WO2020116840A1 - 미각 선호도에 대한 민감도 예측용 조성물, 키트, 및 이를 이용한 방법 - Google Patents

미각 선호도에 대한 민감도 예측용 조성물, 키트, 및 이를 이용한 방법 Download PDF

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WO2020116840A1
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taste
sensitivity
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차소연
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    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
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    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers

Definitions

  • compositions and kits for predicting or diagnosing sensitivity to taste preferences and methods for providing information for predicting or diagnosing an individual's sensitivity to taste preferences.
  • cardiovascular diseases such as obesity, hypertension, diabetes, stroke, and hyperlipidemia
  • This increase in chronic diseases is due to large changes in lifestyles such as people's eating, smoking, and exercise, and changes in eating patterns cause undesirable nutritional conditions, leading to the development of these chronic non-communicable diseases.
  • the organization reports According to the 2009 results of the National Health and Nutrition Survey, the prevalence of obesity among adults over the age of 19 ranged from 26.0% in 1998 to 30.6% in 2001, 30.8% in 2005, and 31.3% in 2009.
  • Taste is formed not only by genetic factors but also by environmental influences (diseases that change taste). By changing dietary behavior, it affects another disease risk rate. Few reports have been conducted on the sensitivity and preference of taste in Koreans, but the published study deals mainly with saltiness and the relationship with the risk of hypertension. Sweet taste studies for foreigners include age, aging, menstrual cycle phase, and psychological eating disorder. They mainly studied the sensitivity and preferences of sweetness related to factors that humans could not control.
  • One aspect provides a composition for predicting or diagnosing sensitivity to taste preferences.
  • Another aspect provides a kit for predicting or diagnosing sensitivity to taste preferences.
  • Another aspect provides a method of providing information for predicting or diagnosing an individual's sensitivity to taste preferences.
  • Another aspect provides a use for predicting or diagnosing sensitivity to taste preferences of a composition comprising a polynucleotide capable of detecting a monobasic polymorphic marker.
  • compositions for predicting or diagnosing sensitivity to taste preferences comprising a polynucleotide capable of detecting a monobasic polymorphic marker.
  • Sensitivity to the taste preference may be expressed by weight control.
  • the composition may be a composition for predicting or diagnosing weight control according to taste preferences.
  • Single nucleotide polymorphism is used in a sense commonly known in the art.
  • Monobasic polymorphism is a single base or nucleotide in the genome (A, T, C or G, nucleotide A is adenine, nucleotide T is thymine, nucleotide C is cytosine, nucleotide G is guanine) between members or groups of species.
  • A, T, C or G nucleotide A is adenine
  • nucleotide T is thymine
  • nucleotide C is cytosine
  • nucleotide G is guanine
  • the single base polymorphism may be mixed with a single nucleotide variant (SNV).
  • SNV single nucleotide variant
  • the single-base polymorphic markers include 23524924 base C or T (rs1808579) of human 18th chromosome, 130418627 base A or G (rs1542829) of human 3rd chromosome, and 12366779th base of 3rd human chromosome.
  • a or G (rs2938397), 49853685 base number of human 12th chromosome A or G (rs7138803), 12350682 human base chromosome A or G (rs17036333), human 1st chromosome 111730863 Base T or C (rs1546924), 36 969208 nucleotide base G or T (rs16933812) of human ninth chromosome, 64279894 nucleotide base A or G (rs11787111) of human eighth chromosome, 24935412 of human second chromosome
  • the first base is T or C (rs713587)
  • the third chromosome of human 12334081 is the T or C (rs76608844)
  • the 11th chromosome of human 111125247 is the G or A (rs321358)
  • a composition according to one aspect comprises a single-stranded polynucleotide associated with weight control according to taste preference with one specific sequence and a polynucleotide having a sequence complementary thereto.
  • the 24293557th base (single base polymorphic marker) of human chromosome 4 is "C" or "T".
  • the composition not only comprises the nucleotide "C” or “T” of the 24293557 base (single base polymorphic marker) of human chromosome 4, but also the 24293557 base (single base polymorphic marker) of human chromosome 4 ), complementary single-stranded polynucleotides having "G” or "A” nucleotides at positions corresponding to.
  • the composition can detect the 24293557th base (single base polymorphic marker) of human chromosome 4.
  • the composition can detect C>T at 24293557th base (single nucleotide polymorphism marker) of human chromosome 4.
  • Polynucleotides with complementary sequences apply equally to other monobasic polymorphic markers.
  • the monobasic polymorphic marker may be specifically related to the degree of weight control or body fat change according to taste preference, among the monobasic polymorphic markers known to be associated with obesity.
  • the taste preference may be salty, sweet, or oily.
  • the taste preference has the same meaning as the food preference (Food Intake Preferences), and each of the salty, sweet, and oily tastes may be salty food preference, sweet food preference, and oily food preference.
  • the polynucleotide comprises 23524924 base C or T (rs1808579) of human 18th chromosome, 130418627 base A or G of human 3rd chromosome (rs1542829 ), 12366779 nucleotides of human 3rd chromosome A or G(rs2938397), 49853685 nucleotides of human 12th chromosome A or G (rs7138803), 12350682 nucleotides of human 3rd chromosome A or G( rs17036333), the first chromosome 111730863 base T or C (rs1546924), the ninth human chromosome 36969208 base G or T (rs16933812), the eighth human chromosome 64279894 base base A or G (rs11787111), the 24935412th base of the second chromosome of human T or C (rs713587),
  • the polynucleotide is the 111125247th base G or A (rs321358) of the human 11th chromosome, and the 50094148th base value T or C (rs11583200) of the human 1st chromosome.
  • the polynucleotide comprises 110129355th base value T or C (rs17806457) of human ninth chromosome, 83226700th base value A or C of human 1st chromosome ( rs2389438), the 96381018th base of the fifth chromosome of human G or A (rs7713317), the 8652392th base of human 11th chromosome G or C (rs4256980), the 8640969th base of human 11th chromosome C or T (rs11042023), the 44580470th base of human 4th chromosome A or G (rs10938353), the 15th human chromosome 51270548th base G or A (rs1878047), the 22nd human chromosome 40208941th base G or T(rs4820408), the 23922574th base of the 12th chromosome of human G or A
  • the term “gene” refers to a structural unit that determines genetic information, and controls the expression of a structural gene and/or a structural gene having information to determine the amino acid sequence of a protein or the nucleotide sequence of a functional RNA (tRNA, rRNA, etc.)
  • the regulatory gene may include a promoter, a repressor, an operator, and the like.
  • the term “gene” is understood herein to mean the single-stranded side comprising the nucleotide sequence that is transcribed to produce the product of the gene.
  • polynucleotide refers to a nucleotide polymer of any length, which can be used interchangeably with a nucleic acid, or oligonucleotide.
  • the polynucleotide may be a specific binding to the nucleotide sequence of the target region. Using the specific binding properties of these polynucleotides, it is possible to effectively separate a target gene or a fragment thereof containing the target region from the mixture.
  • the polynucleotide may be single or plural, and may be in the form of a single strand or double strand.
  • the polynucleotide may also be composed of natural nucleotides, as well as natural nucleotides, analogs of natural nucleotides, sugars, bases or phosphate sites of natural nucleotides, as long as they have properties that can be hybridized by hydrogen bonding with complementary nucleotides. And nucleotides selected from the group consisting of these combinations (Scheit, Nucleotide Analogs, John Wiley, New York (1980); Uhlman and Peyman, Chemical Reviews, 90:543-584 (1990)).
  • the polynucleotide may be DNA or RNA.
  • the polynucleotide may be a polynucleotide comprising a continuous nucleotide sequence containing the single-nucleotide polymorphism marker or a complementary polynucleotide thereof.
  • nucleotide sequence means a sequence of two or more adjacent nucleotides.
  • complementary means to have a degree of complementarity sufficient to selectively hybridize to the nucleotide sequence under certain specific hybridization or annealing conditions.
  • the size of the polynucleotide may be 5 to 200nt (nucleotide: nt).
  • the polynucleotide may have a length of 10 to 150 nt, 10 to 100 nt, or 15 to 100 nt.
  • the polynucleotide may be a primer, a probe, or a combination thereof.
  • a nucleotide sequence that is perfectly complementary to the nucleotide sequence of the target region may be used, but a nucleotide sequence that is substantially complementary to the extent that does not interfere with hybridization (substantially) may be used. It might be.
  • the primer or probe may be one having a modified nucleotide sequence within a range that does not interfere with hybridization specifically with respect to the nucleotide sequence of the target region.
  • primer refers to a single-stranded oligonucleotide that can act as a starting point in the polymerization reaction of a nucleotide by a polymerase.
  • the primer can serve as a starting point for template-directed DNA synthesis in the presence of four different nucleoside triphosphates and polymerases at suitable temperatures and in suitable buffers, i.e. It may be a single-stranded oligonucleotide.
  • the suitable length of the primer can vary depending on various factors, such as temperature and the use of the primer.
  • the primer may be 5 to 100nt, 5 to 70nt, 10 to 50nt, or 15 to 30nt in length.
  • the shorter the length of the primer the more stable hybridization complex can be formed with the mold at a low annealing temperature.
  • the length of the primer has a size of less than 5nt, the accuracy for capturing a target region is low, and when it has a size of more than 100nt, the synthesis cost increases. Therefore, the primer is economical and has a size optimized for gene polymorphism or mutation detection.
  • the design of the primer can be easily performed by a person skilled in the art by referring to the nucleotide sequence of a target region to be amplified. For example, it may be designed using a commercially available primer design program. Examples of such commercially available primer design programs include the PRIMER 3 program.
  • the primer may further include a nucleotide analog such as phosphorothioate or alkylphosphorothioate, a peptide nucleic acid or an intercalating agent.
  • a nucleotide analog such as phosphorothioate or alkylphosphorothioate
  • a peptide nucleic acid or an intercalating agent may further include a fluorescent, phosphorescent or radioactive labeling material.
  • the fluorescent label material may be VIC, NED, FAM, PET, or a combination thereof.
  • the labeling material may be labeled at the 5'end of the polynucleotide.
  • the radioactive labeling material may be incorporated into the amplification product through a PCR reaction using a reaction solution of a polymerase chain reaction (PCR) to which a radioactive isotope such as 32 P or 35 S is added.
  • PCR polymerase chain reaction
  • the primer may be used for allele specific PCR (PCR-single strand conformation polymorphism: PCR-SSCP), TaqMan method, and method using sequencing, etc. have.
  • probe refers to a polynucleotide capable of sequence specific binding to a complementary polynucleotide strand.
  • the probe may have a length of 5 to 100nt, 10 to 90nt, 15 to 80nt, 20 to 70nt, or 30 to 50nt.
  • the length of the probe has a size of less than 10nt, accuracy for capturing a target region is low, and when it has a size of more than 100nt, synthesis cost increases. Therefore, the probe is economical and has a size optimized for gene polymorphism or mutation detection.
  • the probe is a group consisting of a probe having a sequence completely complementary to all nucleotide sequences except for a perfect match probe and a monobasic polymorphic marker, for example, a sequence completely complementary to the nucleotide sequence of the target region. It may be selected from.
