WO2014148800A1 - 패턴 히터가 반복 배치된 pcr 열 블록 및 이를 포함하는 pcr 장치 - Google Patents

패턴 히터가 반복 배치된 pcr 열 블록 및 이를 포함하는 pcr 장치 Download PDF

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WO2014148800A1
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heaters
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김성우
이정환
김덕중
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나노바이오시스(주)
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Definitions

  • the present invention relates to a PCR device having a PCR heat block in which a heater is continuously and repeatedly arranged.
  • Polymerase chain reaction or PCR (Polymerase Chain Reaction, hereinafter) is a technique of repeatedly heating and cooling a specific site of a template nucleic acid to replicate the specific site in sequence to amplify exponentially a nucleic acid having the specific site. It is widely used for analysis and diagnostic purposes in the life sciences, genetic engineering and medical fields. Recently, a variety of devices for efficiently performing PCR have been developed.
  • One example of a conventional PCR apparatus is equipped with a container containing a sample solution containing a template nucleic acid in a heater, and the container is repeatedly heated and cooled to perform PCR.
  • the above PCR device has one heater, but the overall structure is not complicated, but it is necessary to have a complicated circuit for accurate temperature control, and the entire PCR time is long due to repeated heating or cooling for one heater. There is this.
  • a PCR device is equipped with a plurality of heaters having a PCR temperature, and performs a PCR by flowing a sample solution containing nucleic acid through one channel through these heaters.
  • a PCR device can be implemented in a relatively simple circuit because it uses a plurality of heaters, but a long flow path for passing a high-temperature and low-temperature heater is necessary, so the overall structure is complicated and flows through the channel passing through the heater.
  • the PCR device has been developed to improve the PCR yield and the PCR process in real time, as well as to develop a miniaturized and portable device by using a miniaturized heater.
  • the performance of the miniaturized heater has a great influence on the PCR yield, it is very important to develop a technology that can accurately control or implement the set temperature of the miniaturized heater. Accordingly, there is still a need for implementation of a PCR device that can significantly reduce PCR time and at the same time obtain a reliable PCR yield, and furthermore, can reduce the size and portability of a product.
  • embodiments of the present invention to significantly improve the PCR time and yield, further proposed a PCR heat block to enable the miniaturization and portability of the product, and further propose a PCR device including the same do.
  • a PCR heat block in which two or more heaters are repeatedly implemented, wherein the heaters include at least one of the heaters to prevent uneven heat overlap between adjacent heaters according to a radial heat distribution generated from individual heaters. It provides a PCR thermal block characterized in that it comprises a compensated pattern (compensated pattern) for controlling the heat uniformity of the heater surface by adjusting the resistance of the portion.
  • the compensation pattern may be formed by repeatedly forming a gap in at least a portion of the heater to adjust the resistance according to the gap pattern to adjust the thermal uniformity of the heater surface.
  • the compensating pattern may be one in which a thermal uniformity of the surface of the heater is controlled by adjusting a resistance by implementing a line width of a gap repeatedly formed in at least a portion of the heater.
  • the compensation pattern may be one in which the thermal uniformity of the surface of the heater is adjusted by adjusting the resistance by implementing a different thickness of the gap repeatedly formed in at least one portion of the heater.
  • the compensation pattern may be one in which the heat uniformity of the surface of the heater is adjusted by controlling the resistance by implementing materials differently on at least one part of the heater.
  • the compensation pattern may be implemented by differently disposing a heater electrode on at least a portion of the heater to adjust resistance to adjust thermal uniformity of the heater surface.
  • a second embodiment of the present invention is a PCR column block according to the first embodiment of the present invention; And an inlet and an outlet at both ends, which are attached to the heat block to allow heat exchange with the PCR heat block, and are arranged to extend in a longitudinal direction through upper corresponding portions of the heaters provided in the PCR heat block.
  • a PCR chip comprising a plate-shaped PCR reaction unit having one or more reaction channels.
  • the upper surface of the PCR thermal block may be an insulating film (insulator) for preventing the electrolysis of the PCR solution.
  • a third embodiment of the present invention is a PCR column block according to the first embodiment of the present invention; Inlet and outlet portions are implemented at both ends, which are in contact with the PCR heat block so as to allow heat exchange, and are arranged to extend in a longitudinal direction through upper corresponding portions of the heaters provided in the PCR heat block.
  • a plate-shaped PCR reaction unit having the above reaction channel; And it provides a PCR device including a power supply for supplying power to the heaters provided in the PCR thermal block.
  • An upper surface of the PCR thermal block may be an insulating film for protecting the heater.
  • the PCR device may further include a pump arranged to provide a positive or negative pressure to control the flow rate and flow rate of the PCR solution flowing in the one or more reaction channels.
  • the PCR apparatus may further include a light source disposed to provide light to the PCR reaction unit, and a light detector disposed to receive light emitted from the PCR reaction unit.
  • the light source or light detector may be repeatedly arranged in a space between adjacent heaters of the PCR heat block.
  • the PCR reaction unit is disposed repeatedly spaced apart across the bottom surface in the longitudinal direction of the reaction channel, and provided with a detection electrode implemented to detect an electrochemical signal generated due to the combination of the amplifying nucleic acid and the active material in the reaction channel
  • the detection electrode may be implemented to be disposed between the two or more heater groups.
  • the PCR device may further include an electrochemical signal measuring module that is electrically connected to the detection electrode and implemented to measure in real time an electrochemical signal generated in the reaction channel of the PCR reaction unit.
  • the PCR reaction unit may be repeatedly spaced apart across the cross section in the longitudinal direction of the reaction channel, but formed in one region inside the reaction channel to capture and complementarily bind to one region of the amplification target nucleic acid.
  • the PCR device may further include an electrochemical signal measuring module that is electrically connected to the detection electrode and implemented to measure in real time an electrochemical signal generated in the reaction channel of the PCR reaction unit.
  • the heater unit can be amplified and rapidly amplified a plurality of nucleic acid samples simultaneously and rapidly using a thermal block and plate-shaped PCR reaction unit repeatedly arranged, and the nucleic acid amplification process is real-time by measuring a continuous optical signal or an electrochemical signal. You can check with
  • FIG. 1 illustrates a PCR thermal block 100 in which two or more heaters 111 and 121 are repeatedly implemented.
  • FIG. 7 is a photograph showing a non-uniform radial heat distribution generated when power is supplied to individual heaters to which a compensation pattern is not applied.
  • FIG 9 illustrates a PCR column block 100 according to a first embodiment of the present invention to which a compensated pattern 1000 is applied.
  • FIG. 10 illustrates a compensation pattern including a gap 1100 formed in a portion of the heater 111 in the PCR thermal block according to the first embodiment of the present invention.
  • FIG. 11 illustrates a compensation pattern in which a line width of a gap formed in a portion of the heater 111 is implemented in the PCR thermal block according to the first embodiment of the present invention.
  • FIG. 12 illustrates a compensation pattern in which a thickness of a part of the heater 111 is implemented in the PCR thermal block according to the first embodiment of the present invention.
  • FIG. 13 illustrates a compensation pattern in which a material of at least one portion of the heater 111 is implemented differently in the PCR thermal block according to the first embodiment of the present invention.
  • FIG. 14 illustrates a compensation pattern in which different arrangements of at least one portion of the heater 111 are implemented in the PCR thermal block according to the first embodiment of the present invention.
  • FIG. 15 is a photograph showing a heat distribution generated from a PCR heat block according to a first embodiment of the present invention.
  • 16 is a graph showing the heat distribution generated from the PCR heat block according to the first embodiment of the present invention.
  • FIG. 17 illustrates a PCR reaction section 300 in thermal contact with a PCR thermal block.
  • FIG. 18 illustrates a PCR chip in which the PCR thermal block 100 and the PCR reaction unit 300 are integrally implemented.
  • FIG. 19 illustrates a PCR device in which the PCR thermal block 100 and the PCR reaction unit 300 are implemented separately.
  • FIG. 20 illustrates a PCR implemented through a PCR apparatus including a PCR thermal block 100 in which heaters to which a compensation pattern is applied according to a first embodiment of the present invention are repeatedly arranged.
  • 21 is an optical real-time implemented through a PCR apparatus including a PCR thermal block 100, a light source 150, and a light detector 600 in which heaters to which a compensation pattern is applied according to a first embodiment of the present invention are repeatedly arranged. PCR is shown.
  • 22-25 illustrate another type of PCR reaction unit 900 in thermal contact with the PCR thermal block of FIGS. 12-16.
  • 26 is a PCR implemented through a PCR apparatus including a PCR thermal block 100 in which heaters to which a compensation pattern is applied according to a first embodiment of the present invention are repeatedly arranged and the PCR reaction unit 900 of FIGS. 22 to 25. To show.
  • FIG. 27 is a PCR thermal block 100 in which heaters to which a compensation pattern is applied according to a first embodiment of the present invention are repeatedly arranged, a PCR reaction unit 900 of FIGS. 22 to 25, a detection electrode 950, and a signal measurement An electrochemical real-time PCR is shown implemented through a PCR device having a module 800.
  • 28-31 illustrate another type of PCR reaction unit 900 in thermal contact with the PCR thermal block of FIGS. 12-16.
  • FIG. 32 is a PCR implemented through a PCR apparatus including a PCR thermal block 100 in which heaters to which a compensation pattern is applied according to a first embodiment of the present invention are repeatedly arranged and the PCR reaction unit 900 of FIGS. 28 to 31. To show.
  • PCR thermal block 100 repeatedly arranged with heaters to which a compensation pattern is applied according to a first embodiment of the present invention, a PCR reaction unit 900 of FIGS. 28 to 31, an immobilization layer 940, Electrochemical real-time PCR is shown implemented through a PCR device having a detection electrode 950 and a signal measurement module 800.
  • PCR Polymerase Chain Reaction
  • a PCR device may prepare a solution containing a PCR sample and a reagent comprising double stranded DNA as a template nucleic acid at a specific temperature, for example about 95 ° C.
  • a PCR thermal block and a PCR device including the same refers to a device including modules for performing the above steps, and a detailed module not described herein is one of the prior art for performing PCR. It is assumed that all are provided in the range disclosed or self-explanatory.
  • FIG. 1 illustrates a PCR thermal block 100 in which two or more heaters 111 and 121 are repeatedly implemented
  • FIGS. 2 to 6 are arrangements of heaters implementing the PCR thermal block 100 according to an embodiment of the present invention. The structure is shown.
  • embodiments of the present invention are based on the premise that two or more heaters 111 and 121 are repeatedly arranged on a PCR heat block 100 for supplying heat to a PCR solution.
  • the PCR thermal block 100 is a module for supplying heat to a sample and a reagent at a specific temperature to perform a PCR solution, that is, PCR, and at least one surface of the PCR reaction unit 900 in which the sample and the reagent are accommodated. In order to perform PCR by supplying heat to the PCR solution through thermal contact with one surface of the PCR reaction unit 900.
  • the PCR thermal block 100 is based on the substrate 99.
  • the substrate 99 is made of a material such that physical or chemical properties thereof do not change due to heating of the heaters 111 and 121 disposed on the surface thereof, and heat exchange does not occur frequently between two or more heaters.
  • the substrate 99 may be made of a material such as plastic, glass, silicon, or the like, and may be implemented to be transparent or translucent as necessary.
  • the PCR thermal block 100 has a generally thin plate shape, for example, about 50 nanometers (nm) to 1 millimeter (mm) thick, preferably about 250 micrometers ( ⁇ m), for miniaturization and integration of the device. It may be implemented, but is not limited thereto. Two or more heaters are repeatedly arranged on the PCR thermal block 100.
  • the PCR thermal block 100 may include a heater group having one or more heaters, two or more heater groups, and the two or more heater groups. Two or more spaced heater units may be repeatedly arranged.
  • the contact surface of the PCR reaction unit 900 of the PCR thermal block 100 has various shapes, for example, a surface area ratio per volume, for efficiently supplying heat to the PCR reaction unit 900 containing the PCR solution. In order to increase the volume ratio, it may be implemented in a plane shape, a channel shape, or a pillar shape.
  • the heaters 111, 112, 121, 122, 131, and 132 are conductive heating elements disposed or printed on the substrate 99.
  • the heaters use joule heating, and thermoelectrics that cause a peltier effect. It may be implemented as a element (Thermoelement).
  • the heaters 111, 112, 121, 122, 131, and 132 may be operably connected to various power modules and control modules to maintain a constant temperature, and the heaters 111, 112, 121, 122, 131, and 132 may be driven. Can be operably connected to a sensor for monitoring the temperature of the sensor.
  • the heaters 111, 112, 121, 122, 131, and 132 have unit electrodes, that is, the heater electrodes are the surface center points of the heaters 111, 112, 121, 122, 131, and 132 in order to maintain a constant internal temperature thereof. It may be arranged symmetrically in the vertical and / or left and right directions with respect to.
  • the heaters (111, 112, 121, 122, 131, 132) is a metal material for fast heat transfer and conductivity, for example, from the group consisting of chromium, aluminum, copper, iron, silver, and carbon 1 It may be selected from the above or may be made of composite materials based thereon, but is not limited thereto.
  • the heaters 111, 112, 121, 122, 131, and 132 are light-transmitting heating elements, for example, oxide semiconductor materials or from the group consisting of In, Sb, Al, Ga, C, and Sn in the oxide semiconductor materials. It may include one or more materials selected from the group consisting of conductive nanoparticles, indium tin oxide, conductive polymer materials, carbon nanotubes, and graphene, including a material to which selected impurities are added.
  • the heater group 110, 120, 130 is a unit including the one or more heaters 111, 112, 121, 122, 131, and 132, and performs a denaturation step, annealing step, and / or extension step for PCR. It means a region for maintaining the temperature for.
  • the heater groups 110, 120, and 130 are disposed at least two in the PCR thermal block 100, and the two or more heater groups 110, 120, and 130 are spaced apart on the substrate 99. Two to four may be present in the PCR thermal block 100.
  • the first heater group maintains the PCR denaturation step temperature and the second heater group maintains the PCR annealing / extension step temperature, or The first heater group may maintain the PCR annealing / extension step temperature and the second heater group may maintain the PCR denaturation step temperature.
  • the first heater group maintains the PCR denaturation step temperature and the second heater group maintains the PCR annealing step temperature and the third heater group.
  • the heater group maintains the PCR extension step temperature, or the first heater group maintains the PCR annealing step temperature, the second heater group maintains the PCR extension step temperature, and the third heater group maintains the PCR denaturation step temperature Alternatively, the first heater group may maintain the PCR extension step temperature, the second heater group may maintain the PCR denaturation step temperature, and the third heater group may maintain the PCR annealing step temperature.
  • the heater group is disposed three times in the PCR thermal block 100 to maintain three temperatures for performing PCR, that is, a temperature for performing a denaturation step, an annealing step, and an extension step, and more preferably the The thermal block 100 may be disposed twice to maintain two temperatures for performing PCR, that is, a temperature for performing a denaturation step and an annealing / extension step, respectively.
  • the heater group is disposed twice on the PCR thermal block 100 to perform two steps for performing PCR, that is, a denaturation step and an annealing / extension step, three steps for performing a PCR, that is, a denaturation step, an annealing step, and PCR time can be shortened than performing the extension step, and the number of heaters is reduced, thereby simplifying the structure and increasing the density.
  • the temperature for performing the denaturation step is 85 °C to 105 °C, preferably 95 °C
  • the temperature for performing the annealing step is 40 °C to 60 °C, preferably Is 50 ° C.
  • the temperature for performing the extension step is 50 ° C. to 80 ° C., preferably 72 ° C.
  • the temperature for performing the denaturation step is 85 ° C. to 105 ° C.
  • the temperature for performing the annealing / extension step is 50 ° C. to 80 ° C., preferably 72 ° C.
  • the specific temperature and temperature range for performing the PCR can be adjusted within a known range in the PCR performance.
  • the heater groups 110, 120, and 130 may further include additional heaters for performing a temperature buffering role.
  • the heater units 10 and 20 are units including the two or more heater groups including the one or more heaters, and the first circulation including the denaturation step, annealing step, and / or extension step for performing PCR is completed. It means an area.
  • the heater units 10 and 20 may be repeatedly arranged in the PCR column block 100 at least two times as necessary.
  • the heater units 10 and 20 are 10, 20, 30 or 40 circuits in the PCR column block 100. May be repeated.
  • the PCR thermal block 100 includes heater units 10 and 20 repeatedly disposed on an upper surface thereof, two heater groups 110 and 120 respectively included therein, and one heater respectively included therein.
  • the first heater 111 maintains one temperature in the range of 85 ° C. to 105 ° C., preferably 95 ° C., so that the first heater group 110 provides a temperature for performing the modification step
  • the second The heater 121 maintains one temperature in the range of 50 ° C. to 80 ° C., preferably 72 ° C. such that the second heater group 120 provides a temperature for performing an annealing / extension step, thereby providing the PCR thermal block 100.
  • the PCR thermal block 100 includes heater units 10 and 20 repeatedly disposed on an upper surface thereof, two heater groups 110 and 120 included therein, and two heaters respectively included therein.
  • the first heater 111 has one temperature in the range of 85 ° C to 105 ° C
  • the second heater 112 has one temperature that is the same as or different from the temperature of the first heater 111 in the range of 85 ° C to 105 ° C.
  • the third heater 121 is one temperature in the range of 50 °C to 80 °C
  • the fourth heater 122 is 50 °C to 80
  • the second heater group 120 provides a temperature for performing the annealing / extension step so that the PCR thermal block 100 is
  • the first heater unit 10 and the second heater unit 20 may repeatedly provide two-stage temperature for performing PCR.
  • the PCR thermal block 100 includes heater units 10 and 20 repeatedly disposed on an upper surface thereof, three heater groups 110, 120 and 130 included therein, and 1 included in each of them.
  • three heaters 111, 121, and 131 three steps of temperature for performing PCR, that is, one temperature of the denaturation step, one temperature of the annealing step, and one temperature of the extension step can be sequentially provided.
  • the first heater 111 maintains one temperature in the range of 85 ° C. to 105 ° C., preferably 95 ° C., so that the first heater group 110 provides a temperature for performing the modification step.
  • the second heater 121 maintains one temperature in the range of 40 ° C.
  • step 10 and the second heater unit 20 three steps of temperature for performing PCR may be repeatedly provided sequentially.
  • the PCR thermal block 100 includes heater units 10 and 20 repeatedly disposed on an upper surface thereof, three heater groups 110, 120 and 130 included therein, and 2 included in each of them.
  • the three heaters 111, 112, 121, 122, 131, and 132 the three stage temperatures for performing PCR, that is, the two temperatures of the denaturation step, the two temperatures of the annealing step, and the two temperatures of the extension step are sequentially repeated.
  • the first heater 111 has one temperature in the range of 85 ° C to 105 ° C
  • the second heater 112 has one temperature that is the same as or different from the temperature of the first heater 111 in the range of 85 ° C to 105 ° C.
  • the third heater 121 is in the temperature range of 40 °C to 60 °C 1
  • the fourth heater 122 is 40 °C to Maintaining one temperature equal to or different from the temperature of the third heater 121 in the range of 60 ° C.
  • the second heater group 120 provides a temperature for performing the annealing step
  • the fifth heater 131 is 50 ° C.
  • the third heater group 130 extends by maintaining the first temperature equal to or different from the temperature of the fifth heater 131 within the temperature range of 50 ° C. to 80 ° C., and the sixth heater 132.
  • the PCR thermal block 100 is a three step for performing PCR in the first heater unit 10 and the second heater unit 20 It may also provide a sequentially repeated.
  • two or more heaters 111, 112, 121, 122, 131, and 132 maintaining a constant temperature may be repeatedly disposed on the PCR heat block 100, thereby greatly increasing the temperature change rate per hour.
  • the rate of temperature change between the heaters This can be made within the range of 20 °C to 40 °C per second can greatly shorten the PCR time.
  • the repeated batch heater structure According to the repeated batch heater structure according to the embodiment of the present invention, accurate temperature control is possible in the denaturation step, annealing step, and extension step (or the denaturation step and annealing / modification step) of PCR, and also heat from the heaters. It is possible to maintain the desired temperature or temperature range only at the site where the supply is made.
  • a PCR cycle may be variously implemented.
  • the heater unit may be repeatedly arranged ten times when it is to be applied to a PCR having 10 cycles. That is, the heater unit may be repeatedly arranged on the PCR thermal block 100 in 10, 20, 30, 40, 50, etc. in consideration of the intended PCR cycle.
  • the heater unit may be repeatedly arranged in half the number of predetermined PCR cycles.
  • the heater unit may be repeatedly arranged ten times when it is to be applied to a PCR having 20 cycles.
  • the sample and reagent solution are repeated 10 times of the PCR circulation cycle from the inlet to the outlet in the reaction channel of the PCR reaction unit, which will be described in detail below. Can be run repeatedly.
  • FIG. 6 illustrates a power supply unit 200 implemented to supply power to a PCR thermal block 100 and a heater repeatedly disposed in the PCR thermal block 100 according to an embodiment of the present invention.
  • the top of FIG. 6 shows a vertical cross-sectional view of the PCR column block 100
  • the bottom of FIG. 6 shows a top view of the PCR column block 100.
  • the PCR thermal block 100 of FIG. 6 includes a heater unit that is repeatedly disposed ten times, and the heater unit includes a first heater group and a second heater group, and the first heater group and the second heater group, respectively.
  • One heater, that is, the first heater 110 and the second heater 120 is included.
  • the power supply unit 200 is a module for supplying power to the PCR thermal block 100 by heating from a power supply source, the wiring (210, 220) implemented to distribute the power to each of the heaters (110, 120) Include.
  • the first wiring 210 of the PCR thermal block 100 is connected to supply power to the first heater 110
  • the second wiring 220 is connected to the first wiring 110. 2 is connected to supply power to the heater (120).
  • the first heater 110 maintains the PCR denaturation step temperature, for example 85 °C to 105 °C and the second heater 120 maintains the PCR annealing / extension stage temperature, for example 50 °C to 80 °C
  • the second wiring 220 is the PCR annealing / extension step temperature from the power supply unit 200 Power can be supplied for maintenance.
  • the first wire 210 and the second wire 220 may be implemented with a conductive material such as gold, silver, copper, but is not limited thereto.
  • FIG. 7 is a photograph showing a non-uniform radial heat distribution generated when powering individual heaters to which a compensation pattern is not applied.
  • the photograph shows the uneven heat overlap between adjacent heaters 111 and 121 according to the uneven radial heat distribution generated from the individual heaters.
  • a radial heat distribution is formed when a single heater whose overall edge is rectangular is heated by power supply.
  • a single heater having an overall rim has a rectangular shape in which the heat is generated in the central region of the heater when the constant temperature is maintained after power supply, and heat is generated at a high temperature. Compared to the edge portion is a low temperature heating. Due to this non-uniform heating phenomenon, radial heat distribution is observed around the single heater as shown in FIG. 7. This radial heat distribution provides a cause for increasing thermal nonuniformity due to thermal overlap between adjacent heaters in a PCR heat block in which two or more rectangular heaters are repeatedly arranged. According to FIG.
  • FIG 9 illustrates a PCR column block 100 according to a first embodiment of the present invention to which a compensated pattern 1000 is applied.
  • the PCR heat block 100 may prevent the non-uniform thermal overlap between adjacent heaters according to the radial heat distribution generated from the individual heaters 111 and 121.
  • Compensated pattern (1000) for controlling the thermal uniformity of the heater surface by adjusting the resistance of at least a portion of the 111, 121.
  • the compensation pattern 1000 refers to a processed pattern structure for controlling the resistance and heat dissipation amount of the heater part by modifying the shape, material, size, and arrangement of at least one part of the rectangular heater.
  • the compensation pattern 1000 may be implemented in various ways according to the characteristics of the rectangular heater, for example, by repeatedly forming a gap in at least a portion of the heater to implement the gap pattern or the wavelength pattern, or at least the heater.
  • the material of one part may be implemented differently from other parts, the size of at least one part of the heater may be implemented differently from other parts, or the unit electrode of at least one part of the heater, that is, the arrangement of the heater electrodes may be implemented differently from other parts. have.
  • the compensation pattern 1000 may be evenly applied to the entire area of the heater, but in some cases, the compensation pattern 1000 may be applied only to a partial area of the heater or may be implemented differently in each heater repeatedly arranged.
  • the heater having the compensation pattern includes photolithography, electroplating, shadow mask, and the like on the substrate.
  • Evaporator Deposition, Shadow Mask and Sputter Deposition, Ink Jet, Gravure, Gravure-Offset, Screen Printing, CNC Machining It can be implemented by a manufacturing method selected from the group consisting of computerized numerically controlled machine tool, laser beam machining, and electrical discharge machining.
  • FIG. 10 illustrates a compensation pattern having a gap 1100 formed in a portion of the heater 111 in the PCR thermal block according to the first embodiment of the present invention.
  • the compensation pattern 1000 may be formed by repeatedly forming a gap 1100 in at least a portion of the heater 111 to adjust the resistance according to the gap pattern to adjust thermal uniformity of the heater surface.
  • the gap 1100 is a shape in which at least one portion of the heater 111 is modified, and refers to a processing pattern having a heater shape, such as a recessed area, a protruding area, or a gap.
  • the gap 1100 may be variously implemented on the surface of the heater 111.
  • the identification number 1100a indicates a convex gap
  • the identification number 1100b indicates a concave gap
  • the identification number 1100c indicates a gap. Indicates.
  • the gap 1100 may be repeatedly implemented on the heater rim surface to be implemented in a wave shape, which is implemented by the rim surface of the heater 111 in the form of a continuous recessed area and a protruding area. Accordingly, the shape of the heater surface may be variously implemented by the various gaps 1100 structures, and thus, the amount of heat dissipation may be controlled by adjusting the resistance of at least one portion of the heater. Meanwhile, the gap 1100 may be disposed on at least one surface of the heater 111 but may be implemented in various standards. For example, the size of the gap 1100 or the width of the gap may be variously implemented on any surface of each heater 111.
  • the resistance of at least two or more regions of the heater may be adjusted, respectively, and as a result, a uniform heat distribution of each heater may be realized by adjusting the amount of heat released. Can be.
  • FIG. 11 illustrates a compensation pattern in which a line width of a gap formed in a portion of the heater 111 is implemented in the PCR thermal block according to the first embodiment of the present invention.
  • the compensation pattern 1000 may be one in which the thermal uniformity of the surface of the heater is controlled by controlling the resistance by differently implementing a line width of a gap repeatedly formed in at least a portion of the heater 111.
  • the compensation pattern 1000 whose thermal uniformity is adjusted by adjusting the resistance according to the line width is implemented by varying the line width of at least one portion of the heater 111 to deform the resistance of at least one portion of the heater to each position of the heater. It means the processing form to control the amount of heat generated by the star.
  • the line width-compensated pattern may be variously implemented in a structure in which a gap is repeatedly formed on the heater surface.
  • the line width-compensated pattern may be evenly applied to the entire region of the heater 111, but may be applied to a partial region of the heater 111 in some cases.
  • the PCR thermal block 100 according to the first embodiment of the present invention may be implemented in a different line width in any partition section formed on at least two or more surfaces of the heater 111. That is, a plurality of partition sections A, B, and C of the heater surfaces may be determined, and the amount of heat generated in the heater region corresponding to each of the partition sections A, B, and C may be adjusted.
  • the partition sections A and C are The line width is narrower than the compartment section B, which has a relatively high resistance, resulting in higher calorific value, while the compartment section B has a wider line width than the compartment sections A and C, which has a relatively low resistance, resulting in lower heat generation. do.
  • the high temperature part of the existing rectangular heater is low resistance
  • the high temperature part is high resistance to adjust the heat discharge amount to reduce the overall temperature unevenness It can be improved.
  • FIG. 12 illustrates a compensation pattern in which a thickness of a portion of the heater 111 is implemented in the PCR thermal block according to the first embodiment of the present invention.
  • the compensating pattern 1000 may be one in which the thermal uniformity of the surface of the heater is adjusted by controlling the resistance by implementing a different thickness of at least a portion of the heater 111.
  • the pattern 1000 in which the thickness of at least one portion of the heater 111 is compensated for may vary the resistance of at least one portion of the heater 111 by implementing different thicknesses of the at least one portion of the heater 111. It means a processing form for adjusting the amount of heat generated by the position of the heater 111.
  • the thickness-compensated pattern 1000 may be a convex surface and a concave surface continuously arranged repeatedly on the surface of the heater 111 to implement a different thickness of the convex surface or concave surface,
  • the thickness is realized in the range of about 0.001 micrometer ( ⁇ m) to 1 millimeter (mm), but is not limited thereto.
  • the thickness-compensated pattern 1000 may be applied evenly to the entire region of the heater 111, but may be applied to a partial region of the heater in some cases.
  • the PCR thermal block 100 according to the first embodiment of the present invention may be implemented in a different thickness in any partition section formed on at least two or more surfaces of the heater 111.
  • a plurality of partition sections A, B, and C of the heater surfaces may be determined, and the amount of heat generated in the heater region corresponding to each of the partition sections A, B, and C may be adjusted.
  • the thickness of the convex surface of the partition sections (A, B, C) when comparing the thickness of the convex surface of the partition sections (A, B, C), partition sections A and C are Compared with the partition sections B, the thickness is implemented to have a relatively high resistance, resulting in a higher heat generation, whereas the partition section B is thicker than the sections A and C, and thus has a relatively low resistance, resulting in lower heat generation.
  • the high temperature part of the existing rectangular heater lowers the resistance, and the high temperature part adjusts the resistance and adjusts the heat dissipation amount to adjust the unevenness of the overall temperature. It can be improved.
