WO2012146811A1 - Procedimiento de calibración y corrección de la distorsión de barrido de un sistema de tomografía de coherencia óptica - Google Patents

Procedimiento de calibración y corrección de la distorsión de barrido de un sistema de tomografía de coherencia óptica Download PDF

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Susana Marcos Celestino
Damian SIEDLECKI
Carlos DORRONSORO DÍAZ
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    • G06T2207/10101Optical tomography; Optical coherence tomography [OCT]

Definitions

  • the present invention as expressed in the statement of this specification refers to a procedure for calibration and correction of scanning distortion of optical coherence tomography systems.
  • the present invention is an improvement of the optical coherence tomography technique, in that the application of the method described in the invention allows obtaining a two-dimensional and three-dimensional quantitative topography of surfaces from optical coherence tomography images.
  • the procedure is applicable to any optical coherence tomography system whose scanning system is based on a two-axis scanner system.
  • the present invention implies an improvement of the state of the art, by allowing the quantification of images obtained by optical coherence tomography techniques, and obtaining topographic maps of surfaces in general, and eye surfaces in particular, with advantages over alternative techniques. existing.
  • the objective of the present invention is to provide a method for correcting the distortion of any optical coherence tomography system, by using reference standards and obtaining mathematical relationships between the positions of the reference points in a reference pattern and coordinates premises of said reference points obtained by means of said optical coherence tomography system.
  • the present invention relates, in general, to the field of image capture systems, and in particular, to optical coherence tomography systems.
  • Optical coherence tomography (Huang, D. et al., 1991. Optical coherence tomography. Science 254: 1178-1181) is an interferometric technique that allows obtaining differences in optical path between surfaces.
  • a scanner of lateral scan of a sample allows to obtain a collection of interferograms (A-scans) that form an image of the cross-section of the sample (B-Scan).
  • a two-way scan (x and y) allows you to obtain a collection of B-scans and build a three-dimensional image of the sample.
  • the axial resolution of the technique is in the order of the myras (Povazay, B. et al. 2002. Submicrometer axial resolution optical coherence tomography.
  • Interferograms can be obtained in the temporal domain, by physically changing the length of the reference arm, or in the frequency domain: spatially (spatial frequency domain (Fercher AF et al., "Measurement of Infraocular Distances by Backscattering Spectral Interferometry.”
  • the increase in the speed of data acquisition in OCT systems (up to 150,000 A-scans / s) has allowed the capture of three-dimensional images in times less than 1 second.
  • the high axial (2-20 ym) and lateral resolution (of the order of 100 ym) give the optical coherence tomography a high potential for topographic and prophyometric surface characterization and for the measurement, in vivo, of corneal topography, among others.
  • the use of the OCT technique as a topographic technique is limited by the presence of the scanning distortion associated with the scanning system architecture (usually formed by a bi-axial mirror scanner), and which produces field distortion and astigmatism in the images.
  • the main contribution to this distortion is given by the separation of the mirrors in the scanner and the focal lens of the lens that collimates the beam on the sample, and in smaller measured, by the flatness of the mirrors and misalignment of the beam of rotation of the mirrors.
  • One of the main objectives of the present invention is to provide a method for calibration and correction of scanning distortion for the quantification of topographic data obtained with any Optical Coherence Tomography system.
  • the correction of the optical distortion is relatively simple in optical coherence tomography systems based on a single scanner, and with only two-dimensional data acquisition.
  • Westphal et al. (Correction of geometric and refractive image distortions in optical coherence tomography applying Fermat's principie, Opt. Express 10, 397-404 (2002)) provides a solution to scanning distortion in corneal OCT systems in which the scanning system is a system of non-linear scanner (resonant mirrors with non-telecentric scanning), by taking axial images around the axial position, and applied only to two-dimensional sections of the sample, and not three-dimensional images.
  • Kim et al. Automated analysis of OCT images of the crystalline lens, Proc. SPIE 7163, 716313 (2009)) use a telecentric system for the acquisition of transverse (bi-dimensional) images free of optical distortion.
  • O'hara and Meyer (US7878651) propose the use of normal beams to the cornea to obtain the refraction of the cornea, however this would not produce the intended correction of the distortion, but rather on the contrary, since you do them they have to travel very different paths.
  • Ortiz et al. (Optical coherence tomography for quantitative surface topography, Appl. Opt. 48, 6708-6715 (2009)) proposed a method for optimizing scanning distortion in a proprietary temporal domain OCT system, and three-dimensional correction of residual scanning distortion, based on the acquisition of axial images through a confocal lateral image channel incorporated in the OCT system.
  • this procedure requires the use of a confocal channel to obtain the scanning distortion.
  • Said confocal channel is not generally available in Optical Coherence Tomography instruments, so the procedure is not generally applicable.
  • These authors also provide theoretical estimates of the scanning distortion that allow predicting the scanning distortion measured experimentally, but these require precise knowledge of the optical and geometric configuration of the instrument. Theoretical estimates allow to obtain an optimized configuration that allows minimizing these distortions but not eliminating them, being necessary to perform the proposed method for residual distortions that remain in the optical lighting and light collection system.
  • the scanning distortion correction method of the present invention can be applied to obtaining surface profilometry in general, or corneal topography in particular, by using optical coherence tomography systems.
  • US7416300 has described the use of optical coherence tomography for lens and surface metrology, but does not refer to the correction of scanning distortion.
  • Various patents US7878651, US716313 and US5491524 describe corneal topographic mapping systems using optical coherence tomography, but do not refer to the correction of scanning distortion.
  • the maps are obtained from a set of cross sections acquired for a set of meridians around a rotation axis, centered on the corneal apex (similar to Scheimpflug systems, or by rotation scanning slit), limiting the lateral resolution in the radial dimension.
  • the optical coherence tomography technique once the scanning distortion has been corrected, has advantages over surface contact profilometry (for example Talysurf), including faster data acquisition and lack of contact with the sample. It also has advantages over optical profilometry based on microscopy, including a greater working distance, much faster data acquisition in wider areas and greater independence from the specular reflection properties of the sample.