  • the probe may be used in a hybridization method, for example, a microarray, southern blotting, dynamic allele-specific hybridization, and a method using a DNA chip.
  • the microarray is used in a sense known in the art, for example, a probe or a population of probes may be immobilized in a plurality of distinct regions on a substrate.
  • the substrate is a suitable stiff or semi-rigid support, such as membranes, filters, chips, slides, wafers, fibers, magnetic beads or non-magnetic beads, gels, tubing, plates, polymers, It may be to include microparticles and capillaries.
  • the probe or a probe complementary thereto may be used in a method capable of hybridizing with a nucleic acid obtained from an individual and measuring the degree of hybridization obtained therefrom.
  • the weight control may be that the body fat is reduced.
  • the monobasic polymorphic marker may be specifically related to the degree of change in body fat, among general physical characteristics related to obesity.
  • the weight control may be a relative decrease in body fat.
  • the weight control may indicate whether the degree of reduction in body fat is increased or no significant difference compared to the group without the monobasic polymorphism or the group having the same genotype as the reference genotype.
  • the weight control may indicate whether an individual having a specific allele or genotype has an increased degree of reduction in body fat compared to an individual having a specific allele or genotype or there is no significant difference.
  • the prediction or diagnosis may include vertebrates, mammals, or humans ( Homo sapiens ).
  • the prediction or diagnosis may be for Koreans.
  • the prediction or diagnosis may be about 40 to about 70 years old Korean.
  • the monobasic polymorphic marker may be used as a marker for predicting or diagnosing sensitivity to taste preference or weight control according to taste preference.
  • the monobasic polymorphic marker may be used as a marker for predicting or diagnosing a degree of decrease in body fat according to salty taste preference, sweet taste preference, or fatty taste preference.
  • Another aspect provides a kit for predicting or diagnosing sensitivity to taste preferences.
  • the kit may be a kit for predicting or diagnosing weight control according to taste preferences.
  • the kit may be to include the composition.
  • the kit includes a polynucleotide capable of detecting a monobasic polymorphic marker, and the monobasic polymorphic marker is the same as described above.
  • the kit may include, for example, the polynucleotide and components necessary for a specific use thereof. It may be to include a reagent necessary for the method of use together with the polynucleotide.
  • the kit may further include a known substance required for the polynucleotide to hybridize with a nucleic acid.
  • the kit may be a kit for specifically amplifying the nucleotide sequence of the target region and predicting or diagnosing an individual's weight control through the presence or absence of an amplification product. Or it may be a kit for hybridizing the polynucleotide or a probe derived therefrom with a nucleic acid in a sample, and predicting or diagnosing an individual's weight control from the hybridization result.
  • the kit may further include reagents, buffers, cofactors, and/or substrates required for hybridization of the nucleic acid.
  • the kit when the kit is applied to a PCR amplification process, it may optionally include reagents necessary for PCR amplification, for example, buffers, DNA polymerase, DNA polymerase cofactors, and dNTPs.
  • the kit may further include instructions for use to amplify the target region, and may be manufactured in a number of separate packaging or compartments containing the reagent components described above.
  • the instructions for use include, for example, a target region amplified in an amplification reaction using the specific primer, and a target region not amplified in an amplification reaction using the non-specific primer, a target associated with weight control among samples used for amplification. It may include a description of the outcome determination, including a description of determining the presence of a region, polymorphism or mutation, and determining the degree of weight control according to the subject's taste preferences from the results.
  • Another aspect provides a method of providing information for predicting or diagnosing an individual's sensitivity to taste preferences.
  • the method may be to provide information for predicting or diagnosing weight control according to taste preferences of an individual.
  • the method comprises obtaining a nucleic acid sample from a biological sample of an individual; And analyzing the genotype of the monobasic polymorphic marker from the obtained nucleic acid sample.
  • the single-base polymorphic markers include 23524924 base C or T (rs1808579) of human 18th chromosome, 130418627 base A or G (rs1542829) of human 3rd chromosome, and 12366779th base of 3rd human chromosome.
  • a or G (rs2938397), 49853685 base number of human 12th chromosome A or G (rs7138803), 12350682 human base chromosome A or G (rs17036333), human 1st chromosome 111730863 Base T or C (rs1546924), 36 969208 nucleotide base G or T (rs16933812) of human ninth chromosome, 64279894 nucleotide base A or G (rs11787111) of human eighth chromosome, 24935412 of human second chromosome
  • the first base is T or C (rs713587)
  • the third chromosome of human 12334081 is the T or C (rs76608844)
  • the 11th chromosome of human 111125247 is the G or A (rs321358)
  • Sensitivity to the taste preference may be expressed by weight control.
  • the method includes obtaining a nucleic acid sample from an individual biological sample.
  • the individual means an object for predicting or diagnosing weight control according to taste preferences.
  • the individual may include vertebrates, mammals, humans ( homo sapiens ), mice, rats, cows, horses, pigs, sheep, goats, dogs, cats, and the like.
  • the human may be an Asian, a Korean, or a Korean of about 40 to about 70 years of age.
  • the biological sample refers to a sample obtained from an organism.
  • the biological sample is, for example, blood, tissue, urine, mucus, saliva, tears, plasma, serum, sputum, spinal fluid, pleural fluid, nipple suction, lymph fluid, airway fluid, intestinal fluid, genitourinary fluid, breast milk, lymphatic fluid, semen , Cerebrospinal fluid, body fluid in the tracheal system, ascites, cystic tumor fluid, amniotic fluid, or a combination thereof.
  • the biological sample may be a purely isolated nucleic acid, a crude isolated nucleic acid, a cell lysate containing nucleic acid, or a cell free nucleic acid.
  • the method of separating the genomic nucleic acid from the biological sample can be performed by a conventional nucleic acid separation method.
  • a target nucleic acid may be polymerase chain reaction (PCR), ligase chain reaction (LCR), transcription amplification, or real-time nucleic acid sequence amplification. It can be obtained by amplification and purification through sequence based amplification (NASBA).
  • PCR polymerase chain reaction
  • LCR ligase chain reaction
  • NASBA sequence based amplification
  • the method includes analyzing the genotype of a monobasic polymorphic marker from the obtained nucleic acid sample.
  • analyzing the genotype of a monobasic polymorphic marker means determining a nucleotide at a target region in the chromosome or at each position of the monobasic polymorphic marker.
  • a target region in a chromosome or a nucleotide at each position can be directly determined by a nucleotide sequencing method of a known nucleic acid.
  • the method for determining the nucleotide sequence may be one that includes a Sanger (or dideoxy) sequencing method or a Maksam-Gilbert (chemical cleavage) method.
  • the nucleotide sequence of the target region can be determined by hybridizing the probe with the target polynucleotide and analyzing the hybridization result.
  • the degree of hybridization can be confirmed, for example, by labeling a target nucleic acid with a detectable label and detecting the hybridized target nucleic acid, or by an electrical method or the like.
  • a single base primer extension (SBE) method can be used.
  • the method of nucleotide sequence determination may also include next-generation base sequencing.
  • NGS next generation sequencing
  • the step of analyzing the genotype may determine whether an individual or a subject exhibits a remarkable weight control effect according to taste preferences, based on the presence or absence of a specific allele or a specific genotype in the monobasic polymorphic marker.
  • the taste may be salty, sweet or oily.
  • the weight control may be that the body fat is reduced.
  • the 23524924th base value of human 18th chromosome C (rs1808579), the 130418627th base value of human 3rd chromosome A (rs1542829), and the 3rd human chromosome 12366779th base of G (rs2938397), human 12th chromosome 49853685th base G (rs7138803), 3rd human chromosome 12350682th base G (rs17036333), human 1st chromosome 111730863 base C(rs1546924), 36969208th base value of human 9th chromosome G(rs16933812), 64279894th base value of human 8th chromosome G(rs11787111), 24935412th base value of human 2nd chromosome T(rs713587), The 12334081th base of human 3rd
  • the 23524924th base value of human 18th chromosome C (rs1808579), the 130418627th base value of human 3rd chromosome A (rs1542829), and the 3rd human chromosome 12366779th base of G (rs2938397), human 12th chromosome 49853685th base G (rs7138803), 3rd human chromosome 12350682th base G (rs17036333), human 1st chromosome 111730863 base C(rs1546924), 36969208th base value of human 9th chromosome G(rs16933812), 64279894th base value of human 8th chromosome G(rs11787111), 24935412th base value of human 2nd chromosome T(rs713587), When the 12334081th base of the human 3r
  • the method may further include determining, as a result of analyzing the genotype of the monobasic polymorphism marker, that the sensitivity to the salty taste preference is greater than that of the control group (another individual) when the monobasic polymorphism is obtained.
  • the 111125247th base value of human 11th chromosome is G (rs321358), the 50094148th base value of human 1st chromosome T (rs11583200), and the first human chromosome.
  • the 230705813th base of G (rs3827749), the 1st human chromosome 230707692th base G (rs3789666), the 1st human chromosome 230707700th base G (rs3789667), the 1st human chromosome 230707887 base G(rs3789669), the 230708054th base value of the first chromosome of human T(rs3789671), the 74527379th base value of the first chromosome of human T(rs1514174), the 230708375th base of the human first chromosome G(rs2478545), If the 74536509th base of the human first chromosome is A (rs12566985), or a combination thereof, further comprising determining that the degree of reduction in body fat is greater than that of the control group (another individual) as the sweetness preference decreases.
  • the method may further include determining, as a result of analyzing the genotype of the monobasic polymorphism marker, that the sensitivity to the sweet taste preference is greater than that of the control group (another individual) when the monobasic polymorphism is obtained.
  • the 110129355th base value of human 9th chromosome is T (rs17806457), the 83226700th base value of human 1st chromosome A (rs2389438), and the 5th human chromosome.
  • the method may further include determining, as a result of analyzing the genotype of a single-base polymorphism marker, that the sensitivity to the fatty taste preference is greater than that of a control group (another individual) when the single-base polymorphism is obtained.
  • Providing information for predicting or diagnosing weight control according to taste preferences of the individual may be for predicting or diagnosing a degree of reduction in body fat according to taste preferences.
  • the numerical value may be for predicting or diagnosing whether the degree of decrease in body fat is increased as compared to a group having a reference genomic sequence or a group having no single nucleotide polymorphism.
  • the term "reference genome sequence” may be a human genome sequence, which is referenced for polymorphism or mutation identification.
  • the reference genome sequence may be a nucleotide sequence of the reference genome, for example, a nucleotide sequence of a human gene published in a database of the Institute of Biotechnology Information, National Institutes of Health, specifically, NCBI37.1 or UCSC hg19 (GRCh37).
  • the comparison between the nucleotide sequence of the individual and the reference genomic sequence can be performed using various known sequence comparison analysis programs, such as Maq, Bowtie, SOAP, GSNAP, and the like.
  • the number of polymorphisms in the single-basic polymorphic marker is 1, 2, 2, 3, 4, 5 or more, it can be determined that the degree of decrease in systemic preference according to taste preferences is increased. Accuracy for prediction or diagnosis can be increased.
