CN100455355C - 具有数据存储器的样本过滤器容器 - Google Patents

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CN100455355C CNB2004800332482A CN200480033248A CN100455355C CN 100455355 C CN100455355 C CN 100455355C CN B2004800332482 A CNB2004800332482 A CN B2004800332482A CN 200480033248 A CN200480033248 A CN 200480033248A CN 100455355 C CN100455355 C CN 100455355C
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Abstract

本发明提供了一种使用具有数据存储装置的过滤盘来制备生物样本的样品的设备。该数据存储装置存储与过滤器适应性、过期以及处理器步骤和参数相关的数据。存储装置可以被附着到或设置在过滤盘中。存储装置也可以与样品处理系统相连接。

Description

具有数据存储器的样本过滤器容器
技术领域
本发明涉及制备生物样本载玻片，更特别地，本发明涉及具有数据存储能力的样本过滤器容器。
背景技术
医学工作者和技术人员经常将生物样本保存在溶液或防腐剂中，并且随后使用过滤器从溶液中采集样本的样品或细胞。所采集或过滤的细胞被放置在载玻片或其他样本载体上。技术人员检查样本载玻片，以检测诸如恶性或恶性前期细胞，作为巴氏(Pap)涂片试验和其它癌检测试验的一部分。在很多情况下，样本样品必须使用适合特定样本或试验的特定过滤器来制备。为了区分过滤器并识别哪个过滤器可以被用于特定试验或样本，一些已知的系统使用彩色编码系统。例如，蓝色过滤器可以用于非妇科(non-GYN)样本，以及透明(clear)过滤器可以用于妇科样本。
然而，在传统系统中，通常要求技术人员检验出过滤器和样本没有超过其有效期并且彼此相适应，以及所需的试验或处理。此外，在检验样本和过滤器的有效性和适应性之后，通常要求技术人员确定试验参数或从其它来源获得参数。
发明内容
根据本发明的一个实施例，用于制备生物样本样品的设备包括：过滤器，过滤器容器和数据存储装置。与过滤器有关的数据存储在数据存储装置中。
根据本发明的另一实施例，提供了一种用于使用过滤器制备生物样本样品的设备，包括：样本过滤器；过滤器容器；数据存储装置，与容器相关；处理器；以及通信接口，例如连接到数据存储装置和处理器的串行数据、机械或无线接口。与过滤器有关的数据存储在数据存储装置中，并由处理器通过接口获取。
根据本发明的另一实施例，提供了一种使用样本过滤器制备保存在瓶中的生物样本的样品的方法。该方法包括：使数据存储装置与容纳有过滤器的容器相关联；将与过滤器相关的数据存储到数据存储装置；从数据存储装置获取所存储的数据；以及使用与制备样本有关的获取的数据。
在另一实施例中，用于制备生物样本样品的装置包括：样本过滤器和与该过滤器相关联的数据存储装置。与过滤器相关的数据存储在数据存储装置中以指示过滤器是否被使用。
在本发明的各种实施例中，过滤器可以是基于液体的(liquid-based)过滤器，以及数据存储装置可以是只读或读/写存储器。数据存储装置可以附着到容器表面或容器壁或位于容器中的凹口(recess)(例如，通常为直的或对称的凹口，或用于对准或定向的锥形凹口)内。此外，存储在数据存储装置中的数据可以指示：试验或适合(in compatible with)过滤器的试验的结合，适合过滤器的样本，过滤器是否过期，涉及过滤器或样本的多个处理步骤，以及涉及过滤器或样本的处理步骤的一个或多个参数。
