WO2020122427A1 - 말디-토프 질량분석기를 이용한 메티실린-내성 황색포도구균 균류의 동정방법 - Google Patents

말디-토프 질량분석기를 이용한 메티실린-내성 황색포도구균 균류의 동정방법 Download PDF

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WO2020122427A1
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WO
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charge ratio
sample
mrsa
mass charge
value
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PCT/KR2019/015063
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Inventor
김재석
김정민
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한림대학교 산학협력단
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    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6803—General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
    • G01N33/6848—Methods of protein analysis involving mass spectrometry
    • G01N33/6851—Methods of protein analysis involving laser desorption ionisation mass spectrometry
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    • G01N2333/195—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from bacteria
    • G01N2333/305—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from bacteria from Micrococcaceae (F)
    • G01N2333/31—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from bacteria from Micrococcaceae (F) from Staphylococcus (G)

Definitions

  • the present invention is a methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) mass spectrometer without performing an antibiotic resistance test, preferably a Maldi-Top mass spectrometer (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-Of-Flight Mass Spectrometer) ; MALDI-TOF MS).
  • MRSA methicillin-resistant Staphylococcus aureus
  • Staphylococcus aureus is the most representative pathogen that can cause disease in the human body, and is a bacterium on human skin. Staphylococcus aureus is a Gram-positive bacterium, and belongs to a coccus form of colony. It does not form spores and is classified as Facultative anaerobes.
  • methicillin-resistant Staphylococcus aureus MRSA
  • mecA methicillin resistance determinant A
  • PBP2a penicillin-binding protein 2a
  • methicillin resistance is not limited to PBP2a, but several mechanisms are involved, but the mecA gene and PBP2a are still important.
  • mecA gene detection through biochemical tests or PCR by automated machines is mainly used.
  • mass spectrometer the identification of microorganisms using protein analysis through a mass spectrometer (Mass spectrometer) is suitable for the identification of microorganisms that require rapid and accurate.
  • the mass spectrometer basically consists of three parts: an ionization part, an analyzer part, and a detector.
  • the mass spectrometer can be classified according to the type of ionization part and analyzer part used.
  • Mass spectrometry using a Maldi-Top mass spectrometer has recently become a common method for microbial identification in clinical laboratories. Microbial identification using a Maldi-Top mass spectrometer directly analyzes the cells without complicated pretreatment, so the identification time is only 5 minutes per species. Maldi-Top mass spectrometers identify bacteria with different patterns of bacterial peptides or protein spectra within a mass range between 2,000 and 20,000 Da. Since methicillin resistance is due to the PBP2a protein, an accurate test can be performed if it can be detected directly, but due to the large mass of 76 kDa, direct detection using a Maldi-Top mass spectrometer is difficult.
  • MRSAs express PSM-mec proteins having a mass charge ratio (m/z) value of 2415, they can be identified by a Maldi-Top mass spectrometer, but this has a problem that only about 36% of the total MRSA can be identified. Therefore, research is needed to identify the remaining 64% of MRSA.
  • the present inventors are not a method of identification using a single MRSA-specific mass charge ratio value, but a method of combining and selecting them as follows, and a method of sorting using a mass charge ratio value step by step, and identifying them by dividing a group.
  • the invention was completed.
  • One aspect is a method of identifying a methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) fungus, comprising: dropping a sample on a target plate; Treating the matrix solution on the target plate and drying it to analyze it with a mass spectrometer (MS); And identifying at least one MRSA-specific mass charge ratio value from the mass charge ratio (m/z) value of the sample.
  • MRSA methicillin-resistant Staphylococcus aureus
  • Another aspect is to provide an MRSA identification method comprising the step of confirming that a sample has a mass charge ratio (m/z) value of 2415 (PSM-mec).
  • One aspect is a method for identifying a methicillin-resistant Staphylococcus aureus fungus, comprising: dropping a sample on a target plate; After processing the matrix solution on the target plate and dried to analyze with a mass spectrometer (MS); And one or more MRSA-specific mass charges selected from the group consisting of 1975, 2116, 2134, 2205, 2275, 2415, 2593, 2877, 3891, 4607, 6593, and 9217 in the mass charge ratio (m/z) value of the sample.
  • MS mass spectrometer
  • MRSA-specific mass charges selected from the group consisting of 1975, 2116, 2134, 2205, 2275, 2415, 2593, 2877, 3891, 4607, 6593, and 9217 in the mass charge ratio (m/z) value of the sample.
  • an MRSA identification method comprising the step of identifying a ratio value.
  • MRSA Staphylococcus aureus resistant to beta-lactam antibiotics.
  • Antibiotic resistance refers to drug resistance that allows microorganisms to survive exposure to antibiotics.
  • the term'identity' is to identify the species of the target microorganism and find out what characteristics it belongs to and where it belongs.
  • the mass spectrometer may include a Maldi-Top mass spectrometer.
  • the Maldi-Top mass spectrometer can ionize a sample by the principle of ionizing a solid sample using a support.
  • the analyzer serves to trap the ionized peptide through the ESI or LDI in a mass spectrometer and measure the mass, and the mass can be measured through a time of flight mass analyzer (TOF) method.
  • TOF time of flight mass analyzer
  • m/z unit'mass charge ratio value (m/z)' is the theoretical part of all mass spectrometers, based on Newton's second law of thermodynamics and Lorentz's law of mechanics. For both the electric and magnetic fields given by these two theories, the motion of an ion is determined by the mass and charge amount of the ion, which means the ratio of the mass and charge amount.
  • Checking the mass charge ratio value means comparing the mass charge ratio value of the sample detected through the mass spectrometer with the specific mass charge ratio value of the fungus for identification purposes.
  • the mass charge ratio may be within an error range (m/z) of ⁇ 4, ⁇ 3, ⁇ 2.5, ⁇ 2, ⁇ 1.5, ⁇ 0.5, ⁇ 0.1, and ⁇ 0.01.
  • MRSA-specific mass charge ratio values may be 1975, 2116, 2134, 2205, 2275, 2415, 2593, 2877, 3891, 4607, 6593, and 9217.
  • the specific mass charge ratio value may be determined by rounding off the first decimal place. For example, 2415 may be rounded up at 2415.3.
  • sample' refers to a substance or organism that is subject to testing, inspection, and analysis.
  • dropping a sample onto a target plate may include dropping directly onto the target plate without any pretreatment.
  • the method may include the step of drying the plate after the dropping of the sample and adding, but not limited to, trifluoro acetic acid (TFA).
  • the method may further include drying the plate again.
  • the sample when the value of the mass charge ratio of the sample is identified as the value of the MRSA-specific mass charge ratio, the sample may be determined to contain MRSA fungi.
  • the method confirms two or more MRSA-specific mass charge ratio values selected from the group consisting of 1975, 2116, 2134, 2205, 2275, 2415, 2593, 2877, 3891, 4607, 6593, and 9217 from the sample mass charge ratio values. It may further include a step.
  • the value of two or more MRSA-specific mass charge ratios selected in the above method may be a high sensitivity mass transfer ratio value among the group consisting of 1975, 2116, 2134, 2205, 2275, 2415, 2593, 2877, 3891, 4607, 6593, and 9217 Can be.
