WO2012140304A2 - Cepas de trichoderma útiles para el tratamiento y/o prevención de infecciones provocadas por microorganismos fitopatógenos - Google Patents

Cepas de trichoderma útiles para el tratamiento y/o prevención de infecciones provocadas por microorganismos fitopatógenos Download PDF

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Alfonso CARRERAS EGAÑA
Raquel VALDERRAMA RODRÍGUEZ
Mounira CHAKI
Juan Carlos BEGARA MORALES
Jesús MERCADO BLANCO
Encarnación PÉREZ ARTÉS
Ana María RINCÓN ROMERO
Antonio CARBALLO CODÓN
Tahía BENÍTEZ FERNÁNDEZ
Antonio VALVERDE CORREDOR
Felipe GUEVARA PEZOA
María Jesús RODRÍGUEZ PALERO
Rafael DUEÑAS SÁNCHEZ
Jesús FIERRO RISCO
Antonio Alejandro LÓPEZ GARCÍA
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    • A01N63/00Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing microorganisms, viruses, microbial fungi, animals or substances produced by, or obtained from, microorganisms, viruses, microbial fungi or animals, e.g. enzymes or fermentates
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    • C12R2001/645Fungi ; Processes using fungi
    • C12R2001/885Trichoderma

Definitions

  • the present invention falls within the field of agriculture, microbiology and phytosanitary products, and specifically refers to new fungal strains belonging to the Trichoderma atroviride and Trichoderma harzianum species resistant to copper capable of inhibiting the growth of other microorganisms, preferably fungi, phytopathogens.
  • the invention also relates to a composition comprising said strains, as well as the use of these strains and this composition as fertilizers and for the prevention and / or treatment of infections of plants and / or soils caused by microorganisms, preferably fungi, phytopathogens .
  • the present invention relates to the use of Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma harzianum PF1, Trichoderma atroviride IMI 206040 or any combination thereof, with each other or with the new previous strains, for the prevention and / or treatment of plant infections and / or soils caused by phytopathogenic fungi belonging to the genus Verticillium, more preferably by Verticillium dahliae, the causative agent of verticillosis.
  • Verticillosis or vascular wilt are diseases caused by the fungus Hyphomycete Verticillium dahliae Kleb. which can attack a wide range of crops, both woody and herbaceous, including fruit, legumes, horticultural, forestry, ornamental and weeds. Thus, attacks of verticilosis constitute a serious problem in various crops such as artichoke, cotton, melon, tomato, potato or olive.
  • Verticillium dahliae isolates that infect olive trees can be differentiated by their virulence on the plant and thus classified into defoliant (D) or non-defoliant (ND) patotypes by their ability or not to cause the generalized fall of the green leaves of infected branches respectively.
  • the VO can lead to the death of whole trees or the drying of branches causing a delay in growth and production losses.
  • verticillosis are diseases that are difficult to control, contributing to factors such as the pathogen's ability to survive long in the soil (more than 15 years), the wide range of plants susceptible to infection by it, the difficulty of to reach the fungus, since it is in the xylem of the plant and buried in the ground (between 10 and 30 cm deep), and the ineffectiveness of the chemical treatments so far explored to combat the fungus during its parasitic phase in the xylem
  • efficient control of VO requires the application of an integrated disease management strategy (López-Escudero and Mercado-Blanco, 201 1, Plant and Soil, 344, pp. 1 -50 ).
  • the control measures for fungal diseases of the olive tree have been in many cases indirect (elimination of diseased plants, use of potassium fertilizers, etc.).
  • indirect indirect (elimination of diseased plants, use of potassium fertilizers, etc.).
  • CBAs biological control agents
  • Biological control of phytopathogenic organisms is a more attractive alternative than that of chemical products, since these ACBs are less harmful to the environment than the commonly used chemical compounds.
  • the use of such ACBs has been limited by different causes, including inadequate identification of them.
  • Trichoderma filamentous fungus such as strains belonging to the Trichoderma harzianum species, have been used as biological control agents against plant pathogenic fungi, due to their protective capacity both against soil fungi that infect the roots and against which produce diseases in the aerial parts. Some of these strains also have a fertilizing effect on plants, stimulating their vigor, growth and defense mechanisms.
  • Trichoderma strains use different mechanisms to attack fungi. Relations of mycoparasitism have been described between Trichoderma harzianum and Rhizoctonia solani, Sclerotium rolfsii or Pythium, where lithic enzymes play a primary role, and competitive relationships between Trichoderma harzianum and Botrytis cinerea (on vine) or Fusarium (on cotton). Thus, strains of Trichoderma harzianum, Trichoderma virens and Trichoderma viride (Hermosa et al., 2000, Applied and Environmental Microbiology, 66: 5, pp.
  • Trichoderma asperellum Trichoderma atroviride and Trichoderma inhamatum (ES2200602 A1 ) have been used in combination as ACBs in compositions against different plant pathogenic fungi.
  • An example of a synergistic composition of this type is one that comprises different strains of Trichoderma harzianum (those with access number in the NRRL collection 30595, 30596 and 30597) that has a phytopathogenic fungus controlling capacity, is tolerant of abiotic stress, stimulates growth of the plant as well as its phenol content and induces systemic resistance to diseases caused by phytopathogenic organisms (WO20071 10686 A2).
  • Trichoderma strains that provide an improved palliative effect against infection by microorganisms, preferably fungi, phytopathogens, specifically against the ND and D patotypes of Verticillium dahliae in plant varieties susceptible to being infected by it, such as the olive tree.
  • microorganisms preferably fungi, phytopathogens
  • these strains with activity as ACBs have a better capacity to adapt to the environment, so that they can successfully face the biological competence that takes place in the environment to be treated.
  • these strains allowed a combined treatment with fungicides of a chemical nature.
  • the present invention provides new fungal strains, belonging to the species Trichoderma atroviride and Trichoderma harzianum, capable of inhibiting the growth of other microorganisms, preferably fungi, phytopathogens. Therefore, its use is proposed as ACBs against them, preferably against Verticillium, more preferably against the D and ND patotypes of Verticillium dahliae, the agent causing verticillosis.
  • the present invention provides the use of other fungal strains such as Trichoderma harzianum PF1, Trichoderma atroviride IMI 206040 or Trichoderma harzianum CECT 2413 for the prevention and / or treatment of plant and / or soil infections caused by phytopathogenic fungi belonging to the genus Verticillium, more preferably by the D or ND patotypes of Verticillium dahliae, the causative agent of verticillosis.
  • other fungal strains such as Trichoderma harzianum PF1, Trichoderma atroviride IMI 206040 or Trichoderma harzianum CECT 2413 for the prevention and / or treatment of plant and / or soil infections caused by phytopathogenic fungi belonging to the genus Verticillium, more preferably by the D or ND patotypes of Verticillium dahliae, the causative agent of verticillosis.
  • the examples of the present invention demonstrate that these new strains, belonging to Trichoderma atroviride and Trichoderma harzianum, have an ability to inhibit the growth of the phytopathogenic fungus Verticillium dahliae improved with respect to other strains of the same genus.
  • this antifungal ability is observed in pathogen isolates, both sensitive and resistant, to fungi of the genus Trichoderma. Therefore, the strains described in the present invention have a high palliative value against infection of plants and / or soils caused by microorganisms, preferably fungi, phytopathogens, more preferably by Verticillium, even more preferably by Verticillium dahliae, being applicable both in nursery conditions like field.
  • the strains described in the present invention are resistant to copper, so they have the advantage that, compared to other strains of the same genus and species, it has a better ability to adapt to media characterized by the presence of metal contaminants .
  • metal pollutants are commonly used as antifungals and, among them, copper is widely used in the olive grove sector.
  • the copper resistance of these strains allows their use in combination with chemical antifungal agents, which results in better control and greater protection of the plant and / or soil against microorganisms, preferably fungi, phytopathogens compared to The simple chemical or biological treatment.
  • Trichoderma harzianum PF1 strain has an ability to inhibit the growth of the enhanced phytopathogenic fungus Verticillium dahliae with respect to the strain from which it originates, Trichoderma harzianum CECT 2413, in pathogen isolates both sensitive and resistant to fungi of the genus Trichoderma.
  • This capacity is due to its superexcretory activity of hydrolytic enzymes, such as, but not limited to, glucanases, proteases and / or chitinases.
  • the Trichoderma harzianum PF1 fungal strain has a high palliative and preventive value against infection of plants and / or soils caused by phytopathogenic fungi of the genus Verticillium, more preferably by Verticillium dahliae, being applicable both in nursery conditions and in countryside.
  • Trichoderma harzianum PF1 hydrolytic enzymes gives this strain the advantage that, compared to other strains of the same genus and species, it can better cope with the biological competence that takes place in the plant's root environment. try.
  • the examples of the present invention demonstrate that the Trichoderma atroviride IMI 206040 strain has an ability to inhibit the growth of the phytopathogenic fungus Verticillium dahliae improved with respect to other strains of the same genus, and this inhibition is observed both in isolated from pathogen D pathogen and ND pathotype, and both sensitive and fungal resistant of the genus Trichoderma. Therefore, the strain of fungi Trichoderma atroviride IMI 206040 has a high palliative and preventive value against infection of plants and / or soils caused by phytopathogenic fungi of the genus Verticillium, more preferably by Verticillium dahliae, being applicable both in nursery conditions and field
  • the examples of the present invention demonstrate that the strain Trichoderma harzianum CECT 2413 is capable of inhibiting the growth of the phytopathogenic fungus Verticillium dahliae, and this inhibition is observed in both isolates of the pathogen of the D-type and the ND-pathogen, and both sensitive and resistant to fungi of the genus Trichoderma.
  • this strain has a preventive effect against the infection of plants by Verticillium dahliae improved with respect to other strains of the same genus.
  • the strain of fungi Trichoderma harzianum CECT 2413 has a high palliative and preventive value against infection of plants and / or soils caused by phytopathogenic fungi of the genus Verticillium, more preferably by Verticillium dahliae, being applicable both in nursery conditions and field
  • one aspect of the invention relates to a Trichoderma strain selected from the strain of the Trichoderma atroviride species deposited in the Spanish Type Culture Collection (CECT) with deposit number 20755 or the strain of the Trichoderma species harzianum deposited in the Spanish Type Crops Collection (CECT) with deposit number 20756.
  • first strain of the invention Spanish Type Culture Collection (CECT) with deposit number 20755, hereafter "first strain of the invention” or “RCU1”, was deposited with the CECT on October 15, 2009. It is a spontaneous mutant (not genetically manipulated) resistant to copper, specifically, but not limited to 4 mM of CU2SO4, derived from Trichoderma atroviride IMI 206040.
  • This first strain of the invention shares its phenotypic characteristics with the strain from which it originates. It is able to grow in vitro in, for example, although without limiting the culture media CECT 54/68, at an incubation temperature of, for example, but not limited to 25 ° C, for example, but not limited to 5 days and in aerobic conditions.
  • This second strain of the invention shares its phenotypic characteristics with the strain from which it comes. It is capable of growing in vitro in, for example, but not limited to, CECT culture media 54/68, at an incubation temperature of, for example, but not limited to, 25 ° C, for example, but not limited to , 5 days and in aerobic conditions.
  • the strains of the invention are in a sporulated state.
  • "Sporulated state” means the stage of the fungus in which it is in the form of a spore.
  • the term “spore” refers to the reproductive cell produced in fungal sporangia, either asexually or as a result of a sexual reproduction process, usually haploid and unicellular, which at the same time allows dispersion and survival for a long time. (dormancy) in adverse conditions.
  • the spore produces a new organism by dividing by mitosis without fusion with another cell, producing a multicellular gametophyte. When the spore germinates, a first hypha arises from it, whose extension and branching constitutes a mycelium.
  • composition of the invention which comprises an element selected from the list:
  • the term "metabolism products” or “metabolites” refers to any molecule excreted by the strain or strains of the invention into the medium, preferably when said strains are growing in the presence of medium of PDA culture (Potato-Dextrose Agar).
  • PDA culture Paneto-Dextrose Agar
  • examples of these metabolites are, but are not limited to, amino acids, nucleotides, vitamins, organic acids, alcohols, such as polyols, sugars, such as polysaccharides, antibiotics, enzymes, such as, but not limited to, cell wall hydrolytic enzymes, etc.
  • the examples of the present invention demonstrate the efficacy, not only of the strains of the invention and its metabolism products, but also of other Trichoderma strains, in addition to Trichoderma atroviride CECT 20755 and Trichoderma harzianum CECT 20756, specifically Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 and Trichoderma harzianum PF1, and their metabolism products, to inhibit the growth of phytopathogenic microorganisms, such as, but not limited to, Verticillium dahliae.
  • the composition of the invention in addition to any of the strains of the invention comprises at least one strain of Trichoderma selected from the list: Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 or Trichoderma harzianum PF1.
  • the examples of the present invention demonstrate the efficacy of the composition of the invention comprising the five strains of Trichoderma: Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma harzianum CECT 20756 and Trichoderma harzianum PF1, to inhibit the growth of phytopathogenic microorganisms, such as, but not limited to, Verticillium dahliae. Therefore, in a more preferred embodiment, the composition of the invention comprises an element selected from the list: to. strains of the invention, that is, Trichoderma atroviride CECT 20755 and Trichoderma harzianum CECT 20756, preferably in a sporulated state,
  • the composition of the invention comprises: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 and Trichoderma harzianum PF1.
  • the proportion of each strain in the composition of the invention varies between 10% and 30% of the final volume of the composition (to total 100% with the five strains); more preferably the proportion of each strain in the composition of the invention is 20% of the final volume of said composition, that is, the five strains are found in the composition of the invention in the same proportion (1: 1: 1: eleven ).
  • Trichoderma strains Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 and / or Trichoderma harzianum PF1 are in a sporulated state in the composition of the invention.
  • composition of the invention further comprises products of the metabolism of at least one strain of Trichoderma selected from the list: Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 or Trichoderma harzianum PF1.
  • Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413, and Trichoderma harzianum PF1 strains are accessible to one skilled in the art.
  • IMI 206040 are identifiable both for their morphological characteristics, which can be found described in databases for Trichoderma such as, for example, but not limited to, the collection on http://www.isth.info, as for certain molecular markers, such as, but not limited to, the sequence of internal spacers of the rRNA, ITS1 e genes ITS2.
  • the trichoderma harzianum derivative CECT 2413, Trichoderma harzianum PF1, induced with nitrosoguanidine is characterized by its superexcretory capacity of hydrolytic enzymes (glucanases, proteases and / or chitinases). This strain shares the morphological characteristics of the strain from which it comes.
  • the composition of the invention further comprises elements necessary for the growth and development of the strains of the invention and of the Trichoderma strains mentioned in the preceding paragraph.
  • said composition may comprise, but is not limited to, carbon sources, mineral salts and / or organic and inorganic nutrients.
  • composition of the invention may be presented in any form suitable for administration or application, for example, but not limited to, in solid or liquid form.
  • liquid presentation forms are suitable for spraying on the ground, the plant or the plant material, or for creating a solution in which the plants or plant material are submerged, so that preferably the composition of the invention is presented in liquid form
  • the examples of the present invention demonstrate that when phytopathogenic microorganisms are inoculated such as, for example, but not limited to, Verticillium dahliae, in a culture medium where at least one of the strains of the invention has previously grown and excreted all kinds of metabolites before if removed from said medium, there is inhibition of the growth of the phytopathogenic microorganism.
  • phytopathogenic microorganisms such as, for example, but not limited to, Verticillium dahliae
  • Trichoderma atroviride CECT 20755 Trichoderma harzianum CECT 20756
  • Trichoderma atroviride IMI 206040 Trichoderma harzianum CECT 2413
  • the inventors show that both the mycelium of the strains of the invention and of these other strains of Trichoderma, such as the metabolites excreted to the medium by them, are capable of inhibiting the growth of microorganisms, preferably fungi, phytopathogens such as for example, but not limited to, Verticillium dahliae. Therefore, another aspect of the invention relates to the use of the strains of the invention, preferably in a sporulated state, and / or of the products of its metabolism, or of the composition of the invention, for the prevention and / or treatment of infections caused by phytopathogenic microorganisms.
  • the metabolism products of the strains of the invention can be isolated and applied, alone or in combination with said strains, directly to the plant, both the roots and the aerial part, the plant material, including but not limited to seeds, leaves or fruits, or to the soil.
  • the mode of administration can be simultaneous or sequential.
  • the strains can be administered alone to both the roots and the aerial part of the plant, to the plant material, including but not limited to seeds, leaves or fruits, or to the soil, so that they produce said metabolic products in situ. .
  • treatment refers to combating the effects caused as a result of an infection caused by microorganisms, preferably fungi, phytopathogens, more preferably by Verticillium, even more preferably by Verticillium dahliae, in a plant, in a crop or in a soil.
  • microorganisms preferably fungi, phytopathogens, more preferably by Verticillium, even more preferably by Verticillium dahliae, in a plant, in a crop or in a soil.
