WO2024047701A1 - 電気泳動装置とキャピラリアレイ - Google Patents

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capillary
electrophoresis
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周平 山本
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Definitions

  • the present invention relates to an electrophoresis device that separates and analyzes samples such as DNA, and a capillary array that is attached to the electrophoresis device.
  • An electrophoresis device is a device that separates a fluorescently labeled sample by electrophoresis and analyzes the sample by detecting fluorescence induced by irradiation with excitation light. Particularly when analyzing a trace amount of a sample such as DNA, a sample filled with a separation medium in a quartz glass capillary is separated by electrophoresis. Furthermore, in order to simultaneously analyze a plurality of samples, excitation light may be irradiated onto a capillary array in which capillaries are arranged in a planar manner along the arrangement direction.
  • the excitation light is dispersed and reflected due to the difference in refractive index between the two, so the excitation light that passes through the capillary array is attenuated exponentially, and the fluorescence emitted by the sample is also reduced.
  • Patent Document 1 discloses that in order to suppress the attenuation of excitation light transmitted through a capillary array, a liquid or solid whose refractive index is greater than air but not greater than water is placed in the space between the capillaries through which the excitation light passes. Disclosed is an intervening light transmission medium that is .
  • Patent Document 1 does not give sufficient consideration to foreign substances that exist around the area where the excitation light is irradiated.
  • Raman scattered light emitted from the light transmission medium interposed between the capillaries becomes a noise signal with respect to the fluorescence emitted by the sample, increasing the sensitivity limit and making it impossible to detect a small amount of fluorescence from the sample.
  • Fluorescence emitted from floating dust in the atmosphere that is attracted to the charged capillary during electrophoresis also becomes a noise signal.
  • the adhesive used to fix the capillary flows into the excitation light irradiation section, the fluorescence emitted from the adhesive becomes a noise signal.
  • an object of the present invention to provide an electrophoresis device and a capillary array that can reduce noise signals caused by foreign matter around the excitation light irradiation part of the capillary array.
  • the present invention provides a capillary array in which capillaries used for sample electrophoresis are arranged in a planar manner, an excitation light source that irradiates the capillary array with excitation light, and an excitation light source that emits excitation light from the capillary array.
  • An electrophoresis apparatus comprising a fluorescence measurement section for measuring fluorescence, wherein the capillary array has a sealed structure in which the area around the excitation light irradiation section, which is the location where the excitation light is irradiated, is filled with air. do.
  • the present invention also provides a capillary array in which capillaries used for sample electrophoresis are arranged in a plane, an excitation light source that irradiates the capillary array with excitation light, and a fluorescence measurement method that measures fluorescence induced from the capillary array.
  • An electrophoresis apparatus comprising: a substrate on which the capillary array is arranged and fixed with an adhesive; a coating section where the adhesive is applied; and a section where the excitation light is irradiated. A groove is provided between the excitation light irradiation section and the excitation light irradiation section.
  • the present invention provides a capillary array in which capillaries used for electrophoresis of a sample are arranged in a planar shape, and has a sealed structure in which the area around the excitation light irradiation part where the excitation light is irradiated is filled with air. It is characterized by
  • an electrophoresis device and a capillary array that can reduce noise signals caused by foreign matter around the excitation light irradiation section of the capillary array.
  • FIG. 1 is a diagram illustrating an example of the overall configuration of an electrophoresis apparatus of Example 1.
  • FIG. 1 is a diagram showing an example of the overall configuration of a capillary array according to Example 1.
  • FIG. 3 is a diagram showing an example of the configuration of a detection section of Example 1.
  • FIG. 3 is a diagram showing members constituting the detection section of Example 1.
  • FIG. 3 is a diagram showing a cross section of a detection section of Example 1.
  • FIG. 3 is a diagram showing surplus adhesive in the detection section of Example 1.
  • FIG. 3 is a diagram illustrating the influence of noise signals.
  • FIG. 3 is a diagram illustrating an example of the configuration of a detection unit according to a second embodiment.
  • FIG. 7 is a diagram illustrating an example of the configuration of a detection unit in Example 3.
  • FIG. 7 is a diagram showing a cross section of a detection section of Example 3.
  • FIG. 7 is a diagram illustrating an example of the configuration of a detection unit according to a fourth embodiment.
  • FIG. 3 is a diagram illustrating an example of the overall configuration of an electrophoresis apparatus of Example 4.
  • An electrophoresis device is a device that separates a fluorescently labeled sample by electrophoresis and analyzes the sample by detecting fluorescence induced by irradiation with excitation light.
  • the electrophoresis apparatus includes a light source 165, a fluorescence measuring section 167, a capillary array 119, a constant temperature bath 168, a voltage source 169, an anode buffer container 160, a cathode buffer container 155, and a gel block 157. Each part will be explained below.
  • the light source 165 is a device that irradiates the capillary array 119 with excitation light, and is, for example, a laser light source.
  • Excitation light 163 emitted from light source 165 is split into two excitation lights 172 and 173 by half mirror 171.
  • the excitation light beams 172 and 173 have their traveling directions changed by mirrors 174, and then are condensed by a condenser lens 175, and are sent almost coaxially to the excitation light irradiation section 164 of the detection section 101 in the capillary array 119 from above and below. irradiated.
  • the excitation light irradiation section 164 may be irradiated with either one of the excitation lights 172 and 173.
  • the fluorescence measurement unit 167 is a device that measures fluorescence 132 induced in the capillary array 119 by irradiation with excitation lights 172 and 173, and includes, for example, a CCD camera, a diffraction grating, and a lens. Fluorescence measuring section 167 is arranged in a direction perpendicular to the arrangement plane of capillary array 119.
  • the capillary array 119 is an array of capillaries 103 used for electrophoresis of samples such as DNA molecules, and is a consumable item that is replaced as necessary.
  • the configuration of the capillary array 119 will be explained using FIG. 2.
  • the capillary array 119 includes a plurality of capillaries 103, a capillary head 170, a detection section 101, and an electrode holding section 183. Note that the number of capillaries 103 is not limited to eight illustrated in FIG. 2 .
  • the capillary 103 is a capillary tube used for sample electrophoresis, and is, for example, a glass tube with an inner diameter of several tens to several hundred ⁇ m and an outer diameter of several hundred ⁇ m, and the outer surface of which is coated with polyimide of several tens of ⁇ m for reinforcement. It is something that The capillary 103 is filled with a separation medium, which is an electrolyte solution, together with a sample.