  • the analysis of the genotype includes sequencing, hybridization by microarray, allele specific PCR, dynamic allele-specific hybridization, PCR extension analysis, PCR-SSCP (PCR-single strand) conformation polymorphism), TaqMan method, or a combination thereof.
  • Allele-specific PCR refers to a PCR method for amplifying a DNA fragment in which the single-basic polymorphic marker is located with a primer set including a primer designed with the base at which the single-basic polymorphic marker is located at the 3'end.
  • PCR extension analysis first amplifies a DNA fragment containing the base in which the monobasic polymorphic marker is located with a primer pair, and then deactivates it by dephosphorylating all nucleotides added to the reaction, in which the specific extension to the monobasic polymorphic marker This is accomplished by adding a primer, dNTP mixture, didioxynucleotide, reaction buffer and DNA polymerase to perform primer extension reaction.
  • the TaqMan method is performed by designing and manufacturing primers and TaqMan probes to amplify a desired DNA fragment, and labeling probes of different alleles with FAM and VIC (Applied Biosystems) to amplify and analyze them.
  • compositions comprising a polynucleotide capable of detecting a monobasic polymorphic marker for predicting or diagnosing sensitivity to taste preferences.
  • Sensitivity to the taste preference may be expressed by weight control.
  • the composition may be used for predicting or diagnosing weight control according to taste preferences.
  • the monobasic polymorphic marker is the same as described above.
  • a composition for predicting or diagnosing sensitivity to taste preferences comprising a polynucleotide capable of detecting a monobasic polymorphic marker, and a method for providing information for predicting or diagnosing sensitivity to taste preferences of kits and individuals It is possible to predict or measure the degree of decrease in body fat according to the taste preference of. The degree of decrease in body fat according to the taste preference of the predicted or measured individual may be applied to treatment of personalized obesity to increase the effect.
  • Example 1 Analysis of the association between body fat and monobasic polymorphism according to salt taste preference, sweet taste preference, and fatty taste preference
  • the cohort study is a medical research method that reveals the causal link between risk factors and disease outbreaks by identifying health status through long-term follow-up on group members who share certain characteristics.
  • This study used community-based cohort data from the Korea Genome Epidemiology Survey, which is being conducted by the Department of Genomics and Epidemiology at the National Institute of Health, Centers for Disease Control and Prevention. This study was conducted through the follow-up management of study subjects, taking into account the methodal characteristics of prospective cohort studies.
  • the community-based cohort began a basic survey of adults aged 40 to 69 years in 2001 and 2002 in Ansan and Anseong, Gyeonggi-do, and repeated it every two years. Initial 8840 subjects were tested. At each survey, biological samples such as blood and urine were collected along with epidemiological data such as health and lifestyle information.
  • Insulation polymorphism related to salty taste preference Rs# P-Value rs1808579 0.001292342 rs1542829 0.002369246 rs2938397 0.006737605 rs7138803 0.006984449 rs17036333 0.007000085 rs1546924 0.010253035 rs16933812 0.011810143 rs11787111 0.012207763 rs713587 0.014674742 rs76608844 0.015188604

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Abstract

단일염기다형성 마커를 검출할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단하기 위한 조성물, 및 키트 및 개체의 미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법에 의하면, 개체의 미각 선호도에 따른 체치방이 감소하는 정도를 예측 또는 측정할 수 있다. 예측 또는 측정된 개체의 미각 선호도에 따른 체지방이 감소하는 정도는 개인 맞춤의학적 비만 치료에 적용하여 효과를 증대시킬 수 있다.

Description

미각 선호도에 대한 민감도 예측용 조성물, 키트, 및 이를 이용한 방법
미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단을 위한 조성물 및 키트, 및 개체의 미각 선호도에 대한 민감도를 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법을 제공한다.
생활 수준의 향상으로 인한 우리나라 식생활의 서구화 및 인구의 고령화에 따라 비만, 고혈압, 당뇨병, 뇌졸중, 고지혈증 등 심혈관질환의 발병이 증가 추세에 있다. 이와 같은 만성 질환의 증가는 사람들의 식사, 흡연, 운동 등과 같은 생활 양식의 큰 변화 때문이며 식사 패턴의 변화가 바람직하지 않은 영양 상태를 초래하여 이들 만성적 비전염성 질환을 발병시키는 원인이 되고 있는 것으로 세계 보건 기구에서는 보고하고 있다. 2009년도 국민건강영양조사 결과에 의하면 19세 이상 성인 중 비만 유병률은 1998년 26.0%에서 2001년 30.6%, 2005년 30.8%, 2009년 31.3%로 우리나라 비만 인구의 지속적인 증가 추세를 나타내고 있다.
미각은 유전적 인자는 물론 환경적 영향(미각을 변화시키는 질병)을 받아 형성되는데 식행동을 변화시킴으로써 또 다른 질병 위험률에 영향을 주게 된다. 우리나라 사람을 대상으로 미각의 민감도와 선호도를 연구한 보고는 많지 않은 가운데, 발표된 연구는 주로 짠맛에 대한 것으로서 고혈압 위험성과의 관련을 다루었다. 외국인을 대상으로 한 단맛 연구로는, 연령, 및 노화, 월경주기상 단계, 심리적 섭식장애 등이 있다. 이들은 주로 사람이 조절할 수 없는 요인들과 관련된 단맛의 민감도와 선호도를 연구한 것이다.
인간에게서 비만을 유발하는 것으로 알려진 유전자로는 POMC, MC4R 등이 있으며, 대한민국 등록특허번호 10-1561656 등은 유전적 특징을 이용하여 비만 유병률을 예측할 수 있는 유전적 지표에 대하여 개시하고 있어, 유전적 특징을 이용하여 비만을 예측하기 위한 연구는 지속적으로 다양하게 수행되어 왔다. 그러나, 비만을 치료 또는 개선하기 위한 지침으로서, 유전적 특징을 이용하여 비만 치료시에 치료 또는 개선 정도를 예측할 수 있는 유전적 지표에 대한 연구는 미흡한 실정이다.
일 양상은 미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단을 위한 조성물을 제공한다.
다른 양상은 미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단을 위한 키트를 제공한다.
다른 양상은 개체의 미각 선호도에 대한 민감도를 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법을 제공한다.
다른 양상은 단일염기다형성 마커를 검출할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 조성물의 미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단을 위한 용도를 제공한다.
일 양상은 단일염기다형성 마커를 검출할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는, 미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단을 위한 조성물을 제공한다.
상기 미각 선호도에 대한 민감도는 체중 조절로 표현되는 것일 수 있다.
상기 조성물은 미각 선호도에 따른 체중 조절 예측 또는 진단을 위한 조성물인 것일 수 있다.
단일염기다형성(single nucleotide polymorphism: SNP)은 당해 기술분야에 통상적으로 알려진 의미로 사용된다. 단일염기다형성은 유전체 상에서 단일 염기 또는 뉴클레오티드(A, T, C 또는 G, 뉴클레오티드 A는 아데닌, 뉴클레오티드 T는 티민, 뉴클레오티드 C는 시토신, 뉴클레오티드 G는 구아닌을 의미함)가 종의 멤버들 간 또는 집단 내 게놈에 존재하는 염기 또는 뉴클레오티드 서열의 다양성 또는 다형을 의미한다. 단일염기다형성는 인간 유전체 상에 가장 많이 존재하는 유전적 다형성으로, 유전학적으로 단일염기다형성에 따라 각 개체에 큰 차이를 야기할 수 있다. 상기 단일염기다형성은 단일뉴클레오티드변이(single nucleotide variant: SNV)와 혼용될 수 있다. 상기 단일뉴클레오티드변이는 유전체 상에서 하나의 염기 또는 뉴클레오티드의 차이를 보이는 서열의 변경을 의미한다.
상기 단일염기다형성 마커는, 인간의 18번째 염색체의 23524924번째 염기가 C 또는 T(rs1808579), 인간의 3번째 염색체의 130418627번째 염기가 A 또는 G(rs1542829), 인간의 3번째 염색체의 12366779번째 염기가 A 또는 G(rs2938397), 인간의 12번째 염색체의 49853685번째 염기가 A 또는 G(rs7138803), 인간의 3번째 염색체의 12350682번째 염기가 A 또는 G(rs17036333), 인간의 1번째 염색체의 111730863번째 염기가 T 또는 C(rs1546924), 인간의 9번째 염색체의 36969208번째 염기가 G 또는 T(rs16933812), 인간의 8번째 염색체의 64279894번째 염기가 A 또는 G(rs11787111), 인간의 2번째 염색체의 24935412번째 염기가 T 또는 C(rs713587), 인간의 3번째 염색체의 12334081번째 염기가 T 또는 C(rs76608844), 인간의 11번째 염색체의 111125247번째 염기가 G 또는 A(rs321358), 인간의 1번째 염색체의 50094148번째 염기가 T 또는 C(rs11583200), 인간의 1번째 염색체의 230705813번째 염기가 A 또는 G(rs3827749), 인간의 1번째 염색체의 230707692번째 염기가 C 또는 G(rs3789666), 인간의 1번째 염색체의 230707700번째 염기가 A 또는 G(rs3789667), 인간의 1번째 염색체의 230707887번째 염기가 A 또는 G(rs3789669), 인간의 1번째 염색체의 230708054번째 염기가 G 또는 T(rs3789671), 인간의 1번째 염색체의 74527379번째 염기가 T 또는 C(rs1514174), 인간의 1번째 염색체의 230708375번째 염기가 A 또는 G(rs2478545), 인간의 1번째 염색체의 74536509번째 염기가 A 또는 G(rs12566985), 인간의 9번째 염색체의 110129355번째 염기가 T 또는 C(rs17806457), 인간의 1번째 염색체의 83226700번째 염기가 A 또는 C(rs2389438), 인간의 5번째 염색체의 96381018번째 염기가 G 또는 A(rs7713317), 인간의 11번째 염색체의 8652392번째 염기가 G 또는 C(rs4256980), 인간의 11번째 염색체의 8640969번째 염기가 C 또는 T(rs11042023), 인간의 4번째 염색체의 44580470번째 염기가 A 또는 G(rs10938353), 인간의 19번째 염색체의 51270548번째 염기가 G 또는 A(rs1878047), 인간의 22번째 염색체의 40208941번째 염기가 G 또는 T(rs4820408), 인간의 12번째 염색체의 23922574번째 염기가 G 또는 A(rs7970953), 인간의 3번째 염색체의 141556594번째 염기가 T 또는 G(rs16851483), 또는 이들의 조합인 것일 수 있다.
상기 폴리뉴클레오티드는 하나의 단일가닥 폴리뉴클레오티드가 미각 선호도에 대한 민감도 또는 미각 선호도에 따른 체중 조절과 연관되어 있는 경우, 상기 단일가닥 폴리뉴클레오티드에 상보적인 폴리뉴클레오티드도 당연히 미각 선호도에 대한 민감도 또는 미각 선호도에 따른 체중 조절과 연관되어 있는 것을 판단될 수 있다. 따라서, 일 양상에 따른 조성물은, 하나의 특정한 서열을 가진 미각 선호도에 따른 체중 조절과 연관되어 있는 단일가닥 폴리뉴클레오티드 및 그에 상보적인 서열을 가진 폴리뉴클레오티드를 포함한다.
