CN101358206A - 基于昆虫病毒出芽后细胞膜及细胞器膜蛋白的分离方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种基于昆虫病毒出芽后细胞膜及细胞器膜蛋白的分离方法:通过重组杆状病毒Bm-sp-HA-tm感染昆虫宿主细胞后增殖,在病毒大量出芽后,宿主细胞膜破裂,经分离、超滤,获得细胞膜及细胞器膜蛋白。本发明提供了一种大量分离膜蛋白的方法,利用杆状病毒感染昆虫细胞后以出芽的方式大量释放出来,致使细胞破裂,细胞剩余的膜因疏水作用而形成膜“小球”状,并且膜带有杆状病毒表达的HA融合蛋白,以此为膜蛋白的标志,经过多步纯化步骤获得宿主细胞剩余膜,过750kD中空纤维膜超滤后,再经HPLC和质谱分析,鉴定并找出目标膜蛋白。
Description
技术领域
本发明涉及一种蛋白质工程中的蛋白表达与分离纯化的领域,特别涉及一种利用昆虫病毒出芽后分离获得细胞膜及细胞器的膜蛋白的方法。
背景技术
生物膜有着重要的生物功能,如提供细胞识别位点,介导细胞与细胞、细胞与基质之间的连接等等。膜蛋白的研究也正成为蛋白质组研究的热点。膜蛋白是许多药物的作用靶位点,研究膜蛋白不仅有利于低丰度蛋白的研究,更为药物研发和疾病的诊断提供靶体与标记蛋白质。然而,膜蛋白的分离是膜蛋白研究的“瓶颈”。
发明内容
针对现有技术的不足之处,本发明提供一种细胞膜和细胞器膜蛋白分离与纯化新的技术方法。
本发明的一种基于昆虫病毒出芽后细胞膜及细胞器膜蛋白的分离方法:通过重组杆状病毒Bm-sp-HA-tm感染昆虫宿主细胞后增殖,在病毒大量出芽后,宿主细胞膜破裂,经分离、超滤,获得细胞膜及细胞器膜蛋白。
所述的基于昆虫病毒出芽后细胞膜及细胞器膜蛋白的分离方法,依次包括以下步骤:
(1)重组杆状病毒Bm-sp-HA-tm1×106PFU/条针刺接种法感染昆虫宿主细胞,培养5-7天,收获细胞;
(2)将上述收获物在4℃下解冻后,与0.85%生理盐水混和,匀浆;3000rpm离心20-60min,取上清;6000rpm离心20-60min,取上清;12000rpm离心30-120min,取上清;18000rpm离心30-120min,取上清;35000rpm离心30-90min;35000rpm离心后,取上清,进行超滤,获得细胞膜及细胞器的膜蛋白。
所述的昆虫宿主细胞为家蚕蛹。
所述重组杆状病毒Bm-sp-HA-tm的构建方法包括以下步骤:
(1)以gp64DNA为模板,PCR扩增gp64信号肽,所用引物:
Psp1:5’gcggatcc atgctactagtaaatcagtc 3’;
Psp2:5’catgtgtaacagtaacgttcttttccgcaaaggcagaatgcgccgccgcc3’;
(2)以gp64 DNA为模板,PCR扩增gp64跨膜域,所用引物:
Ptm1:5’gtcgttacaatgcagaatttgcattggtgatactgggctatccaaaaatc 3’
Ptm2:5’gagcggccgc ttactttccaagtcggttcatctct 3’;
(3)以禽流感病毒H5N1 HA基因为模板,PCR扩增HA基因,所用引物:
Pha1:5’gaaaagaacgttactgttacacatgc 3’
Pha2:5’aatgcaaattctgcattgtaacgac 3’
(4)以gp64信号肽和HA基因为模板,PCR扩增sp-HA融合基因,所用引物:
Psp1:5’gcggatcc atgctactagtaaatcagtc 3’;
Pha2:5’aatgcaaattctgcattgtaacgac 3’
(5)以sp-HA融合基因和gp64跨膜域为模板,PCR扩增sp-HA-tm融合基因,所用引物:
Psp1:5’gcggatcc atgctactagtaaatcagtc 3’;
