WO2012160934A1 - ホルマリン固定パラフィン包埋組織切片中のタンパク質の賦活化処理システム及び賦活化処理方法 - Google Patents

ホルマリン固定パラフィン包埋組織切片中のタンパク質の賦活化処理システム及び賦活化処理方法 Download PDF

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慶一 畠山
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    • G01N33/6803—General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
    • G01N33/6848—Methods of protein analysis involving mass spectrometry

Definitions

  • the present invention provides for pretreatment of a tissue section in mass spectrometry of a formalin-fixed paraffin-embedded tissue section (hereinafter referred to as “paraffin-embedded tissue section”) that has been subjected to a paraffin-embedded process after a formalin-fixed process. It is related with the activation processing system and the activation processing method of the protein used in this tissue slice used.
  • Non-Patent Documents 1, 2, 3, and 4 In order to use a paraffin-embedded tissue section as a section sample for mass spectrometry, a pretreatment method as described in Non-Patent Documents 1, 2, 3, and 4 has been conventionally performed. A conventional pretreatment method will be described with reference to the chart of FIG. First, after removing paraffin from the paraffin-embedded tissue section, hydration is performed to obtain a deparaffinized tissue section (S1).
  • the crosslinks are dissociated by heat treatment in the activation treatment liquid (S2: hereinafter referred to as “activation treatment”). Further, the activation treatment liquid adhering to the deparaffinized tissue section during the activation treatment is washed (S3). Thereafter, the deparaffinized tissue section after washing is treated with a digestive enzyme such as trypsin to hydrolyze the protein contained in the tissue section into a peptide (S4). Finally, the matrix solution is dropped onto the enzyme-treated deparaffinized tissue section to deposit the matrix (S5). The section sample thus prepared is subjected to MALDI mass spectrometry.
  • the activation treatment not only restores the two-dimensional structure and three-dimensional structure of the protein molecule damaged by the cross-linking reaction associated with the formalin immobilization treatment, but also in the subsequent enzyme treatment. This process is indispensable for making digestive enzymes easy to approach protein molecules.
  • heat treatment a hot tub, a microwave oven, an autoclave
  • an activation treatment solution containing a surfactant a surfactant
  • An object of the present invention is to provide an activation processing system and an activation processing method for a protein in a deparaffinized tissue section that can detect an intensity peak that does not come and improve the amount of information in image mapping.
  • the protein activation treatment system in the deparaffinized tissue section according to the present invention made to solve the above problems, In order to mass-analyze the measurement area of the deparaffinized tissue section obtained by removing paraffin from the formalin-fixed paraffin-embedded tissue section that has been subjected to paraffin-embedding after formalin-fixation, formalin fixation in the protein molecules contained in the measurement area is performed.
  • a protein activation treatment system for dissociating the cross-linking generated in step 1 and activating the protein molecule A dispensing unit that dispenses the activation treatment liquid into the entire dispensing region containing the measurement region of the deparaffinized tissue section; And a wet heat treatment part that heats the deparaffinized tissue section in which the activation treatment liquid has been dispensed in the dispensing region with saturated steam.
  • the protein activation processing system in the deparaffinized tissue section immerses the deparaffinized tissue section in the activation processing liquid, which has been performed in the conventional activation processing, or is washed after the immersion. This processing is excluded.
  • the activation treatment liquid contains a surfactant. If a surfactant is included in the activation treatment liquid, the affinity between the activation treatment liquid and the deparaffinized tissue section is increased. Therefore, the cross-linking caused by formalin fixation is sufficiently dissociated when wet heat treatment is performed. Because it can be done.
  • the dispensing unit may dispense the activation treatment liquid at predetermined intervals so that the dispensing unit forms a plurality of droplets independent from each other in the dispensing region. .
  • the volume of each droplet and the dispensing interval are set so that the dispensing region is covered with the plurality of droplets.
  • the dispensing unit may dispense the activation treatment liquid a plurality of times to the same spot in the dispensing region.
  • the activation treatment method of the protein in the deparaffinized tissue section according to the present invention made to solve the above problems, In order to mass-analyze the measurement area of the deparaffinized tissue section obtained by removing paraffin from the formalin-fixed paraffin-embedded tissue section that has been subjected to paraffin-embedding after formalin-fixation, formalin fixation in the protein molecules contained in the measurement area is performed.
  • the activation treatment liquid in the dispensing step, may be dispensed at predetermined intervals so as to become a plurality of droplets independent from each other in the dispensing region.
  • the volume of each droplet and the dispensing interval are set so that the dispensing region is covered with the plurality of droplets.
  • the activation treatment liquid may be dispensed a plurality of times to the same spot in the dispensing region.
  • the pH of the activation treatment liquid may be 9 or more.
  • the activation processing liquid is deparaffinized tissue. Since the wet heat treatment is performed after dispensing into the sections, the biological components of the deparaffinized tissue sections are not lost by the immersion. In addition, since the washing process after the activation process, which was necessary in the past, is omitted, the biological components of the deparaffinized tissue section are not lost by the washing. Therefore, since the peak intensity reflecting the actual amount of the biological component is obtained, the peak intensity obtained in MALDI mass spectrometry is higher than the conventional one. This increases the number of peaks whose chemical structure is identified by qualitative analysis, and improves the detection limit in quantitative analysis. As a result, more accurate image mapping with an improved amount of information becomes possible.
  • the figure which expanded the main detection peak obtained by the present Example and the comparative example A dark line shows a present Example and a thin line shows a comparative example.
  • FIG. 3 is a main part configuration diagram of the activation processing system 1 according to an embodiment.
  • the activation processing system 1 heats the dispensing part 10 for dispensing the activation treatment liquid to the deparaffinized tissue section 30 and the deparaffinized tissue section 30 into which the activation treatment liquid 31 has been dispensed under saturated steam. It is comprised by the wet heat processing part 20 for doing.
  • the dispensing unit 10 includes a placement table 11 for placing the sample plate 34 on which the deparaffinized tissue section 30 is placed, a storage container (not shown) for storing the activation treatment liquid, and the activation treatment liquid.
  • a dispenser 12 for dispensing is provided.
  • the wet heat treatment unit 20 stores the sample plate 34 on which the deparaffinized tissue section 30 into which the activation treatment liquid 31 has been dispensed is placed in a pressure-resistant container, and the dehumidification process is performed with saturated steam at a predetermined temperature and time.
  • the paraffin tissue section 30 is heated.
  • a dispensing device capable of dispensing a small amount of solution to a designated region can be used, and in particular, a chemical capable of dispensing a picoliter (pL) unit solution.
  • a printer CHIP-1000 manufactured by Shimadzu Corporation
  • an autoclave apparatus can be used suitably as the wet heat treatment part 20.
  • Dispensing unit 10 and wet heat treatment unit 20 may be separate from each other or may be integrated.
  • the dispensing unit 10 can be used not only for dispensing the activation treatment liquid but also for applying a predetermined treatment liquid to the deparaffinized tissue section 30 in the subsequent enzyme treatment and matrix deposition treatment. .
  • activation process method executed by the activation system 1
  • the activation treatment was performed under a plurality of dispensing conditions in order to examine the optimum dispensing amount of the activation treatment liquid.
  • a chemical printer CHIP-1000 was applied as the dispensing unit 10 of the activation processing system 1
  • an autoclave KS-243 manufactured by Tommy Seiko Co., Ltd. was applied as the wet heat treatment unit 20.