附图说明
下面参照附图，其中在整个附图中，相同的参考标号表示对应的部件，以及在附图中：
图1A示出典型过滤器；以及图1B示出了包括具有数据存储装置的过滤器容器的设备；
图2A-B是根据本发明的替换实施例的过滤器盘的正视图和顶视图，其中过滤盘具有位于过滤盘的锥形凹口中的数据存储装置；
图3示出根据本发明的一个实施例的系统，其包括样本载玻片处理器和具有数据存储装置的过滤器容器；
图4是示出从过滤器容器的数据存储装置获取数据的流程图；
图5是示出制备具有样本样品的载玻片的流程图；以及
图6A示出生物样本瓶，以及图6B示出使用过滤器采集细胞样品并将所采集的样品转移到载玻片上的一种方式。
具体实施方式
下面将描述使用包括数据存储能力的过滤器包(package)或容器制备样本载玻片的设备和系统的实施例。存储在数据存储装置(例如，存储器装置)中的数据可以用于各种验证和处理目的。在下面的描述中，将参考附图进行描述，附图作为说明书的一部分，以图解可以实施本发明的特定实施例的方式被示出。应该明白，也可以使用其它实施例。
本领域普通技术人员应该意识到，所描述的实施例可以用来处理和分析各种类型的生物样本。例如，样本可以是被分析以识别癌症或其它医学状况的人类样本。样本也可以是由兽医分析的动物样本。为了描述的目的，所描述的实施例是关于患者的妇科(GYN)和非妇科(non-GYN)癌症相关的样本120，但不限于此。应当理解，所描述的实施例可以用于各种其它样本的采样和分析。
参考图1A-1B，设备100包括：盘(tray)、包或容器110(“过滤盘”)，用于容纳一个或多个样本过滤器，例如，细胞学或细胞过滤器120或其它适合的过滤器；以及数据存储装置130，其与盘相关联，例如，附着或嵌入盘110内。
更具体地，过滤盘110包括容纳过滤器120的孔或洞132。典型过滤器120包括基于液体的过滤器，例如由Cytyc公司(位于85Swanson Road，Boxborough，Massachusetts)提供的妇科(Gynecological，GYN)和非妇科(non-Gynecological，non-GYN)TransCyt过滤器。除了这些典型过滤器之外，也可以使用其它适合的过滤器。过滤盘可以被设计为根据需要容纳更多或更少的过滤器。因此，过滤盘通常具有正方形形状(如图所示)，或需要的其它形状。数据存储装置130可以附着到过滤盘的侧面、顶面或底面。可选地，数据存储装置130可以被嵌入或设置在过滤盘内。例如，如图1B所示，数据存储装置130可以设置在过滤盘110的凹口134内。
在图1B所示的实施例中，凹口134是形成在过滤盘的一个侧面中的通常为直的或对称的圆柱形凹口。凹口可以具有不同的形状，以与其它处理部件配合或接合。例如，在可选实施例中，如图2A-2B所示，锥形凹口134在盘内部变窄。换句话说，凹口的宽度和/或高度变窄，形成锥形形状。锥形凹口便于在载玻片处理机中插入过滤盘。具体地，锥形形状有助于在将过滤盘插入处理机中时，对准过滤盘。也可以使用其它凹口形状，包括“自对准”形状。
凹口134和数据存储装置130也可以根据过滤盘和处理系统是如何彼此接合的而设置在过滤盘110的不同区域中。此外，可以使用一个或多个额外的凹口或数据存储装置，使得例如，单个盘可以包括一个或多个数据存储装置，以提供额外的数据存储能力。
设备100支持生物样本和载玻片处理以及制备技术，该设备减少了用户或技术人员的工作量和误差。生物样本的样品可以更精确和有效地制备。例如，处理系统可以与数据存储装置连接并获取(retrieve)所存储的数据，以确定一个或多个过滤器是否已经过期并且不应使用，哪些试验和样品适合过滤器，以及处理步骤的参数。
