WO2008047574A1 - Sensibilisateur pour agent anticancéreux - Google Patents
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- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
Definitions
- the present invention relates to a drug having an effect of enhancing the anticancer action of the anticancer agent by using it together with the anticancer agent.
- anticancer drugs used in drug therapy often have side effects.
- anti-cancer drugs such as actinomycin D, camptothecin, cisplatin, doxorubicin, etoposide (VP16), 5-fluorouracil, mitomycin C, etc.
- VP16 doxorubicin
- etoposide VP16
- 5-fluorouracil 5-fluorouracil
- mitomycin C etc.
- Research is being conducted to develop anticancer drugs that act specifically on tumor cells, such as molecularly targeted drugs, or to improve selectivity for tumors by devising their administration. It is extremely difficult to eliminate side effects.
- alkyltransferase MGMT an alkylating agent, 06-benzylguanine having an effect of enhancing the alkylation effect is known.
- This compound is known to be a concomitant drug with alkylating drugs (see Non-Patent Documents 1 and 2).
- an effective drug that enhances the anticancer effect has not been developed.
- WS Wang syndrome
- 4NQO 4-ni troquinoline-l-oxide
- WS patient B-cells (LCL) transformed with EBV inhibit topoisomerase I compared with healthy LCL. It is highly sensitive to the drug camptothecin (Non-patent Document 4) and similarly sensitive to topoisomerase II inhibitor etoposide (Non-patent Document 5).
- ES cells knocked out of the WRN gene are more sensitive to etoposide, a topoisomerase II inhibitor, than wild ES cells (+ WRN / + WRN)! Reference 6).
- colorectal cancer whose WRN helicase expression has been reduced by methylation of the promoter region CpG of the WRN gene is treated with camptothecin compared to colorectal cancer with less methylation and higher WRN helicase expression. It has been reported that the effect is high (Non-patent Document 7). In this paper, it has been reported that chromosomal breakage by mitomycin C is enhanced when cells are treated with siRNA against the WRN gene to lower the mRNA level of the WRN gene.
- Non-Patent Document l Margison, G.P. and Santibanez-Koref, MF., 2002, Bioessays., Vol.24, p.255-66
- Non-Patent Document 2 Gerson, S., 2002, J Clin Oncol., Vol.20, p.2388-99
- Non-Patent Document 3 Gebhart, E. et al., Hum Genet, 80: 135-139, 1988
- Non-Patent Document 4 Okada, M. et al., Biol Pharm Bull, 21: 235-239, 1998
- Non-patent literature 5 Elli, R. et al., Cancer Genet. Cytogenet., 87: 112-116, 1996
- Non-patent literature 6 Lebel, M. and Leder, P. Proc Natl Acad Sci USA, 95: 13097- 13102, 1998
- Non-Patent Document 7 Agrelo, R. et al., Proc Natl Acad Sci USA, 103: 8822-8827, 2006 Disclosure of the Invention
- the present invention has been made in view of such circumstances, and an object thereof is to provide a drug that enhances the anticancer action of an anticancer drug, that is, an anticancer drug sensitizer.
- the present inventors have demonstrated anticancer activity for anticancer agents such as actinomycin D, camptothecin, cisplatin, doxorubicin, etoposide, 5-fluorouracil, and mitomycin C.
- anticancer agents such as actinomycin D, camptothecin, cisplatin, doxorubicin, etoposide, 5-fluorouracil, and mitomycin C.
- Intensive research was conducted to develop concomitant drugs that could be enhanced.
- the inventors succeeded in finding a plurality of genes capable of enhancing the anticancer action of the anticancer agent by suppressing the expression.
- the functions of proteins encoded by these genes found by the present inventors were examined, it was found that the genes are involved in chromosome repair and stabilization.
- the substance that suppresses the expression of each gene found by the present inventors functions as a sensitizer for the above-described anticancer agent.
- a substance that suppresses the expression of the gene or the function of the protein encoded by the gene is useful as a concomitant drug with the anticancer agent.
- the concept of sensitizing anticancer agents by reducing the expression or function of genes involved in DNA repair or stabilization such as the WRN gene has not been known so far.
- the present inventors have demonstrated for the first time that the sensitivity to an anticancer agent having a DNA toxic effect is enhanced by suppressing the expression of a gene such as a WRN gene involved in DNA repair or stabilization.
- the present inventors have succeeded in developing a drug capable of enhancing the anticancer action of an anticancer drug, and completed the present invention. That is, the present invention relates to a novel anticancer agent sensitizer and a method for enhancing the anticancer agent sensitivity of non-human animals.
- An anticancer agent sensitizer comprising, as an active ingredient, a compound that inhibits expression of a gene involved in DNA repair or stabilization, or a function of a protein encoded by the gene,
- the anticancer agent sensitizer according to (1) wherein the gene is any of the following genes and the anticancer agent is camptothecin, irinotecan hydrochloride, SN-38, or topotecan, (l) Mcm3, 2) Cdc7, (3) TopBPl, (5) RFC3, (6) RFC5, (7) Elgl, (10) Chkl, (1 2) Husl, (13) Ubcl3, (14) CSA, (16) Polh, (17) Poli, (19) DNA-PKcs, (25) TIM ELESS, (26) WRN, (27) BLM
- the gene is any of the following genes, and the anticancer agent is cisplatin, force norepoplatin, nedaplatin, donkeyplatin, oxaloplatin, JM216, JM335, DWA-2114R, NK-121, I_OHP, or TRK-710 (1) Mcm3, (9) Scc3, (10) Chkl, (ll) NBSl, (12) Husl, (13) Ubcl3, (14) CSA, (15) ) XPF, (26) WRN, (27) BLM
- the gene is any of the following genes, and the anticancer agent is doxorubicin, daunorubicin, aclarubicin, piravicine, or epilubicin, the anticancer agent sensitizer according to (1),
- the anticancer agent sensitizer according to (1) wherein the gene is any of the following genes, and the anticancer agent is 5-fluorouracil, degafur, carmofur, doxyfluridine, cytarabine, ancitabine, or enocitabine,
- the double-stranded RNA includes a structure in which an RNA comprising the base sequence of SEQ ID NO: 6;! -87 and an RNA comprising a sequence complementary to the RNA are hybridized.
- the anticancer agent sensitizer according to [10] which is a double-stranded RNA,
- An anticancer agent characterized by selecting a compound that decreases the expression level of the gene according to any one of (1) to (27) of [2] or the activity of the protein encoded by the gene. Sensitizer screening method,
- the present invention also provides the following method.
- An organism comprising a step of administering to an individual a compound that inhibits the expression of a gene involved in DNA repair or stabilization, or the function of a protein encoded by the gene. And the like).
- the gene is any of the following genes, and the anticancer agent is cisplatin, carpoplatin, nedaplatin, donkeyplatin, oxaloplatin, JM216, JM335, DWA-2114R, NK-121, I_OHP, or TRK-710 , [13] A method for enhancing the sensitivity of an organism (human, non-human animal, etc.) described in [13].
- the double-stranded RNA has a structure in which RNA comprising the nucleotide sequence set forth in any of SEQ ID NO: 6;! -87 and RNA comprising a sequence complementary to the RNA are hybridized.
- a method for treating cancer comprising a step of administering the anticancer agent sensitizer of the present invention to an individual (for example, a patient),
- [25] Increase in anticancer agent or anticancer agent for a compound that suppresses the expression of the gene according to any one of (1) to (27) above, or a compound that inhibits the function of the protein encoded by the gene. It relates to the use for the production of sensitizers.
- the present invention provides the following.
- composition comprising a compound that inhibits the expression of a gene involved in DNA repair or stabilization, or the function of a protein encoded by the gene, and an anticancer agent.
- an anticancer agent is actinomycin D or clomycin A3.
- the gene is any of the following genes, and the anticancer agent is cisplatin, carpoplatin, nedaplatin, donkeyplatin, oxaloplatin, JM216, JM335, DWA-2114R, N-121, I-OHP, or TRK-710
- the anticancer agent is cisplatin, carpoplatin, nedaplatin, donkeyplatin, oxaloplatin, JM216, JM335, DWA-2114R, N-121, I-OHP, or TRK-710
- the gene is any of the following genes, and the anticancer agent is mitomycin [26] The composition according to [26].
- FIG. 1 shows IC50 values for various anticancer agents of 27 types of genes.
- the present inventors have succeeded in finding 27 types of proteins (genes) that can enhance the anticancer action of known anticancer agents by suppressing the function or expression.
- the protein (gene) is a protein (gene) described in the following (1) to (27).
- the above gene is a gene involved in DNA repair or stabilization.
- the present invention provides an anticancer agent sensitizer comprising, as an active ingredient, a compound that inhibits the expression of a gene involved in DNA repair or stabilization, or the function of a protein encoded by the gene.
- Preferred or embodiment of the present invention! /! Inhibits the expression of a gene selected from the group consisting of the above (1) to (27) or the function of a protein encoded by the gene.
- an anticancer agent sensitizer containing a compound as an active ingredient.
- the present invention also includes the step of administering to an individual a compound that inhibits the expression of a gene involved in DNA repair or stabilization, or the function of a protein encoded by the gene. Provide a method to enhance the sensitivity of non-human animals).
- Preferred methods and embodiments of the method of the present invention are to inhibit the expression of a gene selected from the group consisting of the above (1) to (27) or the function of the protein encoded by the gene.
- a method comprising administering to an individual a compound.
- gene names described in the present specification are widely known names, those skilled in the art can use public literature databases based on information on the base sequences of the genes. Alternatively, it can be appropriately obtained from a gene database (eg, GenBank).
- Table 1 shows the relationship between NCBI accession numbers from which the sequence information of the genes can be obtained and the sequence numbers of the base sequences of the genes obtained by the numbers.
- An example of the amino acid sequence of the protein encoded by each gene of the present invention is also shown in the sequence listing.
- each gene described in the above (1) to (27) may be given the same accession number even if it is the same gene due to the presence or absence of polymorphism in the base sequence. is there.
- This “polymorphism” is not limited to single nucleotide polymorphisms (SNPs) consisting of single nucleotide substitutions, deletions and insertion mutations, but also includes substitutions, deletions and insertion mutations of several consecutive nucleotides. Therefore, the base sequences of the genes described in (1) to (27) above are not necessarily the sequences obtained by the accession numbers described in Table 1 or the sequences described in SEQ ID NOs:;!-30. Not limited Yes. Similarly, the amino acid sequence of the protein encoded by each gene described in the above (1) to (27) is not particularly limited to the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 3;! -60.
- the protein of the present invention is not limited to the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 3;! To 60, and in the amino acid sequence, one or a plurality of amino acid residues are appended, deleted, substituted, A mutant protein or a homologous protein of the protein encoded by the gene according to (1) to (27) above containing the inserted amino acid sequence, and encoded by the gene according to (1) to (27) above Proteins that are functionally equivalent to the protein (SEQ ID NO: 3; protein described in! ⁇ 60) are also included.
- the “functionally equivalent protein” has the same function as the function (for example, chromosomal repair or stabilization function) of the protein encoded by the gene described in (1) to (27) above. Protein.
- the protein possessed can be shown as a protein functionally equivalent to the protein encoded by the genes described in (1) to (27) above.
- genes described in the above (1) to (27) of the present invention are not particularly limited, but are usually derived from animals, more preferably derived from mammals, and most preferably derived from humans. .
- the drug in the present invention can also be expressed as, for example, an anticancer agent sensitivity enhancer, an anticancer agent combination agent, an anticancer agent action enhancer, an anticancer agent side effect inhibitor, an anticancer agent side effect reducing agent, or the like.
- the “anticancer agent” may be expressed as “antitumor agent”, “antitumor agent”, “antitumor pharmaceutical composition” or the like.
- inhibitorting protein function specifically refers to inhibiting the function of chromosome repair or stabilization of the protein of the present invention.
- each protein described in the above (1) to (27) of the present invention has functions described in the following (a) to (n) in more detail. Therefore, in a preferred embodiment of the present invention, “function is inhibited. “Harm” refers to inhibiting the following functions of the protein of the present invention. However, the functions described below are examples of the functions of the protein of the present invention, and even substances that inhibit functions other than those exemplified are considered to act as the anticancer agent sensitizer of the present invention.
- Chromosomal breaks, deletions, translocations, and aneuploidy are observed in cells derived from patients with human chromosomal instability, and patients from these diseases are sensitive to drugs that cause DNA damage. Since chromosomal destabilization occurs, genes related to human chromosomal instability diseases are involved in chromosome stabilization. Examples of human chromosomal instability diseases include xeroderma pigmentosum, cocaine disease, progeria and the like. The genes of the present invention relating to each of these diseases are described below.
- the chromosomal DNA replication reaction plays a role in replicating chromosomal DNA when cells proliferate, and when a cell divides into two, it accurately duplicates the chromosome and maintains the number of chromosomes. It has a function.
- the gene of the present invention having this function is described below.
- the DNA damage checkpoint is used to check for DNA damage that includes a broken 'chemical modification' bridge in the chromosome when the cell cycle transitions from the G1, S, G2, and M stages to the next stage. It has the function of removing DNA damage on the chromosome before moving to the next cell cycle stage.
- the gene of the present invention having this function is described below.
- Direct base repair is responsible for removing modified bases when chemical modification damage, including oxidation and methylation, occurs in the bases of chromosomal DNA.
- chemical modification damage including oxidation and methylation
- Nucleotide excision repair occurs in chromosomal DNA by UV irradiation, such as cyclobutane-type pyrimidine dimers and 6-4 photoproducts, and cisplatin between adjacent bases in chromosomal DNA, such as intrastrand crosslinks. It is responsible for recognizing damage and removing and repairing damaged parts.
- UV irradiation such as cyclobutane-type pyrimidine dimers and 6-4 photoproducts
- cisplatin between adjacent bases in chromosomal DNA such as intrastrand crosslinks. It is responsible for recognizing damage and removing and repairing damaged parts.
- the gene of the present invention having this function is described below.
- Homologous recombination repair involves DNA damage caused by incomplete repair mechanisms such as base excision repair, mismatch excision repair, and nucleotide excision repair, as well as various DNA damage, including breaks and gaps in chromosomal DNA. It has no role! / It plays a role in repairing homologous chromosomes as cocoons.
- the gene of the present invention having this function is described below.
- Non-homologous end-joining repair plays a role in joining and repairing the ends of double-strand breaks that occur in chromosomal DNA!
- the gene of the present invention having this function is described below.
- Double-strand DNA break repair plays a role in repairing double-strand breaks that occur in chromosomal DNA.
- the repair mechanism includes homologous recombination repair and non-homologous end-joining repair (non-homologous recombination repair).
- the gene of the present invention having this function is described below.
- DNA replication repair (DNA damage tolerance) is a mechanism that allows replication of damaged DNA strands when damaged chromosomal DNA is replicated, and the remaining DNA damage is repaired after replication.
- the gene of the present invention having this function is described below.
- DNA polymerase plays a role in carrying out DNA synthesis reactions in chromosomal stabilization mechanisms such as replication, recombination, and repair.
- the gene of the present invention having this function is described below.
- Nucleotide purification plays a role in removing a modified base when chemical modification damage including methylation occurs on the base in the nucleotide that is the substrate of the DNA synthesis reaction.
- the gene of the present invention having this function is described below.
- chromatin structure acts on the chromosomal stabilization mechanism such as replication, recombination, and repair via the higher order structure of the chromosome.
- the gene of the present invention having this function is described below.
- Telomere structure maintenance plays an important role in chromosome stabilization through the control of telomere length at the end of the chromosome and the formation and maintenance of special higher-order structures in the telomeric region.
- the gene of the present invention having this function is described below.
- the region where the single strands are exposed is accumulated or accumulated, or the double-stranded strands DDNNAA breaks This refers to the state of the state that appears in large numbers, but it is not necessarily limited to such a state of state here. .
- the invention of the present invention remains unsatisfactory ! //, the aspect is like ! //, the anti-cancer drug is DDNNAA poison It is an anti-anticancer cancer drug with toxic action. .
- DD Documenttrine
- Tethyssin Tethyssin
- Sisspratatin Doxoxosolrubicin
- Etotoposide 55--Fluluo This is the place where you can cite Oloroura Urashishiruru, Mamaito Tomamai Ishin Shin CC and so on.
- these anti-anti-cancer cancer drugs have the following different names (the names of the official and formal formulas) shown below. Exist. .
- other names other than those shown below there are no restrictions on those skilled in the art.
- camptothecin Another name for camptothecin:
- the various anticancer agents described above are preferably treated with the ability S to enhance the action (sensitivity) by suppressing the expression of the gene shown below or the function of the protein encoded by the gene.
- the gene of the present invention is preferably the following gene! /
- the anticancer drug actinomycin D is known to bind to double-stranded DNA and to selectively inhibit RNA synthesis.
- the present inventors have found that the anticancer action (sensitivity) of actinomycin D can be enhanced by inhibiting the expression of the above gene or the function of the protein encoded by the gene. . That is, it is considered that an anticancer agent having the same mechanism of action as actinomycin D can enhance the anticancer activity by inhibiting the expression of the gene or the function of the protein encoded by the gene.
- the anticancer agent having the same mechanism of action as actinomycin D is not particularly limited as long as it is an anticancer agent having a force S capable of suitably exhibiting, for example, clomycin A3, and the like mechanism.
- the gene of the present invention is preferably the following gene.
- the anticancer drug camptothecin has an action of inhibiting DNA synthesis by inhibiting type I DNA topoisomerase.
- the cell killing effect of this drug is specific to the S phase of the cell cycle.
- Anticancer agents that are thought to be able to enhance the action (sensitivity) by inhibiting are not particularly limited as long as they have the same mechanism of action as camptothecin, such as irinotecan hydrochloride, SN-38, or topotecan. Etc.
- the gene of the present invention is preferably the following gene.
- the anticancer drug cisbratine is highly reactive in cells with low platinum complex compounds and chloride ions, and binds to nucleobases. Mainly creates intra- and double-strand cross-links of DNA and has the effect of inhibiting DNA synthesis and tumor cell division.
- an anticancer agent capable of enhancing the action (sensitivity) by suppressing the expression of the above gene or the function of the protein encoded by the gene, an anticancer having the same mechanism of action as cisbratin is used.
- the gene of the present invention is preferably the following gene.
- the anticancer drug doxorubicin binds to DNA in tumor cells and has the effect of preventing DNA cleavage during cell division. It also suppresses DNA-dependent RNA polymerase and deoxyribonuclease.
- an anticancer agent capable of enhancing the action (sensitivity) by suppressing the expression of the above gene or the function of the protein encoded by the gene
- an anticancer agent having the same mechanism of action as doxorubicin is used. If so, there is no particular limitation. For example, daunorubicin, aclarubicin, pyrasubicin, or epilubicin can be listed with a force S.
- the gene of the present invention is preferably the following gene.
- the anticancer drug etoposide has a cytocidal effect on cells in the late S and G2 phases of the cell cycle. Since it does not break the isolated DNA strand in vitro, its action on DNA is considered indirect.
- An anticancer agent whose action (sensitivity) can be enhanced by suppressing the expression of the above gene or the function of the protein encoded by the gene is an anticancer agent having the same mechanism of action as etoposide. If there is, it is not particularly limited to etoposide.
- the gene of the present invention is preferably the following gene! /.
- the anticancer agent 5-fluorouracil is a pyrimidine antimetabolite, and is converted into fluorodeoxy UMP (FdUMP) in tumor cells and has an action of inhibiting thymidylate synthase by antagonizing deoxy UMP and inhibiting DNA synthesis. It is also involved in the inhibition of ribosomal RNA formation when it is incorporated into RNA.
- an anticancer agent capable of enhancing the action (sensitivity) by suppressing the expression of the above gene or the function of the protein encoded by the gene it has the same mechanism of action as 5-fluorouracil.
- the anticancer agent include degafur, carmofur, doxyfluridine, cytarabine, ancitabine, and inositabine.
- the gene of the present invention is preferably the following gene! /.
- the anticancer agent whose action (sensitivity) can be enhanced by suppressing the expression of the above gene or the function of the protein encoded by the gene is an anticancer agent having the same mechanism of action as mitomycin C.
- mitomycin C it is not particularly limited to mitomycin C.
- examples of the compound that inhibits the function of a protein selected from the group consisting of (1) to (27) above include the following substances.
- the protein variant having the above-described dominant negative property is expressed by the expression of the protein.
- the present invention also provides chromosome repair containing an antibody that binds to a protein encoded by a gene selected from the group consisting of (1) to (27) above as an active ingredient! / Or inhibits stabilization.
- An anticancer agent sensitizer having an action is provided.
- the antibody is expected to inhibit the function of the protein by binding to the protein of the present invention.
- the above antibody can be prepared by methods known to those skilled in the art.
- a polyclonal antibody can be obtained as follows. Serum is obtained by immunizing a small animal such as a rabbit with a recombinant protein expressed in a microorganism such as Escherichia coli or a partial peptide thereof as a fusion protein with the natural protein of the present invention or GST. This is prepared by, for example, purification by ammonium sulfate precipitation, protein A, protein G column, DEAE ion exchange chromatography, or an affinity column in which the protein of the present invention is coupled.
- a monoclonal antibody for example, a small animal such as a mouse is immunized with the protein of the present invention or a partial peptide thereof, the spleen is removed from the mouse, and this is crushed to give cells.
- the cells and mouse myeloma cells are fused using a reagent such as polyethylene glycol, and an antibody that binds to the protein of the present invention is produced from the resulting fused cells (nobridoma). Select a clone.
- the obtained hyperidoma is transplanted into the abdominal cavity of the mouse, and ascites is collected from the mouse, and the obtained monoclonal antibody is obtained by, for example, ammonium sulfate precipitation, protein A, protein G column, DEAE ion exchange chromatograph, It can be prepared by purification using an affinity column coupled with the protein or synthetic peptide of the invention.
- the form of the antibody of the present invention is not particularly limited as long as it binds to the protein of the present invention, in addition to the polyclonal antibody and the monoclonal antibody described above, a human antibody, a humanized antibody by genetic recombination, and an antibody fragment thereof And modified antibodies.
- the protein of the present invention used as a sensitizing antigen for obtaining an antibody is not limited to the animal species from which it is derived, but is preferably a protein derived from a mammal such as a mouse or a human, and particularly preferably a protein derived from a human.
- Human-derived proteins can be obtained using the gene sequences or amino acid sequences disclosed herein.
- the protein used as the sensitizing antigen may be a complete protein or a partial peptide of the protein.
- the partial peptide of the protein include an amino group (N) terminal fragment and a carboxy (C) terminal fragment of the protein.
- the “antibody” in the present specification means an antibody that reacts with the full length or fragment of a protein. In addition to immunizing an animal other than a human to obtain the above hyperidoma, human lymphocytes are used.
- human lymphocytes infected with EB virus are sensitized in vitro with proteins, protein-expressing cells or lysates thereof, and the sensitized lymphocytes are fused with human-derived myeloma cells, such as U266.
- human-derived myeloma cells such as U266.
- a hyperidoma that produces a desired human antibody having binding activity to a protein can also be obtained.
