WO2019168446A1 - Новые ингибиторы cdk8/19 - Google Patents

Новые ингибиторы cdk8/19 Download PDF

Info

Publication number
WO2019168446A1
WO2019168446A1 PCT/RU2019/050021 RU2019050021W WO2019168446A1 WO 2019168446 A1 WO2019168446 A1 WO 2019168446A1 RU 2019050021 W RU2019050021 W RU 2019050021W WO 2019168446 A1 WO2019168446 A1 WO 2019168446A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
alkyl
substituted
naphth
carbonyl
unsubstituted
Prior art date
Application number
PCT/RU2019/050021
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
Алексей Леонидович МИНДИЧ
Светлана Леонидовна ГОРБУНОВА
Александра Владимировна ПОПКОВА
Артем Евгеньевич ШЕХОВЦОВ
Андрей Иванович АЛАФИНОВ
Мария Андреевна КАСАТКИНА
Наталья Владимировна КОЖЕМЯКИНА
Анна Сергеевна КУШАКОВА
Елена Александровна МАКСИМЕНКО
Леонид Евгеньевич МИХАЙЛОВ
Мария Сергеевна МИШИНА
Анна Юрьевна ЧЕСТНОВА
Дмитрий Валентинович МОРОЗОВ
Original Assignee
Закрытое Акционерное Общество "Биокад"
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Закрытое Акционерное Общество "Биокад" filed Critical Закрытое Акционерное Общество "Биокад"
Priority to US17/052,078 priority Critical patent/US20220098160A1/en
Publication of WO2019168446A1 publication Critical patent/WO2019168446A1/ru

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/496Non-condensed piperazines containing further heterocyclic rings, e.g. rifampin, thiothixene
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/4965Non-condensed pyrazines
    • A61K31/497Non-condensed pyrazines containing further heterocyclic rings
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/50Pyridazines; Hydrogenated pyridazines
    • A61K31/502Pyridazines; Hydrogenated pyridazines ortho- or peri-condensed with carbocyclic ring systems, e.g. cinnoline, phthalazine
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/517Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with carbocyclic ring systems, e.g. quinazoline, perimidine
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/535Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with at least one nitrogen and one oxygen as the ring hetero atoms, e.g. 1,2-oxazines
    • A61K31/53751,4-Oxazines, e.g. morpholine
    • A61K31/53771,4-Oxazines, e.g. morpholine not condensed and containing further heterocyclic rings, e.g. timolol
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/02Antineoplastic agents specific for leukemia
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D215/00Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems
    • C07D215/02Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen atoms or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom
    • C07D215/16Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen atoms or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D215/38Nitrogen atoms
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D215/00Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems
    • C07D215/02Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen atoms or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom
    • C07D215/16Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen atoms or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D215/38Nitrogen atoms
    • C07D215/42Nitrogen atoms attached in position 4
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D215/00Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems
    • C07D215/02Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen atoms or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom
    • C07D215/16Heterocyclic compounds containing quinoline or hydrogenated quinoline ring systems having no bond between the ring nitrogen atom and a non-ring member or having only hydrogen atoms or carbon atoms directly attached to the ring nitrogen atom with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D215/48Carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D237/00Heterocyclic compounds containing 1,2-diazine or hydrogenated 1,2-diazine rings
    • C07D237/26Heterocyclic compounds containing 1,2-diazine or hydrogenated 1,2-diazine rings condensed with carbocyclic rings or ring systems
    • C07D237/28Cinnolines
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D239/00Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings
    • C07D239/70Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings condensed with carbocyclic rings or ring systems
    • C07D239/72Quinazolines; Hydrogenated quinazolines
    • C07D239/78Quinazolines; Hydrogenated quinazolines with hetero atoms directly attached in position 2
    • C07D239/80Oxygen atoms
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D239/00Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings
    • C07D239/70Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings condensed with carbocyclic rings or ring systems
    • C07D239/72Quinazolines; Hydrogenated quinazolines
    • C07D239/86Quinazolines; Hydrogenated quinazolines with hetero atoms directly attached in position 4
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D239/00Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings
    • C07D239/70Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings condensed with carbocyclic rings or ring systems
    • C07D239/72Quinazolines; Hydrogenated quinazolines
    • C07D239/95Quinazolines; Hydrogenated quinazolines with hetero atoms directly attached in positions 2 and 4
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D241/00Heterocyclic compounds containing 1,4-diazine or hydrogenated 1,4-diazine rings
    • C07D241/02Heterocyclic compounds containing 1,4-diazine or hydrogenated 1,4-diazine rings not condensed with other rings
    • C07D241/04Heterocyclic compounds containing 1,4-diazine or hydrogenated 1,4-diazine rings not condensed with other rings having no double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D401/00Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom
    • C07D401/02Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom containing two hetero rings
    • C07D401/12Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom containing two hetero rings linked by a chain containing hetero atoms as chain links
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D403/00Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by group C07D401/00
    • C07D403/02Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by group C07D401/00 containing two hetero rings
    • C07D403/12Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by group C07D401/00 containing two hetero rings linked by a chain containing hetero atoms as chain links
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D413/00Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, at least one ring having nitrogen and oxygen atoms as the only ring hetero atoms
    • C07D413/02Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, at least one ring having nitrogen and oxygen atoms as the only ring hetero atoms containing two hetero rings
    • C07D413/12Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, at least one ring having nitrogen and oxygen atoms as the only ring hetero atoms containing two hetero rings linked by a chain containing hetero atoms as chain links
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D471/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00
    • C07D471/02Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D471/04Ortho-condensed systems

