WO2020029521A1 - 有机分子的立体异构全集自动化生成方法 - Google Patents

有机分子的立体异构全集自动化生成方法 Download PDF

Info

Publication number
WO2020029521A1
WO2020029521A1 PCT/CN2018/123533 CN2018123533W WO2020029521A1 WO 2020029521 A1 WO2020029521 A1 WO 2020029521A1 CN 2018123533 W CN2018123533 W CN 2018123533W WO 2020029521 A1 WO2020029521 A1 WO 2020029521A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
atom
fragments
fragment
broken
stereoisomers
Prior art date
Application number
PCT/CN2018/123533
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
张焕淮
孙广旭
刘阳
温书豪
马健
赖力鹏
Original Assignee
深圳晶泰科技有限公司
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 深圳晶泰科技有限公司 filed Critical 深圳晶泰科技有限公司
Priority to PCT/CN2018/123533 priority Critical patent/WO2020029521A1/zh
Priority to US16/629,959 priority patent/US11562809B2/en
Publication of WO2020029521A1 publication Critical patent/WO2020029521A1/zh

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16C—COMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
    • G16C20/00—Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
    • G16C20/50—Molecular design, e.g. of drugs
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
    • G06F30/00—Computer-aided design [CAD]
    • G06F30/20—Design optimisation, verification or simulation
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16C—COMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
    • G16C20/00—Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures

Definitions

  • the present invention belongs to the field of organic molecule simulation calculation, and in particular relates to a method for automatically generating a complete set of stereoisomers of organic molecules, which is used for comprehensive analysis of chiral, cyclic and cis-trans isomers of molecules. Regardless of the linear isomerism, such as the isomerism formed by the rotation of flexible angles, all stereoisomerism is generated. Background technique
  • Stereoisomerization is of great significance in cheminformatics.
  • the common stereo isomerization generation methods are mainly knowledge-based methods for heterogeneous generation:
  • the present invention provides a method for automatically generating a complete set of stereoisomers of organic molecules, and provides as many stereoisomers of common rings as possible.
  • a method for automatically generating a complete set of stereoisomers of organic molecules includes the following steps:
  • the molecular segmentation method described in step (1) includes the following steps:
  • None of the above-mentioned broken bonds includes a chemical bond with a hydrogen atom.
  • Step (2) The specific process is: constructing a graph using an atomic template as a node and a key template as an edge; and then using a subgraph isomorphic algorithm to perform segment template matching; the atomic template describes a group of atoms A template object, a key template is a template object describing a group of key types; the fragment template describes all stereoisomeric shapes of the fragment and all possible sites and their relative positions.
  • step (4) the specific process of assembling the fragments in step (4) is:
  • step (2) If all broken keys are not traversed, go to step (2).
  • a fragment template only needs to be described
  • the simplest kind of fragment is described, so it is easy to exhaust the stereoisomers of common rings.
  • the use of a fragment template can conveniently describe the stereoisomerization of similar fragments, greatly reduce the number of fragments, and greatly reduce the difficulty of constructing a fragment library. Dividing the fragments, then traversing all the stereoisomers of the fragments, and then assembling according to the site combination, can easily generate all the stereoisomers of a molecule.
  • FIG. 1 is a flowchart of a method for generating stereoisomerization according to the present invention
  • FIG. 2 is a schematic diagram of molecular segmentation in this embodiment
  • FIG. 3 is a schematic diagram of the isomerization of the six-membered single bond ring in this embodiment to form isomerization;
  • FIG. 4 is a schematic diagram of cis-trans isomerization and isomerization in this embodiment
  • FIG. 5 is a schematic diagram of chiral isomerization and isomerization in this embodiment
  • FIG. 7 is a flowchart of assembling fragments according to the present invention.
  • a method for automatically generating a complete set of stereoisomers of organic molecules includes the following steps:
  • the input molecule is cut into a set of fragments, and the fragments are mainly divided into three types: cyclic isomers, cis-trans isomers, and chiral isomers.
  • Cycloisomeric fragments usually include a non-conjugated ring or a fused ring consisting of multiple rings; cis-trans isomers refer to one or more cis-trans sites and the surrounding chemical environment; Chiral center and surrounding chemical environment.
  • These three types of fragments represent three types of isomers of this molecule, of which the cyclic isomerism is the most complicated case.
  • FIG. 6 it is a molecular segmentation algorithm flow, and the algorithm includes the following processes:
  • None of the above-mentioned broken bonds includes a chemical bond with a hydrogen (H) or fluorine (F) atom.
  • fragment 1 is a cis-trans isomer fragment
  • fragment 2 is a cyclic isomer fragment
  • fragment 3 is a chiral isomer fragment.
  • Atomic templates are used as nodes, key templates are used as edges, and graphs are constructed. Then, a subgraph isomorphic algorithm (generally using VF2 algorithm) is used to perform segment template matching.
  • Atomic templates are template objects that describe a set of atoms, and key templates are template objects that describe a set of bond types.
  • the fragment template describes all stereoisomeric shapes of the fragment and all possible sites and their relative positions. It describes all possible heterogeneous information of the same type of fragment: as shown in Figure 3, it describes a single-bond six-membered ring, which has two stereoisomers, namely ship isomerism and chair isomerism.
  • Each atom on the atom may have two heterogeneous sites.
  • a fragment template describes the simplest fragment, so a fused ring fragment may match multiple fragment templates.
  • Chiral isomers and cis-trans isomers are very simple and do not need to be described by templates, as shown in Figures 4 and 5, because their chemical nature naturally determines that they can exchange any two sites (connected groups or atoms) to form isomers.
  • step (2) If all broken keys have not been traversed, go to step (2).
  • fragment 2 is a six-membered single bond ring fragment.
  • This ring has two isomeric forms, and two carbon atoms that break the bond have two heterogeneous sites, so fragmentl
  • fragment 3 and fragment 2 are assembled, there are two insertion sites; therefore, there are 8 (2 * 2 *) stereoisomers related to fragment2, and fragmentl and fragment themselves have two different isomers, so In the end, the molecule will generate a total of 32 (8 * 2 * 2) stereoisomers. If filtering is required, you can filter according to the specified filtering rules.