- the antibody that binds to the protein of the present invention may be used for the purpose of, for example, combined use with an anticancer agent.
- an anticancer agent When the obtained antibody is used for the purpose of administering it to the human body (antibody therapy), a human antibody or a human antibody is preferred in order to reduce immunogenicity.
- the low molecular weight compound may be a natural or artificial compound.
- the compound of the present invention can be obtained by the screening method described below.
- examples of the substance that inhibits the expression of the genes described in (1) to (27) above include the following substances.
- the "nucleic acid" in the present invention usually means RNA or DNA.
- a method for inhibiting the expression of a specific endogenous gene a method using an antisense technique is well known to those skilled in the art. There are a number of factors that cause the antisense nucleic acid to inhibit the expression of the target gene.
- antisense nucleic acids inhibit target gene expression by inhibiting various processes such as transcription, splicing, and translation (Hirashima and Inoue, Shinsei Kagaku Kenkyusho 2 Nucleic acid IV gene replication and expression, Japan Academic Society, Tokyo Kagaku Dojin, 1993, 319-347.).
- the antisense nucleic acid used in the present invention has the above-mentioned! You may inhibit gene expression.
- an antisense sequence complementary to the untranslated region near the 5 ′ end of the mRNA of the gene of the present invention is designed, it is considered effective for inhibiting translation of the gene. It is also possible to use sequences complementary to the coding region or the 3 'untranslated region.
- the nucleic acid containing the antisense sequence of the sequence of the non-translated region as well as the translated region of the gene of the present invention is also included in the antisense nucleic acid used in the present invention.
- the antisense nucleic acid to be used is linked downstream of an appropriate promoter, and preferably a sequence containing a transcription termination signal is linked on the 3 ′ side.
- the nucleic acid thus prepared can be transformed into a desired animal by using a known method.
- the sequence of the antisense nucleic acid is preferably a sequence complementary to the endogenous gene or part of the animal to be transformed, but it is not completely complementary as long as the gene expression can be effectively suppressed. May be.
- the transcribed RNA preferably has a complementarity of 90% or more, most preferably 95% or more, to the transcript of the target gene.
- the length of the antisense nucleic acid is at least 15 bases or more, preferably 100 bases or more, more preferably 500 bases or more.
- Ribozyme refers to an RNA molecule that has catalytic activity.
- Some ribozymes have a size of 400 nucleotides or more, such as group I intron type and Ml RNA contained in RNase P.
- the self-cleaving domain of the hammerhead ribozyme cleaves on the 3 'side of C15 in the sequence G13U14C15, but base pairing between U14 and A9 is important for its activity.
- A15 or U15 can also be cleaved (Koizumi, M. et al., FEBS Lett, 1988, 228, 228.).
- a ribozyme in which the substrate binding site is complementary to the RNA sequence near the target site it is possible to recognize the sequence UC, UU, or UA in the target RNA.
- a restriction enzyme-like RNA cleavage ribozyme can be created (Koizumi, M.
- Hairpin ribozymes are also useful for the purposes of the present invention.
- This ribozyme is found, for example, in the minus strand of tobacco ring spot virus satellite RNA (Buzayan, JM., Nature, 1986, 323, 349). It has been shown that hairpin-type ribozymes can produce target-specific RNA cleavage ribozymes (Kikuchi, Y. & Sasaki, N., Nucl Acids Res, 1991, 19, 6751., Hiroshi Kikuchi, Biology, 1992, 30, 112.). In this way, the ability S to inhibit the expression of the gene can be obtained by specifically cleaving the transcription product of the gene of the present invention using a ribozyme.
- a preferable embodiment of the compound that inhibits the expression of the gene according to any one of the above (1) to (27) is any one of the above (1) to (27) of the present invention.
- examples include double-stranded RNA (siRNA) having RNAi (RNA interference) effect on the genes described in 1. More specifically, SEQ ID NO: 6; RNA containing the base sequence set forth in any one of! To 87 can be mentioned.
- siRNA double-stranded RNA
- siRNA double-stranded RNA having one strand of RNA comprising the base sequence set forth in any of SEQ ID NOs: 61 to 87. .
- RNAi refers to the introduction of a double-stranded RNA consisting of a sense RNA consisting of a sequence homologous to the mRNA sequence of a target gene and an antisense RNA consisting of a complementary sequence into the cell. Refers to a phenomenon in which target gene mRNA destruction is induced and target gene expression is inhibited.
- DICER a member of the RNase III nuclease family
- double-stranded RNA is called small interfering RNA or siRNA. It is thought to break down into small pieces.
- siRNA is also included in the double-stranded RNA having RNAi effect in the present invention.
- an RNA capable of suppressing the expression of the gene according to any one of (1) to (27) above by an RNAi effect, comprising SEQ ID NO: 6; RNA consisting of the base sequence described in any of 87 and RNA consisting of a sequence complementary to the RNA
- an anticancer agent sensitizer comprising, as an active ingredient, a double-stranded RNA having a heteroidized structure.
- siRNA of the present invention containing the base sequence described in SEQ ID NO: 61 (5′_gaugcaggaugacaaucagTT-3 ′) can be exemplified by an RNA molecule having the following structure.
- RNA molecules having one end closed in the above RNA molecule for example, siRNA (shRNA) having a hairpin structure is also included in the present invention. That is, a molecule capable of forming a double-stranded RNA structure in the molecule is also included in the present invention.
- shRNA siRNA
- siRNA is RNA (siRNA) capable of suppressing the expression of the gene according to any one of the above (1) to (27) by the RNAi effect, comprising SEQ ID NO: 6;
- siRNA RNA
- a double-stranded RNA containing a structure in which an RNA comprising any one of the base sequences described above and an RNA comprising a sequence complementary to the RNA are hybridized can be suitably represented.
- the base sequence shown in Table 1 (SEQ ID NO: 6;! -87 base sequencing IJ) SiRNA molecule comprising one strand of the double-stranded RNA (SEQ ID NO: 6; siRNA comprising a structure obtained by hybridizing a base sequence described in any of!
- one strand force of a double-stranded RNA that can be suppressed by the RNAi effect is a siRNA molecule comprising the nucleotide sequence of any one of SEQ ID NO: 6;! -87 (SEQ ID NO: 6;
- An anticancer agent sensitizer comprising, as an active ingredient, a siRNA molecule comprising a structure obtained by hybridizing a base sequence set forth in any one of! To 87 and an RNA complementary to the RNA.
- double-stranded RNA having a structure in which one or more RNAs are added or deleted at the end of double-stranded RNA is also included in the present invention.
- the RNA that forms the double strand does not have to be completely identical (homologous) to the partial sequence of the gene described in (1) (27)! It is preferable.
- the double-stranded RNA having the RNAi effect of the present invention is usually homologous to any continuous RNA region in the mRNA of the gene according to any one of the above (1) to (27) of the present invention.
- the length of the RNA in the region forming a double strand in the siRNA of the present invention is preferably about 15 3 Obp, more preferably 1921 bp, most preferably 19 bp.
- the length of the siRNA having one strand of the RNA described in SEQ ID NO: 6;! 87 is not necessarily limited to these lengths.
- RNA having an RNAi effect is expected to be degraded by siRNA having an RNAi effect in cells.
- the length of the single-stranded RNA is not particularly limited.
- a long double-stranded RNA corresponding to the full-length or almost full-length region of the mRNA of the gene according to any one of (1) to (27) of the present invention is decomposed in advance with, for example, DICER.
- the degradation product can be used as an anticancer agent sensitizer.
- This degradation product is expected to contain double-stranded RNA molecules (siRNA) having the RNAi effect. According to this method, it is not necessary to particularly select a region on mRNA expected to have an RNAi effect. That is, the region on the mRNA of the gene of the present invention having the RNAi effect does not necessarily need to be accurately defined! /.
- the double-stranded RNA of the present invention preferably has an overhang of several bases at the end. .
- the length and sequence of the base that forms this overhang are not particularly limited.
- the overhang may be either DNA or RNA.
- a 2-base overhang can be exemplified.
- TT two thymines
- UU two uracils
- double-stranded RNA having an overhang of other bases most preferably 19-base double-stranded RNA and two bases (TT ) Overhang Molecule
- the double-stranded RNA of the present invention also includes a molecule in which the base that forms an overhang is DNA, and a mating IJ that is homologous to the target mRNA sequence.
- the siRNA molecule of the present invention is TT, the siRNA molecule of the present invention is
- the above-mentioned “double-stranded RNA that can be suppressed by the RNAi effect” of the present invention means that, for those skilled in the art, the above-mentioned (1) to (27)! /, It can be appropriately prepared based on the base sequence of the gene described in any one of them.
- the base sequence of the gene according to any one of (1) to (27) of the present invention can be easily obtained from a public gene database as described above.
- the double-stranded RNA of the present invention can be prepared based on the base sequence set forth in any of SEQ ID NOs:;!-30. That is, based on the base sequence described in any of SEQ ID NOs:;!
- RNA region of mRNA that is a transcription product of the sequence is selected, and a double-stranded RNA corresponding to this region It can be easily performed by those skilled in the art to produce the above.
- a method for selecting a siRNA sequence having a stronger RNAi effect from an mRNA sequence that is a transcription product of the sequence is described in, for example, literature (Reynold et al. Nature biotechnology 22. 326-330 (2004), Ui -Tei et al. Nucleic Acids Res. 32. 936-948 (2004), Boese Q, Leake D, Reynolds A, Read S, Sc aringe SA, Marshall WS, hvorova A.
- Mechanistic insights aid computational short i nterfering RNA design. Methods Enzymol. 2005; 392: 73-96., Snove O Jr, Nedland M, Fjeldstad SH, Humberset H, Birkeland OR, Grunfeld T, Saetrom P. Designing effective siRNAs with off-target control. Biochem Biophys Res Commun. 2004 ; 325 (3): 76 9-73, Yiu SM, Wong PW, Lam TW, Mui YC, ung HF, Lin M, Cheung YT. Filtering of Ineffective siRNAs and Improved siRNA Design Tool. Bioinformatics. 200515; 21 ( 2): 144-51, Chalk AM, Wahlestedt C, Sonnhammer EL.
- RNA and the like can be appropriately implemented by those skilled in the art.
- one strand for example, the nucleotide sequence IJ described in any of SEQ ID NO: 6;! 87
- a person skilled in the art can easily determine the base sequence of the other strand (complementary strand). I can know.
- the siRNA can be appropriately prepared by those skilled in the art using a commercially available nucleic acid synthesizer.
- RNA ribonucleotides
- one or more ribonucleotides constituting siRNA may be a corresponding deoxyribonucleotide.
- This “corresponding” refers to the same base species (adenine, guanine, cytosine, thymine (uracil)) although the structures of the sugar moieties are different.
- uracil uracil
- the “plurality” is not particularly limited, but preferably refers to a small number of about 25.
- the nucleic acid constituting the siRNA is, for example, a nucleic acid analog such as LNA (Locked Nucleic Acid). May be. Since the LNP is a substance resistant to nucleases, the siRNA effect can be maintained for a longer time.
- LNA Locked Nucleic Acid
- a DNA (vector) capable of expressing the double-stranded RNA of the present invention is also included in a preferable embodiment of the compound capable of suppressing the expression of the gene according to the above (1) (27) of the present invention.
- the DNA (vector) capable of expressing the double-stranded RNA of the present invention usually has a DNA encoding one strand of the double-stranded RNA and a DNA encoding the other strand of the double-stranded RNA. These are DNAs having a structure linked to a promoter so that each can be expressed.
- the expression vector of the present invention can be prepared by appropriately inserting DNA encoding the RNA of the present invention into various known expression vectors. It is.
- the gene described in any one of (1) to (27) above may include various polymorphisms even in the same gene.
- RNA sequences expected to have an RNAi effect can be appropriately designed.
- Anticancer agent sensitizers containing such RNA are also included in the present invention. Further, those skilled in the art can appropriately select an RNA having an optimal RNAi effect from a plurality of types of double-stranded RNA of the present invention to be used as an anticancer agent sensitizer.
- the sequence of the gene (target gene) that forms the basis of the double-stranded RNA of the present invention is not necessarily required to have the full-length nucleotide sequence of the gene. Any continuous RNA region to be selected (for example, 20 to 30 bases) may be known. Therefore, the double-stranded RNA of the present invention can be obtained from gene fragments whose full length is not known, such as EST (Expressed Sequence Tag), based on the nucleotide sequence of the fragment. Can be produced.
- EST Expressed Sequence Tag
- accession numbers of EST sequences showing high homology with the gene of the present invention in the GenBank database are listed separately for each gene name. However, these are merely examples of many existing EST sequences, and those skilled in the art can easily obtain information on appropriate EST fragments from public databases.
- Mcm3 BM467763, AL551465, BQ066322, BQ061652, BLM061652, AL559830, BQ059704, BM471050, BU849776, AL545116, BQ063041, BU541430, BU860117, BM542415, AU124791, BU857116, BM453648, BQ056448Q4 , AU119321, BX462455, BQ898140, CF995699, BI772155, AL54937 2, BQ214499, BU856617, BM007763, BI223143, BQ652945, BQ649476, BU50975 5, BQ058522, BQ641758, BQ064200, BG281527, AU133404, BE651947, 154 BX462766, BU558287, BQ051029, BM9175 94, AU13408
- Pola p70 BU508486, AL543898, AU121118, CB134498, AU132112, BX327138, BQ883339, CB121808, AW674983, CB149914, CB140712, CB152927, BQ882043, AL570197, BF210579, BE835570, BE835570, BE835570, BE835389, 831514 , BE837504, AI354751, BM475170, CB122291, AL044294, BE771020, AA355814, BQ351870, AW589637, AA383406, BE717631, R72191, BX117096, AA828105, BF888988, AI261685, BE163167, BF817842, 999470
- RFC3 BG505237.1, ⁇ 5388761, BG505582.1, BG505623.1, BU589268.1, BU 155229.1, BG613217.1, BU195324.1, BU195203.1, BU181580.1, BG744175.1 , BQ 439678.1, BG825971.1, BI091341.1, BG717111.1, BG719528.1, BI223327.1, BI19 6125.1, BI253515.1, AW675027.1, BI522746.1, BI758657.1, BM014911.1, BI83800 6.1, BI858352.1, BG287568.1, BG389475.1, BG501687.1, BG501708.1, BG501821.1, BG257052.1, BG502023.1, BG502134.1, BG502391.1, BG106685.1, BF794744.1, BG5023
- RFC5 BI835603.1, ⁇ 838951-1, ⁇ 8717341, BM011886.1, BM017634.1, AW65 1734.1, ⁇ 172401 / 1, BM463996.1, ⁇ 470463: 1, BM475899.1, BM801393.1, ⁇ 9 04897.1 BM923289.1, BQ069409.1, BQ218788.1, BQ226753.1, BQ881971.1, BU 178209.1 BE781077.1 ⁇ 785303 ⁇ 1 ⁇ 797316-1 ⁇ 883861 1 252521 1 25 0566.1 BG386327.1, BG766412.1, BG825474.1, ⁇ 0888891 BG698981.1, ⁇ 7624 41.1, BU942095.1, CA390335.1, BU162275.1, BU179190.1, BQ427429.1, BQ4237 12.1, CX163390.1, BF438149.1, BF594665.1
- NBS1 BM542698, BX405940, BG182890, BU166634, BM461758, BG214621, BG388866, BG284646, CF593314, CB123692, BU517247, BU661996, BM014420, AW976050, AI796269, BG483074, AU118357, 392, 907118, BG11, 907 , CB250418, AW183153, BF027776, BU620472, AI888159, BE69445
- DNA-PKcs AW674077.1, BG286622.1, BG287347.1, BG290914.1, N34539.1, BG325656.1, BG337552.1, BG423711.1, BG435226.1, BG386118.1, BG388191.1, BG391741.1, BG392601.1, BG393846.1, BG403059.1, BG403205.1, BF175507.1, BG474794.1, BG482079.1, N23156.1, BG250363.1, BG250653.1, BG250745.
- Tin2 BM911894, BQ941808, BX398174, BM915062, BQ066985, BX430064, BX347075, BX387627, BI837194, BQ423479, BX347045, BI871294, BE747943, B X429614, BX347087, BX337, 388, 388 , BX423719, BX367761, BG420146, BE903807, BE727299, B X388767, BX428959, BX430065, BX326045, BX346831, BX355414, BX428954, B X367991, BI193188, BX388709, BX398173, BX394341, BX442338, BX326 BU187043, BX429889, BM541314, BX 444001, BX474320, BX386120, BX355792, BX4
- TIMELESS BM467715, BM927658, BM541298, BM801216, BQ052552, BQ94 5096, AL560919, BQ068552, BU845242, BQ071352, BU930918, BU854737, BQO 68451, BQ961203, BQ055183, BU500665, BX4013041, B , BG749383, BX346012, BU521442, CF242984, BU5522412, CD653932, AU 125640, BU543485, BQ927368, BQ051381, BI222498, BG822789, BQ944034, BM 046877, BU146750, BU956003, BQ670516, BQ061549, BG6 746 BU187951, BE794062, BM013386, BE795708, BU 553769, BM552373, BQ424
- BLM BG772975.1, BG721596.1, BU588736.1, BG531593.1, BM804157.1, BG 217661.1, BG210806.1, BG199179.1, BG192554.1, BG187329.1, BG185919.1, BG 182955.1 BG574669.1 BG397477.1
- the gene according to the above (1) to (27) of the present invention or the mRNA corresponding to each of the above ESTs has a continuous RNA region as one strand.
- An anticancer agent sensitizer comprising double-stranded RNA having NAi effect as an active ingredient is provided.
- the present inventors have found that the substance that suppresses the gene expression described in the above (1) to (27) has an anticancer agent sensitivity enhancing action. Therefore, it is possible to screen for compounds having an anticancer drug sensitivity-enhancing effect by using the expression of each gene as an index. The compound is useful as an anticancer agent sensitizer.
- the present invention provides an anticancer agent sensitization characterized by selecting a compound that decreases the expression level of the gene according to any one of (1) to (27) above or the activity of a protein encoded by the gene.
- An agent screening method is provided.
- a preferred embodiment of the screening method of the present invention relates to a screening method for an anticancer agent sensitizer comprising the following steps (a) to (c).
- (c) a step of selecting a compound that reduces the expression level as compared to the case where measurement is performed in the absence of the test compound.
- the cells in the step (a) include cells expressing the endogenous genes described in (1) to (27) above, or exogenous cells described in (1) to (27) above.
- a cell into which a gene has been introduced and expresses the gene can be used.
- a cell in which the exogenous gene is expressed can usually be produced by introducing an expression vector containing the gene into a host cell. This expression vector can be prepared by a person skilled in the art by general genetic engineering techniques.
- Examples of the “cell” in the above method include MCF7 (breast cancer), ⁇ 549 (lung cancer), U20S (osteosarcoma), C33A (cervical cancer), ⁇ 1080 (fibrosarcoma), ⁇ -1 (ovarian teratocarcinoma), Tera2 (embryonic cancer), ⁇ 24 (bladder cancer), ⁇ 562 (chronic myeloid leukemia), Molt4 (acute lymphoblastic leukemia), A172 (glioblastoma), HeLa (cervical cancer), Hep G2 (monthly dry cancer), ACC62 (melanoma), P4 (knee cancer), Ca i-1 (Kidney cancer), MN45 (gastric cancer), L Neap (prostate cancer), MDA-MB435 (breast cancer), EJ 1 (bladder cancer), OVCAR3 (ovarian cancer), etc.
- the cells having the gene of the present invention are not limited to specific cells.
- the “contact” in the step (a) is usually performed by adding a test compound to the culture medium of the cell expressing the gene described in any of (1) to (27) above. It is not limited to this method.
- the test compound is a protein or the like
- “contact” can be carried out by introducing a DNA vector expressing the protein into the cell.
- gene expression includes both transcription and translation.
- the gene expression level can be measured by methods known to those skilled in the art. For example, mRNA is extracted from cells expressing the genes described in (1) to (27) according to a standard method, and the Northern hybridization method or RT-PCR method using this mRNA as a cocoon is performed. Thus, the transcription level of the gene can be measured.
- the translational level of the gene can be measured by collecting the protein fraction from cells expressing the gene and detecting the expression of the protein encoded by the gene by electrophoresis such as SDS-PAGE. You can also.
- the antibody used for detecting the protein encoded by the gene is not particularly limited as long as it is a detectable antibody.
- a compound that reduces the expression level is selected as compared with the case where the measurement is performed in the absence of the test compound (control).
- the compound thus selected is expected to have an effect of enhancing the sensitivity to anticancer agents.
- the compound is expected to be a concomitant drug for an anticancer agent whose mechanism of action is sensitization of the anticancer agent.
- the present invention provides a screening method for an anticancer agent sensitizer comprising the following steps (a) to (c).
- (c) a step of selecting a compound that reduces the expression level as compared to the case where measurement is performed in the absence of the test compound.
- a cell or cell containing DNA having a structure in which the transcriptional regulatory region of the gene according to any one of (1) to (27) above and a reporter gene are functionally linked.
- the extract is brought into contact with the test compound.
- “functionally linked” means that the expression of a reporter gene is induced by binding of a transcription factor to the transcriptional regulatory region of the gene described in (1) to (27) above. This means that the transcriptional regulatory region of the gene is linked to the reporter gene. Therefore, even when the reporter gene is bound to another gene and forms a fusion protein with another gene product, the fusion protein is bound by the transcription factor binding to the transcriptional regulatory region of the gene. If the expression of is induced, it is included in the meaning of “functionally linked”. Based on the cDNA base sequence of the gene described in the above (1) to (27), those skilled in the art can obtain the transcriptional regulatory region of the gene present in the genome by a well-known method.
- the reporter gene used in this method is not particularly limited as long as its expression can be detected, and examples thereof include a CAT gene, a lacZ gene, a luciferase gene, and a GFP gene.
- a cell containing DNA having a structure in which the transcriptional regulatory region of the gene described in any one of the above and a reporter gene is functionally linked is functionally linked.
- a vector having a structure in which the transcriptional regulatory region of the gene described in (27) and a reporter gene are functionally linked is introduced.
- the above vector can be produced by a person skilled in the art using general genetic engineering techniques.
- the vector can be introduced into the cells by a general method such as calcium phosphate precipitation, electric pulse perforation, ribophetamine, microinjection and the like.
- a cell containing DNA having a structure in which the transcriptional regulatory region of the gene described in (1) to (27) above and a reporter gene are functionally linked includes a cell in which the structure is inserted into a chromosome. included.
- the insertion of the DNA structure into the chromosome can be performed by a method generally used by those skilled in the art, for example, a random integration or a gene introduction method using homologous recombination.
- a cell extract containing a DNA having a structure in which the transcriptional regulatory region of the gene according to any one of (1) to (27) above and a reporter gene is functionally linked is, for example, a commercially available product Examples of addition of DNA having a structure in which the transcriptional regulatory region of the gene described in (1) to (27) and the reporter gene are functionally linked to the cell extract contained in the in vitro transcription / translation kit. That's the power S.
- Contact in this method refers to a culture solution of “a cell containing DNA having a structure in which the transcriptional regulatory region of the gene according to any one of (1) to (27) above and a reporter gene are functionally linked”.