Definitions

  • the present invention relates to new inhibitors of cyclin-dependent protein kinases CDK8 / 19, methods for their preparation, pharmaceutical compositions containing these compounds, and to the use of such compounds or such compositions for the treatment of diseases or disorders.
  • CDK8 along with the CDK19 isoform closely related to its structural and functional characteristics, is an oncogenic kinase that regulates transcription (Xu, W. & L, JY (2011) Dysregulation of CDK8 and Cyclin C in tumorigenesis, J. Genet. Genomics 38, 439-452; Galbraith, MD, et al. (2010) CDK8: a positive regulator of transcription, Transcription. 1, 4-12; Firestein, R. & Hahn, WC (2009) Revving the Throttle on an oncogene: CDK8 takes the driver seat, Cancer Res 69, 7899-7901).
  • CDK8 does not play a role in the regulation of the cell cycle, however, the knockout of the CDK8 gene in embryonic stem cells leads to arrest of embryo development (Adler, AS, et al. (2012) CDK8 maintains tumor differentiation and embryonic stem cell pluripotency, Cancer Res. 72, 2129-2139) because of its important role in the formation of the pluripotent stem cell phenotype (Firestein, R., et al. (2008) CDK8 is a colorectal cancer oncogene that regulates beta-catenin activity, Nature 455, 547-551).
  • CDK8 does not inhibit normal cell growth (Adler, AS, et al. (2012) CDK8 maintains tumor differentiation and embryonic stem cell pluripotency, Cancer Res. 72, 2129-2139, Kapoor, A., et al . (2010) The histone variant macroH2A suppresses melanoma progression through regulation of CDK8, Nature 468, 1105-1109).
  • the role of CDK8 in carcinogenesis is associated with its unique function as a regulator of several transcription factors (Xu, W. & L, JY (2011) Dysregulation of CDK8 and Cyclin C in tumorigenesis, J. Genet. Genomics 38, 439- 452). High expression of CDK8 was detected in colon cancer (Firestein, R., et al.
  • CDK8 in cancer Known mechanisms associated with CDK8 in cancer include upregulation of the Wnt / [beta] catenin pathway (Kapoor, A., et al. (2010) The histone variant macroH2A suppresses melanoma progression through regulation of CDK8, Nature 468, 1105-1109; Alarcon, C, et al. (2009) Nuclear CDKs drive Smad transcriptional activation and turnover in BMP and TGF-beta pathways, Cell 139, 757-769), growth factor-induced transcription (DiDonato, JA, et al. (2012) NF-kappaB and the link between inflammation and cancer, Immunol. Rev.
  • CDK8 can support the pluripotent phenotype of embryonic stem cells and that it can be associated with the cancer stem cell phenotype (Firestein, R., et al. (2008) CDK8 is a colorectal cancer oncogene that regulates beta-catenin activity, Nature 455, 547-551). Chemotherapeutic drugs that cause DNA damage induce TNF-a, an activator of the transcription factor NFkB (Fabian et al.
  • S 100A8 / 9 acts on tumor cells, promoting both their metastasis and survival against chemotherapy (Huang, et al. (2012) MED 12 Controls the response to multiple cancer drugs through regulation of TGF-b receptor signaling, Cell 151, 937-950).
  • Alkyl means an aliphatic hydrocarbon linear or branched group with 1 to 12 carbon atoms in a chain, more preferably with 1-6 carbon atoms in a chain. “Branched” means that the alkyl chain has one or more “lower alkyl” substituents. Examples of alkyl groups include, but are not limited to, methyl, ethyl, // - propyl, isopropyl, // - butyl, isobutyl, sec-butyl, tert-butyl, // - pentyl, 2-pentyl, 3 -pentyl, neopentyl, // - hexyl. Alkyl may have substituents, which may be the same or different.
  • Aryl means an aromatic monocyclic or polycyclic system comprising from 6 to 14 carbon atoms, preferably from 6 to 10 carbon atoms. Examples of aryl groups include, but are not limited to, phenyl, naphthyl, anthranyl, and others. Aryl may have cyclic substituents, which may be the same or different. Aryl can be annelated with a non-aromatic ring system or heterocycle.
  • Alkyloxy or “Alkoxy” means an alkyl-O— group in which alkyl is defined in this section.
  • alkoxy groups include, but are not limited to, methoxy, ethoxy, n-propoxy, u-propoxy and n-butoxy.
  • Amino group means R'R "N-group, substituted or unsubstituted optionally with the same substituents R 'and R".
  • Alkylsulfonyl (-S (O) 2 -C 1 -C 6 alkyl) means “alkyl” as defined above, attached to the corresponding moiety of the molecule through a sulfonyl group -S0 2 -.
  • alkylsulfonyls include, but are not limited to, methylsulfonyl, ethylsulfonyl, etc.
  • “Lower alkyl” means a linear or branched alkyl with 1 to 4 carbon atoms.
  • Halo or “Halogen” (Hal) means fluorine, chlorine, bromine or iodine.
  • Heterocycle means a monocyclic or polycyclic system containing from 3 to 11 carbon atoms, in which one or more carbon atoms are replaced by a heteroatom such as nitrogen, oxygen, sulfur.
  • the heterocycle may be fused with aryl or heteroaryl.
  • the heterocycle may have one or more substituents, which may be the same or different.
  • the nitrogen and sulfur atoms in the heterocycle can be oxidized to N-oxide, S-oxide or S-dioxide.
  • the heterocycle may be saturated, partially unsaturated or unsaturated. Examples of heterocycles include, but are not limited to, azetidine, pyrrolidine, piperidine, 2,8-diazaspiro [4.5] decane, piperazine, morpholine, etc.
  • Heteroaryl means an aromatic monocyclic or polycyclic system comprising from 5 to 11 carbon atoms, preferably from 5 to 10, in which one or more carbon atoms are replaced by a heteroatom, such as nitrogen, sulfur or oxygen.
  • the nitrogen atom in the heteroaryl can be oxidized to an N-oxide.
  • Heteroaryl may have one or more substituents, which may be the same or different.
  • heteroaryl are pyrrolyl, furanyl, thienyl, pyridyl, pyrazinyl, pyrimidinyl, pyridazinyl, isoxazolyl, isothiazolyl, tetrazolyl, oxazolyl, thiazolyl, pyrazolyl, furazanyl, triazolyl, 1, 2,4-thiadiazinylazole, 2, -a] pyridinyl, imidazo [2,1-b] thiazolyl, benzofurazanil, indolyl, azainindolyl, benzimidazolyl, benzothiazenyl, quinolinyl, imidazolyl, pyrazolyl, thienopyridyl, quinazolinyl, pyrnylpyridinopyridinyl-pyrimidino-pyridinyl-pyridinyl-pyridinyl, is
  • Partially unsaturated means a ring system that includes at least one double or triple bond.
  • the term “partially unsaturated” refers to rings having many saturation sites, but does not include aryl and heteroaryl systems, as defined above.
  • Substituent means a chemical radical that binds to a molecular skeleton (scaffold, fragment).
  • solvent molecules are those commonly used in pharmaceuticals that are known to be harmless to the recipient, for example, water, ethanol, ethylene glycol and the like.
  • Other solvents can be used as intermediate solvates in the preparation of more desirable solvates, such as methanol, methyl - // g ret-butyl ether, ethyl acetate, methyl acetate, (S) -propylene glycol, (R) -propylene glycol, 1,4-butanediol and the like.
  • hydrate refers to a complex in which the solvent molecule is water.
  • Solvates and / or hydrates preferably exist in crystalline form.
  • bond refers to a chemical bond between two atoms or two groups (groups, fragments) if two atoms connected by a bond are considered as part of a larger substructure.
  • protecting group refers to groups that are used to block the reactivity of functional groups, such as amino groups, carboxyl groups or hydroxy groups. Examples of, but not limited to, protecting groups are mpem-butoxycarbonyl (Boe), benzyloxycarbonyl (Cbz), 2- (trimethylsilyl) ethoxy) methylacetal (SEM), trialkylsilyl, alkyl (diaryl) silyl or alkyl.
  • excipient is used herein to describe any ingredient other than the compound (s) of this invention.
  • “Pharmaceutical composition” means a composition comprising a compound of the invention and at least one excipient.
  • the excipient may be selected from the group consisting of pharmaceutically acceptable and pharmacologically compatible excipients, solvents, diluents, carriers, excipients, distributing and perceptive means, delivery vehicles such as preservatives, stabilizers, excipients, grinders, moisturizers, emulsifiers, suspending agents, thickeners , sweeteners, perfumes, flavors, antibacterial agents, fungicides, lubricants, prolonged delivery regulators, the choice and ratio of which depends on the nature and method of administration and dosage.
  • suspending agents examples include ethoxylated isostearyl alcohol, polyoxyethylene, sorbitol and sorbitol ether, microcrystalline cellulose, aluminum metahydroxide, bentonite, agar-agar and tragacanth, as well as mixtures of these substances. Protection against the action of microorganisms can be achieved using a variety of antibacterial and antifungal agents, for example, such as parabens, chlorobutanol, sorbic acid and the like.
  • the composition may also include isotonic agents, for example, sugars, sodium chloride and the like.
  • the prolonged action of the composition can be achieved using agents that slow down the absorption of the active principle, for example, aluminum monostearate and gelatin.
  • suitable carriers, solvents, diluents and delivery vehicles are water, ethanol, polyalcohols, and also mixtures thereof, vegetable oils (such as olive oil) and injectable organic esters (such as ethyl oleate).
  • excipients are lactose, milk sugar, sodium citrate, calcium carbonate, calcium phosphate and the like.
  • grinders and dispensers are starch, alginic acid and its salts, silicates and the like.
  • lubricants are magnesium stearate, sodium lauryl sulfate, talc, and high molecular weight polyethylene glycol.
  • the pharmaceutical composition for oral, sublingual, transdermal, intramuscular, intravenous, subcutaneous, local or rectal administration of the active principle, alone or in combination with another active principle, can be administered to animals and humans in a standard administration form in the form of a mixture with traditional pharmaceutical carriers.
  • Suitable unit dosage forms include oral forms such as tablets, gelatine capsules, pills, powders, granules, chewing gums and oral solutions or suspensions, sublingual and buccal administration forms, aerosols, implants, local, transdermal, subcutaneous, intramuscular, intravenous, intranasal or intraocular administration forms and rectal administration forms.
  • “Pharmaceutically acceptable salt” means the relatively non-toxic salts of the compounds of the present invention. Salts of the compounds provided herein may be prepared from inorganic or organic acids and bases. Examples of salts thus obtained are hydrochlorides, hydrobromides, sulfates, bisulfates, phosphates, nitrates, acetates, oxalates, valeriates, oleates, palmitates, stearates, laurates, borates, benzoates, lactates, tosylates, citrates, maleates, fumarates, succinates, tartrates mesylates, malonates, salicylates, propionates, ethanesulfonates, benzenesulfonates, sulfamates and the like; salts of sodium, potassium, ammonium, calcium, magnesium, iron, zinc, copper, manganese and aluminum, salts of primary, secondary and tertiary amines, substituted amine
  • Medical product - a substance (or a mixture of substances in the form of a pharmaceutical composition) in the form of tablets, capsules, injections, ointments and other formulations intended to restore, correct or alter physiological functions in humans and animals, as well as treatment and prevention of diseases, diagnosis, anesthesia, contraception, cosmetology and other things.
  • Treatment refers to a method of alleviating or eliminating a biological disorder and / or at least one of accompanying symptoms.
  • alleviate means a decrease in the severity and / or frequency of occurrence of symptoms of a disease, disorder or condition.
  • references to “treatment” contained herein include references to therapeutic, palliative, and prophylactic therapy.
  • the subject of treatment or the patient is a mammal, preferably a human subject.
  • the above subject may be male or female of any age.
  • the term "violation” means any condition that can be improved as a result of treatment of the present invention.
  • the definition of this term includes chronic and acute disorders or diseases, including pathological conditions that cause a mammal's predisposition to the occurrence of this violation.
  • diseases to be treated include oncological diseases, in particular breast cancer, triple negative breast cancer (TNBC), ovarian cancer, metastatic ovarian cancer, gastric cancer, metastatic gastric cancer, endometrial cancer, salivary gland, lung, kidney, colon, colorectal cancer, melanoma, metastatic melanoma, cancer of the thyroid gland, pancreas, prostate or bladder; blood-oncological diseases, leukemia, acute myeloid leukemia and lymphoid malignancies; neural, glial, astrocytal, hypothalamic and other granular, macrophage, epithelial, stromal and blastocellular disorders; inflammatory, angiogenic and immunological disorders.
  • a “therapeutically effective amount” is defined as the amount of a therapeutic agent administered during treatment that relieves a certain degree of one or more symptoms of the disease for which treatment is being carried out.
  • the present invention relates to a compound of formula I:
  • X 2 represents CR 2 , N;
  • Xs, X 4 , X5, X 6 each independently represents CH, N;
  • Ri represents H, Hal, C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 7 cycloalkyl
  • R 2 represents H, Hal, C 1 -C 6 alkyl, —ORio, —NR 11 R 12 ,
  • R 3 and R 4 each independently represents H; C 1 -C 6 alkyl unsubstituted or substituted by one or more halogens; C 1 -C 6 alkoxy C 1 -C 6 alkyl; C 3 -C 7 cycloalkyl; C 3 -C 7 cycloalkyl C 1 -C 3 alkyl; C 6 -C 10 aryl unsubstituted or substituted by one or more substituents selected from Hal, C 1 -C 6 alkyl unsubstituted or substituted by one or more halogens, C i-Cr, alkoxy; 5-10 membered heteroaryl with 1-4 heteroatoms selected from N, O and / or S, unsubstituted or substituted with one or more substituents selected from Hal, C 1 -C 6 alkyl, unsubstituted or substituted with one or more halogens, C 1 -C 6 alkoxy; 5-6 membered heterocyclyl with 1-2 hetero
  • R 3 and R 4 together with the nitrogen atom to which they are attached may be a 4-7 membered heterocyclyl with 1-2 heteroatoms selected from N and / or O, which may be unsubstituted or substituted with one or more substituents selected from oxo group; -HE; C 1 -C 6 alkoxy; C 3 -C 6 alkyl unsubstituted or substituted with one or more halogens, C 1 -C 6 alkoxy;
  • Y represents —N (R 13 ) -, —O—, —S— or —C (O) -;
  • Z represents —C (R 14 ) 2 - or —C (O) -;
  • R 10 represents H, C 1 -C 6 alkyl, C 1 -C 6 , acyl
  • R 11 , R 12 each independently represents H, C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 7 cycloalkyl;
  • R 13 represents H, C 3 -C 6 alkyl, C 3 -C 6 acyl
  • R 14 each independently represents H, C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 7 cycloalkyl; not including compounds where X 1z X 3 represent N, X 2 , X 4 , X 5 , X 6 represent CH, R 3 and R 4 together with the nitrogen atom to which they are attached represent R represents H C 1 -C 6 alkyl.
  • the present invention relates to a compound of formula I, where if X 3 is CR 1 , X 2 is CR 2 , X 3 are N, then X 4 , X 5 , X 6 is CH; if Ci is CR 3 , X 2 , X 3 are N, then X 4 , X 5 , X 6 is CH;
  • Ci represents CR b
  • X 2 , X 4 represent N
  • X 3 , X 5 , X 6 represents CH
  • Ci is CR i
  • X 2 is CR 2
  • X 3 , X 5 are N
  • X 4 , X 6 is CH
  • Ci is CR i
  • X 2 is CR 2
  • X 3 , X 4 are N
  • X 5 , X 6 is CH
  • Ci is CR 1
  • X 2 is CR 2
  • X 3 , X 6 are N
  • X 4 , X 5 is CH.
  • the present invention relates to a compound of formula I, wherein Y is —NH—, —O— or —S—; Z represents —CH 2 -.
  • the present invention relates to a compound of formula II:
  • Xs, X 4 , X 5 , X 6 each independently represents CH, N;
  • Ri represents H, Hal, C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 7 cycloalkyl
  • R 2 represents H, Hal, C 1 -C 6 alkyl, —ORio, —NR 11 R 12 ,
  • R 3 and R 4 each independently represents H; C 1 -C 6 alkyl unsubstituted or substituted by one or more halogens; C 1 -C 6 alkoxy C 1 -C 6 alkyl; C 3 -C 7 cycloalkyl; C 3 -C 7 cycloalkyl C 1 -C 3 alkyl; C 6 -C 10 aryl unsubstituted or substituted by one or more substituents selected from Hal, C 1 -C 6 alkyl, unsubstituted or substituted by one or more halogens, C 1 -C 6 alkoxy; 5-10 membered heteroaryl with 1-4 heteroatoms selected from N, O and / or S, unsubstituted or substituted with one or more substituents selected from Hal, C 1 -C 6 , alkyl unsubstituted or substituted with one or more halogens, C 1 -C 6 alkoxy; 5-6 membered heterocyclyl with 1-2
  • R 3 and R 4 together with the nitrogen atom to which they are attached may be a 4-7 membered heterocyclyl with 1-2 heteroatoms selected from N and / or O, which may be unsubstituted or substituted with one or more substituents selected from oxo group; -HE; C 1 -C 6 alkoxy; C 1 -C 6 alkyl unsubstituted or substituted by one or more halogens, C 1 -C 6 alkoxy;
  • Y represents —N (R 13 ) -, —O—, —S— or —C (O) -;
  • Z represents —C (R 14 ) 2 - or —C (O) -;
  • R 10 represents H, C 1 -C 6 alkyl, C 1 -C 6 acyl
  • R 11 , R 12 each independently represents H, C 3 -C 6 alkyl, C 3 -C 7 cycloalkyl;
  • R 13 represents H, C 1 -C 6 alkyl, C 1 -C 6 acyl
  • R 14 each independently represents H, C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 7 cycloalkyl.
  • the present invention relates to a compound of formula II, wherein Y is —NH—, —O— or —S—; Z represents —CH 2 -.
  • the present invention relates to a compound of formula I, II, where R 3 and R 4 each independently represents by itself H; C 1 -C 6 alkyl unsubstituted or substituted by one or more halogens; C 1 -C 6 alkoxy C hC ( , alkyl; C 3 -C 7 cycloalkyl, C 3 -C 7 cycloalkyl C 1 -C 3 alkyl; Cr, -C m aryl representing phenyl, unsubstituted or substituted by one or more substituents selected from Hal, C 1 -C 6 alkyl unsubstituted or substituted by one or more halogens, C 1 -C 6 alkoxy; 5-10 membered heteroaryl with 1-4 heteroatoms selected from N, O and / or S, which is pyridine or pyrimidine unsubstituted or substituted by one or more substituents selected from Hal, C 1 -C 6 alkyl, unsub
  • R 3 and R 4 together with the nitrogen atom to which they are attached can be a 4-7 membered heterocyclyl with 1-2 heteroatoms selected from N and / or O, which is morpholinyl, piperazinyl, pyrrolidinyl, piperidinyl, azetidine, which may be unsubstituted or substituted by one or more substituents selected from oxo group; -HE; C 1 -C 6 alkoxy; C 1 -C 6 alkyl unsubstituted or substituted with one or more halogens, C 1 -C 6 alkoxy.
  • the present invention relates to a compound of formula III:
  • Xs, X 4 , X 5 , X 6 each independently represents CH, N;
  • R 1 represents H, Hal, C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 7 cycloalkyl
  • R 2 represents H, Hal, C 1 -C 6 alkyl, —ORio, —NR 11 R 12 ,
  • X 7 represents —N (R 15 ), —O—;
  • Y represents —N (R 13 ) -, —O—, —S— or —C (O) -;
  • Z represents —C (R 14 ) 2 - or —C (O) -;
  • R 10 represents H, C 1 -C 6 alkyl, C 1 -C 6 acyl
  • R 11 , R 12 each independently represents H, C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 7 cycloalkyl;
  • R 15 represents H, C 1 -C 6 alkyl, unsubstituted or substituted by one or more halogens, C 1 -C 6 alkoxy.
  • the present invention relates to a compound of formula III, wherein Y is —N ⁇ —, —O— or —S—; Z represents —CH 2 -.
  • the present invention relates to a compound of formula II, III, wherein if X 2 is CR 2 , Xs are N, then X 4 , X 5 , X b is CH;
  • X 2 represents CR 2 , Xs, X 5 represent N, then X 4 , X 6 represents CH; if X 2 represents CR 2 , Xs, X 4 represent N, then X 5 , X 6 represents CH;
  • the present invention relates to a compound of formula 1.1:
  • X 2 represents CR 2 , N;
  • X 3 , X 4 , X 5 , X b each independently represents CH, N;
  • Ri represents H, Hal, C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 7 cycloalkyl
  • R 2 represents H, Hal, C 1 -C 6 alkyl, —ORio, —NR 11 R 12 ,
  • X 7 represents —N (R 15 ), —O—;
  • Y represents —N (R 13 ) -, —O—, —S— or —C (O) -;
  • Z represents —C (R 14 ) 2 - or —C (O) -;
  • R 10 represents H, C 1 -C 6 alkyl, C 1 -C 6 acyl
  • R 11 , R 12 each independently represents H, C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 7 cycloalkyl;
  • R 15 represents H, C 1 -C 6 alkyl unsubstituted or substituted by one or more halogens
  • the present invention relates to a compound of formula 1.2:
  • the present invention relates to a compound of formula II.1:
  • the present invention relates to a compound of formula II.2:
  • the present invention relates to a compound of formula P.Z:
  • the present invention relates to a compound of formula II.4:
  • the present invention relates to a compound of formula II.5:
  • the present invention relates to a compound of formula II.6:
  • the compounds described in the present invention can be obtained in the form and / or can be used in the form of pharmaceutically acceptable salts.
  • Types of pharmaceutically acceptable salts include, but are not limited to: acid salts formed by reacting the free base compound with a pharmaceutically acceptable inorganic acid, such as hydrochloric, hydrobromic, sulfuric, nitric, phosphoric, metaphosphoric acids, etc .; or with an organic acid, such as acetic, propionic, caproic, cyclopentane propionic, glycolic, pyruvic, lactic, malonic, succinic, malic, maleic, fumaric, trifluoroacetic, tartaric, citric, benzoic, 3- (4-hydroxybenzoic, benzene) mandelic acid, methanesulfonate slots, ethanesulfonic acid, 1,2-ethanedisulfonic acid, 2-hydroxyethanedisulfonic acid, benzenesulfonic acid, toluen
  • the corresponding counterions of pharmaceutically acceptable salts can be investigated and identified using various methods, including but not limited to: ion exchange chromatography, ion chromatography, capillary electrophoresis, induction plasma binding, atomic absorption spectroscopy, mass spectrometry, or any combination thereof.
  • Salts are reduced using at least one of the following methods: filtration, precipitation with a precipitant, followed by filtration, evaporation of the solvent or, in the case of aqueous solutions, lyophilization.
  • a pharmaceutically acceptable salt includes solvent addition salt forms or crystalline forms thereof, in particular solvates or polymorphs.
  • Solvates contain a stoichiometric or non-stoichiometric amount of solvent and can be formed during the crystallization process with pharmaceutically acceptable solvents such as water, ethanol and the like. Hydrates are formed when the solvent is water, and alcoholates are formed when the solvent is alcohol. Solvates of the compounds described in this patent can be easily prepared or formed in the methods described in the present invention.
  • the compounds provided by the present invention may exist in unsolvated as well as in solvated forms. In general, solvated forms are considered equivalent to unsolvated forms when describing the compounds and methods provided by the present invention.
  • the compounds described in the present invention can be presented in various forms, including the listed, but not limited to: structureless forms, ground forms and nanoparticles.
  • the compounds described in the present invention include crystalline forms, also known as polymorphs. Polymorphs include crystals with different structures of the same elemental composition of the compound. Polymorphs, as a rule, have a different nature of X-ray diffraction, different infrared spectra, melting point, different density, hardness, crystalline form, optical and electrical properties, stability and solubility. Various factors, such as a solvent for recrystallization, degree of crystallization and storage temperature, may determine the dominance of a single crystalline form.
  • thermoanalysis methods are aimed at studying thermochemical decomposition or thermophysical processes, including, but not limited to polymorphic transitions, and such methods are used to analyze the relationship between polymorphic forms, to determine the mass loss, to find the glass transition temperature or to study compatibility with the filler.
  • Such methods include, without limitation, differential scanning calorimetry (DSC), modulating differential scanning calorimetry (MDSK), thermogravimetric analysis (TGA), thermogravimetric and infrared analysis (TG / IR).
  • Crystallographic methods include those listed, but not limited to: single crystal and powder diffractometers and synchrotron sources.
  • Various spectroscopic methods used include but are not limited to limited to them: determination of the Raman spectrum (Raman scattering), FTIR, UVIS and NMR (liquid and solid state).
  • Various microscopy methods include, but are not limited to: polarized light microscopy, scanning electron microscopy (SEM) with X-ray energy dispersion analysis (EDX), electron microscopy scanning in a natural environment with EDX (in a gas or water vapor atmosphere), IR microscopy and Raman microscopy.
  • the present invention relates to compounds selected from the group including:
  • the present invention also relates to a method for inhibiting the biological activity of cyclin-dependent CDK8 / 19 protein kinases in a subject, comprising contacting the cyclin-dependent CDK8 / 19 protein kinases with a compound of the present invention.
  • the present invention relates to a pharmaceutical composition
  • a pharmaceutical composition comprising a therapeutically effective amount of a compound described herein, or a pharmaceutically acceptable salt, solvate thereof, and one or more pharmaceutically acceptable excipients.
  • the pharmaceutical composition of this invention is intended for the prophylaxis or treatment of a disease or disorder mediated by the activation of cyclin-dependent protein kinases CDK8 / 19.
  • the pharmaceutical composition of this invention is intended for the prophylaxis or treatment of a disease or disorder mediated by activation of the cyclin-dependent protein kinase CDK8 / 19, where the disease, or disorder mediated by the activation of cyclin-dependent protein kinases CDK8 / 19, is an oncological or hematologic cancer.
  • the pharmaceutical composition of This invention is intended for the prevention or treatment of colorectal cancer, melanoma, metastatic melanoma, breast cancer, triple negative breast cancer (TNBC), prostate cancer, metastatic ovarian cancer, metastatic gastric cancer, leukemia, acute myeloid leukemia, pancreatic cancer ( PCa).
  • the pharmaceutical composition of the present invention may contain, for example, from about 10% to about 100% of the active ingredients, preferably from about 20% to about 60% of the active ingredients. It is understood that the content of the active ingredient or ingredients in an individual dose of each dosage form is not necessarily an effective amount, since the required effective amount can be achieved with the introduction of several standard dosage forms.
  • a typical composition is prepared by mixing a compound of the present invention and one or more excipients.
  • excipients include, but are not limited to, diluents, carriers, excipients.
  • Suitable carriers, diluents, fillers are well known to specialists in this field and include substances such as carbohydrates, waxes, water-soluble and / or swellable polymers, hydrophilic or hydrophobic substances, gelatin, oils, solvents, water and the like.
  • the particular carrier, diluent or excipient used will depend on the means and the purpose for which the compound of the present invention is used. Solvents are generally selected based on solvents recognized by those skilled in the art as safe for administration to a mammal.
  • safe solvents are aqueous solvents such as water and other solvents that are soluble in water or miscible with water.
  • Suitable aqueous solvents include water as the main component, and ethanol, propylene glycol, polyethylene glycols (e.g., PEG400, PEG300), etc., and mixtures thereof.
  • compositions may also include one or more buffers, stabilizing agents, surfactants, wetting agents, lubricants, emulsifiers, suspending agents, preservatives, antioxidants, matting agents, glidants, processing aids, colorants, sweeteners, fragrances, flavors and other known additives to obtain a good appearance of the drug (i.e., the compound of the present invention or its pharmaceutical composition) or to promote capturing a pharmaceutical product (i.e., drug).
  • buffers stabilizing agents, surfactants, wetting agents, lubricants, emulsifiers, suspending agents, preservatives, antioxidants, matting agents, glidants, processing aids, colorants, sweeteners, fragrances, flavors and other known additives to obtain a good appearance of the drug (i.e., the compound of the present invention or its pharmaceutical composition) or to promote capturing a pharmaceutical product (i.e., drug).
  • compositions may also include salts, solvates and hydrates of the compounds of the present invention, or a stable form of the compound (for example, a complex with a cyclodextrin derivative or other known complexing agent).
  • compositions of the present invention are generally suitable for oral administration.
  • Oral medication taking the medicine through the mouth (lat.per os, oris), by swallowing the medicine.
  • the compounds of the present invention can also be administered buccally, lingually or sublingually, so that the compound enters the bloodstream directly from the oral cavity.
  • Dosage forms suitable for oral, buccal, lingual or sublingual administration include solid, semi-solid and liquid systems, such as tablets; granules; soft or hard capsules containing multi- or nanoparticles, liquids or powders; lozenges (including those filled with liquid); chewing forms; gels; rapidly soluble dosage forms; films; suppositories; Sprays and buccal / mucoadhesive adhesives.
  • Liquid dosage forms include suspensions, solutions, syrups and elixirs. Such dosage forms can be used as excipients in soft or hard capsules (for example, from gelatin or hydroxypropyl methylcellulose) and usually contain a carrier, for example, water, ethanol, polyethylene glycol, propylene glycol, methyl cellulose or a suitable oil and one or more emulsifiers and / or suspending agents. Liquid dosage forms can also be made by reconstituting a solid, for example, from a sachet.
  • parenteral administration of a pharmaceutical composition includes any route of administration that is characterized by a physical violation of the integrity of the tissue of the subject and the administration of the pharmaceutical composition through a violation in the tissue, which usually leads to direct entry into the bloodstream, muscle or internal organ.