  • FIG. 13 illustrates a compensation pattern in which a material of at least one portion of the heater 111 is implemented differently in the PCR thermal block according to the first embodiment of the present invention.
  • the compensating pattern 1000 may adjust the resistance by differently implementing materials of at least a part of the heater 111 to adjust thermal uniformity of the heater surface.
  • the pattern 1000 compensated for the material may be implemented by differently implementing the material of at least one portion of the heater 111 to modify the resistance of at least one portion of the heater 111 to control the amount of heat generated by the location of the heater. It means form.
  • the material of the heater may be a composite material selected from the group consisting of at least one selected from the group consisting of chromium, aluminum, copper, iron, silver, and carbon, and is not particularly limited as long as it is a conductive material.
  • the pattern 1000 compensated for the material may be uniformly applied to the entire region of the heater 111, but may be applied to a partial region of the heater in some cases.
  • the PCR thermal block 100 according to the first embodiment of the present invention may be implemented in a different material in any partition section formed on at least two or more surfaces of the heater 111. That is, a plurality of partition sections A, B, and C of the heater surfaces may be determined, and the amount of heat generated in the heater region corresponding to each of the partition sections A, B, and C may be adjusted. For example, in the PCR thermal block 100 according to the first embodiment of the present invention according to FIG.
  • Sections A and C are made of a material with a higher resistivity than the section B, and thus have a higher resistance, resulting in a higher heat generation. The lower the resistance, the lower the amount of heat generated.
  • the high temperature part of the conventional rectangular heater has a low resistance
  • the high temperature part has a high resistance and adjusts the heat dissipation to adjust the unevenness of the overall temperature. It can be improved.
  • FIG. 14 illustrates a compensation pattern in which the arrangement of at least one portion of the heater 111 is implemented differently in the PCR thermal block according to the first embodiment of the present invention.
  • the compensation pattern 1000 may be configured to adjust at least one part of the heater 111 to adjust the resistance to adjust the thermal uniformity of the heater surface.
  • a gap 1100 for example, a convex gap or a concave gap is disposed on one surface of the heater 111 and the other surface corresponding thereto.
  • the heater electrodes 1110a and 1110b implemented in a bidirectional zigzag manner may be included.
  • the gap 1100 may be implemented in a zigzag manner on the corresponding surfaces of the heater electrodes 1110a and 1110b.
  • the PCR thermal block 100 is disposed away from the rectangular heater electrode 1500 and the rectangular heater electrode 1500, the heater electrode 1110a to which the compensation pattern 1000 is applied. 1110b). Furthermore, as shown in FIG. 14, the rectangular heater electrode 1500 is disposed in the center region of the heater 111, and the heater electrodes 1110a and 1110b to which the compensation pattern is applied are separated from the rectangular heater electrode 1500.
  • the heater electrodes 1110a and 1110b, which are spaced apart in both directions and to which the compensation pattern is applied, may be symmetrically based on the position of the rectangular heater electrode 1500.
  • the PCR thermal block 100 may be implemented by only the heater electrode including the compensation pattern 1000, but if necessary, the heater electrode to which the compensation pattern 1000 is applied and existing
  • the heater electrode to which the compensation pattern 1000 is applied and existing
  • the high temperature portion of the existing rectangular heater is low resistance
  • the high temperature portion of the high temperature resistance by adjusting the resistance and heat dissipation to adjust the overall temperature unevenness Can improve the degree.
  • Figure 16 is a graph showing a heat distribution generated from a PCR heat block according to a first embodiment of the present invention.
  • the PCR thermal block is implemented such that a heater having a compensation pattern in which convex gaps and concave gaps are continuously arranged repeatedly is repeatedly arranged on a substrate.
  • the PCR column block implements both the line width and the distance between the convex gaps of the partition sections A and C to 200 micrometers ( ⁇ m), and the line width and the distance between the convex gaps of the partition sections B to 400 micrometers. ( ⁇ m) was implemented to control the amount of heat generated in each section of the heater.
  • the line width and the distance between the gaps of the convex gaps were found to be adjustable within a range of about 50 nanometers (nm) to 1 millimeter (mm), and the thickness of the heater was realized to be 10 micrometers ( ⁇ m), but about 10 nanometers. It was found to be adjustable within the range of meters (nm) to 1 millimeter (mm).
  • the heat distribution of the PCR heat block according to an embodiment of the present invention is fairly uniform compared to the heat distribution of the conventional rectangular heater according to Figs.
  • the temperature peak point (circular dotted line) of the first heater 111 and the second heater 121 adjacent thereto of the PCR heat block according to the embodiment of the present invention is distinctly different from each other. It was confirmed that the thermal uniformity was significantly reduced and the thermal uniformity was increased. Based on this, when the power is supplied to the heater to which the compensation pattern is applied, and the temperature is maintained at a constant temperature, the temperature difference between the central region and the edge portion of the heater is reduced, indicating that the overall uniform heat distribution is formed. there was.
  • PCR heat block As described above, using the PCR heat block according to the first embodiment of the present invention, it is possible to precisely control the temperature can significantly increase the PCR efficiency through the PCR process and further simplify and integrate the control module Miniaturization of the PCR apparatus is possible, and the manufacturing process is expected to be simpler, thereby further securing economic efficiency.
  • FIG. 17 illustrates a PCR reaction unit 300 in thermal contact with a PCR thermal block.
  • the PCR reaction unit 300 is disposed on the first plate 310 and the first plate 310 that are attached or attached to the PCR thermal block 100 and the one or more reaction channels 303. And a second plate 320 having an inlet) and an inlet 304 and an outlet 305 at both ends of the one or more reaction channels 303, respectively, disposed on the second plate 320. It may include a third plate 330.
  • the PCR reaction unit 300 may be implemented in a variety of materials, but is preferably implemented in a thin film shape of a plastic material as a whole.
  • the PCR reaction unit 300 may be implemented with a light transmitting material, and if fluorescence, phosphorescence, luminescence, Raman spectroscopy, surface enhanced Raman scattering, Surface Enhanced Raman When used for optical measurement-based real-time PCR applications such as Scattering, and Surface Plasmon Resonance, the PCR reaction unit 300 is preferably implemented with a light transmissive material.
  • the first plate 310 is adhered to or attached to the PCR heat block 100 to receive heat from the PCR heat block 100.
  • the first plate 310 may be implemented with various materials, but preferably, polydimethylsiloxane (PDMS), cycloolefin copolymer (COC), polymethylmethacrylate (PMMA), or the like. ), Polycarbonate (PC), polypropylene carbonate (PPC), polyether sulfone (PES), and polyethylene terephthalate (PET), and combinations thereof
  • the material may be.
  • the top surface of the first plate 310 may be treated with a hydrophilic material (not shown), which allows the PCR to be performed smoothly.
  • a single layer including a hydrophilic material may be formed on the first plate 310.
  • the hydrophilic material may be a variety of materials, but preferably may be selected from the group consisting of carboxyl group (-COOH), amine group (-NH2), hydroxy group (-OH), and sulfone group (-SH), Treatment of the hydrophilic material can be carried out according to methods known in the art.
  • the second plate 320 is disposed on the first plate 310.
  • the second plate 320 includes one or more reaction channels 303.
  • the one or more reaction channels 303 are connected to portions corresponding to the inlet 304 and the outlet 305 formed in the third plate 330. Therefore, the PCR reaction proceeds after the target sample solution to be amplified is introduced into the one or more reaction channels 303.
  • the one or more reaction channels 303 may be present in two or more depending on the purpose and range of use, and according to FIG. 1, five reaction channels 303 are illustrated.
  • the second plate 320 may be made of various materials, but preferably, polymethylmethacrylate (PMMA), polycarbonate (PC), cycloolefin copolymer (cycloolefin copolymer, COC) , Polyamide (PA), polyethylene (PE), polypropylene (PP), polyphenylene ether (PPE), polystyrene (PS), polyoxymethylene (POM) Polyetheretherketone (PEEK), polytetrafluoroethylene (PTFE), polyvinylchloride (PVC), polyvinylidene fluoride (PVDF), polybutylene terephthalate (polybutylene terephthalate) , PBT), fluorinated ethylenepropylene (FEP), perfluoroalkoxyalkane (PFA), and combinations thereof It is chosen or a thermoplastic resin may be a thermosetting resin material.
  • the thickness of the second plate 320 may vary, but may be selected from 0.01 ⁇ m to 5 mm.
  • the width and length of the reaction channel 303 may vary, but preferably the width of the reaction channel 303 is selected from 0.001 mm to 10 mm, the length of the reaction channel 303 is 1 mm To 400 mm.
  • the inner wall of the second plate 320 may be coated with a material such as silane-based and Bovine Serum Albumin (BSA) to prevent DNA and protein adsorption. Treatment of the materials can be carried out according to methods known in the art.
  • BSA Bovine Serum Albumin
  • the third plate 330 is disposed on the second plate 320.
  • the third plate 330 includes an inlet portion 304 formed in one region on one or more reaction channels 303 formed in the second plate 320 and an outlet portion 305 formed in the other region.
  • the inlet 304 is a portion to which the target sample solution containing the nucleic acid to be amplified is introduced.
  • the outlet 305 is a portion where the target sample solution is discharged after PCR is completed.
  • the third plate 330 covers at least one reaction channel 303 formed in the second plate 320, wherein the inlet 304 and the outlet 305 are at least one reaction channel ( It serves as an inlet and outlet of 303).
  • the third plate 330 may be implemented with various materials, but preferably, polydimethylsiloxane (PDMS), cycloolefin copolymer (COC), polymethylmethacrylate (polymethylmetharcylate) , PMMA), polycarbonate (PC), polypropylene carbonate (PPC), polyether sulfone (PES), and polyethylene terephthalate (PET), and combinations thereof It may be a material selected from.
  • the inlet 304 may have various sizes, but preferably may be selected from 0.001 mm to 10 mm in diameter.
  • the outlet 305 may have a variety of sizes, but preferably may be selected from 0.001 mm to 10 mm in diameter.
  • the inlet 304 and the through-opening outlet 305 are provided with separate cover means (not shown) to target the PCR when the target sample solution proceeds in the one or more reaction channels 303.
  • the sample solution can be prevented from leaking.
  • the cover means may be implemented in various shapes, sizes or materials.
  • the thickness of the third plate 330 may vary, but preferably may be selected from 0.001 mm to 10 mm.
  • the inlet 304 and the outlet 305 may be present in two or more.
  • the PCR reaction unit 300 to form the inlet 304 and the outlet 305 through mechanical processing to provide the third plate (330);
  • the plate having a size corresponding to the bottom surface of the third plate 330 from the portion corresponding to the inlet portion 304 of the third plate 330 to the outlet portion 305 of the third plate 330 Forming one or more reaction channels 303 through mechanical processing to a corresponding portion to provide a second plate 320;
  • Providing a first plate 310 by forming a surface made of a hydrophilic material (not shown) through a surface treatment on an upper surface of a plate having a size corresponding to a lower surface of the second plate 320.
  • the inlet 304 and outlet 305 of the third plate 330, and one or more reaction channels 303 of the second plate 320 are injection molding, hot-embossing It can be formed by a processing method selected from the group consisting of embossing, casting, and laser ablation.
  • the hydrophilic material on the surface of the first plate 310 may be treated by a method selected from the group consisting of oxygen and argon plasma treatment, corona discharge treatment, and surfactant application and performed according to methods known in the art. Can be.
  • the lower surface of the third plate 330 and the upper surface of the second plate 320, the lower surface of the second plate 320 and the upper surface of the first plate 310 may be thermally bonded ( Thermal bonding, Ultrasonic Welding, Solvent Bonding, Hot Plate Welding, Ultraviolet Bonding, and Press Bonding processes, It can be carried out according to a known method.
  • a double-sided adhesive or a thermoplastic or thermosetting resin (not shown) may be processed between the third plate 330 and the second plate 320 and between the second plate 320 and the first plate 310. .
  • FIG. 18 illustrates a PCR chip in which the PCR thermal block 100 and the PCR reaction unit 300 are integrally implemented
  • FIG. 19 illustrates a PCR in which the PCR thermal block 100 and the PCR reaction unit 300 are separately implemented. The device is shown.
  • the PCR column block having the compensated pattern according to the first embodiment of the present invention can be applied to various PCR modules or devices.
  • the PCR heat block having the compensation pattern may be mounted on a PCR reaction unit containing a PCR solution and implemented as a PCR chip (chip embedded type, FIG. 18), and a separate PCR chip including the PCR reaction unit. It can be implemented with a PCR device implemented to overheat or separate (chip external, Fig. 19).
  • an insulating layer 306 may be formed on an upper surface of the PCR thermal block including the compensated pattern to prevent electrolysis of the PCR solution.
  • An insulating layer 307 for protecting a heater may be formed on an upper surface of the PCR thermal block.
  • the thickness of the insulating layers 306 and 307 is preferably about 20 micrometers ( ⁇ m), it has been confirmed that the thickness of the insulating films 306 and 307 may be implemented within a range of about 50 nanometers (nm) to 1 millimeter (mm).
  • the insulating film may be implemented with various materials to prevent electrolysis of the PCR solution.
  • the insulating film may be selected from the group consisting of oxide, nitride, thermosetting resin, thermoplastic resin, and UV curable resin. have.
  • the oxide is silicon oxide (SiO 2 ), titanium oxide (TiO 2 ), aluminum oxide (Al 2 O 3 ), hafnium oxide (HfO 2 ), vanadium oxide (V 3 O 4 ), zirconium Oxide (ZrO 2 ), antimony oxide (Sb 2 O 3 ), and yttrium oxide (Y 2 O 3 ), wherein the nitride is silicon nitride (Si 3 N 4 ), titanium nitride (TiN), aluminum nitride (AlN), tantalum nitride (Ta 3 N 5 ), hafnium nitride (HfN), vanadium nitride (VN), and zirconium nitride (ZrN),
  • the thermosetting resin is a phenol resin (Phenol Resin), epoxy resin (Epoxy Resin), urea resin (Urea Resin), melamine resin (Melamine Resin), alkyd resin (Polyester Res
  • the UV curable resin may be selected from epoxy acrylate, polyester acrylate, urethane acrylate, polybutadiene acrylate, and silicone acrylate. Acrylate), and alkyl acrylate (Alkyl Acrylate).
  • the insulating film is photolithography, electroplating, shadow mask and evaporator deposition, shadow mask and sputter deposition on the upper surface of the PCR thermal block. (Sputter Deposition, Ink jet, Gravure, Gravure-Offset, and Screen Printing) can be implemented by a manufacturing method selected from the group consisting of.
  • FIG. 20 illustrates a PCR implemented through a PCR apparatus including a PCR thermal block 100 in which heaters to which a compensation pattern is applied according to a first embodiment of the present invention are repeatedly arranged.
  • a PCR device includes a PCR reaction unit 300, a power supply 400, and a pump 500. Specifically, the PCR reaction unit 300 is in contact with the PCR heat block.
  • the power supply 400 is a module for supplying power to the power supply 200, and may be connected to the first wire 210 and the second wire 220 of the power supply 200, respectively.
  • a first power port (not shown) of the power supply 400 is electrically connected to the first wiring 210
  • a second power port (shown in the power supply 400) is shown. Not connected) is electrically connected to the second wiring 220.
  • the power supply 400 supplies power to the first wiring 210 and the second wiring 220, respectively, so that the first heater and the second heater of the PCR thermal block.
  • the heaters can be heated quickly, and when each heater reaches a predetermined temperature, the power supply is controlled to maintain the predetermined temperature.
  • the predetermined temperature may be a PCR denaturation step temperature (85 ° C. to 105 ° C., preferably 95 ° C.) in the first heater and a PCR annealing / extension step temperature (50 ° C. to 80 ° C., Preferably 72 ° C.) or PCR annealing / extension step temperature (50 ° C. to 80 ° C., preferably 72 ° C.) in the first heater and PCR denaturation step temperature (85 ° C. to 105 ° C., in the second heater).
  • 95 ° C Preferably 95 ° C).
  • the pump 500 is a module for controlling the flow rate and the flow rate of the fluid flowing in the one or more reaction channels 303 of the PCR reaction unit 300, may be a positive pressure pump or a negative pressure pump, for example It may be a syringe pump.
  • the pump 500 may be operably disposed in a portion of the reaction channel 303, but preferably the inlet 304 and / or outlet 305 formed at both ends of the reaction channel 303. Is placed connected to).
  • the pump 500 When the pump 500 is connected to the inlet 304 and / or outlet 305, it serves as a pump as well as a target sample through the inlet 304 and / or outlet 305. It can also act as a stopper to prevent leakage of the solution.
  • the pump 500 may include one of the inlet 304 and the outlet 305. It can be connected to only one, and a general stopper can be sealedly connected to the remaining one, the pump (if you want to control the flow rate and flow rate of the fluid flowing in the reaction channel 303, i. 500 may be connected to both the inlet 304 and the outlet 305.
  • the nucleic acid amplification reaction of the PCR solution in the PCR device including the PCR reaction unit 300, the power supply 400, and the pump 500 may be performed through the following steps.
  • oligonucleotide primer having a sequence complementary to the specific nucleotide sequence to be amplified
  • DNA polymerase DNA polymerase
  • dNTP deoxyribonucleotide triphosphates
  • PCR reaction buffer Prepare a PCR solution containing.
  • the PCR solution is introduced into the PCR reaction unit 300.
  • the PCR solution is disposed in the reaction channel 303 inside the PCR reaction unit 300 through the inlet 304.
  • the power supply unit 200 specifically, the first wiring 210 and the second wiring 220 are connected to the power supply 400, respectively, the inlet 304 of the PCR reaction unit 300 And the outlet 305 is sealedly connected to the pump 500.
  • the power supply unit 400 is instructed to supply power to heat the first heater and the second heater through the first wire 210 and the second wire 220, and generate a specific temperature, for example.
  • the PCR denaturation step temperature (95 ° C.) for the first heater and the PCR annealing / extension step temperature (72 ° C.) are maintained for the second heater.
  • the target sample solution is transferred to the reaction channel 303. Allow it to flow horizontally from the inside.
  • the flow rate and flow rate of the PCR solution may be controlled by adjusting the strength of the positive pressure or the negative pressure provided by the pump 500.
  • the PCR solution lengthens the upper corresponding portion of the first heater and the upper corresponding portion of the second heater from the inlet 304 end to the outlet 305 end of the reaction channel 303.
  • the PCR solution is supplied with heat from a heat block 100 in which a heater unit including the first heater and the second heater is disposed 10 times, and denatures the PCR in an upper corresponding portion of the first heater.
  • the PCR annealing / extension step is performed in the step and the upper corresponding portion of the second heater to complete the 10 PCR cycles.
  • the PCR solution is then longitudinally directed to the upper corresponding portion of the first heater and the upper corresponding portion of the second heater from the outlet 305 end of the reaction channel 303 to the inlet 304 end.
  • the PCR can be performed again while moving backward.
  • 21 is an optical real-time implemented through a PCR apparatus including a PCR thermal block 100, a light source 150, and a light detector 600 in which heaters to which a compensation pattern is applied according to a first embodiment of the present invention are repeatedly arranged. PCR is shown.
  • a PCR device includes a PCR reaction part 300 made of a light transmissive material and a light source 150 between the first heater 110 and the second heater 120. It includes a thermal block 100, a power supply 400, a pump 500 and a light detector 600 disposed.
  • the PCR reaction unit 300 according to FIG. 21 is implemented with a light transmissive material, and the light source 150 is disposed between the first heater 110 and the second heater 120 of the PCR heat block 100. It is done.
  • the PCR apparatus further includes a light detector 600 for detecting the light emitted from the light source 150. Therefore, the PCR device can measure and analyze the nucleic acid amplification process in real-time during PCR. In this case, a separate fluorescent substance may be further added to the PCR solution, which induces a measurable light signal by emitting light with a specific wavelength according to the generation of the PCR product.
  • the light source 150 may be a mercury arc lamp, a xenon arc lamp, a tungsten arc lamp, a metal halide arc lamp, a metal halide optical fiber fiber) and LEDs (Light Emitting Diodes).
  • the wavelength of the light source 150 may be selected within a range of about 200 nanometers (nm) to 1300 nanometers (nm), and may be implemented in multiple wavelengths using multiple light sources or filters.
  • the light detector 600 may be selected from a group consisting of a charge-coupled device (CCD), a charge-injection device (CID), a complementary-metal-oxide-semiconductor detector (CMOS), and a photo multiplier tube (PMT). Can be.
  • CCD charge-coupled device
  • CID charge-injection device
  • CMOS complementary-metal-oxide-semiconductor detector
  • PMT photo multiplier tube
  • the light source 150 may be disposed in a space between the first heater 110 and the second heater 120.
  • the light source 150 may be operably connected to a lens (not shown) that collects the light emitted from the light source 150 and an optical filter (not shown) that filters light of a specific wavelength band. .
  • the PCR solution may denature the PCR while successively passing through the upper corresponding portion 301 of the first heater 110 and the upper corresponding portion 302 of the second heater 120 in the reaction channel 303.
  • Step and PCR annealing / extension step in which case the PCR solution is between the first heater 110 and the second heater 120 and between the first heater 110 and the second heater 120 Between the heater unit to pass through the upper corresponding portion of the light source 150.
  • the light detector 600 passes through the optical transparent PCR reaction unit 300, specifically, the reaction channel 330, and measures and analyzes the optical signal generated by nucleic acid amplification in the reaction channel 330.
  • the amount of target nucleic acid is monitored in real-time by monitoring the result of the reaction by amplification of nucleic acid (with fluorescent substance bound) in the reaction channel 303 during each cycle of PCR. -time) can be measured and analyzed.
  • 22-25 illustrate another type of PCR reaction unit 900 in thermal contact with the PCR thermal block of FIGS. 12-16.
  • the PCR reaction unit 900 according to FIGS. 22 to 25 is repeatedly spaced apart across the bottom surface in the longitudinal direction of the reaction channel, and the electrochemical signal generated due to the binding of the amplifying nucleic acid and the active material inside the reaction channel. And a detection electrode configured to detect, wherein the detection electrode is disposed between the two or more heater groups in thermal contact with the heat block.
  • the PCR reaction unit 900 is implemented in a plate shape, at least one reaction channel 921 having the inlet part 931 and the outlet part 932 implemented at both ends, and in the longitudinal direction of the reaction channel 921.
  • the PCR reaction unit 900 is a nucleic acid, for example, a template nucleic acid double stranded DNA, which is a PCR sample, an oligonucleotide primer having a sequence complementary to a specific nucleotide sequence to be amplified, a PCR reagent, DNA polymerase, and triphosphate deoxyribo.
  • the PCR reaction unit 900 includes an inlet 931 for introducing the sample and reagent, an outlet 932 for discharging the solution having completed the nucleic acid amplification reaction, and a nucleic acid amplification reaction of the sample and reagent.
  • Reaction channel 921 is provided. Referring to FIG. 22, the reaction channel 921 may be disposed to extend in a longitudinal direction through an upper corresponding portion of the first heater and an upper corresponding portion of the second heater.
  • the PCR reaction unit 900 may receive heat from the heat block 100, and PCR samples and reagents included in the reaction channel 921 of the PCR reaction unit 900 may be heated and maintained.
  • the PCR reaction unit 900 is implemented in a plate shape as a whole so as to increase the thermal conductivity and have two or more reaction channels 921.
  • the PCR reaction unit 900 may be implemented as a plastic material of a transparent or opaque material, the thickness of the plastic material can be easily adjusted to increase the heat transfer efficiency only by adjusting the thickness, the manufacturing process is simple You can save money.
  • the active material is defined as a substance that chemically reacts (couples) with the amplifying nucleic acid to generate an electrochemical signal
  • the electrochemical signal can be continuously detected and measured according to the continuous amplification of the nucleic acid Say a signal.
  • a double stranded nucleic acid DNA
  • the amplified nucleic acid reacts with the active material as a result of continuous amplification of the nucleic acid, thereby detecting a change in total charge amount. Can be derived.
  • the electrochemical signal may be due to the change in the total current value due to the combination of the negative charge of the amplified nucleic acid and the positive charge of the active material
  • the active material may be a cationic material in the ionization product of the ion-binding material have.
  • the ionizable material may be methylene blue
  • the active material may be a cationic material in the ionization product of methylene blue.
  • the methylene blue (C 16 H 18 N 3 SCl.3H 2 O) is ionized when dissolved in a solvent and ionized with C 16 H 18 N 3 S + and Cl ⁇ , in the case of the former is positively charged by a sulfur atom (S).
  • Double-stranded nucleic acid is composed of sugar, base and phosphoric acid, of which the phosphate group is negatively charged, double-stranded nucleic acid (DNA) is negatively charged as a whole.
  • the cation of methylene blue binds to the phosphate group of DNA, reducing the apparent diffusion of methylene blue bound to the double-stranded nucleic acid rather than the apparent diffusion of methylene blue, thus reducing the peak value of the current. Therefore, as the PCR cycle proceeds, the double-stranded nucleic acid (DNA) is amplified and the amount of methylene blue bound to the double-stranded nucleic acid (DNA) increases, resulting in a decrease in the peak value of the current. Real-time quantification of amplified nucleic acids is possible through an electrical signal due to chemical bonding of.
  • the detection electrode 950 may be formed of various materials to detect an electrochemical signal generated by the combination of an amplifying nucleic acid and an active material in the one or more reaction channels 921, for example, gold (Au ), Cobalt (Co), platinum (Pt), silver (Ag), carbon nanotubes (carbon nanotube), graphene (graphene), and carbon (carbon) may be selected from one or more.
  • the detection electrode 950 is repeatedly spaced apart across the bottom surface in the longitudinal direction of the reaction channel 921, and the detection electrode 950 is the two or more heater groups in thermal contact with the thermal block 100. It is implemented to be disposed between (110, 120, 130). Referring to FIG.
  • the detection electrodes 950 are repeatedly spaced at regular intervals from the inlet 931 to the outlet 932 at regular intervals.
  • the electrochemical signal may be repeatedly detected from the nucleic acid sequentially amplified while passing through the channel 921 in the longitudinal direction.
  • the detection electrode 950 is disposed on the bottom surface of the reaction channel 921.
  • the PCR reaction unit 900 may be divided into three layers based on the vertical cross-sectional view.
  • the PCR reaction unit 900 may include a first plate 910 provided with the detection electrode 950; A second plate 920 disposed on the first plate 910 and provided with the one or more reaction channels 921; And a third plate 930 disposed on the second plate 920 and provided with the inlet part 931 and the outlet part 932.
  • An upper surface of the first plate 910 provided with the detection electrode 950 is adhesively disposed on a lower surface of the second plate 920.
  • the first plate 910 is adhered to the second plate 920 having the reaction channel 921 to secure a space with respect to the reaction channel 921, and further, at least the reaction channel 921.
  • the detection electrode 950 is disposed in one region (surface).
  • the first plate 910 may be implemented in a variety of materials, preferably polydimethylsiloxane (PDMS), cycloolefin copolymer (cycle olefin copolymer, COC), polymethyl methacrylate (polymethylmetharcylate) , PMMA), polycarbonate (PC), polypropylene carbonate (PPC), polyether sulfone (PES), and polyethylene terephthalate (PET), and combinations thereof It may be a material selected from.
  • a hydrophilic material (not shown) may be processed on the upper surface of the first plate 910 to smoothly perform PCR.
  • hydrophilic material By treating the hydrophilic material, a single layer including a hydrophilic material may be formed on the first plate 910.
  • the hydrophilic material may be a variety of materials, but preferably may be selected from the group consisting of carboxyl group (-COOH), amine group (-NH2), hydroxy group (-OH), and sulfone group (-SH), Treatment of the hydrophilic material can be carried out according to methods known in the art.
  • the second plate 920 includes the reaction channel 921.
  • the reaction channel 921 is connected to a portion corresponding to the inlet portion 931 and the outlet portion 932 formed on the third plate 910 so that the inlet portion 931 and the outlet portion 932 are implemented at both ends.
  • the reaction channel 921 may be present in two or more depending on the purpose and range of use.
  • the second plate 920 may be formed of various materials, but preferably, polymethylmethacrylate (PMMA), polycarbonate (PC), cycloolefin copolymer (cycloolefin copolymer, COC) , Polyamide (PA), polyethylene (PE), polypropylene (PP), polyphenylene ether (PPE), polystyrene (PS), polyoxymethylene (POM) Polyetheretherketone (PEEK), polytetrafluoroethylene (PTFE), polyvinylchloride (PVC), polyvinylidene fluoride (PVDF), polybutylene terephthalate (polybutylene terephthalate) , PBT), fluorinated ethylenepropylene (FEP), perfluoroalkoxyalkane (PFA), and combinations thereof It is chosen or a thermoplastic resin may be a thermosetting resin material.
  • the thickness of the second plate 920 may vary, but may be selected from 10 ⁇ m to 2000 ⁇ m.
  • the width and length of the reaction channel 921 may vary, but preferably, the width of the reaction channel 921 is selected from 0.001 mm to 10 mm, the length of the reaction channel 921 is 1 mm To 400 mm.
  • the inner wall of the second plate 920 may be coated with a material such as silane-based and Bovine Serum Albumin (BSA) to prevent DNA and protein adsorption.
  • BSA Bovine Serum Albumin
  • the lower surface of the third plate 930 is disposed on the upper surface of the second plate 920.
  • the third plate 930 includes an inlet portion 931 formed in one region on the reaction channel 921 formed in the second plate 920 and an outlet portion 932 formed in the other region.
  • the inlet portion 931 is a portion into which the PCR sample and the reagent are introduced.
  • the outlet 932 is a portion where the PCR product flows out after the PCR is completed. Accordingly, the third plate 930 covers the reaction channel 921 formed in the second plate 920, but the inlet part 931 and the outlet part 932 are the inlet part of the reaction channel 921 and the same. It will act as an outlet.
  • the third plate 930 may be made of various materials, but preferably, polydimethylsiloxane (PDMS), cycloolefin copolymer (CCO), polymethylmethacrylate (polymethylmetharcylate) , PMMA), polycarbonate (PC), polypropylene carbonate (PPC), polyether sulfone (PES), and polyethylene terephthalate (PET), and combinations thereof It may be a material selected from.
  • the inlet portion 931 may have various sizes, but preferably may be selected from a diameter of 1.0 mm to 3.0 mm.
  • the outlet portion 932 may have various sizes, but preferably may be selected from a diameter of 1.0 mm to 1.5 mm.
  • the inlet part 931 and the outlet part 932 are provided with separate cover means (not shown), so that the solution leaks when the PCR sample and the reagent in the reaction channel 921 proceed with the PCR. Can be prevented.
  • the cover means may be implemented in various shapes, sizes or materials.
  • the thickness of the third plate may vary, but preferably may be selected from 0.1 mm to 2.0 mm.
  • the inlet part 931 and the outlet part 932 may exist at least two.
  • the PCR reaction unit 900 to form an inlet (931) and outlet 932 through mechanical processing to provide a third plate (930);
  • the plate having a size corresponding to the bottom surface of the third plate 930 from the portion corresponding to the inlet portion 931 of the third plate 930 to the outlet portion 932 of the third plate 930.
  • the inlet 931 and outlet 932 of the third plate 930 and the reaction channel 921 of the second plate 920 are injection molding, hot-embossing. It can be produced by a processing method selected from the group consisting of, casting, and laser ablation.