Ptm2:5’gagcggccgc ttactttccaagtcggttcatctct 3’;
(6)将融合基因sp-HA-tm连接到pGEM-T vector上,转化至感受态细胞E.coli DH5α中,构建得克隆质粒pGEM-sp-HA-tm;
(7)克隆质粒pGEM-sp-HA-tm经BamH I和Not I双酶切切下sp-HA-tm融合基因片段克隆至经BamH I和Not I双酶切的pBacPAK8中,构建成重组转移质粒pBacsp-HA-tm;
(8)取重组转移质粒pBac-sp-HA-tm DNA和经Bsu36I酶切线性化的修饰型病毒BmBacPAK6 DNA,加入无血清的TC-100培养基混匀,取Dosper加入无血清的TC-100培养基混均,将事先培养在平皿中的BmN细胞用无血清的TC-100培养基洗涤两次,并逐滴加入pBac-sp-HA-tm转移质粒和Dosper混合物,27℃培养4-5天,取上清感染平皿中的Bm N细胞,1小时后弃去上清加入等量混合的TC-100培养基和低熔点琼脂糖,4-5天后挑取噬斑,感染BmN细胞3-4天,保存上清,细胞用NaOH裂解用于Southern blot斑点杂交,以sp-HA-tm融合基因作模板用随机引物探针标记试剂盒标记探针,杂交;取阳性克隆的上清感染家蚕细胞扩增,即得到含sp-HA-tm融合基因的重组杆状病毒Bm-sp-HA-tm。
本发明的有益之处在于:提供一种大量分离膜蛋白的方法,利用杆状病毒感染昆虫细胞后以出芽的方式大量释放出来,致使细胞破裂,细胞剩余的膜因疏水作用而形成膜“小球”状,并且膜带有杆状病毒表达的HA融合蛋白,以此为膜蛋白的标志,经过多步纯化步骤获得宿主细胞剩余膜,过750kD中空纤维膜超滤后,再经HPLC和质谱分析,鉴定并找出目标膜蛋白。本发明能促进膜蛋白组学研究的发展,有助于发现药物蛋白作用的靶点,促进药物学、医学的发展。
说明书附图
图1为本发明的实施例的质粒pGEM-sp-HA-tm;
图2为本发明的实施例的质粒pBac-sp-HA-tm。
具体实施方式
下面结合实施例来说明本发明的技术方案:
1.融合基因sp-HA-tm的构建。
在HA基因(Genbank号DQ520855)的5’和3’端分别连接编码杆状病毒囊膜蛋白gp64信号肽基因序列(Genbank号NP 074525)和gp64跨膜区基因(Genbank号NP 074525)序列,并在融合基因的5’和3’端分别引入BamH I和Not I酶切位点。分别以杆状病毒AcNPV gp64信号肽基因序列(Genbank号NP 074525)、禽流感病毒H5N1 HA基因序列(Genbank号DQ520855)和gp64跨膜区基因序列(Genbank号NP 074525)为模板设计3对引物,首先扩增目的片段gp64信号肽(sp)、HA和gp64跨膜域(tm),然后利用各目的片段互为引物和模板合成融合基因sp-HA-tm。设计引物如下:
Psp1:5’gcggatcc atgctactagtaaatcagtc 3’
Psp2:5’catgtgtaacagtaacgttcttttccgcaaaggcagaatgcgccgccgcc 3’
Pha1:5’gaaaagaacgttactgttacacatgc 3’
Pha2:5’aatgcaaattctgcattgtaacgac 3’
Ptm1:5’gtcgttacaatgcagaatttgcattggtgatactgggctatccaaaaatc 3’
Ptm2:5’gagcggccgc ttactttccaagtcggttcatctct 3’
gp64信号肽(sp)的扩增
以gp64 DNA(Genbank号NP 074525)为模板,PCR反应参数设计为,94℃预变性3min,94℃变性30s,68℃复性延伸30s,30个循环,68℃延伸5min。