  • parenteral administration includes, but is not limited to, administering the pharmaceutical composition by injecting the composition, administering the composition through a surgical incision, applying the composition using a non-surgical wound penetrating the tissue, and the like.
  • parenteral administration includes, but is not limited to, subcutaneous, intraperitoneal, intramuscular, intravenous, intraarterial, intrathecal, intraventricular, intraurethral, intracranial, intraarticular injection or infusion; and renal dialysis infusion techniques.
  • Intratumoral delivery for example, intratumoral injection, may also be useful.
  • Regional perfusion is also provided.
  • Dosage forms of pharmaceutical compositions suitable for parenteral administration usually contain the active ingredient in combination with a pharmaceutically acceptable carrier, for example, sterile water or a sterile isotonic solution. Such dosage forms can be prepared, packaged in a form suitable for bolus administration or for continuous administration. Injectable dosage forms can be manufactured, packaged in unit dosage form, for example, in ampoules, or in multi-dose containers, containing a preservative. Dosage forms for parenteral administration include, but are not limited to, suspensions, solutions, emulsions in oily or aqueous bases, pastes, and the like.
  • Dosage forms can be performed for immediate and / or modified release.
  • Modified release dosage forms include delayed, delayed, pulsating, controlled, targeted and programmed release.
  • the present invention relates to a method for treating a disease or disorder mediated by the activation of cyclin-dependent CDK8 / 19 protein kinases, which comprises administering to a therapeutically effective amount of a compound of the present invention or a pharmaceutically acceptable salt or pharmaceutical composition of this invention to a subject in need such a treatment.
  • the present invention relates to a method for treating a disease or disorder mediated by the activation of cyclin-dependent CDK8 / 19 protein kinases, which is an oncological or hematologic oncological disease, which comprises administering a compound described herein or a pharmaceutically acceptable salt or pharmaceutical thereof the compositions of this invention to a subject in need of such treatment in a therapeutically effective amount.
  • the present invention relates to a treatment method described above, wherein the oncological or hematologic cancer is selected from the group consisting of colorectal cancer, melanoma, metastatic melanoma, breast cancer, triple negative breast cancer (TNBC), prostate cancer, metastatic ovarian cancer, metastatic cancer of the stomach, leukemia, acute myeloid leukemia, pancreatic cancer (PCa).
  • the compounds of this invention can be used in the methods of treatment as described above, can be used in the treatment as described above, and / or can be used in the manufacture of medicaments for treatment as described above.
  • Compounds that are inhibitors of CDK8 / 19 can be used in the methods of treatment described above, as monotherapy or in combination with surgery, or radiation therapy, or drug therapy.
  • co-administration refers to or include:
  • therapeutically effective dosages can vary when drugs are used in combination treatments.
  • Methods for experimentally determining therapeutically effective dosages of drugs and other agents for use in combination treatment regimens are described in the literature. For example, the use of uniform dosing, i.e. the introduction of more frequent and smaller doses to minimize toxic side effects is described in the literature.
  • Combined treatment includes periodic treatment, which begins and stops at various times in accordance with the patient’s treatment plan.
  • the dosages of the co-administered compounds will undoubtedly vary depending on the type of adjuvant used, the specificity of the applied drug, the disease or condition being treated, etc.
  • the compounds described in the present invention can also be used in combination with procedures that can provide additive or synergistic benefits to the patient.
  • patients are expected to receive therapeutic and / or prophylactic benefit in the methods described in this patent, wherein the pharmaceutical composition of the compound described in the present invention and / or combination with other methods of therapy combined with genetic research to determine whether an object is a carrier of a mutant gene, for which it is known that it correlates with certain diseases or conditions.
  • the above drug therapy may include the introduction of one or more anti-cancer agents.
  • anticancer agents include, without limitation, any of the following agents: alkylating agents, alkyl sulfonates, nitrosoureas or triazenes; antimetabolites; hormonal agents or hormone antagonists; platinum compounds; antitumor antibiotics; topoisomerase inhibitors.
  • antimetabolites include, but are not limited to, folic acid analogues (e.g., methotrexate, trimerexate, pemetrexed, pralatrexate, altitrexed, calcium levofolinate) or pyrimidine analogues (e.g., cytarabine, tegafur, fluorouracil, capecitabine, phloxuridine, azinocytin, azacycytin, sapacitabine, elacitarabine, doxyfluuridine), or purine analogues (e.g., mercaptopurine, thioguanine, pentostatin, fludarabine, cladribine, non-larabin, azathioprine, clofarabin), or asparaginase.
  • folic acid analogues e.g., methotrexate, trimerexate, pemetrexed, pralatrexate, altitrexe
  • alkylating agents include, without limitation, mehloroetamin, cyclophosphamide, chlorambucil, menfalan, bendamustine, sametilimelamine, thiotepa, busulfan, carmustine, lomustine, laromustin, semustine, streptozocin, dacarbazine, ifosfamide, improsulfan, mitobronitol, mitolaktol, nimustine, ranimustine, temozolomide, threosulfan, carbochion, apazihion, fotemustine, altretamine, glufosfamide, pipobromane, trophosphamide, uramustine, euphosphamide, VAL-083.
  • hormonal agents and hormone antagonists include, but are not limited to, prednisone, prednisolone, hydroxyprogesterone caproate, megestrol acetate, medroxyprogesterone acetate, diethylstilbestrol, estradiol, tamoxifen, testosterone propionate, fluoxymesterone, flutamidelteridel, lemidameridelaparide, leurolimetaridel, leutamidelaparidel, leutamidelaparidel, leucidamerdelicone, calusterone, chlorotrianisene, degarelix, dexamethasone, fluocortolone, fulvestrant, goserelin, histrelin, leuprorelin, mitotan, nafarelin, nandrolone, nilutamide, octreotide, eryloltinoltoleloltolinol, dimethyltrolinoltole,
  • platinum compounds include, but are not limited to, cisplatin, carboplatin, oxaliplatin, eptaplatin, myriplatin hydrate, lobaplatin, nedaplatin, picoplatin, satraplatin.
  • antitumor antibiotics include, but are not limited to, doxorubicin, daunorubicin, idarubicin, carubicin, valrubicin, zorubicin, aclarubicin, pyrarubicin, nemorubicin, amrubicin, epirubicin, bleomycin, plicincytin, pepticincytin, pepticin, pepticin, pepticin, pepticin, pepticin, pepticin, pepticin, pepticin, pepticin, pepticin, pepticin, pepticin, and pepticin.
  • topoisomerase inhibitors include, but are not limited to, irinotecan, topotecan, belotecan, teniposide, etoposide, voreloxin, amonafide.
  • anticancer agents include, but are not limited to, any of the following agents: microtubule-acting drugs such as taxanes (eg, paclitaxel, docetaxel, cabazitaxel, tesetaxel), periwinkle alkaloids (eg, vinorelbine, vinblastine, vincristine, vindesine, vinflunine); mitogen-activated protein kinase signaling inhibitors (for example, U0126, PD98059, PD184352, PD0325901, ARRY-142886, SB239063, SP600125, BAY 43-9006, Wortman or LY294002); mTOR inhibitors (e.g.
  • microtubule-acting drugs such as taxanes (eg, paclitaxel, docetaxel, cabazitaxel, tesetaxel), periwinkle alkaloids (eg, vinorelbine, vinblastine, vincristine, vindesine, vinflun
  • the present invention relates to the use of a compound described herein, or a pharmaceutically acceptable salt thereof, or a pharmaceutical composition of this invention for treating a disease or disorder mediated by activation of cyclin-dependent CDK8 / 19 protein kinases in a subject in need of such treatment.
  • the present invention relates to the use of a compound described herein, or a pharmaceutically acceptable salt thereof, or a pharmaceutical composition of this invention in a subject in need of such treatment for the treatment of a disease or disorder mediated by activation of cyclin-dependent CDK8 / 19 protein kinases representing an oncological or hematologic oncological disease.
  • the present invention relates to the use of a compound described above, or a pharmaceutically acceptable salt thereof, or a pharmaceutical composition of this invention for the treatment of an oncological or hematologic cancer, which is selected from the group consisting of colorectal cancer, melanoma, metastatic melanoma, breast cancer glands, thrice-negative breast cancer (TNBC), prostate cancer, metastatic ovarian cancer, metastatic gastric cancer, leukemia, acute myelitis loid leukemia, pancreatic cancer (PCa), in a subject in need of such treatment.
  • an oncological or hematologic cancer which is selected from the group consisting of colorectal cancer, melanoma, metastatic melanoma, breast cancer glands, thrice-negative breast cancer (TNBC), prostate cancer, metastatic ovarian cancer, metastatic gastric cancer, leukemia, acute myelitis loid leukemia, pancreatic cancer (PCa), in a subject in need of such treatment.
  • TNBC thrice-negative
  • the compounds of the present invention will be administered in an amount effective to treat the condition in question, i.e. in doses and for periods of time necessary to achieve the desired result.
  • the therapeutically effective amount may vary depending on factors such as the particular condition being treated, the patient’s age, gender and weight, and whether the administration of these compounds is an independent treatment or is carried out in combination with one or more additional treatments.
  • Drug regimens can be adjusted to provide the optimum desired response. For example, a single dose may be administered, several divided doses may be administered over time, or the dose may be proportionally reduced or increased depending on the severity of the therapeutic situation. Especially useful is the manufacture of oral compositions in unit dosage form for ease of administration and uniformity of dosage.
  • the unit dosage form refers to physically discrete units suitable as unit doses for patients / subjects to be treated; each unit contains a predetermined amount of the active compound, calculated to produce the desired therapeutic effect in combination with the desired pharmaceutical carrier.
  • the dosage regimen with the compositions of this invention can be based on various factors, including the type of disease, age, weight, gender, health status of the patient, severity of the condition, route of administration, and the particular compound of the present invention used.
  • the dosage regimen can vary widely, but can be determined regularly using standard methods.
  • doses may be adjusted based on pharmacokinetic and pharmacodynamic parameters, which may include clinical effects, such as toxic effects or laboratory values.
  • the present invention encompasses an individual dose increase, which is determined by a qualified specialist. Determination of the required dose and modes are well known in the relevant field of technology and will be clear to a person skilled in the art after familiarization with the ideas disclosed herein.
  • the doses used to treat an adult are usually in the range of 0.02-5000 mg per day, or from about 1-1500 mg per day.
  • a maintenance dose is administered, if necessary. Subsequently, the dosage or frequency of administration, or both, may be reduced, depending on the symptoms, to a level at which a relieved condition of the disease, disorder or condition is maintained. Patients may, however, require periodic treatment over time for any relapse of symptoms.
  • Example 1 Obtaining intermediate compounds 7.2, 12.2, 13.2, 17.2.
  • Step 1 To a suspension of 6-methylnaphthalene-2-carboxylic acid 1.12 (10.0 g, 53.7 mmol) in 85 ml of methanol was added dropwise SOCh (1.64 g, 13.8 mmol). After boiling for 1.5 h, SOCh (660 mg, 5.5 mmol) was added dropwise. After stirring at the boil for 1 h, the solvent was distilled off in vacuo. Product 1.11 was obtained as a light yellow powder and was used in the next step without further purification. Yield 10.3 g (98%).
  • Step 2 To a suspension of compound 1.11 (10.0 g, 49.9 mmol) in 43 ml of carbon tetrachloride were added NBS (4.58 g, 25.7 mmol) and AIBN (370 mg, 2.3 mmol). After holding at 78 ° ⁇ for 1.5 hours, the reaction mixture was cooled to 60 ° ⁇ and NBS (4.58 g, 25.7 mmol) and AIBN (370 mg, 2.3 mmol) were added. After exposure for 1.5 h at a temperature of 63.5 ° ⁇ , the reaction mixture was cooled to 35 ° ⁇ and 65 ml of hexane were added to it.
  • Step 3 To a solution of compound 1.10 (7.4 g, 26.5 mmol) in 70 ml of methanol, KCN (2.07 g, 31.8 mmol) was added at the boil. After holding for 1.25 hours, the solvent was distilled off. The residue was extracted with dichloromethane, the solvent was distilled off in vacuo. Product 1.9 was isolated as a light brown powder after recrystallization from ethanol. Yield 4.78 g (80%).
  • Step 4 To a solution of LiOHxH 2 0 (306 mg, 7.20 mmol) in 30 ml of a water-THF mixture was added compound 1.9 (1.50 g, 6.60 mmol). The reaction mass was stirred for 3 hours, the solvent was distilled off. 5 ml of MTBE was added to the mixture. The layers were separated, the aqueous layer was acidified to pH 2-3 by adding 0.75 ml of concentrated HCl. The precipitate was filtered off, washed with water, dried in air, dissolved in 14 ml of dry dichloromethane in a nitrogen atmosphere, SOCl 2 (1.40 ml, 19.3 mmol) and 50 ⁇ l of DMF were added.
  • Step 5 To a solution of 1-isopropylpiperazine (390 mg, 3.00 mmol) and DIPEA (510 mg, 5.00 mmol) in 20 ml of dichloromethane was added dropwise with stirring and cooling in an ice bath under a nitrogen atmosphere a solution of compound 7.3 (580 mg, 2.50 mmol ) in 10 ml of dichloromethane. Stirring was continued at 20 ° C for 3 h, then the reaction mixture was washed with water, the organic layer was stirred with Na 2 S0 4 and activated carbon for 15 min, filtered through a layer of celite, the solvent was distilled off. Received the product 7.2 in the form of an orange viscous liquid. Yield 800 mg (99%).
  • Example 2 A method of obtaining a compound 1.
  • Step 2 SOCl 2 (7.42 g, 62.4 mmol) and DMF (15 mg, 0.208 mmol) were added to a suspension of compound 1.8 (4.39 g, 20.8 mmol) in 44 ml of dry dichloromethane.
  • the reaction mixture was stirred at reflux for 4 hours, the solvent was distilled off, the residue was dissolved in 45 ml of dry dichloromethane.
  • the resulting solution was added dropwise to a solution of triethylamine (2.35 g, 22.9 mmol) and N-methylpiperazine (2.19 g, 21.84 mmol) in 45 ml of dry dichloromethane at temperature 5 ° ⁇ . After 30 minutes, the resulting mixture was warmed to room temperature, washed with water, dried over Na 2 S0 4 , and the solvent was distilled off.
  • Product 1.7 was isolated as a brown oily liquid. Yield 5.80 g (95%).
  • Step 3 To a solution of compound 1.7 (5.80 g, 19.8 mmol) in 50 methanol was added 50 ml of a 25% ammonia solution and a suspension of freshly prepared Raney Ni catalyst (2.90 g, 49.0 mmol) in 20 ml of methanol was added. After 4 hours in an autoclave with hydrogen at a pressure of 10 atm, the reaction mixture was filtered through celite, and the filtrate was distilled off in vacuo. The residue was extracted with dichloromethane, the solvent was distilled off in vacuo. Product 1.6 was isolated as a brown oily liquid. Yield 5.58 g (95%)
  • Step 4 Urea (22.8 g, 380 mmol) was added to a suspension of compound 1.5 (10.0 g, 38 mmol) in 70 ml of DMAA. After 3 hours at 160 ° C, the reaction mixture was cooled to room temperature and poured into 210 ml of water. The precipitate of product 1.4 was filtered off, washed with water and dried in vacuo to constant weight. Yield 8.30 g (76%).
  • Step 5 To a suspension of compound 1.4 (8.30 g, 28.9 mmol) in 30 ml of DMF were added Zn (CN) 2 (2.77 g, 23.7 mmol) and Pc1 (PP113) 4 (335 mg, 0.29 mmol, 0.01 eq). Nitrogen was passed through the reaction mass for 15 minutes, then it was stirred for 2 hours at 120 ° C. The hot reaction mixture was filtered through celite and washed with DMF. The filtrate was cooled to 5 ° C, the precipitate of product 1.3 was filtered off, washed with acetonitrile, water and dried in vacuum to constant weight. Yield 2.90 g (54%).
  • Step 6 To a suspension of compound 1.3 (2.90 g, 15.6 mmol) in 5.8 ml of toluene was added DIPEA (5.84 g, 45.2 mmol). POC1 3 (14.35 g, 93.6 mmol) was added to the mixture at a temperature of 0 ° C. After exposure for 30 min at 0 ° C and 3 hours at 90 ° C, the mixture was cooled to room temperature and poured into ice. The resulting mixture was adjusted with NaHC0 3 solution to pH 8. The precipitate was filtered off and washed with water. Product 1.2 was isolated by silica gel column chromatography using eluent hexane dichloromethane (1: 9) as a brown powder. Yield 2.70 g (78%).
  • Step 7 To a solution of compound 1.6 (4.00 g, 13.5 mmol) in 60 ml of acetonitrile were added triethylamine (3.70 g, 36.6 mmol) and compound 1.2 (2.70 g, 12.2 mmol) at 0 ° C. After holding at room temperature for 2 h, the precipitated precipitate of product 1.1 was filtered off, washed with acetonitrile, water and dried in vacuum to constant weight. Yield 4.86 g (82%). Stage 8.
  • Example 3 A method of obtaining a compound 2.
  • Example 4 A method of obtaining a compound 3.
  • Step 1 Compound 4.2 was prepared analogously to compound 1.3 (Example 2, step 5) using compound 4.3 (prepared according to the procedure described in Bioorganic & Medicinal Chemistry 2006, 14 (20), 6832) instead of compound 1.4.
  • Step 2 Compound 4.1 was prepared analogously to compound 1.2 (Example 2, step 6) using compound 4.2 instead of compound 1.3.
  • Stage 1 Nitrogen was passed through a suspension of 6-iodine-4-hydroxyquinoline (8.00 g, 29.5 mmol) in 60 ml of DMF for 10 min, then Zn (CN) 2 (4.16 g, 35.4 mmol) and Pd (PPh 3 ) were added. 4 (1.71 g, 1.48 mmol, 0.05 equiv.). The mixture was stirred in a nitrogen atmosphere at 100 ° C for 2 hours. Then the reaction mixture was brought to room temperature and, with cooling in an ice bath, Rb 3 (3 ml, 32.5 mmol) was added dropwise, after 10 minutes it was kept at 0 ° C. and then stirred for 1 h at room temperature.
  • Example 7 A method of obtaining compounds 6.
  • Step 2 To a solution of compound 6.2 (300 mg, 1.19 mmol) in 6 ml of 1,4-dioxane at 0 ° C were added pyridine (190 ⁇ l, 2.38 mmol) and trifluoroacetic anhydride (180 ⁇ l, 1.42 mmol). The reaction mass was stirred at 40 ° C for 1.5 hours. Then the reaction mass was poured into 40 ml of water and extracted with ethyl acetate. The organic layer was separated, dried with Na 2 S0 4 and concentrated in vacuo. Product 6.1 in as a white powder was isolated by silica gel column chromatography, eluent dichloromethane-methanol (97: 3). Yield 180 mg (65%).
  • Example 8 A method of obtaining a compound 8.
  • Triphenylphosphine (131 mg, 0.50 mmol) and 4-hydroxy-6-iodoquinoline 5.2 (134 mg, 0.50 mmol) were added to a solution of compound 8.2 (131 mg, 4.90 mmol) in 10 ml of dry THF. Then, at a temperature of 0 ° C., DIAD was added dropwise (101 mg, 0.50 mmol). The reaction mass was maintained at room temperature for 16 hours. The solvent was distilled off in vacuo, product 8.1 was isolated by silica gel column chromatography using an eluent of dichloromethane-methanol (98: 2-> 92: 8) as a yellow oily residue. Yield 40 mg (22%).
  • Step 3 Compound 8 was prepared analogously to compound 1.3 (Example 2, step 5) using compound 8.1 instead of compound 1.4. The product was further purified by preparative chromatography (Method B).
  • Example 9 The method of obtaining compounds 9.
  • Step 1 Compound 9.3 was obtained analogously to compound 1.3 (example 2, step 5) using compound 5.2 instead of compound 1.4.
  • Step 3 Compound 9.2 (430 mg, 1.89 mmol) in 5 ml of POCl was stirred at the boil for 1 h, then the reaction mixture was poured into ice, neutralized with saturated NaHCO 3 solution, and extracted with ethyl acetate. The combined organic fractions were concentrated in vacuo, product 9.1 was isolated by column chromatography on silica gel using eluent ethyl acetate-hexane (50:50). Yield 270 mg (64%).
  • Step 4 Compound 9 was prepared analogously to compound 4 (Example 5, Step 3) using compound 9.1 instead of compound 4.1.
  • Example 10 A method of obtaining a compound 11.
  • Example 11 A method of obtaining a compound 18.
  • Stage 1 A mixture of acid 1.8 (1.00 g, 4.74 mmol) and N-Boc-piperazine (971 mg, 5.21 mmol) was dissolved in 10 ml of DMF and, with cooling in an ice bath, CDI (922 mg, 5.69 mmol) was added in portions. The reaction mixture was stirred at room temperature for 18 hours, after which 100 ml of water was added. The resulting precipitate was filtered off, washed with water. Product 18.3 was isolated by silica gel column chromatography using an eluent of dichloromethane-methanol (50: 1) as a light yellow powder. Yield 281 mg (16%).
  • Step 2 Compound 18.2 was obtained analogously to compound 1.6 (Example 2, Step 3) using compound 18.3 instead of compound 1.7.
  • Step 3 Compound 18.1 was obtained analogously to compound 5 (example 6, step 2), using compound 18.2 instead of compound 1.6.
  • Step 4. To a solution of compound 18.1 (71 mg, 0.133 mmol) in 3 ml of dichloromethane, 1.5 ml of a 4M solution of HCl in dioxane was added dropwise with cooling with a water bath. After 16 hours, the precipitate was filtered off and washed with dichloromethane. Yield 48 mg (79%). The product of reaction 18 was further purified by preparative chromatography (Method B).
  • Example 12 The method of obtaining compound 19.
  • Step 1 To a suspension of compound 1.10 (3.00 g, 10.2 mmol) in 20 ml of a mixture of ethanol: water (1: 1), urotropine (1.58 g, 11.2 mmol) was added at room temperature. The reaction mixture was stirred at the boil for 9 hours. Then, at room temperature, 10 ml of concentrated HCl was added and it was stirred for 18 hours. 30 ml of water was added to the reaction mixture, the precipitate of product 19.5 was filtered off, washed with water and hexane, and dried in air. Yield 1.38 g (43%).
  • Step 4 A mixture of compound 9.3 (400 mg, 2.11 mmol) and Lawesson's reagent (864 mg, 2.11 mmol) in 7 ml of pyridine was stirred at room temperature for 1 h. The reaction mixture was extracted with ethyl acetate and concentrated in vacuo. Product 19.6 was isolated by silica gel column chromatography using dichloromethane eluent. Yield 350 mg (88%).
  • Step 5 Argon was passed through 10 ml of DMSO through a mixture of compounds 19.3 (672 mg, 2.30 mmol), 19.6 (385 mg, 2.07 mmol) and K 2 C0 3 (643 mg, 4.60 mmol) in 10 ml, after which the mixture was stirred 10 hours at room temperature. The reaction mixture was extracted with ethyl acetate and concentrated in vacuo. Product 19.2 was isolated by silica gel column chromatography using eluent hexane-ethyl acetate (85:15). Yield 412 mg (50%).
  • Step 6 Compound 19.1 was obtained analogously to compound 1.8 (example 2, step 1), using compound 19.2 instead of compound 1.9.
  • Step 7. To a mixture of compound 19.1 (100 mg, 0.26 mmol), N-methylpiperazine (32 ⁇ l, 0.29 mmol) and DMAP (3 mg, 0.03 mmol) in 5 ml of dichloromethane was added EDCxHC1 (65 mg, 0.34 mmol). The reaction mixture was stirred under nitrogen for 8 hours. The reaction mixture was extracted with dichloromethane and concentrated in vacuo. Product 19 was isolated by silica gel column chromatography, eluent dichloromethane-methanol (95: 5). Yield 45 mg (37%). The product was further purified by preparative chromatography (Method B).
  • the determination of stability in human blood plasma was carried out using a pooled human blood plasma taken from ten healthy donors.
  • the initial solution of the candidate (10 mM in DMSO) was diluted with the pulsed blood plasma to a concentration of 10 ⁇ M (test solution).
  • the test solution was kept in a solid-state thermostat for 4 hours at a temperature of 37 ° C.
  • HPLC using an Agilentl200 chromatograph (Agilent, United States), the peak areas of the compounds in the test samples were determined that correspond to the initial test time (before aging) and the final test time (after aging in a solid state thermostat for 4 hours at a temperature of 37 ° C) with preliminary precipitation of proteins with acetonitrile .
  • the compounds described herein have chemical stability values of more than 75%, i.e. are chemically stable in the acidic environment of artificial gastric juice and in human blood plasma (table 7).
  • Example 15 Determination of enzymatic stability.
  • the reaction was stopped with acetonitrile based on 100 ⁇ l of acetonitrile per 100 ⁇ l of the reaction mixture.
  • the compounds of the present invention showed sufficient resistance to the action of biotransformation enzymes and had an enzymatic decomposition rate of Cl int less than 13 ⁇ l / min / mg. The results are shown in table 8.
  • the upper chamber was filled with pH 6.5 buffer, and the solutions of the studied substances were introduced in pH 7.4 buffer at a concentration of 10 ⁇ M into the lower chamber.
  • Propranolol was used as a control as a high permeability substance.
  • the amounts of the studied substances in the upper and lower chambers were determined by HPLC using an Agilentl200 chromatograph (Agilent, United States) with preliminary precipitation of proteins with acetonitrile. Chromatographic analysis was performed in a gradient elution mode at a flow rate of 1 ml / min. Peak areas corresponding to the compounds were determined on chromatograms. Based on the values of the peak area of the compound in calibration standards, the concentration of the compound in the initial solution and in samples from the wells of the upper and lower chambers was determined.
  • V is the volume of the solution (in the test A-> B - 0.8 ml, in the test B-> A - 0.2 ml), ml
  • C (0) is the concentration of the initial solution, ⁇ M
  • the efflux coefficient showed the ability of cells to eliminate the substance from the bloodstream. The value was calculated by the formula:
  • the compounds of the present invention showed a high speed of direct transport “intestinal lumen” - “blood flow”, while the efflux coefficient did not exceed 2, which indicates that the Pgp transporter does not impose restrictions on the bioavailability of the substance.
  • the results are shown in Table 9.
  • Table 9 The results of determining the permeability of compounds through a monolayer of cells Caco-2.
  • Example 17 Antiproliferative activity against CDK8-sensitive cell lines in vitro.
  • the antiproliferative activity of the CDK8 inhibitors of the present invention was measured in a cell test on a transplantable MV4-11 cell culture (biphenotypic myelomonocytic leukemia, ATCC® CRL-9591 TM) using an intravital AlamarBlue stain (Therm oFisher, # DAL1100).
  • Cells were grown in RPMI-1640 medium (PanEco, # C330p) supplemented with 10% FBS (Gibco, # 16140-071), washed and re-plated on culture medium with 10% FBS (Gibco, # 16140-071) in 96-well full-time culture plates (Coming, # 3599) in an amount of 10 x 10 3 cells in 100 ⁇ l of medium per well.
  • the test compounds were dissolved in DMSO and diluted with 10% FBS medium (Gibco, # 16140-071) to a final concentration ranging from 0 to 100 ⁇ M.
  • Diluted compounds in a volume of 50 ⁇ l were then added to each well (final DMSO concentration was not more than 1%) and incubated at 37 ° ⁇ in an incubator with 5% ⁇ 0 2 for 120 h.
  • 15 ⁇ l AlamarBlue reagent was added to the wells (Therm oFisher, # DAL1100), mixed the contents of the tablets on an orbital shaker (Biosan, Lithuania), then additionally incubated for 3 to 5 hours at 37 ° C in an incubator with 5% CO 2 .
  • the number of living cells was detected on a microplate spectrophotometer (Tecan Infinite ⁇ 200 ⁇ r Switzerland) by measuring the fluorescence signal at an excitation wavelength (lEc) of 540 nm and an emission wavelength (lEm of 590 nm.
  • the value of 1C 50 was determined using the Magellan 7.2 program (Tesap, Switzerland), approximating the experimental points using a four-parameter model with Levenberg-Markart optimization (table 10).
  • SS 5 The value of SS 5 about was determined in the test for cytotoxicity. Studies were performed on HepG2 cells (hepatocellular carcinoma, ATCC® HB-8065 TM). Cells were scattered into 96-well plates (Coming, # 3599) at a concentration of -20 c 10 3 cells in 100 ⁇ l of medium per well and incubated for 72 hours with compounds added in the concentration range from 200 to 0.78 ⁇ M. Cell viability was evaluated according to the method described above. The results are shown in table 10.
  • Table 10 The results of the specific activity of the compounds in the cell line antiproliferative test on the cell line (MV-4-11) and the results of general toxicity on the HepG2 cell line. Data are presented as average activity values obtained in several formulations.
  • Example 18 The affinity of the compounds for the recombinant protein CDK8 in complex with Cyclin C in vitro.
  • the ability of the compounds described in this patent to bind to the CDK8 protein was determined using the LanthaScreen method (Therm o Fisher). A FRET signal was detected proportional to the amount of CDK8 bound fluorescently labeled ligand (Tracer 236), which competes with the inhibitor for the ATP binding site.
  • Staurosporin was used as a control inhibitor, and a 0.1% solution of dimethyl sulfoxide (DMSO) in a reaction buffer containing 250 tM HEPES (pH 7.5), 50 tM MgC12, 5 tM EGTA, and 0.05% Brij-35 was used as a blank.
  • DMSO dimethyl sulfoxide
  • Test inhibitors and controls were added to the corresponding wells of 5 ⁇ l.
  • the plate was incubated at room temperature for 20 minutes.
  • 5 ⁇ l of tracer solution Alexa Fluor-647 (Kinase Tracer 236, ThermoFisher, # PV5592)
  • the final concentration of the tracer was 10 nm.
  • a negative control was used.
  • reaction buffer The plate was incubated for 40 minutes at 25 ° C, then the TR-FRET signal was measured, according to the manufacturer's recommendations, on a SPARK20 plate reader (Tesap, Switzerland) and counted on the amount of the kinase bound tracer.
  • the value of 1 ⁇ 5 schreib was determined using the SparkControl Magellan 1.2 program (Tesap, Switzerland), approximating the experimental points using a four-parameter model with Levenberg-Markart optimization (Table 11).
  • Table 11 The results of measuring the interaction of compounds with protein CDK8-Cyclin C in a biochemical HTRF test. The data are presented in the form of average values of 1C 5 about, obtained in several settings.

