WO2018216504A1 - 脳画像データ処理装置、脳画像データ処理方法、および脳画像データ処理プログラム - Google Patents

脳画像データ処理装置、脳画像データ処理方法、および脳画像データ処理プログラム Download PDF

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ヒラルド ホラシオ サンソン
クワイ ベン フェルナンド ハビエル ウォン
厳 増岡
洋之 高尾
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株式会社アルム
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    • G06T2207/30016Brain

Definitions

  • the present invention relates to a brain image data processing device, a brain image data processing method, and a brain image data processing program.
  • each point is separated into a plurality of regions to which the point belongs based on the attribute of each point of the image.
  • the MRI image of the human head is classified into three regions other than the brain, scalp, and head (see Patent Document 1).
  • the brain image data processing apparatus reads brain image data that reads brain image data in which a part region for identifying each part is set at a position corresponding to each part of the brain. And each of the pixels that are not included in any part area in the brain image data read by the means and the brain image data reading means, each pixel is set based on the distance between each pixel and each part area. Probability calculating means for calculating a probability included in the part region and determination means for determining which part region each pixel belongs to based on the probability calculated by the probability calculating means.
  • the probability calculating means calculates the relationship between each pixel and each part region for each pixel not included in any part region. The distance between the geodesic lines is calculated, and the probability that each pixel is included in each region is calculated based on the distance between the geodesic lines.
  • the determination means is configured to apply a target when the probability calculated by the probability calculation means is larger than a preset threshold value. Is determined to belong to the region.
  • the brain image data processing device includes pixels determined to belong to each region based on the determination result by the determination unit.
  • the information processing apparatus further includes update means for updating the setting of the region of the brain image data.
  • the probability calculation means, the determination means, and the update are performed on the brain image data whose part region setting has been updated by the update means.
  • the apparatus further includes processing repeating means for repeating the processing by the means until a preset end condition is satisfied.
  • the processing repetition means is configured such that when the setting of the part region in the brain image data is not changed from the previous processing, the end condition Is determined to be satisfied.
  • the process repetition means determines that the end condition is satisfied when the number of repetitions of the process reaches a preset number of times.
  • a brain image data processing method for reading brain image data in which a part region for identifying each part is set at a position corresponding to each part of the brain.
  • each pixel is assigned to each part based on the distance between each pixel and each part region.
  • This is a method for causing a computer to execute a probability calculation procedure for calculating a probability included in a region and a determination procedure for determining which part region each pixel belongs to based on the probability calculated in the probability calculation procedure.
  • the probability calculation procedure is performed for each pixel that is not included in any part region. The distance between the geodesic lines is calculated, and the probability that each pixel is included in each region is calculated based on the distance between the geodesic lines.
  • the determination procedure is performed when the probability calculated in the probability calculation procedure is larger than a preset threshold value. Is determined to belong to the region.
  • the pixel determined to belong to each region is included based on the determination result by the determination procedure As described above, an update procedure for updating the setting of the region of the brain image data is further included.
  • the probability calculation procedure, the determination procedure, and the update are performed on the brain image data in which the setting of the region is updated in the update procedure. It further includes a process repetition procedure for repeating the process according to the procedure until a preset end condition is satisfied.
  • the process repetition procedure is performed when the setting of the part region in the brain image data is not changed from the previous process. Is determined to be satisfied.
  • the processing repetition procedure determines that the end condition is satisfied when the number of processing repetitions reaches a preset number.
  • the brain image data processing program reads brain image data that reads brain image data in which a part region for identifying each part is set at a position corresponding to each part of the brain. In the brain image data read in the procedure and the brain image data reading procedure, for each pixel not included in any part region, each pixel is assigned to each part based on the distance between each pixel and each part region.
  • the probability calculation procedure is performed for each pixel and each part region for each pixel not included in any part region. The distance between the geodesic lines is calculated, and the probability that each pixel is included in each region is calculated based on the distance between the geodesic lines.
  • the determination procedure is performed when the probability calculated in the probability calculation procedure is greater than a preset threshold value. Is determined to belong to the region.
  • the pixels determined to belong to each part region are included.
  • An update procedure for updating the setting of the region in the brain image data is further included.
  • a probability calculation procedure, a determination procedure, and an update are performed on brain image data in which the setting of the region has been updated in the update procedure. It further includes a process repetition procedure for repeating the process according to the procedure until a preset end condition is satisfied.
  • the processing repetition procedure is performed when the setting of the region of the brain image data is not changed from the previous process. Is determined to be satisfied.
  • the process repetition procedure determines that the end condition is satisfied when the number of repetitions of the process reaches a preset number. .
  • the present invention it is possible to determine to which part region each pixel not included in any part region belongs to the brain image data in which the part region is set.
  • FIG. 1 is a block diagram showing a configuration of an embodiment of a brain image data processing apparatus 100.
  • FIG. The figure which showed an example of brain image data typically.
  • FIG. 1 is a block diagram showing a configuration of an embodiment of a brain image data processing apparatus 100 in the present embodiment.
  • a server apparatus or a personal computer is used as the brain image data processing apparatus 100.
  • FIG. 1 shows the configuration of an embodiment in which a server apparatus is used as the brain image data processing apparatus 100.