  • the optical coherence tomography technique once the scanning distortion has been corrected, has advantages tailored to corneal topography in patients compared to Placido rings based corneal videokeratoscopy, usually used in clinical settings, including greater axial and lateral resolution. , in the radial dimension, and the direct acquisition of elevation data, without assumptions derived from the presence of the "skew ray". It also has advantages over Scheimpflug-based corneal topography, including faster acquisition, greater axial and lateral resolution.
  • the invention consists in a calibration procedure of any type of optical coherence tomography system.
  • the method of the present invention is intended as a calibration protocol of any optical coherence tomography system for obtaining quantitative topographic maps from the three-dimensional images of optical coherence tomography of the sample.
  • the procedure allows correction of distortion of any optical coherence tomography system, regardless of its specific optical and geometric configuration, unlike other described procedures that are limited to a particular system configuration, two-dimensional images, or assume assumptions that require knowledge prior to the system, including the arrangement of its elements, the alignment and response of the system.
  • the present invention addresses the empirical measurement of the system's scanning distortion, determining, by using a reference pattern, the distortion of the spatial coordinates of the volume of interest.
  • the present invention makes use of a reference standard, which may consist of, but is not limited to, a calibrated grid mounted on an axial linear displacer; a transparent cube with a carved three-dimensional grid, or a ladder pattern.
  • the present invention makes use of optical coherence tomography images of said reference pattern, from which the positions in the image of the reference points in the pattern are extracted, allowing to establish a correspondence between the known coordinates of the reference pattern and the measurements resulting from the optical coherence tomography instrument.
  • the correspondence will be established between discrete points of the pattern, for example nodes in a grid for each axial position or nodes in a three-dimensional grid and the positions of the points of the reference pattern in the data obtained by the optical coherence tomography system , expressed in local coordinates of the system.
  • the correspondence is generalized to any position of the volume in the region calibrated by means of the interpolation -in general nonlinear- of the data between the sampled points, by means of analytical or numerical functions with a sufficiently dense sampling of points.
  • the distorted horizontal and vertical lines of a calibration grid consisting of equally spaced nodes joined by straight lines can be adjusted to quadric functions (lateral coordinates) and axial positions of the nodes by a linear regression (director cosines).
  • the present invention establishes a mathematical transformation of coordinates between the distorted volume, in the local coordinates of the system and the actual volume of the reference pattern, or equivalently, of the magnitude of the scanning distortion for each point, in general, in angular coordinates .
  • the present invention establishes a mathematical transformation of coordinates between the distorted volume, in the local coordinates of the system and the actual volume of the reference standard.
  • the correction of the scanning distortion is done by applying the transformation to all points of any image acquired by the Optical Coherence Tomography system.
  • the procedure is applied directly to optical coherence tomography images at gray levels. These images are processed by digital algorithms for the elimination of image noise and surface segmentation.
  • the procedure is applied to previously segmented surface points.
  • the procedure is applied to analytical functions adjusted to the edges or surfaces of the image.
  • the procedure is applied to the image of any reflective surface, obtained by any optical coherence tomography system with a biaxial scan scanner.
  • the procedure is applied to the anterior corneal surface, obtained by any optical coherence tomography system with a biaxial scanning scanner of the anterior segment.
  • the procedure is applied to the entire image of the anterior segment of the eye, obtained by any optical coherence tomography system with a biaxial scanning scanner of the anterior segment.
  • the procedure is applied to the entire anterior segment image, obtained by any optical coherence tomography system with a biaxial retinal scanning scanner.
  • the present invention claims a method of calibration and correction of the scanning distortion of an optical coherence tomography system, which comprises the following phases: i) selecting a reference pattern comprising known reference points and which are described in real coordinates;
  • iii identify, in the acquired images of the reference standard, positions of some reference points described in local coordinates provided by the optical coherence tomography system and which correspond to the known reference points of phase i);
  • iv) obtain a mathematical distortion relationship that defines a transformation between the local coordinates provided by the optical coherence tomography system and real coordinates, the mathematical relationship being based on the comparison of the positions of the known reference points in the coordinates premises of phase iii) and in the actual coordinates of phase i); Y,
  • the mathematical distortion relationship described in phase iv) comprises being an interpolation of the positions of the reference points, by selected functions between analytical functions, numerical functions and a combination of both.
  • the reference pattern of phase i) is selected from any mobile two-dimensional structure with marks located in known positions and any three-dimensional structure with marks located in known positions.
  • the reference pattern of phase i) is selected from:
  • the reference points described by the local coordinates of phase iii) are joined by lines, the lines being defined by analytical functions.
  • the points identified in phase iii) of the procedure are joined with lines.
  • the analytical functions would correspond to parabolic functions since said parabolas would resemble the curves described by the lines that would join the points identified in phase iii) of the procedure.
  • scanning distortion is a type of geometric distortion.
  • the present invention it allows that once corrected said scanning distortion by means of the described procedure, other corrections can be addressed such as for example the correction of the optical distortion, said optical distortion being produced when seeing a surface through another surface.
  • Figure la.- Shows an integrated image of a grid as a reference pattern.
  • Figure Ib Shows the grid of the figure with the nodes marked.
  • Figure le- Shows the grid of Figure 1 with the nodes and the estimation of the real lateral coordinates marked.
  • Figure 2a Shows the difference between the actual topography (measured by profilometry) of a spherical surface and the OCT-based topography without correction of the optical distortion.
  • Figure 2b Shows the difference between the actual topography (measured by profilometry) of a spherical surface and the OCT-based topography after the correction of the geometric distortion.
  • Figure 3a Shows a topographic map of the anterior aspect of the cornea of a patient obtained by OCT before applying the scanning distortion correction.
  • Figure 3b Shows a topographic map of the anterior aspect of the cornea of a patient obtained by OCT after applying the scanning distortion correction.
  • the procedure has been applied to OCT images obtained by a non-commercial anterior chamber spectral Optical Coherence Tomograph in a research laboratory.
  • the device used includes a system of x-y scanners (8 mm aperture and separation between centers of 13.6 mm mirrors) and a 75 mm collimator-focusing lens.
  • the light source is a superluminescent diode (840 nm, 50 nm spectral width).
  • the delay line consists of a spectrometer with a diffraction network and a CMOS camera.
