WO2009113551A1 - タンパク質モノマー、そのモノマーから得られるタンパク質ポリマーおよびこれらを含むデバイス - Google Patents
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- WO2009113551A1 WO2009113551A1 PCT/JP2009/054569 JP2009054569W WO2009113551A1 WO 2009113551 A1 WO2009113551 A1 WO 2009113551A1 JP 2009054569 W JP2009054569 W JP 2009054569W WO 2009113551 A1 WO2009113551 A1 WO 2009113551A1
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- 0 CCC(CC1)CC2(CC2)C1N* Chemical compound CCC(CC1)CC2(CC2)C1N* 0.000 description 6
- QDSDAAHBWQVQFZ-UMAGBFNSSA-N CCC[C@](CS[C@@H](CC1OC1N1C)C1=O)(C(C)C)C=C=C Chemical compound CCC[C@](CS[C@@H](CC1OC1N1C)C1=O)(C(C)C)C=C=C QDSDAAHBWQVQFZ-UMAGBFNSSA-N 0.000 description 1
- PBFDPSDPYJWJDX-UHFFFAOYSA-N CN(C(C(C1)SC)OC)C1=O Chemical compound CN(C(C(C1)SC)OC)C1=O PBFDPSDPYJWJDX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
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Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/795—Porphyrin- or corrin-ring-containing peptides
Definitions
- the present invention relates to a protein monomer and a protein polymer obtained from the monomer. More specifically, the present invention relates to a protein monomer, a protein polymer having the monomer as a monomer unit, and a device including these.
- organic compounds having a large molecular weight by regularly arranging organic compounds having a large molecular weight, such as proteins, regularly by various interactions such as coordination bonds, covalent bonds, and ionic bonds. It is difficult to.
- the reason for this difficulty is that it is difficult to appropriately chemically modify the functional group present on the surface of a protein having a higher-order steric structure, and the proteins thus chemically modified It is difficult to develop a mechanism that allows interaction. J.-M. Lehn, "Supramolecular Chemistry: Concepts and Perspectives” Germany, Weinheim, VCH Publishing, 1995.
- an object of the present invention is to provide a protein polymer having a larger molecular weight obtained by regularly arranging proteins having a large molecular weight.
- the present invention is a protein monomer represented by the general formula (I) or a salt thereof.
- R 1 , R 2 , R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, a lower alkyl group, a lower alkyl group or a lower alkenyl group substituted with a halogen atom
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — Or — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 are Each independently represents an integer from 1 to 20, M is selected from the group consisting of Fe, Zn and Co; X means X in the hemoprotein mutant, and the hemoprotein mutant is represented by the formula (
- the mutant is obtained by replacing one amino acid residue with a cysteine residue in the amino acid sequence of a natural heme protein.
- —SH means a side chain thiol group of the cysteine residue
- Fe is bonded to four nitrogen atoms of the porphyrin group contained in the heme protein.
- the present invention is a protein monomer represented by the general formula (II) or a salt thereof.
- R 1 , R 2 , R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, a lower alkyl group, a lower alkyl group or a lower alkenyl group substituted with a halogen atom
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — Or — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 are Each independently represents an integer from 1 to 20, M is selected from the group consisting of Fe, Zn and Co; X means X in the hemoprotein mutant, and the hemoprotein mutant is represented by the formula
- the mutant is obtained by replacing one amino acid residue with a cysteine residue in the amino acid sequence of a natural heme protein.
- —SH means a side chain thiol group of the cysteine residue
- Fe is bonded to four nitrogen atoms of the porphyrin group contained in the heme protein.
- the present invention is a protein polymer or a salt thereof having a protein monomer represented by the formula (II) or a salt thereof as a monomer unit.
- the protein monomer represented by the formula (I) or a salt thereof and the protein monomer represented by the formula (II) or a salt thereof are useful as a monomer for producing a protein polymer.
- the protein monomer of the present invention or a salt thereof has a large molecular weight.
- a protein polymer having a larger molecular weight can be produced by regularly arranging the protein monomers or salts thereof using heme (including those containing Zn instead of Fe).
- FIG. 1a shows the UV-vis spectrum of natural myoglobin.
- FIG. 1 b shows the UV-vis spectrum of the protein polymer (III-4) produced in Example 4.
- FIG. 1 c shows the UV-vis spectrum of the protein polymer (III-3) produced in Example 3.
- FIG. 1d shows the UV-vis spectrum of the protein polymer (III-5) produced in Example 5.
- FIG. 1e shows the UV-vis spectrum of an oxygen complex of natural myoglobin.
- FIG. 1f shows the UV-vis spectrum of the oxygen complex of the protein polymer (III-5) produced in Example 5.
- FIG. 2a shows size exclusion chromatography for the protein polymers obtained in Examples 3-5.
- FIG. 2b shows size exclusion chromatography for the protein polymer (III-1) obtained in Example 1 and the protein polymer (III-2) obtained in Example 2.
- FIG. 2c shows size exclusion chromatography on the protein polymer (III-6) obtained in Example 10.
- FIG. 3 shows a size exclusion chromatogram of the protein polymer (III-5) obtained in Example 5 measured under conditions where the concentration was changed.
- FIG. 4 a shows an AFM image of the protein polymer (III-4) obtained in Example 4.
- FIG. 4 b shows an AFM image of the protein polymer (III-3) obtained in Example 3.
- FIG. 4 c shows an AFM image of the protein polymer (III-5) obtained in Example 5.
- FIG. 4d shows an AFM image of the protein polymer (III-2) obtained in Example 2.
- FIG. 5 (a) shows the ESI-TOF-MS spectrum of the protein monomer (II-5) obtained in Example 4, and FIG. 5 (b) shows the deconvolution of the protein polymer (II-5)).
- ESI-TOF-MS spectrum is shown.
- FIG. 5 (c) shows the ESI-TOF-MS spectrum of the protein monomer (II-4) obtained in Example 3, and
- FIG. 5 (d) shows the deconvolution of the protein monomer (II-4).
- An ESI-TOF-MS spectrum is shown.
- FIG. 5 (e) shows the ESI-TOF-MS spectrum of the protein monomer (II-3) obtained in Example 5
- FIG. 5 (f) shows the deconvolution of the protein monomer (II-3).
- FIG. 6 shows an AFM image of the assembly obtained in Example 6.
- FIG. 7 shows an AFM image of the assembly obtained in Example 7.
- FIG. 8 shows an AFM image of the assembly obtained in Example 8.
- FIG. 9 shows an AFM image of the assembly obtained in Example 9.
- FIG. 10 shows an AFM image of compound (IV-1) (triad).
- FIG. 11 (a) shows a cyclic voltammogram of the hemin modified gold electrode (A).
- FIG. 11 (b) shows a cyclic voltammogram of the protein monomer modified gold electrode (B).
- FIG. 11 (c) shows a cyclic voltammogram of the protein polymer modified gold electrode (C).
- FIG. 11 (a) shows a cyclic voltammogram of the hemin modified gold electrode (A).
- FIG. 11 (b) shows a cyclic voltammogram of the protein monomer modified gold electrode (B).
- FIG. 11 (c) shows a cyclic voltamm
- FIG. 12 (a) shows a cyclic voltammogram obtained by changing the sweep rate obtained for the hemin-modified gold electrode (A).
- FIG. 12 (b) shows a cyclic voltammogram with different sweep rates obtained for the protein monomer modified gold electrode (B).
- FIG. 12 (c) shows a cyclic voltammogram with different sweep rates obtained for the protein polymer modified gold electrode (C).
- FIG. 12 (d) shows a cyclic voltammogram with different sweep rates obtained for the hemin modified gold electrode (D).
- FIG. 12 (e) shows a cyclic voltammogram with varying sweep speed obtained for the protein polymer modified gold electrode (E).
- FIG. 13 (a) shows a plot of the peak current obtained for the hemin modified gold electrode (A).
- FIG. 13 (b) shows a plot of the peak current obtained for the protein monomer modified gold electrode (B).
- FIG. 13 (c) shows a plot of the peak current obtained for the protein polymer modified gold electrode (C).
- FIG. 13 (d) shows a plot of the peak current obtained for the hemin modified gold electrode (D).
- FIG. 13 (e) shows a plot of the peak current obtained for the protein polymer modified gold electrode (E).
- FIG. 14 (a) shows the DPV results obtained for the hemin-modified gold electrode (A).
- FIG. 14 (b) shows the DPV results obtained for the protein monomer modified gold electrode (B).
- FIG. 14 (c) shows the DPV results obtained for the protein polymer modified gold electrode (C).
- FIG. 14 (d) shows the DPV results obtained for the hemin-modified gold electrode (D).
- FIG. 14 (e) shows the DPV results obtained for the protein polymer modified gold electrode (E).
- FIG. 15 shows respective resistance values of the hemin-modified gold electrode (A), the protein monomer-modified gold electrode (B), and the protein polymer-modified gold electrode (C).
- the present invention is a protein monomer represented by the general formula (I) or a salt thereof.
- the present invention is a protein monomer represented by the general formula (II) or a salt thereof.
- the present invention is a protein polymer or a salt thereof having the protein monomer represented by the formula (II) or a salt thereof as a monomer unit.
- the protein monomer represented by the formula (II) or the salt thereof constituting the protein polymer or the salt thereof may be one kind or a mixture of two or more kinds. It may be a mixture.
- the said protein polymer is a random protein polymer represented by general formula (III).
- R 1 , R 2 , R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, a lower alkyl group, a lower alkyl group or a lower alkenyl group substituted with a halogen atom
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — Or — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 are Each independently represents an integer from 1 to 20, M is selected from the group consisting of Fe, Zn and Co; X means X in the hemoprotein mutant, and the hemoprotein mutant is represented by the formula (
- the mutant is obtained by replacing one amino acid residue with a cysteine residue in the amino acid sequence of a natural heme protein.
- —SH means a side chain thiol group of the cysteine residue
- Fe is bonded to four nitrogen atoms of the porphyrin group contained in the heme protein.
- this invention is a protein assembly or its salt containing the triad represented by general formula (IV), or its salt, and the protein monomer represented by said Formula (II), or its salt.
- the protein monomer represented by the formula (II) or a salt thereof may be one type, a mixture of two or more types, or a mixture of regioisomers.
- the protein monomer represented by the formula (II) or a salt thereof may form a protein polymer as a monomer unit.
- the protein assembly may also include one or more triads.
- R 11 , R 12 , R 13 , R 14 , R 21 , R 22 , R 23 , R 24 , R 31 , R 32 , R 33 , and R 34 are each independently a hydrogen atom, a lower alkyl group, Means a lower alkyl group or a lower alkenyl group substituted with a halogen atom, M 1 , M 2 and M 3 are each independently selected from the group consisting of Fe, Zn and Co; Z 1 , Z 2 and Z 3 are each independently of the formula — (CH 2 ) m1 —, — (CH 2 ) m1 —O— (CH 2 ) m2 —, — (CH 2 ) m1 —O— ( CH 2 ) m2 —O— (CH 2 ) m3 — or — (CH 2 ) m1 —O— (CH 2 ) m2 —O— (CH 2 ) m3 —O— (CH 2 ) m
- the present invention is a nanosheet containing the protein assembly or a salt thereof.
- the present invention is a device comprising one or more selected from the group consisting of protein monomers, protein monomer salts, protein polymers, protein polymer salts, protein assemblies and protein assembly salts.
- the protein monomer or the salt of the protein monomer is the protein monomer of the present invention represented by formula (I) or a salt thereof, or the protein monomer of the present invention represented by formula (II) or a salt thereof, and the protein polymer or protein
- the polymer salt is a protein polymer having the monomer unit of the protein monomer represented by the formula (II) or a salt thereof, or the protein polymer of the present invention represented by the formula (III) or the salt thereof, and the protein assembly or the protein assembly Is a protein assembly of the present invention or a salt of a protein assembly.
- the present invention is a substrate modified with one or more selected from the group consisting of protein monomers, protein monomer salts, protein polymers, and protein polymer salts.
- the protein monomer or protein monomer salt is the protein monomer of the present invention represented by formula (II) or a salt thereof (wherein M is Fe in formula (II)), and the protein polymer or protein polymer salt is A protein polymer having a monomer unit of a protein monomer represented by formula (II) or a salt thereof (wherein M is Fe in formula (II)), or a protein polymer of the present invention represented by formula (III) or a salt thereof Salt (wherein M is Fe in formula (III)).
- lower means 1 to 6 carbon atoms, preferably 1 to 4 carbon atoms, unless otherwise specified.
- Examples of the “lower alkyl group” in the “lower alkyl group” and the “lower alkyl group substituted with a halogen atom” include methyl, ethyl, propyl, isopropyl, butyl, isobutyl, t-butyl, pentyl, neopentyl, hexyl, etc. Such a linear or branched alkane residue having 1 to 6 carbon atoms is meant.
- Preferable examples of the lower alkyl group include alkyl having 1 to 5 carbon atoms.
- Preferable alkyl having 1 to 5 carbon atoms includes methyl, ethyl, propyl, isopropyl, butyl, isobutyl, tertiary butyl, pentyl, neopentyl and the like.
- lower alkenyl group includes vinyl, allyl, isopropenyl, 1-, 2- or 3-butenyl, 1-, 2-, 3- or 4-pentenyl, 1-, 2-, 3-, 4- or Examples thereof include straight-chain or branched alkenyl groups having 2 to 6 carbon atoms such as 5-hexenyl.
- Preferred lower alkenyl groups include vinyl.
- halogen atom examples include fluorine, chlorine, bromine, iodine, etc. Among them, fluorine is preferable.
- a lower alkyl group substituted with a halogen atom means one or more hydrogen atoms of the lower alkyl group replaced with the halogen atom.
- Preferable examples of the lower alkyl group substituted with the halogen atom include methyl iodide, dichloromethyl, trichloromethyl, trifluoromethyl and the like.
- a preferred lower alkyl group substituted with a halogen atom is trifluoromethyl.
- the monomers, polymers or assemblies and salts thereof of the present invention may take the form of solvates, which are also within the scope of the present invention.
- Preferred solvates include hydrates and ethanol solvates.
- M contained in the monomer, polymer, assembly or salt thereof of the present invention is selected from the group consisting of Fe, Zn and Co.
- M is Fe
- M includes Fe 2+ and Fe 3+
- M includes Zn 2+
- M includes Co 2+ and Co 3+ .
- the protein contains heme ( However, it is not particularly limited as long as it is a protein having one or more (including those in which Fe is substituted with Zn), and examples thereof include cytochrome, hemoglobin, myoglobin, or peroxidase.
- the cytochrome include cytochrome b 562 , cytochrome b 5 and cytochrome P450 CAM , and among them, cytochrome b 562 is preferable.
- hemoglobin examples include hemoglobin (human), hemoglobin (bovine), hemoglobin (equine), and hemoglobin (rat). Among them, hemoglobin (human) is preferable.
- hemoglobin (human) is preferable.
- myoglobin examples include myoglobin (sus scrofa), myoglobin (equine), myoglobin (human), and myoglobin (sperm whale). Among them, myoglobin (sperm whale) and myoglobin (sus scrofa) are preferable.
- peroxidase examples include horseradish peroxidase, chloroperoxidase, and catalase. Among them, horseradish peroxidase is preferable.
- R 1 , R 2 , R 3 and R 4 each independently represents a lower alkyl group or a lower alkenyl group.
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — or — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 each independently represents an integer of 1 to 20, and M is Preferably it means Fe or Zn.
- the hemoprotein variant represented by is one in which one amino acid residue is replaced with a cysteine residue in the amino acid sequence of the heme protein.
- a hemoprotein variant is (a) a protein comprising an amino acid sequence in which one amino acid of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 is substituted with cysteine, and (b) SEQ ID NO: 1. It means a protein that consists of an amino acid sequence in which one or two amino acids are deleted, substituted, or added in the amino acid sequence in which one amino acid in the amino acid sequence represented is substituted with cysteine, and functions as cytochrome.
- the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 is the amino acid sequence of natural cytochrome b 562 .
- the amino acid sequence of natural cytochrome b 562 is not limited to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, and an appropriate one may be selected in the Protein Data Bank. Specific examples include ID number 1QPU (June 2, 1999), and the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 corresponds to that of ID number 1QPU.
- the one amino acid residue that is replaced by cysteine is preferably an amino acid residue that is located outside the structure when the cytochrome takes a three-dimensional structure. Moreover, it is necessary that the replacement with a cysteine residue does not affect the structure of the heme contained in the cytochrome.
- the first to 106th amino acid residues preferably 60, 62, 63, 66, 67, 70, 73, 74, 76, 78
- the 89th, 90th, 96th, 99th and 100th amino acid residues more preferably the 60th, 63rd, 66th, 67th and 100th amino acid residues can be replaced with cysteine residues.
- such a hemoprotein variant is (a) a protein comprising an amino acid sequence in which one amino acid of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9 or SEQ ID NO: 10 is substituted with cysteine, ( b) an amino acid sequence in which one or two amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence in which one amino acid of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9 or 10 is substituted with cysteine, and hemoglobin A protein that functions as (human).
- the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9 is the amino acid sequence of the natural hemoglobin ⁇ subunit
- the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 10 is the amino acid sequence of the ⁇ subunit of natural hemoglobin.
- the amino acid sequence of natural hemoglobin is not limited to the amino acid sequences represented by SEQ ID NO: 9 and SEQ ID NO: 10, and an appropriate one may be selected in Protein Data Bank. Specific examples include those with ID number 1GZX (July 8, 2002), and the amino acid sequences represented by SEQ ID NO: 9 and SEQ ID NO: 10 correspond to those with ID number 1GZX.
- the one amino acid residue that can be replaced with cysteine is preferably an amino acid residue that is located outside the structure when the hemoglobin takes a three-dimensional structure. Moreover, it is necessary that the replacement with a cysteine residue does not affect the structure of the heme contained in the hemoglobin.
- such a variant of heme protein is (a) a protein comprising an amino acid sequence in which one amino acid of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 is substituted with cysteine, (b) SEQ ID NO: It means an amino acid sequence in which one or two amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence in which one amino acid of the amino acid sequence represented by 2 is substituted with cysteine, and which functions as myoglobin.
- the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 is an amino acid sequence of wild-type myoglobin (sperm whale).
- the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 further contains Met as an amino acid residue before the first amino acid residue Val of the natural amino acid sequence (the amino acid sequence of the protein actually extracted from whale). . Furthermore, aspartic acid which is the 122nd amino acid residue of the natural amino acid sequence corresponds to the 123rd amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, but the amino acid residue is replaced by asparagine. Yes.
- the amino acid sequence of wild-type myoglobin is not limited to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, and an appropriate one may be selected at the Protein Data Bank. Specific examples include those with ID number 2 MBW (June 20, 1996), and the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 corresponds to that with ID number 2 MBW.
- the one amino acid residue that can be replaced by cysteine is preferably an amino acid residue that is located outside the structure when the myoglobin takes a three-dimensional structure. Moreover, it is necessary that the replacement with a cysteine residue does not affect the structure of the heme contained in the myoglobin.
- the 1st to 154th amino acid residues preferably the 8, 9, 12, 13, 16, 17, 53, 54, 102, 103, 106, 107, 113, 114, 117, 118, 121, 122, 125, 126, 127, 133, 134, 140, 141, 147 and 148th amino acid residues, more preferably 125, 126, 133 and
- the 134th amino acid residue can be replaced with a cysteine residue.
- such a variant of heme protein is (a) a protein comprising an amino acid sequence in which one amino acid of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 3 is substituted with cysteine, (b) A protein comprising an amino acid sequence in which one or two amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence in which one amino acid of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 is substituted with cysteine, and having horseradish peroxidase activity Means.
- the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 3 is the amino acid sequence of natural horseradish peroxidase.
- the amino acid sequence of natural horseradish peroxidase is not limited to that represented by SEQ ID NO: 3, and an appropriate one may be selected in Protein Data Bank. Specific examples include those with ID number 1ATJ (February 4, 1998), and the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 3 corresponds to that with ID number 1ATJ.
- the one amino acid residue to be replaced with cysteine is preferably an amino acid residue that is located outside the structure when the horseradish peroxidase takes a three-dimensional structure. Moreover, it is necessary that the replacement with a cysteine residue does not affect the structure of heme contained in the horseradish peroxidase.
- —SH means a side chain thiol group of the cysteine residue
- Fe is bonded to four nitrogen atoms of the porphyrin group contained in the heme protein.
- R 1 and R 3 are each independently a lower alkyl group
- R 2 and R 4 are each independently Y represents a lower alkenyl group
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — or — (CH 2 N1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —
- n1, n2, n3 and n4 are each independently 1 It means an integer of ⁇ 3
- M means Fe or Zn
- the heme protein is more preferably cytochrome or myoglobin.
- R 2 and R 4 are each independently a lower alkyl group
- R 1 and R 3 are Each independently represents a lower alkenyl group
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — or — ( CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —
- M represents an integer of 1 to 3
- M represents Fe or Zn
- the heme protein is more preferably cytochrome or myoglobin.
- R 1 and R 3 are each independently a methyl group
- R 2 and R 4 are each independently Y represents a vinyl group
- Y represents the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 -O- (CH 2 ) 2 -O- (CH 2 ) 2 -O- (CH 2 ) 3-
- M represents Fe or Zn
- the hemoprotein is represented by SEQ ID NO: 1.
- Cytochrome having the amino acid sequence represented by the above, wherein the one amino acid residue is the 63rd histidine, or myoglobin having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, wherein the one amino acid residue is the 125 or 126 More preferably in the range of eye-alanine.
- R 2 and R 4 are each independently a methyl group, and R 1 and R 3 are each Independently, it represents a vinyl group
- Y represents the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 3 —
- M means Fe or Zn
- the hemoprotein is represented by SEQ ID NO:
- a cytochrome having the amino acid sequence represented by 1, wherein the one amino acid residue is the 63rd histidine, or myoglobin having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, wherein the one amino acid residue 125th or And further more preferably it is in the 26 th alanine.
- R 1 , R 2 , R 3 and R 4 are each independently a lower alkyl group or a lower alkenyl group.
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — or — (CH 2 ) n1 —O— ( CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 each independently represents an integer of 1 to 20 M preferably represents Fe or Zn.
- R 1 and R 3 are each independently a lower alkyl group
- R 2 and R 4 are each independently Y represents a lower alkenyl group
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — or — (CH 2 N1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —
- n1, n2, n3 and n4 are each independently 1 It means an integer of ⁇ 3
- M means Fe or Zn
- the heme protein is more preferably cytochrome or myoglobin.
- R 2 and R 4 are each independently a lower alkyl group
- R 1 and R 3 are Each independently represents a lower alkenyl group
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — or — ( CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —
- M represents an integer of 1 to 3
- M represents Fe or Zn
- the heme protein is more preferably cytochrome or myoglobin.
- R 1 and R 3 are each independently a methyl group
- R 2 and R 4 are each independently Y represents a vinyl group
- Y represents the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 -O- (CH 2 ) 2 -O- (CH 2 ) 2 -O- (CH 2 ) 3-
- M represents Fe or Zn
- the hemoprotein is represented by SEQ ID NO: 1.
- Cytochrome having the amino acid sequence represented by the above, wherein the one amino acid residue is the 63rd histidine, or myoglobin having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, wherein the one amino acid residue is the 125 or 1 And further more preferably it is in the 6 th alanine.
- R 2 and R 4 are each independently a methyl group, and R 1 and R 3 are each Independently, it represents a vinyl group
- Y represents the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 3 —
- M means Fe or Zn
- the hemoprotein is represented by SEQ ID NO:
- a cytochrome having the amino acid sequence represented by 1, wherein the one amino acid residue is the 63rd histidine, or myoglobin having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, wherein the one amino acid residue Is 125th Further preferably is 126 th alanine.
- the protein monomer is represented by the following formula (II):
- R 1 , R 2 , R 3 and R 4 are each independently
- Y represents a lower alkyl group or a lower alkenyl group
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — or — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —
- n1, n2, n3 and n4 are each Independently, it means an integer of 1 to 20, and
- M is preferably a protein monomer represented by the formula (II) meaning Fe or Zn.
- R 1 and R 3 are each independently a lower alkyl group
- R 2 and R 4 each independently represents a lower alkenyl group
- Y represents a formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —
- the protein monomer is the above formula (II), wherein R 1 and R 3 are each independently a lower alkyl group. , R 2 and R 4 each independently represents a lower alkenyl group, and Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— ( CH 2 ) n3 — or — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 each independently represents an integer of 1 to 3, M represents Fe or Zn, and the protein represented by formula (II), wherein the heme protein is cytochrome or myoglobin Nomar is more preferable.
- the protein monomer is represented by the formula (II), wherein R 2 and R 4 are each independently a lower alkyl group. , R 1 and R 3 each independently represents a lower alkenyl group, and Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— ( CH 2 ) n3 — or — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 each independently represents an integer of 1 to 3, M represents Fe or Zn, and the protein represented by the formula (II) wherein the heme protein is cytochrome or myoglobin Nomar is more preferable.
- the protein polymer or salt thereof having the protein monomer of the present invention or a salt thereof as a monomer unit includes, in the formula (II), the formula (II), R 1 and R 3 are each independently a methyl group.
- Each of R 2 and R 4 independently represents a vinyl group
- Y represents the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— ( CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 3 —
- M represents Fe or Zn.
- the heme protein is cytochrome having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, and the one amino acid residue is the 63rd histidine or has the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2.
- Myoglobi And the said one protein monomer or a salt thereof is an amino acid residue # 125 or 126 th alanine
- R 2 and R 4 each independently represent a methyl group
- R 1 and R 3 each independently represent a vinyl group
- Y represents a formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2
- the protein monomer is represented by the formula (II), wherein R 1 and R 3 are each independently a methyl group, R 2 and R 4 each independently represents a vinyl group, and Y represents the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 3 —, wherein M represents Fe or Zn
- the heme protein is cytochrome having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, and the one amino acid residue is the 63rd histidine or the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 A globin, protein monomer wherein one amino acid residue is represented by formula (II) is a 125 or 126 th alanine is more
- the protein monomer is represented by the formula (II), wherein R 2 and R 4 are each independently a methyl group.
- R 1 and R 3 independently represents a vinyl group
- Y represents the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— ( CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 3 —
- M represents Fe or Zn.
- the heme protein is cytochrome having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, and the one amino acid residue is the 63rd histidine or has the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2. That is myoglobin, a protein monomer wherein one amino acid residue is represented by formula (II) is a 125 or 126 th alanine is more preferable.
- R 1 , R 2 , R 3 and R 4 are each independently a lower alkyl group or a lower alkenyl group.
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — or — (CH 2 ) n1 —O— ( CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 each independently represents an integer of 1 to 20 M is preferably a protein polymer or a salt thereof having a monomer unit of Fe or Zn as a protein monomer or a salt thereof.
- R 1 and R 3 each independently represent a lower alkyl group
- R 2 and R 4 each independently represent a lower alkenyl group
- Y represents a formula — ( CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — or — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 N3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 each independently represents an integer of 1 to 3, and M represents Fe or Zn.
- R 2 and R 4 each independently represent a lower alkyl group
- R 1 and R 3 each independently represent a lower alkenyl group
- Y represents a formula — ( CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — or — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 N3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 each independently represents an integer of 1 to 3, M represents Fe or Zn.
- a protein polymer or a salt thereof having a monomer unit of at least one of a protein monomer or a salt thereof wherein the heme protein is cytochrome or myoglobin is more preferable.
- R 1 and R 3 are each independently a lower alkyl group
- R 2 and R 4 are Each independently represents a lower alkenyl group wherein Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — or — ( CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 are each independently A protein polymer or salt thereof, wherein M represents Fe or Zn, and the heme protein is a cytochrome or myoglobin protein monomer or salt thereof as a monomer unit, And In the formula (II), R 2 and R 4 each independently represent a lower alkyl
- R 1 and R 3 are each independently a methyl group
- R 2 and R 4 are each independently Y represents a vinyl group
- Y represents the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 -O- (CH 2 ) 2 -O- (CH 2 ) 2 -O- (CH 2 ) 3-
- M represents Fe or Zn
- the hemoprotein is represented by SEQ ID NO: 1.
- R 2 and R 4 each independently represent a methyl group
- R 1 and R 3 each independently represent a vinyl group
- Y represents a formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2- O— (CH 2 ) 3 —
- M means Fe or Zn
- the heme protein is cytochrome having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1
- the one amino acid residue A protein monomer or a salt thereof, wherein the group is the 63rd
- R 1 and R 3 are each independently a methyl group
- R 2 and R 4 are each independently Y represents a vinyl group
- Y represents the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 -O- (CH 2 ) 2 -O- (CH 2 ) 2 -O- (CH 2 ) 3-
- M represents Fe or Zn
- the hemoprotein is represented by SEQ ID NO: 1.