  • the brain image data processing apparatus 100 includes a control device 101 and a recording device 102.
  • the control device 101 includes a CPU, a memory, and other peripheral circuits, and controls the entire brain image data processing device 100.
  • the memory which comprises the control apparatus 101 is volatile memories, such as SDRAM, for example. This memory is used as a work memory for the CPU to expand the program when the program is executed and a buffer memory for temporarily recording data.
  • the recording device 102 is a recording device for recording various data stored in the brain image data processing device 100, data of a program to be executed by the control device 101, and the like, for example, HDD (Hard Disk Drive) or SSD (SSD). (Solid State Drive) or the like is used.
  • the program data recorded in the recording device 102 is provided by being recorded on a recording medium such as a CD-ROM or DVD-ROM, or provided via a network, and records the program data acquired by the operator. By installing in the device 102, the control device 101 can execute the program.
  • brain image data obtained by photographing the subject's brain is recorded in the recording apparatus 102 in advance.
  • brain image data brain image data of the subject imaged by MRI or CT is used.
  • a part area for identifying each part is set in the brain image data of the subject at a position corresponding to each part of the brain.
  • the method of setting the region is performed in advance using a known method, and the method is not limited, and thus detailed description thereof is omitted here.
  • An example of a region setting method is as follows: brain image data is divided into regions based on the density value of each pixel using a preset threshold value, and the shape of each region of the brain is determined.
  • a simulated template image may be prepared, and a region may be divided for each part of the brain by a shape matching process using the template image.
  • part region 1 indicates an area set for the frontal lobe
  • part region 2 indicates an area set for the parietal lobe
  • part region 3 indicates the temporal lobe.
  • the set region is shown, and the part region 4 is a region set for the occipital lobe.
  • the region division for each part performed in advance on the brain image data is not always highly accurate. For this reason, there is a possibility that pixels originally belonging to any of the part regions are located outside the part region.
  • it is determined whether or not a pixel that is not included in a part region belongs to any part region, and pixels that are determined to belong to any part are originally A method for updating a part region included in a part region to be included will be described.
  • the control device 101 reads the brain image data in which the region is set from the recording device 102, and for each pixel not included in any region, based on the distance between each pixel and each region.
  • the probability that each pixel is included in each part region is calculated, and based on the calculated probability, it is determined to which part region each pixel belongs.
  • processing is performed as follows.
  • Controller 101 for each part region that is set on the read brain image data, using the following equation (1), and initializes the binary map B i.
  • x indicates a pixel in the brain image data
  • a (x) indicates a region of the region including the pixel x.
  • l i indicates a label for identifying each region.
  • the site region 1 shown in FIG. 3 is assigned a label l 1
  • the site region 2 are assigned to the part region 3
  • allocation label l 3 is, in the part region 4, it is assumed that the label l 4 is assigned.
  • the pixels belonging to the part region a label l i is allocated is initialized to a value of 1
  • the pixel not belonging to a site area label l i is assigned initialized to a value of 0
  • B i (x) can be obtained.
  • B 1 (x) pixels belonging to part region 1 are initialized to a value of 1
  • pixels not belonging to part region 1 are initialized to a value of 0, whereby the pixel is binarized. .
  • Controller 101 uses the following equation (2), show, for each pixel not included in any of the site region, the distance D (x geodesic connecting between each pixel x and each part region l i , B, I).
  • d (x, y) is calculated by the following equation (3).
  • P x, y is a set of all paths between the pixel x and the pixel y, and p is one path between the pixel x and the pixel y, This is parameterized by s taking a value of 0 or 1.
  • I (s) is the gradient of the brain image data I at the position s of the path p
  • p ′ (s) is the direction vector of the path p, and is calculated by the following equation (4).
  • p ′ (s) p (s + 1) ⁇ p (s) (4)
  • the control device 101 can calculate the geodesic distance D (x, B, I) between each part region l i and each pixel x by executing the above processing.
  • the geodesic distance D (x, B) between the point P and the region 1 is expressed by the equation (2) as shown by a broken line in FIG. , I)
  • d1 is calculated
  • d2 is calculated as the geodesic distance D (x, B, I) between the point P and the part region 2
  • the geodesic distance D between the point P and the part region 3 D3 is calculated as (x, B, I)
  • d4 is calculated as the geodesic distance D (x, B, I) between the point P and the region 4.
  • the control device 101 calculates the probability p (x
  • n L.
  • the control apparatus 101 can specify a part region corresponding to the original part with respect to pixels that did not belong to any part region on the input brain image data I.
  • the control device 101 updates the setting of the part region so that the pixel newly determined to belong to the part region belongs to each part region on the brain image data. Let it be image data. For example, in FIG. 6, the part region 2 is enlarged so as to include the pixel P, and the other part regions are also enlarged and updated so as to include surrounding pixels.
  • the control device 101 can improve the setting accuracy of the region of the brain image data by newly reading the brain image data after updating the setting of the region and repeating the above processing.
  • the number of times the process is repeated is not particularly limited. For example, it may be determined that the end condition is satisfied when the setting of the region of the brain image data is not changed from the previous process, and the repetition may be ended. Alternatively, the repetition may be ended by determining that the end condition is satisfied when the number of repetitions of the process reaches a preset number of times.