  • the separation medium may include a polymer gel, polymer, or the like.
  • the plurality of capillaries 103 are held by a capillary holding part 182 having an annular shape. By holding the capillary 103 in the capillary holding section 182, the capillary array 119 can be easily carried.
  • a separator 181 is provided in the capillary holding part 182 via each of a plurality of separator holding parts 185.
  • the separator 181 has the same number of holes as the capillaries 103 provided at equal intervals, and each of the capillaries 103 is inserted into each hole. By inserting the capillaries 103 into the holes of the separator 181, the distances between the capillaries 103 are maintained at equal intervals, and the temperature of the capillaries 103 can be easily controlled.
  • the electrode holding part 183 holds the cathode 152, which is a hollow metal electrode.
  • the number of cathodes 152 and capillaries 103 are the same, one end of each of the capillaries 103 is passed through each of the cathodes 152, and both are fixed with adhesive or the like.
  • the capillary head 170 is a resin member that binds the other ends of the plurality of capillaries 103 together.
  • the detection unit 101 is a location where excitation lights 172 and 173 from a light source 165 are irradiated, and fluorescence is measured by a fluorescence measurement unit 167.
  • the polyimide on the outer surface of the capillary 103 is removed so that excitation light irradiation and fluorescence measurement are not hindered.
  • a plurality of capillaries 103 are arranged in a plane.
  • the constant temperature bath 168 is a temperature regulator that maintains the capillary array 119 at a predetermined temperature, for example, 60°C.
  • the voltage source 169 is a power source that applies voltage to both ends of the capillary array 119, and has an anode connected to the capillary head 170 side and a cathode connected to the electrode holding part 183 side.
  • the anode side buffer solution container 160 and the cathode side buffer solution container 155 are containers in which buffer solutions 159 and 154 that supply charges during electrophoresis are stored.
  • a side buffer solution container 155 is arranged on the side of the electrode holding part 183.
  • the gel block 157 has a tube inside thereof to which the capillary head 170 is connected.
  • the upper end of the tube of the gel block 157 is connected to a syringe 161, and the lower end of the tube is immersed in the buffer solution 159 in the anode side buffer solution container 160.
  • a separation medium is injected into the capillary 103 by operating a valve 156 and a syringe 161 provided in the middle of the tube.
  • FIG. 3 shows a perspective view in which the members constituting the detection unit 101 are assembled
  • FIG. 4 shows a perspective view in which each member is separated
  • FIG. 5 shows a cross-sectional view of the detection section 101, showing an excitation light irradiation section and a detection section mounting section.
  • the detection unit 101 includes a plurality of capillaries 103, a substrate 102, a fixing plate 104, and a light transmitting plate 106.
  • a plurality of capillaries 103 are arranged on a substrate 102, and a fixing plate 104 and a light transmitting plate 106 are sequentially placed on the plurality of capillaries 103.
  • the substrate 102 and the fixing plate 104 are made of a member that blocks light, and by bonding them together with an adhesive 105, the plurality of capillaries 103 are fixed on the substrate 102.
  • the light transmitting plate 106 is made of a member that transmits light.
  • the substrate 102 has a capillary array surface 111 that serves as a reference plane, and a plurality of capillaries 103 are arranged so as to be in contact with the capillary array surface 111.
  • the fixing plate 104 may have V-shaped positioning grooves 118 formed at equal intervals. By fitting the capillaries 103 into the positioning grooves 118, the capillaries 103 are arranged at desired intervals. Note that when the capillaries 103 are arranged in close contact with each other on the substrate 102, that is, when the diameter of the capillaries 103 and the arrangement interval of the capillaries 103 are the same, the positioning groove 118 does not need to be formed in the fixed plate 104.
  • the covering of the capillary 103 is removed and the quartz tube 115 is exposed.
  • the fixing plate 104 is provided with a fluorescence passage port 112 through which fluorescence 132 from the sample passes. After passing through the fluorescence passage port 112, the fluorescence 132 passes through the light transmitting plate 106 and reaches the fluorescence measuring section 167.
  • a light transmitting member 107 provided in the light transmitting plate 106 is fitted into a recess 109 provided in the substrate 102, and an adhesive or the like is applied to the shaded area shown in FIG. 102.
  • the light transmitting member 107 is a member through which the excitation lights 172 and 173 irradiated onto the quartz tube 115 are transmitted.
  • a sealed structure is formed in which the periphery of the quartz tube 115 of the excitation light irradiation section 164 is filled with air.
  • the adhesive applied to the shaded area shown in FIG. 4 emits fluorescence, which becomes a noise signal, when the scattered light of the excitation lights 172 and 173 that passes through the light transmitting member 107 enters the adhesive. Therefore, by using a non-light transmitting member that does not transmit light as a constituent material of the substrate 102, it is possible to suppress the fluorescence emitted by the adhesive from reaching the excitation light irradiation section 164. Furthermore, by providing the convex light shielding section 113 having a convex shape on the substrate 102, it is possible to further suppress the fluorescence emitted by the adhesive from reaching the excitation light irradiation section 164.
  • a detection unit installation surface 114 having a step of height S with respect to the capillary arrangement surface 111 may be provided at the four corners of the substrate 102.
  • the detection unit installation surface 114 is a surface that comes into contact with the device mating surface 133 of the detection unit fixing mechanism 134 shown in FIG. Note that the detection unit fixing mechanism 134 is provided in the electrophoresis device, and a substrate presser 136 is used when bringing the detection unit installation surface 114 into contact with the device mating surface 133.
  • the diameter of the quartz tube 115, the arrangement interval of the capillaries 103, and the amount of polymer filled inside the capillaries are determined. Since the laser irradiation efficiency to each capillary 103 is determined by the refractive index, by using capillary arrays 119 with different height S values depending on the analysis purpose, it is possible to use multiple analysis applications with one capillary array electrophoresis device. The sample can then be analyzed.
  • the substrate 102 may be provided with an adhesive groove 108.
  • the adhesive used to fix the capillary 103 to the substrate 102 may flow into the excitation light irradiation section 164 due to capillary action, and the adhesive that has flowed into the excitation light irradiation section 164 emits fluorescence that becomes a noise signal. Therefore, an adhesive groove 108 is provided in the substrate 102, which is a groove that prevents the adhesive from flowing into the excitation light irradiation section 164.
