WO2021093720A1 - 吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈化合物及其在医药上的用途 - Google Patents
吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈化合物及其在医药上的用途 Download PDFInfo
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Abstract
本发明提供了一种式(I)所示的化合物或其药学上可接受的盐、及其制备方法,以及它们作为治疗剂,特别是作为选择性转染期间重排(RET)激酶抑制剂的用途,其中式(I)中的各取代基的定义与说明书中的定义相同。
Description
本发明涉及医药技术领域,尤其是一种新的吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈化合物、其制备方法以及含有该衍生物的药物组合物以及其作为治疗剂特别是作为选择性转染期间重排(RET)激酶抑制剂的用途。
RET是属于络氨酸激酶超家族的单次跨膜受体,是数种组织和细胞的正常发育、成熟和维持所需,和其他受体络氨酸激酶不同,RET与胶质细胞衍生的神经营养因子(GDNF)家族受体-α(GFRα)通过糖基磷脂肌醇键连接到细胞表面。胶质细胞衍生的神经营养因子家族配体(GFL)和胶质细胞衍生的神经营养因子(GDNF)家族受体-α(GFRα)家族成员形成二元复合物,复合物再与RET结合并将其募集到脂筏的富含胆固醇的膜压结构域。在其中产生RET信号传导。
RET基因的异常表达与多种癌症疾病相关。该基因通过染色体重排与其他基因发生融合或者是通过定点的变异,可以不依赖配体而处于持续激活状态,导致信号通路异常,从而导致细胞的过度增殖和癌症的产生。
近年来,越来越多证据显示,RET基因融合和突变是某些癌症诱发的驱动力,并且与其他驱动基因并不重合,具有显著的特异性。RET基因融合多见于乳头状甲状腺癌和非小细胞肺癌,如30%散发的乳头状甲状腺癌和70%辐射诱导的乳头状甲状腺癌以及约2%的非小细胞肺癌是由RET的融合驱动。RET基因突变多见于甲状腺髓样癌,如超过50%的甲状腺髓样癌以及近乎所有的先天性髓样癌和多发性内分泌腺瘤病是由RET基因的定点突变造成。
目前的治疗手段主要采取具有RET抑制活性的多靶点激酶抑制剂来治疗RET融合或突变的癌症病人。但是在此条件下,由于脱靶效应和药物毒性,药物的剂量不足以达到足够抑制异常RET基因表达的水平。此外,在治疗癌症的过程中,癌细胞会通过变异产生耐药性。而一旦耐药性产生,病人的治疗选择将会变得非常的有限。因此,目前非常需要一种选择性的RET抑制剂来治疗RET基因融合或突变的病人。
市场上还未有选择性地针对于RET靶点的药物,而采用多靶点激酶抑制剂可以对RET阳性的患者起到治疗作用。目前已经公开了一系列的选择性RET激酶抑制剂专利,其中包括WO2016127074、WO2017079140、WO2017011776、WO2017161269、 WO2018022761、WO2018136661、WO2018136663等,目前处于临床I期的药物包括Blu-667、Loxo-292、GSK-3352589等。但这些对于抗肿瘤研究是远远不够的,仍有必要研究和开发新的选择性转染期间重排(RET)激酶抑制剂,来解决未满足的医疗需求。
发明内容
为了克服现有技术的不足之处,本发明提供了一种式(I)所示的化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐:
其中:
X
1、X
2各自独立地选自CH或N;
L选自:
其中L的两端点任选与A和R
2相连接;
A选自4~6元单环杂环基、-NH-4~6元杂环基、7~11元桥杂环基、7~11元螺杂环基或7~11元稠环杂环基,其中所述的单环杂环基、-NH-4~6元杂环基、桥杂环基、螺杂环基或稠环杂环基任选进一步被一个或多个选自C
1-C
3烷基、羟基烷基、卤代C
1-C
3烷基、羟基、C
3-C
6环烷基或=O的取代基所取代;
R
1选自:C
3-C
6环烷基、3~6元杂环基、6~7元杂芳基或7~11元的稠杂环基,其中所述的环烷基、杂环基任选进一步被一个或多个选自羟基、羟基烷基、氨基、C
1-C
3烷基、C
1-C
3烷氧基、卤代C
1-C
3烷基、卤代C
1-C
3烷氧基的取代基所取代;所 述的杂芳基、稠杂环基任选进一步被一个多个选自卤素、羟基、氨基、C
1-C
3烷基、C
1-C
3烷氧基、卤代C
1-C
3烷基、卤代C
1-C
3烷氧基、C
3-C
6环烷基、-NHR
3、-NR
3R
4或=O的取代基所取代;
R
2选自C
1-C
6烷基、C
3-C
6环烷基、3~6元杂环基、芳基或杂芳基,其中所述的烷基、环烷基、杂环基、芳基或杂芳基任选进一步被一个或多个选自卤素、羟基、氰基、C
1-C
3烷基、C
1-C
3烷氧基、卤代C
1-C
3烷基、卤代C
1-C
3烷氧基、C
3-C
6环烷基、-NHR
3、-NR
3R
4或=O的取代基所取代;
R
3、R
4各自独立地选自C
1-C
6烷基;
其中上述所述的卤代C
1-C
3烷基或卤代C
1-C
3烷氧基优选为1~3个氟代的C
1-C
3烷基或C
1-C
3烷氧基。
在本发明的一些优选方案中,式(I)所述的化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,其为式(II)所示的化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐:
其中:A、L、R
1和R
2的定义如式(I)中所述。
在本发明的一些优选方案中,式(I)或(II)所述的化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,其中A选自:
其中:1端点、2端点任选与L相连。
在本发明的一些优选方案中,式(I)或(II)所述的化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,其中R
1选自:
在本发明的一些优选方案中,式(I)或(II)所述的化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,其中R
2选自C
1-C
6烷基、C
4-C
6环烷基、4~6元杂环基、苯基、5~6元杂芳基或10元杂芳基,其中所述的C
4-C
6环烷基、4~6元杂环基、苯基、5~6元杂芳基或10元杂芳基任选进一步被一个或多个选自氰基、卤素、羟基、C
1-C
3烷基、C
1-C
3烷氧基、卤代C
1-C
3烷基、卤代C
1-C
3烷氧基或=O的取代基所取代。
在本发明的一些优选方案中,式(I)或(II)所述的化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,其中R
2选自:
本发明的优选方案,提供了式(I)所述的化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,其中所述的化合物选自:
或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐。
进一步,本发明提供了式(I)化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐的方法,所述方法包括:
方法1:
化合物(IA)和化合物(IB)在碱性条件下,在缩合试剂存在下反应,得到式(I)化合物;
其中:
所述的缩合试剂选自2-(7-氧化苯并三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸酯、二环己基碳二亚胺、1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐、N,N’-二环己基碳化二亚胺、N,N’-二异丙基碳二酰亚胺、1-羟基-7-偶氮苯并三氮唑、1H-苯并三唑-1-基氧三吡咯烷基六氟磷酸盐、2-(7-偶氮苯并三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸酯、五氟苯基二苯基磷酸酯、苯并三氮唑-1-基氧基三(二甲基氨基)磷鎓六氟磷酸盐或六氟磷酸苯并三唑-1-基-氧基三吡咯烷基磷;优选为2-(7-偶氮苯并三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸酯、2-(7-氧化苯并三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸酯或六氟磷酸苯并三唑-1-基-氧基三吡咯烷基磷;
所述碱性条件的提供试剂为有机碱,所述的有机碱选自N,N-二异丙基乙胺、吡啶、三乙胺、哌啶、N-甲基哌嗪和4-二甲氨吡啶,优选为N,N-二异丙基乙基胺或三乙胺;
A、L、X
1、X
2、R
1和R
2的定义如式(I)中所述;或者
方法2:
将化合物(IA)和化合物(IB)在碱性条件下反应,得到式(I)化合物;
其中:
所述碱性条件的提供试剂为无机碱,其中所述的无机碱选自磷酸钾、三水合磷酸钾、乙酸钾、氢氧化钠、氢氧化钾、氢氧化锂、碳酸钠、碳酸钾、碳酸铯、氢化钠和氢化钾,优选为碳酸钠或碳酸钾;
G选自离去基团,优选为卤素;
A、L、X
1、X
2、R
1和R
2的定义如式(I)中所述。
更近一步,本发明提供一种药物组合物,所述的药物组合物含有有效剂量的式(I)或(II)化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,及可药用的载体、赋形剂或它们的组合。
本发明提供了一种式(I)或(II)化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,或其药物组合物在制备药物中的用途。
本发明还提供了一种式(I)或(II)化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,或其药物组合物在制备转染期间重排(RET)激酶抑制剂中的用途。
本发明进一步提供了一种式(I)或(II)化合物或其立体异构体、互变异构体或其药 学上可接受的盐,或其药物组合物在制备治疗由转染期间重排(RET)基因驱动的疾病的药物中的用途,其中所述的疾病优选为癌症,其中所述的癌症优选为肺癌、甲状腺癌、结肠癌、乳腺癌或胰腺癌。
本发明提供的式(I)或(II)化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐为选择性转染期间重排(RET)激酶抑制剂。因此,本发明提供了一种选择性抑制转染期间重排(RET)激酶的方法,包括使转染期间重排(RET)激酶与本发明的式(I)或(II)化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,或其药物组合物相接触。相应地,本发明还提供了一种治疗由转染期间重排(RET)基因驱动的疾病的方法,包括向有此需要的对象施用本发明的式(I)或(II)化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,或其药物组合物,其中所述的疾病优选为癌症,其中所述的癌症优选为肺癌、甲状腺癌、结肠癌、乳腺癌或胰腺癌。
发明的详细说明
本发明在说明书和权利要求书中所使用的部分术语定义如下:
“烷基”当作一基团或一基团的一部分时是指包括C
1-C
20直链或者带有支链的脂肪烃基团。优选为C
1-C
10烷基,更优选为C
1-C
6烷基。烷基基团的实施例包括但不限于甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、仲丁基、正戊基、1,1-二甲基丙基、1,2-二甲基丙基、2,2-二甲基丙基、1-乙基丙基、2-甲基丁基、3-甲基丁基、正己基、1-乙基-2-甲基丙基、1,1,2-三甲基丙基、1,1-二甲基丁基、1,2-二甲基丁基、2,2-二甲基丁基、1,3-二甲基丁基、2-乙基丁基、2-甲基戊基、3-甲基戊基、4-甲基戊基、2,3-二甲基丁基等。烷基可以是取代或未取代的。