  • prevention is to prevent the occurrence of damage caused by infections caused by microorganisms, preferably fungi, phytopathogens, more preferably by Verticillium, even more preferably by Verticillium dahliae; that is, to prevent infection from occurring in a plant, in a crop or in a soil, in particular, when said plant, crop or soil is predisposed to infection but has not yet been diagnosed to have it.
  • “Infection” means the colonization of a host organism, for example, but not limited to, a plant, by pathogens, which in the context of the present invention consist of microorganisms, preferably fungi, phytopathogens, which invade the organism and they multiply in it, producing toxic substances.
  • the colonizing organism is detrimental to the normal functioning and survival of the host, whereby the agent is qualified as a pathogen or, in the context of the present invention, as a phytopathogen.
  • the term “infection” includes both localized infections that affect a single area of the host organism, and generalized infections that affect the entire organism; and both symptomatic and asymptomatic infections. Likewise, within this term, soil infestations caused by microorganisms, preferably fungi, phytopathogens are also included.
  • phytopathogenic microorganisms means those microorganisms belonging to the Fungi kingdom or to the Oomycetes class, capable of causing infections, and sometimes diseases, in plants.
  • Examples of phytopathogenic microorganisms belonging to the Oomycetes class are, but not limited to, those belonging to the genera Phytophthora, Plasmopara, Pseudoperonospora or Pythium.
  • Plant pathogenic fungi are those organisms belonging to the Fungi kingdom capable of causing infections, and sometimes diseases, in plants through alterations in their metabolism, for example, but not limited to, the secretion of enzymes, toxins, phytoregulators and other substances and, in addition, by absorbing nutrients from the plant for its own growth.
  • phytopathogenic fungi that cause diseases to grow and multiply in the xylem and / or phloem of the plant and, therefore, to block the transport of water and nutrients from the root to the leaves or the flow of sap from the leaves to the rest of the plant
  • Some examples of phytopathogenic fungi are, but not limited to, those belonging to the genera Armillaria, Botrytis, Chondrostereum, Colletotrichum, Cladosporium, Fusarium, Monilia, Nectria, Rhizoctonia, Rhizopus, Sclerotinia, Sclerotium or Verticillium.
  • the presence of phytopathogenic microorganisms in plants or in the soil can be detected by molecular biology techniques known in the state of the art to carry out said identification, such as, for example, by amplifying, for example, but not limited to, chain reaction. of polymerase (PCR), polymerase chain reaction in real time (RT-PCR) or Q-PCR, a region of the genome of the phytopathogenic microorganism present in a sample isolated from the soil or plant and comparing the amplification product obtained with the gene sequences available in databases such as, for example, but not limited to GenBank, organism specific to determine the type of pathogen present in the sample.
  • PCR polymerase
  • RT-PCR polymerase chain reaction in real time
  • Q-PCR Q-PCR
  • phytopathogenic microorganisms in plants or soil could also be carried out by immunohistochemical techniques, such as, but not limited to, ELISA; or by in vitro growth of the organisms contained in the isolated soil or plant sample in specific pathogen-specific culture media known in the state of the art.
  • strains belonging to the genus Trichoderma are capable of exerting growth inhibition not only on a single type of phytopathogenic microorganism but on a wide variety of them, such as strains belonging to the Trichoderma atroviride or Trichoderma harzianum species. Therefore, although the examples of the present invention demonstrate the effect of the mentioned strains and the composition of the invention on the inhibition of the growth of the phytopathogenic fungus Verticillium dahliae, said strains and composition are also useful in the prevention and / or treatment of infections caused by other microorganisms Phytopathogens that can be controlled by strains belonging to the Trichoderma atroviride or Trichoderma harzianum species.
  • the phytopathogenic microorganism belongs to a genus selected from the list comprising: Armillaria, Botrytis, Chondrostereum, Colletotrichum, Cladosporium, Fusarium, Monilia, Nectria, Phytophthora, Plasmopara, Pseudoperonospora, Pythium , Rhizoctonia, Rhizopus, Sclerotinia, Sclerotium or Verticillium.
  • the phytopathogenic microorganism belongs to the genus Verticillium.
  • the phytopathogenic microorganism is Verticillium dahliae.
  • the genus of fungi Verticillium belongs to the Ascomicota division or phylum, Plectosphaerellaceae family and includes various groups comprising parasites and saprophytes of plants, insects, nematodes, mollusc eggs and other fungi, so the genus has a wide range of taxonomic groups , containing about 51 species, among which are, but not limited to, Verticillium dahliae, Verticillium alboatrum, Verticillium nubilium, Verticillium nigrescens or Verticillium tricorpus. Species of this genus are the causes of diseases known as verticillosis.
  • the simplest method to identify pathogens of the genus Verticillium is, for example, but not limited to, cultivation in a selective medium, such as, but not limited to, in PDA medium (Potato-Dextrose Agar) at room temperature, where colonies grow white and the background color of the plates is between colorless and yellowish. Some crops may have a low profile with rounded edges and forming curves.
  • PDA medium Panato-Dextrose Agar
  • the species Verticillium alboatrum, Verticillium dahliae and Verticillium tricorpus have prostrate and orange-yellow colonies in PDA culture medium, the species Verticillium nubilium forms gloomy clamidospores and Verticillium nigrescens forms abundant clamidospores.
  • Verticillium dahliae species is characterized by the production of conidiophores with phyllides arranged in verticil and the formation of numerous microsclerocios, resistance structures.
  • the fungus can be found in the soil in the form of mycelium and conidia, although it is preferably found in form of microsclerocios.
  • Some cultures infected by this pathogen may be asymptomatic.
  • stroke and slow decay In the olive grove there are two types of syndromes derived from this infection that causes the disease called "verticillosis": stroke and slow decay.
  • the initial symptoms of the first syndrome consist of the loss of coloration of the leaves, later there is a rapid drying of buds and branches that usually begins from the tip and that can cause the death of the tree.
  • the bark of the affected branches may be purple or purple and sometimes a brown color is also seen in the tissues of the xylem.
  • the most typical symptoms of slow decay are necrosis and mummification of the inflorescences while the leaves generally come off, except those at the end.
  • both its defoliant (D) and its non-defoliant (ND) patotype are included within Verticillium dahliae.
  • the Verticillium dahliae patotype D is characterized by causing, in olive groves and cotton, the generalized fall of the green leaves of infected branches, unlike the ND patotype.
  • the diagnosis of infection by one or another V is characterized by causing, in olive groves and cotton, the generalized fall of the green leaves of infected branches, unlike the ND patotype.
  • dahliae pathotype could be carried out by means of phenotypic visualization techniques based on the symptomatic characteristic mentioned above, or by molecular techniques of characterization of both patotypes, such as, but not limited to , by PCR (Mercado-Blanco et al., 2003, Plant Disease, 87, pp. 1487-1494).
  • Examples of plants susceptible to infection with Verticillium dahliae are, but not limited to, artichoke, cotton, melon, tomato, potato or olive. Therefore, in another preferred embodiment, the plant affected by the phytopathogenic microorganism is selected from the list comprising: artichoke, cotton, melon, tomato, potato or olive. In a more preferred embodiment, the plant is the olive tree. When Verticillium dahliae infects the olive tree it causes what is called "olive verticillosis or VO".
  • the present invention relates both to olive varieties that are very susceptible to Patotype D, such as, but not limited to, Picual or Arbequina, as well as to varieties susceptible to ND patotype.
  • the strains of the invention are resistant to copper, a metal used as a fungicide mainly in the olive grove sector. Therefore, this ability of the strains of the invention allows their use, individually or together, in a method of treatment and / or prevention of infections caused by microorganisms, preferably fungi, phytopathogens in combination with other antifungal agents. Therefore, another preferred embodiment relates to the use of the strains of the invention, and / or of the products of its metabolism, or of the composition of the invention, in combination with other antifungal agents.
  • antifungal agent refers to those substances, both biological and chemical in nature, which are used to inhibit growth (fungistatics) or to kill (fungicides) fungi capable of causing infections in plants and / or soils, preferably to Verticillium, more preferably to Verticillium dahliae.
  • the term refers to both protective or contact antifungal agents, which are applied before the infection occurs, as well as to eradicating or systematic antifungal agents, which are applied once the infection has occurred, as well as to antifungal agents used in coatings. of seeds, for use in soil disinfection, for application on plants, etc.
  • an antifungal agent of a biological nature is microorganisms that act as ACBs of phytopathogenic fungi, such as, but not limited to, fungi of the genus Trichoderma other than those included in the composition of the invention, fungi belonging to other genera or bacteria, and mixtures thereof, as long as these are not incompatible with the strains of the invention and with the fungi included in the composition of the invention.
  • Some types of antifungal agents that could be used in combination with the strain of the invention, and / or with the products of its metabolism, or with the composition of the invention are, but not limited to, those composed of copper chloride, oxychloride.
  • another aspect of the invention relates to the use of one of the strains of the invention or both, and / or of the products of its metabolism, or of the composition of the invention, as fertilizer.
  • a preferred embodiment of this aspect of the invention relates to the use of one of the strains of the invention or both, and / or of the products of its metabolism, or of the composition of the invention, as fertilizer in olive plants.
  • fertilizer refers to any substance or mixture of chemical and / or biological substances, of natural or synthetic origin, used to supply the inorganic or organic elements to the soil in order for the plant to absorb them and thus favor their growth or vigor
  • Trichoderma strains mentioned herein, and / or the products of their metabolism, or the composition of the invention can be administered to a plant, soil or plant material, including but not limited to seeds, leaves or fruits, in combination with one or more antifungal agents and / or fertilizers simultaneously or sequentially.
  • the strains mentioned herein, and / or the products of their metabolism, as well as the composition of the invention can be administered to, for example but not limited to, a plant, both the roots and the aerial part, the plant material, including but not limited to seeds, leaves or fruits, or to the soil, in an amount effective for the treatment and / or prevention of infections caused by microorganisms, preferably fungi, phytopathogens and to cause fertilization.
  • the term "effective amount” refers to the sufficient amount of the strains, and / or the products of their metabolism, or of the composition of the invention, which allows to obtain the desired results. Said effective amount can be administered at one time or in several administrations.
  • a "sufficient amount” is the amount sufficient to avoid, alleviate, improve, stabilize, reverse, retard or delay the effects of infections caused by microorganisms, preferably fungi, plant pathogens, or to Stimulate their growth.
  • the effective amount to be administered from the strains in a sporulated state is between 10 4 and 10 6 spores / ml of irrigation water, and more preferably 10 5 spores / ml (from 1, 4 x 10 11 forming units of colonies / g).
  • the mode of administration of the strains, and / or the products of their metabolism, as well as of the composition of the invention can be carried out, for example, but not limited to, by irrigation, spraying, spraying, coating, fumigation water , impregnation, mixing with the substrate, immersion of the root of the plant in a solution comprising the strains, or spores thereof, and / or the products of their metabolism, or the composition of the invention.
  • the term "genus” refers to the category of biological classification (taxonomic category) that is located between the family and the species and that includes one or more morphologically similar species phylogenetically related. "Taxonomic category” means the level of hierarchy used for the classification of organisms.
  • Another aspect of the invention relates to the use of Trichoderma harzianum PF1 strain and / or the products of its metabolism for the prevention and / or treatment of infections caused by phytopathogenic fungi belonging to the Verticillium genus.
  • a preferred embodiment of this aspect of the invention relates to said use in combination with at least one strain of Trichoderma selected from the list comprising: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 or Trichoderma harzianum CECT 2413.
  • said use is in combination with the Trichoderma Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 and Trichoderma harzianum CECT 2413 strains.
  • said Trichoderma strains are in a sporulated state.
  • Another preferred embodiment of this aspect of the invention relates to said use in combination with metabolism products of at least one strain of Trichoderma selected from the list comprising: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 or Trichoderma harzianum CECT 2413.
  • a more preferred embodiment refers to said use in combination with metabolic products of Trichoderma strains: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 and Trichoderma harzianum CECT 2413.
  • Another aspect of the invention relates to the use of Trichoderma atroviride IMI 206040 strain and / or the products of its metabolism for the prevention and / or treatment of infections caused by phytopathogenic fungi belonging to the Verticillium genus.
  • a preferred embodiment of this aspect of the invention relates to said use in combination with at least one strain of Trichoderma selected from the list comprising: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma harzianum PF1 or Trichoderma harzianum CECT 2413.
  • said use is in combination with the Trichoderma Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma harzianum PF1 and Trichoderma harzianum CECT 2413 strains.
  • said Trichoderma strains are in sporulated state. .
  • Another preferred embodiment of this aspect of the invention relates to said use in combination with metabolic products of at least one strain of Trichoderma selected from the list comprising: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma harzianum PF1 or Trichoderma harzianum CECT 2413.
  • a more preferred embodiment refers to said use in combination with metabolism products of Trichoderma strains: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma harzianum PF1 and Trichoderma harzianum CECT 2413.
  • Trichoderma harzianum CECT 2413 strain and / or the products of its metabolism for the prevention and / or treatment of infections caused by phytopathogenic fungi belonging to the Verticillium genus.
  • a preferred embodiment of this aspect of the invention relates to said use in combination with at least one strain of Trichoderma selected from the list comprising: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 or Trichoderma harzianum PF1.
  • said use is in combination with the strains of Trichoderma Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 and Trichoderma harzianum PF1.
  • said Trichoderma strains are in a sporulated state.
  • Another preferred embodiment of this aspect of the invention relates to said use in combination with metabolism products of at least one strain of Trichoderma selected from the list comprising: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 or Trichoderma harzianum PF1.
  • a more preferred embodiment relates to said use in combination with metabolic products of Trichoderma strains: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 and Trichoderma harzianum PF1.
  • the phytopathogenic fungus is Verticillium dahliae.
  • the plant affected by the phytopathogenic fungus is selected from the list comprising: artichoke, cotton, melon, tomato, potato or olive. More preferably the plant is the olive tree.
  • Fig. 1 Shows the results of the direct confrontation tests between the Trichoderma strains and two isolates of Verticillium dahliae.
  • A Petri dishes in which the Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma atroviride RCU1 or Trichoderma harzianum CECT 2413 strains are growing at one end, and the Verticillium dahliae 1A-2 or 2A-12 isolates at the opposite end.
  • Control Petri dishes in which only Verticillium dahliae 1A-2 or 2A-12 was inoculated. The images were taken after 18 days of growth.
  • Fig. 2 It shows the growth of two isolates of Verticillium dahliae, 1A-2 (A) and 2A-12 (B), in media where the Trichoderma, Trichoderma atroviride IMI 206040 (7. atroviride), Trichoderma, Trichoderma strains had previously grown atroviride RCU1, Trichoderma harzianum CECT 2413 (7. harzianum), Trichoderma harzianum RCU2 or Trichoderma harzianum PF1, or a combination of the five strains formed by 1/5 of each (formulation).
  • the figure shows the growth of two isolates of the pathogen in the presence of metabolites excreted by the different strains of Trichoderma. Control: growth of Verticillium dahliae 1A-2 (A) or 2A-12 (B) in Petri dishes in which no strain of Trichoderma had previously grown.
  • Fig. 3 Shows the results of the direct confrontation tests between the Trichoderma atroviride IMI 206040 strain, or a combination of Trichoderma atroviride IMI 206040 and Trichoderma harzianum CECT 2413, and various isolates of Verticillium dahliae.
  • Fig. 4 It shows the growth of different Verticillium dahliae isolates during the direct confrontation tests with the Trichoderma harzianum CECT 2413 (2413), Trichoderma viride CECT 2423 (2423) or Trichoderma atroviride IMI 206040 (IMI) strains, or combinations of the same, at 3 (white), 6 (gray) and 15 (black) days of incubation.
  • IMI 206040 Trichoderma atroviride IMI 206040
  • Fig. 5 It shows the growth inhibition (%) in ten-day cultures of the different Verticillium isolates (1A2, 1A3, 1A4, 2A12, 2A16, 2A17, 4B31, 4B34, 4B35) by the metabolites of T strains.
  • harzianum CECT 2413 2413
  • IMI T. atroviride IMI 206040
  • VIRIDE T. viride CECT 2423
  • Fig. 6. It shows the results of the direct confrontation tests between the Trichoderma harzianum CECT 2413 strain, or a combination of Trichoderma harzianum CECT 2413 and Trichoderma atroviride IMI 206040, and different isolates of Verticillium dahliae.
  • Fig. 7 It shows the evolution of the total number of leaves over time in olive plants inoculated with V. dahliae (vert.) And previously treated with strains of T. harzianum CECT 2413 (T. Harz.), T. asperellum (T. Asp.) or mix both strains. Cont. + Vert .: Control, olive plants treated with V. dahliae but not with Trichoderma.
  • Fig. 8 It shows the analysis of the symptomatology of the disease by means of the scale of severity of damage over time in olive plants previously treated with strains of T. harzianum CECT 2413 (T. Harz.), T. asperellum ( T. Asp.) Or with the mixture of both strains, during treatment with V. dahliae (vert.). Cont. + Vert .: Control, olive plants treated with V. dahliae but not with Trichoderma.