예를 들면, 인간의 4번 염색체의 24293557번째 염기(단일염기다형성 마커)는 "C" 또는 "T"이다. 이 경우, 상기 조성물은 인간의 4번 염색체의 24293557번째 염기(단일염기다형성 마커)의 "C" 또는 "T" 뉴클레오티드를 포함할 뿐만 아니라, 인간의 4번 염색체의 24293557번째 염기(단일염기다형성 마커)에 대응되는 위치에 "G" 또는 "A" 뉴클레오티드를 갖는 상보적인 단일가닥 폴리뉴클레오티드를 포함한다. 상기 조성물은 인간의 4번 염색체의 24293557번째 염기(단일염기다형성 마커)를 검출할 수 있다. 또는 상기 조성물은 인간의 4번 염색체의 24293557번째 염기(단일염기다형성 마커)에서 C>T를 검출할 수 있다.
상보적인 서열을 가진 폴리뉴클레오티드는 다른 단일염기다형성 마커에 대하여, 동일하게 적용된다.
상기 단일염기다형성 마커는 비만과 연관된 것으로 알려진 단일염기다형성 마커 중에서도, 미각 선호도에 따른 체중 조절 또는 체지방이 변화하는 정도와 특이적으로 연관되어 있는 것일 수 있다.
상기 미각 선호도은 짠맛, 단맛, 또는 기름진 맛인 것일 수 있다. 상기 미각 선호도는 음식 선호도(Food Intake Preferences)와 동일한 의미로서, 짠맛, 단맛, 및 기름진 맛 각각은 짠음식 선호도, 단음식 선호도, 및 기름진 음식 선호도인 것일 수 있다.
짠맛 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단을 위한 조성물의 경우, 상기 폴리뉴클레오티드는 인간의 18번째 염색체의 23524924번째 염기가 C 또는 T(rs1808579), 인간의 3번째 염색체의 130418627번째 염기가 A 또는 G(rs1542829), 인간의 3번째 염색체의 12366779번째 염기가 A 또는 G(rs2938397), 인간의 12번째 염색체의 49853685번째 염기가 A 또는 G(rs7138803), 인간의 3번째 염색체의 12350682번째 염기가 A 또는 G(rs17036333), 인간의 1번째 염색체의 111730863번째 염기가 T 또는 C(rs1546924), 인간의 9번째 염색체의 36969208번째 염기가 G 또는 T(rs16933812), 인간의 8번째 염색체의 64279894번째 염기가 A 또는 G(rs11787111), 인간의 2번째 염색체의 24935412번째 염기가 T 또는 C(rs713587), 인간의 3번째 염색체의 12334081번째 염기가 T 또는 C(rs76608844), 또는 이들의 조합을 분석하기 위한 것일 수 있다.
단맛 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단을 위한 조성물의 경우, 상기 폴리뉴클레오티드는 인간의 11번째 염색체의 111125247번째 염기가 G 또는 A(rs321358), 인간의 1번째 염색체의 50094148번째 염기가 T 또는 C(rs11583200), 인간의 1번째 염색체의 230705813번째 염기가 A 또는 G(rs3827749), 인간의 1번째 염색체의 230707692번째 염기가 C 또는 G(rs3789666), 인간의 1번째 염색체의 230707700번째 염기가 A 또는 G(rs3789667), 인간의 1번째 염색체의 230707887번째 염기가 A 또는 G(rs3789669), 인간의 1번째 염색체의 230708054번째 염기가 G 또는 T(rs3789671), 인간의 1번째 염색체의 74527379번째 염기가 T 또는 C(rs1514174), 인간의 1번째 염색체의 230708375번째 염기가 A 또는 G(rs2478545), 인간의 1번째 염색체의 74536509번째 염기가 A 또는 G(rs12566985), 또는 이들의 조합을 분석하기 위한 것일 수 있다.
기름진맛 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단을 위한 조성물의 경우, 상기 폴리뉴클레오티드는 인간의 9번째 염색체의 110129355번째 염기가 T 또는 C(rs17806457), 인간의 1번째 염색체의 83226700번째 염기가 A 또는 C(rs2389438), 인간의 5번째 염색체의 96381018번째 염기가 G 또는 A(rs7713317), 인간의 11번째 염색체의 8652392번째 염기가 G 또는 C(rs4256980), 인간의 11번째 염색체의 8640969번째 염기가 C 또는 T(rs11042023), 인간의 4번째 염색체의 44580470번째 염기가 A 또는 G(rs10938353), 인간의 19번째 염색체의 51270548번째 염기가 G 또는 A(rs1878047), 인간의 22번째 염색체의 40208941번째 염기가 G 또는 T(rs4820408), 인간의 12번째 염색체의 23922574번째 염기가 G 또는 A(rs7970953), 인간의 3번째 염색체의 141556594번째 염기가 T 또는 G(rs16851483), 또는 이들의 조합을 분석하기 위한 것일 수 있다.
용어 "유전자"는 유전 정보를 결정하는 구조 단위를 의미하며, 단백질의 아미노산 서열 또는 기능 RNA(tRNA, rRNA 등)의 염기 배열을 결정하는 정보를 가지는 구조 유전자, 및/또는 구조 유전자의 발현을 제어하는 조절 유전자, 예를 들면, 프로모터, 억제자(repressor), 작동유전자(operator) 등을 포함하는 것일 수 있다. 본 명세서에서 용어 "유전자"는 유전자의 산물을 생성하기 위해 전사되는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 단일 가닥 쪽을 의미하는 것으로 이해된다.
통상의 기술자라면 상기 등록번호를 이용하여 단일염기다형성 마커 및 서열을 용이하게 확인할 수 있을 것이다. UCSC genome browser 또는 GenBank에 등록되어 있는 번호에 해당하는 구체적인 서열은 시간이 지남에 따라 다소 변경될 수 있다. 본 발명의 범위가 상기 변경된 서열에도 미치는 것은 통상의 기술자에게 자명할 것이다.
용어 "폴리뉴클레오티드"는 임의의 길이를 지닌 뉴클레오티드 폴리머를 의미하며, 상기 폴리뉴클레오티드는 핵산, 또는 올리고뉴클레오티드와 상호교환적으로 사용할 수 있다. 상기 폴리뉴클레오티드는 표적 영역의 뉴클레오티드 서열과 특이적으로 결합하는 것일 수 있다. 이러한 폴리뉴클레오티드의 특이적 결합 특성을 이용하여, 혼합물로로부터 표적 영역을 포함하는 표적 유전자 또는 그의 단편을 효과적으로 분리할 수 있다.
상기 폴리뉴클레오티드는 단수개 또는 복수개인 것일 수 있고, 단일 가닥 또는 이중 가닥의 형태인 것일 수 있다. 상기 폴리뉴클레오티드는 또한, 상보적인 뉴클레오티드와 수소 결합에 의하여 혼성화될 수 있는 성질을 갖는 것이면, 천연 뉴클레오티드로 구성된 것뿐만 아니라, 천연 뉴클레오티드, 천연 뉴클레오티드의 유사체, 천연 뉴클레오티드의 당, 염기 또는 인산 부위가 변형되어 있는 뉴클레오티드 및 이들 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 뉴클레오티드를 포함하는 것일 수 있다(Scheit, Nucleotide Analogs, John Wiley, New York(1980); Uhlman 및 Peyman, Chemical Reviews, 90:543-584(1990)). 상기 폴리뉴클레오티드는 DNA 또는 RNA인 것일 수 있다.
상기 폴리뉴클레오티드는 상기 단일염기다형성 마커를 포함하는 연속 뉴클레오티드 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드인 것일 수 있다.
용어 "연속 뉴클레오티드 서열(contiguous nucleotide sequence)"은 인접한 2개 이상의 뉴클레오티드 서열을 의미한다.
용어 "상보적(complementary)"은 어떤 특정한 혼성화(hybridization) 또는 어닐링 조건하에서 상기 뉴클레오티드 서열에 선택적으로 혼성화할 수 있을 정도의 상보성을 갖는 것을 의미한다.
상기 폴리뉴클레오티드의 크기는 5 내지 200nt(nucleotide : nt)인 것일 수 있다. 예를 들면, 상기 폴리뉴클레오티드는 길이가 10 내지 150 nt, 10 내지 100 nt, 또는 15 내지 100 nt인 것일 수 있다.
상기 폴리뉴클레오티드는 프라이머, 프로브, 또는 이들의 조합인 것일 수 있다. 상기 프라이머 또는 프로브는, 표적 영역의 뉴클레오티드 서열에 완전하게(perfectly) 상보적인 뉴클레오티드 서열이 이용될 수 있으나, 특이적으로 혼성화를 방해하지 않는 범위 내에서 실질적으로(substantially) 상보적인 뉴클레오티드 서열이 이용될 수도 있다. 또한, 상기 프라이머 또는 프로브는, 표적 영역의 뉴클레오티드 서열에 대하여 특이적으로 혼성화를 방해하지 않는 범위 내에서, 변형된 뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있다.
용어 "프라이머(primer)"는 중합효소에 의한 뉴클레오티드의 중합 반응에서, 개시점으로 작용할 수 있는 단일 가닥의 올리고뉴클레오티드를 의미한다. 예를 들면, 상기 프라이머는 적합한 온도 및 적합한 완충액 내에서 적합한 조건, 즉, 4종의 다른 뉴클레오시드 트리포스페이트 및 중합효소의 존재 하에서 주형-지시(template-directed) DNA 합성의 개시점으로 작용할 수 있는 단일 가닥의 올리고뉴클레오티드인 것일 수 있다. 프라이머의 적합한 길이는 다양한 인자, 예를 들면, 온도와 프라이머의 용도에 따라 달라질 수 있다. 상기 프라이머는 길이가 5 내지 100nt, 5 내지 70nt, 10 내지 50nt, 또는 15 내지 30nt인 것일 수 있다. 예를 들면, 프라이머의 길이가 짧을수록, 낮은 어닐링(annealing) 온도에서 주형과 충분히 안정된 혼성화 복합체를 형성할 수 있다. 상기 프라이머의 길이가 5nt 미만의 크기를 가질 경우 표적 영역을 캡처하기 위한 정확도가 낮으며, 100nt 초과의 크기를 가질 경우 합성 비용이 증가하는 단점을 갖는다. 따라서 상기 프라이머는 경제적이면서 유전자 다형성 또는 변이 검출에 최적화된 크기를 갖는다. 프라이머의 설계는 주어진 증폭하고자 하는 표적 영역의 뉴클레오티드 서열을 참조하여 통상의 기술자에 의해 용이하게 실시할 수 있다. 예를 들면, 상업적으로 구입가능한 프라이머 설계용 프로그램을 사용하여 설계할 수 있다. 상기 상업적으로 구입가능한 프라이머 설계용 프로그램의 예는 PRIMER 3 프로그램이 포함된다.