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Abstract

Настоящее изобретение относится к новым соединениям формулы (I) которые обладают свойствами ингибитора CDK8/19, к фармацевтической композиции, содержащей данные соединения, и применению данных соединений и композиции в качестве фармацевтических препаратов для лечения заболеваний или нарушений.

Description

Новые ингибиторы CDK8/19
Область техники
Настоящее изобретение относится к новым ингибиторам циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19, способам их получения, фармацевтическим композициям, содержащим данные соединения, и к применению таких соединений или таких композиций для лечения заболеваний или нарушений.
Уровень техники
CDK8, наряду с близко связанной с ней по структурным и функциональным хакратеристикам изоформой CDK19, является онкогенной киназой, регулирующей транскрипцию (Xu, W. & Л, J. Y. (2011) Dysregulation of CDK8 and Cyclin C in tumorigenesis, J. Genet. Genomics 38, 439-452; Galbraith, M. D., et al. (2010) CDK8: a positive regulator of transcription, Transcription. 1, 4- 12; Firestein, R. & Hahn, W. C. (2009) Revving the Throttle on an oncogene: CDK8 takes the driver seat, Cancer Res 69, 7899-7901). В противоположность более известным членам семейства CDK (таким как CDK1, CDK2 и CDK4/6), CDK8 не играет роли в регуляции клеточного цикла, однако нокаут по гену CDK8 в эмбриональных стволовых клетках приводит к остановке развития эмбриона (Adler, A. S., et al. (2012) CDK8 maintains tumor de- differentiation and embryonic stem cell pluripotency, Cancer Res. 72, 2129-2139) ввиду своей важной роли в формировании фенотипа плюрипотентных стволовых клеток (Firestein, R., et al. (2008) CDK8 is a colorectal cancer oncogene that regulates beta-catenin activity, Nature 455, 547-551). Следует отметить, что блокирование CDK8 не подавляет рост нормальных клеток (Adler, A. S., et al. (2012) CDK8 maintains tumor de- differentiation and embryonic stem cell pluripotency, Cancer Res. 72, 2129-2139, Kapoor, A., et al. (2010) The histone variant macroH2A suppresses melanoma progression through regulation of CDK8, Nature 468, 1105-1109). Роль CDK8 в канцерогенезе связана с его уникальной функцией в качестве регулятора нескольких транскрипционных факторов (Xu, W. & Л, J. Y. (2011) Dysregulation of CDK8 and Cyclin C in tumorigenesis, J. Genet. Genomics 38, 439- 452). Высокая экспрессия CDK8 была выявлена при раке толстой кишки (Firestein, R., et al. (2010) CDK8 expression in 470 colorectal cancers in relation to beta-catenin activation, other molecular alterations and patient survival, Int. J. Cancer 126, 2863-2873), меланоме (Kapoor, A., et al. (2010) The histone variant macroH2A suppresses melanoma progression through regulation of CDK8, Nature 468, 1105-1109), при этом, при указанных видах рака повышенная экспрессия CDK8 наблюдается в -50% случаев; подобная ситуация наблюдается и при раке молочной железы (Broude Е., et al. (2015) Expression of CDK8 and CDK8- interacting genes as potential biomarkers in breast cancer, Curr. Cancer Drug Targets, 15(8), 739-749). Повышенную экспрессию CDK8 связывают с неблагоприятным прогнозом при раке толстой кишки (Gyorffy, В., et al. (2010) An online survival analysis tool to rapidly assess the effect of 22,277 genes on breast cancer prognosis using microarray data of 1 ,809 patients, Breast Cancer Res. Treat. 123, 725-731).
Известные механизмы, ассоциированные c CDK8 при раке, включают положительное регулирование пути катенина Wnt / [бета] (Kapoor, A., et al. (2010) The histone variant macroH2A suppresses melanoma progression through regulation of CDK8, Nature 468, 1105-1109; Alarcon, C, et al. (2009) Nuclear CDKs drive Smad transcriptional activation and turnover in BMP and TGF-beta pathways, Cell 139, 757- 769), транскрипцию, индуцированную фактором роста (DiDonato, J. A., et al. (2012) NF-kappaB and the link between inflammation and cancer, Immunol. Rev. 246, 379-400) и сигнальный путь TGF-бета (Acharyya, S., et al. (2012) A CXCL1 paracrine network links cancer chemoresistance and metastasis, Cell 150, 165-178). Было также показано, что CDK8 может поддерживать плюрипотентный фенотип эмбриональных стволовых клеток, и что он может ассоциироваться с фенотипом стволовых клеток рака (Firestein, R., et al. (2008) CDK8 is a colorectal cancer oncogene that regulates beta-catenin activity, Nature 455, 547-551). Химиотерапевтические препараты, вызывающие повреждения ДНК, индуцируют ФНО-а, активатор фактора транскрипции NFkB (Fabian et al. (2005) A small molecule-kinase interaction map for clinical kinase inhibitors, Nat. Biotechnol. 23, 329-336), в эндотелиальных клетках и в других стромальных элементах микроокружения опухоли. Стромальный ФНО-а действует на опухолевые клетки, где он индуцирует NFkB- опосредованную выработку цитокинов CXCL1 и CXCL2, способствующих выживанию и росту опухолевых клеток. CXCL 1/2 привлекают миелоидные клетки к опухоли путем связывания с рецептором CXCR2 на поверхности миелоидных клеток. Миелоидные клетки затем секретируют небольшие кальций-связывающие белки S 100А8 и А9, которые связаны с процессами хронического воспаления и опухолевого роста. S 100А8/9 действуют на опухолевые клетки, способствуя как их метастазированию, так и выживаемости на фоне химиотерапии (Huang, et al. (2012) MED 12 Controls the response to multiple cancer drugs through regulation of TGF-b receptor signaling, Cell 151, 937-950).
В настоящее время представляется актуальным поиск новых соединений, ингибирующих циклинзависимые протеинкиназы CDK8/19.
Описание изобретения
Ниже приведены определения терминов, которые использованы в описании этого изобретения.
«Алкил» означает алифатическую углеводородную линейную или разветвленную группу с 1 - 12 атомами углерода в цепи, более предпочтительно с 1-6 атомами углерода в цепи. «Разветвленная» означает, что алкильная цепь имеет один или несколько «низших алкильных» заместителей. Примеры алкильных групп включают, но не ограничиваются ими, метил, этил, //-пропил, изо- пропил, //-бутил, изо- бутил, втор- бутил, трет- бутил, //-пентил, 2-пентил, 3-пентил, нео- пентил, //-гексил. Алкил может иметь заместители, которые могут быть одинаковыми или разными.
«Арил» означает ароматическую моноциклическую или полициклическую систему, включающую от 6 до 14 атомов углерода, преимущественно от 6 до 10 атомов углерода. Примеры арильных групп включают, но не ограничиваются ими, фенил, нафтил, антранил и прочие. Арил может иметь заместители циклической системы, которые могут быть одинаковыми или разными. Арил может быть аннелирован с неароматической циклической системой или гетероциклом.
«Алкилокси» или «Алкокси» означает алкил-О- группу, в которой алкил определен в данном разделе. Примеры алкокси групп включают, но не ограничиваются ими, метокси, этокси, н-пропокси, uзо-пропокси и н-бутокси.
«Аминогруппа» означает R'R"N- группу, замещенную или незамещенную необязательно одинаковыми заместителями R' и R".
«Алкилсульфонил» (-S(O)216алкил ) означает «алкил», определение которого приведено выше, присоединенный к соответствующему фрагменту молекулы через сульфонильную группу -S02-. Примеры алкилсульфонилов, включают, но не ограничиваются ими, метилсульфонил, этилсульфонил и т.д.
«Низший алкил» означает линейный или разветвленный алкил с 1 -4 атомами углерода.
«Гало» или «Галоген» (Hal) означает фтор, хлор, бром или йод.
«Гетероцикл», «гетероциклил» или «гетероциклическое кольцо» означает моноциклическую или полициклическую систему, включающую от 3 до 11 атомов углерода, в которой один или несколько атомов углерода заменены на гетероатом, такой как азот, кислород, сера. Гетероцикл может быть конденсирован с арилом или гетероарилом. Гетероцикл может иметь один или несколько заместителей, которые могут быть одинаковыми или разными. Атомы азота и серы, находящиеся в гетероцикле могут быть окислены до N-оксида, S-оксида или S-диоксида. Гетероцикл может быть насыщенным, частично ненасыщенным или ненасыщенным. Примеры гетероциклов включают, но не ограничиваются ими, азетидин, пирролидин, пиперидин, 2,8-диазаспиро[4.5]декан, пиперазин, морфолин и др.
«Гетероарил» означают ароматическую моноциклическую или полициклическую систему, включающую от 5 до 11 атомов углерода, предпочтительно от 5 до 10, в которой один или несколько атомов углерода замещены на гетероатом, такой как азот, сера или кислород. Атом азота, находящийся в гетероариле, может быть окислен до N-оксида. Гетероарил может иметь один или несколько заместителей, которые могут быть одинаковыми или разными. Представителями гетероарилов являются пирролил, фуранил, тиенил, пиридил, пиразинил, пиримидинил, пиридазинил, изооксазолил, изотиазолил, тетразолил, оксазолил, тиазолил, пиразолил, фуразанил, триазолил, 1 ,2,4-тиадиазолил, хиноксалинил, фталазинил, имидазо[1 ,2-а]пиридинил, имидазо[2,1 -Ь]тиазолил, бензофуразанил, индолил, азаиндолил, бензимидазолил, бензотиазенил, хинолинил, имидазолил, пиразолил, тиенопиридил, хиназолинил, нафтиридинил, тиенопиримидинил, пирролопиридинил, имидазопиридил, изохинолинил, бензоазаиндолил, 1 ,2,4-триазинил, тиенопирролил, фуропирролил и др.
«Частично ненасыщенный» означает кольцевую систему, которая включает по меньшей мере одну двойную или тройную связь. Термин «частично ненасыщенный» относится к кольцам, имеющим множество сайтов для насыщения, но не включает арильные и гетероарильные системы, как они определены выше.
Термин «оксо», используемый в настоящем документе, относится к радикалу =0.
«Заместитель» означает химический радикал, который присоединяется к молекулярному остову (скэффолду, фрагменту).
«Сольват» означает молекулярный комплекс соединения по настоящему изобретению, включая его фармацевтически приемлемые соли, с одной или более молекулами растворителя. Такие молекулы растворителя представляют собой молекулы, обычно используемые в фармацевтике, которые известны как безвредные для реципиента, например, воду, этанол, этиленгликоль и подобные. Другие растворители можно использовать как промежуточные сольваты в получении более желательных сольватов, такие как метанол, метил -//г рет -бутиловый эфир, этилацетат, метилацетат, (S)-пропиленгликоль, (R)-пропиленгликоль, 1,4-бутандиол и подобные.
Термин «гидрат» относится к комплексу, в котором молекула растворителя представляет собой воду.
Сольваты и/или гидраты предпочтительно существуют в кристаллической форме.
Термин «связь», «химическая связь» или «одинарная связь» относится к химической связи между двумя атомами или двумя группировками (группами, фрагментами), если два атома, соединенные связью, рассматриваются как часть более крупной субструктуры.
Термин "защитная группа" относится к группам, которые применяются для блокирования реакционной способности функциональных групп, таких как аминогруппы, карбоксильной группы или гидроксигруппы. Примерами, без ограничения, защитных групп являются mpem-бутоксикарбонил (Вое), бензилоксикарбонил (Cbz), 2- (триметилсилил)этокси) метилацеталь (SEM), триалкилсилил, алкил(диарил)силил или алкил.
Термин «эксципиент» используется в данном документе для описания любого ингредиента, отличающегося от соединения(-ий) по данному изобретению.
«Фармацевтическая композиция» обозначает композицию, включающую в себя соединение согласно изобретению и, по крайней мере, один эксципиент. Эксципиент может быть выбран из группы, состоящей из фармацевтически приемлемых и фармакологически совместимых наполнителей, растворителей, разбавителей, носителей, вспомогательных, распределяющих и воспринимающих средств, средств доставки, таких как консерванты, стабилизаторы, наполнители, измельчители, увлажнители, эмульгаторы, суспендирующие агенты, загустители, подсластители, отдушки, ароматизаторы, антибактериальные агенты, фунгициды, лубриканты, регуляторы пролонгированной доставки, выбор и соотношение которых зависит от природы и способа назначения и дозировки. Примерами суспендирующих агентов являются этоксилированный изостеариловый спирт, полиоксиэтилен, сорбитол и сорбитовый эфир, микрокристаллическая целлюлоза, метагидроксид алюминия, бентонит, агар-агар и трагакант, а также смеси этих веществ. Защита от действия микроорганизмов может быть обеспечена с помощью разнообразных антибактериальных и противогрибковых агентов, например, таких как парабены, хлорбутанол, сорбиновая кислота и подобные им соединения. Композиция может включать также изотонические агенты, например, сахара, хлористый натрий и им подобные. Пролонгированное действие композиции может быть обеспечено с помощью агентов, замедляющих абсорбцию активного начала, например, моностеарат алюминия и желатин. Примерами подходящих носителей, растворителей, разбавителей и средств доставки являются вода, этанол, полиспирты, а также их смеси, растительные масла (такие как оливковое масло) и инъекционные органические сложные эфиры (такие как этилолеат). Примерами наполнителей являются лактоза, молочный сахар, цитрат натрия, карбонат кальция, фосфат кальция и им подобные. Примерами измельчителей и распределяющих средств являются крахмал, альгиновая кислота и ее соли, силикаты и им подобные. Примерами лубрикантов являются стеарат магния, лаурилсульфат натрия, тальк, а также полиэтиленгликоль с высоким молекулярным весом. Фармацевтическая композиция для перорального, сублингвального, транс дермального, внутримышечного, внутривенного, подкожного, местного или ректального введения активного начала, одного или в комбинации с другим активным началом, может быть введена животным и людям в стандартной форме введения в виде смеси с традиционными фармацевтическими носителями. Пригодные стандартные формы введения включают пероральные формы, такие как таблетки, желатиновые капсулы, пилюли, порошки, гранулы, жевательные резинки и пероральные растворы или суспензии, сублингвальные и трансбуккальные формы введения, аэрозоли, имплантаты, местные, трансдермальные, подкожные, внутримышечные, внутривенные, интраназальные или внутриглазные формы введения и ректальные формы введения.
«Фармацевтически приемлемая соль» означает относительно нетоксичные соли соединения, заявленного в настоящем изобретении. Соли соединений, предусмотренных настоящим документом, могут быть получены из неорганических или органических кислот и оснований. Примерами полученных таким образом солей являются гидрохлориды, гидробромиды, сульфаты, бисульфаты, фосфаты, нитраты, ацетаты, оксалаты, валериаты, олеаты, пальмитаты, стеараты, лаураты, бораты, бензоаты, лактаты, тозилаты, цитраты, малеаты, фумараты, сукцинаты, тартраты, мезилаты, малонаты, салицилаты, пропионаты, этансульфонаты, бензолсульфонаты, сульфаматы и им подобные; соли натрия, калия, аммония, кальция, магния, железа, цинка, меди, марганца и алюминия, соли первичных, вторичных и третичных аминов, замещенных аминов, в том числе природных замещенных аминов, циклических аминов, таких как изопропиламин, триметиламин, диэтиламин, триэтиламин, трипропиламин, этаноламин, 2-диэтиламиноэтанол, триметамин, дициклогексиламин, лизин, аргинин, гистидин, кофеин, прокаин, гидрабамин, холин, этилендиамин, глюкозамин, метилглюкамин, теобромин, пурины, пиперазин, пиперидин, N-этилпиперидин (Подробное описание свойств таких солей дано в Berge S.M., et al., "Pharmaceutical Salts" J. Pharm. Sci. 1977, 66: 1-19).
«Лекарственное средство (препарат)» - вещество (или смесь веществ в виде фармацевтической композиции) в виде таблеток, капсул, инъекций, мазей и др. готовых форм, предназначенное для восстановления, исправления или изменения физиологических функций у человека и животных, а также для лечения и профилактики болезней, диагностики, анестезии, контрацепции, косметологии и прочего.
«Лечить», «лечение» и «терапия» относятся к методу смягчения или устранения биологического расстройства и/или по меньшей мере одного из сопутствующих ему симптомов. Термин «облегчить» болезнь, заболевание или состояние, означает уменьшение тяжести и/или частоты возникновения симптомов заболевания, расстройства или состояния. Кроме того, содержащиеся в данном документе ссылки на «лечение» включают ссылки на лечебную, паллиативную и профилактическую терапию.
В одном аспекте субъект лечения или пациент является млекопитающим, предпочтительно человеческим субъектом. Вышеупомянутый субъект может быть мужского или женского пола любого возраста.
Термин "нарушение" означает любое состояние, которое можно улучшить в результате лечения по настоящему изобретению. В определение данного термина входят хронические и острые нарушения или заболевания, включающие в себя патологические состояния, которые вызывают предрасположенность млекопитающего к возникновению данного нарушения. Неограничивающие примеры подлежащих лечению заболеваний включают в себя онкологические заболевания, в частности рак молочной железы, трижды негативный рак молочной железы (ТНРМЖ), рак яичника, метастатический рак яичника, рак желудка, метастатический рак желудка, рак эндометрия, слюнной железы, легкого, почки, ободочной кишки, колоректальный рак, меланому, метастатическую меланому, рак щитовидной железы, поджелудочной железы, предстательной железы или мочевого пузыря; гематоонкологические заболевания, лейкозы, острый миелоидный лейкоз и лимфоидные злокачественные новообразования; нейронные, глиальные, астроцитальные, гипоталамусные и другие гранулярные, макрофаговые, эпителиальные, стромальные и бластоцельные нарушения; воспалительные, ангиогенные и иммунологические нарушения.
«Терапевтически эффективным количеством» считается количество вводимого в процессе лечения терапевтического агента, которое избавит в определенной степени от одного или нескольких симптомов заболевания, по поводу которого проводится лечение.
В настоящем описании и в последующей формуле изобретения, если контекстом не предусмотрено иное, слова «иметь», «включать» и «содержать» или их вариации, такие как «имеет», «имеющий», «включает», «включающий», «содержит» или «содержащий», следует понимать, как включение указанного целого или группы целых, но не исключение любого другого целого или группы целых.
Подробное описание изобретения
В одном варианте осуществления, настоящее изобретение относится к соединению формулы I:
Figure imgf000012_0001
где X1 представляет собой CR1, N;
Х2 представляет собой CR2, N;
Хз, Х4, Х5, Х6 каждый независимо представляет собой СН, N;
Ri представляет собой Н, Hal, С16 алкил, С37 циклоалкил;
R2 представляет собой Н, Hal, С16 алкил, -ORio, -NR11R12,
R3 и R4 каждый независимо представляет собой Н; С16 алкил, незамещенный или замещенный одним или несколькими галогенами; С16 алкокси С 16 алкил; С37 циклоалкил, С37 циклоалкил С1-C3 алкил; С610 арил, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal, С16 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С i-Cr, алкокси; 5-10 членный гетероарил с 1 -4 гетероатомами, выбранными из N, О и/или S, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal, С1-C6 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6 алкокси; 5-6 членный гетероциклил с 1-2 гетероатомами, выбранными из N, О и/или S, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal; -ОН; С1-C6 алкокси; С1-CV, алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6 алкокси; или
R3 и R4 вместе с атомом азота, к которому они присоединены, могут представлять собой 4-7-членный гетероциклил с 1-2 гетероатомами, выбранными из N и/или О, который может быть незамещенным или замещенным одним или несколькими заместителями, выбранными из оксо группы; -ОН; С16 алкокси; С3-C6 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6, алкокси;
Y представляет собой -N( R13)-, -О-, -S- или -С(О)-;
Z представляет собой -C(R14)2- или -С(О)-;
R10 представляет собой Н, С1-C6 алкил, С1-C6, ацил;
R11, R12 каждый независимо представляет собой Н, С16 алкил, С37 цикло алкил;
R13 представляет собой Н, С3-C6 алкил, С36 ацил;
R14 каждый независимо представляет собой Н, С1-C6 алкил, С37 циклоалкил; не включая, соединения, где Х Х3 представляют собой N, Х2, Х4, Х5, Х6 представляют собой СН, R3 и R4 вместе с атомом азота, к которому они присоединены, представляют собой R представляет собой Н, С1-C6 алкил.
Figure imgf000013_0001
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы I, где если Х3 представляет собой CR1, Х2 представляет собой CR2, Х3 представляют собой N, то Х4, Х5, Х6 представляет собой СН; если Ci представляет собой CR3, Х2, Х3 представляют собой N, то Х4, Х5, Х6 представляет собой СН;
если Х2 представляет собой CR2, Ci, Х3 представляют собой N, то Х4, Х5, Хб представляет собой СН;
если Ci представляет собой CRb Х2, Х4 представляют собой N, то Х3, Х5, Х6 представляет собой СН;
если Ci представляет собой CR i, Х2 представляет собой CR2, Х3, Х5 представляют собой N, то Х4, Х6 представляет собой СН;
если Ci представляет собой CR i, Х2 представляет собой CR2, Х3, Х4 представляют собой N, то Х5, Х6 представляет собой СН;
если Ci представляет собой CR1, Х2 представляет собой CR2, Х3, Х6 представляют собой N, то Х4, Х5 представляет собой СН.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы I, где Y представляет собой -NH-, -О- или -S-; Z представляет собой -СН2-.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы II:
Figure imgf000014_0001
где Х2 представляет собой CR2, N;
Хз, Х4, Х5, Х6 каждый независимо представляет собой СН, N;
Ri представляет собой Н, Hal, С16 алкил, С37 циклоалкил;
R2 представляет собой Н, Hal, С16 алкил, -ORio, -NR11R12,
R3 и R4 каждый независимо представляет собой Н; С16 алкил, незамещенный или замещенный одним или несколькими галогенами; С16 алкокси С16 алкил; C3-C7 циклоалкил, C3-C7 циклоалкил С13 алкил; С610 арил, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal, С1-C6 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С16 алкокси; 5-10 членный гетероарил с 1 -4 гетероатомами, выбранными из N, О и/или S, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal, С1-C6, алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6 алкокси; 5-6 членный гетероциклил с 1-2 гетероатомами, выбранными из N, О и/или S, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal; -ОН; С1-C6 алкокси; С16 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6 алкокси; или
R3 и R4 вместе с атомом азота, к которому они присоединены, могут представлять собой 4-7-членный гетероциклил с 1-2 гетероатомами, выбранными из N и/или О, который может быть незамещенным или замещенным одним или несколькими заместителями, выбранными из оксо группы; -ОН; С16 алкокси; С1-C6 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6 алкокси;
Y представляет собой -N(R13)-, -О-, -S- или -С(О)-;
Z представляет собой -C(R14)2- или -С(О)-;
R10 представляет собой Н, С1-C6 алкил, С1-C6 ацил;
R11, R12 каждый независимо представляет собой Н, С3-C6 алкил, С37 цикло алкил;
R13 представляет собой Н, С1-C6 алкил, С1-C6 ацил;