- R 2 and R 4 each independently represent a methyl group
- R 1 and R 3 each independently represent a vinyl group
- Y represents a formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2- O— (CH 2 ) 3 —
- M means Fe or Zn
- the hemoprotein is cytochrome having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1
- the one amino acid residue A protein monomer or a salt
- the assembly or a salt thereof includes a protein monomer represented by the formula (I), a protein monomer represented by the formula (II), a protein polymer represented by the formula (III), a triad represented by the formula (IV), and a protein assembly.
- Alkali metal salts such as sodium and potassium, alkaline earth metal salts such as calcium and magnesium, salts with inorganic bases such as ammonium salts, and triethylamine, pyridine, picoline, ethanolamine, triethanolamine, dicyclohexylamine, N , N
- Organic amine salts such as dibenzylethyleneamine
- inorganic acid salts such as hydrochloric acid, hydrobromic acid, sulfuric acid, phosphoric acid, and organic carboxylates such as formic acid, acetic acid, trifluoroacetic acid, maleic acid, tartaric acid, and Examples thereof include sulfonic acid addition salts such as methanesulfonic acid, benzenesulfonic acid, and p-toluenesulfonic acid, and salts or acid addition salts with bases such as basic or acidic amino acids such as arginine, aspartic acid, and glutamic acid.
- R 11 , R 12 , R 13 , R 14 , R 21 , R 22 , R 23 , R 24 , R 31 , R 32 , R 33 , and R 34 are each independent.
- Z 1 , Z 2 and Z 3 each independently represents a formula — (CH 2 ) m1 —, — (CH 2 ) m1 —O— (CH 2 ) m2 —O— (CH 2 ) m3 — or — (CH 2 ) m1 —O— (CH 2 ) m2 —O— (CH 2 ) m3 —O— (CH 2 ) m4 —
- M1, m2, m3 and m4 each independently represents an integer of 1 to 20
- M 1 , M 2 and M 3 are each independently represented by the formula (IV) meaning Fe or Zn Triad or its And one or more, R 1 , R 2 , R 3 and R 4 each independently represents a lower alkyl group or
- n1, n2, n3 and n4 each independently represents an integer of 1 to 20, and M represents one or more protein monomers represented by the formula (II) or a salt thereof, which means Fe or Zn.
- M represents one or more protein monomers represented by the formula (II) or a salt thereof, which means Fe or Zn.
- R 11 and R 13 represent a lower alkenyl group
- R 12 and R 14 represent a lower alkyl group
- R 11 and R 13 represent a lower alkyl group.
- R 12 and R 14 represent a lower alkenyl group
- R 21 and R 23 represent a lower alkenyl group
- R 22 and R 24 represent a lower alkyl group
- R 21 and R 23 represent a lower alkyl group
- R 22 and R 23 24 represents a lower alkenyl group
- R 31 and R 33 represent a lower alkenyl group
- R 32 and R 34 represent a lower alkyl group
- R 31 and R 33 represent a lower alkyl group
- R 32 and R 34 represents a lower alkenyl group
- Z 1 , Z 2 and Z 3 are each independently of the formula — (CH 2 ) m1 —, — (CH 2 ) m1 —O— (CH 2 ) m2 —O— (CH 2 ) m3
- R 11 and R 13 represent a lower alkenyl group
- R 12 and R 14 represent a lower alkyl group
- R 11 and R 13 represent a lower alkyl group.
- R 12 and R 14 represent a lower alkenyl group
- R 21 and R 23 represent a lower alkenyl group
- R 22 and R 24 represent a lower alkyl group
- R 21 and R 23 represent a lower alkyl group
- R 22 and R 23 24 represents a lower alkenyl group
- R 31 and R 33 represent a lower alkenyl group
- R 32 and R 34 represent a lower alkyl group
- R 31 and R 33 represent a lower alkyl group
- R 32 and R 34 represents a lower alkenyl group
- Z 1 , Z 2 and Z 3 are each independently of the formula — (CH 2 ) m1 —, — (CH 2 ) m1 —O— (CH 2 ) m2 —O— (CH 2 ) m3
- R 11 and R 13 , R 21 and R 23 , R 31 and R 33 each independently represent a lower alkyl group
- R 12 and R 14 , R 22 and R 24, R 32 and R 34 each independently means a lower alkenyl group
- Z 1, Z 2 and Z 3 are each independently formula - (CH 2) m1 -, - (CH 2) m1 —O— (CH 2 ) m2 —O— (CH 2 ) m3 — or — (CH 2 ) m1 —O— (CH 2 ) m2 —O— (CH 2 ) m3 —O— (CH 2 ) m4 —
- m1, m2, m3 and m4 each independently represents an integer of 1 to 20
- M 1 , M 2 and M 3 each independently represent Fe or Zn.
- R 1 and R 3 are each independently a lower alkyl group
- R 2 and R 4 are each independently a lower alkenyl group
- Y is a group of formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — or — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) a group represented by n4- , wherein n1, n2, n3 and n4 each independently represents an integer of 1 to 3, M represents Fe or Zn, and the heme protein is cytochrome or A protein assembly obtained by treating a protein monomer represented by the formula (II) that is myoglobin or a salt thereof under neutral conditions is more preferred.
- R 11 and R 13 represent a vinyl group
- R 12 and R 14 represent a methyl group
- R 11 and R 13 represent a methyl group
- R 12 and R 14 represent a vinyl group
- R 21 and R 23 represent a vinyl group
- R 22 and R 24 represent a methyl group
- R 21 and R 23 represent a methyl group
- R 22 and R 24 represent a vinyl group
- Means group, R 31 and R 33 represent a vinyl group
- R 32 and R 34 represent a methyl group, or R 31 and R 33 represent a methyl group, and R 32 and R 34 represent a vinyl group.
- Z 1 , Z 2 and Z 3 are each independently of the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — ( CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 3 — means a group represented by M 1 , M 2 and M 3 each independently One or more of the triads represented by the formula (IV) meaning Fe or Zn or a salt thereof, R 1 and R 3 are each independently a methyl group, R 2 and R 4 are each independently a vinyl group, and Y is a group of the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH
- R 11 and R 13 represent a vinyl group
- R 12 and R 14 represent a methyl group
- R 11 and R 13 represent a methyl group
- R 12 and R 14 represent a vinyl group
- R 21 and R 23 represent a vinyl group
- R 22 and R 24 represent a methyl group
- R 21 and R 23 represent a methyl group
- R 22 and R 24 represent a vinyl group
- Means group, R 31 and R 33 represent a vinyl group
- R 32 and R 34 represent a methyl group, or R 31 and R 33 represent a methyl group, and R 32 and R 34 represent a vinyl group.
- Z 1 , Z 2 and Z 3 are each independently of the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — ( CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 3 — means a group represented by M 1 , M 2 and M 3 each independently One or more of the triads represented by the formula (IV) meaning Fe or Zn or a salt thereof, R 1 and R 3 are each independently a methyl group, R 2 and R 4 are each independently a vinyl group, and Y is a group of the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH
- R 11 and R 13 , R 21 and R 23 , R 31 and R 33 each independently represent a methyl group
- R 12 and R 14 , R 22 and R 24 , R 32 and R 34 each independently represents a vinyl group
- Z 1 , Z 2 and Z 3 each independently represent the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 — O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 3 —
- M 1 , M 2 and M 3 each independently represents a triad represented by the formula (IV) which means Fe or Zn, or a salt thereof
- R 1 and R 3 are each independently a methyl group
- R 2 and R 4 are each independently a vinyl group
- Y is a group of the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 )
- R 11 and R 13 , R 21 and R 23 , R 31 and R 33 each independently represent a vinyl group
- R 12 and R 14 , R 22 and R 24 , R 32 and R 34 each independently represent a methyl group
- Z 1 , Z 2 and Z 3 each independently represent the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 — or — (CH 2 ) 3 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 2 —O— (CH 2 ) 3 —
- M 1 , M 2 and M 3 each independently represents a triad represented by the formula (IV) or a salt thereof, which means Fe or Zn
- R 1 and R 3 are each independently a methyl group
- R 2 and R 4 are each independently a vinyl group
- Y is a group of the formula — (CH 2 ) 2 —, — (CH 2 )
- the production method is characterized in that a porphyrin linker represented by general formula (VI) is reacted with a heme protein represented by general formula (V) to obtain a protein monomer of general formula (I) or a salt thereof. (See Scheme 1).
- R 1 , R 2 , R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, a lower alkyl group, a lower alkyl group or a lower alkenyl group substituted with a halogen atom
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — Or — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 are Each independently represents an integer from 1 to 20, M is selected from the group consisting of Fe, Zn and Co;
- X means X in the
- the mutant is obtained by replacing one amino acid residue with a cysteine residue in the amino acid sequence of a natural heme protein.
- —SH means a side chain thiol group of the cysteine residue
- Fe is bonded to four nitrogen atoms of the porphyrin group contained in the heme protein.
- the reaction of the porphyrin linker represented by the formula (VI) and the heme protein represented by the formula (V) is carried out in a solvent in the presence of a catalyst in an inert gas atmosphere (for example, argon, nitrogen, etc.).
- a catalyst for example, argon, nitrogen, etc.
- the catalyst include weak acids and weak bases.
- the weak acid include citric acid, hydrochloric acid, sulfuric acid, nitric acid, toluenesulfonic acid, and acetic acid.
- the weak base include histidine, sodium hydrogen carbonate, tris (hydroxymethyl) aminomethane, and the like.
- the reaction solvent is not limited.
- alcohols for example, methanol, ethanol, etc.
- polar solvents such as water, dimethyl sulfoxide, dimethylformamide, buffer solutions (for example, Tris-HCl buffer solution, phosphate buffer). Liquid, borate buffer, carbonate buffer) and the like.
- the reaction solvent may contain an additive for enhancing the solubility of the porphyrin linker represented by the formula (VI) and / or the heme protein represented by the general formula (V). Examples of the additive include histidine.
- the said solvent may use 1 type, or may mix and use 2 or more types.
- the solvent is preferably selected from the dimethyl sulfoxide and buffer that may be added as described above, and more preferably a mixture of dimethyl sulfoxide and Tris-HCl buffer, water containing histidine, and the like.
- the reaction temperature is not limited, but is, for example, 0 ° C. to 100 ° C., preferably 10 ° C. to 60 ° C., more preferably 20 ° C. to 30 ° C.
- reaction time is not limited, but is, for example, 30 minutes to 24 hours, preferably 2 hours to 10 hours, more preferably 5 hours to 8 hours.
- the molar ratio of the heme protein represented by the formula (V) used for the porphyrin linker represented by the formula (VI) (porphyrin linker represented by the formula (VI): represented by the formula (V)
- porphyrin linker represented by the formula (VI) may be obtained commercially, or may be made in-house with reference to known literature.
- the heme protein represented by the formula (V) can be produced, for example, as follows.
- the gene of the heme protein represented by the above formula (V) may be cloned using guinea pig total RNA or the like based on the base sequence of the gene of the natural heme protein, or using the phosphoramidite method Then, the DNA may be chemically synthesized.
- the cloning method is not particularly limited, and can be performed using, for example, a commercially available cloning kit. Further, the gene of the heme protein represented by the formula (V) may be introduced into the host cell.
- Examples of the host cell include animal cells, plant cells, insect cells, yeasts, bacteria, and the like.
- Examples of the gene introduction method include a lithium acetate method, a calcium phosphate method, a method using a liposome, electroporation, a method using a viral vector, a micropipette injection method, and the like.
- it may be introduced using an integration type into a host chromosome or an artificial chromosome or plasmid type capable of autonomous replication / distribution.
- the gene to be introduced into the host cell is operably linked to necessary regulatory sequences so that it is constitutively or arbitrarily expressed in the host cell.
- the regulatory sequence is a base sequence necessary for expression of the gene operably linked in a host cell.
- examples of regulatory sequences suitable for eukaryotic cells include promoters, polyadenylation signals, enhancers. Etc. Said operatively connected means that the components are juxtaposed so that they can perform their functions.
- the production method is characterized in that a protein monomer represented by formula (II) or a salt thereof is obtained by treating the protein monomer represented by formula (I) or a salt thereof with an acid (see Scheme 2).
- R 1 , R 2 , R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, a lower alkyl group, a lower alkyl group or a lower alkenyl group substituted with a halogen atom
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — Or — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 are Each independently represents an integer from 1 to 20, M is selected from the group consisting of Fe, Zn and Co; X means X in the hemoprotein mutant, and the hemoprotein mutant
- the mutant is obtained by replacing one amino acid residue with a cysteine residue in the amino acid sequence of a natural heme protein.
- —SH means a side chain thiol group of the cysteine residue
- Fe is bonded to four nitrogen atoms of the porphyrin group contained in the heme protein.
- the acid treatment reaction of the protein monomer represented by the formula (I) or a salt thereof is performed by, for example, treatment with hydrochloric acid, sulfuric acid, nitric acid or the like.
- the reaction solvent is not limited.
- alcohols for example, methanol, ethanol, etc.
- polar solvents such as water, dimethyl sulfoxide, dimethylformamide, buffer solutions (for example, Tris-HCl buffer solution, phosphate buffer). Liquid, borate buffer, carbonate buffer) and the like.
- the said solvent may use 1 type, or may mix and use 2 or more types.
- the solvent is preferably selected from dimethyl sulfoxide and a buffer solution, and more preferably a mixture of dimethyl sulfoxide and a tris hydrochloric acid buffer solution, a phosphate buffer solution, or the like.
- the reaction temperature is not limited, but is, for example, 0 ° C. to 30 ° C., preferably 0 ° C. to 10 ° C., more preferably 3 ° C. to 5 ° C.
- the acid treatment can be performed at a pH of, for example, 0.5 to 3.0, preferably 1.5 to 2.5, more preferably 1.8 to 2.1.
- the heme protein is preferably cytochrome, hemoglobin, myoglobin, or peroxidase.
- the production method is characterized by obtaining a protein polymer or a salt thereof by treating the protein monomer represented by the formula (II) or a salt thereof under neutral conditions.
- the reaction solvent is not limited.
- alcohols for example, methanol, ethanol, etc.
- polar solvents such as water, dimethyl sulfoxide, dimethylformamide
- buffer solutions for example, Tris-HCl buffer solution, phosphate buffer. Liquid, borate buffer, carbonate buffer) and the like.
- the said solvent may use 1 type, or may mix and use 2 or more types.
- the solvent is preferably selected from buffer solutions, more preferably Tris-HCl buffer solution, phosphate buffer solution and the like.
- the reaction temperature is not limited, but is, for example, 0 ° C. to 30 ° C., preferably 0 ° C. to 10 ° C., more preferably 3 ° C. to 5 ° C.
- the treatment under neutral conditions is performed at a pH of, for example, 6.0 to 10.0, preferably 6.5 to 8.5, more preferably 7.0 to 8.0. it can.
- the protein polymer or a salt thereof is preferably a protein polymer represented by the formula (III) or a salt thereof (see Scheme 3).
- R 1 , R 2 , R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, a lower alkyl group, a lower alkyl group or a lower alkenyl group substituted with a halogen atom
- Y represents the formula — (CH 2 ) n1 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —, — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 — Or — (CH 2 ) n1 —O— (CH 2 ) n2 —O— (CH 2 ) n3 —O— (CH 2 ) n4 —, wherein n1, n2, n3 and n4 are Each independently represents an integer from 1 to 20, M is selected from the group consisting of Fe, Zn and Co; X means X in the hemoprotein mutant, and the hemoprotein mutant
- the mutant is obtained by replacing one amino acid residue with a cysteine residue in the amino acid sequence of a natural heme protein.
- —SH means a side chain thiol group of the cysteine residue
- Fe is bonded to four nitrogen atoms of the porphyrin group contained in the heme protein.
- the protein monomer represented by the formula (II) or a salt thereof is a protein monomer represented by the formula (II) or a salt thereof, or a compound which is a positional isomer or a salt thereof. May be a mixture in which they coexist.
- the resulting formula (III) The protein polymer represented will also be a mixture of regioisomers.
- the heme protein is preferably cytochrome, hemoglobin, myoglobin, or peroxidase.
- the protein polymer having a monomer unit of a protein monomer represented by the formula (II) or a salt thereof of the present invention or a salt thereof is useful as a biopolymer for storing oxygen when the hemoprotein is cytochrome, hemoglobin and myoglobin. .
- the heme protein is peroxidase, it is useful as an assembly of enzymes.
- the protein polymer having a monomer unit of the protein monomer represented by formula (II) or a salt thereof of the present invention or a salt thereof is decomposed into the protein monomer represented by formula (II) or a salt thereof under acidic or basic conditions. be able to. Therefore, the protein polymer of the present invention or a salt thereof is useful as a pH-responsive protein polymer that controls the aggregation state by pH.
- the production method comprises treating the protein assembly of the present invention or the salt thereof by treating the triad represented by (IV) or a salt thereof and the protein monomer represented by (II) or a salt thereof under neutral conditions. It is characterized by obtaining salt.
- the production method obtains a protein assembly or a salt thereof by treating the triad represented by (IV) or a salt thereof and the protein monomer or a salt thereof represented by (II) under neutral conditions. It is characterized by.
- the reaction solvent is not limited.
- alcohols for example, methanol, ethanol, etc.
- polar solvents such as water, dimethyl sulfoxide, dimethylformamide
- buffer solutions for example, Tris-HCl buffer solution, phosphate buffer. Liquid, borate buffer, carbonate buffer) and the like.
- the said solvent may use 1 type, or may mix and use 2 or more types.
- the solvent is preferably selected from buffer solutions, more preferably Tris-HCl buffer solution.
- the reaction temperature is not limited, but is, for example, 0 ° C. to 30 ° C., preferably 0 ° C. to 10 ° C., more preferably 3 ° C. to 5 ° C.
- the treatment under neutral conditions is performed at a pH of, for example, 6.0 to 10.0, preferably 6.5 to 8.5, more preferably 7.0 to 8.0. it can.
- the protein assembly or a salt thereof is preferably a protein assembly represented by the formula (VII) or a salt thereof (see Scheme 4).
- R 1 , R 2 , R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, a lower alkyl group, a lower alkyl group or a lower alkenyl group substituted with a halogen atom
- R 11 , R 12 , R 13 , R 14 , R 21 , R 22 , R 23 , R 24 , R 31 , R 32 , R 33 and R 344 are each independently a hydrogen atom, lower alkyl group, halogen Means a lower alkyl group or a lower alkenyl group substituted with an atom
- Z 1 , Z 2 and Z 3 are each independently of the formula — (CH 2 ) m1 —, — (CH 2 ) m1 —O— (CH 2 ) m2 —, — (CH 2 ) m1 —O— ( CH 2 ) m2 —O— (CH 2 ) m3 — or — (CH 2 ) m1 —,
- the mutant is obtained by replacing one amino acid residue with a cysteine residue in the amino acid sequence of a natural heme protein.
- —SH means a side chain thiol group of the cysteine residue
- Fe is bonded to four nitrogen atoms of the porphyrin group contained in the heme protein.
- the protein monomer represented by the formula (II) or a salt thereof is a protein monomer represented by the formula (II) or a salt thereof, or a compound which is a positional isomer or a salt thereof. May be a mixture in which they coexist.
- the resulting formula (VII) The protein assembly or salt thereof represented also becomes a mixture of regioisomers.
- the protein monomer represented by (II) or a salt thereof is, for example, 1: 1 to 1: 1000, preferably 1: 5 to 1: 500, more preferably 1:10 to 1: 100.
- the heme protein is preferably cytochrome, hemoglobin, myoglobin, or peroxidase.
- a protein assembly or a salt thereof having a protein monomer represented by the formula (II) or a salt thereof of the present invention as a monomer unit is useful as a biomaterial for storing oxygen when the hemoprotein is cytochrome, hemoglobin, or myoglobin. .
- the heme protein is peroxidase, it is useful as an assembly of enzymes.
- M protein assembly or a salt thereof to a protein monomer or a salt thereof represented by formula (II) as a monomer unit is Fe 2+ is preferable.
- the present invention is a nanosheet containing a protein assembly or a salt thereof as described above.
- the thickness of the nanosheet is, for example, 1 to 10 nm, preferably 2 to 5 nm.
- the nanosheet preferably has a mesh-like structure.
- the protein assembly represented by the formula (II) in which the heme protein is cytochrome, hemoglobin and myoglobin or a salt thereof as a monomer unit or a salt thereof is useful as a biomaterial for storing oxygen, a catalyst fiber, a sensor fiber, etc. It is.
- M in the protein assembly is preferably Fe 2+ .
- the present invention also provides a protein monomer of the formula (I), a salt of the protein monomer of the formula (I), a protein monomer of the formula (II), a salt of the protein monomer of the formula (II), the formula (II), as described above.
- the device include an oxygen sensor and an oxygen adsorbent.
- M in the protein monomer, protein monomer salt, protein polymer, protein polymer salt, protein assembly and protein assembly salt contained in the device is preferably Fe 2+ .
- the present invention provides a protein monomer of the formula (II), a salt of the protein monomer of the formula (II), a protein polymer having the protein monomer of the formula (II) as a monomer unit, and a protein of the formula (II) From a salt of a protein polymer having a monomer as a monomer unit, a protein polymer of the formula (III) and a salt of a protein polymer of the formula (III) (wherein M is Fe in the above formulas (II) and (III))
- the substrate is modified with one or more selected from the group consisting of: Since the protein monomer has an oxygen storage capacity, oxygen is stored by the protein monomer by passing an electric current through such a substrate, and oxygen is released from the protein monomer that has stored oxygen by stopping the current. Can. Therefore, the substrate can be used as an oxygen storage electrode.
- M in the protein monomer, protein monomer salt, protein polymer and protein polymer salt that modifies the substrate is
- the substrate as described above can be manufactured, for example, as follows. First, a substrate is prepared.
- the substrate may be a metal plate or a plate of plastic or the like whose surface is metal-coated.
- the shape of the substrate is not limited to a plate shape.
- a linker having heme is fixed to the surface of the substrate by a covalent bond. Specifically, for example, first, a linker having a reactive group is bonded on the substrate. Thereafter, hemin is bonded to the reactive group, and then the protein monomer represented by the formula (II), the salt of the protein monomer represented by the formula (II), and the protein monomer represented by the formula (II) are used as monomer units on the substrate.
- a protein polymer selected from the group consisting of a protein polymer, a salt of a protein polymer having a protein monomer of formula (II) as a monomer unit, a protein polymer represented by formula (III), and a salt of a protein polymer represented by formula (III) React with the above.
- heme in hemin existing on the surface of the substrate protein monomer represented by formula (II), salt of protein monomer represented by formula (II), and protein monomer represented by formula (II) are used as monomer units.
- a substrate modified with one or more selected may be obtained.
- the method for binding a linker having a reactive group to the substrate include A.I. It can be carried out with reference to a report by Das et al. (J. Biophysical Chemistry, 2006, 123, pp. 102-112). The length of the linker is not particularly limited.
- the pH of the aqueous solution was measured using a pH meter F-52 manufactured by Horiba. Size Exclusion Chromatography (SEC) is connected to GE Healthcare's AKTA FPLC system with a Superdex 200 10/300 GL column (exclusion limit 1.3 ⁇ 10 6 Da) and UPC-900 detection is used for detection. Measured using a vessel. The atomic force microscope (AFM) was measured using a Nanoscope V manufactured by Digital Instruments.
- SEC Size Exclusion Chromatography
- AFM atomic force microscope
- the abundance ratio is 1: 1 based on peak intensity), 8.45-8.31 (m, 2H) 6.42 ( m, 2H) 6.17 (m, 2H) 4.63-4.55 (m, 4H) 3.59-3.45 (m, 16H) 3.34 (m, 2H) 3.05-2.96 (m, 6H) 2.47 (m, 2H) 2.39 (m, 2H) -3.80 (s, 2H); ESI-TOF-MS (positive mode) m / z 693.97 (M-TFA) +, calculated for C 40 H 49 N 6 O 5 : 693.85; UV-vis (MeOH) [lambda] max / nm (absorption) 628 (0.018) 574 (0.042) 538 (0.055) 504 (0.057) 399 (0.93).
- cytochrome b 562 mutant (H63C) The site-specific mutant was generated using a polymerase chain reaction polymerase (TAKaRa) LA PCR in vitro mutagenesis kit according to the attached protocol. Performed by chain reaction (PCR). Escherichia coli TG1 having an expression plasmid (pUC118) of wild-type cytochrome b 562 (hereinafter abbreviated as b 562 ) was mass-cultured to prepare a plasmid, which was used as a template for preparing an H63C mutant.
- Mutation site introduction primer (SEQ ID NO: 5)
- M13 primer M4 (SEQ ID NO: 6) (5′-GTTTTCCCAGTCCAGAC-3 ′), or M13 primer RV SEQ ID NO: 7 (5′-CAGGAAACAGCTATGAC-3 ′) and MUT4 primer SEQ ID NO: 8 ( 5'-GGCCAGTGCCTAGCTTACAT-3 '), and first-stage DNA amplification by PCR was performed in each system.
- a hetero double-stranded DNA was prepared from these two first-stage PCR products, and the second-stage amplification by PCR of the hetero double-stranded DNA was performed using M13 primer RV and M13 primer M4.
- a DNA fragment having the base sequence of the b562 mutant was excised with restriction enzymes EcoRI and HindIII and specifically ligated to the EcoRI / HindIII sites of the pUC118 vector. Thereafter, Escherichia coli strain TG1 was transformed with the obtained expression plasmid. The base sequence of the H63C mutant was confirmed by DNA sequencing (SEQ ID NO: 4). At that time, a mutation was also observed at the position of Ala37, but this mutation was unchanged (GCC was mutated to GCG).
- the mutant protein is Escherichia coli strain TG1, and the expression of wild type b 562 according to the literature (Y. Kawamata, S. Machida, T. Ogawa, K. Horie, T.
- Formula (V-1) Means a cytochrome b 562 mutant (H63C), which is a protein mutant expressed in Example 1 (2), which is the residue of the 63rd histidine residue in the amino acid sequence of natural cytochrome b 562. The group is replaced with a cysteine residue.
- —SH means a side chain thiol group of the cysteine residue, and Fe is bonded to four nitrogen atoms of the porphyrin group contained in the heme protein.
- the protein polymer (III-1) has a random copolymer structure of the formula (III-11).
- Formula (V-1) Means a cytochrome b 562 mutant (H63C), which is a protein mutant expressed in Example 1 (2), which is the residue of the 63rd histidine residue in the amino acid sequence of natural cytochrome b 562. The group is replaced with a cysteine residue.
- —SH means a side chain thiol group of the cysteine residue, and Fe is bonded to four nitrogen atoms of the porphyrin group contained in the heme protein.
- the protein polymer (III-2) has a random copolymer structure of the formula (III-12).
- X ′ means X ′ in a hemoprotein variant
- the hemoprotein variant is represented by formula (V-1).
- the expressed proteins were anion exchange column (DEAE Sepharose FF, 2.7 cm ⁇ 10 cm), cation exchange column (CM-52, 2.7 cm ⁇ 18 cm) and gel filtration column (Sephadex G-50, 1.5 cm ⁇ 100 cm).
- the fraction of myoglobin mutant A125C dimer derived from sperm whale was recovered and used in the following experiments.
- Formula (V-2) Means the sperm whale-derived myoglobin mutant (A125C), which is a monomer derived from the protein mutant expressed in Example 3 (1), and the mutant is an amino acid sequence (sequence) of wild-type myoglobin.
- the 126th alanine residue is replaced with a cysteine residue.
- —SH means a side chain thiol group of the cysteine residue, and Fe is bonded to four nitrogen atoms of the porphyrin group contained in the heme protein.
- the A125C monomer (V-2) was diluted to 1.5 mL with the 0.1 M L-histidine aqueous solution to prepare an A125C monomer solution.
- the compound 1 (8) (1.1 ⁇ 10 ⁇ 6 mol) solution was added to the A125C monomer solution, and the mixture was stirred at room temperature for 24 hours to obtain the compound 1 (8) and the A125C monomer.
- a protein monomer (1-4) which is a conjugate of (V-2) was obtained.
- Compound 1 (8) (1.1 ⁇ 10 ⁇ 6 mol) was dissolved in (0.6 mL). All the above operations were performed in a glove box under a nitrogen atmosphere.