Landscapes

  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Computing Systems (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Computer Hardware Design (AREA)
  • Evolutionary Computation (AREA)
  • Geometry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Information Retrieval, Db Structures And Fs Structures Therefor (AREA)

Abstract

本发明属于有机分子模拟计算领域，具体涉及一种有机分子的立体异构全集自动化生成方法，(1)将输入分子切分成一组片段；(2)用得到的异构片段到片段模板库中匹配片段模板；(3)根据片段模板信息生成出对应片段的所有异构；(4)遍历所有的异构片段及其位点，将步骤(1)中断的键两端的片段，按断键原子的所有可能的位点进行组装，得到所有的立体异构；如果需要过滤，则可以按照指定的过滤规则进行过滤。本发明可以很方便的描述相似片段的立体异构，并大量减少片段数量，极大地降低片段库的构建难度。分片段，再遍历片段的所有立体异构，然后根据位点组合拼装，可以容易地生成一个分子的所有立体异构。

Description

说明书 发明名称:有机分子的立体异构全集自动化生成方法 技术领域
[0001] 本发明属于有机分子模拟计算领域， 具体涉及一种有机分子的立体异构全集自 动化生成方法， 用于对分子的手性异构、 环异构、 顺反异构进行综合分析， 在 不考虑直链异构如转动柔性角形成的异构的情况下， 生成出所有的立体异构。 背景技术
[0002] 立体异构生成在化学信息学中具有重要意义。 目前常见的立体异构生成方法主 要是基于知识的方法进行异构生成：
[0003] 通常利用已有的异构库， 寻找相似的结构集团并给出其立体异构。 此方法适常 见的方式是基于已知的构象数据库， 将目标分子拆解成片段， 然后在数据库中 搜寻相同或相似的片段。 最后将搜索出的片段异构组合成为整体异构。 这种方 式不足之处主要在于： 基于已有的知识， 数据库的片段异构覆盖度不够， 对一 些分子生成的立体异构不全。 特别是环异构， 由于稠环形式多种多样， 5见有数 据库很难覆盖所有的环异构片段。 另外， 对于新出现的立体异构， 可能查找不 到， 需要手动生成。
发明概述
技术问题
问题的解决方案
技术解决方案
[0004] 针对上述技术问题， 本发明提供一种有机分子的立体异构全集自动化生成方法 ， 尽可能的提供更多的常见环的立体异构，
[0005] 具体技术方案为：
[0006] 有机分子的立体异构全集自动化生成方法， 包括以下步骤：
[0007] （一） 将输入分子切分成一组片段， 片段主要分为三种类型： 环异构片段、 顺 反异构片段、 手性异构片段；
[0008] （二） 用得到的异构片段到片段模板库中匹配片段模板； 手性异构和顺反异构 可不需要用模板描述；
[0009] (三) 根据片段模板信息生成出对应片段的所有异构； 对于顺反异构和手性异 构， 只需要在第 (四) 步中， 交换其任意两个位点进行组装；
[0010] (四) 遍历所有的异构片段及其位点， 将步骤 (一) 中断的键两端的片段， 按 断键原子的所有可能的位点进行组装， 得到所有的立体异构。