“环烷基”是指饱和或部分饱和的单环、稠环、桥环和螺环的碳环。优选为C
3-C
12环烷基,更优选为C
3-C
8环烷基,最优选为C
3-C
6环烷基。单环环烷基的实施例包括但不限于环丙基、环丁基、环戊基、环戊烯基、环己基、环己烯基、环己二烯基、环庚基、环庚三烯基、环辛基等,优选环丙基、环己烯基。
“杂环基”、“杂环”或“杂环的”在本申请中可交换使用,都是指非芳香性杂环基,其中一个或多个成环的原子是杂原子,如氧、氮、硫原子等,包括单环、稠环、桥环和螺环。优选具有5~7元单环或7~10元双环或三环,其可以包含1、2或3个选自氮、氧或硫中的原子。“杂环基”的实例包括但不限于吗啉基、氧杂环丁烷基、硫代吗啉基、四氢吡喃基、1,1-二氧代-硫代吗啉基、哌啶基、烯基哌啶基、3,6-二氢-2H-吡喃基、1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶、2-氧代-哌啶基、吡咯烷基、2-氧代-吡咯烷基、哌嗪-2-酮、8-氧杂-3-氮杂-双环[3.2.1]辛基和哌嗪基。杂环基可以是取代或未取代的。
“芳基”是指含有一个或者两个环的碳环芳香系统,其中所述环可以以稠合的 方式连接在一起。术语“芳基”包括比如苯基、萘基、四氢萘基的芳香基团。优选芳基为C
6-C
10芳基,更优选芳基为苯基和萘基,最优选为苯基。芳基可以是取代或未取代的。所述“芳基”可与杂芳基、杂环基或环烷基稠合,其中与母体结构连接在一起的为芳基环,非限制性实施例包括但不限于:
“杂芳基”是指芳香族5~7元单环或9~10元双环,其可以包含1至4个选自氮、氧或硫中的原子。“杂芳基”的实施例包括但不限于呋喃基、吡啶基、哒嗪基、嘧啶基、吡嗪基、噻吩基、异噁唑基、噁唑基、噁二唑基、咪唑基、吡咯基、吡唑基、三唑基、四氮唑基、噻唑基、异噻唑基、1,2,3-噻二唑基、苯并间二氧杂环戊烯基、苯并咪唑基、吲哚基、异吲哚基、1,3-二氧代-异吲哚基、喹啉基、吲唑基、苯并异噻唑基、苯并噁唑基和苯并异噁唑基。杂芳基可以是取代或未取代的。所述杂芳基环可以稠合于芳基、杂环基或环烷基环上,其中与母体结构连接在一起的环为杂芳基环,非限制性实施例包括但不限于:
“烷氧基”是指(烷基-O-)的基团。其中,烷基见本文有关定义。C
1-C
6的烷氧基为优先选择。其实例包括,但不限于:甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、异丁氧基、叔丁氧基等。
“羟基”指-OH。
“卤素”是指氟、氯、溴和碘,优选氯、溴和氟。
“氨基”指-NH
2。
“氰基”指-CN。
“硝基”指-NO
2。
“苄基”指-CH
2-苯基。
“羧基”指-C(O)OH。
“羧酸酯基”指-C(O)O(烷基)或(环烷基),其中烷基、环烷基的定义如上所述。
“DMSO”指二甲基亚砜。
“Boc”指叔丁氧基羰基。
“Ms”指甲磺酰基。
“Ts”指4-甲基苯磺酰基。
“离去基团(leaving group)”,或称离去基,在化学反应中从一较大分子中脱离的原子或官能基,是亲核取代反应与消除反应中应用的术语。在亲核取代反应中,被亲核试剂进攻的反应物称为底物(substrate),而从底物分子中带着一对电子断裂出去的原子或原子团称为离去基团。易接受电子、承受负电荷能力强的基团是好的离去基团。当离去基团共轭酸的pKa越小,离去基团越容易从其他分子中脱离。原因是因为当其共轭酸的pKa越小,相应离去基团不需和其他原子结合,以阴离子(或电中性离去基团)的形式存在的趋势也就增强。常见的离去基团包括但不限于卤素、-OTs或-OH。
“取代的”指基团中的一个或多个氢原子,优选为最多5个,更优选为1-3个氢原子彼此独立地被相应数目的取代基取代。不言而喻,取代基仅处在它们的可能的化学位置,本领域技术人员能够在不付出过多努力的情况下确定(通过实验或理论)可能或不可能的取代。例如,具有游离氢的氨基或羟基与具有不饱和(如烯属)键的碳原子结合时可能是不稳定的。
本说明书所述的“取代”或“取代的”,如无特别指出,均是指基团可被一个或多个选自以下的基团取代:烷基、烯基、炔基、烷氧基、烷硫基、烷基氨基、卤素、疏基、羟基、硝基、氰基、环烷基、杂环基、芳基、杂芳基、环烷氧基、杂环烷氧基、环烷硫基、杂环烷硫基、氨基、卤代烷基、羟烷基、羧基、羧酸酯基、NH烷基、N’N-二烷基的取代基或=O所取代。
本发明中立体化学的定义和惯例的使用通常参考以下文献:
S.P.Parker,Ed.,McGraw-Hill Dictionary of Chemical Terms(1984)McGraw-HillBook Company,New York;and Eliel,E.and Wilen,S.,"Stereochemistry of Organic Compounds",John Wiley&Sons,Inc.,New York,1994.本发明的化合物可以包含不对称中心或手性中心,因此存在不同的立体异构体。本发明的化合物所有的立体异构体形式,包括但绝不限于非对映体、对映异构体、阻转异构体及其它们的混合物,如外消旋混合物,组成了本发明的一部分。非对映异构体可以以其物理化学差异为基础,通过层析、结晶、蒸馏或升华等方法被分离为个别非对映异构体。对映异构体可以通过分离,使手性异构混合物转化为非对映异构混合物,其方式是与适当光学活性化合物(例如手性辅助剂,譬如手性醇或Mosher氏酰氯)的反应,分离非对映异构体,且使个别非对映异构体转化为相应的纯对映异构体。本发明的中间体与化合物也可以以不同互变异构形式存在,且所有此种形式被包含在本发明的范围内。很多有机化 合物都以光学活性形式存在,即它们有能力旋转平面偏振光的平面。在描述光学活性化合物时,前缀D、L或R、S用来表示分子手性中心的绝对构型。前缀d、l或(+)、(-)用来命名化合物平面偏振光旋转的符号,(-)或l是指化合物是左旋的,前缀(+)或d是指化合物是右旋的。这些立体异构体的原子或原子团互相连接次序相同,但是它们的立体结构不一样。特定的立体异构体可以是对映体,异构体的混合物通常称为对映异构体混合物。50:50的对映体混合物被称为外消旋混合物或外消旋体,这可能导致化学反应过程中没有立体选择性或立体定向性。术语“外消旋混合物”和“外消旋体”是指等摩尔的两个对映异构体的混合物,缺乏光学活性。
“互变异构体”或“互变异构的形式”是指不同能量的结构的同分异构体可以通过低能垒互相转化。例如质子互变异构体(即质子移变的互变异构体)包括通过质子迁移的互变,如酮式-烯醇式和亚胺-烯胺的同分异构化作用。原子价(化合价)互变异构体包括重组成键电子的互变。除非其他方面表明,本发明所描述的结构式包括所有的同分异构形式(如对映异构,非对映异构,和几何异构):例如含有不对称中心的R、S构型,双键的(Z)、(E)异构体,和(Z)、(E)的构象异构体。因此,本发明的化合物的单个立体化学异构体或其对映异构体,非对映异构体,或几何异构体的混合物都属于本发明的范围。
“药学上可接受的盐”是指上述化合物能保持原有生物活性并且适合于医药用途的某些盐类。式(I)所表示的化合物的药学上可接受的盐可以为金属盐、与合适的酸形成的盐。
“药物组合物”表示含有一种或多种本文所述化合物或其药学上可接受的盐或前体药物与其他化学组分的混合物,以及其他组分例如生理学可药用的载体和赋形剂。药物组合物的目的是促进对生物体的给药,利于活性成分的吸收进而发挥生物活性。
以下结合实施例用于进一步描述本发明,但这些实施例并非限制着本发明的范围。
实施例
实施例给出了式(I)所表示的代表性化合物的制备及相关结构鉴定数据。必须说明,以下实施例是用于说明本发明而不是对本发明的限制。化合物的结构是通过核磁共振(NMR)或质谱(MS)来确定的。
1H NMR图谱式用Bruker仪器(400MHz)测定而得,化学位移用ppm表示,使用四甲基硅烷内标准(0.00ppm)。
1H NMR的表示方法: s=单峰,d=双重峰,m=多重峰,br=变宽的,dd=双重峰的双重峰,dt=三重峰的双重峰。若提供耦合常数时,其单位为Hz。质谱的测定用FINNIGAN LCQAd(ESI)质谱仪(生产商:Thermo,型号:Finnigan LCQ advantage MAX)。
薄层层析硅胶板使用烟台黄海HSGF254或青岛GF254硅胶板,薄层色谱法(TLC)使用的硅胶板采用的规格是0.15mm~0.2mm,薄层层析分离纯化产品采用的规格是0.4mm~0.5mm硅胶板。
柱层析一般使用烟台黄海200~300目硅胶为载体。
本发明的已知的起始原料可以采用或按照本领域已知的方法来合成,或可购买自ABCR GmbH&Co.KG,Acros Organnics,Aldrich Chemical Company,韶远化学科技(Accela ChemBio Inc)、达瑞化学品等公司。
实施例中如无特殊说明,反应均在空气氛下敞口进行。
氩气氛或氮气氛是指反应瓶连接一个约1L容积的氩气或氮气气球。
氢气氛是指反应瓶连接一个约1L容积的氢气气球。氢化反应通常抽真空,充入氢气,反复操作3次。
实施例中无特殊说明,反应中的溶液是指水溶液。
实施例中如无特殊说明,反应的温度为室温。
室温为最适宜的反应温度,温度范围是20℃~30℃。
实施例中的反应进程的监测采用薄层色谱法(TLC),反应所使用的展开剂的体系有:A:二氯甲烷和甲醇体系;B:正己烷和乙酸乙酯体系,溶剂的体积比根据化合物的极性不同而进行调节。
纯化化合物采用的柱层析的洗脱剂的体系和薄层色谱法的展开剂的体系包括:A:二氯甲烷和甲醇体系;B:正己烷和乙酸乙酯体系,溶剂的体积比根据化合物的极性不同而进行调节,也可以加入少量的三乙胺等酸性或碱性试剂等进行调节。
中间体的制备
中间体1-d
第一步:Boc-均三甲基磺酰羟胺
在3L单口瓶中加入2,4,6-三甲基苯磺酰氯(a)(200g,914.5mmol)、N-羟基氨基甲酸叔丁酯(b)(133.0g,1000mmol)以及甲基叔丁基醚(1.5L),冰浴,搅拌30min后,缓慢滴加三乙胺(170mL,1371.7mmol),滴加完毕后于0摄氏度反应30min,随后室温搅拌4h。反应液加稀HCl(2N)调PH至4左右,分液,有机相分别水洗三次(30mL×3),饱和食盐水洗一次,无水硫酸钠干燥,过滤,减压蒸馏除去溶剂得白色固体Boc-均三甲基磺酰羟胺(1-a)290g。产率:74.2%。
MS m/z(ESI):316.2[M+1]
第二步:均三甲基磺酰羟胺的合成
在2L单口瓶中加入三氟乙酸(500mL),冰盐浴降温至-15~-20摄氏度,分批缓慢加入Boc-均三甲基磺酰羟胺(1-a)(290g,919.5mmol),加完后冰盐浴下反应6h,反应结束后反应液倒入6L冰水中,析出大量白色固体,过滤,滤饼经水洗涤至滤液呈中性。将滤饼溶于二氯甲烷中,分液,有机相使用无水硫酸钠干燥,过滤,所得有机相直接进行下一步反应。
MS m/z(ESI):216.2[M+1]
第三步:(3,5二氯吡啶-鎓-1-基)((均三苯磺酰基)羟胺的合成
在2L单口瓶中加入均三甲基磺酰羟胺(1-b)的二氯甲烷溶液(197g,915.1mmol),冰浴降至0摄氏度,加入3,5-二氯嘧啶(1-b)(135.4g,915.1mmol),室温搅拌过夜。反应结束后过滤,滤饼用二氯甲烷洗涤,干燥后得到白色固体(1-c)210g, 产率:63.2%。
MS m/z(ESI):362.02[M+1]
第四步:4,6-二氯吡唑啉[1,5-a]吡啶-3-腈的合成
在1L单口瓶中加入(1-c)(105g,290.7mmol),三乙胺(84mL,481.4mmol),乙醇300mL,搅拌,加入3-甲氧基丙烯腈(d)(25g,290.7mmol),80摄氏度下反应4h,反应液冷却至室温,倒入3L冰水中,过滤,滤饼硅胶柱层析纯化(正己烷:乙酸乙酯=3:1)得棕黄色产物4,6-二氯吡唑啉[1,5-a]吡啶-3-腈(1-d)25g,产率:40.6%。MS m/z(ESI):213.2[M+1]