  • a formalin-fixed paraffin-embedded kidney tissue section (thickness 3 ⁇ m) obtained by slicing mouse kidney tissue after formalin-fixing and paraffin-embedding was attached to a conductive support and dried.
  • the obtained formalin-fixed paraffin-embedded kidney tissue section was exposed to xylene at room temperature for 30 minutes to obtain a deparaffinized kidney tissue section 30 from which paraffin was removed.
  • the deparaffinized kidney tissue section 30 was exposed for 10 seconds in order of 100% ethanol (twice), 90% ethanol, 80% ethanol, and 70% ethanol.
  • the deparaffinized kidney tissue section 30 after hydration treatment is placed on a slide glass sample plate and set on a chemical printer CHIP-1000, and 10 mM Tris-HCl (pH 10.0) /0.1% n as an activation treatment solution.
  • a storage container was filled with -octyl- ⁇ -D-glucoside solution.
  • the activation treatment liquid 31 was dispensed at intervals of 200 ⁇ m into a plurality of 1000 ⁇ m square dispensing regions 32 set in the deparaffinized kidney tissue section 30.
  • the total dispensing volume was set to 11 conditions of 500pL, 1000pL, 2000pL, 2500pL, 3000pL, 3500pL, 4000pL, 4500pL, 5000pL, 7500pL and 10000pL per spot.
  • the deparaffinized kidney tissue section 30 was placed in a stainless steel box together with wet paper material, and wet-heat treated at 110 ° C. for 10 minutes by an autoclave.
  • the deparaffinized kidney tissue section 30 after the heat treatment was set again on the chemical printer CHIP-1000, and a storage container was filled with 100 ⁇ g / mL trypsin / 10 mM ammonium bicarbonate / 5% isopropanol solution as an enzyme treatment solution.
  • Dispensing the deparaffinized kidney tissue section 30 by dispensing 5000 pL of the enzyme-treated solution to all spots where the activation treatment solution 31 has been dispensed, and allowing to stand at 37 ° C.
  • the activation treatment liquid used in the activation treatment described above was prepared at pH 9.6. In this way, by inclining the pH of the activation treatment solution toward the basic side, in the subsequent enzyme treatment, the reaction rate of protein hydrolysis by trypsin having an optimum pH of weak basicity (pH 8-9) is increased. Can be improved.
  • a mouse formalin-fixed paraffin-embedded kidney section was processed by the following method based on the conventional method. Autoclaving at 110 ° C. for 10 minutes in a state where a deparaffinized kidney tissue section 30 of a mouse subjected to deparaffinization and hydration in the same manner as in the above example was immersed in an activation treatment liquid having the same composition as in the above example Wet heat treatment. The deparaffinized kidney tissue section 30 after the wet heat treatment was taken out from the activation treatment liquid, and in order to remove the activation treatment liquid, the deparaffinization kidney tissue section 30 was immersed in 70% ethanol for 5 minutes and sufficiently washed. The enzyme treatment and matrix deposition treatment of the deparaffinized kidney tissue section 30 after washing were performed under the same conditions as in the above examples. The obtained section sample was subjected to MALDI mass spectrometry under the same measurement conditions as in the examples.
  • MALDI mass spectrometry was performed under the following measurement conditions.
  • a total of 121 points are irradiated per measurement region at intervals of 50 ⁇ m, and two shots are irradiated at each point.
  • MALDI mass spectrometry was performed. After obtaining the peak intensity of each mass number in the measurement mass range, subtracting from the peak intensity, the minimum intensity of 100 peaks before and after each detection peak is regarded as the background of each detection peak, Correction was made by dividing by the sum of the intensities.
  • the detection peak of this example was compared with the detection peak of the same mass number in the comparative example, and a detection peak having a detection intensity more than twice that of the comparative example and having statistical significance (p ⁇ 0.05) was selected.
  • FIG. 5 is a graph showing the number of detected peaks for each dispensing amount of the activation treatment liquid in this example.
  • the number of detected peaks shows a tendency to increase as the dispensed volume of the activation treatment liquid increases up to 1000pL of the activation treatment liquid.
  • the number of detected peaks at the dispense volume of 1000pL is About twice as much.
  • the number of detected peaks reached a peak at a dispensing amount of 1000 pL to 2500 pL.
  • the activation treatment liquid having a dispensing amount of 500 pL cannot be said to have a sufficient volume for activating the protein in the dispensing region 32, but if the dispensing amount is 1000 pL or more, the dispensing region 32 It was shown that the inner protein can be sufficiently activated.
  • the number of detected peaks tended to decrease rapidly when the dispensing amount of the activation treatment liquid exceeded 3000 pL. This is because, when the dispensing amount of the activation treatment liquid becomes a certain amount or more, the droplets of the activation treatment liquid formed on the deparaffinized kidney tissue section 30 are united, and the activation treatment liquid is dispensed in the dispensing region 32. It is considered that the biological components that have migrated into the activation treatment liquid are lost from within the dispensing region 32 by flowing out of the liquid.
  • the dispensing volume of the activation treatment liquid per spot is 2500 pL and 5000 pL
  • the deparaffinized kidney tissue section 30 after the dispensing is observed.
  • the dispensing volume is 2500 pL
  • the droplets of each spot it was confirmed that when the dispensing amount was 5000 pL, the droplets of adjacent spots merged and the activation treatment liquid flowed out of the dispensing region 32. According to these results, the activation treatment liquid can be dispensed as independent droplets up to a dispensing amount of 2500 pL per spot.
  • FIG. 6 shows the mass when the activation treatment liquid is dispensed 2500 pL at a time in this embodiment (that is, when the maximum volume of the activation treatment liquid droplets is well maintained).
  • FIG. 5 is a diagram showing a peak profile and a mass peak profile obtained in a comparative example in a total of three measurement ranges of m / z 750 to 1150, m / z 1150 to 1650, and m / z 1650 to 2250. It can be seen that the number of clear peaks in the example is larger than that in the comparative example as a whole, and the tendency is particularly remarkable in the mass range of m / z 1650 to 2250.
  • FIG. 5 is a diagram showing a peak profile and a mass peak profile obtained in a comparative example in a total of three measurement ranges of m / z 750 to 1150, m / z 1150 to 1650, and m / z 1650 to 2250. It can be seen that the
  • FIG. 7 is an enlarged view of typical detection peaks (m / z 1274, m / z 1443, m / z 1509, m / z 1529, m / z 1745, and m / z 1961) in the mass peak profile of FIG.
  • the dark line shows the detection peak obtained in this example in which the activation treatment solution was dispensed in 2500 pL, and the thin line shows the detection peak obtained in the comparative example.
  • the detection peak of this example showed a peak intensity more than twice that of the comparative example.
  • FIG. 8 shows twice the detection peak of the same mass number in the comparative example among the detection peaks obtained when MALDI mass spectrometry was performed on the section sample obtained by dispensing 2500 pL of the activation treatment liquid in this example.
  • the specific peak intensity ratios of a total of 461 detection peaks showing the above peak intensity ratios are shown for each mass range. It was recognized that the peak intensity ratio tended to increase as the detection peak having a larger mass number.
  • 182 (39.5%) were detected with a peak intensity 2 to 3 times higher than that of the comparative example, and 149 (32.3%) were detected 3 to 5 times higher.
  • the number of detection peaks improved 5 to 10 times was 104 (22.6%), and the number of detection peaks improved 10 times or more was 26 (5.6%).
  • the number of detection peaks at the time of MALDI mass spectrometry is increased and the detection sensitivity is higher than when the activation processing is performed by the conventional method. Will also improve. This is thought to be due to the fact that in the present invention, the conventional treatment of immersion in the activation treatment liquid and subsequent washing is omitted, thereby avoiding the loss of biological components from the deparaffinized tissue section. In addition, during the wet heat treatment, it is expected that the biological components and the molecules of the activation treatment liquid frequently collide with each other in the small inside of the droplets of the activation treatment liquid. It is considered that the detection sensitivity is improved by being promoted.