  • the term'sensitivity' refers to the probability that, if the sample contains MRSA, it will be included in the test results.
  • the term'specificity' refers to the probability that, if the sample does not contain MRSA, it will appear as not included in the test results.
  • the sample is MRSA fungi It may be determined to include.
  • the method is characterized in that at least one methicillin-sensitive Staphylococcus aureus (MSSA) specific mass charge rate value selected from the group consisting of 2085, 2193, 2233, 2303, 2340, 2631, 2669, 2748, 2767, 3035, and 5507 in the sample It may further include the step of confirming.
  • MSSA methicillin-sensitive Staphylococcus aureus
  • the MSSA-specific mass charge ratio values may be 2085, 2193, 2233, 2303, 2340, 2631, 2669, 2748, 2767, 3035, and 5507.
  • the specific mass charge ratio value may be determined by rounding off the first decimal place.
  • Metalicillin-sensitive Staphylococcus aureus refers to Staphylococcus aureus that is susceptible to beta-lactam antibiotics. Antibiotic susceptibility refers to the degree to which a pathogen is killed or inhibited by a particular antibiotic.
  • the sample when the mass charge ratio value of the sample is found to include 1975, 2275, and 2415 of the MRSA-specific mass charge ratio values, and the sample does not contain the MSSA-specific mass charge ratio value 2631, the sample May be determined to include MRSA fungi.
  • Another aspect is a method for identifying a methicillin-resistant Staphylococcus aureus fungus, comprising: dropping a sample on a target plate; Treating the matrix solution on the target plate and drying it to analyze with a mass spectrometer; And 2415 of MRSA-specific mass charge ratio values, wherein the sample has a mass charge ratio (m/z) value of 1975, 2116, 2134, 2205, 2275, 2415, 2593, 2877, 3891, 4607, 6593, and 9217. It provides a method for identifying MRSA comprising the step of confirming that it includes.
  • the method may be to determine that the sample contains MRSA fungus, if the sample is found to contain MRSA-specific mass charge ratio value 2415.
  • the method further includes confirming that the mass charge ratio value of the sample includes 5539 of the MRSA-specific mass charge ratio value. Can be.
  • the method may further include the step of confirming that the sample contains 5073 of the MRSA-specific mass charge ratio value when it is determined that the sample contains 5539 of the MRSA-specific mass charge ratio value.
  • the method may be to determine that the sample contains MRSA fungus, when the sample is found to contain 5073 of the MRSA-specific mass charge ratio value.
  • the sample is determined to contain MRSA fungus, and the MRSA fungus may include MRSA SCC mec type IV. .
  • the MRSA SCC mec type IV fungus is a fungus belonging to MRSA, and may belong to one of various types of classification of MRSA. Most MRSA found in Korea can be SCC mec type II. In the case of community infection, it may be SCC mec type IV. The MRSA SCC mec type IV may be susceptible to various antibiotics compared to other types of MRSA.
  • the method may be to determine that the sample does not contain MRSA fungus, when it is determined that the sample contains 5539 of MRSA-specific mass charge ratio values but does not contain 5073.
  • the method was determined from the group consisting of 2085, 2193, 2233, 2303, 2340, 2631, 2767, 3035, and 5507 in the sample when it was confirmed that the sample does not contain 2415 and 5539 of MRSA-specific mass charge ratio values. It may further comprise the step of identifying the selected one or more MSSA-specific mass charge ratio values.
  • the method may be to determine that the sample contains MRSA fungus, when it is determined that the sample does not contain the MSSA-specific mass charge ratio value.
  • the method may be to determine that the sample does not contain MRSA fungus, when the sample is found to contain the MSSA-specific mass charge ratio value.
  • the MRSA identification method does not confirm a single MRSA-specific mass charge ratio value, but selects and identifies samples having two to three mass charge ratio combinations, thereby significantly more sensitive than the conventional identification method. Provide an elevated identification method.
  • the MRSA identification method provides an invention of a method of selecting a sample having a specific mass charge ratio step by step, and dividing and identifying a group, rather than confirming a single MRSA-specific mass charge ratio value.
  • each branch point is a step of confirming the presence or absence of a value for each mass charge ratio, and each end point is frozen to the determined ratio of MRSA and MSSA.
  • Staphylococcus aureus isolated from the blood culture of Staphylococcus aureus patients is used.
  • 208 strains identified as MRSA and 116 strains identified as MSSA were cultured according to the expression of mecA gene.
  • Each strain used a strain isolated from the Department of Diagnostic Testing, Gangdong Sacred Heart Hospital, and cultured in a medium containing 5% (v/v) blood.
  • a single colony of MRSA strain cultured in Reference Example 1 was buried in a toothpick and added to a Maldi-Top target plate. After dripping, the target plate was dried at room temperature for 5 minutes. Then, 1 ⁇ l of 4% (v/v) trifluoroacetic acid (TFA) was added. After addition, it was dried for 5 minutes at room temperature again. After drying, 1 ⁇ l of the matrix solution was added onto a single colony dropped on the target plate, and then dried at room temperature for 5 minutes. It was then analyzed with a Maldi-Toff mass spectrometer (Bruker, Germany).
  • MRSA-specific mass charge ratio (m/z) values were 1975 (1974.7), 2116 (2115.8, type II), 2134 (2133.7, type II), 2205 (2204.9), One or more selected from the group consisting of 2275 (2275.1), 2415 (2411.3), 2593 (2592.8, type II), 2877 (2877.1), 3891 (3891.1), 4607 (4606.7), 6593 (6593.0), and 9217 (9216.8) It was confirmed that the value, each measurement value was within the error range ( ⁇ 4).
  • MSSA-specific mass charge ratio (m/z) values are 2085 (2084.8), 2193 (2192.9), 2233 (2233.3), 2303 (2302.6), 2340 (2340.5), 2631 (2630.7), 2669 (2668.5), It was confirmed that it was one or more values selected from the group consisting of 2748 (2748.4), 2767 (2766.9), 3035 (3034.6), and 5507 (5506.9). Each measurement value was within the error range ( ⁇ 4).
  • Example 1 Identification method of MRSA using a combination of mass charge ratios
  • strains having two or three MRSA-specific mass charge ratio values which are considered to have high sensitivity, were selected. That is, strains containing mass charge ratios 1975 (52.4% sensitivity) and 2275 (45.7% sensitivity), strains containing 1975 and 2415 (36.5% sensitivity), and strains containing 1975, 2275 and 2415 were selected. Among these, strains containing 2085 (specificity 99%), which has the highest specificity among MSSA-specific mass charge ratio values, were selected and selected. The fungi and number, sensitivity, specificity, positive predictive rate and negative predictive rate of the selected strains were calculated.
  • any one of 19 (R groups 1 to 8; S groups 9 to 17, 22 and 23) in Table 1 Twenty-nine strains that were not detected were excluded as impossible to determine. Among the remaining 295 fungi in which one or more of the 19 mass charge ratio values were detected, 77 fungi with a mass charge ratio value of 2415 (2411.3) were identified (end point 1: 76 MRSA strains, 1 MSSA strain). .
  • MRSA SCC mec type IV
  • SCC mec type IV MRSA (SCC mec type IV) in the sensitivity and specificity of a high degree of mass charge ratio value 5539 (5539.7) was detected strain 40 to distinguish Dogs were selected.
  • 23 strains with a high sensitivity and specificity of mass charge ratio value 5073 (5073.6) for MRSA (SCC mec type IV) were selected and identified.
  • End point 2 14 MRSA strains, 9 MSSA strains.
  • 17 strains with a mass charge ratio value of 5539 detected but not 5073 were identified as MSSA (end point 3, MRSA strain 4, MSSA strain 13).