상기 프라이머는 포스포로티오에이트(phosphorothioate), 알킬포스포로티오에이트와 같은 뉴클레오티드 유사체(analogue), 펩티드 핵산(peptide nucleic acid) 또는 삽입 물질(intercalating agent)을 더 포함하는 것일 수 있다. 또한, 형광, 인광 또는 방사성을 발하는 표지 물질을 더 포함하는 것일 수 있다. 상기 형광 표지 물질은 VIC, NED, FAM, PET, 또는 이들의 조합인 것일 수 있다. 상기 표지 물질은 상기 폴리뉴클레오티드의 5' 말단에 표지되는 것일 수 있다. 또한, 방사성 표지 물질은, 32P 또는 35S와 같은 방사성 동위원소가 첨가된 중합효소 연쇄 반응(polymerase chain reaction: PCR)의 반응액을 이용한 PCR 반응을 통해 증폭 산물에 혼입되는 것일 수 있다.
상기 프라이머는 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), PCR 연장 분석, PCR 단일 가닥 고차 구조 다형성(PCR-single strand conformation polymorphism: PCR-SSCP), TaqMan 방법 및 시퀀싱 등을 이용한 방법에 이용되는 것일 수 있다.
용어 "프로브(probe)"는 상보적인 폴리뉴클레오티드 가닥에 서열 특이적으로 결합할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 의미한다. 상기 프로브는 길이가 5 내지 100nt, 10 내지 90nt, 15 내지 80nt, 20 내지 70nt, 또는 30 내지 50nt인 것일 수 있다. 상기 프로브의 길이가 10nt 미만의 크기를 가질 경우 표적 영역을 캡처하기 위한 정확도가 낮으며, 100nt 초과의 크기를 가질 경우 합성 비용이 증가하는 단점을 갖는다. 따라서 상기 프로브는 경제적이면서 유전자 다형성 또는 변이 검출에 최적화된 크기를 갖는다. 상기 프로브는, 예를 들면, 표적 영역의 뉴클레오티드 서열에 완전 상보적인 서열로 이루어진 완전 매치 프로브(perfect match probe) 및 단일염기다형성 마커를 제외한 모든 뉴클레오티드 서열에 대하여 완전 상보적인 서열을 갖는 프로브로 이루어진 군으로부터 선택되는 것일 수 있다.
상기 프로브는 혼성화 방법, 예를 들면, 마이크로어레이(microarray), 서던 블로팅, 다이나믹 대립유전자 혼성화(dynamic allele-specific hybridization) 및 DNA 칩 등을 이용한 방법에 이용되는 것일 수 있다. 마이크로어레이는 당해 기술 분야에 알려진 의미로 사용되며, 예를 들면, 기판 상의 복수 개의 구분된 영역에 프로브 또는 프로브의 집단이 고정화되어 있는 것일 수 있다. 상기 기판은 적합한 견고성 또는 반-견고성 지지체로서, 예를 들면, 막, 필터, 칩, 슬라이드, 웨이퍼(wafer), 파이버(fiber), 자기성 비드 또는 비자기성 비드, 겔, 튜빙, 플레이트, 고분자, 미소입자 및 모세관을 포함하는 것일 수 있다. 상기 프로브 또는 그에 상보적인 프로브는 개체로부터 수득된 핵산과 혼성화되고 그로부터 얻어지는 혼성화 정도를 측정할 수 있는 방법에 이용되는 것일 수 있다.
상기 체중 조절은 체지방이 감소하는 정도인 것일 수 있다. 상기 단일염기다형성 마커는 비만관 관련된 일반적인 신체적 특징 중에서도, 체지방이 변화하는 정도와 특이적으로 연관되어 있는 것일 수 있다.
상기 체중 조절은 상대적으로 체지방이 감소하는 정도인 것일 수 있다. 예를 들면, 상기 체중 조절은 체지방이 감소하는 정도가 상기 단일염기다형성을 갖지 않는 군 또는 참조 유전체의 유전형과 동일한 유전형을 갖는 군에 비하여, 증가되어 있는지 또는 유의한 차이가 없는지를 나타내는 것일 수 있다. 또한, 상기 체중 조절은 특정 대립인자 또는 유전형을 갖는 개체가 다른 특정 대립인자 또는 유전형을 갖는 개체에 비하여 체지방이 감소하는 정도가 증가되어 있는지 또는 유의한 차이가 없는지를 나타내는 것일 수 있다.
상기 예측 또는 진단은 척추동물, 포유동물, 또는 인간(Homo sapiens)을 포함하는 것일 수 있다. 상기 예측 또는 진단은 한국인을 대상으로 하는 것일 수 있다. 상기 예측 또는 진단은 약 40 세 내지 약 70 세의 한국인인 것일 수 있다.
상기 단일염기다형성 마커는 미각 선호도에 대한 민감도 또는 미각 선호도에 따른 체중 조절을 예측 또는 진단하기 위한 마커로 사용될 수 있다. 상기 단일염기다형성 마커는 짠맛 선호도, 단맛 선호도, 또는 기름진맛 선호도에 따른 체지방이가 감소하는 정도를 예측 또는 진단하기 위한 마커로 사용될 수 있다.
다른 양상은 미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단을 위한 키트를 제공한다.
상기 키트는 미각 선호도에 따른 체중 조절 예측 또는 진단을 위한 키트인 것일 수 있다. 상기 키트는 상기 조성물을 포함하는 포함하는 것일 수 있다. 상기 키트은 단일염기다형성 마커를 검출할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하고, 상기 단일염기다형성 마커는 전술한 바와 동일하다.
상기 키트는, 예를 들면, 상기 폴리뉴클레오티드와 그의 특정 용도에 필요한 구성들을 포함하는 것일 수 있다. 상기 폴리뉴클레오티드와 함께 그의 사용 방법에 필요한 시약을 포함하는 것일 수 있다. 상기 키트는 상기 폴리뉴클레오티드가 핵산과 혼성화하는데 요구되는 알려진 물질을 더 포함하는 것일 수 있다. 상기 키트는 표적 영역의 뉴클레오티드 서열을 특이적으로 증폭하고, 증폭 산물의 존재 유무를 통하여, 개체의 체중 조절을 예측 또는 진단하기 위한 키트인 것일 수 있다. 또는 상기 폴리뉴클레오티드 또는 그로부터 유래된 프로브를 시료 중의 핵산과 혼성화시키고, 그 혼성화 결과로부터 개체의 체중 조절을 예측 또는 진단하기 위한 키트인 것일 수 있다. 예를 들면, 상기 핵산의 혼성화에 필요한 시약, 버퍼, 보조인자, 및/또는 기질을 더 포함하는 것일 수 있다. 또한 상기 키트가 PCR 증폭 과정에 적용되는 경우 선택적으로, PCR 증폭에 필요한 시약, 예를 들면, 완충액, DNA 중합효소, DNA 중합효소보조인자 및 dNTPs를 포함하는 것일 수 있다. 또한, 상기 키트는 표적 영역을 증폭하기 위하여 사용하기 위한 설명서를 더 포함할 수 있으며, 상기한 시약 성분을 포함하는 다수의 별도 패키징 또는 컴파트먼트로 제작될 수 있다. 상기 사용 설명서는 예를 들면, 상기 특이적 프라이머를 사용한 증폭 반응에서 표적 영역이 증폭되고, 상기 비특이적 프라이머를 사용한 증폭 반응에서 표적 영역이 증폭되지 않는 경우, 증폭에 사용된 시료 중에서 체중 조절과 연관된 표적 영역, 다형성 또는 변이가 존재하는 것으로 결정하고, 그 결과로부터 개체의 미각 선호도에 따른 체중 조절 정도를 결정하는 것에 대한 설명을 포함한, 결과 판정에 대한 설명을 포함하는 것일 수 있다.
다른 양상은 개체의 미각 선호도에 대한 민감도를 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법을 제공한다. 상기 방법은 개체의 미각 선호도에 따른 체중 조절을 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 것일 수 있다.
상기 방법은 개체의 생물학적 시료로부터 핵산 시료를 수득하는 단계; 및 수득된 핵산 시료로부터 단일염기다형성 마커의 유전형을 분석하는 단계를 포함하는 것일 수 있다.
상기 단일염기다형성 마커는, 인간의 18번째 염색체의 23524924번째 염기가 C 또는 T(rs1808579), 인간의 3번째 염색체의 130418627번째 염기가 A 또는 G(rs1542829), 인간의 3번째 염색체의 12366779번째 염기가 A 또는 G(rs2938397), 인간의 12번째 염색체의 49853685번째 염기가 A 또는 G(rs7138803), 인간의 3번째 염색체의 12350682번째 염기가 A 또는 G(rs17036333), 인간의 1번째 염색체의 111730863번째 염기가 T 또는 C(rs1546924), 인간의 9번째 염색체의 36969208번째 염기가 G 또는 T(rs16933812), 인간의 8번째 염색체의 64279894번째 염기가 A 또는 G(rs11787111), 인간의 2번째 염색체의 24935412번째 염기가 T 또는 C(rs713587), 인간의 3번째 염색체의 12334081번째 염기가 T 또는 C(rs76608844), 인간의 11번째 염색체의 111125247번째 염기가 G 또는 A(rs321358), 인간의 1번째 염색체의 50094148번째 염기가 T 또는 C(rs11583200), 인간의 1번째 염색체의 230705813번째 염기가 A 또는 G(rs3827749), 인간의 1번째 염색체의 230707692번째 염기가 C 또는 G(rs3789666), 인간의 1번째 염색체의 230707700번째 염기가 A 또는 G(rs3789667), 인간의 1번째 염색체의 230707887번째 염기가 A 또는 G(rs3789669), 인간의 1번째 염색체의 230708054번째 염기가 G 또는 T(rs3789671), 인간의 1번째 염색체의 74527379번째 염기가 T 또는 C(rs1514174), 인간의 1번째 염색체의 230708375번째 염기가 A 또는 G(rs2478545), 인간의 1번째 염색체의 74536509번째 염기가 A 또는 G(rs12566985), 인간의 9번째 염색체의 110129355번째 염기가 T 또는 C(rs17806457), 인간의 1번째 염색체의 83226700번째 염기가 A 또는 C(rs2389438), 인간의 5번째 염색체의 96381018번째 염기가 G 또는 A(rs7713317), 인간의 11번째 염색체의 8652392번째 염기가 G 또는 C(rs4256980), 인간의 11번째 염색체의 8640969번째 염기가 C 또는 T(rs11042023), 인간의 4번째 염색체의 44580470번째 염기가 A 또는 G(rs10938353), 인간의 19번째 염색체의 51270548번째 염기가 G 또는 A(rs1878047), 인간의 22번째 염색체의 40208941번째 염기가 G 또는 T(rs4820408), 인간의 12번째 염색체의 23922574번째 염기가 G 또는 A(rs7970953), 인간의 3번째 염색체의 141556594번째 염기가 T 또는 G(rs16851483), 또는 이들의 조합인 것일 수 있다.
상기 미각 선호도에 대한 민감도는 체중 조절로 표현되는 것일 수 있다.
상기 방법은 개체의 생물학적 시료로부터 핵산 시료를 수득하는 단계를 포함한다.
상기 개체는 미각 선호도에 따른 체중 조절을 예측 또는 진단하기 위한 대상을 의미한다. 상기 개체는 척추동물, 포유동물, 인간(Homo sapiens), 마우스, 래트, 소, 말, 돼지, 양, 염소, 개, 고양이 등을 포함하는 것일 수 있다. 예를 들면, 상기 인간은 아시아계 인, 한국인, 또는 약 40 세 내지 약 70 세의 한국인인 것일 수 있다.
