BRPI0913924B1 - método para determinação da probabilidade de que um indivíduo do sexo feminino irá experimentar um evento de nascimento com vida - Google Patents

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Abstract

método para determinação da probabilidade de que um indivíduo do sexo feminino irá experimentar um evento de nascimento com vida são fornecidos métodos e sistemas baseados em computador para facilitar a avaliação de infertilidade clínica. os métodos e sistemas podem ser implementados para, por exemplo, facilitar a avaliação de um indivíduo para um ciclo de tratamento de fertilização in vitro, incluindo determinar a probabilidade de um evento de nascido vivo. os métodos e sistemas podem ser implementados para, por exemplo, facilitar uma determinação de implantação com sucesso de embriões, seleção de um número ótimo de embriões para transferência, e determinação do sucesso em ciclos de tratamento de fertilização in vitro subsequentes após um ciclo de tratamento malsucedido.

Description

Relatório Descritivo da Patente de Invenção para MÉTODO PARA DETERMINAÇÃO DA PROBABILIDADE DE QUE UM INDIVÍDUO DO SEXO FEMININO IRÁ EXPERIMENTAR UM EVENTO DE NASCIMENTO COM VIDA.
REFERÊNCIA CRUZADA [0001] Este pedido reivindica o benefício do Pedido Provisório nos
U.S. 61/077.439, depositado em 1 de Julho de 2008, e 61/081.596, depositado em 17 de Julho de 2008, pedidos os quais são incorporados aqui por referência em sua totalidade.
DIREITOS GOVERNAMENTAIS [0002] A invenção foi criada com apoio governamental sob as concessões nos R01 GM067250 e R01 HD057970, concedidas pelos Institutos Nacionais de Saúde. O Governo dos Estados Unidos possui certos direitos no que concerne a invenção.
ANTECEDENTES DA INVENÇÃO [0003] A incapacidade de reprodução é um problema sério que vem sendo clinicamente estudado por várias técnicas de reprodução assistidas, incluindo a fertilização in vitro (FIV) e a transferência de embriões (TE). A expectativa é que esses procedimentos produzam altas taxas de concepção, uma vez que a fertilização in vitro fornece embriões aparentemente normais no nível morfológico para a transferência a um receptor completamente condicionado. Apesar dos esforços, a taxa de sucesso da FIV/TE não é a ideal. Segundo dados publicados sobre FIV/TE nos Estados Unidos e no Canadá em 1994, havia 26.961 ciclos de FIV padrão iniciados. Desses, 86,2% resultaram na recuperação, e desses, 90,2% resultaram na transferência. No entanto, a taxa de sucesso total em termos de gestação clínica foi de 22,7% por ciclo iniciado, e uma taxa de gestação de 29,1% por transferências.
[0004] Ademais, é apresentada uma alta incidência de perda de
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2/357 gestação no estágio inicial após a fertilização in vitro, com uma taxa de gestação bioquímica de 18% e taxa de abortos espontâneos de 27%. Dessa forma, a técnica de FIV aparenta ter sido otimizada, porém, as falhas de implantação podem ser a causa para o grande número de perdas com TE, fazendo com que a perda peri-implantacional seja uma área com potencial de melhoria. Um dos fatores principais da taxa de sucesso de diversas técnicas de reprodução assistida é a receptividade endometrial, um estado transitório que deve ser coordenado com o desenvolvimento do embrião para a blástula apta para implantação.
[0005] A FIV é um procedimento dispendioso e pode ser psicologicamente traumático para o paciente. Procedimentos cirúrgicos são necessários para a coleta dos óvulos de uma pessoa do sexo feminino para a FIV e, após a fertilização, outra cirurgia é necessária para implantar os óvulos fertilizados no útero. O receptor deverá então aguardar um período de tempo para a determinação da consolidação ou não da gestação. Em alguns casos, a gestação pode não ocorrer apesar de tentativas repetidas, e esses casos podem representar gastos consideráveis ao paciente e à sociedade, tanto em termos financeiros quanto humanos.
[0006] Portanto, enquanto as taxas de sucesso da FIV não sofrerem um aumento, é desejável a identificação de receptores aos quais a FIV tem pouca probabilidade de sucesso previamente ao tratamento, de forma que tais pacientes possam evitar os custos e os traumas supracitados decorrentes do procedimento da FIV.
[0007] A presente invenção é direcionada a essas necessidades.
SUMÁRIO DA INVENÇÃO [0008] Métodos e sistemas de informática para facilitar a avaliação da infertilidade clínica são fornecidos. Os métodos e sistemas podem ser implementados para, por exemplo, facilitar a avaliação de uma
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3/357 pessoa para o ciclo de tratamento de fertilização in vitro, incluindo a determinação da probabilidade do evento de nascimento com vida. Os métodos e sistemas podem ser implementados para, por exemplo, facilitar a determinação do sucesso na implantação de embriões, na seleção de número otimizado de embriões para transferência e na determinação do sucesso de ciclos de tratamento de fertilização in vitro subsequentes seguintes a um ciclo de tratamento malsucedido. [0009] Esses e outros objetivos, vantagens e características da invenção irão se tornar aparentes àqueles versados na técnica no decorrer da leitura dos detalhes da invenção, descritas com maiores detalhes abaixo.
BREVE DESCRIÇÃO DOS DESENHOS [00010] A invenção é melhor compreendida a partir das descrições detalhadas seguintes quando lidas em conjunto com os desenhos anexados. Deve ser enfatizado que, de acordo com a prática comum, vários traços dos desenhos não estão representados em escala. Pelo contrário, as dimensões de vários traços foram arbitrariamente expandidas ou reduzidas para fins de clareza. São incluídas nos desenhos as figuras que seguem.
[00011] A figura 1 mostra a fonte dos dados. O Painel A mostra os ciclos da FIV executados em 2005. O Painel B mostra a utilização de ovócitos e embriões em 665 ciclos de FIV novos e de não doadores. Todos os números do Painel A indicam o número de ciclos e os números no Painel B indicam o número de ovócitos ou embriões. Ciclos novos são definidos pela estimulação ovariana de gonadotrofinas e a transferência de embriões executadas no mesmo ciclo; ciclos de criopreservação utilizam os embriões obtidos e criopreservados em um ciclo anterior; ciclos de congelamento acontecem quando a estimulação ovariana foi executada, porém os embriões sofrem criopreservação ao invés de serem transferidos de
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4/357 volta dentro do mesmo ciclo, por motivos médicos ou não médicos. 157 ciclos foram removidos da análise por uma série de motivos médicos e não médicos que não resultaram na nova transferência de embriões.
[00012] A figura 2 mostra a distribuição de todos os embriões entre os 665 casos de FIV novos e de não doadores de acordo com o número de célula equivalente no Dia 3.
[00013] A figura 3 mostra variáveis e sua importância relativa na determinação de A) o número de embriões de 8 células (Painel A), FSH no dia 3 (Painel B) e o número total de embriões (Painel C).
[00014] A figura 4 mostra que um bloco translacional de ciclina A2 por Ccna2-MO ocasiona a retenção de embriões no estágio de 2 células. O Painel A mostra a expressão de Ccna2 em embriões de 1 a 2 células por RT-PCR. O Painel B mostra que a localização da ciclina nuclear A2 era inexistente em 83,4 ± 6,0% dos embriões injetados com Ccna2-MO, porém estava presente em todos os embriões não injetados; p<0,01). O Painel C mostra que ~50kD da proteína ciclina A2 não foi detectado em embriões injetados com Ccna2-MO.
[00015] Na figura 5, o painel A mostra que o Ccna2-MO induziu taxas maiores de retenção na etapa de 2 células quando comparadas com os controles (p<0,01). O Painel B mostra que somente 1,8 ± 1,8% dos embriões injetados com Ccna2-MO alcançaram o estágio de blástula (p=0.06 comparado com Ccna2-MM). O Painel C mostra que as taxas de retenção na etapa de 2 células diminuem com a concentração de Ccna2-MO (p=0,05 para 0,5 mM; p=0,01 para 0,25 mM). O Painel D mostra que a taxa de desenvolvimento de blástulas foram maiores em 0,25 mM do que em 0,75 mM (p<0,001). Todas as colunas e barras de erro representam meio ± s.e.m., respectivamente, de pelo menos três conjuntos independentes de experimentos. Barra de escala 40 pm. Observe a Tabela 1 para a sequência direcionada de
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5/357 todos os Mos utilizados, e a Tabela 7 para o número total de embriões testados em cada conjunto de experimentos.
[00016] A figura 6 mostra os mecanismos que regulam o desenvolvimento do embrião mamífero nos estágios iniciais. Nos embriões de tipo selvagem (+/-), transcrições maternas estão presentes antes da ativação do genoma embrionário (AGE), enquanto transcrições maternas e embrionárias estão presentes no estágio de transição materno-embrionário, ambos resultando na produção de produto de gene normal (Painel A). Nos embriões mutantes (-/-) com homozigotos nulos gerados de mãe que é heterozigota (+/-) para a mutação nula, transcrições maternas persistentes e/ou proteínas podem resgatar ou atrasar a ativação de fenótipos (Painel B). Em contraste, nos embriões mutantes com homozigotos nulos gerados por indivíduo do sexo feminino mutante homozigoto, ou indivíduo do sexo feminino com supressão de genes específicos de ovócitos, os defeitos observados podem refletir os defeitos dos ovócitos, e não uma necessidade de gene específico no embrião em estágio inicial (Painel C). Portanto, essas estratégias não são direcionadas aos papéis exatos de genes específicos na cúspide da AGE ou durante a AGE, quando tanto as transcrições maternas quanto as embrionárias em estágio inicial podem estar presentes simultaneamente. A micro injeção citoplásmica de oligômeros morfólicos antissenso (MOs) em embriões do tipo selvagem em ou antes dos resultados da EGA em blocos translacionais específicos de transcrições de gene maternas e embrionárias (Painel D). Já que os Mos persistem por pelo menos alguns ciclos da divisão celular, o bloco transicional específico para gentes é aparentemente eficaz até os estágios de mórula blástula. A falta do produto do gene durante os estágios de desenvolvimento irão revelar a função crítica do gene e desmascarar fenótipos iniciais que poderiam não ser detectados em estratégias direcionadas a genes
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6/357 pela recombinação homóloga e transgênese. Apesar de esse modelo estar bem estabelecido em outras espécies, ele muda o paradigma da função investigativa dos genes embrionários para os produtos de genes, independentemente de sua origem materna ou embrionária. [00017] A figura 7 mostra a estratégia experimental. Embriões no estágio com 2 pró-núcleos (2PN) ou 1 célula foram coletados de cópulas do tipo selvagem, e injetados com oligômero morfólico antissenso (MO) designado para ser direcionado a um gene específico. O MO se liga a 5' UTR ou local de início da transcrição e bloqueia a translação por impedimento histérico. Embriões micro injetados e embriões de controle não injetados foram cultivados in vitro e observados para fenótipos experimentais como fragmentação ou a retenção nos estágios de 2 células, 4 células, multicélulas, ou mórula. Caso o MO específico para genes produza o mesmo fenótipo consistentemente, enquanto o MO de controle de incompatibilidade permite o desenvolvimento normal, então o nocaute do gene de interesse foi validado por citoquímica imunológica e/ou mancha imune. O mecanismo da função de gene foi investigado mais profundamente através da obtenção de perfis de expressão de genes globais de embriões injetados e de controle no meio estágio de 2 células (43 horas após a HCG). Genes a jusante candidatos foram testados para expressões diferenciais e a função do gene no embrião de estado inicial.
[00018] A figura 8 mostra a expressão Oct4 em zigotos de camundongos por embriões únicos de RT-PCR.
[00019] A figura 9 mostra que a Oct4 é necessária para o desenvolvimento embrionário inicial anterior a formação da blástula. O Painel A mostra que os embriões injetados com Oct4-MO detidos no estágio de multicélulas, que controla o estágio de blástulas alcançadas. O Painel B mostra que o Oct4 nocaute induziu maiores
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7/357 taxas de retenção nos estágios de 1 ou multicélulas; p<0,01. O Painel C mostra que nenhum dos embriões injetados com Oct4-MO apresentou desenvolvimento para blástulas. O Painel D mostra que as taxas de retenção nos estágio de 1 ou multicélulas diminuíram com a concentração de Oct4-MO (p<0,01). O Painel E mostra que houve uma tendência não significante de taxas maiores de desenvolvimento de blástulas com concentrações reduzidas de Oct4-MO.
[00020] A figura 10 mostra que a expressão de OCT4 reduzida é evidente em embriões injetados com Oct4-MO no estágio de 4 células. O sinal de OCT4 não existe em embriões injetados com Oct4-MO, porém, sua localização nuclear estava presente em controles de não injetados e de incompatibilidade. Barra de escala 40 pm.
[00021] A figura 11, Painel A, mostra que a expressão de OCT4 nuclear não existe em embriões injetados com Oct4-MO (painel superior) mas está presente em embriões injetados com Oct4-MO e não injetados. O Painel B mostra que quando comparada com nenhuma co-injeção ou co-injeção de mEYFP mRNA, a co-injeção de 36 ou 3.6 ng/pL de Oct4 mRNA resultou no resgate parcial dos fenótipos induzidos por Oct4-MO especificamente através da diminuição das taxas de retenção nos estágios de 1 ou multicélulas, que resultam em maiores taxas de desenvolvimento de blástulas (p<0,01). O Painel C mostra que a superexpressão de Oct4 mRNA induz maior retenção de desenvolvimento em formas dependentes de dose, de forma que as taxas de blástulas são significativamente menores após a injeção de Oct4 mRNA em 36 ou 90 ng/pL, quando comparada com a superexpressão de mEYFP (p<0,01). A superexpressão dos genes foi validada por q-PCR ou citoquímica imunológica (informações não apresentadas). (Barra de escala = 40 pm).
[00022] A figura 12 mostra a redução da expressão de Oct4no
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8/357 estágio de multicélulas em embriões injetados com Oct4-MO. Somente 6,4 ± 3,2% dos embriões injetados com Oct4-MO apresentaram sinal de Oct4 nuclear, enquanto 88,9 ± 11,1% dos embriões injetados com Oct4-MO apresentaram sinal de Oct4 nuclear claro no estágio de multicélulas; p<0,05.
[00023] A figura 13 mostra a confirmação de que a necessidade de Oct4 no desenvolvimento do embrião no estágio inicial por Oct4E4MO, um morfolino antissenso direcionado ao local de junção do exon 4 de Oct4. O Painel A mostra os locais que são alvo dos dois morfolinos, Oct4-MO e Oct4E4-MO. O Oct4-MO é direcionado aos 25 nucleotídeos que se iniciam no local de início do ATG, enquanto o Oct4E4-MO é direcionado ao local de junção no limite intron (I)-exon (E) do quarto exon (E4). É esperado que a remoção do E4 resulte em um produto de proteína que não contém domínios de ligação de DNA e ativação. O Painel B mostra que 64,6 ± 19,9% dos embriões injetados com Oct4E4-MM, embora nenhum que tenha sido injetado com o controle de incompatibilidade, Oct4E4-MM, tenha sido detido no estágio de 2 células. O Painel C mostra que o desenvolvimento de blástulas é severamente comprometido após a injeção de Oct4E4-MO quando comparado com o controle de incompatibilidade, Oct4E4-MM.
[00024] A figura 13 mostra a confirmação da necessidade de Oct4 no desenvolvimento do embrião no estágio inicial por Oct4E4-MO, um morfolino antissenso que é direcionado o local de junção do exon 4 do Oct4. O Painel A mostra os locais que são alvos dos dois morfolinos, Oct4-MO e Oct4E4-MO. O Oct4-MO é direcionado aos 25 nucleotídeos que se iniciam no local de início do ATG, enquanto o Oct4E4-MO é direcionado ao local de junção no limite intron (I)-exon (E) do quarto exon (E4). É esperado que a remoção do E4 resulte em um produto de proteína que não contém domínios de ligação de DNA e ativação. O Painel B mostra que 64,6 ± 19,9% dos embriões
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9/357 injetados com Oct4E4-MM, embora nenhum que tenha sido injetado com o controle de incompatibilidade, Oct4E4-MM, tenha sido detido no estágio de 2 células. O Painel C mostra que o desenvolvimento de blástulas é severamente comprometido após a injeção de Oct4E4-MO quando comparado com o controle de incompatibilidade, Oct4E4-MM. [00025] As figuras 14 e 15 mostram a regulação do gene por Oct4. A figura 14, no Painel A, mostra a agregação não supervisionada de 3 Oct4 nocaute, 3 Ccna2 nocaute, e 6 amostras de embriões agrupados não injetados (NI), e expressão de gene aumentada (vermelho) e reduzida (azul). A escala tem afastamento padrão. A figura 14, no Painel B mostra a interseção de genes expressados diferentes em embriões de Oct4 e Ccna2 nocaute. A figura 14, no Painel C, e a figura 15 mostram a expressão relativa de Oct4 nocaute por um único embrião q-PCR para os genes super expressos (p<0,05 para Hes5) da FIG14, Painel C, e a regulação decrescente dos genes (*p<<0,001, **p<0,05, ***p<0,1). Repressão de TR translacional. Barras de erro indicam s.e.m.
[00026] A figura 16 mostra os modelos da função Oct4 no estágio de 1 a 2 células. O Painel A mostra que os genes cuja Absoluta (ACT) (vermelho) é maior do que o seu s.e.m. (azul) são ordenados em sentido horário baseado no aumento do s.e.m. (Escala logarítmica). O Painel B mostra a regulação proposta de vários módulos por Oct4 através de mecanismos transcricionais e não transcricionais.
[00027] A figura 17 mostra um resumo da fonte de dados da análise de nascimentos com vida. Os números nas caixas indicam o número de novos ciclos executados no centro Stanford FIV entre 2003-06. Os ciclos não incluídos eram referentes a: portadoras gestacionais, TE Crio. ou transferência de embriões criopreservados (ciclos que utilizaram embriões congelados, independente do ciclo ter sido executado em Stanford ou em outro local), ovócitos doados (ovócitos
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10/357 não próprios), ciclos recipientes e ciclos nos quais não foi injetado gonadotrofina. 9 ciclos foram excluídos da análise por motivo de entradas duplicadas e resultados desconhecidos. Os ciclos analisados foram também classificados como Ciclos 1, 2, 3 ou além, dependendo do número de vezes que o paciente retornou para um novo ciclo de FIV.
[00028] A figura 18 mostra um resumo do resultado de nascimentos com vida. Caixas diferentes representadas como C1 (primeiro ciclo de FIV), C2 (segundo ciclo de FIV), e C3 (terceiro ciclo de FIV). Cada caixa apresenta o número de ciclos resultantes em nascimentos com vida (LB+) ou sem nascimentos com vida (LB-), com a porcentagem do número total (N) de ciclos analisados e o número de pacientes que desistiram e não retornaram.
[00029] A figura 19 é um gráfico que apresenta a distribuição de embriões no que diz respeito ao estágio de desenvolvimento. A distribuição de 2969 casos de FIV novos e de não doadores de todos os três ciclos de acordo com o seu número celular no dia 3 da cultura in vitro. O número de células por embrião e o número máximo de embriões (~40%) com 8 células foi similar entre os ciclos C1 (sem padrão de preenchimento), C2 (padrão de preenchimento horizontal), e C3 (padrão de preenchimento vertical).
[00030] A figura 20 mostra os modelos de prognóstico e sua relação temporal com o ciclo de FIV padrão. Um ciclo de FIV compreende uma regulação decrescente de gonadotrofinas endógenas e o ciclo menstrual com auxílio da pílula anticoncepcional oral (PAO), injeções periódicas de FSH e monitoramento do ciclo por ultrassonografia com ou sem estradiol em soro, seguido de injeções de hCG para estimular a oscilação de LH endógeno, restauração do ovócito, fertilização por FIV ou ISCI, cultura de embriões in vitro, transferência de embriões, e a criopreservação de embriões em excesso. As três estrelas pretas
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11/357 representam os pontos em que os pacientes podem tomar uma decisão informada sobre outras opções de tratamento e se desejam continuar o tratamento. O modelo pré-FIV se estende até a data de início do tratamento. O modelo pré-RO (restauração dos ovócitos) se estende até a injeção de hCG. O modelo pós-FIV inclui todas as variáveis até a transferência dos embriões.
[00031] As figuras 21A, 21B, e 21C mostram árvores de decisão para três grupos de análise: pré-FIV (21A), pré-RO (21B) e pós-FIV (21C). Os gráficos setoriais mostram a porcentagem de nascimentos com vida (LB) entre o número total (N) de ciclos analisados. As populações terminais são rotuladas como população 1 (Pop 1) etc., dentro da sua taxa indicada de nascimentos com vida.
[00032] A figura 22 mostra a inclusão e a exclusão dos critérios para o conjunto de dados de 2007.
[00033] A figura 23 mostra que os modelos pré-FIV, pré-RO e pósFIV identificam populações distintas com taxas de nascimento com vida diferenciais.
[00034] As figuras 24A, 24 B e 24C mostram a comparação das taxas de nascimento com vida entre os modelos de pré-FIV (figura23A), pré-RO (figura23B), pós-FIV e um modelo de controle baseado em idade.
[00035] A figura 25 mostra que o modelo pós-FIV da distribuição da população C1 prevê taxas de nascimentos com vida diferenciais em C2 e taxas de nascimentos com vida acumulados em ciclos subsequentes (C2 e C3).
[00036] A figura 26 mostra os resultados dos experimentos com chips de genes no estágio de 1 célula.
[00037] A figura 27 mostra os resultados dos experimentos com chips de genes no estágio de 4 células.
[00038] A figura 28 mostra os resultados dos experimentos com
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12/357 chips de genes no estágio de 8 células.
[00039] A figura 29 mostra a correlação de dois experimentos de chip de gene mostrando a expressão de um painel de genes em vários estágios de célula.
[00040] A figura 30 mostra a correlação de dois experimentos de chip de gene mostrando a expressão de um painel de genes em vários estágios de célula.
[00041] Antes da descrição das presentes modalidades deve ser compreendido que essa invenção não é limitada às modalidades especificamente listadas, de forma que pode, obviamente, variar. Deve também ser compreendido que a terminologia descrita aqui serve o único propósito de descrever modalidades específicas e não tem a intenção de ser limitante, uma vez que o escopo da presente invenção irá ser limitado somente pelas reivindicações anexadas.
[00042] Quando uma gama de valores for fornecida, deve ser compreendido que cada valor interveniente, até a décima parte da unidade do limite mais baixo, a não ser que o contexto indique ao contrário, entre os limites maiores e menores da gama será também especificamente divulgado. Cada gama menor entre qualquer valor divulgado, ou valor interveniente na gama divulgada, é abrangida pela invenção. Os limites maiores e menores dessas gamas menores podem ser incluídos ou excluídos independentemente na gama, e cada gama em que um, nenhum ou ambos os limites sejam incluídos nas gamas menores é também abrangida na invenção, sujeita a qualquer limite especificamente excluído na gama determinada. Quando a gama determinada incluir um ou ambos os limites, as gamas que excluem um ou ambos os limites incluídos, será também incluída na invenção.
[00043] A não ser que seja definido de outra forma, todos os termos técnicos e científicos utilizados aqui possuem o mesmo significado
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13/357 comumente compreendido por aqueles com conhecimentos normais da técnica à qual a invenção pertence. Apesar de qualquer método e material similar ou equivalente aqueles descritos aqui poderem ser utilizado na prática ou em testes da presente invenção, alguns métodos e materiais potenciais e preferenciais serão descritos. Todas as publicações mencionadas aqui são incorporadas a este por referência para a divulgação e descrição dos métodos e/ou materiais conectados com as publicações citadas. Deve ser compreendido que a presente divulgação substitui qualquer divulgação de publicação anexada no que diz respeito a contradições.
[00044] Deve ser observado que, de acordo com o utilizado aqui e nas reivindicações anexadas, as formas singulares de um, uma, e o, a incluem as referências no plural, a não ser que o contexto claramente especifique ao contrário. Assim, por exemplo, uma referência a uma célula inclui uma pluralidade de tais células, e um referência a um composto faz referência a um ou mais compostos ou equivalentes deste conhecidos por aqueles versados na técnica, e assim por diante.
[00045] Também deve ser observado que as reivindicações podem ter sido projetadas para excluir qualquer elemento adicional. Assim, esta afirmação tem a intenção de servir como base de antecedentes para o uso de tais terminologias exclusivas como somente, apenas e similares em conexão com a recitação dos elementos das reivindicações, ou o uso de limitações negativas.
[00046] As publicações discutidas aqui são fornecidas unicamente para a divulgação prévia à data do depósito da presente aplicação. Nada aqui deve ser considerado como uma admissão de que a presente invenção não pode preceder tal publicação por virtude de uma prévia invenção. Ademais, as datas de publicação fornecidas podem diferir das datas da real publicação, que podem ter a
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14/357 necessidade de confirmação independente.
DEFINIÇÕES [00047] Os termos pessoa, indivíduo, e paciente são utilizados de forma intercambiável aqui com referência a um mamífero sendo avaliado para tratamento e/ou sendo tratado. Em uma modalidade, o mamífero é humano, como uma pessoa humana do sexo feminino. Os termos pessoa, indivíduo, e paciente, portanto, englobam indivíduos com necessidade de avaliação de infertilidade clínica, incluindo aqueles que passaram ou são candidatos ao ciclo de fertilização in vitro.
[00048] Como utilizado aqui, o termo correlacionado, ou se correlaciona com, e termos similares, refere-se à associação estatística entre as circunstâncias de dois eventos, nas quais os eventos envolvem números, conjuntos de dados e similares. Por exemplo, quando os eventos envolvem números, uma correlação positiva (também referida aqui como correlação direta) significa que na medida em que um aumenta, o outro aumenta também. Uma correlação negativa (também referida aqui como correlação inversa) significa que na medida em que um diminui, o outro diminui.
[00049] Uma amostra biológica engloba uma variedade de tipos de amostras obtidas de um indivíduo. A definição engloba sangue e outras amostras líquidas de origem biológica, amostras de tecido sólido como espécimes de biópsia ou culturas de tecido ou células derivadas deste e a prole deste. A definição também inclui amostras que tenham sido manipuladas de qualquer maneira após seu aprovisionamento, como tratadas com reagentes; lavadas; ou enriquecidas por certas populações celulares, como células cancerígenas. A definição também inclui amostras que tenham sido enriquecidas para tipos específicos de moléculas, como ácidos nucleicos, polipeptídios etc. O termo amostra biológica engloba uma
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15/357 amostra química, e também inclui tecido obtido por resseção cirúrgica, tecido obtido por biópsia, células em cultura, células sobrenadantes, lisados de células, amostras de tecido, órgãos, medula óssea, sangue, plasma, soro e similares. Uma amostra biológica inclui uma amostra obtida do útero de um paciente, incluindo culturas de embriões.
[00050] Os termos produto dos genes e produto de expressão são utilizados de forma intercambiável aqui com referência a um gene para se referir a produtos da transcrição de RNA (transcrições) do gene, incluindo mRNA e produtos da translação polipeptídica de tais transcrições de RNA, caso tal produto seja modificado pós-translação ou não. Os termos produto dos genes e produto de expressão são utilizados de forma intercambiável aqui com referência a um RNA, especificamente o mRNA, para se referir a produtos da translação polipeptídica de tal RNA, caso tal produto seja modificado póstranslação ou não. Um produto de genes pode ser, por exemplo, um RNA não combinado, um mRNA, uma variação de combinação de RNA, um polipeptídio, um polipeptídio modificado pós-translação, uma variação de combinação de polipeptídio etc.
[00051] Como utilizado aqui, o termo nível de expressão normalizado refere-se a um nível de expressão de um gene de indicador de resposta relativo ao nível de um produto de expressão de gene(s) referenciado(s).
[00052] Como utilizado aqui, os termos rótulo e rótulo detectável refere-sem a uma molécula capaz de ser detectada, em que tais moléculas incluem, mas não são limitadas a, isótopos radioativos, fluorescentes (fluoróforos), quimioluminescentes, cromóforos, corantes, íons metálicos, soluções metálicas, aglutinantes (como biotinas, avidinas, estreptavidinas ou haptenos), corantes intercalados e similares. O termo florescentes ou fluoróforos refere-se a uma substância ou parte desta que seja capaz de exibir fluorescência em
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16/357 amplitude detectável.
[00053] Como utilizado aqui, o termo região de ácido nucleico alvo ou ácido nucleico alvo refere-se a um ácido nucleico com uma sequência alvo a ser detectada (como em um método que envolva hibridação e/ou amplificação de ácido nucleico). O ácido nucleico alvo pode ser tanto de filamento único ou duplo filamento e pode ou não incluir outras sequências diferentes da sequência alvo (por exemplo, o ácido nucleico alvo pode ou não incluir sequências de ácido nucleico e sequência a montante ou de flanqueamento 5', e pode ou não incluir sequência a jusante ou de flanqueamento 3'. Quando a detecção é por amplificação, as outras sequências, adicionalmente à sequência alvo, pode ou não ser ampliada com a sequência alvo.
[00054] O termo iniciador ou iniciador de oligômero utilizado aqui refere-se a um oligômero que age de forma a iniciar a síntese de um filamento de ácido nucleico complementar quando exposto a condições em que a síntese de um produto de extensão de iniciador seja induzida, como na presença de nucleotídeos e um agente indutor de polimerização como polimerase de DNA ou RNA e em temperatura, pH, concentração de íons metálicos e concentração de sal adequados. Iniciadores são geralmente de comprimento compatível com seu uso na síntese de produtos de extensão de iniciador, e podem ter uma gama de entre 8 nucleotídeos e entre 100 nucleotídeos (nt) de comprimento, como entre cerca de 10 nt a cerca de 75 nt, cerca de 15 nt a cerca de 60 nt, cerca de 15 nt a cerca de 40 nt, cerca de 18 nt a cerca de 30 nt, cerca de 20 nt a cerca de 40 nt, cerca de 21 nt a cerca de 50 nt, cerca de 22 nt a cerca de 45 nt, cerca de 25 nt a cerca de40 nt, e assim por diante, como na gama de cerca de 18 nt a cerca de40 nt, entre cerca de 20 nt e cerca de 35 nt, entre cerca de 21 e cercade nt em comprimento, inclusive, e qualquer comprimento dentre as gamas listadas. Iniciadores podem ser de uma gama de cerca de 10
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17/357 nucleotídeos, como cerca de 15-45, cerca de 18-40, cerca de 2030, cerca de 21-25 nt, e assim por diante, e qualquer comprimento entre as gamas listadas. Em algumas modalidades, os iniciadores não são maiores que 10, 12, 15, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, ou 70 nucleotídeos em comprimento. Nesse contexto, o termo cerca de pode ser interpretado como 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 ou 20 nucleotídeos a mais com 5' ou 3' de cada término ou de ambos os términos.
[00055] Os iniciadores são, em muitas modalidades, de filamento único para máxima eficiência na amplificação, mas podem, como alternativa, serem de duplo filamento. Caso sejam de duplo filamento, o iniciador é, em muitas modalidades, previamente tratado para separar seus filamentos antes de ser utilizado para preparar os produtos de extensão. Essa etapa de desnaturação é tipicamente afetada pelo calor, mas pode, como alternativa, ser conduzida com o uso de bases alcalinas, seguido da neutralização. Assim, um iniciador é complementar ao modelo e complexos através de ligações de hidrogênio ou hibridação com o modelo para proporcionar a iniciação da síntese por polimerase de um complexo de iniciador/modelo, que é estendido por adição covalente de bases na sua extremidade 3'.
[00056] Um par de iniciadores, Como utilizado aqui, refere-se a um primeiro e a um Segundo iniciador com sequência de ácido nucleico adequada para a amplificação baseada em ácido nucleico de um ácido nucleico alvo. Tais pares de iniciadores geralmente incluem um primeiro iniciador com sequência que é igual ou similar a uma da primeira parte do ácido nucleico alvo, e um segundo iniciador com sequência que é igual ou similar a uma da segunda parte do ácido nucleico alvo para fornecer a amplificação do ácido nucleico alvo ou um fragmento deste. As referências feitas ao primeiro e ao segundo
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18/357 iniciadores feitas aqui são arbitrárias, a não ser que especificamente indicado de outra forma. Por exemplo, o primeiro iniciador pode ser projetado como iniciador de envio (que inicia a síntese do ácido nucleico de uma extremidade 5' de um ácido nucleico alvo) ou como um iniciador de reversão (que inicia a síntese do ácido nucleico alvo de uma extremidade 5' do produto de extensão produzido a partir da síntese iniciada no iniciador de envio). Da mesma forma, o segundo iniciador pode ser projetado como um iniciador de envio ou um iniciador de reversão.
[00057] Como utilizado aqui, o termo sonda ou sonda de oligômero, utilizados de forma intercambiável aqui, refere-se a uma estrutura que compreende um polinucleotídeo, como definido acima, que contém uma sequência de ácido nucleico complementar à sequência de ácido nucleico presente no analito de ácido nucleico alvo (como um produto de amplificação de ácido nucleico). Sondas geralmente têm um comprimento compatível com o seu uso na detecção específica de toda ou uma parte da sequência alvo de um ácido nucleico alvo, e estão, em muitas modalidades, na gama de entre 8 nt e entre 100 nt de comprimento, como cerca de 8 a cerca de 75 nt, cerca de 10 a cerca de 74 nt, cerca de 12 a cerca de 72 nt, cerca de 15 a cerca de 60 nt, cerca de 15 a cerca de 40 nt, cerca de 18 a cerca de 30 nt, cerca de 20 a cerca de 40 nt, cerca de 21 a cerca de 50 nt, cerca de 22 a cerca de 45 nt, cerca de 25 a cerca de 40 nt em comprimento, e assim por diante, como na gama de cerca de 1840 nt, cerca de 20-35 nt, ou cerca de 21-30 nt em comprimento, e qualquer comprimento dentre as gamas listadas. Em algumas modalidades, a sonda tem gama de entre 10-50 nucleotídeos, como cerca de 15-45, cerca de 18-40, cerca de 20-30, cerca de 21-28 nt, cerca de 22-25 e assim por diante, e qualquer comprimento entre as gamas listadas. Em algumas modalidades, os iniciadores não são
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19/357 maiores que 10, 12, 15, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, ou 70 nucleotídeos em comprimento. Nesse contexto, o termo cerca de pode ser interpretado como 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 ou 20 nucleotídeos a mais com 5' ou 3' de cada término ou de ambos os términos.
[00058] Quando for mencionado que um ácido nucleico se hibridiza a uma sequência de ácido nucleico referida, a hibridação acontece sob condições restritivas. Um exemplo das condições de hibridação restritivas é a hibridação em 50 °C ou mais e 0,1xSSC (15 mM cloreto de sódio/1.5 mM citrato de sódio). Outro exemplo de condições de hibridação restritivas é a incubação noturna em 42 °C em solução: 50% formamida, 5 x SSC (150 mM NaCl, 15 mM citrato de trisódio), 50 mM fosfato de sódio (pH7,6), 5 x solução de Denhardt, 10% sulfato de dextrano, e 20 pg/ml de corte de DNA de esperma de salmão desnaturalizado, seguido pela lavagem dos filtros em 0,1 x SSC em cerca de 65 °C. As condições de hibridação restritivas são condições de hibridação que sejam pelo menos tão restritivas quanto as condições representadas acima, em que as condições são consideradas como pelo menos tão restritivas caso sejam pelo menos 80% tão restritivas, como por exemplo, pelo menos 90% tão restritivas quanto as condições restritivas especificadas acima.
DESCRIÇÃO DETALHADA DA INVENÇÃO [00059] Como observado acima, métodos e sistemas de informática para facilitar a avaliação da infertilidade clínica são fornecidos. Os métodos e sistemas podem ser implementados para, por exemplo, facilitar a avaliação de uma pessoa para o ciclo de tratamento de fertilização in vitro. Os métodos e sistemas podem ser implementados para, por exemplo, facilitar a determinação do sucesso na implantação de embriões, na seleção de número otimizado de embriões para transferência e na determinação do sucesso de ciclos de tratamento
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20/357 de fertilização in vitro subsequentes seguintes a um ciclo de tratamento malsucedido.
[00060] Em certas modalidades, o método inclui a obtenção de componentes de informação de uma pessoa do sexo feminino para fornecer um perfil da pessoa do sexo feminino, em que cada componente da informação refere-se a variáveis de pacientes préselecionados, comparando o perfil da pessoa do sexo feminino a uma biblioteca de padrões de perfis conhecidos sabidos serem indicativos de resposta a um procedimento de fertilização in vitro com o uso de um algoritmo baseado em variáveis de pacientes pré-selecionados, em que a comparação fornece uma avaliação da pessoa do sexo feminino para o procedimento de fertilização in vitro. Em certas modalidades, o procedimento de fertilização in vitro é pelo menos o segundo procedimento de fertilização in vitro ao qual a pessoa sexo feminino é submetida.
[00061] Os componentes de informação podem ser fornecidos pela pessoa do sexo feminino através de questionário por escrito ou eletrônico, ou pode ser solicitado, transcrito, ou de outra forma registrado por um profissional da área médica, como um médico, uma enfermeira, um técnico, ou similares, durante ou concomitantemente à avaliação médica que pode ser opcionalmente associada com a determinação da submissão a um primeiro ou a um ciclo subsequente de fertilização in vitro.Componentes exemplares de informação relacionados às variáveis de pacientes pré-selecionados incluem, mas não são limitadas a: características dos pacientes, como idade, histórico prévio de infertilidade, diagnóstico clínico; informações de tratamento clínico, como tipos de medicação, número de dias de estimulação, número de ovócitos etc.; dados de morfologia dos embriões convencionais, como números de embriões, etapas de desenvolvimento, série e similares. Em algumas modalidades, as
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21/357 informações incluem idade, número total de embriões, taxa de retenção de clivagem, número de embriões de 8 células, nível do hormônio estimulador de folículos (FSH) no dia 3, e número de embriões de 8 células transferidos.
[00062] Em certas modalidades, o procedimento de fertilização in vitro apresenta um evento de nascimento com vida após o procedimento de fertilização in vitro. Em tais modalidades, o método fornece uma probabilidade de evento de nascimento com vida ocorrendo como resultado de uma primeira ou uma subsequente fertilização in vitro baseada pelo menos em parte nos componentes de informações das pessoas do sexo feminino.
[00063] Em algumas modalidades, uma pessoa do sexo feminino é uma paciente de procedimento de pré-fertilização in vitro (pré-FIV). Em certas modalidades, os componentes de informação relacionados a variáveis de pacientes pré-selecionados para determinar a probabilidade de um evento de nascimento com vida para um paciente de procedimento pré-FIV podem incluir idade, reservas de óvulos reduzidas, nível do hormônio estimulador de folículos 3 (FSH), índice de massa corporal, doença do ovário policístico, estação, infertilidade feminina não justificável, número de abortos espontâneos, período, outras causas de infertilidade feminina, número de gestações prévias, números de partos bem sucedidos, endometriose, doença tubária, ligação das trompas, infertilidade masculina, fibroide uterina, hidrossalpinge e motivos para infertilidade masculina.
[00064] Em algumas modalidades, a pessoa do sexo feminino é uma paciente de procedimento pré-cirúrgico (pré-OR também é conhecido aqui como recuperação pré-ovócita). Em algumas modalidades, os componentes de informação relacionados às variáveis de pacientes pré-selecionados para determinar a probabilidade do evento de nascimento com vida para um paciente de
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22/357 procedimento pré-OR podem incluir idade, espessura endométrica, número total de ovócitos, número total de gonadotrofinas administradas, número total de espermas móveis após a lavagem, nível do hormônio de estimulação dos folículos (FSH) no dia 3, índice de massa corporal, idade do parceiro, estação, número de abortos espontâneos, infertilidade feminina não justificável, número de partos prévios bem sucedidos, período, número de gestações anteriores, outras causas de infertilidade feminina, endometriose, infertilidade masculina, ligação das trompas, doença do ovário policístico, doença tubária, esperma de doador, hidrossalpinge, fibroideoides uterinas, e motivos para infertilidade masculina.
[00065] Em algumas modalidades, a pessoa do sexo feminino é uma paciente de procedimento de pós-fertilização in vitro (pós-FIV). Em algumas modalidades, os componentes de informação relacionados às variáveis de pacientes pré-selecionados para determinar a probabilidade do evento de nascimento com vida para um paciente de procedimento pós-FIV podem incluir taxa de desenvolvimento das blástulas, número total de embriões, número total de gonadotrofinas administradas, espessura endométrica, protocolo de flare, número médio de células por embrião, tipo de cateter utilizado, porcentagem de embriões de 8 células transferidos, nível do hormônio de estimulação dos folículos (FSH) no dia 3, índice de massa corporal, número de espermas móveis após lavagem, nota média dos embriões, dia da transferência do embrião, estação, número de abortos espontâneos, número de partos bem sucedidos, pílulas anticoncepcionais orais, coleta de espermas, porcentagem de óvulos não fertilizados, número de embriões detidos na etapa de 4 células, condensação no terceiro dia após transferência, porcentagem de fertilização normal, porcentagem de óvulos fertilizados anormalmente, porcentagem de ovócitos normais e maduros, número
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23/357 de gestações anteriores, ano, doença do ovário policístico, infertilidade feminina não justificável, doença tubária, somente infertilidade masculina, motivos para a infertilidade masculina, endometriose, outras causas de infertilidade feminina, fibroideoides uterinas, ligação das trompas, esperma de doador, hidrossalpinge, execução de ICSI, ou incubação assistida.
[00066] Exemplos adicionais de parâmetros são fornecidos na seção dos exemplos, incluindo as Tabelas 13 e 15.
[00067] Em certas modalidades, o método inclui a obtenção de componentes de informações relacionados a pelo menos duas variáveis de pacientes pré-selecionados, ou mais. Dessa forma, em outras modalidades, o método inclui a obtenção de componentes de informações relacionados a 3 ou mais variáveis de pacientes préselecionados, incluindo 4 ou mais, 5 ou mais, 6 ou mais, 7 ou mais, 8 ou mais, 9 ou mais, 10 ou mais, 12 ou mais, 15 ou mais, 17 ou mais, 20 ou mais, e similares.
[00068] Em certas modalidades, o método inclui a associação de uma importância relativa ponderada a cada variável de paciente préselecionado em relação a outras variáveis de pacientes préselecionados. Por exemplo, em uma análise de um sujeito modelo de pré-FIV, as variáveis de pacientes pré-selecionados de idade e reserva ovariana reduzida possuem um valor maior de importância relativa sobre as variáveis de pacientes pré-selecionados, como, por exemplo, índice de massa corporal, doença tubária e endometriose. Em tais modalidades, a soma da importância relativa de cada variável de paciente pré-selecionado será igual a 100.
[00069] Em outra modalidade, em uma análise de um sujeito modelo de pré-OR, as variáveis de pacientes pré-selecionados de quantidade total de gonadotrofinas, espessura endometrial e idade possuem um valor maior de importância relativa sobre as variáveis de
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24/357 pacientes pré-selecionados, como, por exemplo, número de gestações anteriores, ligação de trompas e número de abortos espontâneos. Em tais modalidades, a soma da importância relativa de cada variável de paciente pré-selecionado será igual a 100.
[00070] Ainda em outra modalidade, em uma análise de um sujeito modelo de pós-FIV, as variáveis de pacientes pré-selecionados de taxa de desenvolvimento de blástulas, número total de embriões, quantidade total de gonadotrofinas administradas e espessura endometrial possuem um valor maior de importância relativa sobre as variáveis de pacientes pré-selecionados, como, por exemplo, índice de massa corporal, número de espermas móveis antes da lavagem, nota média dos embriões e dia da transferência de embriões. Em tais modalidades, a soma da importância relativa de cada variável de paciente pré-selecionado será igual a 100.
[00071] Em algumas modalidades, a comparação inclui a aplicação de uma regra de decisão. Em algumas modalidades, o algoritmo da análise dos dados compreende o uso de uma árvore de decisão. Em outras modalidades, o algoritmo da análise de dados é não paramétrica, como a utilização do Teste de Postos com Sinais de Wilcoxon. Em certas modalidades, o algoritmo da análise dos dados detecta diferenças na distribuição dos valores apresentados. Em algumas modalidades, o algoritmo de análise dos dados inclui o uso de uma árvore de decisão de adição múltipla. Em algumas modalidades, o algoritmo da análise dos dados é uma regressão logística.
[00072] Em outras modalidades, o método inclui uma avaliação de um perfil de expressão de gene de um embrião retido de uma pessoa do sexo feminino. Por exemplo, embriões que foram retidos, por exemplo, embriões que possuem menos do que 5 células no terceiro dia seguinte a fertilização in vitro, são testados para o nível de
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25/357 expressão relativa de um painel de genes que são críticos ao desenvolvimento embrionário. O perfil da expressão do gene é então comparado ao perfil de expressão do gene de controle.
[00073] Qualquer gene para o qual o nível de expressão normalizada seja correlacionado (positivamente ou negativamente) com infertilidade ou probabilidade de sucesso ou falha de um ciclo de fertilização in vitro é adequado para o uso com os métodos da invenção. Genes exemplares incluem, mas não são limitados a, Oct4, Eif3c, Papola, Piwil2, Eif3b, Eif4b, Rbm3, Cpsf4 e outros genes que possam ter regulação decrescente ou crescente diante de Oct4 nocaute, ou o nocaute de outro gene codificado com um regulador de pluripotência (como Sall4). Outros genes exemplares incluem os listados nas tabelas 8A, 8B, 9A e 9B nos Apêndices A-D anexados, assim como na tabela 12. Esses produtos de genes são referidos aqui como produtos de genes indicadores de infertilidade; e genes codificados com os produtos de gene indicadores de resposta são referidos como genes indicadores de infertilidade. Os níveis de expressão normalizados de um ou mais desses genes de infertilidade podem ser determinados para avaliar um paciente do sexo feminino para um ciclo de tratamento de fertilização in vitro. Genes indicadores de infertilidade foram identificados conforme a descrição abaixo em exemplos. Outros genes que são adequados para o uso na análise podem ser identificados utilizando os métodos descritos aqui na seção de exemplos.
[00074] Ao conduzir uma avaliação de sujeito, uma amostra compreendendo um gene indicador de infertilidade é examinado para um nível de produto(s) de gene indicador de infertilidade. Quando o produto do gene sendo analisado for um ácido nucleico, uma amostra de ácido nucleico (como uma amostra compreendendo ácido nucleico) é obtida de uma célula embrionária. Quando um produto de gene
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26/357 sendo examinado for uma proteína, uma amostra polipeptídica (como uma amostra compreendendo polipeptídios) é obtida de um embrião. [00075] O ácido nucleico (incluindo mRNA) e/ou produtos de genes indicadores de infertilidade polipeptídios podem ser obtidas a partir de um embrião, incluindo um ovócito, como um embrião retido ou ovócito (como um embrião ou ovócito como menos de 8 células em cerca de trás dias seguintes à fertilização, incluindo cerca de 7 células, cerca de 6 células, cerca de 5 células, cerca de 4 células, cerca de 3 células etc.), com o uso de métodos padrão. Níveis de ácido nucleico e/ou produtos de gene polipeptídio podem ser medidos com o uso de qualquer variedade de métodos conhecidos, incluindo aqueles descritos nos exemplos abaixo.
[00076] Um nível de expressão de um gene indicador de resposta é normalizado com relação ao nível de produto de expressão de um(ns) gene(s) de referência. A análise da probabilidade de infertilidade é conduzida através da comparação do nível de expressão normalizado com a gama de valores de níveis de expressão normalizado do produto do gene em uma célula embrionária.
[00077] O nível de expressão normalizado de um ou mais genes indicadores de infertilidade pode ser conduzido de forma a analisar a probabilidade de um paciente responder positivamente ou negativamente a um ciclo de tratamento de fertilização in vitro. O nível de expressão normalizado de um único gene indicador de infertilidade pode ser conduzido para analisar a possibilidade de um paciente responder positivamente ou negativamente a um tratamento de fertilização in vitro. Ademais, o nível de expressão normalizado de dois ou mais genes indicadores de infertilidade pode ser conduzido para analisar a possibilidade de um paciente responder positivamente ou negativamente a um tratamento de fertilização in vitro. A análise pode ser mais restrita, como o número otimizado de embriões para
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27/357 transferência para o paciente do sexo feminino para maximizar a possibilidade de resultado de nascimento com vida ao mesmo tempo em que minimiza a possibilidade de gestações múltiplas. A análise pode ser menos restrita, como a possibilidade do paciente de apresentar uma resposta benéfica ao ciclo de tratamento de fertilização in vitro.
[00078] Em algumas modalidades, a análise inclui a determinação do número otimizado de embriões para transferência de forma a minimizar a probabilidade de eventos de gestação múltipla em um sujeito. Em tais modalidades, o sujeito é primeiramente identificado como um sujeito com alta possibilidade de apresentar eventos de gestação múltipla. O sujeito é então analisado para determinar o número otimizado de embriões para transferência de forma a fornecer um evento de nascimento único após o ciclo de fertilização in vitro.
[00079] Deve ser observado que a análise da possibilidade de um paciente responder positivamente ou negativamente ao ciclo de tratamento de fertilização in vitro pode ser conduzido através da determinação dos níveis de expressão normalizados de dois ou mais genes indicadores de infertilidade (como 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, ou mais genes indicadores de infertilidade), ou qualquer combinação de um ou mais conjuntos de genes indicadores de infertilidade. A análise pode envolver o estudo de níveis de expressão de uma combinação de genes indicadores de infertilidade, em que os produtos de genes indicadores de infertilidade podem incluir produtos de gene que são positivamente correlacionados com um ciclo de tratamento de fertilização in vitro. Por exemplo, um nível normalizado de um primeiro gene que se correlaciona positivamente com um ciclo de tratamento de fertilização in vitro e um nível normalizado de um segundo gene que se correlaciona negativamente com um ciclo de tratamento de fertilização in vitro podem ser determinados.
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Determinação de um nível normalizado de produto de gene [00080] Como discutido acima, o nível de expressão de um gene indicador de infertilidade é normalizado, fornecendo, portanto, um valor normalizado. O nível de expressão de um gene indicador de infertilidade é normalizado com relação ao produto de expressão de gene(s) referenciado(s).
[00081] Por exemplo, o nível de expressão de um gene indicador de infertilidade pode ser normalizado com relação ao nível médio dos produtos de gene de dois ou mais genes de referência. Como um exemplo, o nível de expressão de um gene indicador de infertilidade pode ser normalizado com relação ao nível médio dos produtos de gene de todos os genes estudados, ou a um subconjunto de genes estudados, em que um subconjunto de genes estudados pode incluir 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, ou mais genes estudados.
[00082] Genes de referência adequados incluem, mas não são limitados a, gliceraldeido-3-fosfato de-hidrogenase (GAPDH) (vide, por exemplo, Acesso GenBank No NM_002046; fosfoglicerato quinase 1 (vide, por exemplo, Acesso GenBank No NM_000291); lactato dehidrogenase A (vide, por exemplo, Acesso GenBank No NM_005566); proteína ribossomal L32 (vide, por exemplo, Acesso GenBank No NM_000994); proteína ribossomal S18 (vide, por exemplo, Acesso GenBank No NM_022551); tubulina, beta polipeptídio (TUBB) (vide, por exemplo, Acesso GenBank No NM_001069); e beta actina (vide, por exemplo, Acesso GenBank No NM_001101). Vide, por exemplo, Eisenberg e Levanon (2003) Trends in Genetics 19:362, para uma lista de mais genes de referência adequados.
[00083] O nível de uma transcrição de RNA medida através de TaqMan® RT-PCR refere-se a um valor de limiar de ciclo (Ct). Quanto menor o Ct, maior será a quantidade de transcrição de RNA presente em uma amostra. O valor de expressão de uma transcrição de RNA
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29/357 em uma amostra é normalizado, por exemplo, primeiramente pela determinação de um valor de expressão de meio em Ct de genes de referência designados em uma amostra (CtRef). O valor de expressão normalizado para um gene (CtGene) é então calculado como CtGene -Ct CtRef. Opcionalmente, os valores de expressão normalizados para todos os genes podem ser ajustados, como de forma que todos os Ct normalizados ajustados tenham valor>0.
Determinação da probabilidade de uma resposta benéfica [00084] Um nível normalizado de um produto de gene indicador de infertilidade determinado para um paciente individual pode ser comparado com valores de nível de expressão normalizada para o gene indicador de infertilidade determinado em uma população de pacientes para os quais o resultado clínico já seja conhecido de forma a determinar a probabilidade de um paciente individual de resposta benéfica a um ciclo de tratamento de fertilização in vitro. Valores de nível de expressão normalizados (por exemplo, expressados como Ct) correlacionados com a probabilidade podem ser utilizados. Por exemplo, um nível normalizado de um produto de gene indicador de resposta pode ser comparado graficamente de forma a determinar a probabilidade de resposta benéfica a um ciclo de tratamento de fertilização in vitro.
[00085] As análises e determinações descritas aqui relacionadas com o método sujeito para avaliar a possibilidade de resposta pode ser executado sem a necessidade de qualquer mudança no nível de um gene indicador de resposta com o tempo.
Análise de Árvore de Decisão [00086] Uma das possibilidades de análise desses dados é o uso de um algoritmo de árvore de decisão que busca padrões e relacionamentos em grandes bancos de dados. Uma árvore de decisão é uma divisão recursiva para avaliar uma pessoa do sexo
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30/357 feminino para um procedimento de fertilização in vitro utilizando uma série de questões que são formuladas para classificar adequadamente o paciente em uma das categorias. Cada questão questiona se as condições dos pacientes satisfazem certos indicadores, com cada resposta sendo utilizada para direcionar o usuário à árvore de decisões até que a classificação do paciente possa ser determinada. Como utilizado aqui, um indicador é uma gama de valores das características — como, por exemplo, idade, número total de embriões, taxa de retenção de clivagem, número de embriões de 8 células, nível do hormônio estimulador de folículos (FSH) no terceiro dia e número de embriões de 8 células transferidos.
Árvore de Regressão de Adições Múltiplas [00087] Uma técnica de modelagem flexível e automática que utiliza árvores de regressão de adições múltiplas (MART) também pode ser utilizada para classificar conjuntos de características como pertencentes a uma ou duas populações. Um modelo MART utiliza uma projeção inicial que especifica uma constante que é aplicada a todas as previsões, seguido por uma série de árvores de regressão. Sua adequação é específica para o número de pontos de decisão em cada árvore, o número de árvores a adequar e uma constante de granularidade que especifica o quão radicalmente uma árvore específica pode influenciar o modelo MART. Para cada interação, uma árvore de regressão é adaptada para estimar a direção da descendência mais pronunciada dos critérios de adaptação. Uma etapa que contenha um comprimento especificado pela constante de granularidade é executada dessa forma. O modelo MART então consistirá em uma projeção inicial além da etapa fornecida pela árvore de regressão. As diferenças entre os valores observados e os valores previstos serão recalculadas, e o ciclo prossegue novamente, levando a um refinamento regressivo da previsão. O processo continua por um
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31/357 número predeterminado de ciclos ou até a regra de interrupção ser ativada.
[00088] O número de ramificações em árvore é um parâmetro de adaptação particularmente significante. Caso cada árvore contenha duas ramificações, o modelo poderá acomodar interações de duas vias entre suas características. Com três árvores, o modelo poderá acomodar interações de três vias, e assim por diante.
[00089] O valor de conjuntos de características na previsão da posição da classe foi determinado para conjuntos de dados com características e posição de classe conhecida. A MART fornece uma medida da contribuição ou importância de características individuais para a regra de classificação de decisões. Especificamente, o grau ao qual uma única característica contribui para a regra de decisão sobre sua seleção em dada ramificação da árvore pode ser medida para fornecer uma categorização das características por sua importância em determinada regra de decisão final. A repetição da análise MART no mesmo conjunto de dados pode render uma categorização de características levemente diferentes, especialmente no que diz respeito às características que são menos importantes no estabelecimento da regra de decisão. Conjuntos de características de previsão e seus biomarcadores correspondentes que são úteis na presente invenção podem, portanto, variar levemente dos especificados aqui.
[00090] Uma implementação exemplar da tecnologia MART é encontrada em um módulo, ou pacote, para o ambiente de programação estatístico R (vide Venables et al., em Modern Applied Statistics with S, 4a ed. (Springer, 2002); www.r-project.org). Os resultados observados nestes documentos foram calculados com as versões 1.7.0 e 1.7.1 de R. O módulo de implementação de MART, escrito pelo Dr. Greg Ridgeway, é conhecido como gbm e também
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32/357 está disponível para download (vide www.r-project.org). O algoritmo MART é receptivo à validação cruzada de dez vezes. O parâmetro de granularidade foi determinado em 0,05 e a regra de interrupção interna do pacote gbm foi baseada na exclusão de 20% dos casos de dados em cada interação marcada. O grau de interação foi determinado em um, de forma que nenhuma das interações entre as características foi considerada. O pacote gbm estima a importância relativa de cada característica em base de porcentagem, que se iguala cumulativamente em 100% para todas as características do perfil do biomarcador. As características com maior importância, que em conjunto formam pelo menos 90% da importância, são reportadas como contendo valor de previsão potencial. Deve ser observado que a regra de interrupção da adaptação de cada modelo MART contribui com um componente estocástico à adaptação do modelo e seleção de características. Consequentemente, as modelagens múltiplas de MART executadas com base nas mesmas informações podem em parte, ou até completamente, escolher diferentes conjuntos de características. Tais conjuntos diferentes conduzem as mesmas informações de previsões; portanto, todos os conjuntos são válidos para a presente invenção. A adaptação de modelos de MART em um número de vezes suficiente tem a expectativa de produzir todos os conjuntos possíveis de características de previsão dentro de um perfil. Portanto, os conjuntos divulgados de previsão são meramente representativos dos conjuntos de características que podem ser utilizados para classificar indivíduos em populações.
Análise do Teste de Postos com Sinais de Wilcoxon [00091] Em outra modalidade, um teste não paramétrico como um Teste de Postos com Sinais de Wilcoxon pode ser utilizado para identificar biomarcadores individuais de interesse. As características em um perfil de biomarcador são designadas com um valor p, que
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33/357 indica o grau de certeza com o qual o biomarcadores pode ser utilizado para classificar indivíduos como pertencentes a uma população de referência específica. Geralmente, um valor p com valor de previsão é menor que cerca de 0,05. Os biomarcadores com valor p baixo podem ser utilizados sozinhos para classificar indivíduos, em que as combinações são escolhidas com base no valor p relativo de um biomarcador. Em geral, esses biomarcadores com valores p baixos são preferíveis para uma dada combinação de componentes de informação. Combinações de pelo menos três, quatro, cinco, seis, 10, 20 ou 30 ou mais biomarcadores podem também ser utilizadas para classificar indivíduos dessa forma. Aquele versado na técnica irá compreender que o valor p relativo de um dado biomarcador pode variar dependendo do valor da população de referência.
Relatório dos Resultados da Análise [00092] Como discutido acima, a avaliação de uma pessoa do sexo feminino para um procedimento de fertilização in vitro, incluindo a determinação da probabilidade de um evento de nascimento com vida, é feita pela obtenção e comparação de componentes de informação sobre a pessoa do sexo feminino a uma biblioteca de padrões de perfil sabidos ser indicativos de resposta a um procedimento de fertilização in vitro com o uso de algoritmo baseado em tais variáveis de pacientes pré-selecionados e opcionalmente avaliar o nível de expressão normalizada em um ou mais genes de resposta de fertilidade. Em algumas modalidades, a avaliação da paciente é fornecida em um relatório. Assim, em algumas modalidades, o método também inclui uma etapa de preparo ou geração de relatório que inclua informações relacionadas a possibilidade de sucesso da paciente em um procedimento de fertilização in vitro. Por exemplo, um método sujeito pode também incluir uma etapa de geração ou produção de relatório que forneça os resultados da avaliação de um paciente, relatório o
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34/357 qual pode ser fornecido na forma de meio eletrônico (como uma apresentação eletrônica em um monitor de computador), ou na forma de um meio tangível (como um relatório impresso em papel ou outro meio tangível).
[00093] Um relatório que inclua informações relacionadas as avaliações do paciente é fornecido a um usuário. A avaliação pode incluir, por exemplo, uma determinação de sucesso para a implantação de embriões, a seleção de um número otimizado de embriões para transferência e a determinação do sucesso em um ciclo de tratamento de fertilização in vitro subsequente após um ciclo que não tenha sido bem sucedido.
[00094] Um gerador de relatórios pode também executar uma ou mais assembleias de amostras, processamento de amostras e geração de dados, como, por exemplo, um gerador de relatórios pode também executar um ou mais: a) assembleia de amostras; b) processamento de amostras; c) medida de um nível de produto(s) de genes indicadores de infertilidade; d) medida de nível de produto(s) de gene de referência; e e) determinação de um nível normalizado de produto(s) de genes indicadores de infertilidade. Como alternativa, uma entidade diferente de um gerador de relatórios pode executar uma ou mais assembleias de amostras, processamento de amostras e geração de dados.
[00095] Para clarificar, deve ser observado que o termo usuário, que utilizado de forma intercambiável com cliente, é feito em referência a uma pessoa ou entidade para quem um relatório é transmitido, podendo ser a mesma pessoa ou entidade que executa um ou mais dos seguintes: a) coleta amostra; b) processa amostra; c) fornece uma amostra ou amostra processada; d) gera dados (como o nível de produto(s) de genes indicadores de infertilidade, o nível de produto(s) de gene de referência; e o nível normalizado de produto(s)
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35/357 de genes) para o uso na análise de possibilidade. Em alguns casos, a pessoa(s) ou entidade(s) que fornece a coleção de amostras e/ou processamento de amostras e/ou geração de dados, e a pessoa que recebe os resultados e/ou relatórios podem ser pessoas diferentes, mas ambos são referidos como usuários ou clientes neste documento para evitar confusões. Em certas modalidades, como, por exemplo, nas quais os métodos são totalmente executados em um único computador, o usuário ou cliente fornece os dados de entrada e saída de revisão de dados. Um usuário pode ser um profissional de saúde (por exemplo, um clínico, um técnico de laboratório, um médico (por exemplo, um endocrinologista de reprodução) etc.) [00096] Em modalidades em que o usuário executa apenas uma parte do método, o indivíduo que, após o processamento informatizado de dados de acordo com os métodos da invenção, saída de dados de revisão (por exemplo, os resultados antes da liberação para fornecer um relatório completo, uma completa ou a revisão de um relatório incompleto e o fornecimento de intervenção manual e conclusão de um relatório interpretativo) é aqui referido como um revisor. O revisor pode estar localizado em um local remoto ao usuário (por exemplo, em um serviço prestado a partir de uma unidade de saúde diferente de onde um usuário esteja localizado).
Relatório [00097] Um relatório, como aqui descrito, é um documento eletrônico ou tangível, que inclui elementos do relatório que fornecem informações de interesse relacionadas com a avaliação de possibilidade da pessoa e seus resultados. Um relatório da pessoa inclui pelo menos uma avaliação de um ciclo de tratamento de fertilização in vitro, como, por exemplo, facilitar a determinação do sucesso de implantação de embriões, a seleção de um número ideal de embriões para transferência, e a determinação de sucesso em
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36/357 ciclos de fertilização in vitro subsequentes após um ciclo de tratamento malsucedido. Um relatório da pessoa pode ser total ou parcialmente gerado por meio eletrônico. Um relatório da pessoa pode ainda incluir um ou mais dos seguintes: 1) informação sobre a instalação de testes; 2) informações do provedor do serviço; 3) dados do paciente, 4) dados da amostra; 5) relatório interpretativo, que pode incluir diversas informações, incluindo: a) indicação; b) teste de dados, em que os dados de teste podem opcionalmente incluir o nível normalizado de um ou mais produtos do gene indicador infertilidade e 6) outros recursos. [00098] Sempre que regulamentos governamentais ou outras restrições sejam aplicáveis (por exemplo, os requisitos de saúde, imperícia ou seguro de responsabilidade civil), todos os resultados, sejam eles gerados, total ou parcialmente por via eletrônica, são submetidos a um controle de qualidade antes da liberação para o usuário.
Informação das instalações de testes [00099] O relatório pode incluir informações sobre as instalações de testes, em que a informação é relevante para o hospital, clínica ou laboratório no qual o recolhimento de amostras e/ou geração de dados tenha sido realizado. A geração de dados pode incluir um ou mais dos seguintes: a) medir o nível de um produto de gene(s) (por exemplo, produto(s) de gene indicador de infertilidade, produto(s) de gene de referência), b) determinar nível normalizado de um produto do gene indicador de infertilidade. Essa informação pode incluir uma ou mais informações relacionadas, como, por exemplo, o nome e a localização da instalação de testes, a identidade do técnico de laboratório que realizou o ensaio e/ou que inseriu os dados de entrada, a data e a hora em que o teste foi conduzido e/ou analisado, o local em que a amostra e/ou dados de resultado são armazenados, o número do lote dos reagentes (por exemplo, kit etc.) utilizado no ensaio, e assim por
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37/357 diante. Relatórios de campo com essas informações podem geralmente ser preenchidos com informações fornecidas pelo usuário.
Informações de fornecimento de serviços [000100] O relatório pode incluir informações sobre o prestador de serviços, que pode estar localizado fora da instalação de saúde na qual o usuário está localizado, ou no posto de saúde. Exemplos de tais informações podem incluir o nome e a localização do prestador do serviço, o nome do revisor, e, quando necessário ou desejado, o nome da pessoa que realizou coleta de amostra e/ou geração de dados. Relatórios de campo com essas informações podem geralmente ser preenchidos com dados inseridos pelo usuário que podem ser escolhidos de entre seleções pré-roteiro (por exemplo, usando um menu suspenso). Outras informações do provedor de serviço no relatório podem incluir informações de contato para informações técnicas sobre o resultado e/ou sobre o relatório interpretativo.
Dados do paciente [000101] Os dados do paciente podem incluir o histórico clínico do paciente (que pode incluir, por exemplo, dados sobre ciclos de tratamento de fertilização in vitro prévios ou atuais), histórico pessoal, dados administrativos do paciente (ou seja, dados que não são essenciais para a avaliação de risco), tais como informações para identificar o paciente (por exemplo, nome, data de nascimento do paciente (DOB), sexo, endereço postal e/ou endereço de residência (MRN), número do prontuário do quarto, e/ou número de leitos em unidade de saúde), seguro, informações e outros), o nome do médico do paciente ou outro profissional de saúde que ordenou a avaliação da probabilidade de resposta e, caso diferente do médico solicitante, o nome de um médico da equipe que seja responsável pelo cuidado do paciente (por exemplo, clínico geral). Relatórios de campo com essas informações podem geralmente ser preenchidos com o uso de dados
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38/357 inseridos pelo usuário.
[000102] Componentes exemplares de informações incluem, mas não estão limitados a: características do paciente, como idade, histórico de infertilidade anterior, diagnóstico clínico, tratamento de informações clínicas, tais como tipo de medicação, número de dias de estimulação, o número de ovócitos etc.; dados de morfologia do embrião convencionais, como o número de embriões, estágio de desenvolvimento, grau, e afins. Em algumas modalidades, a informação inclui a idade, o número total de embriões, a taxa de retenção de clivagem, o número de embriões de 8 células, nível do hormônio estimulador de folículos (FSH) no terceiro dia, número de embriões de 8 células transferidos, idade, reserva ovariana reduzida, espessura endometrial, taxa de blástulas, número total de embriões, número total de ovócitos, quantidade total de gonadotrofinas administradas, e o número total de espermatozoideoides móveis.
Dados de amostra [000103] Os dados da amostra podem fornecer informações sobre o embrião analisado na avaliação da possibilidade, tais como o número de dias após a fecundação, resultando na retenção, e a data e hora de colheita. Relatórios de campo com essas informações podem geralmente ser preenchidos com dados inseridos pelo usuário, alguns dos quais podem ser fornecidos como seleções pré-roteirizadas (por exemplo, usando um menu suspenso).
Relatórios interpretativos [000104] A parte do relatório interpretativo do relatório inclui informações geradas após o processamento dos dados, conforme descrito aqui. O relatório interpretativo pode incluir uma avaliação de uma pessoa do sexo feminino para um procedimento de fertilização in vitro. O relatório interpretativo pode incluir, por exemplo, o resultado da análise comparando o perfil da pessoa do sexo feminino a uma
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39/357 biblioteca de padrões conhecidos perfil conhecidos por ser indicativos da capacidade de resposta a um procedimento de fertilização in vitro, usando um algoritmo baseado em referidas variáveis de pacientes préselecionados e, opcionalmente, Resultado do nível normalizado do(s) gene(s) indicador(es) de infertilidade (por exemplo, nível normalizado do(s) gene(s) indicador(es) de infertilidade); Interpretação; e, opcionalmente, Recomendação(ões).
[000105] A parte de interpretação do relatório pode incluir recomendação(ões). Sempre que os resultados indiquem uma determinação do sucesso de implantação de embriões, a seleção de um número ideal de embriões para transferência, e determinação do sucesso de ciclos de tratamento de fertilização in vitro subsequentes após um ciclo de tratamentos malsucedidos.
[000106] Deve ser facilmente observado que o relatório pode incluir todos ou alguns dos elementos acima, com a ressalva de que o relatório geralmente inclui pelo menos os elementos suficientes para que a análise solicitada pelo usuário (por exemplo, avaliação de risco).
Características adicionais [000107] Também será facilmente observado que os relatórios podem incluir elementos adicionais ou elementos modificados. Por exemplo, quando eletrônicos, os relatórios podem conter hiperlinks que apontam para bases de dados internas ou externas que forneçam informações mais detalhadas sobre os elementos selecionados do relatório. Por exemplo, o elemento de dados do paciente do relatório pode incluir um hiperlink para um prontuário eletrônico do paciente, ou um site para acessar tais registros do paciente, registro do paciente o qual é mantido em um banco de dados confidenciais. Essa última modalidade pode ser do interesse em um sistema intra-hospitalar ou estabelecimento de clínica.
Métodos e Sistemas de Informática
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40/357 [000108] Os métodos e sistemas descritos aqui podem ser implementados de várias maneiras. Em uma modalidade particularmente de interesse, os métodos envolvem o uso de uma infraestrutura de comunicações, como a internet. Várias modalidades da invenção são discutidas abaixo. Também é preciso entender que a presente invenção pode ser implementada em diversas formas de hardware, software, firmware, processadores ou uma combinação destes. Os métodos e sistemas descritos aqui podem ser implementados como uma combinação de hardware e software. O software pode ser implementado como um programa de aplicação tangível incorporado em um dispositivo de armazenamento de programas, ou partes diferentes do software implementado em ambiente de computação do usuário (por exemplo, como um aplicativo) e no ambiente de computação do revisor, em que o revisor pode ser localizado em um local remoto associado (por exemplo, na instalação de um provedor de serviços).
[000109] Os vários elementos do dispositivo de computação, tais como o dispositivo de entrada, podem ser associados com outros elementos do sistema através de uma conexão com fio ou uma conexão sem fio, incluindo, por exemplo, uma conexão LAN sem fio, protocolo de conexão Bluetooth, protocolo de conexão ZigBee, protocolo de ligação de rádiofrequência ou um protocolo de conexão de telefone celular, incluindo o acesso ao código derivado múltiplo (CDMA), ou através de um sistema global para comunicação móvel (GSM).
[000110] Por exemplo, durante ou depois da entrada de dados pelo usuário, parte do processamento de dados pode ser feita no ambiente de computação do lado do usuário. Por exemplo, o ambiente de computação pelo usuário pode ser programado para fornecer os códigos de ensaio definidos para indicar uma probabilidade score,
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41/357 em que o score é transmitido como respostas processadas ou parcialmente transformadas ao ambiente de computação do revisor sob a forma de código de teste para posterior execução de um ou mais algoritmos para fornecer um resultado e/ou gerar um relatório em ambiente de computação do revisor.
[000111] O programa aplicativo para executar os algoritmos descritos aqui pode ser carregado e executado por uma máquina que compreende qualquer arquitetura adequada. Em geral, a máquina envolve uma plataforma de computador com hardware, como uma ou mais unidades de processamento central (CPU), uma memória de acesso aleatório (RAM), e interface(s) de entrada/saída (I/O). A plataforma de computador também inclui um sistema operacional de código de micro instrução. Os vários processos e funções descritos aqui podem ser parte do código de micro instrução ou parte do programa de aplicação (ou uma combinação dos mesmos), que é executado através do sistema operacional. Além disso, vários outros dispositivos periféricos podem ser conectados à plataforma de computador, como um dispositivo adicional de armazenamento de dados e um dispositivo de impressão.
[000112] Como um sistema de computador, o sistema geralmente inclui uma unidade de processamento. A unidade do processador opera para receber informações, que geralmente incluem dados de informações sobre o assunto, tais como idade, número total de embriões, a taxa de retenção de clivagem, o número de embriões de 8 células, nível do hormônio estimulador de folículos (FSH) no terceiro dia, número de embriões de 8 células transferidos, idade, reserva ovariana reduzida, espessura endometrial, taxa de blástulas, número total de embriões, número total de ovócitos, a quantidade total de gonadotrofinas administradas, e o número total de espermatozoideoides móveis. Essas informações recebidas podem ser
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42/357 armazenadas pelo menos temporariamente em um banco de dados e analisadas para gerar um relatório como descrito acima.
[000113] Parte ou todos os dados de entrada e de saída também podem ser enviados eletronicamente; certos dados de saída (por exemplo, relatórios) podem ser enviados eletronicamente ou por telefone (por exemplo, por fax, por exemplo, usando dispositivos como fax de volta). Dispositivos de recebimento de saída exemplares podem incluir um elemento de exibição, uma impressora, um aparelho de fax e outros. Os formulários eletrônicos de transmissão e/ou exposição podem incluir, televisão interativa, e-mail, e assim por diante. Em uma modalidade particularmente interessante, todos ou parte dos dados de entrada e/ou a totalidade ou uma parte dos dados de saída (como, geralmente, pelo menos o relatório final) são mantidas em um servidor web para acesso, de preferência com acesso confidenciais, com navegadores comuns. Os dados podem ser acessados ou enviados para os profissionais de saúde, como desejado. Os dados de entrada e saída, incluindo a totalidade ou uma parte do relatório final, podem ser usados para preencher a ficha médica de um paciente que pode existir em um banco de dados confidencial na instalação de saúde.
[000114] Um sistema para o uso dos métodos aqui descritos geralmente inclui pelo menos um processador de computador (por exemplo, no qual o método é realizado em sua totalidade em um único local) ou, pelo menos, dois processadores de computador em rede (por exemplo, no qual os dados são introduzidos por um usuário (também referido aqui como um cliente) e transmitidos para um local remoto para um segundo computador processador para análise, no qual o primeiro e o segundo processadores de computador são conectados por uma rede, por exemplo, através de intranet ou internet). O sistema pode também incluir componente(s) de usuário para a entrada, e componente(s) crítico(s) para análise de dados,
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43/357 relatórios gerados, e intervenção manual. Os componentes adicionais do sistema podem incluir componente(s) de servidor e banco(s) de dados para o armazenamento de dados (como em um banco de dados de elementos do relatório, por exemplo, os elementos do relatório interpretativo, ou um banco de dados relacional (RDB), que pode incluir dados enviados pelo usuário e dados de saída. Os processadores de computador podem ser processadores que são normalmente encontrados em computadores pessoais de mesa (por exemplo, IBM, Dell, Macintosh), computadores portáteis, computadores centrais, minicomputadores, ou outros dispositivos de computação, tais como dispositivos de Smartphone, incluindo, por exemplo, um dispositivo da Apple® iPhone®.
[000115] A rede cliente/servidor pode ser selecionada conforme desejado e pode ser, por exemplo, um modelo clássico de servidor do cliente de duas ou três camadas. Um sistema de gerenciamento de banco de dados relacional (RDMS), como parte de um componente de servidor de aplicação ou como um componente separado (máquina RDB) fornece a interface para o banco de dados.
[000116] Em uma modalidade, a arquitetura é fornecida como um banco de dados centralizada no cliente/servidor, no qual o aplicativo do cliente geralmente solicita serviços do servidor de aplicação que faz solicitações ao banco de dados (ou ao servidor do banco de dados) para preencher o relatório dos elementos do relatório, tal como exigido, em especial os elementos do relatório interpretativo, especialmente a interpretação de texto e alertas. O(s) servidor(es) (por exemplo, como parte da máquina do servidor de aplicativo ou um RDB /máquina de banco de dados relacional separado) responde(m) às solicitações do cliente.
[000117] Os componentes do cliente de entrada podem ser completos, computadores pessoais autônomos oferecendo uma gama
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44/357 completa de energia e recursos para executar aplicações. O componente cliente normalmente funciona em qualquer sistema operacional desejado e inclui um elemento de comunicação (por exemplo, um modem ou outro hardware para conexão a uma rede), um ou mais dispositivos de entrada (por exemplo, teclado, mouse, teclado numérico ou outro dispositivo usado para transferência de informações ou comandos), um elemento de armazenamento (por exemplo, um disco rígido ou outro meio de armazenamento legível por computador ou que possa ser escrito pelo computador), e um elemento de exibição (por exemplo, um monitor de televisão, LCD, LED, ou outro dispositivo de visualização que transmita informações para o usuário). O usuário digita comandos de entrada no processador do computador através de um dispositivo de entrada. Geralmente, a interface de usuário é uma interface gráfica de usuário (GUI) escrita para aplicações de navegador da web.
[000118] O(s) componente(s) do servidor pode(m) ser um computador pessoal, um minicomputador ou um computador principal e oferece(m) gerenciamento de dados, compartilhamento de informações entre clientes, administração de rede e segurança. A aplicação e os bancos de dados podem ser usados nos mesmos ou em diferentes servidores.
[000119] Outros métodos de computação para o cliente e servidor (es), incluindo o processamento em uma única máquina, como um computador principal, um conjunto de máquinas, ou outra configuração adequada são contemplados. Em geral, as máquinas do cliente e do servidor trabalham em conjunto para realizar o processamento da presente invenção.
[000120] Quando utilizado(s), o(s) banco(s) de dados está(ão) normalmente ligado(s) a componente de servidor de banco de dados e pode(m) ser qualquer dispositivo que irá armazenar dados. Por
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45/357 exemplo, o banco de dados pode ser qualquer dispositivo magnético ou óptico de armazenamento de um computador (por exemplo, CDROM, disco rígido interno, unidade de fita). O banco de dados pode ser localizado em local remoto ao componente do servidor (com acesso através de uma rede, modem etc.) ou localmente para o componente de servidor.
[000121] Quando usado no sistema e nos métodos, o banco de dados pode ser um banco de dados relacional que é organizado e acessado de acordo com os relacionamentos entre os componentes de dados. O banco de dados relacional é geralmente composto de uma pluralidade de tabelas (entidades). As linhas da tabela representam os registros (coleções de informações sobre os componentes em separado) e as colunas representam os campos (atributos específicos de um registro). Na sua concepção mais simples, o banco de dados relacional é uma coleção de entradas de dados que se referem uns aos outros através de pelo menos um campo comum.
[000122] Estações de trabalho adicionais equipadas com computadores e impressoras podem ser utilizadas no ponto de serviço para inserir dados e, em algumas modalidades, gerar relatórios adequados, caso desejado. O(s) computador(es) pode(m) ter um atalho (por exemplo, na área de trabalho) para lançar a aplicação para facilitar a abertura de entrada de dados, transmissão, análise, recebimento de relatório etc., como desejado.
Meio de Armazenamento Legível por Computador [000123] A invenção contempla também um meio de armazenamento legível por computador (por exemplo, CD-ROM, chaveiro de memória, cartão de memória flash, disquete etc.), no qual é armazenado um programa que, quando executado em um ambiente de computação, prevê a aplicação de algoritmos para realizar a
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46/357 totalidade ou uma parte dos métodos de análise da avaliação de um sujeito para um procedimento de fertilização in vitro, conforme descrito aqui. Quando o meio legível por computador contém um programa completo para a realização dos métodos descritos aqui, o programa inclui instruções do programa para coletar, analisar e gerar saída e, geralmente, inclui dispositivos de leitura de código de computador para interagir com o usuário, como descrito aqui, processando esses dados em conjunto com informações analíticas e gerando uma única mídia impressa ou eletrônica para esse usuário.
[000124] Quando o meio de armazenamento oferece um programa que permite uma implementação de parte dos métodos descritos aqui (por exemplo, o aspecto dos usuários dos métodos (por exemplo, entrada de dados, capacidades de recepção de relatório etc.)), o programa permite a transmissão de dados introduzidos pelo usuário (por exemplo, através da internet, através da intranet etc.) para um ambiente de computação em um local remoto. O processamento ou conclusão do processamento dos dados é realizado no local remoto para gerar um relatório. Após a revisão do relatório e a conclusão de qualquer intervenção manual necessária para fornecer um relatório completo, o relatório completo é então transmitido para o usuário como um documento eletrônico ou documento impresso (por exemplo, através de fax ou relatório impresso enviado por correio). O meio de armazenamento que contém um programa de acordo com a invenção pode ser embalado com instruções (por exemplo, para instalação do programa, uso etc.), gravado em um substrato adequado ou um endereço da web no qual essas instruções possam ser obtidas. O meio de armazenamento legível por computador também pode ser fornecido em combinação com um ou mais reagentes para determinação dos dados de informações da pessoa sobre o assunto, como material para determinar a taxa de retenção de clivagem, o
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47/357 número de embriões de 8 células, nível de hormônio estimulador de folículos (FSH) no terceiro dia, e número de embriões de 8 células transferidos e assim por diante.
Kits [000125] Os materiais para uso nos métodos da presente invenção são adequados para a preparação de kits produzidos em conformidade com procedimentos conhecidos. A invenção, portanto, fornece o kit composto por reagentes, que pode incluir sondas específicas para genes ou seletivas de genes e/ou iniciadores úteis para analisar a expressão de genes divulgada aqui e para avaliar a probabilidade de resposta a um ciclo de tratamento in vitro.
[000126] Por exemplo, um kit do indivíduo pode incluir uma ou mais sondas de ácidos nucleicos que hibridizam especificamente em um produto de gene identificador de infertilidade de ácido nucleico. Um kit do indivíduo pode incluir, por exemplo, uma ou mais sondas de ácidos nucleicos, na qual cada uma das uma ou mais sondas se hibridizam especificamente em um produto de gene identificador diferente. Por exemplo, um kit do indivíduo pode incluir sondas que se hibridizam especificamente em produto de gene identificador de infertilidade de ácido nucleico, incluindo, mas não estão limitados a, Oct4, Eif3c, Papola, Piwil2, Eif3b, Eif4b, Rbm3, e Cpsf4. Como outro exemplo, um kit da pessoa pode incluir um conjunto de duas ou mais sondas de ácidos nucleicos, na qual cada sonda do conjunto se hibridiza em um produto de gene identificador de infertilidade de ácido nucleico. Por exemplo, um kit do indivíduo pode incluir um conjunto de dois, três, quatro, cinco, seis, sete, ou mais, sondas de ácidos nucleicos, em que cada sonda do conjunto se hibridiza em um produto ácido nucleico de um membro diferente de um conjunto de genes identificador de infertilidade.
[000127] Em alguns casos, um kit de indivíduo irá incluir, além de
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48/357 uma sonda que se hibridiza especificamente em produto de gene identificador de infertilidade de ácido nucleico, uma ou mais sondas que se hibridizam especificamente em um produto de gene de referência. Essas sondas podem ser usadas para determinar os níveis de expressão normalizados de um gene indicador de infertilidade. [000128] Um kit de indivíduo pode incluir um ou mais pares de iniciadores de ácidos nucleicos, no qual os pares de iniciadores, quando usados como iniciadores em uma reação em cadeia da polimerase, amplificam um produto de gene identificador de ácido nucleico alvo, ou uma região alvo de produto de gene indicador de resposta de ácido nucleico alvo. Um kit do indivíduo pode incluir pares de iniciadores para múltiplos genes indicadores de infertilidade.
[000129] Sequências de iniciadores e sondas de ácido nucleico exemplares são fornecidas nos Exemplos aqui descritos. Aqueles versados na técnica imediatamente entenderão que outras sequências de sondas e iniciadores também são possíveis, e são facilmente obtidas com base em sequências conhecidas de nucleotídeos de genes indicadores de infertilidade, e/ou com base em sequências conhecidas de nucleotídeos de genes de referência.
[000130] Além das sondas e iniciadores supracitados, um kit do indivíduo pode incluir reagentes para a extração e/ou isolamento de RNA a partir de embriões de única célula, especificamente amostras de tecidos fixados embebidos em parafina e/ou reagentes para o preparo de um cDNA cópia de um mRNA, e/ou reagentes para amplificação de ácidos nucleicos. Reagentes exemplares incluem aqueles necessários para a utilização de sistema de disposição dinâmica 48,48 FLUIDIGM® BIOMARK®, plataforma de análise da expressão de gene de única célula comparável (RT-PCR), ou de tecnologias emergentes como próxima geração, o sequenciamento de transcritoma total de um único nível de célula.
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49/357 [000131] Os iniciadores e sondas podem ser designados com base em sequências de genes indicadores de infertilidade, e são prontamente sintetizados por técnicas padrão, como síntese de fase sólida via química fosforamidita, como divulgado pelas Patentes N° U.S.s 4,458,066 e 4,415,732, incorporados aqui por referência; Beaucage et al. (1992) Tetrahedron 48:2223-2311; e Boletim de
Usuário de Biossistemas Aplicados No 13 (1 de abril de 1987). Outros métodos de síntese química incluem, por exemplo, o método fosfodiéster divulgado por Brown et al., Meth. Enzymol. (1979) 68:109. Poli (A) ou poli (C), ou outras extensões de nucleotídeos não complementares podem ser incorporadas em sondas com o uso dos mesmos métodos. Extensões de óxido de hexaetileno podem ser acopladas a sondas através de métodos conhecidos na técnica. Cload et al. (1991) J. Am. Chem. Soc. 113:6324-6326; Pat. N° U.S.
4.914.210 para Levenson et al.; Durand et al. (1990) Nucleic Acids Res. 18:6353-6359; e Horn et al. (1986) Tet. Lett. 27:4705-4708.
[000132] Uma sonda ou um iniciador podem incluir um rótulo detectável. Rótulos exemplares incluem fluorocromos, como isotiocianato de fluoresceína (FITC), rodamina, Texas Red, ficoeritrina, aloficocianina, 6-carboxifluorescina (6-FAM), 2',7'-dimetoxi-4',5'-dicloro6-carboxifluorescina (JOE), 6-carboxi-X-rodamina (ROX), 6-carboxi2',4',7',4,7-hexaclorofluorescina (HEX), 5-carboxifluorescina (5-FAM), N,N,N',N'-tetrametil-6-carboxirodamina (TAMRA), Cy5, Cy3, e similares; e rótulos radioativos (como 32P etc.).
[000133] Sondas e iniciadores para inclusão em um kit do indivíduo incluem aqueles úteis em vários sistemas de amplificação e/ou de detecção. Sistemas de amplificação e/ou de detecção exemplares incluem sistemas baseados em iniciador Sunrise™, Sinalizadores de Moléculas, o sistema TaqMan™, um sistema de grampo baseado em iniciador Amplifluor™, uma tecnologia Scorpions (por exemplo,
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50/357 moléculas bi-funcionais que contêm um elemento iniciador PCR ligado de forma covalente a um elemento de sonda), uma sistema baseado em Light Upon Extension ou LUX™, e um sistema de disposição dinâmica
48,48 FLUIDIGM® BIOMARK®. Outros sistemas de detecção exemplares incluem aqueles baseados em análise de curva de dissociação, e com corantes intercalados, como o corante fluorescente SYBR Green.
[000134] Os kits podem, opcionalmente, incluir o(s) reagente(s) com uma descrição ou etiqueta de identificação ou instruções relativas à sua utilização nos métodos da presente invenção. Os kits podem conter recipientes (incluindo placas de microtitulação adequadas para uso em uma aplicação automática do método), cada uma com um ou mais dos vários reagentes (geralmente na forma concentrada), utilizados nos métodos da invenção, incluindo, por exemplo, micro arranjos pré-fabricados, amortecedores, nucleotídeos trifosfato adequados (como dATP, dCTP, dGTP e dTTP; ou rATP, rCTP, rGTP e UTP) transcriptase reversa, DNA polimerase, RNA polimerase, e uma ou mais sondas e iniciadores da presente invenção (por exemplo, poli (T) com comprimento adequado ou iniciadores aleatórios ligados a um promotor reativo com RNA polimerase).
[000135] As instruções para o uso de algoritmos matemáticos utilizados para avaliar uma pessoa do sexo feminino para um ciclo de tratamento de fertilização in vitro, inclusive que determinem a probabilidade de um evento de nascimento com vida, também podem ser incluídas em um kit do indivíduo. Em tais modalidades, o kit também inclui um meio escrito ou eletrônico, ou instruções para acessar um banco de dados remoto, conforme descrito acima, para fornecer e/ou receber informações, que geralmente incluem dados de informações sobre o sujeito, tais como idade, número total de
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51/357 embriões, a taxa de retenção de clivagem, o número de embriões de 8 células, hormônio estimulador de folículos (FSH) no terceiro dia, número de embriões de 8 células transferidos, idade, reserva ovariana reduzida, espessura endometrial, taxa de blástulas, número total de embriões, número total de óvulos, quantidade total de gonadotrofinas administradas, e número total de espermatozoideoides móveis, a fim de realizar os métodos descritos acima.
EXEMPLOS [000136] Os exemplos a seguir são apresentados para fornecer àqueles versados na técnica com a divulgação e descrição completas sobre como fazer e utilizar a presente invenção, e não se destina a limitar o escopo do que os inventores consideram sua invenção, nem são destinados a representação de que as experiências abaixo são todos ou os únicos experimentos realizados. Houveram tentativas de garantir a precisão em relação aos números usados (como valores, temperatura etc.), mas alguns erros experimentais e desvios devem ser levados em conta. Caso não haja indicação do contrário, peças são peças por peso, peso molecular é a média do peso molecular, a temperatura está em graus centígrados, e a pressão é igual ou próximo a atmosférica.
Materiais e Métodos [000137] Os seguintes métodos e materiais foram utilizados nos exemplos abaixo.