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Abstract

　本発明のタンパク質賦活化処理システム１は、ホルマリン固定パラフィン包埋組織切片からパラフィンを取り除いて得た脱パラフィン組織切片３０について、該脱パラフィン組織切片中に含まれるタンパク質を賦活化するためのものである。タンパク質賦活化処理システム１は、脱パラフィン組織切片３０の測定領域３３を内包する分注領域３２内全体を賦活化処理液３１が覆うように、該賦活化処理液３１を該分注領域３２に分注する分注部１０と、前記分注領域３２が前記賦活化処理液３１で覆われた前記脱パラフィン組織切片３０を飽和水蒸気下にて加熱する湿熱処理部２０とを備える。

Description

ホルマリン固定パラフィン包埋組織切片中のタンパク質の賦活化処理システム及び賦活化処理方法
　本発明は、ホルマリン固定処理後にパラフィン包埋処理が施されたホルマリン固定パラフィン包埋組織切片（以下、「パラフィン包埋組織切片」と呼ぶ）の質量分析に際して、該組織切片の前処理のために用いられる、該組織切片中に含まれるタンパク質の賦活化処理システム及び賦活化処理方法に関する。
　近年、臨床診断や創薬の分野において、生体組織切片中に含まれるタンパク質や代謝物等の生体成分の分布をイメージングするバイオイメージング技術が用いられている。特に、パラフィン包埋組織切片に適宜の前処理を施して作製した切片試料を、MALDI質量分析計（MALDI：Matrix Assisted Laser Desorption Ionization、マトリックス支援レーザー脱離イオン化）で走査し、切片試料の生体成分の質量を網羅的に分析することにより、生体成分の分布を調べることが広く行われている。
　パラフィン包埋組織切片を切片試料として質量分析に供するために、非特許文献１、２、３、４に記載されるような前処理方法が従来より行われている。従来の前処理方法について図２のチャート図を用いて説明する。
　まず、パラフィン包埋組織切片からパラフィンを除去した後、水和処理を施して脱パラフィン組織切片を得る（S1）。このようにして得られた脱パラフィン組織切片に含まれるタンパク質の分子内では、ホルマリン固定化処理の際に単一アミノ酸残基の結合、ヒドロメチル基によるメチレン架橋の形成、特に一級アミノ基やフェニル基を介して強固なメチレン架橋が生じているので、賦活化処理液中で加熱処理をすることで架橋を解離する（S2：以下、これを「賦活化処理」という）。さらに、賦活化処理の際に脱パラフィン組織切片に付着した賦活化処理液を洗浄する（S3）。その後、洗浄後の脱パラフィン組織切片をトリプシン等の消化酵素で処理し、該組織切片に含まれるタンパク質をペプチドに加水分解する（S4）。最後に、酵素処理された脱パラフィン組織切片にマトリックス溶液を滴下してマトリックスを堆積させる（S5)。こうして作製された切片試料がMALDI質量分析に供される。
　上述した従来の前処理方法において、賦活化処理は、ホルマリン固定化処理に伴う架橋反応により損なわれたタンパク質分子の二次元構造及び三次元構造を回復させるだけでなく、その後に行われる酵素処理において消化酵素をタンパク質分子にアプローチしやすくするために欠かすことのできない処理である。従来の賦活化処理方法として、界面活性剤を含む賦活化処理液に脱パラフィン組織切片を浸漬した状態で、所定の時間にわたり加熱処理（温浴槽、電子レンジ、オートクレーブ）を施すことが行われている。
Maurizio Ronci、Elena Bonanno、Alfredo Colantoni、Luisa Pieroni、Carmine Di Ilio、Luigi Giusto Spagnoli、Giorgio Federici、Andrea Urbani、「プロテイン・アンロッキング・プロスデュアーズ・オブ・フォルマリン－フィクスト・パラフィン－インベディド・ティシュー：アプリケーション・トゥ・マルディ－トフ・イメージング・マス・インベスティゲーションズ（Protein unlocking procedures of formalin-fixed paraffin-embedded tissues: Application to MALDI-TOF Imaging MS investigations）」、Proteomics、vol. 8、2008、pp.3702-3714 M. Reid Groseclose、Pierre P. Massion、Pierre Chaurand、Richard M. Caprioli、「ハイ－スループット・プロテオミック・アナリシス・オブ・フォルマリン－フィクスト・パラフィン－インベディド・ティシュー・マイクロアレイズ・ユージング・マルディ・イメージング・マス・スペクトロメトリー（High-throughput proteomic analysis of formalin-fixed paraffin-embedded tissue microarrays using MALDI imaging mass spectrometry）」、Proteomics、Vol. 8、No. 18、2008、pp.3715-3724 Marie-Claude Djidja、Emmanuelle Claude、Marten F. Sne、Peter Scriven、Simona Francese、Vikki Carolan、Malcolm R. Clench、「マルディ－イオン・モビリティ・セパレーション－マス・スペクトロメトリー・イメージング・オブ・グルコース－レギュレーティド・プロテイン・７８キロダルトン（Grp78）・イン・ヒューマン・フォルマリン－フィクスト・パラフィン－インベディド・パンクレアティック・アデノカルシノーマ・ティシュー・セクション（MALDI-Ion Mobility Separation-Mass Spectrometry Imaging of Glucose-Regulated Protein 78 kDa (Grp78) in Human Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded Pancreatic Adenocarcinoma Tissue Sections）」、Journal of