상기 생물학적 시료는 생물로부터 수득된 시료를 말한다. 상기 생물학적 시료는 예를 들면 혈액, 조직, 소변, 점액, 타액, 눈물, 혈장, 혈청, 객담, 척수액, 흉수, 유두 흡인물, 림프액, 기도액, 장액, 비뇨생식관액, 모유, 림프계 체액, 정액, 뇌척수액, 기관계내 체액, 복수, 낭성 종양 체액, 양수액 또는 이들의 조합인 것일 수 있다. 생물학적 시료는 순수하게 분리된 핵산, 조 분리된 핵산, 핵산을 포함하는 세포 파쇄물, 또는 세포 유리 핵산을 포함하는 것일 수 있다.
생물학적 시료로부터 유전체 핵산을 분리하는 방법은 통상의 핵산 분리 방법에 의하여 수행될 수 있다. 예를 들면, 표적 핵산을 중합효소 연쇄 반응(polymerase chain reaction: PCR), 리가제 연쇄 반응(ligase chain reaction: LCR), 전사 증폭(transcription amplification), 또는 실시간-핵산 서열 기초 증폭(realtime-nucleic acid sequence based amplification: NASBA)을 통하여 증폭하고 이를 정제하여 얻을 수 있다.
상기 방법은 수득된 핵산 시료로부터 단일염기다형성 마커의 유전형을 분석하는 단계를 포함한다.
상기 방법에서 단일염기다형성 마커의 유전형을 분석하는 단계는 염색체 내 표적 영역 또는 단일염기다형성 마커의 각 위치에서의 뉴클레오티드를 결정하는 것을 의미한다. 예를 들면, 알려진 핵산의 뉴클레오티드 시퀀싱 방법(sequencing method)에 의하여 염색체 내 표적 영역 또는 각 위치에서의 뉴클레오티드를 직접적으로 결정할 수 있다. 뉴클레오티드 서열 결정 방법은 생거(또는 디데옥시) 시퀀싱 방법 또는 막삼-길버트(화학 절단) 방법을 포함하는 것일 수 있다. 또한, 프로브를 대상 폴리뉴클레오티드와 혼성화시키고, 혼성화 결과를 분석함으로써, 표적 영역의 뉴클레오티드 서열을 결정할 수 있다. 혼성화 정도는 예를 들면, 검출 가능한 표지를 대상 핵산에 표지하고, 혼성화된 대상 핵산을 검출함으로써 확인되거나, 전기적 방법 등에 의하여 확인될 수 있다. 또한, 단일 염기 연장(single base primer extension: SBE) 방법이 이용될 수 있다. 뉴클레오티드 서열 결정 방법은 또한, 차세대 염기 시퀀싱을 포함하는 것일 수 있다. 용어 "차세대 염기시퀀싱(next generation sequencing: NGS)은 칩(Chip)기반 그리고 PCR 기반 쌍-말단(paired end) 형식으로 전장 유전체를 조각내고, 상기 조각을 화학적인 반응(hybridization)에 기초하여 초고속으로 시퀀싱을 수행하는 기술을 의미한다. 차세대 염기시퀀싱에 의해 짧은 시간 내에 분석 대상이 되는 시료에 대해 대량의 염기서열 데이터를 생성할 수 있다.
상기 유전형을 분석하는 단계는 상기 단일염기다형성 마커에서의 특정 대립유전자의 유무 또는 특정 유전형의 유무에 근거하여, 개체 또는 피검체가 미각 선호도에 따른 현저한 체중 조절 효과를 보일 것인지를 판별할 수 있다.
상기 미각은 짠맛, 단맛 또는 기름진맛인 것일 수 있다.
상기 체중 조절은 체지방이 감소하는 정도인 것일 수 있다.
상기 방법은, 단일염기다형성 마커의 유전형을 분석한 결과, 인간의 18번째 염색체의 23524924번째 염기가 C(rs1808579), 인간의 3번째 염색체의 130418627번째 염기가 A(rs1542829), 인간의 3번째 염색체의 12366779번째 염기가 G(rs2938397), 인간의 12번째 염색체의 49853685번째 염기가 G(rs7138803), 인간의 3번째 염색체의 12350682번째 염기가 G(rs17036333), 인간의 1번째 염색체의 111730863번째 염기가 C(rs1546924), 인간의 9번째 염색체의 36969208번째 염기가 G(rs16933812), 인간의 8번째 염색체의 64279894번째 염기가 G(rs11787111), 인간의 2번째 염색체의 24935412번째 염기가 T(rs713587), 인간의 3번째 염색체의 12334081번째 염기가 C(rs76608844), 인간의 11번째 염색체의 111125247번째 염기가 G(rs321358), 인간의 1번째 염색체의 50094148번째 염기가 T(rs11583200), 인간의 1번째 염색체의 230705813번째 염기가 G(rs3827749), 인간의 1번째 염색체의 230707692번째 염기가 G(rs3789666), 인간의 1번째 염색체의 230707700번째 염기가 G(rs3789667), 인간의 1번째 염색체의 230707887번째 염기가 G(rs3789669), 인간의 1번째 염색체의 230708054번째 염기가 T(rs3789671), 인간의 1번째 염색체의 74527379번째 염기가 T(rs1514174), 인간의 1번째 염색체의 230708375번째 염기가 G(rs2478545), 인간의 1번째 염색체의 74536509번째 염기가 A(rs12566985), 인간의 9번째 염색체의 110129355번째 염기가 T(rs17806457), 인간의 1번째 염색체의 83226700번째 염기가 A(rs2389438), 인간의 5번째 염색체의 96381018번째 염기가 A(rs7713317), 인간의 11번째 염색체의 8652392번째 염기가 C(rs4256980), 인간의 11번째 염색체의 8640969번째 염기가 T(rs11042023), 인간의 4번째 염색체의 44580470번째 염기가 A(rs10938353), 인간의 19번째 염색체의 51270548번째 염기가 G(rs1878047), 인간의 22번째 염색체의 40208941번째 염기가 T(rs4820408), 인간의 12번째 염색체의 23922574번째 염기가 A(rs7970953), 인간의 3번째 염색체의 141556594번째 염기가 G(rs16851483), 또는 이들의 조합인 경우, 미각 선호도에 대한 민감도가 대조군(다른 개체)에 비하여 큰 것으로 결정하는 단계를 더 포함하는 것일 수 있다. 또는 짠맛 선호도, 단맛 선호도, 또는 기름진맛 선호도가 감소함에 따라 체지방이 감소하는 정도가 대조군(다른 개체)에 비하여 큰 것으로 결정하는 단계를 더 포함하는 것일 수 있다.
상기 방법은, 단일염기다형성 마커의 유전형을 분석한 결과, 인간의 18번째 염색체의 23524924번째 염기가 C(rs1808579), 인간의 3번째 염색체의 130418627번째 염기가 A(rs1542829), 인간의 3번째 염색체의 12366779번째 염기가 G(rs2938397), 인간의 12번째 염색체의 49853685번째 염기가 G(rs7138803), 인간의 3번째 염색체의 12350682번째 염기가 G(rs17036333), 인간의 1번째 염색체의 111730863번째 염기가 C(rs1546924), 인간의 9번째 염색체의 36969208번째 염기가 G(rs16933812), 인간의 8번째 염색체의 64279894번째 염기가 G(rs11787111), 인간의 2번째 염색체의 24935412번째 염기가 T(rs713587), 인간의 3번째 염색체의 12334081번째 염기가 C(rs76608844), 또는 이들의 조합인 경우, 짠맛 선호도가 감소함에 따라 체지방이 감소하는 정도가 대조군(다른 개체)에 비하여 큰 것으로 결정하는 단계를 더 포함하는 것일 수 있다. 상기 방법은 단일염기다형성 마커의 유전형을 분석한 결과, 상기 단일염기다형성을 갖는 경우, 상기 짠맛 선호도에 대한 민감도가 대조군(다른 개체)에 비하여 큰 것으로 결정하는 단계를 더 포함하는 것일 수 있다.
상기 방법은, 단일염기다형성 마커의 유전형을 분석한 결과, 인간의 11번째 염색체의 111125247번째 염기가 G(rs321358), 인간의 1번째 염색체의 50094148번째 염기가 T(rs11583200), 인간의 1번째 염색체의 230705813번째 염기가 G(rs3827749), 인간의 1번째 염색체의 230707692번째 염기가 G(rs3789666), 인간의 1번째 염색체의 230707700번째 염기가 G(rs3789667), 인간의 1번째 염색체의 230707887번째 염기가 G(rs3789669), 인간의 1번째 염색체의 230708054번째 염기가 T(rs3789671), 인간의 1번째 염색체의 74527379번째 염기가 T(rs1514174), 인간의 1번째 염색체의 230708375번째 염기가 G(rs2478545), 인간의 1번째 염색체의 74536509번째 염기가 A(rs12566985), 또는 이들의 조합인 경우, 단맛 선호도가 감소함에 따라 체지방이 감소하는 정도가 대조군(다른 개체)에 비하여 큰 것으로 결정하는 단계를 더 포함하는 것일 수 있다. 상기 방법은 단일염기다형성 마커의 유전형을 분석한 결과, 상기 단일염기다형성을 갖는 경우, 상기 단맛 선호도에 대한 민감도가 대조군(다른 개체)에 비하여 큰 것으로 결정하는 단계를 더 포함하는 것일 수 있다.
상기 방법은, 단일염기다형성 마커의 유전형을 분석한 결과, 인간의 9번째 염색체의 110129355번째 염기가 T(rs17806457), 인간의 1번째 염색체의 83226700번째 염기가 A(rs2389438), 인간의 5번째 염색체의 96381018번째 염기가 A(rs7713317), 인간의 11번째 염색체의 8652392번째 염기가 C(rs4256980), 인간의 11번째 염색체의 8640969번째 염기가 T(rs11042023), 인간의 4번째 염색체의 44580470번째 염기가 A(rs10938353), 인간의 19번째 염색체의 51270548번째 염기가 G(rs1878047), 인간의 22번째 염색체의 40208941번째 염기가 T(rs4820408), 인간의 12번째 염색체의 23922574번째 염기가 A(rs7970953), 인간의 3번째 염색체의 141556594번째 염기가 G(rs16851483), 또는 이들의 조합인 경우, 기름진맛 선호도가 감소함에 따라 체지방이 감소하는 정도가 대조군(다른 개체)에 비하여 큰 것으로 결정하는 단계를 더 포함하는 것일 수 있다. 상기 방법은 단일염기다형성 마커의 유전형을 분석한 결과, 상기 단일염기다형성을 갖는 경우, 상기 기름진맛 선호도에 대한 민감도가 대조군(다른 개체)에 비하여 큰 것으로 결정하는 단계를 더 포함하는 것일 수 있다.