  • the acquisition rate is 25,000 scans (interferograms per second).
  • FIG. 1 (3) Acquisition of 3D volumes of the calibration grid placed in the position of the sample (object space), and in different axial positions around said position, in a range of 7 mm and 0.5 mm steps.
  • Figures la, Ib and show the images of the grid used for calibration of the scanning distortion in the present embodiments.
  • the figure shows the calibration grid used, Figure Ib shows that same grid with the known nodes identified by white dots.
  • the figure shows the grid with the identified nodes and the displacement of said nodes due to the scanning distortion.
  • the scanning distortion has produced a displacement of the nodes, said displacement being represented by the lines that start from the original positions of the nodes to the position in which they remain after taking images in the object space of the optical coherence tomography system;
  • the measured scan distortion is 24 pixels (86 um) in the horizontal direction and 7 pixels (24 um) in the vertical direction for a scanner angular range between -7.5 and 7.5 degrees .
  • the procedure was applied on three-dimensional data of a spherical surface of PMMA (Polymethylmethacrylate) and a cornea of a patient.
  • Image processing routines were used for noise elimination and surface segmentation.
  • the procedure is used for each point on the surface detected in the three-dimensional image.
  • the images were acquired over an area of 10 x 10 mm, with a density of 200 x 200 A scans for the case of the spherical surface d PMMA, and 10 x 12 mm, with a density of 120x50 A-scans for e case of the patient's cornea.
  • the PMMA surface consisted of an aspherical surface treated with a refractive surgery laser (myopic ablation pattern) which altered the shape of the surface increasing its corneal asphericity.
  • a refractive surgery laser myopic ablation pattern
  • surface topography was evaluated with a non-contact profilometer based on confocal microscopy (PLy, Sensofar).
  • Figure 2a shows the map of difference between the surface and the adjustment of the profilometric profile before calibration
  • Figure 2b shows the map of difference between the surface and the adjustment of the profilometric profile after the application of the calibration procedure of the invention.
  • the patient measured was a normal young subject.
  • the subject fixes the view in a stimulus that allows aligning the keratometric pupillary axis with the optical axis of the instrument.
  • the acquisition time of the OCT image is 0.72 seconds.
  • the procedure described in the invention, with the parameters detailed in the application example was applied to the three-dimensional image of OCT acquired from the anterior corneal face.
  • Topographic data were adjusted to biconic surfaces and Zernike polynomials of order 8.
  • the correction of the scanning distortion decreased the surface asymmetry by 5.7% (radius of curvature) and 9.5% (asphericality).
  • the radius of apical curvature of the cornea before and after correction was 7.38 and 7.59 mm respectively, and the asphericity -0.38 and -0.42, respectively.
  • Figure 3a shows the topographic map of the anterior aspect of the cornea (adjustment to Zernike polynomials) of a patient obtained by OCT before applying the correction of the scanning distortion
  • Figure 3b shows said topographic map of the anterior face of the cornea after applying the correction of the distortion of scanning, in both cases, previous subtraction of the best sphere.

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Abstract

Procedimiento de calibración y corrección de la distorsión de barrido de cualquier sistema de tomografía de coherencia óptica, mediante el uso de patrones de referencia y la obtención de relaciones matemáticas entre las posiciones de los puntos de referencia en un patrón de referencia y las coordenadas locales de dichos puntos de referencia obtenidas mediante el citado sistema de tomografía de coherencia óptica.

Description

PROCEDIMIENTO DE CALIBRACIÓN Y CORRECCIÓN DE LA DISTORSIÓN DE BARRIDO DE UN SISTEMA DE TOMOGRAFIA DE
COHERENCIA ÓPTICA OBJETO DE LA INVENCIÓN
La presente invención, tal y como se expresa en el enunciado de esta memoria descriptiva se refiere a un procedimiento de calibración y corrección de la distorsión de barrido de sistemas de tomografia de coherencia óptica.
La presente invención supone una mejora de la técnica de tomografia de coherencia óptica, en cuanto a que la aplicación del procedimiento descrito en la invención permite la obtención de una topografía cuantitativa bidimensional y tridimensional de superficies a partir de imágenes de tomografia de coherencia óptica. El procedimiento es aplicable a cualquier sistema de tomografia de coherencia óptica cuyo sistema de barrido esté basado en un sistema de escáner de dos ejes.
La presente invención supone una mejora del estado de la técnica, al permitir la cuantificación de imágenes obtenidas mediante técnicas de tomografia de coherencia óptica, y la obtención de mapas topográficos de superficies en general, y de superficies oculares en particular, con ventajas sobre técnicas alternativas existentes .
En consecuencia, el objetivo de la presente invención es proporcionar un procedimiento para la corrección de la distorsión de cualquier sistema de tomografia de coherencia óptica, mediante el uso de patrones de referencia y la obtención de relaciones matemáticas entre las posiciones de los puntos de referencia en un patrón de referencia y las coordenadas locales de dichos puntos de referencia obtenidas mediante el citado sistema de tomografia de coherencia óptica.
La presente invención se refiere, en general, al campo de los sistemas de captura de imágenes, y en particular, a los sistemas de tomografia de coherencia óptica .
ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN
La tomografia de coherencia óptica, OCT, (Huang, D. et al., 1991. Optical coherence tomography. Science 254:1178-1181) es una técnica interferométrica que permite obtener las diferencias de camino óptico entre superficies. Un escáner de barrido lateral de una muestra permite obtener una colección de interferogramas (A-scans) que forman una imagen de la sección transversal de la muestra (B-Scan) . Un barrido en dos direcciones (x e y) permite obtener una colección de B-scans y construir una imagen tridimensional de la muestra. La resolución axial de la técnica se encuentra en el orden de las mieras (Povazay, B. et al. 2002. Submicrometer axial resolution optical coherence tomography. Opt . Lett. 27:1800) y viene determinada por el ancho de banda espectral de la fuente (típicamente se utilizan diodos superluminiscentes , aunque en también se utilizan láseres de femtosegundos o fuentes de barrido) . Los interferogramas se pueden obtener en el dominio temporal, cambiando físicamente la longitud del brazo de referencia, o en el dominio de frecuencias: espacialmente (dominio frecuencial espacial (Fercher A. F. et al., "Measurement of Infraocular Distances by Backscattering Spectral Interferometry . " Optics Communications
1995,117:43-48)) o temporalmente (dominio frecuencial temporal (Chinn, S.R. et al. (1997). Optical coherence tomography using a frequency-tunable optical source. Opt. Lett., 22, 340-342)) codificadas mediante un espectrómetro o barriendo la frecuencia de la fuente.