与过滤盘110相关联的数据存储装置130可以存储与过滤器或处理步骤相关的各种类型的数据。例如，与一批或一组过滤器的编码或标识符有关的数据、试验或适合过滤器的试验的组合、适合过滤器的样本、制备样品载玻片的多个步骤、制备载玻片所涉及的步骤的操作参数、注册号码、数据完整性、以及加密或安全性都可以存储在数据存储装置中。存储器的不同容量和分配(allocation)可以用于不同的处理和应用。例如，在一个实施例中，数据存储装置可以存储与上述种类相关的大约529个字节的数据。存储器的529字节的典型分配如下。
存储器的12个字节可以被分配给一批或一组过滤器的编码或标识符。一批通常是一组具有相同保存期或过期日的过滤器。例如，一批过滤器可以在相同时间制造并具有相同的过期日。在一个实施例中，过滤器批号包括高达24位，并指示一批过滤器是否可以被使用或该批过滤器是否过期并应该被丢弃。
存储器的10个字节可以指示过滤器的适应性。例如，数据可以指示过滤器是否适于特定试验，以及过滤器是否适于特定样本。例如，在一个实施例中，数据可以识别大约80种过滤器和样本种类的组合，包括GYN样本和非GYN样本，例如，表面的、液体的和细针吸取(Fine Needle Aspirate，FNA)的、粘液状的(mucoid)和其它非妇科样本。事实上，不同数量组合可以被用于不同处理和部件。因此，过滤器适应性数据很灵活，适于不同的过滤器/样本和过滤器/试验组合。
存储器的一个或两个字节指示用于处理特定试验的样品载玻片的多个处理步骤(例如，可达32个步骤)。
存储器的480个字节可以指定处理步骤的操作参数，例如，在该实例中，用于32个处理步骤中的每一个步骤的操作参数。具体地，存储器的15个字节可以指定用于每个步骤的诸如时间、压力、等级、距离、温度、电压、电流等参数。
存储器的8个字节可以分配给注册号码，例如只读存储器(ROM)注册号码。一些存储器装置提供了识别单个ROM的唯一的注册号码(例如，64位)。因此，单个ROM以及与这些ROM相关联的过滤器的盘可以被跟踪并被精确识别。
存储器的16个字节可以分配有加密或安全编码，以确保只有授权的用户允许存取和/或改变所存储的数据。例如，具有加密密钥的经授权的人可以解密或解码被加密的数据。
本领域的普通技术人员应该想到，不同实施例可以使用不同类型、配置、大小和分配量的数据存储装置。一个典型数据存储装置是由Dallas Semiconductor公司(位于4401 South Beltwood Parkway，Dallas，Texas)提供的DS1985 iButton存储器装置。该存储器装置可以存储2k字节的数据，足够存储上述实例中描述的529字节的数据。因此，典型装置具有多余存储量，可根据需要存储其它类型的数据，例如，与附加过滤器相关的数据、试验、样本、处理参数等。其它典型数据存储装置可以包括诸如8管脚SOIC、TSOC和TO-92的存储器包。
特定实施例优选使用典型iButton存储器装置，这是因为其使用了唯一注册号码。唯一号码可以用来精确地跟踪ROM存储器装置。iButton存储器装置还因为其存储能力、相对较小的尺寸以及通过单一连接与存储的数据、功率和编程信号的接口连接而具有优势。如图1A所示，存储在过滤盘中的过滤器也可以用条形码标记，例如1维或2维条形码，或包括一些前面描述的有关过滤器的信息的另一标识符或编码，例如过滤器批号。
参考图3，系统300包括载玻片或样本处理器310(“处理器”)；接口或连接线320，位于处理器310和过滤盘110中的数据存储器或存储器130之间；以及接口330和332，例如电光接口，连接到数据存储装置和处理器。接口可以分别读取过滤器120以及瓶(vial)340上的条形码或识别码122和342。
