CN101883782A - 衣原体抗原 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及编码来自衣原体(Chlamydia)物种的抗原的分离的核酸分子、包括此类核酸分子的载体和包括此类载体的宿主细胞。此外，本发明提供来自来自衣原体(Chlamydia)物种的抗原、以及其片段和变体、用于生产此类抗原的方法和用于生产表达此类抗原的细胞的方法。更具体地此类抗原由肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)生产或与由肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)引起的细菌感染相关。此外，本发明提供与此类抗原结合的抗体、生产此类抗体的杂交瘤细胞、用于生产此类抗体的方法、包括此类核酸分子、抗原、载体或抗体的药物组合物、此类核酸分子、抗原、载体或抗体在制备药物组合物上的用途、用于鉴定能够结合此类抗原或降低或抑制此类抗原的相互作用活性的拮抗剂的方法、用于诊断衣原体(Chlamydia)感染的方法和用于治疗或预防衣原体(Chlamydia)感染的方法。

Description

衣原体抗原
本发明涉及编码来自衣原体(Chlamydia)物种的抗原的分离的核酸分子、包括此类核酸分子的载体和包括此类载体的宿主细胞。此外，本发明提供来自来自衣原体(Chlamydia)物种的抗原、以及其片段和变体、用于生产此类抗原的方法和用于生产表达此类抗原的细胞的方法。更具体地此类抗原由肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)生产或与由肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)引起的细菌感染相关。此外，本发明提供与此类抗原结合的抗体、生产此类抗体的杂交瘤细胞、用于生产此类抗体的方法、包括此类核酸分子、抗原、载体或抗体的药物组合物、此类核酸分子、抗原、载体或抗体在制备药物组合物上的用途、用于鉴定能够结合此类抗原或降低或抑制此类抗原的相互作用活性的拮抗剂的方法、用于诊断衣原体(Chlamydia)感染的方法和用于治疗或预防衣原体(Chlamydia)感染的方法。
肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)(C.pneumoniae)为专性细胞内细菌，并认为是重要的人类病原体。其是医院和门诊环境中肺炎和上呼吸道疾病的通常原因，占成人中社区获得性肺炎病例的约7至10％(Montigiani，S.等，2002)。肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)感染还与其它呼吸道疾病例如支气管炎、鼻窦炎、哮喘性支气管炎、成人发作的哮喘(adult-onset asthma)和慢性阻塞性肺疾病(COPD；Murdin，A.D.等，2000)有关。重要的是，肺炎衣原体(Chlamydiapneumoniae)感染还与动脉粥样硬化和心血管疾病有关，其例如通过动脉粥样硬化斑块中肺炎衣原体的血清流行病学研究或检测来指示(Montigiani，S.等，2002)。
近来建议革兰氏阴性衣原体科(Chlamydiaceae)，不确定起源的科和衣原体目(Chlamydiales)的唯一成员，可以按照16S rRNA系统发生分为两个属，衣原体属(Chlamydia)和嗜衣体属(Chlamydophila)(Everett，K.D.等，1999)。根据该建议，在衣原体属(Chlamydia)中描述了三个物种：沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis)、鼠型沙眼衣原体(Chlamydia muridarum)和猪衣原体(Chlamydia suis)。建议将物种鹦鹉热衣原体(Chlamydia psittaci)、兽类衣原体(Chlamydiapecorum)和肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)重命名为鹦鹉热嗜衣原体(Chlamydophila psittaci)、兽类嗜衣原体(Chlamydophilapecorum)和肺炎嗜衣原体(Chlamydophila pneumoniae)。然而，两种属的细菌共有生物和生化性质。对于本发明，未使用新建议的命名法，但因为完整的原因，应该提到物种肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)和肺炎嗜衣原体(Chlamydophila pneumoniae)是相同的。
来自四种不同物种的7个衣原体科(Chlamydiaceae)基因组的测序已经证明在宿主范围和疾病上的显著差异可能由基因含量上的十分微妙的变化引起(Read，T.D.等，2003)。衣原体科(Chlamydiaceae)在真细菌中分类为十分独立的组，与浮霉状菌属(planctomyces)有非常弱的关系。因此，衣原体科(Chlamydiaceae)在真细菌内显示某些独特性质，特别是它们的发育周期和它们的膜的结构。它们具有独特的两阶段细胞周期：原体(elementary body)(EB)，小的细胞外形式，其附着至宿主并且被吞噬。随后，其在吞噬体中转化成复制的细胞内形式，网状体(reticulate body)。作为专性细胞内细菌，衣原体科(Chlamydiaceae)在真核细胞中依靠其能量储备和核苷酸库增殖；它们是哺乳动物和鸟类中各种疾病的原因。
物种沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis)为表征最好的。沙眼衣原体(C.trachomatis)由两种人类生物变种(biovar)组成：沙眼型和性病淋巴肉芽肿(LGV)型。过去归类为该物种的鼠和猪菌株现在属于单独的种(分别为鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)和猪衣原体(C.suis)。在两种沙眼衣原体(C.trachomatis)生物变种中的血清变型引起沙眼、性传播疾病、某些形式的哮喘和新生儿包涵体性结膜炎以及肺炎。沙眼型生物变种目前具有14种血清变型，并且感染主要限于粘膜的上皮细胞。其在取自患有颞颌关节疾病的患者的背部双层组织(posterior bilaminar tissue)中也检测到。LGV生物变种由四种血清变型组成，L1，L2，L2a和L3，其能够入侵淋巴组织。尽管沙眼型生物变种的特定菌株主要发现于眼睛感染中，沙眼型生物变种和LGV的其它菌株为生殖器进入感染的主要原因。应该提及LGV菌株为全身疾病的原因。从历史观点上说，沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis)微生物的表征仅在细胞培养物中一系列分离后，在1957年成功地进行。
物种鹦鹉热衣原体(Chlamydia psittaci)感染许多动物，特别是鸟类，并且传播给人类。其是非典型肺炎、肝和肾障碍、心内膜炎和结膜炎的原因。
兽类衣原体(Chlamydia pecorum)不感染人类，而是为反刍动物的病原体。
在1983年肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)被认为是人类病原体(Grayston，J.T.等，1986)。其后，对该细菌付出特别的关注，并且估计(Gaydos，C.A.等，1994)10％的肺炎，和5％的支气管炎以及鼻窦炎归因于肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)(Aldous，M.B.等，1992)。最近，该细菌与哮喘疾病和心血管损伤的发病机理的关系日益令人感兴趣。
血清学研究已经显示肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)感染在5至16岁之间的儿童中是常见的。比该年龄小，很少发现针对肺炎衣原体(C.pneumoniae)的抗体，最有效的数据指示儿童在约5岁开始血清转化。然后携带抗体的个体数目的增加与年龄相关直至20岁。因此，50％至70％的成人为抗体的携带者。由于随时间诱导抗体的持续性限于首次感染后3或最多5年，说明一生期间发生经常再感染。在8至16岁之间每年的血清转化率为约6至8％(Kuo，C.-C.等，1995)，15岁之前疾病的血清阳性率在两性之间是相同的。比该年龄大，在世界所有地区中男性比女性更经常地受感染。
这些衣原体(Chlamydia)感染地理上高度分布广泛遍及全世界(Tong，C.Y.等，1993)，最低感染率在北部发达国家例如加拿大和斯堪的纳维亚国家中观察到。相反，最高流行率在热带地区的欠发达国家发现，其中感染可能在5岁之前发生。对于肺炎衣原体(Chlamydiapneumoniae)人类是唯一已知的贮主，这可能是感染通过呼吸道分泌物的人对人的传播引起(Aldous，M.B.等，1992)。传播链还似乎是间接的(Kleemola，M.等，1988)，暗示存在由有效传播引起的感染和无症状携带者的可能性，这可以解释该疾病的高流行。这还与肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)可以在不利环境中存活达30小时的发现一致(Falsey，A.R.等，1993)，经在露天中的微生物的感染性在高相对湿度条件下快速降低。潜伏期为几个周，这比许多其它呼吸性病原菌显著更长。
由肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)引起的主要临床表现主要为呼吸道疾病。肺炎和支气管炎是最经常的，因为它们在临床上是明显的，并且可以鉴定感染原。病原体(etiologicagent)的分离是困难的，尽管成对的急性和康复期的血清需要使用抗体测试确认诊断。由肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)引起的无症状疾病可能有许多(例如Grayston，J.T.，1992)。其它症状例如鼻窦炎、化脓性中耳炎(Ogawa，H.et al.，1992)或咽炎已经描述，并且患有呼吸道损伤的感染与哮喘类似(Hahn，D.L.et al.，1991)。肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)还与结节病以及结节性红斑相关(Sundelof，B.et al.，1993)，并且已经描述了格林-巴利综合症(Guillain-Barrésyndrome)的一个病例(Haidl，S.et al.，1992)。肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)在赖特综合症(Reiter′s syndrome)中的参与也已经评价(Braun，J.et al.，1994)。
心血管疾病为西方世界国家中死亡的主要原因。由于在患有心脏病的患者中观察到的高抗体水平，首次怀疑肺炎衣原体(Chlamydiapneumoniae)与心血管疾病例如冠状动脉心脏病和心肌梗塞的发育的关系(例如Shor，A.等，1992)。此外，病理解剖学和微生物学研究能够在血管中检测肺炎衣原体(C.pneumoniae)。来自几个国家的研究还显示肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)感染与患者中的动脉粥样损伤有关(例如Grayston，J.T.等，1996)。这样还似乎细菌在晚期动脉粥样损伤比在早期损伤中更经常地出现，但是在无动脉粥样疾病的患者中未发现。因此动脉粥样斑块与肺炎衣原体(Chlamydiapneumoniae)的存在强烈相关是得到这些研究支持的。然而，该细菌在血管病理学中所起的作用尚未被界定。
对于肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)感染的治疗，仅存在有限的从受控的临床研究中获得的数据。与莱姆病和支原体感染类似并且由于肺炎衣原体(C.pneumoniae)的细胞内性质，需要长期的抗菌治疗。该长期的抗菌治疗需要从感染动脉的巨噬细胞和内皮细胞中根除肺炎衣原体(C.pneumoniae)。不同于青霉素、氨苄青霉素或硫酰胺，抗生素例如红霉素、四环素、强力霉素、氧氟沙星、克林沙星、环丙沙星、阿奇霉素、克林霉素和米诺环素显示针对肺炎衣原体(C.pneumoniae)的体外抗菌活性。然而，任何高剂量的治疗应该持续几个周以避免感染的复发。因此，现在优选使用两种新的大环内酯，克拉霉素和阿奇霉素，其扩散、生物利用度和半衰期允许较短和更好的耐受治疗。不幸的是，许多针对衣原体(Chlamydia)的传统治疗仍然失败，导致显著的复发率和发病率。因此在不存在基于临床研究结果的权威证据时，仍然需要肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)感染的有效且良好耐受的治疗，所述治疗还保护免受再感染。
非常重要的问题在于开发特异和敏感的诊断，其可以方便快速地执行，允许早期筛选该感染。肺炎衣原体(C.pneumoniae)感染的实验室诊断基于微生物的分离和培养、血清学和/或通过PCR的DNA检测。不幸的是，由于涉及在合适条件下的菌株收集、保存和贮存的困难，基于肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)培养的方法是缓慢的，并且需要相当多的专有技术(know-how)。
肺炎衣原体(C.pneumoniae)可以从来自患者的鼻咽或喉拭子、痰或胸水中分离。鼻咽似乎是用于分离的最佳位点(Block，S.等，1995)。分离时，有机体需要在组织培养物中生长。肺炎衣原体(C.pneumoniae)易于在衍生自呼吸道组织的细胞系中生长，特别是Hep-2和HL细胞系(Roblin，P.M.等，1992)。将试样培养72小时后，通过用肺炎衣原体(C.pneumoniae)物种-特异性或衣原体(Chlamydia)属-特异性荧光素-缀合的单克隆抗体染色来进行培养物确认。
衣原体(Chlamydia)的血清学诊断通常通过使用微免疫荧光测试进行。该方法基于抗体的显微检测，所述抗体对固定在载玻片上作为独特斑点的衣原体抗原特异。如果临床试样包含与抗原反应的抗体，则该检验被认为是阳性的。然后使用荧光素-缀合的二抗使该免疫反应可视化(Tuuminen，T.等，2000)。已经证明微免疫荧光测试为非常特异和敏感的方法，然而需要专门的荧光显微设备和完整的纯化有机体作为用于测试性能的抗原使得其不适用于在标准实验室中使用。
另一方面，基于抗原检测(酶联免疫检测(EIA)、直接荧光抗体测试(DFA))或基于核酸扩增(聚合酶链反应(PCR))的方法提供更适合用于实验室实践的测试。PCR似乎在开发用于检测肺炎衣原体(C.pneumoniae)的快速方法中是最有希望的技术。在文献中报道对于在临床试样中检测该病原体存在至少19种内部(in-house)PCR检验(Boman，J.等，1999)。然而，这些检验没有一种被标准化，或与培养方法相比已经充分地被验证，并且它们不是商业上可获得的或获得FDA批准。在这些方法中的主要变体包括以下方式：收集和加工试样、引物设计、核酸提取、扩增产物检测和鉴定。
因此，高度期望允许区分血清组之间、更不必说肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)物种之间的可信、敏感和方便的测试。这是更加重要的，因为肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)感染的症状缓慢地出现，并且不是所有与这些感染相关的病理学都已经鉴定出。此外，在这些感染和严重的慢性感染、哮喘和动脉粥样硬化之间怀疑有相关性。虽然已经开发基于抗原检测的敏感和特异性测试，仍然存在对于标准化的基于PCR的检测策略和测试的需要(Dowell，S.F.等，2001)。
衣原体感染经常是慢性和复发性的，暗示针对衣原体(Chlamydia)的保护性免疫是弱的并且不必须是杀菌性的或灭活的。目前没有针对衣原体感染的有效疫苗。虽然研究和开发的动物模型数量很高，所用的抗原尚未诱导充分的保护性免疫以导致人类疫苗的开发。
肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)生物学，该菌与其宿主的相互作用、特别是它们逃脱宿主的免疫防御，以及它们参与相关疾病的发育的更详细地理解，将允许更好的控制、治疗或预防衣原体(Chlamydia)诱导的疾病。因此必须使用允许开发新的预防性和治愈性治疗的新的分子工具，特异、有效和耐受的新的诊断方法和新的疫苗策略。这正好是本发明的目的。
疫苗可以包括各种不同的抗原。抗原的实例为完整-杀死的或减毒的有机体、这些有机体/器官的亚组分(subfractions)、蛋白质、或以它们的最简单形式，肽。抗原还可以以糖基化蛋白或肽的形式被免疫系统识别，并且可以为或包含多糖或脂质。可以使用短肽，因为例如细胞毒性T细胞(CTL)识别以短的，通常8-11个氨基酸长的形式、与主要组织相容性复合物(MHC)连接的肽的抗原。B细胞可以识别短至4-5个氨基酸的线性表位，以及三维结构(构象表位)。
为了获得持续的、抗原特异性的免疫应答，佐剂需要触发参与免疫系统所有细胞的免疫级联。首先，佐剂作用在所谓的抗原呈递细胞(APCs)上，但不限于其作用模式。这些细胞通常首先遭遇抗原，然后呈递加工或未修饰的抗原至免疫效应子细胞。还可以包括中间细胞类型。仅具有合适特异性的效应子细胞在产生的免疫应答中激活。佐剂还可以局部地保留抗原和可能共注射的其它因子。此外，佐剂还可以充当用于其它免疫细胞的化学引诱物或可以局部地和/或全身地充当用于免疫系统的刺激剂。
通过人类免疫系统针对衣原体(Chlamydia)产生并且在人类血清中存在的抗体指示抗原性蛋白的体内表达和其免疫原性。通过血清抗体识别的线性表位的识别可以基于短至4-5个氨基酸的序列。当然，其不必须意味着这些短肽能够在体内诱导给定的抗体。为此原因，所定义的表位、多肽和蛋白质在动物中(主要在小鼠中)就其诱导针对所选体内蛋白的T细胞和抗体的能力进一步测试。
作为专门细胞内寄生生物的肺炎衣原体(C.pneumoniae)具有独特的两阶段生命周期：较小的细胞外形式，感染性的、非复制的、代谢上相对惰性的原体(EB)；和较大的细胞内形式，感染性的、复制的、代谢上活性的网状体。EB附着至易感的宿主细胞，并通过吞噬作用摄入。在细胞内它们回复至网状体，并在宿主细胞裂解前在它们回复至EB前复制。尽管针对肺炎衣原体(C.pneumoniae)的保护的免疫相关性未良好地定义，使用如实地模拟人类感染重要方面的小鼠模型的研究指示特别是CD8+T细胞和IFN-γ对于小鼠中的保护是关键的(Wizel，B.等，2002)。此外，CD4+T细胞也可以是重要的，因为它们刺激B细胞增殖和分化成抗体分泌细胞。由于Th1型CD4+T细胞也可以产生IFN-γ，因此它们可以以几种方式有助于抗体-衣原体免疫性。由于肺炎衣原体(C.pneumoniae)残留在膜结合空泡，优选的抗原必须到达感染细胞的胞液，并且需要随后被CD8+T细胞识别为MHC I类-肽复合物。大多数之前报道的抗原-其似乎因此能够到达胞液-位于细胞表面(例如外膜蛋白)或被分泌(例如Murdin，A.D.等，2000；Wizel，B.等，2002)。已经显示肺炎衣原体(C.pneumoniae)肽特异性CD8+CTL及其可溶因子可以抑制体外衣原体生长(Wizel，B.等，2002)。除了T细胞-介导免疫应答之外，由B细胞表位诱导的针对细胞壁蛋白的抗体可以帮助T细胞-介导的免疫应答，和用作多种目的：它们可以抑制粘附、干扰养分吸收、抑制免疫逃避和促进吞噬作用(Hornef，M.等，2002)。针对分泌蛋白的抗体在中和它们作为毒素或致病性组分的功能上潜在地有益。还已知该菌通过分泌蛋白相互通信。针对这些蛋白的中和抗体将中断衣原体物质之间或内的生长-促进交叉通信。描述的试验方法基于使用从人类血清中纯化的通过肺炎衣原体(C.pneumoniae)特异诱导的抗体。由此通过基因组筛选鉴定的抗原显示在宿主中体内表达，以及能够诱导抗体应答。由于对于许多蛋白已经显示B细胞和T细胞表位位于相同的蛋白质，通过基因组筛选鉴定的最有希望的候选物可以进一步就诱导体内有效的T细胞应答评估。作为第一步骤，生物信息学分析已经用于鉴定计算的(in silico)有效T细胞表位，然后其可以在合适的感染的鼠模型中测试。这样本发明将免疫原性蛋白质的试验鉴定与T细胞表位的生物信息学预测组合，以提供针对有效疫苗的候选物，从而治疗或预防衣原体感染。
由于可能诱导针对人类抗原的交叉反应抗体的潜在风险，已经关心开发用于人类的失活的全细胞疫苗。因此，认为亚单位疫苗在预防由肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)引起的感染上具有最大的可能。
肺炎衣原体(C.pneumoniae)的三个分离株(AR 39，J138，CWL029)的完整基因组序列由各种机构确定(Ka lman，S.等，1999；Read，T.D.等，2000；Shirai，M.等，2000；还参见http://www.tigr.org/tigr-scripts/CMR2/CMRHomePage.spl)。虽然两个菌株AR 39和CWL029分别在美国在1987年之前和在日本于1994年分离，其序列高度同一性，指示在最近人类历史上的趋异。除了这三个肺炎衣原体(C.pneumoniae)菌株之外，已经确定两个沙眼衣原体(C.trachomatis)菌株，D/UW-3/CX(血清变型D)和HAR-13(Kalman，S.等，1999；Stephens，R.S.等，1998；Carlson，J.H.等，2005)，相关的鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)菌株MoPn(Read，T.D.等，2000)以及鹦鹉热衣原体(C.psittacl)的菌株(Read，T.D.等，2003)的序列。
以本发明为基础的课题在于提供用于开发针对由衣原体(Chlamydia)引起的感染的药物组合物例如疫苗的方法。更具体地，该课题在于提供来自衣原体(Chlamydia)的核酸分子或抗原，或其片段或变体的有效、相关和综合的组，其可用于制备所述药物组合物。另一课题在于提供用于生产抗原，其片段或变体的方法和手段。另一课题在于提供包括所述核酸或所述抗原的药物组合物。本发明的另一课题在于提供抗体、包括所述抗体的药物组合物、用于生产所述抗体的方法和所述抗体在制备药物制剂上的用途。此外，本发明的目的在于提供用于鉴定能够结合抗原，或其片段或变体的拮抗剂的方法，以及在于提供用于鉴定能够降低或抑制此类抗原与其相互作用伴侣的相互作用活性的拮抗剂的方法。本发明的另一课题在于提供用于诊断衣原体(Chlamydia)有机体感染的方法。以本发明为基础的另一课题在于提供治疗衣原体(Chlamydia)感染的方法，和提供用于免疫动物或人类的方法。
以本发明为基础的课题在一个方面通过编码抗原或其片段的分离的核酸分子而解决，包括选自以下的核酸序列：
a)与具有选自Seq ID Nos 1至98的核苷酸序列的核酸分子具有至少70％序列同一性的核酸分子，
b)与a)的核酸分子互补的核酸分子，
c)包括a)或b)的核酸分子的至少15个连续碱基的核酸分子，
d)在严紧杂交条件下与a)、b)或c)的核酸分子退火的核酸分子，和
e)要不是遗传密码的简并性，将与a)、b)、c)或d)中定义的核酸分子杂交的核酸分子。
在本发明的一个实施方式中，与Seq ID Nos 1至98的序列同一性为至少80％，更优选至少90％，仍更优选至少95％，96％，97％，98％，或99％，或最优选100％。
在一个实施方式中所述核酸为DNA。
在另一实施方式中所述核酸为RNA。
在另一实施方式中所述核酸分离自基因组DNA，所述基因组DNA优选来自衣原体(Chlamydia)物种，更优选来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，最优选来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
在本发明的一个实施方式中编码的抗原片段为其活性片段或活性变体。
在实施方式中所述核酸编码抗原或其片段，其包括或由来自以下的多肽或肽片段组成：肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
以本发明为基础的课题还通过包括如上所述的核酸分子的载体来解决。
在实施方式中，所述载体适合于由如上定义的核酸分子编码的抗原或其片段的重组表达。
本发明还涉及包括如上定义的载体的宿主细胞。
在另一方面以本发明为基础的课题还通过免疫学上与血清反应的抗原来解决，所述血清来自患有衣原体(Chlamydia)感染的人类或之前被衣原体(Chlamydia)感染的未感染的健康人类，其中所述抗原包括来自以下的分离的多肽或其活性片段或活性变体：衣原体(Chlamydia)，优选来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
如本文所用的术语“未感染的健康人类”包括具有多次遭遇病原体的那些个体，其可能导致定殖(colonization)，但其不会导致任何症状，或其导致轻度疾病。所述术语和就抗原鉴定选择未感染的健康人类的血清的基本原理进一步定义于Nagy，E.等(2003)。
本发明的另一方面涉及包括或由选自Seq ID Nos 99至196的分离多肽组成的抗原，或其活性片段或活性变体。
在本发明的实施方式中所述多肽由如上定义的核酸分子编码。
在另一实施方式中，所述抗原的活性片段由所述多肽，特别是由Seq ID Nos 99至196中任一个所定义的多肽的至少50％，特别是至少60％，优选至少70％，更优选至少80％，更优选至少90％，更优选至少95％，96％，97％或98％，最优选99％组成。
在实施方式中，所述抗原的活性变体与所述多肽，特别是由SeqID Nos 99至196中任一个所定义的多肽具有至少50％，特别是至少60％，优选至少70％，更优选至少80％，更优选至少90％，更优选至少95％，96％，97％或98％，最优选99％的序列同一性。
在本发明的一个实施方式中，所述抗原的活性片段包括或由SeqID No 123的氨基酸2-872、Seq ID No 124的氨基酸2-812、Seq IDNo 125的氨基酸2-514或516至1090、Seq ID No 127的氨基酸2-252、Seq ID No 128的氨基酸2-324、Seq ID No 130的氨基酸2-235、Seq ID No 131的氨基酸2-792、Seq ID No 132的氨基酸2-252、SeqID No 135的氨基酸8-245、Seq ID No 138的氨基酸2-393、Seq IDNo 139的氨基酸2-237、Seq ID No 140的氨基酸16-620、Seq ID No155的氨基酸2-287、Seq ID No 156的氨基酸27-231、Seq ID No 157的氨基酸2-550、Seq ID No 165的氨基酸2-644、Seq ID No 168的氨基酸2-343、Seq ID No 170的氨基酸2-325、Seq ID No 171的氨基酸2-458或Seq ID No 172的氨基酸31-379组成。
如上所列的片段进一步在各Seq ID Nos中定义；即，Seq ID No 123的氨基酸2-872与Seq ID No 99相同、Seq ID No 124的氨基酸2-812与Seq ID No 100相同、Seq ID No 125的氨基酸2-514与Seq ID No 101相同、Seq ID No 125的516至1090与Seq ID No 102相同、Seq ID No127的氨基酸2-252与Seq ID No 104相同、Seq ID No 128的氨基酸2-324与Seq ID No 105相同、Seq ID No 130的氨基酸2-235与Seq IDNo 106相同、Seq ID No 131的氨基酸2-792与Seq ID No 107相同、Seq ID No 132的氨基酸2-252与Seq ID No 108相同、Seq ID No 135的氨基酸8-245与Seq ID No 109相同、Seq ID No 138的氨基酸2-393与Seq ID No 110相同、Seq ID No 139的氨基酸2-237与Seq ID No 111相同、Seq ID No 140的氨基酸16-620与Seq ID No 112相同、Seq IDNo 155的氨基酸2-287与Seq ID No 114相同、Seq ID No 156的氨基酸27-231与Seq ID No 115相同、Seq ID No 157的氨基酸2-550与Seq ID No 116相同、Seq ID No 165的氨基酸2-644与Seq ID No 117相同、Seq ID No 168的氨基酸2-343与Seq ID No 118相同、Seq IDNo 170的氨基酸2-325与Seq ID No 120相同、Seq ID No 171的氨基酸2-458与Seq ID No 121相同或Seq ID No 172的氨基酸31-379与Seq ID No 122相同。
当三种鉴定的抗原氨基酸序列与整个开放阅读框(ORF)相同时，Seq ID No 103与Seq ID No 126相同；Seq ID No 113与Seq ID No 151相同；Seq ID No 119与Seq ID No 169相同。
在另一实施方式中，所述抗原的活性变体与Seq ID No 123的氨基酸2-872、Seq ID No 124的氨基酸2-812、Seq ID No 125的氨基酸2-514或516至1090、Seq ID No 127的氨基酸2-252、Seq ID No128的氨基酸2-324、Seq ID No 130的氨基酸2-235、Seq ID No 131的氨基酸2-792、Seq ID No 132的氨基酸2-252、Seq ID No 135的氨基酸8-245、Seq ID No 138的氨基酸2-393、Seq ID No 139的氨基酸2-237、Seq ID No 140的氨基酸16-620、Seq ID No 155的氨基酸2-287、Seq ID No 156的氨基酸27-231、Seq ID No 157的氨基酸2-550、Seq ID No 165的氨基酸2-644、Seq ID No 168的氨基酸2-343、Seq ID No 170的氨基酸2-325、Seq ID No 171的氨基酸2-458或Seq ID No 172的氨基酸31-379具有至少50％，特别是至少60％，优选至少70％，更优选至少80％，更优选至少90％，更优选至少95％，96％，97％或98％，最优选99％的序列同一性。
在另一实施方式中，所述抗原进一步由以下定义：
a)1至570个另外的氨基酸残基，优选1至500，1至400，1至300，1至250，1至200，或1至150，更优选1至100，更优选1至50，最优选1，2，3，4，5，10，20，30或40个另外的氨基酸残基至包括或由Seq ID No 125的氨基酸2至514组成的抗原的活性片段；或
b)1至510个另外的氨基酸残基，优选1至400，1至300，1至250，1至200，或1至150，更优选1至100，更优选1至50，最优选1，2，3，4，5，10，20，30或40个另外的氨基酸残基至包括或由Seq ID No 125的氨基酸516至1090组成的活性片段；或
c)1至25个另外的氨基酸残基，优选1，2，3，4，5，10，15，或20个另外的氨基酸残基至包括或由Seq ID No 172的氨基酸31-379组成的抗原的活性片段；或
d)1至20个另外的氨基酸残基，优选1，2，3，4，5，10，或15个另外的氨基酸残基至包括或由Seq ID No 156的氨基酸27-231组成的抗原的活性片段；或
e)1至10个另外的氨基酸残基，优选1，2，3，4，5，6，7，8，或9个另外的氨基酸残基至包括或由Seq ID No 140的氨基酸16至620组成的抗原的活性片段；或
f)1至5个另外的氨基酸残基，优选1，2，3，或4个另外的氨基酸残基至包括或由Seq ID No 135的氨基酸8至245组成的抗原的活性片段。
另外的氨基酸残基可以与如上定义的抗原是同源的。同源是指与片段衍生自其的衣原体(Chlamydia)抗原的氨基酸序列同一或类似的任何氨基酸残基。
作为选择或另外，多肽可以包括或由抗原、任选地如上定义的另外的序列和与抗原同源的至少一个氨基酸残基组成。
在本发明的实施方式中，所述抗原进一步包括或由与所述抗原同源的至少一个氨基酸残基、优选标记蛋白的氨基酸序列组成。
如上定义的另外的序列或氨基酸残基由氨基酸残基组成，其可为任何氨基酸，其可以为L-和/或D-氨基酸，无论天然发生的或其它。优选地所述氨基酸为任何天然发生的氨基酸，例如丙氨酸、半胱氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、苯丙氨酸、甘氨酸、组氨酸、异亮氨酸、赖氨酸、亮氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、脯氨酸、谷氨酰胺、精氨酸、丝氨酸、苏氨酸、缬氨酸、色氨酸或酪氨酸。
然而，该氨基酸还可以为修饰的或为非天然氨基酸。这些的实例为2-氨基己二酸、3-氨基己二酸、β-丙氨酸、2-氨基丁酸、4-氨基丁酸、6-氨基己酸、2-氨基庚酸、2-氨基异丁酸、3-氨基异丁酸、2-氨基庚二酸、2，4-二氨基丁酸、锁链素、2，2’-二氨基庚二酸、2，3-二氨基丙酸、N-乙基甘氨酸、N-乙基天冬酰胺、羟基赖氨酸、别-羟基赖氨酸、3-羟基脯氨酸、4-羟基脯氨酸、异锁链素、别-异亮氨酸、N-甲基甘氨酸、N-甲基异亮氨酸、6-N-甲基甘氨酸、N-甲基缬氨酸、正缬氨酸、正亮氨酸或鸟氨酸。此外，氨基酸可以进行修饰例如翻译后修饰。修饰的实例包括乙酰化、酰胺化、阻断、甲酰化、γ-羧基谷氨酸羟基化、糖基化、甲基化、磷酸化和硫酸化。如果超出一种另外的或异源氨基酸残基存在于肽中，氨基酸残基可以相互相同或不同。
特征“异源氨基酸”或“与抗原异源的氨基酸”是指任何氨基酸，其不同于位置与在衣原体(Chlamydia)、优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)的任何天然发生的蛋白中的抗原相邻的氨基酸。因此，包括至少一个或一种异源氨基酸的本发明的蛋白质是指这样的蛋白质，其不同于衣原体科(Chlamydiae)或其片段，优选肺炎衣原体、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)的任何天然发生的蛋白质。
在一种实施方式中，另外的氨基酸残基侧翼于抗原N-末端、C-末端或N-和C-末端。
在另一种实施方式中，另外的氨基酸残基侧翼于由以下定义的抗原：
a)Seq ID No 125的氨基酸2至514或其C-末端衍生的变体，或
b)Seq ID No 125的氨基酸516至1090、Seq ID No 135的8至245、Seq ID No 140的16至620、Seq ID No 156的27-231、Seq IDNo 172的31-379，或其N-末端衍生的变体。
在另一种实施方式中，抗原进一步包括或者由前导序列或分泌序列、用于纯化的序列，或者前蛋白序列组成。
以本发明为基础的课题在另一方面通过抗原解决，由此所述抗原包括如在表1的“预测的免疫原性aa”或“预测的II类-限制性T细胞表位/区域”或“鉴定的免疫原性区域(aa)的位置”栏中所示的核心氨基酸序列，由此更优选核心氨基酸序列选自以下：
Seq ID No 123的氨基酸20-28，32-40，45-56，85-96，102-118，120-130，132-154，158-172，174-181，193-202，208-221，228-241，250-259，274-283，285-291，296-309，317-324，328-339，348-354，383-391，402-412，418-428，443-455，467-482，484-490，519-525，545-557，568-582，601-606，613-638，646-656，661-676，687-694，706-724，741-766，776-782，789-798，812-822和847-869；Seq IDNo 124的氨基酸28-37，44-88，95-102，107-115，142-150，212-226，228-233，235-245，262-269，278-311，319-338，343-354，372-405，409-418，426-435，439-445，447-462，471-478，481-490，502-514，522-529，539-565，568-589，595-605，608-622，645-651，656-662，665-670，679-685，696-715，731-744，775-781和789-809；Seq IDNo 125的氨基酸6-14，21-44，52-70，74-93，106-132，136-157，162-168，174-184，186-223，232-248，250-262，264-270，278-284，303-324，342-348，352-357，409-415，423-442，444-454，458-478，480-494，499-509，514-521，529-538，541-559，561-575，582-605，611-619，630-638，647-665，672-683，696-719，727-739，748-791，800-806，815-822，848-855，860-868，876-884，891-896，898-950，956-962，971-980，995-1008，1036-1043，1045-1061和1069-1074；Seq ID No 126的氨基酸7-13，21-27，33-57，63-72，74-80，82-88，94-105，107-119，121-132，134-152，162-199，201-225，229-237，239-246，252-258，261-267，277-298，300-325，340-366，373-383和391-401；Seq ID No 127的氨基酸4-17，22-32，45-58，60-70，72-86，88-98，100-108，112-121，128-138，148-162，167-176，184-198，216-231和241-248；Seq ID No 128的氨基酸6-23，32-52，60-77，84-90，92-107，117-163，165-239，249-254，273-280和289-308；Seq ID No 129的氨基酸5-49，52-59，65-95，102-108，115-123，126-139，142-153，180-186，193-204，206-214，225-247，270-278，280-297，303-319，321-337，344-358，363-371，378-389，399-406和412-419；Seq I D No 130的氨基酸4-30，32-38，43-50，55-62，64-72，76-83，97-119，125-132，139-156，158-172，204-210和221-227；Seq ID No 131的氨基酸4-16，21-31，39-57，61-67，73-99，105-111，119-128，135-147，150-159，163-196，213-246，248-255，257-284，286-293，295-317，333-360，369-387，389-413，415-422，424-438，443-454，461-467，478-490，508-520，527-532，534-551，557-564，566-576，578-588，596-684，687-711，713-724，729-741，749-758和770-782；Seq ID No 132的氨基酸4-13，38-59，80-90，95-102，108-123，130-183，190-223和239-249；Seq ID No133的氨基酸4-13，27-38，43-48，53-74，82-100，104-110，112-137，147-154，169-179，184-192，196-223，234-249和252-262；Seq ID No 134的氨基酸7-36，45-50，52-92，103-125，129-138，140-154，163-176，178-188，194-203，207-222，230-239，244-297，299-314，324-332，335-343，361-368，370-404，409-416，426-443，451-456，459-469，477-493，496-513，515-522，529-535，540-546，549-561，578-586，588-596，609-628，636-645，659-665，668-687，708-724，726-739，761-770，788-795，818-825，842-869，872-883，887-897，905-972，976-984，988-998，1015-1030，1033-1051，1076-1082，1084-1107，1141-1151，1167-1180，1184-1189，1193-1205，1221-1228，1235-1254，1258-1305，1307-1314，1326-1335，1350-1369和1371-1395；Seq ID No 135的氨基酸4-14，22-32，48-61，63-71，79-111，119-145，147-167，179-186，188-201，217-223和227-235；Seq ID No 136的氨基酸14-29，31-38，50-56，68-74，81-89，108-118，125-138，144-151，167-175，215-228，252-262，272-279，281-288，322-344，358-374，386-395，406-418，426-441，455-465，485-490，513-519，521-528，538-543，548-555，558-574，577-583，585-596，608-624，636-643，665-672，680-686，699-707，715-730，747-755，775-786，812-818，824-841，856-868，892-899，930-946，963-972，979-984，1008-1015，1032-1038，1044-1050，1052-1060，1092-1110，1143-1148，1157-1181，1184-1196，1215-1222，1229-1244，1248-1255，1267-1272，1282-1295，1300-1311，1323-1329，1390-1396，1399-1407，1423-1431，1452-1458，1478-1484，1488-1501，1504-1511，1521-1551，1573-1599，1622-1641，1644-1663，1669-1675，1681-1688和1692-1711；Seq ID No 137的氨基酸7-33，39-47，53-66，72-104，117-126，132-138，146-154，160-167，182-188，199-213，259-270，283-289，291-308，314-326，328-334，352-358，364-370，372-379，407-417，424-445，461-475，477-485，488-497，510-516，539-553，567-581，589-595，668-687，697-707，709-731，733-752，756-765，772-780，797-827，845-852，860-876，884-891，896-903和915-922；Seq ID No 138的氨基酸17-23，26-34，36-42，45-51，53-63，69-79，89-97，106-119，146-161，175-184，186-201，217-244，252-265，268-278，280-294，304-315，324-340，343-351和353-374；Seq ID No 139的氨基酸17-27，34-40，47-65，68-112，114-126，133-148，150-157，163-187，190-204和207-234；Seq I D No 140的氨基酸4-16，20-42，60-66，75-108，112-117，131-138，148-153，157-174，201-206，213-228，235-243，246-259，266-271，295-301，311-316，331-337，344-353，364-377，383-389，405-412，452-458，470-487，491-505，508-517，540-555，557-565，576-587，593-603和612-617；Seq ID No 141的氨基酸7-14，18-25，30-35，43-48，82-98，102-111，139-149，165-185，189-197，203-219，231-236，268-277，291-301，303-311，315-330，332-340，344-354，365-374，381-400，404-409，419-426，431-441，457-467，469-475，481-490，556-562，605-613和649-655；Seq ID No 142的氨基酸4-15，23-32，48-67，76-83，86-94，97-105，107-120，127-136，180-185，206-212，251-257，313-322，325-331，340-353，374-381，397-403，407-413，420-432，450-457，471-483，492-503，505-515，519-530，539-548，558-579，602-611，625-633，636-643，650-656，658-666，677-683，686-694，707-714，716-730，745-763，765-786，791-830，841-857，864-870，873-885，887-895，912-919，921-938和940-949；Seq ID No 143的氨基酸4-32，34-61，65-75，81-91，99-106，121-132，150-156，162-170，174-182，189-196，201-214，230-236，239-246，276-285，287-295，301-310，335-354，366-383，390-398，408-433，439-445，466-478，499-519，525-544，550-555，572-580，589-603，624-633，648-655，659-671和677-682；Seq ID No 144的氨基酸5-29，42-60，72-77，114-143，151-157，162-174，177-182，185-193，233-251，266-274，279-298，301-308，321-335，338-365，378-386，388-396，401-407，412-434，439-459，475-480和499-505；Seq ID No 145的氨基酸4-26，28-34，57-64，75-81，95-100，126-141，144-150，158-163，200-210，216-221，243-249，291-309，326-339，363-369，380-389，396-403，410-422，436-455，485-498，516-525，541-576，608-619，635-641，664-674，683-692，697-703，707-723，737-749，760-765，775-808，827-839，851-859，869-875，877-884，886-906和910-927；Seq ID No 146的氨基酸4-29，43-48，56-66，70-82，93-102，107-113，127-152，159-164，179-184，201-207，216-224，231-239，244-250，262-269，291-305，307-313，333-340，368-374，379-387，414-422，432-438，440-461，487-498，518-524，539-548，557-567，610-615，644-651，667-675，681-693，709-718，721-726，734-758，780-817，833-843，856-865，872-879，893-900，902-908和913-921；Seq ID No 147的氨基酸4-22，58-73，85-106，115-129，139-145，170-181，185-191，199-204，242-249，270-276，293-303，332-339，353-359，387-392，424-439，459-472，532-538，555-563，593-604，631-636，654-659，679-686，689-705，718-733，740-751，756-771，789-796，798-805，834-842，851-856，885-894，922-930，934-947，953-960，963-975，983-988，1008-1019，1026-1038，1041-1083，1086-1098，1121-1157，1159-1166，1169-1182，1192-1207，1209-1216和1232-1260；Seq ID No 148的氨基酸5-12，38-50，70-91，109-157，169-182，185-191，205-229，234-251，262-279，287-314，321-331，335-351，356-364，366-373，377-383，386-394，396-415，417-429，437-448，456-467，490-496，504-512，518-530，533-543，545-555，577-586，603-610，617-628，635-662，670-682，689-699，713-719，724-741，745-769，779-784，790-808，816-850，866-879和894-905；Seq ID No 149的氨基酸6-23，26-31，35-99，108-120，134-146，154-167，171-178，183-189，194-203，206-212，241-250，252-270，278-298和302-338；Seq ID No 150的氨基酸21-26，31-37，42-92，100-127，131-149，182-188，190-214，216-231，249-257，264-289，305-326，332-342，348-357，360-368，379-385，387-393，396-410，421-427和435-452；Seq IDNo 151的氨基酸4-9，16-21，23-29，34-41，46-51，58-73，104-113，115-122，125-134和141-168；Seq ID No 152的氨基酸4-11，16-34，82-98，103-114，132-147，151-158，164-182，215-221，236-244，253-259，261-267，272-283和285-307；Seq ID No 153的氨基酸4-18，20-34，50-56，64-69，100-109，114-131，142-150和159-165；Seq ID No 154的氨基酸10-23，36-48，55-66，68-75，95-109，116-151，156-169，173-192，199-205，208-213，219-226，232-238，246-256，276-284，295-314，332-343，358-373，381-393，406-426，431-438，454-469，481-492，519-533，536-551，556-561，567-572，594-608，612-619，629-638，665-681，685-697，710-727，759-777和792-798；Seq ID No 155的氨基酸7-13，29-39，54-60，62-68，99-104，126-138，140-153，159-190，204-210，217-223，234-240，243-262和270-278；Seq ID No 156的氨基酸4-22，50-58，71-77，83-93，108-127，143-153，158-191，205-213和221-228；Seq ID No 157的氨基酸4-22，26-35，38-61，63-76，85-99，101-109，145-151，153-160，162-172，180-187，194-202，208-215，223-231，235-247，253-273，278-295，302-323，337-358，366-404，420-434，436-450，454-468，474-485，491-514，524-533和539-545；Seq IDNo 158的氨基酸7-30，35-45，53-70，78-105，120-127，129-143，151-158，162-193，208-216，219-249，252-258，277-308，311-321，323-347，359-364，375-385，389-395，401-409，414-420，436-449，467-474，491-507和513-519；Seq ID No 159的氨基酸12-22，27-35，38-53，60-81，87-94，96-113，115-136，144-172，189-196，208-237，239-251，258-265，272-292，296-305，319-331，351-371，378-389，404-425，428-436，443-448，458-477，501-513，535-541，547-554，557-565，574-584和590-598；Seq ID No 160的氨基酸10-30，36-46，56-67，78-105，116-124，126-142，146-160，166-172，186-198，207-224，249-256，278-289，297-304，307-315，318-350，352-367，373-388，395-413，427-438，444-455，457-472，482-490，495-501，512-522，529-535，537-552，572-580和589-620；Seq IDNo 161的氨基酸4-14，16-22，26-34，40-50，56-65，75-86，88-101，105-117，126-132，134-142，145-170，172-191，193-205，214-223，227-235，247-290，294-319，332-339，345-355，363-369，394-403，407-412，429-466，468-475，494-510，515-522，528-534，539-545，556-562，574-589，596-604，609-627，637-647，663-671，679-689，694-702，708-715，718-727，738-744，750-758，774-808，815-836，840-883，890-906，910-929，933-943，951-967，972-986，988-1027，1032-1041，1045-1058，1069-1079，1081-1102，1117-1123，1125-1143，1145-1168，1173-1178，1186-1199，1202-1209，1214-1220，1225-1242，1244-1251，1257-1266，1269-1275，1295-1313，1339-1345，1364-1377，1390-1410，1412-1431，1438-1459，1472-1499，1511-1537，1543-1549，1553-1560，1566-1579，1585-1609，1621-1632，1636-1665，1669-1718，1721-1730，1734-1761，1763-1787，1796-1802和1805-1823；SeqID No 162的氨基酸11-21，27-48，58-69，73-89，100-110，142-152，165-178，187-196，203-216，238-246，254-262，278-288，294-299，308-315，334-340，366-374，376-386，392-401，406-412，444-459，463-469，474-479，484-490，500-517，524-534，542-552，566-578，586-594，603-628，643-664，668-692，699-706，714-726，729-735，747-755，765-771，778-785，804-814，822-837，848-855，860-886，898-909，912-919，925-933，936-942，945-957，966-975，978-997，1015-1035，1045-1055，1066-1076，1082-1107，1141-1179，1193-1214，1240-1246和1252-1259；Seq ID No 163的氨基酸7-15，17-28，34-39，83-96，100-107，119-149，152-158，168-174，176-213，220-231，237-262，264-273，280-286，318-327，338-348，358-369，371-386，405-410，413-421，427-443，445-462，467-473，483-490，498-503，513-527，529-537，540-546和581-590；Seq IDNo 164的氨基酸4-16，18-24，57-69，121-140，151-157，159-166，175-183，206-212，261-272，276-283，285-305，321-327，343-350，352-367，383-389，410-416，424-435，448-455，45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 No 159的氨基酸36-49，59-70，100-113，121-130，147-155和351-360；Seq ID No 160的氨基酸17-28，291-300，340-352，362-371和387-396；Seq ID No161的氨基酸425-443；Seq ID No 162的氨基酸685-693，699-709，1065-1075和1147-1158；Seq ID No 163的氨基酸66-80，169-178，262-271，333-348，360-370和554-564；Seq ID No 164的氨基酸5-17，131-141，183-198和376-385；Seq ID No 165的氨基酸33-43，187-200，223-232，259-272，306-316，443-452和461-472；Seq IDNo 166的氨基酸62-70，141-161，224-238，297-305和339-354；Seq ID No 167的氨基酸12-22，82-94，186-194，371-382，434-447和580-589；Seq ID No 168的氨基酸27-38，56-38，77-102，174-185，259-270，298-309和319-331；Seq ID No 169的氨基酸10-18，28-51，59-68，127-138，167-177和338-347；Seq ID No 170的氨基酸52-67，86-98，127-138，144-167，227-237，282-296和307-319；Seq ID No 171的氨基酸1-18，124-137，244-258，298-310，324-343，368-384和431-450；Seq ID No 172的氨基酸9-25，75-88，104-116，121-133，180-197，215-227和324-338；Seq ID No 173的氨基酸234-244，336-346，457-468和1002-1012；Seq ID No 174的氨基酸3-18，332-340，445-454和580-591；Seq ID No 175的氨基酸251-270，342-352，380-405，407-417和443-451；Seq IDNo 176的氨基酸1-27；Seq ID No 177的氨基酸22-46，56-70，79-96，98-107和119-135；Seq ID No 178的氨基酸10-38；Seq ID No 179的氨基酸10-20和29-43；Seq ID No 180的氨基酸3-18；Seq ID No181的氨基酸8-19；Seq ID No 182的氨基酸5-22；Seq ID No 183的氨基酸7-34；Seq ID No 184的氨基酸21-34，61-72和74-92；Seq ID No 185的氨基酸5-14，21-34和42-54；Seq ID No 186的氨基酸4-32；Seq ID No 187的氨基酸1-9和38-55；Seq ID No 188的氨基酸4-12和20-30；Seq ID No 189的氨基酸20-42；Seq ID No190的氨基酸41-52，66-81和104-121；Seq ID No 191的氨基酸1-17；Seq ID No 192的氨基酸4-32；Seq ID No 193的氨基酸10-45；Seq ID No 194的氨基酸2-23；Seq ID No 195的氨基酸8-29，41-50和52-72；Seq ID No 196的氨基酸3-26；Seq ID No 123的氨基酸249-260；Seq ID No 124的氨基酸569-636；Seq ID No 125的氨基酸697-758和808-875；Seq ID No 126的氨基酸3-23；Seq ID No127的氨基酸139-199；Seq ID No 128的氨基酸20-89；Seq ID No 129的氨基酸168-178；Seq ID No 130的氨基酸112-182和167-216；Seq ID No 131的氨基酸518-538；Seq ID No 132的氨基酸31-105；Seq ID No 133的氨基酸119-187；Seq ID No 134的氨基酸34-43；SeqID No 135的氨基酸223-241；Seq ID No 136的氨基酸91-170，1369-1393和1423-1486；Seq ID No 137的氨基酸397-456；Seq IDNo 138的氨基酸32-48；Seq ID No 139的氨基酸5-66；Seq ID No 140的氨基酸271-367；Seq ID No 141的氨基酸270-279和621-632；Seq ID No 142的氨基酸146-221和782-847；Seq ID No 143的氨基酸216-283；Seq ID No 144的氨基酸245-264和367-374；Seq IDNo 145的氨基酸716-781；Seq ID No 146的氨基酸692-760；Seq IDNo 147的氨基酸1189-1244；Seq ID No 148的氨基酸446-462；SeqID No 149的氨基酸79-94和136-145；Seq ID No 150的氨基酸97-165；Seq ID No 151的氨基酸106-123；Seq ID No 152的氨基酸16-80；Seq ID No 153的氨基酸36-113；Seq ID No 154的氨基酸303-330；Seq ID No 155的氨基酸154-168；Seq ID No 156的氨基酸28-49；Seq ID No 157的氨基酸406-485；Seq ID No 158的氨基酸421-488；Seq ID No 159的氨基酸442-492和526-610；Seq IDNo 160的氨基酸194-207；Seq ID No 161的氨基酸1058-1076和1643-1700；Seq ID No 162的氨基酸1068-1077；Seq ID No 163的氨基酸228-287；Seq ID No 164的氨基酸786-836；Seq ID No 165的氨基酸306-370；Seq ID No 166的氨基酸259-277和298-320；Seq ID No 167的氨基酸498-506；Seq ID No 168的氨基酸138-205；Seq ID No 169的氨基酸247-293；Seq ID No 170的氨基酸61-74；SeqID No 171的氨基酸201-262；Seq ID No 172的氨基酸208-288；SeqID No 173的氨基酸938-1000；Seq ID No 174的氨基酸309-374；SeqID No 175的氨基酸36-109和375-388；Seq ID No 176的氨基酸10-21；Seq ID No 177的氨基酸71-134；Seq ID No 178的氨基酸5-26；Seq ID No 179的氨基酸21-36；Seq ID No 180的氨基酸1-10；SeqID No 181的氨基酸13-23；Seq ID No 182的氨基酸5-11；Seq ID No183的氨基酸22-32；Seq ID No 184的氨基酸11-72；Seq ID No 185的氨基酸4-18；Seq ID No 186的氨基酸13-26；Seq ID No 187的氨基酸8-77；Seq ID No 188的氨基酸5-27；Seq ID No 189的氨基酸4-18；Seq ID No 190的氨基酸30-45；Seq ID No 191的氨基酸4-16；Seq ID No 192的氨基酸12-25；Seq ID No 193的氨基酸37-48；Seq ID No 194的氨基酸4-21；Seq ID No 195的氨基酸18-44和SeqID No 196的氨基酸11-22。
在一种实施方式中，抗原进一步由以下组成：
a)1至50个另外的氨基酸残基，优选1至40，更优选1至30，更优选最多1至25，更优选最多1至10，最优选1，2，3，4或5个另外的氨基酸残基；和/或
b)与核心氨基酸序列同源的至少一个氨基酸序列。
所述另外的氨基酸残基进一步如上定义。
在另一实施方式中，所述氨基酸残基侧翼于核心氨基酸序列N-末端、C-末端或N-末端和C-末端。
在本发明的实施方式中，所述抗原包括如上定义的至少2，至少3，至少4，至少5或至少6个核心氨基酸序列。
以本发明为基础的课题在另一方面通过用于生产如本发明中定义的抗原，或其活性片段或活性变体的方法解决，包括表达如上定义的核酸分子。
本发明还涉及用于生产表达如上定义的抗原，或其活性片段或活性变体的细胞的方法，包括将合适的宿主细胞用如上定义的载体转化或转染。
在实施方式中，所述抗原或其活性片段或活性变体，分离自衣原体(Chlamydiae)、优选分离自肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C. pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选分离自肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
以本发明为基础的课题在另一方面通过药物组合物，优选疫苗来解决，其包括如上定义的抗原或活性片段或活性变体；或如上定义的核酸分子；或如上定义的载体。
本发明的另一方面提供药物组合物，优选疫苗，包括如上定义的抗原，或其活性片段或活性变体；或如上定义的核酸分子；或如上定义的载体，以用于治疗或预防衣原体(Chlamydia)、优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.tra chomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染。
在优选的实施方式中本发明的药物组合物还包括免疫刺激物质，优选聚阳离子聚合物(polycationic polymer)，特别是聚阳离子肽，免疫刺激寡脱氧核苷酸(ODNs)，特别是Oligo(dIdC)13，包含至少两个Lys LeuLys基序的肽，特别是KLKLLLLLKLK，神经活性化合物，特别是人类生长激素，明矾，弗罗因德(Freund)完全或不完全佐剂，或其组合。
在本发明药物组合物的更优选的实施方式中，免疫刺激物质为聚阳离子聚合物和免疫刺激脱氧核苷酸，或包含至少两个Lys LeuLys基序的肽和免疫刺激脱氧核苷酸的组合，优选KLKLLLLLKLK和Oligo(dIdC)13的组合。
在本发明药物组合物的更优选的实施方式中，聚阳离子聚合物为聚阳离子肽，特别是聚精氨酸。
本发明的另一方面还提供如上定义的抗原或其活性片段或活性变体，或如上定义的核酸分子，或如上定义的载体，以用于用于治疗或预防衣原体(Chlamydia)、优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染。
本发明的另一优选方面涉及如上定义的抗原或其活性片段或活性变体，如上定义的核酸分子，或如上定义的载体在用于制备治疗或预防衣原体(Chlamydia)、优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C. muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C. pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染的药物组合物，特别是制备疫苗上的用途。
以本发明为基础的课题在另一方面通过抗体，或至少其有效部分来解决，其结合至至少如上定义的抗原的选择性部分或其片段，优选其活性片段，或其变体，优选其活性变体。
在优选的实施方式中，所述抗体为单克隆抗体。
在另一优选的实施方式中所述有效部分包括Fab片段，F(ab)片段，F(ab)N片段，F(ab)2片段或Fv片段。
在本发明另一优选的实施方式中所述抗体为嵌合抗体。
在另一实施方式中所述抗体为人源化抗体。
在另一实施方式中所述抗体为IgA抗体。
本发明的另一方面涉及杂交瘤细胞系，其产生如上定义的抗体。
以本发明为基础的课题还通过产生如上定义的抗体的方法来解决，其特征在于以下步骤：
a)在非人动物中通过给药如上定义的抗原，或其活性片段或活性变体给所述动物来引发免疫应答，
b)从所述动物中除去包含抗体的体液，和
c)通过将所述包含抗体的体液进行进一步的纯化步骤来产生抗体。
本发明还涉及生产如上定义的抗体的方法，其特征在于以下步骤：
a)在非人动物中通过给药如上定义的抗原或其活性片段或活性变体给所述动物来引发免疫应答，
b)从所述动物中除去脾或脾细胞，和
c)产生所述脾或脾细胞的杂交瘤细胞，
d)选择和克隆对所述抗原或对所述活性片段或对其所述活性变体特异的杂交瘤细胞，
e)通过培养所述克隆的杂交瘤细胞产生抗体，和
f)任选地进行进一步纯化步骤。
本发明的另一方面涉及包括如上指出的抗体的药物组合物。
另一方面还涉及如上定义的抗体或包括如上定义的抗体的药物组合物，以用于治疗或预防衣原体(Chlamydia)、优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染。
以本发明为基础的课题在另一方面通过使用如上定义的抗体在制备治疗或预防衣原体(Chlamydia)、优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.tra chomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染的药物组合物上的用途来解决。
根据另一方面本发明提供拮抗剂，其结合或能够结合在本发明中所公开的抗原、或其活性片段或活性变体。根据另一方面，根据本发明的拮抗剂为能够降低或抑制根据本发明的抗原或其活性片段或其活性变体与其相互作用伴侣的相互作用活性的拮抗剂。在优选的实施方式中，此类相互作用伴侣为所述抗原或其活性片段或其活性变体的抗体或受体，优选生理学上的受体。
根据另一方面本发明提供用于鉴定能够结合如上定义的抗原或其活性片段或活性变体的拮抗剂的方法，包括：
a)使分离或固定的如上定义的抗原或其活性片段或活性变体与候选拮抗剂在允许所述候选拮抗剂与所述抗原或其活性片段或活性变体结合的条件下，在能够提供应答于所述候选拮抗剂与所述抗原或其活性片段或活性变体的结合的可检测信号的组分的存在下接触；和
b)检测应答于所述拮抗剂与所述抗原或其活性片段或活性变体的结合产生的信号的存在或不存在。
以本发明为基础的课题还通过用于鉴定能够降低或抑制如上定义的抗原或其活性片段或活性变体与其相互作用伴侣的相互作用活性的拮抗剂的方法来解决，包括：
a)提供如上定义的抗原，或其活性片段或活性变体，
b)提供所述抗原，或其活性片段或活性变体的相互作用伴侣，特别是如上定义的抗体，
c)使所述抗原，或其所述活性片段或活性变体与所述相互作用伴侣相互作用以形成相互作用复合物，
d)提供候选拮抗剂，
e)使所述候选拮抗剂和所述相互作用复合物之间出现竞争反应，
f)确定所述候选拮抗剂是否抑制或降低所述抗原或其活性片段或活性变体与所述相互作用伴侣的相互作用活性。
本发明还涉及任何如上定义的抗原或其活性片段或活性变体在分离和/或纯化和/或鉴定所述抗原或其所述活性片段或活性变体的相互作用伴侣上的用途。
本发明的另一方面涉及用于诊断衣原体(Chlamydia)有机体感染的方法，包括以下步骤：
a)使获自受试者的样品与如上定义的抗原或其活性片段或活性变体接触；和
b)检测样品中针对所述衣原体(Chlamydia)有机体的抗体的存在。
根据本方法的实施方式，针对所述衣原体(Chlamydia)有机体的的一种或多种抗体的存在指示衣原体(Chlamydia)感染。
在所述方法的另一实施方式中所述抗体为IgA抗体。
在另一方面本发明提供用于诊断衣原体(Chlamydia)有机体感染的方法，包括以下步骤：
a)使获自受试者的样品与如上定义的抗体接触；和
b)检测样品中所述衣原体(CHlamydia)有机体的抗原的存在。
在所述方法的实施方式中所述衣原体(Chlamydia)有机体的抗原为如上定义的抗原或其活性片段或活性变体。
根据所述方法的实施方式，所述衣原体(Chlamydia)有机体的一种或多种抗原的存在指示衣原体(Chlamydia)感染。
在所述方法的另一实施方式中所述抗体为IgA抗体。
另一方面还涉及用于诊断衣原体(Chlamydia)有机体感染的方法，包括以下步骤：
a)使获自受试者的样品与对如上定义的核酸分子，或其片段特异的引物或探针接触；和
b)检测样品中此类核酸分子或其片段的存在。
根据所述方法的实施方式，一种或多种所述核酸分子或其片段的存在指示衣原体(Chlamydia)感染。
本发明还提供用于体外诊断与根据本发明的抗原或其片段的表达有关的疾病的方法，包括确定编码根据本发明的所述抗原或其片段的核酸序列的存在，或确定根据本发明的抗原或其片段的存在。
在用于诊断衣原体(Chlamydia)有机体感染的任何上述方法的实施方式中，衣原体(Chlamydia)有机体为致病性衣原体(Chlamydia)有机体，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C. suis)，最优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C. trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
此外，本发明提供如本发明中定义的抗原，或其片段或变体在产生与所述抗原，或其片段或其变体结合的肽上的用途，其中所述肽为抗促成素(anticaline)。
此外，本发明提供如上定义的抗原，或其活性片段或活性变体在制备功能性核酸上的用途，其中所述功能性核酸选自适配子和镜像异构体(spiegelmer)。
在另一方面，本发明提供如上定义的核酸分子在制备功能性核糖核酸上的用途，其中所述功能性核糖核酸选自核酶、反义核酸和siRNA。
以本发明为基础的课题还通过用于在优选需要其的动物或人类中治疗衣原体(Chlamydia)感染的方法来解决，包括给药给所述动物或人类以治疗有效量的如任何之前方面所定义的抗原，或其活性片段或活性变体、或核酸分子、或载体，或抗体，或药物组合物。
在一个实施方式中所述衣原体(Chlamydia)感染为肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染。
以本发明为基础的课题在另一方面通过用于使动物或人类免疫衣原体(Chlamydia)有机体感染的方法来解决，包括给予所述动物或人类以有效量的如上定义的抗原，或其活性片段或活性变体、或如上定义的核酸分子、或如上定义的载体，或如上定义的抗体，或如上定义的药物组合物，其中所述有效量适合在所述动物或人类中引起免疫应答。
在用于使动物或人类免疫衣原体(Cglamydia)有机体感染的所述方法的实施方式中，所述衣原体(Chlamydia)有机体优选为肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选为肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
以本发明为基础的课题在另一方面通过用于针对衣原体(Chlamydia)有机体在动物或人类中刺激免疫应答的方法来解决，包括给予所述动物或人类以有效量的如上定义的抗原，或其活性片段或活性变体、或如上定义的核酸分子、或如上定义的载体，或如上定义的抗体，或如上定义的药物组合物，其中所述有效量适合在所述动物或人类中刺激免疫应答。
在用于针对衣原体(Chlamydia)有机体在动物或人类中刺激免疫应答的所述方法的实施方式中，所述衣原体(Chiamydia)有机体优选为肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选为肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
其中使用如在本发明中所定义的抗原的各种方法和用途，分别还可以使用此类抗原的片段，优选其活性片段，或此类抗原的变体，优选其活性变体(每一个都如优选地在本文所述)来进行或实施，这在本发明内。与根据本发明的抗原相互作用或靶向其的本文公开的各种化合物，可以另外地或备选地与所述抗原的活性片段或活性变体相互作用或靶向其，这也在本发明内。
在其中使用抗体的实践的每一方法和任何方法，原则上也可以当使用本文定义的抗促成素或功能性核酸代替抗体时实施，这也在本发明内，由此优选此类功能性核酸选自适配子或镜像异构体。这等效地适用于本申请的各种用途。
在优选的实施方式中本文公开的抗原的片段为显示此类抗原的至少一种特征的此类抗原的部分。优选此类特征为选自以下的特征：用于治疗感染的适合性、使包括人类的动物的免疫、和/或在包括人类的动物中刺激免疫应答。
与衣原体(Chlamydia)、特别是肺炎衣原体(C.pneumoniae)有关本文造成的任何公开还同样地适用于任何衣原体(Chlamydia)物种，这也在本发明内，由此衣原体(Chlamydia)物种优选为肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选为肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
术语“多肽”、“肽”、“蛋白质”或“抗原”在整个本说明书中可相互替换地使用，并且以综合的方式指根据本发明的抗原，包括每一个或任何其变体、片段、类似物或衍生物，特别本文所述的那些。在这个范围，无论何时术语多肽、肽、蛋白质或抗原在本文中使用，并且如果不明确地另外指出，各公开还涉及或关于根据本发明的任何抗原，包括每一个或任何其变体、片段、类似物或衍生物，特别本文所述的那些。还应该理解被根据本发明的术语多肽、肽、蛋白质或抗原覆盖的，与任何上述化合物相关描述的任何用途或方面应该还适用于被根据本发明的术语多肽、肽、蛋白质或抗原覆盖的，每一个和任何其它上述化合物。
本发明使用来自多个人类血浆池的抗体制剂以及衍生自肺炎衣原体(C.pneumoniae)的表面表达文库，有利地提供了有效、相关和综合的分离的核酸分子以及由其编码的抗原(包括其活性片段和活性变体)的组。这样，本发明满足了对于肺炎衣原体(C.pneumoniae)抗原、疫苗、诊断和产品的广泛迫切的需要，所述肺炎衣原体(C.pneumoniae)抗原、疫苗、诊断和产品在用于制备抗体和用于鉴定针对由以下引起的感染有效的化合物的方法中是有用的：致病性衣原体(Chlamydia)物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
有效的疫苗应该由蛋白质或多肽组成，其能够被所有菌株表达并且能够诱导高亲和力的、丰富的针对以下的细胞表面组分的抗体：所述致病性衣原体(Chlamydiae)，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。抗体应该为用于调理作用(opsonisation)的IgG1和/或IgG3，任何IgG亚型，和/或用于中和粘附或毒素作用的IgA。
肺炎衣原体(C.pneumoniae)通过呼吸道的粘膜上皮感染宿主，因此认为粘膜免疫性对于控制感染是重要的。IgA为在粘膜位置诱导的主要免疫球蛋白(Ig)亚型，并且认为在这些位置介导防御功能。
事实上，观察到IgA-缺陷小鼠比野生型小鼠更容易受感染(Rodriguez，A.等，2006)，表明局部IgA应答可能在针对肺炎衣原体(C.pneumoniae)感染的呼吸道感染的保护上起作用。
IgA可以在被肺炎衣原体(C.pneumoniae)感染后的患者中在血清和痰样品中都检测到(Ciarrocchi，G.等，2004)。因此，已经选择IgA抗体来鉴定本发明方法中的相关抗原。这样，通过IgA筛选鉴定的抗原，以及通过根据本发明方法产生的各IgA抗体良好地适合用作治疗或预防衣原体(Chlamydia)物种感染，特别是肺炎衣原体(C.pneumoniae)感染的药物组合物。
化学上定义的疫苗与全细胞疫苗(减毒的或杀死的)相比必须明确地较好，因为与人类组织交叉反应或抑制调理作用(opsonisation)的所述致病性衣原体(Chlamydia)，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)的组分，可以被消除，并且可以选择诱导保护性抗体和/或保护性免疫应答的个体多肽。
在本发明的优选实施方式中，核酸分子在其全长上与Seq ID No 1至98中提出的核苷酸序列显示70％的同一性。更优选的是包括在其全长上与Seq ID No 1至98中所示的核酸分子有至少80％或至少85％同一性的区域的核酸。在这点上，在其全长上与同样的具有至少90％，91％，92％，93％，94％，95％，或96％同一性的核酸分子特别优选。此外，高度优选具有至少97％的那些，特别高度优选具有至少98％和至少99％的那些，更优选具有至少99％或99.5％的，特别优选具有100％同一性的。此外，在该方面优选的实施方式为核酸，其编码抗原或其片段(多肽)，其基本上保留与在Seq ID No s 99至196中所示的成熟多肽相同的生物功能或活性。根据本发明的核酸分子编码优选为抗原的蛋白质，这也在本发明内。由Seq ID No s 99至196定义的分子为优选为抗原的蛋白质，这还在本发明内。
本领域所知和本文所用的同一性，为通过比较序列确定的两种或多种多肽序列或两种或多种多核苷酸序列之间的关系。在本领域，同一性还意味着多肽或多核苷酸序列之间的序列相关性的程度，因为该情形可以通过在此类序列的串之间匹配来确定。同一性可以容易地计算。由于存在许多方法测定两个多核苷酸或两个多肽序列之间的同一性，该术语对本领域技术人员是已知的(例如Sequence AnalysisinMolecular Biology，von Heinje，G.，Academic Press，1987)。确定同一性的优选方法被设计成给出测试的序列之间的最大匹配。确定同一性的方法在计算机程序中编码。确定两个序列之间的同一性的优选计算机程序方法包括，但不限于，GCG程序包(Devereux，J.等，1984)，BLASTP，BLASTN，and FASTA(Altschul，S.等，1990)。
作为通过称为Seq ID Nos 1至98的本文所述的核酸分子(其描述在本文中称为第一备选方案)的第二备选方案，根据本发明的核酸分子还可以为这样的核酸分子，其与符合本文的第一备选方案所述的核酸至少基本上互补。本领域技术人员将知道个体核酸分子与另一个体核酸分子至少基本上互补。如本文所用，互补是指核酸链与第二核酸链通过Watson-Crick碱基配对原则而碱基配对。如本文所用的基本上互补是指碱基配对不对于各链的所有碱基而发生，而是留下特定数量或百分比的碱基不配对或错误地配对。正确配对碱基的百分比优选为至少70％，更优选80％，更优选90％和最优选比90％更高的任何百分比。此类更高的百分比包括91，92，93，94，95，96，97，98，99和100％，由此此类限定适用于其中使用此类术语的本申请的各方面。应该注意认为70％百分比匹配的碱基为同源的，并且认为具有此种程度匹配碱基的杂交为严紧的。用于此类严紧杂交的杂交条件可以获自Current Protocols in Molecular Biology(John Wiley and Sons，Inc.，1987)。更具体地，杂交条件如下：
-例如在5x SSPE，5x Denhardt′s试剂(Denhardt′s reagent)，0.1％SDS，100g/mL剪切的DNA中在68℃下进行杂交
-在0.2x SSC，0.1％SDS在42℃下中等严紧洗涤
-在0.1x SSC，0.1％SDS在68℃下高严紧洗涤。
具有50％GC含量的基因组DNA具有约96℃的TM。对于1％错配，TM降低约1℃。
此外，本文所述的任何其它杂交条件原则上也是适用的。
当然，编码与本发明鉴定出的那些相同的多肽分子的所有核酸序列分子被任何公开的给定的编码序列包括，因为遗传密码的简并性直接适用于明确地确定编码给定多肽分子的所有可能核酸分子，即使此类简并的核酸分子的数目可能高。这还适用于给定抗原的活性片段或活性变体，只要所述片段或变体编码适合使用的抗原，以能够获得如同使用全长抗原的相同效果。优选地，此类抗原或其活性片段或活性变体可以用于接种应用，例如作为主动或被动接种。
作为第三备选方案，根据本发明的核酸分子还可以为这样的核酸，其包括根据如上所述依照本发明的第一或第二备选方案的核酸分子的核酸分子的至少15个碱基的伸长。优选地，所述碱基形成碱基的相邻伸长。然而，该伸长由两个或更多个通过一定数量碱基分开的部分组成，这也在本发明的范围内。
根据本发明的核酸分子优选由来自本文公开的序列的20，更优选至少30，特别至少50个相邻碱基组成。由于使用的目的领域(例如作为(PCR)引物，探针，捕获分子(例如在(DNA)芯片上)，等)，合适的长度易于优化。优选的核酸分子包含至少表1中列出的一种或多种免疫原性氨基酸序列的至少相邻的15个碱基部分。特别优选的是这样的核酸，其包含在本申请的序列策略中包含的任何序列的DNA序列的相邻部分，其与可获得的肺炎衣原体(C.pneumoniae)AR 39，CWL029，TW183和J138的基因组序列相比显示1个以上，优选超过2个，特别优选超过5个非同一的核酸残基(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/lproks.cgi，或http://pedant.gsf.de/，和http://cmr.tigr.org/)。特别优选的非同一的核酸残基为导致非同一的氨基酸残基的残基。优选地，核酸序列编码具有与上述出版或列出的肺炎衣原体(C.pneumoniae)配对物(counterpart)相比至少1，优选至少2，优选至少3个不同氨基酸残基的多肽、蛋白质或抗原。优选地，此类多肽、蛋白质或抗原仍具有至少一种本文公开的具有相同氨基酸残基的分子的特性。还优选的是此类分离的多肽，其为例如在序列表中本文公开的蛋白质或抗原的片段，具有至少6，7，或8个氨基酸残基并被本文所述的核酸编码。
作为第四备选方案，根据本发明的核酸分子，还可以为在严紧杂交条件下与根据本文公开的第一、第二或第三备选方案的本发明的任何核酸退火的核酸分子。严紧杂交条件典型地为本文所述的那些。
最后，作为第五备选方案，根据本发明的核酸分子还可以为要不是遗传密码的简并性，将与根据本文所述的第一、第二、第三或第四备选方案的本发明的任何核酸分子杂交的核酸分子。此类核酸分子是指以下事实：优选根据本发明的核酸编码根据本发明的抗原，或其片段或变体。此类核酸分子特别有用之处在于检测根据本发明的核酸分子并且从而诊断各微生物例如肺炎衣原体(C.pneumoniae)或任何致病性衣原体(Chlamydia)物种，特别是本文公开的那些致病性衣原体(Chlamydia)物种，以及其中涉及这些类微生物的任何疾病或疾病状况。优选地此类微生物，特别是机会主义的微生物，直接或间接引起此类疾病。优选地，杂交将在与本文所述第四备选方案有关所述的严紧条件下进行。
本文所述的核酸分子通常是指任何核糖核酸分子，例如mRNA或cRNA，或脱氧核糖核酸分子，包括例如，通过克隆或通过化学合成技术生产或通过其组合获得的cDNA和基因组DNA。核酸分子可以是未修饰的RNA或DNA或修饰的RNA或DNA。这样，例如，除了别的以外，本文所用的核酸分子是指单链和双链DNA、为单链和双链DNA的混合物的DNA，以及为单链和双链区域的混合物的RNA，包括DNA和RNA的杂交分子，所述DNA和RNA可以为单链，或更典型地，双链，或三链，或单和双链区域的混合物。此外，本文所用的核酸分子是指包括RNA或DNA或RNA和DNA二者的三链区域。在此类区域中的链可以来自相同的分子或来自不同的分子。所述区域可以衍生自一种或多种分子，但更典型地仅包括某些分子的区域。三螺旋区域的分子之一通常为寡核苷酸。单链DNA可以为编码链，也称为正义链，或其可为非编码链，也称为反义链。如本文所用，术语核酸分子包括如上所述包含一种或多种修饰碱基的DNA或RNA。这样，具有为了稳定性或为了其它原因修饰的主链的DNA或RNA为按照该术语在本文中所规定的核酸分子。此外，包括非常见碱基，例如肌苷(inosine)，或修饰的碱基，例如三苯甲基化碱基(仅列举两个实例)的DNA或RNA为按照该术语在本文中所规定的核酸分子。将意识到各种修饰可以对DNA和RNA进行，其对本领域技术人员已知的许多有用目的起作用。本文所用的术语核酸分子包括核酸分子的此类化学上、酶促地或代谢上修饰的形式，以及特征在于病毒和细胞的DNA和RNA的化学形式，包括简单或复杂的细胞等。术语核酸分子还包括通常被称为寡核苷酸的短核酸分子。本文“多核苷酸”和“核酸”或“核酸分子”通常可相互替换地使用。
在本发明中提供的核酸分子还包括许多独特的片段，其比本申请的序列表中提出的核酸分子序列，更具体地肺炎衣原体(C.pneumoniae)编码区域更长或更短，其可以通过标准克隆方法产生。为了独特起见，片段必须具有足够的大小以将其与其它已知核酸序列区分开，最容易通过将任何所选的肺炎衣原体(C.pneumoniae)片段与生物序列数据库例如GenBank中的核苷酸序列比较来确定。本领域技术人员将意识到在关于肺炎衣原体(C.pneumoniae)的本文所述的任何方面将同样地适合于任何其它本文所述的衣原体(Chlamydia)物种，更优选任何本文所述的任何致病性衣原体(Chlamydia)物种。
此外，修饰可以对本发明包括的核酸分子和多肽进行。例如，核酸还可以包括遗传密码的简并性的结果的序列。存在20种天然氨基酸，大多数被多于一种的密码指定。这样可以进行不影响由核酸编码的多肽的核苷酸取代。因此，本发明包括编码抗原或其片段的任何核酸分子。
此外，编码本发明提供的抗原或其片段的任何核酸分子可以使用标准技术例如标准克隆技术，功能上连接至任何所需的调控序列，无论是肺炎衣原体(C.pneumoniae)调控序列或异源调控序列、异源前导序列、异源标记序列或异源编码序列，以形成融合蛋白。
本发明还涉及本文所述核酸分子的变体，其编码序列表中提出的具有扣除(deducted)的肺炎衣原体(C.pneumoniae)氨基酸序列的抗原的片段、类似物及其衍生物或其片段。核酸分子的变体可以为天然发生的变体例如天然发生的等位变体，或其可为已知不是天然发生的变体。核酸分子的此类非天然发生的变体可以通过突变形成技术，包括应用到核酸分子、细胞或有机体的那些来进行。
在这点上的变体中为通过核苷酸取代、缺失或添加与前述核酸分子不同的变体。取代、缺失或添加可以包括一个或多个核苷酸。变体可以在编码或非编码区或二者都改变。在编码区的改变可能产生保守或非保守性氨基酸取代、缺失或添加。优选地为编码变体、类似物、衍生物或片段，或片段的变体、类似物或衍生物的核酸分子，其具有序列表中提出的肺炎衣原体(C.pneumoniae)序列，其中几个、少数、5至10、1至5、1至4、3、2、1或没有氨基酸以任何组合被取代、缺失或添加。这些中特别优选的是沉默取代(silent substitution)、添加和缺失，其不改变序列表中提出的肺炎衣原体(C.pneumoniae)多肽的性质和活性。在这点上还特别优选的是保守性取代。
本发明的核酸分子还可以用作用于例如RNA，cDNA和基因组DNA的杂交探针以分离编码本发明多肽的全长cDNA和基因组克隆，和以分离与本发明核酸分子具有高度序列相似性的其它基因的cDNA和基因组克隆。此类探针通常将包括至少15个碱基。优选地，此类探针将具有至少20，至少25或至少30个碱基，和可以具有至少50个碱基。特别优选的探针将具有至少30个碱基，以及将具有50个碱基或更少，例如30，35，40，45，或50个碱基。
例如，本发明核酸分子的编码区可以使用已知的DNA序列以合成寡核苷酸探针，通过筛选相关文库来分离。具有与本发明基因的序列互补的序列的标记的寡核苷酸然后用于筛选cDNA、基因组DNA或mRNA的文库，来确定该探针与文库的哪些成员杂交。
本发明的核酸分子和多肽将用作用于开发或制备药物组合物和/或诊断本文进一步讨论的疾病，特别是人类疾病的试剂和材料。
为寡核苷酸的本发明的核酸分子可用于本文所述的方法，但优选用于PCR，以确定本文鉴定的肺炎衣原体(C.pneumoniae)基因是否以全部或部分在感染组织例如皮肤、滑液或血液中存在和/或转录。意识到此类序列还将在诊断病原体导致的感染的阶段和感染的类型上具有用途。为这种和其它目的，可以使用阵列，所述阵列为在本领域已知的并且包括至少根据本文所述的本发明的核酸或多肽的至少一种。
根据本发明的核酸分子可用于检测核酸分子和包含这些核酸分子的有机体或样品。优选地，此类检测用于诊断，更优选用于诊断与衣原体(Chlamydiae)或衣原体(Chlamydia)属的任何其它病原体物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)的存在或丰度相关或有关的疾病的诊断。
被衣原体(Chlamydiae)或衣原体(Chlamydia)属的任何其它病原体物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C. muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染的真核生物(本文也称为“个体”)，特别是哺乳动物，以及特别是人类，可以通过检测通过各种技术在DNA水平检测的根据本发明的任何核酸分子来鉴定。可以获得用于将衣原体(Chlamydiae)或所述其它致病性衣原体(Chlamydia)从其它有机体区分开的优选的核酸分子候选物。
本发明提供用于诊断由衣原体(Chlamydiae)或衣原体(Chlamydia)属的任何其它病原体物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染引起的疾病的方法，包括从分离的样品或源自个体的样品确定具有本文公开的，更优选序列表中提出的核酸分子的序列的核酸分子表达的增加水平。核酸分子的表达可以使用本领域已知方法的任何一种测定以用于定量核酸分子，例如，比如，PCR、RT-PCR、核糖核酸酶保护、Northern印迹、其它杂交方法以及本文所述的阵列。
本文所用的分离是指“借助于人工”从其天然状态分离，即，如果其在自然中出现，其已经从其起始环境改变或除去，或二者。例如，如本文所用，以其天然状态天然地存在于活的有机体中的天然发生的核酸分子或多肽为未“分离”的，但是从其天然状态的共存材料中分离的相同核酸分子或多肽为“分离”的。作为分离的部分或分离后，此类核酸分子可以连接至其它核酸分子，例如DNA，用于突变形成，以形成融合基因，并且例如用于在宿主中增殖或表达。可以将分离的核酸分子，单独或与其它核酸分子例如载体连接，引入培养或完整有机体的宿主细胞。如本文所用的术语，引入培养或完整有机体的宿主细胞，此类DNA仍将是分离的，因为他们将不以其天然发生的形式或环境。类似地，核酸分子和多肽可以出现在组合物，例如用于将核酸分子或多肽引入细胞的培养基制剂、溶液；用于化学或酶促反应的组合物或溶液，例如，其不是天然发生的组合物，但其中仍保留如本文所用的该术语的意义内的分离的核酸分子或多肽。
该核酸可以例如通过本领域技术人员已知的方法从以下分离：衣原体(Chlamydiae)或衣原体(Chlamydia)属的任何其它病原体物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.tra chomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。同样地还适用于根据本发明的多肽。
优选地，本发明的核酸分子可以最初在体外形成，例如通过化学合成，或最初在细胞培养物中形成以及随后分离或纯化。通常，核酸可以借助于内切核酸酶和/或外切核酸酶和/或聚合酶和/或连接酶和/或重组酶通过核酸的操作或熟练从业者已知的其它方法来获得以产生核酸。
Seq ID Nos 1至98所定义的核酸序列以要插入载体的片段所包括的第一完整密码子起始，并且编码Seq ID Nos 99至196所定义的第一氨基酸。然而，对于重组产物另外的核酸可能是有用的或需要的，以促进克隆和表达。
本发明还涉及载体，其包括本发明的一个或多个核酸分子。载体可以另外地包括允许其在宿主细胞复制的核酸序列，例如复制的起点(origin)、一种或多种治疗性基因和/或选择标记基因和其它本领域已知的基因元件，例如指导编码蛋白的转录、翻译和/或分泌的调控元件。载体可以用于转导、转化或感染细胞，从而引起细胞表达除对细胞是天然的那些之外的核酸和/或蛋白质。载体任选地包括有助于实现核酸进入细胞的材料，例如病毒颗粒，脂质体、蛋白涂层等。
本发明还涉及被本发明载体遗传上操纵的宿主细胞，以及通过重组技术产生根据本发明的多肽。
各种表达载体可用于表达根据本发明的多肽。通常，在这点上，在宿主中适合保持、增殖或表达核酸以表达多肽的任何载体可以用于表达。根据本发明的这方面，载体可以为例如质粒载体，单链或双链噬菌体载体，单链或双链RNA或DNA病毒载体。本文公开的起始质粒可商业上获得、公众可获得或可以从获得的质粒通过已知的出版的方法的常规应用构建。在某些方面，载体中优选的为用于表达根据本发明的核酸分子和多肽的那些。在宿主细胞中的核酸构建体可以以传统的方式用于生产由重组序列编码的基因产物。作为选择，根据本发明的多肽可以通过传统的肽合成仪合成地生产。成熟蛋白可以在合适的启动子的控制下在哺乳动物细胞、酵母、细菌或其它细胞中表达。无细胞翻译系统也可用于使用从本发明的DNA构建体衍生的RNA生产此类蛋白。
宿主细胞可以被遗传上操作以引入核酸分子和表达本发明的核酸分子。合适宿主的代表性实例包括细菌细胞，例如链球菌(streptococci)、葡萄球菌(staphylococci)、大肠杆菌(E.coli)，链霉菌(streptomyces)和枯草杆菌(Bacillus subtilis)细胞；真菌细胞例如酵母细胞和曲霉菌(Aspergillus)细胞；昆虫细胞例如果蝇(Drosophila)S2和草地贪夜蛾(Spodoptera)Sf9细胞；动物细胞例如CHO，COS，HeLa，C127，3T3，BHK，293，Vero，PER.
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和人黑色素瘤(Bowes melanoma)细胞；以及植物细胞。
宿主细胞可以被转染，例如通过传统的方法例如用至少一种包含在转录调控序列的控制下的本发明核酸的表达载体电穿孔。
根据本发明的另一方面，提供综合性的新多肽的组。本文之前所述的此类多肽，为本文公开的抗原或其片段，优选其活性片段，及其变体，优选其活性变体。优选地，根据本发明的多肽为抗原或其片段。在本发明的优选实施方式中，提供包括氨基酸序列的抗原，所述氨基酸序列优选由本文公开的任何一种核酸分子及其片段编码。在本发明另一优选的实施方式中，提供新的蛋白质和抗原和其活性片段以及活性变体的组，其包括选自Seq ID Nos 99至196的氨基酸序列。
由本发明提供的根据本发明的多肽，即抗原，优选包括在序列表中提出的任何多肽或分子，以及以下多肽：其与根据本发明的此类多肽具有至少70％同一性，优选与根据本发明的此类多肽具有至少80％或85％同一性，更优选与根据本发明，更优选如在序列表中提出的此类多肽有至少90％相似性(更优选至少90％同一性)，仍更优选与根据本发明的此类多肽具有至少95％，96％，97％，98％，99％或99.5％相似性(仍更优选至少95％，96％，97％，98％，99％，或99.5％同一性)，并且还包括此类多肽的部分，所述该多肽的此类部分通常包含至少4个氨基酸，更优选至少8，更优选至少30，更优选最多50个氨基酸，例如4，8，10，20，30，35，40，45或50个氨基酸。在优选的实施方式中此类部分为根据本发明的多肽的活性片段。
本发明还涉及根据本发明多肽的片段、类似物及衍生物。当指其氨基酸序列是优选在序列表中提出的此类多肽时，术语“片段”，“衍生物”和“类似物”是指这样的多肽，其基本上保持与此类多肽相同或相似的生物活性。本领域技术人员将承认本文所用的术语“相似的生物活性”依赖于考虑中的多肽，以及更具体地其功能。本文所用的术语“生物活性”进一步如下定义。更优选地，相似的生物功能和活性在活性、亲和力、免疫原性、稳定性和/或特异性的程度方面不同于非片段或非衍生物的功能。在优选的实施方式中差异低于50％，低于75％或低于90％。
在实施方式中根据本发明的多肽的片段、衍生物、变体或类似物为1)其中一个或多个氨基酸残基被保守性或非保守性氨基酸残基(优选保守性氨基酸残基)取代并且此类取代的氨基酸残基可以或可以不为由遗传密码编码的氨基酸残基的那些，或2)其中一个或多个氨基酸残基包括取代基的那些，或3)其中根据本发明的多肽或其片段与另一化合物，例如增加根据本发明的多肽或其片段的半衰期的化合物，例如比如聚乙二醇融合的那些，或4)其中另外的氨基酸融合到根据本发明的多肽或其片段，例如前导或分泌序列，或用于纯化根据本发明的多肽或其片段的序列，或前蛋白序列的那些。相信此类片段、衍生物、变体和类似物从本文教导下在本领域技术人员的范围内。
本发明还涉及不同衣原体(Chlamydia)物种，优选致病性衣原体(Chlamydia)物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)的蛋白质或抗原，其优选是同源的。此类同源物可以易于基于本文公开的核酸和氨基酸序列分离。
迄今为止对于每一病原体存在多种可区分的血清型、基因型或临床菌株，并且分型基于血清型特异的抗血清或分子方法。因此任何抗原的存在可以就每一血清型、基因型或菌株来确定。各种血清型对不同衣原体(Chlamydia)感染的贡献在不同年龄组特别是地理区域中变化。最有价值的保护性抗原在各种临床菌株中需要是保守的，这是重要的方面。
此外，包括此类抗原、变体、类似物、衍生物或其片段，或片段的变体、类似物或衍生物的融合多肽，也被本发明包括。此类融合多肽和蛋白，以及编码其的核酸分子，可以使用标准技术，包括用于生产和表达编码融合蛋白的重组多核酸的标准重组技术易于获得。
在本发明在另一实施方式中，如上定义的肽可以通过各种化学技术修饰来产生具有与未修饰的肽基本上相同活性(如上定义对于片段和变体)，以及任选地具有其它所需性质的衍生物。例如，蛋白质的羧酸基团，无论C末端或侧链，可以以药学上可接受的阳离子的盐或酯化以形成酯，或转换成酰胺的形式提供。肽的氨基，无论氨基末端或侧链，可以为药学上可接受的酸加成盐，例如HCl、HBr、乙酸、苯甲酸、甲苯磺酸、马来酸、酒石酸和其它有机盐的形式，或可以转换成酰胺。肽侧链的羟基可以使用公知的技术转换成烷氧基或酯。肽侧链的苯基或酚环(phenolic rings)可以被一种或多种卤素原子，例如氟、氯、溴或碘取代，或被烷基、烷氧基、羧酸或其酯，或此类羧酸的酰胺取代。巯基可以用许多公知的保护基团的任何一种，例如乙酰胺基团保护。
在这点上还特别优选的是变体、类似物、衍生物和片段，以及片段的变体、类似物和衍生物，其具有本文所公开，优选在序列表中提出的根据本发明的任何多肽的氨基酸序列，其中几个、少数、5至10、1至5、1至4、3、2、1或没有氨基酸残基以任何组合被取代、缺失或添加。这些中特别优选的是沉默取代、添加和缺失，其不改变本发明肽的性质和活性。在这点上还特别优选的是保守性取代。最高度优选的是具有序列表中提出的没有取代的氨基酸序列的肽。
在本文公开的其各种实施方式中任何抗原的变体，特别是Seq IDNos 99至196规定的抗原和肽，可以典型地借助于生物信息学来表征。各工具例如NCBI Basic Local Alignment Search Tool(BLAST)(Altschul，S.等，1990)可以从几种来源获得，包括国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information)(NCBI，Bethesda，MD)和在因特网上，以连同序列分析程序blastp，blastn，blastx，tblastn和tblastx一起使用。为了比较至少35氨基酸的氨基酸序列，使用NCBI Blast 2.0的Blast 2序列功能，使用设定为默认参数的默认的BLOSUM62矩阵(matrix)(空位的blastp；空位存在成本(gap existence cost)11，以及每残基空位成本(per residuegap cost)为1)。当比对短肽(低于约35个氨基酸)时，将使用Blast 2序列功能，使用设定成默认参数(开放的空位(open gap)9，延伸空位(extension gap)1罚分)的PAM30矩阵。用于在此类短窗口例如15个氨基酸或更少上确定序列同一性的方法描述于由在马里兰的贝塞斯达(Bethesda)的国家生物技术信息中心维护的网址(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)。
抗原的活性变体通过在抗原上的序列改变而获得，如果不明确地指出相反，包括其每一和任何变体、片段、类似物或衍生物，其中具有序列改变的根据本发明的多肽保持未改变的根据本发明的多肽的功能，例如具有与完整抗原所展示的相似的生物活性，包括例如在衣原体(Chlamydia)感染的小鼠模型中诱导免疫应答和/或显示保护免受衣原体(Chlamydia)有机体的能力。合适的小鼠模型为，例如，如在Yang，Z.P.等.(1993)中所述的肺炎的小鼠模型；如Little，C.S.等(2004)所述的阿耳茨海默疾病(Alzheimer’s disease)的小鼠模型；Ma rangoni，A.等(2006)所述的原发性胆汁性肝硬化的小鼠模型；和/或Hauer，A.D.等(2006)所述的动脉粥样硬化的小鼠模型。
保留未改变的根据本发明的多肽的功能的另一实例为抗原的活性变体与多肽特异性抗体特异性结合，所述抗体结合根据本发明的多肽的未改变形式。提到“生物功能”或“生物活性”优选指多肽在其中天然地发生的细胞或有机体中的多肽的功能，即使该功能对于细胞和有机体的生长或存活分别是不需要的。例如，孔蛋白的生物功能允许在细胞外基质中存在的化合物进入细胞。该生物功能不同于抗原性功能。根据本发明的多肽可以具有超过一种生物功能。
此类变体的序列改变可以包括，但不限于，保守性取代、缺失、突变或插入。优选的变体为不同于保守性氨基酸取代所指的那些。保守性取代为在根据本发明的多肽中给定的氨基酸被类似性质的另一氨基酸取代的那些，即发生在其侧链和化学性质相关的氨基酸家族内的那些取代。此类家族的实例为具有碱性侧链、具有酸性侧链，具有非极性脂肪性侧链、具有非极性芳香性侧链、具有不带电的极性侧链、具有小侧链、具有大侧链等的氨基酸。典型看作保守性取代的是脂肪性氨基酸Ala，Val，Leu和Ile中一个对另一个的置换；羟基残基Ser和Thr的相互交换；酸性残基Asp和Glu的交换，酰胺残基Asn和Gln之间的取代，碱性残基Lys和Arg的交换，以及芳香性残基Phe和Tyr中的置换。
在一种实施方式中，一种保守性取代包括在肽中。在另一种实施方式中，两种保守性取代或更少包括在肽中。在另一实施方式中，三种保守性取代或更少包括在肽中。
保守性氨基酸取代的实例包括，但不限于，以下列举的这些：
Figure G2008800221257D00511
优选地，活性变体显示与患有衣原体(Chlamydia)感染的患者的人类血清的反应性，更优选介导血清转化，最优选显示杀菌活性。活性变体的这些特性可以例如按照实施例中具体地评估。在本发明的上下文中，变体特异性结合特异性抗体(优选针对动物例如小鼠、兔中的重组蛋白产生的多克隆抗体或在小鼠中产生的单克隆抗体)，显示与来自患有衣原体(Chlamydia)感染的患者的人类血清的反应性，介导血清转化或显示杀菌活性，如果变体的活性总计为没有序列改变的抗原的活性的至少10％，优选至少25％，更优选至少50％，更优选至少70％，更优选至少80％，特别是至少90％，特别是至少95％，最优选至少99％。
所述活性变体包括天然发生的等位变体，以及突变体或任何其它非天然发生的变体。在本领域已知，等位变体为(多)肽的改变形式，如上所述，其特征在于具有基本上不改变多肽的生物功能的一个或多个氨基酸的取代、缺失或添加。
在生活世界的任何物种内，等位变体为常规的。例如，任何细菌物种，例如肺炎衣原体(C.pneumoniae)，通常由相互不同之处在于微小的等位变化的各种菌株(特征在于克隆繁殖)代表。实际上，在不同菌株中履行相同生物功能的多肽可以具有在每一菌株中不相同的氨基酸序列。此类等位变化同样地反映在核苷酸水平。
等位变化对于外膜蛋白A在所述的衣原体(Chlamydia)物种内非常常见(Brunelle，B.W.等，2006)。
在优选的实施方式中，通过氨基酸交换、缺失或插入衍生自根据本发明的多肽的活性变体或活性片段还可以保持，或更优选改进活性(如本文定义的反应性、血清转化和/或杀菌活性)。此外，这些多肽还可以包括表位，其触发相同或优选改进的T细胞应答。如本文进一步定义，这些表位称为”异变的(heteroclitic)”。它们对MHC/HLA分子具有类似的或优选更高的亲和力，以及以类似或优选更强的方式刺激针对起始表位的T细胞受体(TCR)。异变表位可以通过合理设计获得，即例如Rammensee H.等(1999)所述，考虑个别残基对结合MHC/HLA的贡献，结合可能与TCR相互作用的残基的有规则交换，用具有针对起始表位的T细胞测试所得的序列。此类设计对于本领域技术人员无需过度试验即是可行的。
在本发明更优选的实施方式中，根据本发明的多肽的活性变体为任何本文公开的多肽，更具体地为由Seq ID Nos 99至196定义的任何多肽，其与任何所述Seq ID Nos 99至196的多肽具有至少50％的序列同一性，特别与任何所述Seq ID Nos 99至196的多肽具有至少60％，优选至少70％，更优选至少80％，更优选至少90％，更优选至少95％，96％，97％，98％，最优选99％的序列同一性，和/或通过如上定义的保守性取代衍生自Seq ID Nos 99至196的任何序列的所述多肽。
根据本发明的多肽、其片段或变体还包括或由修饰的表位(modified epitope)以及编码此类修饰表位的核酸序列组成，其中优选给定表位的一种或两种氨基酸根据在例如，Tourdot，S.等，(2000)中公开的规则修饰或取代。由根据本发明多肽呈现的表位本文还称为呈递表位(或称“本发明的表位”)。
通过氨基酸交换衍生自呈递表位的，改进、保持或至少不显著地阻碍表位的T细胞激活能力的表位，也包含在根据本发明的表位中，这是明显的。因此，呈递表位还包括这样的表位，其不包含衍生自肺炎衣原体(C.pneumoniae)的起始序列，但是触发相同或优选改进的T细胞应答。这些表位还称为″异变的″，它们需要具有类似的或优选更高的与MHC/HLA分子的亲和力，并且需要以类似或优选更强的方式刺激针对起始表位的T细胞应答(TCR)。
用于鉴定表位特别是异变的表位的另一种可能包括用针对一种或几种呈递表位的T细胞筛选肽文库。优选方式为合成肽文库的位置扫描。此类方法已经例如由Hemmer，B.等，(1999)和其中给出的参考文献具体地描述。
作为由本文公开的本发明衍生的氨基酸序列或异变表位代表的表位的备选方案，模拟这些表位的本文也称为″拟肽(peptidemimetica)″或″反向释放肽(retro-inverse-peptides)″的物质或化合物也可使用并且从而在本发明内。
改进表位的设计的另一方面为其用增加其刺激T细胞的能力的物质的配制或修饰。这些包括T辅助细胞表位、脂质或脂质体或优选如在WO 01/78767中公开的修饰。
增加表位的T细胞刺激能力的另一方式为其用免疫刺激物质的配制，所述免疫刺激物质例如细胞因子或趋化因子如白介素-2，-7，-12，-18，I类和II干扰素(IFN)，特别是IFN-γ，GM-CSF，TNF-α，flt3-配体和其它。
根据本发明的多肽优选以分离的形式提供，优选纯化成同质的。
在本发明的另一实施方式中变体为片段。片段的特征在于通过一个或多个氨基酸缺失衍生自如上定义的抗原。缺失可以为C-末端、N-末端和/或内部的。优选片段通过最多10，20，30，40，50，60，80，100，150或200，更优选最多10，20，30，40或50，更优选最多5，10或15，更优选最多5或10，最优选1，2，3，4或5个缺失来获得。本发明的活性片段的特征在于具有与完整抗原显示的类似的生物活性，包括例如如上所述诱导免疫应答和/或显示保护免受例如在衣原体(Chlamydia)感染的小鼠模型中的衣原体(Chlamydia)的能力。抗原的片段在本发明的上下文中是活性的，如果片段的活性总计为没有序列改变的抗原的活性的至少10％，优选至少25％，更优选至少50％，更优选至少70％，更优选至少80％，特别是至少90％，特别是至少95％，最优选至少99％。这些片段可以以任何所需的长度设计或获得，包括长度上小至约50至80个氨基酸。
在进一步的实施方式中，根据本发明的多肽的片段，更优选活性片段的特征在于结构或功能属性，即包括根据本发明的多肽的α-螺旋或α-螺旋形成区域、β-折叠和β-折叠形成区域、转角和转角-形成区域、卷曲(coil)或卷曲-形成区域、亲水性区域、疏水性区域、α-两性区域、β-两性区域、柔性区域(flexible regions)、表面-形成区域、底物结合区域、以及高抗原性指示区域的片段，以及此类片段的组合。优选的区域为介导根据本发明的多肽的抗原性和抗体结合活性的那些。在这点上最高度优选的为具有本发明的抗原及其片段的化学、生物或其它活性的片段，包括具有类似或改进活性的那些，由此此类改进活性为免疫原性和稳定性，或具有降低的不期望的活性，由此此类降低的不期望的活性为酶促和毒性功能，并且产生人类交叉反应抗体。特别优选的是包含酶的受体或结构域的片段，其赋予对于衣原体(Chlamydiae)或其它任何致病性衣原体(Chlamydia)物种的存活关键的功能，或在人类中引起疾病的功能。根据本发明的多肽的进一步优选的片段为包括或包含在动物，特别是人类中的抗原性或免疫原性决定子的那些。此类片段还称为抗原性片段。
抗原性片段还优选定义为其自身为抗原性或当以半抗原提供时可以获得抗原性的片段。因此，显示一个，特别对于更长的片段，显示仅几个氨基酸交换的抗原或抗原性片段，也能够通过本发明实现，条件是具有氨基酸交换的此类片段的抗原性或抗原性能力因交换不严重地恶化，即适合在用此抗原接种的个体中引发合适的免疫应答并且通过来自个体血清的个体抗体制备来鉴定。
根据本发明的多肽的此类片段的优选实例为在表1的“预测的免疫原性aa”或“预测的II类限制性T细胞表位/区域”或“鉴定的免疫原性区域(aa)的位置”栏中所示的核心氨基酸序列。
表1中列出的所有这些片段单独地和独立地每一个形成本发明的优选方面。
将意识到，除了其它，本发明还涉及编码前述片段、变体、活性变体和活性片段的核酸分子，与编码片段、变体、活性变体和活性片段的核酸分子杂交的核酸分子，特别是在严紧条件下杂交的那些，以及用于扩增编码片段的核酸分子的核酸分子，例如PCR引物。在这些方面，优选的核酸分子为符合如上讨论的优选片段的那些。
根据本发明的多肽可以以修饰的形式表达，例如融合蛋白，并且可以不仅包括分泌信号还包括另外的异源功能区域。这样，例如，另外的氨基酸的区域，特别是带电的氨基酸，可以添加至多肽的N-或C-末端以改进在纯化期间或在随后的处理和贮存期间在宿主细胞中的稳定性和持续性。同样地，区域可以添加至多肽以促进纯化或以增强表达。此类区域还可以在最终制备多肽之前除去。将肽部分添加至多肽以引起分泌或排泄，以改进稳定性，以增强表达或以促进纯化等，在本领域是熟悉和例行的技术。优选的融合蛋白包括来自免疫球蛋白的异源区域，其用于使多肽溶解或纯化。例如，EP 0464533公开了包括免疫球蛋白分子的恒定区的各种部分以及另一蛋白或其部分的融合蛋白。在药物发现中，例如，蛋白质已经与抗体Fc部分融合，以旨在高通量筛选检测，从而鉴定拮抗剂。参见例如，(Bennett，D.等，1995)and(Johanson，K.等，1995)。融合还可以包括融合或偶合至除了氨基酸部分(包括脂质和碳水化合物)的根据本发明的多肽。此外，本发明的抗原还可以与现有技术描述的其它疫苗试剂，以及与衍生自其它微生物的其它物种疫苗试剂组合使用。此类蛋白可用于预防、治疗和诊断由广谱衣原体(Chlamydia)分离物引起的疾病。
在进一步的实施方式中本发明的肽融合至表位标记，其提供抗-标记物质可以选择性结合至其的表位。表位标记通常位于肽的氨基-或羧基-末端，但是只要生物活性允许就可以引入作为内部插入物或取代物。肽的此类表位-标记的形式的存在可以使用例如针对标记的肽的抗体的物质来检测。同样地，表位标记的提供允许肽通过使用抗标记(anti-tag)抗体或与表位标记结合的其它类型的亲和基质的亲和纯化来容易地纯化。各种标记肽及其各抗体在本领域是已知的。实例包括聚组氨酸(poly-his)、聚组氨酸-甘氨酸(poly-his-gly)标记、HA标记多肽、c-myc标记、Strep标记和FLAG标记。
本发明的多肽可以通过许多传统技术中的任一制备。例如，它们可以通过化学合成以及通过生物技术手段生产。后者包括用包含根据本发明的核酸的载体转染或转化宿主细胞。在优选的实施方式中，载体为根据本发明的载体。根据本发明的多肽的生物技术生产进一步包括在允许蛋白质表达并且对本领域技术人员而言是已知的条件下，转染或转化的宿主细胞的培养。将表达的蛋白质通过对本领域技术人员已知的合适手段从细胞(或从培养基，如果细胞外地表达)回收、分离和任选地纯化。例如，蛋白质使用已知的技术，例如在盐酸胍中在细胞裂解或提取后以溶液的形式分离。包括本发明多肽和抗原的分子可以使用各种传统方法中的任何进一步纯化，所述传统方法包括但不限于：硫酸铵或乙醇沉淀、酸提取、液相色谱例如正相或反相，使用HPLC，FPLC等；亲和色谱(例如使用无机配体或单克隆抗体)，尺寸排阻色谱、阴离子或阳离子交换色谱、磷酸纤维素色谱、疏水相互作用色谱、羟基磷灰石色谱、凝集素色谱、固定金属螯合物色谱、凝胶电泳等。本领域技术人员可以选择最合适的分离和纯化技术而无需背离本发明的范围。此类纯化提供基本上不含微生物的其它蛋白质和非蛋白质材料的形式的抗原。
制备根据本发明的多肽的备选方案涉及通过酶促消化已知肽的片段产生，例如通过用已知在由特定氨基酸残基限定的位点处裂解蛋白质的酶处理，或通过用合适的限制性酶消化DNA，表达消化的DNA和分离所需片段。另一合适的技术涉及通过聚合酶链反应(PCR)分离和扩增编码所需肽片段的DNA片段。限定DNA片段的所需末端(termini)的寡核苷酸在PCR中用作5′和3′引物。具有在已知序列的DNA中，并从而在蛋白质中的预定位点处，用于形成突变，例如缺失、插入和取代的技术是已知的。使用传统技术，例如PCR，本领域技术人员可以容易地使用本文提供的抗原和肽，来鉴定和分离其它类似的蛋白。此类方法是常规的，并且认为如果根据本文提供的信息，不需要过度的试验。例如，使用寡核苷酸介导的定点突变形成(Carter，P.等，1985；Zoller，M.J.等，1987)、盒式突变形成(cassette mutagenesis)(Wells，J.A.等，1985)、限制性选择突变形成(Wells，J.A.等，1986)、PCR突变形成或其它已知的技术，可以形成变化，以在克隆的DNA上进行，从而产生本发明的肽。
根据本发明的多肽可以用于检测有机体或在包含这些有机体或蛋白质或抗原(包括其片段)的样品中的有机体。优选此类检测用于诊断，更优选用于诊断疾病，最优选用于诊断与革兰氏阴性细菌，特别是致病性衣原体(Chlamydia)物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)的存在或丰度有关或相关的疾病。
根据本发明的核酸还可用于诊断或检测样品中的有机体，由此有机体分别为与在根据本发明的多肽和根据本发明的抗体使用方面公开的相同的有机体。基本上，其在本领域技术人员的技能内以分别按照本公开内容设计和实施此类诊断和检测检验和方法。更优选此类诊断或检测使用引物或探针以特异地与根据本发明的核酸分子相互作用。此类引物和探针的长度和设计分别依赖于具体方法或实施的诊断而变化。在优选的实施方式中，使用用于例如基于PCR的检测或诊断系统，即方法或检验的引物，引物的长度将从约10个核苷酸至约30个核苷酸，更优选约16至25个核苷酸。在基于探针的检测或诊断系统的情况下，探针的长度优选约与基于引物的系统所规定的相同。此外，在基于探针的系统的情况下，探针将包括允许其直接或间接检测的部分。用于直接检测的此类部分可以为本领域技术人员已知的放射性标记或荧光标记。用于间接检测的此类部分可以为生物素或任何其它部分，其介导与其它化合物的相互作用，所述其它化合物又被标记以允许其检测。
本发明还涉及诊断检验，例如用于检测在细胞和组织中的根据本发明的多肽，更优选本发明的抗原及其片段的水平(包括确定正常和异常水平)的定量诊断检验。这样，例如，用于检测根据本发明的多肽相对于正常对照组织样品的过度表达的根据本发明的诊断检验可以用于检测感染的存在，例如，鉴定感染的有机体。可用于确定在衍生自宿主的样品中的此类多肽水平的检验技术对本领域技术人员是已知的。此类检验方法包括放射性免疫检验、竞争结合检验、Western印迹分析和ELISA检验。其中，经常优选ELISA和Western印迹分析。ELISA检验最初包括制备对根据本发明的多肽之一特异的抗体，优选单克隆抗体。此外，通常制备与单克隆抗体结合的报道抗体。报道抗体连接至可检测试剂例如放射性、荧光或酶试剂，例如辣根过氧化物酶。根据本发明的多肽的一种或几种，更优选根据本发明的抗原及其片段可以固定在ELISA平板上以用于检测要测试的患者或受试者中的反应性抗体。
Western印迹分析最初单独地或与SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳组合地分离根据本发明的多肽，并且其随后转移并固定到固相载体基质上，例如硝基纤维素、尼龙或其组合。与报道抗体一起反应性抗体可以被检测。报道抗体连接至可检测试剂例如放射性、荧光或酶试剂，例如辣根过氧化物酶上。
还可以使用如本文所述的根据本发明的多肽或根据本发明的核酸分子或针对其的引物或探针，以用于阵列目的或与其一起使用。在根据本发明的核酸分子或针对其的引物或探针的情况下，探针和引物的长度可优选为约25至约75个核苷酸，更优选从约35至约50个核苷酸。更具体地，根据本发明的多肽的至少一种可以固定在载体上。所述载体典型地包括各种根据本发明的多肽和/或其抗原和片段，从而通过使用根据本发明的抗原及其片段，和/或不同的抗原及其片段的一种或几种可以形成变化。此类阵列以及通常的任何阵列的特性化特征在于以下事实：在所述载体或其表面上的独特或预定义区域或位置，独特的多肽被固定。因为这个在阵列的独特位置或区域的任何活性可以与特定多肽有关。在载体上固定的不同多肽，更优选不同抗原及其片段的数量可以分别从少至10个至几千不同的多肽和抗原及其片段。每
Figure G2008800221257D00591
所述分子的密度在优选的实施方式中可以少至10每
Figure G2008800221257D00592
至少400个不同的此类多肽每cm2，更特别是至少1,000个不同的此类多肽，更优选不同的抗原及其片段每
Figure G2008800221257D00593
。本文关于固定根据本发明的多肽及其用途所述的，还适用于核酸分子和本领域技术人员已知的分别针对其的引物和探针。