상기 개체의 미각 선호도에 따른 체중 조절을 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 것은 미각 선호도에 따라 상대적으로 체지방이 감소하는 정도를 예측 또는 진단하기 위한 것일 수 있다. 예를 들면, 상기 수치는 참조 유전체 서열을 갖고 있는 군 또는 상기 단일염기다형성을 갖지 않는 군에 비하여 체지방이 감소하는 정도가 증가되어 있는지를 예측 또는 진단하기 위한 것일 수 있다.
용어 "참조 유전체 서열(reference genome sequence)"은 다형성 또는 변이 확인을 위해 참조가 되는, 인간 유전체 서열인 것일 수 있다. 참조 유전체 서열은, 참조 유전체의 뉴클레오티드 서열, 예를 들면, 미국 국립보건원 산하 생물공학정보연구소의 데이터베이스에 게시된 인간 유전자의 뉴클레오티드 서열, 구체적으로, NCBI37.1 또는 UCSC hg19(GRCh37)인 것일 수 있다. 상기 개체의 뉴클레오티드 서열과 참조 유전체 서열 간의 비교는 공지된 다양한 서열 비교 분석프로그램, 예를 들면 Maq, Bowtie, SOAP, GSNAP 등을 이용하여 수행할 수 있다.
상기 단일염기다형성 마커에서 다형성의 수가, 1개 이상, 2개 이상, 3개 이상, 4개 이상, 또는 5개 이상인 경우, 미각 선호도에 따른 체제방이 감소하는 정도가 증가되어 있다고 판단할 수 있으며, 예측 또는 진단에 대한 정확도가 높아질 수 있다.
상기 유전형을 분석하는 단계는 시퀀싱, 마이크로어레이에 의한 혼성화, 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 다이나믹 대립유전자 혼성화(dynamic allele-specific hybridization), PCR 연장 분석, PCR-SSCP(PCR-single strand conformation polymorphism), TaqMan 방법 또는 이들의 조합에 의해 수행되는 것일 수 있다.
시퀀싱 분석은 염기서열 결정을 위한 통상적인 방법을 사용할 수 있으며, 자동화된 유전자 분석기를 이용하여 수행될 수 있다. 대립유전자 특이적 PCR은 단일염기다형성 마커가 위치하는 염기를 3' 말단으로 하여 고안한 프라이머를 포함한 프라이머 세트로 상기 단일염기다형성 마커가 위치하는 DNA 단편을 증폭하는 PCR 방법을 의미한다. PCR 연장 분석은 먼저 단일염기다형성 마커가 위치하는 염기를 포함하는 DNA 단편을 프라이머 쌍으로 증폭한 다음, 반응에 첨가된 모든 뉴클레오티드를 탈인산화시킴으로써 불활성화시키고, 여기에 단일염기다형성 마커에 특이적인 연장 프라이머, dNTP 혼합물, 디디옥시뉴클레오티드, 반응 완충액 및 DNA 중합효소를 첨가하여 프라이머 연장반응을 수행함으로써 이루어진다. TaqMan 방법은 원하는 DNA 단편을 증폭할 수 있도록 프라이머 및 TaqMan 탐침을 설계 및 제작하고, 서로 다른 대립유전자의 탐침을 FAM 및 VIC로 표지(Applied Biosystems)하여, 증폭 및 분석하는 단계로 수행된다.
다른 양상은 단일염기다형성 마커를 검출할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 조성물의 미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단을 위한 용도를 제공한다.
상기 미각 선호도에 대한 민감도는 체중 조절로 표현되는 것일 수 있다. 상기 조성물의 용도는 미각 선호도에 따른 체중 조절 예측 또는 진단을 위한 용도일 수 있다. 상기 단일염기다형성 마커는 전술한 바와 동일하다.
단일염기다형성 마커를 검출할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단하기 위한 조성물, 및 키트 및 개체의 미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법에 의하면, 개체의 미각 선호도에 따른 체지방이 감소하는 정도를 예측 또는 측정할 수 있다. 예측 또는 측정된 개체의 미각 선호도에 따른 체지방이 감소하는 정도는 개인 맞춤의학적 비만 치료에 적용하여 효과를 증대시킬 수 있다.
본 발명은 하기 실시예에 의하여 더욱 구체적으로 설명한다. 그러나, 하기 실시예는 본 발명의 이해를 돕기 위한 것일 뿐, 어떤 의미로든 본 발명의 범위가 이러한 실시예에 의하여 한정되는 것은 아니다.
실시예 1. 짠맛 선호도, 단맛 선호도, 및 기름진맛 선호도에 따른 체지방과 단일염기다형성과의 연관성 분석
1. 연구 대상 선정
코호트 연구(Cohort study)는 어떤 특성을 공유하는 집단 구성원들에 대하여 장기간 추적조사를 통해 건강 상태를 확인함으로써 위험 요인들과 질병 발생 간의 원인적 연관성을 밝혀내는 의학 연구방법이다. 본 연구는 질병관리본부 국립보건연구원 유전체역학과에서 수행 중인 한국인유전체역학조사사업 내 지역사회기반 코호트 자료를 이용하였다. 본 연구는 전향성 코호트 연구라는 방법적인 특성을 고려하여, 연구 대상자의 추적관리를 통하여 이루어졌다. 지역사회기반 코호트는 2001년 내지 2002년 경기도 안산과 안성 지역에 거주하는 40 내지 69세 성인을 대상으로 기반조사를 시작하여, 이후 매 2년마다 반복 추적조사를 수행하였다. 초기 8840명을 검사 대상으로 하였다. 매 조사 시 건강 및 생활습관 정보 등의 역학 자료와 함께 혈액, 소변 등의 생체시료를 수집하였다.
2. 미각 선호도에 따른 체지방 차이와 단일염기다형성과의 연관성 분석
상기의 검사 대상자에 대하여 미각 선호도에 따른 단일염기다형성과의 연관성을 분석하였다.
구체적으로, 미각 선호도와 관련하여 짠맛, 단맛, 및 기름진맛 선호도에 대한 설문조사를 사용하여 확인하였다.
"짠 음식의 선호도" 문항은 1=아주싫다, 2=싫어한다, 3=보통이다, 4=좋아한다, 5=아주좋다로 하였고, "단 음식의 선호도" 문항은 1=아주싫다, 2=싫어한다, 3=보통이다, 4=좋아한다, 5=아주좋다로 하였고, "기름진 음식의 선호도" 문항은 1=아주싫다, 2=싫어한다, 3=보통이다, 4=좋아한다, 5=아주좋다로 하였다.
개인별 미각 선호도의 차이에 따른 체지방 변화에 대한 유전적인 영향을 조사하였다. 이후에, 미각 선호도의 차이에 의해 유도된 체지방 변화에 대하여 연령이 조정된 (Age-adjusted)선형 모델(linear model)을 이용한 통계학적 분석을 실시하였다.
ΔBMI ~ X + SNP + X ·SNP + Gender + Age
그 결과, 비만과 관련된 다형성이라고 알려진 7248종의 다형성들 중, 10종의 다형성은 짠맛 선호도 감소에 의해 유도된 체지방의 감소와 현저하게 연관되어 있음을 확인하였다 (P=(0.001292342)-(0.015188604)).
비만과 관련된 다형성이라고 알려진 7248종의 다형성들 중, 10종의 다형성은 단맛 선호도 감소에 의해 유도된 체지방 감소와 현저하게 연관되어 있음을 확인하였다 (P=(0.000793839)-(0.008577709)).
비만과 관련된 다형성이라고 알려진 7248종의 다형성들 중, 10종의 다형성은 기름진맛 선호도 감소에 의해 유도된 체지방 감소와 현저하게 연관되어 있음을 확인하였다 (P=(0.000381878)-(0.022943187)).
짠맛 선호도와 관련된 단열염기다형성
Rs# P-Value
rs1808579 0.001292342
rs1542829 0.002369246
rs2938397 0.006737605
rs7138803 0.006984449
rs17036333 0.007000085
rs1546924 0.010253035
rs16933812 0.011810143
rs11787111 0.012207763
rs713587 0.014674742
rs76608844 0.015188604
단맛 선호도 감소에 의한 체질량지수 변화와 다형성의 회귀 분석
Rs# P-Value
rs321358 0.000793839
rs11583200 0.00089111
rs3827749 0.001991254
rs3789666 0.00265186
rs3789667 0.00274485
rs3789669 0.003146946
rs3789671 0.004724516
rs1514174 0.007330753
rs2478545 0.008002341
rs12566985 0.008577709
기름진맛 선호도와 관련된 단일염기다형성
Rs# P-Value
rs17806457 0.000381878
rs2389438 0.002704613
rs7713317 0.004283235
rs4256980 0.007346787
rs11042023 0.009648288
rs10938353 0.00969894
rs1878047 0.012163276
rs4820408 0.019050455
rs7970953 0.021151206
rs16851483 0.022943187

Claims (11)

  1. 단일염기다형성 마커를 검출할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는, 미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단을 위한 조성물로서,
    상기 단일염기다형성 마커는,
    인간의 18번째 염색체의 23524924번째 염기가 C 또는 T(rs1808579),
    인간의 3번째 염색체의 130418627번째 염기가 A 또는 G(rs1542829),
    인간의 3번째 염색체의 12366779번째 염기가 A 또는 G(rs2938397),
    인간의 12번째 염색체의 49853685번째 염기가 A 또는 G(rs7138803),
    인간의 3번째 염색체의 12350682번째 염기가 A 또는 G(rs17036333),
    인간의 1번째 염색체의 111730863번째 염기가 T 또는 C(rs1546924),
    인간의 9번째 염색체의 36969208번째 염기가 G 또는 T(rs16933812),
    인간의 8번째 염색체의 64279894번째 염기가 A 또는 G(rs11787111),
    인간의 2번째 염색체의 24935412번째 염기가 T 또는 C(rs713587),
    인간의 3번째 염색체의 12334081번째 염기가 T 또는 C(rs76608844),
    인간의 11번째 염색체의 111125247번째 염기가 G 또는 A(rs321358),
    인간의 1번째 염색체의 50094148번째 염기가 T 또는 C(rs11583200),
    인간의 1번째 염색체의 230705813번째 염기가 A 또는 G(rs3827749),
    인간의 1번째 염색체의 230707692번째 염기가 C 또는 G(rs3789666),
    인간의 1번째 염색체의 230707700번째 염기가 A 또는 G(rs3789667),
    인간의 1번째 염색체의 230707887번째 염기가 A 또는 G(rs3789669),
    인간의 1번째 염색체의 230708054번째 염기가 G 또는 T(rs3789671),
    인간의 1번째 염색체의 74527379번째 염기가 T 또는 C(rs1514174),
    인간의 1번째 염색체의 230708375번째 염기가 A 또는 G(rs2478545),
    인간의 1번째 염색체의 74536509번째 염기가 A 또는 G(rs12566985),
    인간의 9번째 염색체의 110129355번째 염기가 T 또는 C(rs17806457),
    인간의 1번째 염색체의 83226700번째 염기가 A 또는 C(rs2389438),
    인간의 5번째 염색체의 96381018번째 염기가 G 또는 A(rs7713317),
    인간의 11번째 염색체의 8652392번째 염기가 G 또는 C(rs4256980),
    인간의 11번째 염색체의 8640969번째 염기가 C 또는 T(rs11042023),
    인간의 4번째 염색체의 44580470번째 염기가 A 또는 G(rs10938353),
    인간의 19번째 염색체의 51270548번째 염기가 G 또는 A(rs1878047),
    인간의 22번째 염색체의 40208941번째 염기가 G 또는 T(rs4820408),
    인간의 12번째 염색체의 23922574번째 염기가 G 또는 A(rs7970953),
    인간의 3번째 염색체의 141556594번째 염기가 T 또는 G(rs16851483), 또는 이들의 조합이고,
    상기 미각 선호도에 대한 민감도는 체중 조절로 표현되는 것인 조성물.
