BR112016029090B1 - Método para a detecção de câncer colorretal - Google Patents

Método para a detecção de câncer colorretal Download PDF

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Satoko Kozono
Hitoshi Nobumasa
Satoshi Kondou
Hiroko SUDO
Junpei KAWAUCHI
Atsushi Ochiai
Motohiro Kojima
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National Cancer Center
Toray Industries, Inc
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Abstract

KIT, DISPOSITIVO E MÉTODO PARA A DETECÇÃO DE CÂNCER COLORRETAL. A invenção pretende oferecer um kit ou um dispositivo para a detecção de câncer colorretal e um método para a detecção de câncer colorretal. A presente invenção provê um kit ou um dispositivo para a detecção de câncer colorretal, compreendendo um ácido nucleico capaz de ligar especificamente a um miRNA em uma amostra de um sujeito, e um método para a detecção de câncer colorretal compreendendo a medição do miRNA in vitro.

Description

CAMPO DA INVENÇÃO
[0001] A presente invenção diz respeito a um kit ou um dispositivo para a detecção do câncer colorretal, que compreende um ácido nucleico capaz de se ligar especificamente a um determinado miRNA, que é usado para a análise da presença ou ausência do câncer colorretal em um sujeito, e um método para a detecção do câncer colorretal, que compreende a medição de um nível de expressão de miRNA usando o ácido nucleico.
ANTECEDENTES DA INVENÇÃO
[0002] O intestino grosso é um órgão que armazena o conteúdo residual do intestino após a digestão e absorção, e produz fezes enquanto absorve água. O intestino grosso começa com o ceco, que está ligado ao cólon ascendente, cólon transverso, cólon descendente, cólon sigmoide, reto, e canal anal. De acordo com estatísticas por tipo específico de câncer de 2012 no Japão divulgadas pelo Center for Cancer Control and Information Services, National Cancer Center, o número de pessoas afetadas pelo câncer colorretal foi de 112,772 pessoas. Ou seja, calcula-se que um em aproximadamente 14 japoneses sofrerá de câncer colorretal. O número de casos deste tipo de câncer leva o 2° lugar pelo local do câncer. O número de mortes por câncer colorretal em homens e mulheres juntos sobe para 45,744 pessoas e leva o terceiro lugar pela localização do câncer. Estima-se que um em cerca de 20 americanos desenvolve câncer colorretal. O número estimado de indivíduos americanos afetados pelo câncer colorretal subiu para 96.830 pessoas em 2014, entre os quais cerca de 40.000 pessoas supostamente morreram (literatura não patentária 1).
[0003] Os estádios de progressão do câncer colorretal são especificados na literatura não patentária 2 e classificados em estádio 0 (Tis/N0/M0), estádio I (T1 a T2/N0/M0), estádio II (T3 a T4/N0/M0), estádio IIA (T3/N0/M0), estádio IIB (T4a/N0/M0), estádio IIC (T4b/N0/M0), estádio III (N1 a N2/M0), estádio IIIA (T1 a T2/N1/M0 e T1/N2a/M0), estádio IIIB (T3 a T4a/N1/M0 e T2 a T3/N2a/M0 e T1 a T2/N2b/M0), estádio IIIC (T4a/N2a/M0 e T3 a T4a/N2b/M0 e T4b/N1 a N2/M0), estádio IVA (M1d), e estádio IVB (M1b) de acordo com os graus de disseminação do tumor (Tis e T1 a T4), metástase linfonodal (N0, N1A a N1c e N2a a N2b) e metástases à distância (M0 e M1d a M1b).
[0004] A taxa de sobrevida para o câncer colorretal varia de acordo com as fases de progressão. A literatura não patentária 1 relatou os seguintes valores estatísticos para o câncer de cólon e câncer retal. A taxa de sobrevida relativa em 5 anos do câncer de cólon é declaradamente de 74% para o estádio I, 67% para o estádio IIA, 59% para o estádio IIB, 37% para o estádio IIC, 73% para o estádio III, 46% para o estádio III-B, 28% para o estádio IIIC, e 6% para o estádio IV. Além disso, a taxa de sobrevida relativa em 5 anos do câncer de reto é declaradamente de 74% para o estádio I, 65% para o estádio IIA, 52% para o estádio IIB, 32% para o estádio IIC, 74% para o estádio III, 45% para o estádio IIIB, 33% para o estádio IIIC, e 6% para o estádio IV. Evidentemente, o câncer colorretal em uma fase precoce de progressão conduz a uma elevada taxa de sobrevida. Assim, a detecção precoce e tratamento do câncer colorretal faz uma contribuição significativa para a melhora na taxa de sobrevida.
[0005] O tratamento do câncer colorretal é principalmente a cirurgia de laparotomia ou laparoscopia, que é frequentemente usada em combinação com tratamento pós-operatório com drogas anticâncer ou radioterapia (literatura não patentária 1). Particularmente, o câncer colorretal precoce pode ser adaptável à cirurgia endoscópica, o que permite o tratamento sem a ressecção abdominal.
[0006] Conforme descrito na literatura não patentária 1, teste de sangue oculto nas fezes e endoscopia são amplamente prevalentes como testes para o câncer colorretal. Particularmente, o teste de sangue oculto nas fezes é barato e não invasivo e é também realizado em casa. Portanto, a American Cancer Society recomenda o exame de sangue oculto nas fezes a cada ano. A fim de examinar adicionalmente um tumor local e a propagação do câncer, um exame de imagem, tal como enema de bário, CT, MRI ou também é realizado além da colonoscopia. Alternativamente, os ensaios de marcadores tumorais no sangue, como CEA e CA19-9 podem ser realizados com o objetivo de observar o prognóstico ou os efeitos terapêuticos em pacientes já diagnosticados com câncer colorretal (literatura não patentária1).
[0007] Conforme mostrado nas Literaturas Patentárias de 1 a 4, existem relatos, embora em fase de investigação, de determinação do câncer colorretal utilizando níveis de expressão de microRNAs (miRNAs), ou combinações dos níveis de expressão de miRNAs e níveis de expressão de marcadores proteicos adicionais em amostras biológicas, incluindo o sangue.
[0008] A literatura patentária1 revela um método para a detecção do câncer colorretal ou de outros cânceres utilizando hsa-miR-92a-2-5p, hsa- miR-128-2-5p, e Hsa-miR-24-3p em tecidos de câncer colorretal.
[0009] A literatura patentária 2 revela um método para a detecção de câncer colorretal utilizando hsa-miR-1233-5p e hsa-miR-1225-3p no plasma.
[0010] A literatura patentária 3 divulga um método para a detecção de câncer colorretal usando diversos miRNAs tais como hsa-miR- 1231, hsa-miR-423-5p, e hsa-miR-1268a em tecidos do intestino grosso ou fezes.
[0011] A literatura patentária 4 revela um método para a detecção de câncer colorretal utilizando hsa-miR-150-3p, miR-92a-2-5p e similares em tecidos. LISTA DE CITAÇÕES Literatura Patentária Literatura patentária 1: Publicação Internacional WO 2007/081740; Literatura patentária 2: Pedido de Patente Publicado US 2013/102487; Literatura patentária 3: Pedido de Patente Publicado US 2012/088687; e Literatura patentária 4: Publicação de Patente JP (Kohyo) N° 2009-531.019 A (2009). Literatura não patentária Literatura não patentária 1: American Cancer Society, “Colorectal Cancer”, 2013, p. 5 a 6, 17 a 28, 33 a 45 a 54, e 67 a 71; Literatura não patentária 2: Sobin, L. et al., “TNM Classification of Malignant Tumours, the 7th edition”, 2010, p. 94-99; Literatura não patentária 3: Allison, JE. et al., 1996, The New England Journal of Medicine, Vol. 334 (3), p. 155-9; e Literatura não patentária 4: Palmqvist, R. et al., 2007, Diseases of colon and rectum, Vol. 46 (11), p. 1538-44.
DESCRIÇÃO RESUMIDA DA INVENÇÃO PROBLEMA TÉCNICO
[0012] Um objeto da presente invenção é o de encontrar um novo marcador tumoral para o câncer colorretal e proporcionar um método que pode detectar eficazmente o câncer colorretal utilizando um ácido nucleico capaz de se ligar especificamente ao marcador. O exame de sangue oculto nas fezes, que é amplamente utilizado na atualidade como primeiro teste para o câncer colorretal, produz resultados positivos mesmo por razões não cancerosas, tal como por hemorroidas, enquanto não consegue detectar o câncer colorretal precoce, sem sangramento e subestima em 90% ou mais as anormalidades no intestino grosso (incluindo o câncer) de acordo com o relatório (literatura não patentária 1). A sensibilidade específica do exame de sangue oculto nas fezes difere grandemente de 37% a 79,4%, dependendo do kit de teste usado, e sua especificidade é declaradamente de 86,7% a 97,7% (literatura não patentária 3). Embora a colonoscopia seja conhecida por ter elevada acurácia de análise, este exame é de difícil aplicação como triagem primária devido à necessidade de pré-tratamento ou sedação em pacientes, e um custo relativamente elevado, etc. (literatura não patentária 1). Os marcadores tumorais, como CEA e CA19-9 no sangue podem elevar em outros cânceres além do colorretal e, portanto, alegadamente falham em determinar a presença ou ausência de câncer colorretal. O falso diagnóstico de outros tipos de câncer como sendo câncer colorretal desperdiça a oportunidade terapêutica adequada e dá lugar a ônus econômicos e físicos desnecessários aos pacientes devido à aplicação de terapêutica equivocada. Portanto, o uso da CEA ou CA19-9 é muitas vezes limitado à observação do prognóstico e dos efeitos terapêuticos em pacientes já diagnosticados com câncer colorretal (literatura não patentária 1). O relatório afirma que o teste CEA tem especificidade de 99%, mas a sensibilidade de apenas 12%, sugerindo que a significância de medição do marcador tumoral como teste de rastreio do câncer colorretal é pobre (literatura não patentária 4).
[0013] Tal como descrito abaixo, há relatos, embora a uma fase de investigação, de determinação do câncer colorretal utilizando níveis de microRNAs (miRNAs) em amostras biológicas, incluindo sangue, nenhum dos quais, no entanto, foi posto em uso prático.
[0014] A literatura patentária1 revela um método para a detecção do câncer colorretal ou de outros cânceres utilizando hsa-miR-92a-2-5p, hsa- miR-128-2-5p, e hsa-miR-24-3p em tecidos de câncer colorretal. Este método de detecção, no entanto, exige a obtenção de amostras de tecido de câncer colorretal por operação cirúrgica, e esta etapa coloca um pesado fardo físico sobre os pacientes. Portanto, este método não é favorável como método de análise. Além disso, este método de detecção não descreve o desempenho de detecção específica do câncer colorretal, tal como acurácia, sensibilidade, e, portanto, é industrialmente menos prático.
[0015] A literatura patentária 3 divulga um método para a detecção de câncer colorretal usando diversos miRNAs tais como hsa-miR- 1231, hsa-miR-423-5p, e hsa-miR-1268a em tecidos do intestino grosso ou fezes. Uma vez que a operação cirúrgica para a obtenção de tecidos de câncer colorretal coloca um fardo físico pesado sobre os pacientes, este método não é favorável como método de análise. Além disso, embora a coleta de amostras fecais não seja invasiva, as substâncias de ensaio podem existir de forma desigual nas fezes. Isso tende a causar variações desfavoráveis nos resultados dos testes.
[0016] A literatura patentária 4 revela um método para a detecção de câncer colorretal utilizando hsa-miR-150-3p, miR-92a-2-5p e similares em tecidos. Essa literatura, entretanto, não descreve o desempenho de detecção como acurácia, sensibilidade ou especificidade, nem descreve um método específico para a determinação do câncer colorretal utilizando o sangue. Por esse motivo, este método é industrialmente menos prático. Além disso, estes miRNA marcadores não foram validados em um grupo de amostras independentes e são, portanto, menos fiáveis.
[0017] Conforme mencionado acima, os marcadores tumorais existentes exibem baixo rendimento na detecção de câncer colorretal, ou nem o desempenho nem métodos de detecção são especificamente mostrados para os marcadores em uma fase de investigação. Portanto, o uso destes marcadores poderia levar à imposição de exames adicionais desnecessários devido à falsa detecção de indivíduos saudáveis como pacientes com câncer colorretal, ou pode desperdiçar a oportunidade terapêutica devido à subestimação de pacientes com câncer colorretal. Além disso, a medição de várias dezenas a várias centenas de miRNAs aumenta os custos do exame e, por esse motivo, é de difícil uso no rastreio em larga escala, tal como em um exame médico. Além disso, a coleta de tecidos colorretais para mensurar os marcadores tumorais é altamente invasiva para os pacientes e não é favorável. Portanto, existe a procura de um marcador para o câncer colorretal altamente preciso que seja detectável a partir do sangue, que pode ser coletado de uma maneira menos invasiva, e seja capaz de determinar corretamente um paciente com câncer colorretal como um paciente com câncer colorretal e um sujeito saudável como um sujeito saudável. A detecção precoce e tratamento do câncer colorretal podem melhorar drasticamente as taxas de sobrevida. Além disso, a detecção precoce do câncer colorretal leva à aplicabilidade da cirurgia endoscópica permitindo um tratamento sem resecção abdominal. Portanto, um marcador de câncer colorretal altamente sensível que pode detectar o câncer colorretal, mesmo em uma fase precoce da progressão, é desejado.
SOLUÇÃO DO PROBLEMA
[0018] Os presentes inventores conduziram estudos diligentes para atingir o objetivo e, dessa forma, concluíram a presente invenção, encontrando múltiplos genes utilizáveis como marcadores para a detecção do câncer colorretal a partir do sangue, que pode ser coletado com invasividade limitada, e encontraram que o câncer colorretal pode ser significativamente detectado usando ácidos nucleicos capazes de se ligar especificamente a qualquer um desses marcadores.
DESCRIÇÃO RESUMIDA DA INVENÇÃO
[0019] Especificamente, a presente invenção tem as seguintes características.
[0020] (1) Um kit para a detecção de câncer colorretal que compreende um ácido nucleico capaz de se ligar especificamente a pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir do grupo consistindo nos marcadores de câncer colorretal miR-6726-5p, miR-4257, miR-6787-5p, miR-6780b-5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343-3p, miR- 1247-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR-6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR-1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744- 5p, miR-4792, miR-564, miR-6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665- 3p, miR-4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1- 5p, miR-6724-5p, miR-1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR-7110-5p, miR- 187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749-5p, miR-6515-3p, miR-3937, miR-6840-3p, miR-6893-5p, miR- 4728-5p, miR-6717-5p, miR-7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109- 5p, miR-6842-5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR-6126, miR- 4449, miR-4706, miR-1913, miR-602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR-4632-5p, miR-6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-887- 3p, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195-3p, miR- 6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR-1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR-3620-5p, miR- 1915-5p, miR-4294, miR-642a-3p, miR-371a-5p, miR-940, miR-4450, miR- 4723-5p, miR-1469, miR-6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR-6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR-125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR-4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-671-5p, miR-4454, miR-4516, miR-7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR-6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782- 5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777-5p, miR-6785-5p, miR-7106-5p, miR- 3663-3p, miR-6131, miR-1915-3p, miR-4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR- 4638-5p, miR-3656, miR-3621, miR-6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR- 3135b, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765-3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR-6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR- 6870-5p, miR-6722-3p, miR-7977, miR-4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR- 6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803-5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR- 4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p, miR-4763-3p, miR- 6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR- 6752-5p e miR-135a-3p.
[0021] (2) O kit de acordo com (1), em que miR-6726-5p é hsa- miR-6726-5p, miR-4257 é hsa-miR-4257, miR-6787-5p é hsa-miR-6787-5p, miR-6780b-5p é hsa-miR-6780b-5p, miR-3131 é hsa-miR-3131, miR-7108-5p é hsa-miR-7108-5p, miR-1343-3p é hsa-miR-1343-3p, miR-1247-3p é hsa- miR-1247-3p, miR-4651 é hsa-miR-4651, miR-6757-5p é hsa-miR-6757-5p, miR-3679-5p é hsa-miR-3679-5p, miR-7641 é hsa-miR-7641, miR-6746-5p é hsa-miR-6746-5p, miR-8072 é hsa-miR-8072, miR-6741-5p é hsa-miR-6741- 5p, miR-1908-5p é hsa-miR-1908-5p, miR-6857-5p é hsa-miR-6857-5p, miR- 4746-3p é hsa-miR-4746-3p, miR-744-5p é hsa-miR-744-5p, miR-4792 é hsa- miR-4792, miR-564 é hsa-miR-564, miR-6791-5p é hsa-miR-6791-5p, miR- 6825-5p é hsa-miR-6825-5p, miR-6826-5p é hsa-miR-6826-5p, miR-4665-3p é hsa-miR-4665-3p, miR-4467 é hsa-miR-4467, miR-3188 é hsa-miR-3188, miR-6125 é hsa-miR-6125, miR-6756-5p é hsa-miR-6756-5p, miR-1228-3p é hsa-miR-1228-3p, miR-8063 é hsa-miR-8063, miR-8069 é hsa-miR-8069, miR-6875-5p é hsa-miR-6875-5p, miR-3185 é hsa-miR-3185, miR-4433b-3p é hsa-miR-4433b-3p, miR-6887-5p é hsa-miR-6887-5p, miR-128-1-5p é hsa- miR-128-1-5p, miR-6724-5p é hsa-miR-6724-5p, miR-1914-3p é hsa-miR- 1914-3p, miR-1225-5p é hsa-miR-1225-5p, miR-4419b é hsa-miR-4419b, miR-7110-5p é hsa-miR-7110-5p, miR-187-5p é hsa-miR-187-5p, miR-3184- 5p é hsa-miR-3184-5p, miR-204-3p é hsa-miR-204-3p, miR-5572 é hsa-miR- 5572, miR-6729-5p é hsa-miR-6729-5p, miR-615-5p é hsa-miR-615-5p, miR- 6749-5p é hsa-miR-6749-5p, miR-6515-3p é hsa-miR-6515-3p, miR-3937 é hsa-miR-3937, miR-6840-3p é hsa-miR-6840-3p, miR-6893-5p é hsa-miR- 6893-5p, miR-4728-5p é hsa-miR-4728-5p, miR-6717-5p é hsa-miR-6717-5p, miR-7113-3p é hsa-miR-7113-3p, miR-4665-5p é hsa-miR-4665-5p, miR- 642b-3p é hsa-miR-642b-3p, miR-7109-5p é hsa-miR-7109-5p, miR-6842-5p é hsa-miR-6842-5p, miR-4442 é hsa-miR-4442, miR-4433-3p é hsa-miR- 4433-3p, miR-4707-5p é hsa-miR-4707-5p, miR-6126 é hsa-miR-6126, miR- 4449 é hsa-miR-4449, miR-4706 é hsa-miR-4706, miR-1913 é hsa-miR-1913, miR-602 é hsa-miR-602, miR-939-5p é hsa-miR-939-5p, miR-4695-5p é hsa- miR-4695-5p, miR-711 é hsa-miR-711, miR-6816-5p é hsa-miR-6816-5p, miR- 4632-5p é hsa-miR-4632-5p, miR-6721-5p é hsa-miR-6721-5p, miR-7847-3p é hsa-miR-7847-3p, miR-6132 é hsa-miR-6132, miR-887-3p é hsa-miR-887- 3p, miR-3679-3p é hsa-miR-3679-3p, miR-6784-5p é hsa-miR-6784-5p, miR- 1249 é hsa-miR-1249, miR-937-5p é hsa-miR-937-5p, miR-5195-3p é hsa- miR-5195-3p, miR-6732-5p é hsa-miR-6732-5p, miR-4417 é hsa-miR-4417, miR-4281 é hsa-miR-4281, miR-4734 é hsa-miR-4734, miR-6766-3p é hsa- miR-6766-3p, miR-663a é hsa-miR-663a, miR-4513 é hsa-miR-4513, miR- 6781-5p é hsa-miR-6781-5p, miR-1227-5p é hsa-miR-1227-5p, miR-6845-5p é hsa-miR-6845-5p, miR-6798-5p é hsa-miR-6798-5p, miR-3620-5p é hsa- miR-3620-5p, miR-1915-5p é hsa-miR-1915-5p, miR-4294 é hsa-miR-4294, miR-642a-3p é hsa-miR-642a-3p, miR-371a-5p é hsa-miR-371a-5p, miR-940 é hsa-miR-940, miR-4450 é hsa-miR-4450, miR-4723-5p é hsa-miR-4723-5p, miR-1469 é hsa-miR-1469, miR-6861-5p é hsa-miR-6861-5p, miR-7975 é hsa-miR-7975, miR-6879-5p é hsa-miR-6879-5p, miR-6802-5p é hsa-miR- 6802-5p, miR-1268b é hsa-miR-1268b, miR-663b é hsa-miR-663b, miR-125a- 3p é hsa-miR-125a-3p, miR-2861 é hsa-miR-2861, miR-6088 é hsa-miR-6088, miR-4758-5p é hsa-miR-4758-5p, miR-296-3p é hsa-miR-296-3p, miR-6738- 5p é hsa-miR-6738-5p, miR-671-5p é hsa-miR-671-5p, miR-4454 é hsa-miR- 4454, miR-4516 é hsa-miR-4516, miR-7845-5p é hsa-miR-7845-5p, miR-4741 é hsa-miR-4741, miR-92b-5p é hsa-miR-92b-5p, miR-6795-5p é hsa-miR- 6795-5p, miR-6805-3p é hsa-miR-6805-3p, miR-4725-3p é hsa-miR-4725-3p, miR-6782-5p é hsa-miR-6782-5p, miR-4688 é hsa-miR-4688, miR-6850-5p é hsa-miR-6850-5p, miR-6777-5p é hsa-miR-6777-5p, miR-6785-5p é hsa-miR- 6785-5p, miR-7106-5p é hsa-miR-7106-5p, miR-3663-3p é hsa-miR-3663-3p, miR-6131 é hsa-miR-6131, miR-1915-3p é hsa-miR-1915-3p, miR-4532 é hsa-miR-4532, miR-6820-5p é hsa-miR-6820-5p, miR-4689 é hsa-miR-4689, miR-4638-5p é hsa-miR-4638-5p, miR-3656 é hsa-miR-3656, miR-3621 é hsa-miR-3621, miR-6769b-5p é hsa-miR-6769b-5p, miR-149-3p é hsa-miR- 149-3p, miR-23b-3p é hsa-miR-23b-3p, miR-3135b é hsa-miR-3135b, miR- 6848-5p é hsa-miR-6848-5p, miR-6769a-5p é hsa-miR-6769a-5p, miR-4327 é hsa-miR-4327, miR-6765-3p é hsa-miR-6765-3p, miR-6716-5p é hsa-miR- 6716-5p, miR-6877-5p é hsa-miR-6877-5p, miR-6727-5p é hsa-miR-6727-5p, miR-4534 é hsa-miR-4534, miR-614 é hsa-miR-614, miR-1202 é hsa-miR- 1202, miR-575 é hsa-miR-575, miR-6870-5p é hsa-miR-6870-5p, miR-6722- 3p é hsa-miR-6722-3p, miR-7977 é hsa-miR-7977, miR-4649-5p é hsa-miR- 4649-5p, miR-4675 é hsa-miR-4675, miR-6075 é hsa-miR-6075, miR-6779-5p é hsa-miR-6779-5p, miR-4271 é hsa-miR-4271, miR-3196 é hsa-miR-3196, miR-6803-5p é hsa-miR-6803-5p, miR-6789-5p é hsa-miR-6789-5p, miR-4648 é hsa-miR-4648, miR-4508 é hsa-miR-4508, miR-4749-5p é hsa-miR-4749- 5p, miR-4505 é hsa-miR-4505, miR-5698 é hsa-miR-5698, miR-1199-5p é hsa-miR-1199-5p, miR-4763-3p é hsa-miR-4763-3p, miR-6836-3p é hsa-miR- 6836-3p, miR-3195 é hsa-miR-3195, miR-718 é hsa-miR-718, miR-3178 é hsa-miR-3178, miR-638 é hsa-miR-638, miR-4497 é hsa-miR-4497, miR-6085 é hsa-miR-6085, miR-6752-5p é hsa-miR-6752-5p, e miR-135a-3p é hsa-miR- 135a-3p.
[0022] (3) O kit de acordo com (1) ou (2), em que o ácido nucleico é um polinucleotídeo selecionado a partir do grupo consistindo nos seguintes polinucleotídeos de (a) a (e): (a) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T; uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (b) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614; (c) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, derivado do mesmo, ou fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (d) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; e (e) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (a) a (d).
[0023] (4) O kit de acordo com qualquer um de (1) a (3), em que o dispositivo compreende ainda um ácido nucleico capaz de se ligar especificamente a pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir do grupo que consiste em outros marcadores do câncer colorretal; miR- 1231-5p, miR-1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR-92a-2-5p, miR-423- 5p, miR-1268a, miR-128-2-5p e miR-24-3p.
[0024] (5) O kit de acordo com (4), em que miR-1231 é hsa-miR- 1231, miR-1233-5p é hsa-miR-1233-5p, miR-150-3p é hsa-miR-150-3p, miR- 1225-3p é hsa-miR-1225-3p, miR-92a-2-5p é hsa-miR-92a-2-5p, miR-423-5p é hsa-miR-423-5p, miR-1268a é hsa-miR-1268a, miR-128-2-5p é hsa-miR- 128-2-5p, e miR-24-3p é hsa-miR-24-3p.
[0025] (6) O kit de acordo com (4) ou (5), em que o ácido nucleico é um polinucleotídeo selecionado a partir do grupo consistindo nos seguintes polinucleotídeos de (f) a (j):
[0026] (f) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (g) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOS: 172 a 180; (h) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (i) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; e (j) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (f) a (i).
[0027] (7) O kit de acordo com qualquer um de (1) a (6), em que o dispositivo compreende ainda um ácido nucleico capaz de se ligar especificamente a pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir do grupo que consiste em outros marcadores do câncer colorretal miR- 4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR-4486, miR-7107-5p, miR-23a-3p, miR- 4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR-8059, miR-6813-5p, miR-4492, miR- 4476 e miR-6090.
[0028] (8) O kit de acordo com (7), em que miR-4697-5p é hsa- miR-4697-5p, miR-3197 é hsa-miR-3197, miR-675-5p é hsa-miR-675-5p, miR- 4486 é hsa-miR-4486, miR-7107-5p é hsa-miR-7107-5p, miR-23a-3p é hsa- miR-23a-3p, miR-4667-5p é hsa-miR-4667-5p, miR-451a é hsa-miR-451a, miR-3940-5p é hsa-miR-3940-5p, miR-8059 é hsa-miR-8059, miR-6813-5p é hsa-miR-6813-5p, miR-4492 é hsa-miR-4492, miR-4476 é hsa-miR-4476, e miR-6090 é hsa-miR-6090.
[0029] (9) O kit de acordo com (7) ou (8), em que o ácido nucleico é um polinucleotídeo selecionado a partir do grupo consistindo nos seguintes polinucleotídeos de (k) a (o): (k) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (l) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOS: 181 a 194; (m) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (n) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; e (o) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (k) a (n).
[0030] (10) O kit de acordo com qualquer um de (1) a (9), em que o kit compreende pelo menos dois ou mais ácidos nucleicos capazes de se ligar especificamente a pelo menos dois ou mais polinucleotídeos, respectivamente, selecionados a partir do grupo consistindo em todos os marcadores de câncer colorretal de acordo com (1) ou (2).
[0031] (11) Um dispositivo para a detecção de câncer colorretal que compreende um ácido nucleico capaz de se ligar especificamente a pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir do grupo consistindo nos marcadores de câncer colorretal miR-6726-5p, miR-4257, miR-6787-5p, miR-6780b-5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343-3p, miR- 1247-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR-6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR-1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744- 5p, miR-4792, miR-564, miR-6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665- 3p, miR-4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1- 5p, miR-6724-5p, miR-1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR-7110-5p, miR- 187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749-5p, miR-6515-3p, miR-3937, miR-6840-3p, miR-6893-5p, miR- 4728-5p, miR-6717-5p, miR-7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109- 5p, miR-6842-5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR-6126, miR- 4449, miR-4706, miR-1913, miR-602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR-4632-5p, miR-6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-887- 3p, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195-3p, miR- 6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR-1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR-3620-5p, miR- 1915-5p, miR-4294, miR-642a-3p, miR-371a-5p, miR-940, miR-4450, miR- 4723-5p, miR-1469, miR-6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR-6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR-125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR-4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-671-5p, miR-4454, miR-4516, miR-7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR-6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782- 5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777-5p, miR-6785-5p, miR-7106-5p, miR- 3663-3p, miR-6131, miR-1915-3p, miR-4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR- 4638-5p, miR-3656, miR-3621, miR-6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR- 3135b, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765-3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR-6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR- 6870-5p, miR-6722-3p, miR-7977, miR-4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR- 6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803-5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR- 4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p, miR-4763-3p, miR- 6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR- 6752-5p e miR-135a-3p.
[0032] (12) O dispositivo de acordo com (11), em que miR-6726- 5p é hsa-miR-6726-5p, miR-4257 é hsa-miR-4257, miR-6787-5p é hsa-miR- 6787-5p, miR-6780b-5p é hsa-miR-6780b-5p, miR-3131 é hsa-miR-3131, miR-7108-5p é hsa-miR-7108-5p, miR-1343-3p é hsa-miR-1343-3p, miR- 1247-3p é hsa-miR-1247-3p, miR-4651 é hsa-miR-4651, miR-6757-5p é hsa- miR-6757-5p, miR-3679-5p é hsa-miR-3679-5p, miR-7641 é hsa-miR-7641, miR-6746-5p é hsa-miR-6746-5p, miR-8072 é hsa-miR-8072, miR-6741-5p é hsa-miR-6741-5p, miR-1908-5p é hsa-miR-1908-5p, miR-6857-5p é hsa-miR- 6857-5p, miR-4746-3p é hsa-miR-4746-3p, miR-744-5p é hsa-miR-744-5p, miR-4792 é hsa-miR-4792, miR-564 é hsa-miR-564, miR-6791-5p é hsa-miR- 6791-5p, miR-6825-5p é hsa-miR-6825-5p, miR-6826-5p é hsa-miR-6826-5p, miR-4665-3p é hsa-miR-4665-3p, miR-4467 é hsa-miR-4467, miR-3188 é hsa-miR-3188, miR-6125 é hsa-miR-6125, miR-6756-5p é hsa-miR-6756-5p, miR-1228-3p é hsa-miR-1228-3p, miR-8063 é hsa-miR-8063, miR-8069 é hsa-miR-8069, miR-6875-5p é hsa-miR-6875-5p, miR-3185 é hsa-miR-3185, miR-4433b-3p é hsa-miR-4433b-3p, miR-6887-5p é hsa-miR-6887-5p, miR- 128-1-5p é hsa-miR-128-1-5p, miR-6724-5p é hsa-miR-6724-5p, miR-1914-3p é hsa-miR-1914-3p, miR-1225-5p é hsa-miR-1225-5p, miR-4419b é hsa-miR- 4419b, miR-7110-5p é hsa-miR-7110-5p, miR-187-5p é hsa-miR-187-5p, miR- 3184-5p é hsa-miR-3184-5p, miR-204-3p é hsa-miR-204-3p, miR-5572 é hsa- miR-5572, miR-6729-5p é hsa-miR-6729-5p, miR-615-5p é hsa-miR-615-5p, miR-6749-5p é hsa-miR-6749-5p, miR-6515-3p é hsa-miR-6515-3p, miR-3937 é hsa-miR-3937, miR-6840-3p é hsa-miR-6840-3p, miR-6893-5p é hsa-miR- 6893-5p, miR-4728-5p é hsa-miR-4728-5p, miR-6717-5p é hsa-miR-6717-5p, miR-7113-3p é hsa-miR-7113-3p, miR-4665-5p é hsa-miR-4665-5p, miR- 642b-3p é hsa-miR-642b-3p, miR-7109-5p é hsa-miR-7109-5p, miR-6842-5p é hsa-miR-6842-5p, miR-4442 é hsa-miR-4442, miR-4433-3p é hsa-miR- 4433-3p, miR-4707-5p é hsa-miR-4707-5p, miR-6126 é hsa-miR-6126, miR- 4449 é hsa-miR-4449, miR-4706 é hsa-miR-4706, miR-1913 é hsa-miR-1913, miR-602 é hsa-miR-602, miR-939-5p é hsa-miR-939-5p, miR-4695-5p é hsa- miR-4695-5p, miR-711 é hsa-miR-711, miR-6816-5p é hsa-miR-6816-5p, miR- 4632-5p é hsa-miR-4632-5p, miR-6721-5p é hsa-miR-6721-5p, miR-7847-3p é hsa-miR-7847-3p, miR-6132 é hsa-miR-6132, miR-887-3p é hsa-miR-887- 3p, miR-3679-3p é hsa-miR-3679-3p, miR-6784-5p é hsa-miR-6784-5p, miR- 1249 é hsa-miR-1249, miR-937-5p é hsa-miR-937-5p, miR-5195-3p é hsa- miR-5195-3p, miR-6732-5p é hsa-miR-6732-5p, miR-4417 é hsa-miR-4417, miR-4281 é hsa-miR-4281, miR-4734 é hsa-miR-4734, miR-6766-3p é hsa- miR-6766-3p, miR-663a é hsa-miR-663a, miR-4513 é hsa-miR-4513, miR- 6781-5p é hsa-miR-6781-5p, miR-1227-5p é hsa-miR-1227-5p, miR-6845-5p é hsa-miR-6845-5p, miR-6798-5p é hsa-miR-6798-5p, miR-3620-5p é hsa- miR-3620-5p, miR-1915-5p é hsa-miR-1915-5p, miR-4294 é hsa-miR-4294, miR-642a-3p é hsa-miR-642a-3p, miR-371a-5p é hsa-miR-371a-5p, miR-940 é hsa-miR-940, miR-4450 é hsa-miR-4450, miR-4723-5p é hsa-miR-4723-5p, miR-1469 é hsa-miR-1469, miR-6861-5p é hsa-miR-6861-5p, miR-7975 é hsa-miR-7975, miR-6879-5p é hsa-miR-6879-5p, miR-6802-5p é hsa-miR- 6802-5p, miR-1268b é hsa-miR-1268b, miR-663b é hsa-miR-663b, miR-125a- 3p é hsa-miR-125a-3p, miR-2861 é hsa-miR-2861, miR-6088 é hsa-miR-6088, miR-4758-5p é hsa-miR-4758-5p, miR-296-3p é hsa-miR-296-3p, miR-6738- 5p é hsa-miR-6738-5p, miR-671-5p é hsa-miR-671-5p, miR-4454 é hsa-miR- 4454, miR-4516 é hsa-miR-4516, miR-7845-5p é hsa-miR-7845-5p, miR-4741 é hsa-miR-4741, miR-92b-5p é hsa-miR-92b-5p, miR-6795-5p é hsa-miR- 6795-5p, miR-6805-3p é hsa-miR-6805-3p, miR-4725-3p é hsa-miR-4725-3p, miR-6782-5p é hsa-miR-6782-5p, miR-4688 é hsa-miR-4688, miR-6850-5p é hsa-miR-6850-5p, miR-6777-5p é hsa-miR-6777-5p, miR-6785-5p é hsa-miR- 6785-5p, miR-7106-5p é hsa-miR-7106-5p, miR-3663-3p é hsa-miR-3663-3p, miR-6131 é hsa-miR-6131, miR-1915-3p é hsa-miR-1915-3p, miR-4532 é hsa-miR-4532, miR-6820-5p é hsa-miR-6820-5p, miR-4689 é hsa-miR-4689, miR-4638-5p é hsa-miR-4638-5p, miR-3656 é hsa-miR-3656, miR-3621 é hsa-miR-3621, miR-6769b-5p é hsa-miR-6769b-5p, miR-149-3p é hsa-miR- 149-3p, miR-23b-3p é hsa-miR-23b-3p, miR-3135b é hsa-miR-3135b, miR- 6848-5p é hsa-miR-6848-5p, miR-6769a-5p é hsa-miR-6769a-5p, miR-4327 é hsa-miR-4327, miR-6765-3p é hsa-miR-6765-3p, miR-6716-5p é hsa-miR- 6716-5p, miR-6877-5p é hsa-miR-6877-5p, miR-6727-5p é hsa-miR-6727-5p, miR-4534 é hsa-miR-4534, miR-614 é hsa-miR-614, miR-1202 é hsa-miR- 1202, miR-575 é hsa-miR-575, miR-6870-5p é hsa-miR-6870-5p, miR-6722- 3p é hsa-miR-6722-3p, miR-7977 é hsa-miR-7977, miR-4649-5p é hsa-miR- 4649-5p, miR-4675 é hsa-miR-4675, miR-6075 é hsa-miR-6075, miR-6779-5p é hsa-miR-6779-5p, miR-4271 é hsa-miR-4271, miR-3196 é hsa-miR-3196, miR-6803-5p é hsa-miR-6803-5p, miR-6789-5p é hsa-miR-6789-5p, miR-4648 é hsa-miR-4648, miR-4508 é hsa-miR-4508, miR-4749-5p é hsa-miR-4749- 5p, miR-4505 é hsa-miR-4505, miR-5698 é hsa-miR-5698, miR-1199-5p é hsa-miR-1199-5p, miR-4763-3p é hsa-miR-4763-3p, miR-6836-3p é hsa-miR- 6836-3p, miR-3195 é hsa-miR-3195, miR-718 é hsa-miR-718, miR-3178 é hsa-miR-3178, miR-638 é hsa-miR-638, miR-4497 é hsa-miR-4497, miR-6085 é hsa-miR-6085, miR-6752-5p é hsa-miR-6752-5p, e miR-135a-3p é hsa-miR- 135a-3p.