Coleta de Dados, Critérios de Inclusão e Exclusão [000138] Os dados relativos a diagnósticos clínicos, protocolo de tratamento e acompanhamento de FIV, dados de embriologia e os resultados do tratamento para todos os ciclos de FIV realizados entre 01 de janeiro de 2003 e 31 de dezembro de 2006 no Centro Médico da Universidade de Stanford foram retirados de BabySentryPro (BabySentry Ltd., Limassol, Chipre), um sistema de gerenciamento de
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52/357 banco de dados de fertilidade amplamente utilizado, ou obtidos de prontuários médicos e de embriologia, de acordo com a necessidade. A coleta de dados retrospectiva, a desidentificação e análises foram realizadas de acordo com um protocolo aprovado pelo Comitê de Revisão Institucional da Universidade de Stanford. O critério de inclusão para a análise dos dados foi a presença de ciclos de FIV com ovócitos não doados, estimulados e novos.
[000139] Em certas modalidades, ciclos que não resultarem na transferência de embriões por qualquer motivo, ciclos realizados por mulheres com idade superior a 45 anos, e aqueles realizados para análise genética pré-implantacional, foram excluídos.
[000140] Em outros experimentos, não foram excluídos ciclos que foram cancelados em algum momento devido a razões médicas ou não médicas após o início do tratamento de FIV. Foram excluídos os ciclos de transferência de embriões criopreservados que utilizaram embriões concebidos em clínicas de fertilização in vitro diferentes.
Definição do Número de Ciclos [000141] Foram renumerados todos os ciclos de fertilização in vitro de acordo com o método a seguir. Para cada paciente, o primeiro ciclo de fertilização in vitro que aparece neste conjunto de dados de quatro anos é chamado de Ciclo 1. O resultado final de todos os tratamentos de transferência de embriões que utilizam embriões novos e criopreservados concebidos a partir do Ciclo 1 será definido como resultado para o Ciclo 1. O segundo ciclo de fertilização in vitro ilustrado é definido como Ciclo 2, e assim por diante. O nosso banco de dados não pode acomodar os dados sobre os ciclos de fertilização in vitro que foram realizados em outros locais.
Análise do Desenvolvimento do Embrião [000142] Os protocolos clínicos padrão para o tratamento de FIV, fertilização, cultura de embriões, análise de embriões, critérios de
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53/357 criopreservação e os resultados clínicos são descritos abaixo. A progressão normal do desenvolvimento do embrião humano in vitro é caracterizada pelo aparecimento de dois pró-núcleos em 16-20 horas após a inseminação, como evidenciado na fertilização no Dia 1, com o Dia 0 como sendo o dia da captação ovacitária. Mais tarde no Dia 1, o desenvolvimento do embrião atinge a fase de 2 células, seguida pela de 4 células e pela fase de 8 células, nos Dias 2 e 3, respectivamente. Nos Dias 4 e 5, o desenvolvimento do embrião é caracterizado pelo estabelecimento dos estágios de mórulas e blástulas, respectivamente. Todos os embriões estavam disponíveis para avaliação no Dia 3. O dia da transferência de embriões foi determinado pelo número de blastômeros no Dia 3. Em geral, se 4 ou mais embriões de 8 células estiverem presentes, é recomendado a prorrogação de cultura de embriões até o Dia 5, quando a transferência de blástulas, que tem sido associada a maiores taxas de gestação, deve ser executada. Se menos de quatro embriões de 8 células estiverem presentes, a transferência de embriões deve ser realizada no Dia 3.
Paciente, Ciclo de FIV e Parâmetros de Embriões [000143] Foram analisadas 30 variáveis para associação com resultados de tratamentos de FIV, como listado na tabela 1, sob quatro categorias principais: características de pacientes e diagnósticos clínicos, características de ciclos de FIV, parâmetros de coorte de embriões e os parâmetros de embriões transferidos. A taxa de retenção de clivagem foi definida como a porcentagem de embriões dentro de um grupo com 4 ou menos células no Dia 3 do cultivo in vitro. Todas as demais variáveis foram autoexplicativas.
Definição dos Resultados [000144] As análises estatísticas foram realizadas com base nos resultados dicotômicos de resultados de nascimentos com vida contra
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54/357 nenhum nascimento com vida. Nenhum nascimento com vida abrange todos os resultados, tais como soro β-hCG negativo, ou soro β-hCG positivo, seguido por gestação bioquímica, aborto espontâneo e gestação ectópica.
Análise de Estatísticas [000145] Uma vez que alguns pacientes foram submetidos a mais de um ciclo de FIV durante o período do estudo, as análises foram realizadas com base em ciclos de tratamento em vez de pacientes. As análises estatísticas foram realizadas com base nos resultados dicotômicos de nenhuma gestação, como definido pelo soro β-hCG negativo e gestação, tal como definido pelo soro β-hCG positivo, e incluem gestação bioquímica, gestação clínica, aborto espontâneo e gestação ectópica. Foram executadas regressões logísticas relacionadas a pares de cada variável para o resultado e foi determinado o coeficiente da correlação de Pearson entre cada par de variáveis contínuas.
[000146] Para as análises principais, árvores de classificação ampliadas foram formuladas por MART® para identificar variáveis de prognósticos não variáveis, os quais serão analisados também por CART para identificar o limiar que define a estrutura interativa das variáveis que prevêem os resultados. O uso da validação cruzada e a ampliação da seleção de parâmetros e análise de modelos por MART® também preservam a parcimônia e previnem a superadaptação. Nas construções de árvore por MART®, todo o conjunto de informações é dividido em 10 subtipos para alcançar a validação cruzada de dez vezes para análise de modelo. A mesma validação de 10 vezes foi repetida 1000 vezes para executar uma estimativa de taxa de previsão forte e identificar modelos de árvores com as maiores taxas de previsão no CART. Apesar do MART® ser eficiente na seleção de variáveis de prognósticos não redundantes a parte de um conjunto
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55/357 amplo de variáveis altamente interativas, as análises de CART resultam em algoritmos simples, mais facilmente compreendidos como árvores de decisão, utilizadas na literatura médica (Guznick et al., N Engl J Med 345: 1388-1393. (2001)). Assim, variáveis de prognósticos não redundantes identificados por MART® para checar as previsões foram analisados por CART para melhor definir o limiar dos prognósticos.
[000147] Em algumas modalidades, caso os pacientes tenham sido submetidos a múltiplos ciclos de fertilização in vitro durante o período de estudo, apenas os três primeiros ciclos serão analisados. Geramos os modelos com base apenas no ciclo 1 (C1). Dados do C2 e do C3 foram usados para testar a validação interciclo somente do modelo de pré-transferência.
[000148] Em tais experimentos, foi executada uma regressão logística de pares de cada variável do resultado e foi determinado o coeficiente da correlação Pearson entre cada par de variáveis contínuas. Foram gerados três modelos baseados nas informações disponíveis em três pontos de tempo diferentes antes do tratamento de FIV (pré-FIV), recuperação dos ovócitos (pré-OR) e após a transferência dos embriões (pós-FIV). Foi gerado cada modelo através da classificação da variável de acordo com a sua influência relativa com o uso de um aparelho de regulação de grau (GBM), a implantação de MART® pelo software R, seguido da elaboração de modelos de árvores de regressão com o uso das melhores variáveis com o software Rpart. O MART® é um método poderoso utilizado para identificar a estrutura interativa das variáveis que prevêem resultados. O uso da validação cruzada e o aumento da seleção de parâmetros e análise de modelos no MART® também preservam a parcimônia e previnem a superadaptação. Nas construções de árvore por MART®, todo o conjunto de informações é dividido em 10 subtipos para
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56/357 alcançar a validação cruzada de dez vezes para análise de modelo. A mesma validação de 10 vezes foi repetida 1000 vezes para executar uma estimativa de taxa de previsão forte e identificar modelos de árvores com as maiores taxas de previsão. O MART® é eficiente na seleção de variáveis de prognósticos não redundantes de um conjunto amplo de variáveis altamente interativas.
Protocolos de Tratamento utilizados para tecnologias de Reprodução Assistida
Protocolos de Tratamento utilizados para Reprodução Medicamente Assistida (RMA) [000149] A maior parte de nossos ciclos de FIV analisados foram executados em pacientes com pequena reserva ovariana, fator de infertilidade masculina alto, infertilidade tubária, distúrbios de anovulação ou etiologia não explicável. No geral, um dos três protocolos de estimulação foi utilizado em cada ciclo de tratamento: desregulamento luteal (longo) foi utilizada na maior parte dos pacientes, microdoses de lupron (irrupção) e protocolos de antagonistas foram utilizados primariamente para pacientes com reservas ovarianas presumidamente reduzidas ou com histórico de ciclos de FIV previamente malsucedidos. O protocolo longo consistia em desregulamento luteal com o uso de 0,5 mg de acetato de leuprolida, que foi reduzido para 0,25 mg com estímulo. No protocolo de irrupção, a microdose de lupron (0,04 mg por via subcutânea) foi iniciada após 2-4 semanas de pílulas anticoncepcionais. Nos protocolos antagonistas, o antagonista GnRH foi iniciado que o folículo principal alcançou 14 mm em tamanho. Em todos os três protocolos, os parâmetros dos testes de ultrassonografia foram executados para documentar que nenhum cisto > 1,5 cm estava presente nos ovários. Quando os critérios dos parâmetros foram alcançados, a terapia de gonadotrofina com o uso recombinante de FSH com gonadotrofina da
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57/357 menopausa humana foi iniciada. A estimulação foi geralmente alcançada com o uso diário de dose de um total de 150-600 IU por dia de forma a maximizar o recrutamento dos folículos. O monitoramento do crescimento dos folículos através de ultrassonografia foi executado a partir do dia 7 do ciclo, e então a cada 1-3 dias, conforme indicado. Os níveis de soro de estradiol foram monitorados quando necessário. [000150] Uma dose de 10.000 IU de gonadotrofina coriônica humana foi administrada quando pelo menos dois folículos alcançaram um diâmetro médio de >17mm. A recuperação de ovócitos guiada por ultrassonografia transvaginal foi executada 34-36 horas após a administração de hCG na forma padrão com o tratamento anestésico monitorado.
Fertilização de Ovócitos e Cultura Embrionária [000151] Os ovócitos foram cultivados em grupos previamente a fertilização sob óleo mineral em aproximadamente 125 μΙ gotas de Meio de Clivagem com Sage (Cooper Surgical, Inc, Trumbull, CT) com 10% do Substituto de Proteína de Soro (SPS, Irvine Scientific, Santa Ana, CA). Os ovócitos destinados para FIV convencional foram cultivados em grupos de 5 e os ovócitos destinados para micro injeção intracitoplasmática de espermatozoides (ICSI) foram cultivados em grupos de até 20 após a remoção das células do cúmulo. Os ovócitos foram inseminados com esperma caso a análise do sêmen tenha sido anormal ou tenha sido esperada a fertilização fraca, e então os ovócitos foram injetados com esperma com o uso de ICSI. Os ovócitos fertilizados foram cultivados em grupos de até 20 sob óleo mineral em aproximadamente 125 μΙ gotas de Meio de Clivagem com Sage (Cooper Surgical, Inc, Trumbull, CT) com 10% de SPS em 37oC em atmosfera umidificada em 5% de O2, 5% de CO2 e 90% de N2. A verificação da fertilização foi executada 16~18 horas após a inseminação ou ICSI. Os zigotos com dois pró-núcleos claros foram
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58/357 cultivados para outras 48 horas no Meio de Clivagem com Sage com 10% de SPS. Os ovócitos com um único pró-núcleo (1PN) ou três ou mais pró-núcleos foram considerados como anormalmente fertilizados. No Dia 5, a transferência de blástulas foi indicada, a cultura embrionária estendida foi executada no meio Quinn de Vantagem de Blástulas (Cooper Surgical) com 10% de SPS para 48 horas antes da transferência. Deve ser observado que o mesmo meio de cultura foi utilizado durante o período de tempo do estudo.
Clivagem e Graduação Embrionária [000152] Uma única equipe de embriologistas experientes avaliou os embriões no dia 3 pós-recuperação, 68 a 72 horas após a colheita dos ovócitos. Os embriões foram examinados para clivagem (número de célula) e grau, que inclui fragmentação citoplásmica. Os embriões foram graduados como segue no Dia 3; Grau 1, blástulas possuem tamanhos iguais e nenhuma fragmentação citoplásmica; Grau 2, blástulas possuem tamanhos iguais e menor fragmentação citoplásmica envolvendo <10% do embrião; Grau 3, blástulas possuem tamanhos diferentes e fragmentação citoplásmica envolvendo 10-20% do embrião; Grau 4, blástulas possuem tamanhos iguais ou diferentes e fragmentação citoplásmica moderada a significante cobrindo 20-50% do embrião; e Grau 5, poucas blástulas e fragmentação severa cobrindo >50% do embrião (Veeck et al., (1999) An Atlas of Human Gametes and Conceptuses. Nova York: Parthenon Publishing. 47-50). Deve ser observado que a fragmentação citoplásmica em embriões foi facilmente diferenciada da clivagem com base no tamanho dos fragmentos, sua locação no embrião e a ausência de um núcleo. Em contraste, a fragmentação citoplásmica de ovócitos não foi incluída como variável por ser extremamente rara. A presença ou ausência da compactação foi rotineiramente observada pelos embriologistas no Dia 3. Como a compactação foi observada em <10% dos embriões, foi
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59/357 decidido não incluir essa variável na análise.
Incubação Assistida [000153] Indicações para a incubação assistida (AH) em nosso centro foram de idade avançada para maternidade, nível de FSH elevado, e/ou históricos de múltiplos ciclos de reprodução assistida ineficazes. No dia da transferência do embrião, os embriões sendo incubados foram depositados em tampão fosfato salino (PBS) com 10% de SPS. A AH foi realizada com o uso de laser ZILOS-tk (Hamilton Thorne Biosciences, Beverly, MA) para formar um orifício na área da zona pelúcida entre as blástulas. Os embriões foram então enxaguados e devolvidos ao meio até a transferência.
Transferência Embrionária e Criopreservação [000154] A transferência de embriões guiada por ultrassonografia foi executada com o uso de Tefcat ou cateter Echotip Softpass (Cook Ob/Gyn, Spencer, IN). Suplementos de progesterona com supositórios vaginais foram administrados a todos os pacientes. Para pacientes com transferência embrionária no Dia 3, qualquer embrião restante com mais de cinco blástulas foi depositado em cultura estendida por mais 2 ou 3 dias. Qualquer blástula que esteja se expandindo, seja expandida ou incubada com boa massa intracelular e trofectoderma foram congeladas no dia 5 ou dia 6. Além disso, a criopreservação foi executada em embriões excessivos, síndrome de hiperestimulação ovariana severa e preservação de fertilidade devido a razões médicas ou sociais. Embriões excessivos que não foram transferidos foram comumente descartados caso não sejam de qualidade suficiente para a criopreservação ou caso os pacientes não tenham optado pela criopreservação devido a razões médicas. Em casos de diagnósticos genéticos de pré-implementação, embriões que tenham testado positivo para doenças genéticas ou aneuploidia foram também descartados.
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Resultados Clínicos [000155] Os níveis de soro β-HCG quantitativo foram obtidos em 8010 dias após a transferência de embriões, e seguiu em série até o diagnóstico de gestação clínica ser realizado através da presença da bolsa gestacional na ultra-sonografia transvaginal. Resultados diferentes da gestação clínica incluíram: 1) ausência de gestação se o soro β-HCG quantitativo foi negativo; 2) gestação bioquímica conforme definido pela diminuição do soro β-HCG quantitativo antes da bolsa gestacional ter sido visualizada por ultra-sonografia transvaginal; 3) aborto espontâneo definido como perda da gestação depois da bolsa gestacional ter sido visualizada por ultra-sonografia transvaginal; e 4) gestação ectópica; e 5) outras gestações anormais, tais como a doença trofoblástica gestacional. Resultados de nascimentos com vida foram obtidos pelo acompanhamento com os pacientes como parte do atendimento clínico de rotina, porém não foram usados neste estudo.
Árvores de Regressão [000156] Dados clínicos de FIV, especialmente quando se considera os parâmetros de ovócitos e embriões, geralmente não se prestam à análise significativa por meio de regressão logística multivariada. O alto grau de interação e de multicolinearidade de muitas variáveis relevantes interfere com a regressão multivariada convencional. Nessas situações, a regressão e os modelos de classificação de árvores (CART), têm sido amplamente utilizados em pesquisas clínicas (Fonarow GC, Jama 293: 572-580 (2005); Friedman J (1999) Greedy function approximation: A stochastic boosting machine. Technical Report, Departmento de Estatística, Universidade de Stanford; Friedman J (1999) Stochastic gradient boosting. Technical Report, Departmento de Estatística, Universidade de Stanford; Friedman J (2002) Tutorial: Getting started with MART in R. Departmento de Estatística, Universidade de Stanford; Friedman et al.,
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Stat Med 22: 1365-1381 (2003); Guzick et al., N Engl J Med 345: 13881393 (2001); Pilote et al., N Engl J Med 335: 1198-1205 (1996)). Aqui, foi utilizado a Árvore de Repressão de Adições Múltiplas ((MART®), um método estatístico mais poderoso, que combina reforço no CART para reforçar ou aumentar a precisão do método CART, para identificar variáveis prognósticas não redundantes.
[000157] Em geral, árvores de regressão têm várias vantagens importantes: 1) capacidade de considerar todos os tipos de FIV clínica e dados embriológicos, incluindo as variáveis numéricas, ordinais, binárias e categóricas; 2) capacidade de lidar com valores ausentes baseados em uma técnica de divisão de aluguel, sem necessidade de imputação; 3) capacidade de gerar resultados que são invariantes à transformação monotônica de dados, eliminando assim a necessidade de testar diferentes métodos de transformação de dados ou métricas; 4) capacidade de gerar árvores imunes aos efeitos de valores extremamente discrepantes; 5) capacidade de gerar árvores que, inerentemente, exploram e identificam as interações das variáveis que precisariam ser declaradas explicitamente em uma regressão logística múltipla. Ainda mais importante, as árvores de regressão podem considerar um grande número de variáveis, incluindo aqueles que podem vir a ser irrelevantes, mesmo que apenas um pequeno número de variáveis tenha impacto estatístico significativo nos resultados. Essa capacidade de analisar muitas variáveis é fundamental para a análise dos resultados de FIV, como muitas variáveis, como a porcentagem de embriões de 8 células, o número de embriões de 8 células, porcentagem de embriões de 8 células transferidos e o número de embriões de 8 células transferidas, podem ser altamente interativas, assim, a seleção arbitrária de uma delas pode comprometer a integridade dos dados e introduzir tendência, enquanto a inclusão de todas elas pode causar a regressão multivariada
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62/357 convencional à quebra.
[000158] Os resultados de MART® podem ajudar a identificar as variáveis, que podem ser analisadas novamente por regressão logística multivariada. Frequentemente, podem identificar limiares ou cortes que serão utilizados para criar variáveis categóricas para a segregação de casos em subgrupos para maior comparação intergrupal de características por métodos convencionais como testest, análise chi-quadrado, ou teste de postos com sinais de Wilcoxon. Por exemplo, a análise de CART utilizada por Guzick et al. para classificar homens como subférteis, com status de fertilidade não definido ou fértil com base nos valores de limiar para a concentração, mobilidade e morfologia do esperma, exemplifica o poder dessa estratégia para a pesquisa de infertilidade (Guzick et al., N Engl J Med 345: 1388-1393 (2001)).
Cultura Embrionária [000159] Indivíduos do sexo feminino do tipo selvagem F1(C57BL6xDBA/2) com 3 a 5 semanas (Charles River) foram superovuladas com injeções intraperitonais de 5 IU do soro de gonadotrofina de éguas (Sigma) seguido por 5 IU de gonadotrofina coriônica humana (Sigma) após 48 horas e acasalados com indivíduos do sexo masculino do tipo selvagem. Camundongos foram sacrificados por deslocação cervical 17 horas após a injeção de hCG e embriões de 1 célula foram liberados das trompas de falópio. Células do cúmulo foram removidas por tratamento de hialuronidase (Sigma) e pipeta. Embriões pré-implantados no estágio de dois pró-núcleos foram recuperados compartilhados de 3-6 indivíduos do sexo feminino em meio M2 (Chemicon International), seguido de micro injeção citoplásmica imediata e da cultura de Fluido Tubário Humano com micro gotas de 10% de suplemento de soro (In-Vitro Fertilization, Inc.) sob óleo mineral (Sigma) em gás misto (90% de nitrogênio, 5% de
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63/357 oxigênio, 5% de dióxido de carbono; Praxair) em 37° C e cultivados em 10 embriões por 20 pL gotas.
Microinjeções de Oligômero Morfólico Antissenso [000160] Oligômeros morfólicos antissenso (MOs) de 25-nt direcionados especificamente para o 5'UTR ou local de início de translação, ou controles inadequados em 5 nts foram adquiridos de Gene Tools, LLC. (Vide tabela 1 para detalhes das sequências). Havia sido determinado que 0,6-0,75 mm seria a concentração máxima que permitiria as taxas normais de desenvolvimento embrionário (dados não mostrados). Portanto, salvo indicação em contrário, 5-10 PL de 0,75 mM MO-CCNA2 (0,60 mM para Oct4-MO) foram injetados no citoplasma de cada embrião em um microscópio invertido (Olympus IX70) equipado com o sistema hidráulico de micro manipulação (IM300 Microinjector, Narishige, Japão). Dez embriões de controle não injetados foram utilizados em cada experimento, que foi realizado pelo menos três vezes. O percentual médio e erro padrão do meio (meio ± SEM) de embriões progredindo ou retidos em cada estágio de desenvolvimento foram calculados, e a significância estatística foi determinada pelo cálculo do valor-p usando o teste t de Student com 2 extremidades.
Tabela 1: Sequência Específica de Gene de Oligômeros Morfólicos
Antissenso Alvo em 5' UTR e/ou Local de Início
Nome Sequência conteúdo GC, %
Ccna2-MO-1 5'-TCGAGGTGCCCGGCATCGCGGCTCC-3' (SEQ ID N°:01) 76
Ccna2-MO-2 5'-CTGTCGGCGGCAGAGCGTTCACAGC-3' (SEQ ID N°:02) 68
Ccna2-MM-1 5'-TCCAGGTCCCCCGCATCCCGGATCC-3' (SEQ ID N°:03) 72
Oct4-MO 5'-AGTCTGAAGCCAGGTGTCCAGCCAT-3' (SEQ ID N°:04) 56
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Oct4-MM 5'-AÇTCTÇAAGCCAÇGTGTGCAGCGAT-3' (SEQ ID N°:05) 56
Oct4E4-MO 5'-CTCCGA II IGCATATCTGGGCAGGG-3' (SEQ ID N°:06) 56
Oct4E4-MM 5'-CTGCGAIIIÇCATATGTGÇGCAÇGG-3' (SEQ ID N°:07) 56
Controle padrão* 5'-TCCAGGTCCCCCGCATCCCGGATCC-3' (SEQ ID N°:08) 72
* local de separação do gene β-globina humano mutado. Nucleotídeos incompatíveis foram sublinhados.
Mancha imune e citoquímica imunológica [000161] Embriões injetados e de controle foram coletados no estágio de 2 células (43 horas após a administração de gonadotrofina coriônica humana (hCG)) e lavados em PBS contendo 3mg/mL polivinilpirrolidona (PVP). Para a mancha imune, os embriões injetados e de controle foram lisados em tampão de RIPA (50 mM de Tris-HCl, pH7,5, 150 mM de NaCl, 1 mM de EDTA, 1% de P-40 não identificado, 2 mg/ml de aprotonina, 2 mg/ml de leupeptina, 1 mg/ml de pepstain, e 20 mg/ml de fenilmetilsulfonil) contendo um coquetel de inibidor de fosfatase (Roche) fervido em tampão Laemli e armazenado em -80° C até a coleta de lisatos de 75 embriões para cada condição. As amostras serão carregadas e analisadas por electroforese em 10% de gel de poliacrilamida Tris-HCl, transferido semi-seco para a membrana de nitrocululose (Bio-Rad), incubada durante a noite em 1:250 de anticorpo A2 anticiclina policlonal de coelho primário diluído (Santa Cruz Biotechnologies, sc-751) em 4° C e em anticorpo ligado a peroxidase de raiz forte anti-coelho de macaco secundário diluído (Amersham, NA934V) por uma hora em temperatura ambiente e visualizado com o uso de Reagente de Detecção Blotting ECL (Amersham). A citoquímica imunológica foi executada de acordo com o protocolo padrão. Brevemente, os embriões foram fixados em 4% de solução paraformaldeído-PBS, impermeabilizada em 0,1% de Triton X
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PBS e tratada com solução Ampliadora de Sinais ImageIT FX (Invitrogen) em RT, incubada em 1:100 de anticorpo primário diluído durante a noite em 4° C, em 1:10.000 de anticorpo secundário diluído por uma hora, seguido de 3μΜ DAPI por 10 minutos, e montada em Meio de Montagem VectaShield (Vector Laboratories, H-1000). Os controles foram executados paralelamente com soro de controle normal de coelhos ou camundongos. Todos os anticorpos foram diluídos em 1% BSA. Os embriões foram visualizados por microscópios confocais utilizando Microscópio de Varredura com Laser Confocal LSM 510 ou microscópio epifluoroscente ou o microscópio Axiovert 200 equipado com câmera digital Axiocam (Zeiss) utilizando parâmetros e tempos de exposição fixos. Os anticorpos primários foram adquiridos da Santa Cruz Biotechnologies (coelho policlonal anti-ciclina A2 (sc-751), coelho comum IgG (sc-2027), camundongo monoclonal anti-Oct4 (sc-5279), e camundongo comum IgG (sc2025)). Os anticorpos secundários foram adquiridos de Molecular Probes (IgG de cabra anti-coelho Alexa Fluor 594 (A-11012) e IgG de camundongo anti-cabra (A-11001).
Síntese de mRNA por transcrição in vitro.
[000162] O clone de camundongo cDNA completo, Oct4-pSPORT (identidade do clone 30019896) (Open Biosystems), e um plasmídeo codificando o biossensor mitótico de fluorescência, uma versão modificada e melhorada da proteína de fluorescência amarela (mEYFP), foram verificados em sequência, linearizados pela digestão de enzimas de restrição, e usados como modelos. Transcrições de mRNA com poliadenilação e tampas de 5' foram transcritas in vitro (mMessage e kits PolyA-Tail, Ambion), que foram então quantificadas por espectroscopia de UV, e analisados por eletroforese para confirmar seu tamanho.
Preparo de amostras de RNA para experimentos de chip de
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66/357 genes [000163] Amostras contendo 20 embriões agrupados injetados ou de camundongos controle foram lavadas com 3 gotas de PBS/PVP e coletadas para extração e isolamento de RNA total (Kit de Isolação de RNA Total Picopure, Molecular Devices Corporation), para produzir 10pL de RNA total. 5pL de RNA total, ou o equivalente a 10 embriões de camundongos, foram submetidos a dois ciclos de amplificação (sistema WT-Ovation Pico, Nugen) de acordo com as instruções do fabricante. A qualidade do ssDNA resultante da segunda rodada de amplificação foi testada em Bioanalyzer 2100 (Agilent), e um rendimento médio de 5-8 pg por amostra foi quantificado pelo espectrofotômetro UV ND-1000 (Nanodrop Technologies). Rotulagem de biotina direta e a fragmentação foram realizadas (Módulo de Biotina de cDNA FL-Ovation (Nugen)). Amostras de ssDNA fragmentadas e marcadas foram submetidas ao Laboratório Central PAN da Universidade de Stanford para a hibridação ao Genoma de Camundongos GeneChip® 430 2,0 Agrupamento (Affymetrix), e a varredura a laser .
Análise estatística para experimentos com chip de genes [000164] Os dados brutos de um total de 12 chips de genes (3 Ccna2-MO e seus controles não injetados e 3 Oct4-MO e seus controles não injetados) e foram normalizados por dChip (Li C & Wong WH (2003) em The analysis of gene expression data: methods and software (Springer, Nova York), pp 120-141). Análises de agrupamentos não supervisionados fora realizadas por genes contendo: 1) o nível de expressão com o Sinal de Intensidade (SI) maior que 500 em pelo menos 10 por cento das amostras; 2) desvio padrão com relação média de > 0,4 e <1000 entre as amostras. As análises subsequentes não se restringiram a esses critérios. As listas de genes diferencialmente expressos e suas classificações foram
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67/357 geradas pelo método proposto por Johnson e Wong, que se baseia na modulação, modulação registrada e estatística t não pareada (Nicholas Johnson e WHW (2007), Combining scientific and statistical significance in gene ranking. Não publicado). A expressão diferencial foi definida por um limiar de 5 por cento da taxa de descoberta falsa mediana falsa (FDR) estimada a partir de 300 permutações aleatórias entre as amostras. Para encontrar os termos de ontologia gênica (GO) significativamente enriquecida (Ashburner M, et al. (2000) Gene ontology: tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium. Nat Genet 25, 25-29), cada listagem de genes foi mapeada por números de identificação de gene Entrez (NCBI) e testadas por GOSTAT PACKAGE (Beissbarth T & Speed TP (2004) GOstat: find statistically overrepresented Gene Ontologies within a group of genes. Bioinformatics 20, 1464-1465) contra um conjunto de genes de universo definidos por chamada P em pelo menos 2 de 3 amostras tratadas ou 4 de 6 amostras controle por (MAS, Affymetrix). Para estimar o FDR, 50 testes foram realizados com listagens de genes geradas aleatoriamente do conjunto de genes universo, e o número médio de termos GO enriquecidos foram calculados (Ashburner et al.; Beissbarth et al.). O corte para o valor-p foi escolhido para refletir o FDR de ~10 por cento. Genes diferencialmente expressos com possíveis locais de ligação de Oct4 foram identificados por comparação com os genes putativos com Oct4 regulado previamente identificados por Zhou et al. al Zhou et. al. (Zhou Q, Chipperfield H, Melton DA, & Wong WH (2007) A gene regulatory network in mouse embryonic stem cells. Proc Natl Acad Sci U S A 104, 16438-16443), seguido pelo mapeamento de conjuntos de sonda para RefSeq usando o BIOCONDUCTOR ANNOT PACKAGE (R.C. Gentleman VJC, D.M. Bates, B. Bolstad, M. Dettling, S. Dudoit, B. Ellis, L. Gautier, Y. Ge, J. Gentry, K. Hornik, T. Hothorn, W. Huber, S. Iacus,
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R. Irizarry, F. Leisch, C. Li, M. Maechler, A.J. Rossini, G. Sawitzki, C. Smith, G. Smyth, L. Tierney, J.Y.H. Yang, J. Zhang. (2004) Bioconductor: Open software development for computational biology and bioinformatics. Genome Biology 5, R80).
Análise de RT-PCR, q-PCR e q-PCR de embrião único [000165] Tampões de lise foram adicionados em embriões lavados com PBS/PVP (kit Células-para-cDNA, Ambion) e as amostras foram tratadas com 1 ml de DNAse I. A transcrição reversa (RT) foi realizada usando 1,0 pL da enzima RT SuperScript III (200 U/pL), conforme o protocolo (Invitrogen). A amplificação do produto do gene específico por Kit TaqPolymerase High Fidelity (Invitrogen) foi realizada no termociclador (grau Mastercycler 5331, Eppendorf) como segue: 94,0o C por 2 minutos, 94,0oC por 15 segundos, 60,0o C por 30 segundos, 68,0o C por 45 segundos, 68,0o C por 7 minutos para 50 ciclos. (Vide Quadro 2 para todas as sequências de iniciadores e sondas TaqMan). O embrião único qRT-PCR foi executado utilizando o sistema Biomark Dynamic Array 48.48 (Fluidigm, Sul de São Francisco, CA). Embriões únicos foram tratados com ácido Tyrode, e recolhidos em 10 ql de tampão de reação, seguido de pré-amplificação, conforme as instruções do fabricante (Exame da Expressão de Genes,
Biossistemas Ampliados; Tabela S8). cDNA amplificados foram carregado em um Dynamic Array 48.48 usando o controlador
NanoFlex IFC (Fluidigm). O ciclo limiar (CT), como uma medida da intensidade de fluorescência relativa, foi extraído do software de análise BioMark PCR (Fluidigm). Todas as reações foram executadas em duplicatas ou triplicatas, juntamente com RT negativo, PBS e os controles positivos em pelo menos 3-5 experimentos independentes. Os dados de cada gene examinado foram testados com um modelo linear (ANCOVA) em que Ct ~ βϋ + 31*Condição + β2* CT[Gapdh] + β3* CT[beta-actina], onde Condição refere-se a sem injeção ou Oct4
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69/357 knockdown. Os valores de Ct foram diretamente usados na análise de dados, uma vez que a expressão gênica ao nível de uma única célula tem demonstrado seguir uma distribuição log-normal.
Tabela 2. Sondas Taqman® e Iniciadores Específicos para Genes
Utilizados em q-PCR
Nome da Sonda Identificação do Exame de Biossistemas Aplicado/No do Catálogo
Bmpr1a Mm01208758 m1
Poo u5f1 Mm00658129 gH
Klf9 Mm00495172 m1
Fgf4 Mm00438917 m1
Sall4 Mm01240680 m1
Bclaf1 Mm00464127 m1
Yy1 Mm00456392 m1
Pknox1 Mm00479320 m1
Gata4 Mm00484689 m1
Mta2 Mm00488671 m1
Rest1 Mm00803268 m1
Tcfl5 Mm00626495 m1
Dppa5 Mm01171664 g1
Bmpr1a Mm00477650 m1
Fgfrl1 Mm00475318 g1
Il17rd Mm00460340 m1
Ubtf Mm00456972 m1
Gtf3c4 Mm00557022 m1
Gtf3c2 Mm00510828 m1
Polr3e Mm00491765 m1
Polr3a Mm00805896 m1
Eif3b Mm00659801 m1 Eif3s10
Eif3s10 Mm00468721 m1
Piwil2 Mm00502383 m1
Eif4e Mm00725633 s1
Polr2h Mm01344328 g1
Eif2c5 Mm01305462 m1
Eif3c Mm01278697 m1
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Eif5b Mm01227234 m1
Papola Mm01334253 m1
Eif3e Mm01700222 g1
Sox2 Mm03053810 s1
Camundongo β-actina 4352341E
Camundongo β-actina 4352933E
Camundongo GAPDH 4352932E
Iniciadores Específicos para Genes para Oct4 (produto 302 bp)
Avançado GGCGTTCTCII IGGAAAGGTGTT (SEQ NO:09)
Inverso CTCGAACCACATCCTTCTCT (SEQ NO:10)
Iniciadores Específicos para Genes para Ccna2 (produto 212 bp)
Avançado GATAGATTCCTCTCCTCCATG (SEQ NO:11)
Inverso TCACACACTTAGTGTCTCTGG (SEQ NO:12)
EXEMPLO 1
DADOS CLÍNICOS E EMBRIOLÓGICOS [000166] De todos as 1117 tratamentos de FIV realizados na Universidade de Stanford em 2005, 822 foram ciclos novos de FIV que utilizaram ovócitos dos próprios pacientes (figura 1, painel A). Com base em nossos critérios de exclusão, 157 ciclos foram excluídos por uma variedade de razões médicas e não médicas.
[000167] Os 157 ciclos que foram excluídos consistiram em: a captação cancelada de ovócitos devido à estimulação ovariana pequena (63 ciclos), a transferência embrionária cancelada devido a falta de desenvolvimento completo do embrião (8 ciclos), a transferência embrionária cancelada devido a motivos inesperados médicos ou não médicos (35 ciclos), ciclos que não foram tratados com gonadotrofinas (3 ciclos), falta de resultados (8 ciclos), e as mulheres com > 45 anos de idade, com base apenas na idade (29 ciclos). Em nosso estudo, 160 pacientes foram submetidos a ciclos repetidos subsequentes após prévias tentativas falhas em um total de 368 ciclos. Desses, 126 pacientes tiveram dois ciclos de FIV realizados, 25 pacientes tiveram três ciclos, seis pacientes tiveram 4
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71/357 ciclos, um paciente teve 5 ciclos e dois pacientes tiveram seis ciclos realizados no mesmo ano e na mesma instituição. 511 ciclos (76,8%) com a transferência de embriões no Dia 3 e 154 ciclos (23,2%) com a transferência de embriões no Dia 5, ou um total de 665 ciclos de FIV, preencheram os critérios de inclusão e exclusão para as análises.
[000168] Os dados clínicos e embriológicos nos 665 ciclos restantes que preencheram os critérios de inclusão e exclusão, e seus 4144 embriões, respectivamente, foram analisados para testar a hipótese de que as variáveis específicas de coorte prevêem os resultados do ciclo de FIV (Figura 1). Desses 4144 embriões, o número de blástulas ou células no dia 3 foi registrado em 4002 embriões (96,6%). No geral, 38,8% tinham oito células, o número de células de desenvolvimento adequado, enquanto 18,2% dos embriões tinham < 4 células, e 33,6% tinham 5-7 células (figura 2).
EXEMPLO 2
SIGNIFICÂNCIA DO PROGNÓSTICO E CORRELAÇÃO DE VARIÁVEIS [000169] Foi sistematicamente examinada a associação de cada variável com os resultados de FIV, e a correlação de cada par de variáveis. Os testes de regressão logística em pares confirmaram muitas variáveis de prognósticos conhecidos, incluindo a idade da pessoa do sexo feminino, FSH do dia 3 e o número de embriões de 8 células. No entanto, além dessas variáveis de prognósticos conhecidos, observamos que as variáveis específicas de coorte, tais como taxa de fertilização e a taxa de retenção de clivagem também foram significativamente associadas com o resultado do ciclo de FIV (p <0,001; Tabela 3). Em contraste, exceto pelo fator de infertilidade masculina (p <0,05), nenhum dos diagnósticos de infertilidade convencionais foram significativamente associados com os resultados de FIV. Deve ser observado que, apesar de um elevado grau de
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72/357 correlação entre muitas variáveis e a idade ou o nível de FSH no dia 3, que estima o envelhecimento ovariano, nem a idade nem o nível de FSH no dia 3 foram correlacionados com parâmetros de embriões específicos de coorte (tabela 4). Coletivamente, esses resultados sugerem que determinantes diferentes de mecanismos relacionados com a idade e diagnósticos clínicos têm impacto na competência de desenvolvimento de competência de embriões específicos de coorte.
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Tabela 4: Correlação . entre cada par . de variáveis
No. de embriões de 8 células transferidos No. de embriões de 8 células Taxa de fertilização No. médio de células de embriões transferidos Porcentagem de embriões transferidos no estágio de <4 células Porcentagem de embriões transferidos no estágio de 8 células No. de embriões transferidos Número médio de células de embriões Porcentagem de embriões com <4 células Porcentagem de embriões no estágio de 8 células N° de embriões Grau médio dos embriões transferidos Grau médio N° de ovócitos Nível de FSH máximo no Dia 3 Gravidade Idade
-0,02 O 0,03 -0,13 0,15 -0,20 0,25 0,03 0,03 0,03 -0,25 0,12 -0,01 -0,30 0,13 0,19 1,00 Idade
0,09 0,06 0,03 0,02 0,03 0,03 0,06 O -0,03 O o 00 -0,03 -0,03 -0,08 -0,06 O o 1,00 0,19 Gravidade
-0,10 -0,20 O o 4^ -0,05 0,00 -0,20 -0,03 0,02 -0,03 -0,02 -0,20 0,05 0,02 0,24 1,00 o o 0,13 Nível de FSH máximo no Dia 3
0,38 0,68 -0,06 0,27 -0,21 0,35 0,13 0,06 -0,05 0,06 0,86 -0,25 -0,02 1,00 -0,24 -0,06 -0,30 N° de ovócitos
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Continuação
No. de embriões de 8 células transferidos No. de embriões de 8 células 1 Taxa de fertilização No. médio de células de embriões transferidos Porcentagem de embriões transferidos no estágio de <4 células Porcentagem de embriões transferidos no estágio de 8 células No. de embriões transferidos Número médio de células de embriões Porcentagem de embriões com <4 células Porcentagem de embriões no estágio de 8 células N° de embriões Grau médio dos embriões transferidos Grau médio N° de ovócitos Nível de FSH máximo no Dia 3 Gravidade Idade
O -0,20 O o 4^ -0,28 0,20 -0,24 O o 4^ -0,39 0,29 -0,35 0,02 O 00 4^ 1,00 -0,02 0,02 -0,09 -0,01 Grau médio
-0,30 -0,39 -0,10 -0,41 0,31 o 4^ hO 0,09 -0,36 0,28 -0,34 -0,28 1,00 o 00 4^ -0,25 0,05 -0,03 0,12 Grau médio dos embriões transferidos
0,45 O 0,35 0,35 -0,28 0,41 0,14 0,05 O o 00 0,05 1,00 -0,28 0,02 0,86 -0,20 -0,03 -0,25 N° de embriões
0,55 0,51 -0,02 0,50 -0,41 O -0,15 0,61 -0,51 1,00 0,05 -0,34 -0,35 0,06 -0,02 O o 00 0,03 Porcentagem de embriões no estágio de 8 células
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Continuação
No. de embriões de 8 células transferidos No. de embriões de 8 células 1 Taxa de fertilização No. médio de células de embriões transferidos Porcentagem de embriões transferidos no estágio de <4 células Porcentagem de embriões transferidos no estágio de 8 células No. de embriões transferidos Número médio de células de embriões Porcentagem de embriões com <4 células Porcentagem de embriões no estágio de 8 células N° de embriões Grau médio dos embriões transferidos Grau médio N° de ovócitos Nível de FSH máximo no Dia 3 Gravidade Idade
-0,35 -0,32 -0,12 -0,70 0,87 -0,41 O o 4^ -0,83 1,00 -0,51 -0,08 0,28 0,29 -0,05 -0,03 -0,03 0,03 Porcentagem de embriões com <4 células
0,39 0,35 O o 4^ O 00 -0,67 0,45 -0,03 1,00 -0,83 0,61 0,05 -0,36 -0,39 0,06 0,02 O 0,03 Número médio de células de embriões
0,39 -0,03 0,16 -0,06 0,02 -0,22 1,00 -0,03 O o 4^ -0,15 0,14 0,09 O o 4^ 0,13 -0,03 0,06 0,25 N° de embriões transferidos
0,70 0,64 0,14 0,58 -0,48 1,00 -0,22 0,45 -0,41 O 0,41 ò 4^ hO -0,24 0,35 -0,12 0,03 -0,20 Porcentagem de embriões transferidos no estágio de 8 células
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Continuação
No. de embriões de 8 células transferidos No. de embriões de 8 células 1 Taxa de fertilização No. médio de células de embriões transferidos Porcentagem de embriões transferidos no estágio de <4 células Porcentagem de embriões transferidos no estágio de 8 células No. de embriões transferidos Número médio de células de embriões Porcentagem de embriões com <4 células Porcentagem de embriões no estágio de 8 células N° de embriões Grau médio dos embriões transferidos Grau médio N° de ovócitos Nível de FSH máximo no Dia 3 Gravidade Idade
-0,41 -0,34 -0,22 -0,80 1,00 -0,48 0,02 -0,67 0,87 -0,41 -0,28 0,31 0,20 -0,21 0,00 0,03 0,15 Porcentagem de embriões transferidos no estágio de <4 células
O 4^ 00 O 4^ 4^ 0,20 1,00 -0,80 0,58 -0,06 O 00 -0,70 0,50 0,35 -0,41 -0,28 0,27 -0,05 0,02 -0,13 N° médio de células de embriões transferidos
0,19 0,24 1,00 0,20 -0,22 0,14 0,16 o o 4^ -0,12 -0,02 0,35 -0,10 O o 4^ -0,06 O o 4^ 0,03 0,03 Taxa de fertilização
0,59 1,00 0,24 O 4^ 4^ -0,34 0,64 -0,03 0,35 -0,32 0,51 O -0,39 -0,20 0,68 -0,20 0,06 -0,14 N° de embriões de 8 células
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Continuação
No. de embriões de 8 células transferidos No. de embriões de 8 células I Taxa de fertilização No. médio de células de embriões transferidos Porcentagem de embriões transferidos no estágio de <4 células Porcentagem de embriões transferidos no estágio de 8 células No. de embriões transferidos Número médio de células de embriões Porcentagem de embriões com <4 células Porcentagem de embriões no estágio de 8 células N° de embriões Grau médio dos embriões transferidos Grau médio N° de ovócitos Nível de FSH máximo no Dia 3 Gravidade Idade
1,00 0,59 0,19 O 4^ 00 -0,41 0,70 0,39 0,39 -0,35 0,55 0,45 -0,29 O 0,38 -0,10 0,09 -0,02 N° de embriões de 8 células transferidos
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EXEMPLO 3
LIMIARES DAS VARIÁVEIS NÃO REDUNTANTES DE PROGNÓSTICO DEFININDO FENÓTIPOS DE COORTES DE EMBRIÕES HUMANOS [000170] Análises de árvores de regressão de adições múltiplas (MART®) sequênciais e árvores de classificação e regressão (CART), análises de todas as 30 variáveis (listadas na tabela 3 e sua legenda) determinou que os resultados do ciclo de FIV foram mais precisamente estimados em ~70% com o uso de apenas quatro variáveis não redundantes: número total de embriões, a taxa de retenção de clivagem de um coorte de embriões, o número de embriões de 8 células em um coorte, e o nível de FSH no Dia 3. Deve ser observado que essas quatro variáveis descrevem o coorte de embriões, em vez de embriões individuais, e foram mais informativas do que a idade, os diagnósticos clínicos ou qualquer medida dos embriões transferidos. Curiosamente, o número total de embriões, FSH de Dia 3 e o número de embriões de 8 células dependia de, e, portanto, capturou os efeitos de muitas outras variáveis. Em contraste, a taxa de retenção de clivagem foi independente de qualquer uma dessas variáveis conhecidas. (Detalhes sobre análises de MART® e CART são apresentados na tabela 5 e na figura3).
Tabela 3: Associação de cada variável de resultados de gestação
Variáveis Estimativas* S.E. Valor P
Características de Pacientes e Diagnósticos Clínicos 1
Idade -0,10 0,02 2.16E-007
Nível de FSH no Dia 3 Máximo -0,08 0,03 1.70E-003
Gravidade 0,036 0,066 5.86E-001
Fator Masculino (diagnostico de infertilidade) 0,50 0,24 3.71E-002
Características de Ciclos de FIV
Protocolo de micro dose de lupron (flare) -1,14 0,24 2.53E-006
Protocolo de antagonista -0,74 0,19 9.98E-005
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Variáveis Estimativas* S.E. Valor P
Performance de ICSI -0,15 0,16 3.47E-001
No de ovócitos 0,08 0,01 1.58E-009
Parâmetros de Coorte de Embriões
Taxa de fertilização 1,24 0,36 5.37E-004
No de embriões 0,14 0,02 2.67E-012
No médio de células de embriões 0,29 0,06 6.34E-006
No médio de embriões de 8 células 0,26 0,04 2.88E-012
Porcentagem de embriões de 8 células 0,76 0,28 5.75E-003
Taxa de retenção de clivagemí -1,28 0,35 2.76E-004
Grau médio dos embriões -0,091 0,17 5.88E-001
Parâmetros de embriões transferidos
Transferência de embrião no dia 5§ 1,40 0,19 7.51E-013
No de embriões transferidos 0,0058 0,053 9.12E-001
No médio de células de embriões transferidos 0,47 0,07 2.19E-010
Porcentagem de embriões de 8 células transferidos 1,33 0,21 5.35E-010
No médio de embriões de 8 células transferidos 0,41 0,08 4.40E-008
No de embriões transferidos com <4 células -2,14 0,49 1.06E-005
Grau médio dos embriões transferidos -0,52 0,17 2.61E-003
* As estimativas positivas e negativas indicam associação com os resultados positivos e negativos da gestação, respectivamente. t Dos diagnósticos clínicos de infertilidade que não foram significativamente associados com o resultado da gestação (p> 0,05) não foram indicados: o fator uterino, síndrome dos ovários policísticos, endometriose, ligação das trompas, doença tubária, hidrossalpinge, infertilidade inexplicada, e outros diagnósticos. Cada caso de FIV pode ter mais de um diagnóstico de infertilidade clínica. φ A taxa de retenção de clivagem é definida como a porcentagem de embriões com quatro ou menos células no Dia 3 de cultivo in vitro. § A transferência de embriões no Dia 5 é arbitrariamente listada em Parâmetros de Embriões Transferidos. Ela também pode ser considerada um Parâmetro de Coorte de Embriões, pois depende do número total de embriões e número de embriões de 8 células.
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Tabela 5: Modelos gerados por MART® para identificar variáveis não redundantes de prognósticos
Mod elo Grau de Interação Taxa de Aprendizado* Número da Árvoref Taxa de Previsão de Erro Transversal (CV)
1 2 0·0100 2 0·300800
2 3 0·0010 3 0·300800
8 20 0·0010 4 0·308300
6 10 0·0001 4 0·315800
3 4 0·1000 30 0·323300
4 5 0·0020 16 0·323300
5 6 0·0100 16 0·330800
7 15 0·0001 3 0·330800
* Um dos parâmetros de ajuste de reforço em MART ® para evitar a superadaptação das informações2 f Número de árvores construídas por MART ® tf Erro de validação cruzada de 10 vezes
[000171] Dos limiares de prognósticos identificados, os fenótipos mais poderosos, são A1 e A2, B1 e B2 (Tabela 6). O número de embriões <6 ou > 6 é usado por todos os 5 modelos CART principais, define todos os outros fenótipos (B a F) e pode ser aplicado a todos os casos. Especificamente, o fenótipo definido por ter menos de seis embriões, tem uma razão de probabilidade de 3,9 para nenhuma gestação quando comparado aos casos com > 6 embriões (95% intervalo de confiança [IC], 2,8 a 5,5). Da mesma forma, os próximos fenótipos mais poderosos são definidos pelo número de embriões e pela taxa de retenção de clivagem, como para os casos com > 6 embriões, aqueles com taxa de retenção de clivagem >14,6% têm 3,0 vezes mais chances de resultar em nenhuma gestação do que aquelas com taxa de retenção de clivagem < 14,6% (95% CI, 1,9-4,9).
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Tabela 6: Limiares de prognóstico definindo fenótipos específicos para coorte
Embriões (No)* Retenção de Clivagem (%)* Embriões de 8 células (No.)* FSH (mIU/mL)* Gestação - No (%)t No de Gestação No (%) t Casos Aplicáveis - No (%) § No de Árvores Condição de Referências || Razão de Probabilidade 95% Intervalo de Confiança (C.I.)
A1** >6 177 (57.7) 130 (42.3) 307 (46.2) 5
A2 < 6 92 (25.7) 266 (74.3) 358 (53.8) 5 A1 3.9 (2.8, 5.5)
B1 >6 < 14,6 112 (70,4) 47 (29,6) 159 (23,9) 4
B2 >6 > 14,6 65 (43,9) 83 (56,1) 148 (22,3) 4 B1 3,0 (1,9, 4,9)
B3 >6 14,6 - 52,8 62 (47,3) 69 (52,7) 131 (19,7) 1 B1 2,6 (1,6, 4,3)
B4 >6 < 52,8 174 (60,0) 116 (40,0) 290 (43,6) n/a
B5 >6 > 52,8 3 14 (82,3) 17 (2,6) 1 B1 10,6 (3,2, 49,6)
(17,6) B4 6,7 (2,1,30,9)
C1 >6 > 2 157 (63,6) 90 (36,4) 247 (37,1) 1
C2 >6 < 2 20 (33,3) 40 (66,7) 60 (9,2) 1 C1 3,5 (1,9, 6,4)
D1 >6 > 14,6 > 2 51 (53,1) 45 (46,9) 96 (14,4) 1
D2 >6 > 14,6 < 2 14 (26,9) 38 (73,1) 52 (7,8) 1 D1 3,0 (1,5, 6,5)
E1 >6 > 14,6 > 2 < 4,6 14 (82,4) 3 (17,6) 17 (2,6) 1
E2 >6 > 14,6 > 2 > 4,6 34 (46,9) 37 (53,1) 71 (12,2) 1 E1 4,8 (1,4, 23,4)
* Fenótipos de coorte definidos por limiares de variáveis de prognósticos não redundantes. Cada conjunto de condições (A-E) usa E como o operador em que mais de uma condição é listada. t N° de casos que preenchem as condições dos limiares e têm resultado de gestação. Essa porcentagem é calculada usando N° de Casos Aplicáveis como denominador. Em geral, as condições que discriminam entre resultados de gestação e não gestação com maior certeza são mais poderosos e espera-se que tenham maior utilidade na gestão clínica e nas pesquisas translacionais.
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82/357 * N° de casos que preenchem as condições dos limiares e não têm resultado de gestação. Essa porcentagem é calculada usando N° de Casos Aplicáveis como denominador.
§ O N° de Casos Aplicáveis é o número total de casos que preenchem as condições dos limiares. Essa percentagem é calculada usando o número total de ciclos (665) como o denominador. Em geral, quanto maior o número de casos aplicáveis, mais útil o conjunto de condições será para a gestão clínica e o aconselhamento. No entanto, para fins de pesquisas translacionais, as condições que definem um número menor de casos podem ter correlação mais específica em um nível molecular.
O N° de Árvores mostra o número de árvores CART que utilizam cada conjunto de condições. Há um total de 5 árvores. (Vide Resultados Suplementares) A maior utilização indica utilidade ou robustez de um determinado conjunto de condições.
II Condição de referência contra a qual a razão de probabilidade e 95% do C.I. para não ter gestação são calculadas.
** As condições A-E estão listados do mais poderoso e útil ao menos útil com base: no número de árvores que utilizam cada conjunto de condições, no número de casos aplicáveis, bem como na razão de probabilidade e 95% do C.I.__________________________________________ [000172] Em contrapartida, o resto dos limiares indicados na tabela 6 são utilizados, cada um, por apenas um modelo CART, e são aplicáveis a menos casos. No entanto, como alguns dos fenótipos descrevem um subconjunto de casos muito específicos e têm razão de probabilidade altamente discriminatória, podem ser extremamente úteis, dependendo do contexto da investigação clínica ou da translação. Por exemplo, para os casos com > 6 embriões, taxa de retenção de clivagem de 14,6-52,8% e >52,8% de aumento na probabilidade de gestação por 2,6 (95% CI 1,6 a 4,3) e 10,6 (IC 95% 3,2 a 49,6), respectivamente, quando comparado aos casos com taxas de clivagem < 14,6%.
EXEMPLO 3
ANÁLISES POR MART® E MODELOS CART [000173] Para superar os desafios apresentados pela natureza altamente interativa e dependência potencialmente não linear entre as variáveis, e seus multicolineares, todas as 30 variáveis listadas na
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83/357 tabela 5 e sua legenda foram analisadas por MART® para gerar modelos que utilizam variáveis de prognóstico não redundantes. Oito modelos foram gerados por MART® com a complexidade crescente de árvores individuais para a melhoria, enquanto a taxa de aprendizagem foi escolhida para produzir um erro de ensaio mínimo para a complexidade dada. Entre eles, os três modelos com melhor classificação tinham taxas de previsão de erro de validação cruzada (CV) variando entre 0,301 a 0,308, o que os separa muito dos outros cinco modelos, cujas taxas de erro de CV variam entre 0,315 a 0,331 (tabela 5). O terceiro modelo, no entanto, baseou-se em árvores individuais muito complexas, mas ainda apresentou maior erro de CV que os dois modelos anteriores, e, portanto, foi excluída da análise. Os dois modelos superiores resultantes, de acordo com as características de modelos de árvore de regressão significativa, usaram muito poucas árvores e compartilham características comuns, de modo que os dois modelos coletivamente usaram apenas 5 árvores contendo 5 variáveis, enquanto alguns dos outros modelos usou entre 16 a 30 árvores cada um.
[000174] Essas 5 variáveis de prognósticos não redundantes foram: o número total de embriões, a taxa de retenção de clivagem, o número de embriões de 8 células, níveis de FSH no dia 3 e o número de embriões de 8 células transferidos. Em cada modelo, a remoção de cada uma das quatro primeiras variáveis, mantendo todos os outros parâmetros constantes, aumentou a taxa de erro do modelo, confirmando assim a sua contribuição significativa. Porém, a supressão do número de embriões de 8 células transferidos não alterou a taxa de erro (dados não mostrados), sugerindo que essa variável foi menos relevante do que outras.
[000175] Os 24 modelos que representam todas as combinações possíveis dessas cinco variáveis foram analisados pelo CART para
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84/357 definir melhor os limites com prognóstico significante. As 5 árvores principais geradas pelo CART tiveram pontuação de predição superior (0,6828 a 0,6950) em comparação com o resto dos modelos (0,565 a 0,6700). Como não havia recursos compartilhados, esses 5 modelos de árvores principais utilizam principalmente as mesmas condições de limiar para 4 variáveis, enquanto a variável, número de embriões de 8 células transferidos, não foram utilizados por qualquer um desses modelos superiores. Portanto, os resultados do ciclo de FIV poderiam ser mais precisamente estimados em ~70% usando apenas as quatro variáveis não redundantes que são mais informativas do que a idade, os diagnósticos clínicos, ou de qualquer medida dos embriões transferidos.
[000176] A fim de compreender quais os fatores que, entre as características do paciente, os diagnósticos e as características de tratamento de FIV, por sua vez determinam essas quatro variáveis de prognóstico específicas para coorte e não redundantes, modelos de árvores foram construídos por MART para representar a dependência de cada uma dessas quatro variáveis de prognóstico. O número total de embriões, o FSH no Dia 3 e o número de embriões de 8 células dependeram de e capturaram, portanto, os efeitos de muitas outras variáveis (Figura 3). Em contraste, a taxa de retenção de clivagem foi independente de qualquer uma dessas variáveis conhecidas.
EXEMPLO 4
ESTUDO DE GENE KNOCKOUT MEDIADO POR MORFOLINA [000177] Fornecemos aqui validade do conceito da eficiência e da especificidade do gene knockdown mediado por MO por testes do procedimento no gene Ccna2. Em seguida, é relatado o novo papel de Oct4 revelado pelo gene knockdown mediado por MO. O Ccna2, gene que codifica ciclo regulador celular ciclina A2, tem sido sugerido como
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85/357 um importante regulador transcricional na ativação do genoma embrionário (Hara KT, et al. (2005) Dev Biol 286, 102-113), um marco fundamental no desenvolvimento nos estágios de 1 a 2 células para o qual alguns mecanismos claros ou reguladores têm surgido. Consistente com a literatura, o Ccna2 knockdown mediado por MO diminuiu a expressão da proteína ciclina A2. Além disso, nossos resultados mostraram que a ciclina A2 é necessária para o desenvolvimento além do estágio de 2 células (figura 4, painéis A-C, figura 5, painéis A-D, tabelas 1 e 7). Os MOs bloqueiam a tradução de transcrições por bloqueio histérico de uma maneira eficiente e específica para gene, que tem sido bem estabelecida no peixe-zebra e em outros organismos modelo (Gore AV, et al. (2005) Nature 438, 1030-1035; Imai et al., (2006). Science 312, 1183-1187; Sumanas S & Larson JD (2002) Brief Funct Genomic Proteomic 1, 239-256; Yamada L, et al. (2003) Development 130, 6485-6495). Ainda mais importante, os MOs mediam o knockdown rápido de transcrições, independentemente da sua origem materna ou embrionária, antes da ativação de genes a jusante fornecer o resgate parcial do fenótipo. Ao contrário de siRNAs, MOs funcionam de forma independente das vias endógenas, de modo que o bloco translacional mediado por MO não deve limitar a eficiência do knockdown ou interferir com os mecanismos de degradação do mRNA endógeno.
[000178] Pela combinação gene knockdown mediado por MO com um perfil de expressão de gene global e do nível de um único embrião RT-PCR quantitativo (Q-PCR), foi determinado a influência de Oct4 sobre a expressão gênica, e foi analisada a rede do gene regulado por Oct4 no embrião precoce (figura 6 e figura 7). De forma coerente com a literatura, foi confirmado a expressão do gene Oct4 no estágio de 1 célula (figura 8). Após os embriões de 1 célula serem micro injetados com 0,6 mM de Oct4-MO, a taxa de retenção de desenvolvimento nos
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86/357 estágios de 1 a multicélulas foi significativamente maior que a observada para controles não injetados e incompatíveis (Oct4-MM) (figura9, painéis A e B ). Dos embriões injetados com Oct4-MO que atingiram o estágio de multicélulas, 86,8 ± 8,3% foram detidos e não formaram mórulas, em comparação com 10,5 ± 10,5% de embriões injetados com Oct4-MM (p <0,01; dados não mostrados). Notadamente, nenhum dos embriões injetados com Oct4-MM desenvolveu blástulas, em relação às taxas de blástulas relativamente elevadas de embriões injetados e não injetados com Oct4-MM (p <0,01; figura 9, painel C). Além disso, a especificidade do Oct4-MO é apoiada pela relação direta entre o grau do fenótipo e a dosagem de gene presumida, como titulada pela concentração de Oct4 MO (figura9, painéis D e E). A expressão da proteína de Oct4 foi realmente reduzida em embriões injetados com Oct4-MM nos estágios de 4 células (figura10) e multicélulas (figura 11, painel A, e figura 12). A injeção de outro MO, visando uma fronteira intron-exon em Oct4, confirmou que o rompimento da função Oct4 é prejudicial ao desenvolvimento antes do estágio de blástulas (figura 13, painéis A-C). [000179] A função crítica de Oct4 na transição de 1 a 2 células foi autônoma de embriões. Os efeitos do Oct4 knockdown não puderam ser resgatados por meios condicionados por embriões não injetados ou pelo ambiente in vivo fornecido pela transferência de embriões injetados em tubas uterinas de mães de aluguel em tempo adequado (dados não mostrados). A co-injeção de concentrações baixas (3,6 ng/pL) ou altas (3,6 ng/pL) de Oct4 mRNA inalterado e com 0,6 mM de Oct4-MO resultou em uma diminuição na porcentagem de embriões retidos nos estágios de 1 a multicélulas, em comparação com a coinjeção de mRNA de controle codificando uma proteína amarelo fluorescente modificada e melhorada do mRNA fluorescente melhorada amarelo (mEYFP) (figura. 11, painel B). Nenhum embrião
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87/357 co-injetado com Oct4 mRNA no estágio de multicélulas, enquanto 80,0 ± 5,2% detidos após a co-injeção de mEYFP mRNA (p <0,01; dados não mostrados). Assim, a co-injeção de Oct4 mRNA, mas não o controle do mRNA, parcialmente resgatou o fenótipo de retenção no estágio de multicélulas induzido por Oct4-MO. A falha em alcançar o resgate integral do fenótipo pode ser devido a expressão Oct4 insuficiente após a co-injeção de Oct4 mRNA em baixa concentração, de Oct4 em expressão inadequadamente alta com a concentração elevada, ou a instabilidade relativa do Oct4 mRNA transcrito in vitro em comparação com Oct4-MO; além disso, essas possibilidades não são mutuamente exclusivas. Assim, o próximo teste foi para determinar se a própria superexpressão de iria interferir com o desenvolvimento.
[000180] A injeção de Oct4 mRNA resultou na superexpressão quantificada por q-PCR, mas não causou a expressão ectópica da proteína de Oct4 (dados não mostrados). A superexpressão de Oct4 de fato induziu a retenção do desenvolvimento de uma forma dependente de forma, enquanto a injeção de quantidades comparáveis ou maiores de mRNA mEYFP interferiu minimamente com o desenvolvimento de blástulas (figura 11, painel C). O efeito de dosagem de gene de injeção de Oct4 RNA pode ser devido a funções de Oct4 avançadas na regulação da transcrição, ou a super produção de Oct4 pode permitir a ligação de promotor não específica, ou o Oct4 extra causa o sequestro inadequado e subsequente inativação de co-fatores. Coletivamente, esses dados definitivamente mostram que a expressão de Oct4 era necessária, e que o seu nível correto foi fundamental para o desenvolvimento embrionário inicial, assim como a pluripotência das ESCs depende de uma gama precisa dos níveis de expressão de Oct4 (Stefanovic Puceat S & M (2007) Cell Cycle 6, 8-10).
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Tabela 7. Resumo do Número de Embriões Testados e o Número de
Experimentos Executados para Cada Condição
Experimento Condição No de Embriões Injetados No de Embriões Não Injetados No de Experiment os
Ccna2 knockdown Ccna2-MO 0,75 mM 94 65 8
Ccna2-MM 0,75 mM 75 101 9
Ccna2-MO Citoquímica Ccna2-MO 0,75 mM 26 28 3
imunológica
Ccna2 dosagem de Ccna2-MO, 0,5 mM 39 30 3
gene
Ccna2-MO, 0,25 mM 50 29 3
Oct4 knockdown Oct4-MO, 0,60 mM 41 37 4
Oct4-MM, 0,60 mM 57 30 3
Oct4-MO, 0,40 mM 79 25 3
Oct4-MO, 0,20 63 30 3
mM 35 30 3
Oct4E4-MO, 0,60 mM Oct4E4-MM, 0,60 mM 32 30 3
Oct4-MO Oct4-MO, 0,60 32 22 3
Citoquímica imunológica mM Oct4-MM, 0,60 mM 20 20 3
Resgate 0,036pg/pl Oct4 mRNA+ 0,60mM Oct4-MO 32 30 3
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Experimento Condição No de Embriões Injetados No de Embriões Não Injetados No de Experiment os
0,036pg/pl EYFP mRNA + 0,60mM Oct4-MO 72 30 3
Superexpress ão 0,09pg/pl Oct4 mRNA 24 20 3
0,036pg/pl Oct4 mRNA 33 25 3
3,6ng/pl Oct4 mRNA 35 30 3
0,09pg/pl EYFP mRNA 41 20 2
Oct4MO/Meio condicionado Oct4-MO, 0,60 mM, meio condicionado 20 20 2
Oct4-MO, 0,60 mM meio condicionado 20 20 2
Ccna2-MO chip de gene Ccna2-MO, 0,75 mM 60 60 3
Oct4-MO chip de gene Oct4-MO, 0,6 mM 60 60 3
Oct4-MO embrião único QPCR Oct4-MO, 0,60 mM, estágio de 2 células 14-20 14-20 3-5
Controle-MO, 0,60 mM, estágio de 2 células 5-10 n/a 2
EXEMPLO 5
REGULAÇÃO DE GENE POR OCT4 [000181] Para dissecar os mecanismos da função Oct4, comparamos o perfil de expressão gênica global de embriões Oct4 knockdown aos efeitos do CCNA2 Oct4 e controles não injetados na
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90/357 metade do estágio de duas células. O objetivo foi identificar a expressão diferencial de genes que coincide com a primeira grande onda de ativação do genoma embrionário na metade do estágio de duas células (T Hamatani, Carter MG, Sharov AA, MS & Ko (2004) Dev Cell 6, 117-1317; QT Wang, et al (2004) Cell Dev 6, 133-1448) (Tabelas 8, A e B, 9, A e B). A análise por um algoritmo não supervisionado mostrou que as amostras de embriões se agruparam de acordo com condições experimentais, o que mais apoiou os efeitos específicos e não aleatórios do gene knockdown (figura 14, painel A). Com uma taxa de detecção falsa do limiar arbitrário (FDR) de 0,05, o conjunto de genes regulados Oct4 é cinco vezes maior em comparação com o número de genes que alternam a expressão em resposta à ciclina A2 knockdown (figura 14, painel B). Os tamanhos diferentes dos conjuntos de genes Oct4-knockdown sub-expressos contra os super-expressos sugerem que Oct4 pode ser predominantemente ativador ao invés de reprimir a transcrição (figura 14, painel B). Alguns dos genes alvo candidatos de Oct4 foram previamente identificados como alvos putativos de Oct4 com base em dados de cromatina de imunoprecipitação mESC (ChIP) ou na análise de sequências genômicas dos locais de ligação de Oct4 (Zhou Q, Chipperfield H, Melton DA, & Wong WH (2007) Proc Natl Acad Sci U S A 104, 16438-16443) (tabela 10).
[000182] A lista de genes regulados por ciclina A2 era rica em fatores codificadores de genes para a modificação da cromatina e a remodelação (p = 0,005), o metabolismo de nucleotídeos (p = 0,01), e a organização de cromossomos (p = 0,01; Quadros 11 A e B). Genes regulados por Oct4 foram significativamente enriquecidos por tradução (p = 1,1x10-4) e funções de processamento de RNA (p = 3,0x10-5) (Tabelas 11, C e D). A comparação dos nossos dados publicados com redes reguladas por Oct4 em camundongos ESCs indica que o Oct4
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91/357 tem funções regulatórias pós-transcricionais e traducionais distintas e específicas mediadas por seu controle de genes que codificam as subunidades de fatores de iniciação de conversão eucariótica (Eif), incluindo Eif3c e Eif3b.
[000183] Curiosamente, estas duas subunidades de Eif são evolutivamente conservadas de levedura para os seres humanos e estão entre as seis subunidades que compõem o núcleo funcional de mamíferos Eif3, o maior dos complexos Eif (Masutani M, N Sonenberg, Yokoyama, S & H Imataka (2007) Embo J 26, de 3373-3383). Além de sua função específica para embriões, o Oct4 também controla a expressão de genes que codificam os reguladores pós-transcircionais Dppa5 e Piwil2 (também conhecido como Mili), como acontece nos ESCs (dados não mostrados). O Dppa5 é uma célula germinativa de embriões e proteína de ligação de RNA específico de ESC cujo papel na transição materno-embrionária não é conhecido. No entanto, Piwil2 e suas ligações pi-RNAs, são conhecidos por seu papel na regulação de retrotransposons no ovócito totalmente maduro do camundongo (T Watanabe, et al. (2008) Nature 453, 539-543,26). Coletivamente, os nossos dados indicam que o Oct4 tem um papel distinto específico para estágios de desenvolvimento, no controle de genes que codificam reguladores pós-transcricionais, além de suas funções conservadas compartilhadas entre tipos de células pluripotentes.
Tabela 8A: Genes Que Possuem Níveis de Expressão Maiores Em Oct4-MO Injetados, Em Comparação Com Embriões Não Injetados (Seguindo A Seção De Exemplos)
Tabela 8B: Genes Que Possuem Níveis de Expressão Menores Em Oct4-MO Injetados, Em Comparação Com Embriões Não Injetados (Seguindo A Seção De Exemplos)
Tabela 9A: Genes Que Possuem Níveis de Expressão Maiores Em Ccna2-MO Injetados, Em Comparação Com Embriões
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Não Injetados (Seguindo A Seção De Exemplos)
Tabela 9B: Genes Que Possuem Níveis de Expressão Menores Em Ccna2-MO Injetados, Em Comparação Com Embriões Não Injetados (Seguindo A Seção De Exemplos)
Tabela 10: Genes Alvos Candidatos De Oct4 Com Locais De Ligação De Oct4 Putativo Baseado Na Análise De Sequência Genômica Ou Dados De Precipitação De Cromatina De Camundongos ESC (ChIP)
Desregulação em embriões Oct4 knockdown:
1700021F05Rik: gene RIKEN cDNA 1700021F05
2900073H19Rik: gene RIKEN cDNA 2900073H19
Arhgap8: Rho GTPase proteína de ativação 8
Cbfa2t2h: fator de ligação de núcleo, domínio subdesenvolvido, subunidade alfa 2, translocado a, 2 homólogo (humano)
Cdt1: licença de cromatina e fator de replicação de DNA 1
Didol: obliterador de indutor de morte 1
Dpm1: fosfato de dolicol (beta-D) manosiltransferase 1
Dppa5: pluripotência desenvolvimental associada 5
Eif4e2: fator de iniciação de translação eucariótica 4E membro 2
Elovl6: membro da família ELOVL 6, alongamento de cadeia longa de ácidos graxos (levedura)
Etv5: genes variantes de et 5
Fkbp4: FK506 proteína de ligação4
Gnb2l1: proteína de ligação de nucleotídeo guanina (proteína G), polipeptídeo beta 2 como 1
Hexb: hexosaminidase B
Igf2bp1: fator de crescimento como insulina 2 proteína de ligação de mRNA 1
Klf9: fator como Kruppel 9
Mkrn1: makorin, proteína de dedo RING, 1
Mtf2: elemento de resposta de metal ligado a fator de transcrição 2
Myg1: gene de proliferação de melanocita 1
Pa2g4: associado a proliferação 2G4
Pitpnc1: transferência de proteína fosfatidilinositol, citoplásmica 1
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Desregulação em embriões Oct4 knockdown:
Ppm1a: fosfatase de proteína 1A, dependente de magnésio, isoforma alfa
Rest: fator de silenciamento de transcrição de RE1
Rif1 /// LOC671598: Rap1 fator de interação 1 homólogo (levedura) /// similar à proteína associada a Telomere RIF1 (Rap1 fator de interação 1 homólogo) (mRif1)
Slc19a3: família de transportadores de soluto 19 (permutador de sódio/hidrogênio), membro 3
Slc22a12: família de transportadores de soluto 22 (permutador de ânion/íon orgânico), membro 12
Slc25a36: família de transportadores de soluto 25, membro 36
Tfrc: receptor de transferrina
Tnpo3: transportina 3
Ube2h: enzima conjugadora de ubiquitina E2H
Ube2o: enzima conjugadora de ubiquitina E2O
Zfp297b: proteína de dedo de zinco 297B
Superregulação em embriões Oct4 knockdown
BC022623: sequência de cDNA BC022623
2810429O05Rik: gene RIKEN cDNA 2810429O05
Blcap: homólogo de proteína associada a câncer de bexiga (humano)
Icosl: aglutinante de icos
Sox2: caixa SRY contendo gene 2
Bcas2: sequência amplificada de carcinoma de mama 2
Ldlr: receptor de lipoproteína de baixa densidade
Zfp219: proteína de dedo de zinco 219
Arl4c /// LOC632433: fator similar a ribosilação do ADP 4C /// proteína de fator similar a ribosilação do ADP 7
Tcl1: ponto de quebra do linfoma de célula T 1
Dcp1a: enzima de desoperculação
Nes: nestina
Rbpsuh: supressor de proteínas de ligação recombinante de hairless (Drosófila)
Tabela 11A. Categorias Funcionais Que Foram Enriquecidas Em
Genes De Regulação Decrescente No Modelo De Ccna2 Knockdown
GOBPID Valor p Termo
GO:0050875 1.1E-3 Processo fisiológico celular**
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GOBPID Valor p Termo
GO:0016568 4.0E-3 Modificação da cromatina*
GO:0042254 4.0E-3 Biogênese e montagem de ribossomos**
GO:0006338 4.8E-3 Remodelagem de cromatinas*
GO:0007028 0,01 Biogênese e organização do citoplasma**
GO:0044237 0,01 Metabolismo celular**
GO:0007582 0,01 Processo fisiológico
GO:0006139 0,01 Metabolismo de base de núcleo, nucleosídeo, nucleotídeo e ácido nucleico *
GO:0008152 0,01 metabolismo
GO:0006376 0,01 Seleção do local de divisão do mRNA *
GO:0006413 0,01 Início da translação**
GO:0007001 GO:0007001 GO:0007001 0,01 Biogênese e organização do cromossoma (domínio Eukaryota)*
GO:0006996 0,01 Biogênese e organização de organela*
GO:0007046 0,01 Biogênese de ribossomos**
GO:0043170 0,02 Metabolismo de macromoléculas**
GO:0051276 0,02 Biogênese e organização de cromossomas
GO:0006325 0,02 Estabelecimento e/ou manutenção da estrutura de cromatinas
GO:0006323 0,02 Empacotamento de DNA*
GO:0016043 0,02 Biogênese e organização de células
GO:0044238 0,03 Metabolismo primário**
GO:0000245 0,03 Montagem de spliceossoma
GO:0006486 0,03 Glicosilação de aminoácido de proteína
GO:0009059 0,03 Biossíntese de macromoléculas**
GO:0043413 0,03 Glicosilação de biopolímeros
GO:0009101 0,04 Biossíntese de glicoproteínas
GO:0006364 0,04 Processamento de rRNA
GO:0006412 0,04 Biossíntese de proteínas**
GO:0006259 0,04 Metabolismo de DNA
GO:0016072 0,04 Metabolismo de rRNA **
GO:0009100 0,05 Metabolismo de glicoproteína
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GOBPID Valor p Termo
Notas: **Indica categorias também enriquecidas no conjunto de dados de Oct4. * Indica categorias funcionais que foram especificamente enriquecidas no Ccna2 knockdown.
Tabela 11B. Categorias Funcionais Que Foram Enriquecidas Por
Genes De Regulação Crescente No Modelo Ccna2 Knockdown
GOBPID Valor P Termo
GO:0044262 7.1E-4 Metabolismo de carboidrato celular
Tabela 11C. Categorias Funcionais Que Foram Enriquecidas Em
Genes De Regulação Decrescente No Modelo De Oct4 Knockdown
GOBPID Valor p Termo
GO:0006412 1, 8E-7 Biossíntese de proteína**
GO:0009059 1, 3E-6 Biossíntese de macromolécula**
GO:0006413 3, 6E-6 Início da translação**
GO:0009058 1, 8E-5 biossíntese
GO:0044249 2, 1E-5 Biossíntese celular
GO:0042254 2, 3E-5 Biogênese e reunião de ribossomos**
GO:0006396 3, 0E-5 Processamento de RNA *
GO:0007046 3, 3E-5 Biogênese de ribossomos**
GO:0016070 3, 9E-5 Metabolismo de RNA **
GO:0007028 7, 0E-5 Organização e biogênese de citoplasma **
GO:0043037 1, 1E-4 Translação*
GO:0043170 1,2E-4 Metabolismo de macromoléculas**
GO:0019538 1,6E-4 Metabolismo de proteína
GO:0044238 3, 1E-4 Metabolismo primário**
GO:0044267 3, 1 E-4 Metabolismo de proteína celular
GO:0050875 3, 3E-4 Processo fisiológico celular**
GO:0044237 5, 3E-4 Metabolismo celular**
GO:0044260 5, 7E-4 Metabolismo de macromolécula celular
Notas: **Indica categorias também enriquecidas no conjunto de dados de Ccna2. * Indica categorias funcionais que foram especificamente enriquecidas no Oct4 knockdown.
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Tabela 11D. Categorias Funcionais Que Foram Enriquecidas Por
Genes De Regulação Crescente No Modelo Oct4 Knockdown
GOBPID Valor p Termo
GO:0044262 2, 0E-4 Metabolismo de álcool
EXE MPLO 6
FUNÇÃO OCT4 NO ESTÁGIO DE 1 A 2 CÉLULAS [000184] A fim de compreender o papel de Oct4 na reprogramação do embrião em estágio inicial, foi examinado o seu papel na ativação do genoma embrionário e na degradação da transcrição materna. No geral, Oct4 regula a expressão gênica pertinente ao mecanismo básico necessário para todo o espectro de regulação gênica, incluindo a transcrição envolvendo os três RNA polimerase, tradução, processamento do RNA, tais como a regulação da poliadenilação e proteínas degradação do mRNA (tabela 12). Altos níveis de mRNA de genes de desenvolvimento, tais como Six1, Nestin e Hoxa3, indicaram que Oct4 era necessário para a sua repressão, enquanto os níveis excessivos de transcrições maternas que normalmente seriam rapidamente degradadas, como Zar1 e Nobox1, indicou que Oct4 knockdown interfere com os mecanismos de degradação do mRNA. Assim, Oct4 tem funções específicas para o estágio de desenvolvimento e células, e tem um papel importante nos processos que marcam a transição materno-embrionária.
[000185] Para definir melhor a rede do gene regulado por Oct4 foram selecionados 42 genes que representam as funções transcricional, pós-transcricional e de sinalização para os testes de q-PCR. Foi analisado o RNA de um único embrião de controle injetado com Oct4MO e focado em genes que estavam sub-expressos em Oct4 knockdown. Depois de retirar os dados relacionados a 3 genes para os quais existem dificuldades técnicas, as alterações de expressão de 39 genes foram devidamente medidas com base na análise utilizando um modelo linear (vide Materiais e Métodos). Desses, 34 ou ~ 87%
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97/357 apresentaram níveis de expressão alterados em Oct4 knockdown nas direções esperadas (figura 14, painel C e figura 15), enquanto 5 genes, incluindo Sox2, não se alteraram (dados não mostrados). 21 dos 34 genes, ou ~ 62%, mostraram uma expressão diferencial estatisticamente significativa de q-PCR em p <0,05 ou menos, enquanto a injeção de um MO de controle não alterou a expressão de qualquer um dos genes analisados (dados não mostrados). Assim, foi provado que o Oct4 direta ou indiretamente regula genes que codificam todo o espectro de reguladores transcricionais e póstranscricional no estágio de 1 a 2 células.
[000186] Nossos dados sobre um único embrião nos permitiu ir além da simples validação de nossos dados do chip de gene. Os métodos que utilizam amostras compostas de células agrupadas ou embriões geram a expressão de gene relativa que representa uma média de todas as células analisadas, mas pode discernir entre os genes que são consistentemente diferencialmente regulados versus aqueles com tendência a mudanças estocásticas; do mesmo modo, os embriões discrepantes raros expressando transcriptomas únicos não são reconhecidos (Bengtsson M, Stahlberg A, Rorsman P, & Kubista M (2005) Genome Res 15, 1388-1392; Chang HH, et al. (2008) Nature 453, 544-547; Warren L, Bryder D, Weissman IL, & Quake SR (2006) Proc Natl Acad Sci U S A 103, 17807-17812). Ao analisar os dados de expressão quantitativa no nível de um único embrião, foi possível fazer tal discriminação. É pressuposto que genes cuja expressão é consistente entre embriões únicos têm uma maior probabilidade de serem nós essenciais em uma rede reguladora do gene, que deve responder a perturbações de uma forma consistente e previsível. O conjunto de genes foi restrito aos genes cuja expressão diferencial (representada pela diferença nos ciclos limiares, ACt) ACt é maior do que as diferenças entre os embriões únicos (representados pelo
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98/357 desvio-padrão da média, s.e.m.). É proposta uma hierarquia na rede de gene regulado por Oct4 na qual 29 genes estão ordenados com base em suas s.e.m. crescentes, ou na variação interembriões e significância biológica reduzida presumida dessa rede (figura 16, painel A). Tomados em conjunto, foram identificados e classificados os nós chave potenciais dessa rede de forma quantitativa.
[000187] Os dados mostram que, no contexto único de desenvolvimento da transição materno-embrionária, concomitante com a degradação do mRNA enorme e reprogramação dramática, o Oct4 controla a expressão de muitos reguladores de transcrição. O Oct4 também mantém a expressão de muitos genes, como Eif3c, Papola, Piwil2, Eif3b, Eif4e, Rbm3 e Cpsf4, que estão envolvidos no controle pós-transcricional. Através de sua influência nos reguladores transcricionais e pós-transcricionais, o Oct4 pode afetar direta ou indiretamente muitos processos essenciais, como o remodelamento da cromatina, a regulação epigenética, a apoptose, a regulação do ciclo celular e a sinalização durante o programa de desenvolvimento precoce (figura 16, painel B).
Tabela 12: Genes Regulados por Oct4 Candidatos que Funcionam na Transcrição, Translação, Processamento de RNA, Remodelagem de Cromatina, Sinalização, Apoptose e Ciclo Celular.
Símbolo do Gene Mudanç a das vezes Taxa de detecção falsa (FDR) Valor P T.
Transcrição de POL I
Fator de transcrição de ligação montante, polimerase de RNA I Ubtf 0, 49 0, 02667 0, 00424
Sintetase arginil-tRNA Rars 0, 47 0, 03200 0, 00131
Transcrição de POL II
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Símbolo do Gene Mudanç a das vezes Taxa de detecção falsa (FDR) Valor P T.
BTAF1 polimerase de RNA II, fator de transcrição associado a B-TFIID, (Mot1 homólogo, S. cerevisiae) Btaf1 0, 12 0, 03834 0, 00833
Mediador de transcrição de polimerase de RNA, subunidade 8 homóloga (levedura) Med8 0, 25 0, 03405 0, 00142
Transcrição do fator de alongamento B (SIII), polipeptídio 3 Tceb3 0, 29 0, 01471 0, 00001
TAF9 polimerase de RNA II, fator associado à proteína de ligação de caixa TATA (TBP) Taf9 0, 30 0, 02151 0, 00027
polimerase (RNA) II (direcionado a DNA) polipeptídio H Polr2h 0, 42 0, 02586 0, 00859
Fator de alongamento de polimerase de RNA II 2 Ell2 0, 49 0, 03696 0, 00098
Cofator necessário para ativação de transcrição Sp1, subunidade2 Med14 0, 50 0, 03794 0, 00156
Transcrição de POL III
Fator de transcrição geral IIIC, polipeptídio 4 Gtf3c4 0, 07 0, 00000 0, 00002
Fator de transcrição geral IIIC, polipeptídio 5 Gtf3c5 0, 34 0, 03209 0, 00212
BRF2, subunidade de polimerase de RNA III fator de iniciação de transcrição, como BRF1 Brf2 0, 34 0, 04385 0, 05104
Fator de transcrição geral IIIC, polipeptídio 2, beta Gtf3c2 0, 35 0, 03314 0, 00047
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Fator de transcrição geral III C 1 Gtf3c1 0, 47 0, 03303 0, 00236
polimerase (RNA) III (direcionado a DNA) polipeptídio A Polr3a 0, 55 0, 04421 0, 01694
polimerase (RNA) III (direcionado a DNA) polipeptídio E Polr3e 0, 56 0, 03366 0, 00134
Controle translacional. Processamento de RNA e regulação póstranscricional
Iniciação Translacional
Fator de iniciação de translação eucariótica 2C, 5 Eif2c5 0, 09 0, 01370 0, 00022
Fator de iniciação de translação eucariótica 5B Eif5b 0, 14 0, 03802 0, 00002
Fator de iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 9 (eta) Eif3b 0, 29 0, 03803 0, 00358
Fator de iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 8 Eif3c 0, 36 0, 00000 0, 00016
Fator de iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 3 (gama) Eif3h 0, 42 0, 03226 0, 00485
Fator de iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 4 (delta) Eif3g 0, 47 0, 04924 0, 01507
integrin beta 4 proteína de ligação Eif6 0, 53 0, 02756 0, 00236
Fator de iniciação de translação eucariótica 4, gama 1 Eif4g1 0, 59 0, 04065 0, 00041
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Símbolo do Gene Mudanç a das vezes Taxa de detecção falsa (FDR) Valor P T.
Fator de iniciação de translação eucariótica 2, subunidade 1 alfa Eif2s1 0, 60 0, 04879 0, 00311
Fator de iniciação de translação eucariótica 4E /// hipotético LOC630527 Eif4e 0, 65 0, 03742 0, 00177
Fator de iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 10 (teta) Eif3s10 0, 66 0, 04070 0, 01798
Repressão translacional
Homólogo similar a piwi 2 (Drosófila) Piwil2 0, 34 0, 02778 0, 00051
Fator de iniciação de translação eucariótica 4E membro 2 Eif4e2 0, 46 0, 02553 0, 01084
Processamento de extremidade 3'
poli (A) polimerase alfa Papola 0, 10 0, 02475 0, 00014
Fator específico de clivagem e poliadenilação 6 Cpsf6 0, 20 0, 03256 0, 00009
Fator específico de clivagem e poliadenilação 4 Cpsf4 0, 48 0, 03542 0, 00233
Término translacional
Fator de iniciação de translação eucariótica 1 Etf1 0, 36 0, 02717 0, 00207
Mecanismo de decaimento do mRNA mediado por mutações nonsense (NMD)
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Símbolo do Gene Mudanç a das vezes Taxa de detecção falsa (FDR) Valor P T.
Fator de iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 6 Eif3e 0, 21 0, 00000 0, 00000
Outras ligações e processamento de RNA
Complexo integrante de subunidade 7 Ints7 0, 10 0, 02757 0, 00004
Proteína de ligação principal de RNA 3 Rbm3 0, 20 0, 03791 0, 00037
Proteína de ligação principal de RNA 4 Rbm4 0, 42 0, 04967 0, 00236
Pluripotência de desenvolvimento de pluripotência associada 5 Dppa5 0, 46 0, 03672 0, 00786
Proteína de ligação principal de RNA 5 Rbm5 0, 52 0, 03415 0, 00245
Proliferação associada 2G4 Pa2g4 0, 70 0, 04956 0, 01729
Transporte e processamento pré-mRNA
Ribonucleoproteína nuclear heterogênea U 0, 18 0, 03688 0, 00020
Fator de processamento de PRP4 pré-mRNA 4 homólogo (levedura) Prpf4 0, 34 0, 03828 0, 00128
RNA, U transportador 1 Snupn 0, 35 0, 01681 0, 00227
Domínio de fator de processamento de PRP38 pré-mRNA 38 (levedura) contendo B Prpf38b 0, 48 0, 04103 0, 00548
Fosfatase de proteína 1G (anteriormente 2C), dependente de magnésio, isoforma gama Ppm1g 0, 48 0, 02463 0, 00012
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Símbolo do Gene Mudanç a das vezes Taxa de detecção falsa (FDR) Valor P T.
Ribonucleoproteína nuclear heterogênea A/B Hnrpab 0, 58 0, 03233 0, 00100
Ribonucleoproteína nuclear heterogênea A1 Hnrpa1 0, 63 0, 04981 0, 00961
Ribonucleoproteína nuclear heterogênea K Hnrpk 0, 64 0, 04473 0, 01239
Ribonucleoproteína nuclear heterogênea M Hnrpm 0, 63 0, 04884 0, 00724
Regulação transcricional
Proteína quinase interativa com homeodomínio 3 Hipk3 0, 17 0, 04003 0, 00031
Fator similar a Kruppel 9 Klf9 0, 17 0, 00000 0, 00020
Fator respiratório nuclear 1 Nrf1 0, 20 0, 01923 0, 00073
subunidade complexa integrante 4 Ints4 0, 34 0, 03520 0, 00080
Proteína quinase interativa com homeodomínio 1 Hipk1 0, 35 0, 01786 0, 00073
homeobox Pbx/nó 1 Pknox1 0, 37 0, 03796 0, 00484
Proteína rica em prolina, ácido glutâmico e leucina 1 Pelp1 0, 40 0, 02415 0, 00573
Fator de ligação ao núcleo, domínio subdesenvolvido, subunidade alfa 2, translocado a, 2 homólogo (humano) 0, 41 0, 04076 0, 02903
Fator de transcrição YY1 Yy1 0, 43 0, 03853 0, 00074
Proteína de ligação GATA 4 Gata4 0, 45 0, 03963 0, 00325
Família de gene associado com metástase, membro 2 Mta2 0, 51 0, 03395 0, 00326
Fator de transcrição associado com BCL2 1 Bclaf1 0, 54 0, 02664 0, 00242
Fator de transcrição silenciador de RE1 Rest 0, 62 0, 03827 0, 00983
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Símbolo do Gene Mudanç a das vezes Taxa de detecção falsa (FDR) Valor P T.