  • the hydrophilic material 922 on the surface of the first plate 910 may be treated by a method selected from the group consisting of oxygen and argon plasma treatment, corona discharge treatment, and surfactant application and are known in the art. Can be performed according to.
  • a lower surface of the third plate 930 and an upper surface of the second plate 920, and a lower surface of the second plate 920 and an upper surface of the first plate 910 may be thermally bonded ( Thermal bonding, Ultrasonic Welding, Solvent Bonding, Hot Plate Welding, Ultraviolet Bonding, and Press Bonding processes, It can be carried out according to a known method.
  • a double-sided adhesive, a thermoplastic resin, or a thermosetting resin 500 may be processed between the third plate 930 and the second plate 920 and between the second plate 920 and the third plate 910.
  • the detection electrode 950 may be implemented in various ways.
  • a working electrode 950a in which the amplification nucleic acid is coupled to the active material and a reference electrode as a reference for measuring the electrode potential by the coupling of the amplification nucleic acid and the active material do not occur (a two-electrode module having a reference electrode 950b, or a counter electrode through which currents generated from the working electrode 950a, the reference electrode 950b, and the working electrode flow, as shown in FIG. It can be implemented as a three-electrode module having a (950c).
  • the sensitivity of the electrochemical signal generated inside the reaction channel 921 may be increased, and the detection and detection of the generated signal may be performed. Measurement can be performed easily.
  • 26 is a PCR implemented through a PCR apparatus including a PCR thermal block 100 in which heaters to which a compensation pattern is applied according to a first embodiment of the present invention are repeatedly arranged and the PCR reaction unit 900 of FIGS. 22 to 25. To show.
  • the PCR reaction unit 900 is disposed on the PCR thermal block 100, and the detection electrode 950 is repeatedly disposed on the upper surface of the thermal block 100. It is arrange
  • the PCR reaction unit 900 and the components included therein are as described above.
  • the power supply 400 is a module for supplying power to the power supply 200, and may be connected to the first wire 210 and the second wire 220 of the power supply 200, respectively.
  • a first power port (not shown) of the power supply 400 is electrically connected to the first wiring 210
  • a second power port (not shown) of the power supply 400 is not shown. Not connected) is electrically connected to the second wiring 220.
  • the power supply 400 supplies power to the first wiring 210 and the second wiring 220, respectively, so that the first heater of the PCR thermal block 100 is provided.
  • the predetermined temperature may be a PCR denaturation step temperature (85 ° C. to 105 ° C., preferably 95 ° C.) in the first heater and a PCR annealing / extension step temperature (50 ° C. to 80 ° C., Preferably 72 ° C.) or PCR annealing / extension step temperature (50 ° C. to 80 ° C., preferably 72 ° C. or 60 ° C.) for the first heater and PCR denaturation step temperature (85 ° C. to 60 ° C.) for the second heater. 105 ° C., preferably 95 ° C.).
  • the pump 500 is a module for controlling the flow rate and flow rate of the fluid flowing in the one or more reaction channels 921 of the PCR reaction unit 900, may be a positive pressure pump or a negative pressure pump, for example It may be a syringe pump.
  • the pump 500 may be operably disposed in a portion of the reaction channel 921, but preferably the inlet 931 and / or outlet 932 formed at both ends of the reaction channel 921. Is placed in the connection. When the pump 500 is connected to the inlet 931 and / or the outlet 932, the pump 500 may not only serve as a pump but also provide a sample and the like through the inlet 931 and / or the outlet 932.
  • the pump 500 when it is desired to control the flow rate and the flow rate of the fluid flowing in the reaction channel 921, that is, the sample and reagent solution in one direction, the pump 500 is the inlet part 931 and the outlet part 932 If only one of the connections, and the remaining one can be connected to the common plug is sealed, the flow rate and flow rate of the fluid flowing in the reaction channel 921, that is, the sample and reagent solution in both directions if the The pump 500 may be connected to both the inlet part 931 and the outlet part 932.
  • the nucleic acid amplification reaction of the PCR solution in the real-time PCR device may be performed by the following steps as an example.
  • oligonucleotide primer having a sequence complementary to the specific nucleotide sequence to be amplified
  • DNA polymerase DNA polymerase
  • dNTP deoxyribonucleotide triphosphates
  • PCR reaction buffer Prepare a PCR solution containing.
  • the PCR solution is introduced into the PCR reaction unit 900.
  • the PCR solution is disposed in the reaction channel 921 inside the PCR reaction unit 900 through the inlet 931.
  • the power supply unit 200 specifically, the first wiring 210 and the second wiring 220 are connected to the power supply 400, respectively, and the inlet portion 931 of the PCR reaction unit 900. And the outlet 932 is sealingly connected to the pump 500.
  • the sample and reagent solutions are transferred to the reaction channel 921.
  • the flow rate and flow rate of the sample and reagent solutions may be controlled by adjusting the strength of the positive pressure or the negative pressure provided by the pump 500.
  • the PCR solution lengthens the upper corresponding portion of the first heater and the upper corresponding portion of the second heater from the inlet 931 end to the outlet 932 end of the reaction channel 921.
  • the PCR solution is supplied with heat from a heat block 100 in which a heater unit including the first heater and the second heater is disposed 10 times, and denatures the PCR in an upper corresponding portion of the first heater.
  • the PCR annealing / extension step is performed in the step and the upper corresponding portion of the second heater to complete the 10 PCR cycles.
  • the PCR solution is then longitudinally directed to the upper corresponding portion of the first heater and the upper corresponding portion of the second heater from the outlet 931 end of the reaction channel 921 to the inlet 932 end.
  • the PCR can be performed again while moving backward.
  • FIG. 27 is a PCR thermal block 100 in which heaters to which a compensation pattern is applied according to a first embodiment of the present invention are repeatedly arranged, a PCR reaction unit 900 of FIGS. 22 to 25, a detection electrode 950, and a signal measurement An electrochemical real-time PCR is shown implemented through a PCR device having a module 800.
  • a PCR device includes a PCR thermal block 100 in which a first heater 110 and a second heater 120 are repeatedly arranged in a horizontal direction, and the first heater 110. And a PCR reaction unit 900 repeatedly arranged to correspond to the detection electrode 950 in a space between the second heaters 120 and an electrical connection with a connection port (not shown) of the chip holder (not shown).
  • the electrochemical signal measuring module 800 implemented to measure in real time the electrochemical signal generated inside the reaction channel 921 of the PCR reaction unit 900, and other, although not shown, includes a power supply, a pump, etc. .
  • the electrochemical signal measuring module 800 may be electrically connected to the connection port of the chip holder through an electrical connection means 700, for example, a lead wire. Therefore, electrochemical signals repeatedly generated by sequential nucleic acid amplification in the reaction channel 921 of the PCR reaction unit 900 are sequentially detected through the detection electrode 950 of the PCR reaction unit 900. The detected signal may be measured and further processed or analyzed by the electrochemical signal measuring module 800 via the connection port of the chip holder and the electrical connection means 700.
  • the electrochemical signal measuring module 800 may vary, but an anode stripping voltammetry (ASV), a chronoamperometry (CA), a cyclic voltammetry, a square wave voltmeter (square) wave voltammetry (SWV), differential pulse voltammetry (DPV), and impedance. Therefore, according to the real-time PCR device according to an embodiment of the present invention, it is possible to measure and analyze the nucleic acid amplification process in real-time when performing PCR. In this case, unlike the optical real-time PCR device, the PCR solution does not need to be added a separate fluorescent material.
  • the step of measuring the nucleic acid amplification reaction in real-time (real-time) by the real-time PCR device can be confirmed.
  • the PCR solution may denature the PCR while successively passing the upper corresponding portion 301 of the first heater 110 and the upper corresponding portion 302 of the second heater 120 in the reaction channel 921.
  • Step and PCR annealing / extension step in which case the PCR solution is between the first heater 110 and the second heater 120 and between the first heater 110 and the second heater 120 Passes through the detection electrode 950 region repeatedly disposed between the heater unit including.
  • the electrochemical generated by the binding of the amplifying nucleic acid and the active substance after slowing or maintaining the flow rate of the PCR solution for a short time through fluid control The signal may be sequentially detected and measured through the detection electrode 950 in real time. Accordingly, the amount of target nucleic acid is monitored in real time by monitoring the result of the reaction by amplification of the nucleic acid in the reaction channel 921 (without the fluorescent substance and the light detection system) in real time during each cycle of PCR. Can be detected and measured in real-time
  • 28-31 illustrate another type of PCR reaction unit 900 in thermal contact with the PCR thermal block of FIGS. 12-16.
  • the PCR reaction unit 900 is repeatedly spaced apart across the cross section in the longitudinal direction of the reaction channel is formed in one region inside the reaction channel is complementary to one region of the amplification target nucleic acid Capable capture probe (capture probe) having a surface-treated immobilization layer and a detection electrode formed in the other region inside the reaction channel implemented to detect an electrochemical signal, the metal nanoparticle and the And a complex having a signaling probe coupled to the metal nanoparticle and capable of complementarily binding to another region of the amplification target nucleic acid.
  • Capable capture probe capture probe having a surface-treated immobilization layer and a detection electrode formed in the other region inside the reaction channel implemented to detect an electrochemical signal, the metal nanoparticle and the And a complex having a signaling probe coupled to the metal nanoparticle and capable of complementarily binding to another region of the amplification target nucleic acid.
  • the PCR reaction unit 900 is disposed above the PCR thermal block 100, and at least one reaction channel 921 having the inlet part 931 and the outlet part 932 implemented at both ends thereof, and the reaction.
  • Capture probes that are repeatedly spaced apart across the cross section in the longitudinal direction of the channel 921 and are formed in one region inside the reaction channel 921 to complementarily bind to one region of the amplification target nucleic acid.
  • the reaction channel 921 is a space in which PCR is performed by a PCR solution, and is formed in the PCR reaction unit 900.
  • the reaction channel 921 may be implemented in various shapes and structures, such as a hollow cylinder shape, a bar shape, and a square cylinder shape.
  • the reaction channel 921 is disposed in one region therein, and an immobilization layer 940 surface-treated with a capture probe capable of complementarily binding to one region of the amplifying target nucleic acid, and A detection electrode 950 disposed in another region of the interior, and configured to detect an electrochemical signal, wherein the immobilization layer 940 and the detection electrode 950 are located inside the reaction channel 921.
  • the reaction channel 921 is a complex having a metal nanoparticle and a signal probe (signaling probe) that is connected to the metal nanoparticles and can complementarily bind to another region of the amplification target nucleic acid therein.
  • the complex may be previously contained in the reaction channel 921 before introduction of a PCR sample including a template nucleic acid, and the like, and may be included in a PCR reagent including a primer, a polymerase, and the like. It may be introduced together.
  • the immobilization layer 940 is formed of various materials, for example, silicon, plastic, glass, metal, or the like, so that a capture probe is deposited and exposed on one surface thereof.
  • the surface of the immobilization layer 940 may be first surface-treated with a material such as amine NH 3 + , aldehyde COH, carboxyl group COOH, or the like before the capture probe deposition.
  • the capture probe is implemented to complementarily bind to a portion (region) of the amplification target nucleic acid, and binds to metal nanoparticles to form a complex.
  • the metal nanoparticles may vary, but zinc (Zn), cadmium (Cd), lead (Pb), copper (Cu), gallium (Ga), indium (In), gold (Au), chromium (Cr), Manganese (Mn), Iron (Fe), Cobalt (Co), Nickel (Ni), Cesium (Cs), Barium (Ba), Cadmium (Cd), Mercury (Hg), Arsenic (As), Selenium (Se), It may be selected from the group consisting of tin (Sn), antimony (Sb), bismuth (Bi) and silver (Ag).
  • the signaling probe is implemented to bind to a region of the amplification target nucleic acid complementarily, in this case, in the amplification target nucleic acid, the complementary binding region of the signaling probe is the capture It is different from the complementary binding region of the capture probe.
  • the capture probe and the signaling probe can complementarily bind to the amplification target nucleic acid.
  • the amplified target nucleic acid complementarily binds to a capture probe surface-treated on the immobilization layer 940, and Complementarily binds with a signaling probe coupled to the metal nanoparticles to concentrate the metal nanoparticles in a region proximate the immobilization layer 940.
  • the metal nanoparticles do not reach the detection electrode 26, causing a current change (decrease) between the metal nanoparticle and the detection electrode 26, so that a detectable electrochemical signal due to amplification of a target nucleic acid is obtained. Will occur.
  • the amplification target nucleic acid, the capture probe, and the signaling probe may be single stranded DNA.
  • the detection electrode 950 is disposed in at least one region of the reaction channel 921 and is implemented to detect an electrochemical signal generated inside the reaction channel 921.
  • the detection electrode 950 may be made of various materials to perform the above functions, but for example, gold (Au), cobalt (Co), platinum (Pt), silver (Ag), carbon nanotubes (carbon) nanotube), graphene, graphene, and carbon.
  • the detection electrode 950 may be implemented in various shapes and structures to efficiently detect electrochemical signals generated inside the reaction channel 921. For example, as illustrated in FIG. ) It may be implemented in a plate shape of a metal material disposed along the inner surface.
  • the electrochemical signal is measured by the electrochemical signal measuring module to be described later, the electrochemical signal measuring module may vary, but anodizing stripping voltammetry (ASV), a time-based ammeter (chronoamperometry, CA) ), Cyclic voltammetry, square wave voltammetry (SWV), differential pulse voltammetry (DPV), and impedance.
  • ASV stripping voltammetry
  • CA time-based ammeter
  • SWV square wave voltammetry
  • DPV differential pulse voltammetry
  • impedance impedance
  • the electrochemical signal may be due to a change in current generated as the amplification target nucleic acid complementarily binds to the capture probe and the signaling probe.
  • the first step is before the initiation of PCR, the original state of the signaling probe-metal nanoparticles containing the capture probe, the signaling probe and the metal nanoparticles surface-treated in the immobilization layer.
  • the second step includes a current change (signal) generated by reduction or oxidation between the working electrode and the metal nanoparticles
  • the third step is after initiation of PCR, thereby amplifying a target nucleic acid. (target DNA) in combination with a capture probe and a signaling probe of the signaling probe-metal nanoparticle to cause a decrease in current change (signal reduction).
  • a reducing voltage is applied to the metal nanoparticles of the signaling probe-metal nanoparticles, the metal nanoparticles are placed on the proximal surface of the working electrode.
  • the accumulation of metal nanoparticles is reduced to form an accumulation layer, followed by application of a voltage to the working electrode, whereby the reducing metal nanoparticles are oxidized (Stripping) and a change in current, that is, a signal.
  • the signal change can be easily measured by the voltage value indicated by the oxidation current peak.
  • a current change value ie, an electrochemical signal
  • in the reaction channel 921 represents a change amount of target DNA.
  • the voltage value at which the metal nanoparticles are oxidized is different for each kind of metal nanoparticles, when two or more metal nanoparticles are used, Simultaneous signal detection is also possible. Then, when PCR is performed, target DNA is amplified from a template nucleic acid, and the amplified target DNA is a signal probe of the capture probe and the signaling probe-metal nanoparticle.
  • hybridized target DNA by interfering with (signaling probe) to prevent the accumulation of metal nanoparticles (Accumulation of metal nanoparticles) of the metal nanoparticles (Signaling probe-metal nanoparticles) as above
  • the signal value of the capture probe and the signaling probe-metal nanoparticle increases as the current value decreases, and further, the amount of amplified target DNA increases as the PCR cycle proceeds.
  • the hybridized target DNA also increases with the probe so that the current value (signal) is further reduced. Therefore, real-time PCR can be implemented by detecting and measuring the current reduction phenomenon, that is, the electrochemical signal.
  • the immobilization layer 940 and the detection electrode 950 are repeatedly spaced apart across the cross section in the longitudinal direction of the reaction channel 921, and the PCR thermal block 100 is disposed.
  • the immobilization layer 940 and the detection electrode 950 are arranged to be disposed between the two or more heater groups 110, 120, and 130 in thermal contact with the substrate.
  • the immobilization layer 940 and the detection electrode 950 may include a reaction channel from the inlet 931 to the outlet 932. 921 is repeatedly arranged at regular intervals. Through such a structure, an electrochemical signal can be repeatedly detected from nucleic acids sequentially amplified while passing through the reaction channel 921 in the longitudinal direction.
  • FIG. 29 which shows a vertical cross-sectional view of the PCR reaction unit 900
  • the immobilization layer 940 and the detection electrode 950 are disposed to face each other in the cross section of the reaction channel 921.
  • the positions of the immobilization layer 940 and the detection electrode 950 may be changed up and down.
  • the PCR reaction unit 900 may be divided into three layers based on a vertical cross-sectional view.
  • the PCR reaction unit 900 may include a first plate 910 provided with the detection electrode 950; A second plate 920 disposed on the first plate 910 and provided with the one or more reaction channels 921; And a third plate 930 disposed on the second plate 920 and provided with the immobilization layer 940, the inlet 931, and the outlet 932.
  • the detection electrode 950 may be disposed on the third plate 930
  • the immobilization layer 940 may be disposed on the first plate 910.
  • An upper surface of the first plate 910 provided with the detection electrode 950 is adhesively disposed on a lower surface of the second plate 920.
  • the first plate 910 is adhered to the second plate 920 having the reaction channel 921 to secure a space with respect to the reaction channel 921, and further, at least the reaction channel 921.
  • the detection electrode 950 is disposed in one region (surface).
  • the first plate 910 may be implemented in a variety of materials, preferably polydimethylsiloxane (PDMS), cycloolefin copolymer (cycle olefin copolymer, COC), polymethyl methacrylate (polymethylmetharcylate) , PMMA), polycarbonate (PC), polypropylene carbonate (PPC), polyether sulfone (PES), and polyethylene terephthalate (PET), and combinations thereof It may be a material selected from.
  • a hydrophilic material (not shown) may be processed on the upper surface of the first plate 910 to smoothly perform PCR.
  • hydrophilic material By treating the hydrophilic material, a single layer including a hydrophilic material may be formed on the first plate 910.
  • the hydrophilic material may be a variety of materials, but preferably may be selected from the group consisting of carboxyl group (-COOH), amine group (-NH2), hydroxy group (-OH), and sulfone group (-SH), Treatment of the hydrophilic material can be carried out according to methods known in the art.
  • the second plate 920 includes the reaction channel 921.
  • the reaction channel 921 is connected to a portion corresponding to the inlet portion 931 and the outlet portion 932 formed on the third plate 910 so that the inlet portion 931 and the outlet portion 932 are implemented at both ends.
  • the reaction channel 921 may be present in two or more according to the purpose and range of use of the PCR device according to an embodiment of the present invention.
  • the second plate 920 may be formed of various materials, but preferably, polymethylmethacrylate (PMMA), polycarbonate (PC), cycloolefin copolymer (cycloolefin copolymer, COC) , Polyamide (PA), polyethylene (PE), polypropylene (PP), polyphenylene ether (PPE), polystyrene (PS), polyoxymethylene (POM) Polyetheretherketone (PEEK), polytetrafluoroethylene (PTFE), polyvinylchloride (PVC), polyvinylidene fluoride (PVDF), polybutylene terephthalate (polybutylene terephthalate) , PBT), fluorinated ethylenepropylene (FEP), perfluoroalkoxyalkane (PFA), and combinations thereof It is chosen or a thermoplastic resin may be a thermosetting resin material.
  • the thickness of the second plate 920 may vary, but may be selected from 100 ⁇ m to 200 ⁇ m.
  • the width and length of the reaction channel 921 may vary, but preferably, the width of the reaction channel 921 is selected from 0.001 mm to 10 mm, the length of the reaction channel 921 is 1 mm To 400 mm.
  • the inner wall of the second plate 920 may be coated with a material such as silane-based and Bovine Serum Albumin (BSA) to prevent DNA and protein adsorption.
  • BSA Bovine Serum Albumin
  • the lower surface of the third plate 930 is disposed on the upper surface of the second plate 920.
  • the third plate 930 includes an immobilization layer 940, an inlet 931, and an outlet 932 formed on the reaction channel 921 formed in the second plate 920.
  • the inlet portion 931 is a portion into which the PCR sample and the reagent are introduced.
  • the outlet 932 is a portion where the PCR product flows out after the PCR is completed. Accordingly, the third plate 930 covers the reaction channel 921 formed in the second plate 920, but the inlet part 931 and the outlet part 932 are the inlet part of the reaction channel 921 and the same. It will act as an outlet.
  • the third plate 930 may be made of various materials, but preferably, polydimethylsiloxane (PDMS), cycloolefin copolymer (CCO), polymethylmethacrylate (polymethylmetharcylate) , PMMA), polycarbonate (PC), polypropylene carbonate (PPC), polyether sulfone (PES), and polyethylene terephthalate (PET), and combinations thereof It may be a material selected from.
  • the inlet portion 931 may have various sizes, but preferably may be selected from a diameter of 1.0 mm to 3.0 mm.
  • the outlet portion 932 may have various sizes, but preferably may be selected from a diameter of 1.0 mm to 1.5 mm.
  • the inlet part 931 and the outlet part 932 are provided with separate cover means (not shown), so that the solution leaks when the PCR sample and the reagent in the reaction channel 921 proceed with the PCR. Can be prevented.
  • the cover means may be implemented in various shapes, sizes or materials.
  • the thickness of the third plate may vary, but preferably may be selected from 0.1 mm to 2.0 mm.
  • the inlet part 931 and the outlet part 932 may exist at least two.
  • the PCR reaction unit 900 to form an inlet (931) and outlet 932 through mechanical processing to provide a third plate (930);
  • the plate having a size corresponding to the bottom surface of the third plate 930 from the portion corresponding to the inlet portion 931 of the third plate 930 to the outlet portion 932 of the third plate 930.
  • the inlet 931 and outlet 932 of the third plate 930 and the reaction channel 921 of the second plate 920 are injection molding, hot-embossing. It can be produced by a processing method selected from the group consisting of, casting, and laser ablation.
  • the hydrophilic material 922 on the surface of the first plate 910 may be treated by a method selected from the group consisting of oxygen and argon plasma treatment, corona discharge treatment, and surfactant application and are known in the art. Can be performed according to.
  • a lower surface of the third plate 930 and an upper surface of the second plate 920, and a lower surface of the second plate 920 and an upper surface of the first plate 910 may be thermally bonded ( Thermal bonding, Ultrasonic Welding, Solvent Bonding, Hot Plate Welding, Ultraviolet Bonding, and Press Bonding processes, It can be carried out according to a known method.
  • a double-sided adhesive, a thermoplastic resin, or a thermosetting resin 500 may be processed between the third plate 930 and the second plate 920 and between the second plate 920 and the third plate 910.
  • the detection electrode 950 may be implemented in various ways.
  • a two-electrode module having a working electrode 950a in which an oxidation or reduction reaction occurs and a reference electrode 950b in which no oxidation or reduction reaction occurs, as shown in FIG. 30, or FIG.
  • the three-electrode module may include a working electrode 950a, a reference electrode 950b, and a counter electrode 950c for adjusting an electronic balance generated from the indicator electrode. .
  • the sensitivity of the electrochemical signal generated inside the reaction channel 921 may be increased, and the detection and detection of the generated signal may be performed. Measurement can be performed easily.
  • FIG. 32 is a PCR implemented through a PCR apparatus including a PCR thermal block 100 in which heaters to which a compensation pattern is applied according to a first embodiment of the present invention are repeatedly arranged and the PCR reaction unit 900 of FIGS. 28 to 31. To show.
  • the PCR reaction unit 900 is disposed on the PCR thermal block 100, and specifically, the detection electrode 950 is repeatedly disposed on an upper surface of the PCR thermal block 100.
  • the power supply 400 is a module for supplying power to the power supply 200, and may be connected to the first wire 210 and the second wire 220 of the power supply 200, respectively.
  • a first power port (not shown) of the power supply 400 is electrically connected to the first wiring 210
  • a second power port shown in the power supply 400 is shown. Not connected is electrically connected to the second wiring 220.
  • the power supply 400 supplies power to the first wiring 210 and the second wiring 220, respectively, so that the first heater of the PCR thermal block 100 is provided.
  • 110 and the second heater 120 can be quickly heated, and when the heaters 110 and 120 reach a predetermined temperature, power supply is controlled to maintain the predetermined temperature.
  • the predetermined temperature may be a PCR denaturation step temperature (85 ° C. to 105 ° C., preferably 95 ° C.) in the first heater 110 and a PCR annealing / extension step temperature (in the second heater 120). 50 ° C.
  • a PCR annealing / extension step temperature 50 ° C. to 80 ° C., preferably 72 ° C. or 60 ° C.
  • the PCR denaturation step temperature 85 °C to 105 °C, preferably 95 °C
  • the pump 500 is a module for controlling the flow rate and flow rate of the fluid flowing in the one or more reaction channels 921 of the PCR reaction unit 900, may be a positive pressure pump or a negative pressure pump, for example It may be a syringe pump.
  • the pump 500 may be operably disposed in a portion of the reaction channel 921, but preferably the inlet 931 and / or outlet 932 formed at both ends of the reaction channel 921. Is placed in the connection. When the pump 500 is connected to the inlet 931 and / or the outlet 932, the pump 500 may not only serve as a pump but also provide a sample and the like through the inlet 931 and / or the outlet 932.
  • the pump 500 when it is desired to control the flow rate and the flow rate of the fluid flowing in the reaction channel 921, that is, the sample and reagent solution in one direction, the pump 500 is the inlet part 931 and the outlet part 932 If only one of the connections, and the remaining one can be connected to the common plug is sealed, the flow rate and flow rate of the fluid flowing in the reaction channel 921, that is, the sample and reagent solution in both directions if the The pump 500 may be connected to both the inlet part 931 and the outlet part 932.
  • the nucleic acid amplification reaction of the PCR solution in the real-time PCR device may be performed by the following steps as an example.
  • oligonucleotide primer having a sequence complementary to the specific nucleotide sequence to be amplified
  • DNA polymerase DNA polymerase
  • dNTP deoxyribonucleotide triphosphates
  • PCR reaction buffer Prepare a PCR solution containing.
  • the PCR solution is introduced into the PCR reaction unit 900.
  • the PCR solution is disposed in the reaction channel 921 inside the PCR reaction unit 900 through the inlet 931.
  • the power supply unit 200 specifically, the first wiring 210 and the second wiring 220 are connected to the power supply 400, respectively, and the inlet portion 931 of the PCR reaction unit 900. And the outlet 932 is sealingly connected to the pump 500.
  • the power supply 400 is instructed to supply power to heat the first heater 110 and the second heater 120 through the first wiring 210 and the second wiring 220, A specific temperature, for example, the PCR denaturation step temperature (95 ° C.) for the first heater 110 and the PCR annealing / extension step temperature (72 ° C.) for the second heater 120 are maintained.
  • the sample and reagent solutions are transferred to the reaction channel 921.
  • the flow rate and flow rate of the sample and reagent solutions may be controlled by adjusting the strength of the positive pressure or the negative pressure provided by the pump 500.
  • the PCR solution is supplied from the end of the inlet 931 of the reaction channel 921 to the end of the outlet 932 of the upper corresponding portion 301 of the first heater 110 and the second heater. PCR is performed while moving the upper corresponding portion 302 of 120 in the longitudinal direction.
  • the PCR solution receives heat from the PCR heat block 100 in which a heater unit including the first heater 110 and the second heater 120 is repeatedly disposed 10 times, and is located above the first heater 110. 10 PCR cycles are completed while undergoing a PCR denaturation step in the corresponding part 301 and a PCR annealing / extension step in the upper corresponding part 302 of the second heater 120.
  • the PCR solution is formed from the upper corresponding portion of the first heater 110 and the second heater 120 from the outlet 931 end of the reaction channel 921 to the end of the inlet 932. PCR can be performed again while the upper corresponding part is reversely moved in the longitudinal direction.
  • PCR thermal block 100 repeatedly arranged with heaters to which a compensation pattern is applied according to a first embodiment of the present invention, a PCR reaction unit 900 of FIGS. 28 to 31, an immobilization layer 940, Electrochemical real-time PCR is shown implemented through a PCR device having a detection electrode 950 and a signal measurement module 800.
  • a PCR device includes a PCR thermal block 100 in which a first heater 110 and a second heater 120 are repeatedly disposed in a horizontal direction, and the first heater 110. ) And a PCR reaction unit 900 repeatedly arranged to correspond to an immobilization layer 940 and a detection electrode 950 in a space between the second heater 120 and the chip holder (not shown).
  • An electrochemical signal measuring module 800 which is electrically connected to a connection port (not shown) and is implemented to measure in real time an electrochemical signal generated inside the reaction channel 921 of the PCR reaction unit 900, although shown in FIG. But not necessarily includes power sources, pumps, and the like.
  • the electrochemical signal measuring module 800 may be electrically connected to the connection port of the chip holder through an electrical connection means 700, for example, a lead wire. Therefore, electrochemical signals repeatedly generated by sequential nucleic acid amplification in the reaction channel 921 of the PCR reaction unit 900 are sequentially detected through the detection electrode 950 of the PCR reaction unit 900. The detected signal may be measured and further processed or analyzed by the electrochemical signal measuring module 800 via the connection port of the chip holder and the electrical connection means 700.
  • the electrochemical signal measuring module 800 may vary, but an anode stripping voltammetry (ASV), a chronoamperometry (CA), a cyclic voltammetry, a square wave voltmeter (square) wave voltammetry (SWV), differential pulse voltammetry (DPV), and impedance. Therefore, according to the real-time PCR device according to an embodiment of the present invention according to Figure 33, it is possible to measure and analyze the nucleic acid amplification process in real-time (PC) when performing the PCR. In this case, unlike the conventional real-time PCR device, the PCR solution does not need to add a separate fluorescent material.
  • ASV anode stripping voltammetry
  • CA chronoamperometry
  • SWV square wave voltmeter
  • DPV differential pulse voltammetry
  • the PCR solution may denature the PCR while successively passing the upper corresponding portion 301 of the first heater 110 and the upper corresponding portion 302 of the second heater 120 in the reaction channel 921.
  • Step and PCR annealing / extension step in which case the PCR solution is between the first heater 110 and the second heater 120 and between the first heater 110 and the second heater 120 Passes through the detection electrode 950 region repeatedly disposed between the heater unit including.
  • the amplification target nucleic acid and the capture probe and the amplification target nucleic acid and the capture probe An electrochemical signal (change of current) generated by complementary coupling with a signaling probe of a complex may be sequentially detected and measured in real time through the detection electrode 950. Accordingly, the amount of target nucleic acid is monitored in real time by monitoring the result of the reaction by amplification of the nucleic acid in the reaction channel 921 (without the fluorescent substance and the light detection system) in real time during each cycle of PCR. Can be detected and measured in real-time