此类阵列的制造对于本领域技术人员是已知的，并且，例如，描述于美国专利5,744,309。阵列优选包括具有至少第一表面的平坦的、多孔或非多孔的固相载体。根据本发明的多肽固定在所述表面上。其中，优选的载体材料为玻璃或纤维素。阵列用于本文所述诊断应用任一项，这也在本发明内。除了根据本发明的多肽之外，根据本发明的核酸分子也可以用于产生如上所述阵列，其原则上可用于任何公开的针对包含多肽的阵列所公开的目的。其中，这也应用到由本文所述的抗体，优选单克隆抗体组成的阵列。
在另一方面，本发明涉及针对根据本发明的多肽、根据本发明的其衍生物、片段、变体、活性片段和活性变体的任何的抗体。本发明包括，例如，单克隆和多克隆抗体、嵌合、单链和人源化抗体、以及Fab片段或Fab表达文库的产物。抗体可以是嵌合的，即其不同部分源于不同物种或至少各序列取自不同物种，这在本发明内。
通常和特别针对对应于本发明序列的抗原及其片段的此类抗体可以通过将根据本发明的多肽直接注射入动物或通过给药所述多肽给动物，优选非人类来获得。如此获得的抗体然后结合所述多肽自身。以此方式，甚至仅编码所述多肽片段的序列可以用于产生结合根据本发明的完整天然多肽的抗体。此类抗体然后可以用于从表达抗原及其片段的组织分离根据本发明的多肽。本领域技术人员将理解该方法还适用于所述多肽的片段、变体、其活性片段和活性变体。
本发明的另一方面涉及用于生产根据本发明的抗体的方法。这包括，例如，单克隆和多克隆抗体、嵌合、单链和人源化抗体、以及Fab片段或Fab表达文库的产物，其能够特异地与根据本发明的多肽或组合物结合。
在优选的实施方式中，抗体为单克隆、多克隆、嵌合或人源化抗体或其功能性活性片段。在另一优选地实施方式中所述功能性活性片段包括Fab片段。
针对根据本发明的肽或抗原或组合物产生的抗体可以通过将根据本发明的肽或抗原或组合物直接注射入动物或给药根据本发明的肽或抗原或组合物给动物，优选非人类来获得。这样获得的抗体将然后结合根据本发明的肽或抗原或组合物。此类抗体可以然后用于从表达这些的组织分离反应性抗原、肽或蛋白质。
为了制备单克隆抗体，可以使用提供通过连续细胞系培养物产生的抗体的本领域已知的任何技术(如最初在
Figure G2008800221257D00601
G.等，1975中描述)。
可以使为了生产单链抗体描述的技术(美国专利No.4,946,778)适合在根据本发明的各种实施方式中生产针对免疫原性抗原及其片段的单链抗体。同样地，转基因小鼠，或其它有机体例如其它哺乳动物，可以用于表达针对根据本发明多肽的人源化抗体。
抗体还可以使用杂交瘤细胞系来生产。
本发明的另一方面还涉及生产本发明抗体的杂交瘤细胞系。
表达所需单克隆抗体的杂交瘤细胞系通过已知的传统技术产生。杂交瘤细胞可以通过将正常激活的，抗体-产生B细胞与骨髓瘤细胞融合来产生。在本发明的上下文中，杂交瘤细胞能够产生特异性结合本发明抗原的抗体。
类似地，所述高滴度抗体可以通过将已知的重组技术应用到为这些抗原开发的单克隆或多克隆抗体来产生(参见，例如，PCT专利申请No.PCT/GB85/00392；英国专利申请公开No.GB2188638A；Amit，A.G.等，1986；Queen，C.等，1989；PCT专利申请No.WO90/07861；Riechmann，L.等，1988；Huse，W.D.等，1988)。
作为选择，抗体可以使用展示文库来产生。例如，可以使用噬菌体展示技术或核糖体展示来选择具有针对根据本发明多肽的结合活性的抗体基因，所述多肽来自源于人类的筛选以具有各靶抗原结合抗体的淋巴细胞的PCR扩增v-基因的库或来自天然文库(McCafferty，J.等，1990；Marks，J.等，1992)。这些抗体的亲和性还可以通过链改组(chain shuffling)来改进(Clackson，T.等，1991)。
如果存在两种抗原结合结构域，每一结构域可以针对不同的表位-称为‘双特异’抗体。
上述抗体可以用于通过将抗体连接到固相载体上来分离或鉴定表达根据本发明的多肽的克隆以用于通过亲和色谱分离和/或纯化。
这样，其中，针对根据本发明的多肽的抗体可以用于抑制和/或治疗感染，特别是细菌感染，更特别是由以下引起的感染：致病性衣原体(Chlamydia)物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
在其各种实施方式中根据本发明的多肽，更具体地抗原及其片段包括抗原学上、表位学上或免疫学上的等效衍生物，其形成本发明的特别方面。如本文所用的术语“抗原学上的等效衍生物”包括根据本发明的此类多肽或其等效物(equivalent)，其将被特定抗体特异性地识别，所述特定抗体当针对所述多肽产生时，干扰病原体与哺乳动物宿主之间的相互作用。如本文所用的术语“免疫学上的等效衍生物”包括这样的肽或其等效物，当在合适的制剂中使用以在脊椎动物中产生抗体时，抗体起作用以干扰病原体与哺乳动物宿主之间的相互作用。
在其各种实施方式中根据本发明的多肽，更具体地抗原及其片段，例如其抗原学上或免疫学上的等效衍生物或其融合蛋白可用作抗原以使小鼠或其它动物例如大鼠或鸡免疫。融合蛋白可以提供稳定性给根据本发明的多肽。此类多肽可以例如通过与免疫原性载体蛋白，例如胎牛血清白蛋白(BSA)或钥孔血蓝蛋白(KLH)缀合而连接。作为选择，包括根据本发明的多肽，更优选抗原及其片段，或抗原学上或免疫学上的等效抗原及其片段的多拷贝的抗原性肽，可以为充分抗原性的，以改进免疫原性从而避免使用载体。
优选地将抗体或其衍生物修饰以使其在个体中较少免疫原性。例如，如果个体为人类，抗体可以最优选为“人源化的”，其中杂交瘤衍生的抗体的互补决定区已经移植到人类单克隆抗体，例如如在(J0nes，P.等，1986)或(Tempest，P.等，1991)中所述。
在遗传免疫中根据本发明的核酸分子的使用将优选使用合适的递送方法，例如将质粒DNA直接注射入肌肉，递送与特异蛋白载体复合的DNA，使DNA与磷酸钙共沉淀，以脂质体的各种形式封装DNA，粒子轰击(particle bombardment)(Tang，D.等，1992；Eisenbraun，M.等，1993)和使用克隆的逆转录病毒载体体内感染(Seeger，C.等，1984)。
在另一方面本发明涉及与任何根据本发明的多肽结合的肽，以及用于制备此类肽的方法，由此该方法特征在于使用所述多肽和本领域技术人员已知的基本步骤。
此类肽可以通过使用根据现有技术的方法例如噬菌体展示或核糖体展示来产生。在噬菌体展示的情况下，基本上以噬菌体的形式产生肽的文库，并且将此类文库与靶分子(在该情况下为根据本发明多肽)接触。与靶分子结合的这些肽随后优选作为具有靶分子的复合物从各反应中除去。本领域技术人员已知结合特性，至少在某种程度上，依赖于具体实行的试验构建例如盐浓度等。从文库的未结合成员中分离具有更高亲和力或更强力的与靶分子结合的这些肽后，并且任选地还在从靶分子和肽的复合物除去靶分子之后，各肽可以随后表征。在表征之前，任选地实行扩增步骤，例如通过使编码肽的噬菌体增殖。表征优选包括靶结合肽的测序。基本上，肽不在其长度上受限，然而优选具有约8至20个氨基酸长度的肽优选在各方法中获得。文库的大小可为约102至1018，优选108至1015个不同的肽，然而不限于此。在优选的实施方式中此类肽为高亲和力的结合肽。在更优选的实施方式中，肽为肽适配子。
本文所用的肽适配子是指结合特定的靶分子的肽分子。肽适配子设计成干扰细胞内其它蛋白的相互作用。它们由在两端连接至蛋白支架(protein scaffold)的可变肽环组成。该双结构限制极大地将肽适配子的结合亲和力增加到可与抗体相比的水平(纳摩尔范围)。可变环长度典型地由10至20个氨基酸组成，支架可以为具有良好溶解度和兼容性(compacity properties)的任何蛋白质。目前，细菌蛋白硫氧还蛋白-A为最常用的支架蛋白，可变环插入还原活性的位点内，其在野生型蛋白中为-Cys-Gly-Pro-Cys-环，两个半胱氨酸侧链能够形成二硫键。可以使用不同的系统进行肽适配子选择，但是最常用的为目前的酵母双杂交系统。已经证明了配体调节的肽适配子(LiRPAs)的选择。通过从基于三聚FKBP-雷帕霉素-FRB结构的新支架蛋白展示7个氨基酸的肽，随机肽和靶分子之间的相互作用可以通过小分子雷帕霉素(Rapamycin)或非免疫抑制性类似物来控制。
如上所述的靶结合肽的特别形式为所谓的“抗促成素”，其中，其描述于德国专利申请DE 19742706。迄今为止，本发明还涉及与根据本发明的多肽特异性结合的肽，以及其用于本文所述治疗性和诊断性应用的任何之一，优选用于抗体的用途。
在另一方面，本发明涉及与任何根据本发明的多肽相互作用的功能性核酸，以及用于制备此类功能性核酸的方法，由此该方法特征在于使用根据本发明的多肽，并且基本步骤对本领域技术人员而言是已知的。功能性核酸优选为核酸适配子和镜像异构体。迄今为止，本发明还涉及与根据本发明的多肽特异性结合的核酸适配子和镜像异构体，以及其用于本文所述治疗性和诊断性应用的任何之一，优选用于抗体的用途。
核酸适配子为D-核酸，其为单链或双链的并且其与靶分子特异性地相互作用。适配子的制备或选择例如描述于欧洲专利EP 0 533 838。基本上实行以下步骤。首先，提供核酸的混合物，即潜在的适配子，由此各核酸典型地包括几个，优选至少8个连续的(subsequent)随机核苷酸的片段。将该混合物随后与靶分子接触，由此核酸例如基于与候选混合物相比，增加的针对靶的亲和力或具有至其的更大的力，与靶分子结合。结合核酸然后从剩下的混合物分离。任选地，将这样获得的核酸使用例如聚合酶链反应扩增。这些步骤可以重复几次，最后给出具有与靶特异性结合的核酸的比率增加的混合物，从其最终的结合核酸然后任选地选择。这些特异性结合核酸被称为适配子。显然可以在用于产生或鉴定个体核酸的混合物的适配子样品的方法的任何阶段，使用标准技术确定其序列。适配子可以被例如通过引入预定义的化学基团来稳定化，所述化学基团对于产生适配子领域的技术人员而言是已知的。此类修饰可以例如在于在核苷酸的糖部分的2’-位置处引入氨基。适配子目前用作治疗剂。然而，这样选择或产生的适配子可以用于靶验证和/或用作前导物质，以用于开发药物组合物，优选基于小分子的药物组合物，这也在本发明内。这实际上通过竞争检验来完成，由此靶分子和适配子之间的特异性相互作用被候选药物抑制，从而当从靶和适配子的复合物置换为适配子时，可以假定各药物候选物允许特异性抑制靶和适配子之间的相互作用，并且如果该相互作用是特异的，所述候选药物将至少原则上适合阻断靶，从而降低其在包括此类靶的各系统上的生物利用度或活性。这样获得的小分子可以然后进行进一步的衍生化和修饰以优化其物理、化学、生物和/或医学性质例如毒性、特异性、生物降解性和生物利用度。
镜像异构体及其产生或制备基于类似的原理。镜像异构体的制备描述于国际专利申请WO 98/08856。镜像异构体为L-核酸，其是指它们由L-核苷酸组成而不是如适配子那样由D-核苷酸组成。镜像异构体的特征在于以下事实：它们在生物系统中具有非常高的稳定性，并且与适配子相比，特异性地与它们针对的靶分子相互作用。在产生镜像异构体的过程中，形成D-核酸的异源群体，并且使该群体与靶分子的光学对映体接触，在本案中例如与根据本发明的抗原或其片段的天然发生的L-对映异构体的D-对映异构体接触。随后，分离不与靶分子的光学对映体相互作用的那些D-核酸。但是将与靶分子的光学对映体相互作用的那些D-核酸分离、任选地鉴定和/或测序，并且随后基于从D-核酸获得的核酸序列信息合成相应的L-核酸。这些L-核酸，其和上述与靶分子的光学对映体相互作用的那些D-核酸在序列方面相同，将特异性地与天然发生的靶分子而不是与其光学对映体相互作用。与用于产生适配子的方法类似，还可以重复各种步骤几次，从而富集与靶分子的光学对映体特异性地相互作用的那些核酸。
在另一方面，本发明涉及与根据本发明的任何核酸分子相互作用的功能性核酸，和用于制备此类功能性核酸的方法，由此该方法的特征在于使用根据本发明的核酸分子及其各序列，并且基本步骤对本领域技术人员而言是已知的。功能性核酸优选为核酶、反义寡核苷酸和siRNA。迄今为止，本发明还涉及与根据本发明的多肽特异性结合的此类功能性核酸，以及其用于本文所述的任何治疗性和诊断性应用，优选用于抗体的用途。
核酶为催化活性的核酸，其优选由RNA组成，其基本上包括两部分。第一部分显示催化活性而第二部分负责与靶核酸特异性地相互作用，在本案中所述核酸编码根据本发明的多肽。当靶核酸与核酶的第二部分之间相互作用时，典型地通过杂交和与在两条杂交链上的碱基的基本上互补的延伸的Watson-Crick碱基配对，催化活性部分可以变得有活性，这意味着在核酶的催化活性为磷酸二酯酶活性的情况下，其分子内或分子间地催化靶核酸。随后可以存在靶核酸的进一步降解，其最终导致靶核酸以及从所述靶核酸衍生的蛋白质的降解。核酶、其用途和设计原则对于本领域技术人员而言是已知的，并且例如描述于(Doherty，E.等，2001)和(Lewin，A.等，2001)。
分别用于制备药物组合物和作为诊断试剂的反义寡核苷酸的活性和设计，基于类似的作用模式。基本上，反义寡核苷酸基于碱基互补性与靶RNA，优选与mRNA杂交，由此激活核糖核酸酶H。核糖核酸酶H被磷酸二酯和硫代磷酸酯偶合的DNA激活。然而磷酸二酯偶合的DNA被细胞核酸酶迅速地降解，除了硫代磷酸酯偶合的DNA之外。当与RNA杂交时，这些有抗性的、非天然发生的DNA衍生物不抑制核糖核酸酶H。换句话说，反义多核苷酸仅作为DNA RNA杂交复合物有效。其中此类反义寡核苷酸的实例描述于美国专利US 5,849,902和US 5,989,912。换句话说，基于靶分子的核酸序列(其在本案中为用于根据本发明的抗原及其片段的核酸分子，其来自从其原则上可以推断出各核酸序列的靶蛋白，或通过知道核酸序列等，特别是mRNA)，合适的反义寡核苷酸可以基于碱基互补的原理而设计。
特别优选的为反义寡核苷酸，其具有短延伸的硫代磷酸酯DNA(3至9个碱基)。最少3个DNA的碱基需要细菌核糖核酸酶H的激活，而最少5个碱基需要哺乳动物核糖核酸酶H的激活。在这些嵌合寡核苷酸中，存在形成核糖核酸酶H的底物的中心区域，其侧翼于由修饰的核苷酸组成的不形成核糖核酸酶H的底物的杂交“臂”。嵌合寡核苷酸的杂交臂可以被例如2’-0-甲基或2’′-氟修饰。备选方法在所述臂中使用甲基磷酸酯或氨基磷酸酯键。用于实施本发明的反义寡核苷酸的进一步实施方式为P-甲氧基寡核苷酸，部分P-甲氧基寡脱氧核糖核苷酸或P-甲氧基寡脱氧-核糖核苷酸。
更具体地描述于上述两篇提到的美国专利中的那些反义寡核苷酸与本发明尤其相关和对本发明有用。这些寡核苷酸不包含天然发生的5′＝＞3′-连接的核苷酸。而是该寡核苷酸具有两种类型的核苷酸：激活核糖核酸酶H的2’-脱氧硫代磷酸酯(deoxyphosphorothioate)，以及不激活的2’-修饰核苷酸。2’-修饰核苷酸之间的键可以为磷酸二酯、硫代磷酸酯或P-乙氧基磷酸二酯。核糖核酸酶H的激活通过相邻的核糖核酸酶H-激活区域实现，其在3’和5’之间包含2’-脱氧硫代磷酸酯核苷酸以激活细菌核糖核酸酶H，以及在5和10之间包含2’-脱氧硫代磷酸酯核苷酸以激活真核，特别是哺乳动物核糖核酸酶H。保护免受降解通过使5’和3’末端碱基高度核酸酶抗性，并且任选地通过在3’末端放置阻断基团来实现。
更具体地，反义寡核苷酸包括5’末端和3’末端；并且从位置11至595′＝＞3′-连接的核苷酸独立地选自2’-修饰的磷酸二酯核苷酸和2’-修饰的P-烷氧基磷酸三酯核苷酸；并且其中所述5’-末端核苷连接至三和十邻近的硫代磷酸酯-连接的脱氧核糖核苷酸之间的核糖核酸酶H-激活区域，并且其中所述寡核苷酸的3’末端选自倒置的(inverted)脱氧核糖核苷酸、1至3个硫代磷酸酯2’-修饰的核糖核苷酸的相邻延伸、生物素基团和P-烷氧基磷酸三酯核苷酸。
同样地还可以使用这样的反义寡核苷酸，其中不是5’末端核苷酸连接到核糖核酸酶H-激活区域，而是如上指出的3’末端核苷酸。同样地，5’末端选自特定的组而不是所述核苷酸的3’末端。
在各种实施方式中根据本发明的核酸和多肽可用作或用于制备药物组合物，特别是疫苗。优选地此类药物组合物，优选疫苗用于预防或治疗由以下相关或有关引起的疾病：衣原体(Chlamydia)物种，优选致病性衣原体(Chlamydia)，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。迄今为止本发明的另一方面涉及用于在个体，特别在哺乳动物中诱导免疫应答的方法，其包括用在其各种实施方式中的根据本发明的多肽，或其片段或变体接种个体，所述多肽，或其片段或变体足以产生抗体或保护所述个体免受上述微生物的感染。
本发明的另一方面还涉及在个体中诱导免疫应答的方法，其包括，通过基因治疗或其它，递送根据本发明的核酸分子，优选其在各种实施方式中功能性编码抗原或其片段，以用于在体内表达根据本发明的多肽，从而诱导免疫应答以产生抗体或细胞介导的T细胞应答(细胞因子-产生T细胞或细胞毒性T细胞)，以保护所述个体免受疾病，无论该疾病已经在个体中确立与否。单因素给药(One-way ofadministering)该基因通过促进其进入所需细胞作为颗粒或其它上的涂层。
本发明的另一方面涉及免疫组合物，当引入能够在其内诱导免疫应答的宿主时，所述免疫组合物在此类宿主中诱导免疫应答，其中所述组合物包括重组DNA，所述重组DNA在其各种实施方式中编码和表达根据本发明的多肽的至少一种。免疫应答可以治疗学上或预防学上地使用，并且可以采用抗体免疫性或细胞免疫性的形式例如由CTL或CD4+T细胞产生的形式。
在其各种实施方式中根据本发明的多肽可以与辅蛋白(co-protein)融合，该辅蛋白自身不能产生抗体，但是能够稳定第一蛋白并且产生具有免疫原性和保护性质的融合蛋白。该融合重组蛋白优选进一步包括抗原性辅蛋白，例如谷胱甘肽-S-转移酶(GST)或β-半乳糖苷酶；相对大的辅蛋白，其使蛋白溶解并促进其生产和纯化。此外，辅蛋白在提供免疫系统的普遍刺激的意义上可以充当佐剂。辅蛋白可以与第一蛋白的氨基或羧基末端连接。
通过本发明还提供这样的方法，其在其各种实施方式中在具有任何以下感染的动物模型中的此类基因免疫试验中使用根据本发明的核酸分子：本文所述的衣原体(Chlamydia)物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。此类分子将特别地用于鉴定能够激起预防性或治疗性免疫应答的蛋白表位。该方法能够允许随后从成功地抵抗或清除感染的动物的必要器官中制备特定价值的单克隆抗体，以用于开发在哺乳动物中，特别在人类中以下感染的预防性试剂或治疗性治疗：本文所述的衣原体(Chlamydia)物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染。
在其各种实施方式中根据本发明的多肽可以用作用于接种宿主的抗原，以产生特异性抗体，所述抗体例如通过阻断细菌粘附到受损组织上来保护防止细菌的入侵。组织损伤和进而受损组织的实例包括例如由病毒感染(特别是呼吸性的，例如流感)、机械的、化学的或热损伤或由植入留置装置引起的皮肤或结缔组织和肌肉组织中的创伤，或在粘膜，例如口、乳腺、尿道或阴道中的创伤。
本发明还包括疫苗制剂，其包括在其各种实施方式中的根据本发明的一种或几种多肽以及一种或多种合适的载体和/或赋形剂。用于本发明的药学上可接受的载体和/或赋形剂是常规的，并且可以包括缓冲剂、稳定剂、稀释剂、防腐剂和增溶剂。E.W.Martin，Mack PublishingCo.，Easton，PA，15th Edition(1975)的Remington′sPharmaceutical Sciences，描述了适合药学上递送本文所述(多)肽的组合物和制剂。通常，载体或赋形剂的性质将依赖于所用的给药的具体模式。例如，胃肠外制剂通常包括注射液，其包括药学上和生理学上可接受的流体例如水、生理盐水、平衡的盐溶液、水性右旋糖、甘油等作为载体。对于固体组合物(例如粉末、丸剂、片剂或胶囊形式)，传统的非毒性固体载体可以包括，例如，医药级的甘露醇、乳糖、淀粉或硬脂酸镁。除了生物学上的中性载体之外，要给药的药物组合物可以包含少量的非毒性助剂物质，例如增湿或乳化剂、防腐剂、pH缓冲剂等，例如乙酸钠或去水山梨糖醇月桂酸酯。
由于根据本发明的所述多肽可以在胃中分解，它们优选胃肠外地给药，包括，例如为以下的给药：皮下地、肌肉内的、静脉内的、皮内的、鼻内的或透皮的。适合胃肠外给药的制剂包括水性或非水性无菌注射液，其可以包含抗氧化剂、缓冲剂、抑菌剂和赋予制剂与体液等渗性的溶质，优选个体的血液；以及水性和非水性无菌悬浮液，其可以包含悬浮剂或增稠剂。制剂可以存在于单位剂量或多剂量容器(container)，例如，密封的安瓿或小瓶(vials)中，并且可以在冷冻干燥条件下贮存，其在立即使用之前仅需要添加无菌液体载体。疫苗制剂还可以包括佐剂系统以增强制剂的免疫原性，例如水包油系统和其它本领域已知的其它系统。剂量将依赖于疫苗的比活性并且可以通过常规试验容易地确定。
根据另一方面，本发明涉及药物组合物，其包括在其各种实施方式中的一种或几种根据本发明的多肽以用于本文所述的各种衣原体(Chlamydia)物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。此类药物组合物可以包括针对所述衣原体(Chlamydia)物种的所述多肽的一种，优选至少两种或更多。任选地，在组合药物组合物中此类多肽还可以与针对另一病原体的抗原组合。优选地，所述药物组合物为用于预防或治疗由以下引起的感染的疫苗：衣原体(Chlamydia)物种，优选本文公开的致病性衣原体(Chlamydia)，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoiae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)，和/或其它病原体(针对其抗原已经包含在疫苗中)。
根据另一方面，本发明涉及包括根据本发明的核酸分子的药物组合物。此类药物组合物可以包括编码根据本发明的多肽的一种或多种根据本发明的核酸分子。任选地，在组合的药物组合物中使此类编码根据本发明的多肽的核酸分子与编码针对其它病原体的抗原的核酸分子组合。优选地，所述药物组合物为用于预防或治疗由以下引起的感染的疫苗：衣原体(Chlamydia)物种，优选本文公开的致病性衣原体(Chlamydia)，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)，和/或其它病原体(针对其抗原已经包含在疫苗中)。
药物组合物可以包含任何合适的助剂物质(auxiliarysubstance)，例如缓冲物质、稳定剂或其它活性成分，特别是关于药物组合物和/或疫苗生产已知的成分。
在优选的实施方式中药物组合物还包括免疫刺激物质例如佐剂。佐剂可以基于给药方法选择，并可以包括聚阳离子物质，特别是聚阳离子肽，免疫刺激性核酸分子，优选免疫刺激性寡脱氧核苷酸(ODNs)，特别是Oligo(dIdC)13，包含至少两个LysLeuLys基序的肽，特别是肽KLKLLLLLKLK，明矾、无机油类佐剂例如弗罗因德(Freund)完全佐剂、弗罗因德(Freund)不完全佐剂，神经活性化合物，特别是人类生长激素，或一种或多种上述佐剂的任何组合。其它合适的佐剂可以从以下选择：Montanide不完全Seppic佐剂(incomplete Seppic adjuvant)例如ISA、水包油乳化佐剂例如Ribi佐剂系统、包含胞壁酰二肽的syntax佐剂制剂，或铝盐佐剂或其组合。
本发明中所用的术语“Oligo(dIdC)13”是指包含13个脱氧(肌酐-胞嘧啶)基序的磷酸二酯主链的单链DNA分子，还定义为术语[oligo-d(IC)13]。确切序列为5’-dIdCdIdCdIdCdIdCdIdCdIdCdIdCdIdCdIdCdIdCdIdCdIdCdIdC-3’。Oligo(dIdC)13还可以定义为术语(oligo-dIC26)；oligo-dIC26-mer；oligo-deoxy IC，26-mer；或oligo-dIC，26-mer，例如在WO 01/93903和WO 01/93905中所指出。
药物组合物，特别是疫苗，包括除了在其各种实施方式中的一种或几种根据本发明的多肽和/或根据本发明的核酸分子之外，还包括生物学上或药学上活性的其它化合物。优选地，疫苗组合物包括至少一种聚阳离子肽。根据本发明要使用的聚阳离子化合物可以为任何聚阳离子化合物，其显示根据WO 97/30721的特性效果。优选的聚阳离子化合物选自：碱性多肽、有机聚阳离子、碱性聚氨基酸或其混合物。这些聚氨基酸应该具有至少4个氨基酸残基的链长(WO 97/30721)。特别优选的为例如以下物质：聚赖氨酸、聚精氨酸和包含在多于8个，特别多于20个氨基酸残基中碱性氨基酸超过20％，特别超过50％的多肽，或其混合物。其它优选的聚阳离子及其药物组合物描述于WO 97/30721(例如聚乙烯亚胺)和WO 99/38528。优选地这些多肽包含20至500个氨基酸残基，特别是30至200个残基。
这些聚阳离子化合物可以化学地或重组地生产，或可以来自天然来源。
阳离子(多)肽还可以为具有在(Ganz，T.，1999)中所述性质的抗菌剂。这些(多)肽可以为原核或动物或植物来源，或可以化学地或重组地生产(WO 02/13857)。肽还可以属于防御素类(WO 02/13857)。此类肽的序列可以例如在以下网址的抗菌序列数据库(AntimicrobialSequences Database)中发现：http://www.bbcm.univ.trieste.it/ -tossi/pag2.html。
此类宿主防御肽或防御剂(defensives)还为根据本发明的聚阳离子聚合物的优选形式。通常，将允许适应性免疫系统的激活(或下调)(优选通过APC(包括树突细胞)介导的)作为最终产物的化合物用作聚阳离子聚合物。
用作在本发明中聚阳离子物质的特别优选的为导管素(cathelicidin)衍生的抗菌肽或其衍生物(国际专利申请WO02/13857，在此通过参考引入)，特别是衍生自哺乳动物导管素，优选来自人类、牛或小鼠的抗菌肽。
来自天然来源的聚阳离子化合物包括HIV-REV或HIV-TAT(衍生的阳离子肽、触角足(antennapedia)肽、壳聚糖或几丁质的其它衍生物)或衍生自这些肽的其它肽或通过生化或重组生产的蛋白质。其它优选的聚阳离子化合物为凯萨林(cathelin)或与凯萨林相关或衍生的物质。例如，小鼠凯萨林为肽，其具有氨基酸序列NH 2-RLAGLLRKGGEKIGEKLKKIGOKIKNFFQKLVPQPE-COOH。相关或衍生的凯萨林物质包含具有至少15-20个氨基酸残基的凯萨林序列的全部或部分。衍生可以包括天然氨基酸被不在20种标准氨基酸中的氨基酸的取代或修饰。此外，其它阳离子残基可以引入此类凯萨林分子。这些凯萨林分子优选与抗原组合。这些凯萨林分子令人惊奇地被证明作为用于抗原的佐剂而无需添加其它佐剂也是有效的。因此可以使用此类凯萨林分子作为在具有或不具有其它免疫激活物质的疫苗制剂中的有效佐剂。
根据本发明使用的另一优选的聚阳离子物质为包含被3至7个疏水性氨基酸分开的至少2个2KLK-基序的合成肽(国际专利申请WO02/32451，在此通过参考引入)。
本发明的药物组合物还可以包括免疫刺激性核酸。免疫刺激性核酸为例如中性或人工的包含CpG的核酸、衍生自非脊椎动物的核酸的短延伸(stretches)；或以短的寡核苷酸(ODNs)的形式，所述寡核苷酸(ODNs)在特定的碱基背景(base context)中包含未甲基化的胞嘧啶-鸟嘌呤二核苷酸(CpG)(例如描述于WO 96/02555)。作为选择，例如描述于WO 01/93903的基于肌苷和胞苷的核酸，或包含脱氧肌苷和/或脱氧尿苷残基的脱氧核酸(描述于WO 01/93905和WO 02/095027，在此通过参考引入)可以优选用作与本发明相关的免疫刺激性核酸。优选地，不同免疫刺激性核酸的混合物可以根据本发明使用。
任何上述聚阳离子化合物与任何上述免疫刺激性核酸组合，这也在本发明内。优选地，此类组合根据描述于以下的那些：WO 01/93905，WO 02/32451，WO 01/54720，WO 01/93903，WO 02/13857和WO02/095027和WO 03/047602，在此通过参考引入。
此外或作为选择，除了根据本发明的多肽和根据本发明的核酸分子(优选根据本发明的编码核酸分子)之外，此类疫苗组合物可以包括优选神经活性化合物。优选地，神经活性化合物为如例如描述于WO01/24822的人类生长因子。同样优选地，神经活性化合物与上述的任何聚阳离子化合物和/或免疫刺激性核酸组合。
同样地，根据本发明的药物组合物为这样的药物组合物，其包括至少任何以下化合物或其组合：在其各种实施方式中的根据本发明的核酸分子、根据本发明的多肽、根据本发明的载体、根据本发明的细胞、根据本发明的抗体、根据本发明的功能性核酸和分别根据本发明的结合肽例如抗促成素和高亲和力结合肽和肽适配子、优选按照本文所述筛选的根据本发明的激动剂和拮抗剂。与其相关的任何这些化合物可以与用于细胞、组织或有机体的未灭菌或灭菌的载体，例如适用于施用于受试者的药学上的载体组合使用。此类组合物包括，例如介质添加剂或治疗有效量的本发明的抗原及其片段，和药学上可接受的载体或赋形剂。此类载体可以包括，但不限于，生理盐水、缓冲生理盐水、右旋糖、水、甘油、乙醇及其组合。制剂应该适合给药模式。
所述组合物可以例如用于免疫或治疗受试者。所述药物组合物包括至少一种本发明的肽；然而，其还可以包括鸡尾酒(即，简单的混合物)，所述鸡尾酒包含本发明的不同肽(包括片段和其它变体)，任选地与其它病原体的不同的抗原性蛋白质或肽混合。这些肽、多肽、蛋白质或其片段或变体的此类混合物例如用于产生针对广谱衣原体(Chlamydia)分离株的所需抗体。本发明的肽还可以以药学上可接受的盐的形式使用。能够与本发明的肽形成盐的合适的酸和碱对于本领域技术人员而言是已知的，并且包括无机和有机酸和碱。
本发明的另一方面为包含选自以下的核酸的药物组合物：
(i)本发明的核酸和/或与其互补的核酸，和
(ii)任选地药学上可接受的载体或赋形剂。
单独或与其它核酸序列组合的核酸序列可以进一步用作药物组合物的成分，所述其它核酸序列编码抗原或抗体或针对其它致病性微生物。所述组合物可以用于免疫或治疗患有以下感染引起的疾病的人类和/或动物：衣原体(Chlamydia)，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.rachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。药学上可接受的载体或赋形剂可以如上定义。
在另一种实施方式中，单独或与编码来自其它致病性微生物的其它抗原或抗体的其它核酸序列组合的本发明的核酸序列，可以进一步用于组合物，所述组合物旨在主动地诱导针对受试者中的病原体的保护性免疫应答。本发明的这些组分在用于诱导针对患有以下感染的人类和/或动物中的保护性免疫应答的方法中是有用的：衣原体(Chlamydia)，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C. pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
为了用于制备治疗剂或疫苗组合物，核酸递送组合物和方法是有用的，其对于本领域技术人员而言是已知的。本发明的核酸还可用于本发明的方法或用于本文所述的组合物作为DNA序列，其或者作为裸DNA给药，或与药学上可接受的载体一起给药，并且提供了抗原、肽或多肽的体内表达。所谓的“裸DNA”可以用于在患者中在体内表达本发明的抗原、肽或多肽(参见，例如，Cohen，J.，1993，其描述了“裸DNA”的类似用途)。例如，与调控序列相关的“裸DNA”可以治疗等上地或作为疫苗组合物的部分例如通过注射给药。
作为选择，编码本发明的抗原或肽的核酸或与其互补的核酸可以用于药物组合物内，例如以在体内表达本发明的抗原或肽或多肽，例如以诱导抗体。
本发明的优选实施方式涉及药物组合物，其中根据本发明的核酸包括在载体和/或细胞内。适合本发明上下文的载体和/或细胞如上所述。载体特别地用于DNA疫苗。用于递送的合适的载体可以由本领域技术人员容易地选择。用于体内基因递送的示例性载体容易地获自各种学院和商业来源，并且包括，例如腺相关病毒(国际专利申请No.PCT/US91/03440)、腺病毒载体(Kay，M.等，1994；Ishibashi，S.等，1993)或其它病毒载体，例如各种痘病毒、牛痘等。重组病毒载体，例如逆转录病毒或腺病毒，优选用于将外源DNA整合入细胞的染色体。
本发明的药物组合物可以任何有效传统的方式给药，包括例如，通过局部、口服、肛门、阴道、静脉内、腹膜内、皮下、鼻内、气管内或皮内途径等给药。
为了治疗或作为预防剂，本发明的药物组合物的活性剂可以作为注射组合物，例如作为优选等渗的无菌水分散液给药给个体。
优选地，本发明的药物组合物可以鼻内地例如作为气溶胶制剂给药。
通常，鼻内接种代表替代基于针的注射的有吸引力的非入侵性方案，并且在粘膜表面提供较优的保护。此外，可以在鼻内免疫后诱导粘膜以及全身免疫性。
在上述Rodriguez A.等，(2006)的公开的研究中已经显示，使用DNA疫苗的鼻内免疫在小鼠中提供针对肺炎衣原体(C.pneumoniae)感染的保护。同样地，使用蛋白质疫苗的鼻内免疫在小鼠的呼吸道中诱导局部免疫应答。
因此，鼻内应用特别适合用于根据本发明的衣原体(Chlamydiae)疫苗，特别是用于肺炎衣原体(C.pneumoniae)疫苗。
作为选择，所述组合物，优选药物组合物可以例如以软膏剂、霜剂、洗剂、眼膏、滴眼剂、滴耳剂、嗽口水、浸渍敷料(impregnateddressing)和缝合以及气溶胶的形式配制以用于局部应用，并且可以包含合适的常规添加剂，包括，例如防腐剂，帮助药物渗透的溶剂和在软膏剂和霜剂中的润肤剂。此类局部制剂还可以包含相容的常规载体，例如软膏剂和霜剂基质，和用于洗剂的乙醇或油醇。此类载体可以占制剂重量的约1％至约98％，更通常它们占制剂质量的达约80％。
除本文所述的治疗之外，本发明的药物还通常用作伤口处理剂以防止细菌粘附到在伤口组织中暴露的基质蛋白，并且以用于预防性应用，所述预防性应用在牙科治疗中作为抗生素预防的替代方案或与其联合使用。
在优选的实施方式中药物组合物为疫苗组合物。优选地，此类疫苗组合物方便地以注射形式或以气溶胶制剂以用于鼻内递送。常规佐剂可用于增强免疫应答。用于使用蛋白质抗原接种的合适的单位剂量对于成人为约0.02至3μg抗原/每kg体重，对于儿童为约0.2至10μg抗原/每kg体重，并且此类剂量优选以2至24个周的间隔给药1-3次。
本发明的抗原、核酸、载体、抗体或药物组合物的“有效量”或“治疗有效量”可以按照能够显示体内效应的量计算，例如预防或改善以下感染的迹象或症状：衣原体(Chlamydia)，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(Cpsittaci)。此类量可以由本领域技术人员确定。
使用指出的剂量范围，期望使用本发明的化合物没有不利地毒理学效应，其将排除它们给药给合适的个体。
在进一步的实施方式中本发明涉及诊断包和药物包和试剂盒，其包括填充有本发明的上述组合物的一种或多种成分的一个或多个容器。成分可以以有用的量、剂量、制剂或组合存在。与此类容器相关的为以由政府机构规定形式的注意事项(notice)，该机构调节药物或生物产品的制备、使用或销售，反映由机构批准用于人类给药的产品的制备、使用或销售。
关于本发明，如本文所述的任何疾病相关的用途例如，比如，药物组合物或疫苗用途，特别地为疾病或患病状况，其由以下引起，与以下相关或有关：衣原体(Chlamydia)，更优选任何衣原体(Chlamydia)物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。根据本发明要预防和/或治疗的，与细菌感染相关、由其引起或有关的疾病，包括慢性感染。常见位置包括上和下呼吸道。临床症状的范围包括肺炎、上呼吸道疾病、支气管炎、鼻窦炎、哮喘性支气管炎、成人发作的哮喘和慢性阻塞性肺疾病。此外，衣原体(Chlamydia)感染还与动脉粥样硬化和心血管疾病以及阿耳茨海默疾病有关。
本文所述的每一和任何症状、疾病、障碍或综合症分别地和独立地为本发明意义上的适应症、疾病或障碍，这也在本发明的范围内，所述症状、疾病、障碍或综合症直接或间接与有机体的接触有关或由其引起，所述有机体例如患有以下的动物或人类：衣原体(Chlamydia)物种，优选致病性衣原体(Chlamydia)，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。因此并且仅借助于举例，本发明意义上的疾病为肺炎以及支气管炎和慢性阻塞性肺疾病。
本文所述各种化合物用于的疾病还可以为其中表达根据本发明的多肽的那些疾病或其中本文所述的化合物例如根据本发明的多肽、疫苗、抗体或任何适配子和镜像异构体分别适合治疗和/或诊断其的任何疾病，这也在本发明内。此类潜在应用可以分别由交叉反应性和同源性产生。本领域技术人员理解，与根据本发明的药物组合物相关描述的任何疾病可以进行使用本文所述的药物组合物，反之亦然。
本发明上下文的治疗是指治疗性治疗和预防性(prophylactic)或预防性(preventative)措施，其中目的在于预防或降低(减轻)靶向的致病性状况或障碍。需要治疗的那些包括已经患有疾病的那些以及倾向于患有疾病的那些或在其中要预防疾病的那些。
在更进一步的实施方式中，本发明涉及使用任何根据本发明的多肽或任何根据本发明的核酸的筛选方法。像这样的筛选方法对于本领域技术人员而言是已知的，并且可以如此设计以筛选激动剂或拮抗剂。与此类筛选方法相关，优选地筛选这样的拮抗剂，其在本案中抑制或预防根据本发明的任何抗原或其片段与相互作用伴侣的结合。此类相互作用伴侣可以为天然发生的相互作用伴侣或非天然发生的相互作用伴侣。
本发明还提供用于筛选化合物以鉴定增强(激动剂)或阻断(拮抗剂)根据本发明的多肽或本发明的核酸分子的功能，例如其与结合分子的相互作用的那些。筛选方法可以包括高通量的。
例如，为了筛选激动剂或拮抗剂，根据本发明的多肽的相互作用伴侣，可能为合成反应混合、细胞区室(cellular compartment)，例如膜，细胞包膜或细胞壁，或其任何的制剂，其可以从细胞制备，所述细胞表达与根据本发明的多肽结合的分子。将制剂与标记形式的此类多肽在候选分子的不存在或存在下一起孵育，所述候选分子可以为激动剂或拮抗剂。候选分子与结合分子结合的能力反映了标记的配体的降低的结合。无效地(gratuitously)结合，即不诱导所述多肽的功能效应的分子最可能是良好的拮抗剂。良好地结合并且引发与相对于根据本发明的多肽相同或紧密相关的功能效应的分子为良好的激动剂。
潜在激动剂和拮抗剂的功能效应可以例如通过以下测定：确定报道系统的活性，然后使候选分子与细胞或合适的细胞制剂相互作用，将该效应与根据本发明的多肽或与所述多肽引起相同效应的分子的效应比较。关于此点可以使用的报道系统包括但不限于转化成产物的比色标记的底物，对根据本发明的多肽的功能活性上的改变应答的报道基因和结合检验是本领域已知的。
用于拮抗剂的检验的另一实例为竞争检验，其使根据本发明的多肽和潜在的拮抗剂与膜-结合结合分子、重组结合分子、天然底物或配体、或底物或配体模拟物在用于竞争抑制检验的合适条件下结合。根据本发明的多肽可以例如通过放射性或比色化合物标记，以使与结合分子结合的或转化成产物的根据本发明的多肽的分子数可以精确地确定以评估潜在拮抗剂的有效性。
潜在的拮抗剂包括小有机分子、肽、多肽和抗体，其与根据本发明的多肽结合并由此抑制其活性或使其活性消失。潜在的拮抗剂还可以为小有机分子、肽、多肽例如紧密相关的蛋白质或抗体，其与结合分子上的相同位点结合而不诱导根据本发明的多肽的功能活性。
潜在的拮抗剂包括小分子，其结合并占据根据本发明的多肽的结合位点，由此防止与细胞结合分子的结合，从而预防正常的生物活性。小分子的实例包括但不限于小有机分子、肽或类肽分子(peptide-likemolecules).
其它潜在的拮抗剂包括反义分子(参见(Okano，H.等，1991)；OLIGODEOXYNUCLEOTIDES AS ANTISENSE INHIBITORS OF GENEEXPRESSION；CRC Press，Boca Raton，FL(1988)，用于这些分子的描述)。
优选的潜在的拮抗剂包括本发明的抗原及其片段的衍生物。
如本文所用，根据本发明的多肽的活性为其与任何其相互作用伴侣结合的能力或此类与其或任何相互作用伴侣结合的能力的程度。
在特别方面，本发明提供根据本发明的多肽、抗原及其片段、本发明的核酸分子或抑制剂在干扰病原体和哺乳动物宿主之间的起始物理相互作用上的用途，所述相互作用对感染的后遗症负责。具体地，本发明的分子可以用于：i)预防本文公开的以下有机体粘附至哺乳动物细胞外基质蛋白：衣原体(Chlamydia)物种，更优选其致病性物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.tra chomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)；ii)阻断哺乳动物细胞外基质蛋白和细菌蛋白之间的细菌粘附，所述细菌蛋白介导组织反应；iii)或导致免疫防御的规避(evasion)；iv)例如通过抑制营养获得阻断感染中发病机理的正常进展，所述感染由除了植入留置装置(in-dwelling device)或通过其它外科技术之外的引起。
本文提供的各DNA编码序列可以用于发现、开发和/或制备抗菌化合物。当表达时编码的蛋白可以用作筛选抗菌药物的靶。此外，编码编码蛋白的氨基区域的DNA序列或Shine-Delgarno或各mRNA的其它翻译促进序列可用于构建反义序列以控制目的编码序列的表达。
拮抗剂或激动剂可以用于例如抑制由以下感染引起的疾病：衣原体(Chlamydia)物种，优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C. muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
在另一方面本发明涉及亲和装置。此类亲和装置包括至少载体材料和连接到载体材料的任何根据本发明的多肽。由于所述多肽对于其靶细胞或靶分子或其相互作用伴侣的特异性，所述多肽允许从应用到载体材料上的任何种类的样品中选择性地除去其相互作用伴侣，条件是满足结合的条件。样品可以是生物或医学样品，包括但不限于，发酵肉汤、细胞碎片、细胞制剂、组织制剂、器官制剂、血液、尿、淋巴液、酒(liquor)等。
根据本发明的多肽可以以共价或非共价方式连接到基质上。合适的载体材料对于本领域技术人员而言是已知的，并且可以选自：纤维素、硅、玻璃、铝、顺磁珠、淀粉和右旋糖。
本发明通过以下图、表、实施例和序列表进一步描述，从其可以获得进一步的特性、实施方式和优点。应该理解本实例仅以例举的方式而不是限制公开内容地给出。
关于本发明
图1显示作为病原体特异性抗体的来源的人类血清的表征。
图2显示文库的表征。
图3显示使用生物素化的人类IgA通过MACS选择细菌细胞。
图4显示PCR分析以在各细菌病原体的临床分离株中确定所选抗原的基因分布。
表1显示使用基因组肺炎衣原体(C.pneumoniae)AR 39文库和人类血清进行的筛选的总结
表2显示用于基因分布分析的菌株。
表3显示对于所选数量的抗原在各细菌物种的各种菌株中的基因分布分析的总结。
说明书中可能引用的图和表在以下更详细地描述。
图1显示通过免疫印迹测定的就抗-肺炎衣原体(C.pneumoniae)抗体的人类血清的表征。血清使用衣原体(Chlamydia)原体(EB)制剂通过IgG-ELISA就高抗-肺炎衣原体(C.pneumoniae)IgG抗体水平预选择。从肺炎衣原体(C.pneumoniae)AR 39感染的海拉细胞中分离的原体的蛋白质在SDS-PAGE凝胶上分离并转移到硝基纤维素膜。显示以5,000x稀释使用所选患者血清的代表性试验的结果。使用抗-人IgG二抗试剂使印迹显影。选择反应最强的样品进入筛选池(用*指示)。Mw：分子量标记。
图2(A)显示肺炎衣原体(C.pneumoniae)AR39大片段基因组文库，LCPn-50的片段大小分布。测序480个随机选择克隆后，将序列修剪(trimmed)以消除载体残基，绘制具有各种基因组片段大小的克隆的数量。(B)显示相同的LCPn-50的随机测序克隆的组在肺炎衣原体(C.pneumoniae)染色体(根据AR39的基因组数据)上的分布的图形描述。矩形表示针对有注释的ORF的匹配序列，菱形表示针对非编码染色体序列分别在+/+或+/-方向的完全匹配克隆。圆形用嵌合序列定位所有克隆。碱基对的数值距离在环形基因组上就取向指示。各种克隆组在文库内的划分在图的底部以数字和百分比给出。
图3(A)显示使用人IgA的MACS选择。用15至30μgIgA(P14-IgA，从人类血清纯化)和10μg生物素化的抗-人IgA抗体筛选在pMAL9.1中的LCPn-50文库。作为阴性对照，不添加血清至用于筛选的文库细胞。对于两轮选择的每一次显示在1st和/或2nd洗脱后所选择的细胞的数量。(B)显示按照通过使用人类血清I gA池(P14-I gA)的免疫印迹分析分析的，通过细菌表面展示所选择的特定克隆(1-22)的反应性，所述人类血清IgA池用于通过MACS选择，浓度为1μg/ml。
图4显示使用各寡核苷酸和17个肺炎衣原体(C.pneumoniae)和沙眼衣原体(C.trachomatis)菌株，对于两种基因的基因分布分析的PCR分析的实例。基因组DNA以1∶25至1∶50的稀释使用。2微升的各PCR加载到1％琼脂糖凝胶上。衍生自来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)的抗原CP0238和CP0242的PCR片段的预测大小，分别为683和935bp。1-13，15-17，菌株或临床分离株如表2中所示；-，无基因组DNA；+，肺炎衣原体(C.pneumoniae)菌株AR 39(表2中的菌株14)的基因组DNA。
表1：通过细菌表面展示鉴定的免疫原性蛋白
A，在具有P14-IgA的lamB中的肺炎衣原体(C.pneumoniae)AR39的50bp文库(LCPn-50)(修剪后的克隆数量：767)；B，在具有P14-IgA的fhuA中的300bp文库(LCPn-300)(883)。列出所选择的克隆的数量每ORF以及由所选择的克隆描绘(delineate)的免疫原性区域。CP0019，有注释的肺炎衣原体(C.pneumoniae)的阅读框；ARF 0008，在CP0008的另一阅读框中预测的新ORF；CRF0082，在CP0082的互补阅读框上预测的新ORF。*，长于5个的能够诱导抗体应答的序列的预测使用程序ANTIGENIC(Kolaskar，A.S.and Tongaonkar，P.C.，1990)进行；**，能够诱导II类-限制性T细胞应答的序列的预测使用程序IEDBAnalysis resource(Bui，H.H.等，2005)进行。进行针对12种MHCII型HLA DRB1*0101，*0301，*0401，*0405，*0701，*0802，*0901，*1101，*1302，*1501，HLADRB4*0101和HLADRB5*0101预测。选择具有比IC50＝5000nM更强的结合的表位。
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0019   保守假定蛋白   20-28，  32-40，45-56，  85-96，102-118，120-130，132-154，158-172，174-181，193-202，208-221，228-241，250-259，274-283，285-291，296-309，317-324，328-339，348-354，383-391，402-412，418-428，443-455，467-482，484-490，519-525，545-557，568-582，601-606，613-638，   48-59，267-277，452-467，497-512，659-673   A：1   249-260   25   123
  646-656，661-676，687-694，706-724，741-766，776-782，789-798，812-822，847-869
  CP0020   保守假定蛋白   28-37，  44-88，95-102， 107-115，142-150，212-226，228-233，235-245，262-269，278-311，319-338，343-354，372-405，409-418，426-435，439-445，447-462，471-478，481-490，502-514，522-529，539-565，568-589，595-605，608-622，645-651，656-662，665-670，679-685，696-715，731-744，775-781，789-809   315-326，428-442，741-756，789-808   B：9   569-636   26   124
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0052   青霉素结合蛋白，假定的   6-14，21-44，52-70，74-93，106-132，136-157，162-168，174-184，186-223，232-248，250-262，264-270，278-284，303-324，342-348，352-357，409-415，423-442，444-454，458-478，480-494，499-509，514-521，529-538，541-559，561-575，582-605，611-619，630-638，647-665，672-683，696-719，727-739，748-791，800-806，   24-38，108-123，599-620，775-788，939-949   B：3   697-758，808-875   27   125
  815-822，848-855，860-868，876-884，891-896，898-950，956-962，971-980，995-1008，1036-1043，1045-1061，1069-1074
  CP0057  转氨酶，V类   7-13，21-27，33-57，63-72，74-80，82-88，94-105，107-119，121-132，134-152，162-199，201-225，229-237，239-246，252-258，261-267，277-298，300-325，340-366，373-383，391-401   17-30，40-59，71-83，93-113，216-231，260-277，371-385，392-404   A：3   3-23   28   126
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0058  保守假定蛋白   4-17，22-32，45-58，60-70，72-86，88-98，100-108，112-121，128-138，148-162，167-176，184-198，216-231，241-248   3-37，42-52，58-67，72-83，94-114，123-137，142-160，197-209，218-250   B：3   139-199   29   127
  CP0064  肽ABC转运体，ATP结合蛋白   6-23，32-52，60-77，84-90，92-107，117-163，165-239，249-254，273-280，289-308   7-22，24-35，78-93，97-110，124-136，162-176，193-209，213-225，230-239   B：2   20-89   30   128
  CP0075  D-丙氨酰-D-丙氨酸羧肽酶   5-49，52-59，65-95，102-108，115-123，126-139，142-153，   12-27，125-138，190-202，   A：2   168-178   31   129
  180-186，193-204，206-214，225-247，270-278，280-297，303-319，321-337，344-358，363-371，378-389，399-406，412-419   260-277，394-417
  CP0129   脂酸蛋白连接酶相关蛋白   4-30，32-38，43-50，55-62，64-72，76-83，97-119，125-132，139-156，158-172，204-210，221-227   9-21，26-37，49-63，84-97，107-120，127-137，142-154，197-208，223-235   B：3   112-182167-216   32   130
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0154   苯丙氨酰基-tRNA合成酶β链   4-16，21-31，39-57，61-67，73-99，105-111，119-128，135-147，150-159，163-196，213-246，248-255，257-284，286-293，295-317，333-360，369-387，389-413，415-422，424-438，443-454，461-467，478-490，508-520，527-532，534-551，557-564，566-576，578-588，596-684，687-711，713-724，729-741，749-758，770-782   526-543，609-624，654-673，682-699   A：2   518-538   33   131
  CP0159   保守假定蛋白   4-13，38-59，80-90，95-102，108-123，130-183，190-223，239-249   7-25，45-63，91-122，173-183，216-227   B：2   31-105   34   132
  CP0168   tRNA假尿苷合酶A   4-13，27-38，43-48，53-74，82-100，104-110，112-137，147-154，169-179，184-192，196-223，234-249，252-262   1-11，30-43，70-86，142-150，192-207，217-229   B：2   119-187   35   133
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0186   secDF蛋白，假定的   7-36，45-50，52-92，103-125，129-138，140-154，163-176，178-188，194-203，207-222，230-239，244-297，299-314，324-332，335-343，361-368，370-404，409-416，426-443，451-456，459-469，477-493，496-513，515-522，529-535，540-546，549-561，578-586，588-596，609-628，636-645，659-665，668-687，708-724，726-739，761-770，788-795，818-825，842-869，872-883，887-897，905-972，976-984，988-998，1015-1030，1033-1051，1076-1082，1084-1107，1141-1151，1167-1180，1184-1189，1193-1205，1221-1228，1235-1254，1258-1305，   428-440，561-572，859-870，919-930，1055-1067   A：1   34-43   36   134
  1307-1314，1326-1335，1350-1369，1371-1395
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0210   ABC  转运体，ATP结合蛋白   4-14，22-32，48-61，63-71，79-111，119-145，147-167，179-186，188-201，217-223，227-235   12-25，44-60，72-88，97-117，145-158，178-201，211-221   A：50   223-241   37   135
  CP0212   多形态膜蛋白B/C家族   14-29，31-38，50-56，68-74，81-89，108-118，125-138，144-151，167-175，215-228，252-262，272-279，281-288，322-344，358-374，386-395，406-418，426-441，455-465，485-490，513-519，521-528，538-543，548-555，558-574，577-583，585-596，608-624，636-643，665-672，680-686，699-707，715-730，747-755，775-786，812-818，824-841，856-868，892-899，930-946，963-972，979-984，1008-1015，1032-1038，1044-1050，1052-1060，1092-1110，1143-1148，1157-1181，   6-26，1430-1441，1648-1666   A：23，B：4   91-170，1369-1393，1423-1486   38   136
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  1184-1196，1215-1222，1229-1244，1248-1255，1267-1272，1282-1295，1300-1311，1323-1329，1390-1396，1399-1407，1423-1431，1452-1458，1478-1484，1488-1501，1504-1511，1521-1551，1573-1599，1622-1641，1644-1663，1669-1675，1681-1688，1692-1711
  CP0213   多形态膜蛋白A家族   7-33，39-47，53-66，72-104，117-126，132-138，146-154，160-167，182-188，199-213，259-270，283-289，291-308，314-326，328-334，352-358，364-370，372-379，407-417，424-445，461-475，477-485，488-497，510-516，539-553，567-581，589-595，668-687，697-707，709-731，733-752，756-765，772-780，797-827，845-852，   84-94，113-125，141-152，331-342，716-728，743-763   B：2   397-456   39   137
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  860-876，884-891，896-903，915-922
  CP0225   2-氧酸脱氢酶，E2组分，硫辛酰胺(lipoamide)   17-23，26-34，36-42，45-51，53-63，69-79，89-97，106-119，146-161，175-184，186-201，217-244，252-265，268-278，280-294，304-315，324-340，343-351，353-374   17-27，110-120，166-179，220-234，251-262，282-294，322-339，354-366，379-387   A：2   32-48   40   138
  CP0238   泛醌/甲基萘醌生物合成甲基转移酶   17-27，34-40，47-65，68-112，114-126，133-148，150-157，163-187，190-204，207-234   5-25，34-51，115-125，140-152，166-181，191-201，215-233   A：2，B：2   5-66   41   139
  CP0242   保守假定蛋白   4-16，20-42，60-66，75-108，112-117，131-138，148-153，157-174，201-206，213-228，235-243，246-259，266-271，295-301，311-316，331-337，344-353，364-377，383-389，405-412，452-458，470-487，491-505，508-517，540-555，557-565，576-587，593-603，612-617   20-31，159-177，235-244，362-371，444-454   B：5   271-367   42   140
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0251   dnak蛋白   7-14，18-25，30-35，43-48，82-98，102-111，139-149，165-185，189-197，203-219，231-236，268-277，291-301，   8-23，122-130，289-300，289-300，336-345，388-398，   A：9   270-279，621-632   43   141
  303-311，315-330，332-340，344-354，365-374，381-400，404-409，419-426，431-441，457-467，469-475，481-490，556-562，605-613，649-655   590-614
  CP0285   多形态膜蛋白E/F家族   4-15，23-32，48-67，76-83，86-94，97-105，107-120，127-136，180-185，206-212，251-257，313-322，325-331，340-353，374-381，397-403，407-413，420-432，450-457，471-483，492-503，505-515，519-530，539-548，558-579，602-611，625-633，636-643，650-656，658-666，677-683，686-694，707-714，716-730，745-763，765-786，791-830，841-857，864-870，873-885，887-895，912-919，921-938，940-949   84-97，141-152，181-189，318-328，439-447，498-512，656-668，819-828   B：15   146-221，782-847   44   142
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0294   假定蛋白   4-32，34-61，65-75，81-91，99-106，121-132，150-156，162-170，174-182，189-196，201-214，230-236，239-246，276-285，287-295，301-310，335-354，366-383，390-398，   3-17，53-72，187-199，452-465，468-483，592-601   B：2   216-283   45   143
  408-433，439-445，466-478，499-519，525-544，550-555，572-580，589-603，624-633，648-655，659-671，677-682
  CP0301   多形态膜蛋白G家族   5-29，42-60，72-77，114-143，151-157，162-174，177-182，185-193，233-251，266-274，279-298，301-308，321-335，338-365，378-386，388-396，401-407，412-434，439-459，475-480，499-505   7-21，74-84，91-101，119-130，363-372，387-396   A：3   245-264，367-374   46   144
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0307   多形态膜蛋白G家族   4-26，28-34，57-64，75-81，95-100，126-141，144-150，158-163，200-210，216-221，243-249，291-309，326-339，363-369，380-389，396-403，410-422，436-455，485-498，516-525，541-576，608-619，635-641，664-674，683-692，697-703，707-723，737-749，760-765，775-808，827-839，851-859，869-875，877-884，886-906，910-927   2-13，542-552，627-637，652-660，798-807   B：7   716-781   47   145
  CP0308   多形态膜蛋白G家族   4-29，43-48，56-66，70-82，93-102，107-113，127-152，159-164，179-184，201-207，216-224，   7-23，173-185，530-540，726-734   B：1   692-760   48   146
  231-239，244-250，262-269，291-305，307-313，333-340，368-374，379-387，414-422，432-438，440-461，487-498，518-524，539-548，557-567，610-615，644-651，667-675，681-693，709-718，721-726，734-758，780-817，833-843，856-865，872-879，893-900，902-908，913-921
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0309   多形态膜蛋白G家族   4-22，58-73，85-106，115-129，139-145，170-181，185-191，199-204，242-249，270-276，293-303，332-339，353-359，387-392，424-439，459-472，532-538，555-563，593-604，631-636，654-659，679-686，689-705，718-733，740-751，756-771，789-796，798-805，834-842，851-856，885-894，922-930，934-947，953-960，963-975，983-988，1008-1019，1026-1038，1041-1083，1086-1098，1121-1157，1159-1166，   10-24，1065-1079，1101-1110，1141-1156   B：2   1189-1244   49   147
  1169-1182，1192-1207，1209-1216，1232-1260
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0378   2-酮戊二酸脱氢酶，E1组分   5-12，38-50，70-91，109-157，169-182，185-191，205-229，234-251，262-279，287-314，321-331，335-351，356-364，366-373，377-383，386-394，396-415，417-429，437-448，456-467，490-496，504-512，518-530，533-543，545-555，577-586，603-610，617-628，635-662，670-682，689-699，713-719，724-741，745-769，779-784，790-808，816-850，866-879，894-905   80-90，212-221，233-243，286-296，356-367，531-541，859-869   A：5   446-462   50   148
  CP0392   假定蛋白   6-23，26-31，35-99，108-120，134-146，154-167，171-178，183-189，194-203，206-212，241-250，252-270，278-298，302-338   3-14，31-45，51-69，70-91，152-165，257-268，299-311   A：2   79-94，136-145   51   149
  CP0405   假定蛋白   21-26，31-37，42-92，100-127，131-149，182-188，190-214，216-231，249-257，264-289，305-326，332-342，348-357，360-368，379-385，387-393，396-410，421-427，   42-51，62-75，79-88，264-276，336-353，398-406   B：2   97-165   52   150
  435-452
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0409   保守假定蛋白   4-9，16-21，23-29，34-41，46-51，58-73，104-113，115-122，125-134，141-168   17-32，44-70，89-103，122-133，150-165   A：1   106-123   53   151
  CP0444   硫氧还蛋白还原酶   4-11，16-34，82-98，103-114，132-147，151-158，164-182，215-221，236-244，253-259，261-267，272-283，285-307   4-13，23-40，61-74，169-191，203-212，289-297   B：16   16-80   54   152
  CP0457   阳离子外膜蛋白0mpH，假定的   4-18，20-34，50-56，64-69，100-109，114-131，142-150，159-165   3-20，48-59，75-83，104-122   B：1   36-113   55   153
  CP0484   DNA旋转酶，亚单位B   10-23，36-48，55-66，68-75，95-109，116-151，156-169，173-192，199-205，208-213，219-226，232-238，246-256，276-284，295-314，332-343，358-373，381-393，406-426，431-438，454-469，481-492，519-533，536-551，556-561，567-572，594-608，612-619，629-638，665-681，685-697，710-727，759-777，792-798   191-200，276-285，307-321，523-535，568-577，721-729，772-780   A：1   303-330   56   154
  CP0504   保守假定蛋白   7-13，29-39，54-60，62-68，99-104，126-138，140-153，159-190，204-210，217-223，234-240，   6-17，79-88，98-107，125-137，159-167，   A：4   154-168   57   155
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  243-262，270-278   173-191，267-276
  CP0529   保守假定蛋白   4-22，50-58，71-77，83-93，108-127，143-153，158-191，205-213，221-228   6-27，36-45，147-157，172-197   A：6   28-49   58   156
  CP0559   焦磷酸-果糖6-磷酸1-磷酸转移酶   4-22，26-35，38-61，63-76，85-99，101-109，145-151，153-160，162-172，180-187，194-202，208-215，223-231，235-247，253-273，278-295，302-323，337-358，366-404，420-434，436-450，454-468，474-485，491-514，524-533，539-545   175-187，242-254，377-389，450-467，493-503，528-538   B：3   406-485   59   157
  CP0569   肽ABC转运体，周质肽-结合蛋白   7-30，35-45，53-70，78-105，120-127，129-143，151-158，162-193，208-216，219-249，252-258，277-308，311-321，323-347，359-364，375-385，389-395，401-409，414-420，436-449，467-474，491-507，513-519   6-27，94-106，135-145，255-265，289-311   B：2   421-488   60   158
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0625   保守假定蛋白(S/T蛋白激酶)   12-22，27-35，38-53，60-81，87-94，96-113，115-136，144-172，189-196，208-237，239-251，258-265，272-292，296-305，319-331，351-371，378-389，404-425，   36-49，59-70，100-113，121-130，147-155，351-360   B：2   442-492，526-610   61   159
  428-436，443-448，458-477，501-513，535-541，547-554，557-565，574-584，590-598
  CP0664   信号肽酶I，假定的   10-30，36-46，56-67，78-105，116-124，126-142，146-160，166-172，186-198，207-224，249-256，278-289，297-304，307-315，318-350，352-367，373-388，395-413，427-438，444-455，457-472，482-490，495-501，512-522，529-535，537-552，572-580，589-620   17-28，291-300，340-352，362-371，387-396   A：2   194-207   62   160
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0678   切除核酸酶(excinuclease)ABC，亚单位A   4-14，16-22，26-34，40-50，56-65，75-86，88-101，105-117，126-132，134-142，145-170，172-191，193-205，214-223，227-235，247-290，294-319，332-339，345-355，363-369，394-403，407-412，429-466，468-475，494-510，515-522，528-534，539-545，556-562，574-589，596-604，609-627，637-647，663-671，679-689，694-702，708-715，718-727，738-744，750-758，774-808，   425-443   B：2   1058-1076，1643-1700   63   161
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  815-836，840-883，890-906，910-929，933-943，951-967，972-986，988-1027，1032-1041，1045-1058，1069-1079，1081-1102，1117-1123，1125-1143，1145-1168，1173-1178，1186-1199，1202-1209，1214-1220，1225-1242，1244-1251，1257-1266，1269-1275，1295-1313，1339-1345，1364-1377，1390-1410，1412-1431，1438-1459，1472-1499，1511-1537，1543-1549，1553-1560，1566-1579，1585-1609，1621-1632，1636-1665，1669-1718，1721-1730，1734-1761，1763-1787，1796-1802，1805-1823
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0694  DNA指导的RNA聚合酶，β亚单位   11-21，27-48，58-69，73-89，100-110，142-152，165-178，187-196，203-216，238-246，254-262，278-288，294-299，308-315，334-340，366-374，376-386，392-401，406-412，444-459，463-469，474-479，484-490，500-517，524-534，542-552，566-578，586-594，603-628，643-664，668-692，699-706，714-726，729-735，747-755，765-771，778-785，804-814，822-837，848-855，860-886，898-909，912-919，925-933，936-942，945-957，966-975，978-997，1015-1035，1045-1055，1066-1076，1082-1107，1141-1179，1193-1214，1240-1246，1252-1259   685-693，699-709，1065-1075，1147-1158   A：2   1068-1077   64   162
  CP0719   磷酸葡萄糖变位酶/磷酸甘露糖变位酶，假定的   7-15，17-28，34-39，83-96，100-107，119-149，152-158，168-174，176-213，220-231，237-262，264-273，280-286，318-327，338-348，   66-80，169-178，262-271，333-348，360-370，554-564   B：2   228-287   65   163
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  358-369，371-386，405-410，413-421，427-443，445-462，467-473，483-490，498-503，513-527，529-537，540-546，581-590
  CP0761   多形态膜蛋白G家族   4-16，18-24，57-69，121-140，151-157，159-166，175-183，206-212，261-272，276-283，285-305，321-327，343-350，352-367，383-389，410-416，424-435，448-455，457-464，469-478，493-499，509-528，543-555，564-575，584-594，608-631，635-658，667-676，683-689，692-698，708-731，737-750，757-774，778-784，798-805，809-815   5-17，131-141，183-198，376-385   B：9   786-836   66   164
  CP0790   1-脱氧木酮糖-5-磷酸合酶   4-30，35-47，49-67，73-86，114-120，123-132，140-160，168-176，195-201，211-218，220-256，261-285，313-328，330-349，367-373，375-385，388-422，449-488，509-547，553-569，582-597，599-606   33-43，187-200，223-232，259-272，306-316，443-452，461-472   B：5   306-370   67   165
  CP0815   分支酸合酶   6-11，19-44，62-72，78-87，101-108，128-142，149-185，   62-70，141-161，224-238，   A：3   259-277，298-320   68   166
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  191-198，204-222，224-241，284-294，296-301，304-311，327-356   297-305，339-354
  CP0837   保守假定蛋白   6-23，34-59，66-75，79-96，106-117，119-130，133-143，164-172，179-193，195-207，215-241，247-261，285-293，300-307，317-329，346-352，357-362，368-384，397-408，416-424，432-453，461-485，493-501，518-527，533-544，552-562，574-588，604-613   12-22，82-94，186-194，371-382，434-447，580-589   A：3   498-506   69   167
  CP0879   假定蛋白   4-13，15-21，32-41，43-54，56-84，86-93，95-113，120-126，130-165，175-189，195-202，210-222，244-250，253-270，273-280，283-291，301-313，315-339   27-38，56-38，77-102，174-185，259-270，298-309，319-331   B：2   138-205   70   168
  CP0938   保守假定蛋白   6-25，28-87，93-100，105-112，118-133，138-145，157-165，167-184，198-209，220-237，245-252，254-262，265-277，288-299，310-326，335-362   10-18，28-51，59-68，127-138，167-177，338-347   B：3   247-293   71   169
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP0946   3(2)，5-二磷酸核苷酸酶   8-19，21-27，29-36，49-67，84-101，103-122，128-157，159-166，168-177，   52-67，86-98，127-138，144-167，   A：2   61-74   72   170
  181-187，192-205，207-217，222-251，255-266，272-280，284-297，306-322   227-237，282-296，307-319
  CP0977   氧-非依赖性粪卟啉原III氧化酶   9-25，33-41，48-73，78-86，89-97，100-106，117-135，141-147，164-181，189-195，200-215，226-251，267-283，289-300，318-324，332-340，355-362，374-382，389-394，397-402，422-448，450-455   1-18，124-137，244-258，298-310，324-343，368-384，431-450   B：4   201-262   73   171
  CP1002   细胞形状决定蛋白MrdB   4-31，36-45，52-76，78-118，120-135，145-164，167-228，241-250，269-279，283-312，315-333，337-362，364-376   9-25，75-88，104-116，121-133，180-197，215-227，324-338   B：13   208-288   74   172
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP1020   螺旋酶，Snf2家族   24-34，39-50，52-60，70-93，96-105，124-130，146-168，173-183，195-213，217-231，248-259，267-285，304-312，314-322，334-350，365-388，391-403，408-416，418-443，450-477，496-503，516-522，544-550，565-592，594-600，614-635，639-670，691-705，707-714，733-744，751-764，777-787，797-829，848-856，   234-244，336-346，457-468，1002-1012   A：12，B：4   938-1000   75   173
  864-887，901-913，919-938，941-950，955-961，966-990，1004-1023，1027-1033，1040-1047，1053-1058，1063-1073，1079-1090，1104-1109，1112-1124，1128-1134，1138-1145，1149-1155
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CP1056   通用分泌途径蛋白(generalsecretionpathwayprotein)D   4-28，59-66，93-98，128-134，140-164，166-186，198-208，211-227，233-240，246-258，264-277，282-291，297-302，318-349，362-370，372-386，393-417，420-427，437-462，464-473，481-503，508-514，519-533，543-549，554-568，584-592，636-647，655-662，680-688，702-707，716-723，726-731，738-746   3-18，332-340，445-454，580-591   B：2   309-374   76   174
  CP1062   保守假定蛋白   16-31，78-84，131-140，145-155，168-174，176-193，219-225，253-292，303-368，376-406，420-436，444-453，468-485   251-270，342-352，380-405，407-417，443-451   A：1，B：2   36-109，375-388   77   175
  ARF0008   假定蛋白(27aa)   4-14   1-27   A：5   10-21   78   176
  ARF0009   假定蛋白(143aa)   18-35，47-55，65-82，106-112，117-140   22-46，56-70，79-96，98-107，119-135   B：2   71-134   79   177
  ARF0014   假定蛋白(41aa)   15-38   10-38   A：2   5-26   80   178
  ARF0044   假定蛋白(58aa)   31-48，50-55   10-20，29-43   A：2   21-36   81   179
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  ARF0138   假定蛋白(20aa)   无   3-18   A：2   1-10   82   180
  ARF0195   假定蛋白(23aa)   6-14   8-19   A：2   13-23   83   181
  ARF0199   假定蛋白(39aa)   4-10   5-22   A：20   5-11   84   182
  ARF0297   假定蛋白(34aa)   9-18，21-30   7-34   A：1   22-32   85   183
  ARF0533   假定蛋白(94)   4-13，31-39，56-74，76-83，85-91   21-34，61-72，74-92   B：1   11-72   86   184
  ARF0965   假定蛋白(69aa)   8-32，38-49，57-66   5-14，21-34，42-54   A：2   4-18   87   185
  ARF1099   假定蛋白(34aa)   4-19，25-31   4-32   A：2   13-26   88   186
  CRF0082   假定蛋白(101aa)   1-9，17-25，38-49，52-58   1-9，38-55   B：9   8-77   89   187
  CRF0151   假定蛋白(36aa)   4-16，20-27   4-12，20-30   A：50   5-27   90   188
  CRF0265   假定蛋白(47aa)   20-26，32-41   20-42   A：8   4-18   91   189
  CRF0302   假定蛋白(133aa)   4-15，21-41，45-55，63-92，105-123   41-52，66-81，104-121   A：3   30-45   92   190
  CRF0306   假定蛋白(18aa)   无   1-17   A：4   4-16   93   191
  CRF0484   假定蛋白(32aa)   4-17，19-25   4-32   A：9   12-25   94   192
  肺炎衣原体抗原性蛋白   推定功能(通过同源性) 预测的免疫原性aa*   预测的II类限制性T细胞表位/区域**   所选择克隆的数量每ORF和筛选   鉴定的免疫原性区域(aa)的位置 Seq.ID(DNA) Seq.ID(蛋白)
  CRF0796   假定蛋白(53aa)   5-31，33-50   10-45   A：69   37-48   95   193
  CRF0819   假定蛋白(23aa)   10-17   2-23   A：18   4-21   96   194
  CRF0823   假定蛋白(72aa)   4-21，52-69   8-29，41-50，52-72   A：7   18-44   97   195
  CRF1103   假定蛋白(32aa)   11-29   3-26   A：5   11-22   98   196
表2.用于基因分布分析的菌株的列表
表2显示用于基因分布研究分析的肺炎衣原体(C.pneumoniae)和沙眼衣原体(C.trachomatis)的菌株。给出菌株的物种和来源。肺炎衣原体(C.pneumoniae)AR39用于产生基因组文库
  No   菌株ID   物种   描述
  1   MUL-1   肺炎衣原体   临床分离株
  2   MUL-250   肺炎衣原体   临床分离株
  3   PB-2   肺炎衣原体   临床分离株
  4   PB-4   肺炎衣原体   临床分离株
  5   CV-2   肺炎衣原体   临床分离株
  6   CV-3   肺炎衣原体   临床分离株
  7   CV-4   肺炎衣原体   临床分离株
  No   菌株ID   物种   描述
  8   CV-5   肺炎衣原体   临床分离株
  9   CV-6   肺炎衣原体   临床分离株
  10   CV-14   肺炎衣原体   临床分离株
  11   L2   沙眼衣原体   参考菌株
  12   C/TW   沙眼衣原体   参考菌株
  13   CM-1   肺炎衣原体   参考菌株
  14   AR 39   肺炎衣原体   参考菌株
  15   TWAR   肺炎衣原体   参考菌株
  16   CWL-029   肺炎衣原体   参考菌株
  17   2043   肺炎衣原体   参考菌株
表3.在肺炎衣原体(C.pneumoniae)和沙眼衣原体(C.trachomatis)的各种菌株中的所选数量的抗原的基因分布分析
使用对编码相关抗原的基因特异的寡核苷酸通过PCR测试包括如表2中所示AR39菌株作为阳性PCR对照的17个衣原体(Chlamydia)菌株。基因分布表就各基因列出了来自15个肺炎衣原体(C.pneumoniae)和2个沙眼衣原体(C.trachomatis)菌株的阳性PCR结果的数量，并且为在肺炎衣原体(C.pneumoniae)和沙眼衣原体(C.trachomatis)(例如：14/1；14肺炎衣原体(C.pneumoniae)和1沙眼衣原体(C.trachomatis)菌株阳性)的各种分离株中基因的存在和保守的指示。
ORF   SEQ ID NO(DNA) 基因分布
  CP0019   25   15/1
  CP0020   26   15/1
  CP0052   27   15/1
  CP0057   28   15/1
ORF   SEQ ID NO(DNA) 基因分布
  CP0058   29   15/1
  CP0064   30   15/2
  CP0075   31   15/2
  CP0129   32   15/1
  CP0154   33   15/1
  CP0159   34   14/1
  CP0186   36   14/2
  CP0210   37   6/1
  CP0225   40   15/2
  CP0238   41   13/1
  CP0242   42   15/2
  CP0409   53   15/2
  CP0504   57   15/1
  CP0529   58   12/1
  CP0559   59   15/1
  CP0664   62   14/2
  CP0790   67   15/1
  CP0815   68   15/2
  CP0879   70   15/1
ORF   SEQ ID NO(DNA) 基因分布
  CP0938   71   15/1
  CP0946   72   13/1
  CP0977   73   15/2
  CP1002   74   15/2
实施例
实施例1：用于鉴定根据本发明的肽的一般筛选过程
已经用于本发明的方法，基于由肺炎衣原体(C.pneumoniae)编码的蛋白质或肽与在人类血清中存在的抗体的相互作用。由人类免疫系统针对肺炎衣原体(C.pneumoniae)产生并且存在于人类血清中的抗体，指示抗原性蛋白的体内表达及其免疫原性。此外，使用预选择的血清的池通过细菌表面展示表达文库鉴定的抗原性蛋白，通过个体选择或产生的血清在第2和3轮筛选中处理。这样，本发明提供有效、相关、综合的抗原的组作为药物组合物，特别是防止由肺炎衣原体(C.pneumoniae)引起的感染的疫苗。
在用于鉴定根据本发明的综合的抗原的组的抗原鉴定程序中，用几种血清池或血浆组分(抗体池)筛选来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)的至少两种不同的细菌表面表达文库。抗体池源自血清收集，其已经针对肺炎衣原体(C.pneumoniae)的抗原性化合物，例如全细胞、总提取物测试。确定具有高ELISA滴度的血清必须与多种蛋白在免疫印迹中反应，以在用于本发明的筛选方法中被认为是相关的。
本发明中所用的表达文库应该允许所有潜在的抗原的表达，所述抗原例如衍生自肺炎衣原体(C.pneumoniae)的所有分泌的表面蛋白。细菌表面展示文库将由细菌宿主的重组文库代表，所述细菌宿主在细菌宿主膜处展示肺炎衣原体(C.pneumoniae)的有关两个所选择的外膜蛋白(LamB和FhuA)的表达的肽序列的(全部)组(Georgiou，G.，1997；Etz，H.等，2001)。使用重组表达文库的优点之一在于鉴定的血清-反应性抗原可以立即通过筛选和选择的克隆的编码序列的表达产生而无需进一步的重组DNA技术或必需的克隆步骤，所述筛选和选择的克隆表达该抗原。
通过根据本发明所述的程序鉴定的综合的抗原的组可以进一步通过一轮或多轮另外的筛选来分析。因此，可以使用鉴定为免疫原性的个体抗体制剂或针对所选择的肽产生的抗体。根据优选实施方式，用于第二轮筛选的个体抗体制剂源自健康成人和/或人工感染的成人(challenged adult)，其显示在特定最低水平之上的抗体滴度，例如高于测试的人类(患者或健康个体)血清80个百分点，优选高于90个百分点，特别是高于95个百分点的抗体滴度。在第二轮筛选中使用此类高滴度个体抗体制剂允许高度选择性地鉴定来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)的抗原及其片段。
综合筛选过程后，选择的抗原性蛋白，其表达为重组蛋白，或万一它们不能在原核表达系统中表达-体外翻译产物，或合成产生的抗原性肽，可以通过一系列的ELISA和Western印迹检验测试，以用于使用大的人类血清收集(最小值～20个健康和患者血清)评估其免疫原性。
重要的是个体抗体制剂(其还可以为选择的血清)允许选择性地鉴定来自第一轮的所有有希望的候选物的所有血清-反应性抗原中的最有希望的候选物。因此，优选至少10个个体抗体制剂(即来自暴露到所选病原体的至少10个不同个体的抗体制剂(例如血清))应该用于在第二轮筛选中鉴定这些抗原。当然，还可以使用低于10个个体制剂，然而，使用低数量的个体抗体制剂该步骤的选择性可能不是最佳的。另一方面，如果给定的抗原(或其抗原性片段)被至少10个个体抗体制剂，优选至少30，特别是至少50个个体抗体制剂识别，抗原的鉴定对于合适的鉴定也是充分选择性的。当然可以使用尽可能多的个体制剂测试血清-反应性(例如使用超过100个，或甚至超过1,000个)。
因此，根据本发明方法的抗体制剂的相关部分应该优选至少10，更优选至少30，特别是至少50个体抗体制剂。作为选择(或组合)抗原还可以优选使用用于第二轮筛选的所有个体抗体制剂的至少20％，优选至少30％，特别是至少40％来鉴定。
根据本发明的优选实施方式，从其制备用于第二轮筛选的个体抗体制剂的血清(或其用作抗体制剂)，通过其针对肺炎衣原体(C.pneumoniae)(例如针对该病原体的制剂，例如裂解液、细胞壁组分或重组蛋白)的滴度来选择。优选地，当全有机体(总裂解液或全细胞)用作在ELISA中的抗原时，一些使用在1,000U之上，特别在5,000U(U＝单位，在给定稀释下从OD405nm读数计算)之上的IgG滴度来选择。
被血清抗体识别的线性表位的识别可以基于短至4-5个氨基酸的序列。当然，这不必然地意味着这些短肽能够在体内诱导给定的抗体。由于这个原因，定义的表位、多肽和蛋白质被进一步在动物中(主要在小鼠中)就其在体内诱导针对所选择的蛋白的抗体的能力进行测试。
用于细胞外细菌的优选抗原位于细胞表面或被分泌，并且因此为细胞外可及的。来自在宿主细胞中细胞内阶段的细菌的抗原还可以源自细胞内位置，但必须在宿主细胞上作为抗原呈递。期望针对细胞壁蛋白的抗体用作多种目的：抑制粘附、干扰营养获得，抑制免疫逃避，和促进噬菌作用(Hornef，M.等，2002)。针对分泌蛋白的抗体的有益之处在于其作为毒素或毒性组分的功能的中和作用。还已知细菌通过分泌蛋白相互通信。针对这些蛋白的中和抗体将干扰引起感染的病原体物种之间或内部的生长-促进交叉对话(cross-talk)。生物信息分析(信号序列、细胞壁定位信号、以及跨膜结构域)证明在评估细胞表面定位或分泌上非常有用。试验方法包括从人类血清中具有相应表位的抗体和蛋白的分离，在小鼠中针对(多)肽的免疫血清的产生，所述(多)肽通过细菌表面展示筛选选择。这些血清然后用于第三轮筛选作为在至少一种以下检验中的试剂：在不同条件下生长的肺炎衣原体(C.pneumoniae)的细胞表面染色(FACS或显微镜检查)、中和能力的确定(毒性、粘附性)、和调理作用(opsonisation)和噬菌作用的促进(体外噬菌作用检验)。
为此目的，将细菌大肠杆菌(E.coli)克隆直接注射入小鼠，并且取免疫血清并在相关的体外检验中测试。作为选择，特异抗体可以从人类或小鼠血清中使用肽或蛋白质作为底物来纯化。
根据本文使用的抗原鉴定方法，如本文所述，本发明可以令人惊奇地提供肺炎衣原体(C.pneumoniae)的综合的新核酸和新蛋白质、抗原及其片段，等的组。编码此类抗原的根据本发明的核苷酸序列优选具有Seq ID Nos 1至98单独地所示的核苷酸序列，由此相应的编码氨基酸序列具有如Seq ID Nos 99至196所示的氨基酸序列。
特定抗原的所有线性片段可以通过具有至少10个氨基酸长度的1个氨基酸重叠的肽组，通过分析蛋白质抗原的全序列来鉴定。随后，非线性表位可以通过使用血清使用表达的全长蛋白质或其结构域多肽分析抗原来鉴定。假定蛋白质的独特结构域足以形成独立于天然蛋白的3D结构，使用血清分析各重组或合成产生的结构域多肽将允许鉴定多结构域蛋白的各结构域内的构象表位。对于这些其中结构域拥有线性以及构象表位(conformationalepitope)的抗原，使用符合线性表位的肽的竞争试验可以用于确认构象表位的存在
实施例2基于抗衣原体抗体的人类血清样品的表征和选择以及抗体筛选试剂的制备
试验步骤
酶联免疫吸附检验(ELISA).商业上获得的ELISA试剂盒，Chlamydien-IgG-ELISA medac(Medac Gmbh，Germany)，其使用高度纯化和特异的抗原，用于测定抗肺炎衣原体(C.pneumoniae)抗体滴度。测定血清的三种稀释液，400x，200x，100x，并且反应性表达为滴度＞1∶400；1∶400；1∶200；1∶100和＜1∶100。
免疫印迹.将用作细菌抗原提取物的原体(EB)，从肺炎衣原体(C.pneumoniae)AR39感染的海拉细胞培养物中根据Wang等(1991)分离。EB的感染性被破坏，并且蛋白质通过添加包含SDS和2-巯基乙醇的SDS-PAGE样品缓冲液来溶解。约5μg的总蛋白质通过SDS-PAGE使用BioRad Mini-Protean 3Cell电泳系统分离，并且将蛋白质转移至硝基纤维素膜(ECL，Amersham Pharmacia)。在5％牛奶中封闭过夜后，以5,000x的稀释添加人类血清，并且HRP标记的抗-人IgG用于检测。
用于基因组筛选的抗体的纯化.基于总体的抗-衣原体滴度筛选5种血清以用于用于筛选步骤的血清池。针对大肠杆菌(E.coli)蛋白的抗体通过将热失活的血清与全细胞大肠杆菌(E.coli)细胞(DH5α，用pHIE11转化，在与用于细菌表面展示相同的条件下生长)一起孵育来除去。来自合并的耗竭血清(depleted sera)的高度富集的IgA的制剂通过亲和色谱使用在抗生蛋白链菌素-琼脂糖(GIBCO BRL)上固定的生物素-标记的抗-人IgA(Southern Biotech)来纯化。IgA纯化品的有效性通过SDS-PAGE和蛋白质浓度测定(OD280nm)来检查。
结果
如上所述，针对肺炎衣原体(C.pneumoniae)由人类免疫系统产生的并且存在于人类血清中的抗体指示抗原性蛋白的体外表达及其免疫原性。这些分子在本发明所述的方法中鉴定个体抗原是必需的，其基于特异性抗-衣原体抗体和相应的肺炎衣原体(C.pneumoniae)肽或蛋白质的相互作用。为了可以使用相关的抗体库(antibodyrepertoires)，人类血清从具有肺炎衣原体(C.pneumoniae)相关感染，例如肺炎和支气管炎的症状的患者中选择。通过医学血清学的测试指示肺炎衣原体(C.pneumoniae)为病原体(causative agent)。
肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)感染通过血清学来检测和诊断，因为病原体使用常规的微生物方法不能培养。基于抗原检测的高度特异和选择性的诊断试剂盒已经开发出并且可以商业上获得。我们已经选择具有高滴度的患者血清，所述高滴度针对肺炎衣原体(C.pneumoniae)并通过标准衣原体(Chlamydia)ELISA试剂盒检测，所述试剂盒常规地用于临床以诊断由衣原体(Chlamydia)引起的急性、慢性和持续性感染。测试了185个血清样品，选择源自个体的所有样品以基于临床症状就肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)的特异性抗体的存在诊断测试。83个血清显示抗体滴度＞1∶400；34个血清显示约1∶400的滴度；14个血清1∶200；20个血清1∶100以及34个血清具有滴度＜1∶100。根据流行病学研究肺炎衣原体(C.pneumoniae)运输和感染是普遍的，一生中具有经常的再感染。为此原因，血清的初次选择目的在于鉴定具有最高IgG滴度(＞400)的样品以降低非特异性、假阳性诊断的风险。
随后，通过免疫印迹分析预选择的血清以确保针对在肺炎衣原体(C.pneumoniae)中存在的多种蛋白质抗原的抗体反应性。图1中所示的代表性免疫印迹证明，当针对从在体外培养物中感染的人类细胞(海拉)分离的原体的蛋白质测试时，不同模式的反应性使用个体血清检测。基于这些免疫印迹分析选择展示不同模式反应性的血清，获得了特别的关注。
将5个选择的血清合并以进一步就丰富的抗体富集，但仍具有不同个体的抗体库的表现。基于关于IgG抗体获得的数据，IgA从合并的血清(包括个体血清P922，P923，P 925，P928，和P949；后三个示于图1)通过亲和色谱纯化，并减少大肠杆菌(E.coli)-反应性抗体以避免在细菌表面展示筛选中的背景。
实施例3：肺炎衣原体(C.pneumoniae)的高度随机、读框选择(frame-selected)、小片段的基因组DNA文库的产生
试验步骤
衣原体基因组DNA的制备。肺炎衣原体(C.pneumoniae)AR39按照Campbell，L.A.等(1989)所述培养。分离原体(EB)并将其用于制备基因组DNA。来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)EB的基因组DNA按照Cox，R.L.等(1988)所述制备。将最终的基因组DNA制剂溶解于ddH2O。
小基因组DNA片段的制备。来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)AR39的基因组DNA使用杯角(cup-horn)超声破碎器(Bandelin Sonoplus UV2200sonicator，配备有BB5杯角，10sec.脉冲，以100％功率输出)机械地剪切成大小为150至300bp的片段或通过温和的DNA酶I处理(Novagen)剪切成大小50至70bp的片段。观察到当将DNA破碎成150-300bp大小范围的片段时，超声波处理产生紧密地多的片段大小分布。然而，尽管将DNA暴露到超声波-诱导的流体力学剪切力，随后片段大小的降低不能有效和可再现地实现。因此，50至70bp大小的片段将通过温和的DNA酶I处理使用Novagen′s鸟枪裂解试剂盒(shotgun cleavage kit)获得。制备试剂盒配备的DNA酶I的1∶20稀释液，并且在MnCl2存在下以60μL的体积在20℃下进行消化5分钟，以确保通过酶的双链裂解。用2μL的0.5M EDTA停止反应，在2％TAE-琼脂糖凝胶上评价片段效率。该处理导致基因组DNA的总体片段化成近50-70bp的片段。片段然后使用T4DNA聚合酶在100μM各dNTP的存在下平末端化两次，以确保有效地清洗末端。片段在连接反应中立即使用或在-20℃下冷冻以用于随后的使用。
载体的描述。载体pMAL4.31在pASK-IBA主链(Skerra，A.，1994)上构建，所述pASK-IBA主链具有与卡那霉素抗性基因交换的β-内酰胺酶(bla)基因。此外，将bla基因克隆入多克隆位点。将编码成熟β-内酰胺酶的序列置于ompA的前导肽序列之前以穿过细胞膜有效地分泌。此外，编码成熟β-内酰胺酶的前12个氨基酸(间隔序列)的序列在ompA前导肽序列之后，以避免前导肽酶切割位点后序列立即融合，因为在该区域带正电的氨基酸的聚簇(cluster)将降低或禁止移动穿过细胞膜(Kajava，A.等，2000)。SmaI限制性位点用于文库插入。用于所选择片段的恢复(recovery)的上游FseI位点和下游NotI位点，侧翼于SmaI位点。这三个限制性位点在编码12个氨基酸间隔序列的序列之后以这样的方式插入，以使bla基因在-1阅读框中转录，导致在NotI位点之后15bp处的终止密码子。+1bp插入恢复(restores)bla ORF，以产生具有随后获得氨苄青霉素抗性的β-内酰胺酶蛋白。
载体pMAL 9.1通过将lamB基因克隆入pEH1的多克隆位点来构建(Hashemzadeh-Bonehi，L.等，1998)。随后，将包含限制性位点FseI，SmaI and NotI的序列插入在氨基酸154之后的lamB中。用于此插入的阅读框以如此的方式构建，从而使通过使用FseI和NotI消化从质粒pMAL4.31切下的读框-选择的DNA片段的转移产生lamB和各插入的连续阅读框。
载体pHIE11通过将fhuA基因克隆入pEH1的多克隆位点来构建。其后，将包含限制性位点FseI，XbaI和NotI的序列插入在氨基酸405之后的thuA中。用于此插入的阅读框以如此的方式选择，从而使通过使用FseI和NotI消化从质粒pMAL4.31切下的读框-选择的DNA片段的转移产生fhuA和各插入的连续阅读框。
用于读框选择(frame selection)的文库的克隆和评价。将基因组肺炎衣原体(C.pneumoniae)AR39DNA片段连接到载体pMAL4.31的SmaI位点。重组DNA电穿孔到DH10B电感受态的大肠杆菌(E.coll)细胞(GIBCO BRL)，并使转化体在补充有卡那霉素(50μg/ml)和氨苄青霉素(50μg/ml)的LB-琼脂上铺平板。平板在37℃下孵育过夜，并且收集克隆以用于大规模DNA提取。将代表性的平板贮存和保存以用于收集用于克隆PCR分析和大规模测序的克隆。简单的克隆PCR检验用于最初确定大致的片段大小分布以及插入效率。从测序数据计算精确的片段大小，插入位点处的接合完整性以及读框筛选精度(3n+1规律(rule))。
用于细菌表面展示的文库的克隆和评价。将包含具有限制性酶FseI和NotI的肺炎衣原体(C.pneumoniae)文库的基因组DNA片段从pMAL4.31载体切下。全部群体的片段然后转移到质粒pMAL9.1(LamB)或pHIE11(FhuA)，其已经用FseI和NotI消化。使用这两种限制性酶，其识别8bp富GC序列(8bp GC rich sequence)，将在pMAL4.31载体中选择的阅读框保持在各平台载体中。质粒文库然后通过电穿孔转化入大肠杆菌(E.coli)DH5α细胞。将细胞在补充有50μg/mL卡那霉素的大LB-琼脂平板上铺平板，并在37℃以产生清楚可见单个克隆的密度生长过夜。然后将细胞从这些平板的表面刮下，用新鲜LB培养基洗涤，并以用于文库筛选的等分试样形式贮存在-80℃。
结果
用于读框筛选(frame selection)的文库。两个文库(LCPn-50和LCPn-300)在pMAL4.31载体中产生，分别具有约50和300bp的大小。对于每一文库，约1μg pMAL4.31质粒DNA和50ng片段化的基因组肺炎衣原体(C.pneumoniae)基因组AR 39DNA的连接和随后转化在读框筛选后产生6x104至3x105个克隆。为了评估文库的随机性，测序LCPn-50的480个随机选择的克隆。将载体序列修剪(trimming)后，390个可以进行生物信息分析，显示这些克隆中仅非常少的可以呈现多于一次。此外，显示98％的克隆落入25至100bp的大小范围，平均大小46bp(图2)。几乎所有的序列遵循3n+1规律，显示所有的克隆合适地被读框选择。
细菌表面展示文库。在大肠杆菌(E.coli)表面上的肽的展示需要来自LCPn文库的插入物从读框筛选载体pMAL4.31转移到展示质粒pMAL9.1(LamB)或pHIE11(FhuA)。将基因组DNA片段用FseI和NotI限制性酶切下并且将5ng插入物与0.1μg质粒DNA连接，随后转化入DH5α细胞，产生2x105至2x106个克隆。将克隆从LB平板上刮下，并冷冻而不进一步扩增。
实施例4：使用细菌表面展示的基因组文库和人类血清鉴定来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)的高免疫原性肽序列
试验步骤
MACS筛选。约2.5x108个来自给定文库的细胞在5mL补充有50μg/mL卡那霉素的LB-培养基中在37℃下生长2h。通过添加1mM IPTG30min诱导表达。将细胞用新鲜LB培养基洗涤两次，使约2x107个细胞再悬浮于100μL LB培养基并转移到Eppendorf管。
将从血清纯化的10至20μg生物素化的、人类IgA添加至细胞，使悬浮液在4℃下轻微摇动过夜。添加900μL的LB培养基，使悬浮液混合并随后以6,000rpm在4℃下离心10min。细胞用1mL LB洗涤一次，然后再悬浮于100μL LB培养基。添加10μL与抗生蛋白链菌素偶合的MACS微珠(Miltenyi Biotech，Germany)，并且孵育在4℃下持续20min。其后添加900μL LB培养基，将MACS微珠细胞悬浮液加载到固定到磁体上的平衡的MS柱(Miltenyi Biotech，Germany)上。(MS柱通过用1mL 70％EtOH洗涤1次和用2mL LB培养基洗涤2次来平衡)。
然后用3mL LB培养基将柱洗涤3次。除去磁体后，细胞通过用2mL LB培养基洗涤来洗脱。用3mL LB培养基将柱洗涤后，在同一柱上第二次加载2mL洗脱液，并且重复洗涤和洗脱过程。第三次进行加载、洗涤和洗脱过程，产生2ml的终洗脱液。
将两轮筛选后选择的细胞在补充有50μg/mL卡那霉素的LB-琼脂平板上铺平板，并在37℃下生长过夜。
通过测序和Western印迹分析评价所选择的克隆。随机选择的克隆在3mL补充有50μg/mL卡那霉素的LB培养基上在37℃下生长过夜，以使用标准方法制备质粒DNA。测序在MWG(德国)或Agowa(德国)上进行。
对于Western印迹分析，约10至20μg的总细胞蛋白通过10％SDS-PAGE分离并在印迹到HybondC膜(Amersham Pharmacia Biotech，England)上。LamB或FhuA融合蛋白使用以约1∶3,000至1∶5,000的稀释的人类血清作为一抗，以1∶5,000稀释的与HRP偶合的抗-人IgA抗体作为二抗。使用ECL检测试剂盒(Amersham Pharmacia Biotech，England)进行检测。作为选择，兔抗-FhuA或兔抗-LamB多克隆免疫血清用作一抗与和HRP偶合的各二抗联合以用于检测融合蛋白。
结果
通过磁性激活细胞分选(MACS)使用生物素化的IgA筛选细菌表面展示文库。在pMAL9.1中的文库LCPn-50和在pHIE11中的LCPn-300用来自患者血清的生物素化的人IgA的池筛选(参见实施例2：用于基因组筛选的抗体的纯化，和实施例2的结果的最后一段)。按照试验步骤下的描述进行选择步骤。图3A显示使用LCPn-50文库和P14-IgA筛选获得的数据。从来自MACS筛选的第一次选择循环之后的克隆计数可以看出，最后恢复的细胞的总数从1x108细胞显著地降低至约5x104细胞，而不使用添加的抗体的选择显示降低至约1x104细胞的数量(图3A)。第二轮后，使用P14-IgA约1x104细胞恢复，而当不添加来自人类血清的IgA时恢复仅1-2x103细胞，清楚地显示选择依赖于肺炎衣原体(C.pneumoniae)特异性抗体。为了评价筛选的性能，随机挑选25个选择的克隆，并使用筛选IgA(P14-IgA)池进行免疫印迹分析(图3B)。该分析揭示，约80％的选择的克隆显示与在相关血清中存在的抗体的反应性，而表达LamB且没有肺炎衣原体(C.pneumoniae)特异性插入物的对照菌株不与相同的血清反应(未示出)。通常，观察到反应率在40至80％的范围内。克隆PCR分析显示所有选择的克隆包含期望大小范围内的插入物。
随后较大数量的随机挑选的克隆的测序(约600个克隆每筛选)导致基因和相应的肽或蛋白质序列的鉴定，所述基因和相应的肽或蛋白质序列被用于筛选的人类血清抗体特异性识别。特异性克隆选择的频率至少部分反映用于筛选的血清中特异性抗体的丰度和/或亲和力，和识别通过此克隆呈递的表位。在这点上，引人注目的是，衍生自某些ORF(例如CP0210，CP0212)的克隆非常频繁地被挑选出(27至50次)，指示他们的高免疫原性质。表1总结了就两次进行的筛选获得的数据。在表1中存在的所有克隆已经通过免疫印迹分析使用来自单个克隆的全细胞提取物证明，以显示与用于各筛选的人类血清的池的指出的反应性。从表1中可以看出，各ORF的不同区域鉴定为免疫原性，因为蛋白质可变大小的片段通过平台蛋白在表面上展示。
进一步还值得注意的是，通过细菌表面展示筛选鉴定的大量表面编码肺炎衣原体(C.pneumoniae)的蛋白质，其不具有指定的功能或甚至可以组成尚未被之前生物信息学分析预测的蛋白质。这样，许多这些候选物组成肺炎衣原体(C.pneumoniae)的新抗原性蛋白。
实施例5：从肺炎衣原体(C.pneumoniae)鉴定的具有高免疫原性蛋白质的基因分布研究
试验步骤
通过PCR的抗原的基因分布。理想的疫苗抗原将为这样的抗原，其存在于疫苗针对的所有，或大多数靶有机体的菌株中。为了确定编码鉴定出的肺炎衣原体(C.pneumoniae)抗原的基因是否在相关菌株中普遍存在地出现，在一系列独立细菌分离株上使用对目的基因特异的引物进行PCR。作为引物的寡核苷酸序列针对约1,000bp的所有鉴定的ORF产生产物而设计，如果可能覆盖所有鉴定的免疫原性表位。
为了制备基因组DNA，收获在一个6孔板中培养的衣原体(Chlamydia)细胞，并将其转移至Falcon管。在玻璃珠的存在下通过摇晃10min来破坏细胞，细胞碎片通过在4℃下以900rpm随后离心5min来除去。上清液在10℃下以13,000rpm离心1小时，以收集染色体DNA。将球团(pellet)再悬浮于1mL PBS中并以200μL等分试样的形式贮存。基因组DNA的提取使用QIAamp DNA MiniKit(Qiagen)根据制造商的建议进行。
使用Taq聚合酶(1U)、200nM dNTP s、10pMol各寡核苷酸和根据制造商说明书的试剂盒(Invitrogen，The Netherlands)以25μL的反应体积进行PCR。作为标准，进行30个循环(1x：5min.95℃，30x：30s ec.95℃，30sec.56℃，30sec.72℃，1x4min.72℃)，除非条件必须适合各引物对。
结果
编码免疫原性蛋白的27个鉴定的基因的选择在17个不同衣原体(Chlamydia)菌株(15个肺炎衣原体(C.pneumoniae)和2个沙眼衣原体(C.trachomatis)；表2)中通过PCR就其存在进行测试。所有的阴性PCR数据通过独立的试验确认，以消除假阴性结果。由于针对各特定基因的特异性寡核苷酸的使用，阴性PCR还可由寡核苷酸的3’区域的错配导致。然而在大多数情况下，通过另外的手段确认基因的不存在不认为是必需的。在＞90％的肺炎衣原体(C.pneumoniae)菌株(＞13/15)中检测到85％(23/27)，而在＞75％的肺炎衣原体(C.pneumoniae)菌株(＜12/17)中仅1个失去，因此分类为不充分保守的。此外，几种基因还可存在于分析的两种沙眼衣原体(C.trachomatis)菌株(例如CP0064，CP0664)。作为实例，图4显示使用所有指定的17种菌株，对于两种肺炎衣原体(C.pneumoniae)抗原CP0238和CP0242的PCR反应。可以清楚地看出，CP0242基因存在于所有分析的菌株中，而CP0238基因在3个菌株中不存在，并且从另外的5-6个菌株仅微弱地扩增。使用选择的抗原的所有结果总结于表3.重要的是，超过90％的测试抗原在肺炎衣原体(C.pneumoniae)的分析菌株中良好地保守，涉及基因-特异性PCR产物的存在和大小。因此，这些抗原表示有价值的候选物以保证进一步的研究，从而评价其疫苗潜力。
实施例6：在所选择抗原内的HLAII类限制性T细胞表位或表位区域的鉴定
试验步骤
HLA II类限制性表位预测
使用程序IEDB Analysis resource(Bui，H.H.等，2005)进行通过细菌展示在鉴定的抗原内的HLA II类限制性表位的预测。预测就12种MHC II类HLA DRB1*0101，*0301，*0401，*0405，*0701，*0802，*0901，*1101，*1302，*1501，HLADRB4*0101和HLADRB 5*0101进行。选择具有高于IC50＝5000nM的结合的表位。为了确定其中大多数表位位于的区域，对于各等位基因确定十个最强结合表位的定位。这允许我们查看来自不同等位基因的表位是否与相同区域结合。这些区域然后可以在IEDB程序中就MHCII结合肽选择和分析。选择在至少4个MHCII等位基因中包含命中的区域。仅在其中表位在较大的区域中连续地重叠的情况下，预测整个区域(可能大于25个氨基酸)。
结果
T细胞表位为源自刺激细胞(T细胞)免疫应答的非自身(或自身)蛋白的信息的最小必须单位。它们存在于在针对T细胞受体(TCR)的抗原呈递细胞的表面处的MHC I类或II类分子的裂缝(cleft)中。在MHC分子的裂缝中由TCR和病原体-衍生的肽表位的相互作用触发的细胞事件的接下来的级联反应(cascade)，起通知细胞免疫系统存在细菌、病毒或寄生虫的作用。表位-特异性T细胞应答的诱导可以改进针对病原体的免疫应答并从而提供允许保护免受感染或清除由各病原体引起的感染的方法，对于所述病原体不存在传统的疫苗。对于T细胞表位的生物信息学预测方法的精度是显著的(Martin，W.等，2003)，并且因此通过细菌表面展示提供针对所述抗原鉴定方法的补充方法，其基于在B细胞表位上的试验鉴定。由于ORF，对应于在通过人类血清中的抗体识别的基础上鉴定的抗原，很可能还包含线性T细胞表位，本发明的目的在于还提供用于所列抗原的T细胞表位的组。
相应HLA II类辅助-表位的分子定义用于设计合成的人抗衣原体疫苗，其可以包括免疫记忆，因为衍生自衣原体抗原的辅助-表位提供″同源帮助(cognate help)″给针对这些抗原或其片段的B细胞应答。此外，可以使用这些辅助-表位来诱导对T-非依赖性抗原例如碳水化合物(缀合疫苗)的记忆。MHC II类分子结合由11至25个氨基酸组成的肽(具有9个氨基酸的识别序列)，并且被CD4+辅助T细胞显著地识别。从表1明显的看出，通过细菌表面展示鉴定的几乎所有抗原包含许多潜在的MHC II类-限制性表位，其还可以与鉴定的B细胞表位(例如CP0444)重叠。
此外，细胞内肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)可以被CD8+细胞毒性T细胞消除，其识别HLA I类限制性表位。MHC I类分子在具有两个保守锚定残基的长度为8至10个氨基酸的一般肽中呈递。在保护性免疫应答的背景下，表位特异性T细胞可以持续作为记忆细胞，从而当遭遇时允许针对病原体的更快的应答。因此两种类型的细胞免疫应答是互补的，预防性以及治疗性疫苗应该被设计成包含I类-限制性和II类-限制性表位。表位还可以使用生物信息学算法预测，但在此不具体地列出。
鉴定出的肽或抗原的片段(例如重叠15个(overlapping15-mers))可以合成并就其与各种MHC分子在体外结合的能力测试。其免疫原性还可以通过评估肽(抗原-)-驱动的增殖(BrdU或3H-胸腺嘧啶的引入)或体外T细胞的细胞因子(ELIspot，细胞内细胞因子染色)的分泌(Schmittel，A.等，2000；Sester，M.等，2000)。在这点上，确定针对在患有不同衣原体感染的患者中，或在克隆个体vs既不是近期感染也不是克隆的健康个体中的衣原体抗原或所选择的混合性肽(promiscuous peptide)或其片段的T细胞应答上的定量和定性差异，这是令人感兴趣的。此外，预测的肽的免疫原性可以在HLA-转基因的小鼠中测试(Sonderstrup，G.等，1999)。
此外，可以将抗原/表位注入小鼠，并且然后可以确定诱导的抗体和T细胞应答。通过抗原通过接种诱导的抗体和T细胞的保护能力可以在动物模型中评估。所有这些方法对于本领域技术人员而言是可以获得的。
参考文献
以下在本说明书中以节略形式已经引用的参考文献在此通过参考将其全文引入
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在说明书、权利要求和/或中描述的本发明的特性可以单独地或组合地成为用于以其各种形式实现本发明的材料。
序列表
<110>Intercell AG
 