El aumento de la velocidad de adquisición de datos en los sistemas OCT (de hasta 150.000 A-scans/s) ha permitido la captura de imágenes tridimensionales en tiempos inferiores a 1 segundo. La alta resolución axial (2-20 ym) y lateral (del orden de 100 ym) confiere a la tomografia de coherencia óptica un alto potencial para la caracterización topográfica y profilométrica de superficies y para la medida, in vivo, de la topografía corneal, entre otros.
En el estado actual de la técnica (relativo a las técnicas de tomografia de coherencia óptica, a los sistemas de topografía de superficies oculares, y a las técnicas de profilometría de superficies en general basadas en otros métodos) existe la necesidad de cuantificar los sistemas de topografía de coherencia óptica para mejorar la biometría ocular que se obtiene mediante estos sistemas, y conseguir así un nuevo y ventajoso procedimiento asociado al uso de profilometría basada en tomografia de coherencia óptica. Además, existe la necesidad de un procedimiento general de calibración de sistemas de tomografia de coherencia óptica, con el fin de mejorar la información cuantitativa que se obtiene de estos sistemas. En general, el uso de la técnica de OCT como técnica topográfica viene limitada por la presencia de la distorsión de barrido asociada a la arquitectura del sistema de barrido (generalmente formada por un escáner de espejos bi-axial) , y que produce distorsión de campo y astigmatismo en las imágenes. La principal contribución a dicha distorsión viene dada por la separación de los espejos en el escáner y la focal de la lente que colima el haz sobre la muestra, y en menor medida, por la planitud de los espejos y desalineamiento del haz de rotación de los espejos.
Hasta el momento, no existe ningún método general para la calibración y corrección de la distorsión de barrido aplicable a cualquier sistema de tomografia de coherencia óptica, sin conocimiento previo de la configuración óptica y mecánica del sistema. La ausencia de calibración y corrección de la distorsión de barrido ha impedido la generalización del uso cuantitativo de los sistemas de tomografia de coherencia óptica, o la correcta interpretación de datos topográficos. Uno de los objetivos principales de la presente invención es proporcionar un método para la calibración y corrección de la distorsión de barrido para la cuantificación de los datos topográficos obtenidos con cualquier sistema de Tomografia de Coherencia Óptica. La corrección de la distorsión óptica es relativamente sencilla en sistemas de tomografia de coherencia óptica basados en un solo escáner, y con adquisición únicamente bidimensional de los datos. Sin embargo, en sistemas de dos escáneres, con adquisición tridimensional de datos, la distorsión es compleja, al ser no lineal, con dependencias entre las posiciones laterales y axiales, y dependiente de la configuración óptica y geométrica de cada equipo. Esta complejidad ha impedido la obtención general de datos topográficos tridimensionales cuantitativos.
Existen en el mercado varios sistemas de tomografia de coherencia óptica del segmento anterior del ojo. Estos sistemas proporcionan datos biométricos cuantitativos, generalmente en la dirección axial. Sin embargo, no se tiene constancia de la corrección de la distorsión de barrido en estos sistemas comerciales. De hecho, uno de los sistemas comerciales más extendidos (Visante, Zeiss) ha incorporado un sistema de topografía corneal de cara anterior basado en anillos de Placido, a pesar de disponer de datos tridimensionales de elevación corneal. Algunos autores proporcionan configuraciones de barrido alternativas que minimizan la distorsión de barrido dependiendo de la configuración de espejos del mismo (Chinn, et al (1997) . Optical coherence tomography using a frequency-tunable optical source. Opt . Lett., 22, 340- 342), o en sistemas de escáneres orientados a maquinas de corte (Ireneusz Grulkowski et al "Anterior segment imaging with Spectral OCT system using a high-speed CMOS camera," Opt. Express 17, 4842-4858 (2009)). Sin embargo, estos sistemas siempre dejan distorsiones residuales que deben de ser corregidas para poder obtener las coordenadas tridimensionales de cada punto de una superficie.
Westphal et al. (Correction of geometric and refractive image distortions in optical coherence tomography applying Fermat's principie, Opt. Express 10, 397-404 (2002)) proporciona una solución a la distorsión de barrido en sistemas de OCT corneal en que el sistema de barrido es un sistema de escáner no lineal (espejos resonantes con barrido no telecéntrico) , mediante la toma de imágenes axialmente alrededor de la posición axial, y aplicado únicamente a secciones bi-dimensionales de la muestra, y no imágenes tridimensionales. Kim et al. (Automated analysis of OCT images of the crystalline lens, Proc. SPIE 7163, 716313 (2009)) utilizan un sistema telecéntrico para la adquisición de imágenes transversales (bi-dimensionales) libres de distorsión óptica. O'hara y Meyer (US7878651) proponen el uso de haces normales a la cornea para la obtención de la refracción de la cornea, sin embargo esto no produciría la pretendida corrección de la distorsión, si no más bien al contrario, dado que los haces tienen que recorrer caminos muy diferentes.
Ortiz et al. (Optical coherence tomography for quantitative surface topography, Appl. Opt . 48, 6708-6715 (2009)) propusieron un método para la optimización de la distorsión de barrido en un sistema propio de OCT de dominio temporal, y la corrección tri-dimensional de la distorsión de barrido residual, basado en la adquisición de imágenes axiales mediante un canal de imagen lateral confocal incorporado en el sistema de OCT. Sin embargo, este procedimiento requiere el uso de un canal confocal para la obtención de la distorsión de barrido. Dicho canal confocal no está disponible en general en instrumentos de Tomografia de Coherencia Óptica, por lo cual el procedimiento no es aplicable de manera general. Estos autores proporcionan además estimaciones teóricas de la distorsión de barrido que permiten predecir la distorsión de barrido medida experimentalmente, pero éstas exigen conocimiento preciso de la configuración óptica y geométrica del instrumento. Las estimaciones teóricas permiten obtener una configuración optimizada que permite minimizar estas distorsiones pero no eliminarlas, siendo necesario realizar el método propuesto para las distorsiones residuales que permanecen en el sistema óptico de iluminación y recolección de luz.