[0033] (13) O dispositivo de acordo com (11) ou (12), em que o ácido nucleico é um polinucleotídeo selecionado a partir do grupo consistindo nos seguintes polinucleotídeos de (a) a (e): (a) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T; uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (b) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614; (c) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, derivado do mesmo, ou fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (d) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; e (e) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (a) a (d).
[0034] (14) O dispositivo de acordo com qualquer um de (11) a (13), em que o dispositivo compreende ainda um ácido nucleico capaz de se ligar especificamente a pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir do grupo consistindo em outros marcadores do câncer colorretal miR-1231, miR-1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR-92a-2-5p, miR-423-5p, miR-1268a, miR-128-2-5p e miR-24-3p.
[0035] (15) O dispositivo de acordo com (14), em que miR-1231 é hsa-miR-1231, miR-1233-5p é hsa-miR-1233-5p, miR-150-3p é hsa-miR- 150-3p, miR-1225-3p é hsa-miR-1225-3p, miR-92a-2-5p é hsa-miR-92a-2-5p, miR-423-5p é hsa-miR-423-5p, miR-1268a é hsa-miR-1268a, miR-128-2-5p é hsa-miR-128-2-5p, e miR-24-3p é hsa-miR-24-3p.
[0036] (16) O dispositivo de acordo com (14) ou (15), em que o ácido nucleico é um polinucleotídeo selecionado a partir do grupo consistindo nos seguintes polinucleotídeos de (f) a (j): (f) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (g) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOS: 172 a 180; (h) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (i) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; e (j) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (f) a (i).
[0037] (17) O dispositivo de acordo com qualquer um de (11) a (16), em que o dispositivo compreende ainda um ácido nucleico capaz de se ligar especificamente a pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir do grupo consistindo em outros marcadores do câncer colorretal miR-4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR-4486, miR-7107-5p, miR- 23a-3p, miR-4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR-8059, miR-6813-5p, miR- 4492, miR-4476, e miR-6090.
[0038] (18) O dispositivo de acordo com (17), em que miR-4697- 5p é hsa-miR-4697-5p, miR-3197 é hsa-miR-3197, miR-675-5p é hsa-miR- 675-5p, miR-4486 é hsa-miR-4486, miR-7107-5p é hsa-miR-7107-5p, miR- 23a-3p é hsa-miR-23a-3p, miR-4667-5p é hsa-miR-4667-5p, miR-451a é hsa- miR-451a, miR-3940-5p é hsa-miR-3940-5p, miR-8059 é hsa-miR-8059, miR- 6813-5p é hsa-miR-6813-5p, miR-4492 é hsa-miR-4492, miR-4476 é hsa- miR-4476, e miR-6090 é hsa-miR-6090.
[0039] (19) O dispositivo de acordo com (17) ou (18), em que o ácido nucleico é um polinucleotídeo selecionado a partir do grupo consistindo nos seguintes polinucleotídeos de (k) a (o): (k) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (l) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOS: 181 a 194; (m) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (n) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; e (o) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (k) a (n).
[0040] (20) O dispositivo de acordo com qualquer um de (11) a (19), em que o dispositivo é um dispositivo para a medição baseada por uma técnica de hibridização.
[0041] (21) O dispositivo de acordo com (20), em que a técnica de hibridização é uma técnica de arranjo de ácido nucleico (nucleic acid array technique).
[0042] (22) O dispositivo de acordo com qualquer um de (11) a (21), em que o dispositivo compreende pelo menos dois ou mais ácidos nucleicos capazes de se ligar especificamente a pelo menos dois ou mais polinucleotídeos, respectivamente, selecionados a partir de todos os marcadores de câncer colorretal de acordo com (11) ou (12).
[0043] (23) Um método para a detecção do câncer colorretal, compreendendo a medição de um nível de expressão de um ácido nucleico alvo em uma amostra de um sujeito utilizando um kit de acordo com qualquer exemplo dentre (1) a (10) ou um dispositivo de acordo com qualquer exemplo dentre (11) a (22), e a avaliação in vitro para determinar se o sujeito possui ou não o câncer colorretal utilizando tanto o nível de expressão mensurado quanto um nível de expressão de controle obtido em uma amostra de um sujeito saudável mensurado da mesma maneira.
[0044] (24) O método de acordo com (23), em que o sujeito é um ser humano.
[0045] (25) O método de acordo com (23) ou (24), em que a amostra é sangue, soro, ou plasma.
DEFINIÇÃO DE TERMOS
[0046] Os termos utilizados na presente divulgação são definidos os seguintes.
[0047] As abreviaturas ou termos como “nucleotídeo”, “polinucleotídeo”, “DNA”, e “RNA” respeitam as “Diretrizes para a elaboração de relatório descritivo contendo sequências de nucleotídeos e/ou aminoácidos (Guidelines for the preparation of specification which contain nucleotide and/or amino acid sequences)” (editado pelo Japan Patent Office) e o uso comum no estado da técnica.
[0048] O termo “polinucleotídeo”, utilizado na presente invenção é usado para se referir a um ácido nucleico incluindo qualquer RNA, DNA e RNA/DNA (quimera). O DNA inclui qualquer DNA, seja cDNA, DNA genômico, e DNA sintético. O RNA inclui qualquer RNA, como RNA total, mRNA, rRNA, miRNA, siRNA, snoRNA, snRNA, RNA não codificante e RNA sintético. No presente relatório, “DNA sintético” e “RNA sintético” referem-se ao DNA e RNA artificialmente preparados utilizando, por exemplo, um sintetizador automático de ácidos nucleicos, com base em sequências nucleotídicas pré- determinadas (que podem ser quaisquer sequências, naturais e não naturais). A expressão “sequência não natural” destina-se a ser utilizada em um sentido amplo e inclui, por exemplo, uma sequência que compreende a substituição, deleção, inserção e/ou adição de um ou mais nucleotídeos (ou seja, uma sequência variante) e uma sequência que compreende um ou mais nucleotídeos modificados (ou seja, uma sequência modificada), que são diferentes da sequência natural. Na presente invenção, o termo “polinucleotídeo” é utilizado de maneira alternada com o termo “ácido nucleico”.
[0049] O termo “fragmento” utilizado na presente invenção é um polinucleotídeo possuindo uma sequência nucleotídica que consiste em uma porção consecutiva de um polinucleotídeo e, desejavelmente, tem um comprimento de 15 ou mais nucleotídeos, de preferência 17 ou mais nucleotídeos, mais preferencialmente 19 ou mais nucleotídeos.
[0050] O termo “gene” utilizado na presente invenção destina-se a incluir não apenas RNA e DNA de fita dupla, como também cada DNA de fita simples, tal como uma fita positiva (ou uma fita sense) ou uma fita complementar (ou uma fita antisense) que constitui um duplexo. O gene não é particularmente limitado pelo seu comprimento.
[0051] Assim, o termo “gene” utilizado na presente invenção inclui qualquer DNA de fita dupla incluindo o DNA genômico humano, DNA de fita simples (fita positiva), incluindo cDNA, DNA de fita simples possuindo uma sequência complementar da fita positiva (fita complementar), microRNA (miRNA), e seus fragmentos, e seus transcritos, salvo quando indicação de outra forma. O “gene” inclui não apenas um “gene” representado por uma sequência nucleotídica específica (ou SEQ ID NO), mas também “ácidos nucleicos” que codificam RNA possuindo funções biológicas equivalentes ao RNA codificado pelo gene, por exemplo, um congênere (ou seja, um homólogo ou ortólogo), uma forma variante (por exemplo, polimorfo genético), e um derivado do mesmo. Exemplos específicos de tal “ácido nucleico” que codifica um congênere, uma variante, ou derivado pode incluir um “ácido nucleico” que possui uma sequência de nucleotídeos que hibridiza sob condições estringentes descritas mais adiante com uma sequência complementar à sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 635 ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência nucleotídica pela substituição de U por T. O “gene” não é particularmente limitado pela sua região funcional e pode conter, por exemplo, uma região controle da expressão, uma região codificante, um éxon ou um íntron. O “gene” pode estar contido em uma célula, ou pode existir sozinho após ser libertado para o exterior de uma célula. Alternativamente, o “gene” pode estar em um estado fechado em uma vesícula denominada exossomo.
[0052] O termo “exossomo” conforme utilizado na presente invenção é uma vesícula que é encapsulada por uma bicamada lipídica e secretada a partir de uma célula. O exossomo é derivado a partir de um endossomo multivesicular e pode incorporar biomateriais, tal como um “gene” (por exemplo, RNA ou DNA) ou uma proteína quando liberado em um ambiente extracelular. O exossomo é conhecido por estar contido em um fluido corporal tal como sangue, soro, plasma, soro ou linfa.
[0053] O termo “transcrito” utilizado na presente invenção refere- se ao RNA sintetizado com a sequência de DNA de um gene como um molde. A RNA polimerase se liga a um local denominado promotor que está localizado a montante do gene e adiciona ribonucleotídeos complementares na sequência de nucleotídeos do DNA na extremidade 3' para sintetizar um RNA. Este RNA contém não apenas o próprio gene, com também toda a sequência de um sítio de iniciação da transcrição até o fim de uma sequência poliA, incluindo uma região de controle da expressão, uma região codificante, um éxon ou um íntron.
[0054] O termo “microRNA (miRNA)” utilizado na presente invenção pretende designar um RNA não codificante de 15 a 25 nucleotídeos que é transcrito como um RNA precursor que tem uma estrutura similar a um grampo de cabelo (hairpin-like), clivado por uma enzima de clivagem de dsRNA possuindo atividade de clivagem de RNAase III, e integrado em um complexo de proteínas denominado RISC, e está envolvido na supressão da tradução do mRNA, a menos que especificado de outra forma. O termo “miRNA” utilizado na presente invenção, inclui não apenas um “miRNA” representado por uma sequência nucleotídica específica (ou SEQ ID NO), como também um “miRNA” precursor (pré-miRNA ou pri-miRNA), e miRNAs possuindo funções biológicas equivalentes ao mesmo, por exemplo, um congênere (ou seja, um homólogo ou ortólogo), uma forma variante (por exemplo, um polimorfo genético), e um derivado do mesmo. Tal precursor, congênere, variante ou derivado pode ser especificamente identificado utilizando miRBase Release 20 (http://www.mirbase.org/), e os seus exemplos podem incluir um “miRNA” com uma sequência de nucleotídeos que hibridiza sob condições estringentes descritas mais adiante a uma sequência complementar de qualquer sequência de nucleotídeos particular, representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 635. O termo “miRNA” utilizado na presente invenção pode ser um produto gênico de um gene miR. Tal produto gênico inclui um miRNA maduro (por exemplo, de 15 a 25- nucleotídeos ou 19 a 25 nucleotídeos de RNA não codificante envolvidos na supressão da tradução de mRNA, tal como descrito acima) ou um miRNA precursor (por exemplo, pré- miRNA ou pri-miRNA conforme descrito acima).
[0055] O termo “sonda” utilizado na presente invenção inclui um polinucleotídeo que é usado para detectar especificamente um RNA resultante da expressão de um gene ou polinucleotídeo derivado do RNA, e/ou um polinucleotídeo complementar aos mesmos.
[0056] O termo “primer” utilizado na presente invenção inclui um polinucleotídeo que reconhece e amplifica especificamente um RNA resultante da expressão de um gene ou polinucleotídeo derivado do RNA, e/ou um polinucleotídeo complementar aos mesmos.
[0057] Neste contexto, o polinucleotídeo complementar (fita complementar ou fita reversa) significa um polinucleotídeo em uma relação de base complementar dos pares de bases A:T (U) e G:C, com a sequência de comprimento total de um polinucleotídeo consistindo em uma sequência de nucleotídeos definida por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 635 ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, ou uma sequência parcial da mesma (aqui, esta sequência de comprimento total ou parcial é referida como uma fita positiva por uma questão de conveniência). No entanto, tal fita complementar não está limitada a uma sequência totalmente complementar da sequência de nucleotídeos alvo de fita positiva e pode ter uma relação de complementaridade de uma forma que permite a hibridização sob condições estringentes com o alvo de fita positiva.
[0058] O termo “condições estringentes” utilizado na presente invenção refere-se às condições sob as quais uma sonda de ácido nucleico hibridiza com a sua sequência alvo em uma extensão maior (por exemplo, valores de medição iguais ou maiores do que “(uma média dos valores de medição de fundo) + (um desvio padrão dos valores de medição do fundo) x 2”) do que a outras sequências. As condições estringentes são dependentes de uma sequência e diferem dependendo de um ambiente em que a hibridização é realizada. Uma sequência alvo 100% complementar à sonda de ácido nucleico pode ser identificada pelo controle da estringência das condições de hibridização e/ou lavagem. Os exemplos específicos de “condições estringentes” serão mencionados mais adiante.
[0059] O termo “valor Tm” utilizado na presente invenção significa uma temperatura na qual a porção de fita dupla de um polinucleotídeo é desnaturada em fitas simples de modo a existir fitas duplas e fitas simples na proporção de 1:1.
[0060] O termo “variante” utilizado na presente invenção significa, no caso de um ácido nucleico, um ácido nucleico variante natural atribuído a polimorfismo, mutação, ou similar; uma variante que possui deleção, substituição, adição ou inserção de 1 ou 2 ou mais nucleotídeos em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 194 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T , ou uma sequência parcial desta; uma variante que exibe uma porcentagem (%) de identidade de aproximadamente 90% ou mais, cerca de 95% ou mais, cerca de 97% ou mais, cerca de 98% ou mais, cerca de 99% ou mais para cada uma destas sequências nucleotídicas ou uma sequência parcial das mesmas; ou um ácido nucleico que hibridiza sob condições estringentes definidas acima a um polinucleotídeo ou oligonucleotídeo compreendendo cada uma destas sequências nucleotídicas ou uma sequência parcial das mesmas.
[0061] Os termos “vários” ou “diversos” utilizados na presente invenção indicam um número inteiro de aproximadamente 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3 ou 2.
[0062] O “variante” usado na presente invenção pode ser preparado pelo uso de uma técnica bem conhecida, tal como a mutagênese sítio-dirigida ou mutagênese baseada em PCR.
[0063] O termo “percentagem (%) de identidade” utilizado na presente invenção pode ser determinado com ou sem a introdução de lacunas (gaps), utilizando um sistema de pesquisa de proteína ou gene baseado no BLAST ou FASTA descrito acima (Zheng Zhang et al., 2000, J. Comput. Biol., Vol. 7, p. 203-214; Altschul, S.F. et al., 1990, Journal of Molecular Biology, Vol. 215, p. 403-410; e Pearson, W.R. et al., 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, vol. 85, p. 2444-2448).
[0064] O termo “derivado” utilizado na presente invenção pretende abranger um ácido nucleico modificado, por exemplo, um derivado que é marcado com um fluoróforo ou similar, um derivado contendo um nucleotídeo modificado (por exemplo, um nucleotídeo contendo um grupo como halogêneo, alquila, tais como metila, alcóxi tal como metóxi, tio, ou carboximetilcelulose, e um nucleotídeo que foi submetido ao rearranjo de bases, saturação de dupla ligação, desaminação, substituição de uma molécula de oxigênio por um átomo de enxofre, etc.), PNA (ácido nucleico peptídico; Nielsen, P.E. et al, 1991, Science, Vol 254, p 1497-500), e LNA (ácido nucleico bloqueado (LNA - Locked Nucleic Acid); Obika, S. et al, 1998, Tetrahedron Lett., Vol 39, p 5401-5404) sem limitar o escopo da invenção.
[0065] Tal como utilizado na presente invenção, o “ácido nucleico” capaz de se ligar especificamente a um polinucleotídeo selecionado a partir dos miRNAs marcadores de câncer colorretal descritos acima é um ácido nucleico sintetizado ou preparado e inclui especificamente uma “sonda de ácido nucleico” ou “primer”. O “ácido nucleico” é utilizado diretamente ou indiretamente para a detecção da presença ou ausência do câncer colorretal em um sujeito, para o diagnóstico da presença ou ausência de câncer colorretal, para diagnóstico da severidade do câncer colorretal, a presença ou ausência de melhora ou grau de melhora do câncer colorretal, ou sensibilidade ao tratamento do câncer colorretal, ou para o rastreio de uma substância candidata útil na prevenção, melhora ou tratamento do câncer colorretal. O “ácido nucleico” inclui um nucleotídeo, um oligonucleotídeo, e um polinucleotídeo capaz de reconhecer especificamente e de se ligar a um transcrito representado por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 635 ou um ácido nucleico de cDNA in vivo sintético das mesmas, particularmente, em uma amostra tal como um fluido corporal (por exemplo, sangue ou urina), em relação ao desenvolvimento do câncer colorretal. O nucleotídeo, oligonucleotídeo, e polinucleotídeo podem ser eficazmente usados como sondas para detectar o gene supramencionado expresso in vivo em tecidos, células, ou similar, com base nas propriedades descritas acima, ou como primers para amplificar o gene supramencionado expresso in vivo.
[0066] O termo “capaz de se ligar especificamente”, conforme utilizado na presente invenção, indica que a sonda de ácido nucleico ou primer utilizado na presente invenção se liga a um ácido nucleico alvo específico e pode não se ligar substancialmente a outros ácidos nucleicos.
[0067] O termo “detecção” utilizado na presente invenção é utilizado de maneira alternada com os termos “exame”, “medição”, “detecção”, ou “apoio à decisão”. Conforme utilizado na presente invenção, o termo “avaliação” é utilizado para designar o diagnóstico ou apoio à avaliação com base nos resultados do exame ou resultados da medição.
[0068] O termo “sujeito” utilizado na presente invenção significa um mamífero, tal como um primata, incluindo humano e chimpanzé, um animal de estimação, incluindo o cão e gato, um animal de rebanho incluindo gado, cavalo, ovelha, cabra e um roedor, incluindo um rato e camundongo. O termo “sujeito saudável” também significa tal mamífero sem o câncer a ser detectado.
[0069] O termo “P” ou “valor de P” utilizado na presente invenção refere-se a uma probabilidade em que uma estatística mais extrema quanto àquela que é efetivamente calculada a partir de dados sob uma hipótese nula é observada em um teste estatístico. Assim, um “P” menor ou “valor de P” menor indica uma diferença mais significativa entre os sujeitos sendo comparados.
[0070] O termo “sensibilidade” utilizado na presente invenção significa um valor de (o número de verdadeiros positivos)/(número de verdadeiros positivos + o número de falsos negativos). Alta sensibilidade permite que o câncer colorretal seja detectado precocemente, levando à ressecção completa dos locais com câncer e redução da taxa de recorrência.
[0071] O termo “especificidade” utilizado na presente invenção significa um valor (do número de verdadeiros negativos) / (número de verdadeiros negativos + o número de falsos positivos). Uma alta especificidade previne a realização de exame adicional desnecessário para sujeitos saudáveis mal interpretados como sendo pacientes com câncer colorretal, levando à redução de ônus sobre os pacientes e redução de despesas médicas.
[0072] O termo “acurácia” utilizado na presente invenção significa um valor do (número de verdadeiros positivos + número de verdadeiros negativos) / (número total de casos). A acurácia indica a proporção de amostras corretamente identificada nos resultados discriminantes para todas as amostras, e serve como um indicador primário para avaliar o desempenho de detecção.
[0073] Tal como utilizado na presente invenção, “amostra” que é submetida a determinação, detecção ou diagnóstico refere-se a um tecido e material biológico, em que a expressão do gene da presente invenção varia quando o câncer colorretal se desenvolve, quando o câncer colorretal progride, ou quando efeitos terapêuticos sobre o câncer colorretal são exercidos. Especificamente, a “amostra” refere-se a um tecido do intestino grosso, um canal vascular em torno do intestino grosso, um linfonodo, e órgão, um órgão com suspeita de ter metástase, a pele, um fluido corporal tal como o sangue, urina, saliva, suor, ou exsudados teciduais, soro ou plasma preparado a partir do sangue, fezes, cabelo, e similares. A “amostra” refere-se ainda a uma amostra biológica extraída dela, especificamente, um gene, tal como RNA ou miRNA.
[0074] O termo “gene hsa-miR-6726-5p” ou “hsa-miR-6726-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6726-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027353) descrito na SEQ ID NO: 1, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6726-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6726” (n° de acesso miRBase: MI0022571, SEQ ID NO: 195) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6726-5p”.
[0075] O termo “gene hsa-miR-4257” ou “hsa-miR-4257” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4257 (n° de acesso miRBase: MIMAT0016878) descrito na SEQ ID NO: 2, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4257 pode ser obtido por um método descrito em Goff LA et al., 2009, PLoS One, Vol. 4, e7192. Além disso, o “hsa-mir-4257” (n° de acesso miRBase: MI0015856, SEQ ID NO: 196) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4257”.
[0076] O termo “gene hsa-miR-6787-5p” ou “hsa-miR-6787-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6787-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027474) descrito na SEQ ID NO: 3, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6787-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6787” (n° de acesso miRBase: MI0022632, SEQ ID NO: 197) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6787-5p”.
[0077] O termo “gene hsa-miR-6780b-5p” ou “hsa-miR-6780b- 5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6780b-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027572) descrito na SEQ ID NO: 4, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa- miR-6780b-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6780b” (n° de acesso miRBase: MI0022681, SEQ ID NO: 198) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6780b-5p”.
[0078] O termo “gene hsa-miR-3131” ou “hsa-miR-3131” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3131 (n° de acesso miRBase: MIMAT0014996) descrito na SEQ ID NO: 5, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-3131 pode ser obtido por um método descrito em Stark MS et al., 2010, PLoS One, Vol. 5, e9685. Além disso, o “hsa-mir-3131” (n° de acesso miRBase: MI0014151, SEQ ID NO: 199) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-3131”.
[0079] O termo “gene hsa-miR-7108-5p” ou “hsa-miR-7108-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-7108-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0028113) descrito na SEQ ID NO: 6, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 7108-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-7108” (n° de acesso miRBase: MI0022959, SEQ ID NO: 200) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-7108-5p”.
[0080] O termo “gene hsa-miR-1343-3p” ou “hsa-miR-1343-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1343-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019776) descrito na SEQ ID NO: 7, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1343-3p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-1343” (n° de acesso miRBase: MI0017320, SEQ ID NO: 201) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 1343-3p”.
[0081] O termo “gene hsa-miR-1247-3p” ou “hsa-miR-1247-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1247-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0022721) descrito na SEQ ID NO: 8, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1247-3p pode ser obtido por um método descrito em Morin RD et al., 2008, Genome Res, Vol. 18, p. 610-621. Além disso, o “hsa-mir-1247” (n° de acesso miRBase: MI0006382, SEQ ID NO: 202) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 1247-3p”.
[0082] O termo “gene hsa-miR-4651” ou “hsa-miR-4651” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4651 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019715) descrito na SEQ ID NO: 9, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4651 pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4651” (n° de acesso miRBase: MI0017279, SEQ ID NO: 203) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4651”.
[0083] O termo “gene hsa-miR-6757-5p” ou “hsa-miR-6757-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6757-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027414) descrito na SEQ ID NO: 10, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6757-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6757” (n° de acesso miRBase: MI0022602, SEQ ID NO: 204) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6757-5p”.
[0084] O termo “gene hsa-miR-3679-5p” ou “hsa-miR-3679-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3679-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0018104) descrito na SEQ ID NO: 11, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 3679-5p pode ser obtido por um método descrito em Creighton CJ et al., 2010, PLoS One, Vol. 5, e9637. Além disso, o “hsa-mir-3679” (n° de acesso miRBase: MI0016080, SEQ ID NO: 205) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 3679-5p”.
[0085] O termo “gene hsa-miR-7641” ou “hsa-miR-7641” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-7641 (n° de acesso miRBase: MIMAT0029782) descrito na SEQ ID NO: 12, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-7641 pode ser obtido por um método descrito em Yoo JK et al., 2013, Arch Pharm Res, Vol. 36, p. 353-358. Além disso, o “hsa-mir-7641-1” e “hsa-mir-7641-2” (nos de acesso miRBase:. MI0024975 e MI0024976, SEQ ID NOs: 206 e 207) possuindo estruturas similares a grampos (hairpin-like) são conhecidos como precursores de “hsa-miR-7641”.
[0086] O termo “gene hsa-miR-6746-5p” ou “hsa-miR-6746-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6746-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027392) descrito na SEQ ID NO: 13, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6746-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6746” (n° de acesso miRBase: MI0022591, SEQ ID NO: 208) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6746-5p”.
[0087] O termo “gene hsa-miR-8072” ou “hsa-miR-8072” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-8072 (n° de acesso miRBase: MIMAT0030999) descrito na SEQ ID NO: 14, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-8072 pode ser obtido por um método descrito em Wang HJ et al., 2013, Shock, Vol. 39, p. 480-487. Além disso, o “hsa-mir-8072” (n° de acesso miRBase: MI0025908, SEQ ID NO: 209) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-8072”.
[0088] O termo “gene hsa-miR-6741-5p” ou “hsa-miR-6741-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6741-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027383) descrito na SEQ ID NO: 15, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6741-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6741” (n° de acesso miRBase: MI0022586, SEQ ID NO: 210) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6741-5p”.
[0089] O termo “gene hsa-miR-1908-5p” ou “hsa-miR-1908-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1908-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0007881) descrito na SEQ ID NO: 16, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1908-5p pode ser obtido por um método descrito em Bar M et al., 2008, Stem Cells, Vol. 26, p. 2496-2505. Além disso, o “hsa-mir-1908” (n° de acesso miRBase: MI0008329, SEQ ID NO: 211) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 1908-5p”.
[0090] O termo “gene hsa-miR-6857-5p” ou “hsa-miR-6857-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6857-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027614) descrito na SEQ ID NO: 17, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6857-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6857” (n° de acesso miRBase: MI0022703, SEQ ID NO: 212) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6857-5p”.
[0091] O termo “gene hsa-miR-4746-3p” ou “hsa-miR-4746-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4746-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019881) descrito na SEQ ID NO: 18, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4746-3p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4746” (n° de acesso miRBase: MI0017385, SEQ ID NO: 213) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4746-3p”.
[0092] O termo “gene hsa-miR-744-5p” ou “hsa-miR-744-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-744-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004945) descrito na SEQ ID NO: 19, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 744-5p pode ser obtido por um método descrito em Berezikov E et al., 2006, Genome Res, Vol. 16, p. 1289-1298. Além disso, o “hsa-mir-744” (n° de acesso miRBase: MI0005559, SEQ ID NO: 214) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-744-5p”.
[0093] O termo “gene hsa-miR-4792” ou “hsa-miR-4792” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4792 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019964) descrito na SEQ ID NO: 20, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4792 pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4792” (n° de acesso miRBase: MI0017439, SEQ ID NO: 215) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4792”.
[0094] O termo “gene hsa-miR-564” ou “hsa-miR-564” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-564 (n° de acesso miRBase: MIMAT0003228) descrito na SEQ ID NO: 21, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-564 pode ser obtido por um método descrito em Cummins JM et al., 2006, Proc Natl Acad Sci USA, Vol. 103, p. 3687-3692. Além disso, o “hsa-mir-564” (n° de acesso miRBase: MI0003570, SEQ ID NO: 216) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-564”.
[0095] O termo “gene hsa-miR-6791-5p” ou “hsa-miR-6791-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6791-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027482) descrito na SEQ ID NO: 22, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6791-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6791” (n° de acesso miRBase: MI0022636, SEQ ID NO: 217) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6791-5p”.
[0096] O termo “gene hsa-miR-6825-5p” ou “hsa-miR-6825-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6825-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027550) descrito na SEQ ID NO: 23, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6825-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6825” (n° de acesso miRBase: MI0022670, SEQ ID NO: 218) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6825-5p”.
[0097] O termo “gene hsa-miR-6826-5p” ou “hsa-miR-6826-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6826-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027552) descrito na SEQ ID NO: 24, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6826-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6826” (n° de acesso miRBase: MI0022671, SEQ ID NO: 219) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6826-5p”.
[0098] O termo “gene hsa-miR-4665-3p” ou “hsa-miR-4665-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4665-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019740) descrito na SEQ ID NO: 25, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4665-3p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4665” (n° de acesso miRBase: MI0017295, SEQ ID NO: 220) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4665-3p”.
[0099] O termo “gene hsa-miR-4467” ou “hsa-miR-4467” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4467 (n° de acesso miRBase: MIMAT0018994) descrito na SEQ ID NO: 26, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4467 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4467” (n° de acesso miRBase: MI0016818, SEQ ID NO: 221) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4467”.
[0100] O termo “gene hsa-miR-3188” ou “hsa-miR-3188” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3188 (n° de acesso miRBase: MIMAT0015070) descrito na SEQ ID NO: 27, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-3188 pode ser obtido por um método descrito em Stark MS et al., 2010, PLoS One, Vol. 5, e9685. Além disso, o “hsa-mir-3188” (n° de acesso miRBase: MI0014232, SEQ ID NO: 222) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin- like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-3188”.
[0101] O termo “gene hsa-miR-6125” ou “hsa-miR-6125” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6125 (n° de acesso miRBase: MIMAT0024598) descrito na SEQ ID NO: 28, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-6125 pode ser obtido por um método descrito em Smith JL et al., 2012, J Virol, Vol. 86, p. 5278-5287. Além disso, o “hsa-mir-6125” (n° de acesso miRBase: MI0021259, SEQ ID NO: 223) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6125”.
[0102] O termo “gene hsa-miR-6756-5p” ou “hsa-miR-6756-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6756-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027412) descrito na SEQ ID NO: 29, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6756-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6756” (n° de acesso miRBase: MI0022601, SEQ ID NO: 224) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6756-5p”.
[0103] O termo “gene hsa-miR-1228-3p” ou “hsa-miR-1228-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1228-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0005583) descrito na SEQ ID NO: 30, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1228-3p pode ser obtido por um método descrito em Berezikov E et al., 2007, Mol Cell, Vol. 28, p. 328-336. Além disso, o “hsa-mir-1228” (n° de acesso miRBase: MI0006318, SEQ ID NO: 225) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 1228-3p”.
[0104] O termo “gene hsa-miR-8063” ou “hsa-miR-8063” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-8063 (n° de acesso miRBase: MIMAT0030990) descrito na SEQ ID NO: 31, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-8063 pode ser obtido por um método descrito em Wang HJ et al., 2013, Shock, Vol. 39, p. 480-487. Além disso, o “hsa-mir-8063” (n° de acesso miRBase: MI0025899, SEQ ID NO: 226) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-8063”.
[0105] O termo “gene hsa-miR-8069” ou “hsa-miR-8069” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-8069 (n° de acesso miRBase: MIMAT0030996) descrito na SEQ ID NO: 32, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-8069 pode ser obtido por um método descrito em Wang HJ et al., 2013, Shock, Vol. 39, p. 480-487. Além disso, o “hsa-mir-8069” (n° de acesso miRBase: MI0025905, SEQ ID NO: 227) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-8069”.
[0106] O termo “gene hsa-miR-6875-5p” ou “hsa-miR-6875-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6875-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027650) descrito na SEQ ID NO: 33, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6875-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6875” (n° de acesso miRBase: MI0022722, SEQ ID NO: 228) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6875-5p”.
[0107] O termo “gene hsa-miR-3185” ou “hsa-miR-3185” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3185 (n° de acesso miRBase: MIMAT0015065) descrito na SEQ ID NO: 34, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-3185 pode ser obtido por um método descrito em Stark MS et al., 2010, PLoS One, Vol. 5, e9685. Além disso, o “hsa-mir-3185” (n° de acesso miRBase: MI0014227, SEQ ID NO: 229) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-3185”.
[0108] O termo “gene hsa-miR-4433b-3p” ou “hsa-miR-4433b- 3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4433b-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0030414) descrito na SEQ ID NO: 35, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa- miR-4433b-3p pode ser obtido por um método descrito em Ple H et al., 2012, PLoS One, Vol. 7, e50746. Além disso, o “hsa-mir-4433b” (n° de acesso miRBase: MI0025511, SEQ ID NO: 230) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4433b-3p”.
[0109] O termo “gene hsa-miR-6887-5p” ou “hsa-miR-6887-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6887-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027674) descrito na SEQ ID NO: 36, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6887-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6887” (n° de acesso miRBase: MI0022734, SEQ ID NO: 231) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6887-5p”.
[0110] O termo “gene hsa-miR-128-1-5p” ou “hsa-miR-128-1-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-128-1-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0026477) descrito na SEQ ID NO: 37, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 128-1-5p pode ser obtido por um método descrito em Lagos-Quintana M et al., 2002, Curr Biol, Vol. 12, p. 735-739. Além disso, o “hsa-mir-128-1” (n° de acesso miRBase: MI0000447, SEQ ID NO: 232) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-128-1-5p”.
[0111] O termo “gene hsa-miR-6724-5p” ou “hsa-miR-6724-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6724-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0025856) descrito na SEQ ID NO: 38, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6724-5p pode ser obtido por um método descrito em Li Y et al., 2012, Gene, Vol. 497, p. 330-335. Além disso, o “hsa-mir-6724” (n° de acesso miRBase: MI0022559, SEQ ID NO: 233) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6724-5p”.
[0112] O termo “gene hsa-miR-1914-3p” ou “hsa-miR-1914-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1914-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0007890) descrito na SEQ ID NO: 39, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1914-3p pode ser obtido por um método descrito em Bar M et al., 2008, Stem Cells, Vol. 26, p. 2496-2505. Além disso, o “hsa-mir-1914” (n° de acesso miRBase: MI0008335, SEQ ID NO: 234) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 1914-3p”.
[0113] O termo “gene hsa-miR-1225-5p” ou “hsa-miR-1225-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1225-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0005572) descrito na SEQ ID NO: 40, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1225-5p pode ser obtido por um método descrito em Berezikov E et al., 2007, Mol Cell, Vol. 28, p. 328-336. Além disso, o “hsa-mir-1225” (n° de acesso miRBase: MI0006311, SEQ ID NO: 235) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 1225-5p”.
[0114] O termo “gene hsa-miR-4419b” ou “hsa-miR-4419b” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4419b (n° de acesso miRBase: MIMAT0019034) descrito na SEQ ID NO: 41, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4419b pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4419b” (n° de acesso miRBase: MI0016861, SEQ ID NO: 236) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4419b”.
[0115] O termo “gene hsa-miR-7110-5p” ou “hsa-miR-7110-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-7110-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0028117) descrito na SEQ ID NO: 42, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 7110-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-7110” (n° de acesso miRBase: MI0022961, SEQ ID NO: 237) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-7110-5p”.
[0116] O termo “gene hsa-miR-187-5p” ou “hsa-miR-187-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-187-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004561) descrito na SEQ ID NO: 43, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 187-5p pode ser obtido por um método descrito em Lim LP et al., 2003, Science, Vol. 299, p. 1540. Além disso, o “hsa-mir-187” (n° de acesso miRBase: MI0000274, SEQ ID NO: 238) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-187- 5p”.
[0117] O termo “gene hsa-miR-3184-5p” ou “hsa-miR-3184-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3184-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0015064) descrito na SEQ ID NO: 44, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 3184-5p pode ser obtido por um método descrito em Stark MS et al., 2010, PLoS One, Vol. 5, e9685. Além disso, o “hsa-mir-3184” (n° de acesso miRBase: MI0014226, SEQ ID NO: 239) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 3184-5p”.
[0118] O termo “gene hsa-miR-204-3p” ou “hsa-miR-204-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-204-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0022693) descrito na SEQ ID NO: 45, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 204-3p pode ser obtido por um método descrito em Lim LP et al., 2003, Science, Vol. 299, p. 1540. Além disso, o “hsa-mir-204” (n° de acesso miRBase: MI0000284, SEQ ID NO: 240) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-204- 3p”.
[0119] O termo “gene hsa-miR-5572” ou “hsa-miR-5572” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-5572 (n° de acesso miRBase: MIMAT0022260) descrito na SEQ ID NO: 46, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-5572 pode ser obtido por um método descrito em Tandon M et al., 2012, Oral Dis, Vol. 18, p. 127-131. Além disso, o “hsa-mir-5572” (n° de acesso miRBase: MI0019117, SEQ ID NO: 241) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-5572”.
[0120] O termo “gene hsa-miR-6729-5p” ou “hsa-miR-6729-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6729-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027359) descrito na SEQ ID NO: 47, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6729-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6729” (n° de acesso miRBase: MI0022574, SEQ ID NO: 242) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6729-5p”.
[0121] O termo “gene hsa-miR-615-5p” ou “hsa-miR-615-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-615-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004804) descrito na SEQ ID NO: 48, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 615-5p pode ser obtido por um método descrito em Cummins JM et al., 2006, Proc Natl Acad Sci USA, Vol. 103, p. 3687-3692. Além disso, o “hsa-mir-615” (n° de acesso miRBase: MI0003628, SEQ ID NO: 243) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-615-5p”.
[0122] O termo “gene hsa-miR-6749-5p” ou “hsa-miR-6749-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6749-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027398) descrito na SEQ ID NO: 49, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6749-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6749” (n° de acesso miRBase: MI0022594, SEQ ID NO: 244) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6749-5p”.
[0123] O termo “gene hsa-miR-6515-3p” ou “hsa-miR-6515-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6515-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0025487) descrito na SEQ ID NO: 50, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6515-3p pode ser obtido por um método descrito em Joyce CE et al., 2011, Hum Mol Genet, Vol. 20, p. 4025-4040. Além disso, o “hsa-mir-6515” (n° de acesso miRBase: MI0022227, SEQ ID NO: 245) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6515-3p”.