<120>衣原体抗原
 
<130>ICP059-PCT
 
<150>EP07110472.3
<151>2007-06-18
 
<160>196
<170>PatentIn version 3.5
 
<210>1
<211>2613
<212>DNA
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>1
tctacctttt ctatccaaaa tcgactaaga accatttcag gtgaaagtac tcgaatcatc    60
aagctggacc ataagtactc tggttttgat cccagatcag tgcctgcgat aaatttagaa    120
gagttaaatt cagggattta tgctctaagg catttaatga acgccctgca atcagaaaat    180
accaatgttg ctgctttatt aaacccaaac aatacgatct tccccacaac atcttggaca    240
gattacaagc attcgcgtcc gcaagctagc tctccaagag caccctcatc acaaactccc    300
acagatatcg tatcagcagc agctcttgct ttagttcttg ttattgacgg aggtctagcg    360
gaattagtgg cctccgttac agaaattgat ctcggagctt tatccactat atccacagtt    420
cgtcagttaa tggcgagcta cctcggtttg acaactctaa cagctgaaca agaaaaggtt    480
gtattttcca gctcctatgt tccttcagaa aaaaatctcc ttgaacatgt aaaacaagaa    540
aaagctgctg aaatccaagc taagcaagaa gaaataaaag cagtattaga agctaaagga    600
gtctctactg aagagatcga agcgatactt aaggaatatc ctgatatcta tgcagcagat    660
ttcttcaaag agtttataga agagccttta catacatatc gtgcaaaagt cggtgcaccg    720
atccaagaga tgaatgagaa cgcgattcag ctgcttccta cacctcctgc gatcactcct    780
gacaatgtca atgaagtcaa cggaatgaac accctcagca ctattttaca agctatagat    840
gatgctatta aacaagctcc tgcacttggt ggggatcagg aaatcattac tatactacaa    900
actttggttc ccctagtcga taagaccacg tttacaaaag ctgaattcga tcttatttac    960
acagcaacac aacttcctaa tacagcatct ttaaaactct accttacgga tagacaaatt    1020
gctgagtatc gagggaaaat cacgaaagta tatcaaaatt ctatccaaaa tctctctgag    1080
acaaaacgtg tagttgaaaa caaccgaagc atgctagaaa cacaactctc catgttccaa    1140
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<210>2
<211>2433
<212>DNA
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>2
cattcttttg cacaaagaca cagggaatct ttagaacata tcgctaatta tgagaagact    60
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<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
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<400>34
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<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
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<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
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<212>DNA
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>98
attccagtat tcaacaggaa caaaagcatc aatagccttt tctcgatcta cgacaagctt    60
caaagctaca gattgcacac gccctgcaga tatccc                              96
 
<210>99
<211>871
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>99
Ser Thr Phe Ser Ile Gln Asn Arg Leu Arg Thr Ile Ser Gly Glu Ser
1               5                   10                  15
Thr Arg Ile Ile Lys Leu Asp His Lys Tyr Ser Gly Phe Asp Pro Arg
            20                  25                  30
Ser Val Pro Ala Ile Asn Leu Glu Glu Leu Asn Ser Gly Ile Tyr Ala
        35                  40                  45
Leu Arg His Leu Met Asn Ala Leu Gln Ser Glu Asn Thr Asn Val Ala
    50                  55                  60
Ala Leu Leu Asn Pro Asn Asn Thr Ile Phe Pro Thr Thr Ser Trp Thr
65                  70                  75                  80
Asp Tyr Lys His Ser Arg Pro Gln Ala Ser Ser Pro Arg Ala Pro Ser
                85                  90                  95
Ser Gln Thr Pro Thr Asp Ile Val Ser Ala Ala Ala Leu Ala Leu Val
            100                 105                 110
Leu Val Ile Asp Gly Gly Leu Ala Glu Leu Val Ala Ser Val Thr Glu
        115                 120                 125
Ile Asp Leu Gly Ala Leu Ser Thr Ile Ser Thr Val Arg Gln Leu Met
    130                 135                 140
Ala Ser Tyr Leu Gly Leu Thr Thr Leu Thr Ala Glu Gln Glu Lys Val
145                 150                 155                 160
Val Phe Ser Ser Ser Tyr Val Pro Ser Glu Lys Asn Leu Leu Glu His
                165                 170                 175
Val Lys Gln Glu Lys Ala Ala Glu Ile Gln Ala Lys Gln Glu Glu Ile
            180                 185                 190
Lys Ala Val Leu Glu Ala Lys Gly Val Ser Thr Glu Glu Ile Glu Ala
        195                 200                 205
Ile Leu Lys Glu Tyr Pro Asp Ile Tyr Ala Ala Asp Phe Phe Lys Glu
    210                 215                 220
Phe Ile Glu Glu Pro Leu His Thr Tyr Arg Ala Lys Val Gly Ala Pro
225                 230                 235                 240
Ile Gln Glu Met Asn Glu Asn Ala Ile Gln Leu Leu Pro Thr Pro Pro
                245                 250                 255
Ala Ile Thr Pro Asp Asn Val Asn Glu Val Asn Gly Met Asn Thr Leu
            260                 265                 270
Ser Thr Ile Leu Gln Ala Ile Asp Asp Ala Ile Lys Gln Ala Pro Ala
        275                 280                 285
Leu Gly Gly Asp Gln Glu Ile Ile Thr Ile Leu Gln Thr Leu Val Pro
    290                 295                 300
Leu Val Asp Lys Thr Thr Phe Thr Lys Ala Glu Phe Asp Leu Ile Tyr
305                 310                 315                 320
Thr Ala Thr Gln Leu Pro Asn Thr Ala Ser Leu Lys Leu Tyr Leu Thr
                325                 330                 335
Asp Arg Gln Ile Ala Glu Tyr Arg Gly Lys Ile Thr Lys Val Tyr Gln
            340                 345                 350
Asn Ser Ile Gln Asn Leu Ser Glu Thr Lys Arg Val Val Glu Asn Asn
        355                 360                 365
Arg Ser Met Leu Glu Thr Gln Leu Ser Met Phe Gln Gln Ala Gln Asn
    370                 375                 380
Cys Phe Val Thr Trp Ile Ser Gln Ala Asn Ala Leu Asn Ile Ala Ile
385                 390                 395                 400
Thr Asn Lys Tyr Ile Ser Ala Val Leu Thr Thr Ser Met Glu Met Tyr
                405                 410                 415
Gly Gly Leu Leu Cys Leu Ser Tyr Met Tyr Glu Arg Leu Ala Asp Asp
            420                 425                 430
Glu Lys Ala Ile Phe Asp Lys Ser Val Asn Glu Tyr Leu Pro Ile His
        435                 440                 445
Ile Val Val Gly Gly Ser Trp Val Asn Gly Trp Ile Ala Lys Met Ala
    450                 455                 460
Ala Tyr Gln Glu Leu Ala Glu Tyr Ser Leu Gly Thr Ala Val Thr Ser
465                 470                 475                 480
Gln Asp Gln Ile Lys Ala Tyr Leu Gln Thr Arg Gly Asn Glu Phe Lys
                485                 490                 495
Ala Thr Arg His Phe Phe His Asn Ile Gly Asp Gln Met Tyr Gln Phe
            500                 505                 510
Ala Asn Glu Thr Val Phe Gly Asn Cys Leu Thr Thr Ala Asn Gly Ala
        515                 520                 525
Ile Gln Pro Asp Leu Gly Gly Phe Ile Arg Glu Ala Met Thr Asn Val
    530                 535                 540
Gly Thr Val Glu Ala Asp Tyr Val Ser Asn Ala Gln Arg Ile Leu Asn
545                 550                 555                 560
Glu Phe Asn Thr Ala Ala Thr Ala His Val Leu Gln Leu Gln Leu Gln
                565                 570                 575
Ile Ala Glu Leu Gln Lys Lys Ala Asp Asp Leu Asp Pro Gly Lys Ala
            580                 585                 590
Ser Phe Thr Glu Asn Arg Lys Phe Ala Val Ala Ala Trp Ile Thr Ser
        595                 600                 605
Glu Ser Leu Gly Asp Ala Leu Ile Ser Met Ile Leu Asn Ser Gln Leu
    610                 615                 620
Pro Lys Gln Glu Ala Phe Leu Lys Pro Leu Ile Glu Glu Ile Asn Phe
625                 630                 635                 640
Asn Asn Leu Ala Ala Asn Ala Leu Asn Ser Leu Leu Gln Ile Thr Asn
                645                 650                 655
Glu Phe Ser Thr Thr Ser Val Tyr Tyr Ser Leu Ser Ser Tyr Leu Val
            660                 665                 670
Gln Ser Lys Thr Gly Gln Asn Leu Phe Ala Gly Asp Tyr Tyr Glu Thr
        675                 680                 685
Leu Leu Ala Ala Ala Arg Glu Arg Glu Tyr Ile Tyr Arg Asp Thr Ala
    690                 695                 700
Arg Cys Lys Gln Ala Ile Asn Leu Val Asn Gly Leu Leu Gln Lys Ile
705                 710                 715                 720
Asn Ser Leu Pro Gly Ala Thr Ser Ala Gln Lys Gln Glu Met Leu Asn
                725                 730                 735
Ala Thr Thr Tyr Tyr Gln Tyr Ser Leu Ser Val Thr Leu Asn Gln Leu
            740                 745                 750
Thr Val Leu Glu Ser Leu Leu Ala Gly Leu Lys Met Thr Leu Gln Thr
        755                 760                 765
Thr Ser Asn Asn Lys Tyr Asp Lys Ser Val Phe Lys Ile Glu Ser Phe
    770                 775                 780
Asp Asp Trp Ile Pro Thr Leu Ala Ala Leu Glu Ser Phe Leu Thr Ser
785                 790                 795                 800
Gly Phe Pro Asn Ile Ser Ala Thr Gly Gly Leu Gly Pro Leu Phe Thr
                805                 810                 815
Gln Val Gln Ser Asp Gln Gln Thr Tyr Thr Ser Gln Gly Gln Thr Gln
            820                 825                 830
Gln Leu Asn Leu Gln Asn Gln Met Thr Thr Ile Gln Gln Glu Trp Thr
        835                 840                 845
Leu Val Ser Thr Ser Met Gln Val Leu Asn Gly Ile Leu Ser Gln Leu
    850                 855                 860
Ala Gly Ala Ile Tyr Ser Asn
865                 870
 
<210>100
<211>811
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>100
His Ser Phe Ala Gln Arg His Arg Glu Ser Leu Glu His Ile Ala Asn
1               5                   10                  15
Tyr Glu Lys Thr Thr Ala Glu Arg Asp Ile Leu Lys Arg Leu Ile Glu
            20                  25                  30
Val Leu Asp Gln Arg Ala Ser Glu Arg Tyr Arg Ser Ala Val Glu Lys
        35                  40                  45
Leu His Lys Tyr Glu Val Glu Arg Ala Thr Val Ala Lys Ser Ile Pro
    50                  55                  60
Val Ala Ala Ile His Glu Lys Pro Leu Ser Ser Thr His Ala Ser Val
65                  70                  75                  80
Gln Val Thr Ala Ser Thr Pro Ala Ala Thr Gly Ser Gly Val Gly Ala
                85                  90                  95
Tyr Tyr Asn Ala Val Lys Gln Lys Trp Ala Gln Asp Leu Ile Val Glu
            100                 105                 110
Leu Asn Thr Val Met Thr Thr Ile Met Ala Ser Val Asn Ser Lys Asn
        115                 120                 125
Pro Ala Asn Lys Asp Val Phe Asp Lys Leu Asn Thr Glu Leu Gln Ala
    130                 135                 140
Leu Val Ala Ala Gly Asn Asn Leu Thr Glu Glu Asn Phe Gln Thr Leu
145                 150                 155                 160
Tyr Asn Phe Pro Glu Glu Ile Phe Thr Ala Ile Gln Arg Ala Asp Thr
                165                 170                 175
Phe Thr Gly Gly Met Lys Thr Asp Phe Thr Asn Gln Leu Ala Gly Lys
            180                 185                 190
Tyr Gly Asn Gln Ala Thr Leu Thr Gln Thr Phe Ala Asp Gly Arg Val
        195                 200                 205
Glu Gly Phe Lys Asp Ile Leu Thr Ala Val Gln Gly Val Leu Thr Pro
    210                 215                 220
Glu Gln Phe Thr Ile Phe Ala Glu Ile Ala Thr Glu Leu Gln Ala Leu
225                 230                 235                 240
Ala Asp His Val Gly Asn Phe Asp Glu Ala Gly Leu Gln Arg Ile Glu
                245                 250                 255
Asp Ala Gly Glu Lys Leu Ala Ala Val Ile Asn Ser Ser Asp Leu Thr
            260                 265                 270
Arg Asn Asp Lys Ile Met Phe Cys Gln His Ile Thr Asp Leu Tyr Ser
        275                 280                 285
Asp Gln Val Ala Ala Leu Gly Ser Phe Asp Thr Val Leu Asp Ala Ser
    290                 295                 300
Ile Tyr Val Asn Gln His Gln Gly Thr Met Phe Ser Asn Leu Ser Ser
305                 310                 315                 320
Phe Val Gly Ser Leu Ile Gly Thr Phe Ala Pro Ile Asp Leu Ser Ser
                325                 330                 335
Ser Gln Gly Asp Ile Ser Ser Ala Ala Leu Ala Gly Ala Leu Gln Thr
            340                 345                 350
Ala Arg Gly Leu Asn Ser Arg Phe Asn Glu Leu Thr Ala Glu Gln Gln
        355                 360                 365
Lys Leu Ile Asn Glu Cys Ile Lys Ser Leu Val Thr Phe Lys Cys Gly
    370                 375                 380
Glu His Leu Gly Ala Ile Trp Ala Tyr Phe Thr Ala Ser Thr Val Val
385                 390                 395                 400
Ala Leu Asn Pro Thr Ala Thr Met Asp His Val Lys Ala Ala Ile Leu
                405                 410                 415
Glu Glu Ala Lys Glu Leu Asp Asn Ser Ser Phe Gln Leu Ala Ser Ser
            420                 425                 430
Ile Lys Ser Ala Met Thr Ser Ile Val Asn Ser Ser Gly Ser Phe Ser
        435                 440                 445
Val Thr Val Asn Ser Ser Thr Leu Gln Tyr Thr Ile Tyr Ser Glu Lys
    450                 455                 460
Asn Gly Lys Val Glu Ile Asn Gln Ile Leu Leu Asn Tyr Gly Ser Thr
465                 470                 475                 480
Gly Phe Leu Pro Glu Ile Thr Lys Leu Ala Lys Thr Asn Ala Glu Ser
                485                 490                 495
Thr Ala Arg Ser Tyr Phe Arg Phe Lys Ala Leu Ala Ala Val Glu Ser
            500                 505                 510
Glu Asn Val Gln Asn Lys Ile Glu Asp Leu Gln Ser Gln Leu Gln Gln
        515                 520                 525
Phe Thr Asn Met Lys Thr Glu Leu Phe Asp Gly Gln Leu Leu Ser Gln
    530                 535                 540
Ala Ser Glu Leu Arg Ala Leu Pro Leu Pro Ser Ala Val Ala Ser Val
545                 550                 555                 560
Leu Ile Asp Arg Tyr Met Pro Lys Glu Val Asp Tyr Leu Asn Glu Ile
                565                 570                 575
Tyr Lys Lys Leu Tyr Tyr Ser Asn Leu Gly Ser Ser Val Gly Asn Ser
            580                 585                 590
Ile Ile Asp Ala Ile Ser Gln Tyr Val Asn Gly Ala Thr Tyr Phe Asn
        595                 600                 605
Phe Ala Ser Tyr Val Gly Gln Gln Pro Ala Val Gly Ala Gly Gly Ala
    610                 615                 620
Asn Ala Phe Pro Gly Ser Gln Glu Ser Ala Gln Ala Lys Leu Asp Gln
625                 630                 635                 640
Glu Arg Lys Gln Ala Ala Leu Tyr Leu Gln Glu Thr Arg Gly Ala Leu
                645                 650                 655
Thr Val Ile Glu Glu Gln Arg Ala Arg Val Leu Lys Asp Asp Lys Ile
            660                 665                 670
Thr Asn Glu Gln Arg Ser Thr Ile Leu Asp Ser Leu Arg Asn Tyr Glu
        675                 680                 685
Asp Asn Ile Asn Ser Ile Ser Gly Ser Leu Val Leu Leu Gln Asn Tyr
    690                 695                 700
Leu Gln Pro Leu Ser Ile Ala Gly Gly Ser Val Ala Gly Thr Phe Glu
705                 7107                 15                 720
Val Lys Glu Gly Gln Glu Gln Trp Gln Ala Arg Leu Gln Ile Leu Glu
                725                 730                 735
Glu Ala Leu Val Ser Gly Leu Val Gly Asn Met Ile Asn Gly Gly Met
            740                 745                 750
Phe Pro Leu Gln Ser Thr Ile Gln Ser Asp Gln Gln Ser Phe Ala Asp
        755                 760                 765
Met Gly Gln Asn Phe Gln Leu Asp Leu Gln Met His Leu Thr Ser Met
    770                 775                 780
Gln Gln Glu Trp Thr Val Val Ala Thr Ser Leu Gln Leu Leu Asn Gln
785                 790                 795                 800
Met Tyr Leu Ser Leu Ala Arg Ser Leu Thr Gly
                805                 810
 
<210>101
<211>513
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>101
 
Lys Arg Pro Lys Lys Phe Pro Ile Tyr Leu Ser Ile Ala Gln Lys Thr
1               5                   10                  15
Asn Arg Leu Leu Ser Gly Ile Val Ile Ala Phe Ala Val Ile Ala Leu
            20                  25                  30
Arg Leu Trp Tyr Leu Ala Val Val Glu His Glu Gln Lys Leu Glu Glu
        35                  40                  45
Ala Tyr Lys Pro Gln Ile Arg Val Leu Pro Gln Tyr Val Glu Arg Ala
    50                  55                  60
Thr Ile Cys Asp Arg Phe Gly Lys Thr Leu Ala Val Asn Gln Leu Gln
65                  70                  75                  80
Tyr Asp Val Ser Val Ala Tyr Gly Ala Ile Arg Asp Leu Pro Thr Arg
                85                  90                  95
Ala Trp Arg Val Asp Glu His Gly His Lys Gln Leu Ile Pro Val Arg
            100                 105                 110
Lys His Tyr Ile Met Cys Leu Ser Glu Leu Leu Ser Gln Glu Leu His
        115                 120                 125
Leu Asp Arg Glu Ala Ile Glu Asp Ala Ile His Ala Lys Ala Ser Val
    130                 135                 140
Leu Gly Ser Val Pro Tyr Leu Val Ala Ala Asn Val Ser Glu Arg Thr
145                 150                 155                 160
Tyr Leu Lys Leu Lys Met Leu Ser Lys Asp Trp Pro Gly Leu His Val
                165                 170                 175
Glu Ala Val Val Arg Arg His Tyr Pro Gln Glu Ser Val Ala Ser Asp
            180                 185                 190
Ile Leu Gly Tyr Val Gly Pro Ile Ser Leu Gln Glu Tyr Lys Arg Val
        195                 200                 205
Thr Gln Glu Leu Ser Gln Leu Arg Glu Cys Val Arg Ala Tyr Glu Glu
    210                 215                 220
Gly Glu Asp Pro Lys Leu Pro Glu Gly Leu Ala Ser Ile Asp Gln Val
225                 230                 235                 240
Arg Ala Leu Leu Glu Ser Val Glu Ser Asn Ala Tyr Ser Leu Asn Ala
                245                 250                 255
Leu Val Gly Lys Met Gly Val Glu Ala Cys Trp Asp Ser Lys Leu Arg
            260                 265                 270
Gly Lys Ile Gly Lys Lys Pro Ile Leu Val Asp Arg Arg Gly Asn Phe
        275                 280                 285
Ile Gln Glu Met Glu Gly Ala Val Pro Glu Ala Pro Gly Thr Lys Leu
    290                 295                 300
Gln Leu Thr Leu Ser Ala Glu Leu Gln Ala Tyr Ala Asp Ala Leu Leu
305                 310                 315                 320
Leu Glu Tyr Glu Lys Thr Glu Thr Phe Arg Ser Ala Lys Ser Leu Lys
                325                 330                 335
Lys Arg Glu Lys Leu Pro Pro Leu Phe Pro Trp Ile Lys Gly Gly Ala
            340                 345                 350
Ile Ile Ala Leu Asp Pro Asn Asn Gly Glu Ile Leu Ala Met Ala Ser
        355                 360                 365
Ser Pro Arg Tyr Arg Asn Asn Asp Phe Val Asn Ala Lys Val Ala Glu
    370                 375                 380
Asp Ser Lys Ala Val Arg Ser Ser Ile Tyr Arg Trp Leu Glu Asn Lys
385                 390                 395                 400
Glu His Ile Ala Glu Ile Tyr Asp Arg Lys Val Pro Leu Ile Arg Glu
                405                 410                 415
Arg Arg Asn Pro Leu Thr Gly Leu Cys Tyr Glu Glu Ile Leu Pro Leu
           420                 425                 430
Thr Phe Asp Cys Phe Leu Asp Phe Leu Phe Pro Glu Asn Ser Val Ile
        435                 440                 445
Lys Leu Gln Leu Lys Arg Asn Ser Phe Val Gly Gln Ala Ile Glu Val
    450                 455                 460
Gln Asn Leu Val Thr Arg Leu Leu Ser Leu Phe Pro Tyr Glu Glu Gly
465                 470                 475                 480
Thr Cys Pro Cys Ser Ala Ile Phe Asp Ala Val Phe Pro Asn Glu Glu
                485                 490                 495
Gly His Ile Leu Ile Gln Glu Val Ile Ser Leu Arg Glu Gln Lys Trp
            500                 505                 510
Ile
 
<210>102
<211>575
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>102
 
Glu Cys Leu Asn Gln His Lys Ala Asp Ile Glu Glu Leu Lys Glu Ala
1               5                   10                  15
Leu Asp Gln Val Phe Asn Glu Leu Pro Ala Asn Tyr Asp Lys Ile Leu
            20                  25                  30
Tyr Thr Asp Ile Leu Arg Leu Ile Val Asp Pro Glu Arg Phe Ser Pro
        35                  40                  45
Val Leu Pro Ser Glu Val His Arg Leu Ser Leu Ser Glu Phe Thr Glu
    50                  55                  60
Leu Gln Gly Arg Tyr Val Val Leu Arg Ser Ala Phe Ser Thr Ile Leu
65                  70                  75                  80
Glu Asp Ala Phe Ile Glu Val His Phe Lys Ser Trp Arg Lys Ser Glu
                85                  90                  95
Phe Leu Gln Tyr Leu Ala Ala Lys Arg Gln Glu Glu Ala Leu Arg Lys
            100                 105                 110
Gln Arg Tyr Pro Thr Pro Tyr Val Asp Tyr Leu Glu Glu Glu Lys Thr
        115                 120                 125
Arg Gln Tyr Lys Met Phe Cys Gln Glu His Leu Asp Thr Phe Leu Ala
    130                 135                 140
Tyr Leu Phe Ser Lys Thr Pro Tyr Lys Glu Gly Leu Glu Pro Tyr Tyr
145                 150                 155                 160
Asp Ile Leu Asp Leu Trp Ile Asn GLu Leu Asp Asn Gly Ala His Arg
                165                 170                 175
Ala Leu Ser Trp Asn Glu His Tyr Leu Phe Leu Lys Glu Arg Val Ser
            180                 185                 190
His Leu Ser Glu His Leu Pro Ala Leu Phe Ser Thr Phe Arg Glu Phe
        195                 200                 205
Asn Glu Leu Gln Arg Pro Leu Leu Gly Lys Tyr Pro Ile Ser Ile Val
    210                 215                 220
Arg Asn Lys Arg Gln Thr Glu Gln Asp Leu Ala Ala Ser Phe Tyr Pro
225                 230                 235                 240
Val Tyr Gly Tyr Gly Tyr Leu Arg Pro His Ala Tyr Gly Gln Ala Ala
                245                 250                 255
Thr Leu Gly Ser Ile Phe Lys Leu Val Ser Ala Tyr Ser Val Leu Ser
            260                 265                 270
Gln Arg Ile Leu Trp Gly His Asn Glu Glu Pro Ala Asn Pro Leu Val
        275                 280                 285
Ile Ile Asp Lys Asn Ser Phe Gly Tyr Arg Ser Ser Lys Pro His Val
    290                 295                 300
Gly Phe Phe Lys Asp Gly Thr Pro Ile Pro Thr Phe Phe Arg Gly Gly
305                 310                 315                 320
Ser Leu Pro Gly Asn Asp Phe Met Gly Arg Gly Phe Ile Asp Leu Val
                325                 330                 335
Ser Ala Leu Glu Met Ser Ser Asn Pro Tyr Phe Ser Leu Leu Val Gly
            340                 345                 350
Glu Gly Leu Gly Asp Pro Glu Asp Leu Ala Asp Ala Ala Ser Leu Phe
        355                 360                 365
Gly Phe Gly Glu Lys Thr Gly Leu Gly Leu Pro Gly Glu Tyr Ala Gly
    370                 375                 380
Arg Val Pro His Asp Leu Ala Tyr Asn Arg Ser Gly Leu Tyr Ala Thr
385                 390                 395                 400
Ala Ile Gly Gln His Thr Leu Val Val Thr Pro Leu Gln Thr Ala Val
                405                 410                 415
Met Leu Ala Ser Leu Val Asn Gly Gly Val Val Tyr Val Pro Lys Leu
            420                 425                 430
Leu Leu Gly Glu Trp Glu Gly Glu His Val Ser Tyr Leu Ser Ser Lys
        435                 440                 445
Lys Lys Arg Thr Ile Phe Met Pro Asp Ala Val Val Glu Val Leu Lys
    450                 455                 460
Thr Gly Met Arg Asn Val Ile Trp Gly Gln Tyr Gly Thr Ala Arg Ala
465                 470                 475                 480
Ile Gln Ser Gln Phe Pro Pro Gln Leu Leu Ser Arg Ile Ile Gly Lys
                485                 490                 495
Thr Ser Thr Ala Glu Ser Ile Met Arg Val Gly Leu Asp Arg Glu Tyr
            500                 505                 510
Gly Thr Met Lys Met Lys Asp Ile Trp Phe Ala Ala Val Gly Phe Ser
        515                 520                 525
Asp Gln Asp Leu Ser Leu Pro Thr Ile Val Val Ile Val Tyr Leu Arg
    530                 535                 540
Leu Gly Glu Phe Gly Arg Asp Ala Ala Pro Met Ala Val Lys Met Ile
545                 550                 555                 560
Asp Met Trp Glu Lys Ile Gln Gln Arg Glu Ser Phe Leu Arg Gly
                565                 570                 575
 