  • the adhesive groove 108 is provided, for example, so as to extend in the direction in which the capillaries 103 are arranged.
  • FIG. 6 is a cross-sectional view of the detection unit 101, and the light transmission plate 106 is omitted.
  • the adhesive groove 108 is provided between a location where an adhesive used for fixing the capillary 103 is applied and the excitation light irradiation section 164. Although a part of the adhesive used to fix the capillary 103 becomes surplus adhesive 116 and tries to flow into the excitation light irradiation section 164, it accumulates in the adhesive groove 108, so the surplus adhesive 116 is on the surface near the excitation light. Does not reach 110.
  • the adhesive groove 108 does not need to be formed from end to end of the substrate 102, and may be provided at a location where the adhesive is applied.
  • the adhesive groove 108 is covered by the area of the fixing plate 104 where the fluorescence passage hole 112 is not formed, the adhesive fluorescence 117 emitted from the excess adhesive 116 accumulated in the adhesive groove 108 reaches the fluorescence measuring section 167. do not. That is, by providing the fixing plate 104, which serves as a light shielding portion, between the adhesive groove 108 and the fluorescence measuring section 167, the adhesive fluorescence 117, which serves as a noise signal, is shielded.
  • FIG. 7(a) is an example of a measurement signal when the noise signal cannot be sufficiently reduced
  • FIG. 7(b) is an example of a measurement signal by the detection unit 101 of the first embodiment.
  • the vertical axis in FIG. 7 is the signal intensity measured by the fluorescence measuring section 167
  • the horizontal axis is the electrophoresis time
  • the signal intensity is displayed enlarged in the vertical axis direction.
  • the baseline intensity rises to H as illustrated in FIG.
  • the signal intensity I S of the fluorescence S is buried in the amplitude I N of the noise N and cannot be detected.
  • the baseline intensity decreases to L and the signal intensity of the noise N′ changes as illustrated in FIG.
  • the width I N ' becomes small, and the signal intensity I S ' of the fluorescence S' from the sample can be detected without being buried in the amplitude I N of the noise N'. Note that the fluorescence S from the sample does not depend on the baseline intensity, and the signal intensity I S and the signal intensity I S ' are the same.
  • noise signals caused by foreign objects around the excitation light irradiation section 164 can be reduced.
  • the sensitivity limit is reduced, and even when the fluorescence from the sample is small, it can be detected.
  • Example 1 the case where the excitation light vicinity surface 110 of the substrate 102 is approximately the same height as the capillary array surface 111, and the detection unit installation surface 114 has a step of height S with respect to the capillary array surface 111 was described. .
  • Example 2 a case will be described in which the excitation light vicinity surface 210 of the substrate 202 is formed at a position lower than the capillary array surface 211 by a height T, and the detection unit installation surface 214 is at the same height as the capillary array surface 211. .
  • FIG. 8 is a perspective view showing a state in which a substrate 202, a plurality of capillaries 203, and a fixing plate 204 constituting the detection unit 201 are assembled, and a light transmitting plate 206 is separated.
  • the substrate 202 has a capillary arrangement surface 211, a detection unit installation surface 214, an adhesive groove 208, a recessed portion 209, and a convex light shielding portion 213, as in the first embodiment.
  • the fixing plate 204 includes a fluorescence passage hole 212 and is bonded to the substrate 202 with an adhesive 205, as in the first embodiment.
  • the light transmitting plate 206 includes a light transmitting member 207 as in the first embodiment.
  • the detection unit installation surface 214 is at the same height as the capillary arrangement surface 211, and there is no need to process a step of height S as shown in Example 1. The production becomes easier.
  • the excitation lights 172 and 173 irradiated onto the quartz tube 215 with respect to the excitation light vicinity surface 210, one excitation light follows the path of the other excitation light and returns to the light source 165. It may be possible to prevent this. Although the excitation lights 172 and 173 tilted with respect to the excitation light vicinity surface 210 may be blocked by the substrate 202, the excitation light vicinity surface 210 is formed at a position lower than the capillary arrangement surface 211 by a height T. As a result, the excitation lights 172 and 173 are not blocked by the substrate 202.
  • the convex light shielding portion 113 is provided so that the excitation light 172 and 173 are not blocked by the substrate 102.
  • a slope may be provided at the end.
  • the periphery of the quartz tube 215 of the excitation light irradiation section 164 has a sealed structure filled with air, so as in the first embodiment, noise signals caused by foreign objects around the excitation light irradiation section 164 can be reduced. Sensitivity limit is reduced.
  • Example 1 it has been explained that a plurality of capillaries 103 are fixed by the fixing plate 104 that is adhered to the substrate 102.
  • Example 3 a case will be described in which a plurality of capillaries 303 are fixed by a light transmitting plate 306.
  • FIG. 9 is a perspective view showing a state in which a substrate 302 and a plurality of capillaries 303 constituting a detection unit 301 are assembled and a light transmitting plate 306 is separated. Further, FIG. 10 shows an excitation light irradiation section and a detection section mounting section as a cross-sectional view of the detection section 301. Note that the substrate 302 has a capillary array surface 311, an adhesive groove 308, and a convex light shielding portion 313, as in the first embodiment.
  • a plurality of capillaries 303 arranged on the capillary arrangement surface 311 of the substrate 302 illustrated in FIG. 9 are adhesively fixed by a light transmitting plate 306.
  • a light shielding material 316 is coated on the lower surface of the light transmitting plate 306, that is, the surface in contact with the plurality of capillaries 303, by vapor deposition or the like. However, the region of the fluorescence passage hole 312 is not coated with the light shielding material 316.
  • a positioning guide 317 is provided on the capillary arrangement surface 311 of the substrate 302.
  • the positioning guide 317 is formed, for example, by using a dispenser to apply an adhesive at equal intervals and then curing it.
  • the capillaries 303 are arranged at equal intervals. Therefore, by changing the interval between adhesives applied to the capillary array surface 311, the array interval of the capillaries 303 can be changed.
  • the light transmitting member 307 is provided with a detection unit installation surface 314.
  • the detection unit installation surface 314 contacts the device mating surface 335 of the detection unit fixing mechanism 334, as illustrated in FIG.