El método de corrección de distorsión de barrido de la presente invención se puede aplicar a la obtención de profilometria de superficies en general, o a la topografía corneal en particular, mediante el uso de sistemas de tomografia de coherencia óptica.
La patente US7416300 ha descrito el uso de tomografia de coherencia óptica para la metrología de lentes y superficies, pero no alude a la corrección de la distorsión de barrido. Varias patentes US7878651, US716313 y US5491524 describen sistemas de mapeo topográfico corneal mediante tomografia de coherencia óptica, pero no aluden a la corrección de la distorsión de barrido. Generalmente, en estos estudios los mapas se obtienen a partir de un conjunto de secciones transversales adquiridas para un conjunto de meridianos alrededor de un eje de rotación, centrado en el ápex corneal (de manera similar a los sistemas de Scheimpflug, o de barrido por rotación de rendija), limitando la resolución lateral en la dimensión radial.
La técnica de tomografia de coherencia óptica, una vez corregida la distorsión de barrido, presenta ventajas frente a la profilometria de contacto de superficies (por ejemplo Talysurf) , incluyendo una mayor rapidez de adquisición de datos y la ausencia de contacto con la muestra. También presenta ventajas frente a la profilometria óptica basada en microscopía, incluyendo una mayor distancia de trabajo, mucha mayor rapidez de adquisición de datos en áreas más amplias y mayor independencia de las propiedades de reflexión especular de la muestra. La técnica de tomografia de coherencia óptica, una vez corregida la distorsión de barrido, presenta ventajas a la medida de la topografía corneal en pacientes frente a la videoqueratoscopía corneal basada en anillos de Placido, habitualmente utilizada en clínica, incluyendo una mayor resolución axial y lateral, en la dimensión radial, y la adquisición directa de datos de elevación, sin suposiciones derivadas de la presencia del "skew ray". También presenta ventajas frente a la topografía corneal basada en Scheimpflug, incluyendo una mayor rapidez de aquisición, mayor resolución axial y lateral .
DESCRIPCIÓN DE LA INVENCIÓN Para lograr los objetivos y evitar los inconvenientes indicados anteriormente, la invención consiste en un procedimiento de calibración de cualquier tipo de sistema de tomografia de coherencia óptica.
El procedimiento de la presente invención se plantea como un protocolo de calibración de cualquier sistema de tomografia de coherencia óptica para la obtención de mapas topográficos cuantitativos a partir de las imágenes tridimensionales de tomografia de coherencia óptica de la muestra. El procedimiento permite corregir de distorsión de cualquier sistema de tomografia de coherencia óptica, independientemente de su configuración óptica y geométrica especifica, a diferencia de otros procedimientos descritos que se limitan a una configuración particular del sistema, a imágenes bidimensionales, o asumen hipótesis que exigen conocimiento previo del sistema, incluyendo la disposición de sus elementos, el alineamiento y respuesta del sistema. La presente invención aborda la medida empírica de la distorsión de barrido del sistema, determinando, mediante el uso de un patrón de referencia, la distorsión de las coordenadas espaciales del volumen de interés.
La presente invención hace uso de un patrón de referencia, que puede consistir en, aunque no está limitado a, una rejilla calibrada montada sobre un desplazador lineal axial; un cubo transparente con una rejilla tridimensional tallada, o un patrón en escalera.
La presente invención hace uso de imágenes de tomografia de coherencia óptica de dicho patrón de referencia, de donde se extraen las posiciones en la imagen de los puntos de referencia en el patrón, permitiendo establecer una correspondencia entre las coordenadas conocidas del patrón de referencia y las medidas resultantes del instrumento de tomografía de coherencia óptica.
En general, la correspondencia se establecerá entre puntos discretos del patrón, por ejemplo nodos en una rejilla para cada posición axial o nodos en una rejilla tridimensional y las posiciones de los puntos del patrón referencia en los datos obtenidos por el sistema de tomografia de coherencia óptica, expresadas en coordenadas locales del sistema. La correspondencia se generaliza a cualquier posición del volumen en la región calibrada mediante la interpolación -en general no lineal- de los datos entre los puntos muestreados, mediante funciones analíticas o numéricas con un muestreo de puntos suficientemente denso. Por ejemplo, las líneas horizontales y verticales distorsionadas de una rejilla de calibración constituida por nodos equiespaciados unidos por líneas rectas se pueden ajusfar a funciones cuádricas (coordenadas laterales) y las posiciones axiales de los nodos mediante una regresión lineal (cosenos directores) . Dichas funciones analíticas permiten representar la posición de cualquier punto del volumen distorsionado en coordenadas locales. La presente invención establece una transformación matemática de coordenadas entre el volumen distorsionado, en las coordenadas locales del sistema y el volumen real del patrón de referencia, o equivalentemente, de la magnitud de la distorsión de barrido para cada punto, en general, en coordenadas angulares. La presente invención establece una transformación matemática de coordenadas entre el volumen distorsionado, en las coordenadas locales del sistema y el volumen real del patrón de referencia. La corrección de la distorsión de barrido se realiza mediante la aplicación de la transformación a todos los puntos de una imagen cualquiera adquirida por el sistema de Tomografia de Coherencia Óptica.
En una modalidad de la invención el procedimiento se aplica directamente a imágenes de tomografia de coherencia óptica en niveles de gris. Estas imágenes se procesan mediante algoritmos digitales para la eliminación del ruido de la imagen y segmentación de superficies .
En otra modalidad de la invención el procedimiento se aplica a puntos de la superficie previamente segmentados .
En otra modalidad de la invención el procedimiento se aplica a funciones analíticas ajustadas a los bordes o superficies de la imagen.
En una modalidad de la invención el procedimiento se aplica a la imagen de cualquier superficie reflectante, obtenida mediante cualquier sistema tomografía de coherencia óptica con escáner de barrido biaxial.