[0124] O termo “gene hsa-miR-3937” ou “hsa-miR-3937” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3937 (n° de acesso miRBase: MIMAT0018352) descrito na SEQ ID NO: 51, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-3937 pode ser obtido por um método descrito em Liao JY et al., 2010, PLoS One, Vol. 5, e10563. Além disso, o “hsa-mir-3937” (n° de acesso miRBase: MI0016593, SEQ ID NO: 246) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-3937”.
[0125] O termo “gene hsa-miR-6840-3p” ou “hsa-miR-6840-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6840-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027583) descrito na SEQ ID NO: 52, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6840-3p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6840” (n° de acesso miRBase: MI0022686, SEQ ID NO: 247) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6840-3p”.
[0126] O termo “gene hsa-miR-6893-5p” ou “hsa-miR-6893-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6893-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027686) descrito na SEQ ID NO: 53, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6893-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6893” (n° de acesso miRBase: MI0022740, SEQ ID NO: 248) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6893-5p”.
[0127] O termo “gene hsa-miR-4728-5p” ou “hsa-miR-4728-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4728-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019849) descrito na SEQ ID NO: 54, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4728-5p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4728” (n° de acesso miRBase: MI0017365, SEQ ID NO: 249) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4728-5p”.
[0128] O termo “gene hsa-miR-6717-5p” ou “hsa-miR-6717-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6717-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0025846) descrito na SEQ ID NO: 55, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6717-5p pode ser obtido por um método descrito em Li Y et al., 2012, Gene, Vol. 497, p. 330-335. Além disso, o “hsa-mir-6717” (n° de acesso miRBase: MI0022551, SEQ ID NO: 250) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6717-5p”.
[0129] O termo “gene hsa-miR-7113-3p” ou “hsa-miR-7113-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-7113-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0028124) descrito na SEQ ID NO: 56, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 7113-3p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-7113” (n° de acesso miRBase: MI0022964, SEQ ID NO: 251) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-7113-3p”.
[0130] O termo “gene hsa-miR-4665-5p” ou “hsa-miR-4665-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4665-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019739) descrito na SEQ ID NO: 57, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4665-5p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4665” (n° de acesso miRBase: MI0017295, SEQ ID NO: 220) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4665-5p”.
[0131] O termo “gene hsa-miR-642b-3p” ou “hsa-miR-642b-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-642b-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0018444) descrito na SEQ ID NO: 58, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 642b-3p pode ser obtido por um método descrito em Witten D et al., 2010, BMC Biol, Vol. 8, p. 58. Além disso, o “hsa-mir-642b” (n° de acesso miRBase: MI0016685, SEQ ID NO: 252) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-642b-3p”.
[0132] O termo “gene hsa-miR-7109-5p” ou “hsa-miR-7109-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-7109-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0028115) descrito na SEQ ID NO: 59, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 7109-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-7109” (n° de acesso miRBase: MI0022960, SEQ ID NO: 253) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-7109-5p”.
[0133] O termo “gene hsa-miR-6842-5p” ou “hsa-miR-6842-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6842-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027586) descrito na SEQ ID NO: 60, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6842-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6842” (n° de acesso miRBase: MI0022688, SEQ ID NO: 254) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6842-5p”.
[0134] O termo “gene hsa-miR-4442” ou “hsa-miR-4442” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4442 (n° de acesso miRBase: MIMAT0018960) descrito na SEQ ID NO: 61, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4442 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4442” (n° de acesso miRBase: MI0016785, SEQ ID NO: 255) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4442”.
[0135] O termo “gene hsa-miR-4433-3p” ou “hsa-miR-4433-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4433-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0018949) descrito na SEQ ID NO: 62, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4433-3p pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4433” (n° de acesso miRBase: MI0016773, SEQ ID NO: 256) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4433-3p”.
[0136] O termo “gene hsa-miR-4707-5p” ou “hsa-miR-4707-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4707-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019807) descrito na SEQ ID NO: 63, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4707-5p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4707” (n° de acesso miRBase: MI0017340, SEQ ID NO: 257) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4707-5p”.
[0137] O termo “gene hsa-miR-6126” ou “hsa-miR-6126” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6126 (n° de acesso miRBase: MIMAT0024599) descrito na SEQ ID NO: 64, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-6126 pode ser obtido por um método descrito em Smith JL et al., 2012, J Virol, Vol. 86, p. 5278-5287. Além disso, o “hsa-mir-6126” (n° de acesso miRBase: MI0021260, SEQ ID NO: 258) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6126”.
[0138] O termo “gene hsa-miR-4449” ou “hsa-miR-4449” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4449 (n° de acesso miRBase: MIMAT0018968) descrito na SEQ ID NO: 65, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4449 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4449” (n° de acesso miRBase: MI0016792, SEQ ID NO: 259) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4449”.
[0139] O termo “gene hsa-miR-4706” ou “hsa-miR-4706” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4706 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019806) descrito na SEQ ID NO: 66, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4706 pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4706” (n° de acesso miRBase: MI0017339, SEQ ID NO: 260) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4706”.
[0140] O termo “gene hsa-miR-1913” ou “hsa-miR-1913” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1913 (n° de acesso miRBase: MIMAT0007888) descrito na SEQ ID NO: 67, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-1913 pode ser obtido por um método descrito em Bar M et al., 2008, Stem Cells, Vol. 26, p. 2496-2505. Além disso, o “hsa-mir-1913” (n° de acesso miRBase: MI0008334, SEQ ID NO: 261) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-1913”.
[0141] O termo “gene hsa-miR-602” ou “hsa-miR-602” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-602 (n° de acesso miRBase: MIMAT0003270) descrito na SEQ ID NO: 68, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-602 pode ser obtido por um método descrito em Cummins JM et al., 2006, Proc Natl Acad Sci USA, Vol. 103, p. 3687-3692. Além disso, o “hsa-mir-602” (n° de acesso miRBase: MI0003615, SEQ ID NO: 262) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-602”.
[0142] O termo “gene hsa-miR-939-5p” ou “hsa-miR-939-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-939-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004982) descrito na SEQ ID NO: 69, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 939-5p pode ser obtido por um método descrito em Lui WO et al., 2007, Cancer Res, Vol. 67, p. 6031-6043. Além disso, o “hsa-mir-939” (n° de acesso miRBase: MI0005761, SEQ ID NO: 263) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-939- 5p”.
[0143] O termo “gene hsa-miR-4695-5p” ou “hsa-miR-4695-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4695-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019788) descrito na SEQ ID NO: 70, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4695-5p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4695” (n° de acesso miRBase: MI0017328, SEQ ID NO: 264) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4695-5p”.
[0144] O termo “gene hsa-miR-711” ou “hsa-miR-711” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-711 (n° de acesso miRBase: MIMAT0012734) descrito na SEQ ID NO: 71, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-711 pode ser obtido por um método descrito em Artzi S et al., 2008, BMC Bioinformatics, Vol. 9, p. 39. Além disso, o “hsa-mir-711” (n° de acesso miRBase: MI0012488, SEQ ID NO: 265) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-711”.
[0145] O termo “gene hsa-miR-6816-5p” ou “hsa-miR-6816-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6816-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027532) descrito na SEQ ID NO: 72, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6816-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6816” (n° de acesso miRBase: MI0022661, SEQ ID NO: 266) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6816-5p”.
[0146] O termo “gene hsa-miR-4632-5p” ou “hsa-miR-4632-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4632-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0022977) descrito na SEQ ID NO: 73, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4632-5p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4632” (n° de acesso miRBase: MI0017259, SEQ ID NO: 267) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4632-5p”.
[0147] O termo “gene hsa-miR-6721-5p” ou “hsa-miR-6721-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6721-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0025852) descrito na SEQ ID NO: 74, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6721-5p pode ser obtido por um método descrito em Li Y et al., 2012, Gene, Vol. 497, p. 330-335. Além disso, o “hsa-mir-6721” (n° de acesso miRBase: MI0022556, SEQ ID NO: 268) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6721-5p”.
[0148] O termo “gene hsa-miR-7847-3p” ou “hsa-miR-7847-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-7847-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0030422) descrito na SEQ ID NO: 75, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 7847-3p pode ser obtido por um método descrito em Ple H et al., 2012, PLoS One, Vol. 7, e50746. Além disso, o “hsa-mir-7847” (n° de acesso miRBase: MI0025517, SEQ ID NO: 269) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-7847-3p”.
[0149] O termo “gene hsa-miR-6132” ou “hsa-miR-6132” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6132 (n° de acesso miRBase: MIMAT0024616) descrito na SEQ ID NO: 76, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-6132 pode ser obtido por um método descrito em Dannemann M et al., 2012, Genome Biol Evol, Vol. 4, p. 552-564. Além disso, o “hsa-mir-6132” (n° de acesso miRBase: MI0021277, SEQ ID NO: 270) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6132”.
[0150] O termo “gene hsa-miR-887-3p” ou “hsa-miR-887-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-887-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004951) descrito na SEQ ID NO: 77, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 887-3p pode ser obtido por um método descrito em Berezikov E et al., 2006, Genome Res, Vol. 16, p. 1289-1298. Além disso, o “hsa-mir-887” (n° de acesso miRBase: MI0005562, SEQ ID NO: 271) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-887-3p”.
[0151] O termo “gene hsa-miR-3679-3p” ou “hsa-miR-3679-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3679-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0018105) descrito na SEQ ID NO: 78, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 3679-3p pode ser obtido por um método descrito em Creighton CJ et al., 2010, PLoS One, Vol. 5, e9637. Além disso, o “hsa-mir-3679” (n° de acesso miRBase: MI0016080, SEQ ID NO: 205) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 3679-3p”.
[0152] O termo “gene hsa-miR-6784-5p” ou “hsa-miR-6784-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6784-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027468) descrito na SEQ ID NO: 79, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6784-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6784” (n° de acesso miRBase: MI0022629, SEQ ID NO: 272) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6784-5p”.
[0153] O termo “gene hsa-miR-1249” ou “hsa-miR-1249” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1249 (n° de acesso miRBase: MIMAT0005901) descrito na SEQ ID NO: 80, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-1249 pode ser obtido por um método descrito em Morin RD et al., 2008, Genome Res, Vol. 18, p. 610-621. Além disso, o “hsa-mir-1249” (n° de acesso miRBase: MI0006384, SEQ ID NO: 273) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-1249”.
[0154] O termo “gene hsa-miR-937-5p” ou “hsa-miR-937-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-937-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0022938) descrito na SEQ ID NO: 81, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 937-5p pode ser obtido por um método descrito em Lui WO et al., 2007, Cancer Res, Vol. 67, p. 6031-6043. Além disso, o “hsa-mir-937” (n° de acesso miRBase: MI0005759, SEQ ID NO: 274) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-937- 5p”.
[0155] O termo “gene hsa-miR-5195-3p” ou “hsa-miR-5195-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-5195-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0021127) descrito na SEQ ID NO: 82, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 5195-3p pode ser obtido por um método descrito em Schotte D et al., 2011, Leukemia, Vol. 25, p. 1389-1399. Além disso, o “hsa-mir-5195” (n° de acesso miRBase: MI0018174, SEQ ID NO: 275) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 5195-3p”.
[0156] O termo “gene hsa-miR-6732-5p” ou “hsa-miR-6732-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6732-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027365) descrito na SEQ ID NO: 83, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6732-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6732” (n° de acesso miRBase: MI0022577, SEQ ID NO: 276) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6732-5p”.
[0157] O termo “gene hsa-miR-4417” ou “hsa-miR-4417” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4417 (n° de acesso miRBase: MIMAT0018929) descrito na SEQ ID NO: 84, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4417 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4417” (n° de acesso miRBase: MI0016753, SEQ ID NO: 277) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4417”.
[0158] O termo “gene hsa-miR-4281” ou “hsa-miR-4281” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4281 (n° de acesso miRBase: MIMAT0016907) descrito na SEQ ID NO: 85, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4281 pode ser obtido por um método descrito em Goff LA et al., 2009, PLoS One, Vol. 4, e7192. Além disso, o “hsa-mir-4281” (n° de acesso miRBase: MI0015885, SEQ ID NO: 278) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4281”.
[0159] O termo “gene hsa-miR-4734” ou “hsa-miR-4734” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4734 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019859) descrito na SEQ ID NO: 86, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4734 pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4734” (n° de acesso miRBase: MI0017371, SEQ ID NO: 279) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4734”.
[0160] O termo “gene hsa-miR-6766-3p” ou “hsa-miR-6766-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6766-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027433) descrito na SEQ ID NO: 87, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6766-3p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6766” (n° de acesso miRBase: MI0022611, SEQ ID NO: 280) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6766-3p”.
[0161] O termo “gene hsa-miR-663a” ou “hsa-miR-663a” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-663a (n° de acesso miRBase: MIMAT0003326) descrito na SEQ ID NO: 88, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-663a pode ser obtido por um método descrito em Cummins JM et al., 2006, Proc Natl Acad Sci USA, Vol. 103, p. 3687-3692. Além disso, o “hsa-mir-663a” (n° de acesso miRBase: MI0003672, SEQ ID NO: 281) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 663a”.
[0162] O termo “gene hsa-miR-4513” ou “hsa-miR-4513” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4513 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019050) descrito na SEQ ID NO: 89, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4513 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4513” (n° de acesso miRBase: MI0016879, SEQ ID NO: 282) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4513”.
[0163] O termo “gene hsa-miR-6781-5p” ou “hsa-miR-6781-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6781-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027462) descrito na SEQ ID NO: 90, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6781-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6781” (n° de acesso miRBase: MI0022626, SEQ ID NO: 283) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6781-5p”.
[0164] O termo “gene hsa-miR-1227-5p” ou “hsa-miR-1227-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1227-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0022941) descrito na SEQ ID NO: 91, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1227-5p pode ser obtido por um método descrito em Berezikov E et al., 2007, Mol Cell, Vol. 28, p. 328-336. Além disso, o “hsa-mir-1227” (n° de acesso miRBase: MI0006316, SEQ ID NO: 284) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 1227-5p”.
[0165] O termo “gene hsa-miR-6845-5p” ou “hsa-miR-6845-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6845-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027590) descrito na SEQ ID NO: 92, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6845-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6845” (n° de acesso miRBase: MI0022691, SEQ ID NO: 285) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6845-5p”.
[0166] O termo “gene hsa-miR-6798-5p” ou “hsa-miR-6798-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6798-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027496) descrito na SEQ ID NO: 93, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6798-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6798” (n° de acesso miRBase: MI0022643, SEQ ID NO: 286) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6798-5p”.
[0167] O termo “gene hsa-miR-3620-5p” ou “hsa-miR-3620-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3620-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0022967) descrito na SEQ ID NO: 94, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 3620-5p pode ser obtido por um método descrito em Witten D et al., 2010, BMC Biol, Vol. 8, p. 58. Além disso, o “hsa-mir-3620” (n° de acesso miRBase: MI0016011, SEQ ID NO: 287) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-3620-5p”.
[0168] O termo “gene hsa-miR-1915-5p” ou “hsa-miR-1915-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1915-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0007891) descrito na SEQ ID NO: 95, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1915-5p pode ser obtido por um método descrito em Bar M et al., 2008, Stem Cells, Vol. 26, p. 2496-2505. Além disso, o “hsa-mir-1915” (n° de acesso miRBase: MI0008336, SEQ ID NO: 288) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 1915-5p”.
[0169] O termo “gene hsa-miR-4294” ou “hsa-miR-4294” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4294 (n° de acesso miRBase: MIMAT0016849) descrito na SEQ ID NO: 96, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4294 pode ser obtido por um método descrito em Goff LA et al., 2009, PLoS One, Vol. 4, e7192. Além disso, o “hsa-mir-4294” (n° de acesso miRBase: MI0015827, SEQ ID NO: 289) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4294”.
[0170] O termo “gene hsa-miR-642a-3p” ou “hsa-miR-642a-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-642a-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0020924) descrito na SEQ ID NO: 97, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 642a-3p pode ser obtido por um método descrito em Cummins JM et al., 2006, Proc Natl Acad Sci USA, Vol. 103, p. 3687-3692. Além disso, o “hsa- mir-642a” (n° de acesso miRBase: MI0003657, SEQ ID NO: 290) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-642a-3p”.
[0171] O termo “gene hsa-miR-371a-5p” ou “hsa-miR-371a-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-371a-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004687) descrito na SEQ ID NO: 98, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 371a-5p pode ser obtido por um método descrito em Suh MR et al., 2004, Dev Biol, Vol. 270, p. 488-498. Além disso, o “hsa-mir-371a” (n° de acesso miRBase: MI0000779, SEQ ID NO: 291) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 371a-5p”.
[0172] O termo “gene hsa-miR-940” ou “hsa-miR-940” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-940 (n° de acesso miRBase: MIMAT0004983) descrito na SEQ ID NO: 99, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-940 pode ser obtido por um método descrito em Lui WO et al., 2007, Cancer Res, Vol. 67, p. 6031-6043. Além disso, o “hsa-mir-940” (n° de acesso miRBase: MI0005762, SEQ ID NO: 292) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-940”.
[0173] O termo “gene hsa-miR-4450” ou “hsa-miR-4450” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4450 (n° de acesso miRBase: MIMAT0018971) descrito na SEQ ID NO: 100, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4450 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4450” (n° de acesso miRBase: MI0016795, SEQ ID NO: 293) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4450”.
[0174] O termo “gene hsa-miR-4723-5p” ou “hsa-miR-4723-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4723-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019838) descrito na SEQ ID NO: 101, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4723-5p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4723” (n° de acesso miRBase: MI0017359, SEQ ID NO: 294) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4723-5p”.
[0175] O termo “gene hsa-miR-1469” ou “hsa-miR-1469” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1469 (n° de acesso miRBase: MIMAT0007347) descrito na SEQ ID NO: 102, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-1469 pode ser obtido por um método descrito em Kawaji H et al., 2008, BMC Genomics, Vol. 9, p. 157. Além disso, o “hsa-mir-1469” (n° de acesso miRBase: MI0007074, SEQ ID NO: 295) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-1469”.
[0176] O termo “gene hsa-miR-6861-5p” ou “hsa-miR-6861-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6861-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027623) descrito na SEQ ID NO: 103, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6861-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6861” (n° de acesso miRBase: MI0022708, SEQ ID NO: 296) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6861-5p”.
[0177] O termo “gene hsa-miR-7975” ou “hsa-miR-7975” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-7975 (n° de acesso miRBase: MIMAT0031178) descrito na SEQ ID NO: 104, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-7975 pode ser obtido por um método descrito em Velthut-Meikas A et al., 2013, Mol Endocrinol, online. Além disso, o “hsa-mir-7975” (n° de acesso miRBase: MI0025751, SEQ ID NO: 297) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-7975”.
[0178] O termo “gene hsa-miR-6879-5p” ou “hsa-miR-6879-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6879-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027658) descrito na SEQ ID NO: 105, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6879-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6879” (n° de acesso miRBase: MI0022726, SEQ ID NO: 298) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6879-5p”.
[0179] O termo “gene hsa-miR-6802-5p” ou “hsa-miR-6802-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6802-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027504) descrito na SEQ ID NO: 106, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6802-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6802” (n° de acesso miRBase: MI0022647, SEQ ID NO: 299) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6802-5p”.
[0180] O termo “gene hsa-miR-1268b” ou “hsa-miR-1268b” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1268b (n° de acesso miRBase: MIMAT0018925) descrito na SEQ ID NO: 107, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1268b pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-1268b” (n° de acesso miRBase: MI0016748, SEQ ID NO: 300) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 1268b”.
[0181] O termo “gene hsa-miR-663b” ou “hsa-miR-663b” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-663b (n° de acesso miRBase: MIMAT0005867) descrito na SEQ ID NO: 108, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-663b pode ser obtido por um método descrito em Takada S et al., 2008, Leukemia, Vol. 22, p. 1274-1278. Além disso, o “hsa-mir-663b” (n° de acesso miRBase: MI0006336, SEQ ID NO: 301) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-663b”.
[0182] O termo “gene hsa-miR-125a-3p” ou “hsa-miR-125a-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-125a-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004602) descrito na SEQ ID NO: 109, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 125a-3p pode ser obtido por um método descrito em Lagos-Quintana M et al., 2002, Curr Biol, Vol. 12, p. 735-739. Além disso, o “hsa-mir-125a” (n° de acesso miRBase: MI0000469, SEQ ID NO: 302) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-125a-3p”.
[0183] O termo “gene hsa-miR-2861” ou “hsa-miR-2861” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-2861 (n° de acesso miRBase: MIMAT0013802) descrito na SEQ ID NO: 110, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-2861 pode ser obtido por um método descrito em Li H et al., 2009, J Clin Invest, Vol. 119, p. 3666-3677. Além disso, o “hsa-mir-2861” (n° de acesso miRBase: MI0013006, SEQ ID NO: 303) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-2861”.
[0184] O termo “gene hsa-miR-6088” ou “hsa-miR-6088” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6088 (n° de acesso miRBase: MIMAT0023713) descrito na SEQ ID NO: 111, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-6088 pode ser obtido por um método descrito em Yoo JK et al., 2012, Stem Cells Dev, Vol. 21, p. 2049-2057. Além disso, o “hsa-mir-6088” (n° de acesso miRBase: MI0020365, SEQ ID NO: 304) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6088”.
[0185] O termo “gene hsa-miR-4758-5p” ou “hsa-miR-4758-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4758-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019903) descrito na SEQ ID NO: 112, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4758-5p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4758” (n° de acesso miRBase: MI0017399, SEQ ID NO: 305) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4758-5p”.
[0186] O termo “gene hsa-miR-296-3p” ou “hsa-miR-296-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-296-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004679) descrito na SEQ ID NO: 113, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 296-3p pode ser obtido por um método descrito em Houbaviy HB et al., 2003, Dev Cell, Vol. 5, p. 351-358. Além disso, o “hsa-mir-296” (n° de acesso miRBase: MI0000747, SEQ ID NO: 306) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-296- 3p”.
[0187] O termo “gene hsa-miR-6738-5p” ou “hsa-miR-6738-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6738-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027377) descrito na SEQ ID NO: 114, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6738-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6738” (n° de acesso miRBase: MI0022583, SEQ ID NO: 307) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6738-5p”.
[0188] O termo “gene hsa-miR-671-5p” ou “hsa-miR-671-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-671-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0003880) descrito na SEQ ID NO: 115, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 671-5p pode ser obtido por um método descrito em Berezikov E et al., 2006, Genome Res, Vol. 16, p. 1289-1298. Além disso, o “hsa-mir-671” (n° de acesso miRBase: MI0003760, SEQ ID NO: 308) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-671-5p”.
[0189] O termo “gene hsa-miR-4454” ou “hsa-miR-4454” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4454 (n° de acesso miRBase: MIMAT0018976) descrito na SEQ ID NO: 116, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4454 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4454” (n° de acesso miRBase: MI0016800, SEQ ID NO: 309) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4454”.
[0190] O termo “gene hsa-miR-4516” ou “hsa-miR-4516” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4516 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019053) descrito na SEQ ID NO: 117, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4516 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4516” (n° de acesso miRBase: MI0016882, SEQ ID NO: 310) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4516”.
[0191] O termo “gene hsa-miR-7845-5p” ou “hsa-miR-7845-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-7845-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0030420) descrito na SEQ ID NO: 118, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 7845-5p pode ser obtido por um método descrito em Ple H et al., 2012, PLoS One, Vol. 7, e50746. Além disso, o “hsa-mir-7845” (n° de acesso miRBase: MI0025515, SEQ ID NO: 311) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-7845-5p”.
[0192] O termo “gene hsa-miR-4741” ou “hsa-miR-4741” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4741 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019871) descrito na SEQ ID NO: 119, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4741 pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4741” (n° de acesso miRBase: MI0017379, SEQ ID NO: 312) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4741”.
[0193] O termo “gene hsa-miR-92b-5p” ou “hsa-miR-92b-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-92b-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004792) descrito na SEQ ID NO: 120, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 92b-5p pode ser obtido por um método descrito em Cummins JM et al., 2006, Proc Natl Acad Sci USA, Vol. 103, p. 3687-3692. Além disso, o “hsa-mir-92b” (n° de acesso miRBase: MI0003560, SEQ ID NO: 313) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-92b-5p”.
[0194] O termo “gene hsa-miR-6795-5p” ou “hsa-miR-6795-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6795-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027490) descrito na SEQ ID NO: 121, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6795-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6795” (n° de acesso miRBase: MI0022640, SEQ ID NO: 314) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6795-5p”.
[0195] O termo “gene hsa-miR-6805-3p” ou “hsa-miR-6805-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6805-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027511) descrito na SEQ ID NO: 122, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6805-3p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6805” (n° de acesso miRBase: MI0022650, SEQ ID NO: 315) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6805-3p”.
[0196] O termo “gene hsa-miR-4725-3p” ou “hsa-miR-4725-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4725-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019844) descrito na SEQ ID NO: 123, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4725-3p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4725” (n° de acesso miRBase: MI0017362, SEQ ID NO: 316) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4725-3p”.
[0197] O termo “gene hsa-miR-6782-5p” ou “hsa-miR-6782-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6782-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027464) descrito na SEQ ID NO: 124, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6782-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6782” (n° de acesso miRBase: MI0022627, SEQ ID NO: 317) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6782-5p”.
[0198] O termo “gene hsa-miR-4688” ou “hsa-miR-4688” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4688 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019777) descrito na SEQ ID NO: 125, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4688 pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4688” (n° de acesso miRBase: MI0017321, SEQ ID NO: 318) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4688”.
[0199] O termo “gene hsa-miR-6850-5p” ou “hsa-miR-6850-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6850-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027600) descrito na SEQ ID NO: 126, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6850-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6850” (n° de acesso miRBase: MI0022696, SEQ ID NO: 319) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6850-5p”.
[0200] O termo “gene hsa-miR-6777-5p” ou “hsa-miR-6777-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6777-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027454) descrito na SEQ ID NO: 127, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6777-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6777” (n° de acesso miRBase: MI0022622, SEQ ID NO: 320) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6777-5p”.
[0201] O termo “gene hsa-miR-6785-5p” ou “hsa-miR-6785-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6785-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027470) descrito na SEQ ID NO: 128, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6785-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6785” (n° de acesso miRBase: MI0022630, SEQ ID NO: 321) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6785-5p”.
[0202] O termo “gene hsa-miR-7106-5p” ou “hsa-miR-7106-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-7106-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0028109) descrito na SEQ ID NO: 129, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 7106-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-7106” (n° de acesso miRBase: MI0022957, SEQ ID NO: 322) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-7106-5p”.
[0203] O termo “gene hsa-miR-3663-3p” ou “hsa-miR-3663-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3663-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0018085) descrito na SEQ ID NO: 130, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 3663-3p pode ser obtido por um método descrito em Liao JY et al., 2010, PLoS One, Vol. 5, e10563. Além disso, o “hsa-mir-3663” (n° de acesso miRBase: MI0016064, SEQ ID NO: 323) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 3663-3p”.
[0204] O termo “gene hsa-miR-6131” ou “hsa-miR-6131” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6131 (n° de acesso miRBase: MIMAT0024615) descrito na SEQ ID NO: 131, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-6131 pode ser obtido por um método descrito em Dannemann M et al., 2012, Genome Biol Evol, Vol. 4, p. 552-564. Além disso, o “hsa-mir-6131” (n° de acesso miRBase: MI0021276, SEQ ID NO: 324) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 6131”.
[0205] O termo “gene hsa-miR-1915-3p” ou “hsa-miR-1915-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1915-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0007892) descrito na SEQ ID NO: 132, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1915-3p pode ser obtido por um método descrito em Bar M et al., 2008, Stem Cells, Vol. 26, p. 2496-2505. Além disso, o “hsa-mir-1915” (n° de acesso miRBase: MI0008336, SEQ ID NO: 288) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 1915-3p”.
[0206] O termo “gene hsa-miR-4532” ou “hsa-miR-4532” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4532 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019071) descrito na SEQ ID NO: 133, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4532 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4532” (n° de acesso miRBase: MI0016899, SEQ ID NO: 325) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4532”.
[0207] O termo “gene hsa-miR-6820-5p” ou “hsa-miR-6820-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6820-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027540) descrito na SEQ ID NO: 134, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6820-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6820” (n° de acesso miRBase: MI0022665, SEQ ID NO: 326) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6820-5p”.
[0208] O termo “gene hsa-miR-4689” ou “hsa-miR-4689” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4689 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019778) descrito na SEQ ID NO: 135, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4689 pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4689” (n° de acesso miRBase: MI0017322, SEQ ID NO: 327) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4689”.
[0209] O termo “gene hsa-miR-4638-5p” ou “hsa-miR-4638-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4638-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019695) descrito na SEQ ID NO: 136, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4638-5p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4638” (n° de acesso miRBase: MI0017265, SEQ ID NO: 328) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4638-5p”.
[0210] O termo “gene hsa-miR-3656” ou “hsa-miR-3656” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3656 (n° de acesso miRBase: MIMAT0018076) descrito na SEQ ID NO: 137, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-3656 pode ser obtido por um método descrito em Meiri E et al., 2010, Nucleic Acids Res, Vol. 38, p. 6234-6246. Além disso, o “hsa-mir-3656” (n° de acesso miRBase: MI0016056, SEQ ID NO: 329) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-3656”.
[0211] O termo “gene hsa-miR-3621” ou “hsa-miR-3621” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3621 (n° de acesso miRBase: MIMAT0018002) descrito na SEQ ID NO: 138, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-3621 pode ser obtido por um método descrito em Witten D et al., 2010, BMC Biol, Vol. 8, p. 58. Além disso, o “hsa-mir-3621” (n° de acesso miRBase: MI0016012, SEQ ID NO: 330) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-3621”.
[0212] O termo “gene hsa-miR-6769b-5p” ou “hsa-miR-6769b- 5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6769b-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027620) descrito na SEQ ID NO: 139, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-6769b-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir- 6769b” (n° de acesso miRBase: MI0022706, SEQ ID NO: 331) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6769b-5p”.
[0213] O termo “gene hsa-miR-149-3p” ou “hsa-miR-149-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-149-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004609) descrito na SEQ ID NO: 140, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 149-3p pode ser obtido por um método descrito em Lagos-Quintana M et al., 2002, Curr Biol, Vol. 12, p. 735-739. Além disso, o “hsa-mir-149” (n° de acesso miRBase: MI0000478, SEQ ID NO: 332) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-149-3p”.
[0214] O termo “gene hsa-miR-23b-3p” ou “hsa-miR-23b-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-23b-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0000418) descrito na SEQ ID NO: 141, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 23b-3p pode ser obtido por um método descrito em Lagos-Quintana M et al., 2002, Curr Biol, Vol. 12, p. 735-739. Além disso, o “hsa-mir-23b” (n° de acesso miRBase: MI0000439, SEQ ID NO: 333) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-23b-3p”.
[0215] O termo “gene hsa-miR-3135b” ou “hsa-miR-3135b” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3135b (n° de acesso miRBase: MIMAT0018985) descrito na SEQ ID NO: 142, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 3135b pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-3135b” (n° de acesso miRBase: MI0016809, SEQ ID NO: 334) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 3135b”.
[0216] O termo “gene hsa-miR-6848-5p” ou “hsa-miR-6848-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6848-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027596) descrito na SEQ ID NO: 143, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6848-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6848” (n° de acesso miRBase: MI0022694, SEQ ID NO: 335) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6848-5p”.
[0217] O termo “gene hsa-miR-6769a-5p” ou “hsa-miR-6769a- 5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6769a-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027438) descrito na SEQ ID NO: 144, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-6769a-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir- 6769a” (n° de acesso miRBase: MI0022614, SEQ ID NO: 336) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6769a-5p”.
[0218] O termo “gene hsa-miR-4327” ou “hsa-miR-4327” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4327 (n° de acesso miRBase: MIMAT0016889) descrito na SEQ ID NO: 145, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4327 pode ser obtido por um método descrito em Goff LA et al., 2009, PLoS One, Vol. 4, e7192. Além disso, o “hsa-mir-4327” (n° de acesso miRBase: MI0015867, SEQ ID NO: 337) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4327”.
[0219] O termo “gene hsa-miR-6765-3p” ou “hsa-miR-6765-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6765-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027431) descrito na SEQ ID NO: 146, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6765-3p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6765” (n° de acesso miRBase: MI0022610, SEQ ID NO: 338) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6765-3p”.
[0220] O termo “gene hsa-miR-6716-5p” ou “hsa-miR-6716-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6716-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0025844) descrito na SEQ ID NO: 147, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6716-5p pode ser obtido por um método descrito em Li Y et al., 2012, Gene, Vol. 497, p. 330-335. Além disso, o “hsa-mir-6716” (n° de acesso miRBase: MI0022550, SEQ ID NO: 339) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6716-5p”.
[0221] O termo “gene hsa-miR-6877-5p” ou “hsa-miR-6877-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6877-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027654) descrito na SEQ ID NO: 148, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6877-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6877” (n° de acesso miRBase: MI0022724, SEQ ID NO: 340) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6877-5p”.
[0222] O termo “gene hsa-miR-6727-5p” ou “hsa-miR-6727-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6727-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027355) descrito na SEQ ID NO: 149, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6727-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6727” (n° de acesso miRBase: MI0022572, SEQ ID NO: 341) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6727-5p”.
[0223] O termo “gene hsa-miR-4534” ou “hsa-miR-4534” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4534 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019073) descrito na SEQ ID NO: 150, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4534 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4534” (n° de acesso miRBase: MI0016901, SEQ ID NO: 342) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4534”.
[0224] O termo “gene hsa-miR-614” ou “hsa-miR-614” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-614 (n° de acesso miRBase: MIMAT0003282) descrito na SEQ ID NO: 151, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-614 pode ser obtido por um método descrito em Cummins JM et al., 2006, Proc Natl Acad Sci USA, Vol. 103, p. 3687-3692. Além disso, o “hsa-mir-614” (n° de acesso miRBase: MI0003627, SEQ ID NO: 343) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-614”.
[0225] O termo “gene hsa-miR-1202” ou “hsa-miR-1202” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1202 (n° de acesso miRBase: MIMAT0005865) descrito na SEQ ID NO: 152, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-1202 pode ser obtido por um método descrito em Marton S et al., 2008, Leukemia, Vol. 22, p. 330-338. Além disso, o “hsa-mir-1202” (n° de acesso miRBase: MI0006334, SEQ ID NO: 344) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-1202”.
[0226] O termo “gene hsa-miR-575” ou “hsa-miR-575” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-575 (n° de acesso miRBase: MIMAT0003240) descrito na SEQ ID NO: 153, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-575 pode ser obtido por um método descrito em Cummins JM et al., 2006, Proc Natl Acad Sci USA, Vol. 103, p. 3687-3692. Além disso, o “hsa-mir-575” (n° de acesso miRBase: MI0003582, SEQ ID NO: 345) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-575”.
[0227] O termo “gene hsa-miR-6870-5p” ou “hsa-miR-6870-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6870-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027640) descrito na SEQ ID NO: 154, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6870-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6870” (n° de acesso miRBase: MI0022717, SEQ ID NO: 346) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6870-5p”.
[0228] O termo “gene hsa-miR-6722-3p” ou “hsa-miR-6722-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6722-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0025854) descrito na SEQ ID NO: 155, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6722-3p pode ser obtido por um método descrito em Li Y et al., 2012, Gene, Vol. 497, p. 330-335. Além disso, o “hsa-mir-6722” (n° de acesso miRBase: MI0022557, SEQ ID NO: 347) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6722-3p”.
[0229] O termo “gene hsa-miR-7977” ou “hsa-miR-7977” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-7977 (n° de acesso miRBase: MIMAT0031180) descrito na SEQ ID NO: 156, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-7977 pode ser obtido por um método descrito em Velthut-Meikas A et al., 2013, Mol Endocrinol, online. Além disso, o “hsa-mir-7977” (n° de acesso miRBase: MI0025753, SEQ ID NO: 348) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-7977”.
[0230] O termo “gene hsa-miR-4649-5p” ou “hsa-miR-4649-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4649-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019711) descrito na SEQ ID NO: 157, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4649-5p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4649” (n° de acesso miRBase: MI0017276, SEQ ID NO: 349) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4649-5p”.
[0231] O termo “gene hsa-miR-4675” ou “hsa-miR-4675” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4675 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019757) descrito na SEQ ID NO: 158, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4675 pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4675” (n° de acesso miRBase: MI0017306, SEQ ID NO: 350) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4675”.
[0232] O termo “gene hsa-miR-6075” ou “hsa-miR-6075” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6075 (n° de acesso miRBase: MIMAT0023700) descrito na SEQ ID NO: 159, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-6075 pode ser obtido por um método descrito em Voellenkle C et al., 2012, RNA, Vol. 18, p. 472-484. Além disso, o “hsa-mir-6075” (n° de acesso miRBase: MI0020352, SEQ ID NO: 351) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6075”.
[0233] O termo “gene hsa-miR-6779-5p” ou “hsa-miR-6779-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6779-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027458) descrito na SEQ ID NO: 160, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6779-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6779” (n° de acesso miRBase: MI0022624, SEQ ID NO: 352) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6779-5p”.
[0234] O termo “gene hsa-miR-4271” ou “hsa-miR-4271” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4271 (n° de acesso miRBase: MIMAT0016901) descrito na SEQ ID NO: 161, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4271 pode ser obtido por um método descrito em Goff LA et al., 2009, PLoS One, Vol. 4, e7192. Além disso, o “hsa-mir-4271” (n° de acesso miRBase: MI0015879, SEQ ID NO: 353) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4271”.
[0235] O termo “gene hsa-miR-3196” ou “hsa-miR-3196” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3196 (n° de acesso miRBase: MIMAT0015080) descrito na SEQ ID NO: 162, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-3196 pode ser obtido por um método descrito em Stark MS et al., 2010, PLoS One, Vol. 5, e9685. Além disso, o “hsa-mir-3196” (n° de acesso miRBase: MI0014241, SEQ ID NO: 354) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-3196”.