[0011] 其中， 步骤 (一) 所述的分子切分方法包括以下步骤：
[0012] ( 1) 判断原子为环上非平面原子， 则断掉与该原子相连的非环上单键， 即断 掉与该原子相连的非等价取代基； 判断原子是否为环上平面原子的规则为： 不 连接双键或三键且不在共轭体系里；
[0013] (2) 判断原子为手性中心原子， 则断掉与该原子相连的任意一根单键， 一般 断掉相连原子的原子序最小的单键；
[0014] (3) 判断原子处于顺反异构结构中， 则断掉其任意单键， 选取邻接原子原子 序较小的单键；
[0015] 上述所断的键中都不包括与氢原子形成的化学键。
[0016] 步骤 (二) 具体的过程为： 以原子模板为节点， 键模板为边， 构建图； 然后使 用子图同构算法进行片段模板地匹配； 所述的原子模板是描述一组原子的模板 对象， 键模板为描述一组键类型的模板对象； 所述的片段模板描述了该片段所 有立体异构的形状和所有的可能的位点及其位点的相对位置。
[0017] 进一步的， 步骤 (四) 的片段组装具体过程为：
[0018] ( 1) 输入所有异构片段 frg_list;
[0019] (2) 遍历所有断键， 设当前断键的两端原子为 a_atom、 b_atom；
[0020] (3) 从 frg_list中找到包含 a_atom的片段或列表 A和包含 b_atom的片段或列表 B
[0021] (4) 将 B插入到 A中的 a_atom原子的所有异构位点中， 将 A插入到 B中的 a_atom 原子的所有异构位点， 将由 A和 B组装得到新片段列表加到 frg_list中， 并将 A和 B 从 frg_list移除；
[0022] (5) 未遍历完所有断键， 则跳转到步骤 (2) 。
[0023] 本发明提供的有机分子的立体异构全集自动化生成方法， 一个片段模板只需描 述一类最简单的片段， 所以很容易就穷举出常见环的立体异构。 并且使用片段 模板， 可以很方便的描述相似片段的立体异构， 并大量减少片段数量， 极大地 降低片段库的构建难度。 分片段， 再遍历片段的所有立体异构， 然后根据位点 组合拼装， 可以容易地生成一个分子的所有立体异构。
发明的有益效果
有益效果
对附图的简要说明
附图说明
[0024] 图 1是本发明立体异构生成方法的流程图；
[0025] 图 2是本实施例的分子切分示意图；
[0026] 图 3是本实施例的六元单键环异构形成形成异构示意图；
[0027] 图 4是本实施例顺反异构形成形成异构示意图；
[0028] 图 5是本实施例手性异构形成形成异构示意图；
[0029] 图 6是本发明的分子切分流程图；
[0030] 图 7是本发明片段拼装流程图。
发明实施例
本发明的实施方式
[0031] 结合实施例说明本发明的具体技术方案。
[0032] 如图 1所示， 有机分子的立体异构全集自动化生成方法， 包括以下步骤：
[0033] (一) 将输入分子切分成一组片段， 片段主要分为三种类型： 环异构片段， 顺 反异构片段， 手性异构片段。 环异构片段通常包含一个非共轭环或者多个环组 成的稠环； 顺反异构片段是指包括了一个或多个顺反位点以及周围的化学环境 ; 手性异构片段包括了手性中心以及周围的化学环境。 这三种类型的片段代表 了这个分子的三类异构类型， 其中环异构是最复杂的情形。
[0034] 如图 6所示， 为分子切分算法流程， 该算法包括以下过程：