<210>103
<211>406
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>103
 
Val Lys Asn Leu Lys Glu Asp Phe Pro Ile Phe Ala Ala Lys Ala Lys
1               5                   10                  15
Glu Asn Glu Pro Phe Ile Tyr Leu Asp Ser Ala Ala Thr Thr Gln Lys
            20                  25                  30
Pro Gln Gln Val Ile Asp Ala Val Ala Asn Phe Tyr Thr Ser Ser Tyr
        35                  40                  45
Ala Thr Val Asn Arg Ala Ile Tyr Ser Ser Ser Arg Asn Val Thr Glu
    50                  55                  60
Ala Tyr Ala Ala Val Arg Glu Lys Val Arg Lys Trp Val Ser Ala Ala
65                  70                  75                  80
Ser Asp Ser Glu Ile Val Phe Thr Arg Gly Thr Thr Ala Gly Leu Asn
                85                  90                  95
Leu Leu Ala Ile Ser Val Asn Asp Leu Trp Ile Pro Lys Gly Gly Val
            100                 105                 110
Val Leu Val Ser Glu Ala Glu His His Ala Asn Val Leu Ser Trp Glu
        115                 120                 125
Ile Ala Cys Arg Arg Arg Gly Ser Leu Val Lys Lys Ile Arg Val His
    130                 135                 140
Asp Ser Gly Leu Ile Asp Leu Asp Asp Leu Glu Lys Leu Leu Asn Glu
145                 150                 155                 160
Gly Ala Gln Phe Val Ser Ile Pro His Val Ser Asn Val Thr Gly Cys
                165                 170                 175
Val Gln Pro Leu Gln Gln Val Ala Glu Leu Val His Arg Tyr Asp Ala
            180                 185                 190
Tyr Leu Ala Val Asp Gly Ala Gln Gly Ala Pro His Leu Pro Ile Asp
        195                 200                 205
Val Gln Leu Trp Asp Val Asp Phe Tyr Val Phe Ser Ser His Lys Ile
    210                 215                 220
Tyr Gly Pro Thr Gly Ile Gly Val Leu Tyr Gly Lys Lys Asp Leu Leu
225                 230                 235                 240
Asp Gln Leu Pro Pro Val Glu Gly Gly Gly Asp Met Val Ala Ile Tyr
                245                 250                 255
Asp His Gln Asn Pro Glu Tyr Leu Pro Ala Pro Met Lys Phe Glu Ala
            260                 265                 270
Gly Thr Pro Asn Ile Ala Gly Val Leu Gly Leu Gly Ala Ala Leu Asp
        275                 280                 285
Tyr Leu Asp Gly Leu Ser Ala Lys Phe Ile Tyr Asp Lys Glu Ile Ala
    290                 295                 300
Leu Thr Thr Tyr Leu His Lys Glu Leu Leu Glu Ile Pro Gly Val Glu
305                 310                 315                 320
Ile Leu Gly Pro Ser Ile Glu Glu Pro Arg Gly Ala Leu Ile Gly Met
                325                 330                 335
Thr Ile Asp Gly Ala His Pro Leu Asp Leu Gly Phe Leu Leu Asp Leu
            340                 345                 350
Arg Gly Ile Ala Val Arg Thr Gly His Gln Cys Ala Gln Pro Ala Met
        355                 360                 365
Glu Arg Trp Asn Val Gly His Val Leu Arg Val Ser Leu Gly Ile Tyr
    370                 375                 380
Asn Asp Glu Asp Asp Ile Asp Gln Phe Ile Leu Val Leu Gln Asp Ser
385                 390                 395                 400
Leu Asp Lys Ile Arg Arg
                405
 
<210>104
<211>251
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>104
 
Leu Ile Val Leu Ala Phe Arg Gln Val Phe Phe Ser Hi s Ser Arg Ser
1               5                   10                  15
Gln Leu Asp Arg Leu Lys Asn Tyr Leu Arg Leu Leu Lys Gln Asn Phe
            20                  25                  30
Ala Ile Thr Leu Pro Lys Glu Arg Thr Ser Lys Gly His Ser Leu Met
        35                  40                  45
Leu Thr Phe Asp Phe Ala Ser Phe Asp Phe Tyr Thr Asn Ile Phe Pro
    50                  55                  60
Phe Leu Glu Glu Gln Lys Ile Pro Ala Val Val Gly Val Ala Ser Arg
65                  70                  75                  80
Tyr Ile Pro Ser Asn Ala Ala Gln Asp Leu His Pro Ser His Arg Leu
                85                  90                  95
Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ala Phe Gln Asp Glu Ile Phe Ser Asn Tyr
            100                 105                 110
Met Pro Phe Cys Cys Gln Asn Glu Leu Ile Glu Met Ala Lys Ser Pro
        115                 120                 125
Tyr Ile Gln Leu Ala Ser Ser Gly Phe Ala Ile Arg Asn Leu Met Asn
    130                 135                 140
Asn Pro Pro Tyr Leu Thr Thr Glu Ile Leu Leu Ser Arg His His Ile
145                 150                 155                 160
Glu Thr Ile Thr Gly Ala Lys Pro Leu Ala Phe Leu Phe Pro Phe Gly
                165                 170                 175
Lys Ser Asp Pro Thr Ser Arg Lys Leu Ala Ala Asp His Tyr Pro Tyr
            180                 185                 190
Ser Phe Leu Leu Gly Asn Thr Ile Asn Arg Lys Leu Lys Thr His Asn
        195                 200                 205
Ile Tyr Arg Leu Asp Ile Lys Pro Met Gln Tyr Val Cys Pro Ser Leu
    210                 215                 220
Phe Gln Ser Ser Arg Tyr Leu Lys Asn Trp Ile Lys Glu Lys Ser Lys
225                 230                 235                 240
Gln Leu Tyr Leu Lys Lys Gln Leu Pro Lys Arg
                245                 250
 
<210>105
<211>323
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>105
 
Thr Thr Asn Phe Pro Gln Pro Leu Ile Gln Ala Thr Ser Leu Thr Lys
1               5                   10                  15
His Tyr Tyr Lys Arg Ser Phe Trp Phe Gln Gly Lys Thr Ile Ala Ser
            20                  25                  30
Arg Pro Val Asp Asp Val Ser Phe Ser Leu Tyr Ser Arg Arg Ala Val
        35                  40                  45
Gly Leu Ile Gly Glu Ser Gly Ser Gly Lys Ser Thr Leu Ala Leu Ala
    50                  55                  60
Leu Ala Gly Leu Leu Pro Leu Thr Ser Gly Phe Leu Thr Phe Asn Gly
65                  70                  75                  80
Thr Pro Ile Lys Leu His Ser Lys His Gly Arg His Gln Leu Arg Ser
                85                  90                  95
Gln Val Arg Leu Val Phe Gln Asn Pro Gln Ala Ser Leu Asn Pro Arg
            100                 105                 110
Lys Thr Ile Leu Asp Ser Leu Gly His Ser Leu Leu Tyr His Lys Leu
        115                 120                 125
Val Pro Lys Glu Lys Val Leu Ala Thr Val Arg Glu Tyr Leu Glu Leu
    130                 135                 140
Val Gly Leu Ser Glu Glu Tyr Phe Tyr Arg Tyr Pro His Gln Leu Ser
145                 150                 155                 160
Gly Gly Gln Gln Gln Arg Val Ser Ile Ala Arg Ala Leu Leu Gly Val
                165                 170                 175
Pro Gln Leu Ile Ile Cys Asp Glu Ile Val Ser Ala Leu Asp Leu Ser
            180                 185                 190
Ile Gln Ala Gln Ile Leu Asn Met Leu Ala Glu Leu Gln Lys Lys Leu
        195                 200                 205
Ser Leu Thr Tyr Leu Phe Ile Ser His Asp Leu Ala Val Val Arg Ser
    210                 215                 220
Phe Cys Thr Glu Val Phe Ile Met Tyr Lys Gly Gln Ile Val Glu Lys
225                 230                 235                 240
Gly Asn Thr Lys Arg Ile Phe Ser Asp Pro Gln His Pro Tyr Thr Arg
                245                 250                 255
Met Leu Leu Asn Ala Gln Leu Pro Glu Thr Pro Asp Gln Arg Gln Ser
            260                 265                 270
Lys Pro Ile Phe Gln Glu Tyr His Lys Asp Ser Glu Glu Ser Cys Ser
        275                 280                 285
Thr Gly Cys Tyr Phe Tyr Asn Arg Cys Pro Gln Lys Gln Glu Ala Cys
    290                 295                 300
Lys Ser Glu Ile Ile Pro Asn Gln Gly Asp Ala His His Thr Tyr Arg
305                 310                 315                 320
Cys Ile His
 
<210>106
<211>234
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
<400>106
 
Pro Thr Thr Asn Cys Ile Phe Leu Asp Leu Arg Gly His Ser Ile Leu
1               5                   10                  15
His Gln Leu Gln Ile Glu Glu Ala Leu Leu Arg Val Ala Asn Gln Asn
            20                  25                  30
Phe Cys Ile Ile Asn Ser Gly Ala Lys Asp Ser Ile Val Leu Gly Ile
        35                  40                  45
Ser Arg Asn Leu Asn Gln Asp Val His Ile Ser Arg Ala Gln Ala Asp
    50                  55                  60
His Ile Pro Ile Ile Arg Arg Tyr Ser Gly Gly Gly Thr Val Phe Ile
65                  70                  75                  80
Asp Ser Asn Thr Leu Met Val Ser Trp Ile Met Asn Ser Ser Glu Ala
                85                  90                  95
Ser Ala Gln Pro Gln Glu Leu Leu Ala Trp Thr Tyr Gly Ile Tyr Ser
            100                 105                 110
Pro Leu Leu Pro Asn Thr Phe Ser Ile Arg Glu Asn Asp Tyr Val Leu
        115                 120                 125
Gly His Lys Lys Ile Gly Gly Asn Ala Gln Tyr Ile Gln Arg His Arg
    130                 135                 140
Trp Val His His Thr Thr Phe Leu Trp Asp Ile Asp Leu Asp Lys Leu
145                 150                 155                 160
Ser Tyr Tyr Leu Pro Ile Pro Gln Gln Gln Pro Thr Tyr Arg Asn Gln
                165                 170                 175
Arg Ser His Glu Glu Phe Leu Thr Thr Leu Arg Pro Trp Phe Pro Ser
            180                 185                 190
Arg Asp Asp Phe Leu Glu Arg Ile Lys Ala Ser Gly Ser Leu Leu Phe
        195                 200                 205
Thr Trp Glu Glu Phe Leu Asp Asn Glu Leu Glu Glu Ile Leu Ala Gln
    210                 215                 220
Pro His Arg Lys Ala Thr Thr Val Leu Asn
225                 230
 
<210>107
<211>791
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>107
Arg Ile Pro Ile Thr Leu Leu Gln Thr Tyr Phe Ser Glu Pro Leu Ser
1               5                   10                  15
Thr Lys Glu Ile Leu Glu Ala Cys Asp His Ile Gly Ile Glu Ala Glu
            20                  25                  30
Ile Glu Asn Thr Thr Leu Tyr Ser Phe Ala Ser Val Ile Thr Ala Lys
        35                  40                  45
Ile Leu His Thr Ile Pro His Pro Asn Ala Asp Lys Leu Arg Val Ala
    50                  55                  60
Thr Leu Thr Asp Gly Glu Lys Glu His Gln Val Val Cys Gly Ala Pro
65                  70                  75                  80
Asn Cys Glu Ala Gly Leu Ile Val Ala Leu Ala Leu Pro Gly Ala Lys
                85                  90                  95
Leu Phe Asp Ser Glu Gly Gln Ala Tyr Thr Ile Lys Lys Ser Lys Leu
            100                 105                 110
Arg Gly Val Glu Ser Gln Gly Met Cys Cys Gly Ala Asp Glu Leu Gly
        115                 120                 125
Leu Asp Glu Leu Gln Ile Gln Glu Arg Ala Leu Leu Glu Leu Pro Glu
    130                 135                 140
Ala Thr Pro Leu Gly Glu Asp Leu Ala Thr Val Leu Gly Asn Thr Ser
145                 150                 155                 160
Leu Glu Ile Ser Leu Thr Pro Asn Leu Gly His Cys Ala Ser Phe Leu
                165                 170                 175
Gly Leu Ala Arg Glu Ile Cys His Val Thr Gln Ala Asn Leu Val Ile
            180                 185                 190
Pro Lys Glu Phe Ser Phe Glu Asn Leu Pro Thr Thr Ala Leu Asp Met
        195                 200                 205
Gly Asn Asp Pro Asp Ile Cys Pro Phe Phe Ser Tyr Val Val Ile Thr
    210                 215                 220
Gly Ile Ser Ala Gln Pro Ser Pro Ile Lys Leu Gln Glu Ser Leu Gln
225                 230                 235                 240
Ala Leu Lys Gln Lys Pro Ile Asn Ala Ile Val Asp Ile Thr Asn Tyr
                245                 250                 255
Ile Met Leu Ser Leu Gly Gln Pro Leu His Ala Tyr Asp Ala Ser His
            260                 265                 270
Val Ala Leu Asp Ser Leu Arg Val Glu Lys Leu Ser Thr Pro Glu Ser
        275                 280                 285
Leu Thr Leu Leu Asn Gly Glu Thr Val Leu Leu Pro Ser Gly Val Pro
    290                 295                 300
Val Val Arg Asp Asp His Ser Leu Leu Gly Leu Gly Gly Val Met Gly
305                 310                 315                 320
Ala Lys Ala Pro Ser Phe Gln Glu Thr Thr Thr Thr Thr Val Ile Lys
                325                 330                 335
Ala Ala Tyr Phe Leu Pro Glu Ala Leu Arg Ala Ser Gln Lys Leu Leu
            340                 345                 350
Pro Ile Pro Ser Glu Ser Ala Tyr Arg Phe Thr Arg Gly Ile Asp Pro
        355                 360                 365
Gln Asn Val Val Pro Ala Leu Gln Ala Ala Ile His Tyr Ile Leu Glu
    370                 375                 380
Ile Phe Pro Glu Ala Thr Ile Ser Pro Ile Tyr Ser Ser Gly Glu Ile
385                 390                 395                 400
Cys Arg Glu Leu Lys Glu Val Ala Leu Arg Pro Lys Thr Leu Gln Arg
                405                 410                 415
Ile Leu Gly Lys Ser Phe Ser Ile Glu Ile Leu Ser Gln Lys Leu Gln
            420                 425                 430
Ser Leu Gly Phe Ser Thr Thr Pro Gln Glu Thr Ser Leu Leu Val Lys
        435                 440                 445
Val Pro Ser Tyr Arg His Asp Ile Asn Glu Glu Ile Asp Leu Val Glu
    450                 455                 460
Glu Ile Cys Arg Thr Glu Ser Trp Asn Ile Glu Thr Gln Asn Pro Val
465                 470                 475                 480
Ser Cys Tyr Thr Pro Ile Tyr Lys Leu Lys Arg Glu Thr Ala Gly Phe
                485                 490                 495
Leu Ala Asn Ala Gly Leu Gln Glu Phe Phe Thr Pro Asp Leu Leu Asp
            500                 505                 510
Pro Glu Thr Val Ala Leu Thr Arg Lys Glu Lys Glu Glu Ile Ser Leu
        515                 520                 525
Gln Gly Ser Lys His Thr Thr Val Leu Arg Ser Ser Leu Leu Pro Gly
    530                 535                 540
Leu Leu Lys Ser Ala Ala Thr Asn Leu Asn Arg Gln Ala Pro Ser Val
545                 550                 555                 560
Gln Ala Phe Glu Ile Gly Thr Val Tyr Ala Lys His Gly Glu Gln Cys
                565                 570                 575
Gln Glu Thr Gln Thr Leu Ala Ile Leu Leu Thr Glu Asp Gly Glu Ser
            580                 585                 590
Arg Ser Trp Leu Pro Lys Pro Ser Leu Ser Phe Tyr Ser Leu Lys Gly
        595                 600                 605
Trp Val Glu Arg Leu Leu Tyr His His His Leu Ser Ile Asp Ala Leu
    610                 615                 620
Thr Leu Glu Ser Ser Ala Leu Cys Glu Phe His Pro Tyr Gln Gln Gly
625                 630                 635                 640
Val Leu Arg Ile His Lys Gln Ser Phe Ala Thr Leu Gly Gln Val His
                645                 650                 655
Pro Glu Leu Ala Lys Lys Ala Gln Ile Lys His Pro Val Phe Phe Ala
            660                 665                 670
Glu Leu Asn Leu Asp Leu Leu Cys Lys Met Leu Lys Lys Thr Thr Lys
        675                 680                 685
Leu Tyr Lys Pro Tyr Ala Ile Tyr Pro Ser Ser Phe Arg Asp Leu Thr
    690                 695                 700
Leu Thr Val Pro Glu Asp Ile Pro Ala Asn Leu Leu Arg Gln Lys Leu
705                 710                 715                 720
Leu His Glu Gly Ser Lys Trp Leu Glu Ser Val Thr Ile Ile Ser Ile
                725                 730                 735
Tyr Gln Asp Lys Ser Leu Glu Thr Arg Asn Lys Asn Val Ser Leu Arg
            740                 745                 750
Leu Val Phe Gln Asp Tyr Glu Arg Thr Leu Ser Asn Gln Asp Ile Glu
        755                 760                 765
Glu Glu Tyr Cys Arg Leu Val Ala Leu Leu Asn Glu Leu Leu Thr Asp
    770                 775                 780
Thr Lys Gly Thr Ile Asn Ser
785                 790
 
<210>108
<211>251
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>108
 
Gln Ile Cys Val Thr Gly Val Val Leu Arg Ser Arg Pro Leu Gly Lys
1               5                   10                  15
Asn His Thr Leu Thr Thr Leu Phe Thr Pro Glu Gly Leu Phe Thr Phe
            20                  25                  30
Phe Ala Lys Gln Gly Gln Thr Leu Gln Cys Asp Tyr Arg Glu Thr Leu
        35                  40                  45
Val Pro Ile Ser Leu Gly Lys Tyr Thr Leu His Arg Asn Gly Ser Arg
    50                  55                  60
Leu Pro Lys Leu Thr His Gly Asp Ile Leu Asn Ala Phe Glu Ala Ile
65                  70                  75                  80
Lys Gln Thr Tyr Ala Leu Leu Glu Ala Ser Gly Lys Met Ile Gln Ala
                85                  90                  95
Leu Leu Ala Ser Gln Trp Lys Glu Lys Pro Ser His Lys Leu Phe Ser
            100                 105                 110
Leu Phe Leu Asn Phe Leu His Arg Ile Pro Glu Ser Ser Asn Pro Glu
        115                 120                 125
Phe Phe Ala Ala Ile Phe Val Leu Lys Leu Leu Gln Tyr Glu Gly Ile
    130                 135                 140
Leu Asp Leu Thr Pro Ala Cys Ser Leu Cys Lys Ala Ser Leu Pro Tyr
145                 150                 155                 160
Ala Cys Tyr Arg Tyr Gln Gly His Lys Leu Cys Lys Lys His Gln His
                165                 170                 175
Lys Gln Ala Ile Ser Ile Glu Lys Glu Glu Glu Gln Ile Leu Gln Ala
            180                 185                 190
Ile Ile His Ala Lys Gln Phe Ser Glu Leu Leu Ala Ile Ala Glu Phe
        195                 200                 205
Pro Ile Ala Ile Ala Glu Lys Ile Phe Tyr Leu Phe Asp Ser Leu Gln
    210                 215                 220
Glu Glu Lys Lys Ser Glu Arg Asn Ser Ser Glu Asp Pro Tyr His Glu
225                 230                 235                 240
Ile Leu Arg Leu Ser Lys Val Val His Pro Tyr
                245                 250
 
<210>109
<211>238
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>109
 
Glu Gly Leu Ala Phe Arg Tyr Gly Ser Lys Gly Pro Asn Ile Ile His
1               5                   10                  15
Asp Val Ser Phe Ser Val Tyr Asp Gly Asp Phe Ile Gly Ile Ile Gly
            20                  25                  30
Pro Asn Gly Gly Gly Lys Ser Thr Leu Thr Met Leu Ile Leu Gly Leu
        35                  40                  45
Leu Thr Pro Thr Phe Gly Ser Leu Lys Thr Phe Pro Ser His Ser Ala
    50                  55                  60
Gly Lys Gln Thr His Ser Met Ile Gly Trp Val Pro Gln His Phe Ser
65                  70                  75                  80
Tyr Asp Pro Cys Phe Pro Ile Ser Val Lys Asp Val Val Leu Ser Gly
                 85                  90                  95
Arg Leu Ser Gln Leu Ser Trp His Gly Lys Tyr Lys Lys Lys Asp Phe
            100                 105                 110
Glu Ala Val Asp His Ala Leu Asp Leu Val Gly Leu Ser Asp His His
        115                 120                 125
His His Cys Phe Ala His Leu Ser Gly Gly Gln Ile Gln Arg Val Leu
    130                 135                 140
Leu Ala Arg Ala Leu Ala Ser Tyr Pro Glu Ile Leu Ile Leu Asp Glu
145                 150                 155                 160
Pro Thr Thr Asn Ile Asp Pro Asp Asn Gln Gln Arg Ile Leu Ser Ile
                165                 170                 175
Leu Lys Lys Leu Asn Arg Thr Cys Thr Ile Leu Met Val Thr His Asp
            180                 185                 190
Leu His His Thr Thr Asn Tyr Phe Asn Lys Val Phe Tyr Met Asn Lys
        195                 200                 205
Thr Leu Thr Ser Leu Ala Asp Thr Ser Thr Leu Thr Asp Gln Phe Cys
    210                 215                 220
Cys His Pro Tyr Lys Asn Gln Glu Phe Ser Cys Ser Pro His
225                 230                 235
 
<210>110
<211>392
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>110
 
Ile Phe Glu Phe Arg Phe Pro Lys Ile Gly Glu Thr Ser Ser Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Ile Val Arg Trp Leu Lys Asn Leu Gly Asp His Val Ala Arg Asp
            20                  25                  30
Glu Pro Leu Ile Glu Val Ser Thr Asp Lys Ile Ala Thr Glu Leu Pro
        35                  40                  45
Ser Pro Lys Ala Gly Arg Leu Val Arg Phe Cys Val Asn Glu Gly Asp
    50                  55                  60
Glu Val Ala Ser Gly Asp Val Leu Gly Leu Ile Glu Leu Glu Glu Ile
65                  70                  75                  80
Ser Glu Ala Asp Asp Glu Ser Thr Ser Cys Pro Leu Thr Ser Cys Glu
                85                  90                  95
Thr Lys Ser Glu Ala Gly Ser Ser Ser Ser Ser Val Trp Phe Ser Pro
            100                 105                 110
Ala Val Leu Ser Leu Ala Gln Arg Glu Gly Ile Gly Leu Asp Asn Leu
        115                 120                 125
Gln Lys Ile Ala Gly Thr Gly Lys Gly Gly Arg Val Thr Arg Gln Asp
    130                 135                 140
Leu Glu Ala Tyr Ile Ser Glu Ser Gln Gln Val Ser Ile Pro Glu Ile
145                 150                 155                 160
Phe Gln Gly Glu Val Asn Arg Ile Pro Met Ser Pro Leu Arg Arg Ala
                165                 170                 175
Ile Ala Ser Ser Leu Ser Lys Ser Ser Asp Glu Val Pro His Ala Ser
            180                 185                 190
Leu Val Val Asp Val Asp Val Thr Asp Leu Met Asn Leu Ile Ser Gly
        195                 200                 205
Glu Arg Gln Arg Phe Leu Asp Thr His Gly Val Lys Leu Thr Ile Thr
    210                 215                 220
Ser Phe Ile Val Gln Cys Leu Ala Gln Thr Leu Arg Gln Phe Pro Leu
225                 230                 235                 240
Leu Asn Gly Ser Leu Asp Gly Thr Thr Ile Val Met Lys Lys Ser Val
                245                 250                 255
Asn Val Gly Val Ala Val Asn Leu Asn Lys Glu Gly Val Val Val Pro
            260                 265                 270
Val Ile His Asn Cys Gln Asp Arg Gly Leu Val Ser Ile Ala Lys Ala
        275                 280                 285
Leu Ala Asp Leu Ser Ser Arg Ala Arg Leu Asn Lys Leu Asp Pro Ser
    290                 295                 300
Glu Val Gln Asp Gly Ser Val Thr Val Thr Asn Phe Gly Met Thr Gly
305                 310                 315                 320
Ala Leu Ile Gly Met Pro Ile Ile Arg Tyr Pro Glu Val Ala Ile Leu
                325                 330                 335
Gly Ile Gly Thr Ile Gln Lys Arg Val Val Val Arg Asp Asp Asp Ser
            340                 345                 350
Leu Ala Ile Arg Lys Met Val Tyr Val Thr Leu Thr Phe Asp His Arg
        355                 360                 365
Val Leu Asp Gly Ile Tyr Gly Ser Glu Phe Leu Thr Ser Leu Lys Asn
    370                 375                 380
Arg Leu Glu Ser Val Thr Met Gly
385                 390
 
<210>111
<211>236
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>111
 
Lys Asn Ser Gly Asn Ile Met Glu Pro Ser Thr Asn Lys Pro Asp Cys
1               5                   10                  15
Lys Lys Ile Phe Asp Ser Ile Ala Ser Lys Tyr Asp Arg Thr Asn Thr
            20                  25                  30
Ile Leu Ser Leu Gly Met His His Phe Trp Asn Arg Ser Leu Ile Gln
        35                  40                  45
Ile Leu Gly Ser Gly Tyr Ser Leu Leu Asp Leu Cys Ala Gly Thr Gly
    50                  55                  60
Lys Val Ala Lys Arg Tyr Ile Ala Ala His Pro Gln Ala Ser Val Thr
65                  70                  75                  80
Leu Val Asp Phe Ser Ser Ala Met Leu Asp Ile Ala Lys Gln His Leu
                85                  90                  95
Pro Gln Gly Ser Cys Ser Phe Ile His Ser Asp Ile Asn Gln Leu Pro
            100                 105                 110
Leu Glu Asn His Ser Tyr Pro Leu Ala Ala Met Ala Tyr Gly Leu Arg
        115                 120                 125
Asn Leu Ser Asp Pro His Lys Ala Leu Gln Glu Ile Ser Arg Val Leu
    130                 135                 140
Met Pro Ser Gly Lys Leu Gly Ile Leu Glu Leu Thr Pro Pro Lys Lys
145                 150                 155                 160
Thr His Pro Thr Tyr Ser Ala His Lys Leu Tyr Leu Arg Ala Val Val
                165                 170                 175
Pro Trp Ile Gly Lys Ser Val Ser Lys Asp Pro Asp Ala Tyr Ser Tyr
            180                 185                 190
Leu Ser Lys Ser Ile Gln Gln Leu Pro Lys Asp His Asp Leu Glu Asp
        195                 200                 205
Leu Phe Ser Lys Ser Gly Phe Tyr Ile Ala Lys Lys Lys Lys Leu Phe
    210                 215                 220
Leu Gly Ala Ala Thr Ile Trp Leu Leu Glu Lys Gln
225                 230                 235
 
<210>112
<211>605
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>112
 
Gly Gln Ile Ser Thr Trp Lys Phe Leu Tyr Ser Leu Ala Thr Pro Leu
1               5                   10                  15
Pro Ala Gly Thr Lys Cys Lys Phe Asp Leu Ala Gly Ser Gly Lys Pro
            20                  25                  30
Thr Asp Trp Glu Ala Pro Ala Thr Asp Leu Ser Gln Thr Arg Asn Val
        35                  40                  45
Ile Tyr Ala Glu Met Pro Glu Gly Glu Ile Ile Glu Ala Thr Ala Ile
    50                  55                  60
Pro Val Lys Asp Asn Pro Val Pro Gln Phe Glu Phe Thr Leu Pro Tyr
65                  70                  75                  80
Glu Leu Gln Val Gly Glu Thr Leu Thr Ile Val Met Gly Ala Ser Pro
                85                  90                  95
Asn His Pro Gln Val Asp Asp Ala Gly Asn Gly Ala Gln Leu Phe Ala
            100                 105                 110
Gln Arg Arg Lys Pro Phe Tyr Leu Tyr Ile Asp Pro Thr Gly Glu Gly
        115                 120                 125
Asn Tyr Asp Glu Pro Asp Val Phe Ser Met Asp Ile Arg Gly Asn Val
    130                 135                 140
Leu Lys Lys Ile Glu Ile Phe Thr Pro Ser Tyr Val Val Lys Asn Lys
145                 150                 155                 160
Arg Phe Asp Ile Thr Val Arg Phe Glu Asp Glu Phe Gly Asn Leu Thr
                165                 170                 175
Asn Phe Ser Pro Glu Glu Thr Arg Ile Glu Leu Ser Tyr Glu His Leu
            180                 185                 190
Arg Glu Asn Leu Asn Trp Gln Leu Phe Ile Pro Glu Thr Gly Phe Val
        195                 200                 205
Ile Leu Pro Asn Leu Tyr Phe Asn Glu Pro Gly Ile Tyr Arg Ile Gln
    210                 215                 220
Leu Lys Asn Leu Ser Thr Gln Glu Ile Phe Ile Ser Ala Pro Ile Lys
225                 230                 235                 240
Cys Phe Ala Asp Ser Ala Pro Asn Leu Met Trp Gly Leu Leu His Gly
                245                 250                 255
Glu Ser Glu Arg Val Asp Ser Glu Glu Asn Ile Glu Thr Cys Met Arg
            260                 265                 270
Tyr Phe Arg Asp Asp Arg Ala Leu Asn Phe Tyr Ala Ser Ser Ser Phe
        275                 280                 285
Glu Asn Gln Glu Asn Leu Ser Pro Asp Ile Trp Lys Leu Ile Asn Gln
    290                 295                 300
Thr Val Ser Asp Phe Asn Glu Glu Asp Arg Phe Ile Thr Leu Ser Gly
305                 310                 315                 320
Phe Gln Tyr Ser Gly Glu Pro His Leu Glu Gly Val Arg His Ile Leu
                325                 330                 335
His Thr Lys Glu Thr Lys Ser His Ser Lys His Lys Glu Tyr Lys His
            340                 345                 350
Ile Pro Leu Ala Lys Leu Tyr Lys Ser Thr Val Asn His Asp Met Ile
        355                 360                 365
Ser Ile Pro Ser Phe Thr Ala Ser Lys Glu His Gly Phe Asp Phe Glu
    370                 375                 380
Asn Phe Tyr Pro Glu Phe Glu Arg Val Val Glu Ile Tyr Asn Ala Trp
385                 390                 395                 400
Gly Ser Ser Glu Thr Thr Ala Ala Leu Asn Asn Pro Phe Pro Ile Gln
                405                 410                 415
Gly Lys Asp Ser Glu Asp Pro Arg Gly Thr Val Ile Glu Gly Leu Lys
            420                 425                 430
Lys Asn Leu Arg Phe Gly Phe Val Ala Gly Gly Leu Asp Asp Arg Gly
        435                 440                 445
Ile Tyr Lys Asp Tyr Phe Asp Ser Pro Gln Val Gln Tyr Ser Pro Gly
    450                 455                 460
Leu Thr Ala Ile Ile Cys Asn Lys Tyr Thr Arg Glu Ser Leu Val Glu
465                 470                 475                 480
Ala Leu Phe Ala Arg His Cys Tyr Ala Thr Thr Gly Pro Arg Ile Val
                485                 490                 495
Leu Ser Phe Asn Ile Thr Ser Ala Pro Met Gly Ser Glu Leu Ser Thr
            500                 505                 510
Gly Ser Lys Pro Gly Leu Asn Val Asn Arg His Ile Ser Gly His Val
        515                 520                 525
Ala Gly Thr Ala Leu Leu Lys Thr Val Glu Ile Ile Arg Asn Gly Glu
    530                 535                 540
Val Leu His Thr Phe Phe Pro Asp Ser Asn Asn Leu Asp Tyr Glu Tyr
545                 550                 555                 560
Asp Asp Met Val Pro Leu Ser Ser Val Thr Leu Lys Asp Pro Asn Gly
                565                 570                 575
Lys Ala Pro Phe Val Phe Tyr Tyr Leu Arg Val Thr Gln Ala Asp Asn
            580                 585                 590
Ala Met Ala Trp Ser Ser Pro Ile Trp Val Asp Leu Asn
        595                 600                 605
 
<210>113
<211>171
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>113
 
Val Gly Phe Met Ala Val Glu Gln Ser His Ile Lys Glu Glu Ile Glu
1               5                   10                  15
Lys Leu Ile Gly Lys Ala Ile Lys Arg Val Cys Gly Asn Lys Glu Asn
            20                  25                  30
Asp Leu Cys Arg Tyr Leu Pro Gly Pro Ser Gly Gly Tyr Met His His
        35                  40                  45
Phe Thr Leu Lys Lys Met Lys Ser Ala Ala Pro Glu Gln Leu Leu Lys
    50                  55                  60
Met Leu Lys Thr Phe Ile Leu Glu Ser Glu Thr Pro Arg Thr Ile Asn
65                  70                  75                  80
Pro Lys Pro Arg Ala Pro Arg Gly Ser Lys Lys Arg Arg Asp Phe Ile
                85                  90                  95
Asn Phe Thr Lys Thr Asp Ile Glu Arg Val Leu Glu Leu Ala Arg Gln
            100                 105                 110
Val Gly Asp Lys Asp Leu Leu Ala Arg Phe Ser Pro Lys Lys Pro Leu
        115                 120                 125
Thr Ser Leu Lys Arg Glu Leu Ile Arg Ser Ile Arg Asn Gly Ile Val
    130                 135                 140
Ser Val Glu Leu Trp Asn Ala Tyr Val Glu Ala Val Lys Ala Val Ser
145                 150                 155                 160
Ser Pro Asn Leu Glu Val Thr Ser Pro Phe Val
                165                 170
 
<210>114
<211>286
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>114
 
Lys Arg Arg Asn Leu Gln Lys Ile Leu Pro Asn Ala Ser Thr Pro Ser
1               5                   10                  15
Thr Asn Val Ala Glu Asn Thr Gly Ile Lys Asp Gln Asn Leu Phe Leu
            20                  25                  30
Asp Gln Ala Thr Leu Asn Val Asp Gly Asn Val Asp Ile Glu Asn Phe
        35                  40                  45
Leu Glu Thr Arg Asp Leu Lys Val Ala Asp Thr Ile Thr Ser Pro Cys
    50                  55                  60
Glu Phe Thr Val Gly Gly Gly Leu Ser Ala Glu Ser Ser Gln Phe Lys
65                  70                  75                  80
Ala Thr Thr Leu Ser Lys Gly Leu Glu Ile Thr Ser Glu Asp Gln Asp
                85                  90                  95
Gly Arg Val Pro Lys Phe Thr Asn Val Ser Asp Pro Gln Ser Pro Arg
            100                 105                 110
Asp Ala Leu Thr Tyr Asn Tyr Tyr Arg Asn Thr Gly Cys Gln Ala Leu
        115                 120                 125
Asn Leu Tyr Thr Tyr Tyr Ser Ser Ser Gln Pro Thr Thr Val Gly Lys
    130                 135                 140
Pro Ile Glu Thr Val Cys Gln Asn Pro Asn Pro Glu Thr Tyr Arg Ile
145                 150                 155                 160
Ser Ala Ser Ala Lys Ile Tyr Asp Ala Val Thr Arg Phe Pro Tyr Ile
                165                 170                 175
Gln Phe Lys Ala Pro Gly Ile Tyr Gln Val Thr Ile Gln Ile Arg Arg
            180                 185                 190
Glu Ser Gly Gln His Ser Gly Leu Asp Asn Pro Asn Leu Tyr Leu Asn
        195                 200                 205
Leu Met Ile Gly Asn Asn Lys Thr Leu Leu Cys Ala Ser Asp Thr Arg
    210                 215                 220
Gly Tyr Ser Gly Gly His Arg Thr Ser Ile Ala Val Thr Gly Thr Phe
225                 230                 235                 240
Thr Leu Thr Glu Ile Val Ala Thr Pro Pro His Asp Tyr Pro Trp Leu
                245                 250                 255
Phe Leu Glu Thr Thr Ile Gly Leu Asp Ile Lys Ser Met Ser Thr Cys
            260                 265                 270
Val Ile Trp Phe Pro Phe Gln Ala Asn Phe Ala Glu Val Asp
        275                 280                 285
 
<210>115
<211>205
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>115
 
Val Glu Ala Lys Ser Gly Phe Leu Gly Lys Val Lys Gly Trp Phe Ser
1               5                   10                  15
Lys Lys Glu Ile Gln Glu Glu Ala Arg Ile Leu Pro Val Lys Asp Ser
            20                  25                  30
Leu Ser Trp Lys Arg Tyr Asp Tyr Thr Ser Ser Ser Gly Phe Ser Val
        35                  40                  45
Glu Phe Pro Gly Glu Pro Asp His Ser Gly Gln Ile Val Glu Val Pro
    50                  55                  60
Gln Ser Glu Ile Thr Ile Arg Tyr Asp Thr Tyr Val Thr Glu Thr His
65                  70                  75                  80
Pro Asp Asn Thr Val Tyr Val Val Ser Val Trp Glu Tyr Pro Glu Lys
                85                  90                  95
Val Asp Ile Ser Arg Pro Glu Leu Asn Leu Gln Glu Gly Phe Ser Gly
            100                 105                 110
Met Met Gln Ala Leu Pro Glu Ser Gln Val Leu Phe Met Gln Ala Arg
        115                 120                 125
Gln Ile Gln Gly His Lys Ala Leu Glu Phe Trp Ile Val Cys Glu Asp
    130                 135                 140
Val Tyr Phe Arg Gly Met Leu Ile Ser Val Asn His Thr Leu Tyr Gln
145                 150                 155                 160
Val Phe Met Val Tyr Lys Asn Lys Asn Pro Gln Ala Leu Asp Lys Glu
                165                 170                 175
Tyr Glu Ala Phe Ser Gln Ser Phe Lys Ile Thr Lys Ile Arg Glu Pro
            180                 185                 190
Arg Thr Ile Pro Ser Ser Val Lys Lys Lys Val Ser Leu
        195                 200                 205
 
<210>116
<211>549
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>116
 
His Pro Leu Tyr Val Asp Leu Asp Thr Ile Ile Ser Ser Tyr Ser Pro
1               5                   10                  15
Pro Leu Pro Lys Glu Phe Gln Glu Ala Ala Ser Leu Ile Ala Val Pro
            20                  25                  30
Asp Thr Ser His Ser Lys Pro Val Val Pro Gly Val Lys Thr Leu Phe
        35                  40                  45
Pro Gln Thr Tyr His Leu Pro Tyr Leu Lys Phe Val Gln Gly Glu Asn
    50                  55                  60
Val Val His Thr Pro Leu Lys Val Gly Val Met Phe Ser Gly Gly Pro
65                  70                  75                  80
Ala Pro Gly Gly His Asn Val Ile Gln Gly Leu Phe Asn Ser Leu Lys
                85                  90                  95
Asp Phe His Pro Asp Ser Ser Leu Val Gly Phe Val Asn Asn Gly Asp
            100                 105                 110
Gly Leu Thr Asn Asn Lys Ser Ile Asp Ile Thr Glu Glu Phe Leu Ser
        115                 120                 125
Lys Phe Arg Asn Ser Gly Gly Phe Asn Cys Ile Gly Thr Gly Arg Lys
    130                 135                 140
Lys Ile Val Thr Pro Glu Ala Lys Glu Ala Cys Leu Lys Thr Ala Glu
145                 150                 155                 160
Ala Leu Asp Leu Asp Gly Leu Val Ile Ile Gly Gly Asp Gly Ser Asn
                165                 170                 175
Thr Ala Thr Ala Ile Leu Ala Glu Tyr Phe Ala Lys Arg Arg Pro Lys
            180                 185                 190
Thr Ser Ile Val Gly Val Pro Lys Thr Ile Asp Gly Asp Leu Gln His
        195                 200                 205
Thr Phe Leu Asp Leu Thr Phe Gly Phe Asp Thr Ala Thr Lys Phe Tyr
    210                 215                 220
Ser Ser Ile Ile Ser Asn Ile Ser Arg Asp Ala Leu Ser Cys Lys Ala
225                 230                 235                 240
His Tyr His Phe Ile Lys Leu Met Gly Arg Ser Ala Ser His Ile Ala
                245                 250                 255
Leu Glu Cys Ala Leu Gln Thr His Pro Asn Ile Ala Leu Ile Gly Glu
            260                 265                 270
Glu Ile Ala Glu Lys Asn Leu Pro Leu Lys Thr Ile Ile His Lys Ile
        275                 280                 285
Cys Ser Val Ile Ala Asp Arg Ala Ala Met Glu Lys Tyr Tyr Gly Val
    290                 295                 300
Ile Leu Ile Pro Glu Gly Ile Ile Glu Phe Ile Pro Glu Ile Ile Asn
305                 310                 315                 320
Leu Ile Thr Glu Ile Glu Ser Leu Ser Glu Tyr Glu Asp Lys Ile Ser
                325                 330                 335
Arg Leu Ser Pro Glu Ser Gln Arg Leu Leu Lys Ser Phe Pro Ala Pro
            340                 345                 350
Ile Ile Glu Gln Ile Leu Asn Asp Arg Asp Ala His Gly Asn Val Tyr
        355                 360                 365
Val Ser Lys Ile Ser Val Asp Lys Leu Leu Ile His Leu Val Ser Asn
    370                 375                 380
His Leu Gln Gln Tyr Phe Pro Asn Val Pro Phe Asn Ala Ile Ser His
385                 390                 395                 400
Phe Leu Gly Tyr Glu Gly Arg Ser Gly Leu Pro Thr Lys Phe Asp Asn
                405                 410                 415
Thr Tyr Gly Tyr Ser Leu Gly Tyr Gly Ala Gly Ile Leu Val Arg Asn
            420                 425                 430
His Cys Asn Gly Tyr Leu Ser Thr Ile Glu Ser Leu Ala Cys Pro Phe
        435                 440                 445
Met Lys Trp Lys Leu Arg Ala Ile Pro Val Val Lys Met Phe Thr Val
    450                 455                 460
Lys Gln Gln Ala Asp Gly Thr Leu Gln Pro Lys Ile Lys Lys Tyr Leu
465                 470                 475                 480
Val Asp Ile Gly Ser Thr Ala Phe Arg Lys Phe Lys Leu Tyr Arg Lys
                485                 490                 495
Ile Trp Ala Leu Glu Asp Ser Tyr Arg Phe Leu Gly Pro Leu Gln Ile
            500                 505                 510
Glu Thr Pro Pro Glu Met His Ser Asp Asn Phe Pro Pro Leu Thr Leu
        515                 520                 525
Leu Leu Asn His Asn Phe Trp Gln Arg His Gln Gly Cys Ile Glu Ile
    530                 535                 540
Pro Asp Thr Thr Tyr
545
 
<210>117
<211>643
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>117
 
Thr Ser Ser Ser Cys Pro Leu Leu Asp Leu Ile Leu Ser Pro Ala Asp
1               5                   10                  15
Leu Lys Lys Leu Ser Ile Ser Gln Leu Pro Gly Leu Ala Glu Glu Ile
            20                  25                  30
Arg Tyr Arg Ile Ile Ser Val Leu Ser Gln Thr Gly Gly His Leu Ser
        35                  40                  45
Ser Asn Leu Gly Ile Val Glu Leu Thr Ile Ala Leu His Tyr Val Phe
    50                  55                  60
Ser Ser Pro Lys Asp Lys Phe Ile Phe Asp Val Gly His Gln Thr Tyr
65                  70                  75                  80
Pro His Lys Leu Leu Thr Gly Arg Asn Asn Glu Gly Phe Asp His Ile
                85                  90                  95
Arg Asn Asp Asn Gly Leu Ser Gly Phe Thr Asn Pro Thr Glu Ser Asp
            100                 105                 110
His Asp Leu Phe Phe Ser Gly His Ala Gly Thr Ala Leu Ser Leu Ala
        115                 120                 125
Leu Gly Met Ala Gln Thr Thr Pro Leu Glu Ser Arg Thr His Val Ile
    130                 135                 140
Pro Ile Leu Gly Asp Ala Ala Phe Ser Cys Gly Leu Thr Leu Glu Ala
145                 150                 155                 160
Leu Asn Asn Ile Ser Thr Asp Leu Ser Lys Phe Val Val Ile Leu Asn
                165                 170                 175
Asp Asn Asn Met Ser Ile Ser Lys Asn Val Gly Ala Met Ser Arg Ile
            180                 185                 190
Phe Ser Arg Trp Leu His His Pro Ala Thr Asn Lys Leu Thr Lys Gln
        195                 200                 205
Val Glu Lys Trp Leu Ala Lys Ile Pro Arg Tyr Gly Asp Ser Leu Ala
    2l0                 215                 220
Lys His Ser Arg Arg Leu Ser Gln Cys Val Lys Asn Leu Phe Cys Pro
225                 230                 235                 240
Thr Pro Leu Phe Glu Gln Phe Gly Leu Ala Tyr Val Gly Pro Ile Asp
                245                 250                 255
Gly His Asn Val Lys Lys Leu Ile Pro Ile Leu Gln Ser Val Arg Asn
            260                 265                 270
Leu Pro Phe Pro Ile Leu Val His Val Cys Thr Thr Lys Gly Lys Gly
        275                 280                 285
Leu Asp Gln Ala Gln Asn Asn Pro Ala Lys Tyr His Gly Val Arg Ala
    290                 295                 300
Asn Phe Asn Lys Arg Glu Ser Ala Lys His Leu Pro Ala Ile Lys Pro
305                 310                 315                 320
Lys Pro Ser Phe Pro Asp Ile Phe Gly Gln Thr Leu Cys Glu Leu Gly
                325                 330                 335
Glu Val Ser Ser Arg Leu His Val Val Thr Pro Ala Met Ser Ile Gly
            340                 345                 350
Ser Arg Leu Glu Gly Phe Lys Gln Lys Phe Pro Glu Arg Phe Phe Asp
        355                 360                 365
Val Gly Ile Ala Glu Gly His Ala Val Thr Phe Ser Ala Gly Ile Ala
    370                 375                 380
Lys Ala Gly Asn Pro Val Ile Cys Ser Ile Tyr Ser Thr Phe Leu His
385                 390                 395                 400
Arg Ala Leu Asp Asn Val Phe His Asp Val Cys Met Gln Asp Leu Pro
                405                 410                 415
Val Ile Phe Ala Ile Asp Arg Ala Gly Leu Ala Tyr Gly Asp Gly Arg
            420                 425                 430
Ser His His Gly Ile Tyr Asp Met Ser Phe Leu Arg Ala Met Pro Gln
        435                 440                 445
Met Ile Ile Cys Gln Pro Arg Ser Gln Val Val Phe Gln Gln Leu Leu
    450                 455                 460
Tyr Ser Ser Leu His Trp Ser Ser Pro Ser Ala Ile Arg Tyr Pro Asn
465                 470                 475                 480
Ile Pro Ala Pro His Gly Asp Pro Leu Thr Gly Asp Pro Asn Phe Leu
                485                 490                 495
Arg Ser Pro Gly Asn Ala Glu Thr Leu Ser Gln Gly Glu Asp Val Leu
            500                 505                 510
Ile Ile Ala Leu Gly Thr Leu Cys Phe Thr Ala Leu Ser Ile Lys His
        515                 520                 525
Gln Leu Leu Ala Tyr Gly Ile Ser Ala Thr Val Val Asp Pro Ile Phe
    530                 535                 540
Ile Lys Pro Phe Asp Asn Asp Leu Phe Ser Leu Leu Leu Met Ser His
545                 550                 555                 560
Ser Lys Val Ile Thr Ile Glu Glu His Ser Ile Arg Gly Gly Leu Ala
                565                 570                 575
Ser Glu Phe Asn Asn Phe Val Ala Thr Phe Asn Phe Lys Val Asp Ile
            580                 585                 590
Leu Asn Phe Ala Ile Pro Asp Thr Phe Leu Ser His Gly Ser Lys Glu
        595                 600                 605
Ala Leu Thr Lys Ser Ile Gly Leu Asp Glu Ser Ser Met Thr Asn Arg
    610                 615                 620
Ile Leu Thr His Phe Asn Phe Arg Ser Lys Lys Gln Thr Val Gly Asp
625                 630                 635                 640
Val Arg Val
 
<210>118
<211>342
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>118
 
Glu Val Tyr Ser Phe Ser Pro Ser Val Arg Thr Ser Phe Gln His Arg
1               5                   10                  15
Val Met Ala Ala Leu Asp Asn Trp Phe Phe Leu Gly Gly Arg Arg Leu
            20                  25                  30
Lys Val Val Ser Leu Asp Ser Cys Asn Ser Gly Gln Ala Cys Glu Glu
        35                  40                  45
Tyr Val Pro Ile Ser Thr Thr Glu Lys Val Leu Lys Ile Leu Ser Tyr
    50                  55                  60
Leu Leu Ile Pro Ile Val Ile Ile Ala Leu Leu Ile Arg Tyr Leu Leu
65                  70                  75                  80
His Ser Asn Phe Thr Ala Lys Val Ser Gln Lys Pro Trp Leu Lys Thr
                85                  90                  95
Leu Gln Leu Gly Ile Asp Ile Lys Ser Phe Ile Leu Pro Gly Ser His
            100                 105                 110
Val Asn Thr Met Asp Ser Ala Thr Leu Phe Lys Ala Ile Arg Leu Glu
        115                 120                 125
Gly Lys Arg Val Asp Val Glu Tyr His Arg Leu His Ser Ser Asp Lys
    130                 135                 140
Val Val Phe Tyr Ile Pro Ala Gln Lys Leu Pro Asp Asp Leu Arg Leu
145                 150                 155                 160
Thr His Trp Leu Pro Glu Lys Glu Thr Arg Lys Thr Glu Tyr Val Arg
                165                 170                 175
His Met Leu Ala His Val Met Gly Tyr Leu Thr Ser Gln Gly Lys Glu
            180                 185                 190
Arg Leu Gln Gln Val Val Gln Asp Ser Arg Ser Ser Thr Ser Leu Gly
        195                 200                 205
Ala Glu Lys Val Leu Gln Tyr Arg Phe Ile Asp His Pro Gln Ser Gln
    210                 215                 220
Gly Glu Phe Gln Arg Leu Leu Asn Glu Asn Ile Thr Thr Lys Gly Ser
225                 230                 235                 240
Glu Asp Lys Glu Val Val Gln Ser Asp Leu Phe Asp Met Ala Phe Gln
                245                 250                 255
Cys Trp Trp Pro Gln Phe Ile Ser Val Ile Gln Ser Pro Thr Phe Ser
            260                 265                 270
Glu Glu Leu Val His Glu Met Ser Gln Lys Leu Asp Leu Asp Cys Ile
        275                 280                 285
Tyr Pro Glu Asp Asp Glu Phe Glu Gln Lys Phe Leu Asn Thr Leu Leu
    290                 295                 300
Lys Ala Val Leu His His Gly Phe Glu Gly Ile Ser Val Ala Ser Met
305                 310                 315                 320
Gly Val Ile Phe Leu Ile Cys Pro Asp Ser Leu Ala Leu Gln Ile Pro
                325                 330                 335
Phe Leu Arg Asn Gln Lys
            340
 
<210>119
<211>366
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>119
 
Leu Ser Gly Ile Phe Ser Asn Pro His Pro Val Ser Tyr Phe Ser Ser
1               5                   10                  15
Thr His Ala Lys Gln Leu Ser Asp Phe Ser Lys Lys His Pro Ile Leu
            20                  25                  30
Thr Lys Ile Val Thr Ile Ile Val Lys Ile Phe Lys Leu Leu Ile Gly
        35                  40                  45
Leu Ile Ile Pro Pro Leu Gly Ile Tyr Trp Leu Cys Gln Leu Val Cys
    50                  55                  60
Ser Leu Ala Leu Phe Pro Arg Ser Ser Met Leu Tyr Ser Val Leu Lys
65                  70                  75                  80
Thr Cys Phe Lys Lys Tyr Arg Leu Glu Gln Glu Ile Gln Asp Tyr Phe
                85                  90                  95
Val Lys Asn Leu Asp Pro Ser Phe Lys Asp Pro Ala Val Ser Glu Ser
            100                 105                 110
Lys Arg Ile Thr Ile Gln Gln Asp His Leu Thr Ile Asp Thr Leu Ala
        115                 120                 125
Ile His Phe Ser Thr Ala Arg Pro Lys Arg Trp Leu Leu Ile Ser Leu
    130                 135                 140
Gly Ser Gly Asp Phe Leu Glu Asp Met Ile Gly Leu Lys Asp Ser Leu
145                 150                 155                 160
Phe Leu Ser Trp Lys Glu Leu Ala Lys Leu Leu Gly Ala Asn Ile Leu
                165                 170                 175
Ile Tyr Asn Tyr Pro Gly Val Lys Ser Ser Thr Gly Lys Leu Asn Leu
            180                 185                 190
Glu Asn Leu Ala Thr Ala His Asn Leu Cys Ala Lys Tyr Leu Gln Asp
        195                 200                 205
Lys Ile Gln Gly Pro Gly Ala Asn Glu Ile Ile Thr Tyr Gly Tyr Ser
    210                 215                 220
Leu Gly Gly Val Val Gln Ser Ala Ala Leu Gln Lys Asn Pro Phe Thr
225                 230                 235                 240
Asn Ser Glu Thr Ser Trp Val Ala Val Lys Asp Arg Ala Pro His Ser
                245                 250                 255
Leu Pro Ala Ala Ala Asn Ser Phe Phe Gly Pro Ile Gly Lys Leu Ile
            260                 265                 270
Ala Val Leu Ala Arg Trp Lys Met Asp Ala Glu Lys Asn Ser Arg Glu
        275                 280                 285
Leu Pro Cys Pro Glu Ile Leu Val Tyr Ser Ala Asp Arg Phe Arg Pro
    290                 295                 300
Ser Glu Val Gly Asp Asp Thr Ala Leu Leu Pro Glu Phe Thr Leu Ala
305                 310                 315                 320
His Ala Ile Lys Arg Thr Pro Phe Ala Arg Ser Lys Lys Phe Ile Gly
                325                 330                 335
Glu Val Asn Leu Leu His Ser Ser Pro Leu Lys His Pro Thr Ile Gln
            340                 345                 350
Lys Leu Ala Glu Ala Ile Leu Glu Ser Leu Ser Arg Lys Asn
        355                 360                 365
 
<210>120
<211>324
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>120
 
His Ser Glu Leu Pro Asn Tyr Gln Asn Ile Val Glu Ser Val Val Thr
1               5                   10                  15
Glu Ile Thr Thr Gln Leu Leu Asn Tyr Arg Ser Glu His Arg Leu Val
            20                  25                  30
Pro Phe Trp Glu Lys Ser Asp Gly Ser Phe Ile Thr Ala Ala Asp Tyr
        35                  40                  45
Gly Ser Gln Tyr Tyr Leu Lys Gln Gln Leu Ala Lys Ala Phe Pro Asn
    50                  55                  60
Ile Pro Phe Ile Gly Glu Glu Thr Leu Tyr Pro Asp Gln Asp Asn Glu
65                  70                  75                  80
Lys Ile Pro Glu Ile Leu Lys Phe Thr Arg Leu Leu Thr Ser Ser Val
                85                  90                  95
Ser Arg Asp Asp Leu Ile Ser Thr Leu Val Pro Pro Pro Ser Pro Thr
            100                 105                 110
Ser Leu Phe Trp Leu Val Asp Pro Ile Asp Gly Thr Ala Gly Phe Ile
        115                 120                 125
Arg His Arg Ala Phe Ala Val Ala Ile Ser Leu Ile Tyr Glu Tyr Arg
    130                 135                 140
Pro Ile Leu Ser Val Met Ala Cys Pro Ala Tyr Asn Gln Thr Phe Lys
145                 150                 155                 160
Leu Tyr Ser Ala Ala Lys Gly His Gly Leu Ser Ile Val His Ser Gln
                165                 170                 175
Asn Leu Asp Arg Arg Phe Val Tyr Ala Asp Arg Lys Gln Thr Lys Gln
            180                 185                 190
Phe Cys Glu Ala Ser Leu Ala Ala Leu Asn Gln Gln His His Ala Thr
        195                 200                 205
Arg Lys Leu Ser Leu Gly Leu Pro Asn Thr Pro Ser Pro Arg Arg Val
    210                 215                 220
Glu Ser Gln Tyr Lys Tyr Ala Leu Val Ala Glu Gly Ala Val Asp Phe
225                 230                 235                 240
Phe Ile Arg Tyr Pro Phe Ile Asp Ser Pro Ala Arg Ala Trp Asp His
                245                 250                 255
Val Pro Gly Ala Phe Leu Val Glu Glu Ala Gly Gly Arg Val Thr Asp
            260                 265                 270
Ala Leu Gly Ala Pro Leu Glu Tyr Arg Lys Glu Ser Leu Val Leu Asn
        275                 280                 285
Asn His Ala Val Ile Leu Ala Ser Gly Asp Gln Glu Thr His Glu Thr
    290                 295                 300
Thr Leu Ala Ala Leu Gln Asn Gln Leu Asn Val Val Pro Thr Asp Lys
305                 310                 315                 320
Leu Ile Ala Leu
 
<210>121
<211>457
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>121
 
Phe Asn Val Asn Phe Lys Phe Leu Glu Gly Leu His Gln Pro Ala Pro
1               5                   10                  15
Arg Tyr Thr Ser Tyr Pro Thr Ala Leu Glu Trp Glu Pro Ser Asp Ala
            20                  25                  30
Ala Pro Ala Leu Leu Ala Phe Gln Arg Ile Arg Glu Asn Pro Gln Pro
        35                  40                  45
Leu Ser Leu Tyr Phe His Ile Pro Phe Cys Gln Ser Met Cys Leu Tyr
    50                  55                  60
Cys Gly Cys Ser Val Val Leu Asn Arg Arg Glu Asp Ile Val Glu Ala
65                  70                  75                  80
Tyr Ile Asn Thr Leu Ile Gln Glu Met Lys Leu Val Val Glu Thr Ile
                85                  90                  95
Gly Phe Arg Pro Gln Val Ser Arg Ile His Phe Gly Gly Gly Thr Pro
            100                 105                 110
Ser Arg Leu Ser Arg Glu Leu Phe Thr Leu Leu Phe Asp His Ile His
        115                 120                 125
Lys Leu Phe Asp Leu Ser His Ala Glu Glu Ile Ala Ile Glu Val Asp
    130                 135                 140
Pro Arg Ser Leu Arg Asn Asp Met Glu Lys Ala Asp Phe Phe Gln Asn
145                 150                 155                 160
Val Gly Phe Asn Arg Val Ser Leu Gly Val Gln Asp Thr Gln Ala Asp
                165                 170                 175
Val Gln Glu Ala Val Arg Arg Arg Gln Ser His Glu Glu Ser Leu Lys
            180                 185                 190
Ala Tyr Glu Lys Phe Lys Glu Leu Ala Phe Gln Ser Ile Asn Ile Asp
        195                 200                 205
Leu Ile Tyr Gly Leu Pro Lys Gln Thr Lys Glu Ser Phe Ser Lys Thr
    210                 215                 220
Ile Gln Asp Ile Leu Ala Met Tyr Pro Asp Arg Leu Ala Leu Phe Ser
225                 230                 235                 240
Phe Ala Ser Val Pro Trp Ile Lys Pro His Gln Lys Ala Met Lys Ala
                245                 250                 255
Ser Asp Met Pro Ser Met Glu Glu Lys Phe Ala Ile Tyr Ser Gln Ser
            260                 265                 270
Arg His Leu Leu Thr Lys Ala Gly Tyr Gln Ala Ile Gly Met Asp His
        275                 280                 285
Phe Ser Leu Pro His Asp Pro Leu Thr Leu Ala Phe Lys Asn Lys Thr
    290                 295                 300
Leu Ile Arg Asn Phe Gln Gly Tyr Ser Leu Pro Pro Glu Glu Asp Leu
305                 310                 315                 320
Leu Gly Leu Gly Met Thr Ser Thr Ser Phe Ile Arg Gly Ile Tyr Leu
                325                 330                 335
Gln Asn Ala Lys Thr Leu Glu Glu Tyr His Asn Thr Val Leu Arg Gly
            340                 345                 350
Thr Phe Ala Thr Val Lys Ser Lys Ile Leu Thr Glu Asp Asp Arg Ile
        355                 360                 365
Arg Lys Trp Ala Ile His Lys Leu Met Cys Thr Phe Thr Ile Asn Lys
    370                 375                 380
Glu Glu Phe Phe Asn Leu Phe Gly Tyr Glu Phe Asp Thr Tyr Phe Ile
385                 390                 395                 400
Glu Ser Arg Asp Arg Leu Ile Ser Met Glu Thr Thr Gly Leu Ile His
                405                 410                 415
Asn Ser Pro Gly Ser Leu Lys Val Thr Pro Leu Gly Glu Leu Phe Val
            420                 425                 430
Arg Val Ile Ala Thr Ala Phe Asp His Tyr Phe Leu Asn Lys Val Ser
        435                 440                 445
Lys Lys Glu Cys Phe Ser Ala Ser Ile
    450                 455
 
<210>122
<211>349
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>122
 
Ser Met Asp Pro Thr Ala Met Leu Val Thr Ser Ser Lys Gly Leu Leu
1               5                   10                  15
Thr Asn Lys Ser Ile Met Gln Leu Arg His Phe Ala Leu Gly Trp Val
            20                  25                  30
Val Phe Phe Ile Cys Ala Tyr Phe Asp Tyr His Leu Phe Lys Arg Trp
        35                  40                  45
Ala Trp Val Leu Tyr Phe Phe Met Ile Cys Ala Leu Val Gly Leu Phe
    50                  55                  60
Phe Val Pro Ser Val Gln Asn Val His Arg Trp Tyr Arg Ile Pro Phe
65                  70                  75                  80
Ile His Met Ser Val Gln Pro Ser Glu Tyr Gly Lys Leu Val Ile Val
                85                  90                  95
Ile Met Leu Ser Tyr Ile Leu Glu Ser Arg Lys Ala Asp Ile Thr Ser
            100                 105                 110
Lys Thr Thr Ala Phe Leu Ala Cys Leu Val Val Ala Leu Pro Phe Phe
        115                 120                 125
Leu Ile Leu Lys Glu Pro Asp Leu Gly Thr Ala Leu Val Leu Cys Pro
    130                 135                 140
Val Thr Leu Thr Ile Phe Tyr Leu Ser Asn Val His Ser Leu Leu Val
145                 150                 155                 160
Lys Phe Cys Thr Val Val Ala Thr Ile Gly Ile Ile Gly Ser Leu Leu
                165                 170                 175
Ile Phe Ser Gly Ile Val Ser His Gln Lys Val Lys Pro Tyr Ala Leu
            180                 185                 190
Lys Val Ile Lys Glu Tyr Gln Tyr Glu Arg Leu Ser Pro Ser Asn His
        195                 200                 205
His Gln Arg Ala Ser Leu Ile Ser Ile Gly Leu Gly Gly Ile Arg Gly
    210                 215                 220
Arg Gly Trp Lys Thr Gly Glu Phe Ala Gly Arg Gly Trp Leu Pro Tyr
225                 230                 235                 240
Gly Tyr Thr Asp Ser Val Phe Ser Ala Leu Gly Glu Glu Phe Gly Leu
                245                 250                 255
Leu Gly Leu Leu Phe Thr Leu Gly Leu Phe Tyr Cys Leu Ile Cys Phe
            260                 265                 270
Gly Cys Arg Thr Val Ala Val Ala Thr Asp Asp Phe Gly Lys Leu Leu
        275                 280                 285
Ala Ala Gly Ile Thr Val Tyr Leu Ala Met His Val Leu Ile Asn Ile
    290                 295                 300
Ser Met Met Cys Gly Leu Leu Pro Ile Thr Gly Val Pro Leu Ile Leu
305                 310                 315                 320
Ile Ser Tyr Gly Gly Ser Ser Val Ile Ser Thr Met Ala Ser Leu Gly
                325                 330                 335
Val Leu Gln Ser Ile Tyr Ser His Arg Phe Ala Lys Tyr
            340                 345
 
<210>123
<211>872
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>123
 
Met Ser Thr Phe Ser Ile Gln Asn Arg Leu Arg Thr Ile Ser Gly Glu
1               5                   10                  15
Ser Thr Arg Ile Ile Lys Leu Asp His Lys Tyr Ser Gly Phe Asp Pro
            20                  25                  30
Arg Ser Val Pro Ala Ile Asn Leu Glu Glu Leu Asn Ser Gly Ile Tyr
        35                  40                  45
Ala Leu Arg His Leu Met Asn Ala Leu Gln Ser Glu Asn Thr Asn Val
    50                  55                  60
Ala Ala Leu Leu Asn Pro Asn Asn Thr Ile Phe Pro Thr Thr Ser Trp
65                  70                  75                  80
Thr Asp Tyr Lys His Ser Arg Pro Gln Ala Ser Ser Pro Arg Ala Pro
                85                  90                  95
Ser Ser Gln Thr Pro Thr Asp Ile Val Ser Ala Ala Ala Leu Ala Leu
            100                 105                 110
Val Leu Val Ile Asp Gly Gly Leu Ala Glu Leu Val Ala Ser Val Thr
        115                 120                 125
Glu Ile Asp Leu Gly Ala Leu Ser Thr Ile Ser Thr Val Arg Gln Leu
    130                 135                 140
Met Ala Ser Tyr Leu Gly Leu Thr Thr Leu Thr Ala Glu Gln Glu Lys
145                 150                 155                 160
Val Val Phe Ser Ser Ser Tyr Val Pro Ser Glu Lys Asn Leu Leu Glu
                165                 170                 175
His Val Lys Gln Glu Lys Ala Ala Glu Ile Gln Ala Lys Gln Glu Glu
            180                 185                 190
Ile Lys Ala Val Leu Glu Ala Lys Gly Val Ser Thr Glu Glu Ile Glu
        195                 200                 205
Ala Ile Leu Lys Glu Tyr Pro Asp Ile Tyr Ala Ala Asp Phe Phe Lys
    210                 215                 220
Glu Phe Ile Glu Glu Pro Leu His Thr Tyr Arg Ala Lys Val Gly Ala
225                 230                 235                 240
Pro Ile Gln Glu Met Asn Glu Asn Ala Ile Gln Leu Leu Pro Thr Pro
                245                 250                 255
Pro Ala Ile Thr Pro Asp Asn Val Asn Glu Val Asn Gly Met Asn Thr
            260                 265                 270
Leu Ser Thr Ile Leu Gln Ala Ile Asp Asp Ala Ile Lys Gln Ala Pro
        275                 280                 285
Ala Leu Gly Gly Asp Gln Glu Ile Ile Thr Ile Leu Gln Thr Leu Val
    290                 295                 300
Pro Leu Val Asp Lys Thr Thr Phe Thr Lys Ala Glu Phe Asp Leu Ile
305                 310                 315                 320
Tyr Thr Ala Thr Gln Leu Pro Asn Thr Ala Ser Leu Lys Leu Tyr Leu
                325                 330                 335
Thr Asp Arg Gln Ile Ala Glu Tyr Arg Gly Lys Ile Thr Lys Val Tyr
            340                 345                 350
Gln Asn Ser Ile Gln Asn Leu Ser Glu Thr Lys Arg Val Val Glu Asn
        355                 360                 365
Asn Arg Ser Met Leu Glu Thr Gln Leu Ser Met Phe Gln Gln Ala Gln
    370                 375                 380
Asn Cys Phe Val Thr Trp Ile Ser Gln Ala Asn Ala Leu Asn Ile Ala
385                 390                 395                 400
Ile Thr Asn Lys Tyr Ile Ser Ala Val Leu Thr Thr Ser Met Glu Met
                405                 410                 415
Tyr Gly Gly Leu Leu Cys Leu Ser Tyr Met Tyr Glu Arg Leu Ala Asp
            420                 425                 430
Asp Glu Lys Ala Ile Phe Asp Lys Ser Val Asn Glu Tyr Leu Pro Ile
        435                 440                 445
His Ile Val Val Gly Gly Ser Trp Val Asn Gly Trp Ile Ala Lys Met
    450                 455                 460
Ala Ala Tyr Gln Glu Leu Ala Glu Tyr Ser Leu Gly Thr Ala Val Thr
465                 470                 475                 480
Ser Gln Asp Gln Ile Lys Ala Tyr Leu Gln Thr Arg Gly Asn Glu Phe
                485                 490                 495
Lys Ala Thr Arg His Phe Phe His Asn Ile Gly Asp Gln Met Tyr Gln
            500                 505                 510
Phe Ala Asn Glu Thr Val Phe Gly Asn Cys Leu Thr Thr Ala Asn Gly
        515                 520                 525
Ala Ile Gln Pro Asp Leu Gly Gly Phe Ile Arg Glu Ala Met Thr Asn
    530                 535                 540
Val Gly Thr Val Glu Ala Asp Tyr Val Ser Asn Ala Gln Arg Ile Leu
545                 550                 555                 560
Asn Glu Phe Asn Thr Ala Ala Thr Ala His Val Leu Gln Leu Gln Leu
                565                 570                 575
GlnIle Ala Glu Leu Gln Lys Lys Ala Asp Asp Leu Asp Pro Gly Lys
           580                 585                 590
Ala Ser Phe Thr Glu Asn Arg Lys Phe Ala Val Ala Ala Trp Ile Thr
        595                 600                 605
Ser Glu Ser Leu Gly Asp Ala Leu Ile Ser Met Ile Leu Asn Ser Gln
    610                 615                 620
Leu Pro Lys Gln Glu Ala Phe Leu Lys Pro Leu Ile Glu Glu Ile Asn
625                 630                 635                 640
Phe Asn Asn Leu Ala Ala Asn Ala Leu Asn Ser Leu Leu Gln Ile Thr
                645                 650                 655
Asn Glu Phe Ser Thr Thr Ser Val Tyr Tyr Ser Leu Ser Ser Tyr Leu
            660                 665                 670
Val Gln Ser Lys Thr Gly Gln Asn Leu Phe Ala Gly Asp Tyr Tyr Glu
        675                 680                 685
Thr Leu Leu Ala Ala Ala Arg Glu Arg Glu Tyr Ile Tyr Arg Asp Thr
    690                 695                 700
Ala Arg Cys Lys Gln Ala Ile Asn Leu Val Asn Gly Leu Leu Gln Lys
705                 710                 715                 720
Ile Asn Ser Leu Pro Gly Ala Thr Ser Ala Gln Lys Gln Glu Met Leu
                725                 730                 735
Asn Ala Thr Thr Tyr Tyr Gln Tyr Ser Leu Ser Val Thr Leu Asn Gln
            740                 745                 750
Leu Thr Val Leu Glu Ser Leu Leu Ala Gly Leu Lys Met Thr Leu Gln
        755                 760                 765
Thr Thr Ser Asn Asn Lys Tyr Asp Lys Ser Val Phe Lys Ile Glu Ser
    770                 775                 780
Phe Asp Asp Trp Ile Pro Thr Leu Ala Ala Leu Glu Ser Phe Leu Thr
785                 790                 795                 800
Ser Gly Phe Pro Asn Ile Ser Ala Thr Gly Gly Leu Gly Pro Leu Phe
                805                 810                 815
Thr Gln Val Gln Ser Asp Gln Gln Thr Tyr Thr Ser Gln Gly Gln Thr
            820                 825                 830
Gln Gln Leu Asn Leu Gln Asn Gln Met Thr Thr Ile Gln Gln Glu Trp
        835                 840                 845
Thr Leu Val Ser Thr Ser Met Gln Val Leu Asn Gly Ile Leu Ser Gln
    850                 855                 860
Leu Ala Gly Ala Ile Tyr Ser Asn
865                 870
<210>124
<211>812
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>124
 
Met His Ser Phe Ala Gln Arg His Arg Glu Ser Leu Glu His Ile Ala
1               5                   10                  15
Asn Tyr Glu Lys Thr Thr Ala Glu Arg Asp Ile Leu Lys Arg Leu Ile
            20                  25                  30
Glu Val Leu Asp Gln Arg Ala Ser Glu Arg Tyr Arg Ser Ala Val Glu
        35                  40                  45
Lys Leu His Lys Tyr Glu Val Glu Arg Ala Thr Val Ala Lys Ser Ile
    50                  55                  60
Pro Val Ala Ala Ile His Glu Lys Pro Leu Ser Ser Thr His Ala Ser
65                  70                  75                  80
Val Gln Val Thr Ala Ser Thr Pro Ala Ala Thr Gly Ser Gly Val Gly
                85                  90                  95
Ala Tyr Tyr Asn Ala Val Lys Gln Lys Trp Ala Gln Asp Leu Ile Val
            100                 105                 110
Glu Leu Asn Thr Val Met Thr Thr Ile Met Ala Ser Val Asn Ser Lys
        115                 120                 125
Asn Pro Ala Asn Lys Asp Val Phe Asp Lys Leu Asn Thr Glu Leu Gln
    130                 135                 140
Ala Leu Val Ala Ala Gly Asn Asn Leu Thr Glu Glu Asn Phe Gln Thr
145                 150                 155                 160
Leu Tyr Asn Phe Pro Glu Glu Ile Phe Thr Ala Ile Gln Arg Ala Asp
                165                 170                 175
Thr Phe Thr Gly Gly Met Lys Thr Asp Phe Thr Asn Gln Leu Ala Gly
            180                 185                 190
Lys Tyr Gly Asn Gln Ala Thr Leu Thr Gln Thr Phe Ala Asp Gly Arg
        195                 200                 205
Val Glu Gly Phe Lys Asp Ile Leu Thr Ala Val Gln Gly Val Leu Thr
    210                 215                 220
Pro Glu Gln Phe Thr Ile Phe Ala Glu Ile Ala Thr Glu Leu Gln Ala
225                 230                 235                 240
Leu Ala Asp His Val Gly Asn Phe Asp Glu Ala Gly Leu Gln Arg Ile
                245                 250                 255
Glu Asp Ala Gly Glu Lys Leu Ala Ala Val Ile Asn Ser Ser Asp Leu
            260                 265                 270
Thr Arg Asn Asp Lys Ile Met Phe Cys Gln His Ile Thr Asp Leu Tyr
        275                 280                 285
Ser Asp Gln Val Ala Ala Leu Gly Ser Phe Asp Thr Val Leu Asp Ala
    290                 295                 300
Ser Ile Tyr Val Asn Gln His Gln Gly Thr Met Phe Ser Asn Leu Ser
305                 310                 315                 320
Ser Phe Val Gly Ser Leu Ile Gly Thr Phe Ala Pro Ile Asp Leu Ser
                325                 330                 335
Ser Ser Gln Gly Asp Ile Ser Ser Ala Ala Leu Ala Gly Ala Leu Gln
            340                 345                 350
Thr Ala Arg Gly Leu Asn Ser Arg Phe Asn Glu Leu Thr Ala Glu Gln
        355                 360                 365
Gln Lys Leu Ile Asn Glu Cys Ile Lys Ser Leu Val Thr Phe Lys Cys
    370                 375                 380
Gly Glu His Leu Gly Ala Ile Trp Ala Tyr Phe Thr Ala Ser Thr Val
385                 390                 395                 400
Val Ala Leu Asn Pro Thr Ala Thr Met Asp His Val Lys Ala Ala Ile
                405                 410                 415
Leu Glu Glu Ala Lys Glu Leu Asp Asn Ser Ser Phe Gln Leu Ala Ser
            420                 425                 430
Ser Ile Lys Ser Ala Met Thr Ser Ile Val Asn Ser Ser Gly Ser Phe
        435                 440                 445
Ser Val Thr Val Asn Ser Ser Thr Leu Gln Tyr Thr Ile Tyr Ser Glu
    450                 455                 460
Lys Asn Gly Lys Val Glu Ile Asn Gln Ile Leu Leu Asn Tyr Gly Ser
465                 470                 475                 480
Thr Gly Phe Leu Pro Glu Ile Thr Lys Leu Ala Lys Thr Asn Ala Glu
                485                 490                 495
Ser Thr Ala Arg Ser Tyr Phe Arg Phe Lys Ala Leu Ala Ala Val Glu
            500                 505                 510
Ser Glu Asn Val Gln Asn Lys Ile Glu Asp Leu Gln Ser Gln Leu Gln
        515                 520                 525
Gln Phe Thr Asn Met Lys Thr Glu Leu Phe Asp Gly Gln Leu Leu Ser
    530                 535                 540
Gln Ala Ser Glu Leu Arg Ala Leu Pro Leu Pro Ser Ala Val Ala Ser
545                 550                 555                 560
Val Leu Ile Asp Arg Tyr Met Pro Lys Glu Val Asp Tyr Leu Asn Glu
                565                 570                 575
Ile Tyr Lys Lys Leu Tyr Tyr Ser Asn Leu Gly Ser Ser Val Gly Asn
            580                 585                 590
Ser Ile Ile Asp Ala Ile Ser Gln Tyr Val Asn Gly Ala Thr Tyr Phe
        595                 600                 605
Asn Phe Ala Ser Tyr Val Gly Gln Gln Pro Ala Val Gly Ala Gly Gly
    610                 615                 620
Ala Asn Ala Phe Pro Gly Ser Gln Glu Ser Ala Gln Ala Lys Leu Asp
625                 630                 635                 640
Gln Glu Arg Lys Gln Ala Ala Leu Tyr Leu Gln Glu Thr Arg Gly Ala
                645                 650                 655
Leu Thr Val Ile Glu Glu Gln Arg Ala Arg Val Leu Lys Asp Asp Lys
            660                 665                 670
Ile Thr Asn Glu Gln Arg Ser Thr Ile Leu Asp Ser Leu Arg Asn Tyr
        675                 680                 685
Glu Asp Asn Ile Asn Ser Ile Ser Gly Ser Leu Val Leu Leu Gln Asn
    690                 695                 700
Tyr Leu Gln Pro Leu Ser Ile Ala Gly Gly Ser Val Ala Gly Thr Phe
705                 710                 715                 720
Glu Val Lys Glu Gly Gln Glu Gln Trp Gln Ala Arg Leu Gln Ile Leu
                725                 730                 735
Glu Glu Ala Leu Val Ser Gly Leu Val Gly Asn Met Ile Asn Gly Gly
            740                 745                 750
Met Phe Pro Leu Gln Ser Thr Ile Gln Ser Asp Gln Gln Ser Phe Ala
        755                 760                 765
Asp Met Gly Gln Asn Phe Gln Leu Asp Leu Gln Met His Leu Thr Ser
    770                 775                 780
Met Gln Gln Glu Trp Thr Val Val Ala Thr Ser Leu Gln Leu Leu Asn
785                 790                 795                 800
Gln Met Tyr Leu Ser Leu Ala Arg Ser Leu Thr Gly
                805                 810
 