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Abstract

본 발명은 메티실린 내성 황색포도구균(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus: MRSA)을 항생제 내성검사 수행 없이 말디-토프 질량분석기를 이용하여, 신속하게 동정하는 방법을 제공한다. MRSA-특이 질량전하비율 값 중 민감도가 높은 값 2개 또는 3개를 포함하는 시료를 선별하고, 이 중에서 메티실린 감수성 황색포도구균(Methicillin-sensitive Staphylococcus aureus: MSSA) 특이 질량전하비율 값을 갖는 시료를 제외하는 동정 방법과, 단계적으로 질량전하비율 값을 갖는 시료를 선별하고, 그룹을 이용하는 동정 방법을 제공한다.

Description

말디-토프 질량분석기를 이용한 메티실린-내성 황색포도구균 균류의 동정방법
본 발명은 메티실린 내성 황색포도구균(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus: MRSA)을 항생제 내성검사 수행 없이 질량분석기, 바람직하게는 말디-토프 질량분석기(Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-Of-Flight Mass Spectrometer; MALDI-TOF MS)를 이용하여 신속하게 동정하는 방법에 관한 것이다.
황색포도구균은 인체에 질병을 발생시킬 수 있는 가장 대표적인 병원균주로 인간의 피부에 상재하는 균이다. 황색포도구균은 그람(Gram) 양성균으로서, 군집을 형성하는 형태의 구균(coccus)에 속한다. 아포는 형성하지 않으며, 조건 혐기성균(Facultative anaerobes)으로 분류된다.
1961년 메티실린 내성인 황색포도구균이 발견된 후, 메티실린 내성 황색포도구균(MRSA) 감염은 임상에서 크게 증가하였다. MRSA는 mecA (methicillin resistance determinant A) 유전자를 외부로부터 획득하여 베타 락탐(β-lactam) 계열 항균제와 친화력이 떨어지는 penicillin-binding protein 2a(PBP2a)를 발현시켜 항균제 작용이 억제된다. 최근 보고에 의하면 메티실린 내성이 PBP2a에 국한되지 않고 여러 기전이 관여 하는 것이 밝혀졌지만, 여전히 mecA 유전자와 PBP2a가 중요시 되고 있다. 임상에서 메티실린 내성 여부를 검사하는 방법으로 자동화 기계에 의한 생화학적 검사 혹은 PCR을 통한 mecA 유전자 검출이 주로 이용되고 있다.
한편, 질량 분석기(Mass spectrometer)를 통한 단백질 분석을 이용한 미생물의 동정은 신속하고 정확성이 필요한 미생물 동정에 적합하다. 질량 분석기는 기본적으로 이온화 부분, 분석기 부분, 검출기의 세 부분으로 이루어져 있는데, 사용하는 이온화 부분, 분석기부분의 종류에 따라 질량 분석기를 구분할 수 있다.
말디-토프 질량 분석기를 이용한 질량 분석법은 최근 임상검사실에서 미생물 동정 검사방법으로 보편화되고 있다. 말디-토프 질량 분석기를 이용한 미생물 동정은 복잡한 전처리 없이 균체를 직접적으로 분석함으로써 동정에 소요되는 시간은 한 균종 당 불과 5분 정도이다. 말디-토프 질량 분석기는 2,000에서 20,000 Da 사이의 질량 범위 내에서 서로 다른 패턴의 세균 펩타이드 혹은 단백 스펙트럼으로 균을 동정한다. 메티실린 내성이 PBP2a 단백에 기인하므로 직접적으로 이를 검출할 수 있다면 정확한 검사를 수행할 수 있겠지만, 76 kDa의 큰 질량 때문에 말디-토프 질량 분석기를 이용한 직접적인 검출이 어렵다.
일부 MRSA가 질량전하비율(m/z) 값 2415을 갖는 PSM-mec 단백질을 발현하여 말디-토프 질량 분석기로 동정이 가능하지만 이는 전체 MRSA의 약 36% 밖에 동정할 수 없는 문제점이 있다. 따라서 나머지 64%의 MRSA를 동정할 수 있는 방법의 연구가 필요하다.
이에 본 발명자들은 단일 MRSA-특이 질량전하비율 값을 이용한 동정방법이 아닌, 하기와 같이 이를 조합하고 선별하여 동정하는 방법과, 단계적으로 질량전하비율 값을 이용하여 선별하고, 그룹을 나누어 동정하는 방법의 발명을 완성하였다.
일 양상은 메티실린-내성 황색포도구균(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus: MRSA) 균류의 동정 방법으로서, 시료를 타겟 플레이트 위에 점적하는 단계; 매트릭스 용액을 상기 타겟 플레이트에 처리한 후 건조시켜 질량분석기(Mass Spectrometer : MS)로 분석하는 단계; 및 상기 시료의 질량전하비율(m/z) 값에서 하나 이상의 MRSA-특이 질량전하비율 값을 확인하는 단계를 포함하는 MRSA 동정 방법을 제공하는 것이다.
다른 일 양상은 시료의 질량전하비율(m/z) 값이 2415(PSM-mec)를 포함하는지 확인하는 단계를 포함하는 MRSA 동정 방법을 제공하는 것이다.
일 양상은 메티실린-내성 황색포도구균 균류의 동정 방법으로서, 시료를 타겟 플레이트 위에 점적하는 단계; 매트릭스 용액을 상기 타겟 플레이트에 처리한 후 건조시켜 질량분석기(MS)로 분석하는 단계; 및 상기 시료의 질량전하비율(m/z) 값에서 1975, 2116, 2134, 2205, 2275, 2415, 2593, 2877, 3891, 4607, 6593, 및 9217로 이루어지는 군으로부터 선택된 하나 이상의 MRSA-특이 질량전하비율 값을 확인하는 단계를 포함하는 MRSA 동정 방법을 제공한다.
용어 'MRSA'는 베타 락탐 (β-lactam) 항생제에 내성을 갖는 황색포도구균을 의미한다. 항생제 내성이란 미생물이 항생제에 노출되어도 생존할 수 있는 약제 내성을 의미한다.