En otra modalidad de la invención el procedimiento se aplica a la superficie anterior corneal, obtenida mediante cualquier sistema tomografía de coherencia óptica con escáner de barrido biaxial de segmento anterior .
En otra modalidad de la invención el procedimiento se aplica a toda la imagen de segmento anterior del ojo, obtenida mediante cualquier sistema tomografía de coherencia óptica con escáner de barrido biaxial de segmento anterior.
En otra modalidad de la invención el procedimiento se aplica a toda la imagen de segmento anterior, obtenida mediante cualquier sistema tomografía de coherencia óptica con escáner de barrido biaxial de retina.
Así pues, la presente invención reivindica un procedimiento de calibración y corrección de la distorsión de barrido de un sistema de tomografia de coherencia óptica, que comprende las siguientes fases: i) seleccionar un patrón de referencia que comprende unos puntos de referencia conocidos y que están descritos en unas coordenadas reales;
ii) adquirir imágenes del patrón de referencia seleccionado en la fase i) , estando situado el patrón de referencia en un espacio objeto del sistema de tomografia de coherencia óptica, mediante el sistema de tomografia de coherencia óptica;
iii) identificar, en las imágenes adquiridas del patrón de referencia, unas posiciones de unos puntos de referencia descritas en unas coordenadas locales proporcionadas por el sistema de tomografia de coherencia óptica y que se corresponden a los puntos de referencia conocidos de la fase i) ;
iv) obtener una relación matemática de distorsión que define una transformación entre las coordenadas locales proporcionadas por el sistema de tomografia de coherencia óptica y unas coordenadas reales, estando basada la relación matemática en la comparación de las posiciones de los puntos de referencia conocidos en las coordenadas locales de la fase iii) y en las coordenadas reales de la fase i); y,
v) corregir la distorsión mediante la aplicación de la relación matemática de distorsión obtenida en la fase iv) a los datos obtenidos por el sistema de tomografia de coherencia óptica.
En una realización preferente de la invención la relación matemática de distorsión descrita en la fase iv) comprende ser una interpolación de las posiciones de los puntos de referencia, mediante funciones seleccionadas entre funciones analíticas, funciones numéricas y una combinación de ambas.
En otra realización de la invención, el patrón de referencia de la fase i) está seleccionado entre cualquier estructura bidimensional móvil con marcas localizadas en posiciones conocidas y cualquier estructura tridimensional con marcas localizadas en posiciones conocidas.
En otra realización de la invención el patrón de referencia de la fase i) está seleccionado entre:
• una rejilla de calibración tridimensional, y los puntos de referencia conocidos son los nodos de la rejilla de calibración tridimensional;
• una rejilla de calibración bidimensional montada sobre una etapa lineal de desplazamiento calibrada, y los puntos de referencia conocidos son los nodos de la rejilla de calibración en distintas posiciones axiales ;
• un cubo con una rejilla de calibración tridimensional tallada, y los puntos de referencia conocidos son los nodos de la rejilla de calibración tridimensional; y,
• un patrón en escalera, y los puntos de referencia conocidos son las transiciones abruptas en profundidad entre escalones.
En otra realización de la invención, los puntos de referencia descritos mediante las coordenadas locales de la fase iii) se unen mediante líneas, estando la líneas definidas por funciones analíticas. Para llevar a cabo la calibración del sistema, los puntos identificados en la fase iii) del procedimiento se unen con líneas. Como debido a la distorsión de barrido las líneas que los unen, en cualquiera de los tres ejes del espacio, no son rectas sino curvas, para definir dichas rectas, se emplean funciones analíticas convencionales. Por ejemplo en una realización particular, las funciones analíticas corresponderían con funciones parabólicas ya que dichas parábolas se asemejarían a las curvas descritas por las líneas que unirían los puntos identificados en la fase iii) del procedimiento.
Además, se ha previsto el uso del procedimiento descrito en la presente memoria para la obtención de datos calibrados y corregidos de distorsión de barrido con el sistema de tomografía de coherencia óptica seleccionados entre:
datos de secciones bidimensionales ;
- datos de volúmenes tridimensionales;
- datos de topografías corneales;
- datos de topografías de la retina;
- datos de superficies internas de un ojo en combinación con una compensación de una distorsión óptica y de refracción;
- datos de imagen de segmento anterior del ojo;
- datos de imagen de las capas de la retina;
- datos de señales obtenidas en un fotodetector del sistema de tomografía de coherencia óptica;
- datos de imágenes y volúmenes en intensidad;
- datos de mapas de puntos correspondientes a unos bordes previamente extraídos de una imagen de tomografía de coherencia óptica; y,
- datos de superficies ajustadas a unos bordes previamente extraídos de una imagen de tomografía de coherencia óptica.
No obstante existen otros muchos usos posibles de la presente invención en diversos campos de la ciencia no especificados en la presente memoria descriptiva.
Nótese que la distorsión de barrido es un tipo de distorsión geométrica. Además la presente invención permite el que una vez corregida dicha distorsión de barrido mediante el procedimiento descrito, se puedan abordar otro tipo de correcciones como por ejemplo la corrección de la distorsión óptica, siendo dicha distorsión óptica la producida al ver una superficie a través de otra superficie.
BREVE DESCRIPCIÓN DE LAS FIGURAS
Figura la.- Muestra una imagen integrada de una rejilla como patrón de referencia.
Figura Ib.- Muestra la rejilla de la figura con los nodos marcados.
Figura le- Muestra la rejilla de la figura 1 con los nodos y la estimación de las coordenadas laterales reales marcada.
Figura 2a.- Muestra la diferencia entre la topografía real (medida mediante profilometría) de una superficie esférica y la topografía basada en OCT sin corrección de la distorsión óptica.
Figura 2b.- Muestra la diferencia entre la topografía real (medida mediante profilometría) de una superficie esférica y la topografía basada en OCT tras la corrección de la distorsión geométrica.
Figura 3a.- Muestra un mapa topográfico de la cara anterior de la cornea de un paciente obtenido mediante OCT antes de aplicar la corrección de distorsión de barrido .
Figura 3b.- Muestra un mapa topográfico de la cara anterior de la cornea de un paciente obtenido mediante OCT después de aplicar la corrección de distorsión de barrido.