[0236] O termo “gene hsa-miR-6803-5p” ou “hsa-miR-6803-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6803-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027506) descrito na SEQ ID NO: 163, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6803-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6803” (n° de acesso miRBase: MI0022648, SEQ ID NO: 355) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6803-5p”.
[0237] O termo “gene hsa-miR-6789-5p” ou “hsa-miR-6789-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6789-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027478) descrito na SEQ ID NO: 164, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6789-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6789” (n° de acesso miRBase: MI0022634, SEQ ID NO: 356) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6789-5p”.
[0238] O termo “gene hsa-miR-4648” ou “hsa-miR-4648” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4648 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019710) descrito na SEQ ID NO: 165, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4648 pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4648” (n° de acesso miRBase: MI0017275, SEQ ID NO: 357) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4648”.
[0239] O termo “gene hsa-miR-4508” ou “hsa-miR-4508” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4508 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019045) descrito na SEQ ID NO: 166, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4508 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4508” (n° de acesso miRBase: MI0016872, SEQ ID NO: 358) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4508”.
[0240] O termo “gene hsa-miR-4749-5p” ou “hsa-miR-4749-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4749-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019885) descrito na SEQ ID NO: 167, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4749-5p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4749” (n° de acesso miRBase: MI0017388, SEQ ID NO: 359) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4749-5p”.
[0241] O termo “gene hsa-miR-4505” ou “hsa-miR-4505” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4505 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019041) descrito na SEQ ID NO: 168, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4505 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4505” (n° de acesso miRBase: MI0016868, SEQ ID NO: 360) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4505”.
[0242] O termo “gene hsa-miR-5698” ou “hsa-miR-5698” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-5698 (n° de acesso miRBase: MIMAT0022491) descrito na SEQ ID NO: 169, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-5698 pode ser obtido por um método descrito em Watahiki A et al., 2011, PLoS One, Vol. 6, e24950. Além disso, o “hsa-mir-5698” (n° de acesso miRBase: MI0019305, SEQ ID NO: 361) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-5698”.
[0243] O termo “gene hsa-miR-1199-5p” ou “hsa-miR-1199-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1199-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0031119) descrito na SEQ ID NO: 170, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1199-5p pode ser obtido por um método descrito em Salvi A et al., 2013, Int J Oncol, Vol. 42, p. 391-402. Além disso, o “hsa-mir-1199” (n° de acesso miRBase: MI0020340, SEQ ID NO: 362) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 1199-5p”.
[0244] O termo “gene hsa-miR-4763-3p” ou “hsa-miR-4763-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4763-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019913) descrito na SEQ ID NO: 171, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4763-3p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4763” (n° de acesso miRBase: MI0017404, SEQ ID NO: 363) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4763-3p”.
[0245] O termo “gene hsa-miR-1231” ou “hsa-miR-1231” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1231 (n° de acesso miRBase: MIMAT0005586) descrito na SEQ ID NO: 172, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-1231 pode ser obtido por um método descrito em Berezikov E et al., 2007, Mol Cell, Vol. 28, p. 328-336. Além disso, o “hsa-mir-1231” (n° de acesso miRBase: MI0006321, SEQ ID NO: 364) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-1231”.
[0246] O termo “gene hsa-miR-1233-5p” ou “hsa-miR-1233-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1233-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0022943) descrito na SEQ ID NO: 173, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1233-5p pode ser obtido por um método descrito em Berezikov E et al., 2007, Mol Cell, Vol. 28, p. 328-336. Além disso, o “hsa-mir-1233-1 e hsa-mir-1233-2” (nos de acesso miRBase:. MI0006323 e MI0015973, SEQ ID NOs: 365 e 366) possuindo estruturas similares a grampos (hairpin-like) são conhecidos como precursores de “hsa-miR-1233-5p”.
[0247] O termo “gene hsa-miR-150-3p” ou “hsa-miR-150-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-150-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004610) descrito na SEQ ID NO: 174, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 150-3p pode ser obtido por um método descrito em Lagos-Quintana M et al., 2002, Curr Biol, Vol. 12, p. 735-739. Além disso, o “hsa-mir-150” (n° de acesso miRBase: MI0000479, SEQ ID NO: 367) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-150-3p”.
[0248] O termo “gene hsa-miR-1225-3p” ou “hsa-miR-1225-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1225-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0005573) descrito na SEQ ID NO: 175, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1225-3p pode ser obtido por um método descrito em Berezikov E et al., 2007, Mol Cell, Vol. 28, p. 328-336. Além disso, o “hsa-mir-1225” (n° de acesso miRBase: MI0006311, SEQ ID NO: 235) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 1225-3p”.
[0249] O termo “gene hsa-miR-92a-2-5p” ou “hsa-miR-92a-2-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-92a-2-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004508) descrito na SEQ ID NO: 176, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 92a-2-5p pode ser obtido por um método descrito em Mourelatos Z et al., 2002, Genes Dev, Vol. 16, p. 720-728. Além disso, o “hsa-mir-92a-2” (n° de acesso miRBase: MI0000094, SEQ ID NO: 368) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-92a-2-5p”.
[0250] O termo “gene hsa-miR-423-5p” ou “hsa-miR-423-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-423-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004748) descrito na SEQ ID NO: 177, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 423-5p pode ser obtido por um método descrito em Kasashima K et al., 2004, Biochem Biophys Res Commun, Vol. 322, p. 403-410. Além disso, o “hsa-mir- 423” (n° de acesso miRBase: MI0001445, SEQ ID NO: 369) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-423-5p”.
[0251] O termo “gene hsa-miR-1268a” ou “hsa-miR-1268a” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-1268a (n° de acesso miRBase: MIMAT0005922) descrito na SEQ ID NO: 178, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 1268a pode ser obtido por um método descrito em Morin RD et al., 2008, Genome Res, Vol. 18, p. 610-621. Além disso, o “hsa-mir-1268a” (n° de acesso miRBase: MI0006405, SEQ ID NO: 370) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-1268a”.
[0252] O termo “gene hsa-miR-128-2-5p” ou “hsa-miR-128-2-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-128-2-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0031095) descrito na SEQ ID NO: 179, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 128-2-5p pode ser obtido por um método descrito em Lagos-Quintana M et al., 2002, Curr Biol, Vol. 12, p. 735-739. Além disso, o “hsa-mir-128-2” (n° de acesso miRBase: MI0000727, SEQ ID NO: 371) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-128-2-5p”.
[0253] O termo “gene hsa-miR-24-3p” ou “hsa-miR-24-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-24-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0000080) descrito na SEQ ID NO: 180, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 24-3p pode ser obtido por um método descrito em Lagos-Quintana M et al., 2001, Science, Vol. 294, p. 853-858. Além disso, o “hsa-mir-24-1 e hsa-mir- 24-2” (nos de acesso miRBase:. MI0000080 e MI0000081, SEQ ID NOs: 372 e 373) possuindo estruturas similares a grampos (hairpin-like) são conhecidos como precursores de “hsa-miR-24-3p”.
[0254] O termo “gene hsa-miR-4697-5p” ou “hsa-miR-4697-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4697-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019791) descrito na SEQ ID NO: 181, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4697-5p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4697” (n° de acesso miRBase: MI0017330, SEQ ID NO: 374) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4697-5p”.
[0255] O termo “gene hsa-miR-3197” ou “hsa-miR-3197” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3197 (n° de acesso miRBase: MIMAT0015082) descrito na SEQ ID NO: 182, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-3197 pode ser obtido por um método descrito em Stark MS et al., 2010, PLoS One, Vol. 5, e9685. Além disso, o “hsa-mir-3197” (n° de acesso miRBase: MI0014245, SEQ ID NO: 375) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-3197”.
[0256] O termo “gene hsa-miR-675-5p” ou “hsa-miR-675-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-675-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004284) descrito na SEQ ID NO: 183, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 675-5p pode ser obtido por um método descrito em Cai X et al., 2007, RNA, Vol. 13, p. 313-316. Além disso, o “hsa-mir-675” (n° de acesso miRBase: MI0005416, SEQ ID NO: 376) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-675-5p”.
[0257] O termo “gene hsa-miR-4486” ou “hsa-miR-4486” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4486 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019020) descrito na SEQ ID NO: 184, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4486 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4486” (n° de acesso miRBase: MI0016847, SEQ ID NO: 377) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4486”.
[0258] O termo “gene hsa-miR-7107-5p” ou “hsa-miR-7107-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-7107-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0028111) descrito na SEQ ID NO: 185, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 7107-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-7107” (n° de acesso miRBase: MI0022958, SEQ ID NO: 378) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-7107-5p”.
[0259] O termo “gene hsa-miR-23a-3p” ou “hsa-miR-23a-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-23a-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0000078) descrito na SEQ ID NO: 186, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 23a-3p pode ser obtido por um método descrito em Lagos-Quintana M et al., 2001, Science, Vol. 294, p. 853-858. Além disso, o “hsa-mir-23a” (n° de acesso miRBase: MI0000079, SEQ ID NO: 379) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-23a-3p”.
[0260] O termo “gene hsa-miR-4667-5p” ou “hsa-miR-4667-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4667-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019743) descrito na SEQ ID NO: 187, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 4667-5p pode ser obtido por um método descrito em Persson H et al., 2011, Cancer Res, Vol. 71, p. 78-86. Além disso, o “hsa-mir-4667” (n° de acesso miRBase: MI0017297, SEQ ID NO: 380) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 4667-5p”.
[0261] O termo “gene hsa-miR-451a” ou “hsa-miR-451a” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-451a (n° de acesso miRBase: MIMAT0001631) descrito na SEQ ID NO: 188, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-451a pode ser obtido por um método descrito em Altuvia Y et al., 2005, Nucleic Acids Res, Vol. 33, p. 2697-2706. Além disso, o “hsa-mir-451a” (n° de acesso miRBase: MI0001729, SEQ ID NO: 381) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 451a”.
[0262] O termo “gene hsa-miR-3940-5p” ou “hsa-miR-3940-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3940-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0019229) descrito na SEQ ID NO: 189, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 3940-5p pode ser obtido por um método descrito em Liao JY et al., 2010, PLoS One, Vol. 5, e10563. Além disso, o “hsa-mir-3940” (n° de acesso miRBase: MI0016597, SEQ ID NO: 382) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR- 3940-5p”.
[0263] O termo “gene hsa-miR-8059” ou “hsa-miR-8059” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-8059 (n° de acesso miRBase: MIMAT0030986) descrito na SEQ ID NO: 190, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-8059 pode ser obtido por um método descrito em Wang HJ et al., 2013, Shock, Vol. 39, p. 480-487. Além disso, o “hsa-mir-8059” (n° de acesso miRBase: MI0025895, SEQ ID NO: 383) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-8059”.
[0264] O termo “gene hsa-miR-6813-5p” ou “hsa-miR-6813-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6813-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027526) descrito na SEQ ID NO: 191, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6813-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6813” (n° de acesso miRBase: MI0022658, SEQ ID NO: 384) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6813-5p”.
[0265] O termo “gene hsa-miR-4492” ou “hsa-miR-4492” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4492 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019027) descrito na SEQ ID NO: 192, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4492 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4492” (n° de acesso miRBase: MI0016854, SEQ ID NO: 385) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4492”.
[0266] O termo “gene hsa-miR-4476” ou “hsa-miR-4476” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4476 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019003) descrito na SEQ ID NO: 193, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4476 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4476” (n° de acesso miRBase: MI0016828, SEQ ID NO: 386) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4476”.
[0267] O termo “gene hsa-miR-6090” ou “hsa-miR-6090” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6090 (n° de acesso miRBase: MIMAT0023715) descrito na SEQ ID NO: 194, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-6090 pode ser obtido por um método descrito em Yoo JK et al., 2012, Stem Cells Dev, Vol. 21, p. 2049-2057. Além disso, o “hsa-mir-6090” (n° de acesso miRBase: MI0020367, SEQ ID NO: 387) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6090”.
[0268] O termo “gene hsa-miR-6836-3p” ou “hsa-miR-6836-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6836-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027575) descrito na SEQ ID NO: 606, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6836-3p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6836” (n° de acesso miRBase: MI0022682, SEQ ID NO: 615) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6836-3p”.
[0269] O termo “gene hsa-miR-3195” ou “hsa-miR-3195” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3195 (n° de acesso miRBase: MIMAT0015079) descrito na SEQ ID NO: 607, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-3195 pode ser obtido por um método descrito em Stark MS et al., 2010, PLoS One, Vol. 5, e9685. Além disso, o “hsa-mir-3195” (n° de acesso miRBase: MI0014240, SEQ ID NO: 616) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin- like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-3195”.
[0270] O termo “gene hsa-miR-718” ou “hsa-miR-718” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-718 (n° de acesso miRBase: MIMAT0012735) descrito na SEQ ID NO: 608, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-718 pode ser obtido por um método descrito em Artzi S et al., 2008, BMC Bioinformatics, Vol. 9, p. 39. Além disso, o “hsa-mir-718” (n° de acesso miRBase: MI0012489, SEQ ID NO: 617) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-718”.
[0271] O termo “gene hsa-miR-3178” ou “hsa-miR-3178” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-3178 (n° de acesso miRBase: MIMAT0015055) descrito na SEQ ID NO: 609, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-3178 pode ser obtido por um método descrito em Stark MS et al., 2010, PLoS One, Vol. 5, e9685. Além disso, o “hsa-mir-3178” (n° de acesso miRBase: MI0014212, SEQ ID NO: 618) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-3178”.
[0272] O termo “gene hsa-miR-638” ou “hsa-miR-638” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-638 (n° de acesso miRBase: MIMAT0003308) descrito na SEQ ID NO: 610, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-638 pode ser obtido por um método descrito em Cummins JM et al., 2006, Proc Natl Acad Sci USA, Vol. 103, p. 3687-3692. Além disso, o “hsa-mir-638” (n° de acesso miRBase: MI0003653, SEQ ID NO: 619) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-638”.
[0273] O termo “gene hsa-miR-4497” ou “hsa-miR-4497” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-4497 (n° de acesso miRBase: MIMAT0019032) descrito na SEQ ID NO: 611, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-4497 pode ser obtido por um método descrito em Jima DD et al., 2010, Blood, Vol. 116, e118-e127. Além disso, o “hsa-mir-4497” (n° de acesso miRBase: MI0016859, SEQ ID NO: 620) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-4497”.
[0274] O termo “gene hsa-miR-6085” ou “hsa-miR-6085” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6085 (n° de acesso miRBase: MIMAT0023710) descrito na SEQ ID NO: 612, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR-6085 pode ser obtido por um método descrito em Voellenkle C et al., 2012, RNA, Vol. 18, p. 472-484. Além disso, o “hsa-mir-6085” (n° de acesso miRBase: MI0020362, SEQ ID NO: 621) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpinlike) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6085”.
[0275] O termo “gene hsa-miR-6752-5p” ou “hsa-miR-6752-5p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-6752-5p (n° de acesso miRBase: MIMAT0027404) descrito na SEQ ID NO: 613, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 6752-5p pode ser obtido por um método descrito em Ladewig E et al., 2012, Genome Res, Vol. 22, p. 1634-1645. Além disso, o “hsa-mir-6752” (n° de acesso miRBase: MI0022597, SEQ ID NO: 622) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-6752-5p”.
[0276] O termo “gene hsa-miR-135a-3p” ou “hsa-miR-135a-3p” utilizado na presente invenção inclui o gene hsa-miR-135a-3p (n° de acesso miRBase: MIMAT0004595) descrito na SEQ ID NO: 614, um homólogo ou ortólogo de um organismo de espécie diferente, e similares. O gene hsa-miR- 135a-3p pode ser obtido por um método descrito em Lagos-Quintana M et al., 2002, Curr Biol, Vol. 12, p. 735-739. Além disso, o “hsa-mir-135a” (n° de acesso miRBase: MI0000452, SEQ ID NO: 623) possuindo uma estrutura semelhante a um grampo (hairpin-like) é conhecido como um precursor de “hsa-miR-135a-3p”.
[0277] Um miRNA maduro pode tornar-se uma variante devido à sequência que é clivada de maneira mais curta ou mais longa por uma a várias substituições de nucleotídeos quando cortado como o miRNA maduro a partir de seu RNA precursor possuindo uma estrutura similar a um grampo (hairpin-like). Este variante é denominado isomiR (Morin RD. et al., 2008, Genome Res., Vol. 18, p. 610-621). O miRBase Release 20 mostra as sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 194 e 851 a 606, bem como um grande número das sequências nucleotídicas variantes e fragmentos representados pelas SEQ ID NOs: 388 a 605 e 624 a 635, que são denominados isomiRs. Estas variantes podem também ser obtidas como miRNAs possuindo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 e 194 e 606 a 611. Especificamente, entre as variantes de polinucleotídeos consistindo na sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 5, 7, 8, 9, 11, 16, 19, 20, 21, 26, 27, 28, 30, 34, 37, 38, 39, 41, 43, 45, 46, 48, 50, 54, 55, 57, 58, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 69, 70, 71, 73, 74, 76, 77, 78, 80, 81, 82, 84, 85, 86, 88, 89, 94, 95, 97, 98, 99, 100, 101, 104, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 115, 116, 117, 119, 120, 123, 125, 131, 132, 133, 135, 136, 137, 140, 141, 142, 147, 151, 152, 157, 161, 162, 165, 166, 167, 168, 169, 171, 173, 174, 176, 177, 178, 179, 180, 182, 183, 184, 186, 187, 188, 189, 192, 193, 607, 608, 609, 610, 611 e 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência nucleotídica pela substituição de U por T, de acordo com a presente invenção, exemplos das variantes mais longas registradas na miRBase Release 20 incluem os polinucleotídeos representados pelas SEQ ID NOs: 388, 390, 392, 394, 396, 398, 400, 402, 404, 406, 408, 410, 412, 414, 416, 418, 420, 422, 424, 426, 428, 430, 432, 434, 436, 438, 440, 442, 444, 446, 448, 450, 452, 454, 456, 458, 460, 462, 464, 466, 468, 470, 472, 474, 476, 478, 480, 482, 484, 486, 488, 490, 492, 494, 496, 498, 500, 502, 504, 506, 508, 510, 512, 514, 516, 518, 520, 522, 524, 526, 528, 530, 532, 534, 536, 538, 540, 542, 544, 546, 548, 550, 552, 554, 556, 558, 560, 562, 564, 566, 568, 570, 572, 574, 576, 578, 580, 582, 584, 586, 588, 590, 592, 594, 596, 598, 600, 602, 604, 624, 626, 628, 630, 632 e 634, respectivamente. Além disso, entre as variantes de polinucleotídeos consistindo em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 5, 7, 8, 9, 11, 16, 19, 20, 21, 26, 27, 28, 30, 34, 37, 38, 39, 41, 43, 45, 46, 48, 50, 54, 55, 57, 58, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 69, 70, 71, 73, 74, 76, 77, 78, 80, 81, 82, 84, 85, 86, 88, 89, 94, 95, 97, 98, 99, 100, 101, 104, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 115, 116, 117, 119, 120, 123, 125, 131, 132, 133, 135, 136, 137, 140, 141, 142, 147, 151, 152, 157, 161, 162, 165, 166, 167, 168, 169, 171, 173, 174, 176, 177, 178, 179, 180, 182, 183, 184, 186, 187, 188, 189, 192, 193, 607, 608, 609, 610, 611 e 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T de acordo com a presente invenção, exemplos das variantes mais curtas registradas na base de dados miRBase Release 20 incluem polinucleotídeos possuindo a sequência representada pelas SEQ ID NOs: 389, 391, 393, 395, 397, 399, 401, 403, 405, 407, 409, 411, 413, 415, 417, 419, 421, 423, 425, 427, 429, 431, 433, 435, 437, 439, 441, 443, 445, 447, 449, 451, 453, 455, 457, 459, 461, 463, 465, 467, 469, 471, 473, 475, 477, 479, 481, 483, 485, 487, 489, 491, 493, 495, 497, 499, 501, 503, 505, 507, 509, 511, 513, 515, 517, 519, 521, 523, 525, 527, 529, 531, 533, 535, 537, 539, 541, 543, 545, 547, 549, 551, 553, 555, 557, 559, 561, 563, 565, 567, 569, 571, 573, 575, 577, 579, 581, 583, 585, 587, 589, 591, 593, 595, 597, 599, 601, 603, 605, 625, 627, 629, 631, 633 e 635, respectivamente. Além destas variantes e fragmentos, os exemplos incluem um grande número de polinucleotídeos isomiR de SEQ ID NOs: 1 a 194 e 606 a 614 registrados na base de dados miRBase. Exemplos de polinucleotídeos compreendendo uma sequência nucleotídica representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 194 e 606 a 614 incluem um polinucleotídeo representado por qualquer uma das SEQ ID NOs: 195 a 387 e 615 a 623, que são os seus respectivos precursores.
[0278] Os nomes e números de acesso miRBase (números de registro) dos genes representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 635 estão apresentados na Tabela 1.TABELA 1 >> >> >>
[0279] O presente relatório descritivo abrange os conteúdos descritos nos relatórios descritivos e/ou desenhos do pedido de patente Japonesa 2014-122686 e pedido de patente Japonesa 2015-070182, partir dos quais a prioridade do presente pedido é baseada.
EFEITOS VANTAJOSOS DA INVENÇÃO
[0280] De acordo com a presente invenção, o câncer colorretal pode ser facilmente detectado e de maneira altamente acurada.
[0281] Por exemplo, a presença ou ausência do câncer colorretal em um paciente pode ser facilmente detectada utilizando, como um índice, os valores de medição do nível de expressão de diversos miRNAs no sangue, soro e/ou plasma do paciente, que pode ser coletado a partir do paciente com invasividade limitada. BREVE DESCRIÇÃO DAS FIGURAS - Figura 1 - Esta figura mostra a relação entre as sequências nucleotídicas de hsa-miR-3679-5p representada pela SEQ ID NO: 11 e hsa- miR-3679-3p representada pela SEQ ID NO: 78, que são produzidos a partir de um precursor hsa-mir-3679 representado pela SEQ ID NO: 205. - Figura 2 - Diagrama da esquerda: os valores de medição do nível de expressão de hsa-miR-6726-5p (SEQ ID NO: 1) em indivíduos saudáveis (100 pessoas) e pacientes com câncer colorretal (34 pessoas) selecionados como uma coorte de desenvolvimento foram plotados nas ordenadas. A linha horizontal no diagrama representa um limiar (9,43) que foi otimizado por meio de análise discriminante de Fisher e discriminado entre os dois grupos. Diagrama da direita: os valores de medição do nível de expressão de hsa-miR-6726-5p (SEQ ID NO: 1) em indivíduos saudáveis (50 pessoas) e pacientes com câncer colorretal (16 pessoas) selecionados como uma coorte de validação foram plotados nas ordenadas. A linha horizontal no diagrama representa um limiar (9,43) que foi estabelecido para a coorte de desenvolvimento e discriminado entre os dois grupos. - Figura 3 - Diagrama da esquerda: os valores de medição do nível de expressão de hsa-miR-6726-5p (SEQ ID NO: 1) em indivíduos saudáveis (100 pessoas, círculos) e pacientes com câncer colorretal (34 pessoas, triângulos) selecionados como uma coorte de desenvolvimento foram plotados na abscissa contra os seus valores de medição do nível de expressão de hsa-miR-4257 (SEQ ID nO: 2) na ordenada. A linha horizontal no diagrama representa uma função discriminante (0 = 1,26x + y - 18,06) que foi otimizada por meio de análise discriminante de Fisher e uma discriminação entre os dois grupos. Diagrama da direita: os valores de medição do nível de expressão de hsa-miR-6726-5p (SEQ ID NO: 1) em indivíduos saudáveis (50 pessoas, círculos) e pacientes com câncer colorretal (16 pessoas, triângulos) selecionados como uma coorte de validação foram plotados na abscissa contra os seus valores de medição do nível de expressão de hsa-miR-4257 (SEQ ID NO: 2) na ordenada. A linha horizontal no diagrama representa um limiar (0 = 1,26x + y - 18,06) que foi estabelecido na coorte de desenvolvimento e discriminado entre os dois grupos. - Figura 4 - Diagrama superior: uma discriminante (1,49 x hsa- miR-3131 - 0,23 x has-miR-7847-3p - 1,13 x hsa-miR-3196 + 1,11 x hsa-miR- 3195 + 2,25 x hsa-miR-4665-5p - 1,00 x hsa-miR-204-3p - 11,16) foi preparada utilizando a análise discriminante de Fisher a partir dos valores de medição do nível de expressão de hsa-miR-3131 (SEQ ID NO: 5), hsa-miR- 204- 3P (SEQ ID NO: 45), hsa-miR-4665-5p (SEQ ID NO: 57), hsa-miR-7847- 3p (SEQ ID NO: 75), hsa-miR-3196 (SEQ ID NO: 162 ) e hsa-miR-3195 (SEQ ID nO: 607) em 34 pacientes com câncer colorretal, 103 sujeitos saudáveis, 69 pacientes com câncer pancreático, 66 pacientes com câncer ducto biliar, 30 pacientes com câncer de estômago, 33 pacientes com câncer de esôfago, 32 pacientes com câncer de fígado e 15 pacientes com doença pancreatobiliar benigna selecionados como uma coorte de desenvolvimento, e os escores discriminantes obtidos a partir da discriminante foram representados graficamente na ordenada contra os grupos de amostras na abscissa. A linha pontilhada no diagrama representa um limite discriminatório que oferecia um escore discriminante de 0 e discrimina entre os grupos. Diagrama inferior: escores discriminantes obtidos a partir da análise discriminatória preparada a partir da coorte de desenvolvimento para os valores de medição do nível de expressão hsa-miR-3131 (SEQ ID NO: 5), hsa-miR-204-3p (SEQ ID NO: 45), hsa-miR-4665-5p (SEQ ID NO: 57), hsa-miR-7847-3p (SEQ ID NO: 75), hsa- miR-3196 (SEQ ID NO: 162), e hsa-miR-3195 (SEQ ID NO: 607) em 16 pacientes com câncer colorretal, 47 sujeitos saudáveis, 30 pacientes com câncer pancreático, 33 pacientes com câncer de ducto biliar, 20 pacientes com câncer de estômago, 17 pacientes com câncer de esôfago, 20 pacientes com câncer de fígado e 6 pacientes com doença pancreatobiliar benigna selecionados como uma coorte de validação foram representados graficamente na ordenada contra os grupos de amostra na abscissa. A linha pontilhada no diagrama representa o limite discriminatório que oferecia um escore discriminante de 0 e discrimina entre os dois grupos.
DESCRIÇÃO DE EXEMPLOS DE REALIZAÇÃO
[0282] Daqui em diante, a presente invenção será descrita de maneira mais específica.
1. ÁCIDO NUCLEICO ALVO PARA O CÂNCER COLORRETAL
[0283] Um ácido nucleico alvo primário como marcador de câncer colorretal, para detectar a presença e/ou ausência de câncer colorretal ou de células de câncer colorretal, utilizando a sonda de ácido nucleico ou o primer para a detecção do câncer colorretal definido acima de acordo com a presente invenção pode ser usado em pelo menos um ou mais miRNA(s) selecionado(s) a partir do grupo consistindo em: hsa-miR-6726-5p, hsa-miR- 4257, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-6757-5p, hsa- miR-3679-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR- 6741-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR- 744-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-564, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-4467, hsa-miR-3188, hsa-miR- 6125, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-8063, hsa-miR-8069, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-3185, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-6887-5p, hsa- miR-128-1-5p, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-1225-5p, hsa- miR-4419b, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR- 204-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-3937, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6893-5p, hsa- miR-4728-5p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa- miR-642b-3p, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR- 4433-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4449, hsa-miR-4706, hsa-miR-1913, hsa-miR-602, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR- 711, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-7847- 3p, hsa-miR-6132, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-6784-5p, hsa- miR-1249, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR- 4417, hsa-miR-4281, hsa-miR-4734, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-663a, hsa- miR-4513, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR- 6798-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-642a- 3p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-940, hsa-miR-4450, hsa-miR-4723-5p, hsa- miR-1469, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-6879-5p, hsa-miR- 6802-5p, hsa-miR-1268b, hsa-miR-663b, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6088, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa- miR-671-5p, hsa-miR-4454, hsa-miR-4516, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4741, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-6795-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-4725-3p, hsa- miR-6782-5p, hsa-miR-4688, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR- 6785-5p, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-6131, hsa-miR-1915- 3p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4638-5p, hsa- miR-3656, hsa-miR-3621, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-23b- 3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4327, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-6877-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-4534, hsa-miR-614, hsa-miR-1202, hsa-miR-575, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-7977, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR- 6075, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4271, hsa-miR-3196, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-4508, hsa-miR-4749-5p, hsa-miR- 4505, hsa-miR-5698, hsa-miR-1199-5p, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195, hsa-miR-718, hsa-miR-3178, hsa-miR-638, hsa-miR-4497, hsa-miR-6085, hsa-miR-6752-5p e hsa-miR-135a-3p. Além disso, pelo menos um ou mais miRNA(s) selecionado(s) a partir do grupo consistindo em outros marcadores de câncer colorretal podem ser combinados com estes miRNAs, ou seja, hsa-miR-1231, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1268a, hsa-miR-128-2-5p e hsa-miR-24-3p também podem ser preferencialmente usados como um ácido nucleico alvo. Além disso, pelo menos um ou mais miRNA(s) selecionado(s) a partir do grupo consistindo em outros marcadores de câncer colorretal podem ser combinados com estes miRNAs, ou seja, hsa-miR-4697-5p, hsa-miR- 3197, hsa-miR-675-5p, hsa-miR-4486, hsa-miR-7107-5p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-451a, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-8059, hsa-miR- 6813-5p, hsa-miR-4492, hsa-miR-4476 e hsa-miR-6090 também podem ser preferencialmente usados como um ácido nucleico alvo.
[0284] Estes miRNAs incluem, por exemplo, um gene humano, compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 194 e 606 a 614 (ou seja, hsa-miR-6726-5p, hsa- miR-4257, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR- 7108-5p, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-6757- 5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-8072, hsa- miR-6741-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-4746-3p, hsa- miR-744-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-564, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6825- 5p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-4467, hsa-miR-3188, hsa- miR-6125, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-8063, hsa-miR- 8069, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-3185, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-4419b, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-3184-5p, hsa- miR-204-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR- 6749-5p, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-3937, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6893- 5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-4442, hsa- miR-4433-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4449, hsa-miR- 4706, hsa-miR-1913, hsa-miR-602, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-4695-5p, hsa- miR-711, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR- 7847-3p, hsa-miR-6132, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-6784- 5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-6732-5p, hsa- miR-4417, hsa-miR-4281, hsa-miR-4734, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-663a, hsa-miR-4513, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa- miR-6798-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR- 642a-3p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-940, hsa-miR-4450, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-6879-5p, hsa-miR- 6802-5p, hsa-miR-1268b, hsa-miR-663b, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6088, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa- miR-671-5p, hsa-miR-4454, hsa-miR-4516, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4741, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-6795-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-4725-3p, hsa- miR-6782-5p, hsa-miR-4688, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR- 6785-5p, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-6131, hsa-miR-1915- 3p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4638-5p, hsa- miR-3656, hsa-miR-3621, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-23b- 3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4327, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-6877-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-4534, hsa-miR-614, hsa-miR-1202, hsa-miR-575, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-7977, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR- 6075, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4271, hsa-miR-3196, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-4508, hsa-miR-4749-5p, hsa-miR- 4505, hsa-miR-5698, hsa-miR-1199-5p, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-1231, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1268a, hsa-miR-128-2-5p, hsa-miR-24-3p, hsa- miR-4697-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-675-5p, hsa-miR-4486, hsa-miR-7107- 5p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-451a, hsa-miR-3940-5p, hsa- miR-8059, hsa-miR-6813-5p, hsa-miR-4492, hsa-miR-4476, hsa-miR-6090, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195, hsa-miR-718, hsa-miR-3178, hsa-miR-638, hsa-miR-4497, hsa-miR-6085, hsa-miR-6752-5p e hsa-miR-135a-3p, respectivamente), um congênere dos mesmos, um transcrito dos mesmos, e/ou uma variante ou derivado dos mesmos. Neste contexto, o gene, congênere, transcrito, variante, e derivado são conforme definido anteriormente.
[0285] O ácido nucleico alvo é de um modo preferido um gene humano, compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 635 ou um transcrito do mesmo, mais preferencialmente, o transcrito, ou seja, um miRNA ou seu RNA precursor (pri-miRNA ou pré-miRNA ).