  • FIG. 7 is a flowchart showing a flow of processing executed by the brain image data processing apparatus 100 in the present embodiment.
  • the processing shown in FIG. 7 is executed by the control device 101 as a program that is activated when the operator of the brain image data processing device 100 is instructed to execute the program.
  • step S10 the control device 101 reads the brain image data in which the region is set from the recording device 102. Then, it progresses to step S20.
  • step S20 the control device 101 initializes the binary map B i using the equation (1). Then, it progresses to step S30.
  • step S30 the control apparatus 101 uses the equation (2) to set the interval between each pixel x and each part region l i for each pixel not included in any part region.
  • the distance D (x, B, I) of the geodesic line to be connected is calculated. Thereafter, the process proceeds to step S40.
  • step S40 the control device 101 calculates the probability p (x
  • step S50 as described above, the control device 101 determines which part region the pixel x belongs to using the equation (6). Thereafter, the process proceeds to step S60.
  • step S60 as described above, the control device 101 assigns the pixel newly determined to belong to the part region based on the result of the expression (6) so as to belong to each part region on the brain image data. Is updated to obtain new brain image data. Thereafter, the process proceeds to step S70.
  • step S70 the control device 101 determines whether or not the conditions for ending the processing from step S10 to step S60 are satisfied. If a negative determination is made in step S70, the process returns to step S10, the brain image data after updating the setting of the region is newly read, and the processing from step S10 to step S60 is repeated. On the other hand, if an affirmative determination is made in step S70, the process ends.
  • the control device 101 reads brain image data in which a part region for identifying each part is set at a position corresponding to each part of the brain, and any part region in the read brain image data For each pixel that is not also included, based on the geodesic distance between each pixel and each part region, calculate the probability that each pixel is included in each part region, and based on the calculated probability, A determination is made as to which part region each pixel belongs to. As a result, the accuracy of the part region set on the brain image is low, and even if a pixel that should originally be included in the part region is located outside the part region, the pixel belongs to the part region to which the pixel should originally belong. Can be determined.
  • the control device 101 updates the setting of the part region in the brain image data so as to include the pixels determined to belong to each part region.
  • the setting accuracy of the region of the brain image data can be improved.
  • the volume of a specific part of the brain such as Alzheimer, can be obtained by comparing the patient's brain image taken in the past with the latest patient's brain image. It becomes possible to detect a disease affected by a change in (cross-sectional area) with high accuracy.