- the reaction solution was transferred to a dialysis membrane (Wako, MWCO 14,000 Da) and dialyzed at 4 ° C. using a phosphate buffer (0.01 M, pH 6.0) (1 L ⁇ 1 hour ⁇ 2).
- the protein monomer (1-4) solution obtained by dialysis was adjusted to pH 2.25 by adding 0.1N hydrochloric acid to obtain protein monomer (II-4).
- 2-butanone 5 mL ⁇ 4
- the aqueous layer was separated and transferred to a dialysis membrane (Wako, MWCO 14,000 Da), and dialyzed at 4 ° C.
- X ′′ means X ′′ in a hemoprotein variant
- the hemoprotein variant is represented by formula (V-2).
- X ′′ means X ′′ in a hemoprotein variant
- the hemoprotein variant is represented by formula (V-2).
- Compound 5 (13) has high water solubility, and the final precipitate could not be sufficiently washed with water. Therefore, it was used for the next reaction without purification.
- ESI-TOF-MS positive mode
- the protein polymer (III-5) has a random copolymer structure of the formula (III-15).
- X ′′ means X ′′ in a hemoprotein variant
- the hemoprotein variant is represented by formula (V-2).
- FIG. 1a shows the UV-vis spectrum of natural myoglobin
- FIG. 1b shows the UV-vis spectrum of the protein polymer (III-4) produced in Example 4
- FIG. 1d shows the UV-vis spectrum of the produced protein polymer (III-3)
- FIG. 1d shows the UV-vis spectrum of the protein polymer (III-5) produced in Example 5.
- FIG. 1a and FIGS. 1b, 1c and 1d the spectra of protein polymer (III-4), protein polymer (III-3), and protein polymer (III-5) are very different from those of the natural myoglobin. It was confirmed that they had similar spectra.
- FIG. 1e shows the UV-vis spectrum of the oxygen complex of natural myoglobin
- FIG. 1f shows the UV-vis spectrum of the oxygen complex of the protein polymer (III-5) produced in Example 5.
- myoglobin having an oxygen storage capacity forms a very stable oxygen complex by reducing heme iron to divalent with a reducing agent in the atmosphere and exhibits a characteristic ultraviolet-visible absorption spectrum.
- An oxygen complex was prepared by treating the protein polymer (III-5) produced this time in the same manner.
- This FIG. 1f and FIG. 1e have characteristic 417 nm, 543 nm and 580 nm absorption as well. Therefore, it was confirmed that the protein polymer of the present invention forms a very stable oxygen complex. Furthermore, this confirmed that the protein polymer of the present invention formed a supramolecular assembly while maintaining the original protein function.
- the oxygen binding constant K O2 is obtained by dividing the binding rate constant k O2 on by the dissociation rate constant k O2 off .
- the results obtained from the following measurements are shown in Table 1.
- the whole protein polymer (III-5) was calculated as one molecule.
- k ox is an oxidation rate constant from the deoxy body to the met body.
- the reaction follows a first-order rate constant, and the apparent rate constant k obs can be expressed as in equation (2).
- the elution amounts of protein polymer (III-3), protein polymer (III-4) and protein polymer (III-5) were 10.5 mL, 11.3 mL and 9.3 mL, respectively. Therefore, it was confirmed that the protein polymer had a smaller elution amount than those of the myoglobin mutant A125C monomer and the dimer, and the molecular weight of these polymers was large. It was also confirmed that the protein polymer (III-3), protein polymer (III-4), and protein polymer (III-5) each had a larger molecular weight as the length of the linker connecting the protein and heme was longer. did it.
- the protein polymer (III-5) has a large chromatography from the detection limit of 8 mL, and it can be confirmed that the protein polymer (III-3) contains more molecular weight components than the protein polymer (III-3) and protein polymer (III-4). It was. Since the common logarithm of the molecular weight and the elution amount are in a proportional relationship, the molecular weights of the protein polymer (III-3), protein polymer (III-4) and protein polymer (III-5) can be calculated roughly. From the molecular weight and the molecular weight of the monomer, the degree of polymerization of the protein polymer (III-3), protein polymer (III-4) and protein polymer (III-5) could be calculated as 22, 18 and 33.
- Size exclusion chromatography was measured for the protein polymer (III-1) produced in Example 1 and the protein polymer (III-2) produced in Example 2.
- the elution solvent was 50 mM Tris-HCl buffer (pH 7.3) with 0.15 M NaCl added. The measurement was performed at a temperature of 4 ° C. and a flow rate of 0.5 mL / min.
- the results for protein polymer (III-1) and protein polymer (III-2) are shown in FIG. 2b.
- a is the protein polymer (III-2)
- b is the protein polymer (III-1) produced in Example 1
- c is a dimer of H63C (V-1)
- d is H63C.
- the chromatography of the monomer of (V-1) is shown.
- Example 10 size exclusion chromatography was measured for the protein polymer obtained in Example 10.
- a mixed aqueous solution of Tris-HCl buffer (50 mM, pH 7.3) and NaCl (150 mM) was used as an elution solvent. The measurement was performed at a temperature of 4 ° C. and a flow rate of 0.5 mL / min. The result is shown in FIG. As shown in FIG. 2c, it was confirmed that the protein polymer (III-6) was formed as a dimer or a trimer due to the interaction between Zn protoporphyrin and the heme pocket.
- V Atomic force microscope
- the sample used for AFM measurement was prepared as follows.
- the surface of the highly oriented sintered graphite (HOPG) substrate was wall-opened, and the wall-opened surface was an aqueous solution of the protein polymer obtained in Examples 3 to 5 (about 10 ⁇ 8 M, 0.05 M Tris buffer, pH 7 .3 or 0.1 M phosphate buffer, pH 7.0) for several seconds.
- the substrate was lifted from the solution, it was thoroughly washed with water, dried well in a desiccator containing calcium chloride at room temperature, and then set in an AFM measuring apparatus.
- the measurement was performed in a tapping mode, and a silicon single crystal having a scanning speed of 2 Hz and a radius of curvature of about 10 nm was used for the probe.
- the AFM image of the protein polymer (III-4) obtained in Example 4 is shown in FIG. 4a
- the AFM image of the protein polymer (III-3) obtained in Example 3 is shown in FIG. 4b
- Example 5 An AFM image of the protein polymer (III-5) is shown in FIG. 4c.
- An AFM image of the protein polymer (III-2) obtained in Example 2 is shown in FIG. 4d.
- FIG. 4a shows an overall view of the protein polymer (III-4), and (b) shows a profile along the gray line in (a). Further, (c) in FIG. 4b shows an overall view of the protein polymer (III-3), and (d) shows a partially enlarged view and a cross-sectional profile thereof. Further, (e) in FIG. 4c shows an overall view of the protein polymer (III-5), and (f) shows a profile along the gray line in (e).
- images showing linear polymer structures having a uniform height were confirmed. In addition, a linear polymer structure having a length corresponding to several tens of monomers was also confirmed.
- FIG. 4 d shows an overall view of the protein polymer (III-2), and (b) shows an enlarged view of one of the structures found in the overall view. From (b), it was confirmed that this tissue was about 200 nm in length. Therefore, it was confirmed that this tissue body was about 80-mer. The height of this tissue body was in the range of 2.5 to 5 nm. This height corresponds to the height of one heme protein.
- FIG. 4d (c) shows an enlarged view of another of the structures found in the overall view. This tissue was confirmed to be donut-shaped.
- FIG. 4d (d) shows the profile along the gray line in (c). From (d), it was confirmed that all the tissues had the same height.
- FIG. 5 shows an ESI-TOF-MS spectrum and a deconvoluted ESI-TOF-MS spectrum of the protein monomer.
- An ESI-TOF-MS spectrum of the protein monomer (II-5) obtained in Example 4 is shown in FIG. 5 (a), and a deconvoluted ESI-TOF-MS spectrum of the protein monomer (II-5) is shown. Shown in 5 (b).
- the calculated molecular weight of the protein monomer (II-5) is 18100.8. From FIG. 5 (b), it was confirmed that the molecular weight of the protein monomer (II-5) was in agreement with the calculated value.
- the ESI-TOF-MS spectrum of the protein monomer (II-4) obtained in Example 3 is shown in FIG. 5 (c), and the ESI-TOF-MS spectrum obtained by deconvolution of the protein monomer (II-4) is shown. Is shown in FIG.
- the calculated molecular weight of the protein monomer (II-4) is 18188.8. From FIG. 5 (d), it was confirmed that the molecular weight of the protein monomer (II-4) coincided with the calculated value.
- the ESI-TOF-MS spectrum of the protein monomer (II-3) obtained in Example 5 is shown in FIG. 5 (e), and the ESI-TOF-MS spectrum obtained by deconvolution of the protein monomer (II-3) is shown in FIG. Is shown in FIG.
- the calculated molecular weight of the protein monomer (II-3) is 18260.9. From FIG. 5 (f), it was confirmed that the molecular weight of the protein monomer (II-3) was consistent with the calculated value.
- protoporphyrin IX mono-t-butyl ester used a mixture of positional isomers, but the compound represented by formula 12, the compound represented by formula 13 and the compound represented by formula (IV-1) obtained thereafter Shows the structural formula when combined with the protoporphyrin IX mono-t-butyl ester shown in Scheme 13.
- Protein monomer (II-2) and compound (IV-1) (triad) were mixed at a molar ratio of 40: 1.
- the protein monomer (II-2) and the compound (IV-1) (triad) were mixed at a molar ratio of 1: 1.
- the protein monomer (II-2) and compound (IV-1) (triad) were mixed at a molar ratio of 100: 1.
- AFM measurement The sample used for AFM measurement was prepared as follows. The surface of the highly oriented sintered graphite (HOPG) substrate was wall-opened, and the wall-opened surface was an aqueous solution of the assembly obtained in Example 6 (about 10 ⁇ 8 M, 0.05 M in Tris buffer, pH 7.3). For a few seconds. After the substrate was lifted from the solution, it was thoroughly washed with water, dried well in a desiccator containing calcium chloride at room temperature, and then set in an AFM measuring apparatus. The measurement was performed in a tapping mode, and a silicon single crystal having a scanning speed of 2 Hz and a radius of curvature of about 10 nm was used for the probe. An AFM image of the assembly obtained in Example 6 is shown in FIG.
- FIG. 6 (a) shows an AFM image of an assembly obtained by mixing protein monomer (II-2) and compound (IV-1) (triad) at a molar ratio of 40: 1.
- FIG. 6B is an enlarged view of FIG.
- FIG. 6C shows a cross-sectional profile analyzed along the gray line in FIG. According to the cross-sectional profile, this assembly has a thickness of about 4 nm. From this height information, it was confirmed that this assembly was a nanosheet having a height of one protein (2.5 to 5.0 nm).
- FIG. 7 shows an AFM image of the assembly obtained in Example 7
- FIG. 8 shows an AFM image of the assembly obtained in Example 8
- FIG. 9 shows an AFM image of the assembly obtained in Example 9.
- FIG. 10 shows an AFM image of compound (IV-1) (triad).
- FIG. 10 From FIG. 10, in the case of compound (IV-1) alone, only dot-like objects were observed. These are assumed to be aggregates of compound (IV-1). From FIG. 7, in the case of the assembly obtained in Example 7, a rod-shaped object was confirmed. Since these objects are less than 1 nm in height, it is assumed that the denatured products of proteins aggregated. From FIG. 8, in the case of the assembly obtained in Example 8, it was confirmed that a locally dense network was formed as compared with the assembly obtained in Example 6. From FIG. 9, it was confirmed that in the case of the assembly obtained in Example 9, an overall sparse network was formed compared to the assembly obtained in Example 6. FIG. 9B is a cross-sectional profile analyzed along the gray line in FIG.
- this assembly has a thickness of about 4 nm. From this height information, it was confirmed that this assembly was a nanosheet having a height of one protein (2.5 to 5.0 nm).
- FIG. 9C is an enlarged view of a part of FIG. From FIG. 9 (c), it can be confirmed that the protein chains of the assembly are branched.
- the mixture was adjusted to pH 4 with 1M hydrochloric acid and then extracted from the mixture with chloroform.
- the obtained organic phase was washed successively with a pH 4 aqueous citric acid solution and saturated brine, and then dried over sodium sulfate.
- the product was purified using an anion exchange column (HiTrap Q FF, 5 mL, GE Healthcare) to obtain protein monomer (II-6) (1.78 ⁇ 10 ⁇ 7 mol, 8. 91 ⁇ 10 ⁇ 5 M, yield 8.5%).
- II-6 protein monomer
- UV-Vis spectrum measurement it was confirmed that zinc protoporphyrin was bound since there was a characteristic absorption of zinc protoporphyrin at 417,523,567 nm.
- UV-Vis (10 mM pH 7.3 Tris-HCl buffer) ⁇ max / nm (absorption) 417 (0.0637) 523 (0.00880) 567 (0.00850).
- a gold electrode gold-deposited glass electrode
- a glass electrode (Matsunami Glass Industry s3399X5 BK-71 edge polishing 13 ⁇ 36 t0.7 double-sided polishing) was immersed in a 5 M aqueous potassium hydroxide solution for 12 hours, followed by ultrasonic cleaning for 20 minutes. This glass electrode was washed with ultrapure water and then with ethanol and dried.
- the gold electrode was washed by applying a potential of -1.2V.
- the gold electrode was added to a dimethyl sulfoxide solution (500 ⁇ L) in which the concentration ratio of 3-mercaptopropionic acid / 3,3′-dithiobis (succinimidyl propionate) was adjusted to 100 mM / 1.00 mM at room temperature. Soaked for hours.
- the surface of the gold electrode was washed with dimethyl sulfoxide and then with ultrapure water.
- the gold electrode was immersed in a 1,12-diaminododecane solution (20 mM, the solvent was a mixture of 95% ethanol and 5% water, 500 ⁇ L) at room temperature for 4 hours, and then dimethyl sulfoxide and then ultrapure water in that order.
- the gold electrode surface was washed with A gold electrode was immersed in a mixed solution of 1-ethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) carbodiimide hydrochloride (300 mM aqueous solution, 25 ⁇ L) and triethylamine aqueous solution (300 mM, 25 ⁇ L), and then hemin ( 10 mM solution, 50 ⁇ L) was added and immersed at 4 ° C. overnight, and the gold electrode surface was modified by a coupling reaction. Next, the gold electrode was washed with ultrapure water to obtain a hemin-modified gold electrode.
- 1-ethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) carbodiimide hydrochloride 300 mM aqueous solution, 25 ⁇ L
- triethylamine aqueous solution 300 mM, 25 ⁇ L
- hemin 10 mM solution, 50 ⁇ L
- hemin modified gold electrode (D) The hemin modified electrode (D) was prepared in the same manner as in Example 11 (1) except that 1,6-diaminohexane was used instead of 1,12-diaminododecane. Obtained.
- a hemin modified gold electrode (A), a protein monomer modified gold electrode (B) or a protein polymer modified gold electrode (C) is mounted on the cell, and these electrodes are immersed in a MOPS buffer (100 mM, pH 7.0). MOPS buffer solution was added to the cell. The buffer in the cell was degassed through argon for 30 minutes, and hemin-modified gold electrode (A), protein monomer-modified gold electrode (B), protein polymer-modified gold electrode (C), hemin-modified gold electrode (D), Alternatively, cyclic voltammetry and impedance measurement of the protein polymer-modified gold electrode (E) were performed. Sweep speed 0.30 [V / s], counter electrode: platinum, reference electrode: silver / silver chloride.
- Cyclic voltammetry Cyclic voltammetry (sweep speed 0.30 (V / s), counter electrode is platinum, reference electrode is silver / silver chloride), hemin modified gold electrode (A), protein monomer modified gold E 1/2 of the electrode (B) and the protein polymer-modified gold electrode (C) was approximately ⁇ 0.30 [V] (vs silver / silver chloride), and a redox response derived from heme was observed.
- the cyclic voltammograms of the hemin-modified gold electrode (A), the protein monomer-modified gold electrode (B) and the protein polymer-modified gold electrode (C) are shown in FIGS. 11 (a), 11 (b) and 11 (c). Each is shown.
- the oxidation and reduction responses in the protein polymer-modified gold electrode (C) decreased in the amount of faradic current and increased in non-faradic current value, indicating that the substrate was modified with heme protein. It could be confirmed.
- hemin modified gold electrode A
- protein monomer modified gold electrode B
- protein polymer modified gold electrode C
- hemin modified gold electrode D
- protein polymer modified gold electrode E
- FIGS. 13 (a), 13 (b), 13 (c), 13 (d) and 13 (e) respectively. From FIG. 12 and FIG. 13, the presence of a proportional relationship between the sweep rate and the current value indicates that there is an electrochemical response of the surface adsorbed species.
- heme-modified gold electrode A
- protein monomer-modified gold electrode B
- protein polymer-modified gold electrode C
- hemin-modified gold electrode D
- protein polymer-modified gold electrode E
- DPV Differential pulse voltammetry
- A hemin modified gold electrode
- B protein monomer modified gold electrode
- C protein polymer modified gold electrode
- D hemin modified gold electrode
- E protein polymer modified gold electrode
- the hemin-modified gold electrode (D) and the protein polymer-modified gold electrode (E) are -0.30 and -0.34 [V], respectively, and it is clear that the redox potentials are almost the same. It is. From these results, it was confirmed that the gold electrode was modified with heme molecules, cytochrome b 562 , and protein polymer, respectively.
- (E) Impedance measurement Measures the resistance value of an electrode by assuming that the system is an electric circuit by measuring the impedance of the system using AC impedance measurement that utilizes the phase shift of the voltage applied to the resistor and capacitor when AC voltage is applied. it can.
- the horizontal axis is a real number and the vertical axis is an imaginary impedance
- the frequency of the AC voltage is changed, a characteristic semicircle appears in the parallel circuit of the resistor and capacitor, and the diameter of the semicircle is called the charge transfer resistance.
- the charge transfer resistance When the material is laminated on the surface and the film thickness is increased, the electrification movement resistance is increased.
- the resistance values of the hemin-modified gold electrode (A), the protein monomer-modified gold electrode (B), and the protein polymer-modified gold electrode (C) are 4.0 ⁇ 10 3 ⁇ , 1.0 ⁇ 10 4 ⁇ , and It was 2.2 ⁇ 10 4 ⁇ (see FIG. 15).
- the magnitude relationship of the resistance value is electrode (A) ⁇ electrode (B) ⁇ electrode (C), and particularly the resistance value greatly increased in electrode (C), so that the gold electrode can be modified with a protein polymer. was confirmed.
- Impedance measurement was performed in an aqueous solution of 100 mM potassium chloride + 5 mM K 3 Fe (CN) 6 / K 4 Fe (CN) 6 . Sweep speed: 0.30 [V / s]
- Counter electrode Platinum Reference electrode: Silver / silver chloride AC voltage range: -0.2 ⁇ 0.01 [V] (vs silver / silver chloride) Frequency: 100,000 to 0.1 [Hz]
- the protein polymer of the present invention can also be used as an assembly of enzymes.
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Abstract
大分子量を有するタンパク質を規則的に配列させることにより得られる、さらに大分子量を有するタンパク質ポリマーの提供を提供する。一般式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩を用いることにより、大分子量を有するタンパク質ポリマーを得ることができる。 前記式(I)中、R1、R2、R3、R4、YおよびXは、明細書中で定義のとおり。
Description
本発明は、タンパク質モノマーおよびそのモノマーから得られるタンパク質ポリマーに関する。より詳細には、本発明は、タンパク質モノマー、およびそのモノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマーならびにこれらを含むデバイスに関する。
従来、小分子量を有する有機化合物を様々な相互作用、例えば配位結合、共有結合、イオン結合等により規則的に配列させ、大分子量を有する有機化合物を製造することが試みられている(例えば、非特許文献1参照)。このようにして製造された大分子量の有機化合物は、様々な機能を有するナノデバイスとしての利用が期待されている。
一方、もともと大分子量を有する有機化合物、例えばタンパク質を様々な相互作用、例えば配位結合、共有結合、イオン結合等により規則的に配列させ、さらに大分子量を有する有機化合物を製造することは、非常に困難である。この困難さの理由としては、高次立体構造を有するタンパク質の表面に存在する官能基に対して適切に化学修飾を施すことが困難であること、かつ、そのように化学修飾されたタンパク質同士を相互作用させるようなしくみを開発するのが困難であることなどが挙げられる。
J.-M. Lehn, "Supramolecular Chemistry: Concepts and Perspectives" ドイツ、Weinheim、VCH社出版、1995年.
J.-M. Lehn, "Supramolecular Chemistry: Concepts and Perspectives" ドイツ、Weinheim、VCH社出版、1995年.