- the force which can be performed by adding a test compound or adding the test compound to the above-described commercially available cell extract containing the DNA is not limited to these methods.
- contact can be performed by introducing a DNA vector expressing the protein into the cell.
- the expression level of the reporter gene is then measured.
- the expression level of the reporter gene can be measured by methods known to those skilled in the art depending on the type of the reporter gene. For example, when the reporter gene is a CAT gene, the expression level of the reporter gene can be measured by detecting acetylation of chloramphenicol by the gene product.
- the reporter gene is the lac Z gene, by detecting the color development of the dye compound by the catalytic action of the gene expression product, and when it is a luciferase gene, the fluorescent compound by the catalytic action of the gene expression product In the case of the GFP gene, the expression level of the reporter gene can be measured by detecting the fluorescence of the GFP protein.
- a compound that lowers the measured expression level of the reporter gene is then compared with that measured in the absence of the test compound. The compound thus selected is expected to have an action of enhancing the sensitivity of anticancer agents.
- Another aspect of the present invention is a method for screening an anticancer agent sensitizer using as an index the activity of a protein encoded by the gene described in any one of (1) to (27)! /.
- the present invention provides a screening method for an anticancer agent sensitizer comprising the following steps (a) to (c).
- test compound is contacted with a protein encoded by the gene described in any one of (1) to (27) above, or a cell or cell extract expressing the protein.
- (c) a step of selecting a compound that reduces the activity of the protein as compared to the case where it is measured in the absence of the test compound.
- the activity of the protein include the above-described function (activity) relating to the protein described in (1) to (27) of the present invention.
- a person skilled in the art can obtain information on the function (activity) and the evaluation (measurement) method of the function (activity) of the protein used as an index. Use human power S as appropriate in the database.
- the protein used as an index is Mcm3, for example, by detecting the helicase activity inhibitory activity of Mcm4, 6, and 7 by the Mcm2, 3, and 5 complex containing the protein, the protein is detected. Can be evaluated (measured) (JBC (1998) 273, 8369-8375.)
- the function of the protein can be evaluated (measured) by detecting the phosphorylation activity of the protein using the MCM complex as a substrate, for example. ( ⁇ (1997) 16, 4340_4351 ⁇ ).
- the index protein is TopBPl
- the protein and DNA polyme By detecting the DNA synthesis activity by the interaction of rase ⁇ , the function of the protein can be evaluated (measured) (J Biol Chem. (2001) 276, 30399-30406).
- the protein to be used as an index is Pola p70, for example, by detecting tetramer formation by Pola p 180, p70, p58, p48 containing the protein, or Primase or Polymerase activity of this complex, The function of the protein can be evaluated (measured) (Eur. J. Biochem. 222, 781-793 ⁇ ).
- the function of the protein can be evaluated (measured) by measuring the ATPase activity of the complex of the protein and RFC2, RFC4, RFC5 and Radl7, for example. (J Biol Chem. (2004) 279, 20921-20926 ⁇ ).
- the function of the protein can be evaluated (measured) by measuring the ATPase activity of the complex of the protein and RFC2, RFC3, RFC4 and Radl7 (J Biol Chem. (2004) 279, 20921-20926 ⁇ ).
- the function of the protein can be evaluated by detecting the complex formation of the protein with RFC2, RFC3, RFC4, and RFC5 (EMBO J. ( 2003) 22, 4304-4313 ⁇ ).
- the function of the protein can be evaluated (measured) by detecting the formation of a 14S cohesin complex between the protein and Smcl, Smc3, or Scc3. Yes (JCB (2000) 151, 749-762.)
- the function of the protein can be evaluated (measured) by detecting the formation of a 14S cohesin complex between the protein and Smcl, Smc3, or Scc 1 (JCB (2000) 151, 749-762.).
- the protein used as an index is Chkl
- the protein used as an index is Chkl
- the protein to be used as an index is Husl
- the protein in response to DNA damage By detecting the complex formed between the click protein and Radl, Rad9, evaluate the function of the protein (measured) can be force s to (J. Biol. Chem. (1999 ) 274,567-570 ⁇ ).
- the function of the protein can be evaluated (measured), for example, by detecting the ubiquitin conjugating activity of the protein (Cell (1999) 96, 645_653.).
- the function of the protein can be evaluated (measured) by detecting the interaction between the protein and CSB or TFIIH (Cell (1995)). ) 82, 555_564.).
- protein power PF as an index
- complex function between the protein and ERCC1 is detected, and the function of the protein is evaluated by detecting the endonuclease activity of the protein using stem-loop structure DNA as a substrate. (Measure) (Cell (1996) 86, 811 -822.).
- the function of the protein can be evaluated (measured) by detecting the DNA synthesis activity of the protein (Nature. (1999) 399, 700-704 ⁇ ).
- the function of the protein can be evaluated (measured) by detecting, for example, mismatch partial duplex DNA strength and the primer extension activity (JBC (2001) ) 276, 30615-30622.).
- the index protein is Dmcl
- Dmcl DNA-dependent ATPase activity of the protein
- the function of the protein can be evaluated (measured) by detecting the kinase activity of the protein (Nucleic Acids Res. (1993) 21 , 1289-1295 ⁇ ).
- the function of the protein can be evaluated (measured) by detecting the interaction between the protein and TRF1 (Nat Genet (1999) 23, 405- 412 ⁇ ).
- the protein used as an index is Sir2, for example, histone deacetylation of the protein
- the function of the protein can be evaluated (measured) by glycation assay (Gene (199 9) 234, 161-168 ⁇ ).
- the protein to be used as an index is MGMT, it is possible to evaluate (measure) the function of the protein by detecting a methyl group transfer reaction from methylated DNA by the protein (JBC (1990) 265). , 14754-14762 ⁇ ).
- the function of the protein can be evaluated (measured) by detecting the dUTPase activity of the protein (J Biol Chem. (1996) 271, 7745- 7751 ⁇ ).
- protein power TIMELESS as an index, for example, the function of the protein is evaluated (measured) by detecting the formation of a complex between the protein and mammal clock period proteins (mPERs). (Science (2003) 302, 439-442 ⁇ ).
- the function of the protein can be evaluated (measured) by detecting the 3'_5 'DNA helicase activity and the DNA-dependent ATP degradation activity of the protein.
- the protein used as an index is BLM
- the function of the protein can be evaluated (measured), for example, by detecting the 3'_5 'DNA helicase activity and the DNA-dependent ATP degradation activity of the protein.
- a compound that reduces the activity of the protein encoded by the gene according to any one of 7) is selected.
- the protein encoded by the gene used in the above method is preferably a full-length protein containing no mutation. However, if it has an activity equivalent to that of the protein, a part of the amino acid sequence is substituted and / or It may be a deleted protein.
- anticancer agents such as actinomycin D, camptothecin, cisplatin, doxorubicin, etoposide, 5-fluorouracil, mitomycin C and the like are efficiently screened for substances that enhance their anticancer activity.
- the anticancer agent is actinomycin.
- the gene (protein) used as an index for the measurement of expression or activity is the following gene (protein).
- the gene (protein) that is used as an indicator for the measurement of expression or activity is preferably the following gene (protein).
- the gene (protein) used as an index in the measurement of expression or activity is preferably the following gene (protein).
- the gene (protein) that is used as an indicator for the measurement of expression or activity is preferably the following gene (protein).
- the gene (protein) used as an index in the measurement of expression or activity is the following gene (protein).
- the gene (protein) used as an index when measuring expression or activity is preferably the following gene (protein).
- the target gene is preferably the following gene (protein).
- a compound that inhibits the expression of a gene selected from the group consisting of the above (1) to (27) or the function of a protein encoded by the gene is given to an individual.
- This is a method for enhancing the susceptibility of an organism (such as a human or non-human animal) to an anticancer agent, comprising an administration step.
- the present invention provides a method for determining whether or not a desired compound has a function of enhancing an anticancer action against an anticancer agent. That is, the determination method reduces the expression level of the gene according to any one of the above (1) to (27) of the present invention or the activity of the protein encoded by the gene for the test compound. In the case where the test compound has an action to evaluate and reduce the ability, it is determined that the test compound has a function to enhance the anticancer action of the anticancer agent.
- the present invention also provides a pharmaceutical composition for treating cancer comprising both the above-described anticancer agent and the anticancer agent sensitizer of the present invention as essential components.
- the pharmaceutical composition has a therapeutic effect at a lower concentration than conventional anticancer agents, and is expected as a therapeutic agent with few side effects.
- composition comprising actinomycin D and (l) Mcm3, (7) Elgl, (21) Sir2, or (25) TIMELESS! /, A compound that inhibits the expression of any gene Therefore, it is expected to become an anticancer agent (pharmaceutical composition) having a therapeutic effect at a lower concentration than conventional anticancer agents.
- the present invention also provides a method for producing an anticancer agent sensitizer as a pharmaceutical composition.
- a compound that is a component of an anticancer agent sensitizer is selected by the screening method of the present invention.
- the selected compound is then mixed with a pharmaceutically acceptable carrier.
- these pharmaceutically acceptable carriers include surfactants, excipients, coloring agents, flavoring agents, preservatives, stabilizers, buffering agents, suspending agents, isotonic agents, binders, disintegrating agents, lubricants.
- Agent examples thereof include fluidity promoters and corrigents, but are not limited thereto, and other conventional carriers can be used as appropriate.
- the anticancer agent sensitizer of the present invention it is possible to add the above-mentioned carrier as necessary according to a conventional method.
- Specific examples include light anhydrous carboxylic acid, lactose, crystalline cellulose, mannitol, starch, canolemellose canolecium, canolemellose sodium, hydroxypropenoresenorelose, hydroxypropinoremethinoresenorelose, polyvinylidene
- Examples include nolacetano retino chinamino minoacetate, polybulur pyrrolidone, gelatin, medium chain fatty acid tridalylide, polyoxyethylene hydrogenated castor oil 60, sucrose, carboxymethyl cellulose, corn starch, inorganic salts, and the like.
- Examples of the dosage form of the drug include tablets, powders, pills, powders, granules, fine granules, soft capsules, film coating agents, pellets, sublingual agents, Examples include parenteral preparations such as injections, suppositories, transdermal preparations, ointments, plasters, liquids for external use, etc., and those skilled in the art will know the optimal dosage form according to the route of administration and the administration subject. Can be selected.
- viruses such as retrovirus, adenovirus, and Sendai virus
- Non-viral vectors such as vectors and ribosomes
- non-viral vectors such as ribosomes, high molecular micelles, and cationic carriers can be used. Examples of the administration method include in vivo method and ex vivo method.
- the dosage of the drug or pharmaceutical composition of the present invention is finally determined appropriately according to the judgment of a doctor in consideration of the type of dosage form, administration method, patient age and weight, patient symptoms, etc.
- the present invention also relates to a method for treating cancer, comprising the step of administering the anticancer agent sensitizer of the present invention to an individual (eg, a patient).
- the administration method is not particularly limited, and examples thereof include intravenous administration, arterial administration, and subcutaneous administration.
- the present invention provides a compound that suppresses the expression of the gene according to any one of the above (1) to (27), or a compound that inhibits the function of the protein encoded by the gene.
- the present invention relates to the use of an anticancer agent or an anticancer agent sensitizer. It should be noted that all prior art documents cited in this specification are incorporated herein by reference.
- HeLa cells were cultured in Dulbecco's modified Eagle's medium containing 10% fetal bovine serum and 50 g / ml gentamicin at 37 ° C. and 5% CO.
- SiRNAs for 27 genes related to chromosome stabilization were designed according to the method of Elbasher et al. (Elbasher, MS et al. Duplexes or 1-nucleotide RNAs mediate RNA interference in cultured mammalian cells. Nature 411, 494-498 (2001)). Table 1 shows each siRNA sequence and the sequence number corresponding to each sequence. The siRNA synthesis was done with Qiagen!