中间体1-f
第一步:4-(5-溴吡啶-2-基)哌嗪-1-碳酸叔丁酯的合成
在200mL单口瓶中加入2-氟-5-溴吡啶(e)(20g,113.6mmol),Boc-哌嗪(f)(32g,170.5mmol),K
2CO
3(37g,113.6mmol),100mL N,N-二甲基乙酰胺,110摄氏度下反应4h,反应结束待反应液冷却至室温后倒入1L水中,使用有机溶剂(MeOH/DCM=10:1)萃取三次(300mL×3),有机相经水(300mL×3)、饱和氯化钠水 溶液(300mL)洗涤后用无水硫酸钠干燥,浓缩过柱,硅胶柱层析纯化(正己烷:乙酸乙酯=2:1)得得到产物4-(5-溴吡啶-2-基)哌嗪-1-碳酸叔丁酯(1-e)29.9g,产率:77.3%。MS m/z(ESI):342.2[M+1]
第二步:6-(4-Boc-1-哌嗪基)吡啶-3-硼酸频哪醇酯
在100mL单口瓶中加入4-(5-溴吡啶-2-基)哌嗪-1-碳叔丁酯(1-e)(29.9g,87.3mmol),联硼频哪醇酯(33.3g,131.0mmol),[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯化钯(3.2g,4.37mmol),乙酸钾(17.2g,174.5mmol)及400mL 1,4-二氧六环,氮气保护,100摄氏度反应过夜。反应液冷却至室温,浓缩,硅胶柱层析纯化(正己烷:乙酸乙酯=2:1)得到产物6-(4-Boc-1-哌嗪基)吡啶-3-硼酸频哪醇酯(1-f)24.2g,产率:71.2%。
中间体2-f
第一步:3-(5-溴吡啶-2-基)-3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-6-碳酸叔丁酯
重复中间体1-f第一步的合成步骤,不同的是以原料2-a代替f,得到中间体3-(5-溴吡啶-2-基)-3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-6-碳酸叔丁酯2-e。
MS m/z(ESI):354.07[M+1]
第二步:叔丁基-3-(5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼烷-2-基)吡啶-2-基)-3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-6-碳酸酯
重复中间体1-f第二步的合成步骤,不同的是以原料2-e代替1-e,得到中间体叔丁基-3-(5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼烷-2-基)吡啶-2-基)-3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-6-碳酸酯2-f。
MS m/z(ESI):402.25[M+1]
中间体3-f
第一步:3-(5-溴吡啶-2-基)-3,6-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-8-碳酸叔丁酯的合成
重复中间体1-f第一步的合成步骤,不同的是以原料3-a代替f,得到中间体3-(5-溴吡啶-2-基)-3,6-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-8-碳酸叔丁酯3-e。
MS m/z(ESI):368.09[M+1]
第二步:3-(5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼烷-2-基)吡啶-2-基)-3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-8-碳酸叔丁酯
重复中间体1-f第二步的合成步骤,不同的是以原料3-e代替1-e,得到中间体3-(5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼烷-2-基)吡啶-2-基)-3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-8-碳酸叔丁酯3-f。
MS m/z(ESI):416.25[M+1]
中间体4-f
第一步:3-(5-溴吡啶-2-基)哌啶-4-基)碳酸叔丁酯的合成
重复中间体1-f第一步的合成步骤,不同的是以原料4-a代替f,得到中间体3-(5-溴吡啶-2-基)哌啶-4-基)碳酸叔丁酯4-e。
MS m/z(ESI):368.09[M+1]
第二步:3-(5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼烷-2-基)吡啶-2-基)哌啶-4-基)碳酸叔丁酯
重复中间体1-f第二步的合成步骤,不同的是以原料4-e代替1-e,得到中间体3-(5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼烷-2-基)吡啶-2-基)哌啶-4-基)碳酸叔丁酯4-f。
MS m/z(ESI):416.25[M+1]
中间体1-i
第一步:4-(5-(3-氰基-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)哌嗪-1-碳酸叔丁酯的合成
在100mL单口瓶中加入4,6-二氯吡唑啉[1,5-a]吡啶-3-腈(1-d)(2.0g,9.4mmol), 6-(4-Boc-1-哌嗪基)吡啶-3-硼酸频哪醇酯(1-f)(4.04g,10.3mmol),磷酸钾(4.0g,18.8mmol),三(二亚苄基丙酮)二钯(0.8g,0.94mmol),三环己基膦(0.53g,1.88mmol)和60mL溶剂(1,4-二氧六环:水=10:1),氮气保护,70摄氏度下反应5h,加入3,6-二氢-2H-吡喃-4-硼酸频哪醇酯(h)(2.96g,14.1mmol)的1,4-二氧六环溶液,回流过夜。反应结束后,待反应液冷却至室温,浓缩,硅胶柱层析纯化(正己烷:乙酸乙酯=1:1)得到产物4-(5-(3-氰基-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)哌嗪-1-碳酸叔丁酯(1-h)1.4g,产率:30.7%。
MS m/z(ESI):486.2[M+1]
第二步:4-(5-(3-氰基-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)哌嗪的合成。
在100mL单口瓶中加入4-(5-(3-氰基-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基吡唑啉[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)哌嗪-1-碳酸叔丁酯(1-h)(1.4g,2.88mmol)和25mL乙醇,浓盐酸5mL,室温反应过夜。反应结束后浓缩反应液,残余物溶于水(100mL),使用饱和NaHCO
3水溶液调节PH至8-9,用二氯甲烷萃取三次(30mL×3),合并有机相,有机相经水(30mL×3)、饱和氯化钠水溶液(30mL)洗涤后用无水硫酸钠干燥,过滤浓缩后得到产物4-(5-(3-氰基-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)哌嗪(1-i)1.1g,产率:99.1%。
MS m/z(ESI):386.2[M+1]
中间体2-i
第一步:3-(5-(3-氰基-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)-3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-6-碳酸叔丁酯的合成
重复中间体1-i第一步的合成步骤,不同的是以原料2-f代替1-f,得到中间体3-(5-(3-氰基-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)-3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-6-碳酸叔丁酯2-h。
MS m/z(ESI):499.2[M+1]
第二步:4-(6-(3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-3-基)吡啶-3-基)-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈的合成。
重复中间体1-i第二步的合成步骤,不同的是以原料2-h代替1-h,得到中间体4-(6-(3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-3-基)吡啶-3-基)-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈2-i。
MS m/z(ESI):399.2[M+1]
中间体3-i
第一步:3-(5-(3-氰基-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)-3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-8-碳酸叔丁酯的合成
重复中间体1-i第一步的合成步骤,不同的是以原料3-f代替1-f,得到中间体3-(5-(3-氰基-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)-3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-8-碳酸叔丁酯3-h。
MS m/z(ESI):513.2[M+1]
第二步:4-(6-(3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-3-基)吡啶-3-基)-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈的合成。
重复中间体1-i第二步的合成步骤,不同的是以原料3-h代替1-h,得到中间体4-(6-(3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-3-基)吡啶-3-基)-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈3-i。
MS m/z(ESI):413.2[M+1]
中间体4-i
第一步:(1-(5-(3-氰基-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)哌啶-4-氨基)碳酸叔丁酯的合成
重复中间体1-i第一步的合成步骤,不同的是以原料4-f代替1-f,得到中间体(1-(5-(3-氰基-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)哌啶-4-氨基)碳酸叔丁酯4-h。
MS m/z(ESI):501.2[M+1]
第二步:4-(6-(4-氨基哌啶-1-基)吡啶-3-基)-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈的合成。
重复中间体1-i第二步的合成步骤,不同的是以原料4-h代替1-h,得到中间体4-(6-(4-氨基哌啶-1-基)吡啶-3-基)-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈4-i。MS m/z(ESI):401.2[M+1]
中间体5-i
第一步:4-(5-(3-氰基-6-(2-甲基吡啶-4-yl)基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)哌嗪-1-碳酸叔丁酯的合成
