WO2007085497A3 - Marqueurs de prévision des résultats d'un traitement à l'anthracycline - Google Patents

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John Foekens
John Martens
Serenella Eppenberger-Scastori
Vincent Vuaroqueaux
Frederique Spyratos
Nadia Harbeck
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Gunter Weiss
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Achim Plum
Olivier Hartmann
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John Foekens
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Serenella Eppenberger-Scastori
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Abstract

La présente invention concerne des méthodes de pronostic et/ou de prévision des résultats du traitement à l'anthracycline de patients souffrant de troubles liés à une prolifération cellulaire. Lesdites méthodes consistent à déterminer le niveau d'expression d'au moins un gène sélectionné dans le groupe de gènes du tableau 1. L'invention concerne également des séquences, des oligonucléotides et des anticorps pouvant être utilisés dans lesdites méthodes.
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Families Citing this family (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2008053357A2 (fr) * 2006-11-01 2008-05-08 Epigenomics Ag Procédés, systèmes et produits de programme informatique pour déterminer des biomarqueurs de réponse à un traitement
WO2009034481A2 (fr) * 2007-04-16 2009-03-19 Korea Research Institute Of Bioscience And Biotechnology Biomarqueur de méthylation pour une détection précoce du cancer gastrique
US20090125247A1 (en) * 2007-08-16 2009-05-14 Joffre Baker Gene expression markers of recurrence risk in cancer patients after chemotherapy
EP2302069A1 (fr) * 2007-12-11 2011-03-30 Epigenomics AG Procédés et acides nucléiques pour les analyses de troubles prolifératifs cellulaires
EP2641977B1 (fr) * 2008-05-12 2014-09-03 Genomic Health, Inc. Tests pour prédire une sensibilité de patients atteints de cancer à des options de traitement de chimiothérapie
EP2660337B1 (fr) * 2008-07-15 2016-09-14 Epigenomics AG Procédés de prédire un prognostic thérapeutique du cancer du sein à base d'une analyse de la méthylation génetique
US20110217297A1 (en) * 2010-03-03 2011-09-08 Koo Foundation Sun Yat-Sen Cancer Center Methods for classifying and treating breast cancers
WO2013002733A1 (fr) * 2011-06-29 2013-01-03 National University Of Singapore Compositions pharmaceutiques pour le traitement du cancer
US10626462B2 (en) 2011-07-08 2020-04-21 Epigenomics Ag Methods and nucleic acids for determining the prognosis of a cancer subject
US11214836B2 (en) 2014-07-15 2022-01-04 Ontario Institute For Cancer Research Methods and devices for predicting anthracycline treatment efficacy
WO2017059521A1 (fr) * 2015-10-06 2017-04-13 Ontario Institute For Cancer Research (Oicr) Ciblage de la voie de l'histone pour détecter et vaincre la résistance à l'anthracycline
EP3246413A1 (fr) * 2016-05-20 2017-11-22 Klinikum rechts der Isar der Technischen Universität München Procédé permettant de prédire la réponse d'une patiente atteinte de cancer du sein à un traitement à l'anthracycline
DE102022131984B4 (de) * 2022-12-02 2024-08-22 Universitätsklinikum Jena, Körperschaft des öffentlichen Rechts Verfahren zum in vitro-Nachweis eines Harnblasenkarzinoms in einer Urinprobe

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2004111603A2 (fr) * 2003-05-28 2004-12-23 Genomic Health, Inc. Marqueurs de l'expression genetique permettant de predire la reponse une chimiotherapie
WO2005059172A2 (fr) * 2003-12-11 2005-06-30 Epigenomics Ag Procede et acides nucleiques permettant un traitement ameliore des troubles proliferatifs des cellules mammaires
WO2005100606A2 (fr) * 2004-04-09 2005-10-27 Genomic Health, Inc. Marqueurs d'expression genique permettant de predire la reponse a la chimiotherapie

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2004111603A2 (fr) * 2003-05-28 2004-12-23 Genomic Health, Inc. Marqueurs de l'expression genetique permettant de predire la reponse une chimiotherapie
WO2005059172A2 (fr) * 2003-12-11 2005-06-30 Epigenomics Ag Procede et acides nucleiques permettant un traitement ameliore des troubles proliferatifs des cellules mammaires
WO2005100606A2 (fr) * 2004-04-09 2005-10-27 Genomic Health, Inc. Marqueurs d'expression genique permettant de predire la reponse a la chimiotherapie

Non-Patent Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ASANO T ET AL: "Altered expression of topoisomerase II alpha contributes to cross-resistant to etoposide K562/MX2 cell line by aberrant methylation", BRITISH JOURNAL OF CANCER, vol. 92, no. 8, April 2005 (2005-04-01), pages 1486 - 1492, XP002419685, ISSN: 0007-0920 *
ESTELLER M ET AL: "Analysis of adenomatous polyposis coli promoter hypermethylation in human cancer", CANCER RESEARCH, AMERICAN ASSOCIATION FOR CANCER RESEARCH, BALTIMORE, MD, US, vol. 60, no. 16, 15 August 2000 (2000-08-15), pages 4366 - 4371, XP002305018, ISSN: 0008-5472 *
MAIER S ET AL: "DNA METHYLATION MARKERS- AN OPPORTUNITY TO FURTHER INDIVIDUALIZE THERAPY IN BREAST CANCER?", PERSONALIZED MEDICINE, FUTURE MEDICINE LTD., LONDON, GB, vol. 2, no. 4, November 2005 (2005-11-01), pages 339 - 347, XP001208231, ISSN: 1741-0541 *
MAIER SABINE ET AL: "IDENTIFYING DNA METHYLATION BIOMARKERS OF CANCER DRUG RESPONSE", AMERICAN JOURNAL OF PHARMACOGENOMICS, XX, XX, vol. 5, no. 4, 2005, pages 223 - 232, XP009077941, ISSN: 1175-2203 *
MARTIN V ET AL: "Involvement of DNA methylation in the control of the expression of an estrogen-induced breast-cancer-associated protein (pS2) in human breast cancers.", JOURNAL OF CELLULAR BIOCHEMISTRY APR 1997, vol. 65, no. 1, April 1997 (1997-04-01), pages 95 - 106, XP002324819, ISSN: 0730-2312 *
MUELLER H M ET AL: "PROGNOSTIC DNA METHYLATION MARKER IN SERUM OF CANCER PATIENTS", ANNALS OF THE NEW YORK ACADEMY OF SCIENCES, NEW YORK ACADEMY OF SCIENCES, NEW YORK, NY, US, vol. 1022, June 2004 (2004-06-01), pages 44 - 49, XP009055564, ISSN: 0077-8923 *
SANTOS K F ET AL: "The prima donna of epigenetics: the regulation of gene expression by DNA methylation.", BRAZILIAN JOURNAL OF MEDICAL AND BIOLOGICAL RESEARCH = REVISTA BRASILEIRA DE PESQUISAS MÉDICAS E BIOLÓGICAS / SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOFÍSICA ... [ET AL.] OCT 2005, vol. 38, no. 10, October 2005 (2005-10-01), pages 1531 - 1541, XP002435081, ISSN: 0100-879X *

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