Gene variador de ets 5 Etv5 0, 50 0, 04900 0, 00576
makorin, proteína de dedo RING, 1 Mkrn1 0, 58 0, 03793 0, 00310
Remodelagem de cromatina, regulação e pigenética
Domínio jumonji contendo 1B Kdm3b 0, 14 0, 03770 0, 00132
jumonji, AT domínio interativo rico 1C (similar a Rbp2) Kdm5c 0, 23 0, 01408 0, 00075
sirtuína 1 ((regulação de informação de acasalamento silencioso 2, homólogo) 1 (S. cerevisiae) Sirt1 0, 28 0, 01136 0, 00002
Similar a metiltransferase 2 Mettl2 0, 37 0, 03333 0, 00010
Domínio jumonji contendo 1A Kdm3a 0, 38 0, 04874 0, 00764
Regulador de cromatina dependente de actina, associado a matriz e relacionado a SWI/SNF, subfamília c, membro 1 Rsc8 0, 41 0, 03665 0, 01049
jumonji, AT domínio interativo rico 1B (similar a Rbp2) Kdm5b 0, 57 0, 03738 0, 00388
Fator de iniciação de translação eucariótica 2, subunidade 3, gene estrutural ligado a X /// similar ao fator de iniciação de translação eucariótica 2, subunidade 3, gene estrutural ligado a X 0, 57 0, 04905 0, 00183
Histona específica de H3 atividade HAT
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Símbolo do Gene Mudanç a das vezes Taxa de detecção falsa (FDR) Valor P T.
Fator de transcrição geral IIIC, polipeptídio 4 Gtf3c4 0, 07 0, 00000 0, 00002
Fator de transcrição geral IIIC, polipeptídio 5 Gtf3c5 0, 34 0, 03209 0, 00212
GCN5 controle geral de aminoácido similar a síntese 2 (levedura) Gcn5 0, 34 0, 02525 0, 00159
Fator de transcrição geral IIIC, polipeptídio 2, beta Gtf3c2 0, 35 0, 03314 0, 00047
Fator de transcrição geral III C 1 Gtf3c1 0, 47 0, 03303 0, 00236
Histona H3, família 3A H3f3a 0, 53 0, 04006 0, 00865
Caminhos de sinalização (Fgf4, Bmp, Toll, Egf, Mapk, Erk, Igf2, Amp)
Fator de crescimento de fibroblasto 4 Fgf4 0, 09 0, 02591 0, 00088
Intermediário de sinalização em caminho Toll evolucionariamente conservado Ecsit 0, 17 0, 01935 0, 00000
Proteína quinase ativada por AMP subunidade não catalítica gama 1 Prkag1 0, 19 0, 03786 0, 00010
Fator de crescimento similar a insulina 2 mRNA proteína de ligação 1 Imp1 0, 26 0, 04930 0, 00047
Receptor de proteína de osso morfogenético, tipo 1A Bmpr1a 0, 35 0, 02347 0, 00005
Fator de crescimento de fibroblasto similar a receptor 1 Fgfrl1 0, 34 0, 03349 0, 01815
receptor D de interleuquina 17 Il17rd 0, 35 0, 01961 0, 00052
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Símbolo do Gene Mudanç a das vezes Taxa de detecção falsa (FDR) Valor P T.
Proteína quinase ativada por mitógeno 1 Mapk1 0, 39 0, 04889 0, 00710
Fator de divisão, rico em arginina/serina 15 /// similar ao fator de divisão rico em arginina/serina 15 Sfrs15 0, 47 0, 02113 0, 00047
Fosfatase de proteína 1A, dependente de magnésio, isoforma alfa Ppm1a 0, 46 0, 02525 0, 00280
proteína quinase C, delta Prkcd 0, 45 0, 03465 0, 02184
Fator de crescimento similar a insulina 2 receptor Igf2r 0, 53 0, 04738 0, 00600
Apoptose
Proteína mediadora de junção e regulação Jmy 0, 21 0, 00000 0, 00036
Fosfatase esfingosina-1fosfato 1 Sgpp1 0, 23 0, 01538 0, 00160
catepsina B Ctsb 0, 28 0, 00000 0, 00024
Obliterador indutor de morte 1 Dido1 0, 46 0, 03440 0, 00196
Ciclo celular, replicação de DNA, reparo de DNA, divisão celular, segregação de cromossomas, crescimento celular, tamanho celular
Complexo de reconhecimento de origem, subunidade similar a 4 (S. cerevisiae) Orc4l 0, 17 0, 01852 0, 00383
Proteína de elemento de ligação rico em purina B Purb 0, 29 0, 02669 0, 00019
Segregação de cromossoma similar a 1 (S. cerevisiae) Cse1l 0, 34 0, 03254 0, 00002
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Símbolo do Gene Mudanç a das vezes Taxa de detecção falsa (FDR) Valor P T.
Minicromossoma deficiente de manutenção 5, ciclo de divisão celular 46 (S. cerevisiae) Mcm5 0, 34 0, 01852 0, 00004
Membro da família quinesina 11 Kif11 0, 34 0, 01938 0, 00170
Fator de replicação C (ativador 1) 2 Rfc3 0, 40 0, 04420 0, 00919
Membro da família quinesina 22 Kif22 0, 42 0, 02667 0, 00033
Proteína fosfatase 2 (anteriormente 2A), subunidade catalítica, isoforma beta Ppp2cb 0, 43 0, 03243 0, 00658
Proteína centrômera E Cenpe 0, 54 0, 03801 0, 00299
Fator interativo de Rap1 1 homólogo (levedura) /// similar a proteína associada aTelomere RIF1 (Fator interativo de Rap1 homólogo) (mRif1) mRif1 0, 63 0, 04515 0, 00228
EXEMPLO 6
DETERMINAÇÃO DA PROBABILIDADE DE NASCIMENTO
COM VIDA [000188] Nos Estados Unidos, 7,3 milhões de casais sofrem de infertilidade clínica, para os quais mais de ~ 120.000 ciclos de tratamento de FIV por ano. A FIV é o tratamento mais eficaz para a maioria dos casais inférteis, mas é altamente empírica, e pode não resultar em nascimento com vida para alguns casais, apesar de várias tentativas. O tratamento de FIV revolucionou a forma como os médicos podem ajudar os pacientes subférteis, mas as taxas de sucesso com a utilização de ovócitos autólogos parecem ter estagnado na década
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108/357 passada. Por um custo médio de US$ 12.000 por ciclo, somente o tratamento de FIV custa dos contribuintes de saúde, a maioria dos quais são os casais, mais de US$ 1 bilhão por ano. No entanto, o processo de tomada de decisão para a FIV pode ser assustador, porque o aconselhamento de FIV A e as decisões de gestão são muitas vezes feitas com base na idade cronológica da mulher, com formas não padronizadas para se ajustar a várias estimativas da reserva ovariana e da qualidade embrionária. Além disso, é acreditado que a qualidade do atendimento varie dependendo das clínicas de FIV, mas as comparações diretas não são possíveis na ausência de um prognóstico de estratificação rigorosamente definido e científico dos pacientes. Como o tratamento que é fisicamente, emocionalmente e financeiramente exigente, os pacientes podem sentir que estão fazendo uma aposta no momento de decidir se desejam iniciar ou repetir o tratamento de FIV. Consequentemente, pode haver incongruência no paciente ou na auto-seleção para a FIV, de tal forma que alguns pacientes com prognóstico verdadeiramente precário podem desenvolver expectativas irreais, enquanto outros com o prognóstico verdadeiramente bom podem perder oportunidades de um tratamento eficaz. Apesar de inúmeras publicações terem relatado variáveis, incluindo a idade cronológica do paciente, que são significativamente associadas com os resultados de FIV, a sua contribuição em relação aos resultados não é clara, e são ainda não é certo como essas conclusões se aplicam diretamente no aconselhamento dos pacientes.
[000189] Assim, no exemplo, foi aplicado MART para analisar os resultados de nascimentos com vida de forma dicotômica de um conjunto de dados maior e de duração de quatro anos com 3.338 ciclos de FIV com doadores novos e ovócitos não doados e seus embriões associados, incluindo a posterior transferência de embriões
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109/357 criopreservados, de 2003 a 2006. Mais importante, 57 variáveis referentes aos diagnósticos clínicos, resposta ao tratamento, e parâmetros de desenvolvimento do embrião a partir de 1.879 primeiros novos ciclos foram utilizados para gerar modelos de predição de uma maneira imparcial, sem pré-seleção das variáveis com base na literatura anterior. Foram identificados quatro fatores de prognósticos a porcentagem de blástulas (Taxa de Blástulas), o número total de embriões (número de embriões), a quantidade total de gonadotrofinas necessárias (TG) e a espessura endometrial (EndoTh) - que determinam os resultados do nascimento com vida. A contribuição do prognóstico de outras variáveis, tais como a idade e o número de embriões em estágio de 8 células no dia 3, foram opcionais uma vez que essas quatro variáveis prognósticos eram conhecidas. Finalmente, os resultados mostram como a nossa abordagem e os resultados podem ser aplicados para melhorar imediatamente o aconselhamento do paciente e os protocolos de gestão, e como esses critérios rigorosamente definidos de prognóstico podem alimentar o nosso esforço para melhorar a garantia de qualidade e diminuir as taxas de gestação múltipla.
[000190] Entre 1 de janeiro de 2003 e 31 de dezembro de 2006, 5.037 tratamentos de FIV foram realizadas no total, com volumes anuais que foram comparáveis ao longo dos anos. Desses, 3.347 foram ciclos novos de FIV que utilizaram ovócitos dos próprios pacientes e que se adequavam aos critérios de inclusão. Depois de aplicar os critérios de exclusão, 3338 ciclos permaneceram, dos quais 1879 eram primeiros ciclos de FIV (C1), 778 eram os segundos ciclos de FIV realizados em pacientes que não tiveram resultados de nascimentos com vida em C1 e que retornaram para o seu segundo tratamento (C2); 312 eram terceiros ciclos de FIV (C3); 369 ciclos eram quartos, quintos e sextos ciclos que não foram analisados
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110/357 (figura. 17 e figura. 18).
[000191] Dados de C1, C2 e C3 foram posteriormente analisados em separado. Globalmente, 41%% dos embriões possuía oito blástulas, o número de células adequadas ao desenvolvimento, enquanto 17%% dos embriões tinha < 4 células, e 33%% tinham 5-7 células, e 9%% tinham mais de 8 células (figura. 19). Esse perfil de desenvolvimento in vitro de embriões humanos em FIV é consistente com relatos anteriores. Além disso, o número de blástulas de embriões formados por 10.687, 3.932 e 1.573 embriões no dia 3 da cultura in vitro em C1, C2 e C3 não foi significativamente diferente, sugerindo que o desenvolvimento do embrião foi comparável entre os três primeiros ciclos (p = 0,6; figura 19).
[000192] Foram utilizados dados de C1 apenas para gerar os modelos de previsão, já que os pacientes desistiram por uma variedade de razões pelas quais não havia controles (figura. 18), e não era desejável que importantes fatores de prognóstico fossem mascarados pelo número do ciclo; não foi possível definir se as taxas de desistência eram comparáveis entre os subgrupos de pacientes, que variaram em seus prognósticos. Em consonância com outros relatos, um número significativo de pacientes que não tiveram nascimentos com vida desistiu após cada ciclo malsucedido e não retornou para tratamentos posteriores. No entanto, os dados de C2 e C3 foram usados para testar se os modelos de previsão se realizaram em tratamentos subsequentes.
Variáveis Associadas com Resultados de Nascimentos com Vida [000193] Primeiro, o foco foi direcionado em 1879 ciclos C1 e os seus 10.687 embriões associados que se adequaram a todos os critérios de inclusão e exclusão. Foi sistematicamente examinada a associação de cada uma das 57 variáveis com resultados de
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111/357 nascimentos com vida. Essas variáveis foram escolhidas com base na qualidade e integridade dos dados de entrada, ao invés de conhecimento prévio científico ou clínico. A regressão logística de pares confirmou a associação significativa de muitas variáveis com resultados de nascimentos com vida, incluindo a idade do paciente, a idade do parceiro masculino, o FSH do dia 3 e o número de perdas anteriores de gestação clínica (p <0,05) (Tabela 13). Como já era esperado, a reserva ovariana reduzida (DOR), um diagnóstico clínico baseado na resposta ovariana precária em tratamentos de infertilidade não-FIV anteriores ou em teste de desafio com clomida foi altamente negativa quando associada a resultados de nascimentos com vida (p <0,0001), enquanto o diagnóstico da síndrome dos ovários policísticos, o que tende a aumentar a resposta do ovário, foi positivamente associado com nascimentos com vida (p <0,0001).
Tabela 13. Variáveis e sua associação com resultados de nascimentos com vida por FIV.
Tabela 13A. Variáveis Contínuas
Variáveis Estimativa S.E. Valor P Meio Des.Pad.
Pré-FIV
Idade do paciente -1.27E-01 1.24E-02 4,12E-24 40, 99 4, 56
Idade do parceiro masculino -6.31E-02 1.02E-02 2,28E-09 42, 95 5, 82
Índice de Massa corporal -4,55E-03 6,17E-03 5,55E-01 24, 90 9, 75
No. de gestações anteriores -1.16E-01 4,29E-02 1.07E-02 1,04 1,33
No. de gestações anteriores bem sucedidas -3,05E-02 9,05E-02 7,49E-01 0, 27 0, 60
Abortos espontâneos -2.01E-01 7,36E-02 1.04E-02 0, 41 0, 82
Soro d. 3 FSH (IU/L) -6,93E-02 1.60E-02 2,89E-05 8, 05 4, 92
Ano 2,24E-02 4,73E-02 6,83E-01 4, 32 1, 12
Pré-OR
Quantidade total de FSH recombinante (IU/L) -4,46E-04 3,94E-05 1.15E-28 3, 512, 03 1,587, 94
Quantidade total de gonadotrofinas humanas de menopausa(IU/L) -1.01E-03 1.18E-04 4,69E-17 1,257, 11 544,41
Quantidade total de gonadotrofinas -3,55E-04 3,14E-05 1.36E-28 4, 769, 14 1,990, 39
Espessura endometrial (mm) 2,22E-01 2,66E-02 2,94E-16 10, 00 2, 10
No. de espermas móveis após lavagem (milhões/mL) -3,92E-04 2,92E-04 2,53E-01 128, 41 244,60
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Tabela 13A. Variáveis Contínuas
Variáveis Estimativa S.E. Valor P Meio Des.Pad.
No. de espermas móveis antes da lavagem (milhões/mL) -2.71E-04 3,39E-04 5,22E-01 106, 46 198, 93
Pós-FIV
No. total de ovócitos 1.06E-01 8,66E-03 2,53E-33 10, 24 6, 63
Porcentagem de ovócitos normais e maduros 3,36E+00 5,86E-01 2,69E-08 0, 80 0, 38
Fertilização normal (%) 1.32E+00 2,40E-01 9,74E-08 0, 65 0, 24
Óvulos não fertilizados (%) -1.08E+00 2,48E-01 2,79E-05 0, 27 0, 23
Óvulos anormalmente fertilizados (%) -9.87E-01 4,34E-01 3,56E-02 0, 08 0, 14
Número total de embriões 1.78E-01 1,21 E-02 2,43E-47 5, 92 4, 94
Desenvolvimento de blástulas (%) 3,05E+00 2.41E-01 3,03E-35 0, 15 0, 23
Compactação no dia 3 2,66E-01 2,76E-01 4.51E-01 0, 09 0, 19
No. geral de células por embrião 2,90E-01 4,57E-02 7,05E-10 6, 76 1,32
No.de embriões retidos em 4 células -1.32E-02 2,74E-03 3,00E-06 16, 69 23, 44
No. de embriões de 8 células 2,59E-01 2,25E-02 1.71E-29 2, 73 2, 74
Porcentagem de embriões de 8 células (%) 9,40E-03 1.89E-03 1.50E-06 40, 49 29, 09
No. de embriões criopreservados 3,23E+00 2,88E-01 2,33E-28 0, 11 0, 19
Grau geral dos embriões -1.49E-01 1.11E-01 2,53E-01 1,83 0, 61
No. Total de embriões transferidos 9,59E-02 3,51E-02 1.04E-02 2, 28 1,49
No. geral de células por embrião transferido 5,37E-01 6,02E-02 2,07E-18 7, 41 1,24
Grau geral dos embriões transferidos -6.33E-01 1.24E-01 8,24E-07 1,62 0, 62
No. de embriões transferidos detidos em 4 células -2,36E-02 3,29E-03 7,12E43 8, 56 24, 50
No. de embriões transferidos de 8 células 3,26E-01 5,43E-02 5,59E-09 1,47 1,07
Porcentagem de embriões de 8 células transferidos 1.67E-02 1.62E-03 3,65E-24 59, 61 39, 12
Tabela 13B. Variáveis Categóricas
Variáveis Estimativa S.E. Valor P Meio Des.Pad.
Pré-FIV
Reserva ovariana reduzida -1,07E+00 1.23E-01 1.40E-17 0, 39 0, 49
Síndrome do ovário policístico 7,58E-01 1.66E-01 1.01E-05 0, 09 0, 29
Infertilidade feminina inexplicável 5,74E-01 1.70E-01 1.37E-03 0, 09 0, 28
Outras causas para infertilidade -2.52E-01 1.14E-01 4,19E-02 0, 34 0, 47
Doença tubária -9,40E-02 1.66E-01 6,24E-01 0, 12 0, 32
Fibroide uterina -1.87E-01 1.95E-01 4.51E-01 0, 09 0, 28
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Tabela 13A. Variáveis Contínuas
Variáveis Estimativa S.E. Valor P Meio Des.Pad.
Endometriose -9.18E-02 1.53E-01 6,23E-01 0, 14 0, 35
Infertilidade Masculina 4,51E-02 1.07E-01 7,09E-01 0, 42 0, 49
Ligação das trompas 4,09E-02 3,72E-01 9.12E-01 0, 02 0, 14
hidrossalpinge -7,22E-02 2,97E-01 8,08E-01 NA NA
Estação: verão 9,88E-02 1.54E-01 6.15E-01 0, 22 0, 42
Estação: inverno 1.32E-01 1.42E-01 4,63E-01 0, 30 0, 46
Estação: outono 3,27E-01 1.54E-01 5,05E-02 0, 20 0, 40
Pré-OR
Anticoncepcional oral 7,33E-01 1.85E-01 1.39E-04 0, 87 0, 34
Esperma coletado cirurgicamente 1.57E-01 2,57E-01 6,23E-01 0, 04 0, 20
Esperma coletado congelado 2.61E-01 3.21E-01 5,22E-01 0, 03 0, 16
Esperma de doador -4.03E-01 4,56E-01 4,84E-01 0, 02 0, 13
Pós-FIV
Incubação assistida -8.58E-01 1.26E-01 4.03E-11 0, 33 0, 47
Transferência de embriões no Dia 5 1.42E+00 1.20E-01 6,89E-31 0, 27 0, 44
Protocolo de antagonista -1.35E+00 1.21E-01 6,30E-28 0, 47 0, 50
Protocolo de flare -1.70E+00 1.84E-01 8,98E-20 0, 18 0, 39
Cateter Echotip 6,83E-01 1.47E-01 7,64E-06 0, 14 0, 35
Outro cateter -2.69E-01 4,67E-01 6,24E-01 0, 02 0, 13
Execução de ICSI 3,34E-01 1.07E-01 3,07E-03 0, 41 0, 49
NOTAS DE RODAPÉ:
[000194] Cada variável foi testada por sua associação com os resultados de nascimentos com vida na FIV por meio de regressão logística, o que deu uma estimativa de erro padrão da estimativa (SE), o valor-p, média e desvio padrão (SD). Os resultados para variáveis contínuas e variáveis categóricas foram listadas na tabela 1A e tabela 1B, respectivamente.
[000195] 1 As estimativas positivas e negativas indicam associação com os resultados positivos e negativos de gestação, respectivamente. [000196] 2Número de gestações clínicas anteriores definido por soro positivo de gonadotrofina coriônica humana (hCG) ou teste de gravidez.
[000197] 3Número de gestações anteriores bem sucedidas, 37 semanas.
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114/357 [000198] 4Abortos referem-se a retenção de desenvolvimento ou perda de gestação clínica durante ou após 5 semanas de gestação. A estação do ano, aparentemente irrelevante, foi incluída como controle negativo.
[000199] Foi observado que muitos pares de variáveis, como idade, quantidade total de gonadotrofinas utilizadas, foram altamente correlacionados entre si (Tabela 14). Embora esses resultados sejam consistentes com os mecanismos biológicos mal compreendidos e presumidamente complexos sobre o envelhecimento ovariano, a produção hormonal ovariana e a qualidade dos óvulos, essas interações não poderiam ser estudadas profundamente por ANOVA com o uso de testes estatísticos de qui-quadrado (dados não mostrados), presumivelmente porque eles não interagem de uma forma linear, ou porque várias condições podem afetar a natureza das interações.
[000200] Foi optado pela análise de dados e a geração de modelos de previsão pela construção de árvores de classificação melhoradas por MART® para identificar as variáveis prognósticas não redundantes. MART® é um método poderoso usado para identificar a estrutura interativa de variáveis que podem predizer os resultados. O uso de validação cruzada e o aumento na seleção de parâmetros e análise de modelos em MART® também preservam a parcimônia e evitam a superadaptação. Finalmente, MART não pressupõe a ausência ou a presença de interações, ou a natureza das interações.
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Tabela 14A e 14B. Correlação Entre Cada Par de Variáveis.
Tabela 14A
Idade do paciente Idade do parceiro Índice de Massa Corporal No. de gestações anteriores No. de gestações anteriores levadas a termo Abortos espontâneos Soro d. 2FSH Ano Quantidade total de FSH (IU/L) Quantidade total de HMg (IU/L) Quantidade total de gonadotrofina (IU/L) Espessura endometrial (mil/ML) No. total de espermas móveis após lavagem (mil/ML) No. total de espermas móveis antes da lavagem (mil/ML) No. total de ovócitos Porcentagem de ovócitos normais e maduros Fertilização normal (%)
Variáveis de pré-FIV
Idade do paciente 1,00 0,56 0,04 0,22 0 ,13 0,14 0,17 -0,27 0,43 0,33 0,44 -0 16 004 0,05 -037 -0,20 -0,05
Idade do parceiro 0,56 1,00 0 ,01 0 ,10 0,09 0,06 0,08 -0,19 0,23 0,19 0,24 -0 12 -006 -0,05 -020 -0,08 -0,05
Índice de Massa Corporal 0,04 0 ,01 1,00 0,08 0,05 0 ,05 -0,04 0,07 0,00 0,00 0,00 -0,05 -0 01 0,00 0,06 -0,05 -0,04
No. de gestações anteriores 0,22 0 ,10 0,08 1,00 0,56 0,70 0,01 -0,01 0,08 0,06 0,08 -0,07 007 0,05 -0,04 -0,16 0,00
No. de gestações anteriores levadas a termo 0,13 0,09 0,05 0,56 1,00 0,14 0,05 -0,01 0,02 0,00 0,02 0,05 001 0,02 0,00 -0,09 0,01
Abortos espontâneos 0,14 0,06 0,05 0,70 0 ,14 1,00 -0,02 0,01 0,06 0,05 0,06 -0,07 005 0,03 -0,02 -0,13 0,00
Soro d. 2FSH 0,17 0,08 -0,04 0 ,01 0,05 -0,02 1,00 0,03 0,35 0,28 0,36 -0 11 000 0,00 -030 -0,13 -0,06
Ano -0,27 -0 ,19 0,07 -0 ,01 -0, 01 0 ,01 0,03 1,00 -0,05 -0,06 -0,06 -0,04 -011 -0,08 0 11 -0,01 0,04
Variáveis de pré-OR
Quantidade total de FSH (IU/L) 0,43 0,23 0,00 0,08 0,02 0,06 0,35 -0,05 1,00 0,66 0,98 -0,16 0,01 0,03 -055 -0,06 -0,05
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Idade do paciente Idade do parceiro Índice de Massa Corporal No. de gestações anteriores No. de gestações anteriores levadas a termo Abortos espontâneos Soro d. 2FSH Ano Quantidade total de FSH (IU/L) Quantidade total de HMg (IU/L) Quantidade total de gonadotrofina (IU/L) Espessura endometrial (mil/ML) No. total de espermas móveis após lavagem (mil/ML) No. total de espermas móveis antes da lavagem (mil/ML) No. total de ovócitos Porcentagem de ovócitos normais e maduros Fertilização normal (%)
Quantidade total de HMg (IU/L) 0,33 0 ,19 0,00 0,06 0,00 0,05 0,28 -0,06 0,06 1,00 0,80 -0,11 0,01 0,03 -044 -0,09 -0,06
Quantidade total de gonadotrofina (IU/L) 0,44 0,24 0,00 0,08 0,02 0,06 0,36 -0,06 0,98 0,80 1,00 -0,16 0,02 0,03 -056 -0,07 -0,05
Espessura endometrial (mil/ML) -0,16 -0, 12 -0,05 -0,07 0,05 -0,07 -0,11 -0,04 -0,16 -0 11 -0,16 1,00 0,01 0,01 0 14 0,37 0,01
No. total de espermas móveis após lavagem (mil/ML) 0,04 -0,06 -0, 01 0,07 0, 01 0,05 0,00 -0,11 0,01 0,01 0,02 0,01 1,00 0,02 -0,03 -0,19 0,01
No. total de espermas móveis antes da lavagem (mil/ML) (m)II/mL) 0,05 -0,05 0,00 0,05 0,02 0,03 0,00 -0,08 0,03 0,03 0,03 0,01 0,02 1,00 0 01 -0,08 -0,01
Variáveis pós-FIV
No. Total de ovócitos -0,37 -0,20 0,06 -0,04 0,00 -0,02 -0,30 0,11 -0,55 -0,44 -0,56 0,14 -0,03 0,01 1,00 0,13 0,03
Porcentagem de ovócitos normais e maduros -0,20 -0,08 -0,05 -0 ,16 -0,09 -0,13 -0,13 -0,01 -0,06 -0,09 -0,07 0,37 -0,19 -0,08 0 13 1,00 -0,04
Fertilização normal (%) -0,05 -0,05 -0,04 0,00 0 ,01 0,00 -0,06 0,04 -0,05 -0,06 -0,05 0,01 0,01 -0,01 0,03 -0,04 1,00
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Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 122/373 continuação
Idade do paciente Idade do parceiro Índice de Massa Corporal No. de gestações anteriores No. de gestações anteriores levadas a termo Abortos espontâneos Soro d. 2FSH Ano Quantidade total de FSH (IU/L) Quantidade total de HMg (IU/L) Quantidade total de gonadotrofina (IU/L) Espessura endometrial (mil/ML) No. total de espermas móveis após lavagem (mil/ML) No. total de espermas móveis antes da lavagem (mil/ML) No. total de ovócitos Porcentagem de ovócitos normais e maduros Fertilização normal (%)
Óvulos não fertilizados (%) 0,01 0,03 0,03 -0,02 -0 ,01 -0, 02 0 ,06 -0,08 0,04 0,03 0,04 0,01 -0,04 -0,04 -0 01 0,05 -0,83
Óvulos anormalmente fertilizados (%) 0,06 0,03 0 ,01 0,04 0,00 0,02 -0,01 0,07 0,02 0,05 0,03 -0,02 0,05 0,09 -0,03 -0,01 -0,35
No. total de embriões -0,34 -0,20 0,02 -0,03 0,00 -0,01 -0,27 0,10 -0,45 -0,36 -0,46 0,21 -0,01 -0,02 0,87 0,48 0,39
Desenvolvimento das blástulas (%) -0,35 -0,21 0,06 0 ,01 0,03 0,02 -0,20 0,19 -0,41 -0,32 -0,42 0,12 0,00 -0,01 047 0,03 0,15
Compactação no d.3 (%) 0,09 0,05 -0,04 0,04 0 ,01 0 ,02 -0 ,02 -0,24 -0,05 -0,04 -0,05 -0,01 0,01 -0,01 -0,04 0,02 0,05
No. médio de células por embrião 0,00 -0 ,01 0,04 0,07 0,02 0,05 -0,01 -0,04 -0,06 -0,07 -0,06 0,05 0,02 0,02 0,03 0,02 -0,01
No. de embriões retidos em 4 células -0,03 0,00 -0 ,01 -0,04 0,00 -0,04 0,00 0,08 0,02 0,04 0,03 -0,04 -0,03 0,00 0,00 0,01 -0,03
No. de embriões de 8 células -0,23 -0 ,14 0,06 0,02 0,02 0,01 -0,22 0,02 -0,41 -0,32 -0,42 0,13 0,00 -0,01 0,65 0,03 0,26
Porcentagem de embriões de 8 células (%) 0,03 0 ,01 0,03 0,05 0 ,01 0,02 -0,06 -0,10 -0,08 -0,06 -0,08 0,06 0,01 0,04 0,06 0,01 0,05
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Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 123/373 continuação
Idade do paciente Idade do parceiro Índice de Massa Corporal No. de gestações anteriores No. de gestações anteriores levadas a termo Abortos espontâneos Soro d. 2FSH Ano Quantidade total de FSH (IU/L) Quantidade total de HMg (IU/L) Quantidade total de gonadotrofina (IU/L) Espessura endometrial (mil/ML) No. total de espermas móveis após lavagem (mil/ML) No. total de espermas móveis antes da lavagem (mil/ML) No. total de ovócitos Porcentagem de ovócitos normais e maduros Fertilização normal (%)
Embriões criopreservados (%) -0,37 -0,24 0,03 -0,04 -0,02 -0,04 -0,19 0,11 -0,37 -0,31 -0,38 0,10 0,03 0,01 043 0,00 0,17
Grau médio dos embriões -0,05 -0,03 -0,08 0,04 0,03 0,04 -0,01 0,16 0,04 0,02 0,04 0,01 -0,04 0,01 -0,02 0,01 0,01
No. total de embriões transferidos 0,13 0,08 -0,03 -0,02 -0,05 -0,03 -0,13 -0,07 0,02 0,04 0,03 0,11 0,02 0,00 0,08 0,59 0,23
No. médio de células por embriões transferidos -0,16 -0 ,10 0,04 0,03 0 ,01 0,04 -0,12 -0,01 -021 -0,18 -0,22 0,10 0,01 0,00 028 0,02 0,11
Grau médio de embriões transferidos 0,11 0,06 -0,08 0,04 0,03 0,04 0,08 0,12 0,20 0,14 0,20 -0,05 -0,05 0,02 -023 -0,03 -0,06
No. de embriões transferidos retidos em 4 células 0,09 0,06 -0 ,01 -0 ,01 0,01 -0,03 0,08 0,04 0,15 0,13 0,15 -0,07 -0,02 0,02 -0 19 0,01 -0,12
No. de embriões de 8 células transferidos 0,03 0,04 0,04 0,00 0,00 -0,02 -0,14 -0,10 -0,18 -0,11 -0,17 0,08 0,02 -0,01 029 -0,01 0,18
Porcentagens de embriões de embriões de 8 células transferidos (%) -0,19 -0,10 0,04 0,00 0,01 -0,01 -0,16 -0,02 -0,30 -0,21 -0,30 0,13 0,01 0,01 0,36 0,03 0,15
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Tabela 14B
Óvulos não fertilizados (%) Óvulos anormalmente fertilizados (%) No. total de embriões Desenvolvimento das blástulas (%) Compactação no d.3 (%) No. médio de células por embrião No. de embriões retidos em 4 células No. de embriões de 8 células Porcentagem de embriões de 8 células (%) Embriões criopreservados (%) Grau médio dos embriões No. total de embriões transferidos No. médio de células por embriões transferidos Grau médio de embriões transferidos No. de embriões transferidos retidos em 4 No. de embriõe s de 8 células transferidos Porcentagens de embriões de embriões de 8 células
Variáveis de pré-FIV
Idade do paciente 1,00 0,56 0,04 0,22 0 ,13 0,14 0,17 -0,27 0,43 0,33 0,44 -0,16 0,04 0,05 -0,37 -0,20 -0,05
Idade do parceiro 0,56 1,00 0, 01 0 ,10 0,09 0,06 0,08 -0,19 0,23 0 ,19 0,24 -0,12 -0,06 -0,05 -0,20 -0,08 -0,05
Índice de Massa Corporal 0 ,04 0 ,01 1,00 0,08 0,05 0 ,05 -0 ,04 0 ,07 0 ,00 0,00 0,00 -0,05 -0,01 0 ,00 0,06 -0,05 -0,04
No. de gestações anteriores 0,22 0 ,10 0,08 1,00 0,56 0,70 0,01 -0,01 0,08 0,06 0,08 -0,07 0,07 0,05 -0,04 -0 16 0,00
No. de gestações anteriores levadas a termo 0,13 0,09 0,05 0,56 1,00 0,14 0,05 -0,01 0,02 0,00 0,02 0,05 0,01 0,02 0,00 -0,09 0 ,01
Abortos espontâneos 0,14 0,06 0,05 0,70 0, 14 1,00 -0,02 0,01 0,06 0,05 0,06 -0,07 0,05 0,03 -0,02 -0,13 0,00
Soro d. 2FSH 0,17 0,08 -0,04 0 ,01 0,05 -0,02 1,00 0,03 0,35 0,28 0,36 -0,11 0,00 0,00 -0,30 -0,13 -0,06
Ano -0 ,27 -0 ,19 0,07 -0 ,01 -0, 01 0 ,01 0 ,03 1 ,00 -0,05 -0,06 -0,06 -0,04 -0,11 -0,08 0,11 -0,01 0,04
Variáveis de pré-OR ,
Quantidade total de FSH (IU/L) 0,43 0,23 0,00 0,08 0,02 0,06 0,35 -0,05 1,00 0,66 0,98 -0,16 0,01 0,03 -0,55 -0,06 -0,05
Quantidade total de HMg (IU/L) 0,33 0 ,19 0,00 0,06 0,00 0,05 0,28 -0,06 0,06 1,00 0,80 -0,11 0,01 0,03 -0,44 -0,09 -0,06
119/357
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Continuação
Óvulos não fertilizados (%) Óvulos anormalmente fertilizados (%) No. total de embriões Desenvolvimento das blástulas (%) Compactação no d.3 (%) No. médio de células por embrião No. de embriões retidos em 4 células No. de embriões de 8 células Porcentagem de embriões de 8 células Embriões criopreservados (%) Grau médio dos embriões No. total de embriões transferidos No. médio de células por embriões transferidos Grau médio de embriões transferidos No. de embriões transferidos retidos em 4 r.ph line No. de embriões de 8 células transferidos Porcentagens de embriões de embriões
Quantidade total de gonadotrofina (IU/L) 0,44 0,24 0,00 0,08 0,02 0,06 0,36 -0,06 0,98 0,80 1,00 -0 16 0,02 0,03 -0,56 -0,07 -0,05
Espessura endometrial (mil/ML) -0,16 -0 ,12 -0,05 -0,07 0,05 -0,07 -0,11 -0,04 -0,16 -0,11 -0 ,16 1,00 0,01 0,01 0 ,14 0,37 0 ,01
No. total de espermas móveis após lavagem (mil/ML) 0,04 -0,06 -0, 01 0,07 0, 01 0,05 0,00 -0,11 0,01 0, 01 0,02 0,01 1,00 0,02 -0,03 -0 ,19 0 ,01
No. total de espermas móveis antes da lavagem (mil/ML) (m)II/mL) 0,05 -0,05 0,00 0,05 0,02 0,03 0,00 -0,08 0,03 0,03 0,03 0 ,01 0,02 1,00 0 ,01 -0,08 -0 ,01
Variáveis pós-FIV
No. Total de ovócitos -0,37 -0,20 0,06 -0,04 0,00 -0,02 -0,30 0,11 -0,55 -0,44 -0,56 0 ,14 -0,03 0,01 1,00 0 ,13 0,03
Porcentagem de ovócitos normais e maduros -0,20 -0,08 -0,05 -0 ,16 -0,09 -0,13 -0,13 -0,01 -0,06 -0,09 -0,07 0,37 -0,19 -0,08 0 13 1,00 -0,04
Fertilização normal (%) -0,05 -0,05 -0,04 0,00 0, 01 0,00 -0,06 0,04 -0,05 -0,06 -0,05 0 ,01 0,01 -0,01 0,03 -0,04 1,00
Óvulos não fertilizados (%) 0 ,01 0,03 0,03 -0,02 -0, 01 -0 ,02 0 ,06 -0 ,08 0 ,04 0,03 0,04 0 ,01 -0,04 -0,04 -0 ,01 0,05 -0,83
Óvulos anormalmente fertilizados (%) 0,06 0,03 0, 01 0,04 0,00 0,02 -0,01 0,07 0,02 0,05 0,03 -0,02 0,05 0,09 -0,03 -0 01 -0,35
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Continuação
Óvulos não fertilizados (%) Óvulos anormalmente fertilizados (%) No. total de embriões Desenvolvimento das blástulas (%) Compactação no d.3 (%) No. médio de células por embrião No. de embriões retidos em 4 células No. de embriões de 8 células Porcentagem de embriões de 8 células Embriões criopreservados (%) Grau médio dos embriões No. total de embriões transferidos No. médio de células por embriões transferidos Grau médio de embriões transferidos No. de embriões transferidos retidos em 4 r.ph iIíiq No. de embriões de 8 células transferidos Porcentagens de embriões de embriões
No. total de embriões -0,34 -0,20 0,02 -0,03 0,00 -0,01 -0,27 0,10 -0,45 -0,36 -0,46 0,21 -0,01 -0,02 0,87 0,48 0,39
Desenvolvimento das blástulas (%) -0,35 -0,21 0,06 0 ,01 0,03 0,02 -0,20 0,19 -0,41 -0,32 -0,42 0 ,12 0,00 -0,01 0,47 0,03 0 ,15
Compactação no d.3 (%) 0 ,09 0,05 -0,04 0,04 0 01 0 ,02 -0 ,02 -0,24 -0,05 -0,04 -0,05 -0,01 0 ,01 -0,01 -0,04 0,02 0,05
No. médio de células por embrião 0,00 -0 ,01 0,04 0,07 0,02 0,05 -0,01 -0,04 -0,06 -0,07 -0,06 0,05 0,02 0,02 0,03 0,02 -0 01
No. de embriões retidos em 4 células -0,03 0,00 -0, 01 -0,04 0,00 -0,04 0,00 0,08 0,02 0,04 0,03 -0,04 -0,03 0,00 0,00 0 ,01 -0,03
No. de embriões de 8 células -0,23 -0 ,14 0,06 0,02 0,02 0,01 -0,22 0,02 -0,41 -0,32 -0,42 0 ,13 0,00 -0,01 0,65 0,03 0,26
Porcentagem de embriões de 8 células (%) 0,03 0 ,01 0,03 0,05 0 01 0,02 -0,06 -0,10 -0,08 -0,06 -0,08 0,06 0,01 0,04 0,06 0 ,01 0,05
Embriões criopreservados (%) -0,37 -0,24 0,03 -0,04 -0,02 -0,04 -0,19 0,11 -0,37 -0,31 -0,38 0,10 0,03 0,01 0,43 0,00 0 ,17
Grau médio dos embriões -0,05 -0,03 -0,08 0,04 0,03 0,04 -0,01 0,16 0,04 0,02 0,04 0,01 -0,04 0,01 -0,02 0 ,01 0 ,01
No. total de embriões transferidos 0,13 0,08 -0,03 -0,02 -0,05 -0,03 -0,13 -0,07 0,02 0,04 0,03 0 ,11 0,02 0,00 0,08 0,59 0,23
121/357
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Continuação φ
E π
E
ο ο
No. de embriões retidos em 4 células ω SP
CO CO CD
E
E
E LU
E 0
E
CP £ CD in CD
No. médio de células por embriões transferidos
Grau médio de embriões transferidos
No. de embriões transferidos retidos em 4 células
No. de embriões de 8 células transferidos
Porcentagens de embriões de embriões de 8 células transferidos (%)
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-0,16
-0 ,10
0,04
0,03
01
0,04 ,12
-0,01
-0,21
-0,18
-0,22
0,10
0,01
0,00
0,28
0,02
0, 11
0,11
0,09
0,03
-0,19
0,06
0,06
0,04
-0, 10
-0,08
-0, 01
0,04
0,04
0,04
0,03
0,04
0,12
0,20
0,14
0,20
-0,05
-0,05
0,02
-0,23
-0,03
-0,06
-0 ,01
0, 01
-0,03
0,04
0,15
0,13 ,15
-0,07
-0,02
0,02
-0,19 ,01
-0, 12
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0,00
0,00
-0,02 ,14
-0,10
-0,18
-0,11
-0 ,17
0,08
0,02
-0,01
0,29
-0 ,01
0, 18
0,00
0, 01
-0,01 ,16
-0,02
-0,30
-0,21
-0,30
0,13
0,01
0,01
0,36
0,03
0, 15
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Fatores e Modelos de Prognósticos de Tratamentos de FIV com Tempo Específico [000201] De forma coerente com o objetivo de facilitar a real tomada de decisões, utilizou-se uma árvore melhorada de MART para gerar três modelos de previsão, cada qual utilizando variáveis que estariam disponíveis em um tempo específico durante o planejamento e tratamento de FIV. Como mostra o esquema na figura. 20, o modelo pré-FIV foi limitado a 21 variáveis principalmente relacionadas às características gerais dos pacientes, aos diagnósticos clínicos; o modelo de recuperação pré-ovócito (Pré-OR) utilizou as mesmas 21 variáveis referentes à resposta do paciente à estimulação ovariana, além de 9 variáveis utilizadas no modelo pré-FIV, com um total de 30 variáveis; o modelo pós-FIV utilizou todas as variáveis do pré-FIV e do pré-OR além dos dados relativos ao desenvolvimento do embrião e os parâmetros embrionários relacionados com a transferência ou a criopreservação de um total de 57 variáveis.
[000202] Modelo pré-FIV. A análise MART de 1879 pacientes C1com relação a 21 variáveis contínuas e categóricas, que já eram conhecidas antes de iniciar o tratamento de FIV (vide Tabela 13), mostrou que somente a idade do paciente e o diagnóstico da reserva ovariana reduzida (DOR), bem como a sua interação, prevêem resultados de nascimentos com vida. No nosso centro de pesquisas, o DOR tem sido rotineiramente usado para descrever pacientes que apresentavam uma história de resposta precária à estimulação ovariana com gonadotrofinas em tratamento de hiperestimulação ovariana controlada/inseminação intra-uterina (COH/IUI). Apesar da presença de DOR ser um indicador negativo para LB, só diz respeito a ~12% da população. O restante dos pacientes foi estratificado por idade. No entanto, o modelo identifica limites de idade (ou seja, 40,5, 42,5 e 46,5) que foram muito diferentes dos limiares (ou seja, <35, 36-37, 3840, 41-42,> 42) que são arbitrariamente e comumente utilizados na
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124/357 literatura (ref). No geral, cinco subgrupos de pacientes, agora populações, foram discernidos por esse modelo LB com taxas de 21%, 39%, 27%, 17% e 4% para 222 (12% de todos os pacientes C1), 690 (37%), 176 (9%), 581 (31%) e 199 (11%) pacientes, respectivamente (figura. 21A).
[000203] Modelo pré-OR. Nesse modelo, 30 variáveis conhecidas no momento da captação dos ovócitos, da mesma população compreendendo 1879 pacientes C1, foram analisadas por MART. Três fatores prognósticos independentes foram identificados - o montante total das gonadotrofinas necessárias (TG), idade e espessura endometrial (EndoTh). Mais uma vez, embora cada um desses fatores de terem sido relatados estarem associados com resultados de LB, pela primeira vez estamos definindo objetivamente seus limiares e a natureza do seu potencial de interação, que são críticos para a aplicação clínica. No geral, esse modelo identificou sete populações distintas com relação a suas taxas de LB abrangendo 2%, 51%, 28%, 32%, 18%, 37% e 8% para 26 (1,4% de todos os pacientes C1), 387 (21%), 58 (3%), 200 (11%), 662 (35%), 141 (8%) e 405 (22%) pacientes em Populações (Pops) 1 a 7 (figura. 21B). Além de populações precisamente analisadas, os resultados impressionantes foram a chance minúscula de resultados de LB para os pacientes que tinham EndoTh <7,05 mm (Pop 1), aqueles que se saíram mal de acordo com todos os três fatores prognósticos (Pop 5) e idade> 44,5 ( Pop 7). A simples combinação de Pops 1, 5 e 7 mostrou que 1119, ou ~ 60% de todos os pacientes C1 tiveram uma taxa de LB muito baixa de 13,5%.
[000204] Modelo pós-FIV. O modelo pós-FIV foi gerado por MART com base em todas as 57 variáveis listadas na tabela 1. Deve ser observado que essa análise foi restrita a 1664 dos 1.879 pacientes C1 devido a 215 pacientes não terem completado o tratamento de FIV e
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125/357 optaram pelo cancelamento do ciclo principalmente devido à resposta ovariana insuficiente. Quatro importantes fatores de prognósticos - Taxa de Blást., Número de Embriões, TG e EndoTh são suficientes para diferenciar 6 populações com taxas de LB variando entre 7%, 39%, 17%, 54%, 36% e 72% para 361 (19% dos pacientes analisados), 96 (5,5%), 643 (40%), 316 (19%), 198 (12%) e 95 (6%) pacientes nas Populações 1 a 6 (figura. 21C).
Validação do Modelo em Pacientes Reincidente e um Conjunto de Dados Independente.
[000205] Nós validamos nossos modelos testando se as taxas de nascimento entre as populações são significativamente diferentes em conjuntos de dados relacionados compostos por pacientes cujo C1 não resultou em um nascimento com vida e que retornaram para a repetição do tratamento em 778 segundos ciclos (C2) e 312 terceiros ciclos (C3). Para validar ainda mais nossos resultados, também testamos um conjunto de dados independentes, compostos por dados de C1 de 343 pacientes diferentes que se submeteram ao tratamento de FIV em 2007. (Ver figura. 22) Curiosamente, notamos que a composição da população geral de pacientes de FIV se alternou entre os ciclos, e entre conjuntos de dados.
[000206] Testamos diferentes taxas de nascimentos com vida entre as populações por teste ANOVA de qui-quadrado, que descreveu que os resultados de LBs diferenciais entre as populações permaneceram significativamente diferentes em C2 e C3 a partir dos conjuntos de dados 2003-2006, bem como o C1 de conjuntos de dados independentes de 2007, para cada um dos modelos pré-FIV, pré-OR e pós-FIV com valores p em 1.17E-50 8.69E-71 e 1.64E-96, respectivamente (figura. 23).
[000207] Foram então validados os modelos de uma maneira diferente, testando se as taxas de nascimento com vida de cada
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126/357 população definida por prognóstico eram estáveis e inalteradas entre C1, C2, C3 dados entre 2003-2006 (interciclo, de agora em diante), e entre conjuntos de dados de C1 de 2007 e C1 de 2003-2006. A comparação interciclo mostrou que toda a população manteve-se similar para os modelos pré-OR e pós-FIV; no modelo pré-FIV, apenas a Pop 2 e a Pop 4 demonstraram que a sua taxa de nascimentos com vida alteradas entre os ciclos (p = 0,02). (Vide tabela 15 para valores p das comparações interciclo.) Além disso, a comparação das populações entre o conjunto de dados de 2003-2006 e 2007 indicou que os modelos pré-FIV e pós-FIV, e a maioria dos modelos pré-OR têm se mantido constantes e altamente reprodutivos (p > 0,5); Pops 1 e 6 do modelo pré-OR tiveram resultados diferenciais de nascimentos com vida entre os dois conjuntos de dados.
Tabela 15. Taxas de nascimento com vida foram comparados com o modelo de controle baseado em idade e cada modelo pré-FIV, pré-OR, pós-FIV ao longo de populações para cada faixa etária.
Faixa etária
<35 35-37 38-40 41-42 >=43
Pré-FIV 0,6 0,1 0,01 NA NA
Pré-OR 0,04 1,8E-04 3,2E-07 4,1E-05 2,1E-06
Pós-FIV 3,2E-07 3,7E-05 9,5E-16 3,7E-05 1,6E-00
[000208] Coletivamente, nossos resultados apresentaram que todos os três modelos foram eficazes na estratificação dos pacientes com taxas diferenciais de nascimento com vida, e essa habilidade de estratificar através de diagnósticos é reproduzível em ciclos subsequentes e em um conjunto de dados independente, apesar das mudanças na composição da população geral de pacientes de FIV. Ademais, confirmamos que a estratificação do prognóstico e a previsão de nascimentos com vida utilizado em cada modelo eram reproduzíveis e validadas em um conjunto de dados independentes, assim como em ciclos repetidos de pacientes reincidentes.
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127/357 [000209] Os modelos previram os resultados de nascimentos com maior especificidade do que a idade.
[000210] Foi testada a possibilidade de esses modelos de previsão definirem populações de pacientes de maneira melhor e mais especificamente do que um modelo de controle baseado na idade (doravante, controle). (Vide Detalhes de métodos para modelo de controle baseado na idade). Mostramos que o específico para população observa os resultados de nascimentos com vida em relação às taxas de nascimento com vida previstas pelo controle para cada cinco categorias de idade, <35, 35-37, 38-40, 41 -42, e > 43 (figura. 24A-C). Aqui, as categorias de idade foram definidas pelos padrões convencionais utilizados pelo registro nacional da Sociedade de Tecnologias de Reprodução Assistida (SART) e a maioria da literatura (ref). Essas comparações destacam a tendência para a idade superestimar ou subestimar as taxas de nascimento com vida. Por exemplo, o modelo de controle tende a superestimar a taxa de nascimento com vida da Pop 1 do modelo pré-FIV, aas Pops 5 e 7 do modelo pré-OR e das Pops 1 e 3 do modelo pós-FIV (figura 24A-C). Na comparação com o modelo pré-OR, o modelo de controle também tende a subestimar a taxa de nascimento com vida das Pops 2 e 3 e das faixas etárias 41-42 e > 43 da Pop 6, enquanto na comparação com o modelo pós-FIV, a idade tende a subestimar as Pops 4 e 6.
[000211] Cada um dos modelos de pré-FIV, pré-OR e pós-FIV foi comparado com o controle em relação à taxa de nascimentos com vida em cada uma das cinco categorias de idade. Tanto o modelo préOR quanto o pós-FIV previram a taxa de nascimentos com vida significativamente melhor do que o modelo de controle entre as populações em todas as cinco faixas etárias (valores p variam de 0,04 a 0.5E-16, vide Tabela 15 para todos os valores p dessas comparações). No modelo pré-FIV, em que a idade é um fator chave
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128/357 no prognóstico, o modelo pré-FIV prevê melhor os resultados do que o controle para a faixa etária 38-40, presumivelmente porque também considera o diagnóstico da reserva ovariana reduzida (p = 0,01). Em resumo, entre os pacientes que são submetidos primeiro ciclo de FIV, 17,7% dos pacientes receberia a previsão do resultado de nascimentos com vida de forma mais exata e personalizada com o uso do modelo pré-FIV e 76% dos pacientes se beneficiaria do uso do modelo pré-OR. A utilidade do modelo pós-FIV é facilitar a tomada de decisões sobre o tratamento de FIV subsequente, no caso do não resultado de nascimento com vida no primeiro tratamento, a sua utilização como ferramenta de predição para os ciclos subsequentes será analisada em maiores detalhes mais tarde.
A estratificação prognóstica prevê taxas de nascimento com vida posteriores e cumulativas.
[000212] Foi questionado se a atribuição da população em C1 prevê taxa de nascimentos com vida no C2 e taxas cumulativas de nascimentos com vida em C2 e C3, para pacientes que não obtêm resultados de nascimentos com vida a partir de C1. Essas perguntas precisamente abordam a situação frequente em que um casal precisa decidir se deseja repetir o tratamento de FIV após um ciclo malsucedido. Essas questões foram endereçadas através da distribuição de pacientes em populações com base no modelo pósFIV, seguido de acompanhamento dos resultados dos pacientes em C2 e C3. Foram consideradas as taxas de nascimento com vida cumulativas observadas e hipotéticas. As taxas observadas foram acumuladas conservadoramente calculadas com base nos pacientes reais que voltaram para C2 e C3; o numerador foi o número de nascimentos com vida em C2 e C3; o denominador foi o número total de ciclos C2. As taxas cumulativas hipotéticas foram calculadas com base na probabilidade da obtenção de resultados de nascimentos com
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129/357 vida nos C2 e C3, e partem do princípio que os pacientes que desistiram não eram diferentes dos que retornaram e, portanto, eles não são afetados pelo número limitado de pacientes que optaram por C3. Especificamente, o C1 destinado às Pops 1 e 3 resultou nas taxas cumulativas de nascimentos com vida de 15,1% e 18,4%, respectivamente, e 27,5% para a Pop 5. Em contraste, as Pops 2, 4 e 6 demonstraram taxas muito maiores cumulativas de nascimentos com vida de 56,7%, 42,9% e 75%, respectivamente, as taxas de nascimento com vida cumulativas hipotéticas demonstraram uma tendência a ser levemente maiores (figura. 25). Portanto, a atribuição de população com base em fatores prognósticos em C1 redefine a população de FIV em subconjuntos que possuem taxas de nascimentos com vida cumulativas distintas e previsíveis em C2 e C3.
Análise do Aumento de Grau para Identificar a Importância Relativa de Variáveis de Pacientes Pré-Selecionados [000213] Foi utilizado um aparelho de regulação de grau (GBM) para realizar análises para determinar a influência relativa de cada variável sobre os resultados de nascimentos com vida para todos os três modelos. Portanto, foram realizadas validações cruzadas por 10 vezes para 1879, 1879 e 1664 novos ciclos para modelos de pré-FIV, pré-OR, e pós-FIV, respectivamente. O número ideal de árvores foi de 4.677, 8.680 e 10.745 para modelos de pré-FIV, pré-OR, e pós-FIV, respectivamente, 25.000 árvores (ou seja, mais do que o mínimo necessário) foram analisadas para cada modelo. Os resultados são mostrados nas Tabelas 16A, 16B e 16C. As variáveis são classificadas de acordo com a influência/importância relativa diminuída, de forma que as variáveis mais importantes estão no topo da classificação. Os números de influência relativa somam 100 em cada modelo.
[000214] Essas saídas GBM contêm milhares de árvores que não podem ser visualizadas e são conceitualmente muito abstratas para a
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130/357 maioria das discussões científicas e clínicas. Portanto, nós escolhemos as variáveis principais para uma análise mais aprofundada para a construção de modelos mais simples de árvores que possam ser visualizadas com Rpart. As vantagens de modelos mais simples de árvores é serem conceitualmente mais facilmente compreendidas pelos cientistas, médicos e leigos; sub-populações distintas podem ser caracterizadas e submetidas a análises suplementares para abordar questões específicas e para explorar a utilidade dos modelos.
Tabelas 16A, 16B, e 16C. Lista de variáveis e suas importâncias relativas na determinação de resultados de nascimentos com vida nos modelos pré-FIV, pré-OR e pós-FIV, respectivamente.
Tabela 16A: Modelo Pré-FIV
Modelo pré-FIV
Variáveis Importância Relativa
Idade do paciente 45, 38
Reserva ovariana reduzida 14, 82
Idade do parceiro 11,55
Soro d. 3 FSH (IU/L) 10, 71
Índice de Massa Corporal 6, 37
Síndrome do ovário policístico 2, 88
Estação 1, 75
Infertilidade feminina inexplicada 1, 35
Abortos espontâneos 0, 97
Ano 0, 89
Outras causas de infertilidade masculina 0, 76
No. de gestações prévias 0, 74
No. de partos com sucesso prévios 0, 64
Endometriose 0, 51
Doença tubária 0, 48
Ligação das trompas 0, 09
Somente infertilidade masculina 0, 07
Fibroide uterina 0, 02
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Modelo pré-FIV
Variáveis Importância Relativa
hidrossalpinge 0, 01
Causas de infertilidade masculina 0, 01
Tabela 16B: Modelo Pré-OR
Modelo pré-OR
Variáveis Importância Relativa
Quantidade total de gonadotrofina 35, 22
Espessura endometrial 17, 58
Idade do paciente 14, 16
No. de espermas móveis antes da lavagem (milhões/mL) 8, 05
No. de espermas móveis após lavagem (milhões/mL) 6, 87
Idade do parceiro 6, 03
Índice de Massa Corporal 4, 27
Soro d. 3 FSH (IU/L) 2, 91
Estação 2, 41
Abortos espontâneos 0, 75
Infertilidade masculina inexplicada 0, 39
No. de partos com sucesso prévios 0, 26
Ano 0, 26
No. de gestações prévias 0, 21
Outras causas de infertilidade masculina 0, 10
Endometriose 0, 04
Somente infertilidade masculina 0, 02
Ligação de trompas 0, 02
Síndrome de ovários policísticos 0, 02
Doença tubária 0, 02
Esperma de doador 0, 00
hidrossalpinge 0, 00
Fibroide uterina 0, 00
Causas de infertilidade masculina 0, 00
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Tabela 16C: Modelo Pós-FIV
Modelo pós-FIV
Variáveis Importância Relativa
Desenvolvimento das blástulas (%) 27, 30
Quantidade total de gonadotrofina 10, 58
No. total de embriões 8, 95
Espessura endometrial 7, 24
Protocolo de flare 6, 13
No. médio de células por embrião 4, 97
Cateter utilizado 4, 04
Porcentagem de embriões de 8 células 3, 54
Soro d. FSH (IU/L) 3, 17
Índice de Massa Corporal 3, 16
No. de espermas móveis antes da lavagem (milhões/mL) 2, 99
No. de espermas móveis após lavagem (milhões/mL) 2, 88
Idade do paciente 2, 56
Grau médio do embrião 2, 49
Dia da transferência do embrião 1, 88
Estação 1, 32
Abortos espontâneos 0, 93
No. de partos com sucesso prévios 0, 74
Pílulas anticoncepcionais orais 0, 68
Coleção de espermas 0, 58
Óvulos não fertilizados (%) 0, 56
No. de embriões retidos em 4 células 0, 54
Compactação no dia 3 0, 51
Fertilização normal (%) 0, 48
Óvulos anormalmente fertilizados (%) 0, 48
Porcentagem de ovócitos normais e maduros 0, 48
No. de gestações anteriores 0, 26
Ano 0, 17
Síndrome do ovário policístico 0, 12
Infertilidade feminina inexplicada 0, 11
Doença tubária 0, 05
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Modelo pós-FIV
Variáveis Importância Relativa
Somente infertilidade masculina 0, 05
Causas de infertilidade masculina 0, 03
Endometriose 0, 02
Outras causas de infertilidade feminina 0, 01
Fibroide uterina 0, 01
Ligação de trompas 0, 00
Esperma de doador 0, 00
hidrossalpinge 0, 00
Execução de ICSI 0, 00
Incubação Assistida 0, 00
EXEMPLO 7
DETERMINAÇÃO DE UMA IMPRESSÃO GENÉTICA MOLECULAR PARA EMBRIÕES HUMANOS NORMAIS VERSUS ANORMAIS [000215] Foi testada com sucesso a expressão de um painel de genes em blástulas dissociadas do controle de embriões humanos criopreservados e descongelados que estejam no estágio de 1, 4 e 8 células. (Pacientes doaram os embriões de controle para pesquisa por já terem completado suas famílias.) Foram analisados os dados, considerando o desvio padrão e o meio. Os resultados dos experimentos chip de gene no estágio de 1, 4 e 8 células são fornecidos nas figuras 25-30. Esses resultados mostram a utilidade da análise da análise da expressão gênica ao nível de uma única célula, assim como o exame simultâneo da expressão de muitos genes. Como tal, os resultados mostram que a análise de impressões genéticas para os embriões poderia ser utilizada para fornecer informações que possam melhorar a previsão dos resultados de nascimentos com vida para os ciclos subsequentes de FIV.
[000216] Os fatos acima ilustram apenas os princípios da invenção. Aqueles versados na técnica serão capazes de elaborar diferentes
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Tabela 8A
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
12561 0610039J04Rik: gene RIKEN cDNA 0610039J04 726,94 952,88 925,99 702,03 806,57 331
17702 0610040J01Rik: gene RIKEN cDNA 0610040J01 408,14 292,64 232,51 164,99 152,49 79,1
14297 1110007M04Rik: gene RIKEN cDNA 1110007M04 1261,71 969,97 1148,54 891,24 883,27 742,9
23774 1300003B13Rik: gene RIKEN cDNA 1300003B13 366,9 654,15 629,58 353,58 521,61 292,6
2769 1500005A01Rik: gene RIKEN cDNA 1500005A01 190,67 162,34 88,43 60,38 43,44 74,49
22816 1500011B03Rik: gene RIKEN cDNA 1500011B03 322,26 247,98 673,66 122,44 129,61 103,8
22897 1500041J02Rik: gene RIKEN cDNA 1500041J02 1893,92 1849,18 1693,29 1451 1424 1116
39273 1700013H16Rik: gene RIKEN cDNA 1700013H16 758,43 675,7 737,99 758,17 463,94 313,6
39378 1700080016Rik /// LOC665895 /// LOC671223 /// LOC676479: RIKEN 200,58 99,12 179,18 2,68 13,11 53,79
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
cDNA 1700080016 gene /// similar à família de antígeno de melanoma A,5 /// similar à família de antígeno de melanoma A,5 /// similar à família de antígeno de melanoma A,5
25993 1700129I15Rik: gene RIKEN cDNA 1700129I15 669,05 306,9 110,37 38,64 337,75 62,42
1469 1810021J13Rik: gene RIKEN cDNA 1810021J13 197,73 84,01 193,51 54,69 91,43 27,17
38853 1810044A24Rik: gene RIKEN cDNA 1810044A24 327,76 445,4 180,89 194,87 99,06 230,3
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
12883 2010301N04Rik: gene RIKEN cDNA 2010301N04 137,6 388,98 247,94 70,02 143,76 72,7
4342 2410022L05Rik: gene RIKEN cDNA 2410022L05 1336,22 1283,42 1702,28 919,13 704,51 611,2
4343 2410022L05Rik: gene RIKEN cDNA 2410022L05 1587,18 1242,98 1840,86 1006,1 799,09 735,3
7831 2510042P03Rik: gene RIKEN cDNA 2510042P03 609,91 476,61 483,28 205,72 292,53 253,9
38903 2600010E01Rik: gene RIKEN cDNA 2600010E01 303,78 312,45 368,93 57,76 100,13 37,76
12473 2610001J05Rik: gene RIKEN cDNA 2610001J05 296,77 409,38 503,49 245,92 295,87 217,2
17629 2610200G18Rik: gene RIKEN cDNA 2610200G18 507,41 353,97 562,56 226,7 318,05 160
8796 2610204L23Rik: gene RIKEN cDNA 2610204L23 2035,34 2238,21 2213,21 1158 1919,6 996,2
13166 2610206B13Rik: gene RIKEN cDNA 2610206B13 225,38 66,31 200,47 99,87 45,82 54,05
15069 2700060E02Rik: gene RIKEN cDNA 2700060E02 1283,21 1570,89 1406,02 866,04 1267,3 698,8
12465 2810026P18Rik: gene RIKEN cDNA 2810026P18 2572,92 1625,64 2626,66 1339,2 1910,7 1650
1357 2810037C14Rik: gene RIKEN cDNA 2810037C14 1234,26 1441,36 1159,06 686,13 824,88 637,2
7425 2810405K02Rik: gene RIKEN cDNA 2810405K02 178,7 133,85 23,59 37,21 19,15 47,42
2836 2810429O05Rik: gene RIKEN cDNA 2810429O05 545,26 616,74 406,07 256,07 314,66 153,4
8173 2900092E17Rik: gene RIKEN cDNA 2900092E17 364,43 535,89 536,98 201,3 208,16 223,1
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
31900 cDNA de timo de neonate de 3 dias, biblioteca enriquecida de comprimento total RIKEN, clone:A630060L04 produto:inclassificável, sequência de inserção completa 217,23 198,01 208,5 35,11 62,24 25,96
23783 3110040M04Rik /// LOC668050 /// LOC668055 /// LOC671025 /// LOC671035 /// LOC671043 /// LOC671049 /// 262,9 66,64 204,12 24,31 69,95 13,99
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
LOC676755 /// LOC676758: RIKEN cDNA 3110040M04 gene /// similar à proteina SR140 associada a U2 /// proteína hipotética LOC668055 /// similar à proteína SR140 associada a U2 // similar à proteína SR140 associada a U2 /// similar à proteína SR140 associada a U2 /// similar à proteína SR140 associada a U2 /// similar à proteína SR140 associada a U2 /// similar à proteína SR140 associada a U2
24812 3110045A19Rik: gene RIKEN cDNA 3110045A19 133,79 102,29 11,36 16,34 11,54 14,64
41988 4930406H16Rik /// Nalp4e: RIKEN cDNA 4930406H16 gene /// NACHT, rico em leucina 4E repetido e contendo PYD 504,28 1414,88 933,88 507,4 694,22 548,5
25457 4930452B06Rik: gene RIKEN cDNA 4930452B06 159,43 56,45 170,72 54,77 36,42 26,26
27714 4930455F23Rik: gene RIKEN cDNA 4930455F23 534,1 677,74 522,3 346,74 399,19 274,9
12139 4933407C03Rik: gene RIKEN cDNA 4933407C03 132,88 24,46 352,91 23,21 29,24 24,42
5148 4933411K20Rik: gene RIKEN cDNA 4933411K20 738,65 1039,49 815,98 385,61 591,61 566
39323 4933416M07Rik: gene RIKEN cDNA 4933416M07 131,45 240,96 376,74 164,45 78,57 97,69
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
29217 4933427D06Rik: gene RIKEN cDNA 4933427D06 908,64 946,8 1089,77 626,62 734,75 426,3
32880 5330427D05Rik: gene RIKEN cDNA 5330427D05 288,66 223,45 219,68 127,67 89,86 117,7
12662 5730507H05Rik: gene RIKEN cDNA 5730507H05 812,73 648,02 809,21 424,8 297,08 456,7
10438 5830415L20Rik: gene RIKEN cDNA 5830415L20 1798,9 1735,07 1623,57 447,1 794,05 612,1
10605 6430548M08Rik: gene RIKEN cDNA 6430548M08 172,77 77,66 129,96 52,6 22,23 16,06
26997 6720463M24Rik: gene RIKEN cDNA 6720463M24 217,15 218,01 225,79 73,98 49,43 68,05
31488 7420416P09Rik: gene RIKEN cDNA 7420416P09 891,83 777,85 767,35 491,65 642,89 411,6
29615 A230048G03Rik /// LOC670614: RIKEN cDNA A230048G03 gene /// similar a CG2747-PB, isoforma B 171,76 66,93 163,5 48,01 41,96 51,96
22603 A230062G08Rik: gene RIKEN cDNA A230062G08 322,83 261,74 354,1 323,26 201,66 68,32
41840 A430033K04Rik: gene RIKEN cDNA A430033K04 1229,01 998,13 1215,48 461,08 557,03 342,2
15795 A830039H10Rik: gene RIKEN cDNA A830039H10 285,01 249,94 242,98 101,83 100,81 86,69
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
14842 Adcy3: adenilato ciclase 3 758,96 864,83 804,58 572,29 686,9 438,5
27502 Medula oblongata adulta masculina cDNA, RIKEN biblioteca compl, enriquecida, clone:6330441D15 produto: proteína hipotética, sequência de inserção completa 149,12 176,59 33,92 30,73 59,6 50,95
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
42166 Agrp: proteína relacionada a agouti 231,44 178,62 94,37 33,38 179,24 13,68
30358 A1449441: sequência expressa A1449441 151,46 251,91 122,96 52,19 97,84 34,47
27056 Akap7: uma proteína-âncora 7 de quinase (PRKA) 474,68 818,9 809,2 330,68 516,16 412,1
40856 Arhgefl5: fator rho de troca de nucleotídeos guanina (GEF) 15 75,81 156,72 162,47 102,39 39,12 15,89
14676 Ar14c /// LOC632433: 4C similar ao fator de ribosilação do ADP /// proteína 7 similar ao fator de ribosilação do ADP 311,79 210,2 41,38 104,69 73,13 31,74
14653 Arpc51: 2/3 complexo proteína relacionada a actina, similar subunidade 5 2473,77 2293,93 2924,51 1813,4 2433,6 1537
40302 Arrdc3: contendo 3 domínios arrestina 183,69 264,91 361,58 62,76 138,75 89,69
18069 Arx: gene homeobox relacionado a aristaless (Drosophila) 297,32 299,7 123,78 72,45 57,19 29,97
29021 AscL 1: similar ao homólogo do complexo achaete-scute 1 (Drosophila) 78,29 281,43 176,69 53,61 123,08 40,97
7414 Atp6v1g1: ATPase, 1-1 + transportador, lisossomal VI subunidade GI 814,9 317,26 545,09 311,05 237,03 227
27011 Atp8al: ATPase, transportador aminofosfolípide (APLT), classe I, tipo 8A, membro 1 113,19 302,99 336,88 111,03 98,91 55,24
10707 Atpbd4: Domínio de ligação de ATP 4 644,58 851,86 1031,97 378,68 582,62 175,6
26830 AU022751: sequência expressa AU022751 1575,02 1805,09 1927,95 1006,1 1485,3 930,7
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
28921 AU041783: sequência expressa AU041783 728,29 1031,63 715,32 268,18 470,17 621,1
17440 Aurkc: aurora quinase C 1462,84 1182,78 1533,48 1312,5 1219,2 927,9
15571 Auts2: candidato 2 suscetibilidade ao autismo 892,1 1352,74 1127,84 816,47 892,95 829,9
8718 AW060207: sequência expressa AW060207 432,59 609,26 574,19 250,29 379,24 218,9
29405 AW146299: sequência expressa AW146299 284,07 216,2 332,39 121,93 161,67 105,2
29099 B230312I18Rik: gene RIKEN cDNA B230312I18 420,5 374,15 459,33 169,13 94,51 275,9
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 143/373
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
11389 B930041F14Rik: gene RIKEN cDNA B930041F14 26,1 145,4 149,78 15,65 34,72 7,96
35357 B930096F20Rik: gene RIKEN cDNA B930096F20 232,53 102,36 229,72 30,99 16,44 13,59
33323 B930096F20Rik: gene RIKEN cDNA B930096F20 162,51 79,13 176,86 11,2 5,38 6,12
30001 BB 176347: sequência expressa BB176347 141,82 106,11 79,54 18,32 14,54 23,04
27229 BC010981: sequência cDNA BC010981 388,39 149,2 438 121,27 178,69 160,1
10371 BC021367: sequência cDNA BC021367 255,84 599,36 133,32 56,72 58,42 9,17
10893 BC022623: sequência cDNA BC022623 784,51 724,29 716,83 301,14 357,98 339,1
28308 BC047219: sequência cDNA BC047219 402,73 298,41 481,25 99,48 304,76 138,3
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
31719 BC052883: sequência cDNA BC052883 3547,69 3957,57 3518,81 3150,9 2830 3065
14991 Bcas2: carcinoma de mama sequência amplificada 2 933,79 898,82 1023,13 656,47 683,52 725,1
4790 Blcap: homólogo de proteína associado ao carcinoma de bexiga (humano) 1031,43 970,72 1005,09 398,98 455,59 428,7
7998 Btf3: fator de transcrição básico 3 1578,04 1824,51 1702,45 1348,1 1356,3 1018
27083 C030048B08Rik: gene RIKEN cDNA C030048B08 408,49 460,05 549,24 205,03 223,41 242,7
31101 C330046E03: proteína hipotética C330046E03 4819,33 3225,07 3559,24 755,8 537,22 920,6
43660 C80008: sequência expressa C80008 387,88 488,55 927,38 95,78 305,61 74,02
41465 C87977: sequência expressa C87977 1813,37 1754,04 1731,6 1381 1479,5 1226
22912 Calcocol: ligação cálcio e domínio coiled-coil 1 551,7 236,85 422,22 259,49 280,12 113,5
8101 Camk2g: proteína quinase II gama dependente de cálcio/calmodulina 336,31 254,03 256,42 116,66 94,65 136,1
11172 Car9: anidrase carbônica 9 471,81 315,93 321,74 92,43 324,34 121,6
270 Carhspl: proteína termicamente estável regulada por cálcio 1 783,29 492,05 805,9 323,58 378,15 367,8
15424 Ccdc102a /// LOC672218: contendo domínio coiled-coil 102A /// similar a CG31638PA 88,88 90,52 37,42 3,07 8,66 4,42
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
4096 Ccdc56: contendo domínio coiled-coil 56 392,74 395,1 319,83 208,46 301,88 148,4
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
22624 Ccdc69: contendo domínio coiled-coil 69 962,65 1366,13 1349,11 634,59 688,1 744
22741 Ccdc69: contendo domínio coiled-coil 69 1132,93 1623,05 1851,99 805,4 1046,3 856
22623 Ccdc69: contendo domínio coiled-coil 69 1050,67 1566,05 1589,84 762,24 1001,9 968,9
16411 Ccni: ciclina I 493,47 644,26 702,9 315,9 404,45 474,9
16410 Ccni: ciclina I 995,58 940,06 798,15 555,77 798,27 475,2
44690 Ccnjl: ciclina similar a J 710,33 626,07 346,33 315,27 210,57 294
329 Cd24a: antígeno CD24a 1205 1433,76 1104,89 719,21 978,74 647,6
6122 Cdc25b: ciclo de divisão celular 25 homólogo B (S, cerevisiae) 1318 1113,87 1472,91 1078,3 923,92 886,1
15802 Cdc9111: CDC91 ciclo de divisão celular 1 similar a 91 (S, cerevisiae) 49,58 345,26 607,45 52,03 65,68 20,93
12970 Cdcal: ciclo de divisão celular associado 1 674,36 667 543,88 296,75 413,81 246,4
42049 Cdk9: quinase dependente de ciclina 9 (quinase relacionada a CDC2) 139,64 199,95 196,21 14,31 19,14 29,4
8112 Cdkal 1: proteína CDK5 associada a subunidade reguladora 1 similar a 1 879,67 767,38 813,54 253,82 513,83 385,5
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
3196 Cebpb: CCAAT/ proteína de ligação ativadora (C/EBP), beta 132 304,11 204,27 35,5 57,66 60,4
19532 Chchd5: contendo domínio coiled-coil-helix coiled-coilhelix 5 220,46 43,46 183,56 95,26 39,57 75,13
21181 Chchd7: contendo domínio coiled-coil-helix coiled-coilhelix 7 143,11 45,85 147,48 54,41 37,61 40,61
14624 Chd4: proteína de ligação 4 DNA cromodomíniohelicase 618,5 949,18 1142,49 391 589,16 319,2
15480 Chd4: proteína de ligação 4 DNA cromodomíniohelicase 1585,68 1818,1 1935,42 1226,8 1598,3 1198
15075 Clu: clusterina 196,31 133,06 97,6 58,66 66,23 26,33
2308 Cml 1: similar a camello 1 47,86 117,93 133,93 4,92 25,59 4,56
14516 Cnot3: complexo de transcrição CCR4-NOT, subunidade 3 796,98 668,81 778,76 366,48 721,23 392,7
3016 Cops7b: homólogo COP9 (fotomorfogenética constitutiva), subunidade 7b (Arabidopsis thaliana) 630,4 592,56 784,56 381,57 313,14 269,3
9970 Csrpl: cisteína e protein rica em glicina 1 592,11 830,02 1000,51 402,09 254,56 515,3
42439 Cxcl l: ligante quimiocina (motivo C-X-C) 1 22,86 80,3 90,94 1,97 4,77 2,02
3504 Cxcl 1: ligante quimiocina (motivo C-X-C) 1 47,52 119,73 89,85 17,25 11,6 15,44
16786 Cxcr4: receptor quimiocina (motivo C-X-C) 4 358,53 513,32 197,69 121,26 183,91 87,45
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
30909 Cyp1la1: citocromo P450, família 11, subfamília a, polipeptídeo 1 258,01 292,08 442,1 107,55 178,36 106,1
41238 Cypt3: theca perinuclear rica em cisteína 3 423,83 155,74 395,11 142,52 146,78 84,29
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
17076 D10Jhu81e: segmento DNA expresso, Chr 10, Universidade Johns Hopkins 81 1166,3 278,18 584,98 41,06 273,73 194,1
21185 D10Wsu102e: segmento DNA expresso, Chr 10, Universidade Wayne State 102 2792,95 2498,66 2814,16 1716,1 1847 1338
31660 D11Ertd497e: segmento DNA expresso, Chr 11, ERATO Doi 497 1363,15 1027,38 1189,28 742,66 758,15 478,8
32944 D130073L02Rik: gene RIKEN cDNA D130073L02 1475,86 1476,22 1683,68 818,11 1061,5 984,4
19130 D14Ertd500e: segmento DNA expresso, Chr 14, ERATO Doi 500 681,58 601,92 716,43 390,44 459,16 256,8
29688 D2Ertd612e: segmento DNA expresso, Chr 2, ERATO Doi 612 319,43 176,06 370,14 220,95 120,36 106
7623 D2Ertd750e: segmento DNA expresso, Chr 2, ERATO Doi 750 394,9 506,08 652,28 243,42 291,26 438
17383 Dbnddl: contendo domínio disbindina (proteína de ligação à distrobrevina 1) 1 464,15 301,44 304,82 104,24 166,01 137,6
41824 Dbxl: devenvolvimento cerebral homeobox 1 276,19 187,2 124,35 38,52 58,77 7,62
6290 Dcpla: enzima de desoperculação 577,73 499,84 520,9 251,84 361,9 184
542 Dctn3: dinactina 3 540,25 352,08 532,14 252,9 202,65 271,3
1811 Ddit3: transcrição induzível a danos no DNA 3 499,34 650,01 844 254,47 351,31 188,1
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
9363 Ddx19a /// Ddx19b: DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) polipeptídeo box 19a /// Dead (Asp-Glu-Ala-Asp) polipeptídeo box 19b 1578,61 1941,12 1533,78 1167,2 1152,7 885,9
2222 Ddx19a: DEAD (Asp-GluAla, Asp) polipeptídeo box 19a 1009,15 1114,59 1292,36 497,39 638,59 587,9
36061 Dgat1: diacilglicerol Oaciltransferase 1 289,38 324,34 39,41 98,71 107,58 55,58
24651 Dhfr: dihidrofolato reductase 426,78 75,47 340,75 63,57 73,72 47,34
16466 Dhrs3: membro desidrogenase/reductase (família SDR) 3 175,77 358,46 397,37 163,62 207,39 44,67
36303 Diras2: família DIRAS, similar a RAS de ligação a GTP 2 83,58 244,42 311,89 57,09 96,41 29,57
14159 Dmpk: proteína quinasedistrofia miotônica 130,39 64,65 251,65 43,94 24,65 45,01
18463 Dnajb5: DnaJ (Hsp40) 173,41 174,8 38,49 23,48 43,07 40,6
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
homólogo, subfamília B, membro 5
1165 Dnalc4: dineína, axonemal, cadeia leve 4 627,08 485,5 527,62 152,51 208,44 124,3
4618 Dscr6: homólogo região crítica síndrome de Down 6 (humano) 364,43 202,42 53,05 100,55 71,25 41,67
14348 Dsp: desmoplaquina 348,74 368,07 172,59 17,12 59,21 37,98
44606 Dynlt3: cadeia leve dineína tipo Tctex 3 1184,16 850,7 1225,34 804,47 862,49 821,8
30501 E130311K13Rik: gene RIKEN cDNA E130311K13 292,14 72,05 149,12 73,07 44,21 47,25
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
1360 Egrl: resposta ao crescimento precoce 1 863,82 594,38 874,96 651,4 743,85 349,3
28198 Ehd2 /// LOC673251: domínio contendo EH 2 /// similar ao domínio contendo EH 2 552,22 499,34 187,9 118,31 170,8 197,3
3769 Ehf: fator ets homólogo 422,95 299,88 362,77 181,23 308,34 201
6059 Eif2ak1: fator de iniciação de tradução eucariótica 2 alfa-quinase 1 601,03 422,26 534,76 313,33 270,08 133,6
22574 Eif2b1: fator de iniciação de tradução eucariótica 2B, subunidade 1 (alfa) 639,36 591,13 452,83 426,81 356,95 299,3
41276 Emx2: homólogos espiráculos nulos 2 (Drosophila) 234,91 298,01 341,22 97,13 165,98 119,9
27167 Faah: hidrolase de ácido graxo amido 147,03 240,15 277,1 108,99 47,52 58,21
316 Fabp5 /// LOC628298 /// LOC637129 /// LOC669559 /// LOC672321: proteína de ligação a ácidos graxos 5, epidérmica /// similar à proteína de ligação a ácidos graxos, epidérmica (E FABP) (homólogo de proteína de ligação a ácidos graxos associada a psoríase) (PA-FABP) (proteína de ligação a lipídios queratinócitos) /// similar à proteína de ligação a ácidos graxos, epidérmica (E-FABP) (homólogo de proteína de ligação a ácidos graxos associada a psoríase) (PA-FABP) ((proteína de ligação a lipídios queratinócitos) /// similar à proteína de ligação a ácidos graxos, epidérmica (E-FABP) (homólogo de proteína de ligação a ácidos graxos associada a psoríase) (PA-FABP) (proteína de ligação a lipídios queratinócitos) /// similar à proteína de ligação 1266,08 1469,82 1868,49 809,42 1034,2 1028
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 147/373
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
a ácidos graxos, epidérmica (E-FABP) (homólogo de proteína de ligação a ácidos graxos associada a psoríase) (PA-FABP) (proteína de ligação a lipídios queratinócitos)
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
317 Fabp5: proteína de ligação a ácidos graxos 5, epidérmica 436,27 439,2 537,34 241,63 390,24 301,4
1371 Fabp9: proteína de ligação a ácidos graxos 9, testículo 409,89 270,29 333,46 189,49 58,21 125,5
38293 Fank1: fibronectina tipo 3 e domínios anquirina repetidos 1 2043,72 1333,16 2424,93 1297,9 895,96 1029
38294 Fankl: fibronectina tipo 3 e domínios anquirina repetidos 1 924,97 617,49 1115,41 530,43 486,47 334,5
28859 Fbxw14 /// LOC668758 /// LOC673189: F-box e WD 40 proteína do domínio 14 /// similar a F-box e WD-40 proteína do domínio 14 /// similar a F-box e WD-40 proteína do domínio 14 1689,47 1449,1 1379,4 771,7 977,11 774
17631 Fetub: fetuína-beta 339,98 98,9 176,78 28,16 22,02 28,89
18896 Fgf1: fator de crescimento fibroblástico 1 681,86 369,41 720,7 327,77 349,5 445,6
16430 G6pdx: glicose-6-fosfato desidrogenase ligada por X 1968,98 1787,51 2156,26 787,91 1751,9 1060
20610 Galm: galactose mutarotase 325,39 308,96 339,4 107,5 239,54 178,8
32346 Gas211: interrupção crescimento específico 2 similar a 1 161,84 235,35 19,91 17,07 61,3 43,92
12777 Gchl: GTP ciclohidrolase 1 398,77 412,01 533,59 236,21 254,72 224,9
38302 Ghitm: proteína transmembrana induzível por hormônio de crescimento 167,4 64,72 61,47 5,07 13,4 2,06
27801 Gm129: modelo genético 129, (NCBI) 962,68 506,38 860,85 158,2 317,4 272,4
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
31138 Gm1568: modelo genético 1568, (NCBI) 543,23 1089,27 807,32 324,93 568,66 388,6
16058 Gm428 /// LOC623180 /// LOC623197 /// LOC623210 /// LOC623219: modelo genético 428, (NCBI) /// hipotética LOC623180 /// hipotética LOC623197 /// hipotética LOC623210 /// hipotética LOC623219 1914,89 1546,15 1987,58 718,98 1301,8 938
17875 Gna14: proteína de ligação ao nucleotídeo guanina, alfa 14 300,19 342,97 390,91 109,58 273,46 141,3
27857 Gnaz: proteína de ligação ao nucleotídeo guanina, Subunidade alfa z 291,26 148,83 411,78 101,45 157,63 114,7
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
3764 Gnb4: proteína de ligação ao nucleotídeo guanina, beta 4 800,06 500,22 743,39 483,85 537,75 253,1
1723 Gng3: proteína de ligação ao nucleotídeo guanina (proteína G), subunidade gama 3 1141,11 1006,13 938,92 376,96 611,22 390,9
38463 Gng4: proteína de ligação ao nucleotídeo guanina (proteína G), subunidade gama 4 29,31 68,46 318,22 20,93 10,51 15,87