R14 каждый независимо представляет собой Н, С1-C6 алкил, С37 циклоалкил.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы II, где Y представляет собой -NH-, -О- или -S-; Z представляет собой -СН2-.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы I, II, где R3 и R4 каждый независимо представляет собой H; С1-C6 алкил, незамещенный или замещенный одним или несколькими галогенами; С16 алкокси С гС(, алкил; С37 циклоалкил, С37 циклоалкил С1-C3 алкил; Cr,-C m арил, представляющий собой фенил, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal, С1- С6 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С16 алкокси; 5-10 членный гетероарил с 1-4 гетероатомами, выбранными из N, О и/или S, представляющий собой пиридин или пиримидин, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal, С1-C6 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С16 алкокси; 5-6 членный гетероциклил с 1 -2 гетероатомами, выбранными из N, О и/или S, представляющий собой 4- морфолинил, 1 -пиперазинил, 1 -пирролидинил, 1 -пиперидинил, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal; -ОН; С16 алкокси; С1-C6, алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С16, алкокси; или
R3 и R4 вместе с атомом азота, к которому они присоединены, могут представлять собой 4-7-членный гетероциклил с 1-2 гетероатомами, выбранными из N и/или О, представляющий собой морфолинил, пиперазинил, пирролидинил, пиперидинил, азетидин, который может быть незамещенным или замещенным одним или несколькими заместителями, выбранными из оксо группы; -ОН; С16 алкокси; С1-C6 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6, алкокси.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы III:
Figure imgf000017_0001
где X2 представляет собой CR2, N;
Хз, X4, X5, X6 каждый независимо представляет собой СН, N;
R1 представляет собой Н, Hal, С1-C6 алкил, С37 циклоалкил;
R2 представляет собой Н, Hal, С16 алкил, -ORio, -NR11R12,
Х7 представляет собой -N(R15), -О-;
Y представляет собой -N(R13)-, -O-, -S- или -С(О)-;
Z представляет собой -C(R14)2- или -С(О)-;
R10 представляет собой Н, С16 алкил, С1-C6 ацил;
R11, R12 каждый независимо представляет собой Н, С1-C6 алкил, С37 цикло алкил;
R15 представляет собой Н, С1-C6 алкил, незамещенный или замещенный одним или несколькими галогенами, С1-C6 алкокси.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы III, где Y представляет собой -NΉ-, -О- или -S-; Z представляет собой -СН2-.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы II, III, где если Х2 представляет собой CR2, Хз представляют собой N, то Х4, Х5, Хб представляет собой СН;
если Х2, Х3 представляют собой N, то Х4, Х5, Х6 представляет собой СН;
если Х2, Х4 представляют собой N, то Хз, Х5, Хб представляет собой СН;
если Х2 представляет собой CR2, Хз, Х5 представляют собой N, то Х4, Х6 представляет собой СН; если X2 представляет собой CR2, Хз, Х4 представляют собой N, то Х5, Х6 представляет собой СН;
если Х2 представляет собой CR2, Х3, Х6 представляют собой N, то Х4, Х5 представляет собой СН.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы 1.1:
Figure imgf000018_0001
где Xi представляет собой CR1, N;
Х2 представляет собой CR2, N;
Х3, Х4, Х5, Хб каждый независимо представляет собой СН, N;
Ri представляет собой Н, Hal, С16 алкил, С37 циклоалкил;
R2 представляет собой Н, Hal, С16 алкил, -ORio, -NR11R12,
Х7 представляет собой -N(R15), -О-;
Y представляет собой -N(R13)-, -О-, -S- или -С(О)-;
Z представляет собой -C(R14)2- или -С(О)-;
R10 представляет собой Н, С16 алкил, С16 ацил;
R11, R12 каждый независимо представляет собой Н, С16 алкил, С37 цикло алкил;
R15 представляет собой Н, С16 алкил, незамещенный или замещенный одним или несколькими галогенами;
не включая, соединения, где Х1, Хз представляют собой N, Х2, Х4, Х5, Х6 представляют собой СН, R3 и R4 вместе с атомом азота, к которому они присоединены, представляют собой
Figure imgf000019_0001
, R представляет собой H, С1-C6 алкил.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы 1.2:
Figure imgf000019_0002
где Х7, Y, Z, R2 имеют вышеуказанные значения;
не включая, соединения, где Х Х3 представляют собой N, Х2, Х4, Х5, Хб представляют собой СН, R3 и R4 вместе с атомом азота, к которому они присоединены, представляют собой
Figure imgf000019_0003
R представляет собой Н, С16 алкил.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы II.1:
Figure imgf000019_0004
где Х7, Y, Z, R|, R2 имеют вышеуказанные значения.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы II.2:
Figure imgf000020_0001
где Х7, Y, Z, R1 имеют вышеуказанные значения.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы П.З:
Figure imgf000020_0002
где X7, Y, Z, R1 имеют вышеуказанные значения.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы II.4:
Figure imgf000020_0003
где Х7, Y, Z, R1, R2 имеют вышеуказанные значения.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы II.5:
Figure imgf000021_0001
где Х7, Y, Z, R 1, R2 имеют вышеуказанные значения.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединению формулы II.6:
Figure imgf000021_0002
где Х7, Y, Z, R1, R2 имеют вышеуказанные значения.
Соединения, описанные в настоящем изобретении, могут быть получены в виде и/или их можно применять в виде фармацевтически приемлемых солей. Типы фармацевтически приемлемых солей включают следующие, но не ограничены ими: соли кислот, образованные при взаимодействии соединения в форме свободного основания с фармацевтически приемлемой неорганической кислотой, такой как соляная, бромистоводородная, серная, азотная, фосфорная, метафосфорная кислоты и т.п.; или с органической кислотой, такой как уксусная, пропионовая, капроновая, циклопентанпропионовая, гликолевая, пировиноградная, молочная, малоновая, янтарная, яблочная, малеиновая, фумаровая, трифторуксусная, винная, лимонная, бензойная, 3-(4-гидроксибензоил)бензойная, коричная, миндальная кислоты, метансульфоки слота, этансульфокислота, 1,2- этандисульфокислота, 2-гидроксиэтандисульфокислота, бензолсульфокислота, толуолсульфокислота, 2-нафталинсульфокислота, 4- метилбицикло[2.2.2]окт-2-ен-1-карбоновая, глюкогептоновая, 4,4'-метилен- бис-3-гидрокси-2-ен-1 -карбоновая, 3-фенилпропионовая, триметилуксусная, третбутилуксусная, лаурилсерная, глюконовая, глутаминовая, гидроксинафтойная, салициловая, стеариновая, муконовая кислоты и т.п.
Соответствующие противоионы фармацевтически приемлемых солей можно исследовать и идентифицировать с использованием различных методов, включая перечисленные, но не ограничиваясь ими: ионнообменную хроматографию, ионную хроматографию, капиллярный электрофорез, индукционное связывание плазмы, атомно-абсорбционную спектроскопию, масс-спектрометрию или любую их комбинацию.
Соли восстанавливают с применением по меньшей мере одной из следующих методик: фильтрация, осаждение с осадителем с последующей фильтрацией, выпариванием растворителя или в случае водных растворов лиофилизацией. Следует понимать, что упоминание фармацевтически приемлемой соли включает формы аддитивной соли растворителем или их кристаллические формы, в частности сольваты или полиморфы. Сольваты содержат стехиометрическое или нестехиометрическое количество растворителя и могут быть образованы в ходе процесса кристаллизации с фармацевтически приемлемыми растворителями, такими как вода, этанол и т.п. Гидраты образуются в случае, если растворителем является вода, а алкоголяты образуются в случае, когда растворителем является спирт. Сольваты соединений, описанных в настоящем патенте, могут быть легко получены или образованы в способах, описанных в настоящем изобретении. Кроме того, соединения, предусмотренные настоящим изобретением, могут существовать в несольватированной, а также в сольватированной формах. В целом, сольватированные формы рассматриваются как эквивалент несольватированных форм при описании соединений и способов, предусмотренных настоящим изобретением. Соединения, описанные в настоящем изобретении, могут быть представлены в различных формах, включая перечисленные, но не ограничиваясь ими: бесструктурные формы, молотые формы и наночастицы. Кроме того, описанные в настоящем изобретении соединения включают кристаллические формы, также известные как полиморфы. Полиморфы включают кристаллы с различной структурой одинакового элементного состава соединения. Полиморфы, как правило, имеют различный характер рентгеновской дифракции, различные инфракрасные спектры, температуру плавления, различную плотность, твердость, кристаллическую форму, оптические и электрические свойства, стабильность и растворимость. Различные факторы, такие как растворитель для рекристаллизации, степень кристаллизации и температура хранения, могут обусловливать доминирование одной кристаллической формы.
Скрининг и определение характеристик фармацевтически приемлемых солей, полиморфов и/или сольватов можно осуществлять рядом методов, включая перечисленные, но не ограничиваясь ими: термический анализ, рентгено-дифракционный метод, спектроскопию, сорбцию пара и микроскопию. Термические методы анализа направлены на исследование термохимического разложения или термофизических процессов, включая, но не ограничиваясь, полиморфные переходы, и такие методы применяют для анализа связи между полиморфными формами, определения потери в массе, для нахождения температуры стеклования или исследования совместимости с наполнителем. Такие способы включают, без ограничения, дифференциальную сканирующую калориметрию (ДСК), модулирующую дифференциальную сканирующую калориметрию (МДСК), термогравиметрический анализ (ТГА), термогравиметрический и инфракрасный анализ (ТГ/ИК). Кристаллографические методы включают перечисленные, но не ограничиваются ими: монокристаллические и порошковые дифрактометры и синхротронные источники. Различные используемые спектроскопические методы включают перечисленные, но не ограничены ими: определение спектра Рамана (комбинационного рассеяния), FTIR, UVIS и ЯМР (жидкого и твердого состояния). Различные методы микроскопии включают перечисленные, но не ограничены ими: микроскопию в поляризованном свете, сканирующую электронную микроскопию (СЭМ) с рентгеновским анализом методом энергетической дисперсии (EDX), сканирующую электронную микроскопию в режиме естественной среды с EDX (в атмосфере газа или водяного пара), ИК-микроскопию и микроскопию комбинационного рассеяния.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединениям, выбранным из группы, включающей:
Figure imgf000024_0001
Figure imgf000025_0001
Figure imgf000026_0001
Figure imgf000027_0001
Настоящее изобретение также относится к способу ингибирования биологической активности циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19 у субъекта, заключающемуся в контактировании циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19 с соединением по настоящему изобретению.
В одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей терапевтически эффективное количество соединения, описанного в настоящем документе, или его фармацевтически приемлемую соль, сольват, и один или несколько фармацевтически приемлемых эксципиентов. В еще одном варианте изобретения фармацевтическая композиция по данному изобретению предназначена для профилактики или лечения заболевания, или нарушения, опосредованного активацией циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19. В еще одном варианте изобретения фармацевтическая композиция по данному изобретению предназначена для профилактики или лечения заболевания, или нарушения, опосредованного активацией циклинзависимой протеинкиназы CDK8/19, где заболевание, или нарушение, опосредованное активацией циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19, представляет собой онкологическое или гематоонкологическое заболевание. В еще одном варианте осуществления изобретения фармацевтическая композиция по данному изобретению предназначена для профилактики или лечения колоректального рака, меланомы, метастатической меланомы, рака молочной железы, трижды негативного рака молочной железы (ТНРМЖ), рака предстательной железы, метастатического рака яичника, метастатического рака желудка, лейкоза, острого миелоидного лейкоза, рака поджелудочной железы (РПЖЖ).
Фармацевтическая композиция по настоящему изобретению может содержать, например, от приблизительно 10% до приблизительно 100% активных ингредиентов, предпочтительно от приблизительно 20% до приблизительно 60% активных ингредиентов. Подразумевается, что содержание активного ингредиента или ингредиентов в индивидуальной дозе каждой лекарственной формы не обязательно составляет эффективное количество, поскольку необходимое эффективное количество может достигаться при введении нескольких стандартных лекарственных форм.
Типичную композицию получают посредством смешивания соединения по настоящему изобретению и одного или нескольких эксципиентов. Примеры эксципиентов включают, но не ограничиваются ими, разбавители, носители, наполнители. Подходящие носители, разбавители, наполнители хорошо известны специалистам в данной области и включают такие вещества, как углеводы, воска, водорастворимые и/или набухающие полимеры, гидрофильные или гидрофобные вещества, желатин, масла, растворители, воду и подобное. Конкретный используемый носитель, разбавитель или наполнитель будет зависеть от средств и цели, для которой применяют соединение по настоящему изобретению. Растворители в общем случае выбирают на основании растворителей, признанных специалистами в данной области техники безопасными для введения млекопитающему. В общем случае безопасные растворители представляют собой водные растворители, такие как вода и другие растворители, которые растворимы в воде или смешиваются с водой. Подходящие водные растворители включают воду, как основной компонент, и этанол, пропиленгликоль, полиэтиленгликоли (например, PEG400, PEG300) и т.д., и их смеси. Композиции также могут включать один или более буферов, стабилизирующих агентов, поверхностно - активных веществ, увлажняющих агентов, смазывающих агентов, эмульгаторов, суспендирующих агентов, консервантов, антиокислителей, матирующих агентов, скользящих веществ, технологических добавок, красителей, подсластителей, отдушек, ароматизаторов и других известных добавок для получения хорошего внешнего вида лекарственного средства (т.е. соединения по настоящему изобретению или его фармацевтической композиции) или чтобы способствовать изготовлению фармацевтического продукта (т.е. лекарственного средства).
Фармацевтические композиции также могут включать соли, сольваты и гидраты соединений по настоящему изобретению, или стабилизированную форму соединения (например, комплекс с производным циклодекстрина или другим известным агентом комплексообразования).
Фармацевтические композиции по настоящему изобретению, как правило, пригодны для перорального введения. Пероральный приём лекарственных средств . приём лекарства через рот (лат. per os, oris), путём проглатывания лекарства. Соединения по настоящему изобретению могут также вводиться буккально, лингвально или сублингвально, так что соединение поступает в кровоток непосредственно из полости рта.
Лекарственные формы, пригодные для перорального, буккального, лингвального или сублингвального введения, включают твердые, полутвердые и жидкие системы, такие как таблетки; гранулы; мягкие или твердые капсулы, содержащие мульти- или наночастицы, жидкости или порошки; пастилки (включая заполненные жидкостью); жевательные формы; гели; быстро растворимые лекарственные формы; пленки; суппозитории; спреи; и щечные/мукоадгезивные пластыри.
Жидкие лекарственные формы включают суспензии, растворы, сиропы и эликсиры. Такие лекарственные формы могут быть использованы как наполнители в мягких или жестких капсулах (например, из желатина или гидроксипропилметилцеллюлозы) и обычно содержат носитель, например, воду, этанол, полиэтиленгликоль, пропиленгликоль, метилцеллюлозу или подходящее масло и один или более эмульгаторов и/или суспендирующих агентов. Жидкие лекарственные формы могут быть также изготовлены путем восстановления твердого вещества, например, из саше.
Соединения по настоящему изобретению могут также вводиться парентерально. Используемый в данном документе термин «парентеральное введение» фармацевтической композиции включает любой способ введения, для которого характерно физическое нарушение целостности ткани субъекта и введение фармацевтической композиции через нарушение в ткани, что обычно приводит к прямому попаданию в кровоток, в мышцу или во внутренний орган. Таким образом, парентеральное введение включает, помимо прочего, введение фармацевтической композиции путем инъекции композиции, посредством введения композиции через хирургический разрез, путем нанесения композиции с помощью проникающей в ткани нехирургической раны и т.п. В частности, предполагается, что парентеральное введение включает, помимо прочего, подкожную, внутрибрюшинную, внутримышечную, внутривенную, внутриартериальную, интратекальную, внутрижелудочковую, интрауретральную, внутричерепную, внутрисуставную инъекцию или инфузии; и почечные диализные инфузионные методики. Внутриопухолевая доставка, например, внутриопухолевая инъекция, также может оказаться полезной. Также предусмотрена региональная перфузия.
Лекарственные формы фармацевтических композиций, подходящие для парентерального введения, обычно содержат активный ингредиент в сочетании с фармацевтически приемлемым носителем, например, стерильной водой или стерильным изотоническим раствором. Такие лекарственные формы могут быть изготовлены, упакованы в форме, подходящей для болюсного введения или для непрерывного введения. Инъекционные лекарственные формы могут быть изготовлены, упакованы в стандартной лекарственной форме, например, в ампулах, или в многодозовых контейнерах, содержащих консервант. Лекарственные формы для парентерального введения включают, помимо прочего, суспензии, растворы, эмульсии в масляных или водных основах, пасты и тому подобное.
Лекарственные формы могут быть выполнены для немедленного и/или модифицированного высвобождения. Лекарственные формы с модифицированным высвобождением включают отсроченное, замедленное, пульсирующее, контролируемое, нацеленное и программируемое высвобождение.
В одном варианте настоящее изобретение относится к способу лечения заболевания или нарушения, опосредованного активацией циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19, который включает в себя введение в терапевтически эффективном количестве соединения по настоящему изобретению или его фармацевтически приемлемой соли, или фармацевтической композиции по данному изобретению субъекту, нуждающемуся в таком лечении.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к способу лечения заболевания или нарушения, опосредованного активацией циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19, представляющего собой онкологическое или гематоонкологическое заболевание, который включает в себя введение соединения, описанного в настоящем документе, или его фармацевтически приемлемой соли, или фармацевтической композиции по данному изобретению субъекту, нуждающемуся в таком лечении, в терапевтически эффективном количестве.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к способу лечения, описанному выше, где онкологическое или гематоонкологическое заболевание выбирают из группы, включающей колоректальный рак, меланому, метастатическую меланому, рак молочной железы, трижды негативный рак молочной железы (ТНРМЖ), рак предстательной железы, метастатический рак яичника, метастатический рак желудка, лейкоз, острый миелоидный лейкоз, рак поджелудочной железы (РПЖЖ). Подразумевается, что соединения по данному изобретению могут использоваться в способах лечения, как описано выше, могут использоваться в лечении, как описано выше, и/или могут использоваться в производстве медикаментов для лечения, как описано выше.
Соединения, являющиеся ингибиторами CDK8/19, могут использоваться в способах лечения, описанных выше, в виде монотерапии или в сочетании с хирургией, или лучевой терапией, или лекарственной терапией.
Используемые в данном документе термины «совместное назначение», «совместно назначенный», «в комбинации с» или «в сочетании с», относящиеся к данным соединениям с одним или более другими терапевтическими агентами, как предполагается, означают, ссылаются или включают:
• одновременное введение такой комбинации соединения по данному изобретению и терапевтического агента пациенту, который нуждается в лечении, когда такие компоненты сформулированы вместе в одной лекарственной форме, из которой указанные компоненты высвобождаются практически одновременно,
• одновременное введение такой комбинации соединения по данному изобретению и терапевтического агента пациенту, который нуждается в лечении, когда такие компоненты сформулированы отдельно в разных лекарственных формах, введение которых происходит практически в одно и то же время указанному пациенту, после чего указанные компоненты высвобождаются практически одновременно,
• последовательное введение такой комбинации соединения по данному изобретению и терапевтического агента пациенту, который нуждается в лечении, когда такие компоненты сформулированы отдельно друг от друга в отдельных лекарственных формах, которые принимаются последовательно по времени указанным пациентом со значимым временным интервалом между каждым введением, после чего указанные компоненты высвобождаются в разное время; а также • последовательное введение такой комбинации соединения по данному изобретению и терапевтического агента пациенту, который нуждается в лечении, когда такие компоненты сформулированы вместе в единый лекарственной форме, из которой высвобождение указанных компонентов происходит контролируемым образом, после чего они одновременно, последовательно или совместно высвобождаются в одно и то же время и/или разное время, где каждая часть может быть введена одним или разными путями.
Специалистам в данной области известно, что терапевтически эффективные дозировки могут меняться при применении препаратов в комбинированном лечении. Способы для экспериментального определения терапевтически эффективных дозировок препаратов и других агентов для применения в режимах комбинированного лечения описаны в литературе. Например, применение равномерного дозирования, т.е. введение более частых и меныних доз для минимизации токсичных побочных эффектов, описано в литературе. Комбинированное лечение, кроме того, включает периодическое лечение, которое начинается и останавливается в различное время в соответствии с планом лечения пациента. В комбинированной терапии, описанной в настоящем патенте, дозировки совместно вводимых соединений, несомненно, меняются в зависимости от типа применяемого вспомогательного лекарственного средства, специфики применяемого лекарственного средства, болезни или состояния, подвергаемого лечению, и Т.д.