- HeLa cells were seeded on a 24 well plate at a density of 1 ⁇ 10 4 cells / well, 24 hours before the transfer. Transfusion was performed using Oligofectamine (Invitrogen) according to the manufacturer's protocol. 5 pmol siRNA per well was introduced into 20% confluent HeLa cells, and total RNA was extracted from cells 48 hours after transfection using RNeasy Mini it (Qiagen). All primers and TaqMan probes used in RT-PCR were purchased from Applied Biosystems, RT-PCR reactions were performed using QuantiTect Probe RT-P CR Kit (Qiagen), and ABI PRISM 7000 Sequence Detion System ( Quantification was performed using Applied Biosystems. The expression of each gene was comparatively quantified using ⁇ -actin expression as a standard.
- HeLa cells were seeded on a 24 well plate at a density of 1 ⁇ 10 4 cells / well, 24 hours before the transfer. Transfusion was performed using Oligofectamine (Invitrogen) according to the manufacturer's protocol. To 20% confluent HeLa cells, 5 pmol siRNA per well was introduced, and after 24 hours, the medium was replaced with a medium containing each anticancer agent. As anticancer agents, actinomycin D, camptothecin, cisplatin, doxorubicin, etoposide, 5-fluorouracil, and mitomycin C were used. The number of viable cells 48 hours after transfection was measured using a living cell count measuring reagent SF (manufactured by NARO LIGHTESTAR).
- Mcm3, Elgl, Sir2, and TIMELESS genes When the expression of Mcm3, Elgl, Sir2, and TIMELESS genes was suppressed, the IC50 value against actinomycin D decreased by 3 ⁇ 4-4 times compared to NS, and the sensitivity increased. Similarly, suppression of Mcm3, Cdc7, TopBPl, RFC3, RFC5, Elgl, Chkl, Husl, Ubcl3, CSA, Polh, Poli, DNA_PKcs, TI MELESS, WRN, and BLM genes increased sensitivity to camptothecin. Suppression of Mcm3, Scc3, Chkl, NBS1, Husl, Ubcl3, CSA, XPF, WRN, and BLM genes increased sensitivity to cisplatin.
- a WRN helicase inhibitor was selected by the screening method described below.
- test compound Add 195 1 accessi buffer per well to the working plate of the compound library (compound with a concentration of 2 mM in each well of 51).
- the composition of Atsy buffer is 50 mM Tirs-HCl buffer (pH 7.5) containing 1.0 mM ATP, 5 mM MgCl, ImM DTT, O. lmg / ml BSA. Stir with 12 pipettes.
- the substrate solution was prepared by dissolving 5 nM of europium-labeled DNA (Eu-DNA) and 50 nM of trapper DNA in Atsy's buffer.
- Table 2 shows the WRN helicase inhibitors obtained by the above screening.
- ⁇ 21 are WRN helicase inhibitors obtained by screening.
- the numerical value is LD ( ⁇
- the expression or function of a protein involved in chromosome repair 'stabilization By inhibiting, it is possible to enhance the anticancer action of various anticancer agents.
- the substance of the present invention that inhibits the function of a gene involved in chromosome repair and stabilization is used as an anticancer agent sensitizer and It is greatly useful for a method for enhancing the sensitivity of an organism (such as a human or non-human animal) to an anticancer agent. Since the anticancer agent sensitizer of the present invention can suppress the amount of various anticancer agents used, it is possible to reduce the side effects of the anticancer agent by using it together with the anticancer agent.
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Description
明 細 書
抗癌剤増感剤
技術分野
[0001] 本発明は、抗癌剤と併用することにより、該抗癌剤の抗癌作用を増強させる効果を 有する薬剤に関する。
背景技術
[0002] 近年、抗癌剤による癌の薬物療法の進歩は目覚しぐ余命を延長させる薬剤、投与 量、投与法などが確立されつつある。しかし、薬物療法で使われる抗癌剤の多くは、 副作用を伴うことが多い。例えば、ァクチノマイシン D、カンプトテシン、シスプラチン、 ドキソルビシン、エトポシド (VP16)、 5-フルォロウラシル、マイトマイシン C等の抗癌剤 につレ、ても、正常細胞にも傷害を与える等の強レ、副作用を有することが知られてレ、る 。分子標的薬剤のように腫瘍細胞特異的に作用する抗癌剤の開発、あるいは投与の 工夫により腫瘍への選択性を高めるための研究がなされている力 副作用をゼロに することは非常に困難である。
[0003] 副作用は、薬剤(副作用防止剤など)で抑制が可能である。また多剤併用化学療法 のように、副作用の異なる複数の抗癌剤を同時に用いて各薬物の副作用を分散する ことも可能である。しかし副作用を軽減するためには、少量の抗癌剤で効果が得られ るような手法の開発が望ましい。抗癌剤の作用を増強させる薬剤があれば、抗癌剤 の使用を少量に抑えることが可能である。
[0004] これまでに、アルキル化剤のアルキルトランスフェラーゼ MGMTについて、当該アル キル化効果を増強する効果を有する 06-ベンジルグァニン (benzylguanine)が知られ ている。この化合物は、アルキル化薬の併用薬となることが知られている(非特許文 献 1および 2参照)。し力もながら、上述のような既存の抗癌剤については、当該抗癌 作用を増強させる有効な薬剤は開発されていない。
[0005] WS (ウェルナー症候群)患者の末梢血リンパ球は健常人のリンパ球に比較して 4-ni troquinoline-l-oxide (4NQO)に対する感受性が高い(非特許文献 3)。また、 EBVで 形質転換した WS患者 B-細胞(LCL)は健常人の LCLに比較しトポイソメラーゼ I阻害
剤であるカンプトテシンに対する感受性が高く(非特許文献 4)、同様にトポイソメラー ゼ II阻害剤であるエトポシドに対する感受性が高い(非特許文献 5)。また、 WRN遺伝 子をノックアウトした ES細胞(-WRN/-WRN)は野生の ES細胞(+WRN/+WRN)に比較 してトポイソメラーゼ II阻害剤であるエトポシドに対する感受性が高!/、(非特許文献 6) 。最近、 WRN遺伝子のプロモータ領域 CpGのメチル化により WRNヘリカーゼの発現 が低下した結腸直腸癌はカンプトテシンに対する治療に対して、メチル化の程度が 低ぐ WRNヘリカーゼの発現が高い結腸直腸癌に比較し治療効果が高いことが報告 されている(非特許文献 7)。また、この論文において、 WRN遺伝子に対する siRNAで 細胞を処理し WRN遺伝子の mRNAレベルを下げると、マイトマイシン Cによる染色体 切断が増強されることが報告されてレ、る。
[0006] しかしながら、 WRN遺伝子等の発現または機能を低下させることにより抗癌剤の増 感を図るとレ、う考え方はこれまでのところ知られて!/ヽなレ、。
非特許文献 l : Margison, G.P.および Santibanez-Koref, MF.著、 2002年、 Bioessays. 、 Vol.24, p.255-66
非特許文献 2 : Gerson, S丄.著、 2002年、 J Clin Oncol.、 Vol.20, p.2388-99
非特許文献 3 : Gebhart, E. et al., Hum Genet, 80: 135-139, 1988
非特許文献 4 : Okada, M. et al., Biol Pharm Bull, 21: 235-239, 1998
非特許文献 5 : Elli, R. et al., Cancer Genet. Cytogenet., 87: 112-116, 1996 非特許文献 6 : Lebel, M. and Leder, P. Proc Natl Acad Sci U S A, 95: 13097-13102, 1998
非特許文献 7 :Agrelo, R. et al., Proc Natl Acad Sci U S A, 103: 8822-8827, 2006 発明の開示
発明が解決しょうとする課題
[0007] 本発明はこのような状況に鑑みてなされたものであり、抗癌剤の抗癌作用を増強さ せる薬剤、即ち、抗癌剤増感剤の提供を課題とする。
課題を解決するための手段
[0008] 本発明者らは、ァクチノマイシン D、カンプトテシン、シスプラチン、ドキソルビシン、 エトポシド、 5-フルォロウラシル、マイトマイシン C等の抗癌剤について、抗癌作用を
増強し得る併用薬を開発すべく鋭意研究を行った。その結果、発現を抑制することに より、上記抗癌剤の抗癌作用を増強することが可能な複数の遺伝子を見出すことに 成功した。本発明者らによって見出されたこれらの遺伝子によってコードされるタンパ ク質の機能を考察したところ、該遺伝子は染色体の修復'安定化に関与することが分 かった。本発明者らによって実際に取得された知見から、染色体の修復'安定化に 関与するタンパク質の発現もしくは機能を阻害する物質は、上述の化合物に代表さ れる抗癌剤に対して、抗癌作用を増強させる働きがあることが示された。
[0009] 即ち、本発明者らによって見出された各遺伝子の発現を抑制する物質は、上記の 抗癌剤に対する増感剤として機能することが明らかとなった。該遺伝子の発現、もしく は該遺伝子によってコードされるタンパク質の機能を抑制する物質は、上記抗癌剤と の併用薬として有用である。
[0010] 上述のように、 WRN遺伝子等の DNAの修復もしくは安定化に関与する遺伝子の発 現または機能を低下させることにより、抗癌剤の増感を図るという考え方はこれまでの ところ知られていない。また、 DNAの修復もしくは安定化に関与する WRN遺伝子等の 遺伝子の発現を抑制することにより、 DNA毒性作用を有する抗癌剤に対する感受性 が増強することが本発明者によって初めて実証された。
[0011] 上述の如く本発明者らは、抗癌剤の抗癌作用を増強することが可能な薬剤を開発 することに成功し、本発明を完成させた。即ち本発明は、新規な抗癌剤増感剤、およ び非ヒト動物の抗癌剤感受性を増強させる方法に関し、より詳しくは、
〔1〕 DNAの修復もしくは安定化に関与する遺伝子の発現、または該遺伝子によって コードされるタンパク質の機能を阻害する化合物を有効成分として含む、抗癌剤増感 剤、
〔2〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子である、〔1〕に記載の抗癌剤増感剤、 (l) Mcm3、 (2) Cdc7、 (3) TopBPl、 (4) Pola p70、 (5) RFC3、 (6) RFC5、 (7) Elgl、 ( 8) Sccl、 (9) Scc3、 (10) Chkl、 (l l) NBSl, (12) Husl、 (13) Ubcl3、 (14) CSA、 (1 5) XPF、 (16) Polh、 (17) Poli、 (18) Dmcl、 (19) DNA_PKcs、 (20) Tin2、 (21) Sir2、 (22) MGMT、 (23)ABH、 (24) DUT、 (25) TIMELESS, (26)WRN、 (27) BLM 〔3〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がァクチノマイシ
ン0、またはクロマイシン A3である、〔1〕に記載の抗癌剤増感剤、
(l)Mcm3、 (7)Elgl、 (21)Sir2、 (25) TIMELESS
〔4〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がカンプトテシン 、塩酸イリノテカン、 SN-38、またはトポテカンである、〔1〕に記載の抗癌剤増感剤、 (l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (10)Chkl、 (1 2)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (16)Polh、 (17)Poli、 (19) DNA- PKcs、 (25) TIM ELESS, (26)WRN、 (27)BLM
〔5〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がシスブラチン、 力ノレポプラチン、ネダプラチン、ロバプラチン、ォキザロプラチン、 JM216、 JM335、 D WA-2114R、 NK-121、 I_OHP、または TRK-710である、〔1〕に記載の抗癌剤増感剤、 (l)Mcm3、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (ll)NBSl, (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (15)XPF、 (26)WRN、 (27)BLM
〔6〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がドキソルビシン 、ダウノルビシン、アクラルビシン、ピラスビシン、またはェピルビシンである、 〔1〕に記 載の抗癌剤増感剤、
(5)RFC3、 (7)Elgl、 (8)Sccl、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (17) Poli, (25) TIMELESS
[7] 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がエトポシドであ る、〔1〕に記載の抗癌剤増感剤、
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (9)Scc3、 (10) Chkl、 (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (16)Polh、 (17)Poli、 (19) DNA- PKcs、 (20)Tin2、 (23)ABH、 (25) TIMELESS
〔8〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤が 5-フルォロウラ シル、デガフール、カルモフール、ドキシフルリジン、シタラビン、アンシタビン、または エノシタビンである、〔1〕に記載の抗癌剤増感剤、
(l)Mcm3、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (8)Sccl、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (12)H usl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (15)XPF、 (16)Polh、 (17)Poli、 (18)Dmcl、 (19)D NA-P cs, (20)Tin2、 (21)Sir2、 (22)MGMT、 (23)ABH、 (24)DUT
〔9〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がマイトマイシン Cである、〔1〕に記載の抗癌剤増感剤、
(I) Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (8)Sccl、 (9)S cc3、 (10)Chkl、 (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (15)XPF、 (16)Polh、 (17)P oli、 (18)Dmcl、 (19) DNA-P cs, (20)Tin2、 (21)Sir2、 (22)MGMT、 (23)ABH、 (25) TIMELESS
〔10〕 前記化合物が、前記遺伝子の発現を RNAi効果により抑制し得る二本鎖 RNA である、〔2〕〜〔9〕の!/、ずれかに記載の抗癌剤増感剤、
[II] 前記二本鎖 RNAが、配列番号: 6;!〜 87のいずれかに記載の塩基配列からな る RNAと、該 RNAと相補的な配列からなる RNAとがハイブリダィズした構造を含む二 本鎖 RNAである、〔10〕に記載の抗癌剤増感剤、
〔12〕 〔2〕の(1)〜(27)のいずれかに記載の遺伝子の発現量、もしくは該遺伝子に よってコードされるタンパク質の活性を低下させる化合物を選択することを特徴とする 、抗癌剤増感剤のスクリーニング方法、
を、提供する。
また本発明は、以下の方法を提供する。
〔13〕 DNAの修復もしくは安定化に関与する遺伝子の発現、または該遺伝子によつ てコードされるタンパク質の機能を阻害する化合物を個体へ投与する工程を含む、 生物 (ヒト、または非ヒト動物等)の抗癌剤感受性を増強させる方法。
〔14〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子である、〔13〕に記載の生物(ヒト、ま たは非ヒト動物等)の抗癌剤感受性を増強させる方法。
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (4)Polap70、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 ( 8)Sccl、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (ll)NBSl, (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (1 5)XPF、 (16)Polh、 (17)Poli、 (18)Dmcl、 (19) DNA_PKcs、 (20)Tin2、 (21)Sir2、 (22)MGMT、 (23)ABH、 (24)DUT、 (25) TIMELESS, (26)WRN、 (27)BLM 〔15〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がァクチノマイ シン D、またはクロマイシン A3である、〔13〕に記載の生物(ヒト、または非ヒト動物等) の抗癌剤感受性を増強させる方法。
(l)Mcm3、 (7)Elgl、 (21)Sir2、 (25) TIMELESS
[16] 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がカンプトテシ ン、塩酸イリノテカン、 SN-38、またはトポテカンである、〔13〕に記載の生物(ヒト、また は非ヒト動物等)の抗癌剤感受性を増強させる方法。
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (10)Chkl、 (1 2)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (16)Polh、 (17)Poli、 (19) DNA- PKcs、 (25) TIM ELESS, (26)WRN、 (27)BLM
〔17〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がシスブラチン 、カルポプラチン、ネダプラチン、ロバプラチン、ォキザロプラチン、 JM216、 JM335、 D WA-2114R、 NK-121、 I_OHP、または TRK-710である、〔13〕に記載の生物(ヒト、また は非ヒト動物等)の抗癌剤感受性を増強させる方法。
(l)Mcm3、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (ll)NBSl, (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (15)XPF、 (26)WRN、 (27)BLM
〔18〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がドキソルビシ ン、ダウノルビシン、アクラルビシン、ピラスビシン、またはェピルビシンである、〔13〕 に記載の生物 (ヒト、または非ヒト動物等)の抗癌剤感受性を増強させる方法。
(5)RFC3、 (7)Elgl、 (8)Sccl、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (17) Poli, (25) TIMELESS
〔19〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がエトポシドで ある、〔13〕に記載の生物(ヒト、または非ヒト動物等)の抗癌剤感受性を増強させる方 法。
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (9)Scc3、 (10) Chkl、 (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (16)Polh、 (17)Poli、 (19) DNA- PKcs、 (20)Tin2、 (23)ABH、 (25) TIMELESS
〔20〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤が 5-フルォロウ ラシル、デガフール、カルモフール、ドキシフルリジン、シタラビン、アンシタビン、また はエノシタビンである、〔13〕に記載の生物(ヒト、または非ヒト動物等)の抗癌剤感受 性を増強させる方法。
(l)Mcm3、 (5)RFC3、(6)RFC5、(7)Elgl、(8)Sccl、(9)Scc3、(10)Chkl、 (12)H usl、(13)Ubcl3、(14)CSA、(15)XPF、(16)Polh、(17)Poli、 (18)Dmcl、 (19)D NA-P cs, (20)Tin2、(21)Sir2、(22)MGMT、(23)ABH、 (24)DUT
〔21〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がマイトマイシ ン Cである、〔13〕に記載の生物(ヒト、または非ヒト動物等)の抗癌剤感受性を増強さ せる方法。
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、(3)TopBPl、(5)RFC3、(6)RFC5、(7)Elgl、(8)Sccl、 (9)S cc3、(10)Chkl、(12)Husl、(13)Ubcl3、(14)CSA、(15)XPF、 (16)Polh、 (17)P oli、(18)Dmcl、 (19) DNA-P cs, (20)Tin2、(21)Sir2、(22)MGMT、(23)ABH、 (25) TIMELESS
〔22〕 前記化合物が、前記遺伝子の発現を RNAi効果により抑制し得る二本鎖 RNA である、〔14〕〜〔21〕のいずれかに記載の生物(ヒト、または非ヒト動物等)の抗癌剤 感受性を増強させる方法。
〔23〕 前記二本鎖 RNAが、配列番号: 6;!〜 87のいずれかに記載の塩基配列からな る RNAと、該 RNAと相補的な配列からなる RNAとがハイブリダィズした構造を含む二 本鎖 RNAである、〔22〕に記載の生物(ヒト、または非ヒト動物等)の抗癌剤感受性を 増強させる方法。
さらに本発明は、
〔24〕 本発明の抗癌剤増感剤を個体 (例えば、患者等)へ投与する工程を含む、癌 の治療方法、
〔25〕 上記(1)〜(27)のいずれかに記載の遺伝子の発現を抑制する化合物、もしく は該遺伝子によってコードされるタンパク質の機能を阻害する化合物についての、抗 癌剤もしくは抗癌剤増感剤の製造のための使用に関する。
さらに本発明は、以下を提供する。
〔26〕 DNAの修復もしくは安定化に関与する遺伝子の発現、または該遺伝子によつ てコードされるタンパク質の機能を阻害する化合物、および、抗癌剤を含む組成物。 〔27〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がァクチノマイ シン D、またはクロマイシン A3である、〔26〕に記載の組成物。
(l)Mcm3、 (7)Elgl、 (21)Sir2、 (25) TIMELESS
〔28〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がカンプトテシ ン、塩酸イリノテカン、 SN-38、またはトポテカンである、〔26〕に記載の組成物。
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (10)Chkl、 (1 2)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (16)Polh、 (17)Poliゝ (19)DNA- PKcs、 (25) TIM ELESS、 (26)WRN、 (27)BLM
〔29〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がシスプラチン 、カルポプラチン、ネダプラチン、ロバプラチン、ォキザロプラチン、 JM216、 JM335, D WA-2114R、 N -121, I- OHP、または TRK-710である、〔26〕に記載の組成物。
(l)Mcm3、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (ll)NBSl, (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (15)XPF、 (26)WRN、 (27)BLM
〔30〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がドキソルビシ ン、ダウノルビシン、アクラルビシン、ピラスビシン、またはェピルビシンである、〔26〕 に記載の組成物。
(5)RFC3、 (7)Elgl、 (8)Sccl、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (17) Poli, (25) TIMELESS
〔31〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がエトボシドで ある、〔26〕に記載の組成物。
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (9)Scc3、 (10) Chkl、 (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (16)Polh、 (17)Poli、 (19) DNA- PKcs、 (20)Tin2、 (23)ABH、 (25) TIMELESS
〔32〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤が 5-フルォロウ ラシル、デガフール、カルモフール、ドキシフルリジン、シタラビン、アンシタビン、また はエノシタビンである、〔26〕に記載の組成物。
(l)Mcm3、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (8)Sccl、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (12)H usl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (15)XPF、 (16)Polh、 (17)Poli、 (18)Dmcl、 (19)D NA-P cs, (20)Tin2、 (21)Sir2、 (22)MGMT、 (23)ABH、 (24)DUT
〔33〕 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がマイトマイシ
ン Cである、〔26〕に記載の組成物。
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (8)Sccl、 (9)S cc3、 (10)Chkl、 (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (15)XPF、 (16)Polh、 (17)P oli、 (18)Dmcl、 (19) DNA-P cs, (20)Tin2、 (21)Sir2、 (22)MGMT、 (23)ABH、 (25) TIMELESS