[0035] ( 1) 判断原子为环上非平面原子， 则断掉与该原子相连的非环上单键， 即断 掉与该原子相连的非等价取代基。 判断原子是否为环上平面原子的规则为： 不 连接双键或三键且不在共轭体系里。
[0036] （2） 判断原子为手性中心原子， 则断掉与该原子相连的任意一根单键， 一般 断掉相连原子原子序最小的单键。
[0037] （3） 判断原子处于顺反异构结构中， 则断掉其任意单键， 这里也选取邻接原 子原子序较小的单键。
[0038] 上述所断的键中都不包括与氢 （H） 或氟 （F） 原子形成的化学键。
[0039] 图 2中的分子切分为三个片段： fragment 1为顺反异构片段， fragment2为环异构 片段， fragment3为手性异构片段。
[0040] （二） 用得到的异构片段到片段模板库中匹配片段模板。 以原子模板为节点， 键模板为边， 构建图； 然后使用子图同构算法 （一般使用 VF2算法） 进行片段 模板地匹配。 原子模板是描述一组原子的模板对象， 键模板为描述一组键类型 的模板对象。 片段模板描述了该片段所有立体异构的形状和所有的可能的位点 及其位点的相对位置。 它描述的是同一类片段的所有可能的异构信息： 如图 3， 描述的是一个单键六元环， 它有两种立体异构， 分别是船式异构和椅式异构， 环上每个原子都可能有两个异构位点。 片段模板描述的是最简的片段， 所以一 个稠环片段可能匹配到多个片段模板。 手性异构和顺反异构很简单， 可以不需 要用模板描述， 如图 4和图 5， 因为其化学性质天然决定其交换任意两个位点 （ 相连集团或者原子） 即可形成异构。
[0041] （三） 根据片段模板信息生成出对应片段的所有异构。 一个异构片段可能匹配 到多个片段模板， 一个模板对应一个环， 所以稠环片段的异构就是该片段对应 的所有片段模板的所有异构组合。 对于顺反异构和手性异构， 只需要在第四步 中， 交换其任意两个位点进行组装就可以了。
[0042] （四） 遍历所有的异构片段及其位点， 将步骤一中断的键两端的片段， 按断键 原子的所有可能的位点进行组装， 得到所有的立体异构， 如图 7 , 片段组装具体 过程为：
[0043] （1） 输入所有异构片段 frg_list;
[0044] （2） 遍历所有断键， 设当前断键的两端原子为 a_atom、 b_atom；
[0045] （3） 从 frg_list中找到包含 a_atom的片段或列表 A和包含 b_atom的片段或列表 B [0046] (4) 将 B插入到 A中的 a_atom原子的所有异构位点中， 将 A插入到 B中的 a_atom 原子的所有异构位点， 将由 A和 B组装得到新片段列表加到 frg_list中， 并将 A和 B 从 frg_list移除；
[0047] (5) 未遍历完所有断键， 则跳转到步骤 (2) 。
[0048] 如图 2所示分子， 切出来的 fragment2就是一个六元单键环片段， 这个环有两种 异构形式， 断键的两个碳原子都有两个异构位点， 因而 fragmentl、 fragment3和 fr agment2进行组装时， 都有两个插入位点； 因此与 fragment2相关的立体异构就有 8 (2 * 2 *) 种， 而 fragmentl和 fragment 自身也分别有两种异构， 所以最终该分 子一共会生成 32 (8*2*2) 种立体异构。 如果需要过滤， 则可以按照指定的过滤 规则进行过滤。