14851 Gng5: proteína de ligação ao nucleotídeo guanina (protein G), subunidade gama 5 751,62 1021,23 1032,02 380,3 617,1 541,3
19438 Gprc5b: receptor acoplado à proteína G, família C, grupo 5, membro B 306,88 118,93 6,69 4,77 9,28 5,32
14609 Grina: receptor de glutamato, ionotrópico, proteína associada a N-metil Dasparato 1 (ligação ao glutamato) 1034,42 812,15 1228,38 477,25 540,8 546,5
15539 Gm: granulina 1352,59 514,79 1057,39 324,87 349,47 237,6
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
21945 Gm: granulina 1042,32 422,35 831,7 282,08 293,46 176,8
44280 Gyg: glicogenina 1636,36 1537,64 1912,79 587,38 955,09 642,4
16505 Gyg: glicogenina 1843,18 1329,97 1474,57 451,38 788,27 545
21695 Hadhsc: L-3-hidroxiacil coenzima A desidrogenase, cadeia curta 176,86 172,31 47,15 7,97 25,17 8,67
20748 Hba-al: hemoglobina alfa, cadeia adulta 1 145,01 91,26 185,79 31,03 31,41 48,27
34409 Hdlbp: proteína de ligação a lipoproteínas de alta densidade (HDL) 65,43 20,02 222,9 4,86 15,41 2,9
21722 Hess: pilosos e ativadores de separação 5 (Drosophila) 77,81 670,65 255,74 37,89 6,51 4,11
14548 Hes6: pilosos e ativadores de separação 6 (Drosophila) 874,59 449,21 52,72 14,43 115,08 53,85
294 Heyl: pilosos/ativadores de separação relacionados com YRPW motivo 1 782,14 951,79 1330,97 370,68 579,38 458,1
40573 Hist2h2be: histona 2, H2be 45,26 112,92 234,65 9,51 47,79 32,3
15290 Hkl: hexoquinase 1 97,53 40,72 292,16 23,48 13,09 10,02
1997 Hnmt: histamina N metiltransferase 291,41 218,29 287,13 133,75 161,6 140,3
20448 Hoxa3: homeobox A3 67,37 168,06 195,07 30,43 54,67 3,04
38029 Hspa12a: proteína de choque térmico12A 99,91 395,12 430,36 63,95 34,34 2,89
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
20415 Hspa1a: proteína de choque térmico 1A 665,51 521,22 682,91 384,53 418,07 300,9
20345 Hspa1b: proteína de choque térmico 1B 1356,32 1044,04 604,27 612,34 519,36 458,8
11286 Hspa1b: proteína de choque 603,12 550,63 273,69 292,64 253,66 243,1
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
térmico 1B
1396 Hspa2: proteína de choque térmico 2 1671,68 1450,86 1466,81 768,33 1325,6 888
3507 Icosl: ligante icos 698,31 470,26 803,79 259,27 478,54 329,9
14244 1d2: inibidor de ligação ao DNA 2 159,2 175,61 225 87,31 76,02 44,55
3942 Ier3: resposta precoce imediata 3 135,39 282,8 200,44 43,45 88,87 51,5
5812 Igh-VJ558 /// LOC238447 /// L00544903 /// L00544907: cadeia pesada da imunoglobulina (família J558) /// similar à região variável da cadeia pesada da imunoglobulina /// similar à cadeia mu da imunoglobulina /// similar à cadeia pesada do anticorpo monoclonal anti-poli(dC) 796,82 447,15 483,63 357,22 539,3 266,5
18787 Ing3: família do inibidor de crescimento, membro 3 797,55 862,17 1017,87 636,48 680,07 589
40325 Insig1: gene induzido por insulina I 2692,54 2321,16 2684,68 1690,3 1802,6 1778
16512 lrf1: fator regulador de interferon 1 789,3 575,41 867,38 269,32 522,82 348,8
2812 Irx3: homeobox relacionado a iroquois 3 (Drosophila) 348,55 332,29 138,19 5,68 121,77 63,47
18056 Itga9: integrina-alfa 9 602,24 988,31 1038,91 552,93 662,74 418,5
1704 Jun: oncogene jun 824,08 580,75 436,92 74,84 119,42 26,57
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
38760 Kalrn: calirina, RhoGEF quinase 455,34 326,78 526,39 276,27 277,62 210,1
17540 Kcnq 1: canal fechado de tensão de potássio, subfamília Q, membro 1 253,97 94,35 476,89 62,84 42,18 56,37
38646 Kifl3a: membro da família cinesina 13A 341,25 421,32 771,62 218,81 258,08 529
25517 Kif24: membro da família cinesina 24 338,53 277,95 398,92 132,82 85,27 159,4
16345 K1h113: similar a kelch 13 (Drosophila) 1515,8 1527,54 1239,11 1454,6 785,49 962,1
13958 Ldhb: lactato desidrogenase B 2740,69 2312,29 3295,47 1762 2507 1685
5980 Ldlr: receptor de lipoproteína de baixa densidade 335,33 308,94 424,04 117,76 245,41 172
29964 Ldlrad3:Domínio de classe A receptor de lipoproteína de baixa densidade contendo 3 349,24 268,52 370,69 153,24 103,08 147,7
916 LIg11: homólogo 1 de larva gigante letal (Drosophila) 1297,45 1170,92 1328,72 919,12 927,65 845
21355 Lmo7: apenas domínio LIM 7 2299,11 2393,96 2530,26 1703,4 2212,2 1824
32615 LOC240444: Similar a membro 2 de subfamília G de canal dependente de voltagem de potássio (subunidade Kv6.2canal de 218,5 275,91 425,72 86,21 127,38 61,45
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 150/373
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
potássiodependente de voltagem)(subunidade de canal de potássio cardíaco)
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
14891 L00545161 /// LOC637273: similar a Peroxirredoxina 1 (Tiorredoxina peroxidase 2) (peróxido redutase 2 Tiorredoxina-dependente) (fator osteoblastoespecífico3) (OSF-3) (proteína de estresse de macrófago de 23 kDa) /// similar a Peroxirredoxina-1 (Tiorredoxina peroxidase 2) (peróxido redutase Tiorredoxina dependente 2) (fator osteoblastoespecífico3) (OSF-3) (proteína de estresse de macrófago de 23 kDa) 1517,86 1912,84 1961,88 1213,5 1373,7 1085
19912 L00574530: metalotioneína 1K 226,98 259,54 118,5 143,89 63,21 9,37
34813 LOC627488 /// LOC627520 /// LOC667692 /// LOC667695 /// LOC673990: similar a subunidade 4 de complexo THO (Tho4) (RNA e proteína de ligação 1 a fator de exportação) (REF1-I) (Unido a AML-1e LEF-1) (Aly/REF) /// similar a subunidade 4 de complexo THO (Tho4) (RNA e proteína de ligação 1 a fator de exportação) (REF1-I) (Unido a AML-1 e LEF-1 ) (Aly/REF) /// similar a subunidade 4 de complexo THO (Tho4) (RNA e proteína de ligação 1 a fator de exportação) (REF1-I) (Unido a AML-1 e LEF-1 ) (Aly/REF) /// similar a subunidade 4 de complexo THO (Tho4) (RNA e proteína de ligação 1 a fator de exportação) 1) (REF1-I) (Unido a AML-1 e LEF-1 ) (Aly/REF) /// similar a subunidade 4 de complexo THO (Tho4) (RNA e proteína de ligação 1 a fator de exportação) (REF1-I) (Unido a AML-1 e LEF-1 ) (Aly/REF) 3712,88 3330,05 4059,81 2547,1 3079,4 2572
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 151/373
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
36676 LOC665521 /// LOC665546 /// LOC665755 /// LOC666203: similar a membro da família PRAME 8 /// similar a membro da família PRAME 8 /// similar a membro da família PRAME 8 similar a membro da família PRAME 8 1690,74 1078,83 1867,35 435,93 1040,6 413,3
35372 LOC666806: similar ao fator de iniciação de translação eucariótica ligado a X 1A 1437,33 1258,08 1431,69 830,47 904,29 911,7
23907 LOC677447: similar a RIKEN cDNA similar a 5730590G19 169,23 96,13 289,52 47,67 49,17 46,11
2237 Lypd3: domínio Ly6/Plaur contendo 3 398,36 354 401,18 228,49 210,36 118,7
22323 Lysmd3: LysM, domínio de ligação com peptodoglicano putativo contendo 3 453,85 368,82 661,12 92,84 321,95 197,1
14392 Marcksll /// LOC673071: MARCKS-like 1 /// similar a proteína relacionada a MARCKS (similar a proteína relacionada a MARCKSI) (substrato quinase C rico em alcalina macrófago demiristoilada) (MacMARCKS) (MacMARCKS) (protein do cérebro F52) 1185,33 1143,21 1024,39 984,94 699,06 786,1
14326 Marcksl 1: similar a MARCKS1 1090,15 1065,54 915,39 902,84 654,38 711,6
9962 Mbd2: proteína do domínio de ligação metil-CpG 705,4 147,62 1019,73 112,36 370,48 107,5
1105 Meal: antígeno masculino acentuado 542,92 668,6 745,81 373,15 443,27 291,3
14305 Mm.10009.3 245,87 217,16 188,38 53,3 153,42 55,43
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
43719 Mm.150985.1 393 518,17 908,05 363,36 370,12 406,2
4333 Mm.25004.1 145,84 123,93 76,52 26,6 44,95 15,88
9278 Mm.37131.1 290,79 409,6 147,87 153,64 67,38 113,6
38596 Mm.45490.1 458,52 300,11 583,52 157,64 158,29 215,6
22096 Mm.69144.1 564,45 289,9 595,48 130,38 120,9 231,2
21487 Mm.9772.3 207,88 220,36 148,09 29,05 85,16 103,9
8468 Mocs2: síntese de cofator milibidênio 2 451,72 641,1 548,64 204,64 269,88 172,8
29403 Mrp19: proteína ribossomal mitocondrial L9 687,37 522,93 342,88 378,66 145,59 253,6
6034 Mrps23: proteína ribossomal mitocondrial S23 189,41 237,99 295,52 122,32 119,68 82,57
44561 Mrps23: proteína ribossomal mitocondrial S23 133,78 165,37 174,49 82,76 82,15 57,97
18672 Mt4: metalotioneína 4 471,49 401,25 465,5 283,03 160,15 374,6
8584 Mtap: metiltioadenosina fosforilase 301,33 399,52 615,48 133,87 304,21 110,8
3549 Mthfd2: 983,54 1203,2 1182,24 590,25 760,27 536,8
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
metilenetetrahidrofolato desidrogenase (dependente de NAD+), metilenetetrahidrofolato ciclohidrolase
27588 Mxdl: proteína de dimerização MAX 1 993,73 911,74 644,1 466,93 617,29 512,7
6161 Mxdl: proteína de dimerização MAX 1 181,67 333,48 504,31 168,5 123,99 172,7
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
20325 Myo5b: miosina Vb 768,64 656,09 488,09 409,12 389,77 359
29664 Myom2: miomesina 2 1192,6 1602,71 1540,02 1131,7 1059,7 972
28881 Nalp4f: NACHT, repetição rica em leucina e PYD contendo 4F 2150,11 2492,25 2718,12 1515,2 1789,6 1160
11528 Nalp6: NACHT, repetição rica em leucina e PYD contendo 6 317,78 138,89 39,96 17,77 77,33 22,29
41896 Nalp9b: NACHT, LRR e PYD contendo proteína 9b 743,42 818,13 815,08 320,66 556,55 474,3
18033 Ncoa4 /// LOC627557: Coativador de recepção nuclear 4///similar ao coativador de recepção nuclear 4 552,62 540,61 580,1 250,08 280,29 212,8
21797 Ndrgl: gene regulador descendente N-myc 1 760,12 747,8 336,89 280,11 487,1 357,4
4919 Ndrl: similar a regulador descendente N-myc 1 442,34 476,68 210,38 300,65 162,3 171,9
10414 Nefl: neurofilamento, polipeptídio leve 1726,22 1655,4 1459,28 902,95 1121 600,9
2584 Nes: nestina 259,68 196,54 282,1 75,72 199,89 71,08
6998 Neurog2: neurogenina 2 231,05 418,13 218,55 123,46 78,36 80,47
9918 Nobox: NOBOX oogênese homeobox 396,92 408,09 475,01 129,03 371,41 87,59
17216 Nudcd2: domínio contendo NudC 2 1083,58 1300,17 1922,19 656,24 404,23 762,1
2861 Nudcd2: domínio contendo NudC 2 653,94 528,12 803,02 415,16 310,05 389,2
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
3960 Nuprl: proteína nuclear 1 312,62 225,23 176,51 47,1 36,87 54,82
3961 Nuprl: proteína nuclear 1 208,1 133,13 133,4 11,64 27,13 47,78
2981 Oaslc: 2'-5' sintetase de oligoadenilato 1C 1384,52 1483,79 1747,71 600,25 1009 720,6
1142 Oas 1 d /// Oas le: 2'-5' sintetase de oligoadenilato ID /// 2'-5' sintetase de oligoadenilato 1E 2035,81 1982,09 2708,21 777,35 1074,7 732,5
19318 Obfc2b: dobramento de ligação a oligonucleotídeos/ oligosacarídeos contendo 2B 433,1 115,04 679,94 161,64 146 98,16
10199 Odf2: fibra densa exterior do flagelo2 1037,05 1156,32 1111,85 662,64 858,1 614
22813 Osbp2: proteína de ligação oxisteriol2 269,05 335,57 568,18 144,89 117,87 130,8
43535 Pak7: P21 (CDKN1A)- 394,46 1076,97 817,61 505,83 477,53 544
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
quinase ativada 7
41333 Paqr5: progestina membro da família receptor adipoQ V 724,43 758,22 613,93 502,88 471,52 563,1
849 Pdliml: PDZ e domínio LIM 1 (elfina) 300,99 412,46 570 141,35 241,6 138,6
41503 Pex10 /// LOC668173 /// LOC671348: fator de biogênese de perixoma 10 /// similar a fator de biogênese de perixoma 10 isoforma 1 /// similar a proteína de agrupamento de perixoma 10 (Peroxina-10) (fator de biogênese de perixoma 10) (proteína de dedo RING 69) 280,61 206,54 96,17 72,22 80,02 54,72
12239 Pgam5: membro da família fofoglicerato mutase 5 110,6 127,3 151,21 91,12 15,55 11,93
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
6474 Phkgl: fosforilase quinase gama 1 178,41 106,98 171,74 40,05 80,47 88,56
4052 Pitpnm2:proteína de transferência fosfatidilinositol, associado a membrana 2 84,85 63,94 331,06 11,48 54,66 9,66
19362 Plac8: específico para placenta 8 662,3 661,38 795,38 468 575,56 338,1
20205 Plecl /// LOC671535: plectina 1 /// similar a poli (ADP ribose) família polimerase, membro 10 121,35 70,86 157,14 22,86 52,58 29,9
27915 Plekhgl: domínio de homologia com pleckstrin a contendo, família G (com domínio RhoGef) membro 1 1853,45 1666,06 1893,1 1079,7 1334,2 984
11164 Plk2: similar a polo quinase 2 (Drosophila) 498,11 383,42 423,89 177,35 110,99 143,6
15242 Pofut2: proteína Ofucosiltransferase 2 1778,06 1154,32 2374,19 882,1 1201,9 822,3
14202 Pofut2: proteína Ofucosiltransferase 2 841,36 629,59 1545,03 432,55 580,35 395,1
10997 Pold3: polimerase (direcionada DNA), delta 3, subunidade acessório 1231,65 1183,23 1391,33 824,72 900,21 640,4
34590 Pold3: polimerase (direcionada DNA), delta 3, subunidade acessório 423,34 669,16 843,98 290,44 334,78 246,5
38961 Ppplr3d: proteína fosfatase 1, subunidade regulatória 3D 575,14 503,37 526,53 166,64 221,68 213,9
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
36182 Ppp4c: proteína fosfatase 4, Subunidade catalítica 571,66 453,52 340,78 131,19 406,4 205,3
14726 Prdx1: peroxiredoxina 1 2781,18 3417,86 3506,42 2190,9 2626,8 2285
14063 Prdx1: peroxiredoxina 1 2078,16 2456,52 2879,78 1833,6 1734,2 1642
13692 Prdx1: peroxiredoxina 1 1982,74 2435,22 2494,71 1597,2 1890,1 1553
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
295 Prdx1: peroxiredoxina 1 687,71 1005,25 1004,39 538,28 643,24 491,2
12996 Prdx2: peroxiredoxina 2 2137,92 1606,1 1921,64 1079,9 1587,9 1273
2801 Prdx2: peroxiredoxina 2 3503,34 3323,1 3762,91 2292,1 2644,3 1942
42136 Prmt3: proteína arginina N metiltransferase 3 165 52,27 96,5 11,63 3,78 14,62
2615 Prss8: protease, serina, 8 (prostasina) 471,01 140,12 249,79 75,51 130,38 26,33
8719 Pstpipl: prolina-serina treonina fosfatase proteína de interação 1 44,1 110,11 91,14 10,97 19,4 25,08
43158 Ptdss2: fosfatidilserina sintase 2 1203,34 418,9 557,48 508,13 304,61 307,9
41102 Rab3gapl: RAB3 GTPase Subunidade de proteína de ativação 1 460,17 347,13 470,57 199,81 233,06 254,1
16961 Rap2b: RAP2B, membro da família oncogene 808,09 565,99 369,3 354,3 287,58 166,3
8013 Rash 1 lb: similar a RAS, família 11, membro B 426,89 253,01 172 67,51 155,36 83,97
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
16931 Rassfl: associação Ras (RaIGDS/AF-6) família domínio 1 551,69 251,68 515,62 171,98 181,71 219,6
6797 Rassf5: associação Ras (RaIGDS/AF-6) família domínio 5 720,77 665,14 560,86 336,47 286,71 262,6
19264 Rbm7: RNA proteína de ligação principal 7 1311,84 1104,68 1399,09 852,61 1194,9 761,2
30077 Rbpsuh: recombinação de proteína de ligação supressora de hairless (Drosophila) 229,78 181,62 164,15 47,11 63,14 54,63
17285 Rdh11: retinol desidrogenase 11 266,28 352,96 301,12 131,17 93,27 93,1
3831 Rela: v-rel reticuloendoteliose viral homólogo oncogene A (aviário) 1165,05 845,26 817,64 573,79 604,68 707
19286 Rexo2: REX2, RNA exonuclease 2 homólogo (S. cerevisiae) 496,13 531,04 541,91 329,27 450,19 238
3543 Rgs2: regulador de sinalização de proteína G 2 982,72 955,41 1090,21 552,53 601,28 456,3
3542 Rgs2: regulador de sinalização de proteína G 2 755,61 753,62 945,56 289,77 380,15 277,6
38623 Rgs2: regulador de sinalização de proteína G 2 439,17 401,76 570,74 252,29 232,03 224,9
40641 Rndl: família Rho GTPase 1 341,36 140,63 50,42 22,78 40,06 50,85
996 Rnd3 família Rho GTPase 3 236,49 269,23 240,29 57,64 90,84 104,7
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
995 Rnd3: família Rho GTPase 3 346,48 273,15 396,01 104,43 242,51 112,8
44629 Rnf185: proteína ring finger 185 3391,02 3265,6 3308,22 2163,5 2326,9 1837
19135 Rnf185: proteína ring finger 185 3100,72 2881,41 3164,78 1942 2217,8 1890
19484 Sc5d: esterol-05-desaturase 156,19 125,87 470,87 12,69 92,23 44,12
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
(ERG3 fungal, delta-5desaturase) homólogo (S. cerevisae)
21214 Scarb2: receptor de depurador classe B, membro 2 412,98 136,41 11,58 17,91 8,27 79,58
14524 Sdhc: complexo de desidrogenase sucinato, subunidade C, proteína de membrana integral 655,46 629,8 569,58 133,4 248,7 128
16404 Sh3bp2: protein de ligação de domínio SH3 939,44 869,33 963,81 543,92 577,31 563,7
11436 Sixl: homeobox relacionada a sine oculis 1 homólogo (Drosophila) 890,55 896,49 591,29 257,89 404,29 126,8
16644 Slc20al: família portadora de soluto 20, membro 1 755,61 816,13 1040,94 591,52 587,71 537,5
5126 Slc25a15: família portadora de soluto 25 (transportador ornitina portador mitocondrial), membro 15 2097,82 2285,89 2519,54 1552,6 1649,2 1444
42635 Slc7a14: família portadora de soluto 7 (transportador de aminoácido catiônico,sistema y+), membro 14 850,08 861,15 971,47 367,62 635,72 604,9
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
15341 Slc9a3r1: família portadora de soluto 9 (permutador de sódio/hidrogênio), isoforma 3 regulador 1 1945,59 1874,86 1042,14 1213,4 1279,4 924,9
15340 Slc9a3r1: família portadora de soluto 9 (permutador de sódio/hidrogênio), isoforma 3 regulador 1 1511,18 1791 882,39 908,38 1070,8 773,7
29662 Slco4al: família portadora de soluto transportador de ânion orgânico, membro 4a1 1518,9 1099,65 758,84 781,47 590,77 472,9
22832 Smurf1 /// LOC640390: proteína ligase 1 de ubiquitina U3 específica para SMAD /// similar a fator regulatório 1 de ubiquitinação de Smad (Ubiquitina--proteína ligase SMURF1) (ubiquitina ligase E3 Smad-specífica 1) (hSMURF1) 353,27 405,72 431,46 185,4 183,4 173,3
7515 Snap29: proteína associada à sinaptossomo 1533,29 1209,31 1300,59 1097,4 921,79 856,9
15156 Snord22: pequeno RNA nucleolar RNA, C/D box 22 244,55 88,91 292,33 138,36 78,77 71,21
10772 Snrpb2: ribonucleoproteína B pequena nuclear U2 1280 1540,43 1365,87 675,42 748,01 668,4
20449 Snrpb2: ribonucleoproteína B pequena nuclear U3 1101,45 1113,13 1328,87 444,18 372,6 458,6
1262 Sox2: gene 2 contendo 258,38 397,22 227,54 100,5 112,85 106,8
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
SRY-box
7733 Srd5a2l:similar a esteroide 5 alfa-redutase 2 951,51 803,16 917,18 539,46 538,83 573,3
37863 Ssr3: receptor de sequência sinal, gama 878,88 551,79 1339,32 496,85 533,72 503,9
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
17274 St3gal5: ST3 betagalactosídeo alfa-2,3sialiltransferase 5 585,5 294,61 591,89 101,96 252,48 156
10512 Stat6: transdutor de sinal e ativador de transcrição 6 280,93 369,43 537,91 177,71 247,51 140,3
5687 Surf5: gene surfeit 5 808,83 625,57 901,86 425,58 600,45 367,5
16783 Taf13: RNA polymerase II TAF13 , fator associado a proteína de ligação à TATA box (TBP) 2786,83 2273,04 2785,38 1860,7 2037,4 1751
14515 Taok3: TAO quinase 3 840,36 751,13 664 644,14 406,28 520,9
21642 Tax1bp3 /// Rpl13: proteína de ligação 3 de Tax1 (vírus tipo I de leucemia de célula T humana) /// proteína ribossomal L13 871,73 903,94 1048,44 382,12 394,43 282,3
502 Taz: tafazina 510,91 478,79 738,95 285,8 194,27 193,5
6617 Tcl1: ponto de quebra 1 de linfoma de célula T 4221,74 3745,3 4210,23 2520,7 3350,8 3381
19537 Thedc1: contendo domínio de tioesterase 1 749,49 760,8 818,91 422,7 601,57 400,7
20152 Thrap3: proteína associada 3 a receptor de hormônio tireoidiano 308,4 324,33 307,94 159,33 140,04 211,4
16803 Tle6: intensificador de split 6 similar à transducina, homólogo de Drosophila E(spl) 1270,14 833,99 1229,7 374,24 654,97 691,3
15195 Tm2d2: contendo domínio TM2 - 2 934,68 572,01 641,41 527,63 320,67 388,1
21204 Tmed10 /// LOC634748: proteína de tráfego 10 (levedura) similar à emp24 transmembrana /// similar a proteína de tráfego transmembrana 371,69 689,99 932,01 227,36 344,45 312
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
15880 Tmed10 /// LOC634748: proteína de tráfego 10 (levedura) similar à emp24 transmembrana /// similar a proteína de tráfego transmembrana 293,24 526,59 744,83 183,86 260,8 259
15864 Tmed10 /// LOC634748: proteína de tráfego 10 (levedura) similar à emp24 transmembrana /// similar a proteína de tráfego transmembrana 325,23 522,46 807,94 214,86 292,41 263,9
21746 Tmem109: proteína transmembrana 109 658,76 639,21 690,17 367,58 528,21 245,5
14887 Tmem 109: proteína de transmembrana109 827,27 787,55 910,96 487,81 701,24 347,9
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
8336 Tmem38a: proteína de transmembrana 38a 965,95 199,02 508,25 119,7 369,44 96,15
10674 Torla: família torsina 1, membro A (torsina A) 1760,16 1607,94 1566,85 1294,5 1207 1120
7470 Tpbg: glicoproteína de trofoblasto 135,67 173,87 65,62 38,44 9,01 28,02
20812 Tpil: Isomerase de trisefosfato 1 723,43 510,71 278,29 243,4 202,66 199,6
22085 Lócus transcrito 244,72 168,35 553,92 235,2 92,48 72,5
43618 Lócus transcrito 1331,08 1132,84 759,97 700,03 776,17 653,8
30279 Lócus transcrito 115,59 77,5 3,01 1 6,1 4,39
31948 Lócus transcrito 948,04 695,42 1011,76 481,07 569,52 551,4
36521 Lócus transcrito 163,5 288,96 275,95 153,58 132,29 129
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
14557 Lócus transcrito, moderadamente similar a XP_574723.1 PREVISÃO: similar a LRRGT00097 [Rattus norvegicus] 389,93 446,02 354,24 146,9 73,38 178,6
31203 Lócus transcrito, moderadamente similar a XP_417295.1 PREVISÃO: similar a proteína TAF3 [Gallus gallus] 833,28 557,28 868,7 344,25 284,45 400,2
16554 Trfp: Trf (fator de ligação relacionado a proteína TATA) homólogo de proteína aproximado (Drosophila) 1346,13 1510,81 1419,34 707,69 420,35 502,5
11566 Trip11:integrador receptor de hormônio da tiroide 11 259,32 592,74 496,79 341,11 199,04 280
39305 Troap: proteína associada a trofina 208,07 262,5 390,33 82,47 98,83 71,69
8651 Trpc2: canal de cátion potencial receptor transiente, subfamília C, membro2 1159,04 683,82 924,49 504,31 574,63 394,4
17247 Ttk: quinase de proteína Ttk 442,51 328,09 595,94 156,99 233,89 156,6
20704 Tubb2b: tubulina, beta 2b 2089,18 1881,38 2187,75 1223,2 1598,2 1370
1904 Ube2a: ubiquitina conjugadora de enzima E2A, RAD6 homólogo (S. cerevisiae) 668,24 817,55 665,53 322,75 424,91 331,9
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
6873 Ube2i /// L00546265 /// LOC669417: ubiquitina conjugadora de enzima E2I /// similar a Cadeia A, ubiquitina humana conjugadora de enzima Ubc9 /// similar a ubiquitina conjugadora de enzima E2 I (Ubiquitinprotein ligase I) (proteína carregadora de ubiquitina I) (SUMO-1-proteína ligase) 881,06 714,36 770,75 667,98 572,39 299,1
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
(SUMO-1-enzima de conjugação) (ubiquitina conjugadora de enzima UbcE2A)
34066 Ube2w: ubiquitina conjugadora de enzima E2W (putativa) 257,73 223,92 304,28 83,65 208,87 56,27
30305 Umodl 1: similar a uromodulina 1 918,71 1173,24 1195,72 468,99 479,34 394,6
27170 Unc5a: unc-5 homólogo A (C. elegans) 251,93 17,43 149,64 24,49 31,01 22,93
18877 Vi12: villin 2 241,97 205,21 109,2 76,45 75,17 88,63
36640 Wdr27: WD domínio repetido 27 258,28 184,34 219,19 117,86 87,15 48,94
40438 Wdr40b: WD domínio repetido 40B 412,95 601,38 440,4 258,01 180,34 165,1
20216 Wdr82: WD domínio repetido contendo 82 930,14 666,97 795,89 478,36 548,79 548,8
44710 Wfdc3: WAP domínio de núcleo quarto-disulfida 3 840,41 352,61 513,04 317,4 228,96 204,5
4516 X1 r3a /// X1 r3b /// MGC76689: regulado por linfócito ligado a X 3A /// regulado por linfócito ligado a X 3B /// proteína hipotética LOC574437 360,83 588,71 622,92 230,28 410,11 221,9
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
6776 Xmr /// L00546272 /// LOC619991 /// LOC664810 /// LOC664861 /// LOC664877 /// LOC664890 /// LOC664906 /// LOC664923 /// LOC664944 /// LOC664989: proteína Xmr /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar à proteína 3 do complexo Sinaptonemal (SCP-3) /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose///similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose 402,45 431,9 419,31 132,31 243,77 319
6777 Xmr /// L00546272 /// LOC619991 /// LOC664810 /// LOC664861 /// LOC664877 /// LOC664890 416,14 408,25 408,94 135,94 270,28 290,5
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Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
/// LOC664906 /// LOC664923 /// LOC664944 /// LOC664989: proteína Xmr /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose /// similar à proteína 3 do complexo Sinaptonemal (SCP-3) /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose ///similar to Xlrrelated, meiosis regulated /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose ///similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose
15133 Ywhaq: tirosina 3monooxigenase/triptófano 5 protein de ativação de monooxigenase, teta polipeptídeo 823,51 1230,44 1166,2 689,41 787,92 682,6
Coluna Gene Oct4.1 Oct4.2 Oct4.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3
14866 Ywhaz: tirosina 3monooxigenase/triptófano 5 protein de ativação de monooxigenase, zeta polipeptídeo 1349,62 789,35 427,74 385,13 670,02 394,3
27398 Zarl: retenção de zigoto 1 308,67 302,35 296,84 96,91 62,32 61,6
8460 Zfp219: proteína dedo de zinco 219 362,85 474,33 421,09 139,56 154,27 248,9
15729 Zfp3612: proteína dedo de zinco 36, C3H tipo similar a 2 1493,92 1568,61 1661,69 1083,2 1187,2 1122
20879 Zfp422-rsl: proteína dedo de zinco 422, sequência relacionada 807,14 637,1 963,93 639,73 531,32 551,3
24731 Zfp444: proteína dedo de zinco 444 153,25 73,77 591 9,86 2,23 35,58
7994 Zfp503: proteína dedo de zinco 503 499,68 1344,57 631,84 248,83 28,76 97,85
7995 Zfp503: proteína dedo de zinco 503 201,34 138,04 36,43 20 36,65 32,65
44691 Zfp68: proteína dedo de zinco 68 836,97 770,67 353,93 367,82 511,34 379,8
8911 Zfp71-rs1: proteína dedo de zinco 71, sequência relacionada 1 118,31 304,51 288,84 100,79 115,62 155,5
17202 Zfp90: proteína dedo de zinco 90 148,51 168,8 284,96 41,22 44,14 22,58
1832 Zmat2: dedo de zinco, tipo matrin 2 271,97 245,47 570,3 68,8 63,18 133,6
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Tabela 8A - continuação
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1256 0610039J04Rik: 405, 335, 516, 1,6824811 0,0479674 0,094241 11,41
1 gene RIKEN cDNA 0610039J04 8 4 8 63 8 19 21
1770 0610040J01Rik: 50,4 95,6 57,8 3,1081175 0,0273109 0,060035 19,37
2 gene RIKEN cDNA 0610040J01 6 2 9 59 24 01 13
1429 1110007M04Rik: 514, 528, 552, 1,6436082 0,0475352 0,091745 11,95
7 gene RIKEN cDNA 1110007M04 8 3 7 15 11 89 66
2377 1300003B13Rik: 233, 199, 273, 1,7613953 0,0477787 0,092886 11,64
4 gene RIKEN cDNA 1300003B13 5 1 9 46 09 28 52
2769 1500005A01Rik: 60,4 32,4 37,6 2,8588821 0,0480854 0,091875 12,01
gene RIKEN cDNA 1500005A01 3 3 5 97 85 93 61
2281 1500011B03Rik: 91,8 188, 110, 3,3323956 0,0284463 0,060218 19,62
6 gene RIKEN cDNA 1500011B03 3 2 6 87 89 82 18
2289 1500041J02Rik: 106 101 1102 1,5152559 0,0468343 0,091803 11,87
7 gene RIKEN cDNA 1500041J02 6 7 95 45 99 67
3927 1700013H16Rik: 215 215, 339, 1,8840570 0,0456349 0,084907 12,95
3 gene RIKEN cDNA 1700013H16 7 4 91 21 41 79
3937 8 1700080016Rik /// LOC665895 /// LOC671223 /// LOC676479: RIKEN cDNA 1700080016 gene /// similar à família de antígeno de melanoma A,5 /// similar à família de antígeno de melanoma A,5 /// similar à família de antígeno de melanoma A,5 4,95 4,98 14,2 4 10,216106 67 0,0104166 67 0,0375 38,90 31
2599 3 1700129I15Rik: gene RIKEN cDNA 1700129I15 8,11 130, 2 9,06 3,7065015 27 0,0324149 11 0,069162 61 16,83 02
1469 1810021J13Rik: 26,0 36,5 61,8 3,1919537 0,0325732 0,069104 16,85
gene RIKEN cDNA 1810021J13 9 5 5 91 9 23 74
3885 1810044A24Rik: 90,6 104, 122, 2,2665827 0,0444015 0,086621 12,71
3 gene RIKEN cDNA 1810044A24 3 2 7 24 44 62 89
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1288 2010301N04Rik: 44,8 53,4 47,0 3,5877339 0,0235602 0,057582 21,16
3 gene RIKEN cDNA 2010301N04 3 2 3 26 09 9 02
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
4342 2410022L05Rik: gene RIKEN cDNA 2410022L05 198 869, 9 354, 8 2,3633515 15 0,0190476 19 0,043555 56 28,44 16
4343 2410022L05Rik: 264, 106 383, 2,1953583 0,0208333 0,042274 29,57
gene RIKEN cDNA 2410022L05 5 7 1 25 33 31 35
7831 2510042P03Rik: 143, 227, 130, 2,5060464 0,0269230 0,063012 18,44
gene RIKEN cDNA 2510042P03 3 1 3 08 77 82 94
3890 2600010E01Rik: 33,3 102, 59,8 5,0378931 0,0101010 0,037508 38,22
3 gene RIKEN cDNA 2600010E01 2 2 9 22 1 42 28
1247 2610001J05Rik: 127, 127, 112, 2,1492102 0,0429887 0,083138 13,19
3 gene RIKEN cDNA 2610001J05 3 2 1 41 41 86 93
1762 2610200G18Rik: 138, 150 181, 2,4241815 0,0228426 0,058544 20,81
9 gene RIKEN cDNA 2610200G18 3 7 49 4 84 6
8796 2610204L23Rik: gene RIKEN cDNA 2610204L23 131 0 129 4 1439 1,5982536 09 0,0358146 07 0,072228 46 15,75 5
1316 2610206B13Rik: 28,4 45,3 49,1 3,0508306 0,0331325 0,071285 16,21
6 gene RIKEN cDNA 2610206B13 7 3 47 3 14 51
1506 2700060E02Rik: 686, 853, 876, 1,6232182 0,0473157 0,090206 12,20
9 gene RIKEN cDNA 2700060E02 8 4 6 25 42 25 15
1246 2810026P18Rik: 137 134 1218 1,5449189 0,0272232 0,064694 17,91
5 gene RIKEN cDNA 2810026P18 0 8 09 3 49 41
1357 2810037C14Rik: 505, 807, 513, 1,9293210 0,0271844 0,062828 18,53
gene RIKEN cDNA 2810037C14 8 8 3 84 66 48 28
7425 2810405K02Rik: gene RIKEN cDNA 2810405K02 21,4 2 5,11 43,3 1 3,8721345 47 0,0478223 74 0,092465 13 11,75 88
2836 2810429O05Rik: 93,4 189, 192, 2,6154115 0,0243902 0,050952 24,31
gene RIKEN cDNA 2810429O05 4 3 3 59 44 38 84
8173 2900092E17Rik: 249, 258, 279, 2,0239528 0,0349500 0,072325 15,82
gene RIKEN cDNA 2900092E17 4 8 6 55 71 25 64
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
3190 cDNA de timo de 128, 54,0 42,2 3,5836828 0,0261569 0,061026 18,92
0 neonate de 3 dias, biblioteca enriquecida de comprimento total RIKEN, clone:A630060L04 produto:inclassificáve l, sequência de inserção completa 6 1 1 5 42 16 22
2378 3110040M04Rik /// 53,8 27,0 11,4 5,3195773 0,0196078 0,042450 28,90
3 LOC668050 /// LOC668055 2 8 9 52 43 98 87
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
/// LOC671025 /// LOC671035 /// LOC671043 /// LOC671049 /// LOC676755 /// LOC676758: RIKEN cDNA 3110040M04 gene /// similar à proteina SR140 associada a U2 /// proteína hipotética LOC668055 /// similar à proteína SR140 associada a U2 // similar à proteína SR140 associada a U2 /// similar à proteína SR140 associada a U2 /// similar à proteína SR140 associada a U2 /// similar à proteína SR140 associada a U2 /// similar à proteína SR140 associada a U2
2481 2 3110045A19Rik: gene RIKEN cDNA 3110045A19 9,74 11,0 8 9,95 6,7523536 64 0,0356643 36 0,072214 45 15,73 71
4198 4930406H16Rik /// 512, 494, 292, 1,8713183 0,0450980 0,085323 12,87
8 Nalp4e: RIKEN cDNA 4930406H16 gene /// NACHT, rico em leucina 4E repetido e contendo PYD 1 6 4 33 39 53 93
2545 4930452B06Rik: 16,2 39,2 26,3 3,8791892 0,0296684 0,065956 17,56
7 gene RIKEN cDNA 4930452B06 8 9 43 12 95 9
2771 4930455F23Rik: 281, 256, 176, 1,9978686 0,0474576 0,092234 11,73
4 gene RIKEN cDNA 4930455F23 7 8 6 51 27 46 32
1213 4933407C03Rik: 23,6 16,7 20,7 7,3890377 0,0237467 0,056631 21,44
9 gene RIKEN cDNA 4933407C03 7 8 9 24 02 49 33
5148 4933411K20Rik: 375, 430, 545, 1,7926087 0,0484400 0,093992 11,46
gene RIKEN cDNA 4933411K20 2 3 6 68 66 88 61
3932 4933416M07Rik: 70,3 90 47,9 2,7291438 0,0420711 0,080978 13,64
3 gene RIKEN cDNA 4933416M07 8 1 98 97 07 43
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
2921 4933427D06Rik: 393, 601, 587, 1,7479509 0,0476190 0,091669 11,97
7 gene RIKEN cDNA 3 6 3 78 48 61 54
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158/357
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
4933427D06
3288 5330427D05Rik: 46,9 105, 66,5 2,6391258 0,0471204 0,091823 11,90
0 gene RIKEN cDNA 5330427D05 2 9 6 09 19 73 53
1266 5730507H05Rik: 492, 353, 405, 1,8681645 0,0351617 0,072147 15,76
2 gene RIKEN cDNA 5730507H05 6 6 4 17 44 21 84
1043 5830415L20Rik: 547, 578, 472, 2,9881460 0 0,029444 58,79
8 gene RIKEN cDNA 5830415L20 7 6 5 02 44 02
1060 6430548M08Rik: 21,8 26,1 38,8 4,2802970 0,0381679 0,074664 15,01
5 gene RIKEN cDNA 6430548M08 8 2 5 63 39 97 98
2699 6720463M24Rik: 56,2 107, 70,8 3,1016682 0,0327868 0,071500 16,12
7 gene RIKEN cDNA 6720463M24 8 7 7 85 25 48
3148 7420416P09Rik: 237, 519, 353 1,8351267 0,0481712 0,091787 12,02
8 gene RIKEN cDNA 7420416P09 4 4 71 76 09 7
2961 A230048G03Rik /// 61,6 18,3 49,8 2,9602178 0,0430327 0,083152 13,20
5 LOC670614: RIKEN cDNA A230048G03 gene /// similar a CG2747PB, isoforma B 1 4 5 63 87 32 34
2260 A230062G08Rik: 42,8 53,8 127, 2,2968618 0,0478589 0,092927 11,65
3 gene RIKEN cDNA A230062G08 4 3 4 1 42 51 5
4184 A430033K04Rik: 761 837, 205, 2,1759469 0,0168776 0,047201 26,74
0 gene RIKEN cDNA A430033K04 6 4 07 37 13 52
1579 A830039H10Rik: 105, 99,3 94,1 2,6426496 0,0422535 0,081202 13,65
5 gene RIKEN cDNA A830039H10 9 7 6 82 21 6 01
1484 Adcy3: adenilato 319, 409, 337, 1,7570146 0,0483333 0,093016 11,60
2 ciclase 3 3 5 8 88 33 67 11
2750 Medula oblongata 19,2 31,3 26,3 3,2961825 0,0429009 0,083101 13,18
2 adulta masculina cDNA, RIKEN biblioteca compl, enriquecida, clone:6330441D15 produto: proteína hipotética, sequência de inserção completa 7 4 2 76 19 8 96
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
4216 6 Agrp: proteína relacionada a agouti 1 3,54 25,2 1 3,9400898 26 0,0331825 04 0,071070 89 16,23 97
3035 A1449441: 27,9 63,1 28,1 3,4668027 0,0448473 0,087824 12,58
8 sequência expressa A1449441 3 1 93 28 43 97
2705 Akap7: uma proteína- 350, 355, 259, 1,8910062 0,0285204 0,065377 17,73
6 âncora 7 de quinase (PRKA) 4 2 5 14 99 3 96
4085 Arhgefl5: fator rho de 18,5 57,9 26,4 3,0349596 0,0450623 0,087462 12,63
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
6 troca de nucleotídeos guanina (GEF) 15 3 7 62 2 45 44
1467 Ar14c /// 50,3 49,4 54,6 3,0952694 0,0427528 0,082919 13,32
6 LOC632433: 4C similar ao fator de ribosilação do ADP /// proteína 7 similar ao fator de ribosilação do ADP 1 9 6 91 68 71 39
1465 Arpc51: 2/3 135 175 1247 1,5175244 0,0485596 0,093766 11,49
3 complexo proteína relacionada a actina, similar subunidade 5 3 4 43 71 8 08
4030 Arrdc3: contendo 3 46,2 105, 72,6 3,1440102 0,0262096 0,060907 18,94
2 domínios arrestina 4 3 6 45 77 26 42
1806 Arx: gene homeobox 24,0 38,1 24,4 5,8539754 0,0161290 0,035537 46,13
9 relacionado a aristaless (Drosophila) 5 2 8 73 32 63 16
2902 AscL 1: similar ao 87,5 31,0 24,1 2,9767480 0,0467937 0,091793 11,87
1 homólogo do complexo achaetescute 1 (Drosophila) 5 1 8 58 61 76 01
7414 Atp6v1g1: ATPase, 233, 269, 361, 2,0461379 0,0427083 0,082923 13,31
1-1+ transportador, lisossomal VI subunidade GI 4 9 2 87 33 61 61
2701 Atp8al: ATPase, 45,1 134, 41,7 3,0925853 0,0246153 0,054010 22,95
1 transportador aminofosfolípide (APLT), classe I, tipo 8A, membro 1 6 9 4 68 85 26 11
1070 Atpbd4: Domínio de 246, 575, 407, 2,1370517 0,0267857 0,059293 19,84
7 ligação de ATP 4 6 3 5 19 14 15 53
2683 AU022751: 114 114 924 1,5984232 0,0379746 0,077836 14,18
0 sequência expressa AU022751 8 8 76 84 59 67
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
2892 AU041783: 289, 297, 348, 2,1562451 0,0348506 0,072238 15,81
1 sequência expressa AU041783 7 9 9 4 03 65
1744 Aurkc: aurora 377, 555, 561, 1,6871823 0,0473729 0,092072 11,82
0 quinase C 4 4 6 24 54 93 31
1557 Auts2: candidato 2 561, 507, 366, 1,6966471 0,0474934 0,091682 11,95
1 suscetibilidade ao autismo 9 8 7 31 04 79 62
8718 AW060207: sequência expressa AW060207 259, 2 166, 6 185 2,2147849 68 0,0269461 08 0,061656 69 18,80 51
2940 AW146299: 66,4 71,0 112, 2,6075628 0,0362903 0,073642 15,40
5 sequência expressa AW146299 1 3 4 28 23 47 19
2909 B230312I18Rik: gene 97,8 101, 61,4 3,1344798 0,0169491 0,047358 26,75
9 RIKEN cDNA B230312I18 9 3 4 28 53 76 39
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 165/373
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1138 B930041F14Rik: 30,0 31,9 43,3 3,9247495 0,0360962 0,073582 15,37
9 gene RIKEN cDNA B930041F14 2 8 9 72 57 89 8
3535 B930096F20Rik: 17,8 40,9 54,5 6,4786001 0,0103092 0,037216 38,84
7 gene RIKEN cDNA B930096F20 1 2 5 15 78 49 16
3332 B930096F20Rik: 14,6 19,8 13,6 11,817026 0,0186915 0,037850 36,95
3 gene RIKEN cDNA B930096F20 6 2 5 68 89 47 37
3000 BB 176347: 8,15 16,9 11,4 7,0873282 0,0296167 0,066190 17,55
1 sequência expressa BB176347 2 4 11 25 48 16
2722 BC010981: 120, 85,0 190, 2,2790431 0,0327102 0,070228 16,53
9 sequência cDNA BC010981 7 2 4 47 8 45 97
1037 BC021367: 12,4 144, 45,7 6,0458089 0,0151515 0,037449 34,48
1 sequência cDNA BC021367 3 6 1 97 15 49 98
1089 BC022623: 388, 240, 107, 2,5661445 0,0219123 0,048618 26,06
3 sequência cDNA BC022623 4 7 3 51 51 86 18
2830 BC047219: 227, 47,9 55,0 2,7076496 0,0269058 0,059222 19,87
8 sequência cDNA BC047219 8 5 7 79 3 72 18
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
3171 BC052883: 843, 108 691 1,8894270 0,0243902 0,055627 21,77
9 sequência cDNA BC052883 8 9 57 44 82 01
1499 Bcas2: carcinoma de 238, 384, 299, 1,9119140 0,0375469 0,074964 14,89
1 mama sequência amplificada 2 6 1 6 63 34 54 65
4790 Blcap: homólogo de proteína associado ao carcinoma de bexiga (humano) 593, 8 433, 6 467, 8 2,1646422 0,0252365 93 0,054342 8 23,15 94
7998 Btf3: fator de 743, 874, 818, 1,6576236 0,0368098 0,075521 14,73
transcrição básico 3 3 9 7 07 16 47 89
2708 C030048B08Rik: 206, 243, 160, 2,2117562 0,0369913 0,075696 14,75
3 gene RIKEN cDNA C030048B08 1 9 9 63 69 67 67
3110 1 C330046E03: proteína hipotética C330046E03 495, 6 490, 6 1006 5,5174768 31 0 0,005 199,6 36
4366 C80008: sequência 92,3 277, 122, 3,7302327 0,0188679 0,038218 32,11
0 expressa C80008 7 2 2 51 25 03 99
4146 5 C87977: sequência expressa C87977 879 105 4 758, 5 1,5636071 78 0,0472103 0,091982 83 11,81 26
2291 Calcocol: ligação 190, 154, 163, 2,0844975 0,0447906 0,085890 12,80
2 cálcio e domínio coiled-coil 1 8 3 4 85 52 94 67
8101 Camk2g: proteína 97,1 109, 105, 2,5673397 0,0461393 0,088647 12,46
quinase II gama dependente de 2 2 9 61 6 21 65
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
cálcio/calmodulina
1117 Car9: anidrase 91,7 148, 106, 2,5071011 0,045 0,084573 13,01
2 carbônica 9 7 2 8 33 33 89
270 Carhspl: proteína termicamente estável regulada por cálcio 1 428, 5 461, 3 410, 2 1,7566764 58 0,0381062 36 0,077602 14,22 29
1542 4 Ccdc102a /// LOC672218: contendo domínio coiled-coil 102A /// similar a CG31638PA 4,14 2,85 2,42 16,965571 21 0,0270270 27 0,062863 58 18,47 83
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
4096 Ccdc56: contendo domínio coiled-coil 56 177, 1 110 108, 4 2,1012823 92 0,0443101 71 0,084021 48 13,07 46
2262 Ccdc69: contendo 606, 369, 463, 2,0980906 0,0192307 0,043685 28,46
4 domínio coiled-coil 69 2 6 5 69 69 9 95
2274 Ccdc69: contendo 984, 482 775, 1,8619339 0,0225352 0,055032 22,12
1 domínio coiled-coil 69 6 4 51 11 86 89
2262 Ccdc69: contendo 918, 524, 763, 1,7033296 0,0270793 0,062869 18,48
3 domínio coiled-coil 69 1 8 3 76 04 12 74
1641 Ccni: ciclina I 206, 318, 253, 1,8659320 0,0429447 0,083173 13,19
1 1 3 3 38 85 14 2
1641 Ccni: ciclina I 498, 513, 309, 1,7354476 0,0454995 0,085308 12,92
0 2 8 3 87 05 28 22
4469 Ccnjl: ciclina similar a 79,6 182, 113, 2,8166380 0,0176470 0,038705 31,47
0 J 2 2 2 72 59 88 2
329 Cd24a: antígeno 776, 731, 580, 1,6885764 0,0471785 0,089633 12,31
CD24a 5 8 3 61 38 06 97
6122 Cdc25b: ciclo de 576, 563, 362, 1,7785419 0,0361445 0,073627 15,38
divisão celular 25 homólogo B (S, cerevisiae) 7 7 2 69 78 84 18
1580 2 Cdc9111: CDC91 ciclo de divisão celular 1 similar a 91 (S, cerevisiae) 52,8 45,1 2 27,0 3 7,6049167 27 0 0,03 60,88 74
1297 Cdcal: ciclo de 141, 321, 221, 2,2964126 0,0220385 0,055206 21,98
0 divisão celular associado 1 6 8 5 93 67 61 07
4204 Cdk9: quinase 35,5 8,3 51,8 6,7600302 0,0142857 0,038071 33,64
9 dependente de ciclina 9 (quinase relacionada a CDC2) 5 2 8 14 43 61
8112 Cdkal 1: proteína 494, 208, 137, 2,4688978 0,0221774 0,048723 26,15
CDK5 associada a subunidade reguladora 1 similar a 1 5 3 4 41 19 12 09
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
3196 Cebpb: CCAAT/ proteína de ligação ativadora (C/EBP), beta 8,94 15,3 5 29,7 5 6,1693641 62 0,0184049 08 0,038629 86 31,73 17
1953 2 Chchd5: contendo domínio coiled-coilhelix coiled-coil-helix 5 40,7 6 8,84 10,2 4 3,3171237 95 0,0428571 43 0,0835 13,16 59
2118 Chchd7: contendo 18,6 32,6 27,5 3,1814657 0,0453201 0,085146 12,91
1 domínio coiled-coilhelix coiled-coil-helix 7 3 7 7 21 97 14 26
1462 Chd4: proteína de 415, 423, 527, 2,0330976 0,0243309 0,058523 20,50
4 ligação 4 DNA cromodomíniohelicase 8 6 4 54 93 04
1548 Chd4: proteína de 946, 909, 980, 1,5567020 0,0448343 0,085864 12,81
0 ligação 4 DNA cromodomíniohelicase 6 1 4 38 08 2 14
1507 Clu: clusterina 41,5 27,4 12,0 3,6769720 0,0456707 0,088154 12,55
5 3 5 4 98 9 14 18
2308 Cml 1: similar a camello 1 62,2 9 5,09 4,57 5,6011960 38 0,0325203 25 0,069105 69 16,84 67
1451 Cnot3: complexo de 402, 266, 437, 1,7354812 0,0481825 0,092964 11,68
6 transcrição CCR4- NOT, subunidade 3 2 4 8 77 87 22 55
3016 Cops7b: homólogo COP9 (fotomorfogenética constitutiva), subunidade 7b (Arabidopsis thaliana) 386 255, 5 166, 9 2,2652614 47 0,0274223 03 0,064594 76 17,98 07
9970 Csrpl: cisteína e 117, 186, 282, 2,7557087 0,0143884 0,037841 33,68
protein rica em glicina 1 8 2 4 36 89 73 1
4243 9 Cxcl l: ligante quimiocina (motivo C-X-C) 1 4,71 2,48 4,31 19,160908 19 0,0336391 44 0,070907 24 16,35 34
3504 Cxcl 1: ligante quimiocina (motivo C-X-C) 1 9,7 10,4 3 6,75 7,2249543 35 0,0369047 62 0,076301 59 14,51 78
1678 Cxcr4: receptor 18,1 32,9 17,6 4,6376723 0,0105263 0,037789 38,91
6 quimiocina (motivo C-X-C) 4 1 1 61 16 47 13
3090 Cyp1la1: citocromo 178, 12,5 54,9 3,1103134 0,0320512 0,069150 16,77
9 P450, família 11, subfamília a, polipeptídeo 1 5 1 5 8 82 64 46
4123 Cypt3: theca 153, 281, 54,2 2,2576670 0,0368550 0,075581 14,74
8 perinuclear rica em cisteína 3 7 9 7 06 37 49 18
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1707 D10Jhu81e: 342, 66,4 240, 3,5041439 0,0174418 0,039418 31,34
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
6 segmento DNA expresso, Chr 10, Universidade Johns Hopkins 81 2 5 7 33 6 6 57
2118 D10Wsu102e: 196 171 1577 1,5968059 0,0266666 0,063022 18,36
5 segmento DNA expresso, Chr 10, Universidade Wayne State 102 2 2 04 67 22 54
3166 D11Ertd497e: 680, 595 536, 1,8883394 0,0277264 0,064485 18,05
0 segmento DNA expresso, Chr 11, ERATO Doi 497 6 3 13 33 52 57
3294 D130073L02Rik: 665, 689 969, 1,7870294 0,0342261 0,071537 16,11
4 gene RIKEN cDNA D130073L02 5 7 88 9 7 58
1913 D14Ertd500e: 360, 265, 425, 1,8536149 0,0452261 0,084247 13,05
0 segmento DNA expresso, Chr 14, ERATO Doi 500 4 9 3 07 31 91 23
2968 D2Ertd612e: 116, 108, 103, 2,2331058 0,0432946 0,082474 13,44
8 segmento DNA expresso, Chr 2, ERATO Doi 612 2 1 6 86 15 48 81
7623 D2Ertd750e: segmento DNA expresso, Chr 2, ERATO Doi 750 219, 8 255, 7 110, 9 1,9925724 0,0476190 48 0,092787 52 11,62 57
1738 Dbnddl: contendo 190, 70,3 112, 2,7399690 0,0371747 0,075163 14,82
3 domínio disbindina (proteína de ligação à distrobrevina 1) 1 5 9 6 27 21 16 91
4182 Dbxl: 29,5 11,6 10,8 7,4904734 0,0145985 0,038248 33,79
4 devenvolvimento cerebral homeobox 1 5 3 4 6 4 18 6
6290 Dcpla: enzima de 289, 278, 245, 1,9845306 0,0460093 0,088651 12,44
desoperculação 1 2 9 75 9 02 52
542 Dctn3: dinactina 3 222 154 123, 8 2,3224612 58 0,0224438 9 0,058063 18 20,75 09
1811 Ddit3: transcrição induzível a danos no DNA 3 199 274, 8 371, 5 2,4321752 13 0,0227272 73 0,054715 91 22,22 71
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
9363 Ddx19a /// Ddx19b: DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) polipeptídeo box 19a /// DEAD (Asp-GluAla-Asp) polipeptídeo box 19b 897, 4 100 7 1065 1,6368969 15 0,048 0,091739 26 12,01 51
2222 Ddx19a: DEAD (Asp- 581, 501, 556, 2,0310716 0,0241545 0,058421 20,45
Glu-Ala, Asp) polipeptídeo box 19a 9 6 5 32 89 9 66
3606 Dgat1: diacilglicerol 34,3 61,2 22,9 3,4336408 0,0276008 0,059908 19,43
1 O-aciltransferase 1 6 7 3 8 49 49
2465 Dhfr: dihidrofolato 58,3 22,9 36,0 5,5820421 0,0188679 0,034716 49,13
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1 reductase 8 6 7 14 25 98 36
1646 Dhrs3: membro 59,2 66,6 115, 2,8364821 0,0224719 0,054906 22,12
6 desidrogenase/reduct ase (família SDR) 3 1 7 3 05 1 37 63
3630 Diras2: família 84,6 77,3 98,7 2,8841412 0,0316455 0,069498 16,66
3 DIRAS, similar a RAS de ligação a GTP 2 1 3 2 57 7 95 42
1415 Dmpk: proteína 36,8 47,2 31,1 3,9030975 0,0445736 0,086482 12,75
9 quinase-distrofia miotônica 8 9 2 58 43 56 04
1846 Dnajb5: DnaJ 23,6 34,5 27 4,0210044 0,0249433 0,058904 20,00
3 (Hsp40) homólogo, subfamília B, membro 5 2 7 71 11 01 01
1165 Dnalc4: dineína, axonemal, cadeia leve 4 259, 5 384 378, 6 2,1761541 17 0,0377833 75 0,075155 33 14,91 73
4618 Dscr6: homólogo 57,7 52,2 26,7 3,5398583 0,0333839 0,071021 16,29
região crítica síndrome de Down 6 (humano) 9 6 2 83 15 75 03
1434 8 Dsp: desmoplaquina 120, 1 62,8 1 35,6 5,3449519 23 0,0181818 18 0,035090 91 48,15 04
4460 Dynlt3: cadeia leve 513, 484, 546, 1,6167937 0,0444874 0,086508 12,72
6 dineína tipo Tctex 3 8 1 3 87 27 7 86
3050 E130311K13Rik: 43,9 46,7 53,8 3,3212125 0,0483736 0,092813 11,61
1 gene RIKEN cDNA E130311K13 5 6 7 13 45 46 39
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1360 Egrl: resposta ao 362, 301, 296, 1,7250975 0,0477908 0,090474 12,15
crescimento precoce 1 2 7 6 98 03 9 22
2819 Ehd2 /// LOC673251: 120 329, 107, 2,3752179 0,0246913 0,058296 20,66
8 domínio contendo EH 2 /// similar ao domínio contendo EH 2 7 7 83 58 3 13
3769 Ehf: fator ets 118, 82,2 115, 2,1564713 0,0481283 0,091729 12,02
homólogo 5 8 5 01 42 06 51
6059 Eif2ak1: fator de 249, 221, 232, 2,1940348 0,0320197 0,068237 16,96
iniciação de tradução eucariótica 2 alfa-quinase 1 2 6 5 95 04 55 8
2257 Eif2b1: fator de 292, 218, 271, 1,8040371 0,0479394 0,092943 11,66
4 iniciação de tradução eucariótica 2B, subunidade 1 (alfa) 9 6 6 46 45 65 28
4127 6 Emx2: homólogos espiráculos nulos 2 (Drosophila) 85,5 2 182 66,6 8 2,4375784 28 0,0375854 21 0,078265 14,08 86
2716 Faah: hidrolase de 61,4 124, 50,0 2,9501920 0,0302521 0,067781 17,15
7 ácido graxo amido 5 1 2 81 01 51 04
316 Fabp5 /// LOC628298 272, 598 286, 2,2854313 0,0194174 0,043770 28,54
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
/// LOC637129 /// LOC669559 /// LOC672321: proteína de ligação a ácidos graxos 5, epidérmica /// similar à proteína de ligação a ácidos graxos, epidérmica (E FABP) (homólogo de proteína de ligação a ácidos graxos associada a psoríase) (PA-FABP) (proteína de ligação a lipídios queratinócitos) /// similar à proteína de ligação a ácidos graxos, epidérmica (E-FABP) (homólogo de proteína de ligação a ácidos graxos associada a psoríase) (PA-FABP) ((proteína de ligação a lipídios queratinócitos) /// similar à proteína de ligação a ácidos graxos, epidérmica (E-FABP) (homólogo de proteína de ligação a ácidos graxos associada a psoríase) (PA-FABP) (proteína de ligação a lipídios queratinócitos) /// similar à proteína de ligação a ácidos graxos, epidérmica (E-FABP) (homólogo de proteína de ligação a ácidos graxos associada a psoríase) (PA-FABP) (proteína de ligação a lipídios queratinócitos) 5 8 61 76 23 22
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
317 Fabp5: proteína de 62,4 184, 99,4 2,2084300 0,0483870 0,091066 12,09
ligação a ácidos graxos 5, epidérmica 7 3 7 53 97 31 81
1371 Fabp9: proteína de 90,9 122, 177, 2,6524316 0,0299003 0,067652 17,10
ligação a ácidos graxos 9, testículo 1 6 7 05 32 27 13
3829 Fank1: fibronectina 224, 906, 897, 2,2097461 0,0147058 0,038088 33,93
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
3 tipo 3 e domínios anquirina repetidos 1 5 6 4 3 82 24 09
3829 Fankl: fibronectina 325, 374, 450, 2,1251144 0,0227920 0,054843 22,22
4 tipo 3 e domínios anquirina repetidos 1 3 2 5 36 23 3 8
2885 Fbxw14 /// 924, 979, 930, 1,6864578 0,0425079 0,081909 13,51
9 LOC668758 /// LOC673189: F-box e WD 40 proteína do domínio 14 /// similar a F-box e WD-40 proteína do domínio 14 /// similar a F-box e WD-40 proteína do domínio 14 7 8 5 55 7 32 48
1763 Fetub: fetuína-beta 47,1 149, 27,0 4,0647014 0,0300500 0,067913 17,11
1 9 6 8 16 83 19 06
1889 Fgf1: fator de 311, 285, 249, 1,7992191 0,0385487 0,078571 14,04
6 crescimento fibroblástico 1 8 3 7 74 53 43 2
1643 G6pdx: glicose-6- 912, 963, 1065 1,8079537 0,0229007 0,058668 20,82
0 fosfato desidrogenase ligada por X 4 3 43 63 36 36
2061 Galm: galactose 127, 148, 72,6 2,2254599 0,0474885 0,090210 12,22
0 mutarotase 7 9 9 47 84 05 55
3234 Gas211: interrupção 20,1 11,3 52,2 4,0504976 0,0454545 0,085266 12,91
6 crescimento específico 2 similar a 1 2 3 1 94 45 8 77
1277 Gchl: GTP 133, 148, 134, 2,3742681 0,0373599 0,074960 14,87
7 ciclohidrolase 1 7 3 7 8 56 21
3830 2 Ghitm: proteína transmembrana induzível por hormônio de crescimento 3,34 4,13 8,35 16,153507 57 0,0377142 86 0,078415 24 14,10 66
2780 Gm129: modelo 320, 434, 279, 2,6154372 0,0149253 0,038233 34,07
1 genético 129, (NCBI) 2 4 1 89 73 83 65
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
3113 Gm1568: modelo 233, 198, 220 2,5223904 0,0175438 0,045657 27,24
8 genético 1568, (NCBI) 9 5 51 6 89 03
1605 Gm428 /// 108 134 986, 1,7091618 0,0266940 0,060095 19,16
8 LOC623180 /// LOC623197 /// LOC623210 /// LOC623219: modelo genético 428, (NCBI) /// hipotética LOC623180 /// hipotética LOC623197 /// hipotética LOC623210 /// 6 4 9 59 45 82 31
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
hipotética LOC623219
1787 Gna14: proteína de 122, 96,2 128, 2,3722642 0,0375586 0,077218 14,35
5 ligação ao nucleotídeo guanina, alfa 14 7 5 81 85 31 1
2785 Gnaz: proteína de 126, 93,3 144 2,3111900 0,0458372 0,088690 12,42
7 ligação ao nucleotídeo guanina, Subunidade alfa z 2 4 92 31 36 47
3764 Gnb4: proteína de 157, 393, 258, 1,9609474 0,0336749 0,070976 16,07
ligação ao nucleotídeo guanina, beta 4 9 7 1 33 63 09 5
1723 Gng3: proteína de 606, 482, 588, 2,0195796 0,0263691 0,060757 19,00
ligação ao nucleotídeo guanina (proteína G), subunidade gama 3 5 2 5 14 68 27 26
3846 Gng4: proteína de 14,5 12,2 10,9 9,7868486 0,0480847 0,094379 11,41
3 ligação ao nucleotídeo guanina (proteína G), subunidade gama 4 3 6 1 06 6 24 71
1485 Gng5: proteína de 307, 450, 359, 2,1118067 0,0214285 0,05125 24,52
1 ligação ao nucleotídeo guanina (protein G), subunidade gama 5 9 5 3 14 71 86
1943 8 Gprc5b: receptor acoplado à proteína G, família C, grupo 5, membro B 8,02 2,74 32,2 6 13,864401 35 0,0233463 04 0,051024 64 25,46 72
1460 Grina: receptor de 285, 670, 531, 2,0151647 0,0270880 0,059292 19,92
9 glutamato, ionotrópico, proteína associada a N-metil D-asparato 1 (ligação ao glutamato) 4 3 6 71 36 7 98
1553 Gm: granulina 326, 429, 434, 2,7820904 0,0128205 0,036837 41,84
9 6 6 5 89 13 61 78
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
2194 5 Gm: granulina 252, 5 333, 1 328 2,7567466 99 0,0170940 17 0,037635 33 35,87 99
4428 Gyg: glicogenina 640, 735, 665, 2,4069566 0,0175438 0,037953 36,23
0 7 8 4 62 6 22 79
1650 5 Gyg: glicogenina 633, 2 808, 2 736 2,3461602 53 0,0186335 4 0,038674 95 31,87 23
2169 Hadhsc: L-3- 37,3 48,5 24,6 5,2024153 0,0244755 0,050734 24,41
5 hidroxiacil coenzima A desidrogenase, cadeia curta 1 6 8 32 24 27 28
2074 Hba-al: hemoglobina 14,0 70,2 28,9 3,7697391 0,0376670 0,075751 14,67
8 alfa, cadeia adulta 1 5 3 3 93 72 32 33
3440 Hdlbp: proteína de 23,0 5,26 6,4 10,662171 0,0484140 0,092804 11,62
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
9 ligação a lipoproteínas de alta densidade (HDL) 1 51 23 67 02
2172 2 Hess: pilosos e ativadores de separação 5 (Drosophila) 5,4 49,4 2 10,0 1 17,720134 11 0 0,035714 29 76,32 51
1454 8 Hes6: pilosos e ativadores de separação 6 (Drosophila) 47,9 5 155, 1 45,4 6,3755818 53 0 0,030630 63 57,35 56
294 Heyl: 340, 320, 328, 2,5564693 0,0199004 0,042603 29,03
pilosos/ativadores de separação relacionados com YRPW motivo 1 9 2 5 71 98 65 33
4057 Hist2h2be: histona 2, 12,2 14,7 13,0 6,0626591 0,0323574 0,070421 16,45
3 H2be 3 5 1 56 73 16 12
1529 0 Hkl: hexoquinase 1 17,7 8,41 70,3 7 6,0167750 05 0,0452793 83 0,087029 54 12,68 18
1997 Hnmt: histamina N 63,0 104, 82,1 2,3258997 0,0426195 0,082955 13,30
metiltransferase 3 4 1 64 43 65 18
2044 Hoxa3: homeobox A3 114, 21,4 18,6 3,5491982 0,0366430 0,076958 14,43
8 4 2 7 36 26 23 59
3802 Hspa12a: proteína de 11,2 190, 15,7 5,8107437 0 0,028861 56,20
9 choque térmico12A 7 3 2 76 79 68
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
2041 Hspa1a: proteína de 177, 256, 240, 2,1032004 0,0267175 0,062805 18,41
5 choque térmico 1A 6 6 2 05 57 34 44
2034 Hspa1b: proteína de 326, 890, 200, 1,9979120 0,0302013 0,067857 17,13
5 choque térmico 1B 2 6 5 74 42 94 51
1128 Hspa1b: proteína de 178, 397, 109, 1,9348690 0,0451866 0,085199 12,89
6 choque térmico 1B 7 6 8 94 4 74 68
1396 Hspa2: proteína de choque térmico 2 653 101 0 758, 9 1,6987054 33 0,0418454 94 0,081105 15 13,61 08
3507 Icosl: ligante icos 299, 9 350, 5 227, 8 2,0272164 78 0,0305084 75 0,066887 01 17,29 22
1424 1d2: inibidor de 20,8 47,4 37,6 3,5678276 0,0362622 0,072570 15,70
4 ligação ao DNA 2 2 4 7 66 04 9 07
3942 Ier3: resposta precoce imediata 3 102, 8 52,7 5 30 3,3496494 03 0,0324074 07 0,070473 25 16,45 63
5812 Igh-VJ558 /// 77,6 114, 116, 2,3486867 0,0475319 0,090018 12,24
LOC238447 /// L00544903 /// L00544907: cadeia pesada da imunoglobulina (família J558) /// similar à região variável da cadeia pesada da imunoglobulina /// similar à cadeia mu da imunoglobulina /// similar à cadeia pesada do anticorpo 4 2 3 15 93 28 14
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
monoclonal antipoli(dC)
1878 Ing3: família do 200, 400, 302, 1,9067487 0,0419806 0,080961 13,63
7 inibidor de crescimento, membro 3 3 2 5 02 24 61 03
4032 Insig1: gene induzido 164 163 1534 1,5276185 0,0351506 0,072343 15,84
5 por insulina I 3 1 07 46 38 72
1651 lrf1: fator regulador 278, 292, 194, 2,3414472 0,0229007 0,051017 25,25
2 de interferon 1 6 6 5 96 63 81 31
2812 Irx3: homeobox relacionado a iroquois 3 (Drosophila) 127, 6 69,4 2 60,1 3,6564655 46 0,0178571 43 0,044821 43 27,57 57
1805 Itga9: integrina-alfa 9 555, 457, 546, 1,6467265 0,0422680 0,082986 13,25
6 2 9 3 37 41 25 95
1704 Jun: oncogene jun 109, 4 37,8 9 28,3 5 9,2902721 38 0 0,025833 33 113,6 84
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
3876 Kalrn: calirina, 85,3 54,3 126, 2,5414870 0,0286975 0,059727 19,72
0 RhoGEF quinase 3 1 1 06 72 74 66
1754 Kcnq 1: canal 133, 55,7 24,7 4,3958449 0,0206611 0,047796 26,47
0 fechado de tensão de potássio, subfamília Q, membro 1 6 4 5 86 57 14 73
3864 Kifl3a: membro da 77,7 47,7 84,3 2,5241068 0,0471698 0,091935 11,81
6 família cinesina 13A 1 3 3 42 11 39 17
2551 Kif24: membro da 147, 148, 106, 2,6042908 0,0298013 0,067864 17,07
7 família cinesina 24 6 5 2 99 25 24 03
1634 K1h113: similar a 538, 329, 445, 1,8966265 0,0269662 0,059250 19,89
5 kelch 13 (Drosophila) 2 8 6 56 92 94 85
1395 8 Ldhb: lactato desidrogenase B 141 7 202 7 1678 1,5075540 68 0,0451055 66 0,087508 12,63 71
5980 Ldlr: receptor de 99,4 87,7 147, 2,4560544 0,0382830 0,077536 14,24
lipoproteína de baixa densidade 1 5 7 41 63 74 99
2996 Ldlrad3:Domínio de 93,0 223, 96,6 2,4183446 0,0338733 0,071237 16,08
4 classe A receptor de lipoproteína de baixa densidade contendo 3 5 7 5 28 43 11 46
916 LIg11: homólogo 1 526, 632, 506, 1,7429637 0,0364511 0,072640 15,63
de larva gigante letal (Drosophila) 8 3 2 03 69 99 91
2135 Lmo7: apenas 127 137 1271 1,4964677 0,0474978 0,092304 11,73
5 domínio LIM 7 1 3 27 8 21 38
3261 LOC240444: Similar 46,8 105, 143, 3,2250749 0,0263157 0,060883 18,97
5 a membro 2 de subfamília G de canal dependente de voltagem de potássio (subunidade Kv6.2canal de 2 4 3 2 89 94 99
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
potássiodependente de voltagem)(subunidad e de canal de potássio cardíaco)
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1489 L00545161 /// 657, 832, 661, 1,8517934 0,0238907 0,051194 24,05
1 LOC637273: similar a Peroxirredoxina 1 (Tiorredoxina peroxidase 2) (peróxido redutase 2 Tiorredoxinadependente) (fator osteoblastoespecífico3) (OSF-3) (proteína de estresse de macrófago de 23 kDa) /// similar a Peroxirredoxina-1 (Tiorredoxina peroxidase 2) (peróxido redutase Tiorredoxina dependente 2) (fator osteoblastoespecífico3) (OSF-3) (proteína de estresse de macrófago de 23 kDa) 6 6 9 74 85 54 88
1991 L00574530: 10,4 15,5 12,4 4,7473027 0,0189573 0,043491 28,40
2 metalotioneína 1K 7 2 3 58 46 31 84
3481 LOC627488 /// 185 259 2372 1,4790440 0,0367197 0,075891 14,70
3 LOC627520 /// LOC667692 /// LOC667695 /// LOC673990: similar a subunidade 4 de complexo THO (Tho4) (RNA e proteína de ligação 1 a fator de exportação) (REF1-I) (Unido a AML-1e LEF-1) (Aly/REF) /// similar a subunidade 4 de complexo THO (Tho4) (RNA e proteína de ligação 1 a fator de exportação) (REF1-I) (Unido a AML-1 e LEF-1 ) (Aly/REF) /// 2 1 54 06 47 15
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
similar a subunidade 4 de complexo THO (Tho4) (RNA e proteína de ligação 1 a fator de exportação) (REF1-I) (Unido a AML-1 e LEF-1 ) (Aly/REF) /// similar a subunidade 4 de complexo THO (Tho4) (RNA e proteína de ligação 1 a fator de exportação) 1) (REF1-I) (Unido a AML-1 e LEF-1 ) (Aly/REF) /// similar a subunidade 4 de complexo THO (Tho4) (RNA e proteína de ligação 1 a fator de exportação) (REF1-I) (Unido a AML-1 e LEF-1 ) (Aly/REF)
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
3667 6 LOC665521 /// LOC665546 /// LOC665755 /// LOC666203: similar a membro da família PRAME 8 /// similar a membro da família PRAME 8 /// similar a membro da família PRAME 8 similar a membro da família PRAME 8 298 288, 9 409, 9 3,2127208 48 0 0,028115 94 69,69 07
3537 LOC666806: similar 639, 803, 395 1,8406024 0,0285087 0,060255 19,64
2 ao fator de iniciação de translação eucariótica ligado a X 1A 8 3 29 72 85 27
2390 LOC677447: similar 50,1 30,4 38,5 4,2350786 0,0264150 0,062955 18,31
7 a RIKEN cDNA similar a 5730590G19 5 4 14 94 97 3
2237 Lypd3: domínio 246, 99,1 235, 2,0261893 0,0478632 0,092324 11,77
Ly6/Plaur contendo 3 3 7 7 68 48 79 37
2232 3 Lysmd3: LysM, domínio de ligação com peptodoglicano putativo contendo 3 125 290, 1 91,8 1 2,6523721 0,0267489 71 0,060116 6 19,17 22
1439 Marcksll /// 242, 549, 257, 1,9048087 0,0348330 0,071848 15,96
2 LOC673071: MARCKS-like 1 /// 8 7 9 06 91 09 39
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
similar a proteína relacionada a MARCKS (similar a proteína relacionada a MARCKSI) (substrato quinase C rico em alcalina macrófago demiristoilada) (MacMARCKS) (MacMARCKS) (protein do cérebro F52)
1432 Marcksl 1: similar a 198, 505, 271, 1,8928715 0,0368906 0,073807 15,27
6 MARCKS1 7 8 7 61 46 64 28
9962 Mbd2: proteína do domínio de ligação metil-CpG 65,9 2 14,2 4 271, 8 3,9747644 11 0,0142857 14 0,036 43,80 36
1105 Meal: antígeno masculino acentuado 373 331, 2 365 1,7982562 52 0,0477876 11 0,091687 32 11,99 39
1430 5 Mm.10009.3 78,1 79,4 3 58,1 2,7268198 75 0,0425311 2 0,082897 65 13,29 56
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
4371 Mm.150985.1 195, 152, 111, 2,2763155 0,0450538 0,085507 12,86
9 3 2 3 43 69 67 66
4333 Mm.25004.1 28,2 8 3,92 34,9 1 4,4815581 73 0,0373134 33 0,074975 12 14,86 37
9278 Mm.37131.1 173 47,3 5 77,8 2,6813124 29 0,0351002 87 0,072254 06 15,84 7
3859 6 Mm.45490.1 52,9 4 334 76,8 3 2,6967590 27 0,0241935 48 0,056057 35 21,65 19
2209 Mm.69144.1 100, 88,4 177, 3,4138146 0,0123456 0,037325 41,22
6 7 8 7 2 79 1 74
2148 Mm.9772.3 122, 53,9 65,1 2,5049113 0,0475785 0,092367 11,73
7 9 7 7 35 9 6 65
8468 Mocs2: síntese de 296, 378, 132, 2,2563954 0,0297202 0,065850 17,59
cofator milibidênio 2 6 2 9 53 8 82 62
2940 Mrp19: proteína 220, 250, 282, 2,0282061 0,0431125 0,082839 13,38
3 ribossomal mitocondrial L9 5 8 4 66 13 12 99
6034 Mrps23: proteína 55,8 57,0 56,9 2,9244928 0,0353107 0,072283 15,77
ribossomal mitocondrial S23 2 1 9 09 34 43 53
4456 Mrps23: proteína 48,9 9,82 35,5 2,9868516 0,0484304 0,090998 12,10
1 ribossomal mitocondrial S23 1 4 47 93 51 46
1867 Mt4: metalotioneína 4 77,1 182, 150, 2,1804495 0,0379266 0,074989 14,93
2 1 5 1 35 75 46 89
8584 Mtap: 88,9 14,4 153, 3,2683956 0,0255591 0,054345 23,22
metiltioadenosina fosforilase 8 3 2 35 05 05 05
3549 Mthfd2: 554, 527, 690, 1,8413047 0,0266159 0,062934 18,35
metilenetetrahidrofola to desidrogenase 4 2 5 16 7 09 88
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
(dependente de NAD+), metilenetetrahidrofola to ciclohidrolase
2758 Mxdl: proteína de 418 374, 279, 1,9104557 0,0292553 0,065508 17,69
8 dimerização MAX 1 6 5 02 19 27 84
6161 Mxdl: proteína de 110, 62,7 111, 2,7161335 0,0294627 0,066360 17,50
dimerização MAX 1 9 8 8 87 38 49 11
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
2032 5 Myo5b: miosina Vb 270, 7 380 263, 4 1,8464137 3 0,0446168 77 0,086498 55 12,75 32
2966 4 Myom2: miomesina 2 571, 8 941, 8 785, 8 1,5872306 31 0,0433403 81 0,082537 13,44 85
2888 Nalp4f: NACHT, 566, 103 625, 2,1999656 0,0106382 0,038085 38,95
1 repetição rica em leucina e PYD contendo 4F 2 5 4 28 98 11 65
1152 8 Nalp6: NACHT, repetição rica em leucina e PYD contendo 6 55,6 7 9,16 5,59 5,2886427 77 0,0316957 21 0,069550 98 16,66 49
4189 Nalp9b: NACHT, 285, 410, 285, 2,0378741 0,0269749 0,062909 18,46
6 LRR e PYD contendo proteína 9b 5 1 4 76 52 44 75
1803 Ncoa4 /// 299, 200, 191 2,3334030 0,0271084 0,061285 18,87
3 LOC627557: Coativador de recepção nuclear 4///similar ao coativador de recepção nuclear 4 8 4 57 34 14 62
2179 Ndrgl: gene 374, 244, 197, 1,9014543 0,0317965 0,069093 16,73
7 regulador descendente N-myc 1 4 3 2 24 02 8 06
4919 Ndrl: similar a 239, 189, 144, 1,8695889 0,0480530 0,093515 11,54
regulador descendente N-myc 1 9 1 4 69 24 6 62
1041 Nefl: neurofilamento, 759, 965, 548, 1,9766924 0,0228136 0,050899 25,23
4 polipeptídio leve 2 7 3 32 88 87 96
2584 Nes: nestina 119, 4 87,3 7 86,2 2,3084042 02 0,0467532 47 0,091780 66 11,86 81
6998 Neurog2: 63,6 209, 71,8 2,7661141 0,0479285 0,094397 11,40
neurogenina 2 7 6 1 22 13 51 3
9918 Nobox: NOBOX 172, 98,8 245, 2,3174493 0,0383275 0,077417 14,25
oogênese homeobox 8 2 1 97 26 73 96
1721 Nudcd2: domínio 293 236, 633, 2,8845011 0,0129870 0,037186 41,85
6 contendo NudC 2 5 6 17 13 15 66
2861 Nudcd2: domínio 346, 283, 405, 1,8465173 0,0477453 0,091682 11,98
contendo NudC 2 4 8 5 39 58 88 6
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá FDR médio T
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
rio
3960 Nuprl: proteína nuclear 1 8,86 46,3 100 4,8597571 35 0,0180995 48 0,045294 12 27,58 71
3961 Nuprl: proteína nuclear 1 1,98 17,5 2 68,5 3 5,4373925 99 0,0299823 63 0,065955 32 17,64 34
2981 Oaslc: 2'-5' sintetase 552, 343, 414, 2,5357731 0,0099009 0,037227 37,96
de oligoadenilato 1C 8 8 4 44 9 72 55
1142 Oas 1 d /// Oas le: 2'5' sintetase de oligoadenilato ID /// 2'-5' sintetase de oligoadenilato 1E 695 757, 1 651, 1 2,8696416 42 0 0,029927 54 53,61 91
1931 Obfc2b: dobramento 107, 78,9 143, 3,3366752 0,0205128 0,041880 29,50
8 de ligação a oligonucleotídeos/ oligosacarídeos contendo 2B 4 8 9 25 21 34 08
1019 9 Odf2: fibra densa exterior do flagelo2 392, 7 651, 3 460, 8 1,8163094 28 0,035 0,0724 15,82 8
2281 Osbp2: proteína de 68,7 106, 53,3 3,7711217 0,0166666 0,047319 26,60
3 ligação oxisteriol2 2 4 6 22 67 44 72
4353 Pak7: P21 153 241, 217, 2,1399697 0,0273224 0,064553 17,96
5 (CDKN1A)quinase ativada 7 8 1 1 04 73 74
4133 Paqr5: progestina 113, 175, 121 2,1531541 0,0321027 0,069176 16,77
3 membro da família receptor adipoQ V 6 4 25 29 03 83
849 Pdliml: PDZ e 163, 202, 181, 2,4020699 0,0339233 0,071214 16,09
domínio LIM 1 (elfina) 9 1 2 59 04 36 41
4150 Pex10 /// LOC668173 83,5 24,3 29,1 3,3916911 0,0287769 0,065035 17,82
3 /// LOC671348: fator de biogênese de perixoma 10 /// similar a fator de biogênese de perixoma 10 isoforma 1 /// similar a proteína de agrupamento de perixoma 10 (Peroxina-10) (fator de biogênese de perixoma 10) (proteína de dedo RING 69) 9 2 36 78 97 29
1223 Pgam5: membro da 56,8 11,6 29,0 3,6012031 0,0469565 0,091898 11,88
9 família fofoglicerato mutase 5 1 4 5 47 22 55 15
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
6474 Phkgl: fosforilase 39,2 46,0 40,2 2,7325602 0,0478723 0,091755 11,99
quinase gama 1 5 3 2 25 4 32 89
4052 Pitpnm2:proteína de transferência fosfatidilinositol, 23,3 6 16,5 7 16,8 7,2413793 1 0,0469181 23 0,089451 09 12,29 52
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
associado a membrana 2
1936 2 Plac8: específico para placenta 8 183 196, 8 196, 9 2,1641058 64 0,0338235 29 0,071215 69 16,08
2020 Plecl /// LOC671535: 14,0 42,1 35,1 3,5521098 0,0477386 0,092830 11,64
5 plectina 1 /// similar a poli (ADP ribose) família polimerase, membro 10 4 8 4 12 93 82 37
2791 Plekhgl: domínio de 491, 722, 597, 2,0780086 0,0158730 0,041252 29,99
5 homologia com pleckstrin a contendo, família G (com domínio RhoGef) membro 1 4 9 2 84 16 2 28
1116 Plk2: similar a polo 134, 38,5 65,3 3,8920707 0,0169491 0,037740 35,77
4 quinase 2 (Drosophila) 9 6 8 8 53 11 85
1524 Pofut2: proteína O- 491, 875, 1214 1,9342230 0,0248447 0,054192 23,02
2 fucosiltransferase 2 1 2 68 2 55 26
1420 Pofut2: proteína O- 328, 451, 735, 2,0640432 0,0428422 0,083012 13,33
2 fucosiltransferase 2 1 2 2 52 15 89 17
1099 Pold3: polimerase 329, 569, 526, 2,0079130 0,0239808 0,058433 20,42
7 (direcionada DNA), delta 3, subunidade acessório 6 7 6 41 15 25 91
3459 Pold3: polimerase 303, 237, 260, 2,3134027 0,0245231 0,055449 21,87
0 (direcionada DNA), delta 3, subunidade acessório 9 9 6 02 61 59 11
3896 Ppplr3d: proteína 94,0 104 89,5 3,6077232 0,0096153 0,036762 37,81
1 fosfatase 1, subunidade regulatória 3D 6 2 57 85 82 47
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
3618 Ppp4c: proteína 175, 111, 158, 2,2988026 0,0350500 0,072441 15,83
2 fosfatase 4, Subunidade catalítica 5 2 9 02 72 58 15
1472 Prdx1: 122 157 1196 1,7490545 0,0170940 0,046253 26,97
6 peroxiredoxina 1 6 4 55 17 56 76
1406 Prdx1: 870, 902, 801, 1,9049999 0,0220883 0,048862 26,09
3 peroxiredoxina 1 6 3 4 94 53 12 18
1369 Prdx1: 859, 114 886, 1,743495 0,0234604 0,054672 22,49
2 peroxiredoxina 1 4 4 3 11 53 06
295 Prdx1: 434, 689, 439, 1,6669293 0,0410199 0,080539 13,80
peroxiredoxina 1 4 3 9 11 56 54 32
1299 Prdx2: 690, 158 625, 1,6553793 0,0374574 0,078460 14,05
6 peroxiredoxina 2 7 8 7 56 35 08 76
2801 Prdx2: peroxiredoxina 2 258 6 253 0 2441 1,4670591 07 0,0418006 43 0,081193 28 13,60 17
4213 Prmt3: proteína 15,1 34,4 6,54 7,2868091 0,0353025 0,072367 15,87
6 arginina N metiltransferase 3 1 4 04 94 92 27
2615 Prss8: protease, 79,4 130, 70,0 3,3600811 0,0291519 0,065535 17,67
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 181/373
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
serina, 8 (prostasina) 3 7 9 8 43 92 34
8719 Pstpipl: prolina-serina 18,9 12,4 10,2 5,0525123 0,0471615 0,091816 11,91
treonina fosfatase proteína de interação 1 1 9 7 56 72 59 08
4315 Ptdss2: 188, 147 386, 2,3660846 0,0466853 0,088954 12,39
8 fosfatidilserina sintase 2 3 5 58 41 25 85
4110 Rab3gapl: RAB3 132, 145 138, 2,3179212 0,0262664 0,063858 18,20
2 GTPase Subunidade de proteína de ativação 1 1 5 77 17 66 65
1696 Rap2b: RAP2B, 57,4 218, 87 2,9782276 0,0186046 0,043844 28,17
1 membro da família oncogene 8 1 32 51 96 39
8013 Rash 1 lb: similar a 28,6 67,3 76,1 3,5575879 0,0229885 0,058061 20,19
RAS, família 11, membro B 3 2 3 06 06 3 14
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1693 Rassfl: associação 213, 114, 183, 2,4325062 0,0247678 0,054148 23,01
1 Ras (RaIGDS/AF-6) família domínio 1 6 1 5 01 02 61 86
6797 Rassf5: associação Ras (RaIGDS/AF-6) família domínio 5 254, 6 257, 9 268 2,3367642 73 0,0220994 48 0,055174 95 22,01 15
1926 Rbm7: RNA proteína 564, 793, 454, 1,6513717 0,0444444 0,086689 12,71
4 de ligação principal 7 4 3 9 39 44 21 96
3007 Rbpsuh: 33,2 159, 37,3 2,9171312 0,0479638 0,090494 12,16
7 recombinação de proteína de ligação supressora de hairless (Drosophila) 6 1 5 72 01 72 46
1728 Rdh11: retinol 130, 206, 92,8 2,4631277 0,0393700 0,079370 13,95
5 desidrogenase 11 5 4 5 52 79 08 53
3831 Rela: v-rel reticuloendoteliose viral homólogo oncogene A (aviário) 323, 3 379, 4 436 1,8702816 38 0,0470383 28 0,091837 98 11,88 94
1928 Rexo2: REX2, RNA 210, 214, 230, 1,8754205 0,0480065 0,094298 11,41
6 exonuclease 2 homólogo (S. cerevisiae) 9 8 2 74 09 89 37
3543 Rgs2: regulador de 215, 392, 290, 2,4138084 0,0181818 0,045242 27,61
sinalização de proteína G 2 4 9 8 95 18 42 43
3542 Rgs2: regulador de 309, 389, 287, 2,5390351 0,0221402 0,051340 24,85
sinalização de proteína G 2 3 5 4 88 21 71 58
3862 Rgs2: regulador de 47,9 265, 134, 2,4395499 0,0357142 0,072222 15,74
3 sinalização de proteína G 2 4 8 4 95 86 22 14
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
4064 Rndl: família Rho 49,9 22,2 23,6 5,0817027 0,0318627 0,068556 16,92
1 GTPase1 4 3 8 78 45 64 55
996 Rnd3 família Rho GTPase 3 34,9 5 86,4 66,4 9 3,3833420 26 0,0271966 53 0,060027 89 19,33 16
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
995 Rnd3: família Rho 134, 41,0 157, 2,5631940 0,0318979 0,069037 16,75
GTPase 3 1 5 7 24 27 75 71
4462 Rnf185: proteína ring 154 182 2169 1,6803732 0,0222222 0,055324 22,02
9 finger 185 3 1 12 22 07 13
1913 Rnf185: proteína ring 223 223 2297 1,4277178 0,0478339 0,090547 12,15
5 finger 185 3 4 53 35 53 23
1948 Sc5d: esterol-05- 37,4 10,1 75,3 5,5372678 0,0267686 0,062906 18,41
4 desaturase (ERG3 fungal, delta5desaturase) homólogo (S. cerevisae) 6 3 2 8 42 31 7
2121 Scarb2: receptor de 23,2 12,1 32,6 6,4568370 0,0489959 0,094819 11,32
4 depurador classe B, membro 2 4 5 1 17 84 28 71
1452 Sdhc: complexo de 367, 95,0 439, 2,6272893 0,0237154 0,050487 25,71
4 desidrogenase sucinato, subunidade C, proteína de membrana integral 2 9 6 38 15 48 65
1640 Sh3bp2: protein de 456, 460, 392, 1,8518867 0,0368852 0,073110 15,55
4 ligação de domínio SH3 3 2 8 33 46 2 76
1143 Sixl: homeobox 116, 139, 145, 3,9951789 0 0,027142 66,89
6 relacionada a sine oculis 1 homólogo (Drosophila) 8 6 3 01 86 15
1664 Slc20al: família 338, 299, 249, 2,0056884 0,0367454 0,074081 15,23
4 portadora de soluto 20, membro 1 8 8 9 7 07 36 04
5126 Slc25a15: família portadora de soluto 25 (transportador ornitina portador mitocondrial), membro 15 801, 2 103 1 1206 1,7967270 72 0,0246575 34 0,055159 82 21,92 46
4263 Slc7a14: família 171, 384 263, 2,2105306 0,0242130 0,058305 20,48
5 portadora de soluto 7 (transportador de aminoácido catiônico,sistema y+), membro 14 7 3 53 75 08 81