在一个无菌的0.5ml离心管中,混合下列成分:
10×PCR Buffer 10μl
25mmol MgCl2 8μl
2.5mmol dNTPs 8μl
Psp1 1μl
Psp2 1μl
模板 1μl
KOD-Plus DNA聚合酶(TOYOBO公司,日本) 1μl
加无菌双蒸水至100μl
各组分混匀后,放入PCR仪中,按上述反应参数设计30个循环。待反应结束后,电泳鉴定扩增片断,同时切胶回收目的片断。
(2)gp64跨膜域(tm)的扩增
以gp64DNA(Genbank号NP 074525)为模板,PCR反应参数设计为,94℃预变性3min,94℃变性30s,68℃复性延伸30s,30个循环,68℃延伸5min。
100ul的反应体系同上,所用引物为Ptm1和Ptm2,各组分混匀后,放入PCR仪中,按上述反应参数设计30个循环。待反应结束后,电泳鉴定扩增片断,同时切胶回收目的片断。
(3)HA基因的扩增
以禽流感病毒H5N1HA基因(Genbank号DQ520855)为模板,PCR反应参数为94℃预变性3min,94℃变性30s,68℃复性延伸1min,30个循环,68℃延伸5min。在一个无菌的0.5ml离心管中,混合下列成分:10×PCR Buffer10l,25mmol MgCl2 8μl,2.5mmol dNTPs 8μl,引物Pha1 1μl,引物Pha2 1μl,模板1μl,KOD-Plus DNA聚合酶(TOYOBO公司,日本)1μl,加无菌双蒸水至100μl。
各组分混匀后,放入PCR仪中,按上述反应参数设计30个循环。待反应结束后,电泳鉴定扩增片断,同时切胶回收目的片断。
(4)gp64信号肽sp基因与HA基因的融合
PCR反应参数为94℃预变性3min,94℃变性30s,68℃复性延伸1min,30个循环,68℃延伸5min。在一个无菌的0.5ml离心管中,混合下列成分:10×PCR Buffer10μl,25mmol MgCl2 8μl,2.5mmol dNTPs 8μl,引物Psp1 1μl,引物Pha2 1μl,模板sp 1μl,模板HA 1μl,KOD-Plus DNA聚合酶(TOYOBO公司,日本)1μl,加无菌双蒸水至100μl。
各组分混匀后,放入PCR仪中,按上述反应参数设计30个循环。待反应结束后,电泳鉴定扩增片断,同时切胶回收目的片断。
因为sp的下游引物Psp2设计时加入了HA基因5’端的部分序列,所以PCR扩增出的sp片断3’端序列与HA基因5’端序列存在重叠,再次利用PCR方法就可以扩增出sp-HA融合基因序列。
(5)融合基因sp-HA再次与tm的融合
PCR反应参数为94℃预变性3min,94℃变性30s,68℃复性延伸1.5min,30个循环,68℃延伸5min。在一个无菌的0.5ml离心管中,混合下列成分:10×PCR Buffer10μl,25mmol MgCl2 8μl,2.5mmol dNTPs 8μl,引物Psp1 1μl,引物Ptm2 1μl,模板sp-HA 1μl,模板tm 1μl,KOD-Plus DNA聚合酶(TOYOBO公司,日本)1μl,加无菌双蒸水至100μl。
各组分混匀后,放入PCR仪中,按上述反应参数设计30个循环。待反应结束后,电泳鉴定扩增片断,同时切胶回收目的片断。
同上,因为tm的上游引物Ptm1设计时加入了HA基因3’端的部分序列,所以PCR扩增出的tm片断5’端序列与HA基因3’端序列存在重叠,再次利用PCR方法就可以扩增出sp-HA-tm融合基因即sp-HA-tm序列。
2.克隆质粒pGEM-sp-HA-tm(图1)的构建
将PCR扩增出的融合基因sp-HA-tm连接到pGEM-T vector上
融合基因sp-HA-tm 2ul
pGEM-T vector 0.5ul