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Abstract

본 발명의 일 실시예는 패턴 히터가 반복 배치된 PCR 열 블록 및 이를 포함하는 PCR 장치에 관한 것으로서, 이에 따르면 히터가 반복 배치된 열 블록에서 개별 히터로부터 발생하는 방사형 열 분포 및 이에 따른 인접 히터 간 불균일한 열 중첩을 방지하여 PCR 수율을 상당히 개선할 수 있고, 별도의 온도 조절 수단이 요구되지 아니하므로 장치의 소형화 및 집적화에 상당히 기여할 수 있으며 더 나아가, 히터 유닛이 반복 배치된 열 블록 및 판 형상의 PCR 반응부를 이용하여 다수의 핵산 샘플을 동시에 그리고 신속하게 증폭할 수 있고, 연속적인 광학 신호 또는 전기화학적 신호를 측정함으로써 핵산 증폭 과정을 실시간으로 확인할 수 있다.

Description

패턴 히터가 반복 배치된 PCR 열 블록 및 이를 포함하는 PCR 장치
본 발명은 히터가 연속적으로 반복 배치된 PCR 열 블록을 구비하는 PCR 장치에 관한 것이다.
중합효소 연쇄 반응, 즉 PCR(Polymerase Chain Reaction, 이하 같다)은 주형 핵산의 특정 부위를 반복적으로 가열 및 냉각하여 상기 특정 부위를 연쇄적으로 복제하여 그 특정 부위를 갖는 핵산을 기하급수적으로 증폭하는 기술로써, 생명과학, 유전공학 및 의료 분야 등에서 분석 및 진단 목적으로 널리 사용되고 있다. 최근 PCR을 효율적으로 수행하기 위한 장치가 다양하게 개발되고 있는 실정이다.
기존 PCR 장치의 일 예는 가열기에 주형 핵산을 포함하는 샘플 용액을 수용한 용기를 장착하고, 상기 용기를 반복적으로 가열 및 냉각하여 PCR을 수행한다. 그러나 위와 같은 PCR 장치는 하나의 가열기를 구비하기 때문에 전체적인 구조가 복잡하진 않지만, 정확한 온도 제어를 위해 복잡한 회로를 갖춰야 하고, 하나의 가열기에 대한 가열 또는 냉각의 반복으로 인해 전체 PCR 시간이 길어지는 단점이 있다.
또한, 기존 PCR 장치의 다른 예는 PCR 온도를 갖는 복수 개의 가열기를 장착하고, 이들 가열기를 통과하는 하나의 채널을 통해 핵산을 포함하는 샘플 용액을 흐르게 하여 PCR을 수행한다. 그러나 위와 같은 PCR 장치는 복수 개의 가열기를 이용하기 때문에 비교적 단순한 회로로 구현 가능하지만, 고온 및 저온의 가열기를 통과하기 위한 긴 유로가 반드시 필요하므로 전체 구조가 복잡하고, 상기 가열기를 통과하는 채널에 흐르는 핵산을 포함하는 샘플 용액의 유속을 제어하기 위한 별도의 제어 장치가 요구된다.
한편, 최근 PCR 장치는 PCR 수율 개선 및 PCR 과정을 실시간으로 파악하기 위한 효율적인 방법이 개발되고 있을 뿐만 아니라, 소형화된 가열기를 사용함으로써 장치의 소형화 및 휴대화가 가능하도록 개발되고 있다. 이 경우, 소형화된 가열기의 성능이 PCR 수율에 큰 영향을 미치기 때문에, 소형화된 가열기의 설정 온도를 정확하게 제어 또는 구현할 수 있는 기술 개발이 매우 중요하다. 따라서, PCR 시간을 획기적으로 줄임과 동시에 신뢰할 수 있는 PCR 수율을 얻을 수 있고, 더 나아가 제품의 소형화 및 휴대화가 가능한 PCR 장치의 구현이 여전히 요구되고 있는 실정이다.
위와 같은 문제점을 해결하고자, 본 발명의 실시예는 PCR 시간 및 수율을 상당하게 개선하고, 더 나아가 제품의 소형화 및 휴대화가 가능하도록 PCR 열 블록을 제안하고, 더 나아가 이를 포함하는 PCR 장치를 제안하고자 한다.
본 발명의 제1 실시예는 2 이상의 히터가 반복적으로 구현된 PCR 열 블록에 있어서, 상기 히터는 개별 히터로부터 발생하는 방사형 열 분포에 따른 인접 히터 간 불균일한 열 중첩을 방지하기 위해 상기 히터의 적어도 일 부분의 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도를 조절하는 보상형 패턴(compensated pattern)을 구비하는 것을 특징으로 하는 PCR 열 블록을 제공한다.
본 발명의 제1 실시예에 있어서,
상기 보상형 패턴은 상기 히터의 적어도 일 부분에 간극을 반복 형성하여 간극 패턴에 따른 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것일 수 있다.
상기 보상형 패턴은 상기 히터의 적어도 일 부분에 반복 형성된 간극의 폭(line width)을 달리 구현함으로써 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것일 수 있다.
상기 보상형 패턴은 상기 히터의 적어도 일 부분에 반복 형성된 간극의 두께를 달리 구현함으로써 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것일 수 있다.
상기 보상형 패턴은 상기 히터의 적어도 일 부분에 재질을 달리 구현함으로써 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것일 수 있다.
상기 보상형 패턴은 상기 히터의 적어도 일 부분에 히터 전극의 배치를 달리 구현함으로써 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것일 수 있다.
본 발명의 제2 실시예는 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록; 및 상기 PCR 열 블록과 열 교환이 가능하도록 상기 열 블록 상에 부착되되 상기 PCR 열 블록에 구비된 히터들의 상측 대응 부분들을 길이 방향으로 통과하도록 연장 배치된, 양 말단에 유입부 및 유출부가 구현된 1 이상의 반응 채널을 구비하는 판 형상의 PCR 반응부를 포함하는 PCR 칩을 제공한다.
본 발명의 제2 실시예에 있어서,
상기 PCR 열 블록의 상부 면은 PCR 용액의 전기 분해 방지용 절연막(insulator)이 형성된 것일 수 있다.
본 발명의 제3 실시예는 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록; 상기 PCR 열 블록과 열 교환이 가능하도록 상기 열 블록 상에 접촉되되 상기 PCR 열 블록에 구비된 히터들의 상측 대응 부분들을 길이 방향으로 통과하도록 연장 배치된, 양 말단에 유입부 및 유출부가 구현된 1 이상의 반응 채널을 구비하는 판 형상의 PCR 반응부; 및 상기 PCR 열 블록에 구비된 히터들에 전력을 공급하기 위한 전력 공급부를 포함하는 PCR 장치를 제공한다.
본 발명의 제3 실시예에 있어서,
상기 PCR 열 블록의 상부 면은 히터 보호용 절연막(insulator)이 형성된 것일 수 있다.
상기 PCR 장치는 상기 1 이상의 반응 채널 내에서 유동하는 PCR 용액의 유량 및 유속을 제어하기 위해 양압 또는 음압을 제공하도록 배치된 펌프를 더 포함할 수 있다.
상기 PCR 장치는 상기 PCR 반응부에 광을 제공하도록 배치된 광원, 및 상기 PCR 반응부로부터 방출되는 광을 수용하도록 배치된 광 검출부를 더 포함할 수 있다.
상기 광원 또는 광 검출부는 상기 PCR 열 블록의 인접 히터 사이 공간에 반복 배치될 수 있다.
상기 PCR 반응부는 상기 반응 채널의 길이 방향으로 그 하단 면을 가로질러 반복 이격 배치되되 상기 반응 채널 내부에서 증폭 핵산과 활성물질의 결합으로 인해 발생하는 전기화학적 신호를 검출하도록 구현된 검출 전극을 구비하는 것으로서, 상기 PCR 열 블록과의 열 접촉시 상기 검출 전극은 상기 2 이상의 히터 군 사이에 배치되도록 구현될 수 있다. 이 경우 상기 PCR 장치는 상기 검출 전극과 전기적으로 연결되어 상기 PCR 반응부의 반응 채널 내부에서 발생하는 전기화학적 신호를 실시간으로 측정하도록 구현된 전기화학적 신호 측정 모듈을 더 포함할 수 있다.
상기 PCR 반응부는 상기 반응 채널의 길이 방향으로 그 단면을 가로질러 반복 이격 배치되되 상기 반응 채널 내부의 일 영역에 형성되어 증폭 표적 핵산의 일 영역과 상보적으로 결합할 수 있는 포획 프로브(capture probe)가 표면 처리된 고정화(immobilization) 층 및 상기 반응 채널 내부의 다른 일 영역에 형성되어 전기화학적 신호를 검출하도록 구현된 검출 전극을 구비하는 것으로서, 금속 나노입자 및 상기 금속 나노입자에 연결되되 상기 증폭 표적 핵산의 다른 일 영역과 상보적으로 결합할 수 있는 신호 프로브(signaling probe)를 구비하는 복합체를 포함하는 것일 수 있다. 이 경우 상기 PCR 장치는 상기 검출 전극과 전기적으로 연결되어 상기 PCR 반응부의 반응 채널 내부에서 발생하는 전기화학적 신호를 실시간으로 측정하도록 구현된 전기화학적 신호 측정 모듈을 더 포함할 수 있다.
본 발명의 실시예에 따르면, 히터가 반복 배치된 열 블록에서 개별 히터로부터 발생하는 방사형 열 분포 및 이에 따른 인접 히터 간 불균일한 열 중첩을 방지하여 PCR 수율을 상당히 개선할 수 있고, 별도의 온도 조절 수단이 요구되지 아니하므로 장치의 소형화 및 집적화에 상당히 기여할 수 있다. 더 나아가, 히터 유닛이 반복 배치된 열 블록 및 판 형상의 PCR 반응부를 이용하여 다수의 핵산 샘플을 동시에 그리고 신속하게 증폭할 수 있고, 연속적인 광학 신호 또는 전기화학적 신호를 측정함으로써 핵산 증폭 과정을 실시간으로 확인할 수 있다.
도 1은 2 이상의 히터(111, 121)가 반복적으로 구현된 PCR 열 블록(100)을 도시한다.
도 2 내지 6은 본 발명의 실시예에 있어서 PCR 열 블록(100)을 구현하는 히터의 배치 구조를 도시한다.
도 7은 보상형 패턴이 적용되지 않은 개별 히터에 전력을 공급할 경우 발생하는 불균일한 방사형 열 분포를 보여주는 사진이다.
도 8은 PCR 열 블록 상에 보상형 패턴이 적용되지 않은 2 이상의 히터가 반복 배치된 상태에서 전력을 공급할 경우 개별 히터로부터 발생하는 뷸균일한 방사형 열 분포에 따른 인접 히터(111, 121) 간 불균일한 열 중첩을 보여주는 사진이다.
도 9는 보상형 패턴(1000)이 적용된 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)을 도시한다.
도 10은 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록에 있어서, 히터(111)의 일 부분에 형성된 간극(1100)을 포함하는 보상형 패턴을 도시한다.
도 11은 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록에 있어서, 히터(111)의 일 부분에 형성된 간극의 폭(line width)을 달리 구현한 보상형 패턴을 도시한다.
도 12는 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록에 있어서, 히터(111)의 일 부분의 두께를 달리 구현한 보상형 패턴을 도시한다.
도 13은 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록에 있어서, 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 재질을 달리 구현한 보상형 패턴을 도시한다.
도 14은 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록에 있어서, 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 배치를 달리 구현한 보상형 패턴을 도시한다.
도 15는 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록으로부터 발생하는 열 분포를 보여주는 사진이다.
도 16은 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록으로부터 발생하는 열 분포를 보여주는 그래프이다.
도 17은 PCR 열 블록과 열 접촉하는 PCR 반응부(300)를 도시한다.
도 18은 PCR 열 블록(100)과 PCR 반응부(300)가 일체형으로 구현된 PCR 칩을 도시한다.
도 19는 PCR 열 블록(100)과 PCR 반응부(300)가 별개형으로 구현된 PCR 장치를 도시한다.
도 20은 본 발명의 제1 실시예에 따른 보상형 패턴이 적용된 히터들이 반복 배치된 PCR 열 블록(100)을 구비하는 PCR 장치를 통해 구현되는 PCR을 도시한다.
도 21은 본 발명의 제1 실시예에 따른 보상형 패턴이 적용된 히터들이 반복 배치된 PCR 열 블록(100), 광원(150) 및 광 검출부(600)를 구비하는 PCR 장치를 통해 구현되는 광학적 실시간 PCR을 도시한다.
도 22 내지 25는 도 12 내지 16의 PCR 열 블록과 열 접촉하는 다른 유형의 PCR 반응부(900)를 도시한다.
도 26은 본 발명의 제1 실시예에 따른 보상형 패턴이 적용된 히터들이 반복 배치된 PCR 열 블록(100) 및 도 22 내지 25의 PCR 반응부(900)를 구비하는 PCR 장치를 통해 구현되는 PCR을 도시한다.
도 27은 본 발명의 제1 실시예에 따른 보상형 패턴이 적용된 히터들이 반복 배치된 PCR 열 블록(100), 도 22 내지 25의 PCR 반응부(900), 검출 전극(950), 및 신호 측정 모듈(800)을 구비하는 PCR 장치를 통해 구현되는 전기화학적 실시간 PCR을 도시한다.
도 28 내지 31은 도 12 내지 16의 PCR 열 블록과 열 접촉하는 또 다른 유형의 PCR 반응부(900)를 도시한다.
도 32는 본 발명의 제1 실시예에 따른 보상형 패턴이 적용된 히터들이 반복 배치된 PCR 열 블록(100) 및 도 28 내지 31의 PCR 반응부(900)를 구비하는 PCR 장치를 통해 구현되는 PCR을 도시한다.
도 33은 본 발명의 제1 실시예에 따른 보상형 패턴이 적용된 히터들이 반복 배치된 PCR 열 블록(100), 도 28 내지 31의 PCR 반응부(900), 고정화(immobilization) 층(940), 검출 전극(950), 및 신호 측정 모듈(800)을 구비하는 PCR 장치를 통해 구현되는 전기화학적 실시간 PCR을 도시한다.
이하, 첨부 도면을 참조하여 본 발명에 따른 실시예들을 상세하게 설명한다. 이하 설명은 본 발명에 따른 실시예들을 용이하게 이해하기 위한 것일 뿐이며, 보호범위를 제한하기 위한 것은 아니다.
본 발명의 실시예에 있어서, PCR(Polymerase Chain Reaction)은 특정 염기 서열을 갖는 핵산을 증폭하는 반응의 일종을 의미한다. 예를 들어, 특정 염기 서열을 갖는 DNA(deoxyribonucleic acid)를 증폭하기 위해 PCR 장치는 주형 핵산인 이중 가닥의 DNA를 포함하는 PCR 시료 및 시약을 포함하는 용액을 특정 온도, 예를 들어 약 95℃로 가열하여 상기 이중 가닥의 DNA를 단일 가닥의 DNA로 분리하는 변성 단계(denaturing step), 증폭하고자 하는 염기 서열과 상보적인 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드(oligonucleotide) 프라이머를 제공하고, 상기 분리된 단일 가닥의 DNA와 함께 특정 온도, 예를 들어 55℃로 냉각하여 상기 단일 가닥의 DNA의 특정 염기 서열에 상기 프라이머를 결합시켜 부분적인 DNA-프라이머 복합체를 형성하는 어닐링 단계(annealing step), 및 상기 어닐링 단계 이후 상기 용액을 적정 온도, 예를 들어 72℃로 유지하여 DNA 중합효소(polymerase)에 의해 상기 부분적인 DNA-프라이머 복합체의 프라이머를 기초로 이중 가닥의 DNA를 형성하는 연장 (혹은 증폭) 단계(extension step)를 수행하고, 상기 3 단계를 예를 들어 20회 내지 40회로 반복함으로써 상기 특정 염기 서열을 갖는 DNA를 기하급수적으로 증폭할 수 있다. 경우에 따라, 상기 PCR 장치는 상기 어닐링 단계와 상기 연장(혹은 증폭) 단계를 동시에 수행할 수 있고, 이 경우 PCR 장치는 상기 연장 단계와 상기 어닐링 및 연장(혹은 증폭) 단계로 구성된 2 단계를 수행함으로써, 제1 순환을 완성할 수도 있다. 따라서, 본 발명의 실시예에 따른 PCR 열 블록 및 이를 포함하는 PCR 장치는 상기 단계들을 수행하기 위한 모듈들을 포함하는 장치를 말하며, 본 명세서에 기재되지 아니한 세부 모듈은 PCR을 수행하기 위한 종래 기술 중 개시되거나 또는 자명한 범위에서 모두 구비하고 있는 것을 전제로 한다.
도 1은 2 이상의 히터(111, 121)가 반복적으로 구현된 PCR 열 블록(100)을 도시하고, 도 2 내지 6은 본 발명의 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)을 구현하는 히터의 배치 구조를 도시한다.
도 1에 따르면, 본 발명의 실시예들은 PCR 용액에 열을 공급하는 PCR 열 블록(100) 상에 2 이상의 히터(111, 121)가 반복 배치된 것을 전제로 한다. 상기 PCR 열 블록(100)은 PCR 용액, 즉 PCR을 수행하기 위해 시료 및 시약에 특정 온도로 열을 공급하는 모듈로서, 적어도 일 면에 시료 및 시약이 수용된 PCR 반응부(900)의 접촉 면을 구비하여 상기 PCR 반응부(900)의 일 면과 열 접촉을 통해 PCR 용액에 열을 공급하여 PCR을 수행하도록 한다.
도 2 내지 6에 따르면, 상기 PCR 열 블록(100)은 기판(99)을 기저로 한다. 상기 기판(99)은 그 표면에 배치된 히터(111, 121)의 가열 등으로 인해 그 물리적 또는 화학적 성질이 변하지 않고, 2 이상의 히터 사이에서 열 교환이 빈번하게 일어나지 않도록 하는 재질로 구현된다. 예를 들어, 상기 기판(99)은 플라스틱, 유리, 실리콘 등의 재질로 구현되되, 필요에 따라 투명 또는 반투명하게 구현될 수 있다. 상기 PCR 열 블록(100)은 장치의 소형화 및 집적화를 위해 전체적으로 얇은 판 형상, 예를 들어 약 50 나노미터(nm) 내지 1 밀리미터(mm)의 두께, 바람직하게는 약 250 마이크로미터(㎛)로 구현될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 상기 PCR 열 블록(100) 상에는 2 이상의 히터가 반복 배치되는데, 예를 들어 상기 PCR 열 블록(100)은 1 이상의 히터를 구비하는 히터 군, 상기 히터 군을 2 이상 구비하되 상기 2 이상의 히터 군이 이격 배치된 히터 유닛이 2 이상 반복 배치될 수 있다. 또한, 상기 PCR 열 블록(100)의 PCR 반응부(900) 접촉 면은 PCR 용액이 수용된 PCR 반응부(900)에 효율적으로 열을 공급하기 위한 다양한 형상, 예를 들어 체적당 표면적 비율(Surface to Volume Ratio)을 증가시키도록 평면(Plane) 형상, 유로(Channel) 형상 또는 기둥(pillar) 형상으로 구현될 수 있다.
상기 히터(111, 112, 121, 122, 131, 132)는 상기 기판(99)에 배치 또는 인쇄되는 전도성 발열 소자로서, 줄 열(Joule Heating)을 이용하는 히터, 펠티어 효과(Peltier Effect)를 일으키는 열전소자(Thermoelement)로 구현될 수 있다. 상기 히터(111, 112, 121, 122, 131, 132)는 일정 온도를 유지하기 위해 다양한 전원 모듈 및 제어 모듈과 구동 가능하게 연결될 수 있고, 상기 히터(111, 112, 121, 122, 131, 132)의 온도를 모니터링하기 위한 센서와 구동 가능하게 연결될 수 있다. 상기 히터(111, 112, 121, 122, 131, 132)는 그 내부 온도를 일정하게 유지하기 위해 단위 전극, 즉 히터 전극들이 상기 히터(111, 112, 121, 122, 131, 132)의 표면 중심점을 기준으로 상하 및/또는 좌우 방향으로 대칭 배치될 수 있다. 또한, 상기 히터(111, 112, 121, 122, 131, 132)는 신속한 열 전달 및 전도성을 구현하기 위한 금속 재질, 예를 들어 크롬, 알루미늄, 구리, 철, 은, 및 탄소로 구성된 군으로부터 1 이상 선택되거나 또는 이를 기초로 하는 복합재료(composite materials)로 제조될 수 있으나, 이에 제한되진 않는다. 또한, 상기 히터(111, 112, 121, 122, 131, 132)는 광 투과성 발열 소자, 예를 들어 산화물 반도체 물질 또는 상기 산화물 반도체 물질에 In, Sb, Al, Ga, C 및 Sn로 구성된 군으로부터 선택된 불순물이 첨가된 물질을 포함하는 도전성 나노 입자, 인듐 주석 산화물, 전도성 고분자 물질, 탄소 나노 튜브, 및 그래핀(graphene)이 포함된 군으로부터 선택되는 하나 이상의 물질을 포함할 수 있다.
상기 히터 군(110, 120, 130)은 상기 1 이상의 히터(111, 112, 121, 122, 131, 132)를 포함하는 단위로서, PCR 수행을 위한 변성 단계, 어닐링 단계 및/또는 연장 단계를 수행하기 위한 온도를 유지하는 영역을 의미한다. 상기 히터 군(110, 120, 130)은 상기 PCR 열 블록(100)에 2 이상 배치되고, 상기 2 이상의 히터 군(110, 120, 130)은 상기 기판(99) 상에서 이격 배치되되, 바람직하게는 상기 PCR 열 블록(100)에 2개 내지 4개가 존재할 수 있다. 만약 상기 PCR 열 블록(100)이 2개의 히터 군을 구비한다고 가정하면, 상기 제1 히터 군은 PCR 변성 단계 온도를 유지하고 상기 제2 히터 군은 PCR 어닐링/연장 단계 온도를 유지하거나, 또는 상기 제1 히터 군은 PCR 어닐링/연장 단계 온도를 유지하고 상기 제2 히터 군은 PCR 변성 단계 온도를 유지하는 것일 수 있다. 또한, 만약 상기 PCR 열 블록(100)이 3개의 히터 군을 구비한다고 가정하면, 상기 제1 히터 군은 PCR 변성 단계 온도를 유지하고 상기 제2 히터 군은 PCR 어닐링 단계 온도를 유지하고 상기 제3 히터 군은 PCR 연장 단계 온도를 유지하거나, 또는 상기 제1 히터 군은 PCR 어닐링 단계 온도를 유지하고 상기 제2 히터 군은 PCR 연장 단계 온도를 유지하고 상기 제3 히터 군은 PCR 변성 단계 온도를 유지하거나, 또는 상기 제1 히터 군은 PCR 연장 단계 온도를 유지하고 상기 제2 히터 군은 PCR 변성 단계 온도를 유지하고 상기 제3 히터 군은 PCR 어닐링 단계 온도를 유지하는 것일 수 있다. 바람직하게는 상기 히터 군은 상기 PCR 열 블록(100)에 3회 배치되어 PCR 수행을 위한 3 단계, 즉 변성 단계, 어닐링 단계 및 연장 단계를 수행하기 위한 온도를 각각 유지하고, 더 바람직하게는 상기 열 블록(100)에 2회 배치되어 PCR 수행을 위한 2 단계, 즉 변성 단계 및 어닐링/연장 단계를 수행하기 위한 온도를 각각 유지하는 것일 수 있다. 상기 히터 군이 상기 PCR 열 블록(100) 상에 2회 배치되어 PCR 수행을 위한 2 단계, 즉 변성 단계 및 어닐링/연장 단계를 수행하는 경우 PCR 수행을 위한 3 단계, 즉 변성 단계, 어닐링 단계 및 연장 단계를 수행하는 것보다 PCR 시간을 줄일 수 있고, 히터 개수가 줄어듦으로써 구조의 단순화 및 집적도(density)를 증가시키는 이점이 있다. 한편, 이 경우 PCR 수행을 위한 3 단계에 있어서, 변성 단계를 수행하기 위한 온도는 85℃ 내지 105℃, 바람직하게는 95℃이고, 어닐링 단계를 수행하기 위한 온도는 40℃ 내지 60℃, 바람직하게는 50℃이고, 연장 단계를 수행하기 위한 온도는 50℃ 내지 80℃, 바람직하게는 72℃이고, 더 나아가 PCR 수행을 위한 2 단계에 있어서, 변성 단계를 수행하기 위한 온도는 85℃ 내지 105℃, 바람직하게는 95℃이고, 어닐링/연장 단계를 수행하기 위한 온도는 50℃ 내지 80℃, 바람직하게는 72℃이다. 다만, 상기 PCR 수행을 위한 특정 온도 및 온도 범위는 PCR 수행에 있어서 공지된 범위 내에서 조절 가능함은 물론이다. 상기 히터 군(110, 120, 130)은 온도 완충 역할을 수행하기 위한 추가적인 히터를 더 포함할 수 있다.
상기 히터 유닛(10, 20)은 상기 1 이상의 히터를 포함하는 상기 2 이상의 히터 군을 포함하는 단위로서, PCR 수행을 위한 변성 단계, 어닐링 단계 및/또는 연장 단계를 포함하는 제1 순환이 완료되는 영역을 의미한다. 상기 히터 유닛(10, 20)은 필요에 따라 상기 PCR 열 블록(100)에 2 이상 반복 배치될 수 있는데, 바람직하게는 상기 PCR 열 블록(100)에 10회, 20회, 30회 또는 40회로 반복 배치될 수 있다.
도 2에 따르면, 상기 PCR 열 블록(100)은 그 상부 면에 반복 배치된 히터 유닛(10, 20), 그에 각각 포함된 2개의 히터 군(110, 120), 및 그에 각각 포함된 1개의 히터(111, 121)를 구비함으로써, PCR 수행을 위한 2 단계 온도, 즉 변성 단계의 1 온도 및 어닐링/연장 단계의 1 온도를 순차적으로 반복 제공할 수 있다. 예를 들어, 제1 히터(111)는 85℃ 내지 105℃ 범위 중 1 온도, 바람직하게는 95℃를 유지하여 제1 히터 군(110)은 변성 단계를 수행하기 위한 온도를 제공하고, 제2 히터(121)는 50℃ 내지 80℃ 범위 중 1 온도, 바람직하게는 72℃를 유지하여 제2 히터 군(120)은 어닐링/연장 단계를 수행하기 위한 온도를 제공하여, 상기 PCR 열 블록(100)은 제1 히터 유닛(10) 및 제2 히터 유닛(20)에서 PCR 수행을 위한 2 단계 온도를 순차적으로 반복 제공할 수 있다.
도 3에 따르면, 상기 PCR 열 블록(100)은 그 상부 면에 반복 배치된 히터 유닛(10, 20), 그에 각각 포함된 2개의 히터 군(110, 120), 및 그에 각각 포함된 2개의 히터(111, 112, 121, 122)를 구비함으로써, PCR 수행을 위한 2 단계 온도, 즉 변성 단계의 2 온도 및 어닐링/연장 단계의 2 온도를 순차적으로 반복 제공할 수 있다. 예를 들어, 제1 히터(111)는 85℃ 내지 105℃ 범위 중 1 온도, 제2 히터(112)는 85℃ 내지 105℃ 범위 중 상기 제1 히터(111)의 온도와 동일하거나 상이한 1 온도를 유지하여 제1 히터 군(110)은 변성 단계를 수행하기 위한 온도를 제공하고, 제3 히터(121)는 50℃ 내지 80℃ 범위 중 1 온도, 제4 히터(122)는 50℃ 내지 80℃ 범위 중 상기 제3 히터(121)의 온도와 동일하거나 상이한 1 온도를 유지하여 상기 제2 히터 군(120)은 어닐링/연장 단계를 수행하기 위한 온도를 제공하여 상기 PCR 열 블록(100)은 제1 히터 유닛(10) 및 제2 히터 유닛(20)에서 PCR 수행을 위한 2 단계 온도를 순차적으로 반복 제공할 수 있다.
도 4에 따르면, 상기 PCR 열 블록(100)은 그 상부 표면에 반복 배치된 히터 유닛(10, 20), 그에 각각 포함된 3개의 히터 군(110, 120, 130), 및 그에 각각 포함된 1개의 히터(111, 121, 131)를 구비함으로써, PCR 수행을 위한 3 단계 온도, 즉 변성 단계의 1 온도, 어닐링 단계의 1 온도, 및 연장 단계의 1 온도를 순차적으로 반복 제공할 수 있다. 예를 들어, 제1 히터(111)는 85℃ 내지 105℃ 범위 중 1 온도, 바람직하게는 95℃를 유지하여 상기 제1 히터 군(110)은 변성 단계를 수행하기 위한 온도를 제공하고, 제2 히터(121)는 40℃ 내지 60℃ 범위 중 1 온도, 바람직하게는 50℃를 유지하여 상기 제2 히터 군(120)은 어닐링 단계를 수행하기 위한 온도를 제공하고, 제3 히터(131)는 50℃ 내지 80℃ 범위 중 1 온도, 바람직하게는 72℃를 유지하여 상기 제3 히터 군(130)은 연장 단계를 수행하기 위한 온도를 제공함으로써, 상기 열 블록(100)은 제1 히터 유닛(10) 및 제2 히터 유닛(20)에서 PCR 수행을 위한 3 단계 온도를 순차적으로 반복 제공할 수 있다.
도 5에 따르면, 상기 PCR 열 블록(100)은 그 상부 표면에 반복 배치된 히터 유닛(10, 20), 그에 각각 포함된 3개의 히터 군(110, 120, 130), 및 그에 각각 포함된 2개의 히터(111, 112, 121, 122, 131, 132)를 구비함으로써, PCR 수행을 위한 3 단계 온도, 즉 변성 단계의 2 온도, 어닐링 단계의 2 온도, 및 연장 단계의 2 온도를 순차적으로 반복 제공한다. 예를 들어, 제1 히터(111)는 85℃ 내지 105℃ 범위 중 1 온도, 제2 히터(112)는 85℃ 내지 105℃ 범위 중 상기 제1 히터(111)의 온도와 동일하거나 상이한 1 온도를 유지하여 상기 제1 히터 군(110)은 변성 단계를 수행하기 위한 온도를 제공하고, 제3 히터(121)는 40℃ 내지 60℃ 범위 중 1 온도, 제4 히터(122)는 40℃ 내지 60℃ 범위 중 상기 제3 히터(121)의 온도와 동일하거나 상이한 1 온도를 유지하여 제2 히터 군(120)은 어닐링 단계를 수행하기 위한 온도를 제공하고, 제5 히터(131)는 50℃ 내지 80℃ 범위 중 1 온도, 제6 히터(132)는 50℃ 내지 80℃ 범위 중 상기 제5 히터(131)의 온도와 동일하거나 상이한 1 온도를 유지하여 상기 제3 히터 군(130)은 연장 단계를 수행하기 위한 온도를 제공하여, 상기 PCR 열 블록(100)은 제1 히터 유닛(10) 및 제2 히터 유닛(20)에서 PCR 수행을 위한 3 단계 온도를 순차적으로 반복 제공할 수 있다.
도 2 내지 5와 같이, 일정 온도를 유지하는 2 이상의 히터(111, 112, 121, 122, 131, 132)가 PCR 열 블록(100) 상에 반복 배치됨으로써 시간당 온도 변화율을 크게 증가시킬 수 있다. 예를 들어, 기존의 단일 히터 방식에 따르면, 시간당 온도 변화율이 초당 3℃ 내지 7℃ 범위 내에서 이루어지는 데 반해, 본 발명의 실시예에 따른 반복 배치 히터 구조에 의하면, 상기 히터들 간의 시간당 온도 변화율이 초당 20℃ 내지 40℃ 범위 내에서 이루어져 PCR 시간을 크게 단축할 수 있다. 본 발명의 실시예에 따른 반복 배치 히터 구조에 따르면, PCR의 변성 단계, 어닐링 단계 및 연장 단계(또는 상기 변성 단계 및 어닐링/변성 단계)에서 정확한 온도 제어가 가능하게 되고, 아울러 상기 히터들로부터 열을 공급받는 부위에서만 원하는 온도 또는 온도 범위를 유지하는 것이 가능하게 된다. 또한, 상기 PCR 열 블록(100) 상에 다양한 수의 히터 유닛(10, 20)을 반복 배치함으로써 PCR 순환 주기를 다양하게 구현할 수 있다. 예를 들어, 순환 주기를 10회로 하는 PCR에 적용하고자 하는 경우 상기 히터 유닛을 10회 반복 배치할 수 있다. 즉, 의도된 PCR 순환 주기를 고려하여 상기 PCR 열 블록(100) 상에 상기 히터 유닛을 10회, 20회, 30회, 40회, 50회 등으로 반복 배치할 수 있다. 아울러, 상기 히터 유닛을 미리 결정된 PCR 순환 주기의 절반의 수로 반복 배치할 수도 있다. 예를 들어, 순환 주기 20회로 하는 PCR에 적용하고자 하는 경우 상기 히터 유닛을 10회 반복 배치할 수 있다. 이 경우 시료 및 시약 용액은 이하 상세하게 설명될 PCR 반응부의 반응 채널 내에서 유입부로부터 유출부 방향으로 PCR 순환 주기를 10회 반복 실행하되, 뒤이어 반대로 유출부로부터 유입부 방향으로 PCR 순환 주기를 10회 반복 실행할 수 있다.
도 6은 본 발명의 실시예에 따른 PCR 열 블록(100) 및 상기 PCR 열 블록(100)에 반복 배치된 히터에 전력을 공급하도록 구현된 전력 공급부(200)를 도시한다. 구체적으로, 도 6의 상단은 상기 PCR 열 블록(100)의 수직 단면도를 도시하고, 도 6의 하단은 상기 PCR 열 블록(100)의 평면도를 도시한다. 도 6의 PCR 열 블록(100)은 10회 반복 배치된 히터 유닛을 포함하고, 상기 히터 유닛은 제1 히터 군 및 제2 히터 군을 포함하며, 상기 제1 히터 군 및 제2 히터 군은 각각 1개의 히터, 즉 제1 히터(110) 및 제2 히터(120)를 포함한다. 상기 전력 공급부(200)는 전력 공급원으로부터 상기 PCR 열 블록(100)에 전력을 공급하여 가열하는 모듈로서, 상기 각 히터들(110, 120)에 전력을 분배하도록 구현된 배선(210, 220)을 포함한다. 예를 들어, 도 6에 따르면, 상기 PCR 열 블록(100)의 상기 제1 배선(210)은 상기 제1 히터(110)에 전력을 공급하도록 연결되고, 상기 제2 배선(220)은 상기 제2 히터(120)에 전력을 공급하도록 연결되어 있다. 만약 상기 제1 히터(110)가 PCR 변성 단계 온도, 예를 들어 85℃ 내지 105℃를 유지하고 상기 제2 히터(120)가 PCR 어닐링/연장 단계 온도, 예를 들어 50℃ 내지 80℃를 유지하는 경우 상기 제1 배선(210)은 상기 전력 공급부(200)로부터 PCR 변성 단계 온도 유지를 위한 전력을 공급받고, 상기 제2 배선(220)은 상기 전력 공급부(200)로부터 PCR 어닐링/연장 단계 온도 유지를 위한 전력을 공급받을 수 있다. 상기 제1 배선(210) 및 상기 제2 배선(220)은 금, 은, 구리 등 전도성 재질로 구현될 수 있으나, 이에 제한되진 않는다.
도 7은 보상형 패턴이 적용되지 않은 개별 히터에 전력을 공급할 경우 발생하는 불균일한 방사형 열 분포를 보여주는 사진이고, 도 8은 PCR 열 블록 상에 보상형 패턴이 적용되지 않은 2 이상의 히터가 반복 배치된 상태에서 전력을 공급할 경우 개별 히터로부터 발생하는 불균일한 방사형 열 분포에 따른 인접 히터(111, 121) 간 불균일한 열 중첩을 보여주는 사진이다.
도 7에 따르면, 전체적인 테두리가 장방형으로 구현된 단일 히터가 전력 공급에 의해 발열할 때 방사형 열 분포가 형성된다. 일반적으로, 전체적인 테두리가 장방형으로 구현된 단일 히터는 전력 공급 후 일정 온도를 유지할 때 히터 중앙 영역에서 열 쏠림 현상이 발생하여 고온 발열하고, 히터 테두리 부분으로 갈수록 열 손실 현상이 발생하여 상기 히터 중앙 영역에 비해 테두리 부분이 저온 발열하게 된다. 이러한 불균일한 발열 현상으로 인해, 도 7과 같이 단일 히터 주변에서 방사형의 열 분포가 관찰된다. 이러한 방사형 열 분포는 장방형 히터들이 2 이상 반복 배치된 PCR 열 블록에서 인접 히터 간 열 중첩에 의한 열 불균일도를 증가시키는 원인을 제공한다. 도 8에 따르면, 제1 히터(111)와 제2 히터(121) 사이에 개별 히터로부터 발생하는 방사형 열 분포 현상으로 인해 제1 히터(111)와 제2 히터(121) 사이에 불균일한 열 중첩 현상이 생기는 것을 확인할 수 있다. 예를 들어, 장방형 히터의 폭이 약 4 밀리미터(mm)로 구현되고, 상기 인접 히터 간 거리가 약 8 밀리미터(mm)로 구현된 2 이상의 히터가 반복 배치된 PCR 열 블록에서, 위와 같은 불균일한 열 중첩 현상이 발생하는 것을 쉽게 확인할 수 있다. 이와 같은 불균일한 열 중첩 현상은 도 1 내지 4와 같이 2 이상의 히터가 반복적으로 이격 배치된 열 블록에서 각 히터가 유지해야 할 정확한 온도 생성을 방해하고, 아울러 각 히터에 대한 온도 제어를 어렵게 하며, 더 나아가 정확한 PCR 수행을 어렵게 하여 결과적으로 PCR 효율을 감소시키게 된다. 이러한 인접 히터 간 불균일한 열 중첩 현상에 의한 문제점을 해결하고자 인접 히터 간 거리를 충분히 확보하거나, 인접 히터 사이의 공간에 열 차단 물질 등을 처리할 수는 있지만, 이 경우 PCR 열 블록의 전체 크기가 커지게 되어 장치의 소형화 및 집적화가 어려워지고, 제조 공정이 복잡해져서 경제성이 확보되기 어렵다.