Proteome Research、Vol. 8、No. 10、2009、pp.4876-4884 Johan O. R. Gustafsson、Martin K. Oehler、Shaun R. McColl、 Peter Hoffmann、「シトリック・アシッド・アンチジェン・レトリーヴァル（CAAR）・フォー・トリプティック・ペプタイド・イメージング・ディレクトリー・オン・アーカイヴド・ホルマリン－フィクスト・パラフィン－インベディド・ティシュー（Citric Acid Antigen Retrieval (CAAR) for Tryptic Peptide Imaging Directly on Archived Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Tissue）」、Journal of Proteome Research、Vol. 9、No. 9、2010、pp.4315-4328
　しかしながら、このように脱パラフィン組織切片を賦活化処理液に浸漬すると、脱パラフィン組織切片の生体成分の一部が賦活化処理液中に流出して失われる。さらに、賦活化処理後の脱パラフィン組織切片に付着した賦活化処理液を洗い流す際に、該組織切片の生体成分がさらに流失してしまう。従って、従来の賦活化処理を経て作製された切片試料をMALDI質量分析に供したとき、生体成分由来のピークの強度が小さくなってしまい、正しい定量結果が得られなかったり、微量成分の定性解析に支障を来していた。これに伴い、MALDI質量分析の結果に基づいてイメージマッピングを行う際に、本来の生体成分濃度を反映した十分な情報量のマッピングを行うことが難しいという問題があった。
　そこで、本発明が解決しようとする課題は、脱パラフィン組織切片中のタンパク質を賦活化する際、該組織切片から生体成分の流失を防ぐことにより、MALDI質量分析において定量解析や定性解析に支障を来すことのない強度のピークを検出し、イメージマッピングにおける情報量を向上させることのできる、脱パラフィン組織切片中のタンパク質の賦活化処理システム及び賦活化処理方法を提供することにある。
　上記課題を解決するために成された本発明に係る脱パラフィン組織切片中のタンパク質の賦活化処理システムは、
　ホルマリン固定処理後にパラフィン包埋処理が施されたホルマリン固定パラフィン包埋組織切片からパラフィンを取り除いた脱パラフィン組織切片の測定領域を質量分析するために、当該測定領域に含まれるタンパク質分子内のホルマリン固定で生じた架橋を解離して該タンパク質分子を賦活化させるタンパク質賦活化処理システムであって、
　賦活化処理液を前記脱パラフィン組織切片の前記測定領域を内包する分注領域内の全体に分注する分注部と、
　前記分注領域に前記賦活化処理液が分注された前記脱パラフィン組織切片を飽和水蒸気により加熱する湿熱処理部と
　を備えることを特徴とする。
　本発明に係る脱パラフィン組織切片中のタンパク質の賦活化処理システムは、従来の賦活化処理で行われていた、脱パラフィン組織切片を賦活化処理液に浸漬したり、また浸漬後に洗浄したりするという処理を排除したものである。分注部により脱パラフィン組織切片に賦活化処理液を分注した後、その脱パラフィン組織切片に湿熱処理を施したときに、脱パラフィン組織切片を賦活化処理液に浸漬した場合と同等の効果が得られるようにするためには、賦活化処理液に界面活性剤が含まれていることが望ましい。賦活化処理液に界面活性剤が含まれていれば、賦活化処理液と脱パラフィン組織切片との親和性が高まるため、湿熱処理を施したときに、ホルマリン固定によって生じた架橋を十分、解離することができるからである。
　上記賦活化処理システムにおいては、前記分注部が、前記分注領域内において互いに独立した複数の液滴となるように前記賦活化処理液を所定の間隔で分注するものとすることができる。
　このとき、前記分注領域が前記複数の液滴で覆われるように、各液滴の体積及び分注間隔が設定されていることが望ましい。
　また、前記分注部が、前記賦活化処理液を前記分注領域内の同一のスポットに複数回分注するものとすることもできる。
　さらに、上記課題を解決するために成された本発明に係る脱パラフィン組織切片中のタンパク質の賦活化処理方法は、
　ホルマリン固定処理後にパラフィン包埋処理が施されたホルマリン固定パラフィン包埋組織切片からパラフィンを取り除いた脱パラフィン組織切片の測定領域を質量分析するために、当該測定領域に含まれるタンパク質分子内のホルマリン固定で生じた架橋を解離して該タンパク質分子を賦活化させるタンパク質賦活化処理方法であって、
　賦活化処理液を前記脱パラフィン組織切片の前記測定領域を内包する分注領域内の全体に分注する分注工程と、
　前記分注領域に前記賦活化処理液が分注された前記脱パラフィン組織切片を飽和水蒸気により加熱する湿熱処理工程と
　を有することを特徴とする。
　上記発明では、前記分注工程において、前記賦活化処理液が前記分注領域内において互いに独立した複数の液滴となるように所定の間隔で分注されるものとすることができる。
　このとき、前記分注領域が前記複数の液滴で覆われるように、各液滴の体積及び分注間隔が設定されていることが望ましい。
　また、前記分注工程において、前記賦活化処理液が前記分注領域内の同一のスポットに複数回分注されるものとすることもできる。
　さらに、前記賦活化処理液のpHは9以上であるものとすることができる。
　本発明に係る脱パラフィン組織切片中のタンパク質の賦活化処理システム及び賦活化処理方法では、従来のように脱パラフィン組織切片を賦活化処理液に浸漬する代わりに、賦活化処理液を脱パラフィン組織切片に分注してから湿熱処理を行うため、浸漬によって脱パラフィン組織切片の生体成分が失われることがない。また、従来は必要であった賦活化処理後の洗浄処理が省かれるため、洗浄によって脱パラフィン組織切片の生体成分が失われることもない。従って、実際の生体成分の量を反映したピーク強度が得られるため、MALDI質量分析において得られるピーク強度が従来に比べて高くなる。これにより、定性解析により化学構造が同定されるピークの本数が増加し、定量解析における検出限界も向上する。その結果、情報量が向上したより正確なイメージマッピングが可能となる。