図面の簡単な説明
[0013] [図 1]27種類の各遺伝子の各種抗癌剤に対する IC50値を示す。
発明を実施するための最良の形態
[0014] 本発明者らは、機能もしくは発現を抑制することにより、既知の抗癌剤の抗癌作用 を増強させることが可能なタンパク質 (遺伝子) 27種を見出すことに成功した。該タン ノ ク質 (遺伝子)は、以下の(1)〜(27)に記載のタンパク質 (遺伝子)である。
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (4)Polap70、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 ( 8)Sccl、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (ll)NBSl, (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (1 5)XPF、 (16)Polh、 (17)Poli、 (18)Dmcl、 (19) DNA_PKcs、 (20)Tin2、 (21)Sir2、 (22)MGMT、 (23)ABH、 (24)DUT、 (25) TIMELESS, (26)WRN、 (27)BLM
[0015] 上記の遺伝子は、 DNAの修復もしくは安定化に関与する遺伝子である。本発明は 、 DNAの修復もしくは安定化に関与する遺伝子の発現、または該遺伝子によってコ ードされるタンパク質の機能を阻害する化合物を有効成分として含む、抗癌剤増感 剤を提供する。
本発明の好まし!/、態様にお!/、ては、上記(1)〜(27)からなる群より選択される遺伝 子の発現、または該遺伝子によってコードされるタンパク質の機能を阻害する化合物 を有効成分として含有する、抗癌剤増感剤を提供する。
また本発明は、 DNAの修復もしくは安定化に関与する遺伝子の発現、または該遺 伝子によってコードされるタンパク質の機能を阻害する化合物を個体へ投与するェ 程を含む、生物(ヒト、または、非ヒト動物等)の抗癌剤感受性を増強させる方法を提 供する。
本発明の方法の好ましレ、態様にお!/、ては、上記(1)〜(27)からなる群より選択さ れる遺伝子の発現、または該遺伝子によってコードされるタンパク質の機能を阻害す
る化合物を個体へ投与する工程を含む方法である。
[0016] 本明細書において記載された遺伝子名は、広く一般的に知られる名称であることか ら、当業者であれば該遺伝子の塩基配列についての情報をもとに、公共の文献デー タベースあるいは遺伝子データベース(例えば GenBank等)から適宜取得することが できる。
本発明の上記(1)〜(27)に記載の各遺伝子の塩基配列、および該遺伝子によつ てコードされるタンパク質のアミノ酸配列の具体例を配列表に掲載する。上記遺伝子 の配列情報が取得可能な NCBIのァクセッション番号、および該番号によって取得さ れる遺伝子の塩基配列の配列番号との関係を表 1に示す。また本発明の上記の各 遺伝子によってコードされるタンパク質のアミノ酸配列の一例についても配列表に示 す。
[0017] [表 1]
なお、上記(1)〜(27)に記載の各遺伝子は、塩基配列中の多型の有無等により、 同一の遺伝子であっても複数のァクセッション番号が付与されてレ、る場合がある。こ の「多型」とは、一塩基の置換、欠失、揷入変異からなる一塩基多型(SNPs)に限定さ れず、連続する数塩基の置換、欠失、挿入変異も含まれる。従って、上記(1)〜(27 )に記載の各遺伝子の塩基配列としては、必ずしも表 1に記載のァクセッション番号 によって取得される配列あるいは配列番号:;!〜 30に記載された配列に限定されな
い。同様に、上記(1)〜(27)に記載の各遺伝子によってコードされるタンパク質のァ ミノ酸配列も、配列番号: 3;!〜 60に記載されたアミノ酸配列に特に限定されない。
[0019] 本発明の上記タンパク質は、配列番号: 3;!〜 60に記載されたアミノ酸配列に限定 されず、該アミノ酸配列において、 1もしくは複数のアミノ酸残基が付カロ、欠失、置換、 揷入されたアミノ酸配列を含む上記(1)〜(27)に記載の遺伝子によってコードされ るタンパク質の変異タンパク質もしくはホモログタンパク質であって、上記(1)〜(27) に記載の遺伝子によってコードされるタンパク質 (配列番号: 3;!〜 60に記載されたタ ンパク質)と機能的に同等なタンパク質も含まれる。ここで「機能的に同等なタンパク 質」とは、上記(1)〜(27)に記載の遺伝子によってコードされるタンパク質における 機能 (例えば、染色体の修復あるいは安定化機能)と同様の機能を備えたタンパク質 である。
[0020] あるいは上記(1)〜(27)に記載の遺伝子によってコードされるタンパク質のァミノ 酸配列に対して、例えば 90%以上、望ましくは 95%以上、更に望ましくは 99%以上の 相同性を有するタンパク質を、上記(1)〜(27)に記載の遺伝子によってコードされる タンパク質と機能的に同等なタンパク質として示すことができる。
また、本発明の上記(1)〜(27)に記載の遺伝子は特に制限されるものではないが 、通常、動物由来であり、より好ましくは哺乳動物由来であり、最も好ましくはヒト由来 である。
[0021] なお、本発明における上記薬剤は、例えば、抗癌剤感受性増強剤、抗癌剤併用剤 、抗癌剤作用増強剤、あるいは、抗癌剤副作用抑制剤、抗癌剤副作用低減剤等と表 記することも可能である。また、前記「抗癌剤」は、「抗腫瘍剤」、「抗腫瘍薬剤」または 「抗腫瘍医薬組成物」等と表現される場合もある。
上記(1)〜(27)からなる群より選択される遺伝子によってコードされるタンパク質は 、染色体の修復あるいは安定化に関与している。従って本発明の好ましい態様にお いて「タンパク質の機能を阻害する」とは、具体的には、本発明のタンパク質が有する 染色体の修復あるいは安定化の機能を阻害することを指す。
[0022] 本発明の上記(1)〜(27)に記載の各タンパク質は、より詳細には、以下の(a)〜( n)に記載された機能を有する。従って、本発明の好ましい態様において、「機能を阻
害する」とは、本発明のタンパク質の有する下記の機能を阻害することを指す。ただし 、下記に記載された機能は、本発明のタンパク質が有する機能の一例であり、例示し た以外の機能を阻害する物質であっても、本発明の抗癌剤増感剤として作用すると 考えられる。
[0023] (a)ヒト染色体不安定性疾患関連遺伝子
ヒト染色体不安定性疾患の患者由来細胞では、染色体の切断 ·欠失 ·転座 ·異数化 が見られ、またこれら疾患の患者由来細胞は DNA損傷を引き起こす薬剤に対して感 受性を示すなど、染色体の不安定化が生じていることから、ヒト染色体不安定性疾患 関連遺伝子は染色体安定化に関与している。ヒト染色体不安定性疾患としては、例 えば色素性乾皮症、コケイン症、あるいは早老症等が挙げられる。これら各疾患に関 連する本発明の遺伝子を以下に記載する。
•ナイミーヘン症候群: (l l) NBSl
•色素性乾皮症: (15) XPF
-コケイン症: (14) CSA
•早老症: (26)WRN、 (27) BLM
[0024] (b)染色体 DNAの複製開始、複製フォークの進行を含む染色体 DNA複製反応
染色体 DNA複製反応は細胞が増殖する時に、染色体 DNAを複製する役割を担つ ており、 1個の細胞が 2個に分裂する際に正確に染色体を 2倍に複製して染色体数を 維持する機能をもつ。この機能を有する本発明の遺伝子を以下に記載する。
(l) Mcm3、(2) Cdc7、(4) Pola p70、(7) Elgl、(3) TopBPl、(5) RFC3、 (6) RFC5
[0025] (c) DNA損傷チェックポイント
DNA損傷チェックポイントは、細胞周期が G1期、 S期、 G2期、 M期の各ステージか ら次のステージへ移行する際に、染色体に切断'化学修飾'架橋を含む DNA損傷を チェックする役割を担っており、次の細胞周期のステージへ移行する前に染色体上 の DNA損傷を取り除く機能をもつ。この機能を有する本発明の遺伝子を以下に記載 する。
(10) Chkl、 (l l) NBSl, (12) Husl、 (3) ΤορΒΡ1
[0026] (d)姉妹染色分体凝集,分離
姉妹染色分体凝集 ·分離は、体細胞において複製を終えた姉妹染色分体を娘細 胞に正確に分離する役割を担っている。この機能を有する本発明の遺伝子を以下に 記載する。
(8) Sccl、 (9) Scc3
[0027] (e)直接塩基修復
直接塩基修復は、染色体 DNA中の塩基に酸化やメチル化を含む化学修飾損傷が 生じた場合に、修飾された塩基を取り除く役割を担っている。この機能を有する本発 明の遺伝子を以下に記載する。
(22) MGMT、 (23)ABH
[0028] (f)ヌクレオチド除去修復
ヌクレオチド除去修復は、紫外線照射によって染色体 DNA中に生じる、シクロブタ ン型ピリミジン 2量体や 6— 4光産物、またシスプラチンによって染色体 DNA中の隣り 合った塩基の間で生じる、 DNA鎖内架橋などの損傷を認識して、損傷部を除去して 修復する役割を担っている。この機能を有する本発明の遺伝子を以下に記載する。
(14) CSA、 (15) XPF
[0029] (g)相同組換え修復
相同組換え修復は、塩基除去修復、ミスマッチ除去修復、ヌクレオチド除去修復な どの修復機構が不完全で生じた DNA損傷、また染色体 DNA中に生じた切断、ギヤッ プなどを含む様々な DNA損傷を、損傷をもたな!/、相同染色体を铸型として修復する 役割を担っている。この機能を有する本発明の遺伝子を以下に記載する。
(18) DMC1、 (l l) NBSl, (26)WRN、 (27) BLM
[0030] (h)非相同末端結合修復 (非相同組換え修復)
非相同末端結合修復(非相同組換え修復)は、染色体 DNA中に生じた二重鎖切断 の末端を結合して修復する役割を担って!/、る。この機能を有する本発明の遺伝子を 以下に記載する。
(19) DNA-pkcs、 (26)WRN
[0031] (i)二本鎖 DNA切断修復
二本鎖 DNA切断修復は、染色体 DNA中に生じた二重鎖切断を修復する役割を担
つており、相同組換え修復や非相同末端結合修復(非相同組換え修復)がこの修復 機構に含まれる。この機能を有する本発明の遺伝子を以下に記載する。
(l l) NBSl, (18) DMC1、 (19) DNA-pkcs, (26)WRN、 (27) BLM
[0032] (j ) DNA複製後修復(DNA損傷トレランス)
DNA複製後修復(DNA損傷トレランス)は、損傷をもつ染色体 DNAが複製される場 合に、損傷が存在する DNA鎖の複製を可能にする機構で、残された DNA損傷は複 製後に修復される。この機能を有する本発明の遺伝子を以下に記載する。
(13) Ubcl3
[0033] (k) DNAポリメラーゼ
DNAポリメラーゼは、複製、組換え、修復などの染色体安定化機構において、 DNA 合成反応を行う役割を担っている。この機能を有する本発明の遺伝子を以下に記載 する。
(17) Poli, (16) Polh、 (4) Pola p70
[0034] (1)ヌクレオチド浄化
ヌクレオチド浄化は、 DNA合成反応の基質となるヌクレオチド中の塩基に酸化ゃメ チル化を含む化学修飾損傷が生じた場合に、修飾された塩基を取り除く役割を担つ ている。この機能を有する本発明の遺伝子を以下に記載する。
(24) DUT
[0035] (m)クロマチン構造維持
クロマチン構造維持は、染色体の高次構造を介した複製、組換え、修復などの染 色体安定化機構に働く。この機能を有する本発明の遺伝子を以下に記載する。
(21) Sir2
[0036] (n)テロメァ構造維持
テロメァ構造維持は、染色体末端のテロメァ長の制御、テロメァ領域の特殊な高次 構造の形成'維持を介して、染色体安定化に重要な役割を担っている。この機能を 有する本発明の遺伝子を以下に記載する。
(20) Tin2、 (21) Sir2
[0037] 上記の各遺伝子は、共通の機能として、染色体の修復 ·安定化に関与している。従
つつてて、、染染色色体体のの修修復復 ··安安定定化化をを阻阻害害すするる物物質質 ((化化合合物物))はは、、抗抗癌癌剤剤増増感感剤剤ととししてて作作用用 すするるここととがが期期待待さされれるる。。ここのの「「染染色色体体のの安安定定化化をを阻阻害害すするる」」ととはは、、例例ええばば、、染染色色体体 DDNNAA 中中にに修修復復さされれずずにに残残っったた損損傷傷がが蓄蓄積積ししたた状状態態ととななるるこことと等等をを指指しし、、具具体体的的ににはは、、染染色色 体体 DDNNAA中中にに一一本本鎖鎖がが露露出出ししたた領領域域がが蓄蓄積積ししたたりり、、二二本本鎖鎖 DDNNAA切切断断部部分分がが多多数数出出現現 すするる状状態態をを指指すすがが、、必必ずずししももここののよよううなな状状態態にに限限定定さされれなないい。。
[[00003388]] 本本発発明明ににおお!!//、、てて上上記記((aa))〜〜((ηη))のの!!//、、ずずれれかかのの機機能能をを阻阻害害すするるたためめににはは、、例例ええばば該該 機機能能にに関関与与すするる遺遺伝伝子子のの発発現現をを阻阻害害すするる、、ももししくくはは該該遺遺伝伝子子にによよっっててココーードドさされれるるタタ ンンパパクク質質のの機機能能((活活性性))をを阻阻害害すするるここととがが挙挙げげらられれるる。。
[[00003399]] ままたた本本発発明明のの好好まましし!!//、、態態様様ににおお!!//、、てて抗抗癌癌剤剤はは、、 DDNNAA毒毒作作用用ををももつつ抗抗癌癌剤剤ででああるる。。
例例ええばば、、ァァククチチノノママイイシシンン DD、、カカンンププトトテテシシンン、、シシススププララチチンン、、ドドキキソソルルビビシシンン、、エエトトポポシシ ドド、、 55--フフルルォォロロウウララシシルル、、ママイイトトママイイシシンン CC等等をを挙挙げげるるここととががででききるる。。ななおお、、ここれれららのの抗抗癌癌 剤剤ににはは、、以以下下でで示示すす別別称称((ああるるいいはは正正式式名名称称))がが存存在在すするる。。ままたた、、以以下下でで示示すす以以外外のの 別別称称ががああっったた場場合合ででああっっててもも、、当当業業者者ににおおいいてて、、化化合合物物のの構構造造等等かからら本本願願のの上上記記抗抗 癌癌剤剤とと同同一一かか否否かかににつついいてて適適宜宜知知るるここととがが可可能能ででああるる。。
jH-Phenoxazine- l ,9-aicarboxamiae, 2-amino-N, N'-bis [hexadecahydro-2 , 5 ,9-tnme thyl-6, 13-bis(l-methylethyl)- l ,4,7, l l , 14-pentaoxo- lH-pyrrolo[2, l-i] [l ,4, 7, 10, 13] oxatetraazacyclohexadecin- 10-yl]-4,6-dimethyl-j-oxo-; AC Γ; hbf 386; Lyovac cos megen; Meractinomycin; Oncostatin ; X 97; Actactinomycin A IV; Actinomycin 7; Actinomycin AIV; Actinomycindioic D acid, dilactone; Actinomycin C i ; actinomycin cl; Actinomycin D; (-) -actinomycin d; actinomycin i; Actinomycin I I ; Actinomycin I V; Actinomycin-[threo-val-pro-sar-meval] ; Actinomycin X 1 ; actinomycin x i; actin omyein-theo-val-pro-sar-meval; ACTO-D ; AD ; Dilactone actinomycindioic D acid;
Dilactone actinomycin D acid; C l ; Cosmegen; Dactinomycin; Dactinomycin D ; dact inomyein d
[0041] カンプトテシンの別称:
(+)-camptothecin; 4_Ethyl_4_hydroxy_ lH_pyrano_[3[,4[:6,7]indolizino[l,2_b]quinol ine~3, 14(4H, 12H)-dione; 4_Ethyト 4_hydroxy_ lH_pyrano_[3,4' :6,7」indolizino[l,2_b
]quinoline-3, 14(4H, 12H)-dione; camptothecin; CPT; (S)_(+)_C腿 ptothecin; (S)_4_e thyト 4_hydroxy_lH_Pyrano[3,,4,:6,7]indolizino[l,2_b]quinoline_3,14(4H,12H)_dion e; (S)-Camptothecin
[0042] シスプラチンの別称:
2 -Deoxycytidine diphosphate; diaminedichloroplatinum; し Aし P; CDDP; cis-Diammi ne dicnloroplatinum(II); cis-Diaminedichloroplatinum; cis-Diaminedichloroplatinum(II ); cis-diaminodichloroplatinum(II); cis-dichlorodiamineplatinum; cis-Dichlorodiamine platinum(II); cis-dichlorodiaminoplatinum(II); cis_Dichlorodi腿 mine platinum (II); cis -ddp; Cisplatin; CISPLATIN (CIS-DIAMINEDICHLOROPLATIUM (II)); cis- Platino us diamine dichloride; cis-Platinous Diamine Dichloroplatin; cis-platinous diaminodic nloride; cis-platinum(II) diamine dichloride; cisplatyl; cis Pt II; CPDC; CPDD; dCDP ; DDP; DDPt; neoplatin; peyrone's chloride; Platiblastin; platinex; Platinol; PT-01; ( SP-4-2)-diaminedichloroplatinum
[0043] ドキソルビシンの別称:
10_((3_Amino_2,3,6_trideoxy_alpna~L_lyso_hexopyranosyl)oxyノ- /, 8,9,10_tetrahyar o_o,8,l l_trihydroxy_8_(hydroxyacetyl)_l_methoxy_5,12_naphthacenedione; 14_Hy aroxydaunomycin; (8 _cis)_10_、0_Amino_2,0,6_ ndeoxy-alpna-L-Lyxo-Hexopyran osyl)Oxy_7,8,9,10_Tetrahydro_6,8,l l_Trmydroxy_8_(Hydroxyacetyl)_l_Metho; y_5 , 12-Naphthacenedione; adiblastine (hydrochloride salt); adriablastine (hydrochloride salt); adnaolatina (hydrochloride salt); Adriacin; Adriacin (hydrochloride salt); Adria mycin; Adriamycin PFS; Adriamycin PFS (hydrochloride salt); Adriamycin RDF; Adri amycin RDF (hydrochloride salt); Adriblastin; Adriblastina; Adriblastina (hydrochlori de salt); adriblatina (hydrochloride salt); Doxorubicin; Doxorubicin hydrochloride (hy drochloride salt); Farmablastina (hydrochloride salt); Hydroxydaunomycin hydrochlo ride (hydrochloride salt); Hydroxy daunorubicin hydrochloride (hydrochloride salt); R ubex; Rubex (hydrochloride salt)
[0044] エトポシドの別称:
4,-Demethylepipodophyllotoxin-(4,6-0-(R)-ethylidene-beta-D-glucopyranoside); 4
'-Demethylepipodophyllotoxin 9_(4,6_0_(R)_ethylidene_beta~D_glucopyranoside); 4,-Demethylepipodophyllotoxin 9_ (4,6_0_(R)_ethylidene_ beta-D-glycopyranoside) ; 4-Demethylepipodophyllotoxin-beta-D-ethylideneglucoside; 4,- Demethylepipodop hyllotoxin ethylidene-beta-D-glucoside; [5R-[5alpha,5abeta,8aalpha,9beta(R^)]]-9- [(4,6-0-ethylidene-beta-D-glucopyranosyl)oxy]-5,8,8a,9-tetrahydro-5-(4-hydroxy _3,5_dimethoxyphenyl)furo[3,,4,:6,7]naphtho[2,3_d]_l,3_dioxc^_6(5aH)_one; Demet hyl-epipodophyllotoxin,ethylidene glucoside; Epe; EPEG; Epipodophyllotoxin, 4,- de methyl-, 4,6-O-ethylidene-beta-D-glucopyranoside; Epipodophyllotoxin, 4,_demet hyl-, 9-(4,6-0-ethylidene-beta-D-glucopyranoside); Epipodophyllotoxin VP - 16213 ; Etoposide; Etopside; Furo[3,,4,:6,7]naphtho[2,3_d][l,3]dioxoト 6(5a,H)_one_,((4,6 -0-ethylidene-beta-D-glucopyranosyl)oxy)-5,8,8a,9-tetrahydro-5-(4-hydroxy-3,5 -dimethoxyphenyl, (5R-(5alpha,5abeta,8aalpha,9beta(R^)))); Vepesid; Vepesid J; VP -16; VP- 16- 213; VP- 16 (etoposide)
[0045] 5-フルオロフラシルの別称:
50fluoro uracil; 5-fluoro-2,4(lHJ3H)-Pyrimidinedione; queroplex; Ro 2-9757; Timaz in; U-8953; Ulup; 5_Fluoro_2,4_pyrimidinedione; 5_Fluoropyrimidine_2,4_dione; 5_ Fluorouracil; 5-Ftouracyl; 5-FU; Adrucil; Arumel; Carzonal; Effluderm (free base); Efudix; Efudex; efurix; Fluoroblastin; Fluoroplex; Fluorouracil; Fluorouracil (Topical ); Fluracil; fluracilum; Fluri; Fluril; Fluroblastin; ftoruracil; FU; Kecimeton
[0046] マイトマイシン Cの別称:
[laR_(laaipha,8beta,8aaipha,8balpha)]_6_amino_8_[[、aminocarbonyl)oxy」metnyl]_l, la,2,8,8a,8b— hexahydro— 8a— methoxy— 5— metnylazirino[2,3 :3,4]pyrrolo[l,2— alphajin dole_4,7_dione; (lar)-6-amino-8-(((aminocarbonyl)oxy)methyl)-l, laJ2J8,8aJ8b-hexa hydro_8a~methoxy_5_methylazirino[2,,3 : ,4]pyrrolo[l,2_aJindole_4,7_dione; 6~ami no_l,la,2,8,8a,8b_hexa ydro_8_(hydroxymethyl)_8a~methoxy_5_methylazirino[2,,3 : ,4]pyrrolo[l,2_aJindole_4,7_dione, carbamate (ester); 6_腿 ino_8_ [[(腿 inocarbon yl)oxy]methyl]_l,la,2,8,8a,8b_hexahydro_8a_methoxy_5_methyl, [laS-(laalpha,8be ta,8aalpha,8balpha)]-azirino[2, J3 :^,4]pyrrolo[l,2a]indole-4,7-dione; 7-Amino-9alp
ha-methoxymitosane; Ametycin; Azirino[2',3':3,4]pyrrolo[l,2_a]indole_4,7_dione, 6 -amino-8-[[(aminocarbonyl)oxy]methyl]-l, la,2,8,8a,8b-hexahydro-8a-methoxy-5- methyl-, [laS-(laalpha,8beta,8aalpha,8balpha)]-; Mit-C; Mito-C; Mitocin-C; Mito mycin; Mitomycin C; Mitomycinum; MMC; Mutamycin; Mytomycin
[0047] 上記の各種抗癌剤は、好ましくは、以下で示す遺伝子の発現もしくは該遺伝子によ つてコードされるタンパク質の機能を抑制することにより、作用(感受性)を増強させる こと力 Sでさる。
即ち、抗癌剤がァクチノマイシン Dである場合には、本発明の遺伝子としては以下 の遺伝子であることが好まし!/、。
(l) Mcm3、(7) Elgl、(21) Sir2、 (25) TIMELESS
抗癌剤ァクチノマイシン Dは、二本鎖 DNAに結合し、 RNA合成を選択的に阻害する 作用を有することが知られている。
[0048] 本発明者らは上記遺伝子の発現もしくは該遺伝子によってコードされるタンパク質 の機能を阻害することにより、ァクチノマイシン Dの抗癌作用(感受性)を増強させるこ とが可能であることを見出した。即ち、ァクチノマイシン Dと同様の作用機序を有する 抗癌剤であれば、上記遺伝子の発現もしくは該遺伝子によってコードされるタンパク 質の機能を阻害することによって抗癌作用を増強させることが可能と考えられる。ァク チノマイシン Dと同様の作用機序を有する抗癌剤としては、例えばクロマイシン A3等 を好適に示すことができる力 S、同様の機序を有する抗癌剤であれば、これらに特に限 定されない。
[0049] また、抗癌剤がカンプトテシンである場合には、本発明の遺伝子としては以下の遺 伝子であることが好ましい。
(l) Mcm3、 (2) Cdc7、(3) TopBPl、(5) RFC3、(6) RFC5、(7) Elgl、(10) Chkl、 (1 2) Husl、(13) Ubcl3、(14) CSA、(16) Polh、(17) Poli、(19) DNA- PKcs、 (25) TIM ELESS, (26) WRN、 (27) BLM
抗癌剤カンプトテシンは、 I型 DNAトポイソメラーゼを阻害することによって、 DNA合 成を阻害する作用を有する。本剤の殺細胞効果は細胞周期の S期に特異的である。 なお、上記遺伝子の発現もしくは該遺伝子によってコードされるタンパク質の機能を
抑制することにより、作用(感受性)を増強させることが可能と考えられる抗癌剤として は、カンプトテシンと同様の作用機序を有する抗癌剤であれば特に制限はなぐ例え ば塩酸イリノテカン、 SN-38、またはトポテカン等を挙げることができる。
[0050] また、抗癌剤がシスブラチンである場合には、本発明の遺伝子としては以下の遺伝 子であることが好ましい。
(l) Mcm3、 (9) Scc3、 (10) Chkl、 (l l) NBSl , (12) Husl、 (13) Ubcl3、 (14) CSA、 (15) XPF、 (26) WRN、 (27) BLM
抗癌剤シスブラチンは、白金錯化合物、塩素イオンの低い細胞内では反応性に富 み、核酸塩基と結合する。主に DNAの 1本鎖内架橋や 2本鎖間架橋を作り、 DNA合成 や腫瘍細胞の分裂を阻害する作用を有する。なお、上記遺伝子の発現もしくは該遺 伝子によってコードされるタンパク質の機能を抑制することにより、作用(感受性)を増 強させることができる抗癌剤としては、シスブラチンと同様の作用機序を有する抗癌 剤であれば特に制限はなぐ例えばカルポプラチン(Carboplatin)、ネダプラチン(Ne daplatin)、ロバプラチン(Lobaplatin)、ォキザロプラチン(Oxaliplatin)、 JM216, JM335 、 DWA-2114R、 NK-121、 I_OHP、または TRK-710等を挙げることができる。
[0051] また、抗癌剤がドキソルビシンである場合には、本発明の遺伝子としては以下の遺 伝子であることが好ましい。
(5) RFC3、 (7) Elgl、 (8) Sccl、 (9) Scc3、 (10) Chkl、 (13) Ubcl3、 (14) CSA、 (17) Poli, (25) TIMELESS
抗癌剤ドキソルビシンは、腫瘍細胞内の DNAと結合し細胞分裂の際に DNAの開裂 を妨げる作用を有する。また DNA依存性 RNAポリメラーゼ及びデォキシリボヌクレア ーゼを抑制する。なお、上記遺伝子の発現もしくは該遺伝子によってコードされるタ ンパク質の機能を抑制することにより、作用(感受性)を増強させることができる抗癌 剤としては、ドキソルビシンと同様の作用機序を有する抗癌剤であれば特に制限はな ぐ例えばダウノルビシン、アクラルビシン、ピラスビシン、またはェピルビシン等を挙 げること力 Sでさる。
[0052] また、抗癌剤がエトポシドである場合には、本発明の遺伝子としては以下の遺伝子 であることが好ましい。
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、(3)TopBPl、(5)RFC3、(6)RFC5、(7)Elgl、(9)Scc3、 (10) Chkl、(12)Husl、(13)Ubcl3、(14)CSA、(16)Polh、(17)Poli、 (19) DNA- PKcs、 (20)Tin2、(23)ABH、 (25) TIMELESS