도 9는 보상형 패턴(1000)이 적용된 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)을 도시한다.
도 9에 따르면, 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)은 개별 히터(111, 121)로부터 발생하는 방사형 열 분포에 따른 인접 히터 간 불균일한 열 중첩을 방지하기 위해 상기 히터(111, 121)의 적어도 일 부분의 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도를 조절하는 보상형 패턴(compensated pattern)(1000)을 구비한다. 상기 보상형 패턴(1000)은 장방형 히터의 적어도 일 부분의 형상, 재질, 크기, 배치 등을 변형함으로써 그 히터 부분의 저항 및 열 방출량을 조절하기 위한 가공된 패턴 구조를 말한다. 상기 보상형 패턴(1000)은 장방형 히터의 특징에 따라 다양하게 구현될 수 있는데, 예를 들어 상기 히터의 적어도 일 부분에 간극을 반복 형성하여 간극 패턴 또는 파장형 패턴을 구현하거나, 상기 히터의 적어도 일 부분의 재질을 다른 부분과 달리 구현하거나, 상기 히터의 적어도 일 부분의 크기를 다른 부분과 달리 구현하거나, 상기 히터의 적어도 일 부분의 단위 전극, 즉 히터 전극의 배치를 다른 부분과 달리 구현할 수 있다. 또한, 상기 보상형 패턴(1000)은 상기 히터의 전체 영역에 고르게 적용될 수 있지만, 경우에 따라 상기 히터의 일부 영역에만 국한하여 적용되거나, 반복 배치된 각 히터에 다르게 구현될 수도 있다. 한편, 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록에 있어서, 상기 보상형 패턴을 구비하는 히터는 상기 기판에 포토리소그래피(Photo lithography), 전기도금(Electro Plating), 섀도 마스크(Shadow Mask) 및 증발 증착(Evaporator Deposition), 섀도 마스크(Shadow Mask) 및 스퍼터 증착(Sputter Deposition), 잉크젯(Ink jet), 그라비아(Gravure), 그라비아-옵셋(Gravure-Offset), 스크린 인쇄(Screen Printing), CNC 공작 기계(computerized numerically controlled machine tool), 레이저 가공(Laser beam Machining), 및 방전 가공(Electric Discharge Machining)으로 구성된 군으로부터 선택되는 제조방법에 의해 구현될 수 있다.
도 10은 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록에 있어서, 히터(111)의 일 부분에 형성된 간극(1100)을 구비하는 보상형 패턴을 도시한다.
도 10에 따르면, 상기 보상형 패턴(1000)은 상기 히터(111)의 적어도 일 부분에 간극(1100)을 반복 형성하여 간극 패턴에 따른 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것일 수 있다. 상기 간극(1100)은 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 형상을 변형한 것으로서, 함몰 영역 또는 돌출 영역 또는 틈(gap)과 같이 히터 형상의 가공 패턴을 의미한다. 도 10에 따르면, 상기 간극(1100)은 히터(111) 표면에서 다양하게 구현될 수 있는데, 식별번호 1100a는 볼록형 간극을 나타내고, 식별번호 1100b는 오목형 간극을 나타내고, 식별번호 1100c는 틈새형 간극을 나타낸다. 또한, 상기 간극(1100)은 히터 테두리 표면에서 반복적으로 구현되어 파장형으로 구현될 수 있는데, 이는 상기 히터(111)의 테두리 표면이 연속적인 함몰 영역과 돌출 영역의 반복 형태로 구현된 것이다. 따라서, 상기 다양한 간극(1100) 구조에 의해 히터 표면의 형상이 다양하게 구현될 수 있고, 그로 인해 상기 히터의 적어도 일 부분의 저항을 조절되어 열 방출량을 조절될 수 있다. 한편, 상기 간극(1100)은 상기 히터(111)의 적어도 일 표면에 배치되되 다양한 규격으로 구현될 수 있다. 예를 들어, 상기 간극(1100)의 크기 또는 간극의 폭은 각 히터(111)의 임의의 표면에서 다양하게 구현될 수 있다. 이와 같이, 히터의 2 이상의 표면에서 상기 간극(1100)의 규격을 조절함으로써 상기 히터의 적어도 2 이상의 영역의 저항을 각각 조절할 수 있고, 그 결과 열 방출량을 조절하여 각 히터의 균일한 열 분포를 구현할 수 있다.
도 11은 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록에 있어서, 히터(111)의 일 부분에 형성된 간극의 폭(line width)을 달리 구현한 보상형 패턴을 도시한다.
상기 보상형 패턴(1000)은 상기 히터(111)의 적어도 일 부분에 반복 형성된 간극의 선폭(line width)을 달리 구현함으로써 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것일 수 있다. 위와 같이 선폭에 따른 저항 조절로 열 균일도가 조절된 보상형 패턴(1000)은 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 선폭을 달리 구현함으로써 상기 히터의 적어도 일 부분의 저항을 변형시켜 히터의 각 위치별 발열량을 조절하기 위한 가공 형태를 의미한다. 상기 선폭이 보상된 패턴은 상기 히터 표면에 간극이 반복 형성된 구조에서 다양하게 구현될 수 있다. 상기 선폭이 보상된 패턴은 상기 히터(111)의 전체 영역에 고르게 적용될 수 있지만, 경우에 따라 상기 히터(111)의 일부 영역에 적용될 수도 있다. 한편, 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)은 상기 히터(111)의 적어도 2 이상의 표면에 형성된 임의의 구획 구간에서 상이한 선폭으로 구현될 수 있다. 즉, 상기 히터 표면 중 다수의 구획 구간(A, B, C)을 정하고, 각 구획 구간(A, B, C)에 해당하는 히터 영역의 발열량을 조절할 수 있다. 예를 들어, 도 11에 따른 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)에 있어서, 구획 구간(A, B, C)의 볼록형 간극의 선폭을 비교해 보면, 구획 구간 A 및 C는 구획 구간 B에 비해 선폭이 좁게 구현되어 상대적으로 높은 저항을 갖게 되어 발열량이 높아지는데 반해, 구획 구간 B는 구획 구간 A 및 C에 비해 선폭이 넓게 구현되어 상대적으로 낮은 저항을 갖게 되어 발열량이 낮아지게 된다. 위와 같이, 히터 표면에 구현된 간극의 선폭을 조절함으로써, 기존의 장방형 히터 중 온도가 높은 부분은 저항을 낮게, 온도가 높은 부분은 저항을 높게 조절하고 열 방출량을 조절하여 전체적인 온도의 불균일도를 개선할 수 있다.
도 12는 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록에 있어서, 히터(111)의 일 부분의 두께를 달리 구현한 보상형 패턴을 도시한다.
상기 보상형 패턴(1000)은 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 두께를 달리 구현함으로써 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것일 수 있다. 위와 같이, 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 두께가 보상된 패턴(1000)은 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 두께를 다르게 구현함으로써 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 저항을 변형시켜 상기 히터(111)의 위치별 발열량을 조절하기 위한 가공 형태를 의미한다. 예를 들어, 상기 두께가 보상된 패턴(1000)은 상기 히터(111)의 표면에 볼록 면과 오목 면을 연속적으로 반복 배치하되 그 볼록 면 또는 오목 면의 두께를 달리 구현하는 것일 수 있고, 그 두께는 약 0.001 마이크로미터(㎛) 내지 1 밀리미터(mm) 범위 내에서 구현되지만, 이에 제한되진 않는다. 또한, 상기 두께가 보상된 패턴(1000)은 상기 히터(111)의 전체 영역에 고르게 적용될 수 있지만, 경우에 따라 상기 히터의 일부 영역에 적용될 수도 있다. 한편, 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)은 상기 히터(111)의 적어도 2 이상의 표면에 형성된 임의의 구획 구간에서 상이한 두께로 구현될 수 있다. 즉, 상기 히터 표면 중 다수의 구획 구간(A, B, C)을 정하고, 각 구획 구간(A, B, C)에 해당하는 히터 영역의 발열량을 조절할 수 있다. 예를 들어, 도 12에 따른 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)에 있어서, 구획 구간(A, B, C)의 볼록 면의 두께를 비교해 보면, 구획 구간 A 및 C는 구획 구간 B에 비해 두께가 얇게 구현되어 상대적으로 높은 저항을 갖게 되어 발열량이 높아지는데 반해, 구획 구간 B는 구획 구간 A 및 C에 비해 두께가 두껍게 구현되어 상대적으로 낮은 저항을 갖게 되어 발열량이 낮아진다. 위와 같이, 히터의 임의의 일 부분의 두께를 조절함으로써, 기존의 장방형 히터 중 온도가 높은 부분은 저항을 낮게, 온도가 높은 부분은 저항을 높게 조절하고 열 방출량을 조절하여 전체적인 온도의 불균일도를 개선할 수 있다.
도 13은 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록에 있어서, 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 재질을 달리 구현한 보상형 패턴을 도시한다.
상기 보상형 패턴(1000)은 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 재질을 달리 구현함으로써 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것일 수 있다. 위와 같이 재질이 보상된 패턴(1000)은 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 재질을 다르게 구현함으로써 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 저항을 변형시켜 히터의 위치별 발열량을 조절하기 위한 가공 형태를 의미한다. 상기 히터의 재질은 크롬, 알루미늄, 구리, 철, 은, 및 탄소로 구성된 군으로부터 1 이상 선택되거나 이를 기초로 하는 복합 재료(composite materials)일 수 있으며, 전도성을 가진 물질이라면 특별히 제한되지 않는다. 또한, 상기 재질이 보상된 패턴(1000)은 상기 히터(111)의 전체 영역에 고르게 적용될 수 있지만, 경우에 따라 상기 히터의 일부 영역에 적용될 수 있음은 물론이다. 한편, 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)은 상기 히터(111)의 적어도 2 이상의 표면에 형성된 임의의 구획 구간에서 상이한 재질로 구현될 수 있다. 즉, 상기 히터 표면 중 다수의 구획 구간(A, B, C)을 정하고, 각 구획 구간(A, B, C)에 해당하는 히터 영역의 발열량을 조절할 수 있다. 예를 들어, 도 13에 따른 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)에 있어서, 구획 구간(A, B, C)의 볼록 면(또는 볼록형 간극)의 재질을 비교해 보면, 구획 구간 A 및 C는 구획 구간 B에 비해 비저항이 높은 재질로 구현되어 상대적으로 높은 저항을 갖게 되어 발열량이 높아지는데 반해, 구획 구간 B는 구획 구간 A 및 C에 비해 비저항이 낮은 재질로 구현되어 상대적으로 낮은 저항을 갖게 되어 발열량이 낮아진다. 위와 같이, 히터의 임의의 일 부분의 재질을 조절함으로써, 기존의 장방형 히터 중 온도가 높은 부분은 저항을 낮게, 온도가 높은 부분은 저항을 높게 조절하고 열 방출량을 조절하여 전체적인 온도의 불균일도를 개선할 수 있다.
도 14는 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록에 있어서, 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 배치를 달리 구현한 보상형 패턴을 도시한다.
상기 보상형 패턴(1000)은 상기 히터(111)의 적어도 일 부분의 배치를 달리 구현함으로써 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것일 수 있다. 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)은 상기 히터(111)의 일 표면 및 이에 대응하는 타 표면에 간극(1100), 예를 들어 볼록형 간극 또는 오목형 간극이 배치되되, 서로 쌍 방향 지그재그 방식으로 구현된 히터 전극(1110a, 1110b)을 포함할 수 있다. 예를 들어, 상기 간극(1100)은 상기 히터 전극(1110a, 1110b)의 대응하는 표면에 지그재그 방식으로 구현될 수 있다. 또한, 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)은 장방형 히터 전극(1500), 및 상기 장방형 히터 전극(1500)으로부터 이격 배치되되 상기 보상형 패턴(1000)이 적용된 히터 전극(1110a, 1110b)을 포함할 수 있다. 더 나아가, 도 14와 같이, 상기 장방형 히터 전극(1500)은 상기 히터(111)의 중심 영역에 배치되되, 상기 보상형 패턴이 적용된 히터 전극(1110a, 1110b)은 상기 장방형 히터 전극(1500)으로부터 양 방향으로 이격 배치되되 상기 보상형 패턴이 적용된 히터 전극(1110a, 1110b)은 상기 장방형 히터 전극(1500) 위치를 기준으로 대칭으로 구현될 수 있다. 즉, 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)은 보상형 패턴(1000)을 포함하는 히터 전극만으로 구현될 수도 있지만, 필요에 따라 보상형 패턴(1000)이 적용된 히터 전극과 기존의 장방형 히터 전극(1500)을 다양하게 조합한 상태로 구현됨으로써, 기존의 장방형 히터 중 온도가 높은 부분은 저항을 낮게, 온도가 높은 부분은 저항을 높게 조절하고 열 방출량을 조절하여 전체적인 온도의 불균일도를 개선할 수 있다.
도 15는 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록으로부터 발생하는 열 분포를 보여주는 사진이고, 도 16은 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록으로부터 발생하는 열 분포를 보여주는 그래프이다.
기존의 장방형 히터 대비 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록(100)의 열 균일도 개선 효과를 확인하기 위하여, 도 11과 같은 PCR 열 블록을 제작하였다. 상기 PCR 열 블록은 볼록형 간극과 오목형 간극이 연속적으로 반복 배치된 보상형 패턴을 구비하는 히터가 기판 상에 반복 배치되도록 구현하였다. 또한, 상기 PCR 열 블록은 구획 구간 A 및 C의 볼록형 간극의 선폭 및 간극 간 거리를 모두 200 마이크로미터(㎛)로 구현하고, 구획 구간 B의 볼록형 간극의 선폭 및 간극 간 거리를 모두 400 마이크로미터(㎛)로 구현하여 히터의 각 구획 구간의 발열량을 조절하였다. 이 경우 볼록형 간극의 선폭 및 간극 간 거리는 약 50 나노미터(nm) 내지 1 밀리미터(mm) 범위 내에서 조절 가능한 것으로 확인되었고, 상기 히터의 두께는 10 마이크로미터(㎛)로 구현하되, 약 10 나노미터(nm) 내지 1 밀리미터(mm) 범위 내에서 조절 가능한 것으로 확인되었다.
도 15에 따르면, 본 발명의 일 실시예에 따른 PCR 열 블록의 열 분포는 도 7 내지 8에 따른 기존 장방형 히터의 열 분포에 비해 상당히 균일하게 나타난 것을 확인할 수 있다. 아울러, 도 16에 따르면, 본 발명의 일 실시예에 따른 PCR 열 블록의 제1 히터(111) 및 이에 인접하는 제2 히터(121)의 온도 피크 점(원형 점선)이 뚜렷하게 구별되는 것으로 보아 불균일한 열 중첩 현상이 상당히 감소하여 열 균일도가 증가한 것을 확인할 수 있었다. 이를 토대로, 위와 같은 보상형 패턴이 적용된 히터에 전력을 공급한 후 일정 온도를 유지한 상태에서 확인하면, 히터의 중앙 영역과 테두리 부분의 온도 차이가 감소하여 전체적으로 균일한 열 분포가 형성되었음을 확인할 수 있었다. 또한, 위와 같은 보상형 패턴이 적용된 히터들이 2 이상 반복 배치된 PCR 열 블록에 전력을 공급한 후 일정 온도를 유지한 상태에서 확인하면, 인접 히터 간 열 균일도가 상당하게 증가하는 것을 확인할 수 있었다. 더 나아가, 위와 같은 보상형 패턴이 적용된 히터가 반복 배치된 PCR 열 블록을 통해 2 단계 PCR(2-step PCR)을 수행한 결과, 인접하는 2개의 히터는 각각 변성 단계 온도(95 ℃) 및 어닐링/연장 단계 온도(72 ℃)를 정확하게 유지하는 것으로 파악되었다. 위와 같이, 본 발명의 제1 실시예에 따른 PCR 열 블록을 사용하면, 온도의 정밀 제어가 가능하여 PCR 과정을 통해 PCR 효율을 상당하게 증가시킬 수 있고 더 나아가 제어 모듈을 단순화 및 집적화할 수 있어서 PCR 장치의 소형화 구현이 가능하고, 제조 공정이 단순해져서 경제성이 더욱 확보될 것으로 예상된다.
도 17은 PCR 열 블록과 열 접촉하는 PCR 반응부(300)를 도시한다.
도 17에 따르면, 상기 PCR 반응부(300)는 상기 PCR 열 블록(100)에 접착 또는 부착되는 제1 판(310), 상기 제1 판(310) 상에 배치되고 상기 1 이상의 반응 채널(303)을 구비하는 제2 판(320), 및 상기 제2 판(320) 상에 배치되고 상기 1 이상의 반응 채널(303)의 양 말단에 각각 유입부(304) 및 유출부(305)를 구비하는 제3 판(330)을 포함할 수 있다. 이와 같이, 상기 PCR 반응부(300)를 박막 형상의 적층 구조로 구현하여 제조 방식이 간단하고, 비용을 크게 낮출 수 있으며, 상기 PCR 열 블록(100)과 열 교환이 매우 용이하다. 상기 PCR 반응부(300)는 다양한 재질로 구현될 수 있지만, 전체적으로 플라스틱 재질의 박막 형상으로 구현되는 것이 바람직하다. 또한, 상기 PCR 반응부(300)는 광 투과성 재질로 구현될 수 있고, 만약 형광(Fluorescence), 인광(Phosphorescence), 발광(Luminescence), 라만 분광법(Raman Spectroscopy), 표면 강화 라만 산란 (Surface Enhanced Raman Scattering), 및 표면 플라스몬 공명 (Surface Plasmon Resonance)와 같은 광학 측정 기반의 실시간(real-time) PCR 용도로 사용될 경우 상기 PCR 반응부(300)는 광 투과성 재질로 구현되는 것이 바람직하다.
상기 제1 판(310)은 상기 PCR 열 블록(100)과 접착 또는 부착되어 상기 PCR 열 블록(100)으로부터 열을 공급받는다. 상기 제1 판(310)은 다양한 재질로 구현될 수 있으나, 바람직하게는 폴리디메틸실옥산(polydimethylsiloxane, PDMS), 사이클로올레핀코폴리머(cycle olefin copolymer, COC), 폴리메틸메타크릴레이트(polymethylmetharcylate, PMMA), 폴리카보네이트(polycarbonate, PC), 폴리프로필렌카보네이트(polypropylene carbonate, PPC), 폴리에테르설폰(polyether sulfone, PES), 및 폴리에틸렌텔레프탈레이트(polyethylene terephthalate, PET), 및 그의 조합물로 구성된 군으로부터 선택되는 재질일 수 있다. 또한, 상기 제1 판(310)의 상단 면은 친수성 물질(도시되지 않음)이 처리될 수 있고, 이는 PCR을 원활하게 수행할 수 있도록 한다. 상기 친수성 물질의 처리에 의해 상기 제1 판(310) 상에 친수성 물질을 포함하는 단일 층이 형성될 수 있다. 상기 친수성 물질은 다양한 물질일 수 있으나, 바람직하게는 카르복시기(-COOH), 아민기(-NH2), 히드록시기(-OH), 및 술폰기(-SH)로 구성된 군으로부터 선택되는 것일 수 있고, 상기 친수성 물질의 처리는 당 업계에 공지된 방법에 따라 수행할 수 있다.
상기 제2 판(320)은 상기 제1 판(310) 상에 배치된다. 상기 제2 판(320)은 1 이상의 반응 채널(303)을 포함한다. 상기 1 이상의 반응 채널(303)은 상기 제3 판(330)에 형성된 유입부(304) 및 유출부(305)에 대응되는 부분과 연결된다. 따라서, 상기 1 이상의 반응 채널(303)에 증폭하고자 하는 표적 샘플 용액이 도입된 후 PCR 반응이 진행된다. 또한, 상기 1 이상의 반응 채널(303)은 사용 목적 및 범위에 따라 2 이상 존재할 수 있고, 도 1에 따르면, 5개의 반응 채널(303)이 예시되고 있다. 또한, 상기 제2 판(320)은 다양한 재질로 구현될 수 있으나, 바람직하게는 폴리메틸메타크릴레이트(polymethylmethacrylate, PMMA), 폴리카보네이트(polycarbonate, PC), 사이클로올레핀 코폴리머(cycloolefin copolymer, COC), 폴리아미드(polyamide, PA), 폴리에틸렌(polyethylene, PE), 폴리프로필렌(polypropylene, PP), 폴리페닐렌 에테르(polyphenylene ether, PPE), 폴리스티렌(polystyrene, PS), 폴리옥시메틸렌(polyoxymethylene, POM), 폴리에테르에테르케톤(polyetheretherketone, PEEK), 폴리테트라프로오르에틸렌(polytetrafluoroethylene, PTFE), 폴리비닐클로라이드(polyvinylchloride, PVC), 폴리비닐리덴 플로라이드(polyvinylidene fluoride, PVDF), 폴리부틸렌테레프탈레이트(polybutyleneterephthalate, PBT), 불소화에틸렌프로필렌(fluorinated ethylenepropylene, FEP), 퍼플로로알콕시알칸(perfluoralkoxyalkane, PFA), 및 그의 조합물로 구성된 군으로부터 선택되는 열 가소성 수지 또는 열 경화성 수지 재질일 수 있다. 또한, 상기 제2 판(320)의 두께는 다양할 수 있으나, 0.01 ㎛ 내지 5 mm에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 반응 채널(303)의 폭과 길이는 다양할 수 있으나, 바람직하게는 상기 반응 채널(303)의 폭은 0.001 mm 내지 10 mm에서 선택되고, 상기 반응 채널(303)의 길이는 1 mm 내지 400 mm에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 제2 판(320)의 내벽은 DNA, 단백질(protein) 흡착을 방지하기 위해 실란(silane) 계열, 보바인 시럼 알부민(Bovine Serum Albumin, BSA) 등의 물질로 코팅할 수 있고, 상기 물질의 처리는 당업계에 공지된 방법에 따라 수행될 수 있다.
상기 제3 판(330)은 상기 제2 판(320) 상에 배치된다. 상기 제3 판(330)은 상기 제2 판(320)에 형성된 1 이상의 반응 채널(303) 상의 일 영역에 형성된 유입부(304) 및 다른 일 영역에 형성된 유출부(305)를 구비한다. 상기 유입부(304)는 증폭하고자 하는 핵산을 포함하는 표적 샘플 용액이 유입되는 부분이다. 상기 유출부(305)는 PCR이 종료된 후 상기 표적 샘플 용액이 배출되는 부분이다. 따라서, 상기 제3 판(330)은 상기 제2 판(320)에 형성된 1 이상의 반응 채널(303)을 커버하되, 상기 유입부(304) 및 상기 유출부(305)는 상기 1 이상의 반응 채널(303)의 유입부 및 유출부 역할을 수행하게 된다. 또한, 상기 제3 판(330)은 다양한 재질로 구현될 수 있지만, 바람직하게는 폴리디메틸실옥산(polydimethylsiloxane, PDMS), 사이클로올레핀코폴리머(cycle olefin copolymer, COC), 폴리메틸메타크릴레이트(polymethylmetharcylate, PMMA), 폴리카보네이트(polycarbonate, PC), 폴리프로필렌카보네이트(polypropylene carbonate, PPC), 폴리에테르설폰(polyether sulfone, PES), 및 폴리에틸렌텔레프탈레이트(polyethylene terephthalate, PET), 및 그의 조합물로 구성된 군으로부터 선택되는 재질일 수 있다. 또한, 상기 유입부(304)는 다양한 크기를 구비할 수 있으나, 바람직하게는 지름 0.001 mm 내지 10 mm에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 유출부(305)는 다양한 크기를 구비할 수 있으나, 바람직하게는 지름 0.001 mm 내지 10 mm에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 유입부(304) 및 관통 개구 유출부(305)는 별도의 커버 수단(도시되지 않음)을 구비하여, 상기 1 이상의 반응 채널(303) 내에서 표적 샘플 용액에 대한 PCR이 진행될 때 표적 샘플 용액이 누출되는 것을 방지할 수 있다. 상기 커버 수단은 다양한 형상, 크기 또는 재질로서 구현될 수 있다. 또한, 상기 제3 판(330)의 두께는 다양할 수 있으나, 바람직하게는 0.001 mm 내지 10 mm에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 유입부(304) 및 유출부(305)는 2 이상 존재할 수 있다.
상기 PCR 반응부(300)는 기계적 가공을 통해 상기 유입부(304) 및 상기 유출부(305)를 형성하여 상기 제3 판(330)을 제공하는 단계; 상기 제3 판(330)의 하부 면과 대응되는 크기를 갖는 판재에 상기 제3 판(330)의 유입부(304)와 대응되는 부분으로부터 상기 제3 판(330)의 유출부(305)에 대응되는 부분까지 기계적 가공을 통해 1 이상의 반응 채널(303)을 형성하여 제2 판(320)을 제공하는 단계; 상기 제2 판(320)의 하부 면과 대응되는 크기를 갖는 판재의 상부 면에 표면 처리 가공을 통해 친수성 물질(도시되지 않음)로 구현된 표면을 형성하여 제1 판(310)을 제공하는 단계; 및 상기 제3 판(330)의 하부 면을 상기 제2 판(320)의 상부 면에 접합 공정을 통해 접합하고, 상기 제2 판(320)의 하부 면을 상기 제1 판(310)의 상부 면에 접합 공정을 통해 접합하는 단계를 포함하는 방법에 의해 쉽게 제조될 수 있다.
상기 제3 판(330)의 유입부(304) 및 유출부(305), 및 상기 제2 판(320)의 1 이상의 반응 채널(303)은 사출성형(injection molding), 핫-엠보싱(hot-embossing), 캐스팅(casting), 및 레이저 어블레이션(laser ablation)으로 구성된 군으로부터 선택되는 가공 방법에 의해 형성될 수 있다. 또한, 상기 제1 판(310) 표면의 친수성 물질은 산소 및 아르곤 플라즈마 처리, 코로나 방전 처리, 및 계면 활성제 도포로 구성된 군으로부터 선택되는 방법에 의해 처리될 수 있고 당 업계에 공지된 방법에 따라 수행될 수 있다. 또한, 상기 제3 판(330)의 하부 면과 상기 제2 판(320)의 상부 면, 및 상기 제2 판(320)의 하부 면과 상기 제1 판(310)의 상부 면은 열 접합(Thermal bonding), 초음파 융착(Ultrasonic Welding), 용매 접합(Solvent Bonding), 열판용착(Hot Plate Welding), UV 접합(Ultraviolet Bonding), 및 프레스 접합(Press Bonding) 공정에 의해 접착될 수 있고 당 업계에 공지된 방법에 따라 수행될 수 있다. 상기 제3 판(330)과 제2 판(320) 사이 및 상기 제2 판(320)과 제1 판(310) 사이에는 양면 접착제 또는 열가소성 수지 또는 열경화성 수지(도시되지 않음)가 처리될 수 있다.
도 18은 PCR 열 블록(100)과 PCR 반응부(300)가 일체형으로 구현된 PCR 칩을 도시하고, 도 19는 PCR 열 블록(100)과 PCR 반응부(300)가 별개형으로 구현된 PCR 장치를 도시한다.
본 발명의 제1 실시예에 따른 보상형 패턴을 구비하는 PCR 열 블록은 다양한 PCR 모듈 또는 장치에 적용될 수 있다. 예를 들어, 상기 보상형 패턴을 구비하는 PCR 열 블록은 PCR 용액을 수용하는 PCR 반응부에 장착되어 PCR 칩으로 구현될 수 있고(칩 내장형, 도 18), 상기 PCR 반응부를 구비하는 별개 PCR 칩과 열 접촉 또는 분리하도록 구현된 PCR 장치로 구현될 수 있다(칩 외장형, 도 19). 상기 칩 내장형의 경우 상기 보상형 패턴을 구비하는 PCR 열 블록의 상부 면은 PCR 용액의 전기 분해를 방지하기 위한 절연막(insulator, 306)이 형성될 수 있고, 상기 칩 외장형의 경우 상기 보상형 패턴을 구비하는 PCR 열 블록의 상부 면은 히터 보호용 절연막(insulator, 307)이 형성될 수 있다. 상기 절연막(306, 307)의 두께는 약 20 마이크로미터(㎛)로 구현되는 것이 바람직하지만, 약 50 나노미터(nm) 내지 1 밀리미터(mm) 범위 내에서 구현될 수 있음이 확인되었다. 상기 절연막은 PCR 용액의 전기 분해를 방지하기 위한 다양한 재질로 구현될 수 있는데, 예를 들어 산화물(Oxide), 질화물(Nitride), 열경화성 수지, 열가소성 수지, 및 UV 경화 수지로 구성된 군으로부터 선택될 수 있다. 구체적으로, 상기 산화물은 실리콘 산화물(SiO2), 티타니움 산화물(TiO2), 알루미늄 산화물(Al2O3), 하프니움 산화물(HfO2), 바나디윰 산화물(V3O4), 지르코니움 산화물(ZrO2), 안티모니 산화물(Sb2O3), 및 이트리윰 산화물(Y2O3)로 구성된 군으로부터 선택될 수 있고, 상기 질화물은 실리콘 질화물(Si3N4), 티타니움 질화물(TiN), 알루미늄 질화물(AlN), 탄탈륨 질화물(Ta3N5), 하프니윰 질화물(HfN), 바나디윰 질화물(VN), 및 지르코니움 질화물(ZrN)로 구성된 군으로부터 선택될 수 있고, 상기 열경화성 수지는 페놀 수지(Phenol Resin), 에폭시 수지(Epoxy Resin), 요소 수지(Urea Resin), 멜라민 수지(Melamine Resin), 알키드 수지(Alkyd Resin), 폴리에스테르 수지(Polyester Resin), 아닐린(Aniline), 폴리이미드(Polyimide), 및 실리콘 수지(Silicone Resin)로 구성된 군으로부터 선택될 수 있고, 상기 열가소성 수지는 폴리에틸렌(Polyethylene), 폴리염화비닐수지(Polyvinyl chloride Resin), 폴리스틸렌(Polystyrene), 폴리아미드 수지(Polyamide Resin), 폴리 4불화 에틸렌(Polytetrafluorethylene), 및 폴리프로필렌(Polypropylene)으로 구성된 군으로부터 선택될 수 있으며, 상기 UV 경화 수지는 에폭시 아크릴레이트(Epoxy Acrylate), 폴리 에스테르 아크릴레이트(Polyester Acrylate), 우레탄 아크릴레이트(Urethane Acrylate), 폴리 부타디엔 아크릴레이트(Polybutadiene Acrylate), 실리콘 아크릴레이트(Silicone Acrylate), 및 알킬 아크릴레이트(Alkyl Acrylate)로 구성된 군으로부터 선택될 수 있다. 한편, 상기 절연막은 상기 PCR 열 블록의 상부 면에 포토리소그래피(Photo lithography), 전기도금(Electro Plating), 섀도 마스크(Shadow Mask) 및 증발 증착(Evaporator Deposition), 섀도 마스크(Shadow Mask) 및 스퍼터 증착(Sputter Deposition), 잉크젯(Ink jet), 그라비아(Gravure), 그라비아-옵셋(Gravure-Offset), 및 스크린 인쇄(Screen Printing)로 구성된 군으로부터 선택되는 제조방법에 의해 구현될 수 있다.
도 20은 본 발명의 제1 실시예에 따른 보상형 패턴이 적용된 히터들이 반복 배치된 PCR 열 블록(100)을 구비하는 PCR 장치를 통해 구현되는 PCR을 도시한다.
도 20에 따르면, 본 발명의 일 실시예에 따른 PCR 장치는 PCR 반응부(300), 전력 공급원(400) 및 펌프(500)를 포함한다. 구체적으로, 상기 PCR 반응부(300)는 상기 PCR 열 블록 상에 접촉된다.
상기 전력 공급원(400)은 상기 전력 공급부(200)에 전력을 공급하기 위한 모듈로서, 상기 전력 공급부(200)의 제1 배선(210) 및 제2 배선(220)과 각각 연결될 수 있다. 예를 들어, PCR 수행시 상기 전력 공급원(400)의 제1 전력 포트(도시되지 않음)는 상기 제1 배선(210)과 전기적으로 연결되고, 상기 전력 공급원(400)의 제2 전력 포트(도시되지 않음)는 상기 제2 배선(220)과 전기적으로 연결된다. 뒤이어, PCR 수행을 위한 사용자 지시가 있는 경우 상기 전력 공급원(400)은 상기 제1 배선(210) 및 상기 제2 배선(220)에 각각 전력을 공급하여 상기 PCR 열 블록의 제1 히터 및 제2 히터를 신속히 가열할 수 있고, 각 히터들이 미리 결정된 온도에 도달하게 되면 전력 공급량을 제어하여 상기 미리 결정된 온도를 유지토록 한다. 예를 들어, 상기 미리 결정된 온도는 상기 제1 히터에서는 PCR 변성 단계 온도(85℃ 내지 105℃, 바람직하게는 95℃) 및 상기 제2 히터에서는 PCR 어닐링/연장 단계 온도(50℃ 내지 80℃, 바람직하게는 72℃)이거나, 또는 상기 제1 히터에서는 PCR 어닐링/연장 단계 온도(50℃ 내지 80℃, 바람직하게는 72℃) 및 상기 제2 히터에서는 PCR 변성 단계 온도(85℃ 내지 105℃, 바람직하게는 95℃)일 수 있다.