そこで、本発明は、大分子量を有するタンパク質を規則的に配列させることにより得られる、さらに大分子量を有するタンパク質ポリマーの提供を目的とする。
本発明は、一般式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩である。
前記式(I)中、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
前記変異体は、天然のヘムタンパク質のアミノ酸配列中、1つのアミノ酸残基をシステイン残基に置き換えたものである。前記変異体中、-SHは、前記システイン残基の側鎖チオール基を意味し、Feは、前記ヘムタンパク質に含まれるポルフィリン基の4つの窒素原子と結合している。
また、本発明は、一般式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩である。
前記式(II)中、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
前記変異体は、天然のヘムタンパク質のアミノ酸配列中、1つのアミノ酸残基をシステイン残基に置き換えたものである。前記変異体中、-SHは、前記システイン残基の側鎖チオール基を意味し、Feは、前記ヘムタンパク質に含まれるポルフィリン基の4つの窒素原子と結合している。
また、本発明は、前記式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩である。
前記式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩および前記式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩は、タンパク質ポリマー製造用モノマーとして有用である。
本発明のタンパク質モノマーまたはその塩は、大分子量を有する。そのタンパク質モノマーまたはその塩を、ヘム(Feの代わりにZnを含むものも含む)を利用して規則的に配列させることにより、さらに大分子量を有するタンパク質ポリマーを製造することができる。
本発明は、前記のように、前記一般式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩である。
また、本発明は、前記のように、前記一般式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩である。
また、本発明は、前記のように、前記式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩である。なお、前記タンパク質ポリマーまたはその塩を構成する、前記式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩は、1種類であっても、2種類以上の混合物であってもよく、さらに位置異性体の混合物であってもよい。また、前記タンパク質ポリマーは、一般式(III)で表わされるランダムなタンパク質ポリマーであるのが好ましい。
前記式(III)中、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
前記変異体は、天然のヘムタンパク質のアミノ酸配列中、1つのアミノ酸残基をシステイン残基に置き換えたものである。前記変異体中、-SHは、前記システイン残基の側鎖チオール基を意味し、Feは、前記ヘムタンパク質に含まれるポルフィリン基の4つの窒素原子と結合している。
また、本発明は、一般式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩と、前記式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩とを含むタンパク質アセンブリまたはその塩である。前記式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩は、1種類であっても、2種類以上の混合物であってもよく、さらに位置異性体の混合物であってもよい。さらに、式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩は、モノマー単位としてタンパク質ポリマーを形成してもよい。また、前記タンパク質アセンブリは、1以上のトライアドを含んでもよい。
前記式(IV)中、
R11、R12、R13,R14、R21、R22、R23、R24、R31、R32、R33、およびR34は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
M1、M2およびM3は、それぞれ独立して、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)m1-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-または-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-O-(CH2)m4-で表わされる基であり、ここでm1、m2、m3およびm4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味する。
R11、R12、R13,R14、R21、R22、R23、R24、R31、R32、R33、およびR34は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
M1、M2およびM3は、それぞれ独立して、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)m1-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-または-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-O-(CH2)m4-で表わされる基であり、ここでm1、m2、m3およびm4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味する。
また、本発明は、前記タンパク質アセンブリまたはその塩を含むナノシートである。
さらに、本発明は、タンパク質モノマー、タンパク質モノマーの塩、タンパク質ポリマー、タンパク質ポリマーの塩、タンパク質アセンブリおよびタンパク質アセンブリの塩からなる群から選択される1以上を含むデバイスである。前記タンパク質モノマーまたはタンパク質モノマーの塩は、式(I)で表わされる本発明のタンパク質モノマーもしくはその塩、または式(II)で表わされる本発明のタンパク質モノマーもしくはその塩であり、前記タンパク質ポリマーまたはタンパク質ポリマーの塩は、式(II)で表わされるタンパク質モノマーもしくはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマー、または式(III)で表わされる本発明のタンパク質ポリマーもしくはその塩であり、前記タンパク質アセンブリまたはタンパク質アセンブリの塩は、本発明のタンパク質アセンブリまたはタンパク質アセンブリの塩である。
また、本発明は、タンパク質モノマー、タンパク質モノマーの塩、タンパク質ポリマーおよびタンパク質ポリマーの塩からなる群から選択される1以上で修飾された基板ある。前記タンパク質モノマーまたはタンパク質モノマーの塩は、式(II)で表わされる本発明のタンパク質モノマーもしくはその塩(ただし式(II)においてMはFeである)であり、前記タンパク質ポリマーまたはタンパク質ポリマーの塩は、式(II)で表わされるタンパク質モノマーもしくはその塩(ただし式(II)においてMはFeである)をモノマー単位とするタンパク質ポリマー、または、式(III)で表わされる本発明のタンパク質ポリマーもしくはその塩(ただし式(III)においてMはFeである)である。
本発明において、「低級」は特に指示がなければ、炭素原子が1~6個、好ましくは炭素原子1~4個を意味する。
「低級アルキル基」および「ハロゲン原子で置換された低級アルキル基」中の「低級アルキル基」としては、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、t-ブチル、ペンチル、ネオペンチル、ヘキシル等のような直鎖状もしくは分岐鎖状の炭素数1~6のアルカンの残基を意味する。低級アルキル基の好ましい例としては、炭素数1~5のアルキルが挙げられる。好ましい炭素数1~5のアルキルとしては、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、第三級ブチル、ペンチル、ネオペンチル等が挙げられる。
「低級アルケニル基」としては、ビニル、アリル、イソプロペニル、1-、2-もしくは3-ブテニル、1-、2-、3-もしくは4-ペンテニル、1-、2-、3-、4-もしくは5-へキセニル等の炭素数2~6個を有する直鎖または分枝鎖アルケニル基が挙げられる。好ましい低級アルケニル基としては、ビニルが挙げられる。
「ハロゲン原子」としては、フッ素、塩素、臭素、ヨウ素等が挙げられ、中でもフッ素が好ましい。
「ハロゲン原子で置換された低級アルキル基」の例としては、前記低級アルキル基の1以上の水素原子が、前記ハロゲン原子で置き換えられたものを意味する。前記ハロゲン原子で置換された低級アルキル基の好ましい例としては、ヨウ化メチル、ジクロロメチル、トリクロロメチル、トリフルオロメチル等が挙げられる。好ましいハロゲン原子で置換された低級アルキル基としては、トリフルオロメチルが挙げられる。
本発明のモノマー、ポリマーまたはアセンブリおよびその塩は、溶媒和物の形をとることもありうるが、これも本発明の範囲に含まれる。溶媒和物としては、好ましくは、水和物及びエタノール和物が挙げられる。
本発明のモノマー、ポリマーまたはアセンブリまたはその塩に含まれるMは、前記のとおり、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択される。このMがFeである場合、MはFe2+およびFe3+を含み、MがZnである場合、MはZn2+を含み、MがCoである場合、MはCo2+およびCo3+を含む。
前記式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩、前記式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩、および前記式(III)で表わされるタンパク質ポリマーまたはその塩において、前記タンパク質は、ヘム(ただしFeがZnに置換されたものを含む)を1以上有するタンパク質であれば特に限定されないが、例えば、シトクロム、ヘモグロビン、ミオグロビン、またはペルオキシダーゼが挙げられる。前記シトクロムとしては、例えばシトクロムb562、シトクロムb5、シトクロムP450CAMが挙げられ、中でもシトクロムb562が好ましい。前記ヘモグロビンとしては、例えばヘモグロビン(human)、ヘモグロビン(bovine)、ヘモグロビン(equine)、ヘモグロビン(rat)が挙げられ、中でもヘモグロビン(human)が好ましい。前記ミオグロビンとしては、例えばミオグロビン(sus scrofa)、ミオグロビン(equine)、ミオグロビン(human)、ミオグロビン(sperm whale)が挙げられ、中でもミオグロビン(sperm whale)およびミオグロビン(sus scrofa)が好ましい。前記ペルオキシダーゼとしては、例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、クロロペルオキシダーゼ、カタラーゼが挙げられ、中でも西洋ワサビペルオキシダーゼが好ましい。
前記式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩としては、前記式(I)中、R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味するのが好ましい。
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味するのが好ましい。
本発明において、式(V)
で表わされるヘムタンパク質の変異体は、前記ヘムタンパク質のアミノ酸配列中、1つのアミノ酸残基をシステイン残基に置き換えたものである。このようなヘムタンパク質の変異体は、例えば、シトクロムの場合、(a)配列番号1で表わされるアミノ酸配列の1つのアミノ酸がシステインに置換されたアミノ酸配列からなるタンパク質、(b)配列番号1で表わされるアミノ酸配列の1つのアミノ酸がシステインに置換されたアミノ酸配列において、1もしくは2個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつシトクロムとして機能するタンパク質を意味する。なお、前記配列番号1で表わされるアミノ酸配列は、天然のシトクロムb562のアミノ酸配列である。天然のシトクロムb562のアミノ酸配列は、配列番号1で表わされるアミノ酸配列に限定されず、Protein Data Bankにおいて、適切なものを選択すればよい。具体的には、ID番号1QPU(1999年6月2日付)のものが挙げられ、前記配列番号1で表わされるアミノ酸配列は、ID番号1QPUのものに対応する。システインに置き換えられる前記1つのアミノ酸残基は、前記シトクロムが立体構造をとる際、構造の外側に配置されるようなアミノ酸残基が好ましい。また、システイン残基に置き換えられたことにより、前記シトクロムに含まれるヘムの構造に影響を与えない必要がある。このような置換を行うため、例えば配列番号1のアミノ酸配列において、第1~106番目のアミノ酸残基、好ましくは第60、62、63、66、67、70、73、74、76、78、89、90、96、99および100番目のアミノ酸残基、より好ましくは第60、第63、第66、第67および第100番目のアミノ酸残基をシステイン残基に置き換えることができる。
また、このようなヘムタンパク質の変異体は、例えば、ヘモグロビンの場合、(a)配列番号9または配列番号10で表わされるアミノ酸配列の1つのアミノ酸がシステインに置換されたアミノ酸配列からなるタンパク質、(b)配列番号9または配列番号10で表わされるアミノ酸配列の1つのアミノ酸がシステインに置換されたアミノ酸配列において、1もしくは2個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつヘモグロビン(human)として機能するタンパク質を意味する。なお、前記配列番号9で表わされるアミノ酸配列は、天然のヘモグロビンαサブユニットのアミノ酸配列であり、前記配列番号10で表わされるアミノ酸配列は、天然のヘモグロビンのβサブユニットのアミノ酸配列である。天然のヘモグロビンのアミノ酸配列は、配列番号9および配列番号10で表わされるアミノ酸配列に限定されず、Protein Data Bankにおいて、適切なものを選択すればよい。具体的には、ID番号1GZX(2002年7月8日付)のものが挙げられ、前記配列番号9および配列番号10で表わされるアミノ酸配列は、ID番号1GZXのものに対応する。システインに置き換えらえる前記1つのアミノ酸残基は、前記ヘモグロビンが立体構造をとる際、構造の外側に配置されるようなアミノ酸残基が好ましい。また、システイン残基に置き換えられたことにより、前記ヘモグロビンに含まれるヘムの構造に影響を与えない必要がある。
また、このようなヘムタンパク質の変異体は、例えば、ミオグロビンの場合、(a)配列番号2で表わされるアミノ酸配列の1つのアミノ酸がシステインに置換されたアミノ酸配列からなるタンパク質、(b)配列番号2で表わされるアミノ酸配列の1つのアミノ酸がシステインに置換されたアミノ酸配列において、1もしくは2個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつミオグロビンとして機能するタンパク質を意味する。なお、前記配列番号2で表わされるアミノ酸配列は、野生型のミオグロビン(sperm whale)のアミノ酸配列である。前記配列番号2で表わされるアミノ酸配列は、天然型のアミノ酸配列(実際に鯨から抽出したタンパク質のアミノ酸配列)の第1番目のアミノ酸残基Valの前に、アミノ酸残基としてMetをさらに含むものである。さらに、天然型のアミノ酸配列の第122番目のアミノ酸残基であるアスパラギン酸は、前記配列番号2で表わされるアミノ酸配列の第123番目に対応するが、そのアミノ酸残基は、アスパラギンに置き換えられている。野生型のミオグロビンのアミノ酸配列は、配列番号2で表わされるアミノ酸配列に限定されず、Protein Data Bankにおいて、適切なものを選択すればよい。具体的には、ID番号2MBW(1996年6月20日付)のものが挙げられ、前記配列番号2で表わされるアミノ酸配列は、ID番号2MBWのものに対応する。システインに置き換えらえる前記1つのアミノ酸残基は、前記ミオグロビンが立体構造をとる際、構造の外側に配置されるようなアミノ酸残基が好ましい。また、システイン残基に置き換えられたことにより、前記ミオグロビンに含まれるヘムの構造に影響を与えない必要がある。このような置換を行うため、例えば配列番号2のアミノ酸配列において、第1~154番目のアミノ酸残基、好ましくは第8、9、12、13、16、17、53、54、102、103、106、107、113、114、117、118、121、122、125、126、127、133、134、140、141、147および148番目のアミノ酸残基、より好ましくは第125、126、133および第134番目のアミノ酸残基をシステイン残基に置き換えることができる。
また、このようなヘムタンパク質の変異体は、例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼの場合、(a)配列番号3で表わされるアミノ酸配列の1つのアミノ酸がシステインに置換されたアミノ酸配列からなるタンパク質、(b)配列番号1で表わされるアミノ酸配列の1つのアミノ酸がシステインに置換されたアミノ酸配列において、1もしくは2個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ西洋ワサビペルオキシダーゼ活性を有するタンパク質を意味する。なお、前記配列番号3で表わされるアミノ酸配列は、天然の西洋ワサビペルオキシダーゼのアミノ酸配列である。天然の西洋ワサビペルオキシダーゼのアミノ酸配列は、配列番号3で表わされるものに限定されず、Protein Data Bankにおいて、適切なものを選択すればよい。具体的には、ID番号1ATJ(1998年2月4日付)のものが挙げられ、前記配列番号3で表わされるアミノ酸配列は、ID番号1ATJのものに対応する。システインに置き換えられる前記1つのアミノ酸残基は、前記西洋ワサビペルオキシダーゼが立体構造をとる際、構造の外側に配置されるようなアミノ酸残基が好ましい。また、システイン残基に置き換えられたことにより、前記西洋ワサビペルオキシダーゼに含まれるヘムの構造に影響を与えない必要がある。
前記変異体中、前述のように、-SHは、前記システイン残基の側鎖チオール基を意味し、Feは、前記ヘムタンパク質に含まれるポルフィリン基の4つの窒素原子と結合している。
前記式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩としては、前記式(I)中、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるのがより好ましい。
また、前記式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩としては、前記式(I)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるのがより好ましい。
前記式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩としては、前記式(I)中、R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンであるのがさらに好ましい。
また、前記式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩としては、前記式(I)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、メチル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンであるのがさらに好ましい。
また、前記式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩としては、前記式(II)中、R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味するのが好ましい。
前記式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩としては、前記式(II)中、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるのがより好ましい。
また、前記式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩としては、前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるのがより好ましい。
前記式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩としては、前記式(II)中、R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンであるのがさらに好ましい。
また、前記式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩としては、前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、メチル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンであるのがさらに好ましい。
また、本発明のタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩としては、前記タンパク質モノマーが、前記式(II)中、R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味する式(II)で表わされるタンパク質モノマーであるのが好ましい。
本発明のタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩としては、前記式(II)中、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるタンパク質モノマーまたはその塩、
ならびに、
前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるタンパク質モノマーまたはその塩
の少なくとも一方をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩がより好ましい。
ならびに、
前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるタンパク質モノマーまたはその塩
の少なくとも一方をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩がより好ましい。
本発明のタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩としては、前記タンパク質モノマーが、前記式(II)中、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーがより好ましい。
本発明のタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩としては、前記タンパク質モノマーが、前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーがより好ましい。
本発明のタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩としては、前記式(II)中、前記式(II)中、R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンであるタンパク質モノマーまたはその塩、
ならびに、
前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、メチル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンであるタンパク質モノマーまたはその塩
の少なくとも一方をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩がより好ましい。
ならびに、
前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、メチル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンであるタンパク質モノマーまたはその塩
の少なくとも一方をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩がより好ましい。
本発明のタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩としては、前記タンパク質モノマーが、前記式(II)中、R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーがさらに好ましい。
また、本発明のタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩としては、前記タンパク質モノマーが、前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、メチル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーがさらに好ましい。
また、前記式(III)で表わされるタンパク質ポリマーまたはその塩としては、前記式(II)中、R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味するタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩が好ましい。
また、前記式(III)で表わされるタンパク質ポリマーまたはその塩としては、
前記式(II)中、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるタンパク質モノマーまたはその塩、
ならびに、
前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるタンパク質モノマーまたはその塩
の少なくとも一方をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩がより好ましい。
前記式(II)中、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるタンパク質モノマーまたはその塩、
ならびに、
前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるタンパク質モノマーまたはその塩
の少なくとも一方をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩がより好ましい。
また、前記式(III)で表わされるタンパク質ポリマーまたはその塩としては、前記式(II)中、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩、
ならびに、
前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩からなる群から選択される1以上がより好ましい。
ならびに、
前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンであるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩からなる群から選択される1以上がより好ましい。
前記式(III)で表わされるタンパク質ポリマーまたはその塩としては、前記式(II)中、R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンであるタンパク質モノマーまたはその塩、
ならびに
前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、メチル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンであるタンパク質モノマーまたはその塩
の少なくとも一方をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩がさらに好ましい。
ならびに
前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、メチル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンであるタンパク質モノマーまたはその塩
の少なくとも一方をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩がさらに好ましい。
前記式(III)で表わされるタンパク質ポリマーまたはその塩としては、前記式(II)中、R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンであるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩、
ならびに
前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、メチル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンであるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩からなる群から選択される1以上がさらに好ましい。
ならびに
前記式(II)中、R2およびR4は、それぞれ独立して、メチル基であり、R1およびR3は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンであるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩からなる群から選択される1以上がさらに好ましい。
前記式(I)で表わされるタンパク質モノマーの塩、式(II)で表わされるタンパク質モノマーの塩、式(III)で表わされるタンパク質ポリマーの塩、式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩、タンパク質アセンブリまたはその塩は、前記式(I)で表わされるタンパク質モノマー、式(II)で表わされるタンパク質モノマー、式(III)で表わされるタンパク質ポリマー、式(IV)で表わされるトライアド、およびタンパク質アセンブリの、例えばナトリウム、カリウムなどのアルカリ金属塩、カルシウム、マグネシウムなどのアルカリ土類金属塩、アンモニウム塩などの無機塩基との塩、及びトリエチルアミン、ピリジン、ピコリン、エタノールアミン、トリエタノールアミン、ジシクロヘキシルアミン、N,N’-ジベンジルエチレンアミンなどの有機アミン塩、及び塩酸、臭化水素酸、硫酸、リン酸などの無機酸塩、及びギ酸、酢酸、トリフルオロ酢酸、マレイン酸、酒石酸などの有機カルボン酸塩、及びメタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸、p-トルエンスルホン酸などのスルホン酸付加塩、及びアルギニン、アスパラギン酸、グルタミン酸などの塩基性又は酸性アミノ酸といった塩基との塩又は酸付加塩がそれぞれ挙げられる。
前記タンパク質アセンブリまたはその塩としては、R11、R12、R13,R14、R21、R22、R23、R24、R31、R32、R33、およびR34は、それぞれ独立して、低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)m1-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-または-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-O-(CH2)m4-で表わされる基であり、ここでm1、m2、m3およびm4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、M1、M2およびM3は、それぞれ独立してFeまたはZnを意味する式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩を1以上と、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味する式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩を1以上とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩が好ましい。
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味する式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩を1以上とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩が好ましい。
また、前記タンパク質アセンブリまたはその塩としては、R11およびR13は低級アルケニル基を意味し、かつ、R12およびR14は低級アルキル基を意味するか、または、R11およびR13は低級アルキル基を意味し、かつ、R12およびR14は低級アルケニル基を意味し、
R21およびR23は低級アルケニル基を意味し、かつ、R22およびR24は低級アルキル基を意味するか、または、R21およびR23は低級アルキル基を意味し、かつ、R22およびR24は低級アルケニル基を意味し、
R31およびR33は低級アルケニル基を意味し、かつ、R32およびR34は低級アルキル基を意味するか、または、R31およびR33は低級アルキル基を意味し、かつ、R32およびR34は低級アルケニル基を意味し、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)m1-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-または-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-O-(CH2)m4-で表わされる基であり、ここでm1、m2、m3およびm4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、M1、M2およびM3は、それぞれ独立してFeまたはZnを意味する式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩1以上と、
R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
ならびに、
R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルケニル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
の少なくとも一方とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がより好ましい。
R21およびR23は低級アルケニル基を意味し、かつ、R22およびR24は低級アルキル基を意味するか、または、R21およびR23は低級アルキル基を意味し、かつ、R22およびR24は低級アルケニル基を意味し、
R31およびR33は低級アルケニル基を意味し、かつ、R32およびR34は低級アルキル基を意味するか、または、R31およびR33は低級アルキル基を意味し、かつ、R32およびR34は低級アルケニル基を意味し、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)m1-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-または-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-O-(CH2)m4-で表わされる基であり、ここでm1、m2、m3およびm4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、M1、M2およびM3は、それぞれ独立してFeまたはZnを意味する式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩1以上と、
R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
ならびに、
R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルケニル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
の少なくとも一方とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がより好ましい。
また、前記タンパク質アセンブリまたはその塩としては、R11およびR13は低級アルケニル基を意味し、かつ、R12およびR14は低級アルキル基を意味するか、または、R11およびR13は低級アルキル基を意味し、かつ、R12およびR14は低級アルケニル基を意味し、
R21およびR23は低級アルケニル基を意味し、かつ、R22およびR24は低級アルキル基を意味するか、または、R21およびR23は低級アルキル基を意味し、かつ、R22およびR24は低級アルケニル基を意味し、
R31およびR33は低級アルケニル基を意味し、かつ、R32およびR34は低級アルキル基を意味するか、または、R31およびR33は低級アルキル基を意味し、かつ、R32およびR34は低級アルケニル基を意味し、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)m1-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-または-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-O-(CH2)m4-で表わされる基であり、ここでm1、m2、m3およびm4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、M1、M2およびM3は、それぞれ独立してFeまたはZnを意味する式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩1以上と、
R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
ならびに、
R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルケニル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がより好ましい。
R21およびR23は低級アルケニル基を意味し、かつ、R22およびR24は低級アルキル基を意味するか、または、R21およびR23は低級アルキル基を意味し、かつ、R22およびR24は低級アルケニル基を意味し、
R31およびR33は低級アルケニル基を意味し、かつ、R32およびR34は低級アルキル基を意味するか、または、R31およびR33は低級アルキル基を意味し、かつ、R32およびR34は低級アルケニル基を意味し、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)m1-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-または-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-O-(CH2)m4-で表わされる基であり、ここでm1、m2、m3およびm4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、M1、M2およびM3は、それぞれ独立してFeまたはZnを意味する式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩1以上と、
R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
ならびに、
R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルケニル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルキル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がより好ましい。