[0286] O primeiro gene alvo é o gene hsa-miR-6726-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que alterações na expressão do gene ou transcrito desse gene podem servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0287] O segundo gene alvo é o gene hsa-miR-4257, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que alterações na expressão do gene ou transcrito desse gene podem servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0288] O terceiro gene alvo é o gene hsa-miR-6787-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que alterações na expressão do gene ou transcrito desse gene podem servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0289] O quarto gene alvo é o gene hsa-miR-6780b-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que alterações na expressão do gene ou transcrito desse gene podem servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0290] O quinto gene alvo é o gene hsa-miR-3131, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que alterações na expressão do gene ou transcrito desse gene podem servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0291] O sexto gene alvo é o gene hsa-miR-7108-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que alterações na expressão do gene ou transcrito desse gene podem servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0292] O sétimo gene alvo é o gene hsa-miR-1343-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que alterações na expressão do gene ou transcrito desse gene podem servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0293] O oitavo gene alvo é o gene hsa-miR-1247-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que alterações na expressão do gene ou transcrito desse gene podem servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0294] O nono gene alvo é o gene hsa-miR-4651, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que alterações na expressão do gene ou transcrito desse gene podem servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0295] O 10° gene alvo é o gene hsa-miR-6757-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0296] O 11° gene alvo é o gene hsa-miR-3679-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0297] O 12° gene alvo é o gene hsa-miR-7641, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0298] O 13° gene alvo é o gene hsa-miR-6746-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0299] O 14° gene alvo é o gene hsa-miR-8072, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0300] O 15° gene alvo é o gene hsa-miR-6741-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0301] O 16° gene alvo é o gene hsa-miR-1908-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0302] O 17° gene alvo é o gene hsa-miR-6857-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0303] O 18° gene alvo é o gene hsa-miR-4746-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0304] O 19° gene alvo é o gene hsa-miR-744-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0305] O 20° gene alvo é o gene hsa-miR-4792, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0306] O 21° gene alvo é o gene hsa-miR-564, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0307] O 22° gene alvo é o gene hsa-miR-6791-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0308] O 23° gene alvo é o gene hsa-miR-6825-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0309] O 24° gene alvo é o gene hsa-miR-6826-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0310] O 25° gene alvo é o gene hsa-miR-4665-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0311] O 26° gene alvo é o gene hsa-miR-4467, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0312] O 27° gene alvo é o gene hsa-miR-3188, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0313] O 28° gene alvo é o gene hsa-miR-6125, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0314] O 29° gene alvo é o gene hsa-miR-6756-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0315] O 30° gene alvo é o gene hsa-miR-1228-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0316] O 31° gene alvo é o gene hsa-miR-8063, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0317] O 32° gene alvo é o gene hsa-miR-8069, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0318] O 33° gene alvo é o gene hsa-miR-6875-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0319] O 34° gene alvo é o gene hsa-miR-3185, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0320] O 35° gene alvo é o gene hsa-miR-4433b-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0321] O 36° gene alvo é o gene hsa-miR-6887-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0322] O 37° gene alvo é o gene hsa-miR-128-1-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0323] O 38° gene alvo é o gene hsa-miR-6724-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0324] O 39° gene alvo é o gene hsa-miR-1914-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0325] O 40° gene alvo é o gene hsa-miR-1225-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0326] O 41° gene alvo é o gene hsa-miR-4419b, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0327] O 42° gene alvo é o gene hsa-miR-7110-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0328] O 43° gene alvo é o gene hsa-miR-187-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0329] O 44° gene alvo é o gene hsa-miR-3184-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0330] O 45° gene alvo é o gene hsa-miR-204-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0331] O 46° gene alvo é o gene hsa-miR-5572, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0332] O 47° gene alvo é o gene hsa-miR-6729-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0333] O 48° gene alvo é o gene hsa-miR-615-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0334] O 49° gene alvo é o gene hsa-miR-6749-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0335] O 50° gene alvo é o gene hsa-miR-6515-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0336] O 51° gene alvo é o gene hsa-miR-3937, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0337] O 52° gene alvo é o gene hsa-miR-6840-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0338] O 53° gene alvo é o gene hsa-miR-6893-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0339] O 54° gene alvo é o gene hsa-miR-4728-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0340] O 55° gene alvo é o gene hsa-miR-6717-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0341] O 56° gene alvo é o gene hsa-miR-7113-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0342] O 57° gene alvo é o gene hsa-miR-4665-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0343] O 58° gene alvo é o gene hsa-miR-642b-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0344] O 59° gene alvo é o gene hsa-miR-7109-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0345] O 60° gene alvo é o gene hsa-miR-6842-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0346] O 61° gene alvo é o gene hsa-miR-4442, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0347] O 62° gene alvo é o gene hsa-miR-4433-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0348] O 63° gene alvo é o gene hsa-miR-4707-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0349] O 64° gene alvo é o gene hsa-miR-6126, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0350] O 65° gene alvo é o gene hsa-miR-4449, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0351] O 66° gene alvo é o gene hsa-miR-4706, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0352] O 67° gene alvo é o gene hsa-miR-1913, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0353] O 68° gene alvo é o gene hsa-miR-602, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0354] O 69° gene alvo é o gene hsa-miR-939-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0355] O 70° gene alvo é o gene hsa-miR-4695-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0356] O 71° gene alvo é o gene hsa-miR-711, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0357] O 72° gene alvo é o gene hsa-miR-6816-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0358] O 73° gene alvo é o gene hsa-miR-4632-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0359] O 74° gene alvo é o gene hsa-miR-6721-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0360] O 75° gene alvo é o gene hsa-miR-7847-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0361] O 76° gene alvo é o gene hsa-miR-6132, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0362] O 77° gene alvo é o gene hsa-miR-887-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0363] O 78° gene alvo é o gene hsa-miR-3679-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0364] O 79° gene alvo é o gene hsa-miR-6784-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0365] O 80° gene alvo é o gene hsa-miR-1249, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0366] O 81° gene alvo é o gene hsa-miR-937-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0367] O 82° gene alvo é o gene hsa-miR-5195-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0368] O 83° gene alvo é o gene hsa-miR-6732-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0369] O 84° gene alvo é o gene hsa-miR-4417, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0370] O 85° gene alvo é o gene hsa-miR-4281, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0371] O 86° gene alvo é o gene hsa-miR-4734, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0372] O 87° gene alvo é o gene hsa-miR-6766-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0373] O 88° gene alvo é o gene hsa-miR-663a, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0374] O 89° gene alvo é o gene hsa-miR-4513, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0375] O 90° gene alvo é o gene hsa-miR-6781-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0376] O 91° gene alvo é o gene hsa-miR-1227-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0377] O 92° gene alvo é o gene hsa-miR-6845-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0378] O 93° gene alvo é o gene hsa-miR-6798-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0379] O 94° gene alvo é o gene hsa-miR-3620-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0380] O 95° gene alvo é o gene hsa-miR-1915-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0381] O 96° gene alvo é o gene hsa-miR-4294, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0382] O 97° gene alvo é o gene hsa-miR-642a-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0383] O 98° gene alvo é o gene hsa-miR-371a-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0384] O 99° gene alvo é o gene hsa-miR-940, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0385] O 100° gene alvo é o gene hsa-miR-4450, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0386] O 101° gene alvo é o gene hsa-miR-4723-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0387] O 102° gene alvo é o gene hsa-miR-1469, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0388] O 103° gene alvo é o gene hsa-miR-6861-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0389] O 104° gene alvo é o gene hsa-miR-7975, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0390] O 105° gene alvo é o gene hsa-miR-6879-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0391] O 106° gene alvo é o gene hsa-miR-6802-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0392] O 107° gene alvo é o gene hsa-miR-1268b, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0393] O 108° gene alvo é o gene hsa-miR-663b, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0394] O 109° gene alvo é o gene hsa-miR-125a-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0395] O 110° gene alvo é o gene hsa-miR-2861, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0396] O 111° gene alvo é o gene hsa-miR-6088, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0397] O 112° gene alvo é o gene hsa-miR-4758-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0398] O 113° gene alvo é o gene hsa-miR-296-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0399] O 114° gene alvo é o gene hsa-miR-6738-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0400] O 115° gene alvo é o gene hsa-miR-671-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0401] O 116° gene alvo é o gene hsa-miR-4454, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0402] O 117° gene alvo é o gene hsa-miR-4516, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0403] O 118° gene alvo é o gene hsa-miR-7845-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0404] O 119° gene alvo é o gene hsa-miR-4741, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0405] O 120° gene alvo é o gene hsa-miR-92b-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0406] O 121° gene alvo é o gene hsa-miR-6795-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0407] O 122° gene alvo é o gene hsa-miR-6805-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0408] O 123° gene alvo é o gene hsa-miR-4725-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0409] O 124° gene alvo é o gene hsa-miR-6782-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0410] O 125° gene alvo é o gene hsa-miR-4688, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0411] O 126° gene alvo é o gene hsa-miR-6850-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0412] O 127° gene alvo é o gene hsa-miR-6777-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0413] O 128° gene alvo é o gene hsa-miR-6785-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0414] O 129° gene alvo é o gene hsa-miR-7106-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0415] O 130° gene alvo é o gene hsa-miR-3663-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0416] O 131° gene alvo é o gene hsa-miR-6131, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0417] O 132° gene alvo é o gene hsa-miR-1915-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0418] O 133° gene alvo é o gene hsa-miR-4532, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0419] O 134° gene alvo é o gene hsa-miR-6820-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0420] O 135° gene alvo é o gene hsa-miR-4689, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0421] O 136° gene alvo é o gene hsa-miR-4638-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0422] O 137° gene alvo é o gene hsa-miR-3656, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0423] O 138° gene alvo é o gene hsa-miR-3621, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0424] O 139° gene alvo é o gene hsa-miR-6769b-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0425] O 140° gene alvo é o gene hsa-miR-149-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0426] O 141° gene alvo é o gene hsa-miR-23b-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0427] O 142° gene alvo é o gene hsa-miR-3135b, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0428] O 143° gene alvo é o gene hsa-miR-6848-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0429] O 144° gene alvo é o gene hsa-miR-6769a-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0430] O 145° gene alvo é o gene hsa-miR-4327, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0431] O 146° gene alvo é o gene hsa-miR-6765-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0432] O 147° gene alvo é o gene hsa-miR-6716-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0433] O 148° gene alvo é o gene hsa-miR-6877-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0434] O 149° gene alvo é o gene hsa-miR-6727-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0435] O 150° gene alvo é o gene hsa-miR-4534, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0436] O 151° gene alvo é o gene hsa-miR-614, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0437] O 152° gene alvo é o gene hsa-miR-1202, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0438] O 153° gene alvo é o gene hsa-miR-575, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0439] O 154° gene alvo é o gene hsa-miR-6870-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0440] O 155° gene alvo é o gene hsa-miR-6722-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0441] O 156° gene alvo é o gene hsa-miR-7977, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0442] O 157° gene alvo é o gene hsa-miR-4649-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0443] O 158° gene alvo é o gene hsa-miR-4675, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0444] O 159° gene alvo é o gene hsa-miR-6075, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0445] O 160° gene alvo é o gene hsa-miR-6779-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0446] O 161° gene alvo é o gene hsa-miR-4271, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0447] O 162° gene alvo é o gene hsa-miR-3196, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0448] O 163° gene alvo é o gene hsa-miR-6803-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0449] O 164° gene alvo é o gene hsa-miR-6789-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0450] O 165° gene alvo é o gene hsa-miR-4648, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0451] O 166° gene alvo é o gene hsa-miR-4508, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0452] O 167° gene alvo é o gene hsa-miR-4749-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0453] O 168° gene alvo é o gene hsa-miR-4505, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0454] O 169° gene alvo é o gene hsa-miR-5698, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0455] O 170° gene alvo é o gene hsa-miR-1199-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0456] O 171° gene alvo é o gene hsa-miR-4763-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0457] O 172° gene alvo é o gene hsa-miR-1231, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. O relatório conhecido anteriormente mostra que alterações na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal (literatura patentária 3).
[0458] O 173° gene alvo é o gene hsa-miR-1233-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. O relatório conhecido anteriormente mostra que alterações na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal (literatura patentária 2).
[0459] O 174° gene alvo é o gene hsa-miR-150-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. O relatório conhecido anteriormente mostra que alterações na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal (literatura patentária 4).
[0460] O 175° gene alvo é o gene hsa-miR-1225-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. O relatório conhecido anteriormente mostra que alterações na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal (literatura patentária 2).
[0461] O 176° gene alvo é o gene hsa-miR-92a-2-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. O relatório conhecido anteriormente mostra que alterações na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal (literaturas patentárias 1 e 4).
[0462] O 177° gene alvo é o gene hsa-miR-423-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. O relatório conhecido anteriormente mostra que alterações na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal (literatura patentária 3).
[0463] O 178° gene alvo é o gene hsa-miR-1268a, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. O relatório conhecido anteriormente mostra que alterações na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal (literatura patentária 3).
[0464] O 179° gene alvo é o gene hsa-miR-128-2-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. O relatório conhecido anteriormente mostra que alterações na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal (literatura patentária 1).
[0465] O 180° gene alvo é o gene hsa-miR-24-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. O relatório conhecido anteriormente mostra que alterações na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal (literatura patentária 1).
[0466] O 181° gene alvo é o gene hsa-miR-4697-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0467] O 182° gene alvo é o gene hsa-miR-3197, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0468] O 183° gene alvo é o gene hsa-miR-675-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0469] O 184° gene alvo é o gene hsa-miR-4486, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0470] O 185° gene alvo é o gene hsa-miR-7107-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0471] O 186° gene alvo é o gene hsa-miR-23a-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. O relatório conhecido anteriormente mostra que alterações na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal (literatura patentária 2).
[0472] O 187° gene alvo é o gene hsa-miR-4667-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0473] O 188° gene alvo é o gene hsa-miR-451a, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0474] O 189° gene alvo é o gene hsa-miR-3940-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0475] O 190° gene alvo é o gene hsa-miR-8059, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0476] O 191° gene alvo é o gene hsa-miR-6813-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0477] O 192° gene alvo é o gene hsa-miR-4492, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0478] O 193° gene alvo é o gene hsa-miR-4476, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0479] O 194° gene alvo é o gene hsa-miR-6090, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0480] O 195° gene alvo é o gene hsa-miR-6836-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0481] O 196° gene alvo é o gene hsa-miR-3195, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0482] O 197° gene alvo é o gene hsa-miR-718, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0483] O 198° gene alvo é o gene hsa-miR-3178, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0484] O 199° gene alvo é o gene hsa-miR-638, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0485] O 200° gene alvo é o gene hsa-miR-4497, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0486] O 201° gene alvo é o gene hsa-miR-6085, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0487] O 202° gene alvo é o gene hsa-miR-6752-5p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
[0488] O 203° gene alvo é o gene hsa-miR-135a-3p, um congênere do mesmo, um transcrito do mesmo, ou uma variante ou um derivado do mesmo. Nenhum dos relatórios anteriormente conhecidos mostra que a alteração na expressão do gene ou do transcrito desse gene pode servir como um marcador para o câncer colorretal.
2. SONDA DE ÁCIDO NUCLEICO OU PRIMER PARA A DETECÇÃO DO CÂNCER COLORRETAL
[0489] Na presente invenção, um ácido nucleico capaz de se ligar especificamente a qualquer um dos ácidos nucleicos alvo como os marcadores de câncer colorretal descritos acima pode ser usado como um ácido nucleico, por exemplo, uma sonda de ácido nucleico ou um primer, para a detecção ou diagnóstico do câncer colorretal.
[0490] Na presente invenção, a sonda de ácido nucleico ou o primer que pode ser usado para a detecção do câncer colorretal ou para o diagnóstico do câncer colorretal permite a medição qualitativa e/ou quantitativa da presença, o nível de expressão, ou abundância de qualquer um dos ácidos nucleicos alvo, como os marcadores do câncer colorretal descritos acima, por exemplo, hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-4257, hsa-miR- 6787-5p, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-1343- 3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR- 1908-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR- 4792, hsa-miR-564, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-4467, hsa-miR-3188, hsa-miR-6125, hsa-miR- 6756-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-8063, hsa-miR-8069, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-3185, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa- miR-6724-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-4419b, hsa-miR- 7110-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-6515-3p, hsa- miR-3937, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR- 6717-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR- 7109-5p, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-4707- 5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4449, hsa-miR-4706, hsa-miR-1913, hsa-miR- 602, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6816-5p, hsa- miR-4632-5p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6132, hsa-miR- 887-3p, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-4281, hsa-miR- 4734, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-663a, hsa-miR-4513, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-371a-5p, hsa- miR-940, hsa-miR-4450, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-6879-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-1268b, hsa- miR-663b, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6088, hsa-miR-4758- 5p, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-4454, hsa- miR-4516, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4741, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-6795- 5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-4688, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-6131, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-4532, hsa-miR- 6820-5p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4638-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-3621, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-3135b, hsa- miR-6848-5p, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4327, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR- 6716-5p, hsa-miR-6877-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-4534, hsa-miR-614, hsa-miR-1202, hsa-miR-575, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR- 7977, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-6075, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4271, hsa-miR-3196, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR- 4648, hsa-miR-4508, hsa-miR-4749-5p, hsa-miR-4505, hsa-miR-5698, hsa- miR-1199-5p, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195, hsa-miR- 718, hsa-miR-3178, hsa-miR-638, hsa-miR-4497, hsa-miR-6085, hsa-miR- 6752-5p e hsa-miR-135a-3p, ou uma combinação dos mesmos; congêneres dos mesmos, transcritos dos mesmos; ou variantes ou derivados dos mesmos, e, opcionalmente, em combinação com estes, hsa-miR-1231, hsa- miR-1233-5p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-92a-2-5p, hsa- miR-423-5p, hsa-miR-1268a, hsa-miR-128-2-5p e hsa-miR-24-3p ou uma combinação dos mesmos; congêneres dos mesmos, transcritos dos mesmos; ou variantes ou derivados dos mesmos: e, opcionalmente, em combinação com estes, hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-675-5p, hsa-miR-4486, hsa-miR-7107-5p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-451a, hsa- miR-3940-5p, hsa-miR-8059, hsa-miR-6813-5p, hsa-miR-4492, hsa-miR-4476 e hsa-miR-6090 ou uma combinação dos mesmos; congêneres dos mesmos, transcritos dos mesmos; ou variantes ou derivados dos mesmos.
[0491] O nível de expressão do ácido nucleico alvo descrito acima está aumentado ou diminuído (daqui em diante referido como “aumentado/diminuído”), de acordo com o tipo de ácido nucleico alvo em um sujeito que tem câncer colorretal quando comparado com um sujeito saudável. Assim, o ácido nucleico da presente invenção pode ser eficazmente utilizado para medir o nível de expressão do(s) ácido(s) nucleico(s) alvo descrito(s) acima em um fluido corporal derivado de um sujeito (por exemplo, um ser humano) com suspeita de ter câncer colorretal e um fluido corporal derivado de um sujeito saudável e detectando o câncer colorretal pela da comparação dos mesmos.
[0492] A sonda de ácido nucleico ou o primer que pode ser utilizado na presente invenção é uma sonda de ácido nucleico capaz de se ligar especificamente a um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por pelo menos uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou um primer para a amplificação de um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por pelo menos uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614.
[0493] A sonda de ácido nucleico ou o primer que pode ser adicionalmente utilizado na presente invenção pode compreender adicionalmente uma sonda de ácido nucleico capaz de se ligar especificamente a um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por, pelo menos, uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou um primer para a amplificação de um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por, pelo menos, uma das SEQ ID NOs: 172 a 180.
[0494] A sonda de ácido nucleico ou o primer que pode ser adicionalmente utilizado na presente invenção pode compreender adicionalmente uma sonda de ácido nucleico capaz de se ligar especificamente a um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por, pelo menos, uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou um primer para a amplificação de um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por, pelo menos, uma das SEQ ID NOs: 181 a 194.
[0495] Especificamente, estas sondas de ácidos nucleicos ou primers compreendem uma combinação de um ou mais polinucleotídeos selecionados dentre um grupo de polinucleotídeos compreendendo as sequências nucleotídicas representadas por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 635 ou sequências de nucleotídicas derivadas dessas sequências nucleotídicas pela substituição de U por T, e um grupo de polinucleotídeos complementares, um grupo de polinucleotídeos que hibridizam sob condições estringentes (mencionado mais adiante) aos DNAs que consistem nas sequências nucleotídicas complementares a estas sequências, e um grupo de polinucleotídeos complementares às mesmas, e um grupo polinucleotídeo compreendendo 15 ou mais, de preferência 17 ou mais nucleotídeos consecutivos das sequências nucleotídicas destes grupos de polinucleotídeos. Estes polinucleotídeos podem ser utilizados como sondas de ácidos nucleicos e primers para a detecção dos marcadores de câncer colorretal como ácidos nucleicos-alvo.
[0496] Mais especificamente, exemplos de sonda de ácidos nucleicos ou primer que podem ser utilizados na presente invenção incluem um ou mais polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir do grupo que consiste nos polinucleotídeo(s) (a) a (e): (a) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T; uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (b) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614; (c) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, derivado do mesmo, ou fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (d) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; e (e) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (a) a (d).
[0497] Além do pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir dos polinucleotídeos de (a) a (e), a sonda de ácidos nucleicos ou primer que podem ser utilizados na presente invenção podem compreender polinucleotídeos selecionados a partir do grupo consistindo nos seguintes polinucleotídeos de (f) a (j): (f) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (g) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOS: 172 a 180; (h) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (i) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; e (j) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (f) a (i).
[0498] Além do pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir dos polinucleotídeos de (a) a (j), a sonda de ácidos nucleicos ou primer que podem ser utilizados na presente invenção podem compreender polinucleotídeos selecionados a partir do grupo consistindo nos seguintes polinucleotídeos de (k) a (o): (k) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (l) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOS: 181 a 194; (m) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (n) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; e (o) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (k) a (n).
[0499] Para estes polinucleotídeos o “fragmento deste compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos” pode conter o número de nucleotídeos no intervalo de, por exemplo, a partir de 15 nucleotídeos consecutivos até menos do que o número total de nucleotídeos da sequência, a partir de 17 nucleotídeos consecutivos até menos do que o número total de nucleotídeos da sequência, a partir de 19 nucleotídeos consecutivos até menos do que o número total de nucleotídeos da sequência, na sequência nucleotídica de cada polinucleotídeo, embora o fragmento não seja limitado aos mesmos.
[0500] Estes polinucleotídeos ou os seus fragmentos utilizados na presente invenção podem ser DNA ou RNA.
[0501] Cada um dos polinucleotídeos que pode ser utilizado na presente invenção pode ser preparado pelo uso de uma técnica geral, tal como uma técnica de recombinação de DNA, um método de PCR, ou um método que utiliza um sintetizador de DNA/RNA automático.
[0502] A técnica de recombinação de DNA e o método de PCR podem empregar uma técnica descrita, por exemplo, em Ausubel et al, Current Protocols in Molecular Biology, John Willey & Sons, EUA (1993); e Sambrook et al, Molecular Cloning - A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, EUA (1989).
[0503] O hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-4257, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-1343-3p, hsa- miR-1247-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR- 7641, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR-4792, hsa- miR-564, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR- 4665-3p, hsa-miR-4467, hsa-miR-3188, hsa-miR-6125, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-8063, hsa-miR-8069, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR- 3185, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR- 6724-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-4419b, hsa-miR-7110- 5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-5572, hsa- miR-6729-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR- 3937, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-6717- 5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa- miR-6126, hsa-miR-4449, hsa-miR-4706, hsa-miR-1913, hsa-miR-602, hsa- miR-939-5p, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR- 4632-5p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6132, hsa-miR-887- 3p, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-937-5p, hsa- miR-5195-3p, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-4281, hsa-miR- 4734, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-663a, hsa-miR-4513, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-371a-5p, hsa- miR-940, hsa-miR-4450, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-6879-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-1268b, hsa- miR-663b, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6088, hsa-miR-4758- 5p, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-4454, hsa- miR-4516, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4741, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-6795- 5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-4688, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-6131, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-4532, hsa-miR- 6820-5p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4638-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-3621, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-3135b, hsa- miR-6848-5p, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4327, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR- 6716-5p, hsa-miR-6877-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-4534, hsa-miR-614, hsa-miR-1202, hsa-miR-575, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR- 7977, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-6075, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4271, hsa-miR-3196, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR- 4648, hsa-miR-4508, hsa-miR-4749-5p, hsa-miR-4505, hsa-miR-5698, hsa- miR-1199-5p, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-1231, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR- 150-3p, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-423-5p, hsa-miR- 1268a, hsa-miR-128-2-5p, hsa-miR-24-3p, hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-675-5p, hsa-miR-4486, hsa-miR-7107-5p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR- 4667-5p, hsa-miR-451a, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-8059, hsa-miR-6813-5p, hsa-miR-4492, hsa-miR-4476, hsa-miR-6090, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR- 3195, hsa-miR-718, hsa-miR-3178, hsa-miR-638, hsa-miR-4497, hsa-miR- 6085, hsa-miR-6752-5p e hsa-miR-135a-3p derivados de humanos, representados pelas SEQ ID NOs: 1 a 194 e 606 a 614 são conhecidos no estado da técnica, e os seus métodos de captação também são conhecidos conforme mencionado anteriormente. Portanto, cada polinucleotídeo que pode ser utilizado como sonda de ácido nucleico ou primer na presente invenção pode ser preparado pela clonagem do gene.
[0504] Tais sondas de ácidos nucleicos ou primers podem ser sintetizados quimicamente utilizando um aparato de síntese de DNA automático. Em geral, nesta síntese é utilizado um método de fosforamidita, e um DNA de fita simples de até cerca de 100 nucleotídeos pode ser sintetizado automaticamente por este método. O aparato de síntese de DNA automático está comercialmente disponível a partir, por exemplo, Polygen GmbH, ABI, ou Applied Biosystems, Inc.
[0505] Alternativamente, o polinucleotídeo da presente invenção também pode ser preparado por métodos de clonagem de cDNA. A técnica de clonagem de cDNA pode empregar, por exemplo, o Kit de Clonagem de microRNA da Wako.
[0506] Neste contexto, as sequências da sonda de ácido nucleico e do primer para a detecção do polinucleotídeo consistindo em uma sequência nucleotídica representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 194 e 606 a 614 não existem como miRNAs ou seus precursores in vivo. Por exemplo, as sequências nucleotídicas representadas pela SEQ ID NO: 11 e SEQ ID NO: 78 são produzidas a partir do precursor representado pela SEQ ID NO: 205. Este precursor tem uma estrutura similar a um grampo (hairpinlike) tal como é ilustrado na Figura 1, e as sequências nucleotídicas representadas pela SEQ ID NO: 11 e SEQ ID NO: 78 têm sequências com pareamento incorreto (mismatch) entre si. DA mesma forma, uma sequência nucleotídica totalmente complementar com a sequência nucleotídica representada pela SEQ ID NO: 11 ou SEQ ID NO: 78 não é produzida naturalmente in vivo. Portanto, a sonda de ácido nucleico e o primer para detectar a sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 194, e 606 a 614 tem uma sequência de nucleotídeo artificial que não existe in vivo.
3. KIT OU DISPOSITIVO PARA A DETECÇÃO DO CÂNCER COLORRETAL
[0507] A presente invenção também proporciona um kit ou um dispositivo para a detecção do câncer colorretal, que compreende um ou mais de polinucleotídeo(s) (que pode incluir uma variante, um fragmento, e um derivado, a seguir, também referido como polinucleotídeo para a detecção) que pode ser utilizado como sonda de ácido nucleico ou primer na presente invenção para a medição de um ácido nucleico alvo como um marcador do câncer colorretal.
[0508] O ácido nucleico alvo como um marcador de câncer colorretal de acordo com a presente invenção é preferencialmente selecionado a partir do grupo 1:
[0509] miR-6726-5p, miR-4257, miR-6787-5p, miR-6780b-5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343-3p, miR-1247-3p, miR-4651, miR-6757- 5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR-6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR- 1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744-5p, miR-4792, miR-564, miR- 6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665-3p, miR-4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1-5p, miR-6724-5p, miR- 1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR-7110-5p, miR-187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749-5p, miR-6515- 3p, miR-3937, miR-6840-3p, miR-6893-5p, miR-4728-5p, miR-6717-5p, miR- 7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109-5p, miR-6842-5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR-6126, miR-4449, miR-4706, miR-1913, miR- 602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR-4632-5p, miR- 6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-887-3p, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195-3p, miR-6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR-1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR-3620-5p, miR-1915-5p, miR-4294, miR- 642a-3p, miR-371a-5p, miR-940, miR-4450, miR-4723-5p, miR-1469, miR- 6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR-6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR- 125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR-4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR- 671-5p, miR-4454, miR-4516, miR-7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR- 6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782-5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777-5p, miR-6785-5p, miR-7106-5p, miR-3663-3p, miR-6131, miR- 1915-3p, miR-4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR-4638-5p, miR-3656, miR- 3621, miR-6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR-3135b, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765-3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR- 6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR-6870-5p, miR-6722- 3p, miR-7977, miR-4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR-6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803-5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR-4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p, miR-4763-3p, miR-6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR-6752-5p e miR- 135a-3p.
[0510] Um ácido nucleico alvo adicional que pode ser opcionalmente utilizado na medição é selecionado a partir do grupo 2: miR- 1231, miR-1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR-92a-2-5p, miR-423-5p, miR-1268a, miR-128-2-5p e miR-24-3p.
[0511] Um ácido nucleico alvo adicional que pode ser opcionalmente utilizado na medição é selecionado a partir do grupo 3: miR- 4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR-4486, miR-7107-5p, miR-23a-3p, miR- 4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR-8059, miR-6813-5p, miR-4492, miR- 4476, e miR-6090.
[0512] O kit ou o dispositivo da presente invenção compreende um ou mais ácido(s) nucleico(s) capaz(s) de ligar especificamente a qualquer ácido nucleico alvo, tal como os marcadores de câncer colorretal descritos acima, preferencialmente um ou mais polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir do grupo de sondas de ácido nucleico ou primers descritos na Seção 2 anterior, especificamente, os polinucleotídeos descritos na Seção 2 anterior, ou variante(s) do(s) mesmo(s).
[0513] Especificamente, o kit ou o dispositivo da presente invenção pode compreender pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) compreendendo (ou consistindo em) uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 606 a 614 ou uma sequência de nucleotídeos derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, polinucleotídeo(s) compreendendo (ou consistindo em) uma sua sequência complementar, polinucleotídeo(s) que hidridiza(m) sob condições estringentes com qualquer um destes polinucleotídeos, ou variante(s) ou fragmento(s) compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos de qualquer uma destas sequências de polinucleotídeos.
[0514] O kit ou o dispositivo da presente invenção pode compreender adicionalmente pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) compreendendo (ou consistindo em) uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180 ou uma sequência de nucleotídeos derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, polinucleotídeo(s) compreendendo (ou consistindo em) uma sequência complementar das mesmas, polinucleotídeo(s) que hidridiza(m) sob condições estringentes com qualquer um destes polinucleotídeos, ou variante(s) ou fragmento(s) compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos de qualquer uma destas sequências de polinucleotídeos.
[0515] O kit ou o dispositivo da presente invenção pode compreender adicionalmente pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) compreendendo (ou consistindo em) uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194 ou uma sequência de nucleotídeos derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, polinucleotídeo(s) compreendendo (ou consistindo em) uma sequência complementar das mesmas, polinucleotídeo(s) que hidridiza(m) sob condições estringentes com qualquer um destes polinucleotídeos, ou variante(s) ou fragmento(s) compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos de qualquer uma destas sequências de polinucleotídeos.
[0516] O fragmento que pode estar compreendido no kit ou dispositivo da presente invenção é, por exemplo, um ou mais, de preferência dois ou mais, polinucleotídeos selecionados a partir do grupo que consiste nos seguintes polinucleotídeos de (1) a ( 3): (1) um polinucleotídeo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos em uma sequência nucleotídica derivada de uma sequência nucleotídica representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614 pela substituição de U por T, ou uma sequência complementar às mesmas. (2) um polinucleotídeo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos em uma sequência nucleotídica derivada de uma sequência nucleotídica representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180 pela substituição de U por T, ou uma sequência complementar às mesmas; e (3) um polinucleotídeo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos em uma sequência nucleotídica derivada de uma sequência nucleotídica representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194 pela substituição de U por T, ou uma sequência complementar às mesmas.
[0517] Em um exemplo de realização preferido, o polinucleotídeo é um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, um polinucleotídeo que consiste em uma sequência complementar às mesmas, um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um destes polinucleotídeos, ou variante dessas sequências compreendendo 15 ou mais, de preferência 17 ou mais, mais preferencialmente 19 ou mais nucleotídeos consecutivos.
[0518] Em um exemplo de realização preferido, o polinucleotídeo é um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, um polinucleotídeo que consiste em uma sequência complementar às mesmas, um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um destes polinucleotídeos, ou variante dessas sequências compreendendo 15 ou mais, de preferência 17 ou mais, mais preferencialmente 19 ou mais nucleotídeos consecutivos.
[0519] Em um exemplo de realização preferido, o polinucleotídeo é um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, um polinucleotídeo que consiste em uma sequência complementar às mesmas, um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um destes polinucleotídeos, ou variante dessas sequências compreendendo 15 ou mais, de preferência 17 ou mais, mais preferencialmente 19 ou mais nucleotídeos consecutivos.
[0520] Em um exemplo de realização preferido, o fragmento pode ser um polinucleotídeo que compreende 15 ou mais, de preferência 17 ou mais, mais preferencialmente 19 ou mais nucleotídeos consecutivos.
[0521] Na presente invenção, o tamanho do fragmento de polinucleotídeo é o número de bases no intervalo de, por exemplo, a partir de 15 nucleotídeos consecutivos, até menos do que o número total de bases da sequência, a partir de 17 nucleotídeos consecutivos, até menos do que o número total de bases da sequência, ou a partir de 19 nucleotídeos consecutivos, até menos do que o número total de nucleotídeos da sequência, na sequência de nucleotídeos de cada polinucleotídeo.
[0522] Os exemplos específicos de combinação de polinucleotídeos mencionados acima constituindo o kit ou o dispositivo da presente invenção podem incluir combinações de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 ou mais polinucleotídeos que consistem nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs mostradas na Tabela 1 (SEQ ID NOs: 1 a 194 e 606 a 614 que correspondem aos miRNA marcadores na tabela). Entretanto, estes são dados meramente para fins ilustrativos, e várias outras combinações possíveis estão incluídas na presente invenção.
[0523] A combinação constituindo o kit ou o dispositivo para discriminar um paciente com câncer colorretal a partir de um sujeito saudável de acordo com a presente invenção é desejavelmente, por exemplo, uma combinação de dois ou mais dos polinucleotídeos que consistem nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs mostradas na Tabela 1. Normalmente, uma combinação de dois destes polinucleotídeos pode produzir um desempenho adequado.
[0524] A combinação específica de dois polinucleotídeos que consistem nas sequências de nucleotídeos ou sequências complementares das mesmas, para discriminar um paciente com câncer colorretal a partir de um sujeito saudável é de preferência uma combinação que compreende pelo menos um ou mais dos polinucleotídeos recentemente encontrados consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 171, entre as combinações constituídas por dois dos polinucleotídeos mencionados acima consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 194, e 606 a 614. Mais especificamente, uma combinação compreendendo pelo menos um dos polinucleotídeos consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 5, 15, 24, 32, 38, 45, 55, 64, 96, 97 e 162, entre as combinações dos polinucleotídeos consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 194 e 606 a 614, é mais preferida.
[0525] A combinação de polinucleotídeos com especificidade para o tipo de câncer capaz de discriminar um paciente com câncer colorretal não apenas de um sujeito saudável, como também a partir de outros pacientes com outros tipos de cânceres é preferencialmente, por exemplo, uma combinação de vários polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo selecionado a partir do grupo consistindo nos polinucleotídeos de SEQ ID NOs: 5, 13, 15, 24, 32, 38, 41, 45, 55, 57, 64, 72, 75, 77, 96, 97, 115, 162, 163, 173, 189, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613 e 614 (daqui em diante, este grupo é referido como “grupo 1 de polinucleotídeos tipo de câncer-específicos”), com qualquer um dos polinucleotídeos das outras SEQ ID NOs.
[0526] A combinação de polinucleotídeos com especificidade para o tipo de câncer capaz de discriminar um paciente com câncer colorretal não apenas de um sujeito saudável, como também a partir de outros pacientes é mais preferencialmente uma combinação de vários polinucleotídeos selecionados a partir do grupo 1 de polinucleotídeos tipo de câncer-específico.
[0527] A combinação de polinucleotídeos com especificidade para o tipo de câncer capaz de discriminar um paciente com câncer colorretal não só a partir de um sujeito saudável, mas também a partir de pacientes com outros cânceres é mais preferivelmente uma combinação que compreende pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir do grupo consistindo nos polinucleotídeos de SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 96 e 606 (daqui em diante este grupo é referido como “grupo 2 de polinucleotídeos tipo de câncer-específicos”) incluídos no grupo 1 de polinucleotídeos tipo de câncer- específicos, entre as combinações de múltiplos polinucleotídeos selecionados a partir do grupo 1 de polinucleotídeos tipo de câncer-específicos.
[0528] O número dos polinucleotídeos mencionados acima com especificidade para o tipo de câncer na combinação pode ser de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 ou mais para a combinação e é preferencialmente uma combinação de 6 ou mais. Normalmente, a combinação de 5 ou 6 destes polinucleotídeos pode produzir um desempenho adequado.
[0529] Exemplos não limitantes da combinação do polinucleotídeo consistindo na sequência nucleotídica representada pela SEQ ID NO: 5 ou uma sequência complementar a esta, com os polinucleotídeos consistindo em sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs de quatro ou cinco polinucleotídeos selecionados dentre o ‘grupo 1 de polinucleotídeos tipo de câncer-específico’ ou sequências complementares a estas sequências serão listadas. (1) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 75, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 7847-3p, e hsa-miR-3195); (2) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 96, 606, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836- 3p, e hsa-miR-3195); (3) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 97, 115, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 642a-3p, hsa-miR-671-5p, e hsa-miR-3195); (4) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 97, 162, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 642a-3p, hsa-miR-3196, e hsa-miR-3195); (5) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 162, 607, e 613 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 3196, hsa-miR-3195, e hsa-miR-6752-5p); (6) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 97, 607, e 612 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 642a-3p, hsa-miR-3195, e hsa-miR-6085); (7) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 13, 45, 57, 606, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR- 4665-5p, hsa-miR-6836-3p, e hsa-miR-3195); (8) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 96, 189, 606, e 608 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3940- 5p, hsa-miR-6836-3p, e hsa-miR-718); (9) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 96, 189, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 4294, hsa-miR-3940-5p, e hsa-miR-6836-3p); (10) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 24, 45, 57, 96, e 608 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR- 4665-5p, hsa-miR-4294, e hsa-miR-718); (11) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 162, 607, e 610 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa- miR-3196, hsa-miR-3195, e hsa-miR-638); e (12) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 189, 606, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa- miR-3940-5p, hsa-miR-6836-3p, e hsa-miR-3195).
[0530] Exemplos não limitantes da combinação do polinucleotídeo consistindo na sequência nucleotídica representada pela SEQ ID NO: 45 ou uma sequência complementar a esta, com os polinucleotídeos consistindo em sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs de quatro ou cinco polinucleotídeos selecionados dentre o ‘grupo 1 de polinucleotídeos tipo de câncer-específico’ ou sequências complementares a estas sequências serão adicionalmente listados abaixo. (1) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 96, 606, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836- 3p, e hsa-miR-3195); (2) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 75, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 7847-3p, e hsa-miR-3195); (3) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 75, 606, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 7847-3p, hsa-miR-6836-3p, e hsa-miR-3195); (4) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 77, 607, e 613 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 887-3p, hsa-miR-3195, e hsa-miR-6752-5p); (5) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 97, 606, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 642a-3p, hsa-miR-6836-3p, e hsa-miR-3195); (6) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 75, 77, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 7847-3p, hsa-miR-887-3p, e hsa-miR-3195); (7) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 32, 45, 57, 96, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-8069, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665- 5p, hsa-miR-4294, e hsa-miR-6836-3p); (8) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 24, 45, 57, 96, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR- 4665-5p, hsa-miR-4294, e hsa-miR-6836-3p); (9) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 96, 162, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 4294, hsa-miR-3196, e hsa-miR-6836-3p); (10) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 15, 45, 75, 96, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR- 7847-3p, hsa-miR-4294, e hsa-miR-6836-3p); (11) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 32, 45, 57, 162, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-8069, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665- 5p, hsa-miR-3196, e hsa-miR-3195); e (12) uma combinação das SEQ ID NOs: 38, 45, 96, 606, 608, e 611 (marcadores: hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa- miR-6836-3p, hsa-miR-718, e hsa-miR-4497).
[0531] Exemplos não limitantes da combinação do polinucleotídeo consistindo na sequência nucleotídica representada pela SEQ ID NO: 57 ou uma sequência complementar a esta, com os polinucleotídeos consistindo em sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs de quatro ou cinco polinucleotídeos selecionados dentre o ‘grupo 1 de polinucleotídeos tipo de câncer-específico’ ou sequências complementares a estas sequências serão adicionalmente listados abaixo. (1) uma combinação das SEQ ID NOs: 24, 41, 57, 45, e 96 (marcadores: hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-4419b, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 204-3p, e hsa-miR-4294); (2) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 607, e 612 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 3195, e hsa-miR-6085); (3) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 606, 607, e 608 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 6836-3p, hsa-miR-3195, e hsa-miR-718); (4) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 13, 45, 57, 75, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR- 4665-5p, hsa-miR-7847-3p, e hsa-miR-3195); (5) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 64, 75, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 6126, hsa-miR-7847-3p, e hsa-miR-3195); (6) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 55, 57, 607, e 613 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR- 4665-5p, hsa-miR-3195, e hsa-miR-6752-5p); (7) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 55, 57, 75, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR- 4665-5p, hsa-miR-7847-3p, e hsa-miR-3195); (8) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 38, 45, 57, 96, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR- 4665-5p, hsa-miR-4294, e hsa-miR-3195); (9) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 75, 162, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 7847-3p, hsa-miR-3196, e hsa-miR-3195); (10) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 75, 162, e 609 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 7847-3p, hsa-miR-3196, e hsa-miR-3178); (11) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 64, 96, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 6126, hsa-miR-4294, e hsa-miR-3195); e (12) uma combinação das SEQ ID NOs: 57, 64, 96, 606, 608, e 611 (marcadores: hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4294, hsa-miR- 6836-3p, hsa-miR-718, e hsa-miR-4497).