  • the detection unit fixing mechanism 334 is provided in the electrophoresis device, and a substrate presser 136 is used when bringing the detection unit installation surface 314 into contact with the device mating surface 335.
  • the area around the quartz tube 315 of the excitation light irradiation section 164 has a sealed structure filled with air, so as in the first embodiment, noise signals caused by foreign objects around the excitation light irradiation section 164 can be reduced. , the sensitivity limit becomes smaller.
  • the detection unit 101 includes the light transmitting plate 106 and the light transmitting member 307 .
  • the light transmitting plate 106 and the light transmitting member 307 which are relatively expensive members, are mounted on the capillary array 119, which is a consumable item, the unit price of the capillary array 119 increases, and the running cost also increases. Therefore, in the fourth embodiment, running costs are suppressed by installing substitutes for the light transmitting plate 306 and the light transmitting member 307 in the electrophoresis apparatus.
  • FIG. 11 is a perspective view showing a state in which a substrate 402, a plurality of capillaries 403, and a fixing plate 404 constituting a detection unit 401 of Example 4 are assembled.
  • FIG. 12 shows a perspective view of the main part of the electrophoresis device to which the detection section 401 is attached.
  • the substrate 402 has a capillary array surface 411, a detection unit installation surface 414, an adhesive groove 408, and a recess 409, as in the first embodiment.
  • the fixing plate 404 includes a fluorescence passage hole 412 and a positioning groove 418, and is bonded to the substrate 402 with an adhesive 405.
  • the electrophoresis apparatus illustrated in FIG. 12 includes a light source 465 and a fluorescence measuring section 467, as in the first embodiment.
  • Excitation light 431 emitted from a light source 465 is split into two excitation lights by a half mirror 471, passes through a plurality of mirrors 474 and a condensing lens 475, and then passes through excitation light exit holes 476 (two locations, upper and lower).
  • the excitation light exit hole 476 is provided in the detection unit fixing mechanism 434 to which the detection unit 401 is attached, and the excitation light exit hole 476 includes an excitation light transmission window 477.
  • the excitation light transmission window 477 fits into the recess 409 of the detection unit 401, and the excitation light transmitted through the excitation light transmission window 477 is irradiated onto the excitation light irradiation unit 464. Ru. That is, the excitation light transmission window 477 becomes a substitute for the light transmission member 307.
  • Fluorescence 432 emitted from the excitation light irradiation unit 464 by irradiation with excitation light is measured by the fluorescence measurement unit 467 after passing through a fluorescence transmission window 478 provided in the fluorescence entrance hole 479. That is, the fluorescent light transmitting window 478 becomes a substitute for the light transmitting plate 306.