  • the control device 101 determines that the target pixel belongs to the part region. As a result, when the probability is less than the threshold value, it is not determined that the pixel belongs to the part region, so that it is possible to improve the determination accuracy of whether each pixel belongs to any part region.
  • the control device 101 repeats a series of processes until the preset end condition is satisfied for the brain image data after updating the setting of the region. Thereby, the setting accuracy of the part region can be further improved.
  • the control apparatus 101 sets the process end condition when the setting of the region of the brain image data is not changed from the previous process or when the process repeat count reaches the preset count. Judged that it was satisfied. As a result, the process can be terminated at the stage where improvement in the setting accuracy of the part region is expected.
  • the brain image data processing apparatus 100 can be modified as follows.
  • processing is performed on two-dimensional brain image data.
  • the above processing may be performed on the three-dimensional brain image data created by superimposing the cross-sectional images of the subject's brain taken by MRI or CT.
  • voxel data is used as the three-dimensional image data of the brain.
  • the processing performed on each pixel x of the image data in the above processing is performed on a three-dimensional pixel in the three-dimensional image space, that is, voxel. To do so.
  • the present invention is not limited to the configurations in the above-described embodiments as long as the characteristic functions of the present invention are not impaired. Moreover, it is good also as a structure which combined the above-mentioned embodiment and a some modification.

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Abstract

【課題】脳の画像データにおける部位領域の設定精度を向上させること。 【解決手段】 脳画像データ処理装置100は、脳の各部位に対応する位置に、各部位を識別するための部位領域が設定された脳の画像データを読み込む脳画像データ読み込み手段と、脳画像データ読み込み手段によって読み込まれた脳の画像データにおいて、いずれの部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出する確率算出手段と、確率算出手段によって算出された確率に基づいて、各画素がどの部位領域に属するかを判定する判定手段とを備える。

Description

脳画像データ処理装置、脳画像データ処理方法、および脳画像データ処理プログラム
 本発明は、脳画像データ処理装置、脳画像データ処理方法、および脳画像データ処理プログラムに関する。
 次のような輪郭抽出装置が知られている。この輪郭抽出装置では、輪郭抽出の対象となる物体の像を含む画像データに対し、画像の各点が持つ属性に基づいて、各点をその点が属する複数の領域に分離し、領域間の境界を輪郭として抽出することにより、人体頭部のMRI画像から、脳、頭皮、頭部以外の3つの領域に分類する(特許文献1参照)。
特開2001-92980号公報
 従来の輪郭抽出装置のように、MRI画像を解析して、画像内を複数の領域に分割する技術が存在している。このように画像内を複数の領域に分割した場合、処理の精度によっては、領域の分割が正しく行われない可能性がある。例えば、脳の画像に対して脳の部位ごとに領域分割を行う場合、本来はいずれかの部位に対応する領域に含まれるべき画素が、いずれの領域にも属さないように分割されてしまう可能性があった。従来の技術では、このような場合に各画素がどの領域に含まれるべきかを判定する技術については、何ら検討されていなかった。
 本発明の第1の態様によると、脳画像データ処理装置は、脳の各部位に対応する位置に、各部位を識別するための部位領域が設定された脳の画像データを読み込む脳画像データ読み込み手段と、脳画像データ読み込み手段によって読み込まれた脳の画像データにおいて、いずれの部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出する確率算出手段と、確率算出手段によって算出された確率に基づいて、各画素がどの部位領域に属するかを判定する判定手段とを備える。
 本発明の第2の態様によると、第1の態様の脳画像データ処理装置において、確率算出手段は、いずれの部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との間の測地線の距離を算出し、測地線の距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出する。