  • two types of antagonism tests were carried out: one of direct confrontation and the other of growth capacity of different isolates of Verticillium dahliae in a medium where Trichoderma had previously grown and excreted all kinds of metabolites (including antibiotics and cell wall hydrolytic enzymes).
  • the trials included direct confrontation in solid medium and cellophane tests to see the effect of the substances secreted by Trichoderma, following usual protocols in the laboratory for Rhizoctonia and Fusarium tests.
  • -Trichoderma atroviride RCU1 (deposit number in CECT 20755), derived from Trichoderma atroviride IMI 206040, or first strain of the invention.
  • -Trichoderma harzianum RCU2 (deposit number in CECT 20756), derived from Trichoderma harzianum CECT 2413, or second strain of the invention.
  • Trichoderma harzianum CECT 2413 Trichoderma atroviride IMI 206040 and Trichoderma harzianum PF1.
  • This last strain is a nitrosoguanidine-induced mutant derived from Trichoderma harzianum CECT 2413 with a high antifungal capacity and characterized as a superexcretor of hydrolytic enzymes (glucanases, proteases and chitinases).
  • isolate 1A-2 representative of pathotype D
  • isolate 2A-12 more sensitive
  • the direct confrontation tests consisted of inoculating a portion of mycelium of the different isolates of V. dahliae to be tested (1A-2 or 2A-12) at one end of Petri dishes containing PDA nutritive culture medium (2% mashed potatoes , 2% glucose, 2% agar). The boxes were incubated at 22 ° C for 4 days to allow the growth of the pathogen and subsequently inoculated, at the opposite end of the boxes, 20 ⁇ of spores of the different Trichoderma strains at a concentration of 10 5 spores / ml. The boxes continued to incubate at 22 ° C for 18 days. As a control, boxes with PDA nutrient medium were inoculated with the different isolates of V. dahliae in which Trichoderma was not inoculated.
  • the fungi came into contact and there could be two different situations: that both stopped growing in the contact area or that one of them caused a lysis of the mycelium of the other and ended up growing above it.
  • the antagonistic effect was verified by seeing the overgrowth of Trichoderma and the possible death of the pathogen under a microscope and by seeding in a selective medium for the pathogen (growth in the presence of toxins in which Trichoderma could not grow but at which the pathogen was resistant ).
  • Figure 1 shows the results of the confrontations with the different Verticillium isolates. It was observed that the Trichoderma strains used overgrow the pathogen, reducing the area occupied by it. As can be seen in this figure, the composition of the five strains of Trichoderma (formulation) is more effective against the two isolates of Verticillium dahliae tested than most of the strains that compose it separately, except in the case of Trichoderma atroviride IMI 206040 and its derived strain, RCU1, which have a similar capacity.
  • two types of antagonism tests were carried out: one of direct confrontation and another of growth capacity of different isolates of Verticillium dahliae in a medium where Trichoderma had previously grown and excreted all kinds of metabolites (including antibiotics and cell wall hydrolytic enzymes ).
  • the trials included direct confrontation in solid medium and cellophane tests to see the effect of the substances secreted by Trichoderma, following usual protocols in the laboratory for Rhizoctonia and Fusarium tests.
  • Trichoderma strains used in the trials were: Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma viride CECT 2423 and Trichoderma atroviride IMI 206040, as well as the following combinations thereof: T. atroviride IMI 206040 + T viride CECT 2423, T harzianum CECT 2413 + T. atroviride IMI 206040, and T harzianum CECT 2413 + T viride CECT 2423, and in combination with Verticillium isolates 1A-2, 1A-3, 1A-4, characterized as pathotype D, and 2A-12, 2A-16 , 2A-17,4B-31, 4B-34, 4B-35, of the ND patotype.
  • -Trichoderma atroviride RCU1 (deposit number in CECT 20755), derived from Trichoderma atroviride IMI 206040.
  • -Trichoderma harzianum RCU2 (deposit number in CECT 20756), derived from Trichoderma harzianum CECT 2413.
  • Trichoderma harzianum PF1 strain a nitrosoguanidine-induced mutant derived from Trichoderma harzianum CECT 2413 with a high antifungal capacity and characterized as a superexcretor of hydrolytic enzymes (glucanases, proteases and chitinases), was also included in the assays of the present invention.
  • Trichoderma atroviride IMI 206040 Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma atroviride RCU1, Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma harzianum RCU2 and Trichoderma harzianum PF1.
  • the direct confrontation assays consisted of inoculating a portion of mycelium of the different isolates of V. dahliae to be tested in one end of Petri dishes containing PDA nutritive culture medium (2% mashed potatoes, 2% glucose, 2% agar) .
  • PDA nutritive culture medium 2% mashed potatoes, 2% glucose, 2% agar
  • the boxes were incubated at 22 ° C for 4 days to allow the growth of the pathogen and subsequently inoculated, at the opposite end of the boxes, 20 ⁇ of spores of the different Trichoderma strains at a concentration of 10 5 spores / ml.
  • the boxes continued to incubate at 22 ° C for 18 days.
  • boxes with PDA nutrient medium were inoculated with the different isolates of V. dahliae in which Trichoderma was not inoculated.
  • the fungi came into contact and there could be two different situations: that both stopped growing in the contact area or that one of them caused a lysis of the mycelium of the other and ended up growing above it.
  • the antagonistic effect was verified by seeing the overgrowth of Trichoderma and the possible death of the pathogen under a microscope and by seeding in a selective medium for the pathogen (growth in the presence of toxins in which Trichoderma could not grow but to which the pathogen was resistant).
  • Figure 3 shows the results of the confrontations of the T. atroviride IMI 206040 strain (Fig. 3B), or of the combination of T. atroviride IMI 206040 and T harzianum CECT 2413 strains (Fig. 3C), with different isolates of Verticillium.
  • the T. atroviride IMI 206040 strain and the combination of T. atroviride IMI 206040 and T. harzianum CECT 2413 strains overgrown the pathogen, reducing the area occupied by it.
  • the growth area of the different strains of Verticillium was measured in the different trials of confrontation with Trichoderma.
  • the results obtained are represented in Figure 4 A-1 at different incubation times (3, 6, and 15 days). It was observed that in most cases the Trichoderma strains used were overgrowth of the pathogen, although in some cases the strains only managed to stop their growth (see the case of T. harzianum CECT 2413 against V. dahliae 1A-3 and 1A-4 ).
  • the most efficient strain was T. atroviride IMI 206040, capable of reducing the growth of the pathogen in 100% of cases, and only against the strain of Verticillium 2A-17 a combination of T. atroviride IMI 206040 with T. viride CECT 2423 Improved IMI antagonistic capacity individually (Fig. 4).
  • Figure 1 shows the results of the confrontations of the T atroviride IMI 206040, T atroviride RCU1, T harzianum CECT 2413, T. harzianum RCU2, T. harzianum PF1 strains, or a combination of these five strains (formulation), with Verticillium 1A-2 isolates, representative of the Patotype D, or 2A-12, isolated more sensitive to strains of the genus Trichoderma representative of the ND patotype.
  • composition of these five strains of Trichoderma was more effective against the two isolates of Verticillium dahliae tested than most of the strains that compose it separately, except in the case of Trichoderma atroviride IMI 206040 and of their derived strain, RCU1, which have a similar capacity.
  • EXAMPLE 3 In vitro antagonism assays of different strains of Trichoderma and isolates of Verticillium dahliae.
  • two types of antagonism tests were carried out: one of direct confrontation and the other of growth capacity of different isolates of Verticillium dahliae in a medium where Trichoderma had previously grown and excreted all kinds of metabolites (including antibiotics and cell wall hydrolytic enzymes).
  • the trials included direct confrontation in solid medium and cellophane tests to see the effect of the substances secreted by Trichoderma, following usual protocols in the laboratory for Rhizoctonia and Fusarium tests.
  • Trichoderma strains used in the trials were: Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma viride CECT 2423 and Trichoderma atroviride IMI 206040, as well as the following combinations thereof: T atroviride IMI 206040 + T viride CECT 2423, T harzianum CECT 2413 + T atroviride IMI 206040, and T harzianum CECT 2413 + T viride CECT 2423, and in combination with the isolates of Verticillium 1A-2, 1A-3, 1A-4, characterized as defoliant patotypes, and 2A-12, 2A-16, 2A-17,4B-31, 4B-34 and 4B-35, with non-defoliant capacity.
  • Trichoderma atroviride RCU1 (deposit number in CECT 20755), derived from Trichoderma atroviride IMI 206040.
  • Trichoderma harzianum RCU2 (deposit number in CECT 20756), derived from Trichoderma harzianum CECT 2413.
  • Trichoderma harzianum PF1 strain a nitrosoguanidine-induced mutant derived from Trichoderma harzianum CECT 2413 with a high capacity was also included in the assays of the present invention antifungal and characterized as a superexcretor of hydrolytic enzymes (glucanases, proteases and chitinases).
  • Trichoderma atroviride IMI 206040 Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma atroviride RCU1, Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma harzianum RCU2 and Trichoderma harzianum PF1.
  • the direct confrontation assays consisted of inoculating a portion of mycelium of the different isolates of V. dahliae to be tested in one end of Petri dishes containing PDA nutritive culture medium (2% mashed potatoes, 2% glucose, 2% agar) .
  • PDA nutritive culture medium 2% mashed potatoes, 2% glucose, 2% agar
  • the boxes were incubated at 22 ° C for 4 days to allow the growth of the pathogen and subsequently inoculated, at the opposite end of the boxes, 20 ⁇ of spores of the different Trichoderma strains at a concentration of 10 5 spores / ml.
  • the boxes continued to incubate at 22 ° C for 18 days.
  • boxes with PDA nutrient medium were inoculated with the different isolates of V. dahliae in which Trichoderma was not inoculated.
  • FIG. 6 shows the results of the confrontations of the Trichoderma harzianum CECT 2413 strain (Fig. 6B), or of the combination of T harzianum CECT 2413 and T atroviride IMI 206040 (Fig.
  • Figure 1 shows the results of the confrontations of the T atroviride IMI 206040, T atroviride RCU1, T harzianum CECT 2413, T. harzianum RCU2, T. harzianum PF1 strains, or a combination of these five strains (formulation), with the isolates of Verticillium 1A-2, representative of patotype D, or 2A-12, isolated more sensitive to strains of the genus Trichoderma representative of the ND patotype. As can be seen, the composition of these five strains of Trichoderma (formulation) was more effective against the two isolates of Verticillium dahliae tested than most of the strains that compose it separately. 3.2.
  • EXAMPLE 4 In vitro trials of protection of olive plants against Verticillium dahliae infection by treatment with Trichoderma harzianum CECT 2413.
  • T harzianum CECT 2413 and T asperellum were used (the latter also called “olive strain” because it is native to the root of this plant), strains that have a high antagonism against the pathogen and also It was seen that they developed the greatest capacity to colonize the root of the olive tree among all the strains analyzed. The combination of both strains was also used.
  • Trichoderma preparations were made at a concentration of 10 5 spores strain / ml of irrigation water, and a volume of 35 ml per plant (determined previously, and that ensured a permanent contact without loss of the dissolution of Trichoderma with the substrate on which it is added) for a period of 32 days, and under experimental conditions based on a photoperiod of 12h / 12h, light intensity (fluorescent light) of 360 ⁇ m -2 - s -1 , temperature 22-24 ° C day / night and humidity 70-80%.
  • V. dahliae Plants inoculated with V. dahliae (VCG1A-3, pathotype D) (disease control), 6) Plants treated with Trichoderma harzianum CECT 2413 and inoculated with V. dahliae (VCG1A-3, patotype D) (biocontrol treatment of the disease),
  • V. dahliae Plants treated with Trichoderma asperellum and inoculated with V. dahliae (VCG1A-3, pathotype D) (biocontrol treatment of the disease), and
  • treatment n ° 1, n ° 2, n ° 3 and n ° 4 allowed the establishment of comparative effects among themselves, for example, possible stimulation of plant growth mediated by the Trichoderma strains (treatments n ° 2, n ° 3 and n ° 4) with respect to their absence (treatment n ° 1).
  • Treatment n ° 1 only received the manipulations that took place in the other treatments, for example, application of the same number of irrigations (volume, vehicle, etc.) that was performed for the Trichoderma treatments, as well as the manipulations that supported the plants of the rest of treatments (transplants, etc.).
  • Treatment No. 5 it was the reference for disease control and treatments No. 6, No. 7 and No. 8 were the problem treatments for disease biocontrol.
  • V. dahliae pathogen for the artificial inoculation of the V. dahliae pathogen in olive plants, conidia suspensions of the VCG1A-3 isolate (patotype D) obtained from cultures in dextrose potato broth (CPD) of 7 days of growth at 24 ° C, 125 were used. rpm in the dark These cultures were established from colonies of V. dahliae in PDA 2-3 weeks of growth at 24 ° C and darkness; three portions (-0.5 cm 2 ) taken from active growing areas of the colonies were deposited in flasks with 100 ml of CPD. The conidia suspension was obtained by filtration of the liquid cultures through sterile double gauze. The concentration of the inoculum used in the experiments was adjusted to 5 x 10 6 conidia-ml "1 by microscopic counting in Neubauer chamber.
  • Scalpel incisions were made in the four corners of the pots in order to break the root system to facilitate the penetration of the pathogen and avoid direct manipulation of the plant. Subsequently, the plants were inoculated by the direct addition to the soil of 35 ml of the conidia suspension. Finally, the pots were placed individually on Petri dishes in the culture chambers under controlled conditions of photoperiod, light intensity, temperature and humidity.
  • the evolution of the plants against the development of the disease was analyzed.
  • the total number of leaves was determined as an index of defoliation, both of the main stem and secondary, and a scale of severity of damage was applied in order to establish the symptomatology of the development of the disease.

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Abstract

La invención se refiere al uso de cepas de hongos Trichoderma para la prevención y/o tratamiento de infecciones de plantas y/o suelos provocadas por hongos fitopatógenos pertenecientes al género Verticillium. Además, la invención se refiere a nuevas cepas de hongos perteneciente a las especies Trichoderma harzianum y Trichoderma atroviride que son también resistentes a cobre capaces de inhibir el crecimiento de otros microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatógenos. Por ello, se propone su uso como fertilizante y para la prevención y/o tratamiento de infecciones de plantas y/o suelos provocadas por microorganismos fitopatógenos, preferiblemente por los patotipos defoliante o no defoliante de Verticillium dahliae, agente causante de la verticilosis del olivo.

Description

CEPAS DE TRICHODERMA ÚTILES PARA EL TRATAMIENTO Y/O PREVENCIÓN DE INFECCIONES PROVOCADAS POR MICROORGANISMOS FITOPATÓGENOS
La presente invención se encuadra en el campo de la agricultura, la microbiología y los productos fitosanitarios, y específicamente se refiere a unas nuevas cepas de hongos pertenecientes a las especies Trichoderma atroviride y Trichoderma harzianum resistentes a cobre capaz de inhibir el crecimiento de otros microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatógenos. La invención también se refiere a una composición que comprende dichas cepas, así como al uso de estas cepas y de esta composición como fertilizantes y para la prevención y/o tratamiento de infecciones de plantas y/o suelos provocadas por microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatógenos. Además la presente invención se refiere al uso de la cepas Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma harzianum PF1 , Trichoderma atroviride IMI 206040 o cualquiera de sus combinaciones, entre si o con las nuevas cepas anteriores, para la prevención y/o tratamiento de infecciones de plantas y/o suelos provocadas por hongos fitopatógenos pertenecientes al género Verticillium, más preferiblemente por Verticillium dahliae, agente causante de las verticilosis. ESTADO DE LA TÉCNICA ANTERIOR
Las verticilosis o marchitez vascular son enfermedades causadas por el hongo hifomiceto Verticillium dahliae Kleb. que puede atacar a una amplia gama de cultivos, tanto leñosos como herbáceos, entre ellos frutales, legumbres, hortícolas, forestales, ornamentales y malas hierbas. Así, los ataques de verticilosis constituyen un serio problema en diversos cultivos como alcachofa, algodón, melón, tomate, patata u olivo.
Actualmente, en cultivos como el olivo, la verticilosis está considerada como uno de los problemas fitopatológicos más grave y amenazador, causante de importantes pérdidas económicas. La verticilosis del olivo (VO) es una enfermedad en preocupante expansión en países donde el olivar es un cultivo relevante, afectando severamente tanto a olivares adultos como a las plantaciones jóvenes, posiblemente como consecuencia, entre otras causas, del establecimiento de plantaciones intensivas en suelos infestados por el patógeno y/o de la utilización de material de plantación infectado. Los aislados de Verticillium dahliae que infectan olivos pueden ser diferenciados por su virulencia sobre la planta y clasificarse así en los patotipos defoliante (D) o no defoliante (ND) por su capacidad o no de originar la caída generalizada de las hojas verdes de ramos infectados, respectivamente. La VO puede llegar a producir la muerte de árboles enteros o la seca de ramas ocasionando un retraso en el crecimiento y mermas de producción.