  • the fluorescence measuring section 467 includes a fluorescence condensing lens 481, a transmission type diffraction grating 482, an imaging lens 483, and a two-dimensional CCD 484.
  • the light transmitting plate 106 and the light transmitting member 307 which are relatively expensive members, do not need to be mounted on the capillary array 119, which is a consumable item, so running costs can be suppressed.
  • the area around the quartz tube 415 of the excitation light irradiation section 164 has a sealed structure filled with air, so as in the first embodiment, noise signals caused by foreign objects around the excitation light irradiation section 164 can be reduced. , the sensitivity limit becomes smaller.
  • Electrode holding part 185... Separator holding part, 316... Light shielding material, 320... Light transmitting member mating surface, 476... Excitation light exit hole, 477... Excitation light transmission window, 478... Fluorescence transmission window, 479... Fluorescence Entrance hole, 481... Fluorescence condensing lens, 482... Transmission type diffraction grating, 483... Imaging lens, 484... Two-dimensional CCD.

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Abstract

キャピラリアレイの励起光照射部の周辺異物によるノイズ信号を低減可能な電気泳動装置を提供するために、試料の電気泳動に用いられるキャピラリが平面状に配列されるキャピラリアレイと、前記キャピラリアレイに励起光を照射する励起光源と、前記キャピラリアレイから誘起される蛍光を測定する蛍光測定部を備える電気泳動装置であって、前記キャピラリアレイは、前記励起光が照射される箇所である励起光照射部の周辺が空気で満たされる密閉構造を有することを特徴とする。

Description

電気泳動装置とキャピラリアレイ
　本発明は、ＤＮＡ等の試料を分離して分析する電気泳動装置と電気泳動装置に取り付けられるキャピラリアレイに関する。
　電気泳動装置は、蛍光標識された試料を電気泳動によって分離し、励起光を照射することで誘起される蛍光を検出することによって試料を分析する装置である。特にＤＮＡのような微量な試料を分析する場合、石英ガラス製のキャピラリの中に分離媒体とともに充填された試料が電気泳動によって分離される。また複数の試料を同時に分析するために、キャピラリが平面状に配列されたキャピラリアレイに対し、配列方向に沿って励起光を照射することがある。ただしキャピラリと空気との境界面では、両者の屈折率の差異による励起光の分散と反射が生じるため、キャピラリアレイを透過する励起光は指数的に減衰し、試料が発する蛍光も低下する。
　特許文献１には、キャピラリアレイを透過する励起光の減衰を抑制するために、キャピラリの間であって励起光が通過する空間に、屈折率が空気よりも大きく水よりも大きくない液体又は固体である光伝達媒体を介在させることが開示される。
特開２０１０－９６７７８号公報
　しかしながら特許文献１には、励起光が照射される箇所の周辺に存在する異物に対する配慮が不十分である。キャピラリの間に介在させられる光伝達媒体から発せられるラマン散乱光は、試料が発する蛍光に対しノイズ信号となるため、感度限界が大きくなり、試料からのわずかな蛍光を検出できなくなる。また電気泳動中に帯電するキャピラリに引き寄せられる大気中の浮遊塵から発せられる蛍光もノイズ信号となる。さらにキャピラリの固定に用いられる接着剤が励起光照射部に流れ込んだ場合、接着剤から発せられる蛍光がノイズ信号となる。
　そこで本発明は、キャピラリアレイの励起光照射部の周辺異物によるノイズ信号を低減可能な電気泳動装置及びキャピラリアレイを提供することを目的とする。
　上記目的を達成するために本発明は、試料の電気泳動に用いられるキャピラリが平面状に配列されるキャピラリアレイと、前記キャピラリアレイに励起光を照射する励起光源と、前記キャピラリアレイから誘起される蛍光を測定する蛍光測定部を備える電気泳動装置であって、前記キャピラリアレイは、前記励起光が照射される箇所である励起光照射部の周辺が空気で満たされる密閉構造を有することを特徴とする。
　また本発明は、試料の電気泳動に用いられるキャピラリが平面状に配列されるキャピラリアレイと、前記キャピラリアレイに励起光を照射する励起光源と、前記キャピラリアレイから誘起される蛍光を測定する蛍光測定部を備える電気泳動装置であって、前記キャピラリアレイが配列され、接着剤によって固定される基板には、前記接着剤が塗布される箇所である塗布部と前記励起光が照射される箇所である励起光照射部との間に溝が設けられることを特徴とする。
　また本発明は、試料の電気泳動に用いられるキャピラリが平面状に配列されるキャピラリアレイであって、励起光が照射される箇所である励起光照射部の周辺が空気で満たされる密閉構造を有することを特徴とする。
　本発明によれば、キャピラリアレイの励起光照射部の周辺異物によるノイズ信号を低減可能な電気泳動装置及びキャピラリアレイを提供することができる。
実施例１の電気泳動装置の全体構成の一例を示す図。 実施例１のキャピラリアレイの全体構成の一例を示す図。 実施例１の検出部の構成の一例を示す図。 実施例１の検出部を構成する部材を示す図。 実施例１の検出部の断面を示す図。 実施例１の検出部における余剰接着剤を示す図。 ノイズ信号の影響について説明する図。 実施例２の検出部の構成の一例を示す図。 実施例３の検出部の構成の一例を示す図。 実施例３の検出部の断面を示す図。 実施例４の検出部の構成の一例を示す図。 実施例４の電気泳動装置の全体構成の一例を示す図。
　以下、添付図面に従って本発明に電気泳動装置の好ましい実施例について説明する。電気泳動装置は、蛍光標識された試料を電気泳動によって分離し、励起光を照射することで誘起される蛍光を検出することによって試料を分析する装置である。