根据处理器310和过滤盘110的设置，盘110可以被插入处理器310，或与处理器310分开并通过接口电缆或其它连接器连接。例如，在一个实施例中，处理器310是由Cytyc公司提供的ThinPrep3000载玻片处理器。ThinPrep 3000处理器是批处理系统，其能够同时处理多个载玻片/过滤器。在该系统中，过滤盘110被插入处理系统310的架构中。多个过滤器可以被用于同时制备多个样本样品。
为了确保盘适当地位于处理器架构内，盘可以被设计为特定形状，以使盘可以以一个正确的方向插入架构中。此外，凹口可以形成一定的形状和/或定位，以使盘仅以一个正确方向插入架构中。因此，对于如图1B和2B所示的正方形形状的过滤盘110，系统可以被设计为使得盘定位至载玻片处理器的架构“凹口/数据存储装置优先(first)”，以正确地闭合系统。例如，处理器的锁闩(latch)仅在过滤盘被适当设置时才能完全闭锁，从而通知技术人员盘被适当地装入。可选地，盘可以形成适当的形状，并在盘的多个或所有侧面上包括凹口和数据存储装置，以使用不同的盘位置。
可以使用各种接口以适应不同的处理器和过滤器配置。典型接口包括串行数据接口和无线接口。串行数据接口可以被用在过滤盘被插入或装入处理机中的系统中，例如ThinPrep 3000。其它处理器可以使用相同或不同的接口。例如，对于还是由Cytyc公司提供的ThinPrep 2000，过滤盘与处理系统分开，并且样本和过滤器部件是手动装入的。因此，当使用诸如ThinPrep 2000的处理器时，接口可以是条形码读入器(wand)接口或其它串行数据接口连接器或电缆，将分开的处理器和过滤盘的数据存储装置相连。也可以使用无线接口。
作为另一实例，处理器可以具有与过滤盘的凹/凹口配合的凸接口部件。凸和凹/凹口串行数据接口部件也可以包括电极或其它连接器(例如，一个信号电极和一个参考电极)(未示出)，以将处理系统连接到过滤盘中的数据存储装置。因此，当过滤盘被插入处理系统(例如，ThinPrep 3000)时，数据存储装置被连接到处理系统。锥形凹口对于配合以及对准该种类型处理器中的凸/凹连接器和电极特别有用。本领域普通技术人员应该明白前面所述的配置可以被应用或修改用于其它处理系统。
参考图3和图4，描述制备生物样本的样品的典型方法。首先，在步骤400中，具有数据存储装置的过滤盘插入载玻片处理器进行处理。如前所述，可以使用不同配置的载玻片处理器，但是为了说明的目的，该说明书中涉及过滤盘插入处理器的处理器，例如ThinPrep 3000。在步骤405，处理器建立与过滤盘的数据存储装置的通信，例如通过电极或到数据存储装置的其它连接。在步骤410中，处理器获取和读取存储在数据存储装置中的数据。在步骤415中，如果必要，则处理器检验循环冗余码校验(Cyclic RedundancyCheck，CRC)，以检验数据的完整性。在步骤420中，如果需要，对数据进行解密或解码。在步骤425中，获取的数据可以保存在处理器中，并被用来制备具有生物样本的样品的载玻片。该处理器可以使用可见或声音指示，提供来自数据存储装置的数据已经被获取、检验和解码的指示，例如，发光或发出嘟嘟声。
数据可以包括，例如，包括批号或过期信息的过滤器批信息、过滤器适应性信息、处理步骤数量、处理步骤参数、注册号码和CRC。根据需要，上述的步骤可以以不同的顺序执行。在读取、解码和检验数据存储装置中的数据之后，载玻片处理器如图5所示那样处理生物样品。
参考图5，在步骤500中，处理器读取容纳有样本的瓶上的条形码或其它编码或标识符，并识别样本批号。在步骤505中，处理器基于批号检验出样本没有过期。编码也可以识别样品的类型，例如，GYN或非GYN样品。患者号码或标识符也可以从条形码获得。如果样本还没有过期，系统进行到步骤510。