本実施例に係る賦活化処理システムを採用した、パラフィン包埋組織切片の前処理方法を示すフローチャート。 従来の賦活化処理方法を採用した、パラフィン包埋組織切片の前処理方法を示すフローチャート。 本実施例に係る賦活化処理システムの要部構成図。 （ａ）本実施例に係る賦活化処理について模式的に示した図。（ｂ）本実施例に係るMALDI質量分析について模式的に示した図。 賦活化処理液の分注量別の検出ピーク数を示す棒グラフ。 本実施例及び比較例にて得られたマスピークプロファイルを所定の質量範囲毎に示した図。 本実施例及び比較例にて得られた主な検出ピークを拡大した図。濃い線は本実施例、薄い線は比較例を示す。 本実施例にて得られた検出ピークの比較例に対する強度比を質量範囲毎に示した棒グラフ。
　本発明に係る脱パラフィン組織切片中のタンパク質の賦活化処理システム（以下、単に「賦活化処理システム」という）の一実施例について、図面を参照しながら以下に説明する。図３は、一実施例に係る賦活化処理システム１の要部構成図である。
　賦活化処理システム１は、脱パラフィン組織切片３０に賦活化処理液を分注するための分注部１０と、賦活化処理液３１が分注された脱パラフィン組織切片３０を飽和水蒸気下で加熱するための湿熱処理部２０により構成される。
　分注部１０は、脱パラフィン組織切片３０を載せたサンプルプレート３４を載置するための載置台１１と、賦活化処理液を格納する貯液容器（図示せず）と、賦活化処理液を分注するための分注器１２を備えている。
　湿熱処理部２０は、賦活化処理液３１が分注された脱パラフィン組織切片３０を載せたサンプルプレート３４を、耐圧性を有する容器内に格納し、所定の温度及び時間で飽和水蒸気により前記脱パラフィン組織切片３０を加熱するものである。
　分注部１０として、微量の溶液を指定された領域へ分注することのできる分注装置を使用することができ、特に、ピコリットル（pL）単位の溶液を分注することの可能なケミカルプリンタCHIP-1000（株式会社島津製作所製）を好適に使用することができる。また、湿熱処理部２０として、オートクレーブ装置を好適に使用することができる。
　分注部１０と湿熱処理部２０とは互いに別体であっても良いし、一体であっても良い。　また、分注部１０は、賦活化処理液の分注だけでなく、その後の酵素処理及びマトリックス堆積処理において、所定の処理液を脱パラフィン組織切片３０に付与する際にも使用することができる。
　次に、上記賦活化処理システム１により実行された、脱パラフィン組織切片中のタンパク質の賦活化処理方法（以下、単に「賦活化処理方法」という）の一実施例について説明する。本実施例では、賦活化処理液の至適分注量を検討するために、複数の分注条件にて賦活化処理を行った。
　本実施例では、賦活化処理システム１の分注部１０としてケミカルプリンタCHIP-1000を適用し、また湿熱処理部２０としてオートクレーブＫＳ-２４３（株式会社トミー精工製）を適用した。
　マウスの腎臓組織をホルマリン固定後にパラフィン包埋処理してスライスすることにより得たホルマリン固定パラフィン包埋腎臓組織切片（厚さ3μm）を導電性を有した支持体に貼り付け乾燥させた。得られたホルマリン固定パラフィン包埋腎臓組織切片を室温下で30分間キシレン中に晒すことにより、パラフィンを取り除いた脱パラフィン腎臓組織切片３０を得た。次に、水和処理として、100%エタノール（2回）、90%エタノール、80%エタノール及び70%エタノールの順に10秒ずつ脱パラフィン腎臓組織切片３０を晒した。
　水和処理後の脱パラフィン腎臓組織切片３０をスライドグラス用サンプルプレートに載置し、ケミカルプリンタCHIP-1000にセットするとともに、賦活化処理液として10mM Tris-HCl（pH10.0）/0.1%n-オクチル-β-D-グルコシド溶液を貯液容器に充填した。さらに、図４（ａ）に示すように、前記脱パラフィン腎臓組織切片３０に複数個設定した1000μm四方の分注領域３２に、200μmの間隔で賦活化処理液３１を分注した。即ち、1つの分注領域３２の一辺に200μmの間隔で計6スポットを設定し、6スポット×6スポットの計36スポットに賦活化処理液３１を分注した。
　至適分注量を検討するために、分注量は1スポットあたり合計500pL、1000pL、2000pL、2500pL、3000pL、3500pL、4000pL、4500pL、5000pL、7500pL及び10000pLの計11条件とした。スポット上に1滴100pLを当該量分、滴下することで（即ち、1スポットに合計2500pLを分注したいときは、100pLを25滴、組織上に滴下することで）、目的の体積の賦活化処理液を分注した。
　分注後の前記脱パラフィン腎臓組織切片３０を湿った紙材とともにステンレス箱に入れ、オートクレーブにより110℃で10分間湿熱処理した。
　次に、湿熱処理後の脱パラフィン腎臓組織切片３０をケミカルプリンタCHIP-1000に再びセットし、酵素処理液として100μg/mLトリプシン/10mM重炭酸アンモニウム/5%イソプロパノール溶液を貯液容器に充填した。賦活化処理液３１を分注した全てのスポットに、前記酵素処理液を合計5000pLずつ分注し、恒温庫にて37℃で180分間静置することにより、脱パラフィン腎臓組織切片３０の分注領域３２に含まれるタンパク質を加水分解した。さらに、マトリックス溶液として50mg/mL 2,5-ジヒドロキシ安息香酸/50%アセトニトリル/0.1%トリフルオロ酢酸溶液を貯液容器に充填し、150μmの間隔で合計7500pLずつ分注して、2,5-ジヒドロキシ安息香酸を脱パラフィン腎臓組織切片３０に堆積させた。こうして得られた切片試料をMALDI質量分析へ供した。MALDI質量分析の測定条件については後述する。
　なお、上記の賦活化処理において用いられた賦活化処理液はpH9.6に調製されたものである。このように、賦活化処理液のpHを塩基性側に傾けておくことにより、後段の酵素処理において、弱塩基性（pH8～9）の至適pHを有するトリプシンによるタンパク質加水分解の反応速度を向上させることができる。
比較例
　比較例として、従来法に基づく以下の方法によりマウスのホルマリン固定パラフィン包埋腎臓切片を処理した。