前記タンパク質アセンブリまたはその塩としては、R11およびR13、R21およびR23、R31およびR33は、それぞれ独立して、低級アルキル基を意味し、R12およびR14、R22およびR24、R32およびR34は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)m1-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-または-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-O-(CH2)m4-で表わされる基であり、ここでm1、m2、m3およびm4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、M1、M2およびM3は、それぞれ独立してFeまたはZnを意味する式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩と、
R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がより好ましい。
R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がより好ましい。
また、前記タンパク質アセンブリまたはその塩としては、R11およびR13、R21およびR23、R31およびR33は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、R12およびR14、R22およびR24、R32およびR34は、それぞれ独立して、低級アルキル基を意味し、Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)m1-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-または-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-O-(CH2)m4-で表わされる基であり、ここでm1、m2、m3およびm4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、M1、M2およびM3は、それぞれ独立してFeまたはZnを意味する式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩と、
R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がより好ましい。
R1およびR3は、それぞれ独立して、低級アルキル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、低級アルケニル基を意味し、Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~3の整数を意味し、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質がシトクロムまたはミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がより好ましい。
また、前記タンパク質アセンブリまたはその塩としては、R11およびR13はビニル基を意味し、かつ、R12およびR14はメチル基を意味するか、または、R11およびR13はメチル基を意味し、かつ、R12およびR14はビニル基を意味し、
R21およびR23はビニル基を意味し、かつ、R22およびR24はメチル基を意味するか、または、R21およびR23はメチル基を意味し、かつ、R22およびR24はビニル基を意味し、
R31およびR33はビニル基を意味し、かつ、R32およびR34はメチル基を意味するか、または、R31およびR33はメチル基を意味し、かつ、R32およびR34はビニル基を意味し、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基を意味し、M1、M2およびM3は、それぞれ独立してFeまたはZnを意味する式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩の1以上と、
R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
ならびに、
R1およびR3は、それぞれ独立して、ビニル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、メチル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
の少なくとも一方とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がさらに好ましい。
R21およびR23はビニル基を意味し、かつ、R22およびR24はメチル基を意味するか、または、R21およびR23はメチル基を意味し、かつ、R22およびR24はビニル基を意味し、
R31およびR33はビニル基を意味し、かつ、R32およびR34はメチル基を意味するか、または、R31およびR33はメチル基を意味し、かつ、R32およびR34はビニル基を意味し、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基を意味し、M1、M2およびM3は、それぞれ独立してFeまたはZnを意味する式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩の1以上と、
R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
ならびに、
R1およびR3は、それぞれ独立して、ビニル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、メチル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
の少なくとも一方とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がさらに好ましい。
また、前記タンパク質アセンブリまたはその塩としては、R11およびR13はビニル基を意味し、かつ、R12およびR14はメチル基を意味するか、または、R11およびR13はメチル基を意味し、かつ、R12およびR14はビニル基を意味し、
R21およびR23はビニル基を意味し、かつ、R22およびR24はメチル基を意味するか、または、R21およびR23はメチル基を意味し、かつ、R22およびR24はビニル基を意味し、
R31およびR33はビニル基を意味し、かつ、R32およびR34はメチル基を意味するか、または、R31およびR33はメチル基を意味し、かつ、R32およびR34はビニル基を意味し、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基を意味し、M1、M2およびM3は、それぞれ独立してFeまたはZnを意味する式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩の1以上と、
R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
ならびに、
R1およびR3は、それぞれ独立して、ビニル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、メチル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がさらに好ましい。
R21およびR23はビニル基を意味し、かつ、R22およびR24はメチル基を意味するか、または、R21およびR23はメチル基を意味し、かつ、R22およびR24はビニル基を意味し、
R31およびR33はビニル基を意味し、かつ、R32およびR34はメチル基を意味するか、または、R31およびR33はメチル基を意味し、かつ、R32およびR34はビニル基を意味し、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基を意味し、M1、M2およびM3は、それぞれ独立してFeまたはZnを意味する式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩の1以上と、
R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
ならびに、
R1およびR3は、それぞれ独立して、ビニル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、メチル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩
とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がさらに好ましい。
前記タンパク質アセンブリまたはその塩としては、R11およびR13、R21およびR23、R31およびR33は、それぞれ独立して、メチル基を意味し、R12およびR14、R22およびR24、R32およびR34は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基を意味し、M1、M2およびM3は、それぞれ独立してFeまたはZnを意味する式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩と、
R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がさらに好ましい。
R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がさらに好ましい。
また、前記タンパク質アセンブリまたはその塩としては、R11およびR13、R21およびR23、R31およびR33は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、R12およびR14、R22およびR24、R32およびR34は、それぞれ独立して、メチル基を意味し、Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基を意味し、M1、M2およびM3は、それぞれ独立してFeまたはZnを意味する式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩と、
R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がさらに好ましい。
R1およびR3は、それぞれ独立して、メチル基であり、R2およびR4は、それぞれ独立して、ビニル基を意味し、Yは、式-(CH2)2-、-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)2-または-(CH2)3-O-(CH2)2-O-(CH2)2-O-(CH2)3-で表わされる基であり、MはFeまたはZnを意味し、前記ヘムタンパク質が、配列番号1で表わされるアミノ酸配列を有するシトクロムであり、前記1つのアミノ酸残基が第63番目のヒスチジンであるか、または、配列番号2で表わされるアミノ酸配列を有するミオグロビンであり、前記1つのアミノ酸残基が第125または126番目のアラニンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩とを、中性条件下で処理することにより得られるタンパク質アセンブリまたはその塩がさらに好ましい。
次に、本発明の式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩の製造方法の一例を説明する。
その製造方法は、一般式(VI)で表わされるポルフィリンリンカーと、一般式(V)で表わされるヘムタンパク質とを反応させて、一般式(I)のタンパク質モノマーまたはその塩を得ることを特徴とする(スキーム1参照)。
前記式(I)および式(VI)中、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
式(I)および式(V)中、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
式(I)および式(V)中、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
前記変異体は、天然のヘムタンパク質のアミノ酸配列中、1つのアミノ酸残基をシステイン残基に置き換えたものである。前記変異体中、-SHは、前記システイン残基の側鎖チオール基を意味し、Feは、前記ヘムタンパク質に含まれるポルフィリン基の4つの窒素原子と結合している。
前記式(VI)中、低級アルキル基および低級アルケニル基の定義は、前記のとおりである。
前記製造方法において、式(VI)で表わされるポルフィリンリンカーと、式(V)で表わされるヘムタンパク質との反応は、不活性ガス(例えばアルゴン、窒素等)雰囲気下に、触媒存在下に溶媒中で行うことができる。前記触媒としては、例えば弱酸、弱塩基等が挙げられる。前記弱酸としてはクエン酸、塩酸、硫酸、硝酸、トルエンスルホン酸、酢酸等が挙げられる。前記弱塩基としては、ヒスジチン、炭酸水素ナトリウム、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン等が上げられる。
前記製造方法において、反応溶媒は限定されないが、例えば、アルコール類(例えば、メタノール、エタノール等)、水、ジメチルスルホキシド、ジメチルホルムアミド等の極性溶媒、緩衝液(例えば、トリス塩酸緩衝液、リン酸緩衝液、ホウ酸緩衝液、炭酸緩衝液)等が挙げられる。また、前記反応溶媒には、式(VI)で表わされるポルフィリンリンカーおよび/または一般式(V)で表わされるヘムタンパク質の溶解性を高めるための添加物を含有してもよい。前記添加物としては、ヒスチジン等が挙げられる。前記溶媒は、1種類を用いても、2種類以上を混合して用いてもよい。前記溶媒としては、前記添加物してもよいジメチルスルホキシドおよび緩衝液から選択されるのが好ましく、ジメチルスルホキシドおよびトリス塩酸緩衝液の混合物、ヒスチジンを含有する水等がより好ましい。
前記製造方法において、反応温度は限定されないが、例えば0℃~100℃、好ましくは10℃~60℃、より好ましくは20℃~30℃である。
前記製造方法において、反応時間は限定されないが、例えば30分~24時間、好ましくは2時間~10時間、より好ましくは5時間~8時間である。
前記製造方法において、式(VI)で表されるポルフィリンリンカーに対し使用される式(V)で表わされるヘムタンパク質のモル比(式(VI)で表されるポルフィリンリンカー:式(V)で表わされるヘムタンパク質)は、例えば100:1~5:1、好ましくは50:1~10:1、より好ましくは20:1~10:1である。
前記製造方法において、前記式(VI)で表されるポルフィリンリンカーは、市販で入手してもよいし、公知文献を参照して自家製造してもよい。
前記製造方法において、前記式(V)で表わされるヘムタンパク質は、例えば以下のようにして製造することができる。
前記式(V)で表わされるヘムタンパク質の遺伝子は、天然のヘムタンパク質の遺伝子の塩基配列に基づいて、モルモットのトータルRNA等を利用してクローニングしてもよく、また、ホスホロアミダイト法を利用して化学的にDNA合成してもよい。前記クローニングの方法は特に制限されず、例えば、市販のクローニングキット等を利用して行える。また、前記式(V)で表わされるヘムタンパク質の遺伝子を宿主細胞内に導入すればよい。
前記宿主細胞としては、例えば、動物細胞、植物細胞、昆虫細胞、酵母、細菌等が挙げられる。前記遺伝子導入方法としては、例えば、酢酸リチウム法、リン酸カルシウム法、リポソームを用いた方法、エレクトロポレーション、ウイルスベクターを用いる方法、マイクロピペットインジェクション法等があげられる。または、宿主染色体への組込み型もしくは自律複製・分配可能な人工染色体もしくはプラスミド型を用いて、それを導入してよい。
前記宿主細胞内に導入する遺伝子は、宿主細胞内で恒常的または任意に発現するように、必要な調節配列と作動的に連結されていることが好ましい。前記調節配列とは、宿主細胞内において、作動的に連結された前記遺伝子の発現に必要な塩基配列であって、例えば、真核細胞に適した調節配列としては、プロモーター、ポリアデニル化シグナル、エンハンサー等があげられる。前記作動的に連結とは、各構成要素が機能を果たすことができるように並置していることを意味する。
また、本発明の式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩の製造方法の一例を説明する。
その製造方法は、式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩を酸で処理することにより、式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩を得ることを特徴とする(スキーム2参照)。
前記式(I)および式(II)中、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
前記変異体は、天然のヘムタンパク質のアミノ酸配列中、1つのアミノ酸残基をシステイン残基に置き換えたものである。前記変異体中、-SHは、前記システイン残基の側鎖チオール基を意味し、Feは、前記ヘムタンパク質に含まれるポルフィリン基の4つの窒素原子と結合している。
前記製造方法において、式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩の酸処理反応は、例えば、塩酸、硫酸、硝酸等で処理することにより行う。
前記製造方法において、反応溶媒は限定されないが、例えば、アルコール類(例えば、メタノール、エタノール等)、水、ジメチルスルホキシド、ジメチルホルムアミド等の極性溶媒、緩衝液(例えば、トリス塩酸緩衝液、リン酸緩衝液、ホウ酸緩衝液、炭酸緩衝液)等が挙げられる。前記溶媒は、1種類を用いても、2種類以上を混合して用いてもよい。前記溶媒としては、ジメチルスルホキシドおよび緩衝液から選択されるのが好ましく、ジメチルスルホキシドおよびトリス塩酸緩衝液の混合物、リン酸緩衝液等がより好ましい。
前記製造方法において、反応温度は限定されないが、例えば0℃~30℃、好ましくは0℃~10℃、より好ましくは3℃~5℃である。
前記製造方法において、酸処理は、pHが、例えば0.5~3.0、好ましくは1.5~2.5、より好ましくは1.8~2.1で行うことができる。
前記式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩および前記式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩の製造方法において、前記ヘムタンパク質は、シトクロム、ヘモグロビン、ミオグロビン、またはペルオキシダーゼであるのが好ましい。
また、本発明のタンパク質ポリマーまたはその塩の製造方法の一例を説明する。
その製造方法は、式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩を中性条件下で処理することにより、タンパク質ポリマーまたはその塩を得ることを特徴とする。
前記製造方法において、反応溶媒は限定されないが、例えば、アルコール類(例えば、メタノール、エタノール等)、水、ジメチルスルホキシド、ジメチルホルムアミド等の極性溶媒、緩衝液(例えば、トリス塩酸緩衝液、リン酸緩衝液、ホウ酸緩衝液、炭酸緩衝液)等が挙げられる。前記溶媒は、1種類を用いても、2種類以上を混合して用いてもよい。前記溶媒としては、緩衝液から選択されるのが好ましく、トリス塩酸緩衝液、リン酸緩衝液等がより好ましい。
前記製造方法において、反応温度は限定されないが、例えば0℃~30℃、好ましくは0℃~10℃、より好ましくは3℃~5℃である。
前記製造方法において、中性条件下での処理は、pHが、例えば6.0~10.0、好ましくは6.5~8.5、より好ましくは7.0~8.0で行うことができる。
前記本発明のタンパク質ポリマーまたはその塩の製造方法において、前記タンパク質ポリマーまたはその塩は、式(III)で表わされるタンパク質ポリマーまたはその塩であるのが好ましい(スキーム3参照)。
前記式(II)および式(III)中、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
前記変異体は、天然のヘムタンパク質のアミノ酸配列中、1つのアミノ酸残基をシステイン残基に置き換えたものである。前記変異体中、-SHは、前記システイン残基の側鎖チオール基を意味し、Feは、前記ヘムタンパク質に含まれるポルフィリン基の4つの窒素原子と結合している。
前記製造方法において、式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩は、式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩1種類の化合物であっても、その位置異性体である化合物またはその塩が共存する、混合物であってもよい。式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩と、式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩の位置異性体である化合物またはその塩との混合物である場合、得られる式(III)で表わされるタンパク質ポリマーも、位置異性体の混合物になる。
また、前記本発明のタンパク質ポリマーまたはその塩の製造方法において、前記ヘムタンパク質は、シトクロム、ヘモグロビン、ミオグロビン、またはペルオキシダーゼであるのが好ましい。
本発明の式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩は、前記ヘムタンパク質がシトクロム、ヘモグロビンおよびミオグロビンである場合、酸素を貯蔵する生体ポリマーとして有用である。また、前記ヘムタンパク質がペルオキシダーゼである場合、酵素の集合体として有用である。
本発明の式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩は、酸性もしくは塩基性条件下で、式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩に分解することができる。従って、本発明のタンパク質ポリマーまたはその塩は、pHによって集合状態を制御するpH応答性タンパク質ポリマーとして有用である。
また、本発明のタンパク質アセンブリまたはその塩の製造方法の一例を説明する。
その製造方法は、前記(IV)で表わされるトライアドまたはその塩と、前記(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩とを、中性条件下で処理することにより、本発明のタンパク質アセンブリまたはその塩を得ることを特徴とする。
その製造方法は、前記(IV)で表わされるトライアドまたはその塩と、前記(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩とを中性条件下で処理することにより、タンパク質アセンブリまたはその塩を得ることを特徴とする。
前記製造方法において、反応溶媒は限定されないが、例えば、アルコール類(例えば、メタノール、エタノール等)、水、ジメチルスルホキシド、ジメチルホルムアミド等の極性溶媒、緩衝液(例えば、トリス塩酸緩衝液、リン酸緩衝液、ホウ酸緩衝液、炭酸緩衝液)等が挙げられる。前記溶媒は、1種類を用いても、2種類以上を混合して用いてもよい。前記溶媒としては、緩衝液から選択されるのが好ましく、トリス塩酸緩衝液がより好ましい。
前記製造方法において、反応温度は限定されないが、例えば0℃~30℃、好ましくは0℃~10℃、より好ましくは3℃~5℃である。
前記製造方法において、中性条件下での処理は、pHが、例えば6.0~10.0、好ましくは6.5~8.5、より好ましくは7.0~8.0で行うことができる。
前記本発明のタンパク質アセンブリまたはその塩の製造方法において、前記タンパク質アセンブリまたはその塩は、式(VII)で表わされるタンパク質アセンブリまたはその塩であるのが好ましい(スキーム4参照)。
前記式(II)、(IV)および(VII)中、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
R11、R12、R13,R14、R21、R22、R23、R24、R31、R32、R33およびR344は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)m1-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-または-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-O-(CH2)m4-で表わされる基であり、ここでm1、m2、m3およびm4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
M1、M2、M3、M4、M5およびM6は、それぞれ独立して、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択される。
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
R11、R12、R13,R14、R21、R22、R23、R24、R31、R32、R33およびR344は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)m1-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-または-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-O-(CH2)m4-で表わされる基であり、ここでm1、m2、m3およびm4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
M1、M2、M3、M4、M5およびM6は、それぞれ独立して、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択される。
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
前記変異体は、天然のヘムタンパク質のアミノ酸配列中、1つのアミノ酸残基をシステイン残基に置き換えたものである。前記変異体中、-SHは、前記システイン残基の側鎖チオール基を意味し、Feは、前記ヘムタンパク質に含まれるポルフィリン基の4つの窒素原子と結合している。
前記製造方法において、式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩は、式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩1種類の化合物であっても、その位置異性体である化合物またはその塩が共存する、混合物であってもよい。式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩と、式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩の位置異性体である化合物またはその塩との混合物である場合、得られる式(VII)で表わされるタンパク質アセンブリまたはその塩も、位置異性体の混合物になる。
前記製造方法において、式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩に対し使用される式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩のモル比(式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩:式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩)は、例えば1:1~1:1000、好ましくは1:5~1:500、より好ましくは1:10~1:100である。
また、前記本発明のタンパク質アセンブリまたはその塩の製造方法において、前記ヘムタンパク質は、シトクロム、ヘモグロビン、ミオグロビン、またはペルオキシダーゼであるのが好ましい。
本発明の式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質アセンブリまたはその塩は、前記ヘムタンパク質がシトクロム、ヘモグロビンおよびミオグロビンである場合、酸素を貯蔵する生体材料として有用である。また、前記ヘムタンパク質がペルオキシダーゼである場合、酵素の集合体として有用である。また、前記生体材料において、式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質アセンブリまたはその塩中のMはFe2+が好ましい。
また、本発明は、前記のように、タンパク質アセンブリまたはその塩を含むナノシートである。前記ナノシートの厚みは、例えば1~10nmであり、好ましくは2~5nmである。前記ナノシートは、また、メッシュ状の構造を有するのが好ましい。前記ヘムタンパク質がシトクロム、ヘモグロビンおよびミオグロビンである式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質アセンブリまたはその塩は、酸素を貯蔵する生体材料、触媒繊維、センサ繊維等として有用である。また、前記ナノシートにおいて、タンパク質アセンブリ中のMはFe2+が好ましい。
また、本発明は、前記のように、式(I)のタンパク質モノマー、式(I)のタンパク質モノマーの塩、式(II)のタンパク質モノマー、式(II)のタンパク質モノマーの塩、式(II)のタンパク質モノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマー、式(II)のタンパク質モノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマーの塩、式(III)のタンパク質ポリマー、式(III)のタンパク質ポリマーの塩、式(VII)のタンパク質アセンブリおよび式(VII)のタンパク質アセンブリの塩からなる群から選択される1以上を含むデバイスである。前記デバイスとしては、酸素センサー、酸素吸着剤等が挙げられる。このようなデバイスとして用いられる場合、前記デバイスに含まれるタンパク質モノマー、タンパク質モノマーの塩、タンパク質ポリマー、タンパク質ポリマーの塩、タンパク質アセンブリおよびタンパク質アセンブリの塩中のMは、Fe2+であるのが好ましい。
また、本発明は、前記のように、式(II)のタンパク質モノマー、式(II)のタンパク質モノマーの塩、式(II)のタンパク質モノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマー、式(II)のタンパク質モノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマーの塩、式(III)のタンパク質ポリマーおよび式(III)のタンパク質ポリマーの塩(ただし、前記式(II)および式(III)において、MはFeである)からなる群から選択される1以上で修飾された基板である。前記タンパク質モノマー等が酸素吸蔵能を有するため、このような基板に電流を流すことにより前記タンパク質モノマー等により酸素が吸蔵され、電流を止めることにより酸素を吸蔵した前記タンパク質モノマー等から酸素が放出されることができる。従って、前記基板は酸素吸蔵電極として用いることができる。このような基板として用いられる場合、前記基板を修飾するタンパク質モノマー、タンパク質モノマーの塩、タンパク質ポリマーおよびタンパク質ポリマーの塩中のMは、Fe2+であるのが好ましい。
前記のような基板は、例えば、以下のようにして製造することができる。まず基板を用意する。基板は金属板であってもよいし、表面が金属コーティングされたプラスチック等の板であってもよい。なお、基板の形状は板状に限定されない。前記基板の表面に、まず、ヘムを有するリンカーを共有結合で固定する。具体的には、例えば、まず、基板上に反応基を有するリンカーを結合させる。その後、その反応基にヘミンを結合させ、次いでこの基板に、式(II)で表わされるタンパク質モノマー、式(II)で表わされるタンパク質モノマーの塩、式(II)のタンパク質モノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマー、式(II)のタンパク質モノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマーの塩、式(III)で表わされるタンパク質ポリマーおよび式(III)で表されるタンパク質ポリマーの塩からなる群から選択される1以上と反応させる。その結果、前記基板の表面に存在するヘミン中のヘムと、式(II)で表わされるタンパク質モノマー、式(II)で表わされるタンパク質モノマーの塩、式(II)のタンパク質モノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマー、式(II)のタンパク質モノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマーの塩、式(III)で表わされるタンパク質ポリマーおよび式(III)で表されるタンパク質ポリマーの塩からなる群から選択される1以上が反応し、式(II)で表わされるタンパク質モノマー、式(II)で表わされるタンパク質モノマーの塩、式(II)のタンパク質モノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマー、式(II)のタンパク質モノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマーの塩、式(III)で表わされるタンパク質ポリマーおよび式(III)で表されるタンパク質ポリマーの塩からなる群から選択される1以上で修飾された基板が得られる。なお、式(II)のタンパク質モノマーまたはその塩を反応させた場合において、基板上で重合が起こり、その結果、式(III)のタンパク質ポリマーおよび式(III)のタンパク質ポリマーの塩からなる群から選択される1以上で修飾された基板を得てもよい。また、基板への反応基を有するリンカーの結合方法としては、例えば、A.Dasら(J.Biophysical Chemistry, 2006年、123巻、pp.102-112)等の報告を参照して行うことができる。リンカーの長さは特に限定されない。
以下に本発明を実施例によりさらに具体的に説明するが、本発明の範囲は、以下の実施例により限定されない。
種々のスペクトルは、以下の機器を用いて測定した。
核磁気共鳴(NMR)スペクトルは日本電子JEOL EX270核磁気共鳴装置(270MHz)もしくはBruker DPX-400核磁気共鳴装置(400MHz)を用いて測定し、測定溶媒の残存シグナルを内部基準として使用した。エレクトロスプレーイオン化法による飛行時間型質量分析(ESI-TOF-MS)はアプライド・バイオシステム・マリナー(Applied Biosystems Mariner)API-TOFワークステーション(Workstation)を用いて測定した。紫外可視吸収スペクトルは島津製作所製分光光度計UV-2550もしくはUV-3150を用いて測定した。水溶液のpHは堀場製作所製pHメーターF-52を用いて測定した。サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)はGEヘルスケア社製AKTAFPLCシステムにスーパーデック(Superdex)200 10/300 GLカラム(排除限界1.3×106Da)を接続し、検出にはUPC-900検出器を用いて測定した。原子間力顕微鏡(AFM)はデジタル・インスツゥルメンツ(Digital Instruments)社製ナノスコープ(Nanoscope)Vを用いて測定した。
種々のスペクトルは、以下の機器を用いて測定した。
核磁気共鳴(NMR)スペクトルは日本電子JEOL EX270核磁気共鳴装置(270MHz)もしくはBruker DPX-400核磁気共鳴装置(400MHz)を用いて測定し、測定溶媒の残存シグナルを内部基準として使用した。エレクトロスプレーイオン化法による飛行時間型質量分析(ESI-TOF-MS)はアプライド・バイオシステム・マリナー(Applied Biosystems Mariner)API-TOFワークステーション(Workstation)を用いて測定した。紫外可視吸収スペクトルは島津製作所製分光光度計UV-2550もしくはUV-3150を用いて測定した。水溶液のpHは堀場製作所製pHメーターF-52を用いて測定した。サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)はGEヘルスケア社製AKTAFPLCシステムにスーパーデック(Superdex)200 10/300 GLカラム(排除限界1.3×106Da)を接続し、検出にはUPC-900検出器を用いて測定した。原子間力顕微鏡(AFM)はデジタル・インスツゥルメンツ(Digital Instruments)社製ナノスコープ(Nanoscope)Vを用いて測定した。
また、出発原料は、以下の文献を参考にして製造した。
プロトポルフィリンIXモノt-ブチルエステル2:T. Matsuo, T. Hayashi, Y. Hisaeda, J. Am. Chem. Soc. 124, 11234 (2002)。
モノN-Boc保護ジアミン類:M. Trester-Zedlitz, K. Kamada, S. K. Burley, D. Fenyo, B. T. Chait, T. W. Muir, J. Am. Chem. Soc. 125, 2416 (2003);およびR. Schneider, F. Schmitt, C. Frochot, Y. Fort, N. Lourette, F. Guillemin, J.-F. Mueller, M. Barberi-Heyob, Bioorg. Med. Chem. 13, 2799 (2005)。
N-メトキシカルボニルマレイミド:O. Keller, J. Rudinger, Helv. Chim. Acta. 58, 531(1975)。
その他の一般試薬は市販品をそのまま用いた。
プロトポルフィリンIXモノt-ブチルエステル2:T. Matsuo, T. Hayashi, Y. Hisaeda, J. Am. Chem. Soc. 124, 11234 (2002)。
モノN-Boc保護ジアミン類:M. Trester-Zedlitz, K. Kamada, S. K. Burley, D. Fenyo, B. T. Chait, T. W. Muir, J. Am. Chem. Soc. 125, 2416 (2003);およびR. Schneider, F. Schmitt, C. Frochot, Y. Fort, N. Lourette, F. Guillemin, J.-F. Mueller, M. Barberi-Heyob, Bioorg. Med. Chem. 13, 2799 (2005)。
N-メトキシカルボニルマレイミド:O. Keller, J. Rudinger, Helv. Chim. Acta. 58, 531(1975)。
その他の一般試薬は市販品をそのまま用いた。
(1)式1(8)で示す化合物の製造
式1(8)で示す化合物は、以下のスキーム5に従い製造した。
式1(8)で示す化合物は、以下のスキーム5に従い製造した。
(i)式3(8)で表わす化合物の製造
窒素雰囲下、50mLのナス型フラスコにプロトポルフィリンIXモノt-ブチルエステル2(255mg,4.1×10-4mol)、N-Boc-1,2-ビス(2-アミノエトキシ)エタン(ジアミン(8)、208mg,8.4×10-4mol)およびDMF(25mL)を加えて溶解させた。溶液を氷浴によって冷却し、そこへジフェニルリン酸アジド(DPPA,290mg,1.1×10-3mol)のDMF溶液(1mL)およびトリエチルアミン(Et3N,170mg,1.7×10-3mol)のDMF溶液(1mL)をそれぞれ加えた。この溶液を遮光下、室温にて4時間撹拌した後、再び同じ量のDPPAおよびEt3NのDMF溶液を加えた。さらに2時間撹拌した後、溶媒を減圧留去し、残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(クロロホルム/アセトン=5/1)によって精製した。得られた固体を最少量のクロロホルムに溶解させ、そこへヘキサンを加えることによって生じた沈殿を集め、標題化合物3(8)およびその位置異性体との混合物を得た(218mg,63%、紫色、固体)。
窒素雰囲下、50mLのナス型フラスコにプロトポルフィリンIXモノt-ブチルエステル2(255mg,4.1×10-4mol)、N-Boc-1,2-ビス(2-アミノエトキシ)エタン(ジアミン(8)、208mg,8.4×10-4mol)およびDMF(25mL)を加えて溶解させた。溶液を氷浴によって冷却し、そこへジフェニルリン酸アジド(DPPA,290mg,1.1×10-3mol)のDMF溶液(1mL)およびトリエチルアミン(Et3N,170mg,1.7×10-3mol)のDMF溶液(1mL)をそれぞれ加えた。この溶液を遮光下、室温にて4時間撹拌した後、再び同じ量のDPPAおよびEt3NのDMF溶液を加えた。さらに2時間撹拌した後、溶媒を減圧留去し、残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(クロロホルム/アセトン=5/1)によって精製した。得られた固体を最少量のクロロホルムに溶解させ、そこへヘキサンを加えることによって生じた沈殿を集め、標題化合物3(8)およびその位置異性体との混合物を得た(218mg,63%、紫色、固体)。