En general, las verticilosis son enfermedades de difícil control, a lo cual contribuyen factores tales como la capacidad del patógeno de sobrevivir prolongadamente en el suelo (más de 15 años), la amplia gama de plantas susceptibles a la infección por éste, la dificultad de llegar hasta el hongo, ya que se encuentra en el xilema de la planta y enterrado en el suelo (entre 10 y 30 cm de profundidad), y la ineficacia de los tratamientos químicos hasta ahora explorados para combatir al hongo durante su fase parasítica en el xilema. Como sucede con otras verticilosis de plantas leñosas, el control eficiente de la VO requiere la aplicación de una estrategia de manejo integrado de la enfermedad (López-Escudero and Mercado-Blanco, 201 1 , Plant and Soil, 344, pp. 1 -50).
Las medidas de control de las enfermedades fúngicas del olivo han sido en muchos casos indirectas (eliminación de plantas enfermas, utilización de abonos potásicos, etc.). No obstante, desde la perspectiva de una agricultura sostenible y en una estrategia de control integrado de las enfermedades, una de las posibles medidas de control a aplicar es el uso de antagonistas microbianos con potencial como agentes de control biológico (ACBs) de la enfermedad. El control biológico de los organismos fitopatógenos constituye una alternativa más atractiva que la de los productos químicos, ya que estos ACBs son menos perjudiciales para el medio ambiente que los compuestos químicos habitualmente utilizados. Sin embargo, el uso de dichos ACBs se ha visto limitado por diferentes causas, entre ellas, una inadecuada identificación de los mismos. Algunas cepas del hongo filamentoso Trichoderma, como por ejemplo cepas pertenecientes a la especie Trichoderma harzianum, han sido utilizadas como agentes de control biológico contra hongos patógenos de plantas, debido a su capacidad protectora tanto contra hongos del suelo que infectan las raíces como contra los que producen enfermedades en las partes aéreas. Algunas de estas cepas tienen también un efecto fertilizante sobre las plantas, estimulando su vigor, crecimiento y mecanismos de defensa.
Las cepas de Trichoderma emplean distintos mecanismos para atacar a los hongos. Se han descrito relaciones de micoparasitismo entre Trichoderma harzianum y Rhizoctonia solani, Sclerotium rolfsii o Pythium, donde las enzimas líticas juegan un papel primordial, y relaciones de competición entre Trichoderma harzianum y Botrytis cinérea (en vid) o Fusarium (en algodón). Así, cepas de Trichoderma harzianum, Trichoderma virens y Trichoderma viride (Hermosa et al., 2000, Applied and Environmental Microbiology, 66:5, pp. 1890-1898), y otras de Trichoderma asperellum, Trichoderma atroviride y Trichoderma inhamatum (ES2200602 A1 ), han sido utilizadas en combinación como ACBs en composiciones contra diferentes hongos patógenos de plantas. Un ejemplo de composición sinérgica de este tipo es aquella que comprende diferentes cepas de Trichoderma harzianum (aquellas con número de acceso en la colección NRRL 30595, 30596 y 30597) que posee capacidad controladora de hongos fitopatógenos, es tolerante al estrés abiótico, estimula el crecimiento de la planta así como su contenido en fenoles e induce resistencia sistémica a enfermedades causadas por organismos fitopatógenos (WO20071 10686 A2).
En el caso del patógeno Verticillium dahliae, se han caracterizado una amplia gama de antagonistas del mismo, entre los que se encuentran diferentes cepas de Trichoderma (Berg et al., 2005, Applied and Environmental Microbiology, 71 :8, pp. 4203-4213). De hecho, uno de los métodos propuestos para el control biológico de este hongo fitopatógeno en el olivo se basa en la aplicación de esporas de Trichoderma harzianum, lo que además favorece la biofertilización (WO2009083819 A1 ). Los criterios a utilizar para la elección de las cepas de Trichoderma adecuadas para su empleo como ACBs presentan como principales características: 1 ) producción de enzimas líticos y 2) buen desarrollo en condiciones de competición. Esto último también depende de: 3) las condiciones de producción y preparación del inoculo y de 4) factores ambientales, incluyendo la presencia de fungicidas y/o pesticidas. En este sentido, se ha desarrollado una cepa muíante de Trichoderma harzianum CECT 2413, la cepa Trichoderma harzianum PF1 , que posee una capacidad de producción de enzimas líticos superior a la de la cepa salvaje, y se ha ensayado su efecto en el crecimiento de agentes fitopatógenos como Rhizoctonia solani o Botrytis cinérea, demostrándose que efectivamente su actividad antifúngica se encuentra incrementada con respecto a la de la cepa de la que procede (Rey et al., 2001 , Applied Microbiology and Biotechnology, 55, pp. 604-608).
En cuanto a la mejora de la capacidad de competición de las cepas en el entorno, éste es un proceso complejo pero en algunas aproximaciones experimentales se ha intentado la obtención de cepas mejoradas, más adaptables al entorno (aumento de los mecanismos de resistencia a la sequedad, a la presencia de metales, a la producción de enzimas o sustancias tóxicas por parte de los patógenos, capacidad de colonizar suelos con pHs extremos, etc.). Sobre todo, serían de interés cepas resistentes a fungicidas, lo que permitiría una mejor adaptación a un entorno tratado con estos compuestos y la posibilidad de un tratamiento integrado que combine pequeñas dosis de fungicidas a las que los patógenos sean sensibles combinadas con las cepas de Trichoderma resistentes. El efecto combinado permitiría un mejor control y una mayor protección que el simple tratamiento químico o biológico. Por otro lado, la competencia de las cepas de Trichoderma en el suelo podría optimizarse aplicando de forma óptima el ACB.
En resumen, sería deseable disponer de cepas de Trichoderma que proporcionasen un efecto paliativo mejorado frente a la infección por microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatógenos, concretamente frente a los patotipos ND y D de Verticillium dahliae en variedades de plantas susceptibles de ser infectadas por el mismo, como por ejemplo, el olivo. Para ello, es fundamental que dichas cepas con actividad como ACBs presenten una mejor capacidad de adaptación al medio, de manera que así puedan afrontar con éxito la competencia biológica que tiene lugar en el entorno a tratar. Además, sería interesante que estas cepas permitieran llevar a cabo un tratamiento combinado con fungicidas de naturaleza química.
DESCRIPCIÓN DE LA INVENCIÓN
La presente invención proporciona nuevas cepas de hongos, perteneciente a las especies Trichoderma atroviride y Trichoderma harzianum, capaces de inhibir el crecimiento de otros microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatogenos. Por ello, se propone su uso como ACBs frente a los mismos, preferiblemente frente a Verticillium, más preferiblemente frente a los patotipos D y ND de Verticillium dahliae, agente causante de las verticilosis.
Además, la presente invención proporciona el uso de otras cepas de hongos como son Trichoderma harzianum PF1 , Trichoderma atroviride IMI 206040 o Trichoderma harzianum CECT 2413 para la prevención y/o tratamiento de infecciones de plantas y/o suelos provocadas por hongos fitopatogenos pertenecientes al género Verticillium, más preferiblemente por los patotipos D o ND de Verticillium dahliae, agente causante de las verticilosis.
Los ejemplos de la presente invención demuestran que estas nuevas cepas, pertenecientes a Trichoderma atroviride y Trichoderma harzianum, presentan una capacidad de inhibir el crecimiento del hongo fitopatógeno Verticillium dahliae mejorada con respecto a otras cepas de su mismo género. Además, esta capacidad antifúngica se observa en aislados del patógeno, tanto sensibles como resistentes, a hongos del género Trichoderma. Por tanto, las cepas descritas en la presente invención poseen un elevado valor paliativo frente a la infección de plantas y/o suelos provocada por microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatogenos, más preferiblemente por Verticillium, aun más preferiblemente por Verticillium dahliae, siendo aplicable tanto en condiciones de vivero como de campo. Además, las cepas descritas en la presente invención son resistentes a cobre, por lo que presentan la ventaja de que, en comparación con otras cepas de su mismo género y especie, posee una mejor capacidad de adaptación a medios caracterizados por la presencia de contaminantes metálicos. Estos contaminantes metálicos son empleados comúnmente como antifúngicos y, entre ellos, el cobre es ampliamente utilizado en el sector del olivar. Así, la resistencia a cobre de dichas cepas permite sus usos de manera combinada con agentes antifúngicos químicos, lo que deriva en un mejor control y una mayor protección de la planta y/o el suelo frente a microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatógenos en comparación con el simple tratamiento químico o biológico.
Los ejemplos de la presente invención demuestran que la cepa Trichoderma harzianum PF1 presenta una capacidad de inhibir el crecimiento del hongo fitopatógeno Verticillium dahliae mejorada con respecto a la cepa de la que procede, Trichoderma harzianum CECT 2413, en aislados del patógeno tanto sensibles como resistentes a hongos del género Trichoderma. Esta capacidad es debida a su actividad superexcretora de enzimas hidrolíticas, como por ejemplo, aunque sin limitarnos, glucanasas, proteasas y/o quitinasas. Por tanto, la cepa de hongos Trichoderma harzianum PF1 posee un elevado valor paliativo y preventivo frente a la infección de plantas y/o suelos provocada por hongos fitopatógenos del género Verticillium, más preferiblemente por Verticillium dahliae, siendo aplicable tanto en condiciones de vivero como de campo.
Además, la actividad superexcretora de enzimas hidrolíticas de Trichoderma harzianum PF1 proporciona a esta cepa la ventaja de que, en comparación con otras cepas de su mismo género y especie, puede afrontar mejor la competencia biológica que tiene lugar en el entorno radicular de la planta a tratar.
Los ejemplos de la presente invención demuestran que la cepa Trichoderma atroviride IMI 206040 presenta una capacidad de inhibir el crecimiento del hongo fitopatógeno Verticillium dahliae mejorada con respecto a otras cepas de su mismo género, y esta inhibición se observa tanto en aislados del patógeno del patotipo D como del patotipo ND, y tanto sensibles como resistentes a hongos del género Trichoderma. Por tanto, la cepa de hongos Trichoderma atroviride IMI 206040 posee un elevado valor paliativo y preventivo frente a la infección de plantas y/o suelos provocada por hongos fitopatógenos del género Verticillium, más preferiblemente por Verticillium dahliae, siendo aplicable tanto en condiciones de vivero como de campo.
Los ejemplos de la presente invención demuestran que la cepa Trichoderma harzianum CECT 2413 es capaz de inhibir el crecimiento del hongo fitopatógeno Verticillium dahliae, y esta inhibición se observa tanto en aislados del patógeno del patotipo D como del patotipo ND, y tanto sensibles como resistentes a hongos del género Trichoderma. Además, los ejemplos demuestran que esta cepa posee un efecto preventivo frente a la infección de plantas por Verticillium dahliae mejorado con respecto a otras cepas de su mismo género. Por tanto, la cepa de hongos Trichoderma harzianum CECT 2413 posee un elevado valor paliativo y preventivo frente a la infección de plantas y/o suelos provocada por hongos fitopatógenos del género Verticillium, más preferiblemente por Verticillium dahliae, siendo aplicable tanto en condiciones de vivero como de campo.
Por todo ello, un aspecto de la invención se refiere a una cepa de Trichoderma seleccionada de entre la cepa de la especie Trichoderma atroviride depositada en la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT) con el número de depósito 20755 o la cepa de la especie Trichoderma harzianum depositada en la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT) con el número de depósito 20756.
La cepa de hongo de la especie Trichoderma atroviride depositada en la
Colección Española de Cultivos Tipo (CECT) con el número de depósito 20755, de ahora en adelante "primera cepa de la invención" o "RCU1 ", fue depositada en la CECT el 15 de octubre de 2009. Se trata de un muíante espontáneo (no manipulado genéticamente) resistente a cobre, concretamente, aunque sin limitarnos, a 4 mM de CU2SO4, derivado de Trichoderma atroviride IMI 206040. Esta primera cepa de la invención comparte sus características fenotípicas con la cepa de la que procede. Es capaz de crecer in vitro en, por ejemplo, aunque sin limitarnos, los medios de cultivo CECT 54/68, a una temperatura de incubación de, por ejemplo, aunque sin limitarnos, 25°C, durante, por ejemplo, aunque sin limitarnos, 5 días y en condiciones aerobias.
La cepa de hongo de la especie Trichoderma harzianum depositada en la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT) con el número de depósito 20756, de ahora en adelante "segunda cepa de la invención" o "RCU2", fue depositada en la CECT el 15 de octubre de 2009. Se trata de un muíante espontáneo (no manipulado genéticamente) resistente a cobre, concretamente, aunque sin limitarnos, a 4 mM de CU2SO4, derivado de Trichoderma harzianum CECT 2413. Esta segunda cepa de la invención comparte sus características fenotípicas con la cepa de la que procede. Es capaz de crecer in vitro en, por ejemplo, aunque sin limitarnos, los medios de cultivo CECT 54/68, a una temperatura de incubación de, por ejemplo, aunque sin limitarnos, 25°C, durante, por ejemplo, aunque sin limitarnos, 5 días y en condiciones aerobias.
En una realización preferida, las cepas de la invención se encuentran en estado esporulado. Se entiende por "estado esporulado" el estadio del hongo en el que éste se encuentra en forma de espora. El término "espora" se refiere a la célula reproductora producida en los esporangios de los hongos, ya sea asexualmente o como resultado de un proceso de reproducción sexual, generalmente haploide y unicelular, que al mismo tiempo permite la dispersión y la supervivencia por largo tiempo (dormancia) en condiciones adversas. La espora produce un nuevo organismo al dividirse por mitosis sin fusión con otra célula, produciendo un gametofito pluricelular. Cuando la espora germina surge de ella una primera hifa, por cuya extensión y ramificación se va constituyendo un micelio.
Otro aspecto de la invención se refiere a una composición, de ahora en adelante "composición de la invención", que comprende un elemento seleccionado de la lista:
a. una de las cepas de la invención o ambas, preferiblemente en estado esporulado,
b. productos del metabolismo de una de las cepas de la invención o ambas, o una combinación de (a) y de (b).
Tal y como se utiliza en la presente invención, el término "productos del metabolismo" o "metabolitos" se refiere a cualquier molécula excretada por la cepa o cepas de la invención al medio, preferiblemente cuando dichas cepas se encuentran creciendo en presencia de medio de cultivo PDA (Agar Patata- Dextrosa). Ejemplos de estos metabolitos son, aunque sin limitarnos, aminoácidos, nucleótidos, vitaminas, ácidos orgánicos, alcoholes, como los polioles, azúcares, como los polisacáridos, antibióticos, enzimas, tales como por ejemplo, aunque sin limitarnos, enzimas hidrolíticas de pared celular, etc.
En los ejemplos de la presente invención se demuestra la eficacia, no solo de las cepas de la invención y de sus productos del metabolismo, sino también de otras cepas de Trichoderma, además de Trichoderma atroviride CECT 20755 y Trichoderma harzianum CECT 20756, en concreto Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 y Trichoderma harzianum PF1 , y de los productos del metabolismo de éstas, para inhibir el crecimiento de microorganismos fitopatógenos, como por ejemplo, aunque sin limitarnos, de Verticillium dahliae. Por ello, en una realización preferida de este aspecto de la invención, la composición de la invención además de cualquiera de las cepas de la invención (Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756 o ambas), comprende al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista: Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 o Trichoderma harzianum PF1 .
En los ejemplos de la presente invención también se demuestra la eficacia de la composición de la invención que comprende las cinco cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma harzianum CECT 20756 y Trichoderma harzianum PF1 , para inhibir el crecimiento de microorganismos fitopatógenos, como por ejemplo, aunque sin limitarnos, de Verticillium dahliae. Por ello, en una realización más preferida, la composición de la invención comprende un elemento seleccionado de la lista: a. cepas de la invención, es decir, Trichoderma atroviride CECT 20755 y Trichoderma harzianum CECT 20756, preferiblemente en estado esporulado,
b. productos del metabolismo de las cepas de la invención,
o una combinación de (a) y de (b),
y además las cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 y Trichoderma harzianum PF1 .
En una realización aún más preferida, la composición de la invención comprende: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 y Trichoderma harzianum PF1 . Preferiblemente, la proporción de cada cepa en la composición de la invención varía entre un 10% y un 30% del volumen final de la composición (hasta sumar un total de 100% con las cinco cepas); más preferiblemente la proporción de cada cepa en la composición de la invención es de un 20% del volumen final de dicha composición, es decir, las cinco cepas se encuentran en la composición de la invención en la misma proporción (1 :1 :1 :1 :1 ).
En otra realización preferida las cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 y/o Trichoderma harzianum PF1 se encuentran en estado esporulado en la composición de la invención.
En otra realización preferida la composición de la invención además comprende productos del metabolismo de al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista: Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 o Trichoderma harzianum PF1 .
Las cepas Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413, y el muíante Trichoderma harzianum PF1 , se encuentran accesibles para un experto en la materia.