  2. 청구항 1에 있어서, 상기 미각은 짠맛, 단맛 또는 기름진 맛인 것인 조성물.
  3. 청구항 1에 있어서, 상기 체중 조절은 체지방이 감소하는 정도인 것인 조성물.
  4. 청구항 1에 있어서, 상기 예측 또는 진단은 한국인을 대상으로 하는 것인 조성물.
  5. 하기 단계를 포함하는 개체의 미각 선호도에 대한 민감도를 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법으로서,
    개체의 생물학적 시료로부터 핵산 시료를 수득하는 단계; 및
    수득된 핵산 시료로부터 단일염기다형성 마커의 유전형을 분석하는 단계를 포함하고,
    상기 단일염기다형성 마커는,
    인간의 18번째 염색체의 23524924번째 염기가 C 또는 T(rs1808579),
    인간의 3번째 염색체의 130418627번째 염기가 A 또는 G(rs1542829),
    인간의 3번째 염색체의 12366779번째 염기가 A 또는 G(rs2938397),
    인간의 12번째 염색체의 49853685번째 염기가 A 또는 G(rs7138803),
    인간의 3번째 염색체의 12350682번째 염기가 A 또는 G(rs17036333),
    인간의 1번째 염색체의 111730863번째 염기가 T 또는 C(rs1546924),
    인간의 9번째 염색체의 36969208번째 염기가 G 또는 T(rs16933812),
    인간의 8번째 염색체의 64279894번째 염기가 A 또는 G(rs11787111),
    인간의 2번째 염색체의 24935412번째 염기가 T 또는 C(rs713587),
    인간의 3번째 염색체의 12334081번째 염기가 T 또는 C(rs76608844),
    인간의 11번째 염색체의 111125247번째 염기가 G 또는 A(rs321358),
    인간의 1번째 염색체의 50094148번째 염기가 T 또는 C(rs11583200),
    인간의 1번째 염색체의 230705813번째 염기가 A 또는 G(rs3827749),
    인간의 1번째 염색체의 230707692번째 염기가 C 또는 G(rs3789666),
    인간의 1번째 염색체의 230707700번째 염기가 A 또는 G(rs3789667),
    인간의 1번째 염색체의 230707887번째 염기가 A 또는 G(rs3789669),
    인간의 1번째 염색체의 230708054번째 염기가 G 또는 T(rs3789671),
    인간의 1번째 염색체의 74527379번째 염기가 T 또는 C(rs1514174),
    인간의 1번째 염색체의 230708375번째 염기가 A 또는 G(rs2478545),
    인간의 1번째 염색체의 74536509번째 염기가 A 또는 G(rs12566985),
    인간의 9번째 염색체의 110129355번째 염기가 T 또는 C(rs17806457),
    인간의 1번째 염색체의 83226700번째 염기가 A 또는 C(rs2389438),
    인간의 5번째 염색체의 96381018번째 염기가 G 또는 A(rs7713317),
    인간의 11번째 염색체의 8652392번째 염기가 G 또는 C(rs4256980),
    인간의 11번째 염색체의 8640969번째 염기가 C 또는 T(rs11042023),
    인간의 4번째 염색체의 44580470번째 염기가 A 또는 G(rs10938353),
    인간의 19번째 염색체의 51270548번째 염기가 G 또는 A(rs1878047),
    인간의 22번째 염색체의 40208941번째 염기가 G 또는 T(rs4820408),
    인간의 12번째 염색체의 23922574번째 염기가 G 또는 A(rs7970953),
    인간의 3번째 염색체의 141556594번째 염기가 T 또는 G(rs16851483), 또는 이들의 조합인 것이고,
    상기 미각 선호도에 대한 민감도는 체중 조절로 표현되는 것인 방법.
  6. 청구항 5에 있어서, 상기 미각은 짠맛, 단맛 또는 기름진 맛인 것인 방법.
  7. 청구항 5에 있어서, 상기 체중 조절은 체지방이 감소하는 정도인 것인 방법.
  8. 청구항 5에 있어서,
    인간의 18번째 염색체의 23524924번째 염기가 C 또는 T(rs1808579),
    인간의 3번째 염색체의 130418627번째 염기가 A 또는 G(rs1542829),
    인간의 3번째 염색체의 12366779번째 염기가 A 또는 G(rs2938397),
    인간의 12번째 염색체의 49853685번째 염기가 A 또는 G(rs7138803),
    인간의 3번째 염색체의 12350682번째 염기가 A 또는 G(rs17036333),
    인간의 1번째 염색체의 111730863번째 염기가 T 또는 C(rs1546924),
    인간의 9번째 염색체의 36969208번째 염기가 G 또는 T(rs16933812),
    인간의 8번째 염색체의 64279894번째 염기가 A 또는 G(rs11787111),
    인간의 2번째 염색체의 24935412번째 염기가 T 또는 C(rs713587),
    인간의 3번째 염색체의 12334081번째 염기가 T 또는 C(rs76608844),
    인간의 11번째 염색체의 111125247번째 염기가 G 또는 A(rs321358),
    인간의 1번째 염색체의 50094148번째 염기가 T 또는 C(rs11583200),
    인간의 1번째 염색체의 230705813번째 염기가 A 또는 G(rs3827749),
    인간의 1번째 염색체의 230707692번째 염기가 C 또는 G(rs3789666),
    인간의 1번째 염색체의 230707700번째 염기가 A 또는 G(rs3789667),
    인간의 1번째 염색체의 230707887번째 염기가 A 또는 G(rs3789669),
    인간의 1번째 염색체의 230708054번째 염기가 G 또는 T(rs3789671),
    인간의 1번째 염색체의 74527379번째 염기가 T 또는 C(rs1514174),
    인간의 1번째 염색체의 230708375번째 염기가 A 또는 G(rs2478545),
    인간의 1번째 염색체의 74536509번째 염기가 A 또는 G(rs12566985),
    인간의 9번째 염색체의 110129355번째 염기가 T 또는 C(rs17806457),
    인간의 1번째 염색체의 83226700번째 염기가 A 또는 C(rs2389438),
    인간의 5번째 염색체의 96381018번째 염기가 G 또는 A(rs7713317),
    인간의 11번째 염색체의 8652392번째 염기가 G 또는 C(rs4256980),
    인간의 11번째 염색체의 8640969번째 염기가 C 또는 T(rs11042023),
    인간의 4번째 염색체의 44580470번째 염기가 A 또는 G(rs10938353),
    인간의 19번째 염색체의 51270548번째 염기가 G 또는 A(rs1878047),
    인간의 22번째 염색체의 40208941번째 염기가 G 또는 T(rs4820408),
    인간의 12번째 염색체의 23922574번째 염기가 G 또는 A(rs7970953),
    인간의 3번째 염색체의 141556594번째 염기가 T 또는 G(rs16851483), 또는 이들의 조합인 경우,
    미각 선호도에 대한 민감도가 다른 개체에 비하여 큰 것으로 결정하는 단계를 더 포함하는 것인 방법.
  9. 청구항 5에 있어서, 상기 예측 또는 진단은 한국인을 대상으로 하는 것인 방법.
  10. 청구항 5에 있어서, 상기 유전형을 분석하는 단계는 시퀀싱, 마이크로어레이에 의한 혼성화, 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 다이나믹 대립유전자 혼성화(dynamic allele-specific hybridization), PCR 연장 분석, PCR-SSCP(PCR-single strand conformation polymorphism), TaqMan 방법 또는 이들의 조합에 의해 수행되는 것인 방법.
  11. 단일염기다형성 마커를 검출할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 조성물의 미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단을 위한 용도로서,
    상기 단일염기다형성 마커는,
    인간의 18번째 염색체의 23524924번째 염기가 C 또는 T(rs1808579),
    인간의 3번째 염색체의 130418627번째 염기가 A 또는 G(rs1542829),
    인간의 3번째 염색체의 12366779번째 염기가 A 또는 G(rs2938397),
    인간의 12번째 염색체의 49853685번째 염기가 A 또는 G(rs7138803),
    인간의 3번째 염색체의 12350682번째 염기가 A 또는 G(rs17036333),
    인간의 1번째 염색체의 111730863번째 염기가 T 또는 C(rs1546924),
    인간의 9번째 염색체의 36969208번째 염기가 G 또는 T(rs16933812),
    인간의 8번째 염색체의 64279894번째 염기가 A 또는 G(rs11787111),
    인간의 2번째 염색체의 24935412번째 염기가 T 또는 C(rs713587),
    인간의 3번째 염색체의 12334081번째 염기가 T 또는 C(rs76608844),
    인간의 11번째 염색체의 111125247번째 염기가 G 또는 A(rs321358),
    인간의 1번째 염색체의 50094148번째 염기가 T 또는 C(rs11583200),
    인간의 1번째 염색체의 230705813번째 염기가 A 또는 G(rs3827749),
    인간의 1번째 염색체의 230707692번째 염기가 C 또는 G(rs3789666),
    인간의 1번째 염색체의 230707700번째 염기가 A 또는 G(rs3789667),
    인간의 1번째 염색체의 230707887번째 염기가 A 또는 G(rs3789669),
    인간의 1번째 염색체의 230708054번째 염기가 G 또는 T(rs3789671),
    인간의 1번째 염색체의 74527379번째 염기가 T 또는 C(rs1514174),
    인간의 1번째 염색체의 230708375번째 염기가 A 또는 G(rs2478545),
    인간의 1번째 염색체의 74536509번째 염기가 A 또는 G(rs12566985),
    인간의 9번째 염색체의 110129355번째 염기가 T 또는 C(rs17806457),
    인간의 1번째 염색체의 83226700번째 염기가 A 또는 C(rs2389438),
    인간의 5번째 염색체의 96381018번째 염기가 G 또는 A(rs7713317),
    인간의 11번째 염색체의 8652392번째 염기가 G 또는 C(rs4256980),
    인간의 11번째 염색체의 8640969번째 염기가 C 또는 T(rs11042023),
    인간의 4번째 염색체의 44580470번째 염기가 A 또는 G(rs10938353),
    인간의 19번째 염색체의 51270548번째 염기가 G 또는 A(rs1878047),
    인간의 22번째 염색체의 40208941번째 염기가 G 또는 T(rs4820408),
    인간의 12번째 염색체의 23922574번째 염기가 G 또는 A(rs7970953),
    인간의 3번째 염색체의 141556594번째 염기가 T 또는 G(rs16851483), 또는 이들의 조합이고,
    상기 미각 선호도에 대한 민감도는 체중 조절로 표현되는 것인, 조성물의 미각 선호도에 대한 민감도 예측 또는 진단을 위한 용도.
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