DESCRIPCIÓN DE VARIOS EJEMPLOS DE REALIZACIÓN DE LA
INVENCIÓN
Seguidamente se realiza, con carácter ilustrativo y no limitativo, una descripción de varios ejemplos de realización de la invención, haciendo referencia a la numeración adoptada en las figuras.
Asi pues a modo de ejemplo de realización, se describe a continuación un procedimiento preferido de calibración de un sistema de tomografia de coherencia óptica y su aplicación a la medida de una superficie de plástico y una córnea de un paciente.
El procedimiento se ha aplicado a las imágenes de OCT obtenidas mediante un Tomógrafo de Coherencia Óptica espectral de cámara anterior no comercial en un laboratorio de investigación. El dispositivo empleado incluye un sistema de escáneres x-y (8 mm de apertura y separación entre centros de los espejos de 13.6 mm) y una lente colimadora-focalizadora de 75 mm. La fuente de iluminación es un diodo superluminiscente (840 nm, 50 nm ancho espectral) . La linea de retardo está constituida por un espectrómetro con una red de difracción y una cámara CMOS. La velocidad de adquisición es de 25.000 A- scans ( interferogramas por segundo) .
El procedimiento descrito en la invención se aplicó siguiendo las siguientes etapas:
(1) Fabricación de un patrón de referencia, consistente en una superficie opaca plana reflectante con interlineado conocido impreso o grabado, y en particular en una malla o rejilla de calibración milimetrada impresa en papel blanco con tinta negra;
(2) Desplazamiento manual o motorizado con graduación, sobre la que se coloca dicha rejilla de calibración;
(3) Adquisición de volúmenes en 3D de la rejilla de calibración colocada en la posición de la muestra (espacio objeto), y en distintas posiciones axiales alrededor de dicha posición, en un rango de 7 mm y pasos de 0.5 mm. Las Figura la, Ib y le muestran las imágenes de la rejilla utilizada para la calibración de la distorsión de barrido en el os presentes ejemplos de realización. La figura la muestra la rejilla de calibración empleada, la figura Ib muestra esa misma rejilla con los nodos conocidos identificados por puntos blancos. La figura le muestra la rejilla con los nodos identificados y el desplazamiento de dichos nodos debido a la distorsión de barrido. Como se ve de estas figuras la distorsión de barrido ha producido un desplazamiento de los nodos, estando dicho desplazamiento representado por las lineas que parten de las posiciones originales de los nodos hasta la posición en la que quedan tras la toma de imágenes en el espacio objeto del sistema de tomografia de coherencia óptica;
(4) Obtención de imágenes bidimensionales integradas de la rejilla de calibración, para cada posición axial, a partir de la suma de la señal de cada A-scan;
(5) Eliminación del ruido de barrido de la imagen mediante filtros digitales;
(6) Extracción de los bordes de las lineas de la rejilla mediante procedimientos de análisis de imagen, en particular una transformada de Hough;
(7) Ajuste a funciones cuádricas de las lineas horizontales y verticales extraídas;
(8) Obtención de los puntos de intersección de las curvas horizontales y verticales y etiquetado de dichos nodos, para cada imagen de rejilla adquirida en una posición axial diferente. Por lo tanto, para cada nodo se obtiene un conjunto de puntos tridimensionales expresados en las coordenadas locales del dispositivo, como por ejemplo pixeles en las imágenes tridimensionales;
(9) Obtención de un factor de calibración entre coordenadas locales del dispositivo (calculadas según el paso 8) y coordenadas euclídeas. La coordinada axial euclídea se obtiene a partir de las posiciones axiales de los desplazamientos lineales;
(10) Obtención de funciones analíticas que representan las posiciones de cualquier punto de la imagen de la rejilla de calibración mediante interpolación bicúbica entre las posiciones estimadas de los nodos (coordenadas laterales) y mediante una regresión lineal de las posiciones axiales de los nodos (cosenos directores) ;
(11) Obtención de las funciones de transformación entre las coordenadas reales y las coordenadas de la imagen, o equivalentemente, de la magnitud de distorsión de barrido obtenida para cada punto, en coordenadas angulares ; y,
(12) Corrección de la distorsión de un punto genérico que se lleva a cabo mediante la aplicación de la función de transformación de coordenadas a cada punto de la imagen de una superficie obtenida mediante el sistema de tomografía de coherencia óptica. La magnitud de distorsión de barrido para cada punto se sustrae (en coordenadas angulares) de la diferencia de camino óptico obtenida como señal de OCT para cada punto de la superficie detectada para obtener la posición actual de la superficie sin distorsión.
Para el sistema de OCT usado en el ejemplo, la distorsión de barrido medida es de 24 píxeles (86 um) en la dirección horizontal y 7 píxeles (24 um) en la dirección vertical para un rango angular del escáner entre -7.5 y 7.5 grados.
En la aplicación del ejemplo descrito, el procedimiento se aplicó sobre datos tridimensionales de una superficie esférica de PMMA (Polimetilmetacrilato) y de una cornea de un paciente. Se utilizaron rutinas de procesado de imagen para la eliminación de ruido y segmentación de las superficies. El procedimiento se utiliza para cada punto de la superficie detectado en la imagen tridimensional. Las imágenes se adquirieron sobre una zona de 10 x 10 mm, con una densidad de 200 x 200 A- scans para el caso de la superficie esférica d PMMA, y de 10 x 12 mm, con una densidad de 120x50 A-scans para e caso de la córnea del paciente.
La superficie de PMMA consistía en una superficie asférica tratada con un láser de cirugía refractiva (patrón de ablación miópico) lo que alteró la forma de la superficie incrementando su asfericidad corneal. Como referencia, la topografía de la superficie se evaluó con un profilómetro de no contacto basado en microscopía confocal (PLy, Sensofar) .