용어 '동정'이란 대상 미생물의 종을 판별하여 어떠한 특성이 있고 어디에 속하는지를 알아내는 것이다.
상기 질량 분석기는 말디-토프 질량 분석기를 포함하는 것일 수 있다. 말디-토프 질량 분석기는 지지체를 이용하여 고체 시료를 이온화하는 원리에 의하여 시료를 이온화 시킬 수 있다. 분석기는 ESI또는 LDI를 통해 이온화된 펩타이드를 질량 분석기 안에 가두고 질량을 측정하는 역할을 하며 토프 (time of flight mass analyzer: TOF) 방식을 통해 질량을 측정할 수 있다.
용어 내지 단위 '질량전하비율 값(m/z)'은 모든 질량분석기에 쓰이는 이론적 부분으로써, 뉴턴의 제2 열역학 법칙과 로렌츠의 역학 법칙에 근거한다. 이 두 이론으로부터 주어진 전기장과 자기장에 대해, 이온의 운동이 그 이온의 질량과 전하량에 의해 결정되는데, 이러한 질량과 전하량의 비를 의미한다.
질량전하비율 값을 확인한다는 것은 질량 분석기를 통해서 검출된 시료의 질량전하비율 값과 동정 목적이 되는 균류의 특이 질량전하비율 값을 상호 비교하는 것을 의미한다.
질량전하비율은 그 오차범위(m/z)가 ±4, ±3, ±2.5, ±2, ±1.5, ±0.5, ±0.1, 및 ±0.01 이내일 수 있다.
MRSA-특이 질량전하비율 값(m/z)은 1975, 2116, 2134, 2205, 2275, 2415, 2593, 2877, 3891, 4607, 6593, 및 9217일 수 있다. 상기 특이 질량전하비율 값은 소수 첫째 자리에서 반올림하여 결정된 것일 수 있다. 예를 들면, 2415는 2415.3에서 반올림된 것일 수 있다.
용어 '시료'는 시험, 검사, 및 분석 등의 대상이 되는 물질이나 생물을 의미한다.
상기 방법에서 시료를 타겟 플레이트 위에 점적하는 단계는 아무런 전처리 없이 타겟 플레이트 위에 직접 점적하는 단계를 포함할 수 있다.
상기 방법은 상기 시료의 점적 이후, 상기 플레이트를 건조시키고, 이에 한정되는 것은 아니지만 트리플루오로 아세트산(trifluoro acetic acid: TFA)을 추가하는 단계를 포함할 수 있다. 상기 방법은 다시 상기 플레이트를 건조시키는 단계를 더 포함할 수 있다.
상기 방법은 시료의 질량전하비율 값이 상기 MRSA-특이 질량전하비율 값으로 확인된 경우, 상기 시료는 MRSA 균류를 포함하는 것으로 결정하는 것일 수 있다.
상기 방법은 시료의 질량전하비율 값에서 1975, 2116, 2134, 2205, 2275, 2415, 2593, 2877, 3891, 4607, 6593, 및 9217로 이루어지는 군으로부터 선택된 둘 이상의 MRSA-특이 질량전하비율 값을 확인하는 단계를 더 포함할 수 있다.
상기 방법에서 선택되는 둘 이상의 MRSA-특이 질량전하비율 값은 1975, 2116, 2134, 2205, 2275, 2415, 2593, 2877, 3891, 4607, 6593, 및 9217로 이루어지는 군 중에서 민감도가 높은 질량전하비율 값일 수 있다.
용어 '민감도(sensitivity)'란 시료에 MRSA를 포함하고 있을 경우, 검사 결과상 포함하는 것으로 나올 확률을 의미한다.
용어 '특이도(specificity)'란 시료에 MRSA를 포함하고 있지 않을 경우, 검사 결과상 포함하지 않는 것으로 나올 확률을 의미한다.
상기 방법은 상기 시료의 질량전하비율 값이 상기 MRSA-특이 질량전하비율 값 중 1975와 2275, 1975와 2415, 및 1975, 2275 및 2415 중 어느 하나를 포함하는 것으로 확인된 경우, 상기 시료는 MRSA 균류를 포함하는 것으로 결정하는 것일 수 있다.
상기 방법은 상기 시료에서 2085, 2193, 2233, 2303, 2340, 2631, 2669, 2748, 2767, 3035, 및 5507로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 메티실린 감수성 황색포도구균 (MSSA) 특이 질량전하비율 값을 확인하는 단계를 더 포함할 수 있다.
상기 MSSA-특이 질량전하비율 값(m/z)은 2085, 2193, 2233, 2303, 2340, 2631, 2669, 2748, 2767, 3035, 및 5507일 수 있다. 상기 특이 질량전하비율 값은 소수 첫째 자리에서 반올림하여 결정된 것일 수 있다.
'메티실린 감수성 황색포도구균'이란 베타 락탐 항생제에 감수성을 나타내는 황색포도구균을 의미한다. 항생제 감수성이란 어떤 병원균이 특정 항생제에 의해 죽거나 억제되는 정도를 의미한다.
상기 방법은 시료의 질량전하비율 값이 상기 MRSA-특이 질량전하비율 값 중 1975, 2275 및 2415을 포함하고, 상기 시료가 MSSA-특이 질량전하비율 값 2631을 포함하지 않는 것으로 확인된 경우, 상기 시료는 MRSA 균류를 포함하는 것으로 결정하는 것일 수 있다.
다른 일 양상은 메티실린-내성 황색포도구균 균류의 동정 방법으로서, 시료를 타겟 플레이트 위에 점적하는 단계; 매트릭스 용액을 상기 타겟 플레이트에 처리한 후 건조시켜 질량분석기로 분석하는 단계; 및 상기 시료의 질량전하비율(m/z) 값이 1975, 2116, 2134, 2205, 2275, 2415, 2593, 2877, 3891, 4607, 6593, 및 9217로 이루어지는 MRSA-특이 질량전하비율 값 중 2415을 포함하는지 확인하는 단계를 포함하는 MRSA 동정 방법을 제공한다.
상기 방법은 시료가 MRSA-특이 질량전하비율 값 2415을 포함하는 것으로 확인된 경우, 상기 시료는 MRSA 균류를 포함하는 것으로 결정하는 것일 수 있다.
상기 방법은 시료가 MRSA-특이 질량전하비율 값 2415을 포함하지 않는 것으로 확인된 경우, 상기 시료의 질량전하비율 값이 MRSA-특이 질량전하비율 값 중 5539을 포함하는지 확인하는 단계를 더 포함하는 것일 수 있다.