2×Rapid Ligation buffer 5ul
T4 DNA ligase 1ul
ddH2O 1.5ul
混匀上述组分,25℃反应1h。反应混合物转化至感受态细胞E.coli DH5α中,LB固体培养基培养过夜,挑取单菌落,提取质粒,进行酶切初步鉴定,经测序,序列完全正确。
3.含sp-HA-tm融合基因杆状病毒转移质粒pBac-sp-HA-tm(图2)的获得
质粒pGEM-sp-HA-tm经BamH I和Not I双酶切切下sp-HA-tm融合基因片段克隆至经BamH I和Not I双酶切的pBacPAK8(Clontech公司)中,使sp-HA-tm融合基因置于多角体蛋白(polyhedrin,ph)基因启动子控制之下,构建成重组转移质粒pBacsp-HA-tm,经酶切分析鉴定基因序列正确。
4.含sp-HA-tm融合基因的家蚕重组杆状病毒Bm-sp-HA-tm的获得
取5ul重组转移质粒pBac-sp-HA-tm DNA和6ul经Bsu36I酶切线性化的修饰型病毒BmBacPAK6 DNA(购自上海生化细胞所),加入100ul无血清的TC-100培养基(GIBCOBRL公司)混均。取6ulDosper(宝灵曼公司)加入100ul无血清的TC-100培养基(GIBCOBRL公司)混均。将事先培养在35mm平皿中的BmN细胞用无血清的TC-100培养基洗涤两次,并逐滴加入pBac-sp-HA-tm转移质粒和Dosper混合物,27℃培养4-5天,收取上清进行第一轮噬斑筛选。取5ul上清感染35mm平皿中的Bm N细胞(购自上海生化细胞所),1小时后弃去上清加入等量混合的TC-100培养基和低熔点琼脂糖。4-5天后挑取噬斑,感染BmN细胞3-4天,保存上清,细胞用NaOH裂解用于Southern blot斑点杂交,以sp-HA-tm融合基因作模板用随机引物探针标记试剂盒(宝灵曼公司)标记探针,杂交方法按照《分子克隆》(科学出版社,1995)。取阳性克隆的上清进行第二轮噬斑筛选。取阳性克隆的上清感染家蚕细胞扩增。即可得到大量的含sp-HA-tm融合基因的重组杆状病毒Bm-sp-HA-tm。该病毒能感染家蚕细胞,在显微镜下细胞呈发病状。
5.杆状病毒感染昆虫(家蚕)细胞
将杆状病毒以1×106PFU/条针刺接种法接入家蚕蛹,在感染5-7天后收集蚕蛹。
6.宿主细胞剩余膜即膜“小球”的分离
(1)从蚕蛹中分离纯化含有HA融合蛋白的膜成分
a.取适量经杆状病毒感染的蚕蛹样品,在4℃下解冻后,与0.85%生理盐水适量混和,匀浆至浆液细致均匀即可;
b.将匀浆液加入500ml离心管中,配平,3000rpm离心20-60min,取上清,小心弃去油脂;
c.将3000rpm离心上清液倒入新500ml离心管中,配平,6000rpm离心20-60min,取上清,弃油脂;
d.6000rpm离心的上清液倒入50ml离心管,配平,12000rpm离心30-120min,取上清,弃油脂;
e.12000rpm离心上清液转入新的50ml离心管,配平,18000rpm离心30-120min,取上清,弃油脂;
f.18000rpm离心后的上清,在超净台上分装于灭菌的超离管中,平衡,35000rpm离心30-90min;
g.35000rpm离心后,取上清,进行超滤。
(2)超滤
使用截留分子量为750kD中空纤维膜进行超滤,根据仪器说明书进行操作。先进行清洗,后加样,用适量无菌超纯水超滤。截留的液体将用于后面的实验。
HA融合蛋白检测
测活方法采用红细胞凝集试验。取24孔细胞培养板,在每一排的1到6孔(A1-A6)加250μl生理盐水(0.85%)后,加入250μl样品于第一孔,做倍比稀释,同时设置阴性对照孔,加入不含样品的液体做倍比稀释,再加入1%鸡红细胞(公鸡市售,抽血,制备成1%红细胞溶液)悬液250μl至每一孔内,轻轻震荡培养板,于37℃孵育4小时后观察结果。结果显示是阳性,说明截留的样品中有HA融合蛋白的表达,因HA是定位于膜上,则说明了截留的样品是膜蛋白。