상기 펌프(500)는 상기 PCR 반응부(300)의 1 이상의 반응 채널(303) 내에서 유동하는 유체의 유량 및 유속을 제어하기 위한 모듈로서, 양압 펌프 또는 음압 펌프일 수 있고, 예를 들어 실린지(syringe) 펌프일 수 있다. 상기 펌프(500)는 상기 반응 채널(303)의 일 부분에 구동가능하게 배치될 수 있으나, 바람직하게는 상기 반응 채널(303)의 양 말단에 형성된 유입부(304) 및/또는 유출부(305)에 연결 배치된다. 상기 펌프(500)가 상기 유입부(304) 및/또는 유출부(305)에 연결 배치된 경우 펌프 역할을 수행할 뿐만 아니라 상기 유입부(304) 및/또는 유출부(305)를 통해 표적 샘플 용액이 새어 나오는 것을 방지하는 마개 역할을 수행할 수도 있다. 또한, 상기 반응 채널(303) 내에서 유동하는 유체, 즉 표적 샘플 용액의 유량 및 유속을 일 방향으로 제어하고자 하는 경우 상기 펌프(500)는 상기 유입부(304) 및 상기 유출부(305) 중 어느 하나에만 연결 배치되고, 남은 하나에는 일반적인 마개가 밀봉 연결될 수 있고, 상기 반응 채널(303) 내에서 유동하는 유체, 즉 표적 샘플 용액의 유량 및 유속을 양 방향으로 제어하고자 하는 경우에는 상기 펌프(500)는 상기 유입부(304) 및 상기 유출부(305) 모두에 연결 배치될 수 있다.
상기 PCR 반응부(300), 상기 전력 공급원(400) 및 상기 펌프(500)를 포함하는 PCR 장치 내에서 PCR 용액의 핵산 증폭 반응은 일 실시예로서, 아래와 같은 단계를 통해 수행될 수 있다.
1. 원하는 이중 가닥 표적 DNA, 증폭하고자 하는 특정 염기 서열과 상보적인 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드 프라이머, DNA 중합효소, 삼인산화데옥시리보뉴클레오티드(deoxyribonucleotide triphosphates, dNTP), PCR 반응 완충액(PCR reaction buffer)를 포함하는 PCR 용액을 준비한다.
2. 상기 PCR 용액을 PCR 반응부(300)에 도입한다. 이 경우 상기 PCR 용액은 상기 유입부(304)를 통해 상기 PCR 반응부(300) 내부의 반응 채널(303)에 배치된다.
3. 상기 전력 공급부(200), 구체적으로 제1 배선(210) 및 제2 배선(220)이 상기 전력 공급원(400)과 각각 연결되도록 하고, 상기 PCR 반응부(300)의 상기 유입부(304) 및 상기 유출부(305)를 펌프(500)와 밀봉 연결한다.
4. 상기 전력 공급부(400)에 전력 공급 지시를 하여 상기 제1 배선(210) 및 상기 제2 배선(220)을 통해 상기 제1 히터 및 상기 제2 히터를 발열시키고, 특정 온도, 예를 들어 제1 히터의 경우 PCR 변성 단계 온도(95℃) 및 제2 히터의 경우 PCR 어닐링/연장 단계 온도(72℃)를 유지한다.
5. 상기 유입부(304)와 연결된 펌프(500)에 의해 양압이 제공되거나 또는 상기 유출부(305)와 연결된 펌프(500)에 의해 음압이 제공되면 상기 표적 샘플 용액은 상기 반응 채널(303) 내부에서 수평 방향으로 유동하도록 한다. 이 경우 상기 PCR 용액의 유량 및 유속은 상기 펌프(500)에 의해 제공되는 양압 또는 음압의 세기를 조절하여 제어될 수 있다.
상기 단계들을 수행함으로써, 상기 PCR 용액은 상기 반응 채널(303)의 유입부(304) 말단으로부터 유출부(305) 말단까지 상기 제1 히터의 상측 대응 부분 및 상기 제2 히터의 상측 대응 부분을 길이 방향으로 이동하면서 PCR을 수행한다. 도 20에 따르면, 상기 PCR 용액은 상기 제1 히터 및 상기 제2 히터를 포함하는 히터 유닛이 10회 반복 배치된 열 블록(100)으로부터 열을 공급받아 상기 제1 히터의 상측 대응 부분에서 PCR 변성 단계 및 상기 제2 히터의 상측 대응 부분에서 PCR 어닐링/연장 단계를 거치면서 10회 PCR 순환 주기를 완료하게 된다. 뒤이어, 선택적으로, 상기 PCR 용액은 상기 반응 채널(303)의 유출부(305) 말단으로부터 유입부(304) 말단까지 상기 제1 히터의 상측 대응 부분 및 상기 제2 히터의 상측 대응 부분을 길이 방향으로 역 이동하면서 PCR을 재수행할 수 있다.
도 21은 본 발명의 제1 실시예에 따른 보상형 패턴이 적용된 히터들이 반복 배치된 PCR 열 블록(100), 광원(150) 및 광 검출부(600)를 구비하는 PCR 장치를 통해 구현되는 광학적 실시간 PCR을 도시한다.
도 21에 따르면, 본 발명의 일 실시예에 따른 PCR 장치는 광 투과성 재질의 PCR 반응부(300) 및 이를 포함하되 제1 히터(110) 및 제2 히터(120) 사이에 광원(150)이 배치된 열 블록(100), 전력 공급부(400), 펌프(500) 및 광 검출부(600)를 포함한다.
도 21에 따른 PCR 반응부(300)은 광 투과성 재질로 구현되고, 상기 PCR 열 블록(100)의 제1 히터(110) 및 제2 히터(120) 사이에 광원(150)이 배치되는 것을 특징으로 한다. 또한, 상기 PCR 장치는 상기 광원(150)으로부터 방출되는 광을 검출하기 위한 광 검출부(600)를 더 포함한다. 따라서, 상기 PCR 장치는 PCR 수행시 핵산 증폭 과정을 실시간(real-time)으로 측정 및 분석할 수 있다. 이 경우 상기 PCR 용액은 별도의 형광 물질이 더 첨가될 수 있고, 이는 PCR 산물의 생성에 따라 특정 파장의 광에 의해 발광함으로써 측정 및 분석 가능한 광 신호를 유발하게 된다. 상기 광원(150)은 수은 아크 램프(Mercury Arc Lamp), 크세논 아크 램프(Xenon Arc Lamp), 텅스텐 아크 램프(Tungsten Arc Lamp), 금속 할라이드 아크 램프(Metal Halide Arc Lamp), 금속 할라이드 광섬유(Metal Halide fiber), 및 LED(Light Emitting Diodes)로 구성된 군으로부터 선택될 수 있다. 또한, 상기 광원(150)의 파장은 약 200 나노미터(nm) 내지 1300 나노미터(nm) 범위 내에서 선택될 수 있고, 다중 광원을 이용하거나, 필터를 이용하여 다중 파장으로 구현될 수 있다. 또한, 상기 광 검출부(600)은 CCD(Charge-coupled Device), CID(Charge-injection Device), CMOS(Complementary-metal-oxide-semiconductor Detector), 및 PMT(Photo Multiplier Tube)로 구성된 군으로부터 선택될 수 있다. 본 발명의 일 실시예에 있어서, 상기 광원(150)은 상기 제1 히터(110) 및 제2 히터(120) 사이의 공간에 배치될 수 있다. 또한, 상기 광원(150)은 상기 광원(150)으로부터 방출되는 광을 포집하는 렌즈(도시되지 않음) 및 특정 파장 대의 광을 여과하는 광 필터(도시되지 않음)와 구동가능하게 연결 배치될 수 있다.
도 21에 따르면, 본 발명의 일 실시예에 따른 PCR 장치에 의해 핵산 증폭 반응이 실시간(real-time)으로 측정되는 단계를 확인할 수 있다. 예를 들어, PCR 용액은 상기 반응 채널(303) 내에서 상기 제1 히터(110)의 상측 대응 부분(301) 및 상기 제2 히터(120)의 상측 대응 부분(302)을 연이어 통과하면서 PCR 변성 단계 및 PCR 어닐링/연장 단계를 수행하는데, 이 경우 PCR 용액은 상기 제1 히터(110)와 상기 제2 히터(120) 사이, 및 상기 제1 히터(110)와 상기 제2 히터(120)를 포함하는 히터 유닛 사이에서 상기 광원(150)의 상측 대응 부분을 통과하게 된다. PCR 용액이 상기 광원(150)의 상측 대응 부분을 통과할 때 유체 제어를 통해 상기 PCR 용액의 유속을 느리게 하거나 잠시 정지 상태로 유지한 후 상기 광원(150)으로부터 광을 방출시키고, 상기 방출된 광은 상기 광 투명한 PCR 반응부(300), 구체적으로 상기 반응 채널(330)을 통과하고, 상기 반응 채널(330) 내의 핵산 증폭에 의해 발생하는 광 신호를 상기 광 검출부(600)가 측정 및 분석할 수 있다. 따라서, PCR 각 순환 주기가 진행되는 동안 상기 반응 채널(303) 내에서 (형광 물질이 결합된) 핵산의 증폭에 의한 반응 결과를 실시간(real-time)으로 모니터링함으로써 표적 핵산의 양을 실시간(real-time)으로 측정 및 분석할 수 있다.
도 22 내지 25는 도 12 내지 16의 PCR 열 블록과 열 접촉하는 다른 유형의 PCR 반응부(900)를 도시한다.
도 22 내지 25에 따른 PCR 반응부(900)는 상기 반응 채널의 길이 방향으로 그 하단 면을 가로질러 반복 이격 배치되되 상기 반응 채널 내부에서 증폭 핵산과 활성물질의 결합으로 인해 발생하는 전기화학적 신호를 검출하도록 구현된 검출 전극을 구비하는 것으로서, 상기 열 블록과의 열 접촉시 상기 검출 전극은 상기 2 이상의 히터 군 사이에 배치되도록 구현된다. 상기 PCR 반응부(900)는 판 형상으로 구현되고, 양 말단에 유입부(931) 및 유출부(932)가 구현된 1 이상의 반응 채널(921), 및 상기 반응 채널(921)의 길이 방향으로 그 하단 면을 가로질러 반복 이격 배치되되 상기 반응 채널(921) 내부에서 증폭 핵산과 활성물질의 결합으로 인해 발생하는 전기화학적 신호를 검출하도록 구현된 검출 전극(950)을 구비하는 것으로서, 상기 PCR 열 블록(100)과의 열 접촉시 상기 검출 전극(950)은 상기 2 이상의 히터 군(110, 120, 130) 사이에 배치되도록 구현된다. 상기 PCR 반응부(900)는 핵산, 예를 들어 PCR 시료인 주형 핵산 이중 가닥 DNA, PCR 시약인 증폭하고자 하는 특정 염기 서열과 상보적인 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드 프라이머, DNA 중합효소, 삼인산화데옥시리보뉴클레오티드(deoxyribonucleotide triphosphates, dNTP), PCR 완충액 (PCR reaction buffer)을 포함하는 용액을 수용할 수 있다. 상기 PCR 반응부(900)는 상기 시료 및 시약을 도입하기 위한 유입부(931), 핵산 증폭 반응을 완료한 용액을 배출하기 위한 유출부(932) 및 상기 시료 및 시약의 핵산 증폭 반응이 수행되는 반응 채널(921)을 구비한다. 도 22에 따르면, 상기 반응 채널(921)은 상기 제1 히터의 상측 대응 부분 및 상기 제2 히터의 상측 대응 부분을 길이 방향으로 통과하도록 연장 배치될 수 있다. 상기 PCR 반응부(900)는 상기 열 블록(100)으로부터 열을 제공받고, 상기 PCR 반응부(900)의 반응 채널(921)에 포함된 PCR 시료 및 시약은 가열 및 유지될 수 있다. 또한, 상기 PCR 반응부(900)는 열 전도율을 높이고 2 이상의 반응 채널(921)을 구비할 수 있도록 전체적으로 판 형상으로 구현된다. 또한, 상기 PCR 반응부(900)는 투명 또는 불투명 재질의 플라스틱 재질로 구현될 수 있는데, 플라스틱 재질의 특성상 두께 조절이 용이하여 두께 조절만으로 열 전달 효율을 증대시킬 수 있고, 제작 공정이 단순하여 제조 비용을 절감할 수 있다.
한편, 상기 활성물질(redox indicator)은 증폭 핵산과 화학적으로 반응(결합)하여 전기화학적 신호를 일으키는 물질로 정의되고, 상기 전기화학적 신호는 핵산의 연속적인 증폭에 따라 연속적으로 검출 및 측정될 수 있는 신호를 말한다. 예를 들어, 이중 가닥 핵산(DNA)의 경우 전체적으로 음전하를 띠는데, 활성물질이 양전하를 띠는 경우 핵산의 연속적인 증폭에 따라 증폭 핵산과 상기 활성물질이 반응하여 총 전하량 변화에 의해 검출가능한 신호가 도출될 수 있다. 따라서, 상기 전기화학적 신호는 상기 증폭 핵산의 음 전하와 상기 활성물질의 양 전하의 결합에 인한 총 전류값 변화에 기인할 수 있고, 상기 활성물질은 이온결합성 물질의 이온화 산물 중 양이온 물질일 수 있다. 더 구체적으로, 상기 이온결합성 물질은 메틸렌 블루(methylene blue)이고, 상기 활성물질은 메틸렌 블루의 이온화 산물 중 양이온 물질일 수 있다. 상기 메틸렌 블루(C16H18N3SCl·3H2O)는 용매에 녹이면 이온화 되어 C16H18N3S+와 Cl-로 이온화되고, 전자의 경우 황원자(S)에 의하여 양전하를 띤다. 이중 가닥 핵산(DNA)은 당과 염기와 인산으로 이루어져 있는데, 이 중 인산기가 음전하를 띠고 있어 이중 가닥 핵산(DNA)은 전체적으로 음전하를 띤다. 메틸렌 블루의 양이온이 DNA의 인산기와 결합하여, 메틸렌 블루의 겉보기 확산율보다 이중가닥 핵산과 결합한 메틸렌블루의 겉보기 확산율이 감소하고, 이에 따라 전류의 피크 값을 감소시킨다. 따라서 PCR 주기가 진행됨에 따라 이중 가닥 핵산(DNA)이 증폭되고 이중가닥 핵산(DNA)에 결합되는 메틸렌 블루의 양이 늘어나 전류의 피크 값이 감소하게 되고, 결과적으로 실시간 PCR의 증폭 산물과 메틸렌 블루의 화학적 결합으로 인한 전기적 신호를 통해 증폭 핵산의 실시간 정량이 가능하다.
상기 검출 전극(950)은 상기 1 이상의 반응 채널(921) 내부에서 증폭 핵산과 활성물질의 결합으로 인해 발생하는 전기화학적 신호를 검출할 수 있도록 다양한 재질로 구현될 수 있는데, 예를 들어 금(Au), 코발트(Co), 백금(Pt), 은(Ag), 탄소나노튜브(carbon nanotube), 그래핀(graphene), 및 탄소(Carbon)로 구성된 군으로부터 1 이상 선택될 수 있다. 상기 검출 전극(950)은 상기 반응 채널(921)의 길이 방향으로 그 하단 면을 가로질러 반복 이격 배치되되 상기 열 블록(100)과의 열 접촉시 상기 검출 전극(950)은 상기 2 이상의 히터 군(110, 120, 130) 사이에 배치되도록 구현된다. 도 22에 따르면, 상기 검출 전극(950)은 상기 유입부(931)로부터 유출부(932)까지의 반응 채널(921) 영역에 일정한 간격으로 반복적으로 이격 배치되어 있는데, 이와 같은 구조를 통해 상기 반응 채널(921)을 길이 방향으로 통과하면서 순차적으로 증폭되는 핵산으로부터 반복적으로 전기화학적 신호를 검출할 수 있다. 아울러, 도 23에 따르면, 상기 검출 전극(950)은 상기 반응 채널(921)의 하단 면에 배치된 것을 확인할 수 있다. 한편, 도 23에 따르면, 상기 PCR 반응부(900)는 수직 단면도를 기준으로 크게 3개의 층(layer)으로 구분될 수 있다. 상기 PCR 반응부(900)는 상기 검출 전극(950)이 구비된 제1 판(910); 상기 제1 판(910) 상에 배치되되 상기 1 이상의 반응 채널(921)이 구비된 제2 판(920); 및 상기 제2 판(920) 상에 배치되되 상기 유입부(931) 및 유출부(932)가 구비된 제3 판(930)을 포함할 수 있다.
상기 검출 전극(950)이 구비된 제1 판(910)의 상부 면은 상기 제2 판(920)의 하부 면에 접착 배치된다. 상기 제1 판(910)이 상기 반응 채널(921)을 구비하는 제2 판(920)에 접착 배치됨으로써 상기 반응 채널(921)에 관한 공간이 확보되고, 더 나아가 상기 반응 채널(921)의 적어도 일 영역(표면)에 상기 검출 전극(950)이 배치된다. 한편, 상기 제1 판(910)은 다양한 재질로 구현될 수 있으나, 바람직하게는 폴리디메틸실옥산(polydimethylsiloxane, PDMS), 사이클로올레핀코폴리머(cycle olefin copolymer, COC), 폴리메틸메타크릴레이트(polymethylmetharcylate, PMMA), 폴리카보네이트(polycarbonate, PC), 폴리프로필렌카보네이트(polypropylene carbonate, PPC), 폴리에테르설폰(polyether sulfone, PES), 및 폴리에틸렌텔레프탈레이트(polyethylene terephthalate, PET), 및 그의 조합물로 구성된 군으로부터 선택되는 재질일 수 있다. 또한, 상기 제1 판(910)의 상부 면은 친수성 물질(도시되지 않음)이 처리되어 PCR을 원활하게 수행할 수 있다. 상기 친수성 물질 처리에 의해 상기 제1 판(910) 상에 친수성 물질을 포함하는 단일 층이 형성될 수 있다. 상기 친수성 물질은 다양한 물질일 수 있으나, 바람직하게는 카르복시기(-COOH), 아민기(-NH2), 히드록시기(-OH), 및 술폰기(-SH)로 구성된 군으로부터 선택되는 것일 수 있고, 상기 친수성 물질의 처리는 당 업계에 공지된 방법에 따라 수행할 수 있다.
상기 제2 판(920)의 상부 면은 상기 제3 판(930)의 하부 면과 접촉 배치된다. 상기 제2 판(920)은 상기 반응 채널(921)을 포함한다. 상기 반응 채널(921)은 상기 제3 판(910)에 형성된 유입부(931)와 유출부(932)에 대응되는 부분과 연결되어 양 말단에 유입부(931) 및 유출부(932)가 구현된 1 이상의 반응 채널(921)을 완성한다. 따라서, 상기 반응 채널(921)에 PCR 시료 및 시약이 도입된 후 PCR이 진행된다. 또한, 상기 반응 채널(921)은 사용목적 및 범위에 따라 2 이상 존재할 수 있다. 또한, 상기 제2 판(920)은 다양한 재질로 구현될 수 있으나, 바람직하게는 폴리메틸메타크릴레이트(polymethylmethacrylate, PMMA), 폴리카보네이트(polycarbonate, PC), 사이클로올레핀 코폴리머(cycloolefin copolymer, COC), 폴리아미드(polyamide, PA), 폴리에틸렌(polyethylene, PE), 폴리프로필렌(polypropylene, PP), 폴리페닐렌 에테르(polyphenylene ether, PPE), 폴리스티렌(polystyrene, PS), 폴리옥시메틸렌(polyoxymethylene, POM), 폴리에테르에테르케톤(polyetheretherketone, PEEK), 폴리테트라프로오르에틸렌(polytetrafluoroethylene, PTFE), 폴리비닐클로라이드(polyvinylchloride, PVC), 폴리비닐리덴 플로라이드(polyvinylidene fluoride, PVDF), 폴리부틸렌테레프탈레이트(polybutyleneterephthalate, PBT), 불소화에틸렌프로필렌(fluorinated ethylenepropylene, FEP), 퍼플로로알콕시알칸(perfluoralkoxyalkane, PFA), 및 그의 조합물로 구성된 군으로부터 선택되는 열 가소성 수지 또는 열 경화성 수지 재질일 수 있다. 또한, 상기 제2 판(920)의 두께는 다양할 수 있으나, 10 ㎛ 내지 2000 ㎛에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 반응 채널(921)의 폭과 길이는 다양할 수 있으나, 바람직하게는 상기 반응 채널(921)의 폭은 0.001 mm 내지 10 mm에서 선택되고, 상기 반응 채널(921)의 길이는 1 mm 내지 400 mm에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 제2 판(920) 내벽은 DNA, 단백질(protein) 흡착을 방지하기 위해 실란(silane) 계열, 보바인 시럼 알부민(Bovine Serum Albumin, BSA) 등의 물질로 코팅할 수 있고, 상기 물질의 처리는 당 업계에 공지된 방법에 따라 수행될 수 있다.
상기 제3 판(930)의 하부 면은 상기 제2 판(920)의 상부 면에 배치된다. 상기 제3 판(930)은 상기 제2 판(920)에 형성된 반응 채널(921) 상의 일 영역에 형성된 유입부(931) 및 다른 일 영역에 형성된 유출부(932)를 구비한다. 상기 유입부(931)는 PCR 시료 및 시약이 유입되는 부분이다. 상기 유출부(932)는 PCR이 종료된 후 PCR 산물이 유출되는 부분이다. 따라서, 상기 제3 판(930)은 상기 제2 판(920)에 형성된 반응 채널(921)을 커버하되 상기 유입부(931) 및 유출부(932)는 상기 반응 채널(921)의 유입부 및 유출부 역할을 수행하게 된다. 또한, 상기 제3 판(930)은 다양한 재질로 구현될 수 있지만, 바람직하게는 폴리디메틸실옥산(polydimethylsiloxane, PDMS), 사이클로올레핀코폴리머(cycle olefin copolymer, COC), 폴리메틸메타크릴레이트(polymethylmetharcylate, PMMA), 폴리카보네이트(polycarbonate, PC), 폴리프로필렌카보네이트(polypropylene carbonate, PPC), 폴리에테르설폰(polyether sulfone, PES), 및 폴리에틸렌텔레프탈레이트(polyethylene terephthalate, PET), 및 그의 조합물로 구성된 군으로부터 선택되는 재질일 수 있다. 또한, 상기 유입부(931)는 다양한 크기를 구비할 수 있으나, 바람직하게는 지름 1.0 mm 내지 3.0 mm에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 유출부(932)는 다양한 크기를 구비할 수 있으나, 바람직하게는 지름 1.0 mm 내지 1.5 mm에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 유입부(931) 및 유출부(932)는 별도의 커버 수단(도시되지 않음)을 구비하여, 상기 반응 채널(921) 내에서 PCR 시료 및 시약에 대한 PCR이 진행될 때 용액이 누출되는 것을 방지할 수 있다. 상기 커버 수단은 다양한 형상, 크기 또는 재질로서 구현될 수 있다. 또한, 상기 제3 판의 두께는 다양할 수 있으나, 바람직하게는 0.1 mm 내지 2.0 mm에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 유입부(931) 및 상기 유출부(932)는 2 이상 존재할 수 있다.
한편, 상기 PCR 반응부(900)는 기계적 가공을 통해 유입부(931) 및 유출부(932)를 형성하여 제3 판(930)을 제공하는 단계; 상기 제3 판(930)의 하부 면과 대응되는 크기를 갖는 판재에 상기 제3 판(930)의 유입부(931)와 대응되는 부분으로부터 상기 제3 판(930)의 유출부(932)에 대응되는 부분까지 기계적 가공을 통해 반응 채널(921)을 형성하여 제2 판(920)을 제공하는 단계; 상기 제2 판(920)의 하부 면과 대응되는 크기를 갖는 판재의 상부 면에 표면 처리 가공을 통해 친수성 물질(922)로 구현된 표면을 형성하여 제1 판(910)을 제공하는 단계; 및 상기 제3 판(930)의 하부 면을 상기 제2 판(920)의 상부 면에 접합 공정을 통해 접합하고, 상기 제2 판(920)의 하부 면을 상기 제1 판(910)의 상부 면에 접합 공정을 통해 접합하는 단계를 포함하는 방법에 의해 용이하게 제조될 수 있다. 상기 제3 판(930)의 유입부(931) 및 유출부(932), 및 상기 제2 판(920)의 반응 채널(921)은 사출성형(injection molding), 핫-엠보싱(hot-embossing), 캐스팅(casting), 및 레이저 어블레이션(laser ablation)으로 구성된 군으로부터 선택되는 가공 방법에 의해 제조될 수 있다. 또한, 상기 제1 판(910) 표면의 친수성 물질(922)은 산소 및 아르곤 플라즈마 처리, 코로나 방전 처리, 및 계면 활성제 도포로 구성된 군으로부터 선택되는 방법에 의해 처리될 수 있고 당 업계에 공지된 방법에 따라 수행될 수 있다. 또한, 상기 제3 판(930)의 하부 면과 상기 제2 판(920)의 상부 면, 및 상기 제2 판(920)의 하부 면과 상기 제1 판(910)의 상부 면은 열 접합(Thermal bonding), 초음파 융착(Ultrasonic Welding), 용매 접합(Solvent Bonding), 열판용착(Hot Plate Welding), UV 접합(Ultraviolet Bonding), 및 프레스 접합(Press Bonding) 공정에 의해 접착될 수 있고 당 업계에 공지된 방법에 따라 수행될 수 있다. 상기 제3 판(930)과 제2 판(920) 사이 및 상기 제2 판(920)과 제3 판(910) 사이에는 양면 접착제 또는 열가소성 수지 또는 열 경화성 수지(500)가 처리될 수 있다.
한편, 도 22의 "a" 부분을 확대한 도 24 내지 25에 따르면, 상기 검출 전극(950)은 다양하게 구현될 수 있다. 예를 들어, 도 24과 같이 상기 증폭 핵산과 활성물질의 결합이 일어나는 작업 전극(working electrode)(950a) 및 상기 증폭 핵산과 활성물질의 결합이 일어나지 않음으로써 전극 전위의 측정 기준이 되는 기준 전극(reference electrode)(950b)을 구비하는 2-전극 모듈, 또는 도 25와 같이 상기 작업 전극(950a), 상기 기준 전극(950b), 및 상기 작업 전극으로부터 발생하는 전류가 흐르게 되는 상대 전극(counter electrode)(950c)을 구비하는 3-전극 모듈로 구현될 수 있다. 이와 같이, 상기 검출 전극(950)의 구조가 위와 같이 다-전극 모듈 방식으로 구현되면, 상기 반응 채널(921) 내부에서 발생하는 전기화학적 신호의 감도를 높일 수 있을 뿐만 아니라, 발생 신호의 검출 및 측정을 용이하게 수행할 수 있다.
도 26은 본 발명의 제1 실시예에 따른 보상형 패턴이 적용된 히터들이 반복 배치된 PCR 열 블록(100) 및 도 22 내지 25의 PCR 반응부(900)를 구비하는 PCR 장치를 통해 구현되는 PCR을 도시한다.
도 26에 따르면, 상기 PCR 반응부(900)는 상기 PCR 열 블록(100) 상에 배치되고, 상기 검출 전극(950)은 상기 열 블록(100)의 상부 표면에 반복 배치된 제1 히터 및 제2 히터 사이에 반복 배치되어 있다. 상기 PCR 반응부(900) 및 이에 포함된 구성요소에 관해서는 상술한 바와 같다.
상기 전력 공급원(400)은 상기 전력 공급부(200)에 전력을 공급하기 위한 모듈로서, 상기 전력 공급부(200)의 제1 배선(210) 및 제2 배선(220)과 각각 연결될 수 있다. 예를 들어, PCR 시 상기 전력 공급원(400)의 제1 전력 포트(도시되지 않음)는 상기 제1 배선(210)과 전기적으로 연결되고, 상기 전력 공급원(400)의 제2 전력 포트(도시되지 않음)는 상기 제2 배선(220)과 전기적으로 연결된다. 뒤이어, PCR 수행을 위한 사용자 지시가 있는 경우 상기 전력 공급원(400)은 상기 제1 배선(210) 및 상기 제2 배선(220)에 각각 전력을 공급하여 상기 PCR 열 블록(100)의 제1 히터 및 제2 히터를 신속히 가열할 수 있고, 각 히터들이 미리 결정된 온도에 도달하게 되면 전력 공급량을 제어하여 상기 미리 결정된 온도를 유지하도록 한다. 예를 들어, 상기 미리 결정된 온도는 상기 제1 히터에서는 PCR 변성 단계 온도(85℃ 내지 105℃, 바람직하게는 95℃) 및 상기 제2 히터에서는 PCR 어닐링/연장 단계 온도(50℃ 내지 80℃, 바람직하게는 72℃)이거나, 또는 상기 제1 히터에서는 PCR 어닐링/연장 단계 온도(50℃ 내지 80℃, 바람직하게는 72℃ 또는 60℃) 및 상기 제2 히터에서는 PCR 변성 단계 온도(85℃ 내지 105℃, 바람직하게는 95℃)일 수 있다.
상기 펌프(500)는 상기 PCR 반응부(900)의 1 이상의 반응 채널(921) 내에서 유동하는 유체의 유량 및 유속을 제어하기 위한 모듈로서, 양압 펌프 또는 음압 펌프일 수 있고, 예를 들어 실린지(syringe) 펌프일 수 있다. 상기 펌프(500)는 상기 반응 채널(921)의 일 부분에 구동가능하게 배치될 수 있으나, 바람직하게는 상기 반응 채널(921)의 양 말단에 형성된 유입부(931) 및/또는 유출부(932)에 연결 배치된다. 상기 펌프(500)가 상기 유입부(931) 및/또는 유출부(932)에 연결 배치된 경우 펌프 역할을 수행할 뿐만 아니라 상기 유입부(931) 및/또는 유출부(932)를 통해 시료 및 시약 용액이 새어 나오는 것을 방지하는 마개 역할을 수행할 수도 있다. 또한, 상기 반응 채널(921) 내에서 유동하는 유체, 즉 시료 및 시약 용액의 유량 및 유속을 일 방향으로 제어하고자 하는 경우 상기 펌프(500)는 상기 유입부(931) 및 상기 유출부(932) 중 어느 하나에만 연결 배치되고, 남은 하나에는 일반적인 마개가 밀봉 연결될 수 있고, 상기 반응 채널(921) 내에서 유동하는 유체, 즉 시료 및 시약 용액의 유량 및 유속을 양 방향으로 제어하고자 하는 경우에는 상기 펌프(500)는 상기 유입부(931) 및 상기 유출부(932) 모두에 연결 배치될 수 있다.
상기 실시간 PCR 장치 내에서 PCR 용액의 핵산 증폭 반응은 일 실시예로서, 아래와 같은 단계를 통해 수행될 수 있다.
1. 원하는 이중 가닥 표적 DNA, 증폭하고자 하는 특정 염기 서열과 상보적인 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드 프라이머, DNA 중합효소, 삼인산화데옥시리보뉴클레오티드(deoxyribonucleotide triphosphates, dNTP), PCR 반응 완충액(PCR reaction buffer)를 포함하는 PCR 용액을 준비한다.
2. 상기 PCR 용액을 PCR 반응부(900)에 도입한다. 이 경우 상기 PCR 용액은 상기 유입부(931)를 통해 PCR 반응부(900) 내부의 반응 채널(921)에 배치된다.
3. 상기 전력 공급부(200), 구체적으로 제1 배선(210) 및 제2 배선(220)이 상기 전력 공급원(400)과 각각 연결되도록 하고, 상기 PCR 반응부(900)의 상기 유입부(931) 및 상기 유출부(932)를 펌프(500)와 밀봉 연결한다.
4. 상기 전력 공급원(400)에 전력 공급 지시를 하여 상기 제1 배선(210) 및 상기 제2 배선(220)을 통해 상기 제1 히터 및 상기 제2 히터를 발열시키고, 특정 온도, 예를 들어 제1 히터의 경우 PCR 변성 단계 온도(95℃) 및 제2 히터의 경우 PCR 어닐링/연장 단계 온도(72℃)를 유지한다.
5. 상기 유입부(931)와 연결된 펌프(500)에 의해 양압이 제공되거나 또는 상기 유출부(932)와 연결된 펌프(500)에 의해 음압이 제공되면 상기 시료 및 시약 용액은 상기 반응 채널(921) 내부에서 수평 방향으로 유동하도록 한다. 이 경우 상기 시료 및 시약 용액의 유량 및 유속은 상기 펌프(500)에 의해 제공되는 양압 또는 음압의 세기를 조절하여 제어될 수 있다.
상기 단계들을 수행함으로써, 상기 PCR 용액은 상기 반응 채널(921)의 유입부(931) 말단으로부터 유출부(932) 말단까지 상기 제1 히터의 상측 대응 부분 및 상기 제2 히터의 상측 대응 부분을 길이 방향으로 이동하면서 PCR을 수행한다. 도 26에 따르면, 상기 PCR 용액은 상기 제1 히터 및 상기 제2 히터를 포함하는 히터 유닛이 10회 반복 배치된 열 블록(100)으로부터 열을 공급받아 상기 제1 히터의 상측 대응 부분에서 PCR 변성 단계 및 상기 제2 히터의 상측 대응 부분에서 PCR 어닐링/연장 단계를 거치면서 10회 PCR 순환 주기를 완료하게 된다. 뒤이어, 선택적으로, 상기 PCR 용액은 상기 반응 채널(921)의 유출부(931) 말단으로부터 유입부(932) 말단까지 상기 제1 히터의 상측 대응 부분 및 상기 제2 히터의 상측 대응 부분을 길이 방향으로 역 이동하면서 PCR을 재수행할 수 있다.
도 27은 본 발명의 제1 실시예에 따른 보상형 패턴이 적용된 히터들이 반복 배치된 PCR 열 블록(100), 도 22 내지 25의 PCR 반응부(900), 검출 전극(950), 및 신호 측정 모듈(800)을 구비하는 PCR 장치를 통해 구현되는 전기화학적 실시간 PCR을 도시한다.
도 27에 따르면, 본 발명의 일 실시예에 따른 PCR 장치는 제1 히터(110) 및 제2 히터(120)가 수평 방향으로 반복 배치된 PCR 열 블록(100), 상기 제1 히터(110) 및 제2 히터(120) 사이 공간에 검출 전극(950)이 대응하도록 반복 배치된 PCR 반응부(900), 상기 칩 홀더(도시되지 않음)의 연결 포트(도시되지 않음)와 전기적으로 연결되어 상기 PCR 반응부(900)의 반응 채널(921) 내부에서 발생하는 전기화학적 신호를 실시간으로 측정하도록 구현된 전기화학적 신호 측정 모듈(800), 기타 비록 도시되지는 않았지만, 전력 공급부, 펌프 등을 포함한다. 상기 전기화학적 신호 측정 모듈(800)은 상기 칩 홀더의 연결 포트와 전기적 연결 수단(700), 예를 들어 리드 전선을 통해 전기 소통가능하게 연결될 수 있다. 따라서, 상기 PCR 반응부(900)의 반응 채널(921) 내부에서 순차적인 핵산 증폭에 의해 반복적으로 발생하는 전기화학적 신호는 상기 PCR 반응부(900)의 검출 전극(950)을 통해 순차적으로 검출되고, 상기 검출된 신호는 상기 칩 홀더의 연결 포트와 상기 전기적 연결 수단(700)을 경유하여 상기 전기화학적 신호 측정 모듈(800)에서 측정되고 더 나아가 가공 또는 분석될 수 있다. 상기 전기화학적 신호 측정 모듈(800)은 다양할 수 있으나, 양극 벗김 전압전류계(anodic stripping voltammetry, ASV), 대시간 전류계 (chronoamperometry, CA), 순환 전압전류계(cyclic voltammetry), 네모파 전압전류계(square wave voltammetry, SWV), 펄스 전압전류계(differential pulse voltammetry, DPV), 및 임피던스계(impedance)로 구성된 군으로부터 선택될 수 있다. 따라서, 본 발명의 일 실시예에 따른 실시간 PCR 장치에 따르면, PCR 수행시 핵산 증폭 과정을 실시간(real-time)으로 측정 및 분석할 수 있다. 이 경우 상기 PCR 용액은 광학적 실시간 PCR 장치와는 달리 별도의 형광 물질이 첨가될 수 필요가 없다. 아울러, 본 발명의 일 실시예에 따른 실시간 PCR 장치에 의해 핵산 증폭 반응이 실시간(real-time)으로 측정되는 단계를 확인할 수 있다. 예를 들어, PCR 용액은 상기 반응 채널(921) 내에서 상기 제1 히터(110)의 상측 대응 부분(301) 및 상기 제2 히터(120)의 상측 대응 부분(302)을 연이어 통과하면서 PCR 변성 단계 및 PCR 어닐링/연장 단계를 수행하는데, 이 경우 PCR 용액은 상기 제1 히터(110)와 상기 제2 히터(120) 사이, 및 상기 제1 히터(110)와 상기 제2 히터(120)를 포함하는 히터 유닛 사이에서 반복 배치된 상기 검출 전극(950) 영역을 통과하게 된다. 상기 PCR 용액이 상기 검출 전극(950)의 상측 대응 부분을 통과할 때 유체 제어를 통해 상기 PCR 용액의 유속을 느리게 하거나 잠시 정지 상태로 유지한 후 증폭 핵산과 활성물질의 결합으로 인해 발생하는 전기화학적 신호를 상기 검출 전극(950)을 통해 순차적으로 실시간으로 검출 및 측정할 수 있다. 따라서, PCR 각 순환 주기가 진행되는 동안 상기 반응 채널(921) 내에서 (형광 물질 및 광 검출 시스템 없이) 핵산의 증폭에 의한 반응 결과를 실시간(real-time)으로 모니터링함으로써 표적 핵산의 양을 실시간(real-time)으로 검출 및 측정할 수 있다.