상기 방법은 상기 시료가 MRSA-특이 질량전하비율 값 중 5539를 포함하는 것으로 확인된 경우, 상기 시료가 MRSA-특이 질량전하비율 값 중 5073을 포함하는지 확인하는 단계를 더 포함하는 것일 수 있다.
상기 방법은 상기 시료가 MRSA-특이 질량전하비율 값 중 5073을 포함하는 것으로 확인된 경우, 상기 시료는 MRSA 균류를 포함하는 것으로 결정하는 것일 수 있다.
상기 방법은 상기 시료가 MRSA-특이 질량전하비율 값 중 5073을 포함하는 것으로 확인된 경우, 상기 시료는 MRSA 균류를 포함하는 것으로 결정하고, 상기 MRSA 균류는 MRSA SCCmec type IV를 포함하는 것일 수 있다.
상기 MRSA SCCmec type IV 균류는 MRSA에 속하는 균류로서, MRSA의 다양한 분류 형태 중 하나에 속할 수 있다. 대한민국에서 발견되는 대부분의 MRSA는 SCCmec type II일 수 있다. 지역사회 감염의 경우 SCCmec type IV일 수 있다. 상기 MRSA SCCmec type IV는 다른 타입의 MRSA에 비하여 다양한 항생제에 감수성을 가질 수 있다.
상기 방법은 시료가 MRSA-특이 질량전하비율 값 중 5539는 포함하지만, 5073을 포함하지 않는 것으로 확인된 경우, 상기 시료는 MRSA 균류를 포함하지 않는 것으로 결정하는 것일 수 있다.
상기 방법은 시료가 MRSA-특이 질량전하비율 값 중 2415와 5539를 포함하지 않는 것으로 확인된 경우, 상기 시료에서 2085, 2193, 2233, 2303, 2340, 2631, 2767, 3035, 및 5507로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 MSSA-특이 질량전하비율 값을 확인하는 단계를 더 포함하는 것일 수 있다.
상기 방법은 상기 시료가 상기 MSSA-특이 질량전하비율 값을 포함하지 않는 것으로 확인된 경우, 상기 시료는 MRSA 균류를 포함하는 것으로 결정하는 것일 수 있다.
상기 방법은 상기 시료가 상기 MSSA-특이 질량전하비율 값을 포함하는 것으로 확인된 경우, 상기 시료는 MRSA 균류를 포함하지 않는 것으로 결정하는 것일 수 있다.
일 양상에 따른 MRSA 동정방법은 단일 MRSA-특이 질량전하비율 값을 확인하는 것이 아닌, 이를 조합한 두개 내지 세개의 질량전하비율 값을 갖는 시료를 선별하여 동정함으로써, 종래의 동정 방법 보다 민감도가 크게 상승한 동정방법을 제공한다.
다른 양상에 따른 MRSA 동정방법은 단일 MRSA-특이 질량전하비율 값을 확인하는 것이 아닌, 단계적으로 특정 질량전하비율 값을 갖는 시료를 선별하고, 그룹을 나누어 동정하는 방법의 발명을 제공한다.
도 1은 그룹을 이용한 동정 방법의 개략도로서, R 그룹은 MRSA, S 그룹은 MSSA, 각 분기점은 각 기재된 질량전하비율 값의 유무를 확인하는 단계, 각 종결점은 동결 내지 결정된 MRSA와 MSSA의 비율을 나타낸다.
이하 본 발명을 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
참고예 1. 황색포도구균의 배양
본 발명에서는 황색포도구균 균혈증 환자의 혈액배양에서 분리된 황색포도구균(Staphylococcus aureus)을 이용한다. mecA 유전자 발현여부에 따라 MRSA로 확인된 208개 균주와 MSSA로 확인된 116개 균주를 각 배양하였다. 각 균주는 강동성심병원 진단검사의학과에서 분리된 균주를 사용하였으며 5%(v/v) 혈액이 첨가된 배지에서 배양하였다.
참고예 2. MRSA 및 MSSA-특이 질량전하비율(m/z) 값 탐색
참고예 1.에서 배양된 MRSA 균주의 단일 집락(colony)을 이쑤시개에 묻혀 말디-토프 타겟 플레이트에 점적하였다. 점적 후, 타겟 플레이트를 상온에서 5분간 건조시켰다. 이후, 4%(v/v) 트리플루오로 아세트산(trifluoroacetic acid : TFA ) 1 ㎕ 첨가하였다. 첨가 후 다시 상온에서 5분간 건조시켰다. 건조 후, 매트릭스용액(Matrix solution) 1 ㎕를 타겟 플레이트에 점적된 단일 집락 위에 첨가하고, 다시 상온에서 5분간 건조시켰다. 이후 말디-토프 질량 분석기(Bruker사, 독일)로 분석하였다.
각 균주의 스펙트럼을 검출하고, 바이오뉴머릭 소프트웨어(BioNumerics software, plied Maths, a BioMerieux사)로 MRSA 및 MSSA 특이적 질량전하비율의 피크(peak)를 탐색하였다.
상기의 방법으로, 통계적으로 검출된 MRSA 및 MSSA-특이 질량전하비율(bio marker)은 아래 표 1과 같다(오차범위: ± 4 m/z 이내).
Figure PCTKR2019015063-appb-T000001
그 결과, 상기 표 1에서 보는 바와 같이, MRSA-특이 질량전하비율(m/z) 값은 1975(1974.7), 2116 (2115.8, type Ⅱ), 2134 (2133.7, type Ⅱ), 2205(2204.9), 2275(2275.1), 2415(2411.3), 2593 (2592.8, type Ⅱ), 2877(2877.1), 3891(3891.1), 4607(4606.7), 6593(6593.0), 및 9217(9216.8)으로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 값임을 확인하였고, 각 측정 값은 오차범위(±4) 이내였다.