Las cepas Trichoderma harzianum CECT 2413 y Trichoderma atroviride
IMI 206040 son identificables tanto por sus características morfológicas, las cuales se pueden encontrar descritas en bases de datos para Trichoderma tales como por ejemplo, pero sin limitarnos, la recogida en http://www.isth.info, como por ciertos marcadores moleculares, como por ejemplo, aunque sin limitarnos, la secuencia de los espaciadores internos de los genes de rRNA, ITS1 e ITS2. El muíante derivado de Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma harzianum PF1 , inducida con nitrosoguanidina, se caracteriza por su capacidad superexcretora de enzimas hidrolíticas (glucanasas, proteasas y/o quitinasas). Esta cepa comparte las características morfológicas de la cepa de la que procede.
Preferiblemente, la composición de la invención además comprende elementos necesarios para el crecimiento y desarrollo de las cepas de la invención y de las cepas de Trichoderma mencionadas en el párrafo anterior. Así, dicha composición puede comprender aunque sin limitarnos, fuentes de carbono, sales minerales y/o nutrientes orgánicos e inorgánicos.
La composición de la invención puede presentarse en cualquier forma de presentación adecuada para su administración o aplicación, por ejemplo, aunque sin limitarse, en forma sólida o líquida. Las formas de presentación líquidas son adecuadas para su pulverización sobre el suelo, la planta o el material vegetal, o bien para crear una solución en la que se sumergen las plantas o el material vegetal, por lo que preferiblemente la composición de la invención se presenta en forma líquida.
Los ejemplos de la presente invención demuestran que cuando se inoculan microorganismos fitopatógenos tales como por ejemplo, aunque sin limitarnos, Verticillium dahliae, en un medio de cultivo donde previamente ha crecido al menos una de las cepas de la invención y excretado toda clase de metabolitos antes de ser retiradas de dicho medio, existe inhibición del crecimiento del microorganismo fitopatógeno. También demuestran dicha inhibición cuando el patógeno se inocula en un medio de cultivo donde previamente han crecido las cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride CECT 20755 Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 y/o Trichoderma harzianum PF1 y excretado toda clase de metabolitos antes de ser retiradas de dicho medio. Así, los inventores ponen de manifiesto que tanto el micelio de las cepas de la invención y de estas otras cepas de Trichoderma, como los metabolitos excretados al medio por las mismas, son capaces de inhibir el crecimiento de microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatógenos tales como por ejemplo, aunque sin limitarnos, Verticillium dahliae. Por ello, otro aspecto de la invención se refiere al uso de las cepas de la invención, preferiblemente en estado esporulado, y/o de los productos de su metabolismo, o de la composición de la invención, para la prevención y/o tratamiento de infecciones provocadas por microorganismos fitopatógenos.
Una vez excretados, los productos del metabolismo de las cepas de la invención, o de las cepas Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 o Trichoderma harzianum PF1 , pueden ser aislados y aplicados, solos o en combinación con dichas cepas, directamente a la planta, tanto a las raíces como a la parte aérea, al material vegetal, incluyendo pero sin limitarnos semillas, hojas o frutos, o al suelo. Cuando los productos del metabolismo son administrados en combinación con las cepas de la invención, o con las cepas Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 o Trichoderma harzianum PF1 , el modo de administración puede ser simultáneo o secuencial. O bien, las cepas pueden ser administradas solas tanto a las raíces como a la parte aérea de la planta, al material vegetal, incluyendo pero sin limitarnos semillas, hojas o frutos, o al suelo, de manera que produzcan dichos productos del metabolismo in situ.
El término "tratamiento", tal como se entiende en la presente invención, se refiere a combatir los efectos provocados como consecuencia de una infección causada por microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatógenos, más preferiblemente por Verticillium, aun más preferiblemente por Verticillium dahliae, en una planta, en un cultivo o en un suelo. Este término incluye:
(i) inhibir la infección, es decir, detener su desarrollo;
(ii) aliviar los efectos provocados por la infección, es decir, causar su regresión;
(iii) estabilizar los efectos provocados por la infección. El término "prevención", tal como se entiende en la presente invención, consiste en evitar la aparición de daños cuya causa sean las infecciones provocadas por microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatogenos, más preferiblemente por Verticillium, aun más preferiblemente por Verticillium dahliae; es decir, evitar que se produzca la infección en una planta, en un cultivo o en un suelo, en particular, cuando dicha planta, cultivo o suelo tienen predisposición a la infección pero aún no se ha diagnosticado que la tengan.
Se entiende por "infección" la colonización de un organismo huésped, por ejemplo, aunque sin limitarnos, una planta, por agentes patógenos, los cuales en el contexto de la presente invención consisten en microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatogenos, que invaden el organismo y se multiplican en él, produciendo sustancias tóxicas. El organismo colonizador es perjudicial para el funcionamiento normal y la supervivencia del huésped, por lo que se califica al agente como patógeno o, en el contexto de la presente invención, como fitopatógeno. Dentro del término "infección" se incluyen tanto las infecciones localizadas que afectan a una única área del organismo huésped, como las infecciones generalizadas que afectan a todo el organismo; y tanto las infecciones sintomáticas como asintomáticas. Asimismo, dentro de dicho término se incluyen también las infestaciones de suelos provocadas por microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatogenos.
En la presente invención se entiende por "microorganismos fitopatogenos" aquellos microorganismos pertenecientes al reino Fungí o a la clase Oomycetes, capaces de provocar infecciones, y en ocasiones enfermedades, en las plantas. Ejemplos de microorganismos fitopatogenos pertenecientes a la clase Oomycetes son, aunque sin limitarnos, aquellos pertenecientes a los géneros Phytophthora, Plasmopara, Pseudoperonospora o Pythium. Los "hongos fitopatogenos" son aquellos organismos pertenecientes al reino Fungí capaces de provocar infecciones, y en ocasiones enfermedades, en las plantas por medio de alteraciones en su metabolismo, mediante por ejemplo, aunque sin limitarnos, la secreción de enzimas, toxinas, fitoreguladores y otras sustancias y, además, mediante la absorción de nutrientes de la planta para su propio crecimiento. Se engloban dentro de este término los hongos fitopatogenos que causan enfermedades por crecer y multiplicarse en el xilema y/o floema de la planta y, por ende, por bloquear el transporte de agua y nutrientes desde la raíz hacia las hojas o el flujo de savia desde las hojas hacia el resto de la planta. Algunos ejemplos de hongos fitopatogenos son, aunque sin limitarnos, aquellos pertenecientes a los géneros Armillaria, Botrytis, Chondrostereum, Colletotrichum, Cladosporium, Fusarium, Monilia, Nectria, Rhizoctonia, Rhizopus, Sclerotinia, Sclerotium o Verticillium.
La presencia de microorganismos fitopatogenos en las plantas o en el suelo puede detectarse mediante técnicas de biología molecular conocidas en el estado de la técnica para llevar a cabo dicha identificación, como por ejemplo, amplificando mediante, por ejemplo, aunque sin limitarnos, reacción en cadena de la polimerasa (PCR), reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (RT-PCR) o Q-PCR, una región del genoma del microorganismo fitopatógeno presente en una muestra aislada del suelo o de la planta y comparando el producto de amplificación obtenido con las secuencias génicas disponibles en bases de datos tales como, por ejemplo, pero sin limitarnos, GenBank, específicas de organismo para determinar el tipo de patógeno presente en la muestra. La presencia de microorganismos fitopatogenos en las plantas o en el suelo también podría llevarse a cabo mediante técnicas inmunohistoquímicas, como por ejemplo, pero sin limitarnos, ELISA; o bien mediante el crecimiento in vitro de los organismos contenidos en la muestra aislada de suelo o de la planta en medios de cultivo selectivos específicos de patógeno conocidos en el estado de la técnica.
Algunas cepas pertenecientes al género Trichoderma son capaces de ejercer una inhibición del crecimiento no solo sobre un único tipo de microorganismo fitopatógeno sino sobre una amplia variedad de ellos, como es el caso de cepas pertenecientes a las especies Trichoderma atroviride o Trichoderma harzianum. Por ello, aunque los ejemplos de la presente invención demuestren el efecto de las cepas mencionadas y de la composición de la invención en la inhibición del crecimiento del hongo fitopatógeno Verticillium dahliae, dichas cepas y composición también son de utilidad en la prevención y/o tratamiento de infecciones provocadas por otros microorganismos fitopatogenos susceptibles de ser controlados por cepas pertenecientes a las especies Trichoderma atroviride o Trichoderma harzianum.
Por tanto, en una realización preferida de este aspecto de la invención el microorganismo fitopatógeno pertenece a un género seleccionado de la lista que comprende: Armillaria, Botrytis, Chondrostereum, Colletotrichum, Cladosporium, Fusarium, Monilia, Nectria, Phytophthora, Plasmopara, Pseudoperonospora, Pythium, Rhizoctonia, Rhizopus, Sclerotinia, Sclerotium o Verticillium. En una realización más preferida, el microorganismo fitopatógeno pertenece al género Verticillium. En una realización aun más preferida, el microorganismo fitopatógeno es Verticillium dahliae.
El género de hongos Verticillium pertenece a la división o filo Ascomicota, familia Plectosphaerellaceae e incluye diversos grupos que comprenden parásitos y saprofitos de plantas, insectos, nemátodos, huevos de moluscos y otros hongos, por lo que el género tiene un amplio rango de grupos taxonómicos, conteniendo unas 51 especies, entre las que se encuentran, aunque sin limitarnos, Verticillium dahliae, Verticillium alboatrum, Verticillium nubilium, Verticillium nigrescens o Verticillium tricorpus. Las especies de este género son las causantes de las enfermedades conocidas como verticilosis.
El método más sencillo para identificar a patógenos del género Verticillium es, por ejemplo, aunque sin limitarnos, el cultivo en un medio selectivo, como por ejemplo, pero sin limitarnos, en medio PDA (Agar Patata- Dextrosa) a temperatura ambiente, donde las colonias crecen de color blanco y el color del fondo de las placas es entre incoloro y amarillento. Algunos cultivos pueden tener un perfil bajo con bordes redondeados y formando curvas. Las especies Verticillium alboatrum, Verticillium dahliae y Verticillium tricorpus presentan colonias postradas y de un color amarillo anaranjado en medio de cultivo PDA, la especie Verticillium nubilium forma clamidosporas globosas y Verticillium nigrescens forma clamidosporas abundantes.
La especie Verticillium dahliae se caracteriza por la producción de conidióforos con fiálidas dispuestas en verticilo y la formación de numerosos microesclerocios, estructuras de resistencia. El hongo se puede encontrar en el suelo en forma de micelio y conidios, aunque preferiblemente se encuentra en forma de microesclerocios. Algunos cultivos infectados por este patógeno pueden ser asintomáticos. En el olivar se distinguen dos tipos de síndromes derivados de esta infección que origina la enfermedad denominada "verticilosis": apoplejía y decaimiento lento. Los síntomas iniciales del primer síndrome consisten en la pérdida de coloración de las hojas, más tarde se produce una seca rápida de brotes y ramas que suele comenzar desde la punta y que puede ocasionar la muerte del árbol. La corteza de las ramas afectadas puede tomar color morado o púrpura y a veces también se observa una coloración marrón en los tejidos del xilema. Los síntomas más típicos del decaimiento lento son la necrosis y momificado de las inflorescencias mientras que las hojas generalmente se desprenden, excepto las del extremo. En el contexto de la presente invención, se incluyen dentro de Verticillium dahliae tanto su patotipo defoliante (D) como su patotipo no defoliante (ND). El patotipo D de Verticillium dahliae se caracteriza por provocar, en olivar y algodonero, la caída generalizada de las hojas verdes de ramos infectados, al contrario que el patotipo ND. El diagnóstico de la infección por uno u otro patotipo de V. dahliae podría llevarse a cabo mediante técnicas de visualización fenotípica en base a la característica sintomática anteriormente mencionada, o bien mediante técnicas moleculares de caracterización de ambos patotipos, como por ejemplo, pero sin limitarnos, mediante PCR (Mercado-Blanco et al., 2003, Plant Disease, 87, pp. 1487-1494).
Ejemplos de plantas susceptibles a la infección por Verticillium dahliae son, pero sin limitarnos, alcachofa, algodón, melón, tomate, patata u olivo. Por tanto, en otra realización preferida, la planta afectada por el microorganismo fitopatógeno se selecciona de la lista que comprende: alcachofa, algodón, melón, tomate, patata u olivo. En una realización más preferida, la planta es el olivo. Cuando Verticillium dahliae infecta al olivo provoca lo que se denomina "verticilosis del olivo o VO". La presente invención se refiere tanto a las variedades de olivo muy susceptibles al patotipo D, como por ejemplo, aunque sin limitarnos, Picual o Arbequina, como a las variedades susceptibles al patotipo ND. Como se ha explicado anteriormente, las cepas de la invención son resistentes a cobre, metal utilizado como fungicida principalmente en el sector del olivar. Por tanto, esta capacidad de las cepas de la invención permite sus usos, de manera individual o en conjunto, en un método de tratamiento y/o prevención de infecciones provocadas por microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatógenos de manera combinada con otros agentes antifúngicos. Por ello, otra realización preferida se refiere al uso de las cepas de la invención, y/o de los productos de su metabolismo, o de la composición de la invención, en combinación con otros agentes antifúngicos.
El término "agente antifúngico" se refiere a aquellas sustancias, tanto de naturaleza biológica como química, que se emplean para inhibir el crecimiento (fungistáticos) o para matar (fungicidas) a los hongos capaces de provocar infecciones en las plantas y/o suelos, preferiblemente a Verticillium, más preferiblemente a Verticillium dahliae. El término se refiere tanto a agentes antifúngicos protectores o de contacto, que se aplican antes de que se produzca la infección, como a agentes antifúngicos erradicadores o sistemáticos, que se aplican una vez producida la infección, así como a agentes antifúngicos de uso en revestimientos de semillas, de uso para desinfección del suelo, para su aplicación sobre las plantas, etc. Un ejemplo de agente antifúngico de naturaleza biológica son los microorganismos que actúan como ACBs de hongos fitopatógenos, como por ejemplo, pero sin limitarnos, hongos del género Trichoderma distintos a los comprendidos en la composición de la invención, hongos pertenecientes a otros géneros o bacterias, y sus mezclas, siempre y cuando éstos no sean incompatibles con las cepas de la invención y con los hongos comprendidos en la composición de la invención. Algunos tipos de agentes antifúngicos que podrían emplearse en combinación con la cepa de la invención, y/o con los productos de su metabolismo, o con la composición de la invención, son, aunque sin limitarnos, aquellos compuestos por cloruro de cobre, oxicloruro de cobre, óxido cúprico, "caldo bordelés", quinolinolato de cobre-8, carbonato de cobre básico, naftenato de cobre, sulfato de cobre, cromato de cobre u oleato de cobre. Por otro lado, los hongos pertenecientes al género Trichoderma con frecuencia actúan como agentes fertilizantes. Por esta razón, y porque además las cepas aquí mencionadas poseen capacidad para inhibir el crecimiento de microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatogenos, los cuales pueden comprometer la viabilidad y el desarrollo de la planta a la que infectan o la idoneidad del suelo de cultivo, otra aplicación de las cepas de la invención es su uso como fertilizante. Así, otro aspecto de la invención se refiere al uso de una de las cepas de la invención o ambas, y/o de los productos de su metabolismo, o de la composición de la invención, como fertilizante. Una realización preferida de este aspecto de la invención se refiere al uso de una de las cepas de la invención o ambas, y/o de los productos de su metabolismo, o de la composición de la invención, como fertilizante en plantas de olivo.
El término "fertilizante" se refiere a cualquier sustancia o mezcla de sustancias químicas y/o biológicas, de origen natural o sintético, utilizada para suministrar los elementos inorgánicos u orgánicos al suelo con el fin de que la planta los absorba y favorecer así su crecimiento o vigor.
Las cepas de Trichoderma aquí mencionadas, y/o los productos de su metabolismo, o la composición de la invención, pueden administrarse a una planta, a un suelo o al material vegetal, incluyendo pero sin limitarnos semillas, hojas o frutos, en combinación con uno o más agentes antifúngicos y/o fertilizantes de manera simultánea o secuencial.
Las cepas aquí mencionadas, y/o los productos de su metabolismo, así como la composición de la invención, se pueden administrar a, por ejemplo pero sin limitarnos, una planta, tanto a las raíces como a la parte aérea, al material vegetal, incluyendo pero sin limitarnos semillas, hojas o frutos, o al suelo, en una cantidad efectiva para el tratamiento y/o prevención de infecciones provocadas por microorganismos, preferiblemente hongos, fitopatogenos y para provocar la fertilización. En el sentido utilizado en esta descripción, el término "cantidad efectiva" se refiere a la cantidad suficiente de las cepas, y/o de los productos de su metabolismo, o de la composición de la invención, que permita obtener los resultados deseados. Dicha cantidad efectiva puede administrarse en una sola vez o en varias administraciones. En términos de tratamiento, prevención y fertilización, una "cantidad suficiente" es la cantidad suficiente para evitar, paliar, mejorar, estabilizar, revertir, retardar o retrasar los efectos derivados de las infecciones provocadas por microorganismos, preferiblemente hongos, patógenos de plantas, o para estimular el crecimiento de las mismas. Preferiblemente, la cantidad efectiva a administrar de las cepas en estado esporulado es de entre 104 y 106 esporas/ml de agua de riego, y más preferiblemente de 105 esporas/ml (a partir de 1 ,4 x 1011 unidades formadoras de colonias/g).