[0532] Exemplos não limitantes da combinação do polinucleotídeo consistindo na sequência nucleotídica representada pela SEQ ID NO: 96 ou uma sequência complementar a esta, com os polinucleotídeos consistindo em sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs de quatro ou cinco polinucleotídeos selecionados dentre o ‘grupo 1 de polinucleotídeos tipo de câncer-específico’ ou sequências complementares a estas sequências serão adicionalmente listados a baixo. (1) uma combinação das SEQ ID NOs: 38, 96, 606, 608, e 611 (marcadores: hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR- 718, e hsa-miR-4497); (2) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 96, e 607 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 4294, e hsa-miR-3195); (3) uma combinação das SEQ ID NOs: 38, 72, 96, 606, 608, e 611 (marcadores: hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4294, hsa- miR-6836-3p, hsa-miR-718, e hsa-miR-4497); (4) uma combinação das SEQ ID NOs: 32, 38, 96, 606, 608, e 611 (marcadores: hsa-miR-8069, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR- 6836-3p, hsa-miR-718, e hsa-miR-4497); (5) uma combinação das SEQ ID NOs: 38, 96, 163, 606, 608, e 611 (marcadores: hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6803-5p, hsa- miR-6836-3p, hsa-miR-718, e hsa-miR-4497); (6) uma combinação das SEQ ID NOs: 64, 72, 96, 162, 609, e 611 (marcadores: hsa-miR-6126, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR- 3196, hsa-miR-3178, e hsa-miR-4497); (7) uma combinação das SEQ ID NOs: 38, 64, 96, 163, 606, e 608 (marcadores: hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4294, hsa-miR- 6803-5p, hsa-miR-6836-3p, e hsa-miR-718); (8) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 75, 96, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR- 7847-3p, hsa-miR-4294, e hsa-miR-6836-3p); (9) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 15, 45, 57, 96, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR- 4665-5p, hsa-miR-4294, e hsa-miR-6836-3p); (10) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 41, 45, 57, 96, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-4419b, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665- 5p, hsa-miR-4294, e hsa-miR-6836-3p); (11) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 41, 45, 96, 189, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-4419b, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3940-5p, e hsa-miR-6836-3p); e (12) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 75, 96, 189, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR- 4294, hsa-miR-3940-5p, e hsa-miR-6836-3p).
[0533] Exemplos não limitantes da combinação do polinucleotídeo consistindo na sequência nucleotídica representada pela SEQ ID NO: 606 ou uma sequência complementar a esta, com os polinucleotídeos consistindo em sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs de três polinucleotídeos selecionados dentre o ‘grupo 1 de polinucleotídeos tipo de câncer-específico’ ou sequências complementares a estas sequências serão adicionalmente listados abaixo. (1) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 24, 45, 96, 189, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR- 4294, hsa-miR-3940-5p, e hsa-miR-6836-3p); (2) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 15, 45, 96, 189, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR- 4294, hsa-miR-3940-5p, e hsa-miR-6836-3p); (3) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 96, 189, 606, e 613 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3940- 5p, hsa-miR-6836-3p, e hsa-miR-6752-5p); (4) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 45, 72, 96, 189, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR- 4294, hsa-miR-3940-5p, e hsa-miR-6836-3p); e (5) uma combinação das SEQ ID NOs: 5, 15, 32, 45, 96, e 606 (marcadores: hsa-miR-3131, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-8069, hsa-miR-204- 3p, hsa-miR-4294, e hsa-miR-6836-3p).
[0534] O kit ou o dispositivo da presente invenção também pode conter um polinucleotídeo que já é conhecido ou que será descoberto no futuro, para permitir a detecção do câncer colorretal, além do(s) polinucleotídeo(s) (que pode incluir uma variante, fragmento, e um derivado) de acordo com a presente invenção descrita acima.
[0535] O kit da presente invenção também pode conter um anticorpo para medir um marcador para exame do câncer colorretal conhecido no estado da técnica, tal como CEA ou CA19-9, além do(s) polinucleotídeo(s) de acordo com a presente invenção descrito(s) acima.
[0536] Estes polinucleotídeos contidos no kit da presente invenção podem ser embalados em recipientes diferentes, individualmente ou em qualquer combinação.
[0537] O kit da presente invenção pode conter um kit para a extração de ácidos nucleicos (por exemplo, RNA, total) a partir de fluidos corporais, células, ou tecidos, um material fluorescente para a marcação, uma enzima e um meio para a amplificação do ácido nucleico, um manual de instruções, etc.
[0538] O dispositivo da presente invenção é um dispositivo para a medição do marcador de câncer, em que os ácidos nucleicos, tais como os polinucleotídeos de acordo com a presente invenção descritos acima, são ligados ou anexados a, por exemplo, uma fase sólida. Exemplos do material para a fase sólida incluem plástico, papel, vidro e silício. O material para a fase sólida é preferencialmente um material plástico a partir do ponto de vista de fácil processabilidade. A fase sólida tem qualquer forma e é, por exemplo, quadrada, redonda, em forma de palheta, ou forma de película. O dispositivo da presente invenção inclui, por exemplo, um dispositivo para a medição por uma técnica de hibridização. Exemplos específicos dos mesmos incluem dispositivos de blotting e matrizes de ácidos nucleicos (por exemplo, microarrays, chips de DNA e chips de RNA).
[0539] A técnica de arranjo de ácido nucleico (nucleic acid array technique) é uma técnica que envolve a ligação ou fixação dos ácidos nucleicos, um a um, pela utilização de um método [por exemplo, um método para detectar ácidos nucleicos utilizando um dispensador de alta densidade denominado spotter ou arrayer sobre a superfície da fase sólida com superfície tratada, se necessário, por revestimento com L-lisina ou introdução de um grupo funcional, tal como um grupo amino ou grupo carboxila, um método de pulverização dos ácidos nucleicos na fase sólida utilizando um jato que injeta gotículas muito pequenas de líquido por um elemento piezoelétrico ou semelhante a partir de um bocal injetor, ou um método de síntese sequencial de nucleotídeos na fase sólida] para preparar uma matriz como um chip e mensurar um ácido nucleico alvo pelo uso da hibridização usando essa matriz.
[0540] O kit ou o dispositivo da presente invenção compreende os ácidos nucleicos capazes de se ligar especificamente aos polinucleotídeos de, pelo menos, um ou mais, de um modo preferido, pelo menos, dois ou mais, mais preferencialmente, pelo menos, três ou mais, mais preferivelmente pelo menos cinco ou mais até todos miRNAs marcadores do câncer colorretal, respectivamente, do grupo 1 descrito acima. O kit ou o dispositivo da presente invenção pode compreender adicionalmente os ácidos nucleicos capazes de se ligar especificamente aos polinucleotídeos de, pelo menos, um ou mais, de um modo preferido, pelo menos, dois ou mais, mais preferencialmente, pelo menos, três ou mais, mais preferivelmente pelo menos cinco ou mais até todos miRNAs marcadores do câncer colorretal, respectivamente, do grupo 2 descrito acima. O kit ou o dispositivo da presente invenção pode compreender adicionalmente os ácidos nucleicos capazes de se ligar especificamente aos polinucleotídeos de, pelo menos, um ou mais, de um modo preferido, pelo menos, dois ou mais, mais preferencialmente, pelo menos, três ou mais, mais preferivelmente pelo menos cinco ou mais até todos miRNAs marcadores do câncer colorretal, respectivamente, do grupo 3 descrito acima.
[0541] O kit ou o dispositivo da presente invenção pode ser utilizado para a detecção do câncer colorretal, tal como descrito na Seção 4 abaixo.
4. MÉTODO PARA A DETECÇÃO DO CÂNCER COLORRETAL
[0542] A presente invenção provê ainda um método para a detecção do câncer colorretal, compreendendo o uso do kit ou do dispositivo da presente invenção (incluindo o(s) ácido(s) nucleico(s) que pode(m) ser utilizado(s) na presente invenção) descrito na seção 3 acima para mensurar um nível de expressão de um ou mais gene(s) derivado(s) do câncer colorretal representado por um nível de expressão do(s) gene(s) derivado(s) do câncer colorretal selecionado(s) a partir do seguinte grupo: miR-6726-5p, miR-4257, miR-6787-5p, miR-6780b-5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343- 3p, miR-1247-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR- 6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR-1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744-5p, miR-4792, miR-564, miR-6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665-3p, miR-4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1-5p, miR-6724-5p, miR-1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR- 7110-5p, miR-187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749-5p, miR-6515-3p, miR-3937, miR-6840-3p, miR-6893- 5p, miR-4728-5p, miR-6717-5p, miR-7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109-5p, miR-6842-5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR- 6126, miR-4449, miR-4706, miR-1913, miR-602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR-4632-5p, miR-6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-887-3p, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195- 3p, miR-6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR-1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR- 3620-5p, miR-1915-5p, miR-4294, miR-642a-3p, miR-371a-5p, miR-940, miR- 4450, miR-4723-5p, miR-1469, miR-6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR- 6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR-125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR- 4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-671-5p, miR-4454, miR-4516, miR- 7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR-6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782-5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777-5p, miR-6785-5p, miR- 7106-5p, miR-3663-3p, miR-6131, miR-1915-3p, miR-4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR-4638-5p, miR-3656, miR-3621, miR-6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR-3135b, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765- 3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR-6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR-6870-5p, miR-6722-3p, miR-7977, miR-4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR-6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803-5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR-4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p, miR- 4763-3p, miR-6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR-6752-5p e miR-135a-3p, opcionalmente, um nível de expressão de gene(s) derivado(s) do câncer colorretal selecionado(s) a partir do seguinte grupo: miR-1231, miR-1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR- 92a-2-5p, miR-423-5p, miR-1268a, miR-128-2-5p e miR-24-3p, opcionalmente, um nível de expressão de gene(s) derivado(s) do câncer colorretal selecionado(s) a partir do seguinte grupo: miR-4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR-4486, miR-7107-5p, miR-23a-3p, miR-4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR-8059, miR-6813-5p, miR-4492, miR-4476, e miR-6090 em uma amostra in vitro, comparando adicionalmente, por exemplo, o nível de expressão dos genes supramencionados na amostra (por exemplo, sangue, soro, ou plasma) coletados de um sujeito com suspeita de ter câncer colorretal com um nível de expressão de controle de uma amostra coletada a partir de um sujeito saudável (incluindo um paciente com câncer que não é o câncer colorretal), e avaliando se o sujeito tem câncer colorretal quando o nível de expressão dos ácidos nucleicos alvo é diferente entre as amostras.
[0543] Este método da presente invenção permite um diagnóstico usando uma abordagem pouco invasiva no início do câncer e com elevada sensibilidade e especificidade e, desse modo, promove o tratamento precoce e um melhor prognóstico. Além disso, a exacerbação da doença ou a eficácia cirúrgica, radioterapêutica, e quimioterápica podem ser monitoradas.
[0544] O método de extração do gene derivado do câncer colorretal a partir da amostra, tal como sangue, soro, ou plasma de acordo com a presente invenção é preferencialmente preparado pela adição de um reagente para a extração de RNA pelo kit de extração de RNA em amostras líquidas “3D-Gene™ RNA extraction reagent from liquid sample kit” (Toray Industries, Inc.). Um método de fenol ácido geral (ácido guanidínio-fenol- clorofórmio (AGPC)) pode ser usado, ou pode ser usado Trizol™ (Life Technologies Corp.). O gene derivado de câncer colorretal pode ser preparado pela adição de um reagente para a extração de RNA contendo fenol acídico, tal como Trizol (Life Technologies Corp.) ou Isogen (Nippon Gene Co., Ltd). Alternativamente, pode ser usado um kit tal como miRNeasy™ Mini Kit (Qiagen NV), embora o método não seja limitado a apenas estes.
[0545] A presente invenção também proporciona a utilização do kit ou dispositivo da presente invenção para a detecção in vitro de um produto da expressão de gene(s) miRNA(s) derivado(s) do câncer colorretal em uma amostra derivada de um sujeito.
[0546] No método da presente invenção, um kit ou dispositivo compreendendo, cada um isoladamente ou em cada composição possível, os polinucleotídeos que podem ser utilizados na presente invenção conforme descrito acima é utilizado como o kit ou dispositivo.
[0547] Na detecção ou diagnóstico (genético) do câncer colorretal de acordo com a presente invenção, cada polinucleotídeo contido no kit ou no dispositivo da presente invenção pode ser utilizado como uma sonda ou primer. No caso de se utilizar o polinucleotídeo como um primer, ensaios TaqMan™ microRNA da Life Technologies Corp., sistema de PCR miScript PCR System da Qiagen N.V., ou métodos similares, podem ser utilizados, embora o método da presente invenção não seja limitado a apenas estes.
[0548] O polinucleotídeo contido no kit ou no dispositivo da presente invenção pode ser usado como um primer ou sonda de acordo com um método rotineiro em um método conhecido no estado da técnica para detectar especificamente o gene específico, por exemplo, uma técnica de hibridização como o Northern blot, Southern blot, hibridização in situ, hibridização Northern, hibridização Southern ou uma técnica de amplificação quantitativa, tal como a RT-PCR quantitativa. Um fluido corporal, tal como sangue, soro, plasma ou urina de um sujeito é coletado como uma amostra a ser analisada de acordo com o tipo de método de detecção utilizado. Alternativamente, pode ser utilizado o RNA total preparado a partir de tal fluido corporal através do método descrito acima, e podem ser usados vários polinucleotídeos incluindo cDNA preparado a partir do RNA.
[0549] O kit ou o dispositivo da presente invenção é útil para o diagnóstico do câncer colorretal ou para a detecção da presença ou ausência do câncer colorretal. Especificamente, a detecção do câncer colorretal utilizando o kit ou o dispositivo pode ser realizada pela detecção in vitro do nível de expressão de um gene usando a sonda de ácido nucleico ou o primer contido no kit ou dispositivo em uma amostra, tal como sangue, soro, plasma ou urina a partir de um sujeito com suspeita de ter câncer colorretal. O sujeito com suspeita de ter câncer colorretal pode ser avaliado como tendo câncer colorretal quando o nível de expressão do miRNA marcador alvo mensurado utilizando polinucleotídeo(s) (incluindo qualquer variante, qualquer fragmento, e qualquer derivado dos mesmos) consistindo nas sequências nucleotídicas representadas por pelo menos uma ou mais das SEQ ID NOs: 1 a 171, 606 a 614, ou uma sequência complementar a estas, opcionalmente, uma sequência nucleotídica representada por uma ou mais das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência complementar a estas, e opcionalmente uma sequência nucleotídica representada por uma ou mais das SEQ ID NOs: 181 a 194 ou uma sequência complementar a estas, na amostra, tal como no sangue, soro, plasma ou urina do sujeito, é estatisticamente diferente de maneira significante quando comparado com o nível de expressão do mesmo na amostra, tal como sangue, soro, plasma ou urina, de um sujeito saudável.
[0550] O método da presente invenção pode ser combinado com sangue oculto nas fezes, exame retal, colonoscopia e bem como um método de imagiologia de diagnóstico, tais como enema de bário, CT, MRI, ou cintilografia óssea. O método da presente invenção é capaz de detectar especificamente o câncer colorretal e pode discriminar substancialmente o câncer colorretal de outros cânceres.
[0551] O método para detectar a ausência de um produto da expressão de gene(s) derivado(s) de câncer colorretal, ou a presença do produto da expressão de gene(s) derivado(s) de câncer colorretal em uma amostra utilizando o kit ou o dispositivo da presente invenção compreende a coleta de um fluido corporal tal como sangue, soro, plasma ou urina a partir do sujeito, e a medição do nível de expressão do gene alvo aí contido utilizando um ou mais polinucleotídeo(s) (incluindo uma variante, fragmento, ou derivado) selecionado(s) a partir do grupo de polinucleotídeos da presente invenção, e a avaliação da presença ou ausência do câncer colorretal ou detecção do câncer colorretal. Utilizando o método para detectar o câncer colorretal de acordo com a presente invenção, por exemplo, a presença ou ausência de melhora da doença ou grau de melhora da doença em um paciente com câncer colorretal recebendo uma droga terapêutica para melhorar a doença também pode ser avaliada ou diagnosticada.
[0552] O método da presente invenção pode compreender, por exemplo, as seguintes etapas (a), (b), e (c): (a) uma etapa de fazer o contato in vitro de uma amostra derivada de um sujeito com o(s) polinucleotídeo(s) contido(s) no kit ou dispositivo da presente invenção; (b) uma etapa de medição do nível de expressão do ácido nucleico -alvo na amostra usando o polinucleotídeo como sonda de ácidos nucleicos ou primer; e (c) uma etapa de avaliação da presença ou ausência do câncer colorretal (células) no sujeito com base na etapa (b).
[0553] Especificamente, a presente invenção provê um método para detectar o câncer colorretal, compreendendo a medição do nível de expressão de ácidos nucleicos alvo em uma amostra de um sujeito utilizando ácidos nucleicos capazes de ligar especificamente a pelo menos um ou mais (de um modo preferido, pelo menos dois ou mais) polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir do grupo consistindo em miR-6726-5p, miR-4257, miR- 6787-5p, miR-6780b-5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343-3p, miR-1247-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR-6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR-1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744-5p, miR- 4792, miR-564, miR-6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665-3p, miR- 4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1-5p, miR- 6724-5p, miR-1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR-7110-5p, miR-187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749- 5p, miR-6515-3p, miR-3937, miR-6840-3p, miR-6893-5p, miR-4728-5p, miR- 6717-5p, miR-7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109-5p, miR-6842- 5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR-6126, miR-4449, miR-4706, miR-1913, miR-602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR- 4632-5p, miR-6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-887-3p, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195-3p, miR-6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR- 1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR-3620-5p, miR-1915-5p, miR-4294, miR-642a-3p, miR-371a-5p, miR-940, miR-4450, miR-4723-5p, miR-1469, miR-6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR-6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR-125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR-4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-671-5p, miR-4454, miR-4516, miR-7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR- 6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782-5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777-5p, miR-6785-5p, miR-7106-5p, miR-3663-3p, miR-6131, miR- 1915-3p, miR-4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR-4638-5p, miR-3656, miR- 3621, miR-6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR-3135b, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765-3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR- 6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR-6870-5p, miR-6722- 3p, miR-7977, miR-4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR-6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803-5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR-4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p e miR-4763-3p, miR-6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR-6752-5p e miR- 135a-3p e avaliando de maneira in vitro se o sujeito tem ou não câncer colorretal utilizando os níveis de expressão mensurados e os níveis de expressão de controle de um sujeito saudável mensurado da mesma maneira.
[0554] Tal como utilizado na presente invenção, o termo “avaliação” é o suporte de avaliação baseado nos resultados do exame in vitro, e não no julgamento do médico.
[0555] Como descrito acima, e relação aos ácidos nucleicos alvo em um exemplo de realização preferido do método da presente invenção, especificamente, miR-6726-5p é hsa-miR-6726-5p, miR-4257 é hsa-miR- 4257, miR-6787-5p é hsa-miR-6787-5p, miR-6780b-5p é hsa-miR-6780b-5p, miR-3131 é hsa-miR-3131, miR-7108-5p é hsa-miR-7108-5p, miR-1343-3p é hsa-miR-1343-3p, miR-1247-3p é hsa-miR-1247-3p, miR-4651 é hsa-miR- 4651, miR-6757-5p é hsa-miR-6757-5p, miR-3679-5p é hsa-miR-3679-5p, miR-7641 é hsa-miR-7641, miR-6746-5p é hsa-miR-6746-5p, miR-8072 é hsa-miR-8072, miR-6741-5p é hsa-miR-6741-5p, miR-1908-5p é hsa-miR- 1908-5p, miR-6857-5p é hsa-miR-6857-5p, miR-4746-3p é hsa-miR-4746-3p, miR-744-5p é hsa-miR-744-5p, miR-4792 é hsa-miR-4792, miR-564 é hsa- miR-564, miR-6791-5p é hsa-miR-6791-5p, miR-6825-5p é hsa-miR-6825-5p, miR-6826-5p é hsa-miR-6826-5p, miR-4665-3p é hsa-miR-4665-3p, miR-4467 é hsa-miR-4467, miR-3188 é hsa-miR-3188, miR-6125 é hsa-miR-6125, miR- 6756-5p é hsa-miR-6756-5p, miR-1228-3p é hsa-miR-1228-3p, miR-8063 é hsa-miR-8063, miR-8069 é hsa-miR-8069, miR-6875-5p é hsa-miR-6875-5p, miR-3185 é hsa-miR-3185, miR-4433b-3p é hsa-miR-4433b-3p, miR-6887-5p é hsa-miR-6887-5p, miR-128-1-5p é hsa-miR-128-1-5p, miR-6724-5p é hsa- miR-6724-5p, miR-1914-3p é hsa-miR-1914-3p, miR-1225-5p é hsa-miR- 1225-5p, miR-4419b é hsa-miR-4419b, miR-7110-5p é hsa-miR-7110-5p, miR-187-5p é hsa-miR-187-5p, miR-3184-5p é hsa-miR-3184-5p, miR-204-3p é hsa-miR-204-3p, miR-5572 é hsa-miR-5572, miR-6729-5p é hsa-miR-6729- 5p, miR-615-5p é hsa-miR-615-5p, miR-6749-5p é hsa-miR-6749-5p, miR- 6515-3p é hsa-miR-6515-3p, miR-3937 é hsa-miR-3937, miR-6840-3p é hsa- miR-6840-3p, miR-6893-5p é hsa-miR-6893-5p, miR-4728-5p é hsa-miR- 4728-5p, miR-6717-5p é hsa-miR-6717-5p, miR-7113-3p é hsa-miR-7113-3p, miR-4665-5p é hsa-miR-4665-5p, miR-642b-3p é hsa-miR-642b-3p, miR- 7109-5p é hsa-miR-7109-5p, miR-6842-5p é hsa-miR-6842-5p, miR-4442 é hsa-miR-4442, miR-4433-3p é hsa-miR-4433-3p, miR-4707-5p é hsa-miR- 4707-5p, miR-6126 é hsa-miR-6126, miR-4449 é hsa-miR-4449, miR-4706 é hsa-miR-4706, miR-1913 é hsa-miR-1913, miR-602 é hsa-miR-602, miR-939- 5p é hsa-miR-939-5p, miR-4695-5p é hsa-miR-4695-5p, miR-711 é hsa-miR- 711, miR-6816-5p é hsa-miR-6816-5p, miR-4632-5p é hsa-miR-4632-5p, miR- 6721-5p é hsa-miR-6721-5p, miR-7847-3p é hsa-miR-7847-3p, miR-6132 é hsa-miR-6132, miR-887-3p é hsa-miR-887-3p, miR-3679-3p é hsa-miR-3679- 3p, miR-6784-5p é hsa-miR-6784-5p, miR-1249 é hsa-miR-1249, miR-937-5p é hsa-miR-937-5p, miR-5195-3p é hsa-miR-5195-3p, miR-6732-5p é hsa-miR- 6732-5p, miR-4417 é hsa-miR-4417, miR-4281 é hsa-miR-4281, miR-4734 é hsa-miR-4734, miR-6766-3p é hsa-miR-6766-3p, miR-663a é hsa-miR-663a, miR-4513 é hsa-miR-4513, miR-6781-5p é hsa-miR-6781-5p, miR-1227-5p é hsa-miR-1227-5p, miR-6845-5p é hsa-miR-6845-5p, miR-6798-5p é hsa-miR- 6798-5p, miR-3620-5p é hsa-miR-3620-5p, miR-1915-5p é hsa-miR-1915-5p, miR-4294 é hsa-miR-4294, miR-642a-3p é hsa-miR-642a-3p, miR-371a-5p é hsa-miR-371a-5p, miR-940 é hsa-miR-940, miR-4450 é hsa-miR-4450, miR- 4723-5p é hsa-miR-4723-5p, miR-1469 é hsa-miR-1469, miR-6861-5p é hsa- miR-6861-5p, miR-7975 é hsa-miR-7975, miR-6879-5p é hsa-miR-6879-5p, miR-6802-5p é hsa-miR-6802-5p, miR-1268b é hsa-miR-1268b, miR-663b é hsa-miR-663b, miR-125a-3p é hsa-miR-125a-3p, miR-2861 é hsa-miR-2861, miR-6088 é hsa-miR-6088, miR-4758-5p é hsa-miR-4758-5p, miR-296-3p é hsa-miR-296-3p, miR-6738-5p é hsa-miR-6738-5p, miR-671-5p é hsa-miR- 671-5p, miR-4454 é hsa-miR-4454, miR-4516 é hsa-miR-4516, miR-7845-5p é hsa-miR-7845-5p, miR-4741 é hsa-miR-4741, miR-92b-5p é hsa-miR-92b- 5p, miR-6795-5p é hsa-miR-6795-5p, miR-6805-3p é hsa-miR-6805-3p, miR- 4725-3p é hsa-miR-4725-3p, miR-6782-5p é hsa-miR-6782-5p, miR-4688 é hsa-miR-4688, miR-6850-5p é hsa-miR-6850-5p, miR-6777-5p é hsa-miR- 6777-5p, miR-6785-5p é hsa-miR-6785-5p, miR-7106-5p é hsa-miR-7106-5p, miR-3663-3p é hsa-miR-3663-3p, miR-6131 é hsa-miR-6131, miR-1915-3p é hsa-miR-1915-3p, miR-4532 é hsa-miR-4532, miR-6820-5p é hsa-miR-6820- 5p, miR-4689 é hsa-miR-4689, miR-4638-5p é hsa-miR-4638-5p, miR-3656 é hsa-miR-3656, miR-3621 é hsa-miR-3621, miR-6769b-5p é hsa-miR-6769b- 5p, miR-149-3p é hsa-miR-149-3p, miR-23b-3p é hsa-miR-23b-3p, miR-3135b é hsa-miR-3135b, miR-6848-5p é hsa-miR-6848-5p, miR-6769a-5p é hsa- miR-6769a-5p, miR-4327 é hsa-miR-4327, miR-6765-3p é hsa-miR-6765-3p, miR-6716-5p é hsa-miR-6716-5p, miR-6877-5p é hsa-miR-6877-5p, miR- 6727-5p é hsa-miR-6727-5p, miR-4534 é hsa-miR-4534, miR-614 é hsa-miR- 614, miR-1202 é hsa-miR-1202, miR-575 é hsa-miR-575, miR-6870-5p é hsa- miR-6870-5p, miR-6722-3p é hsa-miR-6722-3p, miR-7977 é hsa-miR-7977, miR-4649-5p é hsa-miR-4649-5p, miR-4675 é hsa-miR-4675, miR-6075 é hsa-miR-6075, miR-6779-5p é hsa-miR-6779-5p, miR-4271 é hsa-miR-4271, miR-3196 é hsa-miR-3196, miR-6803-5p é hsa-miR-6803-5p, miR-6789-5p é hsa-miR-6789-5p, miR-4648 é hsa-miR-4648, miR-4508 é hsa-miR-4508, miR-4749-5p é hsa-miR-4749-5p, miR-4505 é hsa-miR-4505, miR-5698 é hsa-miR-5698, miR-1199-5p é hsa-miR-1199-5p, miR-4763-3p é hsa-miR- 4763-3p, miR-6836-3p é hsa-miR-6836-3p, miR-3195 é hsa-miR-3195, miR- 718 é hsa-miR-718, miR-3178 é hsa-miR-3178, miR-638 é hsa-miR-638, miR- 4497 é hsa-miR-4497, miR-6085 é hsa-miR-6085, miR-6752-5p é hsa-miR- 6752-5p, e miR-135a-3p é hsa-miR-135a-3p.
[0556] Em um exemplo de realização preferido do método da presente invenção, especificamente, o ácido nucleico (especificamente, sonda ou primer) é selecionado a partir do grupo que consiste nos seguintes polinucleotídeos de (a) a (e): (d) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T; uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (e) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614; (f) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, derivado do mesmo, ou fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (g) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; e (h) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (a) a (d).
[0557] O método da presente invenção pode empregar um ácido nucleico adicional capaz de se ligar especificamente a pelo menos um polinucleotídeo selecionado a partir do grupo consistindo em miR-1231, miR- 1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR-92a-2-5p, miR-423-5p, miR-1268a, miR-128-2-5p e miR-24-3p.
[0558] Quanto a tais ácidos nucleicos, especificamente, miR- 1231 é hsa-miR-1231, miR-1233-5p é hsa-miR-1233-5p, miR-150-3p é hsa- miR-150-3p, miR-1225-3p é hsa-miR-1225-3p, miR-92a-2-5p é hsa-miR-92a- 2-5p, miR-423-5p é hsa-miR-423-5p, miR-1268a é hsa-miR-1268a, miR-128- 2-5p é hsa-miR-128-2-5p, e miR-24-3p é hsa-miR-24-3p.
[0559] Em um exemplo de realização preferido, o ácido nucleico é especificamente selecionado a partir do grupo consistindo nos seguintes polinucleotídeos de (f) a (j): (i) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (j) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOS: 172 a 180; (k) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (l) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; e (m) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (f) a (i).
[0560] O ácido nucleico adicionalmente utilizado no método da presente invenção pode compreender o ácido nucleico capaz de ligar especificamente a pelo menos um ou mias polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir do grupo consistindo em miR-4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR- 4486, miR-7107-5p, miR-23a-3p, miR-4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR- 8059, miR-6813-5p, miR-4492, miR-4476 e miR-6090.
[0561] Quanto a tais ácidos nucleicos, especificamente, miR- 4697-5p é hsa-miR-4697-5p, miR-3197 é hsa-miR-3197, miR-675-5p é hsa- miR-675-5p, miR-4486 é hsa-miR-4486, miR-7107-5p é hsa-miR-7107-5p, miR-23a-3p é hsa-miR-23a-3p, miR-4667-5p é hsa-miR-4667-5p, miR-451a é hsa-miR-451a, miR-3940-5p é hsa-miR-3940-5p, miR-8059 é hsa-miR-8059, miR-6813-5p é hsa-miR-6813-5p, miR-4492 é hsa-miR-4492, miR-4476 é hsa-miR-4476, e miR-6090 é hsa-miR-6090.
[0562] Em um exemplo de realização preferido, o ácido nucleico é especificamente um polinucleotídeo selecionado a partir do grupo consistindo nos seguintes polinucleotídeos de (k) a (o): (n) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (o) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOS: 181 a 194; (p) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (n) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; e (o) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (k) a (n).
[0563] Exemplos das amostras utilizadas no método da presente invenção podem incluir amostras preparadas a partir de tecidos vivos (preferencialmente um tecido colorretal) ou fluido corporal, tal como sangue, soro, plasma ou urina do sujeito. Especificamente, por exemplo, uma amostra contendo RNA preparado a partir do tecido, uma amostra contendo o polinucleotídeo adicionalmente preparado a partir deste, um fluido corporal tal como sangue, soro, plasma ou urina, uma porção ou a totalidade de um tecido vivo coletado a partir do sujeito por biópsia ou método de coleta similar, ou um tecido excisado por cirurgia pode ser utilizado, e a amostra para medição pode ser preparada a partir dele.
[0564] Conforme utilizado no presente, o sujeito refere-se a um mamífero, por exemplo, um ser humano, um macaco, um camundongo e um rato, sem qualquer limitação, e é preferencialmente um ser humano.
[0565] As etapas do método da presente invenção podem ser alteradas de acordo com o tipo de amostra a ser ensaiada.
[0566] No caso de se utilizar RNA como um analito, a detecção do câncer colorretal (células) pode compreender, por exemplo, as seguintes etapas (a), (b), e (c): (a) uma etapa de ligação do RNA preparado a partir da amostra do sujeito ou um polinucleotídeo (cDNA) complementar transcrito dele a um polinucleotídeo no kit ou dispositivo da presente invenção; (b) uma etapa de medição do RNA derivado da amostra ou do cDNA sintetizado a partir do RNA, ligado ao polinucleotídeo por hibridização usando o polinucleotídeo como sonda de ácido nucleico ou por RT-PCR quantitativa utilizando o polinucleotídeo como primer; e (c) uma etapa de avaliação da presença ou ausência do câncer colorretal (ou expressão do gene derivado do câncer colorretal) com base nos resultados de medição da etapa (b).
[0567] Por exemplo, diversos métodos de hibridização podem ser utilizados para detectar, examinar, avaliar, ou diagnosticar o câncer colorretal (ou expressão do gene derivado do câncer colorretal) de modo in vitro de acordo com a presente invenção. Por exemplo, Northern blot, Southern blot, RT-PCR, análise usando chip de DNA, hibridização in situ, hibridização Northern ou hibridização Southern podem ser utilizados como tal método de hibridização.
[0568] No caso de se utilizar o Northern blot, a presença ou ausência da expressão de cada gene ou o nível de expressão deste em RNA pode ser detectada ou mensurada pelo uso da sonda de ácido nucleico que pode ser utilizada na presente invenção. Os exemplos específicos dos mesmos podem incluir um método que envolve a marcação da sonda de ácido nucleico (ou de uma fita complementar) com um radioisótopo (P32, P33, S35, etc.), um material fluorescente, ou similar, que hibridiza ao produto marcado com o RNA derivado do tecido vivo de um sujeito transferido para uma membrana de nylon ou semelhante, de acordo com um método de rotina, e, em seguida, a realização da detecção e medição de um sinal obtido a partir do marcador (radioisótopo ou material fluorescente) no duplexo DNA/RNA formado usando um detector de radiação (exemplos podem incluir BAS-1800 II (Fujifilm Corp., Japão)) ou um detector de fluorescência (exemplos podem incluir STORM 865 (GE Healthcare Japan Corp.)).
[0569] No caso de se utilizar a RT-PCR quantitativa, a presença ou ausência da expressão de cada gene ou o nível de expressão deste em RNA pode ser detectada ou mensurada pelo uso do primer que pode ser utilizado na presente invenção. Os exemplos específicos dos mesmos podem incluir um método que envolve a preparação do cDNA a partir do RNA derivado de tecido vivo de um sujeito de acordo com um método de rotina, a hibridização de um par de primers (consistindo em uma fita positiva e uma fita reversa de ligação ao cDNA) da presente invenção com o cDNA de tal modo que a região de cada um dos genes alvo pode ser amplificada com o cDNA como um molde, e realizando a PCR de acordo com um método rotineiro para detectar o DNA de fita dupla obtido. O método para detectar o DNA de fita dupla pode incluir um processo de realizar a PCR utilizando os primers marcados com antecedência, com um radioisótopo ou material fluorescente, um método de eletroforese do produto da PCR em gel de agarose e coloração do DNA de fita dupla com brometo de etídio, ou métodos semelhantes, para a detecção, e um método de transferência do DNA de fita dupla produzido para uma membrana de nylon ou similar, de acordo com um método rotineiro e hibridizar o DNA de fita dupla com uma sonda de ácido nucleico marcada para a detecção.
[0570] No caso de se utilizar a análise de ácido nucleico em matriz, é usado um chip de RNA ou chip de DNA na qual as sondas de ácido nucleico (fita dupla ou fita simples) da presente invenção são ligadas a um substrato (fase sólida). As regiões que têm as sondas de ácido nucleico ligadas são referidas como spots de sonda, e as regiões que não têm a sonda de ácido nucleico ligada são referidas spots em branco. Um grupo de genes imobilizados em um substrato de fase sólida é geralmente denominado de chip de ácido nucleico, um arranjo de ácido nucleico é denominado de microarray, ou similar. O arranjo de DNA ou RNA inclui um macroarranjo (macroarray) de DNA ou RNA e um microarranjo (microarray) de DNA ou RNA. O termo “chip” utilizado na presente invenção inclui todas essas matrizes (arrays). O chip “3D-Gene™ Human miRNA Oligo chip” (Toray Industries, Inc.) pode ser utilizado como o chip de DNA, embora o chip de DNA não se limita apenas a estes.
[0571] Exemplos de medição usando o chip de DNA podem incluir, mas não estão limitados a, um método de detecção e medição de um sinal obtido a partir do marcador sobre as sondas de ácido nucleico utilizando um detector de imagem (exemplos podem incluir Typhoon 9410 (GE Healthcare Japan) e 3D-Gene™ scanner (Toray Industries, Inc.)).
[0572] O termo “condições estringentes” utilizado na presente invenção, conforme mencionado acima, sob as quais uma sonda de ácido nucleico hibridiza com a sua sequência alvo em uma extensão maior (por exemplo, valores de medição iguais ou maiores do que (uma média dos valores de medição de fundo) + (um desvio padrão dos valores de medição do fundo) x 2) do que para outras sequências.
[0573] As condições estringentes são definidas pela hibridização e subsequentes condições de lavagem. As condições de hibridização envolvem, mas não se limitam a, por exemplo, 30 °C a 60 °C durante 1 a 24 horas em uma solução contendo SSC, um agente tensoativo, formamida, sulfato de dextrano, agente de bloqueio, etc. Neste contexto, SSC 1 x é uma solução aquosa (pH 7,0) contendo 150 mM de cloreto de sódio e 15 mM de citrato de sódio. O tensoativo inclui, por exemplo, SDS (dodecilsulfato de sódio), Triton, ou Tween. As condições de hibridização envolvem mais preferivelmente 3 a 10 x SSC e 0,1 a 1% de SDS. Exemplos das condições da lavagem, após a hibridização, que é outra condição para definir as condições de estringência, podem incluir condições que envolvem a lavagem contínua a 30 °C em uma solução contendo SSC 0,5x e 0,1% de SDS, a 30 °C em uma solução contendo SSC 0,2x e 0,1% de SDS, e a 30 °C em uma solução de SSC 0,05x. É desejável que a fita complementar mantenha o seu estado hibridizado com uma fita positiva alvo mesmo pela lavagem sob tais condições. Especificamente, exemplos de tal fita complementar podem incluir uma fita constituída por uma sequência nucleotídica em uma relação completamente complementar com a sequência nucleotídica da fita positiva alvo e uma fita constituída por uma sequência nucleotídica possuindo pelo menos 80%, de preferência pelo menos 85%, mais preferencialmente pelo menos 90% ou pelo menos 95%, por exemplo, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade com a fita.