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1534 Slc9a3r1: família 732, 124 905, 1,5430131 0,0424836 0,081259 13,66
1 portadora de soluto 9 (permutador de sódio/hidrogênio), isoforma 3 2 7 4 75 6 99 76
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
regulador 1
1534 Slc9a3r1: família 603, 114 742, 1,5972067 0,0474418 0,089779 12,34
0 portadora de soluto 9 (permutador de sódio/hidrogênio), isoforma 3 regulador 1 5 1 5 96 6 84 07
2966 Slco4al: família 410, 560, 483 2,0477717 0,0237529 0,058068 20,37
2 portadora de soluto transportador de ânion orgânico, membro 4a1 2 3 82 69 09 39
2283 Smurf1 /// 130, 182, 293, 2,0719513 0,0454976 0,088366 12,52
2 LOC640390: proteína ligase 1 de ubiquitina U3 específica para SMAD /// similar a fator regulatório 1 de ubiquitinação de Smad (Ubiquitina-proteína ligase SMURF1) (ubiquitina ligase E3 Smadspecífica 1) (hSMURF1) 3 9 9 36 3 51 57
7515 Snap29: proteína 676, 678, 687, 1,6441278 0,0478187 0,092899 11,64
associada à sinaptossomo 1 9 3 97 92 89 99
1515 Snord22: pequeno 96,1 68,6 49,0 2,4922439 0,0417558 0,081241 13,59
6 RNA nucleolar RNA, C/D box 22 6 7 2 71 89 97 08
1077 Snrpb2: 399, 607, 397, 2,3947851 0,0135135 0,037545 33,01
2 ribonucleoproteína B pequena nuclear U2 1 5 8 66 14 05 4
2044 Snrpb2: 607, 424, 345, 2,6719122 0,0162601 0,038373 35,06
9 ribonucleoproteína B pequena nuclear U3 3 6 2 9 63 98 16
1262 Sox2: gene 2 contendo SRY-box 94,1 81,9 5 80,3 8 3,0634799 5 0,0323076 92 0,070451 28 16,43 79
7733 Srd5a2l:similar a 345, 553, 479, 1,7638418 0,0425764 0,081215 13,67
esteroide 5 alfaredutase 2 4 4 2 53 19 43 9
3786 Ssr3: receptor de 432 471, 368, 1,9740662 0,0369863 0,072712 15,60
3 sequência sinal, gama 5 4 35 01 33 44
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1727 St3gal5: ST3 beta- 129, 214, 153, 2,9217653 0,0150375 0,038270 34,23
4 galactosídeo alfa-2,3sialiltransferase 5 7 2 4 66 94 68 05
1051 Stat6: transdutor de 74,9 158, 163, 2,4705442 0,0385604 0,074601 15,09
2 sinal e ativador de transcrição 6 6 2 3 07 11 54 96
5687 Surf5: gene surfeit 5 196, 1 219, 1 363, 8 2,1507274 93 0,0246305 42 0,058341 54 20,62 82
1678 Taf13: RNA 170 136 1418 1,5482599 0,0307692 0,066319 17,42
3 polymerase II TAF13 , fator associado a 0 7 65 31 09 1
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
proteína de ligação à TATA box (TBP)
1451 Taok3: TAO quinase 288, 201 341, 1,8779239 0,0427263 0,083438 13,15
5 3 5 2 92 48 45 23
2164 Tax1bp3 /// Rpl13: 507, 145, 438, 2,6272379 0,0166666 0,041018 30,55
2 proteína de ligação 3 de Tax1 (vírus tipo I de leucemia de célula T humana) /// proteína ribossomal L13 1 2 7 26 67 52 99
502 Taz: tafazina 116, 3 261, 3 97,6 4 3,0097501 52 0,0235294 12 0,050862 75 25,56 73
6617 Tcl1: ponto de quebra 1 de linfoma de célula T 230 0 278 0 3125 1,3949761 58 0,0443995 96 0,083804 24 13,09 61
1953 Thedc1: contendo 231, 336, 417, 1,9323767 0,0365997 0,076887 14,43
7 domínio de tioesterase 1 5 5 7 69 64 05 48
2015 Thrap3: proteína 90,0 100, 151, 2,2072647 0,0482420 0,094265 11,43
2 associada 3 a receptor de hormônio tireoidiano 3 2 4 07 28 47 99
1680 Tle6: intensificador 407, 562, 495, 2,0929048 0,0172413 0,046221 27,08
3 de split 6 similar à transducina, homólogo de Drosophila E(spl) 2 4 8 54 79 26 09
1519 Tm2d2: contendo 290, 286, 252, 2,0799604 0,0418963 0,080874 13,75
5 domínio TM2 - 2 4 3 4 94 62 68 69
2120 Tmed10 /// 356, 335, 331, 2,0908518 0,0293072 0,065476 17,70
4 LOC634748: proteína de tráfego 10 (levedura) similar à emp24 transmembrana /// similar a proteína de tráfego transmembrana 4 3 6 87 82 61 43
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1588 Tmed10 /// 306, 282, 263 2,0107563 0,0427698 0,083509 13,15
0 LOC634748: proteína de tráfego 10 (levedura) similar à emp24 transmembrana /// similar a proteína de tráfego transmembrana 9 8 5 57 84 31
1586 Tmed10 /// 328, 287, 276, 1,9904781 0,0481418 0,093079 11,67
4 LOC634748: proteína de tráfego 10 (levedura) similar à emp24 transmembrana /// similar a proteína de tráfego transmembrana 4 9 1 94 92 95 33
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 185/373
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
2174 Tmem109: proteína 273, 272, 273, 2,0273489 0,036 0,073457 15,37
6 transmembrana 109 8 9 3 28 78 24
1488 Tmem 109: proteína 350, 365 381, 1,9177847 0,0379746 0,074936 14,95
7 de transmembrana109 2 9 13 84 71 06
8336 Tmem38a: proteína 251, 101, 150, 3,0738509 0,0245614 0,050807 24,43
de transmembrana 38a 5 5 5 02 04 02 59
1067 Torla: família torsina 851, 880, 816, 1,5996933 0,0471441 0,090247 12,18
4 1, membro A (torsina A) 9 3 4 48 52 81 7
7470 Tpbg: glicoproteína de trofoblasto 6,79 31,8 104 3,4415191 27 0,0474547 02 0,091993 1 11,83 66
2081 Tpil: Isomerase 498, 79,8 92,9 2,2962923 0,0368608 0,076738 14,48
2 de trisefosfato 1 9 1 4 6 8 01 86
2208 5 Lócus transcrito 7,42 50,2 4 1 4,2149333 1 0,0354107 65 0,072426 82 15,77 75
4361 8 Lócus transcrito 600, 2 448, 6 142, 5 1,9413714 72 0,0390625 0,074422 74 15,17 5
3027 9 Lócus transcrito 6,91 7,21 3,07 13,675034 87 0,0421621 62 0,081084 68 13,64 66
3194 Lócus transcrito 635, 513, 462, 1,6524328 0,0469613 0,089487 12,29
8 4 4 9 58 26 42 85
3652 1 Lócus transcrito 127, 8 62,8 6 77,9 8 2,1313494 85 0,0491143 32 0,094635 11,34 98
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1455 Lócus transcrito, 150, 243, 285, 2,2070186 0,0451354 0,084309 13,04
7 moderadamente similar a XP_574723.1 PREVISÃO: similar a LRRGT00097 [Rattus norvegicus] 5 5 7 82 06 6 36
3120 Lócus transcrito, 464, 244, 342, 2,1722713 0,0227272 0,052694 23,54
3 moderadamente similar a XP_417295.1 PREVISÃO: similar a proteína TAF3 [Gallus gallus] 4 1 7 92 73 81 82
1655 Trfp: Trf (fator de 668, 129 686, 1,9973050 0,0233236 0,054596 22,44
4 ligação relacionado a proteína TATA) homólogo de proteína aproximado (Drosophila) 7 7 1 29 15 7 2
1156 Trip11:integrador 193, 155, 127, 2,0814943 0,0378787 0,074941 14,93
6 receptor de hormônio da tiroide 11 4 1 5 98 88 08 76
3930 Troap: proteína 101, 44,1 107, 3,4012879 0,0251141 0,058531 20,08
5 associada a trofina 3 6 7 78 55 2 49
8651 Trpc2: canal de 398, 456, 182, 2,2044361 0,0235988 0,054857 22,50
cátion potencial receptor transiente, subfamília C, membro2 4 4 6 95 2 42 14
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 186/373
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1724 Ttk: quinase de 291, 218, 142, 2,2783830 0,0378590 0,074299 15,19
7 proteína Ttk 1 8 2 87 08 39 1
2070 Tubb2b: tubulina, 901, 130 685, 1,7391639 0,0283224 0,060428 19,55
4 beta 2b 7 4 8 56 4 47 61
1904 Ube2a: ubiquitina conjugadora de enzima E2A, RAD6 homólogo (S. cerevisiae) 208 371, 1 379, 5 2,1109688 31 0,0364010 99 0,072719 78 15,62 37
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
6873 Ube2i /// L00546265 178, 412, 456, 1,8293690 0,0491935 0,094602 11,35
/// LOC669417: ubiquitina conjugadora de enzima E2I /// similar a Cadeia A, ubiquitina humana conjugadora de enzima Ubc9 /// similar a ubiquitina conjugadora de enzima E2 I (Ubiquitin-protein ligase I) (proteína carregadora de ubiquitina I) (SUMO-1-proteína ligase) (SUMO-1-enzima de conjugação) (ubiquitina conjugadora de enzima UbcE2A) 7 2 5 83 48 15 61
3406 Ube2w: ubiquitina 64,1 66,4 62,1 2,9031102 0,0322580 0,070358 16,43
6 conjugadora de enzima E2W (putativa) 4 1 25 65 42 71
3030 Umodl 1: similar a 140, 315, 169, 3,3404151 0 0,029523 59,06
5 uromodulina 1 4 4 7 55 81 22
2717 Unc5a: unc-5 71,2 19,8 14,9 4,5439757 0,0369487 0,076313 14,52
0 homólogo A (C. elegans) 5 4 08 49 07 35
1887 Vi12: villin 2 56,9 39,1 59,7 2,8095033 0,0385964 0,077559 14,30
7 4 3 5 71 91 45 7
3664 Wdr27: WD domínio 74,5 75,4 48,4 2,9259030 0,0375 0,074883 14,89
0 repetido 27 1 5 7 02 33 53
4043 Wdr40b: WD domínio 177, 333, 44,2 2,5098644 0,0340236 0,071331 16,10
8 repetido 40B 8 6 8 77 69 36 14
2021 Wdr82: WD domínio 439, 334, 377, 1,7541416 0,0474174 0,092209 11,73
6 repetido contendo 82 9 8 7 21 43 99 17
4471 Wfdc3: WAP domínio 83,5 153, 181, 2,9187617 0,0246478 0,050950 24,44
0 de núcleo quartodisulfida 3 3 4 2 08 87 7 57
4516 X1 r3a /// X1 r3b /// MGC76689: 206 332, 5 245 1,9109458 36 0,0368171 02 0,076694 38 14,48 46
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 187/373
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
regulado por linfócito ligado a X 3A /// regulado por linfócito ligado a X 3B /// proteína hipotética LOC574437
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
6776 Xmr /// L00546272 /// LOC619991 /// LOC664810 /// LOC664861 /// LOC664877 /// LOC664890 /// LOC664906 /// LOC664923 /// LOC664944 /// LOC664989: proteína Xmr /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar à proteína 3 do complexo Sinaptonemal (SCP3) /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose///similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose 93,2 2 113 120, 7 2,4534183 98 0,0294117 65 0,066291 81 17,49 67
6777 Xmr /// L00546272 /// LOC619991 /// LOC664810 /// LOC664861 /// LOC664877 /// LOC664890 /// LOC664906 /// LOC664923 /// LOC664944 /// LOC664989: proteína Xmr 105, 7 134, 5 133, 3 2,3049450 55 0,0388601 04 0,074490 5 15,14 75
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183/357
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
/// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose/// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose /// similar à proteína 3 do complexo Sinaptonemal (SCP3) /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose ///similar to Xlrrelated, meiosis regulated /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose /// similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose ///similar ao relacionado a Xlr regulado por meiose
1513 Ywhaq: tirosina 3- 668, 504, 743, 1,5796780 0,0485611 0,090806 12,12
3 monooxigenase/triptó fano 5 protein de ativação de monooxigenase, teta polipeptídeo 7 4 9 45 51 35 7
Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
1486 Ywhaz: tirosina 3- 284, 439, 466, 1,9444036 0,0489566 0,094802 11,31
6 monooxigenase/triptó fano 5 protein de ativação de monooxigenase, zeta polipeptídeo 5 5 6 21 61 03 9
2739 Zarl: retenção de 36,1 73,3 105 4,1710964 0,0168539 0,040599 30,82
8 zigoto 1 4 4 6 33 25 99
8460 Zfp219: proteína 222, 276, 128, 2,1506131 0,0416221 0,081536 13,55
dedo de zinco 219 6 2 6 69 99 82 86
1572 Zfp3612: proteína 833, 104 686, 1,5871781 0,0478771 0,090538 12,15
9 dedo de zinco 36, C3H tipo similar a 2 5 1 1 86 45 99 4
2087 Zfp422-rsl: proteína 241, 450, 320, 1,7616652 0,0491539 0,094633 11,35
9 dedo de zinco 422, sequência relacionada 2 1 3 71 08 36 27
2473 Zfp444: proteína 45,9 75,6 121 5,6358813 0,0412026 0,080449 13,83
1 dedo de zinco 444 1 8 6 73 15 48
7994 Zfp503: proteína dedo de zinco 503 46,1 7 549 78,6 4 4,7196431 8 0,02 0,036 49,70 65
7995 Zfp503: proteína 17,3 48,1 62,9 3,4522322 0,0475754 0,089884 12,25
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Colun a Gene NI2. 1 NI2. 2 NI.2. 3 Modulação FDR intermediá rio FDR médio T
dedo de zinco 503 4 8 25 8 11 07
4469 Zfp68: proteína dedo 260, 345, 315, 1,7987803 0,0371257 0,076443 14,53
1 de zinco 68 4 8 9 76 49 11 73
8911 Zfp71-rs1: proteína 55,7 138, 55,1 2,2905053 0,0434782 0,082520 13,46
dedo de zinco 71, sequência relacionada 1 2 6 3 11 61 33 58
1720 Zfp90: proteína dedo 38,9 17,6 56,8 5,4425266 0,0245398 0,054212 22,88
2 de zinco 90 5 3 58 77 68 85
1832 Zmat2: dedo de 110, 99,8 40,1 4,2180083 0,0239726 0,051335 24,08
zinco, tipo matrin 2 3 3 3 76 03 62 51
Tabela 8B
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
52 Receptor de transferrina 624,6 241,3 260,7 165 122 147
9 4 9 8,5 1,5 5,4
154 Fator de iniciação de translação 1574, 898,0 884,1 306 246 309
eucariótica 3, subunidade 8 05 6 8 4,3 4 1
785 transmembrana emp24 domínio de 158,9 64,18 182,5 508, 418, 577,
transporte de proteína contendo 6 7 6 83 62 06
178 catepsina B 725,9 401,0 413,6 148 129 159
5 6 3 8 0,9 7,2 9,4
436 Cassete de ligação de ATP, sub 415,1 244,3 320,8 937, 895, 108
9 família F (GCN20), membro 1 2 9 07 73 9,7
479 Proteína regulatória e mediadora de 143,6 100,6 83,34 547, 231, 463,
8 junção 2 4 49 34 45
479 Proteína regulatória e mediadora de 290,5 233,1 287,3 119 106 111
9 junção 2 5 8 4 0,9 1,5
518 acilfosfatase 1, tipo eritrócito (comum) 16,91 108,4 111,1 532, 571, 559,
1 9 9 02 18 42
712 Receptor de transferrina 689,3 491,5 251,3 142 122 122
6 9 8 8,2 7 1,1
108 gene RIKEN cDNA 9130011J15 285,5 256,1 271,5 782, 735, 749,
05 3 1 5 98 67 47
108 Sintase de fosfatidilserina 2 708,3 150,5 190,2 142 109 122
87 9 1 2 4,2 2,5 1,8
123 Fator similar a Kruppel 9 42,96 50,16 156,9 413, 485, 353,
67 6 31 3 82
138 Fator de transcrição geral IIIC, 27,87 16,57 35,71 474, 220, 217,
78 polipeptídeo 4 48 1 44
139 Fator de iniciação de translação 203,4 187,0 266,5 101 919, 998,
72 eucariótica 3, subunidade 6 8 5 6 3,4 72 66
140 Sintase de fosfatidilserina 2 602,8 152,2 203,2 115 870, 100
02 4 6 1 2,7 06 8,7
146 diacilglicerol kinase, epsilon 190,0 434,9 115,6 108 777, 733,
83 3 5 2 1,8 24 1
155 Família torsina 2, membro A 231,7 99,13 132,4 803, 625, 692,
04 4 51 23 06
157 acilfosfatase 1, tipo eritrócito (comum) 9,09 70,55 99,27 431, 432, 469,
13 09 79 83
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
157 Fator de iniciação de translação 117,8 107,2 148,8 614, 581, 595,
91 eucariótica 3, subunidade 6 8 1 7 35 81 12
181 22 acilfosfatase 1, tipo eritrócito (comum) 24,1 104,3 7 109,3 8 657, 52 691, 59 706, 49
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
183 Família transportadora de soluto 19 227,4 127,6 156,9 731, 478, 711,
75 (troca de sódio/hidrogênio), membro 3 4 6 5 75 33 17
191 Proteína da transmembrana 111 330,6 240,2 230,3 127 949, 808,
72 3 6 1 1,5 26 68
218 Fator similar a Kruppel 9 126,0 324,9 264,7 141 107 102
63 3 4 8 3,6 3,9 4,2
218 Fator de iniciação de translação 688,4 338,2 292,1 136 940 108
73 eucariótica 3, subunidade 8 5 2 2 7,9 2
221 49 Sintase de fosfatidilserina 2 1200, 27 227,6 292,5 5 241 6,8 192 2 206 3,5
224 Fator de iniciação de translação 253,4 148,8 203,4 867, 627, 653,
19 eucariótica 3, subunidade 6 2 9 2 23 04 69
272 Segmento de DNA, Cr 19, 566,7 267,2 1036, 151 121 216
13 Brigham&Women's Genetics 1357 expresso 4 42 3,8 3 6,7
282 04 galactosidase, beta 1 426,3 9 169,6 51,27 171 3,4 170 7,9 191 9
286 32 domínio anquirina repetido 38 29,64 6,72 16,18 346, 3 291, 12 247, 57
298 67 gene RIKEN cDNA 4933433K01 145,7 8 41,38 31,11 448, 82 321, 98 385, 46
333 96 Lócus transcrito 352,3 82,9 105,8 7 670, 9 481, 47 592, 69
410 50 RIKEN cDNA 4930427A07 gene 225,0 6 114,1 1 217,2 462, 21 493, 17 756, 34
290 64 peptidase específica de ubiquitina 22 470,0 8 134,2 5 91,36 877, 44 673, 24 719, 13
217 Fator de iniciação de translação 873,5 406,6 383,8 153 118 144
59 eucariótica 3, subunidade 8 8 5 9 7,6 4,1 4,6
221 Proteína ribossomal L24 /// similar a 1172, 672,1 952,2 178 143 194
91 proteína ribossomal L24 /// similar a proteína ribossomal L24 49 9 1,4 0,2 6,1
293 sirtuina 1 (regulação das informações 159,7 122,5 182,7 551, 431, 568,
5 do tipo de acasalamento 2, homólogo) 1 (S. cerevisiae) 8 3 1 66 36 18
437 Cassete de ligação de ATP, sub 427,9 279,0 441,2 110 946, 126
0 família F (GCN20), membro 1 5 1 6 0,4 89 6
161 22 Lócus transcrito 93,98 30,44 15,4 215, 29 193, 76 209, 2
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
153 Fator de iniciação de translação 475,1 206,1 253,0 110 888, 784,
eucariótica 3, subunidade 8 4 9 3 8,7 34 61
802 Cassete de ligação de ATP, sub 152,1 156,9 162,9 363, 305, 451,
2 família F (GCN20), membro 2 9 1 7 57 96 65
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
284 57 Família transportadora de soluto 30 (troca de zinco), membro 1 233,4 2 27,36 61,68 315, 4 343, 75 619, 79
218 Similar a tioredoxina 2 294,5 175,6 266,0 909, 693, 804,
24 2 8 5 58 73 9
738 9 Inositol polifosfato-5 fosfatase E 25,77 21,31 39,99 241, 41 177, 04 187, 24
168 08 catepsina B 130,2 3 101,7 7 67,38 288, 01 181, 13 261, 76
392 1 -acilglicerol-3-fosfato O-aciltransferase 499,5 525,4 363,1 121 110 106
14 5 (ácido lisofosfático aciltransferase, epsilon) 4 7 4 0,6 8,5 6,1
339 9 Domínio abidrolase contendo 6 156,9 9 100 43,52 553, 9 326, 89 296, 3
53 Receptor de transferrina 409,3 2 206,6 2 95,99 595, 48 591, 14 503, 44
979 1 PQ ciclo de repetição contendo 2 13,76 7,56 6,29 292, 48 156, 56 55,4 5
712 Receptor de transferrina 361,0 329,3 377,0 974, 842, 895,
5 1 9 7 9 63 37
149 50 Iniciação de translação eucariótica fator 2C, 5 44,09 7,7 7,32 207, 56 115, 15 151, 62
182 50 Ativação de peptase apoptótica fator 1 36,46 51,69 50,02 277, 53 197, 48 388, 51
106 jumonji, domínio de interação rico AT IC 55,24 122,7 112,5 314, 218, 459,
57 (similar a Rbp2) 7 9 35 11 64
439 11 gb:BM122336 /DB_XREF=gi:17106104 /DB_XREF=L0508F03-3 /CLONE=L0508F03 /FEA=EST /CNT=3 MD=Mm.218397.1 /TIER=ConsEnd /STK=2 /UG=Mm.218397 /UG T1TLE=ESTs 75,29 12,69 9,34 166, 18 32,2 5 202, 06
187 Fator de alongamento de translação B 231,4 240,0 198,8 638, 629, 741,
03 (SIII), polipeptídeo 3 4 4 9 35 15 99
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
162 Proteína protetora para 474,0 446,2 267,9 111 569, 135
04 Galactosidase beta 9 1 6 7,8 65 0,3
153 Proteína de seleção vacuolar 54 714,9 245,4 144,2 153 886, 104
95 (levedura) 4 9 5,2 77 8,1
498 0 esfingosina-l-fosfato fosfatase 1 262,0 3 173,6 9 51,88 121 5,3 589, 36 577, 14
54 Receptor de transferrina 434,3 5 354,1 332,5 5 113 8,5 818, 28 858, 07
279 02 Canal retificador interno de potássio, subfamília K, membro 6 44,82 139,1 4 63,27 323, 91 232, 15 319, 5
398 02 neuropilina (NRP) e toloide (TLL) similar a 2 87 64,53 146,3 8 522, 51 475, 14 750, 45
384 Proteína ribossomal S15 256,8 7 118,9 8 155,0 5 330, 72 201, 23 113 5,8
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
646 /DB XREF=gi:14010854 228,1 205,4 238,3 906 787, 785,
6 /GEN=Usmg3 /FEA=FLmRNA /CNT=2 CTID=Mm.218588.1 /TIER=FL /STK=I /UG=Mm.218588 /LL=83678 /DEF=Mus super regulação dos músculos durante o crescimento musculus dos músculos do esqueleto 3 (Usmg3), mRNA. /PROD= superregulação 2 4 2 64 29
347 Proteína de seleção vacuolar 33A 315,2 115,5 221,5 607, 456, 589,
66 (levedura) 1 3 77 63 67
388 85 RNA, U transportador 1 515,7 9 234,6 7 214,8 722, 54 562, 88 810, 9
882 1 peptidase (processamento mitocondrial) alfa 73,11 56,51 41,28 381, 32 318, 1 307, 73
104 gene RIKEN cDNA 2610028H07 638,9 517,0 757,2 138 128 154
48 5 6 5 7 2,6 0,6
140 Sintase de fosfatidilserina 2 252,1 121,8 137,3 847, 360, 528,
01 9 1 7 59 31 7
215 27 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) polipeptídeo box 49 173,5 2 35,84 59,84 496, 4 167, 03 182, 83
293 44 Ceco masculino adulto cDNA, RIKEN biblioteca enriquecida completa, clone:9130409M07 produto:proteína hipotética, sequência de inserção completa 90,7 19,1 227,8 3 613, 93 432, 25 327, 99
135 gene RIKEN cDNA 9430010O03 1276, 930,3 852,5 212 152 227
79 81 9 8 8,7 4,5 0,8
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
869 proteína quinase interativa com 703,0 358,7 437,4 128 954, 118
9 homeodomínio 1 8 5 3 1,1 65 5,9
160 53 Sequência expressa C77815 226,9 8 68,5 120,2 1 355, 27 288, 1 364, 69
332 70 gene modelo 104, (NCBI) 167,8 8 96,62 189,6 1 623, 96 423, 95 354, 11
395 Família transportadora de soluto 25, 196,3 138,0 287,8 552, 426, 612,
1 membro 36 1 7 7 92 31 23
824 7 Gene proliferador de melanocita 1 38,3 8,3 8,89 124, 7 125, 7 87,6 3
249 77 Complexo de reconhecimento de origem, subunidade similar a 4 (S. cerevisiae) 64,74 3,28 40,64 285, 69 259, 43 282, 71
288 minicromossomo manutenção deficiente 521,1 337,3 431,7 140 119 129
87 5, ciclo de divisão celular 46 (S. cerevisiae) 9 2 7 5,9 9,3 6,8
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
447 78 gb:BB473929 /DB_XREF=gi:16439785 /DB_XREF=BB473929 /CLONE=D330003M06 /FEA=EST /CNT=5 MD=Mm.214471.1 /TIER=ConsEnd /STK=3 /UG=Mm.214471 /UG_TITLE=ESTs, levemente similar a POLIPROTEÍNA ENV RELACIONADA A RETROVÍRUS HUMANO (H.sapiens) 186,5 5 85,65 81,04 314, 37 247, 68 303, 97
957 4 Família transportadora de soluto I (transportador de glutamato com alta afinidade neuronal/epitelial sistema Xag), membro 1 86,76 56,92 100,4 2 341, 84 267, 96 357, 7
832 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) polipeptídeo 112,5 127,6 180,3 447, 410, 494,
0 box 27 6 4 5 67 04 24
513 7 Fator de respiração nuclear 1 96,06 22,21 58,59 206, 74 207, 72 216, 54
122 40 Similar a kelch 21 (Drosophila) 945,8 323,3 2 551,7 4 128 6,9 107 1,9 140 7,3
137 5 Sinal intermediário em caminho Toll evolucionariamente conservado 36,01 35,11 41,82 287, 35 199, 74 197, 73
203 42 Membro da família quinesina 11 285,4 9 271,4 175,2 3 802, 55 400, 74 666, 11
322 15 gene RIKEN cDNA 4833426J09 123,1 9 52,54 98,29 403, 04 266, 83 290, 65
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
403 16 Interrompido em carcinoma renal 2 (humano) 76,89 53,93 138,9 311, 28 272, 58 273, 85
224 Proteína ribossomal L37a 1002, 507,9 700,1 136 108 150
48 33 6 3 9,4 6,7 8,1
148 similar a tripartite principal 2079, 1375, 1494, 382 315 368
83 contendo 43 61 77 31 1,7 6,2 6,6
175 dolicol-fosfato (beta-D) 258,6 211,6 223,0 752, 658, 688,
14 manosiltransferase 1 6 1 9 95 07 27
204 Receptor de interleucina D 209,3 454,2 402,8 121 961, 101
98 3 6 7 8,7 8 8,6
869 1 YLP principal contendo 1 212,1 5 172,3 7 259,8 629, 55 420, 34 439, 07
136 3 Proteína tirosina fosfatase, tipo não receptor 1 179,4 4 81,35 70,37 316, 61 354, 23 389, 06
470 7 gene RIKEN cDNA 2310008H09 197,9 4 200,3 4 46,69 511, 26 431, 89 592, 74
295 82 Domínio HECT contendo1 631,0 8 441,6 2 450,4 119 8 860, 21 110 1,7
120 piridoxal (piridoxina, vitamina B6) 799 486,4 774,6 135 120 146
90 quinase 5 6 3,4 7,1 5,8
190 Proteína associada com receptor de 467,7 406,2 272,9 836, 845, 926,
76 célula B 31 9 5 3 98 26 32
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
220 Segmento de DNA, Cr 9, ERATO Doi 78,25 101,4 110,2 395, 368, 211,
59 720, expresso 5 4 68 76 62
149 68 Linhagem Casitas B similar a linfoma I 59,21 39,31 73,98 227, 96 165, 93 243, 84
364 6 gene RIKEN cDNA 0610007P06 95,48 69,48 144,3 7 251, 3 275, 76 304, 24
760 Peptidase caseinolítica X (E.coli) 305,0 204,2 250,9 827, 642, 720,
6 8 3 3 98 13 65
146 Segmento de DNA, Cr 19, ERATO Doi 1485, 1003, 618,9 228 167 168
23 721, expresso 68 23 2 2,7 4,9 4
217 40 Peptidase específica de ubiquitina 22 61,29 89,92 72,62 339, 83 313, 96 288, 37
408 44 gene RIKEN cDNA A530082C11 103,0 2 148,6 2 109,7 459, 34 222, 66 476, 49
418 Segmento de DNA, Cr 14, Abbott 1 186,9 203,5 137,6 493, 316, 653,
46 expresso 1 3 6 13 45 17
123 66 Fator similar a Kruppel 9 16,35 11,35 21,12 152, 11 133, 07 165, 7
162 75 Domínio de repetição de anquirina 10 957,7 7 535,9 6 734 179 1,6 140 2,8 150 8,8
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
155 Família transportadora de soluto 44, 306,3 221,4 247,3 842, 546, 703,
13 membro 2 8 5 9 17 42 47
301 DEAD/H (Asp-Glu-Ala 298,2 107,9 733,5 541, 894, 208
36 Asp/His) polipeptídeo box 31 9 4 6 89 27 8,9
544 3 fosfatidilinositol glicano, classe N 16,63 32,81 16,53 182, 07 166, 32 169, 44
114 Fator de divisão, rico em erginina/serina 1024, 1160, 1136, 209 188 196
92 15 /// similar ao fator de divisão, rico em erginina/serina 15 33 82 04 7 6,9 8,6
512 Proteína ribossomal L37a 554,1 3 423,0 4 428,1 1 112 6,8 809, 26 769, 11
195 TAF9 RNA polimerase II, proteína de 311,5 245,5 144,1 955, 630, 651,
36 ligação box TATA (TBP)-fator associado 3 6 3 42 33 71
139 Similar a bolA 2 (E. coli) 1123, 508,8 707,5 160 111 118
81 84 3 2 7 1,3 2,5
163 39 CNDP dipeptidase 2 (família metalopeptidase M20) 29,26 96,28 61,29 542, 76 229, 08 165, 59
405 Gene RIKEN cDNA D330037H05 2109, 1591, 1770, 328 299 323
77 /// similar a proteína relacionada com La 4 (membro da família ribonucleoproteína La principal 4) /// similar a proteína relacionada com La 4 (membro da família ribonucleoproteína La principal 4) 33 5 31 2,8 8,5 8,5
230 71 gene RIKEN cDNA 3300001M20 252,8 1 164,8 211,2 1 708, 72 562, 73 499, 17
517 gene RIKEN cDNA 1700021F05 1666, 665,5 1064, 232 189 209
8 18 5 07 7,8 9,1 4,8
965 Receptor de proteína morfogenética do 216,8 211,0 155,2 631, 531 550,
0 osso, tipo IA 5 7 4 62 21
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
209 Proteína ribossomal S15a 1300, 959,5 1013, 228 190 202
27 6 3 49 1,4 8 0,4
901 L-2-hidroxiglutarato 651,8 266,1 527,1 103 590, 965,
7 de-hidrogenase 6 8 2 4,2 33 17
190 Proteína ribossomal S25 1492, 819,2 1298, 195 163 206
95 69 4 17 1 4,9 9,3
231 gene RIKEN cDNA 4933417E01 1387, 981,0 1339 234 172 196
46 41 3 2,5 5,8 5,4
141 Proteína ribossomal L37 /// similar a 2088, 1026, 1539, 232 198 285
22 proteína ribossomal L37 46 24 86 5,4 0,6 8,3
191 Família transportadora de soluto 12, 967,3 592,9 609,8 165 110 140
8 membro 2 9 3 4 7,9 3 7,2
920 prolina, ácido glutâmico e proteína rica 510,0 270,1 230,8 665, 602, 521,
1 em leucina 1 7 7 3 9 67 24
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
798 gene RIKEN cDNA 2610012O22 269,1 194,8 225,6 623, 421, 548,
2 5 1 68 41 5
604 Homólogo Son of sevenless 1 324,0 248,6 173,5 684, 368, 779,
5 (Drosophila) 6 1 56 73 87
823 gene RIKEN cDNA 2900073H19 238,9 108,1 83,52 574, 220, 424,
8 9 5 46 64 2
108 fosfatase 1G (anteriormente 2C), 787,6 715,8 989,8 183 167 177
7 isoforma gama dependente de 5 7 7 6,5 0,7 7,8
magnésio
122 Família transportadora de soluto 44, 389,9 279,4 239,5 762, 891, 732,
24 membro 2 9 9 8 05 14 46
837 poli (A) polimerase alfa 27,35 12,11 9,5 148, 91,7 167,
6 02 2 2
156 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) polipeptídio 1421, 650,2 836,9 135 168 172
35 box 54 61 8 2 4,5 5,8 7,6
222 domínio WD repetido 81 30,24 51,94 30,12 149, 94,9 145,
24 76 4 32
696 Criptidina relacionada a defensina 3 151,4 120,2 161,9 432, 333, 435,
1 7 4 6 42 51 02
281 Fator de transcrição de elemento de 1221, 1231, 963,6 214 157 202
1 ligação de resposta metálica 2 23 8 3 8,1 3,3 9
386 Similar a tioredoxina 2 /// similar a 256,9 121,8 146,1 592, 461, 532,
60 similar a tioredoxina 2 3 9 86 89 76
192 Subunidade de proteassoma 308,0 183,7 228,7 497, 390, 588,
32 (prossoma, macropain), beta tipo 4 3 4 19 48 01
713 GCN5 controle geral de aminoácido 166,7 199,3 129,4 236, 512, 594,
0 similar a síntese 2 (levedura) 7 7 2 69 49 15
391 proteína fosfatase IA, 928,9 352,1 441,2 127 106 125
48 dependente de magnésio, isoforma alfa 1 7 6 6,6 5,7 7
207 gene RIKEN cDNA 6330412F12 1221, 833,7 1060, 202 185 230
60 12 6 24 6,1 6,5 9,3
302 gene RIKEN cDNA D630023B12 231,8 124,8 215,7 650, 584, 451,
88 8 4 6 87 15
613 Matriz de metalopeptidase 19 680,5 322,9 248,8 103 954 994,
6 2 9 9 4,6 51
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
504 glutamato de-hidrogenase 1 522,6 2 453,1 9 388,2 5 953, 35 635, 51 724, 4
198 acyl-CoA membro da família de cadeia 127,1 124,6 134,3 543, 402, 284,
55 longa sintetase 4 8 8 08 43 25
109 metionil aminopeptidase 1 241,6 153,5 132,5 424, 450, 589,
96 6 6 9 1 43 31
121 Fator de ligação do molde B2 210,7 107,7 267,2 331, 464, 121
46 4 5 2 79 58 7,3
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
144 Fator de iniciação de translação 608,3 392,9 580,6 106 641, 821,
56 eucariótica 4E membro 2 1 2 3,5 07 13
242 Proteína ribossomal S21 2211, 1389, 1767, 305 265 323
72 44 97 7 7,7 9,7 8,2
201 Histocompatibilidade 47 1061, 593,1 563,7 160 127 133
22 18 3 8 1,4 3,8 7,6
182 9 integrin beta 5 20,55 31,81 35,62 138, 64 106, 21 113, 56
882 0 peptidase (processamento mitocondrial) alfa 103,3 2 47,96 17,42 213, 06 180, 94 210, 53
863 polimerase (RNA) II (direcionado ao 546,8 407,8 194,5 750, 562, 678,
2 DNA) polipeptídio H 9 9 55 77 85
183 09 Fator de crescimento de fibroblasto 4 35,44 14,3 20,86 432, 43 172, 1 100, 94
298 Domínio repetido de anquirina 35 194,2 126,0 115,6 458, 307, 358,
55 1 7 2 93 25 15
238 Gene RIKEN Cdna 4632434i11 448,8 431,7 363,6 671, 596, 936,
08 6 3 2 77 73 9
167 antígenos de células de carcinoma 321,8 208,5 257,4 621, 329, 867,
34 escamosas reconhecidas por células T 1 4 7 8 17 5 92
204 Fator de divisão, rico em arginina/serina 1714, 1723, 1637, 261 253 253
23 15 /// similar a fator de divisão, rico em arginina/serina 15 9 34 59 4,4 8,8 7,6
215 Proteína ribossomal L41 2356, 1636, 2315, 350 320 359
33 65 04 68 6,7 3,3 0,5
113 gb:AV003927 1053, 887,1 842,4 154 158 187
78 /DB_XREF=gi:4780777 /DB_XREF=AV003927 /CLONE=0610038F02 /FEA=mRNA /CNT=8 /TID=Mm.89136.2 /TIER=Stack /STK=8 /UG=Mm.89136 /LL=15078 /UG_GENE=H3f3a /UG_TITLE=H3 histona, família 3A 61 1 6 3,8 4,5 5,9
105 Domínio da família Yipl, membro 4 1301, 782,3 716,9 165 141 167
75 23 3 5 2,4 4,2 2,3
270 86 Gene R1KEN cDNA 6720458F09 514,6 2 69,3 305,0 5 616, 13 470, 79 506, 67
789 WD domínio de repetição 36 254,3 272,4 200,2 610, 547, 595,
4 8 7 9 23 12 16
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
202 UTP20, subunidade pequena (SSU) 265,6 117,4 77,53 395, 294, 367,
79 componente de processoma, homólogo (levedura) 4 7 94 27 33
182 8 integrin beta 5 24,85 44,95 37,18 101, 84 100, 6 157, 78
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
110 29 F-única proteína caixa 33 352,6 363,6 5 331,0 7 680, 26 745, 22 715, 11
296 Fator de transcrição associado a BCL2 2093, 1414, 1845, 304 261 289
19 1 59 28 33 5,3 3,5 3,6
797 2 Membro da família quinesina 22 361,6 5 356,4 2 276,4 873, 55 734, 19 599, 86
208 fator de transcrição de ligação montante 926,9 606,3 732,7 149 977, 129
55 de polimerase de super RNA I 5 7 9 9,9 24 6,7
393 7 Proteína de ligação rica em elemento purina B 92,81 87,2 83,07 292, 59 182, 12 245, 32
155 56 ataxina 10 17,33 32,34 12,45 228, 41 198, 1 179, 58
323 18 Proteína de ligação de nucleotídeo guanina (proteína G), beta similar a polipeptídio beta 1 38,16 26,14 37,97 167, 8 192, 62 140, 2
208 transportina 3 498,7 536,3 322,8 105 938, 988,
65 1 9 5 5,4 14 25
498 esfingosina-l-fosfato 1139, 516,9 256,5 155 138 152
1 7 6 1 6,5 6,4 2,7
197 gb:M11310.1 324,9 291,6 351,8 787, 359, 481,
30 /DB_XREF=gi:192009 /FEA=FLmRNA /CNT=3 MD=Mm.1786.2 /TIER=FL /STK=2 /UG=Mm.1786 /LL=11821 /UG_GENE=Aprt /UG_TITLE=adenina fosforibosil transferase /DEF=Adenina Fosforibosiltransferase de camundongo (APRT), CDs. completo /FL=gb:M11310.1 6 4 8 01 57 37
226 36 glutamina frutose-6-fosfato transaminase 1 91,19 137,7 2 9,09 335, 73 165, 1 314, 89
292 Enzima conjugadora de ubiquitina E2H 294,3 174,3 235,2 787, 546, 553,
6 4 8 4 87 3 52
273 58 Gene RIKEN cDNA 9630055N22 /// proteína relacionada ao receptor do subgrupo C similar ao vírus de leucemia felina relacionada a (receptor do subgrupo C similar ao vírus de leucemia felina) (hFLVCR) 51,52 68,1 41,88 364, 66 211, 27 222, 89
930 Seleção de nexina 6 301,1 372,1 208,1 830, 453, 637,
7 2 4 2 58 64 73
169 24 Família torsina 1, membro B 614,5 6 254,0 5 272,1 102 8,7 649, 17 887, 96
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
134 Gene RIKEN cDNA 1700081L11 279,8 322,0 289,7 766, 332, 382,
06 6 8 08 23 41
426 Fator de terminação de translação 631,4 328,7 441,0 971, 138 108
7 eucariótico 1 6 3 6 21 9,4 8,4
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
109 nucleoporina 107 200,9 280,2 189,5 608, 413, 503,
10 1 1 3 9 29 35
350 Domínio de correção G contendo 4 532,7 280,1 245,5 950, 529, 789,
0 4 1 4 82 03 31
168 Família transportadora de soluto 12, 171,3 87,64 209,0 527, 337, 487,
56 membro 2 4 4 45 21 48
233 Complexo GINS subunidade 3 (Psf3 212,7 16,22 83,74 345, 181, 376,
53 homólogo) 5 6 35 3
115 Proteína associada com receptor de 409,8 226,8 478,0 731, 781, 771,
67 hormônio tiroide 3 9 4 1 74 37 17
201 Gene RIKEN cDNA D230025D16 566,9 244,7 230,8 773, 545, 752,
23 9 2 5 96 87 66
230 gene modelo 608, (NCBI) 19,79 34,73 13,36 118, 152, 170,
22 5 45 4
957 sarcosina de-hidrogenase 102,8 51,26 39,67 276, 330, 409,
5 87 62 42
117 integrina beta 4 proteína de ligação 1478, 784,1 1168, 214 169 202
37 64 2 22 0,2 6,4 7,5
124 Subunidade de complexo integrante 7 15,64 11,95 9,45 107, 81,0 69,1
67 56 4 7
286 Sequência de cDNA BC031781 206,5 200,1 102,8 539, 415, 426,
96 1 87 28 91
261 dodecenoil-Coenzima A delta isomerase 213,1 144,8 245,4 656, 765, 443,
6 (3,2 trans-enoil-Coenzima A isomerase) 6 6 9 83 69 88
167 Proteína associada a receptores Traf e 86,91 90,66 92,25 320, 262, 310,
82 Tnf 57 64 65
172 Homólogo similar a piwi 2 (Drosófila) 194,8 162,1 83,38 485, 471, 370,
46 8 8 71 02 39
282 Proteína de dedo ZINC 297B 346,2 252,8 249,9 689, 506, 491,
63 2 2 8 62 85 93
138 CCR4-NOT transcrição complexa, 624,5 555,9 435,9 100 854, 113
52 subunidade 1 4 4 9 3,5 27 1,5
232 Biogênese de complexo de organelas 79,81 76,06 64,03 325, 170, 148,
77 associadas relacionadas a lisossoma 1, 63 46 71
subunidade 2
427 Gene RIKEN cDNA 2010002M12 174,4 77,58 21,59 574, 290, 438,
53 9 43 32 63
201 Sequência de cDNA BC038286 125,9 73,92 68,54 284, 290, 209,
91 7 36 06 54
397 /DB XREF=gi:12854789 615,3 546,5 659,8 118 113 124
06 /GEN=Hipk1 /FEA=mRNA /CNT=3 /TID=Mm.160710.1 4 9 8 2,5 1,4 5,5
MER=ConsEnd /STK=2
/UG=Mm.160710
/UG_TITLE=Mus músculos
testis masculinos adultos cDNA, RIKEN
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
biblioteca enriquecida completa, clone:4930557G23:proteína quinase interativa com homeodomínio 1, inserir completamente sequência /DEF= Mus músculos testis masculinos adultos cDNA, RIKEN biblioteca enriquecida completa, clone:4930557G23:proteína quinase interativa com homeodomínio 1,
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
273 10 Domínio de correção G e KOW principal 61,52 159,0 3 86,57 532, 82 393, 07 275, 19
156 Proteína de dimerização Max. 3 231,8 142,1 388,8 680, 398, 172
31 7 8 3 62 74 6,9
179 translocase de membrana de 445,4 218,4 297,3 123 550, 497,
4 mitocôndria interior 10 homólogo (levedura) 3 7 8 7,7 92 86
403 Gene RIKEN cDNA A230097K15 542,5 392,9 536,7 113 943, 714,
94 6 4 2 5,4 8 8
139 citocromo c oxidase, subunidade XVII 374,3 512,8 771,2 156 816, 123
32 homólogo de montagem de proteína (levedura) 6 7 7 0,4 01 1,3
125 Fosfoproteína nucleolar e com corpo em 1396, 962,2 1269, 243 171 212
83 espiral 1 29 8 5 3,1 2,7 9
447 Gene RIKEN cDNA 2610510H03 gene 1694, 1302, 1307, 215 219 258
33 62 55 24 4,8 7,4 0,1
240 Gene RIKEN cDNA 6330548622 1941, 1205, 1387, 292 248 269
57 19 89 66 2,2 8,6 1
997 9 Domínio de correção G contendo 4 1180, 84 937,7 5 328,1 234 1,4 122 8,2 195 3,3
153 79 sorbitol de-hidrogenase 27,38 63,24 77,06 217, 25 225, 56 241, 16
139 5 CD320 antígeno 376,3 186,4 5 150,9 5 519, 75 347, 27 458, 89
101 Proteína quinase interativa com 162,2 95,7 238,8 242, 377, 282,
47 homeodomínio 1 /// similar a proteína quinase interativa com homeodomínio I 2 8 84 63 15
404 Dedo de zinco e domínio BTB contendo 154,1 137,4 107,7 393, 317, 313,
08 11 6 7 6 41 18 89
123 44 Família de domínio La ribonucleoproteína, membro 1 /// similar a isoforma da proteína relacionada 1 383,9 74,36 193,3 8 510, 75 581, 65 447, 49
801 proteassoma (prossoma, macropain) 317,4 182,7 245,9 577, 392, 559,
subunidade, tipo alfa 6 1 5 8 9 79 5
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
123 gb:AW545056 575,8 256,8 387,0 829, 524, 892,
65 /DB_XREF=gi:7187569 /DB_XREF=C0190C04-3 /CLONE--00190C04 /FEA=mRNA /CNT=182 MD=Mm.29909.1 /TIER=Stack /STK=60 /UG=Mm.29909 /LL=69023 /UG_GENE=1810005K14Rik /UG_TITLE=geneRIKEN cDNA 1810005K14 1 6 02 34 94
135 Gene RIKEN cDNA 9430010003 252,1 205,7 110,4 548, 407, 529,
80 1 5 4 01 24 86
290 34 jumonji, domínio interativo rico em AT IA (similar a Rbp2) 37,2 22,61 18,65 222, 58 113, 9 160, 57
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
863 Síndrome de Bardet-Biedl 2 Homólogo 145,6 71,74 140,9 337, 236, 247,
7 (humano) 7 7 79 48 56
219 32 Locus transcrito 449,0 7 163,8 1 87,36 583, 75 309, 89 572, 13
244 71 Família do domínio TSC22 2 1111, 19 838,9 701,3 5 153 0,6 131 8,9 145 3,7
127 transportina 3 236,7 170,0 152,0 455, 333, 459,
13 7 7 7 61 47 35
423 5 Proteína de dedo ZINC 644 25,19 29,71 183,2 2 387, 55 173, 75 307, 41
279 Gene RIKEN cDNA 4933439C20/// 214,0 187,6 218,8 489, 385, 354,
56 fosfatidilserina decarboxilase 2 2 8 82 39 78
149 proteassoma (prossoma, macropain) 673,1 339,2 437,7 823, 814, 842,
45 subunidade, tipo alfa 6 7 6 3 99 83 51
831 CDNA IMAGEM clone :30031514 1455, 885,1 844,8 180 168 197
1 82 6 1 2,7 3,2 7,4
184 Antígeno estromal 2 448,6 362,2 221,0 114 777, 108
23 4 6 1 7,6 91 9,8
782 6 metionina adenosiltransferase II, alfa 1253, 06 613,2 6 919,4 148 2,9 137 2 165 2,5
839 6 Proteína de dedo ZINC 639 651,3 3 592 510,8 9 119 0,3 115 9,1 141 6,3
191 14 Domínio de repetição WD 36 205,6 3 144,9 3 118,6 423, 92 347, 67 404, 86
919 ubiquitina A-52 produto do resíduo da fusão da proteína ribossomal 1 /// similar a ubiquitina A-52 produto do resíduo da fusão da proteína ribossomal 1 /// similar a ubiquitina A-52 produto do resíduo da fusão da proteína ribossomal 1 /// similar a ubiquitina A-52 produto do resíduo da fusão da proteína ribossomal 1 1179, 37 800,7 703,0 2 129 0,2 167 0,2 134 4,1
610 Domínio brix contendo 1 189,1 152,8 356,9 579, 457, 505,
4 2 3 6 34 58 53
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
145 gene modelo 288, (NCBI) 611,1 289,5 223,8 897, 493, 694,
28 2 2 6 94 54 95
142 Proteína ribossomal S3 1603, 992,8 1195, 214 151 179
34 17 6 88 0 1 7,1
161 0 Proteína associada GRIP1 1 156,2 1 52,05 43,1 267, 72 230, 72 274, 17
607 arginil-tRNA sintetase 475,2 8 273,8 8 474,3 7 856, 71 656, 69 777, 19
815 7 Fator de transcrição geral MC, polipeptídio 5 212,0 8 99,85 122,9 316, 44 273, 49 369, 01
105 Receptor ativado de peroxissoma 902,3 445,3 392,6 113 999, 103
40 proliferativa, gama, Relacionado a coativador 1 3 1 2 9,4 53 3,5
175 91 Proteína de dedo ZINC 292 33,35 44,66 45,16 200, 8 146, 72 175, 4
167 histocompatibilidade 47 1837, 1122, 1324, 261 188 234
80 26 62 02 0 9,2 4,4
257 Fator de iniciação de translação 627,1 426,4 780,6 119 101 120
eucariótica 3, subunidade 3 (gama) 6 1 6 8,3 9,4 4,3
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
131 ribonucleoproteína A/B heterogênea 1618, 1405, 1477, 246 209 249
01 nuclear 69 47 8 3,2 4 8,9
335 25 Locus transcrito 83,97 35,52 295,5 1 432, 87 220, 51 436, 57
256 Proteína ribossomal L30 /// similar a 1254, 735,9 965,5 168 159 194
8 proteína ribossomal L30 /// similar a proteína ribossomal L30/// similar a proteína ribossomal L30 /// similar a proteína ribossomal L30 95 5 4 9,5 6,4 3,3
751 7 Gene RIKEN cDNA 1810009K13 143,6 2 57,05 68,62 322, 65 136, 04 252, 87
196 TIP41, similar a caminho de sinalização 1754, 1366, 1274, 238 210 207
14 regulador TOR (S, cerevisiae) 37 54 92 3,4 8,3 0,9
598 Proteína fosfatase 2 (anteriormente 2A), 551,4 339,4 280,1 775 546, 692,
2 subunidade catalisadora, isoforma beta 8 8 5 79 17
987 Proteína de ligação do vírus influenza 975,1 492,6 387,2 858, 991, 116
7 NS1A 8 5 3 37 15 3,2
168 Similar a segregação de cromossomas 121,0 97,77 145,6 350, 345, 378,
85 1 (S, cerevisiae) 7 6 27 42 07
291 92 Fator específico de clivagem e poliadenilação 6 17,6 44,66 34,12 174, 3 133 221, 06
873 transmembrana emp24 domínio de 207,7 120,4 223,0 611, 436, 466,
3 transporte de proteína contendo 5 2 1 94 79 68
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
864 /DB XREF=gi:14318706 180,9 186,1 138,7 443, 379, 493,
2 /FEA=FLmRNA /CNT=134 MD=Mm,29500,1 MER=FL+Stack /STK=29 /UG=Mm,29500 /DEF=Mus musculos, proteína hipotética FLJ10788, clone MGC:6884 IMAGE:2651599, mRNA, cds completo, 1 2 5 86 97 4
277 36 Gene RIKEN cDNA C730049014 468,5 5 201,7 280,6 9 854, 88 650, 64 580, 29
151 65 glutaredoxina 2 (tioltransferase) 187,3 1 23,63 26,17 284, 27 207, 99 195, 31
347 73 Domínio de dupla espiral contendo 66 327,6 5 244,5 6 99,43 681, 69 370, 27 538, 09
221 hexosaminidase B 466,7 254,8 157,9 680, 374, 443,
70 6 6 5 55 26 5
417 02 PREVISÃO: Mus músculos similares a aspartoacilase-3 (LOC629627), mRNA 52,96 7,24 13,47 124, 13 107, 95 76,9 4
859 9 Proteína ribossomal mitocondrial S6 84,99 90,76 80,52 172, 16 157, 7 188, 73
127 68 Proteína de dedo ZINC 644 15,61 32,03 46,1 366, 23 40,0 6 93,4 1
199 05 Proteína regulatória e de mediação de junção 169,1 3 233,3 148,2 9 543, 3 293 427, 21
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
139 Similar a bolA 2 (E, coli) 640,9 283,5 474,8 891, 567, 705,
83 3 1 9 08 86 83
125 Fator de transcrição associado a BCL2 2243, 1513, 2041, 329 269 322
72 1 95 18 07 2,2 4 9,5
134 91 fosfatidilinositol 4-quinase tipo 2 alfa 106,2 6 77,85 116,8 8 271, 2 295, 15 204, 29
848 2 Complexo nucleolar associado 2 homólogo (S, cerevisiae) 984,9 484,3 6 571,5 128 9,3 120 2,7 116 9,9
189 Transcrição de gene abundante do 1626, 984,9 926,2 180 138 171
25 hipocampo 1 37 6 5 0,2 4 1,6
298 Fator de transcrição geral III C 649,5 697,5 431,5 108 901, 121
21 4 8 8 0,6 53 2,7
289 01 Gene RIKEN cDNA 4932408B21 57,42 28,78 34,91 186, 88 112, 52 187, 44
272 nucleoporina 98 708,3 558,1 484,9 108 858, 840,
40 3 8 5 6,1 65 28
163 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) polipeptídio 691,3 341,9 479,2 933, 720, 116
47 caixa21 1 8 3 21 44 1,8
124 Fator geral de transcrição IIIC, 134,7 114 117,1 326, 320, 220,
33 polipeptídio 2, beta 5 1 86 97 76
168 Proteína interativa com proteína de 735,9 520,2 616,9 115 110 110
78 retardamento mental X com fragilidade nuclear1 9 7 8 2 6,6 8,4
208 Enzima conjugadora de ubiquitina E2C 1431, 1109, 1108, 134 145 168
19 97 57 32 0,1 7,9 9,9
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
153 Molécula reguladora de adesão 1 2376, 1243, 1825, 279 262 320
67 07 06 49 4,9 3 7,4
354 Domínio TatD DNase contendo 1 49,58 54,22 10,94 234, 114, 144,
87 77 06 99
268 Sintetase de guanina monofosfato 122,9 142,7 107,6 432, 251, 382,
69 synthetase 2 8 72 71 77
177 Proteína de dedo ZINC 644 18,41 38 141,7 287, 126, 223,
50 5 13 78 87
105 Proteína de dedo ZINC 11 81,84 78,97 111,4 413, 203, 266,
63 5 57 45 73
225 Proteína ribossomal L23 1694, 1408, 1322, 254 212 244
25 63 99 27 3,8 2,1 0,6
411 Similar a metiltransferase 2 201,6 120,6 113,2 444, 370, 370,
90 6 8 1 44 04 14
221 CNDP dipeptidase 2 (família 22,88 61,95 32,07 330, 79,8 180,
67 metalopeptidase M20) 23 6 33
103 Proteína de desenvolvimento 632,4 487,3 759,9 127 874, 105
7 craniofacial 1 3 8 3 2,7 72 1,5
194 Proteína de ativação Rho GTPase 8 561,5 232,8 159,5 755, 534, 863,
90 8 4 7 26 11 06
239 Gene RIKEN cDNA 2810004A10 611,4 319,1 196,5 795, 922, 799,
36 2 7 57 98 63
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
386 Receptor similar a fator de crescimento 170,8 122,9 50,89 527, 138, 388,
70 do fibroblasto 1 4 3 58 93 29
139 Similar a bolA 2 (E. coli) 667,2 327,2 632,6 997, 533, 734,
82 6 6 9 91 2 58
219 gene /// gene RIKEN cDNA 936,0 563,5 807,3 124 125 161
23 5830484A20 /// similar a Sp110 proteína 3 8 3 9,3 4,4 2,3
corporal nuclear ///
752 sortilina 1 47,52 42,59 83,69 467, 79,9 299,
2 9 2 98
204 Domínio SDA1 contendo 1 1362, 859,8 1118, 220 172 205
81 71 87 4,8 4,2 0,9
677 catepsina C 620,4 261,0 388,3 114 623, 597,
8 3 2 2,3 95 3
127 Polimerase (RNA) III (direcionado ao 1173, 856,8 818,5 189 148 147
28 DNA) polipeptídeo E 78 5 9 3,6 6,9 7,6
171 Proteína ribossomal S26 1005, 525,6 798,1 115 113 129
17 9 9,7 2,3 1
214 Proteína ribossomal S8 2653, 1674, 2415, 345 332 336
53 11 67 56 3,2 3,5 8,9
180 Família AF4/FMR2, membro 4 66,6 79,82 102,2 260, 269, 166,
58 5 49 44 59
211 Família torsina 1, membro B 611,5 202,3 243,4 852, 486, 714,
4 1 9 1 18 97 88
732 Família de gene associada a metástase, 808,6 595,6 569,4 139 875, 133
4 membro 2 5 5 6 3,2 73 4,4
202 Proteína de dedo PHD 17 45,11 97,31 48,99 150, 219, 156,
07 19 06 4
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199/357
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
227 Similar a zero proteína mielina 1 26,63 58,06 86,57 211, 241, 192,
19 23 63 89
131 Mediador de transcrição de polimerase 88,18 61,52 35,11 199, 152, 177,
29 de DNA II, subunidade 8 homólogo 79 12 8
336 Fator ativador de transcrição 7 Proteína 465,2 439,0 701,3 150 999, 131
84 interativa 2 5 2 9 7,1 44 7,4
965 Receptor de proteína morfogenética do 30,66 33,23 24,13 164, 83,0 98,6
2 osso, tipo IA 86 3 7
202 proteína de ligação de RNA principal 5 571,2 767,8 724,8 970, 111 125
14 7 2 9 89 4,4 8,3
167 Espermatogênese associada 5 137,9 102,3 61,45 459, 274, 228,
15 2 1 08 64 49
241 Candidato suscetível ao câncer 5 /// 152,1 164,8 125,6 368, 261, 337,
91 similar ao candidato suscetível ao 7 9 06 62 15
câncer 5 isoforma 2
276 Complexo de epóxido redutase de 158,7 49,79 76,93 398, 216, 284,
33 vitamina K, similar à subunidade 1 - 1 67 04 84
700 WD domínio repetido 77 1094, 580,2 464,0 136 134 152
3 94 2 8 9,7 5 6,4
344 Decarboxilase de glicina 449,5 174,1 151,6 613, 279, 804,
4 4 7 06 64 84
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
191 Família transportadora de soluto 12, 500,3 207,9 501 101 574, 711,
7 membro 2 2,6 08 55
157 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) peptídeo caixa 385,0 297,4 284,8 475, 561, 524,
22 17 8 8 57 19 9
381 Segmento de DNA, humano DXS9928E 157,4 142,2 194,4 493, 482, 475,
1 3 1 4 98 27 73
141 Gene RIKEN cDNA 2610101103 1078, 693,4 683,9 141 111 140
57 89 7 7 3 6,9 9,9
218 Obliterador de indutor de morte1 489,8 352,8 242,0 885, 746, 817,
88 8 7 7 74 18 23
612 Síndrome de Willi/Angelman 2 146,4 115,6 62,97 277, 180, 205,
7 homólogo (humano) 9 2 82 98 37
104 Pantotenato quinase 3 571,7 464,2 419,8 115 770, 106
18 7 1 1 1,2 81 0,5
794 Família torsina 2, membro A 56,41 57,84 15,89 182, 117, 153,
2 4 93 01
663 Nexina de seleção 3 120,7 103,6 110,2 326, 216, 202,
9 8 5 1 23 07 87
339 Domínio abidrolase contendo 6 330,8 210,9 246,5 422, 380, 691,
8 4 7 75 61 33
640 Translocase de membrana mitocondrial 878,1 670,4 908,3 180 131 141
interna 8 homólogo al (levedura) 7 8 4,6 9 9,3
700 Proteína quinase C, delta 411,2 383,6 115,2 712, 315, 733,
6 5 4 6 82 54 67
155 Síndrome Williams-Beuren Região do 387,3 65,5 224,4 655, 402, 299,
10 cromossoma 1 homólogo 8 2 34 2 57
197 Homólogo de midasina (levedura) 72,03 19,88 33,69 203, 127, 190,
0 55 77 18
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
393 Proteína de ligação de elemento rico em 1414, 939,0 992,3 181 144 169
6 purina B 47 3 2 5,5 2,8 9,3
112 14 membro da superfamília tioesterase 4 209,2 140,6 3 221,2 2 557, 73 459, 97 598, 38
206 08 Gene RIKEN cDNA 2610304G08 85,77 64,41 24,73 216 142, 41 211, 13
401 KTI 12 homólogo, cromatina associada (S. cerevisiae) 204,0 6 74 121,4 1 306, 83 197, 69 220, 06
418 gb:AV006589 750,8 258,8 477,1 770, 790, 855,
7 /DB_XREF=gi:4783576 /DB_XREF=AV006589 /CLONE=1100006A23 /FEA=EST /CNT=1 /TID=Mm.198379.1 MER=ConsEnd /STK=0 /UG=Mm.198379 /LL=99251 /UG_GENE=AV006589 /UG_TITLE=sequência expressa AV006589 1 8 4 5 87 25
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
202 Cassete de ligação de ATP, sub-família 1974, 1512, 1591, 279 237 288
63 F (GCN20), membro 1 08 28 36 9,7 9,2 1,9
606 3 Proteína de interação com coativador de rceptor nuclear 96,49 66,05 71,48 230, 69 170, 41 262, 11
758 Associado a proteína dissulfeto 772,5 580,9 729,2 139 116 129
2 isomerase 3 6 6 1 8,6 6,8 7,1
782 Receptor de partícula de 1178, 396,3 506,1 127 116 132
9 reconhecimento de sinal ('proteína de ancoramento') 28 5 1 4,3 9,1 9,2
114 Família transportadora de soluto 34 1671, 1451, 1598, 277 257 275
9 (fosfato de sódio), membro 2 27 17 15 1,9 1,2 6,1
239 75 gene RIKEN cDNA D530033C11 15,02 9,78 12,59 135, 75 30,0 7 112, 3
306 Imunoglobina da célula T e domínio da 695,0 248,6 328 826, 592, 729,
0 mucina contendo 2 8 2 75 21 65
796 Subunidade de complexo integrante 4 108,7 143,6 117,1 263, 266, 284,
5 9 7 3 16 45 38
151 Proteína ribossomal S8 2879, 1822, 2555, 371 348 373
34 67 12 47 5 7,6 6,8
106 16 Proteína associada a sarcolema 302,6 5 177,5 294,3 6 828, 01 459, 32 599, 96
190 Receptor de folato 1 (adulto) 295,1 157,8 124,5 512, 492, 451,
22 3 9 6 13 87 56
399 Gene RIKEN cDNA 2410019A14 948,0 617,9 722,8 127 146 130
34 4 6 2 6,2 1,4 9,1
275 41 proteína hipotética 5430421B17 29,79 29,13 17,85 111, 26 148, 96 160, 01
133 L2 ciclina 366,3 286,1 242,5 661, 568, 569,
53 2 2 8 8 59 17
862 clivagem e poliadenilação fator 437,6 464,6 259,6 801, 552, 757,
8 específico 4 6 5 65 59 67
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
153 RIKEN gene do DNA 2810409H07 74,5 32,14 51,2 212, 134, 162,
35 66 11 73
211 RIKEN gene do DNA 2900097C17 55,86 42,84 49,42 191, 97,3 143,
43 63 4 81
278 manosidose 2, alfa 2 187,4 198,7 152,2 448, 341, 401,
10 2 1 5 07 04 19
218 proteína 31 receptora associada à 682,5 376,1 741,3 135 913, 136
39 célula B 1 3 2 5,9 47 0,2
271 Espermatogênese associada 2 1161, 964,7 1257, 214 176 195
78 91 96 2,9 1,6 3,7
275 Seqüências expressas AII95381 164,0 50,24 97,33 314, 235, 369,
96 6 61 05 8
835 SEH1-similar (S. cerevisiae 34,37 35,38 21,55 153, 52,0 164,
9 44 9 71
211 Fosfoserina aminotransferase 1 762,0 527,8 423,1 126 111 111
58 8 2 6 8,1 1,2 0,2
209 proteína ribossômica L37 265,6 159,0 539,0 502, 517, 685,
89 8 8 1 7 5 71
206 reticulon 4 1574, 894,9 1056, 190 177 190
76 4 2 14 3,9 5,2 3,2
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
115 ornitina decarboxilase, estrutural 1 /// 1456, 734,6 1199, 158 150 163
23 similar à Ornitina decarboxilase (ODC) 62 2 01 8,9 4 9,4
650 lisofosfolipase 3 47,88 151,1 39,47 198, 143, 151,
0 9 56 95 5
788 proteína transmembrana 49 214,6 75,2 94,84 335, 369, 256,
1 2 84 33 77
107 Proteína associada SNAP 273,6 269,1 162,2 547, 550, 515,
37 9 7 5 62 93 68
970 transcrição específica de leucócitos 1 150,4 125,8 60,94 231, 196, 216,
7 4 2 93 75 83
108 quinase associada G ciclina 189,8 169,8 165,3 414, 338, 451,
62 8 4 7 6 87 82
123 dano regulamentado de DNA e p53 1 548,6 181,7 376,6 789, 643, 739,
76 7 9 75 57 91
129 potenciador do homólogo rudimentar 971,5 772,4 792,7 127 105 143
25 (Drosófila) 9 4 5 7,8 2,4 2,2
980 Fibrilarina 684,3 450,3 486,4 856, 653, 106
1 4 32 88 7,7
294 fator de transcrição trans-atuante 6 683,7 635,1 523,7 922, 833 103
30 1 49 5,4
227 fosfoglucomutase 3 117,4 70,55 76,49 280, 226, 244,
52 7 19 01 57
140 apreensão relacionada 6 similar 23,56 3,91 6,09 51,6 168, 132,
32 homólogo 2 1 7 62
218 similar à ubiquitina A-52 resíduos do 1092, 549,0 901,0 132 104 142
69 produto da fusão da proteína ribossomal 1 71 3 8 6,5 4,1 1,4
159 seqüência expressa AI593864 59,53 130,9 145,4 238, 245, 390,
47 6 1 39 29 12
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
360 repetir domínio anquirina 10 1631, 2 1255, 22 1597, 8 236 6,3 197 6,9 223 3,4
132 32 domínio brix contendo 5 249,7 149,3 4 101,6 9 500, 78 396, 36 411, 4
757 SWI/SNF relacionados, matriz 169,0 151,5 175,7 345, 264, 208,
5 associada, regulador de actina dependente da cromatina, subfamília c, 1 membro 6 4 56 16 33
847 pluripotência evolucionária associada 5 637,0 3 556,1 1 625,1 6 120 0,8 846, 84 133 2,8
195 domínio WW que contêm adaptador 1020, 699,4 883,5 126 140 153
22 com dupla espiral 92 7 8 4,2 8,6 1
216 28 sintetase monofosfato de uridina 98,18 94,72 68,1 288, 06 248, 98 175, 65
153 proteína 1 elemento de ligação de 141,5 165,7 217,7 421, 422, 503,
91 resposta ras 3 4 1 99 79 87
139 13 ribonucleoproteína U heterogênea nuclear 22,26 32,92 25,16 157, 59 122, 26 145, 62
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
286 família 19 transportadora de soluto 485,4 151,4 233,1 737, 511, 592,
27 (permutador de sódio / hidrogênio) membro 3 3 9 7 26 1 5
187 polimerase alongamento de fator RNA II 604,7 436,5 353,7 111 733, 995,
71 2 8 4 9,5 54 87
108 03 TBC1 família domínio, membro 20 126,5 6 81,16 223,1 1 336, 16 248, 27 209, 16
138 seqüência expressa AA408556 215,0 107,3 165,1 295, 310, 421,
48 8 5 8 85 39 99
168 5 XPA proteína 1 de ligação 410,0 6 452,6 766,7 1 140 1,7 105 3,2 878, 62
190 44 ERGIC e golgi 3 44,81 65,7 48,44 93,9 72,3 3 245, 35
270 96 Similar 10) 20,8 3,27 12,57 89,8 103, 08 86,0 3
727 6-fosfofruto-2-quinase/frutose-2,6bifosfatase 3 63,36 20,84 112,3 6 213, 6 178, 27 137, 99
273 9 RGS16 351,7 4 117,1 2 76,23 503, 15 162, 89 413, 91
249 40 segmento de DNA, Chr 8, Brigham & Women's Genetics 1414 expresso 118,7 8 53,72 55,79 186, 53 261, 76 155, 04
101 proteínas de choque térmico 110 1398, 830,8 1073, 166 156 216
52 12 8 63 8,8 5,5 0
191 55 membro da família quinesina 22 398,2 2 450,2 7 354,4 6 841, 6 654, 47 559
772 fosforibosilaminoimidazolecarboxilase, 391,1 442,8 339,1 827, 516, 792,
3 fosforibosilaminoribosilami 3 3 6 89 64 43
113 jumonji, AT domínio rico e interativo 1B 1673, 942,4 1166, 205 179 209
02 (similar Rbp2) 42 5 08 3,4 4,3 9,4
134 proteína ribossômica L38 1996, 1375, 2224, 292 235 298
96 91 66 12 9,6 9,3 0,6
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 208/373
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
189 fator de início de tradução eucarióticas 2312, 1828, 2131, 320 280 328
35 4E /// LOC630527 hipotético 87 13 71 7,1 0,9 6,2
104 translocase da membrana mitocondrial 1200, 871,0 958,2 148 110 139
15 interna 17 54 3 8 0,2 4,9 0,9
118 proteínas 1 que interagem TNFAIP3 321,3 225,2 228,0 806, 511, 512,
48 3 9 1 72 77 88
294 DCN1, com defeito na nedilação cullin 208,2 181,5 129,4 483, 350, 483,
13 1, domínio contendo 3 (S. cerevisiae) 5 4 09 59 79
190 myc induzida pelo antígeno nuclear 198,5 93,12 89,6 515, 223, 260,
69 2 36 46 41
222 alfa carioferina (importina) 1 487,5 288,5 322,3 647, 625, 643,
50 1 8 8 95 2 16
209 proteína ribossomal S24 1503, 981,9 1382, 190 148 182
12 87 1 51 3,5 5 5,7
408 gema (organela nuclear) proteína 66,66 15,96 108,8 341, 213, 149,
11 associada 5 6 52 42 85
194 RIKEN gene do DNA 1810020D17 70,67 116,8 133,4 300, 275, 220,
08 3 5 46 02 85
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
163 Proteína ativadora gangliosídea GM2 1460, 965,3 1158, 158 168 187
17 32 9 55 5,9 1,4 7,4
153 RIKEN gene do cDNA 2610042014 385,7 161,9 351,7 704, 394, 574,
88 7 8 56 83 8
184 domínio brix contendo 1 368,4 490,2 890 149 112 104
50 6 9 6,2 6,8 8,1
721 família oncogene 79,2 22,75 80,1 172, 152, 222,
14 77 72
223 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) polipeptídeo 319,2 262,3 315,6 522, 433, 484,
84 casa 54 2 9 5 53 98 6
327 seqüência de cDNA BC068171 1424, 1570, 1471, 230 239 296
08 91 38 39 8,1 1,8 8,3
136 enzima ubiquitina-conjugando E20 656,8 318,4 383,2 924, 728, 782,
54 6 7 15 47 62
157 proteassoma (prossoma, macropain) 711,5 339,6 377,7 882, 954, 936,
01 tipo de subunidade beta 4 4 7 3 09 28 36
431 domínio jumonji que contêm 1B 13,53 5,03 18,14 102, 28,2 55,5
87 01 8
447 proteínas dedo de zinco 407 25,36 30,71 38,29 227, 134, 183,
02 66 41 53
145 proteína ribossomal S24 1773, 1158, 1610, 215 169 212
51 15 27 42 6,3 2,9 4,5
379 dedo de zinco A20 contendo domínio 2 1713, 1445, 1218, 226 215 217
11 5 63 9,6 0 3,5
209 fator de junção, arginina / serina ricos 1 2351, 1787, 1796, 305 262 286
84 (ASF/SF2) 06 06 58 2,8 7,1 4,6
174 amina oxidase, cobre, contendo 3 69,46 19,83 7,36 85,4 273, 193,
72 3 68 82
295 RIKEN gene do DNA 4930535B03 86,18 17,31 12,72 377, 80,7 145,
73 01 9 39
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
738 ubiquitina-similar I (Sentrin) ativando 239,7 189,4 212,9 490, 339, 437,
uma enzima E1 5 4 2 87 53 9
883 família portadora de soluto 39 926,3 580,0 618,5 917, 115 107
4 (transportador de íons de metal), 2 2 2 82 2,3 7,5
membro da 6
370 proteínas de ligação de nucleotídeos 60,13 20,72 5,19 102, 138, 82,4
9 guanina 13, gama 97 52 1
367 proteína interferon-induzido 35 1116, 271,9 305 985, 159 746,
24 96 49 5,5 92
240 manutenção deficiente minicromossomo 3,51 116,9 27,29 275, 137, 122,
5, o ciclo de divisão celular 3 96 29 81
123 dano de DNA p53 e regulamentado 1 725,3 231,3 442,6 715, 694, 822,
77 8 9 57 98 93
121 B2 fator de fixação do molde 121,6 55,05 141,8 202, 205, 445,
47 7 2 46 91 2
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
117 ativação do fator de transcrição 7 de 225,9 243,5 179,9 629, 458, 542,
62 proteínas que interagem 2 8 4 8 85 47 77
198 proteína quinase, ativada por AMP, uma 41,91 31,4 14,25 149, 132, 140,
5 subunidade gama não catalítica 26 45 8
924 família portadora de soluto 1 10,9 13,02 15,54 68,8 61,4 39,4
(transportador de aminoácido neutro), 6 7 7
membro 5
129 fator de junção, arginina / serina ricos 1 665,4 668,2 445,9 808, 849, 987,
98 (ASF/SF2) 7 8 8 48 06 04
223 drebrin-similar 16,85 15,82 9,22 61,2 99,3 52,2
22 8 5
233 RNA proteína motivo ligadora 3 39,43 20,38 13,54 161, 136, 113,
70 7 81 63
159 dedo de zinco MBD2-interagindo 391,5 235,5 209,1 595, 489, 563,
12 9 2 2 63 39 7
215 macorina, proteína ring finger 1 1072, 807,8 1014, 191 138 137
12 98 2 98 9,8 0 7,3
182 co-fator necessário para a ativação da 478,9 496,9 461,9 789, 829, 748,
56 transcrição Sp1, subunidade 2 2 1 6 66 56 74
189 GTP proteína de ligação 4 1225, 664,5 760,9 149 115 144
00 17 6 1 2,5 8,4 7,9
290 seqüência expressa AA673488 484,1 218,8 155,2 630, 425, 677,
40 1 1 18 47 11
539 PBX / atado 1 homeobox 136,4 110,1 38,04 161, 245, 197,
2 6 7 58 89 24
213 importina 7 1897, 1382, 1447, 261 203 247
15 13 87 66 5,2 8 4,9
295 seqüência de cDNA BC068171 663,4 885,6 893,3 143 136 157
63 8 6 4 4 1,4 2,1
157 proteínas E do centrômero 638,1 667,9 635,8 106 840, 120
23 8 2 5 2,6 39 9,8
143 fator de iniciação 5B da transcrição 20,96 15,05 9,7 81,2 106, 102,
83 eucariótica 7 34 48
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
108 33 fator de iniciação 3 transcrição eucariótica, subunidade 9 (eta) 88,55 23,79 36,88 226, 1 76,8 8 140, 2
657 FK506 proteína de ligação 4 880,0 1 451,6 3 640,6 6 107 3,2 846, 29 101 2,7
301 Receptor de hormônio anti-Mülleriano 144,1 58,14 204,5 277, 226, 364,
38 tipo 2 6 9 7 3 45
208 15 Proteína de transferência fosfatidilinositol, citoplásmico 1 80,4 58,16 113,9 1 393, 06 254, 86 712, 53
660 Integrina alfa 6 593,8 573,7 427,7 925, 118 105
3 3 4 5 3 5,7 6,8
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
123 EBNAI proteína de ligação 2 939,3 650,8 646,4 130 865, 112
82 1 4 4 0,7 58 3,9
565 0 proteína transmembrana 49 178,7 2 95,35 104,8 3 304, 43 188, 62 201, 94
163 Tipo proteassoma (prossoma, 230,2 131,3 156,9 402, 255, 414,
38 Pmacropain) 3 5 4 72 26 95
965 PRP4 processamento do pré-mRNA 299,2 298,4 149,0 561, 546, 598,
6 2 1 9 48 09 99
219 30 fator de transcrição similar 5 (base 1 hélice-curva-hélice) 21,09 38,28 22,9 250, 91 115, 79 62,2 2
213 proteínas de ligação de nucleotídeos 226,3 103,2 158,3 279, 215, 341,
95 guanina (proteína G), beta, polipeptídeo 2 similar 1 7 6 6 05 92 37
484 Sec61 alfa subunidade-1-(S. cerevisiae) 2767, 22 1784, 91 2139, 43 354 0,3 263 3,9 342 2,7
410 RIKEN gene do DNA 2700023E23 383,9 263,7 193,0 576, 466, 578,
81 7 4 2 37 4 03
227 RE1- fator de transcrição silenciadora 2083, 1792, 1660, 230 251 254
51 8 43 4 1,8 8,9 8,3
678 Proteína ribossomal L41 2170, 1455, 2121, 289 267 295
2 73 5 76 0,9 3,8 4,3
237 PRP4 fator 4 de transformação pré- 139,7 105,4 114,1 272, 233, 303,
99 mRNA homólogo (levedura) 6 5 1 96 13 29
522 ativador de ciclase de guanilato La 1137, 874,4 1002, 130 121 155
0 (retina) 82 9 71 3,4 2,1 4,2
226 82 gb:BB204543 /DB_XREF=gi:8869496 /DB_XREF=BB204543 /CLONE=A430058H 10 /FEA=EST /CNT=1 /TID=Mm.215042.2 MER=ConsEnd /STK=0 /UG=Mm.215042 /UG TITLE=ESTs 101,6 39,07 67,86 262, 21 64,7 8 123, 41
721 ADP fator de ribosilação 4 228,8 119,4 108,0 327, 279, 307,
1 3 8 4 09 11 49
254 3 galactosidase, alfa 273,9 4 147,4 7 118,3 418, 22 369, 57 248, 33
196 58 seqüência de cDNA BC021395 585,5 4 403,8 4 321,3 781, 58 616, 26 679, 87
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
278 41 BTAF1 RNA polimerase II, B fator de transcrição TFIID associado, (Motl homólogo, S. cerevisiae) 28,85 6,86 11,93 42,5 8 39,4 2 232, 36
305 Transcrito locus 510,1 377,2 438,0 946, 823, 119
76 8 4 4 62 44 8,9
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
294 57 WD domínio repetido 46 218,1 7 112,4 6 94,73 408, 68 196, 3 309, 16
191 66 transportadora de soluto família 39 (transportador de zinco), membro 4 46,7 42,22 31,16 170, 36 69,4 3 62,7 7
434 48 TatD domínio DNase contendo 1 77,05 76,25 15,42 213, 53 120, 79 170, 2
672 Fator de transcrição YY1 283,2 139,6 276,1 630, 488, 503,
9 1 5 8 7 31 98
399 8 procolágeno, tipo V, alpha 3 33,3 2,46 6,94 108, 05 51,7 7 59,8
143 14391.acetiltransferase 2 315,8 400,2 148,7 745, 497, 110
94 7 4 2 68 68 7,4
478 RIKEN gene do DNA 2410016F19 2626, 1700, 1801, 257 266 299
5 86 7 16 4,1 0,6 5,8
190 GTP da proteína de ligação 3 315,4 126,5 117,9 465, 336, 416,
07 2 6 7 37 42 21
793 regulador da proteína de uma citocinese 717,2 432,7 439,2 852, 910, 799,
3 7 4 8 9 14 31
187 62 RIKEN gene do DNA 1810003N24 844,3 9 363,6 396,7 8 978, 22 773, 69 906, 85
103 IMP4, ribonucleoproteina nucleolar 1079, 720,2 726,1 122 116 150
72 pequena U3, homólogo (levedura) 23 9 6 9,9 1 7,8
411 gb:BB209183 496,8 534,7 672,1 964, 101 106
73 /DB_XREF=gi:8874136 /DB_XREF=BB209183 /CLONE=A430091G17 /FEA=EST /CNT=18 MD=Mm.129698.1 /TIER=Stack /STK=I7 /UG=Mm.129698 /UG TITLE=ESTs 1 3 7 31 3,3 8,5
153 RAB20, membro RAS da família 486,8 419,2 302,0 593, 602, 611,
38 oncogene 4 2 19 78 39
159 02 Crx transcrição e fita oposta 1 216,2 196,7 8 180,3 1 438, 71 365, 54 284, 88
136 proteína ribossomal S21 2584, 1818, 2032, 312 285 313
38 81 73 86 5,7 9,6 7,7
763 M2 ciclina 191,9 160,3 185,3 529, 281, 348,
4 4 9 2 15 25 56
315 GATA proteína de ligação 4 243,2 314,7 216,0 548, 372, 460,
8 9 2 4 17 29 72
140 53 homologo sem dentículo (Drosófila) 117,5 7 78,14 95,78 349, 89 205, 74 183, 08
215 75 tubulina, beta 5 38,96 56,74 38,01 155, 85 185, 38 153, 18
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
135 isomerase peptidilprolil D (ciclofilina D) 707,1 447,2 263,7 114 699, 928,
2 /// proteína da membrana lisossomal associada 3 /// similar à isomerase peptidilprolil D 1 1 8 0,3 01 31
170 69 autofagia relacionadas com 3 (levedura) 314,5 241,2 2 433,4 6 642, 61 635, 28 677, 38
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
208 83 RIKEN gene do DNA 2900053A13 46,21 35,31 27,79 124, 96 115, 95 155, 72
126 dipeptidase 3 414,8 426,4 469,5 773, 660, 710,
26 4 7 3 35 61 24
242 11 proteínas dedo de zinco 292 14,9 34,16 12,24 99,7 9 76,5 7 80,7 2
106 40 Kelch-similar 22 (Drosófila) 63,35 36,5 154,2 8 373, 75 196, 24 394, 95
523 homologo à síndrome von Hippel- 242,3 87,46 145,3 415, 238, 239,
0 Lindau 2 7 71 33 9
120 proteína de ring finger (tipo C3H2C3) 6 554,1 420,1 401,0 655, 583, 868,
58 8 4 7 12 25 77
106 17 sarcolema associado à proteína 102,1 7 105,2 7 51,27 194, 14 150, 33 224, 98
391 proteína nucleolar 9 340,3 166,2 323,6 458, 342, 403,
00 6 1 1 72 33 84
109 78 proteínas que interagem homeodomínio 11,81 29,62 9,18 120, 44 57,7 2 112, 28
135 seqüência cDNA BC010304 1318, 952,7 1281, 197 162 202
62 59 5 75 0,4 4,2 1,9
742 histona H3, família3A 878,8 631,9 853,1 117 112 135
2 1 8 3 4,7 8,4 7,7
169 SUMO/peptidase Sentrin específico 3 2271, 1602, 1721, 278 265 291
42 54 51 79 0,1 9,1 1,5
211 proteína ribossômica L29 /// proteína 1696, 634,9 1377, 198 226 188
71 hipotética LOC669999 /// similar à proteína ribossomal 60S L29 19 9 16 7,6 6,4 3,6
184 domínio família Yipl, membro 4 782,6 357,9 422,7 943, 888, 831,
45 3 7 7 49 23 02
235 83 CXXC dedo 6 166,0 9 59,38 58,14 251, 54 278, 86 292, 88
111 RAN proteínas de ligação 5 1214, 825,3 930,4 143 139 133
04 6 1 4 9,4 7,7 2,6
206 17 placenta específica 9 196,4 3 91,79 72,6 352, 41 222, 51 218, 3
286 receptor fator necrose tumoral 301,2 159,5 151,0 479, 246, 564
7 superfamília, membro 12a 5 2 5 97 27
160 LOC435970 hipotético /// similar à 678,4 317,4 184,7 688, 630, 750,
07 gonadotropina fator 2 de transcrição induzível ovariano 5 3 5 24 48 43
388 00 Transaminase Glutamina frutose-6fosfato 1 154,6 86,66 72,39 201, 4 144, 57 299
137 46 sintase deoxi-hipusine 40,12 11,88 30,86 40,8 9 74,6 5 90,1 8
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
128 07 peptidil prolil isomerase H /// proteína hipotética LOC624822 /// similar ao Peptidil prolil cis-trans isomerase H (PPlase H) (Rotamase H) 48,4 49,08 49,99 166, 67 194, 54 121, 42
131 30 proteína 102,0 4 67,67 139,6 8 333, 55 151, 31 287, 34
236 cofilin 2, músculo 978,5 785,6 989,0 123 114 130
2 1 8 9 3,6 2,6 1,9
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
614 4 fator de iniciação de transcrição eucariótica 4E membro 2 106,8 8 47,69 39,81 160 100, 21 135, 61
140 fator de iniciação de transcrição 630,8 605,0 661,6 984, 922, 100
10 eucariótica 5B 3 7 8 87 28 1,4
171 homologo ariadne 2 (Drosófila) 1041, 675,0 711,1 153 934, 136
95 91 7 9 3 55 9,8
383 proteína ribossomal mitocondrial S6 1289, 719,4 948,2 178 140 155
83 27 3 9 9,4 3,2 9,5
169 85 proteína ribossomal mitocondrial L39 192,7 8 74,48 65,23 382, 08 203, 89 182, 76
226 1 proteína ribossomal mitocondrial L39 11,28 52,99 34,16 169, 89 124, 95 91,9 1
390 73 fosfatidilinositol 3-quinase, polipeptídeo, catalisador beta 76,55 96,39 113,7 3 271, 48 148, 58 263, 12
591 proteassoma (prossoma, macropain) 774,3 476,9 629,3 128 896, 124
0 subunidade 26S, sem ATPase, 14 4 8 2 7,5 48 9
388 RIKEN gene do DNA 1110008B24 723,8 473,8 306,5 908, 546, 872,
75 2 7 8 37 03 14
447 seqüência expressa AF013969 /// 143,5 109,9 108,7 314, 203, 285,
07 similar ao CG5514-PB, isoforma B /região /AF013969 contendo seqüências expressas; RIKEN cDNA do gene A230054D04 7 6 8 91 78 29
804 dedo anelar e domínio repitido WD 3 1896, 1829, 1380, 277 265 305
1 6 31 91 2 8,2 6,3
281 54 metiltransferase similar 2 51,31 48,28 45,52 144, 77 183, 34 169, 06
302 69 proteína nucleolar 11 29,76 6,59 11,32 94,8 2 98,8 6 59,8 4
718 valosin contendo proteína /// similar ao 441,5 368,1 517,6 943, 758, 743,
9 retículo endoplasmático de transição ATPase (TER ATPase) (15S Mg (2 +)subunidade ATPase p97) (valosin contendo proteína) (VCP) 8 4 3 18 44 25
163 06 peptidase ubiquitina específica 10 257,9 263,8 8 466,9 8 838, 32 498, 36 592, 08
243 ativação do fator 7de transcrição de 998,3 673,1 860,2 146 135 132
33 proteínas que interagem 2 6 3 5 1,8 4,6 3,4
184 66 fator da célula hospedeira CI 217,3 5 291,1 3 173,2 369, 82 317, 79 306, 44
735 hipocampo transcrição de genes 392,7 231,6 210,5 490, 398, 461,
4 abundantes 1 6 5 2 55 57 1
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
111 fator de iniciação eucariótico tradução 4, 795,8 790,0 913,2 149 129 132
96 gama 1 2 1 9 2,1 7,2 0,6
120 quinase piridoxal (piridoxina, vitamina 341,5 275,6 123,1 435, 526, 455,
88 B6) 9 7 93 52 27
955 fator de iniciação de transcrição 3497, 2343, 2333, 366 323 390
eucariótica 3, subunidade 10 (Teta) 53 31 08 6,5 3,6 8,4
217 proteína dedo de zinco 444 311,3 109,7 33,14 452, 198, 309,
92 9 4 64 57 81
263 domínio repetido WD 33 130,0 90,77 188,2 291, 355, 593,
3 8 1 14 77 08
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
163 componente do complemento 1, 1157, 830,9 657,3 166 131 136
50 subcomponente-q de proteína de 96 7 6 2,1 2,4 6,6
ligação
162 RIKEN gene do DNA 2610524G07 445,7 163,3 359,1 701, 580, 151
78 9 9 15 47 9,9
413 fator principal de ligação, domínio 362,7 159,5 39,4 549, 295, 488,
75 desprezível, subunidade alfa 2, translocado, homólogo 2 (humano) 6 3 54 88 83
988 Proteína 1 similar à distrofia macular 26,77 68,92 92,66 159, 205, 333,
8 viteliforme 2 89 9 32
124 proteína ribossomal S24 1501, 1020, 1349 194 149 180
66 15 57 2,8 8,5 4,5
675 proteínas dedo de zinco 143 70,96 68,45 69,67 183, 92,1 284,
8 06 3 13
235 GTPase da proteína de ativação e 333,5 155,4 192,6 424, 502, 467,
87 VPS9 domínios 1 8 3 6 38 98 39
127 Acido fosfatídico fosfatase tipo 2B 125,5 76,26 48,2 253, 181, 235,
38 3 24 84 81
144 proteínas de proliferação celular 352,0 285,7 318,7 532, 480, 448,
80 1 4 78 48 55
110 Translocação SET 915,3 704,2 595,0 125 133 116
12 5 9 7 9,9 0,6 0,7
286 necrose tumoral superfamília do 320,4 172,1 158,2 480, 257, 582,
6 receptor do fator, membro 12a 7 6 91 13 58
380 triagem nexina 6 279,1 83,74 111,8 319, 284, 562,
41 2 9 18 78 5
136 Contendo domínio A similar à proteína 221,5 140,4 439,1 494, 549, 538,
31 tirosina fosfatase - 1 2 5 9 52 29 97
406 bromodomínio e o PHD finger contendo 123,2 66,62 84,15 270, 241, 263,
66 3 5 72 5 39
250 M4 ciclina 81,3 61,69 90,14 148, 264, 223,
23 79 46 53
158 receptor ativado de proteína de ligação 3,63 2,38 10,41 65,5 38,6 88,2
39 proliferador de peroxissoma 8 1 8
144 DnaJ (Hsp40) homologo, subfamília B, 183,4 163,9 62,66 294, 274, 311,
94 membro 12 8 9 14 02 49
108 xiluloquinase homóloga (H. influenzae) 570,9 332,3 251,8 818, 532, 562,
65 1 9 7 91 81 41
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
164 quinase Unc-51 similar 1 (C.elegans) 688,4 447,8 387,7 998, 689, 942,
46 2 9 9 96 04 76
125 PRP38 pré-processamento do mRNA 453,6 395,3 239,5 654, 564, 746,
17 domínios fator 38 (levedura), contendo B 7 8 7 65 35 42
123 DEAH (Asp-Glu-Ala-His) polipeptídeo 72,27 61,52 54,09 167, 149, 199
58 casa 40 12 31
137 fator de transcrição geral III C 1 161,5 193,5 135,4 406, 272, 321,
77 4 9 9 5 1 91
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
154 espermatogênese associada 5 119,3 125,1 136,2 318, 254, 257,
9 5 9 8 86 39 63
722 proteína neuroprotetora dependente da 454,3 277,9 262,3 806, 487, 695,
8 atividade 4 2 8 44 17 53
173 glutamina frutose-6-fosfato 374,8 257,9 316,1 699, 464, 769,
44 transaminase 1 1 5 57 92 86
227 proteína de ligação B de elemento rico 155,9 78,28 45,27 264, 195, 234,
65 em purina 8 07 74 5
282 proteína de interação FUS (rico em 2250, 1979, 1833, 287 246 310
2 arginina, serina) 1 39 57 46 7,6 7,7 5,4
298 fator ADP-ribosilação similar 15 102,0 159,0 161,9 336, 397, 326,
54 7 7 1 3 43 19
140 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) polipeptídeo 388,0 161,9 274,4 654, 454, 714
13 casa 52 8 2 2 08 68
447 seqüência expressa AA763515 8,75 107,5 93,59 266, 476, 367,
59 7 69 12 11
257 proteína nucleolar 9 814,2 472,1 250,0 102 836, 843,
23 5 1 5 7,7 53 91
196 sestrina 2 492,4 377,9 378,7 576, 439, 945,
26 9 6 6 84 85 27
178 fosfatidilinositol 4-cinase tipo beta 2 199,3 230,4 234,2 466, 327, 508,
89 1 8 5 28 46 52