Кроме того, соединения, описанные в настоящем изобретении, также можно применять в комбинации с процедурами, которые могут обеспечить аддитивную или синергичную пользу для пациента. Только в качестве примера ожидается, что пациенты получат терапевтическую и/или профилактическую пользу в способах, описанных в настоящем патенте, при которых фармацевтическую композицию соединения, описанного в настоящем изобретении, и/или комбинации с другими способами терапии объединяют с генетическим исследованием для определения того, является ли объект носителем мутантного гена, для которого известно, что он коррелирует с определенными болезнями или состояниями.
Вышеуказанная лекарственная терапия может включать введение одного или более противораковых агентов. Примеры противораковых агентов включают, без ограничения, любой из следующих агентов: алкилирующие агенты, алкилированные сульфонаты, нитрозомочевины или триазены; антиметаболиты; гормональные средства или антагонисты гормонов; соединения платины; противоопухолевые антибиотики; ингибиторы топоизомеразы .
Примеры антиметаболитов включают, без ограничения, аналоги фолиевой кислоты (например, метотрексат, триметрексат, пеметрексед, пралатрексат, ралтитрексед, кальция левофолинат) или аналоги пиримидина (например, цитарабин, тегафур, фторурацил, капецитабин, флоксоуридин, азацитидин, эноцитабин, кармофур, гемцитабин, сапацитабин, элацитарабин, доксифлуридин), или аналоги пурина (например, меркаптопурин, тиогуанин, пентостатин, флударабин, кладрибин, неларабин, азатиоприн, клофарабин), или аспарагиназу.
Примеры алкилирующих агентов включают, без ограничения, мехлороэтамин, циклофосфамид, хлорамбуцил, менфалан, бендамустин, гексаметилимеламине, тиотепа, бусулфан, кармустин, ломустин, ларомустин, семустин, стрептозоцин, дакарбазин, ифосфамид, импросульфан, митобронитол, митолактол, нимустин, ранимустин, темозоломид, треосульфан, карбохион, апазихион, фотемустин, алтретамин, глюфосфамид, пипоброман, трофосфамид, урамустин, эвофосфамид, VAL-083.
Примеры гормональных средств и антагонистов гормонов включают, без ограничения, преднизон, преднизолон, гидроксипрогестерона капроат, мегестрола ацетат, медроксипрогестерона ацетат, диэтилстильбестрол, эстрадиол, тамоксифен, пропионат тестостерона, флуоксиместерон, флутамид, лейпролид, абареликс, абиратерон, бикалутамид, бусерелин, калустерон, хлоротрианизен, дегареликс, дексаметазон, флуокортолон, фулвестрант, гозерелин, хистрелин, лейпрорелин, митотан, нафарелин, нандролон, нилутамид, октреотид, ралоксифен, тиреотропин-альфа, торемифен, трипторелин, диэтилстильбэстрол, аколбифен, даназол, деслорелин, эпитиостанол, ортеронел, энзалутамид, аминоглутетимид, анастрозол, эксеместан, фадрозол, летрозол, тестолактон, форместан.
Примеры соединений платины включают, без ограничения, цисплатин, карбоплатин, оксалиплатин, эптаплатин, мириплатин гидрат, лобаплатин, недаплатин, пикоплатин, сатраплатин.
Примеры противоопухолевых антибиотиков включают, без ограничения, доксорубицин, даунорубицин, идарубицин, карубицин, валрубицин, зорубицин, акларубицин, пирарубицин, неморубицин, амрубицин, эпирубицин, блеомицин, дактиномицин, пликамицин, пепломицин, митомицин С, зиностатин, стрептозоцин.
Примеры ингибиторов топоизомеразы включают, без ограничения, иринотекан, топотекан, белотекан, тенипозид, этопозид, ворелоксин, амонафид.
Примеры противораковых агентов включают, без ограничения, любой из следующих агентов: препараты, действующие на микротрубочки, такие как таксаны (например, паклитаксел, доцетаксел, кабазитаксел, тезетаксел), алкалоиды барвинка (например, винорелбин, винбластин, винкристин, виндезин, винфлунин); ингибиторы сигналинга митогенактивируемой протеинкиназы (например, U0126, PD98059, PD184352, PD0325901, ARRY- 142886, SB239063, SP600125, BAY 43-9006, вортманин или LY294002); ингибиторы mTOR (например, сиролимус, темсиролимус, эверолимус, ридафоролимус); антитела (например, ритуксимаб, трастузумаб, алемтузумаб, бесилесомаб, цетуксимаб, деносумаб, ипилимумаб, бевацизумаб, пертузумаб, ниволумаб, офатумумаб, панитумумаб, тозитумомаб, катумаксомаб, элотузумаб, эпратузумаб, фарлетузумаб, могамулизумаб, нецитумумаб, нимотузумаб, обинутузумаб, окаратузумаб, ореговомаб, рамуцирумаб, рилотумумаб, силтуксимаб, тоцилизумаб, залутумумаб, занолимумаб, матузумаб, далотузумаб, онартузумаб, ракотумомаб, табалумаб, abituzumab); ингибиторы киназ (фосматаниб, энтосплетениб, эрлотиниб, иматиниб, лапатиниб, нилотиниб, пазопаниб, вемурафениб, гефитиниб, кризотиниб, дазатиниб, регорафениб, руксолитиниб, сорафениб, сунитиниб, вандетаниб, бозутиниб, акситиниб, афатиниб, алисертиб, дабрафениб, дакомитиниб, динациклиб, довитиниб, нинтеданиб, ленватиниб, линифаниб, линситиниб, маситиниб, мотесаниб, нератиниб, орантиниб, понатиниб, радотиниб, типифарниб, тивантиниб, тивозаниб, траметиниб, апатиниб, ибрутиниб, акалабрутиниб, кобиметиниб, федратиниб, бриваниб аланинат, цедираниб, кабозантиниб, икотиниб, ципатиниб, ригосертиб, пимасертиб, бупарлисиб, иделалисиб, мидостаурин, перифозин, tesevatinib); фотосенсибилизаторы (например, талапорфин, темопорфин, порфимер натрия); цитокины (например, алдеслейкин, интерферон альфа, интерферон альфа-2 а, интерферон альфа-2Ь, целмолейкин, тасонермин, рекомбинантный интерлейкин-2, опрелвекин, рекомбинантный интерферон бета-1 а); вакцины (например, пицибанил, сипулеуцел-Т, витеспен, эмепепимут-S, онкоВАКС, риндопепимут, троВАКС, MGN-1601 , MGN-1703); бисантрен, децитабин, митоксантрон, прокарбазин, трабектедин, амсакрин, бросталлицин, милтефозин, ромидепсин, плитидепсин, эрибулин, иксабепилон, фосбретабулин, денилейкин дифтитокс, ибритумомаб тиуксетан, преднимустин, трастузумаб эмтанзин, эстрамустин, гемтузумаб-озогамицин, афлиберцепт, опортузумаб монатокс, цинтредекин бесудокс, эдотреотид, инотузумаб-озогамицин, наптумомаб эстафенатокс, винтафолид, брентуксимаб ведотин, бортезомиб, иксазомиб, карфилзомиб, леналидомид, талидомид, помалидомид, золедроновая кислота, ибандроновая кислота, памидроновая кислота, алитретиноин, третиноин, перетиноин, бексаротен, тамибаротен, имихимод, лентинан, мифамуртид, ромуртид, пэгаспаргаза, пентостатин, эндостатин, сизофиран, висмодегиб, вориностат, энтиностат, панобиностат, целекоксиб, циленгитид, этанидазол, ганетеспиб, идроноксил, инипариб, лонидамин, ниморазол, прокодазол, тасхинимод, телотристат, белиностат, тимальфазин, тирапазамин, тоседостат, трабедерсен, убенимекс, валсподар, гендицин, реолизин, ретаспимицин, требананиб, вирулизин.
В одном варианте настоящее изобретение относится к применению соединения, описанного в настоящем документе, или его фармацевтически приемлемой соли, или фармацевтической композиции по данному изобретению для лечения заболевания или нарушения, опосредованного активацией циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19, у субъекта, нуждающегося в таком лечении.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к применению соединения, описанного в настоящем документе, или его фармацевтически приемлемой соли, или фармацевтической композиции по данному изобретению у субъекта, нуждающегося в таком лечении, для лечения заболевания или нарушения, опосредованного активацией циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19, представляющего собой онкологическое или гематоонкологическое заболевание.
В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к применению соединения, описанному выше, или его фармацевтически приемлемой соли, или фармацевтической композиции по данному изобретению для лечения онкологического или гематоонкологического заболевания, которое выбирают из группы, включающей колоректальный рак, меланому, метастатическую меланому, рак молочной железы, трижды негативный рак молочной железы (ТНРМЖ), рак предстательной железы, метастатический рак яичника, метастатический рак желудка, лейкоз, острый миелоидный лейкоз, рак поджелудочной железы (РПЖЖ), у субъекта, нуждающегося в таком лечении. В любом из указанных выше способов лечения, субъект может быть человеком.
Соединения по настоящему изобретению будут вводиться в количестве, эффективном для лечения состояния, о котором идет речь, т.е. в дозах и в течение периодов времени, необходимых для достижения желаемого результата. Терапевтически эффективное количество может изменяться в зависимости от таких факторов, как конкретное состояние, по поводу которого проводится лечение, возраста, пола и веса пациента, а также является ли введение данных соединений самостоятельным лечением или оно проводится в комбинации с одним или более дополнительных методов лечения.
Схемы приема лекарственных средств можно регулировать, чтобы обеспечить оптимальный желаемый ответ. Например, может быть введена одна доза, несколько разделенных доз могут быть введены в течение некоторого времени, или доза может быть пропорционально уменьшена или увеличена в зависимости от остроты терапевтической ситуации. Особенно полезным является изготовление пероральных композиций в стандартной лекарственной форме для простоты введения и однородности дозирования. Стандартная лекарственная форма при использовании в данном документе, относится к физически дискретным единицам, пригодным в качестве единичных доз для пациентов/субъектов, подлежащих лечению; каждая единица содержит заданное количество активного соединения, рассчитанное для получения желаемого терапевтического эффекта в сочетании с требуемым фармацевтическим носителем.
Кроме того, необходимо понимать, что для любого конкретного пациента, конкретные схемы введения должны быть скорректированы через некоторое время согласно индивидуальной потребности и на усмотрение медицинского работника, который осуществляет введение или контролирует введение композиций, и что диапазоны концентрации, приведенные в данном описании, приведены только в качестве примера и не предназначены для ограничения объема или практики заявленных композиций. Кроме того, режим дозирования с композициями по данному изобретению может быть основан на различных факторах, включая тип заболевания, возраст, вес, пол, состояния здоровья пациента, тяжесть состояния, путь введения и конкретное используемое соединение по настоящему изобретению. Таким образом, режим дозирования может широко варьироваться, но может определяться регулярно с помощью стандартных методов. Например, дозы могут быть скорректированы на основе фармакокинетических и фармакодинамических параметров, которые могут включать клинические эффекты, такие как токсические эффекты или лабораторные значения. Таким образом, настоящее изобретение охватывает индивидуальное повышение дозы, которое определяется квалифицированным специалистом. Определение необходимой дозы и режимы хорошо известны в соответствующей области техники и будут понятны специалисту в данной области после ознакомления с идеями, раскрытыми в данном документе.
Как правило, дозы, применяемые для лечения взрослого человека, обычно находятся в диапазоне 0,02-5000 мг в день или приблизительно от 1- 1500 мг в день.
При улучшении состояния пациента вводится поддерживающая доза, если это необходимо. Впоследствии, дозировка или частота введения, или то и другое могут быть уменьшены, в зависимости от симптомов, до уровня, при котором поддерживается облегченное состояние болезни, нарушения или состояния. Пациентам может, однако, потребоваться периодическое лечение в течение долгого времени при любом рецидиве симптомов.
Вышеизложенный спектр является только предположительным, поскольку количество переменных в отношении индивидуального режима лечения велико, и значительные отклонения от этих рекомендованных значений являются весьма обычными. Эти дозировки могут быть изменены в зависимости от множества переменных, не ограниченных активностью применяемого соединения, болезни или состояния, подвергаемого лечению, способа введения, потребности индивидуального субъекта, тяжести болезни или состояния, подвергаемого лечению, и мнения лечащего врача.
Все публикации, патенты и патентные заявки, указанные в этой спецификации включены в данный документ путем отсылки. Хотя вышеупомянутое изобретение было довольно подробно описано, специалистам в данной области на основе идей, раскрытых в данном изобретении, будет вполне понятно, что могут быть внесены определенные изменения и модификации без отклонения от сущности и объема прилагаемых вариантов осуществления изобретения.
Для наилучшего понимания изобретения приводятся следующие примеры. Эти примеры приведены только в иллюстративных целях и не должны толковаться как ограничивающие сферу применения изобретения в любой форме.
Соединения и процессы по настоящему изобретению будут лучше поняты в совокупности со следующими схемами синтеза, которые демонстрируют способы, с помощью которых могут быть получены соединения по настоящему изобретению. Исходные продукты могут быть получены из коммерческих источников или получены с помощью общепринятых способов из уровня техники, известных среднему специалисту. Среднему специалисту будет также очевидно, что стадии выборочного введения защиты и снятия защиты, так же как порядок проведения указанных стадий, могут быть осуществлены в различной очередности, в зависимости от природы заместителей, для успешного завершения синтеза, представленного ниже.
Сокращения, используемые в настоящем описании, включая приведенные в иллюстративных схемах и последующих примерах хорошо известны среднему специалисту. Некоторые из сокращений используют как следующие:
NMP А-метил пиррол идоп
ДМФА AAV-ди метил формам ид
ДМСО - диметилсульфоксид
ТГФ - тетрагидрофуран
ДМАА- АДУ-ди мстил аистам и д
DIPEA - диизопропилэтиламин
DIAD - диизопропилазадикарбоксилат Pd(PPh3)4 - тетракис(трифенилфосфин)палладий(0)
BINAP (±)-2 ,2 '-бuс(дифенилфосфино)- 1,1 '-динафталин
CDI - карбонилдиимидазол
МТБЭ - метил-m - бутиловый эфир
NBS - N-бромсукц-инимид
AIBN - Азобисизобутиронитрил
DMAP - 4-диметиламинопиридин
EDCxHCl - 1 -этил-3 -(3 -дим етиламинопропил)карбодиимид гидрохлорид
Препаративная очистка синтезированных соединений проводилась на хроматографе АКТА Explorer 100 Air с УФ-детектированием в диапазоне 254-
360 нм. Разделение проводилось в градиентном режиме при различных соотношениях элюентов А и Б.
Figure imgf000041_0001
Примеры
Пример 1. Получение промежуточных соединений 7.2, 12.2, 13.2, 17.2.
Figure imgf000042_0001
Стадия 1. К суспензии 6-метилнафталин-2-карбоновой кислоты 1.12 (10.0 г, 53.7 ммоль) в 85 мл метанола добавили по каплям SOCh (1.64 г, 13.8 ммоль). После выдержки при кипении в течение 1.5 ч добавили по каплям SOCh (660 мг, 5.5 ммоль). После перемешивания при кипении в течение 1 ч растворитель отогнали в вакууме. Продукт 1.11 получили в виде светло- желтого порошка и использовали в следующей стадии без дополнительной очистки. Выход 10.3 г (98%).
Стадия 2. К суспензии соединения 1.11 (10.0 г, 49.9 ммоль) в 43 мл четырёххлористого углерода добавили NBS (4.58 г, 25.7 ммоль) и AIBN (370 мг, 2.3 ммоль). После выдержки при температуре 78 °С в течение 1.5 часа реакционную смесь охладили до 60 °С и добавили еще NBS (4.58 г, 25.7 ммоль) и AIBN (370 мг, 2.3 ммоль). После выдержки в течение 1.5 ч при температуре 63.5 °С реакционную смесь охладили до 35 °С и прилили к ней 65 мл гексана. Смесь перемешивали 2 ч при комнатной температуре, выпавший осадок отфильтровали, промыли гексаном, смесью вода-этанол (7:3) и высушили в вакууме до постоянной массы. Продукт 1.10 получили в виде жёлтого порошка и использовали в следующей стадии без дополнительной очистки. Выход 7.4 г (53%). Стадия 3. К раствору соединения 1.10 (7.4 г, 26.5 ммоль) в 70 мл метанола при кипении добавили KCN (2.07 г, 31.8 ммоль). После выдержки в течение 1.25 ч растворитель отогнали. Остаток экстрагировали дихлорметаном, растворитель отогнали в вакууме. Продукт 1.9 выделили в виде порошка светло-коричневого цвета после перекристаллизации из этанола. Выход 4.78 г (80%).
Стадия 4. К раствору LiOHxH20 (306 мг, 7.20 ммоль) в 30 мл смеси вода-ТГФ добавили соединение 1.9 (1.50 г, 6.60 ммоль). Реакционную массу перемешивали 3 ч, растворитель отогнали. К смеси добавили 5 мл МТБЭ. Слои разделили, водный слой подкислили до pH 2-3 добавлением 0.75 мл концентрированной НС1. Осадок отфильтровали, промыли водой, высушили на воздухе, растворили в 14 мл сухого дихлорметана в атмосфере азота, добавили SOCl2 (1.40 мл, 19.3 ммоль) и 50 мкл ДМФА. Реакционную массу перемешивали при кипении в течение 3 ч. После чего растворитель отогнали досуха, добавили 5 мл толуола и снова сконцентрировали в вакууме. Получили продукт 7.3 в виде твердой коричневой массы. Выход 1.36 г (90%).
Стадия 5. К раствору 1-изопропилпиперазина (390 мг, 3.00 ммоль) и DIPEA (510 мг, 5.00 ммоль) в 20 мл дихлорметана прибавили по каплям при перемешивании и охлаждении в ледяной бане в атмосфере азота раствор соединения 7.3 (580 мг, 2.50 ммоль) в 10 мл дихлорметана. Перемешивание продолжали при 20 °С в течение 3 ч, затем реакционную массу промыли водой, органический слой перемешивали с Na2S04 и активированным углем в течение 15 мин, профильтровали через слой целита, растворитель отогнали. Получили продукт 7.2 в виде оранжевой вязкой жидкости. Выход 800 мг (99%).
Аналогично были получены соединения 12.2, 13.2, 17.2 из соответствующих исходных реагентов, приведенные в таблице 1. Таблица 1.
Figure imgf000044_0001
1-(2,2,2-Трифторэтил)пиперазин дигидрохлорид может быть получен по методике, описанной в Journal of Medicinal Chemistry 2007 , 50(15), 3528.
Пример 2. Способ получения соединения 1.
Figure imgf000045_0001
Стадия 1. К раствору LiOH (559 мг, 23.3 ммоль) в 64 мл воды и 52 мл ТГФ присыпали в течение 1.5 ч соединение 1.9 (4.78 г, 21.2 ммоль). После перемешивания в течение 4 ч при температуре 30 °С отогнали ТГФ. Водный раствор промыли МТБЭ и подкислили 1М НС1 до pH 2. Выпавший осадок продукта 1.8 отфильтровали, промыли водой и сушили в вакууме до постоянной массы. Выход 4.39 г (98%).
Стадия 2. К суспензии соединения 1.8 (4.39 г, 20.8 ммоль) в 44 мл сухого дихлорметана добавили SOCl2 (7.42 г, 62.4 ммоль) и ДМФА (15 мг, 0.208 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при кипении 4 ч, растворитель отогнали, остаток растворили в 45 мл сухого дихлорметана. Полученный раствор добавили по каплям к раствору триэтиламина (2.35 г, 22.9 ммоль) и N- метилпиперазина (2.19 г, 21,84 ммоль) в 45 мл сухого дихлорметана при температуре 5 °С. После выдержки 30 мин полученную смесь нагрели до комнатной температуры, промыли водой, высушили над Na2S04, растворитель отогнали. Продукт 1.7 выделили в виде коричневой маслообразной жидкости. Выход 5.80 г (95%).
Стадия 3. К раствору соединения 1.7 (5.80 г, 19.8 ммоль) в 50 метанола прилили 50 мл 25% раствора аммиака и добавили суспензию свежеприготовленного катализатора Ni Ренея (2.90 г, 49.0 ммоль) в 20 мл метанола. После выдержки в течение 4 ч в автоклаве с водородом при давлении 10 атм реакционную смесь отфильтровали через целит, фильтрат отогнали в вакууме. Остаток экстрагировали дихлорметаном, растворитель отогнали в вакууме. Продукт 1.6 выделили в виде коричневой маслообразной жидкости. Выход 5.58 г (95%)
Аналогично были получены соединения 7.1, 12.1, 17.1 из соответствующих исходных реагентов, приведенные в таблице 2.
Таблица 2.
Figure imgf000046_0001
Стадия 4. К суспензии соединения 1.5 (10.0 г, 38 ммоль) в 70 мл ДМАА добавили мочевину (22.8 г, 380 ммоль). После выдержки в течение 3 ч при 160 °С реакционную смесь охладили до комнатной температуры и вылили в 210 мл воды. Выпавший осадок продукта 1.4 отфильтровали, промыли водой и сушили в вакууме до постоянной массы. Выход 8.30 г (76%).
Стадия 5. К суспензии соединения 1.4 (8.30 г, 28.9 ммоль) в 30 мл ДМФА добавили Zn(CN)2 (2.77 г, 23.7 ммоль) и Рс1(РР11з)4 (335 мг, 0.29 ммоль, 0.01 экв). Через реакционную массу пропускали азот в течение 15 мин, затем перемешивали 2 ч при 120 °С. Горячую реакционную смесь отфильтровали через целит и промыли ДМФА. Фильтрат охладили до 5 °С, выпавший осадок продукта 1.3 отфильтровали, промыли ацетонитрилом, водой и высушили в вакууме до постоянной массы. Выход 2.90 г (54%).
Стадия 6. К суспензии соединения 1.3 (2.90 г, 15.6 ммоль) в 5.8 мл толуола добавили DIPEA (5.84 г, 45.2 ммоль). К смеси добавили РОС13 (14.35 г, 93.6 ммоль) при температуре 0 °С. После выдержки в течение 30 мин при 0 °С и 3 часа при 90 °С смесь охладили до комнатной температуры и вылили в лед. Полученную смесь довели раствором NaHC03 до pH 8. Осадок отфильтровали и промыли водой. Продукт 1.2 выделили при помощи колоночной хроматографии на силикагеле с использованием элюента гексан- дихлорметан (1 :9) в виде коричневого порошка. Выход 2.70 г (78%).
Стадия 7. К раствору соединения 1.6 (4.00 г, 13.5 ммоль) в 60 мл ацетонитрила добавили триэтиламин (3.70 г, 36.6 ммоль) и соединение 1.2 (2.70 г, 12.2 ммоль) при 0 °С. После выдержки при комнатной температуре в течение 2 ч выпавший осадок продукта 1.1 отфильтровали, промыли ацетонитрилом, водой и сушили в вакууме до постоянной массы. Выход 4.86 г (82%). Стадия 8. Суспензию пиримидина 1.1 (100 мг, 0.206 ммоль) и метилата натрия (13 мг, 0.247 ммоль) в 10 мл смеси метанол-NMP (2: 1) перемешивали под давлением в закрытом сосуде при 100 °С в течение 15 ч. После удаления летучих компонентов при пониженном давлении продукт 1 выделили в виде белого порошка при помощи препаративной хроматографии (Метод А). Выход 31 мг (31%).
Пример 3. Способ получения соединения 2.
Figure imgf000048_0001
Суспензию пиримидина 2.1 (100 мг, 0.206 ммоль), диметиламина (31 мкл, 0.247 ммоль, 40% раствор в воде) и триэтиламина (30 мкл, 0.216 ммоль) в 3 мл ДМФА перемешивали под давлением в закрытом сосуде при 120 °С в течение 2 ч. После концентрирования реакционной смеси продукт выделили в виде бежевого порошка при помощи препаративной хроматографии (Метод А). Выход 50 мг (52%).
Пример 4. Способ получения соединения 3.
Figure imgf000048_0002
Суспензию пиримидина 3.1 (100 мг, 0.206 ммоль) в 200 мкл 25%-го водного аммиака перемешивали под давлением в закрытом сосуде при 150 °С в течение 8 ч. После концентрирования реакционной смеси продукт выделили в виде белого порошка при помощи препаративной хроматографии (Метод Б). Выход 55 мг (54%). Пример 5. Способ получения соединения 4.
Figure imgf000049_0001
Стадия 1. Соединение 4.2 было получено аналогично соединению 1.3 (пример 2, стадия 5), используя соединение 4.3 (получено по методике, описанной в Bioorganic & Medicinal Chemistry 2006, 14 (20), 6832) вместо соединения 1.4.
Стадия 2. Соединение 4.1 было получено аналогично соединению 1.2 (пример 2, стадия 6), используя соединение 4.2 вместо соединения 1.3.
Стадия 3. К раствору амина 1.6 (212 мг, 0.713 ммоль) и триэтиламина (287 мкл, 2.06 ммоль) в 5 мл ацетонитрила при 10 °С в токе азота добавили соединение 4.1 (130 мг, 0.686 ммоль). Через 10 мин повысили температуру до 60 °С и выдержали при нагревании в течение 8 ч. Суспензию отфильтровали, полученный осадок промыли ацетонитрилом. Продукт 4 в виде жёлтого порошка выделили при помощи колоночной хроматографии на силикагеле, элюент дихлорметан-метанол (95:5). Выход 128 мг (41%). Пример 6. Способ получения соединения 5, 5а, 7, 12, 13, 17.