1H NMR (270 MHz, ピリジン-d5) δ: 10.55 (s, 1H) 10.46 (s, 1H) 10.41 (s, 0.5H) 10.35 (s, 0.5H) 10.29 (s, 0.5H) 10.22 (s, 0.5H)(位置異性体の存在により、メソ-プロトンのシグナルは6つに分割した。存在比は、ピーク強度に基づき、1:1である。), 8.56-8.42 (m, 2H) 6.44 (m, 2H) 6.19 (m, 2H) 4.59-4.49 (m, 4H) 3.68-3.46 (m, 16H) 3.36 (m, 2H) 3.11 (m, 2H) 2.96 (m, 2H) 2.89 (m, 2H) 2.45 (m, 2H) 2.36 (m, 2H) 1.40 (s, 9H) 1.38 (s, 9H) -3.27 (s, 2H);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 850.07 (M + H)+、C49H64N6O7について計算値:850.08;
UV-vis (CHCl3)λmax / nm (吸収) 630 (0.042) 579 (0.056) 543 (0.090) 507 (0.11) 408 (1.27)。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 850.07 (M + H)+、C49H64N6O7について計算値:850.08;
UV-vis (CHCl3)λmax / nm (吸収) 630 (0.042) 579 (0.056) 543 (0.090) 507 (0.11) 408 (1.27)。
(ii)式4(8)で表わす化合物の製造
窒素雰囲気下、50mLのナス型フラスコに化合物3(8)(205mg,2.4×10-4mol)、ジクロロメタン(10mL)およびトリフルオロ酢酸(4mL)を氷浴で冷却しながらそれぞれ加えた。その後、反応溶液を室温に戻し、撹拌した。7時間後、溶媒を減圧留去し、得られた残渣へ最少量のメタノールを加えて溶解させた。そこへジエチルエーテルを加えて、生じた沈殿を集めて標題化合物4(8)およびその位置異性体との混合物を得た(139mg,83%、紫色、固体)。
窒素雰囲気下、50mLのナス型フラスコに化合物3(8)(205mg,2.4×10-4mol)、ジクロロメタン(10mL)およびトリフルオロ酢酸(4mL)を氷浴で冷却しながらそれぞれ加えた。その後、反応溶液を室温に戻し、撹拌した。7時間後、溶媒を減圧留去し、得られた残渣へ最少量のメタノールを加えて溶解させた。そこへジエチルエーテルを加えて、生じた沈殿を集めて標題化合物4(8)およびその位置異性体との混合物を得た(139mg,83%、紫色、固体)。
1H NMR (270 MHz, ピリジン-d5) δ: 10.47 (s, 1H) 10.23 (s, 0.5H) 10.20 (s, 1H) 10.15 (s, 1H) 10.05 (s, 0.5H) 9.98 (s, 0.5H)(位置異性体の存在により、メソ-プロトンのシグナルは6つに分割した。存在比は、ピーク強度に基づき、1:1である。), 8.45-8.31 (m, 2H) 6.42 (m, 2H) 6.17 (m, 2H) 4.63-4.55 (m, 4H) 3.59-3.45 (m, 16H) 3.34 (m, 2H) 3.05-2.96 (m, 6H) 2.47 (m, 2H) 2.39 (m, 2H) -3.80 (s, 2H);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 693.97 (M - TFA)+, C40H49N6O5について計算値:693.85;
UV-vis (MeOH) λmax / nm (吸収) 628 (0.018) 574 (0.042) 538 (0.055) 504 (0.057) 399 (0.93)。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 693.97 (M - TFA)+, C40H49N6O5について計算値:693.85;
UV-vis (MeOH) λmax / nm (吸収) 628 (0.018) 574 (0.042) 538 (0.055) 504 (0.057) 399 (0.93)。
(iii)式5(8)で表わす化合物の製造
50mLのナス型フラスコに化合物4(8)(109mg,1.4×10-4mol)、塩化鉄(II)一水和物(630mg)および炭酸水素ナトリウム(40mg)を加え、窒素飽和にしたクロロホルムとメタノールの混合溶媒(クロロホルム/メタノール=10/1、20mL)に溶解させ、加熱還流を行った。4時間後、反応混合物を室温まで冷却し、溶媒を減圧留去した。残渣をクロロホルムとメタノールの混合溶媒(クロロホルム/メタノール=2/1)に溶解させ、0.05M塩酸で洗浄した。有機層を分離後、無水硫酸ナトリウムで脱水し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣に最少量のメタノールを加えて溶解させ、そこへジエチルエーテルを加えて生じた沈殿を集め、水でよく洗浄し、乾燥させることによって標題の化合物5(8)およびその位置異性体との混合物を得た(92mg,80%、紫色、固体)。
50mLのナス型フラスコに化合物4(8)(109mg,1.4×10-4mol)、塩化鉄(II)一水和物(630mg)および炭酸水素ナトリウム(40mg)を加え、窒素飽和にしたクロロホルムとメタノールの混合溶媒(クロロホルム/メタノール=10/1、20mL)に溶解させ、加熱還流を行った。4時間後、反応混合物を室温まで冷却し、溶媒を減圧留去した。残渣をクロロホルムとメタノールの混合溶媒(クロロホルム/メタノール=2/1)に溶解させ、0.05M塩酸で洗浄した。有機層を分離後、無水硫酸ナトリウムで脱水し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣に最少量のメタノールを加えて溶解させ、そこへジエチルエーテルを加えて生じた沈殿を集め、水でよく洗浄し、乾燥させることによって標題の化合物5(8)およびその位置異性体との混合物を得た(92mg,80%、紫色、固体)。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 746.81 (M-Cl--HCl)+, C40H46FeN6O5について計算値:746.68;
UV-vis (MeOH) λmax / nm (吸収) 627 (0.021) 538 (0.035, sh) 502 (0.053) 397 (0.91)。
UV-vis (MeOH) λmax / nm (吸収) 627 (0.021) 538 (0.035, sh) 502 (0.053) 397 (0.91)。
(iv)式1(8)で表わす化合物の製造
100mLのナス型フラスコに、化合物5(8)(40mg,5.4×10-5mol)およびN-メトキシカルボニルマレイミド(100mg,6.45×10-4mol)を、アセトンと飽和炭酸水素ナトリウム水溶液の混合溶媒(アセトン/飽和炭酸水素ナトリウム水溶液=2/1、10mL)に溶解させた。室温にて2時間撹拌した後、水(40mL)を加え、さらに1時間攪拌した。前記混合物に、0.1N HCl水溶液、ついでクロロホルムを加えて、クロロホルムで抽出した。有機層をまとめて無水硫酸ナトリウムで脱水し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(クロロホルム/メタノール=5/1)によって精製した。得られた固体を最小量のクロロホルムに溶解させ、そこへヘキサンを加えることによって生じた沈殿を集め、標題化合物1(8)およびその位置異性体との混合物を得た(25mg、57%、暗紫色、固体)。
100mLのナス型フラスコに、化合物5(8)(40mg,5.4×10-5mol)およびN-メトキシカルボニルマレイミド(100mg,6.45×10-4mol)を、アセトンと飽和炭酸水素ナトリウム水溶液の混合溶媒(アセトン/飽和炭酸水素ナトリウム水溶液=2/1、10mL)に溶解させた。室温にて2時間撹拌した後、水(40mL)を加え、さらに1時間攪拌した。前記混合物に、0.1N HCl水溶液、ついでクロロホルムを加えて、クロロホルムで抽出した。有機層をまとめて無水硫酸ナトリウムで脱水し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(クロロホルム/メタノール=5/1)によって精製した。得られた固体を最小量のクロロホルムに溶解させ、そこへヘキサンを加えることによって生じた沈殿を集め、標題化合物1(8)およびその位置異性体との混合物を得た(25mg、57%、暗紫色、固体)。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 826.30 (M-Cl-)+, C44H46FeN6O7について計算値: 826.28;
UV-vis (CHCl3/MeOH=1/1、v/v) λmax / nm (吸収) 597 (0.058) 482 (0.090) 399 (0.99)。
UV-vis (CHCl3/MeOH=1/1、v/v) λmax / nm (吸収) 597 (0.058) 482 (0.090) 399 (0.99)。
(2)シトクロムb562変異体(H63C)の調製
部位特異的変異体の生成は、タカラ(TaKaRa)社製LA PCRインビトロ突然変異生成キット(in vitro Mutagenesis)を用いて、付属のプロトコルに従い、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)により行った。野生型シトクロムb562(以下b562と略す)の発現プラスミド(pUC118)を持つ大腸菌TG1を大量培養してプラスミドを調製し、H63C変異体を調製するためのテンプレートとした。変異部位導入プライマー(配列番号5)
部位特異的変異体の生成は、タカラ(TaKaRa)社製LA PCRインビトロ突然変異生成キット(in vitro Mutagenesis)を用いて、付属のプロトコルに従い、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)により行った。野生型シトクロムb562(以下b562と略す)の発現プラスミド(pUC118)を持つ大腸菌TG1を大量培養してプラスミドを調製し、H63C変異体を調製するためのテンプレートとした。変異部位導入プライマー(配列番号5)
(下線部がミスマッチ塩基対)とM13プライマーM4(配列番号6)(5’-GTTTTCCCAGTCACGAC-3’)、もしくはM13プライマーRV配列番号7(5’-CAGGAAACAGCTATGAC-3’)とMUT4プライマー配列番号8(5’-GGCCAGTGCCTAGCTTACAT-3’)を用い、それぞれの系でPCRによる第1段階のDNA増幅を行った。これら2つの第1段階PCR産物からヘテロな2本鎖DNAを調製し、M13プライマーRVとM13プライマーM4を用いて、このヘテロな2本鎖DNAのPCRによる第2段階の増幅を行った。b562変異体の塩基配列を持つDNA断片を、制限酵素EcoRIとHindIIIによって切り出し、pUC118ベクターのEcoRI/HindIII部位に特異的に連結した。その後、大腸菌(Escherichia coli)菌株TG1を得られた発現プラスミドによって形質転換した。H63C変異体の塩基配列はDNAシークエンシングにより確認した(配列番号4)。その際、Ala37の位置にも変異が見られたが、無変化の変異であった(GCCがGCGに変異)。変異体タンパク質は大腸菌株TG1を用い、文献(Y. Kawamata, S. Machida, T. Ogawa, K. Horie, T. Nagamune, J. Lumin. 98, 141 (2002))に従って野生型b562の発現と同様の操作で大量発現した。発現したタンパク質は、陽イオン交換カラム(CM-52、2.7cm×18cm)とゲル濾過カラム(セファデックスG-50、1.5cm×100cm)によって精製し、Rz=A418/A280≧6.0のフラクション(H63Cのストック溶液)を回収して以下の実験に使用した。
(3)タンパク質モノマーおよびそのモノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマーの製造(スキーム6参照)
前記式(V-1)
は、実施例1(2)において発現したタンパク質変異体である、シトクロムb562変異体(H63C)を意味し、前記変異体は、天然のシトクロムb562のアミノ酸配列中、第63番目のヒスチジン残基をシステイン残基に置き換えたものである。前記変異体中、-SHは、前記システイン残基の側鎖チオール基を意味し、Feは、前記ヘムタンパク質に含まれるポルフィリン基の4つの窒素原子と結合している。
は、実施例1(2)において発現したタンパク質変異体である、シトクロムb562変異体(H63C)を意味し、前記変異体は、天然のシトクロムb562のアミノ酸配列中、第63番目のヒスチジン残基をシステイン残基に置き換えたものである。前記変異体中、-SHは、前記システイン残基の側鎖チオール基を意味し、Feは、前記ヘムタンパク質に含まれるポルフィリン基の4つの窒素原子と結合している。
窒素雰囲気下、30mLの二つ口フラスコに窒素飽和の1.9mLのトリス-HCl緩衝液(0.05M、pH7.3、)および化合物1(8)(2.6×10-6mol)のDMSO溶液(0.6mL)を加えて室温にて撹拌した。そこへ、実施例1(2)において発現したH63Cのストック溶液(200μL,0.05Mトリス-HCl緩衝液中濃度1.6×10-3M、pH7.3)を滴下して加え、溶液を窒素下、室温にて穏やかに撹拌した。1.5時間後、化合物1(8)とH63C(V-1)の結合体であるタンパク質モノマー(I-1)を得た。
前記溶液中のタンパク質モノマー(I-1)に塩酸を加えてpH1.9とし、タンパク質モノマー(II-1)を得た。前記タンパク質モノマー(II-1)の水溶液へ2-ブタノン(5mL×4)を加えて抽出操作を行った。水層を分離して透析膜(Wako,MWCO、14,000Da)へと移し、0.05Mトリス-HCl緩衝液(pH7.3)によって4℃で透析を行った(500mL×2時間×3)。得られたタンパク質ポリマー(III-1)の水溶液を限外ろ過によって約10-3Mまで濃縮し、冷暗所にて保管した。
前記タンパク質ポリマー(III-1)は、式(III-11)のランダムコポリマー構造であると推測できる。
前記式中、X’は、ヘムタンパク質の変異体中のX’を意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V-1)で表わされる。
(1)式1(2)で示す化合物の製造
式1(2)で示す化合物は、以下のスキーム7に従い製造した。詳細には、N-Boc-1,2-ビス(2-アミノエトキシ)エタン(ジアミン(8))の代わりに、N-Boc-1,2-ジアミノエタン(ジアミン(2))を用いた以外は、実施例1(1)の式1(8)で示す化合物の製造と同様にして行った。
式1(2)で示す化合物は、以下のスキーム7に従い製造した。詳細には、N-Boc-1,2-ビス(2-アミノエトキシ)エタン(ジアミン(8))の代わりに、N-Boc-1,2-ジアミノエタン(ジアミン(2))を用いた以外は、実施例1(1)の式1(8)で示す化合物の製造と同様にして行った。
得られた化合物3(2)、化合物4(2)、化合物5(2)および化合物1(2)のデータを以下に示す。
化合物3(2): 収率33%。
1H NMR (270 MHz, ピリジン-d5) δ10.47 (s, 1H) 10.38 (s, 1H) 10.36 (s, 0.5H) 10.30 (s, 0.5H) 10.21 (s, 0.5H) 10.16 (s, 0.5H) 8.51-8.38 (m, 2H) 6.45-6.16 (m, 4H), 4.60-4.45 (m, 4H), 3.65-3.41 (m, 16H) 3.43 (m, 2H) 3.33 (m, 2H) 1.33 (s, 9H) 1.26 (s, 9H) -3.39 (s, 2H);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 761.70 (M + H)+, C45H57N6O5について計算値: 761.97;
UV-vis (CHCl3) λmax / nm (吸収) 630 (0.032) 575 (0.041) 542 (0.070) 506 (0.084) 408 (1.02)。
1H NMR (270 MHz, ピリジン-d5) δ10.47 (s, 1H) 10.38 (s, 1H) 10.36 (s, 0.5H) 10.30 (s, 0.5H) 10.21 (s, 0.5H) 10.16 (s, 0.5H) 8.51-8.38 (m, 2H) 6.45-6.16 (m, 4H), 4.60-4.45 (m, 4H), 3.65-3.41 (m, 16H) 3.43 (m, 2H) 3.33 (m, 2H) 1.33 (s, 9H) 1.26 (s, 9H) -3.39 (s, 2H);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 761.70 (M + H)+, C45H57N6O5について計算値: 761.97;
UV-vis (CHCl3) λmax / nm (吸収) 630 (0.032) 575 (0.041) 542 (0.070) 506 (0.084) 408 (1.02)。
化合物4(2):収率 88%。
1H NMR (270 MHz, ピリジン-d5) δ 10.64 (s, 1H) 10.44 (s, 1H) 10.36 (m, 1H) 10.25 (m, 1H) 8.52-8.42 (m, 2H) 6.47-6.17 (m, 4H), 4.63-4.50 (m, 4H), 3.67-3.52 (m, 16H) 3.42-3.28 (m, 4H) -3.29 (s, 2H);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 605.31 (M - TFA)+, C36H41N6O3について計算値: 605.75;
UV-vis (MeOH) λmax / nm (吸収)627 (0.034) 574 (0.048) 537 (0.087) 503 (0.10) 401 (1.12)。
1H NMR (270 MHz, ピリジン-d5) δ 10.64 (s, 1H) 10.44 (s, 1H) 10.36 (m, 1H) 10.25 (m, 1H) 8.52-8.42 (m, 2H) 6.47-6.17 (m, 4H), 4.63-4.50 (m, 4H), 3.67-3.52 (m, 16H) 3.42-3.28 (m, 4H) -3.29 (s, 2H);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 605.31 (M - TFA)+, C36H41N6O3について計算値: 605.75;
UV-vis (MeOH) λmax / nm (吸収)627 (0.034) 574 (0.048) 537 (0.087) 503 (0.10) 401 (1.12)。
化合物5(2): 収率 93%。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 658.21 (M-Cl--HCl)+, C36H38FeN6O3について計算値: 658.57
UV-vis (MeOH) λmax / nm (吸収) 598 (0.082) 478 (0.13) 398 (1.02)。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 658.21 (M-Cl--HCl)+, C36H38FeN6O3について計算値: 658.57
UV-vis (MeOH) λmax / nm (吸収) 598 (0.082) 478 (0.13) 398 (1.02)。
化合物1(2): 収率 31%。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 738.38 (M-Cl-)+, C40H38FeN6O5について計算値: 738.23
UV-vis (CHCl3/MeOH = 1/1, v/v) λmax /nm (吸収) 609 (0.029) 498 (0.067) 399 (0.96)。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 738.38 (M-Cl-)+, C40H38FeN6O5について計算値: 738.23
UV-vis (CHCl3/MeOH = 1/1, v/v) λmax /nm (吸収) 609 (0.029) 498 (0.067) 399 (0.96)。
(2)タンパク質モノマーおよびそのモノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマーの製造(スキーム8参照)
式1(2)で示す化合物を用いて、タンパク質モノマーおよびそのモノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマー(III-2)を以下のスキーム8に従い製造した。詳細には、化合物1(8)の代わりに、化合物1(2)を用いた以外は、実施例1(3)のスキーム6に示す製造と同様にして行った。
式1(2)で示す化合物を用いて、タンパク質モノマーおよびそのモノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマー(III-2)を以下のスキーム8に従い製造した。詳細には、化合物1(8)の代わりに、化合物1(2)を用いた以外は、実施例1(3)のスキーム6に示す製造と同様にして行った。
前記タンパク質ポリマー(III-2)は、式(III-12)のランダムコポリマー構造であると推測できる。
前記式中、X’は、ヘムタンパク質の変異体中のX’を意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V-1)で表わされる。
(1)ミオグロビン変異体(A125C)二量体の調製
変異体タンパク質のプラスミドを持つ大腸菌については文献処方(S. Hirota, K. Azuma, M. Fukuda, S. Kuroiwa, N. Funasaki, Biochemistry 44, 10322 (2005))に従って調製した。変異体タンパク質はEscherichia coli菌株 TB-1を用い、文献処方(B. A. Springer, S. G. Sliger, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84, 8961 (1987))に従って野生型ミオグロビンの発現と同様の操作で大量発現した。発現したタンパク質は、陰イオン交換カラム(DEAE Sepharose FF、2.7 cm×10 cm)、陽イオン交換カラム(CM-52、2.7 cm×18 cm)とゲル濾過カラム(Sephadex G-50、1.5 cm×100 cm)によって精製し、マッコウクジラ由来のミオグロビン変異体A125C二量体のフラクションを回収して以下の実験に使用した。
変異体タンパク質のプラスミドを持つ大腸菌については文献処方(S. Hirota, K. Azuma, M. Fukuda, S. Kuroiwa, N. Funasaki, Biochemistry 44, 10322 (2005))に従って調製した。変異体タンパク質はEscherichia coli菌株 TB-1を用い、文献処方(B. A. Springer, S. G. Sliger, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84, 8961 (1987))に従って野生型ミオグロビンの発現と同様の操作で大量発現した。発現したタンパク質は、陰イオン交換カラム(DEAE Sepharose FF、2.7 cm×10 cm)、陽イオン交換カラム(CM-52、2.7 cm×18 cm)とゲル濾過カラム(Sephadex G-50、1.5 cm×100 cm)によって精製し、マッコウクジラ由来のミオグロビン変異体A125C二量体のフラクションを回収して以下の実験に使用した。
(2)タンパク質モノマーおよびそのモノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマーの製造(スキーム9参照)
前記式(V-2)
は、実施例3(1)において発現したタンパク質変異体由来の単量体である、マッコウクジラ由来のミオグロビン変異体(A125C)を意味し、前記変異体は、野生型のミオグロビンのアミノ酸配列(配列番号2)中、第126番目のアラニン残基をシステイン残基に置き換えたものである。前記変異体中、-SHは、前記システイン残基の側鎖チオール基を意味し、Feは、前記ヘムタンパク質に含まれるポルフィリン基の4つの窒素原子と結合している。
実施例3(1)で調製したA125C二量体のストック溶液(200μL,1.10×10-3M(単量体換算濃度)、0.1Mリン酸緩衝液、pH7.0)に、大過剰のDTT(ジチオスレイトール)を加え溶解させた後、30分間2℃で静置した。0.1M L-ヒスチジン水溶液で平衡化した脱塩バッファー交換用カラム(Hitrap desalting(登録商標)、GEヘルスケアバイオサイエンス株式会社製)でこの溶液を精製し、A125C単量体(V-2)を得た。前記A125C単量体(V-2)を、前記0.1M L-ヒスチジン水溶液で1.5mLにメスアップして、A125C単量体溶液を調製した。前記A125C単量体溶液へ、化合物1(8)(1.1×10-6mol)溶液を加えた後、その混合物を24時間室温で攪拌して、化合物1(8)とA125C単量体(V-2)の結合体であるタンパク質モノマー(1-4)を得た。前記化合物1(8)溶液は、0.1M L-ヒスチジン水溶液とDMSOと、ジチオナイトとの混合溶媒(0.1M L-ヒスチジン水溶液:DMSO=6:1、ジチオナイトは、A125C単量体と当量)(0.6mL)中に化合物1(8)(1.1×10-6mol)を溶解させて調製した。前記全ての操作はグローブボックス中、窒素雰囲気下で行った。
反応溶液を透析膜(Wako,MWCO14,000Da)に移し、リン酸緩衝液(0.01M、pH6.0)を用いて4℃で透析を行った(1L×1時間×2)。透析により得られたタンパク質モノマー(1-4)溶液に0.1N塩酸を加えてpH2.25へ調整し、タンパク質モノマー(II-4)を得た。前記タンパク質モノマー(II-4)の溶液へ2-ブタノン(5mL×4)を加えて抽出操作を行った。水層を分離して透析膜(Wako,MWCO14,000Da)へと移し、リン酸緩衝液(0.1M、pH7.0)を用いて4℃で透析を行った(1L×2時間×3)。得られたタンパク質ポリマー(III-3)の水溶液から遠心分離により沈殿を除去し、上澄みのタンパク質ポリマー(III-3)溶液を限外ろ過によって約10-3Mまで濃縮し、冷暗所にて保管した。
前記タンパク質ポリマー(III-3)は、式(III-13)のランダムコポリマー構造であると推測できる。
前記式中、X’’は、ヘムタンパク質の変異体中のX’’を意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V-2)で表わされる。
タンパク質モノマーおよびそのモノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマーの製造(スキーム10参照)
式1(2)で示す化合物を用いて、タンパク質モノマーおよびそのモノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマー(III-4)を以下のスキーム10に従い製造した。詳細には、化合物1(8)の代わりに、化合物1(2)を用いた以外は、実施例3(2)のスキーム9に示す製造と同様にして行った。
式1(2)で示す化合物を用いて、タンパク質モノマーおよびそのモノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマー(III-4)を以下のスキーム10に従い製造した。詳細には、化合物1(8)の代わりに、化合物1(2)を用いた以外は、実施例3(2)のスキーム9に示す製造と同様にして行った。
前記タンパク質ポリマー(III-4)は、式(III-14)のランダムコポリマー構造であると推測できる。
前記式中、X’’は、ヘムタンパク質の変異体中のX’’を意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V-2)で表わされる。
(1)式1(13)で示す化合物の製造
式1(13)で示す化合物は、以下のスキーム11に従い製造した。詳細には、N-Boc-1,2-ビス(2-アミノエトキシ)エタン(ジアミン(8))の代わりに、N-BOC-ジエチレングリコール-ビス(3-アミノプロピル)エーテル(ジアミン(13))を用いた以外は、実施例1(1)の式1(8)で示す化合物の製造と同様にして行った(スキーム5参照)。
式1(13)で示す化合物は、以下のスキーム11に従い製造した。詳細には、N-Boc-1,2-ビス(2-アミノエトキシ)エタン(ジアミン(8))の代わりに、N-BOC-ジエチレングリコール-ビス(3-アミノプロピル)エーテル(ジアミン(13))を用いた以外は、実施例1(1)の式1(8)で示す化合物の製造と同様にして行った(スキーム5参照)。
得られた化合物3(13)、化合物4(13)、化合物5(13)および化合物1(13)のデータを以下に示す。
化合物3(13): 収率 49%。
1H-NMR (270 MHz, ピリジン-d5) δ 10.34 (s, 1H) 10.21 (s, 0.5H) 10.17 (s, 1H) 10.14 (s, 1H) 10.03 (s, 0.5H) 9.95 (s, 0.5H) 8.39-8.25 (m, 2H) 6.41-6.14 (m, 4H) 4.60-4.38 (m, 4H) 3.62-3.45 (m, 16H) 3.34-3.15 (m, 12H) 3.06 (m, 2H) 2.76 (m, 2H) 2.61 (m, 2H) 2.44 (m, 2H) 1.74 (m, 2H) 1.49 (s, 9H) 1.43 (s, 9H) 1.39 (m, 2H), -3.80 (s, 2H);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 921.83 (M + H)+, C53H72N6O8について計算値: 922.18;
UV-vis (CHCl3) λmax / nm (吸収) 630 (0.032) 576 (0.042) 540 (0.072) 506 (0.088) 408 (1.05)。
1H-NMR (270 MHz, ピリジン-d5) δ 10.34 (s, 1H) 10.21 (s, 0.5H) 10.17 (s, 1H) 10.14 (s, 1H) 10.03 (s, 0.5H) 9.95 (s, 0.5H) 8.39-8.25 (m, 2H) 6.41-6.14 (m, 4H) 4.60-4.38 (m, 4H) 3.62-3.45 (m, 16H) 3.34-3.15 (m, 12H) 3.06 (m, 2H) 2.76 (m, 2H) 2.61 (m, 2H) 2.44 (m, 2H) 1.74 (m, 2H) 1.49 (s, 9H) 1.43 (s, 9H) 1.39 (m, 2H), -3.80 (s, 2H);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 921.83 (M + H)+, C53H72N6O8について計算値: 922.18;
UV-vis (CHCl3) λmax / nm (吸収) 630 (0.032) 576 (0.042) 540 (0.072) 506 (0.088) 408 (1.05)。
化合物4(13): 収率 82%。
1H NMR (270 MHz, ピリジン-d5) δ 10.41 (s, 1H) 10.19 (s, 0.5H) 10.14 (br, 1.5H) 10.00 (s, 0.5H) 9.94 (s, 0.5H) 8.42-8.27 (m, 2H) 6.43-6.12 (m, 4H), 4.60-4.41 (m, 4H), 3.61-3.47 (m, 16H) 3.33-3.22 (m, 8H) 3.13 (m, 2H) 2.93 (m, 2H) 2.80 (m, 2H) 2.71 (m, 2H) 1.90 (m,2H) 1.44 (m, 2H) -3.88 (s, 2H);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 765.55 (M - TFA)+, C44H57N6O6について計算値:765.96;
UV-vis (MeOH) λmax / nm (吸収) 628 (0.035) 574 (0.044) 538 (0.073) 504 (0.090) 401 (1.02)。
1H NMR (270 MHz, ピリジン-d5) δ 10.41 (s, 1H) 10.19 (s, 0.5H) 10.14 (br, 1.5H) 10.00 (s, 0.5H) 9.94 (s, 0.5H) 8.42-8.27 (m, 2H) 6.43-6.12 (m, 4H), 4.60-4.41 (m, 4H), 3.61-3.47 (m, 16H) 3.33-3.22 (m, 8H) 3.13 (m, 2H) 2.93 (m, 2H) 2.80 (m, 2H) 2.71 (m, 2H) 1.90 (m,2H) 1.44 (m, 2H) -3.88 (s, 2H);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 765.55 (M - TFA)+, C44H57N6O6について計算値:765.96;
UV-vis (MeOH) λmax / nm (吸収) 628 (0.035) 574 (0.044) 538 (0.073) 504 (0.090) 401 (1.02)。
化合物5(13): 化合物5(13)は水溶性が高く、最後の沈殿の水洗浄を充分に行うことが出来なかった。このため、精製を行わずに次の反応に用いた。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 818.70 (M -Cl--HCl)+, C44H54FeN6O6 について計算値:818.72
UV-vis (MeOH) λmax / nm (吸収) 601 (0.037) 494 (0.080) 396 (1.07)。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 818.70 (M -Cl--HCl)+, C44H54FeN6O6 について計算値:818.72
UV-vis (MeOH) λmax / nm (吸収) 601 (0.037) 494 (0.080) 396 (1.07)。
化合物1(13):収率 43%。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 898.38 (M-Cl-)+, C44H46FeN6O7 について計算値:898.34
UV-vis (CHCl3/MeOH = 1/1, v/v) λmax / nm (吸収) 596 (0.064) 483 (0.087) 398 (0.78)。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 898.38 (M-Cl-)+, C44H46FeN6O7 について計算値:898.34
UV-vis (CHCl3/MeOH = 1/1, v/v) λmax / nm (吸収) 596 (0.064) 483 (0.087) 398 (0.78)。
(2)タンパク質モノマーおよびそのモノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマーの製造(スキーム12参照)
式1(13)で示す化合物を用いて、タンパク質モノマーおよびそのモノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマー(III-5)を以下のスキーム12に従い製造した。詳細には、化合物1(8)の代わりに化合物1(13)を用いた以外は、実施例3(2)のスキーム9に示す製造と同様にして行った。
式1(13)で示す化合物を用いて、タンパク質モノマーおよびそのモノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマー(III-5)を以下のスキーム12に従い製造した。詳細には、化合物1(8)の代わりに化合物1(13)を用いた以外は、実施例3(2)のスキーム9に示す製造と同様にして行った。
前記タンパク質ポリマー(III-5)は、式(III-15)のランダムコポリマー構造であると推測できる。
前記式中、X’’は、ヘムタンパク質の変異体中のX’’を意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V-2)で表わされる。
[実施例1から5で得られたポリマーに関する種々性質]
(i)UV-visスペクトルの測定
図1aに天然型ミオグロビンのUV-visスペクトル、図1bに実施例4で製造したタンパク質ポリマー(III-4)のUV-visスペクトル、図1cに実施例3で製造したタンパク質ポリマー(III-3)のUV-visスペクトル、図1dに実施例5で製造したタンパク質ポリマー(III-5)のUV-visスペクトルをそれぞれ示す。図1aならびに図1b、図1cおよび図1dより、タンパク質ポリマー(III-4)、タンパク質ポリマー(III-3)、及びタンパク質ポリマー(III-5)のスペクトルが、前記天然型ミオグロビンのものと非常によく似たスペクトルを有していることが確認できた。従って、変異体ミオグロビンにポルフィリンリンカーを導入したタンパク質ポリマー(III-4)、タンパク質ポリマー(III-3)、及びタンパク質ポリマー(III-5)の鉄が、天然型ミオグロビンと同様にヘムポケットに保持されていることが確認できた。
(i)UV-visスペクトルの測定
図1aに天然型ミオグロビンのUV-visスペクトル、図1bに実施例4で製造したタンパク質ポリマー(III-4)のUV-visスペクトル、図1cに実施例3で製造したタンパク質ポリマー(III-3)のUV-visスペクトル、図1dに実施例5で製造したタンパク質ポリマー(III-5)のUV-visスペクトルをそれぞれ示す。図1aならびに図1b、図1cおよび図1dより、タンパク質ポリマー(III-4)、タンパク質ポリマー(III-3)、及びタンパク質ポリマー(III-5)のスペクトルが、前記天然型ミオグロビンのものと非常によく似たスペクトルを有していることが確認できた。従って、変異体ミオグロビンにポルフィリンリンカーを導入したタンパク質ポリマー(III-4)、タンパク質ポリマー(III-3)、及びタンパク質ポリマー(III-5)の鉄が、天然型ミオグロビンと同様にヘムポケットに保持されていることが確認できた。
さらに、図1eに、天然型ミオグロビンの酸素錯体のUV-visスペクトル、図1fに実施例5で製造したタンパク質ポリマー(III-5)の酸素錯体のUV-visスペクトルをそれぞれ示す。酸素貯蔵能を有するミオグロビンは大気中、還元剤でヘム鉄を2価に還元することで非常に安定な酸素錯体を形成し、特徴的な紫外可視吸収スペクトルを示すことが知られている。今回製造したタンパク質ポリマー(III-5)を同様に処理することにより、酸素錯体を調製した。この図1fと図1eは、特徴的な417nm、543nmおよび580nmの吸収を同様に有する。従って、本発明のタンパク質ポリマーが、非常に安定な酸素錯体を形成することが、確認できた。さらに、このことから、本発明のタンパク質ポリマーが、本来のタンパク質の機能を保持したまま、超分子集合体を形成していることが確認できた。
(ii)酸素との親和性の測定
天然型ミオグロビンの酸素錯体または実施例5で製造した酸素結合型タンパク質ポリマー(III-5)の酸素錯体(ミオグロビンのFe(II)ヘム酸素錯体、oxy-Mb)は、過剰量のジチオナイトを天然型ミオグロビンまたは実施例5で製造したタンパク質ポリマー(ミオグロビンのFe(III)ヘム錯体、met-Mb)溶液にそれぞれ加えた後、セファデックス-G25カラムにより精製した。カイネティクス測定はリン酸バッファー(100mM、pH7.0)中で、25℃で行った。自動酸化過程の測定は37℃で行った。酸素の結合定数KO2は、結合速度定数kO2 onを解離速度定数kO2 offで割ることで求められる。以下の測定で得られた結果を表1に示す。なお、タンパク質ポリマー(III-5)は、タンパク質モノマーが11個(n=11)重合されたものに対応していた。このタンパク質ポリマー(III-5)全体を一分子として計算した。