247 RIKEN gene do DNA 4933402C05 526,4 324,3 277,4 582, 656, 516,
60 4 3 2 5 43 22
406 RIKEN cDNA do gene D530033C11 62,8 31,87 92,29 229, 169, 276,
77 92 71 49
407 seqüência de cDNA BC057371 266,3 343,5 142,1 489, 461, 497,
56 1 9 41 09 84
157 proteína ribossomal S17 3413, 2189, 2823, 410 348 359
02 68 66 31 1 3,9 2,5
165 importação nuclear 7 homólogo (S. 1117, 701,4 924,8 146 145 120
56 cerevisiae) 61 6 4 8,6 4,8 8,1
117 Poli (A) alfa-polimerase 15,3 45,46 34,26 129, 144, 119,
03 02 67 25
545 quinase 1 proteína interagindo 982,3 849,3 1301 173 126 172
7 homeodominio 8 4 6,4 6,8 7,8
213 carboxipeptidase D 52,84 88,41 40,22 258, 184, 187,
37 05 47 52
211 ubiquitina proteína 2 associada como 704,7 268,7 278,2 117 736, 781,
83 3 6 5,1 68 12
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
165 fator de iniciação eucariótico tradução 3, 1962, 1345, 1507, 237 185 242
01 subunidade 10 (Teta) 76 41 34 9,6 4,1 7,1
791 família Morf4 associado à proteína 1 1393, 988,4 1124, 187 135 174
96 5 79 3 9,9 8,1
921 proteína arginina metiltransferase N 6 1192, 520,8 617,1 134 107 113
8 36 5 7 7,3 2,8 0,9
394 RIKEN gene do DNA 2610206G21 385,6 426,0 475,4 734, 556, 887,
89 8 3 2 42 38 02
143 WD repetido e domínio contendo SOF 431,5 295,6 235,2 806, 558, 634,
34 65 06 33
242 RIKEN gene do DNA 2610020H08 32,11 23,32 52,07 145, 75,1 165,
09 28 9 2
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
207 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) polipeptídeo 70,39 42,43 116,8 234, 140, 219,
84 caixa 10 1 66 44 65
793 regulador da proteína de uma citocinese 882,2 561,6 562,1 113 990, 915,
4 9 7 4 0,7 99 08
870 dedo de zinco, tipo CCCH com domínio 51,69 25,13 56,62 118, 68,2 140,
7 fragmento G 43 7 57
214 ubiquitina peptidase específicas 36 186,1 106,7 198,3 424, 291, 431,
24 9 1 4 16 35
781 peptidase sinal peptídeo 3 87,29 42,07 37,9 188, 124, 96,4
7 55 22 5
221 estatimina-similar 3 280,8 139,8 201,6 475, 288, 374,
71 5 5 25 43 17
203 co-fator necessário para ativação SpI 401,9 260,3 241,1 724, 562, 486,
09 transcricional, subunidade 7 7 3 8 75 78 97
134 RIKEN gene do DNA 0610009D07 161,9 142,6 83,83 332, 184, 281,
9 7 9 41 17 59
105 CUG repetição tripla, RNA de proteínas 368,5 320,2 329,5 818, 671, 693,
66 de ligação 9 9 2 02 83 42
857 progressão do ciclo celular 1 220,0 202,8 244,2 519, 428, 471,
9 5 3 7 44 94 56
159 homologia BTB e CNC 1 299,5 142,0 280,9 509, 500, 370,
16 2 8 9 03 69 86
464 proteína nucleolar 7 551,7 243,1 360,6 894, 728, 555,
5 7 9 8 12 94 6
293 NIMA (nunca em uma mitose gene) 692,7 642,8 418,9 917, 746, 927,
17 quinase expressa relacionada 2 9 15 99 21
114 tropomiosina 3 gama 574,3 530,7 522,2 115 848, 105
19 1 2 2 3,2 47 8,4
159 NIMA (nunca em uma mitose gene) 750,0 650,5 453,5 102 842, 100
4 quinase expressa relacionada 2 7 5 2 6,9 77 1
232 RIKEN gene do DNA 1110004B13 32,86 16,77 16,39 47,0 45,2 114,
85 7 19
814 FUS proteína de interação (ricos em 657,7 606,6 401,2 128 963, 940,
1 serina, arginina) 1 9 5 9,5 26 8
694 heme oxigenase (desciclagem) 2 228,1 127,3 175,7 429, 306, 318,
5 4 1 17 91 12
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
219 domínio repetido WD 33 423,9 236,6 225,4 650, 442, 521,
21 4 4 3 55 71 71
236 BRF2, subunidade da RNA polimerase 101,7 131,0 195,5 374, 304, 715,
70 III fator de iniciação da transcrição, 9 2 4 57 79 04
BRF1-similar
295 proteína transmembrana39b 176,1 81,2 214,0 384, 398, 485,
02 3 1 29 39 44
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
178 caspase 3 628,3 670,2 458,6 111 883, 126
66 6 7 1 3,9 27 8,1
212 proteína ribossômica L23 4511, 3680, 3884, 545 507 572
77 51 37 36 6,7 1,7 0,7
683 N-acetil alfa-ligados dipeptidase ácido 2 977,4 735,8 1119, 157 151 159
0 3 7 53 6,5 3,4 9,2
144 detenção de crescimento específico 2 296,0 215,2 25,66 413, 244, 357,
69 3 01 06 68
120 RIKEN cDNA do gene 2610304608 258,4 114,7 87,48 371, 264, 368,
46 9 3 57 27 45
688 proteína nucleolar homologo EMG1 (S. 747,9 398,7 373,7 892, 714, 908,
cerevisiae) 4 7 83 84 61
124 amidotransferase pirofosfato 1491, 1292, 865,4 188 187 197
72 fosforribosil 3 29 9 6,3 5,6 7,5
665 transportadora de soluto família 30 297,0 228,4 223,9 509, 464, 462,
6 (transportador de zinco), membro 5 2 5 1 29 77 7
208 sobrevivência de domínio do neurônio 1251, 889,9 1044, 144 154 167
28 motor, contendo 1 34 49 4,9 9 1,9
179 replicação fator C (ativador 1) 2 112,6 81,23 219,0 447, 301, 360,
8 3 8 59 17 79
151 polimerase (RNA), III (DNA direcionada) 722,6 439,9 880,6 968, 883, 140
03 polipeptídeo A 8 5 4 12 9 1,1
251 proteína fosfatase 2 (anterior 2A), 174,7 85,22 66,46 204, 186, 182,
02 subunidade catalítica, isoforma beta 7 94 65 56
110 morte celular programada 2-similar 554,4 517,0 316,4 881, 628, 852,
03 7 2 2 18 34 95
117 seqüência de leucemia célula mieloide 1 967,2 721,9 533,6 144 139 148
6 2 8 0,5 1,5 6,5
519 dedo de zinco e domínio BTB contendo 53,35 146,2 217,3 394, 287, 382,
17 1 9 13 82 18
758 MYB proteínas de ligação (P160) la 627,8 220,8 196,3 619, 559, 543,
9 5 5 81 46 97
152 hexosaminidase B 452,0 322,9 329,0 829, 691, 686,
55 7 8 2 4 76 04
137 5,10-metilenotetrahidrofolato redutase 92,68 23,2 61,28 119, 236, 128,
83 07 68 56
221 proteína ribossomal S23 1550, 917,0 1521, 205 159 179
65 31 7 18 3,3 3,8 8,2
169 ELOVL família membro 6, alongamento 123,8 55,45 27,87 238, 107, 110,
9 de ácidos graxos de cadeia longa 7 32 52 47
(levedura)
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
300 RIKEN cDNA do gene 4930515601 30,95 26,16 15,9 110, 64,6 112,
87 2 9 74
964 repetir anquirina e domínio Mynd 67,44 57,45 75,7 180, 149, 218,
1 contendo 2 49 85 49
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
120 RIKEN cDNA do gene 1100001122 632 348,5 642,7 973, 834, 112
34 9 6 51 59 2,8
604 Homólogo filho sevenless 1 (Drosófila) 230,3 128,9 112,0 438, 273, 373,
4 4 5 1 22 17 78
360 podoplanina 129,3 118,8 88,89 294, 216, 222,
4 5 1 23 59 67
224 ribonucleoproteína K heterogêneo 1641, 1528, 1311, 270 250 285
51 nuclear 05 27 2 7,7 2,9 9,9
815 proteína ribossomal S11 1905, 755,2 1126, 211 157 161
9 11 5 75 6,3 3,3 1,4
197 SET e domínio Mynd contendo 5 83,2 60,13 96,49 253, 152, 155,
49 01 74 94
181 fosfoproteína nucleolar e um corpo 447,2 412,6 479,7 809, 599, 798,
14 espiralado 2 7 13 42 12
219 proteína ring finger 7 978,6 679,3 530,7 150 910, 129
66 7 3 4,8 25 8,1
338 fator interagindo Rapl 1 homólogo 1336, 1290, 1278, 198 172 211
24 (levedura) /// (mRif1) similar ao do telômero-proteína associada RIFI (fator 02 49 51 5,5 6 3,1
interagindo Rapt homólogo 1)
144 família portadora de soluto 5 1025, 706,6 869,5 137 127 121
79 (transportador de vitamina dependente 49 1 9,5 4,1 9,6
de sódio), membro 6
196 RIKEN gene do DNA 1500011J06 2082, 1586, 1424, 259 213 258
67 92 47 05 2,1 8,8 4,9
212 fosfatase proteína tirosina similar 488,9 206,0 471,0 602, 571, 650,
11 domínio contendo 1 6 7 3 68 37 06
201 seqüência expressa AA408296 1123, 793,8 596,3 159 139 149
26 36 7 2 9,9 7,9 0,4
204 fator de junção, ricos em arginina/serina 2421, 1796, 1659, 294 252 280
57 I (ASF/SF2) 27 6 9 7,2 1,6 8,5
505 proteína sinaptossomal-associada 23 749,2 643,0 613,4 116 101 108
6 6 8 5 1,8 2,4 7,2
231 isomerase peptidilprolil (ciclofilina)- 304,9 357,2 348,5 845, 673, 668,
56 similar 1 7 5 83 8 59
144 domínio rico e interativo AT 4B (similar 54,11 86,93 51,53 199, 154, 258,
44 Rbpl) 78 66 1
979 fibrilarina 527,3 324,2 338,1 693, 444, 799,
3 4 8 11 03 63
145 RIKEN gene do DNA 4732471D19 51,05 36,62 123,3 196, 132, 198,
90 6 47 63 82
216 PWPI homólogo (S. cerevisiae) 253,5 123,8 124,0 398, 231, 365,
8 4 2 6 21 41 55
110 ATP-cassete de liagação, sub-família F 147,6 158,8 142,9 345, 164, 215,
80 (GCN20), membro 1 9 8 7 18 53 87
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
197 repetir anquirina e domínio Mynd 3,72 28,84 6,61 112, 69,7 61,2
51 contendo 2 14 4 6
147 Fator Krüppel-similar 9 210,0 29,37 90,94 354, 272, 212,
56 2 82 53 2
150 YTH família domínio 1. 215,6 353,0 190,7 634, 438, 329,
73 9 3 5 54 28 92
274 RNA domínio pseudouridilate sintase 35,48 20,56 13,51 94,0 113, 134,
59 contendo 3 7 99 1
182 Gene Trk-fundido 784,4 340,5 295,5 928, 564, 679,
1 3 8 5 98 38
163 ciclo de divisão celular 2 homólogo A 1520, 991,8 1873, 192 247 290
90 (S. pombe) 87 8 5 2,5 0,7 8,9
214 claudina 6 377,3 362,3 248,6 836, 293, 421,
0 4 1 6 91 71 11
239 RIKEN gene do DNA 2210011C24 72,37 81,79 46,68 176, 192, 212,
88 2 27 67
140 La família domínio ribonucleoproteina, 423,2 344,1 388,7 594, 701, 735,
06 membro 5 7 4 6 63 46 35
827 fator crescimento insulina-similar 434,2 266,7 433,3 781, 500, 705,
0 receptor 2 3 5 7 98 48 3
158 proteínas dedo de zinco 289 81,46 122,0 76,07 252, 206, 182,
78 4 08 46 53
279 caseína quinase 1, epsilon 10,44 8,6 20,89 54,9 27,1 86,6
19 3 6 7
328 transcrição ubiquamente expressa 138,5 90,92 30,95 203, 182, 211,
1 4 48 02 77
162 RIKEN cDNA do gene 5730403B10 77,47 94,8 164,0 275, 166, 142,
69 4 16 89 51
134 domínio IBR contendo 3 1392, 1504, 1813, 241 200 226
17 62 44 39 4 4,9 4,8
236 proteína fosfatase 1A, magnésio, em 690,0 292,9 486,5 859, 850, 120
24 função da isoforma alfa 4 6 2 53 37 1,6
103 caspase 3 74,65 40,81 90,44 109, 153, 190,
24 36 83 24
173 dupla espiral RB1-induzivel 1 901,8 849,9 864,9 145 131 138
68 4 4 6 7,9 3,9 2,7
408 Smg homologo-7, fator de deterioração 670,8 509,1 594,1 909, 935, 910,
92 absurdo medida mRNA (C. elegans) 2 3 6 72 57 25
146 baixa densidade da lipoproteína 75,98 47,15 136,9 150, 243, 316,
99 proteína receptora e proteína 4 37 04 66
relacionada associada 1
969 proteína fosfatase 1A, magnésio, em 281,4 111,9 158,2 565, 304, 544,
6 função da isoforma alfa 6 15 18 53
124 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) polipeptídeo 278,5 119,1 117,3 431, 222, 267,
75 caixa 10 1 9 7 43 53 29
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
127 UTP11-similar, ribonucleoproteina U3 1652, 1247, 876,1 209 202 185
33 nucleolar pequena (levedura) 37 73 1 2,8 4,9 2,2
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
167 proteína ribossomal L36a-similar 2127, 1381, 1791, 231 211 220
73 47 86 81 8 8,3 9,7
289 fosfolipase C, delta 4 138,8 132,4 147,6 335, 224, 209,
91 3 9 3 85 94 08
889 família portadora de soluto 25 207,4 125,9 152,3 472, 322, 339,
4 (transportador mitocondrial, portador de fosfato), membro 25 7 9 1 41 97 68
125 pequeno complexo nuclear de ativação 209,5 210,8 181,9 483, 393, 376,
44 RNA, polipeptídeo 3 6 9 7 56 07 22
219 proteína ribossomal S24 1695, 1059, 1483, 202 155 189
85 18 62 47 1,2 4,3 6,5
794 MOB 1, Mps quinase ativadora-similar 559,1 330,5 241,5 736, 605, 626,
1 com uma ligação IB (levedura) 9 3 1 04 17 58
757 SWI / SNF relacionados, matriz 431,9 141,4 156,2 467, 379, 430,
6 associada, regulador de actina dependente da cromatina, subfamília c, membro 1 4 9 97 07 91
317 proteína de ligação poli A, 1067, 748,2 815,7 148 107 127
8 citoplasmática 1 51 1 3 1,8 8,9 1,7
535 tipo de subunidade proteassoma (prossoma, macropain), 7 beta 683,8 8 672 512,6 2 112 8,4 109 9,8 764, 78
109 69 domínio jumonji contendo IA 120,6 8 130,0 2 130,2 7 359 253, 12 231, 81
235 domínio BAT2 contendo 1 1319, 1222, 1121, 205 191 188
68 8 06 76 1,9 5,5 9,3
206 fator de iniciação de transcrição 873,2 655,2 823,5 121 106 116
89 eucariótica 2, subunidade 1-alfa 4 6 2,8 7,3 2,7
136 sequência expressa AU014645 1511, 1084, 1023, 177 157 191
07 34 22 43 7,7 1,1 0,8
108 ribonucleoproteina heterogênea nuclear 1632, 1042, 1052, 196 155 193
57 M 02 99 83 3,8 8,9 4,4
167 22 domínio repetido WD 12 55,39 143,6 8 73,22 227, 44 175, 28 219, 03
386 3 proteína quinase ativada por mitógenos 192,1 2 80,19 241,9 6 690, 93 358, 51 359, 34
290 RIKEN cDNA do gene D330037H05 /// 1816, 1506, 1606, 224 231 221
78 semelhantes às proteínas La relacionados 4 (ribonucleoproteina La domínio família membro 4) 97 16 86 8,8 9,3 1
107 70 proteassoma (prossoma, macropain) subunidade 26S, ATPase 2 97,46 73,58 87,82 238, 69 150, 72 194, 9
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
221 ER01-similar (S. cerevisiae) /// proteína 1617, 815,6 1036, 139 154 208
47 ribossômica L31 14 7 5 1,6 1,5 6,7
141 Sec61 alfa subunidade I (S. cerevisiae) 1726, 1072, 1292, 208 179 204
75 8 28 76 5,2 1,8 8,5
227 05 ets gene variante 5 505,7 3 222,2 1 367,1 690, 41 565, 33 752, 06
161 proteína complexa t-1 1790, 1179, 1413, 216 184 212
98 6 11 64 7,2 8,4 8,3
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
200 seqüência de cDNA BC024969 39,51 47,41 37,05 94,0 167, 143,
29 2 9 54
605 fator de iniciação de transcrição 752,3 559,3 604,8 124 942, 997,
4 eucariótica 2, subunidade 3, gene estrutural ligado ao X /// similar ao fator de iniciação de transcrição eucariótica 2, subunidade 3, gene estrutural ligado 5 2 7,6 02 47
ao X
219 similar ao PRAME família membro 8 /// 2409, 1514, 1777, 291 227 300
65 seqüência expressa AU018829 02 52 52 9,6 9,5 9,7
763 proteína nucleolar 11 103,2 75,19 118,3 278, 178, 208,
9 5 21 97 17
143 seqüência expressa C78212 421,1 232,7 227,1 553, 581, 405,
11 1 4 5 16 34 68
726 ubiquitina-conjugando enzima E2B, 527,6 343,5 429,5 890, 526, 809,
6 Rad6 homologia (S. cerevisiae) 5 3 9 61 22 78
113 Mus musculus, IMAGEM clone: 72 27,43 24,72 143, 119, 60,5
54 3983419, mRNA 74 31 8
100 RNA guanililtransferase e 5-fosfatase 106,9 84,63 87,19 301, 182, 150,
03 4 26 18 86
146 componente exosome 5 40,73 61,74 17,43 87,1 68,7 139,
2 9 3 55
829 ring finger e domínio SPRY contendo 1 633,6 573,6 579,7 113 137 116
3 5 3 6 7,8 3,9 1,8
827 receptor de fator de crescimento similar 74,29 195,5 490,6 528, 492, 528,
1 à insulina 2 2 9 54 61 94
802 domínio homologia Pleckstrin contendo, 625,3 324,5 341,8 105 850, 998,
0 família F (com domínio FYVE) membro 2 8 1 2,9 6 02
394 proteínas dedo de zinco 710 727,5 440,4 524,2 900, 784, 107
91 5 6 4 66 47 4,7
148 Dnal (Hsp40) homologo, subfamília B, 2390, 1648, 1910, 293 255 298
6 membro 9 47 72 19 5,8 6,3 1,4
150 proteína ribossomal S17 2459, 1443, 2004, 284 244 257
93 15 18 58 5,5 7 9,6
211 família torsin I, membro B 256,1 89,29 93,92 278, 251, 363,
5 9 8 82 38
274 seqüência de cDNA BC035295 443,6 439,2 554,8 570, 834, 708,
18 9 7 76 16 51
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
174 G domínio fragmento contendo 4 560,2 265,5 219,6 798, 518, 726,
66 3 9 7 37 64 56
201 fator de iniciação de transcrição 271,7 95,04 221,2 323, 248, 395,
3 eucariótica 3, subunidade 4 (delta) 4 4 99 6 58
271 RIKEN cDNA do gene E430025E21 155,4 124,8 115,9 304, 355, 222,
89 7 2 4 08 62 62
784 manosidase, classe alfa 2C, membro 1 6,08 8,03 3,61 38,9 14,5 85,0
6 9 6 9
159 ATPase tipo 13A3 1601, 1562, 1794, 214 209 203
48 83 47 92 1,2 4,8 8,2
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
305 6 factor de crecimento de insulina-similar 2 proteínas de ligação do mRNA 1 23,6 23,13 59,05 86,8 7 175, 53 124, 87
318 M-fase fosfoproteína 1 584,1 393,4 472,9 807, 805, 884,
66 8 6 9 12 27 71
111 fator de crescimento, erv1 (S. 390,6 114,2 604,4 777, 571, 116
54 cerevisiae)-similar (aumentador de regeneração do fígado) 9 4 4 64 65 1,3
464 0 M3 ciclina 240,0 3 342,0 7 62,47 256, 37 380, 42 457, 8
121 84 proteína de transferência de fosfatidilinositol, citoplasmática 1 70,98 70,85 77,64 242, 87 150, 65 236, 21
167 53 COX4 vizinho 595,7 7 603,5 354,0 9 995, 56 953, 48 706, 37
877 Pseudouridina Trub sintase (psi) 1598, 788,0 714,9 206 157 173
0 homologo 2 (E. coli) 35 1 2 5,6 5,7 7,5
353 gb:AV268519 446,4 227,1 224,8 668, 557, 627,
01 /DB_XREF=gi:16389684 /DB_XREF=AV268519 /CLONE=4930535J 16 /FEA=EST /CNT=4 MD=Mm.38413.1 /TIER=ConsEnd /STK=2 fUG=Mm.38413 /UG TITLE=ESTs 3 8 4 78 23 97
114 seqüência de cDNA BC010304 237,8 308,4 345,1 374, 548, 431,
55 4 3 4 3 32 79
148 ER01-similar (S. cerevisiae) /// proteína 1914, 1048, 1332, 181 186 245
40 ribossômica L31 61 97 05 5,1 0,9 9,7
163 09 proteína príon 5,67 27,92 7,5 114, 55 67,4 9 114, 67
721 proliferação associados 2G4 3806, 2690, 2523, 414 362 386
9 66 44 51 9,4 7,7 3
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
223 proteassoma (prossoma, macropain) 310,9 225,9 272,8 597, 410, 388,
27 subunidade, tipo alfa 4 7 4 2 48 26 07
171 51 exonuclease 3 -5 domínio similar 2 69,67 29,49 42,91 151, 69 68,2 9 135, 72
107 43 sorbitol desidrogenase 167,8 89,01 200,2 1 398, 11 251, 14 352, 86
606 receptor nuclear co-ativator 6 interação 1342, 996,2 1101, 193 148 178
4 de proteínas 43 5 97 5,4 6,3 9,3
145 46 componente complexo exocista 8 38,13 48,15 41,87 130, 42 147, 06 97,9 5
145 89 RIKEN gene do DNA 4732471D19 50,72 36,59 43,82 139, 69 116, 02 153, 6
173 proteína ribossômica L15 1103, 552,3 1197, 136 113 137
31 58 8 41 8,2 6,3 1,7
292 40 catenina (proteína caderina associada), delta 1 55,32 151,0 5 51,37 125, 57 252, 74 142, 05
857 0 seqüência expressa AI840826 48,97 43,58 48,65 146, 36 99,7 1 108, 05
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Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
291 RNA proteína motivo de ligação 4 177,4 100,6 79,8 250, 194, 248,
69 7 6 81 96 25
404 RIKEN cDNA do gene C130032F08 1581, 805,7 827,6 130 132 151
40 36 4 2 2,8 9,3 0,7
188 zipper da leucina básica e domínios W2 1856, 1429, 1724, 239 218 237
73 1 21 11 42 2,9 9,5 7,5
138 beta carioferina (importina) 1 30,07 36,79 45,53 113, 67,6 72,1
99 82 3 3
186 GA proteína vinculativa repetida, alfa 1521, 896,3 993,4 169 167 180
92 21 6 8 2,9 0,9 6,1
426 ativando o sinal cointegrator 1 300,8 273,1 256,7 436, 426, 352,
81 subunidade complexa 3 1 3 7 29 49 72
705 família portadora de soluto 22 78 127,9 90,24 109, 174, 301,
6 (transportador de ânion/cátion 8 02 7 99
orgânico), membro 12
213 proteína de membrana peroxisomal 2 28,37 71,63 15,47 123, 112, 103,
6 16 33 51
122 aminotransferase histona 1 95,59 63,13 63,73 206, 126, 201,
20 98 57 11
122 fator de junção, ricos 1em arginina / 1549, 1176, 1231, 205 186 195
58 serina (ASF/SF2) 68 89 71 8,8 1 1,5
129 proteínas interagindo PAKI 1 75,66 34,9 47,76 190, 119, 100,
83 93 37 33
123 proteína ribossômica L31 1611, 822,9 1110, 152 152 191
27 89 1 43 5,1 0 6,3
146 ribonucleoproteina heterogênea nuclear 1389, 888,3 1178, 169 142 187
84 Al 69 2 26 0,6 5,1 1,4
Col Gene 10/04 10/04 10/04 NI.1 NI.1 NI.1
una /01 /02 /03 .1 .2 .3
214 translocase da membrana externa da 1215 813,0 1005, 176 149 126
65 mitocôndria homologa 20 (levedura) 2 8 0,6 2,5 9,6
136 Semelhante à proteína de ligaçãoao 627,7 328,7 461,3 838, 772, 739,
01 nucleotídeo guanina 3 (nucleolar) 7 3 1 59 45 06
254 Segmento de DNA, Cr 5, Wayne 31,53 65,26 42,32 176 76,2 139,
26 1 61
221 State University 178, expresso 563,5 337,2 396,2 764, 661, 636,
09 7 2 62 9 46
347 RIKEN cDNA 2700007P21 312,9 195,7 307,8 802, 395, 379,
05 4 6 17 61 25
348 gene 514,4 276,5 265,4 530, 301, 663,
6 6 3 1 11 61 23
236 uroporfirinogênio descarboxilase 728,5 398,4 398,8 916, 850, 120
71 3 9 7 23 34 5,5
387 Proteína quinase 3 de interação com 61,98 31,99 50,41 171, 60,0 122,
0 homeodomínio 7 9 44
195 Ring finger 5 do grupo polycomb 19,32 37,3 32,34 163, 83,3 51,5
9 21 3 9
211 Proteína dedo de zinco 292 132,8 55,7 44,7 210, 136, 157,
27 3 48 27 44
746 gene 3reguladoà jusante de N-myc 504,9 301,8 270,7 671, 450, 487,
8 5 5 3 72 68 94
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Col una Gene 10/04 /01 10/04 /02 10/04 /03 NI.1 .1 NI.1 .2 NI.1 .3
409 86 contendo domínio coiled-coil 747,0 426,7 620,5 928, 864, 976,
3 8 5 7 72 53 28
190 Proteína de rede de golgi transprotein 962,8 668,1 307,2 156 751, 888,
91 2 7 6 9 88 84
781 2 Componente de complexo golgiense oligomérico 4 47,24 70,25 39,58 362, 38 201, 58 163, 49
Tabala 8B - continuação
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
52 Receptor de transferrina 2092,4 1394,6 3 2043,4 6 0,2279 67388 0 0,0001 595
154 Fator de iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 8 3612,2 2968,0 5 3465,9 5 0,3596 26325 0 0,0001 592
785 transmembran a emp24 domínio de transporte de proteína contendo 6 745,64 731,85 729,56 0,2186 19664 0 0,0002 218
1785 catepsina B 2070,4 1870,4 7 2628,6 0,2814 8163 0 0,0002 409
4369 Cassete de ligação de ATP, sub família F (GCN20), membro 1 1088,9 1163,3 2060,8 9 0,2709 72664 0 0,0003 167
4798 Proteína regulatória e mediadora de junção 532,88 603,44 674,49 0,2146 02255 0 0,0003 637
4799 Proteína regulatória e mediadora de junção 1676,9 1290,7 7 1588,1 7 0,2047 52955 0 6,13E- 006
5181 acilfosfatase 1, tipo eritrócito (comum) 528,01 477,38 466,65 0,1509 5098 0 0,0003 878
7126 Receptor de transferrina 2092 1833,6 4 2227,8 5 0,2856 02903 0 0,0006 869
1080 5 gene RIKEN cDNA 9130011J15 1214,6 1679,6 6 1121,6 6 0,2588 11622 0 0,0002 899
1088 7 Sintase de fosfatidilserina 2 1035,7 1127,9 8 1999,1 5 0,2655 55293 0 0,0012 754
1236 7 Fator similar a Kruppel 9 523,55 415,15 759,55 0,1695 0669 0 0,0001 973
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220/357
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1387 8 Fator de transcrição geral IIIC, polipeptídeo 4 516,42 384,03 566,54 0,0673 80969 0 2,35E- 005
1397 2 Fator de iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 6 1287,5 1098,1 9 1049,1 7 0,2064 16571 0 1,86E- 006
1400 2 Sintase de fosfatidilserina 2 1052,6 1114,6 1 1781,7 4 0,2745 71264 0 0,0010 226
1468 3 diacilglicerol kinase, epsilon 1097,9 905,2 997,74 0,2648 31986 0 0,0004 497
1550 4 Família torsina 2, membro A 515,53 1579,9 2 860,9 0,1824 92146 0 0,0003 166
1571 3 acilfosfatase 1, tipo eritrócito (comum) 452,15 386,11 368,38 0,1408 54607 0 0,0006 827
1579 1 Fator de iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 6 849,71 634,84 809,58 0,1830 70977 0 2,91E- 006
1812 2 acilfosfatase 1, tipo eritrócito (comum) 594,96 581,28 463,27 0,1287 3771 0 0,0001 085
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1837 5 Família transportadora de soluto 19 (troca de sódio/hidrogên io), membro 3 1053 795,48 1291,8 1 0,2023 30925 0 0,0001 809
1917 2 Proteína da transmembran a 111 1152,8 998,66 1763,9 9 0,2307 33122 0 7,44E005
2186 3 Fator similar a Kruppel 9 1693,1 992,37 1695,4 0,1813 73344 0 8,56E- 005
2187 3 Fator de iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 8 1811,8 1859,3 3 2228,3 2 0,2839 34988 0 0,0011 251
2214 9 Sintase de fosfatidilserina 2 1639,9 1905,6 3229,7 2 0,2611 13788 0 0,0013 722
2241 9 Fator de iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 6 1252,5 944,86 908,52 0,2305 8519 0 7,39E- 005
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2721 3 Segmento de DNA, Cr 19, Brigham&Wo men's Genetics 1357 expresso 2823,8 2513,7 5 3203,1 6 0,2784 48166 0 0,0026 84
2820 4 galactosidase, beta 1 2551,5 2521,7 5 2747,9 5 0,0983 57318 0 0,0001 485
2863 2 domínio anquirina repetido 38 166 148,99 316,27 0,0693 02556 0 4,02E005
2986 7 gene RIKEN cDNA 4933433K01 480,01 555,13 902,54 0,1410 95173 0 0,0003 186
3339 6 Lócus transcrito 1401,6 1113,6 3 1247,7 4 0,1964 66957 0 0,0014 356
4105 0 RIKEN cDNA 4930427A07 gene 822,19 1212,2 7 977,74 0,2355 5437 0 0,0006 871
2906 4 peptidase específica de ubiquitina 22 843,91 842,44 1309,0 2 0,2642 60671 0,0106 383 0,0012 713
2175 Fator de 1689,9 1790,3 2140,9 0,3400 0,0111 0,0006
9 iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 8 4 3 49716 111 011
2219 1 Proteína ribossomal L24 /// similar a proteína ribossomal L24 /// similar a proteína ribossomal L24 2400,7 2576,5 2545,9 4 0,4411 22173 0,0112 36 0,0018 963
2935 sirtuina 1 (regulação das informações do tipo de acasalamento 2, homólogo) 1 (S. cerevisiae) 612,19 521,34 692,06 0,2754 21332 0,0113 636 2,03E- 005
4370 Cassete de ligação de ATP, sub família F (GCN20), membro 1 1325,4 1128,4 2 2317,2 5 0,2840 61348 0,0113 636 0,0004 576
1612 2 Lócus transcrito 360,32 327,29 349,09 0,1689 71872 0,0114 943 0,0004 8
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
153 Fator de iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 8 1267,7 1026,0 5 1313,3 5 0,2925 01663 0,0116 279 0,0002 463
8022 Cassete de ligação de ATP, sub família F (GCN20), membro 2 884,29 887,81 683,59 0,2639 57035 0,0116 279 0,0020 016
2845 7 Família transportadora de soluto 30 (troca de zinco), membro 1 393,91 491,5 503,8 0,2417 10549 0,0117 647 0,0019 438
2182 4 Similar a tioredoxina 2 643,13 850,93 762,17 0,3156 86342 0,0119 048 4,42E005
7389 Inositol polifosfato-5 fosfatase E 342,97 181,11 290,47 0,1226 13079 0,0120 482 1,28E- 005
1680 8 catepsina B 690,28 580,37 717,78 0,2201 8659 0,0121 951 0,0042 723
3921 4 1-acilglicerol3-fosfato Oaciltransferase 5 (ácido lisofosfático aciltransferase , epsilon) 1281,2 1561,2 7 1458,7 3 0,3612 00628 0,0125 7,86E- 005
3399 Domínio abidrolase contendo 6 593,6 167,18 618,84 0,2350 75546 0,0126 582 0,0041 391
53 Receptor de transferrina 983,73 948,43 1145,3 8 0,2986 53411 0,0131 579 0,0030 139
9791 PQ ciclo de repetição contendo 2 60,34 219,02 172,47 0,0577 42178 0,0133 333 0,0002 489
7125 Receptor de transferrina 1430,9 1069,7 6 1417,7 2 0,3219 52338 0,0135 135 0,0001 175
1495 0 Iniciação de translação eucariótica fator 2C, 5 314,47 175,57 291,88 0,0941 05473 0,0136 986 0,0002 24
1825 0 Ativação de peptase apoptótica fator 1 297,58 228,07 287,72 0,1647 93159 0,0138 889 8,99E006
1065 7 jumonji, domínio de interação rico AT IC (similar a Rbp2) 670,73 493,09 411,48 0,2263 76879 0,0140 845 0,0007 532
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
4391 1 gb:BM122336 /DB_XREF=gi: 17106104 /DB_XREF=L0 508F03-3 /CLONE=L050 8F03 /FEA=EST /CNT=3 MD=Mm.2183 97.1 /TIER=ConsEn d /STK=2 /UG=Mm.2183 97 /UG_T1TLE=E STs 433,2 516,27 301,93 0,1178 28669 0,0144 928 0,0098 685
1870 3 Fator de alongamento de translação B (SIII), polipeptídeo 3 859,61 921,16 783,83 0,2931 16226 0,0147 059 1,39E- 005
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1620 4 Proteína protetora para Galactosidase beta 1365,1 642,54 1356,9 2 0,3711 97851 0,0149 254 0,0062 947
1539 5 Proteína de seleção vacuolar 54 (levedura) 1134,2 921,8 1216,1 9 0,3276 73024 0,0151 515 0,0022 771
4980 esfingosina-lfosfato fosfatase 1 509,63 536,21 763,86 0,2326 61338 0,0153 846 0,0016 041
54 Receptor de transferrina 1238,7 1119,8 9 1324,0 5 0,3450 56322 0,0156 25 0,0001 084
2790 2 Canal retificador interno de potássio, subfamília K, membro 6 516,23 473,27 565,17 0,2034 62224 0,0158 73 0,0004 61
3980 2 neuropilina (NRP) e toloide (TLL) similar a 2 427,95 275,96 347,24 0,2128 49871 0,0163 934 0,0003 248
384 Proteína ribossomal S15 727,25 514,63 1106,9 2 0,2643 53593 0,0166 667 0,0195 56
6466 /DB_XREF=gi: 14010854 /GEN=Usmg3 /FEA=FLmRN A 730,81 656,42 846,69 0,2851 26834 0,0166 667 3,78E006
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/CNT=2 CTID=Mm.218 588.1 /TIER=FL /STK=I /UG=Mm.2185 88 /LL=83678 /DEF=Mus super regulação dos músculos durante o crescimento musculus dos músculos do esqueleto 3 (Usmg3), mRNA. /PROD= superregulaçã o
3476 6 Proteína de seleção vacuolar 33A (levedura) 807,65 809,12 987,11 0,3063 63391 0,0166 667 0,0010 56
3888 RNA, U 985,1 1105,7 1283,7 0,3528 0,0168 0,0022
5 transportador 1 8 4 68063 067 715
8821 peptidase (processament o mitocondrial) alfa 329,1 251,1 518,94 0,1622 7585 0,0169 492 1,65E- 005
1044 gene RIKEN 1558,4 2078,8 1484,0 0,4100 0,0172 0,0002
8 cDNA 2610028H07 8 2 69668 414 259
1400 1 Sintase de fosfatidilserina 2 764,33 553,32 801,99 0,2652 16895 0,0172 414 0,0006 063
2152 7 DEAD (AspGlu-Ala-Asp) polipeptídeo box 49 391,02 405,54 415,71 0,2615 4586 0,0173 913 0,0046 885
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2934 4 Ceco masculino adulto cDNA, RIKEN biblioteca enriquecida completa, clone:9130409 M07 produto:proteí na hipotética, sequência de inserção completa 562,83 671,26 386,9 0,2254 50393 0,0175 439 0,0029 241
1357 gene RIKEN 2042,7 2601,4 3336,8 0,4400 0,0176 0,0022
9 cDNA 9430010O03 9 2 98756 991 117
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8699 proteína quinase interativa com homeodomínio 1 1575,7 1648,7 3 1861,8 9 0,3524 35769 0,0178 571 0,0007 282
1605 3 Sequência expressa C77815 689,78 629,82 713,08 0,2734 13709 0,0178 571 0,0024 756
3327 0 gene modelo 104, (NCBI) 625,11 416,17 774,69 0,2822 32077 0,0180 18 0,0005 568
3951 Família transportadora de soluto 25, membro 36 716,16 716,8 838,71 0,3221 48103 0,0181 818 0,0004 515
8247 Gene proliferador de melanocita 1 225,51 241,69 255,09 0,1046 66516 0,0183 486 0,0002 854
2497 7 Complexo de reconheciment o de origem, subunidade similar a 4 (S. cerevisiae) 113,94 217,49 143,37 0,1668 31717 0,0185 185 0,0038 284
2888 minicromosso 1001,6 1386,4 1286,1 0,3406 0,0185 3,87E-
7 mo manutenção deficiente 5, ciclo de divisão celular 46 (S. cerevisiae) 3 9 1178 185 005
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4477 8 gb:BB473929 /DB_XREF=gi: 16439785 /DB_XREF=B B473929 /CLONE=D330 003M06 /FEA=EST /CNT=5 MD=Mm.2144 71.1 /TIER=ConsEn d /STK=3 /UG=Mm.2144 71 /UG_TITLE=E STs, levemente similar a POLIPROTEÍ NA ENV RELACIONAD A A RETROVÍRUS HUMANO (H.sapiens) 629,46 581,85 788,79 0,2464 93517 0,0188 679 0,0026 378
9574 Família transportadora de soluto I (transportador de glutamato com alta afinidade neuronal/epitel ial sistema Xag), membro 1 469,01 318,11 475,25 0,2189 3653 0,0190 476 4,04E- 005
8320 DEAD (AspGlu-Ala-Asp) polipeptídeo box 27 453,03 489,33 871,51 0,2656 81561 0,0190 84 0,0001 682
5137 Fator de respiração nuclear 1 387,53 439,3 340,7 0,1966 71726 0,0192 308 0,0007 295
1224 0 Similar a kelch 21 (Drosophila) 2344,7 2073,5 1 1947,4 0,3594 39618 0,0192 308 0,0032 461
1375 Sinal intermediário em caminho Toll evolucionaria mente conservado 218,85 209,08 241,65 0,1667 74956 0,0193 548 7,77E- 007
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2034 2 Membro da família quinesina 11 896,31 538,17 967,58 0,3427 9614 0,0193 798 0,0017 006
3221 5 gene RIKEN cDNA 4833426J09 664,64 325,8 820,34 0,1977 55566 0,0194 175 0,0010 283
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
4031 6 Interrompido em carcinoma renal 2 (humano) 386,44 406,16 550,1 0,2451 54312 0,0194 805 0,0003 145
2244 Proteína 1821,2 2432,0 2770,4 0,4023 0,0195 0,0060
8 ribossomal L37a 9 3 40412 313 903
1488 3 similar a tripartite principal contendo 43 3576,3 3726,6 1 3888,5 0,4529 40224 0,0196 078 0,0001 253
1751 4 dolicol-fosfato (beta-D) manosiltransfe rase 1 654,69 634,23 705,73 0,3387 25042 0,0196 078 4,11E- 006
2049 8 Receptor de interleucina D 741,16 890,6 1180,0 7 0,3548 38495 0,0196 078 0,0005 224
8691 YLP principal contendo 1 700,52 1020 768,8 0,3239 1888 0,0196 85 0,0011 842
1363 Proteína tirosina fosfatase, tipo não receptor 1 459,26 401,39 646,69 0,2579 89125 0,0197 368 0,0003 368
4707 gene RIKEN cDNA 2310008H09 490,78 359,97 815,86 0,2778 89149 0,0198 413 0,0023 341
2958 Domínio 1757,5 1238,8 1402,2 0,4030 0,0198 0,0008
2 HECT contendo1 4 1 19138 675 206
1209 0 piridoxal (piridoxina, vitamina B6) quinase 1752,2 1584,8 3 2835,5 4 0,4039 85912 0,02 0,0027 95
1907 6 Proteína associada com receptor de célula B 31 1177,4 1170,2 5 1387,1 6 0,3616 29108 0,02 0,0003 538
2205 9 Segmento de DNA, Cr 9, ERATO Doi 720, expresso 565,85 296,89 522,68 0,2455 5787 0,02 0,0004 27
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1496 8 Linhagem Casitas B similar a linfoma I 387,77 297,25 353,48 0,2058 19011 0,0201 342 0,0001 355
3646 gene RIKEN cDNA 0610007P06 515,25 489,89 705,11 0,2434 18386 0,0201 613 0,0011 365
7606 Peptidase caseinolítica X (E.coli) 860,05 674,03 951,76 0,3251 25091 0,0204 082 4,40E- 005
1462 Segmento de 2958,2 2051,0 2943,8 0,4572 0,0204 0,0054
3 DNA, Cr 19, ERATO Doi 721, expresso 6 4 11329 082 623
2174 0 Peptidase específica de ubiquitina 22 464,56 442,81 598,41 0,1828 72129 0,0204 082 3,09E005
4084 4 gene RIKEN cDNA A530082C11 456,67 365,07 541,49 0,2865 82174 0,0204 918 0,0004 431
4184 6 Segmento de DNA, Cr 14, Abbott 1 expresso 637,61 639,35 503,72 0,3256 42915 0,0205 479 0,0004 529
1236 6 Fator similar a Kruppel 9 191,43 117,35 292,03 0,0928 41046 0,0206 612 1,05E- 005
1627 Domínio de 1900,9 1549,2 1875,2 0,4442 0,0206 0,0004
5 repetição de anquirina 10 8 9 74929 897 349
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1551 Família 972,75 1046,0 1193,4 0,2922 0,0208 0,0002
3 transportadora de soluto 44, membro 2 6 7 96497 333 617
3013 DEAD/H (Asp- 557,59 1736,8 1228,5 0,3234 0,0208 0,0215
6 Glu-Ala Asp/His) polipeptídeo box 31 9 2 32306 333 081
5443 fosfatidilinosito l glicano, classe N 257,91 95,85 192,79 0,1239 59488 0,0209 79 3,41E- 005
1149 Fator de 2810,8 2721,9 2515,6 0,4744 0,0211 0,0004
2 divisão, rico em erginina/serina 15 /// similar ao fator de divisão, rico em erginina/serina 15 9 6 25893 268 669
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
512 Proteína ribossomal L37a 1242,4 1292,9 5 1650,5 2 0,4078 56568 0,0212 766 0,0019 437
1953 6 TAF9 RNA polimerase II, proteína de ligação box TATA (TBP)fator associado 788,7 630,81 1019,5 2 0,2998 91585 0,0215 054 0,0002 73
1398 Similar a bolA 2058,8 2007,0 2217,3 0,4595 0,0217 0,0077
1 2 (E. coli) 6 6 84404 391 394
1633 9 CNDP dipeptidase 2 (família metalopeptida se M20) 150,97 419,23 414,14 0,1944 35338 0,0217 391 0,0024 606
4057 Gene RIKEN 4490,2 4321,1 4046,7 0,4889 0,0219 0,0007
7 cDNA D330037H05 /// similar a proteína relacionada com La 4 (membro da família ribonucleoprot eína La principal 4) /// similar a proteína relacionada com La 4 (membro da família ribonucleoprot eína La principal 4) 6 6 76197 78 465
2307 1 gene RIKEN cDNA 3300001M20 858,23 902,18 429,21 0,3175 66612 0,0222 222 0,0005 967
5178 gene RIKEN cDNA 1700021F05 2301 2524,0 8 2681,1 7 0,4911 53722 0,0233 918 0,0028 338
9650 Receptor de proteína morfogenética do osso, tipo IA 566,68 440,17 655,89 0,3455 17942 0,0234 742 4,52E005
2092 7 Proteína ribossomal S15a 1644,5 2363,4 2951,0 7 0,4971 81577 0,0235 849 0,0016 8
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
9017 L-2hidroxiglutarat o dehidrogenase 1621,2 1345,6 3 1417,5 9 0,4144 35677 0,0236 686 0,0098 61
1909 Proteína 2782,6 3268,3 3608,7 0,4714 0,0238 0,0093
5 ribossomal S25 2 2 53683 095 561
2314 gene RIKEN 2559,7 2606,7 2682,3 0,5341 0,0239 0,0022
6 cDNA 4933417E01 5 8 17054 234 504
1412 2 Proteína ribossomal L37 /// similar a proteína ribossomal L37 3213,9 3926,6 5118,5 9 0,4792 7296 0,0239 521 0,0158 553
1918 Família transportadora de soluto 12, membro 2 2393,4 1532,6 5 1828,3 4 0,4374 22461 0,0240 964 0,0025 157
9201 prolina, ácido glutâmico e proteína rica em leucina 1 1107,5 1067,0 4 1083,9 9 0,4005 53843 0,0241 546 0,0057 344
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
7982 gene RIKEN cDNA 2610012O22 719,07 776,11 829,08 0,3520 09393 0,0242 424 0,0003 918
6045 Homólogo Son of sevenless 1 (Drosophila) 937,33 493,55 698,66 0,3765 96765 0,0243 902 0,0031 761
8238 gene RIKEN cDNA 2900073H19 345,06 612,16 561,13 0,3146 20203 0,0243 902 0,0037 228
1087 fosfatase 1G (anteriormente 2C), isoforma gama dependente de magnésio 1497,2 1797,0 5 1727,8 2 0,4838 25524 0,0246 305 0,0001 246
1222 4 Família transportadora de soluto 44, membro 2 894,68 755,73 873,96 0,3702 87697 0,0246 914 5,28E- 005
8376 poli (A) polimerase alfa 349,39 111,73 134,94 0,0976 27119 0,0247 525 0,0001 411
1563 5 DEAD (AspGlu-Ala-Asp) polipeptídio box 54 2190,6 2797,0 1 3685,1 2 0,4328 37698 0,025 0,0116 347
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2222 4 domínio WD repetido 81 314,53 347,69 678,34 0,1297 83079 0,025 0,0027 992
6961 Criptidina relacionada a defensina 3 555,4 446,67 466,28 0,3249 3163 0,0251 046 4,13E- 005
2811 Fator de transcrição de elemento de ligação de resposta metálica 2 2913,6 2368,8 9 2633,3 4 0,5000 13171 0,0251 256 0,0021 686
3866 0 Similar a tioredoxina 2 /// similar a similar a tioredoxina 2 354,26 505,22 432,44 0,3645 99938 0,0251 678 0,0004 661
1923 2 Subunidade de proteassoma (prossoma, macropain), beta tipo 4 679,25 828,99 1020,7 9 0,3598 11322 0,0252 101 0,0025 591
7130 GCN5 controle geral de aminoácido similar a síntese 2 (levedura) 527,41 562,67 457,51 0,3428 38958 0,0252 525 0,0015 86
3914 proteína 1597,5 1131,1 1120,3 0,4624 0,0252 0,0028
8 fosfatase IA, dependente de magnésio, isoforma alfa 2 4 79307 525 015
2076 gene RIKEN 2009,3 2276,2 2705,7 0,4725 0,0253 0,0003
0 cDNA 6330412F12 3 8 93299 165 673
3028 8 gene RIKEN cDNA D630023B12 354,09 367,11 666,9 0,3723 39595 0,0253 378 0,0016 265
6136 Matriz de metalopeptida se 19 1010,7 1245,3 9 922,69 0,4064 99315 0,0253 807 0,0010 616
504 glutamato dehidrogenase 1 1144,2 1119,6 4 1119,8 5 0,4788 71262 0,0254 237 0,0029 959
1985 5 acyl-CoA membro da família de cadeia longa sintetase 4 500,48 291,57 601,29 0,2944 30254 0,0254 777 0,0004 21
1099 6 metionil aminopeptidas e 1 730,27 394,02 744,54 0,3167 49033 0,0255 102 0,0005 83
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1214 6 Fator de ligação do molde B2 391,51 663,29 603,91 0,3189 8202 0,0255 102 0,0075 341
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1445 Fator de 1540,2 1462,7 1376,8 0,4581 0,0255 0,0108
6 iniciação de translação eucariótica 4E membro 2 2 9 35605 319 369
2427 Proteína 3772,8 3453,7 5642,0 0,4920 0,0256 0,0050
2 ribossomal S21 5 6 33374 41 088
2012 Histocompatibi 1610,6 1602,2 1546,1 0,4944 0,0257 0,0011
2 lidade 47 5 4 65907 511 762
1829 integrin beta 5 245,56 233,83 262,94 0,1598 56097 0,0257 732 0,0001 947
8820 peptidase (processament o mitocondrial) alfa 289,87 282,06 241,71 0,2379 12239 0,0257 732 0,0008 926
8632 polimerase (RNA) II (direcionado ao DNA) polipeptídio H 1016,1 1159,3 5 1244,5 2 0,4247 01322 0,0258 621 0,0085 917
1830 9 Fator de crescimento de fibroblasto 4 143,65 149,66 594,64 0,0886 14427 0,0259 067 0,0008 834
2985 5 Domínio repetido de anquirina 35 396,59 1145,2 9 528,2 0,2729 14247 0,0259 516 0,0031 84
2380 Gene RIKEN 1130,6 1078,9 1163,2 0,4461 0,0259 0,0029
8 Cdna 4632434Í11 4 2 02905 74 039
1673 4 antígenos de células de carcinoma escamosas reconhecidas por células T 1 525,03 704,23 1019,1 7 0,3874 53221 0,0260 417 0,0069 247
2042 Fator de 4326,7 3486,4 3541,5 0,5330 0,0260 0,0035
3 divisão, rico em arginina/serina 15 /// similar a fator de divisão, rico em arginina/serina 15 3 3 24807 87 933
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2153 Proteína 4290,3 3926,8 4970,5 0,5371 0,0261 0,0018
3 ribossomal L41 2 1 55245 78 175
1137 8 gb:AV003927 /DB_XREF=gi: 4780777 /DB_XREF=A V003927 /CLONE=0610 038F02 /FEA=mRNA /CNT=8 /TID=Mm.8913 6.2 /TIER=Stack /STK=8 /UG=Mm.8913 6 /LL=15078 /UG_GENE=H 3f3a /UG_TITLE=H 3 histona, família 3A 1827,2 1989,2 7 2602,7 0,4872 82112 0,0262 009 0,0009 576
1057 Domínio da 2397,5 2218,5 2274,8 0,4816 0,0263 0,0031
5 família Yipl, membro 4 8 2 13455 158 262
2708 6 Gene R1KEN cDNA 6720458F09 1261,3 1536,3 928,03 0,3342 48254 0,0264 317 0,0191 853
7894 WD domínio de repetição 36 573,36 653,39 981,04 0,3672 14605 0,0265 018 0,0002 455
2027 9 UTP20, subunidade pequena (SSU) componente de processoma, homólogo (levedura) 559,06 746,95 535 0,3178 41679 0,0265 487 0,0029 134
1828 integrin beta 5 300,13 259,71 279,75 0,1783 28235 0,0265 957 0,0008 741
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1102 9 F-única proteína caixa 33 875,23 916,58 1126,4 9 0,4140 51304 0,0265 957 0,0002 359
2961 9 Fator de transcrição associado a BCL2 1 4169,1 3260,8 3703,5 0,5438 64934 0,0266 393 0,0024 184
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
7972 Membro da família quinesina 22 722,03 806,28 1047,4 4 0,4158 04823 0,0266 667 0,0003 301
2085 fator de 1732,9 1838,7 1899,8 0,4902 0,0266 0,0042
5 transcrição de ligação montante de polimerase de super RNA I 7 1 14572 667 355
3937 Proteína de ligação rica em elemento purina B 380,5 365,18 322,38 0,2942 58119 0,0266 904 0,0001 887
1555 6 ataxina 10 181,72 19,95 77,06 0,1404 12739 0,0267 38 0,0125 911
3231 8 Proteína de ligação de nucleotídeo guanina (proteína G), beta similar a polipeptídio beta 1 315,19 211,09 159,05 0,1724 69328 0,0267 49 3,09E005
2086 5 transportina 3 892,24 975,15 1289,6 4 0,4424 15456 0,0267 559 0,0003 86
4981 esfingosina-lfosfato 1138,2 1603,7 5 1205,3 9 0,4548 13871 0,0268 817 0,0067 968
1973 0 gb:M11310.1 /DB_XREF=gi: 192009 /FEA=FLmRN A /CNT=3 MD=Mm.1786. 2 /TIER=FL /STK=2 /UG=Mm.1786 /LL=11821 /UG_GENE=A prt /UG_TITLE=a denina fosforibosil transferase /DEF=Adenina Fosforibosiltra nsferase de camundongo (APRT), CDs. completo /FL=gb:M1131 0.1 843,3 1266,5 1 1056,9 0,4039 82764 0,0268 817 0,0192 797
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2263 6 glutamina frutose-6fosfato transaminase 1 566,93 599,99 90,41 0,2296 13372 0,0269 058 0,0224 723
2926 Enzima conjugadora de ubiquitina E2H 647,84 590,18 714,62 0,3666 14327 0,0269 71 0,0001 281
2735 8 Gene RIKEN cDNA 9630055N22 /// proteína relacionada ao receptor do subgrupo C similar ao vírus de leucemia felina relacionada a (receptor do subgrupo C similar ao vírus de leucemia felina) (hFLVCR) 271,25 214,45 185,62 0,2197 06967 0,0269 784 4,17E- 005
9307 Seleção de nexina 6 836,86 766,12 1038,7 7 0,3862 56765 0,0270 27 0,0017 574
1692 4 Família torsina 1, membro B 740,56 964,62 1195,3 8 0,4173 51759 0,0270 27 0,0026 552
1340 6 Gene RIKEN cDNA 1700081L11 846,57 836,8 863,11 0,4428 08899 0,0270 758 0,0207 857
4267 Fator de terminação de translação eucariótico 1 1011 1046,3 1 2206,0 7 0,3633 73978 0,0271 739 0,0020 725
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1091 0 nucleoporina 107 667,94 577,6 680,86 0,3885 64112 0,0271 739 0,0002 774
3500 Domínio de correção G contendo 4 962,71 725,77 902,34 0,4355 53233 0,0272 727 0,0026 549
1685 6 Família transportadora de soluto 12, membro 2 447,9 572,27 515,56 0,3241 28164 0,0273 224 0,0004 126
2335 3 Complexo GINS subunidade 3 (Psf3 homólogo) 448,35 272,34 362,05 0,3149 15986 0,0273 723 0,0094 52
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1156 Proteína 1117 1028,7 1020,1 0,4090 0,0273 0,0010
7 associada com receptor de hormônio tiroide 3 8 2 69141 973 239
2012 3 Gene RIKEN cDNA D230025D16 969,51 843,84 1512,6 6 0,3862 40622 0,0274 725 0,0055 159
2302 2 gene modelo 608, (NCBI) 284,71 124,46 269,07 0,1212 58675 0,0274 725 8,52E- 005
957 sarcosina dehidrogenase 265,49 87,25 247,39 0,2396 72488 0,0275 229 0,0040 517
1173 integrina beta 2235,5 2368,9 2496,3 0,5292 0,0275 0,0023
7 4 proteína de ligação 1 3 74561 591 595
1246 7 Subunidade de complexo integrante 7 167,85 135,22 200,6 0,0972 89347 0,0275 735 3,84E005
2869 6 Sequência de cDNA BC031781 561,46 529,25 585,07 0,3331 829 0,0276 243 0,0002 035
2616 dodecenoilCoenzima A delta isomerase (3,2 transenoil-Coenzim a A isomerase) 467,21 472 709,62 0,3433 68713 0,0276 498 0,0004 38
1678 2 Proteína associada a receptores Traf e T nf 271,8 329,04 442,44 0,2785 75632 0,0277 778 1,87E- 005
1724 6 Homólogo similar a piwi 2 (Drosófila) 490,29 309,46 467,42 0,3395 45695 0,0277 778 0,0005 092
2826 3 Proteína de dedo ZINC 297B 824,26 739,66 843,71 0,4145 57511 0,0277 778 0,0008 967
1385 CCR4-NOT 1220,5 1252,7 1422,6 0,4695 0,0278 0,0007
2 transcrição complexa, subunidade 1 1 8 5327 81 801
2327 7 Biogênese de complexo de organelas associadas relacionadas a lisossoma 1, subunidade 2 292,97 413,85 462,88 0,2423 80821 0,0279 33 0,0014 894
4275 3 Gene RIKEN cDNA 2010002M12 251,82 312,33 262,98 0,2568 96236 0,0279 851 0,0034 619
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2019 1 Sequência de cDNA BC038286 343,44 337,31 491,7 0,2744 10783 0,028 0,0003 098
3970 6 /DB_XREF=gi: 12854789 /GEN=Hipk1 /FEA=mRNA /CNT=3 /TID=Mm.1607 10.1 MER=ConsEn d /STK=2 /UG=Mm.1607 10 /UG_TITLE=M us músculos testis masculinos adultos cDNA, RIKEN biblioteca enriquecida completa, clone:4930557 G23:proteína quinase interativa com homeodomínio 1, inserir completament e sequência /DEF= Mus músculos testis masculinos adultos cDNA, RIKEN biblioteca enriquecida completa, clone:4930557 G23:proteína quinase interativa com homeodomínio 1, 1548,5 1390,4 2 1818,5 5 0,4380 98857 0,0280 374 0,0003 247
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2731 0 Domínio de correção G e KOW principal 336,31 260,97 331,72 0,2883 64756 0,0280 899 0,0005 661
1563 1 Proteína de dimerização Max. 3 635,95 544,19 1682,2 3 0,2691 58034 0,0281 955 0,0129 852
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1794 translocase de membrana de mitocôndria interior 10 homólogo (levedura) 560,37 1173,8 1 1446,1 8 0,3516 74081 0,0282 486 0,0119 719
4039 Gene RIKEN 1147,6 1095,1 1136,2 0,4769 0,0283 0,0009
4 cDNA A230097K15 2 4 93833 019 963
1393 citocromo c 757,93 1492,7 1259,9 0,4659 0,0283 0,0084
2 oxidase, subunidade XVII homólogo de montagem de proteína (levedura) 7 5 78119 401 615
1258 Fosfoproteína 2601,3 2478,5 2899,6 0,5090 0,0284 0,0016
3 nucleolar e com corpo em espiral 1 7 6 51699 091 689
4473 Gene RIKEN 2853,9 2696,9 3033,9 0,5547 0,0284 0,0012
3 cDNA 2610510H03 gene 3 6 99252 091 75
2405 Gene RIKEN 2668,2 2814,6 3260,9 0,5383 0,0284 0,0008
7 cDNA 6330548622 6 3 8802 553 83
9979 Domínio de correção G contendo 4 2071,8 1558,2 8 1584,7 7 0,4557 20416 0,0285 714 0,0099 865
1537 9 sorbitol dehidrogenase 303,1 194,63 333,28 0,2213 62658 0,0285 714 0,0001 589
1395 CD320 antígeno 885,75 732,05 898,14 0,3715 39753 0,0287 356 0,0068 117
1014 7 Proteína quinase interativa com homeodomínio 1 /// similar a proteína quinase interativa com homeodomínio I 900,14 726,92 970,38 0,2838 80848 0,0287 356 0,0148 624
4040 8 Dedo de zinco e domínio BTB contendo 11 408,57 545,45 573,96 0,3129 45159 0,0288 462 0,0002 445
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1234 4 Família de domínio La ribonucleoprot eína, membro 1 /// similar a isoforma da proteína relacionada 1 684,6 681,6 1010,2 0,3327 84344 0,0289 017 0,0042 813
801 proteassoma (prossoma, macropain) subunidade, tipo alfa 6 873,25 678,68 1083,5 3 0,3582 34609 0,0289 575 0,0029 615
1236 gb:AW545056 1101,1 1108,6 1025,5 0,4450 0,0290 0,0054
5 /DB_XREF=gi: 7187569 /DB_XREF=C 0190C04-3 /CLONE-00190C04 /FEA=mRNA /CNT=182 MD=Mm.2990 9.1 /TIER=Stack /STK=60 /UG=Mm.2990 9 /LL=69023 /UG_GENE=1 810005K14Rik /UG_TITLE=g eneRIKEN cDNA 1810005K14 2 1 1485 698 53
1358 0 Gene RIKEN cDNA 9430010003 651,64 535,7 411,67 0,3685 33001 0,0292 969 0,0006 763
2903 4 jumonji, domínio interativo rico em AT IA (similar a Rbp2) 93,92 144 233,42 0,1620 42152 0,0295 082 0,0001 196
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
8637 Síndrome de Bardet-Biedl 2 Homólogo (humano) 500,41 586,34 389,87 0,3118 44939 0,0296 053 0,0021 667
2193 2 Locus transcrito 653,87 636,22 766,49 0,3975 98194 0,0297 03 0,0095 005
2447 Família do 2101,3 2010,4 1899,3 0,5141 0,0298 0,0025
1 domínio TSC22 2 3 3 36405 013 007
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1271 3 transportina 3 782,62 552,05 536,83 0,3582 83679 0,0299 003 0,0008 886
4235 Proteína de dedo ZINC 644 242,2 191,55 329,75 0,2917 76181 0,0306 407 0,0041 324
2795 6 Gene RIKEN cDNA 4933439C20/// fosfatidilserina decarboxilase 580,99 667,79 1214,0 5 0,3360 68371 0,0307 263 0,0056 734
1494 proteassoma 1149,9 1450,1 1653,8 0,4306 0,0308 0,0055
5 (prossoma, macropain) subunidade, tipo alfa 6 8 2 18656 123 242
8311 CDNA IMAGEM clone :30031514 2026,2 1949,4 9 2208,3 7 0,5470 43051 0,0310 734 0,0016 712
1842 3 Antígeno estromal 2 665,09 575,32 749,19 0,4123 63183 0,0311 615 0,0028 202
7826 metionina adenosiltransf erase II, alfa 2217 1838,9 3 2120,4 8 0,5214 90234 0,0314 286 0,0049 962
8396 Proteína de dedo ZINC 639 1011,3 1284,0 1 1188,3 0,4839 70154 0,0315 186 0,0001 776
1911 4 Domínio de repetição WD 36 409,04 556,77 672,92 0,3333 07284 0,0316 092 0,0003 869
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
919 ubiquitina A-52 produto do resíduo da fusão da proteína ribossomal 1 /// similar a ubiquitina A-52 produto do resíduo da fusão da proteína ribossomal 1 /// similar a ubiquitina A-52 produto do resíduo da fusão da proteína ribossomal 1 /// similar a ubiquitina A-52 produto do resíduo da fusão da proteína ribossomal 1 2225,4 1773,6 6 3566,2 8 0,4520 84904 0,0317 003 0,0141 749
6104 Domínio brix contendo 1 797,43 691,14 566,73 0,3885 26162 0,0317 919 0,0011 722
1452 8 gene modelo 288, (NCBI) 841,18 913,47 964,44 0,4680 03463 0,0318 841 0,0074 861
1423 Proteína 2583,6 2433,0 3136,4 0,5575 0,0319 0,0137
4 ribossomal S3 2 9 83805 149 526
1610 Proteína associada GRIP1 1 284,24 349,37 343,89 0,2872 50516 0,0319 767 0,0006 465
607 arginil-tRNA sintetase 931,87 958,54 1034 0,4692 34899 0,032 0,0013 058
8157 Fator de transcrição geral MC, polipeptídio 5 425,12 499,92 698,25 0,3367 86421 0,0320 856 0,0021 154
1054 Receptor 1236,1 1335,2 2000,9 0,4494 0,0321 0,0048
0 ativado de peroxissoma proliferativa, gama, Relacionado a coativador 1 1 8 03209 543 798
1759 1 Proteína de dedo ZINC 292 256,79 209,89 116,94 0,2226 21866 0,0321 637 6,65E005
1678 histocompatibil 2583,7 2481,4 2674,0 0,5875 0,0321 0,0034
0 idade 47 2 7 33816 716 281
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
257 Fator de iniciação de translação eucariótica 3, subunidade 3 (gama) 1897,9 1173,9 2308,6 2 0,4167 5632 0,0322 581 0,0048 499
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1310 ribonucleoprot 2936,5 2830,5 2597,9 0,5838 0,0323 0,0009
1 eína A/B heterogênea nuclear 6 7 69773 326 997
3352 5 Locus transcrito 389,83 242,22 680,37 0,3454 9216 0,0323 45 0,0124 003
2568 Proteína ribossomal L30 /// similar a proteína ribossomal L30 /// similar a proteína ribossomal L30/// similar a proteína ribossomal L30 /// similar a proteína ribossomal L30 1668,9 1938,2 2 2788,5 0,5086 43152 0,0323 529 0,0032 559
7517 Gene RIKEN cDNA 1810009K13 427,73 276,99 553,43 0,2734 31114 0,0323 625 0,0043 57
1961 4 TIP41, similar a caminho de sinalização regulador TOR (S, cerevisiae) 2846,6 2746,0 3 2667,1 0,5931 40169 0,0324 074 0,0026 507
5982 Proteína fosfatase 2 (anteriormente 2A), subunidade catalisadora, isoforma beta 928,41 1201,2 6 1257,0 8 0,4336 87423 0,0324 324 0,0065 785
9877 Proteína de ligação do vírus influenza NS1A 1663,5 2058,9 1 1252,9 7 0,4644 54715 0,0324 826 0,0127 915
1688 5 Similar a segregação de cromossomas 1 (S, cerevisiae) 298,67 387,07 410,09 0,3360 08186 0,0325 444 2,39E- 005
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2919 2 Fator específico de clivagem e poliadenilação 6 127,6 192,74 129,81 0,1969 93388 0,0325 581 8,84E005
8733 transmembran a emp24 domínio de transporte de proteína contendo 5 476,75 506,84 551,44 0,3613 44593 0,0325 733 0,0001 565
8642 /DB_XREF=gi: 14318706 /FEA=FLmRN A /CNT=134 MD=Mm,2950 0,1 MER=FL+Stac k /STK=29 /UG=Mm,2950 0 /DEF=Mus musculos, proteína hipotética FLJ10788, clone MGC:6884 IMAGE:26515 99, mRNA, cds completo, 573,62 451,43 424,69 0,3655 84014 0,0326 087 5,25E- 005
2773 6 Gene RIKEN cDNA C730049014 733,69 724,56 697,53 0,4483 88458 0,0326 34 0,0012 618
1516 5 glutaredoxina 2 (tioltransferase ) 286,09 281,75 295,36 0,3057 96475 0,0326 409 0,0033 592
3477 3 Domínio de dupla espiral contendo 66 732,89 447,88 631,69 0,3947 90904 0,0326 797 0,0047 761
2217 0 hexosaminidas e B 767,08 800,87 731,5 0,4632 04626 0,0327 103 0,0133 97
4170 2 PREVISÃO: Mus músculos similares a aspartoacilase -3 (LOC629627), mRNA 201,8 231,95 168,21 0,1617 37909 0,0327 381 0,0010 704
8599 Proteína ribossomal mitocondrial S6 395,52 436,4 635,42 0,2580 85632 0,0327 869 0,0075 192
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1276 8 Proteína de dedo ZINC 644 192,4 133,37 321,07 0,1635 18063 0,0327 869 0,0113 165
1990 5 Proteína regulatória e de mediação de junção 657,56 428,21 656,69 0,3664 17496 0,0328 358 0,0015 83
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1398 3 Similar a bolA 2 (E, coli) 1189,8 1104,2 3 1324 0,4839 61112 0,0328 638 0,0150 778
1257 2 Fator de transcrição associado a BCL2 1 3913,7 3100,4 7 3629,4 0,5839 30579 0,0329 341 0,0024 758
1349 1 fosfatidilinosito l 4-quinase tipo 2 alfa 626,53 277,93 551,44 0,2703 65679 0,0329 412 0,0020 547
8482 Complexo nucleolar associado 2 homólogo (S, cerevisiae) 1470,8 1389,3 5 1671,6 3 0,4981 35738 0,0329 67 0,0019 398
1892 Transcrição de 2542 2468,7 3077,9 0,5448 0,0330 0,0202
5 gene abundante do hipocampo 1 3 1 94435 189 082
2982 Fator de 1452 1192,1 1707,2 0,4714 0,0330 0,0023
1 transcrição geral III C 1 4 22324 33 58
2890 1 Gene RIKEN cDNA 4932408B21 217,22 178,97 178,07 0,2282 72547 0,0330 688 6,72E005
2724 nucleoporina 1314,9 1255,9 1590,2 0,5042 0,0330 0,0047
0 98 9 4 91543 969 992
1634 DEAD (Asp- 1068,9 1079,1 1463,8 0,4706 0,0331 0,0038
7 Glu-Ala-Asp) polipeptídio caixa21 8 7 44611 325 895
1243 3 Fator geral de transcrição IIIC, polipeptídio 2, beta 337,18 352,3 512,23 0,3534 367 0,0331 384 0,0004 694
1687 Proteína 1669,9 1264,4 1709,5 0,4676 0,0331 0,0010
8 interativa com proteína de retardamento mental X com fragilidade nuclear1 1 2 76882 565 988
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2081 Enzima 3079,3 3096,3 3132,8 0,5291 0,0331 0,0462
9 conjugadora de ubiquitina E2C 1 9 02477 754 045
1536 Molécula 2488,6 3090,3 3801,2 0,6047 0,0332 0,0094
7 reguladora de adesão 1 1 2 78024 031 718
3548 7 Domínio TatD DNase contendo 1 202,21 154,66 288,54 0,2014 34302 0,0332 326 0,0012 908
2686 9 Sintetase de guanina monofosfato synthetase 333,62 321,76 588,17 0,3230 98561 0,0332 41 0,0004 596
1775 0 Proteína de dedo ZINC 644 231,07 167,08 286,89 0,2996 02365 0,0332 681 0,0045 772
1056 3 Proteína de dedo ZINC 11 291,63 298,49 401,2 0,2903 99825 0,0333 333 0,0001 906
2252 Proteína 2267,4 2629,5 3731,6 0,5625 0,0333 0,0041
5 ribossomal L23 2 3 53901 333 351
4119 0 Similar a metiltransferas e 2 371,11 445,47 374,11 0,3667 31079 0,0333 333 9,87E- 005
2216 7 CNDP dipeptidase 2 (família metalopeptida se M20) 84,76 218,18 158,8 0,2222 0955 0,0333 988 0,0038 026
1037 Proteína de desenvolvimen to craniofacial 1 1332,9 1198,0 9 1629,0 4 0,5108 74572 0,0334 129 0,0031 599
1949 0 Proteína de ativação Rho GTPase 8 783,69 493,49 842,26 0,4466 38123 0,0334 347 0,0074 432
2393 6 Gene RIKEN cDNA 2810004A10 775,73 795,6 585,57 0,4821 69289 0,0334 646 0,0050 654
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
3867 0 Receptor similar a fator de crescimento do fibroblasto 1 327,68 457,46 183,49 0,3406 69062 0,0334 928 0,0181 532
1398 Similar a bolA 1519,4 1322,1 1597,3 0,4853 0,0335 0,0399
2 2 (E. coli) 8 9 96 306 924
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2192 gene /// gene 1349,6 1971,4 2092,1 0,4841 0,0335 0,0030
3 RIKEN cDNA 5830484A20 /// similar a Sp110 proteína corporal nuclear /// 1 1 9199 366 915
7522 sortilina 1 346,19 142,97 127,38 0,2373 76566 0,0335 968 0,0133 975
2048 Domínio SDA1 2051,9 2375,7 1968,4 0,5399 0,0336 0,0010
1 contendo 1 4 4 78684 391 108
677 catepsina C 1072,2 767,24 1113,2 2 0,4777 2632 0,0336 538 0,0107 742
1272 8 Polimerase (RNA) III (direcionado ao DNA) polipeptídeo E 1672,1 1702,3 6 2013,3 0,5561 75975 0,0336 634 0,0013 356
171 Proteína ribossomal S26 1650,3 1768,4 6 3066,9 4 0,4626 13383 0,0337 302 0,0172 666
2145 Proteína 3676,3 3927,5 5180,0 0,5881 0,0337 0,0058
3 ribossomal S8 1 8 81318 349 696
1805 8 Família AF4/FMR2, membro 4 260,12 196,38 405,8 0,3190 49024 0,0337 972 0,0006 64
2114 Família torsina 1, membro B 856,26 824,23 655,93 0,4816 40834 0,0338 645 0,0082 054
7324 Família de gene associada a metástase, membro 2 1064 1538,4 8 1479,4 7 0,5136 42858 0,0339 506 0,0032 553
2020 7 Proteína de dedo PHD 17 230,13 395,67 311,67 0,2616 46345 0,0339 806 0,0011 528
2271 9 Similar a zero proteína mielina 1 146,38 553,53 185,92 0,2236 38334 0,034 0,0022 13
1312 9 Mediador de transcrição de polimerase de DNA II, subunidade 8 homólogo 282,24 471,76 209,96 0,2474 57604 0,0340 467 0,0014 173
3368 4 Fator ativador de transcrição 7 Proteína interativa 2 817,23 803,3 1090,4 8 0,4914 10733 0,0340 681 0,0048 091
9652 Receptor de proteína morfogenética do osso, tipo IA 231,61 148,75 169,39 0,1964 05262 0,0341 207 0,0002 027
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2021 proteína de 1664,8 1551,9 1412,3 0,5177 0,0341 0,0024
4 ligação de RNA principal 5 3 2 65759 463 452
1671 5 Espermatogên ese associada 5 327,14 221,78 356,12 0,3231 27594 0,0341 686 0,0009 372
2419 1 Candidato suscetível ao câncer 5 /// similar ao candidato suscetível ao câncer 5 isoforma 2 517,57 426,13 722,68 0,3362 13215 0,0342 105 0,0016 399
2763 3 Complexo de epóxido redutase de vitamina K, similar à subunidade 1 1 293,31 284,28 381,74 0,3070 88139 0,0342 298 0,0008 504
7003 WD domínio repetido 77 1197,9 1576,3 5 1489,5 9 0,5030 58814 0,0342 679 0,0025 445
344 Decarboxilase de glicina 631,24 715,88 615,34 0,4236 88525 0,0343 137 0,0129 965
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1917 Família transportadora de soluto 12, membro 2 831,2 898,12 1082,6 6 0,4732 52358 0,0343 249 0,0072 391
1572 2 DEAD (AspGlu-Ala-Asp) peptídeo caixa 17 865,28 1016,7 851,49 0,4504 45039 0,0343 434 0,0054 816
3811 Segmento de DNA, humano DXS9928E 458,09 304,57 395,93 0,3785 22698 0,0343 75 0,0001 671
1415 Gene RIKEN 2146,7 1725,3 1648,3 0,5193 0,0343 0,0047
7 cDNA 2610101103 3 2 05374 98 066
2188 8 Obliterador de indutor de morte1 629,22 636,1 1048,1 6 0,4555 55019 0,0344 037 0,0019 6
6127 Síndrome de Willi/Angelman 2 homólogo (humano) 423,86 504,78 426,8 0,3219 2354 0,0344 828 0,0049 784
1041 8 Pantotenato quinase 3 873,11 919,21 1010 0,5033 16456 0,0345 489 0,0006 058
7942 Família torsina 2, membro A 167,89 264,45 201,53 0,2394 01772 0,0345 528 0,0008 871
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
6639 Nexina de seleção 3 341,2 336,98 604,44 0,3300 53901 0,0345 622 0,0025 031
3398 Domínio abidrolase contendo 6 684,84 889,36 650,71 0,4238 68158 0,0345 912 0,0045 879
640 Translocase de membrana mitocondrial interna 8 homólogo al (levedura) 1722,5 1433,3 1 1537,6 1 0,5320 26734 0,0346 232 0,0006 723
7006 Proteína quinase C, delta 910,26 661,36 733,23 0,4475 91274 0,0346 535 0,0218 429
1551 0 Síndrome WilliamsBeuren Região do cromossoma 1 homólogo 683,74 452,6 930,59 0,3956 14537 0,0346 939 0,0206 498
1970 Homólogo de midasina (levedura) 139,01 179,55 201,68 0,2411 35024 0,0347 395 0,0003 368
3936 Proteína de ligação de elemento rico em purina B 2127,5 2327,9 5 2198,2 4 0,5763 07096 0,0347 648 0,0054 149
1121 4 membro da superfamília tioesterase 4 413,32 339,06 663,38 0,3767 01937 0,0348 101 0,0007 899
2060 8 Gene RIKEN cDNA 2610304G08 393,72 237,84 189,99 0,2514 71867 0,0348 259 0,0012 655
401 KTI 12 homólogo, cromatina associada (S. cerevisiae) 546,92 436,97 511,52 0,3598 84504 0,0348 361 0,0097 894
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4187 gb:AV006589 /DB_XREF=gi: 4783576 /DB_XREF=A V006589 /CLONE=1100 006A23 /FEA=EST /CNT=1 /TID=Mm.1983 79.1 MER=ConsEn d /STK=0 /UG=Mm.1983 79 /LL=99251 /UG_GENE=A V006589 /UG_TITLE=se quência expressa AV006589 1131,1 1138,4 5 1223,1 1 0,5032 22073 0,0348 837 0,0089 126
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2026 3 Cassete de ligação de ATP, sub-família F (GCN20), membro 1 3476,5 3087,7 6 3006,5 0,5759 78511 0,0349 206 0,0013 487
6063 Proteína de interação com coativador de rceptor nuclear 380,42 250,08 337,13 0,2869 93206 0,035 0,0002 608
7582 Associado a proteína dissulfeto isomerase 3 1691,5 1392,1 3 1417,2 3 0,4980 64757 0,0350 318 0,0003 386
7829 Receptor de partícula de reconheciment o de sinal ('proteína de ancoramento') 1193,6 1444,2 7 1684,7 7 0,5140 6442 0,0350 515 0,0068 465
1149 Família transportadora de soluto 34 (fosfato de sódio), membro 2 2423,9 2605,9 8 2900,3 3 0,5889 95153 0,0350 877 0,0003 483
2397 5 gene RIKEN cDNA D530033C11 106,24 70,57 148,16 0,1239 9476 0,0351 24 0,0006 1
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3060 Imunoglobina da célula T e domínio da mucina contendo 2 1034 1032,9 5 1807,4 5 0,4222 78451 0,0351 759 0,0141 235
7965 Subunidade de complexo integrante 4 553,99 382,53 444,37 0,3367 74676 0,0351 967 0,0007 99
1513 Proteína 3939 4199,8 5464,2 0,5914 0,0352 0,0054
4 ribossomal S8 8 9 03484 48 164
1061 6 Proteína associada a sarcolema 670,2 546,64 765,82 0,4002 68737 0,0352 564 0,0008 675
1902 2 Receptor de folato 1 (adulto) 490,43 421,28 529,28 0,3986 6784 0,0352 645 0,0004 871
3993 4 Gene RIKEN cDNA 2410019A14 1701,5 1341,0 4 1647,3 0,5239 69663 0,0352 697 0,0008 508
2754 1 proteína hipotética 5430421B17 179,04 101,84 124,88 0,1858 86028 0,0353 43 1,86E- 005
1335 3 L2 ciclina 785,19 691,43 896,88 0,4289 51417 0,0353 535 0,0004 481
8628 clivagem e poliadenilação fator específico 4 924,15 849,4 912,93 0,4842 91606 0,0354 167 0,0023 348
1533 5 RIKEN gene do DNA 2810409H07 340,99 117,8 348,25 0,2397 80029 0,0354 406 0,0020 712
2114 3 RIKEN gene do DNA 2900097C17 238,34 247,68 216,44 0,2609 49227 0,0354 43 0,0004 82
2781 0 manosidose 2, alfa 2 578,87 431,83 634,48 0,3797 45228 0,0354 906 0,0004 068
2183 proteína 31 1021,7 1106,7 1232,2 0,5149 0,0356 0,0034
9 receptora associada à célula B 7 5 90859 394 095
2717 Espermatogên 1664,5 2350,8 2119,3 0,5644 0,0357 0,0011
8 ese associada 2 4 8 29895 143 728
2759 6 Seqüências expressas AII95381 208,02 349,59 306,67 0,3494 1191 0,0357 895 0,0017 1
8359 SEH1-similar (S. cerevisiae 185,96 151,36 190,7 0,2032 81901 0,0358 056 0,0010 864
2115 Fosfoserina 1163,3 1112,9 1052,3 0,5025 0,0358 0,0005
8 aminotransfera se 1 8 4 08789 65 821
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2098 9 proteína ribossômica L37 1247,6 1948,9 5 3246,7 0,2365 31774 0,0358 974 0,0247 504
2067 6 reticulon 4 2525,3 2161,7 8 2275,6 9 0,5620 51115 0,0359 408 0,0030 746
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1152 ornitina 2484,2 2389,4 2308,2 0,5691 0,0359 0,0149
3 decarboxilase, estrutural 1 /// similar à Ornitina decarboxilase (ODC) 8 6 09376 848 128
6500 lisofosfolipase 3 374,75 347,89 480,81 0,2810 55224 0,0359 897 0,0076 003
7881 proteína transmembran a 49 372,81 272,48 580,32 0,3516 81104 0,0360 169 0,0025 279
1073 7 Proteína associada SNAP 525,29 571,28 535,32 0,4344 32492 0,0360 531 0,0001 594
9707 transcrição específica de leucócitos 1 442,18 529,47 633,71 0,2996 17481 0,0360 825 0,0085 434
1086 2 quinase associada G ciclina 691,18 343,8 583,16 0,3719 51846 0,0361 702 0,0008 847
1237 6 dano regulamentado de DNA e p53 1 846,21 866 924,2 0,4603 50463 0,0361 757 0,0034 433
1292 5 potenciador do homólogo rudimentar (Drosófila) 1720,9 1915,1 4 1795 0,5518 68619 0,0362 473 0,0060 476
980 Fibrilarina 1220 1189,3 7 1652,2 8 0,4882 99694 0,0362 694 0,0105 173
2943 fator de 1440,4 1366,4 1588,4 0,5127 0,0363 0,0059
0 transcrição trans-atuante 6 6 1 99033 248 473
2275 2 fosfoglucomut ase 3 283,43 365,03 342,8 0,3036 80189 0,0363 636 8,87E- 005
1403 2 apreensão relacionada 6 similar homólogo 2 164,68 29,4 81,1 0,1068 60263 0,0364 026 0,0018 215
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2186 9 similar à ubiquitina A-52 resíduos do produto da fusão da proteína ribossomal 1 1855,2 1998,4 2994,8 6 0,4779 56614 0,0364 583 0,0201 361
1594 7 seqüência expressa AI593864 422,46 217,98 589,3 0,3193 66401 0,0364 807 0,0040 973
360 repetir domínio anquirina 10 2873,1 2724,9 6 2719,9 2 0,6021 27754 0,0365 591 0,0031 308
1323 2 domínio brix contendo 5 449,86 312,53 480,19 0,3925 56995 0,0366 379 0,0009 447
7575 SWI/SNF relacionados, matriz associada, regulador de actina dependente da cromatina, subfamília c, 1 membro 557,93 543,22 522,86 0,4064 6012 0,0366 541 0,0104 879
847 pluripotência evolucionária associada 5 1136 1117,7 4 2353,1 1 0,4553 00635 0,0367 171 0,0078 599
1952 domínio WW 1740,2 1592,4 1789,7 0,5584 0,0367 0,0014
2 que contêm adaptador com dupla espiral 1 4 26352 232 871
2162 8 sintetase monofosfato de uridina 306,21 226,92 452,59 0,3073 46283 0,0367 965 0,0006 572
1539 1 proteína 1 elemento de ligação de resposta ras 510,83 456,58 227,76 0,4127 4933 0,0368 62 0,0026 109
1391 3 ribonucleoprot eína U heterogênea nuclear 79,73 130,3 273,63 0,1767 404 0,0368 764 0,0002 036
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2862 7 família 19 transportadora de soluto (permutador de sódio / hidrogênio) membro 3 613,8 620,42 958,53 0,4314 19994 0,0369 369 0,0045 447
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1877 1 polimerase alongamento de fator RNA II 2 939,53 968,34 900,94 0,4931 37707 0,0369 565 0,0009 8
1080 3 TBC1 família domínio, membro 20 442,89 430,88 702,71 0,3635 58882 0,0370 036 0,0106 165
1384 8 seqüência expressa AA408556 454,92 383,23 796,93 0,3661 68414 0,0370 705 0,0039 773
1685 XPA proteína 1 de ligação 1090,9 995,33 1162,3 1 0,4950 88976 0,0371 179 0,0019 319
1904 4 ERGIC e golgi 3 177,49 438,27 277,99 0,2435 39948 0,0371 377 0,0141 679
2709 6 Similar 10) 136,13 47,95 210,38 0,1088 25757 0,0371 681 0,0006 399
727 6-fosfofruto-2quinase/frutos e-2,6bifosfatase 3 367,86 210,92 349,81 0,2695 46436 0,0372 439 0,0038 094
2739 RGS16 695,01 773,54 1692,2 0,2570 75483 0,0372 727 0,0296 9
2494 0 segmento de DNA, Chr 8, Brigham & Women's Genetics 1414 expresso 261,02 198,73 393,02 0,3135 63629 0,0373 016 0,0015 775
1015 2 proteínas de choque térmico 110 2008,3 1789,2 2 2316,3 0,5739 65664 0,0373 134 0,0040 989
1915 5 membro da família quinesina 22 989,59 886,55 947,43 0,4931 4973 0,0373 626 0,0021 912
7723 fosforibosilami noimidazoleca rboxilase, fosforibosilami noribosilami 952,32 677,57 929,92 0,4995 43303 0,0373 665 0,0026 41
1130 jumonji, AT 2527,4 2125,8 2560,2 0,5747 0,0373 0,0038
2 domínio rico e interativo 1B (similar Rbp2) 7 6 34303 832 824
1349 proteína 2797,4 3517,8 4415,8 0,5891 0,0374 0,0120
6 ribossômica L38 5 5 0883 088 437
1893 fator de início 3402,3 3230,5 3391,0 0,6494 0,0374 0,0017
5 de tradução eucarióticas 4E /// LOC630527 hipotético 6 4 11718 204 68
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1041 translocase da 2541,1 2448,3 2310,8 0,5373 0,0374 0,0283
5 membrana mitocondrial interna 17 9 3 85623 449 043
1184 8 proteínas 1 que interagem TNFAIP3 594,28 486,89 1024,8 0,3934 78846 0,0374 532 0,0019 917
2941 3 DCN1, com defeito na nedilação cullin 1, domínio contendo 3 (S. cerevisiae) 304,94 421,64 437,94 0,4183 65908 0,0375 0,0005 084
1906 9 myc induzida pelo antígeno nuclear 415,61 176,74 570,73 0,3526 22889 0,0375 399 0,0121 538
2225 0 alfa carioferina (importina) 1 953,35 982,64 857,55 0,4664 56469 0,0375 458 0,0019 12
2091 proteína 2662,4 2502,7 2852,5 0,5847 0,0375 0,0179
2 ribossomal S24 1 2 00379 671 769
4081 1 gema (organela nuclear) proteína associada 5 199,83 127,31 288,52 0,2900 22341 0,0376 0,0062 873
1940 8 RIKEN gene do DNA 1810020D17 330,43 391,71 361,99 0,3413 52648 0,0376 106 0,0003 381
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1631 7 Proteína ativadora gangliosídea GM2 2813,6 2472,1 2183,1 5 0,5683 22595 0,0376 147 0,0087 865
1538 RIKEN gene 563,17 1018,2 1190,9 0,4045 0,0376 0,0136
8 do cDNA 2610042014 6 7 572 344 953
1845 0 domínio brix contendo 1 945,53 776,39 1481,1 8 0,5087 83516 0,0376 432 0,0110 167
721 família oncogene 326,45 170,57 344,7 0,2620 64994 0,0376 532 0,0021 194
2238 4 DEAD (AspGlu-Ala-Asp) polipeptídeo casa 54 736,35 779,63 1015,2 3 0,4517 56153 0,0376 766 0,0063 143
3270 seqüência de 2287,8 2852,2 2449,7 0,5854 0,0376 0,0008
8 cDNA BC068171 5 5 84655 838 1
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1365 4 enzima ubiquitinaconjugando E20 1092,4 932,79 1270,0 8 0,4741 40955 0,0376 94 0,0031 235
1570 1 proteassoma (prossoma, macropain) tipo de subunidade beta 4 747,49 930,36 1311,8 1 0,4959 53936 0,0377 02 0,0036 796
4318 7 domínio jumonji que contêm 1B 131,11 118,55 104,24 0,1360 04002 0,0377 049 0,0013 196
4470 2 proteínas dedo de zinco 407 100,04 82,93 152,65 0,2141 57645 0,0377 193 0,0002 96
1455 proteína 2913,4 2832,1 3114,0 0,6123 0,0377 0,0206
1 ribossomal S24 9 2 8471 358 946
379 dedo de zinco A20 contendo domínio 2 2659,8 2431,1 4 3458,7 0,5781 27838 0,0377 358 0,0044 497
2098 fator de 3491,7 3251,3 3629,0 0,6274 0,0377 0,0034
4 junção, arginina / serina ricos 1 (ASF/SF2) 5 6 61802 532 96
1747 2 amina oxidase, cobre, contendo 3 107,32 107,65 335,47 0,1751 90553 0,0377 778 0,0036 378
2957 3 RIKEN gene do DNA 4930535B03 180,67 103,3 181,19 0,2175 50428 0,0377 814 0,0048 109
738 ubiquitinasimilar I (Sentrin) ativando uma enzima E1 482,8 633,06 755,85 0,4089 85959 0,0377 856 0,0015 385
8834 família portadora de soluto 39 (transportador de íons de metal), membro da 6 1430,5 1479,2 3 1557,5 1 0,5580 85418 0,0377 953 0,0068 856
3709 proteínas de ligação de nucleotídeos guanina 13, gama 150,51 146,09 148,15 0,2238 73024 0,0378 007 0,0023 2
3672 proteína 620,37 1621,4 1471,5 0,4811 0,0378 0,0349
4 interferoninduzido 35 6 7 2275 229 178
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240 manutenção deficiente minicromosso mo 5, o ciclo de divisão celular 381,1 145,29 202,31 0,2336 09539 0,0378 289 0,0087 931
1237 dano de DNA 1022,5 1047,4 1095,6 0,5183 0,0378 0,0117
7 p53 e regulamentado 1 8 4 687 422 032
1214 7 B2 fator de fixação do molde 256,47 382,54 338,31 0,3479 6192 0,0378 521 0,0032 866
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1176 2 ativação do fator de transcrição 7 de proteínas que interagem 2 416,46 320,25 530,93 0,4481 27283 0,0378 549 0,0014 608
1985 proteína quinase, ativada por AMP, uma subunidade gama não catalítica 117,68 165,53 217,77 0,1896 28475 0,0378 619 9,79E005
924 família portadora de soluto 1 (transportador de aminoácido neutro), membro 5 135,13 217,53 154,55 0,1165 71395 0,0378 657 0,0009 553
1299 8 fator de junção, arginina / serina ricos 1 (ASF/SF2) 1495,4 1250,6 1317,1 5 0,5306 47294 0,0378 913 0,0079 607
2232 2 drebrin-similar 236,1 101,96 127,64 0,1234 72801 0,0379 032 0,0004 254
2337 0 RNA proteína motivo ligadora 3 64,65 102,43 161,88 0,1979 48995 0,0379 147 0,0003 743
1591 2 dedo de zinco MBD2interagindo 600,44 667,79 618,68 0,4730 30266 0,0379 257 0,0007 328
2151 macorina, 1555,2 1824,2 2003,2 0,5757 0,0379 0,0030
2 proteína ring finger 1 3 2 18958 31 978
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1825 co-fator 1285,9 1020,7 1061,2 0,5013 0,0379 0,0015
6 necessário para a ativação da transcrição Sp1, subunidade 2 7 1 33715 427 605
1890 GTP proteína 2173,7 1808,1 1582,5 0,5486 0,0379 0,0080
0 de ligação 4 8 9 08423 538 171