도 28 내지 31은 도 12 내지 16의 PCR 열 블록과 열 접촉하는 또 다른 유형의 PCR 반응부(900)를 도시한다.
도 28 내지 31에 따른 PCR 반응부(900)는 상기 반응 채널의 길이 방향으로 그 단면을 가로질러 반복 이격 배치되되 상기 반응 채널 내부의 일 영역에 형성되어 증폭 표적 핵산의 일 영역과 상보적으로 결합할 수 있는 포획 프로브(capture probe)가 표면 처리된 고정화(immobilization) 층 및 상기 반응 채널 내부의 다른 일 영역에 형성되어 전기화학적 신호를 검출하도록 구현된 검출 전극을 구비하는 것으로서, 금속 나노입자 및 상기 금속 나노입자에 연결되되 상기 증폭 표적 핵산의 다른 일 영역과 상보적으로 결합할 수 있는 신호 프로브(signaling probe)를 구비하는 복합체를 포함한다.
상기 PCR 반응부(900)는 상기 PCR 열 블록(100)의 상부에 배치된 것으로서, 양 말단에 유입부(931) 및 유출부(932)가 구현된 1 이상의 반응 채널(921), 및 상기 반응 채널(921)의 길이 방향으로 그 단면을 가로질러 반복 이격 배치되되 상기 반응 채널(921) 내부의 일 영역에 형성되어 증폭 표적 핵산의 일 영역과 상보적으로 결합할 수 있는 포획 프로브(capture probe)가 표면 처리된 고정화(immobilization) 층(940) 및 상기 반응 채널(921) 내부의 다른 일 영역에 형성되어 전기화학적 신호를 검출하도록 구현된 검출 전극(950)을 구비한다.
상기 반응 채널(921)은 PCR 용액에 의해 PCR이 수행되는 공간으로서, 상기 PCR 반응부(900)의 내부에 형성된다. 상기 반응 채널(921)은 빈 원기둥 형상, 바(bar) 형상, 사각기둥 형상 등 다양한 형상 및 구조로 구현될 수 있다. 상기 반응 채널(921)은 그 내부의 일 영역에 배치되되 증폭 표적 핵산의 일 영역과 상보적으로 결합할 수 있는 포획 프로브(capture probe)가 표면 처리된 고정화(immobilization) 층(940), 및 그 내부의 다른 일 영역에 배치되되 전기화학적 신호를 검출하도록 구현된 검출 전극(950)을 구비하는데, 상기 고정화(immobilization) 층(940)과 상기 검출 전극(950)은 상기 반응 채널(921) 내부에서 다양한 위치에 배치될 수 있으나, 도 29와 같이 서로 상하 또는 좌우로 마주보도록 배치되는 것이 바람직하다. 또한, 상기 반응 채널(921)은 그 내부에 금속 나노입자 및 상기 금속 나노입자에 연결되되 상기 증폭 표적 핵산의 다른 일 영역과 상보적으로 결합할 수 있는 신호 프로브(signaling probe)를 구비하는 복합체를 수용한다. 이 경우 상기 복합체는 주형 핵산 등을 포함하는 PCR 시료 도입 전 상기 반응 채널(921)에 미리 수용될 수 있고, 프라이머, 중합효소 등을 포함하는 PCR 시약에 포함된 상태로 상기 반응 채널(23)에 함께 도입될 수도 있다. 상기 고정화(immobilization) 층(940)은 그 일 면에 포획 프로브(capture probe)가 증착되어 노출될 수 있도록 다양한 재질, 예를 들어 실리콘, 플라스틱, 유리, 금속 재질 등으로 구현된다. 이 경우 상기 고정화(immobilization) 층(940)의 표면은 예를 들어, 포획 프로브(capture probe) 증착 전 아민 NH3 +, 알데하이드 COH, 카르복실기 COOH 등과 같은 물질이 먼저 표면 처리될 수 있다. 상기 포획 프로브(capture probe)는 상기 증폭 표적 핵산의 일 부위(영역)와 상보적으로 결합할 수 있도록 구현되고, 금속 나노입자와 결합하여 복합체를 형성한다. 상기 금속 나노입자는 다양할 수 있으나, 아연(Zn), 카드뮴(Cd), 납(Pb), 구리(Cu), 갈륨(Ga), 인듐(In), 금(Au), 크롬(Cr), 망간(Mn), 철(Fe), 코발트(Co), 니켈(Ni), 세슘(Cs), 바륨(Ba), 카드뮴(Cd), 수은(Hg), 비소(As), 셀레늄(Se), 주석(Sn), 안티몬(Sb), 비슈뮤트(Bi) 및 은(Ag)으로 구성된 군으로부터 1 이상 선택될 수 있다. 상기 신호 프로브(signaling probe)는 상기 증폭 표적 핵산의 일 영역과 상보적으로 결합할 수 있도록 구현되는데, 이 경우 상기 증폭 표적 핵산에 있어서, 상기 신호 프로브(signaling probe)의 상보적 결합 영역은 상기 포획 프로브(capture probe)의 상보적 결합 영역과 상이하다. 따라서, 상기 포획 프로브(capture probe) 및 신호 프로브(signaling probe)는 증폭 표적 핵산에 함께 상보적으로 결합할 수 있다. 즉, PCR이 진행되면서 상기 반응 채널(921) 내부에서 표적 핵산이 증폭되면 증폭 표적 핵산은 상기 고정화(immobilization) 층(940)에 표면 처리된 포획 프로브(capture probe)와 상보적으로 결합하고, 아울러 금속 나노입자에 연결된 신호 프로브(signaling probe)와 상보적으로 결합하여 상기 금속 나노입자를 상기 고정화(immobilization) 층(940)에 근접한 영역에 집중시킨다. 그 결과, 상기 금속 나노입자는 상기 검출 전극(26)에 도달하지 못하게 되어 상기 금속 나노입자와 상기 검출 전극(26) 간의 전류 변화(감소)를 야기하여 표적 핵산의 증폭에 따른 검출 가능한 전기화학적 신호가 발생하게 된다. 한편, 상기 증폭 표적 핵산, 상기 포획 프로브(capture probe), 및 상기 신호 프로브(signaling probe)는 단일 가닥 DNA일 수 있다.
상기 검출 전극(950)은 상기 반응 채널(921)의 적어도 일 영역에 배치되되 상기 반응 채널(921) 내부에서 발생하는 전기화학적 신호를 검출하도록 구현된다. 상기 검출 전극(950)은 위와 같은 기능을 수행하기 위하여 다양한 재질로 구현될 수 있지만, 예를 들어 금(Au), 코발트(Co), 백금(Pt), 은(Ag), 탄소나노튜브(carbon nanotube), 그래핀(graphene), 및 탄소(Carbon)로 구성된 군으로부터 1 이상 선택될 수 있다. 또한, 상기 검출 전극(950)은 상기 반응 채널(921) 내부에서 발생하는 전기화학적 신호를 효율적으로 검출하기 위해 다양한 형상 및 구조로 구현될 수 있지만, 예를 들어 도 28과 같이 상기 반응 채널(921) 내부 표면에 따라 배치되는 금속 재질의 판 형상으로 구현될 수 있다. 한편, 상기 전기화학적 신호는 후술할 전기화학적 신호 측정 모듈에 의해 측정되는데, 상기 전기화학적 신호 측정 모듈은 다양할 수 있으나, 양극 벗김 전압전류계(anodic stripping voltammetry, ASV), 대시간 전류계 (chronoamperometry, CA), 순환 전압전류계(cyclic voltammetry), 네모파 전압전류계(square wave voltammetry, SWV), 펄스 전압전류계(differential pulse voltammetry, DPV), 및 임피던스계(impedance)로 구성된 군으로부터 선택될 수 있다. 상기 전기화학적 신호는 상기 증폭 표적 핵산이 상기 포획 프로브(capture probe) 및 신호 프로브(signaling probe)와 상보적으로 결합함에 따라 발생하는 전류 변화에 기인할 수 있다. 본 발명의 일 실시예에 따른 PCR 장치의 전기화학적 신호 발생 과정은 다음과 같다. 제1 단계는 PCR 개시 전으로서, 고정화(immobilization) 층에 표면 처리된 포획 프로브(capture probe)와 신호 프로브(signaling probe) 및 금속 나노입자를 포함하는 복합체(Signaling probe-metal nano particle)의 원래 상태를 포함하고, 제2 단계는 상기 검출 전극(working electrode)과 금속 나노입자 간의 환원 또는 산화에 의해 발생하는 전류 변화(신호, Signal)를 포함하고, 제3 단계는 PCR 개시 후로서, 증폭 표적 핵산(target DNA)이 상기 포획 프로브(capture probe) 및 상기 복합체(Signaling probe-metal nano particle)의 신호 프로브(signaling probe)와 결합하여 전류 변화의 감소(신호 감소)를 야기하는 단계를 포함한다. 구체적으로, 상기 복합체(Signaling probe-metal nano particle)의 금속 나노입자(metal nano particle)에 환원 전압이 가해지면, 상기 금속 나노입자(metal nano particle)는 상기 검출 전극(working electrode)의 근접 표면에 모여 축적 층을 형성하면서 환원되고(Accumulation of metal nano particle), 뒤이어 상기 검출 전극(working electrode)에 전압을 인가하면 상기 환원 금속 나노입자(metal nano particle)가 산화되면서(Stripping) 전류 변화, 즉 신호가 발생하고(Signal), 상기 전류 변화는 산화 전류 피크가 나타내는 전압 값으로 쉽게 측정할 수 있다. 이 경우 상기 반응 채널(921) 내부에서 전류 변화값, 즉 전기화학적 신호는 표적 핵산(target DNA)의 변화량을 나타낸다. 또한, 상기 금속 나노입자(metal nano particle)가 산화되는 전압값은 금속 나노입자(metal nano particle)의 종류마다 상이하기 때문에 2 이상의 금속 나노입자(metal nano particle)를 사용하는 경우 2 이상의 시료에 대한 동시 신호 검출도 가능하다. 그 후 PCR이 진행되면, 주형 핵산으로부터 표적 핵산(target DNA)이 증폭되고, 상기 증폭 표적 핵산(target DNA)은 상기 포획 프로브(capture probe) 및 상기 복합체(Signaling probe-metal nano particle)의 신호 프로브(signaling probe)와 상보적으로 결합(Hybridized target DNA)함으로써 위와 같이 상기 복합체(Signaling probe-metal nano particle)의 금속 나노입자(metal nano particle)의 전극 표면 축적(Accumulation of metal nano particle)을 방해하고, 상기 전류 값을 감소시키고, 더 나아가 PCR 주기가 진행될수록 증폭 표적 핵산(target DNA)의 양이 증가하면서 상기 포획 프로브(capture probe) 및 상기 복합체(Signaling probe-metal nano particle)의 신호 프로브(signaling probe)와의 상보적으로 결합(Hybridized target DNA) 또한 증가하여 상기 전류 값(신호)은 더욱 감소한다. 따라서, 위와 같은 전류 감소 현상, 즉 전기화학적 신호를 검출 및 측정함으로써 실시간 PCR 구현이 가능하다.
도 28 내지 29에 따르면, 상기 고정화(immobilization) 층(940) 및 상기 검출 전극(950)은 상기 반응 채널(921)의 길이 방향으로 그 단면을 가로질러 반복 이격 배치되되 상기 PCR 열 블록(100)과의 열 접촉시 상기 고정화(immobilization) 층(940) 및 상기 검출 전극(950)은 상기 2 이상의 히터 군(110, 120, 130) 사이에 배치되도록 구현된다. 상기 PCR 반응부(900)의 평면도를 도시하는 도 28에 따르면, 상기 고정화(immobilization) 층(940) 및 검출 전극(950)은 상기 유입부(931)로부터 유출부(932)까지의 반응 채널(921) 영역에 일정한 간격으로 반복 배치되어 있는데, 이와 같은 구조를 통해 상기 반응 채널(921)을 길이 방향으로 통과하면서 순차적으로 증폭되는 핵산으로부터 반복적으로 전기화학적 신호를 검출할 수 있다. 아울러, 상기 PCR 반응부(900)의 수직 단면도를 도시하는 도 29에 따르면, 상기 고정화(immobilization) 층(940) 및 검출 전극(950)은 상기 반응 채널(921)의 단면에 서로 마주 보며 배치된 것을 확인할 수 있는데, 상기 고정화(immobilization) 층(940) 및 검출 전극(950)의 위치는 상하 변동될 수 있다.
도 29에 따르면, 상기 PCR 반응부(900)는 수직 단면도를 기준으로 크게 3개의 층(layer)으로 구분될 수 있다. 상기 PCR 반응부(900)는 상기 검출 전극(950)이 구비된 제1 판(910); 상기 제1 판(910) 상에 배치되되 상기 1 이상의 반응 채널(921)이 구비된 제2 판(920); 및 상기 제2 판(920) 상에 배치되되 상기 고정화(immobilization) 층(940), 상기 유입부(931), 및 상기 유출부(932)가 구비된 제3 판(930)을 포함할 수 있다. 이 경우 상기 검출 전극(950)이 상기 제3 판(930)에 배치되고, 상기 고정화(immobilization) 층(940)이 상기 제1 판(910)에 배치될 수도 있음은 물론이다.
상기 검출 전극(950)이 구비된 제1 판(910)의 상부 면은 상기 제2 판(920)의 하부 면에 접착 배치된다. 상기 제1 판(910)이 상기 반응 채널(921)을 구비하는 제2 판(920)에 접착 배치됨으로써 상기 반응 채널(921)에 관한 공간이 확보되고, 더 나아가 상기 반응 채널(921)의 적어도 일 영역(표면)에 상기 검출 전극(950)이 배치된다. 한편, 상기 제1 판(910)은 다양한 재질로 구현될 수 있으나, 바람직하게는 폴리디메틸실옥산(polydimethylsiloxane, PDMS), 사이클로올레핀코폴리머(cycle olefin copolymer, COC), 폴리메틸메타크릴레이트(polymethylmetharcylate, PMMA), 폴리카보네이트(polycarbonate, PC), 폴리프로필렌카보네이트(polypropylene carbonate, PPC), 폴리에테르설폰(polyether sulfone, PES), 및 폴리에틸렌텔레프탈레이트(polyethylene terephthalate, PET), 및 그의 조합물로 구성된 군으로부터 선택되는 재질일 수 있다. 또한, 상기 제1 판(910)의 상부 면은 친수성 물질(도시되지 않음)이 처리되어 PCR을 원활하게 수행할 수 있다. 상기 친수성 물질 처리에 의해 상기 제1 판(910) 상에 친수성 물질을 포함하는 단일 층이 형성될 수 있다. 상기 친수성 물질은 다양한 물질일 수 있으나, 바람직하게는 카르복시기(-COOH), 아민기(-NH2), 히드록시기(-OH), 및 술폰기(-SH)로 구성된 군으로부터 선택되는 것일 수 있고, 상기 친수성 물질의 처리는 당 업계에 공지된 방법에 따라 수행할 수 있다.
상기 제2 판(920)의 상부 면은 상기 제3 판(930)의 하부 면과 접촉 배치된다. 상기 제2 판(920)은 상기 반응 채널(921)을 포함한다. 상기 반응 채널(921)은 상기 제3 판(910)에 형성된 유입부(931)와 유출부(932)에 대응되는 부분과 연결되어 양 말단에 유입부(931) 및 유출부(932)가 구현된 1 이상의 반응 채널(921)을 완성한다. 따라서, 상기 반응 채널(921)에 PCR 시료 및 시약이 도입된 후 PCR이 진행된다. 또한, 상기 반응 채널(921)은 본 발명의 일 실시예에 따른 PCR 장치의 사용 목적 및 범위에 따라 2 이상 존재할 수 있다. 또한, 상기 제2 판(920)은 다양한 재질로 구현될 수 있으나, 바람직하게는 폴리메틸메타크릴레이트(polymethylmethacrylate, PMMA), 폴리카보네이트(polycarbonate, PC), 사이클로올레핀 코폴리머(cycloolefin copolymer, COC), 폴리아미드(polyamide, PA), 폴리에틸렌(polyethylene, PE), 폴리프로필렌(polypropylene, PP), 폴리페닐렌 에테르(polyphenylene ether, PPE), 폴리스티렌(polystyrene, PS), 폴리옥시메틸렌(polyoxymethylene, POM), 폴리에테르에테르케톤(polyetheretherketone, PEEK), 폴리테트라프로오르에틸렌(polytetrafluoroethylene, PTFE), 폴리비닐클로라이드(polyvinylchloride, PVC), 폴리비닐리덴 플로라이드(polyvinylidene fluoride, PVDF), 폴리부틸렌테레프탈레이트(polybutyleneterephthalate, PBT), 불소화에틸렌프로필렌(fluorinated ethylenepropylene, FEP), 퍼플로로알콕시알칸(perfluoralkoxyalkane, PFA), 및 그의 조합물로 구성된 군으로부터 선택되는 열 가소성 수지 또는 열 경화성 수지 재질일 수 있다. 또한, 상기 제2 판(920)의 두께는 다양할 수 있으나, 100 ㎛ 내지 200 ㎛에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 반응 채널(921)의 폭과 길이는 다양할 수 있으나, 바람직하게는 상기 반응 채널(921)의 폭은 0.001 mm 내지 10 mm에서 선택되고, 상기 반응 채널(921)의 길이는 1 mm 내지 400 mm에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 제2 판(920) 내벽은 DNA, 단백질(protein) 흡착을 방지하기 위해 실란(silane) 계열, 보바인 시럼 알부민(Bovine Serum Albumin, BSA) 등의 물질로 코팅할 수 있고, 상기 물질의 처리는 당 업계에 공지된 방법에 따라 수행될 수 있다.
상기 제3 판(930)의 하부 면은 상기 제2 판(920)의 상부 면에 배치된다. 상기 제3 판(930)은 상기 제2 판(920)에 형성된 반응 채널(921) 상에 형성된 고정화(immobilization) 층(940), 유입부(931), 및 유출부(932)를 구비한다. 상기 유입부(931)는 PCR 시료 및 시약이 유입되는 부분이다. 상기 유출부(932)는 PCR이 종료된 후 PCR 산물이 유출되는 부분이다. 따라서, 상기 제3 판(930)은 상기 제2 판(920)에 형성된 반응 채널(921)을 커버하되 상기 유입부(931) 및 유출부(932)는 상기 반응 채널(921)의 유입부 및 유출부 역할을 수행하게 된다. 또한, 상기 제3 판(930)은 다양한 재질로 구현될 수 있지만, 바람직하게는 폴리디메틸실옥산(polydimethylsiloxane, PDMS), 사이클로올레핀코폴리머(cycle olefin copolymer, COC), 폴리메틸메타크릴레이트(polymethylmetharcylate, PMMA), 폴리카보네이트(polycarbonate, PC), 폴리프로필렌카보네이트(polypropylene carbonate, PPC), 폴리에테르설폰(polyether sulfone, PES), 및 폴리에틸렌텔레프탈레이트(polyethylene terephthalate, PET), 및 그의 조합물로 구성된 군으로부터 선택되는 재질일 수 있다. 또한, 상기 유입부(931)는 다양한 크기를 구비할 수 있으나, 바람직하게는 지름 1.0 mm 내지 3.0 mm에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 유출부(932)는 다양한 크기를 구비할 수 있으나, 바람직하게는 지름 1.0 mm 내지 1.5 mm에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 유입부(931) 및 유출부(932)는 별도의 커버 수단(도시되지 않음)을 구비하여, 상기 반응 채널(921) 내에서 PCR 시료 및 시약에 대한 PCR이 진행될 때 용액이 누출되는 것을 방지할 수 있다. 상기 커버 수단은 다양한 형상, 크기 또는 재질로서 구현될 수 있다. 또한, 상기 제3 판의 두께는 다양할 수 있으나, 바람직하게는 0.1 mm 내지 2.0 mm에서 선택될 수 있다. 또한, 상기 유입부(931) 및 상기 유출부(932)는 2 이상 존재할 수 있다.
한편, 상기 PCR 반응부(900)는 기계적 가공을 통해 유입부(931) 및 유출부(932)를 형성하여 제3 판(930)을 제공하는 단계; 상기 제3 판(930)의 하부 면과 대응되는 크기를 갖는 판재에 상기 제3 판(930)의 유입부(931)와 대응되는 부분으로부터 상기 제3 판(930)의 유출부(932)에 대응되는 부분까지 기계적 가공을 통해 반응 채널(921)을 형성하여 제2 판(920)을 제공하는 단계; 상기 제2 판(920)의 하부 면과 대응되는 크기를 갖는 판재의 상부 면에 표면 처리 가공을 통해 친수성 물질(922)로 구현된 표면을 형성하여 제1 판(910)을 제공하는 단계; 및 상기 제3 판(930)의 하부 면을 상기 제2 판(920)의 상부 면에 접합 공정을 통해 접합하고, 상기 제2 판(920)의 하부 면을 상기 제1 판(910)의 상부 면에 접합 공정을 통해 접합하는 단계를 포함하는 방법에 의해 용이하게 제조될 수 있다. 상기 제3 판(930)의 유입부(931) 및 유출부(932), 및 상기 제2 판(920)의 반응 채널(921)은 사출성형(injection molding), 핫-엠보싱(hot-embossing), 캐스팅(casting), 및 레이저 어블레이션(laser ablation)으로 구성된 군으로부터 선택되는 가공 방법에 의해 제조될 수 있다. 또한, 상기 제1 판(910) 표면의 친수성 물질(922)은 산소 및 아르곤 플라즈마 처리, 코로나 방전 처리, 및 계면 활성제 도포로 구성된 군으로부터 선택되는 방법에 의해 처리될 수 있고 당 업계에 공지된 방법에 따라 수행될 수 있다. 또한, 상기 제3 판(930)의 하부 면과 상기 제2 판(920)의 상부 면, 및 상기 제2 판(920)의 하부 면과 상기 제1 판(910)의 상부 면은 열 접합(Thermal bonding), 초음파 융착(Ultrasonic Welding), 용매 접합(Solvent Bonding), 열판용착(Hot Plate Welding), UV 접합(Ultraviolet Bonding), 및 프레스 접합(Press Bonding) 공정에 의해 접착될 수 있고 당 업계에 공지된 방법에 따라 수행될 수 있다. 상기 제3 판(930)과 제2 판(920) 사이 및 상기 제2 판(920)과 제3 판(910) 사이에는 양면 접착제 또는 열가소성 수지 또는 열 경화성 수지(500)가 처리될 수 있다.
한편, 도 28의 "a" 부분을 확대한 도 30 내지 31에 따르면, 상기 검출 전극(950)은 다양하게 구현될 수 있다. 예를 들어, 도 30과 같이 산화 또는 환원 반응이 일어나는 작업 전극(working electrode)(950a) 및 산화 또는 환원 반응이 일어나지 않는 기준 전극(reference electrode)(950b)을 구비하는 2-전극 모듈, 또는 도 31과 같이 상기 작업 전극(950a), 상기 기준 전극(950b), 및 상기 지시 전극으로부터 발생하는 전자 밸런스를 조절하는 상대 전극(counter electrode)(950c)을 구비하는 3-전극 모듈로 구현될 수 있다. 이와 같이, 상기 검출 전극(950)의 구조가 위와 같이 다-전극 모듈 방식으로 구현되면, 상기 반응 채널(921) 내부에서 발생하는 전기화학적 신호의 감도를 높일 수 있을 뿐만 아니라, 발생 신호의 검출 및 측정을 용이하게 수행할 수 있다.
도 32는 본 발명의 제1 실시예에 따른 보상형 패턴이 적용된 히터들이 반복 배치된 PCR 열 블록(100) 및 도 28 내지 31의 PCR 반응부(900)를 구비하는 PCR 장치를 통해 구현되는 PCR을 도시한다.
도 32에 따르면, 상기 PCR 반응부(900)는 상기 PCR 열 블록(100) 상에 배치되고, 구체적으로 상기 검출 전극(950)은 상기 PCR 열 블록(100) 상부 표면에 반복 배치된 제1 히터 및 제2 히터 사이에 반복 배치되어 있다. 상기 전력 공급원(400)은 상기 전력 공급부(200)에 전력을 공급하기 위한 모듈로서, 상기 전력 공급부(200)의 제1 배선(210) 및 제2 배선(220)과 각각 연결될 수 있다. 예를 들어, PCR 수행시 상기 전력 공급원(400)의 제1 전력 포트(도시되지 않음)는 상기 제1 배선(210)과 전기적으로 연결되고, 상기 전력 공급원(400)의 제2 전력 포트(도시되지 않음)는 상기 제2 배선(220)과 전기적으로 연결된다. 뒤이어, PCR 수행을 위한 사용자 지시가 있는 경우 상기 전력 공급원(400)은 상기 제1 배선(210) 및 상기 제2 배선(220)에 각각 전력을 공급하여 상기 PCR 열 블록(100)의 제1 히터(110) 및 제2 히터(120)를 신속히 가열할 수 있고, 각 히터들(110, 120)이 미리 결정된 온도에 도달하게 되면 전력 공급량을 제어하여 상기 미리 결정된 온도를 유지하도록 한다. 예를 들어, 상기 미리 결정된 온도는 상기 제1 히터(110)에서는 PCR 변성 단계 온도(85℃ 내지 105℃, 바람직하게는 95℃) 및 상기 제2 히터(120)에서는 PCR 어닐링/연장 단계 온도(50℃ 내지 80℃, 바람직하게는 72℃)이거나, 또는 상기 제1 히터(110)에서는 PCR 어닐링/연장 단계 온도(50℃ 내지 80℃, 바람직하게는 72℃ 또는 60℃) 및 상기 제2 히터(120)에서는 PCR 변성 단계 온도(85℃ 내지 105℃, 바람직하게는 95℃)일 수 있다.
상기 펌프(500)는 상기 PCR 반응부(900)의 1 이상의 반응 채널(921) 내에서 유동하는 유체의 유량 및 유속을 제어하기 위한 모듈로서, 양압 펌프 또는 음압 펌프일 수 있고, 예를 들어 실린지(syringe) 펌프일 수 있다. 상기 펌프(500)는 상기 반응 채널(921)의 일 부분에 구동가능하게 배치될 수 있으나, 바람직하게는 상기 반응 채널(921)의 양 말단에 형성된 유입부(931) 및/또는 유출부(932)에 연결 배치된다. 상기 펌프(500)가 상기 유입부(931) 및/또는 유출부(932)에 연결 배치된 경우 펌프 역할을 수행할 뿐만 아니라 상기 유입부(931) 및/또는 유출부(932)를 통해 시료 및 시약 용액이 새어 나오는 것을 방지하는 마개 역할을 수행할 수도 있다. 또한, 상기 반응 채널(921) 내에서 유동하는 유체, 즉 시료 및 시약 용액의 유량 및 유속을 일 방향으로 제어하고자 하는 경우 상기 펌프(500)는 상기 유입부(931) 및 상기 유출부(932) 중 어느 하나에만 연결 배치되고, 남은 하나에는 일반적인 마개가 밀봉 연결될 수 있고, 상기 반응 채널(921) 내에서 유동하는 유체, 즉 시료 및 시약 용액의 유량 및 유속을 양 방향으로 제어하고자 하는 경우에는 상기 펌프(500)는 상기 유입부(931) 및 상기 유출부(932) 모두에 연결 배치될 수 있다.
상기 실시간 PCR 장치 내에서 PCR 용액의 핵산 증폭 반응은 일 실시예로서, 아래와 같은 단계를 통해 수행될 수 있다.
1. 원하는 이중 가닥 표적 DNA, 증폭하고자 하는 특정 염기 서열과 상보적인 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드 프라이머, DNA 중합효소, 삼인산화데옥시리보뉴클레오티드(deoxyribonucleotide triphosphates, dNTP), PCR 반응 완충액(PCR reaction buffer)를 포함하는 PCR 용액을 준비한다.
2. 상기 PCR 용액을 PCR 반응부(900)에 도입한다. 이 경우 상기 PCR 용액은 상기 유입부(931)를 통해 PCR 반응부(900) 내부의 반응 채널(921)에 배치된다.
3. 상기 전력 공급부(200), 구체적으로 제1 배선(210) 및 제2 배선(220)이 상기 전력 공급원(400)과 각각 연결되도록 하고, 상기 PCR 반응부(900)의 상기 유입부(931) 및 상기 유출부(932)를 펌프(500)와 밀봉 연결한다.
4. 상기 전력 공급원(400)에 전력 공급 지시를 하여 상기 제1 배선(210) 및 상기 제2 배선(220)을 통해 상기 제1 히터(110) 및 상기 제2 히터(120)를 발열시키고, 특정 온도, 예를 들어 제1 히터(110)의 경우 PCR 변성 단계 온도(95℃) 및 제2 히터(120)의 경우 PCR 어닐링/연장 단계 온도(72℃)를 유지한다.
5. 상기 유입부(931)와 연결된 펌프(500)에 의해 양압이 제공되거나 또는 상기 유출부(932)와 연결된 펌프(500)에 의해 음압이 제공되면 상기 시료 및 시약 용액은 상기 반응 채널(921) 내부에서 수평 방향으로 유동하도록 한다. 이 경우 상기 시료 및 시약 용액의 유량 및 유속은 상기 펌프(500)에 의해 제공되는 양압 또는 음압의 세기를 조절하여 제어될 수 있다.
상기 단계들을 수행함으로써, 상기 PCR 용액은 상기 반응 채널(921)의 유입부(931) 말단으로부터 유출부(932) 말단까지 상기 제1 히터(110)의 상측 대응 부분(301) 및 상기 제2 히터(120)의 상측 대응 부분(302)을 길이 방향으로 이동하면서 PCR을 수행한다. 상기 PCR 용액은 상기 제1 히터(110) 및 상기 제2 히터(120)를 포함하는 히터 유닛이 10회 반복 배치된 PCR 열 블록(100)으로부터 열을 공급받아 상기 제1 히터(110)의 상측 대응 부분(301)에서 PCR 변성 단계 및 상기 제2 히터(120)의 상측 대응 부분(302)에서 PCR 어닐링/연장 단계를 거치면서 10회 PCR 순환 주기를 완료하게 된다. 뒤이어, 선택적으로, 상기 PCR 용액은 상기 반응 채널(921)의 유출부(931) 말단으로부터 유입부(932) 말단까지 상기 제1 히터(110)의 상측 대응 부분 및 상기 제2 히터(120)의 상측 대응 부분을 길이 방향으로 역 이동하면서 PCR을 재수행할 수 있다.
도 33은 본 발명의 제1 실시예에 따른 보상형 패턴이 적용된 히터들이 반복 배치된 PCR 열 블록(100), 도 28 내지 31의 PCR 반응부(900), 고정화(immobilization) 층(940), 검출 전극(950), 및 신호 측정 모듈(800)을 구비하는 PCR 장치를 통해 구현되는 전기화학적 실시간 PCR을 도시한다.
도 33에 따르면, 상기 본 발명의 일 실시예에 따른 PCR 장치는 제1 히터(110) 및 제2 히터(120)가 수평 방향으로 반복 배치된 PCR 열 블록(100), 상기 제1 히터(110) 및 제2 히터(120) 사이 공간에 고정화(immobilization) 층(940) 및 검출 전극(950)이 대응하도록 반복 배치된 PCR 반응부(900)를 포함하되, 상기 칩 홀더(도시되지 않음)의 연결 포트(도시되지 않음)와 전기적으로 연결되어 상기 PCR 반응부(900)의 반응 채널(921) 내부에서 발생하는 전기화학적 신호를 실시간으로 측정하도록 구현된 전기화학적 신호 측정 모듈(800), 비록 도시되지는 않았지만, 전력 공급원, 펌프 등을 포함한다. 상기 전기화학적 신호 측정 모듈(800)은 상기 칩 홀더의 연결 포트와 전기적 연결 수단(700), 예를 들어 리드 전선을 통해 전기 소통가능하게 연결될 수 있다. 따라서, 상기 PCR 반응부(900)의 반응 채널(921) 내부에서 순차적인 핵산 증폭에 의해 반복적으로 발생하는 전기화학적 신호는 상기 PCR 반응부(900)의 검출 전극(950)을 통해 순차적으로 검출되고, 상기 검출된 신호는 상기 칩 홀더의 연결 포트와 상기 전기적 연결 수단(700)을 경유하여 상기 전기화학적 신호 측정 모듈(800)에서 측정되고 더 나아가 가공 또는 분석될 수 있다. 상기 전기화학적 신호 측정 모듈(800)은 다양할 수 있으나, 양극 벗김 전압전류계(anodic stripping voltammetry, ASV), 대시간 전류계 (chronoamperometry, CA), 순환 전압전류계(cyclic voltammetry), 네모파 전압전류계(square wave voltammetry, SWV), 펄스 전압전류계(differential pulse voltammetry, DPV), 및 임피던스계(impedance)로 구성된 군으로부터 선택될 수 있다. 따라서, 도 33에 따른 본 발명의 일 실시예에 따른 실시간 PCR 장치에 의하면, PCR 수행시 핵산 증폭 과정을 실시간(real-time)으로 측정 및 분석할 수 있다. 이 경우 상기 PCR 용액은 종래 실시간 PCR 장치와는 달리 별도의 형광 물질이 첨가될 필요가 없다. 예를 들어, PCR 용액은 상기 반응 채널(921) 내에서 상기 제1 히터(110)의 상측 대응 부분(301) 및 상기 제2 히터(120)의 상측 대응 부분(302)을 연이어 통과하면서 PCR 변성 단계 및 PCR 어닐링/연장 단계를 수행하는데, 이 경우 PCR 용액은 상기 제1 히터(110)와 상기 제2 히터(120) 사이, 및 상기 제1 히터(110)와 상기 제2 히터(120)를 포함하는 히터 유닛 사이에서 반복 배치된 상기 검출 전극(950) 영역을 통과하게 된다. 상기 PCR 용액이 상기 검출 전극(950)의 상측 대응 부분을 통과할 때 유체 제어를 통해 상기 PCR 용액의 유속을 느리게 하거나 잠시 정지 상태로 유지한 후 증폭 표적 핵산과 상기 포획 프로브(capture probe) 및 상기 복합체의 신호 프로브(signaling probe)와의 상보적 결합으로 인해 발생하는 전기화학적 신호(전류 변화)를 상기 검출 전극(950)을 통해 순차적으로 실시간으로 검출 및 측정할 수 있다. 따라서, PCR 각 순환 주기가 진행되는 동안 상기 반응 채널(921) 내에서 (형광 물질 및 광 검출 시스템 없이) 핵산의 증폭에 의한 반응 결과를 실시간(real-time)으로 모니터링함으로써 표적 핵산의 양을 실시간(real-time)으로 검출 및 측정할 수 있다.