 本発明の第3の態様によると、第1または第2の態様の脳画像データ処理装置において、判定手段は、確率算出手段によって算出された確率が、あらかじめ設定された閾値より大きい場合に、対象となる画素はその部位領域に属するものと判定する。
 本発明の第4の態様によると、第1~第3のいずれかの態様の脳画像データ処理装置において、判定手段による判定結果に基づいて、各部位領域に属すると判定された画素を包含するように、脳の画像データにおける部位領域の設定を更新する更新手段をさらに備える。
 本発明の第5の態様によると、第4の態様の脳画像データ処理装置において、更新手段によって部位領域の設定が更新された脳の画像データを対象として、確率算出手段、判定手段、および更新手段による処理を、あらかじめ設定された終了条件を満たすまで繰り返す処理繰り返し手段をさらに備える。
 本発明の第6の態様によると、第5の態様の脳画像データ処理装置において、処理繰り返し手段は、前回の処理から脳の画像データにおける部位領域の設定が変更されなくなったときに、終了条件を満たしたと判定する。
 本発明の第7の態様によると、第5の態様の脳画像データ処理装置において、処理繰り返し手段は、処理の繰り返し回数があらかじめ設定された回数に到達したときに、終了条件を満たしたと判定する。
 本発明の第8の態様によると、脳画像データ処理方法は、脳の各部位に対応する位置に、各部位を識別するための部位領域が設定された脳の画像データを読み込む脳画像データ読み込み手順と、脳画像データ読み込み手順で読み込んだ脳の画像データにおいて、いずれの部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出する確率算出手順と、確率算出手順で算出した確率に基づいて、各画素がどの部位領域に属するかを判定する判定手順とをコンピュータに実行させるための方法である。
 本発明の第9の態様によると、第8の態様の脳画像データ処理方法において、確率算出手順は、いずれの部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との間の測地線の距離を算出し、測地線の距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出する。
 本発明の第10の態様によると、第8または第9の態様の脳画像データ処理方法において、判定手順は、確率算出手順で算出した確率が、あらかじめ設定された閾値より大きい場合に、対象となる画素はその部位領域に属するものと判定する。
 本発明の第11の態様によると、第8~第10のいずれかの態様の脳画像データ処理方法において、判定手順による判定結果に基づいて、各部位領域に属すると判定された画素を包含するように、脳の画像データにおける部位領域の設定を更新する更新手順をさらに有する。
 本発明の第12の態様によると、第11の態様の脳画像データ処理方法において、更新手順で部位領域の設定が更新された脳の画像データを対象として、確率算出手順、判定手順、および更新手順による処理を、あらかじめ設定された終了条件を満たすまで繰り返す処理繰り返し手順をさらに有する。
 本発明の第13の態様によると、第12の態様の脳画像データ処理方法において、処理繰り返し手順は、前回の処理から脳の画像データにおける部位領域の設定が変更されなくなったときに、終了条件を満たしたと判定する。
 本発明の第14の態様によると、第12の態様の脳画像データ処理方法において、処理繰り返し手順は、処理の繰り返し回数があらかじめ設定された回数に到達したときに、終了条件を満たしたと判定する。
 本発明の第15の態様によると、脳画像データ処理プログラムは、脳の各部位に対応する位置に、各部位を識別するための部位領域が設定された脳の画像データを読み込む脳画像データ読み込み手順と、脳画像データ読み込み手順で読み込んだ脳の画像データにおいて、いずれの部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出する確率算出手順と、確率算出手順で算出した確率に基づいて、各画素がどの部位領域に属するかを判定する判定手順とをコンピュータに実行させるためのプログラムである。
 本発明の第16の態様によると、第15の態様の脳画像データ処理プログラムにおいて、確率算出手順は、いずれの部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との間の測地線の距離を算出し、測地線の距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出する。
 本発明の第17の態様によると、第15または第16の態様の脳画像データ処理プログラムにおいて、判定手順は、確率算出手順で算出した確率が、あらかじめ設定された閾値より大きい場合に、対象となる画素はその部位領域に属するものと判定する。
 本発明の第18の態様によると、第15~第17の態様の脳画像データ処理プログラムにおいて、判定手順による判定結果に基づいて、各部位領域に属すると判定された画素を包含するように、脳の画像データにおける部位領域の設定を更新する更新手順をさらに有する。
 本発明の第19の態様によると、第18の態様の脳画像データ処理プログラムにおいて、更新手順で部位領域の設定が更新された脳の画像データを対象として、確率算出手順、判定手順、および更新手順による処理を、あらかじめ設定された終了条件を満たすまで繰り返す処理繰り返し手順をさらに有する。
 本発明の第20の態様によると、第19の態様の脳画像データ処理プログラムにおいて、処理繰り返し手順は、前回の処理から脳の画像データにおける部位領域の設定が変更されなくなったときに、終了条件を満たしたと判定する。
 本発明の第21の態様によると、第19の態様の脳画像データ処理プログラムにおいて、処理繰り返し手順は、処理の繰り返し回数があらかじめ設定された回数に到達したときに、終了条件を満たしたと判定する。
 本発明によれば、部位領域が設定された脳の画像データに対して、いずれの部位領域にも含まれない各画素がどの部位領域に属するかを判定することができる。
脳画像データ処理装置100の一実施の形態の構成を示すブロック図。 脳画像データの一例を模式的に示した図。 脳画像データ上での部位領域の設定例を模式的に示した図。 脳画像データ上における画素Pの設定例を模式的に示した図。 脳画像データ上における各部位領域と画素Pとの間の測地線距離を模式的に示した図。 脳画像データ上における部位領域の更新例を模式的に示した図。 脳画像データ処理装置100で実行される処理の流れを示すフローチャート図。
 図1は、本実施の形態における脳画像データ処理装置100の一実施の形態の構成を示すブロック図である。脳画像データ処理装置100としては、例えば、サーバ装置やパソコン等が用いられ、図1は、脳画像データ処理装置100としてサーバ装置を用いた場合の一実施の形態の構成を示している。脳画像データ処理装置100は、制御装置101と、記録装置102とを備えている。
 制御装置101は、CPU、メモリ、およびその他の周辺回路によって構成され、脳画像データ処理装置100の全体を制御する。なお、制御装置101を構成するメモリは、例えばSDRAM等の揮発性のメモリである。このメモリは、CPUがプログラム実行時にプログラムを展開するためのワークメモリや、データを一時的に記録するためのバッファメモリとして使用される。