抗癌剤エトポシドは、細胞周期の S期後半及び G2期にある細胞に対し殺細胞作用 を示す。 in vitroで単離 DNA鎖を切断しないため、 DNAに対する作用は間接的なもの と考えられている。なお、上記遺伝子の発現もしくは該遺伝子によってコードされるタ ンパク質の機能を抑制することにより、作用(感受性)を増強させることができる抗癌 剤は、エトポシドと同様の作用機序を有する抗癌剤であれば、エトポシドに特に限定 されない。
[0053] また、抗癌剤が 5-フルォロウラシルである場合には、本発明の遺伝子としては以下 の遺伝子であることが好まし!/、。
(l)Mcm3、 (5)RFC3、(6)RFC5、(7)Elgl、(8)Sccl、(9)Scc3、(10)Chkl、 (12)H usl、(13)Ubcl3、(14)CSA、(15)XPF、 (16)Polh、 (17)Poli、 (18)Dmcl、 (19)D NA-P cs, (20)Tin2、(21)Sir2、(22)MGMT、(23)ABH、 (24)DUT
抗癌剤 5-フルォロウラシルは、ピリミジン代謝拮抗薬であり、腫瘍細胞内で fluorode oxy UMP(FdUMP)に転換され、 deoxy UMPと拮抗してチミジル酸合成酵素を抑制し DNA合成を阻害する作用を有する。また RNAに組み込まれて fluoro RNA生成ゃリボ ソーム RNA形成の阻害にも関与する。なお、上記遺伝子の発現もしくは該遺伝子に よってコードされるタンパク質の機能を抑制することにより、作用(感受性)を増強させ ること力 Sできる抗癌剤としては、 5-フルォロウラシルと同様の作用機序を有する抗癌 剤であれば特に制限はなぐ例えばデガフール、カルモフール、ドキシフルリジン、シ タラビン、アンシタビン、またはエノシタビン等を挙げることができる。
[0054] また、抗癌剤がマイトマイシン Cである場合には、本発明の遺伝子としては以下の 遺伝子であることが好まし!/、。
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、(3)TopBPl、(5)RFC3、(6)RFC5、(7)Elgl、(8)Sccl、 (9)S cc3、 (10)Chkl、(12)Husl、(13)Ubcl3、(14)CSA、(15)XPF、 (16)Polh、 (17)P oli、(18)Dmcl、 (19) DNA-P cs, (20)Tin2、(21)Sir2、(22)MGMT、(23)ABH、 (25) TIMELESS
抗癌剤マイトマイシン Cは、腫瘍細胞の DNAと結合し、二重鎖 DNAへの架橋形成を 介して DNAの複製を阻害する作用を有する。また細胞周期の DNA合成前期(G1)後 半から DNA合成期(S)前半に作用する。なお、上記遺伝子の発現もしくは該遺伝子 によってコードされるタンパク質の機能を抑制することにより、作用(感受性)を増強さ せることができる抗癌剤は、マイトマイシン Cと同様の作用機序を有する抗癌剤であ れば、マイトマイシン Cに特に限定されない。
[0055] また、本発明において、上記(1)〜(27)からなる群より選択されるタンパク質の機 能を阻害する化合物としては、例えば、以下のような物質を挙げることができる。
(a)上記(1)〜(27)からなる群より選択されるタンパク質に対してドミナントネガティブ の性質を有する該タンパク質変異体
(b)上記(1)〜(27)からなる群より選択されるタンパク質に結合する抗体
(c)上記(1)〜(27)からなる群より選択されるタンパク質に結合する低分子化合物 [0056] 上記のドミナントネガティブの性質を有するタンパク質変異体とは、該タンパク質が 発現することによって、内在性の野生型タンパク質の活性を消失もしくは低下させる 機能を有するタンパク質を指す。
また本発明は、上記(1)〜(27)からなる群より選択される遺伝子によってコードさ れるタンパク質に結合する抗体を有効成分として含有する、染色体の修復ある!/、は 安定化を阻害する作用を有する抗癌剤増感剤を提供する。
[0057] また、上記抗体は、本発明のタンパク質と結合することにより、該タンパク質の機能 を阻害することが期待される。上記抗体は、当業者に公知の方法により調製すること が可能である。ポリクローナル抗体であれば、例えば、次のようにして得ることができ る。天然の本発明のタンパク質、あるいは GSTとの融合タンパク質として大腸菌等の 微生物において発現させたリコンビナントタンパク質、またはその部分ペプチドをゥサ ギ等の小動物に免疫し血清を得る。これを、例えば、硫安沈殿、プロテイン A、プロテ イン Gカラム、 DEAEイオン交換クロマトグラフィー、または、本発明のタンパク質をカツ プリングしたァフィ二ティーカラム等により精製することにより調製する。また、モノクロ ーナル抗体であれば、例えば、本発明のタンパク質もしくはその部分ペプチドをマウ スなどの小動物に免疫を行い、同マウスより脾臓を摘出し、これをすりつぶして細胞
を分離し、該細胞とマウスミエローマ細胞とをポリエチレングリコール等の試薬を用い て融合させ、これによりできた融合細胞 (ノ、イブリドーマ)の中から、本発明のタンパク 質に結合する抗体を産生するクローンを選択する。次いで、得られたハイプリドーマ をマウス腹腔内に移植し、同マウスより腹水を回収し、得られたモノクローナル抗体を 、例えば、硫安沈殿、プロテイン A、プロテイン Gカラム、 DEAEイオン交換クロマトダラ フィ一、本発明のタンパク質や合成ペプチドをカップリングしたァフィ二ティーカラム等 により精製することで、調製することが可能である。
[0058] 本発明の抗体の形態には、特に制限はなぐ本発明のタンパク質に結合する限り、 上記ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体のほかに、ヒト抗体、遺伝子組み換え によるヒト型化抗体、さらにその抗体断片や抗体修飾物も含まれる。
抗体取得の感作抗原として使用される本発明のタンパク質は、その由来となる動物 種に制限されないが哺乳動物、例えばマウス、ヒト由来のタンパク質が好ましぐ特に ヒト由来のタンパク質が好ましい。ヒト由来のタンパク質は、本明細書に開示される遺 伝子配列またはアミノ酸配列を用いて得ることができる。
[0059] 本発明において、感作抗原として使用されるタンパク質は、完全なタンパク質あるい はタンパク質の部分ペプチドであってもよい。タンパク質の部分ペプチドとしては、例 えば、タンパク質のアミノ基 (N)末端断片やカルボキシ (C)末端断片が挙げられる。 本明細書における「抗体」とはタンパク質の全長または断片に反応する抗体を意味す また、ヒト以外の動物に抗原を免疫して上記ハイプリドーマを得る他に、ヒトリンパ球
、例えば EBウィルスに感染したヒトリンパ球を in vitroでタンパク質、タンパク質発現細 胞又はその溶解物で感作し、感作リンパ球をヒト由来の永久分裂能を有するミエロー マ細胞、例えば U266と融合させ、タンパク質への結合活性を有する所望のヒト抗体を 産生するハイプリドーマを得ることもできる。
[0060] 本発明のタンパク質に結合する抗体は、例えば、抗癌剤との併用を目的とした使用 が考えられる。得られた抗体を人体に投与する目的 (抗体治療)で使用する場合には 、免疫原性を低下させるため、ヒト抗体やヒト型抗体が好ましい。
また、上記低分子化合物は、天然または人工の化合物のいずれであってもよい。
本発明の化合物は、後述のスクリーニング方法によって、取得することが可能である
〇
[0061] また、本発明において、上記(1)〜(27)に記載の遺伝子の発現を阻害する物質と しては、例えば、以下のような物質を挙げることができる。
(a)上記(1)〜(27)からなる群より選択される遺伝子の転写産物、またはその一部に
(b)上記(1)〜(27)からなる群より選択される遺伝子の転写産物を特異的に開裂す るリボザィム活性を有する核酸
(c)上記(1)〜(27)からなる群より選択される遺伝子の発現を、 RNAi効果による阻害 作用を有する核酸
[0062] 本発明における「核酸」とは、通常 RNAまたは DNAを意味する。特定の内在性遺伝 子の発現を阻害する方法としては、アンチセンス技術を利用する方法が当業者によく 知られている。アンチセンス核酸が標的遺伝子の発現を阻害する作用としては、以下 のような複数の要因が存在する。すなわち、三重鎖形成による転写開始阻害、謹 ポリメラーゼによって局部的に開状ループ構造が作られた部位とのハイブリッド形成 による転写阻害、合成の進みつつある RNAとのハイブリッド形成による転写阻害、ィ ントロンとェキソンとの接合点におけるハイブリッド形成によるスプライシング阻害、ス プライソソーム形成部位とのハイブリッド形成によるスプライシング阻害、 mRNAとのハ イブリツド形成による核から細胞質への移行阻害、キヤッビング部位やポリ (A)付加部 位とのハイプリッド形成によるスプライシング阻害、翻訳開始因子結合部位とのハイブ リツド形成による翻訳開始阻害、開始コドン近傍のリボソーム結合部位とのハイブリツ ド形成による翻訳阻害、 mRNAの翻訳領域やポリソーム結合部位とのハイブリッド形 成によるペプチド鎖の伸長阻害、および核酸とタンパク質との相互作用部位とのハイ ブリツド形成による遺伝子発現阻害などである。このようにアンチセンス核酸は、転写 、スプライシングまたは翻訳など様々な過程を阻害することで、標的遺伝子の発現を 阻害する(平島および井上,新生化学実験講座 2核酸 IV遺伝子の複製と発現, 日本 生化学会編,東京化学同人, 1993, 319-347.)。
[0063] 本発明で用いられるアンチセンス核酸は、上記の!/、ずれの作用により本発明の遺
伝子の発現を阻害してもよい。一つの態様としては、本発明の遺伝子の mRNAの 5'端 近傍の非翻訳領域に相補的なアンチセンス配列を設計すれば、遺伝子の翻訳阻害 に効果的と考えられる。また、コード領域もしくは 3'側の非翻訳領域に相補的な配列 も使用すること力できる。このように、本発明の遺伝子の翻訳領域だけでなく非翻訳 領域の配列のアンチセンス配列を含む核酸も、本発明で利用されるアンチセンス核 酸に含まれる。使用されるアンチセンス核酸は、適当なプロモーターの下流に連結さ れ、好ましくは 3'側に転写終結シグナルを含む配列が連結される。このようにして調 製された核酸は、公知の方法を用いることで、所望の動物へ形質転換できる。アンチ センス核酸の配列は、形質転換される動物が持つ内在性遺伝子またはその一部と相 補的な配列であることが好ましいが、遺伝子の発現を有効に抑制できる限り、完全に 相補的でなくてもよい。転写された RNAは、標的遺伝子の転写産物に対して好ましく は 90%以上、最も好ましくは 95%以上の相補性を有する。アンチセンス核酸を用いて 標的遺伝子の発現を効果的に抑制するには、アンチセンス核酸の長さは少なくとも 1 5塩基以上であり、好ましくは 100塩基以上であり、さらに好ましくは 500塩基以上であ
[0064] また、本発明の遺伝子の発現の阻害は、リボザィム、またはリボザィムをコードする DNAを利用して行うことも可能である。リボザィムとは触媒活性を有する RNA分子を指 す。リボザィムには種々の活性を有するものが存在する力 中でも RNAを切断する酵 素としてのリボザィムに焦点を当てた研究により、 RNAを部位特異的に切断するリボ ザィムの設計が可能となった。リボザィムには、グループ Iイントロン型や RNase Pに含 まれる Ml RNAのように 400ヌクレオチド以上の大きさのものもある力 ハンマーヘッド 型やヘアピン型と呼ばれる 40ヌクレオチド程度の活性ドメインを有するものもある(小 泉誠および大塚栄子,蛋白質核酸酵素, 1990, 35, 2191.)。
[0065] 例えば、ハンマーヘッド型リボザィムの自己切断ドメインは、 G13U14C15という配列 の C15の 3'側を切断するが、その活性には U14と A9との塩基対形成が重要とされ、 C1 5の代わりに A15または U15でも切断され得ることが示されている(Koizumi, M. et al., FEBS Lett, 1988, 228, 228.)。基質結合部位が標的部位近傍の RNA配列と相補的 なリボザィムを設計すれば、標的 RNA中の UC、 UUまたは UAという配列を認識する制
限酵素的な RNA切断リボザィムを作出することができる(Koizumi, M. et al., FEBS Le tt, 1988, 239, 285·、小泉誠および大塚栄子,蛋白質核酸酵素, 1990, 35, 2191.、 o izumi, M. et al., Nucl Acids Res, 1989, 17, 7059·)。
[0066] また、ヘアピン型リボザィムも本発明の目的に有用である。このリボザィムは、例え ばタバコリングスポットウィルスのサテライト RNAのマイナス鎖に見出される(Buzayan, JM. , Nature, 1986, 323, 349·)。ヘアピン型リボザィム力、らも、標的特異的な RNA切断 リボザィムを作出できることが示されている(Kikuchi, Y. & Sasaki, N. , Nucl Acids Res, 1991, 19, 6751.、菊池洋,化学と生物, 1992, 30, 112.)。このように、リボザィムを用 いて本発明の遺伝子の転写産物を特異的に切断することで、該遺伝子の発現を阻 害すること力 Sでさる。
[0067] 本発明の上記(1 )〜(27)の!/、ずれかに記載の遺伝子の発現を阻害する化合物の 好ましい態様としては、本発明の上記(1 )〜(27)のいずれかに記載の遺伝子に対し て RNAi (RNA interference; RNA干渉)効果を有する二本鎖 RNA (siRNA)を挙げること 力 Sできる。より具体的には、配列番号: 6;!〜 87のいずれかに記載の塩基配列を含む RNAを挙げることがでさる。また、上記 siRNAの具体的な態様としては、配列番号: 61 〜87のいずれかに記載の塩基配列からなる RNAを一方の鎖とする二本鎖 RNA (siRN A)を挙げること力 Sでさる。
[0068] 一般的に RNAiとは、標的遺伝子の mRNA配列と相同な配列からなるセンス RNAお よびこれと相補的な配列からなるアンチセンス RNAとからなる二本鎖 RNAを細胞内に 導入することにより、標的遺伝子 mRNAの破壊を誘導し、標的遺伝子の発現が阻害さ れる現象を言う。
RNAi機構の詳細については未だに不明な部分もある力 DICERといわれる酵素(R Nase III核酸分解酵素ファミリーの一種)が二本鎖 RNAと接触し、二本鎖 RNAが small i nterfering RNAまたは siRNAと呼ばれる小さな断片に分解されるものと考えられている 。本発明における RNAi効果を有する二本鎖 RNAには、この siRNAも含まれる。
[0069] 本発明の好ましい態様においては、上記(1)〜(27)のいずれかに記載の遺伝子 の発現を RNAi効果により抑制し得る RNA(siRNA)であって、配列番号: 6;!〜 87のい ずれかに記載の塩基配列からなる RNAと、該 RNAと相補的な配列からなる RNAとが
ノ、イブリダィズした構造を含む二本鎖 RNAを有効成分として含む、抗癌剤増感剤を 提供する。
例えば、配列番号: 61に記載の塩基配列(5'_ gaugcaggaugacaaucagTT-3')を含む 本発明の siRNAとは、以下のような構造の RNA分子を例示することができる。
5'-gaugcaggaugacaaucag-3'
3'-cuacguccuacuguuaguc-5'
(上記「ι」は水素結合を表す。)
なお、上記 RNA分子において一方の端が閉じた構造の分子、例えば、ヘアピン構 造を有する siRNA(shRNA)も本発明に含まれる。即ち、分子内において二本鎖 RNA構 造を形成し得る分子もまた本発明に含まれる。
例えば、
0 -gaugcaggaugacaaucag、xxxx)n cugauugucauccugcauc-3' のよつな分子ちまに本発 明に含まれる。 (上記「(ΧΧΧχ)η」は任意塩基および配列数からなるポリヌクレオチドを 表す。)
上記 siRNAの好ましい態様としては、上記(1)〜(27)のいずれかに記載の遺伝子 の発現を RNAi効果により抑制し得る RNA(siRNA)であって、配列番号: 6;!〜 87のい ずれかに記載の塩基配列からなる RNAと、該 RNAと相補的な配列からなる RNAとが ハイブリダィズした構造を含む二本鎖 RNAを好適に示すことができる。
本発明の上記「RNAi効果により抑制し得る二本鎖 RNA」の具体例として、表 1に記 載の塩基配列(配列番号: 6;!〜 87のいずれかに記載の塩基配歹 IJ)を該ニ本鎖 RNA の一方の鎖とする siRNA分子(配列番号: 6;!〜 87のいずれかに記載の塩基配列と、 該 RNAと相補的な配列からなる RNAとがハイブリダィズした構造を含む siRNA分子)を 挙げること力 Sできる。即ち本発明の一つの態様としては、 RNAi効果により抑制し得る 二本鎖 RNAの一方の鎖力 配列番号: 6;!〜 87のいずれかに記載の塩基配列からな る siRNA分子(配列番号: 6;!〜 87のいずれかに記載の塩基配列と、該 RNAと相補的 な配列からなる RNAとがハイブリダィズした構造を含む siRNA分子)を有効成分として 含む、抗癌剤増感剤を提供する。
[0071] ただし、二本鎖 RNAの末端において、例えば、 1もしくは複数の RNAが付加もしくは 欠失された構造の二本鎖 RNAもまた、本発明に含まれる。その場合、二本鎖を形成 する RNAは、上記(1) (27)の!/、ずれかに記載の遺伝子の部分配列と完全に同一 (相同)である必要はないが、相同性を有することが好ましい。また、本発明の RNAi効 果を有する二本鎖 RNAは、通常、本発明の上記(1)〜(27)のいずれかに記載の遺 伝子の mRNAにおける連続する任意の RNA領域と相同な配列からなるセンス RNA および該センス RNAに相補的な配列のアンチセンス RNAからなる二本鎖 RNAである
[0072] 本発明の siRNAにおいて二本鎖を形成する領域の RNAの長さは、好ましくは 15 3 Obp程度の長さであり、より好ましくは 19 21bpの長さであり、最も好ましくは 19 bp (例 えば、配列番号: 6;! 87のいずれかに記載の RNAを一方の鎖とする siRNA)の長さ であるが、必ずしもこれらの長さに限定されない。
[0073] また、そのままの長さでは RNAi効果を有さないような長鎖の RNAであっても、細胞に おいて RNAi効果を有する siRNA 分解されることが期待されるため、本発明における 二本鎖 RNAの長さは、特に制限されない。また、本発明の上記(1)〜(27)のいずれ かに記載の遺伝子の mRNAの全長もしくはほぼ全長の領域に対応する長鎖二本鎖 R NAを、例えば、予め DICERで分解させ、その分解産物を抗癌剤増感剤として利用す ることが可能である。この分解産物には、 RNAi効果を有する二本鎖 RNA分子 (siRNA) が含まれることが期待される。この方法によれば、 RNAi効果を有することが期待され る mRNA上の領域を、特に選択しなくともよい。即ち、 RNAi効果を有する本発明の遺 伝子の mRNA上の領域は、必ずしも正確に規定される必要はな!/、。
[0074] また、通常、末端に数塩基のオーバーハングを有する二本鎖 RNAは、 RNAi効果が 高いことから、本発明の二本鎖 RNAは、末端に数塩基のオーバーハングを有すること が望ましい。このオーバーハングを形成する塩基の長さ、および配列は特に制限され ない。また、このオーバーハングは、 DNAおよび RNAのいずれであってもよい。好まし くは、 2塩基のオーバーハングを例示することができる。本発明においては例えば、 T T (チミンが 2個)、 UU (ゥラシルが 2個)、その他の塩基のオーバーハングを有する二 本鎖 RNA (最も好ましくは 19塩基の二本鎖 RNAと 2塩基 (TT)のオーバーハングを有す
る分子)を好適に用いることができる。本発明の二本鎖 RNAには、このようにオーバー ハングを形成する塩基が DNAであるような分子や、標的 mRNA配列と相同な配歹 IJも含 よれる。
例えば、オーバーハング部分の塩基が TTである場合には、本発明の siRNA分子と しては、
5' -gaugcaggaugacaaucagTT-3'
Ι Ι Ι Ι Ι Ι Ι Ι Ι Ι Ι Ι Ι Ι Ι Ι Ι Ι Ι
3' -TTcuacguccuacuguuaguc-5'
のような分子(3'側に TTが付加された分子)を例示すること力 Sできる。
本発明の上記「RNAi効果により抑制し得る二本鎖 RNA」は、当業者においては、該 二本鎖 RNAの標的となる本発明によって開示された上記(1)〜(27)の!/、ずれかに 記載の遺伝子の塩基配列を基に、適宜作製することができる。本発明の上記(1 )〜( 27)のいずれかに記載の遺伝子の塩基配列は、上述のように公共の遺伝子データ ベースから容易に取得することができる。一例を示せば、配列番号:;!〜 30のいずれ かに記載の塩基配列をもとに、本発明の二本鎖 RNAを作製することができる。即ち、 配列番号:;!〜 30のいずれかに記載の塩基配列をもとに、該配列の転写産物である mRNAの任意の連続する RNA領域を選択し、この領域に対応する二本鎖 RNAを作製 することは、当業者においては、容易に行い得ることである。また、該配列の転写産 物である mRNA配列から、より強!/、RNAi効果を有する siRNA配列を選択する方法は、 例えば文献(Reynold et al. Nature biotechnology 22. 326-330 (2004)、 Ui-Tei et al. Nucleic Acids Res. 32. 936-948 (2004)、 Boese Q, Leake D, Reynolds A, Read S, Sc aringe SA, Marshall WS, hvorova A. Mechanistic insights aid computational short i nterfering RNA design. Methods Enzymol. 2005;392:73-96. , Snove O Jr, Nedland M, Fjeldstad SH, Humberset H, Birkeland OR, Grunfeld T, Saetrom P. Designing effec tive siRNAs with off-target control. Biochem Biophys Res Commun. 2004;325(3):76 9—73·、 Yiu SM, Wong PW, Lam TW, Mui YC, ung HF, Lin M, Cheung YT. Filterin g of Ineffective siRNAs and Improved siRNA Design Tool. Bioinformatics. 200515;21 (2): 144-51、 Chalk AM, Wahlestedt C, Sonnhammer EL. Improved and automated pr ediction of effective siRNA. Biochem Biophys Res Commun. 2004;319(1):264_74·、 A
marzguioui M, Prydz H. An algorithm for selection of functional siRNA sequences. B iochem Biophys Res Commun. 2004;316(4): 1050-8· Sioud M, Leirdal M. Potential d esign rules and enzymatic synthesis of siRNAs. Methods Mol Biol. 2004;252:457-69.
)等を参考にして、当業者においては、適宜実施することが可能である。また、一方の 鎖 (例えば、配列番号: 6;! 87のいずれかに記載の塩基配歹 IJ)が判明していれば、 当業者においては容易に他方の鎖 (相補鎖)の塩基配列を知ることができる。 siRNA は、当業者においては市販の核酸合成機を用いて適宜作製することが可能である。 また、所望の RNAの合成については、一般の合成受託サービスを利用することが可 能である。
[0076] また、本発明における siRNAは、必ずしも全てのヌクレオチドがリボヌクレオチド (RN A)でなくともよい。即ち、本発明において、 siRNAを構成する 1もしくは複数のリボヌク レオチドは、対応するデォキシリボヌクレオチドであってもよい。この「対応する」とは、 糖部分の構造は異なるものの、同一の塩基種(アデニン、グァニン、シトシン、チミン( ゥラシル))であることを指す。例えば、アデニンを有するリボヌクレオチドに対応する う。また、前記「複数」とは特に制限されないが、好ましくは 2 5個程度の少数を指す また、本発明において siRNAを構成する核酸は、例えば、 LNA(Locked Nucleic Aci d)等の核酸アナログであってもよい。該 LNPは、ヌクレアーゼに耐性の物質であるた め、より長時間 siRNA効果を持続させることが可能である。
[0077] さらに、本発明の二本鎖 RNAを発現し得る DNA (ベクター)もまた、本発明の上記(1 ) (27)に記載の遺伝子の発現を抑制し得る化合物の好ましい態様に含まれる。本 発明の上記二本鎖 RNAを発現し得る DNA (ベクター)は、通常、該ニ本鎖 RNAの一 方の鎖をコードする DNA、および該ニ本鎖 RNAの他方の鎖をコードする DNAが、そ れぞれ発現し得るようにプロモーターと連結した構造を有する DNAである。本発明の 上記 DNAは、当業者においては、一般的な遺伝子工学技術により、容易に作製する こと力 Sできる。より具体的には、本発明の RNAをコードする DNAを公知の種々の発現 ベクタ 適宜揷入することによって、本発明の発現ベクターを作製することが可能
である。
[0078] なお、上述のように上記(1)〜(27)のいずれかに記載の遺伝子には、同一の遺伝 子であっても種々の多型が含まれている場合がある。当業者においては、配列番号: 6;!〜 87のいずれかに記載の塩基配列に対し、例えば、上記(1)〜(27)のいずれか に記載の遺伝子に関する公共の多型データベースからの情報を加味し、 RNAi効果 を有することが期待される RNAの配列を適宜設計することができる。このような RNAを 含む抗癌剤増感剤もまた本発明に含まれる。また、当業者においては、複数種作製 された本発明の二本鎖 RNAから、最適な RNAi効果を有する RNAを適宜選択して抗 癌剤増感剤とすることも可能である。
[0079] また、本発明の二本鎖 RNAの基となる遺伝子 (標的遺伝子)の配列は、必ずしも遺 伝子全長の塩基配列が判明している必要はない。選択すべき任意の連続する RNA 領域(例えば、 20〜30塩基)が判明していればよい。従って、 EST (Expressed Sequen ce Tag)等のように mRNAの一部は判明している力 全長が判明していない遺伝子断 片からも、該断片の塩基配列を基に本発明の二本鎖 RNAを作製することが可能であ る。以下に、 GenBankデータベースにおいて、本発明の遺伝子と高い相同性を示し た EST配列のァクセッションナンバーを、各遺伝子名ごとに分けて記載する。但し、こ れらは多数存在する EST配列のうちの一例に過ぎず、当業者においては、適切な ES T断片に関する情報を公共のデータベースから容易に取得することができる。
[0080] (l) Mcm3: BM467763, AL551465、 BQ066322, BQ061652, AL559830、 BQ059704, BM471050, BU849776、 AL545116、 BQ063041 , BU541430、 BU860117、 BM542415 、 AU124791、 BU857116、 BM453648, BQ056448, BM927480, BQ218351 , BQ05764 7、 BQ940737, AU119321、 BX462455、 BQ898140, CF995699、 BI772155、 AL54937 2、 BQ214499, BU856617、 BM007763, BI223143、 BQ652945, BQ649476, BU50975 5、 BQ058522, BQ641758、 BQ064200, BG281527、 AU133404、 BE249947、 BU6013 17、 BU154249、 BQ927115, BI457651、 BX462766、 BU558287、 BQ051029, BM9175 94、 AU134083、 BM561561 , CD656673、 BQ422727, BQ058080, BM478599, BQ881 515、 BE795211、 BI196606、 BG034961、 BE892181、 BQ649956, BM479437, BG765 473、 AL527918、 BE560376、 BI261474、 B 99305、 BX348989、 BE793456、 BM46173
2、 BE620320、 BE783059、 BE799563、 BE561200、 BQ064568, BE620857、 BG681460 、 BE616575、 AU124152、 BM832703, BG392301、 BG259417、 AW083217、 BI086286 、 BQ650935, BI259905、 BG686972、 CD642696、 BI091236、 CD655620、 BI551396、 BE778348、 BG773437、 BU193733、 BE274144、 BE891644、 AW732422、 AU131124、 BG742232、 BU178300、 AU123260
[0081] (2) Cdc7: CA441701、 BG170872、 BM463748, AL044123、 BE789148、 AU 120443, A U129167、 AU116849、 AW968900、 AW574512、 BI462237、 AL602215、 BM789148, CB959717、 AL039323、 AA814975、 AA936081、 BG721963、 BU657893、 CB216422、 AU117631、 AA768993、 AA131310、 BF366907、 W76628、画 295、 BF982876、 AA48 8999、 AW405542、 AL044122、 BF031756、 BQ221549, AA291015、 BX419687、 BF69 6442、 AA488783、 CD523327、 BG116756、 D20593、 CD689440、 BG116838、 BU5680 48、 CD642993
[0082] (3)ΤορΒΡ1:ΒΙ860562·1、 BG211676.1、 BG205968.1、 BG205121.1、 BG199994.1、 B G197369.1、 BG194973.1、 BG191292.1、 BG188141.1、 BG182400.1、 BG574255.1、 B G530865.1、 BG530326.1、 BG506287.1、 BG503699.1、 BG499145.1、 BG470035.1、 B G212752.1、 BG679852.1、 N66108.1, BI025248.1, BG944229.1、 AU185190.1, AL60 1561.1、 BI457669.1, BI599631.1, BI599739.1, N98714.1, BI909100.1、 BM193596.1 、 BM457984.1, BM466768.1, BM468599.1, AU154485.1, AU148410.1, BF059530.