重复中间体1-i第一步的合成步骤,不同的是以原料j代替原料h,得到中间体4-(5-(3-氰基-6-(2-甲基吡啶-4-yl)基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)哌嗪-1-碳酸叔丁酯5-h。
MS m/z(ESI):496.2[M+1]
第二步:6-(2-甲基吡啶-4-基)-4-(6-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈的合成。
重复中间体1-i第二步的合成步骤,不同的是以原料5-h代替1-h,得到中间体6-(2-甲基吡啶-4-基)-4-(6-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈5-i。
MS m/z(ESI):396.2[M+1]
中间体6-i
第一步:3-(5-(3-氰基-6-(2-甲基吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)-3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-8-碳酸叔丁酯的合成
重复中间体1-i第一步的合成步骤,不同的是以原料3-f代替1-f,以原料j代替原料h,得到中间体3-(5-(3-氰基-6-(2-甲基吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)-3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-8-碳酸叔丁酯6-h。
MS m/z(ESI):522.2[M+1]
第二步:4-(6-(3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-3-基)吡啶-3-基)-6-(2-甲基吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈的合成。
重复中间体1-i第二步的合成步骤,不同的是以原料6-h代替1-h,得到中间体 4-(6-(3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-3-基)吡啶-3-基)-6-(2-甲基吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈6-i。
MS m/z(ESI):422.2[M+1]
中间体7-i
第一步:3-(5-(3-氰基-6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)哌嗪-1-碳酸叔丁酯的合成
重复中间体1-i第一步的合成步骤,不同的是以原料k代替原料h,得到中间体3-(5-(3-氰基-6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)哌嗪-1-碳酸叔丁酯7-h。
合成方法见中间体1-i第一步。
MS m/z(ESI):512.2[M+1]
第二步:6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)-4-(6-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈的合成。
重复中间体1-i第二步的合成步骤,不同的是以原料7-h代替1-h,得到中间体6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)-4-(6-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈7-i。
MS m/z(ESI):412.2[M+1]
中间体8-i
第一步:3-(5-(3-氰基-6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)-3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-6-碳酸叔丁酯的合成
重复中间体1-i第一步的合成步骤,不同的是以原料2-f代替1-f,以原料k代替原料h,得到中间体3-(5-(3-氰基-6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)-3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-6-碳酸叔丁酯8-h。
MS m/z(ESI):524.2[M+1]
第二步:4-(6-(3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-3-基)吡啶-3-基)-6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈的合成。
重复中间体1-i第二步的合成步骤,不同的是以原料8-h代替1-h,得到中间体4-(6-(3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-3-基)吡啶-3-基)-6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈8-i。
MS m/z(ESI):424.2[M+1]
中间体9-i
第一步:3-(5-(3-氰基-6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)-3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-8-碳酸叔丁酯的合成
重复中间体1-i第一步的合成步骤,不同的是以原料3-f代替1-f,以原料k代替 原料h,得到中间体3-(5-(3-氰基-6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)-3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-8-碳酸叔丁酯9-h。
MS m/z(ESI):538.2[M+1]
第二步:4-(6-(3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-3-基)吡啶-3-基)-6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈的合成。
重复中间体1-i第二步的合成步骤,不同的是以原料9-h代替1-h,得到中间体4-(6-(3,8-二氮杂二环[3.2.1]辛烷-3-基)吡啶-3-基)-6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈9-i。
MS m/z(ESI):438.2[M+1]
中间体1-m
第一步:(6-甲氧基吡啶-3-基)甲醇的合成
在100mL单口瓶中加入6-甲氧基烟酸(1-j)(15g,97.95mmol)和150mL四氢呋喃,冰浴搅拌30min,分批缓慢加入氢化铝锂(5.58g,146.93mmol),冰浴下反应1h,移除冰浴,随后室温反应2h,待反应结束后缓慢加入五水合硫酸钠至无气泡冒出,过滤,使用二氯甲烷(200mL)洗涤滤饼,滤液浓缩得到产物13g,收率:93.4%。第二步:5-(氯甲基)-2-甲氧基吡啶的合成
在100mL单口瓶中加入(6-甲氧基吡啶-3-基)甲醇(1-k)(13g,93.42mmol)和150mL二氯甲烷,冰浴搅拌30min,滴加二氯亚砜(13.5mL,186.84mmol),移除冰浴,室温反应过夜。待反应结束后往反应液中加饱和碳酸氢钠水溶液调节PH至7-8,分液,有机相用无水硫酸钠干燥,过滤,浓缩,硅胶柱层析(正己烷:乙酸乙酯=10:1)纯化得到产物2.7g,收率:18.3%。
实施例1
化合物I-1的制备
(R)-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)-4-(6-(4-(2-羟基-3-甲基丁酰基)哌嗪-1-基)吡啶-3-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈的合成
在100mL单口瓶中加入4-(5-(3-氰基-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-4-基)吡啶-2-基)哌嗪(1-i)(100mg,0.26mmol),(R)-2-羟基-3-甲基丁酸(61.3mg,0.52mmol),N,N-二异丙基乙基胺(134mg,1.03mmol),1H-苯并三唑-1-基氧三吡咯烷基六氟磷酸盐(536.0mg,1.03mmol)和10mL N,N-二甲基甲酰胺,室温反应过夜。待反应结束后将反应液倒入水中(100mL),用二氯甲烷萃取三次(30mL×3),合并有机相,有机相用水(30mL×3)、饱和氯化钠水溶液(30mL)洗涤,无水硫酸钠干燥,硅胶柱层析(二氯甲烷:甲醇=30:1)纯化得到产物(R)-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)-4-(6-(4-(2-羟基-3-甲基丁酰基)哌嗪-1-基)吡啶-3-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈(I-1)42mg,产率:33.3%。
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ8.89(s,1H),8.68(s,1H),8.40(d,J=2.4Hz,1H),7.86(dd,J=8.9,2.4Hz,1H),7.72(s,1H),7.01(d,J=8.9Hz,1H),6.61(s,1H),4.77(d, J=7.0Hz,1H),4.26(d,J=3.3Hz,2H),4.10(d,J=6.1Hz,1H),3.85(t,J=5.5Hz,2H),3.74-3.55(m,8H),2.55(s,2H),1.89(q,J=6.6Hz,1H),0.91(d,J=6.7Hz,3H),0.85(d,J=6.7Hz,3H).
MS m/z(ESI):487.6[M+1]
实施例2-实施例36
化合物I-2到化合物I-36的制备
参考实施例1化合物I-1的制备步骤,分别用1i、2i、3i、4i、5i、6i、7i、8i和9i与合适的羧酸反应,得到化合物I-2到化合物I-36,它们的结构及表征数据如下:
I-2
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.49(s,1H),8.35(s,1H),8.27(s,1H),7.78(s,1H),7.57(s,1H),7.42(s,1H),6.90(d,J=32.1Hz,2H),6.66(s,1H),6.31(s,1H),4.80(s,1H),4.54(s,1H),4.34(d,J=25.8Hz,3H),3.98(s,2H),3.70(d,J=43.6Hz,3H),2.92(s,1H),2.81(d,J=4.6Hz,1H),2.54(s,2H),1.77(s,1H).
MS m/z(ESI):539.2[M+1]
I-3
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.84(s,1H),8.65(d,J=5.2Hz,1H),8.43(d,J=2.4Hz,1H),8.37-8.29(m,2H),7.82(dd,J=8.7,2.4Hz,1H),7.74(dd,J=8.6,2.2Hz,1H),7.56(s,1H),7.43(s,1H),7.37(d,J=5.3Hz,1H),6.83(dd,J=8.7,5.4Hz,2H),4.00(s,3H),3.78(d,J=23.8Hz,8H),2.68(s,3H).