 記録装置102は、脳画像データ処理装置100が蓄える種々のデータや、制御装置101が実行するためのプログラムのデータ等を記録するための記録装置であり、例えばHDD(Hard Disk Drive)やSSD(Solid State Drive)等が用いられる。なお、記録装置102に記録されるプログラムのデータは、CD-ROMやDVD-ROMなどの記録媒体に記録されて提供されたり、ネットワークを介して提供され、操作者が取得したプログラムのデータを記録装置102にインストールすることによって、制御装置101がプログラムを実行できるようになる。
 本実施の形態における脳画像データ処理装置100では、記録装置102には、対象者の脳を撮影した脳画像データがあらかじめ記録されている。脳画像データとしては、MRIやCTなどにより撮影された対象者の脳の画像データが用いられる。
 また、本実施の形態では、対象者の脳画像データには、脳の各部位に対応する位置に、各部位を識別するための部位領域が設定されている。部位領域の設定方法は、公知の方法を用いてあらかじめ行われており、その方法は限定されないため、ここでは詳細な説明は省略する。部位領域の設定方法の一例を挙げると、脳画像データに対して、あらかじめ設定された閾値を用いて画像内を各画素の濃度値に基づいて領域分けを行ったり、脳の各部位の形状を模したテンプレート画像を用意しておき、該テンプレート画像を用いた形状のマッチング処理により脳の各部位ごとに領域分けを行ったりすればよい。
 例えば、図2に示すような脳画像データに対して、図3に示すように、脳の各部位に応じた位置に、部位領域1、部位領域2、部位領域3、部位領域4が設定される。なお、図3において、部位領域1は、前頭葉に対して設定された領域を示し、部位領域2は、頭頂葉に対して設定された領域を示し、部位領域3は、側頭葉に対して設定された領域を示し、部位領域4は、後頭葉に対して設定された領域を示している。
 このように、あらかじめ脳画像データ上で行われた各部位ごとの領域分けは、必ずしも精度が高いとは限らない。このため、本来はいずれかの部位領域に属する画素が、部位領域の外に位置してしまう可能性がある。本実施の形態では、このような問題を解決するために、部位領域に含まれない画素がいずれかの部位領域に属するか否かを判定し、いずれかの部位に属すると判定した画素を本来含まれるべき部位領域に含めて部位領域を更新する方法について説明する。
 制御装置101は、記録装置102から部位領域が設定された脳画像データを読み込んで、いずれの部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出し、算出した確率に基づいて、各画素がどの部位領域に属するかを判定する。本実施の形態では、n個の画素で構成される脳画像データIに対して、L個の部位領域が設定されている場合を想定し、以下のように処理を行う。
 制御装置101は、読み込んだ脳画像データ上に設定されている各部位領域に対して、次式(1)を用いて、バイナリマップBを初期化する。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000001
 なお、式(1)では、xは脳画像データ内の画素を示し、A(x)は、画素xが含まれる部位領域を示している。また、lは各部位領域を識別するためのラベルを示している。本実施の形態では、例えば、図3に示した部位領域1には、ラベルlが割り当てられ、部位領域2には、ラベルlが割り当てられ、部位領域3には、ラベルlが割り当てられ、部位領域4には、ラベルlが割り当てられているものとする。このため、式(1)によって、ラベルlが割り当てられた部位領域に属する画素は1の値に初期化され、ラベルlが割り当てられた部位領域に属さない画素は0の値に初期化したB(x)を得ることができる。例えば、B(x)では、部位領域1に属する画素は1の値に初期化され、部位領域1に属さない画素は0の値に初期化されることにより、画素が2値化される。
 制御装置101は、次式(2)を用いて、いずれの部位領域にも含まれない各画素を対象として、各画素xと各部位領域lとの間を結ぶ測地線の距離D(x,B,I)を算出する。次式(2)において、d(x,y)は、次式(3)により算出される。なお、次式(3)において、Px,yは、画素xと画素yとの間のすべての経路の集合であり、pは画素xと画素yとの間の1つの経路であって、これは0または1の値をとるsによってパラメータ化される。▽I(s)は、経路pの位置sにおける脳画像データIの勾配であり、p´(s)は経路pの方向ベクトルであって、次式(4)により算出される。また、定数γは、経路pに沿って画素xから画素yまでの全距離に対する画像勾配▽I(s)の寄与を調整するための定数である。通常の距離変換の計算では、γ=0に設定される。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000002
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000003
 p´(s)=p(s+1)-p(s) ・・・(4)
 制御装置101は、上記の処理を実行することにより、各部位領域lと各画素xとの間の測地線距離D(x,B,I)を算出することができる。
 例えば、図4に示した画素Pを対象とした場合には、図5において破線で示すように、式(2)によって、点Pと部位領域1との間の測地線距離D(x,B,I)としてd1が算出され、点Pと部位領域2との間の測地線距離D(x,B,I)としてd2が算出され、点Pと部位領域3との間の測地線距離D(x,B,I)としてd3が算出され、点Pと部位領域4との間の測地線距離D(x,B,I)としてd4が算出される。
 制御装置101は、上記処理によって算出した測地線距離D(x,B,I)に基づいて、各画素xが各部位領域lに属する確率p(x|l)を次式(5)により算出する。本実施の形態では、次式(5)を用いて、各画素xがn個の部位領域l1、2、・・・、lのそれぞれに属する確率をp(x)=(p(x|l),p(x|l),・・・,p(x|l))として算出する。なお、次式(5)では、上述したように脳画像データIにL個の部位領域が設定されている場合には、n=Lとなる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000004
 制御装置101は、各画素について確率を計算すると、次式(6)により、画素xがどの部位領域に属するかを判定する。すなわち、制御装置101は、式(5)を用いて算出したp(x)の中で最も高く算出された確率が、あらかじめ設定されている閾値tより大きい場合には、画素xは、式(5)で最も高い確率が算出された部位領域に属するものと判定し、画素xが含まれる部位領域A(x)の情報を更新する。一方、制御装置101は、式(5)で最も高く算出された確率が、あらかじめ設定されている閾値t未満である場合には、画素xはいずれの部位領域にも属さないと判定し、A(x)=0とする。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000005