I、 BF687788.1、 BF677901.1、 BF247342.1、 BF219040.1、 BF217865.1、 AU133127.1 、 AU133081.1, AU127105.1AU126208.1, AU124582.1, AV762536.1、 BF103955.1、 AV734003.1、 R97836.1、 BG388685.1、 BG388593.1、 BG436243.1、 BG425541.1、 BG 258516.1、 F19044.2、 BF902481.1、 BF898849.1、 BF897077.1、 BF977080.1、 BF976 093.1、 BF974954.1、 BG031742.1、 BF811031.1、 BF742486.1、 BF571595.1、 AU1545
II.1, BU430653.1, BU166007.1、 BU166267.1、 BU176955.1, Τ57641·1、 Τ59304·1、 ΑΑ122044·1、 BU567509.1, BU569949.1, BU615657.1, ΑΑ179731·1、 ΑΑ180484·1、 ΑΑ195149·1、 ΑΑ195048·1、 BU682937.1, BU742911.1, ΑΑ877778·1、 ΑΑ827881·1、 ΑΑ806586·1、 ΑΑ687343·1、 ΑΑ679914·1、 ΑΑ629943·1、 ΑΑ580922·1、 ΑΑ548644·1、 ΑΑ502992·1、 ΑΑ287172·1、 ΑΑ287050·1、 ΑΑ374330·1、 ΑΑ283610·1、 CA414001.1,
ΑΑ282490·1、 BU934705.1, BU754087.1, AL703988.1、 ΒΜ980333·1、 BM976686.1, W80449.1、 W79045.1、 BM849790.1, BM847838.1, W61209.1、 W61104.1、 BM7876 23.1, BM800578.1, BM727770.1, BM696206.1, BM681414.1, BM665950.1, BM664 480.1、 BM477192.1, BU430127.1, BU429013.1、 BQ924347.1, BM150522.1, BM14 7383.1、 BM145207.1, AA019931.1, AA019919.1, AA015707.1, AA013344.1, AA01 3051.1、 BQ232300.1, BQ183678.1, W92384.1、 W92328.1、 BQ049012.1, BQ00253 3.1、 ΑΙ932674·1、 BX340974.2, BX340975.2, BX373975.2, ΑΙ949967·1、 AI950324.1 、 ΒΧ421354·2、 ΒΧ435839·1、 ΒΧ452308·2、 AW003763.1、 CD652979.1、 AW027550. 1、 ΒΧ495380·1、 ΒΧ501663·1、 AL120892.1、 AW102634.1、 AW500655.1、 AW474804 •1、 AW468446.1、 AW444550.1、 AW361151.1、 AW338037.1、 AW292841.1、 AL1351 65.1, F09486.1、 F11839.1、 ΑΙ905758·1、 ΒΡ429870·1、 AW197098.1、 AW196674.1、 CF121353.1、 CF121336.1、 CF121614.1、 AI243782.1, R33183.1、 R33092.1、 AI2418 99.1, AI241853.1, AI221574.1, AI219074.1, BX092549.1, BX112533.1, R20921.1、 R20807.1、 ΑΙ041207·1、 ΑΙ032829·1、 ΑΙ028590·1、 ΑΙ022185·1、 ΑΙ004886·1、 ΑΑ970 099.1、 ΑΙ911250·1、 ΑΙ911060·1、 ΑΙ862633·1、 ΑΙ803733·1、 ΑΙ718633·1、 AI690370.1 、 ΑΙ656252·1、 ΑΙ652145·1、 ΑΙ630013·1、 R54257.1, ΑΙ492307·1、 ΑΙ470457·1、 ΑΙ470 058.1、 R51863.1, ΑΙ351858·1、 ΑΙ288841·1、 ΑΙ249039·1、 ΒΕ545536·1、 CV814998.1 、 CV808215.1、 ΒΕ466592·1、 CV379650.1, ΒΕ350532·1、 ΒΡ348277·1、 BP283951.1 、 ΒΡ261103·1、 ΒΡ340246·1、 ΒΡ332144·1、 ΒΡ368690·1、 ΒΡ367688·1、 ΒΡ367131·1、 ΒΡ344747·1、 ΒΡ327858·1、 ΒΡ326794·1、 R97785.1, BF033225.1, ΒΕ960630·1、 ΒΕ9 40106.1、 D63182.1, ΒΕ894142·1、 ΒΕ888860·1、 ΒΕ884830·1、 ΒΕ875686·1、 ΒΕ8724 54.1, ΒΕ867751·1、 ΒΕ866097·1、 ΒΕ832117·1、 ΒΕ832116·1、 R84827.1, BE709318.1 、 ΒΕ613449·1、 CN346334.1, CN346332.1, CN346333.1, CN346341.1, CN346340.1 、 CN346339.1, CN346338.1, CN346337.1, CN346336.1, CN346335.1, AW957490. 1、 ΒΧ955996·1、 ΒΧ952812·1、 R76678.1, R76351.1, AW629039.1, AW516017.1, Β Ρ298788·1、 ΒΡ234764·1、 ΒΡ212638·1、 ΒΡ243801·1、 ΒΡ242220·1、 ΒΡ239750·1、 BP 230541.1、 ΒΕ247037·1、 ΒΕ244452·1、 ΒΕ243607·1、 ΒΕ003309·1、 AW978277.1, CN 401550.1、 CN401549.1, CN346344.1, CN346343.1, CN346342.1, ΑΑ904777·1、 ΒΧ
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1、 BG714322.1、 BM471189.1 , BM552381.1 , W40393.1、 BM721721.1 , BM785803.1 、 AL707510.1、 AL709832.1、 BQ305407.1 , BQ305613.1 , BQ354585.1 , BQ774611.1 、 BU633322.1 , ΑΑ193286· 1、 ΑΑ193296· 1、 BU683758.1 , ΑΑ344201· 1、 AA359610.1 、 ΑΑ373157· 1、 ΑΑ287923· 1、 ΑΑ287985· 1、 ΑΑ778924· 1、 ΑΙ025669· 1、 CB156864.1
、 ΑΙ277125·1、 ΑΙ203498·1、 ΑΙ280329·1、 ΑΙ457716·1、 R58879.1, AW016548.1, CD6 57076.1、 ΒΧ489680·1、 CD723639.1, AW102683.1, CF137269.1, AW811688.1, AW 959698.1、 AW965099.1, CN425423.1, CR737800.1, ΒΡ357289·1、 ΒΡ279291·1、 BP 282255.1、 ΒΡ349077·1、 CV336651.1, CV808073.1, ΒΕ787985·1、 ΒΕ932661·1、 BF1 03840.1、 ΑΑ835784·1、 ΑΙ023450·1、 CD518484.1, CD654107.1, AW264759.1, AW7 95617.1、 C 822577.1, C 822578.1, AW867817.1, CN287362.1, CV405693.1, CV 412820.1、 R93929.1, R93930.1, R94279.1, BF380402.1, BF380420.1, BF513297.1 、 BF897051.1, Ν54899·1、 Ν67012·1、 BM505282.1, BM509688.1, BM720570.1, BQ 711780.1、 BF927695.1, AA878280.1
(27)BLM:BG772975.1、 BG721596.1、 BU588736.1, BG531593.1、 BM804157.1, BG 217661.1、 BG210806.1、 BG199179.1、 BG192554.1、 BG187329.1、 BG185919.1、 BG 182955.1、 BG574669.1、 BG397477.1、 AL556853.3、 AL556823.3、 Η53763·1、 BE963 549.2、 ΒΕ940055·1、 ΒΕ889560·1、 ΒΕ778486·1、 ΒΕ618504·1、 CV803292.1, ΒΕ5380 92.1, ΒΕ535950·1、 ΒΡ333288·1、 ΑΑ769336·1、 ΑΑ747832·1、 ΑΑ480209·1、 CA4889 94.1, ΑΑ249737·1、 ΑΑ214549·1、 BU431321.1, BM151892.1, BM150628.1, BQ359 304.1、 BQ316432.1, BQ230262.1, ΒΜ542461·1、 BM451903.1, BM041661.1, ΒΜ04 0993.1、 ΒΙ667071·1、 AU185765.1, ΒΙ091772·1、 ΒΙ091601·1、 BG875917.1, BG7562 62.1, ΑΙ114820·1、 AW138812.1、 CD707743.1, CD698394.1, AL120858.1、 BX4751 96.1, ΒΧ474261·1、 ΒΧ451970·1、 ΒΧ451969·1、 ΒΧ419085·2、 ΒΧ434842·2、 ΒΧ2838 39.1, CB243435.1, ΑΙ630521·1、 ΑΙ590599·1、 ΑΙ423875·1、 ΑΙ394601·1、 BX092961. 1、 ΒΧ106802·1、 ΑΙ097184·1、 ΑΑ904488·1、 ΑΑ903504·1、 ΑΑ974756·1、 AA862803.1 、 ΒΡ366542·1、 ΒΡ363946·1、 ΒΡ199711·1、 ΒΕ245802·1、 ΒΕ245666·1、 CN277542.1, CN277540.1, CN277539.1, CN277538.1, CN277537.1, CN277541.1, AW847854.1 、 AW847725.1, AW847706.1, AW847600.1, AW847599.1, AW847595.1, AW57559 5.1、 AW504704.1, AW503829.1, AW502890.1, AW404657.1, ΒΧ643554·1、 ΒΧ643 048.1、 ΒΧ102449·1、 C 299441.1, AW847795.1, AW847798.1, AW847850.1, CN35 9774.1、 ΒΕ143192·1、 CR742420.1, R94839.1, R96946.1, R97003.1, Η53817·1、 BF 767997.1、 BF804521.1、 ΒΙ020403·1、 ΒΙ041746·1、 ΒΙ041748·1、 BG979051.1, BG979
187.1、 BQ184600.1 , BQ186574.1 , BQ 189280.1 , ΑΑ213534· 1、 ΑΑ299069· 1、 Τ8369 2.1、 Τ84312· 1、 Τ85194· 1、 ΑΑ584761· 1、 Τ95850· 1、 Τ95942· 1、 Τ99033· 1、 T99034.1 、 Τ99720· 1、 Τ99721· 1、 AA776195.1
[0107] 本発明の好ましい態様においては、本発明の上記(1)〜(27)に記載の遺伝子、も しくは上記各 ESTに対応する mRNAにおける、連続する RNA領域を一方の鎖とする R NAi効果を有する二本鎖 RNAを有効成分として含む、抗癌剤増感剤を提供する。 本発明者らによって、上記(1)〜(27)に記載の遺伝子の発現を抑制する物質は、 抗癌剤感受性増強作用を有することが見出された。従って、上記の各遺伝子の発現 を指標とすることにより、抗癌剤感受性増強作用を有する化合物をスクリーニングす ることが可能である。該化合物は、抗癌剤増感剤として有用である。
即ち本発明は、上記(1)〜(27)のいずれかに記載の遺伝子の発現量、もしくは該 遺伝子によってコードされるタンパク質の活性を低下させる化合物を選択することを 特徴とする、抗癌剤増感剤のスクリーニング方法を提供する。
[0108] 本発明のスクリーニング方法の好ましい態様としては、以下の(a)〜(c)の工程を含 む、抗癌剤増感剤のスクリーニング方法に関する。
(a)本発明の(1)〜(27)の!/、ずれかに記載の遺伝子を発現する細胞もしくは細胞抽 出液と、被検化合物を接触させる工程
(b)前記遺伝子の発現レベルを測定する工程
(c)被検化合物の非存在下において測定した場合と比較して、該発現レベルを低下 させる化合物を選択する工程
[0109] 上記工程 (a)における細胞としては、内因性の上記(1)〜(27)に記載の遺伝子が 発現している細胞、または外来性の上記(1)〜(27)に記載の遺伝子が導入され、該 遺伝子を発現してレ、る細胞等を利用することができる。外来性の前記遺伝子が発現 した細胞は、通常、該遺伝子を含む発現ベクターを宿主細胞へ導入することにより作 製すること力 Sできる。この発現ベクターは、当業者においては一般的な遺伝子工学技 術によって作製すること力 Sできる。上記方法における「細胞」としては、例えば、 MCF7 (乳癌)、 Α549 (肺癌)、 U20S (骨肉腫)、 C33A (子宮頸癌)、 ΗΤ1080 (繊維肉腫)、 ΡΑ -1 (卵巣の奇形癌)、 Tera2 (胎生期癌)、 Τ24 (膀胱癌)、 Κ562 (慢性骨髄性白血病)、
Molt4 (急性リンパ芽球性白血病)、 A172 (神経膠芽細胞腫)、 HeLa (子宮頸癌)、 Hep G2 (月干癌)、 ACC62 (メラノーマ)、 P4 (膝臓癌)、 Ca i- 1 (腎臓癌)、 M N45 (胃癌)、 L Neap (前立腺癌)、 MDA-MB435 (乳癌)、 EJ 1 (膀胱癌)、 OVCAR3 (卵巣癌)等の細 胞を利用することができる力 必ずしもこれらの特定の細胞に限定されず、本発明の 遺伝子を有する細胞であればょレ、。
また、上記工程 (a)における「接触」は、通常、上記(1)〜(27)のいずれかに記載 の遺伝子を発現する細胞の培養液に被検化合物を添加することによって行うが、こ の方法に限定されない。被検化合物がタンパク質等の場合には、該タンパク質を発 現する DNAベクターを、該細胞へ導入することにより、「接触」を行うことができる。
[0110] 次いで本方法においては、上記(1)〜(27)に記載の遺伝子の発現レベルを測定 する。ここで「遺伝子の発現」には、転写および翻訳の双方が含まれる。遺伝子の発 現レベルの測定は、当業者に公知の方法によって行うことができる。例えば、上記(1 )〜(27)に記載の遺伝子を発現する細胞から mRNAを定法に従って抽出し、この mR NAを铸型としたノーザンハイブリダィゼーシヨン法または RT-PCR法を実施することに よって、該遺伝子の転写レベルの測定を行うことができる。また、上記遺伝子を発現 する細胞からタンパク質画分を回収し、該遺伝子によってコードされるタンパク質の 発現を SDS-PAGE等の電気泳動法で検出することにより、遺伝子の翻訳レベルの測 定を行うこともできる。さらに、上記遺伝子によってコードされるタンパク質に対する抗 体を用いて、ウェスタンブロッテイング法を実施することにより、該タンパク質の発現を 検出し、遺伝子の翻訳レベルの測定を行うことも可能である。上記遺伝子によってコ ードされるタンパク質の検出に用いる抗体としては、検出可能な抗体であれば、特に 制限はないが、例えばモノクローナル抗体、またはポリクローナル抗体の両方を利用 すること力 Sでさる。
[0111] 本方法においては更に、被検化合物の非存在下において測定した場合 (対照)と 比較して、該発現レベルを低下させる化合物を選択する。このようにして選択された 化合物は、抗癌剤感受性を増強させる作用を有することが期待される。さらに、該化 合物は、抗癌剤の増感を作用機序とする抗癌剤の併用薬剤となることが期待される。
[0112] また、本発明のスクリーニング方法の別の態様としては、上記(1)〜(27)のいずれ
かに記載の遺伝子の発現レベルを低下させるような化合物を、レポーター遺伝子を 利用してスクリーニングする方法が挙げられる。
即ち本発明は、以下の(a)〜(c)の工程を含む、抗癌剤増感剤のスクリーニング方 法を提供する。
(a)上記(1)〜(27)のいずれかに記載の遺伝子の転写調節領域とレポーター遺伝 子とが機能的に結合した構造を有する DNAを含む細胞または細胞抽出液と、被検化 合物を接触させる工程
(b)前記レポーター遺伝子の発現レベルを測定する工程
(c)被検化合物の非存在下において測定した場合と比較して、前記発現レベルを低 下させる化合物を選択する工程
[0113] 本方法においては、まず、上記(1)〜(27)のいずれかに記載の遺伝子の転写調 節領域とレポーター遺伝子とが機能的に結合した構造を有する DNAを含む細胞また は細胞抽出液と、被検化合物を接触させる。ここで「機能的に結合した」とは、上記(1 )〜(27)に記載の遺伝子の転写調節領域に転写因子が結合することにより、レポ一 ター遺伝子の発現が誘導されるように、該遺伝子の転写調節領域とレポーター遺伝 子とが結合していることをいう。従って、レポーター遺伝子が他の遺伝子と結合してお り、他の遺伝子産物との融合タンパク質を形成する場合であっても、該遺伝子の転写 調節領域に転写因子が結合することによって、該融合タンパク質の発現が誘導され るものであれば、上記「機能的に結合した」の意に含まれる。上記(1)〜(27)に記載 の遺伝子の cDNA塩基配列に基づいて、当業者においては、ゲノム中に存在する該 遺伝子の転写調節領域を周知の方法により取得することが可能である。
[0114] 本方法に用いるレポーター遺伝子としては、その発現が検出可能であれば特に制 限されず、例えば、 CAT遺伝子、 lacZ遺伝子、ルシフェラーゼ遺伝子、および GFP遺 伝子等が挙げられる。「上記(1)〜(27)の!/、ずれかに記載の遺伝子の転写調節領 域とレポーター遺伝子とが機能的に結合した構造を有する DNAを含む細胞」として、 例えば、上記(1)〜(27)に記載の遺伝子の転写調節領域とレポーター遺伝子とが 機能的に結合した構造を有するベクターが導入された細胞等が挙げられる。上記べ クタ一は、当業者においては一般的な遺伝子工学技術によって作製することができ
る。ベクターの細胞への導入は、一般的な方法、例えば、リン酸カルシウム沈殿法、 電気パルス穿孔法、リボフエタミン法、マイクロインジェクション法等によって実施する こと力 Sできる。「上記(1)〜(27)に記載の遺伝子の転写調節領域とレポーター遺伝 子とが機能的に結合した構造を有する DNAを含む細胞」には、染色体に該構造が揷 入された細胞も含まれる。染色体への DNA構造の揷入は、当業者に一般的に用いら れる方法、例えば、ランダムインテグレーションや、相同組み換えを利用した遺伝子 導入法により行うことができる。
[0115] 「上記(1)〜(27)のいずれかに記載の遺伝子の転写調節領域とレポーター遺伝子 とが機能的に結合した構造を有する DNAを含む細胞抽出液」とは、例えば、市販の 試験管内転写翻訳キットに含まれる細胞抽出液に、上記(1)〜(27)に記載の遺伝 子の転写調節領域とレポーター遺伝子とが機能的に結合した構造を有する DNAを 添加したあのを挙げること力 Sでさる。
本方法における「接触」は、「上記(1)〜(27)のいずれかに記載の遺伝子の転写 調節領域とレポーター遺伝子とが機能的に結合した構造を有する DNAを含む細胞」 の培養液に被検化合物を添加する、または該 DNAを含む上記の市販された細胞抽 出液に被検化合物を添加することにより行うことができる力、これらの方法に限定され ない。被検化合物がタンパク質の場合には、例えば、該タンパク質を発現する DNA ベクターを、該細胞へ導入することにより接触を行うことも可能である。
[0116] 本方法においては、次いで、該レポーター遺伝子の発現レベルを測定する。レポ 一ター遺伝子の発現レベルは、該レポーター遺伝子の種類に応じて、当業者に公知 の方法により測定することができる。例えば、レポーター遺伝子が CAT遺伝子である 場合には、該遺伝子産物によるクロラムフエ二コールのァセチル化を検出することに よって、レポーター遺伝子の発現量を測定することができる。レポーター遺伝子が lac Z遺伝子である場合には、該遺伝子発現産物の触媒作用による色素化合物の発色 を検出することにより、また、ルシフェラーゼ遺伝子である場合には、該遺伝子発現 産物の触媒作用による蛍光化合物の蛍光を検出することにより、さらに、 GFP遺伝子 である場合には、 GFPタンパク質による蛍光を検出することにより、レポーター遺伝子 の発現量を測定することができる。
[0117] 本方法においては、次いで、測定したレポーター遺伝子の発現レベルを、被検化 合物の非存在下にお!/、て測定した場合と比較して、低下させる化合物を選択する。 このようにして選択された化合物は、抗癌剤の感受性を増強させる作用を有すること が期待される。
本発明の別の態様としては、上記(1)〜(27)の!/、ずれかに記載の遺伝子によって コードされるタンパク質の活性を指標とする、抗癌剤増感剤のスクリーニング方法で ある。
[0118] 本発明は、以下の(a)〜(c)の工程を含む、抗癌剤増感剤のスクリーニング方法を 提供する。
(a)上記(1)〜(27)の!/、ずれかに記載の遺伝子によってコードされるタンパク質、ま たは該タンパク質を発現する細胞もしくは細胞抽出液と、被検化合物を接触させるェ 程
(b)前記タンパク質の活性を測定する工程
(c)被検化合物の非存在下において測定した場合と比較して、前記タンパク質の活 性を低下させる化合物を選択する工程
上記タンパク質の活性としては、具体的には、本発明の(1)〜(27)に記載のタンパ ク質に関する上述の機能 (活性)等を挙げることができる。当業者においては、スクリ 一ユングにぉレ、て指標とするタンパク質につ!/、ての機能(活性)、および該機能(活 性)の評価 (測定)方法についての情報を、例えば、文献データベース等により適宜、 人手すること力 Sでさる。
一例を示せば、指標とするタンパク質が Mcm3である場合は、例えば、該タンパク質 を含む Mcm2,3,5複合体による Mcm4,6,7の helicase活性阻害活性を検出することによ つて、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる (JBC(1998)273,8369-8375.)