Claims

权利要求书
[权利要求 1] 有机分子的立体异构全集自动化生成方法， 其特征在于， 包括以下步 骤：
（一） 将输入分子切分成一组片段， 片段主要分为三种类型： 环异构 片段、 顺反异构片段、 手性异构片段；
（二） 用得到的异构片段到片段模板库中匹配片段模板； 手性异构和 顺反异构可不需要用模板描述；
（三） 根据片段模板信息生成出对应片段的所有异构； 对于顺反异构 和手性异构， 只需要在第 （四） 步中， 交换其任意两个位点进行组装
（四） 遍历所有的异构片段及其位点， 将步骤 （一） 中断的键两端的 片段， 按断键原子的所有可能的位点进行组装， 得到所有的立体异构
[权利要求 2] 根据权利要求 1所述的有机分子的立体异构全集自动化生成方法， 其 特征在于， 步骤 （一） 所述的分子切分方法包括以下步骤：
（1） 判断原子为环上非平面原子， 则断掉与该原子相连的非环上单 键， 即断掉与该原子相连的非等价取代基； 判断原子是否为环上平面 原子的规则为： 不连接双键或三键且不在共轭体系里；
（2） 判断原子为手性中心原子， 则断掉与该原子相连的任意一根单 键， 一般断掉相连原子的原子序最小的单键；
（3） 判断原子处于顺反异构结构中， 则断掉其任意单键， 选取邻接 原子原子序较小的单键；
上述所断的键中都不包括与氢原子形成的化学键。
[权利要求 3] 根据权利要求 1所述的有机分子的立体异构全集自动化生成方法， 其 特征在于， 步骤 （二） 具体的过程为： 以原子模板为节点， 键模板为 边， 构建图； 然后使用子图同构算法进行片段模板地匹配； 所述的 原子模板是描述一组原子的模板对象， 键模板为描述一组键类型的模 板对象； 所述的片段模板描述了该片段所有立体异构的形状和所有的 可能的位点及其位点的相对位置。
[权利要求 4] 根据权利要求 1所述的有机分子的立体异构全集自动化生成方法， 其 特征在于， 步骤 (四) 的片段组装具体过程为：
( 1) 输入所有异构片段 frg_liSt;
⑵ 遍历所有断键， 设当前断键的两端原子为 a_atom、 b_atom；
(3) 从 frg_list中找到包含 a_atom的片段或列表 A和包含 b_atom的片 段或列表 B ;
(4) 将 B插入到 A中的 a_atom原子的所有异构位点中， 将 A插入到 B 中 a_atom原子的所有异构位点， 将由 A和 B组装得到新片段列表加 到 frg_list中， 并将 A和 B从 frg_list移除；
(5) 未遍历完所有断键， 则跳转到步骤 (2) 。
PCT/CN2018/123533 2018-12-25 2018-12-25 有机分子的立体异构全集自动化生成方法 WO2020029521A1 (zh)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/CN2018/123533 WO2020029521A1 (zh) 2018-12-25 2018-12-25 有机分子的立体异构全集自动化生成方法
US16/629,959 US11562809B2 (en) 2018-12-25 2018-12-25 Method for automatically generating universal set of stereoisomers of organic molecule

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/CN2018/123533 WO2020029521A1 (zh) 2018-12-25 2018-12-25 有机分子的立体异构全集自动化生成方法