　図１を用いて、実施例１の電気泳動装置の全体構成の一例を説明する。電気泳動装置は、光源１６５、蛍光測定部１６７、キャピラリアレイ１１９、恒温槽１６８、電圧源１６９、陽極側緩衝液容器１６０、陰極側緩衝液容器１５５、ゲルブロック１５７を備える。以下、各部について説明する。
　光源１６５は、キャピラリアレイ１１９に励起光を照射する装置であり、例えばレーザ光源である。光源１６５から発せられた励起光１６３は、ハーフミラー１７１によって２つの励起光１７２，１７３に分割される。励起光１７２，１７３は、それぞれミラー１７４によって進行方向が変更されたのち、集光レンズ１７５によって集光され、キャピラリアレイ１１９の中の検出部１０１の励起光照射部１６４に上下両側からほぼ同軸で照射される。なお励起光照射部１６４への照射は励起光１７２，１７３のいずれか一方であっても良い。
　蛍光測定部１６７は、励起光１７２，１７３の照射によってキャピラリアレイ１１９において誘起される蛍光１３２を測定する装置であり、例えばＣＣＤカメラや回折格子、レンズを有する。蛍光測定部１６７は、キャピラリアレイ１１９の配列面と直交する方向に配置される。
　キャピラリアレイ１１９は、ＤＮＡ分子等の試料の電気泳動に用いられるキャピラリ１０３が配列されたものであり、必要に応じて交換される消耗品である。図２を用いて、キャピラリアレイ１１９の構成について説明する。キャピラリアレイ１１９は、複数のキャピラリ１０３と、キャピラリヘッド１７０、検出部１０１、電極保持部１８３を有する。なおキャピラリ１０３の本数は図２に例示される８本に限定されない。
　キャピラリ１０３は、試料の電気泳動に用いられる毛細管であり、例えば内径が数十～数百μｍ、外径が数百μｍのガラス管の外表面に数十μｍのポリイミドが補強のためにコーティングされたものである。キャピラリ１０３には、電解質溶液である分離媒体が試料とともに充填される。分離媒体には高分子ゲルやポリマ等が含まれても良い。
　複数のキャピラリ１０３は、円環形状を有するキャピラリ保持部１８２によって保持される。キャピラリ１０３がキャピラリ保持部１８２に保持されることにより、キャピラリアレイ１１９の持ち運びが容易になる。キャピラリ保持部１８２には、複数のセパレータ保持部１８５のそれぞれを介してセパレータ１８１が設けられる。セパレータ１８１にはキャピラリ１０３の本数と同数の穴が等間隔に設けられ、キャピラリ１０３のそれぞれは各穴に挿入される。キャピラリ１０３がセパレータ１８１の孔に挿入されることにより、キャピラリ１０３の間の距離が等間隔に保たれ、キャピラリ１０３の温度管理が容易になる。
　電極保持部１８３は、金属製の中空電極である陰極１５２を保持する。陰極１５２とキャピラリ１０３とは同数であり、陰極１５２のそれぞれにキャピラリ１０３のそれぞれの一端が貫通させられ、両者は接着剤などで固定される。キャピラリヘッド１７０は、複数のキャピラリ１０３の他端を束ねる樹脂製の部材である。
　検出部１０１は、光源１６５からの励起光１７２，１７３が照射されるとともに、蛍光測定部１６７によって蛍光が測定される箇所である。検出部１０１では、励起光の照射と蛍光の測定とが阻害されないように、キャピラリ１０３の外表面のポリイミドが除去される。また検出部１０１では複数のキャピラリ１０３が平面状に配列される。
　図１の説明に戻る。恒温槽１６８は、キャピラリアレイ１１９を所定の温度、例えば６０℃に保つ温度調整器である。
　電圧源１６９は、キャピラリアレイ１１９の両端に電圧を印加する電源であり、キャピラリヘッド１７０の側に陽極が、電極保持部１８３の側に陰極が接続される。陽極側緩衝液容器１６０及び陰極側緩衝液容器１５５は、電気泳動時に電荷を供給する緩衝液１５９、１５４が収容される容器であり、陽極側緩衝液容器１６０がキャピラリヘッド１７０の側に、陰極側緩衝液容器１５５が電極保持部１８３の側に配置される。
　ゲルブロック１５７は、キャピラリヘッド１７０が接続される管を内部に備える。ゲルブロック１５７の管の上端はシリンジ１６１に接続され、管の下端は陽極側緩衝液容器１６０の中の緩衝液１５９に浸される。管の途中に設けられるバルブ１５６とシリンジ１６１を操作することによって、キャピラリ１０３に分離媒体が注入される。
　図３、図４、図５を用いて、実施例１の検出部１０１について説明する。なお図３には検出部１０１を構成する部材が組付けられた状態が斜視図で示され、図４には各部材が分離された状態が斜視図で示される。また図５には検出部１０１の断面図として、励起光照射部と検出部取付部が示される。
　検出部１０１は、複数のキャピラリ１０３と、基板１０２、固定板１０４、光透過板１０６を有する。基板１０２の上に複数のキャピラリ１０３が配列され、複数のキャピラリ１０３の上に固定板１０４と光透過板１０６が順に被せられる。なお基板１０２と固定板１０４は光を遮る部材で構成され、両者が接着剤１０５によって接着されることにより複数のキャピラリ１０３が基板１０２の上に固定される。また光透過板１０６は光を透過する部材で構成される。
　基板１０２は、基準平面となるキャピラリ配列面１１１を有し、複数のキャピラリ１０３がキャピラリ配列面１１１の上に接触するように配列される。固定板１０４には、Ｖ形状などの位置決め溝１１８が等間隔で形成されていても良い。位置決め溝１１８にキャピラリ１０３が嵌ることによって、キャピラリ１０３は所望の間隔で配列される。なお、キャピラリ１０３同士を密接させて基板１０２に配列する場合、すなわちキャピラリ１０３の直径とキャピラリ１０３の配列間隔が同じである場合、固定板１０４には位置決め溝１１８が形成されなくても良い。
　励起光１７２，１７３が照射される箇所である励起光照射部１６４では、キャピラリ１０３の被覆が除去され、石英管１１５が露出させられる。固定板１０４には、試料からの蛍光１３２が通過する蛍光通過口１１２が設けられる。蛍光１３２は蛍光通過口１１２を通過した後、光透過板１０６を透過して蛍光測定部１６７に達する。
　基板１０２に設けられる凹部１０９には、光透過板１０６に備えられる光透過部材１０７が嵌合し、図４に示される斜線部に接着剤等が塗布されることで、光透過板１０６が基板１０２に組付けられる。光透過部材１０７は、石英管１１５に照射される励起光１７２,１７３が透過する部材である。凹部１０９に光透過部材１０７が嵌合し、光透過板１０６が基板１０２に組付けられることにより、励起光照射部１６４の石英管１１５の周辺が空気で満たされる密閉構造となる。励起光照射部１６４の石英管１１５の周辺が空気で満たされることにより、ラマン散乱光を発する異物を励起光照射部１６４に存在させずに済むのでノイズ信号を抑制できる。また石英管１１５の周辺が密閉構造となることにより、大気中の浮遊塵等を石英管１１５に付着させずに済むのでノイズ信号を抑制できる。
　なお図４に示される斜線部に塗布される接着剤は、光透過部材１０７を透過する励起光１７２,１７３の散乱光が入射することによって、ノイズ信号となる蛍光を発する。そこで基板１０２の構成材として、光を透過させない非光透過部材を用いることにより、接着剤が発する蛍光が励起光照射部１６４に達することを抑制できる。さらに凸形状を有する凸部遮光部１１３を基板１０２に設けることにより、接着剤が発する蛍光が励起光照射部１６４に達することをより抑制できる。