Figure imgf000050_0001
Стадия 1. Через суспензию 6-йод-4-гидроксихинолина (8.00 г, 29.5 ммоль) в 60 мл ДМФА в течение 10 мин пропускали азот, затем добавили Zn(CN)2 (4.16 г, 35.4 ммоль) и Pd(PPh3)4 (1.71 г, 1.48 ммоль, 0.05 экв.). Смесь перемешивали в атмосфере азота при 100 °С в течение 2 ч. Затем реакционную смесь довели до комнатной температуры и при охлаждении ледяной баней добавили по каплям РВг3 (3 мл, 32.5 ммоль), по окончании добавления выдержали 10 мин при 0 °С, а затем перемешивали в течение 1 ч при комнатной температуре. Смесь нейтрализовали насыщенным раствором Na2C03, продукт экстрагировали дихлорметаном, сушили над Na2S04, раствор сконцентрировали в вакууме. Продукт 5.1 выделили при помощи колоночной хроматографии на силикагеле, элюент гексан-этилацетат-дихлорметан (4: 1 : 1) в виде белого порошка. Выход 4.28 г (62%).
Стадия 2. Через суспензию соединения 1.6 (842 мг, 2.83 ммоль), соединения 5.1 (600 мг, 2.57 ммоль) и Cs2C03 (1.68 г, 5.15 ммоль) в 20 мл диоксана в течение 10 мин пропускали азот. Затем добавили BINAP (321 мг, 0.516 ммоль, 0.20 экв.) и ацетат палладия(П) (58 мг, 0.259 ммоль, 0.10 экв.) и перемешивали в инертной атмосфере в течение 3 ч при 100 °С. После концентрирования реакционной смеси продукт 5 в виде светло-жёлтого порошка выделили при помощи колоночной хроматографии на силикагеле, элюент дихлорметан-метанол (95:5). Выход 640 мг (55%).
Аналогично были получены соединения 7, 12, 13, 17 из соответствующих исходных реагентов, приведенные в таблице 3.
Таблица 3.
Figure imgf000051_0001
Стадия 3. К суспензии соединения 5 (495 мг, 1.10 ммоль) в 50 мл метанола добавили по каплям 4М раствор НС1 в ди этиловом эфире (605 мкл, 2.42 ммоль). Через 1 ч отогнали растворители, добавили 30 мл диэтилового эфире и отфильтровали образовавшийся жёлтый осадок соединения 5а. Выход 422 мг (73%).
Пример 7. Способ получения соединения 6.
Figure imgf000052_0001
Стадия 1. К 5-бром- 1,7-нафтиридин-З-карбоновой кислоте 6.3 (500 мг, 1.97 ммоль) (получена по методике, описанной в WO 2015/014768) прибавили 5 мл SOCl2 и одну каплю ДМФА. Реакционную смесь перемешивали при кипении 5 ч, после чего удалили летучие компоненты при пониженном давлении. К остатку прилили 5 мл МТБЭ, сконцентрировали, остаток сушили в вакууме роторного испарителя. Суспензию полученного порошка в 10 мл дихлорметана добавили к 20 мл 4М раствора NH3 в метаноле при 0 °С. Реакционную массу перемешивали в течение 8 часов, после этого удалили летучие компоненты при пониженном давлении. Продукт реакции 6.2, выделенный в виде коричневого порошка, использовали в следующей стадии без дополнительной очистки. Выход 450 мг (90%).
Стадия 2. К раствору соединения 6.2 (300 мг, 1.19 ммоль) в 6 мл 1,4- диоксана при 0 °С добавили пиридин (190 мкл, 2.38 ммоль) и трифторуксусный ангидрид (180 мкл, 1.42 ммоль). Реакционную массу перемешивали при температуре 40 °С в течение 1.5 ч. Затем реакционную массу вылили в 40 мл воды и экстрагировали этилацетатом. Органический слой отделили, сушили Na2S04 и сконцентрировали в вакууме. Продукт 6.1 в виде белого порошка выделили при помощи колоночной хроматографии на силикагеле, элюент дихлорметан-метанол (97:3). Выход 180 мг (65%).
Стадия 3. Соединение 6 было получено аналогично соединению 5 (пример 6, стадия 2), используя соединение 6.1 вместо соединения 5.1.
Пример 8. Способ получения соединения 8.
Figure imgf000053_0001
Стадия 1. К раствору соединения 1.6 (1.00 г, 3.36 ммоль) в смеси 10 мл воды и 10 мл ледяной уксусной кислоты при температуре 0 °С добавили по каплям раствор нитрита натрия (230 мг, 330 ммоль) в 2.3 мл воды. Раствор выдержали при этой температуре в течение 30 мин, затем при 80 °С 1 ч. Реакционную массу нейтрализовали 25% водным раствором NH3 до pH 9 и экстрагировали смесью этилацетат-метанол (9: 1). Растворитель отогнали, остаток растворили в 10 мл ТГФ. В полученную смесь добавили LiOH (38 мг, 1.6 ммоль) и 10 мл воды. После 3 ч выдержки при комнатной температуре в смесь добавили 20 мл этилацетата. Реакционную смесь экстрагировали 1- бутанолом, растворитель отогнали в вакууме. Продукт 8.2 выделили при помощи колоночной хроматографии на силикагеле с использованием элюента дихлорметан-метанол (94:6) в виде желтого маслообразного остатка. Выход 650 мг (68%).
Стадия 2. К раствору соединения 8.2 (131 мг, 4.90 ммоль) в 10 мл сухого ТГФ добавили трифенилфосфин (131 мг, 0.50 ммоль) и 4-гидрокси-6- йодхинолин 5.2 (134 мг, 0.50 ммоль). Затем при температуре 0 °С добавили по каплям (101 мг, 0.50 ммоль) DIAD. Реакционную массу выдержали при комнатной температуре в течение 16 часов. Растворитель отогнали в вакууме, продукт 8.1 выделили при помощи колоночной хроматографии на силикагеле с использованием элюента дихлорметан-метанол (98:2->92:8) в виде желтого маслообразного остатка. Выход 40 мг (22%).
Стадия 3. Соединение 8 было получено аналогично соединению 1.3 (пример 2, стадия 5), используя соединение 8.1 вместо соединения 1.4. Продукт дополнительно очищали при помощи препаративной хроматографии (Метод В).
Пример 9. Способ получения соединения 9.
Figure imgf000054_0001
Стадия 1. Соединение 9.3 было получено аналогично соединению 1.3 (пример 2, стадия 5), используя соединение 5.2 вместо соединения 1.4.
Стадия 2. К раствору нитрила 9.3 (500 мг, 2.64 ммоль) в ледяной уксусной кислоте при 50 °С добавили TV-хлорсукцинимид (428 мг, 3.17 ммоль). Полученную смесь перемешивали при 65 °С в течение 1 ч, охладили до 2 °С, выпавший осадок отфильтровали, высушили в вакууме. Продукт 9.2 использовали с следующей стадии без дополнительной очистки. Выход 480 мг (89%).
Стадия 3. Соединение 9.2 (430 мг, 1.89 ммоль) в 5 мл РОС1з перемешивали при кипении в течение 1 ч, затем реакционную смесь вылили в лёд, нейтрализовали насыщенным раствором NaHCO3, экстрагировали этилацетатом. Объединённые органические фракции сконцентрировали в вакууме, продукт 9.1 выделили с помощью колоночной хроматографии на силикагеле с использованием элюента этилацетат-гексан (50:50). Выход 270 мг (64%).
Стадия 4. Соединение 9 было получено аналогично соединению 4 (пример 5, стадия 3), используя соединение 9.1 вместо соединения 4.1.
Стадия 5. Соединение 9а было получено аналогично соединению 5а (пример 6, стадия 3), используя соединение 9 вместо соединения 5. Продукт дополнительно очищали при помощи препаративной хроматографии (Метод
Г).
Пример 10. Способ получения соединения 11.
Figure imgf000055_0001
Стадия 1. 2-Амино-4-хлорникотинальдегид 11.3 (313 мг, 2.00 ммоль) (получен по методике, описанной в Journal of Medicinal Chemistry 2010, 53(8), 3330), 2-цианэтенолат натрия (получен по методике, описанной в Journal of the Chemical Society, Perkin Transactions 1: Organic and Bio-Organic Chemistry (1972-1999), 1986, 5, 747) (520 мг, 5.60 ммоль) и 8 мл уксусной кислоты перемешивали при 70 °С в течение 5 ч, реакционную массу охладили, сконцентрировали в вакууме. Продукт 11.2 выделили в виде твердой серой массы при помощи колоночной хроматографии на силикагеле, элюент этилацетат, затем этилацетат-метанол (9: 1). Выход 77 мг (20%).
Стадия 2. К раствору 11.2 (73 мг, 0.43 ммоль) в 1 мл ДМФА добавили РВгз (120 мг, 0.45 ммоль). Реакционную массу перемешивали при комнатной температуре в атмосфере азота 2 ч, сконцентрировали в вакууме. Продукт 11.1 выделили в виде твердой серой массы при помощи колоночной хроматографии на силикагеле, элюент этилацетат-гексан (1 : 1). Выход 90 мг (70%).
Стадия 3. Соединение 11 было получено аналогично соединению 5 (пример 6, стадия 2), используя соединение 11.1 вместо соединения 5.1.
Пример 11. Способ получения соединения 18.
Figure imgf000056_0001
Стадия 1. Смесь кислоты 1.8 (1.00 г, 4.74 ммоль) и N-Boc-пиперазина (971 мг, 5.21 ммоль) растворили в 10 мл ДМФА и при охлаждении ледяной баней присыпали порциями CDI (922 мг, 5.69 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре 18 ч, после чего добавили 100 мл воды. Полученный осадок отфильтровывали, промывали водой. Продукт 18.3 выделили с помощью колоночной хроматографии на силикагеле с использованием элюента дихлорметан-метанол (50: 1) в виде светло-жёлтого порошка. Выход 281 мг (16%).
Стадия 2. Соединение 18.2 было получено аналогично соединению 1.6 (пример 2, стадия 3), используя соединение 18.3 вместо соединения 1.7.
Стадия 3. Соединение 18.1 было получено аналогично соединению 5 (пример 6, стадия 2), используя соединение 18.2 вместо соединения 1.6. Стадия 4. К раствору соединения 18.1 (71 мг, 0.133 ммоль) в 3 мл дихлорметана при охлаждении водяной баней добавили по каплям 1.5 мл 4М раствора НС1 в диоксане. Через 16 часов отфильтровали выпавший осадок и промыли его дихлорметаном. Выход 48 мг (79%). Продукт реакции 18 был дополнительно очищен с помощью препаративной хроматографии (Метод В).
Пример 12. Способ получения соединения 19.
Figure imgf000057_0001
Стадия 1. К суспензии соединения 1.10 (3.00 г, 10.2 ммоль) в 20 мл смеси этанол:вода (1 : 1) при комнатной температуре добавили уротропин (1.58 г, 11.2 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при кипении в течение 9 ч. После чего при комнатной температуре добавили к ней 10 мл концентрированной НС1 и перемешивали 18 часов. К реакционной смеси добавили 30 мл воды, выпавший осадок продукта 19.5 отфильтровали, промыли водой и гексаном, сушили на воздухе. Выход 1.38 г (43%).
Стадия 2. Суспензию метилтрифенилфосфониййодида (5.36 г, 12.6 ммоль) в 50 мл ТГФ охладили до -60 °С, затем к ней постепенно добавили 2.5М раствор бутиллития в гексане (5.60 мл, 12.6 ммоль), реакционную смесь нагрели до комнатной температуры в течение 1 ч, затем при -20 °С добавили соединение 19.5 (2.50 г, 10.5 ммоль) в 35 мл ТГФ, перемешивали при комнатной температуре в течение 1 ч. Реакционную смесь экстрагировали этилацетатом, объединённые органические фракции сконцентрировали в вакууме. Продукт 19.4 выделили с помощью колоночной хроматографии на силикагеле с использованием элюента гексан-этилацетат (97:3). Выход 2.07 г (93%).
Стадия 3. Смесь соединения 19.4 (2.00 г, 8.48 ммоль) и AIBN (280 мг, 1.69 ммоль) в четырёххлористом углероде довели до кипения, добавили 30% раствор НВг в уксусной кислоте (5 мл, 25.4 ммоль), перемешивали при кипении в течение 6 ч. Реакционную смесь экстрагировали дихлорметаном. Объединённые органические фракции сконцентрировали в вакууме. Продукт 19.3 выделили с помощью колоночной хроматографии на силикагеле с использованием элюента гексан-этилацетат (95:5). Выход 2.0 г (80%).
Стадия 4. Смесь соединения 9.3 (400 мг, 2.11 ммоль) и реагента Лавессона (864 мг, 2.11 ммоль) в 7 мл пиридина, перемешивали при комнатной температуре в течение 1 ч. Реакционную смесь экстрагировали этилацетатом и сконцентрировали в вакууме. Продукт 19.6 выделили с помощью колоночной хроматографии на силикагеле с использованием элюента дихлорметана. Выход 350 мг (88%).
Стадия 5. Через смесь соединений 19.3 (672 мг, 2.30 ммоль), 19.6 (385 мг, 2.07 ммоль) и К2С03 (643 мг, 4.60 ммоль) в 10 мл ДМСО пропускали аргон в течение 10 мин, после чего смесь перемешивали 10 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь экстрагировали этилацетатом и сконцентрировали в вакууме. Продукт 19.2 выделили с помощью колоночной хроматографии на силикагеле с использованием элюента гексан-этилацетат (85: 15). Выход 412 мг (50%).
Стадия 6. Соединение 19.1 было получено аналогично соединению 1.8 (пример 2, стадия 1), используя соединение 19.2 вместо соединения 1.9. Стадия 7. К смеси соединения 19.1 (100 мг, 0.26 ммоль), N- метилпиперазина (32 мкл, 0.29 ммоль) и DMAP (3 мг, 0.03 ммоль) в 5 мл дихлорметана добавили EDCxHC1 (65 мг, 0.34 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в атмосфере азота в течение 8 ч. Реакционную смесь экстрагировали дихлорметаном и сконцентрировали в вакууме. Продукт 19 выделили при помощи колоночной хроматографии на силикагеле, элюент дихлорметан-метанол (95:5). Выход 45 мг (37 %). Продукт был дополнительно очищен с помощью препаративной хроматографии (Метод В).
Пример 13. Анализ полученных соединений.
Чистота и строение полученных соединений была подтверждена методом хромато-масс-спектрометрии LC/MS и спектроскопии 1Н ЯМР
(таблица 6).
Данные на оборудование:
Таблица 4. Хромато-масс-спектрометрия
Figure imgf000059_0001
Таблица 5. Спектрометр ЯМР
Figure imgf000060_0001
Таблица 6. Аналитические данные для примеров соединений
Figure imgf000060_0002
Figure imgf000061_0001
Figure imgf000062_0001
Пример 14. Определение химической стабильности.
Химическую стабильность соединений, описанных в настоящем документе, определяли в плазме крови человека.
Определение стабильности в плазме крови человека приводили с использованием пулированной плазмы крови человека, взятой у десяти здоровых доноров. Исходный раствор кандидата (10 мМ в ДМСО) разводили пулированной плазмой крови до концентрации 10 мкМ (испытуемый раствор). Испытуемый раствор выдерживали в твердотельном термостате 4 часа при температуре 37°С. Методом ВЭЖХ с использованием хроматографа Agilentl200 (Agilent, США) определяли площади пиков соединений в испытуемых образцах, соответствующие начальному времени испытания (до выдерживания) и конечному времени испытания (после выдерживании в твердотельном термостате 4 часа при температуре 37°С) с предварительным осаждением белков ацетонитрилом. Хроматографический анализ проводили в градиентном режиме элюирования при скорости потока 1 мл/мин. Определяли количество вещества в образце в % после термостатирования. Оценивали стабильность соединений. Соединения, описанные в настоящем документе, имеют значения химической стабильности более 75%, т.е. являются химически стабильными в кислой среде искусственного желудочного сока и в плазме крови человека (таблица 7).
Таблица 7. Результаты определения химической стабильности соединений.
Figure imgf000063_0001
Пример 15. Определение ферментативной стабильности.
Определение ферментативной стабильности кандидатов позволило оценить устойчивость соединений по настоящему изобретению к действию ферментов биотрансформации.
Скорость ферментативного разложения соединения определяли путем выдерживания в твердотельном термостате при температуре 37°С реакционной смеси, содержащей 0,5 мг/мл пулированных S9 фракций печени человека (XenoTech, США, cat#H0610), Юмкм соединения, 2 мМ b- никотинамидадениндинуклеотида (Carbosynth,UK, cat#NN 10871 ) и 4 мМ хлорида магния в 0,1М натрий-фосфатном буфере рН=7,4. Реакцию останавливали ацетонитрилом из расчета 100 мкл ацетонитрила на 100 мкл реакционной смеси. После остановки реакции образцы центрифугировали 10 минут при 10000 об/мин. Надосадочную жидкость анализировали хроматографическим методом с использованием хроматографа Agilentl200 (Agilent, США). Хроматографический анализ проводили в градиентном режиме элюирования при скорости потока 1 мл/мин. Строили график зависимости логарифма площади пика вещества от времени. Зависимый коэффициент этой прямой соответствовал константе элиминирования к, на основе которой рассчитывали период полураспада препарата tm и скорость разложения CLint:
Figure imgf000064_0001
Соединения по настоящему изобретению показали достаточную устойчивость к действию ферментов биотрансформации и имели скорость ферментативного разложения Сlint менее 13 мкл/мин/мг. Результаты приведены в таблице 8.
Таблица 8. Результаты определения ферментативной стабильности соединений
Figure imgf000064_0002
Пример 16. Определение проницаемости через монослой клеток Сасо-
2.
Определение проницаемости через монослой клеток Сасо-2 позволяет оценить способность веществ проникать через биологические мембраны как посредством активного, так и пассивного транспорта.
Клетки кишечного эпителия Сасо-2 культивировали во вставках с фильтрами (с порами 0,4 мкм, BD Falcon with High Density) в течение 21 дня, после чего проверяли целостность монослоя с помощью красителя Lucifer Yellow (Sigma- Aldrich, США) по стандартному протоколу. При постановке переноса А->В (перенос «просвет кишечника» - «кровоток»), растворы исследуемых веществ вносили в буфере pH 6.5 (HBSS, 10 мМ HEPES, 15мМ p-p Глюкозы) в концентрации 10 мкМ в верхнюю камеру; нижнюю камеру при этом заполняли буфером с pH 7.4 (HBSS, 10 мМ HEPES, 15мМ р-р Глюкозы, 1% BSA). При постановке переноса В->А (перенос «кровоток»- «просвет кишечника»), верхнюю камеру заполняли буфером pH 6.5, а растворы исследуемых веществ вносили в буфере pH 7.4 в концентрации 10 мкМ в нижнюю камеру. В качестве контроля использовали пропранолол, как вещество высокой проницаемости.
После инкубации в течение 2 ч при 37°С в атмосфере с 5% С02, определяли количества исследуемых веществ в верхних и нижних камерах методом ВЭЖХ с использованием хроматографа Agilentl200 (Agilent, США) с предварительным осаждением белков ацетонитрилом. Хроматографический анализ проводили в градиентном режиме элюирования при скорости потока 1 мл/мин. На хроматограммах определяли площади пиков, соответствующие соединениям. На основе значений площади пиков соединения в калибровочных стандартах, определяли концентрацию соединения в исходном растворе и в образцах из лунок верхней и нижней камер.
Проницаемость через слой клеток Рарр рассчитывали по формуле:
Рарр = (C(t) * V)/ (С(0) * t * Area), где
Рарр - эффективная константа проницаемости, м/с
V - объем раствора (в тесте А->В - 0,8 мл, в тесте В->А - 0,2 мл), мл
Area - площадь поверхности мембраны (0,33см2), см2
С - время выдерживания (7200 с), с
С(0) - концентрация исходного раствора, мкМ
С(t)_ концентрация раствора после 2 часов (в тесте А->В - концентрация в образце из лунки нижней камеры; в тесте В->А - концентрация в образце из лунки верхней камеры), мкМ.
Коэффициент эффлюкса показал способность клеток элиминировать вещество из кровотока. Значение рассчитывали по формуле:
efflux =Рарр В— А/ Р арр А— В , ГДe P app А— B значение проницаемости прямого анализаА— > В ;
Р арр B-А значение проницаемости обратного анализаВ— > А .
Соединения по настоящему изобретению показали высокую скорость прямого транспорта «просвет кишечника» - «кровоток», при этом коэффициент эффлюкса не превышал 2, что указывает на то, что транспортер Pgp не накладывает ограничения на биодоступность вещества. Результаты приведены в Таблице 9.
Таблица 9. Результаты определения проницаемости соединений через монослой клеток Сасо-2.
Figure imgf000066_0001
Пример 17. Антипролиферативная активность в отношении CDK8- чувствительных клеточных линий in vitro.
Антипролиферативную активность ингибиторов CDK8 по настоящему изобретению измеряли в клеточном тесте на перевиваемой культуре клеток MV4-11 ( бифенотипический миеломоноцитарный лейкоз , АТСС® CRL- 9591™)с помощью прижизненного красителя AlamarBlue (Therm oFisher, #DAL1100). Клетки выращивали в среде RPMI-1640 (ПанЭко, #С330п) с добавлением 10% FBS (Gibco, #16140-071), промывали и повторно высевали на питательную среду с 10% FBS (Gibco, #16140-071) в 96-лун очные культуральные планшеты (Coming, #3599) в количестве 10 x 103 клеток в 100 мкл среды на лунку. Исследуемые соединения растворяли в ДМСО и разбавляли средой с 10% FBS (Gibco, #16140-071) до конечной концентрации в пределах от 0 до 100 мкМ. Разбавленные соединения в объеме 50 мкл затем добавляли в каждую лунку (конечная концентрация ДМСО составляла не более 1%) и инкубировали при 37 °С в инкубаторе с 5% С02 в течение 120 ч. По окончании инкубации добавляли в лунки по 15 мкл реагента AlamarBlue (Therm oFisher, #DAL1100), перемешивали содержимое планшетов на орбитальном шейкере (Biosan, Латвия), затем дополнительно инкубировали от 3 до 5 ч при 37 °С в инкубаторе с 5% СO2. Детектировали количество живых клеток на микропланшетном спектрофотометре (Tecan Infinite М200Рr Швейцария), измеряя флуоресцентный сигнал при длине волны возбуждения (lEc) 540 нм и длине волны испускания (lEm 590 нм.
Величину 1С50 определяли с использованием программы Magellan 7.2 (Тесап, Швейцария), аппроксимируя экспериментальные точки по четырехпараметрической модели с оптимизацией по Левенбергу-Маркарту (таблица 10).
Величину СС5о определяли в тесте на цитотоксичность. Исследования проводили на клетках HepG2 ( гепатоцеллюлярная карцинома , АТСС® НВ- 8065™). Клетки рассевали в 96-луночные планшеты (Coming, #3599) в концентрации— 20 c 103 клеток в 100 мкл среды на лунку и инкубировали в течение 72 ч с внесенными соединениями в диапазоне концентраций от 200 до 0.78 мкМ. Жизнеспособность клеток оценивали по методу, описанному выше. Результаты приведены в таблице 10.
Таблица 10. Результаты специфической активности соединений в клеточном антипролиферативном тесте на клеточной линии (MV-4-11) и результаты общей токсичности на клеточной линии HepG2. Данные представлены в виде средних значений активности, полученных в нескольких постановках.
Figure imgf000067_0001
Figure imgf000068_0001
Пример 18. Аффинность соединений к рекомбинантному белку CDK8 в комплексе с Cyclin С in vitro.
Способность соединений, описанных в настоящем патенте, связываться с белком CDK8 определяли с помощью методики LanthaScreen (Therm о Fisher). Детектировался сигнал FRET, пропорциональный количеству связанного с CDK8 флуоресцентно меченного лиганда (Tracer 236), который конкурирует с ингибитором за сайт связывания с АТФ.
Измерения проводили в реакционном объеме 15 мкл с использованием 384-луночного планшета (Coming, #CLS4513). Фермент CDK8/CyclinC (Therm oFisher, #PR7261B) смешивали с антителами Anti-His-tag-Biotin (Therm oFisher, #PV6090), Streptavidin-Eu (Therm oFisher, #PV6025) и добавляли полученную смесь в лунки планшета по 5 мкл. Конечные концентрации веществ составляли: CDK8/CyclinC - 5 nM, Streptavidin-Eu - 3 nM, Anti-His- tag-Biotin - 3 nM. В качестве контрольного ингибитора использовали стауроспорин, в качестве бланка использовали 0.1% раствор диметилсульфоксида (ДМСО) в реакционном буфере, содержащем 250 тМ HEPES (pH 7.5), 50 тМ MgC12, 5 тМ EGTA, и 0.05% Brij-35.
Исследуемые ингибиторы и контроли добавлялись в соответствующие лунки по 5 мкл. Планшет инкубировали при комнатной температуре в течение 20 минут. По истечению инкубации, в лунки добавляли по 5 мкл раствора трейсера (Alexa Fluor-647 (Kinase Tracer 236, ThermoFisher, #PV5592)). Конечная концентрация трейсера составляла 10 нМ. В качестве отрицательного контроля вместо раствора трейсера использовали реакционный буфер. Инкубировали планшет в течение 40 минут при 25 С, затем измеряли TR-FRET сигнал, согласно рекомендациям производителя, на планшетном ридере SPARK20 (Тесап, Швейцария) и пересчитывали на количество связанного с киназой трейсера. Величину 1С5о определяли с использованием программы SparkControl Magellan 1.2 (Тесап, Швейцария), аппроксимируя экспериментальные точки по четырехпараметрической модели с оптимизацией по Левенбергу-Маркарту (Табл. 11).
Таблица 11. Результаты измерения взаимодействия соединений с белком CDK8-Cyclin С в биохимическом HTRF тесте. Данные представлены в виде средних значений 1С5о, полученных в нескольких постановках.
Figure imgf000069_0001