天然型ミオグロビンの酸素錯体または実施例5で製造した酸素結合型タンパク質ポリマー(III-5)の酸素錯体(ミオグロビンのFe(II)ヘム酸素錯体、oxy-Mb)は、過剰量のジチオナイトを天然型ミオグロビンまたは実施例5で製造したタンパク質ポリマー(ミオグロビンのFe(III)ヘム錯体、met-Mb)溶液にそれぞれ加えた後、セファデックス-G25カラムにより精製した。カイネティクス測定はリン酸バッファー(100mM、pH7.0)中で、25℃で行った。自動酸化過程の測定は37℃で行った。酸素の結合定数KO2は、結合速度定数kO2 onを解離速度定数kO2 offで割ることで求められる。以下の測定で得られた結果を表1に示す。なお、タンパク質ポリマー(III-5)は、タンパク質モノマーが11個(n=11)重合されたものに対応していた。このタンパク質ポリマー(III-5)全体を一分子として計算した。
[酸素の結合速度定数kO2
onの測定]
大気下([O2]=2.64×10-4M)でリン酸バッファー(100mM、pH7.0)中の天然型ミオグロビンの酸素錯体または実施例5で製造した酸素結合型タンパク質ポリマー(III-5)の酸素錯体をそれぞれ、レーザーフラッシュフォトリシス(励起波長532nm、5nsパルス)により励起させた。その後、天然型ミオグロビンまたは実施例5で製造したタンパク質ポリマー(ミオグロビンのFe(II)ヘム錯体、deoxy-Mb)のそれぞれの極大吸収波長である434nmの吸光度変化を追跡した。プローブ光はモノクロメーターを通過させた。反応曲線を非線形最小二乗法によりフィッティングし、一次反応速度定数を決定した。次いで、得られた速度定数をO2の濃度で割ることにより、酸素の結合速度定数kO2 onを算出した。
大気下([O2]=2.64×10-4M)でリン酸バッファー(100mM、pH7.0)中の天然型ミオグロビンの酸素錯体または実施例5で製造した酸素結合型タンパク質ポリマー(III-5)の酸素錯体をそれぞれ、レーザーフラッシュフォトリシス(励起波長532nm、5nsパルス)により励起させた。その後、天然型ミオグロビンまたは実施例5で製造したタンパク質ポリマー(ミオグロビンのFe(II)ヘム錯体、deoxy-Mb)のそれぞれの極大吸収波長である434nmの吸光度変化を追跡した。プローブ光はモノクロメーターを通過させた。反応曲線を非線形最小二乗法によりフィッティングし、一次反応速度定数を決定した。次いで、得られた速度定数をO2の濃度で割ることにより、酸素の結合速度定数kO2 onを算出した。
[酸素の解離速度定数kO2
offの測定]
酸素の解離速度はフェリシアン化カリ法により求めた。測定にはストップトフロー装置を用い、プローブ光はモノクロメーターを通過させた。[K3Fe(CN)6]>>Mb]の条件で580nmの吸光度変化を一次速度式でフィッティングした。以下の式(1)に従い、K3Fe(CN)6が大過剰の条件で観測される速度定数からkO2 offを決定した。
酸素の解離速度はフェリシアン化カリ法により求めた。測定にはストップトフロー装置を用い、プローブ光はモノクロメーターを通過させた。[K3Fe(CN)6]>>Mb]の条件で580nmの吸光度変化を一次速度式でフィッティングした。以下の式(1)に従い、K3Fe(CN)6が大過剰の条件で観測される速度定数からkO2 offを決定した。
ここでkoxはdeoxy体からmet体への酸化速度定数である。定常状態の近似が成り立つとき、反応は一次速度定数に従い、見かけの速度定数kobsは式(2)のように表すことができる。
kox[K3[Fe(CN)6]]>>kO2
on[O2]の条件が満たされるとき、以下のように酸素の解離速度定数kO2
offが算出できる。
[自動酸化速度定数kautoの測定]
37℃で、天然型ミオグロビンの酸素錯体または実施例5で製造したタンパク質ポリマー(III-5)の酸素錯体を試料として500~650nmの範囲でUV-visスペクトルを30分毎に測定した。580nmの吸光度変化を時間に対してプロットし、一次速度式でフィッティングすることにより自動酸化速度定数kautoを算出した。得られた結果を表1に示す。
37℃で、天然型ミオグロビンの酸素錯体または実施例5で製造したタンパク質ポリマー(III-5)の酸素錯体を試料として500~650nmの範囲でUV-visスペクトルを30分毎に測定した。580nmの吸光度変化を時間に対してプロットし、一次速度式でフィッティングすることにより自動酸化速度定数kautoを算出した。得られた結果を表1に示す。
表1の結果から、本発明のタンパク質ポリマーが、天然型より優れた酸素との親和性を有することが確認できた。
(iii)サイズ排除クロマトグラムの測定
実施例3~5で得られたタンパク質ポリマーについて、サイズ排除クロマトグラフィーを測定した。溶出溶媒には100mMリン酸緩衝液(pH7.0)を用いた。測定は温度4℃、流速0.5mL/分にて行った。その結果を図2aに示す。図2a中、溶出成分の早い成分ほど大きな分子量を持つ。ミオグロビン変異体A125C単量体の溶出量は、17.6mLであり、ミオグロビン変異体A125C二量体の溶出量は、16.2mLである(図示せず)。タンパク質ポリマー(III-3)、タンパク質ポリマー(III-4)およびタンパク質ポリマー(III-5)の溶出量は、それぞれ10.5mL、11.3mLおよび9.3mLであった。従って、タンパク質ポリマーは、これらミオグロビン変異体A125C単量体と、二量体より溶出量が少なく、これらのポリマーの分子量が大きいことが確認できた。また、タンパク質ポリマー(III-3)、タンパク質ポリマー(III-4)およびタンパク質ポリマー(III-5)は、それぞれ、タンパク質とヘムとを繋ぐリンカーの長さが長いほど、大きな分子量を有することが確認できた。さらに、タンパク質ポリマー(III-5)は、検出限界の8mLから大きくクロマトグラフィーが立ち上がっており、タンパク質ポリマー(III-3)およびタンパク質ポリマー(III-4)より大きな分子量成分を多く含むことが確認できた。なお、分子量の常用対数と溶出量とは比例関係にあるので、タンパク質ポリマー(III-3)、タンパク質ポリマー(III-4)およびタンパク質ポリマー(III-5)の分子量が概算で算出できる。その分子量とモノマーの分子量から、タンパク質ポリマー(III-3)、タンパク質ポリマー(III-4)およびタンパク質ポリマー(III-5)の重合度は、22、18および33と算出できた。
実施例3~5で得られたタンパク質ポリマーについて、サイズ排除クロマトグラフィーを測定した。溶出溶媒には100mMリン酸緩衝液(pH7.0)を用いた。測定は温度4℃、流速0.5mL/分にて行った。その結果を図2aに示す。図2a中、溶出成分の早い成分ほど大きな分子量を持つ。ミオグロビン変異体A125C単量体の溶出量は、17.6mLであり、ミオグロビン変異体A125C二量体の溶出量は、16.2mLである(図示せず)。タンパク質ポリマー(III-3)、タンパク質ポリマー(III-4)およびタンパク質ポリマー(III-5)の溶出量は、それぞれ10.5mL、11.3mLおよび9.3mLであった。従って、タンパク質ポリマーは、これらミオグロビン変異体A125C単量体と、二量体より溶出量が少なく、これらのポリマーの分子量が大きいことが確認できた。また、タンパク質ポリマー(III-3)、タンパク質ポリマー(III-4)およびタンパク質ポリマー(III-5)は、それぞれ、タンパク質とヘムとを繋ぐリンカーの長さが長いほど、大きな分子量を有することが確認できた。さらに、タンパク質ポリマー(III-5)は、検出限界の8mLから大きくクロマトグラフィーが立ち上がっており、タンパク質ポリマー(III-3)およびタンパク質ポリマー(III-4)より大きな分子量成分を多く含むことが確認できた。なお、分子量の常用対数と溶出量とは比例関係にあるので、タンパク質ポリマー(III-3)、タンパク質ポリマー(III-4)およびタンパク質ポリマー(III-5)の分子量が概算で算出できる。その分子量とモノマーの分子量から、タンパク質ポリマー(III-3)、タンパク質ポリマー(III-4)およびタンパク質ポリマー(III-5)の重合度は、22、18および33と算出できた。
実施例1で製造したタンパク質ポリマー(III-1)および実施例2で製造したタンパク質ポリマー(III-2)について、サイズ排除クロマトグラフィーを測定した。溶出溶媒には50mMトリス-HCl緩衝液(pH7.3)に0.15MのNaClを加えたものを用いた。測定は温度4℃、流速0.5mL/分にて行った。タンパク質ポリマー(III-1)およびタンパク質ポリマー(III-2)の結果を図2bに示す。図2b中、aは、タンパク質ポリマー(III-2)、bは、実施例1で製造したタンパク質ポリマー(III-1)、cは、H63C(V-1)の二量体、dは、H63C(V-1)の単量体のクロマトグラフィーを示す。aまたはbは、cおよびdに比べて速い時点で溶出したことから、巨大な分子量を持つことが推定される。また、a、bのピークが幅広いことからそれぞれタンパク質ポリマー(III-1)およびタンパク質ポリマー(III-2)が、幅広い分子量分布を有することが確認できた。
また、実施例10で得られたタンパク質ポリマーについて、サイズ排除クロマトグラフィーを測定した。溶出溶媒にはTris-HCl緩衝液(50mM、pH7.3)およびNaCl(150mM)の混合水溶液を用いた。測定は温度4℃、流速0.5mL/分にて行った。その結果を図2cに示す。図2cに示すようにZnプロトポルフィリンとヘムポケットとの相互作用により、タンパク質ポリマー(III-6)は2量体、3量体程度で形成されていることが確認できた。
(iv)濃度を変化させた条件下でのサイズ排除クロマトグラムの測定
実施例5で得た前記タンパク質ポリマー(III-5)について、前記ポリマーの濃度を10μM、100μM、500μMおよび1000μMのそれぞれにおいて、前記(ii)と同様にしてサイズ排除クロマトグラムを測定した。その結果を図3に示す。図3から、前記ポリマー(III-5)の濃度が高くなるにつれ、前記タンパク質ポリマー(III-5)の長さが長くなり、かつタンパク質ポリマーの低分子量成分の量が低下することが確認できた。これはタンパク質ポリマー(III-5)が濃度に依存して分子量分布を変えることを示しており、熱力学的な平衡に支配されていることがわかる。
実施例5で得た前記タンパク質ポリマー(III-5)について、前記ポリマーの濃度を10μM、100μM、500μMおよび1000μMのそれぞれにおいて、前記(ii)と同様にしてサイズ排除クロマトグラムを測定した。その結果を図3に示す。図3から、前記ポリマー(III-5)の濃度が高くなるにつれ、前記タンパク質ポリマー(III-5)の長さが長くなり、かつタンパク質ポリマーの低分子量成分の量が低下することが確認できた。これはタンパク質ポリマー(III-5)が濃度に依存して分子量分布を変えることを示しており、熱力学的な平衡に支配されていることがわかる。
(v)原子間力顕微鏡(AFM)測定
AFM測定に用いたサンプルは以下のように調製した。高配向性焼結グラファイト(HOPG)基板の表面を壁開し、その壁開面を実施例3~5で得たタンパク質ポリマーの水溶液(約10-8M、0.05Mトリス緩衝液中、pH7.3もしくは0.1Mリン酸緩衝液中、pH7.0)に数秒間浸漬した。基板を溶液から引き上げた後、水でよく洗浄し、室温にて塩化カルシウムの入ったデシケーター内にてよく乾燥させた後、AFM測定装置にセットした。測定はタッピングモードで行い、スキャン速度は2Hz、探針には曲率半径が約10nmのシリコン単結晶を用いた。実施例4で得たタンパク質ポリマー(III-4)のAFMイメージを図4aに示し、実施例3で得たタンパク質ポリマー(III-3)のAFMイメージを図4bに示し、実施例5で得たタンパク質ポリマー(III-5)のAFMイメージを図4cに示す。実施例2で得たタンパク質ポリマー(III-2)のAFMイメージを図4dに示す。
AFM測定に用いたサンプルは以下のように調製した。高配向性焼結グラファイト(HOPG)基板の表面を壁開し、その壁開面を実施例3~5で得たタンパク質ポリマーの水溶液(約10-8M、0.05Mトリス緩衝液中、pH7.3もしくは0.1Mリン酸緩衝液中、pH7.0)に数秒間浸漬した。基板を溶液から引き上げた後、水でよく洗浄し、室温にて塩化カルシウムの入ったデシケーター内にてよく乾燥させた後、AFM測定装置にセットした。測定はタッピングモードで行い、スキャン速度は2Hz、探針には曲率半径が約10nmのシリコン単結晶を用いた。実施例4で得たタンパク質ポリマー(III-4)のAFMイメージを図4aに示し、実施例3で得たタンパク質ポリマー(III-3)のAFMイメージを図4bに示し、実施例5で得たタンパク質ポリマー(III-5)のAFMイメージを図4cに示す。実施例2で得たタンパク質ポリマー(III-2)のAFMイメージを図4dに示す。
図4aの(a)では、タンパク質ポリマー(III-4)の全体図を、(b)では、(a)中の灰色の線に沿ったプロファイルを示す。また、図4bの(c)では、タンパク質ポリマー(III-3)の全体図を、(d)ではその一部拡大図とその断面プロファイルを示す。また、図4cの(e)では、タンパク質ポリマー(III-5)の全体図を、(f)では(e)中の灰色の線に沿ったプロファイルを示す。3種類のタンパク質ポリマーについて、それぞれ、高さが均一な線状ポリマー構造体を示す像が確認できた。また、数十量体に相当する長さの線状ポリマー構造体も確認できた。図4dの(a)では、タンパク質ポリマー(III-2)の全体図を、(b)では、全体図中で見られる構造体の一つを拡大した図を示す。(b)から、この組織体は長さが約200nmであることが確認できた。従って、この組織体は、約80量体であることが確認できた。この組織体の高さは、2.5~5nmの範囲であった。この高さは、ヘムタンパク質の1つ分の高さに相当する。図4dの(c)では、全体図中に見られる構造体の別の一つを拡大した図を示す。この組織体は、ドーナツ状であることが確認できた。図4dの(d)は、(c)中の灰色の線に沿ったプロファイルを示す。この(d)より、組織体はいずれも同等の高さを有していることが確認できた。
(vi)質量スペクトルの測定
前記タンパク質モノマーのESI-TOF-MSスペクトルおよびデコンボリューション化したESI-TOF-MSスペクトルを、図5に示す。実施例4で得た前記タンパク質モノマー(II-5)のESI-TOF-MSスペクトルを図5(a)に、前記タンパク質モノマー(II-5)のデコンボリューション化したESI-TOF-MSスペクトルを図5(b)に示す。前記タンパク質モノマー(II-5)の分子量の計算値は、18100.8である。図5(b)から、前記タンパク質モノマー(II-5)の分子量は計算値と一致していることが確認できた。
前記タンパク質モノマーのESI-TOF-MSスペクトルおよびデコンボリューション化したESI-TOF-MSスペクトルを、図5に示す。実施例4で得た前記タンパク質モノマー(II-5)のESI-TOF-MSスペクトルを図5(a)に、前記タンパク質モノマー(II-5)のデコンボリューション化したESI-TOF-MSスペクトルを図5(b)に示す。前記タンパク質モノマー(II-5)の分子量の計算値は、18100.8である。図5(b)から、前記タンパク質モノマー(II-5)の分子量は計算値と一致していることが確認できた。
また、実施例3で得た前記タンパク質モノマー(II-4)のESI-TOF-MSスペクトルを図5(c)に、前記タンパク質モノマー(II-4)のデコンボリューション化したESI-TOF-MSスペクトルを図5(d)に示す。前記タンパク質モノマー(II-4)の分子量の計算値は、18188.8である。図5(d)から、前記タンパク質モノマー(II-4)の分子量は計算値と一致していることが確認できた。
また、実施例5で得た前記タンパク質モノマー(II-3)のESI-TOF-MSスペクトルを図5(e)に、前記タンパク質モノマー(II-3)のデコンボリューション化したESI-TOF-MSスペクトルを図5(f)に示す。前記タンパク質モノマー(II-3)の分子量の計算値は、18260.9である。図5(f)から、前記タンパク質モノマー(II-3)の分子量は計算値と一致していることが確認できた。
タンパク質アセンブリまたはその塩の製造
(1)式(IV-1)で示す化合物の製造
式(IV-1)で示す化合物は、以下のスキーム13に従い製造した。
(1)式(IV-1)で示す化合物の製造
式(IV-1)で示す化合物は、以下のスキーム13に従い製造した。
なお、スキーム13において、プロトポルフィリンIXモノ-t-ブチルエステルは位置異性体の混合物を用いたが、その後得られる式12で表わす化合物、式13で表わす化合物、式(IV-1)で表わす化合物は、スキーム13において示したプロトポルフィリンIXモノ-t-ブチルエステルと結合した場合の構造式を示している。
(i)式10で表わす化合物の製造
式9で表すトリメシン酸クロリド(0.21g,8.1×10-4mol)の塩化メチレン溶液(10mL)を、N-Boc-1,2-ビス(アミノエトキシ)エタン(0.80g,3.2×10-3mol)およびトリエチルアミン(0.32g,3.2×10-3mol)の塩化メチレン溶液(10mL)に滴下し、得られた混合物を氷浴で冷やしながら撹拌した。5時間後、その混合物を水で洗浄した。前記混合物から分離した有機層を無水硫酸ナトリウムで脱水し、その後溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(溶出液:CHCl3/CH3OH=20/1,v/v)によって精製し、無色油状液体の化合物10を得た(0.91g,31%)。
式9で表すトリメシン酸クロリド(0.21g,8.1×10-4mol)の塩化メチレン溶液(10mL)を、N-Boc-1,2-ビス(アミノエトキシ)エタン(0.80g,3.2×10-3mol)およびトリエチルアミン(0.32g,3.2×10-3mol)の塩化メチレン溶液(10mL)に滴下し、得られた混合物を氷浴で冷やしながら撹拌した。5時間後、その混合物を水で洗浄した。前記混合物から分離した有機層を無水硫酸ナトリウムで脱水し、その後溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(溶出液:CHCl3/CH3OH=20/1,v/v)によって精製し、無色油状液体の化合物10を得た(0.91g,31%)。
1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ:8.44 (s, 3H) 5.30 (bs, 3H) 3.66-3.54 (m, 30H) 3.30-3.27 (m, 6H) 1.38 (s, 27H);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 901.42 (M + H)+, C42H73N6O15について計算値:901.51。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 901.42 (M + H)+, C42H73N6O15について計算値:901.51。
(ii)式11で表わす化合物の製造
化合物10(0.91g,1.0×10-3mol)の塩化メチレン溶液(10mL)に、トリフルオロ酢酸(5mL)を加え、得られた混合物を氷浴で冷やしながら撹拌した。7時間後、前記混合物から溶媒を減圧留去し、残渣を最少量のメタノールに溶解させた。前記メタノール溶液へジエチルエーテル(100mL)を加え、生じた白色固体を集め、乾燥させることによって化合物11を得た(0.63g,99%)。
化合物10(0.91g,1.0×10-3mol)の塩化メチレン溶液(10mL)に、トリフルオロ酢酸(5mL)を加え、得られた混合物を氷浴で冷やしながら撹拌した。7時間後、前記混合物から溶媒を減圧留去し、残渣を最少量のメタノールに溶解させた。前記メタノール溶液へジエチルエーテル(100mL)を加え、生じた白色固体を集め、乾燥させることによって化合物11を得た(0.63g,99%)。
1H NMR (400 MHz, D2O)δ: 8.21 (s, 3H) 3.70-3.63 (m, 24H) 3.56 (t, 6H, J = 5.2 Hz) 3.08 (t, 6H, J = 5.2 Hz);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 601.36 (M-3TFA--2H+)+, C40H49N6O5について計算値:601.36。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 601.36 (M-3TFA--2H+)+, C40H49N6O5について計算値:601.36。
(iii)化合物12(代表的な構造式は式12で表わされる)の製造
プロトポルフィリンIXモノ-t-ブチルエステル(100mg,1.6×10-4mol)と化合物11(35mg,4.0×10-5mol)をDMF(15mL)に溶解させ、窒素雰囲気下に置いた。前記溶液へジフェニルリン酸アジド(178mg,6.4×10-4mol)およびトリエチルアミン(65mg,6.4×10-4mol)を加え、得られた混合物を室温で4時間撹拌した。その後、ジフェニルリン酸アジド(178mg,6.4×10-4mol)およびトリエチルアミン(65mg,6.4×10-4mol)を加え、前記混合物をさらに2時間撹拌した。前記混合物から溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(溶出液:CHCl3/CH3OH=15/1,v/v)によって精製した。さらに得られた生成物をサイズ排除クロマトグラフィーによって精製した。得られた生成物を最少量のクロロホルムに溶解させ、前記クロロホルム溶液へヘキサンを加えることによって生成した紫色の沈殿物を回収し、化合物12を得た(62mg,66%)。
プロトポルフィリンIXモノ-t-ブチルエステル(100mg,1.6×10-4mol)と化合物11(35mg,4.0×10-5mol)をDMF(15mL)に溶解させ、窒素雰囲気下に置いた。前記溶液へジフェニルリン酸アジド(178mg,6.4×10-4mol)およびトリエチルアミン(65mg,6.4×10-4mol)を加え、得られた混合物を室温で4時間撹拌した。その後、ジフェニルリン酸アジド(178mg,6.4×10-4mol)およびトリエチルアミン(65mg,6.4×10-4mol)を加え、前記混合物をさらに2時間撹拌した。前記混合物から溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(溶出液:CHCl3/CH3OH=15/1,v/v)によって精製した。さらに得られた生成物をサイズ排除クロマトグラフィーによって精製した。得られた生成物を最少量のクロロホルムに溶解させ、前記クロロホルム溶液へヘキサンを加えることによって生成した紫色の沈殿物を回収し、化合物12を得た(62mg,66%)。
1H NMR (400 MHz, ピリジン-d5) δ: 10.25-9.72 (m, 12H) 9.13 (bs, 3H) 8.90 (s, 3H) 8.52 (bs, 3H) 8.38-8.11 (m, 6H) 6.34-6.05 (m, 12H) 4.51-4.39 (m, 12H) 3.52-3.29 (m, 60H) 3.05-2.95 (m, 12H) 2.51-2.49 (m, 6H) 2.45-2.32 (m, 6H) 1.39 (s, 27H) -4.00 (bs, 6H) (複数の位置異性体が混在するためにピークは複雑に分裂した);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 1213.18 (M+H+Na)2+, C141H169N18NaO18について計算値:2426.95;
UV-vis (DMF) λmax/nm (吸光度) 630 (0.024) 576 (0.032) 540 (0.055) 506 (0.070) 405 (0.873)。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 1213.18 (M+H+Na)2+, C141H169N18NaO18について計算値:2426.95;
UV-vis (DMF) λmax/nm (吸光度) 630 (0.024) 576 (0.032) 540 (0.055) 506 (0.070) 405 (0.873)。
(iv)化合物13(代表的な構造式は式13で表わされる)の製造
蟻酸(1mL)に溶解させた化合物12(62mg,2.6×10-5mol)にトリフルオロ酢酸(4mL)を加え、得られた混合物を室温で6時間撹拌した。その後、前記混合物から溶媒を減圧留去し、得られた残渣を最少量のメタノールに溶解させた。前記メタノール溶液へジエチルエーテルを加えて、生成した紫色固体を回収し、化合物13を得た(52mg,89%)。
蟻酸(1mL)に溶解させた化合物12(62mg,2.6×10-5mol)にトリフルオロ酢酸(4mL)を加え、得られた混合物を室温で6時間撹拌した。その後、前記混合物から溶媒を減圧留去し、得られた残渣を最少量のメタノールに溶解させた。前記メタノール溶液へジエチルエーテルを加えて、生成した紫色固体を回収し、化合物13を得た(52mg,89%)。
1H NMR (400 MHz, ピリジン-d5) δ: 10.40-9.72 (m, 12H) 9.11 (bs, 3H) 8.89 (s, 3H) 8.58 (bs, 3H) 8.38-8.11 (m, 6H) 6.34-6.06 (m, 12H) 4.52-4.39 (m, 12H) 3.52-3.20 (m, 60H) 3.07-3.01 (m, 12H) 2.57-2.56 (m, 6H) 2.55-2.40 (m, 6H) -4.00 (bs, 6H) (複数の位置異性体が混在するためにピークは複雑に分裂した);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 1118.33 (M+2H)2+, C129H146N18O18について計算値:2236.65;
UV-vis (DMF) λmax/nm (吸光度) 631 (0.034) 577 (0.047) 541 (0.071) 507 (0.091) 404 (0.944)。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 1118.33 (M+2H)2+, C129H146N18O18について計算値:2236.65;
UV-vis (DMF) λmax/nm (吸光度) 631 (0.034) 577 (0.047) 541 (0.071) 507 (0.091) 404 (0.944)。
(v)化合物(IV-1)(代表的な構造式は式(IV-1)で表わされる)の製造
化合物13、塩化鉄・n水和物(200mg)および炭酸水素ナトリウム(20mg)を窒素下にてクロロホルムとメタノールの混合液(クロロホルム:メタノール=10:1、20mL)に溶解し、得られた混合物を加熱還流した。4時間後、前記混合物から溶媒を減圧留去し、残渣をクロロホルムとメタノールの混合液(クロロホルム:メタノール=2:1)に溶解させ、その溶液を0.05Mの塩酸水溶液で洗浄した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで脱水後、溶媒を減圧留去した。得られた残渣を最少量のメタノールに溶解させ、前記メタノール溶液へジエチルエーテルを加えて生成した紫色固体を回収した。得られた固体を水で洗浄後、よく乾燥させることによって化合物(IV-1)を得た(47mg,82%)。
化合物13、塩化鉄・n水和物(200mg)および炭酸水素ナトリウム(20mg)を窒素下にてクロロホルムとメタノールの混合液(クロロホルム:メタノール=10:1、20mL)に溶解し、得られた混合物を加熱還流した。4時間後、前記混合物から溶媒を減圧留去し、残渣をクロロホルムとメタノールの混合液(クロロホルム:メタノール=2:1)に溶解させ、その溶液を0.05Mの塩酸水溶液で洗浄した。得られた有機層を無水硫酸ナトリウムで脱水後、溶媒を減圧留去した。得られた残渣を最少量のメタノールに溶解させ、前記メタノール溶液へジエチルエーテルを加えて生成した紫色固体を回収した。得られた固体を水で洗浄後、よく乾燥させることによって化合物(IV-1)を得た(47mg,82%)。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 1208.42 (M-3Cl-2H+Na)2+, C129H136Fe3N18NaO18について計算値:2417.10;
FAB-MS (positive mode, m-ニトロベンジルアルコール・マトリックス) m/z 2394.19 (M-3Cl-2H)+, C129H136Fe3N18O18について計算値:2394.11;
UV-vis (DMF) λmax/nm (吸光度) 595 (0.093) 571 (0.11) 397 (0.99)。
FAB-MS (positive mode, m-ニトロベンジルアルコール・マトリックス) m/z 2394.19 (M-3Cl-2H)+, C129H136Fe3N18O18について計算値:2394.11;
UV-vis (DMF) λmax/nm (吸光度) 595 (0.093) 571 (0.11) 397 (0.99)。
(2)トライアドとタンパク質モノマーとからのアセンブリの製造
タンパク質モノマー(II-2)と化合物(IV-1)(トライアド)とを40:1のモル比で混合して製造した。具体的には、0.05Mトリス-HCl緩衝液(pH7.3)に溶解したタンパク質モノマー(II-2)の溶液(4.0×10-4mol/l,10μL、4.0×10-3μmol)に、DMSO:水=1:1の混合溶液に溶解した化合物(IV-1)(トライアド)の溶液(1.0×10-4mol/l,1μL、1×10-4μmol)を加え、4℃で一晩静置し、調製した。
タンパク質モノマー(II-2)と化合物(IV-1)(トライアド)とを40:1のモル比で混合して製造した。具体的には、0.05Mトリス-HCl緩衝液(pH7.3)に溶解したタンパク質モノマー(II-2)の溶液(4.0×10-4mol/l,10μL、4.0×10-3μmol)に、DMSO:水=1:1の混合溶液に溶解した化合物(IV-1)(トライアド)の溶液(1.0×10-4mol/l,1μL、1×10-4μmol)を加え、4℃で一晩静置し、調製した。
タンパク質モノマー(II-2)と化合物(IV-1)(トライアド)とを1:1のモル比で混合して製造した。具体的には、
0.05Mトリス-HCl緩衝液(pH7.3)に溶解したタンパク質モノマー(II-2)の溶液(4.0×10ー4mol/l,10μL、4.0×10-3μmol)に、DMSO:水=1:1の混合溶液に溶解した化合物(IV-1)(トライアド)の溶液(4.0×10-3mol/l,1μL、4×10-3μmol)を加え、4℃で一晩静置し、調製した。
0.05Mトリス-HCl緩衝液(pH7.3)に溶解したタンパク質モノマー(II-2)の溶液(4.0×10ー4mol/l,10μL、4.0×10-3μmol)に、DMSO:水=1:1の混合溶液に溶解した化合物(IV-1)(トライアド)の溶液(4.0×10-3mol/l,1μL、4×10-3μmol)を加え、4℃で一晩静置し、調製した。
タンパク質モノマー(II-2)と化合物(IV-1)(トライアド)とを10:1のモル比で混合して製造した。具体的には、0.05Mトリス-HCl緩衝液(pH7.3)に溶解したタンパク質モノマー(II-2)の溶液(4.0×10-4mol/l,10μL、4.0×10-3μmol)に、DMSO:水=1:1の混合溶液に溶解した化合物(IV-1)(トライアド)の溶液(4.0×10-4mol/l,1μL、4×10-4μmol)を加え、4℃で一晩静置し、調製した。
タンパク質モノマー(II-2)と化合物(IV-1)(トライアド)とを100:1のモル比で混合して製造した。具体的には、0.05Mトリス-HCl緩衝液(pH7.3)に溶解したタンパク質モノマー(II-2)の溶液(4.0×10-4mol/l,10μL、4.0×10-3μmol)に、DMSO:水=1:1の混合溶液に溶解した化合物(IV-1)(トライアド)の溶液(4.0×10-5mol/l,1μL、4.0×10-5μmol)を加え、4℃で一晩静置し、調製した。
[原子間力顕微鏡(AFM)測定]
AFM測定に用いたサンプルは以下のように調製した。高配向性焼結グラファイト(HOPG)基板の表面を壁開し、その壁開面を実施例6で得たアセンブリの水溶液(約10-8M、0.05Mトリス緩衝液中、pH7.3)に数秒間浸漬した。基板を溶液から引き上げた後、水でよく洗浄し、室温にて塩化カルシウムの入ったデシケーター内にてよく乾燥させた後、AFM測定装置にセットした。測定はタッピングモードで行い、スキャン速度は2Hz、探針には曲率半径が約10nmのシリコン単結晶を用いた。実施例6で得たアセンブリのAFMイメージを図6に示した。
AFM測定に用いたサンプルは以下のように調製した。高配向性焼結グラファイト(HOPG)基板の表面を壁開し、その壁開面を実施例6で得たアセンブリの水溶液(約10-8M、0.05Mトリス緩衝液中、pH7.3)に数秒間浸漬した。基板を溶液から引き上げた後、水でよく洗浄し、室温にて塩化カルシウムの入ったデシケーター内にてよく乾燥させた後、AFM測定装置にセットした。測定はタッピングモードで行い、スキャン速度は2Hz、探針には曲率半径が約10nmのシリコン単結晶を用いた。実施例6で得たアセンブリのAFMイメージを図6に示した。
図6の(a)では、タンパク質モノマー(II-2)と化合物(IV-1)(トライアド)をモル比40:1で混合して得られたアセンブリのAFMイメージを示す。図6の(b)は、図6の(a)の拡大図である。図6の(c)は、図(b)中の灰色の線に沿って解析した断面プロファイルを示す。断面プロファイルによれば、このアセンブリは、約4nmの厚みを有する。この高さ情報から、このアセンブリは、タンパク質1つ分の高さ(2.5~5.0nm)を有するナノシートであることが確認できた。
実施例7で得たアセンブリのAFMイメージを図7に、実施例8で得たアセンブリのAFMイメージを図8に、実施例9で得たアセンブリのAFMイメージを図9に示す。化合物(IV-1)(トライアド)のAFMイメージを図10に示す。
図10から、化合物(IV-1)のみの場合、観測されるのはドット状の物体のみが確認できた。これらは化合物(IV-1)の凝集体であると推測する。図7から、実施例7で得られたアセンブリの場合、ロッド状の物体が確認できた。これらの物体は高さが1nmに満たないことから、タンパク質の変性物が凝集したものと推測される。図8から、実施例8で得られたアセンブリの場合、実施例6で得られたアセンブリと比較して、局所的に密なネットワークが形成されることが確認できた。図9から、実施例9で得られたアセンブリの場合、実施例6で得られたアセンブリより全体的に疎なネットワークが形成されることが確認できた。図9の(b)は、図9(a)中の灰色の線に沿って解析した断面プロファイルである。断面プロファイルによれば、このアセンブリは、約4nmの厚みを有する。この高さ情報から、このアセンブリは、タンパク質1つ分の高さ(2.5~5.0nm)を有するナノシートであることが確認できた。図9(c)は、図9(a)の一部を拡大し、3D表記したものである。図9(c)から、アセンブリのタンパク質の鎖が枝分かれする様子が確認できる。
(1)式11(2)で示す化合物の製造
式11(2)で示す化合物は、以下のスキーム14に従い製造した。詳細には、式4(2)で示す化合物は、実施例2の式4(2)で示す化合物の製造と同様にして行った。また、式15(2)で示す化合物は、実施例2の式1(2)で示す化合物の製造と同様にして行った。
式11(2)で示す化合物は、以下のスキーム14に従い製造した。詳細には、式4(2)で示す化合物は、実施例2の式4(2)で示す化合物の製造と同様にして行った。また、式15(2)で示す化合物は、実施例2の式1(2)で示す化合物の製造と同様にして行った。
化合物3(2):収率40%
1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.44-10.10 (4H, m), 8.45 (2H, d), 7.91 (1H, s), 6.47 (2H, d), 6.20 (2H, d), 4.51-4.38 (4H, m), 3.66 (6H, s), 3.57 (6H, s), 3.42-3.10 (2H, m), 2.90-2.81 (2H, m), 1.28 (9H,s), 1.24 (9H, s), -3.27 (2H, s);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 761.38 [M+H]+ C45H56N6O5について計算値;761.44。
1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.44-10.10 (4H, m), 8.45 (2H, d), 7.91 (1H, s), 6.47 (2H, d), 6.20 (2H, d), 4.51-4.38 (4H, m), 3.66 (6H, s), 3.57 (6H, s), 3.42-3.10 (2H, m), 2.90-2.81 (2H, m), 1.28 (9H,s), 1.24 (9H, s), -3.27 (2H, s);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 761.38 [M+H]+ C45H56N6O5について計算値;761.44。
化合物4(2):収率95%
1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.44-10.23 (4H, m), 8.57 (2H, d), 8.06 (1H, s), 7.87-7.58 (3H, br), 6.46 (2H, d), 6.24 (2H, d), 4.33(4H, s), 3.76 (6H, s), 3.65 (6H, s), 3.26-3.07 (2H, m), 2.80-2.61 (2H, m),-3.87 (2H, s);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 605.32 [M+H]+ C36H41N6O3について計算値:605.75。
1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.44-10.23 (4H, m), 8.57 (2H, d), 8.06 (1H, s), 7.87-7.58 (3H, br), 6.46 (2H, d), 6.24 (2H, d), 4.33(4H, s), 3.76 (6H, s), 3.65 (6H, s), 3.26-3.07 (2H, m), 2.80-2.61 (2H, m),-3.87 (2H, s);
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 605.32 [M+H]+ C36H41N6O3について計算値:605.75。
化合物15(2):
窒素雰囲気下、氷浴中の二口フラスコ(30mL)中で、化合物4(2)(60.0mg,0.0990mmol)を混合溶媒(飽和炭酸水素ナトリウム:アセトン(体積比)=1:2、5mL)に溶解させた。そこに同じ混合溶媒中に溶解させたN-(メトキシカルボニル)マレイミド(HELVETICA CHIMICA ACTA,第58巻, pp.531-541 (1975年)を参考にして製造した)(27.0mg,0.170mmol)溶液(2mL)を加えて、その後0℃で2時間撹拌した。次いでその混合物へ水(30mL)を加えて希釈し、さらに1時間撹拌した。1M塩酸でその混合物をpH4に調整して、その後、混合物からクロロホルムで抽出した。得られた有機相をpH4のクエン酸水溶液、飽和食塩水で順次洗浄し、その後硫酸ナトリウムで乾燥した。有機相から溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラム(クロロホルム/メタノール=5/1,v/v)によって精製して標題の化合物を得た(20.0mg,31%)。
窒素雰囲気下、氷浴中の二口フラスコ(30mL)中で、化合物4(2)(60.0mg,0.0990mmol)を混合溶媒(飽和炭酸水素ナトリウム:アセトン(体積比)=1:2、5mL)に溶解させた。そこに同じ混合溶媒中に溶解させたN-(メトキシカルボニル)マレイミド(HELVETICA CHIMICA ACTA,第58巻, pp.531-541 (1975年)を参考にして製造した)(27.0mg,0.170mmol)溶液(2mL)を加えて、その後0℃で2時間撹拌した。次いでその混合物へ水(30mL)を加えて希釈し、さらに1時間撹拌した。1M塩酸でその混合物をpH4に調整して、その後、混合物からクロロホルムで抽出した。得られた有機相をpH4のクエン酸水溶液、飽和食塩水で順次洗浄し、その後硫酸ナトリウムで乾燥した。有機相から溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラム(クロロホルム/メタノール=5/1,v/v)によって精製して標題の化合物を得た(20.0mg,31%)。
1H-NMR (400 MHz,DMSO-d6) δ 10.32-10.12 (4H, m), 8.46 (2H, d), 8.14-8.09 (1H, br), 6.87 (2H, d), 6.40 (2H, d), 6.21 (2H, d), 4.37-4.29 (2H, m), 4.29-4.22 (2H, m), 3.77 (6H, s), 3.59 (6H, s), 3.28-3.16(2H, m), 2.99-2.88 (2H, m), -4.05 (2H, s).