在步骤510中，识别样本可以使用的合适过滤器。因为盘可以具有不同类型和不同数量的过滤器，所以处理器可以继续到具有正确过滤器的预定位置。例如，数据存储装置可以存储具有不同过滤器的盘位置的映射或目录。处理器可以被编程或设计为搜索和定位用于特定试验或样本的正确过滤器。
在步骤515，从过滤盘的数据存储装置获取的数据中获取过滤器批号。在步骤520中，处理器将来自步骤515的数据与印制在过滤器上的批号相比较，并检验出过滤器还没有过期，以及适合样本类型和将执行的试验或处理。在步骤525中，处理器基于获取的数据，确定适当数量的处理步骤和/或处理步骤的参数。例如，在步骤530中，处理系统可以建立测试样品类型的算法，并产生用于每个处理步骤的参数表。表中的参数可以从ROM数据中得到。
在步骤535，如果需要，系统检验出所得到的处理参数在由处理算法建立的范围内。在步骤540中，使用参数执行载玻片处理步骤，以制备具有生物样本的样品的载玻片。步骤500-540根据要制备的附加样品和载玻片的需要而被重复。本领域普通技术人员应该理解，不必要以所述的顺序执行这些步骤。
图6A-B总体示出制备样本载玻片的一种方式。瓶300容纳有悬浮液或溶液602，例如由Cytyc公司提供的PreservCyt溶液，溶液中包括生物样本604。瓶可以用条形码342或包括关于样本的信息的其它标识符(例如，样本批号)标记。
使用时，瓶被打开，并将过滤器放入瓶中。过滤器可以被旋转以形成均匀的样本和溶液的混合物。然后，可以将过滤器抽成真空，使得样本细胞聚集在过滤器的底面上。随后，将过滤器从瓶中取出，将具有所收集的细胞的过滤器表面施加到载玻片上，以将细胞从过滤器转移到载玻片。美国专利第6,634,244号中提供了关于以该方式制备载玻片的其它细节。
本领域的普通技术人员应该理解，在此描述的发明思想和实施例可以用于不同类型的样本、过滤器、过滤盘、数据存储装置、载玻片处理系统和分析。例如，可以使用不同类型、配置和大小的数据存储装置。数据存储装置可以是只读或读/写集成电路、磁性或光学存储装置。此外，本领域的普通技术人员应该意识到，根据特定患者、试验和所执行的分析，其它数据也可以存储到存储装置130。此外，尽管为了安全的目的，本说明书主要涉及ROM装置，但是，如果必要，数据存储装置可以是读/写装置，并且可以被更新或被补充。
此外，本发明的实施例可以应用于大规模处理和文件编制系统。例如，从患者获得样本的医生可以将对应于该患者和/或样品的条形码或其它指标编码。然后技术人员可以扫描过滤器码并从过滤盘中的存储装置获取数据，并扫描医生制备的编码作为有效性和适应性检验的一部分。可替换地，特定编码可以被预留用于特定试验，以使关于主图表或目录的随后有效性和适应性(compatability)分析可以被执行。
此外，本发明的实施例可以通过将数据存储装置结合在过滤器中或上来实现，而不是通过使数据存储装置或与过滤器容器中的数据存储装置相结合来实现的。例如，处理系统可以读取并存储单独过滤器的编码或号码，例如，过滤器上或中的条形码或序列号。然后，所存储的过滤器数据可以被用来防止相同的过滤器被再次使用。
例如，如果过滤器被第二次使用，则处理器读取过滤器编码，该编码将与过滤器第一次被使用时先前存储的相同编码重复。然后处理器将因为编码匹配而拒绝该过滤器，并且使用具有不同编码的新的或不同的过滤器可以继续载玻片制备过程。此外，如果过滤器缺少编码，则过滤器可以被拒绝。
来自样本瓶的编码或号码也可以与过滤器匹配或与过滤器相关。因此，处理器可以扫描并存储过滤器和瓶的编码。该数据可以用于检验出过滤器仅被特定样本使用过一次。因此，如果处理器在后来读取到相同的过滤器编码，则该过滤器被拒绝。