<210>125
<211>1090
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>125
 
Met Lys Arg Pro Lys Lys Phe Pro Ile Tyr Leu Ser Ile Ala Gln Lys
1               5                   10                  15
Thr Asn Arg Leu Leu Ser Gly Ile Val Ile Ala Phe Ala Val Ile Ala
            20                  25                  30
Leu Arg Leu Trp Tyr Leu Ala Val Val Glu His Glu Gln Lys Leu Glu
        35                  40                  45
Glu Ala Tyr Lys Pro Gln Ile Arg Val Leu Pro Gln Tyr Val Glu Arg
    50                  55                  60
Ala Thr Ile Cys Asp Arg Phe Gly Lys Thr Leu Ala Val Asn Gln Leu
65                  70                  75                  80
Gln Tyr Asp Val Ser Val Ala Tyr Gly Ala Ile Arg Asp Leu Pro Thr
                85                  90                  95
Arg Ala Trp Arg Val Asp Glu His Gly His Lys Gln Leu Ile Pro Val
            100                 105                 110
Arg Lys His Tyr Ile Met Cys Leu Ser Glu Leu Leu Ser Gln Glu Leu
        115                 120                 125
His Leu Asp Arg Glu Ala Ile Glu Asp Ala Ile His Ala Lys Ala Ser
    130                 135                 140
Val Leu Gly Ser Val Pro Tyr Leu Val Ala Ala Asn Val Ser Glu Arg
145                 150                 155                 160
Thr Tyr Leu Lys Leu Lys Met Leu Ser Lys Asp Trp Pro Gly Leu His
                165                 170                 175
Val Glu Ala Val Val Arg Arg His Tyr Pro Gln Glu Ser Val Ala Ser
            180                 185                 190
Asp Ile Leu Gly Tyr Val Gly Pro Ile Ser Leu Gln Glu Tyr Lys Arg
        195                 200                 205
Val Thr Gln Glu Leu Ser Gln Leu Arg Glu Cys Val Arg Ala Tyr Glu
    210                 215                 220
Glu Gly Glu Asp Pro Lys Leu Pro Glu Gly Leu Ala Ser Ile Asp Gln
225                 230                 235                 240
Val Arg Ala Leu Leu Glu Ser Val Glu Ser Asn Ala Tyr Ser Leu Asn
                245                 250                 255
Ala Leu Val Gly Lys Met Gly Val Glu Ala Cys Trp Asp Ser Lys Leu
            260                 265                 270
Arg Gly Lys Ile Gly Lys Lys Pro Ile Leu Val Asp Arg Arg Gly Asn
        275                 280                 285
Phe Ile Gln Glu Met Glu Gly Ala Val Pro Glu Ala Pro Gly Thr Lys
    290                 295                 300
Leu Gln Leu Thr Leu Ser Ala Glu Leu Gln Ala Tyr Ala Asp Ala Leu
305                 310                 315                 320
Leu Leu Glu Tyr Glu Lys Thr Glu Thr Phe Arg Ser Ala Lys Ser Leu
                325                 330                 335
Lys Lys Arg Glu Lys Leu Pro Pro Leu Phe Pro Trp Ile Lys Gly Gly
            340                 345                 350
Ala Ile Ile Ala Leu Asp Pro Asn Asn Gly Glu Ile Leu Ala Met Ala
        355                 360                 365
Ser Ser Pro Arg Tyr Arg Asn Asn Asp Phe Val Asn Ala Lys Val Ala
    370                 375                 380
Glu Asp Ser Lys Ala Val Arg Ser Ser Ile Tyr Arg Trp Leu Glu Asn
385                 390                 395                 400
Lys Glu His Ile Ala Glu Ile Tyr Asp Arg Lys Val Pro Leu Ile Arg
                405                 410                 415
Glu Arg Arg Asn Pro Leu Thr Gly Leu Cys Tyr Glu Glu Ile Leu Pro
            420                 425                 430
Leu Thr Phe Asp Cys Phe Leu Asp Phe Leu Phe Pro Glu Asn Ser Val
        435                 440                 445
Ile Lys Leu Gln Leu Lys Arg Asn Ser Phe Val Gly Gln Ala Ile Glu
    450                 455                 460
Val Gln Asn Leu Val Thr Arg Leu Leu Ser Leu Phe Pro Tyr Glu Glu
465                 470                 475                 480
Gly Thr Cys Pro Cys Ser Ala Ile Phe Asp Ala Val Phe Pro Asn Glu
                485                 490                 495
Glu Gly His Ile Leu Ile Gln Glu Val Ile Ser Leu Arg Glu Gln Lys
            500                 505                 510
Trp Ile Met Glu Cys Leu Asn Gln His Lys Ala Asp Ile Glu Glu Leu
        515                 520                 525
Lys Glu Ala Leu Asp Gln Val Phe Asn Glu Leu Pro Ala Asn Tyr Asp
    530                 535                 540
Lys Ile Leu Tyr Thr Asp Ile Leu Arg Leu Ile Val Asp Pro Glu Arg
545                 550                 555                 560
Phe Ser Pro Val Leu Pro Ser Glu Val His Arg Leu Ser Leu Ser Glu
                565                 570                 575
Phe Thr Glu Leu Gln Gly Arg Tyr Val Val Leu Arg Ser Ala Phe Ser
            580                 585                 590
Thr Ile Leu Glu Asp Ala Phe Ile Glu Val His Phe Lys Ser Trp Arg
        595                 600                 605
Lys Ser Glu Phe Leu Gln Tyr Leu Ala Ala Lys Arg Gln Glu Glu Ala
    610                 615                 620
Leu Arg Lys Gln Arg Tyr Pro Thr Pro Tyr Val Asp Tyr Leu Glu Glu
625                 630                 635                 640
Glu Lys Thr Arg Gln Tyr Lys Met Phe Cys Gln Glu His Leu Asp Thr
                645                 650                 655
Phe Leu Ala Tyr Leu Phe Ser Lys Thr Pro Tyr Lys Glu Gly Leu Glu
            660                 665                 670
Pro Tyr Tyr Asp Ile Leu Asp Leu Trp Ile Asn Glu Leu Asp Asn Gly
        675                 680                 685
Ala His Arg Ala Leu Ser Trp Asn Glu His Tyr Leu Phe Leu Lys Glu
    690                 695                 700
Arg Val Ser His Leu Ser Glu His Leu Pro Ala Leu Phe Ser Thr Phe
705                 710                 715                 720
Arg Glu Phe Asn Glu Leu Gln Arg Pro Leu Leu Gly Lys Tyr Pro Ile
                725                 730                 735
Ser Ile Val Arg Asn Lys Arg Gln Thr Glu Gln Asp Leu Ala Ala Ser
            740                 745                 750
Phe Tyr Pro Val Tyr Gly Tyr Gly Tyr Leu Arg Pro His Ala Tyr Gly
        755                 760                 765
Gln Ala Ala Thr Leu Gly Ser Ile Phe Lys Leu Val Ser Ala Tyr Ser
    770                 775                 780
Val Leu Ser Gln Arg Ile Leu Trp Gly His Asn Glu Glu Pro Ala Asn
785                 790                 795                 800
Pro Leu Val Ile Ile Asp Lys Asn Ser Phe Gly Tyr Arg Ser Ser Lys
                805                 810                 815
Pro His Val Gly Phe Phe Lys Asp Gly Thr Pro Ile Pro Thr Phe Phe
            820                 825                 830
Arg Gly Gly Ser Leu Pro Gly Asn Asp Phe Met Gly Arg Gly Phe Ile
        835                 840                 845
Asp Leu Val Ser Ala Leu Glu Met Ser Ser Asn Pro Tyr Phe Ser Leu
    850                 855                 860
Leu Val Gly Glu Gly Leu Gly Asp Pro Glu Asp Leu Ala Asp Ala Ala
865                 870                 875                 880
Ser Leu Phe Gly Phe Gly Glu Lys Thr Gly Leu Gly Leu Pro Gly Glu
                885                 890                 895
Tyr Ala Gly Arg Val Pro His Asp Leu Ala Tyr Asn Arg Ser Gly Leu
            900                 905                 910
Tyr Ala Thr Ala Ile Gly Gln His Thr Leu Val Val Thr Pro Leu Gln
        915                 920                 925
Thr Ala Val Met Leu Ala Ser Leu Val Asn Gly Gly Val Val Tyr Val
    930                 935                 940
Pro Lys Leu Leu Leu Gly Glu Trp Glu Gly Glu His Val Ser Tyr Leu
945                 950                 955                 960
Ser Ser Lys Lys Lys Arg Thr Ile Phe Met Pro Asp Ala Val Val Glu
                965                 970                 975
Val Leu Lys Thr Gly Met Arg Asn Val Ile Trp Gly Gln Tyr Gly Thr
            980                 985                 990
Ala Arg Ala Ile Gln Ser Gln Phe Pro Pro Gln Leu Leu Ser Arg Ile
        995                 1000                1005
Ile Gly Lys Thr Ser Thr Ala Glu Ser Ile Met Arg Val Gly Leu
    1010                1015                1020
Asp Arg Glu Tyr Gly Thr Met Lys Met Lys Asp Ile Trp Phe Ala
    1025                1030                1035
Ala Val Gly Phe Ser Asp Gln Asp Leu Ser Leu Pro Thr Ile Val
    1040                1045                1050
Val Ile Val Tyr Leu Arg Leu Gly Glu Phe Gly Arg Asp Ala Ala
    1055                1060                1065
Pro Met Ala Val Lys Met Ile Asp Met Trp Glu Lys Ile Gln Gln
    1070                1075                1080
Arg Glu Ser Phe Leu Arg Gly
    1085                1090
 
<210>126
<211>406
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>126
 
Val Lys Asn Leu Lys Glu Asp Phe Pro Ile Phe Ala Ala Lys Ala Lys
1               5                   10                  15
Glu Asn Glu Pro Phe Ile Tyr Leu Asp Ser Ala Ala Thr Thr Gln Lys
            20                  25                  30
Pro Gln Gln Val Ile Asp Ala Val Ala Asn Phe Tyr Thr Ser Ser Tyr
        35                  40                  45
Ala Thr Val Asn Arg Ala Ile Tyr Ser Ser Ser Arg Asn Val Thr Glu
    50                  55                  60
Ala Tyr Ala Ala Val Arg Glu Lys Val Arg Lys Trp Val Ser Ala Ala
65                  70                  75                  80
Ser Asp Ser Glu Ile Val Phe Thr Arg Gly Thr Thr Ala Gly Leu Asn
                85                  90                  95
Leu Leu Ala Ile Ser Val Asn Asp Leu Trp Ile Pro Lys Gly Gly Val
            100                 105                 110
Val Leu Val Ser Glu Ala Glu His His Ala Asn Val Leu Ser Trp Glu
        115                 120                 125
Ile Ala Cys Arg Arg Arg Gly Ser Leu Val Lys Lys Ile Arg Val His
    130                 135                 140
Asp Ser Gly Leu Ile Asp Leu Asp Asp Leu Glu Lys Leu Leu Asn Glu
145                 150                 155                 160
Gly Ala Gln Phe Val Ser Ile Pro His Val Ser Asn Val Thr Gly Cys
                165                 170                 175
Val Gln Pro Leu Gln Gln Val Ala Glu Leu Val His Arg Tyr Asp Ala
            180                 185                 190
Tyr Leu Ala Val Asp Gly Ala Gln Gly Ala Pro His Leu Pro Ile Asp
        195                 200                 205
Val Gln Leu Trp Asp Val Asp Phe Tyr Val Phe Ser Ser His Lys Ile
    210                 215                 220
Tyr Gly Pro Thr Gly Ile Gly Val Leu Tyr Gly Lys Lys Asp Leu Leu
225                 230                 235                 240
Asp Gln Leu Pro Pro Val Glu Gly Gly Gly Asp Met Val Ala Ile Tyr
                245                 250                 255
Asp His Gln Asn Pro Glu Tyr Leu Pro Ala Pro Met Lys Phe Glu Ala
            260                 265                 270
Gly Thr Pro Asn Ile Ala Gly Val Leu Gly Leu Gly Ala Ala Leu Asp
        275                 280                 285
Tyr Leu Asp Gly Leu Ser Ala Lys Phe Ile Tyr Asp Lys Glu Ile Ala
    290                 295                 300
Leu Thr Thr Tyr Leu His Lys Glu Leu Leu Glu Ile Pro Gly Val Glu
305                 310                 315                 320
Ile Leu Gly Pro Ser Ile Glu Glu Pro Arg Gly Ala Leu Ile Gly Met
                325                 330                 335
Thr Ile Asp Gly Ala His Pro Leu Asp Leu Gly Phe Leu Leu Asp Leu
            340                 345                 350
Arg Gly Ile Ala Val Arg Thr Gly His Gln Cys Ala Gln Pro Ala Met
        355                 360                 365
Glu Arg Trp Asn Val Gly His Val Leu Arg Val Ser Leu Gly Ile Tyr
    370                 375                 380
Asn Asp Glu Asp Asp Ile Asp Gln Phe Ile Leu Val Leu Gln Asp Ser
385                 390                 395                 400
Leu Asp Lys Ile Arg Arg
                405
 
<210>127
<211>252
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>127
Met Leu Ile Val Leu Ala Phe Arg Gln Val Phe Phe Ser His Ser Arg
1               5                   10                  15
Ser Gln Leu Asp Arg Leu Lys Asn Tyr Leu Arg Leu Leu Lys Gln Asn
            20                  25                  30
Phe Ala Ile Thr Leu Pro Lys Glu Arg Thr Ser Lys Gly His Ser Leu
        35                  40                  45
Met Leu Thr Phe Asp Phe Ala Ser Phe Asp Phe Tyr Thr Asn Ile Phe
    50                  55                  60
Pro Phe Leu Glu Glu Gln Lys Ile Pro Ala Val Val Gly Val Ala Ser
65                  70                  75                  80
Arg Tyr Ile Pro Ser Asn Ala Ala Gln Asp Leu His Pro Ser His Arg
                85                  90                  95
Leu Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ala Phe Gln Asp Glu Ile Phe Ser Asn
            100                 105                 110
Tyr Met Pro Phe Cys Cys Gln Asn Glu Leu Ile Glu Met Ala Lys Ser
        115                 120                 125
Pro Tyr Ile Gln Leu Ala Ser Ser Gly Phe Ala Ile Arg Asn Leu Met
    130                 135                 140
Asn Asn Pro Pro Tyr Leu Thr Thr Glu Ile Leu Leu Ser Arg His His
145                 150                 155                 160
Ile Glu Thr Ile Thr Gly Ala Lys Pro Leu Ala Phe Leu Phe Pro Phe
                165                 170                 175
Gly Lys Ser Asp Pro Thr Ser Arg Lys Leu Ala Ala Asp His Tyr Pro
            180                 185                 190
Tyr Ser Phe Leu Leu Gly Asn Thr Ile Asn Arg Lys Leu Lys Thr His
        195                 200                 205
Asn Ile Tyr Arg Leu Asp Ile Lys Pro Met Gln Tyr Val Cys Pro Ser
    210                 215                 220
Leu Phe Gln Ser Ser Arg Tyr Leu Lys Asn Trp Ile Lys Glu Lys Ser
225                 230                 235                 240
Lys Gln Leu Tyr Leu Lys Lys Gln Leu Pro Lys Arg
                245                 250
 
<210>128
<211>324
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>128
Met Thr Thr Asn Phe Pro Gln Pro Leu Ile Gln Ala Thr Ser Leu Thr
1               5                   10                  15
Lys His Tyr Tyr Lys Arg Ser Phe Trp Phe Gln Gly Lys Thr Ile Ala
            20                  25                  30
Ser Arg Pro Val Asp Asp yal Ser Phe Ser Leu Tyr Ser Arg Arg Ala
        35                  40                  45
Val Gly Leu Ile Gly Glu Ser Gly Ser Gly Lys Ser Thr Leu Ala Leu
    50                  55                  60
Ala Leu Ala Gly Leu Leu Pro Leu Thr Ser Gly Phe Leu Thr Phe Asn
65                  70                  75                  80
Gly Thr Pro Ile Lys Leu His Ser Lys His Gly Arg His Gln Leu Arg
                85                  90                  95
Ser Gln Val Arg Leu Val Phe Gln Asn Pro Gln Ala Ser Leu Asn Pro
            100                 105                 110
Arg Lys Thr Ile Leu Asp Ser Leu Gly His Ser Leu Leu Tyr His Lys
        115                 120                 125
Leu Val Pro Lys Glu Lys Val Leu Ala Thr Val Arg Glu Tyr Leu Glu
    130                 135                 140
Leu Val Gly Leu Ser Glu Glu Tyr Phe Tyr Arg Tyr Pro His Gln Leu
145                 150                 155                 160
Ser Gly Gly Gln Gln Gln Arg Val Ser Ile Ala Arg Ala Leu Leu Gly
                165                 170             175
Val Pro Gln Leu Ile Ile Cys Asp Glu Ile Val Ser Ala Leu Asp Leu
            180                 185                 190
Ser Ile Gln Ala Gln Ile Leu Asn Met Leu Ala Glu Leu Gln Lys Lys
        195                 200                 205
Leu Ser Leu Thr Tyr Leu Phe Ile Ser His Asp Leu Ala Val Val Arg
    210                 215                 220
Ser Phe Cys Thr Glu Val Phe Ile Met Tyr Lys Gly Gln Ile Val Glu
225                 230                 235                 240
Lys Gly Asn Thr Lys Arg Ile Phe Ser Asp Pro Gln His Pro Tyr Thr
                245                 250                 255
Arg Met Leu Leu Asn Ala Gln Leu Pro Glu Thr Pro Asp Gln Arg Gln
            260                 265                 270
Ser Lys Pro Ile Phe Gln Glu Tyr His Lys Asp Ser Glu Glu Ser Cys
        275                 280                 285
Ser Thr Gly Cys Tyr Phe Tyr Asn Arg Cys Pro Gln Lys Gln Glu Ala
    290                 295                 300
Cys Lys Ser Glu Ile Ile Pro Asn Gln Gly Asp Ala His His Thr Tyr
305                 310                 315                 320
Arg Cys Ile His
 
<210>129
<211>436
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>129
 
Met Lys Arg Pro Phe Phe Thr Tyr Leu Cys Ile Ile Phe Tyr Gly Ser
1               5                   10                  15
Cys Ala Ser Leu Ser Leu His Ala Gly Leu Ser Phe Pro Glu Val Arg
            20                  25                  30
Gly Ala Thr Ala Ala Val Val His Ala Asp Ser Gly Lys Val Phe Tyr
        35                  40                  45
Asp Lys Asp Ile Asp Ala Val Ile Tyr Pro Ala Ser Met Thr Lys Ile
    50                  55                  60
Ala Thr Ala Leu Phe Ile Leu Lys His Tyr Pro Thr Val Leu Asp Thr
65                  70                  75                  80
Leu Ile Lys Val Lys Gln Asp Ala Ile Ala Ser Ile Thr Pro Gln Ala
                85                  90                  95
Lys Lys Gln Ser Gly Tyr Arg Ser Pro Pro His Trp Leu Glu Thr Asp
            100                 105                 110
Gly Ser Thr Ile Gln Leu His Leu Arg Glu Glu Leu Leu Gly Trp Asp
        115                 120                 125
Leu Phe His Ala Leu Leu Val Cys Ser Ala Asn Asp Ala Ala Asn Val
    130                 135                 140
Leu Ala Met Ala Cys Cys Gly Ser Val Glu Lys Phe Met Asp Lys Leu
145                 150                 155                 160
Asn Phe Phe Leu Lys Glu Glu Ile Gly Cys Thr His Thr His Phe Asn
                165                 170                 175
Asn Pro His Gly Leu His His Pro Asn His Tyr Thr Thr Thr Arg Asp
            180                 185                 190
Leu Ile Ser Ile Met Arg Cys Ala Leu Lys Glu Pro Pro Phe Arg Gly
        195                 200                 205
Val Ile Ser Thr Thr Ser Tyr Lys Ile Gly Ala Thr Asn Leu His Gly
    210                 215                 220
Glu Arg Ile Leu Ser Pro Thr Asn Lys Leu Leu Leu Pro Gly Ser Thr
225                 230                 235                 240
Tyr His Tyr Pro Pro Ala Leu Gly Gly Lys Thr Gly Thr Thr Lys Thr
                245                 250                 255
Ala Gly Lys Asn Leu Ile Met Ala Ala Glu Lys Asn Asn Arg Leu Leu
            260                 265                 270
Val Thr Ile Ala Thr Gly Tyr Ser Gly Pro Val Ser Asp Leu Tyr Gln
        275                 280                 285
Asp Val Ile Ala Leu Cys Glu Thr Val Phe Asn Glu Pro Leu Leu Arg
    290                 295                 300
Lys Glu Leu Val Pro Pro Ser Asp Cys Leu Gln Leu Glu Ile Ala Asn
305                 310                 315                 320
Leu Gly Lys Leu Ser Cys Pro Leu Pro Glu Gly Leu Tyr Tyr Asp Phe
                325                 330                 335
Tyr Ala Ser Glu Asp Arg Glu Pro Leu Ser Val Ser Phe Ile Ala His
            340                 345                 350
Ala Asp Ala Phe Pro Ile Glu Gln Gly Asp Leu Leu Gly His Trp Val
        355                 360                 365
Phe Tyr Asp Asp Glu Gly Lys Lys Ile Ser Ser Gln Pro Phe Tyr Ala
    370                 375                 380
Pro Cys Arg Phe Glu Arg Thr Ile Lys Pro Trp Lys Leu Tyr Met Lys
385                 390                 395                 400
Arg Val Phe Thr Ser Tyr Arg Thr Tyr Met Ser Ile Thr Met Leu Leu
                405                 410                 415
Met Tyr Phe Arg Ile Arg Lys His Arg Lys Tyr Lys Asn Leu Lys His
            420                 425                 430
Tyr Ser Lys Ile
        435
 
<210>130
<211>235
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>130
 
Met Pro Thr Thr Asn Cys Ile Phe Leu Asp Leu Arg Gly His Ser Ile
1               5                   10                  15
Leu His Gln Leu Gln Ile Glu Glu Ala Leu Leu Arg Val Ala Asn Gln
            20                  25                  30
Asn Phe Cys Ile Ile Asn Ser Gly Ala Lys Asp Ser Ile Val Leu Gly
        35                  40                  45
Ile Ser Arg Asn Leu Asn Gln Asp Val His Ile Ser Arg Ala Gln Ala
    50                  55                  60
Asp His Ile Pro Ile Ile Arg Arg Tyr Ser Gly Gly Gly Thr Val Phe
65                  70                  75                  80
Ile Asp Ser Asn Thr Leu Met Val Ser Trp Ile Met Asn Ser Ser Glu
                85                  90                  95
Ala Ser Ala Gln Pro Gln Glu Leu Leu Ala Trp Thr Tyr Gly Ile Tyr
            100                 105                 110
Ser Pro Leu Leu Pro Asn Thr Phe Ser Ile Arg Glu Asn Asp Tyr Val
        115                 120                 125
Leu Gly His Lys Lys Ile Gly Gly Asn Ala Gln Tyr Ile Gln Arg His
    130                 135                 140
Arg Trp Val His His Thr Thr Phe Leu Trp Asp Ile Asp Leu Asp Lys
145                 150                 155                 160
Leu Ser Tyr Tyr Leu Pro Ile Pro Gln Gln Gln Pro Thr Tyr Arg Asn
                165                 170                 175
Gln Arg Ser His Glu Glu Phe Leu Thr Thr Leu Arg Pro Trp Phe Pro
            180                 185                 190
Ser Arg Asp Asp Phe Leu Glu Arg Ile Lys Ala Ser Gly Ser Leu Leu
        195                 200                 205
Phe Thr Trp Glu Glu Phe Leu Asp Asn Glu Leu Glu Glu Ile Leu Ala
    210                 215                 220
Gln Pro His Arg Lys Ala Thr Thr Val Leu Asn
225                 230                 235
 
<210>131
<211>792
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>131
 
Met Arg Ile Pro Ile Thr Leu Leu Gln Thr Tyr Phe Ser Glu Pro Leu
1               5                   10                  15
Ser Thr Lys Glu Ile Leu Glu Ala Cys Asp His Ile Gly Ile Glu Ala
            20                  25                  30
Glu Ile Glu Asn Thr Thr Leu Tyr Ser Phe Ala Ser Val Ile Thr Ala
        35                  40                  45
Lys Ile Leu His Thr Ile Pro His Pro Asn Ala Asp Lys Leu Arg Val
    50                  55                  60
Ala Thr Leu Thr Asp Gly Glu Lys Glu His Gln Val Val Cys Gly Ala
65                  70                  75                  80
Pro Asn Cys Glu Ala Gly Leu Ile Val Ala Leu Ala Leu Pro Gly Ala
                85                  90                  95
Lys Leu Phe Asp Ser Glu Gly Gln Ala Tyr Thr Ile Lys Lys Ser Lys
            100                 105                 110
Leu Arg Gly Val Glu Ser Gln Gly Met Cys Cys Gly Ala Asp Glu Leu
        115                 120                 125
Gly Leu Asp Glu Leu Gln Ile Gln Glu Arg Ala Leu Leu Glu Leu Pro
    130                 135                 140
Glu Ala Thr Pro Leu Gly Glu Asp Leu Ala Thr Val Leu Gly Asn Thr
145                 150                 155                 160
Ser Leu Glu Ile Ser Leu Thr Pro Asn Leu Gly His Cys Ala Ser Phe
                165                 170                 175
Leu Gly Leu Ala Arg Glu Ile Cys His Val Thr Gln Ala Asn Leu Val
            180                 185                 190
Ile Pro Lys Glu Phe Ser Phe Glu Asn Leu Pro Thr Thr Ala Leu Asp
        195                 200                 205
Met Gly Asn Asp Pro Asp Ile Cys Pro Phe Phe Ser Tyr Val Val Ile
    210                 215                 220
Thr Gly Ile Ser Ala Gln Pro Ser Pro Ile Lys Leu Gln Glu Ser Leu
225                 230                 235                 240
Gln Ala Leu Lys Gln Lys Pro Ile Asn Ala Ile Val Asp Ile Thr Asn
                245                 250                 255
Tyr Ile Met Leu Ser Leu Gly Gln Pro Leu His Ala Tyr Asp Ala Ser
            260                 265                 270
His Val Ala Leu Asp Ser Leu Arg Val Glu Lys Leu Ser Thr Pro Glu
        275                 280                 285
Ser Leu Thr Leu Leu Asn Gly Glu Thr Val Leu Leu Pro Ser Gly Val
    290                 295                 300
Pro Val Val Arg Asp Asp His Ser Leu Leu Gly Leu Gly Gly Val Met
305                 310                 315                 320
Gly Ala Lys Ala Pro Ser Phe Gln Glu Thr Thr Thr Thr Thr Val Ile
                325                 330                 335
Lys Ala Ala Tyr Phe Leu Pro Glu Ala Leu Arg Ala Ser Gln Lys Leu
            340                 345                 350
Leu Pro Ile Pro Ser Glu Ser Ala Tyr Arg Phe Thr Arg Gly Ile Asp
        355                 360                 365
Pro Gln Asn Val Val Pro Ala Leu Gln Ala Ala Ile His Tyr Ile Leu
    370                 375                 380
Glu Ile Phe Pro Glu Ala Thr Ile Ser Pro Ile Tyr Ser Ser Gly Glu
385                 390                 395                 400
Ile Cys Arg Glu Leu Lys Glu Val Ala Leu Arg Pro Lys Thr Leu Gln
                405                 410                 415
Arg Ile Leu Gly Lys Ser Phe Ser Ile Glu Ile Leu Ser Gln Lys Leu
            420                 425                 430
Gln Ser Leu Gly Phe Ser Thr Thr Pro Gln Glu Thr Ser Leu Leu Val
        435                 440                 445
Lys Val Pro Ser Tyr Arg His Asp Ile Asn Glu Glu Ile Asp Leu Val
    450                 455                 460
Glu Glu Ile Cys Arg Thr Glu Ser Trp Asn Ile Glu Thr Gln Asn Pro
465                 470                 475                 480
Val Ser Cys Tyr Thr Pro Ile Tyr Lys Leu Lys Arg Glu Thr Ala Gly
                485                 490                 495
Phe Leu Ala Asn Ala Gly Leu Gln Glu Phe Phe Thr Pro Asp Leu Leu
            500                 505                 510
Asp Pro Glu Thr Val Ala Leu Thr Arg Lys Glu Lys Glu Glu Ile Ser
        515                 520                 525
Leu Gln Gly Ser Lys His Thr Thr Val Leu Arg Ser Ser Leu Leu Pro
    530                 535                 540
Gly Leu Leu Lys Ser Ala Ala Thr Asn Leu Asn Arg Gln Ala Pro Ser
545                 550                 555                 560
Val Gln Ala Phe Glu Ile Gly Thr Val Tyr Ala Lys His Gly Glu Gln
                565                 570                 575
Cys Gln Glu Thr Gln Thr Leu Ala Ile Leu Leu Thr Glu Asp Gly Glu
            580                 585                 590
Ser Arg Ser Trp Leu Pro Lys Pro Ser Leu Ser Phe Tyr Ser Leu Lys
        595                 600                 605
Gly Trp Val Glu Arg Leu Leu Tyr His His His Leu Ser Ile Asp Ala
    610                 615                 620
Leu Thr Leu Glu Ser Ser Ala Leu Cys Glu Phe His Pro Tyr Gln Gln
625                 630                 635                 640
Gly Val Leu Arg Ile His Lys Gln Ser Phe Ala Thr Leu Gly Gln Val
                645                 650                 655
His Pro Glu Leu Ala Lys Lys Ala Gln Ile Lys His Pro Val Phe Phe
            660                 665                 670
Ala Glu Leu Asn Leu Asp Leu Leu Cys Lys Met Leu Lys Lys Thr Thr
        675                 680                 685
Lys Leu Tyr Lys Pro Tyr Ala Ile Tyr Pro Ser Ser Phe Arg Asp Leu
    690                 695                 700
Thr Leu Thr Val Pro Glu Asp Ile Pro Ala Asn Leu Leu Arg Gln Lys
705                 710                 715                 720
Leu Leu His Glu Gly Ser Lys Trp Leu Glu Ser Val Thr Ile Ile Ser
                725                 730                 735
Ile Tyr Gln Asp Lys Ser Leu Glu Thr Arg Asn Lys Asn Val Ser Leu
            740                 745                 750
Arg Leu Val Phe Gln Asp Tyr Glu Arg Thr Leu Ser Asn Gln Asp Ile
        755                 760                 765
Glu Glu Glu Tyr Cys Arg Leu Val Ala Leu Leu Asn Glu Leu Leu Thr
    770                 775                 780
Asp Thr Lys Gly Thr Ile Asn Ser
785                 790
 
<210>132
<211>252
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>132
 
Met Gln Ile Cys Val Thr Gly Val Val Leu Arg Ser Arg Pro Leu Gly
1               5                   10                  15
Lys Asn His Thr Leu Thr Thr Leu Phe Thr Pro Glu Gly Leu Phe Thr
            20                  25                  30
Phe Phe Ala Lys Gln Gly Gln Thr Leu Gln Cys Asp Tyr Arg Glu Thr
        35                  40                  45
Leu Val Pro Ile Ser Leu Gly Lys Tyr Thr Leu His Arg Asn Gly Ser
    50                  55                  60
Arg Leu Pro Lys Leu Thr His Gly Asp Ile Leu Asn Ala Phe Glu Ala
65                  70                  75                  80
Ile Lys Gln Thr Tyr Ala Leu Leu Glu Ala Ser Gly Lys Met Ile Gln
                85                  90                  95
Ala Leu Leu Ala Ser Gln Trp Lys Glu Lys Pro Ser His Lys Leu Phe
            100                 105                 110
Ser Leu Phe Leu Asn Phe Leu His Arg Ile Pro Glu Ser Ser Asn Pro
        115                 120                 125
Glu Phe Phe Ala Ala Ile Phe Val Leu Lys Leu Leu Gln Tyr Glu Gly
    130                 135                 140
Ile Leu Asp Leu Thr Pro Ala Cys Ser Leu Cys Lys Ala Ser Leu Pro
145                 150                 155                 160
Tyr Ala Cys Tyr Arg Tyr Gln Gly His Lys Leu Cys Lys Lys His Gln
                165                 170                 175
His Lys Gln Ala Ile Ser Ile Glu Lys Glu Glu Glu Gln Ile Leu Gln
            180                 185                 190
Ala Ile Ile His Ala Lys Gln Phe Ser Glu Leu Leu Ala Ile Ala Glu
        195                 200                 205
Phe Pro Ile Ala Ile Ala Glu Lys Ile Phe Tyr Leu Phe Asp Ser Leu
    210                 215                 220
Gln Glu Glu Lys Lys Ser Glu Arg Asn Ser Ser Glu Asp Pro Tyr His
225                 230                 235                 240
Glu Ile Leu Arg Leu Ser Lys Val Val His Pro Tyr
                245                 250
 
<210>133
<211>267
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>133
 
Met Thr Lys Val Ala Leu Leu Ile Ala Tyr Gln Gly Thr Ala Tyr Ser
1               5                   10                  15
Gly Trp Gln Gln Gln Pro Asn Asp Leu Ser Ile Gln Glu Val Ile Glu
            20                  25                  30
Ser Ser Leu Lys Lys Ile Thr Lys Thr Arg Thr Pro Leu Ile Ala Ser
        35                  40                  45
Gly Arg Thr Asp Ala Gly Val His Ala Tyr Gly Gln Val Ala His Phe
    50                  55                  60
Arg Ala Pro Asp His Pro Leu Phe Ala Asn Ala Asn Leu Thr Lys Lys
65                  70                  75                  80
Ala Leu Asn Ala Ile Leu Pro Lys Asp Ile Val Ile Arg Asp Val Ala
                85                  90                  95
Leu Phe Asp Asp Asn Phe His Ala Arg Tyr Leu Thr Ile Ala Lys Glu
            100                 105                 110
Tyr Arg Tyr Ser Leu Ser Arg Leu Ala Lys Pro Leu Pro Trp Gln Arg
        115                 120                 125
His Phe Cys Tyr Thr Pro Arg His Pro Phe Ser Thr Glu Leu Met Gln
    130                 135                 140
Glu Gly Ala Asn Leu Leu Ile Gly Thr His Asp Phe Ala Ser Phe Ala
145                 150                 155                 160
Asn His Gly Arg Asp Tyr Asn Ser Thr Val Arg Thr Ile Tyr Thr Leu
                165                 170                 175
Asp Ile Val Asp Lys Gly Asp Ser Leu Ser Ile Ile Cys Arg Gly Asn
            180                 185                 190
Gly Phe Leu Tyr Lys Met Val Arg Asn Leu Val Gly Ala Leu Leu Asp
        195                 200                 205
Val Gly Lys Gly Ala Tyr Pro Pro Glu His Leu Leu Asp Ile Leu Glu
    210                 215                 220
Gln Lys Asn Arg Arg Glu Gly Pro Ser Ala Ala Pro Ala Tyr Gly Leu
225                 230                 235                 240
Ser Leu His His Val Cys Tyr Ser Ser Pro Tyr Asn Asn Phe Cys Cys
                245                 250                 255
Glu Gln Cys Ser Val Ser Thr Ser Asn Glu Gly
            260                 265
 
<210>134
<211>1402
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>134
 
Met Lys Gln Lys Val Lys Arg Asn Phe Ala Ile Ile Ile Cys Val Phe
1               5                   10                  15
Ala Leu Ala Leu Tyr Tyr Val Leu Pro Thr Cys Leu Tyr Tyr Ala Lys
            20                  25                  30
Pro Leu Asp Lys Lys Ile Asp Gly Asn Glu Ala Glu His Ile Ile Lys
        35                  40                  45
Ser Phe Thr Lys Gln Ala Gln Gln Val Arg Lys Asp Val Ile Pro Arg
    50                  55                  60
Val Ser Ala Ile Leu Ser Ser Leu His Leu Arg Gly His Ile Gln Gln
65                  70                  75                  80
His Pro Ala Ile Pro Asp Ile Val Ser Val Arg Phe Lys Arg Gly Glu
                85                  90                  95
Asp Ala Glu Asp Phe Ile Gly Asn Leu Val His Gly Glu Pro Asn Val
            100                 105                 110
Pro Ile Lys Ser Ala Arg Leu His Val Val Gly Tyr Ser Arg Glu His
        115                 120                 125
Asp Asp His Val Ile Gln Val Ala Ser Ser Ile Asn Thr Ser Leu Val
    130                 135                 140
Glu Ser Asp Phe Ser Phe Val Ser Tyr Ser Ser Glu Asn Glu Gln Glu
145                 150                 155                 160
Met Ala Ser Ser Ile Leu Gln Arg Val Tyr Ser Ala Cys Thr Phe Pro
                165                 170                 175
Lys Gln Lys Asp Cys Ser Cys Ser Tyr Pro Ser Ile Trp Glu Thr Ala
            180                 185                 190
Pro Lys Glu Gln Leu Leu Gln Tyr Ala Lys Asn Leu Ser Ser Gly Phe
        195                 200                 205
Glu Val Phe Ser Ser Arg Leu Ser Ala Phe Cys Gln Gln Ser Phe Ser
    210                 215                 220
Ser Asn Gln Asp Arg Leu Ala Phe Leu Ser Arg Leu Ser Ser Leu Ser
225                 230                 235                 240
Asn Asp Ala Ala Ile Asp Val Glu Asp Gln Lys Leu Leu Lys Ser Val
                245                 250                 255
Tyr Glu Thr Leu Ser Gln Thr Ala Cys Ile Arg Ser Leu Asp Cys Pro
            260                 265                 270
Tyr Ile Glu Gly Leu Arg Leu Asp Cys Ser Glu Ser Ser Leu Phe Phe
        275                 280                 285
Ser Ser Ile Glu Tyr Cys Pro Lys Glu Arg Lys Ile Phe Leu Thr Leu
    290                 295                 300
His Ser Asp Leu Leu Ala Gln Arg Thr Ser Leu Ser Lys Glu Gln Arg
305                 310                 315                 320
Leu Asp Phe Asp Ser Arg Leu Ala Val Glu Lys Gln Lys Leu Ser Lys
                325                 330                 335
Asn Leu Thr Val Gln Val Glu Asp Tyr Asn Asn Gly Phe Ser Phe Gln
            340                 345                 350
Trp Met Asp Lys Asp Thr Gln Gly Lys Ile Ile Leu Gln Gly Glu Arg
        355                 360                 365
Leu Leu Gln Gly Ile Ala Glu His Leu Thr Ala Leu Thr Leu His Arg
    370                 375                 380
Pro Ala Ala Glu Ser Cys Asp Leu Ile Pro Glu Asn Phe Pro Val Phe
385                 390                 395                 400
Cys Arg Gln Pro Arg Glu Ser Glu Ala Phe Gly Cys Tyr Ile Phe Ser
                405                 410                 415
Pro Asn Thr Asp Cys Lys His Phe Ser Lys Gly Ser Val Tyr Ile Leu
            420                 425                 430
Leu Lys Gly Leu Arg Ser Ile Val Ala Lys Tyr Gln Gln Gly Gly Gly
        435                 440                 445
Lys Glu Leu Gln Ser Phe Glu Lys Asp Leu Gln Asn Leu Tyr Asn Cys
    450                 455                 460
Phe Ser His Thr Glu Ala Ile Ser Trp Thr Leu Gly Glu Asp Gln Val
465                 470                 475                 480
Leu Glu Ile Arg His Pro Leu Gln Gln Phe Leu Asp Val Trp Gly Glu
                485                 490                 495
Gly Phe Val Ile Gly Lys Glu Gly Cys Ala Phe Leu Glu Val Lys Asp
            500                 505                 510
Ile Gln Asp Arg Leu Ala Thr Val Asn Gln Ile Glu Lys Asn Arg Gln
        515                 520                 525
Ser Asp Leu Val Arg Trp His Glu Gln Tyr Arg His Ala Lys Cys Ser
    530                 535                 540
Met Asp Leu Gln Glu Arg Leu Ser Ala Pro Ile Pro Tyr Gln Asn Leu
545                 550                 555                 560
Phe Leu Glu Asn Met Lys Leu Asn Met Arg Lys Phe Ser Arg Gly Glu
                565                 570                 575
Asn Ile Leu Arg Leu Gly Ile Asp Phe Val Gly Gly Arg Gln Leu Leu
            580                 585                 590
Leu Ser Phe Lys Asp His Gln Gly Lys Gln Leu Thr Asp Lys Glu Asp
        595                 600                 605
Ile Leu Lys Val Ser Asp Glu Leu Cys Ala Arg Leu Asn Lys Leu Gly
    610                 615                 620
Val Ser Glu Ile Glu Leu Arg Arg Glu Gly Asp Tyr Ile His Leu Ser
625                 630                 635                 640
Val Pro Gly Ser Ser Thr Ile Ser Ser Ser Glu Ile Leu Gly Thr Ser
                645                 650                 655
Lys Met Ser Phe His Val Val Asn Glu Arg Phe Ser Ser Tyr Ser Ala
            660                 665                 670
Ser Arg Tyr Glu Val Gln Arg Phe Leu Asp Tyr Leu Trp Phe Thr Ser
        675                 680                 685
Gln Ala Gln Gly Lys Thr Ser Pro Glu Glu Ile Asn Thr Phe Ala Ser
    690                 695                 700
Ala Leu Phe Asn Glu Glu Val Asp Val Pro Pro Ser Val His Glu Ala
705                 710                 715                 720
Ile Thr Lys Leu Lys Ser Glu Gly Leu Ala Phe Ser Pro Ser Gly Cys
                725                 730                 735
Glu Thr Pro Ser Thr Asp Leu Asp Thr Thr Phe Ser Met Ile Ala Ile
            740                 745                 750
Gly Lys Asp Ala Glu Gln Lys Ala Asn Pro Leu Val Ile Val Phe Arg
        755                 760                 765
Asn Tyr Ala Leu Asp Gly Ala Ser Leu Lys Asp Ile Arg Pro Glu Phe
    770                 775                 780
Ala Ala Gly Glu Gly Tyr Val Leu Asn Phe Ser Val Lys Asp Thr Ser
785                 790                 795                 800
Pro Lys Lys Met Ala Glu Lys Leu Ser Pro Thr Glu Ser Phe His Thr
                805                 810                 815
Trp Thr Ser Ala Tyr Cys Gln Glu Gly Ile Ser Gly Thr Ala Asn Gly
            820                 825                 830
Gln Tyr Ser Ala Asn Arg Gly Trp Arg Met Ala Val Val Ile Asp Gly
        835                 840                 845
Tyr Met Val Ser Ser Pro Ile Leu Asn Val Pro Leu Lys Asn His Ala
    850                 855                 860
Ser Val Ser Gly Lys Phe Thr His Arg Glu Val Ser Lys Leu Ala Ser
865                 870                 875                 880
Asp Leu Lys Ser Gly Ala Met Ser Phe Val Pro Glu Val Leu Ser Glu
                885                 890                 895
Glu Thr Ile Ser Ser Asp Leu Gly Lys Lys Gln Cys Thr Gln Gly Ile
            900                 905                 910
Ile Ser Ala Cys Cys Gly Leu Ala Met Leu Ile Val Leu Met Ser Val
        915                 920                 925
Tyr Tyr Arg Phe Gly Gly Val Ile Ala Ser Gly Ala Val Leu Leu Asn
    930                 935                 940
Leu Leu Leu Ile Trp Ala Ala Leu Gln Tyr Leu Asp Ala Pro Leu Thr
945                 950                 955                 960
Leu Ser Gly Leu Ala Gly Ile Val Leu Ala Met Gly Met Ala Val Asp
                965                 970                 975
Ala Asn Val Leu Val Phe Glu Arg Ile Arg Glu Glu Phe Leu Leu Ser
            980                 985                 990
Gln Ser Leu Lys Lys Ser Val Glu Lys Gly Tyr Thr Lys Ala Phe Gly
        995                 1000                1005
Ala Ile Phe Asp Ser Asn Leu Thr Thr Val Leu Ala Ser Ala Leu
    1010                1015                1020
Leu Phe Phe Leu Asp Thr Gly Pro Ile Lys Gly Phe Ala Leu Thr
    1025                1030                1035
Leu Ile Leu Gly Ile Phe Ser Ser Met Phe Thr Ala Leu Phe Met
    1040                1045                1050
Thr Lys Phe Phe Phe Met Leu Trp Met Asn Lys Thr Gln His Thr
    1055                1060                1065
Gln Leu His Met Met Asn Lys Phe Val Gly Ile Lys His Asp Phe
    1070                1075                1080
Leu Arg Gly Cys Lys Lys Leu Trp Ala Val Ser Gly Ser Val Phe
    1085                1090                1095
Leu Leu Gly Cys Val Ala Leu Gly Phe Gly Ala Trp Asn Ser Val
    1100                1105                1110
Leu Gly Met Asp Phe Lys Gly Gly Tyr Ala Phe Thr Phe Asn Pro
    1115                1120                1125
Lys Glu His Gly Ile Ser Asp Val Ala Gln Met Arg Gly Lys Val
    1130                1135                1140
Val His Lys Leu Gln Glu Ala Gly Leu Ser Ser Arg Asp Phe Arg
    1145                1150                1155
Ile Gln Thr Phe Gly Ser Ser  Glu LysIle Lys Ile Tyr Phe Ser
    1160                1165                1170
Asp Lys Ala Leu Ser Tyr Thr Lys Ala Asp Thr Ser Leu Ser Pro
    1175                1180                1185
Lys Ile Asn Asp His Glu Leu Ala Leu Ala Val Gly Leu Leu Ser
    1190                1195                1200
Glu Thr Gly Leu Asp Phe Ser Thr Glu Thr Leu Asn Glu Thr Gln
    1205                1210                1215
Asn Phe Trp Ser Lys Val Ser Ser Lys Leu Ser Lys Lys Met Arg
    1220                1225                1230
Tyr Gln Ala Thr Ile Gly Leu Leu Gly Ala Leu Ala Ile Ile Leu
    1235                1240                1245
Leu Tyr Val Ser Leu Arg Phe  Glu Trp Gln Tyr Ala  Phe Ser Ala
    1250                1255                1260
Val Cys Ala Leu Ile His Asp Leu Leu Ala Thr Cys Ala Val Leu
    1265                1270                1275
Phe Ile Ala His Phe Phe Leu Lys Lys Ile Gln Ile Asp Leu Gln
    1280                1285                1290
Ala Ile Gly Ala Leu Met Thr Val Leu Gly Tyr Ser Leu Asn Asn
    1295                1300                1305
Thr Leu Ile Ile Phe Asp Arg Ile Arg Glu Asp Arg Gln Ala Asn
    1310                1315                1320
Leu Phe Thr Pro Met His Val Leu Val Asn Asp Ala Leu Gln Lys
    1325                1330                1335
Thr Phe Ser Arg Thr Val Met Thr Thr Ala Thr Thr Leu Ser Val
    1340                1345                1350
Leu Leu Met Leu Leu Phe Ile Gly Gly Ser Ser Val Phe Asn Phe
    1355                1360                1365
Ala Phe Ile Met Thr Ile Gly Ile Leu Leu Gly Thr Leu Ser Ser
    1370                1375                1380
Leu Tyr Ile Ala Pro Pro Leu Leu Leu Phe Met Val Arg Lys Glu
    1385                1390                1395
Asn Arg Ser Lys
1400
 
<210>135
<211>245
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>135
 
Met Thr Ile Arg Ile Leu Ala Glu Gly Leu Ala Phe Arg Tyr Gly Ser
1               5                   10                  15
Lys Gly Pro Asn Ile Ile His Asp Val Ser Phe Ser Val Tyr Asp Gly
            20                  25                  30
Asp Phe Ile Gly Ile Ile Gly Pro Asn Gly Gly Gly Lys Ser Thr Leu
        35                  40                  45
Thr Met Leu Ile Leu Gly Leu Leu Thr Pro Thr Phe Gly Ser Leu Lys
    50                  55                  60
Thr Phe Pro Ser His Ser Ala Gly Lys Gln Thr His Ser Met Ile Gly
65                  70                  75                  80
Trp Val Pro Gln His Phe Ser Tyr Asp Pro Cys Phe Pro Ile Ser Val
                85                  90                  95
Lys Asp Val Val Leu Ser Gly Arg Leu Ser Gln Leu Ser Trp His Gly
            100                 105                 110
Lys Tyr Lys Lys Lys Asp Phe Glu Ala Val Asp His Ala Leu Asp Leu
        115                 120                 125
Val Gly Leu Ser Asp His His His His Cys Phe Ala His Leu Ser Gly
    130                 135                 140
Gly Gln Ile Gln Arg Val Leu Leu Ala Arg Ala Leu Ala Ser Tyr Pro
145                 150                 155                 160
Glu Ile Leu Ile Leu Asp Glu Pro Thr Thr Asn Ile Asp Pro Asp Asn
                165                 170                 175
Gln Gln Arg Ile Leu Ser Ile Leu Lys Lys Leu Asn Arg Thr Cys Thr
            180                 185                 190
Ile Leu Met Val Thr His Asp Leu His His Thr Thr Asn Tyr Phe Asn
        195                 200                 205
Lys Val Phe Tyr Met Asn Lys Thr Leu Thr Ser Leu Ala Asp Thr Ser
    210                 215                 220
Thr Leu Thr Asp Gln Phe Cys Cys His Pro Tyr Lys Asn Gln Glu Phe
225                 230                 235                 240
Ser Cys Ser Pro His
                245
 
<210>136
<211>1732
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>136
 
Val Asn Ile Ser Asp Arg Phe Ser Ser Met Lys Trp Leu Pro Ala Thr
1               5                   10                  15
Ala Val Phe Ala Ala Val Leu Pro Ala Leu Thr Ala Phe Gly Asp Pro
            20                  25                  30
Ala Ser Val Glu Ile Ser Thr Ser His Thr Gly Ser Gly Asp Pro Thr
        35                  40                  45
Ser Asp Ala Ala Leu Thr Gly Phe Thr Gln Ser Ser Thr Glu Thr Asp
    50                  55                  60
G1y Thr Thr Tyr Thr Ile Val Gly Asp Ile Thr Phe Ser Thr Phe Thr
65                  70                  75                  80
Asn Ile Pro Val Pro Val Val Thr Pro Asp Ala Asn Asp Ser Ser Ser
                85                  90                  95
Asn Ser Ser Lys Gly Gly Ser Ser Ser Ser Gly Ala Thr Ser Leu Ile
            100                 105                 110
Arg Ser Ser Asn Leu His Ser Asp Phe Asp Phe Thr Lys Asp Ser Val
        115                 120                 125
Leu Asp Leu Tyr His Leu Phe Phe Pro Ser Ala Ser Asn Thr Leu Asn
    130                 135                 140
Pro Ala Leu Leu Ser Ser Ser Ser Ser Gly Gly Ser Ser Ser Ser Ser
145                 150                 155                 160
Ser Ser Ser Ser Ser Gly Ser Ala Ser Ala Val Val Ala Ala Asp Pro
                165                 170                 175
Lys Gly Gly Ala Ala Phe Tyr Ser Asn Glu Ala Asn Gly Thr Leu Thr
            180                 185                 190
Phe Thr Thr Asp Ser Gly Asn Pro Gly Ser Leu Thr Leu Gln Asn Leu
        195                 200                 205
Lys Met Thr Gly Asp Gly Ala Ala Ile Tyr Ser Lys Gly Pro Leu Val
    210                 215                 220
Phe Thr Gly Leu Lys Asn Leu Thr Phe Thr Gly Asn Glu Ser Gln Lys
225                 230                 235                 240
Ser Gly Gly Ala Ala Tyr Thr Glu Gly Ala Leu Thr Thr Gln Ala Ile
                245                 250                 255
Val Glu Ala Val Thr Phe Thr Gly Asn Thr Ser Ala Gly Gln Gly Gly
            260                 265                 270
Ala Ile Tyr Val Lys Glu Ala Thr Leu Phe Asn Ala Leu Asp Ser Leu
        275                 280                 285
Lys Phe Glu Lys Asn Thr Ser Gly Gln Ala Gly Gly Gly Ile Tyr Thr
    290                 295                 300
Glu Ser Thr Leu Thr Ile Ser Asn Ile Thr Lys Ser Ile Glu Phe Ile
305                 310                 315                 320
Ser Asn Lys Ala Ser Val Pro Ala Pro Ala Pro Glu Pro Thr Ser Pro
                325                 330                 335
Ala Pro Ser Ser Leu Ile Asn Ser Thr Thr Ile Asp Thr Ser Thr Leu
            340                 345                 350
Gln Thr Arg Ala Ala Ser Ala Thr Pro Ala Val Ala Pro Val Ala Ala
        355                 360                 365
Val Thr Pro Thr Pro Ile Ser Thr Gln Glu Thr Ala Gly Asn Gly Gly
    370                 375                 380
Ala Ile Tyr Ala Lys Gln Gly Ile Ser Ile Ser Thr Phe Lys Asp Leu
385                 390                 395                 400
Thr Phe Lys Ser Asn Ser Ala Ser Val Asp Ala Thr Leu Thr Val Asp
                405                 410                 415
Ser Ser Thr Ile Gly Glu Ser Gly Gly Ala Ile Phe Ala Ala Asp Ser
            420                 425                 430
Ile Gln Ile Gln Gln Cys Thr Gly Thr Thr Leu Phe Ser Gly Asn Thr
        435                 440                 445
Ala Asn Lys Ser Gly Gly Gly Ile Tyr Ala Val Gly Gln Val Thr Leu
    450                 455                 460
Glu Asp Ile Ala Asn Leu Lys Met Thr Asn Asn Thr Cys Lys Gly Glu
465                 470                 475                 480
Gly Gly Ala Ile Tyr Thr Lys Lys Ala Leu Thr Ile Asn Asn Gly Ala
                485                 490                 495
Ile Leu Thr Thr Phe Ser Gly Asn Thr Ser Thr Asp Asn Gly Gly Ala
            500                 505                 510
Ile Phe Ala Val Gly Gly Ile Thr Leu Ser Asp Leu Val Glu Val Arg
        515                 520                 525
Phe Ser Lys Asn Lys Thr Gly Asn Tyr Ser Ala Pro Ile Thr Lys Ala
    530                 535                 540
Ala Ser Asn Thr Ala Pro Val Val Ser Ser Ser Thr Thr Ala Ala Ser
545                 550                 555                 560
Pro Ala Val Pro Ala Ala Ala Ala Ala Pro Val Thr Asn Ala Ala Lys
                565                 570                 575
Gly Gly Ala Leu Tyr Ser Thr Glu Gly Leu Thr Val Ser Gly Ile Thr
            580                 585                 590
Ser Ile Leu Ser Phe Glu Asn Asn Glu Cys Gln Asn Gln Gly Gly Gly
        595                 600                 605
Ala Tyr Val Thr Lys Thr Phe Gln Cys Ser Asp Ser His Arg Leu Gln
    610                 615                 620
Phe Thr Ser Asn Lys Ala Ala Asp Glu Gly Gly Gly Leu Tyr Cys Gly
625                 630                 635                 640
Asp Asp Val Thr Leu Thr Asn Leu Thr Gly Lys Thr Leu Phe Gln Glu
                645                 650                 655
Asn Ser Ser Glu Lys His Gly Gly Gly Leu Ser Leu Ala Ser Gly Lys
            660                 665                 670
Ser Leu Thr Met Thr Ser Leu Glu Ser Phe Cys Leu Asn Ala Asn Thr
        675                 680                 685
Ala Lys Glu Asn Gly Gly Gly Ala Asn Val Pro Glu Asn Ile Val Leu
    690                 695                 700
Thr Phe Thr Tyr Thr Pro Thr Pro Asn Glu Pro Ala Pro Val Gln Gln
705                 710                 715                 720
Pro Val Tyr Gly Glu Ala Leu Val Thr Gly Asn Thr Ala Thr Lys Ser
                725                 730                 735
Gly Gly Gly Ile Tyr Thr Lys Asn Ala Ala Phe Ser Asn Leu Ser Ser
            740                 745                 750
Val Thr Phe Asp Gln Asn Thr Ser Ser Glu Asn Gly Gly Ala Leu Leu
        755                 760                 765
Thr Gln Lys Ala Ala Asp Lys Thr Asp Cys Ser Phe Thr Tyr Ile Thr
    770                 775                 780
Asn Val Asn Ile Thr Asn Asn Thr Ala Thr Gly Asn Gly Gly Gly Ile
785                 790                 795                 800
Ala Gly Gly Lys Ala His Phe Asp Arg Ile Asp Asn Leu Thr Val Gln
                805                 810                 815
Ser Asn Gln Ala Lys Lys Gly Gly Gly Val Tyr Leu Glu Asp Ala Leu
            820                 825                 830
Ile Leu Glu Lys Val Ile Thr Gly Ser Val Ser Gln Asn Thr Ala Thr
        835                 840                 845
Glu Ser Gly Gly Gly Ile Tyr Ala Lys Asp Ile Gln Leu Gln Ala Leu
    850                 855                 860
Pro Gly Ser Phe Thr Ile Thr Asp Asn Lys Val Glu Thr Ser Leu Thr
865                 870                 875                 880
Thr Ser Thr Asn Leu Tyr Gly Gly Gly Ile Tyr Ser Ser Gly Ala Val
                885                 890                 895
Thr Leu Thr Asn Ile Ser Gly Thr Phe Gly Ile Thr Gly Asn Ser Val
            900                 905                 910
Ile Asn Thr Ala Thr Ser Gln Asp Ala Asp Ile Gln Gly Gly Gly Ile
        915                 920                 925
Tyr Ala Thr Thr Ser Leu Ser Ile Asn Gln Cys Asn Thr Pro Ile Leu
    930                 935                 940
Phe Ser Asn Asn Ser Ala Ala Thr Lys Lys Thr Ser Thr Thr Lys Gln
945                 950                 955                 960
Ile Ala Gly Gly Ala Ile Phe Ser Ala Ala Val Thr Ile Glu Asn Asn
                965                 970                 975
Ser Gln Pro Ile Ile Phe Leu Asn Asn Ser Ala Lys Ser Glu Ala Thr
            980                 985                 990
Thr Ala Ala Thr Ala Gly Asn Lys Asp Ser Cys Gly Gly Ala Ile Ala
        995                 1000                1005
Ala Asn Ser Val Thr Leu Thr Asn Asn Pro Glu Ile Thr Phe Lys
    1010                1015                1020
Gly Asn Tyr Ala Glu Thr Gly Gly Ala Ile Gly Cys Ile Asp Leu
    1025                1030                1035
Thr Asn Gly Ser Pro Pro Arg Lys Val Ser Ile Ala Asp Asn Gly
    1040                1045                1050
Ser Val Leu Phe Gln Asp Asn Ser Ala Leu Asn Arg Gly Gly Ala
    1055                1060                1065
Ile Tyr Gly Glu Thr Ile Asp Ile Ser Arg Thr Gly Ala Thr Phe
    1070                1075                1080
Ile Gly Asn Ser Ser Lys His Asp Gly Ser Ala Ile Cys Cys Ser
    1085                1090                1095
Thr Ala Leu Thr Leu Ala Pro Asn Ser Gln Leu Ile Phe Glu Asn
    1100                1105                1110
Asn Lys Val Thr Glu Thr Thr Ala Thr Thr Lys Ala Ser Ile Asn
    1115                1120                1125
Asn Leu Gly Ala Ala Ile Tyr Gly Asn Asn Glu Thr Ser Asp Ile
    1130                1135                1140
Thr Ile Ser Leu Ser Ala Glu Asn Gly Ser Ile Phe Phe Lys Asn
    1145                1150                1155
Asn Leu Cys Thr Ala Thr Asn Lys Tyr Cys Ser Ile Ala Gly Asn
    1160                1165                1170
Val Lys Phe Thr Ala Ile Glu Ala Ser Ala Gly Lys Ala Ile Ser
    1175                1180                1185
Phe Tyr Asp Ala Val Asn Val Ser Thr Lys Glu Thr Asn Ala Gln
    1190                1195                1200
Glu Leu Lys Leu Asn Glu Lys Ala Thr Ser Thr Gly Thr Ile Leu
    1205                1210                1215
Phe Ser Gly Glu Leu His Glu Asn Lys Ser Tyr Ile Pro Gln Lys
    1220                1225                1230
Val Thr Phe Ala His Gly Asn Leu Ile Leu Gly Lys Asn Ala Glu
    1235                1240                1245
Leu Ser Val Val Ser Phe Thr Gln Ser Pro Gly Thr Thr Ile Thr
    1250                1255                1260
Met Gly Pro Gly Ser Val Leu Ser Asn His Ser Lys Glu Ala Gly
    1265                1270                1275
Gly Ile Ala Ile Asn Asn Val Ile Ile Asp Phe Ser Glu Ile Val
    1280                1285                1290
Pro Thr Lys Asp Asn Ala Thr Val Ala Pro Pro Thr Leu Lys Leu
    1295                1300                1305
Val Ser Arg Thr Asn Ala Asp Ser Lys Asp Lys Ile Asp Ile Thr
    1310                1315                1320
Gly Thr Val Thr Leu Leu Asp Pro Asn Gly Asn Leu Tyr Gln Asn
    1325                1330                1335
Ser Tyr Leu Gly Glu Asp Arg Asp Ile Thr Leu Phe Asn Ile Asp
    1340                1345                1350
Asn Ser Ala Ser Gly Ala Val Thr Ala Thr Asn Val Thr Leu Gln
    1355                1360                1365
Gly Asn Leu Gly Ala Lys Lys Gly Tyr Leu Gly Thr Trp Asn Leu
    1370                1375                1380
Asp Pro Asn Ser Ser Gly Ser Lys Ile Ile Leu Lys Trp Thr Phe
    1385                1390                1395
Asp Lys Tyr Leu Arg Trp Pro Tyr Ile Pro Arg Asp Asn His Phe
    1400                1405                1410
Tyr Ile Asn Ser Ile Trp Gly Ala Gln Asn Ser Leu Val Thr Val
    1415                1420                1425
Lys Gln Gly Ile Leu Gly Asn Met Leu Asn Asn Ala Arg Phe Glu
    1430                1435                1440
Asp Pro Ala Phe Asn Asn Phe Trp Ala Ser Ala Ile Gly Ser Phe
    1445                1450                1455
Leu Arg Lys Glu Val Ser Arg Asn Ser Asp Ser Phe Thr Tyr His
    1460                1465                1470
Gly Arg Gly Tyr Thr Ala Ala Val Asp Ala Lys Pro Arg Gln Glu
    1475                1480                1485
Phe Ile Leu Gly Ala Ala Phe Ser Gln Val Phe Gly His Ala Glu
    1490                1495                1500
Ser Glu Tyr His Leu Asp Asn Tyr Lys His Lys Gly Ser Gly His
    1505                1510                1515
Ser Thr Gln Ala Ser Leu Tyr Ala Gly Asn Ile Phe Tyr Phe Pro
    1520                1525                1530
Ala Ile Arg Ser Arg Pro Ile Leu Phe Gln Gly Val Ala Thr Tyr
    1535                1540                1545
Gly Tyr Met Gln His Asp Thr Thr Thr Tyr Tyr Pro Ser Ile Glu
    1550                1555                1560
Glu Lys Asn Met Ala Asn Trp Asp Ser Ile Ala Trp Leu Phe Asp
    1565                1570                1575
Leu Arg Phe Ser Val Asp Leu Lys Glu Pro Gln Pro His Ser Thr
    1580                1585                1590
Ala Arg Leu Thr Phe Tyr Thr Glu Ala Glu Tyr Thr Arg Ile Arg
    1595                1600                1605
Gln Glu Lys Phe Thr Glu Leu Asp Tyr Asp Pro Arg Ser Phe Ser
    1610                1615                1620
Ala Cys Ser Tyr Gly Asn Leu Ala Ile Pro Thr Gly Phe Ser Val
    1625                1630                1635
Asp Gly Ala Leu Ala Trp Arg Glu Ile Ile Leu Tyr Asn Lys Val
    1640                1645                1650
Ser Ala Ala Tyr Leu Pro Val Ile Leu Arg Asn Asn Pro Lys Ala
    1655                1660                1665
Thr Tyr Glu Val Leu Ser Thr Lys Glu Lys Gly Asn Val Val Asn
    1670                1675                1680
Val Leu Pro Thr Arg Asn Ala Ala Arg Ala Glu Val Ser Ser Gln
    1685                1690                1695
Ile Tyr Leu Gly Ser Tyr Trp Thr Leu Tyr Gly Thr Tyr Thr Ile
    1700                1705                1710
Asp Ala Ser Met Asn Thr Leu Val Gln Met Ala Asn Gly Gly Ile
    1715                1720                1725
Arg Phe Val Phe
    1730
 
<210>137
<211>947
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>137
 
Met Lys Gln Met Arg Leu Trp Gly Phe Leu Phe Leu Ser Ser Phe Cys
1               5                   10                  15
Gln Val Ser Tyr Leu Arg Ala Asn Asp Val Leu Leu Pro Leu Ser Gly
            20                  25                  30
Ile His Ser Gly Glu Asp Leu Glu Leu Phe Thr Leu Arg Ser Ser Ser
        35                  40                  45
Pro Thr Lys Thr Thr Tyr Ser Leu Arg Lys Asp Phe Ile Val Cys Asp
    50                  55                  60
Phe Ala Gly Asn Ser Ile His Lys Pro Gly Ala Ala Phe Leu Asn Leu
65                  70                  75                  80
Lys Gly Asp Leu Phe Phe Ile Asn Ser Thr Pro Leu Ala Ala Leu Thr
                85                  90                  95
Phe Lys Asn Ile His Leu Gly Ala Arg Gly Ala Gly Leu Phe Ser Glu
            100                 105                 110
Ser Asn Val Thr Phe Lys Gly Leu His Ser Leu Val Leu Glu Asn Asn
        115                 120                 125
Glu Ser Trp Gly Gly Val Leu Thr Thr Ser Gly Asp Leu Ser Phe Ile
    130                 135                 140
Asn Asn Thr Ser Val Leu Cys Gln Asn Asn Ile Ser Tyr Gly Pro Gly
145                 150                 155                 160
Gly Ala Leu Leu Leu Gln Gly Arg Lys Ser Lys Ala Leu Phe Phe Arg
                165                 170                 175
Asp Asn Arg Gly Thr Ile Leu Phe Leu Lys Asn Lys Ala Val Asn Gln
            180                 185                 190
Asp Glu Ser His Pro Gly Tyr Gly Gly Ala Val Ser Ser Ile Ser Pro
        195                 200                 205
Gly Ser Pro Ile Thr Phe Ala Asp Asn Gln Glu Ile Leu Phe Gln Glu
    210                 215                 220
Asn Glu Gly Glu Leu Gly Gly Ala Ile Tyr Asn Asp Gln Gly Ala Ile
225                 230                 235                 240
Thr Phe Glu Asn Asn Phe Gln Thr Thr Ser Phe Phe Ser Asn Lys Ala
                245                 250                 255
Ser Phe Gly Gly Ala Val Tyr Ser Arg Tyr Cys Asn Leu Tyr Ser Gln
            260                 265                 270
Trp Gly Asp Thr Leu Phe Thr Lys Asn Ala Ala Ala Lys Val Gly Gly
        275                 280                 285
Ala Ile His Ala Asp Tyr Val His Ile Arg Asp Cys Lys Gly SerIle
    290                 295                 300
Val Phe Glu Glu Asn Ser Ala Thr Ala Gly Gly Ala Ile Ala Val Asn
305                 310                 315                 320
Ala Val Cys Asp Ile Asn Ala Gln Gly Pro Val Arg Phe Ile Asn Asn
                325                 330                 335
Ser Ala Leu Gly Leu Asn Gly Gly Ala Ile Tyr Met Gln Ala Thr Gly
            340                 345                 350
Ser Ile Leu Arg Leu His Ala Asn Gln Gly Asp Ile Glu Phe Cys Gly
        355                 360                 365
Asn Lys Val Arg Ser Gln Phe His Ser His Ile Asn Ser Thr Ser Asn
    370                 375                 380
Phe Thr Asn Asn Ala Ile Thr Ile Gln Gly Ala Pro Arg Glu Phe Ser
385                 390                 395                 400
Leu Ser Ala Asn Glu Gly His Arg Ile Cys Phe Tyr Asp Pro Ile Ile
                405                 410                 415
Ser Ala Thr Glu Asn Tyr Asn Ser Leu Tyr Ile Asn His Gln Arg Leu
            420                 425                 430
Leu Glu Ala Gly Gly Ala Val Ile Phe Ser Gly Ala Arg Leu Ser Pro
        435                 440                 445
Glu His Lys Lys Glu Asn Lys Asn Lys Thr Ser Ile Ile Asn Gln Pro
    450                 455                 460
Val Arg Leu Cys Ser Gly Val Leu Ser Ile Glu Gly Gly Ala Ile Leu
465                 470                 475                 480
Ala Val Arg Ser Phe Tyr Gln Glu Gly Gly Leu Leu Ala Leu Gly Pro
                485                 490                 495
Gly Ser Lys Leu Thr Thr Gln Gly Lys Asn Ser Glu Lys Asp Lys Ile
            500                 505                 510
Val Ile Thr Asn Leu Gly Phe Asn Leu Glu Asn Leu Asp Ser Ser Asp
        515                 520                 525
Pro Ala Glu Ile Arg Ala Thr Glu Lys Ala Ser Ile Glu Ile Ser Gly
    530                 535                 540
Val Pro Arg Val Tyr Gly His Thr Glu Ser Phe Tyr Glu Asn His Glu
545                 550                 555                 560
Tyr Ala Ser Lys Pro Tyr Thr Thr Ser Ile Ile Leu Ser Ala Lys Lys
                565                 570                 575
Leu Val Thr Ala Pro Ser Arg Pro Glu Lys Asp Ile Gln Asn Leu Ile
            580                 585                 590
Ile Ala Glu Ser Glu Tyr Met Gly Tyr Gly Tyr Gln Gly Ser Trp Glu
        595                 600                 605
Phe Ser Trp Ser Pro Asn Asp Thr Lys Glu Lys Lys Thr Ile Ile Ala
    610                 615                 620
Ser Trp Thr Pro Thr Gly Glu Phe Ser Leu Asp Pro Lys Arg Arg Gly
625                 630                 635                 640
Ser Phe Ile Pro Thr Thr Leu Trp Ser Thr Phe Ser Gly Leu Asn Ile
                645                 650                 655
Ala Ser Asn Ile Val Asn Asn Asn Tyr Leu Asn Asn Ser Glu Val Ile
            660                 665                 670
Pro Leu Gln His Leu Cys Val Phe Gly Gly Pro Val Tyr Gln Ile Met
        675                 680                 685
Glu Gln Asn Pro Lys Gln Ser Ser Asn Asn Leu Leu Val Gln His Ala
    690                 695                 700
Gly His Asn Val Gly Ala Arg Ile Pro Phe Ser Phe Asn Thr Ile Leu
705                 710                 715                 720
Ser Ala Ala Leu Thr Gln Leu Phe Ser Ser Ser Ser Gln Gln Asn Val
                725                 730                 735
Ala Asp Lys Ser His Ala Gln Ile Leu Ile Gly Thr Val Ser Leu Asn
            740                 745                 750
Lys Ser Trp Gln Ala Leu Ser Leu Arg Ser Ser Phe Ser Tyr Thr Glu
        755                 760                 765
Asp Ser Gln Val Met Lys His Val Phe Pro Tyr Lys Gly Thr Ser Arg
    770                 775                 780
Gly Ser Trp Arg Asn Tyr Gly Trp Ser Gly Ser Val Gly Met Ser Tyr
785                 790                 795                 800
Ala Tyr Pro Lys Gly Ile Arg Tyr Leu Lys Met Thr Pro Phe Val Asp
                805                 810                 815
Leu Gln Tyr Thr Lys Leu Val Gln Asn Pro Phe Val Glu Thr Gly Tyr
            820                 825                 830
Asp Pro Arg Tyr Phe Ser Ser Ser Glu Met Thr Asn Leu Ser Leu Pro
        835                 840                 845
Ile Gly Ile Ala Leu Glu Met Arg Phe Ile Gly Ser Arg Ser Ser Leu
    850                 855                 860
Phe Leu Gln Val Ser Thr Ser Tyr Ile Lys Asp Leu Arg Arg Val Asn
865                 870                 875                 880
Pro Gln Ser Ser Ala Ser Leu Val Leu Asn His Tyr Thr Trp Asp Ile
                885                 890                 895
Gln Gly Val Pro Leu Gly Lys Glu Ala Leu Asn Ile Thr Leu Asn Ser
            900                 905                 910
Thr Ile Lys Tyr Lys Ile Val Thr Ala Tyr Met Gly Ile Ser Ser Thr
        915                 920                 925
Gln Arg Glu Gly Ser Asn Leu Ser Ala Asn Ala His Ala Gly Leu Ser
    930                 935                 940
Leu Ser Phe
945
 
<210>138
<211>393
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>138
 
Met Ile Phe Glu Phe Arg Phe Pro Lys Ile Gly Glu Thr Ser Ser Gly
1               5                   10                  15
Gly Ser Ile Val Arg Trp Leu Lys Asn Leu Gly Asp His Val Ala Arg
            20                  25                  30
Asp Glu Pro Leu Ile Glu Val Ser Thr Asp Lys Ile Ala Thr Glu Leu
        35                  40                  45
Pro Ser Pro Lys Ala Gly Arg Leu Val Arg Phe Cys Val Asn Glu Gly
    50                  55                  60
Asp Glu Val Ala Ser Gly Asp Val Leu Gly Leu Ile Glu Leu Glu Glu
65                  70                  75                  80
Ile Ser Glu Ala Asp Asp Glu Ser Thr Ser Cys Pro Leu Thr Ser Cys
                85                  90                  95
Glu Thr Lys Ser Glu Ala Gly Ser Ser Ser Ser Ser Val Trp Phe Ser
            100                 105                 110
Pro Ala Val Leu Ser Leu Ala Gln Arg Glu Gly Ile Gly Leu Asp Asn
        115                 120                 125
Leu Gln Lys Ile Ala Gly Thr Gly Lys Gly Gly Arg Val Thr Arg Gln
    130                 135                 140
Asp Leu Glu Ala Tyr Ile Ser Glu Ser Gln Gln Val Ser Ile Pro Glu
145                 150                 155                 160
Ile Phe Gln Gly Glu Val Asn Arg Ile Pro Met Ser Pro Leu Arg Arg
                165                 170                 175
Ala Ile Ala Ser Ser Leu Ser Lys Ser Ser Asp Glu Val Pro His Ala
            180                 185                 190
Ser Leu Val Val Asp Val Asp Val Thr Asp Leu Met Asn Leu Ile Ser
        195                 200                 205
Gly Glu Arg Gln Arg Phe Leu Asp Thr His Gly Val Lys Leu Thr Ile
    210                 215                 220
Thr Ser Phe Ile Val Gln Cys Leu Ala Gln Thr Leu Arg Gln Phe Pro
225                 230                 235                 240
Leu Leu Asn Gly Ser Leu Asp Gly Thr Thr Ile Val Met Lys Lys Ser
                245                 250                 255
Val Asn Val Gly Val Ala Val Asn Leu Asn Lys Glu GIy Val Val Val
            260                 265                 270
Pro Val Ile His Asn Cys Gln Asp Arg Gly Leu Val Ser Ile Ala Lys
        275                 280                 285
Ala Leu Ala Asp Leu Ser Ser Arg Ala Arg Leu Asn Lys Leu Asp Pro
    290                 295                 300
Ser Glu Val Gln Asp Gly Ser Val Thr Val Thr Asn Phe Gly Met Thr
305                 310                 315                 320
Gly Ala Leu Ile Gly Met Pro Ile Ile Arg Tyr Pro Glu Val Ala Ile
                325                 330                 335
Leu Gly Ile Gly Thr Ile Gln Lys Arg Val Val Val Arg Asp Asp Asp
            340                 345                 350
Ser Leu Ala Ile Arg Lys Met Val Tyr Val Thr Leu Thr Phe Asp His
        355                 360                 365
Arg Val Leu Asp Gly Ile Tyr Gly Ser Glu Phe Leu Thr Ser Leu Lys
    370                 375                 380
Asn Arg Leu Glu Ser Val Thr Met Gly
385                 390
 
<210>139
<211>237
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>139
 
Leu Lys Asn Ser Gly Asn Ile Met Glu Pro Ser Thr Asn Lys Pro Asp
1               5                   10                  15
Cys Lys Lys Ile Phe Asp Ser Ile Ala Ser Lys Tyr Asp Arg Thr Asn
            20                  25                  30
Thr Ile Leu Ser Leu Gly Met His His Phe Trp Asn Arg Ser Leu Ile
        35                  40                  45
Gln Ile Leu Gly Ser Gly Tyr Ser Leu Leu Asp Leu Cys Ala Gly Thr
    50                  55                  60
Gly Lys Val Ala Lys Arg Tyr Ile Ala Ala His Pro Gln Ala Ser Val
65                  70                  75                  80
Thr Leu Val Asp Phe Ser Ser Ala Met Leu Asp Ile Ala Lys Gln His
                85                  90                  95
Leu Pro Gln Gly Ser Cys Ser Phe Ile His Ser Asp Ile Asn Gln Leu
            100                 105                 110
Pro Leu Glu Asn His Ser Tyr Pro Leu Ala Ala Met Ala Tyr Gly Leu
        115                 120                 125
Arg Asn Leu Ser Asp Pro His Lys Ala Leu Gln Glu Ile Ser Arg Val
    130                 135                 140
Leu Met Pro Ser Gly Lys Leu Gly Ile Leu Glu Leu Thr Pro Pro Lys
145                 150                 155                 160
Lys Thr His Pro Thr Tyr Ser Ala His Lys Leu Tyr Leu Arg Ala Val
                165                 170                 175
Val Pro Trp Ile Gly Lys Ser Val Ser Lys Asp Pro Asp Ala Tyr Ser
            180                 185                 190
Tyr Leu Ser Lys Ser Ile Gln Gln Leu Pro Lys Asp His Asp Leu Glu
        195                 200                 205
Asp Leu Phe Ser Lys Ser Gly Phe Tyr Ile Ala Lys Lys Lys Lys Leu
    210                 215                 220
Phe Leu Gly Ala Ala Thr Ile Trp Leu Leu Glu Lys Gln
225                 230                 235
 
<210>140
<211>620
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>140
 
Met Arg Arg Ser Val Cys Tyr Val Asn Pro Ser Ile Ala Arg Ala Gly
1               5                   10                  15
Gln Ile Ser Thr Trp Lys Phe Leu Tyr Ser Leu Ala Thr Pro Leu Pro
            20                  25                  30
Ala Gly Thr Lys Cys Lys Phe Asp Leu Ala Gly Ser Gly Lys Pro Thr
        35                  40                  45
Asp Trp Glu Ala Pro Ala Thr Asp Leu Ser Gln Thr Arg Asn Val Ile
    50                  55                  60
Tyr Ala Glu Met Pro Glu Gly Glu Ile Ile Glu Ala Thr Ala Ile Pro
65                  70                  75                  80
Val Lys Asp Asn Pro Val Pro Gln Phe Glu Phe Thr Leu Pro Tyr Glu
                85                  90                  95
Leu Gln Val Gly Glu Thr Leu Thr Ile Val Met Gly Ala Ser Pro Asn
            100                 105                 110
His Pro Gln Val Asp Asp Ala Gly Asn Gly Ala Gln Leu Phe Ala Gln
        115                 120                 125
Arg Arg Lys Pro Phe Tyr Leu Tyr Ile Asp Pro Thr Gly Glu Gly Asn
    130                 135                 140
Tyr Asp Glu Pro Asp Val Phe Ser Met Asp Ile Arg Gly Asn Val Leu
145                 150                 155                 160
Lys Lys Ile Glu Ile Phe Thr Pro Ser Tyr Val Val Lys Asn Lys Arg
                165                 170                 175
Phe Asp Ile Thr Val Arg Phe Glu Asp Glu Phe Gly Asn Leu Thr Asn
            180                 185                 190
Phe Ser Pro Glu Glu Thr Arg Ile Glu Leu Ser Tyr Glu His Leu Arg
        195                 200                 205
Glu Asn Leu Asn Trp Gln Leu Phe Ile Pro Glu Thr Gly Phe Val Ile
    210                 215                 220
Leu Pro Asn Leu Tyr Phe Asn Glu Pro Gly Ile Tyr Arg Ile Gln Leu
225                 230                 235                 240
Lys Asn Leu Ser Thr Gln Glu Ile Phe Ile Ser Ala Pro Ile Lys Cys
                245                 250                 255
Phe Ala Asp Ser Ala Pro Asn Leu Met Trp Gly Leu Leu His Gly Glu
            260                 265                 270
Ser Glu Arg Val Asp Ser Glu Glu Asn Ile Glu Thr Cys Met Arg Tyr
        275                 280                 285
Phe Arg Asp Asp Arg Ala Leu Asn Phe Tyr Ala Ser Ser Ser Phe Glu
    290                 295                 300
Asn Gln Glu Asn Leu Ser Pro Asp Ile Trp Lys Leu Ile Asn Gln Thr
305                 310                 315                 320
Val Ser Asp Phe Asn Glu Glu Asp Arg Phe Ile Thr Leu Ser Gly Phe
                325                 330                 335
Gln Tyr Ser Gly Glu Pro His Leu Glu Gly Val Arg His Ile Leu His
            340                 345                 350
Thr Lys Glu Thr Lys Ser His Ser Lys His Lys Glu Tyr Lys His Ile
        355                 360                 365
Pro Leu Ala Lys Leu Tyr Lys Ser Thr Val Asn His Asp Met Ile Ser
    370                 375                 380
Ile Pro Ser Phe Thr Ala Ser Lys Glu His Gly Phe Asp Phe Glu Asn
385                 390                 395                 400
Phe Tyr Pro Glu Phe Glu Arg Val Val Glu Ile Tyr Asn Ala Trp Gly
                405                 410                 415
Ser Ser Glu Thr Thr Ala Ala Leu Asn Asn Pro Phe Pro Ile Gln Gly
            420                 425                 430
Lys Asp Ser Glu Asp Pro Arg Gly Thr Val Ile Glu Gly Leu Lys Lys
        435                 440                 445
Asn Leu Arg Phe Gly Phe Val Ala Gly Gly Leu Asp Asp Arg Gly Ile
    450                 455                 460
Tyr Lys Asp Tyr Phe Asp Ser Pro Gln Val Gln Tyr Ser Pro Gly Leu
465                 470                 475                 480
Thr Ala Ile Ile Cys Asn Lys Tyr Thr Arg Glu Ser Leu Val Glu Ala
                485                 490                 495
Leu Phe Ala Arg His Cys Tyr Ala Thr Thr Gly Pro Arg Ile Val Leu
            500                 505                 510
Ser Phe Asn Ile Thr Ser Ala Pro Met Gly Ser Glu Leu Ser Thr Gly
        515                 520                 525
Ser Lys Pro Gly Leu Asn Val Asn Arg His Ile Ser Gly His Val Ala
    530                 535                 540
Gly Thr Ala Leu Leu Lys Thr Val Glu Ile Ile Arg Asn Gly Glu Val
545                 550                 555                 560
Leu His Thr Phe Phe Pro Asp Ser Asn Asn Leu Asp Tyr Glu Tyr Asp
                565                 570                 575
Asp Met Val Pro Leu Ser Ser Val Thr Leu Lys Asp Pro Asn Gly Lys
            580                 585                 590
Ala Pro Phe Val Phe Tyr Tyr Leu Arg Val Thr Gln Ala Asp Asn Ala
        595                 600                 605
Met Ala Trp Ser Ser Pro Ile Trp Val Asp Leu Asn
    610                 615                 620
 