또한, MSSA-특이 질량전하비율 (m/z) 값은 2085(2084.8), 2193(2192.9), 2233(2233.3), 2303(2302.6), 2340(2340.5), 2631(2630.7), 2669(2668.5), 2748(2748.4), 2767(2766.9), 3035(3034.6), 및 5507(5506.9)으로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 값임을 확인하였다. 각 측정 값은 오차범위(±4) 이내였다.
실시예 1. 질량전하비율의 조합을 이용한 MRSA의 동정방법
상기 표 1에서 제시하는 질량전하비율 값 중, 민감도가 높다고 판단되는 MRSA-특이 질량전하비율 값 2개 또는 3개를 갖는 균주를 선별하였다. 즉, 질량전하비율 1975(민감도 52.4%)와 2275(민감도 45.7%)를 포함하는 균주, 1975와 2415(민감도 36.5%)를 포함하는 균주, 1975, 2275 및 2415를 포함하는 균주를 선택하였다. 이 중, MSSA-특이 질량전하비율 값 중 특이도가 가장 높은 2085(특이도 99%)를 포함하는 균주를 선별하여 이를 제외하고 선별하였다. 선별된 균주의 균류와 개수, 민감도, 특이도, 양성예측률 및 음성예측률을 산정하였다. 같은 방법으로, MSSA-특이 질량전하비율 값 중 민감도가 높은 2631을 갖는 균주를 제외한 후, 다시 균주의 균류와 개수, 민감도, 특이도 양성예측률 및 음성예측률을 산정하였다. 결과는 하기 표 2와 같다.
peak R S SE SP PPV NPV
1975+, 2275+ 146 29 70 75 83 58
1975+, 2275+, 2631- 142 15 68 87 90 60
1975+, 2415+ 149 15 72 87 91 63
1975+, 2415+, 2085- 149 10 72 91 94 64
1975+, 2415+, 2275+, 2631- 162 15 78 87 92 69
(R: MRSA, S: MSSA, SE: 민감도(sensitivity), SP: 특이도(specificity), PPV: 양성 예측률(positive predict value), NPV: 음성 예측률(negative predict value))
상기 결과에 의하면, MRSA-특이 질량전하비율 값 중 1975, 2275, 및 2415을 갖는 시료에서, MSSA-특이 질량전하비율 값 2631을 갖는 시료를 제외한 경우, 전체 MRSA 208개의 균주 중 162개의 균주를 MRSA를 동정할 수 있음을 알 수 있다. 즉, 78%의 민감도로 MRSA를 검출할 수 있고, 단일 질량전하비율 값으로만 동정할 경우에 비하여 상당히 증가하였다.
비교예 1. 단일 질량전하비율만 갖는 균주에서 제외한 경우,
상기 표 1에서 제시하는 질량전하비율 값 중, 민감도가 가장 높다고 판단되는 질량전하비율 값 1975를 갖는 균주를 선택하고, 이 중, MSSA-특이 질량전하비율 값 2085(2084.8), 2233(2233.3), 2631(2630.7), 및 2303(2302.6)를 갖는 균주를 제외하여 선별한다. 선별된 균주의 균류, 민감도, 특이도, 양성예측률 및 음성예측률은 하기 표 3과 같다.
peak R S SE SP PPV NPV
1975+ 109 15 52 87 88 51
1975+, 2085- 109 10 52 91 92 52
1975+, 2233- 108 9 52 92 92 52
1975+, 2631- 106 7 51 94 94 52
1975+, 2303- 106 8 51 93 93 51
상기 표 3에서 알 수 있는 바와 같이, 민감도가 가장 높은 질량전하비율 값 1975를 갖는 균주 중, MSSA-특이 질량전하비율을 가진 균주를 제외한 경우, 특이도는 90 이상으로 높아졌지만 민감도는 52로 동일하거나 51로 소폭 감소하였다.
즉, 실시예 1의 동정방법에 의할 경우, 민감도가 상당히 증가될 수 있다는 점을 나타낸다.
실시예 2. 그룹을 이용한 동정 방법
324개의 균주 (MRSA 208개, MSSA 116개) 중 표 1에서 19개(R 그룹 1번 내지 8번; S 그룹 9번 내지 17번, 22번, 및 23번)의 질량전하비율 값 중 어느 하나의 값도 검출되지 않는 균주 29개를 판정 불가능으로서 배제하였다. 상기 19개의 질량전하비율 값 중 하나 이상이 검출되는 나머지 295개 균류 중, 질량전하비율 값 2415(2411.3)이 있는 77개의 균류를 동정하였다(종결점 1: MRSA 균주 76개, MSSA 균주 1개).
질량전하비율 값 2415가 없는 나머지 218 균주 중, MRSA(SCCmec type IV)를 구별하고자, MRSA(SCCmec type IV)에 민감도와 특이도가 높은 질량전하비율 값 5539(5539.7)이 검출된 균주 40개를 선별하였다. 선별된 균류 중 MRSA(SCCmec type IV)를 한번 더 구별하기 위해 MRSA(SCCmec type IV)에 대해 민감도와 특이도가 높은 질량전하비율 값 5073(5073.6)이 검출된 균주 23개를 선별하여 동정하였다(종결점 2: MRSA 균주 14개, MSSA 균주 9개). 질량전하비율 값 5539는 검출되지만 5073은 검출되지 않는 17개의 균주를 MSSA로 동정하였다(종결점 3, MRSA 균주 4개, MSSA 균주 13개).
질량전하비율 값 5539가 검출되지 않은 균주 178개에서 MSSA-특이 질량전하비율 값 9개 (표 1에서 9번 내지 17번; S 그룹) 중 어느 하나라도 검출된 균주 73개는 MSSA로 동정하였다(종결점 4: MRSA 균주 4개, MSSA 균주 69개).　반면, 상기 9개 중 어느 하나도 검출되지 않은 균주 105개는 MRSA로 동정하였다(종결점 5: MRSA 98개, MSSA 균주 7개). 위와 같이 동정한 결과, MRSA 동정의 민감도는 전체 MRSA 196개 중 188개가 동정하여 95.9%, MSSA 동정의 민감도는 99개 중 82개를 동정하여 82.8%의 민감도를 보였다.
상술한 동정방법은 도 1에서 개략적으로 나타낸다.