防止或限制过滤器被重复使用也可以通过计算一批过滤器中被使用的过滤器的数量，或仅使用与特定编码或号码(例如，ROM注册号码)相关联的过滤器。例如，第一批或组过滤器可以使用ROM注册号码来唯一识别。处理器可以读取唯一的注册号码并使用该批次中的过滤器。当第一批过滤器被用光时，处理器可以被设计为拒绝任何额外的过滤器，直到使用具有新的唯一ROM注册号码的新过滤盘。因此，处理器防止第一批过滤器被循环使用。换句话说，唯一的ROM注册号码可以指示先前没有被使用的一组过滤器开始。

Claims (21)

1.一种用于制备生物样本样品的设备，包括：
生物样本过滤器，用于收集一部分将被检验的生物样本样品；
盘，限定用于容纳所述过滤器的孔；以及
数据存储装置，连接至或位于所述盘内，其中，与所述过滤器相关的数据存储在所述数据存储装置中。
2.根据权利要求1所述的设备，包括多个生物样本过滤器，用于收集将被检验的各个生物样本样品的一部分，所述盘限定用于各个过滤器的多个孔，以及所述数据存储装置存储与所述多个过滤器相关的数据。
3.根据权利要求2所述的设备，所述数据存储装置存储与所述多个过滤器中的每个相关的数据。
4.根据权利要求1所述的设备，所述过滤器包括基于液体的过滤器。
5.根据权利要求1到4中任一项所述的设备，所述数据存储装置包括读/写存储器。
6.根据权利要求1所述的设备，所存储的数据指示试验或适合所述过滤器的试验的组合。
7.根据权利要求1所述的设备，所存储的数据指示适合所述过滤器的样本。
8.根据权利要求1所述的设备，所存储的数据指示所述过滤器是否过期。
9.根据权利要求1所述的设备，所存储的数据指示涉及所述过滤器的多个处理步骤。
10.根据权利要求1所述的设备，所存储的数据指示涉及所述过滤器的处理步骤的一个或多个参数。
11.根据权利要求1所述的设备，所存储的数据包括所述数据存储装置的唯一注册号码。
12.根据权利要求1所述的设备，所述过滤器包括细胞学过滤器。
13.根据权利要求1到12中任一项所述的设备，还包括：
处理器；以及
通信接口，连接到所述数据存储装置和所述处理器，其中，与一个或多个过滤器相关的数据存储在所述数据存储装置中，并可以通过所述通信接口由所述处理器从所述数据存储装置获取。
14.根据权利要求13所述的设备，所述通信接口包括串行数据接口。
15.根据权利要求13所述的设备，所述通信接口包括机械接口。
16.根据权利要求13所述的设备，所述通信接口包括无线接口。
17.根据权利要求13所述的设备，其中，所述样本容纳在瓶中，并且其中所述瓶和所述过滤器均具有与自身相关联的各自的编码。
18.根据权利要求17所述的设备，包括多个接口，各个接口被设计为将瓶和过滤器的编码读入所述处理器。
19.根据权利要求18所述的设备，所述各个接口包括电光接口。
20.一种用于制备生物样本样品的设备，包括：
样本过滤器；
容器，用于容纳所述过滤器；
瓶，用于容纳所述生物样本样品，其中，所述瓶和所述过滤器每个均包括各自的编码；
数据存储装置，与所述容器相关，其中，与所述过滤器相关的数据被存储在所述数据存储装置中；
处理器；以及
通信接口，连接至所述数据存储装置和所述处理器中的每个，其中，与一个或多个过滤器相关的数据被存储在所述数据存储装置中并且可以从其通过所述通信接口由所述处理器被重新获得。
21.根据权利要求20所述的设备，包括多个接口，各个接口被配置为将各个瓶和过滤器编码读取至所述处理器。
CNB2004800332482A 2003-11-12 2004-10-01 具有数据存储器的样本过滤器容器 Expired - Fee Related CN100455355C (zh)

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