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 685.24 [M+H]+ C40H40N6O5について計算値:685.31。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 685.24 [M+H]+ C40H40N6O5について計算値:685.31。
式11(2):
ナスフラスコ(30mL)中に化合物15(2)(21.0mg,0.0307mmol)のDMF(6mL)溶液をいれ、それを40℃に昇温した後、酢酸亜鉛(24.2mg,0.132mmol)を加えて混合物を5時間撹拌した。混合物から溶媒を減圧留去した後に得られた残渣をクロロホルムに溶解し、そのクロロホルム溶液を飽和食塩水で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥した。その後、クロロホルム溶液から溶媒を減圧留去して、得られた残渣を真空乾燥することで標題化合物を得た(20.0mg,90%)。
ナスフラスコ(30mL)中に化合物15(2)(21.0mg,0.0307mmol)のDMF(6mL)溶液をいれ、それを40℃に昇温した後、酢酸亜鉛(24.2mg,0.132mmol)を加えて混合物を5時間撹拌した。混合物から溶媒を減圧留去した後に得られた残渣をクロロホルムに溶解し、そのクロロホルム溶液を飽和食塩水で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥した。その後、クロロホルム溶液から溶媒を減圧留去して、得られた残渣を真空乾燥することで標題化合物を得た(20.0mg,90%)。
1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.30-10.09 (4H, m), 8.76-8.54 (2H, m), 7.43-7.411H, br), 6.98 (2H, d), 4.40-4.33 (2H, m), 4.32-4.25 (2H, m), 3.76-3.68 (6H, m), 3.62-3.53 (6H, m), 3.30-3.18 (2H, m), 3.09-2.98 (2H, m).
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 747.12 [M+H]+ C40H38N6O5Zn について計算値:747.22。
UV-Vis (DMF) λmax/ nm (吸収) 419(0.787), 547(0.0569), 584 (0.0581)。
ESI-TOF-MS (positive mode) m/z 747.12 [M+H]+ C40H38N6O5Zn について計算値:747.22。
UV-Vis (DMF) λmax/ nm (吸収) 419(0.787), 547(0.0569), 584 (0.0581)。
(2)タンパク質モノマーおよびそのモノマーをモノマー単位とするタンパク質ポリマーの製造(スキーム15参照)
実施例1(2)において発現したH63Cのストック溶液(200μL,10mMトリス-HCl緩衝液中濃度3.11×10-3M、pH7.3)と10mMジチオトレイトール溶液(10mM Tris-HCl緩衝液(pH7.3)、2.8mL)とを混合し、含まれるシトクロムb562(H63C)の酸化体を還元した。この反応溶液を複数回、限外濾過処理し、大過剰のジチオトレイトールを除去後、脱塩カラム(HiTrap desalting、5mL、GEヘルスケア製)により脱塩を施して、還元体シトクロムb562(H63C)の溶液を得た。この還元体シトクロムb562(H63C)溶液(1.6mL)へ10mM Tris-HCl(pH7.3、1.8mL)緩衝液を加えて希釈した後、化合物15(2)のDMSO溶液(4.71×10-6mol、0.6mL)を徐々に加えて、遮光下、得られた混合物を室温にて4時間撹拌した。反応溶液中の過剰の化合物15(2)を2-ブタノンによって抽出して除き、化合物15(2)とH63C(V-1)との結合体である化合物16(2)を得た。
UV(10mM pH7.3 トリス-HCl緩衝液)λmax/nm(吸収)373(0.725)417(0.803)523(0.150)567(0.112)631(0.0470)670(0.0424)。
化合物16(2)溶液(4.45×10-6mol,4.1mL)にヒスチジン(13mg)を加えた後、0.1Mの塩酸を滴下し、その溶液のpHを2に調整した。遊離したヘムをブタノンで抽出し、その抽出液に対してTris-HCl緩衝液(10mM、pH7.3)による透析を90分間、3回行い、化合物17(2)(アポ体)を得た。
化合物17(2)(アポ体)溶液(1.04×10-3M、2mL、10mM Tris-HCl緩衝液、pH7.3)に、酢酸亜鉛(38.1mg、1.04×10-5mol、100当量)を加え、得られた混合物を40℃で4時間撹拌した。室温まで放冷後、反応溶液に対して10mM Tris-HCl緩衝液(pH7.3)で90分間、3回の透析処理を行い、過剰の酢酸亜鉛を除いて、粗生成物を得た。その生成物に対して脱塩処理(HiTrap desalting、5mL、GEヘルスケア)を行い、残存する亜鉛などの塩を除去した。次に、その生成物を陰イオン交換カラム(HiTrap Q FF、5mL、GEヘルスケア)を用いて精製し、タンパク質モノマー(II-6)を得た(1.78×10-7mol,8.91×10-5M,収率8.5%)。生成物のUV-Visスペクトル測定をおこなったところ、417,523,567nmに亜鉛プロトポルフィリンに特徴的な吸収があることから、亜鉛プロトポルフィリンが結合していることが確認できた。
UV-Vis(10mM pH7.3 トリス-HCl緩衝液)λmax/nm(吸収)417(0.0637)523(0.00880)567(0.00850)。
タンパク質モノマー(II-6)溶液を濃縮した後、遠心分離(8000rpm,10分間,4℃)と濾過により溶液中の沈殿を除去し、上澄みのタンパク質ポリマー(III-6)を得た。
前記タンパク質ポリマー(III-6)は、式(III-16)のランダムコポリマー構造であると推測できる。
前記式中、X’は、ヘムタンパク質の変異体中のX’を意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V-1)で表わされる。
(1)ヘミン修飾金電極(A)の作製
金電極(金蒸着ガラス電極)の作製は、以下のように行った。
ガラス電極(松浪硝子工業s3399X5 BK-71 縁磨 13×36 t0.7両面研摩)を5M水酸化カリウム水溶液に12時間浸漬し、続いて、20分間の超音波洗浄を施した。このガラス電極を超純水、次いでエタノールで洗浄し、乾燥した。蒸着に用いる金線を濃硫酸と過酸化水素の混合溶液(濃硫酸/過酸化水素=3/1)に3分間浸漬後、超純水、次いでエタノールで洗浄し、乾燥した。蒸着装置内に洗浄した金線、クロム粉末およびガラス電極を配置し、真空下260℃にてクロム粉末に電圧を印加してガラス電極表面に蒸着させ、次いで、金線に電圧を印加してクロム膜上に金薄膜蒸着させた。蒸着装置を大気圧、室温条件化に戻して、金電極(金蒸着ガラス電極)を取り出した。
金電極(金蒸着ガラス電極)の作製は、以下のように行った。
ガラス電極(松浪硝子工業s3399X5 BK-71 縁磨 13×36 t0.7両面研摩)を5M水酸化カリウム水溶液に12時間浸漬し、続いて、20分間の超音波洗浄を施した。このガラス電極を超純水、次いでエタノールで洗浄し、乾燥した。蒸着に用いる金線を濃硫酸と過酸化水素の混合溶液(濃硫酸/過酸化水素=3/1)に3分間浸漬後、超純水、次いでエタノールで洗浄し、乾燥した。蒸着装置内に洗浄した金線、クロム粉末およびガラス電極を配置し、真空下260℃にてクロム粉末に電圧を印加してガラス電極表面に蒸着させ、次いで、金線に電圧を印加してクロム膜上に金薄膜蒸着させた。蒸着装置を大気圧、室温条件化に戻して、金電極(金蒸着ガラス電極)を取り出した。
次に、A. Dasらの方法(A. Das et al. / Biophysical Chemistry, 2006, 123, 102-112.)に基づいて、金電極へのヘムの修飾を行った(スキーム16参照)。
具体的には、まず、-1.2Vの電位をかけて金電極を洗浄した。次に、3-メルカプトプロピオン酸/3,3’-ジチオビス(プロピオン酸スクシンイミジル)の濃度比を100mM/1.00mMに調整したジメチルスルホキシド溶液(500μL)に、前記金電極を室温にて1.5時間浸漬した。その後、金電極表面をジメチルスルホキシド、次いで超純水の順で洗浄した。次に、金電極を1,12-ジアミノドデカン溶液(20mM、溶媒は95%エタノールおよび5%水の混合液、500μL)に室温で4時間浸漬させ、その後、ジメチルスルホキシド、ついで超純水の順で金電極表面を洗浄した。1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(300mM水溶液、25μL)とトリエチルアミン水溶液(300mM、25μL)の混合溶液に金電極を浸漬させ、その後、さらにジメチルスルホキシドに溶解したヘミン(10mM溶液、50μL)を加えて4℃にて一晩浸漬後し、金電極表面におけるカップリング反応による修飾を行った。次いで金電極を超純水で洗浄し、ヘミン修飾金電極を得た。
(2)タンパク質モノマー修飾金電極(B)の作製
(1)で得たへミン修飾金電極(A)をアポ化したシトクロムb562(野生型、50μL、10mM、pH7.0リン酸緩衝溶液)中に4℃で18時間浸漬した。MOPS緩衝液(100mM、pH7.0)でその電極を洗浄し、タンパク質モノマー修飾金電極(B)を得た(スキーム17参照)。
(1)で得たへミン修飾金電極(A)をアポ化したシトクロムb562(野生型、50μL、10mM、pH7.0リン酸緩衝溶液)中に4℃で18時間浸漬した。MOPS緩衝液(100mM、pH7.0)でその電極を洗浄し、タンパク質モノマー修飾金電極(B)を得た(スキーム17参照)。
(3)タンパク質ポリマー修飾金電極(C)の作製
(1)で得たへミン修飾金電極(A)をアポ化したタンパク質ポリマー(II-2)(実施例2で製造、50μL、10mM、pH7.0リン酸緩衝溶液)中に4℃で18時間浸漬した。MOPS緩衝液(100mM、pH7.0)でその電極を洗浄し、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)を得た(スキーム18参照)。
(1)で得たへミン修飾金電極(A)をアポ化したタンパク質ポリマー(II-2)(実施例2で製造、50μL、10mM、pH7.0リン酸緩衝溶液)中に4℃で18時間浸漬した。MOPS緩衝液(100mM、pH7.0)でその電極を洗浄し、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)を得た(スキーム18参照)。
(4)ヘミン修飾金電極(D)の作製
1,12-ジアミノドデカンの代わりに1,6-ジアミノヘキサンを用いた以外は、実施例11(1)と同様にしてヘミン修飾電極(D)を得た。
1,12-ジアミノドデカンの代わりに1,6-ジアミノヘキサンを用いた以外は、実施例11(1)と同様にしてヘミン修飾電極(D)を得た。
(5)タンパク質ポリマー修飾金電極(E)の作製
(1)で得たヘミン修飾金電極(A)の変わりに(4)で得たヘミン修飾金電極(D)を用いた以外は、実施例11(3)と同様にしてタンパク質ポリマー修飾金電極(E)を得た。
(1)で得たヘミン修飾金電極(A)の変わりに(4)で得たヘミン修飾金電極(D)を用いた以外は、実施例11(3)と同様にしてタンパク質ポリマー修飾金電極(E)を得た。
(i)電気化学測定
電気化学測定は、ALS/CH Instruments electrochemical Analyzer(Model 610B)を用いて行った。
電気化学測定は、ALS/CH Instruments electrochemical Analyzer(Model 610B)を用いて行った。
へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)またはタンパク質ポリマー修飾金電極(C)をセルに装着し、これらの電極がMOPS緩衝液(100mM、pH7.0)中に浸るまでMOPS緩衝溶液をセルに加えた。セル中の緩衝液を30分間アルゴンを通じて脱気し、へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)、へミン修飾金電極(D)、またはタンパク質ポリマー修飾金電極(E)のサイクリックボルタンメトリーおよびインピーダンス測定を行った。掃引速度0.30[V/s]、対電極:白金、参照電極:銀/塩化銀。
(a)サイクリックボルタンメトリー
サイクリックボルタンメトリー(掃引速度0.30(V/s)、対電極は白金、参照電極は銀/塩化銀)の結果、へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(C)のE1/2はおよそ―0.30[V](vs銀/塩化銀)であり、ヘム由来の酸化還元応答が観測された。へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)およびタンパク質ポリマー修飾金電極(C)のサイクリックボルタモグラムは、図11(a)、図11(b)および図11(c)にそれぞれ示す。タンパク質ポリマー修飾金電極(C)における酸化及び還元応答はファラディックな電流の量が減少し、ノンファラディックな電流値が増加しており、このことにより、基板がヘムタンパク質で修飾されたことが確認できた。
サイクリックボルタンメトリー(掃引速度0.30(V/s)、対電極は白金、参照電極は銀/塩化銀)の結果、へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(C)のE1/2はおよそ―0.30[V](vs銀/塩化銀)であり、ヘム由来の酸化還元応答が観測された。へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)およびタンパク質ポリマー修飾金電極(C)のサイクリックボルタモグラムは、図11(a)、図11(b)および図11(c)にそれぞれ示す。タンパク質ポリマー修飾金電極(C)における酸化及び還元応答はファラディックな電流の量が減少し、ノンファラディックな電流値が増加しており、このことにより、基板がヘムタンパク質で修飾されたことが確認できた。
(b)掃引速度とピーク電流値の相関
へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)において掃引速度に対する還元ピーク電流値をプロットしたところ、いずれの場合にも直線関係が得られた。へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)について得られた掃引速度を変えたサイクリックボルタモグラムは、図12(a)、図12(b)、図12(c)、図12(d)および図12(e)にそれぞれ示す。また、へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)について得られたピーク電流のプロットは、図13(a)、図13(b)、図13(c)、図13(d)および図13(e)にそれぞれ示す。図12および図13から、この掃引速度と電流値との間に比例関係が存在することは、表面吸着種の電気化学応答が存在することを示す。したがってへミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)上にはヘム分子、シトクロムb562、タンパク質ポリマー、ヘム分子、タンパク質ポリマーによりそれぞれ修飾されていることが確認された。
へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)において掃引速度に対する還元ピーク電流値をプロットしたところ、いずれの場合にも直線関係が得られた。へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)について得られた掃引速度を変えたサイクリックボルタモグラムは、図12(a)、図12(b)、図12(c)、図12(d)および図12(e)にそれぞれ示す。また、へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)について得られたピーク電流のプロットは、図13(a)、図13(b)、図13(c)、図13(d)および図13(e)にそれぞれ示す。図12および図13から、この掃引速度と電流値との間に比例関係が存在することは、表面吸着種の電気化学応答が存在することを示す。したがってへミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)上にはヘム分子、シトクロムb562、タンパク質ポリマー、ヘム分子、タンパク質ポリマーによりそれぞれ修飾されていることが確認された。
(c)表面修飾率の算出
吸着系の場合、サイクリックボルタモグラムの電流ピーク面積から電気量を算出することができるので、電気量Q=nFx(n:反応に要する電子数、F:ファラデー定数、x:電極表面上に修飾されている物質のモル数)である。この式を用い、表面吸着種の分子量ならびに表面被覆率を算出した。へミン修飾金電極(A)において反応で消費された電気量は1.66×10-6[mol・m-2]であり、ヘミン1分子の平面の大きさを10[Å]×10[Å]としたときの表面被覆率は3%と算出された。これは電極作製のはじめの段階で3-メルカプトプロピオン酸/3,3’-ジチオビス(プロピオン酸スクシンイミジル)の濃度比を100mM/1mMに調整して浸漬したことと良い相関を示しており、ヘミン修飾金電極(A)においてほぼ定量的な表面修飾に成功していることが確認できた。
吸着系の場合、サイクリックボルタモグラムの電流ピーク面積から電気量を算出することができるので、電気量Q=nFx(n:反応に要する電子数、F:ファラデー定数、x:電極表面上に修飾されている物質のモル数)である。この式を用い、表面吸着種の分子量ならびに表面被覆率を算出した。へミン修飾金電極(A)において反応で消費された電気量は1.66×10-6[mol・m-2]であり、ヘミン1分子の平面の大きさを10[Å]×10[Å]としたときの表面被覆率は3%と算出された。これは電極作製のはじめの段階で3-メルカプトプロピオン酸/3,3’-ジチオビス(プロピオン酸スクシンイミジル)の濃度比を100mM/1mMに調整して浸漬したことと良い相関を示しており、ヘミン修飾金電極(A)においてほぼ定量的な表面修飾に成功していることが確認できた。
(d)微分パルスボルタンメトリー(DPV)
DPVは一定速度で増大する直流電圧に一定周期毎に一定パルス電圧を印加する方法であり、高い分解能のピークを得ることができる測定法である。へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)のそれぞれのDPVを測定した。へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)について得られた結果を図14(a)、図14(b)、図14(c)、図14(d)および図14(e)にそれぞれ示す。図14から、へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)の酸化ピーク電位および還元ピーク電位はいずれもE=-0.31[V]付近であり、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)は、それぞれ―0.30、-0.34[V]であり、酸化還元電位がほぼ一致することが明らかである。これらのことから、ヘム分子、シトクロムb562、タンパク質ポリマーにより金電極がそれぞれ修飾されていることが確認された。
DPVは一定速度で増大する直流電圧に一定周期毎に一定パルス電圧を印加する方法であり、高い分解能のピークを得ることができる測定法である。へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)のそれぞれのDPVを測定した。へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)について得られた結果を図14(a)、図14(b)、図14(c)、図14(d)および図14(e)にそれぞれ示す。図14から、へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)、タンパク質ポリマー修飾金電極(C)の酸化ピーク電位および還元ピーク電位はいずれもE=-0.31[V]付近であり、へミン修飾金電極(D)、およびタンパク質ポリマー修飾金電極(E)は、それぞれ―0.30、-0.34[V]であり、酸化還元電位がほぼ一致することが明らかである。これらのことから、ヘム分子、シトクロムb562、タンパク質ポリマーにより金電極がそれぞれ修飾されていることが確認された。
(e)インピーダンス測定
交流電圧をかけたときに抵抗部分とコンデンサー部分にかかっている電圧の位相がずれることを利用した交流インピーダンス測定により、系中を電気回路に見立てることで電極の抵抗値を測定できる。横軸を実数の、縦軸を虚数のインピーダンスとしたとき、交流電圧の周波数を変化させると抵抗とコンデンサーの並列回路に特徴的な半円が現れ、その半円の直径を電荷移動抵抗と呼び、表面に物質が積層され膜厚が大きくなると電化移動抵抗は増大する。へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)およびタンパク質ポリマー修飾金電極(C)のそれぞれの抵抗値は、4.0×103Ω、1.0×104Ω、および2.2×104Ωであった(図15参照)。抵抗値の大きさ関係が電極(A)<電極(B)<電極(C)であり、特に電極(C)において抵抗値が大きく増加したことから、タンパク質ポリマーにより金電極が修飾できていることが確認できた。
交流電圧をかけたときに抵抗部分とコンデンサー部分にかかっている電圧の位相がずれることを利用した交流インピーダンス測定により、系中を電気回路に見立てることで電極の抵抗値を測定できる。横軸を実数の、縦軸を虚数のインピーダンスとしたとき、交流電圧の周波数を変化させると抵抗とコンデンサーの並列回路に特徴的な半円が現れ、その半円の直径を電荷移動抵抗と呼び、表面に物質が積層され膜厚が大きくなると電化移動抵抗は増大する。へミン修飾金電極(A)、タンパク質モノマー修飾金電極(B)およびタンパク質ポリマー修飾金電極(C)のそれぞれの抵抗値は、4.0×103Ω、1.0×104Ω、および2.2×104Ωであった(図15参照)。抵抗値の大きさ関係が電極(A)<電極(B)<電極(C)であり、特に電極(C)において抵抗値が大きく増加したことから、タンパク質ポリマーにより金電極が修飾できていることが確認できた。
[インピーダンス測定条件]
100mMの塩化カリウム+5mMのK3Fe(CN)6/K4Fe(CN)6水溶液中においてインピーダンス測定をおこなった。
掃引速度:0.30[V/s]
対電極:白金
参照電極:銀/塩化銀
交流電圧範囲:-0.2±0.01[V](vs銀/塩化銀)
周波数;100000~0.1[Hz]
100mMの塩化カリウム+5mMのK3Fe(CN)6/K4Fe(CN)6水溶液中においてインピーダンス測定をおこなった。
掃引速度:0.30[V/s]
対電極:白金
参照電極:銀/塩化銀
交流電圧範囲:-0.2±0.01[V](vs銀/塩化銀)
周波数;100000~0.1[Hz]
本発明のタンパク質ポリマーは、酵素の集合体として用いることも可能である。
配列番号1 シトクロムb562
配列番号2 マッコウクジラ由来野性型ミオグロビン(sperm whale)
配列番号3 西洋ワサビペルオキシダーゼ
配列番号4 H63Cシトクロムb562
配列番号5 変異部位導入プライマー
配列番号6 M13プライマーM4
配列番号7 M13プライマーRV
配列番号8 MUT4プライマー
配列番号9 ヘモグロビンαサブユニット(human)
配列番号10 ヘモグロビンβサブユニット(human)
配列番号2 マッコウクジラ由来野性型ミオグロビン(sperm whale)
配列番号3 西洋ワサビペルオキシダーゼ
配列番号4 H63Cシトクロムb562
配列番号5 変異部位導入プライマー
配列番号6 M13プライマーM4
配列番号7 M13プライマーRV
配列番号8 MUT4プライマー
配列番号9 ヘモグロビンαサブユニット(human)
配列番号10 ヘモグロビンβサブユニット(human)
Claims (10)
- 一般式(I)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩。
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
- 一般式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩。
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
- 請求項2に記載の一般式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩をモノマー単位とするタンパク質ポリマーまたはその塩。
- 前記タンパク質ポリマーが、一般式(III)で表わされるランダムなタンパク質ポリマーである請求項4に記載のタンパク質ポリマーまたはその塩。
R1、R2、R3およびR4は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
Yは、式-(CH2)n1-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-、-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-または-(CH2)n1-O-(CH2)n2-O-(CH2)n3-O-(CH2)n4-で表わされる基であり、ここでn1、n2、n3およびn4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味し、
Mは、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Xは、ヘムタンパク質の変異体中のXを意味し、前記ヘムタンパク質の変異体は式(V)で表わされ、
- 請求項3に記載のタンパク質ポリマーまたはその塩の製造方法であって、
請求項2に記載のタンパク質モノマーまたはその塩を中性条件下で処理することにより、請求項3に記載のタンパク質ポリマーまたはその塩を得る製造方法。 - 一般式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩と、請求項2に記載の一般式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩とを含むタンパク質アセンブリまたはその塩。
R11、R12、R13,R14、R21、R22、R23、R24、R31、R32、R33、およびR34は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
M1、M2およびM3は、それぞれ独立して、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)m1-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-または-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-O-(CH2)m4-で表わされる基であり、ここでm1、m2、m3およびm4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味する。 - 請求項6に記載のタンパク質アセンブリまたはその塩の製造方法であって、
一般式(IV)で表わされるトライアドまたはその塩と、請求項2に記載の一般式(II)で表わされるタンパク質モノマーまたはその塩とを、中性条件下で処理することにより、請求項6に記載のタンパク質アセンブリまたはその塩を得る製造方法。
R11、R12、R13,R14、R21、R22、R23、R24、R31、R32、R33、およびR34は、それぞれ独立して、水素原子、低級アルキル基、ハロゲン原子で置換された低級アルキル基または低級アルケニル基を意味し、
M1、M2およびM3は、それぞれ独立して、Fe、ZnおよびCoからなる群から選択され、
Z1、Z2およびZ3は、それぞれ独立して、式-(CH2)m1-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-、-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-または-(CH2)m1-O-(CH2)m2-O-(CH2)m3-O-(CH2)m4-で表わされる基であり、ここでm1、m2、m3およびm4は、それぞれ独立して1~20の整数を意味する。 - 請求項6に記載のタンパク質アセンブリまたはその塩を含むナノシート。
- タンパク質モノマー、タンパク質モノマーの塩、タンパク質ポリマー、タンパク質ポリマーの塩、タンパク質アセンブリおよびタンパク質アセンブリの塩からなる群から選択される1以上を含むデバイスであって、
前記タンパク質モノマーまたはタンパク質モノマーの塩が、請求項1に記載のタンパク質モノマーもしくはその塩、または請求項2に記載のタンパク質モノマーもしくはその塩であり、
前記タンパク質ポリマーまたはタンパク質ポリマーの塩が、請求項3に記載のタンパク質ポリマーもしくはその塩、または請求項4に記載のタンパク質ポリマーもしくはその塩であり、
前記タンパク質アセンブリまたはタンパク質アセンブリの塩が、請求項6に記載のタンパク質アセンブリまたはタンパク質アセンブリの塩であるデバイス。 - タンパク質モノマー、タンパク質モノマーの塩、タンパク質ポリマーおよびタンパク質ポリマーの塩からなる群から選択される1以上で修飾された基板であって、
前記タンパク質モノマーまたはタンパク質モノマーの塩が、MはFeである請求項2に記載のタンパク質モノマーもしくはその塩であり、
前記タンパク質ポリマーまたはタンパク質ポリマーの塩が、MはFeである請求項3に記載のタンパク質ポリマーもしくはその塩、またはMはFeである請求項4に記載のタンパク質ポリマーもしくはその塩である基板。
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