El modo de administración de las cepas, y/o de los productos de su metabolismo, así como de la composición de la invención, puede realizarse, por ejemplo, aunque sin limitarnos, mediante el agua de riego, pulverización, rociado, revestimiento, fumigación, impregnación, mezcla con el sustrato, inmersión de la raíz de la planta en una solución que comprenda las cepas, o esporas de las mismas pregerminadas, y/o los productos de su metabolismo, o la composición de la invención.
El término "género" se refiere a la categoría de la clasificación biológica (categoría taxonómica) que se ubica entre la familia y la especie y que comprende una o más especies morfológicamente similares relacionadas filogenéticamente. Por "categoría taxonómica" se entiende el nivel de jerarquía utilizado para la clasificación de los organismos.
Otro aspecto de la invención se refiere al uso de la cepa Trichoderma harzianum PF1 y/o de los productos de su metabolismo para la prevención y/o tratamiento de infecciones provocadas por hongos fitopatógenos pertenecientes al género Verticillium. Una realización preferida de este aspecto de la invención se refiere a dicho uso en combinación con al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista que comprende: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 o Trichoderma harzianum CECT 2413. En una realización más preferida, dicho uso es en combinación con las cepas de Trichoderma Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 y Trichoderma harzianum CECT 2413. En una realización aún más preferida, dichas cepas de Trichoderma se encuentran en estado esporulado.
Otra realización preferida de este aspecto de la invención se refiere a dicho uso en combinación con productos del metabolismo de al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista que comprende: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 o Trichoderma harzianum CECT 2413. Una realización más preferida se refiere a dicho uso en combinación con productos del metabolismo de las cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 y Trichoderma harzianum CECT 2413.
Otro aspecto de la invención se refiere al uso de la cepa Trichoderma atroviride IMI 206040 y/o de los productos de su metabolismo para la prevención y/o tratamiento de infecciones provocadas por hongos fitopatogenos pertenecientes al género Verticillium. Una realización preferida de este aspecto de la invención se refiere a dicho uso en combinación con al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista que comprende: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma harzianum PF1 o Trichoderma harzianum CECT 2413. En una realización más preferida, dicho uso es en combinación con las cepas de Trichoderma Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma harzianum PF1 y Trichoderma harzianum CECT 2413. En una realización aún más preferida, dichas cepas de Trichoderma se encuentran en estado esporulado.
Otra realización preferida de este aspecto de la invención se refiere a dicho uso en combinación con productos del metabolismo de al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista que comprende: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma harzianum PF1 o Trichoderma harzianum CECT 2413. Una realización más preferida se refiere a dicho uso en combinación con productos del metabolismo de las cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma harzianum PF1 y Trichoderma harzianum CECT 2413.
Y otro aspecto de la invención se refiere al uso de la cepa Trichoderma harzianum CECT 2413 y/o de los productos de su metabolismo para la prevención y/o tratamiento de infecciones provocadas por hongos fitopatógenos pertenecientes al género Verticillium. Una realización preferida de este aspecto de la invención se refiere a dicho uso en combinación con al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista que comprende: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 o Trichoderma harzianum PF1 . En una realización más preferida, dicho uso es en combinación con las cepas de Trichoderma Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 y Trichoderma harzianum PF1 . En una realización aún más preferida, dichas cepas de Trichoderma se encuentran en estado esporulado.
Otra realización preferida de este aspecto de la invención se refiere a dicho uso en combinación con productos del metabolismo de al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista que comprende: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 o Trichoderma harzianum PF1 . Una realización más preferida se refiere a dicho uso en combinación con productos del metabolismo de las cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 y Trichoderma harzianum PF1 .
En una realización preferida, el hongo fitopatógeno es Verticillium dahliae.
En otra realización preferida, la planta afectada por el hongo fitopatógeno se selecciona de la lista que comprende: alcachofa, algodón, melón, tomate, patata u olivo. Más preferiblemente la planta es el olivo.
A lo largo de la descripción y las reivindicaciones la palabra "comprende" y sus variantes no pretenden excluir otras características técnicas, aditivos, componentes o pasos. Para los expertos en la materia, otros objetos, ventajas y características de la invención se desprenderán en parte de la descripción y en parte de la práctica de la invención. Los siguientes ejemplos y dibujos se proporcionan a modo de ilustración, y no se pretende que sean limitativos de la presente invención.
DESCRIPCIÓN DE LAS FIGURAS
Fig. 1. Muestra los resultados de los ensayos de enfrentamiento directo entre las cepas de Trichoderma y dos aislados de Verticillium dahliae. (A) Placas de Petri en las que se encuentran creciendo en un extremo las cepas Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma atroviride RCU1 o Trichoderma harzianum CECT 2413, y en el extremo opuesto los aislados de Verticillium dahliae 1A-2 ó 2A-12. (B) Placas de Petri en las que se encuentran creciendo en un extremo las cepas Trichoderma harzianum RCU2, Trichoderma harzianum PF1 o una combinación de las cinco cepas formada por 1/5 de cada una (formulación), y en el extremo opuesto los aislados de Verticillium dahliae 1A-2 ó 2A-12. Control: cajas de Petri en las que únicamente se inoculó Verticillium dahliae 1A-2 ó 2A-12. Las imágenes se tomaron tras 18 días de crecimiento.
Fig. 2. Muestra el crecimiento de dos aislados de Verticillium dahliae, 1A-2 (A) y 2A-12 (B), en medios donde habían crecido previamente las cepas de Trichoderma, Trichoderma atroviride IMI 206040 (7. atroviride), Trichoderma atroviride RCU1, Trichoderma harzianum CECT 2413 (7. harzianum), Trichoderma harzianum RCU2 o Trichoderma harzianum PF1 , o una combinación de las cinco cepas formada por 1/5 de cada una (formulación). La figura muestra el crecimiento de dos aislados del patógeno en presencia de metabolitos excretados por las diferentes cepas de Trichoderma. Control: crecimiento de Verticillium dahliae 1A-2 (A) ó 2A-12 (B) en cajas de Petri en las que no había crecido ninguna cepa de Trichoderma previamente.
Fig. 3. Muestra los resultados de los ensayos de enfrentamiento directo entre la cepa Trichoderma atroviride IMI 206040, o una combinación de Trichoderma atroviride IMI 206040 y Trichoderma harzianum CECT 2413, y distintos aislados de Verticillium dahliae. Placas de Petri conteniendo PDA a distintos tiempos de incubación (3 y 15 días) a 22 °C en las que se encuentran creciendo: (A) diferentes aislados de V. dahliae (control), (B) diferentes aislados de V. dahliae en un extremo y Trichoderma atroviride IMI 206040 en otro extremo, (C) diferentes aislados de V. dahliae en un extremo y una combinación de las cepas Trichoderma atroviride IMI 206040 y Trichoderma harzianum CECT 2413 en otro extremo.
Fig. 4. Muestra el crecimiento de distintos aislados de Verticillium dahliae durante los ensayos de enfrentamiento directo con las cepas Trichoderma harzianum CECT 2413 (2413), Trichoderma viride CECT 2423 (2423) o Trichoderma atroviride IMI 206040 (IMI), o combinaciones de las mismas, a los 3 (blanco), 6 (gris) y 15 (negro) días de incubación. (A) Aislado de V. dahliae 1A-2. (B) Aislado de V. dahliae 1A-3. (C) Aislado de V. dahliae 1A-4. (D) Aislado de V. dahliae 2A-12. (E) Aislado de V. dahliae 2A-16. (F) Aislado de V. dahliae 2A-17. (G) Aislado de V. dahliae 4B-31 . (H) Aislado de V. dahliae 4B-34. (I) Aislado de V. dahliae 4B-35.
Fig. 5. Muestra la inhibición del crecimiento (%) en cultivos de diez días de los distintos aislados de Verticillium (1A2, 1A3, 1A4, 2A12, 2A16, 2A17, 4B31 , 4B34, 4B35) por los metabolitos de las cepas T. harzianum CECT 2413 (2413), T. atroviride IMI 206040 (IMI) y T. viride CECT 2423 (VIRIDE) o por los metabolitos de las combinaciones de estas cepas entre sí.
Fig. 6. Muestra los resultados de los ensayos de enfrentamiento directo entre la cepa Trichoderma harzianum CECT 2413, o una combinación de Trichoderma harzianum CECT 2413 y Trichoderma atroviride IMI 206040, y distintos aislados de Verticillium dahliae. Placas de Petri conteniendo PDA a distintos tiempos de incubación (3 y 15 días) a 22 °C en las que se encuentran creciendo: (A) diferentes aislados de V. dahliae (control), (B) diferentes aislados de V. dahliae en un extremo y Trichoderma harzianum CECT 2413 en otro extremo, (C) diferentes aislados de V. dahliae en un extremo y una combinación de las cepas Trichoderma harzianum CECT 2413 y Trichoderma atroviride IMI 206040 en otro extremo. Fig. 7. Muestra la evolución del número total de hojas a lo largo del tiempo en plantas de olivo inoculadas con V. dahliae (vert.) y tratadas previamente con cepas de T. harzianum CECT 2413 (T. Harz.), T. asperellum (T. Asp.) o la mezcla ambas cepas. Cont.+vert.: Control, plantas de olivo tratadas con V. dahliae pero no con Trichoderma.
Fig. 8. Muestra el análisis de la sintomatología de la enfermedad mediante la escala de severidad de daño a lo largo del tiempo en plantas de olivo previamente tratadas con cepas de T. harzianum CECT 2413 (T. Harz.), T. asperellum (T. Asp.) o con la mezcla de ambas cepas, durante el tratamiento con V. dahliae (vert.). Cont.+vert.: Control, plantas de olivo tratadas con V. dahliae pero no con Trichoderma.
EJEMPLOS
A continuación se ilustrará la invención mediante unos ensayos realizados por los inventores, que ponen de manifiesto la efectividad de las cepas y de la composición descritas en la presente invención en la inhibición del crecimiento de aislados representativos de los patotipos D y ND del hongo fitopatógeno Verticillium dahliae. Estos ejemplos específicos que se proporcionan sirven para ilustrar la naturaleza de la presente invención y se incluyen solamente con fines ilustrativos, por lo que no han de ser interpretados como limitaciones a la invención que aquí se reivindica. Por tanto, los ejemplos descritos más adelante ilustran la invención sin limitar el campo de aplicación de la misma. EJEMPLO 1. Ensayos de antagonismo in vitro de distintas cepas de Trichoderma y aislados de Verticillium dahliae.
Se procedió a la realización de un conjunto de ensayos de antagonismo in vitro de distintas cepas de Trichoderma, o combinaciones de cepas, con el objeto de determinar su capacidad antifúngica frente a aislados de Verticillium dahliae suministrados por el Instituto de Agricultura Sostenible (IAS-CSIC- Córdoba). Así, se realizaron dos tipos de ensayos de antagonismo: uno de confrontación directa y otro de capacidad de crecimiento de distintos aislados de Verticillium dahliae en un medio donde Trichoderma había crecido previamente y excretado toda clase de metabolitos (incluidos antibióticos y enzimas hidrolíticas de pared celular). Como se explicará más adelante, los ensayos incluyeron enfrentamiento directo en medio sólido y ensayos con celofanes para ver el efecto de las sustancias secretadas por Trichoderma, siguiendo protocolos habituales en el laboratorio para ensayos con Rhizoctonia y Fusarium.
Además, se procedió al desarrollo y caracterización de mutantes espontáneos resistentes a cobre (a 4 mM de Cu2S04) derivados de Trichoderma harzianum y de Trichoderma atroviride, con el objeto de disponer así de cepas resistentes a los contaminantes metálicos utilizados como antifúngicos, entre los cuales el cobre es ampliamente utilizado en el sector del olivar. Concretamente, dichas cepas mutantes son las que a continuación se detallan y que en la actualidad se encuentran depositadas en la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT):
-Trichoderma atroviride RCU1 (número de depósito en la CECT 20755), derivado de Trichoderma atroviride IMI 206040, o primera cepa de la invención. -Trichoderma harzianum RCU2 (número de depósito en la CECT 20756), derivado de Trichoderma harzianum CECT 2413, o segunda cepa de la invención.
Además de estas dos cepas, en los ensayos de la presente invención se utilizaron las siguientes cepas de Trichoderma: Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma atroviride IMI 206040 y Trichoderma harzianum PF1 . Esta última cepa es un muíante inducido con nitrosoguanidina derivado de Trichoderma harzianum CECT 2413 con una elevada capacidad antifúngica y que se caracteriza como superexcretor de enzimas hidrolíticas (glucanasas, proteasas y quitinasas). Así, se han realizado también ensayos para comprobar la eficacia in vitro de una composición que comprende estas cinco cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma atroviride RCU1 , Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma harzianum RCU2 y Trichoderma harzianum PF1 . En los experimentos se pretendía, por tanto, establecer la capacidad de distintas cepas del hongo Trichoderma de controlar a aislados de Verticillium dahliae causantes de la verticilosis en el olivo.
En cuanto a los aislados de Verticillium dahliae empleados en los ensayos, se seleccionaron dos aislados con distinta sensibilidad a Trichoderma: el aislado 1A-2, representante del patotipo D, y el aislado 2A-12 (más sensible), caracterizado como patotipo ND.
1 .1 . Ensayos de confrontación directa de distintas cepas de Trichoderma y aislados de Verticillium dahliae.
Los ensayos de confrontación directa consistieron en inocular una porción de micelio de los distintos aislados de V. dahliae a ensayar (1A-2 ó 2A- 12) en un extremo de cajas de Petri conteniendo medio de cultivo nutritivo PDA (puré de patatas 2%, glucosa 2%, agar 2%). Las cajas se incubaron a 22 °C durante 4 días para permitir el crecimiento del patógeno y posteriormente se inocularon, en el extremo opuesto de las cajas, 20 μΙ de esporas de las distintas cepas de Trichoderma a una concentración de 105 esporas/ml. Las cajas continuaron incubándose a 22°C durante 18 días. Como control se inocularon cajas con medio nutritivo PDA con los distintos aislados de V. dahliae en las que no se inoculó Trichoderma.
Al cabo del tiempo, los hongos entraron en contacto y podían darse dos situaciones distintas: que ambos parasen su crecimiento en la zona de contacto o que uno de ellos provocase una lisis del micelio del otro y acabase creciendo por encima de éste. De hecho, el efecto antagonista se comprobó viendo el sobrecrecimiento de Trichoderma y la posible muerte del patógeno al microscopio y por siembra en medio selectivo para el patógeno (crecimiento en presencia de tóxicos en el que Trichoderma no podía crecer pero al que el patógeno era resistente).
En la figura 1 se aprecian los resultados de los enfrentamientos con los diferentes aislados de Verticillium. Se observó que las cepas de Trichoderma empleadas sobrecrecen al patógeno, reduciendo el área ocupada por el mismo. Como se puede observar en esta figura, la composición de las cinco cepas de Trichoderma (formulación) es más eficaz frente a los dos aislados de Verticillium dahliae ensayados que la mayoría de las cepas que la componen por separado, salvo en el caso de Trichoderma atroviride IMI 206040 y de su cepa derivada, RCU1 , que presentan una capacidad similar.
1 .2. Ensayos de capacidad de crecimiento de distintos aislados de Verticillium dahliae en presencia de metabolitos excretados por
Trichoderma.
Se realizaron ensayos de capacidad de crecimiento del patógeno en presencia de metabolitos excretados por Trichoderma mediante el cultivo de las cepas de Trichoderma sobre un disco de celofán permeable a metabolitos extracelulares (hidrolasas, antibióticos, etc.) colocado a su vez sobre el medio de cultivo PDA de una caja de Petri, a 22 °C. A los cuatro días de crecimiento, se retiró el celofán y con él el micelio desarrollado y un trozo de micelio del patógeno se colocó en el centro de las cajas. Para analizar cuantitativamente los resultados obtenidos en este ensayo con celofanes, a los diez días se midió el área de crecimiento de los distintos aislados de V. dahliae y se comparó el diámetro de crecimiento del patógeno en cajas control con el crecimiento en cajas donde Trichoderma había crecido sobre un celofán y que previamente había sido retirado antes de inocular el patógeno.
Los resultados obtenidos se representan en la figura 2 a diferentes tiempos de incubación (días). En este sentido, en ensayos para determinar la capacidad de inhibir el crecimiento de V. dahliae que tienen los metabolitos excretados por las diferentes cepas de Trichoderma ensayadas, se observaron resultados similares a los anteriores aunque diferentes según la cepa del patógeno. La formulación (combinación de las cinco cepas) fue tan eficaz como las cepas que la componían contra el aislado más sensible del patógeno (2A- 12, patotipo ND) pero fue intermedia contra el aislado más resistente (1A-2, patotipo D). Esto último puede deberse a un efecto de dilución de los metabolitos que intervienen en esta interacción debido a que en la formulación las cepas iban en una proporción 1/5 cada una.