2904 0 seqüência expressa AA673488 680,05 395,77 933,82 0,4585 93416 0,0379 63 0,0136 816
5392 PBX / atado 1 homeobox 309,66 326,55 315,1 0,3658 9504 0,0379 645 0,0048 399
2131 5 importina 7 2454,8 2754,7 7 2633,6 0,6315 63479 0,0379 845 0,0031 179
2956 seqüência de 1455,6 1492,3 1452,4 0,5571 0,0379 0,0003
3 cDNA BC068171 4 5 43297 965 425
1572 3 proteínas E do centrômero 1570,6 1201,8 7 1244,4 0,5447 56305 0,0380 068 0,0029 877
1438 3 fator de iniciação 5B da transcrição eucariótica 124,36 76,5 147,21 0,1432 5561 0,0380 165 1,95E- 005
1083 3 fator de iniciação 3 transcrição eucariótica, subunidade 9 (eta) 208,42 168,48 203,88 0,2914 56698 0,0380 259 0,0035 835
657 FK506 proteína de ligação 4 1672,7 1558,5 8 1505,6 6 0,5143 45769 0,0380 313 0,0113 274
3013 8 Receptor de hormônio antiMülleriano tipo 2 492,22 340,87 636,14 0,3481 1437 0,0380 334 0,0067 571
2081 5 Proteína de transferência fosfatidilinosito l, citoplásmico 1 266,43 91,96 256,22 0,2556 58056 0,0380 435 0,0155 905
6603 Integrina alfa 6 971,42 1090,2 6 915,58 0,5192 19472 0,0380 711 0,0004 221
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1238 EBNAI 1609,4 1404,1 1650,0 0,5623 0,0381 0,0105
2 proteína de ligação 2 8 5 92505 026 059
5650 proteína transmembran a 49 473,19 397,83 447,36 0,3763 83874 0,0381 041 0,0069 334
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1633 8 Tipo proteassoma (prossoma, Pmacropain) 581,61 681,86 363,66 0,3840 80354 0,0381 426 0,0039 386
9656 PRP4 processament o do prémRNA 669,75 360,25 512,38 0,4596 69923 0,0381 494 0,0031 3
2193 0 fator de transcrição similar 5 (base 1 hélice-curvahélice) 136,62 119,48 296,43 0,1676 49906 0,0381 944 0,0014 46
2139 5 proteínas de ligação de nucleotídeos guanina (proteína G), beta, polipeptídeo 2 similar 1 489,8 485,86 609,01 0,4031 29272 0,0382 003 0,0100 163
484 Sec61 alfa subunidade-1(S. cerevisiae) 3549,9 3286,0 1 3718,6 3 0,6641 31513 0,0382 215 0,0096 203
4108 1 RIKEN gene do DNA 2700023E23 626,96 633,72 924,84 0,4417 54766 0,0382 609 0,0021 624
2275 RE1- fator de 3491,2 3525,9 3353,0 0,6242 0,0382 0,0098
1 transcrição silenciadora 5 7 28963 653 295
6782 Proteína ribossomal L41 3287,7 3064,3 3 3459,9 3 0,6271 33956 0,0382 696 0,0035 157
2379 9 PRP4 fator 4 de transformação pré-mRNA homólogo (levedura) 299,62 458,97 563,81 0,3371 07957 0,0382 813 0,0012 762
5220 ativador de ciclase de guanilato La (retina) 2394,2 2176,1 3 2314,5 0,5504 67392 0,0382 883 0,0181 616
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2268 2 gb:BB204543 /DB_XREF=gi: 8869496 /DB_XREF=B B204543 /CLONE=A430 058H 10 /FEA=EST /CNT=1 /TID=Mm.2150 42.2 MER=ConsEn d /STK=0 /UG=Mm.2150 42 /UG_TITLE=E STs 308,26 237,22 438,68 0,2907 23288 0,0383 305 0,0281 589
7211 ADP fator de ribosilação 4 457,63 425,84 551,85 0,3885 46664 0,0383 333 0,0020 173
2543 galactosidase, alfa 523,01 438,32 654,08 0,4070 93263 0,0383 361 0,0057 031
1965 8 seqüência de cDNA BC021395 1012,7 951,38 1013,9 2 0,5184 95955 0,0383 412 0,0049 379
2784 1 BTAF1 RNA polimerase II, B fator de transcrição TFIID associado, (Motl homólogo, S. cerevisiae) 46,01 239,9 187,23 0,1209 90476 0,0383 436 0,0083 348
3057 6 Transcrito locus 651,44 766,79 926,47 0,4988 86833 0,0383 959 0,0018 899
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2945 7 WD domínio repetido 46 631,99 252,45 611,74 0,3529 48986 0,0384 013 0,0117 77
1916 6 transportadora de soluto família 39 (transportador de zinco), membro 4 295,72 198,68 333,58 0,2124 29458 0,0384 615 0,0108 679
4344 8 TatD domínio DNase contendo 1 248,59 156,85 449,66 0,2481 86993 0,0384 615 0,0055 05
6729 Fator de transcrição YY1 593,02 531,08 482,62 0,4328 80971 0,0385 26 0,0007 367
3998 procolágeno, tipo V, alpha 3 243,66 175,36 95,74 0,1162 8857 0,0385 274 0,0018 74
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1439 4 14391.acetiltra nsferase 2 690,17 601,4 547,17 0,4128 58906 0,0386 364 0,0053 437
4785 RIKEN gene do DNA 2410016F19 4101,9 3403,4 6 3437,8 5 0,6392 84686 0,0386 399 0,0141 618
1900 7 GTP da proteína de ligação 3 408,64 480,29 597,69 0,4140 69259 0,0387 205 0,0024 624
7933 regulador da proteína de uma citocinese 1103 1075,9 4 1372,0 7 0,5199 41636 0,0390 505 0,0038 711
1876 RIKEN gene 985,65 1181,4 1314,6 0,5226 0,0394 0,0072
2 do DNA 1810003N24 3 9 81267 022 729
1037 2 IMP4, ribonucleoprot eina nucleolar pequena U3, homólogo (levedura) 1381,4 1559,2 1 2228,6 0,5570 65661 0,0394 558 0,0088 448
4117 gb:BB209183 823,07 1042,4 1568,6 0,5258 0,0395 0,0033
3 /DB_XREF=gi: 8874136 /DB_XREF=B B209183 /CLONE=A430 091G17 /FEA=EST /CNT=18 MD=Mm.1296 98.1 /TIER=Stack /STK=I7 /UG=Mm.1296 98 /UG_TITLE=E STs 7 2 09642 095 35
1533 8 RAB20, membro RAS da família oncogene 1207 970,25 1217,6 1 0,4644 3661 0,0395 137 0,0119 522
1590 2 Crx transcrição e fita oposta 1 517,72 489,36 491,37 0,4585 67465 0,0395 522 0,0012 529
1363 proteína 3666 3359,2 5278,1 0,6007 0,0395 0,0123
8 ribossomal S21 4 2 91827 738 343
7634 M2 ciclina 414,53 418,85 581,74 0,4177 41484 0,0396 114 0,0013 164
3158 GATA proteína de ligação 4 660,84 563,02 829,97 0,4506 82822 0,0396 341 0,0032 473
1405 3 homologo sem dentículo (Drosófila) 336,21 206,1 338,68 0,3599 30851 0,0396 707 0,0011 816
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2157 5 tubulina, beta 5 142,88 165,48 195,42 0,2679 04908 0,0396 717 1,01E- 005
1352 isomerase peptidilprolil D (ciclofilina D) /// proteína da membrana lisossomal associada 3 /// similar à isomerase peptidilprolil D 1030,2 754,1 902,76 0,5199 60034 0,0396 947 0,0079 545
1706 9 autofagia relacionadas com 3 (levedura) 1423 439,15 1211,1 8 0,3934 20846 0,0397 301 0,0135 613
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2088 3 RIKEN gene do DNA 2900053A13 172,07 129,07 221,68 0,2377 72581 0,0397 805 6,40E005
1262 6 dipeptidase 3 1012,5 968,29 930,73 0,5185 54122 0,0397 898 0,0011 178
2421 1 proteínas dedo de zinco 292 137 132,44 131,78 0,1862 37278 0,0398 496 0,0001 292
1064 0 Kelch-similar 22 (Drosófila) 84,02 140,12 513,75 0,2984 7959 0,0398 818 0,0313 684
5230 homologo à síndrome von Hippel-Lindau 369,93 417,03 500,62 0,4356 13701 0,0399 449 0,0083 894
1205 8 proteína de ring finger (tipo C3H2C3) 6 1096,2 908,12 1006,9 3 0,5374 26516 0,0399 729 0,0070 928
1061 7 sarcolema associado à proteína 300,15 333,64 268,15 0,3516 53878 0,04 0,0017 526
3910 0 proteína nucleolar 9 935,22 768,76 875,51 0,4387 40296 0,04 0,0234 789
1097 8 proteínas que interagem homeodomínio 96,61 68,27 152,13 0,1666 30998 0,0400 271 0,0003 059
1356 seqüência 1486,9 2242,2 2206,7 0,6151 0,0400 0,0068
2 cDNA BC010304 5 7 26394 302 27
7422 histona H3, família3A 1349,5 1593,5 9 2334,2 9 0,5289 57723 0,0400 552 0,0086 503
1694 SUMO/peptida 2929,1 2911,4 3250,4 0,6416 0,0400 0,0023
2 se Sentrin específico 3 1 8 64431 593 832
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2117 1 proteína ribossômica L29 /// proteína hipotética LOC669999 /// similar à proteína ribossomal 60S L29 1592,1 2337,5 3 4074,9 0,5244 36456 0,0400 908 0,0291 742
1844 domínio 1009,3 1081,2 1031,2 0,5405 0,0401 0,0034
5 família Yipl, membro 4 5 6 31103 107 779
2358 3 CXXC dedo 6 369,76 167,47 233,69 0,3558 02283 0,0401 189 0,0023 989
1110 RAN proteínas 1951,6 1977,6 2086,4 0,5832 0,0401 0,0077
4 de ligação 5 4 5 53563 515 671
2061 7 placenta específica 9 278,58 511,3 340,48 0,3751 5466 0,0401 662 0,0043 009
2867 receptor fator necrose tumoral superfamília, membro 12a 471,44 369,03 575,57 0,4521 48336 0,0402 047 0,0084 492
1600 7 LOC435970 hipotético /// similar à gonadotropina fator 2 de transcrição induzível ovariano 1021,2 760,72 1173,0 3 0,4699 85729 0,0402 219 0,0102 952
3880 0 Transaminase Glutamina frutose-6fosfato 1 425,52 262,91 388,13 0,3643 85169 0,0402 685 0,0067 053
1374 6 sintase deoxihipusine 175,94 258,31 230,11 0,1904 65245 0,0402 778 0,0095 116
1280 7 peptidil prolil isomerase H /// proteína hipotética LOC624822 /// similar ao Peptidil prolil cis-trans isomerase H (PPlase H) (Rotamase H) 198,1 204,78 97,2 0,3001 29234 0,0403 226 0,0003 583
1313 0 proteína 230,45 274,04 374,05 0,3748 50067 0,0403 338 0,0028 329
2362 cofilin 2, músculo 2052,8 1861,5 1865,7 8 0,5822 08806 0,0403 769 0,0142 835
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
6144 fator de iniciação de transcrição eucariótica 4E membro 2 343,08 263,59 456,25 0,2665 03969 0,0403 818 0,0098 113
1401 fator de 1288,8 1369,4 1283,3 0,5540 0,0403 0,0017
0 iniciação de transcrição eucariótica 5B 1 5 29868 9 04
1719 homologo 1554,4 1033,0 1685,4 0,5987 0,0404 0,0181
5 ariadne 2 (Drosófila) 3 9 85251 172 685
3838 3 proteína ribossomal mitocondrial S6 1291,6 2038,1 9 1795,1 0,5987 60357 0,0404 313 0,0089 626
1698 5 proteína ribossomal mitocondrial L39 355,09 320,19 281,17 0,3854 55431 0,0404 624 0,0046 953
2261 proteína ribossomal mitocondrial L39 119,25 152,47 153,1 0,2425 66877 0,0404 858 0,0008 446
3907 3 fosfatidilinosito l 3-quinase, polipeptídeo, catalisador beta 289,7 255,76 314,46 0,3715 50774 0,0405 028 0,0007 747
5910 proteassoma (prossoma, macropain) subunidade 26S, sem ATPase, 14 1056,8 933,88 1219,7 2 0,5661 67074 0,0405 046 0,0034 601
3887 5 RIKEN gene do DNA 1110008B24 1023,5 1117,8 2 1343 0,5177 40797 0,0405 21 0,0187 583
4470 7 seqüência expressa AF013969 /// similar ao CG5514-PB, isoforma B /região /AF013969 contendo seqüências expressas; RIKEN cDNA do gene A230054D04 503,61 242,43 417,29 0,3683 3036 0,0405 229 0,0021 265
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8041 dedo anelar e domínio repitido WD 3 2072,4 2195,3 3 2804,0 8 0,6564 77432 0,0405 405 0,0104 482
2815 4 metiltransferas e similar 2 101,31 165,95 286,78 0,2760 81849 0,0405 585 0,0004 243
3026 9 proteína nucleolar 11 176,47 125,5 88,54 0,1480 36582 0,0405 759 0,0003 318
7189 valosin contendo proteína /// similar ao retículo endoplasmátic o de transição ATPase (TER ATPase) (15S Mg (2 +)subunidade ATPase p97) (valosin contendo proteína) (VCP) 937,83 818,51 891,57 0,5212 67363 0,0405 797 0,0004 249
1630 6 peptidase ubiquitina específica 10 738,05 449,15 994,08 0,4811 43736 0,0405 928 0,0102 128
2433 ativação do 1579,9 1425,8 1629,0 0,5770 0,0405 0,0010
3 fator 7de transcrição de proteínas que interagem 2 9 2 57117 954 214
1846 6 fator da célula hospedeira CI 711,47 663,73 675,05 0,4478 40226 0,0406 125 0,0172 365
7354 hipocampo transcrição de genes abundantes 1 662,98 750,7 838,3 0,4635 66709 0,0406 291 0,0070 341
1119 fator de 1521,8 1501,2 1366,3 0,5880 0,0406 0,0004
6 iniciação eucariótico tradução 4, gama 1 6 8 76665 452 087
1208 8 quinase piridoxal (piridoxina, vitamina B6) 643,14 513,95 833,89 0,4343 94344 0,0406 732 0,0051 941
955 fator de iniciação de transcrição eucariótica 3, subunidade 10 (Teta) 5268,7 4157,7 4 4381,7 4 0,6640 95243 0,0406 977 0,0179 812
2179 2 proteína dedo de zinco 444 294,53 537,31 689,29 0,3660 2945 0,0406 977 0,0199 065
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2633 domínio repetido WD 33 234,78 271,81 596,3 0,3491 94154 0,0407 21 0,0051 895
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1635 componente 1453,8 1506,6 2023,7 0,5675 0,0407 0,0045
0 do complemento 1, subcomponent e-q de proteína de ligação 4 8 54294 359 046
1627 8 RIKEN gene do DNA 2610524G07 587,27 478,76 1412,3 6 0,3667 76895 0,0407 503 0,0187 662
4137 5 fator principal de ligação, domínio desprezível, subunidade alfa 2, translocado, homólogo 2 (humano) 219,51 745,72 448,33 0,4088 27393 0,0407 569 0,0290 346
9888 Proteína 1 similar à distrofia macular viteliforme 2 240,53 128,6 182,61 0,3011 55214 0,0407 895 0,0025 478
1246 6 proteína ribossomal S24 2346,8 2369,9 6 2625,8 0,6149 66159 0,0408 163 0,0137 755
6758 proteínas dedo de zinco 143 176,81 250,89 303,16 0,3241 09814 0,0408 451 0,0039 866
2358 7 GTPase da proteína de ativação e VPS9 domínios 1 685,61 645,29 353,59 0,4427 52108 0,0408 56 0,0036 275
1273 8 Acido fosfatídico fosfatase tipo 2B 167,98 240,57 313,04 0,3590 57222 0,0408 685 0,0011 957
1448 0 proteínas de proliferação celular 821,48 910,68 792,96 0,4797 92723 0,0408 759 0,0069 435
1101 Translocação 1068,8 1370,7 1550,0 0,5722 0,0408 0,0022
2 SET 9 2 20299 847 09
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2866 necrose tumoral superfamília do receptor do fator, membro 12a 497,84 384,37 599,54 0,4644 85418 0,0408 971 0,0096 218
3804 1 triagem nexina 6 346,75 388,99 594,39 0,3803 18755 0,0409 027 0,0050 067
1363 1 Contendo domínio A similar à proteína tirosina fosfatase - 1 573,99 612,57 1361,4 1 0,3879 00502 0,0409 091 0,0095 586
4066 6 bromodomínio e o PHD finger contendo 3 137,62 214,11 397,32 0,3594 50632 0,0409 207 0,0027 552
2502 3 M4 ciclina 165,53 233,02 314,14 0,3455 13424 0,0409 511 0,0006 637
1583 9 receptor ativado de proteína de ligação proliferador de peroxissoma 38,4 118,58 104,52 0,0723 39582 0,0409 623 0,0001 351
1449 4 DnaJ (Hsp40) homologo, subfamília B, membro 12 605,82 320,93 536,74 0,3500 68711 0,0409 731 0,0046 306
1086 5 xiluloquinase homóloga (H. influenzae) 921,59 711,51 946,94 0,5140 74901 0,0410 053 0,0097 179
1644 6 quinase Unc- 51 similar 1 (C.elegans) 783,34 1059,4 1087,8 2 0,5481 07284 0,0410 184 0,0048 392
1251 7 PRP38 préprocessament o do mRNA domínios fator 38 (levedura), contendo B 1167 624,92 806,21 0,4770 90355 0,0410 256 0,0054 774
1235 8 DEAH (AspGlu-Ala-His) polipeptídeo casa 40 299,91 175,4 477,91 0,2558 54016 0,0410 596 0,0015 695
1377 7 fator de transcrição geral III C 1 350,92 440,43 553,06 0,4184 53508 0,0410 783 0,0011 97
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1549 espermatogên ese associada 5 387,86 321,28 353,57 0,4022 20122 0,0411 141 0,0001 23
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
7228 proteína neuroprotetora dependente da atividade 665,1 564,28 782,06 0,4972 47899 0,0411 255 0,0026 866
1734 4 glutamina frutose-6fosfato transaminase 1 656,51 363,82 746,9 0,5126 7837 0,0411 348 0,0111 343
2276 5 proteína de ligação B de elemento rico em purina 347,63 237,43 304,74 0,3529 17411 0,0411 84 0,0016 556
2822 proteína de interação FUS (rico em arginina, serina) 1 3470 3149,8 4 3432,4 9 0,6553 9575 0,0411 932 0,0049 336
2985 4 fator ADPribosilação similar 15 521,65 339,7 306,09 0,3798 66748 0,0413 105 0,0003 549
1401 3 DEAD (AspGlu-Ala-Asp) polipeptídeo casa 52 468,82 637,43 504,22 0,4802 59115 0,0414 013 0,0040 472
4475 9 seqüência expressa AA763515 115,8 208,23 76,04 0,2780 28331 0,0414 541 0,0322 283
2572 3 proteína nucleolar 9 990,85 1023,2 913,87 0,5452 03243 0,0416 141 0,0095 371
1962 6 sestrina 2 773,15 957,31 978,1 0,5349 34012 0,0416 667 0,0202 333
1788 9 fosfatidilinosito l 4-cinase tipo beta 2 589,11 402,49 715,19 0,4413 61892 0,0417 266 0,0022 702
2476 0 RIKEN gene do DNA 4933402C05 821,01 823,62 1015 0,5110 96816 0,0417 706 0,0078 696
4067 7 RIKEN cDNA do gene D530033C11 176,84 152,21 205,02 0,3089 76276 0,0418 227 0,0007 036
4075 6 seqüência de cDNA BC057371 765,56 698,43 524,25 0,4376 44402 0,0418 251 0,0028 567
1570 proteína 4611,8 4168,5 4913,6 0,6776 0,0418 0,0143
2 ribossomal S17 3 2 20117 782 546
1655 importação 1615,1 1894,9 1641,9 0,5911 0,0419 0,0045
6 nuclear 7 homólogo (S. cerevisiae) 5 3 38237 314 796
1170 3 Poli (A) alfapolimerase 158,08 76,86 140,95 0,2471 80781 0,0419 799 0,0004 212
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
5457 quinase 1 proteína interagindo homeodominio 1609,9 1888,4 4 2141,7 9 0,6041 26672 0,0420 326 0,0075 205
2133 7 carboxipeptida se D 155,3 168,61 253,58 0,3005 63961 0,0420 854 0,0002 639
2118 3 ubiquitina proteína 2 associada como 765,49 711,76 1019,4 5 0,4823 8121 0,0421 384 0,0065 507
1650 fator de 3453,2 2549,0 3057,4 0,6126 0,0421 0,0145
1 iniciação eucariótico tradução 3, subunidade 10 (Teta) 7 5 38481 836 323
791 família Morf4 associado à proteína 1 1989,4 2140,1 8 2023,4 7 0,6299 94243 0,0422 36 0,0078 603
9218 proteína arginina metiltransferas e N 6 1415,4 1423,2 9 1354,9 4 0,6018 06934 0,0427 746 0,0110 855
3948 9 RIKEN gene do DNA 2610206G21 879,79 778,82 850,91 0,5491 94212 0,0428 241 0,0020 246
1433 4 WD repetido e domínio contendo SOF 784,95 603,44 597,88 0,4829 23537 0,0428 737 0,0012 824
2420 9 RIKEN gene do DNA 2610020H08 243,85 127,48 115,24 0,2464 91791 0,0430 233 0,0009 938
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2078 4 DEAD (AspGlu-Ala-Asp) polipeptídeo caixa 10 270,65 147,92 253,11 0,3626 41441 0,0430 504 0,0023 71
7934 regulador da proteína de uma citocinese 1248,9 1220,2 5 1392,5 5 0,5816 10598 0,0430 733 0,0047 674
8707 dedo de zinco, tipo CCCH com domínio fragmento G 216,62 178,11 256,1 0,2728 55536 0,0431 034 0,0039 527
2142 4 ubiquitina peptidase específicas 36 322,19 484,24 311,35 0,4337 90055 0,0431 235 0,0015 881
7817 peptidase sinal peptídeo 3 188,49 216,63 182,01 0,3357 45471 0,0431 739 0,0017 956
2217 1 estatiminasimilar 3 564,11 475,36 454,23 0,4729 53202 0,0432 099 0,0039 225
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2030 9 co-fator necessário para ativação SpI transcricional, subunidade 7 470,51 624,15 970,19 0,4706 42166 0,0432 243 0,0049 021
1349 RIKEN gene do DNA 0610009D07 388,71 302,32 482,73 0,3940 20072 0,0432 633 0,0039 389
1056 6 CUG repetição tripla, RNA de proteínas de ligação 734,46 490,43 505,7 0,5204 06964 0,0433 168 0,0021 673
8579 progressão do ciclo celular 1 477,1 413 524,9 0,4706 62518 0,0433 255 8,49E005
1591 6 homologia BTB e CNC 1 552,06 427,69 703,89 0,4716 30627 0,0433 763 0,0042 92
4645 proteína nucleolar 7 772,7 534,61 874,95 0,5299 98257 0,0434 783 0,0092 876
2931 NIMA (nunca 1171,3 1253,8 1243,9 0,5604 0,0435 0,0077
7 em uma mitose gene) quinase expressa relacionada 2 9 9 96959 294 02
1141 9 tropomiosina 3 gama 816,32 879,3 1247,3 6 0,5421 46497 0,0435 807 0,0016 093
1594 NIMA (nunca em uma mitose gene) quinase expressa relacionada 2 1176,3 1304,6 1 1168,1 2 0,5687 77283 0,0436 321 0,0038 513
2328 5 RIKEN gene do DNA 1110004B13 120,64 162,14 140,35 0,2097 23788 0,0436 893 0,0029 445
8141 FUS proteína de interação (ricos em serina, arginina) 1 1005,2 1015,7 9 962,73 0,5392 83789 0,0437 87 0,0014 819
694 heme oxigenase (desciclagem) 2 522,16 364,93 537,19 0,4286 49818 0,0437 956 0,0018 308
2192 1 domínio repetido WD 33 588,06 600,77 812,98 0,4899 44094 0,0438 389 0,0034 789
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2367 0 BRF2, subunidade da RNA polimerase III fator de iniciação da transcrição, BRF1-similar 381,23 100,11 630,97 0,3417 62709 0,0438 49 0,0510 42
2950 2 proteína transmembran a39b 203,27 287,14 367,76 0,4433 44981 0,0438 909 0,0091 891
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1786 6 caspase 3 856,19 1204,3 7 987,32 0,5566 89339 0,0439 024 0,0026 925
2127 7 proteína ribossômica L23 6020,5 5596,0 8 6154,6 0,7099 44642 0,0439 56 0,0053 816
6830 N-acetil alfaligados dipeptidase ácido 2 1649,9 1277,7 9 1688,2 8 0,6088 81433 0,0440 098 0,0026 034
1446 9 detenção de crescimento específico 2 862,42 415,16 513,27 0,3827 27402 0,0441 008 0,0287 334
1204 6 RIKEN cDNA do gene 2610304608 247,09 401,41 444,6 0,4393 07902 0,0441 176 0,0051 825
688 proteína nucleolar homologo EMG1 (S. cerevisiae) 952,79 986,65 1139,2 4 0,5434 92715 0,0441 354 0,0048 715
1247 amidotransfera 2339,7 2006,5 1731,5 0,6175 0,0441 0,0050
2 se pirofosfato fosforribosil 8 7 88445 514 14
6656 transportadora de soluto família 30 (transportador de zinco), membro 5 542,34 536,01 601,37 0,4809 14365 0,0441 527 0,0001 724
2082 sobrevivência 1831,8 1993,5 1836,2 0,6169 0,0441 0,0030
8 de domínio do neurônio motor, contendo 1 3 8 51332 889 34
1798 replicação fator C (ativador 1) 2 232,07 199,2 517,32 0,4012 74938 0,0442 021 0,0091 867
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1510 polimerase 997,47 1601,3 1547,5 0,5522 0,0442 0,0169
3 (RNA), III (DNA direcionada) polipeptídeo A 8 2 73944 055 418
2510 2 proteína fosfatase 2 (anterior 2A), subunidade catalítica, isoforma beta 357,01 457,2 468,36 0,3516 41605 0,0442 424 0,0097 182
1100 3 morte celular programada 2similar 854,94 1019,8 1 858,95 0,5446 87481 0,0442 529 0,0036 133
1176 seqüência de leucemia célula mieloide 1 898,34 715,94 1658,0 9 0,5856 53235 0,0442 584 0,0461 12
519 dedo de zinco e domínio BTB contendo 17 413,55 194,42 1009,2 7 0,3109 97736 0,0443 548 0,0166 182
7589 MYB proteínas de ligação (P160) la 759,99 756,52 1180,5 3 0,4728 20726 0,0443 645 0,0135 193
1525 5 hexosaminidas e B 625,54 661,85 990,61 0,4923 16954 0,0444 06 0,0010 227
1378 3 5,10metilenotetrahi drofolato redutase 224,28 167,49 212,1 0,3256 07896 0,0444 178 0,0031 695
2216 proteína 2341,2 2253,2 2552,8 0,6334 0,0444 0,0165
5 ribossomal S23 8 4 74792 712 089
1699 ELOVL família membro 6, alongamento de ácidos graxos de cadeia longa (levedura) 373,69 190,73 287,91 0,3166 49346 0,0445 247 0,0123 824
3008 7 RIKEN cDNA do gene 4930515601 138,13 116,5 168,78 0,2053 61161 0,0445 783 0,0001 638
9641 repetir anquirina e domínio Mynd contendo 2 301,23 86,12 363,81 0,3086 02374 0,0446 224 0,0079 18
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1203 4 RIKEN cDNA do gene 1100001122 900,12 946,7 1813,9 0,4925 4739 0,0446 321 0,0094 875
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
6044 Homólogo filho sevenless 1 (Drosófila) 444,95 294,97 346,44 0,4340 7183 0,0446 833 0,0016 692
3604 podoplanina 344,13 264,7 548,92 0,3564 32817 0,0446 86 0,0021 688
2245 ribonucleoprot 1831,5 2175,8 1879,6 0,6420 0,0447 0,0123
1 eina K heterogêneo nuclear 4 9 18685 339 942
8159 proteína ribossomal S11 2104,2 2067,4 6 2512,7 9 0,6319 50714 0,0448 864 0,0280 728
1974 9 SET e domínio Mynd contendo 5 279,3 195,61 293,15 0,3606 9938 0,0449 374 0,0010 929
1811 4 fosfoproteína nucleolar e um corpo espiralado 1128 790,66 1288,0 1 0,4949 22719 0,0450 399 0,0051 717
2196 proteína ring 1164,5 1209,1 1470,3 0,5792 0,0450 0,0083
6 finger 7 1 9 44127 913 056
3382 fator 2351,9 1874,3 2319,6 0,6313 0,0451 0,0022
4 interagindo Rapl 1 homólogo (levedura) /// (mRif1) similar ao do telômeroproteína associada RIFI (fator interagindo Rapt homólogo 1) 9 2 44433 467 792
1447 família 1518,8 1593,9 1642,9 0,6029 0,0451 0,0027
9 portadora de soluto 5 (transportador de vitamina dependente de sódio), membro 6 5 4 96207 977 146
1966 RIKEN gene 3671,4 2264,1 2862,8 0,6321 0,0456 0,0139
7 do DNA 1500011J06 5 9 67509 081 711
2121 1 fosfatase proteína tirosina similar domínio contendo 1 818,59 878,21 1244,5 0,4893 84964 0,0456 595 0,0142 331
2012 seqüência 981,23 1241,5 1475,9 0,6140 0,0459 0,0132
6 expressa AA408296 2 4 46445 127 658
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2045 fator de 3149 2942,5 3230,5 0,6679 0,0459 0,0056
7 junção, ricos em arginina/serina I (ASF/SF2) 3 8 56494 641 88
5056 proteína sinaptossomal -associada 23 1424,7 1123,3 1276,5 1 0,5661 41158 0,0460 157 0,0008 734
2315 6 isomerase peptidilprolil (ciclofilina)similar 1 562,18 556,37 635,42 0,5127 7082 0,0460 674 0,0006 206
1444 4 domínio rico e interativo AT 4B (similar Rbpl) 146,18 272,78 173,72 0,3195 59914 0,0467 547 0,0004 23
979 fibrilarina 1106,8 681,18 990,6 0,5046 2636 0,0468 062 0,0146 82
1459 0 RIKEN gene do DNA 4732471D19 195,08 238,56 382,09 0,3141 14539 0,0468 75 0,0029 813
2168 PWPI homólogo (S. cerevisiae) 410,58 364,75 416,54 0,4585 37567 0,0469 095 0,0033 81
1108 0 ATP-cassete de liagação, sub-família F (GCN20), membro 1 707,42 447,31 892,23 0,3242 80263 0,0469 274 0,0351 595
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1975 1 repetir anquirina e domínio Mynd contendo 2 111,73 38,77 117,79 0,1531 78343 0,0469 613 0,0011 35
1475 6 Fator Krüppelsimilar 9 254,78 274,03 358,42 0,3825 96509 0,0469 799 0,0074 702
1507 3 YTH família domínio 1. 608,02 420,79 788,44 0,4717 21962 0,0470 133 0,0102 676
2745 9 RNA domínio pseudouridilat e sintase contendo 3 103,42 130,55 442,34 0,1365 77415 0,0470 653 0,0010 117
182 Gene Trkfundido 871,81 1022,5 8 1079,0 2 0,5520 58093 0,0471 698 0,0205 261
1639 ciclo de 2019,7 2007,3 3556,9 0,5893 0,0472 0,0214
0 divisão celular 2 homólogo A (S. pombe) 9 2 07355 009 476
2140 claudina 6 822,38 709,62 736,86 0,5173 59884 0,0472 222 0,0478 054
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2398 8 RIKEN gene do DNA 2210011C24 138,15 189,52 394,55 0,3081 88068 0,0472 527 0,0013 637
1400 6 La família domínio ribonucleoprot eina, membro 5 726,67 737,66 830,55 0,5344 81962 0,0472 747 0,0003 652
8270 fator crescimento insulina-similar receptor 2 745,85 596 939,69 0,5313 9859 0,0473 802 0,0059 995
1587 8 proteínas dedo de zinco 289 595,85 231,71 743,7 0,2527 38063 0,0474 138 0,0083 116
2791 9 caseína quinase 1, epsilon 149,6 94,28 120,88 0,1496 8511 0,0475 162 0,0016 715
3281 transcrição ubiquamente expressa 247,35 247,04 374,41 0,3552 49067 0,0475 41 0,0043 143
1626 9 RIKEN cDNA do gene 5730403B10 330,15 361,39 315,31 0,4226 56638 0,0475 93 0,0118 599
1341 7 domínio IBR contendo 3 2704,7 2941,4 2 2367 0,6410 18401 0,0476 19 0,0050 437
2362 4 proteína fosfatase 1A, magnésio, em função da isoforma alfa 707,21 1015,6 1 891,22 0,5319 00954 0,0476 451 0,0069 881
1032 4 caspase 3 284,59 203,65 344,59 0,3201 53002 0,0476 974 0,0041 79
1736 dupla espiral 1641,7 1296,4 1849,8 0,5852 0,0477 0,0014
8 RB1-induzivel 1 5 8 40717 223 588
4089 Smg 1666,9 1373,1 1068,3 0,5169 0,0477 0,0054
2 homologo-7, fator de deterioração absurdo medida mRNA (C. elegans) 1 8 34078 742 151
1469 9 baixa densidade da lipoproteína proteína receptora e proteína relacionada associada 1 208,78 258,74 221,87 0,3716 71931 0,0477 981 0,0021 835
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
9696 proteína fosfatase 1A, magnésio, em função da isoforma alfa 369,01 388,93 396,41 0,4295 28738 0,0478 261 0,0034 317
1247 5 DEAD (AspGlu-Ala-Asp) polipeptídeo caixa 10 496,73 357,89 488,83 0,4548 68194 0,0478 495 0,0119 792
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1273 UTP11-similar, 1938,2 1738,6 2374,9 0,6282 0,0478 0,0080
3 ribonucleoprot eina U3 nucleolar pequena (levedura) 3 1 36461 781 157
1677 proteína 3314,3 3112,0 3538,9 0,6382 0,0479 0,0260
3 ribossomal L36a-similar 2 6 55937 826 8
2899 1 fosfolipase C, delta 4 437,46 324,88 403,75 0,4328 08529 0,0480 769 0,0029 441
8894 família portadora de soluto 25 (transportador mitocondrial, portador de fosfato), membro 25 379,28 255,45 490,21 0,4298 84956 0,0481 283 0,0016 834
1254 4 pequeno complexo nuclear de ativação RNA, polipeptídeo 3 534,26 381,24 455,1 0,4592 57847 0,0483 015 0,0001 963
2198 proteína 2472,7 2477,2 2756,8 0,6431 0,0484 0,0247
5 ribossomal S24 2 7 94644 043 109
7941 MOB 1, Mps quinase ativadorasimilar com uma ligação IB (levedura) 639,84 1041,8 2 1058,4 4 0,4805 67728 0,0484 558 0,0071 857
7576 SWI / SNF relacionados, matriz associada, regulador de actina dependente da cromatina, subfamília c, membro 1 503,05 853,05 827,37 0,4215 78427 0,0485 075 0,0109 639
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
3178 proteína de ligação poli A, citoplasmática 1 1877 1398,4 2 2496,9 9 0,5479 52194 0,0486 772 0,0179 144
535 tipo de subunidade proteassoma (prossoma, macropain), 7 beta 900,56 1120,7 9 1147,5 8 0,6064 65831 0,0487 288 0,0053 277
1096 9 domínio jumonji contendo IA 183,78 364,53 594,57 0,3834 99177 0,0487 421 0,0076 35
2356 domínio BAT2 2016,7 1664,8 1912,5 0,6398 0,0487 0,0011
8 contendo 1 7 5 91151 805 897
2068 9 fator de iniciação de transcrição eucariótica 2, subunidade 1alfa 1408,9 1473,8 6 1531,6 0,5986 88079 0,0487 933 0,0031 133
1360 sequência 1920,8 1977,0 2014,1 0,6478 0,0488 0,0044
7 expressa AU014645 6 9 89341 181 839
1085 ribonucleoprot 1928,3 2260,4 2173,4 0,6308 0,0488 0,0072
7 eina heterogênea nuclear M 5 2 07682 445 385
1672 2 domínio repetido WD 12 230,08 395,68 302,9 0,3512 49024 0,0488 683 0,0019 824
3863 proteína quinase ativada por mitógenos 325,02 315,25 558,26 0,3944 83203 0,0488 911 0,0071 012
2907 8 RIKEN cDNA do gene D330037H05 /// semelhantes às proteínas La relacionados 4 (ribonucleoprot eina La domínio família membro 4) 2969,8 2795,2 9 2623,9 0,6500 4971 0,0489 186 0,0040 869
1077 0 proteassoma (prossoma, macropain) subunidade 26S, ATPase 2 269,55 209,28 386,58 0,3571 17236 0,0489 297 0,0013 447
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2214 7 ER01-similar (S. cerevisiae) /// proteína ribossômica L31 1682,1 2068,8 3 2407,9 0,6207 0841 0,0489 474 0,0227 059
1417 Sec61 alfa 2261,1 2116,3 2459,7 0,6412 0,0489 0,0058
5 subunidade I (S. cerevisiae) 5 9 15536 899 544
2270 5 ets gene variante 5 668,44 1034,4 639,83 0,5034 12275 0,0489 989 0,0057 579
1619 proteína 2997,3 2246,7 2828,7 0,6166 0,0490 0,0101
8 complexa t-1 5 7 4846 196 808
2002 9 seqüência de cDNA BC024969 230,28 67,15 149,97 0,2907 15944 0,0490 394 0,0024 461
6054 fator de iniciação de transcrição eucariótica 2, subunidade 3, gene estrutural ligado ao X /// similar ao fator de iniciação de transcrição eucariótica 2, subunidade 3, gene estrutural ligado ao X 1342,5 1152,5 4 1009,0 5 0,5728 33831 0,0490 49 0,0018 304
2196 5 similar ao PRAME família membro 8 /// seqüência expressa AU018829 2492,5 2865,6 3135,8 1 0,6826 51308 0,0490 506 0,0141 426
7639 proteína nucleolar 11 352,34 374,83 213,44 0,3695 48432 0,0490 702 0,0014 996
1431 1 seqüência expressa C78212 580,26 619,3 637,51 0,5217 26257 0,0490 891 0,0033 25
7266 ubiquitinaconjugando enzima E2B, Rad6 homologia (S. cerevisiae) 736,6 884,92 789,17 0,5610 0317 0,0490 982 0,0050 4
1135 4 Mus musculus, IMAGEM clone: 3983419, mRNA 222,57 201,82 145,95 0,2777 49813 0,0491 21 0,0043 004
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1000 3 RNA guanililtransfer ase e 5fosfatase 353,53 154,09 362,86 0,3704 99342 0,0491 388 0,0061 185
1462 componente exosome 5 145,69 246,81 177,61 0,2770 39673 0,0491 559 0,0052 26
8293 ring finger e domínio SPRY contendo 1 843,63 923,02 883,55 0,5651 88996 0,0491 632 0,0032 451
8271 receptor de fator de crescimento similar à insulina 2 459,73 649,21 498,88 0,4816 47672 0,0491 718 0,0138 287
8020 domínio homologia Pleckstrin contendo, família F (com domínio FYVE) membro 2 505,77 626,89 737,95 0,5413 4623 0,0491 803 0,0174 188
3949 1 proteínas dedo de zinco 710 975,36 1333,2 5 979,43 0,5596 17585 0,0491 886 0,0045 662
1486 Dnal (Hsp40) homologo, subfamília B, membro 9 2867,2 2942,9 3211,2 1 0,6801 3085 0,0491 968 0,0054 914
1509 proteína 3506,8 2970,3 3555,6 0,6598 0,0492 0,0169
3 ribossomal S17 5 6 10063 048 152
2115 família torsin I, membro B 456,6 304,99 408,7 0,4257 15379 0,0492 147 0,0045 365
2741 8 seqüência de cDNA BC035295 1041,6 1097,1 6 911,05 0,5569 25937 0,0492 228 0,0086 183
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1746 6 G domínio fragmento contendo 4 747,62 528,15 616,45 0,5312 73264 0,0492 308 0,0088 493
2013 fator de iniciação de transcrição eucariótica 3, subunidade 4 (delta) 465,04 463,27 611,39 0,4689 39778 0,0492 386 0,0150 693
2718 9 RIKEN cDNA do gene E430025E21 391,26 261,61 311,02 0,4292 36111 0,0492 537 0,0005 567
7846 manosidase, classe alfa 2C, membro 1 59,15 145,44 156,62 0,0709 0127 0,0492 813 0,0020 38
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1594 ATPase tipo 3190,7 2860,1 3084,8 0,6436 0,0492 0,0168
8 13A3 3 5 39106 958 886
3056 factor de crecimento de insulina-similar 2 proteínas de ligação do mRNA 1 113,81 134,37 168,17 0,2632 58754 0,0493 028 0,0004 664
3186 6 M-fase fosfoproteína 1 916,93 822,02 1167,4 8 0,5369 19384 0,0493 25 0,0013 036
1115 4 fator de crescimento, erv1 (S. cerevisiae)similar (aumentador de regeneração do fígado) 360,32 727,15 1012,7 7 0,4811 98735 0,0493 519 0,0451 772
4640 M3 ciclina 470,6 681,96 476,52 0,4733 09909 0,0493 708 0,0279 584
1218 4 proteína de transferência de fosfatidilinosito l, citoplasmática 1 204,73 89,26 219,98 0,3837 89455 0,0494 012 0,0047 793
1675 3 COX4 vizinho 894,23 725,76 1113,0 9 0,5765 47419 0,0494 129 0,0076 965
8770 Pseudouridina Trub sintase (psi) homologo 2 (E. coli) 1380 1601,9 1 1777,9 8 0,6117 69533 0,0494 277 0,0140 73
3530 1 gb:AV268519 /DB_XREF=gi: 16389684 /DB_XREF=A V268519 /CLONE=4930 535J 16 /FEA=EST /CNT=4 MD=Mm.3841 3.1 /TIER=ConsEn d /STK=2 fUG=Mm.3841 3 /UG_TITLE=E STs 642,03 432,62 473,25 0,5282 07932 0,0494 505 0,0052 961
1145 5 seqüência de cDNA BC010304 1196,5 751,72 656,51 0,4503 06002 0,0495 146 0,0203 492
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1484 ER01-similar 2005,3 2401,7 2725,5 0,6475 0,0495 0,0183
0 (S. cerevisiae) /// proteína ribossômica L31 5 3 09527 192 777
1630 9 proteína príon 39,64 77,22 93,19 0,1621 67495 0,0495 327 0,0006 81
7219 proliferação associados 2G4 4934,9 4376,4 7 4773,3 8 0,7013 16785 0,0495 584 0,0172 926
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2232 7 proteassoma (prossoma, macropain) subunidade, tipo alfa 4 523,64 561,2 597,35 0,5261 40351 0,0495 627 0,0021 888
1715 1 exonuclease 3 -5 domínio similar 2 157,58 233,27 169,66 0,3101 25408 0,0495 669 0,0033 075
1074 3 sorbitol desidrogenase 403,04 323,86 301,79 0,4500 88635 0,0495 71 0,0021 916
6064 receptor nuclear coativator 6 interação de proteínas 1894 2042,3 4 1527,1 8 0,6446 4665 0,0495 825 0,0053 951
1454 6 componente complexo exocista 8 144,96 178,44 148,81 0,3023 6893 0,0496 109 4,94E005
1458 9 RIKEN gene do DNA 4732471D19 151,77 176,54 113,67 0,3080 73629 0,0496 255 3,73E- 005
1733 proteína 1675,9 2054,5 2318,9 0,5749 0,0496 0,0285
1 ribossômica L15 6 5 53378 324 166
2924 0 catenina (proteína caderina associada), delta 1 216,39 309,83 274,46 0,3902 07715 0,0496 559 0,0086 747
8570 seqüência expressa AI840826 225,48 172,99 158,23 0,3100 50284 0,0496 657 0,0004 189
2916 9 RNA proteína motivo de ligação 4 310,54 382,4 312,05 0,4213 39486 0,0496 72 0,0023 589
4044 RIKEN cDNA 2220,7 2011,8 2336,3 0,6002 0,0497 0,0310
0 do gene C130032F08 7 4 28723 047 912
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1887 zipper da 2784,2 2571,6 2854,6 0,6604 0,0497 0,0040
3 leucina básica e domínios W2 1 5 4 57255 132 118
1389 9 beta carioferina (importina) 1 158,24 180,43 197,68 0,2845 56859 0,0497 186 0,0032 513
1869 2 GA proteína vinculativa repetida, alfa 2042,8 1734,7 3 2022,7 0,6218 77894 0,0497 561 0,0045 946
4268 1 ativando o sinal cointegrator 1 subunidade complexa 3 661,15 697,71 694,37 0,5082 76915 0,0497 608 0,0090 114
7056 família portadora de soluto 22 (transportador de ânion/cátion orgânico), membro 12 259,41 365,4 248,19 0,4061 39671 0,0497 696 0,0132 837
2136 proteína de membrana peroxisomal 2 137,14 245,59 211,62 0,2474 31296 0,0498 028 0,0017 665
1222 0 aminotransfera se histona 1 258,49 221,04 202,13 0,3657 75454 0,0498 047 0,0005 087
1225 8 fator de junção, ricos 1em arginina / serina (ASF/SF2) 1990,7 2140,9 2193,1 2 0,6491 06926 0,0498 084 0,0018 66
1298 3 proteínas interagindo PAKI 1 294,26 127,72 233,41 0,2970 30074 0,0498 102 0,0031 002
1232 proteína 1780,2 2157,7 2472,1 0,6235 0,0498 0,0194
7 ribossômica L31 2 3 34481 12 633
1468 ribonucleoprot 1956,1 2275,2 1706,9 0,6327 0,0498 0,0096
4 eina heterogênea nuclear Al 2 8 00133 138 143
Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
2146 translocase da 1678,3 1498,0 2176,7 0,6143 0,0498 0,0094
5 membrana externa da mitocôndria homologa 20 (levedura) 7 4 91051 155 199
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Colu na Gene NI.2.1 NI.2.2 NI.2.3 modula ção fdr t.pvals
1360 1 Semelhante à proteína de ligaçãoao nucleotídeo guanina 3 (nucleolar) 836,66 835,1 1505,9 7 0,5129 71636 0,0498 519 0,0092 099
2542 6 Segmento de DNA, Cr 5, Wayne 139,72 309,45 160,76 0,2777 33966 0,0498 534 0,0030 42
2210 9 State University 178, expresso 1052,8 777,27 896,81 0,5415 61061 0,0498 575 0,0041 5
3470 5 RIKEN cDNA 2700007P21 967,5 396,14 683,09 0,4506 36908 0,0498 589 0,0205 448
3486 gene 1201,7 793,58 994,76 0,4710 80332 0,0498 602 0,0504 72
2367 1 uroporfirinogê nio descarboxilase 787,59 737,65 933,74 0,5619 10338 0,0498 615 0,0066 228
3870 Proteína quinase 3 de interação com homeodomínio 175,23 148,97 187,23 0,3335 72072 0,0499 049 0,0048 636
1959 Ring finger 5 do grupo polycomb 232,87 162 63,09 0,2353 15902 0,0499 067 0,0068 601
2112 7 Proteína dedo de zinco 292 194,19 308,63 357,29 0,3419 04273 0,0499 076 0,0049 613
7468 gene 3reguladoà jusante de Nmyc 700,65 843,07 702,27 0,5588 37029 0,0499 084 0,0131 579
4093 86 contendo domínio coiled-coil 1190,5 1078,3 8 2087,7 6 0,5036 09237 0,0499 52 0,0152 768
1909 1 Proteína de rede de golgi transprotein 1338,8 947,09 1617,5 3 0,5449 79622 0,0499 529 0,0378 109
7812 Componente de complexo golgiense oligomérico 4 145,12 138,2 113,32 0,2794 61609 0,0499 542 0,0017 652
TABELA 9A
Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
8013 Rasl 11 b: similar à RAS, família 11, membro B 1175, 28 1162, 12 866,0 8 67,51 155,4 83,97 28,63
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
16505 Gyg: glicogenina 2774, 07 3647, 22 2911, 43 451,4 788,3 545 633,2
44280 Gyg: glicogenina 2716, 28 3189, 75 2680, 95 587,4 955,1 642,4 640,7
19189 Hsbp1: proteína de ligação 1 de fator de choque térmico 2054, 28 1787, 07 1312, 02 326,5 423,8 376,3 415,9
38879 /// LOC631337: RIKEN cDNA 0610008C08 gene /// hipotético LOC621156 /// proteína hipotética LOC631337 574,7 4 794,4 4 810,3 8 108,3 279,7 167,9 96,73
21617 Ywhab: tirosina 3 Proteína de ativação de monooxigenase/tri ptofano 5 monooxigenase, polipeptídeo beta 1175, 16 1329, 81 1339, 93 250,9 326,1 341,3 285,4
12776 Gpsn2: glicoproteína, sináptica 2 960,0 8 781,1 6 213,6 3 107,9 146,7 123,1 160,8
38623 Rgs2: regulador 2 de sinalização de proteína G 963,9 8 951,5 7 378,0 4 252,3 232 224,9 47,94
14769 Ywhab: Proteína de ativação de tirosina 3-monooxigenase/ triptofano 5-monooxigenase, polipeptídeo beta 984,1 8 1329, 73 1254, 81 241 312 348,2 323,2
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
21642 Tax Ibp3 /// Rp113: Taxl (vírus de leucemia de célula T humana tipoI) proteína de ligação 3 /// proteína ribossomal L13 1245, 68 2205, 53 913,4 4 382,1 394,4 282,3 507,1
22387 BC018601: sequência de cDNA BC018601 871,1 1 1011, 02 988,6 9 263 239,9 197,1 251,4
28288 Zfp291: proteína dedo de zinco 291 987,3 9 413,2 1 165,7 7 31,66 208,2 60,95 9,02
15663 Ninjl: ninjurina 1 768,7 6 910,4 1 1337, 77 236,5 145 273,4 260,1
27398 Zarl: detenção do zigoto 1 196,3 4 550,8 7 430,2 4 96,91 62,32 61,6 36,14
8065 Hsbp l: proteína de ligação 1 de fator de choque térmico 1479, 03 1221, 16 1148, 4 399 455,2 495,6 385,2
20436 Gltscr2: gene 2 de região de candidato a supressor de tumor de glioma 229,4 345,2 9 561,0 3 117,9 44,11 14,4 87,12
10123 Hspbl: proteína de choque térmico 1 451,2 6 233,4 8 504,6 5 36,78 60,45 103,9 181,6
32039 Myo5b: miosina Vb 932,0 1 832,8 6 419,7 5 167 224 201,3 246,4
19373 Mtap: metiltioadeno sina fosforilase 430,0 5 544,6 9 232,6 1 76,62 179,7 135,6 24,53
Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
15861 Ptk91: similar à proteína tirosina quinase 9 (proteína relacionada à A6) 3879, 84 515,2 8 668,1 6 278,3 548 167,5 39,25
5039 Ywhab: Proteína de ativação de tirosina 3-monooxigenase/ triptofano 5-monooxigenase, polipeptídeo beta 786,4 3 1401, 89 1268, 98 550,3 550,1 542,5 548,9
7118 Zfp313: proteína dedo de zinco 313 664,6 3 959,1 606,3 3 102,2 233,1 60,95 260,6
27301 Chsyl: carboidrato (condroitina) sintase 1 3606, 66 3856, 21 3309, 81 1920 1952 1650 1778
23482 Wdr51b: domínio de repetição WD 51B 549,7 1 635,2 9 186,2 4 78,52 121,3 128,3 70,8
22475 Sept11: septina 11 379,6 7 680,2 8 606,4 9 144,3 278,7 239,7 234,4
16314 2700060E02 Rik: RIKEN cDNA 2700060E02 gene 1657, 64 2133, 91 1718, 85 759,8 1151 666,9 740,4
40450 Pfdn4: prefoldina 4 835,7 4 1351, 12 1275, 03 465,7 482,3 379,6 367,1
3542 Rgs2: regulador 2 de sinalização de proteína G 910,4 5 1375, 3 511,1 289,8 380,2 277,6 309,3
38514 Prkaca: proteína quinase, dependente de cAMP, catalítica, alfa 1061, 04 1151, 27 898,9 8 699,1 230,1 414,1 446,6
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
9746 Ptprj: proteína tirosina fosfatase, tipo receptor, J 313,6 3 348,7 4 149,5 6 38,69 84,77 85,95 59,83
21697 Zfp3I3: proteína dedo de zinco 313 3162, 11 3960, 29 3102, 1 1059 1648 1223 1678
19162 Gtf2b: fator de traanscrição geral 11B 952,5 5 1437, 02 1358, 53 532,4 552,3 466,5 425,1
5038 Ywhab: Proteína de ativação de tirosina 3-monooxigenase/ triptofano 5-monooxigenase, polipeptídeo beta 842,8 1 1251, 66 740,5 218,4 255,6 347,1 475,5
16058 Gm428 /// LOC623180 /// LOC623197 /// LOC623210 /// LOC623219: modelo de gene 428, (NCBI) /// hipotético LOC623180 /// hipotético LOC623197 /// hipotético LOC623210 /// hipotético LOC623219 1730, 14 2814, 61 2209, 92 719 1302 938 1086
1904 Ube2a: enzima conjugadora de ubiquitina E2A, RAD6 homólogo (S.cerevisiae ) 835,5 8 1090, 31 1082, 16 322,8 424,9 331,9 208
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
1431 Srpk2: quinase 2 específica de proteína rica em serina/arginin a 1149, 91 1761, 01 1427, 58 473,3 698,9 399,7 966,1
Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
11264 2610510J17 Rik: gene RIKEN cDNA 2610510J17 957,0 3 1024, 23 729,2 175,1 254,7 235,5 303
16336 Uchl l: hidrolase L1 de carbóxiterminal de ubiquitina 1255, 01 1792, 27 1364, 58 299 536,1 340,2 818,6
16195 Bpgm: mutase 2,3bisfosfoglicer ato 1084, 63 1316, 44 933,0 3 223,6 542,2 298,2 441
15069 2700060E02 Rik: gene RIKEN cDNA 2700060E02 1911, 39 1978, 28 1849, 47 866 1267 698,8 686,8
1378 Sec61b: Sec61 subunidade beta 629,4 1333, 69 789,3 7 274,4 516,3 341,2 201,2
277 Herpud2: membro 2 da família HERPUD 1579, 89 1939, 26 1921, 14 868,5 883,8 596,7 827,7
22096 Mm.69144.1 453,0 6 395,6 4 858,4 4 130,4 120,9 231,2 100,7
28335 Usp27x: peptidase específica de ubiquitina 27, cromossomo X 1037, 34 637,2 9 144,4 4 150,5 158,3 218 119,3
1111 Nek7: quinase 7 expressa relacionada a NIMA (nunca no gene a de mitose) 717,1 2 574,9 5 336,9 3 210,7 267,8 172 134
12221 Cpal: carbóxipeptid ase A1 1233, 98 1187, 56 1071, 87 304,4 410,4 369,7 630,8
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
10438 5830415L20 Rik: gene RIKEN cDNA 5830415L20 1215, 2 1852, 35 1334, 99 447,1 794,1 612,1 547,7
20740 Mm.27444.1 337,5 9 481,4 7 424,2 81,2 144,9 122,1 82,14
6654 Hmgnl: grupo de alta mobilidade Domínio 1 de ligação nucleossoma l 2802, 24 3952, 07 3639, 58 1578 1726 1428 2308
2773 Lmol: domínio 1 L1M apenas 728,8 2 1098, 32 1034, 76 305,5 364,2 304 486,9
16848 Ube2a: enzima conjugadora de ubiquitina E2A, RAD6 homólogo (S.cerevisiae ) 986,4 2 1081, 65 857,1 7 294,9 401,6 308,1 491,7
28139 Mall: mal, similar à diferenciação de célula T 140,4 3 181,8 2 65,34 2,1 15,41 3,36 15,11
23084 2410127E18 Rik: gene RIKEN cDNA 2410127E18 526,4 3 815,9 1 633,9 9 308,7 278,7 283,9 152,4
42427 Mrgl: gene 1 relacionado ao sítio de integração viral ecotrópica mieloide 1187, 24 1519, 64 1212, 95 887,5 524,6 553,7 452,6
Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
34813 LOC627488 /// LOC627520 /// LOC667692 /// LOC667695 /// LOC673990: similar à subunidade 4 do complexo THO (Tho4) 2997, 33 4389, 29 4558, 04 2547 3079 2572 1852
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
(proteína 1 de ligação do fator de exportação e RNA 1) (REF1-I) (Ally de AML1 e LEF-1) (Aly/REF) /// similar à subunidade 4 do complexo THO (Tho4) (proteína 1 de ligação do fator de exportação e RNA) (REFII) (Ally de AML. 1 e LEF-1) (Aly/REF) /// similar à subunidade 4 do complexo THO (Tho4) (proteína 1 de ligação do fator de exportação e RNA) (REF1I) (Ally de AML-1 e LEF-1) (Aly/REF) /// similar à subunidade 4 do complexo THO (Tho4) (proteína 1 de ligação do fator de exportação e RNA) (REFI I) (Ally de AML-1 e LEF-1) (Aly/REF) /// similar à subunidade 4 do complexo THO (Tho4)
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
(proteína 1 de ligação do fator de exportação e RNA) (REF1I) (Ally de AML 1 e LEF-1) (Aly/REF)
14324 2700060E02 Rik: gene RIKEN cDNA 2700060E02 1736, 22 1743, 31 1787, 5 771,8 1146 670 697,7
5988 Ak311: similar a adenilato quinase 3 alfa 923,3 6 955,8 444,0 5 293,2 479 230,4 457,2
1245 Tnfaip8: fator de necrose do tumor, proteína 8 alfa-induzida 360,7 2 565,7 5 517,2 173,1 264,6 167,2 150,3
29349 Srrm2: matriz 2 repetitiva de serina/arginin a 422,7 6 520,4 9 235,8 4 276,2 142 111,1 23,71
18213 Gnas: GNAS (proteína de ligação de nucleotídeo de guanina, alfa estimulador) lócus complexo 749,5 6 1054, 77 1007, 27 303,1 467,2 274,3 329,4
12033 Zfp313: proteína 313 com dedo de zinco 2750, 76 3476, 54 2573, 42 687,5 1148 821,6 1426
27637 Nr2e1: subfamília do receptor nuclear 2, grupo E, membro 1 1154, 42 1358, 16 898,9 5 372,1 477,2 439,9 220,9
2211 Fxcl: transcrição 1 com calo fraturado expresso 319,9 6 265,7 2 286,0 7 4,63 47,28 3,92 13,61
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
23218 5730405I09 Rik: gene RIKEN cDNA 5730405I09 1466, 98 1315, 46 1000, 54 584,5 638,8 679,3 643,1
9918 Nobox: NOBOX oogênese homeobox 557,2 2 579,5 4 288,3 7 129 371,4 87,59 172,8
Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
27981 1110003E01 Rik: gene RIKEN cDNA 1110003E01 935,0 7 637 979,7 1 438,5 639,8 244,7 270,6
23766 4930431B09 Rik: gene RIKEN cDNA 4930431B09 288,0 9 929,8 5 626,5 8 234,9 253,4 170 197,8
2222 Ddx19a: DEAD (AspGlu-Ala-Asp) polipeptídeo box 19a 1171, 65 1506, 5 1210, 32 497,4 638,6 587,9 581,9
9267 BC004728:s equência de cDNA BC004728 2914, 05 3310, 43 4063, 56 1785 1884 1762 2063
11008 Sec24b: SEC24 família de gene relacionada, membro B (S. cerevisiae) 491,1 7 371,3 8 563,6 9 38,39 140,5 93,28 159,3
20332 2610510J17 Rik: gene RIKEN cDNA 2610510J17 920,3 4 904,5 6 875,7 9 268,6 445 387,9 292,4
1259 Eefsec: fator de alongamento eucariótico, selenocisteín a-tRNA específico 420,3 9 175,3 7 131,6 27,72 33,52 41,27 19,45
17879 Ehd4:domíni o EH contendo 4 1018, 34 1327, 03 1393, 04 514,7 741 621,1 418,3
7236 Snx9: classificação de nexina 9 2034, 25 2223, 65 2179, 13 937,6 906,1 769,4 1117
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 297/373
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
19870 Ggtal: glicoproteína galactosiltran sferase alfa 1,3 2076, 84 1911, 12 1747, 57 1034 1405 1131 712,7
4975 Ywhag: proteína de ativação 3monooxigena se/triptofano 5monooxigena se, polipeptídeo gama 1701, 12 2425, 78 1962, 92 1046 935,4 694,1 728,4
3840 Atp6vIcl: ATPase, transporte de H+, subunidade VI lisossomal C1 1562, 18 1993, 36 1324, 28 641,1 676,2 434,4 835,1
1499 Kdelr2: KDEL (LysAsp-Glu Leu) receptor de retenção de proteína do retículo endoplasmáti co 2 1134, 97 1840, 76 1296, 63 454,7 740,1 649,3 505,6
19039 Csda: proteína A do domínio de choque a frio 1886, 38 2541, 08 2229, 73 996,1 1299 937,6 1283
9095 Dnahc8: dineína, axonemal, cadeia pesada 8 275,0 9 424,8 2 466,6 2 57,34 144,7 48,48 81,76
4403 Gadd45b: Parada de crescimento e 45 beta induzível por lesão do DNA 325,8 1088, 25 1693, 72 59,09 210,2 129,8 401,4
Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
23361 Fbxo28: proteína Fbox 28 728,1 6 665,6 3 382,0 2 171,4 132,3 122,3 209,7
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 298/373
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
6486 G6pd2 /// G6pdx: glucose-6 fosfato dehidrogenase 2 /// glucose-6fosfato dehidrogenase X-ligada 919,6 1 1851, 91 1150, 83 309,7 590,7 402 725,6
22429 Gorasp2: proteína de empilhament o de reagrupamen to de golgi 1053, 97 1211, 58 759,0 4 341,9 459 419,6 583,3
6921 Kif17: membro 17 da família da quinesina 1050, 79 1040, 1 651,5 1 576,5 561,7 248,7 435,1
13584 Dcpla: enzima de desoperculaç ão 1250, 95 1233, 21 734,4 3 514,4 536,9 508,7 712,4
4967 Ncoa4 /// LOC627557: coativador do receptor nuclear 4 /// similar ao coativador do receptor nuclear 4 819,6 7 1349, 74 597,1 225,4 376,4 254,5 372,8
14382 Pcid2: domínio contendo 2 PC1 208,2 1 208,8 4 103,6 4 13,83 77,97 8,25 39,19
9970 Csrp I: proteína 1 rica em cisteína e glicina 707,3 7 1081, 76 451,8 6 402,1 254,6 515,3 117,8
9611 Ptprj /// AW125753: proteína tirosina fosfatase, receptor tipo, J /// sequência expressa AW125753 276,1 8 258,5 7 380,7 8 49,33 87,25 38,19 50,96
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
12280 2610528K11 Rik: gene RIKEN cDNA 2610528K11 847,6 2 350,1 5 887,0 5 191,3 286,5 257,4 379,5
14887 Tmem109: proteína de transmembra na 109 1049, 13 1100, 4 693,1 5 487,8 701,2 347,9 350,2
8101 Cam1c2g: proteína cálcio/calmo dulina dependente quinase II gama 283,0 6 354,2 5 367,2 116,7 94,65 136,1 97,12
22457 Sepwl: selenoproteí na W, músculo 1 2758, 54 3164, 45 4104, 83 1518 1644 1398 1870
15377 Tm2d2: domínio TM2 contendo 2 761,3 1 348,9 5 1367, 84 465,4 283,5 356,7 295,1
13610 Pnrcl: coativador 1 do receptor nuclear rico em prolina 1875, 98 2497, 69 2218, 37 912,7 1173 1023 1143
22912 Calcocol: ligação de cálcio e domínio coiled coil 1 645,5 564,9 7 318,6 1 259,5 280,1 113,5 190,8
Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
7409 Tgfb2: fator de crescimento de transformaçã o, beta 2 793,7 8 1590, 37 1213, 53 412,2 635,7 521,1 714,9
38991 Ttll 1I: família similar a tubulina tirosina ligase, membro 11 629,8 8 997,1 5 450,4 8 230,8 216,8 257,8 240
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 300/373
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
21361 Slc25a4: family 25 do carreador soluto (mitocôndria] carreador, translocador de nucleotídeo de adenina), membro 4 609,2 8 302,3 5 741,4 4 237 343,3 259,4 201,2
21528 Cnn3: calponina 3, acidífero 842,6 930,2 4 788,1 2 354,8 542,4 337,9 180,8
15242 Pofut2: proteína Ofucosiltransfe rase 2 1778, 35 1399, 41 2187, 94 882,1 1202 822,3 491,1
23699 Cd16412: D164 similar a sialomucina 2 294,2 5 488,6 4 324,2 3 53,73 65,52 83,92 138,4
37480 4930562C15 Rik: gene RIKEN cDNA 4930562C15 266,9 9 324,5 3 138,9 8 37,48 48,81 45,36 87,04
16487 Wfs 1: síndrome de Wolfram 1 homólogo (humano) 539 852,8 431,8 5 108 256,6 262,6 278,2
20014 Arrb2: arrestina, beta 2 261,8 442,5 1 421,6 6 79,45 122,9 130,7 191,7
33055 2700050L05 Rik: gene RIKEN cDNA 2700050L05 504,8 7 984,4 8 426,5 3 189 221,1 184 321,7
408 Fkbp8: FK506 proteína de ligação 8 590,1 4 427,0 4 302,1 9 164,6 241,9 117,1 99,71
39254 8430429K09 Rik: gene RIKEN cDNA 8430429K09 483,6 1 603,3 382,1 4 140,5 172,4 143,3 254,2
159 Bpgm: mutase 2,3bisfosfoglicer ato 4125, 5 4888, 39 3943, 66 2337 3162 2111 2186
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 301/373
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
1105 Meal: antígeno 1 aumentado masculino 641,7 9 1052, 56 800,1 6 373,2 443,3 291,3 373
38903 2600010E01 Rik: gene RIKEN cDNA 2600010E01 247,2 8 200,2 5 369,0 5 57,76 100,1 37,76 33,32
15195 Tm2d2: domínio TM2 contendo 2 807,8 5 315,8 9 1436, 51 527,6 320,7 388,1 290,4
21185 D1 OWsu I 02e: segmento de DNA, Chr 10, Wayne State University 102, expresso 2625, 46 3167, 45 2893, 72 1716 1847 1338 1962
4343 2410022L05 Rik: gene RIKEN cDNA 2410022L05 1605, 23 1541, 87 1099, 08 1006 799,1 735,3 264,5
12245 Dnmll: similar a dinamina 1 714,0 7 890,4 5 642,3 5 203,1 404,7 362,8 383,8
Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
109 Atp6vIb2: ATPase, H+ transporte, lisossomal V1 subunidade B2 1155, 57 1164, 53 728,3 9 468,3 602,1 390,5 479,6
41382 9230115E21 Rik: gene RIKEN cDNA 9230115E21 1049, 24 1705, 49 1742 671,1 1012 681,8 714,7
1430 Srpk2: proteína específica quinase 2 rica em serinalarginin a 1999, 89 2326, 25 2092, 34 1043 1218 1110 1149
16430 G6pdx: glucose-6fosfato dehidrogenase X-ligada 1912, 61 2849, 68 1863, 38 787,9 1752 1060 912,4
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
2300 Sdhb: complexo sucinato dehidrogenase, subunidade B, enxofre ferroso (1p) 538,0 2 229,9 7 832,0 3 138,8 236,8 218,7 38,77
6223 Zbtb20: dedo de zinco e domínio BTB contendo 20 134,9 7 146,1 3 16 4,9 11,08 4,9 9,14
13279 Dcpla: enzima de desoperculaç ão 370,0 6 844,4 7 493,1 2 102,2 141,4 115,2 321,2
9363 Ddx19a /// Ddx19b: DEAD (Asp Glu-Ala-Asp) polipeptídeo box 19a /// DEAD (Asp-GluAla-Asp) polipeptídeo box 19b 1900, 93 2603, 49 1537, 03 1167 1153 885,9 897,4
10998 Pold3: polimerase (DNA direcionado), delta 3, subunidade suplementar 1214, 68 1819, 91 1832, 16 850,3 830,5 871 1004
18210 Lnk: ligante de vias do receptor de células T 473,2 5 331,5 4 156,1 95,8 81,69 130,4 71,84
21746 Tmem109: proteína de transmembra na 109 786,4 7 847,0 1 508,1 3 367,6 528,2 245,5 273,8
16900 Ube2j1: enzima conjugadora de ubiquitina E2, J1 1048, 14 731,1 1 425,7 9 189,2 297,8 190,2 412,6
14774 Surf4: gene 4 em excesso 2026, 91 2349, 99 1707, 51 1143 1323 1046 1020
6591 Dbi: inibidor de ligação de diazepam 748,1 6 1411, 18 1571, 45 551,5 796,2 566,5 644,3
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
916 LIg11: homólogo de larva gigante letal 1 (Drosophila) 1430, 08 1103, 73 1765, 18 919,1 927,7 845 526,8
14725 Aldh9al: aldeído dehidrogenase 9, subfamília A1 2464, 65 2087, 14 1545, 48 936,9 1225 1018 1310
Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
22776 Abhd13: domínio abhidrolase contendo 13 1448, 41 1446, 62 1230, 77 644,7 823 682,5 642,8
8799 Arl8a: similar ao fator de ADPribosilação 8A 450,6 3 484,5 2 240,8 2 185,2 144,7 165,6 126,1
4729 Tcllb3: leucemia/linf oma de célula T 1B, 3 3067, 43 4225, 86 3944, 03 1750 2137 2048 2719
8719 Pstpipl: proteína 1 de interação com prolinaserinatreonina fosfatase 133 150,1 8 47,71 10,97 19,4 25,08 18,91
5059 Rab18: RAB18, família do oncogene do membro RAS 1682, 03 1655, 73 1019, 13 929,2 817,7 742,1 723,3
11799 Runxlt 1: fator de transcrição 1 relacionado ao subdesenvol vimento; translocado para, 1 (relacionado à ciclina D) 720,1 9 672,3 8 443,2 238,1 239,4 221,5 336,5
3543 Rgs2: regulador de sinalizador de Gproteína 2 871,7 5 1343, 48 839,9 2 552,5 601,3 456,3 215,4
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
11937 Defb8: defensina beta 8 322,3 225,1 3 147,3 3 19,16 51,47 86,7 48,97
22002 Anapc5: subunidade 5 do complexo que promove anafase 2197, 5 1065, 37 1661, 25 652,3 960,9 647,2 1135
270 Carhspl: proteína I estável ao calor, regulada por cálcio 695,9 6 1334, 14 836,2 9 323,6 378,2 367,8 428,5
11459 Lhx8: LIM homeobox proteína 8 915,6 5 1329, 12 940,3 8 474,1 516,8 519 579,1
34771 2700050L05 Rik: gene RIKEN cDNA 2700050L05 83,83 110,4 7 358,7 6 26,54 30,56 15,02 19,41
412 Orc31: complexo de reconhecime nto de origem, similar a subunidade (S.cerevisiae ) 512,7 9 479,0 4 423,3 1 81,65 207,6 115,3 178
8298 Rapla: proteína-la relacionada a RAS 1038, 15 1345, 27 1417, 09 535,1 752,6 615 727,4
18549 H110: H1 família da histona, membro 0 1417, 73 1021, 56 619,5 3 522,4 740,5 456,5 358,3
29960 LOC433810: similar à proteína de transmembra na SHREW1 689,2 2 717,5 3 441,9 2 260,5 343,3 371,8 226,1
2778 Ggtal: glicoproteína galactosiltran sferase alfa 1,3 615,1 1 636,6 7 665,4 6 268,8 335 231,9 263,9
Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
23726 1700010D01 Rik /// MGC118250: gene RIKEN cDNA 1700010D01 /// proteína LOC76386 similar ao hipotético 514,5 4 738,8 8 626,1 4 342,7 278,7 196,3 235,7
12425 Zcchc3: dedo de zinco, domínio CCHC contendo 3 601,6 494,7 3 290,7 5 165 163,9 195,7 202,5
10133 Tritn25: proteína 25 de motivo tripartite 616,9 6 638,7 1 337,0 3 143,7 248,1 271 339,9
8706 Car10: anidrase carbônica 10 126,1 2 168,1 5 16,02 9,61 16,81 12,12 1,76
7747 Arpc4: complexo de 2/3 de proteína relacionada à actina, subunidade 4 1172, 92 1818, 6 1389, 88 803,2 994,5 747,6 842,5
39091 Chesl: supressor de ponto de controle 1 691,6 2 717,9 7 330,8 186,5 461,5 200,6 209,6
1396 Hspa2: proteína 2 de choque ao calor 1165, 3 1847, 21 1706, 76 768,3 1326 888 653
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
43852 L00545637 /// LOC623272 /// LOC623281 /// LOC636750 /// LOC667780: hipotético L00545637 /// hipotético LOC623272 /// hipotético LOC623281 /// proteína LOC636750 hipotética /// proteína LOC667780 hipotética 3154, 18 5046, 7 4038, 1 1862 3004 2393 2912
1723 Gng3: proteína de ligação ao nucleotídeo de guanina (proteína G), gama 3 subunidade 939,2 6 1673, 4 1032, 44 377 611,2 390,9 606,5
8545 Reep2: proteína suplementar receptora 2 1276, 5 951,3 8 773,5 7 228,1 348,3 268 801
26935 Bandl: homologia adjacente de bromo contendo domínio 1 496,5 645,9 8 493,5 200,3 217,8 255,2 202,4
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Coluna Gene CycA2 .1 CycA2 .2 CycA2 .3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
927 Mod 1 /// LOC624892 /// LOC677317: enzima málica, sobrenadant e /// similar à enzima málica NADP dependente (NADP ME) (enzima málica 1) /// similar à enzima málica NADPdependente (NADP-ME) (enzima málica 1) 998,0 6 922,6 7 686,5 1 467,8 580,6 523,9 272,3
38626 Mfap2: proteína 2 associada a microfibrilar 509,3 7 115,6 7 349,2 4 27,37 198,3 120,4 76,61
33836 Lócus transcrito 22,68 284,4 5 137,8 8 67,18 11,32 10,03 13,47
13825 Plekhcl: homologia de pleckstrina contendo domínio, família C (com domínio FERM) membro 1 433,8 8 1351, 76 1329, 49 686,8 581,8 481,9 519
20764 Txn2: tioredoxina 2 417,2 626,9 8 484,3 144,4 244,2 113,1 228,5
Tabela 9A - continuação
Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
8013 Rasl 11 b: similar à RAS, família 11, membro B 67,32 76,13 13,3779 3368 0 0,01333 333 281,069
16505 Gyg: glicogenina 808,2 736 4,71113 938 0 0,03666 667 146,474
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
44280 Gyg: glicogenina 735,8 665,4 4,06316 9251 0 0,04666 667 115,459
19189 Hsbp1: proteína de ligação 1 de fator de choque térmico 610,1 588,6 3,76001 9554 0 0,05666 667 88,0219
38879 /// LOC631337: RIKEN cDNA 0610008C08 gene /// hipotético LOC621156 /// proteína hipotética LOC631337 84,66 122,9 5,06803 7018 0 0,04428 571 82,2657
21617 Ywhab: tirosina 3 Proteína de ativação de monooxigenase/tri ptofano 5 monooxigenase, polipeptídeo beta 335,3 415,3 3,93503 1906 0 0,045 79,1967
12776 Gpsn2: glicoproteína, sináptica 2 174,9 137,5 4,59553 1107 0 0,04333 333 75,6419
38623 Rgs2: regulador 2 de sinalização de proteína G 265,8 134,4 3,96362 2853 0 0,04166 667 72,6641
14769 Ywhab: Proteína de ativação de tirosina 3-monooxigenase/ triptofano 5-monooxigenase, polipeptídeo beta 330,1 398,3 3,65492 1319 0 0,04333 333 69,7329
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
21642 Tax Ibp3 /// Rp113: Taxl (vírus de leucemia de célula T humana tipoI) proteína de ligação 3 /// proteína ribossomal L13 145,2 438,7 4,06038 5047 0 0,04166 667 68,3463
22387 BC018601: sequência de cDNA BC018601 209,6 269,5 4,01378 5582 0 0,04155 556 67,9884
28288 Zfp291: proteína dedo de zinco 291 50,48 51,43 7,60946 3431 0 0,03833 333 65,2239
15663 Ninjl: ninjurina 1 211,1 352,7 4,08039 2223 0 0,03712 121 60,0212
27398 Zarl: detenção do zigoto 1 73,34 105 5,40970 8024 0 0,0376 56,505
8065 Hsbp l: proteína de ligação 1 de fator de choque térmico 442,7 494,5 2,88043 3196 0,02222 2222 0,05311 111 42,8537
20436 Gltscr2: gene 2 de região de candidato a supressor de tumor de glioma 56,32 106 5,33464 8536 0,02272 7273 0,05416 667 42,8606
10123 Hspbl: proteína de choque térmico 1 70,72 133,1 4,05547 5996 0,02325 5814 0,05426 357 43,1189
32039 Myo5b: miosina Vb 398,8 209,8 3,01891 1206 0,02564 1026 0,05743 59 43,5021
19373 Mtap: metiltioadeno sina fosforilase 69,42 68,87 4,35277 1519 0,02631 5789 0,05877 193 43,6173
Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
15861 Ptk91: similar à proteína tirosina quinase 9 (proteína relacionada à A6) 201,2 238,1 6,87782 117 0,02702 7027 0,05387 387 45,4725
5039 Ywhab: Proteína de ativação de tirosina 3-monooxigenase/ triptofano 5-monooxigenase, polipeptídeo beta 344,8 534,8 2,25134 4699 0,02752 2936 0,05788 991 31,9962
7118 Zfp313: proteína dedo de zinco 313 238,4 243,2 3,91788 4751 0,02777 7778 0,05231 481 45,8903
27301 Chsyl: carboidrato (condroitina) sintase 1 2224 1985 1,87216 9743 0,02830 1887 0,05820 755 32,1594
23482 Wdr51b: domínio de repetição WD 51B 228,5 105,5 3,74236 511 0,02857 1429 0,05285 714 46,074
22475 Sept11: septina 11 123,4 131 2,89475 8327 0,02884 6154 0,05875 32,2155
16314 2700060E02 Rik: RIKEN cDNA 2700060E02 gene 552,1 918,6 2,30155 7302 0,02912 6214 0,05776 699 32,463
40450 Pfdn4: prefoldina 4 416,9 417 2,73824 1285 0,02941 1765 0,05294 118 46,429
3542 Rgs2: regulador 2 de sinalização de proteína G 389,5 287,4 2,89283 424 0,02941 1765 0,05622 549 37,2147
38514 Prkaca: proteína quinase, dependente de cAMP, catalítica, alfa 245,9 459,6 2,49354 0321 0,02941 1765 0,05826 797 32,4698
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
9746 Ptprj: proteína tirosina fosfatase, tipo receptor, J 36,02 100,1 4,00557 4741 0,02970 297 0,05877 888 32,499
21697 Zfp3I3: proteína dedo de zinco 313 2090 1793 2,15451 3004 0,02985 0746 0,05432 836 37,9163
19162 Gtf2b: fator de traanscrição geral 11B 572,2 544,4 2,42369 5714 0,03030 303 0,05479 798 37,9814
5038 Ywhab: Proteína de ativação de tirosina 3-monooxigenase/ triptofano 5-monooxigenase, polipeptídeo beta 409,7 250,6 2,89758 6852 0,03030 303 0,05875 421 32,6829
16058 Gm428 /// LOC623180 /// LOC623197 /// LOC623210 /// LOC623219: modelo de gene 428, (NCBI) /// hipotético LOC623180 /// hipotético LOC623197 /// hipotético LOC623210 /// hipotético LOC623219 1344 986,9 2,11885 2909 0,03092 7835 0,05945 017 32,7088
1904 Ube2a: enzima conjugadora de ubiquitina E2A, RAD6 homólogo (S.cerevisiae ) 371,1 379,5 2,95162 96 0,03125 0,05385 417 46,9047
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
1431 Srpk2: quinase 2 específica de proteína rica em serina/arginin a 423,3 728,8 2,35151 6006 0,03125 0,06 32,7117
Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
11264 2610510J17 Rik: gene RIKEN cDNA 2610510J17 296 462,7 3,13888 6637 0,03225 8065 0,05408 602 47,3645
16336 Uchl l: hidrolase L1 de carbóxiterminal de ubiquitina 772,9 910,7 2,39936 6965 0,03252 0325 0,06138 211 30,5168
16195 Bpgm: mutase 2,3bisfosfoglicer ato 450,4 441 2,78256 733 0,03278 6885 0,05584 699 38,5724
15069 2700060E02 Rik: gene RIKEN cDNA 2700060E02 853,4 876,6 2,18676 3905 0,03296 7033 0,05860 806 33,4602
1378 Sec61b: Sec61 subunidade beta 346,8 199,6 2,92922 4024 0,03305 7851 0,06101 928 30,716
277 Herpud2: membro 2 da família HERPUD 1099 877,4 2,11163 511 0,03333 3333 0,05918 519 33,4759
22096 Mm.69144.1 88,48 177,7 4,01968 4715 0,03370 7865 0,05745 318 33,9669
28335 Usp27x: peptidase específica de ubiquitina 27, cromossomo X 163,4 242,3 3,45949 1841 0,03389 8305 0,05638 418 39,0302
1111 Nek7: quinase 7 expressa relacionada a NIMA (nunca no gene a de mitose) 130 199,5 2,92491 1121 0,03389 8305 0,06098 87 30,8699
12221 Cpal: carbóxipeptid ase A1 505,1 743,8 2,35706 7674 0,03448 2759 0,06100 575 30,9745
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
10438 5830415L20 Rik: gene RIKEN cDNA 5830415L20 578,6 472,5 2,55071 8424 0,03488 3721 0,05922 481 33,9864
20740 Mm.27444.1 158 135,1 3,43726 8455 0,03508 7719 0,06 31,3576
6654 Hmgnl: grupo de alta mobilidade Domínio 1 de ligação nucleossoma l 2200 2526 1,76684 0536 0,03571 4286 0,06114 286 29,2973
2773 Lmol: domínio 1 L1M apenas 565,8 414,4 2,34501 2373 0,036 0,06098 667 30,4439
16848 Ube2a: enzima conjugadora de ubiquitina E2A, RAD6 homólogo (S.cerevisiae ) 435,7 385,5 2,52456 6112 0,03636 3636 0,05878 788 31,7403
28139 Mall: mal, similar à diferenciação de célula T 1 10,85 16,2069 8307 0,03703 7037 0,05843 621 34,7455
23084 2410127E18 Rik: gene RIKEN cDNA 2410127E18 171,6 168,7 2,89799 3299 0,03703 7037 0,06051 852 29,7435
42427 Mrgl: gene 1 relacionado ao sítio de integração viral ecotrópica mieloide 589,9 467,5 2,25556 9398 0,03703 7037 0,06310 185 25,4067
Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
34813 LOC627488 /// LOC627520 /// LOC667692 /// LOC667695 /// LOC673990: similar à subunidade 4 do 2591 2372 1,59119 9861 0,03720 9302 0,06322 481 25,4182
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
complexo THO (Tho4) (proteína 1 de ligação do fator de exportação e RNA 1) (REF1-I) (Ally de AML1 e LEF-1) (Aly/REF) /// similar à subunidade 4 do complexo THO (Tho4) (proteína 1 de ligação do fator de exportação e RNA) (REFII) (Ally de AML. 1 e LEF-1) (Aly/REF) /// similar à subunidade 4 do complexo THO (Tho4) (proteína 1 de ligação do fator de exportação e RNA) (REF1I) (Ally de AML-1 e LEF-1) (Aly/REF) /// similar à subunidade 4 do complexo THO (Tho4) (proteína 1 de ligação do fator de exportação e RNA) (REFI I) (Ally de AML-1 e LEF-1) (Aly/REF) /// similar à subunidade
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
4 do complexo THO (Tho4) (proteína 1 de ligação do fator de exportação e RNA) (REF1I) (Ally de AML 1 e LEF-1) (Aly/REF)
14324 2700060E02 Rik: gene RIKEN cDNA 2700060E02 850,4 807,8 2,13099 0215 0,03731 3433 0,06074 627 29,8051
5988 Ak311: similar a adenilato quinase 3 alfa 322,9 400,3 2,12847 5753 0,03738 3178 0,06331 776 25,4548
1245 Tnfaip8: fator de necrose do tumor, proteína 8 alfa-induzida 188 131 2,68804 8113 0,03755 8685 0,06306 729 25,4969
29349 Srrm2: matriz 2 repetitiva de serina/arginin a 54,04 95,17 3,35856 0971 0,03787 8788 0,06050 505 30,0013
18213 Gnas: GNAS (proteína de ligação de nucleotídeo de guanina, alfa estimulador) lócus complexo 595 414,5 2,35928 8924 0,03816 7939 0,06091 603 30,0133
12033 Zfp313: proteína 313 com dedo de zinco 1577 1289 2,53259 9515 0,03846 1538 0,04858 974 51,0983
27637 Nr2e1: subfamília do receptor nuclear 2, grupo E, membro 1 478,6 491,6 2,75083 4556 0,03846 1538 0,05570 513 40,7351
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
2211 Fxcl: transcrição 1 com calo fraturado expresso 90,27 179,1 5,14610 3896 0,03846 1538 0,05816 239 35,2462
23218 5730405I09 Rik: gene RIKEN cDNA 5730405I09 491,1 601,7 2,07934 3049 0,03883 4951 0,06271 845 25,8477
9918 Nobox: NOBOX oogênese homeobox 98,82 245,1 2,58016 8012 0,03902 439 0,06252 033 25,9252
Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
27981 1110003E01 Rik: gene RIKEN cDNA 1110003E01 373,4 222,4 2,33107 3921 0,03921 5686 0,06091 503 28,4683
23766 4930431B09 Rik: gene RIKEN cDNA 4930431B09 182,5 246,5 2,87044 6163 0,03968 254 0,06134 921 30,3043
2222 Ddx19a: DEAD (AspGlu-Ala-Asp) polipeptídeo box 19a 501,6 556,5 2,31192 3278 0,03977 2727 0,06242 424 27,0664
9267 BC004728:s equência de cDNA BC004728 1805 2091 1,80671 016 0,03980 0995 0,06303 483 25,9867
11008 Sec24b: SEC24 família de gene relacionada, membro B (S. cerevisiae) 103,5 197,2 3,89608 5448 0,04 0,05686 667 41,2419
20332 2610510J17 Rik: gene RIKEN cDNA 2610510J17 305,2 492,6 2,46450 4236 0,04 0,06155 556 28,6135
1259 Eefsec: fator de alongamento eucariótico, selenocisteín a-tRNA específico 30,53 65,01 6,68836 7816 0,04 0,06203 81 27,1963
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 317/373
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
17879 Ehd4:domíni o EH contendo 4 856,2 476,6 2,06100 183 0,04 0,06296 667 26,0088
7236 Snx9: classificação de nexina 9 1452 1343 1,97297 5541 0,04026 8456 0,06093 96 28,7304
19870 Ggtal: glicoproteína galactosiltran sferase alfa 1,3 1003 500,2 1,98237 2856 0,04040 404 0,06301 347 26,0912
4975 Ywhag: proteína de ativação 3monooxigena se/triptofano 5monooxigena se, polipeptídeo gama 780,6 1140 2,28753 1271 0,04054 0541 0,05783 784 35,922
3840 Atp6vIcl: ATPase, transporte de H+, subunidade VI lisossomal C1 1096 751,8 2,20090 7908 0,04054 0541 0,06130 631 28,7411
1499 Kdelr2: KDEL (LysAsp-Glu Leu) receptor de retenção de proteína do retículo endoplasmáti co 2 898,4 565,5 2,24060 9193 0,04054 0541 0,06310 811 25,1968
19039 Csda: proteína A do domínio de choque a frio 1407 1167 1,87766 3438 0,04072 3982 0,06321 267 25,2231
9095 Dnahc8: dineína, axonemal, cadeia pesada 8 152,8 74,6 4,16900 7541 0,04081 6327 0,05401 361 41,8892
4403 Gadd45b: Parada de crescimento e 45 beta induzível por lesão do DNA 453,8 881,7 2,91008 774 0,04081 6327 0,06136 054 28,7836
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 318/373
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
23361 Fbxo28: proteína Fbox 28 213,5 344,9 2,97440 6646 0,04109 589 0,05616 438 36,4751
6486 G6pd2 /// G6pdx: glucose-6 fosfato dehidrogenase 2 /// glucose-6fosfato dehidrogenase X-ligada 646,1 587,9 2,40486 6938 0,04123 7113 0,06348 797 26,2283
22429 Gorasp2: proteína de empilhament o de reagrupamen to de golgi 420,2 553,7 2,17777 3618 0,04147 4654 0,06319 508 25,3481
6921 Kif17: membro 17 da família da quinesina 356,1 394 2,13242 0979 0,04166 6667 0,06336 806 26,3333
13584 Dcpla: enzima de desoperculaç ão 438,6 473,5 2,02145 4389 0,04188 4817 0,06356 021 26,3363
4967 Ncoa4 /// LOC627557: coativador do receptor nuclear 4 /// similar ao coativador do receptor nuclear 4 517,1 318,5 2,67981 7891 0,04191 6168 0,06257 485 27,4886
14382 Pcid2: domínio contendo 2 PC1 18,14 57,28 4,85129 973 0,04242 4242 0,06303 03 27,5603
9970 Csrp I: proteína 1 rica em cisteína e glicina 186,2 282,4 2,54908 518 0,04247 1042 0,06593 308 23,6583
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 319/373
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
9611 Ptprj /// AW125753: proteína tirosina fosfatase, receptor tipo, J /// sequência expressa AW125753 146,2 102,3 3,86136 6512 0,04255 3191 0,06425 532 24,6082
12280 2610528K11 Rik: gene RIKEN cDNA 2610528K11 362,4 372,6 2,25413 9704 0,04268 2927 0,06313 008 27,6
14887 Tmem109: proteína de transmembra na 109 365 381,9 2,15840 1859 0,04278 0749 0,06417 112 26,423
8101 Cam1c2g: proteína cálcio/calmo dulina dependente quinase II gama 109,2 105,9 3,04563 095 0,04280 1556 0,06582 361 23,7561
22457 Sepwl: selenoproteí na W, músculo 1 1618 3062 1,80505 0019 0,04296 875 0,06595 052 23,7661
15377 Tm2d2: domínio TM2 contendo 2 314,2 225,9 2,55366 2885 0,04313 7255 0,06618 301 23,7726
13610 Pnrcl: coativador 1 do receptor nuclear rico em prolina 1267 1272 1,94151 63 0,04320 9877 0,06333 333 27,6831
22912 Calcocol: ligação de cálcio e domínio coiled coil 1 154,3 163,4 2,63250 9534 0,04324 3243 0,06372 973 26,5901
Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
7409 Tgfb2: fator de crescimento de transformaçã o, beta 2 491,8 663,4 2,09223 397 0,04330 7087 0,06572 178 23,8689
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 320/373
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