〇
[0119] 指標とするタンパク質が Cdc7である場合は、例えば、 MCM複合体を基質とした該タ ンパク質のリン酸化活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価 (測定) することができる (ΕΜΒΟ(1997)16,4340_4351·)。
指標とするタンパク質が TopBPlである場合は、例えば、該タンパク質と DNA polyme
rase εの相互作用による DNA合成活性を検出することによって、該タンパク質の機 能を評価(測定)することができる(J Biol Chem. (2001) 276, 30399-30406)。
指標とするタンパク質が Pola p70である場合は、例えば、該タンパク質を含む Pola p 180、 p70、 p58、 p48による 4量体形成、あるいはこの複合体の Primase、 Polymerase活 性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価 (測定)することができる (Eur.J. Biochem.222,781- 793·)。
[0120] 指標とするタンパク質が RFC3である場合は、例えば、該タンパク質と RFC2、 RFC4、 RFC5と Radl7の複合体の ATPase活性を測定することによって、該タンパク質の機能 を評価(測定)することができる(J Biol Chem. (2004) 279, 20921-20926·)。
指標とするタンパク質が RFC5である場合は、例えば、該タンパク質と RFC2、 RFC3、 RFC4と Radl7の複合体の ATPase活性を測定することによって、該タンパク質の機能 を評価(測定)することができる(J Biol Chem. (2004) 279, 20921-20926·)。
指標とするタンパク質が Elglである場合は、例えば、該タンパク質と RFC2、 RFC3、 R FC4、 RFC5との複合体形成を検出する事によって、該タンパク質の機能を評価する 事ができる(EMBO J. (2003) 22, 4304-4313·)。
[0121] 指標とするタンパク質が Scclである場合は、例えば、該タンパク質と Smcl,Smc3,Scc 3との 14S cohesin複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価( 測定)することができる (JCB(2000)151,749-762.)。
指標とするタンパク質が Scc3である場合は、例えば、該タンパク質と Smcl,Smc3,Scc 1との 14S cohesin複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価( 測定)することができる (JCB(2000)151,749-762.)。
指標とするタンパク質が Chklである場合は、例えば、 p53タンパク質を基質とした該 タンパク質によるリン酸化を検出することによって、該タンパク質の機能を評価 (測定) すること力 Sできる (Genes Dev. (2000) 14, 289-300)。
[0122] 指標とするタンパク質が NBSlである場合は、例えば、 DNA損傷に応答した該タンパ ク質と Mrel l/Rad50との複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を 評価(測定)することができる (Cell(1998)93,477_486.)。
指標とするタンパク質が Huslである場合は、例えば、 DNA損傷に応答した該タンパ
ク質と Radl,Rad9との複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価 (測定)すること力 sできる (J. Biol. Chem. (1999)274,567—570·)。
指標とするタンパク質が Ubcl3である場合は、例えば、該タンパク質のュビキチン co njugating活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することが できる (Cell(1999)96,645_653.)。
[0123] 指標とするタンパク質が CSAである場合は、例えば、該タンパク質と CSB,TFIIHとの 相互作用を検出することによって、該タンパク質の機能を評価 (測定)することができ る (Cell(1995)82,555_564.)。
指標とするタンパク質力 PFである場合は、例えば、該タンパク質と ERCC1との複合 体形成、 stem-loop構造 DNAを基質とした該タンパク質の endonuclease活性を検出す ることによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる (Cell(1996)86,811 -822.)。
指標とするタンパク質が Polhである場合は、例えば、該タンパク質の DNA合成活性 を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nature. (1999) 399, 700-704·)。
[0124] 指標とするタンパク質力 SPoliである場合は、例えば、ミスマッチ partial duplex DNA力、 らの primer extension活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定 )することができる (JBC(2001)276,30615-30622.)。
指標とするタンパク質が Dmclである場合は、例えば、該タンパク質の DNA依存性 A TPase活性を測定することによって、該タンパク質の機能を評価 (測定)すること力 Sでき る(Proc Natl Acad Sci U S A. (1997) 94, 11221-11226·)。
指標とするタンパク質が DNA-PKcsである場合は、例えば、該タンパク質の kinase活 性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価 (測定)することができる(Nucl eic Acids Res. (1993) 21, 1289-1295·)。
指標とするタンパク質が Tin2である場合は、例えば、該タンパク質と TRF1との相互 作用を検出することによって、該タンパク質の機能を評価 (測定)することができる (Nat Genet(1999)23,405- 412·)。
[0125] 指標とするタンパク質が Sir2である場合は、例えば、該タンパク質のヒストン脱ァセチ
ル化アツセィによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる (Gene(199 9)234, 161-168·)。
指標とするタンパク質が MGMTである場合は、例えば、該タンパク質によるメチル化 DNAからのメチル基転移反応を検出することによって、該タンパク質の機能を評価( 測定)すること力できる (JBC(1990)265, 14754-14762·)。
指標とするタンパク質が DUTである場合は、例えば、該タンパク質の dUTPase活性 を検出することによって、該タンパク質の機能を評価 (測定)することができる (J Biol C hem. (1996) 271, 7745-7751·)。
[0126] 指標とするタンパク質力 TIMELESSである場合は、例えば、該タンパク質と mammalia n clock Period proteins (mPERs)との複合体形成を検出することによって、該タンパク 質の機能を評価(測定)することができる(Science (2003) 302, 439-442·)。
指標とするタンパク質が WRNである場合は、例えば、該タンパク質の 3'_5' DNAヘリ カーゼ活性および、 DNA依存性 ATP分解活性を検出することによって、該タンパク質 の機能を評価(測定)することができる(Nucleic Acids Res. (1997) 25, 2973-2978·)。 指標とするタンパク質が BLMである場合は、例えば、該タンパク質の 3'_5' DNAヘリ カーゼ活性および、 DNA依存性 ATP分解活性を検出することによって、該タンパク質 の機能を評価(測定)することができる(J Biol Chem. (1997) 272, 30611-30614·)。
[0127] 次いで、被検化合物の非存在下において測定した場合と比較して、上記(1)〜(2
7)のいずれかに記載の遺伝子によってコードされるタンパク質の活性を低下させる 化合物を選択する。上記方法に使用する該遺伝子によってコードされるタンパク質は 、変異を含まない全長タンパク質であることが好ましいが、該タンパク質と同等の活性 を有するものであれば、一部のアミノ酸配列が置換および/あるいは欠失されたタン パク質であってもよい。
本発明の上記スクリーニング方法においては、好ましくは、ァクチノマイシン D、カン プトテシン、シスプラチン、ドキソルビシン、エトポシド、 5-フルォロウラシル、マイトマイ シン C等の抗癌剤について、その抗癌作用を増強させる物質を効率的にスクリー二 ングすること力 Sでさる。
[0128] また本発明のスクリーニング方法において、さらに好ましくは、抗癌剤がァクチノマイ
シン Dである場合には、発現もしくは活性の測定の際に指標とする遺伝子(タンパク 質)は、以下の遺伝子(タンパク質)であること力 S好ましレ、。
(l)Mcm3、 (7)Elgl、 (21)Sir2、 (25) TIMELESS
また、抗癌剤がカンプトテシンである場合には、発現もしくは活性の測定の際に指 標とする遺伝子(タンパク質)は、以下の遺伝子(タンパク質)であることが好ましレ、。 (l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (10)Chkl、 (1 2)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (16)Polh、 (17)Poli、 (19) DNA- PKcs、 (25) TIM ELESS, (26)WRN、 (27)BLM
[0129] また、抗癌剤がシスブラチンである場合には、発現もしくは活性の測定の際に指標 とする遺伝子(タンパク質)は、以下の遺伝子(タンパク質)であることが好ましレ、。 (l)Mcm3、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (ll)NBSl, (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (15)XPF、 (26)WRN、 (27)BLM
また、抗癌剤がドキソルビシンである場合には、発現もしくは活性の測定の際に指 標とする遺伝子(タンパク質)は、以下の遺伝子(タンパク質)であることが好ましレ、。 (5)RFC3、 (7)Elgl、 (8)Sccl、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (17) Poli, (25) TIMELESS
[0130] また、抗癌剤がエトポシドである場合には、発現もしくは活性の測定の際に指標とす る遺伝子(タンパク質)は、以下の遺伝子(タンパク質)であること力 S好ましレ、。
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (9)Scc3、 (10) Chkl、 (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (16)Polh、 (17)Poli、 (19) DNA- PKcs、 (20)Tin2、 (23)ABH、 (25) TIMELESS
また、抗癌剤が 5-フルォロウラシルである場合には、発現もしくは活性の測定の際 に指標とする遺伝子(タンパク質)は、以下の遺伝子(タンパク質)であることが好まし い。
(l)Mcm3、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (8)Sccl、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (12)H usl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (15)XPF、 (16)Polh、 (17)Poli、 (18)Dmcl、 (19)D NA-P cs, (20)Tin2、 (21)Sir2、 (22)MGMT、 (23)ABH、 (24)DUT
[0131] また、抗癌剤がマイトマイシン Cである場合には、発現もしくは活性の測定の際に指
標とする遺伝子(タンパク質)は、以下の遺伝子(タンパク質)であることが好ましレ、。
(l) Mcm3、 (2) Cdc7、 (3) TopBPl、 (5) RFC3、 (6) RFC5、 (7) Elgl、 (8) Sccl、 (9) S cc3、 (10) Chkl、 (12) Husl、 (13) Ubcl3、 (14) CSA、 (15) XPF、 (16) Polh、 (17) P oli、 (18) Dmcl、 (19) DNA-P cs, (20) Tin2、 (21) Sir2、 (22) MGMT、 (23)ABH、 (25) TIMELESS
[0132] また本発明の好ましい態様においては、上記(1)〜(27)からなる群より選択される 遺伝子の発現、または該遺伝子によってコードされるタンパク質の機能を阻害する化 合物を個体へ投与する工程を含む、生物(ヒト、または、非ヒト動物等)の抗癌剤感受 性を増強させる方法である。
[0133] さらに本発明は、所望の化合物について、該化合物が抗癌剤に対して抗癌作用を 増強させる機能を有するか否かの判定方法を提供する。即ち該判定方法は、被検化 合物について、本発明の上記(1)〜(27)のいずれかに記載の遺伝子の発現量、ま たは該遺伝子によってコードされるタンパク質の活性を低下させる作用を有するか否 力、を評価し、低下させる作用を有する場合に、該被検化合物は抗癌剤の抗癌作用を 増強させる機能を有するものと判定する。
また本発明は、上記の抗癌剤、および本発明の抗癌剤増感剤の双方を必須成分と して含む、癌治療のための医薬組成物を提供する。該医薬組成物は、従来の抗癌 剤と比べて低濃度で治療効果を奏し、また、副作用の少ない治療薬として期待される
〇
一例を示せば、ァクチノマイシン Dと、(l) Mcm3、 (7) Elgl、 (21) Sir2、または(25) TIMELESSの!/、ずれかの遺伝子の発現を阻害する化合物とを混合した組成物は、従 来の抗癌剤と比べて低濃度で治療効果を奏する抗癌剤(医薬組成物)となること力期 待される。
[0134] また本発明は、抗癌剤増感剤を医薬組成物として製造する方法を提供する。本方 法においてはまず、本発明の上記スクリーニング方法によって抗癌剤増感剤の成分 となる化合物を選択する。次いで、選択された化合物を薬学上許容される担体と混 合する。これら薬学上許容される担体として、例えば界面活性剤、賦形剤、着色料、 着香料、保存料、安定剤、緩衝剤、懸濁剤、等張化剤、結合剤、崩壊剤、滑沢剤、
流動性促進剤、矯味剤等が挙げられるが、これらに制限されず、その他常用の担体 を適宜使用することができる。
[0135] 本発明の抗癌剤増感剤の製剤化にあたっては、常法に従い、必要に応じて上記担 体を添加すること力 Sできる。具体的には、軽質無水ケィ酸、乳糖、結晶セルロース、マ ンニトーノレ、デンプン、カノレメロースカノレシゥム、カノレメロースナトリウム、ヒドロキシプロ ピノレセノレロース、ヒドロキシプロピノレメチノレセノレロース、ポリビニノレァセターノレジェチノレ ァミノアセテート、ポリビュルピロリドン、ゼラチン、中鎖脂肪酸トリダリセライド、ポリオ キシエチレン硬化ヒマシ油 60、 白糖、カルボキシメチルセルロース、コーンスターチ、 無機塩類等を挙げることカできる。
[0136] 上記薬剤の剤型の種類としては、例えば経口剤として錠剤、粉末剤、丸剤、散剤、 顆粒剤、細粒剤、軟'硬カプセル剤、フィルムコーティング剤、ペレット剤、舌下剤、ぺ 一スト剤等、非経口剤として注射剤、坐剤、経皮剤、軟膏剤、硬膏剤、外用液剤等が 挙げられ、当業者においては投与経路や投与対象等に応じた最適の剤型を選ぶこ とができる。本発明のタンパク質を発現する DNA、本発明の遺伝子の発現を抑制す るアンチセンス RNA、リボザィム、 siRNAを発現する DNAを生体内に投与する場合、レ トロウィルス、アデノウイルス、センダイウィルスなどのウィルスベクターやリボソームな どの非ウィルスベクターを利用することができる。また、本発明の遺伝子の発現を抑 制する合成アンチセンス核酸や合成 siRNAを生体内に投与する場合、リボソーム、高 分子ミセル、カチオン性キャリアなどの非ウィルスベクターを利用することができる。投 与方法としては、例えば in vivo法および ex vivo法を挙げること力 Sできる。
[0137] 本発明の薬剤または医薬組成物の投与量は、剤型の種類、投与方法、患者の年 齢や体重、患者の症状等を考慮して、最終的には医師の判断により適宜決定するこ と力 Sできる。
また本発明は、本発明の抗癌剤増感剤を個体 (例えば、患者等)へ投与する工程 を含む、癌の治療方法に関する。投与方法は特に制限されないが、例えば、静脈投 与、動脈投与、皮下投与等が挙げられる。
さらに本発明は、上記(1)〜(27)の!/、ずれかに記載の遺伝子の発現を抑制する化 合物、もしくは該遺伝子によってコードされるタンパク質の機能を阻害する化合物に
ついての、抗癌剤もしくは抗癌剤増感剤の製造のための使用に関する。 なお、本明細書において引用された全ての先行技術文献は、参照として本明細書 に組み入れられる。
実施例
[0138] 以下、本発明を実施例により詳細に説明する力 本発明はこれら実施例により制限 されるものではない。
[0139] 〔実施例 1〕細胞培養
HeLa細胞を、 10%牛胎児血清、 50 g/mlゲンタマイシンを含む Dulbecco's modifi ed Eagle's medium中で、 37度、 5%CO条件下にて培養した。
[0140] 〔実施例 2〕siRNAの設計
染色体安定化に関する 27遺伝子に対する siRNAを Elbasherらの方法(Elbasher, M. S. et al. Duplexes or 1-nucleotide RNAs mediate RNA interference in cultured mam malian cells. Nature 411, 494-498 (2001) )に従って設計した。それぞれの siRNA配 列および各配列に対応する配列番号を表 1に示す。 siRNAの合成を Qiagen社にお!/ヽ て fiつた。
[0141] 〔実施例 3〕 siRNAによる遺伝子発現抑制
トランスフエクシヨンの 24時間前に、 HeLa細胞を 24ゥエルプレートに 1 X 104個/ゥェ ノレの密度で播種した。 Oligofectamine (Invitrogen)を用い、製造者のプロトコールに 従ってトランスフエクシヨンを行った。 20%コンフルェントの HeLa細胞に、 1ゥエルあた り 5 pmolの siRNAを導入し、トランスフエクシヨン後 48時間の細胞から、 RNeasy Mini i t (Qiagen社製)を用いて、全 RNAを抽出した。 RT-PCRに用いたすべてのプライマー および、 TaqManプローブを Applied Biosystemsから購入し、 QuantiTect Probe RT-P CR Kit (Qiagen社製)を用いて RT-PCR反応を行い、 ABI PRISM 7000 Sequence Dete ction System (Applied Biosystems社製)を用いて定量化を行った。 β -ァクチンの発 現を標準として、それぞれの遺伝子の発現を比較定量した。
各遺伝子の発現に影響を及ぼさないコントロール siRNA (NS)を導入した細胞にお ける、各遺伝子の発現量を 100%として、 siRNAを導入した細胞における各遺伝子の発 現量を比較した。その結果、すべての遺伝子の発現が 90%以上抑制された (表 1)。
[0142] 〔実施例 4〕抗癌剤感受性試験
トランスフエクシヨンの 24時間前に、 HeLa細胞を 24ゥエルプレートに 1 X 104個/ゥェ ノレの密度で播種した。 Oligofectamine (Invitrogen)を用い、製造者のプロトコールに 従ってトランスフエクシヨンを行った。 20%コンフルェントの HeLa細胞に、 1ゥエルあた り 5 pmolの siRNAを導入し、 24時間後にそれぞれの抗癌剤を含む培地に交換した。 抗癌剤として、ァクチノマイシン D、カンプトテシン、シスプラチン、ドキソルビシン、エト ポシド、 5-フルォロウラシル、マイトマイシン Cを使用した。生細胞数測定試薬 SF (ナ 力ライテスタ社製)を用いて、トランスフエクシヨン後 48時間の生細胞数を測定した。実 験を 3回繰り返して行い、コントロール siRNA(NS)を導入した細胞に対する各薬剤の I C50値と、それぞれの siRNAを導入した細胞の IC50値を比較した。 siRNAの導入によ つて IC50値が明瞭に低下し、抗癌剤に対する感受性が高まった遺伝子を図 1に示し た。
[0143] Mcm3、 Elgl、 Sir2、 TIMELESS遺伝子の発現を抑制すると、 NSと比べてァクチノマイ シン Dに対する IC50値力 ¾-4倍低下し、感受性が高まった。同様に、 Mcm3、 Cdc7、 T opBPl、 RFC3、 RFC5、 Elgl、 Chkl、 Husl、 Ubcl3、 CSA、 Polh、 Poli、 DNA_PKcs、 TI MELESS、 WRN、 BLM遺伝子の発現を抑制すると、カンプトテシンに対する感受性が 高まった。 Mcm3、 Scc3、 Chkl、 NBS1、 Husl、 Ubcl3、 CSA、 XPF、 WRN、 BLM遺伝子 の発現を抑制すると、シスプラチンに対する感受性が高まった。 RFC3、 Elgl、 Sccl、 S cc3、 Chkl、 Ubcl3、 CSA、 Poli、 TIMELESS遺伝子の発現を抑制すると、ドキソルビシ ンに対する感受性が高まった。 Mcm3、 Cdc7、 TopBPl、 RFC3、 RFC5、 Elgl、 Scc3、 C hkl、 Husl、 Ubcl3、 CSA、 Polh、 Poli、 DNA_PKcs、 Tin2、 ABH、 TIMELESS遺伝子の 発現を抑制すると、エトポシドに対する感受性が高まった。 Mcm3、 RFC3、 RFC5、 Elg
1、 Sccl、 Scc3、 Chkl、 Husl、 Ubcl3、 CSA、 XPF、 Polh、 Poli、 Dmcl、 DNA_PKcs、 Tin
2、 Sir2、 MGMT、 ABH、 DUT遺伝子の発現を抑制すると、 5_フルォロウラシルに対す る感受性が高まった。 Mcm3、 Cdc7、 TopBPl、 RFC3、 RFC5、 Elgl、 Sccl、 Scc3、 Chkl 、 Husl、 Ubcl3、 CSA、 XPF、 Polh、 Poli、 Dmcl、 DNA_PKcs、 Tin2、 Sir2、 MGMT、 AB H、 TIMELESS遺伝子の発現を抑制すると、マイトマイシン Cに対する感受性が高まつ た。
以上の結果から、染色体の修復'安定化に関与する遺伝子の発現を抑制すること により、抗癌剤の効果が増強されることが示された。
[0144] 〔実施例 5〕 WRNヘリカーゼ阻害剤のスクリーニング方法と選択された化合物
以下に記載のスクリーニング方法により、 WRNヘリカーゼ阻害剤を選択した。
1)試験化合物の調整:化合物ライブラリーのワーキングプレート(2mMの濃度の化合 物を各 wellに 5 1ずつ分注したもの)に各 wellあたり 195 1のアツセィバッファーを加 える。アツセィバッファーの組成は 1.0 mM ATP, 5 mM MgCl、 ImM DTT、 O. lmg/ml BSAを含む、 50 mM Tirs-HClバッファー(pH 7.5)である。 12連ピペットで攪拌する。
2)黒色プレートに上記液を 5 1ずつ移し、アツセィバッファーで 5倍希釈する。
3)基質溶液を 10 ずつ添加する。基質溶液は、ユーロピウムでラベルした DNA (Eu -DNA) 5 nM、トラッパ一 DNA 50 nMをアツセィバッファーに溶かしたものである。
4) WRNヘリカーゼ(3.52 nM)溶液を 10 1ずつ添加する。
5)アルミフォイルで覆い、 37°Cで 1時間反応させる。
6) 50 mM Tris-HCl (ρΗ7·5)に溶かした 25 mM EDTAを 25 1ずつ添加して反応を停 止させる。
7)パーキン.エルマ社の ARVOsx- HTSを用い、 Excitation: 340 nM、 Emission: 620 n Mで測定する。
上記スクリーニングによって取得された、 WRNヘリカーゼ阻害剤を表 2に示す。
[0145] [表 2]
;!〜 21はスクリーニングして得られた WRNヘリカーゼ阻害剤である。数値は LD ( β
Μ)で示した阻害活性である。今回見出された WRNヘリカーゼ阻害剤は、ブルーム (Β LM)ヘリカーゼに対しても阻害活性を示した。 Helicase IIは大腸菌由来のへリカーゼ であり、 Quenchingはこれら化合物のクェンチング効果を LD ( μ Μ)で示したものであ 産業上の利用可能性
本発明により、染色体の修復'安定化に関与するタンパク質の発現もしくは機能を
阻害することにより、種々の抗癌剤について、抗癌作用を増強させることが可能であ 本発明の、染色体の修復および安定化に関与する遺伝子の機能を阻害する物質 は、抗癌剤増感剤として、また、生物 (ヒト、または非ヒト動物等)の抗癌剤感受性を増 強させる方法にとって、大いに有用である。本発明の抗癌剤増感剤は、各種抗癌剤 の使用量を抑えることができることから、抗癌剤と併用することにより、抗癌剤の有す る副作用を低減させることが可能である。
Claims
請求の範囲
DNAの修復もしくは安定化に関与する遺伝子の発現、または該遺伝子によってコ ードされるタンパク質の機能を阻害する化合物を有効成分として含む、抗癌剤増感 剤。
前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子である、請求項 1に記載の抗癌剤増感剤。 (l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (4)Polap70、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 ( 8)Sccl、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (ll)NBSl, (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (1 5)XPF、 (16)Polh、 (17)Poli、 (18)Dmcl、 (19) DNA_PKcs、 (20)Tin2、 (21)Sir2、 (22)MGMT、 (23)ABH、 (24)DUT、 (25) TIMELESS, (26)WRN、 (27)BLM 前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がァクチノマイシン D 、またはクロマイシン A3である、請求項 1に記載の抗癌剤増感剤。
(l)Mcm3、 (7)Elgl、 (21)Sir2、 (25) TIMELESS
前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がカンプトテシン、塩 酸イリノテカン、 SN-38、またはトポテカンである、請求項 1に記載の抗癌剤増感剤。 (l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (10)Chkl、 (1 2)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (16)Polh、 (17)Poli、 (19) DNA- PKcs、 (25) TIM ELESS, (26)WRN、 (27)BLM
前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がシスブラチン、カル ポプラチン、ネダプラチン、ロバプラチン、ォキザロプラチン、 JM216, JM335, DWA-2 114R、 NK-m I-OHP、または TRK-710である、請求項 1に記載の抗癌剤増感剤。 (l)Mcm3、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (ll)NBSl, (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (15)XPF、 (26)WRN、 (27)BLM
前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がドキソルビシン、ダ ウノルビシン、アクラルビシン、ピラスビシン、またはェピルビシンである、請求項 1に 記載の抗癌剤増感剤。
(5)RFC3、 (7)Elgl、 (8)Sccl、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (17) Poli, (25) TIMELESS
前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がエトポシドである、
請求項 1に記載の抗癌剤増感剤。
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (9)Scc3、 (10) Chkl、 (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (16)Polh、 (17)Poli、 (19) DNA- PKcs、 (20)Tin2、 (23)ABH、 (25) TIMELESS
前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤が 5-フルォロウラシ ノレ、デガフール、カルモフール、ドキシフルリジン、シタラビン、アンシタビン、または エノシタビンである、請求項 1に記載の抗癌剤増感剤。
(l)Mcm3、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (8)Sccl、 (9)Scc3、 (10)Chkl、 (12)H usl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (15)XPF、 (16)Polh、 (17)Poli、 (18)Dmcl、 (19)D NA-P cs, (20)Tin2、 (21)Sir2、 (22)MGMT、 (23)ABH、 (24)DUT
前記遺伝子が以下のいずれかの遺伝子であり、かつ、抗癌剤がマイトマイシンじで ある、請求項 1に記載の抗癌剤増感剤。
(l)Mcm3、 (2)Cdc7、 (3)TopBPl、 (5)RFC3、 (6)RFC5、 (7)Elgl、 (8)Sccl、 (9)S cc3、 (10)Chkl、 (12)Husl、 (13)Ubcl3、 (14)CSA、 (15)XPF、 (16)Polh、 (17)P oli、 (18)Dmcl、 (19) DNA-P cs, (20)Tin2、 (21)Sir2、 (22)MGMT、 (23)ABH、 (25) TIMELESS
前記化合物が、前記遺伝子の発現を RNAi効果により抑制し得る二本鎖 RNAである 、請求項 2〜9の!/、ずれかに記載の抗癌剤増感剤。
前記二本鎖 RNAが、配列番号: 6;!〜 87のいずれかに記載の塩基配列からなる RN Aと、該 RNAと相補的な配列からなる RNAとがハイブリダィズした構造を含む二本鎖 R NAである、請求項 10に記載の抗癌剤増感剤。
請求項 2の(1)〜(27)の!/、ずれかに記載の遺伝子の発現量、もしくは該遺伝子に よってコードされるタンパク質の活性を低下させる化合物を選択することを特徴とする 、抗癌剤増感剤のスクリーニング方法。
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CN107129987A (zh) * | 2017-06-30 | 2017-09-05 | 苏州大学 | Timeless基因作为靶点在制备治疗宫颈癌的药物中的应用 |
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WO2005097189A1 (ja) * | 2004-04-09 | 2005-10-20 | Genecare Research Institute Co., Ltd. | 染色体安定化に関する遺伝子を標的とする癌細胞特異的アポトーシス誘導剤 |
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2007
- 2007-09-28 JP JP2008539728A patent/JPWO2008047574A1/ja active Pending
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BEER M.H. ET AL.: "The Merck Manual of Diagnosis and Therapy", vol. 17TH ED., 1999, MERCK RESEARCH LABORATORIES, pages: 988 - 993, XP003022313 * |
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