　また基板１０２の四隅には、キャピラリ配列面１１１に対して高さＳの段差を有する検出部設置面１１４が設けられても良い。検出部設置面１１４は、図５に示される検出部固定機構１３４の装置合わせ面１３３に接触する面である。なお検出部固定機構１３４は電気泳動装置に備えられ、検出部設置面１１４を装置合わせ面１３３に接触させるときには基板押さえ１３６が用いられる。キャピラリが平面状に配列されたキャピラリアレイに対し、配列方向に沿って励起光を照射するマルチフォーカス方式では、石英管１１５の直径と、キャピラリ１０３の配列間隔と、キャピラリ内部に充填されるポリマの屈折率により、各キャピラリ１０３へのレーザ照射効率が決まるため、分析用途によって、高さＳの値が異なるキャピラリアレイ１１９を使い分けることにより、１台のキャピラリアレイ電気泳動装置で複数の分析アプリケーションを用いて、試料を分析することができる。
　さらに基板１０２には、接着剤溝１０８が設けられても良い。キャピラリ１０３を基板１０２に固定するために使用される接着剤は、毛細管現象により励起光照射部１６４に流れ込む場合があり、励起光照射部１６４に流れ込んだ接着剤はノイズ信号となる蛍光を発する。そこで基板１０２に、励起光照射部１６４への接着剤の流れ込みを防止する溝である接着剤溝１０８を設ける。接着剤溝１０８は、例えばキャピラリ１０３が配列される方向に延在するように設けられる。
　図６を用いて、接着剤溝１０８についてさらに説明する。なお図６は検出部１０１の断面図であり、光透過板１０６は省略される。接着剤溝１０８は、キャピラリ１０３の固定に用いられる接着剤が塗布される箇所と励起光照射部１６４との間に設けられる。キャピラリ１０３の固定に用いられる接着剤の一部は余剰接着剤１１６となって励起光照射部１６４へ流れ込もうとするものの、接着剤溝１０８に溜まるため、余剰接着剤１１６は励起光近傍面１１０に達しない。なお接着剤溝１０８は、基板１０２の端から端までに形成されなくても良く、接着剤が塗布される箇所に設けられれば良い。
　また接着剤溝１０８は、固定板１０４の蛍光通過口１１２が形成されていない領域で覆われるため、接着剤溝１０８に溜まる余剰接着剤１１６から発せられる接着剤蛍光１１７は蛍光測定部１６７に達しない。すなわち、接着剤溝１０８と蛍光測定部１６７との間に、光を遮る遮光部となる固定板１０４が設けられることにより、ノイズ信号となる接着剤蛍光１１７が遮光される。
　図７を用いて、実施例1の効果について説明する。図７の（ａ）はノイズ信号を十分に低減できなかったときの測定信号の例であり、図７の（ｂ）は実施例１の検出部１０１による測定信号の例である。なお図７の縦軸は蛍光測定部１６７によって測定される信号強度、横軸は泳動時間であり、信号強度は縦軸方向に拡大表示される。
　ノイズ信号を十分に低減できなかった場合、図７の（ａ）に例示されるように、ベースライン強度がＨにまで上がるとともにノイズＮの信号強度の振れ幅ＩＮが大きくなり、試料からの蛍光Ｓの信号強度ＩＳがノイズＮの振れ幅ＩＮの中に埋もれてしまい検出できない。
　これに対して実施例１の検出部１０１によりノイズ信号を低減できた場合、図７の（ｂ）に例示されるように、ベースライン強度がＬにまで下がるとともにノイズＮ´の信号強度の振れ幅ＩＮ´が小さくなり、試料からの蛍光Ｓ´の信号強度ＩＳ´がノイズＮ´の振れ幅ＩＮの中に埋もれることなく検出できる。なお試料からの蛍光Ｓはベースライン強度に依存せず、信号強度ＩＳと信号強度ＩＳ´は同じである。
　従って、実施例１によれば、励起光照射部１６４の周辺異物によるノイズ信号を低減できる。その結果、感度限界が小さくなり、試料からの蛍光が小さい場合であっても検出することができる。
　実施例１では、基板１０２の励起光近傍面１１０がキャピラリ配列面１１１と略同じ高さであり、検出部設置面１１４がキャピラリ配列面１１１に対して高さＳの段差を有する場合について説明した。実施例２では、基板２０２の励起光近傍面２１０がキャピラリ配列面２１１から高さＴだけ下がった位置に形成され、検出部設置面２１４がキャピラリ配列面２１１と同じ高さである場合について説明する。
　図８を用いて、実施例２の検出部２０１について説明する。図８には検出部２０１を構成する基板２０２と複数のキャピラリ２０３、固定板２０４が組付けられ、光透過板２０６が分離された状態が斜視図で示される。なお基板２０２は、実施例1と同様に、キャピラリ配列面２１１、検出部設置面２１４、接着剤溝２０８、凹部２０９、凸部遮光部２１３を有する。また固定板２０４は、実施例1と同様に、蛍光通過口２１２を備え、接着剤２０５によって基板２０２に接着される。さらに光透過板２０６は、実施例1と同様に、光透過部材２０７を備える。
　図８に例示される基板２０２では、検出部設置面２１４がキャピラリ配列面２１１と同じ高さであり、実施例1に示したような高さＳの段差の加工は不要となるため、基板２０２の製作が容易になる。
　またマルチフォーカス方式では、石英管２１５に照射される励起光１７２，１７３を励起光近傍面２１０に対して傾斜させることにより、一方の励起光が他方の励起光の経路をたどって光源１６５に戻ることを防ぐ場合がある。励起光近傍面２１０に対して傾斜させられた励起光１７２，１７３は基板２０２によって遮られる場合があるが、励起光近傍面２１０がキャピラリ配列面２１１から高さＴだけ下がった位置に形成されることにより、励起光１７２，１７３は基板２０２によって遮られずに済む。
　なお実施例１のように励起光近傍面１１０がキャピラリ配列面１１１と略同じ高さである場合であっても、励起光１７２，１７３が基板１０２によって遮られないように、凸部遮光部１１３の端部に斜面が設けられても良い。
　実施例２においても、励起光照射部１６４の石英管２１５の周辺が空気で満たされる密閉構造となるので、実施例1と同様に、励起光照射部１６４の周辺異物によるノイズ信号を低減でき、感度限界が小さくなる。
　実施例１では、基板１０２に接着される固定板１０４により複数のキャピラリ１０３が固定されることについて説明した。実施例３では、光透過板３０６により複数のキャピラリ３０３が固定されることについて説明する。
　図９及び図１０を用いて、実施例３の検出部３０１について説明する。図９には検出部３０１を構成する基板３０２と複数のキャピラリ３０３が組付けられ、光透過板３０６が分離された状態が斜視図で示される。また図１０には検出部３０１の断面図として、励起光照射部と検出部取付部が示される。なお基板３０２は、実施例1と同様に、キャピラリ配列面３１１、接着剤溝３０８、凸部遮光部３１３を有する。
　図９に例示される基板３０２のキャピラリ配列面３１１の上に配列される複数のキャピラリ３０３は、光透過板３０６により接着固定される。光透過板３０６の下面、すなわち複数のキャピラリ３０３が接触する面には遮光材３１６が蒸着等によってコーティングされる。ただし、蛍光通過口３１２の領域には、遮光材３１６はコーティングされない。
　基板３０２のキャピラリ配列面３１１には、位置決めガイド３１７が備えられる。位置決めガイド３１７は、例えばディスペンサを用いて等間隔に塗布された接着剤を硬化させることにより形成される。等間隔に形成された位置決めガイド３１７の間にキャピラリ３０３が配置されることにより、キャピラリ３０３は等間隔に配列される。従って、キャピラリ配列面３１１に塗布される接着剤の間隔を変更することにより、キャピラリ３０３の配列間隔を変更することができる。