MS m/z(ESI):531.2[M+1]
I-4
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.83(s,1H),8.64(s,1H),8.35(d,J=12.7Hz,2H),7.76(d,J=8.5Hz,1H),7.58-7.18(m,8H),6.72(d,J=8.7Hz,1H),4.76(s,1H),4.25-3.16(m,9H),2.97(d,J=11.9Hz,1H),2.67(d,J=5.5Hz,3H).
MS m/z(ESI):530.2[M+1]
I-5
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.52(d,J=1.6Hz,1H),8.38(d,J=2.5Hz,1H),8.29(s,1H),7.81(dd,J=8.9,2.5Hz,1H),7.45(d,J=1.6Hz,1H),7.28-7.23(m,1H),7.19-7.07(m,2H),6.69(d,J=8.9Hz,1H),6.34(dd,J=3.2,1.8Hz,1H),4.85(s,1H),4.58(s,1H),4.40(q,J=2.8Hz,2H),4.31(d,J=11.3Hz,1H),4.01(t,J=5.4Hz,2H),3.81(t,J=14.2Hz,2H),3.69(d,J=12.0Hz,1H),2.95(q,J=7.0Hz,1H),2.61-2.53(m,2H),1.82(d,J=8.8Hz,1H).
MS m/z(ESI):539.2[M+1].
I-6
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ8.88(d,J=1.5Hz,1H),8.67(s,1H),8.39(d,J=2.5Hz,1H),8.02(d,J=2.4Hz,1H),7.84(dd,J=8.8,2.6Hz,1H),7.71(d,J=1.6Hz,1H),7.56(dd,J=8.5,2.5Hz,1H),7.00(d,J=8.8Hz,1H),6.77(d,J=8.5Hz,1H),6.62-6.55(m,1H),4.25(q,J=2.8Hz,2H),3.83(d,J=8.9Hz,5H),3.74(s,2H),3.69-3.56(m,8H),2.54(s,2H).
MS m/z(ESI):536.2[M+1]
I-7
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.52(d,J=1.6Hz,1H),8.38(d,J=2.5Hz,1H),8.29(s,1H),7.80(d,J=8.7Hz,1H),7.73-7.66(m,2H),7.44(d,J=1.6Hz,1H),7.13(t,J=8.6Hz,2H),6.70(d,J=9.1Hz,1H),6.33(dd,J=3.5,1.9Hz,1H),4.77(s,2H),4.40(q,J=2.8Hz,2H),4.01(t,J=5.4Hz,2H),3.75(s,4H),2.96(q,J=7.1Hz,1H),2.57(s,2H),1.80(d,J=8.8Hz,1H).
MS m/z(ESI):521.2[M+1]
I-8
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ8.89(s,1H),8.68(s,1H),8.37(d,J=2.4Hz,1H),8.17(s,2H),7.87-7.77(m,1H),7.70(s,1H),7.45-7.35(m,2H),7.32(d,J=7.1Hz,1H),6.95(d,J=8.9Hz,1H),6.61(s,1H),4.26(s,2H),3.86(t,J=5.5Hz,2H),3.70–3.54(m,6H),3.15(dt,J=12.2,5.7Hz,4H),2.55(s,2H).
MS m/z(ESI):521.2[M+1]
I-9
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ8.89(s,1H),8.68(d,J=1.6Hz,1H),8.40(d,J=2.5Hz,1H),8.34(d,J=2.3Hz,1H),7.85(td,J=8.1,2.3Hz,2H),7.72(s,1H),7.00(d,J=8.9Hz,1H),6.90(s,1H),6.61(s,1H),4.26(d,J=3.1Hz,2H),3.91(s,3H),3.85(t,J=5.5Hz,2H),3.70(s,4H),3.34(s,4H),2.55(s,2H).
MS m/z(ESI):522.2[M+1]
I-10
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ9.50(d,J=1.6Hz,1H),8.77(d,J=1.7Hz,1H),8.55(d,J=5.3Hz,1H),8.45(t,J=2.5Hz,3H),7.96–7.84(m,3H),7.77(d,J=5.4Hz,1H),7.62(d,J=8.1Hz,1H),7.41–7.33(m,1H),6.97(d,J=8.9Hz,1H),3.50(d,J=81.3Hz,8H),2.55(s,3H),1.42(d,J=5.2Hz,2H),1.32(s,2H).
MS m/z(ESI):541.2[M+1]
I-11
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ8.90(s,1H),8.69(s,1H),8.42(dd,J=16.1,2.4Hz,2H),7.98-7.89(m,1H),7.86(dd,J=8.8,2.5Hz,1H),7.73(s,1H),6.92(dd,J=8.9,3.2Hz,2H),6.62(s,1H),4.81(s,1H),4.23(d,J=31.4Hz,4H),3.94(d,J=5.8Hz,4H),3.86(t,J=5.6Hz,2H),3.15(d,J=12.2Hz,2H),2.56(s,2H),1.94(s,2H),1.74(d,J=8.9Hz,2H).
MS m/z(ESI):548.2[M+1]
I-12
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ9.44(s,1H),8.78(s,1H),8.48(d,J=2.5Hz,1H),8.35(d,J=2.3Hz,1H),7.93(d,J=8.9Hz,1H),7.85(d,J=8.8Hz,3H),7.02(d,J=8.3Hz,2H),6.93(d,J=8.6Hz,1H),6.85(d,J=7.2Hz,1H),3.92(s,3H),3.72(s,8H),3.48(s,3H).
MS m/z(ESI):547.2[M+1]
I-13
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ9.50(s,1H),8.78(s,1H),8.56(d,J=5.3Hz,1H),8.45(d,J=2.4Hz,1H),7.94(s,1H),7.90(d,J=7.6Hz,2H),7.78(d,J=5.3Hz,1H),7.26(t,J=8.0Hz,1H),6.98(d,J=8.9Hz,1H),6.81(d,J=7.6Hz,2H),6.70(t,J=2.0Hz,1H),3.75(s,3H),3.59(d,J=37.7Hz,8H),2.56(s,3H),1.36(d,J=2.4Hz,2H),1.25-1.20(m,2H).
MS m/z(ESI):570.2[M+1]
I-14
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ8.89(s,1H),8.69(s,1H),8.37(d,J=2.5Hz,1H),7.81(dd,J=8.8,2.5Hz,1H),7.71(s,1H),7.64(d,J=8.2Hz,1H),6.99(d,J=9.0Hz,1H),6.62(s,1H),5.28(d,J=5.7Hz,1H),4.42–4.31(m,2H),4.27(d,J=3.2Hz,2H),3.98-3.76(m,3H),3.66(t,J=4.8Hz,1H),3.02(t,J=12.4Hz,2H),2.56(s,2H),2.09-1.91(m,1H),1.79(d,J=12.6Hz,2H),1.52(p,J=13.6,13.2Hz,2H),1.27(dd,J=13.6,6.7Hz,1H),0.91(d,J=6.9Hz,3H),0.79(d,J=6.8Hz,3H).
MS m/z(ESI):501.2[M+1]
I-15
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ8.91(s,1H),8.71(s,1H),8.41(d,J=2.4Hz,1H),8.34(d,J=7.7Hz,1H),7.84(dd,J=8.8,2.5Hz,1H),7.72(s,1H),7.46(d,J=7.6Hz,1H),7.40(dd,J=14.2,5.8Hz,2H),7.10(dd,J=8.0,2.5Hz,1H),7.04(d,J=8.9Hz, 1H),6.64(s,1H),4.47(d,J=13.2Hz,2H),4.29(d,J=3.3Hz,2H),4.14(s,1H),3.88(t,J=5.5Hz,2H),3.82(s,3H),3.07(t,J=12.6Hz,2H),2.58(s,2H),1.98-1.82(m,2H),1.60(q,J=12.0Hz,2H).
MS m/z(ESI):535.2[M+1]
I-16
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ8.91(s,1H),8.70(s,1H),8.40(d,J=2.5Hz,1H),7.86(dd,J=8.8,2.4Hz,1H),7.74(s,1H),6.93(d,J=8.8Hz,1H),6.63(s,1H),4.75(d,J=32.4Hz,2H),4.28(d,J=3.2Hz,2H),4.18(t,J=11.9Hz,2H),3.98(d,J=6.4Hz,1H),3.90-3.82(m,2H),3.12-2.88(m,2H),2.57(s,2H),1.83(dd,J=57.4,28.5Hz,6H),0.90(d,J=7.0Hz,6H).
MS m/z(ESI):513.2[M+1]
I-17
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ9.52(d,J=1.7Hz,1H),8.79(s,1H),8.53(dd,J=28.9,3.9Hz,2H),8.01–7.84(m,2H),7.79(d,J=5.3Hz,1H),7.04(d,J=8.9Hz,1H),4.79(d,J=7.1Hz,1H),4.13(t,J=6.5Hz,1H),3.77–3.53(m,8H),2.56(s,3H),1.91(q,J=6.6Hz,1H),0.89(dd,J=22.5,6.6Hz,6H).
MS m/z(ESI):496.2[M+1]
I-18
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ9.53(d,J=1.7Hz,1H),8.80(s,1H),8.58(d,J=5.3Hz,1H),8.50(d,J=2.5Hz,1H),8.00-7.89(m,3H),7.81(d,J=5.3Hz,1H),7.05(d,J=8.8Hz,1H),4.82(d,J=7.0Hz,1H),4.15(s,1H),3.67(dt,J=28.8,8.5Hz,7H),2.58(s,3H),1.65(dd,J=50.6,12.3Hz,7H),1.17(ddt,J=35.9,23.9,12.2Hz,2H).