7.HPLC与质谱分析膜蛋白
对于上述分离出的膜蛋白进行-80℃和+37℃反复冻融3次,12000rpm离心30min。沉淀部分用5%乙睛反复溶解,用于HPLC上样,按0.5ml/管收集样品。12000rpm离心的上清直接用于HPLC分析,按0.5ml/管收集样品。
收集到的蛋白溶液注入ABI公司所产的三级四极杆线性离子阱Q-TRAPTMLC/MS/MS系统进行EMS(Enhanced MS)、EMC(Enhanced Multi-charged)和EPI(Enhanced Product Ion)扫描分析。系统条件如下:Ion source:turbosprayTM interface,syringe pump flow rate:3ul/min,syringediameter:4.61.mm。EMS、EMC扫描条件为阳离子模式下Curtain Gas(CUR):10.0,Collision Gas(CAD):High,Ionspray Votage(IS):5500,ionsource Gas 1(GS 1):20;Declustering Potential(DP):30.0V,Entrance Potential(EP):10.0V,Collision Energy(CE):10.0eV;质荷比(m/z)采集范围为200-1700amu。EPI扫描模式条件为Curtain Gas:15.0,Collision Gas:High,Ionspray Votage:5500;ion source Gas 1(Gas1):20;Declustering Potential(DP):70.0V,Entrance Potential(EP):10.0V,Collision Energy(CE):40.0eV;质荷比(m/z)采集范围为50-1700amu。分析获得目的蛋白质的可能氨基酸序列,建成数据库。
8.数据检索
质谱所测得的可能性氨基酸序列与西南农大和本地的家蚕蛋白数据库进行比对,通过NPS@提供的跨膜区域分析软件及TMHMM服务器(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM)对蛋白进行跨膜分析,分析结果发现,约85%的蛋白为膜蛋白,具有跨膜区。
最后,还需要注意的是,以上列举的仅是本发明的具体实施例子。显然,本发明不限于以上实施例子,还可以有许多变形。本领域的普通技术人员能从本发明公开的内容直接导出或联想到的所有变形,均应认为是本发明的保护范围。
序列表
SEQ ID NO 1:
28 gcggatccat gctactagta aatcagtc
SEQ ID NO 2:
50 catgtgtaac agtaacgttc ttttccgcaa aggcagaatg cgccgccgcc
SEQ ID NO 3:
50 gtcgttacaa tgcagaattt gcattggtga tactgggcta tccaaaaatc
SEQ ID NO 4:
35 gagcggccgc ttactttcca agtcggttca tctct
SEQ ID NO 5:
26 gaaaagaacg ttactgttac acatgc
SEQ ID NO 6:
25 aatgcaaatt ctgcattgta acgac
Claims (4)
1、一种基于昆虫病毒出芽后细胞膜及细胞器膜蛋白的分离方法,其特征在于:通过重组杆状病毒Bm-sp-HA-tm感染昆虫宿主细胞后增殖,在病毒大量出芽后,宿主细胞膜破裂,经分离、超滤,获得细胞膜及细胞器膜蛋白。
2、根据权利要求1所述的基于昆虫病毒出芽后细胞膜及细胞器膜蛋白的分离方法,其特征依次包括以下步骤:
(1)重组杆状病毒Bm-sp-HA-tm1×106PFU/条针刺接种法感染昆虫宿主细胞,培养5-7天,收获细胞;
(2)将上述收获物在4℃下解冻后,与0.85%生理盐水混和,匀浆;3000rpm离心20-60min,取上清;6000rpm离心20-60min,取上清;12000rpm离心30-120min,取上清;18000rpm离心30-120min,取上清;35000rpm离心30-90min;35000rpm离心后,取上清,进行超滤,获得细胞膜及细胞器的膜蛋白。
3、根据权利要求1或2所述的基于昆虫病毒出芽后细胞膜及细胞器膜蛋白的分离方法,其特征在于所述的昆虫宿主细胞为家蚕蛹。
4、根据权利要求1或2所述的基于昆虫病毒出芽后细胞膜及细胞器膜蛋白的分离方法,其特征在于所述重组杆状病毒Bm-sp-HA-tm的构建方法包括以下步骤:
(1)以gp64DNA为模板,PCR扩增gp64信号肽,所用引物:
Psp1:5’gcggatcc atgctactagtaaatcagtc 3’;
Psp2:5’catgtgtaacagtaacgttcttttccgcaaaggcagaatgcgccgccgcc 3’;
(2)以gp64DNA为模板,PCR扩增gp64跨膜域,所用引物:
Ptm1:5’gtcgttacaatgcagaatttgcattggtgatactgggctatccaaaaatc 3’
Ptm2:5’gagcggccgc ttactttccaagtcggttcatctct 3’;
(3)以禽流感病毒H5N1HA基因为模板,PCR扩增HA基因,所用引物:
Pha1:5’gaaaagaacgttactgttacacatgc 3’
Pha2:5’aatgcaaattctgcattgtaacgac 3’
(4)以gp64信号肽和HA基因为模板,PCR扩增sp-HA融合基因,所用引物:
Psp1:5’gcggatcc atgctactagtaaatcagtc 3’;
Pha2:5’aatgcaaattctgcattgtaacgac 3’
(5)以sp-HA融合基因和gp64跨膜域为模板,PCR扩增sp-HA-tm融合基因,所用引物:
Psp1:5’gcggatcc atgctactagtaaatcagtc 3’;
Ptm2:5’gagcggccgc ttactttccaagtcggttcatctct 3’;
(6)将融合基因sp-HA-tm连接到pGEM-T vector上,转化至感受态细胞E.coli DH5α中,构建得克隆质粒pGEM-sp-HA-tm;
(7)克隆质粒pGEM-sp-HA-tm经BamH I和Not I双酶切切下sp-HA-tm融合基因片段克隆至经BamHI和Not I双酶切的pBacPAK8中,构建成重组转移质粒pBacsp-HA-tm;
(8)取重组转移质粒pBac-sp-HA-tm DNA和经Bsu36I酶切线性化的修饰型病毒BmBacPAK6DNA,加入无血清的TC-100培养基混匀,取Dosper加入无血清的TC-100培养基混均,将事先培养在平皿中的BmN细胞用无血清的TC-100培养基洗涤两次,并逐滴加入pBac-sp-HA-tm转移质粒和Dosper混合物,27℃培养4-5天,取上清感染平皿中的Bm N细胞,1小时后弃去上清加入等量混合的TC-100培养基和低熔点琼脂糖,4-5天后挑取噬斑,感染BmN细胞3-4天,保存上清,细胞用NaOH裂解用于Southern blot斑点杂交,以sp-HA-tm融合基因作模板用随机引物探针标记试剂盒标记探针,杂交;取阳性克隆的上清感染家蚕细胞扩增,即得到含sp-HA-tm融合基因的重组杆状病毒Bm-sp-HA-tm。
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