　上記実施例と同じ方法で脱パラフィン処理及び水和処理を施したマウスの脱パラフィン腎臓組織切片３０を、上記実施例と同じ組成の賦活化処理液に浸漬した状態で、110℃で10分間オートクレーブにて湿熱処理した。湿熱処理後の脱パラフィン腎臓組織切片３０を賦活化処理液から取り出し、賦活化処理液を取り除くために、前記脱パラフィン腎臓組織切片３０を70%エタノールで5分間浸漬し、十分に洗浄した。洗浄後の脱パラフィン腎臓組織切片３０の酵素処理及びマトリックス堆積処理については上記実施例と同じ条件にて実施した。得られた切片試料について、実施例と同じ測定条件にてMALDI質量分析を行った。
　実施例１及び比較例にて得られた切片試料について、いずれも下記の測定条件によりMALDI質量分析を行った。
　装置：マトリックス支援レーザー脱離イオン化一飛行時間型質量分析計　AXIMA-QIT（株式会社島津製作所製）
　レーザー：5Hz、2 shots/point
　照射間隔：50μm
　イオン極性：positive
　測定質量領域モード：MID MASS
　測定質量範囲：m/z 700-2500
　測定領域：500μm×500μm
　測定ポイント：11×11=121 points
　図４（ｂ）にて模式的に示すように、分注領域３２内に含まれる500μm四方の測定領域３３において、50μm間隔で1測定領域あたり合計121ポイント、各ポイントにつき2ショットずつレーザーを照射してMALDI質量分析を行った。
　上記測定質量範囲において各質量数のピーク強度を獲得し、各検出ピークの前後100ピークずつの最小強度を各検出ピークのバックグラウンドとみなして前記ピーク強度から差し引いた後に、各ピーク強度を全ピーク強度の総和で除する補正を行った。本実施例の検出ピークを比較例における同じ質量数の検出ピークと比較し、比較例に対し2倍以上の検出強度があり、かつ統計的意義（p<0.05）のある検出ピークを選出した。
　得られたMALDI質量分析結果を以下に示す。
　まず、図５は、本実施例において賦活化処理液の分注量毎の検出ピーク数を示したグラフである。検出ピーク数は、賦活化処理液の分注量1000pLまでは、賦活化処理液の分注量が大きくなるにつれて増加する傾向を示し、分注量1000pLにおける検出ピーク数は分注量500pLの時の約2倍であった。また、検出ピーク数は分注量1000pLから2500pLにおいて頭打ちとなった。このことから、分注量500pLの賦活化処理液は、分注領域３２内のタンパク質を賦活化する上で十分な体積とはいえないが、分注量1000pL以上であれば、分注領域３２内のタンパク質を十分に賦活化できることが示された。
　その一方、検出ピーク数は、賦活化処理液の分注量が3000pLを超えると急激に減少する傾向を示した。これは、賦活化処理液の分注量がある一定以上になると、脱パラフィン腎臓組織切片３０に形成された賦活化処理液の液滴が合体してしまい、賦活化処理液が分注領域３２の外へ流出することにより、賦活化処理液中に移行した生体成分が分注領域３２内から失われるためと考えられる。
　この裏付けとして、1スポットあたりの賦活化処理液の分注量が2500pL及び5000pLの場合において、分注後の脱パラフィン腎臓組織切片３０を観察したところ、分注量2500pLのときには各スポットの液滴の形状がよく維持されているが、分注量5000pLでは隣接するスポットの液滴が合体してしまい、賦活化処理液が分注領域３２の外へ流出する現象が確認された。
　これらの結果によれば、賦活化処理液を独立した液滴として分注できるのは、1スポットあたりの分注量2500pLまでということができる。
　図６は、本実施例において賦活化処理液を2500pLずつ分注した際（即ち、賦活化処理液の液滴の形状がよく維持される最大の分注量でもって分注した際）のマスピークプロファイルと、比較例にて得られたマスピークプロファイルを、m/z750～1150、m/z1150～1650及びm/z1650～2250の計3つの測定範囲において示した図である。全体的に比較例に比べて実施例の方が明瞭なピークの数が多く、特にm/z1650～2250の質量範囲においてその傾向が顕著であることが分かる。
　また、図７は、図６のマスピークプロファイルのうち代表的な検出ピーク（m/z1274、m/z1443、m/z1509、m/z1529、m/z1745及びm/z1961）を拡大したものであり、濃い線は賦活化処理液を2500pLずつ分注した本実施例において、また薄い線は比較例において得られた検出ピークを示す。いずれの質量数においても、本実施例の検出ピークは比較例の検出ピークの２倍以上のピーク強度を示した。
　図８は、本実施例で賦活化処理液を2500pLずつ分注して得られた切片試料をMALDI質量分析した際の検出ピークのうち、比較例における同じ質量数の検出ピークに対して2倍以上のピーク強度比を示した計461本の検出ピークの具体的なピーク強度比を、質量範囲毎に示したものである。質量数の大きな検出ピークほどピーク強度比が増大する傾向が認められた。計461本の検出ピークのうち、比較例に対してピーク強度が2～3倍に向上した検出ピークは182本（39.5%）、3～5倍に向上した検出ピークは149本（32.3%）、5～10倍に向上した検出ピークは104本（22.6%）、10倍以上に向上した検出ピークは26本（5.6%）であった。
　以上述べたように、本発明に係る賦活化処理システム及び賦活化処理方法では、従来法で賦活化処理を行った場合に比べ、MALDI質量分析の際の検出ピーク本数が増加し、また検出感度も向上する。これは、本発明では賦活化処理液への浸漬及びその後の洗浄という従来の処理が省かれることにより、脱パラフィン組織切片からの生体成分の流失が回避されるためと考えられる。また、湿熱処理中に、賦活化処理液の液滴の矮小な内部において生体成分や賦活化処理液の成分の分子同士が互いに頻繁に衝突することが予想され、このような現象によって賦活化が促進されることにより、検出感度が向上するものと考えられる。
　以上、本発明における具体的な形態について示したが、本発明はこれらに限定されるものではない。例えば、図面では分注領域や測定領域を矩形として示したが、円形等の他の形状であってもよい。その他、本発明の主旨を逸脱しない範囲で種々の変形が可能である。
１…賦活化処理システム
１０…分注部
１１…載置台
１２…分注器
２０…湿熱処理部
３０…脱パラフィン組織切片
３１…賦活化処理液
３２…分注領域
３３…測定領域
３４…サンプルプレート