MS m/z(ESI):536.2[M+1]
I-19
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ9.51(s,1H),8.78(s,1H),8.55(d,J=5.3Hz,1H),8.44(d,J=2.5Hz,1H),7.97-7.82(m,3H),7.78(d,J=5.3Hz,1H),7.35(d,J=4.4Hz,4H),7.27(q,J=4.3Hz,1H),6.97(d,J=8.9Hz,1H),4.76(t,J=5.4Hz,1H),4.18(t,J=6.9Hz,1H),4.02(dt,J=14.5,7.1Hz,1H),3.78-3.38(m,8H),3.09(s,1H),2.56(s,3H).
MS m/z(ESI):544.2[M+1]
I-20
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ9.81(s,1H),8.87(d,J=6.2Hz,2H),8.60-8.47(m,1H),8.47-8.36(m,1H),8.12(s,1H),8.02(dd,J=8.8,2.4Hz,1H),7.94(t,J=6.8Hz,1H),7.80(d,J=7.7Hz,1H),7.44(t,J=6.5Hz,2H),7.14(d,J=8.9Hz,1H),4.46(s,2H),3.54(d,J=62.9Hz,8H),2.77(s,3H).
MS m/z(ESI):522.2[M+1]
I-21
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ8.90(s,1H),8.69(s,1H),8.39(d,J=2.4Hz,1H),7.85(dd,J=8.9,2.5Hz,1H),7.73(s,1H),7.61-7.43(m,4H),6.92(d,J=8.9Hz,1H),6.62(s,1H),4.84(s,1H),4.32-4.07(m,5H),3.86(t,J=5.5Hz,2H),3.13(s,2H),2.56(s,2H),1.93(s,2H),1.75(s,2H).
MS m/z(ESI):517.2[M+1]
I-22
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ8.90(s,1H),8.69(s,1H),8.39(d,J=2.4Hz,1H),7.89-7.78(m,2H),7.72(s,1H),6.91(d,J=8.9Hz,1H),6.62(s,1H),6.47(s,1H),6.31(dd,J=6.9,1.8Hz,1H),4.78(d,J=5.8Hz,1H),4.32-4.06(m,5H),3.86(t,J=5.5Hz,2H),3.47(s,3H),3.09(dd,J=20.1,12.1Hz,2H),2.56(s,2H),1.94(d,J=9.7Hz,2H),1.73(dd,J=10.5,4.4Hz,2H).
MS m/z(ESI):548.2[M+1]
I-23
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ8.89(s,1H),8.68(s,1H),8.36(d,J=2.4Hz,1H),7.83(dd,J=8.8,2.5Hz,1H),7.72(s,1H),7.62(q,J=7.5Hz,5H),6.87(d,J=8.9Hz,1H),6.62(s,1H),4.85-4.76(m,1H),4.42(s,1H),4.30-4.18(m,3H),4.08(d,J=12.5Hz,1H),3.86(t,J=5.6Hz,2H),3.00(d,J=12.3Hz,1H),2.59(d,J=29.0Hz,4H),1.85(s,1H),1.71(d,J=9.1Hz,3H).
MS m/z(ESI):567.2[M+1]
I-24
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ8.89(s,1H),8.69(s,1H),8.39(d,J=2.4Hz,1H),7.85(dd,J=8.6,2.4Hz,1H),7.72(s,1H),7.41(t,J=8.2Hz,1H),7.16-7.04(m,3H),6.91(d,J=8.9Hz,1H),6.62(s,1H),4.83(s,1H),4.23(d,J=34.3Hz,5H),3.84(d,J=16.4Hz,4H),3.13(s,2H),2.70(s,3H),2.56(s,2H),1.93(s,2H),1.74(s,2H).
MS m/z(ESI):547.2[M+1]
I-25
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ9.43(s,1H),8.78(s,1H),8.46(s,1H),7.97-7.78(m,3H),7.03(s,1H),6.97-6.89(m,1H),6.87-6.81(m,1H),4.71(d,J=22.1Hz,2H),4.16(t,J=12.8Hz,2H),3.99(s,1H),3.48(s,3H),3.09-2.87(m,2H),1.96-1.46(m,10H),1.28-0.97(m,6H).
MS m/z(ESI):578.2[M+1]
I-26
1H NMR(400MHz,DMSO-d
6)δ9.44(s,1H),8.79(s,1H),8.51-8.41(m,2H),7.92(d,J=8.7Hz,2H),7.85(d,J=8.0Hz,2H),7.03(s,1H),6.93(d,J=8.7Hz,2H),6.85(d,J=7.2Hz,1H),4.21(s,4H),3.93(s,3H),3.48(s,3H),3.16(d,J=12.1Hz,2H),1.94(s,2H),1.75(d,J=9.0Hz,2H).
MS m/z(ESI):573.2[M+1]
I-27
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.50(s,1H),8.37(d,J=2.4Hz,1H),8.27(s,1H),7.93(s,2H),7.76(dd,J=8.8,2.4Hz,1H),7.42(s,1H),6.75(d,J=8.9Hz,1H),6.31(s, 1H),5.03(s,1H),4.65(s,1H),4.37(d,J=3.6Hz,2H),4.14(d,J=45.4Hz,2H),3.98(t,J=5.5Hz,2H),3.29(d,J=12.0Hz,2H),2.55(d,J=5.2Hz,2H),2.09-1.84(m,4H).
MS m/z(ESI):507.2[M+1]
I-28
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.47(s,1H),8.34(s,1H),8.25(s,1H),7.74(s,2H),7.65(s,1H),7.40(s,1H),7.24(d,J=7.4Hz,1H),6.72(s,1H),6.35-6.16(m,1H),4.35(s,2H),4.14(s,2H),3.96(s,2H),3.31(s,2H),2.54(s,2H),1.99(d,J=46.3Hz,4H),1.24(s,2H).
MS m/z(ESI):507.2[M+1]
I-29
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.88(s,1H),8.68(d,J=5.3Hz,1H),8.41(d,J=18.9Hz,2H),7.83(t,J=8.6Hz,1H),7.58(s,1H),7.47(d,J=18.0Hz,2H),6.78(dd,J=16.5,8.9Hz,1H),5.05(s,0.5H),4.88(s,0.5H),4.32(q,J=12.5Hz,2H),4.21-4.02(m,2H),3.37-3.07(m,2H),2.74(s,3H),2.10-1.13(m,15H).
MS m/z(ESI):562.2[M+1]
I-30
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.87(s,1H),8.68(d,J=5.3Hz,1H),8.45(s,2H),8.38(s,1H),7.84(t,J=8.1Hz,2H),7.58(s,1H),7.50-7.38(m,2H),6.82(dd,J=24.4,8.7Hz,2H),5.03(s,1H),4.40(s,1H),4.18(s,2H),4.03(s,3H),3.32(s,2H),2.72(s,3H),2.13-1.85(m,4H).
MS m/z(ESI):557.2[M+1]
I-31
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.84(d,J=1.6Hz,1H),8.65(d,J=5.3Hz,1H),8.42(d,J=2.5Hz,1H),8.36(s,1H),7.80(dd,J=8.8,2.6Hz,1H),7.56(d,J=1.6Hz,1H),7.44(d,J=1.8Hz,1H),7.38(dd,J=5.2,1.8Hz,1H),6.75(d,J=8.9Hz,1H),4.40(d,J=6.7Hz,1H),4.31-4.26(m,1H),4.11-3.93(m,2H),3.72-3.47(m,4H),3.37(s,3H),3.32(dd,J=11.9,2.4Hz,1H),3.22(dd,J=12.0,2.4Hz,1H),2.69(s,3H),1.99(tdd,J=21.1,9.7,4.4Hz,4H),1.84(t,J=8.9Hz,2H).
MS m/z(ESI):549.2[M+1]
I-32
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.53(d,J=1.6Hz,1H),8.40(d,J=2.5Hz,1H),8.30(s,1H),7.80(dd,J=8.9,2.5Hz,1H),7.46(d,J=1.6Hz,1H),7.23(t,J=7.8Hz,1H),6.90-6.78(m,3H),6.65(d,J=8.8Hz,1H),6.35(p,J=1.6Hz,1H),4.67(d,J=5.9Hz,1H),4.54(s,1H),4.41(q,J=2.8Hz,2H),4.22-4.14(m,1H),4.02(t,J=5.4Hz,2H),3.84(s,2H),3.77(s,3H),3.68(d,J=11.3Hz,1H),3.55(d,J=6.8Hz,2H),2.80(p,J=7.0Hz,1H),2.58(dt,J=7.0,3.7Hz,2H),1.71(d,J=8.8Hz,1H).
MS m/z(ESI):547.2[M+1]
I-33
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.78(d,J=1.6Hz,1H),8.41-8.34(m,2H),8.13(d,J=2.3Hz,1H),7.75(dd,J=8.9,2.6Hz,1H),7.51-7.41(m,2H),6.87(d,J=2.1 Hz,1H),6.79(d,J=8.5Hz,1H),6.70(d,J=8.8Hz,1H),6.44(dd,J=7.1,2.1Hz,1H),3.97(s,5H),3.64(s,5H),3.38(s,2H),2.13-2.03(m,2H),1.86-1.67(m,2H).
MS m/z(ESI):556.2[M+1]
I-34
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.52(d,J=1.5Hz,1H),8.38(d,J=2.5Hz,1H),8.29(s,1H),7.81(d,J=8.8Hz,1H),7.44(d,J=1.5Hz,1H),7.35(t,J=7.9Hz,1H),7.25-7.20(m,2H),7.08-6.99(m,1H),6.70(d,J=9.1Hz,1H),6.34(s,1H),4.78(s,2H),4.40(q,J=2.8Hz,2H),4.01(t,J=5.5Hz,2H),3.86(s,3H),3.76(s,4H),2.96(q,J=7.1Hz,1H),2.57(s,2H),1.80(d,J=8.8Hz,1H).