Claims (6)

  1. 메티실린-내성 황색포도구균(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus: MRSA) 균류의 동정 방법으로서,
    시료를 타겟 플레이트 위에 점적하는 단계;
    매트릭스 용액을 상기 타겟 플레이트에 처리한 후 건조시켜 말디-토프 질량 분석기(Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight Mass Spectrometer: MALDI-TOF MS)로 분석하는 단계;
    상기 시료의 질량전하비율(m/z) 값에서 1975 및 2275, 또는 1975 및 2415의 MRSA-특이 질량전하비율 값을 검출하는 단계; 및
    상기 MRSA-특이 질량전하비율 값이 검출되는 경우 상기 시료는 MRSA 균류를 포함하는 것으로 결정하는 단계를 포함하는 MRSA 동정 방법.
  2. 청구항 1에 있어서, 상기 시료의 질량전하비율 값에서 2116, 2134, 2205, 2593, 2877, 3891, 4607, 6593, 및 9217로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 MRSA-특이 질량전하비율 값을 검출하는 단계를 더 포함하는 것인 방법.
  3. 청구항 1에 있어서, 상기 시료에서 2085, 2193, 2233, 2303, 2340, 2631, 2669, 2748, 2767, 3035, 및 5507로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 메티실린 감수성 황색포도구균 (Methicillin-sensitive Staphylococcus aureus: MSSA) 특이 질량전하비율 값을 확인하는 단계를 더 포함하는 것인 방법.
  4. 청구항 5에 있어서, 상기 시료의 질량전하비율 값이 상기 MRSA-특이 질량전하비율 값 중 1975, 2275 및 2415을 포함하고, 상기 시료가 MSSA-특이 질량전하비율 값 2631을 포함하지 않는 것으로 확인된 경우, 상기 시료는 MRSA 균류를 포함하는 것으로 결정하는 것인 방법.
  5. 메티실린-내성 황색포도구균(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus: MRSA) 균류의 동정 방법으로서,
    시료를 타겟 플레이트 위에 점적하는 단계;
    매트릭스 용액을 상기 타겟 플레이트에 처리한 후 건조시켜 MALDI-TOF MS로 분석하는 단계;
    상기 시료의 질량전하비율(m/z) 값에서 2415의 질량전하비율 값을 포함하지 않는 시료를 선별하는 단계; 및
    상기 시료의 질량전하비율(m/z) 값에서 5539 및 5073의 질량전하비율 값을 검출하거나, 또는
    상기 시료의 질량전하비율(m/z) 값에서 5539, 2085, 2193, 2233, 2303, 2340, 2631, 2767, 3035, 및 5507 값이 검출되지 않는 경우,
    상기 시료는 MRSA 균류를 포함하는 것으로 결정하는 단계를 포함하는 MRSA 균류의 동정 방법.
  6. 메티실린-감수성 황색포도구균(Methicillin-sensitive Staphylococcus aureus: MSSA) 균류의 동정 방법으로서,
    시료를 타겟 플레이트 위에 점적하는 단계;
    매트릭스 용액을 상기 타겟 플레이트에 처리한 후 건조시켜 MALDI-TOF MS로 분석하는 단계;
    상기 시료의 질량전하비율(m/z) 값에서 2415의 질량전하비율 값을 포함하지 않는 시료를 선별하는 단계; 및
    상기 시료의 질량전하비율(m/z) 값에서 5539의 질량전하비율 값을 포함하지만, 5073의 질량전하비율 값을 검출하거나, 또는
    상기 시료의 질량전하비율(m/z) 값에서 5539의 질량전하비율 값을 포함하지 않으나, 2085, 2193, 2233, 2303, 2340, 2631, 2767, 3035, 및 5507로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 질량전하비율 값을 포함하는 경우,
    상기 시료는 MSSA 균류를 포함하는 것으로 결정하는 단계를 포함하는 MSSA 균류의 동정 방법.
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Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11352655B2 (en) 2020-08-28 2022-06-07 China Medical University Hospital Method of identification of methicillin-resistant Staphylococcus aureus
TWI775205B (zh) * 2020-08-28 2022-08-21 中國醫藥大學附設醫院 鑑定抗甲氧西林金黃色葡萄球菌的方法