<210>141
<211>660
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>141
 
Met Ser Glu His Lys Lys Ser Ser Lys Ile Ile Gly Ile Asp Leu Gly
1               5                   10                  15
Thr Thr Asn Ser Cys Val Ser Val Met Glu Gly Gly Gln Ala Lys Val
            20                  25                  30
Ile Thr Ser Ser Glu Gly Thr Arg Thr Thr Pro Ser Ile Val Ala Phe
        35                  40                  45
Lys Gly Asn Glu Lys Leu Val Gly Ile Pro Ala Lys Arg Gln Ala Val
    50                  55                  60
Thr Asn Pro Glu Lys Thr Leu Gly Ser Thr Lys Arg Phe Ile Gly Arg
65                  70                  75                  80
Lys Tyr Ser Glu Val Ala Ser Glu Ile Gln Thr Val Pro Tyr Thr Val
                85                  90                  95
Thr Ser Gly Ser Lys Gly Asp Ala Val Phe Glu Val Asp Gly Lys Gln
            100                 105                 110
Tyr Thr Pro Glu Glu Ile Gly Ala Gln Ile Leu Met Lys Met Lys Glu
        115                 120                 125
Thr Ala Glu Ala Tyr Leu Gly Glu Thr Val Thr Glu Ala Val Ile Thr
    130                 135                 140
Val Pro Ala Tyr Phe Asn Asp Ser Gln Arg Ala Ser Thr Lys Asp Ala
145                 150                 155                 160
Gly Arg Ile Ala Gly Leu Asp Val Lys Arg Ile Ile Pro Glu Pro Thr
                165                 170                 175
Ala Ala Ala Leu Ala Tyr Gly Ile Asp Lys Val Gly Asp Lys Lys Ile
            180                 185                 190
Ala Val Phe Asp Leu Gly Gly Gly Thr Phe Asp Ile Ser Ile Leu Glu
        195                 200                 205
Ile Gly Asp Gly Val Phe Glu Val Leu Ser Thr Asn Gly Asp Thr Leu
    210                 215                 220
Leu Gly Gly Asp Asp Phe Asp Glu Val Ile Ile Lys Trp Met Ile Glu
225                 230                 235                 240
Glu Phe Lys Lys Gln Glu Gly Ile Asp Leu Ser Lys Asp Asn Met Ala
                245                 250                 255
Leu Gln Arg Leu Lys Asp Ala Ala Glu Lys Ala Lys Ile Glu Leu Ser
            260                 265                 270
Gly Val Ser Ser Thr Glu Ile Asn Gln Pro Phe Ile Thr Met Asp Ala
        275                 280                 285
Gln Gly Pro Lys His Leu Ala Leu Thr Leu Thr Arg Ala Gln Phe Glu
    290                 295                 300
Lys Leu Ala Ala Ser Leu Ile Glu Arg Thr Lys Ser Pro Cys Ile Lys
305                 310                 315                 320
Ala Leu Ser Asp Ala Lys Leu Ser Ala Lys Asp Ile Asp Asp Val Leu
                325                 330                 335
Leu Val Gly Gly Met Ser Arg Met Pro Ala Val Gln Glu Thr Val Lys
            340                 345                 350
Glu Leu Phe Gly Lys Glu Pro Asn Lys Gly Val Asn Pro Asp Glu Val
        355                 360                 365
Val Ala Ile Gly Ala Ala Ile Gln Gly Gly Val Leu Gly Gly Glu Val
    370                 375                 380
Lys Asp Val Leu Leu Leu Asp Val Ile Pro Leu Ser Leu Gly Ile Glu
385                 390                 395                 400
Thr Leu Gly Gly Val Met Thr Thr Leu Val Glu Arg Asn Thr Thr Ile
                405                 410                 415
Pro Thr Gln Lys Lys Gln Ile Phe Ser Thr Ala Ala Asp Asn Gln Pro
            420                 425                 430
Ala Val Thr Ile Val Val Leu Gln Gly Glu Arg Pro Met Ala Lys Asp
        435                 440                 445
Asn Lys Glu Ile Gly Arg Phe Asp Leu Thr Asp Ile Pro Pro Ala Pro
    450                 455                 460
Arg Gly His Pro Gln Ile Glu Val Ser Phe Asp Ile Asp Ala Asn Gly
465                 470                 475                 480
Ile Phe His Val Ser Ala Lys Asp Val Ala Ser Gly Lys Glu Gln Lys
                485                 490                 495
Ile Arg Ile Glu Ala Ser Ser Gly Leu Gln Glu Asp Glu Ile Gln Arg
            500                 505                 510
Met Val Arg Asp Ala Glu Ile Asn Lys Glu Glu Asp Lys Lys Arg Arg
        515                 520                 525
Glu Ala Ser Asp Ala Lys Asn Glu Ala Asp Ser Met Ile Phe Arg Ala
    530                 535                 540
Glu Lys Ala Ile Lys Asp Tyr Lys Glu Gln Ile Pro Glu Thr Leu Val
545                 550                 555                 560
Lys Glu Ile Glu Glu Arg Ile Glu Asn Val Arg Asn Ala Leu Lys Asp
                565                 570                 575
Asp Ala Pro Ile Glu Lys Ile Lys Glu Val Thr Glu Asp Leu Ser Lys
            580                 585                 590
His Met Gln Lys Ile Gly Glu Ser Met Gln Ser Gln Ser Ala Ser Ala
        595                 600                 605
Ala Ala Ser Ser Ala Ala Asn Ala Lys Gly Gly Pro Asn Ile Asn Thr
    610                 615                 620
Glu Asp Leu Lys Lys His Ser Phe Ser Thr Lys Pro Pro Ser Asn Asn
625                 630                 635                 640
Gly Ser Ser Glu Asp His Ile Glu Glu Ala Asp Val Glu Ile Ile Asp
                645                 650                 655
Asn Asp Asp Lys
            660
 
<210>142
<211>952
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
<400>142
 
Val Ser Lys Thr Pro Pro Lys Phe Leu Phe Tyr Leu Gly Asn Phe Thr
1               5                   10                  15
Ala Cys Met Phe Gly Met Thr Pro Ala Val Tyr Ser Leu Gln Thr Asp
            20                  25                  30
Ser Leu Glu Lys Phe Ala Leu Glu Arg Asp Glu Glu Phe Arg Thr Ser
        35                  40                  45
Phe Pro Leu Leu Asp Ser Leu Ser Thr Leu Thr Gly Phe Ser Pro Ile
    50                  55                  60
Thr Thr Phe Val Gly Asn Arg His Asn Ser Ser Gln Asp Ile Val Leu
65                  70                  75                  80
Ser Asn Tyr Lys Ser Ile Asp Asn Ile Leu Leu Leu Trp Thr Ser Ala
                85                  90                  95
Gly Gly Ala Val Ser Cys Asn Asn Phe Leu Leu Ser Asn Val Glu Asp
            100                 105                 110
His Ala Phe Phe Ser Lys Asn Leu Ala Ile Gly Thr Gly Gly Ala Ile
        115                 120                 125
Ala Cys Gln Gly Ala Cys Thr Ile Thr Lys Asn Arg Gly Pro Leu Ile
    130                 135                 140
Phe Phe Ser Asn Arg Gly Leu Asn Asn Ala Ser Thr Gly Gly Glu Thr
145                 150                 155                 160
Arg Gly Gly Ala Ile Ala Cys Asn Gly Asp Phe Thr Ile Ser Gln Asn
                165                 170                 175
Gln Gly Thr Phe Tyr Phe Val Asn Asn Ser Val Asn Asn Trp Gly Gly
            180                 185                 190
Ala Leu Ser Thr Asn Gly His Cys Arg Ile Gln Ser Asn Arg Ala Pro
        195                 200                 205
Leu Leu Phe Phe Asn Asn Thr Ala Pro Ser Gly Gly Gly Ala Leu Arg
    210                 215                 220
Ser Glu Asn Thr Thr Ile Ser Asp Asn Thr Arg Pro Ile Tyr Phe Lys
225                 230                 235                 240
Asn Asn Cys Gly Asn Asn Gly Gly Ala Ile Gln Thr Ser Val Thr Val
                245                 250                 255
Ala Ile Lys Asn Asn Ser Gly Ser Val Ile Phe Asn Asn Asn Thr Ala
            260                 265                 270
Leu Ser Gly Ser Ile Asn Ser Gly Asn Gly Ser Gly Gly Ala Ile Tyr
        275                 280                 285
Thr Thr Asn Leu Ser Ile Asp Asp Asn Pro Gly Thr Ile Leu Phe Asn
    290                 295                 300
Asn Asn Tyr Cys Ile Arg Asp Gly Gly Ala Ile Cys Thr Gln Phe Leu
305                 310                 315                320
Thr Ile Lys Asn Ser Gly His Val Tyr Phe Thr Asn Asn Gln Gly Asn
                325                 330                 335
Trp Gly Gly Ala Leu Met Leu Leu Gln Asp Ser Thr Cys Leu Leu Phe
            340                 345                 350
Ala Glu Gln Gly Asn Ile Ala Phe Gln Asn Asn Glu Val Phe Leu Thr
        355                 360                 365
Thr Phe Gly Arg Tyr Asn Ala Ile His Cys Thr Pro Asn Ser Asn Leu
    370                 375                 380
Gln Leu Gly Ala Asn Lys Gly Tyr Thr Thr Ala Phe Phe Asp Pro Ile
385                 390                 395                 400
Glu His Gln His Pro Thr Thr Asn Pro Leu Ile Phe Asn Pro Asn Ala
                405                 410                 415
Asn His Gln Gly Thr Ile Leu Phe Ser Ser Ala Tyr Ile Pro Glu Ala
            420                 425                 430
Ser Asp Tyr Glu Asn Asn Phe Ile Ser Ser Ser Lys Asn Thr Ser Glu
        435                 440                 445
Leu Arg Asn Gly Val Leu Ser Ile Glu Asp Arg Ala Gly Trp Gln Phe
    450                 455                 460
Tyr Lys Phe Thr Gln Lys Gly Gly Ile Leu Lys Leu Gly His Ala Ala
465                 470                 475                 480
Ser Ile Ala Thr Thr Ala Asn Ser Glu Thr Pro Ser Thr Ser Val Gly
                485                 490                 495
Ser Gln Val Ile Ile Asn Asn Leu Ala Ile Asn Leu Pro Ser Ile Leu
            500                 505                 510
Ala Lys Gly Lys Ala Pro Thr Leu Trp Ile Arg Pro Leu Gln Ser Ser
        515                 520                 525
Ala Pro Phe Thr Glu Asp Asn Asn Pro Thr Ile Thr Leu Ser Gly Pro
    530                 535                 540
Leu Thr Leu Leu Asn Glu Glu Asn Arg Asp Pro Tyr Asp Ser Ile Asp
545                 550                 555                 560
Leu Ser Glu Pro Leu Gln Asn Ile His Leu Leu Ser Leu Ser Asp Val
                565                 570                 575
Thr Ala Arg His Ile Asn Thr Asp Asn Phe His Pro Glu Ser Leu Asn
            580                 585                 590
Ala Thr Glu His Tyr Gly Tyr Gln Gly Ile Trp Ser Pro Tyr Trp Val
        595                 600                 605
Glu Thr Ile Thr Thr Thr Asn Asn Ala Ser Ile Glu Thr Ala Asn Thr
    610                 615                 620
Leu Tyr Arg Ala Leu Tyr Ala Asn Trp Thr Pro Leu Gly Tyr Lys Val
625                 630                 635                 640
Asn Pro Glu Tyr Gln Gly Asp Leu Ala Thr Thr Pro Leu Trp Gln Ser
                645                 650                 655
Phe His Thr Met Phe Ser Leu Leu Arg Ser Tyr Asn Arg Thr Gly Asp
            660                 665                 670
Ser Asp Ile Glu Arg Pro Phe Leu Glu Ile Gln Gly Ile Ala Asp Gly
        675                 680                 685
Leu Phe Val His Gln Asn Ser Ile Pro Gly Ala Pro Gly Phe Arg Ile
    690                 695                 700
Gln Ser Thr Gly Tyr Ser Leu Gln Ala Ser Ser Glu Thr Ser Leu His
705                 710                 715                 720
Gln Lys Ile Ser Leu Gly Phe Ala Gln Phe Phe Thr Arg Thr Lys Glu
                725                 730                 735
Ile Gly Ser Ser Asn Asn Val Ser Ala His Asn Thr Val Ser Ser Leu
            740                 745                 750
Tyr Val Glu Leu Pro Trp Phe Gln Glu Ala Phe Ala Thr Ser Thr Val
        755                 760                 765
Leu Ala Tyr Gly Tyr Gly Asp His His Leu His Ser Leu His Pro Ser
    770                 775                 780
His Gln Glu Gln Ala Glu Gly Thr Cys Tyr Ser His Thr Leu Ala Ala
785                 790                 795                 800
Ala Ile Gly Cys Ser Phe Pro Trp Gln Gln Lys Ser Tyr Leu His Leu
                805                 810                 815
Ser Pro Phe Val Gln Ala Ile Ala Ile Arg Ser His Gln Thr Ala Phe
            820                 825                 830
Glu Glu Ile Gly Asp Asn Pro Arg Lys Phe Val Ser Gln Lys Pro Phe
        835                 840                 845
Tyr Asn Leu Thr Leu Pro Leu Gly Ile Gln Gly Lys Trp Gln Ser Lys
    850                 855                 860
Phe His Val Pro Thr Glu Trp Thr Leu Glu Leu Ser Tyr Gln Pro Val
865                 870                 875                 880
Leu Tyr Gln Gln Asn Pro Gln Ile Gly Val Thr Leu Leu Ala Ser Gly
                885                 890                 895
Gly Ser Trp Asp Ile Leu Gly His Asn Tyr Val Arg Asn Ala Leu Gly
            900                 905                 910
Tyr Lys Val His Asn Gln Thr Ala Leu Phe Arg Ser Leu Asp Leu Phe
        915                 920                 925
Leu Asp Tyr Gln Gly Ser Val Ser Ser Ser Thr Ser Thr His His Leu
    930                 935                 940
Gln Ala Gly Ser Thr Leu Lys Phe
945                 950
 
<210>143
<211>695
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>143
 
Leu Phe Val Ser Asn Phe Ile Phe Phe Val Val Met Pro Ile Pro Tyr
1               5                   10                  15
Ile Ser Ser Trp Ile Ser Thr Val Arg Gln His Phe Val Lys Ala Phe
            20                  25                  30
Asp Phe Ser Arg Pro Phe Cys Ser Arg Val Thr Asn Phe Ala Leu Gly
        35                  40                  45
Val Ile Lys Ala Ile Pro Ile Val Gly His Ile Val Met Gly Met Glu
    50                  55                  60
Trp Leu Val Ser Ser Cys Val Ala Gly Ile Ile Thr Arg Ser Ser Phe
65                  70                  75                  80
Thr Ser Asp Val Val Gln Ile Val Lys Thr Glu Lys Ala Leu Gly Arg
                85                  90                  95
Asp His Ile Ser Arg Val Ala Glu Ile Leu Gln Arg Glu Arg Gly Thr
            100                 105                 110
Ile Thr Pro Glu Asn Gln Asp Lys Val His Gly Lys Phe Pro Val Cys
        115                 120                 125
Pro Phe Gly Arg Leu Lys Ser Glu Glu Thr Leu Lys Leu Lys Pro Gly
    130                 135                 140
Glu Arg Gly Gly Thr Leu Asp Thr Val Phe Ser Pro Ile Arg Thr Arg
145                 150                 155                 160
Val Thr Arg Ala Tyr Leu Gln Ala Pro Arg Pro Glu Ile Arg Thr Ile
                165                 170                 175
Ser Ile Val Gly Ser Lys Leu Lys Thr Pro Gln Asp Phe Ser Gln Phe
            180                 185                 190
Val Ser Leu Ala Asn Glu Thr Gln Arg Leu His Pro Glu Ala Leu Val
        195                 200                 205
Cys Leu Tyr Leu Thr Gly Leu Asn Arg Glu Ser Gln Met Cys Asp Thr
    210                 215                 220
Thr Thr Ala Glu Lys Lys Gln Tyr Leu His Asn Ser Gly Leu Asp Ser
225                 230                 235                 240
Arg Ile Gln Cys Lys Asp Ser Lys Glu Asp Asp Ala Gly Ser Pro Glu
                245                 250                 255
Asn Pro Glu Leu Trp Ile Gly Tyr Tyr Ser Arg Glu Gln Gln His Asn
            260                 265                 270
Ile Asp Gly Gln Tyr Ile Gln Gln Cys Leu Gly Lys Ser Ala Asp Pro
        275                 280                 285
Ile Pro Trp Ile His Val Thr Glu Asp Thr Lys Asp Phe Tyr Tyr Pro
    290                 295                 300
Pro Asn Phe Thr Ser Tyr Ser His Thr Arg Gln Ser Thr Asp Pro Thr
305                 310                 315                 320
Ser Pro Pro Arg Leu Pro Glu Ser Glu Gly Asp Lys Asp Ser Leu Tyr
                325                 330                 335
Gly Gln Leu Ser Arg Ser Tyr His His Glu Tyr Met Leu Gly Leu Gly
            340                 345                 350
Leu Lys Pro Glu Asp Ala Gly Leu Leu Met Asp Pro Asp Arg Ile Tyr
        355                 360                 365
Ala Pro Leu Ser Gln Gly His Tyr Cys His Ser Tyr Leu Ala Asp Ile
    370                 375                 380
Glu Asn Glu Asp Leu Arg Thr Leu Val Leu Ser Pro Phe Leu Asp Pro
385                 390                 395                 400
Gly Asn Leu Ser Ser Glu Asp Leu Arg Pro Val Ala Phe Asn Ile Ala
                405                 410                 415
Arg Leu Pro Leu Glu Leu Asp Ser Leu Phe Phe Arg Leu Val Ala Gly
            420                 425                 430
Gln Gln Glu Gly Arg Asn Ile Val Thr Leu Ala His Gly Thr Pro Arg
        435                 440                 445
Pro Glu Asp Leu Asp Pro Asp Ser Met Asn Ile Leu Thr Arg Arg Leu
    450                 455                 460
Gln Met Ser Gly Tyr Ser Tyr Leu Asn Ile Phe Ser Tyr Lys Ser Arg
465                 470                 475                 480
Lys Met Ile Val Lys Glu Arg Gln Phe Phe Gly Asp Arg Ser Glu Gly
                485                 490                 495
Lys Ser Phe Thr Leu Ile Leu Phe Glu Asp Pro Ile Ser Ala Ala Asp
            500                 505                 510
Phe Arg Cys Leu Gln Leu Ala Ala Glu Gly Met Val Ala Lys Asp Leu
        515                 520                 525
Pro Ser Val Ala Asp Ile Cys Ala Ser Gly Cys Ser Cys Ile Gln Phe
    530                 535                 540
Ser Glu Met Gln Ser Pro Gln Ala Ile Glu Tyr Arg Gln Trp Glu Ala
545                 550                 555                 560
Arg Val Glu Asp Glu Ala Gly Glu Glu Ala Arg Glu Pro Val Ile Tyr
                565                 570                 575
Ser Gln Asp Gln Leu Ser Ser Met Leu Thr Thr Gln Gln Asn Phe Val
            580                 585                 590
Phe Ser Leu Asp Ala Val Val Lys Gln Ala Ile Trp Arg Phe Arg Ser
        595                 600                 605
Lys Gly Leu Leu Thr Met Glu Arg Lys Ala Leu Gly Glu Glu Phe Leu
    610                 615                 620
Thr Ala Ile Phe Ser Tyr Leu Gly Ser Gln Glu Arg Asn Glu Asn Met
625                 630                 635                 640
Gly Lys Arg Thr Thr Glu Glu His Glu Val Val Ile Ser Phe Glu Glu
                645                 650                 655
Leu Asp Arg Met Val Gln Val Leu Pro Ala Glu Val Pro Ala Asp Ser
            660                 665                 670
Gly Asn Asp Pro Thr His Pro Val Pro Asn Pro Asp Ser Asn Pro Asp
        675                 680                 685
Ser Ser Gln Asn Glu Gly Ser
    690                 695
 
<210>144
<211>514
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>144
 
Met Thr Ile Leu Arg Asn Phe Leu Thr Cys Ser Ala Leu Phe Leu Ala
1               5                   10                  15
Leu Pro Ala Ala Ala Gln Val Val Tyr Leu His Glu Ser Asp Gly Tyr
            20                  25                  30
Asn Gly Ala Ile Asn Asn Lys Ser Leu Glu Pro Lys Ile Thr Cys Tyr
        35                  40                  45
Pro Glu Gly Thr Ser Tyr Ile Phe Leu Asp Asp Val Arg Ile Ser Asn
    50                  55                  60
Val Lys His Asp Gln Glu Asp Ala Gly Val Phe Ile Asn Arg Ser Gly
65                  70                  75                  80
Asn Leu Phe Phe Met Gly Asn Arg Cys Asn Phe Thr Phe His Asn Leu
                85                  90                  95
Met Thr Glu Gly Phe Gly Ala Ala Ile Ser Asn Arg Val Gly Asp Thr
            100                 105                 110
Thr Leu Thr Leu Ser Asn Phe Ser Tyr Leu Ala Phe Thr Ser Ala Pro
        115                 120                 125
Leu Leu Pro Gln Gly Gln Gly Ala Ile Tyr Ser Leu Gly Ser Val Met
    130                 135                 140
Ile Glu Asn Ser Glu Glu Val Thr Phe Cys Gly Asn Tyr Ser Ser Trp
145                 150                 155                 160
Ser Gly Ala Ala Ile Tyr Thr Pro Tyr Leu Leu Gly Ser Lys Ala Ser
                165                 170                 175
Arg Pro Ser Val Asn Leu Ser Gly Asn Arg Tyr Leu Val Phe Arg Asp
            180                 185                 190
Asn Val Ser Gln Gly Tyr Gly Gly Ala Ile Ser Thr His Asn Leu Thr
        195                 200                 205
Leu Thr Thr Arg Gly Pro Ser Cys Phe Glu Asn Asn His Ala Tyr His
    210                 215                 220
Asp Val Asn Ser Asn Gly Gly Ala Ile Ala Ile Ala Pro Gly Gly Ser
225                 230                 235                 240
Ile Ser Ile Ser Val Lys Ser Gly Asp Leu Ile Phe Lys Gly Asn Thr
                245                 250                 255
Ala Ser Gln Asp Gly Asn Thr Ile His Asn Ser Ile His Leu Gln Ser
            260                 265                 270
Gly Ala Gln Phe Lys Asn Leu Arg Ala Val Ser Glu Ser Gly Val Tyr
        275                 280                 285
Phe Tyr Asp Pro Ile Ser His Ser Glu Ser His Lys Ile Thr Asp Leu
    290                 295                 300
Val Ile Asn Ala Pro Glu Gly Lys Glu Thr Tyr Glu Gly Thr Ile Ser
305                 310                 315                 320
Phe Ser Gly Leu Cys Leu Asp Asp His Glu Val Cys Ala Glu Asn Leu
                325                 330                 335
Thr Ser Thr Ile Leu Gln Asp Val Thr Leu Ala Gly Gly Thr Leu Ser
            340                 345                 350
Leu Ser Asp Gly Val Thr Leu Gln Leu His Ser Phe Lys Gln Glu Ala
        355                 360                 365
Ser Ser Thr Leu Thr Met Ser Pro Gly Thr Thr Leu Leu Cys Ser Gly
    370                 375                 380
Asp Ala Arg Val Gln Asn Leu His Ile Leu Ile Glu Asp Thr Asp Asn
385                 390                 395                 400
Phe Val Pro Val Arg Ile Arg Ala Glu Asp Lys Asp Ala Leu Val Ser
                405                 410                 415
Leu Glu Lys Leu Lys Val Ala Phe Glu Ala Tyr Trp Ser Val Tyr Asp
            420                 425                 430
Phe Pro Gln Phe Lys Glu Ala Phe Thr Ile Pro Leu Leu Glu Leu Leu
        435                 440                 445
Gly Pro Ser Phe Asp Ser Leu Leu Leu Gly Glu Thr Thr Leu Glu Arg
    450                 455                 460
Thr Gln Val Thr Thr Glu Asn Asp Ala Val Arg Gly Phe Trp Ser Leu
465                 470                 475                 480
Ser Trp Glu Glu Tyr Pro Pro Ser Leu Asp Lys Asp Arg Arg Ile Thr
                485                 490                 495
Pro Thr Lys Lys Thr Val Phe Leu Thr Trp Asn Pro Glu Ile Thr Ser
            500                 505                 510
Thr Pro
 
<210>145
<211>930
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>145
 
Met Lys Ile Pro Leu His Lys Leu Leu Ile Ser Ser Thr Leu Val Thr
1               5                   10                  15
Pro Ile Leu Leu Ser Ile Ala Thr Tyr Gly Ala Asp Ala Ser Leu Ser
            20                  25                  30
Pro Thr Asp Ser Phe Asp Gly Ala Gly Gly Ser Thr Phe Thr Pro Lys
        35                  40                  45
Ser Thr Ala Asp Ala Asn Gly Thr Asn Tyr Val Leu Ser Gly Asn Val
    50                  55                  60
Tyr Ile Asn Asp Ala Gly Lys Gly Thr Ala Leu Thr Gly Cys Cys Phe
65                  70                  75                  80
Thr Glu Thr Thr Gly Asp Leu Thr Phe Thr Gly Lys Gly Tyr Ser Phe
                85                  90                  95
Ser Phe Asn Thr Val Asp Ala Gly Ser Asn Ala Gly Ala Ala Ala Ser
            100                 105                 110
Thr Thr Ala Asp Lys Ala Leu Thr Phe Thr Gly Phe Ser Asn Leu Ser
        115                 120                 125
Phe Ile Ala Ala Pro Gly Thr Thr Val Ala Ser Gly Lys Ser Thr Leu
    130                 135                 140
Ser Ser Ala Gly Ala Leu Asn Leu Thr Asp Asn Gly Thr Ile Leu Phe
145                 150                 155                 160
Ser Gln Asn Val Ser Asn Glu Ala Asn Asn Asn Gly Gly Ala Ile Thr
                165                 170                 175
Ala Lys Thr Leu Ser Ile Ser Gly Asn Thr Ser Ser Ile Thr Phe Thr
            180                 185                 190
Ser Asn Ser Ala Lys Lys Leu Gly Gly Ala Ile Tyr Ser Ser Ala Ala
        195                 200                 205
Ala Ser Ile Ser Gly Asn Thr Gly Gln Leu Val Phe Met Asn Asn Lys
    210                 215                 220
Gly Glu Thr Gly Gly Gly Ala Leu Gly Phe Glu Ala Ser Ser Ser Ile
225                 230                 235                 240
Thr Gln Asn Ser Ser Leu Phe Phe Ser Gly Asn Thr Ala Thr Asp Ala
                245                 250                 255
Ala Gly Lys Gly Gly Ala Ile Tyr Cys Glu Lys Thr Gly Glu Thr Pro
            260                 265                 270
Thr Leu Thr Ile Ser Gly Asn Lys Ser Leu Thr Phe Ala Glu Asn Ser
        275                 280                 285
Ser Val Thr Gln Gly Gly Ala Ile Cys Ala His Gly Leu Asp Leu Ser
    290                 295                 300
Ala Ala Gly Pro Thr Leu Phe Ser Asn Asn Arg Cys Gly Asn Thr Ala
305                 310                 315                 320
Ala Gly Lys Gly Gly Ala Ile Ala Ile Ala Asp Ser Gly Ser Leu Ser
                325                 330                 335
Leu Ser Ala Asn Gln Gly Asp Ile Thr Phe Leu Gly Asn Thr Leu Thr
            340                 345                 350
Ser Thr Ser Ala Pro Thr Ser Thr Arg Asn Ala Ile Tyr Leu Gly Ser
        355                 360                 365
Ser Ala Lys Ile Thr Asn Leu Arg Ala Ala Gln Gly Gln Ser Ile Tyr
    370                 375                 380
Phe Tyr Asp Pro Ile Ala Ser Asn Thr Thr Gly Ala Ser Asp Val Leu
385                 390                 395                 400
Thr Ile Asn Gln Pro Asp Ser Asn Ser Pro Leu Asp Tyr Ser Gly Thr
                405                 410                 415
Ile Val Phe Ser Gly Glu Lys Leu Ser Ala Asp Glu Ala Lys Ala Ala
            420                 425                 430
Asp Asn Phe Thr Ser Ile Leu Lys Gln Pro Leu Ala Leu Ala Ser Gly
        435                 440                 445
Thr Leu Ala Leu Lys Gly Asn Val Glu Leu Asp Val Asn Gly Phe Thr
    450                 455                 460
Gln Thr Glu Gly Ser Thr Leu Leu Met Gln Pro Gly Thr Lys Leu Lys
465                 470                 475                 480
Ala Asp Thr Glu Ala Ile Ser Leu Thr Lys Leu Val Val Asp Leu Ser
                485                 490                 495
Ala Leu Glu Gly Asn Lys Ser Val Ser Ile Glu Thr Ala Gly Ala Asn
            500                 505                 510
Lys Thr Ile Thr Leu Thr Ser Pro Leu Val Phe Gln Asp Ser Ser Gly
        515                 520                 525
Asn Phe Tyr Glu Ser His Thr Ile Asn Gln Ala Phe Thr Gln Pro Leu
    530                 535                 540
Val Val Phe Thr Ala Ala Thr Ala Ala Ser Asp Ile Tyr Ile Asp Ala
545                 550                 555                 560
Leu Leu Thr Ser Pro Val Gln Thr Pro Glu Pro His Tyr Gly Tyr Gln
                565                 570                 575
Gly His Trp Glu Ala Thr Trp Ala Asp Thr Ser Thr Ala Lys Ser Gly
            580                 585                 590
Thr Met Thr Trp Val Thr Thr Gly Tyr Asn Pro Asn Pro Glu Arg Arg
        595                 600                 605
Ala Ser Val Val Pro Asp Ser Leu Trp Ala Ser Phe Thr Asp Ile Arg
    610                 615                 620
Thr Leu Gln Gln Ile Met Thr Ser Gln Ala Asn Ser Ile Tyr Gln Gln
625                 630                 635                 640
Arg Gly Leu Trp Ala Ser Gly Thr Ala Asn Phe Phe His Lys Asp Lys
                645                 650                 655
Ser Gly Thr Asn Gln Ala Phe Arg His Lys Ser Tyr Gly Tyr Ile Val
            660                 665                 670
Gly Gly Ser Ala Glu Asp Phe Ser Glu Asn Ile Phe Ser Val Ala Phe
        675                 680                 685
Cys Gln Leu Phe Gly Lys Asp Lys Asp Leu Phe Ile Val Glu Asn Thr
    690                 695                 700
Ser His Asn Tyr Leu Ala Ser Leu Tyr Leu Gln His Arg Ala Phe Leu
705                 710                 715                 720
Gly Gly Leu Pro Met Pro Ser Phe Gly Ser Ile Thr Asp Met Leu Lys
                725                 730                 735
Asp Ile Pro Leu Ile Leu Asn Ala Gln Leu Ser Tyr Ser Tyr Thr Lys
            740                 745                 750
Asn Asp Met Asp Thr Arg Tyr Thr Ser Tyr Pro Glu Ala Gln Gly Ser
        755                 760                 765
Trp Thr Asn Asn Ser Gly Ala Leu Glu Leu Gly Gly Ser Leu Ala Leu
    770                 775                 780
Tyr Leu Pro Lys Glu Ala Pro Phe Phe Gln Gly Tyr Phe Pro Phe Leu
785                 790                 795                 800
Lys Phe Gln Ala Val Tyr Ser Arg Gln Gln Asn Phe Lys Glu Ser Gly
                805                 810                 815
Ala Glu Ala Arg Ala Phe Asp Asp Gly Asp Leu Val Asn Cys Ser Ile
            820                 825                 830
Pro Val Gly Ile Arg Leu Glu Lys Ile Ser Glu Asp Glu Lys Asn Asn
        835                 840                 845
Phe Glu Ile Ser Leu Ala Tyr Ile Gly Asp Val Tyr Arg Lys Asn Pro
    850                 855                 860
Arg Ser Arg Thr Ser Leu Met Val Ser Gly Ala Ser Trp Thr Ser Leu
865                 870                 875                 880
Cys Lys Asn Leu Ala Arg Gln Ala Phe Leu Ala Ser Ala Gly Ser His
                885                 890                 895
Leu Thr Leu Ser Pro His Val Glu Leu Ser Gly Glu Ala Ala Tyr Glu
            900                 905                 910
Leu Arg Gly Ser Ala His Ile Tyr Asn Val Asp Cys Gly Leu Arg Tyr
        915                 920                 925
Ser Phe
    930
 
<210>146
<211>936
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>146
 
Met Lys Ser Ser Val Ser Trp Leu Phe Phe Ser Ser Ile Pro Leu Phe
1               5                   10                  15
Ser Ser Leu Ser Ile Val Ala Ala Glu Val Thr Leu Asp Ser Ser Asn
            20                  25                  30
Asn Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Gly Thr Thr Phe Thr Val Phe Ser Thr
        35                  40                  45
Thr Asp Ala Ala Ala Gly Thr Thr Tyr Ser Leu Leu Ser Asp Val Ser
    50                  55                  60
Phe Gln Asn Ala Gly Ala Leu Gly Ile Pro Leu Ala Ser Gly Cys Phe
65                  70                  75                  80
Leu Glu Ala Gly Gly Asp Leu Thr Phe Gln Gly Asn Gln His Ala Leu
                85                  90                  95
Lys Phe Ala Phe Ile Asn Ala Gly Ser Ser Ala Gly Thr Val Ala Ser
            100                 105                 110
Thr Ser Ala Ala Asp Lys Asn Leu Leu Phe Asn Asp Phe Ser Arg Leu
        115                 120                 125
Ser Ile Ile Ser Cys Pro Ser Leu Leu Leu Ser Pro Thr Gly Gln Cys
    130                 135                 140
Ala Leu Lys Ser Val Gly Asn Leu Ser Leu Thr Gly Asn Ser Gln Ile
145                 150                 155                 160
Ile Phe Thr Gln Asn Phe Ser Ser Asp Asn Gly Gly Val Ile Asn Thr
                165                 170                 175
Lys Asn Phe Leu Leu Ser Gly Thr Ser Gln Phe Ala Ser Phe Ser Arg
            180                 185                 190
Asn Gln Ala Phe Thr Gly Lys Gln Gly Gly Val Val Tyr Ala Thr Gly
        195                 200                 205
Thr Ile Thr Ile Glu Asn Ser Pro Gly Ile Val Ser Phe Ser Gln Asn
    210                 215                 220
Leu Ala Lys Gly Ser Gly Gly Ala Leu Tyr Ser Thr Asp Asn Cys Ser
225                 230                 235                 240
Ile Thr Asp Asn Phe Gln Val Ile Phe Asp Gly Asn Ser Ala Trp Glu
                245                 250                 255
Ala Ala Gln Ala Gln Gly Gly Ala Ile Cys Cys Thr Thr Thr Asp Lys
            260                 265                 270
Thr Val Thr Leu Thr Gly Asn Lys Asn Leu Ser Phe Thr Asn Asn Thr
        275                 280                 285
Ala Leu Thr Tyr Gly Gly Ala Ile Ser Gly Leu Lys Val Ser Ile Ser
    290                 295                 300
Ala Gly Gly Pro Thr Leu Phe Gln Ser Asn Ile Ser Gly Ser Ser Ala
305                 310                 315                 320
Gly Gln Gly Gly Gly Gly Ala Ile Asn Ile Ala Ser Ala Gly Glu Leu
                325                 330                 335
Ala Leu Ser Ala Thr Ser Gly Asp Ile Thr Phe Asn Asn Asn Gln Val
            340                 345                 350
Thr Asn Gly Ser Thr Ser Thr Arg Asn Ala Ile Asn Ile Ile Asp Thr
        355                 360                 365
Ala Lys Val Thr Ser Ile Arg Ala Ala Thr Gly Gln Ser Ile Tyr Phe
    370                 375                 380
Tyr Asp Pro Ile Thr Asn Pro Gly Thr Ala Ala Ser Thr Asp Thr Leu
385                 390                 395                 400
Asn Leu Asn Leu Ala Asp Ala Asn Ser Glu Ile Glu Tyr Gly Gly Ala
                405                 410                 415
Ile Val Phe Ser Gly Glu Lys Leu Ser Pro Thr Glu Lys Ala Ile Ala
            420                 425                 430
Ala Asn Val Thr Ser Thr Ile Arg Gln Pro Ala Val Leu Ala Arg Gly
        435                 440                 445
Asp Leu Val Leu Arg Asp Gly Val Thr Val Thr Phe Lys Asp Leu Thr
    450                 455                 460
Gln Ser Pro Gly Ser Arg Ile Leu Met Asp Gly Gly Thr Thr Leu Ser
465                 470                 475                 480
Ala Lys Glu Ala Asn Leu Ser Leu Asn Gly Leu Ala Val Asn Leu Ser
                485                 490                 495
Ser Leu Asp Gly Thr Asn Lys Ala Ala Leu Lys Thr Glu Ala Ala Asp
            500                 505                 510
Lys Asn Ile Ser Leu Ser Gly Thr Ile Ala Leu Ile Asp Thr Glu Gly
        515                 520                 525
Ser Phe Tyr Glu Asn His Asn Leu Lys Ser Ala Ser Thr Tyr Pro Leu
    530                 535                 540
Leu Glu Leu Thr Thr Ala Gly Ala Asn Gly Thr Ile Thr Leu Gly Ala
545                 550                 555                 560
Leu Ser Thr Leu Thr Leu Gln Glu Pro Glu Thr His Tyr Gly Tyr Gln
                565                 570                 575
Gly Asn Trp Gln Leu Ser Trp Ala Asn Ala Thr Ser Ser Lys Ile Gly
            580                 585                 590
Ser Ile Asn Trp Thr Arg Thr Gly Tyr Ile Pro Ser Pro Glu Arg Lys
        595                 600                 605
Ser Asn Leu Pro Leu Asn Ser Leu Trp Gly Asn Phe Ile Asp Ile Arg
    610                 615                 620
Ser Ile Asn Gln Leu Ile Glu Thr Lys Ser Ser Gly Glu Pro Phe Glu
625                 630                 635                 640
Arg Glu Leu Trp Leu Ser Gly Ile Ala Asn Phe Phe Tyr Arg Asp Ser
                645                 650                 655
Met Pro Thr Arg His Gly Phe Arg His Ile Ser Gly Gly Tyr Ala Leu
            660                 665                 670
Gly Ile Thr Ala Thr Thr Pro Ala Glu Asp Gln Leu Thr Phe Ala Phe
        675                 680                 685
Cys Gln Leu Phe Ala Arg Asp Arg Asn His Ile Thr Gly Lys Asn His
    690                 695                 700
Gly Asp Thr Tyr Gly Ala Ser Leu Tyr Phe His His Thr Glu Gly Leu
705                 710                 715                 720
Phe Asp Ile Ala Asn Phe Leu Trp Gly Lys Ala Thr Arg Ala Pro Trp
                725                 730                 735
Val Leu Ser Glu Ile Ser Gln Ile Ile Pro Leu Ser Phe Asp Ala Lys
            740                 745                 750
Phe Ser Tyr Leu His Thr Asp Asn His Met Lys Thr Tyr Tyr Thr Asp
        755                 760                 765
Asn Ser Ile Ile Lys Gly Ser Trp Arg Asn Asp Ala Phe Cys Ala Asp
    770                 775                 780
Leu Gly Ala Ser Leu Pro Phe Val Ile Ser Val Pro Tyr Leu Leu Lys
785                 790                 795                 800
Glu Val Glu Pro Phe Val Lys Val Gln Tyr Ile Tyr Ala His Gln Gln
                805                 810                 815
Asp Phe Tyr Glu Arg Tyr Ala Glu Gly Arg Ala Phe Asn Lys Ser Glu
            820                 825                 830
Leu Ile Asn Val Glu Ile Pro Ile Gly Val Thr Phe Glu Arg Asp Ser
        835                 840                 845
Lys Ser Glu Lys Gly Thr Tyr Asp Leu Thr Leu Met Tyr Ile Leu Asp
    850                 855                 860
Ala Tyr Arg Arg Asn Pro Lys Cys Gln Thr Ser Leu Ile Ala Ser Asp
865                 870                 875                 880
Ala Asn Trp Met Ala Tyr Gly Thr Asn Leu Ala Arg Gln Gly Phe Ser
                885                 890                 895
Val Arg Ala Ala Asn His Phe Gln Val Asn Pro His Met Glu Ile Phe
            900                 905                 910
Gly Gln Phe Ala Phe Glu Val Arg Ser Ser Ser Arg Asn Tyr Asn Thr
        915                 920                 925
Asn Leu Gly Ser Lys Phe Cys Phe
    930                 935
 
<210>147
<211>1276
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>147
 
Met Lys Tyr Ser Leu Pro Trp Leu Leu Thr Ser Ser Ala Leu Val Phe
1               5                   10                  15
Ser Leu His Pro Leu Met Ala Ala Asn Thr Asp Leu Ser Ser Ser Asp
            20                  25                  30
Asn Tyr Glu Asn Gly Ser Ser Gly Ser Ala Ala Phe Thr Ala Lys Glu
        35                  40                  45
Thr Ser Asp Ala Ser Gly Thr Thr Tyr Thr Leu Thr Ser Asp Val Ser
    50                  55                  60
Ile Thr Asn Val Ser Ala Ile Thr Pro Ala Asp Lys Ser Cys Phe Thr
65                  70                  75                  80
Asn Thr Gly Gly Ala Leu Ser Phe Val Gly Ala Asp His Ser Leu Val
                85                  90                  95
Leu Gln Thr Ile Ala Leu Thr His Asp Gly Ala Ala Ile Asn Asn Thr
            100                 105                 110
Asn Thr Ala Leu Ser Phe Ser Gly Phe Ser Ser Leu Leu Ile Asp Ser
        115                 120                 125
Ala Pro Ala Thr Gly Thr Ser Gly Gly Lys Gly Ala Ile Cys Val Thr
    130                 135                 140
Asn Thr Glu Gly Gly Thr Ala Thr Phe Thr Asp Asn Ala Ser Val Thr
145                 150                 155                 160
Leu Gln Lys Asn Thr Ser Glu Lys Asp Gly Ala Ala Val Ser Ala Tyr
                165                 170                 175
Ser Ile Asp Leu Ala Lys Thr Thr Thr Ala Ala Leu Leu Asp Gln Asn
            180                 185                 190
Thr Ser Thr Lys Asn Gly Gly Ala Leu Cys Ser Thr Ala Asn Thr Thr
        195                 200                 205
Val Gln Gly Asn Ser Gly Thr Val Thr Phe Ser Ser Asn Thr Ala Thr
    210                 215                 220
Asp Lys Gly Gly Gly Ile Tyr Ser Lys Glu Lys Asp Ser Thr Leu Asp
225                 230                 235                 240
Ala Asn Thr Gly Val Val Thr Phe Lys Ser Asn Thr Ala Lys Thr Gly
                245                 250                 255
Gly Ala Trp Ser Ser Asp Asp Asn Leu Ala Leu Thr Gly Asn Thr Gln
            260                 265                 270
Val Leu Phe Gln Glu Asn Lys Thr Thr Gly Ser Ala Ala Gln Ala Asn
        275                 280                 285
Asn Pro Glu Gly Cys Gly Gly Ala Ile Cys Cys Tyr Leu Ala Thr Ala
    290                 295                 300
Thr Asp Lys Thr Gly Leu Ala Ile Ser Gln Asn Gln Glu Met Ser Phe
305                 310                 315                 320
Thr Ser Asn Thr Thr Thr Ala Asn Gly Gly Ala Ile Tyr Ala Thr Lys
                325                 330                 335
Cys Thr Leu Asp Gly Asn Thr Thr Leu Thr Phe Asp Gln Asn Thr Ala
            340                 345                 350
Thr Ala Gly Cys Gly Gly Ala Ile Tyr Thr Glu Thr Glu Asp Phe Ser
        355                 360                 365
Leu Lys Gly Ser Thr Gly Thr Val Thr Phe Ser Thr Asn Thr Ala Lys
    370                 375                 380
Thr Gly Gly Ala Leu Tyr Ser Lys Gly Asn Ser Ser Leu Thr Gly Asn
385                 390                 395                 400
Thr Asn Leu Leu Phe Ser Gly Asn Lys Ala Thr Gly Pro Ser Asn Ser
                405                 410                 415
Ser Ala Asn Gln Glu Gly Cys Gly Gly Ala Ile Leu Ser Phe Leu Glu
            420                 425                 430
Ser Ala Ser Val Ser Thr Lys Lys Gly Leu Trp Ile Glu Asp Asn Glu
        435                 440                 445
Asn Val Ser Leu Ser Gly Asn Thr Ala Thr Val Ser Gly Gly Ala Ile
    450                 455                 460
Tyr Ala Thr Lys Cys Ala Leu His Gly Asn Thr Thr Leu Thr Phe Asp
465                 470                 475                 480
Gly Asn Thr Ala Glu Thr Ala Gly Gly Ala Ile Tyr Thr Glu Thr Glu
                485                 490                 495
Asp Phe Thr Leu Thr Gly Ser Thr Gly Thr Val Thr Phe Ser Thr Asn
            500                 505                 510
Thr Ala Lys Thr Ala Gly Ala Leu His Thr Lys Gly Asn Thr Ser Phe
        515                 520                 525
Thr Lys Asn Lys Ala Leu Val Phe Ser Gly Asn Ser Ala Thr Ala Thr
    530                 535                 540
Ala Thr Thr Thr Thr Asp Gln Glu Gly Cys Gly Gly Ala Ile Leu Cys
545                 550                 555                 560
Asn Ile Ser Glu Ser Asp Ile Ala Thr Lys Ser Leu Thr Leu Thr Glu
                565                 570                 575
Asn Glu Ser Leu Ser Phe Ile Asn Asn Thr Ala Lys Arg Ser Gly Gly
            580                 585                 590
Gly Ile Tyr Ala Pro Lys Cys Val Ile Ser Gly Ser Glu SerIle Asn
        595                 600                 605
Phe Asp Gly Asn Thr Ala Glu Thr Ser Gly Gly Ala Ile Tyr Ser Lys
    610                 615                 620
Asn Leu Ser Ile Thr Ala Asn Gly Pro Val Ser Phe Thr Asn Asn Ser
625                 630                 635                 640
Gly Gly Lys Gly Gly Ala Ile Tyr Ile Ala Asp Ser Gly Glu Leu Ser
                645                 650                 655
Leu Glu Ala Ile Asp Gly AspIle Thr Phe Ser Gly Asn Arg Ala Thr
            660                 665                 670
Glu Gly Thr Ser Thr Pro Asn Ser Ile His Leu Gly Ala Gly Ala Lys
        675                 680                 685
Ile Thr Lys Leu Ala Ala Ala Pro Gly His Thr Ile Tyr Phe Tyr Asp
    690                 695                 700
Pro Ile Thr Met Glu Ala Pro Ala Ser Gly Gly Thr Ile Glu Glu Leu
705                 710                 715                 720
Val Ile Asn Pro Val Val Lys Ala Ile Val Pro Pro Pro Gln Pro Lys
                725                 730                 735
Asn Gly Pro Ile Ala Ser Val Pro Val Val Pro Val Ala Pro Ala Asn
            740                 745                 750
Pro Asn Thr Gly Thr Ile Val Phe Ser Ser Gly Lys Leu Pro Ser Gln
        755                 760                 765
Asp Ala Ser Ile Pro Ala Asn Thr Thr Thr Ile Leu Asn Gln Lys Ile
    770                 775                 780
Asn Leu Ala Gly Gly Asn Val Val Leu Lys Glu Gly Ala Thr Leu Gln
785                 790                 795                 800
Val Tyr Ser Phe Thr Gln Gln Pro Asp Ser Thr Val Phe Met Asp Ala
                805                 810                 815
Gly Thr Thr Leu Glu Thr Thr Thr Thr Asn Asn Thr Asp Gly Ser Ile
            820                 825                 830
Asp Leu Lys Asn Leu Ser Val Asn Leu Asp Ala Leu Asp Gly Lys Arg
        835                 840                 845
Met Ile Thr Ile Ala Val Asn Ser Thr Ser Gly Gly Leu Lys Ile Ser
    850                 855                 860
Gly Asp Leu Lys Phe His Asn Asn Glu Gly Ser Phe Tyr Asp Asn Pro
865                 870                 875                 880
Gly Leu Lys Ala Asn Leu Asn Leu Pro Phe Leu Asp Leu Ser Ser Thr
                885                 890                 895
Ser Gly Thr Val Asn Leu Asp Asp Phe Asn Pro Ile Pro Ser Ser Met
            900                 905                 910
Ala Ala Pro Asp Tyr Gly Tyr Gln Gly Ser Trp Thr Leu Val Pro Lys
        915                 920                 925
Val Gly Ala Gly Gly Lys Val Thr Leu Val Ala Glu Trp Gln Ala Leu
    930                 935                 940
Gly Tyr Thr Pro Lys Pro Glu Leu Arg Ala Thr Leu Val Pro Asn Ser
945                 950                 955                 960
Leu Trp Asn Ala Tyr Val Asn Ile His Ser Ile Gln Gln Glu Ile Ala
                965                 970                 975
Thr Ala Met Ser Asp Ala Pro Ser His Pro Gly Ile Trp Ile Gly Gly
            980                 985                 990
Ile Gly Asn Ala Phe His Gln Asp Lys Gln Lys Glu Asn Ala Gly Phe
        995                 1000                1005
Arg Leu Ile Ser Arg Gly Tyr Ile Val Gly Gly Ser Met Thr Thr
    1010                1015                1020
Pro Gln Glu Tyr Thr Phe Ala Val Ala Phe Ser Gln Leu Phe Gly
    1025                1030                1035
Lys Ser Lys Asp Tyr Val Val Ser Asp Ile Lys Ser Gln Val Tyr
    1040                1045                1050
Ala Gly Ser Leu Cys Ala Gln Ser Ser Tyr Val Ile Pro Leu His
    1055                1060                1065
Ser Ser Leu Arg Arg His Val Leu Ser Lys Val Leu Pro Glu Leu
    1070                1075                1080
Pro Gly Glu Thr Pro Leu Val Leu His Gly Gln Val Ser Tyr Gly
    1085                1090                1095
Arg Asn His His Asn Met Thr Thr Lys Leu Ala Asn Asn Thr Gln
    1100                1105                1110
Gly Lys Ser Asp Trp Asp Ser His Ser Phe Ala Val Glu Val Gly
    1115                1120                1125
Gly Ser Leu Pro Val Asp Leu Asn Tyr Arg Tyr Leu Thr Ser Tyr
    1130                1135                1140
Ser Pro Tyr Val Lys Leu Gln Val Val Ser Val Asn Gln Lys Gly
    1145                1150                1155
Phe Gln Glu Val Ala Ala Asp Pro Arg Ile Phe Asp Ala Ser His
    1160                1165                1170
Leu Val Asn Val Ser Ile Pro Met Gly Leu Thr Phe Lys His Glu
    1175                1180                1185
Ser Ala Lys Pro Pro Ser Ala Leu Leu Leu Thr Leu Gly Tyr Ala
    1190                1195                1200
Val Asp Ala Tyr Arg Asp His Pro His Cys Leu Thr Ser Leu Thr
    1205                1210                1215
Asn Gly Thr Ser Trp Ser Thr Phe Ala Thr Asn Leu Ser Arg Gln
    1220                1225                1230
Ala Phe Phe Ala Glu Ala Ser Gly His Leu Lys Leu Leu His Gly
    1235                1240                1245
Leu Asp Cys Phe Ala Ser Gly Ser Cys Glu Leu Arg Ser Ser Ser
    1250                1255                1260
Arg Ser Tyr Asn Ala Asn Cys Gly Thr Arg Tyr Ser Phe
    1265                1270                1275
 
<210>148
<211>908
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>148
 
Met Asp Ser Glu Phe Val Gly Gln Val Tyr Ser Ser Asp Met Asp Trp
1               5                   10                  15
Ile Glu Ser Met Tyr Gln Arg Phe Met Asn His Glu Thr Leu Asp Pro
            20                  25                  30
Ser Trp Lys Tyr Phe Phe Glu Gly Tyr Gln Leu Gly Gln Ala Ala Ser
        35                  40                  45
Pro Ser Glu Ala Ser Thr Lys Ile Ser Gly Asn Glu Thr Ile Ala Met
    50                  55                  60
Leu Gln Glu Gln Lys Ser Gln Phe Leu Cys Thr Ile Tyr Arg Tyr Tyr
65                  70                  75                  80
Gly Tyr Leu Gln Ser Gln Ile Ser Thr Leu Ala Pro Thr Thr Asp Ser
                85                  90                  95
Arg Phe Ile Gln Glu Lys Ile Ala Lys Ile Asp Leu Asp Glu Gln Val
            100                 105                 110
Pro Ser Ala Gly Leu Leu Pro Lys Ala Gln Val Ser Val Arg Glu Leu
        115                 120                 125
Ile Glu Ala Leu Lys Lys Cys Tyr Cys Gly Ser Leu Thr Leu Glu Thr
    130                 135                 140
Leu Thr Cys Thr Pro Glu Leu Gln Glu Phe Val Trp Asn Leu Met Glu
145                 150                 155                 160
Lys Arg Gln Val Glu Arg Phe Ala Glu Gln Leu Leu Arg Ser Tyr Lys
                165                 170                 175
Asp Leu Cys Lys Ala Thr Phe Phe Glu Glu Phe Leu Gln Ile Lys Phe
            180                 185                 190
Thr Gly Gln Lys Arg Phe Ser Leu Glu Gly Gly Glu Thr Leu Val Pro
        195                 200                 205
Met Leu Glu His Leu Val His Tyr Gly Ser Ala Leu Gly Ile Ser Asn
    210                 215                 220
Tyr Val Leu Gly Met Ala His Arg Gly Arg Leu Asn Val Leu Thr Asn
225                 230                 235                 240
Val Leu Gly Lys Pro Tyr Arg Tyr Val Phe Met Glu Phe Glu Asp Asp
                245                 250                 255
Pro Ala Ala Arg Gly Leu Glu Ser Val Gly Asp Val Lys Tyr His Lys
            260                 265                 270
Gly Tyr Val Leu Lys Ser His Gln Lys Asp Arg Glu Thr Thr Phe Val
        275                 280                 285
Met Leu Pro Asn Ala Ser His Leu Glu Ser Val Asp Pro Ile Val Glu
    290                 295                 300
Gly Val Val Ala Ala Leu Gln His Gln Gly His Ala Gly Lys Glu Gln
305                 310                 315                 320
Ser Ser Leu Ala Ile Leu Val His Gly Asp Ala Ala Phe Ser Gly Gln
                325                 330                 335
Gly Val Val Tyr Glu Thr Leu Gln Leu Ser Arg Val Pro Gly Tyr Ser
            340                 345                 350
Thr Glu Gly Thr Leu His Ile Val Val Asn Asn Tyr Ile Gly Phe Thr
        355                 360                 365
Ala Val Pro Arg Glu Ser Arg Ser Thr Pro Tyr Cys Thr Asp Ile Ala
    370                 375                 380
Lys Met Leu Gly Ile Pro Val Phe Arg Val Asn Ser Glu Asp Val Val
385                 390                 395                 400
Ala Cys Ile Glu Ala Ile Glu Tyr Ala Leu Gln Val Arg Glu Arg Phe
                405                 410                 415
Ser Cys Asp Val Ile Ile Asp Leu Cys Cys Tyr Arg Lys Tyr Gly His
            420                 425                 430
Asn Glu Ser Asp Asp Pro Ser Val Thr Ala Pro Leu Leu Tyr Asp Gln
        435                 440                 445
Ile Lys Arg Lys Lys Ser Ile Arg Glu Leu Phe Arg Gln Tyr Leu Leu
    450                 455                 460
Glu Gly Gln Phe Ala Asp Ile Ser Glu Glu Thr Leu Ala Ser Ile Glu
465                 470                 475                 480
Lys Glu Ile Gln Glu Ser Leu Asn Arg Glu Phe Gln Val Leu Lys Gly
                485                 490                 495
Thr Asp Pro Glu Pro Phe Pro Lys Lys Glu Cys His His Cys Asp Arg
            500                 505                 510
Leu Asn Asn Gly Glu Leu Ile Leu His Asp Cys Asp Val Ser Leu Asp
        515                 520                 525
Arg Glu Thr Leu Phe His Met Ser Ser Arg Leu Cys Gly Phe Pro Asp
    530                 535                 540
Asn Phe His Pro His Pro Lys Ile Lys Thr Leu Leu Glu Lys Arg Met
545                 550                 555                 560
Lys Met Ala Glu Gly Gly Val Gly Tyr Asp Trp Ala Met Ala Glu Glu
                565                 570                 575
Leu Ala Phe Ala Ser Leu Leu Ile Glu Gly Tyr Asn Leu Arg Leu Ser
            580                 585                 590
Gly Gln Asp Ser Ile Arg Gly Thr Phe Ser Gln Arg His Leu Val Trp
        595                 600                 605
Ser Asp Thr Val Thr Gly Asp Thr Tyr Ser Pro Leu Tyr His Leu Ser
    610                 615                 620
Ala Glu Gln Gly Ser Val Glu Met Tyr Asn Ser Pro Leu Ser Glu Tyr
625                 630                 635                 640
Ala Ile Leu Gly Phe Glu Tyr Gly Tyr Ala Gln Gln Ala Leu Lys Thr
                645                 650                 655
Leu Val Leu Trp Glu Ala Gln Phe Gly Asp Phe Ala Asn Gly Ala Gln
            660                 665                 670
Ile Ile Phe Asp Gln Tyr Ile Ser Ser Gly Ile Gln Lys Trp Asp Leu
        675                 680                 685
His Ser Asp Ile Val Leu Leu Leu Pro His Gly Tyr Glu Gly Gln Gly
    690                 695                 700
Pro Glu His Ser Ser Ser Arg Ile Glu Arg Tyr Leu Gln Leu Ala Ala
705                 710                 715                 720
Asn Trp Asn Phe Gln Val Val Leu Pro Ser Thr Pro Val Gln Tyr Phe
                725                 730                 735
Arg Ile Leu Arg Glu His Ala Lys Arg Asp Leu Ser Leu Pro Leu Val
            740                 745                 750
Ile Phe Thr Pro Lys Leu Leu Leu Arg Tyr Pro Gln Cys Val Ser Ser
        755                 760                 765
Ile Glu Glu Phe Thr Glu Pro Gly Gly Phe Arg Ala Ile Leu Glu Asp
    770                 775                 780
Ala Asp Pro Asn Tyr Asp Ala Ser Ile Leu Val Leu Cys Ser Gly Lys
785                 790                 795                 800
Ile Tyr Tyr Asp Tyr Ala Glu Met Leu Pro Gln Asp Arg Arg Lys Asp
                805                 810                 815
Phe Ser Cys Leu Arg Ile Glu Ser Leu Tyr Pro Leu Ala Leu Glu Asp
            820                 825                 830
Leu Val Ser Leu Ile Asp Lys Tyr Ser His Leu Lys His Phe Val Trp
        835                 840                 845
Leu Gln Glu Glu Ser Lys Asn Met Gly Ala Tyr Asp Tyr Met Phe Met
    850                 855                 860
Ala Leu Gln Asp Ile Leu Pro Glu Lys Leu Leu Tyr Ile Gly Arg Pro
865                 870                 875                 880
Arg Ser Ser Ser Thr Ala Ser Gly Ser Ala Lys Leu Ser Arg Gln Glu
                885                 890                 895
Leu Val Thr Cys Met Glu Thr Leu Phe Ser Leu Arg
            900                 905
 
<210>149
<211>344
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>149
 
Val Asn Ser Leu Ile Met Ala Thr Ile Ser Pro Ile Ser Leu Thr Val
1               5                   10                  15
Asp His Pro Leu Val Asp Thr Lys Lys Lys Ser Cys Ser Asn Phe Asp
            20                  25                  30
Lys Ile Gln Ser Arg Ile Leu Leu Ile Thr Ala Ile Phe Ala Val Leu
        35                  40                  45
Val Thr Ile Gly Thr Leu Leu Ile Gly Leu Leu Leu Asn Ile Pro Val
    50                  55                  60
Ile Tyr Phe Leu Thr Gly Ile Ser Phe Ile Ala Val Val Leu Ser Asn
65                  70                  75                  80
Phe Ile Leu Tyr Lys Arg Ala Thr Thr Leu Leu Lys Pro Arg Ala Cys
                85                  90                  95
Gly Lys His Lys Glu Ile Lys Pro Lys Arg Val Ser Thr Asn Leu Gln
            100                 105                 110
Tyr Ser Ser Ile Ser Ile Ala Ile Asn Arg Ser Lys Glu Asn Trp Glu
        115                 120                 125
His Gln Pro Lys Asp Leu Gln Asn Leu Pro Ala Pro Ser Ala Leu Leu
    130                 135                 140
Thr Asp Asn Pro Tyr Glu Ile Trp Lys Ala Lys His Ser Leu Phe Ser
145                 150                 155                 160
Leu Val Ser Leu Leu Pro Gly Gly Asn Pro Glu His Leu Leu Ile Ser
                165                 170                 175
Ala Ser Glu Asn Leu Gly Lys Thr Leu Leu Ile Glu Glu Thr Ser Gln
            180                 185                 190
Asn Ala Pro Ile Ser Ser Tyr Val Asp Thr Thr Pro Ser Pro Lys Ser
        195                 200                 205
Leu Leu Asn Glu Ala Ile Gln Glu Thr Arg Val Glu Ile Asn Thr Glu
    210                 215                 220
Leu Pro Ala Gly Asp Ser Gly Glu Arg Leu Tyr Trp Gln Pro Asp Phe
225                 230                 235                 240
Arg Gly Arg Val Phe Leu Pro Gln Ile Pro Thr Thr Pro Glu Ala Ile
                245                 250                 255
Tyr Gln Tyr Tyr Tyr Ala Leu Tyr Val Thr Tyr Ile Gln Thr Ala Ile
            260                 265                 270
Asn Thr Asn Thr Gln Ile Ile Gln Ile Pro Leu Tyr Ser Leu Arg Glu
        275                 280                 285
His Leu Tyr Ser Arg Glu Leu Pro Pro Gln Ser Arg Met Gln Gln Ser
    290                 295                 300
Leu Ala Met Ile Thr Ala Val Lys Tyr Met Ala Glu Leu His Pro Glu
305                 310                 315                 320
Tyr Pro Leu Thr Ile Ala Cys Val Glu Arg Ser Leu Ala Gln Leu Pro
                325                 330                 335
Gln Glu Ser Ile Glu Asp Leu Ser
            340
 
<210>150
<211>463
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>150
 
Leu Leu Asn Leu Arg Tyr Asn Thr Gln Ile Asp Glu Pro Arg Lys Cys
1               5                   10                  15
Met Ser Asn Ile Thr Ser Pro Val Ile Gln Asn Asn Arg Ser Cys Asn
            20                  25                  30
Tyr Tyr Phe Glu Leu Lys Asn Ser Thr Thr Ile His Ile Val Ile Ser
        35                  40                  45
Ala Ile Leu Leu Cys Gly Ala Leu Ile Ala Phe Leu Cys Val Ala Ala
    50                  55                  60
Pro Val Ser Tyr Ile Leu Ser Gly Ala Leu Leu Gly Leu Gly Leu Leu
65                  70                  75                  80
Ile Ala Leu Ile Gly Val Ile Leu Gly Ile Lys Lys Ile Thr Pro Met
                85                  90                  95
Ile Ser Ser Lys Glu Gln Val Phe Pro Gln Glu Leu Val Asn Arg Ile
            100                 105                 110
Arg Ala His Tyr Pro Lys Phe Val Ser Asp Phe Val Ser Glu Ala Lys
        115                 120                 125
Pro Asn Leu Lys Asp Leu Ile Ser Phe Ile Asp Leu Leu Asn Gln Leu
    130                 135                 140
His Ser Glu Val Gly Ser Ser Thr Asn Tyr Asn Val Ser Glu Glu Leu
145                 150                 155                 160
Gln Gln Lys Ile Asp Thr Phe Glu Gly Ile Ala Arg Leu Lys Asn Glu
                165                 170                 175
Val Arg Thr Ala Ser Leu Lys Arg Leu Glu Ser Ala Ala Ser Ser Arg
            180                 185                 190
Pro Leu Phe Pro Ser Leu Ala Lys Ile Leu Gln Lys Val Phe Pro Phe
        195                 200                 205
Phe Trp Leu Gly Glu Phe Ile Ser Ala Gly Ser Lys Val Val Glu Leu
    210                 215                 220
His Arg Val Lys Lys Ile Gly Gly Ser Leu Glu Glu Asp Leu Ser Asp
225                 230                 235                 240
Tyr Ile Lys Pro Glu Met Leu Pro Thr Tyr Trp Leu Ile Pro Leu Asp
                245                 250                 255
Phe Arg Pro Thr Asn Ser Ser Ile Leu Asn Leu His Thr Leu Val Leu
            260                 265                 270
Ala Arg Val Leu Thr Arg Asp Val Phe Gln His Leu Lys Tyr Ala Ala
        275                 280                 285
Leu Asn Gly Glu Trp Asn Leu Asn His Ser Asp Leu Asn Thr Met Lys
    290                 295                 300
Gln Gln Leu Phe Ala Lys Tyr His Ala Ala Tyr Gln Ser Tyr Lys His
305                 310                 315                 320
Leu Ser Gln Pro Ser Leu Gln Glu Asp Glu Phe Tyr Asn Leu Leu Leu
                325                 330                 335
Cys Ile Phe Lys His Arg Tyr Ser Trp Lys Gln Met Ser Leu Ile Lys
            340                 345                 350
Thr Val Pro Ala Asp Leu Trp Glu Asn Leu Cys Cys Leu Thr Leu Asp
        355                 360                 365
His Thr Gly Arg Pro Gln Asp Met Glu Phe Ala Ser Leu Ile Gly Thr
    370                 375                 380
Leu Tyr Thr Gln Gly Leu Ile His Lys Glu Ser Glu Ala Phe Leu Ser
385                 390                 395                 400
Ser Leu Thr Leu Leu Ser Leu Asp Gln Phe Lys Thr Ile Arg Arg Gln
                405                 410                 415
Ser Thr Asn Ile Ala Met Phe Leu Glu Asn Leu Ala Thr His Asn Ser
            420                 425                 430
Thr Phe Arg Ser Leu Pro Pro Ile Thr Val His Pro Leu Lys Arg Ser
        435                 440                 445
Val Phe Ser Gln Pro Glu Glu Asp Glu Ser Ser Leu Leu Ile Gly
    450                 455                 460
 
<210>151
<211>171
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>151
 
Val Gly Phe Met Ala Val Glu Gln Ser His Ile Lys Glu Glu Ile Glu
1               5                   10                  15
Lys Leu Ile Gly Lys Ala Ile Lys Arg Val Cys Gly Asn Lys Glu Asn
            20                  25                  30
Asp Leu Cys Arg Tyr Leu Pro Gly Pro Ser Gly Gly Tyr Met His His
        35                  40                  45
Phe Thr Leu Lys Lys Met Lys Ser Ala Ala Pro Glu Gln Leu Leu Lys
    50                  55                  60
Met Leu Lys Thr Phe Ile Leu Glu Ser Glu Thr Pro Arg Thr Ile Asn
65                  70                  75                  80
Pro Lys Pro Arg Ala Pro Arg Gly Ser Lys Lys Arg Arg Asp Phe Ile
                85                  90                  95
Asn Phe Thr Lys Thr Asp Ile Glu Arg Val Leu Glu Leu Ala Arg Gln
            100                 105                 110
Val Gly Asp Lys Asp Leu Leu Ala Arg Phe Ser Pro Lys Lys Pro Leu
        115                 120                 125
Thr Ser Leu Lys Arg Glu Leu Ile Arg Ser Ile Arg Asn Gly Ile Val
    130                 135                 140
Ser Val Glu Leu Trp Asn Ala Tyr Val Glu Ala Val Lys Ala Val Ser
145                 150                 155                 160
Ser Pro Asn Leu Glu Val Thr Ser Pro Phe Val
                165                 170
 
<210>152
<211>311
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>152
 
Met Ile His Ser Arg Leu Ile Ile Ile Gly Ser Gly Pro Ser Gly Tyr
1               5                   10                  15
Thr Ala Ala Ile Tyr Ala Ser Arg Ala Leu Leu His Pro Leu Leu Phe
            20                  25                  30
Glu Gly Phe Phe Ser Gly Ile Ser Gly Gly Gln Leu Met Thr Thr Thr
        35                  40                  45
Glu Val Glu Asn Phe Pro Gly Phe Pro Glu Gly Ile Leu Gly Pro Lys
    50                  55                  60
Leu Met Asn Asn Met Lys Glu Gln Ala Val Arg Phe Gly Thr Lys Thr
65                  70                  75                  80
Leu Ala Gln Asp Ile Ile Ser Val Asp Phe Ser Val Arg Pro Phe Ile
                85                  90                  95
Leu Lys Ser Lys Glu Glu Thr Tyr Ser Cys Asp Ala Cys Ile Ile Ala
            100                 105                 110
Thr Gly Ala Ser Ala Lys Arg Leu Glu Ile Pro Gly Ala Gly Asn Asp
        115                 120                 125
Glu Phe Trp Gln Lys Gly Val Thr Ala Cys Ala Val Cys Asp Gly Ala
    130                 135                 140
Ser Pro Ile Phe Lys Asn Lys Asp Leu Tyr Val Ile Gly Gly Gly Asp
145                 150                 155                 160
Ser Ala Leu Glu Glu Ala Leu Tyr Leu Thr Arg Tyr Gly Ser His Val
                165                 170                 175
Tyr Val Val His Arg Arg Asp Lys Leu Arg Ala Ser Lys Ala Met Glu
            180                 185                 190
Ala Arg Ala Gln Asn Asn Glu Lys Ile Thr Phe Leu Trp Asn Ser Glu
        195                 200                 205
Ile Val Lys Ile Ser Gly Asp Ser Ile Val Arg Ser Val Asp Ile Lys
    210                 215                 220
Asn Val Gln Thr Gln Glu Ile Thr Thr Arg Glu Ala Ala Gly Val Phe
225                 230                 235                 240
Phe Ala Ile Gly His Lys Pro Asn Thr Asp Phe Leu Gly Gly Gln Leu
                245                 250                 255
Thr Leu Asp Glu Ser Gly Tyr Ile Val Thr Glu Lys Gly Thr Ser Lys
            260                 265                 270
Thr Ser Val Pro Gly Val Phe Ala Ala Gly Asp Val Gln Asp Lys Tyr
        275                 280                 285
Tyr Arg Gln Ala Val Thr Ser Ala Gly Ser Gly Cys Ile Ala Ala Leu
    290                 295                 300
Asp Ala Glu Arg Phe Leu Gly
305                 310
 
<210>153
<211>171
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>153
 
Met Lys Lys Leu Leu Phe Ser Thr Phe Leu Leu Val Leu Gly Ser Thr
1               5                   10                  15
Ser Ala Ala His Ala Asn Leu Gly Tyr Val Asn Leu Lys Arg Cys Leu
            20                  25                  30
Glu Glu Ser Asp Leu Gly Lys Lys Glu Thr Glu Glu Leu Glu Ala Met
        35                  40                  45
Lys Gln Gln Phe Val Lys Asn Ala Glu Lys Ile Glu Glu Glu Leu Thr
    50                  55                  60
Ser Ile Tyr Asn Lys Leu Gln Asp Glu Asp Tyr Met Glu Ser Leu Ser
65                  70                  75                  80
Asp Ser Ala Ser Glu Glu Leu Arg Lys Lys Phe Glu Asp Leu Ser Gly
                85                  90                  95
Glu Tyr Asn Ala Tyr Gln Ser Gln Tyr Tyr Gln Ser Ile Asn Gln Ser
            100                 105                 110
Asn Val Lys Arg Ile Gln Lys Leu Ile Gln Glu Val Lys Ile Ala Ala
        115                 120                 125
Glu Ser Val Arg Ser Lys Glu Lys Leu Glu Ala Ile Leu Asn Glu Glu
    130                 135                 140
Ala Val Leu Ala Ile Ala Pro Gly Thr Asp Lys Thr Thr Glu Ile Ile
145                 150                 155                 160
Ala Ile Leu Asn Glu Ser Phe Lys Lys Gln Asn
                165                 170
 
<210>154
<211>805
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>154
 
Met Asp Pro Lys Glu Lys Asn Tyr Asp Ala Ser Ala Ile Thr Val Leu
1               5                   10                  15
Glu Gly Leu Gln Ala Val Arg Glu Arg Pro Gly Met Tyr Ile Gly Asp
            20                  25                  30
Thr Gly Ile Thr Gly Leu His His Leu Val Tyr Glu Val Val Asp Asn
        35                  40                  45
Ser Ile Asp Glu Ala Met Ala Gly Tyr Cys Ser Arg Ile Asp Val Arg
    50                  55                  60
Ile Leu Glu Asp Gly Gly Ile Val Ile Val Asp Asn Gly Arg Gly Ile
65                  70                  75                  80
Pro Ile Glu Val His Glu Arg Glu Ser Ala Lys Gln Gly Arg Glu Val
                85                  90                  95
Ser Ala Leu Glu Val Val Leu Thr Val Leu His Ala Gly Gly Lys Phe
            100                 105                 110
Asp Lys Asp Ser Tyr Lys Val Ser Gly Gly Leu His Gly Val Gly Val
        115                 120                 125
Ser Cys Val Asn Ala Leu Ser Glu Lys Leu Val Ala Thr Val Phe Lys
    130                 135                 140
Asp Lys Lys Cys Tyr Gln Met Glu Phe Ser Arg Gly Ile Pro Val Thr
145                 150                 155                 160
Pro Leu Gln Tyr Val Ser Val Ser Asp Arg Gln Gly Thr Glu Ile Val
                165                 170                 175
Phe Tyr Pro Asp Pro Lys Ile Phe Ser Thr Cys Thr Phe Asp Arg Ser
            180                 185                 190
Ile Leu Met Lys Arg Leu Arg Glu Leu Ala Phe Leu Asn Arg Gly Ile
        195                 200                 205
Thr Ile Val Phe Glu Asp Asp Arg Asp Val Ser Phe Asp Lys Val Thr
    210                 215                 220
Phe Phe Tyr Glu Gly Gly Ile Gln Ser Phe Val Ser Tyr Leu Asn Gln
225                 230                 235                 240
Asn Lys Glu Ser Leu Phe Ser Glu Pro Ile Tyr Ile Cys Gly Thr Arg
                245                 250                 255
Val Gly Asp Asp Gly Glu Ile Glu Phe Glu Ala Ala Leu Gln Trp Asn
            260                 265                 270
Ser Gly Tyr Ser Glu Leu Val Tyr Ser Tyr Ala Asn Asn Ile Pro Thr
        275                 280                 285
Arg Gln Gly Gly Thr His Leu Thr Gly Phe Ser Thr Ala Leu Thr Arg
    290                 295                 300
Val Ile Asn Thr Tyr Ile Lys Ala His Asn Leu Ala Lys Asn Asn Lys
305                 310                 315                 320
Leu Ala Leu Thr Gly Glu Asp Ile Arg Glu Gly Leu Thr Ala Val Ile
                325                 330                 335
Ser Val Lys Val Pro Asn Pro Gln Phe Glu Gly Gln Thr Lys Gln Lys
            340                 345                 350
Leu Gly Asn Ser Asp Val Ser Ser Val Ala Gln Gln Val Val Gly Glu
        355                 360                 365
Ala Leu Thr Ile Phe Phe Glu Glu Asn Pro Gln Ile Ala Arg Met Ile
    370                 375                 380
Val Asp Lys Val Phe Val Ala Ala Gln Ala Arg Glu Ala Ala Lys Lys
385                 390                 395                 400
Ala Arg Glu Leu Thr Leu Arg Lys Ser Ala Leu Asp Ser Ala Arg Leu
                405                 410                 415
Pro Gly Lys Leu Ile Asp Cys Leu Glu Lys Asp Pro Glu Lys Cys Glu
            420                 425                 430
Met Tyr Ile Val Glu Gly Asp Ser Ala Gly Gly Ser Ala Lys Gln Gly
        435                 440                 445
Arg Asp Arg Arg Phe Gln Ala Ile Leu Pro Ile Arg Gly Lys Ile Leu
    450                 455                 460
Asn Val Glu Lys Ala Arg Leu Gln Lys Ile Phe Gln Asn Gln Glu Ile
465                 470                 475                 480
Gly Thr Ile Ile Ala Ala Leu Gly Cys Gly Ile Gly Ala Asp Asn Phe
                485                 490                 495
Asn Leu Ser Lys Leu Arg Tyr Arg Arg Ile Ile Ile Met Thr Asp Ala
            500                 505                 510
Asp Val Asp Gly Ser His Ile Arg Thr Leu Leu Leu Thr Phe Phe Tyr
        515                 520                 525
Arg His Met Thr Ala Leu Ile Glu Asn Glu Cys Val Tyr Ile Ala Gln
    530                 535                 540
Pro Pro Leu Tyr Lys Val Ser Lys Lys Lys Asp Phe Arg Tyr Ile Leu
545                 550                 555                 560
Ser Glu Lys Glu Met Asp Ser Tyr Leu Leu Met Leu Gly Thr Asn Glu
                565                 570                 575
Ser Ser Ile Leu Phe Lys Ser Thr Glu Arg Glu Leu Arg Gly Glu Ala
            580                 585                 590
Leu Glu Ser Phe Ile Asn Val Ile Leu Asp Val Glu Ser Phe Ile Asn
        595                 600                 605
Thr Leu Glu Lys Lys Ala Ile Pro Phe Ser Glu Phe Leu Glu Met Tyr
    610                 615                 620
Lys Glu Gly Ile Gly Tyr Pro Leu Tyr Tyr Leu Ala Pro Ala Thr Gly
625                 630                 635                 640
Met Gln Gly Gly Arg Tyr Leu Tyr Ser Asp Glu Glu Lys Glu Glu Ala
                645                 650                 655
Leu Ala Gln Glu Glu Thr His Lys Phe Lys Ile Ile Glu Leu Tyr Lys
            660                 665                 670
Val Ala Val Phe Val Asp Ile Gln Asn Gln Leu Lys Glu Tyr Gly Leu
        675                 680                 685
Asp Ile Ser Ser Tyr Leu Ile Pro Gln Lys Asn Glu Ile Val Ile Gly
    690                 695                 700
Asn Glu Asp Ser Pro Ser Cys Asn Tyr Ser Cys Tyr Thr Leu Glu Glu
705                 710                 715                 720
Val Ile Asn Tyr Leu Lys Asn Leu Gly Arg Lys Gly Ile Glu Ile Gln
                725                 730                 735
Arg Tyr Lys Gly Leu Gly Glu Met Asn Ala Asp Gln Leu Trp Asp Thr
            740                 745                 750
Thr Met Asn Pro Glu Gln Arg Thr Leu Ile His Val Ser Leu Lys Asp
        755                 760                 765
Ala Val Glu Ala Asp His Ile Phe Thr Met Leu Met Gly Glu Glu Val
    770                 775                 780
Pro Pro Arg Arg Glu Phe Ile Glu Ser His Ala Leu Ser Ile Arg Ile
785                 790                 795                 800
Asn Asn Leu Asp Ile
                805
 