MS m/z(ESI):533.2[M+1]
I-35
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.52(s,1H),8.38(d,J=2.2Hz,1H),8.29(s,1H),7.80(s,0H),7.66(d,J=8.7Hz,2H),7.44(s,1H),6.94(d,J=8.6Hz,2H),6.70(s,1H),6.33(s,1H),4.77(d,J=6.2Hz,2H),4.40(q,J=2.7Hz,2H),4.01(t,J=5.4Hz,2H),3.88(s,3H),3.73(d,J=27.9Hz,4H),2.95(d,J=7.7Hz,1H),2.57(s,2H),1.78(d,J=8.8Hz,1H).
MS m/z(ESI):533.2[M+1]
I-36
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.55-8.49(m,2H),8.38(d,J=2.5Hz,1H),8.29(s,1H),7.92(dd,J=8.6,2.4Hz,1H),7.81(d,J=8.7Hz,1H),7.44(d,J=1.6Hz,1H), 6.80(dd,J=8.6,0.7Hz,1H),6.70(d,J=9.0Hz,1H),6.34(s,1H),4.79(d,J=6.2Hz,2H),4.40(q,J=2.8Hz,2H),4.01(s,5H),3.81(d,J=15.1Hz,4H),2.98(q,J=7.2Hz,1H),2.57(d,J=1.8Hz,2H),1.81(d,J=8.9Hz,1H).
MS m/z(ESI):534.2[M+1]
实施例37
化合物I-37的制备
4-(6-(8-((6-甲氧基吡啶-3-基)甲基)-3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-3-基)吡啶-3-基)-6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈
在100mL单口瓶中加入4-(6-(3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-3-基)吡啶-3-基)-6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈(8-i)(100mg,0.24mmol),5-(氯甲基)-2-甲氧基吡啶1-m(55.8mg,0.35mmol),碳酸钾(65.3mg,0.47mmol)和10mL乙腈,60摄氏度反应过夜。待反应结束后将反应液倒入水中(100mL),用二氯甲烷萃取三次(30mL×3),合并有机相,将有机相用水(30mL×3)、饱和氯化钠水溶液(30mL)洗涤,无水硫酸钠干燥,滤液浓缩后硅胶柱层析纯化(二氯甲烷:甲醇=30:1)得到产物4-(6-(8-((6-甲氧基吡啶-3-基)甲基)-3,6-二氮杂二环[3.1.1]庚烷-3-基)吡啶-3-基)-6-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)吡唑[1,5-a]吡啶-3-腈(I-37)67mg,产率:52.1%。
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.80(d,J=1.6Hz,1H),8.47(d,J=2.4Hz,1H),8.37(s,1H),8.14(s,1H),7.84(dd,J=8.9,2.4Hz,1H),7.72(s,1H),7.52(d,J=1.7Hz,1H),7.47(d,J=7.1Hz,1H),6.89(d,J=2.1Hz,1H),6.74(dd,J=8.6,5.9Hz,2H),6.45(dd,J=7.0,2.1Hz,1H),3.91(d,J=27.9Hz,7H),3.64(s,6H),2.79(s,1H)1.52(m,2H).
MS m/z(ESI):545.2[M+1]
实施例38-实施例40
化合物I-38到化合物I-40的制备
参考化合物I-37的制备步骤,分别用3i、5i、和9i与合适的卤代物反应,得到化合物I-38,化合物I-39和化合物I-40,其结构及表征数据如下:
I-38
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.83(d,J=1.6Hz,1H),8.65(d,J=5.2Hz,1H),8.41(d,J=2.5Hz,1H),8.35(s,1H),8.10(d,J=2.3Hz,1H),7.78(dd,J=8.8,2.6Hz,1H),7.64(dd,J=8.5,2.4Hz,1H),7.55(d,J=1.6Hz,1H),7.42(d,J=1.7Hz,1H),7.36(dd,J=5.3,1.8Hz,1H),6.78(dd,J=12.0,8.6Hz,2H),3.96(s,3H),3.68(t,J=5.1Hz,4H),3.52(s,2H),2.68(s,3H),2.58(t,J=5.1Hz,4H).
MS m/z(ESI):517.2[M+1]
I-39
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.51(d,J=1.5Hz,1H),8.37–8.34(m,1H),8.29(s,1H),7.75(dd,J=8.8,2.6Hz,1H),7.51(s,1H),7.43(d,J=1.6Hz,1H),6.70(d,J=8.8Hz,1H),6.33(d,J=3.4Hz,1H),4.40(q,J=2.8Hz,2H),4.06–3.88(m,6H),3.72–3.29(m,3H),2.57(d,J=6.2Hz,2H),2.10(s,2H),1.79(d,J=70.8Hz,6H).
MS m/z(ESI):507.2[M+1]
I-40
1H NMR(400MHz,Chloroform-d)δ8.78(d,J=1.6Hz,0H),8.41–8.36(m,0H),8.36(s,0H),8.13(d,J=2.3Hz,0H),7.84–7.78(m,1H),7.75(dd,J=8.9,2.6Hz,0H),7.51–7.40(m,1H),6.87(d,J=2.1Hz,0H),6.79(d,J=8.5Hz,0H),6.70(d,J=8.8Hz,0H),6.44(dd,J=7.1,2.1Hz,0H),3.64(s,1H),3.60(s,1H),3.38(s,1H),3.26(s,1H),2.15–2.01(m,1H),1.82(d,J=8.1Hz,1H).
生物学评价
测试例1、本发明化合物对RET激酶活性的测定
本方法使用Cisbio公司的
酪氨酸激酶试剂盒(货号62TK0PEB),通过测定生物素化的多肽底物磷酸化程度,以时间分辨-荧光能量共振转移方法(TR-FRET)进行测定。人源RET蛋白(RET激酶)购买于Carna bioscience(日本,货号08-159-5μg)。
实验步骤如下:
(1)将待测化合物溶解于100%的DMSO中,使其终浓度为10mM。
(2)用46uL的100%DMSO溶解4uL步骤(1)配制的待测化合物溶液,将本步骤得到的溶液编为2号。
(3)将2号溶液进行后续梯度稀释,稀释倍数为5倍(即20μL的100%DMSO加5μL化合物),共稀释9个梯度,编号为3到11号。
注:2号不用于第(4)步的稀释。
(除特别说明,以下步骤均需要在冰上进行)
(4)用试剂盒(Cisbio,货号62TK0PEB)中提供的缓冲液对3到11号溶液继续进行梯度稀释,稀释倍数为20倍(即取1uL 3到11号溶液中分别加19μL缓冲液),编号分别为12-20。此时,12-20号体系中待测化合物的终浓度范围为3200nM~0.008nM(9个梯度),DMSO终浓度为2%。
(5)将步骤(4)中9个梯度浓度的待测化合物溶液按浓度依次加入384孔板中,每孔4μL,设置两个复孔。
(6)每孔加2μL的人源RET蛋白,冰上孵育10分钟。
(7)每孔加入2μL的ATP(Sigma#A7699)和2μL的生物素化多肽底物(Cisbio,货号62TK0PEB)启动磷酸化反应。在37℃下孵育半小时。
(8)每孔中加入5μL偶联有铕系元素化合物的抗磷酸化酪氨酸抗体(试剂盒内提供,货号62TK0PEB)和5μL偶联有修饰化的别藻蓝蛋白XL665的链霉亲和素(Cisbio,货号62TK0PEB)。
(9)室温下继续孵育1小时。孵育结束后,用酶标仪(BMG Labtech,型号:FLUOStar Omega)的TF-FRET模式测定各孔在激发波长为304nM,读取各孔在发射波长为615nM和665nM下的荧光强度,自动算出比值。
(10)通过与对照组荧光强度比值进行对比,计算化合物在各浓度下的抑制率,进而通过GraphPad Prism5以对数浓度-抑制率进行曲线拟合,计算化合物的IC
50值,见下表1。
选用的对照激酶为与RET激酶结构类似的另一种受体酪氨酸激酶KDR。购买自 Carna bioscience(日本,货号08-191-5μg)。梯度稀释步骤同RET激酶,使待测化合物在反应体系中的终浓度范围为16000nM~0.04nM,(用待测化合物进行步骤4的梯度稀释)其他反应条件同上,DMSO的终浓度为2%。待测化合物对KDR激酶抑制的IC
50值计算方法与RET激酶抑制的IC
50值计算方法相同。
表1.化合物对RET激酶和KDR激酶抑制的IC
50值
备注:
LOXO292的结构如下式所示,其制备方法参见WO2018071447的实施例163。
从上表可以看出,本发明的化合物对RET激酶活性具有显著的抑制作用。本发明化合物对于RET激酶的抑制活性优于对KDR激酶的抑制活性。因此本发明化合物可作为一类有效的选择性RET激酶抑制剂。
测试例2.本发明化合物对hERG抑制率的测定
表2
缩写 | 全称 |
CHO | 中国仓鼠卵巢细胞 |
DMSO | 二甲基亚砜 |
ECG | 心电图 |
EGTA | 乙二醇双(2-氨基乙醚)-N,N,N',N'-四乙酸 |
FBS | 胎牛血清 |
HEPES | N-(2-羟乙基)哌嗪-N'-(2-乙磺酸) |
hERG | 人类ether-a-go-go-related(乙醚相关)基因 |
QT | 心电图(ECG)中Q波和T波之间的时间 |
2.1细胞培养
2.1.1本试验所用的细胞为转染有hERG cDNA与稳定表达hERG通道的CHO细胞系(由丹麦Sophion Bioscience公司提供),细胞代数为P13–P14。细胞培养在含有下列成分的培养基中(皆来源于Invitrogen):Ham’s F12培养基,10%(v/v)灭活的胎牛血清,100μg/ml潮霉素B,100μg/ml Geneticin。