 これによって、制御装置101は、入力された脳画像データI上で、いずれの部位領域にも属していなかった画素に対して、本来の部位に応じた部位領域を特定することができる。制御装置101は、式(6)の結果に基づいて、新たに部位領域に属すると判定した画素を、脳画像データ上の各部位領域に属するように部位領域の設定を更新し、新たな脳画像データとする。例えば、図6では、部位領域2が画素Pを包含するように拡大されるとともに、他の部位領域も周囲の画素を含むように拡大されて更新されている。
 制御装置101は、部位領域の設定を更新した後の脳画像データを新たに読み込んで、上記処理を繰り返すことにより、脳画像データにおける部位領域の設定精度を向上させることができる。なお、処理を繰り返す回数は特に限定されないが、例えば、前回の処理から脳画像データにおける部位領域の設定が変更されなくなったときに終了条件を満たしたと判定して繰り返しを終了してもよい。あるいは、処理の繰り返し回数があらかじめ設定された回数に到達したときに終了条件を満たしたと判定して繰り返しを終了してもよい。
 図7は、本実施の形態における脳画像データ処理装置100で実行される処理の流れを示すフローチャートである。図7に示す処理は、脳画像データ処理装置100の操作者によってプログラムの実行が指示されると起動するプログラムとして、制御装置101によって実行される。
 ステップS10において、制御装置101は、記録装置102から部位領域が設定された脳画像データを読み込む。その後、ステップS20へ進む。
 ステップS20では、制御装置101は、上述したように、式(1)を用いて、バイナリマップBを初期化する。その後、ステップS30へ進む。
 ステップS30では、制御装置101は、上述したように、式(2)を用いて、いずれの部位領域にも含まれない各画素を対象として、各画素xと各部位領域lとの間を結ぶ測地線の距離D(x,B,I)を算出する。その後、ステップS40へ進む。
 ステップS40では、制御装置101は、上述したように、式(5)を用いて、各画素xが各部位領域lに属する確率p(x|l)を算出する。その後、ステップS50へ進む。
 ステップS50では、制御装置101は、上述したように、式(6)を用いて、画素xがどの部位領域に属するかを判定する。その後、ステップS60へ進む。
 ステップS60では、制御装置101は、上述したように、式(6)の結果に基づいて、新たに部位領域に属すると判定した画素を、脳画像データ上の各部位領域に属するように部位領域の設定を更新し、新たな脳画像データとする。その後、ステップS70へ進む。
 ステップS70では、制御装置101は、上述したように、ステップS10からステップS60の処理の終了条件を満たしたか否かを判断する。ステップS70で否定判断した場合には、ステップS10へ戻り、部位領域の設定を更新した後の脳画像データを新たに読み込んで、ステップS10からステップS60の処理を繰り返す。これに対して、ステップS70で肯定判断した場合には、処理を終了する。
 以上説明した本実施の形態によれば、以下のような作用効果を得ることができる。
(1)制御装置101は、脳の各部位に対応する位置に、各部位を識別するための部位領域が設定された脳の画像データを読み込み、読み込んだ脳の画像データにおいて、いずれの部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との間の測地線の距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出し、算出した確率に基づいて、各画素がどの部位領域に属するかを判定するようにした。これによって、脳の画像上に設定された部位領域の精度が低く、本来は部位領域に含まれるはずの画素が部位領域外に位置していたとしても、その画素を本来属するべき部位領域に属すると判定することができる。また、確率を算出するための距離として、各画素と各部位領域との間の直線距離を用いようとすると、画像全体におけるエッジや輝度の変化といった特徴が無視され、確率の算出精度が低下する可能性があるが、各画素と各部位領域との間の測地線の距離を用いることによって、このような問題を解消し、画像の特徴を考慮した確率の算出が可能となる。
(2)制御装置101は、各部位領域に属すると判定された画素を包含するように、脳の画像データにおける部位領域の設定を更新するようにした。これによって、脳の画像データにおける部位領域の設定精度を向上させることができる。さらに、部位領域の設定精度を向上することができれば、過去に撮影した患者の脳の画像と、最新の患者の脳の画像を比較することによって、アルツハイマーのように、脳の特定の部位の体積(断面積)の変化が影響する病気を精度高く検出することが可能となる。
(3)制御装置101は、算出した確率が、あらかじめ設定された閾値より大きい場合に、対象となる画素はその部位領域に属するものと判定するようにした。これによって、確率が閾値未満の場合には、その画素は部位領域に属すると判定されないため、各画素がいずれかの部位領域に属するか否かの判定精度を向上させることができる。
(4)制御装置101は、部位領域の設定を更新した後の脳の画像データを対象として、あらかじめ設定された終了条件を満たすまで一連の処理を繰り返すようにした。これによって、さらに部位領域の設定精度を向上させることができる。
(5)制御装置101は、前回の処理から脳の画像データにおける部位領域の設定が変更されなくなったとき、または処理の繰り返し回数があらかじめ設定された回数に到達したときに、処理の終了条件を満たしたと判定するようにした。これによって、部位領域の設定精度の向上が見込まれた段階で、処理を終了させることができる。
―変形例―
 なお、上述した実施の形態の脳画像データ処理装置100は、以下のように変形することもできる。
(1)上述した実施の形態では、図2から図6に示したように、2次元の脳画像データを対象として処理を行う例について説明した。しかしながら、MRIやCTなどにより撮影された対象者の脳の断面画像を重ねることにより作成された脳の3次元画像データを対象として、上記の処理を行うようにしてもよい。例えば、脳の3次元画像データとしてはボクセルデータが用いられ、この場合、上記処理では画像データの各画素xを対象として行った処理は、3次元画像空間における立体的な画素、すなわちボクセルに対して行うようにすればよい。
 なお、本発明の特徴的な機能を損なわない限り、本発明は、上述した実施の形態における構成に何ら限定されない。また、上述の実施の形態と複数の変形例を組み合わせた構成としてもよい。
 次の優先権基礎出願の開示内容は引用文としてここに組み込まれる。
 日本国特許出願2017年第104337号(2017年5月26日出願)
100 脳画像データ処理装置
101 制御装置
102 記録装置

Claims (21)

  1.  脳の各部位に対応する位置に、各部位を識別するための部位領域が設定された脳の画像データを読み込む脳画像データ読み込み手段と、
     前記脳画像データ読み込み手段によって読み込まれた前記脳の画像データにおいて、いずれの前記部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出する確率算出手段と、
     前記確率算出手段によって算出された確率に基づいて、各画素がどの部位領域に属するかを判定する判定手段とを備えることを特徴とする脳画像データ処理装置。
  2.  請求項1に記載の脳画像データ処理装置において、