Claims (9)

  1. 　ホルマリン固定処理後にパラフィン包埋処理が施されたホルマリン固定パラフィン包埋組織切片からパラフィンを取り除いた脱パラフィン組織切片の測定領域を質量分析するために、当該測定領域に含まれるタンパク質分子内のホルマリン固定で生じた架橋を解離して該タンパク質分子を賦活化させるタンパク質賦活化処理システムであって、
    　賦活化処理液を前記脱パラフィン組織切片の前記測定領域を内包する分注領域内の全体に分注する分注部と、
    　前記分注領域に前記賦活化処理液が分注された前記脱パラフィン組織切片を飽和水蒸気により加熱する湿熱処理部と
    　を備えることを特徴とするタンパク質賦活化処理システム。
  2. 　前記分注部が、前記分注領域内において互いに独立した複数の液滴となるように前記賦活化処理液を所定の間隔で分注する
    ことを特徴とする請求項１に記載のタンパク質賦活化処理システム。
  3. 　前記分注領域が前記複数の液滴で覆われるように、各液滴の体積及び分注間隔が設定されていることを特徴とする請求項２に記載のタンパク質賦活化処理システム。
  4. 　前記分注部が、前記賦活化処理液を前記分注領域内の同一のスポットに複数回分注する
    ことを特徴とする請求項１から請求項３のいずれかに記載のタンパク質賦活化処理システム。
  5. 　ホルマリン固定処理後にパラフィン包埋処理が施されたホルマリン固定パラフィン包埋組織切片からパラフィンを取り除いた脱パラフィン組織切片の測定領域を質量分析するために、当該測定領域に含まれるタンパク質分子内のホルマリン固定で生じた架橋を解離して該タンパク質分子を賦活化させるタンパク質賦活化処理方法であって、
    　賦活化処理液を前記脱パラフィン組織切片の前記測定領域を内包する分注領域内の全体に分注する分注工程と、
    　前記分注領域に前記賦活化処理液が分注された前記脱パラフィン組織切片を飽和水蒸気により加熱する湿熱処理工程と
    　を有することを特徴とするタンパク質賦活化処理方法。
  6. 　前記分注工程において、前記賦活化処理液が前記分注領域内において互いに独立した複数の液滴となるように所定の間隔で分注されることを特徴とする、請求項５に記載のタンパク質賦活化処理方法。
  7. 　前記分注領域が前記複数の液滴で覆われるように、各液滴の体積及び分注間隔が設定されていることを特徴とする、請求項６に記載のタンパク質賦活化処理方法。
  8. 　前記分注工程において、前記賦活化処理液が前記分注領域内の同一のスポットに複数回分注されることを特徴とする、請求項５から請求項７のいずれかに記載のタンパク質賦活化処理方法。
  9. 　前記賦活化処理液のpHが9以上であることを特徴とする、請求項５から請求項８のいずれかに記載のタンパク質賦活化処理方法。
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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2017502272A (ja) * 2013-12-12 2017-01-19 ユニバーシティー オブ ヒューストン システム 普遍的な抗原の賦活化化合物とその使用の方法