[0574] Outros exemplos de “condições estringentes” para hibridização estão descritos em, por exemplo, Sambrook, J. e Russel, D., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, publicado em 15 de Janeiro de 2001, Vol. 1, 7,42-7,45 e Vol. 2, 8,98,17, e podem ser utilizado na presente invenção.
[0575] Exemplos das condições para a realização da PCR utilizando um fragmento de polinucleotídeo no kit da presente invenção como primer incluem tratamento durante aproximadamente 15 segundos a 1 minuto, a 5 a 10 °C mais um valor Tm calculado a partir da sequência do primer, utilizando um tampão de PCR possuindo uma composição como 10 mM de Tris-HCl (pH 8,3), 50 mM de KCl, e 1 a 2 mM de MgCl2. Os exemplos do método para calcular tal valor Tm incluem valor Tm = 2 x (o número de resíduos de adenina + o número de resíduos de timina) + 4 x (o número de resíduos de guanina + o número de resíduos de citosina).
[0576] No caso de se utilizar a RT-PCR quantitativa, pode ser utilizado um kit comercialmente disponível para a medição especialmente concebido para a medição quantitativa de miRNA, tal como TaqMan™ MicroRNA Assay (Life Technologies Corp.); PCR de microRNA baseado em LNA (LNA™-based MicroRNA PCR) (Exiqon); ou o kit Ncode™ miRNA qRT- PCT (Invitrogen Corp.).
[0577] Para o cálculo dos níveis de expressão gênica, a análise estatística descrita, por exemplo, em Statistical analysis of gene expression microarray data (Speed T., Chapman e Hall/CRC), e A beginner's guide Microarray gene expression data analysis (Causton H.C. et al. , Blackwell) pode ser utilizada na presente invenção, embora o método de cálculo não seja limitado a estas. Por exemplo, duas vezes, de preferência 3 vezes, mais preferivelmente 6 vezes o desvio padrão dos valores de medição dos spots em branco é adicionado ao valor de medição médio dos spots brancos no chip de DNA, e spots de sonda com valor de sinal igual ou maior do que o valor resultante podem ser considerados como spots de detecção. Alternativamente, o valor médio da medição dos spots em brancos é considerado como fundo e pode ser subtraído dos valores de medição dos spots de sonda para determinar os níveis de expressão gênica. Um valor ausente para um nível de expressão do gene pode ser excluído do analito, de preferência substituído pelo menor valor do nível de expressão do gene em cada chip de DNA, ou mais preferencialmente substituído por um valor obtido pela subtração de 0,1 a partir de um valor logarítmico do menor valor do nível de expressão do gene. A fim de eliminar genes de baixo sinal, apenas um gene possuindo um nível de expressão de 26, de preferência 28, mais preferencialmente 210 ou mais em 20% ou mais, de preferência 50%, mais preferivelmente 80% ou mais do número de amostras de medição pode ser selecionado como analito. Exemplos da normalização do nível de expressão de genes incluem, mas não estão limitados a, normalização global e normalização por quantil (Bolstad, B.M. et al., 2003, Bioinformatics, Vol. 19, p. 185-193).
[0578] A presente invenção também provê um método que compreende a medição de gene alvo ou do nível de expressão do gene em uma amostra de um sujeito utilizando o polinucleotídeo, kit ou dispositivo (por exemplo, chip) para a detecção da presente invenção, ou uma combinação dos mesmos, a preparação de uma discriminante (função discriminante) com níveis de expressão gênica em uma amostra derivada de um paciente com câncer colorretal e uma amostra de um sujeito saudável como amostras de supervisão, e a determinação ou a avaliação da presença e/ou ausência do gene derivado do câncer colorretal na amostra.
[0579] Especificamente, a presente invenção provê ainda o método compreendendo: uma primeira etapa de medição de um nível de expressão in vitro de um gene alvo (ácido nucleico alvo) em múltiplas amostras conhecidas para determinar ou avaliar a presença e/ou ausência de genes derivados do câncer colorretal nas amostras, usando o polinucleotídeo, kit ou dispositivo (por exemplo, chip) para detecção da presente invenção, ou uma combinação destes; uma segunda etapa de preparação de uma discriminante com os valores de medição do nível de expressão de genes alvo obtidos na primeira etapa como amostras de supervisão da expressão; uma terceira etapa de medição do nível de expressão in vitro dos genes-alvo em uma amostra derivada de um sujeito, da mesma forma como na primeira etapa; e uma quarta etapa de atribuição de valores de medição do nível de expressão de genes alvo obtidos na terceira etapa para a discriminante obtida na segunda etapa de expressão, e a determinação ou avaliação da presença e/ou ausência dos genes derivados do câncer colorretal na amostra com base nos resultados obtidos a partir da função discriminante, em que o gene alvo pode ser detectado usando o polinucleotídeo, ou usando um polinucleotídeo para detecção contido no kit ou dispositivo (por exemplo, chip). Neste contexto, a discriminante pode ser preparada pelo uso da análise discriminante de Fisher, análise discriminante linear com base na distância de Mahalanobis, rede neural, máquina de vetores de suporte (SVM, do inglês: Support Vector Machine), ou semelhantes, embora o método não esteja limitado a estes.
[0580] Quando um limite de agrupamento (clustering) é uma linha reta ou um hiperplano, a análise discriminante linear é um método para determinar a associação de um grupo (cluster) usando a Fórmula 1 como discriminante. Na Fórmula 1, x representa uma variável explicativa, w representa um coeficiente da variável explicativa, e w0 representa um termo constante.
[0581] Os valores obtidos a partir da função discriminante são referidos com escores discriminantes. Os valores de medição de um conjunto de dados recém oferecidos podem ser atribuídos como variáveis explicativas para a discriminante para determinar conjuntos ou agrupamentos (clusters) pelos sinais dos escores discriminantes.
[0582] A análise discriminante de Fisher, um tipo de análise discriminante linear, é um método de redução de dimensionalidade para a seleção de uma dimensão adequada para discriminação de classes, e constrói uma variável sintética com desempenho altamente discriminante concentrando-se na variância de variáveis sintéticas e minimizando a variância de dados possuindo o mesmo rótulo (Venables, W.N. et al., Modern Applied Statistics with S. quarta edição. Springer, 2002). Na análise discriminante de Fisher, a direção w de projeção é determinada de modo a maximizar a Fórmula 2. Nessa Fórmula, μ representa uma entrada média, ng representa o número de dados associados à classe g, e μg representa uma entrada média dos dados associados à classe g. O numerador e denominador são a variância interclasse e variância intraclasse, respectivamente, quando cada dado é projetado na direção do vetor w. O coeficiente discriminante wi é determinado pela maximização desta relação (Takafumi Kanamori et al., “Pattern Recognition”, Kyoritsu Shuppan Co., Ltd. (2009); e Richard O. et al., Pattern Classification Segunda Edição., Wiley-Interscience, 2000).
[0583] A distância de Mahalanobis é calculada de acordo com a Fórmula 3 na consideração de correlação de dados e pode ser usada como análise discriminante não linear para a determinação de um grupamento (cluster) possuindo uma distância de Mahalanobis mais próxima a partir de cada grupamento como um grupamento associado. Nessa Fórmula 3, μ representa um vetor central de cada cluster, e S-1 representa uma matriz inversa da matriz de covariância do grupamento (cluster). O vetor central é calculado a partir de variáveis explicativas X, e um vetor médio, um vetor de valor mediano, ou similar pode ser utilizado.
[0584] SVM é um método de análise discriminante concebido por V. Vapnik (The Nature of Statistical Leaning Theory, Springer, 1995). Pontos de dados específicos de um conjunto de dados com classes conhecidas são definidos como variáveis explicativas, e as classes são definidas como variáveis objetivas. Um plano limite denominado hiperplano para classificar corretamente os dados estabelecidos para as classes conhecidas é determinado, e uma discriminante para a classificação de dados é determinada usando o plano limite. Em seguida, os valores de medição de um conjunto de dados recém oferecidos podem ser atribuídos como variáveis explicativas para a discriminante para determinar classes. A este respeito, o resultado da análise discriminante pode ser classes, pode ser uma probabilidade de ser classificada em classes corretas, ou pode ser a distância a partir do hiperplano. No SVM, um método de conversão não linear de um vetor característico de alta dimensão e execução da análise discriminante linear no espaço é conhecido como método para abordar problemas não lineares. Uma expressão na qual um produto interno de dois fatores em um espaço não linearmente mapeado é expresso apenas pelas entradas em seus espaços originais é denominada kernel (núcleo). Exemplos do kernel (núcleo) podem incluir um kernel linear, um kernel RBF (Função de Base Radial (do inglês ”Radial Basis Function”)), e um kernel gaussiano. Embora o mapeamento altamente dimensional seja realizado de acordo com o kernel, a discriminante ótima, ou seja, uma discriminante, pode ser realmente construído por mero cálculo de acordo com o kernel, o que evita o cálculo característicos no espaço mapeado (por exemplo, Hideki Aso et al., Frontier of Statistical Science 6 “Statistics of pattern recognition and learning - New concepts and approaches”, Iwanami Shoten, Publishers, (2004); Nello Cristianini et al., Introduction to SVM, Kyoritsu Shuppan Co., Ltd., (2008)).
[0585] A classificação por vetor suporte - C (C-SVC), um tipo de SVM, envolve a preparação de um hiperplano pela supervisão com as variáveis explicativas de dois grupos e classificação de um conjunto de dados desconhecidos em qualquer um dos grupos (C. Cortes et al. de 1995, Machine Learning, Vol. 20, p. 273-297).
[0586] Exemplos de cálculo de C-SVC discriminante que podem ser utilizados no método da presente invenção serão fornecidos a seguir. Em primeiro lugar, todos os indivíduos são divididos em dois grupos, ou seja, um grupo de pacientes com câncer colorretal e um grupo de sujeitos saudáveis. Por exemplo, o exame do tecido colorretal pode ser utilizado para cada sujeito a ser confirmado como um pacientes com câncer colorretal ou como um sujeito saudável.
[0587] Em seguida, é preparado um conjunto de dados consistindo em níveis de expressão de genes completos de amostras derivadas de soro dos dois grupos divididos (daqui em diante este conjunto de dados é referido como coorte de desenvolvimento), e uma C-SVC discriminante é determinada utilizando variáveis explicativas que são genes encontrados por diferem claramente em seus níveis de expressão gênica entre os dois grupos, e variáveis objetivas (por exemplo, -1 e +1) que são o agrupamento. Uma função objetiva de otimização é representada pela Fórmula 4, em que e representa todos os vetores de entrada, y representa uma variável objetiva, a representa um vetor multiplicador de Lagrange indeterminado, Q representa uma matriz definida positiva, e C representa um parâmetro para ajustar as condições restritas.
[0588] A fórmula 5 é uma discriminante finalmente obtida, e um grupo associado pode ser determinado com base no sinal de um valor obtido de acordo com a discriminante. Nessa fórmula, x representa um vetor de suporte, y representa um marcador que indica a associação a um determinado grupo, a representa o coeficiente correspondente, b representa um termo constante, e K representa uma função do núcleo (kernel).
[0589] Por exemplo, um kernel RBF definido pela Fórmula 6 pode ser usado como a função de kernel. Nessa fórmula, X representa um vetor de suporte, e Y representa um parâmetro de kernel para ajustar a complexidade do hiperplano.
[0590] Além disso, abordagens como rede neural, algoritmos k- vizinhos mais próximos, árvores de decisões, ou análise de regressão logística podem ser selecionadas como um método para a determinação ou avaliação da presença e/ou ausência de expressão de gene(s) alvo derivado(s) do câncer colorretal em uma amostra derivada de um sujeito, ou para avaliar o nível de expressão do mesmo pela comparação com um controle derivado de um sujeito saudável.
[0591] O método da presente invenção pode compreender, por exemplo, as seguintes etapas (a), (b), e (c): (a) uma etapa de medição de um nível de expressão de gene(s)- alvo em tecidos contendo genes derivados do câncer colorretal derivados de pacientes com câncer colorretal e/ou amostras já conhecidas de tecidos não contendo genes derivados do câncer colorretal a partir de sujeitos saudáveis, utilizando o polinucleotídeo, kit ou dispositivo (por exemplo, chip de DNA) para a detecção de acordo com a presente invenção; (b) uma etapa de preparação dos discriminantes de Fórmulas 1 a 3, 5, 6 e descritos acima a partir dos valores de medição do nível de expressão mensurados na etapa (a); e (c) medição de um nível de expressão do(s) gene(s)-alvo em uma amostra derivada de um sujeito utilizando o polinucleotídeo, kit, ou dispositivo (por exemplo, chip de DNA) para a detecção de acordo com a presente invenção, atribuindo o valor de medição obtido nas discriminantes preparadas na etapa (b), e determinando ou avaliando a presença e/ou ausência do gene-alvo derivado do câncer colorretal na amostra, ou avaliando os níveis de expressão do gene pela comparação com um controle derivado de um sujeito saudável, com base nos resultados obtidos.
[0592] Neste contexto, nos discriminantes de Fórmulas 1 a 3, 5, e 6, x representa uma variável explicativa e inclui um valor obtido pela medição de um polinucleotídeo selecionado a partir dos polinucleotídeos descritos na Seção 2 acima, ou um fragmento destes, etc. Especificamente, a variável explicativa para discriminar um paciente com câncer colorretal a partir de um indivíduo saudável de acordo com a presente invenção é(são) pelo(s) nível(eis) de expressão gênica selecionado(s) a partir de, por exemplo, os seguintes níveis de expressão de (1) a (3): (1) um nível de expressão gênica no soro de um paciente com câncer colorretal ou de um indivíduo saudável mensurado por qualquer DNA compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos de uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614 ou um sequência complementar, (2) um nível de expressão gênica no soro de um paciente com câncer colorretal ou de um indivíduo saudável mensurado por qualquer DNA compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos de uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180 ou um sequência complementar; e (3) um nível de expressão gênica no soro de um paciente com câncer colorretal ou de um indivíduo saudável mensurado por qualquer DNA compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos de uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194 ou um sequência complementar dessas.
[0593] Tal como descrito acima, para o método de determinação ou avaliação da presença e/ou ausência de um gene derivado do câncer colorretal em uma amostra derivada de um sujeito, a preparação de uma discriminante requer discriminante construída a partir de uma coorte de desenvolvimento. Para melhorar a acurácia da discriminante, é necessário que a discriminante utilize genes que exibam clara diferença entre dois grupos na coorte de desenvolvimento.
[0594] Cada gene que é utilizado para uma variável explicativa em uma discriminante é preferencialmente determinado da seguinte forma. Em primeiro lugar, os níveis de expressão de genes abrangentes de um grupo de pacientes com câncer colorretal e os níveis de expressão de genes abrangentes de um grupo de sujeitos saudáveis em uma coorte de desenvolvimento, são usados como conjunto de dados, o grau de diferença no nível de expressão de cada gene entre os dois grupos é determinado pelo uso, por exemplo, do valor P do teste t, que é a análise paramétrica, ou o valor P do teste U de Mann-Whitney ou teste de Wilcoxon, que são análises não paramétricas.
[0595] O gene pode ser considerado como sendo estatisticamente significativo quando a taxa crítica (nível de significância) do valor P obtido pelo teste é menor do que, por exemplo, 5%, 1%, ou 0,01%.
[0596] A fim de corrigir um aumento da probabilidade de erro tipo I atribuído à repetição de um teste, um método conhecido no estado da técnica, por exemplo, método de Bonferroni ou de Holm, pode ser utilizado para a correção (por exemplo, Yasushi Nagata et al., “Basics of statistical multiple comparison methods”, Scientist Press Co., Ltd. (2007). Como um exemplo da correção de Bonferroni, por exemplo, o valor de P obtido por um teste é multiplicado pelo número de repetições do teste, ou seja, o número de genes utilizados na análise, e valor obtido pode ser comparado com um nível desejado de significância para suprimir uma probabilidade de causar erros do tipo I em todo o teste.
[0597] Em vez do teste estatístico, o valor absoluto (mudança em vezes) de uma taxa de expressão de um valor mediano de cada nível de expressão do gene entre os níveis de expressão de um grupo de pacientes com câncer colorretal e os níveis de expressão de um grupo de sujeitos saudáveis pode ser calculado para selecionar um gene que é usado para uma variável explicativa em uma discriminante. Alternativamente, as curvas ROC podem ser preparadas utilizando os níveis de um grupo de pacientes com câncer colorretal e um grupo de indivíduos saudáveis, e um gene que é utilizado para uma variável explicativa em uma discriminante pode ser selecionado com base em um valor AUROC.
[0598] Em seguida, uma discriminante que pode ser calculada por vários métodos descritos acima é construída utilizando qualquer número de genes que exibe grande diferença em seus níveis de expressão aqui determinado. Exemplos do método para a construção de uma discriminante que produz a maior acurácia discriminatória incluem um método de construção de uma discriminante em cada combinação de genes que satisfaça o nível de significância de valor P, e um método de avaliação repetitiva dos genes para utilização na construção de uma discriminante, aumentando o número de genes, um por um em uma ordem descendente de diferença no nível de expressão do gene (Furey T.S. et al., 2000, Bioinformatics., Vol. 16, p. 906-14). Um nível de expressão do gene de outro paciente com câncer colorretal independente ou sujeito saudável é atribuído como variável explicativa para esta discriminante, e um resultado da análise discriminante em relação ao grupo ao qual este paciente com câncer colorretal independente ou indivíduo saudável está associado é calculado. Especificamente, o conjunto de genes encontrados para o diagnóstico e a discriminante construída utilizando o gene definido para diagnóstico pode ser avaliado em um grupo de amostras independentes para encontrar um conjunto de genes mais universal para o diagnóstico capaz de detectar o câncer colorretal e um método mais universal para a discriminação do câncer colorretal.
[0599] O método split-sample (amostras divididas) é preferencialmente utilizado para avaliar o desempenho discriminante (generalidade) da discriminante. Especificamente, um conjunto de dados é dividido em uma coorte de desenvolvimento e uma coorte de validação, e a seleção do gene por um teste estatístico e construção discriminante são realizados na coorte de desenvolvimento. A acurácia, sensibilidade e especificidade são calculadas utilizando resultados da análise discriminante em uma coorte de validação de acordo com a discriminante, e um grupo verdadeiro ao qual a coorte de validação está associada, para avaliar o desempenho da discriminante. Por outro lado, em vez de dividir um conjunto de dados, a seleção do gene por um teste estatístico e preparação da discriminante podem ser realizadas utilizando todas as amostras, e a acurácia, sensibilidade e especificidade podem ser calculadas pela discriminante de amostras recém preparadas de acordo com a discriminante para avaliar o desempenho da discriminante.
[0600] A presente invenção provê polinucleotídeos para a detecção ou para o diagnóstico de doença úteis no diagnóstico e tratamento do câncer colorretal, um método para detectar o câncer colorretal utilizando o polinucleotídeo, e um kit e um dispositivo para a detecção do câncer colorretal, compreendendo o polinucleotídeo. Particularmente, a fim de selecionar um gene para o diagnóstico e preparar uma discriminante de modo a exibir acurácia que é superior a um método diagnóstico do câncer colorretal que utiliza marcadores tumorais CEA existentes, um conjunto de genes para o diagnóstico e uma discriminante para o método da presente invenção podem ser construídos, exibindo acurácia superior ao do CEA, por exemplo, pela comparação de genes expressos no soro derivados de um paciente confirmado como negativo utilizando o marcador CEA, mas que finalmente foi diagnosticado com câncer colorretal por exame mais detalhado, tal como por tomografia computadorizada utilizando um meio de contraste, com genes expressos no soro derivado de um paciente que não tem câncer colorretal.
[0601] Por exemplo, o conjunto de genes para o diagnóstico é definido como qualquer combinação selecionada a partir de um ou dois ou mais polinucleotídeos com base em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 171 e 606 a 614, ou uma sequência complementar a estas sequências conforme descrito acima, opcionalmente, um ou dois ou mais dos polinucleotídeos com base em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 172 a 180, ou uma sequência complementar a estas sequências, e, opcionalmente, um ou dois ou mais dos polinucleotídeos com base em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência complementar a estas sequências. Além disso, uma discriminante é construída utilizando os níveis de expressão do conjunto de genes para o diagnóstico em amostras derivadas de pacientes com câncer colorretal classe I e amostras derivadas de indivíduos saudáveis de classe II como um resultado de diagnóstico feito com o tecido. Como resultado, a presença ou ausência de genes derivados do câncer colorretal em uma amostra desconhecida pode ser determinada com uma acurácia de 100% no máximo pela medição dos níveis de expressão do conjunto de genes para o diagnóstico na amostra desconhecida.
EXEMPLOS
[0602] A seguir, a presente invenção será adicionalmente descrita de forma específica com referência aos exemplos. Entretanto, não é pretendido que o escopo da presente invenção se limite a estes Exemplos.
EXEMPLO DE REFERÊNCIA 1 “COLETA DE AMOSTRAS DE PACIENTE COM CÂNCER COLORRETAL E SUJEITOS SAUDÁVEIS”
[0603] Os soros foram coletados utilizando tubos de coleta de sangue a vácuo VENOJECT II VP-AS109K60 (Terumo Corp., Japão) a partir de 100 sujeitos saudáveis e 34 pacientes com câncer colorretal (1 caso em estádio I, 6 casos com estádio IIA, 4 casos com estádio IIIA, 6 casos com estádio IIIB e 2 casos com estádio IIIC e 1 caso em estádio IV) confirmados por não terem outro câncer primário além do câncer colorretal após obtenção do consentimento informado, e usados como uma coorte de desenvolvimento. Da mesma forma, foram coletados soros utilizando tubos de coleta de sangue a vácuo VENOJECT II VP-AS109K60 (Terumo Corp., Japão) a partir de 50 sujeitos saudáveis e 16 pacientes com câncer colorretal (3 casos com estádio I, 4 casos com estádio IIA, 1 caso com estádio IIB, 2 casos com estádio IIIB, 2 casos com estádio IIIC, e 4 casos com estádio IV) confirmados por não terem outro câncer primário além do câncer colorretal após obtenção do consentimento informado, e usados como uma coorte de desenvolvimento.
EXTRAÇÃO DE RNA TOTAL
[0604] O RNA total foi obtido a partir de 300 μL da amostra de soro obtida de cada uma dos 200 sujeitos no total de 150 sujeitos saudáveis e 50 pacientes com câncer colorretal incluídos na coorte de desenvolvimento e coorte de validação, utilizando um reagente para a extração do kit de extração de RNA ‘3D-Gene RNA®’ a partir de amostras líquidas (Toray Industries, Inc.) seguindo o protocolo fornecido pelo fabricante.
MEDIÇÃO DO NÍVEL DE EXPRESSÃO GÊNICA
[0605] miRNAs no RNA total obtido a partir das amostras de soro de cada uma das 200 pessoas em um total de 150 sujeitos saudáveis e 50 pacientes com câncer colorretal incluídos na coorte de desenvolvimento e coorte de validação foram marcados com fluorescência utilizando o kit de marcação de miRNA “3D-Gene® miRNA Labeling kit” (Toray Industries, Inc.) de acordo com o protocolo (versão 2.20) fornecido pelo fabricante. O chip de oligo DNA utilizado foi o 3D-Gene™ Human miRNA Oligo (Toray Industries, Inc.) com sondas ligadas possuindo sequências complementares aos 2.555 miRNAs entre os miRNAs registrados na miRBase Release 20. A hibridização entre miRNAs no RNA total e as sondas sobre o chip de DNA sob condições estringentes e lavagem após a hibridização foram realizadas de acordo com o protocolo fornecido pelo fabricante. O chip de DNA foi digitalizado usando um 3D-Gene™ Sacnner (Toray Industries, Inc.) para obter as imagens. A intensidade de fluorescência foi digitalizada utilizando o 3DGene™ Extraction (Toray Industries, Inc.). As intensidades de fluorescência digitalizadas foram convertida para um valor logarítmico com uma base de 2 e usadas como nível de expressão gênica, a partir das quais o valor de branco foi subtraído. Valores ausentes foram substituídos por um valor obtido pela subtração de 0,1 a partir de um a valor logarítmico do menor valor do nível de expressão gênica em cada chip de DNA. Como resultado, os níveis de expressão compreensivos dos miRNAs no soro foram obtidos para os 50 pacientes com câncer colorretal e 150 sujeitos saudáveis. O cálculo e análise estatística, utilizando os níveis de expressão gênica digitalizados a partir dos miRNAs foram realizados utilizando os programas R language 3.0.2 (R Development Core Team (2013) R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, URL http://www.R- project.org/.) e MASS package 7.3-30 (Venables, W. N. & Ripley, B. D. (2002) Modern Applied Statistics with S. Quarta Edição. Springer, Nova Iorque. ISBN 0-387-95457-0).
EXEMPLO DE REFERÊNCIA 2 “COLETA DE AMOSTRAS DE PACIENTES COM OUTROS CÂNCERES QUE NÃO O CÂNCER COLORRETAL”
[0606]O soro foi coletado usando o tubo de coleta de sangue a vácuo VENOJECT II VP-AS109K60 (Terumo Corp.) de cada um dos 69 pacientes com câncer de pâncreas, 66 pacientes com câncer do trato biliar, 30 pacientes com câncer de estômago, 33 pacientes com câncer de esôfago, 32 pacientes com câncer de fígado e 15 pacientes com doença pancreatobiliar benigna que foram confirmados como sendo pacientes que não possuem cânceres em outros órgão após a obtensão do consentimento informado, e usados como uma coorte de desenvolvimento juntamente com as amostras de 34 pacientes com câncer colorretal e 103 sujeitos saudáveis do Exemplo de Referência 1. Da mesma forma, foram coletados soros usando tubo de coleta de sangue a vácuo VENOJECT II VP-AS109K60 (Terumo Corp.) de cada um dos 30 pacientes com câncer de pâncreas, 33 pacientes com câncer do trato biliar, 20 pacientes com câncer de estômago, 17 pacientes com câncer de esôfago, 20 pacientes com câncer de fígado e 6 pacientes com doença pancreatobiliar benigna que foram confirmados como sendo pacientes que não possuem outros cânceres após a obtensão do consentimento informado, e usados como uma coorte de validação juntamente com as amostras de 16 pacientes com câncer colorretal confirmados como sendo pacientes que não possuem cânceres em outros órgãos além do intestino grosso e 47 sujeitos saudáveis do Exemplo de Referência 1. As operações subsequentes foram realizadas da mesma forma que no Exemplo de Referência 1.
EXEMPLO 1 “SELEÇÃO DE GENE MARCADOR UTILIZANDO AMOSTRAS NA COORTE DE DESENVOLVIMENTO E MÉTODO PARA AVALIAR O DESEMPENHO DISCRIMINANTE DE CÂNCER COLORRETAL DE UM ÚNICO MARCADOR GÊNICO USANDO A COORTE DE VALIDAÇÃO”
[0607] Neste exemplo, um gene marcador para discriminar um paciente com câncer colorretal a partir de um sujeito saudável foi selecionado a partir da coorte de desenvolvimento e estudado em amostras da coorte de validação independente da coorte de desenvolvimento, para um método para avaliar o desempenho discriminante do câncer colorretal de cada gene marcador selecionado sozinho.
[0608] Especificamente, em primeiro lugar, os níveis de expressão de miRNA da coorte de desenvolvimento e coorte de validação obtidos nos exemplos de referência anteriores foram combinados e normalizados por normalização quantil.
[0609] Em seguida, os genes para diagnóstico foram selecionados usando a coorte de desenvolvimento. Aqui, a fim de adquirir marcadores diagnósticos com maior fiabilidade, foram selecionados apenas os genes que exibem um nível de expressão gênica de 26 ou mais em 50% ou mais das amostras no grupo de pacientes com câncer colorretal ou grupo de sujeitos saudáveis da coorte de desenvolvimento. A fim de adquirir mais genes estatisticamente significativos para discriminar um grupo de pacientes com câncer colorretal do grupo de sujeitos saudáveis, o valor P obtido pelo teste t bicaudal assumindo variâncias iguais como para cada nível de expressão gênica foi corrigido pelo método de Bonferroni, e os genes cujo p satisfez um valor < 0,01 foram adquiridos como genes marcadores para utilização em variáveis explicativas de uma discriminante. Os genes obtidos estão descritos na Tabela 2.
[0610] Assim, os genes hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-4257, hsa- miR-6787-5p, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR- 1343-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-3679- 5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-6741-5p, hsa- miR-1908-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR- 4792, hsa-miR-564, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-4467, hsa-miR-3188, hsa-miR-6125, hsa-miR- 6756-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-8063, hsa-miR-8069, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-3185, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa- miR-6724-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-4419b, hsa-miR- 7110-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-6515-3p, hsa- miR-3937, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR- 6717-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR- 7109-5p, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-4707- 5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4449, hsa-miR-4706, hsa-miR-1913, hsa-miR- 602, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6816-5p, hsa- miR-4632-5p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6132, hsa-miR- 887-3p, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-4281, hsa-miR- 4734, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-663a, hsa-miR-4513, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-371a-5p, hsa- miR-940, hsa-miR-4450, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-6879-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-1268b, hsa- miR-663b, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6088, hsa-miR-4758- 5p, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-4454, hsa- miR-4516, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4741, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-6795- 5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-4688, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-6131, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-4532, hsa-miR- 6820-5p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4638-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-3621, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-3135b, hsa- miR-6848-5p, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4327, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR- 6716-5p, hsa-miR-6877-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-4534, hsa-miR-614, hsa-miR-1202, hsa-miR-575, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR- 7977, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-6075, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4271, hsa-miR-3196, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR- 4648, hsa-miR-4508, hsa-miR-4749-5p, hsa-miR-4505, hsa-miR-5698, hsa- miR-1199-5p e hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-1231, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR- 150-3p, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-423-5p, hsa-miR- 1268a, hsa-miR-128-2-5p e hsa-miR-24-3p, e polinucleotídeos consisitndo das sequências nucleotídicas de SEQ ID NOs: 1 a 180 realcioandas a estes foram encontrados.
[0611] Entre eles, os genes recentemente encontrados como marcadores para analisar a presença ou ausência do câncer colorretal são polinucleotídeos que consistem nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 171.
[0612] Uma discriminante para a determinação da presença ou ausência do câncer colorretal foi adicionalmente preparada pela análise discriminante de Fisher com os níveis de expressão destes genes como um índice. Especificamente, qualquer polinucleotídeo descoberto recentemente consistindo em uma sequência nucleotídica representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 1 a 180 encontrado na coorte de desenvolvimento foi aplicado à Fórmula 2 acima para construir uma discriminante. A acurácia, sensibilidade e especificidade calculadas estão apresentadas na Tabela 3. A este respeito, um coeficiente discriminante e um termo constante são mostrados na Tabela 4.
[0613] A acurácia, sensibilidade e especificidade na coorte de validação foram calculadas utilizando a discriminante assim preparada, e o desempenho discriminante dos polinucleotídeos selecionados foi validado usando amostras independentes (Tabela 3). Por exemplo, o valor de medição do nível de expressão da sequência nucleotídica representada pela SEQ ID NO: 1 foi comparado entre os sujeitos saudáveis (100 pessoas) e os pacientes com câncer colorretal (34 pessoas) na coorte de desenvolvimento. Como resultado, os valores de medição do nível de expressão gênica foram encontrados como sendo significativamente menores no grupo de pacientes com câncer colorretal do que no grupo de sujeitos saudáveis (vide o diagrama da esquerda da Figura 2). Estes resultados também foram reprodutíveis para os indivíduos saudáveis (50 pessoas) e pacientes com câncer colorretal (16 pessoas) na coorte de validação (vide o diagrama da direita da Figura 2). Da mesma forma, os resultados obtidos sobre os outros polinucleotídeos mostrados nas SEQ ID NOs: 2 a 180 mostraram que os valores de medição do nível de expressão gênica foram significativamente menores (-) ou maiores (+) no grupo de pacientes com câncer colorretal do que no grupo de sujeitos saudáveis (Tabela 2). Estes resultados puderam ser validados na coorte de validação. Por exemplo, como para esta sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 1, o número de amostras que foi corretamente identificado na detecção do câncer colorretal na coorte de validação foi calculado usando o limiar (9,43) que foi definido na coorte de desenvolvimento e discriminado entre os dois grupos. Como resultado, foram obtidos 16 verdadeiros positivos, 50 verdadeiros negativos, 0 falso positivo e 0 falso negativo. A partir destes valores, foram obtidos 100% de acurácia, 100% de sensibilidade, e 100% de especificidade de detecção. Desta forma, o desempenho da detecção foi calculado para todos os polinucleotídeos apresentados nas SEQ ID NOs: 1 a 180, e descritos na Tabela 3.
[0614] Por exemplo, 110 polinucleotídeos consistindo nas sequências de nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 49, 50, 51, 52, 53, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 65, 66, 67, 68, 69, 71, 72, 73, 74, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 83, 84, 86, 87, 88, 90, 92, 93, 95, 96, 97, 99, 100, 101, 102, 107, 109, 110, 111, 113, 114, 115, 118, 120, 122, 124, 126, 134, 136, 142, 153, 172, 173 e 175 exibiram sensibilidade de 100%, 100%, 100%, 75%, 93,8%, 75%, 87,5%, 75%, 93,8%, 68,8%, 81,2%, 100%, 75%, 50%, 75%, 75%, 68,8%, 75%, 81,2%, 81,2%, 75%, 62,5%, 75%, 56,2%, 75%, 68,8%, 56,2%, 62,5%, 68,8%, 75%, 68,8%, 68,8%, 56,2%, 68,8%, 62,5%, 68,8%, 62,5%, 50%, 56,2%, 56,2%, 56,2%, 75%, 50%, 68,8%, 68,8%, 68,8%, 50%, 56,2%, 62,5%, 62,5%, 50%, 62,5%, 68,8%, 56,2%, 56,2%, 43,8%, 75%, 62,5%, 62,5%, 56,2%, 62,5%, 62,5%, 56,2%, 62,5%, 56,2%, 56,2%, 56,2%, 56,2%, 43,8%, 43,8%, 50%, 68,8%, 56,2%, 62,5%, 62,5%, 43,8%, 62,5%, 56,2%, 62,5%, 62,5%, 50%, 56,2%, 43,8%, 50%, 43,8%, 50%, 43,8%, 56,2%, 43,8%, 50%, 50%, 50%, 50%, 50%, 50%, 43,8%, 50%, 43,8%, 50%, 50%, 50%, 43,8%, 43,8%, 50%, 43,8%, 43,8%, 50%, 81,2%, 68,8% e 56,2%, respectivamente na coorte de validação (Tabela 3). Como pode ser visto a partir do Exemplo Comparativo mencionado mais tarde, os marcadores CEA existentes exibiram sensibilidade de 43,75% na coorte de validação (Tabelas 5-1 e 5-2), demonstrando que os 110 polinucleotídeos consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 49, 50, 51, 52, 53, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 65, 66, 67, 68, 69, 71, 72, 73, 74, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 83, 84, 86, 87, 88, 90, 92, 93, 95, 96, 97, 99, 100, 101, 102, 107, 109, 110, 111, 113, 114, 115, 118, 120, 122, 124, 126, 134, 136, 142, 153, 172, 173 e 174 podem discriminar, sozinhos, o câncer colorretal na coorte de validação com uma sensibilidade superior ao do marcador CEA.
[0615] Por exemplo, 14 polinucleotídeos consistindo nas sequências de nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 10, 14, 17, 21, 23, 32, 36, 47, 59, 65, e 101 foram capazes de determinar corretamente o câncer colorretal em todas as três amostras de câncer colorretal estádio 1 que estavam contidos na coorte de validação. Assim, esses polinucleotídeos podem detectar até mesmo o câncer colorretal precoce, contribuindo assim para o diagnóstico precoce do câncer colorretal.
[0616] Por exemplo, 12 polinucleotídeos consistindo nas sequências de nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 5, 7, 10, 14, 39, 46, 73, 81, e 148 foram capazes de determinar corretamente o câncer colorretal como para todos de caso de câncer de ceco e casos de câncer de cólon ascendente, que eram casos de câncer no intestino grosso superior que são declaradamente difíceis de detectar por exames de sangue oculto nas fezes, na coorte de validação. Assim, esses polinucleotídeos podem detectar o câncer colorretal, independentemente de onde o câncer colorretal se desenvolve.
EXEMPLO 2 “MÉTODO PARA AVALIAR O DESEMPENHO DISCRIMINANTE DO CÂNCER COLORRETAL PELA COMBINAÇÃO DE MÚLTIPLOS GENES MARCADORES UTILIZANDO AMOSTRAS NA COORTE DE VALIDAÇÃO”
[0617] Neste Exemplo, foi estudado um método para avaliar o desempenho discriminante do câncer colorretal por uma combinação dos genes marcadores selecionados no Exemplo 1. Especificamente, a análise discriminante de Fisher foi conduzida para 16.074 combinações de dois polinucleotídeos compreendendo pelo menos um ou mais dos valores de medição do nível de expressão dos polinucleotídeos recentemente descobertos consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 171 entre os polinucleotídeos consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 180 selecionadas no Exemplo 1, para construir uma discriminante para a determinação da presença ou ausência do câncer colorretal. Em seguida, a acurácia, sensibilidade e especificidade na coorte de validação foram calculadas utilizando a discriminante assim preparada, e o desempenho discriminante dos polinucleotídeos selecionados foi validado usando amostras independentes.