2.1.2 CHO hERG细胞生长于含上述培养液的培养皿中,并在37℃、含5%CO2的培养箱中进行培养。电生理实验之前24到48小时,CHO hERG细胞被转移到放置于培养皿中的圆形玻璃片上,并在以上相同的培养液及培养条件下生长。每个圆形玻片上CHO hERG细胞的密度需要达到绝大多数细胞是独立、单个的要求。
2.2实验溶液
下列溶液(由Sophion推荐)用于电生理记录。
表3 细胞内液和外液的组成成分
表4 试剂详细信息
试剂名称 | 货号 | 批号 | 分子量 | 供应商 |
NaCl | S1679-1KG | WXBC1368V | 58.44 | Sigma |
KCl | 31248-100G | WXBC2571V | 74.55 | Sigma |
CaCl2(1M solution) | 21114-1L | BCBM6063V | 110.98 | Sigma |
MgCl2·6H2O | M7304-100G | V900020-500G | 203.30 | Sigma |
HEPES | H3375-1KG | SLBP2246V | 238.30 | Sigma |
Glucose | G8270-1KG | WXBC2393V | 180.16 | Sigma |
EGTA | 03777-50G | SLBP2807V | 380.15 | Sigma |
Na2-ATP | A-7699-5G | SLBJ8915V | 551.14 | Sigma |
NaOH(2M solution) | 35254-1L | BCBG6297V | 40.00 | Sigma |
KOH | 232041-50G | SLBK9251V | 149.91 | Sigma |
2.3电生理记录系统
本实验采用手动膜片钳系统(HEKA EPC-10信号放大器及数字转换系统,购自德国HEKA Electronics)作全细胞电流的记录。表面生长有CHO hERG细胞的圆形玻片被放置于倒置显微镜下的电生理记录槽中。记录槽内以细胞外液作持续灌流(大约每分钟1毫升)。实验过程采用常规全细胞膜片钳电流记录技术。如无特殊说明,实验都是在常规室温下进行(25℃±2℃)。细胞钳制在-80mV的电压下。细胞钳制电压去极化到+20mV以激活hERG钾通道,5秒后再钳制到-50mV以消除失活 并产生尾电流。尾电流峰值用作hERG电流大小的数值。上述步骤所记录的hERG钾电流在记录槽内持续的细胞外液灌流下达到稳定后则可以叠加灌流待测试的药物,直到药物对hERG电流的抑制作用达到稳定状态。一般以最近的连续3个电流记录线重合作为判断是否稳定状态的标准。达到稳定态势以后以细胞外液灌流冲洗直到hERG电流回复到加药物之前的大小。一个细胞上可以测试一个或多个药物,或者同一种药物的多个浓度,但是在不同药物之间需要以细胞外液冲洗。Cisapride(西沙必利,购自Sigma)被用于实验中作为阳性对照以保证所使用的细胞质量正常。
2.4化合物处理和稀释
为了取得化合物的IC50,我们选择了下列浓度(30,10,3,1,0.3和0.1μM)来作测试。在试验之前,用DMSO(Cat#:V900090-500ML,Lot#WXBC6681V,Sigma)以梯度稀释的方式稀释成10,3,1,0.3和0.1mM的贮备液,用细胞外液稀释成最终的0.1μM测试浓度。各浓度化合物溶液中DMSO的最终浓度都为0.1μM,阳性对照Cisapride(西沙比利)的测试浓度为0.1μM。所有的化合物溶液都经过常规的5到10分钟超声和振荡以保证化合物完全溶解。
2.5数据分析
试验数据由HEKA Patchmaster(V2x73.2),Microsoft Excel以及Graphpad Prism 5.0提供的数据分析软件进行分析。
2.6质量控制
报告中的试验数据需要满足以下标准:
记录参数
膜电阻Rm>500MΩ
接入电阻(Ra)<10MΩ
尾电流幅度>300pA
电流rundown(自发性减小)每分钟<2%
漏电流<200pA或者hERG电流峰值的10%(在90%的记录时间之内)
药理学参数
0.1μM的西沙比利(C4740-10mg,Sigma)阻断超过50%的hERG电流作为阳性对照。
表5 本发明化合物的hERG抑制率。
化合物 | %of hERG inhibition at 1μM | %of hERG inhibition at 10μM |
I-1 | -0.91±5.02 | 27.53±4.92 |
I-12 | 1.37±5.32 | 1.51±3.53 |
I-16 | 5.46±3.17 | 20.82±4.37 |
I-40 | 2.59±1.33 | 40.84±0.46 |
LOXO-292 | 32.99±2.02 | 76.52±0.56 |
从上表可以看出,本发明的化合物在10μM浓度下对hERG阻断百分比小于百分之五十,在相同条件下对照LOXO-292化合物对hERG阻断百分比远远大于百分之五十,本发明化合物具有良好的hERG安全性。因此本发明化合物可作为一类安全的RET激酶抑制剂。
综上所述,本发明化合物对RET激酶活性具有显著的抑制作用,具有良好的RET/KDR选择性,具有良好的hERG安全性,因此,本发明化合物可作为一类选择性转染期间重排(RET)激酶抑制剂,可以解决未满足的医疗需求。
Claims (11)
- 一种式(I)所示的化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐:其中:X 1、X 2各自独立地选自CH或N;L选自:其中L的两端点任选与A和R 2相连接;A选自4~6元单环杂环基、-NH-4~6元杂环基、7~11元桥杂环基、7~11元螺杂环基或7~11元稠环杂环基,其中所述的单环杂环基、-NH-4~6元杂环基、桥杂环基、螺杂环基或稠环杂环基任选进一步被一个或多个选自C 1-C 3烷基、羟基烷基、卤代C 1-C 3烷基、羟基、C 3-C 6环烷基或=O的取代基所取代;R 1选自:C 3-C 6环烷基、3~6元杂环基、6~7元杂芳基或7~11元的稠杂环基,其中所述的环烷基、杂环基任选进一步被一个或多个选自羟基、羟基烷基、氨基、C 1-C 3烷基、C 1-C 3烷氧基、卤代C 1-C 3烷基、卤代C 1-C 3烷氧基的取代基所取代;所述的杂芳基、稠杂环基任选进一步被一个多个选自卤素、羟基、氨基、C 1-C 3烷基、C 1-C 3烷氧基、卤代C 1-C 3烷基、卤代C 1-C 3烷氧基、C 3-C 6环烷基、-NHR 3、-NR 3R 4或=O的取代基所取代;R 2选自C 1-C 6烷基、C 3-C 6环烷基、3~6元杂环基、芳基或杂芳基,其中所述的烷基、环烷基、杂环基、芳基或杂芳基任选进一步被一个或多个选自卤素、羟基、氰基、C 1-C 3烷基、C 1-C 3烷氧基、卤代C 1-C 3烷基、卤代C 1-C 3烷氧基、C 3-C 6环烷 基、-NHR 3、-NR 3R 4或=O的取代基所取代;R 3、R 4各自独立地选自C 1-C 6烷基;其中上述所述的卤代C 1-C 3烷基或卤代C 1-C 3烷氧基优选为1~3个氟代的C 1-C 3烷基或C 1-C 3烷氧基。
- 根据权利要求1或2所述的化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,其中R 2选自C 1-C 6烷基、C 4-C 6环烷基、4~6元杂环基、苯基、5~6元杂芳基或10元杂芳基,其中所述的C 4-C 6环烷基、4~6元杂环基、苯基、5~6元杂芳基或10元杂芳基任选进一步被一个或多个选自氰基、卤素、羟基、C 1-C 3烷基、 C 1-C 3烷氧基、卤代C 1-C 3烷基、卤代C 1-C 3烷氧基或=O的取代基所取代。
- 制备根据权利要求1所述的式(I)化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐的方法,所述方法包括:方法1:化合物(IA)和化合物(IB)在碱性条件下,在缩合试剂存在下反应,得到式(I)化合物;其中:所述的缩合试剂选自2-(7-氧化苯并三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸酯、二环己基碳二亚胺、1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐、N,N’-二环己基碳化二亚胺、N,N’-二异丙基碳二酰亚胺、1-羟基-7-偶氮苯并三氮唑、1H-苯并三唑-1-基氧三吡咯烷基六氟磷酸盐、2-(7-偶氮苯并三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸酯、五氟苯基二苯基磷酸酯、苯并三氮唑-1-基氧基三(二甲基氨基)磷鎓六氟磷酸盐或六氟磷酸苯并三唑-1-基-氧基三吡咯烷基磷;优选为2-(7-偶氮苯并三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸酯、2-(7-氧化苯并三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸酯或六氟磷酸苯并三唑-1-基-氧基三吡咯烷基磷;所述碱性条件的提供试剂为有机碱,所述的有机碱选自N,N-二异丙基乙胺、吡 啶、三乙胺、哌啶、N-甲基哌嗪和4-二甲氨吡啶,优选为N,N-二异丙基乙基胺或三乙胺;A、L、X 1、X 2、R 1和R 2的定义如权利要求1所述;或者方法2:将化合物(IA)和化合物(IB)在碱性条件下反应,得到式(I)化合物;其中:所述碱性条件的提供试剂为无机碱,其中所述的无机碱选自磷酸钾、三水合磷酸钾、乙酸钾、氢氧化钠、氢氧化钾、氢氧化锂、碳酸钠、碳酸钾、碳酸铯、氢化钠和氢化钾,优选为碳酸钠或碳酸钾;G选自离去基团,优选为卤素;A、L、X 1、X 2、R 1和R 2的定义如权利要求1所述。
- 一种药物组合物,所述的药物组合物含有有效剂量的根据权利要求1~7中任一项所述的化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,及可药用的载体、赋形剂或它们的组合。
- 根据权利要求1~7中任一项所述的化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,或根据权利要求9所述的药物组合物在制备转染期间重排激酶抑制剂中的用途。
- 根据权利要求1~7中任一项所述的化合物或其立体异构体、互变异构体或其药学上可接受的盐,或根据权利要求9所述的药物组合物在制备治疗由转染期间重排基因驱动的疾病的药物中的用途,其中所述的疾病优选为癌症,其中所述的癌症优选为肺癌、甲状腺癌、结肠癌、乳腺癌或胰腺癌。
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