Claims

Формула изобретения
1. Соединение формулы I:
Figure imgf000070_0001
где Ci представляет собой CR1s N;
Х2 представляет собой CR2, N;
Хз, Х4, Х5, Х6 каждый независимо представляет собой СН, N;
Ri представляет собой Н, Hal, С1-C6 алкил, С37 циклоалкил;
R2 представляет собой Н, Hal, С16 алкил, -ORio, -NR11R12,
R3 и R4 каждый независимо представляет собой Н; С16 алкил, незамещенный или замещенный одним или несколькими галогенами; С \-Сс, алкокси С1-CV, алкил; С37 циклоалкил, С37 циклоалкил С33 алкил; Сб10 арил, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal, С1-C6 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6, алкокси; 5-10 членный гетероарил с 1-4 гетероатомами, выбранными из N, О и/или S, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal, С1-C6 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6 алкокси; 5-6 членный гетероциклил с 1-2 гетероатомами, выбранными из N, О и/или S, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal; -ОН; С1-C6 алкокси; С1-C6, алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6 алкокси; или
R3 и R4 вместе с атомом азота, к которому они присоединены, могут представлять собой 4-7-членный гетероциклил с 1-2 гетероатомами, выбранными из N и/или О, который может быть незамещенным или замещенным одним или несколькими заместителями, выбранными из оксо группы; -ОН; С1-C6 алкокси; С1-C6 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6 алкокси;
Y представляет собой -N(R13)-, -О-, -S- или -С(О)-;
Z представляет собой -C(R14)2- или -С(О)-;
R10 представляет собой Н, С1-C6 алкил, С1-C6 ацил;
R11, R12 каждый независимо представляет собой Н, С1-C6 алкил, С37 цикло алкил;
R13 представляет собой Н, С1-C6 алкил, С1-C6 ацил;
R14 каждый независимо представляет собой Н, С16 алкил, С37 циклоалкил; не включая, соединения, где Х Х3 представляют собой N, Х2, Х4, Х5, Х6 представляют собой СН, R3 и R4 вместе с атомом азота, к которому они присоединены, представляют собой
Figure imgf000071_0001
R представляет собой Н, С1-C6 алкил.
2. Соединение по и. 1, где если Х3 представляет собой CRi, Х2 представляет собой CR2, Х3 представляют собой N, то Х4, Х5, Х6 представляет собой СН;
если Ci представляет собой CR1 Х2, Х3 представляют собой N, то Х4, Х5, Х6 представляет собой СН; если Х2 представляет собой CR2, Х|, Х3 представляют собой N, то Х4, Х5, Х6 представляет собой СН;
если Ci представляет собой CRi, Х2, Х4 представляют собой N, то Х3, Х5, Х6 представляет собой СН;
если Ci представляет собой CR15 Х2 представляет собой CR2, Х3, Х5 представляют собой N, то Х4, Х6 представляет собой СН;
если Ci представляет собой CR1, Х2 представляет собой CR2, Х3, Х4 представляют собой N, то Х5, Х6 представляет собой СН;
если Ci представляет собой CR i, Х2 представляет собой CR2, Х3, Хг, представляют собой N, то Х4, Х5 представляет собой СН.
3. Соединение по п. 1, представляющее собой соединение формулы II:
Figure imgf000072_0001
где Х2 представляет собой CR2, N;
Хз, Х4, Х5, Х6 каждый независимо представляет собой СН, N;
R1 представляет собой Н, Hal, С16 алкил, С37 циклоалкил;
R2 представляет собой Н, Hal, С16 алкил, -ORio, -NR11R12,
R3 и R4 каждый независимо представляет собой Н; С16 алкил, незамещенный или замещенный одним или несколькими галогенами; С i-Cr, алкокси С16 алкил; С37 циклоалкил, С37 циклоалкил С1-C3 алкил; С610 арил, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal, С1-Сг, алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С16 алкокси; 5-10 членный гетероарил с 1-4 гетероатомами, выбранными из N, О и/или S, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal, С3-C6 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6 алкокси; 5-6 членный гетероциклил с 1-2 гетероатомами, выбранными из N, О и/или S, незамещенный или замещенный одним или несколькими заместителями, выбранными из Hal; -ОН; С1-C6 алкокси; С1-Сг, алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6 алкокси; или
R3 и R4 вместе с атомом азота, к которому они присоединены, могут представлять собой 4-7-членный гетероциклил с 1-2 гетероатомами, выбранными из N и/или О, который может быть незамещенным или замещенным одним или несколькими заместителями, выбранными из оксо группы; -ОН; С16 алкокси; С1-C6 алкила, незамещенного или замещенного одним или несколькими галогенами, С1-C6 алкокси;
Y представляет собой -N(R13)-, -O-, -S- или -С(О)-;
Z представляет собой -C(R14)2- или -С(О)-;
R10 представляет собой Н, С16 алкил, С1-C6 ацил;
R11, R12 каждый независимо представляет собой Н, С16 алкил, С37 цикло алкил;
R13 представляет собой Н, С16 алкил, С1-C6 ацил;
R14 каждый независимо представляет собой Н, С1-C6 алкил, С37 циклоалкил.
4. Соединение по пп. 1, 3, представляющее собой соединение формулы III:
Figure imgf000073_0001
где X2 представляет собой CR2, N;
Хз, X4, X5, X6 каждый независимо представляет собой СН, N;
Ri представляет собой Н, Hal, С16 алкил, С37 циклоалкил;
R2 представляет собой Н, Hal, С16 алкил, -OR10, -N R11R12,
Х7 представляет собой -N(R15), -О-;
Y представляет собой -N(R13)-, -O-, -S- или -С(О)-;
Z представляет собой -C(R14)2- или -С(О)-;
R10 представляет собой Н, С16 алкил, С16 ацил;
R11, R12 каждый независимо представляет собой Н, С16 алкил, С37 цикло алкил; R 15 представляет собой H, С16 алкил, незамещенный или замещенный одним или несколькими галогенами, С16 алкокси.
5. Соединение по пп. 3-4, где если Х2 представляет собой CR2, Хз представляют собой N, то Х4, Х5, Х6 представляет собой СН;
если Х2, Х3 представляют собой N, то Х4, Х5, Х6 представляет собой СН;
если Х2, Х4 представляют собой N, то Х3, Х5, Х6 представляет собой СН;
если Х2 представляет собой CR2, Хз, Х5 представляют собой N, то Х4, Х6 представляет собой СН;
если Х2 представляет собой CR2, Х3, Х4 представляют собой N, то Х5, Х6 представляет собой СН;
если Х2 представляет собой CR2, Х3, Х6 представляют собой N, то Х4, Х5 представляет собой СН.
6. Соединение по пп. 1-5, где Y представляет собой -NH-, -О- или -S- ; Z представляет собой -СН2-.
7. Соединение по п. 1 , представляющее собой:
2-метокси-4-((2-(6-(4-метилпиперазин-1-карбонил)нафт-2-ил)этил)амино) хиназолин-6-карбонитрил (1)
2-(диметиламино)-4-((2-(6-(4-метилпиперазин-1-карбонил)нафт-2-ил)этил) амино)хиназолин-6-карбонитрил (2)
2-амино-4-((2-(6-(4-метилпиперазин-1-карбонил)нафт-2-ил)этил)амино) хиназолин-6-карбонитрил (3)
4-((2-(6-(4-метилпиперазин-1-карбонил)нафт-2-ил)этил)амино)циннолин-6- карбонитрил (4)
4-((2-(6-(4-метилпиперазин-1-карбонил)нафт-2-ил)этил)амино)хинолин-6- карбонитрил (5)
4-((2-(6-(4-метилпиперазин-1-карбонил)нафт-2-ил)этил)амино)хинолин-6- карбонитрил дигидрохлорид (5а)
5 -((2-(6-(4-метилпиперазин- 1 -карбонил)нафт-2-ил)этил)амино)- 1,7- нафтиридин-3-карбо нитрил (6) 4-((2-(6-изопропилпиперазин-4-карбонил)нафт-2-ил)этил)амино)хинолин-6- карбонитрил (7)
4-(2-(6-(4-метилпиперазин-1-карбонил)нафт-2-ил)этокси)хинолин-6- карбонитрил (8)
3-хлоро-4-((2-(6-(4-метилпиперазин-1-карбонил)нафт-2-ил)этил)амино) хинолин-6 -карбонитр ил (9)
3-хлоро-4-((2-(6-(4-метилпиперазин-1-карбонил)нафт-2-ил)этил)амино) хинолин-6 -карбонитр ил дигидрохлорид (9а)
4-((2-(6-(4-метилпиперазин- 1 -карбонил)нафт-2-ил)этил)амино)- 1,7- нафтиридин-6-карбонитрил (10)
5 -((2-(6-(4-метилпиперазин- 1 -карбонил)нафт-2-ил)этил)амино)- 1,8- нафтиридин-3-карбо нитрил (11)
4-((2-(6-этилпиперазин-4-карбонил)нафт-2-ил)этил)амино)хинолин-6- карбонитрил (12)
4-((2-(6-морфолин-4-карбонил)нафт-2-ил)этил)амино)хинолин-6- карбонитрил (13)
4-((3-(6-(4-метилпиперазин-1-карбонил)нафт-2-ил)пропаноил)хинолин-6- карбонитрил (14)
8-((2-(6-(4-метилпиперазин- 1 -карбонил)нафт-2-ил)этил)амино)- 1,5- нафтиридин-2-карбонитрил (15)
Ы-(6-цианохинолин-4-ил)-2-(6-(4-метилпиперазин- 1 -карбонил)нафт-2-ил) ацетамид (16)
4-((2-(6-(4-(2,2,2-трифторэтил)пиперазин-4-карбонил)нафт-2-ил)этил)амино) хинолин-6 -карбонитр ил (17)
4-((2-(6-(пиперазин-1-карбонил)нафт-2-ил)этил)амино)хинолин-6- карбонитрил (18)
4-((2-(6-(4-метилпиперазин-1-карбонил)нафт-2-ил)этил)тио)хинолин-6- карбонитрил (19)
8. Способ ингибирования биологической активности циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19 у субъекта, заключающийся в контактировании циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19 с соединением по любому из пп. 1-7.
9. Фармацевтическая композиция, содержащая терапевтически эффективное количество соединения по любому из пп. 1 -7, или его фармацевтически приемлемую соль, и один или несколько фармацевтически приемлемых эксципиентов, и предназначенная для профилактики или лечения заболевания, или нарушения, опосредованного активацией циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19.
10. Фармацевтическая композиция по п. 9, предназначенная для профилактики или лечения заболевания, или нарушения, опосредованного активацией циклинзависимой протеинкиназы CDK8/19, где заболевание, или нарушение, опосредованное активацией циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19, представляет собой онкологическое или гематоонкологическое заболевание.
11. Фармацевтическая композиция по и. 10, где онкологическое или гематоонкологическое заболевание выбирают из группы, включающей колоректальный рак, меланому, метастатическую меланому, рак молочной железы, трижды негативный рак молочной железы (ТНРМЖ), рак предстательной железы, метастатический рак яичника, метастатический рак желудка, лейкоз, острый миелоидный лейкоз, рак поджелудочной железы (РПЖЖ).
12. Способ лечения заболевания или нарушения, опосредованного активацией циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19, включающий введение в терапевтически эффективном количестве соединения по любому из пп. 1 -7 или его фармацевтически приемлемой соли, или фармацевтической композиции по п. 9 субъекту, нуждающемуся в таком лечении.
13. Способ лечения заболевания или нарушения по п. 12, где заболевание или нарушение, опосредованное активацией циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19, представляет собой онкологическое или гематоонкологическое заболевание .
14. Способ лечения заболевания или нарушения по п. 13, где онкологическое или гематоонкологическое заболевание выбирают из группы, включающей колоректальный рак, меланому, метастатическую меланому, рак молочной железы, трижды негативный рак молочной железы (ТНРМЖ), рак предстательной железы, метастатический рак яичника, метастатический рак желудка, лейкоз, острый миелоидный лейкоз, рак поджелудочной железы (РПЖЖ).
15. Применение соединения по любому из пп. 1-7 или его фармацевтически приемлемой соли, или фармацевтической композиции по п. 9 для лечения заболевания или нарушения, опосредованного активацией циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19, у субъекта, нуждающегося в таком лечении.
16. Применение по п. 15, где заболевание или нарушение, опосредованное активацией циклинзависимых протеинкиназ CDK8/19, представляет собой онкологическое или гематоонкологическое заболевание.
17. Применение по п. 16, где онкологическое или гематоонкологическое заболевание выбирают из группы, включающей колоректальный рак, меланому, метастатическую меланому, рак молочной железы, трижды негативный рак молочной железы (ТНРМЖ), рак предстательной железы, метастатический рак яичника, метастатический рак желудка, лейкоз, острый миелоидный лейкоз, рак поджелудочной железы (РПЖЖ).
PCT/RU2019/050021 2018-03-01 2019-02-28 Новые ингибиторы cdk8/19 WO2019168446A1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US17/052,078 US20220098160A1 (en) 2018-03-01 2019-02-28 Novel cdk 8/19 inhibitors

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2018107581A RU2763347C2 (ru) 2018-03-01 2018-03-01 Новые ингибиторы cdk8/19
RU2018107581 2018-03-01

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2019168446A1 true WO2019168446A1 (ru) 2019-09-06

Family

ID=67805981

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/RU2019/050021 WO2019168446A1 (ru) 2018-03-01 2019-02-28 Новые ингибиторы cdk8/19

Country Status (4)

Country Link
US (1) US20220098160A1 (ru)
RU (1) RU2763347C2 (ru)
UY (1) UY38133A (ru)
WO (1) WO2019168446A1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11014906B2 (en) 2018-08-21 2021-05-25 University Of South Carolina Quinoline-based compounds and methods of inhibiting CDK8/19

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20080000330A1 (en) * 2006-06-26 2008-01-03 Hermann Basler Power tong cage plate lock system
US20120000071A1 (en) * 2009-03-19 2012-01-05 Technip France Offshore wind turbine installation system and method
EA201491399A1 (ru) * 2012-02-02 2015-04-30 Сенекс Биотекнолоджи Инк. Селективные ингибиторы cdk8/cdk19 и их применение в качестве противометастатических и химиопрофилактических агентов для лечения рака

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007133773A2 (en) * 2006-05-15 2007-11-22 Senex Biotechnology, Inc Identification of cdki pathway inhibitors
US8598344B2 (en) * 2009-11-30 2013-12-03 Senex Biotechnology CDKI pathway inhibitors and uses thereof
RU2641001C1 (ru) * 2017-04-03 2018-01-15 Закрытое Акционерное Общество "Биокад" Соли 4-((2-(6-(4-метилпиперазин-1-карбонил)нафталин-2-ил)этил)амино)хиназолин-6-карбонитрила и фармацевтическая композиция

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20080000330A1 (en) * 2006-06-26 2008-01-03 Hermann Basler Power tong cage plate lock system
US20120000071A1 (en) * 2009-03-19 2012-01-05 Technip France Offshore wind turbine installation system and method
EA201491399A1 (ru) * 2012-02-02 2015-04-30 Сенекс Биотекнолоджи Инк. Селективные ингибиторы cdk8/cdk19 и их применение в качестве противометастатических и химиопрофилактических агентов для лечения рака

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11014906B2 (en) 2018-08-21 2021-05-25 University Of South Carolina Quinoline-based compounds and methods of inhibiting CDK8/19

Also Published As

Publication number Publication date
RU2018107581A (ru) 2019-09-03
US20220098160A1 (en) 2022-03-31
RU2018107581A3 (ru) 2021-06-16
UY38133A (es) 2019-10-01
RU2763347C2 (ru) 2021-12-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN117683049A (zh) 作为ras抑制剂以治疗癌症的吲哚衍生物
JP7365332B2 (ja) Cdk8/19阻害薬としての新規ヘテロ環式化合物
WO2017003995A1 (en) TBK/IKKε INHIBITOR COMPOUNDS AND USES THEREOF
WO2019079373A1 (en) PYRIMIDINE TBK / IKKε INHIBITORY COMPOUNDS AND USES THEREOF
RU2763347C2 (ru) Новые ингибиторы cdk8/19
WO2023152255A1 (en) Fused pyrimidines as kras inhibitors
RU2761824C2 (ru) Ингибиторы CDK8/19
RU2754441C2 (ru) Новые ингибиторы cdk8/19
RU2739489C2 (ru) Новые гетероциклические соединения как ингибиторы CDK8/19
TWI839374B (zh) Cdk8/19抑制劑
EA042225B1 (ru) Ингибиторы cdk8/19
JP7284161B2 (ja) ピリミジンTBK/IKKεインヒビター化合物およびそれらの使用
WO2024063670A1 (ru) Ингибиторы циклинзависимой киназы 7
RU2786524C2 (ru) Ингибиторы рецептора эпидермального фактора роста
EA041908B1 (ru) Производные 1,7-нафтиридина и их применение в качестве ингибиторов cdk8/19
US20230348462A1 (en) Imidazo[4,5-c]quinoline compounds and their use as atm kinase inhibitors

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 19760997

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

122 Ep: pct application non-entry in european phase

Ref document number: 19760997

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1