<210>155
<211>287
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>155
 
Met Lys Arg Arg Asn Leu Gln Lys Ile Leu Pro Asn Ala Ser Thr Pro
1               5                   10                  15
Ser Thr Asn Val Ala Glu Asn Thr Gly Ile Lys Asp Gln Asn Leu Phe
            20                  25                  30
Leu Asp Gln Ala Thr Leu Asn Val Asp Gly Asn Val Asp Ile Glu Asn
        35                  40                  45
Phe Leu Glu Thr Arg Asp Leu Lys Val Ala Asp Thr Ile Thr Ser Pro
    50                  55                  60
Cys Glu Phe Thr Val Gly Gly Gly Leu Ser Ala Glu Ser Ser Gln Phe
65                  70                  75                  80
Lys Ala Thr Thr Leu Ser Lys Gly Leu Glu Ile Thr Ser Glu Asp Gln
                85                  90                  95
Asp Gly Arg Val Pro Lys Phe Thr Asn Val Ser Asp Pro Gln Ser Pro
            100                 105                 110
Arg Asp Ala Leu Thr Tyr Asn Tyr Tyr Arg Asn Thr Gly Cys Gln Ala
        115                 120                 125
Leu Asn Leu Tyr Thr Tyr Tyr Ser Ser Ser Gln Pro Thr Thr Val Gly
    130                 135                 140
Lys Pro Ile Glu Thr Val Cys Gln Asn Pro Asn Pro Glu Thr Tyr Arg
145                 150                 155                 160
Ile Ser Ala Ser Ala Lys Ile Tyr Asp Ala Val Thr Arg Phe Pro Tyr
                165                 170                 175
Ile Gln Phe Lys Ala Pro Gly Ile Tyr Gln Val Thr Ile Gln Ile Arg
            180                 185                 190
Arg Glu Ser Gly Gln His Ser Gly Leu Asp Asn Pro Asn Leu Tyr Leu
        195                 200                 205
Asn Leu Met Ile Gly Asn Asn Lys Thr Leu Leu Cys Ala Ser Asp Thr
    210                 215                 220
Arg Gly Tyr Ser Gly Gly His Arg Thr Ser Ile Ala Val Thr Gly Thr
225                 230                 235                 240
Phe Thr Leu Thr Glu Ile Val Ala Thr Pro Pro His Asp Tyr Pro Trp
                245                 250                 255
Leu Phe Leu Glu Thr Thr Ile Gly Leu Asp Ile Lys Ser Met Ser Thr
            260                 265                 270
Cys Val Ile Trp Phe Pro Phe Gln Ala Asn Phe Ala Glu Val Asp
        275                 280                 285
 
<210>156
<211>231
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>156
 
Met Leu Gln Ser Cys Lys Lys Ala Leu Leu Ser Ile Val Val Ser Ile
1               5                   10                  15
Leu Ala Phe His Pro Ile Pro Gly Met Gly Val Glu Ala Lys Ser Gly
            20                  25                  30
Phe Leu Gly Lys Val Lys Gly Trp Phe Ser Lys Lys Glu Ile Gln Glu
        35                  40                  45
Glu Ala Arg Ile Leu Pro Val Lys Asp Ser Leu Ser Trp Lys Arg Tyr
    50                  55                  60
Asp Tyr Thr Ser Ser Ser Gly Phe Ser Val Glu Phe Pro Gly Glu Pro
65                  70                  75                  80
Asp His Ser Gly Gln Ile Val Glu Val Pro Gln Ser Glu Ile Thr Ile
                85                  90                  95
Arg Tyr Asp Thr Tyr Val Thr Glu Thr His Pro Asp Asn Thr Val Tyr
            100                 105                 110
Val Val Ser Val Trp Glu Tyr Pro Glu Lys Val Asp Ile Ser Arg Pro
        115                 120                 125
Glu Leu Asn Leu Gln Glu Gly Phe Ser Gly Met Met Gln Ala Leu Pro
    130                 135                 140
Glu Ser Gln Val Leu Phe Met Gln Ala Arg Gln Ile Gln Gly His Lys
145                 150                 155                 160
Ala Leu Glu Phe Trp Ile Val Cys Glu Asp Val Tyr Phe Arg Gly Met
                165                 170                 175
Leu Ile Ser Val Asn His Thr Leu Tyr Gln Val Phe Met Val Tyr Lys
            180                 185                 190
Asn Lys Asn Pro Gln Ala Leu Asp Lys Glu Tyr Glu Ala Phe Ser Gln
        195                 200                 205
Ser Phe Lys Ile Thr Lys Ile Arg Glu Pro Arg Thr Ile Pro Ser Ser
    210                 215                 220
Val Lys Lys Lys Val Ser Leu
225                 230
 
<210>157
<211>550
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>157
 
Met His Pro Leu Tyr Val Asp Leu Asp Thr Ile Ile Ser Ser Tyr Ser
1               5                   10                  15
Pro Pro Leu Pro Lys Glu Phe Gln Glu Ala Ala Ser Leu Ile Ala Val
            20                  25                  30
Pro Asp Thr Ser His Ser Lys Pro Val Val Pro Gly Val Lys Thr Leu
        35                  40                  45
Phe Pro Gln Thr Tyr His Leu Pro Tyr Leu Lys Phe Val Gln Gly Glu
    50                  55                  60
Asn Val Val His Thr Pro Leu Lys Val Gly Val Met Phe Ser Gly Gly
65                  70                  75                  80
Pro Ala Pro Gly Gly His Asn Val Ile Gln Gly Leu Phe Asn Ser Leu
                85                  90                  95
Lys Asp Phe His Pro Asp Ser Ser Leu Val Gly Phe Val Asn Asn Gly
            100                 105                 110
Asp Gly Leu Thr Asn Asn Lys Ser Ile Asp Ile Thr Glu Glu Phe Leu
        115                 120                 125
Ser Lys Phe Arg Asn Ser Gly Gly Phe Asn Cys Ile Gly Thr Gly Arg
    130                 135                 140
Lys Lys Ile Val Thr Pro Glu Ala Lys Glu Ala Cys Leu Lys Thr Ala
145                 150                 155                 160
Glu Ala Leu Asp Leu Asp Gly Leu Val Ile Ile Gly Gly Asp Gly Ser
                165                 170                 175
Asn Thr Ala Thr Ala Ile Leu Ala Glu Tyr Phe Ala Lys Arg Arg Pro
            180                 185                 190
Lys Thr Ser Ile Val Gly Val Pro Lys Thr Ile Asp Gly Asp Leu Gln
        195                 200                 205
His Thr Phe Leu Asp Leu Thr Phe Gly Phe Asp Thr Ala Thr Lys Phe
    210                 215                 220
Tyr Ser Ser Ile Ile Ser Asn Ile Ser Arg Asp Ala Leu Ser Cys Lys
225                 230                 235                 240
Ala His Tyr His Phe Ile Lys Leu Met Gly Arg Ser Ala Ser His Ile
                245                 250                 255
Ala Leu Glu Cys Ala Leu Gln Thr His Pro Asn Ile Ala Leu Ile Gly
            260                 265                 270
Glu Glu Ile Ala Glu Lys Asn Leu Pro Leu Lys Thr Ile Ile His Lys
        275                 280                 285
Ile Cys Ser Val Ile Ala Asp Arg Ala Ala Met Glu Lys Tyr Tyr Gly
    290                 295                 300
Val Ile Leu Ile Pro Glu Gly Ile Ile Glu Phe Ile Pro Glu Ile Ile
305                 310                 315                 320
Asn Leu Ile Thr Glu Ile Glu Ser Leu Ser Glu Tyr Glu Asp Lys Ile
                325                 330                 335
Ser Arg Leu Ser Pro Glu Ser Gln Arg Leu Leu Lys Ser Phe Pro Ala
            340                 345                 350
Pro Ile Ile Glu Gln Ile Leu Asn Asp Arg Asp Ala His Gly Asn Val
        355                 360                 365
Tyr Val Ser Lys Ile Ser Val Asp Lys Leu Leu Ile His Leu Val Ser
    370                 375                 380
Asn His Leu Gln Gln Tyr Phe Pro Asn Val Pro Phe Asn Ala Ile Ser
385                 390                 395                 400
His Phe Leu Gly Tyr Glu Gly Arg Ser Gly Leu Pro Thr Lys Phe Asp
                405                 410                 415
Asn Thr Tyr Gly Tyr Ser Leu Gly Tyr Gly Ala Gly Ile Leu Val Arg
            420                 425                 430
Asn His Cys Asn Gly Tyr Leu Ser Thr Ile Glu Ser Leu Ala Cys Pro
        435                 440                 445
Phe Met Lys Trp Lys Leu Arg Ala Ile Pro Val Val Lys Met Phe Thr
    450                 455                 460
Val Lys Gln Gln Ala Asp Gly Thr Leu Gln Pro Lys Ile Lys Lys Tyr
465                 470                 475                 480
Leu Val Asp Ile Gly Ser Thr Ala Phe Arg Lys Phe Lys Leu Tyr Arg
                485                 490                 495
Lys Ile Trp Ala Leu Glu Asp Ser Tyr Arg Phe Leu Gly Pro Leu Gln
            500                 505                 510
Ile Glu Thr Pro Pro Glu Met His Ser Asp Asn Phe Pro Pro Leu Thr
        515                 520                 525
Leu Leu Leu Asn His Asn Phe Trp Gln Arg His Gln Gly Cys Ile Glu
    530                 535                 540
Ile Pro Asp Thr Thr Tyr
545                 550
 
<210>158
<211>528
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>158
 
Met Lys Met His Arg Leu Lys Pro Thr Leu Lys Ser Leu Ile Pro Asn
1               5                   10                  15
Leu Leu Phe Leu Leu Leu Thr Leu Ser Ser Cys Ser Lys Gln Lys Gln
            20                  25                  30
Glu Pro Leu Gly Lys His Leu Val Ile Ala Met Ser His Asp Leu Ala
        35                  40                  45
Asp Leu Asp Pro Arg Asn Ala Tyr Leu Ser Arg Asp Ala Ser Leu Ala
    50                  55                  60
Lys Ala Leu Tyr Glu Gly Leu Thr Arg Glu Thr Asp Gln Gly Ile Ala
65                  70                  75                  80
Leu Ala Leu Ala Glu Ser Tyr Thr Leu Ser Lys Asp His Lys Val Tyr
                85                  90                  95
Thr Phe Lys Leu Arg Pro Ser Val Trp Ser Asp Gly Thr Pro Leu Thr
            100                 105                 110
Ala Tyr Asp Phe Glu Lys Ser Ile Lys Gln Leu Tyr Phe Glu Glu Phe
        115                 120                 125
Ser Pro Ser Ile His Thr Leu Leu Gly Val Ile Lys Asn Ser Ser Ala
    130                 135                 140
Ile His Asn Ala Gln Lys Ser Leu Glu Thr Leu Gly Ile Gln Ala Lys
145                 150                 155                 160
Asp Asp Leu Thr Leu Val Ile Thr Leu Glu Gln Pro Phe Pro Tyr Phe
                165                 170                 175
Leu Thr Leu Ile Ala Arg Pro Val Phe Ser Pro Val His His Thr Leu
            180                 185                 190
Arg Glu Ser Tyr Lys Lys Gly Thr Pro Pro Ser Thr Tyr Ile Ser Asn
        195                 200                 205
Gly Pro Phe Val Leu Lys Lys His Glu His Gln Asn Tyr Leu Ile Leu
    210                 215                 220
Glu Lys Asn Pro His Tyr Tyr Asp His Glu Ser Val Lys Leu Asp Arg
225                 230                 235                 240
Val Thr Leu Lys Ile Ile Pro Asp Ala Ser Thr Ala Thr Lys Leu Phe
                245                 250                 255
Lys Ser Lys Ser Ile Asp Trp Ile Gly Ser Pro Trp Ser Ala Pro Ile
            260                 265                 270
Ser Asn Glu Asp Gln Lys Val Leu Ser Gln Glu Lys Ile Leu Thr Tyr
        275                 280                 285
Ser Val Ser Ser Thr Thr Leu Leu Ile Tyr Asn Leu Gln Lys Pro Leu
    290                 295                 300
Ile Gln Asn Lys Ala Leu Arg Lys Ala Ile Ala His Ala Ile Asp Arg
305                 310                 315                 320
Lys Ser Ile Leu Arg Leu Val Pro Ser Gly Gln Glu Ala Val Thr Leu
                325                 330                 335
Val Pro Pro Asn Leu Ser Gln Leu Asn Leu Gln Lys Glu Ile Ser Thr
            340                 345                 350
Glu Glu Arg Gln Thr Lys Ala Arg Ala Tyr Phe Gln Glu Ala Lys Glu
        355                 360                 365
Thr Leu Ser Glu Lys Glu Leu Ala Glu Leu Ser Ile Leu Tyr Pro Ile
    370                 375                 380
Asp Ser Ser Asn Ser Ser Ile Ile Ala Gln Glu Ile Gln Arg Gln Leu
385                 390                 395                 400
Lys Asp Thr Leu Gly Leu Lys Ile Lys Ile Gln Gly Met Glu Tyr His
                405                 410                 415
Cys Phe Leu Lys Lys Arg Arg Gln Gly Asp Phe Phe Ile Ala Thr Gly
            420                 425                 430
Gly Trp Ile Ala Glu Tyr Val Ser Pro Val Ala Phe Leu Ser Ile Leu
        435                 440                 445
Gly Asn Pro Arg Asp Leu Thr Gln Trp Arg Asn Ser Asp Tyr Glu Lys
    450                 455                 460
Thr Leu Glu Lys Leu Tyr Leu Pro His Ala Tyr Lys Glu Asn Leu Lys
465                 470                 475                 480
Arg Ala Glu Met Ile Ile Glu Glu Glu Thr Pro Ile Ile Pro Leu Tyr
                485                 490                 495
His Gly Lys Tyr Ile Tyr Ala Ile His Pro Lys Ile Gln Asn Thr Phe
            500                 505                 510
Gly Ser Leu Leu Gly His Thr Asp Leu Lys Asn Ile Asp Ile Leu Ser
        515                 520                 525
 
<210>159
<211>619
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>159
 
Met Glu Ser Glu Lys Asp Ile Gly Ala Lys Phe Leu Gly Asp Tyr Arg
1               5                   10                  15
Ile Leu Tyr Arg Lys Gly Gln Ser Leu Trp Ser Glu Asp Leu Leu Ala
            20                  25                  30
Glu His Arg Phe Ile Lys Lys Arg Tyr Leu Ile Arg Leu Leu Leu Pro
        35                  40                  45
Asp Leu Gly Ser Ser Gln Pro Phe Met Glu Ala Phe His Asp Val Val
    50                  55                  60
Val Lys Leu Ala Lys Leu Asn His Pro Gly Ile Leu Ser Ile Glu Asn
65                  70                  75                  80
Val Ser Glu Ser Glu Gly Arg Cys Phe Leu Val Thr Gln Glu Gln Asp
                85                  90                  95
Ile Pro Ile Leu Ser Leu Thr Gln Tyr Leu Lys Ser Ile Pro Arg Lys
            100                 105                 110
Leu Thr Glu Leu Glu Ile Val Asp Ile Val Ser Gln Leu Ala Ser Leu
        115                 120                 125
Leu Asp Tyr Val His Ser Glu Gly Leu Ala Gln Glu Glu Trp Asn Leu
    130                 135                 140
Asp Ser Val Tyr Ile His Ile Leu Asn Gly Val Pro Lys Val Ile Leu
145                 150                 155                 160
Pro Asp Leu Gly Phe Ala Ser Leu Ile Lys Glu Arg Ile Leu Asp Gly
                165                 170                 175
Phe Ile Ser Asp Glu Glu Asn Arg Glu Ser Lys Ile Lys Glu Arg Val
            180                 185                 190
Leu Leu His Thr Ser Glu Gly Lys Gln Gly Arg Glu Asp Thr Tyr Ala
        195                 200                 205
Phe Gly Ala Ile Thr Tyr Tyr Leu Leu Phe Gly Phe Leu Pro Gln Gly
    210                 215                 220
Ile Phe Pro Met Pro Ser Lys Val Phe Ser Asp Phe Ile Tyr Asp Trp
225                 230                 235                 240
Asp Phe Leu Ile Ser Ser Cys Leu Ser Cys Phe Met Glu Glu Arg Ala
                245                 250                 255
Lys Glu Leu Phe Pro Leu Ile Arg Lys Lys Thr Leu Gly Glu Glu Leu
            260                 265                 270
Gln Asn Val Val Thr Asn Cys Ile Glu Ser Ser Leu Arg Glu Val Pro
        275                 280                 285
Asp Pro Leu Glu Ser Ser Gln Asn Leu Pro Gln Ala Val Leu Lys Val
    290                 295                 300
Gly Glu Thr Lys Ala Ser His Gln Gln Lys Glu Ser Ala Glu His Leu
305                 310                 315                 320
Glu Phe Val Leu Val Glu Ala Cys Ser Ile Asp Glu Ala Met Asp Thr
                325                 330                 335
Ala Ile Glu Ser Glu Ser Ser Ser Gly Val Glu Glu Glu Gly Tyr Ser
            340                 345                 350
Leu Ala Leu Gln Ser Leu Leu Val Arg Glu Pro Val Val Ser Arg Tyr
        355                 360                 365
Val Glu Ala Glu Lys Glu Glu Pro Lys Pro Gln Pro Ile Leu Thr Glu
    370                 375                 380
Met Val Leu Ile Glu Gly Gly Glu Phe Ser Arg Gly Ser Val Glu Gly
385                 390                 395                 400
Gln Arg Asp Glu Leu Pro Val His Lys Val Ile Leu His Ser Phe Phe
                405                 410                 415
Leu Asp Val His Pro Val Thr Asn Glu Gln Phe Ile Arg Tyr Leu Glu
            420                 425                 430
Cys Cys Gly Ser Glu Gln Asp Lys Tyr Tyr Asn Glu Leu Ile Arg Leu
        435                 440                 445
Arg Asp Ser Arg Ile Gln Arg Arg Ser Gly Arg Leu Val Ile Glu Pro
    450                 455                 460
Gly Tyr Ala Lys His Pro Val Val Gly Val Thr Trp Tyr Gly Ala Ser
465                 470                 475                 480
Gly Tyr Ala Glu Trp Ile Gly Lys Arg Leu Pro Thr Glu Ala Glu Trp
                485                 490                 495
Glu Ile Ala Ala Ser Gly Gly Val Ala Ala Leu Arg Tyr Pro Cys Gly
            500                 505                 510
Glu Glu Ile Glu Lys Ser Arg Ala Asn Phe Phe Thr Ala Asp Thr Thr
        515                 520                 525
Thr Val Met Ser Tyr Pro Pro Asn Pro Tyr Gly Leu Tyr Asp Met Ala
    530                 535                 540
Gly Asn Val Tyr Glu Trp Cys Gln Asp Trp Tyr Gly Tyr Asp Phe Tyr
545                 550                 555                 560
Glu Ile Ser Ala Gln Glu Pro Glu Ser Pro Gln Gly Pro Ala Gln Gly
                565                 570                 575
Val Tyr Arg Val Leu Arg Gly Gly Cys Trp Lys Ser Leu Lys Asp Asp
            580                 585                 590
Leu Arg Cys Ala His Arg His Arg Asn Asn Pro Gly Ala Val Asn Ser
        595                 600                 605
Thr Tyr Gly Phe Arg Cys Ala Lys Asn Ile Asn
    610                 615
 
<210>160
<211>636
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>160
 
Met Lys Gln His Tyr Ser Leu Asn Lys Ser Arg His Ile Leu Arg Ser
1               5                   10                  15
Thr Tyr Lys Leu Leu Lys Ser Lys Lys Leu Ala His Ser Pro Ala Asp
            20                  25                  30
Lys Lys Gln Leu Gln Glu Leu Leu Glu Gln Leu Glu Glu Ala Ile Phe
        35                  40                  45
Glu His Asp Gln Glu Thr Ala Ser Asp Leu Ala Gln Gln Ala Leu Ala
    50                  55                  60
Phe Ser Asn Arg Tyr Pro Asn Ser Phe Gly Arg Lys Thr Tyr Glu Leu
65                  70                  75                  80
Ile Lys Ala Leu Leu Phe Ala Gly Val Val Ala Phe Leu Val Arg Gln
                85                  90                  95
Phe Trp Phe Glu Leu Tyr Glu Val Pro Thr Gly Ser Met Arg Pro Thr
            100                 105                 110
Ile Leu Glu Gln Asp Arg Ile Leu Val Ser Lys Thr Thr Phe Gly Leu
        115                 120                 125
His Cys Pro Phe Ala Lys Lys Pro Leu Ala Phe Asn Pro Glu Ser Val
    130                 135                 140
Thr Arg Gly Gly Leu Val Val Phe Thr Val Gly Asp Leu Pro Ile Pro
145                 150                 155                 160
Asp Ala Asp Thr Lys Tyr Phe Gly Leu Ile Pro Gly Lys Lys Arg Tyr
                165                 170                 175
Ile Lys Arg Cys Met Gly Arg Pro Gly Asp Phe Leu Tyr Phe Tyr Gly
            180                 185                 190
Gly Lys Ile Tyr Gly Leu Asp Asp Ala Gly Lys Arg Ile Glu Phe Pro
        195                 200                 205
Ser Val His Gly Leu Glu Asn Leu Tyr His Val Pro Tyr Ile Ser Phe
    210                 215                 220
Asp Gly Thr Thr Ser Ser His Thr Glu Gly Gln Lys Thr Ile Ile Asp
225                 230                 235                 240
Phe Lys Gln Phe Asn Gln Ser Tyr Gly Arg Leu Ile Phe Pro Gln Thr
                245                 250                 255
Ser Met Tyr Gly Gln Phe Phe Asp His Lys Glu Trp His Gln Asp Glu
            260                 265                 270
Pro Asn Lys Leu Lys Asp Pro His Leu Ser Pro Val Ser Tyr Ala Asp
        275                 280                 285
Leu Phe Gly Met Gly Asn Tyr Ala Met Val Arg Ile Leu Thr Glu His
    290                 295                 300
Gln Ala Arg Thr Ser His Leu Leu Pro Asn Pro Gly Ser Pro Thr Lys
305                 310                 315                 320
Val Tyr Leu Glu Ile Cys His Thr Ala Asn Leu Ser Tyr Pro Lys Pro
                325                 330                 335
Leu Leu Arg His Tyr Glu His Gln Leu Ser Pro Ala Ile Gln Pro Met
            340                 345                 350
Lys Thr Leu Leu Pro Leu Arg Lys Glu His Leu His Leu Ile Arg Asn
        355                 360                 365
Asn Leu Thr Thr Ser Arg Phe Ile Val Ala Gln Gly Cys Ala Tyr Lys
    370                 375                 380
Tyr His Gln Phe Lys Ile Asn Thr Ser Gly Ile Ala Lys Ala Tyr Ala
385                 390                 395                 400
Ile Leu Leu Pro Lys Val Pro Asp Gly Cys Tyr Glu Tyr Ser Lys Gly
                405                 410                 415
Glu Ala Tyr Gln Ile Gly Phe Gly Glu Ile Arg Tyr Lys Leu Lys Ser
            420                 425                 430
Ser His Pro Leu Thr Gln Leu Asn Asp Lys Gln Val Ile Glu Leu Phe
        435                 440                 445
Asn Cys Gly Ile Asn Phe Ser Ser Ile Tyr Asn Pro Val Asn Pro Leu
    450                 455                 460
Gln Ala Pro Leu Pro Asn Arg Tyr Ala Phe Phe Asn Gln Gly Asn Leu
465                 470                 475                 480
Tyr Ile Met Asp Ser Pro Val Phe Ile Lys Asn Asp Pro Thr Leu Gln
                485                 490                 495
Lys Phe Val Thr Ser Glu Thr Glu Lys Gln Glu Gly Ser Ser Glu Thr
            500                 505                 510
Gln Pro Tyr Ile Ala Phe Val Asp Lys Gly Leu Pro Pro Glu Asp Phe
        515                 520                 525
Lys Glu Phe Val Glu Phe Ile His Asn Phe Gly Ile Gln Val Pro Lys
    530                 535                 540
Gly His Val Leu Val Leu Gly Asp Asn Tyr Pro Met Ser Ala Asp Ser
545                 550                 555                 560
Arg Glu Phe Gly Phe Val Pro Met Glu Asn Leu Leu Gly Ser Pro Leu
                565                 570                 575
Cys Thr Phe Trp Pro Ile Gly Arg Met Gly Arg Leu Thr Gly Val Ser
            580                 585                 590
Ala Pro Thr Thr Leu Ser Gly Tyr Leu Val Ser Gly Ile Ala Leu Ala
        595                 600                 605
Thr Gly Leu Ser Leu Ile Gly Tyr Val Tyr Tyr Gln Lys Arg Arg Arg
    610                 615                 620
Leu Phe Pro Lys Lys Glu Glu Lys Asn His Lys Lys
625                 630                 635
 
<210>161
<211>1826
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>161
 
Met Lys Ser Leu Pro Val Tyr Val Ser Gly Ile Lys Val Arg Asn Leu
1               5                   10                  15
Lys Asn Val Ser Ile His Phe Asn Ser Glu Glu Ile Val Leu Leu Thr
            20                  25                  30
Gly Val Ser Gly Ser Gly Lys Ser Ser Ile Ala Phe Asp Thr Leu Tyr
        35                  40                  45
Ala Ala Gly Arg Lys Arg Tyr Ile Ser Thr Leu Pro Thr Phe Phe Ala
    50                  55                  60
Thr Thr Ile Thr Thr Leu Pro Asn Pro Lys Val Glu Glu Ile His Gly
65                  70                  75                  80
Leu Ser Pro Thr Ile Ala Ile Lys Gln Asn His Phe Ser His Tyr Ser
                85                  90                  95
His Ala Thr Val Gly Ser Thr Thr Glu Leu Phe Ser His Leu Ala Leu
            100                 105                 110
Leu Phe Thr Leu Glu Gly Gln Ala Arg Asp Pro Lys Thr Lys Glu Val
        115                 120                 125
Leu Asp Leu Tyr Ser Lys Glu Lys Val Leu Ser Thr Ile Met Glu Leu
    130                 135                 140
Ser Glu Gly Val Gln Ile Ser Ile Leu Ala Pro Leu Leu Arg Lys Asp
145                 150                 155                 160
Ile Ala Ala Ile His Glu Tyr Ala Gln Gln Gly Phe Thr Lys Val Arg
                165                 170                 175
Cys Asn Gly Thr Ile His Pro Ile Tyr Ser Phe Leu Thr Ser Gly Ile
            180                 185                 190
Pro Glu Asp Cys Ser Val Asp Ile Val Ile Asp Thr Leu Ile Lys Ser
        195                 200                 205
Glu Asn Asn Ile Ala Arg Leu Lys Val Ser Leu Phe Thr Ala Leu Glu
    210                 215                 220
Phe Gly Glu Gly His Cys Ser Val Leu Ser Asp Glu Glu Leu Met Thr
225                 230                 235                 240
Phe Ser Thr Lys Gln Gln Ile Asp Asp Val Thr Tyr Thr Pro Leu Thr
                245                 250                 255
Gln Gln Leu Phe Ser Pro His Ala Leu Glu Ser Arg Cys Ser Leu Cys
            260                 265                 270
Gln Gly Ser Gly Ile Phe Ile Ser Ile Asp Asn Pro Leu Leu Ile Asp
        275                 280                 285
Glu Asn Leu Ser Ile Lys Glu Asn Cys Cys Ser Phe Ala Gly Asn Cys
    290                 295                 300
Ser Ser Tyr Leu Tyr His Thr Ile Tyr Gln Ala Leu Ala Asp Ala Leu
305                 310                 315                 320
Asn Phe Asn Leu Glu Thr Pro Trp Lys Asp Leu Ser Pro Glu Ile Gln
                325                 330                 335
Asn Ile Phe Leu Arg Gly Lys Asn Asn Leu Val Leu Pro Val Arg Leu
            340                 345                 350
Phe Asp Gln Thr Leu Gly Lys Lys Asn Leu Thr Tyr Lys Val Trp Arg
        355                 360                 365
Gly Val Leu Asn Asp Ile Gly Asp Lys Val Arg Tyr Thr Thr Lys Pro
    370                 375                 380
Ser Arg Tyr Leu Ser Lys Gly Met Ser Ala His Ser Cys Ser Leu Cys
385                 390                 395                 400
Lys Gly Thr Gly Leu Gly Asp Tyr Ala Ser Val Ala Thr Trp Glu Gly
                405                 410                 415
Lys Thr Phe Thr Glu Phe Gln Gln Met Ser Leu Asn Asn Trp His Val
            420                 425                 430
Phe Phe Ser Lys Val Lys Ser Pro Ser Leu Ser Ile Gln Glu Ile Leu
        435                 440                 445
Gln Gly Leu Lys Gln Arg Leu Ser Phe Leu Ile Asp Leu Gly Leu Gly
    450                 455                 460
Tyr Leu Thr Pro Asn Arg Ala Leu Ala Thr Leu Ser Gly Gly Glu Gln
465                 470                 475                 480
Glu Arg Thr Ala Ile Ala Lys His Leu Gly Gly Glu Leu Phe Gly Ile
                485                 490                 495
Thr Tyr Ile Leu Asp Glu Pro Ser Ile Gly Leu His Pro Gln Asp Thr
            500                 505                 510
Glu Lys Leu Ile Gly Val Ile Lys Lys Leu Arg Asp Gln Gly Asn Thr
        515                 520                 525
Val Ile Leu Val Glu His Glu Glu Arg Met Ile Ser Leu Ala Asp Arg
    530                 535                 540
Ile Ile Asp Ile Gly Pro Gly Ala Gly Ile Phe Gly Gly Glu Val Leu
545                 550                 555                 560
Phe Asn Gly Lys Pro Glu Asp Phe Leu Met Asn Ser Ser Ser Leu Thr
                565                 570                 575
Ala Lys Tyr Leu Arg Gln Glu Leu Thr Ile Pro Ile Pro Glu Ser Arg
            580                 585                 590
Glu Ala Pro Thr Ser Trp Leu Leu Leu Thr Glu Ala Thr Ile His Asn
        595                 600                 605
Leu Lys Asn Leu Ser Ile Arg Leu Pro Leu Ala Arg Leu Ile Gly Val
    6l0                 615                 620
Thr Gly Val Ser Gly Ser Gly Lys Ser Ser Leu Ile Asn Asn Thr Leu
625                 630                 635                 640
Val Pro Ala Ile Glu Ser Phe Leu Lys Gln Glu Asn Pro Lys Asn Leu
                645                 650                 655
His Phe Glu Trp Gly Cys Ile Gly Arg Leu Ile His Ile Thr Arg Asp
            660                 665                 670
Leu Pro Gly Arg Ser Gln Arg Ser Ile Pro Leu Thr Tyr Ile Lys Ala
        675                 680                 685
Phe Asp Asp Ile Arg Glu Leu Phe Ala Ser Gln Pro Arg Ser Leu Arg
    690                 695                 700
Gln Gly Leu Thr Lys Ala His Phe Ser Phe Asn Gln Pro Gln Gly Ala
705                 710                 715                 720
Cys Ile Gln Cys Gln Gly Leu Gly Thr Met Thr Ile Ser Asp Asp Asp
                725                 730                 735
Thr Pro Ile Pro Cys Ser Glu Cys Gln Gly Lys Arg Tyr His Ser Glu
            740                 745                 750
Val Leu Glu Ile Leu Tyr Glu Gly Lys Asn Ile Ala Asp Ile Leu Asp
        755                 760                 765
Met Thr Ala Tyr Glu Ala Glu Lys Phe Phe Ile Ser His Pro Lys Ile
    770                 775                 780
His Glu Lys Ile His Ala Leu Cys Ser Leu Arg Leu Asp Tyr Leu Pro
785                 790                 795                 800
Leu Gly Arg Pro Leu Ser Thr Leu Ser Gly Gly Glu Ile Gln Arg Leu
                805                 810                 815
Lys Leu Ala His Glu Leu Leu Phe Ala Ser Pro Lys Gln Thr Leu Tyr
            820                 825                 830
Val Leu Asp Glu Pro Thr Thr Gly Leu His Thr His Asp Ile Gln Ala
        835                 840                 845
Leu Ile Glu Val Leu Leu Ser Leu Thr Tyr Leu Gly His Thr Val Leu
    850                 855                 860
Val Ile Glu His Asn Met His Val Val Lys Val Cys Asp Tyr Val Leu
865                 870                 875                 880
Glu Leu Gly Pro Glu Gly Gly Asp Leu Gly Gly Tyr Leu Leu Ala Ser
                885                 890                 895
Cys Thr Pro Lys Asp Leu Ile Gln Leu Asn Thr Pro Thr Ala Lys Ala
            900                 905                 910
Leu Ala Pro Tyr Ile Glu Gly Ser Leu Asp Ile Pro Val Val Lys Ser
        915                 920                 925
Glu Pro Pro Ser Ser Pro Lys Ser Cys Asp Ile Leu Ile Lys Asp Ala
    930                 935                 940
Tyr Gln Asn Asn Leu Lys His Ile Asp Leu Ala Leu Pro Arg Asn Ser
945                 950                 955                 960
Leu Ile Ala Ile Ala Gly Pro Gly Ala Ser Gly Lys His Ser Leu Val
                965                 970                 975
Phe Asp Ile Leu Tyr Ala Ser Gly Asn Ile Ala Tyr Ala Glu Leu Phe
            980                 985                 990
Pro Pro Tyr Ile Arg Gln Gly Leu Leu Lys Glu Thr Pro Leu Pro Ser
        995                 1000                1005
Val Gly Glu Val Lys Gly Leu Ser Pro Val Ile Ser Val Arg Lys
    1010                1015                1020
Cys Ser Ser Ser Asn Arg Ser Tyr His Thr Ile Ala Ser Ala Leu
    1025                1030                1035
Gly Leu Ser Asn Gly Leu Glu Lys Leu Phe Ala Ile Leu Gly Glu
    1040                1045                1050
Pro Phe Ser Pro Leu Thr Glu Glu Lys Leu Ser Lys Thr Thr Pro
    1055                1060                1065
Gln Thr Ile Ile Asp Ser Leu Leu Lys Ser Tyr Lys Asp Asp Tyr
    1070                1075                1080
Val Thr Ile Thr Ser Pro Ile Pro Leu Gly Ser Asp Leu Glu Ile
    1085                1090                1095
Phe Leu Gln Glu Lys Gln Lys Glu Gly Phe Ile Lys Leu Tyr Ser
    1100                1105                1110
Glu Gly Asn Leu Tyr Asp Leu Asp Glu Arg Leu Pro Leu Asn Leu
    1115                1120                1125
Ile Glu Pro Ala Ile Val Ile Gln His Thr Lys Val Ser Pro Lys
    1130                1135                1140
Asn Ser Ser Ser Leu Leu Ser Ala Ile Ser Val Ala Phe Ser Leu
    1145                1150                1155
Ser Ser Glu Ile Trp Ile Tyr Ile Ser Gln Lys Lys Gln Arg Lys
    1160                1165                1170
Leu Ser Tyr Ser Leu Gly Trp Lys Asp Lys Lys Gly Arg Leu Tyr
    1175                1180                1185
Pro Glu Ile Thr His Gln Leu Leu Ser Ser Asp His Pro Glu Gly
    1190                1195                1200
Arg Cys Leu Thr Cys Gly Gly Arg Gly Glu Ile Leu Lys Ile Ser
    1205                1210                1215
Leu Glu Glu His Lys Glu Lys Ile Ala His Tyr Thr Pro Leu Glu
    1220                1225                1230
Phe Phe Ser Leu Phe Phe Pro Lys Ser Tyr Met Lys Pro Val Gln
    1235                1240                1245
Lys Leu Leu Lys Asp Glu Asn Ala Ser Gln Pro Leu Lys Leu Leu
    1250                1255                1260
Thr Thr Lys Glu Phe Leu Asn Phe Cys Arg Gly Ser Ser Glu Phe
    1265                1270                1275
Pro Gly Met Asn Ala Leu Leu Met Glu Gln Leu Asp Thr Glu Ser
    1280                1285                1290
Asp Ser Pro Leu Ile Lys Pro Leu Leu Ala Leu Thr Ser Cys Pro
    1295                1300                1305
Ala Cys Lys Gly Ser Gly Leu Asn Asp Tyr Ala Asn Tyr Val Arg
    1310                1315                1320
Ile Asn Asn Thr Ser Leu Leu Asp Ile Tyr Gln Glu Asp Ala Thr
    1325                1330                1335
Phe Leu Glu Ser Phe Leu Asn Thr Ile Gly Thr Asp Asp Thr Arg
    1340                1345                1350
Ser Ile Ile Gln Asp Leu Met Asn Arg Leu Thr Phe Ile Ser Lys
    1355                1360                1365
Val Gly Leu Ser Tyr Ile Thr Leu Gly Gln Arg Gln Asp Thr Leu
    1370                1375                1380
Ser Asp Gly Glu Asn Tyr Arg Leu His Leu Ala Lys Lys Ile Ser
    1385                1390                1395
Ile Asn Leu Thr Asn Ile Val Tyr Leu Phe Glu Glu Pro Leu Ser
    1400                1405                1410
Gly Leu His Pro Gln Asp Leu Pro Thr Ile Val Gln Leu Leu Lys
    1415                1420                1425
Glu Leu Val Ala Asn Asn Asn Thr Val Ile Ala Thr Asp Arg Ser
    1430                1435                1440
Cys Ser Leu Ile Pro His Ala Asp His Ala Ile Phe Leu Gly Pro
    1445                1450                1455
Gly Ser Gly Pro Gln Gly Gly Phe Leu Met Asp Ser Asp Thr Glu
    1460                1465                1470
Val Cys Pro Ser Val Asp Leu His Ala Asn Val Pro Gln Thr Glu
    1475                1480                1485
Val Cys Pro Lys Ala Pro Leu Ser Ile Ser Lys Ala Asn His Thr
    1490                1495                1500
Arg Gly Ser Asp Arg Thr Leu Lys Val Asn Leu Ser Ile His His
    1505                1510                1515
Ile Gln Asn Leu Lys Val Ser Ala Pro Leu His Ala Leu Val Ala
    1520                1525                1530
Ile Gly Gly Val Ser Gly Ser Gly Lys Thr Ser Leu Leu Leu Glu
    1535                1540                1545
Gly Phe Lys Lys Gln Ala Glu Leu Leu Ile Ala Lys Gly Thr Thr
    1550                1555                1560
Thr Phe Ser Asp Leu Val Val Ile Asp Ser His Pro Ile Ala Ser
    1565                1570                1575
Ser Gln Arg Ser Asp Ile Ser Thr Tyr Phe Asp Ile Ala Pro Ser
    1580                1585                1590
Leu Arg Ala Phe Tyr Ala Ser Leu Thr Gln Ala Lys Ala Leu Asn
    1595                1600                1605
Ile Ser Ser Thr Met Phe Ser Thr Asn Thr Lys Gln Gly Gln Cys
    1610                1615                1620
Ser Asp Cys Gln Gly Leu Gly Tyr Gln Trp Ile Asp Arg Ala Phe
    1625                1630                1635
Tyr Ala Leu Glu Lys Arg Pro Cys Pro Thr Cys Ser Gly Phe Arg
    1640                1645                1650
Ile Gln Pro Leu Ala Gln Glu Val Leu Tyr Glu Gly Lys His Phe
    1655                1660                1665
Gly Glu Leu Leu His Thr Pro Ile Glu Thr Val Ala Leu Arg Phe
    1670                1675                1680
Pro Phe Ile Lys Lys Ile Gln Lys Pro Leu Lys Ala Leu Leu Asp
    1685                1690                1695
Ile Gly Leu Gly Tyr Leu Pro Ile Gly Gln Lys Leu Ser Ser Leu
    1700                1705                1710
Ser Val Ser Glu Lys Thr Ala Leu Lys Thr Ala Tyr Phe Leu Tyr
    1715                1720                1725
Gln Thr Pro Glu Thr Pro Thr Leu Phe Leu Ile Asp Glu Leu Phe
    1730                1735                1740
Ser Ser Leu Asp Pro Ile Lys Lys Gln His Leu Pro Glu Lys Leu
    1745                1750                1755
Arg Ser Leu Ile Asn Ser Gly His Ser Val Ile Tyr Ile Asp His
    1760                1765                1770
Asp Val Lys Leu Leu Lys Ser Ala Asp Tyr Leu Ile Glu Ile Gly
    1775                1780                1785
Pro Gly Ser Gly Lys Gln Gly Gly Lys Leu Leu Phe Ser Gly Ser
    1790                1795                1800
Pro Lys Asp Ile Tyr Ala Ser Lys Asp Ser Leu Leu Lys Lys Tyr
    1805                1810                1815
Ile Cys Asn Glu Glu Leu Asp Ser
    1820                1825
 
<210>162
<211>1262
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>162
 
Leu Ser His Gln Asn Ser Arg Arg Thr Arg Met Leu Lys Cys Pro Glu
1               5                   10                  15
Arg Val Ser Val Lys Lys Lys Glu Asp Ile Pro Asp Leu Pro Asn Leu
            20                  25                  30
Ile Glu Ile Gln Ile Lys Ser Tyr Lys Gln Phe Leu Gln Ile Gly Lys
        35                  40                  45
Leu Ala Glu Glu Arg Glu Asn Ile Gly Leu Glu Glu Val Phe Arg Glu
    50                  55                  60
Ile Phe Pro Ile Lys Ser Tyr Asn Glu Ala Thr Val Leu Glu Tyr Leu
65                  70                  75                  80
Ser Tyr Asn Leu Gly Val Pro Lys Tyr Ser Pro Glu Glu Cys Ile Arg
                85                  90                  95
Arg Gly Ile Thr Tyr Ser Val Thr Leu Lys Val Arg Phe Arg Leu Thr
            100                 105                 110
Asp Glu Thr Gly Ile Lys Glu Glu Glu Val Tyr Met Gly Thr Ile Pro
        115                 120                 125
Leu Met Thr Asp Lys Gly Thr Phe Ile Ile Asn Gly Ala Glu Arg Val
    130                 135                 140
Val Val Ser Gln Val His Arg Ser Pro Gly Ile Asn Phe Glu Gln Glu
145                 150                 155                 160
Lys His Ser Lys Gly Asn Ile Leu Phe Ser Phe Arg Ile Ile Pro Tyr
                165                 170                 175
Arg Gly Ser Trp Leu Glu Ala Ile Phe Asp Ile Asn Asp Leu Ile Tyr
            180                 185                 190
Ile His Ile Asp Arg Lys Lys Arg Arg Arg Lys Ile Leu Ala Ile Thr
        195                 200                 205
Phe Ile Arg Ala Leu Gly Tyr Ser Ser Asp Ala Asp Ile Ile Glu Glu
    210                 215                 220
Phe Phe Thr Ile Gly Glu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Lys Asp Phe Ala
225                 230                 235                 240
Leu Leu Val Gly Arg Ile Leu Ala Asp Asn Ile Ile Asp Glu Ala Ser
                245                 250                 255
Ser Leu Val Tyr Gly Lys Ala Gly Glu Lys Leu Ser Thr Ala Met Leu
            260                 265                 270
Lys Arg Met Leu Asp Ala Gly Ile Ala Ser Val Lys Ile Ala Val Asp
        275                 280                 285
Ala Asp Glu Asn His Pro Ile Ile Lys Met Leu Ala Lys Asp Pro Thr
    290                 295                 300
Asp Ser Tyr Glu Ala Ala Leu Lys Asp Phe Tyr Arg Arg Leu Arg Pro
305                 310                 315                 320
Gly Glu Pro Ala Thr Leu Ala Asn Ala Arg Ser Thr Ile Met Arg Leu
                325                 330                 335
Phe Phe Asp Pro Lys Arg Tyr Asn Leu Gly Arg Val Gly Arg Tyr Lys
            340                 345                 350
Leu Asn Arg Lys Leu Gly Phe Ser Ile Asp Asp Glu Ala Leu Ser Gln
        355                 360                 365
Val Thr Leu Arg Lys Glu Asp Val Ile Gly Ala Leu Lys Tyr Leu Ile
    370                 375                 380
Arg Leu Lys Met Gly Asp Glu Lys Ala Cys Val Asp Asp Ile Asp His
385                 390                 395                 400
Leu Ala Asn Arg Arg Val Arg Ser Val Gly Glu Leu Ile Gln Asn Gln
                405                 410                 415
Cys Arg Ser Gly Leu Ala Arg Met Glu Lys Ile Val Arg Glu Arg Met
            420                 425                 430
Asn Leu Phe Asp Phe Ser Ser Asp Thr Leu Thr Pro Gly Lys Val Val
        435                 440                 445
Ser Ala Lys Gly Leu Ala Ser Val Leu Lys Asp Phe Phe Gly Arg Ser
    450                 455                 460
Gln Leu Ser Gln Phe Met Asp Gln Thr Asn Pro Val Ala Glu Leu Thr
465                 470                 475                 480
His Lys Arg Arg Leu Ser Ala Leu Gly Pro Gly Gly Leu Asn Arg Glu
                485                 490                 495
Arg Ala Gly Phe Glu Val Arg Asp Val His Ala Ser His Tyr Gly Arg
            500                 505                 510
Ile Cys Pro Ile Glu Thr Pro Glu Gly Pro Asn Ile Gly Leu Ile Thr
        515                 520                 525
Ser Leu Ser Ser Phe Ala Lys Ile Asn Glu Phe Gly Phe Ile Glu Thr
    530                 535                 540
Pro Tyr Arg Ile Val Arg Asp Gly Ile Val Thr Asp Glu Ile Glu Tyr
545                 550                 555                 560
Met Thr Ala Asp Val Glu Glu Glu Cys Val Ile Ala Gln Ala Ser Ala
                565                 570                 575
Ser Leu Asp Glu Tyr Asn Met Phe Thr Glu Pro Val Cys Trp Val Arg
            580                 585                 590
Tyr Ala Gly Glu Ala Phe Glu Ala Asp Thr Ser Thr Val Thr His Met
        595                 600                 605
Asp Val Ser Pro Lys Gln Leu Val Ser Ile Val Thr Gly Leu Ile Pro
    610                 615                 620
Phe Leu Glu His Asp Asp Ala Asn Arg Ala Leu Met Gly Ser Asn Met
625                 630                 635                 640
Gln Arg Gln Ala Val Pro Leu Leu Lys Thr Glu Ala Pro Val Val Gly
                645                 650                 655
Thr Gly Leu Glu Cys Arg Ala Ala Lys Asp Ser Gly Ala Ile Val Val
            660                 665                 670
Ala Glu Glu Asp Gly Val Val Asp Phe Val Asp Gly Tyr Lys Val Val
        675                 680                 685
Val Ala Ala Lys His Asn Pro Thr Ile Lys Arg Thr Tyr His Leu Lys
    690                 695                 700
Lys Phe Leu Arg Ser Asn Ser Gly Thr Cys Ile Asn Gln Gln Pro Leu
705                 710                 715                 720
Cys Ala Val Gly Asp Val Ile Thr Lys Gly Asp Val Ile Ala Asp Gly
                725                 730                 735
Pro Ala Thr Asp Arg Gly Glu Leu Ala Leu Gly Lys Asn Val Leu Val
            740                 745                 750
Ala Phe Met Pro Trp Tyr Gly Tyr Asn Phe Glu Asp Ala Ile Ile Ile
        755                 760                 765
Ser Glu Lys Leu Ile Arg Glu Asp Ala Tyr Thr Ser Ile Tyr Ile Glu
    770                 775                 780
Glu Phe Glu Leu Thr Ala Arg Asp Thr Lys Leu Gly Lys Glu Glu Ile
785                 790                 795                 800
Thr Arg Asp Ile Pro Asn Val Ser Asp Glu Val Leu Ala Asn Leu Gly
                805                 810                 815
Glu Asp Gly Ile Ile Arg Ile Gly Ala Glu Val Lys Pro Gly Asp Ile
            820                 825                 830
Leu Val Gly Lys Ile Thr Pro Lys Ser Glu Thr Glu Leu Ala Pro Glu
        835                 840                 845
Glu Arg Leu Leu Arg Ala Ile Phe Gly Glu Lys Ala Ala Asp Val Lys
    850                 855                 860
Asp Ala Ser Leu Thr Val Pro Pro Gly Thr Glu Gly Val Val Met Asp
865                 870                 875                 880
Val Lys Val Phe Ser Arg Lys Asp Arg Leu Ser Lys Ser Asp Asp Glu
                885                 890                 895
Leu Val Glu Glu Ala Val His Leu Lys Asp Leu Gln Lys Gly Tyr Lys
            900                 905                 910
Asn Gln Val Ala Thr Leu Lys Thr Glu Tyr Arg Glu Lys Leu Gly Ala
        915                 920                 925
Leu Leu Leu Asn Glu Lys Ala Pro Ala Ala Ile Ile His Arg Arg Thr
    930                 935                 940
Ala Glu Ile Val Val His Glu Gly Leu Leu Phe Asp Gln Glu Thr Ile
945                 950                 955                 960
Glu Arg Ile Glu Gln Glu Asp Leu Val Asp Leu Leu Met Pro Asn Cys
                965                 970                975
Glu Met Tyr Glu Val Leu Lys Gly Leu Leu Ser Asp Tyr Glu Thr Ala
            980                 985                 990
Leu Gln Arg Leu Glu Ile Asn Tyr Lys Thr Glu Val Glu His Ile Arg
        995                 1000                1005
Glu Gly Asp Ala Asp Leu Asp His Gly Val Ile Arg Gln Val Lys
    1010                1015                1020
Val Tyr Val Ala Ser Lys Arg Lys Leu Gln Val Gly Asp Lys Met
    1025                1030                1035
Ala Gly Arg His Gly Asn Lys Gly Val Val Ser Lys Ile Val Pro
    1040                1045                1050
Glu Ala Asp Met Pro Tyr Leu Ser Asn Gly Glu Thr Val Gln Met
    1055                1060                1065
Ile Leu Asn Pro Leu Gly Val Pro Ser Arg Met Asn Leu Gly Gln
    1070                1075                1080
Val Leu Glu Thr His Leu Gly Tyr Ala Ala Lys Thr Ala Gly Ile
    1085                1090                1095
Tyr Val Lys Thr Pro Val Phe Glu Gly Phe Pro Glu Gln Arg Ile
    1100                1105                1110
Trp Asp Met Met Ile Glu Gln Gly Leu Pro Glu Asp Gly Lys Ser
    1115                1120                1125
Phe Leu Tyr Asp Gly Lys Thr Gly Glu Arg Phe Asp Asn Lys Val
    1130                1135                1140
Val Ile Gly Tyr Ile Tyr Met Leu Lys Leu Ser His Leu Ile Ala
    1145                1150                1155
Asp Lys Ile His Ala Arg Ser Ile Gly Pro Tyr Ser Leu Val Thr
    1160                1165                1170
Gln Gln Pro Leu Gly Gly Lys Ala Gln Met Gly Gly Gln Arg Phe
    1175                1180                1185
Gly Glu Met Glu Val Trp Ala Leu Glu Ala Tyr Gly Val Ala His
    1190                1195                1200
Met Leu Gln Glu Ile Leu Thr Val Lys Ser Asp Asp Val Ser Gly
    1205                1210                1215
Arg Thr Arg Ile Tyr Glu Ser Ile Val Lys Gly Glu Asn Leu Leu
    1220                1225                1230
Arg Ser Gly Thr Pro Glu Ser Phe Asn Val Leu Ile Lys Glu Met
    1235                1240                1245
Gln Gly Leu Gly Leu Asp Val Arg Pro Met Val Val  Asp Ala
    1250                1255                1260
 
<210>163
<211>598
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>163
 
Met Lys Glu Val Glu Gln Arg Ile Arg Ser Leu Tyr Asp Ala Val Thr
1               5                   10                  15
Ala Glu Asn Ile Cys Arg Trp Leu Ser Asn Asp Cys Thr Gln Gln Asp
            20                  25                  30
Ala Lys Thr Ile Leu Gly Trp Leu Asp Thr Asp Pro Ala Gln Leu Glu
        35                  40                  45
Asp Leu Phe Gly Ala Thr Leu Thr Phe Gly Thr Gly Gly Leu Arg Ser
    50                  55                  60
Leu Met Gly Ile Gly Thr Asn Arg Ile Asn Leu Phe Thr Ile Arg Arg
65                  70                  75                  80
Thr Thr Gln Gly Leu Val Gln Val Leu Arg Ala His Leu Pro His Pro
                85                  90                  95
Gly Asp Pro Met Arg Val Val Val Gly Cys Asp Thr Arg His Asn Ser
            100                 105                 110
Ile Glu Phe Ala Gln Glu Thr Ala Lys Val Leu Ala Gly Asn Gly Cys
        115                 120                 125
Glu Val Phe Leu Phe Gln Tyr Pro Glu Pro Leu Ala Leu Val Ser Phe
    130                 135                 140
Thr Val Arg Tyr Glu Arg Ala Ile Gly Gly Val Met Ile Thr Ala Ser
145                 150                 155                 160
His Asn Pro Pro Asn Tyr Asn Gly Tyr Lys Val Tyr Met Ala Ser Gly
                165                 170                 175
Gly Gln Val Leu Pro Pro Leu Asp Gln Glu Ile Val Ala Ala Cys Ser
            180                 185                 190
Ala Val Asn Glu Ile Leu Ser Val Pro Ser Ile Asp His Pro Asn Ile
        195                 200                 205
His Leu Ile Gly Lys Glu Tyr Glu Ala Leu Tyr Arg Asp Thr Leu Lys
    210                 215                 220
Gln Leu Gln Leu Tyr Pro Glu Ala Asn Arg Ile Ser Gly Arg Ser Leu
225                 230                 235                 240
Ser Ile Ser Tyr Ser Pro Leu His Gly Thr Gly Ile Ser Leu Val Pro
                245                 250                 255
His Val Leu Lys Asp Trp Gly Phe Leu Ser Val His Leu Val Glu Lys
            260                 265                 270
Gln Ala Ile Gly Asp Gly Asp Phe Pro Thr Val Gln Leu Pro Asn Pro
        275                 280                 285
Glu Asp Pro Glu Ala Leu Thr Leu Gly Thr Glu Gln Met Leu Ala Asn
    290                 295                 300
Asp Asp Asp Leu Phe Ile Ala Thr Asp Pro Asp Ala Asp Arg Val Gly
305                 310                 315                 320
Val Val Cys Leu Glu Asp Gly Gln Pro Tyr Arg Phe Asn Gly Asn Gln
                325                 330                 335
Met Ala Ser Leu Leu Ala Asp His Ile Leu Gly Ala Trp Ser Lys Thr
            340                 345                 350
Arg His Leu Gly Glu His Asp Lys Leu Val Lys Ser Leu Val Thr Thr
        355                 360                 365
Glu Met Leu Ser Ala Ile Ala Lys His Tyr His Val Asp Leu Ile Asn
    370                 375                 380
Val Gly Thr Gly Phe Lys Tyr Ile Gly Glu Lys Ile Glu Ser Trp Arg
385                 390                 395                 400
Asn Ser Thr Asn Lys Phe Val Phe Gly Ala Glu Glu Ser Tyr Gly Cys
                405                 410                 415
Leu Tyr Gly Thr His Val Glu Asp Lys Asp Ala Ile Ile Ala Ser Ala
            420                 425                 430
Leu Ile Ala Glu Ala Ala Leu Gln Gln Lys Leu Gln Gly Lys Thr Leu
        435                 440                 445
Cys Asp Ala Leu Leu Ser Leu Tyr Glu Thr Tyr Gly Tyr Phe Ala Asn
    450                 455                 460
Lys Thr Glu Ser Val Val Phe Ser Ala Lys Thr Asp Glu Gln Glu Ile
465                 470                 475                 480
Arg Lys Lys Leu Ser His Leu Glu Glu Ile Ser Ser Ala Asn Phe Phe
                485                 490                 495
Ser Gly Lys Tyr Gln Val Glu Lys Phe Glu Asn Tyr Lys Gln Gly Ile
            500                 505                 510
Gly Phe Asn Leu Leu Ser Lys Asp Ser Tyr Ala Leu Thr Leu Pro Lys
        515                 520                 525
Thr Ser Met Leu Cys Tyr Tyr Phe Ser Gly Gly Gly Arg Val Ile Ile
    530                 535                 540
Arg Pro Ser Gly Thr Glu Pro Lys Ile Lys Phe Tyr Phe Glu Met Ser
545                 550                 555                 560
Thr His Tyr Pro Glu Arg Val Thr Asp Lys Glu Ile Gln Lys Gln Arg
                565                 570                 575
Glu Ala Glu Ser Phe Gln His Leu Asp Asp Phe Ile Phe Asp Phe Lys
            580                 585                 590
Glu Lys Phe Ser Asn Leu
        595
 
<210>164
<211>841
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>164
 
Met Lys Ile Pro Leu Arg Phe Leu Leu Ile Ser Leu Val Pro Thr Leu
1               5                   10                  15
Ser Met Ser Asn Leu Leu Gly Ala Ala Thr Thr Glu Glu Leu Ser Ala
            20                  25                  30
Ser Asn Ser Phe Asp Gly Thr Thr Ser Thr Thr Ser Phe Ser Ser Lys
        35                  40                  45
Thr Ser Ser Ala Thr Asp Gly Thr Asn Tyr Val Phe Lys Asp Ser Val
    50                  55                  60
Val Ile Glu Asn Val Pro Lys Thr Gly Glu Thr Gln Ser Thr Ser Cys
65                  70                  75                  80
Phe Lys Asn Asp Ala Ala Ala Gly Asp Leu Asn Phe Leu Gly Gly Gly
                85                  90                  95
Phe Ser Phe Thr Phe Ser Asn Ile Asp Ala Thr Thr Ala Ser Gly Ala
            100                 105                 110
Ala Ile Gly Ser Glu Ala Ala Asn Lys Thr Val Thr Leu Ser Gly Phe
        115                 120                 125
Ser Ala Leu Ser Phe Leu Lys Ser Pro Ala Ser Thr Val Thr Asn Gly
    130                 135                 140
Leu Gly Ala Ile Asn Val Lys Gly Asn Leu Ser Leu Leu Asp Asn Asp
145                 150                 155                 160
Lys Val Leu Ile Gln Asp Asn Phe Ser Thr Gly Asp Gly Gly Ala Ile
                165                 170                 175
Asn Cys Ala Gly Ser Leu Lys Ile Ala Asn Asn Lys Ser Leu Ser Phe
            180                 185                 190
Ile Gly Asn Ser Ser Ser Thr Arg Gly Gly Ala Ile His Thr Lys Asn
        195                 200                 205
Leu Thr Leu Ser Ser Gly Gly Glu Thr Leu Phe Gln Gly Asn Thr Ala
    210                 215                 220
Pro Thr Ala Ala Gly Lys Gly Gly Ala Ile Ala Ile Ala Asp Ser Gly
225                 230                 235                 240
Thr Leu Ser Ile Ser Gly Asp Ser Gly Asp Ile Ile Phe Glu Gly Asn
                245                 250                 255
Thr Ile Gly Ala Thr Gly Thr Val Ser His Ser Ala Ile Asp Leu Gly
            260                 265                 270
Thr Ser Ala Lys Ile Thr Ala Leu Arg Ala Ala Gln Gly His Thr Ile
        275                 280                 285
Tyr Phe Tyr Asp Pro Ile Thr Val Thr Gly Ser Thr Ser Val Ala Asp
    290                 295                 300
Ala Leu Asn Ile Asn Ser Pro Asp Thr Gly Asp Asn Lys Glu Tyr Thr
305                 310                 315                 320
Gly Thr Ile Val Phe Ser Gly Glu Lys Leu Thr Glu Ala Glu Ala Lys
                325                 330                 335
Asp Glu Lys Asn Arg Thr Ser Lys Leu Leu Gln Asn Val Ala Phe Lys
            340                 345                 350
Asn Gly Thr Val Val Leu Lys Gly Asp Val Val Leu Ser Ala Asn Gly
        355                 360                 365
Phe Ser Gln Asp Ala Asn Ser Lys Leu Ile Met Asp Leu Gly Thr Ser
    370                 375                 380
Leu Val Ala Asn Thr Glu Ser Ile Glu Leu Thr Asn Leu Glu Ile Asn
385                 390                 395                 400
Ile Asp Ser Leu Arg Asn Gly Lys Lys Ile Lys Leu Ser Ala Ala Thr
                405                 410                 415
Ala Gln Lys Asp Ile Arg Ile Asp Arg Pro Val Val Leu Ala Ile Ser
            420                 425                 430
Asp Glu Ser Phe Tyr Gln Asn Gly Phe Leu Asn Glu Asp His Ser Tyr
        435                 440                 445
Asp Gly Ile Leu Glu Leu Asp Ala Gly Lys Asp Ile Val Ile Ser Ala
    450                 455                 460
Asp Ser Arg Ser Ile Asp Ala Val Gln Ser Pro Tyr Gly Tyr Gln Gly
465                 470                 475                 480
Lys Trp Thr Ile Asn Trp Ser Thr Asp Asp Lys Lys Ala Thr Val Ser
                485                 490                 495
Trp Ala Lys Gln Ser Phe Asn Pro Thr Ala Glu Gln Glu Ala Pro Leu
            500                 505                 510
Val Pro Asn Leu Leu Trp Gly Ser Phe Ile Asp Val Arg Ser Phe Gln
        515                 520                 525
Asn Phe Ile Glu Leu Gly Thr Glu Gly Ala Pro Tyr Glu Lys Arg Phe
    530                 535                 540
Trp Val Ala Gly Ile Ser Asn Val Leu His Arg Ser Gly Arg Glu Asn
545                 550                 555                 560
Gln Arg Lys Phe Arg His Val Ser Gly Gly Ala Val Val Gly Ala Ser
                565                 570                 575
Thr Arg Met Pro Gly Gly Asp Thr Leu Ser Leu Gly Phe Ala Gln Leu
            580                 585                 590
Phe Ala Arg Asp Lys Asp Tyr Phe Met Asn Thr Asn Phe Ala Lys Thr
        595                 600                 605
Tyr Ala Gly Ser Leu Arg Leu Gln His Asp Ala Ser Leu Tyr Ser Val
    610                 615                 620
Val Ser Ile Leu Leu Gly Glu Gly Gly Leu Arg Glu Ile Leu Leu Pro
625                 630                 635                 640
Tyr Val Ser Lys Thr Leu Pro Cys Ser Phe Tyr Gly Gln Leu Ser Tyr
                645                 650                 655
Gly His Thr Asp His Arg Met Lys Thr Glu Ser Leu Pro Pro Pro Pro
            660                 665                 670
Pro Thr Leu Ser Thr Asp His Thr Ser Trp Gly Gly Tyr Val Trp Ala
        675                 680                 685
Gly Glu Leu Gly Thr Arg Val Ala Val Glu Asn Thr Ser Gly Arg Gly
    690                 695                 700
Phe Phe Gln Glu Tyr Thr Pro Phe Val Lys Val Gln Ala Val Tyr Ala
705                 710                 715                 720
Arg Gln Asp Ser Phe Val Glu Leu Gly Ala Ile Ser Arg Asp Phe Ser
                725                 730                 735
Asp Ser His Leu Tyr Asn Leu Ala Ile Pro Leu Gly Ile Lys Leu Glu
            740                 745                 750
Lys Arg Phe Ala Glu Gln Tyr Tyr His Val Val Ala Met Tyr Ser Pro
        755                 760                 765
Asp Val Cys Arg Ser Asn Pro Lys Cys Thr Thr Thr Leu Leu Ser Asn
    770                 775                 780
Gln Gly Ser Trp Lys Thr Lys Gly Ser Asn Leu Ala Arg Gln Ala Gly
785                 790                 795                 800
Ile Val Gln Ala Ser Gly Phe Arg Ser Leu Gly Ala Ala Ala Glu Leu
                805                 810                 815
Phe Gly Asn Phe Gly Phe Glu Trp Arg Gly Ser Ser Arg Ser Tyr Asn
            820                 825                 830
Val Asp Ala Gly Ser Lys Ile Lys Phe
        835                 840
<210>165
<211>644
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>165
 
Met Thr Ser Ser Ser Cys Pro Leu Leu Asp Leu Ile Leu Ser Pro Ala
1               5                   10                  15
Asp Leu Lys Lys Leu Ser Ile Ser Gln Leu Pro Gly Leu Ala Glu Glu
            20                  25                  30
Ile Arg Tyr Arg Ile Ile Ser Val Leu Ser Gln Thr Gly Gly Hi s Leu
        35                  40                  45
Ser Ser Asn Leu Gly Ile Val Glu Leu Thr Ile Ala Leu His Tyr Val
    50                  55                  60
Phe Ser Ser Pro Lys Asp Lys Phe Ile Phe Asp Val Gly His Gln Thr
65                  70                  75                  80
Tyr Pro His Lys Leu Leu Thr Gly Arg Asn Asn Glu Gly Phe Asp His
                85                  90                  95
Ile Arg Asn Asp Asn Gly Leu Ser Gly Phe Thr Asn Pro Thr Glu Ser
            100                 105                 110
Asp His Asp Leu Phe Phe Ser Gly His Ala Gly Thr Ala Leu Ser Leu
        115                 120                 125
Ala Leu Gly Met Ala Gln Thr Thr Pro Leu Glu Ser Arg Thr His Val
    130                 135                 140
Ile Pro Ile Leu Gly Asp Ala Ala Phe Ser Cys Gly Leu Thr Leu Glu
145                 150                 155                 160
Ala Leu Asn Asn Ile Ser Thr Asp Leu Ser Lys Phe Val Val Ile Leu
                165                 170                 175
Asn Asp Asn Asn Met Ser Ile Ser Lys Asn Val Gly Ala Met Ser Arg
            180                 185                 190
Ile Phe Ser Arg Trp Leu His His Pro Ala Thr Asn Lys Leu Thr Lys
        195                 200                 205
Gln Val Glu Lys Trp Leu Ala Lys Ile Pro Arg Tyr Gly Asp Ser Leu
    210                 215                 220
Ala Lys His Ser Arg Arg Leu Ser Gln Cys Val Lys Asn Leu Phe Cys
225                 230                 235                 240
Pro Thr Pro Leu Phe Glu Gln Phe Gly Leu Ala Tyr Val Gly Pro Ile
                245                 250                 255
Asp Gly His Asn Val Lys Lys Leu Ile Pro Ile Leu Gln Ser Val Arg
            260                 265                 270
Asn Leu Pro Phe Pro Ile Leu Val His Val Cys Thr Thr Lys Gly Lys
        275                 280                 285
Gly Leu Asp Gln Ala Gln Asn Asn Pro Ala Lys Tyr His Gly Val Arg
    290                 295                 300
Ala Asn Phe Asn Lys Arg Glu Ser Ala Lys His Leu Pro Ala Ile Lys
305                 310                 315                 320
Pro Lys Pro Ser Phe Pro Asp Ile Phe Gly Gln Thr Leu Cys Glu Leu
                325                 330                 335
Gly Glu Val Ser Ser Arg Leu His Val Val Thr Pro Ala Met Ser Ile
            340                 345                 350
Gly Ser Arg Leu Glu Gly Phe Lys Gln Lys Phe Pro Glu Arg Phe Phe
        355                 360                 365
Asp Val Gly Ile Ala Glu Gly His Ala Val Thr Phe Ser Ala Gly Ile
    370                 375                 380
Ala Lys Ala Gly Asn Pro Val Ile Cys Ser Ile Tyr Ser Thr Phe Leu
385                 390                 395                 400
His Arg Ala Leu Asp Asn Val Phe His Asp Val Cys Met Gln Asp Leu
                405                 410                 415
Pro Val Ile Phe Ala Ile Asp Arg Ala Gly Leu Ala Tyr Gly Asp Gly
            420                 425                 430
Arg Ser His His Gly Ile Tyr Asp Met Ser Phe Leu Arg Ala Met Pro
        435                 440                 445
Gln Met Ile Ile Cys Gln Pro Arg Ser Gln Val Val Phe Gln Gln Leu
    450                 455                 460
Leu Tyr Ser Ser Leu His Trp Ser Ser Pro Ser Ala Ile Arg Tyr Pro
465                 470                 475                 480
Asn Ile Pro Ala Pro His Gly Asp Pro Leu Thr Gly Asp Pro Asn Phe
                485                 490                 495
Leu Arg Ser Pro Gly Asn Ala Glu Thr Leu Ser Gln Gly Glu Asp Val
            500                 505                 510
Leu Ile Ile Ala Leu Gly Thr Leu Cys Phe Thr Ala Leu Ser Ile Lys
        515                 520                 525
His Gln Leu Leu Ala Tyr Gly Ile Ser Ala Thr Val Val Asp Pro Ile
    530                 535                 540
Phe Ile Lys Pro Phe Asp Asn Asp Leu Phe Ser Leu Leu Leu Met Ser
545                 550                 555                 560
His Ser Lys Val Ile Thr Ile Glu Glu His Ser Ile Arg Gly Gly Leu
                565                 570                 575
Ala Ser Glu Phe Asn Asn Phe Val Ala Thr Phe Asn Phe Lys Val Asp
            580                 585                 590
Ile Leu Asn Phe Ala Ile Pro Asp Thr Phe Leu Ser His Gly Ser Lys
        595                 600                 605
Glu Ala Leu Thr Lys Ser Ile Gly Leu Asp Glu Ser Ser Met Thr Asn
    610                 615                 620
Arg Ile Leu Thr His Phe Asn Phe Arg Ser Lys Lys Gln Thr Val Gly
625                 630                 635                 640
Asp Val Arg Val
 
<210>166
<211>359
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>166
 
Met Lys Asn Ser Phe Gly Ser Leu Phe Ser Phe Thr Thr Trp Gly Glu
1               5                   10                  15
Ser His Gly Pro Ser Ile Gly Val Val Ile Asp Gly Cys Pro Ala Gly
            20                  25                  30
Leu Glu Leu His Glu Ser Asp Phe Val Pro Ala Met Lys Arg Arg Arg
        35                  40                  45
Pro Gly Asn Pro Gly Thr Ser Ser Arg Lys Glu Asn Asp Ile Val Gln
    50                  55                  60
Ile Leu Ser Gly Val Tyr Lys Gly Lys Thr Thr Gly Thr Pro Leu Ser
65                  70                  75                  80
Leu Gln Ile Leu Asn Thr Asp Val Asp Ser Ser Pro Tyr Glu Asn Ser
                85                  90                  95
Glu Arg Leu Tyr Arg Pro Gly His Ser Gln Tyr Thr Tyr Glu Lys Lys
            100                 105                 110
Phe Gly Ile Val Asp Pro Asn Gly Gly Gly Arg Ser Ser Ala Arg Glu
        115                 120                 125
Thr Ala Cys Arg Val Ala Ala Gly Val Val Ala Glu Lys Phe Leu Ala
    130                 135                 140
Asn Gln Asn Ile Phe Thr Leu Ala Tyr Leu Ser Ser Leu Gly Ser Leu
145                 150                 155                 160
Thr Leu Pro His Tyr Leu Lys Ile Ser Pro Glu Leu Ile His Lys Ile
                165                 170                 175
His Thr Ser Pro Phe Tyr Ser Pro Leu Pro Asn Glu Lys Ile Gln Glu
            180                 185                 190
Ile Leu Thr Ser Leu His Asp Asp Ser Asp Ser Leu Gly Gly Val Ile
        195                 200                 205
Ser Phe Ile Thr Ser Pro Ile His Asp Phe Leu Gly Glu Pro Leu Phe
    210                 215                 220
Gly Lys Val His Ala Leu Leu Ala Ser Ala Leu Met Ser Ile Pro Ala
225                 230                 235                 240
Ala Lys Gly Phe Glu Ile Gly Lys Gly Phe Ala Ser Ala Gln Met Arg
                245                 250                 255
Gly Ser Gln Tyr Thr Asp Pro Phe Val Met Glu Gly Glu Asn Ile Thr
            260                 265                 270
Leu Lys Ser Asn Asn Cys Gly Gly Thr Leu Gly Gly Ile Thr Ile Gly
        275                 280                 285
Val Pro Ile Glu Gly Arg Ile Ala Phe Lys Pro Thr Ser Ser Ile Lys
    290                 295                 300
Arg Pro Cys Ala Thr Val Thr Lys Thr Lys Lys Glu Thr Thr Tyr Arg
305                 310                 315                 320
Thr Pro Gln Thr Gly Arg His Asp Pro Cys Val Ala Ile Arg Ala Val
                325                 330                 335
Pro Val Val Glu Ala Met Ile Asn Leu Val Leu Ala Asp Leu Val Leu
            340                 345                 350
Tyr Gln Arg Cys Ser Lys Leu
        355
 
<210>167
<211>619
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>167
 
Met Lys Lys Gly Lys Leu Gly Ala Ile Val Phe Gly Leu Leu Phe Thr
1               5                   10                  15
Ser Ser Val Ala Gly Phe Ser Lys Asp Leu Thr Lys Asp Asn Ala Tyr
            20                  25                  30
Gln Asp Leu Asn Val Ile Glu His Leu Ile Ser Leu Lys Tyr Ala Pro
        35                  40                  45
Leu Pro Trp Lys Glu Leu Leu Phe Gly Trp Asp Leu Ser Gln Gln Thr
    50                  55                  60
Gln Gln Ala Arg Leu Gln Leu Val Leu Glu Glu Lys Pro Thr Thr Asn
65                  70                  75                  80
Tyr Cys Gln Lys Val Leu Ser Asn Tyr Val Arg Ser Leu Asn Asp Tyr
                85                  90                  95
His Ala Gly Ile Thr Phe Tyr Arg Thr Glu Ser Ala Tyr Ile Pro Tyr
            100                 105                 110
Val Leu Lys Leu Ser Glu Asp Gly His Val Phe Val Val Asp Val Gln
        115                 120                 125
Thr Ser Gln Gly Asp Ile Tyr Leu Gly Asp Glu Ile Leu Glu Val Asp
    130                 135                 140
Gly Met Gly Ile Arg Glu Ala Ile Glu Ser Leu Arg Phe Gly Arg Gly
145                 150                 155                 160
Ser Ala Thr Asp Tyr Ser Ala Ala Val Arg Ser Leu Thr Ser Arg Ser
                165                 170                 175
Ala Ala Phe Gly Asp Ala Val Pro Ser Gly Ile Ala Met Leu Lys Leu
            180                 185                 190
Arg Arg Pro Ser Gly Leu Ile Arg Ser Thr Pro Val Arg Trp Arg Tyr
        195                 200                 205
Thr Pro Glu His Ile Gly Asp Phe Ser Leu Val Ala Pro Leu Ile Pro
    210                 215                 220
Glu His Lys Pro Gln Leu Pro Thr Gln Ser Cys Val Leu Phe Arg Ser
225                 230                 235                 240
Gly Val Asn Ser Gln Ser Ser Ser Ser Ser Leu Phe Ser Ser Tyr Met
                245                 250                 255
Val Pro Tyr Phe Trp Glu Glu Leu Arg Val Gln Asn Lys Gln Arg Phe
            260                 265                 270
Asp Ser Asn His His Ile Gly Ser Arg Asn Gly Phe Leu Pro Thr Phe
        275                 280                 285
Gly Pro Ile Leu Trp Glu Gln Asp Lys Gly Pro Tyr Arg Ser Tyr Ile
    290                 295                 300
Phe Lys Ala Lys Asp Ser Gln Gly Asn Pro His Arg Ile Gly Phe Leu
305                 310                 315                 320
Arg Ile Ser Ser Tyr Val Trp Thr Asp Leu Glu Gly Leu Glu Glu Asp
                325                 330                 335
His Lys Asp Ser Pro Trp Glu Leu Phe Gly Glu Ile Ile Asp His Leu
            340                 345                 350
Glu Lys Glu Thr Asp Ala Leu Ile Ile Asp Gln Thr His Asn Pro Gly
        355                 360                 365
Gly Ser Val Phe Tyr Leu Tyr Ser Leu Leu Ser Met Leu Thr Asp His
    370                 375                 380
Pro Leu Asp Thr Pro Lys His Arg Met Ile Phe Thr Gln Asp Glu Val
385                 390                 395                 400
Ser Ser Ala Leu His Trp Gln Asp Leu Leu Glu Asp Val Phe Thr Asp
                405                 410                 415
Glu GlnAla Val Ala Val Leu Gly Glu Thr Met Glu Gly Tyr Cys Met
           420                 425                 430
Asp Met His Ala Val Ala Ser Leu Gln Asn Phe Ser Gln Ser Val Leu
        435                 440                 445
Ser Ser Trp Val Ser Gly Asp Ile Asn Leu Ser Lys Pro Met Pro Leu
    450                 455                 460
Leu Gly Phe Ala Gln Val Arg Pro His Pro Lys His Gln Tyr Thr Lys
465                 470                 475                 480
Pro Leu Phe Met Leu Ile Asp Glu Asp Asp Phe Ser Cys Gly Asp Leu
                485                 490                 495
Ala Pro Ala Ile Leu Lys Asp Asn Gly Arg Ala Thr Leu Ile Gly Lys
            500                 505                 510
Pro Thr Ala Gly Ala Gly Gly Phe Val Phe Gln Val Thr Phe Pro Asn
        515                 520                 525
Arg Ser Gly Ile Lys Gly Leu Ser Leu Thr Gly Ser Leu Ala Val Arg
    530                 535                 540
Lys Asp Gly Glu Phe Ile Glu Asn Leu Gly Val Ala Pro His Ile Asp
545                 550                 555                 560
Leu Gly Phe Thr Ser Arg Asp Leu Gln Thr Ser Arg Phe Thr Asp Tyr
                565                 570                 575
Val Glu Ala Val Lys Thr Ile Val Leu Thr Ser Leu Ser Glu Asn Ala
            580                 585                 590
Lys Lys Ser Glu Glu Gln Thr Ser Pro Gln Glu Thr Pro Glu Val Ile
        595                 600                 605
Arg Val Ser Tyr Pro Thr Thr Thr Ser Ala Leu
    610                 615
 
<210>168
<211>343
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>168
 
Met Glu Val Tyr Ser Phe Ser Pro Ser Val Arg Thr Ser Phe Gln His
1               5                   10                 15
Arg Val Met Ala Ala Leu Asp Asn Trp Phe Phe Leu Gly Gly Arg Arg
            20                  25                  30
Leu Lys Val Val Ser Leu Asp Ser Cys Asn Ser Gly Gln Ala Cys Glu
        35                  40                  45
Glu Tyr Val Pro Ile Ser Thr Thr Glu Lys Val Leu Lys Ile Leu Ser
    50                  55                  60
Tyr Leu Leu Ile Pro Ile Val Ile Ile Ala Leu Leu Ile Arg Tyr Leu
65                  70                  75                  80
Leu His Ser Asn Phe Thr Ala Lys Val Ser Gln Lys Pro Trp Leu Lys
                85                  90                  95
Thr Leu Gln Leu Gly Ile Asp Ile Lys Ser Phe Ile Leu Pro Gly Ser
            100                 105                 110
His Val Asn Thr Met Asp Ser Ala Thr Leu Phe Lys Ala Ile Arg Leu
        115                 120                 125
Glu Gly Lys Arg Val Asp Val Glu Tyr His Arg Leu His Ser Ser Asp
    130                 135                 140
Lys Val Val Phe Tyr Ile Pro Ala Gln Lys Leu Pro Asp Asp Leu Arg
145                 150                 155                 160
Leu Thr His Trp Leu Pro Glu Lys Glu Thr Arg Lys Thr Glu Tyr Val
                165                 170                 175
Arg His Met Leu Ala His Val Met Gly Tyr Leu Thr Ser Gln Gly Lys
            180                 185                 190
Glu Arg Leu Gln Gln Val Val Gln Asp Ser Arg Ser Ser Thr Ser Leu
        195                 200                 205
Gly Ala Glu Lys Val Leu Gln Tyr Arg Phe Ile Asp His Pro Gln Ser
    210                 215                 220
Gln Gly Glu Phe Gln Arg Leu Leu Asn Glu Asn Ile Thr Thr Lys Gly
225                 230                 235                 240
Ser Glu Asp Lys Glu Val Val Gln Ser Asp Leu Phe Asp Met Ala Phe
                245                 250                 255
Gln Cys Trp Trp Pro Gln Phe Ile Ser Val Ile Gln Ser Pro Thr Phe
            260                 265                 270
Ser Glu Glu Leu Val His Glu Met Ser Gln Lys Leu Asp Leu Asp Cys
        275                 280                 285
Ile Tyr Pro Glu Asp Asp Glu Phe Glu Gln Lys Phe Leu Asn Thr Leu
    290                 295                 300
Leu Lys Ala Val Leu His His Gly Phe Glu Gly Ile Ser Val Ala Ser
305                 310                 315                 320
Met Gly Val Ile Phe Leu Ile Cys Pro Asp Ser Leu Ala Leu Gln Ile
                325                 330                 335
Pro Phe Leu Arg Asn Gln Lys
            340
 