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110864939A (zh) * 2018-08-27 2020-03-06 深圳大学 一种蛋白质提取方法和应用
JP7215467B2 (ja) * 2019-08-19 2023-01-31 株式会社島津製作所 ホルマリン固定パラフィン包埋組織試料からの抗体の分離、検出及び／又は分析方法

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2004347594A (ja) * 2003-04-30 2004-12-09 Shimadzu Corp 生体標本への試薬の分注方法及び生体標本の解析方法
JP2007514951A (ja) * 2003-12-16 2007-06-07 スリーエム イノベイティブ プロパティズ カンパニー 化学的に架橋された細胞サンプルの分析
WO2008038813A1 (en) * 2006-09-28 2008-04-03 Shimadzu Corporation Method for deparaffinization of paraffin-embedded specimen and method for analysis of paraffin-embedded specimen
JP2008542724A (ja) * 2005-05-25 2008-11-27 エクスプレッション、パソロジー、インコーポレイテッド 組織病理学的に処理した生物学的試料からのプロテオームの適用範囲を増加させるための、液体組織標品を用いたマルチプレックス方法

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20040219588A1 (en) 2003-04-30 2004-11-04 Masaru Furuta Method for dispensing reagents onto biological samples and method for analyzing biological samples
WO2006066039A2 (en) * 2004-12-17 2006-06-22 Kram Brian H High temperature tissue conditioning with low volatility solutions and applications

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2004347594A (ja) * 2003-04-30 2004-12-09 Shimadzu Corp 生体標本への試薬の分注方法及び生体標本の解析方法
JP2007514951A (ja) * 2003-12-16 2007-06-07 スリーエム イノベイティブ プロパティズ カンパニー 化学的に架橋された細胞サンプルの分析
JP2008542724A (ja) * 2005-05-25 2008-11-27 エクスプレッション、パソロジー、インコーポレイテッド 組織病理学的に処理した生物学的試料からのプロテオームの適用範囲を増加させるための、液体組織標品を用いたマルチプレックス方法
WO2008038813A1 (en) * 2006-09-28 2008-04-03 Shimadzu Corporation Method for deparaffinization of paraffin-embedded specimen and method for analysis of paraffin-embedded specimen

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2017502272A (ja) * 2013-12-12 2017-01-19 ユニバーシティー オブ ヒューストン システム 普遍的な抗原の賦活化化合物とその使用の方法

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