　実施例３では、光透過部材３０７に検出部設置面３１４が備えられる。検出部設置面３１４は、図１０に例示されるように、検出部固定機構３３４の装置合わせ面３３５に接触する。なお検出部固定機構３３４は電気泳動装置に備えられ、検出部設置面３１４を装置合わせ面３３５に接触させるときには基板押さえ１３６が用いられる。
　なお実施例３においても、励起光照射部１６４の石英管３１５の周辺が空気で満たされる密閉構造となるので、実施例1と同様に、励起光照射部１６４の周辺異物によるノイズ信号を低減でき、感度限界が小さくなる。
　実施例１では、検出部１０１が光透過板１０６と光透過部材３０７を有する場合について説明した。比較的高価な部材である光透過板１０６と光透過部材３０７が、消耗品であるキャピラリアレイ１１９に搭載されると、キャピラリアレイ１１９の単価が上がり、ランニングコストも上がる。そこで実施例４では、光透過板３０６と光透過部材３０７の代替品を電気泳動装置に搭載することにより、ランニングコストを抑制する。
　図１１及び図１２を用いて、実施例４について説明する。図１１には実施例４の検出部４０１を構成する基板４０２と複数のキャピラリ４０３、固定板４０４が組付けられた状態が斜視図で示される。図１２には検出部４０１が取り付けられる電気泳動装置の要部が斜視図で示される。なお基板４０２は、実施例1と同様に、キャピラリ配列面４１１、検出部設置面４１４、接着剤溝４０８、凹部４０９を有する。また固定板４０４は、実施例1と同様に、蛍光通過口４１２と位置決め溝４１８を備え、接着剤４０５によって基板４０２に接着される。
　図１２に例示される電気泳動装置は、実施例1と同様に、光源４６５、蛍光測定部４６７を備える。光源４６５から発せられた励起光４３１は、ハーフミラー４７１によって２つの励起光に分割され、複数のミラー４７４と集光レンズ４７５を介した後、励起光出口穴４７６（上下２箇所）を通る。励起光出口穴４７６は、検出部４０１が取り付けられる検出部固定機構４３４に設けられ、励起光出口穴４７６は励起光透過窓４７７を備える。検出部固定機構４３４に検出部４０１が取り付けられるとき、励起光透過窓４７７は検出部４０１の凹部４０９に嵌合し、励起光透過窓４７７を透過する励起光が励起光照射部４６４に照射される。すなわち励起光透過窓４７７が光透過部材３０７の代替品となる。
　励起光の照射により励起光照射部４６４から発せられる蛍光４３２は、蛍光入口穴４７９に設けられる蛍光透過窓４７８を透過した後、蛍光測定部４６７によって測定される。すなわち蛍光透過窓４７８が光透過板３０６の代替品となる。なお蛍光測定部４６７は、蛍光集光レンズ４８１、透過型回折格子４８２、結像レンズ４８３、２次元ＣＣＤ４８４を有する。
　実施例４によれば、比較的高価な部材である光透過板１０６と光透過部材３０７が、消耗品であるキャピラリアレイ１１９に搭載されずに済むので、ランニングコストを抑制できる。なお実施例４においても、励起光照射部１６４の石英管４１５の周辺が空気で満たされる密閉構造となるので、実施例1と同様に、励起光照射部１６４の周辺異物によるノイズ信号を低減でき、感度限界が小さくなる。
　以上、本発明の実施例について説明した。本発明は上記実施例に限定されるものではなく、発明の要旨を逸脱しない範囲で構成要素を変形しても良い。また、上記実施例に開示されている複数の構成要素を適宜組み合わせても良い。さらに、上記実施例に示される全構成要素からいくつかの構成要素を削除しても良い。
１０１，２０１，３０１，４０１…検出部、１０２，２０２，３０２，４０２…基板、１０３，２０３，３０３，４０３…キャピラリ、１０４，２０４，４０４…固定板、１０５，２０５，４０５…接着剤、１０６，２０６，３０６…光透過板、１０７，２０７，３０７…光透過部材、１０８，２０８，３０８，４０８…接着剤溝、１０９，２０９，４０９…凹部、１１０，２１０，３１０，４１０…励起光近傍面、１１１，２１１，３１１，４１１…キャピラリ配列面、１１２，２１２，３１２，４１２…蛍光通過口、１１３，２１３，３１３…凸部遮光部、１１４，２１４，３１４，４１４…検出部設置面、１１５，２１５，３１５，４１５…石英管、１１６…余剰接着剤、１１７…接着剤蛍光、１１８，４１８…位置決め溝、１１９…キャピラリアレイ、１６３，１７２，１７３，３３１，４３１…励起光、１３２，３３２，４３２…蛍光、１３３，３３５…装置合わせ面、１３４，３３４，４３４…検出部固定機構、１３６，３３６…基板押さえ、１５２…陰極、１５３…試料導入部、１５４，１５９…緩衝液、１５５…陰極側緩衝液容器、１５６…バルブ、１５７…ゲルブロック、１５８…アース電極、１６０…陽極側緩衝液容器、１６１…シリンジ、１６４，４６４…励起光照射部、１６５，４６５…光源、１６７，４６７…蛍光測定部、１６８…恒温槽、１６９…電圧源、１７０…キャピラリヘッド、１７１，４７１…ハーフミラー、１７４，４７４…ミラー、１７５，４７５…集光レンズ、１８１…セパレータ、１８２…キャピラリ保持部、１８３…電極保持部、１８５…セパレータ保持部、３１６…遮光材、３２０…光透過部材合わせ面、４７６…励起光出口穴、４７７…励起光透過窓、４７８…蛍光透過窓、４７９…蛍光入口穴、４８１…蛍光集光レンズ、４８２…透過型回折格子、４８３…結像レンズ、４８４…２次元ＣＣＤ。

Claims (6)

  1. 　試料の電気泳動に用いられるキャピラリが平面状に配列されるキャピラリアレイと、
    　前記キャピラリアレイに励起光を照射する励起光源と、
    　前記キャピラリアレイから誘起される蛍光を測定する蛍光測定部を備える電気泳動装置であって、
    　前記キャピラリアレイは、前記励起光が照射される箇所である励起光照射部の周辺が空気で満たされる密閉構造を有することを特徴とする電気泳動装置。
  2. 　請求項１に記載の電気泳動装置であって、
    　前記キャピラリアレイが配列され、接着剤によって固定される基板には、前記接着剤が塗布される箇所である塗布部と前記励起光照射部との間に溝が設けられることを特徴とする
    ことを特徴とする電気泳動装置。
  3. 　請求項２に記載の電気泳動装置であって、
    　前記溝と前記蛍光測定部との間には、光を遮る遮光部が設けられることを特徴とする電気泳動装置。
  4. 　請求項２に記載の電気泳動装置であって、
    　前記基板は光を透過させない非光透過部材で構成されることを特徴とする電気泳動装置。
  5. 　試料の電気泳動に用いられるキャピラリが平面状に配列されるキャピラリアレイと、
    　前記キャピラリアレイに励起光を照射する励起光源と、
    　前記キャピラリアレイから誘起される蛍光を測定する蛍光測定部を備える電気泳動装置であって、
    　前記キャピラリアレイが配列され、接着剤によって固定される基板には、前記接着剤が塗布される箇所である塗布部と前記励起光が照射される箇所である励起光照射部との間に溝が設けられることを特徴とする電気泳動装置。
  6. 　試料の電気泳動に用いられるキャピラリが平面状に配列されるキャピラリアレイであって、
    　励起光が照射される箇所である励起光照射部の周辺が空気で満たされる密閉構造を有することを特徴とするキャピラリアレイ。
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