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2020029521A1 true WO2020029521A1 (zh) 2020-02-13

Family

ID=69413975

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/CN2018/123533 WO2020029521A1 (zh) 2018-12-25 2018-12-25 有机分子的立体异构全集自动化生成方法

Country Status (2)

Country Link
US (1) US11562809B2 (zh)
WO (1) WO2020029521A1 (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112420131A (zh) * 2020-11-20 2021-02-26 中国科学技术大学 基于数据挖掘的分子生成方法

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103984878A (zh) * 2014-04-08 2014-08-13 浙江工业大学 一种基于树搜索和片段组装的蛋白质结构预测方法
CN108763852A (zh) * 2018-05-09 2018-11-06 深圳晶泰科技有限公司 类药有机分子的自动化构象分析方法

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE18200782T1 (de) * 2012-04-02 2021-10-21 Modernatx, Inc. Modifizierte polynukleotide zur herstellung von proteinen im zusammenhang mit erkrankungen beim menschen

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103984878A (zh) * 2014-04-08 2014-08-13 浙江工业大学 一种基于树搜索和片段组装的蛋白质结构预测方法
CN108763852A (zh) * 2018-05-09 2018-11-06 深圳晶泰科技有限公司 类药有机分子的自动化构象分析方法

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112420131A (zh) * 2020-11-20 2021-02-26 中国科学技术大学 基于数据挖掘的分子生成方法
CN112420131B (zh) * 2020-11-20 2022-07-15 中国科学技术大学 基于数据挖掘的分子生成方法

Also Published As

Publication number Publication date
US11562809B2 (en) 2023-01-24
US20210065850A1 (en) 2021-03-04

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN109741798B (zh) 有机分子的立体异构全集自动化生成方法
Chen et al. Automatic reaction mapping and reaction center detection
CN103561133B (zh) 一种ip地址归属信息索引方法及快速查询方法
US9104728B2 (en) Query language to traverse a path in a graph
Menon et al. From database to knowledge graph—using data in chemistry
CN107992608B (zh) 一种基于关键字上下文的sparql查询语句自动生成方法
CN113434634A (zh) 知识图谱构建方法、装置
JPH117454A (ja) 濃度を利用した結合順序付け方法
WO2020029521A1 (zh) 有机分子的立体异构全集自动化生成方法
CN109471929A (zh) 一种基于图谱匹配进行设备维修记录语义搜索的方法
Pandurangan et al. The distributed minimum spanning tree problem
CN104902018B (zh) 基于服务簇的服务组合与替换方法
CN109558502A (zh) 一种基于知识图谱的城市安全数据检索方法
CN104008205B (zh) 一种内容路由的查询方法及系统
CN106527912B (zh) 一种基于Voronoi树图的信息检索可视化系统及方法
CN104156431A (zh) 一种基于实体图社团结构的rdf关键词查询方法
Fraigniaud et al. Distributed certification for classes of dense graphs
JP2010044763A (ja) リアルタイム索引情報抽出機能を有するファイルアップロード方法及びこれを用いたウェブストレージシステム
CN102737134B (zh) 适用于大规模实时数据流的查询处理方法
Ge et al. A cost-driven top-K queries optimization approach on federated RDF systems
CN104123357B (zh) 一种查询卡口的方法和装置
CN108595588B (zh) 一种科学数据存储关联方法
CN110807061A (zh) 一种基于分层搜索不确定图的频繁子图的方法
Patras et al. A comparative evaluation of RDBMS and GDBMS for shortest path operations on pedestrian navigation data
CN112466411B (zh) 一种基于晶体拓扑学理论的晶体结构预测方法

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 18929696

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

32PN Ep: public notification in the ep bulletin as address of the adressee cannot be established

Free format text: NOTING OF LOSS OF RIGHTS PURSUANT TO RULE 112(1) EPC (EPO FORM 1205A DATED 17/11/2021)

122 Ep: pct application non-entry in european phase

Ref document number: 18929696

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1