<210>169
<211>366
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>169
 
Leu Ser Gly Ile Phe Ser Asn Pro His Pro Val Ser Tyr Phe Ser Ser
1               5                   10                  15
Thr His Ala Lys Gln Leu Ser Asp Phe Ser Lys Lys His Pro Ile Leu
            20                  25                  30
Thr Lys Ile Val Thr Ile Ile Val Lys Ile Phe Lys Leu Leu Ile Gly
        35                  40                  45
Leu Ile Ile Pro Pro Leu Gly Ile Tyr Trp Leu Cys Gln Leu Val Cys
    50                  55                  60
Ser Leu Ala Leu Phe Pro Arg Ser Ser Met Leu Tyr Ser Val Leu Lys
65                  70                  75                  80
Thr Cys Phe Lys Lys Tyr Arg Leu Glu Gln Glu Ile Gln Asp Tyr Phe
                85                  90                  95
Val Lys Asn Leu Asp Pro Ser Phe Lys Asp Pro Ala Val Ser Glu Ser
            100                 105                 110
Lys Arg Ile Thr Ile Gln Gln Asp His Leu Thr Ile Asp Thr Leu Ala
        115                 120                 125
Ile His Phe Ser Thr Ala Arg Pro Lys Arg Trp Leu Leu Ile Ser Leu
    130                 135                 140
Gly Ser Gly Asp Phe Leu Glu Asp Met Ile Gly Leu Lys Asp Ser Leu
145                 150                 155                 160
Phe Leu Ser Trp Lys Glu Leu Ala Lys Leu Leu Gly Ala Asn Ile Leu
                165                 170                 175
Ile Tyr Asn Tyr Pro Gly Val Lys Ser Ser Thr Gly Lys Leu Asn Leu
            180                 185                 190
Glu Asn Leu Ala Thr Ala His Asn Leu Cys Ala Lys Tyr Leu Gln Asp
        195                 200                 205
Lys Ile Gln Gly Pro Gly Ala Asn Glu Ile Ile Thr Tyr Gly Tyr Ser
    210                 215                 220
Leu Gly Gly Val Val Gln Ser Ala Ala Leu Gln Lys Asn Pro Phe Thr
225                 230                 235                 240
Asn Ser Glu Thr Ser Trp Val Ala Val Lys Asp Arg Ala Pro His Ser
                245                 250                 255
Leu Pro Ala Ala Ala Asn Ser Phe Phe Gly Pro Ile Gly Lys Leu Ile
            260                 265                 270
Ala Val Leu Ala Arg Trp Lys Met Asp Ala Glu Lys Asn Ser Arg Glu
        275                 280                 285
Leu Pro Cys Pro Glu Ile Leu Val Tyr Ser Ala Asp Arg Phe Arg Pro
    290                 295                 300
Ser Glu Val Gly Asp Asp Thr Ala Leu Leu Pro Glu Phe Thr Leu Ala
305                 310                 315                 320
His Ala Ile Lys Arg Thr Pro Phe Ala Arg Ser Lys Lys Phe Ile Gly
                325                 330                 335
Glu Val Asn Leu Leu His Ser Ser Pro Leu Lys His Pro Thr Ile Gln
            340                 345                 350
Lys Leu Ala Glu Ala Ile Leu Glu Ser Leu Ser Arg Lys Asn
        355                 360                 365
 
<210>170
<211>325
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>170
 
Met His Ser Glu Leu Pro Asn Tyr Gln Asn Ile Val Glu Ser Val Val
1               5                   10                  15
Thr Glu Ile Thr Thr Gln Leu Leu Asn Tyr Arg Ser Glu His Arg Leu
            20                  25                  30
Val Pro Phe Trp Glu Lys Ser Asp Gly Ser Phe Ile Thr Ala Ala Asp
        35                  40                  45
Tyr Gly Ser Gln Tyr Tyr Leu Lys Gln Gln Leu Ala Lys Ala Phe Pro
    50                  55                  60
Asn Ile Pro Phe Ile Gly Glu Glu Thr Leu Tyr Pro Asp Gln Asp Asn
65                  70                  75                  80
Glu Lys Ile Pro Glu Ile Leu Lys Phe Thr Arg Leu Leu Thr Ser Ser
                85                  90                  95
Val Ser Arg Asp Asp Leu Ile Ser Thr Leu Val Pro Pro Pro Ser Pro
            100                 105                 110
Thr Ser Leu Phe Trp Leu Val Asp Pro Ile Asp Gly Thr Ala Gly Phe
        115                 120                 125
Ile Arg His Arg Ala Phe Ala Val Ala Ile Ser Leu Ile Tyr Glu Tyr
    130                 135                 140
Arg Pro Ile Leu Ser Val Met Ala Cys Pro Ala Tyr Asn Gln Thr Phe
145                 150                 155                 160
Lys Leu Tyr Ser Ala Ala Lys Gly His Gly Leu Ser Ile Val His Ser
                165                 170                 175
Gln Asn Leu Asp Arg Arg Phe Val Tyr Ala Asp Arg Lys Gln Thr Lys
            180                 185                 190
Gln Phe Cys Glu Ala Ser Leu Ala Ala Leu Asn Gln Gln His His Ala
        195                 200                 205
Thr Arg Lys Leu Ser Leu Gly Leu Pro Asn Thr Pro Ser Pro Arg Arg
    210                 215                 220
Val Glu Ser Gln Tyr Lys Tyr Ala Leu Val Ala Glu Gly Ala Val Asp
225                 230                 235                 240
Phe Phe Ile Arg Tyr Pro Phe Ile Asp Ser Pro Ala Arg Ala Trp Asp
                245                 250                 255
His Val Pro Gly Ala Phe Leu Val Glu Glu Ala Gly Gly Arg Val Thr
            260                 265                 270
Asp Ala Leu Gly Ala Pro Leu Glu Tyr Arg Lys Glu Ser Leu Val Leu
        275                 280                 285
Asn Asn His Ala Val Ile Leu Ala Ser Gly Asp Gln Glu Thr His Glu
    290                 295                 300
Thr Thr Leu Ala Ala Leu Gln Asn Gln Leu Asn Val Val Pro Thr Asp
305                 310                 315                 320
Lys Leu Ile Ala Leu
                325
 
<210>171
<211>458
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>171
 
Met Phe Asn Val Asn Phe Lys Phe Leu Glu Gly Leu His Gln Pro Ala
1               5                   10                  15
Pro Arg Tyr Thr Ser Tyr Pro Thr Ala Leu Glu Trp Glu Pro Ser Asp
            20                  25                  30
Ala Ala Pro Ala Leu Leu Ala Phe Gln Arg Ile Arg Glu Asn Pro Gln
        35                  40                  45
Pro Leu Ser Leu Tyr Phe His Ile Pro Phe Cys Gln Ser Met Cys Leu
    50                  55                  60
Tyr Cys Gly Cys Ser Val Val Leu Asn Arg Arg Glu Asp Ile Val Glu
65                  70                  75                  80
Ala Tyr Ile Asn Thr Leu Ile Gln Glu Met Lys Leu Val Val Glu Thr
                85                  90                  95
Ile Gly Phe Arg Pro Gln Val Ser Arg Ile His Phe Gly Gly Gly Thr
            100                 105                 110
Pro Ser Arg Leu Ser Arg Glu Leu Phe Thr Leu Leu Phe Asp His Ile
        115                 120                 125
His Lys Leu Phe Asp Leu Ser His Ala Glu Glu Ile Ala Ile Glu Val
    130                 135                 140
Asp Pro Arg Ser Leu Arg Asn Asp Met Glu Lys Ala Asp Phe Phe Gln
145                 150                 155                 160
Asn Val Gly Phe Asn Arg Val Ser Leu Gly Val Gln Asp Thr Gln Ala
                165                 170                 175
Asp Val Gln Glu Ala Val Arg Arg Arg Gln Ser His Glu Glu Ser Leu
            180                 185                 190
Lys Ala Tyr Glu Lys Phe Lys Glu Leu Ala Phe Gln Ser Ile Asn Ile
        195                 200                 205
Asp Leu Ile Tyr Gly Leu Pro Lys Gln Thr Lys Glu Ser Phe Ser Lys
    210                 215                 220
rhr Ile Gln Asp Ile Leu Ala Met Tyr Pro Asp Arg Leu Ala Leu Phe
225                 230                 235                 240
Ser Phe Ala Ser Val Pro Trp Ile Lys Pro His Gln Lys Ala Met Lys
                245                 250                 255
Ala Ser Asp Met Pro Ser Met Glu Glu Lys Phe Ala Ile Tyr Ser Gln
            260                 265                 270
Ser Arg His Leu Leu Thr Lys Ala Gly Tyr Gln Ala Ile Gly Met Asp
        275                 280                 285
His Phe Ser Leu Pro His Asp Pro Leu Thr Leu Ala Phe Lys Asn Lys
    290                 295                 300
Thr Leu Ile Arg Asn Phe Gln Gly Tyr Ser Leu Pro Pro Glu Glu Asp
305                 310                 315                 320
Leu Leu Gly Leu Gly Met Thr Ser Thr Ser Phe Ile Arg Gly Ile Tyr
                325                 330                 335
Leu Gln Asn Ala Lys Thr Leu Glu Glu Tyr His Asn Thr Val Leu Arg
            340                 345                 350
Gly Thr Phe Ala Thr Val Lys Ser Lys Ile Leu Thr Glu Asp Asp Arg
        355                 360                 365
Ile Arg Lys Trp Ala Ile His Lys Leu Met Cys Thr Phe Thr Ile Asn
    370                 375                 380
Lys Glu Glu Phe Phe Asn Leu Phe Gly Tyr Glu Phe Asp Thr Tyr Phe
385                 390                 395                 400
Ile Glu Ser Arg Asp Arg Leu Ile Ser Met Glu Thr Thr Gly Leu Ile
                405                 410                 415
His Asn Ser Pro Gly Ser Leu Lys Val Thr Pro Leu Gly Glu Leu Phe
            420                 425                 430
Val Arg Val Ile Ala Thr Ala Phe Asp His Tyr Phe Leu Asn Lys Val
        435                 440                 445
Ser Lys Lys Glu Cys Phe Ser Ala Ser Ile
    450                 455
 
<210>172
<211>379
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>172
 
Met Arg Tyr His Lys Tyr Phe Arg Tyr Val Asn Ser Trp Val Phe Leu
1               5                   10                  15
Val Val Leu Thr Leu Met Leu Leu Ser Val Val Val Ile Ser Ser Met
            20                  25                  30
Asp Pro Thr Ala Met Leu Val Thr Ser Ser Lys Gly Leu Leu Thr Asn
        35                  40                  45
Lys Ser Ile Met Gln Leu Arg His Phe Ala Leu Gly Trp Val Val Phe
    50                  55                  60
Phe Ile Cys Ala Tyr Phe Asp Tyr His Leu Phe Lys Arg Trp Ala Trp
65                  70                  75                  80
Val Leu Tyr Phe Phe Met Ile Cys Ala Leu Val Gly Leu Phe Phe Val
                85                  90                  95
Pro Ser Val Gln Asn Val His Arg Trp Tyr Arg Ile Pro Phe Ile His
            100                 105                 110
Met Ser Val Gln Pro Ser Glu Tyr Gly Lys Leu Val Ile Val Ile Met
        115                 120                 125
Leu Ser Tyr Ile Leu Glu Ser Arg Lys Ala Asp Ile Thr Ser Lys Thr
    130                 135                 140
Thr Ala Phe Leu Ala Cys Leu Val Val Ala Leu Pro Phe Phe Leu Ile
145                 150                 155                 160
Leu Lys Glu Pro Asp Leu Gly Thr Ala Leu Val Leu Cys Pro Val Thr
                165                 170                 175
Leu Thr Ile Phe Tyr Leu Ser Asn Val His Ser Leu Leu Val Lys Phe
            180                 185                 190
Cys Thr Val Val Ala Thr Ile Gly Ile Ile Gly Ser Leu Leu Ile Phe
        195                 200                 205
Ser Gly Ile Val Ser His Gln Lys Val Lys Pro Tyr Ala Leu Lys Val
    210                 215                 220
Ile Lys Glu Tyr Gln Tyr Glu Arg Leu Ser Pro Ser Asn His His Gln
225                 230                 235                 240
Arg Ala Ser Leu Ile Ser Ile Gly Leu Gly Gly Ile Arg Gly Arg Gly
                245                 250                 255
Trp Lys Thr Gly Glu Phe Ala Gly Arg Gly Trp Leu Pro Tyr Gly Tyr
            260                 265                 270
Thr Asp Ser Val Phe Ser Ala Leu Gly Glu Glu Phe Gly Leu Leu Gly
        275                 280                 285
Leu Leu Phe Thr Leu Gly Leu Phe Tyr Cys Leu Ile Cys Phe Gly Cys
    290                 295                 300
Arg Thr Val Ala Val Ala Thr Asp Asp Phe Gly Lys Leu Leu Ala Ala
305                 310                 315                 320
Gly Ile Thr Val Tyr Leu Ala Met His Val Leu Ile Asn Ile Ser Met
                325                 330                 335
Met Cys Gly Leu Leu Pro Ile Thr Gly Val Pro Leu Ile Leu Ile Ser
            340                 345                 350
Tyr Gly Gly Ser Ser Val Ile Ser Thr Met Ala Ser Leu Gly Val Leu
        355                 360                 365
Gln Ser Ile Tyr Ser His Arg Phe Ala Lys Tyr
    370                 375
 
<210>173
<211>1166
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>173
 
Met Leu Asn Phe Arg Lys Leu Arg Arg Asp Phe Ser Ala Asn Ile Leu
1               5                   10                  15
Gln Asp Gly Lys Lys Leu Phe Glu Gln Gly Ala Val Ile Asp Ala Lys
            20                  25                  30
Ile Leu Ser Met Asn Gly Glu Thr Val Cys Ile Ser Ala Gln Val Arg
        35                  40                  45
Gly Leu Tyr Asp Asn Ile Tyr Glu Cys Glu Ile Glu Val Asp Arg Ser
    50                  55                  60
Glu Ser Asp Thr Val Asp Ser Asn Cys Asp Cys Ser Tyr Asn Tyr Asp
65                  70                  75                  80
Cys Gln His Ile Val Ala Leu Leu Phe Tyr Leu Glu Gln Tyr Phe Asn
                85                  90                  95
Glu Met Val Val Ala Tyr Ala Arg Ser Ala Asp Leu Glu Thr Asp His
            100                 105                 110
Glu Ile Asn Glu Glu Val Lys Lys Glu Leu Lys Glu Thr Phe Val Ala
        115                 120                 125
Ala Ala Thr Lys Glu Glu Glu Arg Lys Asp Arg Glu His Gln Lys Glu
    130                 135                 140
Ile Leu Arg Glu Tyr Val His Ala Ala Asn Ala Leu Ser Ala Asn Pro
145                 150                 155                 160
Phe Phe Leu Pro Leu Glu Tyr Leu Glu Lys Asp Ser Ala Glu Leu Ala
                165                 170                 175
Val Leu Phe Val Ser Val Asn Glu Asp Thr Phe Ala Pro Ala Asn Gln
            180                 185                 190
Pro Ile Glu Phe Gln Leu Val Leu Arg Leu Pro Cys Arg Ser Lys Pro
        195                 200                 205
Phe Tyr Ile Ser Asn Ile Arg Thr Phe Leu Glu Gly Val Leu Tyr Gln
    210                 215                 220
Glu Pro Ile Val Leu Asn Gly Arg Arg Phe Phe Phe Thr Met Gln Ser
225                 230                 235                 240
Phe Asn Ala Ser Asp Arg Lys Leu Ile Asp Leu Leu Ile Arg Tyr Val
                245                 250                 255
Arg Tyr Pro Asn His Thr Thr Glu Glu Lys Leu Leu Lys Ser Ala Tyr
            260                 265                 270
Leu Met Pro Pro Ala Leu Gly Val Ile Leu Ala Lys Met Phe Glu His
        275                 280                 285
Gln Leu Ala Asp Arg Gly Gly Gly Ser Leu Gly Glu Lys Glu Ser Phe
    290                 295                 300
Ser Gly Leu Phe Cys Gly Asn Leu Glu Glu Pro Leu Cys Trp Ser Leu
305                 310                 315                 320
Thr Pro Ala Lys Met Lys Phe Asn Leu Asp Phe Phe Asp Met Pro Tyr
                325                 330                 335
Lys Ala Leu Leu Met Thr Pro Val Ile Leu Val Asp Asp Asp Glu Val
            340                 345                 350
Gln Pro Glu Gln Thr Met Leu Leu Glu Ser Asp Ala Pro Gly Ile Ile
        355                 360                 365
His His Phe Val Tyr His Arg Phe Ser Pro Gln Ile Lys Arg Ala His
    370                 375                 380
Leu Arg Ser Phe Ser Arg Leu Arg Asp Ile Ala Ile Pro Glu Ala Leu
385                 390                 395                 400
Phe Gly Ser Phe Arg Glu Asn Ala Leu Pro Val Phe Gln Glu Tyr Ala
                405                 410                 415
Glu Ile Ala Asn Val His Leu Leu Asn Ser Phe Val Thr Leu Pro Tyr
            420                 425                 430
Val Asp Glu Val Arg Ala Ile Cys Asp Met Ser Tyr Leu Asp Gly Glu
        435                 440                 445
Leu Glu Ala Lys Leu His Phe Leu Tyr Gly Ser Leu Arg Val Pro Ala
    450                 455                 460
Ala Ser Leu Ala Leu Gln Tyr Gln Asp Val Arg Ala Phe Ile Ser Asp
465                 470                 475                 480
Glu Gly Ile Leu Ala Arg Asn Leu Val Glu Glu Arg Lys Met Leu Glu
                485                 490                 495
Glu Val Phe Ser Gly Phe Ile Tyr Asp Glu Arg Asp Gly Ala Phe Arg
            500                 505                 510
Val Lys Ser Glu Lys Lys Ile Val Glu Phe Met Thr Glu Thr Ile Pro
        515                 520                 525
Ala Asn Gln His Arg Ile Thr Phe Asn Cys Pro Glu Asn Leu Ser Gly
    530                 535                 540
Gln Phe Ile Tyr Asp Glu Thr Ile Phe Glu Leu Ser Phe Arg Glu Gly
545                 550                 555                 560
Ser Asp Ile Asn Tyr Tyr Glu Ala Asp Leu Lys Val His Gly Leu Leu
                565                 570                 575
Lys Gly Val Pro Leu Asp Leu Leu Trp Asp Cys Ile Ser Ala Lys Lys
            580                 585                 590
Arg Phe Leu Glu Leu Pro Lys Ala Gly Gln Gln Ser Lys Gly Thr Arg
        595                 600                 605
Arg Gly Lys Val Asn Ser Gly Lys Leu Pro Cys Ile Leu Val Leu Asp
    610                 615                 620
Leu Glu Lys Ile Ala Pro Val Val Gln Ile Phe Asn Glu Ile Gly Phe
625                 630                 635                 640
Lys Val Leu Asp Asp Leu Val Gln Lys Cys Pro Leu Trp Ser Leu Thr
                645                 650                 655
Gly Ile Ser Leu Asp Gln Phe Glu Ala Leu Pro Val Asn Phe Ser Met
            660                 665                 670
Ser Glu Arg Leu Ile Glu Ile Gln Lys Gln Ile Arg Gly Glu Ile Glu
        675                 680                 685
Phe Asp Phe Gln Asp Val Pro Gln Gln Ile Gln Ala Thr Leu Arg Ser
    690                 695                 700
Tyr Gln Thr Glu Gly Val His Trp Leu Glu Arg Leu Arg Lys Met His
705                 710                 715                 720
Leu Asn Gly Ile Leu Ala Asp Asp Met Gly Leu Gly Lys Thr Leu Gln
                725                 730                 735
Ala Ile Ile Ala Val Thr Gln Ser Lys Leu Glu Lys Gly Ser Gly Cys
            740                 745                 750
Ser Leu Ile Val Cys Pro Thr Ser Leu Val Tyr Asn Trp Lys Glu Glu
        755                 760                 765
Phe Arg Lys Phe Asn Pro Glu Phe Arg Thr Leu Val Ile Asp Gly Val
    770                 775                 780
Pro Ser Gln Arg Arg Lys Gln Leu Thr Ala Leu Ala Asp Arg Asp Val
785                 790                 795                 800
Ala Ile Thr Ser Tyr Asn Leu Leu Gln Lys Asp Val Glu Leu Tyr Lys
                805                 810                 815
Ser Phe Arg Phe Asp Tyr Val Val Leu Asp Glu Ala His His Ile Lys
            820                 825                 830
Asn Arg Thr Thr Arg Asn Ala Lys Ser Val Lys Met Ile Gln Ser Asp
        835                 840                 845
His Arg Leu Ile Leu Thr Gly Thr Pro Ile Glu Asn Ser Leu Glu Glu
    850                 855                 860
Leu Trp Ser Leu Phe Asp Phe Leu Met Pro Gly Leu Leu Ser Ser Tyr
865                 870                 875                 880
Asp Arg Phe Val Gly Lys Tyr Ile Arg Thr Gly Asn Tyr Met Gly Asn
                885                 890                 895
Lys Ala Asp Asn Met Val Ala Leu Lys Lys Lys Val Ser Pro Phe Ile
            900                 905                 910
Leu Arg Arg Met Lys Glu Asp Val Leu Lys Asp Leu Pro Pro Val Ser
        915                 920                 925
Glu Ile Leu Tyr His Cys His Leu Thr Glu Ser Gln Lys Glu Leu Tyr
    930                 935                 940
Gln Ser Tyr Ala Ala Ser Ala Lys Gln Glu Leu Ser Arg Leu Val Lys
945                 950                 955                 960
Gln Glu Gly Phe Glu Arg Ile His Ile His Val Leu Ala Thr Leu Thr
                965                 970                 975
Arg Leu Lys Gln Ile Cys Cys His Pro Ala Ile Phe Ala Lys Asp Ala
            980                 985                 990
Pro Glu Pro Gly Asp Ser Ala Lys Tyr Asp Met Leu Met Asp Leu Leu
        995                 1000                1005
Ser Ser Leu Val Asp Ser Gly His Lys Thr Val Val Phe Ser Gln
    1010                1015                1020
Tyr Thr Lys Met Leu Gly Ile Ile Lys Lys Asp Leu Glu Ser Arg
    1025                1030                1035
Gly Ile Pro Phe Val Tyr Leu Asp Gly Ser Thr Lys Asn Arg Leu
    1040                1045                1050
Asp Leu Val Asn Gln Phe Asn Glu Asp Pro Ser Leu Leu Val Phe
    1055                1060                1065
Leu Ile Ser Leu Lys Ala Gly Gly Thr Gly Leu Asn Leu Val Gly
    1070                1075                1080
Ala Asp Thr Val Ile His Tyr Asp Met Trp Trp Asn Pro Ala Val
    1085                1090                1095
Glu Asn Gln Ala Thr Asp Arg Val His Arg Ile Gly Gln Ser Arg
    1100                1105                1110
Ser Val Ser Ser Tyr Lys Leu Val Thr Leu Asn Thr Ile Glu Glu
    1115                1120                1125
Lys Ile Leu Thr Leu Gln Asn Arg Lys Lys Ser Leu Val Lys Lys
    1130                1135                1140
Val Ile Asn Ser Asp Asp Glu Val Val Ser Lys Leu Thr Trp Glu
    1145                1150                1155
Glu Val Leu Glu Leu Leu Gln Ile
    1160                1165
 
<210>174
<211>754
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>174
 
Met Val Phe Phe Arg Asn Ser Leu Leu His Leu Val Ala Leu Ser Gly
1               5                   10                  15
Met Leu Cys Cys Ser Ser Gly Val Ala Leu Thr Ile Ala Glu Lys Met
            20                  25                  30
Ala Ser Leu Glu His Ser Gly Arg Gly Ala Asp Asp Tyr Glu Gly Met
        35                  40                  45
Ala Ser Phe Asn Ala Asn Met Arg Glu Tyr Ser Leu Gln Leu Ser Lys
    50                  55                  60
Leu Tyr Glu Glu Ala Arg Lys Leu Arg Ala Ser Gly Thr Glu Asp Glu
65                  70                  75                  80
Ala Leu Trp Lys Asp Leu Ile Arg Arg Ile Gly Glu Val Arg Gly Tyr
                85                  90                  95
Leu Arg Glu Ile Glu Glu Leu Trp Ala Ala Glu Ile Arg Glu Lys Gly
            100                 105                 110
Gly Asn Leu Glu Asp Tyr Ala Leu Trp Asn His Pro Glu Thr Thr Ile
        115                 120                 125
Tyr Asn Leu Val Thr Asp Tyr Gly Thr Glu Asp Ser Ile Tyr Leu Ile
    130                 135                 140
Pro Gln Glu Ile Gly Ala Ile Lys Ile Ala Thr Leu Ser Lys Phe Val
145                 150                 155                 160
Val Pro Lys Glu Ser Phe Glu Asp Cys Leu Thr Gln Ile Leu Ser Arg
                165                 170                 175
Leu Gly Ile Gly Val Arg Gln Val Asn Ser Trp Ile Lys Glu Leu Tyr
            180                 185                 190
Met Met Arg Lys Glu Gly Cys Ser Val Ala Gly Val Phe Ser Ser Arg
        195                 200                 205
Lys Asp Leu Glu Ala Leu Pro Glu Thr Ala Tyr Ile Gly Phe Val Leu
    210                 215                 220
Asn Ser Asn Val Asp Ala His Thr Asn Gln His Val Leu Lys Lys Phe
225                 230                 235                 240
Ile Asn Pro Glu Thr Thr His Val Asp Val Ile Ala Gly Arg Val Trp
                245                 250                 255
Ile Phe Gly Ser Ala Gly Glu Val Gly Glu Leu Leu Lys Ile Tyr Asn
            260                 265                 270
Phe yal Gln Ser Glu Ser Ile Arg Gln Glu Tyr Arg Val Ile Pro Leu
        275                 280                 285
Thr Lys Ile Asp Pro Gly Glu Met Ile Ser Ile Leu Asn Ala Ala Phe
    290                 295                 300
Arg Glu Asp Leu Thr Lys Asp Val Ser Glu Glu Ser Leu Gly Leu Arg
305                 310                 315                 320
Val Val Pro Leu Gln Tyr Gln Gly Arg Ser Leu Phe Leu Ser Gly Thr
                325                 330                 335
Ala Ala Leu Val Gln Gln Ala Leu Thr Leu Ile Arg Glu Leu Glu Glu
            340                 345                 350
Gly Ile Glu Asn Pro Thr Asp Lys Thr Val Phe Trp Tyr Asn Val Lys
        355                 360                 365
His Ser Asp Pro Gln Glu Leu Ala Ala Leu Leu Ser Gln Val His Asp
    370                 375                 380
Val Phe Ser Gly Glu Asn Lys Ala Ser Val Gly Ala Ala Asp Gly Cys
385                 390                 395                 400
Gly Ser Gln Leu Asn Ala Ser Ile Gln Ile Asp Thr Thr Val Ser Ser
                405                 410                 415
Ser Ala Lys Asp Gly Ser Val Lys Tyr Gly Asn Phe Ile Ala Asp Ser
            420                 425                 430
Lys Thr Gly Thr Leu Ile Met Val Val Glu Lys Glu Val Leu Pro Arg
        435                 440                 445
Ile Gln Met Leu Leu Lys Lys Leu Asp Val Pro Lys Lys Met Val Arg
    450                 455                 460
Ile Glu Val Leu Leu Phe Glu Arg Lys Leu Ala His Glu Gln Lys Ser
465                 470                 475                 480
Gly Leu Asn Leu Leu Arg Leu Gly Glu Glu Val Cys Lys Lys Gly Cys
                485                 490                 495
Ser Pro Ser Val Ser Trp Ala Gly Gly Thr Gly Ile Leu Glu Phe Leu
            500                 505                 510
Phe Lys Gly Ser Thr Gly Ser Ser Ile Val Pro Gly Tyr Asp Leu Ala
        515                 520                 525
Tyr Gln Phe Leu Met Ala Gln Glu Asp Val Arg Ile Asn Ala Ser Pro
    530                 535                 540
Ser Val Val Thr Met Asn Gln Thr Pro Ala Arg Ile Ala Val Val Asp
545                 550                 555                 560
Glu Met Ser Ile Ala Val Ser Ser Asp Lys Asp Lys Ala Gln Tyr Asn
                565                 570                 575
Arg Ala Gln Tyr Gly Ile Met Ile Lys Met Leu Pro Val Ile Asn Val
            580                 585                 590
Gly Glu Glu Asp Gly Lys Ser Tyr Ile Thr Leu Glu Thr Asp Ile Thr
        595                 600                 605
Phe Asp Thr Thr Gly Lys Asn His Asp Asp Arg Pro Asp Val Thr Arg
    610                 615                 620
Arg Asn Ile Thr Asn Lys Val Arg Ile Ala Asp Gly Glu Thr Val Ile
625                 630                 635                 640
Ile Gly Gly Leu Arg Cys Lys Gln Met Ser Asp Ser His Asp Gly Ile
                645                 650                 655
Pro Phe Leu Gly Asp Ile Pro Gly Ile Gly Lys Leu Phe Gly Met Ser
            660                 665                 670
Ser Thr Ser Asp Ser Leu Thr Glu Met Phe Val Phe Ile Thr Pro Lys
        675                 680                 685
Ile Leu Glu Asn Pro Val Glu Gln Gln Glu Arg Lys Glu Glu Ala Leu
    690                 695                 700
Leu Ser Ser Arg Pro Gly Glu Arg Glu Glu Tyr Tyr Gln Ala Leu Ala
705                 710                 715                 720
Ala Ser Glu Ala Ala Ala Arg Ala Ala His Lys Lys Leu Glu Met Phe
                725                 730                 735
Pro Ala Ser Gly Val Ser Leu Ser Gln Val Glu Arg Gln Glu Tyr Asp
            740                 745                 750
Gly Cys
<210>175
<211>488
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>175
 
Met Ser Ile Ser Ser Ser Ser Gly Pro Asp Asn Gln Lys Asn Ile Met
1               5                   10                  15
Ser Gln Val Leu Thr Ser Thr Pro Gln Gly Val Pro Gln Gln Asp Lys
            20                  25                  30
Leu Ser Gly Asn Glu Thr Lys Gln Ile Gln Gln Thr Arg Gln Gly Lys
        35                  40                  45
Asn Thr Glu Met Glu Ser Asp Ala Thr Ile Ala Gly Ala Ser Gly Lys
    50                  55                  60
Asp Lys Thr Ser Ser Thr Thr Lys Thr Glu Thr Ala Pro Gln Gln Gly
65                  70                  75                  80
Val Ala Ala Gly Lys Glu Ser Ser Glu Ser Gln Lys Ala Gly Ala Asp
                85                  90                  95
Thr Gly Val Ser Gly Ala Ala Ala Thr Thr Ala Ser Asn Thr Ala Thr
            100                 105                 110
Lys Ile Ala Met Gln Thr Ser Ile Glu Glu Ala Ser Lys Ser Met Glu
        115                 120                 125
Ser Thr Leu Glu Ser Leu Gln Ser Leu Ser Ala Ala Gln Met Lys Glu
    130                 135                 140
Val Glu Ala Val Val Val Ala Ala Leu Ser Gly Lys Ser Ser Gly Ser
145                 150                 155                 160
Ala Lys Leu Glu Thr Pro Glu Leu Pro Lys Pro Gly Val Thr Pro Arg
                165                 170                 175
Ser Glu Val Ile Glu Ile Gly Leu Ala Leu Ala Lys Ala Ile Gln Thr
            180                 185                 190
Leu Gly Glu Ala Thr Lys Ser Ala Leu Ser Asn Tyr Ala Ser Thr Gln
        195                 200                 205
Ala Gln Ala Asp Gln Thr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Lys Gln Ala Ile
    210                 215                 220
Lys Ile Asp Lys Glu Arg Glu Glu Tyr Gln Glu Met Lys Ala Ala Glu
225                 230                 235                 240
Gln Lys Ser Lys Asp Leu Glu Gly Thr Met Asp Thr Val Asn Thr Val
                245                 250                 255
Met Ile Ala Val Ser Val Ala Ile Thr Val Ile Ser Ile Val Ala Ala
            260                 265                 270
Ile Phe Thr Cys Gly Ala Gly Leu Ala Gly Leu Ala Ala Gly Ala Ala
        275                 280                 285
Val Gly Ala Ala Ala Ala Gly Gly Ala Ala Gly Ala Ala Ala Ala Thr
    290                 295                 300
Thr Val Ala Thr Gln Ile Thr Val Gln Ala Val Val Gln Ala Val Lys
305                 310                 315                 320
Gln Ala Val Ile Thr Ala Val Arg Gln Ala Ile Thr Ala Ala Ile Lys
                325                 330                 335
Ala Ala Val Lys Ser Gly Ile Lys Ala Phe Ile Lys Thr Leu Val Lys
            340                 345                 350
Ala Ile Ala Lys Ala Ile Ser Lys Gly Ile Ser Lys Val Phe Ala Lys
        355                 360                 365
Gly Thr Gln Met Ile Ala Lys Asn Phe Pro Lys Leu Ser Lys Val Ile
    370                 375                 380
Ser Ser Leu Thr Ser Lys Trp Val Thr Val Gly Val Gly Val Val Val
385                 390                 395                 400
Ala Ala Pro Ala Leu Gly Lys Gly Ile Met Gln Met Gln Leu Ser Glu
                405                 410                 415
Met Gln Gln Asn Val Ala Gln Phe Gln Lys Glu Val Gly Lys Leu Gln
            420                 425                 430
Ala Ala Ala Asp Met Ile Ser Met Phe Thr Gln Phe Trp Gln Gln Ala
        435                 440                 445
Ser Lys Ile Ala Ser Lys Gln Thr Gly Glu Ser Asn Glu Met Thr Gln
    450                 455                 460
Lys Ala Thr Lys Leu Gly Ala Gln Ile Leu Lys Ala Tyr Ala Ala Ile
465                 470                 475                 480
Ser Gly Ala Ile Ala Gly Ala Ala
                485
 
<210>176
<211>27
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>176
 
Lys Leu Pro Phe Pro Ala Ser Phe Phe Ile Phe Pro Arg Lys Ser Gly
1               5                   10                  15
Pro Asn Pro Trp Asn Asn Ser Trp Gly Met Gln
            20                  25
 
<210>177
<211>143
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>177
 
Ile Ser Phe Ser Val Phe Pro Ile Gly Arg Gln Asn Ser Asn Arg Glu
1               5                   10                  15
Cys Lys Asp Ser Leu Leu Cys Lys Phe Leu Phe Cys Pro Ser Leu Ser
            20                  25                  30
Phe Thr Ser Ser Ala Ser Trp Lys Phe Ser Arg Ser Leu Ser Glu Thr
        35                  40                  45
Glu Tyr Tyr Leu Ser Asn Gln Ile Tyr Arg Asp Phe Met Tyr Asn Ser
    50                  55                  60
Arg Asn Val Leu Phe Leu Tyr Pro Ile Cys Ser Trp Gly Val Cys Ser
65                  70                  75                  80
Leu Asn Phe Asn Gly Met Ser His His Asn Leu Trp Ala Ser Lys Ala
                85                  90                  95
Arg Asp Ser Ser Arg Asn Ala Thr Leu Arg Thr Ala Leu Pro Ser Gln
            100                 105                 110
Arg Asp Tyr Asp Ser Ser His Leu Tyr Arg Lys Tyr Phe Arg Phe Leu
        115                 120                 125
Pro Cys Ser Ser Ser Cys Arg Cys Asn Ser Ser Phe Arg Cys Lys
    130                 135                 140
 
<210>178
<211>41
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>178
 
Arg Ile Gly Leu Pro Arg Ser Glu Phe Glu Lys Ser Asn Ser His Trp
1               5                   10                  15
Arg Val Cys Arg Tyr Leu Ser Tyr Phe Cys Cys Gly Val Arg His Tyr
            20                  25                  30
Leu Ser Thr Gly Val Gly Arg Cys Ser
        35                  40
 
<210>179
<211>58
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>179
 
Lys Glu Ser Gly Glu Asn Cys Asp Ile Glu His Trp Lys Lys Asn Leu
1               5                   10                  15
Ala Arg His Gln Lys Lys Glu Lys Lys Asp Arg Asp Phe Lys Trp Ser
            20                  25                  30
Leu Phe Phe Arg Phe Ser Phe Thr Trp Cys Lys Phe Pro Glu Ala Tyr
        35                  40                  45
Arg Asp Leu Gly Lys Cys Lys Thr Gln Ser
    50                  55
 
<210>180
<211>20
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>180
 
Arg Asp Thr Phe Asn Tyr Phe Pro Arg Ser Thr His Arg Lys His Ala
1               5                   10                  15
Asn Thr Ile Tyr
             20
 
<210>181
<211>23
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>181
 
Cys Arg Asp Pro Arg Tyr Thr Pro Phe Trp Cys Tyr Ser Thr Arg Ser
1               5                   10                  15
Ser Trp Trp Arg Asp Leu Leu
            20
 
<210>182
<211>39
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>182
 
Pro Thr Arg Tyr Pro Ala Leu Leu Gly Lys Arg Ser Arg Lys Gly His
1               5                   10                  15
Arg Asn Lys Tyr Leu Pro Met Gln Ser Gly Ile His Thr Pro Gly Trp
            20                  25                  30
Ala Ile Asp Ser Leu Arg Gly
        35
 
<210>183
<211>34
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>183
 
Glu Arg Ser Ser Arg Gly Phe Ser Asn Arg Cys Phe Ser Ile Leu Arg
1               5                   10                  15
Phe Lys Phe Arg His Asp Thr Val His Lys Phe Ser Gly His Ser His
            20                  25                  30
Arg Arg
 
<210>184
<211>94
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>184
 
Gln Ser Ser His Phe Lys Gly Cys Phe Phe Pro Ser Val Ser Arg Asp
1               5                   10                  15
Asn Tyr Asp Tyr Phe Arg Lys Phe Trp Ser Trp Lys Asp Asn Phe Val
            20                  25                  30
Ser Phe Ala Cys Gly Phe Pro Thr Phe Ala Arg Arg Arg Thr Ser Met
        35                  40                  45
Glu Trp Glu Pro Ser Lys Ser Gln Arg Arg Cys Leu Tyr Ala Ala Lys
    50                  55                  60
Arg Ser Pro Ala Ser Leu Ala Tyr Gly Phe Lys Lys His Asp Val Val
65                  70                  75                  80
Asn Gly Ala Trp His Gln Tyr Lys Ser Gln Arg Leu Ile Gln
                85                  90
<210>185
<211>69
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>185
 
Trp Gln Asp Asn Asn Asp Ile Ile Ser Tyr Pro Ser Leu Lys Tyr Phe
1               5                   10                  15
Arg Asp Pro Cys Tyr Ser Tyr Gly Gln Tyr Arg Leu Ala Tyr Thr Arg
            20                  25                  30
Pro His Gly Thr Thr Arg Ser Ser Cys Cys Arg Asn Gln Leu Ile Ser
        35                  40                  45
Ala Ser Asn Pro Arg Gly Thr Tyr Pro Ser Thr Phe Trp Ile Cys Val
    50                  55                  60
Phe Glu Leu Phe Ser
65
 
<210>186
<211>34
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>186
 
Ile Ser Ser Leu Cys Leu Gly Lys Asn Ser Phe Leu Tyr Val Gly Val
1               5                   10                  15
Ser Asn Leu Arg Lys Ser Gly Pro Asn Pro Thr Cys Ser Asn Phe Leu
            20                  25                  30
Phe Phe
 
<210>187
<211>101
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>187
 
Ser Ile Met Asn Pro Val Arg Ile Gly Ile Ser Ala Pro Pro Ile Leu
1               5                   10                  15
Trp Glu Val Leu His Thr Leu His Gln Val Pro Arg Ser Asp Phe Ala
            20                  25                  30
Tyr Gln Trp Val Ser Arg Arg Ala His Gly Gly Gln Pro His Pro Trp
        35                  40                  45
Asn His Pro Phe Ser Pro His Gln Arg Ala Asn Asn Thr Ile Glu Asp
    50                  55                  60
Asp Ile Pro Lys Lys Met Leu Val Ser Pro Val Ile Ile Asn Pro Ile
65                  70                  75                  80
Ala Met Lys Tyr Leu Gly Leu Asp Trp Ser Asp Met Thr Pro Leu Thr
                85                  90                  95
Asn Leu Leu Ile Pro
            100
 
<210>188
<211>36
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>188
 
His Lys Gln Tyr Lys Gly Leu Gln Val Ala Pro Ser Cys Cys Asn Pro
1               5                   10                  15
Arg Gly Gly Ala His Ala Leu Phe Leu Ser Arg Pro Ser Glu Thr Val
            20                  25                  30
Gly Ser Cys Pro
        35
 
<210>189
<211>47
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>189
 
Thr Pro Pro Thr Ser Gln Thr Tyr Ser His Phe Asp Asn Thr Thr Gly
1               5                   10                  15
Ser Arg Glu Arg Ile Ile Leu Phe Ser Ser Thr Arg Ser Lys Ile Ile
            20                  25                  30
Arg Arg Ala His Ala Val Thr Ser Ser Ala Trp Lys Glu Pro Ser
        35                  40                  45
 
<210>190
<211>133
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
<400>190
 
Arg Lys Pro Leu Arg Phe Ser Ser Pro Val Leu Cys Arg Lys Phe Val
1               5                   10                  15
Met Glu Glu Thr Gln Lys Pro Cys Leu Cys Ser Ile Pro Val Ala Pro
            20                  25                  30
Ile Ser Thr Ser Cys Cys Arg Glu Arg Met Ser Val Lys Thr Pro His
        35                  40                  45
Arg Val Leu His Thr Asn Ala Asp Phe Leu Ser Gly Leu Gly Thr Asn
    50                  55                  60
Pro Val Leu Val Gln Val Ala Val Ala Ser Phe Val Phe Val Ala Val
65                  70                  75                  80
Ser Val Val Gln Leu Thr Phe His Cys Pro Trp Asn Pro Tyr Ser Glu
                85                  90                  95
Leu Gly Ser Ser Ala Gly Thr Gly Ile Arg Leu Leu Met Ser Thr Leu
            100                 105                 110
Val Ser Thr Ser Ala Ser Thr Val Ile Phe Asn Arg Glu Lys Ser Trp
        115                 120                 125
Ser Trp Leu Asn Ile
    130
 
<210>191
<211>18
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>191
 
Ser Gln Tyr Pro Leu Ala Lys Ile Met Pro Asn Ser Leu Gly Ile Pro
1               5                   10                  15
Asn Gly
 
<210>192
<211>32
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>192
 
Ser Arg Asp Leu Ser Thr Leu Phe Cys Arg Leu Ser Phe Val Asn Phe
1               5                   10                  15
Tyr Arg Asp Ser Ser Ala Ile Ile Tyr Asp Asp Asn Thr Pro Val Leu
            20                  25                  30
 
<210>193
<211>53
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>193
Ser Thr Thr His Thr Lys Gln Leu Phe Phe His Gln Val Gln Pro Leu
1               5                   10                  15
Ser Phe Lys Leu Leu Asp Pro Leu Ser Gln Leu Leu Ser Thr Gly Ser
            20                  25                  30
Tyr Phe Arg Leu Gln Thr Arg Ile Pro Leu Glu Ser Leu Leu Thr Leu
        35                  40                  45
Cys Val Gly Ser Ser
    50
 
<210>194
<211>23
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>194
 
Glu Phe Arg His Lys Arg Lys Phe Gln Glu Arg Arg Val Leu Lys Val
1               5                   10                  15
Lys Glu Asn Glu Arg Ile Ser
            20
 
<210>195
<211>72
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>195
 
Asp Ser Leu Cys Asn Lys Asn Cys Thr Ile Ile Ala Glu Ala Gln Ile
1               5                   10                  15
Thr Leu Lys Ala Gln Lys Lys Ala Pro Lys Pro Asn Val Asp Lys Glu
            20                  25                  30
Ile Ser Gly Ala Ser Arg Glu Gln Ser Phe Arg Asn Asn Ala Asn Thr
        35                  40                  45
Lys Pro Lys Gln Gln Arg Leu Gln Lys Ile Lys Gln Asn Leu Cys Leu
    50                  55                  60
Leu Lys Ile Phe Leu Asn Ala Phe
65                  70
 
<210>196
<211>32
<212>PRT
<213>肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)
 
<400>196
 
Ile Pro Val Phe Asn Arg Asn Lys Ser Ile Asn Ser Leu Phe Ser Ile
1               5                   10                  15
Tyr Asp Lys Leu Gln Ser Tyr Arg Leu His Thr Pro Cys Arg Tyr Pro
            20                  25                  30

Claims (63)

1.编码抗原或其片段的分离的核酸分子，包括选自选自以下的核酸序列：
a)与具有选自Seq ID Nos 1至98的核苷酸序列的核酸分子具有至少70％序列同一性的核酸分子，
b)与a)的核酸分子互补的核酸分子，
c)包括a)或b)的核酸分子的至少15个连续碱基的核酸分子，
d)在严紧杂交条件下与a)、b)或c)的核酸分子退火的核酸分子，和
e)要不是遗传密码的简并性，将与a)、b)、c)或d)中定义的核酸分子杂交的核酸分子。
2.根据权利要求1所述的分离的核酸分子，其中与Seq ID Nos 1至98的序列同一性为至少80％，更优选至少90％，仍更优选至少95％，96％，97％，98％，或99％，或最优选100％。
3.根据权利要求1或2任一项所述的核酸分子，其中所述核酸为DNA。
4.根据权利要求1至2任一项所述的核酸分子，其中所述核酸为RNA。
5.根据权利要求1至3任一项所述的分离的核酸分子，其中所述核酸分离自基因组DNA，所述基因组DNA优选来自衣原体(Chlamydia)物种，更优选来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，最优选来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
6.根据权利要求1至5任一项所述的核酸分子，其中编码的抗原片段为其活性片段或活性变体。
7.根据权利要求1至6任一项所述的编码抗原或其片段的核酸分子，其包括或由来自以下的多肽或肽片段组成：肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
8.载体，包括根据权利要求1至7任一项所述的核酸分子。
9.根据权利要求8所述的载体，其中所述载体适合于由在权利要求1至7任一项中所定义的核酸分子编码的抗原或其片段的重组表达。
10.宿主细胞，包括根据权利要求8或9所定义的载体。
11.抗原，其与血清免疫学上反应，所述血清来自患有衣原体(Chlamydia)感染的人类或来自之前被衣原体(Chlamydia)感染的未感染的健康人类，其中所述抗原包括或由来自以下的分离的多肽或其活性片段或活性变体组成：衣原体(Chlamydia)，优选来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选来自肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
12.包括或由选自Seq ID Nos 99至196的分离多肽组成的抗原，或其活性片段或活性变体。
13.根据权利要求11或12所述的抗原，其中所述多肽由在权利要求1至7任一项中所定义的核酸分子编码。
14.根据权利要求11至13任一项所述的抗原，其中所述其活性片段由所述多肽，特别是由Seq ID Nos 99至196中任一个所定义的多肽的至少50％，特别是至少60％，优选至少70％，更优选至少80％，更优选至少90％，更优选至少95％，96％，97％或98％，最优选99％组成。
15.根据权利要求11至14任一项所述的抗原，其中所述其活性变体与所述多肽，特别是由Seq ID Nos 99至196中任一个所定义的多肽具有至少50％，特别是至少60％，优选至少70％，更优选至少80％，更优选至少90％，更优选至少95％，96％，97％或98％，最优选99％的序列同一性。
16.根据权利要求14所述的抗原，其中所述其活性片段包括或由Seq ID No 123的氨基酸2-872、Seq ID No 124的氨基酸2-812、Seq IDNo 125的氨基酸2-514或516至1090、Seq ID No 127的氨基酸2-252、Seq ID No 128的氨基酸2-324、Seq ID No 130的氨基酸2-235、Seq IDNo 131的氨基酸2-792、Seq ID No 132的氨基酸2-252、Seq ID No 135的氨基酸8-245、Seq ID No 138的氨基酸2-393、Seq ID No 139的氨基酸2-237、Seq ID No 140的氨基酸16-620、Seq ID No 155的氨基酸2-287、Seq ID No 156的氨基酸27-231、Seq ID No 157的氨基酸2-550、Seq ID No 165的氨基酸2-644、Seq ID No 168的氨基酸2-343、Seq ID No 170的氨基酸2-325、Seq ID No 171的氨基酸2-458或Seq IDNo 172的氨基酸31-379组成。
17.根据权利要求16所述的抗原，其中所述其活性变体与Seq ID No123的氨基酸2-872、Seq ID No 124的氨基酸2-812、Seq ID No 125的氨基酸2-514或516至1090、Seq ID No 127的氨基酸2-252、Seq IDNo 128的氨基酸2-324、Seq ID No 130的氨基酸2-235、Seq ID No 131的氨基酸2-792、Seq ID No 132的氨基酸2-252、Seq ID No 135的氨基酸8-245、Seq ID No 138的氨基酸2-393、Seq ID No 139的氨基酸2-237、Seq ID No 140的氨基酸16-620、Seq ID No 155的氨基酸2-287、Seq ID No 156的氨基酸27-231、Seq ID No 157的氨基酸2-550、SeqID No 165的氨基酸2-644、Seq ID No 168的氨基酸2-343、Seq ID No170的氨基酸2-325、Seq ID No 171的氨基酸2-458或Seq ID No 172的氨基酸31-379具有至少50％，特别是至少60％，优选至少70％，更优选至少80％，更优选至少90％，更优选至少95％，96％，97％或98％，最优选99％的序列同一性。
18.根据权利要求16至17任一项所述的抗原，由此所述抗原进一步由以下定义：
a)1至570个另外的氨基酸残基，优选1至500，1至400，1至300，1至250，1至200，或1至150，更优选1至100，更优选1至50，最优选1，2，3，4，5，10，20，30或40个另外的氨基酸残基至包括或由Seq ID No 125的氨基酸2至514组成的抗原的活性片段；或
b)1至510个另外的氨基酸残基，优选1至400，1至300，1至250，1至200，或1至150，更优选1至100，更优选1至50，最优选1，2，3，4，5，10，20，30或40个另外的氨基酸残基至包括或由Seq I D No 125的氨基酸516至1090组成的活性片段；或
c)1至25个另外的氨基酸残基，优选1，2，3，4，5，10，15，或20个另外的氨基酸残基至包括或由Seq ID No 172的氨基酸31-379组成的抗原的活性片段；或
d)1至20个另外的氨基酸残基，优选1，2，3，4，5，10，或15个另外的氨基酸残基至包括或由Seq ID No 156的氨基酸27-231组成的抗原的活性片段；或
e)1至10个另外的氨基酸残基，优选1，2，3，4，5，6，7，8，或9个另外的氨基酸残基至包括或由Seq ID No 140的氨基酸16至620组成的抗原的活性片段；或
f)1至5个另外的氨基酸残基，优选1，2，3，或4个另外的氨基酸残基至包括或由Seq ID No 135的氨基酸8至245组成的抗原的活性片段。
19.根据权利要求11至18任一项所述的抗原，由此所述抗原包括或由与所述抗原，优选标记蛋白同源的至少一个氨基酸残基组成。
20.根据权利要求18或19所述的抗原，其中所述另外的氨基酸残基侧翼于抗原N-末端、C-末端或N-和C-末端。
21.根据权利要求18至20任一项所述的抗原，由此所述另外的氨基酸残基侧翼于由以下定义的抗原：
a)Seq ID No 125的氨基酸2至514或其C-末端衍生的变体，或
b)Seq ID No 125的氨基酸516至1090、Seq ID No 135的8至245、Seq ID No 140的16至620、Seq ID No 156的27-231、Seq ID No172的31-379，或其N-末端衍生的变体。
22.根据权利要求11至21任一项所述的抗原，由此所述抗原进一步包括或由前导序列或分泌序列、用于纯化的序列或前蛋白序列组成。
23.抗原，其包括如在表1的“预测的免疫原性aa”或“预测的II类-限制性T细胞表位/区域”或“鉴定的免疫原性区域(aa)的位置”栏中所示的至少一个核心氨基酸序列，由此更优选所述核心氨基酸序列选自以下：
Seq ID No 123的氨基酸20-28，32-40，45-56，85-96，102-118，120-130，132-154，158-172，174-181，193-202，208-221，228-241，250-259，274-283，285-291，296-309，317-324，328-339，348-354，383-391，402-412，418-428，443-455，467-482，484-490，519-525，545-557，568-582，601-606，613-638，646-656，661-676，687-694，706-724，741-766，776-782，789-798，812-822和847-869；Seq ID No124的氨基酸28-37，44-88，95-102，107-115，142-150，212-226，228-233，235-245，262-269，278-311，319-338，343-354，372-405，409-418，426-435，439-445，447-462，471-478，481-490，502-514，522-529，539-565，568-589，595-605，608-622，645-651，656-662，665-670，679-685，696-715，731-744，775-781和789-809；Seq IDNo 125的氨基酸6-14，21-44，52-70，74-93，106-132，136-157，162-168，174-184，186-223，232-248，250-262，264-270，278-284，303-324，342-348，352-357，409-415，423-442，444-454，458-478，480-494，499-509，514-521，529-538，541-559，561-575，582-605，611-619，630-638，647-665，672-683，696-719，727-739，748-791，800-806，815-822，848-855，860-868，876-884，891-896，898-950，956-962，971-980，995-1008，1036-1043，1045-1061和1069-1074；Seq ID No 126的氨基酸7-13，21-27，33-57，63-72，74-80，82-88，94-105，107-119，121-132，134-152，162-199，201-225，229-237，239-246，252-258，261-267，277-298，300-325，340-366，373-383和391-401；Seq ID No 127的氨基酸4-17，22-32，45-58，60-70，72-86，88-98，100-108，112-121，128-138，148-162，167-176，184-198，216-231和241-248；Seq ID No 128的氨基酸6-23，32-52，60-77，84-90，92-107，117-163，165-239，249-254，273-280和289-308；Seq ID No 129的氨基酸5-49，52-59，65-95，102-108，115-123，126-139，142-153，180-186，193-204，206-214，225-247，270-278，280-297，303-319，321-337，344-358，363-371，378-389，399-406和412-419；Seq ID No 130的氨基酸4-30，32-38，43-50，55-62，64-72，76-83，97-119，125-132，139-156，158-172，204-210和221-227；Seq ID No 131的氨基酸4-16，21-31，39-57，61-67，73-99，105-111，119-128，135-147，150-159，163-196，213-246，248-255，257-284，286-293，295-317，333-360，369-387，389-413，415-422，424-438，443-454，461-467，478-490，508-520，527-532，534-551，557-564，566-576，578-588，596-684，687-711，713-724，729-741，749-758和770-782；Seq ID No 132的氨基酸4-13，38-59，80-90，95-102，108-123，130-183，190-223和239-249；Seq ID No 133的氨基酸4-13，27-38，43-48，53-74，82-100，104-110，112-137，147-154，169-179，184-192，196-223，234-249和252-262；Seq ID No 134的氨基酸7-36，45-50，52-92，103-125，129-138，140-154，163-176，178-188，194-203，207-222，230-239，244-297，299-314，324-332，335-343，361-368，370-404，409-416，426-443，451-456，459-469，477-493，496-513，515-522，529-535，540-546，549-561，578-586，588-596，609-628，636-645，659-665，668-687，708-724，726-739，761-770，788-795，818-825，842-869，872-883，887-897，905-972，976-984，988-998，1015-1030，1033-1051，1076-1082，1084-1107，1141-1151，1167-1180，1184-1189，1193-1205，1221-1228，1235-1254，1258-1305，1307-1314，1326-1335，1350-1369和1371-1395；Seq IDNo 135的氨基酸4-14，22-32，48-61，63-71，79-111，119-145，147-167，179-186，188-201，217-223和227-235；Seq ID No 136的氨基酸14-29，31-38，50-56，68-74，81-89，108-118，125-138，144-151，167-175，215-228，252-262，272-279，281-288，322-344，358-374，386-395，406-418，426-441，455-465，485-490，513-519，521-528，538-543，548-555，558-574，577-583，585-596，608-624，636-643，665-672，680-686，699-707，715-730，747-755，775-786，812-818，824-841，856-868，892-899，930-946，963-972，979-984，1008-1015，1032-1038，1044-1050，1052-1060，1092-1110，1143-1148，1157-1181，1184-1196，1215-1222，1229-1244，1248-1255，1267-1272，1282-1295，1300-1311，1323-1329，1390-1396，1399-1407，1423-1431，1452-1458，1478-1484，1488-1501，1504-1511，1521-1551，1573-1599，1622-1641，1644-1663，1669-1675，1681-1688和1692-1711；Seq ID No 137的氨基酸7-33，39-47，53-66，72-104，117-126，132-138，146-154，160-167，182-188，199-213，259-270，283-289，291-308，314-326，328-334，352-358，364-370，372-379，407-417，424-445，461-475，477-485，488-497，510-516，539-553，567-581，589-595，668-687，697-707，709-731，733-752，756-765，772-780，797-827，845-852，860-876，884-891，896-903和915-922；Seq ID No 138的氨基酸17-23，26-34，36-42，45-51，53-63，69-79，89-97，106-119，146-161，175-184，186-201，217-244，252-265，268-278，280-294，304-315，324-340，343-351和353-374；Seq ID No 139的氨基酸17-27，34-40，47-65，68-112，114-126，133-148，150-157，163-187，190-204和207-234；Seq ID No 140的氨基酸4-16，20-42，60-66，75-108，112-117，131-138，148-153，157-174，201-206，213-228，235-243，246-259，266-271，295-301，311-316，331-337，344-353，364-377，383-389，405-412，452-458，470-487，491-505，508-517，540-555，557-565，576-587，593-603和612-617；Seq ID No 141的氨基酸7-14，18-25，30-35，43-48，82-98，102-111，139-149，165-185，189-197，203-219，231-236，268-277，291-301，303-311，315-330，332-340，344-354，365-374，381-400，404-409，419-426，431-441，457-467，469-475，481-490，556-562，605-613和649-655；Seq ID No 142的氨基酸4-15，23-32，48-67，76-83，86-94，97-105，107-120，127-136，180-185，206-212，251-257，313-322，325-331，340-353，374-381，397-403，407-413，420-432，450-457，471-483，492-503，505-515，519-530，539-548，558-579，602-611，625-633，636-643，650-656，658-666，677-683，686-694，707-714，716-730，745-763，765-786，791-830，841-857，864-870，873-885，887-895，912-919，921-938和940-949；Seq ID No 143的氨基酸4-32，34-61，65-75，81-91，99-106，121-132，150-156，162-170，174-182，189-196，201-214，230-236，239-246，276-285，287-295，301-310，335-354，366-383，390-398，408-433，439-445，466-478，499-519，525-544，550-555，572-580，589-603，624-633，648-655，659-671和677-682；Seq ID No 144的氨基酸5-29，42-60，72-77，114-143，151-157，162-174，177-182，185-193，233-251，266-274，279-298，301-308，321-335，338-365，378-386，388-396，401-407，412-434，439-459，475-480和499-505；Seq ID No 145的氨基酸4-26，28-34，57-64，75-81，95-100，126-141，144-150，158-163，200-210，216-221，243-249，291-309，326-339，363-369，380-389，396-403，410-422，436-455，485-498，516-525，541-576，608-619，635-641，664-674，683-692，697-703，707-723，737-749，760-765，775-808，827-839，851-859，869-875，877-884，886-906和910-927；Seq ID No 146的氨基酸4-29，43-48，56-66，70-82，93-102，107-113，127-152，159-164，179-184，201-207，216-224，231-239，244-250，262-269，291-305，307-313，333-340，368-374，379-387，414-422，432-438，440-461，487-498，518-524，539-548，557-567，610-615，644-651，667-675，681-693，709-718，721-726，734-758，780-817，833-843，856-865，872-879，893-900，902-908和913-921；Seq ID No 147的氨基酸4-22，58-73，85-106，115-129，139-145，170-181，185-191，199-204，242-249，270-276，293-303，332-339，353-359，387-392，424-439，459-472，532-538，555-563，593-604，631-636，654-659，679-686，689-705，718-733，740-751，756-771，789-796，798-805，834-842，851-856，885-894，922-930，934-947，953-960，963-975，983-988，1008-1019，1026-1038，1041-1083，1086-1098，1121-1157，1159-1166，1169-1182，1192-1207，1209-1216和1232-1260；Seq IDNo 148的氨基酸5-12，38-50，70-91，109-157，169-182，185-191，205-229，234-251，262-279，287-314，321-331，335-351，356-364，366-373，377-383，386-394，396-415，417-429，437-448，456-467，490-496，504-512，518-530，533-543，545-555，577-586，603-610，617-628，635-662，670-682，689-699，713-719，724-741，745-769，779-784，790-808，816-850，866-879和894-905；Seq ID No 149的氨基酸6-23，26-31，35-99，108-120，134-146，154-167，171-178，183-189，194-203，206-212，241-250，252-270，278-298和302-338；Seq ID No 150的氨基酸21-26，31-37，42-92，100-127，131-149，182-188，190-214，216-231，249-257，264-289，305-326，332-342，348-357，360-368，379-385，387-393，396-410，421-427和435-452；Seq ID No 151的氨基酸4-9，16-21，23-29，34-41，46-51，58-73，104-113，115-122，125-134和141-168；Seq ID No 152的氨基酸4-11，16-34，82-98，103-114，132-147，151-158，164-182，215-221，236-244，253-259，261-267，272-283和285-307；Seq ID No 153的氨基酸4-18，20-34，50-56，64-69，100-109，114-131，142-150和159-165；Seq ID No 154的氨基酸10-23，36-48，55-66，68-75，95-109，116-151，156-169，173-192，199-205，208-213，219-226，232-238，246-256，276-284，295-314，332-343，358-373，381-393，406-426，431-438，454-469，481-492，519-533，536-551，556-561，567-572，594-608，612-619，629-638，665-681，685-697，710-727，759-777和792-798；Seq ID No 155的氨基酸7-13，29-39，54-60，62-68，99-104，126-138，140-153，159-190，204-210，217-223，234-240，243-262和270-278；Seq ID No 156的氨基酸4-22，50-58，71-77，83-93，108-127，143-153，158-191，205-213和221-228；Seq ID No 157的氨基酸4-22，26-35，38-61，63-76，85-99，101-109，145-151，153-160，162-172，180-187，194-202，208-215，223-231，235-247，253-273，278-295，302-323，337-358，366-404，420-434，436-450，454-468，474-485，491-514，524-533和539-545；Seq ID No 158的氨基酸7-30，35-45，53-70，78-105，120-127，129-143，151-158，162-193，208-216，219-249，252-258，277-308，311-321，323-347，359-364，375-385，389-395，401-409，414-420，436-449，467-474，491-507和513-519；Seq ID No 159的氨基酸12-22，27-35，38-53，60-81，87-94，96-113，115-136，144-172，189-196，208-237，239-251，258-265，272-292，296-305，319-331，351-371，378-389，404-425，428-436，443-448，458-477，501-513，535-541，547-554，557-565，574-584和590-598；Seq ID No 160的氨基酸10-30，36-46，56-67，78-105，116-124，126-142，146-160，166-172，186-198，207-224，249-256，278-289，297-304，307-315，318-350，352-367，373-388，395-413，427-438，444-455，457-472，482-490，495-501，512-522，529-535，537-552，572-580和589-620；Seq ID No 161的氨基酸4-14，16-22，26-34，40-50，56-65，75-86，88-101，105-117，126-132，134-142，145-170，172-191，193-205，214-223，227-235，247-290，294-319，332-339，345-355，363-369，394-403，407-412，429-466，468-475，494-510，515-522，528-534，539-545，556-562，574-589，596-604，609-627，637-647，663-671，679-689，694-702，708-715，718-727，738-744，750-758，774-808，815-836，840-883，890-906，910-929，933-943，951-967，972-986，988-1027，1032-1041，1045-1058，1069-1079，1081-1102，1117-1123，1125-1143，1145-1168，1173-1178，1186-1199，1202-1209，1214-1220，1225-1242，1244-1251，1257-1266，1269-1275，1295-1313，1339-1345，1364-1377，1390-1410，1412-1431，1438-1459，1472-1499，1511-1537，1543-1549，1553-1560，1566-1579，1585-1609，1621-1632，1636-1665，1669-1718，1721-1730，1734-1761，1763-1787，1796-1802和1805-1823；Seq ID No 162的氨基酸11-21，27-48，58-69，73-89，100-110，142-152，165-178，187-196，203-216，238-246，254-262，278-288，294-299，308-315，334-340，366-374，376-386，392-401，406-412，444-459，463-469，474-479，484-490，500-517，524-534，542-552，566-578，586-594，603-628，643-664，668-692，699-706，714-726，729-735，747-755，765-771，778-785，804-814，822-837，848-855，860-886，898-909，912-919，925-933，936-942，945-957，966-975，978-997，1015-1035，1045-1055，1066-1076，1082-1107，1141-1179，1193-1214，1240-1246和1252-1259；Seq ID No 163的氨基酸7-15，17-28，34-39，83-96，100-107，119-149，152-158，168-174，176-213，220-231，237-262，264-273，280-286，318-327，338-348，358-369，371-386，405-410，413-421，427-443，445-462，467-473，483-490，498-503，513-527，529-537，540-546和581-590；Seq ID No 164的氨基酸4-16，18-24，57-69，121-140，151-157，159-166，175-183，206-212，261-272，276-283，285-305，321-327，343-350，352-367，383-389，410-416，424-435，448-455，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 ID No 159的氨基酸36-49，59-70，100-113，121-130，147-155和351-360；Seq ID No 160的氨基酸17-28，291-300，340-352，362-371和387-396；Seq ID No 161的氨基酸425-443；Seq ID No 162的氨基酸685-693，699-709，1065-1075和1147-1158；Seq ID No 163的氨基酸66-80，169-178，262-271，333-348，360-370和554-564；SeqID No 164的氨基酸5-17，131-141，183-198和376-385；Seq ID No165的氨基酸33-43，187-200，223-232，259-272，306-316，443-452和461-472；Seq ID No 166的氨基酸62-70，141-161，224-238，297-305和339-354；Seq ID No 167的氨基酸12-22，82-94，186-194，371-382，434-447和580-589；Seq ID No 168的氨基酸27-38，56-38，77-102，174-185，259-270，298-309和319-331；Seq ID No 169的氨基酸10-18，28-51，59-68，127-138，167-177和338-347；Seq IDNo 170的氨基酸52-67，86-98，127-138，144-167，227-237，282-296和307-319；Seq ID No 171的氨基酸1-18，124-137，244-258，298-310，324-343，368-384和431-450；Seq ID No 172的氨基酸9-25，75-88，104-116，121-133，180-197，215-227和324-338；Seq ID No173的氨基酸234-244，336-346，457-468和1002-1012；Seq ID No174的氨基酸3-18，332-340，445-454和580-591；Seq ID No 175的氨基酸251-270，342-352，380-405，407-417和443-451；Seq IDNo 176的氨基酸1-27；Seq ID No 177的氨基酸22-46，56-70，79-96，98-107和119-135；Seq ID No 178的氨基酸10-38；Seq ID No 179的氨基酸10-20和29-43；Seq ID No 180的氨基酸3-18；Seq ID No181的氨基酸8-19；Seq ID No 182的氨基酸5-22；Seq ID No 183的氨基酸7-34；Seq ID No 184的氨基酸21-34，61-72和74-92；Seq IDNo 185的氨基酸5-14，21-34和42-54；Seq ID No 186的氨基酸4-32；Seq ID No 187的氨基酸1-9和38-55；Seq ID No 188的氨基酸4-12和20-30；Seq ID No 189的氨基酸20-42；Seq ID No 190的氨基酸41-52，66-81和104-121；Seq ID No 191的氨基酸1-17；Seq ID No192的氨基酸4-32；Seq ID No 193的氨基酸10-45；Seq ID No 194的氨基酸2-23；Seq ID No 195的氨基酸8-29，41-50和52-72；SeqID No 196的氨基酸3-26；Seq ID No 123的氨基酸249-260；Seq ID No124的氨基酸569-636；Seq ID No 125的氨基酸697-758和808-875；Seq ID No 126的氨基酸3-23；Seq ID No 127的氨基酸139-199；SeqID No 128的氨基酸20-89；Seq ID No 129的氨基酸168-178；Seq IDNo 130的氨基酸112-182和167-216；Seq ID No 131的氨基酸518-538；Seq ID No 132的氨基酸31-105；Seq ID No 133的氨基酸119-187；Seq ID No 134的氨基酸34-43；Seq ID No 135的氨基酸223-241；Seq ID No 136的氨基酸91-170，1369-1393和1423-1486；Seq ID No 137的氨基酸397-456；Seq ID No 138的氨基酸32-48；SeqID No 139的氨基酸5-66；Seq ID No 140的氨基酸271-367；Seq ID No141的氨基酸270-279和621-632；Seq ID No 142的氨基酸146-221和782-847；Seq ID No 143的氨基酸216-283；Seq ID No 144的氨基酸245-264和367-374；Seq ID No 145的氨基酸716-781；Seq ID No146的氨基酸692-760；Seq ID No 147的氨基酸1189-1244；Seq ID No148的氨基酸446-462；Seq ID No 149的氨基酸79-94和136-145；Seq ID No 150的氨基酸97-165；Seq ID No 151的氨基酸106-123；SeqID No 152的氨基酸16-80；Seq ID No 153的氨基酸36-113；Seq ID No154的氨基酸303-330；Seq ID No 155的氨基酸154-168；Seq ID No 156的氨基酸28-49；Seq ID No 157的氨基酸406-485；Seq ID No 158的氨基酸421-488；Seq ID No 159的氨基酸442-492和526-610；SeqID No 160的氨基酸194-207；Seq ID No 161的氨基酸1058-1076和1643-1700；Seq ID No 162的氨基酸1068-1077；Seq ID No 163的氨基酸228-287；Seq ID No 164的氨基酸786-836；Seq ID No 165的氨基酸306-370；Seq ID No 166的氨基酸259-277和298-320；Seq IDNo 167的氨基酸498-506；Seq ID No 168的氨基酸138-205；Seq ID No169的氨基酸247-293；Seq ID No 170的氨基酸61-74；Seq ID No 171的氨基酸201-262；Seq ID No 172的氨基酸208-288；Seq ID No 173的氨基酸938-1000；Seq ID No 174的氨基酸309-374；Seq ID No 175的氨基酸36-109和375-388；Seq ID No 176的氨基酸10-21；Seq IDNo 177的氨基酸71-134；Seq ID No 178的氨基酸5-26；Seq ID No 179的氨基酸21-36；Seq ID No 180的氨基酸1-10；Seq ID No 181的氨基酸13-23；Seq ID No 182的氨基酸5-11；Seq ID No 183的氨基酸22-32；Seq ID No 184的氨基酸11-72；Seq ID No 185的氨基酸4-18；Seq ID No 186的氨基酸13-26；Seq ID No 187的氨基酸8-77；Seq IDNo 188的氨基酸5-27；Seq ID No 189的氨基酸4-18；Seq ID No 190的氨基酸30-45；Seq ID No 191的氨基酸4-16；Seq ID No 192的氨基酸12-25；Seq ID No 193的氨基酸37-48；Seq ID No 194的氨基酸4-21；Seq ID No 195的氨基酸18-44和Seq ID No 196的氨基酸11-22。
24.根据权利要求23所述的抗原，由此所述抗原进一步由以下组成：
a)1至50个另外的氨基酸残基，优选1至40，更优选1至30，更优选最多1至25，更优选最多1至10，最优选1，2，3，4或5个另外的氨基酸残基；和/或
b)与核心氨基酸序列同源的至少一个氨基酸残基。
25.根据权利要求24所述的抗原，其中所述另外的氨基酸残基侧翼于核心氨基酸序列N-末端、C-末端或N-末端和C-末端。
26.根据权利要求23至25任一项所述的抗原，其中所述抗原包括在权利要求23中所定义的至少2，至少3，至少4，至少5或至少6个核心氨基酸序列。
27.用于生产权利要求11至26任一项中所定义的抗原，或其活性片段或活性变体的方法，包括表达权利要求1至7任一项中所定义的核酸分子。
28.用于生产表达权利要求11至26任一项中所定义的抗原，或其活性片段或活性变体的细胞的方法，包括将合适的宿主细胞用权利要求8或9中所定义的载体转化或转染。
29.根据权利要求27或28任一项所述的方法，其中所述抗原或其活性片段或活性变体，分离自衣原体(Chlamydia)、优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
30.药物组合物，优选疫苗，包括权利要求11至26任一项中所定义的抗原或其活性片段或活性变体；或权利要求1至7任一项中所定义的核酸分子；或权利要求8至9任一项中所定义的载体。
31.药物组合物，优选疫苗，包括权利要求11至26任一项中所定义的抗原或活性片段或活性变体；或权利要求1至7任一项中所定义的核酸分子；或权利要求8至9任一项中所定义的载体，以用于治疗或预防衣原体(Chlamydia)、优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染。
32.根据权利要求30或31所述的药物组合物，其特征在于其还包括免疫刺激物质，优选聚阳离子聚合物，特别是聚阳离子肽，免疫刺激寡脱氧核苷酸(ODNs)，特别是Oligo(dIdC)13，包含至少两个LysLeuLys基序的肽，特别是KLKLLLLLKLK，神经活性化合物，特别是人类生长激素，明矾，弗罗因德完全或不完全佐剂，或其组合。
33.根据权利要求32所述的药物组合物，其中所述免疫刺激物质为聚阳离子聚合物和免疫刺激脱氧核苷酸，或包含至少两个LysLeuLys基序的肽和免疫刺激脱氧核苷酸的组合，优选KLKLLLLLKLK和Oligo(dIdC)13的组合。
34.根据权利要求32或33所述的药物组合物，其中所述聚阳离子肽为聚精氨酸。
35.权利要求11至26任一项中所定义的抗原或其活性片段或活性变体；或权利要求1至7任一项中所定义的核酸分子；或权利要求8至9任一项中所定义的载体，以用于治疗或预防衣原体(Chlamydia)、优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染。
36.权利要求11至26任一项中所定义的抗原或其活性片段或活性变体；或权利要求1至7任一项中所定义的核酸分子；或权利要求8至9任一项中所定义的载体在制备用于治疗或预防衣原体(Chlamydia)、优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染的药物组合物，特别是用于制备疫苗上的用途。
37.抗体，或至少其有效部分，其与权利要求11至26任一项中所定义的抗原或其片段，优选其活性片段，或其变体，优选其活性变体的至少选择性部分结合。
38.根据权利要求37所述的抗体，其中所述抗体为单克隆抗体。
39.根据权利要求37或38所述的抗体，其中所述有效部分包括Fab片段，F(ab)片段，F(ab)N片段，F(ab)2片段或Fv片段。
40.根据权利要求37至39任一项所述的抗体，其中所述抗体为嵌合抗体。
41.根据权利要求37至40任一项所述的抗体，其中所述抗体为人源化抗体。
42.根据权利要求37至41任一项所述的抗体，其中所述抗体为IgA抗体。
43.杂交瘤细胞系，其产生权利要求37至42任一项中所定义的抗体。
44.用于产生权利要求37至42任一项中所定义的抗体的方法，其特征在于以下步骤：
a)在非人动物中通过给药权利要求11至26任一项中所定义的抗原，或其活性片段或活性变体给所述动物来引发免疫应答，
b)从所述动物中除去包含抗体的体液，和
c)通过将所述包含抗体的体液进行进一步的纯化步骤来产生抗体。
45.用于产生权利要求37至42任一项中所定义的抗体的方法，其特征在于以下步骤：
a)在非人动物中通过给药权利要求11至26任一项中所定义的抗原或其活性片段或活性变体给所述动物来引发免疫应答，
b)从所述动物中除去脾或脾细胞，和
c)产生所述脾或脾细胞的杂交瘤细胞，
d)选择和克隆对所述抗原或对所述活性片段或对其所述活性变体特异的杂交瘤细胞，
e)通过培养所述克隆的杂交瘤细胞产生抗体，和
f)任选地进行进一步纯化步骤。
46.药物组合物，包括根据权利要求37至42任一项所述的抗体。
47.根据权利要求37至42任一项所述的抗体或包括根据权利要求37至42任一项所述的抗体的药物组合物，以用于治疗或预防衣原体(Chlamydia)、优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染。
48.权利要求37至42任一项中所定义的抗体在制备用于治疗或预防衣原体(Chlamydia)、优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suiis)，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)感染的药物组合物上的用途。
49.用于鉴定能够结合权利要求11至26任一项中所定义的抗原或其活性片段或活性变体的方法，包括：
a)使权利要求11至26任一项中所定义的分离或固定的抗原或其活性片段或活性变体与候选拮抗剂在允许所述候选拮抗剂与所述抗原或其活性片段或活性变体结合的条件下，在能够提供应答于所述候选拮抗剂与所述抗原或其活性片段或活性变体的结合的可检测信号的组分的存在下接触；和
b)检测应答于所述拮抗剂与所述抗原或其活性片段或活性变体的结合产生的信号的存在或不存在。
50.用于鉴定拮抗剂的方法，所述拮抗剂能够降低或抑制权利要求11至26任一项中所定义的抗原或其活性片段或活性变体与其相互作用伴侣的相互作用活性，包括：
a)提供权利要求11至26任一项中所定义的抗原，或其活性片段或活性变体，
b)提供所述抗原，或其活性片段或活性变体的相互作用伴侣，特别是权利要求37至42任一项中所定义的抗体，
c)使所述抗原，或其活性片段或活性变体与所述相互作用伴侣相互作用以形成相互作用复合物，
d)提供候选拮抗剂，
e)使所述候选拮抗剂和所述相互作用复合物之间出现竞争反应，
f)确定所述候选拮抗剂是否降低或抑制所述抗原或其活性片段或活性变体与所述相互作用伴侣的相互作用活性。
51.权利要求11至26任一项中所定义的抗原或其活性片段或活性变体在用于分离和/或纯化和/或鉴定所述抗原或其所述活性片段或活性变体的相互作用伴侣上的用途。
52.用于诊断衣原体(Chlamydia)有机体感染的方法，包括以下步骤：
a)使获自受试者的样品与权利要求11至26任一项中所定义的抗原或其活性片段或活性变体接触，和
b)检测样品中针对所述衣原体(Chlamydia)有机体的抗体的存在。
53.用于诊断衣原体(Chlamydia)有机体感染的方法，包括以下步骤：
a)使获自受试者的样品与根据权利要求37至42任一项所述的抗体接触；和
b)检测样品中所述衣原体(Chlamydia)有机体的抗原的存在。
54.根据权利要求53所述的方法，其中所述衣原体(Chlamydia)有机体的抗原为权利要求11至26任一项所定义的抗原或其活性片段或活性变体。
55.根据权利要求52至54任一项所述的方法，其中所述抗体为IgA抗体。
56.用于诊断衣原体(Chlamydia)有机体感染的方法，包括以下步骤：
a)使获自受试者的样品与对权利要求1至7任一项中所定义的核酸分子，或其片段特异的引物或探针接触；和
b)检测样品中此类核酸分子或其片段的存在。
57.根据权利要求52至56任一项所述的方法，其中所述衣原体(Chlamydia)有机体为致病性衣原体(Chlamydia)有机体，更优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，最优选肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
58.权利要求11至26任一项中所定义的抗原，或其活性片段或活性变体在制备功能性核酸上的用途，其中所述功能性核酸选自适配子和镜像异构体。
59.权利要求1至7任一项中所定义的核酸分子在制备功能性核糖核酸上的用途，其中所述功能性核糖核酸选自核酶、反义核酸和siRNA。
60.用于在优选需要其的动物或人类中治疗衣原体(Chlamydia)感染的方法，包括给药给所述动物或人类以治疗有效量的权利要求11至26任一项中所定义的抗原，或其活性片段或活性变体、或权利要求1至7任一项中所定义的核酸分子、或权利要求8至9任一项中所定义的载体，或权利要求37至42任一项中所定义的抗体，或权利要求30至34、46或47任一项中所定义的的药物组合物的步骤。
61.用于使动物或人类免疫衣原体(Chlamydia)有机体感染的方法，包括给药给所述动物或人类以治疗有效量的权利要求11至26任一项中所定义的抗原，或其活性片段或活性变体、或权利要求1至7任一项中所定义的核酸分子、或权利要求8至9任一项所定义的载体，或权利要求37至42任一项中所定义的抗体，或权利要求30至34、46或47任一项中所定义的的药物组合物的步骤，其中所述有效量适合在所述动物或人类中引起免疫应答。
62.用于在动物或人类中刺激针对衣原体(Chlamydia)有机体的免疫应答的方法，包括给药给所述动物或人类以治疗有效量的权利要求11至26任一项中所定义的抗原，或其活性片段或活性变体、或权利要求1至7任一项中所定义的核酸分子、或权利要求8至9任一项中所定义的载体，或权利要求37至42任一项中所定义的抗体，或权利要求30至34、46或47任一项中所定义的的药物组合物的步骤，所述有效量适合在所述动物或人类中刺激免疫应答。
63.根据权利要求60至62任一项所述的方法，其中所述衣原体(Chlamydia)有机体优选为肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)、鹦鹉热衣原体(C.psittaci)、兽类衣原体(C.pecorum)、鼠型沙眼衣原体(C.muridarum)、或猪衣原体(C.suis)，更优选为肺炎衣原体(C.pneumoniae)、沙眼衣原体(C.trachomatis)或鹦鹉热衣原体(C.psittaci)。
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