38991 Ttll 1I: família similar a tubulina tirosina ligase, membro 11 375,5 152,5 2,81988 7748 0,04347 8261 0,06396 739 26,5994
21361 Slc25a4: family 25 do carreador soluto (mitocôndria] carreador, translocador de nucleotídeo de adenina), membro 4 188,6 100,2 2,48619 3413 0,04347 8261 0,06514 493 24,6327
21528 Cnn3: calponina 3, acidífero 351,3 267 2,51816 3806 0,04375 0,06258 333 27,9931
15242 Pofut2: proteína Ofucosiltransfe rase 2 875,2 1214 1,95577 5711 0,04382 4701 0,06494 024 24,0113
23699 Cd16412: D164 similar a sialomucina 2 143,4 130 3,60062 4431 0,04385 9649 0,06480 994 24,7437
37480 4930562C15 Rik: gene RIKEN cDNA 4930562C15 111,8 47,11 3,86896 8805 0,04395 6044 0,06379 121 26,6715
16487 Wfs 1: síndrome de Wolfram 1 homólogo (humano) 201 172,7 2,85165 8705 0,044 0,06509 333 24,0215
20014 Arrb2: arrestina, beta 2 126,2 149,4 2,81397 5283 0,04405 2863 0,06437 592 24,8594
33055 2700050L05 Rik: gene RIKEN cDNA 2700050L05 177,9 178,4 3,01217 6811 0,04436 8601 0,06796 359 22,5402
408 Fkbp8: FK506 proteína de ligação 8 136,4 185,6 2,79163 8014 0,04444 4444 0,06953 439 21,8165
39254 8430429K09 Rik: gene RIKEN cDNA 8430429K09 103,1 239,1 2,79127 8738 0,04453 4413 0,06560 054 24,0684
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
159 Bpgm: mutase 2,3bisfosfoglicer ato 2053 2563 1,79827 2305 0,04458 5987 0,06307 856 28,0958
1105 Meal: antígeno 1 aumentado masculino 331,2 365 2,29177 9211 0,04458 5987 0,06952 229 21,8514
38903 2600010E01 Rik: gene RIKEN cDNA 2600010E01 102,2 59,89 4,17581 1813 0,04464 2857 0,06444 94 24,9266
15195 Tm2d2: domínio TM2 contendo 2 286,3 252,4 2,47903 6756 0,04467 354 0,06837 342 22,5493
21185 D1 OWsu I 02e: segmento de DNA, Chr 10, Wayne State University 102, expresso 1712 1577 1,71123 3117 0,04472 8435 0,06915 868 21,9226
4343 2410022L05 Rik: gene RIKEN cDNA 2410022L05 1067 383,1 1,99568 5441 0,04489 7959 0,06537 415 24,1286
12245 Dnmll: similar a dinamina 1 214,8 288 2,41978 8054 0,04498 2699 0,06837 37 22,606
Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
109 Atp6vIb2: ATPase, H+ transporte, lisossomal V1 subunidade B2 654,4 600,1 1,90834 7679 0,04501 6077 0,06946 409 21,9365
41382 9230115E21 Rik: gene RIKEN cDNA 9230115E21 866,2 989,2 1,82235 3437 0,04508 1967 0,06556 011 24,1432
1430 Srpk2: proteína específica quinase 2 rica em serinalarginin a 875,2 960,9 2,01961 2501 0,04516 129 0,06172 043 28,271
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
16430 G6pdx: glucose-6fosfato dehidrogenase X-ligada 963,3 1065 2,02594 4759 0,04516 129 0,06891 398 22,0228
2300 Sdhb: complexo sucinato dehidrogenase, subunidade B, enxofre ferroso (1p) 316,8 160 2,88333 4535 0,04526 749 0,06577 503 24,1473
6223 Zbtb20: dedo de zinco e domínio BTB contendo 20 2,83 47,12 7,43028 6357 0,04529 6167 0,06822 3 22,6625
13279 Dcpla: enzima de desoperculaç ão 207,5 303,8 2,86696 4391 0,04530 7443 0,06872 708 22,0548
9363 Ddx19a /// Ddx19b: DEAD (Asp Glu-Ala-Asp) polipeptídeo box 19a /// DEAD (Asp-GluAla-Asp) polipeptídeo box 19b 1007 1065 1,95690 3393 0,04545 4545 0,06739 899 23,3704
10998 Pold3: polimerase (DNA direcionado), delta 3, subunidade suplementar 1059 901,8 1,76458 1113 0,04561 4035 0,06817 544 22,7446
18210 Lnk: ligante de vias do receptor de células T 51,82 156,5 3,26766 6463 0,04564 3154 0,06517 289 24,3452
21746 Tmem109: proteína de transmembra na 109 272,9 273,3 2,18384 5573 0,04577 4648 0,06800 469 22,7842
16900 Ube2j1: enzima conjugadora de ubiquitina E2, J1 359 345,7 2,45782 7565 0,04583 3333 0,06501 389 24,4002
14774 Surf4: gene 4 em excesso 1066 1054 1,82922 382 0,04620 462 0,06922 992 22,1641
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
6591 Dbi: inibidor de ligação de diazepam 687,8 749,4 1,86743 5173 0,04626 3345 0,06779 359 22,8636
916 LIg11: homólogo de larva gigante letal 1 (Drosophila) 632,3 506,2 1,97334 894 0,04635 7616 0,06939 294 22,1803
14725 Aldh9al: aldeído dehidrogenase 9, subfamília A1 1014 1062 1,85725 0556 0,04641 3502 0,06531 646 24,4636
Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
22776 Abhd13: domínio abhidrolase contendo 13 658,9 939,6 1,87904 9135 0,04643 9628 0,07084 623 21,5641
8799 Arl8a: similar ao fator de ADPribosilação 8A 202,3 138,2 2,44484 4075 0,04651 1628 0,07179 264 20,9911
4729 Tcllb3: leucemia/linf oma de célula T 1B, 3 3084 2462 1,58271 5554 0,04658 3851 0,07066 253 21,5931
8719 Pstpipl: proteína 1 de interação com prolinaserinatreonina fosfatase 12,49 10,27 6,81404 4481 0,04666 6667 0,06931 111 22,2252
5059 Rab18: RAB18, família do oncogene do membro RAS 1044 764,4 1,73562 2591 0,04678 3626 0,07201 754 21,015
11799 Runxlt 1: fator de transcrição 1 relacionado ao subdesenvol vimento; translocado para, 1 (relacionado à ciclina D) 333,9 281,5 2,22401 6573 0,04687 5 0,07081 25 21,6373
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
3543 Rgs2: regulador de sinalizador de Gproteína 2 392,9 290,8 2,43517 8026 0,04697 9866 0,06951 902 22,2513
11937 Defb8: defensina beta 8 79,85 82 3,77433 1115 0,04705 8824 0,07221 569 21,0551
22002 Anapc5: subunidade 5 do complexo que promove anafase 645,4 1044 1,93684 1774 0,04710 1449 0,06777 778 22,9611
270 Carhspl: proteína I estável ao calor, regulada por cálcio 461,3 410,2 2,41938 4517 0,04713 8047 0,06959 596 22,2624
11459 Lhx8: LIM homeobox proteína 8 373,5 302,8 2,30373 1001 0,04716 9811 0,07059 748 21,6799
34771 2700050L05 Rik: gene RIKEN cDNA 2700050L05 28,26 5,59 8,82214 0692 0,04724 4094 0,07404 199 20,0479
412 Orc31: complexo de reconhecime nto de origem, similar a subunidade (S.cerevisiae ) 144,3 323,5 2,69468 3525 0,04727 2727 0,06761 212 22,9795
8298 Rapla: proteína-la relacionada a RAS 726,5 676,4 1,88475 7581 0,04733 7278 0,07157 791 21,187
18549 H110: H1 família da histona, membro 0 405,5 425,7 2,10301 8928 0,04790 4192 0,07058 882 21,3322
29960 LOC433810: similar à proteína de transmembra na SHREW1 240,7 301,5 2,12007 0873 0,048 0,07283 556 20,2788
2778 Ggtal: glicoproteína galactosiltran sferase alfa 1,3 175,6 342,7 2,36997 6637 0,04804 8048 0,07064 064 21,3411
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
23726 1700010D01 Rik /// MGC118250: gene RIKEN cDNA 1700010D01 /// proteína LOC76386 similar ao hipotético 321 246,2 2,31955 6713 0,04825 7373 0,07303 843 20,3038
12425 Zcchc3: dedo de zinco, domínio CCHC contendo 3 148,4 244,5 2,47679 5886 0,04833 8369 0,07095 67 21,3504
10133 Tritn25: proteína 25 de motivo tripartite 229,3 207,6 2,21282 094 0,04848 4848 0,07115 152 21,3508
8706 Car10: anidrase carbônica 10 21,12 7,68 8,98089 725 0,04850 7463 0,06752 488 23,2315
7747 Arpc4: complexo de 2/3 de proteína relacionada à actina, subunidade 4 574,3 530,5 1,95049 6372 0,04859 335 0,07530 264 19,7699
39091 Chesl: supressor de ponto de controle 1 288,8 218,2 2,22367 1686 0,04868 9139 0,06775 281 23,2316
1396 Hspa2: proteína 2 de choque ao calor 1010 758,9 1,74679 4118 0,04871 7949 0,07525 641 19,7915
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
43852 L00545637 /// LOC623272 /// LOC623281 /// LOC636750 /// LOC667780: hipotético L00545637 /// hipotético LOC623272 /// hipotético LOC623281 /// proteína LOC636750 hipotética /// proteína LOC667780 hipotética 2908 2108 1,61184 5948 0,04878 0488 0,07348 69 20,3393
1723 Gng3: proteína de ligação ao nucleotídeo de guanina (proteína G), gama 3 subunidade 482,2 588,5 2,38534 9318 0,04887 218 0,06753 133 23,2874
8545 Reep2: proteína suplementar receptora 2 510,5 544,4 2,22313 9853 0,04892 9664 0,07108 053 21,4329
26935 Bandl: homologia adjacente de bromo contendo domínio 1 244,1 139,5 2,59856 7276 0,04896 9072 0,07519 759 19,8532
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Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
927 Mod 1 /// LOC624892 /// LOC677317: enzima málica, sobrenadant e /// similar à enzima málica NADP dependente (NADP ME) (enzima málica 1) /// similar à enzima málica NADPdependente (NADP-ME) (enzima málica 1) 372,6 349,5 2,03156 5455 0,04918 0328 0,07290 528 20,4366
38626 Mfap2: proteína 2 associada a microfibrilar 70,93 137 3,08956 8568 0,04923 0769 0,07111 795 21,4898
33836 Lócus transcrito 8,36 30,26 6,32925 6151 0,04947 9167 0,07406 25 20,0011
13825 Plekhcl: homologia de pleckstrina contendo domínio, família C (com domínio FERM) membro 1 457 620,7 1,86135 7091 0,04958 6777 0,07290 174 20,4943
20764 Txn2: tioredoxina 2 145,6 295,8 2,60932 9521 0,04986 1496 0,07281 625 20,5416
Tabela 9B
Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
3646 0610007P06 Rik: gene RIKEN cDNA 0610007P06 53,21 84,8 297,2 251,3 275,8 304,2 515,3
4498 0610016J10R ik: gene RIKEN cDNA 0610016J10 4,86 1,17 7,33 143,31 63,22 201 78,49
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Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
21983 1110005A23 Rik /// LOC625193 /// LOC636633: gene RIKEN cDNA 1110005A23 /// similar à proteína 29 kDa induzida por citocina /// similar à proteína 29 kDa induzida por citocina 278,64 96,47 238,75 422,57 521,2 543,6 778,6
38875 1110008B24 Rik: gene RIKEN cDNA 1110008B24 377,94 192,85 622,98 908,37 546 872,1 1024
14747 1110014K08 Rik /// LOC664786 /// LOC664849 /// LOC669054 /// LOC672175: gene RIKEN cDNA 1110014K08 /// proteína hipotética LOC664786 /// proteína hipotética LOC664849 /// proteína hipotética LOC669054 /// proteína hipotética LOC672175 181,23 248,59 247,67 383,41 393,2 537,9 753,6
40498 1110034A24 Rik: gene RIKEN cDNA 1110034A24 43,95 64,41 50,95 319,84 238,2 282,2 220,5
23309 1600002K03 Rik: gene RIKEN cDNA 1600002K03 107 59,9 245,28 683,77 429,6 346,8 750
41245 2010107H07 Rik: gene RIKEN cDNA 2010107H07 194,12 113,48 300,45 660,66 354,7 360,5 650,7
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Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
12325 2310036O22 Rik: gene RIKEN cDNA 2310036O22 355,44 333,42 817,17 1346,9 1034 1085 1228
16489 2410016O06 Rik: gene RIKEN cDNA 2410016O06 569,29 93,03 367,09 890,36 502,3 860,5 1001
Tabela 9B - continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
3646 0610007P06Ri k: gene RIKEN cDNA 0610007P06 489,89 705,11 0,34247 6048 0,04973 822 0,07412 74 20,028
4498 0610016J10Rik : gene RIKEN cDNA 0610016J10 177,41 3,9 0,04004 136 0,04210 5263 0,06375 439 26,372
21983 1110005A23Ri k /// LOC625193 /// LOC636633: gene RIKEN cDNA 1110005A23 /// similar à proteína 29 kDa induzida por citocina /// similar à proteína 29 kDa induzida por citocina 488,14 494,19 0,37795 5374 0,04863 2219 0,07113 475 21,376
38875 1110008B24Ri k: gene RIKEN cDNA 1110008B24 1117,8 1343 0,41087 267 0,04430 3797 0,06272 152 28,081
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Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
14747 1110014K08RÍ k /// LOC664786 /// LOC664849 /// LOC669054 /// LOC672175: gene RIKEN cDNA 1110014K08 /// proteína hipotética LOC664786 /// proteína hipotética LOC664849 /// proteína hipotética LOC669054 /// proteína hipotética LOC672175 769,32 870,69 0,36541 4799 0,04166 6667 0,06175 926 28,886
40498 1110034A24Ri k: gene RIKEN cDNA 1110034A24 188,83 248,29 0,21271 1129 0,03496 5035 0,06109 557 29,101
23309 1600002K03Ri k: gene RIKEN cDNA 1600002K03 281,7 595,32 0,26702 3406 0,03333 3333 0,05611 111 38,745
41245 2010107H07Ri k: gene RIKEN cDNA 2010107H07 483,92 1044,3 0,34211 1408 0,04081 6327 0,06326 531 26,148
12325 2310036O22Ri k: gene RIKEN cDNA 2310036O22 1278,2 1731 0,39102 1738 0,03947 3684 0,05811 404 35,678
16489 2410016O06Ri k: gene RIKEN cDNA 2410016O06 906,94 1398,2 0,37035 4647 0,03571 4286 0,05976 19 31,466
Coluna Gene CycA2.1 CycA2.2 CycA2.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
15550 2510039O18Rik: gene RIKEN cDNA 2510039O18 530,8 99,11 420,85 1242,7 731,2 1077 660,7
19105 2510039O18Rik: gene RIKEN cDNA 2510039O18 89,8 83,01 199,83 321,54 214,7 216,7 401,7
35340 2600011C06Rik: gene RIKEN cDNA 2600011C06 1515,45 1353,66 1480,64 2833,1 2792 2941 2356
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Coluna Gene CycA2.1 CycA2.2 CycA2.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
2216 2610029G23Rik: gene RIKEN cDNA 2610029G23 572,06 520,64 750,01 1471 1141 1097 1730
12846 2810409H07Rik: gene RIKEN cDNA 2810409H07 86,52 29,18 100,39 480,67 270 281,7 245,2
8238 2900073H19Rik: gene RIKEN cDNA 2900073H19 211,83 95,11 192,63 574,46 220,6 424,2 345,1
13588 3 dias timo neonato cDNA, RIKEN biblioteca enriquecida de comprimento total, clone: produto A630012F14: inclassificável, sequência de inserção total 573,65 184,37 288,58 996,46 770,8 953,6 685,9
36328 3110050K21Rik: gene RIKEN cDNA 3110050K21 311,28 401,01 530,93 1030,8 761,4 1078 1333
24498 3110050K21Rik: gene RIKEN cDNA 3110050K21 451,12 293,97 202,68 849,56 599,4 547,7 1108
23071 3300001M20Rik: gene RIKEN cDNA 3300001M20 108,79 169,76 262,21 708,72 562,7 499,2 858,2
32215 4833426J09Rik: gene RIKEN cDNA 4833426J09 101,24 83,15 123,05 403,04 266,8 290,7 664,6
41050 4930427A07Rik: gene RIKEN cDNA 4930427A07 154,04 258,9 438 462,21 493,2 756,3 822,2
24760 4933402C05Rik: gene RIKEN cDNA 4933402C05 184,74 248,77 343,55 582,5 656,4 516,2 821
23146 4933417E01Rik: gene RIKEN cDNA 4933417E01 1233,06 595,65 1580,61 2342,5 1726 1965 2560
23294 4933440H19Rik: gene RIKEN cDNA 4933440H19 222,08 110,71 164,48 490,16 293,1 477,2 332,2
23653 5730406M06Rik: gene RIKEN cDNA 5730406M06 175,07 173,9 279,19 681,23 606,5 632,7 617
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR interme diário FDR médio T
15550 2510039O18Rik: gene RIKEN cDNA 2510039O18 895,16 784,09 0,38979 1149 0,04419 8895 0,06355 433 26,759
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 332/373
327/357
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR interme diário FDR médio T
19105 2510039O18Rik: gene RIKEN cDNA 2510039O18 481,55 470,2 0,35383 0377 0,04945 0549 0,07271 978 20,494
35340 2600011C06Rik: gene RIKEN cDNA 2600011C06 2682,9 2361,5 0,54486 0232 0,04117 6471 0,06201 961 27,458
2216 2610029G23Rik: gene RIKEN cDNA 2610029G23 1327,7 1092 0,46894 679 0,04693 1408 0,06761 733 22,954
12846 2810409H07Rik: gene RIKEN cDNA 2810409H07 142,85 326,22 0,24744 0742 0,04255 3191 0,06436 17 26,376
8238 2900073H19Rik: gene RIKEN cDNA 2900073H19 612,16 561,13 0,36496 265 0,04444 4444 0,06426 667 24,924
13588 3 dias timo neonato cDNA, RIKEN biblioteca enriquecida de comprimento total, clone: produto A630012F14: inclassificável, sequência de inserção total 734,41 780,12 0,42534 5141 0,04575 1634 0,06929 194 22,066
36328 3110050K21Rik: gene RIKEN cDNA 3110050K21 1029,5 1510,5 0,36874 5523 0,03614 4578 0,05738 956 34,695
24498 3110050K21Rik: gene RIKEN cDNA 3110050K21 684,07 839,07 0,40956 8423 0,04310 3448 0,06469 828 24,629
23071 3300001M20Rik: gene RIKEN cDNA 3300001M20 902,18 429,21 0,27309 456 0,02173 913 0,05210 145 42,838
32215 4833426J09Rik: gene RIKEN cDNA 4833426J09 325,8 820,34 0,22187 4211 0,03 0,05903 333 32,544
41050 4930427A07Rik: gene RIKEN cDNA 4930427A07 1212,3 977,74 0,36026 859 0,03603 6036 0,05921 922 31,601
24760 4933402C05Rik: gene RIKEN cDNA 4933402C05 823,62 1015 0,35202 6602 0,03157 8947 0,06042 105 32,742
23146 4933417E01Rik: gene RIKEN cDNA 4933417E01 2606,8 2682,4 0,49116 8017 0,03571 4286 0,05678 571 34,675
23294 4933440H19Rik: gene RIKEN cDNA 4933440H19 512,35 433,13 0,39183 8118 0,04907 9755 0,07127 812 21,435
23653 5730406M06Rik: gene RIKEN cDNA 5730406M06 514,97 512,55 0,35240 2939 0,03759 3985 0,06057 644 29,915
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 333/373
328/357
Coluna Gene CycA2.1 CycA2.2 CycA2.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
39158 5730406M06Rik: gene RIKEN cDNA 5730406M06 475,1 352,64 504,28 956,32 865,2 1126 938
27731 5730406M06Rik: gene RIKEN cDNA 5730406M06 984,39 305,06 745,9 1521,6 1377 1419 1035
27732 5730406M06Rik: gene RIKEN cDNA 5730406M06 964,44 283,46 700,66 1444 1271 1385 996,7
40394 A230097K15Rik: gene RIKEN cDNA A230097K15 739,64 322,54 497,24 1135,4 943,8 714,8 1148
40844 A530082C11Rik: gene RIKEN cDNA A530082C11 132,33 27,77 268,5 459,34 222,7 476,5 456,7
13848 AA408556: sequência expressa AA408556 171,39 60,02 172,24 295,85 310,4 422 454,9
44961 AA591059: sequência expressa AA591059 56,29 33,55 46,52 130,59 70,28 207,6 294
20263 Abcf1: cassete de ligação a ATP, subfamília F (GCN20), membro 1 1565,6 1512,55 1825,57 2799,7 2379 2882 3477
3399 Abhd6: domínio abhidrolase contendo 6 74 36,87 87,35 553,9 326,9 296,3 593,6
3398 Abhd6: domínio abhidrolase contendo 6 209,56 278,43 237,36 422,75 380,6 691,3 684,8
7228 Adnp: proteína neuroprotetora dependente de atividade 290,38 98,62 340,91 806,44 487,2 695,5 665,1
28853 AI449441: sequência expressa AI449441 152,43 274,6 83,3 549,74 575 368,8 540,3
43126 AI53587: sequência expressa AI553587 45,94 59,16 164,25 440,23 390,5 659,3 420,5
27478 Alkbh I: alkB, homólogo 1 de reparo de alquilação (E. coli) 367,13 252,58 364,88 684,73 472,2 782,4 1187
41185 Ankrdll: domínio de repetição de anquirina 11 194,44 140,3 145,55 605,72 556,5 490,1 635,8
continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
39158 5730406M06Rik: gene RIKEN cDNA 5730406M06 1078,7 754,09 0,46591 231 0,04731 8612 0,07053 628 21,709
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 334/373
329/357
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
27731 5730406M06Rik: gene RIKEN cDNA 5730406M06 1357,1 1056,2 0,52417 2156 0,04819 2771 0,07079 317 21,344
27732 5730406M06Rik: gene RIKEN cDNA 5730406M06 1324 1014,8 0,52414 32 0,04931 5068 0,07291 324 20,452
40394 A230097K15Rik: gene RIKEN cDNA A230097K15 1095,1 1136,2 0,50524 631 0,04487 1795 0,06926 282 21,935
40844 A530082C11Rik: gene RIKEN cDNA A530082C11 365,07 541,49 0,33992 6717 0,04444 4444 0,06285 185 26,878
13848 AA408556: sequência expressa AA408556 383,23 796,93 0,30311 9051 0,04484 3049 0,06391 629 25,047
44961 AA591059: sequência expressa AA591059 193,18 298,12 0,22846 2286 0,04406 7797 0,06924 294 22,352
20263 Abcf1: cassete de ligação a ATP, sub-família F (GCN20), membro 1 3087,8 3006,5 0,55624 1255 0,03846 1538 0,06267 628 25,741
3399 Abhd6: domínio abhidrolase contendo 6 167,18 618,84 0,15505 865 0 0,04020 833 66,025
3398 Abhd6: domínio abhidrolase contendo 6 889,36 650,71 0,39001 5055 0,04022 9885 0,06212 644 27,231
7228 Adnp: proteína neuroprotetora dependente de atividade 564,28 782,06 0,36490 2089 0,03676 4706 0,06019 608 29,716
28853 AI449441: sequência expressa AI449441 415,64 365,12 0,36262 9281 0,04417 6707 0,06532 798 24,024
43126 AI53587: sequência expressa AI553587 199,69 203,51 0,23281 9462 0,03508 7719 0,05421 053 39,797
27478 Alkbh I: alkB, homólogo 1 de reparo de alquilação (E. coli) 1539,4 783,2 0,36136 6497 0,03940 8867 0,06277 504 25,948
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 335/373
330/357
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
41185 Ankrdll: domínio de repetição de anquirina 11 558,13 541,28 0,28356 7726 0,03076 9231 0,05533 333 38,133
Colun a Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
17472 Aoc3: amina oxidase, cobre contendo 3 14,01 4,63 37,83 85,43 273,7 193,8 107,3
20486 Aspm: similar a asp (fuso anormal), associado a microcefalia (Drosophila) 199,52 137,22 144,24 521,87 545,1 411,5 527,3
43330 Aspm: similar a asp (fuso anormal), associado a microcefalia (Drosophila) 158,72 62,35 100,75 406,86 421 369,4 451,4
32443 Aspm: similar a asp (fuso anormal), associado a microcefalia (Drosophila) 292,51 187,37 247,14 625,22 519 571,3 712,9
30016 Atrx: Alfa talassemia/síndro me de retardamento mental, homólogo X ligado (humano) 120,99 183,34 102,72 558,59 325,4 576,4 338,6
15284 AU040096: sequência expressa AU040096 1327,1 7 938,18 1971,1 8 2586,3 2194 3020 2743
8675 B230354K17Rik: gene RIKEN cDNA B230354K17 814,67 430,9 611,56 2576,3 1356 1879 1426
15916 Bachl: BTB e homologia CNC 1 214,4 51,49 267,98 509,03 500,7 370,9 552,1
8637 Bbs2: síndrome de Bardet-Biedl 2 homólogo (humano) 118,85 61,19 192,91 337,79 236,5 247,6 500,4
8704 BC003965: sequência de cDNA BC003965 318,96 314,61 589,74 1242,2 913,8 906,8 1067
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 336/373
331/357
Colun a Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
31179 BF642829: sequência expressa BF642829 55,1 17,77 90,7 564,5 292 569,6 720
1110 Bub3: brotamento não inibido por benzimidazois 3 homólogo (S. cerevisiae) 163,69 146,39 195,19 499,57 444,3 468,1 309,1
18450 Bxdcl: domínio brix contendo 1 521,77 121,43 552,63 1496,2 1127 1048 945,5
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
17472 Aoc3: amina oxidase, cobre contendo 3 107,65 335,47 0,10235 9136 0,03906 25 0,06083 333 30,258
20486 Aspm: similar a asp (fuso anormal), associado a microcefalia (Drosophila) 557,97 436,97 0,32057 96 0,02777 7778 0,05836 42 32,011
43330 Aspm: similar a asp (fuso anormal), associado a microcefalia (Drosophila) 451,4 443,97 0,25299 8172 0,03174 6032 0,05629 63 38,255
32443 Aspm: similar a asp (fuso anormal), associado a microcefalia (Drosophila) 561,32 557,81 0,40986 4669 0,04787 234 0,07400 709 20,159
30016 Atrx: Alfa talassemia/síndro me de retardamento mental, homólogo X ligado (humano) 384,09 383,86 0,31714 5573 0,04814 8148 0,06746 914 23,163
15284 AU040096: sequência expressa AU040096 2441,9 2607,7 0,54338 4867 0,03791 4692 0,06336 493 25,536
8675 B230354K17Rik: gene RIKEN cDNA B230354K17 1638,7 1475,3 0,35886 0153 0,025 0,05741 667 43,36
15916 Bachl: BTB e homologia CNC 1 427,69 703,89 0,34845 4093 0,03864 7343 0,06276 973 25,755
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 337/373
332/357
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
8637 Bbs2: síndrome de Bardet-Biedl 2 homólogo (humano) 586,34 389,87 0,32452 3048 0,04560 2606 0,06908 795 22,06
8704 BC003965: sequência de cDNA BC003965 675,98 1003,8 0,42113 0361 0,04469 2737 0,06277 467 26,933
31179 BF642829: sequência expressa BF642829 231,69 348,62 0,11998 973 0 0,04888 889 85,429
1110 Bub3: brotamento não inibido por benzimidazois 3 homólogo (S. cerevisiae) 361,39 554,54 0,38322 3042 0,04672 8972 0,07061 267 21,629
18450 Bxdcl: domínio brix contendo 1 776,39 1481,2 0,34791 6279 0,03448 2759 0,05551 724 39,356
Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
10968 C430004E15Rik: gene RIKEN cDNA C430004E15 125,61 72,26 122,92 346,64 170,9 293,1 500,2
27736 C730049O14Rik: gene RIKEN cDNA C730049O14 279,36 161,54 258,16 854,88 650,6 580,3 733,7
34773 Ccdc66: domínio coiled-coil contendo 66 152,66 109,96 220,57 681,69 370,3 538,1 732,9
29123 Cdca2: ciclo de divisão celular associado 2 209,02 187,77 269,92 719 518,5 653 696,5
41131 Cdca2: ciclo de divisão celular associado 2 160,58 179,33 233,01 408,1 505,8 456,6 590,4
8311 CDNA clone IMAGE:30031514 1064,6 1 532,91 1115,1 2 1802,7 1683 1977 2026
4656 Cebpz: CCAAT/realçador proteína de ligação zeta 801,7 466,96 1043,2 1 2020,2 1604 1859 1691
15723 Cenpe: proteína E do centrômero 595,49 593,11 496,28 1062,6 840,4 1210 1571
39617 Ckap21: similar à proteína associado ao citosqueleto 2 98,96 178,8 150,55 296,31 387,8 321,9 430,7
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 338/373
333/357
Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
16339 Cndp2: CNDP dipeptidase 2 (família M20 da metalopeptidase) 95,72 12,15 118,99 542,76 229,1 165,6 151
13932 Cox17: citocromo c oxidase, subunidade XVII homólogo de proteína de agrupamento (levedura) 609,8 99,15 883,83 1560,4 816 1231 757,9
1878 CrIzl: zíper de leucina rico em aminoácido carregado 1 547,14 492,43 937,54 1867,1 1324 1690 1664
677 Ctsc: catepsina C 560,59 170,75 535,58 1142,3 624 597,3 1072
10567 Cugbpl: CUG repetição de trio, proteína 1 de ligação ao RNA 144,44 139,03 182,01 475,93 188,6 348,4 686,6
10566 Cugbpl: CUG repetição de trio, proteína 1 de ligação ao RNA 454,48 148,16 264,74 818,02 671,8 693,4 734,5
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
10968 C430004E15Rik: gene RIKEN cDNA C430004E15 350,92 598,27 0,28389 1237 0,03827 7512 0,06291 866 25,625
27736 C730049O14Rik: gene RIKEN cDNA C730049O14 724,56 697,53 0,32962 1675 0,04 0,05737 778 35,895
34773 Ccdc66: domínio coiled-coil contendo 66 447,88 631,69 0,28401 9738 0,03636 3636 0,05381 818 40,471
29123 Cdca2: ciclo de divisão celular associado 2 623,21 617,99 0,34832 2414 0,03225 8065 0,06094 086 30,502
41131 Cdca2: ciclo de divisão celular associado 2 765,51 518,81 0,35308 6549 0,04291 8455 0,06473 534 24,623
8311 CDNA clone IMAGE:30031514 1949,5 2208,4 0,46579 6823 0,03191 4894 0,05836 879 33,071
4656 Cebpz: CCAAT/realçador proteína de ligação zeta 1501,9 1690,1 0,44603 3561 0,02857 1429 0,05825 397 32,212
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334/357
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
15723 Cenpe: proteína E do centrômero 1201,9 1244,4 0,47264 2964 0,04329 0043 0,06494 949 24,63
39617 Ckap21: similar à proteína associado ao citosqueleto 2 480,09 416,15 0,36718 0032 0,04776 1194 0,07039 801 21,332
16339 Cndp2: CNDP dipeptidase 2 (família M20 da metalopeptidase) 419,23 414,14 0,23609 485 0,03278 6885 0,06057 377 30,714
13932 Cox17: citocromo c oxidase, subunidade XVII homólogo de proteína de agrupamento (levedura) 1492,8 1260 0,44751 3191 0,04494 382 0,06275 281 26,972
1878 CrIzl: zíper de leucina rico em aminoácido carregado 1 1073,1 1696,2 0,42452 4879 0,03571 4286 0,05494 048 39,916
677 Ctsc: catepsina C 767,24 1113,2 0,47663 1541 0,04761 9048 0,07378 307 20,134
10567 Cugbpl: CUG repetição de trio, proteína 1 de ligação ao RNA 538,56 396,31 0,35338 8653 0,04682 2742 0,06935 34 22,241
10566 Cugbpl: CUG repetição de trio, proteína 1 de ligação ao RNA 490,43 505,7 0,44323 5067 0,04719 764 0,07229 105 21,077
Coluna Gene CycA2.1 CycA2.2 CycA2.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
41846 D14Abb le: segmento de DNA, Chr 14, Abbott 1 expresso 166,7 221,03 266,86 493,13 316,5 653,2 637,6
18143 D3Ertd300e: segmento de DNA, Chr 3, ERATO Doi 300, expresso 651,01 741,63 789,6 1222,2 864 1291 1856
38498 D530033C11Rik: gene RIKEN cDNA D530033C11 890,62 74,97 669,69 1354,2 1035 1547 1173
29413 Dcunld3: DCN I, defectivo em nedilação de culina 1, domínio contendo 3 (S. cerevisiae) 112,69 125,06 198,24 483,09 350,6 483,8 304,9
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Coluna Gene CycA2.1 CycA2.2 CycA2.3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
15722 Ddx17: DEAD (AspGlu Ala-Asp) polipeptídeo box 17 190,78 456,61 194,03 475,57 561,2 524,9 865,3
16347 Ddx21: DEAD (AspGlu Ala-Asp) polipeptídeo box 21 496,86 124,45 757,01 933,21 720,4 1162 1069
27562 Depdclb: DEP domínio contendo 1B 18,58 56,46 148,7 299,93 171,9 324,2 316,4
14683 Dgke: diacilglicerol quinase, epsilon 343,02 114,18 420,65 1081,8 777,2 733,1 1098
7310 Dnajbl I: DnaJ (Hsp40) homólogo, subfamília B, membro 11 556,18 649,73 756,84 1341,8 1135 1077 1278
14950 Eif2c5: fator de iniciação de tradução eucariótica 2C, 5 73,43 7,99 58,25 207,56 115,2 151,6 314,5
22419 Eif3s6: fator de iniciação de tradução eucariótica 3, subunidade 6 381,28 298,29 530,64 867,23 627 653,7 1253
395 Eif3s7: fator de iniciação de tradução eucariótica 3, subunidade 7 (zeta) 29,43 61,47 88,84 294,07 351,7 339,7 230,4
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
41846 D14Abb le: segmento de DNA, Chr 14, Abbott 1 expresso 639,35 503,72 0,40364 059 0,04744 5255 0,06781 022 22,983
18143 D3Ertd300e: segmento de DNA, Chr 3, ERATO Doi 300, expresso 1684,9 1719,9 0,50528 2071 0,04263 5659 0,06616 279 23,66
38498 D530033C11Rik: gene RIKEN cDNA D530033C11 959,68 1175,8 0,45145 483 0,04365 0794 0,06470 899 24,01
29413 Dcunld3: DCN I, defectivo em nedilação de culina 1, domínio contendo 3 (S. cerevisiae) 421,64 437,94 0,35132 293 0,04471 5447 0,06539 295 24,096
15722 Ddx17: DEAD (Asp-Glu Ala-Asp) polipeptídeo box 17 1016,7 851,49 0,39180 1878 0,04109 589 0,06312 024 25,292
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Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modula ção FDR interme diário FDR médio T
16347 Ddx21: DEAD (Asp-Glu Ala-Asp) polipeptídeo box 21 1079,2 1463,9 0,42888 6151 0,04046 2428 0,06244 701 27,25
27562 Depdclb: DEP domínio contendo 1B 295,91 377,86 0,25051 3646 0,03846 1538 0,06087 179 30,132
14683 Dgke: diacilglicerol quinase, epsilon 905,2 997,74 0,31391 1367 0,03030 303 0,05303 03 46,768
7310 Dnajbl I: DnaJ (Hsp40) homólogo, subfamília B, membro 11 1479,7 1531,5 0,50051 32 0,04651 1628 0,06949 059 22,185
14950 Eif2c5: fator de iniciação de tradução eucariótica 2C, 5 175,57 291,88 0,22236 0199 0,04629 6296 0,07078 189 21,539
22419 Eif3s6: fator de iniciação de tradução eucariótica 3, subunidade 6 944,86 908,52 0,46069 4538 0,04702 1944 0,07048 067 21,669
395 Eif3s7: fator de iniciação de tradução eucariótica 3, subunidade 7 (zeta) 167,87 157,32 0,23327 4065 0,03896 1039 0,06056 277 28,457
Colun a Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
153 Eif3s8: fator de iniciação de tradução eucariótica 3, subunidade 8 647,41 374,43 471,72 1108,7 888,3 784,6 1268
18771 E112: fator de alongamento polimerase de RNA II 2 298,51 184,57 392,63 1119,5 733,5 995,9 939,5
17713 Etnkl: Etanolamina quinase I 159,03 73,22 93,44 636,72 598,3 684 479,5
42522 Fancm: anemia fanconi, grupo de complementação M 235,24 234,96 201,67 561,14 449,8 487,2 710,1
33019 Fancm: anemia fanconi, grupo de complementação M 324,67 275,04 276,12 624,04 629,4 728,5 955,8
16073 Fancm: anemia fanconi, grupo de complementação M 372,48 232,77 365,4 583,78 592,9 710,1 789,6
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Colun a Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
14660 Fen 1: endonuclease 1 específica de estrutura em flap 461,57 282,56 398,88 1199,4 1126 829,3 821,8
6438 Fvl: suscetibilidade a vírus friend 1 38,2 81,88 76,52 241,25 95,92 244,6 302,3
18071 Fzd7: homólogo enrolado 7 (Drosophila) 340,48 178,18 288,66 840,79 815,4 819,6 1126
23587 Gapvd 1: proteína de ativação da GTPase e domínios VPS9 1 129,82 259,4 193,47 424,38 503 467,4 685,6
22636 Gfptl: glutamina fructose-6-fosfato transaminase 1 38,52 89,06 120,23 335,73 165,1 314,9 566,9
28204 Glbl: galactosidase, beta 1 1082,2 6 154,29 824,12 1713,4 1708 1919 2552
33270 Gm104: modelo de gene 104, (NCBI) 270,98 111,96 218,82 623,96 424 354,1 625,1
29375 Gm 1564: modelo de gene 1564, (NCBI) 200,31 157,46 220,69 547,93 543,1 730,7 543,3
3500 Gpatc4: G domínio de via contendo 4 440,58 205,69 292,42 950,82 529 789,3 962,7
9979 Gpatc4: G domínio de via contendo 4 1300,7 1 154,78 656,61 2341,4 1228 1953 2072
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermedi ário FDR médio T
153 Eif3s8: fator de iniciação de tradução eucariótica 3, subunidade 8 1026,1 1313,4 0,46755 9382 0,04832 7138 0,06748 451 23,186
18771 E112: fator de alongamento polimerase de RNA II 2 968,34 900,94 0,30956 2316 0,03333 3333 0,05511 111 47,605
17713 Etnkl: Etanolamina quinase I 375,04 558,65 0,19548 5743 0 0,03666 667 65,023
42522 Fancm: anemia fanconi, grupo de complementação M 690,61 645,65 0,37910 9935 0,03921 5686 0,0625 25,944
33019 Fancm: anemia fanconi, grupo de complementação M 882,68 792,98 0,37968 4662 0,04137 931 0,06165 517 28,839
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 343/373
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Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermedi ário FDR médio T
16073 Fancm: anemia fanconi, grupo de complementação M 732,26 922,82 0,44818 9166 0,04864 8649 0,07340 541 20,319
14660 Fen 1: endonuclease 1 específica de estrutura em flap 831,08 814,02 0,40667 1055 0,04905 6604 0,06747 17 23,342
6438 Fvl: suscetibilidade a vírus friend 1 159,26 316,04 0,28926 4406 0,04899 1354 0,07193 084 20,911
18071 Fzd7: homólogo enrolado 7 (Drosophila) 951,13 832,39 0,29981 3573 0,02380 9524 0,05539 683 43,152
23587 Gapvd 1: proteína de ativação da GTPase e domínios VPS9 1 645,29 353,59 0,37846 3517 0,04871 0602 0,07160 458 20,899
22636 Gfptl: glutamina fructose-6-fosfato transaminase 1 599,99 90,41 0,23907 7687 0,04232 8042 0,06405 644 26,375
28204 Glbl: galactosidase, beta 1 2521,8 2748 0,31313 842 0 0,041 74,678
33270 Gm104: modelo de gene 104, (NCBI) 416,17 774,69 0,37399 7433 0,04676 259 0,06773 381 22,928
29375 Gm 1564: modelo de gene 1564, (NCBI) 424,1 561,78 0,34525 9589 0,04142 0118 0,06234 714 27,459
3500 Gpatc4: G domínio de via contendo 4 725,77 902,34 0,38629 3771 0,03478 2609 0,05953 623 31,334
9979 Gpatc4: G domínio de via contendo 4 1558,3 1584,8 0,39339 9692 0,04255 3191 0,05496 454 42,186
Colun a Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
29821 Gtf3c1: fator de transcrição geral III C 1 1082,0 2 314,5 452,3 1080,6 901,5 1213 1452
13878 Gtf3c4: fator de transcrição geral IIIC, polipeptídeo 4 249,77 12,55 161,14 474,48 220,1 217,4 516,4
7302 Gtpbp4: proteína de ligação a GTP 4 505,74 834,95 1152 1902,8 1141 1611 1950
20122 H47: histocompatibilidad e 47 624,17 411,69 853,39 1601,4 1274 1338 1611
16780 H47: histocompatibilidad e 47 1553,6 7 678,07 1382,6 4 2610 1889 2344 2584
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339/357
Colun a Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
14429 H47: histocompatibilidad e 47 1937,9 1 764,71 1187,4 4 2611 1870 2265 2328
29582 Hectdl: domínio HECT contendo 1 886,78 469,71 529,57 1198 860,2 1102 1758
8699 Hipkl: homeodomínio de interação com a proteína quinase 1 992,48 402,72 711,08 1281,1 954,7 1186 1576
8270 Igf2r: receptor de fator de crescimento similar à insulina 2 327,8 119,68 339,68 781,98 500,5 705,3 745,9
8271 Igf2r: receptor de fator de crescimento similar à insulina 2 169,96 242,38 158,23 528,54 492,6 528,9 459,7
22514 I1f3: fator de ligação realçador da interleuquina 3 170,07 35,32 121,1 560,62 295,1 376,3 300,5
7251 Incenp: proteína do centrômero interno 393,46 237,19 218,41 663,52 579,9 476,3 892,7
21315 Ipo7: importina 7 1777,2 4 743,47 1888,2 7 2615,2 2038 2475 2455
27085 Isg2012: similar 2 do gene de exonuclease estimulado por interferon 20 416,94 227,53 402 1147,7 772,9 990,8 770,5
4798 Jmy: proteína reguladora e de mediação de junção 165,05 95,76 208,4 547,49 231,3 463,5 532,9
4799 Jmy: proteína reguladora e de mediação de junção 886,39 251,37 566,34 1194 1061 1111 1677
19905 Jmy: proteína reguladora e de mediação de junção 187,78 141,18 219,35 543,3 293 427,2 657,6
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermedi ário FDR médio T
29821 Gtf3c1: fator de transcrição geral III C 1 1192,1 1707,2 0,49000 6758 0,04960 8355 0,07422 106 20,008
13878 Gtf3c4: fator de transcrição geral IIIC, polipeptídeo 4 384,03 566,54 0,35599 6822 0,04545 4545 0,06888 528 22,058
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 345/373
340/357
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermedi ário FDR médio T
7302 Gtpbp4: proteína de ligação a GTP 4 1522,4 1943,6 0,49503 7098 0,04402 5157 0,06255 765 28,043
20122 H47: histocompatibilidad e 47 1602,3 1546,1 0,42115 9518 0,03125 0,05572 917 38,172
16780 H47: histocompatibilidad e 47 2481,4 2674,1 0,49570 9628 0,03448 2759 0,05862 069 33,984
14429 H47: histocompatibilidad e 47 2522,8 2346,6 0,55798 7889 0,04421 7687 0,06821 995 22,482
29582 Hectdl: domínio HECT contendo 1 1238,8 1402,2 0,49905 9992 0,04935 0649 0,07448 485 19,948
8699 Hipkl: homeodomínio de interação com a proteína quinase 1 1648,7 1861,9 0,49512 9872 0,04562 7376 0,06700 887 23,415
8270 Igf2r: receptor de fator de crescimento similar à insulina 2 596 939,69 0,36875 366 0,03937 0079 0,06091 864 30,301
8271 Igf2r: receptor de fator de crescimento similar à insulina 2 649,21 498,88 0,36135 9253 0,04621 8487 0,06540 616 24,44
22514 I1f3: fator de ligação realçador da interleuquina 3 289,94 360,17 0,29917 1183 0,04659 4982 0,06761 051 22,913
7251 Incenp: proteína do centrômero interno 816,19 920,58 0,39044 7811 0,04294 4785 0,06310 838 27,646
21315 Ipo7: importina 7 2754,8 2633,6 0,58899 1329 0,04812 8342 0,07298 574 20,287
27085 Isg2012: similar 2 do gene de exonuclease estimulado por interferon 20 676,05 841,48 0,40254 1876 0,04424 7788 0,06415 929 24,912
4798 Jmy: proteína reguladora e de mediação de junção 603,44 674,49 0,30736 729 0,03658 5366 0,05780 488 34,745
4799 Jmy: proteína reguladora e de mediação de junção 1290,8 1588,2 0,43020 7151 0,04347 8261 0,06289 855 27,762
19905 Jmy: proteína reguladora e de mediação de junção 428,21 656,69 0,36481 402 0,04609 9291 0,06806 147 22,831
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 346/373
341/357
Colun a Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
2694 Kctd9: domínio de tetramerização do canal de potássio contendo 9 171,19 85,46 175,44 439,95 379,8 353,7 485,6
20342 Kif11: família da quinesina membro 11 351,66 218,63 237,15 802,55 400,7 666,1 896,3
19155 Kif22: família da quinesina membro 22 291,5 250,11 329,46 841,6 654,5 559 989,6
7972 Kif22: família da quinesina membro 22 202,55 190,1 260,35 873,55 734,2 599,9 722
15135 Kif2c: família da quinesina membro 2C 167,17 158,49 331,1 532,54 543,9 578,5 476,2
21863 IC119: fator 9 similar a Kruppel 1075,1 1 184,91 618,97 1413,6 1074 1024 1693
9017 L2hgdh: L-2hidroxiglutarato de-hidrogenase 356,73 197,34 475,3 1034,2 590,3 965,2 1621
12344 Larpl /// LOC631268: la família do domínio da ribonucleoproteína , membro 1 /// similar ao isoformo de proteína relacionado a la 347,33 50,62 240,65 510,75 581,7 447,5 684,6
27871 Lemd3: domínio LEM contendo 3 355,22 46,19 248,38 639,18 502,4 726,8 660,7
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermedi ário FDR médio T
2694 Kctd9: domínio de tetramerização do canal de potássio contendo 9 295,15 503,25 0,35167 2947 0,04452 0548 0,06816 21 22,544
20342 Kif11: família da quinesina membro 11 538,17 967,58 0,37806 277 0,03546 0993 0,06096 927 29,228
19155 Kif22: família da quinesina membro 22 886,55 947,43 0,35709 542 0,02898 5507 0,05560 386 37,101
7972 Kif22: família da quinesina membro 22 806,28 1047,4 0,27303 0408 0,03448 2759 0,05172 414 48,72
15135 Kif2c: família da quinesina membro 2C 472,46 1022 0,36228 7382 0,04729 7297 0,06951 577 22,301
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 347/373
342/357
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermedi ário FDR médio T
21863 IC119: fator 9 similar a Kruppel 992,37 1695,4 0,47614 2088 0,04624 2775 0,07190 751 20,929
9017 L2hgdh: L-2hidroxiglutarato de-hidrogenase 1345,6 1417,6 0,29519 7523 0 0,03680 556 58,335
12344 Larpl /// LOC631268: la família do domínio da ribonucleoproteína , membro 1 /// similar ao isoformo de proteína relacionado a la 681,6 1010,2 0,32612 4981 0,02803 7383 0,05772 586 32,144
27871 Lemd3: domínio LEM contendo 3 542,9 577,78 0,35607 0777 0,04487 1795 0,06168 803 28,233
Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
21965 /// L00546201 /// LOC619753 /// LOC621019 /// LOC622792 /// LOC664993 /// LOC665003 /// LOC665558 /// LOC665616 /// LOC665711 /// LOC665718 /// LOC665723 /// LOC665802 /// LOC666058 /// LOC666140: similar ao membro 8 da família PRAME /// sequência expressa AU018829 /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME 1318,3 7 1146,5 6 2240,9 2 2919,6 2280 3010 2493
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 348/373
343/357
Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
10972 Ltvl: LTV1 homólogo (S.cerevisiae) 174,72 230,6 499,42 754,54 608,6 673,9 721
27592 Mdcl: mediador do ponto de controle de dano ao DNA 1 262,4 166,34 518,6 980,38 695,3 702,3 682,3
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR interme diário FDR médio T
21965 /// L00546201 /// LOC619753 /// LOC621019 /// LOC622792 /// LOC664993 /// LOC665003 /// LOC665558 /// LOC665616 /// LOC665711 /// LOC665718 /// LOC665723 /// LOC665802 /// LOC666058 /// LOC666140: similar ao membro 8 da família PRAME /// sequência expressa AU018829 /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME /// similar ao membro 8 da família PRAME 2865,6 3135,8 0,56348 3748 0,03960 396 0,06283 828 25,972
10972 Ltvl: LTV1 homólogo (S.cerevisiae) 681,5 835,41 0,42327 5126 0,04605 2632 0,06937 5 22,107
27592 Mdcl: mediador do ponto de controle de dano ao DNA 1 773,12 895,31 0,40067 1635 0,04347 8261 0,06484 848 23,974
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 349/373
344/357
Colun a Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
20064 Mgat2: manosídeo acetilglucosaminiltra nsferase 2 469,73 304,14 823,62 1323,3 860,6 1140 1039
19069 Mina: antígeno nuclear induzido por myc 78,98 36,19 157,22 515,36 223,5 260,4 415,6
21512 MIcrnl: makorin, proteína ring finger, 1 648,36 512,8 1294,7 1 1919,8 1380 1377 1555
6466 Mm.218588.1 254,43 33,9 245,82 906 787,6 785,3 730,8
12365 Mm.29909.1 281,86 28,14 399,88 829,02 524,3 892,9 1101
29718 Mnab: proteína de ligação ao DNA associada à membrana 118,68 46,27 176,41 283,79 408,9 313,3 413,1
8643 Mobklb: MOB1, Mps One similar ao ativador aglutinante da quinase IB (levedura) 331,14 291,72 770,54 1112,7 864 1205 1307
7941 Mobklb: MOB1, Mps One similar ao ativador aglutinante da quinase IB (levedura) 254,91 242,34 466,56 736,04 605,2 626,6 639,8
791 Mrfap I: proteína 1 associada à família Morf4 768,71 852,78 1066,3 3 1873 1360 1748 1989
2811 Mtf2: fator de transcrição de ligação do elemento de resposta metálica 2 1035,2 1 1134,6 8 1619,5 7 2148,1 1573 2029 2914
16360 Ndufcl: NADH dehidrogenase (ubiquinona) 1, subcomplexo desconhecido, 1 305,64 283,11 391,61 1442,1 822,4 1026 1048
14278 Nmel: expresso em células não metastáticas 1, proteína 58,62 18,15 143,92 450,69 102,8 119,3 425,5
23157 Osbpl7: similar à proteína 7 de ligação a oxisterol 208,36 123,05 167,34 291,45 385,8 284,5 615,7
10534 Oxnadl: domínio de ligação a oxidoreductase NAD contendo 1 230,13 169,82 311,6 693,65 783 681,6 465,9
10418 Pank3: pantotenato quinase 3 425,65 241,73 280,88 1151,2 770,8 1060 873,1
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 350/373
345/357
Colun a Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
3006 Pdgfa: fator de crescimento derivado peletizado, alfa 301,5 109,27 223,39 769,44 1041 424,9 654,4
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
20064 Mgat2: manosídeo acetilglucosaminiltra nsferase 2 1107,9 1146,1 0,48287 9947 0,04513 8889 0,06842 593 22,62
19069 Mina: antígeno nuclear induzido por myc 176,74 570,73 0,25194 3523 0,03521 1268 0,06105 634 29,175
21512 MIcrnl: makorin, proteína ring finger, 1 1824,2 2003,2 0,48825 9093 0,04519 774 0,06293 785 26,996
6466 Mm.218588.1 656,42 846,69 0,22667 8125 0 0,04019 608 65,243
12365 Mm.29909.1 1108,6 1025,5 0,25901 034 0 0,03666 667 63,212
29718 Mnab: proteína de ligação ao DNA associada à membrana 248,67 694,29 0,28903 5842 0,04090 9091 0,06340 909 25,243
8643 Mobklb: MOB1, Mps One similar ao ativador aglutinante da quinase IB (levedura) 1049 1225,8 0,41205 3466 0,03061 2245 0,05911 565 32,694
7941 Mobklb: MOB1, Mps One similar ao ativador aglutinante da quinase IB (levedura) 1041,8 1058,4 0,40944 4571 0,04774 5358 0,07390 805 20,138
791 Mrfap I: proteína 1 associada à família Morf4 2140,2 2023,5 0,48280 997 0,03539 823 0,06002 95 31,382
2811 Mtf2: fator de transcrição de ligação do elemento de resposta metálica 2 2368,9 2633,3 0,55457 0812 0,04430 3797 0,06973 629 21,775
16360 Ndufcl: NADH dehidrogenase (ubiquinona) 1, subcomplexo desconhecido, 1 788,41 1348,7 0,30278 3972 0,03571 4286 0,04976 19 49,45
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 351/373
346/357
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
14278 Nmel: expresso em células não metastáticas 1, proteína 295,56 236,64 0,27072 0502 0,04838 7097 0,07321 685 20,305
23157 Osbpl7: similar à proteína 7 de ligação a oxisterol 485,5 504,16 0,38856 622 0,04884 3188 0,07529 563 19,82
10534 Oxnadl: domínio de ligação a oxidoreductase NAD contendo 1 438,48 324,58 0,42014 425 0,04736 8421 0,07421 93 20,048
10418 Pank3: pantotenato quinase 3 919,21 1010 0,32784 5955 0,02439 0244 0,05658 537 43,275
3006 Pdgfa: fator de crescimento derivado peletizado, alfa 303,32 583,26 0,33586 4925 0,03649 635 0,06034 063 29,635
Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
12377 Pdrgl: p53 e danos regulados de DNA 1 372,77 252,95 540,97 715,57 695 822,9 1023
12376 Pdrgl: p53 e danos regulados de DNA 1 285,31 282,96 545,59 789,75 643,6 739,9 846,2
727 Pfkfb3: 6fosfofruto-2quinase/frutose2,6-bifosfatase 3 39,57 6,24 92,23 213,6 178,3 138 367,9
14762 Pgd: fosfogluconato desidrogenase 929,25 508,03 877,51 1851,3 1253 1745 1404
15044 Pgd: fosfogluconato desidrogenase 864,91 479,01 841,06 1775 1198 1646 1303
15538 Pgd: fosfogluconato desidrogenase 641,54 351,22 569,81 1194 750,2 1094 1037
28991 Plcd4: fosfolipase C, delta 4 85,67 50,61 173,34 335,85 224,9 209,1 437,5
16204 Ppgb: proteína protetora para beta-galactosidase 440,09 225,35 350,75 1117,8 569,7 1350 1365
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 352/373
347/357
Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
1352 Ppid /// Lamp3 /// LOC671770: peptidilprolil isomerase D (ciclofilin D) /// proteína 3 de membrana lisossomalassociada /// similar à isomerase D peptidilprolil 177,09 265,27 578,82 1140,3 699 928,3 1030
39148 Ppmla: proteína fosfatase 1A, dependente de magnésio, isoforma alfa 678,05 348,48 381,66 1276,6 1066 1257 1598
9696 Ppmla: proteína fosfatase 1A, dependente de magnésio, isoforma alfa 132,05 88,38 124,3 565,15 304,2 544,5 369
32940 Ppplr3e: Proteína fosfatase I, subunidade reguladora 3E (inibidor) 5,81 13,38 13,14 172,3 123,7 36,66 111,8
Continuação
Coluna Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
12377 Pdrgl: p53 e danos regulados de DNA 1 1047,5 1095,6 0,43217 7036 0,04020 1005 0,06324 958 26,01
12376 Pdrgl: p53 e danos regulados de DNA 1 866 924,2 0,46317 8117 0,04885 0575 0,07174 33 20,906
727 Pfkfb3: 6fosfofruto-2quinase/frutose2,6-bifosfatase 3 210,92 349,81 0,18929 6856 0,04093 5673 0,06185 185 27,429
14762 Pgd: fosfogluconato desidrogenase 1529,3 1992,3 0,47359 8818 0,03947 3684 0,06089 912 28,571
15044 Pgd: fosfogluconato desidrogenase 1437,5 1852,4 0,47439 6469 0,04216 8675 0,06273 092 27,53
15538 Pgd: fosfogluconato desidrogenase 1017,5 1353,6 0,48475 081 0,04637 6812 0,07173 913 20,978
28991 Plcd4: fosfolipase C, delta 4 324,88 403,75 0,31986 1981 0,04545 4545 0,06839 161 22,702
16204 Ppgb: proteína 642,54 1356,9 0,31744 0 0,03811 58,402
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 353/373
348/357
protetora para beta-galactosidase 5293 594
1352 Ppid /// Lamp3 /// LOC671770: peptidilprolil isomerase D (ciclofilin D) /// proteína 3 de membrana lisossomalassociada /// similar à isomerase D peptidilprolil 754,1 902,76 0,37442 549 0,03260 8696 0,05804 348 33,459
39148 Ppmla: proteína fosfatase 1A, dependente de magnésio, isoforma alfa 1131,1 1120,3 0,37812 4375 0,02777 7778 0,05555 556 36,552
9696 Ppmla: proteína fosfatase 1A, dependente de magnésio, isoforma alfa 388,93 396,41 0,26845 9355 0,03333 3333 0,06136 111 30,736
32940 Ppplr3e: Proteína fosfatase I, subunidade reguladora 3E (inibidor) 102,91 75,79 0,10376 8135 0,04972 3757 0,07308 471 20,499
Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
15897 Prame17: antígeno preferencialmente expresso similar ao melanoma 7 228,49 144,58 867,63 970,28 608,2 1186 964
15898 Prame17: antígeno preferencialmente expresso similar ao melanoma 7 883,77 273,04 670,2 1610,9 1099 1407 1266
7006 Prkcd: proteína quinase C, delta 235,8 93,35 81,71 712,82 315,5 733,7 910,3
9218 Prmt6: proteína arginina Nmetiltransferase 6 738,14 448,83 800,51 1347,3 1073 1131 1415
41444 Prpf19: PRP19/PSO4 fator de processamento pré-mRNA 19 homólogo (S. cerevisiae) 3993,0 2 2736,9 3 2277,8 7 4887,6 4660 4959 4053
33047 Prrl1: rico em prolina 11 401,64 173,26 234,39 568,15 688,2 606,6 817,5
35103 Prrl1: rico em prolina 11 265,25 149,08 442,11 729,69 571,3 733,6 873
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349/357
Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
21158 Psatl: fosfoserina aminotransferase 1 608,23 383,49 505,63 1268,1 1111 1110 1163
14945 Psma6: proteassoma (prossoma, macropain) subunidade, alfa tipo 6 297,18 193,17 579,11 823,99 814,8 842,5 1150
14001 Ptdss2: fosfatidilserina sintase 2 286,3 79,67 434,04 847,59 360,3 528,7 764,3
3935 Purb: proteína de ligação B de elemento rico em purina 255,68 124,63 215,26 618,23 457,7 488,1 438,8
16286 Rabl: RABI, membro RAS família do oncogene 24,78 29,32 63,21 200,41 213,3 158,4 260,3
15338 Rab20: RAB20, membro RAS família do oncogene 448,47 171,13 416,25 593,19 602,8 611,4 1207
4228 Rbm35b: proteína 35b do motivo de ligação com RNA 187,48 63,54 221,76 590,29 628,2 453,7 363,2
12058 Rnf6: proteína ring finger (C3H2C3 tipo) 6 508,38 239,28 418,61 655,12 583,3 868,8 1096
12057 Rnf6: proteína ring finger (C3H2C3 tipo) 6 861,12 396,56 614,69 1246,8 778,3 939,7 1510
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
15897 Prame17: antígeno preferencialmente expresso similar ao melanoma 7 982,9 977,84 0,43616 2808 0,03809 5238 0,06279 365 25,608
15898 Prame17: antígeno preferencialmente expresso similar ao melanoma 7 1347,1 1586,8 0,43938 0494 0,03875 969 0,06098 191 30,2
7006 Prkcd: proteína quinase C, delta 661,36 733,23 0,20205 1696 0 0,03909 091 73,85
9218 Prmt6: proteína arginina Nmetiltransferase 6 1423,3 1354,9 0,51325 5025 0,04482 7586 0,06847 126 22,56
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 355/373
350/357
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
41444 Prpf19: PRP19/PSO4 fator de processamento pré-mRNA 19 homólogo (S. cerevisiae) 4990,6 4177,1 0,64976 133 0,04664 723 0,07188 533 21,001
33047 Prrl1: rico em prolina 11 1134 740,86 0,35531 8761 0,03623 1884 0,06014 493 29,566
35103 Prrl1: rico em prolina 11 564,31 1014,1 0,38182 3653 0,04069 7674 0,06170 543 27,381
21158 Psatl: fosfoserina aminotransferase 1 1113 1052,3 0,43923 2447 0,04301 0753 0,06390 681 26,531
14945 Psma6: proteassoma (prossoma, macropain) subunidade, alfa tipo 6 1450,2 1653,8 0,31757 146 0,03921 5686 0,05627 451 41,002
14001 Ptdss2: fosfatidilserina sintase 2 553,32 801,99 0,41491 7121 0,04590 1639 0,06926 776 22,092
3935 Purb: proteína de ligação B de elemento rico em purina 529,05 494,18 0,39362 6056 0,04851 752 0,07339 623 20,306
16286 Rabl: RABI, membro RAS família do oncogene 168,49 186,44 0,19760 9683 0,03773 5849 0,06314 465 25,528
15338 Rab20: RAB20, membro RAS família do oncogene 970,25 1217,6 0,39823 0769 0,04597 7011 0,06689 655 23,518
4228 Rbm35b: proteína 35b do motivo de ligação com RNA 321 412,3 0,34153 495 0,04761 9048 0,06794 872 22,995
12058 Rnf6: proteína ring finger (C3H2C3 tipo) 6 908,12 1006,9 0,45571 3959 0,04779 4118 0,06800 245 23,019
12057 Rnf6: proteína ring finger (C3H2C3 tipo) 6 1251,2 1413,2 0,52453 7304 0,04909 5607 0,07514 212 19,872
Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
1293 Rrsl: RRS1 homólogo regulador da biogênese do ribossomo (S. cerevisiae) 618,8 397,87 439,42 1053,2 649,4 1070 1408
8403 Rwdd4a: domínio RWD contendo 4A 120,1 127,06 198,13 517,17 347,8 401,8 607,9
20481 Sdadl: domínio SDA1 contendo 1 850,27 363,33 872,76 2204,8 1724 2051 2052
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 356/373
351/357
Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
15545 Sf3b2: fator de divisão 3b, subunidade 2 805,59 473,95 826,78 1604,5 2015 1869 1092
12258 Sfrs1: fator de divisão, rico em arginina/serina 1 (ASF/SF2) 1313,2 8 772,48 1279,8 4 2058,8 1861 1952 1991
4980 Sgpp1: esfingosina1-fosfato fosfatase 1 171,97 94,46 279,34 1215,3 589,4 577,1 509,6
4981 Sgpp1: esfingosina1-fosfato fosfatase 1 1314,8 8 188,41 379,99 1556,5 1386 1523 1138
18042 Sgpp1: esfingosina1-fosfato fosfatase 1 31,01 17,03 39,22 176,04 189 215,4 109,3
1917 Slc12a2: família do carreador soluto 12, membro 2 437,13 331,4 303,71 1012,6 574,1 711,6 831,2
16856 Slc12a2: família do carreador soluto 12, membro 2 153,39 179,89 175,06 527,45 337,2 487,5 447,9
21716 SIcla4: família 1 do carreador soluto (transportador de aminoácido glutamato/neutro), membro 4 60,95 35,65 114,42 292,45 193 238,6 177,4
28457 Slc30al: família 30 do carreador soluto (transportador de zinco), membro 1 317,74 103,14 73,18 315,4 343,8 619,8 393,9
23716 Sltm: similar a SAFB, modulador de transcrição 370,13 284,47 502,78 1011,1 760,1 1052 1180
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
1293 Rrsl: RRS1 homólogo regulador da biogênese do ribossomo (S. cerevisiae) 1440,1 939,09 0,44391 8374 0,04237 2881 0,06426 554 24,588
8403 Rwdd4a: domínio RWD contendo 4A 348,3 679,49 0,30684 367 0,04109 589 0,06171 233 28,805
20481 Sdadl: domínio SDA1 contendo 1 2375,7 1968,4 0,33716 3067 0 0,03539 683 62,679
15545 Sf3b2: fator de divisão 3b, subunidade 2 1101,2 1830 0,44291 4549 0,02816 9014 0,05497 653 36,878
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 357/373
352/357
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
12258 Sfrs1: fator de divisão, rico em arginina/serina 1 (ASF/SF2) 2140,9 2193,1 0,55191 5042 0,04878 0488 0,07106 707 21,424
4980 Sgpp1: esfingosina- 1 -fosfato fosfatase 1 536,21 763,86 0,26041 7512 0,03225 8065 0,05677 419 38,387
4981 Sgpp1: esfingosina- 1 -fosfato fosfatase 1 1603,8 1205,4 0,44770 8184 0,03361 3445 0,06098 039 30,851
18042 Sgpp1: esfingosina- 1 -fosfato fosfatase 1 132,56 153,26 0,17889 5791 0,04435 4839 0,06548 387 24,039
1917 Slc12a2: família do carreador soluto 12, membro 2 898,12 1082,7 0,41964 9444 0,04145 0777 0,06310 881 26,299
16856 Slc12a2: família do carreador soluto 12, membro 2 572,27 515,56 0,35205 1858 0,04371 5847 0,06347 905 26,669
21716 SIcla4: família 1 do carreador soluto (transportador de aminoácido glutamato/neutro), membro 4 338,73 362,16 0,26338 4861 0,04366 8122 0,06537 118 24,64
28457 Slc30al: família 30 do carreador soluto (transportador de zinco), membro 1 491,5 503,8 0,37033 8999 0,04761 9048 0,07036 706 21,319
23716 Sltm: similar a SAFB, modulador de transcrição 795,6 946,04 0,40296 4314 0,03418 8034 0,06111 111 30,894
Colun a Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
7575 Smarccl: relacionado a SW1/SNF, associado a maztriz, regulador dependente de actina de cromatina, subfamília c, membro 1 97,38 219,78 155,82 345,56 264,2 208,3 557,9
6834 Smarccl: relacionado a SW1/SNF, associado a maztriz, regulador dependente de actina de cromatina, subfamília e, membro 1 873,62 915,47 718,44 1533,2 1417 1758 1788
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 358/373
353/357
Colun a Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
6044 Sosl: homólogo de son of sevenless 1 (Drosophila) 134,91 61,07 109,98 438,22 273,2 373,8 445
6045 Sosl: homólogo de son of sevenless 1 (Drosophila) 391,93 223,27 270,95 684,56 368,7 779,9 937,3
27178 Spata2: associado a espermatogênese 2 1669,6 5 719,38 963,1 2142,9 1762 1954 1664
15690 Spint2: inibitor da serina protease, tipo Kunitz 2 120,15 171,41 256,46 612,14 318,1 490,9 552,9
21622 Stt3a: STT3, subunidade do complexo de oligosacariltransfera se, homólogo A (S. cerevisiae) 295,43 563,39 363,82 1099,3 829,3 1154 987,8
6577 Supt4h1 /// Supt4h2: supressor do homólogo Ty 4 1 (S. cerevisiae) /// supressor do homólogo Ty 4 2 (S. cerevisiae) 782,52 691,08 832,99 1708,4 1408 1683 1689
1745 Tacc3: proteína transformadora acidífera, contendo coiled-coil 3 738,85 414,57 618,79 1661,2 1188 1269 1517
13841 Tb12: similar a transducina (beta) 293,54 36,54 247,36 684,47 780,8 476,8 685,9
41362 Terf2ip: fator de ligação de repetição telomérico 2, proteína interagente 127,85 108,83 96,14 286,88 330,9 351,4 345,8
182 Tfg: gene Trkfundido 388,74 156,37 629,82 928,5 565 679,4 871,8
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
7575 Smarccl: relacionado a SW1/SNF, associado a maztriz, regulador dependente de actina de cromatina, subfamília c, membro 1 543,22 522,86 0,38736 149 0,04922 2798 0,07473 23 19,915
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 359/373
354/357
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
6834 Smarccl: relacionado a SW1/SNF, associado a maztriz, regulador dependente de actina de cromatina, subfamília e, membro 1 1926,5 1710,1 0,49496 406 0,04166 6667 0,06248 016 27,473
6044 Sosl: homólogo de son of sevenless 1 (Drosophila) 294,97 346,44 0,28179 2101 0,03973 5099 0,06119 205 28,59
6045 Sosl: homólogo de son of sevenless 1 (Drosophila) 493,55 698,66 0,44724 5565 0,04891 3043 0,07344 203 20,356
27178 Spata2: associado a espermatogênese 2 2350,8 2119,4 0,55902 0019 0,04747 7745 0,07050 445 21,273
15690 Spint2: inibitor da serina protease, tipo Kunitz 2 367,02 613,78 0,37092 7895 0,04128 4404 0,06328 746 25,297
21622 Stt3a: STT3, subunidade do complexo de oligosacariltransfera se, homólogo A (S. cerevisiae) 752,3 707,18 0,44216 1261 0,04580 1527 0,06703 562 23,437
6577 Supt4h1 /// Supt4h2: supressor do homólogo Ty 4 1 (S. cerevisiae) /// supressor do homólogo Ty 4 2 (S. cerevisiae) 2017,7 2324,6 0,42589 7785 0,03409 0909 0,05803 03 33,971
1745 Tacc3: proteína transformadora acidífera, contendo coiled-coil 3 1282,6 1702 0,41121 5669 0,03529 4118 0,05729 412 34,361
13841 Tb12: similar a transducina (beta) 393,26 569,1 0,32166 7609 0,0375 0,05737 5 35,143
41362 Terf2ip: fator de ligação de repetição telomérico 2, proteína interagente 519,43 330,16 0,30752 3146 0,04797 048 0,06747 847 23,114
182 Tfg: gene Trkfundido 1022,6 1079 0,45661 4208 0,04642 8571 0,06776 19 22,889
Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
7468 Tgolnl: proteína de rede trans-golgi 305,53 236,42 345,51 671,72 450,7 487,9 700,7
3061 Timd2: imunoglobulina de 608,39 151,76 231,44 1866,9 1351 1401 1475
Petição 870190088214, de 06/09/2019, pág. 360/373
355/357
Coluna Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
célula T e domínio de mucina contendo 2
1794 Timm10: translocase do homólogo da membrana mitocondrial interna 10 (levedura) 207,76 55,6 617,54 1237,7 550,9 497,9 560,4
785 Tmed6: domínio de transporte da proteína emp24 da transmembrana contendo 6 254,44 20,44 279,48 508,83 418,6 577,1 745,6
23223 Tmpo: timopoietina 372,55 239,05 785 1127,4 1035 974,2 1028
13926 Tomm22: translocase do homólogo da membrana mitocondrial externa 22 (levedura) 1013,6 2 632,86 904,75 2273,2 1749 1962 1195
16924 Torlb: família da torsina 1, membro B 272,73 156,58 572,98 1028,7 649,2 888 740,6
21932 Lócus transcrito 332,77 106,56 140,03 583,75 309,9 572,1 653,9
43944 Lócus transcrito 53,89 21,65 39,31 224,22 170,3 140,4 49,01
24471 Tsc22d2: família do domínio TSC22 2 936,98 613,69 879,83 1530,6 1319 1454 2101
10769 Ttfl: fator de término da transcrição 1 42,37 81,67 164,99 294,59 226,2 368,8 336,4
14944 Txndcl: domínio da tioredoxina contendo 1 424,55 133,69 462,39 960,94 645,2 984,3 612,4
22950 Unld: similar a unkempt (Drosophila) 270,84 139,44 154,65 747,39 286,7 573,7 677,1
16306 Uspl0: peptidase específica de ubiquitina 10 173,21 255,12 344,42 838,32 498,4 592,1 738,1
12733 Utp111: similar a UTP11, ribonucleoproteína nucleolar pequena, (levedura) 955,84 514,61 1811,2 4 2092,8 2025 1852 1938
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
7468 Tgolnl: proteína de rede trans-golgi 843,07 702,27 0,46026 144 0,04749 3404 0,07393 14 20,081
3061 Timd2: 1242,5 1993,4 0,21255 0 0,06166 97,488
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356/357
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
imunoglobulina de célula T e domínio de mucina contendo 2 2423 667
1794 Timm10: translocase do homólogo da membrana mitocondrial interna 10 (levedura) 1173,8 1446,2 0,32226 7911 0,03896 1039 0,05835 498 35,358
785 Tmed6: domínio de transporte da proteína emp24 da transmembrana contendo 6 731,85 729,56 0,29872 0754 0,03703 7037 0,05450 617 40,498
23223 Tmpo: timopoietina 951,54 1084,8 0,45039 9171 0,04273 5043 0,06450 142 24,609
13926 Tomm22: translocase do homólogo da membrana mitocondrial externa 22 (levedura) 1371,2 1705,4 0,49752 4304 0,04060 9137 0,06323 181 26,103
16924 Torlb: família da torsina 1, membro B 964,62 1195,4 0,36670 801 0,03797 4684 0,05776 371 35,2
21932 Lócus transcrito 636,22 766,49 0,32896 2199 0,03225 8065 0,05788 53 33,372
43944 Lócus transcrito 235,17 219,21 0,22123 1267 0,04615 3846 0,06666 667 23,586
24471 Tsc22d2: família do domínio TSC22 2 2010,4 1899,3 0,47129 429 0,03597 1223 0,06131 894 29,34
10769 Ttfl: fator de término da transcrição 1 367,68 251,53 0,31327 9391 0,04593 6396 0,06791 519 22,809
14944 Txndcl: domínio da tioredoxina contendo 1 1057,4 631,05 0,41732 4638 0,04545 4545 0,06567 493 24,209
22950 Unld: similar a unkempt (Drosophila) 831,48 565,56 0,30687 4571 0,02857 1429 0,05490 476 37,096
16306 Uspl0: peptidase específica de ubiquitina 10 449,15 994,08 0,37603 0404 0,04102 5641 0,06345 299 26,165
12733 Utp111: similar a UTP11, ribonucleoproteína nucleolar pequena, (levedura) 1738,6 2374,9 0,54596 4687 0,04692 0821 0,07209 189 21,037
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357/357
Colun a Gene CycA2. 1 CycA2. 2 CycA2. 3 NI1.1 NI1.2 NI1.3 NI2.1
27185 Utp15: UTP15, U3 ribonucleoproteína nucleolar pequena, homólogo (levedura) 222,46 131,63 302,63 1588,6 802,7 700,7 623,4
15510 Wbscrl: região do cromossomo da síndrome de Williams-Beuren homólogo (humano) 117,48 136,2 356,85 655,34 402,2 299,6 683,7
26959 Wdr3: domínio de repetição WD 3 772,19 388,92 483,21 1122,9 1121 1247 1066
21792 Zfp444: proteína de dedo de zinco 444 75,01 31,45 145,74 452,64 198,6 309,8 294,5
39491 Zfp710: proteína de dedo de zinco 710 371,26 333,7 313,27 900,66 784,5 1075 975,4
Continuação
Colun a Gene NI2.2 NI.2.3 Modulaç ão FDR intermed iário FDR médio T
27185 Utp15: UTP15, U3 ribonucleoproteína nucleolar pequena, homólogo (levedura) 1475,8 537,97 0,22925 845 0,03703 7037 0,04913 58 50,551
15510 Wbscrl: região do cromossomo da síndrome de Williams-Beuren homólogo (humano) 452,6 930,59 0,35661 3825 0,04602 5105 0,06517 434 24,432
26959 Wdr3: domínio de repetição WD 3 962,84 1081,4 0,49816 8587 0,04904 6322 0,07336 966 20,372
21792 Zfp444: proteína de dedo de zinco 444 537,31 689,29 0,20321 0926 0,04166 6667 0,055 41,9
39491 Zfp710: proteína de dedo de zinco 710 1333,3 979,43 0,33672 2951 0,03773 5849 0,05540 881 40,5
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Claims (14)

  1. REIVINDICAÇÕES
    1. Método para determinação da probabilidade de que um indivíduo do sexo feminino irá experimentar um evento de nascimento com vida, caracterizado pelo fato de que compreende as etapas de:
    (a) obter informações relativas a pelo menos cinco variáveis pré-selecionadas do paciente e opcionalmente outros parâmetros, em que quando esse indivíduo do sexo feminino é uma paciente em procedimento de pré-fertilização in vitro (préFIV), as variáveis da paciente pré-selecionadas são selecionadas dentre idade, reserva ovariana diminuída, nível do hormônio folículo estimulante (FSH), índice de massa corporal, doença ovariana policística, estação do ano, infertilidade feminina inexplicável, número de abortos espontâneos, ano, outras causas de infertilidade feminina, número de gravidezes anteriores, número de partos a termo anteriores, endometriose, doença tubária, ligadura tubária, infertilidade masculina, fibroides uterinos, hidrossalpinge ou causas de infertilidade masculina, em que quando o indivíduo do sexo feminino é uma paciente em procedimento de pré-recuperação oocitária (préOR), as variáveis da paciente pré-selecionadas são selecionadas dentre idade, espessura endometrial, número total de oócitos, quantidade total de gonatropinas administradas, número total de espermatozoides móveis após lavagem, número total de espermatozoides móveis antes da lavagem, nível do hormônio folículo estimulante (FSH) no dia 3, índice de massa corporal, colheita de esperma, idade do cônjuge, estação do ano, número de abortos espontâneos, infertilidade feminina inexplicável, número de partos a termo anteriores, ano, número de gestações anteriores, outras causas de infertilidade feminina,
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  2. 2/5 endometriose, infertilidade masculina, ligadura tubária, doença ovariana policística, doença tubária, esperma do doador, hidrossalpinge, fibroides uterinos ou causas de infertilidade masculina, e em que quando o indivíduo do sexo feminino é uma paciente em procedimento de pós-fertilização in vitro (pós-FIV), as variáveis da paciente pré-selecionadas são selecionadas dentre taxa de desenvolvimento do blastocisto, número total de embriões, quantidade total de gonatropinas administradas, espessura endometrial, protocolo flare, número médio de células por embrião, tipo de cateter utilizado, percentagem de embriões de 8 células transferidos, nível do hormônio folículo estimulante (FSH) no dia 3, índice de massa corporal, número de espermatozoides móveis antes da lavagem, número de espermatozoides móveis após a lavagem, grau médio de embriões, dia de transferência de embriões, estação do ano, número de abortos espontâneos, número de entregas a termo anteriores, pílulas contraceptivas orais, coleta de esperma, porcentagem de óvulos não fertilizados, número de embriões presos no estágio de 4 células, compactação no dia 3 após a transferência, porcentagem de fertilização normal, porcentagem de óvulos anormalmente fertilizados, porcentagem de oócitos normais e maduros, número de gestações anteriores, ano, doença ovariana policística, infertilidade feminina inexplicável, doença tubária, apenas infertilidade masculina, causas de infertilidade masculina, endometriose, outras causas de infertilidade feminina, fibroides uterinos, ligadura tubária, esperma do doador, hidrossalpinge, desempenho da ICSI ou eclosão assistida;
    (b) usar pelo menos um algoritmo para gerar um modelo de
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  3. 3/5 predição a partir de uma biblioteca de padrões de perfil conhecidos que se sabe serem indicativos de capacidade de resposta a um procedimento de fertilização in vitro, em que a biblioteca de padrões de perfil conhecidos compreende variáveis relativas a pacientes em procedimentos pré-FIV, pacientes em procedimentos pré-OR e/ou pacientes em procedimentos pós-FIV; e (c) validar o modelo de predição testando a predição em relação a um conjunto de dados independente, compreendendo pacientes não redundantes que tiveram um tratamento de FIV e um conjunto de dados relacionados a ciclos repetidos de pacientes retornados, em que o modelo de predição estratifica os pacientes com taxas diferenciais de nascimento com vida, em que o modelo de predição validado fornece uma probabilidade de ocorrência de um evento de nascimento com vida ocorrer em um indivíduo do sexo feminino através de um procedimento de fertilização in vitro.
    2. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que as variáveis da paciente pré-selecionadas recebem uma importância relativa ponderada em relação a outras variáveis da paciente pré-selecionadas.
    3. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o pelo menos um algoritmo compreende uma regra de decisão.
  4. 4. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o pelo menos um algoritmo compreende uma árvore de classificação.
  5. 5. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o pelo menos um algoritmo é não-paramétrico.
  6. 6. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o pelo menos um algoritmo detecta diferenças na
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    4/5 distribuição de valores de características.
  7. 7. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o pelo menos um algoritmo compreende uma árvore de regressão de adições múltiplas (MART).
  8. 8. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o pelo menos um algoritmo é aplicado usando um aparelho de regulação de grau (GBM).
  9. 9. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o pelo menos um algoritmo compreende regressão logística.
  10. 10. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que compreende ainda a determinação de um nível de expressão de pelo menos um gene indicador de infertilidade e a comparação desse nível de expressão com um perfil de expressão gênica controle que se sabe ser indicativo da capacidade de resposta a um procedimento de fertilização in vitro.
  11. 11. Método de acordo com a reivindicação 10, caracterizado pelo fato de que o pelo menos um gene indicador de infertilidade compreende ADM, β-ACTIN, BCLAF1, BMPR1A, BRF2, BTAF1, BTBD14A, CBX4, CCNA1, CCNA2, CDC2, CDH1, CDH2, CDT1, CENPE, CITED2, CPSF4, CPSF6, CRB3, CSE11, CS1L, CTSB, DIDO1, DNMT3A, DNMT3B, DPPA5, E112, ECSIT, EIF2C5, EIF2S1, EIF3B, EIF3C, EIF3E, EIF3G, EIF3H, EIF3S, EIF3S10,EIF4E, EIF4E2, EIF4G1, EIF5B, EIF6, ETF1, ETV1, EZH2, FGF4, FGFR1, FGFRL1, GATA4, GATA6, GAPDH, GEN5, GJA1, GTF3C1, GTF3C2, GTF3C4, GTF3C5, H3F3A, HAT1, HBEGF, HIPK1, HIPK3, HNRPA1, HNRPAB, HRNPK, HNRPM, I117RD, IGF2R, IMP1, INTS4, INTS7, JMJD2A, JMY, KDM3A, KDM3B, KDM5B, KDM5C, KFF9, KIF11, KIF22, KITLG, KLF9, KRT16, LIN26, M113, MAPK1, MCM3, MCM5, MED8, MED14, METT12, MKRN1, MRIF1, MTA2, NANOG, NES,
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    5/5
    NRF1, OCT4, ORC41, PA2G4, PAPOLA, PARD3, PELP1, PIWIL2, PKNOX1, POLR2H, POLR3A, POLR3E, POLR3K, POU5F1, PPM1A, PPM1G, PPP2CB, PRKAG1, PRKCA, PRKCD, PRPF4, PRPF38B, PURB, RARS, RBM3, RBM4, RMB5, REST1, RFC2, RFC3, RSC8, SALL4, SESN1, SFRS15, SGPP1, SIRT1, SMARCA4, SMARCC1, SNUPN, SOX2, TAF9, TCEB3, TEFL5, TSTT1, UBTF, UGDH, ou YY1.
  12. 12. Método de acordo com a reivindicação 10, caracterizado pelo fato de que o nível de expressão do pelo menos um gene indicador de infertilidade é determinada usando RT-PCR ou sequenciamento de transcriptoma total.
  13. 13. Método de acordo com a reivindicação 10, caracterizado pelo fato de que o nível de expressão do pelo menos um gene indicador de infertilidade é determinado para um embrião ou um oócito.
  14. 14. Método de acordo com a reivindicação 13, caracterizado pelo fato de que o embrião ou oócito está em desenvolvimento preso.
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