En resumen, estos resultados determinan la capacidad específica de las cepas de Trichoderma propuestas en la presente invención de controlar e impedir in vitro el desarrollo del patógeno Verticillium dahliae. EJEMPLO 2. Ensayos de antagonismo in vitro de distintas cepas de Trichoderma y aislados de Verticillium dahliae.
Se procedió a la realización de un conjunto de ensayos de antagonismo in vitro de distintas cepas de Trichoderma, o combinaciones de cepas, con el objeto de determinar su capacidad antifúngica frente a aislados de Verticillium dahliae suministrados por el Instituto de Agricultura Sostenible (IAS-CSIC- Córdoba). Así, se realizaron dos tipos de ensayos de antagonismo: uno de confrontación directa y otro de capacidad de crecimiento de distintos aislados de Verticillium dahliae en un medio donde Trichoderma había crecido previamente y excretado toda clase de metabolitos (incluidos antibióticos y enzimas hidrolíticas de pared celular). Como se explicará más adelante, los ensayos incluyeron enfrentamiento directo en medio sólido y ensayos con celofanes para ver el efecto de las sustancias secretadas por Trichoderma, siguiendo protocolos habituales en el laboratorio para ensayos con Rhizoctonia y Fusarium.
Las cepas de Trichoderma utilizadas en los ensayos fueron: Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma viride CECT 2423 y Trichoderma atroviride IMI 206040, así como las siguientes combinaciones de las mismas: T. atroviride IMI 206040 + T viride CECT 2423, T harzianum CECT 2413 + T. atroviride IMI 206040, y T harzianum CECT 2413 + T viride CECT 2423, y en combinación con los aislados de Verticillium 1A-2, 1A-3, 1A-4, caracterizados como patotipo D, y 2A-12, 2A-16, 2A-17,4B-31 , 4B-34, 4B-35, del patotipo ND.
Además, se procedió al desarrollo y caracterización de mutantes espontáneos resistentes a cobre (a 4 mM de Cu2S04) derivados de Trichoderma harzianum y de Trichoderma atroviride, con el objeto de disponer así de cepas resistentes a los contaminantes metálicos utilizados como antifúngicos, entre los cuales el cobre es ampliamente utilizado en el sector del olivar. Concretamente, dichas cepas mutantes son las que a continuación se detallan y que en la actualidad se encuentran depositadas en la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT):
-Trichoderma atroviride RCU1 (número de depósito en la CECT 20755), derivado de Trichoderma atroviride IMI 206040. -Trichoderma harzianum RCU2 (número de depósito en la CECT 20756), derivado de Trichoderma harzianum CECT 2413.
Además, en los ensayos de la presente invención se incluyó también la cepa Trichoderma harzianum PF1 , muíante inducido con nitrosoguanidina derivado de Trichoderma harzianum CECT 2413 con una elevada capacidad antifúngica y que se caracteriza como superexcretor de enzimas hidrolíticas (glucanasas, proteasas y quitinasas).
Se han realizado también ensayos para comprobar la eficacia in vitro de una composición que comprende cinco cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma atroviride RCU1 , Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma harzianum RCU2 y Trichoderma harzianum PF1 .
En los experimentos se pretendía, por tanto, establecer la capacidad de distintas cepas del hongo Trichoderma de controlar a aislados de Verticillium dahliae causantes de la verticilosis en el olivo.
2.1 . Ensayos de confrontación directa de distintas cepas de Trichoderma y aislados de Verticillium dahliae.
Los ensayos de confrontación directa consistieron en inocular una porción de micelio de los distintos aislados de V. dahliae a ensayar en un extremo de cajas de Petri conteniendo medio de cultivo nutritivo PDA (puré de patatas 2%, glucosa 2%, agar 2%). Las cajas se incubaron a 22 °C durante 4 días para permitir el crecimiento del patógeno y posteriormente se inocularon, en el extremo opuesto de las cajas, 20 μΙ de esporas de las distintas cepas de Trichoderma a una concentración de 105 esporas/ml. Las cajas continuaron incubándose a 22 °C durante 18 días. Como control se inocularon cajas con medio nutritivo PDA con los distintos aislados de V. dahliae en las que no se inoculó Trichoderma.
Al cabo del tiempo, los hongos entraron en contacto y podían darse dos situaciones distintas: que ambos parasen su crecimiento en la zona de contacto o que uno de ellos provocase una lisis del micelio del otro y acabase creciendo por encima de éste. De hecho, el efecto antagonista se comprobó viendo el sobrecrecimiento de Trichoderma y la posible muerte del patógeno al microscopio y por siembra en medio selectivo para el patógeno (crecimiento en presencia de tóxicos en el que Trichoderma no podía crecer pero al que el patógeno era resistente).
En la figura 3 se aprecian los resultados de los enfrentamientos de la cepa T. atroviride IMI 206040 (Fig. 3B), o de la combinación de cepas T. atroviride IMI 206040 y T harzianum CECT 2413 (Fig. 3C), con diferentes aislados de Verticillium. Así, se observó que la cepa T. atroviride IMI 206040 y la combinación de cepas T. atroviride IMI 206040 y T. harzianum CECT 2413 sobrecrecían al patógeno, reduciendo el área ocupada por el mismo.
Para analizar cuantitativamente los resultados obtenidos se midió el área de crecimiento de las distintas cepas de Verticillium en los diferentes ensayos de enfrentamiento con Trichoderma. Los resultados obtenidos se representan en la figura 4 A-l a diferentes tiempos de incubación (3, 6, y 15 días). Se observó que en la mayoría de los casos las cepas de Trichoderma empleadas sobrecrecían al patógeno, aunque en algunos casos las cepas sólo consiguieron parar su crecimiento (véase el caso de T. harzianum CECT 2413 contra V. dahliae 1A-3 y 1A-4). La cepa más eficiente fue T. atroviride IMI 206040, capaz de reducir el crecimiento del patógeno en el 100% de los casos, y sólo contra la cepa de Verticillium 2A-17 una combinación de T. atroviride IMI 206040 con T. viride CECT 2423 mejoró la capacidad antagonista de IMI de manera individual (Fig. 4).
Por tanto, el análisis de estos resultados mostró un efecto inhibidor del crecimiento, tanto de aislados de Verticillium dahliae D como ND, fundamentalmente en el caso de Trichoderma atroviride IMI 206040, sola o en combinación con T. viride CECT 2423 y T. harzianum CECT 2413, y con una clara tendencia que se hizo patente tras 15 días de incubación, anulando por completo el crecimiento del patógeno Verticillium.
En la figura 1 se aprecian los resultados de los enfrentamientos de las cepas T atroviride IMI 206040, T atroviride RCU1 , T harzianum CECT 2413, T. harzianum RCU2, T. harzianum PF1 , o una combinación de estas cinco cepas (formulación), con los aislados de Verticillium 1A-2, representante del patotipo D, o 2A-12, aislado más sensible a cepas del género Trichoderma representante del patotipo ND. Como se puede observar, la composición de estas cinco cepas de Trichoderma (formulación) fue más eficaz frente a los dos aislados de Verticillium dahliae ensayados que la mayoría de las cepas que la componen por separado, salvo en el caso de Trichoderma atroviride IMI 206040 y de su cepa derivada, RCU1 , que presentan una capacidad similar.
2.2. Ensayos de capacidad de crecimiento de distintos aislados de Verticillium dahliae en presencia de metabolitos excretados por Trichoderma.
Se realizaron ensayos de capacidad de crecimiento del patógeno en presencia de metabolitos excretados por Trichoderma mediante el cultivo de las cepas de Trichoderma sobre un disco de celofán permeable a metabolitos extracelulares (hidrolasas, antibióticos, etc.) colocado a su vez sobre el medio de cultivo PDA de una caja de Petri, a 22 °C. A los cuatro días de crecimiento, se retiró el celofán y con él el micelio desarrollado y un trozo de micelio del patógeno se colocó en el centro de las cajas. Para analizar cuantitativamente los resultados obtenidos en este ensayo con celofanes, a los diez días se midió el área de crecimiento de los distintos aislados de V. dahliae y se comparó el diámetro de crecimiento del patógeno en cajas control con el crecimiento en cajas donde Trichoderma había crecido sobre un celofán y que previamente había sido retirado antes de inocular el patógeno.
En la figura 5 se representan los resultados de inhibición de crecimiento obtenidos para aislados del patógeno cultivados en medios conteniendo metabolitos de las cepas T. harzianum CECT 2413, T. viride CECT 2423, T. atroviride IMI 206040, o metabolitos secretados por combinaciones de estas cepas. Como puede observarse en esta figura todos los aislados de Verticillium ensayados presentaron una alta sensibilidad a los metabolitos producidos por estas tres cepas de Trichoderma, siendo inhibido su crecimiento en alrededor de un 90%. Aunque las diferencias entre cepas no fueron muy elevadas, parece que la combinación 7. harzianum CECT 2413/7. atroviride IMI 206040 posee un ligero incremento en la capacidad de inhibir el crecimiento de todos los aislados del patógeno en general.
En la figura 2 se representan los resultados obtenidos con los metabolitos de las cepas Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma atroviride CECT 20755 o RCU1 , Trichoderma harzianum CECT 20756 o RCU2, Trichoderma harzianum PF1 o Trichoderma harzianum CECT 2413, o con los metabolitos secretados por una combinación de estas cinco cepas (formulación), sobre el crecimiento de un aislado del patógeno sensible a cepas de Trichoderma (2A- 12, patotipo ND) o de un aislado más resistente (1A-2, patotipo D), a diferentes tiempos de incubación (días). En este sentido, en ensayos para determinar la capacidad de inhibir el crecimiento de V. dahliae que tienen los metabolitos excretados por estas cepas de Trichoderma, se observaron resultados similares a los anteriores aunque diferentes según la cepa del patógeno. La formulación (combinación de estas cinco cepas) fue tan eficaz como las cepas que la componían contra el aislado más sensible del patógeno (2A-12, patotipo ND) pero fue intermedia contra el aislado más resistente (1A-2, patotipo D). Esto último puede deberse a un efecto de dilución de los metabolitos que intervienen en esta interacción debido a que en la formulación las cepas iban en una proporción 1/5 cada una.
En resumen, estos resultados determinan la capacidad específica de las cepas de Trichoderma propuestas en la presente invención de controlar e impedir in vitro el desarrollo del patógeno Verticillium dahliae.
EJEMPLO 3. Ensayos de antagonismo in vitro de distintas cepas de Trichoderma y aislados de Verticillium dahliae.
Se procedió a la realización de un conjunto de ensayos de antagonismo in vitro de distintas cepas de Trichoderma, o combinaciones de cepas, con el objeto de determinar su capacidad antifúngica frente a aislados de Verticillium dahliae suministrados por el Instituto de Agricultura Sostenible (IAS-CSIC- Córdoba). Así, se realizaron dos tipos de ensayos de antagonismo: uno de confrontación directa y otro de capacidad de crecimiento de distintos aislados de Verticillium dahliae en un medio donde Trichoderma había crecido previamente y excretado toda clase de metabolitos (incluidos antibióticos y enzimas hidrolíticas de pared celular). Como se explicará más adelante, los ensayos incluyeron enfrentamiento directo en medio sólido y ensayos con celofanes para ver el efecto de las sustancias secretadas por Trichoderma, siguiendo protocolos habituales en el laboratorio para ensayos con Rhizoctonia y Fusarium.
Las cepas de Trichoderma utilizadas en los ensayos fueron: Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma viride CECT 2423 y Trichoderma atroviride IMI 206040, así como las siguientes combinaciones de las mismas: T atroviride IMI 206040 + T viride CECT 2423, T harzianum CECT 2413 + T. atroviride IMI 206040, y T harzianum CECT 2413 + T viride CECT 2423, y en combinación con los aislados de Verticillium 1A-2, 1A-3, 1A-4, caracterizados como patotipos defoliantes, y 2A-12, 2A-16, 2A-17,4B-31 , 4B-34 y 4B-35, con capacidad no defoliante.
Además, se procedió al desarrollo y caracterización de mutantes espontáneos resistentes a cobre (a 4 mM de CU2SO4) derivados de Trichoderma harzianum y de Trichoderma atroviride, con el objeto de disponer así de cepas resistentes a los contaminantes metálicos utilizados como antifúngicos, entre los cuales el cobre es ampliamente utilizado en el sector del olivar. Concretamente, dichas cepas mutantes son las que a continuación se detallan y que en la actualidad se encuentran depositadas en la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT):
-Trichoderma atroviride RCU1 (número de depósito en la CECT 20755), derivado de Trichoderma atroviride IMI 206040.
-Trichoderma harzianum RCU2 (número de depósito en la CECT 20756), derivado de Trichoderma harzianum CECT 2413.
Además, en los ensayos de la presente invención se incluyó también la cepa Trichoderma harzianum PF1 , muíante inducido con nitrosoguanidina derivado de Trichoderma harzianum CECT 2413 con una elevada capacidad antifúngica y que se caracteriza como superexcretor de enzimas hidrolíticas (glucanasas, proteasas y quitinasas).
Se han realizado también ensayos para comprobar la eficacia in vitro de una composición que comprende cinco cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma atroviride RCU1 , Trichoderma harzianum CECT 2413, Trichoderma harzianum RCU2 y Trichoderma harzianum PF1 .
En los experimentos se pretendía, por tanto, establecer la capacidad de distintas cepas del hongo Trichoderma de controlar a aislados de Verticillium dahliae causantes de la verticilosis en el olivo.
3.1 . Ensayos de confrontación directa de distintas cepas de Trichoderma y aislados de Verticillium dahliae.
Los ensayos de confrontación directa consistieron en inocular una porción de micelio de los distintos aislados de V. dahliae a ensayar en un extremo de cajas de Petri conteniendo medio de cultivo nutritivo PDA (puré de patatas 2%, glucosa 2%, agar 2%). Las cajas se incubaron a 22 °C durante 4 días para permitir el crecimiento del patógeno y posteriormente se inocularon, en el extremo opuesto de las cajas, 20 μΙ de esporas de las distintas cepas de Trichoderma a una concentración de 105 esporas/ml. Las cajas continuaron incubándose a 22 °C durante 18 días. Como control se inocularon cajas con medio nutritivo PDA con los distintos aislados de V. dahliae en las que no se inoculó Trichoderma.
Al cabo del tiempo, los hongos entraron en contacto y podían darse dos situaciones distintas: que ambos parasen su crecimiento en la zona de contacto o que uno de ellos provocase una lisis del micelio del otro y acabase creciendo por encima de éste. De hecho, el efecto antagonista se comprobó viendo el sobrecrecimiento de Trichoderma y la posible muerte del patógeno al microscopio y por siembra en medio selectivo para el patógeno (crecimiento en presencia de tóxicos en el que Trichoderma no podía crecer pero al que el patógeno era resistente). En la figura 6 se aprecian los resultados de los enfrentamientos de la cepa Trichoderma harzianum CECT 2413 (Fig. 6B), o de la combinación de cepas T harzianum CECT 2413 y T atroviride IMI 206040 (Fig. 6C), con diferentes aislados de Verticillium. Así, se observó que la cepa Trichoderma harzianum CECT 2413 y la combinación de cepas T. harzianum CECT 2413 y T. atroviride IMI 206040 sobrecrecían al patógeno, reduciendo el área ocupada por el mismo.
Para analizar cuantitativamente los resultados obtenidos se midió el área de crecimiento de las distintas cepas de Verticillium en los diferentes ensayos de enfrentamiento con Trichoderma. Los resultados obtenidos se representan en la figura 2 A-l a diferentes tiempos de incubación (3, 6, y 15 días). Se observó que en la mayoría de los casos las cepas de Trichoderma empleadas sobrecrecían al patógeno, aunque en algunos casos las cepas sólo consiguieron parar su crecimiento (véase el caso de T. harzianum CECT 2413 contra V. dahliae 1A-3 y 1A-4).
Por tanto, el análisis de estos resultados mostró un efecto inhibidor del crecimiento, tanto de aislados de Verticillium dahliae D como ND, en el caso de Trichoderma harzianum CECT 2413, sola o en combinación con T. atroviride IMI 206040, y con una clara tendencia que se hizo patente tras 15 días de incubación.
En la figura 1 se aprecian los resultados de los enfrentamientos de las cepas T atroviride IMI 206040, T atroviride RCU1 , T harzianum CECT 2413, T. harzianum RCU2, T. harzianum PF1 , o una combinación de estas cinco cepas (formulación), con los aislados de Verticillium 1A-2, representante del patotipo D, o 2A-12, aislado más sensible a cepas del género Trichoderma representante del patotipo ND. Como se puede observar, la composición de estas cinco cepas de Trichoderma (formulación) fue más eficaz frente a los dos aislados de Verticillium dahliae ensayados que la mayoría de las cepas que la componen por separado. 3.2. Ensayos de capacidad de crecimiento de distintos aislados de Verticillium dahliae en presencia de metabolitos excretados por Trichoderma. Se realizaron ensayos de capacidad de crecimiento del patógeno en presencia de metabolitos excretados por Trichoderma mediante el cultivo de las cepas de Trichoderma sobre un disco de celofán permeable a metabolitos extracelulares (hidrolasas, antibióticos, etc.) colocado a su vez sobre el medio de cultivo PDA de una caja de Petri, a 22 °C. A los cuatro días de crecimiento, se retiró el celofán y con él el micelio desarrollado y un trozo de micelio del patógeno se colocó en el centro de las cajas. Para analizar cuantitativamente los resultados obtenidos en este ensayo con celofanes, a los diez días se midió el área de crecimiento de los distintos aislados de V. dahliae y se comparó el diámetro de crecimiento del patógeno en cajas control con el crecimiento en cajas donde Trichoderma había crecido sobre un celofán y que previamente había sido retirado antes de inocular el patógeno.