El procedimiento descrito en la invención, con los parámetros detallados en el ejemplo de aplicación, se aplicó sobre la imagen tridimensional de OCT adquirida sobre esta superficie. Los datos topográficos (del profilómetro y de OCT, datos brutos, y tras calibración/corrección de la distorsión de barrido) se ajustaron a funciones bicónicas (caracterizadas por el radio de curvatura y la asfericidad) y a polinomios de Zernike de orden 8. La discrepancia en el radio de curvatura ajustado a la superficie de OCT sin calibrar ni corregir con respecto al ajuste del perfil profilométrico de no contacto fue de 4.6%, mientras que la discrepancia tras la calibración fue de 1.6%. La discrepancia en la asfericidad disminuyó de 130% al 5%. La Figura 2a muestra el mapa de diferencia entre la superficie y el ajuste del perfil profilométrico antes de la calibración y la figura 2b muestra el mapa de diferencia entre la superficie y el ajuste del perfil profilométrico después de la aplicación del procedimiento de calibración de la invención. Para el otro ejemplo de realización en el que se aplicaba el procedimiento objeto de la invención sobre la córnea de un ser humano, el paciente medido era un sujeto joven normal. El sujeto fija la vista en un estimulo que permite alinear el eje pupilar keratométrico con el eje óptico del instrumento. El tiempo de adquisición de la imagen de OCT es de 0.72 segundos. El procedimiento descrito en la invención, con los parámetros detallados en el ejemplo de aplicación, se aplicaron sobre la imagen tridimensional de OCT adquirida de la cara anterior corneal. Los datos topográficos se ajustaron a superficies bicónicas y a polinomios de Zernike de orden 8. La corrección de la distorsión de barrido disminuyó la asimetría de la superficie en 5.7 % (radio de curvatura) y 9.5 % (asfericidad) . El radio de curvatura apical de la cornea antes y después de la corrección fue 7.38 y 7.59 mm respectivamente, y la asfericidad -0.38 y -0.42, respectivamente. La Figura 3a muestra el mapa topográfico de la cara anterior de la córnea (ajuste a polinomios de Zernike) de un paciente obtenido mediante OCT antes de aplicar la corrección de la distorsión de barrido y la figura 3b muestra dicho mapa topográfico de la cara anterior de la córnea tras aplicar la corrección de la distorsión de barrido, en ambos casos, previa sustracción de la mejor esfera.

Claims

REIVINDICACIONES
1.- Procedimiento de calibración y corrección de la distorsión de barrido de un sistema de tomografia de coherencia óptica, caracterizado porque comprende las siguientes fases:
i) seleccionar un patrón de referencia que comprende unos puntos de referencia conocidos y que están descritos en unas coordenadas reales;
ii) adquirir imágenes del patrón de referencia seleccionado en la fase i) , estando situado el patrón de referencia en un espacio objeto del sistema de tomografia de coherencia óptica, mediante el sistema de tomografia de coherencia óptica;
iii) identificar, en las imágenes adquiridas del patrón de referencia, unas posiciones de unos puntos de referencia descritas en unas coordenadas locales proporcionadas por el sistema de tomografia de coherencia óptica y que se corresponden a los puntos de referencia conocidos de la fase i) ;
iv) obtener una relación matemática de distorsión que define una transformación entre las coordenadas locales proporcionadas por el sistema de tomografia de coherencia óptica y unas coordenadas reales, estando basada la relación matemática en la comparación de las posiciones de los puntos de referencia conocidos en las coordenadas locales de la fase iii) y en las coordenadas reales de la fase i) ; y,
v) corregir la distorsión mediante la aplicación de la relación matemática de distorsión obtenida en la fase iv) a los datos obtenidos por el sistema de tomografia de coherencia óptica.
2.- Procedimiento de calibración y corrección de la distorsión de barrido de un sistema de tomografia de coherencia óptica, según la reivindicación 1, caracterizado porque la relación matemática de distorsión de la fase iv) comprende ser una interpolación de las posiciones de los puntos de referencia, mediante funciones seleccionadas entre funciones analíticas, funciones numéricas y una combinación de ambas.
3.- Procedimiento de calibración y corrección de la distorsión de barrido de un sistema de tomografia de coherencia óptica, según la reivindicación 1, caracterizado porque el patrón de referencia de la fase i) está seleccionado entre cualquier estructura bidimensional móvil con marcas localizadas en posiciones conocidas y cualquier estructura tridimensional con marcas localizadas en posiciones conocidas.
4.- Procedimiento de calibración y corrección de la distorsión de barrido de un sistema de tomografia de coherencia óptica, según la reivindicación 1, caracterizado porque el patrón de referencia de la fase i) está seleccionado entre:
• una rejilla de calibración tridimensional, y los puntos de referencia conocidos son los nodos de la rejilla de calibración tridimensional;
• una rejilla de calibración bidimensional montada sobre una etapa lineal de desplazamiento calibrada, y los puntos de referencia conocidos son los nodos de la rejilla de calibración en distintas posiciones axiales ;
• un cubo con una rejilla de calibración tridimensional tallada, y los puntos de referencia conocidos son los nodos de la rejilla de calibración tridimensional; y,
• un patrón en escalera y los puntos de referencia conocidos son las transiciones abruptas en profundidad entre escalones.
5.- Procedimiento de calibración y corrección de la distorsión de barrido de un sistema de tomografia de coherencia óptica, según la reivindicación 1, caracterizado porque los puntos de referencia descritos mediante las coordenadas locales de la fase iii) se unen mediante lineas, estando la lineas definidas por funciones analíticas.
6.- Uso del procedimiento descrito en las reivindicaciones 1 a 5 para la obtención de datos calibrados y corregidos de distorsión de barrido con el sistema de tomografia de coherencia óptica seleccionados entre :
- datos de secciones bidimensionales ;
- datos de volúmenes tridimensionales;
- datos de topografías corneales;
- datos de topografías de la retina;
- datos de superficies internas de un ojo en combinación con una compensación de una distorsión óptica y de refracción;
- datos de imagen de segmento anterior del ojo;
- datos de imagen de las capas de la retina;
- datos de señales obtenidas en un fotodetector del sistema de tomografia de coherencia óptica;
- datos de imágenes y volúmenes en intensidad;
- datos de mapas de puntos correspondientes a unos bordes previamente extraídos de una imagen de tomografia de coherencia óptica; y, - datos de superficies ajustadas a unos bordes previamente extraídos de una imagen de tomografia de coherencia óptica.
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