     前記確率算出手段は、いずれの前記部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との間の測地線の距離を算出し、前記測地線の距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出することを特徴とする脳画像データ処理装置。
  3.  請求項1または2に記載の脳画像データ処理装置において、
     前記判定手段は、前記確率算出手段によって算出された確率が、あらかじめ設定された閾値より大きい場合に、対象となる画素はその部位領域に属するものと判定することを特徴とする脳画像データ処理装置。
  4.  請求項1~3のいずれか一項に記載の脳画像データ処理装置において、
     前記判定手段による判定結果に基づいて、各部位領域に属すると判定された画素を包含するように、前記脳の画像データにおける前記部位領域の設定を更新する更新手段をさらに備えることを特徴とする脳画像データ処理装置。
  5.  請求項4に記載の脳画像データ処理装置において、
     前記更新手段によって前記部位領域の設定が更新された前記脳の画像データを対象として、前記確率算出手段、前記判定手段、および前記更新手段による処理を、あらかじめ設定された終了条件を満たすまで繰り返す処理繰り返し手段をさらに備えることを特徴とする脳画像データ処理装置。
  6.  請求項5に記載の脳画像データ処理装置において、
     前記処理繰り返し手段は、前回の処理から前記脳の画像データにおける前記部位領域の設定が変更されなくなったときに、前記終了条件を満たしたと判定することを特徴とする脳画像データ処理装置。
  7.  請求項5に記載の脳画像データ処理装置において、
     前記処理繰り返し手段は、処理の繰り返し回数があらかじめ設定された回数に到達したときに、前記終了条件を満たしたと判定することを特徴とする脳画像データ処理装置。
  8.  脳の各部位に対応する位置に、各部位を識別するための部位領域が設定された脳の画像データを読み込む脳画像データ読み込み手順と、
     前記脳画像データ読み込み手順で読み込んだ前記脳の画像データにおいて、いずれの前記部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出する確率算出手順と、
     前記確率算出手順で算出した確率に基づいて、各画素がどの部位領域に属するかを判定する判定手順とをコンピュータに実行させるための脳画像データ処理方法。
  9.  請求項8に記載の脳画像データ処理方法において、
     前記確率算出手順は、いずれの前記部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との間の測地線の距離を算出し、前記測地線の距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出することを特徴とする脳画像データ処理方法。
  10.  請求項8または9に記載の脳画像データ処理方法において、
     前記判定手順は、前記確率算出手順で算出した確率が、あらかじめ設定された閾値より大きい場合に、対象となる画素はその部位領域に属するものと判定することを特徴とする脳画像データ処理方法。
  11.  請求項8~10のいずれか一項に記載の脳画像データ処理方法において、
     前記判定手順による判定結果に基づいて、各部位領域に属すると判定された画素を包含するように、前記脳の画像データにおける前記部位領域の設定を更新する更新手順をさらに有することを特徴とする脳画像データ処理方法。
  12.  請求項11に記載の脳画像データ処理方法において、
     前記更新手順で前記部位領域の設定が更新された前記脳の画像データを対象として、前記確率算出手順、前記判定手順、および前記更新手順による処理を、あらかじめ設定された終了条件を満たすまで繰り返す処理繰り返し手順をさらに有することを特徴とする脳画像データ処理方法。
  13.  請求項12に記載の脳画像データ処理方法において、
     前記処理繰り返し手順は、前回の処理から前記脳の画像データにおける前記部位領域の設定が変更されなくなったときに、前記終了条件を満たしたと判定することを特徴とする脳画像データ処理方法。
  14.  請求項12に記載の脳画像データ処理方法において、
     前記処理繰り返し手順は、処理の繰り返し回数があらかじめ設定された回数に到達したときに、前記終了条件を満たしたと判定することを特徴とする脳画像データ処理方法。
  15.  脳の各部位に対応する位置に、各部位を識別するための部位領域が設定された脳の画像データを読み込む脳画像データ読み込み手順と、
     前記脳画像データ読み込み手順で読み込んだ前記脳の画像データにおいて、いずれの前記部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出する確率算出手順と、
     前記確率算出手順で算出した確率に基づいて、各画素がどの部位領域に属するかを判定する判定手順とをコンピュータに実行させるための脳画像データ処理プログラム。
  16.  請求項15に記載の脳画像データ処理プログラムにおいて、
     前記確率算出手順は、いずれの前記部位領域にも含まれない各画素に対して、各画素と各部位領域との間の測地線の距離を算出し、前記測地線の距離に基づいて、各画素が各部位領域に含まれる確率を算出することを特徴とする脳画像データ処理プログラム。
  17.  請求項15または16に記載の脳画像データ処理プログラムにおいて、
     前記判定手順は、前記確率算出手順で算出した確率が、あらかじめ設定された閾値より大きい場合に、対象となる画素はその部位領域に属するものと判定することを特徴とする脳画像データ処理プログラム。
  18.  請求項15~17のいずれか一項に記載の脳画像データ処理プログラムにおいて、
     前記判定手順による判定結果に基づいて、各部位領域に属すると判定された画素を包含するように、前記脳の画像データにおける前記部位領域の設定を更新する更新手順をさらに有することを特徴とする脳画像データ処理プログラム。
  19.  請求項18に記載の脳画像データ処理プログラムにおいて、
     前記更新手順で前記部位領域の設定が更新された前記脳の画像データを対象として、前記確率算出手順、前記判定手順、および前記更新手順による処理を、あらかじめ設定された終了条件を満たすまで繰り返す処理繰り返し手順をさらに有することを特徴とする脳画像データ処理プログラム。
  20.  請求項19に記載の脳画像データ処理プログラムにおいて、
     前記処理繰り返し手順は、前回の処理から前記脳の画像データにおける前記部位領域の設定が変更されなくなったときに、前記終了条件を満たしたと判定することを特徴とする脳画像データ処理プログラム。
  21.  請求項19に記載の脳画像データ処理プログラムにおいて、
     前記処理繰り返し手順は、処理の繰り返し回数があらかじめ設定された回数に到達したときに、前記終了条件を満たしたと判定することを特徴とする脳画像データ処理プログラム。
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