En la figura 5 se representan los resultados de inhibición de crecimiento obtenidos para aislados del patógeno cultivados en medios conteniendo metabolitos de las cepas T. harzianum CECT 2413, T. viride CECT 2423, T. atroviride IMI 206040, o metabolitos secretados por combinaciones de estas cepas. Como puede observarse en esta figura todos los aislados de Verticillium ensayados presentaron una alta sensibilidad a los metabolitos producidos por estas tres cepas de Trichoderma, siendo inhibido su crecimiento en alrededor de un 90%. Aunque las diferencias entre cepas no fueron muy elevadas, parece que la combinación T harzianum CECT 2413/7. atroviride IMI 206040 posee un ligero incremento en la capacidad de inhibir el crecimiento de todos los aislados del patógeno en general.
En la figura 2 se representan los resultados obtenidos con los metabolitos de las cepas Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma atroviride CECT 20755 o RCU1 , Trichoderma harzianum CECT 20756 o RCU2, Trichoderma harzianum PF1 o Trichoderma harzianum CECT 2413, o con los metabolitos secretados por una combinación de estas cinco cepas (formulación), sobre el crecimiento de un aislado del patógeno sensible a cepas de Trichoderma (2A- 12, patotipo ND) o de un aislado más resistente (1A-2, patotipo D), a diferentes tiempos de incubación (días). En este sentido, en ensayos para determinar la capacidad de inhibir el crecimiento de V. dahliae que tienen los metabolitos excretados por estas cepas de Trichoderma, se observaron resultados similares a los anteriores aunque diferentes según la cepa del patógeno. La formulación (combinación de estas cinco cepas) fue tan eficaz como las cepas que la componían contra el aislado más sensible del patógeno (2A-12, patotipo ND) pero fue intermedia contra el aislado más resistente (1A-2, patotipo D). Esto último puede deberse a un efecto de dilución de los metabolitos que intervienen en esta interacción debido a que en la formulación las cepas iban en una proporción 1/5 cada una.
En resumen, estos resultados determinan la capacidad específica de las cepas de Trichoderma propuestas en la presente invención de controlar e impedir in vitro el desarrollo del patógeno Verticillium dahliae.
EJEMPLO 4. Ensayos in vitro de protección de plantas de olivo frente a la infección por Verticillium dahliae mediante el tratamiento con Trichoderma harzianum CECT 2413.
Se procedió a realizar ensayos de protección con un número significativo de plántulas de olivo de la variedad Picual -susceptible a la VO-, con objeto de comprobar la eficacia de las distintas cepas de Trichoderma utilizadas en la protección de la infección provocada por el hongo patógeno V. dahliae.
Para la realización de estos ensayos se emplearon las cepas de T harzianum CECT 2413 y T asperellum (esta última también denominada "cepa olivo" por ser autóctona de la raíz de esta planta), cepas que presentan un alto antagonismo frente al patógeno y que además se vio que desarrollaban la mayor capacidad de colonización de la raíz del olivo de entre todas las cepas analizadas. También se empleó la combinación de ambas cepas.
Los ensayos se realizaron adicionando una preparación estandarizada de esporas de Trichoderma mediante tratamiento por agua de riego, ya que previamente se había visto que no existían diferencias significativas entre este tratamiento y el tratamiento por inmersión en cultivos hidropónicos, y además las plantas así tratadas presentaban una menor manipulación y se asemejaba a las condiciones de cultivo en campo. Para ello, se realizaron cuatro aplicaciones de las distintas preparaciones de Trichoderma a una concentración de 105 esporas cepa/ml de agua de riego, y un volumen de 35 mi por planta (determinado previamente, y que aseguraba un contacto permanente y sin pérdidas de la disolución de Trichoderma con el sustrato sobre el que se añade) durante un periodo de 32 días, y en condiciones experimentales basadas en un fotoperiodo de 12h/12h, intensidad luminosa (luz fluorescente) de 360 μΕ m-2- s-1, temperatura 22-24°C día/noche y humedad 70-80%.
A continuación, y una vez tratadas las plantas con las distintas cepas de Trichoderma, se procedió a realizar la infección con un aislado del patotipo D de V. dahliae para establecer la capacidad de protección de estas cepas frente al desarrollo de la enfermedad.
Para llevar a cabo esta aproximación experimental, se realizaron los tratamientos que se describen a continuación (n=20 plantas / tratamiento): 1 ) Control (de tratamientos y manipulación),
2) Plantas tratadas con Trichoderma harzianum CECT 2413 (control, posible influencia de esta cepa de Trichoderma sobre la planta, por ejemplo, estimulación del crecimiento vegetal, posibles efectos deletéreos, etc.),
3) Plantas tratadas con Trichoderma asperellum [cepa de olivo] (control, posible influencia de esta cepa de Trichoderma sobre la planta, por ejemplo, estimulación del crecimiento vegetal, posibles efectos deletéreos, etc.),
4) Plantas tratadas con T. harzianum CECT 2413+T. asperellum (control, posible influencia de esta combinación de cepas de Trichoderma sobre la planta, por ejemplo, estimulación del crecimiento vegetal, posibles efectos deletéreos, etc.),
5) Plantas inoculadas con V. dahliae (VCG1A-3, patotipo D) (control de enfermedad), 6) Plantas tratadas con Trichoderma harzianum CECT 2413 e inoculadas con V. dahliae (VCG1A-3, patotipo D) (tratamiento biocontrol de la enfermedad),
7) Plantas tratadas con Trichoderma asperellum e inoculadas con V. dahliae (VCG1A-3, patotipo D) (tratamiento biocontrol de la enfermedad), y
8) Plantas tratadas con la combinación de T. harzianum CECT 2413 y T. asperellum e inoculadas con V. dahliae (VCG1A-3, patotipo D) (tratamiento biocontrol de la enfermedad).
Los tratamientos n°1 , n°2, n°3 y n°4 permitieron el establecimiento de efectos comparativos entre sí, por ejemplo, posible estimulación del crecimiento vegetal mediada por las cepas de Trichoderma (tratamientos n°2, n°3 y n°4) con respecto a la ausencia de las mismas (tratamiento n°1 ). El tratamiento n°1 sólo recibió las manipulaciones que tuvieron lugar en los otros tratamientos, por ejemplo, aplicación del mismo número de riegos (volumen, vehículo, etc.) que se realizó para los tratamientos con Trichoderma, así como las manipulaciones que soportaron las plantas del resto de tratamientos (trasplantes, etc.). En cuanto al tratamiento n°5 fue el referente para el control de enfermedad y los tratamientos n°6, n°7 y n°8 fueron los tratamientos problema para el biocontrol de la enfermedad.
Para la inoculación artificial del patógeno V. dahliae en las plantas de olivo se utilizaron suspensiones de conidias del aislado VCG1A-3 (patotipo D) obtenidas de cultivos en caldo de patata dextrosa (CPD) de 7 días de crecimiento a 24°C, 125 rpm, en oscuridad. Dichos cultivos se establecieron de colonias de V. dahliae en PDA de 2-3 semanas de crecimiento a 24°C y oscuridad; tres porciones (-0,5 cm2) tomadas de zonas en crecimiento activo de las colonias se depositaron en matraces con 100 mi de CPD. La suspensión de conidias se obtuvo por filtración de los cultivos líquidos a través de doble gasa estéril. La concentración del inoculo utilizado en los experimentos se ajustó a 5 x 106 conidias-ml"1 mediante recuento microscópico en cámara Neubauer.
Se realizaron incisiones con bisturí en las cuatro esquinas de las macetas con objeto de romper el sistema radicular para facilitar la penetración del patógeno y evitar la manipulación directa de la planta. Posteriormente, se procedió a la inoculación de las plantas mediante la adición directa al suelo de 35 mi de la suspensión de conidias. Finalmente, las macetas se dispusieron individualmente sobre placas de Petri en las cámaras de cultivo en condiciones controladas de fotoperiodo, intensidad luminosa, temperatura y humedad.
Se establecieron condiciones de inoculación del patógeno que pueden considerarse relativamente naturales, y similares a las que pueden tener lugar en el cultivar de campo.
Tras el comienzo de los experimentos se analizó la evolución de las plantas frente al desarrollo de la enfermedad. Se determinó el número total de hojas como índice de defoliación, tanto de tallo principal como secundarios, y se aplicó una escala de severidad de daño al objeto de establecer la sintomatología del desarrollo de la enfermedad.
Los resultados no mostraron diferencias significativas entre el control de manipulación (tratamiento n°1 ) y las plantas pretratadas con cepas de T. harzianum CECT 2413, T. asperellum y la mezcla de ambas cepas de Trichoderma (tratamientos n°2, n°3 y n°4). Sin embargo, la inoculación con V. dahliae 1A-3 originó una disminución significativa en el número total de hojas a partir del día 58 de tratamiento, en las plantas tratadas previamente con T. asperellum o con la mezcla de ambas cepas de Trichoderma, que fue del 33% y 24,5%, respectivamente. Mientras que en las plantas pretratadas con T. harzianum CECT 2413, el patógeno no produjo cambios significativos en el número total de hojas durante los 91 días de tratamiento (Fig. 7).
En este sentido, al realizar el análisis de la escala de severidad del daño a partir de la sintomatología observada a lo largo del tiempo, tanto en plantas control sometidas a la enfermedad como en plantas tratadas previamente con T. asperellum y con la mezcla de T. asperellum y T. harzianum CECT 2413 e inoculadas con V. dahliae se apreció un incremento significativo del daño, sin que se apreciaran modificaciones significativas en las plantas pretratadas con T. harzianum CECT 2413 e inoculadas con V. dahliae a lo largo del tiempo (Fig. 8). El comportamiento observado tras el análisis de los resultados del ensayo anteriormente descrito de inoculación por riego en plantas dañadas mediante lesiones en raíces por cortes en suelo, sugiere la existencia de protección frente a la enfermedad del 100% en el caso del pretratamiento de las plantas con Trichoderma harzianum CECT 2413, del 45% en el caso del pretratamiento con Trichoderma asperellum y del 60% en el caso del pretratamiento de las plantas con la mezcla de ambas cepas de Trichoderma. Estos resultados perfilan la tendencia al control de la enfermedad para las plantas pretratadas con Trichoderma harzianum CECT 2413, estableciendo además que desarrolla un efecto de protección superior al observado para Trichoderma asperellum y la mezcla de ambas cepas.
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Claims

REIVINDICACIONES 1. Cepa de Trichoderma seleccionada de entre la cepa de la especie Trichoderma atroviride depositada en la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT) con el número de depósito 20755; o la cepa de la especie Trichoderma harzianum depositada en la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT) con el número de depósito 20756.
2. Cepa de la especie Trichoderma atroviride depositada en la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT) con el número de depósito 20755.
3. Cepa de la especie Trichoderma harzianum depositada en la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT) con el número de depósito 20756.
4. Cepa según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, en estado esporulado.
5. Composición que comprende un elemento seleccionado de la lista:
a. una de las cepas según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 o cualquiera de sus combinaciones,
b. productos del metabolismo de una de las cepas según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 o cualquiera de sus combinaciones, o una combinación de (a) y de (b).
6. Composición según la reivindicación 5 que además comprende al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista: Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 o Trichoderma harzianum PF1 .
7. Composición según la reivindicación 6 donde las cepas de Trichoderma se encuentran en estado esporulado.
8. Composición según cualquiera de las reivindicaciones 5 a 7 que además comprende productos del metabolismo de al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista: Trichoderma atroviride IMI 206040, Trichoderma harzianum CECT 2413 o Trichoderma harzianum PF1 .
9. Uso de la cepa según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 o de la composición según cualquiera de las reivindicaciones 5 a 8 para la prevención y/o tratamiento de infecciones provocadas por microorganismos fitopatógenos.
10. Uso de la cepa o de la composición según la reivindicación 9 donde el microorganismo fitopatógeno pertenece a un género seleccionado de la lista que comprende: Armillaria, Botrytis, Chondrostereum, Colletotrichum, Cladosporium, Fusarium, Monilia, Nectria, Phytophthora, Plasmopara, Pseudoperonospora, Pythium, Rhizoctonia, Rhizopus, Sclerotinia, Sclerotium o Verticillium.
1 1 . Uso de la cepa o de la composición según la reivindicación 10 donde el microorganismo fitopatógeno pertenece al género Verticillium.
12. Uso de la cepa o de la composición según la reivindicación 1 1 donde el microorganismo fitopatógeno es Verticillium dahliae.
13. Uso de la cepa o de la composición según cualquiera de las reivindicaciones 1 1 ó 12 donde la planta afectada por el microorganismo fitopatógeno se selecciona de la lista que comprende: alcachofa, algodón, melón, tomate, patata u olivo.
14. Uso de la cepa o de la composición según la reivindicación 13 donde la planta es el olivo.
15. Uso de la cepa o de la composición según cualquiera de las reivindicaciones 9 a 14 en combinación con otros agentes antifúngicos.
16. Uso de la cepa según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 o de la composición según cualquiera de las reivindicaciones 5 a 8 como fertilizante.
17. Uso de la cepa o de la composición según la reivindicación 16 como fertilizante en plantas de olivo.
18. Uso de la cepa Trichoderma harzianum PF1 y/o de los productos de su metabolismo para la prevención y/o tratamiento de infecciones provocadas por hongos fitopatógenos pertenecientes al género Verticillium.
19. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según la reivindicación 18 en combinación con al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista que comprende: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 o Trichoderma harzianum CECT 2413.
20. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según la reivindicación 19, en combinación con las cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 y Trichoderma harzianum CECT 2413.
21 . Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según cualquiera de las reivindicaciones 18 a 20 donde las cepas de Trichoderma se encuentran en estado esporulado.
22. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según cualquiera de las reivindicaciones 18 a 21 en combinación con productos del metabolismo de al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista que comprende: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 o Trichoderma harzianum CECT 2413.
23. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según la reivindicación 22, en combinación con productos del metabolismo de las cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 y Trichoderma harzianum CECT 2413.
24. Uso de la cepa Trichoderma atroviride IMI 206040 y/o de los productos de su metabolismo para la prevención y/o tratamiento de infecciones provocadas por hongos fitopatógenos pertenecientes al género Verticillium.
25. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según la reivindicación 24 en combinación con al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista que comprende: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma harzianum PF1 o Trichoderma harzianum CECT 2413.
26. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según la reivindicación 25, en combinación con las cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma harzianum PF1 y Trichoderma harzianum CECT 2413.
27. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según cualquiera de las reivindicaciones 24 a 26 donde las cepas de Trichoderma se encuentran en estado esporulado.
28. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según cualquiera de las reivindicaciones 24 a 27 en combinación con productos del metabolismo de al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista que comprende: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma harzianum PF1 o Trichoderma harzianum CECT 2413.
29. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según la reivindicación 28, en combinación con productos del metabolismo de las cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma harzianum PF1 y Trichoderma harzianum CECT 2413.
30. Uso de la cepa Trichoderma harzianum CECT 2413 y/o de los productos de su metabolismo para la prevención y/o tratamiento de infecciones provocadas por hongos fitopatógenos pertenecientes al género Verticillium.
31 . Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según la reivindicación 30 en combinación con al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista que comprende: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 o Trichoderma harzianum PF1 .
32. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según la reivindicación 31 , en combinación con las cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 y Trichoderma harzianum PF1 .
33. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según cualquiera de las reivindicaciones 30 a 32 donde las cepas de Trichoderma se encuentran en estado esporulado.
34. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según cualquiera de las reivindicaciones 30 a 33 en combinación con productos del metabolismo de al menos una cepa de Trichoderma seleccionada de la lista que comprende: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 o Trichoderma harzianum PF1 .
35. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según la reivindicación 34, en combinación con productos del metabolismo de las cepas de Trichoderma: Trichoderma atroviride CECT 20755, Trichoderma harzianum CECT 20756, Trichoderma atroviride IMI 206040 y Trichoderma harzianum PF1 .
36. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según cualquiera de las reivindicaciones 18 a 35 donde el hongo fitopatógeno es Verticillium dahliae.
37. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según cualquiera de las reivindicaciones 18 a 36 donde la planta afectada por el hongo fitopatógeno se selecciona de la lista que comprende: alcachofa, algodón, melón, tomate, patata u olivo.
38. Uso de la cepa y/o de los productos de su metabolismo según la reivindicación 37 donde la planta es el olivo.
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