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR102028564B1 (ko) * 2018-12-10 2019-10-04 한림대학교 산학협력단 말디-토프 질량분석기를 이용한 메티실린-내성 황색포도구균 균류의 동정방법

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20000035935A (ko) * 1996-08-27 2000-06-26 더 맨체스터 메트로폴리탄 유니버시티 미생물 동정방법
US20080009029A1 (en) * 2006-05-09 2008-01-10 Bruker Daltonik Gmbh Mass spectrometric measurement of microbial resistances
JP2015502529A (ja) * 2011-11-08 2015-01-22 ビオメリューＢｉｏｍｅｒｉｅｕｘ 細菌集団を直接用いて黄色ブドウ球菌のδ溶血素を質量分析により検出する方法
JP2017501721A (ja) * 2013-12-23 2017-01-19 ブルーカー ダルトニック ゲーエムベーハー メシチリン耐性黄色ブドウ球菌（ｍｒｓａ）の同定
KR102028564B1 (ko) * 2018-12-10 2019-10-04 한림대학교 산학협력단 말디-토프 질량분석기를 이용한 메티실린-내성 황색포도구균 균류의 동정방법

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20000035935A (ko) * 1996-08-27 2000-06-26 더 맨체스터 메트로폴리탄 유니버시티 미생물 동정방법
US20080009029A1 (en) * 2006-05-09 2008-01-10 Bruker Daltonik Gmbh Mass spectrometric measurement of microbial resistances
JP2015502529A (ja) * 2011-11-08 2015-01-22 ビオメリューＢｉｏｍｅｒｉｅｕｘ 細菌集団を直接用いて黄色ブドウ球菌のδ溶血素を質量分析により検出する方法
JP2017501721A (ja) * 2013-12-23 2017-01-19 ブルーカー ダルトニック ゲーエムベーハー メシチリン耐性黄色ブドウ球菌（ｍｒｓａ）の同定
KR102028564B1 (ko) * 2018-12-10 2019-10-04 한림대학교 산학협력단 말디-토프 질량분석기를 이용한 메티실린-내성 황색포도구균 균류의 동정방법

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ØSTERGAARD, C. ET AL.: "Rapid first-line discrimination of methicillin resistant Staphylococcus aureus strains using MALDI-TOF MS", INTERNATIONAL JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY, vol. 305, 2015, pages 838 - 847, XP029348136 *

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11352655B2 (en) 2020-08-28 2022-06-07 China Medical University Hospital Method of identification of methicillin-resistant Staphylococcus aureus
TWI775205B (zh) * 2020-08-28 2022-08-21 中國醫藥大學附設醫院 鑑定抗甲氧西林金黃色葡萄球菌的方法

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