Claims (17)

  1. 2 이상의 히터가 반복적으로 구현된 PCR 열 블록(100)에 있어서,
    상기 히터는 개별 히터로부터 발생하는 방사형 열 분포에 따른 인접 히터 간 불균일한 열 중첩을 방지하기 위해 상기 히터의 적어도 일 부분의 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도를 조절하는 보상형 패턴(compensated pattern)(1000)을 구비하는 것을 특징으로 하는 PCR 열 블록.
  2. 제1항에 있어서,
    상기 보상형 패턴은 상기 히터의 적어도 일 부분에 간극(1100)을 반복 형성하여 간극 패턴에 따른 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것을 특징으로 하는 PCR 열 블록.
  3. 제2항에 있어서,
    상기 보상형 패턴은 상기 히터의 적어도 일 부분에 반복 형성된 간극의 폭(line width)을 달리 구현함으로써 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것을 특징으로 하는 PCR 열 블록.
  4. 제1항에 있어서,
    상기 보상형 패턴은 상기 히터의 적어도 일 부분의 두께를 달리 구현함으로써 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것을 특징으로 하는 PCR 열 블록.
  5. 제1항에 있어서,
    상기 보상형 패턴은 상기 히터의 적어도 일 부분의 재질을 달리 구현함으로써 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것을 특징으로 하는 PCR 열 블록.
  6. 제1항에 있어서,
    상기 보상형 패턴은 상기 히터의 적어도 일 부분의 배치를 달리 구현함으로써 저항을 조절하여 상기 히터 표면의 열 균일도가 조절된 것을 특징으로 하는 PCR 열 블록.
  7. 제1항에 따른 PCR 열 블록; 및
    상기 PCR 열 블록과 열 교환이 가능하도록 상기 열 블록 상에 부착되되 상기 PCR 열 블록에 구비된 히터들의 상측 대응 부분들을 길이 방향으로 통과하도록 연장 배치된, 양 말단에 유입부 및 유출부가 구현된 1 이상의 반응 채널을 구비하는 판 형상의 PCR 반응부;
    를 포함하는 PCR 칩.
  8. 제7항에 있어서,
    상기 PCR 열 블록의 상부 면은 PCR 용액의 전기 분해 방지용 절연막(insulator)이 형성된 것을 특징으로 하는 PCR 칩.
  9. 제1항에 따른 PCR 열 블록;
    상기 PCR 열 블록과 열 교환이 가능하도록 상기 열 블록 상에 접촉되되 상기 PCR 열 블록에 구비된 히터들의 상측 대응 부분들을 길이 방향으로 통과하도록 연장 배치된, 양 말단에 유입부 및 유출부가 구현된 1 이상의 반응 채널을 구비하는 판 형상의 PCR 반응부; 및
    상기 PCR 열 블록에 구비된 히터들에 전력을 공급하기 위한 전력 공급부;
    를 포함하는 PCR 장치.
  10. 제9항에 있어서,
    상기 PCR 열 블록의 상부 면은 히터 보호용 절연막(insulator)이 형성된 것을 특징으로 하는 PCR 장치.
  11. 제9항에 있어서,
    상기 1 이상의 반응 채널 내에서 유동하는 PCR 용액의 유량 및 유속을 제어하기 위해 양압 또는 음압을 제공하도록 배치된 펌프를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 PCR 장치.
  12. 제9항에 있어서,
    상기 PCR 반응부에 광을 제공하도록 배치된 광원, 및 상기 PCR 반응부로부터 방출되는 광을 수용하도록 배치된 광 검출부를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 PCR 장치.
  13. 제12항에 있어서,
    상기 광원 또는 광 검출부는 상기 PCR 열 블록의 인접 히터 사이 공간에 반복 배치되는 것을 특징으로 하는 PCR 장치.
  14. 제9항에 있어서,
    상기 PCR 반응부는 상기 반응 채널의 길이 방향으로 그 하단 면을 가로질러 반복 이격 배치되되 상기 반응 채널 내부에서 증폭 핵산과 활성물질의 결합으로 인해 발생하는 전기화학적 신호를 검출하도록 구현된 검출 전극을 구비하는 것으로서, 상기 PCR 열 블록과의 열 접촉시 상기 검출 전극은 상기 2 이상의 히터 군 사이에 배치되도록 구현된 것을 특징으로 하는 PCR 장치.
  15. 제14항에 있어서,
    상기 검출 전극과 전기적으로 연결되어 상기 PCR 반응부의 반응 채널 내부에서 발생하는 전기화학적 신호를 실시간으로 측정하도록 구현된 전기화학적 신호 측정 모듈을 더 포함하는 것을 특징으로 하는 PCR 장치.
  16. 제9항에 있어서,
    상기 PCR 반응부는 상기 반응 채널의 길이 방향으로 그 단면을 가로질러 반복 이격 배치되되 상기 반응 채널 내부의 일 영역에 형성되어 증폭 표적 핵산의 일 영역과 상보적으로 결합할 수 있는 포획 프로브(capture probe)가 표면 처리된 고정화(immobilization) 층 및 상기 반응 채널 내부의 다른 일 영역에 형성되어 전기화학적 신호를 검출하도록 구현된 검출 전극을 구비하는 것으로서, 금속 나노입자 및 상기 금속 나노입자에 연결되되 상기 증폭 표적 핵산의 다른 일 영역과 상보적으로 결합할 수 있는 신호 프로브(signaling probe)를 구비하는 복합체를 포함하는 것을 특징으로 하는 PCR 장치.
  17. 제16항에 있어서,
    상기 검출 전극과 전기적으로 연결되어 상기 PCR 반응부의 반응 채널 내부에서 발생하는 전기화학적 신호를 실시간으로 측정하도록 구현된 전기화학적 신호 측정 모듈을 더 포함하는 것을 특징으로 하는 PCR 장치.
PCT/KR2014/002284 2013-03-18 2014-03-18 패턴 히터가 반복 배치된 pcr 열 블록 및 이를 포함하는 pcr 장치 WO2014148800A1 (ko)

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EP14768574.7A EP2977441A4 (en) 2013-03-18 2014-03-18 THERMAL PCR BLOCK WITH REPEATEDLY FITTED PROFILE HEATING AND PCR APPARATUS INCLUDING THE SAME
CA2907654A CA2907654C (en) 2013-03-18 2014-03-18 Pcr thermal block with pattern heaters repeatedly arranged and pcr apparatus including same
RU2015144509A RU2618859C2 (ru) 2013-03-18 2014-03-18 Нагревательный блок пцр с повторно расположенными контурными нагревателями и устройство пцр, содержащее его
AU2014238680A AU2014238680B2 (en) 2013-03-18 2014-03-18 PCR thermal block with pattern heaters repeatedly arranged and PCR apparatus including same
CN201480016764.8A CN105073974B (zh) 2013-03-18 2014-03-18 反复配置有图案加热器的聚合酶链式反应热块及包括其的聚合酶链式反应装置

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Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2017119902A1 (en) * 2016-01-08 2017-07-13 Hewlett-Packard Development Company, L.P. Polymerase chain reaction device
JP2018500035A (ja) * 2014-12-26 2018-01-11 ナノバイオシス インコーポレーテッドNanobiosys Inc. 繰り返し摺動駆動手段を備えるポリメラーゼ連鎖反応(pcr)装置及びこれを用いるポリメラーゼ連鎖反応(pcr)方法

Families Citing this family (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3107353B1 (en) * 2014-02-13 2018-06-20 Korea Electronics Technology Institute Heating paste composition, surface type heating element using same, and potable low-power heater
KR101904506B1 (ko) * 2016-05-25 2018-10-05 (주)옵토레인 피씨알모듈
JP6938149B2 (ja) * 2016-12-22 2021-09-22 リンテック株式会社 検査用カバーフィルム、検査部材、および検査部材の製造方法
JP6925909B2 (ja) * 2017-08-22 2021-08-25 東芝テック株式会社 薬液滴下装置及び薬液吐出装置
US11067529B2 (en) 2017-11-22 2021-07-20 Jim Connolly Multi-zone, fixed potential test sensor heating system
WO2019103743A1 (en) * 2017-11-22 2019-05-31 Hewlett-Packard Development Company, L.P. Microfluidic devices for blood coagulation
CN109211970B (zh) * 2018-11-09 2021-03-30 中国兵器工业第五九研究所 隔热性能测试装置、隔热性能测试方法及应用
WO2020154642A1 (en) 2019-01-24 2020-07-30 Fluxergy, Llc Microfluidic device with constant heater uniformity
WO2020197487A1 (en) * 2019-03-28 2020-10-01 Cell Id Pte Ltd Real-time pcr chip
CN113583800B (zh) * 2020-04-30 2024-09-27 京东方科技集团股份有限公司 检测芯片及其使用方法、反应系统
KR102705414B1 (ko) * 2022-03-08 2024-09-11 세메스 주식회사 히터 및 그 제조 방법, 기판 처리 장치

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20050003944A (ko) * 2003-07-04 2005-01-12 (주)울텍 히터와 온도센서가 내장된 마이크로 챔버 구조체 및 제작방법
US20080131956A1 (en) * 2006-12-05 2008-06-05 Electronics And Telecommunications Research Institute Natural convection-driven pcr apparatus and method using disposable polymer chip
KR20120137054A (ko) * 2011-06-10 2012-12-20 나노바이오시스 주식회사 히터 유닛이 반복 배치된 열 블록을 포함하는 플루이딕 pcr 칩 및 이를 포함하는 pcr 장치
KR20120139206A (ko) * 2011-06-17 2012-12-27 나노바이오시스 주식회사 박막형 열 블록 및 박막형 pcr 칩을 포함하는 휴대용 실시간 pcr 장치
KR20120139205A (ko) * 2011-06-17 2012-12-27 나노바이오시스 주식회사 히터 유닛이 반복 배치된 열 블록을 포함하는 플루이딕 pcr 장치

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6787338B2 (en) 1990-06-04 2004-09-07 The University Of Utah Method for rapid thermal cycling of biological samples
GB9716052D0 (en) 1996-12-06 1997-10-01 Secr Defence Reaction vessels
JP2004305009A (ja) 2003-04-02 2004-11-04 Hitachi Ltd 核酸増幅装置及び核酸増幅方法
DE10315074A1 (de) 2003-04-02 2004-10-14 Clondiag Chip Technologies Gmbh Vorrichtung zur Vervielfältigung und zum Nachweis von Nukleinsäuren
KR100535817B1 (ko) * 2003-12-26 2005-12-12 한국전자통신연구원 바이오 칩을 위한 플라스틱 구조체, 그를 이용한 미소가열기, 미소 반응기, 미소 반응기 어레이 및 마이크로어레이
JP3952036B2 (ja) 2004-05-13 2007-08-01 コニカミノルタセンシング株式会社 マイクロ流体デバイス並びに試液の試験方法および試験システム
JP2007078393A (ja) * 2005-09-12 2007-03-29 Yamaha Corp マイクロチップ
US8980198B2 (en) * 2006-04-18 2015-03-17 Advanced Liquid Logic, Inc. Filler fluids for droplet operations
KR101465701B1 (ko) * 2008-01-22 2014-11-28 삼성전자 주식회사 핵산 증폭 장치
JP4659889B2 (ja) * 2008-04-02 2011-03-30 日本特殊陶業株式会社 ガスセンサ
SG11201400130RA (en) 2011-08-22 2014-04-28 Panasonic Corp Microfluidic device

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20050003944A (ko) * 2003-07-04 2005-01-12 (주)울텍 히터와 온도센서가 내장된 마이크로 챔버 구조체 및 제작방법
US20080131956A1 (en) * 2006-12-05 2008-06-05 Electronics And Telecommunications Research Institute Natural convection-driven pcr apparatus and method using disposable polymer chip
KR20120137054A (ko) * 2011-06-10 2012-12-20 나노바이오시스 주식회사 히터 유닛이 반복 배치된 열 블록을 포함하는 플루이딕 pcr 칩 및 이를 포함하는 pcr 장치
KR20120139206A (ko) * 2011-06-17 2012-12-27 나노바이오시스 주식회사 박막형 열 블록 및 박막형 pcr 칩을 포함하는 휴대용 실시간 pcr 장치
KR20120139205A (ko) * 2011-06-17 2012-12-27 나노바이오시스 주식회사 히터 유닛이 반복 배치된 열 블록을 포함하는 플루이딕 pcr 장치

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
See also references of EP2977441A4 *

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2018500035A (ja) * 2014-12-26 2018-01-11 ナノバイオシス インコーポレーテッドNanobiosys Inc. 繰り返し摺動駆動手段を備えるポリメラーゼ連鎖反応(pcr)装置及びこれを用いるポリメラーゼ連鎖反応(pcr)方法
US11193098B2 (en) 2014-12-26 2021-12-07 Nanobiosys Inc. PCR apparatus comprising repeated sliding means and PCR method using same
WO2017119902A1 (en) * 2016-01-08 2017-07-13 Hewlett-Packard Development Company, L.P. Polymerase chain reaction device
US10857536B2 (en) 2016-01-08 2020-12-08 Hewlett-Packard Development Company, L.P. Polymerase chain reaction device

Also Published As

Publication number Publication date
CN105073974B (zh) 2018-06-05
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RU2618859C2 (ru) 2017-05-11
EP2977441A1 (en) 2016-01-27

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