[0618] Por exemplo, os valores de medição do nível de expressão da sequência nucleotídica representada pela SEQ ID NO: 1 e SEQ ID NO: 2 foram comparados entre os sujeitos saudáveis (100 pessoas) e os pacientes com câncer colorretal (34 pessoas) na coorte de desenvolvimento. Como resultado, um diagrama de dispersão que separou significativamente os valores de medição do nível de expressão gênica do grupo de pacientes com câncer colorretal a partir do grupo de sujeitos saudáveis foi obtido (veja o diagrama esquerdo da Figura 3). Estes resultados também foram reprodutíveis para os indivíduos saudáveis (50 pessoas) e pacientes com câncer colorretal (16 pessoas) na coorte de validação (vide o diagrama da direita da Figura 3). Do mesmo modo, um diagrama de dispersão que separou significativamente os valores de medição do nível de expressão gênica do grupo de pacientes com câncer colorretal a partir do grupo de sujeitos saudáveis também foi obtido para as outras combinações de valores de medição do nível de expressão compreendendo, pelo menos, uma ou mais dos valores de medição do nível de expressão dos polinucleotídeos recentemente encontrados consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 e 171 entre os polinucleotídeos consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 180. Estes resultados puderam ser validados na coorte de validação. Por exemplo, para estas sequências nucleotídicas representadas pela SEQ ID NO: 1 e SEQ ID NO: 2, o número de amostras que foi corretamente identificado na detecção do câncer colorretal foi calculado usando a função (0 = 1,26x + y - 18,06) que foi estabelecido na coorte de desenvolvimento e discriminado entre os dois grupos. Como resultado, foram obtidos 16 verdadeiros positivos, 50 verdadeiros negativos, 0 falso positivo e 0 falso negativo. A partir destes valores, foram obtidos 100% de acurácia, 100% de sensibilidade, e 100% de especificidade de detecção. Desta forma, o desempenho da detecção foi calculado como para todas as combinações de dois valores de medição de nível de expressão compreendendo pelo menos um ou mais dos valores de medição do nível de expressão dos polinucleotídeos recentemente encontrados consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 171 entre os polinucleotídeos que consistem nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 180. Dentre estas, 179 combinações compreendendo o valor de medição do nível de expressão do polinucleotídeo que consiste na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 1 e a eficácia de detecção desta foram descritas na Tabela 6 como um exemplo. Por exemplo, todas as combinações dos valores de medição do nível de expressão dos polinucleotídeos consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 e 2, SEQ ID NOs: 1 e 3, SEQ ID NOs: 1 e 4, e SEQ ID NOs: 1 e 5 exibiram sensibilidade de 100% na coorte de validação (Tabela 6). Além disso, combinações de dois polinucleotídeos consistindo nas sequências nucleotídicas, exceto a SEQ ID NO: 1, foram descritas na Tabela 7 a título de exemplo. Como combinações específicas de dois polinucleotídeos, por exemplo, combinações representadas pelas SEQ ID NOs: 5 e 6, SEQ ID NOs: 5 e 11, SEQ ID NOs: 5 e 38, SEQ ID NOs: 15 e 16, SEQ ID NOs: 15 e 21, SEQ ID NOs: 15 e 64, SEQ ID NOs: 24 e 25, SEQ ID NOs: 24 e 30, SEQ ID NOs: 24 e 32, SEQ ID NOs: 2 e 32, SEQ ID NOs: 32 e 36, SEQ ID NOs: 15 e 32, SEQ ID NOs: 3 e 38, SEQ ID NOs: 38 e 39, SEQ ID NOs: 38 e 64, SEQ ID NOs: 3 e 45, SEQ ID NOs: 45 e 58, SEQ ID NOs: 45 e 64, SEQ ID NOs: 2 e 55, SEQ ID NOs: 6 e 55, SEQ ID NOs: 55 e 64, SEQ ID NOs: 2 e 64, SEQ ID NOs: 4 e 64, SEQ ID NOs: 2 e 96, SEQ ID NOs: 7 e 96, SEQ ID NOs: 96 e 97, SEQ ID NOs: 2 e 97, SEQ ID NOs: 3 e 97, SEQ ID NOs: 5 e 97, SEQ ID NOs: 2 e 162, SEQ ID NOs: 3 e 162, e SEQ ID NOs: 5 e 162, exibiram uma acurácia de 75% ou mais para discriminar os pacientes com câncer colorretal a partir dos sujeitos saudáveis tanto da coorte de desenvolvimento quanto na coorte de validação. Desta forma, as 14.598 combinações dos valores de medição do nível de expressão de dois polinucleotídeos possuindo sensibilidade além do marcador CEA existente (43,8 na Tabela 5-2) foram obtidas na coorte de validação. Todas as sequências de nucleotídeos de 1 a 180 descritas na Tabela 2, obtidas no Exemplo 1 foram utilizadas pelo menos uma vez nessas combinações. Estes resultados demonstraram que o uso combinado de dois dos polinucleotídeos consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 180 também é capaz de detectar o câncer colorretal com excelente desempenho, superior ao do marcador existente.
[0619] Marcadores para a detecção do câncer colorretal com excelente sensibilidade são obtidos mesmo pela combinação adicional de 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 ou mais valores de medição dos níveis de expressão dos polinucleotídeos consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 180. Por exemplo, os polinucleotídeos recentemente encontrados consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 171 entre os polinucleotídeos consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 180 selecionadas no Exemplo 1, foram mensurados para obter seus níveis de expressão entre o grupo de sujeitos saudáveis e o grupo pacientes com câncer colorretal na coorte de validação. Todos os polinucleotídeos foram classificados em ordem decrescente de seus valores de P obtidos pelo teste t de Student indicando a significância estatística de uma diferença entre os grupos (ou seja, aquele que possui um valor P inferior foi classificado em primeiro lugar), e a sensibilidade de detecção do câncer colorretal foi avaliada utilizando combinações de um ou mais polinucleotídeos em que os polinucleotídeos foram adicionados à combinação um por um a partir do topo para baixo de acordo com a classificação. Em resumo, a ordem nos quais os polinucleotídeos foram combinados nesta avaliação está no sentido inverso em termos de SEQ ID NOs, da SEQ ID NO: 171 a SEQ ID NOs: 170, 169, ..., conforme exibido na Tabela 2. Como resultado, a sensibilidade na coorte de validação foi de 12,5% para um polinucleotídeo (SEQ ID NO: 171), 18,8% para 2 polinucleotídeos (SEQ ID NOs: 170 e 171), 25,0% para 4 polinucleotídeos (SEQ ID NOs: 168 a 171), 31,2% para 5 polinucleotídeos (SEQ ID NOs: 167 a 171), 37,5% para 7 polinucleotídeos (SEQ ID NOs: 165 a 171), 87,5% para 10 polinucleotídeos (SEQ ID NOs: 162 a 171), 100% para 20 polinucleotídeos (SEQ ID NOs: 152 a 171), 100% para 30 polinucleotídeos (SEQ ID NOs: 142 a 171), 100% para 80 polinucleotídeos (SEQ ID NOs: 92 a 171), 100% para 170 polinucleotídeos (SEQ ID NOs: 2 a 171), e 100% para 171 polinucleotídeos (SEQ ID NOs: 1 a 171).
[0620] Estes resultados demonstraram que uma combinação de vários polinucleotídeos pode produzir um melhor desempenho discriminante do câncer colorretal do que o uso individual de cada polinucleotídeo ou uma combinação de um menor número de polinucleotídeos. Neste contexto, as combinações de vários polinucleotídeos não estão limitadas às combinações dos polinucleotídeos adicionados na ordem de diferenças estatisticamente significativas, tal como descrito acima, e qualquer combinação de vários polinucleotídeos pode ser usada na detecção do câncer colorretal.
[0621] A partir destes resultados, pode se concluir que todos os polinucleotídeos consistindo nas sequências de nucleotídeos representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 180 servem como excelentes marcadores para a detecção do câncer colorretal.TABELA 2 TABELA 3 TABELA 4 TABELA 5-1COORTE DE DESENVOLVIMENTO TABELA 5-2 COORTE DE VALIDAÇÃOTABELA 6 TABELA 7
EXEMPLO 3 “SELEÇÃO DE GENE MARCADOR UTILIZANDO TODAS AS AMOSTRAS E MÉTODO PARA AVALIAR O DESEMPENHO DISCRIMINANTE DO CÂNCER COLORRETAL DO GENE MARCADOR ADQUIRIDO”
[0622] Neste Exemplo, as amostras na coorte de desenvolvimento e coorte de validação utilizadas nos Exemplos 1 e 2 foram integradas, e a seleção de um marcador e a avaliação do seu desempenho discriminante para o câncer colorretal foram conduzidas utilizando todas as amostras.
[0623] Especificamente, os níveis de expressão de miRNA no soro de 50 pacientes com câncer colorretal e 150 sujeitos saudáveis obtidos nos Exemplos de Referência acima foram normalizados pela normalização quantil. A fim de adquirir marcadores de diagnóstico com maior fiabilidade, apenas os genes possuindo o nível de expressão gênica de 26 ou mais em 50% ou mais das amostras no grupo de pacientes com câncer colorretal ou grupo de sujeitos saudáveis foram selecionados na seleção dos genes marcadores. A fim de adquirir significância estatística para a discriminação de um grupo de pacientes com câncer colorretal do grupo de sujeitos saudáveis, o valor P obtido pelo teste t bicaudal assumindo variâncias iguais como para cada nível de expressão gênica foi corrigido pelo método de Bonferroni, e os genes cujo p satisfez um valor < 0,01 foram selecionados como genes marcadores para utilização em variáveis explicativas de uma discriminante, e os genes obtidos estão descritos na Tabela 8. Desta forma, os genes hsa- miR-4697-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-675-5p, hsa-miR-4486, hsa-miR-7107- 5p, hsa-miR-23a-3p, hsa- miR-4667-5p, hsa-miR-451a, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-8059, hsa-miR-6813-5p, hsa-miR-4492, hsa-miR-4476 e hsa-miR- 6090, e as sequências nucleotídicas de SEQ ID NOs: 181 a 194 relacionadas com estes genes foram encontrados além dos genes descritos na Tabela 2. Tal como acontece com as sequências de nucleotídeos de SEQ ID NOs: 1 a 180, os resultados obtidos sobre os polinucleotídeos apresentados nas SEQ ID NOs: 181 a 194 também mostraram que os valores da medição de genes foram significativamente menores (-) ou maiores (+) no grupo de pacientes com câncer colorretal do que no grupo de sujeitos saudáveis (Tabela 8). Estes resultados puderam ser validados na coorte de validação. Assim, a presença ou ausência de câncer colorretal nas amostras recentemente obtidas pôde ser determinada pelos métodos descritos nos Exemplos 1 e 2, utilizando os valores de medição do nível de expressão dos genes descritos na Tabela 8 sozinhos ou em combinação com os valores de medição do nível de expressão dos genes descritos na tabela 2. TABELA 8
EXEMPLO 4 “MÉTODO PARA AVALIAR O DESEMPENHO DISCRIMINANTE ESPECÍFICO DO CÂNCER COLORRETAL PELA COMBINAÇÃO DE MÚLTIPLOS GENES MARCADORES UTILIZANDO AMOSTRAS NA COORTE DE VALIDAÇÃO”
[0624] Neste Exemplo, um gene para o diagnóstico é selecionado pela comparação dos níveis de expressão de genes a partir de miRNA no soro entre pacientes com câncer colorretal e um grupo de controle consistindo em indivíduos saudáveis, pacientes com câncer pancreático, pacientes com câncer de ducto biliar, pacientes com câncer de estômago, pacientes com câncer esofágico, pacientes de câncer de fígado, e pacientes com doença pancreatobiliar benigna da mesma maneira como o método descrito no Exemplo 1, utilizando os genes marcadores selecionados no Exemplo 1, e direcionando a coorte de desenvolvimento como grupo de amostra descrito no Exemplo de Referência 2. Os polinucleotídeos consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 606 a 614, assim selecionados foram combinados adicionalmente com ao mesmo para estudar um método para avaliar o desempenho discriminante específico do câncer colorretal.
[0625] Especificamente, em primeiro lugar, os níveis de expressão de miRNA na coorte de desenvolvimento e coorte de validação obtidos no exemplo de referência 2 foram combinados e normalizados por normalização quantil. Em seguida, foi efetuada a análise discriminante de Fisher de afim de que combinações de 1 a 6 valores de medição do nível de expressão compreendendo pelo menos um ou mais dos valores de medição do nível de expressão dos polinucleotídeos consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 1 a 171, 606 a 614, construíssem uma discriminante para a determinação da presença ou ausência do câncer colorretal. Em seguida, a acurácia, sensibilidade e especificidade na coorte de validação foram calculadas utilizando a discriminante assim preparada, com o grupo de pacientes do câncer colorretal como grupo de amostras positivas e, por outro lado, o grupo de sujeitos saudáveis, grupo de pacientes com câncer de pâncreas, grupo de pacientes com câncer do ducto biliar, grupo de pacientes com câncer de estômago, grupo de pacientes com câncer de esôfago, grupo de pacientes com câncer de fígado, e grupo de paciente com doença pancreatobiliar benigna como grupo de amostras negativas. O desempenho discriminante dos polinucleotídeos selecionados foi validado usando amostras independentes.
[0626] A maioria dos polinucleotídeos consistindo nas sequências de nucleotídeos representadas por estas SEQ ID NOs (SEQ ID NO: 1 a 194, 606 a 614 que correspondem aos miRNA marcadores da Tabela 1), ou sequências complementares das mesmas foram capazes de fornecer acurácia, sensibilidade e especificidade relativamente altas na determinação da presença ou ausência do câncer colorretal, e, além disso, foram capazes de discriminar especificamente o câncer colorretal de outros cânceres. Por exemplo, entre as combinações de múltiplos polinucleotídeos selecionados a partir do grupo consistindo nos polinucleotídeos que consistem nas sequências de nucleotídeos representadas pelas SEQ ID NOs: 5, 13, 15, 24, 32, 38, 41, 45, 55, 57, 64, 72, 75, 77, 96, 97, 115, 162, 163, 173, 189, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613 e 614 ou sequências complementares a estas (grupo 1 de polinucleotídeo tipo de câncer-específico) como polinucleotídeos capazes de ligar especificamente aos marcadores alvo, combinações que compreendem pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir do grupo consistindo em polinucleotídeos consistindo nas sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 96, e 606 ou sequências complementares a estas (grupo 2 de polinucleotídeo tipo de câncer-específico) incluídos no grupo 1 de polinucleotídeo tipo de câncer- específico foram capazes de discriminar especificamente o câncer colorretal de outros tipos de cânceres com alta acurácia.
[0627] O número dos polinucleotídeos mencionados acima com especificidade para o tipo de câncer na combinação pode ser de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 ou mais para a combinação. As combinações de 6 ou mais desses polinucleotídeos foram capazes de exibir uma acurácia discriminante de 90% ou mais.
[0628] Especificamente, acurácia discriminante da medição usando o polinucleotídeo que consiste na sequência nucleotídica representada pela SEQ ID NO: 5 ou uma sequência complementar a esta é mostrada na Tabela 9-1. A medição usando a combinação de um polinucleotídeo compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 5 ou uma sequência complementar a esta exibiu a mais alta acurácia de 90,1% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 87,6% na coorte de validação. Além disso, por exemplo, a medição utilizando combinações de dois polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 5 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 91,7% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 88,8% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de três polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 5 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 94,0% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 91,2% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de quatro polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 5 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 95,6% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 93,6% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de cinco polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 5 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 96,4% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 94,8% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de seis polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 5 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 96,9% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 94,7% na coorte de validação.
[0629] A acurácia discriminante da medição usando o polinucleotídeo consistindo na sequência nucleotídica representada pela SEQ ID NO: 45 ou uma sequência complementar a esta é mostrada na Tabela 9-2. A medição usando a combinação de um polinucleotídeo compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 45 ou uma sequência complementar a esta exibiu a mais alta acurácia de 56,7% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 55,4% na coorte de validação. Além disso, por exemplo, a medição utilizando combinações de dois polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 45 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 90,7% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 88,4% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de três polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 45 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 94,0% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 89,6% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de quatro polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 45 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 95,2% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 91,6% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de cinco polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 45 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 96,4% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 94,4% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de seis polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 45 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 97,6% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 92,6% na coorte de validação.
[0630] A acurácia discriminante da medição usando o polinucleotídeo consistindo na sequência nucleotídica representada pela SEQ ID NO: 57 ou uma sequência complementar a esta é mostrada na Tabela 9-3. A medição usando a combinação de um polinucleotídeo compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 57 ou uma sequência complementar a esta exibiu a mais alta acurácia de 60,2% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 60,6% na coorte de validação. Além disso, por exemplo, a medição utilizando combinações de dois polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 57 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 86,7% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 83,7% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de três polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 57 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 92,4% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 90,0% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de quatro polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 57 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 95,2% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 91,2% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de cinco polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 57 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 96,2% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 94,8% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de seis polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 57 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 96,9% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 93,6% na coorte de validação.
[0631]A acurácia discriminante da medição usando o polinucleotídeo consistindo na sequência nucleotídica representada pela SEQ ID NO: 96 ou uma sequência complementar a esta é mostrada na Tabela 9-4. A medição usando a combinação de um polinucleotídeo compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 96 ou uma sequência complementar a esta exibiu a mais alta acurácia de 57,9% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 59,4% na coorte de validação. Além disso, por exemplo, a medição utilizando combinações de dois polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 96 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 85,9% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 83,7% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de três polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 96 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 92,6% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 90,4% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de quatro polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 96 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 94,4% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 91,2% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de cinco polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 96 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 96,0% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 94,0% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de seis polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 96 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 96,3% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 93,6% na coorte de validação.
[0632]A acurácia discriminante da medição usando o polinucleotídeo consistindo na sequência nucleotídica representada pela SEQ ID NO: 606 ou uma sequência complementar a esta é mostrada na Tabela 9-5. A medição usando a combinação de um polinucleotídeo compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 606 ou uma sequência complementar a esta exibiu a mais alta acurácia de 59,4% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 58,6% na coorte de validação. Além disso, por exemplo, a medição utilizando combinações de dois polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 606 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 86,6% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 82,9% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de três polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 606 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 92,6% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 91,2% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de quatro polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 606 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 94,8% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 90,0% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de cinco polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 606 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 96,0% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 93,6% na coorte de validação. Adicionalmente, por exemplo, a medição utilizando combinações de seis polinucleotídeos compreendendo pelo menos um polinucleotídeo consistindo na sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 606 ou uma sequência complementar a esta, exibiu a mais alta acurácia de 95,3% na coorte de desenvolvimento e acurácia de 93,6% na coorte de validação.
[0633]Os valores de medição do nível de expressão das sequências nucleotídicas representadas pelas SEQ ID NOs: 5, 45, 57, 75. 162 e 607 foram comparados entre os 34 pacientes de câncer colorretal, 103 sujeitos saudáveis, 69 pacientes com câncer pancreático, 66 pacientes com câncer de ducto biliar, 30 pacientes com câncer de estômago, 33 pacientes com câncer de esôfago, 32 pacientes com câncer de fígado, e 15 pacientes com doença pancreatobiliar benigna na coorte de desenvolvimento. Como resultado, um diagrama de dispersão que separou significativamente o escore discriminante do grupo de pacientes com câncer colorretal a partir dos escores discriminantes de outros grupos foi obtido na coorte de desenvolvimento (veja o diagrama superior da Figura 4). Estes resultados também foram reprodutíveis na coorte de validação (vide o diagrama inferior da Figura 4).TABELA 9-1TABELA 9-2TABELA 9-3 TABELA 9-4 TABELA 9-5
EXEMPLO COMPARATIVO 1 “DESEMPENHO DISCRIMINANTE DO CÂNCER COLORRETAL USANDO UM MARCADOR TUMORAL EXISTENTE EM SANGUE”
[0634] A concentração do marcador tumoral existente CEA no sangue foi mensurada na coorte de desenvolvimento e coorte de validação obtida nos exemplos de referência anteriores. Quando a concentração deste marcador tumoral no sangue é mais elevada do que o valor de referência descrito na literatura não patentária 4 (CEA: 5 ng/mL), geralmente há suspeita do sujeito ter câncer. Deste modo, se a concentração de CEA no sangue excede ou não seu valor de referência foi confirmado para cada amostra, e os resultados foram avaliados quanto a capacidade deste marcador tumoral em detectar o câncer em pacientes com câncer colorretal. A sensibilidade de cada marcador existente na coorte de desenvolvimento e coorte de validação foi calculada. Os resultados são apresentados nas Tabelas 5-1 e 5-2. A sensibilidade do CEA foi tão baixa quanto 26,5% na coorte de desenvolvimento e tão baixa quanto 43,8% na coorte de validação, demonstrando que o marcador não é útil na detecção do câncer colorretal (Tabela 5-1 e 5-2).
[0635] Por outro lado, tal como mostrado acima nas Tabelas 3 e 6 dos Exemplos 1 e 2, pode se concluir que em todos os polinucleotídeos consistindo nas sequências de nucleotídeos representada pelas SEQ ID NOs: 1 a 180, combinações de 1 ou 2 polinucleotídeos que apresentam sensibilidade superior ao do marcador de câncer colorretal existente estão presentes, e, portanto, esses polinucleotídeos servem como excelentes marcadores diagnósticos.
[0636] Conforme mostrado nestes Exemplos e no Exemplo Comparativo, o kit e etc. e o método da presente invenção podem detectar o câncer colorretal de maneira mais sensível do que pelo uso do marcador tumoral existente e, portanto, permitem a detecção e o tratamento mais precoce do câncer colorretal. Como resultado, a melhora na taxa de sobrevida e uma opção terapêutica de operação endoscópica, colocando menos fardo sobre os pacientes, também podem ser fornecidas.
APLICABILIDADE INDUSTRIAL
[0637] De acordo com a presente invenção, o câncer colorretal pode ser eficazmente detectado por um método simples e barato. Isso permite uma detecção, diagnóstico e tratamento precoces do câncer colorretal. O método da presente invenção pode detectar o câncer colorretal com invasividade limitada usando o sangue de um paciente e, portanto, permite que o câncer colorretal seja detectado de maneira conveniente e rápida.
[0638] Todas as publicações, patentes e pedidos de patentes citados no presente são integralmente incorporados ao presente pela referência.

Claims (11)

1. MÉTODO PARA A DETECÇÃO DE CÂNCER COLORRETAL, caracterizado por compreender a medição de um nível de expressão de um marcador de câncer colorretal miR-6726-5p em uma amostra de um sujeito usando um kit ou um dispositivo, e avaliação in vitro para determinar se o sujeito possui ou não o câncer colorretal utilizando tanto o nível de expressão mensurado quanto um nível de expressão de controle em uma amostra obtida de um sujeito saudável mensurado da mesma maneira, em que o kit ou o dispositivo compreende um ácido nucleico capaz de se ligar especificamente a miR-6726-5p.
2. MÉTODO, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo miR-6726-5p ser hsa-miR-6726-5p.
3. MÉTODO, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 2, caracterizado pelo ácido nucleico ser um polinucleotídeo selecionado a partir do grupo consistindo nos seguintes polinucleotídeos de (a) a (e): (a) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 1 ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T; uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (b) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 1; (c) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 1 ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (d) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada pela SEQ ID NO: 1 ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T; e (e) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (a) a (d).
4. MÉTODO, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 3, caracterizado pelo kit ou pelo dispositivo compreender ainda um ácido nucleico capaz de se ligar especificamente a pelo menos um ou mais polinucleotídeo(s) selecionado(s) a partir do grupo consistindo em outros marcadores do câncer colorretal miR-4257, miR-6787-5p, miR-6780b- 5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343-3p, miR-1247-3p, miR-4651, miR- 6757-5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR-6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR-1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744-5p, miR-4792, miR-564, miR-6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665-3p, miR-4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1-5p, miR-6724-5p, miR- 1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR-7110-5p, miR-187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749-5p, miR-6515- 3p, miR-3937, miR-6840-3p, miR-6893-5p, miR-4728-5p, miR-6717-5p, miR- 7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109-5p, miR-6842-5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR-6126, miR-4449, miR-4706, miR-1913, miR- 602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR-4632-5p, miR- 6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-887-3p, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195-3p, miR-6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR-1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR-3620-5p, miR-1915-5p, miR-4294, miR-642a- 3p, miR-371a-5p, miR-940, miR-4450, miR-4723-5p, miR-1469, miR-6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR-6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR-125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR-4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-671-5p, miR-4454, miR-4516, miR-7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR-6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782-5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777- 5p, miR-6785-5p, miR-7106-5p, miR-3663-3p, miR-6131, miR-1915-3p, miR- 4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR-4638-5p, miR-3656, miR-3621, miR- 6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR-3135b, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765-3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR-6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR-6870-5p, miR-6722-3p, miR-7977, miR- 4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR-6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803- 5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR-4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p, miR-4763-3p, miR-6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR-6752-5p, miR-135a-3p, miR-1231, miR- 1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR-92a-2-5p, miR-423-5p, miR-1268a, miR-128-2-5p, miR-24-3p, miR-4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR-4486, miR-7107-5p, miR-23a-3p, miR-4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR-8059, miR-6813-5p, miR-4492, miR-4476 e miR-6090.
5. MÉTODO, de acordo com a reivindicação 4, caracterizado pelo miR-1231 ser hsa-miR-1231, miR-4257 ser hsa-miR-4257, miR-6787-5p ser hsa-miR-6787-5p, miR-6780b-5p ser hsa-miR-6780b-5p, miR-3131 ser hsa-miR-3131, miR-7108-5p ser hsa-miR-7108-5p, miR-1343-3p ser hsa-miR- 1343-3p, miR-1247-3p ser hsa-miR-1247-3p, miR-4651 ser hsa-miR-4651, miR-6757-5p ser hsa-miR-6757-5p, miR-3679-5p ser hsa-miR-3679-5p, miR- 7641 ser hsa-miR-7641, miR-6746-5p ser hsa-miR-6746-5p, miR-8072 ser hsa-miR-8072, miR-6741-5p ser hsa-miR-6741-5p, miR-1908-5p ser hsa-miR- 1908-5p, miR-6857-5p ser hsa-miR-6857-5p, miR-4746-3p ser hsa-miR-4746- 3p, miR-744-5p ser hsa-miR-744-5p, miR-4792 ser hsa-miR-4792, miR-564 ser hsa-miR-564, miR-6791-5p ser hsa-miR-6791-5p, miR-6825-5p ser hsa- miR-6825-5p, miR-6826-5p ser hsa-miR-6826-5p, miR-4665-3p ser hsa-miR- 4665-3p, miR-4467 ser hsa-miR-4467, miR-3188 ser hsa-miR-3188, miR-6125 ser hsa-miR-6125, miR-6756-5p ser hsa-miR-6756-5p, miR-1228-3p ser hsa- miR-1228-3p, miR-8063 ser hsa-miR-8063, miR-8069 ser hsa-miR-8069, miR- 6875-5p ser hsa-miR-6875-5p, miR-3185 ser hsa-miR-3185, miR-4433b-3p ser hsa-miR-4433b-3p, miR-6887-5p ser hsa-miR-6887-5p, miR-128-1-5p ser hsa-miR-128-1-5p, miR-6724-5p ser hsa-miR-6724-5p, miR-1914-3p ser hsa- miR-1914-3p, miR-1225-5p ser hsa-miR-1225-5p, miR-4419b ser hsa-miR- 4419b, miR-7110-5p ser hsa-miR-7110-5p, miR-187-5p ser hsa-miR-187-5p, miR-3184-5p ser hsa-miR-3184-5p, miR-204-3p ser hsa-miR-204-3p, miR- 5572 ser hsa-miR-5572, miR-6729-5p ser hsa-miR-6729-5p, miR-615-5p ser hsa-miR-615-5p, miR-6749-5p ser hsa-miR-6749-5p, miR-6515-3p ser hsa- miR-6515-3p, miR-3937 ser hsa-miR-3937, miR-6840-3p ser hsa-miR-6840- 3p, miR-6893-5p ser hsa-miR-6893-5p, miR-4728-5p ser hsa-miR-4728-5p, miR-6717-5p ser hsa-miR-6717-5p, miR-7113-3p ser hsa-miR-7113-3p, miR- 4665-5p ser hsa-miR-4665-5p, miR-642b-3p ser hsa-miR-642b-3p, miR-7109- 5p ser hsa-miR-7109-5p, miR-6842-5p ser hsa-miR-6842-5p, miR-4442 ser hsa-miR-4442, miR-4433-3p ser hsa-miR-4433-3p, miR-4707-5p ser hsa-miR- 4707-5p, miR-6126 ser hsa-miR-6126, miR-4449 ser hsa-miR-4449, miR-4706 ser hsa-miR-4706, miR-1913 ser hsa-miR-1913, miR-602 ser hsa-miR-602, miR-939-5p ser hsa-miR-939-5p, miR-4695-5p ser hsa-miR-4695-5p, miR-711 ser hsa-miR-711, miR-6816-5p ser hsa-miR-6816-5p, miR-4632-5p ser hsa- miR-4632-5p, miR-6721-5p ser hsa-miR-6721-5p, miR-7847-3p ser hsa-miR- 7847-3p, miR-6132 ser hsa-miR-6132, miR-887-3p ser hsa-miR-887-3p, miR- 3679-3p ser hsa-miR-3679-3p, miR-6784-5p ser hsa-miR-6784-5p, miR-1249 ser hsa-miR-1249, miR-937-5p ser hsa-miR-937-5p, miR-5195-3p ser hsa- miR-5195-3p, miR-6732-5p ser hsa-miR-6732-5p, miR-4417 ser hsa-miR- 4417, miR-4281 ser hsa-miR-4281, miR-4734 ser hsa-miR-4734, miR-6766-3p ser hsa-miR-6766-3p, miR-663a ser hsa-miR-663a, miR-4513 ser hsa-miR- 4513, miR-6781-5p ser hsa-miR-6781-5p, miR-1227-5p ser hsa-miR-1227-5p, miR-6845-5p ser hsa-miR-6845-5p, miR-6798-5p ser hsa-miR-6798-5p, miR- 3620-5p ser hsa-miR-3620-5p, miR-1915-5p ser hsa-miR-1915-5p, miR-4294 ser hsa-miR-4294, miR-642a-3p ser hsa-miR-642a-3p, miR-371a-5p ser hsa- miR-371a-5p, miR-940 ser hsa-miR-940, miR-4450 ser hsa-miR-4450, miR- 4723-5p ser hsa-miR-4723-5p, miR-1469 ser hsa-miR-1469, miR-6861-5p ser hsa-miR-6861-5p, miR-7975 ser hsa-miR-7975, miR-6879-5p ser hsa-miR- 6879-5p, miR-6802-5p ser hsa-miR-6802-5p, miR-1268b ser hsa-miR-1268b, miR-663b ser hsa-miR-663b, miR-125a-3p ser hsa-miR-125a-3p, miR-2861 ser hsa-miR-2861, miR-6088 ser hsa-miR-6088, miR-4758-5p ser hsa-miR- 4758-5p, miR-296-3p ser hsa-miR-296-3p, miR-6738-5p ser hsa-miR-6738-5p, miR-671-5p ser hsa-miR-671-5p, miR-4454 ser hsa-miR-4454, miR-4516 ser hsa-miR-4516, miR-7845-5p ser hsa-miR-7845-5p, miR-4741 ser hsa-miR- 4741, miR-92b-5p ser hsa-miR-92b-5p, miR-6795-5p ser hsa-miR-6795-5p, miR-6805-3p ser hsa-miR-6805-3p, miR-4725-3p ser hsa-miR-4725-3p, miR- 6782-5p ser hsa-miR-6782-5p, miR-4688 ser hsa-miR-4688, miR-6850-5p ser hsa-miR-6850-5p, miR-6777-5p ser hsa-miR-6777-5p, miR-6785-5p ser hsa- miR-6785-5p, miR-7106-5p ser hsa-miR-7106-5p, miR-3663-3p ser hsa-miR- 3663-3p, miR-6131 ser hsa-miR-6131, miR-1915-3p ser hsa-miR-1915-3p, miR-4532 ser hsa-miR-4532, miR-6820-5p ser hsa-miR-6820-5p, miR-4689 ser hsa-miR-4689, miR-4638-5p ser hsa-miR-4638-5p, miR-3656 ser hsa-miR- 3656, miR-3621 ser hsa-miR-3621, miR-6769b-5p ser hsa-miR-6769b-5p, miR-149-3p ser hsa-miR-149-3p, miR-23b-3p ser hsa-miR-23b-3p, miR-3135b ser hsa-miR-3135b, miR-6848-5p ser hsa-miR-6848-5p, miR-6769a-5p ser hsa-miR-6769a-5p, miR-4327 ser hsa-miR-4327, miR-6765-3p ser hsa-miR- 6765-3p, miR-6716-5p ser hsa-miR-6716-5p, miR-6877-5p ser hsa-miR-6877- 5p, miR-6727-5p ser hsa-miR-6727-5p, miR-4534 ser hsa-miR-4534, miR-614 ser hsa-miR-614, miR-1202 ser hsa-miR-1202, miR-575 ser hsa-miR-575, miR-6870-5p ser hsa-miR-6870-5p, miR-6722-3p ser hsa-miR-6722-3p, miR- 7977 ser hsa-miR-7977, miR-4649-5p ser hsa-miR-4649-5p, miR-4675 ser hsa-miR-4675, miR-6075 ser hsa-miR-6075, miR-6779-5p ser hsa-miR-6779- 5p, miR-4271 ser hsa-miR-4271, miR-3196 ser hsa-miR-3196, miR-6803-5p ser hsa-miR-6803-5p, miR-6789-5p ser hsa-miR-6789-5p, miR-4648 ser hsa- miR-4648, miR-4508 ser hsa-miR-4508, miR-4749-5p ser hsa-miR-4749-5p, miR-4505 ser hsa-miR-4505, miR-5698 ser hsa-miR-5698, miR-1199-5p ser hsa-miR-1199-5p, miR-4763-3p ser hsa-miR-4763-3p, miR-6836-3p ser hsa- miR-6836-3p, miR-3195 ser hsa-miR-3195, miR-718 ser hsa-miR-718, miR- 3178 ser hsa-miR-3178, miR-638 ser hsa-miR-638, miR-4497 ser hsa-miR- 4497, miR-6085 ser hsa-miR-6085, miR-6752-5p ser hsa-miR-6752-5p, miR- 135a-3p ser hsa-miR-135a-3p, miR-1233-5p ser hsa-miR-1233-5p, miR-150- 3p ser hsa-miR-150-3p, miR-1225-3p ser hsa-miR-1225-3p, miR-92a-2-5p ser hsa-miR-92a-2-5p, miR-423-5p ser hsa-miR-423-5p, miR-1268a ser hsa-miR- 1268a, miR-128-2-5p ser hsa-miR-128-2-5p, miR-24-3p ser hsa-miR-24-3p, miR-4697-5p ser hsa-miR-4697-5p, miR-3197 ser hsa-miR-3197, miR-675-5p ser hsa-miR-675-5p, miR-4486 ser hsa-miR-4486, miR-7107-5p ser hsa-miR- 7107-5p, miR-23a-3p ser hsa-miR-23a-3p, miR-4667-5p ser hsa-miR-4667-5p, miR-451a ser hsa-miR-451a, miR-3940-5p ser hsa-miR-3940-5p, miR-8059 ser hsa-miR-8059, miR-6813-5p ser hsa-miR-6813-5p, miR-4492 ser hsa-miR- 4492, miR-4476 ser hsa-miR-4476 e miR-6090 ser hsa-miR-6090.
6. MÉTODO, de acordo com qualquer uma das reivindicações 4 a 5, caracterizado pelo ácido nucleico ser um polinucleotídeo selecionado a partir do grupo consistindo nos seguintes polinucleotídeos de (f) a (o): (f) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NO: 2 a 180 e 606 a 614 ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (g) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOS: 2 a 180 e 606 a 614; (h) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 2 a 180 e 606 a 614 ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (i) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 2 a 180 e 606 a 614, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; (j) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (f) a (i); (k) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (l) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOS: 181 a 194; (m) um polinucleotídeo que consiste em uma sequência nucleotídica complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T, uma variante do mesmo, um derivado do mesmo, ou um fragmento do mesmo compreendendo 15 ou mais nucleotídeos consecutivos; (n) um polinucleotídeo compreendendo uma sequência de nucleotídeos complementar a uma sequência de nucleotídeos representada por qualquer uma das SEQ ID NOs: 181 a 194, ou uma sequência nucleotídica derivada da sequência de nucleotídeos pela substituição de U por T ; e (o) um polinucleotídeo que hibridiza sob condições estringentes com qualquer um dos polinucleotídeos de (k) a (n).
7. MÉTODO, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 6, caracterizado pelo kit ou pelo dispositivo compreender pelo menos dois ou mais ácidos nucleicos capazes de se ligar especificamente a pelo menos dois ou mais polinucleotídeos, respectivamente, selecionados a partir de todos os marcadores de câncer colorretal conforme definido em qualquer uma das reivindicação 1 a 2.
8. MÉTODO, de acordo com qualquer uma das reivindicações de 1 a 7, caracterizado pelo dispositivo ser para a medição baseada na técnica de hibridização.
9. MÉTODO, de acordo com a reivindicação 8, caracterizado pela técnica de hibridização ser uma técnica de arranjo de ácido nucleico (nucleic acid array technique).
10. MÉTODO, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 9, caracterizado pelo sujeito ser um humano.
11. MÉTODO, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 10, caracterizado pela amostra ser sangue, soro ou plasma.
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