsp合酶基因及其应用 | |
| KR101650562B1 (ko) | Ｔｓｗｖ를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| KR101650564B1 (ko) | Ｒｄｖ를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| CN107326031B (zh) | 具有耐盐功能的基因DvRPT1、其编码蛋白及其应用 | |
| Moszer et al. | Multiple IS insertion sequences near the replication terminus in Escherichia coli K-12 | |
| CN106046138A (zh) | 鸭mef2b基因的编码序列及其克隆方法 | |
| KR101650555B1 (ko) | Ｃｃｍｖ를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| KR101650549B1 (ko) | Ｃｐｓｍｖ를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| KR20130054490A (ko) | Ｓｂｍｖ를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| KR101650556B1 (ko) | Ｐｓｖ를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| KR101650550B1 (ko) | ＰＳＴＶｄ를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| KR101650554B1 (ko) | Ｂｂｗｖ２를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| KR101650560B1 (ko) | Ｌｒｓｖ를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| KR101650561B1 (ko) | Ｔｒｖ를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| KR101648030B1 (ko) | Ｃｍｖ를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| KR101650551B1 (ko) | Ａｍｖ를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 | |
| KR20130054483A (ko) | 토바모바이러스 속 바이러스를 진단 또는 검출하기 위한 프로브 세트 및 이의 용도 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| C06 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| C10 | Entry into substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| C02 | Deemed withdrawal of patent application after publication (patent law 2001) | ||
| WD01 | Invention patent application deemed withdrawn after publication |
Application publication date: 20110713 |